View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0687_low_6 (Length: 474)

Name: NF0687_low_6
Description: NF0687
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0687_low_6
NF0687_low_6
[»] chr8 (59 HSPs)
chr8 (98-459)||(24796852-24797213)
chr8 (98-459)||(41837753-41838114)
chr8 (101-459)||(5589972-5590330)
chr8 (158-459)||(7242434-7242734)
chr8 (158-459)||(28564944-28565245)
chr8 (158-459)||(28572567-28572868)
chr8 (98-459)||(1098057-1098418)
chr8 (98-459)||(7012337-7012697)
chr8 (158-459)||(21434899-21435200)
chr8 (97-459)||(3886579-3886941)
chr8 (163-459)||(10092319-10092615)
chr8 (99-459)||(6316877-6317237)
chr8 (165-459)||(22658145-22658439)
chr8 (158-459)||(2317121-2317422)
chr8 (158-459)||(42555892-42556193)
chr8 (158-454)||(36060417-36060713)
chr8 (98-459)||(3659621-3659982)
chr8 (98-459)||(4231220-4231580)
chr8 (164-459)||(41388071-41388366)
chr8 (183-459)||(4697891-4698167)
chr8 (164-459)||(43117414-43117710)
chr8 (99-452)||(1183823-1184176)
chr8 (158-454)||(7413091-7413387)
chr8 (98-459)||(38567127-38567468)
chr8 (277-459)||(197268-197450)
chr8 (277-459)||(312105-312287)
chr8 (158-453)||(7421860-7422148)
chr8 (165-430)||(41169764-41170023)
chr8 (98-312)||(9830607-9830821)
chr8 (277-456)||(9830673-9830851)
chr8 (275-426)||(43117412-43117563)
chr8 (280-430)||(11635828-11635978)
chr8 (280-427)||(25642676-25642823)
chr8 (280-430)||(36108837-36108987)
chr8 (366-459)||(34934283-34934376)
chr8 (164-312)||(22658178-22658327)
chr8 (280-430)||(8995039-8995189)
chr8 (98-312)||(11635758-11635974)
chr8 (279-430)||(25382979-25383129)
chr8 (287-428)||(17836503-17836644)
chr8 (164-276)||(41169877-41169989)
chr8 (163-312)||(197267-197417)
chr8 (163-312)||(312104-312254)
chr8 (171-308)||(36108841-36108979)
chr8 (172-312)||(4697993-4698134)
chr8 (171-292)||(25642697-25642819)
chr8 (171-298)||(8995043-8995171)
chr8 (277-430)||(32017916-32018069)
chr8 (174-312)||(8996424-8996561)
chr8 (295-429)||(8996432-8996564)
chr8 (174-292)||(17836503-17836622)
chr8 (166-312)||(25382983-25383129)
chr8 (98-143)||(34934370-34934415)
chr8 (222-293)||(43073157-43073228)
chr8 (287-429)||(43073109-43073250)
chr8 (163-290)||(32017942-32018070)
chr8 (97-133)||(10092256-10092292)
chr8 (289-329)||(42559031-42559071)
chr8 (250-312)||(34934316-34934379)
[»] chr7 (80 HSPs)
chr7 (98-459)||(36358108-36358469)
chr7 (97-456)||(43859089-43859448)
chr7 (98-459)||(26873702-26874063)
chr7 (101-451)||(44467827-44468177)
chr7 (102-459)||(17166869-17167227)
chr7 (98-459)||(46027679-46028040)
chr7 (98-459)||(45350051-45350411)
chr7 (98-459)||(36675285-36675646)
chr7 (158-453)||(39976380-39976675)
chr7 (158-459)||(22723574-22723875)
chr7 (158-459)||(31065421-31065722)
chr7 (158-459)||(44142821-44143121)
chr7 (158-459)||(9624055-9624356)
chr7 (96-456)||(44723864-44724224)
chr7 (158-459)||(42241727-42242028)
chr7 (164-459)||(41367724-41368019)
chr7 (174-459)||(40055666-40055951)
chr7 (171-459)||(23469194-23469482)
chr7 (158-454)||(31428796-31429092)
chr7 (166-452)||(29075000-29075276)
chr7 (101-452)||(16834080-16834433)
chr7 (277-459)||(8461764-8461946)
chr7 (277-459)||(31931822-31932004)
chr7 (277-454)||(23562564-23562740)
chr7 (280-446)||(46828761-46828926)
chr7 (277-446)||(18104243-18104411)
chr7 (288-430)||(25174223-25174365)
chr7 (308-453)||(29663010-29663155)
chr7 (158-288)||(18104287-18104417)
chr7 (287-430)||(29502072-29502215)
chr7 (158-312)||(31931855-31932010)
chr7 (163-312)||(8461763-8461913)
chr7 (171-312)||(46828781-46828922)
chr7 (174-312)||(16649541-16649679)
chr7 (174-312)||(17623902-17624040)
chr7 (175-312)||(25174223-25174361)
chr7 (97-312)||(29502076-29502292)
chr7 (164-312)||(23469227-23469376)
chr7 (164-312)||(40055769-40055918)
chr7 (287-430)||(16649537-16649679)
chr7 (287-430)||(17623898-17624040)
chr7 (280-430)||(30781079-30781228)
chr7 (275-432)||(9013879-9014035)
chr7 (296-436)||(9014476-9014623)
chr7 (98-312)||(23562592-23562806)
chr7 (280-436)||(22499716-22499868)
chr7 (285-430)||(28754879-28755023)
chr7 (304-436)||(9021516-9021648)
chr7 (195-312)||(29663010-29663128)
chr7 (171-312)||(22499726-22499864)
chr7 (164-312)||(29075026-29075165)
chr7 (279-430)||(40883349-40883499)
chr7 (356-419)||(4248869-4248932)
chr7 (343-426)||(6961163-6961246)
chr7 (285-351)||(22566599-22566665)
chr7 (221-293)||(4248881-4248954)
chr7 (183-293)||(9014476-9014587)
chr7 (331-430)||(24779581-24779680)
chr7 (171-292)||(8727794-8727916)
chr7 (171-292)||(28754878-28754999)
chr7 (98-143)||(29662932-29662977)
chr7 (172-312)||(30781084-30781224)
chr7 (171-231)||(22566606-22566666)
chr7 (320-383)||(14629632-14629695)
chr7 (98-141)||(19692467-19692510)
chr7 (287-393)||(4248977-4249083)
chr7 (248-312)||(6961181-6961246)
chr7 (102-143)||(8727725-8727766)
chr7 (97-134)||(9014390-9014427)
chr7 (214-263)||(14629639-14629688)
chr7 (166-263)||(40883349-40883446)
chr7 (97-141)||(28754812-28754856)
chr7 (98-141)||(8461698-8461741)
chr7 (287-329)||(6961122-6961164)
chr7 (98-136)||(40054298-40054336)
chr7 (97-130)||(9013814-9013847)
chr7 (97-142)||(27949681-27949726)
chr7 (218-293)||(24779604-24779680)
chr7 (276-312)||(25303836-25303872)
chr7 (248-313)||(25303948-25304015)
[»] chr1 (68 HSPs)
chr1 (98-454)||(17285095-17285452)
chr1 (97-459)||(16692746-16693108)
chr1 (100-459)||(44052256-44052615)
chr1 (97-459)||(29169940-29170302)
chr1 (175-459)||(40567042-40567326)
chr1 (158-459)||(23177401-23177702)
chr1 (163-459)||(25298885-25299181)
chr1 (101-459)||(33011854-33012212)
chr1 (98-459)||(6849752-6850112)
chr1 (98-459)||(29981504-29981865)
chr1 (97-459)||(48708214-48708577)
chr1 (158-459)||(51139745-51140046)
chr1 (98-459)||(919507-919868)
chr1 (163-459)||(46224559-46224853)
chr1 (98-459)||(9042216-9042576)
chr1 (98-459)||(37125692-37126053)
chr1 (98-459)||(47561726-47562087)
chr1 (158-459)||(45836903-45837204)
chr1 (98-459)||(42371969-42372330)
chr1 (166-459)||(40428578-40428871)
chr1 (98-459)||(24790434-24790796)
chr1 (172-459)||(8086303-8086590)
chr1 (98-459)||(8530082-8530449)
chr1 (158-410)||(24544564-24544816)
chr1 (164-459)||(24542577-24542873)
chr1 (164-410)||(24542740-24542987)
chr1 (164-410)||(24542854-24543101)
chr1 (164-410)||(24542968-24543215)
chr1 (164-410)||(24543082-24543329)
chr1 (164-410)||(24543196-24543443)
chr1 (164-410)||(24543310-24543557)
chr1 (164-410)||(24543424-24543671)
chr1 (164-410)||(24543538-24543785)
chr1 (164-410)||(24543652-24543899)
chr1 (164-410)||(24543766-24544013)
chr1 (164-410)||(24543880-24544127)
chr1 (164-410)||(24543994-24544241)
chr1 (164-410)||(24544108-24544355)
chr1 (164-410)||(24544222-24544469)
chr1 (164-410)||(24544336-24544583)
chr1 (164-410)||(24544450-24544697)
chr1 (307-459)||(37343082-37343234)
chr1 (158-312)||(44317626-44317780)
chr1 (277-459)||(44317632-44317813)
chr1 (295-441)||(49001410-49001555)
chr1 (252-430)||(9246840-9247020)
chr1 (164-312)||(40567144-40567293)
chr1 (279-426)||(8086297-8086443)
chr1 (279-435)||(32540528-32540684)
chr1 (160-293)||(9246863-9246997)
chr1 (164-312)||(8086408-8086557)
chr1 (290-430)||(21852079-21852219)
chr1 (166-308)||(32540541-32540684)
chr1 (277-427)||(29055876-29056025)
chr1 (285-427)||(46601075-46601217)
chr1 (164-312)||(49001425-49001575)
chr1 (332-427)||(25030372-25030467)
chr1 (177-312)||(21852079-21852215)
chr1 (205-312)||(37343093-37343201)
chr1 (227-312)||(46601130-46601216)
chr1 (174-303)||(29055886-29056015)
chr1 (219-293)||(25030372-25030447)
chr1 (100-140)||(37343027-37343067)
chr1 (99-143)||(46224874-46224918)
chr1 (97-143)||(17879974-17880020)
chr1 (98-131)||(45836854-45836887)
chr1 (100-139)||(43532475-43532514)
chr1 (98-143)||(9247013-9247058)
[»] chr5 (51 HSPs)
chr5 (97-459)||(3631257-3631619)
chr5 (98-459)||(30772878-30773239)
chr5 (98-459)||(26525027-26525388)
chr5 (101-456)||(16823133-16823488)
chr5 (158-459)||(7440278-7440579)
chr5 (100-450)||(43348635-43348985)
chr5 (98-459)||(25701219-25701579)
chr5 (99-459)||(43358410-43358770)
chr5 (98-459)||(13013052-13013413)
chr5 (102-459)||(9595963-9596320)
chr5 (158-459)||(10925568-10925869)
chr5 (158-459)||(13084440-13084741)
chr5 (158-445)||(32304464-32304751)
chr5 (98-459)||(8074036-8074398)
chr5 (98-452)||(41084386-41084738)
chr5 (158-444)||(15374174-15374445)
chr5 (237-459)||(26784968-26785190)
chr5 (98-454)||(26296811-26297167)
chr5 (98-312)||(9737651-9737865)
chr5 (277-456)||(9737621-9737799)
chr5 (275-459)||(20656768-20656952)
chr5 (103-298)||(29390273-29390468)
chr5 (187-459)||(15374301-15374587)
chr5 (277-430)||(19577120-19577273)
chr5 (287-446)||(20487047-20487206)
chr5 (280-426)||(37042496-37042643)
chr5 (164-312)||(20656801-20656950)
chr5 (277-416)||(29390334-29390472)
chr5 (295-430)||(22578874-22579009)
chr5 (172-312)||(37042496-37042638)
chr5 (285-436)||(41817526-41817677)
chr5 (158-278)||(5844165-5844285)
chr5 (174-312)||(20487047-20487186)
chr5 (97-312)||(19577124-19577339)
chr5 (166-312)||(26785010-26785157)
chr5 (171-292)||(41817525-41817647)
chr5 (277-397)||(20071186-20071306)
chr5 (280-436)||(28662185-28662341)
chr5 (167-312)||(22578878-22579024)
chr5 (277-392)||(5844171-5844285)
chr5 (99-143)||(28662117-28662161)
chr5 (96-143)||(26784909-26784956)
chr5 (172-293)||(28662190-28662312)
chr5 (106-143)||(6229072-6229109)
chr5 (277-388)||(30050074-30050184)
chr5 (277-344)||(30062714-30062781)
chr5 (102-140)||(20071329-20071367)
chr5 (97-137)||(20656977-20657017)
chr5 (237-310)||(26683033-26683107)
chr5 (248-312)||(26683145-26683212)
chr5 (280-312)||(36244242-36244274)
[»] chr4 (66 HSPs)
chr4 (98-459)||(16925106-16925466)
chr4 (98-459)||(44134493-44134853)
chr4 (98-459)||(13233229-13233590)
chr4 (101-459)||(38141355-38141714)
chr4 (98-459)||(11650764-11651125)
chr4 (97-459)||(36584422-36584783)
chr4 (100-459)||(2654708-2655067)
chr4 (98-459)||(6755828-6756188)
chr4 (98-459)||(31663965-31664322)
chr4 (97-459)||(18491185-18491547)
chr4 (158-459)||(12700366-12700667)
chr4 (107-459)||(13612890-13613241)
chr4 (99-468)||(44745379-44745748)
chr4 (158-459)||(36954808-36955109)
chr4 (98-459)||(31581548-31581909)
chr4 (158-456)||(43564477-43564775)
chr4 (97-454)||(40228233-40228591)
chr4 (163-459)||(41832440-41832737)
chr4 (98-456)||(19653446-19653803)
chr4 (158-459)||(52581515-52581817)
chr4 (176-459)||(22647189-22647471)
chr4 (98-454)||(27270353-27270708)
chr4 (158-454)||(54795532-54795828)
chr4 (163-452)||(4632509-4632799)
chr4 (158-450)||(50767093-50767385)
chr4 (98-369)||(44817438-44817708)
chr4 (158-444)||(10096270-10096555)
chr4 (285-459)||(51001549-51001722)
chr4 (158-309)||(45670019-45670170)
chr4 (285-436)||(36801795-36801946)
chr4 (285-430)||(13869215-13869360)
chr4 (174-312)||(13857687-13857826)
chr4 (287-429)||(13857687-13857829)
chr4 (284-430)||(10393895-10394041)
chr4 (98-312)||(51001475-51001689)
chr4 (277-417)||(45670025-45670164)
chr4 (279-430)||(7638698-7638848)
chr4 (166-312)||(7638702-7638848)
chr4 (164-312)||(22647289-22647438)
chr4 (382-458)||(45670168-45670244)
chr4 (277-436)||(133416-133574)
chr4 (171-312)||(13869214-13869356)
chr4 (167-312)||(36801805-36801951)
chr4 (289-450)||(26653056-26653217)
chr4 (163-313)||(133415-133565)
chr4 (277-430)||(18668994-18669150)
chr4 (277-410)||(18735245-18735382)
chr4 (277-431)||(9046035-9046174)
chr4 (279-402)||(44817519-44817640)
chr4 (167-312)||(10393891-10394037)
chr4 (346-430)||(7776903-7776987)
chr4 (277-430)||(18707742-18707898)
chr4 (324-430)||(18715045-18715150)
chr4 (221-312)||(9046040-9046131)
chr4 (223-293)||(18707805-18707876)
chr4 (369-430)||(5734193-5734254)
chr4 (163-296)||(18735244-18735382)
chr4 (98-139)||(22647110-22647151)
chr4 (176-312)||(26653080-26653217)
chr4 (260-312)||(7776931-7776983)
chr4 (98-140)||(13857612-13857654)
chr4 (98-139)||(13869142-13869183)
chr4 (98-131)||(36955136-36955169)
chr4 (98-139)||(52581455-52581495)
chr4 (300-348)||(5734148-5734196)
chr4 (260-292)||(5734198-5734230)
[»] chr3 (55 HSPs)
chr3 (98-459)||(29125842-29126203)
chr3 (98-459)||(50527432-50527793)
chr3 (104-459)||(1092676-1093031)
chr3 (158-459)||(44254399-44254700)
chr3 (163-459)||(11231953-11232249)
chr3 (101-459)||(32270717-32271074)
chr3 (101-459)||(22729222-22729580)
chr3 (97-459)||(28952190-28952552)
chr3 (98-459)||(52201981-52202342)
chr3 (98-459)||(12251306-12251667)
chr3 (163-459)||(35083857-35084153)
chr3 (97-459)||(16908617-16908969)
chr3 (165-459)||(27742552-27742846)
chr3 (98-459)||(36633486-36633840)
chr3 (166-459)||(49657010-49657303)
chr3 (98-454)||(52571236-52571584)
chr3 (98-407)||(13594724-13595033)
chr3 (164-459)||(21259119-21259415)
chr3 (158-426)||(21259266-21259534)
chr3 (278-459)||(25246136-25246317)
chr3 (97-311)||(18163716-18163930)
chr3 (97-348)||(49169791-49170042)
chr3 (174-453)||(45045284-45045563)
chr3 (277-453)||(7160208-7160384)
chr3 (277-459)||(18163783-18163964)
chr3 (277-459)||(44205477-44205659)
chr3 (96-312)||(7160235-7160452)
chr3 (195-371)||(743958-744125)
chr3 (280-430)||(31174500-31174650)
chr3 (277-426)||(45045274-45045423)
chr3 (158-312)||(44205471-44205626)
chr3 (164-312)||(45045388-45045536)
chr3 (280-419)||(34660814-34660952)
chr3 (277-446)||(4618216-4618382)
chr3 (277-426)||(13594819-13594967)
chr3 (158-312)||(4618210-4618362)
chr3 (277-426)||(49169858-49170006)
chr3 (171-312)||(2618957-2619098)
chr3 (164-312)||(27742664-27742813)
chr3 (165-312)||(25246169-25246317)
chr3 (171-303)||(34660818-34660950)
chr3 (280-430)||(2618953-2619102)
chr3 (178-312)||(31174504-31174639)
chr3 (370-454)||(49170168-49170252)
chr3 (308-407)||(743958-744048)
chr3 (281-371)||(52499197-52499287)
chr3 (294-430)||(576405-576540)
chr3 (174-258)||(52499197-52499281)
chr3 (369-430)||(18657974-18658035)
chr3 (103-138)||(7441702-7441737)
chr3 (98-139)||(2618884-2618925)
chr3 (98-141)||(25246343-25246386)
chr3 (98-139)||(34660753-34660794)
chr3 (300-348)||(18657929-18657977)
chr3 (260-292)||(18657979-18658011)
[»] chr2 (54 HSPs)
chr2 (98-459)||(36435980-36436341)
chr2 (97-459)||(2249579-2249941)
chr2 (100-459)||(34983277-34983636)
chr2 (98-459)||(6749804-6750165)
chr2 (163-459)||(26293224-26293520)
chr2 (98-459)||(38527173-38527533)
chr2 (158-459)||(16194311-16194612)
chr2 (97-456)||(23869661-23870020)
chr2 (98-459)||(1020866-1021229)
chr2 (158-459)||(12995025-12995326)
chr2 (98-459)||(7366150-7366511)
chr2 (98-459)||(13615761-13616122)
chr2 (98-459)||(1114836-1115197)
chr2 (98-459)||(44545527-44545888)
chr2 (158-459)||(42016562-42016863)
chr2 (164-459)||(26860460-26860755)
chr2 (158-459)||(31392606-31392905)
chr2 (158-459)||(11764853-11765154)
chr2 (98-459)||(28745302-28745653)
chr2 (97-345)||(38763712-38763960)
chr2 (163-427)||(11935205-11935470)
chr2 (158-454)||(3836144-3836439)
chr2 (277-459)||(22674651-22674833)
chr2 (277-459)||(41699249-41699428)
chr2 (277-459)||(34494387-34494568)
chr2 (277-459)||(19283842-19284023)
chr2 (158-312)||(34494420-34494574)
chr2 (277-454)||(43471370-43471547)
chr2 (158-312)||(19283875-19284029)
chr2 (98-312)||(22674684-22674899)
chr2 (285-430)||(31643551-31643696)
chr2 (158-312)||(41699243-41699395)
chr2 (295-430)||(32100014-32100154)
chr2 (284-442)||(2077562-2077720)
chr2 (277-426)||(38763779-38763927)
chr2 (275-426)||(26860607-26860757)
chr2 (158-312)||(43471398-43471553)
chr2 (288-430)||(29141871-29142013)
chr2 (280-430)||(29035340-29035490)
chr2 (166-312)||(31643555-31643702)
chr2 (181-297)||(32100013-32100135)
chr2 (172-312)||(2077563-2077704)
chr2 (30-97)||(995137-995208)
chr2 (167-312)||(29141875-29142021)
chr2 (409-459)||(38763965-38764015)
chr2 (277-344)||(17526052-17526119)
chr2 (171-293)||(29035363-29035486)
chr2 (104-143)||(42473566-42473605)
chr2 (99-131)||(12994975-12995007)
chr2 (101-138)||(2076934-2076971)
chr2 (98-143)||(32099928-32099973)
chr2 (98-139)||(34494593-34494634)
chr2 (163-231)||(17526052-17526120)
chr2 (280-312)||(40897612-40897644)
[»] chr6 (33 HSPs)
chr6 (98-454)||(2660641-2660997)
chr6 (98-459)||(8560426-8560787)
chr6 (98-456)||(24635271-24635629)
chr6 (98-459)||(12698493-12698854)
chr6 (98-456)||(9078857-9079214)
chr6 (97-459)||(11450303-11450668)
chr6 (158-459)||(15469149-15469449)
chr6 (163-459)||(7021882-7022177)
chr6 (100-459)||(24130042-24130396)
chr6 (158-459)||(34023340-34023641)
chr6 (164-454)||(34127563-34127853)
chr6 (164-454)||(26468514-26468804)
chr6 (164-459)||(23258752-23259048)
chr6 (98-445)||(16461220-16461568)
chr6 (178-426)||(23258899-23259147)
chr6 (174-427)||(12996359-12996613)
chr6 (158-442)||(14882977-14883261)
chr6 (277-430)||(7536522-7536675)
chr6 (172-312)||(12996472-12996612)
chr6 (277-435)||(13405298-13405456)
chr6 (102-312)||(13405307-13405518)
chr6 (280-426)||(12996352-12996499)
chr6 (319-430)||(31968932-31969044)
chr6 (163-312)||(7536521-7536671)
chr6 (280-401)||(10290526-10290647)
chr6 (218-294)||(31968954-31969031)
chr6 (97-283)||(10290456-10290643)
chr6 (285-381)||(31489895-31489991)
chr6 (372-427)||(1398049-1398104)
chr6 (97-133)||(12996283-12996319)
chr6 (102-141)||(2399421-2399460)
chr6 (97-140)||(26468447-26468490)
chr6 (99-131)||(15469101-15469133)
[»] scaffold0050 (1 HSPs)
scaffold0050 (101-452)||(19048-19399)
[»] scaffold0014 (2 HSPs)
scaffold0014 (98-426)||(64933-65261)
scaffold0014 (164-453)||(65112-65402)
[»] scaffold0978 (2 HSPs)
scaffold0978 (166-462)||(1171-1467)
scaffold0978 (164-285)||(1282-1404)
[»] scaffold0002 (3 HSPs)
scaffold0002 (158-391)||(331831-332064)
scaffold0002 (277-426)||(331837-331985)
scaffold0002 (383-452)||(332441-332510)
[»] scaffold0131 (4 HSPs)
scaffold0131 (174-364)||(11253-11443)
scaffold0131 (277-426)||(11243-11391)
scaffold0131 (98-142)||(11166-11210)
scaffold0131 (175-255)||(11367-11447)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (277-397)||(303791-303911)
scaffold0003 (102-140)||(303934-303972)
[»] scaffold0041 (2 HSPs)
scaffold0041 (279-430)||(82785-82935)
scaffold0041 (166-263)||(82838-82935)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 260; Significance: 1e-145; HSPs: 59)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 98 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 24797213 - 24796852
Alignment:
Q  98 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccgnnnnnnnnnnnnnntcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaatt 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||              |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  24797213 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccatccggaaaaatttaaaaatcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaatt 24797114  T
Q  198 ttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtgag 297  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||    
T  24797113 ttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccaaaaatttaaataattcaattatagatataatttgcgag 24797014  T
Q  298 attttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattatag 397  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24797013 attttatacaattttatgtcgattttaggtttcggttgatccaaattaccgcaaattggtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattatag 24796914  T
Q  398 gtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacat 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24796913 gtctaatttgtgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacat 24796852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 98 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 41838114 - 41837753
Alignment:
Q  98 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccgnnnnnnnnnnnnnntcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaatt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||              |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  41838114 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccgcccggaaaaattaaaaaatcaacgattataggtctattttgcgagattttatgcaatt 41838015  T
Q  198 ttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtgag 297  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||    
T  41838014 ttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcatgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataattcaattataggtttattttgggag 41837915  T
Q  298 attttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattatag 397  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41837914 attttatacaattttatgtcgattttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcacacccgaaaaatttaaataattcaattatag 41837815  T
Q  398 gtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacat 459  Q
    |||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41837814 gtctaatttacgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggtccaccctgacat 41837753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 101 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 5590330 - 5589972
Alignment:
Q  101 tggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccgnnnnnnnnnnnnnntcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaattttg 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||              |||| || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5590330 tggcggagcccttaatgggctggggtgggccacggcccacccggaaaaattaaaaaatcaacgactataggtctatttttcgagattttatgcaattttg 5590231  T
Q  201 tattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtgagatt 300  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  5590230 tgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctacaaagtggtgtagtggcccaccccaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagatt 5590131  T
Q  301 ttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtc 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5590130 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattatagatc 5590031  T
Q  401 taatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacat 459  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  5590030 taatttgcgagactttaaacaatttttcaatggtaaattttagtggcccaccctgacat 5589972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 158 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 7242734 - 7242434
Alignment:
Q  158 tcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacc 257  Q
    |||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||    
T  7242734 tcaacgattataggtttattttgcgagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaaatggtatagtggcccacc 7242635  T
Q  258 cgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagt 357  Q
    ||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  7242634 cgaaa-tttaaataattcaattatatgtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattggt 7242536  T
Q  358 gtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgac 457  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7242535 gtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgac 7242436  T
Q  458 at 459  Q
    ||    
T  7242435 at 7242434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 158 - 459
Target Start/End: Original strand, 28564944 - 28565245
Alignment:
Q  158 tcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacc 257  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  28564944 tcaacgattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcagttttatgttttggttgatccaaattcttgcaaagtggtgtagtggcccacc 28565043  T
Q  258 cgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagt 357  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  28565044 cgaaaatttaaatgattcaattataggtctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggt 28565143  T
Q  358 gtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgac 457  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28565144 gtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattatgagtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgac 28565243  T
Q  458 at 459  Q
    ||    
T  28565244 at 28565245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 158 - 459
Target Start/End: Original strand, 28572567 - 28572868
Alignment:
Q  158 tcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacc 257  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  28572567 tcaacgattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcagttttatgttttggttgatccaaattcttgcaaagtggtgtagtggcccacc 28572666  T
Q  258 cgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagt 357  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  28572667 cgaaaatttaaatgattcaattataggtctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggt 28572766  T
Q  358 gtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgac 457  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28572767 gtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattatgagtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgac 28572866  T
Q  458 at 459  Q
    ||    
T  28572867 at 28572868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 98 - 459
Target Start/End: Original strand, 1098057 - 1098418
Alignment:
Q  98 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccgnnnnnnnnnnnnnntcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaatt 197  Q
    |||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||              |||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||    
T  1098057 cagtggcggagcccttcatggcgtgaggtgggccacggcccacccggaaaaattaaaaaatcaacgattataggtctaatttgcgatattttatgcaatt 1098156  T
Q  198 ttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtgag 297  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1098157 ttgtatcagttttatgttttggttgatccaaattcctataaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgtgag 1098256  T
Q  298 attttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattatag 397  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1098257 attttatacaaatttatgtcagttttaggtttcggttgatccaaatttctgcaaattggtgtagtggtccaaccgaaaaatttaaataattcaattatag 1098356  T
Q  398 gtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacat 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1098357 gtctaatttgtgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacat 1098418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 98 - 459
Target Start/End: Original strand, 7012337 - 7012697
Alignment:
Q  98 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccgnnnnnnnnnnnnnntcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaatt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||              |||| ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||    
T  7012337 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggctcactcggaaaaattaaaaaatcaatgattataggtctattttgcgatatcttatgcaatt 7012436  T
Q  198 ttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtgag 297  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  7012437 ttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggtccaccctaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgag 7012536  T
Q  298 attttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattatag 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7012537 attttatacaattttatgtcggttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggagtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattatag 7012636  T
Q  398 gtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacat 459  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||    
T  7012637 gtctaatttgtgagactttaaacaatttttcaatag-taattttagtggtccaccctcacat 7012697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 158 - 459
Target Start/End: Original strand, 21434899 - 21435200
Alignment:
Q  158 tcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacc 257  Q
    |||| ||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  21434899 tcaacgattataggtttattttgcgaggttttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccact 21434998  T
Q  258 cgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagt 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21434999 cgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgctagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattggt 21435098  T
Q  358 gtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgac 457  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21435099 gtagtggcccacccaaaaagtttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccatcctgac 21435198  T
Q  458 at 459  Q
    ||    
T  21435199 at 21435200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 97 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 3886941 - 3886579
Alignment:
Q  97 gcagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccgnnnnnnnnnnnnnntcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaat 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||              |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3886941 gcagtggcggagcccttcatgggctggggtaggccacggttcacccggaaaaattaaaaaatcaacgattataggtctattttgcgagattttatgcaat 3886842  T
Q  197 tttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtga 296  Q
    ||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  3886841 tttgtgtcgattttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccaaccaaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcga 3886742  T
Q  297 gattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattata 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3886741 gattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatcccaattcccgcaaattggtgtactgacccacccgaaaaatttaaataatttaattata 3886642  T
Q  397 ggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacat 459  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3886641 ggtctaatttgtgagactttaaacaattttttaaaagttaattttagtggcccaccctgacat 3886579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 163 - 459
Target Start/End: Original strand, 10092319 - 10092615
Alignment:
Q  163 gattataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaa 262  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  10092319 gattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgttggttttttgttttagttgatccaaattcctgcaaaatggtgtagtggcccacccgaaa 10092418  T
Q  263 atttaaataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagt 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||    
T  10092419 atttaaataattcaattatagatctattttgcgagattttatacaattttatgtcgattttaggttttggtagatccaaattcccgcaaattggtatagt 10092518  T
Q  363 ggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacat 459  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  10092519 ggcccatccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggctcaccctaacat 10092615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 99 - 459
Target Start/End: Original strand, 6316877 - 6317237
Alignment:
Q  99 agtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccgnnnnnnnnnnnnnntcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaattt 198  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||              ||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  6316877 agtggcggagcctttcatgggctggggtgggccacggcccacccgaaaaaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgtgagattttatgcaattt 6316976  T
Q  199 tgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtgaga 298  Q
    ||| | | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||    
T  6316977 tgtgtcgattttatgttttggttgatccaaattcttgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattatagttttattttgcgaga 6317076  T
Q  299 ttttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattatagg 398  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6317077 atttatacaattttatgtcgattttaggtttcggatgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattaaagg 6317176  T
Q  399 tctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacat 459  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6317177 tctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttacttttagtggcccaccctgacat 6317237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 165 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 22658439 - 22658145
Alignment:
Q  165 ttataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaat 264  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22658439 ttataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttgattgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaat 22658340  T
Q  265 ttaaataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtgg 364  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| |||||||||    
T  22658339 ttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatcccaattcccacaaattggtgtagtgg 22658240  T
Q  365 tccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacat 459  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  22658239 cccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttaatggcccaccctaacat 22658145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 158 - 459
Target Start/End: Original strand, 2317121 - 2317422
Alignment:
Q  158 tcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacc 257  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  2317121 tcaacgattataggtctattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaattcatgcaaagtggtgtaatggcccacc 2317220  T
Q  258 cgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagt 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  2317221 cgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgatattttatacaattttatgtcggttttagatttcggttgatccaaattcccgcaaattggt 2317320  T
Q  358 gtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgac 457  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2317321 gtagtggttcacccgaaaaatttaaataattcagttatagatctagtttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgac 2317420  T
Q  458 at 459  Q
    ||    
T  2317421 at 2317422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 158 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 42556193 - 42555892
Alignment:
Q  158 tcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacc 257  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  42556193 tcaacgattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgcagtggcccacc 42556094  T
Q  258 cgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagt 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||    
T  42556093 cgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttagatttcggttgatccaaattcccgcaatttggt 42555994  T
Q  358 gtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgac 457  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  42555993 gtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattatatgtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagtttattttaatagcccaccctgac 42555894  T
Q  458 at 459  Q
    ||    
T  42555893 at 42555892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 158 - 454
Target Start/End: Original strand, 36060417 - 36060713
Alignment:
Q  158 tcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacc 257  Q
    |||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  36060417 tcaacgattataggtatattttgcgagattttatgcaattttgtgtcaattttatgttttggttgatccaaattcctggaaagtggtgtagtggcacacc 36060516  T
Q  258 cgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagt 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  36060517 cgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaagtttcggttgatccaaattcccgcaaattggt 36060616  T
Q  358 gtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccct 454  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  36060617 gtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaattttttaatagttaattttagtggcccaccct 36060713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 98 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 3659982 - 3659621
Alignment:
Q  98 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccgnnnnnnnnnnnnnntcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaatt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||              |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3659982 cagtggcggagcccttcatgggctgggatgggccacagcccacccggaaaaattataaaatcaacgattataagtctattttgcgagattttatgcaatt 3659883  T
Q  198 ttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtgag 297  Q
    |||| |  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||    
T  3659882 ttgtgtcaggtttacgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccggaaatttaaataattcaattataggtctgttttgcgag 3659783  T
Q  298 attttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattatag 397  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3659782 attttatacaattttatatcggttttaggtttcggttgatcaaaatttccgcaaattggtgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattatag 3659683  T
Q  398 gtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacat 459  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  3659682 gtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggtccaccctaacat 3659621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 98 - 459
Target Start/End: Original strand, 4231220 - 4231580
Alignment:
Q  98 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccgnnnnnnnnnnnnnntcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaatt 197  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||              |||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  4231220 cagtggcggaccccttcatgggctagggtgggccacggcccacccgaaaaattaaaaaa-tcaacgattataggtctattttacgagattttatgcaatt 4231318  T
Q  198 ttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtgag 297  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||    
T  4231319 ttgtgtcggttttatgttttggttgatctaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgag 4231418  T
Q  298 attttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattatag 397  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4231419 attttatacaattttatgtcgattttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtgccccatccgaaaaatttaaataattcaattatag 4231518  T
Q  398 gtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacat 459  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  4231519 gtctaatttgcgagactttaaacaattttttaatagttaattttagtggtccaccctaacat 4231580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 164 - 459
Target Start/End: Original strand, 41388071 - 41388366
Alignment:
Q  164 attataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaa 263  Q
    |||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||    
T  41388071 attataggtttattttgcaagattttatacaattttgtgtcggttttatgatttggtttatccaaattcctgcaaagtggtgtagtgatccacccgaaaa 41388170  T
Q  264 tttaaataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtg 363  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||     
T  41388171 tttaaataattcaattataggtctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgattcaaattcccgcaaattggtgtagta 41388270  T
Q  364 gtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacat 459  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41388271 gcccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggtccaccctgacat 41388366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 183 - 459
Target Start/End: Original strand, 4697891 - 4698167
Alignment:
Q  183 agattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattata 282  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4697891 agattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccatccgaaaatttaaataattcaattata 4697990  T
Q  283 gatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaatttaa 382  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||    
T  4697991 gatctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttagatttcggtttatccaaattcccgcaaattggtgtagtggctcacccgaaaaatttaa 4698090  T
Q  383 ataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacat 459  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4698091 ataattcaattataggtctaatttgcaagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctaacat 4698167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 164 - 459
Target Start/End: Original strand, 43117414 - 43117710
Alignment:
Q  164 attataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaa 263  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||    
T  43117414 attataggtctattttgcgagattttatacaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtaatggcccatccgaaaa 43117513  T
Q  264 -tttaaataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagt 362  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| || ||||    
T  43117514 atttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtttagt 43117613  T
Q  363 ggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacat 459  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  43117614 ggcccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaacttttcaatagttaattttagtggtccaccctgacat 43117710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 99 - 452
Target Start/End: Original strand, 1183823 - 1184176
Alignment:
Q  99 agtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccgnnnnnnnnnnnnnntcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaattt 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |                | || |||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  1183823 agtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccaacaaaaaaaattaaaaaataaacgattatagatctattttgcgagattttatgcaattt 1183922  T
Q  199 tgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtgaga 298  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| | ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  1183923 tgtatcggttttatgttttggttgattcaaattcctaaaaagtagtgtagtggaccacccaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgaga 1184022  T
Q  299 ttttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattatagg 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  1184023 ttttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccatccgaaaaatttaaataattcaattataga 1184122  T
Q  399 tctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccacc 452  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1184123 tctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccacc 1184176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 158 - 454
Target Start/End: Original strand, 7413091 - 7413387
Alignment:
Q  158 tcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacc 257  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  7413091 tcaacgattataggtctattttgcgagattttatacaattttgtgtcggttttaggttttgattgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggcccacc 7413190  T
Q  258 cgaaaa-tttaaataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattag 356  Q
    | |||| |||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| | |    
T  7413191 caaaaaatttaaataattcaattataggtctattttc-gagattttatacatttttatgtcggttttaggtttcggttgattcaaattccctcaaagtgg 7413289  T
Q  357 tgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccct 454  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  7413290 tgtagtagtccacccgaaaaatttaaacaattcaattataggtctattttgcgagactttaaacaatttttcaacggttaattttaatggcccaccct 7413387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 98 - 459
Target Start/End: Original strand, 38567127 - 38567468
Alignment:
Q  98 cagtggcggagcccttcatgggctgggg-tgggccacggcccaccc-gnnnnnnnnnnnnnntcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaa 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |              |||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  38567127 cagtggcggagcccttcatgggctgggggtgggccacggcccacccaggaaaaattaaaaaatcaacgattataggtatattttgcgagattttatgcaa 38567226  T
Q  196 ttttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtg 295  Q
    |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |    
T  38567227 ttttgtgttgattttatgtttttgttgatccaaattcctgcaaagttgtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcgattataggtctattttgcg 38567326  T
Q  296 agattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattat 395  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||                      ||||||    
T  38567327 agattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggccc----------------------aattat 38567404  T
Q  396 aggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacat 459  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  38567405 aggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggtccaccctgacat 38567468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 277 - 459
Target Start/End: Original strand, 197268 - 197450
Alignment:
Q  277 attatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaa 376  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | ||||||| ||||| ||| ||| || ||||    
T  197268 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaagtttcggttgatccaaatttctgcaaattggtgtaatggcccatccaaaaa 197367  T
Q  377 atttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacat 459  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||    
T  197368 atttaaataattcaattataagtctaatttgcgatactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggtccatcctaacat 197450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 277 - 459
Target Start/End: Original strand, 312105 - 312287
Alignment:
Q  277 attatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaa 376  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | ||||||| ||||| ||| ||| || ||||    
T  312105 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaagtttcggttgatccaaatttctgcaaattggtgtaatggcccatccaaaaa 312204  T
Q  377 atttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacat 459  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||    
T  312205 atttaaataattcaattataagtctaatttgcgatactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggtccatcctaacat 312287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 158 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 7422148 - 7421860
Alignment:
Q  158 tcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacc 257  Q
    |||| ||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||  ||| |||||||||||||||| | ||||||  |||||| ||||||    
T  7422148 tcaacgattataggtttattttgcgagattttatacaattttgtgtcggttttagatttcggttgatccaaattcccgaaaagtgatgtagtgacccacc 7422049  T
Q  258 cgaaaa-tttaaataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattag 356  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||      || ||| |||| ||| ||||||||||||| | |    
T  7422048 cgaaaaatttaaata-ttcaattataggtctattttgcgagattttataaaattttatatc------agttttcggttaatctaaattcccgcaaagtgg 7421956  T
Q  357 tgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccc 453  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||  |||||||||| ||||||||||  | ||||||| |||||||||||    
T  7421955 tgtagtgatccaccc-aaaaatttaaacaattcaattatatgtctattttgcaagactttaaacaatttttcaacggataatttttgtggcccaccc 7421860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 165 - 430
Target Start/End: Original strand, 41169764 - 41170023
Alignment:
Q  165 ttataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaa- 263  Q
    ||||| ||||||||| ||| ||||||   |||||||| | ||||||| |||| |||||||| ||||||  ||||||||| |||||| |||| || ||||     
T  41169764 ttatacgtctattttacgatattttaaataattttgtgtcggttttaggtttaggttgatctaaattcacgcaaagtggtgtagtgacccatccaaaaaa 41169863  T
Q  264 tttaaataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtg 363  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  41169864 tttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatataattttatgtcggttctaggttttggttaatccaaattcccgcaaagtggtgtagtg 41169963  T
Q  364 gtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaa 430  Q
    | |||| || ||||||||||||||||      ||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||    
T  41169964 gcccactcg-aaaatttaaataattc------aggtctattttgtaaaactttaaacaatttttcaa 41170023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 98 - 312
Target Start/End: Original strand, 9830607 - 9830821
Alignment:
Q  98 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccgnnnnnnnnnnnnnntcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaatt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              |||| ||||||| || |||||||||||||||||||||| |    
T  9830607 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccgaaaaaattaaaaaatcaacgattataggtttattttgcgagattttatgcaact 9830706  T
Q  198 ttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtgag 297  Q
    |||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||| |||| |||| ||     
T  9830707 ttgtgtcgattttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccatctgaaaatttaaataattcaatcataggtctaatttgcgaa 9830806  T
Q  298 attttatacaatttt 312  Q
    | |||| ||||||||    
T  9830807 actttaaacaatttt 9830821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 277 - 456
Target Start/End: Original strand, 9830673 - 9830851
Alignment:
Q  277 attatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaa 376  Q
    ||||||| | ||||||| |||||||||| ||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| | |||||    
T  9830673 attataggtttattttgcgagattttatgcaactttgtgtcgattttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccatctgaaaa 9830772  T
Q  377 atttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctga 456  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  9830773 -tttaaataattcaatcataggtctaatttgcgaaactttaaacaatttttcaacagttaattttagtggtccaccctga 9830851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 275 - 426
Target Start/End: Original strand, 43117412 - 43117563
Alignment:
Q  275 caattatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaa 374  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| ||| ||| |||||    
T  43117412 caattataggtctattttgcgagattttatacaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtaatggcccatccgaa 43117511  T
Q  375 aaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttt 426  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||| | ||||||    
T  43117512 aaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 43117563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 280 - 430
Target Start/End: Original strand, 11635828 - 11635978
Alignment:
Q  280 atagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaatt 379  Q
    |||| ||||||||| || |||||||| |||||| |||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||| | || |||||  ||||||||||||||    
T  11635828 ataggtctattttgcgaaattttatataattttgtgtcggttttaggtttcgactgatccaaatttccgcaaagtggtctagtgacccacccgaaaaatt 11635927  T
Q  380 taaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaa 430  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  11635928 taaataattcaattataggtctattttgtgagactttaaacaatttttcaa 11635978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 280 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 25642823 - 25642676
Alignment:
Q  280 atagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaatt 379  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||    
T  25642823 ataggtctattttgcgagattttatataattttgtgtcggttttaggttttggttgatccaaattctcgcaaagtggtgaagtggtccacccgaaaaatt 25642724  T
Q  380 taaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataattttt 427  Q
    ||||||||| | ||||||| ||| |||  |||||||| || |||||||    
T  25642723 taaataatttagttataggcctattttacgagactttgaacaattttt 25642676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 280 - 430
Target Start/End: Original strand, 36108837 - 36108987
Alignment:
Q  280 atagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaatt 379  Q
    |||| |||||||||  ||||| |||||||| || || ||||||||||||| || ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||||||    
T  36108837 ataggtctattttgcaagattctatacaatgttgtgacggttttaggtttgggctgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggcccatccgaaaaatt 36108936  T
Q  380 taaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaa 430  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| || |||||||    
T  36108937 taaataattcaattataggtctattttgcgagactttaaacaaattttcaa 36108987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 366 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 34934376 - 34934283
Alignment:
Q  366 ccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacat 459  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34934376 ccacccgaaaaatttaaataatttaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggtccaccctgacat 34934283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 164 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 22658327 - 22658178
Alignment:
Q  164 attataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccg-aaa 262  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | | ||||||| |||| ||||||||| ||||||  |||| ||| ||||||||||||||| |||    
T  22658327 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatcccaattcccacaaattggtgtagtggcccacccgaaaa 22658228  T
Q  263 atttaaataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaatttt 312  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||| |||| |||| ||||||||    
T  22658227 atttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 22658178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 280 - 430
Target Start/End: Original strand, 8995039 - 8995189
Alignment:
Q  280 atagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaatt 379  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||| ||||||||  |||||||||||| | |||| |  |||||||| |||||| |||||||    
T  8995039 ataggtctattttgagagattttatacaaatttgtatcggtttaaggttttgtctgatccaaattctcacaaagtgatgtagtggcccacccaaaaaatt 8995138  T
Q  380 taaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaa 430  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |  ||||||||||    
T  8995139 taaataattcaattataggtctattttgcgagactttgagcaatttttcaa 8995189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 98 - 312
Target Start/End: Original strand, 11635758 - 11635974
Alignment:
Q  98 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccgnnnnnnnnnnnnnn-tcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaat 196  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||               |||| ||| ||| ||||||||||||| |||||||  |||    
T  11635758 cagtggcggagcccttcatgggctagggtgggccacgacccacccgaaaaaattaaataaatcaatgatcataggtctattttgcgaaattttatataat 11635857  T
Q  197 tttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaa-tttaaataattcaattatagatctattttgtg 295  Q
    ||||| | ||||||| |||| |  ||||||||||| | |||||||||  ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11635858 tttgtgtcggttttaggtttcgactgatccaaatttccgcaaagtggtctagtgacccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttgtg 11635957  T
Q  296 agattttatacaatttt 312  Q
    ||| |||| ||||||||    
T  11635958 agactttaaacaatttt 11635974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 279 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 25383129 - 25382979
Alignment:
Q  279 tatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaat 378  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||| ||| | ||| |||||||||    
T  25383129 tataggtctattttgcgagattttatata-ttttgtgtcggttttaggttttagttgatccaaattctcgcaaagtggtgaagtagcccatccgaaaaat 25383031  T
Q  379 ttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaa 430  Q
    |||||||||| | ||||||| ||| |||| |||||||| || ||||||||||    
T  25383030 ttaaataatttagttataggcctattttgcgagactttgaacaatttttcaa 25382979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 287 - 428
Target Start/End: Original strand, 17836503 - 17836644
Alignment:
Q  287 tattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataa 386  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| || | ||||| |  |||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  17836503 tattttgtaagattttatacaattttgtgtcggttttaggtttcgggtgatccaagtttctgcaaagtgatgtagtggcccatccgaaaaatttaaataa 17836602  T
Q  387 ttcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttc 428  Q
    || ||||||||||||| |||  |||||  |||| ||||||||    
T  17836603 tttaattataggtctattttacgagacaataaacaatttttc 17836644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 164 - 276
Target Start/End: Original strand, 41169877 - 41169989
Alignment:
Q  164 attataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaa 263  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||  |||||| | | |||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  41169877 attataggtctattttgcgagattttatataattttatgtcggttctaggttttggttaatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggcccactcgaaaa 41169976  T
Q  264 tttaaataattca 276  Q
    |||||||||||||    
T  41169977 tttaaataattca 41169989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 163 - 312
Target Start/End: Original strand, 197267 - 197417
Alignment:
Q  163 gattataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggccca-cccgaa 261  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | | ||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||| ||  ||    
T  197267 gattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaagtttcggttgatccaaatttctgcaaattggtgtaatggcccatccaaaa 197366  T
Q  262 aatttaaataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaatttt 312  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| |||| || | |||| ||||||||    
T  197367 aatttaaataattcaattataagtctaatttgcgatactttaaacaatttt 197417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 163 - 312
Target Start/End: Original strand, 312104 - 312254
Alignment:
Q  163 gattataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggccca-cccgaa 261  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | | ||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||| ||  ||    
T  312104 gattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaagtttcggttgatccaaatttctgcaaattggtgtaatggcccatccaaaa 312203  T
Q  262 aatttaaataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaatttt 312  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| |||| || | |||| ||||||||    
T  312204 aatttaaataattcaattataagtctaatttgcgatactttaaacaatttt 312254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 171 - 308
Target Start/End: Original strand, 36108841 - 36108979
Alignment:
Q  171 gtctattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccg-aaaatttaaa 269  Q
    ||||||||||| ||||| ||| |||| ||||   ||||||| |||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  36108841 gtctattttgcaagattctatacaatgttgtgacggttttaggtttgggctgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggcccatccgaaaaatttaaa 36108940  T
Q  270 taattcaattatagatctattttgtgagattttatacaa 308  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||    
T  36108941 taattcaattataggtctattttgcgagactttaaacaa 36108979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 172 - 312
Target Start/End: Original strand, 4697993 - 4698134
Alignment:
Q  172 tctattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccg-aaaatttaaat 270  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| | | |||||||  ||| |||| ||||||||||| ||||| ||| |||||||| |||||| |||||||||||    
T  4697993 tctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttagatttcggtttatccaaattcccgcaaattggtgtagtggctcacccgaaaaatttaaat 4698092  T
Q  271 aattcaattatagatctattttgtgagattttatacaatttt 312  Q
    ||||||||||||| |||| ||||  ||| |||| ||||||||    
T  4698093 aattcaattataggtctaatttgcaagactttaaacaatttt 4698134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 171 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 25642819 - 25642697
Alignment:
Q  171 gtctattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccg-aaaatttaaa 269  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||    
T  25642819 gtctattttgcgagattttatataattttgtgtcggttttaggttttggttgatccaaattctcgcaaagtggtgaagtggtccacccgaaaaatttaaa 25642720  T
Q  270 taattcaattatagatctatttt 292  Q
    ||||| | ||||||  |||||||    
T  25642719 taatttagttataggcctatttt 25642697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 171 - 298
Target Start/End: Original strand, 8995043 - 8995171
Alignment:
Q  171 gtctattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccaccc-gaaaatttaaa 269  Q
    |||||||||| |||||||||| ||| ||||||| ||||| | ||||||  ||||||||||||   |||||||  ||||||||||||||  ||||||||||    
T  8995043 gtctattttgagagattttatacaaatttgtatcggtttaaggttttgtctgatccaaattctcacaaagtgatgtagtggcccacccaaaaaatttaaa 8995142  T
Q  270 taattcaattatagatctattttgtgaga 298  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  8995143 taattcaattataggtctattttgcgaga 8995171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 277 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 32018069 - 32017916
Alignment:
Q  277 attatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaa 376  Q
    ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||| |||||||| || |||| | | |||||||||||  |||||     
T  32018069 attataggtctattttaagagattttatacaattttgtgtcgattttagatttcggttggtccaaatttccacaaagtggcgtagtggtccattcgaaat 32017970  T
Q  377 atttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaa 430  Q
     ||| || |||||||||||||||||| | |   |||||||||| ||||||||||    
T  32017969 tttttaacaattcaattataggtctattataaaagactttaaacaatttttcaa 32017916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 174 - 312
Target Start/End: Original strand, 8996424 - 8996561
Alignment:
Q  174 tattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaa-tttaaataa 272  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||| |||| ||||||||||| ||| |  ||| ||| ||||  | | | ||||||| |||||||||    
T  8996424 tattttacgagattttatgcaattttgtgtcggttttaagtttaggttgatccaatttcat--aaaatggtgtaggaggctatccgaaaaatttaaataa 8996521  T
Q  273 ttcaattatagatctattttgtgagattttatacaatttt 312  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  8996522 ttcaattataggtctattttgcgagattttaaacaatttt 8996561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 295 - 429
Target Start/End: Original strand, 8996432 - 8996564
Alignment:
Q  295 gagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaatta 394  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| |||    ||| | ||||||  | | | |||||||||||||||||||||||||    
T  8996432 gagattttatgcaattttgtgtcggttttaagtttaggttgatccaatttcat--aaaatggtgtaggaggctatccgaaaaatttaaataattcaatta 8996529  T
Q  395 taggtctaatttgtgagactttaaataatttttca 429  Q
    |||||||| |||| |||| |||||| |||||||||    
T  8996530 taggtctattttgcgagattttaaacaatttttca 8996564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 174 - 292
Target Start/End: Original strand, 17836503 - 17836622
Alignment:
Q  174 tattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccg-aaaatttaaataa 272  Q
    |||||||  ||||||||| ||||||||| | ||||||| |||| || |||||||| || ||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  17836503 tattttgtaagattttatacaattttgtgtcggttttaggtttcgggtgatccaagtttctgcaaagtgatgtagtggcccatccgaaaaatttaaataa 17836602  T
Q  273 ttcaattatagatctatttt 292  Q
    || |||||||| ||||||||    
T  17836603 tttaattataggtctatttt 17836622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 166 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 25383129 - 25382983
Alignment:
Q  166 tataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccg-aaaat 264  Q
    |||| |||||||||||||||||||||  | |||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||| | ||| ||||| ||| |||||    
T  25383129 tataggtctattttgcgagattttatata-ttttgtgtcggttttaggttttagttgatccaaattctcgcaaagtggtgaagtagcccatccgaaaaat 25383031  T
Q  265 ttaaataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaatttt 312  Q
    |||||||||| | ||||||  |||||||| |||| |||  ||||||||    
T  25383030 ttaaataatttagttataggcctattttgcgagactttgaacaatttt 25382983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 98 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 34934415 - 34934370
Alignment:
Q  98 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccg 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34934415 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccg 34934370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 222 - 293
Target Start/End: Original strand, 43073157 - 43073228
Alignment:
Q  222 gatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattatagatctattttg 293  Q
    |||||||||| ||| ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  43073157 gatccaaatttctgtaaagtggtgtagttgcctacccgaaaatttaaatatttaaattataggtctattttg 43073228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 287 - 429
Target Start/End: Original strand, 43073109 - 43073250
Alignment:
Q  287 tattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataa 386  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| || |||||| ||||  |  |||||||||| | | ||| | ||||||| | | ||||||||| ||||||||     
T  43073109 tattttatgagattttaaacaattttatttcagttttaagtttcaggcgatccaaatttctgtaaagtggtgtagttgcctacccgaaaa-tttaaatat 43073207  T
Q  387 ttcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttca 429  Q
    || ||||||||||||| ||||  | |||||||| |||||||||    
T  43073208 ttaaattataggtctattttgcaaaactttaaacaatttttca 43073250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 32018070 - 32017942
Alignment:
Q  163 gattataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaa 262  Q
    ||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||||| | | |||||  ||| ||||| |||||||| |  |||||||||||||||| |||  |||||    
T  32018070 gattataggtctattttaagagattttatacaattttgtgtcgattttagatttcggttggtccaaatttccacaaagtggcgtagtggtccattcgaaa 32017971  T
Q  263 -atttaaataattcaattatagatctatt 290  Q
      ||| || ||||||||||||| ||||||    
T  32017970 ttttttaacaattcaattataggtctatt 32017942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 97 - 133
Target Start/End: Original strand, 10092256 - 10092292
Alignment:
Q  97 gcagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccac 133  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10092256 gcagtgacggagcccttcatgggctggggtgggccac 10092292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 289 - 329
Target Start/End: Original strand, 42559031 - 42559071
Alignment:
Q  289 ttttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttt 329  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  42559031 ttttgtgagattttatacaattttgtgtcgattttaggttt 42559071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 250 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 34934379 - 34934316
Alignment:
Q  250 ggcccacccgaaaa-tttaaataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaatttt 312  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||| |||| |||| ||||||||    
T  34934379 ggcccacccgaaaaatttaaataatttaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 34934316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 260; Significance: 1e-145; HSPs: 80)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 98 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 36358469 - 36358108
Alignment:
Q  98 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccgnnnnnnnnnnnnnntcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaatt 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |              |||| |||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  36358469 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggtccacctggaaaaattaaaaaatcaacgattatagatctattttgcgacattttatgcaatt 36358370  T
Q  198 ttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtgag 297  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  36358369 ttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggtccacccaaaaatttaaataattcaattatagatctattttgcgag 36358270  T
Q  298 attttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattatag 397  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36358269 attttatacaattttatgtcgattttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattatag 36358170  T
Q  398 gtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacat 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36358169 gtctaatttgtgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacat 36358108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 97 - 456
Target Start/End: Original strand, 43859089 - 43859448
Alignment:
Q  97 gcagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccgnnnnnnnnnnnnnntcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaat 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |              |||| ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||    
T  43859089 gcagtggcggagcccttcatgggctagggtgggccacggcccacctggaaaaattaaaaaatcaacgattataggtcgaatttgcgagattttatgcaat 43859188  T
Q  197 tttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtga 296  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  43859189 tttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggtccatccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgtga 43859288  T
Q  297 gattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattata 396  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43859289 gattttatacaattttacgtcggttttaggtttcggttgatccaaatttctgcaaattggtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattata 43859388  T
Q  397 ggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctga 456  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43859389 ggtctaatttgtgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctga 43859448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 98 - 459
Target Start/End: Original strand, 26873702 - 26874063
Alignment:
Q  98 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccgnnnnnnnnnnnnnntcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaatt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  26873702 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggaaaaattaaaaaatcaatgattataggtctattttgcgagattttatacaatt 26873801  T
Q  198 ttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtgag 297  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||    
T  26873802 ttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgag 26873901  T
Q  298 attttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattatag 397  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26873902 gttttatacaattttatgtcagttttagatttcgattgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattaaag 26874001  T
Q  398 gtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacat 459  Q
    |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26874002 gtctaatttgcgagactttaaacaacttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacat 26874063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 101 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 44468177 - 44467827
Alignment:
Q  101 tggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccgnnnnnnnnnnnnnntcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaattttg 200  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |              |||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44468177 tggcggagcccttcataggctggggtgggccacggcccacctggaaaaattaaaaaatcaacgattatagatctattttgcgagattttatgcaattttg 44468078  T
Q  201 tattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtgagatt 300  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  44468077 tgttggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagatt 44467978  T
Q  301 ttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtc 400  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  44467977 ttatacaattttatgttggttttaggtttcaattgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggtccacctgaaaaatttaaataattcaattatagatc 44467878  T
Q  401 taatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccac 451  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44467877 taatttgtgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccac 44467827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 102 - 459
Target Start/End: Original strand, 17166869 - 17167227
Alignment:
Q  102 ggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccgnnnnnnnnnnnnnntcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaattttgt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||               ||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17166869 ggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccagaaaaattaaaaaatcaacaattatagttctattttgcgagattttatgcaattttgt 17166968  T
Q  202 attggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaa-tttaaataattcaattatagatctattttgtgagatt 300  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  17166969 atcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccaaaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagatt 17167068  T
Q  301 ttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtc 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17167069 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatcccaattcccgcaaattgatgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtc 17167168  T
Q  401 taatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacat 459  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17167169 taatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtggcccaccctaacat 17167227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 98 - 459
Target Start/End: Original strand, 46027679 - 46028040
Alignment:
Q  98 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccgnnnnnnnnnnnnnntcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaatt 197  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||              |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  46027679 cagtggcggagcccttcgtgggctggggtgggccacggtccacccggaaaaattaaaaaatcaacgattataggtctattttgcgagattttatgcaatt 46027778  T
Q  198 ttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtgag 297  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||    
T  46027779 ttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcttgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattaaattataggtctattttgcgag 46027878  T
Q  298 attttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattatag 397  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46027879 attttatacaattttatgtcagttttagatttaggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattatag 46027978  T
Q  398 gtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacat 459  Q
    || ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  46027979 gtataatttgcgagactttaaacgatttttcaatagttaattttagtggcccaccctaacat 46028040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 98 - 459
Target Start/End: Original strand, 45350051 - 45350411
Alignment:
Q  98 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccgnnnnnnnnnnnnnntcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaatt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||              |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45350051 cagtggcggagcccttcatgggctggg-tgggccacggtccacccggaaaaattaaaaaatcaacgattataagtctattttgcgagattttatgcaatt 45350149  T
Q  198 ttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtgag 297  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  45350150 ttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtaatggcccatccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgag 45350249  T
Q  298 attttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattatag 397  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  45350250 attttatacaattttatgtcgattttaggtttcggttgattcaaattcccgcaaattggtgtagtgtcccacccgaaaaatttaaataattcaattatat 45350349  T
Q  398 gtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacat 459  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  45350350 gtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctaacat 45350411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 98 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 36675646 - 36675285
Alignment:
Q  98 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccgnnnnnnnnnnnnnntcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaatt 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||              | || |||||||  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  36675646 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccatccgaaaaaattaaaaaattaatgattatagatctattttgtgagattttatgcaatt 36675547  T
Q  198 ttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtgag 297  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  36675546 ttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtgatgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgag 36675447  T
Q  298 attttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattatag 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36675446 attttatacaattttatgtcggttttaagtttcggttgatccaaattcccacaaattggtgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattatag 36675347  T
Q  398 gtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacat 459  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  36675346 gtctaatttgcaagactttaaacaattttttaatagttaattttagtggcccatcctaacat 36675285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 158 - 453
Target Start/End: Original strand, 39976380 - 39976675
Alignment:
Q  158 tcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacc 257  Q
    |||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  39976380 tcaacgattatatgtctaatttgcgagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctacaaagtggtgtagtgacccacc 39976479  T
Q  258 cgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagt 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||   |||||||||||| | | ||||| ||    
T  39976480 cgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaaatttatgtcggttttagatttcaattgatccaaatttctgtaaattggt 39976579  T
Q  358 gtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccc 453  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39976580 gtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccc 39976675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 158 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 22723875 - 22723574
Alignment:
Q  158 tcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacc 257  Q
    |||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22723875 tcaacgattataggtctactttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacc 22723776  T
Q  258 cgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagt 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||    
T  22723775 cgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttagatttcggttgatccaatttcccgcaaattggt 22723676  T
Q  358 gtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgac 457  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||    
T  22723675 gtagtggcccacccgcaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgaaactttaaacaatttttcaatagttaattttagtagtccaccctaac 22723576  T
Q  458 at 459  Q
    ||    
T  22723575 at 22723574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 158 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 31065722 - 31065421
Alignment:
Q  158 tcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacc 257  Q
    |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  31065722 tcaacgattataggtctattttacgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttaatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggtccacc 31065623  T
Q  258 cgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagt 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  31065622 cgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggt 31065523  T
Q  358 gtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgac 457  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31065522 gcagtggcccacccgaaaaatttaaataaatcaattacaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccactctgac 31065423  T
Q  458 at 459  Q
    ||    
T  31065422 at 31065421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 158 - 459
Target Start/End: Original strand, 44142821 - 44143121
Alignment:
Q  158 tcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacc 257  Q
    |||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  44142821 tcaacgattataggtatattttgcgagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttctttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcc-acc 44142919  T
Q  258 cgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagt 357  Q
     | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  44142920 tggaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttagattttgattgatccaaattcccgcaaattggt 44143019  T
Q  358 gtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgac 457  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44143020 gtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgac 44143119  T
Q  458 at 459  Q
    ||    
T  44143120 at 44143121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 158 - 459
Target Start/End: Original strand, 9624055 - 9624356
Alignment:
Q  158 tcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacc 257  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  9624055 tcaacgattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgttggttttatattttggttgatccaaattcctacaaagtggtgttgtggcccacc 9624154  T
Q  258 cgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagt 357  Q
    | ||||||||||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  9624155 caaaaatttaaataatttaattataggtctattttccgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattggt 9624254  T
Q  358 gtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgac 457  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  9624255 gtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattatagatctaatttacgagactttaaacaatttttcactagttaattttagtggcccaccctaac 9624354  T
Q  458 at 459  Q
    ||    
T  9624355 at 9624356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 96 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 44724224 - 44723864
Alignment:
Q  96 tgcagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccgnnnnnnnnnnnnnntcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaa 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||               |||  |||||| || ||||||| |||||||||| |||    
T  44724224 tgcagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggaaaaattaaaaaaccaactattataggtttattttgagagattttatacaa 44724125  T
Q  196 ttttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtg 295  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  44724124 ttttgtgtcggttttatgttttggttgatctaaattcctgcaaagtggtgtagaggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcg 44724025  T
Q  296 agattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattat 395  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  44724024 agattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccacaaattggtgtagtggcccatccgaagaatttaaataatttaattat 44723925  T
Q  396 aggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctga 456  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  44723924 aggtctaatttgcgagactttaaacaacttttcaatagttaattttagtagcccaccctga 44723864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 158 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 42242028 - 42241727
Alignment:
Q  158 tcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacc 257  Q
    |||| ||||||| || || |||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||    
T  42242028 tcaacgattataggtttaatttgtgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtgactcacc 42241929  T
Q  258 cgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagt 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| ||    
T  42241928 cgaaaatttaaataattcaattatagatctattttacgagattttatacaattttatgtcggttttagatttcggttgatccaaattcccggaaattggt 42241829  T
Q  358 gtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgac 457  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  42241828 gtagtcgtccacccgaaaaatttaaataattcaattatagatctaatttgagagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcctaccctaac 42241729  T
Q  458 at 459  Q
    ||    
T  42241728 at 42241727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 164 - 459
Target Start/End: Original strand, 41367724 - 41368019
Alignment:
Q  164 attataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaa 263  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  41367724 attataggtctaatttgcgagattttatgcaattttgtatcgattttatattttggttgatccaaatttctacaaagtggtgtagtggtccatccgaaaa 41367823  T
Q  264 tttaaataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtg 363  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  41367824 tttaaataattcagttataggtctattttgtgagattttatacaaatttatgtcggttttaggttttagttgatccaaatttccgcaaattggtgtagtg 41367923  T
Q  364 gtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacat 459  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41367924 atccacccgaaaaatttaaataattcaattatagatctaatttgtgagactttaaacaattttttaatagttaattttagtggcccaccctaacat 41368019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 174 - 459
Target Start/End: Original strand, 40055666 - 40055951
Alignment:
Q  174 tattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaatttaaataat 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  40055666 tattttgcgagattttatgcaattttgtatcggttgtatgttttggttgatccaaattcttgataagtggtgtagtggcccatccgaaaatttaaataat 40055765  T
Q  274 tcaattatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccga 373  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||| |    
T  40055766 tcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgcagtggcccacccaa 40055865  T
Q  374 aaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacat 459  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40055866 aaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaattttttaatagttaattttagtggcgcaccctgacat 40055951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 171 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 23469482 - 23469194
Alignment:
Q  171 gtctattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaatttaaat 270  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||    
T  23469482 gtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatattttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagttgtccacccgaaaatttaaat 23469383  T
Q  271 aattcaattatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacc 370  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| |    
T  23469382 aattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttctgttgatcccaattcccgcaaattggtgtagtggcccatc 23469283  T
Q  371 cgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacat 459  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23469282 tgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagattttaaacaatttttcaaaagttaattttagtggcccaccctaacat 23469194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 158 - 454
Target Start/End: Original strand, 31428796 - 31429092
Alignment:
Q  158 tcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacc 257  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  31428796 tcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttgattgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggtccacc 31428895  T
Q  258 cgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagt 357  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||| ||||| ||    
T  31428896 cgaaaatttaaataatttaattatagatctattttgcgagattttataaaattttatgtcggttttaggtttcagttgatctcaattcccgtaaattggt 31428995  T
Q  358 gtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccct 454  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  31428996 gtagtggtccacccgaaaaatgtaaataattcaattataggtttaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaatttcagtagcccaccct 31429092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 166 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 29075276 - 29075000
Alignment:
Q  166 tataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaatt 265  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29075276 tataggtctattttgcgatattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcttgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatt 29075177  T
Q  266 taaataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggt 365  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||          |||| ||||||||||    
T  29075176 taaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaagtttcggttgatcca----------aattggtgtagtggt 29075087  T
Q  366 ccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccacc 452  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  29075086 ccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgaaactttaaacaattttttaatagttaattttagtggtccacc 29075000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 101 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 16834433 - 16834080
Alignment:
Q  101 tggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccgnnnnnnnnnnnnnntcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaattttg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||              |||| ||||||| || |||||||  | ||||||||||||||||    
T  16834433 tggcggagcccttcatgggctggggtgggccatggcccatccggaaaaataaaaaaatcaacgattataggtttattttgtaaaattttatgcaattttg 16834334  T
Q  201 tattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtgaga-- 298  Q
    | |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||      
T  16834333 tgtcagttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggcccatccgaaaatttaaataattcaattataggtctatattatgagaga 16834234  T
Q  299 ttttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattatagg 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| | |||||| | ||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  16834233 ttttatacaattttatgtcggttttaggtttcgattgatccaaattctcacaaattggggtagtgtcccacccaaaaaatttaaataatttaattatagg 16834134  T
Q  399 tctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccacc 452  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16834133 tctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccacc 16834080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 277 - 459
Target Start/End: Original strand, 8461764 - 8461946
Alignment:
Q  277 attatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaa 376  Q
    ||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8461764 attataggtctattttgcgatattttatacaattttatgtctgttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggtccacccgaaaa 8461863  T
Q  377 atttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacat 459  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8461864 atttaaataattcaattatagatctaatttgtgatactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctaacat 8461946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 277 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 31932004 - 31931822
Alignment:
Q  277 attatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaa 376  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  31932004 attataggtctattttgcgagattttatacgattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggtccacccaaaaa 31931905  T
Q  377 atttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacat 459  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31931904 atttaaataattcaattatagatctaatttacgagattttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctaacat 31931822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 277 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 23562740 - 23562564
Alignment:
Q  277 attatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaa 376  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  || || ||||| |||||||||||| ||||||| | ||||||| |||||||||||||    
T  23562740 attatagatctattttgcgagattttatacaattttgtgtcgaattaag-ttttgattgatccaaatttccgcaaagtggtgtagtagtccacccgaaaa 23562642  T
Q  377 atttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccct 454  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  23562641 atttaaacaattcaattataggtctattttgcgaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagtggcccaccct 23562564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 280 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 46828926 - 46828761
Alignment:
Q  280 atagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaatt 379  Q
    |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| || ||||||    
T  46828926 ataggtctattttgcgagattttgtacaattttatgtcggtattaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggtccactcg-aaaatt 46828828  T
Q  380 taaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtgg 446  Q
    ||||||| || ||||||| |||| |||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||    
T  46828827 taaataactcgattatagatctattttgagagactttaaacaatttttcaacggttaattttagtgg 46828761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 277 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 18104411 - 18104243
Alignment:
Q  277 attatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaa 376  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||| || ||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||    
T  18104411 attataggtctattttgcgagattt-atgcaattttgtgtcggtttcatgttttggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccatccgaaaa 18104313  T
Q  377 atttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtgg 446  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||   | |||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  18104312 atttaaataattcaattaaagatctaatttactaaactttaaacaatttttcaataattaattttagtgg 18104243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 288 - 430
Target Start/End: Original strand, 25174223 - 25174365
Alignment:
Q  288 attttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataat 387  Q
    |||||| ||||||||||| |||| | ||| |||||||||||| ||||||||||||||| | |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25174223 attttgcgagattttatataattatgtgttggttttaggtttcggttgatccaaattctcacaaagtggtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataat 25174322  T
Q  388 tcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaa 430  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  25174323 tcaattataggtctattttgcgagactttaaacaatttttcaa 25174365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 308 - 453
Target Start/End: Original strand, 29663010 - 29663155
Alignment:
Q  308 attttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttg 407  Q
    ||||| |||||||||||| ||| || |||||||||||| | |||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29663010 attttgtgtcggttttagatttcggctgatccaaattctcacaaagtggtgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttg 29663109  T
Q  408 tgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccc 453  Q
      |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  29663110 caagactttaaacaatttttcaacggttaattttagtggtccaccc 29663155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 158 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 18104417 - 18104287
Alignment:
Q  158 tcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacc 257  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| |    
T  18104417 tcaacgattataggtctattttgcgagattt-atgcaattttgtgtcggtttcatgttttggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccatc 18104319  T
Q  258 cg-aaaatttaaataattcaattatagatcta 288  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18104318 cgaaaaatttaaataattcaattaaagatcta 18104287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 287 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 29502215 - 29502072
Alignment:
Q  287 tattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataa 386  Q
    |||||||  ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| |   |||||||||||||||||| | ||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  29502215 tattttgcaagattttattcaattttgtgttggttttaggtttcgacagatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggcccatccgaaaaatttaaataa 29502116  T
Q  387 ttcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaa 430  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||    
T  29502115 ttgaattataggtctattttgtgagactttaaactatttttcaa 29502072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 158 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 31932010 - 31931855
Alignment:
Q  158 tcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacc 257  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| | | ||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||    
T  31932010 tcaacgattataggtctattttgcgagattttatacgattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggtccacc 31931911  T
Q  258 c-gaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaatttt 312  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| ||||||||    
T  31931910 caaaaaatttaaataattcaattatagatctaatttacgagattttaaacaatttt 31931855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 163 - 312
Target Start/End: Original strand, 8461763 - 8461913
Alignment:
Q  163 gattataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccg-aa 261  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| | |  |||||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||||| ||    
T  8461763 gattataggtctattttgcgatattttatacaattttatgtctgttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggtccacccgaaa 8461862  T
Q  262 aatttaaataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaatttt 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| ||||||||    
T  8461863 aatttaaataattcaattatagatctaatttgtgatactttaaacaatttt 8461913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 171 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 46828922 - 46828781
Alignment:
Q  171 gtctattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaatttaaat 270  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||| | | ||| ||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||    
T  46828922 gtctattttgcgagattttgtacaattttatgtcggtattaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggtccactcgaaaatttaaat 46828823  T
Q  271 aattcaattatagatctattttgtgagattttatacaatttt 312  Q
    || || ||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  46828822 aactcgattatagatctattttgagagactttaaacaatttt 46828781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 174 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 16649679 - 16649541
Alignment:
Q  174 tattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaatttaaataat 273  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| |||| || ||||||||||||| ||||||||| |||| ||  ||||| ||||||||||||||    
T  16649679 tattttgcgaaattttatacaattttgtattgattttaggtttcggctgatccaaattcccgcaaagtggtgtagcggtgcaccccaaaatttaaataat 16649580  T
Q  274 tcaattatagatctattttgtgagattttatacaatttt 312  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| | || ||||||||    
T  16649579 tcaattataggtctattttgcgagactataaacaatttt 16649541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 174 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 17624040 - 17623902
Alignment:
Q  174 tattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaatttaaataat 273  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| |||| || ||||||||||||| ||||||||| |||| ||  ||||| ||||||||||||||    
T  17624040 tattttgcgaaattttatacaattttgtattgattttaggtttcggctgatccaaattcccgcaaagtggtgtagcggtgcaccccaaaatttaaataat 17623941  T
Q  274 tcaattatagatctattttgtgagattttatacaatttt 312  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| | || ||||||||    
T  17623940 tcaattataggtctattttgcgagactataaacaatttt 17623902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 175 - 312
Target Start/End: Original strand, 25174223 - 25174361
Alignment:
Q  175 attttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccg-aaaatttaaataat 273  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||| ||||||||| |||| |||||||||||||||   |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  25174223 attttgcgagattttatataattatgtgttggttttaggtttcggttgatccaaattctcacaaagtggtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataat 25174322  T
Q  274 tcaattatagatctattttgtgagattttatacaatttt 312  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  25174323 tcaattataggtctattttgcgagactttaaacaatttt 25174361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 97 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 29502292 - 29502076
Alignment:
Q  97 gcagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccgnnnnnnnnnnnnnntcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaat 196  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||              | || ||| ||| || |||||||| ||||||||| ||||    
T  29502292 gcagcggcggagcccttcatgggctagggtgggccacagcccacccgaaaaatttaaaaaattaacgataataggtatattttgcaagattttattcaat 29502193  T
Q  197 tttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccg-aaaatttaaataattcaattatagatctattttgtg 295  Q
    ||||| ||||||||| |||| |   |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  29502192 tttgtgttggttttaggtttcgacagatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggcccatccgaaaaatttaaataattgaattataggtctattttgtg 29502093  T
Q  296 agattttatacaatttt 312  Q
    ||| |||| || |||||    
T  29502092 agactttaaactatttt 29502076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 164 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 23469376 - 23469227
Alignment:
Q  164 attataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccg-aaa 262  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | | ||||||| ||||  |||||||| |||||| ||||| ||| ||||||||||| | | |||    
T  23469376 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttctgttgatcccaattcccgcaaattggtgtagtggcccatctgaaaa 23469277  T
Q  263 atttaaataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaatttt 312  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  23469276 atttaaataattcaattataggtctaatttgcgagattttaaacaatttt 23469227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 164 - 312
Target Start/End: Original strand, 40055769 - 40055918
Alignment:
Q  164 attataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccaccc-gaaa 262  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | |  |||||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||||  |||    
T  40055769 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgcagtggcccacccaaaaa 40055868  T
Q  263 atttaaataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaatttt 312  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||| |||| |||| ||||||||    
T  40055869 atttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 40055918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 287 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 16649679 - 16649537
Alignment:
Q  287 tattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataa 386  Q
    ||||||| || ||||||||||||||| | | | |||||||||| || ||||||||||||||||||| | |||||| ||| ||||| |||| |||||||||    
T  16649679 tattttgcgaaattttatacaattttgtattgattttaggtttcggctgatccaaattcccgcaaagtggtgtagcggtgcaccccaaaa-tttaaataa 16649581  T
Q  387 ttcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaa 430  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| |||| ||||||||||    
T  16649580 ttcaattataggtctattttgcgagactataaacaatttttcaa 16649537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 287 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 17624040 - 17623898
Alignment:
Q  287 tattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataa 386  Q
    ||||||| || ||||||||||||||| | | | |||||||||| || ||||||||||||||||||| | |||||| ||| ||||| |||| |||||||||    
T  17624040 tattttgcgaaattttatacaattttgtattgattttaggtttcggctgatccaaattcccgcaaagtggtgtagcggtgcaccccaaaa-tttaaataa 17623942  T
Q  387 ttcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaa 430  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| |||| ||||||||||    
T  17623941 ttcaattataggtctattttgcgagactataaacaatttttcaa 17623898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 280 - 430
Target Start/End: Original strand, 30781079 - 30781228
Alignment:
Q  280 atagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaatt 379  Q
    ||||||||| ||||  | ||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||| ||||||||| ||| ||| | ||| | |||||||||| |||||||    
T  30781079 atagatctactttgcaaaattttatacaattttgtgtaggtttt-ggtttcggttaatccaaatttccgtaaagtggtgcaatggtccacccaaaaaatt 30781177  T
Q  380 taaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaa 430  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||||||    
T  30781178 taaataattcaattataggtctattttgcgagtctttaaacaatttttcaa 30781228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 275 - 432
Target Start/End: Original strand, 9013879 - 9014035
Alignment:
Q  275 caattatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaa 374  Q
    |||| |||| |||||||  | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | ||||||| |||| || |||| |  |||| ||| ||| |||||    
T  9013879 caatcataggtctatttcttaagattttatacgattttgtgtcggttttaggtttggattgatccgaatttcc-caaaatgttgtaatggcccatccgaa 9013977  T
Q  375 aaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaata 432  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  9013978 aaatttatataatttaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaata 9014035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 296 - 436
Target Start/End: Original strand, 9014476 - 9014623
Alignment:
Q  296 agattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattat 395  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |  | |||||||||  |||||| | ||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  9014476 agattttatacaattttgtgtcggttttaggtttcgactaatccaaattttcgcaaaatggtgtagtggcccacccgaaaaatttatataatttaattat 9014575  T
Q  396 aggtcta-------atttgtgagactttaaataatttttcaatagtta 436  Q
    |||||||        |||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9014576 aggtctattttgatttttgcgagactttaaacaatttttcaatagtta 9014623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 98 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 23562806 - 23562592
Alignment:
Q  98 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccgnnnnnnnnnnnnnntcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaatt 197  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |              |||| |||||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  23562806 cagtggcggagcccttcatgagctggggtgggccatggcccacctggaaaaattaaaaaatcaacgattatagatctattttgcgagattttatacaatt 23562707  T
Q  198 ttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaa-tttaaataattcaattatagatctattttgtga 296  Q
    |||| | |  || | |||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||| | ||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| ||    
T  23562706 ttgtgtcgaattaa-gttttgattgatccaaatttccgcaaagtggtgtagtagtccacccgaaaaatttaaacaattcaattataggtctattttgcga 23562608  T
Q  297 gattttatacaatttt 312  Q
    |  |||| ||||||||    
T  23562607 ggctttaaacaatttt 23562592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 280 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 22499868 - 22499716
Alignment:
Q  280 atagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaatt 379  Q
    |||| ||||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||  ||||       
T  22499868 ataggtctattttgcgaaattttattcaattttatatcggttttaggtttcggttaatctaaattcccgcaaagtggtgtagtggcccacctaaaaa--- 22499772  T
Q  380 taaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagtta 436  Q
     ||| |||||||||||| || || |||  ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  22499771 -aaaaaattcaattataagtttattttacgagactttaaacaatttttcaatggtta 22499716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 285 - 430
Target Start/End: Original strand, 28754879 - 28755023
Alignment:
Q  285 tctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaatttaaat 384  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||   ||||  | ||||||||| |||||| ||||| ||||||    
T  28754879 tctactttgcgagattttatacaattttatgtcaattttaggtttcagttgatccaaatt-ttgcaaggtggtgtagtggcccacccaaaaaaattaaat 28754977  T
Q  385 aattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaa 430  Q
    |||||||||||| ||||| |||   || ||||||| ||||||||||    
T  28754978 aattcaattataagtctattttccaagtctttaaacaatttttcaa 28755023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 304 - 436
Target Start/End: Original strand, 9021516 - 9021648
Alignment:
Q  304 tacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaa 403  Q
    ||||||||| ||||  ||||| |||| || ||||| ||||| ||||||| | |||| |||| |||||| ||||||||| |||||| |||||||| ||||     
T  9021516 tacaattttgtgtcaattttaagtttcggctgatctaaatttccgcaaaattgtgtggtggcccacccaaaaaatttatataatttaattatagttctat 9021615  T
Q  404 tttgtgagactttaaataatttttcaatagtta 436  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  9021616 tttgcgagactttaaacaatttttcaatggtta 9021648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 195 - 312
Target Start/End: Original strand, 29663010 - 29663128
Alignment:
Q  195 attttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaa-tttaaataattcaattatagatctattttg 293  Q
    ||||||| | |||||||  ||| || ||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29663010 attttgtgtcggttttagatttcggctgatccaaattctcacaaagtggtgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttg 29663109  T
Q  294 tgagattttatacaatttt 312  Q
      ||| |||| ||||||||    
T  29663110 caagactttaaacaatttt 29663128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 171 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 22499864 - 22499726
Alignment:
Q  171 gtctattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaatttaaat 270  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||| |||| |||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||  ||||   |||     
T  22499864 gtctattttgcgaaattttattcaattttatatcggttttaggtttcggttaatctaaattcccgcaaagtggtgtagtggcccacctaaaaa---aaaa 22499768  T
Q  271 aattcaattatagatctattttgtgagattttatacaatttt 312  Q
    ||||||||||||  | ||||||  |||| |||| ||||||||    
T  22499767 aattcaattataagtttattttacgagactttaaacaatttt 22499726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 164 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 29075165 - 29075026
Alignment:
Q  164 attataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccg-aaa 262  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | | ||||||| |||| |||||||||||||          ||| ||||||| ||||||| |||    
T  29075165 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaagtttcggttgatccaaat----------tggtgtagtggtccacccgaaaa 29075076  T
Q  263 atttaaataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaatttt 312  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||| || | |||| ||||||||    
T  29075075 atttaaataattcaattataggtctaatttgcgaaactttaaacaatttt 29075026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 279 - 430
Target Start/End: Original strand, 40883349 - 40883499
Alignment:
Q  279 tatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaat 378  Q
    ||||| |||||| || ||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||  |||||||||  || |||| | | ||||||||||||||||||||     
T  40883349 tataggtctattatgcgagattttatacacttttgtgtcggttttagttttcggcagatccaaatctccccaaagtggcgtagtggtccacccgaaaaaa 40883448  T
Q  379 --ttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaa 430  Q
      ||||| ||   || |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  40883449 aattaaaaaa---aaatataggtctattttgcgagactttaaacaatttttcaa 40883499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 356 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 4248932 - 4248869
Alignment:
Q  356 gtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaa 419  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  4248932 gtgtagtggcccgcccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcaagactttaaa 4248869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 343 - 426
Target Start/End: Original strand, 6961163 - 6961246
Alignment:
Q  343 ttcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttt 426  Q
    |||||||||| | |||  |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| || ||||||    
T  6961163 ttcccgcaaaatggtgcggtggcccatccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagactttgaacaatttt 6961246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 285 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 22566665 - 22566599
Alignment:
Q  285 tctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaa 351  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || ||||||||||| ||||||    
T  22566665 tctattttgcgagattttatacaattttgtgtcggttttaagtttcggctgatccaaattgccgcaa 22566599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 221 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 4248954 - 4248881
Alignment:
Q  221 tgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaa-tttaaataattcaattatagatctattttg 293  Q
    ||||| |||||  |||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4248954 tgatctaaatttttgcaaagtggtgtagtggcccgcccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttg 4248881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 183 - 293
Target Start/End: Original strand, 9014476 - 9014587
Alignment:
Q  183 agattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccg-aaaatttaaataattcaattat 281  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||||||| |||| |  | |||||||||   ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  9014476 agattttatacaattttgtgtcggttttaggtttcgactaatccaaattttcgcaaaatggtgtagtggcccacccgaaaaatttatataatttaattat 9014575  T
Q  282 agatctattttg 293  Q
    || |||||||||    
T  9014576 aggtctattttg 9014587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 331 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 24779680 - 24779581
Alignment:
Q  331 ggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaa 430  Q
    ||||||| ||||||| || ||| | || || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || | |||| ||| ||||||| | ||||||||    
T  24779680 ggttgattcaaattcacgtaaagtggtctaatggtccacccgaaaaatttaaataattaaattatagatccattttgcgagtctttaaacattttttcaa 24779581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 171 - 292
Target Start/End: Original strand, 8727794 - 8727916
Alignment:
Q  171 gtctattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggccca-cccgaaaatttaaa 269  Q
    ||||||||| | ||||||||||  ||||||| ||| |||||||||| || |||||||||||| | ||||||||  ||||||||||  |  ||||||||||    
T  8727794 gtctattttacaagattttatgtcattttgtgttgattttatgtttcggctgatccaaattcttacaaagtggtatagtggcccatgcaaaaaatttaaa 8727893  T
Q  270 taattcaattatagatctatttt 292  Q
     ||||| ||| ||| ||||||||    
T  8727894 caattcgattgtaggtctatttt 8727916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 171 - 292
Target Start/End: Original strand, 28754878 - 28754999
Alignment:
Q  171 gtctattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccaccc-gaaaatttaaa 269  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||| | |   ||||| ||||  |||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||  |||| |||||    
T  28754878 gtctactttgcgagattttatacaattttatgtcaattttaggtttcagttgatccaaatt-ttgcaaggtggtgtagtggcccacccaaaaaaattaaa 28754976  T
Q  270 taattcaattatagatctatttt 292  Q
    |||||||||||||  ||||||||    
T  28754977 taattcaattataagtctatttt 28754999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 98 - 143
Target Start/End: Original strand, 29662932 - 29662977
Alignment:
Q  98 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccg 143  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  29662932 cagtggcggagcccttcatgggctagggtgggctacggcccacccg 29662977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 172 - 312
Target Start/End: Original strand, 30781084 - 30781224
Alignment:
Q  172 tctattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaa-tttaaat 270  Q
    |||| ||||| | ||||||| ||||||||| | ||||||  |||| |||| ||||||||| | | ||||||| | | ||| |||||| |||| |||||||    
T  30781084 tctactttgcaaaattttatacaattttgtgtaggttttg-gtttcggttaatccaaatttccgtaaagtggtgcaatggtccacccaaaaaatttaaat 30781182  T
Q  271 aattcaattatagatctattttgtgagattttatacaatttt 312  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||  |||| ||||||||    
T  30781183 aattcaattataggtctattttgcgagtctttaaacaatttt 30781224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 171 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 22566666 - 22566606
Alignment:
Q  171 gtctattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaatt 231  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||| |||| || |||||||||||    
T  22566666 gtctattttgcgagattttatacaattttgtgtcggttttaagtttcggctgatccaaatt 22566606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 320 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 14629695 - 14629632
Alignment:
Q  320 ttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaatttaaa 383  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||||| |||||    
T  14629695 ttttagtttttggtagatccaaatccctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaaaattaaa 14629632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 98 - 141
Target Start/End: Original strand, 19692467 - 19692510
Alignment:
Q  98 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacc 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  19692467 cagtggcggagcccttcatgggctggggtggaccacggtccacc 19692510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 287 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 4249083 - 4248977
Alignment:
Q  287 tattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataa 386  Q
    |||||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |   ||||||||||  | ||| | |||||| ||| || |||||||||||||||||    
T  4249083 tattttgcaagattttatataattttatgccggttttaggtttcagcaaatccaaattcttggaaagtggtgtagaggttcatccgaaaaatttaaataa 4248984  T
Q  387 ttcaatt 393  Q
     ||||||    
T  4248983 gtcaatt 4248977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 248 - 312
Target Start/End: Original strand, 6961181 - 6961246
Alignment:
Q  248 gtggcccacccgaaaa-tttaaataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaatttt 312  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||  ||||||||    
T  6961181 gtggcccatccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagactttgaacaatttt 6961246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 102 - 143
Target Start/End: Original strand, 8727725 - 8727766
Alignment:
Q  102 ggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccg 143  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  8727725 ggcggagcccttcatgggctagggtgggccacgacccacccg 8727766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 97 - 134
Target Start/End: Original strand, 9014390 - 9014427
Alignment:
Q  97 gcagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacg 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9014390 gcagtggcggagcccttcatgggctgtggtgggccacg 9014427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 214 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 14629688 - 14629639
Alignment:
Q  214 ttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaa 263  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  14629688 ttttggtagatccaaatccctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaa 14629639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 166 - 263
Target Start/End: Original strand, 40883349 - 40883446
Alignment:
Q  166 tataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaa 263  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||| || |||||| | |||||||  ||| ||  |||||||||  |  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  40883349 tataggtctattatgcgagattttatacacttttgtgtcggttttagttttcggcagatccaaatctccccaaagtggcgtagtggtccacccgaaaa 40883446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 97 - 141
Target Start/End: Original strand, 28754812 - 28754856
Alignment:
Q  97 gcagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacc 141  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  28754812 gcagtggcggagcctttcatgggctagggtgggccatggcccacc 28754856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 141
Target Start/End: Original strand, 8461698 - 8461741
Alignment:
Q  98 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacc 141  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  8461698 cagtggcagagcccttcatgggctggggtgggtcacgacccacc 8461741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 287 - 329
Target Start/End: Original strand, 6961122 - 6961164
Alignment:
Q  287 tattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttt 329  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6961122 tattttgcaagattttatacaattttgtgtcggttttaggttt 6961164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 98 - 136
Target Start/End: Original strand, 40054298 - 40054336
Alignment:
Q  98 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggc 136  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  40054298 cagtggcggaaccctccatgggctggggtgggccacggc 40054336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 130
Target Start/End: Original strand, 9013814 - 9013847
Alignment:
Q  97 gcagtggcggagcccttcatgggctggggtgggc 130  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9013814 gcagcggcggagcccttcatgggctggggtgggc 9013847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 142
Target Start/End: Original strand, 27949681 - 27949726
Alignment:
Q  97 gcagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccaccc 142  Q
    ||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  27949681 gcagtggcggagccactcatgggccagggtgggccacggcccaccc 27949726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 218 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 24779680 - 24779604
Alignment:
Q  218 ggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaa-tttaaataattcaattatagatctattttg 293  Q
    ||||||| |||||||  | |||||||  || ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  24779680 ggttgattcaaattcacgtaaagtggtctaatggtccacccgaaaaatttaaataattaaattatagatccattttg 24779604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 276 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 25303872 - 25303836
Alignment:
Q  276 aattatagatctattttgtgagattttatacaatttt 312  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  25303872 aattatagatcaattttgtgagattttagacaatttt 25303836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 248 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 25304015 - 25303948
Alignment:
Q  248 gtggcccacccgaaaatttaaataatt--caattatagatctattttgtgagattttatacaatttta 313  Q
    |||||| | ||||||| ||||| ||||  ||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||    
T  25304015 gtggcctatccgaaaaattaaaaaattaacaattataggtctattatgtgagattttaaacaatttta 25303948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 260; Significance: 1e-145; HSPs: 68)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 98 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 17285452 - 17285095
Alignment:
Q  98 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccgnnnnnnnnnnnnnntcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaatt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              |||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  17285452 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggaaaaattaaaaaatcaacgattataggtctaatttgcgagattttatgcaatt 17285353  T
Q  198 ttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtgag 297  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17285352 ttatatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgtgag 17285253  T
Q  298 attttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtcca-cccgaaaaatttaaataattcaattata 396  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17285252 attttatacaattttacgtcggttttaggtttcggttgatccaaatttccgcaaattggtgtagtggtccaccccgaaaaatttaaataattcaattata 17285153  T
Q  397 ggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccct 454  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17285152 ggtctaatttgtgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccct 17285095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 97 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 16693108 - 16692746
Alignment:
Q  97 gcagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccgnnnnnnnnnnnnnntcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaat 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  16693108 gcagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggaaaaattaaaaaatcaacgattataggtctattttacgagattttatgcaat 16693009  T
Q  197 tttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtga 296  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16693008 tttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctacaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgtga 16692909  T
Q  297 gattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattata 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16692908 gattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattata 16692809  T
Q  397 ggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacat 459  Q
     |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  16692808 tgtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatatttaattttagtggcccaccgtgacat 16692746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 100 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 44052615 - 44052256
Alignment:
Q  100 gtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccgnnnnnnnnnnnnnntcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaatttt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||              |||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  44052615 gtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggctcacccggaaaaatttaaaaatcaacgattataggtctattttgcgagattttatgtaatttt 44052516  T
Q  200 gtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtgagat 299  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44052515 gtgttggttttatgttttgattgatccaaattcctacaaagtggtgtagtgacccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgtgagat 44052416  T
Q  300 tttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggt 399  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44052415 tttatagaattttatgtcggttttaggttttggttgattcaaattctcgcaaattggtgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattataggt 44052316  T
Q  400 ctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacat 459  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44052315 ctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacat 44052256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 97 - 459
Target Start/End: Original strand, 29169940 - 29170302
Alignment:
Q  97 gcagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccgnnnnnnnnnnnnnntcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaat 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||              |||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  29169940 gcagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacagcccacccggaaaaattaaaaaatcaacgattataggtctaatttgcgagattttatgcaat 29170039  T
Q  197 tttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtga 296  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29170040 tttgtatcgattttatgttttggttgatccaaattcctacaaagtggtgtagtagcccacccaaaaatttaaataattcaattataggtctattttgtga 29170139  T
Q  297 gattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattata 396  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29170140 gattttatacaaatttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaatttccgcaaattggtgcagtgatccacccgaaaaatttaaataattcaactata 29170239  T
Q  397 ggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacat 459  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29170240 ggtctaatttgtgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacat 29170302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 175 - 459
Target Start/End: Original strand, 40567042 - 40567326
Alignment:
Q  175 attttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaatttaaataatt 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  40567042 attttgcgagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttagttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaatagtt 40567141  T
Q  275 caattatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaa 374  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  40567142 caattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccgaa 40567241  T
Q  375 aaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacat 459  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40567242 aaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacat 40567326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 158 - 459
Target Start/End: Original strand, 23177401 - 23177702
Alignment:
Q  158 tcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacc 257  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  23177401 tcaacgattataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtatcgattttatattttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggcccacc 23177500  T
Q  258 cgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagt 357  Q
    | |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  23177501 caaaaatttaaataattcaattatatgtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttagatttcggttgatccaaattcccgcaaattggt 23177600  T
Q  358 gtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgac 457  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23177601 gtagtggtccatccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgac 23177700  T
Q  458 at 459  Q
    ||    
T  23177701 at 23177702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 163 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 25299181 - 25298885
Alignment:
Q  163 gattataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaa 262  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  25299181 gattataggtctattttgcgagattttatgcaactttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccaccggaaa 25299082  T
Q  263 atttaaataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagt 362  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25299081 atttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttagatttcggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagt 25298982  T
Q  363 ggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacat 459  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25298981 ggcccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggtccaccctgacat 25298885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 101 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 33012212 - 33011854
Alignment:
Q  101 tggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccgnnnnnnnnnnnnnntcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaattttg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              |||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33012212 tggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggaaaaattaaaaaatcaacgattataggtctattttgtgagattttatgcaattttg 33012113  T
Q  201 tattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtgagatt 300  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  33012112 tgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagatt 33012013  T
Q  301 ttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtc 400  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||   ||    
T  33012012 ttatgcaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccatccgaaaaatttaaataattcaattatttttc 33011913  T
Q  401 taatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacat 459  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33011912 taatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctaacat 33011854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 98 - 459
Target Start/End: Original strand, 6849752 - 6850112
Alignment:
Q  98 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccgnnnnnnnnnnnnnntcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaatt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              |||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||    
T  6849752 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggaaaaattaaaaaatcaacgattataggtctaatttgcgagattttatacaatt 6849851  T
Q  198 ttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtgag 297  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6849852 ttgtatcggttttatgttttggttgattcaaatttctacaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtgag 6849951  T
Q  298 attttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattatag 397  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6849952 attttatacaaatttatatcggttttaggtttcggttgatccaaatttctgcaaattagtatagtggttcacccgaaaaatttaaataattcaattatag 6850051  T
Q  398 gtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacat 459  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6850052 gt-taatttgtgagactttaaacaatttttcaataattaattttagtggcccaccctgacat 6850112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 98 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 29981865 - 29981504
Alignment:
Q  98 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccgnnnnnnnnnnnnnntcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaatt 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||              |||| ||||||| ||||| |||| || |||||||||||||    
T  29981865 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccatccggaaaaattaaaaaatcaacgattataggtctactttgtgatattttatgcaatt 29981766  T
Q  198 ttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtgag 297  Q
    |||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  29981765 ttgtgtcggttttaagttttggtttatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgag 29981666  T
Q  298 attttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattatag 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  29981665 attttatacaattttatgtcggttttaagtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtatagtggtccacccgaaaaatttaaacaattcaattatat 29981566  T
Q  398 gtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacat 459  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29981565 gtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacat 29981504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 97 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 48708577 - 48708214
Alignment:
Q  97 gcagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccgnnnnnnnnnnnnnn-tcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaa 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||               |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  48708577 gcagtggcggagcccttcatgggctggggtgagccacggcccatccgaaaaaattaaaaaaatcaacgattataggtctattttgcgagattttatgcaa 48708478  T
Q  196 ttttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtg 295  Q
    |||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  48708477 ttttatatcgattttatgtttttgttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacctgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcg 48708378  T
Q  296 agattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattat 395  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  48708377 agattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtgtctcacccgaaaaatttaaataattcaattat 48708278  T
Q  396 aggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacat 459  Q
    ||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  48708277 aggtctaatttgcaagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggtccaccctgacat 48708214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 158 - 459
Target Start/End: Original strand, 51139745 - 51140046
Alignment:
Q  158 tcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacc 257  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  51139745 tcaacgattataggtctattttgcgagattttatacaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcttgcaaagtggtgtagtggcccacc 51139844  T
Q  258 cgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagt 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  51139845 cgaaaatttaaataattcaattataggtttattttgcgagattttttacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggt 51139944  T
Q  358 gtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgac 457  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51139945 gtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattataagtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgac 51140044  T
Q  458 at 459  Q
    ||    
T  51140045 at 51140046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 98 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 919868 - 919507
Alignment:
Q  98 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccgnnnnnnnnnnnnnntcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaatt 197  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||              |||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  919868 cagtgacggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccatccggaaaaatttaaaaatcaacgattatagatctattttgcgagattttatgcaatt 919769  T
Q  198 ttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtgag 297  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  919768 ttgtgttggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacctgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgag 919669  T
Q  298 attttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattatag 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  919668 attttatacaattttatgtcggttttaggtttccattgatccaaattccagcaaattggtgtagtagtccacccaaaaaatttaaataattcaattatag 919569  T
Q  398 gtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacat 459  Q
    |||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  919568 gtctaatttacgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtcgcccaccctaacat 919507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 163 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 46224853 - 46224559
Alignment:
Q  163 gattataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaa 262  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  46224853 gattataaatctattttgcgagattttatgcaattttgtatcgattttatgtttttgttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaa 46224754  T
Q  263 atttaaataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagt 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  46224753 atttaaataattcaattatagatctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttagatttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagt 46224654  T
Q  363 ggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacat 459  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  46224653 ggcccacctgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagac--taaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctaacat 46224559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 98 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 9042576 - 9042216
Alignment:
Q  98 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccgnnnnnnnnnnnnnntcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaatt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||              ||||  |||||| ||||| ||| |||||||||||||||||    
T  9042576 cagtggcggagcccttcatgggctgggctgggccacggcccatccggaaaaattaaaaaatcaataattataggtctaatttacgagattttatgcaatt 9042477  T
Q  198 ttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtgag 297  Q
    | |||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9042476 t-gtatcgattttatgttttggttgatccaaattcctacaaagtggtgtagtggcacacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgtgag 9042378  T
Q  298 attttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattatag 397  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9042377 attttatacaaatttaagtcggttttaggtttcggttgatccaaatttccgcaaattggtgtagtggtccacccaaaaaatttaaataattcaattatag 9042278  T
Q  398 gtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacat 459  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  9042277 gtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggctcaccctaacat 9042216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 98 - 459
Target Start/End: Original strand, 37125692 - 37126053
Alignment:
Q  98 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccgnnnnnnnnnnnnnntcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaatt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||              |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  37125692 cagtggcggagcccttcatgggctgaggtgggccacggcccacccggaaaaattataaaatcaacgattataggtctattttgcgatattttatgcaatt 37125791  T
Q  198 ttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtgag 297  Q
    |||  |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  37125792 ttgcgtcagttttacgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtacagtgacccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgag 37125891  T
Q  298 attttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattatag 397  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37125892 attttatacaattttatatcagttttaggtttcggttgatcaaaattcccgcaaattggtgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattatag 37125991  T
Q  398 gtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacat 459  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37125992 gtctaatttgtgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacat 37126053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 98 - 459
Target Start/End: Original strand, 47561726 - 47562087
Alignment:
Q  98 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccgnnnnnnnnnnnnnntcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaatt 197  Q
    ||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||              |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  47561726 cagtggcggagcccttcataggtttgggtgggccacggcccacccggaaaaataaaaaaatcaacgattataggtctattttgcgatattttatgcaatt 47561825  T
Q  198 ttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtgag 297  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||  ||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||     
T  47561826 ttgtgtaggttttatgttttggttgatccaaattactgcaaagtgatgtagtgaaccaaccaaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgaa 47561925  T
Q  298 attttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattatag 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47561926 attttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattatag 47562025  T
Q  398 gtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacat 459  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  47562026 gtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggctcaccctgacat 47562087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 158 - 459
Target Start/End: Original strand, 45836903 - 45837204
Alignment:
Q  158 tcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacc 257  Q
    |||| ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  45836903 tcaacgattataggtctatattgcgagattttatacaattttgtatcggttttatgttttggttgatctaaattcctgcaaagtggtgtagtggtccacc 45837002  T
Q  258 cgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagt 357  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||    
T  45837003 cgaaaatttaaataatttaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgattcaaattcctgcaaattggt 45837102  T
Q  358 gtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgac 457  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  45837103 gtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttttgaaactttaaacaatttttcaatagttaattttagttgtccaccctgac 45837202  T
Q  458 at 459  Q
    ||    
T  45837203 at 45837204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 98 - 459
Target Start/End: Original strand, 42371969 - 42372330
Alignment:
Q  98 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccgnnnnnnnnnnnnnntcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaatt 197  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||               |||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  42371969 cagtggcggagcccttcatggattggggtgggccacggcccacccagaaaaattaaaaaatcaatgattataggtctattttgtgagattttatgcaatt 42372068  T
Q  198 ttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtgag 297  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  42372069 ttgtgtcggttttatgttttggttgatctaaattcctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgag 42372168  T
Q  298 attttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattatag 397  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  42372169 attttatacaattttatgttggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtgtagtggcccacccaaaaaatttaaataattcaattattg 42372268  T
Q  398 gtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacat 459  Q
     ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  42372269 atctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagcggcccaccctaacat 42372330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 166 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 40428871 - 40428578
Alignment:
Q  166 tataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaatt 265  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||||||    
T  40428871 tataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtagtccactcgaaaatt 40428772  T
Q  266 taaataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggt 365  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  40428771 taaataattcaattatagttctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggc 40428672  T
Q  366 ccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacat 459  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40428671 ccacccgaaaaattaaaataattcaattataaatttaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggtccaccctgacat 40428578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 98 - 459
Target Start/End: Original strand, 24790434 - 24790796
Alignment:
Q  98 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccgnnnnnnnnnnnnnntcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaatt 197  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||               |||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24790434 cagtggtggagcccttcatgggctggagtgggccacgacccacccagaaaaataaaaaaatcaacgactataagtctgttttgcgagattttatgcaatt 24790533  T
Q  198 ttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtgag 297  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  24790534 ttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgag 24790633  T
Q  298 attttatacaattttatgtcggttttaggtttt-ggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattata 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  24790634 attttatacaattttatgtcggttttacgttttgggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggctcaagcgaaaaatttaaataattcaattata 24790733  T
Q  397 ggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacat 459  Q
    |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  24790734 ggtcaaatttgcgagactttaaacaatttttcaatggttaattttagtggcacaccctgacat 24790796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 172 - 459
Target Start/End: Original strand, 8086303 - 8086590
Alignment:
Q  172 tctattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaatttaaata 271  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8086303 tctattttgctagattttatgcaattttatgtaggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaata 8086402  T
Q  272 attcaattatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccaccc 371  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |    
T  8086403 attcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacac 8086502  T
Q  372 gaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacat 459  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  8086503 gaaaaatttaaataattcaattataagtttaatttgcgagactttaaacaattttttaatggttaattttaatggcccaccctgacat 8086590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 98 - 459
Target Start/End: Original strand, 8530082 - 8530449
Alignment:
Q  98 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccgnnnnnnnnnnnnnntcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaatt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8530082 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccgaaaaaattaaaaaatcaacgattataggtctattttgcgagattttatgcaatt 8530181  T
Q  198 ttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtgag 297  Q
    |||| | | ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  8530182 ttgtgtcgattttatgttctggttgatccaaattcttgcaaagtggtgtagtggcccacctgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgag 8530281  T
Q  298 attt------tatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaa 391  Q
    ||||      ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8530282 attttaattttatacaattttctgtcggttttaggtttcggttgatcccaattcccgcaaattggtgcagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaa 8530381  T
Q  392 ttataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacat 459  Q
    |||||| ||||||||| || |||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8530382 ttatagatctaatttgcgaaactttatacaatttttcaaaagttaattttagtggcccaccctgacat 8530449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 158 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 24544816 - 24544564
Alignment:
Q  158 tcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacc 257  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  24544816 tcaacgattataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgctttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccact 24544717  T
Q  258 cgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagt 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  24544716 cgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggt 24544617  T
Q  358 gtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtga 410  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24544616 gtagtggcacacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttgtga 24544564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 164 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 24542873 - 24542577
Alignment:
Q  164 attataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaa 263  Q
    |||||| |||||||||| || ||||||| ||||||| | | ||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||    
T  24542873 attataggtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcacacccgaaaa 24542774  T
Q  264 -tttaaataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagt 362  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24542773 atttaaataattcaattataggtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagt 24542674  T
Q  363 ggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacat 459  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24542673 ggcacacccgaaaaatttaaataattcaattatagttctaattagcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacat 24542577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 164 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 24542987 - 24542740
Alignment:
Q  164 attataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaa 263  Q
    |||||| |||||||||| || ||||||| ||||||| | | ||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||    
T  24542987 attataggtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcacacccgaaaa 24542888  T
Q  264 -tttaaataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagt 362  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24542887 atttaaataattcaattataggtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagt 24542788  T
Q  363 ggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtga 410  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24542787 ggcacacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttgtga 24542740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 164 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 24543101 - 24542854
Alignment:
Q  164 attataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaa 263  Q
    |||||| |||||||||| || ||||||| ||||||| | | ||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||    
T  24543101 attataggtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcacacccgaaaa 24543002  T
Q  264 -tttaaataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagt 362  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24543001 atttaaataattcaattataggtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagt 24542902  T
Q  363 ggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtga 410  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24542901 ggcacacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttgtga 24542854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 164 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 24543215 - 24542968
Alignment:
Q  164 attataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaa 263  Q
    |||||| |||||||||| || ||||||| ||||||| | | ||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||    
T  24543215 attataggtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcacacccgaaaa 24543116  T
Q  264 -tttaaataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagt 362  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24543115 atttaaataattcaattataggtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagt 24543016  T
Q  363 ggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtga 410  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24543015 ggcacacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttgtga 24542968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 164 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 24543329 - 24543082
Alignment:
Q  164 attataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaa 263  Q
    |||||| |||||||||| || ||||||| ||||||| | | ||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||    
T  24543329 attataggtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcacacccgaaaa 24543230  T
Q  264 -tttaaataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagt 362  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24543229 atttaaataattcaattataggtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagt 24543130  T
Q  363 ggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtga 410  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24543129 ggcacacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttgtga 24543082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 164 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 24543443 - 24543196
Alignment:
Q  164 attataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaa 263  Q
    |||||| |||||||||| || ||||||| ||||||| | | ||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||    
T  24543443 attataggtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcacacccgaaaa 24543344  T
Q  264 -tttaaataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagt 362  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24543343 atttaaataattcaattataggtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagt 24543244  T
Q  363 ggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtga 410  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24543243 ggcacacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttgtga 24543196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 164 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 24543557 - 24543310
Alignment:
Q  164 attataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaa 263  Q
    |||||| |||||||||| || ||||||| ||||||| | | ||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||    
T  24543557 attataggtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcacacccgaaaa 24543458  T
Q  264 -tttaaataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagt 362  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24543457 atttaaataattcaattataggtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagt 24543358  T
Q  363 ggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtga 410  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24543357 ggcacacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttgtga 24543310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 164 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 24543671 - 24543424
Alignment:
Q  164 attataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaa 263  Q
    |||||| |||||||||| || ||||||| ||||||| | | ||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||    
T  24543671 attataggtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcacacccgaaaa 24543572  T
Q  264 -tttaaataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagt 362  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24543571 atttaaataattcaattataggtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagt 24543472  T
Q  363 ggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtga 410  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24543471 ggcacacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttgtga 24543424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 164 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 24543785 - 24543538
Alignment:
Q  164 attataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaa 263  Q
    |||||| |||||||||| || ||||||| ||||||| | | ||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||    
T  24543785 attataggtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcacacccgaaaa 24543686  T
Q  264 -tttaaataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagt 362  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24543685 atttaaataattcaattataggtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagt 24543586  T
Q  363 ggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtga 410  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24543585 ggcacacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttgtga 24543538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 164 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 24543899 - 24543652
Alignment:
Q  164 attataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaa 263  Q
    |||||| |||||||||| || ||||||| ||||||| | | ||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||    
T  24543899 attataggtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcacacccgaaaa 24543800  T
Q  264 -tttaaataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagt 362  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24543799 atttaaataattcaattataggtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagt 24543700  T
Q  363 ggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtga 410  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24543699 ggcacacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttgtga 24543652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 164 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 24544013 - 24543766
Alignment:
Q  164 attataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaa 263  Q
    |||||| |||||||||| || ||||||| ||||||| | | ||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||    
T  24544013 attataggtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcacacccgaaaa 24543914  T
Q  264 -tttaaataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagt 362  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24543913 atttaaataattcaattataggtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagt 24543814  T
Q  363 ggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtga 410  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24543813 ggcacacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttgtga 24543766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 164 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 24544127 - 24543880
Alignment:
Q  164 attataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaa 263  Q
    |||||| |||||||||| || ||||||| ||||||| | | ||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||    
T  24544127 attataggtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcacacccgaaaa 24544028  T
Q  264 -tttaaataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagt 362  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24544027 atttaaataattcaattataggtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagt 24543928  T
Q  363 ggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtga 410  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24543927 ggcacacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttgtga 24543880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 164 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 24544241 - 24543994
Alignment:
Q  164 attataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaa 263  Q
    |||||| |||||||||| || ||||||| ||||||| | | ||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||    
T  24544241 attataggtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcacacccgaaaa 24544142  T
Q  264 -tttaaataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagt 362  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24544141 atttaaataattcaattataggtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagt 24544042  T
Q  363 ggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtga 410  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24544041 ggcacacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttgtga 24543994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 164 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 24544355 - 24544108
Alignment:
Q  164 attataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaa 263  Q
    |||||| |||||||||| || ||||||| ||||||| | | ||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||    
T  24544355 attataggtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcacacccgaaaa 24544256  T
Q  264 -tttaaataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagt 362  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24544255 atttaaataattcaattataggtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagt 24544156  T
Q  363 ggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtga 410  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24544155 ggcacacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttgtga 24544108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 164 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 24544469 - 24544222
Alignment:
Q  164 attataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaa 263  Q
    |||||| |||||||||| || ||||||| ||||||| | | ||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||    
T  24544469 attataggtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcacacccgaaaa 24544370  T
Q  264 -tttaaataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagt 362  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24544369 atttaaataattcaattataggtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagt 24544270  T
Q  363 ggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtga 410  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24544269 ggcacacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttgtga 24544222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 164 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 24544583 - 24544336
Alignment:
Q  164 attataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaa 263  Q
    |||||| |||||||||| || ||||||| ||||||| | | ||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||    
T  24544583 attataggtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcacacccgaaaa 24544484  T
Q  264 -tttaaataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagt 362  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24544483 atttaaataattcaattataggtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagt 24544384  T
Q  363 ggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtga 410  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24544383 ggcacacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttgtga 24544336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 164 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 24544697 - 24544450
Alignment:
Q  164 attataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaa 263  Q
    |||||| |||||||||| || ||||||| ||||||| | | ||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||    
T  24544697 attataggtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcacacccgaaaa 24544598  T
Q  264 -tttaaataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagt 362  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24544597 atttaaataattcaattataggtctattttgtgaaattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagt 24544498  T
Q  363 ggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtga 410  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24544497 ggcacacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttgtga 24544450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 307 - 459
Target Start/End: Original strand, 37343082 - 37343234
Alignment:
Q  307 aattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaattt 406  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37343082 aattttatgtcggttttaagtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattattggtctaattt 37343181  T
Q  407 gtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacat 459  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37343182 gcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctaacat 37343234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 158 - 312
Target Start/End: Original strand, 44317626 - 44317780
Alignment:
Q  158 tcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacc 257  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  44317626 tcaacgattataggtctattttgcgagattttatgtaattttgtgttgattttatgttttggttgatctaaattcctgtaaagtggtgtagtggcccacc 44317725  T
Q  258 cgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaatttt 312  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44317726 cgaaaatttaaataatttaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 44317780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 277 - 459
Target Start/End: Original strand, 44317632 - 44317813
Alignment:
Q  277 attatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaa 376  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||  |||||| ||| | ||||| ||||||||||||| ||||||| | ||| | ||||||||| |||||||||||    
T  44317632 attataggtctattttgcgagattttatgtaattttgtgttgattttatgttttggttgatctaaattcctgtaaagtggtgtagtggcccacccgaaaa 44317731  T
Q  377 atttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacat 459  Q
     ||||||||||| ||||||||||||| |||| |||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  44317732 -tttaaataatttaattataggtctattttgcgagattttatacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccttgacat 44317813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 295 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 49001555 - 49001410
Alignment:
Q  295 gagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaatta 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  49001555 gagattttatacaattttatgtcggttctaggtttag-ttgatccaaattcccgtaaagtggtgtagtggtccatccgaaaaatttaaataattcaatta 49001457  T
Q  395 taggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaatttt 441  Q
    ||| |||| |||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  49001456 tagatctattttgcgagactttaaacaatttttcaacggttaatttt 49001410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 252 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 9247020 - 9246840
Alignment:
Q  252 cccacccgaaaatttaaataattca--attatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgc 349  Q
    |||||||||||| ||||| |||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||| || | |||||||||| | |    
T  9247020 cccacccgaaaaattaaaaaattaaggattatagatctattttgcgagattttatacaattttgtatcggttttaggtttcggcttatccaaattctcac 9246921  T
Q  350 aaattagtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaa 430  Q
    ||| | ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| | ||||||||    
T  9246920 aaagtggtgtagtggcccactcgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcaagactttaaacattttttcaa 9246840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 164 - 312
Target Start/End: Original strand, 40567144 - 40567293
Alignment:
Q  164 attataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccg-aaa 262  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | | ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||    
T  40567144 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccgaaaa 40567243  T
Q  263 atttaaataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaatttt 312  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||| |||| |||| ||||||||    
T  40567244 atttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 40567293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 279 - 426
Target Start/End: Original strand, 8086297 - 8086443
Alignment:
Q  279 tatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaat 378  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||| |||||    
T  8086297 tatagatctattttgctagattttatgcaattttatgtaggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccg-aaaat 8086395  T
Q  379 ttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttt 426  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||| | ||||||    
T  8086396 ttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 8086443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 279 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 32540684 - 32540528
Alignment:
Q  279 tatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaat 378  Q
    ||||| ||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||  || |||| | ||||| ||| |||||||||||||    
T  32540684 tataggtctattttacgagattttatacaattttgtgtcggttttaggtttcggtttatccaaatatccacaaagtggtgtaatggcccacccgaaaaat 32540585  T
Q  379 ttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagtt 435  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| || ||||||| ||||    
T  32540584 ttaaataattcaattatatgtctattttgagagactttaaacaaattttcaacagtt 32540528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 160 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 9246997 - 9246863
Alignment:
Q  160 aaggattataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccg 259  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| || | ||||||||||   |||||||| |||||||||||| ||    
T  9246997 aaggattatagatctattttgcgagattttatacaattttgtatcggttttaggtttcggcttatccaaattctcacaaagtggtgtagtggcccactcg 9246898  T
Q  260 -aaaatttaaataattcaattatagatctattttg 293  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9246897 aaaaatttaaataattcaattataggtctattttg 9246863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 164 - 312
Target Start/End: Original strand, 8086408 - 8086557
Alignment:
Q  164 attataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccg-aaa 262  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | | ||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| || |||    
T  8086408 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacacgaaaa 8086507  T
Q  263 atttaaataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaatttt 312  Q
    ||||||||||||||||||||  | || |||| |||| |||| ||||||||    
T  8086508 atttaaataattcaattataagtttaatttgcgagactttaaacaatttt 8086557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 290 - 430
Target Start/End: Original strand, 21852079 - 21852219
Alignment:
Q  290 tttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattc 389  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| | ||||||||||||   | ||| | ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  21852079 tttgcgagattttatacaattttgtgtccgttttagatttcgattgatccaaatttttgtaaagtggtgtagtggcccatccgaaaaatttaaattattc 21852178  T
Q  390 aattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaa 430  Q
    ||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||||||    
T  21852179 aattataggtctattttgcgagtctttaaacaatttttcaa 21852219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 166 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 32540684 - 32540541
Alignment:
Q  166 tataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccg-aaaat 264  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||||| |||| |||| ||||||||  |  |||||||| ||| ||||||||||| |||||    
T  32540684 tataggtctattttacgagattttatacaattttgtgtcggttttaggtttcggtttatccaaatatccacaaagtggtgtaatggcccacccgaaaaat 32540585  T
Q  265 ttaaataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaa 308  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||| ||||    
T  32540584 ttaaataattcaattatatgtctattttgagagactttaaacaa 32540541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 277 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 29056025 - 29055876
Alignment:
Q  277 attatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaa 376  Q
    ||||| ||| ||||||| |||||||  ||||||||| ||||| |||||| ||| || | ||||||||| | ||||| | ||||| ||| ||| || ||||    
T  29056025 attattgatttattttgcgagatttg-tacaattttgtgtcgattttagatttcggcttatccaaatttctgcaaagtggtgtattggcccaaccaaaaa 29055927  T
Q  377 atttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataattttt 427  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||    
T  29055926 atttaaataattcaattataggtctattttgcgagactttaaatatttttt 29055876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 285 - 427
Target Start/End: Original strand, 46601075 - 46601217
Alignment:
Q  285 tctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaatttaaat 384  Q
    |||||||||||| |  |||||||| ||| ||||||||||||  ||  |||| || ||||||||||||| | ||| ||||| ||| |||||||||||||||    
T  46601075 tctattttgtgaaagattatacaactttgtgtcggttttagaattcagttggtctaaattcccgcaaagtggtgcagtggcccatccgaaaaatttaaat 46601174  T
Q  385 aattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataattttt 427  Q
    ||||||||||||  |||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  46601175 aattcaattataaatctattttgcgagactttaaacaattttt 46601217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 164 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 49001575 - 49001425
Alignment:
Q  164 attataagtctattttgcgaga--ttttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaa 261  Q
    |||||| || ||||||||||||  |||||| ||||||| | | |||| || |||| | |||||||||||||| | ||||||| ||||||| ||| |||||    
T  49001575 attataggtatattttgcgagagattttatacaattttatgtcggttctaggtttag-ttgatccaaattcccgtaaagtggtgtagtggtccatccgaa 49001477  T
Q  262 aa-tttaaataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaatttt 312  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  49001476 aaatttaaataattcaattatagatctattttgcgagactttaaacaatttt 49001425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 332 - 427
Target Start/End: Original strand, 25030372 - 25030467
Alignment:
Q  332 gttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataattttt 427  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||| || || |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||  ||||||||||||||||||    
T  25030372 gttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggttcaaccaaaaaatttaaataatttaattatagatctattttggaagactttaaataattttt 25030467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 177 - 312
Target Start/End: Original strand, 21852079 - 21852215
Alignment:
Q  177 tttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccg-aaaatttaaataattc 275  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |  ||||||  ||| | ||||||||||||  || ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  21852079 tttgcgagattttatacaattttgtgtccgttttagatttcgattgatccaaatttttgtaaagtggtgtagtggcccatccgaaaaatttaaattattc 21852178  T
Q  276 aattatagatctattttgtgagattttatacaatttt 312  Q
    |||||||| ||||||||| |||  |||| ||||||||    
T  21852179 aattataggtctattttgcgagtctttaaacaatttt 21852215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 205 - 312
Target Start/End: Original strand, 37343093 - 37343201
Alignment:
Q  205 ggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccg-aaaatttaaataattcaattatagatctattttgtgagatttta 303  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| | |||| |||| |||| ||||    
T  37343093 ggttttaagtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattattggtctaatttgcgagacttta 37343192  T
Q  304 tacaatttt 312  Q
     ||||||||    
T  37343193 aacaatttt 37343201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 227 - 312
Target Start/End: Original strand, 46601130 - 46601216
Alignment:
Q  227 aaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaa-tttaaataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaatttt 312  Q
    ||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  46601130 aaattcccgcaaagtggtgcagtggcccatccgaaaaatttaaataattcaattataaatctattttgcgagactttaaacaatttt 46601216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 174 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 29056015 - 29055886
Alignment:
Q  174 tattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaa-tttaaataa 272  Q
    |||||||||||||||  | ||||||||| | | |||||  ||| || | ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| || |||| |||||||||    
T  29056015 tattttgcgagatttg-tacaattttgtgtcgattttagatttcggcttatccaaatttctgcaaagtggtgtattggcccaaccaaaaaatttaaataa 29055917  T
Q  273 ttcaattatagatctattttgtgagatttta 303  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||| ||||    
T  29055916 ttcaattataggtctattttgcgagacttta 29055886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 219 - 293
Target Start/End: Original strand, 25030372 - 25030447
Alignment:
Q  219 gttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaa-tttaaataattcaattatagatctattttg 293  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||  || || |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25030372 gttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggttcaaccaaaaaatttaaataatttaattatagatctattttg 25030447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 100 - 140
Target Start/End: Original strand, 37343027 - 37343067
Alignment:
Q  100 gtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccac 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37343027 gtggcggagcccttcatgggctggggtcggccacggcccac 37343067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 46224918 - 46224874
Alignment:
Q  99 agtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccg 143  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  46224918 agtggcggagcccttcatgggttggggtgggccacggtccacccg 46224874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 17880020 - 17879974
Alignment:
Q  97 gcagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccg 143  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17880020 gcaggggcagagcccttcatgggctggggtgggtcacggcccacccg 17879974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 98 - 131
Target Start/End: Original strand, 45836854 - 45836887
Alignment:
Q  98 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggcc 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45836854 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggcc 45836887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 100 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 43532514 - 43532475
Alignment:
Q  100 gtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggccca 139  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  43532514 gtggcggagccctccatgggttggggtgggccacggccca 43532475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 9247058 - 9247013
Alignment:
Q  98 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccg 143  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  9247058 cagtggtggagcccttcatgggctgaggtgggccacaacccacccg 9247013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 257; Significance: 1e-143; HSPs: 51)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 97 - 459
Target Start/End: Original strand, 3631257 - 3631619
Alignment:
Q  97 gcagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccgnnnnnnnnnnnnnntcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaat 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3631257 gcagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggaaaaattaaaaaatcaacgattataggtctattttgcgagattttatgcaat 3631356  T
Q  197 tttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtga 296  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  3631357 tttgtgttggttttatgttttagttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcga 3631456  T
Q  297 gattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattata 396  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3631457 gattttatacaattttatgtcgattttaagttttggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattata 3631556  T
Q  397 ggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacat 459  Q
     |||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3631557 tgtctaatttgcgggactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggtccaccctgacat 3631619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 98 - 459
Target Start/End: Original strand, 30772878 - 30773239
Alignment:
Q  98 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccgnnnnnnnnnnnnnntcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaatt 197  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||              |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  30772878 cagtggcggagcccttcatgggttggggtgggccacggctcacccgaaaaaattaaaaaatcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaatt 30772977  T
Q  198 ttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtgag 297  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  30772978 ttgtatcggttttatgttttggttgattcaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccaaaaatttaaataattcaattatagatctattttgcgag 30773077  T
Q  298 attttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattatag 397  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30773078 attttatacaattttatgtcgattttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattatag 30773177  T
Q  398 gtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacat 459  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30773178 gtctaatttgtgagactttaaacaatttttcagtagttaattttagtggcccaccctaacat 30773239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 98 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 26525388 - 26525027
Alignment:
Q  98 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccgnnnnnnnnnnnnnntcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaatt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              |||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  26525388 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggaaaaataaaaaaatcaacgattataggtctattttgcgagattttttgcaatt 26525289  T
Q  198 ttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtgag 297  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  26525288 ttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccatccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgag 26525189  T
Q  298 attttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattatag 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26525188 attttatacaattttatgtcggtttaaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattatag 26525089  T
Q  398 gtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacat 459  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26525088 gtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaataattaattttagtggcccaccctgacat 26525027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 101 - 456
Target Start/End: Original strand, 16823133 - 16823488
Alignment:
Q  101 tggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccgnnnnnnnnnnnnnntcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaattttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||              |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16823133 tggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccatccggaaaaattaaaaaatcaacgattataggtctattttgcgagattttatgcaattttg 16823232  T
Q  201 tattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtgagatt 300  Q
    | | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16823233 tgtcggttttatgttttggttgatctaaattcctgcaaagtggtgtagtgacccacccgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgcgagatt 16823332  T
Q  301 ttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtc 400  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16823333 ttatatgattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtc 16823432  T
Q  401 taatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctga 456  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16823433 taatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggtccaccctga 16823488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 158 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 7440579 - 7440278
Alignment:
Q  158 tcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacc 257  Q
    |||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7440579 tcaacgattatagatctattttgcgagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacc 7440480  T
Q  258 cgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagt 357  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  7440479 cgaaaatttaaataattcaactataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcctgcaaattggt 7440380  T
Q  358 gtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgac 457  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7440379 gtagtggcccacccgaaaattttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgac 7440280  T
Q  458 at 459  Q
    ||    
T  7440279 at 7440278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 100 - 450
Target Start/End: Original strand, 43348635 - 43348985
Alignment:
Q  100 gtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccgnnnnnnnnnnnnnntcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaatttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||              | || ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  43348635 gtggcggagcccttcatgggctggggcgggccacggcccacccggaaaaattaaaaaattaacgattataggtttattttgcgagattttatgcaatttt 43348734  T
Q  200 gtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtgagat 299  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  43348735 gtgttggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccaaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagat 43348834  T
Q  300 tttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggt 399  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43348835 tttatacgattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattataggt 43348934  T
Q  400 ctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggccca 450  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43348935 ctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggccca 43348985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 98 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 25701579 - 25701219
Alignment:
Q  98 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccgnnnnnnnnnnnnnntcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaatt 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||              |||| |||||||  |||||||||| |||||||||| ||||    
T  25701579 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccatccggaaaaattaaaaaatcaacgattatagatctattttgcaagattttatgtaatt 25701480  T
Q  198 ttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtgag 297  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  25701479 ttgtatcggttttatgttttggttgatctaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgag 25701380  T
Q  298 attttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattatag 397  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25701379 attttatacaattt-atgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccacaaattggtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattatag 25701281  T
Q  398 gtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacat 459  Q
    ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25701280 gtctaattttttagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacat 25701219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 99 - 459
Target Start/End: Original strand, 43358410 - 43358770
Alignment:
Q  99 agtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccgnnnnnnnnnnnnnntcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaattt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||              |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43358410 agtggcggagcccttcatgggctgaggtgggccacggcccacccggaaaaatgaaaaaatcaacgattataggtctattttgcgagattttatgcaattt 43358509  T
Q  199 tgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtgaga 298  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||    
T  43358510 tgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtagtgtagtgacccacccgaaaatttaaataattcaattataggtttattttgcgaga 43358609  T
Q  299 ttttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattatagg 398  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  43358610 ttttatacaattttatgtctgttttaggttacggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccaaaaaatttaaataattcaattatagg 43358709  T
Q  399 tctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacat 459  Q
    ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  43358710 tctaatttgcgagactttaaacaacttttcaatagttaattttagtgacccatcctgacat 43358770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 98 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 13013413 - 13013052
Alignment:
Q  98 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccgnnnnnnnnnnnnnntcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaatt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              |||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  13013413 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggaaaaattaaaaaatcaacgattataggtctaatttgcgagattttaagcaatt 13013314  T
Q  198 ttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtgag 297  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||  || |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13013313 ttgtatcagttttatgttttggttgatccaaatttctacaaaaaggtgtagtgtcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgtgag 13013214  T
Q  298 attttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattatag 397  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13013213 attttatacaaatttatgtcggttttaggtatcggttgatccaaatttccgcaaattggtatagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattatag 13013114  T
Q  398 gtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacat 459  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13013113 gtttaatttgtgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggtccaccctgacat 13013052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 102 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 9596320 - 9595963
Alignment:
Q  102 ggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccgnnnnnnnnnnnnnntcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaattttgt 201  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||               |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9596320 ggcggagcccttcaaaggctggggtgggccacggcccacccaaaaaaattaaaaaatcaacgattatatgtctattttgcgagattttatgcaattttgt 9596221  T
Q  202 attggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtgagattt 301  Q
     | |||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9596220 gtcggttttatattttagttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggcccacccaaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtgagattt 9596121  T
Q  302 tatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtct 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9596120 tatacaattttatgtcggttttaggtttgtgttgattcaaattcctgcaaattggtgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattatagatct 9596021  T
Q  402 aatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacat 459  Q
    |||||  ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  9596020 aatttacgagactttaaacaattttttaatagttaattttagtggcctatcctgacat 9595963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 158 - 459
Target Start/End: Original strand, 10925568 - 10925869
Alignment:
Q  158 tcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacc 257  Q
    |||| ||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  10925568 tcaacgattatatgtctaatttgcgagattttatgtaattttgtatcggttttatgttttagttgattcaaattcctacaaagtggtgtagtggtccacc 10925667  T
Q  258 cgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagt 357  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||| ||    
T  10925668 tgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaaatttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattttggcaaattggt 10925767  T
Q  358 gtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgac 457  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  10925768 gtagtggtctaccagaaaaatttaaataattcaattataggtctaacttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtgacccaccctaac 10925867  T
Q  458 at 459  Q
    ||    
T  10925868 at 10925869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 158 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 13084741 - 13084440
Alignment:
Q  158 tcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacc 257  Q
    |||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| || ||||  || | |||| ||||||    
T  13084741 tcaacgattataggtctaatttgcgagattttatgcaattttgtatcgattttatgttttggttgatccaaatttctacaaaaaggtgcagtgtcccacc 13084642  T
Q  258 cgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagt 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||| ||    
T  13084641 cgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgtgagattttatacaaatttatgtcggttttaggtatcagttgatccaaatttccgcaaattggt 13084542  T
Q  358 gtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgac 457  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13084541 atagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtttaatttgtgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggtccaccctgac 13084442  T
Q  458 at 459  Q
    ||    
T  13084441 at 13084440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 158 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 32304751 - 32304464
Alignment:
Q  158 tcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacc 257  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  32304751 tcaacgattataagtctattttacgagattttatgcaattttgtgtcggttttatattttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtattggcccacc 32304652  T
Q  258 cgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagt 357  Q
    | |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||    
T  32304651 caaaaattgaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccggaaattggt 32304552  T
Q  358 gtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtg 445  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  32304551 gtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattataagtttaatttgcgagactttaaacattttttcaatagttaattttagtg 32304464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 98 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 8074398 - 8074036
Alignment:
Q  98 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccgnnnnnnnnnnnnnn-tcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaat 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |               |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  8074398 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacctggaaaattttaaaaaatcaacgattataggtctattttgcgagattttatacaat 8074299  T
Q  197 tttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtga 296  Q
    ||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  8074298 tttgtgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaagtagtgtagtggtccacccaaaaatttaaataattcaattataaatctattttgcga 8074199  T
Q  297 gattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattata 396  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8074198 gattttatacaatttaatgtcggttttaggtttcggttgattcaaattcccgcaaagtggtgtagtggcccatccgaaaaatttaaataattcaattata 8074099  T
Q  397 ggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacat 459  Q
    |||||| |||| ||| ||||||| ||||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  8074098 ggtctattttgcgaggctttaaacaattttttaacggttaattttagtggcccaccctaacat 8074036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 98 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 41084738 - 41084386
Alignment:
Q  98 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccgnnnnnnnnnnnnnntcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaatt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||              |||| ||||||| |||||||||||||||||||||  ||||    
T  41084738 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggcc--ggtccacccggaaaaattaaaaaatcaacgattataggtctattttgcgagattttatagaatt 41084641  T
Q  198 ttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaa-tttaaataattcaattatagatctattttgtga 296  Q
    |||| | | ||||| |||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||  ||    
T  41084640 ttgtgtcgattttaggttttgattgatccaaatttccgcaaagtggtgtagtggcccatccaaaaaatttaaataattcaattataggtctattttc-ga 41084542  T
Q  297 gattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattata 396  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| | ||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  41084541 gattttatacatttttatgtcggttttaggtttcggttaattcaaattcccgcaaagtggtgtagtagtccaccggaaaaatttaaacaattcaattata 41084442  T
Q  397 ggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccacc 452  Q
    |||||| |||| ||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  41084441 ggtctattttgcgaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagtggcccacc 41084386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 158 - 444
Target Start/End: Original strand, 15374174 - 15374445
Alignment:
Q  158 tcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacc 257  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| ||| |||||    
T  15374174 tcaacgattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatcgaaattcttgcaaagtggtgtaatggtccacc 15374273  T
Q  258 cgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagt 357  Q
    |  ||||||||||||||||||||||           ||    |||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  15374274 cacaaatttaaataattcaattata-----------tg----tttatacagttttatatcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggt 15374358  T
Q  358 gtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagt 444  Q
    ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15374359 gtagtggcccaactgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagt 15374445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 237 - 459
Target Start/End: Original strand, 26784968 - 26785190
Alignment:
Q  237 aaagtggcgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttga 336  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  26784968 aaagtggtgtagtggcccacccaaaaattgaaataattcaactataggtctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcagttga 26785067  T
Q  337 tccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagtta 436  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  26785068 tccaaattcccgcaaattggtgtagtggctcactcgaaaagtttaaataattcaattataggtcttttttgcgagactttaaacaatttttcaatggtta 26785167  T
Q  437 attttagtggcccaccctgacat 459  Q
    |||||||||||||||||| ||||    
T  26785168 attttagtggcccaccctaacat 26785190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 98 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 26297167 - 26296811
Alignment:
Q  98 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccgnnnnnnnnnnnnnntcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaatt 197  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||              ||||  |||||| ||||||||||| |||| ||||  ||||    
T  26297167 cagtggcggagcccttcatgagctgggatgggccacggtccacccgaaaaaattaaaaaatcaacaattataggtctattttgcaagatcttatataatt 26297068  T
Q  198 ttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaa-atttaaataattcaattatagatctattttgtga 296  Q
    |||| | ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||  |||||||  ||    
T  26297067 ttgtgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggcccatccaaaatatttaaataattcaattataggcctattttc-ga 26296969  T
Q  297 gattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattata 396  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  26296968 gattttatacatttttatgtcggttttagatttcggttgattcaaattcccgcaaagtggtgtagtagtccacccgaaaaatgtaaacaattcaattata 26296869  T
Q  397 ggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccct 454  Q
    | |||| |||| ||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||  |||||||||    
T  26296868 gatctattttgcgaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagcagcccaccct 26296811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 98 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 9737865 - 9737651
Alignment:
Q  98 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccgnnnnnnnnnnnnnntcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaatt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              | || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9737865 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggaaaaattaaaaaattaacgattataggtctattttgcgagattttatgcaatt 9737766  T
Q  198 ttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtgag 297  Q
    |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||    
T  9737765 ttgtgtcggttttatgtttttgttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgag 9737666  T
Q  298 attttatacaatttt 312  Q
    | |||| ||||||||    
T  9737665 actttaaacaatttt 9737651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 277 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 9737799 - 9737621
Alignment:
Q  277 attatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaa 376  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||    
T  9737799 attataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgtttttgttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaa 9737700  T
Q  377 atttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctga 456  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9737699 -tttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctga 9737621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 275 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 20656952 - 20656768
Alignment:
Q  275 caattatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaa 374  Q
    ||||||||| |||| |||  |||||||||| ||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  20656952 caattataggtctaatttacgagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaatttccgcaaattggtgtagtggtccatccgaa 20656853  T
Q  375 aaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacat 459  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||    
T  20656852 aaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgaaactttaaacaatttttcaatagttaattttagtgatccaccctaacat 20656768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 103 - 298
Target Start/End: Original strand, 29390273 - 29390468
Alignment:
Q  103 gcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccgnnnnnnnnnnnnnntcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaattttgta 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |              |||| ||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||     
T  29390273 gcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacctggaaaaattaaaaaatcaacgattataggtgtattttacgagattttatgcaattttgtg 29390372  T
Q  203 ttggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtgaga 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  29390373 ttggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattatagatctaatttgcgaga 29390468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 187 - 459
Target Start/End: Original strand, 15374301 - 15374587
Alignment:
Q  187 tttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaa-tttaaataattcaattatagat 285  Q
    ||||| || |||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| |    
T  15374301 tttatacagttttatatcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccaactgaaaaatttaaataattcaattataggt 15374400  T
Q  286 ctattttgtgagattttatacaatttta-----------tgtcg--gttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccg 372  Q
    ||| |||| |||| |||| ||||||||            | | |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| | |    
T  15374401 ctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtagttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtgacccaactg 15374500  T
Q  373 aaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacat 459  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  15374501 aaaaatttaaataattcaattataggtctaatttacgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtgatccaccctgacat 15374587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 277 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 19577273 - 19577120
Alignment:
Q  277 attatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaa 376  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||    
T  19577273 attatagatctattttgcaacattttatacaattttgtgtcggttctagattttggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggcccactcgaaaa 19577174  T
Q  377 atttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaa 430  Q
    |||||||||||| ||||||||||||  |||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  19577173 atttaaataatttaattataggtctgttttgcgagacattaaacaatttttcaa 19577120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 287 - 446
Target Start/End: Original strand, 20487047 - 20487206
Alignment:
Q  287 tattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataa 386  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||| | |||||||||  || |||||||||||||| ||    
T  20487047 tattttgcaagattttatacaattttgtgtcggttttaggtttcggctgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggctcatccgaaaaatttaaaaaa 20487146  T
Q  387 ttcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtgg 446  Q
    |||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||    
T  20487147 ttcaattataagtctattttgcgagactttaaacaatttttcaaccgttaattttagtgg 20487206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 280 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 37042643 - 37042496
Alignment:
Q  280 atagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccga-aaaat 378  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| | | ||| ||| |||||||| ||||     
T  37042643 atagatctattttgcgagattttatacaattttatatcggttttagatttcggttgattcaaattcccgcaaagtggcgtattggcccacccgaaaaaaa 37042544  T
Q  379 ttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttt 426  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37042543 ttaaataattcaactataggtctattttgtgagactttaaataatttt 37042496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 164 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 20656950 - 20656801
Alignment:
Q  164 attataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccg-aaa 262  Q
    |||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||| ||| ||| |||    
T  20656950 attataggtctaatttacgagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaatttccgcaaattggtgtagtggtccatccgaaaa 20656851  T
Q  263 atttaaataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaatttt 312  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | |||| ||||||||    
T  20656850 atttaaataattcaattataggtctaatttgtgaaactttaaacaatttt 20656801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 277 - 416
Target Start/End: Original strand, 29390334 - 29390472
Alignment:
Q  277 attatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaa 376  Q
    ||||||| | ||||||  |||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||| |||    
T  29390334 attataggtgtattttacgagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccg-aaa 29390432  T
Q  377 atttaaataattcaattataggtctaatttgtgagacttt 416  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  29390433 atttaaataattcaattatagatctaatttgcgagacttt 29390472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 295 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 22579009 - 22578874
Alignment:
Q  295 gagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaatta 394  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||  ||| | |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  22579009 gagattttgtacaattttgtgtcggttttaggtttcggctgatccaaattcccataaagtggtgtagtggttcatccgaaaaatttaaataattcaatta 22578910  T
Q  395 taggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaa 430  Q
    ||  |||| |||  ||||||||||| ||||||||||    
T  22578909 taaatctattttacgagactttaaacaatttttcaa 22578874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 172 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 37042638 - 37042496
Alignment:
Q  172 tctattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccg--aaaatttaaa 269  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||  ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||    
T  37042638 tctattttgcgagattttatacaattttatatcggttttagatttcggttgattcaaattcccgcaaagtggcgtattggcccacccgaaaaaaattaaa 37042539  T
Q  270 taattcaattatagatctattttgtgagattttatacaatttt 312  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||    
T  37042538 taattcaactataggtctattttgtgagactttaaataatttt 37042496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 285 - 436
Target Start/End: Original strand, 41817526 - 41817677
Alignment:
Q  285 tctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaatttaaat 384  Q
    |||| |||| || ||||||||||||||  |||| ||||||| |||||||||||||||||| | ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41817526 tctactttgcgatattttatacaatttagtgtcagttttagattttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaaatttaaat 41817625  T
Q  385 aattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagtta 436  Q
    ||||||||| ||||| || |||  ||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  41817626 aattcaattgtaggtatattttacgagtctttaaacaatttttcaatggtta 41817677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 158 - 278
Target Start/End: Original strand, 5844165 - 5844285
Alignment:
Q  158 tcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacc 257  Q
    |||| ||||||| ||||||||| | |||||||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| || ||||||||||    
T  5844165 tcaacgattataggtctattttactagattttatgcaatttggtgtcgattttatgttttggttgatccaaattattgcaaaatggtgtggtggcccacc 5844264  T
Q  258 cgaaaatttaaataattcaat 278  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  5844265 cgaaaatttaaataattcaat 5844285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 174 - 312
Target Start/End: Original strand, 20487047 - 20487186
Alignment:
Q  174 tattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccg-aaaatttaaataa 272  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||| | ||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||| ||    
T  20487047 tattttgcaagattttatacaattttgtgtcggttttaggtttcggctgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggctcatccgaaaaatttaaaaaa 20487146  T
Q  273 ttcaattatagatctattttgtgagattttatacaatttt 312  Q
    ||||||||||  ||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  20487147 ttcaattataagtctattttgcgagactttaaacaatttt 20487186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 97 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 19577339 - 19577124
Alignment:
Q  97 gcagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccgnnnnnnnnnnnnnntcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaat 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||              | || |||||||  |||||||||| | ||||||| ||||    
T  19577339 gcagtggcggagcccttcatgggctaaggtgggccacggcccacccggaaaaataaaaaatt-aacgattatagatctattttgcaacattttatacaat 19577241  T
Q  197 tttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccg-aaaatttaaataattcaattatagatctattttgtg 295  Q
    ||||| | |||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |    
T  19577240 tttgtgtcggttctagattttggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggcccactcgaaaaatttaaataatttaattataggtctgttttgcg 19577141  T
Q  296 agattttatacaatttt 312  Q
    |||  ||| ||||||||    
T  19577140 agacattaaacaatttt 19577124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 166 - 312
Target Start/End: Original strand, 26785010 - 26785157
Alignment:
Q  166 tataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaa-t 264  Q
    |||| |||||||||| |||||||||| ||||||| | | ||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| ||| |||||| |    
T  26785010 tataggtctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggctcactcgaaaagt 26785109  T
Q  265 ttaaataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaatttt 312  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||| |||| ||||||||    
T  26785110 ttaaataattcaattataggtcttttttgcgagactttaaacaatttt 26785157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 171 - 292
Target Start/End: Original strand, 41817525 - 41817647
Alignment:
Q  171 gtctattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccg-aaaatttaaa 269  Q
    ||||| ||||||| ||||||| |||||| || |  ||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  41817525 gtctactttgcgatattttatacaatttagtgtcagttttagattttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaaatttaaa 41817624  T
Q  270 taattcaattatagatctatttt 292  Q
    |||||||||| ||| | ||||||    
T  41817625 taattcaattgtaggtatatttt 41817647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 277 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 20071306 - 20071186
Alignment:
Q  277 attatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaa 376  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||| ||  ||| | ||||||||||||| |||||      
T  20071306 attaaagatttattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaaatttcggttgattcaaatttccataaagtggtgtagtggtccatccgaatt 20071207  T
Q  377 atttaaataattcaattatag 397  Q
     ||| ||||||||||||||||    
T  20071206 tttttaataattcaattatag 20071186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 280 - 436
Target Start/End: Original strand, 28662185 - 28662341
Alignment:
Q  280 atagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaatt 379  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||| |||  |||||| |||| || ||| |||||||   ||||| | ||||| |||| |  ||||||||||    
T  28662185 atagatctattttacgagattttatacaattttgtgttagttttaagtttcggctgaaccaaatttgtgcaaactggtgtattggttcctccgaaaaatt 28662284  T
Q  380 taaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagtta 436  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||| | |||||||| |||||    
T  28662285 taaataattcaattataggtttattttgcaagactttaaacattttttcaacagtta 28662341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 167 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 22579024 - 22578878
Alignment:
Q  167 ataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaa-tt 265  Q
    |||||| |||||| ||||||||| | ||||||||| | ||||||| |||| || |||||||||||||   ||||||| |||||||  || ||||||| ||    
T  22579024 ataagtttattttacgagattttgtacaattttgtgtcggttttaggtttcggctgatccaaattcccataaagtggtgtagtggttcatccgaaaaatt 22578925  T
Q  266 taaataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaatttt 312  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||  |||| |||| ||||||||    
T  22578924 taaataattcaattataaatctattttacgagactttaaacaatttt 22578878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 277 - 392
Target Start/End: Original strand, 5844171 - 5844285
Alignment:
Q  277 attatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaa 376  Q
    ||||||| ||||||||   ||||||||| ||||||  ||||| ||||| |||||||||||||||||||   ||||| | |||| |||| ||||||| |||    
T  5844171 attataggtctattttactagattttatgcaatttggtgtcgattttatgttttggttgatccaaattattgcaaaatggtgtggtggcccacccg-aaa 5844269  T
Q  377 atttaaataattcaat 392  Q
    ||||||||||||||||    
T  5844270 atttaaataattcaat 5844285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Original strand, 28662117 - 28662161
Alignment:
Q  99 agtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccg 143  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28662117 agtggcggagccctttatgggctggggtgggccacggcccacccg 28662161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 143
Target Start/End: Original strand, 26784909 - 26784956
Alignment:
Q  96 tgcagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccg 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  26784909 tgcagtggcggagcccttcatgggcttaggtgggccacggcccacccg 26784956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 172 - 293
Target Start/End: Original strand, 28662190 - 28662312
Alignment:
Q  172 tctattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtgg-cccacccgaaaatttaaat 270  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||| |||| || ||| |||||||  |||||| ||| ||| |||  || ||  |||||||||||    
T  28662190 tctattttacgagattttatacaattttgtgttagttttaagtttcggctgaaccaaatttgtgcaaactggtgtattggttcctccgaaaaatttaaat 28662289  T
Q  271 aattcaattatagatctattttg 293  Q
    ||||||||||||| | |||||||    
T  28662290 aattcaattataggtttattttg 28662312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 106 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 6229109 - 6229072
Alignment:
Q  106 gagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccg 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6229109 gagcccttcatgggctggggtgggccacagcccacccg 6229072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 277 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 30050184 - 30050074
Alignment:
Q  277 attatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaa 376  Q
    ||||||| ||||||||  || ||||||||||||||| ||||  |||| ||||  ||||||| ||||||  || ||| | ||||||||| ||| || ||||    
T  30050184 attataggtctattttacgatattttatacaattttgtgtcaatttttggttacggttgattcaaattttcgtaaagtggtgtagtgg-ccaacctaaaa 30050086  T
Q  377 atttaaataatt 388  Q
    ||||||||||||    
T  30050085 atttaaataatt 30050074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 277 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 30062781 - 30062714
Alignment:
Q  277 attatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaatt 344  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||  ||||| |||||| ||||||    
T  30062781 attataggtctattttatgatattttatacaactttgtgtcggtttttagttttagttgattcaaatt 30062714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 102 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 20071367 - 20071329
Alignment:
Q  102 ggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccac 140  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  20071367 ggcggagcccttcatgggctagggtgggtcacggcccac 20071329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 97 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 20657017 - 20656977
Alignment:
Q  97 gcagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcc 137  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||    
T  20657017 gcagtggcggagcctttcataggctggggtgggccatggcc 20656977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 237 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 26683107 - 26683033
Alignment:
Q  237 aaagtggcgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaa--ttatagatctattttgtgagattttatacaatt 310  Q
    ||||||| | ||||||||||| ||||| ||||| |||| ||  |||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  26683107 aaagtggtgcagtggcccacc-gaaaaattaaaaaattaaaaattataggtctattttgtgagattttaaacaatt 26683033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 248 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 26683212 - 26683145
Alignment:
Q  248 gtggcccacccg-aaaatttaaataatt--caattatagatctattttgtgagattttatacaatttt 312  Q
    |||||||||||| |||| ||||| ||||  ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||    
T  26683212 gtggcccacccggaaaaattaaaaaattaacaattataggtttattttgtgagattttaaacaatttt 26683145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 280 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 36244274 - 36244242
Alignment:
Q  280 atagatctattttgtgagattttatacaatttt 312  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  36244274 atagatctattttgtgagattttaaacaatttt 36244242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 256; Significance: 1e-142; HSPs: 66)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 98 - 459
Target Start/End: Original strand, 16925106 - 16925466
Alignment:
Q  98 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccgnnnnnnnnnnnnnntcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaatt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||              |||| ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||    
T  16925106 cagtggcggagcccttcatgggc-ggggtgggccacggtccacccggaaaaattaaaaaatcaacgattataggtctaatttgcgagactttatgcaatt 16925204  T
Q  198 ttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtgag 297  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16925205 ttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctacaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgtgag 16925304  T
Q  298 attttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattatag 397  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16925305 attttatacaaatttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaatttccgcaaattggtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattatag 16925404  T
Q  398 gtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacat 459  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16925405 gtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacat 16925466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 98 - 459
Target Start/End: Original strand, 44134493 - 44134853
Alignment:
Q  98 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccgnnnnnnnnnnnnnntcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaatt 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||              |||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  44134493 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggtccacccggaaaaattaaaaaatcaacgattataggtctattttgtgagattttatgcaatt 44134592  T
Q  198 ttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtgag 297  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  44134593 tt-tattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtgatccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgag 44134691  T
Q  298 attttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattatag 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  44134692 attttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggcccacctgaaaaatttaaataattcaattatag 44134791  T
Q  398 gtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacat 459  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  44134792 gtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttaatggcccaccctaacat 44134853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 98 - 459
Target Start/End: Original strand, 13233229 - 13233590
Alignment:
Q  98 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccgnnnnnnnnnnnnnntcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaatt 197  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||              |||| |||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  13233229 cagtggcggagtccttcataggctggggtgggccacggcccacccggaaaaattaaaaaatcaacgattatagatctattttgcgatattttatgcaatt 13233328  T
Q  198 ttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtgag 297  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  13233329 ttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccaaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgag 13233428  T
Q  298 attttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattatag 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13233429 attttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaatcggtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattatag 13233528  T
Q  398 gtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacat 459  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  13233529 atctaatttgtgagactttaaacaatttttcaataattaattttagtggcccaccctaacat 13233590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 101 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 38141714 - 38141355
Alignment:
Q  101 tggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccgnnnnnnnnnnnnnn-tcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaatttt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||               |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38141714 tggcggagcccttcatgggctggggagggccacggcccacccggaaaaattaaaaaaatcaacgattataggtctattttgcgagattttatgcaatttt 38141615  T
Q  200 gtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtgagat 299  Q
    ||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  38141614 gtatcaattttatgtttttgttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgtgagat 38141515  T
Q  300 tttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggt 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38141514 tttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccaaccgaaaaatttaaataattcaattataggt 38141415  T
Q  400 ctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacat 459  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38141414 ctaatttgcgatactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcctaccctgacat 38141355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 98 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 11651125 - 11650764
Alignment:
Q  98 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccgnnnnnnnnnnnnnntcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaatt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||              |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11651125 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccgcccggaaaaattaaaaaatcaacgattataggtctattttgcgagattttatgcaatt 11651026  T
Q  198 ttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtgag 297  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||    
T  11651025 ttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcatgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataattcaattataggtttattttgggag 11650926  T
Q  298 attttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattatag 397  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11650925 attttatacaattttatgtcgattttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcacacccgaaaaatttaaataattcaattatag 11650826  T
Q  398 gtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacat 459  Q
    |||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11650825 gtctaatttacgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggtccaccctgacat 11650764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 97 - 459
Target Start/End: Original strand, 36584422 - 36584783
Alignment:
Q  97 gcagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccgnnnnnnnnnnnnnntcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaat 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              ||||  |||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  36584422 gcagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggaaaaataaaaaa-tcaataattataggtatattttgcgagattttatgcaat 36584520  T
Q  197 tttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtga 296  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  36584521 tttgtgttagttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcga 36584620  T
Q  297 gattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattata 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36584621 gattttatacaattttatgtcggttttaagttttagttgatccaaattcccgctaattggtgtagtggctcacccgaaaaatttaaatatttcaattata 36584720  T
Q  397 ggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacat 459  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36584721 ggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcctaccctgacat 36584783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 100 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 2655067 - 2654708
Alignment:
Q  100 gtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccgnnnnnnnnnnnnnntcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaatttt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              |||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  2655067 gtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccgaaaaaattaaaaaatcaacgattatagatctagtttgcgagattttatgcaatttt 2654968  T
Q  200 gtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtgagat 299  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  2654967 gtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtgacccatccgaaaatttaaatagttcaattataggtctattttatgagat 2654868  T
Q  300 tttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggt 399  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2654867 tttatacaattttacgtcggttttagatttcggttgatcccaatttccgcaaattggtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggt 2654768  T
Q  400 ctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacat 459  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  2654767 ctaatttgtgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccatcctaacat 2654708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 98 - 459
Target Start/End: Original strand, 6755828 - 6756188
Alignment:
Q  98 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccgnnnnnnnnnnnnnntcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaatt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6755828 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggaaaaattaaaaaatcaacgattataggtctattttgcgagattttatgcaatt 6755927  T
Q  198 ttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtgag 297  Q
    |||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  6755928 ttgtgttgtttttatgtttttgttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgag 6756027  T
Q  298 attttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattatag 397  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6756028 attttatactattttatgtcggttttatgtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtgg-ccacccgaaaaatttaaatgattcaattatag 6756126  T
Q  398 gtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacat 459  Q
    || ||||||| ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  6756127 gtttaatttgcgagactttaaacaattttttaattgttaattttagtggcccaccctaacat 6756188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 98 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 31664322 - 31663965
Alignment:
Q  98 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccgnnnnnnnnnnnnnntcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaatt 197  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||              |||| ||||||| ||    |||||||||||||||||||||    
T  31664322 cagtggcggagcccttcatgggatggggtgggccacggcccacccggaaaaattaaaaaatcaatgattataggt----tttgcgagattttatgcaatt 31664227  T
Q  198 ttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtgag 297  Q
    |||  | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||    
T  31664226 ttgagtcggttttatgatttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcaag 31664127  T
Q  298 attttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattatag 397  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31664126 attttataaaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattatag 31664027  T
Q  398 gtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacat 459  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31664026 gtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacat 31663965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 97 - 459
Target Start/End: Original strand, 18491185 - 18491547
Alignment:
Q  97 gcagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccgnnnnnnnnnnnnnntcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaat 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||              |||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| |||    
T  18491185 gcagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccactcggaaaaattaaaaaatcaacgattataggtctattttgtgagattttatgtaat 18491284  T
Q  197 tttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtga 296  Q
    ||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| ||    
T  18491285 tttatgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtgccccacccgaaaatttaaataatttaactataggtctattttgcga 18491384  T
Q  297 gattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattata 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18491385 gattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattata 18491484  T
Q  397 ggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacat 459  Q
     |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  18491485 agtctaatttgcgagactttaaacaatgtttcaatagttaattttagtgacccaccctaacat 18491547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 158 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 12700667 - 12700366
Alignment:
Q  158 tcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacc 257  Q
    |||| ||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12700667 tcaacgattataggtttattttgcgagactttatgcaattttgtgtcgattttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacc 12700568  T
Q  258 cgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagt 357  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  12700567 cgaaaatttaaatagttaaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcgattttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggt 12700468  T
Q  358 gtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgac 457  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12700467 gtagtggttcatccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgac 12700368  T
Q  458 at 459  Q
    ||    
T  12700367 at 12700366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 107 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 13613241 - 13612890
Alignment:
Q  107 agcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccgnnnnnnnnnnnnnntcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtattgg 206  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||              |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13613241 agcccttcatgggctggg-tgggccacggcccacccggaaaaattaaaaaatcaacgattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgttgg 13613143  T
Q  207 ttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtgagattttatac 306  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  13613142 ttttatattttggttgatccaaattcctacaaagtggtgttgtggcccacccaaaaatttaaataatttaattataggtctattttccgagattttatac 13613043  T
Q  307 aattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaattt 406  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13613042 aattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattatagatctaattt 13612943  T
Q  407 gtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacat 459  Q
      ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13612942 acgagactttaaacaatttttcactagttaattttagtggcccaccctaacat 13612890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 99 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 44745748 - 44745379
Alignment:
Q  99 agtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccgnnnnnnnnnnnnnntcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaattt 198  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||               |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  44745748 agtggcggagcctttaatgggctggggtgggccacggcccatccagaaaaattaaaaaatcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaattt 44745649  T
Q  199 tgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtgaga 298  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||    
T  44745648 tgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgcagtggcccactcgaaaatttaaataattcaattgtaggtctattttgcgaga 44745549  T
Q  299 ttttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattatagg 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||     
T  44745548 ttttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggtccactcaaaaaatttaaataattcaattataga 44745449  T
Q  399 tctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacatattcttcga 468  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| || |||||    
T  44745448 tctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagtttattttagtggtccatcctgacatttttttcga 44745379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 158 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 36955109 - 36954808
Alignment:
Q  158 tcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacc 257  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  36955109 tcaacgattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaattcttgcaaagtggtgtagtggcccacc 36955010  T
Q  258 cgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagt 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| ||    
T  36955009 cgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcgattttacgtttcggttgatccaaatccccgcaaattggt 36954910  T
Q  358 gtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgac 457  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||    
T  36954909 gtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattatgagtctaatttgcgagaatttaaacaatttttcaatagttaatattagtggcccatcctaac 36954810  T
Q  458 at 459  Q
    ||    
T  36954809 at 36954808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 98 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 31581909 - 31581548
Alignment:
Q  98 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccgnnnnnnnnnnnnnntcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaatt 197  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||                ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  31581909 cagtggcgaagcccttcatgggctggggtgggccacggtccaccccgaaaaattaaaaaaacaacgattataggtctattttgctagattttatgcaatt 31581810  T
Q  198 ttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtgag 297  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  31581809 ttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgtaaagtagtgtaatggcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgag 31581710  T
Q  298 attttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattatag 397  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||  || ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31581709 attttatacaattttatgtcgattttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtactggctcatccgaaaaatttaaataactcaattatag 31581610  T
Q  398 gtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacat 459  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31581609 gtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacat 31581548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 158 - 456
Target Start/End: Original strand, 43564477 - 43564775
Alignment:
Q  158 tcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacc 257  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| |    
T  43564477 tcaacgattataggtctattttgcgatattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtgttgtagtgccccatc 43564576  T
Q  258 cgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagt 357  Q
    | |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  43564577 caaaaatttaaataattcaattataagtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggt 43564676  T
Q  358 gtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctga 456  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  43564677 gtagtggaacacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagagtttaaacaatttttcaatagttgattttagtggtccaccctga 43564775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 97 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 40228591 - 40228233
Alignment:
Q  97 gcagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccgnnnnnnnnnnnnnn-tcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaa 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||               |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40228591 gcagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggaaaaatttaaaaaatcaacgattataggtctattttgcgagattttatgcaa 40228492  T
Q  196 ttttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtg 295  Q
    |||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | |    
T  40228491 ttttgtgtcggttttatgctttggttgatccaaattcctgcaaagtgttgtagtggcccactcgaaaatttaaataattcaattgtaggtctatttggcg 40228392  T
Q  296 agattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattat 395  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40228391 agattttatacgattttatgtcagttttaggtttcggttgatccaaattctcgcaaattgttgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattat 40228292  T
Q  396 aggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccct 454  Q
    |||||||||||| |||  |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  40228291 aggtctaatttgcgagtatttaaacaatttttcaatagttaattttagtggtccaccct 40228233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 163 - 459
Target Start/End: Original strand, 41832440 - 41832737
Alignment:
Q  163 gattataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaa 262  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  41832440 gattatatgtctattttgcaagattttatgcaattttatgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccaaaa 41832539  T
Q  263 attt-aaataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtag 361  Q
     ||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  41832540 cttttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatcccaattctcgcaaattggtgtag 41832639  T
Q  362 tggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacat 459  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  41832640 tggcccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgaaactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtggcccatcctaacat 41832737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 98 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 19653803 - 19653446
Alignment:
Q  98 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccgnnnnnnnnnnnnnntcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaatt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |               |||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  19653803 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacaccgaaaaataaaaaaatcaacgattataggtctattttgttagattttatgcaatt 19653704  T
Q  198 ttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtgag 297  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  19653703 ttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgtaaaatagtgtaatggcccacttgaaaatttaaataattcaattataggtctattt-gtgag 19653605  T
Q  298 attttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattatag 397  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||     
T  19653604 attttatacaattttatgtcgattttaggtttcggttgatccaaattcccacaaattggtgtagtggtccatccgaaaaatttaaataactcaattataa 19653505  T
Q  398 gtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctga 456  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19653504 gtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggtccaccctga 19653446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 158 - 459
Target Start/End: Original strand, 52581515 - 52581817
Alignment:
Q  158 tcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacc 257  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| | |||||||| | |||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  52581515 tcaacgattataggtctattttgcaatattttatggagttttgtgtcggtttcatgttttagttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtcgcccatc 52581614  T
Q  258 cgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagt 357  Q
    | |||||||||||||||||||||||  | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| || |||||| ||    
T  52581615 caaaaatttaaataattcaattatatgtttattttacgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggtagatccaaatttccacaaattggt 52581714  T
Q  358 gtagtggt-ccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctga 456  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52581715 gtagtggtcccacccaaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctga 52581814  T
Q  457 cat 459  Q
    |||    
T  52581815 cat 52581817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 176 - 459
Target Start/End: Original strand, 22647189 - 22647471
Alignment:
Q  176 ttttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaatttaaataattc 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | | |||||| |||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22647189 ttttgcgagattttatgcaattttgtgtcg-ttttatatttttgttgatccaaattcatgcaaagtggtgtagtggcccacccaaaaatttaaataattc 22647287  T
Q  276 aattatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaa 375  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| |||||| |||    
T  22647288 aattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtttgttttaggtttcggttgattcaaattcccggaaattggtgtagtggcccacccaaaa 22647387  T
Q  376 aatttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacat 459  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  22647388 aaattaaataattcaattatatgtctaatttgtgagactttaaacaattttttaatggttaatttcagtggcccaccctgacat 22647471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 98 - 454
Target Start/End: Original strand, 27270353 - 27270708
Alignment:
Q  98 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccgnnnnnnnnnnnnnntcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaatt 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||              |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27270353 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacagcccacccggaaaattaaaaaa-tcaatgattataagtctattttgcgagattttatacaatt 27270451  T
Q  198 ttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaa-tttaaataattcaattatagatctattttgtga 296  Q
    |||| | ||||||| |||||| |||||| ||||||| | ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  27270452 ttgtgtcggttttaggttttgattgatcaaaattcccgtaaagtggtgtagtggcccacccaaaaaatttaaataattcaattatagatctattttc-ga 27270550  T
Q  297 gattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattata 396  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27270551 gattttatacatttttatgtcggttttaggtttcggttgattcaaattcccgcaaagtggtgtagtagtccacccgaaaaatttaaacaattcaattata 27270650  T
Q  397 ggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccct 454  Q
    |||||| |||| ||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||||  |||||||    
T  27270651 ggtctattttgcgaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagtgatccaccct 27270708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 158 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 54795828 - 54795532
Alignment:
Q  158 tcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacc 257  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||| | |||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  54795828 tcaacgattataggtctattttgcaagattttatacaattttgtgtcggttttagattttgattgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggcccacc 54795729  T
Q  258 cgaaaa-tttaaataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattag 356  Q
    | |||| |||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |    
T  54795728 caaaaaatttaaataattcaattataggtctattttc-gagattttatacatttttatgtcggttttaggtttcggttgattcaaattcccgcaaagtgg 54795630  T
Q  357 tgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccct 454  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  54795629 tgtagtagtccacccgaaaaatttaaacaattcaattataggtctattttgcgaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagtggcccaccct 54795532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 163 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 4632799 - 4632509
Alignment:
Q  163 gattataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaa 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||  ||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| |||||    
T  4632799 gattataagtctattttgcgagattttatacaattttgtgttagttttagatttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggctcacgcgaaa 4632700  T
Q  263 a-tttaaataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtag 361  Q
    | ||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||||| || |||||||| ||||| |||| || | ||||||    
T  4632699 aatttaaataattcaatcataggtctattttgcgagattatatacaattttgtgtcgattttaggattcggttgatctaaatttccgccaagtggtgtag 4632600  T
Q  362 tggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccacc 452  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  4632599 tggaccacccaaaaaatttaaataattcaattataggtctattttgagagaatttaaacaatttttcaacggttaattttagtggcccacc 4632509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 158 - 450
Target Start/End: Original strand, 50767093 - 50767385
Alignment:
Q  158 tcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacc 257  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | | ||||||| |||||| |||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  50767093 tcaacgattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttgattgatccaaatttccgcaaagtggtgtagtggcccacc 50767192  T
Q  258 cgaaaa-tttaaataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattag 356  Q
    | |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |    
T  50767193 caaaaaatttaattaattcaattataggtctattttc-gagattttatacatttttatgtcggttttaggtttcggttgattcaaattcccgcaaagtgg 50767291  T
Q  357 tgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggccca 450  Q
    |||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| |||  ||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  50767292 tgtagtagtccaccaaaaaaatttaaacaattcaattataggtctattttacgaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagtggccca 50767385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 98 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 44817708 - 44817438
Alignment:
Q  98 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccgnnnnnnnnnnnnnntcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaatt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              |||| || |||| ||||||||| ||| |||||||||||||    
T  44817708 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggaaaaattaaaaaatcaacgactataggtctatttttcgaaattttatgcaatt 44817609  T
Q  198 ttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtgag 297  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| |||||| || |||    
T  44817608 ttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtatagtggcccatccaaaaatttaaat-attcaattataggtctattctgcgag 44817510  T
Q  298 attttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccac 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  44817509 attttatacaattttatgtcggttttagatttcgattgatccaaattcctgcaaattggtgtagtggcccac 44817438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 158 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 10096555 - 10096270
Alignment:
Q  158 tcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacc 257  Q
    |||| ||||||| ||  |||||||||||||||||  |||||||| | ||||||| |||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||   |    
T  10096555 tcaacgattataggttcattttgcgagattttatataattttgtgtcggttttaagtttcggttgatccaaatttccgcaaagtggtgtagtgtccattc 10096456  T
Q  258 cgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagt 357  Q
      |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||| | ||    
T  10096455 aaaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaagtttcgattgatccaaattcctgcaaaatggt 10096356  T
Q  358 gtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagt 444  Q
    ||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  10096355 gtagtggcccactcg-aaaatttaaataattcaattataggtctattttctaaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagt 10096270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 285 - 459
Target Start/End: Original strand, 51001549 - 51001722
Alignment:
Q  285 tctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaatttaaat 384  Q
    |||||||||  | ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  51001549 tctattttgcaatattttatacaattttatgtcttttttaggtttcggttgatccaa-ttcccgcaaattggtgtagtggtccacccgaaaaatttaaat 51001647  T
Q  385 aattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacat 459  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  51001648 aattcaattataggtctaatttgtaaaactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctaacat 51001722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 158 - 309
Target Start/End: Original strand, 45670019 - 45670170
Alignment:
Q  158 tcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacc 257  Q
    |||| ||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  45670019 tcaacgattataggtttattttgcgagattttatgtaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctacaaagtggtgtagtggcccacc 45670118  T
Q  258 cgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaat 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  45670119 cgaaaatttaaataattcaattatatgtctattttgcgagattttatacaat 45670170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 285 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 36801946 - 36801795
Alignment:
Q  285 tctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaatttaaat 384  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| || ||| ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  36801946 tctattttgcgagattttatataattttgtgtcggttttaggtttcggctgaaccaaattcccgtaaaatagtgtagtggcccacccgaaaaatttatat 36801847  T
Q  385 aattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagtta 436  Q
    |||||||||||| |||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  36801846 aattcaattataagtctatattgtgagactttaaacaatttttcaatggtta 36801795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 285 - 430
Target Start/End: Original strand, 13869215 - 13869360
Alignment:
Q  285 tctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaatttaaat 384  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| || ||||||||||| | ||||| |  || |||||||||||||||||||||||||    
T  13869215 tctattttgtgagattttatatcattttgtgtcggttttaggtttcggctgatccaaatttctgcaaagtgatgcagtggtccacccgaaaaatttaaat 13869314  T
Q  385 aattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaa 430  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||| |||||| | ||||||||    
T  13869315 aattcaattataggtctattttgcgagattttaaacattttttcaa 13869360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 174 - 312
Target Start/End: Original strand, 13857687 - 13857826
Alignment:
Q  174 tattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccg-aaaatttaaataa 272  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13857687 tattttgtgagattttatacaattttgtgttggttttaagtttcggctgatccaaatttctgtaaagtggtgtagtggcccacccgaaaaatttaaataa 13857786  T
Q  273 ttcaattatagatctattttgtgagattttatacaatttt 312  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| ||||    
T  13857787 ttcaattataggtctattttgcgagattttaaacattttt 13857826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 287 - 429
Target Start/End: Original strand, 13857687 - 13857829
Alignment:
Q  287 tattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataa 386  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| || ||||||||||| | | ||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13857687 tattttgtgagattttatacaattttgtgttggttttaagtttcggctgatccaaatttctgtaaagtggtgtagtggcccacccgaaaaatttaaataa 13857786  T
Q  387 ttcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttca 429  Q
    |||||||||||||||| |||| |||| |||||| | |||||||    
T  13857787 ttcaattataggtctattttgcgagattttaaacattttttca 13857829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 284 - 430
Target Start/End: Original strand, 10393895 - 10394041
Alignment:
Q  284 atctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaatttaaa 383  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |  |||| |||||| || |||| | ||||||||| |||||||||||||||| |    
T  10393895 atctattttgcgagattttatataattttgtgtcggttttaggtttcgtctgattcaaatttccacaaagtggtgtagtggcccacccgaaaaatttata 10393994  T
Q  384 taattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaa 430  Q
    ||| ||||||||| |||||  |||||||||| |||| ||||||||||    
T  10393995 taactcaattataagtctatattgtgagactgtaaacaatttttcaa 10394041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 98 - 312
Target Start/End: Original strand, 51001475 - 51001689
Alignment:
Q  98 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccgnnnnnnnnnnnnnntcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaatt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              |||| | ||||||||||||||||| | ||||||| |||||    
T  51001475 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggaaaaattaaaaaatcaacgtttataagtctattttgcaatattttatacaatt 51001574  T
Q  198 ttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaa-tttaaataattcaattatagatctattttgtga 296  Q
    || | |   ||||| |||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||| |    
T  51001575 ttatgtcttttttaggtttcggttgatccaa-ttcccgcaaattggtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtaa 51001673  T
Q  297 gattttatacaatttt 312  Q
     | |||| ||||||||    
T  51001674 aactttaaacaatttt 51001689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 277 - 417
Target Start/End: Original strand, 45670025 - 45670164
Alignment:
Q  277 attatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaa 376  Q
    ||||||| | ||||||| ||||||||||  |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||| | ||||||||| ||||||| |||    
T  45670025 attataggtttattttgcgagattttatgtaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctacaaagtggtgtagtggcccacccg-aaa 45670123  T
Q  377 atttaaataattcaattataggtctaatttgtgagacttta 417  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||    
T  45670124 atttaaataattcaattatatgtctattttgcgagatttta 45670164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 279 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 7638848 - 7638698
Alignment:
Q  279 tatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaat 378  Q
    |||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| || ||| |||||||| |||||| | ||||||||| ||||||| |||||    
T  7638848 tataaatctattttgcaagattttatacaattttgtgtcgattttacgtttcggctgacccaaattctcgcaaagtggtgtagtggcccacccg-aaaat 7638750  T
Q  379 ttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaa 430  Q
    || |||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  7638749 tttaataattccattattggtctattttgcgagactttaaacaatttttcaa 7638698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 166 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 7638848 - 7638702
Alignment:
Q  166 tataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaatt 265  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||| | | ||||| |||| || ||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7638848 tataaatctattttgcaagattttatacaattttgtgtcgattttacgtttcggctgacccaaattctcgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatt 7638749  T
Q  266 taaataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaatttt 312  Q
    | |||||||| ||||| | ||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  7638748 ttaataattccattattggtctattttgcgagactttaaacaatttt 7638702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 164 - 312
Target Start/End: Original strand, 22647289 - 22647438
Alignment:
Q  164 attataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccaccc-gaaa 262  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | || |||||| |||| ||||||| |||||||| | ||| ||| ||||||||||||||  |||    
T  22647289 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtttgttttaggtttcggttgattcaaattcccggaaattggtgtagtggcccacccaaaaa 22647388  T
Q  263 atttaaataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaatttt 312  Q
    | ||||||||||||||||||  |||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  22647389 aattaaataattcaattatatgtctaatttgtgagactttaaacaatttt 22647438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 382 - 458
Target Start/End: Original strand, 45670168 - 45670244
Alignment:
Q  382 aataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgaca 458  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45670168 aataattcaattataggtctaatttacgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgaca 45670244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 277 - 436
Target Start/End: Original strand, 133416 - 133574
Alignment:
Q  277 attatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaa 376  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| |  || || |||||| |||||| | || |||||| |||||  ||||    
T  133416 attataggtatattttgtgagattttatataattttgtgttggttttaggtttcgactggtctaaattctcgcaaagtggtttagtggcccacctaaaaa 133515  T
Q  377 atttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagtta 436  Q
    |||| ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  133516 attt-aataattcaatcatagatctattttgtgagactttaaataattttacaatggtta 133574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 171 - 312
Target Start/End: Original strand, 13869214 - 13869356
Alignment:
Q  171 gtctattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccg-aaaatttaaa 269  Q
    |||||||||| ||||||||||   ||||||| | ||||||| |||| || ||||||||||| ||||||||||  | ||||| ||||||| ||||||||||    
T  13869214 gtctattttgtgagattttatatcattttgtgtcggttttaggtttcggctgatccaaatttctgcaaagtgatgcagtggtccacccgaaaaatttaaa 13869313  T
Q  270 taattcaattatagatctattttgtgagattttatacaatttt 312  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| ||||    
T  13869314 taattcaattataggtctattttgcgagattttaaacattttt 13869356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 167 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 36801951 - 36801805
Alignment:
Q  167 ataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccg-aaaatt 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||| | ||||||| |||| || ||| ||||||||| | ||| | | ||||||||||||||| ||||||    
T  36801951 ataagtctattttgcgagattttatataattttgtgtcggttttaggtttcggctgaaccaaattcccgtaaaatagtgtagtggcccacccgaaaaatt 36801852  T
Q  266 taaataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaatttt 312  Q
    || ||||||||||||||  ||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  36801851 tatataattcaattataagtctatattgtgagactttaaacaatttt 36801805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 289 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 26653217 - 26653056
Alignment:
Q  289 ttttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataatt 388  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||  |||||| | ||||||||| |   ||| | |||| ||||| || |||||||||||||||||||    
T  26653217 ttttgcgagattttatacaactttgtgtcggttttaaattttggctaatccaaatttctataaagtggtgtggtggttcatccgaaaaatttaaataatt 26653118  T
Q  389 caattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggccca 450  Q
     |||||||||| || |||| ||||||| ||| ||||||| ||| || |||||||||||||||    
T  26653117 taattataggtttattttgcgagacttaaaacaattttttaatggtaaattttagtggccca 26653056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 163 - 313
Target Start/End: Original strand, 133415 - 133565
Alignment:
Q  163 gattataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaa 262  Q
    ||||||| || ||||||| ||||||||||  |||||||| ||||||||| |||| |  || || ||||||  |||||||||  ||||||||||||  |||    
T  133415 gattataggtatattttgtgagattttatataattttgtgttggttttaggtttcgactggtctaaattctcgcaaagtggtttagtggcccacctaaaa 133514  T
Q  263 atttaaataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaatttta 313  Q
    | || ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  133515 aatttaataattcaatcatagatctattttgtgagactttaaataatttta 133565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 277 - 430
Target Start/End: Original strand, 18668994 - 18669150
Alignment:
Q  277 attatagatctattttgtgagattttatacaatt----ttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccg 372  Q
    ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||    || |||||||   |||||| |||| ||| ||||| || |||| ||||||||| |||||||||    
T  18668994 attataggtctactttgcgagattttatacaattaattttgtgtcggtgacaggtttcggttaatctaaatttccacaaagtagtgtagtcgtccacccg 18669093  T
Q  373 aaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaa 430  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||  ||||||| ||||||||||    
T  18669094 caaaatttaaattattcaattataggtctattttgcga-tctttaaacaatttttcaa 18669150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 277 - 410
Target Start/End: Original strand, 18735245 - 18735382
Alignment:
Q  277 attatagatctattttgtgagattttatacaatt----ttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccg 372  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    || |||||||   |||||| |||| ||| ||||| || |||| | ||||||| |||||||||    
T  18735245 attataggtctattttgcgagattttatacaattaattttgtgtcggtgacaggtttcggttaatctaaatttccacaaagtggtgtagtcgtccacccg 18735344  T
Q  373 aaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtga 410  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  18735345 caaaatttaaattattcaattataggtctattttgtga 18735382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 277 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 9046174 - 9046035
Alignment:
Q  277 attatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaa 376  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||              |||||||||| || |||| | || |||||| |||||  ||||    
T  9046174 attatagatctattttgcgagattttatacaattttgtgtcggt--------------gatccaaatttccacaaagtggtatagtggcccacca-aaaa 9046090  T
Q  377 atttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaat 431  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9046089 atttaaataattcaattatatgtctattttatgagactttaaataatttttcaat 9046035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 279 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 44817640 - 44817519
Alignment:
Q  279 tatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaat 378  Q
    ||||| ||||||||  || ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| | || |||||| ||| || ||||||    
T  44817640 tataggtctatttttcgaaattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtatagtggcccatcc-aaaaat 44817542  T
Q  379 ttaaataattcaattataggtcta 402  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  44817541 ttaaata-ttcaattataggtcta 44817519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 167 - 312
Target Start/End: Original strand, 10393891 - 10394037
Alignment:
Q  167 ataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccg-aaaatt 265  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  |||||||| | ||||||| |||| |  |||| |||||| |  |||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  10393891 ataaatctattttgcgagattttatataattttgtgtcggttttaggtttcgtctgattcaaatttccacaaagtggtgtagtggcccacccgaaaaatt 10393990  T
Q  266 taaataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaatttt 312  Q
    || |||| |||||||||  ||||| |||||||| | || ||||||||    
T  10393991 tatataactcaattataagtctatattgtgagactgtaaacaatttt 10394037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 346 - 430
Target Start/End: Original strand, 7776903 - 7776987
Alignment:
Q  346 ccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaa 430  Q
    ||||||| | ||||||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  7776903 ccgcaaaatggtgtagtgtcccatccaaaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagactttaaacaatttttcaa 7776987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 277 - 430
Target Start/End: Original strand, 18707742 - 18707898
Alignment:
Q  277 attatagatctattttgtgagattttatacaatt----ttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccg 372  Q
    ||||||| |||| ||||  |||||||||||||||    || |||||||   |||||| || | ||||||||| ||||||| | ||||||| | |||||||    
T  18707742 attataggtctactttgcaagattttatacaattaattttgtgtcggtgacaggtttcgggtaatccaaatttccgcaaagtggtgtagtcgcccacccg 18707841  T
Q  373 aaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaa 430  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||  ||||||| ||||||||||    
T  18707842 caaaatttaaattattcaattataggtctattttgcga-tctttaaacaatttttcaa 18707898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 324 - 430
Target Start/End: Original strand, 18715045 - 18715150
Alignment:
Q  324 aggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataat 423  Q
    |||||| |||| ||| ||||| || |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||  ||||||| |||    
T  18715045 aggtttcggttaatctaaatttccacaaagtagtgtagtcgtccacccgcaaaatttaaattattcaattataagtctattttgcga-tctttaaacaat 18715143  T
Q  424 ttttcaa 430  Q
    |||||||    
T  18715144 ttttcaa 18715150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 221 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 9046131 - 9046040
Alignment:
Q  221 tgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaatttt 312  Q
    ||||||||||| |  ||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| |||| | ||||||    
T  9046131 tgatccaaatttccacaaagtggtatagtggcccaccaaaaaatttaaataattcaattatatgtctattttatgagactttaaataatttt 9046040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 223 - 293
Target Start/End: Original strand, 18707805 - 18707876
Alignment:
Q  223 atccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccg-aaaatttaaataattcaattatagatctattttg 293  Q
    ||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  18707805 atccaaatttccgcaaagtggtgtagtcgcccacccgcaaaatttaaattattcaattataggtctattttg 18707876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 369 - 430
Target Start/End: Original strand, 5734193 - 5734254
Alignment:
Q  369 cccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaa 430  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||| || |||||||    
T  5734193 cccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgagtctttaaacaaattttcaa 5734254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 163 - 296
Target Start/End: Original strand, 18735244 - 18735382
Alignment:
Q  163 gattataagtctattttgcgagattttatgcaatt----ttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccaccc 258  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    |||| | |||   | |||| |||| ||| ||||| |  |||||||| ||||| | ||||||    
T  18735244 gattataggtctattttgcgagattttatacaattaattttgtgtcggtgacaggtttcggttaatctaaatttccacaaagtggtgtagtcgtccaccc 18735343  T
Q  259 g-aaaatttaaataattcaattatagatctattttgtga 296  Q
    | ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  18735344 gcaaaatttaaattattcaattataggtctattttgtga 18735382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 98 - 139
Target Start/End: Original strand, 22647110 - 22647151
Alignment:
Q  98 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggccca 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22647110 cagtggcggagcccttcatgggctgaggtgggccacggccca 22647151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 176 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 26653217 - 26653080
Alignment:
Q  176 ttttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaa-tttaaataatt 274  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||| | |||||||  |||||| | ||||||||| ||  ||||||| || ||||  || ||||||| |||||||||||    
T  26653217 ttttgcgagattttatacaactttgtgtcggttttaaattttggctaatccaaatttctataaagtggtgtggtggttcatccgaaaaatttaaataatt 26653118  T
Q  275 caattatagatctattttgtgagattttatacaatttt 312  Q
     |||||||| | ||||||| |||| || | ||||||||    
T  26653117 taattataggtttattttgcgagacttaaaacaatttt 26653080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 260 - 312
Target Start/End: Original strand, 7776931 - 7776983
Alignment:
Q  260 aaaatttaaataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaatttt 312  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  7776931 aaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagactttaaacaatttt 7776983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 140
Target Start/End: Original strand, 13857612 - 13857654
Alignment:
Q  98 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccac 140  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13857612 cagtggcgaagcccttcatgggctagggtgggccacggcccac 13857654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 98 - 139
Target Start/End: Original strand, 13869142 - 13869183
Alignment:
Q  98 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggccca 139  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  13869142 cagtggcggagcccttcatgggttagggtgggccacggccca 13869183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 98 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 36955169 - 36955136
Alignment:
Q  98 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggcc 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36955169 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggcc 36955136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 98 - 139
Target Start/End: Original strand, 52581455 - 52581495
Alignment:
Q  98 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggccca 139  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  52581455 cagtggcggagcccttcatgggct-gggtgggccacggccca 52581495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 300 - 348
Target Start/End: Original strand, 5734148 - 5734196
Alignment:
Q  300 tttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccg 348  Q
    |||||||||||||   |||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  5734148 tttatacaattttgcatcggttttaggtttcggttgattcaaattcccg 5734196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 260 - 292
Target Start/End: Original strand, 5734198 - 5734230
Alignment:
Q  260 aaaatttaaataattcaattatagatctatttt 292  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5734198 aaaatttaaataattcaattataggtctatttt 5734230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 256; Significance: 1e-142; HSPs: 55)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 98 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 29126203 - 29125842
Alignment:
Q  98 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccgnnnnnnnnnnnnnntcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaatt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29126203 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggaaaaattaaaaaatcaacgattataggtctattttgcgagattttatgcaatt 29126104  T
Q  198 ttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtgag 297  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  29126103 ttgtgtcggttttatgttttggttgatctaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccatccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgag 29126004  T
Q  298 attttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattatag 397  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29126003 attttatacgattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccatccgaaaaatttaaataattcaattatag 29125904  T
Q  398 gtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacat 459  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29125903 gtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacat 29125842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 98 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 50527793 - 50527432
Alignment:
Q  98 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccgnnnnnnnnnnnnnntcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaatt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              |||| | |||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  50527793 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccgaaaaaattaaaaaatcaacgtttatagttctattttgcgagattttatgcaatt 50527694  T
Q  198 ttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtgag 297  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  50527693 ttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggtccatccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgag 50527594  T
Q  298 attttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattatag 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  50527593 attttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattctcgcaaattggtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattatat 50527494  T
Q  398 gtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacat 459  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  50527493 gtctaatttgtgaaactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccactctgacat 50527432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 104 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 1093031 - 1092676
Alignment:
Q  104 cggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccgnnnnnnnnnnnnnntcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtat 203  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||              |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1093031 cggagcccttcatgggctgaggtgggccacggcccacccggaaaaattaaaaaatcaacgactataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtgt 1092932  T
Q  204 tggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtgagatttta 303  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1092931 gggttttatgttttggttgatccaaattcctgtaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgcgagatttta 1092832  T
Q  304 tacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaa 403  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1092831 tacaattttacgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacgcgaaaaatttaaataattcaattataggtctga 1092732  T
Q  404 tttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacat 459  Q
    |||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1092731 tttgcgagacttaaaacaatttttcaatggttaattttagtggcccaccctgacat 1092676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 158 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 44254700 - 44254399
Alignment:
Q  158 tcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacc 257  Q
    |||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  44254700 tcaatgattatatatctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgattcaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacc 44254601  T
Q  258 cgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagt 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  44254600 cgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggt 44254501  T
Q  358 gtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgac 457  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  44254500 gtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctaac 44254401  T
Q  458 at 459  Q
    ||    
T  44254400 at 44254399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 163 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 11232249 - 11231953
Alignment:
Q  163 gattataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaa 262  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11232249 gattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcttgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaa 11232150  T
Q  263 atttaaataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagt 362  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11232149 atttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagt 11232050  T
Q  363 ggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacat 459  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11232049 ggcccacccgaaaaatttaaataattcaattatgagtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacat 11231953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 101 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 32271074 - 32270717
Alignment:
Q  101 tggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccgnnnnnnnnnnnnnntcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaattttg 200  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||              |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32271074 tggcggagcctttcatgggctggggtgggccacagcccacccggaaaaattaaaaaatcaatgattat--gtctattttgcgagattttatgcaattttg 32270977  T
Q  201 tattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtgagatt 300  Q
    | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  32270976 tgtcggttttatattttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagatt 32270877  T
Q  301 ttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtcca-cccgaaaaatttaaataattcaattataggt 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32270876 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtgtagtggcccaccccgaaaaatttaaataattcaattataggt 32270777  T
Q  400 ctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacat 459  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32270776 ctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctaacat 32270717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 101 - 459
Target Start/End: Original strand, 22729222 - 22729580
Alignment:
Q  101 tggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccgnnnnnnnnnnnnnntcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaattttg 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||              |||| || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22729222 tggcggagcccttaatgggctggggtgggccacggcccacccggaaaaattaaaaaatcaacgactataggtctatttttcgagattttatgcaattttg 22729321  T
Q  201 tattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtgagatt 300  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  22729322 tgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctacaaagtggtgtagtggcccaccccaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagatt 22729421  T
Q  301 ttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtc 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22729422 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggaccaaccgaaaaatttaaataattcaattatagatc 22729521  T
Q  401 taatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacat 459  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  22729522 taatttgcgagactttaaacaatttttcaatggtaaattttagtggcccaccctgacat 22729580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 97 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 28952552 - 28952190
Alignment:
Q  97 gcagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccgnnnnnnnnnnnnnntcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaat 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |              |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  28952552 gcagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacgatccacctggaaaaattaaaaaatcaacgattatgggtctattttgcgagattttatgcaat 28952453  T
Q  197 tttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtga 296  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||    
T  28952452 tttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaatttttgcaaaggggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattacaggtctattttgcga 28952353  T
Q  297 gattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattata 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||     
T  28952352 gattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccaaaaaatttaaataattcaattatg 28952253  T
Q  397 ggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacat 459  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28952252 ggtctaatttgtgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggtccaccctgacat 28952190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 98 - 459
Target Start/End: Original strand, 52201981 - 52202342
Alignment:
Q  98 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccgnnnnnnnnnnnnnntcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaatt 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||              |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  52201981 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggtcacggcccacccggaaaaattaaaaaatcaacgattataggtctattttgcgagattttatacaatt 52202080  T
Q  198 ttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtgag 297  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  52202081 ttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtgacccacccaaaaatttaaataattcaattatagatctattttacgag 52202180  T
Q  298 attttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattatag 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  52202181 attttatacaattttatgtcggttttaggtttcagttgatcccaattcccgcaaattggtgtagtggcccactcaaaaaatttaaataattcaattatag 52202280  T
Q  398 gtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacat 459  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  52202281 gtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtggcccaccctgacat 52202342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 98 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 12251667 - 12251306
Alignment:
Q  98 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccgnnnnnnnnnnnnnntcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaatt 197  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||              |||| ||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||    
T  12251667 cagtggcagagcccttcatgggctggggtggaccacggcccacccggaaaaatttaaaaatcaacgattataggtctattttgtgagattttatataatt 12251568  T
Q  198 ttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtgag 297  Q
    |||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  12251567 ttgtgtcgattttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgag 12251468  T
Q  298 attttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattatag 397  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  12251467 aatttatacaattttatgtcgattttagatttcggttgatccaaattccagcaaattggtgtaatggcccactcgaaaaatttaaataattcaactatag 12251368  T
Q  398 gtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacat 459  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12251367 gtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacat 12251306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 163 - 459
Target Start/End: Original strand, 35083857 - 35084153
Alignment:
Q  163 gattataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaa 262  Q
    ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||    
T  35083857 gattataggtcaattttacgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgtaaagtggtgtagtggtccacccgaaa 35083956  T
Q  263 atttaaataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagt 362  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  35083957 agttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgttggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattgatgtagt 35084056  T
Q  363 ggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacat 459  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  35084057 ggcccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtgacccaccctaacat 35084153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 97 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 16908969 - 16908617
Alignment:
Q  97 gcagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccgnnnnnnnnnnnnnntcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaat 196  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||        
T  16908969 gcagtggcagagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggaaaaataaaaaattcaacgattataggtctattttgcgagattttatg---- 16908874  T
Q  197 tttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtga 296  Q
          | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  16908873 ------tcggttttatgttttggttgatccaaattccagcaaagtggtgtagtggcccacccaaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcta 16908780  T
Q  297 gattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattata 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16908779 gattttatacaattttatgtcggttttaggtttcgattgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattata 16908680  T
Q  397 ggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacat 459  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  16908679 ggtctaatttgctagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggtccaccctaacat 16908617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 165 - 459
Target Start/End: Original strand, 27742552 - 27742846
Alignment:
Q  165 ttataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaat 264  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||||||    
T  27742552 ttataggtctattttgagagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggcctatccgaaaat 27742651  T
Q  265 ttaaataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtgg 364  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  27742652 ttaaataattcaattataggtctattttgcaagattttatacaattttatgtcgtttttaggtttcggttgatcccaattcccgtaaattggtgtagtgg 27742751  T
Q  365 tccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacat 459  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  27742752 cccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtggtccaccctaacat 27742846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 98 - 459
Target Start/End: Original strand, 36633486 - 36633840
Alignment:
Q  98 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccgnnnnnnnnnnnnnntcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaatt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||              |||| ||||||| |||||||||| |||||||||| |||||    
T  36633486 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacgacccatccggaaaaattaaaaaatcaacgattataggtctattttgtgagattttatacaatt 36633585  T
Q  198 ttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtgag 297  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  36633586 ttgtatcgattttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagcggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgag 36633685  T
Q  298 attttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattatag 397  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||       |    
T  36633686 atattatacaattttatgtcggttttagatttcggttgatccaaattcctgcaaattggtgtagtggtccaccagaaaaatttaaataattc-------g 36633778  T
Q  398 gtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacat 459  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||    
T  36633779 gtctaatttgcgagactttaaataatttttcaatggttaattttagtggtccaccctaacat 36633840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 166 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 49657303 - 49657010
Alignment:
Q  166 tataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaatt 265  Q
    |||| |||||||||  || |||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||    
T  49657303 tataggtctattttttgaaattttatgcaattttacgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggtccacctgaaaatt 49657204  T
Q  266 taaataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggt 365  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  49657203 taaataattcaattatagatctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggc 49657104  T
Q  366 ccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacat 459  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||| |||| |||||||    
T  49657103 ccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatgataaattttagtggtccacgctgacat 49657010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 98 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 52571584 - 52571236
Alignment:
Q  98 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccgnnnnnnnnnnnnnntcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaatt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              |||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||    
T  52571584 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggaaaaattaaaaaatcaacgattataggtctaatttgcgatattttatgcaatt 52571485  T
Q  198 ttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtgag 297  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  52571484 ttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctacaaagtggtgtagtggcccactcaaaaatttaaataattcaattataggtctattttgtgag 52571385  T
Q  298 attttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattatag 397  Q
            ||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  52571384 --------caaatttatgtcggttttagatttcggttgatccaaatttccgcaaattggtgtagtggtctacccaaaaaatttaaacaattcaattatag 52571293  T
Q  398 gtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccct 454  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  52571292 gtctaatttgtgagactttaaacaaattttcaatagttaattttagtagtccaccct 52571236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 98 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 13595033 - 13594724
Alignment:
Q  98 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccgnnnnnnnnnnnnnntcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaatt 197  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |              |||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  13595033 cagtggcggagcccgtcatgggctggggtgggccacggcccacctgaaaaaattaaaaaatcaacgattatagatctattttgcgagattttatgcaatt 13594934  T
Q  198 ttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtgag 297  Q
    |||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  13594933 ttgtgtcggttttatgttttggctgattcaaattcctacaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgag 13594834  T
Q  298 attttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattatag 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||     
T  13594833 attttatacaattttatgtcggttttatgtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggccaacccgaaaaatttaaataattcaattatat 13594734  T
Q  398 gtctaatttg 407  Q
    ||||||||||    
T  13594733 gtctaatttg 13594724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 164 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 21259415 - 21259119
Alignment:
Q  164 attataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaa 263  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||  |||||| | | ||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||||| |||||||    
T  21259415 attataggtctattttgctagattttatataattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtaatggcccatccgaaaa 21259316  T
Q  264 -tttaaataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagt 362  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  21259315 atttaaataattcaattataggtctattttgctagattttatataattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtaat 21259216  T
Q  363 ggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacat 459  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  21259215 ggcccatccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcaagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtgacataccctgacat 21259119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 158 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 21259534 - 21259266
Alignment:
Q  158 tcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacc 257  Q
    |||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  |||||    
T  21259534 tcaacgattataggtctattttgtgagattttatgcaattttgtgtcgattttatgttttggttgattcaaattcctgcaaagtggtgtagtgatccacc 21259435  T
Q  258 cgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagt 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  21259434 cgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgctagattttatataattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggt 21259335  T
Q  358 gtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttt 426  Q
    ||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||| ||||||||    
T  21259334 gtaatggcccatccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttgctagattttatataatttt 21259266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 278 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 25246317 - 25246136
Alignment:
Q  278 ttatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaa 377  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  25246317 ttataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcttttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggtctacccgaaaaa 25246218  T
Q  378 tttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacat 459  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25246217 tttaaataattcaattataagtctaatttgtgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccacactgacat 25246136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 97 - 311
Target Start/End: Original strand, 18163716 - 18163930
Alignment:
Q  97 gcagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccgnnnnnnnnnnnnnntcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaat 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  18163716 gcagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggaaaaataaaaaaatcaacgattataggtctattttgcgagattttattcaat 18163815  T
Q  197 tttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtga 296  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18163816 tttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtagtccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgtga 18163915  T
Q  297 gattttatacaattt 311  Q
    || |||| |||||||    
T  18163916 gactttaaacaattt 18163930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 97 - 348
Target Start/End: Original strand, 49169791 - 49170042
Alignment:
Q  97 gcagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccgnnnnnnnnnnnnnntcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaat 196  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||               |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||    
T  49169791 gcagtggcggagccctttatgggctggggtgggccacaacccacccagaaaagtaaaaaaatcaacgattataggtctattttgcgaaattttatacaat 49169890  T
Q  197 tttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtga 296  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||  |    
T  49169891 tttgtgtcggttttatgttttggttgatccgaatttctgcaaagtggtgtaatggcccacccgaaaatttaaataattcaattatgggtctattttgcaa 49169990  T
Q  297 gattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccg 348  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  49169991 gactttatacaattttatgtcggttttaggtttcgattgatccaaattcccg 49170042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 174 - 453
Target Start/End: Original strand, 45045284 - 45045563
Alignment:
Q  174 tattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaa-tttaaataa 272  Q
    |||||||||||||||||   |||||| | |||||||||  ||| |||||||||||||||| ||||| | | ||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  45045284 tattttgcgagattttaaataattttttgttggttttagatttcggttgatccaaattcccgcaaactagtgtagtgatccacccgaaaaatttaaataa 45045383  T
Q  273 ttcaattatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccg 372  Q
    || |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||     
T  45045384 tttaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgttggttttaggtttcgattaatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggtccaccc- 45045482  T
Q  373 aaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccc 453  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  | || |||| ||||||||||| ||||||| |  || |||||||||||||||||||    
T  45045483 aaaaattcaaataattcaattatatatttattttgcgagactttaaacaattttttataagataattttagtggcccaccc 45045563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 277 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 7160384 - 7160208
Alignment:
Q  277 attatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaa 376  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||  |||||| |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  7160384 attataggtctattttgcgagattttatgtaattttgtgtcagttttaggtttcggttaatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccgaaaa 7160285  T
Q  377 atttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccc 453  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  7160284 atttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaattttttaatagttaattttagtgacccaccc 7160208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 277 - 459
Target Start/End: Original strand, 18163783 - 18163964
Alignment:
Q  277 attatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaa 376  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| |||||||||||||    
T  18163783 attataggtctattttgcgagattttattcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtagtccacccgaaaa 18163882  T
Q  377 atttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacat 459  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18163883 -tttaaataattcaattataggtctattttgtgagactttaaacaatttctcaatagttaattttcgtggcccaccctgacat 18163964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 277 - 459
Target Start/End: Original strand, 44205477 - 44205659
Alignment:
Q  277 attatagatctattttgtgagattttatacaatttta-tgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaa 375  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||| |  ||||||||  |||||||||    
T  44205477 attatagatctattttgcgagattttatgcaatttttgtgtcggttttatgtgttggttgatccaaattcttgcaaagtgatgtagtggctcacccgaaa 44205576  T
Q  376 aatttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacat 459  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44205577 a-tttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacat 44205659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 96 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 7160452 - 7160235
Alignment:
Q  96 tgcagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccgnnnnnnnnnnnnnntcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaa 195  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||              |||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  7160452 tgcagtggcggagcctttcatgggctggggtgggccacggcccacccggaaaaattaaaaaatcaacgattataggtctattttgcgagattttatgtaa 7160353  T
Q  196 ttttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccg-aaaatttaaataattcaattatagatctattttgt 294  Q
    |||||| |  |||||| |||| |||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||     
T  7160352 ttttgtgtcagttttaggtttcggttaatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgc 7160253  T
Q  295 gagattttatacaatttt 312  Q
    |||| |||| ||||||||    
T  7160252 gagactttaaacaatttt 7160235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 195 - 371
Target Start/End: Original strand, 743958 - 744125
Alignment:
Q  195 attttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgt 294  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||         ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  743958 attttgtgtcggttttatgttttggttgatcaaaattcctgt--------gtagtggtccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgg 744049  T
Q  295 gagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccaccc 371  Q
     |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  744050 aagattttatacaattttacgtcgg-tttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtcgtccaccc 744125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 280 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 31174650 - 31174500
Alignment:
Q  280 atagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaatt 379  Q
    |||||||||  ||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | |||||||||| || ||||||||||    
T  31174650 atagatctaccttgcgatattttatacaattttgtgtcggttttaggttttggttgatccaaattctagcaaagtggtgtagtggttcatccgaaaaatt 31174551  T
Q  380 taaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaa 430  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||| ||||||||||    
T  31174550 taaataattcaattgtaggtctattttgcgagtctttaaacaatttttcaa 31174500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 277 - 426
Target Start/End: Original strand, 45045274 - 45045423
Alignment:
Q  277 attatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaa 376  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||| | |||||| ||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  45045274 attatagatttattttgcgagattttaaataattttttgttggttttagatttcggttgatccaaattcccgcaaactagtgtagtgatccacccgaaaa 45045373  T
Q  377 atttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttt 426  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||| |||| |||| | ||||||    
T  45045374 atttaaataatttaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 45045423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 158 - 312
Target Start/End: Original strand, 44205471 - 44205626
Alignment:
Q  158 tcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaatttt-gtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccac 256  Q
    |||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| |||    
T  44205471 tcaacgattatagatctattttgcgagattttatgcaatttttgtgtcggttttatgtgttggttgatccaaattcttgcaaagtgatgtagtggctcac 44205570  T
Q  257 ccgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaatttt 312  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||| |||| |||| |||| ||||||||    
T  44205571 ccgaaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 44205626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 164 - 312
Target Start/End: Original strand, 45045388 - 45045536
Alignment:
Q  164 attataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaa 263  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||| | || ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  45045388 attataggtctattttgcgagattttatacaattttatgttggttttaggtttcgattaatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggtccacccaaaaa 45045487  T
Q  264 tttaaataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaatttt 312  Q
    || |||||||||||||||| || ||||||| |||| |||| ||||||||    
T  45045488 ttcaaataattcaattatatatttattttgcgagactttaaacaatttt 45045536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 280 - 419
Target Start/End: Original strand, 34660814 - 34660952
Alignment:
Q  280 atagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaatt 379  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  34660814 ataggtctattttacgagattttatataattttgtgtcggttttaggttttggctgatccaaatttttgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaaatt 34660913  T
Q  380 taaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaa 419  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  34660914 taaat-attcaattataggtctattttgcgagactttaaa 34660952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 277 - 446
Target Start/End: Original strand, 4618216 - 4618382
Alignment:
Q  277 attatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaa 376  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||| ||   |||| | |||||||||||||||||||||    
T  4618216 attatagatctattttgcaagattttatacaattttgtgtcggttttattttttg-ttgatccaaactctttcaaagt-gtgtagtggtccacccgaaaa 4618313  T
Q  377 atttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtgg 446  Q
     ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||| | |||||||||||| |||||||||||||    
T  4618314 -tttaaataattcaattataagtctattttgcgagattttatacaatttttcaataattaattttagtgg 4618382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 277 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 13594967 - 13594819
Alignment:
Q  277 attatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaa 376  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||  |||| | ||||||||| |||||||||||    
T  13594967 attatagatctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggctgattcaaattcctacaaagtggtgtagtggcccacccgaaaa 13594868  T
Q  377 atttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttt 426  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||| | ||||||    
T  13594867 -tttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 13594819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 158 - 312
Target Start/End: Original strand, 4618210 - 4618362
Alignment:
Q  158 tcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacc 257  Q
    |||| |||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||| | |||||||| ||||| |||||||||| || | |||||||  ||||||| |||||    
T  4618210 tcaacgattatagatctattttgcaagattttatacaattttgtgtcggttttattttttg-ttgatccaaactctttcaaagtgt-gtagtggtccacc 4618307  T
Q  258 cgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaatttt 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4618308 cgaaaatttaaataattcaattataagtctattttgcgagattttatacaatttt 4618362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 277 - 426
Target Start/End: Original strand, 49169858 - 49170006
Alignment:
Q  277 attatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaa 376  Q
    ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| | ||||| | ||||| ||| ||||||| |||    
T  49169858 attataggtctattttgcgaaattttatacaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccgaatttctgcaaagtggtgtaatggcccacccg-aaa 49169956  T
Q  377 atttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttt 426  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||  |||||||| | ||||||    
T  49169957 atttaaataattcaattatgggtctattttgcaagactttatacaatttt 49170006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 171 - 312
Target Start/End: Original strand, 2618957 - 2619098
Alignment:
Q  171 gtctattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccg--aaaatttaa 268  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||  |||||||| ||||  |||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||  |||| ||||    
T  2618957 gtctattttgcgagattttatacaattgtgt--tggttttaagtttctgttgattcaaactcctgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaaaaattaa 2619054  T
Q  269 ataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaatttt 312  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| || | |||| ||||||||    
T  2619055 ataattcaattataggtctattttgcgacactttaaacaatttt 2619098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 164 - 312
Target Start/End: Original strand, 27742664 - 27742813
Alignment:
Q  164 attataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccg-aaa 262  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| | | | ||||| |||| ||||||||| |||||| | ||| ||| ||||||||||||||| |||    
T  27742664 attataggtctattttgcaagattttatacaattttatgtcgtttttaggtttcggttgatcccaattcccgtaaattggtgtagtggcccacccgaaaa 27742763  T
Q  263 atttaaataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaatttt 312  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||| |||| |||| ||||||||    
T  27742764 atttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 27742813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 165 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 25246317 - 25246169
Alignment:
Q  165 ttataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaa- 263  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | |   ||||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| | |||||||||     
T  25246317 ttataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcttttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggtctacccgaaaaa 25246218  T
Q  264 tttaaataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaatttt 312  Q
    |||||||||||||||||||  |||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  25246217 tttaaataattcaattataagtctaatttgtgagactttaaacaatttt 25246169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 171 - 303
Target Start/End: Original strand, 34660818 - 34660950
Alignment:
Q  171 gtctattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccg-aaaatttaaa 269  Q
    ||||||||| |||||||||||  |||||||| | ||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||    
T  34660818 gtctattttacgagattttatataattttgtgtcggttttaggttttggctgatccaaatttttgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaaatttaaa 34660917  T
Q  270 taattcaattatagatctattttgtgagatttta 303  Q
    | |||||||||||| ||||||||| |||| ||||    
T  34660918 t-attcaattataggtctattttgcgagacttta 34660950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 280 - 430
Target Start/End: Original strand, 2618953 - 2619102
Alignment:
Q  280 atagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaat- 378  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||| |  || ||||||| ||||  |||||| |||| ||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||      
T  2618953 ataggtctattttgcgagattttatacaattgt--gttggttttaagtttctgttgattcaaactcctgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaaaaa 2619050  T
Q  379 ttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaa 430  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||||||    
T  2619051 ttaaataattcaattataggtctattttgcgacactttaaacaatttttcaa 2619102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 178 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 31174639 - 31174504
Alignment:
Q  178 ttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccg-aaaatttaaataattca 276  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||  || ||| |||||||||||||||||    
T  31174639 ttgcgatattttatacaattttgtgtcggttttaggttttggttgatccaaattctagcaaagtggtgtagtggttcatccgaaaaatttaaataattca 31174540  T
Q  277 attatagatctattttgtgagattttatacaatttt 312  Q
    ||| ||| ||||||||| |||  |||| ||||||||    
T  31174539 attgtaggtctattttgcgagtctttaaacaatttt 31174504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 370 - 454
Target Start/End: Original strand, 49170168 - 49170252
Alignment:
Q  370 ccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccct 454  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| || |||||||| |||||||||||  |||||||| |||| |||||||    
T  49170168 ccgaaaaatttaaataactaaattataggtttaatttgcgaaactttaaacaatttttcaatgattaatttttgtggtccaccct 49170252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 308 - 407
Target Start/End: Original strand, 743958 - 744048
Alignment:
Q  308 attttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttg 407  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |        |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  743958 attttgtgtcggttttatgttttggttgatcaaaattcctg--------tgtagtggtccacccgaaaa-tttaaataattcaattataggtctattttg 744048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 281 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 52499287 - 52499197
Alignment:
Q  281 tagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccaccc 371  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||  ||| || ||||| ||||| ||||||| | ||||||||||||||||    
T  52499287 tagatttattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttaaatttcggctgatctaaatttccgcaaagtggtgtagtggtccaccc 52499197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 294 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 576540 - 576405
Alignment:
Q  294 tgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaatt 393  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||| |||||||| || | | |||||| | ||||||||| | ||   |||||||||||| ||||||||    
T  576540 tgagattttatacaattttgtatcgattttagatttcggttgatctaagtacacgcaaagtggtgtagtggcctactaaaaaaatttaaattattcaatt 576441  T
Q  394 ataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaa 430  Q
    |||||| | ||||  ||| ||||||| ||||||||||    
T  576440 ataggtat-attttcgagtctttaaacaatttttcaa 576405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 174 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 52499281 - 52499197
Alignment:
Q  174 tattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccaccc 258  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  ||| || ||||| ||||| | ||||||||| ||||||| ||||||    
T  52499281 tattttgcgagattttatacaattttgtgttggttttaaatttcggctgatctaaatttccgcaaagtggtgtagtggtccaccc 52499197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 369 - 430
Target Start/End: Original strand, 18657974 - 18658035
Alignment:
Q  369 cccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaa 430  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||| || |||||||    
T  18657974 cccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttacgagtctttaaacaaattttcaa 18658035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 103 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 7441737 - 7441702
Alignment:
Q  103 gcggagcccttcatgggctggggtgggccacggccc 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7441737 gcggagcccttcatgggctggggtgggccacggccc 7441702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 98 - 139
Target Start/End: Original strand, 2618884 - 2618925
Alignment:
Q  98 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggccca 139  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  2618884 cagtggcggagcccttcatgggttgaggtgggccacggccca 2618925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 25246386 - 25246343
Alignment:
Q  98 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacc 141  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  25246386 cagtggcggagcctttcatgagctggggtgggccacgacccacc 25246343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 139
Target Start/End: Original strand, 34660753 - 34660794
Alignment:
Q  98 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggccca 139  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  34660753 cagtggcggagctcttcatggattggggtgggccacggccca 34660794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 300 - 348
Target Start/End: Original strand, 18657929 - 18657977
Alignment:
Q  300 tttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccg 348  Q
    |||||||||||||   |||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  18657929 tttatacaattttgcatcggttttaggtttcggttgattcaaattcccg 18657977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 260 - 292
Target Start/End: Original strand, 18657979 - 18658011
Alignment:
Q  260 aaaatttaaataattcaattatagatctatttt 292  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18657979 aaaatttaaataattcaattataggtctatttt 18658011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 256; Significance: 1e-142; HSPs: 54)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 98 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 36436341 - 36435980
Alignment:
Q  98 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccgnnnnnnnnnnnnnntcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaatt 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||               | || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  36436341 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccaaaaaaattaaaaaattaacgattataagtctattttgcgatattttatgcaatt 36436242  T
Q  198 ttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtgag 297  Q
    |||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  36436241 ttgtgtcggttttatgttttgcttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgag 36436142  T
Q  298 attttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattatag 397  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36436141 attttatacaattttatgtcgattttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattatag 36436042  T
Q  398 gtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacat 459  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36436041 gtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacat 36435980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 97 - 459
Target Start/End: Original strand, 2249579 - 2249941
Alignment:
Q  97 gcagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccgnnnnnnnnnnnnnntcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaat 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||              |||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  2249579 gcagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacgacccacccgaaaaaattaaaaaatcaatgattatagatctattttgcgagattttatgcaat 2249678  T
Q  197 tttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtga 296  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  2249679 tttgtgtcggttttatgttttggttgatctaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcga 2249778  T
Q  297 gattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattata 396  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2249779 gattttatacgattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattata 2249878  T
Q  397 ggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacat 459  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  2249879 ggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttaatgacccaccctaacat 2249941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 100 - 459
Target Start/End: Original strand, 34983277 - 34983636
Alignment:
Q  100 gtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccgnnnnnnnnnnnnnntcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaatttt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34983277 gtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggaaaaattgaaaaatcaacgattataggtctattttgcgagattttatgcaatttt 34983376  T
Q  200 gtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtgagat 299  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  34983377 gtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccatccaaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagat 34983476  T
Q  300 tttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggt 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34983477 tttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattccagcaaattggtgtagtgacccacccaaaaaatttaaataattcaattataggt 34983576  T
Q  400 ctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacat 459  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34983577 ctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaatttttgtggcccaccctgacat 34983636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 98 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 6750165 - 6749804
Alignment:
Q  98 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccgnnnnnnnnnnnnnntcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaatt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              |||| ||||||| ||||||||   ||||||||||||||||    
T  6750165 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggaaaaatttaaaaatcaacgattataggtctatttattgagattttatgcaatt 6750066  T
Q  198 ttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtgag 297  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||     
T  6750065 ttgtgttggttttatgttttgattgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtgatccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgat 6749966  T
Q  298 attttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattatag 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6749965 attttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattatag 6749866  T
Q  398 gtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacat 459  Q
    |||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6749865 gtctaatttgcgagactttaaacagtttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacat 6749804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 163 - 459
Target Start/End: Original strand, 26293224 - 26293520
Alignment:
Q  163 gattataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaa 262  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26293224 gattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaa 26293323  T
Q  263 atttaaataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagt 362  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26293324 atttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacgattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagt 26293423  T
Q  363 ggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacat 459  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26293424 ggcccacccgaaaaatttaaataattcaattatagatctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccacccagacat 26293520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 98 - 459
Target Start/End: Original strand, 38527173 - 38527533
Alignment:
Q  98 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccgnnnnnnnnnnnnnntcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaatt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              |||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  38527173 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggaaaaataaaaaaatcaacgattataggtctattttgtgagattttatgcaatt 38527272  T
Q  198 ttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtgag 297  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||    
T  38527273 ttgtatcggttttatgtcttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtagcccacccgaaaatttaaataattcaattataggt-tattttgcgag 38527371  T
Q  298 attttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattatag 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  38527372 attttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggtccacccaaaaaatttaaataatttatttatag 38527471  T
Q  398 gtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacat 459  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  38527472 gtctaatttatgagactttaaacaatttttcaatagttaattttcgtggcccactctgacat 38527533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 158 - 459
Target Start/End: Original strand, 16194311 - 16194612
Alignment:
Q  158 tcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacc 257  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  16194311 tcaacgattataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaattcctgcagagtggtgtagtggcccacc 16194410  T
Q  258 cgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagt 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  16194411 cgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggt 16194510  T
Q  358 gtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgac 457  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  16194511 gtagtagcccacccgaaaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgcaagactttaaacaatttttcaatagttaattttaatggcccactctgac 16194610  T
Q  458 at 459  Q
    ||    
T  16194611 at 16194612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 97 - 456
Target Start/End: Original strand, 23869661 - 23870020
Alignment:
Q  97 gcagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccgnnnnnnnnnnnnnntcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaat 196  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||               |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23869661 gcagtggcggagccctccatgggctggggtgggccacggcccaccccgaaaaattaaaaaatcaacgattataggtctattttgcgagattttatgcaat 23869760  T
Q  197 tttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtga 296  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||    
T  23869761 tttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcttgcaaagtagtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtatattttgcga 23869860  T
Q  297 gattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattata 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23869861 gattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattatg 23869960  T
Q  397 ggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctga 456  Q
      ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23869961 aatctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctga 23870020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 98 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 1021229 - 1020866
Alignment:
Q  98 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggccc-acccgnnnnnnnnnnnnnn-tcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaa 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||               ||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  1021229 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggccccacccgagaaaaattaaaaaatcaattattataggtctattttgcgagattttatacaa 1021130  T
Q  196 ttttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtg 295  Q
    |||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  1021129 ttttgtgtcggttttatgatttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgag 1021030  T
Q  296 agattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattat 395  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1021029 agattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgattcaaattcccgcaaattggtgtagtagcccatccgaaaaatttaaataattcaattat 1020930  T
Q  396 aggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacat 459  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1020929 aggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacat 1020866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 158 - 459
Target Start/End: Original strand, 12995025 - 12995326
Alignment:
Q  158 tcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacc 257  Q
    |||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||    
T  12995025 tcaacgattataggtctaatttgcgagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctacaaattggtgtagtggcccacc 12995124  T
Q  258 cgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagt 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||    
T  12995125 cgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgtaagattttatacaaatttatgtcggttttaggtttcggttgattcaaatttccgcaaattggt 12995224  T
Q  358 gtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgac 457  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12995225 gtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttatgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctaac 12995324  T
Q  458 at 459  Q
    ||    
T  12995325 at 12995326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 98 - 459
Target Start/End: Original strand, 7366150 - 7366511
Alignment:
Q  98 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccgnnnnnnnnnnnnnntcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaatt 197  Q
    ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||| |||              |||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7366150 cagtggcggagccttttatgggctgaggtgggccacggcccatccgaaaaaataaaaaaatcaacgactataggtctattttgcgagattttatgcaatt 7366249  T
Q  198 ttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtgag 297  Q
    |||| |  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  7366250 ttgtgtgagttttatgttttgcttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattatacatctattttgcgag 7366349  T
Q  298 attttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattatag 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7366350 attttatacaattttatgtcggttttaggtttcgattgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacgcgaaaaatttaaataattcaattatag 7366449  T
Q  398 gtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacat 459  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  7366450 gtctaatttgtgagactttaaacaatttttcaatggttaattttagtggcccaccctaacat 7366511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 98 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 13616122 - 13615761
Alignment:
Q  98 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccgnnnnnnnnnnnnnntcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaatt 197  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||              |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13616122 cagtggcggagtctttcatgggctggggtgggccacggcccacccggaaaaattaaaaaatcaacgattataggtctattttgcgagattttatgcaatt 13616023  T
Q  198 ttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtgag 297  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||    
T  13616022 ttgtgttgtttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaaatggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataatttaattataggtctattttgcgag 13615923  T
Q  298 attttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattatag 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13615922 attttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaatttccgcaaattggtgtagtggcccacctgaaaaatttaaataattcaattatag 13615823  T
Q  398 gtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacat 459  Q
    |||||||| | |||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||    
T  13615822 gtctaattcgcgagattttaaacaatttttcaatagttaattttactgatccaccctgacat 13615761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 98 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 1115197 - 1114836
Alignment:
Q  98 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccgnnnnnnnnnnnnnntcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaatt 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||              ||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  1115197 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggtccactcggaaaaattaaaaaatcaattattataggtctattttgcgagattttatacaatt 1115098  T
Q  198 ttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtgag 297  Q
    |||| | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||    
T  1115097 ttgtgtcggttttatgatttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataatttaattataggtctattttgcgag 1114998  T
Q  298 attttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattatag 397  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1114997 attttatacaattttatgttgattttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtgtagtggcctacccgaaaaatttaaataattcaattatag 1114898  T
Q  398 gtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacat 459  Q
     ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1114897 atctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacat 1114836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 98 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 44545888 - 44545527
Alignment:
Q  98 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccgnnnnnnnnnnnnnntcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaatt 197  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||              |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||    
T  44545888 cagtggcggagcccttcatgggttggggtgggccacggtccacccggaaaaataaaaaaatcaacgattataggtctattttgcgatattttatacaatt 44545789  T
Q  198 ttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtgag 297  Q
    |||| | |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  44545788 ttgtgtcggttttatattttggttgatccaaattcttgcaaagtggtgtaatggcccactcgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgag 44545689  T
Q  298 attttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattatag 397  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  44545688 attttatacaattttatgttggttttaagtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggtccacctgaaaaatttaaataattcaattatag 44545589  T
Q  398 gtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacat 459  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  44545588 gtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggtccacccttacat 44545527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 158 - 459
Target Start/End: Original strand, 42016562 - 42016863
Alignment:
Q  158 tcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacc 257  Q
    |||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||    
T  42016562 tcaacgattataggtctattttgtgagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaattgatgcagtggcccacc 42016661  T
Q  258 cgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagt 357  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  42016662 caaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaagttttggttgatccaaattcccgcaaattggt 42016761  T
Q  358 gtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgac 457  Q
    |||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||    
T  42016762 gtagcggcccacccaaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaacaatttttcaatagttaattttaatggctcaccctaac 42016861  T
Q  458 at 459  Q
    ||    
T  42016862 at 42016863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 164 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 26860755 - 26860460
Alignment:
Q  164 attataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaa 263  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  26860755 attataggtctattttgcgagattttatgcaatttcgtgtcggttttatgttttggttgatccaaatttctacaaagtggtgtagtggcccacccaaaaa 26860656  T
Q  264 tttaaataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtg 363  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||  |||||||    
T  26860655 tttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatcccaatttccgcaaattgatgtagtg 26860556  T
Q  364 gtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacat 459  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26860555 gcccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtggcctaccctgacat 26860460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 158 - 459
Target Start/End: Original strand, 31392606 - 31392905
Alignment:
Q  158 tcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacc 257  Q
    |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31392606 tcaacgattataagtctattttgttagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacc 31392705  T
Q  258 cgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagt 357  Q
    | ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| |||||||| ||    
T  31392706 c-aaaatttaagtaattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcgattgatcccaattctcgcaaattggt 31392804  T
Q  358 gtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgac 457  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  31392805 gtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaa-agttaattttagtgacccaccctgac 31392903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 158 - 459
Target Start/End: Original strand, 11764853 - 11765154
Alignment:
Q  158 tcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacc 257  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||     
T  11764853 tcaacgattataggtctattttgcaagattttatacaactttgtgtcggttttatgttttggttgattcaaattcctgcaaagtggtgtagtggtccaca 11764952  T
Q  258 cgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagt 357  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | ||||||||||||||||||||| ||    
T  11764953 caaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttatgtttcagctgatccaaattcccgcaaattggt 11765052  T
Q  358 gtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgac 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  11765053 gtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggtccaccctaac 11765152  T
Q  458 at 459  Q
    ||    
T  11765153 at 11765154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 98 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 28745653 - 28745302
Alignment:
Q  98 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccaccc--gnnnnnnnnnnnnnntcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaa 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |              | || ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28745653 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccccgggaaaattaaaaaattaacgattataggtctattttgcgagattttatgcaa 28745554  T
Q  196 ttttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtg 295  Q
    |||||| | | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  28745553 ttttgtgtcgattttatgttttggtt-atccaaattcctgcaaagtggtgtagtggctcacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcg 28745455  T
Q  296 agattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattat 395  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||     
T  28745454 agattttatataattttatgccggttttagattttggttgatctaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacctgaaaaatttaaataattcaatta- 28745356  T
Q  396 aggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacat 459  Q
              || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28745355 ----------tgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacat 28745302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 97 - 345
Target Start/End: Original strand, 38763712 - 38763960
Alignment:
Q  97 gcagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccgnnnnnnnnnnnnnntcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaat 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||              |||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  38763712 gcagtggcggagcccttcatgggctgaggtgggccacggcccacccggaaaaattaaaaaatcaacgattataggtctatttagcgagattttatgcaat 38763811  T
Q  197 tttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtga 296  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  38763812 tttgtgttggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcga 38763911  T
Q  297 gattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattc 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38763912 gattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattc 38763960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 163 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 11935470 - 11935205
Alignment:
Q  163 gattataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaa 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||  |||||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||| |||    
T  11935470 gattataagtctattttgcgagattttatacaattttgtgtcggttttagattttggttgatccaaattctcgtaaagtggtgtagtggcccacccaaaa 11935371  T
Q  263 a-tttaaataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtag 361  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| | |||||     
T  11935370 aatttaaataattcaattataggtctattttgcgaggttttatacaattttatgtcggttttagatttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtat 11935271  T
Q  362 tggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataattttt 427  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||    
T  11935270 tggcccaccagaaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtgagactttaaacaattttt 11935205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 158 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 3836439 - 3836144
Alignment:
Q  158 tcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacc 257  Q
    ||||||| ||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||  |||||    
T  3836439 tcaaggactatagatctattttacgagattttatacaattttgtgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcgaagtggtgtagtgaaccacc 3836340  T
Q  258 cgaaaattt-aaataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattag 356  Q
      ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||| |      
T  3836339 taaaaattttaaataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtctgttttaggtttcagttgatcaaaattcccgcaaagtga 3836240  T
Q  357 tgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccct 454  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  |||| |||  ||| ||||||| ||||||| ||  |||||||||||| |||| ||||    
T  3836239 tgtagtgg-ccacccg-aaaatttaaataattcaattatatatctattttacgaggctttaaacaattttttaacggttaattttagtagccctccct 3836144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 277 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 22674833 - 22674651
Alignment:
Q  277 attatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaa 376  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||    
T  22674833 attataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcggttttaggtttcggctgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccaaaaa 22674734  T
Q  377 atttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacat 459  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22674733 atttaaataattcaattgaaggtctaatttgagagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggtccaccctgacat 22674651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 277 - 459
Target Start/End: Original strand, 41699249 - 41699428
Alignment:
Q  277 attatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaa 376  Q
    ||||||| | ||||||| |||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||    
T  41699249 attataggtatattttgcgagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaattcccgcaaatt---gtagaggtccacccgaaaa 41699345  T
Q  377 atttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacat 459  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41699346 atttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccacccagacat 41699428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 277 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 34494568 - 34494387
Alignment:
Q  277 attatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaa 376  Q
    ||||||| ||| ||||| |||||||||| ||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||    
T  34494568 attataggtctcttttgcgagattttatgcaattttgtatcggttttatgtttttgttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaa 34494469  T
Q  377 atttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacat 459  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34494468 -tttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggtccaccctgacat 34494387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 277 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 19284023 - 19283842
Alignment:
Q  277 attatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaa 376  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| | ||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||  |||||||||||    
T  19284023 attataaatctattttgcgagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatctaaattcctgcaaagtggtgtagtgtcccacccgaaaa 19283924  T
Q  377 atttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacat 459  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19283923 -tttaaataattcaattataggtctaatttatgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctaacat 19283842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 158 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 34494574 - 34494420
Alignment:
Q  158 tcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacc 257  Q
    |||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34494574 tcaacgattataggtctcttttgcgagattttatgcaattttgtatcggttttatgtttttgttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacc 34494475  T
Q  258 cgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaatttt 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  34494474 cgaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaacaatttt 34494420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 277 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 43471547 - 43471370
Alignment:
Q  277 attatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaa 376  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||||||| |||||||||||||    
T  43471547 attataggtctattttgcgagattttatacaattttgtgtcggttttaggttttgattgatccaaattctcgcaaagtggtgtagtagtccacccgaaaa 43471448  T
Q  377 atttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccct 454  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||||| |||||||    
T  43471447 atttaaacaattcaattataggtctattttgcgaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagtggtccaccct 43471370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 158 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 19284029 - 19283875
Alignment:
Q  158 tcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacc 257  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  19284029 tcaacgattataaatctattttgcgagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatctaaattcctgcaaagtggtgtagtgtcccacc 19283930  T
Q  258 cgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaatttt 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| |||| ||||||||    
T  19283929 cgaaaatttaaataattcaattataggtctaatttatgagactttaaacaatttt 19283875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 98 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 22674899 - 22674684
Alignment:
Q  98 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccgnnnnnnnnnnnnnntcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaatt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||              |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22674899 cagtggcggagcccttcatgggctggggtggaccacggcccacccggaaaaattaaaaaatcaacgattataggtctattttgcgagattttatgcaatt 22674800  T
Q  198 ttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccaccc-gaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtga 296  Q
    |||| | ||||||| |||| || ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  || |||| |||| ||    
T  22674799 ttgtgtcggttttaggtttcggctgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccaaaaaatttaaataattcaattgaaggtctaatttgaga 22674700  T
Q  297 gattttatacaatttt 312  Q
    || |||| ||||||||    
T  22674699 gactttaaacaatttt 22674684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 285 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 31643696 - 31643551
Alignment:
Q  285 tctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaatttaaat 384  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  |||| |||||||||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  31643696 tctattttacgagattttatacaattttatgtcggttttaagtttcgcctgattcaaattcccgcaaagtggtgtggtggtccacccaaaaaatttaaat 31643597  T
Q  385 aattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaa 430  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  31643596 aattcaattataggtctattttgcgagactttaaacaatttttcaa 31643551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 158 - 312
Target Start/End: Original strand, 41699243 - 41699395
Alignment:
Q  158 tcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacc 257  Q
    |||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |   |||| || |||||    
T  41699243 tcaacgattataggtatattttgcgagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaattcccgcaaatt---gtagaggtccacc 41699339  T
Q  258 cg-aaaatttaaataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaatttt 312  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||| |||| ||||||||    
T  41699340 cgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttt 41699395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 295 - 430
Target Start/End: Original strand, 32100014 - 32100154
Alignment:
Q  295 gagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggt-----ccacccgaaaaatttaaataattc 389  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||| | ||||||||||     ||||||||||||||||||||||||    
T  32100014 gagattttatacaattttgtgtcagttttaggtttcggttgatctaaattcccacaaagtggtgtagtggtgtgacccacccgaaaaatttaaataattc 32100113  T
Q  390 aattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaa 430  Q
    |||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  32100114 aattatagatctattttgtgagtctttaaataatttttcaa 32100154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 284 - 442
Target Start/End: Original strand, 2077562 - 2077720
Alignment:
Q  284 atctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaatttaaa 383  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| || ||||| |||||||| |||| | | |||||||| || || |||||||||||    
T  2077562 atctattttgcgagattctatacaattttgtgtcggttttagctttcggctgatctaaattcccacaaagtggggtagtggttcatccaaaaaatttaaa 2077661  T
Q  384 taattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaatttta 442  Q
    ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  2077662 taattcaattataggtctattttacgagactttaaacaatttttcaacggttaatttta 2077720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 277 - 426
Target Start/End: Original strand, 38763779 - 38763927
Alignment:
Q  277 attatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaa 376  Q
    ||||||| ||||||| | |||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||| |||    
T  38763779 attataggtctatttagcgagattttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccg-aaa 38763877  T
Q  377 atttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttt 426  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||| | ||||||    
T  38763878 atttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 38763927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 275 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 26860757 - 26860607
Alignment:
Q  275 caattatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaa 374  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||| | ||||||||| |||||| ||    
T  26860757 caattataggtctattttgcgagattttatgcaatttcgtgtcggttttatgttttggttgatccaaatttctacaaagtggtgtagtggcccaccc-aa 26860659  T
Q  375 aaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttt 426  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||| | ||||||    
T  26860658 aaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 26860607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 158 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 43471553 - 43471398
Alignment:
Q  158 tcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacc 257  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||| |||||| |||||||||||||  ||||||||| ||||| | |||||    
T  43471553 tcaacgattataggtctattttgcgagattttatacaattttgtgtcggttttaggttttgattgatccaaattctcgcaaagtggtgtagtagtccacc 43471454  T
Q  258 cg-aaaatttaaataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaatttt 312  Q
    || |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||  |||| ||||||||    
T  43471453 cgaaaaatttaaacaattcaattataggtctattttgcgaggctttaaacaatttt 43471398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 288 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 29142013 - 29141871
Alignment:
Q  288 attttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataat 387  Q
    |||||| || |||||||||||| || ||||| |||||| ||| ||||||||||||||| |  ||| |  |||| ||| |||||| |||||||||||||||    
T  29142013 attttgcgatattttatacaatgttgtgtcgattttagatttcggttgatccaaattctcataaaatgatgtaatggcccacccaaaaaatttaaataat 29141914  T
Q  388 tcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaa 430  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  29141913 tcaattataggtctattttgcgagactttaaacaatttttcaa 29141871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 280 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 29035490 - 29035340
Alignment:
Q  280 atagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaatt 379  Q
    |||| |||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||| |||||||||| |||||||| |||||  |||||| | |||||||   |||| |||||||||    
T  29035490 ataggtctactttgtgagattttctacaactttgtgtcgattttaggtttcggttgatctaaattttcgcaaagtggtgtagtttcccactcgaaaaatt 29035391  T
Q  380 taaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaa 430  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||  || ||||||| ||||||||||    
T  29035390 taaataattcaattatagatctattttgcaagtctttaaacaatttttcaa 29035340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 166 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 31643702 - 31643555
Alignment:
Q  166 tataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaa-t 264  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| | | ||||||| |||| |  |||| |||||||| ||||||||| || |||| |||||| |||| |    
T  31643702 tatatgtctattttacgagattttatacaattttatgtcggttttaagtttcgcctgattcaaattcccgcaaagtggtgtggtggtccacccaaaaaat 31643603  T
Q  265 ttaaataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaatttt 312  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  31643602 ttaaataattcaattataggtctattttgcgagactttaaacaatttt 31643555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 181 - 297
Target Start/End: Original strand, 32100013 - 32100135
Alignment:
Q  181 cgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtgg-----cccacccgaaaa-tttaaataatt 274  Q
    ||||||||||| ||||||||| |  |||||| |||| |||||||| |||||||  |||||||| |||||||     |||||||||||| |||||||||||    
T  32100013 cgagattttatacaattttgtgtcagttttaggtttcggttgatctaaattcccacaaagtggtgtagtggtgtgacccacccgaaaaatttaaataatt 32100112  T
Q  275 caattatagatctattttgtgag 297  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  32100113 caattatagatctattttgtgag 32100135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 172 - 312
Target Start/End: Original strand, 2077563 - 2077704
Alignment:
Q  172 tctattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaa-tttaaat 270  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||  ||| || ||||| |||||||  |||||||| |||||||  || || |||| |||||||    
T  2077563 tctattttgcgagattctatacaattttgtgtcggttttagctttcggctgatctaaattcccacaaagtggggtagtggttcatccaaaaaatttaaat 2077662  T
Q  271 aattcaattatagatctattttgtgagattttatacaatttt 312  Q
    ||||||||||||| ||||||||  |||| |||| ||||||||    
T  2077663 aattcaattataggtctattttacgagactttaaacaatttt 2077704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 30 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 995208 - 995137
Alignment:
Q  30 aatcatatatatgaaactataatacatccaaatattgc----tatctcaccaacaccgcgcgcccgcgcctg 97  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  995208 aatcatatatatgaaactgtaatacatccaaatattgctatatatctcaccaacaccgcacgcccgcgcctg 995137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 167 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 29142021 - 29141875
Alignment:
Q  167 ataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaa-tt 265  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||| | | |||||  ||| |||||||||||||||    ||| ||  ||| |||||||||| |||| ||    
T  29142021 ataagtcaattttgcgatattttatacaatgttgtgtcgattttagatttcggttgatccaaattctcataaaatgatgtaatggcccacccaaaaaatt 29141922  T
Q  266 taaataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaatttt 312  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  29141921 taaataattcaattataggtctattttgcgagactttaaacaatttt 29141875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 409 - 459
Target Start/End: Original strand, 38763965 - 38764015
Alignment:
Q  409 gagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacat 459  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38763965 gagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacat 38764015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 277 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 17526119 - 17526052
Alignment:
Q  277 attatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaatt 344  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||| |||||    
T  17526119 attatagatctattttgcgagattttatacaatttagtgtcagttttaggttttagttgatctaaatt 17526052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 171 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 29035486 - 29035363
Alignment:
Q  171 gtctattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaa-tttaaa 269  Q
    ||||| |||| |||||||| | ||| ||||| | | ||||| |||| |||||||| |||||   ||||||||| |||||  ||||| |||||| ||||||    
T  29035486 gtctactttgtgagattttctacaactttgtgtcgattttaggtttcggttgatctaaattttcgcaaagtggtgtagtttcccactcgaaaaatttaaa 29035387  T
Q  270 taattcaattatagatctattttg 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  29035386 taattcaattatagatctattttg 29035363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 104 - 143
Target Start/End: Original strand, 42473566 - 42473605
Alignment:
Q  104 cggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccg 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  42473566 cggagcccttcatgggctggggtgggccacggctcacccg 42473605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 131
Target Start/End: Original strand, 12994975 - 12995007
Alignment:
Q  99 agtggcggagcccttcatgggctggggtgggcc 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12994975 agtggcggagcccttcatgggctggggtgggcc 12995007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 101 - 138
Target Start/End: Original strand, 2076934 - 2076971
Alignment:
Q  101 tggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggccc 138  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  2076934 tggcggagcccttcattggctagggtgggccacggccc 2076971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 143
Target Start/End: Original strand, 32099928 - 32099973
Alignment:
Q  98 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccg 143  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||    
T  32099928 cagtggtggagcccttcatgggctagggtgggccacaacccacccg 32099973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 34494634 - 34494593
Alignment:
Q  98 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggccca 139  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||    
T  34494634 cagtggcggagcccatcatgggctagggtgggccacggtcca 34494593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 163 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 17526120 - 17526052
Alignment:
Q  163 gattataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaatt 231  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||| |||||| || |  |||||| ||||| ||||||| |||||    
T  17526120 gattatagatctattttgcgagattttatacaatttagtgtcagttttaggttttagttgatctaaatt 17526052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 280 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 40897644 - 40897612
Alignment:
Q  280 atagatctattttgtgagattttatacaatttt 312  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40897644 atagatctattttgtgagattttaaacaatttt 40897612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 255; Significance: 1e-142; HSPs: 33)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 98 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 2660997 - 2660641
Alignment:
Q  98 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccgnnnnnnnnnnnnnntcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaatt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||              |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2660997 cagtggcggagcccttcatgggctgggatgggccacgacccacccggaaaaattaaaaaatcaacgattataggtctattttgcgagattttatgcaatt 2660898  T
Q  198 ttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtgag 297  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  2660897 ttgtatcggttttatgttttggatgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgag 2660798  T
Q  298 attttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattatag 397  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  2660797 attttatacaattttatgtcgattttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataa 2660698  T
Q  398 gtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccct 454  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2660697 gtctaatttgtaagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccct 2660641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 98 - 459
Target Start/End: Original strand, 8560426 - 8560787
Alignment:
Q  98 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccgnnnnnnnnnnnnnntcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaatt 197  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||              |||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  8560426 cagtggcggagcccttcaagggttggggtgg-ccacggcccacccgaaaaaattaaaaaatcaacgattataggtctaaattgcgagattttatgcaatt 8560524  T
Q  198 ttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtgag 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8560525 ttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtgag 8560624  T
Q  298 attttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattatag 397  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8560625 attttatacaattttacgtcggttttaggtttcggttgatccaaatttccgcaaattggtgtagtggtgcacctgaaaaatttaaataattcaattatag 8560724  T
Q  398 g-tctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacat 459  Q
    | |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8560725 gatctaatttgtaagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacat 8560787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 98 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 24635629 - 24635271
Alignment:
Q  98 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccgnnnnnnnnnnnnnntcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaatt 197  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||              |||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  24635629 cagtggcgaagcccttcatgggctggggtgggccacggcccatccggaaaaattaaaaaatcaacgattataggtctaatttgcgagattttatgcaatt 24635530  T
Q  198 ttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtgag 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24635529 ttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggtccatccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgtgag 24635430  T
Q  298 attttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattatag 397  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24635429 attttatacaaatttaaatcggttttaggtttcggttgatccaaatttccgcaaattggtgtagtggtccacccaaaaaatttaaataattcaattatag 24635330  T
Q  398 gtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctga 456  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24635329 gtctaatttgtgagactttaaacaatttttcaatagttaattttaatggcccaccctga 24635271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 98 - 459
Target Start/End: Original strand, 12698493 - 12698854
Alignment:
Q  98 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccgnnnnnnnnnnnnnn-tcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaat 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||               ||||  |||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  12698493 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggccgacccggaaaaatttaaaaaatcaacaattataggtctattttgcgagattttatacaat 12698592  T
Q  197 tttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtga 296  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  12698593 tttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccatccgaaaatttaaataattcaattatgg-tctattttgtga 12698691  T
Q  297 gattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattata 396  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12698692 gattttatacaattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattaaa 12698791  T
Q  397 ggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacat 459  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12698792 ggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggtccaccctgacat 12698854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 98 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 9079214 - 9078857
Alignment:
Q  98 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccgnnnnnnnnnnnnnntcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaatt 197  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||              |||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  9079214 cagtggcggagcccttcatggactggggtgggccacagcccatccggaaaaattaaaaaatcaacgattataggtctaatttgcgagattttatgcaatt 9079115  T
Q  198 ttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtgag 297  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9079114 ttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgtgag 9079015  T
Q  298 attttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattatag 397  Q
    | |||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  9079014 a-tttaaacaattttacgtcggttttaggtttcggttgatccaaatttccgcaaattggtgtagtggaccacccgaaaaatttaaataattcaattataa 9078916  T
Q  398 gtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctga 456  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  9078915 gtctaatttgtgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtagtccaccctga 9078857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 97 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 11450668 - 11450303
Alignment:
Q  97 gcagtggcggagcccttcatgggctggg----gtgggccacggcccacccgnnnnnnnnnnnnnntcaaggattataagtctattttgcgagattttatg 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||              |||| |||||||  ||||||||||||||| |||||    
T  11450668 gcagtggcggagcccttcatgggctgggtggggtgggccacggcccacccggaaaaatttaaatatcaacgattatatatctattttgcgagatcttatg 11450569  T
Q  193 caattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattatagatctatttt 292  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  11450568 caattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccatccgaaaatttaaataattcaattattggtctatttt 11450469  T
Q  293 gtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaat 392  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  11450468 acgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccg-aaaatttaaataattcaat 11450370  T
Q  393 tataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacat 459  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11450369 tataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacat 11450303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 158 - 459
Target Start/End: Original strand, 15469149 - 15469449
Alignment:
Q  158 tcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacc 257  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  15469149 tcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtgtcggttttatgttttgattgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggtccacc 15469248  T
Q  258 cgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagt 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| ||    
T  15469249 cgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggtt-atcccaattcccgcaaattggt 15469347  T
Q  358 gtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgac 457  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15469348 gtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaataatttttcaaaagttaattttagtggcccaccctgac 15469447  T
Q  458 at 459  Q
    ||    
T  15469448 at 15469449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 163 - 459
Target Start/End: Original strand, 7021882 - 7022177
Alignment:
Q  163 gattataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaa 262  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  7021882 gattataggtctattttgcgagattttatgcaattttgtgtcagttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtgatgtagtggcccacccgaaa 7021981  T
Q  263 atttaaataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagt 362  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  7021982 atttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccacaaattggtgtagt 7022081  T
Q  363 ggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacat 459  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7022082 ggcccacccg-aaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaattttttaatagttaattttagtggcccaccctgacat 7022177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 100 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 24130396 - 24130042
Alignment:
Q  100 gtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccgnnnnnnnnnnnnnntcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaatttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||              |||| ||||||||     ||||||||||||||||||||||||    
T  24130396 gtggcggagcccttcatgggctggggtgggccactgcccacccggaaaaattaaaaaatcaacgattataa-----ttttgcgagattttatgcaatttt 24130302  T
Q  200 gtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtgagat 299  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |    
T  24130301 gtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagtt 24130202  T
Q  300 tttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggt 399  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24130201 tttatacgattttatgccggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcatattggtgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattatatgt 24130102  T
Q  400 ctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacat 459  Q
     ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24130101 ttaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggtccaccctgacat 24130042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 158 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 34023641 - 34023340
Alignment:
Q  158 tcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacc 257  Q
    |||| ||||||| ||||||||| |||||||||||  |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||    
T  34023641 tcaacgattataggtctattttacgagattttatataattttgtgtcggttttatgttttggttgatctaaatttctgcaaagtggtgtagtgtcccacc 34023542  T
Q  258 cgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagt 357  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  34023541 caaaaatttaaataattcaattatagatctattttacgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggt 34023442  T
Q  358 gtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgac 457  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34023441 gtagtgaaccacccgaaaaatttaaataattcaattataagtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgac 34023342  T
Q  458 at 459  Q
    ||    
T  34023341 at 34023340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 164 - 454
Target Start/End: Original strand, 34127563 - 34127853
Alignment:
Q  164 attataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaa 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| ||||    
T  34127563 attataagtctattttgcgagattttatacaattttgtatcggttttatgatttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtaatgccccacccaaaaa 34127662  T
Q  264 tttaaataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtg 363  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  34127663 tttaaataattcaattataggtctattttgcaagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtgtagtg 34127762  T
Q  364 gtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccct 454  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  34127763 gcccacccggaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaattttacaatagttaattttagtggcgcaccct 34127853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 164 - 454
Target Start/End: Original strand, 26468514 - 26468804
Alignment:
Q  164 attataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaa 263  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26468514 attataggtctattttgcgagattttatacaattttgtgtcggttttataatttgcttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaa 26468613  T
Q  264 tttaaataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtg 363  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26468614 tttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcagttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtg 26468713  T
Q  364 gtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccct 454  Q
    | | | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26468714 gacaaaccgaaaaatttaaataattcaattatagatctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggtccaccct 26468804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 164 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 23259048 - 23258752
Alignment:
Q  164 attataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaa 263  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||   | |||||||  |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||| |||||||    
T  23259048 attataggtctattttgtgagattttatacaattttacgtcggttttagcttttggttgatccaaatttctgcaaattggtgtagtggtccaaccgaaaa 23258949  T
Q  264 -tttaaataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagt 362  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||    
T  23258948 atttaaataattcaattataggtctattttgtgagattttatacaattttacgtcggttttagcttttggttgatccaaatttctgcaaattggtgtagt 23258849  T
Q  363 ggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacat 459  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23258848 ggtccaaccgaaaaatttaaataattcaattatagatctaatttgtgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacat 23258752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 98 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 16461568 - 16461220
Alignment:
Q  98 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccgnnnnnnnnnnnnnntcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaatt 197  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||              |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16461568 cagtggcggagtccttcatggactggggtgggtcacggcccacccggaaatattaaaaaatcaacgattataagcctattttgcgagattttatgcaatt 16461469  T
Q  198 ttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtgag 297  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||    
T  16461468 ttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattccttcaaagttgtgtagtggtccactcgaaaatttaaataattcaattatatgtctattttgcgag 16461369  T
Q  298 attttatacaattttatgtc-ggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattata 396  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||    
T  16461368 attttatataattttatgtcgggttttaggtttcagttgattcaaattcccgcaaattggtgtagtggcctatccgaaaaatttaaataattcaattata 16461269  T
Q  397 ggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtg 445  Q
    ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16461268 ggtttaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtg 16461220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 178 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 23259147 - 23258899
Alignment:
Q  178 ttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaa 277  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23259147 ttgcgagattttatgcaattttctatcggttttatgttttggttgattcaaatttctgcaaaatgttgtagtggcccacccaaaaatttaaataattcaa 23259048  T
Q  278 ttatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaa 377  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  23259047 ttataggtctattttgtgagattttatacaattttacgtcggttttagcttttggttgatccaaatttctgcaaattggtgtagtggtccaaccgaaaaa 23258948  T
Q  378 tttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttt 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||    
T  23258947 tttaaataattcaattataggtctattttgtgagattttatacaatttt 23258899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 174 - 427
Target Start/End: Original strand, 12996359 - 12996613
Alignment:
Q  174 tattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaa-tttaaataa 272  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| | ||||| ||||||||  |||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||    
T  12996359 tattttgcgagattttatacaattttgtatcggttttaggtttcgattgatgcaaattccctcaaagtggtgtagtgacccacccgaaaaatttaaataa 12996458  T
Q  273 -ttcaattatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccaccc 371  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||    
T  12996459 attcaattatagatctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttaatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggtccatcc 12996558  T
Q  372 gaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataattttt 427  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  12996559 g-aaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagactttaaacaattttt 12996613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 158 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 14883261 - 14882977
Alignment:
Q  158 tcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaattttg-tattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccac 256  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | | | ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  14883261 tcaacgattataagtctatttcgcgagattttatacaattttggtgtcgattttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggcccac 14883162  T
Q  257 ccgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattag 356  Q
    |  ||||||||||||||||| || ||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||    |    
T  14883161 caaaaaatttaaataattcatttttaggtctattttttgagattttatacaaatttatgtcggctttagatttcggttgatccaaattcccgcaagag-g 14883063  T
Q  357 tgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaatttta 442  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  || ||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  14883062 tgtagtgatccacccgaaaaatttaaataatttaattataggtctattttgctaggctttaaacaatttttcaacggttaatttta 14882977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 277 - 430
Target Start/End: Original strand, 7536522 - 7536675
Alignment:
Q  277 attatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaa 376  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||  |||||||||| || ||||| |||||| |||||| | ||||| ||  |||||||||||    
T  7536522 attatagatctattttgtaggattttatacaattttgtgtcaattttaggtttcggctgatctaaattctcgcaaagtggtgtaatgacccacccgaaaa 7536621  T
Q  377 atttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaa 430  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  7536622 atttaaataattcaattataggtctattttgtgagactttaaacaatttttcaa 7536675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 172 - 312
Target Start/End: Original strand, 12996472 - 12996612
Alignment:
Q  172 tctattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaatttaaata 271  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| | | ||||||| |||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  12996472 tctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttaatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggtccatccgaaaatttaaata 12996571  T
Q  272 attcaattatagatctattttgtgagattttatacaatttt 312  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  12996572 attcaattataggtctattttgcgagactttaaacaatttt 12996612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 277 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 13405456 - 13405298
Alignment:
Q  277 attatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaa 376  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||   || |   ||| ||| ||| |||||||    
T  13405456 attataggtctattttgcgagattttatacaattttgtgtcggttttaggtttcgattgatccaaattcccatgaagtgaagtaatggcccatccgaaaa 13405357  T
Q  377 atttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagtt 435  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||| |||||||||| ||||    
T  13405356 atttaaataattcaatcataggtctattttgcgagattttaaacaatttttcaacagtt 13405298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 102 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 13405518 - 13405307
Alignment:
Q  102 ggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccgnnnnnnnnnnnnnntcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaattttgt 201  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||              | || ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13405518 ggcggagcccttcatgggttggggtgggccacgacccacccgaaaaaattaaaaaattaacgattataggtctattttgcgagattttatacaattttgt 13405419  T
Q  202 attggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccg-aaaatttaaataattcaattatagatctattttgtgagatt 300  Q
     | ||||||| |||| | ||||||||||||||    |||||  ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  13405418 gtcggttttaggtttcgattgatccaaattcccatgaagtgaagtaatggcccatccgaaaaatttaaataattcaatcataggtctattttgcgagatt 13405319  T
Q  301 ttatacaatttt 312  Q
    ||| ||||||||    
T  13405318 ttaaacaatttt 13405307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 280 - 426
Target Start/End: Original strand, 12996352 - 12996499
Alignment:
Q  280 atagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaatt 379  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||| | ||||| ||||||||| |||| | ||||||||  ||||||||||||||    
T  12996352 atagatatattttgcgagattttatacaattttgtatcggttttaggtttcgattgatgcaaattccctcaaagtggtgtagtgacccacccgaaaaatt 12996451  T
Q  380 taaat-aattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttt 426  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| |||| |||| |||| | ||||||    
T  12996452 taaataaattcaattatagatctattttgcgagattttatacaatttt 12996499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 319 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 31969044 - 31968932
Alignment:
Q  319 gttttaggttttgg-ttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgagacttta 417  Q
    ||||||||||| || |||||| ||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |  |||||    
T  31969044 gttttaggtttcgggttgatctaaattcctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataatttaattataggtctattttgtaactcttta 31968945  T
Q  418 aataatttttcaa 430  Q
    || ||||||||||    
T  31968944 aacaatttttcaa 31968932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 163 - 312
Target Start/End: Original strand, 7536521 - 7536671
Alignment:
Q  163 gattataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaa 262  Q
    |||||||  |||||||||   |||||||| ||||||||| |   ||||| |||| || ||||| ||||||  ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  7536521 gattatagatctattttgtaggattttatacaattttgtgtcaattttaggtttcggctgatctaaattctcgcaaagtggtgtaatgacccacccgaaa 7536620  T
Q  263 a-tttaaataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaatttt 312  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||    
T  7536621 aatttaaataattcaattataggtctattttgtgagactttaaacaatttt 7536671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 280 - 401
Target Start/End: Original strand, 10290526 - 10290647
Alignment:
Q  280 atagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttg-gttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaat 378  Q
    |||| |||| |||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||   ||||||||||||| | ||||| | ||||||||| ||| |||||||||    
T  10290526 ataggtctactttgcgagattttatacaatttg-tgtcggtgttaggtttcaagttgatccaaatttctgcaaaatggtgtagtggcccatccgaaaaat 10290624  T
Q  379 ttaaataattcaattataggtct 401  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  10290625 ttaaataattcaattataggtct 10290647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 218 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 31969031 - 31968954
Alignment:
Q  218 ggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccg-aaaatttaaataattcaattatagatctattttgt 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  31969031 ggttgatctaaattcctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataatttaattataggtctattttgt 31968954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 97 - 283
Target Start/End: Original strand, 10290456 - 10290643
Alignment:
Q  97 gcagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccgnnnnnnnnnnnnnntcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaat 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||               | || ||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||||    
T  10290456 gcagtggcggagcccttcatgggctagggtgggccatggcccacccagagaaattaaaaaattaacgatcataggtctactttgcgagattttatacaat 10290555  T
Q  197 tttgtattggttttatgttttg-gttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccg-aaaatttaaataattcaattatag 283  Q
    || || | ||| ||| ||||   ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10290556 tt-gtgtcggtgttaggtttcaagttgatccaaatttctgcaaaatggtgtagtggcccatccgaaaaatttaaataattcaattatag 10290643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 285 - 381
Target Start/End: Original strand, 31489895 - 31489991
Alignment:
Q  285 tctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaattta 381  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||| ||||| ||| |||||||||| | |||| | |||||||| |||| || |||||||||    
T  31489895 tctattttgtgagattttatataattttgtatcgattttaagttttagttaatccaaattctcacaaagtggtgtagtgatccatccaaaaaattta 31489991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 372 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 1398104 - 1398049
Alignment:
Q  372 gaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataattttt 427  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||    
T  1398104 gaaaaatttaaataatttaattataggtctattttgcgagtgtttaaataattttt 1398049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 97 - 133
Target Start/End: Original strand, 12996283 - 12996319
Alignment:
Q  97 gcagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccac 133  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12996283 gcagtggcggagcccttcatgggttggggtgggccac 12996319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 102 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 2399460 - 2399421
Alignment:
Q  102 ggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacc 141  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  2399460 ggcggagcccttcatgggttggggtgggccacagcccacc 2399421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 140
Target Start/End: Original strand, 26468447 - 26468490
Alignment:
Q  97 gcagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccac 140  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  26468447 gcagtggcggagcctttcatgggctgggatgggccacggtccac 26468490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 99 - 131
Target Start/End: Original strand, 15469101 - 15469133
Alignment:
Q  99 agtggcggagcccttcatgggctggggtgggcc 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15469101 agtggcggagcccttcatgggctggggagggcc 15469133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0050 (Bit Score: 242; Significance: 1e-134; HSPs: 1)
Name: scaffold0050
Description:

Target: scaffold0050; HSP #1
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 101 - 452
Target Start/End: Original strand, 19048 - 19399
Alignment:
Q  101 tggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccgnnnnnnnnnnnnnntcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaattttg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19048 tggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggaaaaataaaaaaatcaacgatcataggtctattttgcgagattttatgcaattttg 19147  T
Q  201 tattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtgagatt 300  Q
    | | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19148 tgtcggttttatgttttggtttatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgcgagatt 19247  T
Q  301 ttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtc 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19248 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattccaaaaaattggtgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtc 19347  T
Q  401 taatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccacc 452  Q
    ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19348 taatttacgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccacc 19399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 2)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 98 - 426
Target Start/End: Original strand, 64933 - 65261
Alignment:
Q  98 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccgnnnnnnnnnnnnnntcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaatt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||               ||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  64933 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccacccggaaaaattaaaaaaacaacgcttataggtctattttgcgagattttatgcaatt 65032  T
Q  198 ttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtgag 297  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  65033 ttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatttaaataattcaattataggtctattttgtgag 65132  T
Q  298 attttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattatag 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  65133 attttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatcccaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattatag 65232  T
Q  398 gtctaatttgtgagactttaaataatttt 426  Q
    ||||| |||| |||| |||| | ||||||    
T  65233 gtctattttgcgagattttatacaatttt 65261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 164 - 453
Target Start/End: Original strand, 65112 - 65402
Alignment:
Q  164 attataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaa 263  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| | | ||||||| |||| ||||||||| |||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  65112 attataggtctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatcccaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccgaaaa 65211  T
Q  264 -tttaaataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagt 362  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  65212 atttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatcccaattcccgcaaattggtgtagt 65311  T
Q  363 ggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccc 453  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  65312 ggcccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtggcccaccc 65402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0978 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 2)
Name: scaffold0978
Description:

Target: scaffold0978; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 166 - 462
Target Start/End: Original strand, 1171 - 1467
Alignment:
Q  166 tataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaatt 265  Q
    |||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1171 tataggtctacttttcgagattttatgcaattttgtgtcgattttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaatt 1270  T
Q  266 taaataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggt 365  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  1271 taaataattcaattatatgtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattctcgcaaattggtgtagtggt 1370  T
Q  366 ccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacatatt 462  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| || |||||||| | ||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||    
T  1371 ccacccgaaaaatttaaataattcaattatagatttaatttgcgaaactttaaacagtttttcaatggtaaattttagtggcccaccctaacatatt 1467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0978; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 164 - 285
Target Start/End: Original strand, 1282 - 1404
Alignment:
Q  164 attataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccg-aaa 262  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | | ||||||| |||| |||||||||||||||  ||||| ||| ||||||| ||||||| |||    
T  1282 attatatgtctattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattctcgcaaattggtgtagtggtccacccgaaaa 1381  T
Q  263 atttaaataattcaattatagat 285  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  1382 atttaaataattcaattatagat 1404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 182; Significance: 3e-98; HSPs: 3)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 158 - 391
Target Start/End: Original strand, 331831 - 332064
Alignment:
Q  158 tcaaggattataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacc 257  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||    
T  331831 tcaacgattataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtagtccacc 331930  T
Q  258 cgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagt 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||    
T  331931 cgaaaatttaaataattcaattatagatctattttgcgagattttatacaattttatgtcgattttaggtttcggttgatccaaattctcgcaaattggt 332030  T
Q  358 gtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaa 391  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  332031 gtagtggtccacccaaaaaatttaaataattcaa 332064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 277 - 426
Target Start/End: Original strand, 331837 - 331985
Alignment:
Q  277 attatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaa 376  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||| ||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| |||||||||||||    
T  331837 attataggtctattttgcaagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtagtccacccgaaaa 331936  T
Q  377 atttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttt 426  Q
     |||||||||||||||||||| |||| |||| |||| |||| | ||||||    
T  331937 -tttaaataattcaattatagatctattttgcgagattttatacaatttt 331985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #3
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 383 - 452
Target Start/End: Original strand, 332441 - 332510
Alignment:
Q  383 ataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccacc 452  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  332441 ataattcaattatagctctaatttgtaagactttaaacaatttttcaacagttaattttcgtggcccacc 332510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 155; Significance: 4e-82; HSPs: 4)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 174 - 364
Target Start/End: Original strand, 11253 - 11443
Alignment:
Q  174 tattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaatttaaataat 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||    
T  11253 tattttgcgagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcgtgcaaagtggtatagtggcccatccaaaaatttaaataat 11352  T
Q  274 tcaattatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtgg 364  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11353 tcaattatagatcaattttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtgg 11443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 277 - 426
Target Start/End: Original strand, 11243 - 11391
Alignment:
Q  277 attatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaa 376  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| | || |||||| ||| || ||||    
T  11243 attatagatttattttgcgagattttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcgtgcaaagtggtatagtggcccatcc-aaaa 11341  T
Q  377 atttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttt 426  Q
    ||||||||||||||||||||| || | |||| |||| |||| | ||||||    
T  11342 atttaaataattcaattatagatcaattttgcgagattttatacaatttt 11391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 98 - 142
Target Start/End: Original strand, 11166 - 11210
Alignment:
Q  98 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccaccc 142  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11166 cagtggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccaccc 11210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131; HSP #4
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 175 - 255
Target Start/End: Original strand, 11367 - 11447
Alignment:
Q  175 attttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggccca 255  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| | | ||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| | | |||||||||||    
T  11367 attttgcgagattttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggccca 11447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 277 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 303911 - 303791
Alignment:
Q  277 attatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaa 376  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||| ||  ||| | ||||||||||||| |||||      
T  303911 attaaagatttattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaaatttcggttgattcaaatttccataaagtggtgtagtggtccatccgaatt 303812  T
Q  377 atttaaataattcaattatag 397  Q
     ||| ||||||||||||||||    
T  303811 tttttaataattcaattatag 303791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 102 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 303972 - 303934
Alignment:
Q  102 ggcggagcccttcatgggctggggtgggccacggcccac 140  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  303972 ggcggagcccttcatgggctagggtgggtcacggcccac 303934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0041 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0041
Description:

Target: scaffold0041; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 279 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 82935 - 82785
Alignment:
Q  279 tatagatctattttgtgagattttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggtccacccgaaaaat 378  Q
    ||||| |||||| || ||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||  |||||||||  || |||| | | ||||||||||||||||||||     
T  82935 tataggtctattatgcgagattttatacacttttgtgtcggttttagttttcggcagatccaaatctccccaaagtggcgtagtggtccacccgaaaaaa 82836  T
Q  379 --ttaaataattcaattataggtctaatttgtgagactttaaataatttttcaa 430  Q
      ||||| ||   || |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  82835 aattaaaaaa---aaatataggtctattttgcgagactttaaacaatttttcaa 82785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0041; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 166 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 82935 - 82838
Alignment:
Q  166 tataagtctattttgcgagattttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggcgtagtggcccacccgaaaa 263  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||| || |||||| | |||||||  ||| ||  |||||||||  |  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  82935 tataggtctattatgcgagattttatacacttttgtgtcggttttagttttcggcagatccaaatctccccaaagtggcgtagtggtccacccgaaaa 82838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 1095 times since January 2019
Visitors: 4402