View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0689_low_4 (Length: 513)

Name: NF0689_low_4
Description: NF0689
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0689_low_4
NF0689_low_4
[»] chr6 (42 HSPs)
chr6 (90-507)||(25421183-25421598)
chr6 (83-507)||(6027119-6027538)
chr6 (83-507)||(33341979-33342402)
chr6 (97-504)||(16554754-16555159)
chr6 (97-504)||(16631310-16631715)
chr6 (83-504)||(16578396-16578817)
chr6 (83-504)||(16616563-16616984)
chr6 (97-504)||(16652997-16653402)
chr6 (90-508)||(34166958-34167373)
chr6 (90-507)||(34164736-34165150)
chr6 (96-504)||(27647746-27648141)
chr6 (192-507)||(13153893-13154207)
chr6 (89-483)||(411976-412369)
chr6 (89-504)||(3072639-3073052)
chr6 (96-436)||(6097398-6097726)
chr6 (96-388)||(2171525-2171823)
chr6 (96-385)||(31404671-31404966)
chr6 (96-385)||(5406196-5406490)
chr6 (96-385)||(5410521-5410815)
chr6 (96-378)||(30834539-30834828)
chr6 (96-385)||(16452325-16452621)
chr6 (98-374)||(5413401-5413682)
chr6 (212-378)||(21588931-21589095)
chr6 (212-378)||(21593664-21593828)
chr6 (212-385)||(33160348-33160521)
chr6 (212-388)||(3808701-3808877)
chr6 (303-374)||(5409076-5409146)
chr6 (129-385)||(16568953-16569193)
chr6 (96-385)||(9183028-9183323)
chr6 (212-378)||(17762990-17763155)
chr6 (215-378)||(17758026-17758188)
chr6 (212-378)||(2972943-2973107)
chr6 (215-385)||(26954283-26954450)
chr6 (303-378)||(26830127-26830200)
chr6 (212-378)||(22424829-22424995)
chr6 (303-385)||(33211182-33211262)
chr6 (212-370)||(28137420-28137576)
chr6 (232-378)||(5043648-5043792)
chr6 (303-374)||(26800679-26800748)
chr6 (470-507)||(6136179-6136216)
chr6 (313-388)||(603082-603156)
chr6 (212-331)||(4045423-4045542)
[»] chr5 (47 HSPs)
chr5 (69-507)||(25077979-25078413)
chr5 (69-507)||(25135948-25136382)
chr5 (83-507)||(40379963-40380383)
chr5 (83-507)||(40382174-40382594)
chr5 (96-507)||(10593142-10593550)
chr5 (90-507)||(16544287-16544703)
chr5 (90-507)||(16546509-16546925)
chr5 (96-502)||(22536174-22536572)
chr5 (96-504)||(29751040-29751445)
chr5 (89-500)||(29720238-29720647)
chr5 (95-500)||(29722406-29722807)
chr5 (89-504)||(9789104-9789518)
chr5 (89-504)||(18441524-18441942)
chr5 (89-503)||(16409349-16409764)
chr5 (89-436)||(26177757-26178103)
chr5 (89-436)||(26170648-26170983)
chr5 (96-385)||(25412638-25412932)
chr5 (96-385)||(13342937-13343232)
chr5 (96-385)||(30182465-30182760)
chr5 (96-385)||(36074039-36074336)
chr5 (231-385)||(37439161-37439313)
chr5 (142-383)||(13239674-13239921)
chr5 (212-378)||(213465-213630)
chr5 (212-378)||(40147261-40147425)
chr5 (212-383)||(28278316-28278485)
chr5 (212-385)||(32636824-32636995)
chr5 (96-376)||(13488079-13488365)
chr5 (212-358)||(13695713-13695859)
chr5 (212-385)||(42428427-42428598)
chr5 (303-378)||(5058136-5058209)
chr5 (104-376)||(31182857-31183133)
chr5 (96-374)||(30682930-30683212)
chr5 (96-376)||(28750661-28750947)
chr5 (104-376)||(16451965-16452242)
chr5 (313-385)||(19806463-19806534)
chr5 (303-378)||(27637616-27637689)
chr5 (96-385)||(39468546-39468841)
chr5 (313-360)||(16640961-16641008)
chr5 (212-385)||(533769-533940)
chr5 (316-376)||(4160702-4160762)
chr5 (129-402)||(33831590-33831866)
chr5 (303-378)||(27015614-27015687)
chr5 (303-385)||(8565943-8566023)
chr5 (218-372)||(316769-316922)
chr5 (212-361)||(42426255-42426403)
chr5 (303-374)||(538116-538185)
chr5 (297-376)||(33906035-33906113)
[»] chr3 (69 HSPs)
chr3 (90-507)||(3617327-3617742)
chr3 (96-507)||(25637312-25637722)
chr3 (89-507)||(4598399-4598814)
chr3 (90-507)||(10211273-10211687)
chr3 (89-507)||(4600620-4601035)
chr3 (90-507)||(10209053-10209467)
chr3 (90-507)||(10056097-10056511)
chr3 (90-507)||(10058319-10058733)
chr3 (90-507)||(10060541-10060955)
chr3 (90-507)||(10062763-10063177)
chr3 (90-507)||(10064985-10065399)
chr3 (96-504)||(54635008-54635412)
chr3 (96-505)||(45282866-45283276)
chr3 (96-504)||(6716383-6716789)
chr3 (90-315)||(10067207-10067431)
chr3 (96-504)||(800974-801376)
chr3 (175-504)||(7779883-7780208)
chr3 (96-246)||(6718567-6718718)
chr3 (89-503)||(23200020-23200438)
chr3 (89-501)||(23197823-23198239)
chr3 (96-385)||(5258140-5258436)
chr3 (89-388)||(9636119-9636428)
chr3 (96-385)||(45095041-45095335)
chr3 (342-507)||(10067435-10067598)
chr3 (96-385)||(5260319-5260615)
chr3 (96-385)||(7762142-7762437)
chr3 (96-385)||(37408335-37408630)
chr3 (215-385)||(19683885-19684054)
chr3 (96-385)||(7764344-7764636)
chr3 (104-385)||(9581167-9581454)
chr3 (212-385)||(34491212-34491383)
chr3 (212-376)||(4569952-4570115)
chr3 (104-385)||(39153358-39153645)
chr3 (212-388)||(49199462-49199638)
chr3 (212-385)||(29196383-29196555)
chr3 (96-385)||(40735259-40735554)
chr3 (212-388)||(43401794-43401970)
chr3 (303-388)||(43403737-43403821)
chr3 (212-385)||(40734498-40734669)
chr3 (212-378)||(41819526-41819691)
chr3 (212-385)||(44331545-44331716)
chr3 (303-378)||(6095603-6095676)
chr3 (216-372)||(30236129-30236283)
chr3 (215-374)||(22835010-22835167)
chr3 (104-361)||(760731-760995)
chr3 (303-378)||(54593795-54593868)
chr3 (303-385)||(16499120-16499200)
chr3 (315-388)||(40913395-40913467)
chr3 (230-385)||(51398833-51398985)
chr3 (96-385)||(5236454-5236748)
chr3 (212-385)||(44700476-44700646)
chr3 (314-373)||(27305719-27305777)
chr3 (104-385)||(32744433-32744710)
chr3 (129-385)||(29682269-29682530)
chr3 (214-373)||(31314447-31314604)
chr3 (212-370)||(46860474-46860631)
chr3 (303-376)||(47304342-47304413)
chr3 (212-374)||(53921511-53921671)
chr3 (313-378)||(55301975-55302040)
chr3 (231-385)||(29813083-29813234)
chr3 (232-361)||(29810889-29811016)
chr3 (313-372)||(46173457-46173515)
chr3 (230-385)||(9666463-9666616)
chr3 (212-284)||(5433971-5434046)
chr3 (313-376)||(2075081-2075143)
chr3 (214-374)||(32891105-32891264)
chr3 (303-385)||(23391906-23391986)
chr3 (217-382)||(4055763-4055926)
chr3 (297-357)||(33191916-33191974)
[»] chr7 (65 HSPs)
chr7 (84-507)||(6594434-6594853)
chr7 (89-507)||(18392072-18392486)
chr7 (69-507)||(32060198-32060635)
chr7 (89-507)||(18388636-18389050)
chr7 (83-507)||(6592216-6592636)
chr7 (96-478)||(20343780-20344158)
chr7 (85-449)||(24789713-24790074)
chr7 (289-508)||(1560540-1560757)
chr7 (96-282)||(1562103-1562287)
chr7 (89-503)||(39731243-39731656)
chr7 (90-436)||(43504102-43504448)
chr7 (96-388)||(25766953-25767246)
chr7 (96-388)||(35853791-35854089)
chr7 (96-385)||(29990931-29991225)
chr7 (96-388)||(48408678-48408979)
chr7 (96-385)||(23554916-23555212)
chr7 (212-385)||(34310712-34310884)
chr7 (142-385)||(25615785-25616025)
chr7 (96-385)||(4178651-4178945)
chr7 (129-385)||(19502088-19502350)
chr7 (212-378)||(22269973-22270137)
chr7 (212-385)||(14069830-14070001)
chr7 (212-385)||(14379858-14380029)
chr7 (212-385)||(41317431-41317602)
chr7 (96-374)||(30024740-30025024)
chr7 (212-378)||(8359319-8359485)
chr7 (303-378)||(32358058-32358131)
chr7 (212-378)||(29608737-29608901)
chr7 (212-361)||(48491579-48491727)
chr7 (212-385)||(27347817-27347988)
chr7 (231-385)||(41649008-41649158)
chr7 (96-376)||(43864120-43864406)
chr7 (212-378)||(48599338-48599502)
chr7 (313-378)||(3259095-3259159)
chr7 (316-388)||(2390385-2390456)
chr7 (313-377)||(6432071-6432134)
chr7 (212-372)||(4253538-4253697)
chr7 (212-385)||(8153342-8153513)
chr7 (212-385)||(18126644-18126815)
chr7 (212-376)||(2360978-2361140)
chr7 (212-378)||(4508710-4508874)
chr7 (230-385)||(31732966-31733118)
chr7 (142-373)||(47673953-47674189)
chr7 (96-374)||(47676144-47676428)
chr7 (316-385)||(48489534-48489602)
chr7 (96-214)||(24514934-24515052)
chr7 (212-376)||(4586161-4586323)
chr7 (313-376)||(18396418-18396481)
chr7 (313-376)||(30814536-30814598)
chr7 (233-376)||(22328395-22328538)
chr7 (212-284)||(23343975-23344048)
chr7 (231-374)||(23565069-23565210)
chr7 (303-376)||(24525508-24525579)
chr7 (212-283)||(24525992-24526065)
chr7 (303-374)||(31518993-31519063)
chr7 (212-385)||(36146405-36146576)
chr7 (303-378)||(4510552-4510625)
chr7 (303-378)||(4512394-4512467)
chr7 (297-376)||(5513673-5513749)
chr7 (303-361)||(496003-496060)
chr7 (445-503)||(24790230-24790288)
chr7 (303-372)||(2759207-2759274)
chr7 (303-376)||(31105399-31105470)
chr7 (303-363)||(1113748-1113807)
chr7 (317-385)||(12097864-12097931)
[»] chr2 (40 HSPs)
chr2 (89-507)||(12647262-12647676)
chr2 (192-508)||(13655904-13656220)
chr2 (96-504)||(6266574-6266979)
chr2 (96-503)||(32289448-32289853)
chr2 (89-503)||(4484211-4484632)
chr2 (104-503)||(30833229-30833633)
chr2 (96-385)||(45099631-45099926)
chr2 (96-502)||(4503017-4503424)
chr2 (96-385)||(5723252-5723546)
chr2 (96-385)||(36205661-36205955)
chr2 (96-500)||(36987961-36988367)
chr2 (96-385)||(2334414-2334709)
chr2 (212-378)||(45726929-45727093)
chr2 (231-385)||(6595002-6595154)
chr2 (230-385)||(34139767-34139920)
chr2 (212-376)||(29867869-29868031)
chr2 (217-376)||(33648176-33648335)
chr2 (104-385)||(723741-724028)
chr2 (212-383)||(24398055-24398228)
chr2 (96-385)||(38312116-38312411)
chr2 (104-361)||(42362236-42362500)
chr2 (303-378)||(35446888-35446961)
chr2 (230-373)||(14633834-14633975)
chr2 (303-378)||(1631736-1631809)
chr2 (303-385)||(17057366-17057446)
chr2 (303-385)||(17085349-17085429)
chr2 (212-385)||(36773562-36773733)
chr2 (313-385)||(39284936-39285007)
chr2 (303-385)||(36318006-36318086)
chr2 (303-376)||(17490154-17490225)
chr2 (212-385)||(11151588-11151759)
chr2 (212-347)||(13121769-13121901)
chr2 (313-385)||(17450678-17450748)
chr2 (318-370)||(28672036-28672088)
chr2 (313-376)||(42288117-42288178)
chr2 (303-385)||(11067396-11067476)
chr2 (303-385)||(33162447-33162527)
chr2 (96-188)||(39284761-39284853)
chr2 (313-378)||(7451218-7451281)
chr2 (313-358)||(42412118-42412162)
[»] chr1 (57 HSPs)
chr1 (89-507)||(44203510-44203924)
chr1 (96-505)||(9036301-9036706)
chr1 (89-504)||(40282251-40282664)
chr1 (96-504)||(21053841-21054245)
chr1 (89-504)||(9987076-9987489)
chr1 (90-504)||(20622118-20622529)
chr1 (89-503)||(51765262-51765684)
chr1 (211-385)||(13316348-13316521)
chr1 (96-385)||(20762548-20762844)
chr1 (215-500)||(8550670-8550952)
chr1 (96-385)||(3189207-3189502)
chr1 (96-385)||(3198024-3198319)
chr1 (96-385)||(3206863-3207158)
chr1 (212-378)||(37168297-37168462)
chr1 (96-385)||(3156742-3157036)
chr1 (212-378)||(13547093-13547257)
chr1 (96-385)||(28220223-28220518)
chr1 (212-388)||(42297968-42298143)
chr1 (212-378)||(13549004-13549168)
chr1 (212-378)||(29136247-29136412)
chr1 (212-378)||(47255343-47255508)
chr1 (212-378)||(7482234-7482399)
chr1 (212-376)||(44455160-44455322)
chr1 (212-378)||(11348698-11348862)
chr1 (215-385)||(834164-834332)
chr1 (212-385)||(4552634-4552805)
chr1 (231-385)||(28265551-28265702)
chr1 (212-361)||(37503577-37503722)
chr1 (212-378)||(47115171-47115337)
chr1 (230-378)||(31925711-31925856)
chr1 (212-385)||(37033068-37033241)
chr1 (96-385)||(28223418-28223713)
chr1 (303-378)||(28242396-28242469)
chr1 (96-385)||(31659114-31659409)
chr1 (212-385)||(49918350-49918521)
chr1 (303-385)||(13659333-13659413)
chr1 (313-378)||(193711-193775)
chr1 (212-385)||(45644351-45644523)
chr1 (230-377)||(34603595-34603740)
chr1 (217-357)||(22079322-22079461)
chr1 (303-385)||(46065009-46065089)
chr1 (212-376)||(19754494-19754657)
chr1 (212-374)||(50169218-50169378)
chr1 (212-361)||(23555286-23555433)
chr1 (212-385)||(50167172-50167343)
chr1 (212-358)||(1833522-1833667)
chr1 (313-378)||(37876770-37876834)
chr1 (104-385)||(3847118-3847405)
chr1 (297-355)||(6808538-6808595)
chr1 (96-188)||(13316518-13316610)
chr1 (303-361)||(36683771-36683828)
chr1 (313-370)||(8871074-8871130)
chr1 (233-284)||(928071-928123)
chr1 (297-353)||(5459991-5460046)
chr1 (217-284)||(12318618-12318685)
chr1 (313-385)||(13137973-13138044)
chr1 (230-286)||(32736952-32737007)
[»] scaffold0565 (1 HSPs)
scaffold0565 (89-507)||(2480-2894)
[»] scaffold0674 (1 HSPs)
scaffold0674 (69-507)||(3602-4037)
[»] chr4 (64 HSPs)
chr4 (95-507)||(7124784-7125194)
chr4 (90-507)||(7122560-7122975)
chr4 (90-507)||(8395483-8395896)
chr4 (90-507)||(8393274-8393687)
chr4 (83-507)||(5138161-5138583)
chr4 (83-507)||(5135935-5136358)
chr4 (89-504)||(31495188-31495611)
chr4 (96-385)||(13992289-13992578)
chr4 (96-378)||(29999809-30000097)
chr4 (96-385)||(56178633-56178928)
chr4 (96-385)||(48142918-48143215)
chr4 (96-383)||(52095361-52095654)
chr4 (6-83)||(31159673-31159750)
chr4 (226-385)||(5370079-5370237)
chr4 (216-388)||(2209717-2209889)
chr4 (96-373)||(9927467-9927749)
chr4 (212-378)||(41964415-41964580)
chr4 (96-385)||(34570411-34570706)
chr4 (212-378)||(46703500-46703666)
chr4 (232-388)||(12119559-12119714)
chr4 (212-385)||(47038408-47038577)
chr4 (212-385)||(12739547-12739718)
chr4 (231-385)||(12743922-12744073)
chr4 (231-385)||(12745311-12745462)
chr4 (212-376)||(26364236-26364398)
chr4 (96-373)||(37740502-37740784)
chr4 (212-376)||(40632445-40632607)
chr4 (303-378)||(50673851-50673924)
chr4 (230-378)||(6655975-6656120)
chr4 (212-378)||(12073392-12073557)
chr4 (212-378)||(41639426-41639590)
chr4 (212-361)||(8665408-8665556)
chr4 (212-385)||(26175633-26175804)
chr4 (238-376)||(26699447-26699585)
chr4 (212-385)||(36463386-36463557)
chr4 (219-376)||(5207848-5208003)
chr4 (303-378)||(8648230-8648303)
chr4 (212-376)||(36994524-36994686)
chr4 (212-376)||(54883020-54883182)
chr4 (230-374)||(379399-379541)
chr4 (212-372)||(37229731-37229890)
chr4 (214-385)||(46147388-46147557)
chr4 (303-385)||(48893635-48893715)
chr4 (303-388)||(50262694-50262778)
chr4 (96-385)||(5429555-5429850)
chr4 (212-373)||(27416974-27417133)
chr4 (212-385)||(45687179-45687351)
chr4 (313-376)||(6542185-6542247)
chr4 (303-385)||(5871911-5871991)
chr4 (303-373)||(35662532-35662600)
chr4 (312-385)||(52467351-52467423)
chr4 (212-361)||(54199926-54200074)
chr4 (266-376)||(4588014-4588121)
chr4 (212-284)||(12747851-12747924)
chr4 (96-284)||(52082752-52082949)
chr4 (303-376)||(31474242-31474313)
chr4 (231-341)||(12744087-12744195)
chr4 (313-385)||(29254594-29254665)
chr4 (299-355)||(33089966-33090021)
chr4 (266-357)||(33989899-33989989)
chr4 (337-385)||(52082660-52082708)
chr4 (303-361)||(13009464-13009521)
chr4 (9-42)||(31034801-31034834)
chr4 (96-168)||(52093885-52093956)
[»] scaffold0137 (1 HSPs)
scaffold0137 (96-507)||(6158-6567)
[»] chr8 (47 HSPs)
chr8 (94-507)||(15290406-15290816)
chr8 (94-507)||(15470775-15471185)
chr8 (69-507)||(42575201-42575635)
chr8 (90-504)||(25689832-25690243)
chr8 (96-504)||(3439387-3439791)
chr8 (89-503)||(2627609-2628024)
chr8 (96-385)||(34254327-34254620)
chr8 (96-385)||(17982529-17982825)
chr8 (96-385)||(31218133-31218429)
chr8 (104-385)||(34256503-34256788)
chr8 (96-385)||(44303730-44304027)
chr8 (96-483)||(42498070-42498459)
chr8 (104-385)||(19945355-19945644)
chr8 (96-384)||(1746216-1746510)
chr8 (96-385)||(43036299-43036594)
chr8 (212-378)||(42434995-42435159)
chr8 (212-385)||(15212786-15212957)
chr8 (214-385)||(40321082-40321251)
chr8 (212-378)||(4283524-4283688)
chr8 (212-385)||(33352150-33352321)
chr8 (96-385)||(12702631-12702930)
chr8 (212-378)||(18655400-18655564)
chr8 (212-385)||(27811278-27811449)
chr8 (303-385)||(4743211-4743291)
chr8 (212-385)||(3303667-3303838)
chr8 (302-361)||(1345391-1345449)
chr8 (313-376)||(10930205-10930267)
chr8 (313-376)||(40221845-40221907)
chr8 (303-385)||(5689362-5689442)
chr8 (215-355)||(40328782-40328922)
chr8 (104-385)||(6598856-6599143)
chr8 (104-385)||(6674309-6674596)
chr8 (313-376)||(4733806-4733868)
chr8 (212-375)||(18141821-18141981)
chr8 (218-361)||(30143346-30143488)
chr8 (266-375)||(41366622-41366727)
chr8 (313-378)||(11384085-11384149)
chr8 (212-373)||(30291606-30291767)
chr8 (212-385)||(4731658-4731829)
chr8 (212-251)||(8965820-8965859)
chr8 (313-376)||(10015180-10015241)
chr8 (212-375)||(1292471-1292631)
chr8 (212-284)||(9765745-9765818)
chr8 (215-283)||(44353796-44353865)
chr8 (313-374)||(7597715-7597776)
chr8 (104-214)||(10929685-10929794)
chr8 (96-168)||(30143218-30143289)
[»] scaffold0491 (2 HSPs)
scaffold0491 (89-503)||(11042-11463)
scaffold0491 (89-503)||(8616-9037)
[»] scaffold1808 (1 HSPs)
scaffold1808 (349-507)||(1-157)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (96-383)||(434409-434703)
[»] scaffold1519 (1 HSPs)
scaffold1519 (96-385)||(793-1087)
[»] scaffold0286 (2 HSPs)
scaffold0286 (212-388)||(11557-11732)
scaffold0286 (96-162)||(22220-22286)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (212-385)||(114602-114774)
[»] scaffold0176 (1 HSPs)
scaffold0176 (231-378)||(18007-18151)
[»] scaffold0236 (1 HSPs)
scaffold0236 (313-376)||(10589-10651)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (303-385)||(149094-149174)
[»] scaffold0466 (1 HSPs)
scaffold0466 (212-378)||(7327-7491)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (212-376)||(20421-20583)
[»] scaffold0219 (1 HSPs)
scaffold0219 (313-370)||(27453-27510)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 372; Significance: 0; HSPs: 42)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 372; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 90 - 507
Target Start/End: Original strand, 25421183 - 25421598
Alignment:
Q  90 gttggaagagagagacttgggaaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgt 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25421183 gttggaagagagagacttgggaaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgt 25421282  T
Q  190 aaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcctg 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  25421283 aaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttg 25421382  T
Q  290 tatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttt 389  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25421383 tatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttt 25421482  T
Q  390 ggtgctt-ttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgtcgctttgtgtttcacacttggttcctggattagatctaggtggtgttttgtt 488  Q
     ||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25421483 -gtgtttattgttttcttcttcc--ctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgtt 25421579  T
Q  489 gtttcttgcttgcacaata 507  Q
    |||||||||||||||||||    
T  25421580 gtttcttgcttgcacaata 25421598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 83 - 507
Target Start/End: Original strand, 6027119 - 6027538
Alignment:
Q  83 gagagaagttggaagagagagacttgggaaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaac 182  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6027119 gagagaggttggaagagagagacttgggaaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaac 6027218  T
Q  183 accttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaa 282  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6027219 accttgta--gagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaa 6027316  T
Q  283 cctcctgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaa 382  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6027317 cctcttgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtatgtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 6027416  T
Q  383 tctctttggtgctt-ttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgtcgctttgtgtttcacacttggttcctggattagatctaggtggtg 481  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||||  | | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6027417 tctctttg-tgtttattgttttcttcttccctc--cat-tttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtg 6027512  T
Q  482 ttttgttgtttcttgcttgcacaata 507  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  6027513 ttttgttgtttcttgcttgcacaata 6027538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 83 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 33342402 - 33341979
Alignment:
Q  83 gagagaagttggaagagagagacttgggaaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaac 182  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33342402 gagagaatttggaagagagagacttgggaaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaac 33342303  T
Q  183 accttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaac-ttgtcaagctaatttcttgta 281  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33342302 accttgta--gagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgta 33342205  T
Q  282 acctcctgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgacca 381  Q
    ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33342204 acctcttgtactccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgacca 33342105  T
Q  382 atctctttggtgctt-ttgttttcttcttccctctcc-ttgtttatcttgtgatt-gtcgctttgtgtttcacacttggttcctggattagatctaggtg 478  Q
    |||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33342104 atctcttt-gtgtttattgttttcttcttccctctcctttgtttatcttgtgtttagttgctt--tgtttcacacttggttcctagattagatctaggtg 33342008  T
Q  479 gtgttttgttgtttcttgcttgcacaata 507  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33342007 gtgttttgttgtttcttgcttgcacaata 33341979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 97 - 504
Target Start/End: Original strand, 16554754 - 16555159
Alignment:
Q  97 gagagagacttgggaaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagaga 196  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16554754 gagagagacttggggaatcaaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagaga 16554853  T
Q  197 gaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcctgtatccct 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  16554854 gaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatccct 16554953  T
Q  297 tttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttggtgctt 396  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |    
T  16554954 tttgt-aagaactcatttgatagtggattggagagtgcaaactctcctccaaagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtat 16555052  T
Q  397 ttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgtcgctttgtgtttcacacttggttcctggattagatctaggtggtgttttgttgtttcttg 496  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16555053 ttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgt-gctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttgttg 16555151  T
Q  497 cttgcaca 504  Q
    ||||||||    
T  16555152 cttgcaca 16555159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 97 - 504
Target Start/End: Original strand, 16631310 - 16631715
Alignment:
Q  97 gagagagacttgggaaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagaga 196  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16631310 gagagagacttggggaatcaaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagaga 16631409  T
Q  197 gaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcctgtatccct 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  16631410 gaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatccct 16631509  T
Q  297 tttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttggtgctt 396  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |    
T  16631510 tttgt-aagaactcatttgatagtggattggagagtgcaaactctcctccaaagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtat 16631608  T
Q  397 ttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgtcgctttgtgtttcacacttggttcctggattagatctaggtggtgttttgttgtttcttg 496  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16631609 ttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgt-gctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttgttg 16631707  T
Q  497 cttgcaca 504  Q
    ||||||||    
T  16631708 cttgcaca 16631715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 83 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 16578817 - 16578396
Alignment:
Q  83 gagagaagttggaag--agagagacttgggaaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaa 180  Q
    ||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16578817 gagaggagttggaagtgagagagacttggggaatcaaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaa 16578718  T
Q  181 acaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgt 280  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16578717 acacgttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgctcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgt 16578618  T
Q  281 aacctcctgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgacc 380  Q
    |||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16578617 aaccttttgtatcccttttgt-aagaactcatttgatagtggattggagagtgcaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaac 16578519  T
Q  381 aatctctttggtgcttttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgtcgctttgtgtttcacacttggttcctggattagatctaggtggt 480  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  16578518 aatctctttggtgtatttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgt-gctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggt 16578420  T
Q  481 gttttgttgtttcttgcttgcaca 504  Q
    |||||||||||| |||||||||||    
T  16578419 gttttgttgtttgttgcttgcaca 16578396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 83 - 504
Target Start/End: Original strand, 16616563 - 16616984
Alignment:
Q  83 gagagaagttggaag--agagagacttgggaaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaa 180  Q
    ||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16616563 gagaggagttggaagtgagagagacttggggaatcaaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaa 16616662  T
Q  181 acaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgt 280  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16616663 acacgttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgctcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgt 16616762  T
Q  281 aacctcctgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgacc 380  Q
    |||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16616763 aaccttttgtatcccttttgt-aagaactcatttgatagtggattggagagtgcaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaac 16616861  T
Q  381 aatctctttggtgcttttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgtcgctttgtgtttcacacttggttcctggattagatctaggtggt 480  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  16616862 aatctctttggtgtatttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgt-gctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggt 16616960  T
Q  481 gttttgttgtttcttgcttgcaca 504  Q
    |||||||||||| |||||||||||    
T  16616961 gttttgttgtttgttgcttgcaca 16616984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 97 - 504
Target Start/End: Original strand, 16652997 - 16653402
Alignment:
Q  97 gagagagacttgggaaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagaga 196  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16652997 gagagagacttggagaatcaaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagaga 16653096  T
Q  197 gaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcctgtatccct 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  16653097 gaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtaaaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatccct 16653196  T
Q  297 tttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttggtgctt 396  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |    
T  16653197 tttgt-aagaactcatttgatagtggattggagagtgcaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtat 16653295  T
Q  397 ttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgtcgctttgtgtttcacacttggttcctggattagatctaggtggtgttttgttgtttcttg 496  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16653296 ttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgt-gctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttgttg 16653394  T
Q  497 cttgcaca 504  Q
    ||||||||    
T  16653395 cttgcaca 16653402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 90 - 508
Target Start/End: Original strand, 34166958 - 34167373
Alignment:
Q  90 gttggaagagagagacttgggaaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgt 189  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34166958 gttgaaagagagagacttgggaaatcaaaggggaagctctagagtttagggttctttgattagagtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgt 34167057  T
Q  190 aaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaacctcct 288  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  34167058 a--gagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctctt 34167155  T
Q  289 gtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctt 388  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34167156 gtattccttttgtaaagaacttatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctt 34167255  T
Q  389 tggtgctt-ttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgtcgctttgtgtttcacacttggttcctggattagatctaggtggtgttttgt 487  Q
    | ||| || ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  34167256 t-gtgtttattgttttcttcttccctctccttg--tatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagatttgatctaggtggtgttttgt 34167352  T
Q  488 tgtttcttgcttgcacaatat 508  Q
    ||||| |||||||| ||||||    
T  34167353 tgttttttgcttgctcaatat 34167373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 90 - 507
Target Start/End: Original strand, 34164736 - 34165150
Alignment:
Q  90 gttggaagagagagacttgggaaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgt 189  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34164736 gttgaaagagagagacttgggaaatcaaaggggaagctctagagtttagggttctttgattagagtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgt 34164835  T
Q  190 aaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaacctcct 288  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  34164836 a--gagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctctt 34164933  T
Q  289 gtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctt 388  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34164934 gtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctt 34165033  T
Q  389 tggtgctt-ttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgatt-gtcgctttgtgtttcacacttggttcctggattagatctaggtggtgttttg 486  Q
    | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||  ||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  34165034 t-gtgtttattgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgtttagttgctt--tgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtg-tttg 34165129  T
Q  487 ttgtttcttgcttgcacaata 507  Q
    ||||||||||||||| |||||    
T  34165130 ttgtttcttgcttgctcaata 34165150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 96 - 504
Target Start/End: Original strand, 27647746 - 27648141
Alignment:
Q  96 agagagagacttgggaaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaaga 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||    
T  27647746 agagagagacttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccatgta--ga 27647843  T
Q  195 gagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcctgtatcc 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  27647844 gagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcc 27647943  T
Q  295 cttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttggtgc 394  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  27647944 cttttgt-aagaactc-tttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtagatcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctc-ttggtgc 27648040  T
Q  395 ttttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgtcgctttgtgtttcacacttggttcctggattagatctaggtggtgttttgttgtttct 494  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||       |  ||| ||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |    
T  27648041 ttttgttttcttcttccctctcct--tttatcttgt-------gtattgagtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattat 27648131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 192 - 507
Target Start/End: Original strand, 13153893 - 13154207
Alignment:
Q  192 agagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaacctcctgt 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13153893 agagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgt 13153992  T
Q  291 atcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttg 390  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  13153993 attccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttt- 13154091  T
Q  391 gtgctt-ttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgtcgctttgtgtttcacacttggttcctggattagatctaggtggtgttttgttg 489  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||    
T  13154092 gtgtttattgttttcttcttccctctccttg--tatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattcgatctaggtggtgtattgttg 13154189  T
Q  490 tttcttgcttgcacaata 507  Q
    |||||||||||| |||||    
T  13154190 tttcttgcttgctcaata 13154207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 89 - 483
Target Start/End: Original strand, 411976 - 412369
Alignment:
Q  89 agttggaagagagaga--cttgggaaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacacc 185  Q
    ||||||||||||||||  |||| |||||||||||| | | ||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  411976 agttggaagagagagaaacttgagaaatcaaagggagtaactctagggtttagagt-ctttgattagagcttctcttgggttgaaaacatgggaaacacc 412074  T
Q  186 ttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaacc 284  Q
    ||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||     
T  412075 ttgaagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaaaggtagaaattagggtt-gttcattgtgaacttatcaaatctaatttcttgtaact 412173  T
Q  285 --tcctgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaa 382  Q
      |  |||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  412174 ctttttgtatctcttttgtaa-gaactcatt-gatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 412271  T
Q  383 tctctttggtgcttttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgtcgctttgtgtttcacacttggttcctggattagatctaggtggtgt 482  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |  ||||||||  |||||| | ||| ||||||||||||||| |||    
T  412272 tctctttggtgtatttgttttcttcttccctctcct--tttatcttgtgcttgt-gtattgtgtttttcacttgttacctagattagatctaggtgctgt 412368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 89 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 3073052 - 3072639
Alignment:
Q  89 agttggaagagagagacttgggaaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacacct 186  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  3073052 agttggaagagagaaacttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagagt-ctttgattagagcttctcttgggttgggaaacatgggaaacacct 3072954  T
Q  187 tgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaa--c 283  Q
    || | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||  |    
T  3072953 tgaagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaatggtagaaattaggg-ttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactc 3072855  T
Q  284 ctcctgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaat 383  Q
     |  |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3072854 tttttgtatctcttttgt-aagaactca-ttgatagtgaattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaat 3072757  T
Q  384 ctctttggtgcttttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgtcgctttgtgtttcacacttggttcctggattagatctaggtggt-gt 482  Q
    ||| ||||||  ||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| |||| | ||| || ||  |||||| ||||| ||||||||||| ||| |  |    
T  3072756 ctc-ttggtgtctttgttttcctcttccctctcct--tttatcttgtgcttgt-gttttatgcttttcacttgtttcctagattagatctatgtgctatt 3072661  T
Q  483 tttgttgtttcttgcttgcaca 504  Q
    ||||||| || |||||||||||    
T  3072660 tttgttgattattgcttgcaca 3072639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 96 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 6097726 - 6097398
Alignment:
Q  96 agagagagacttgggaaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaag 193  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||||||   ||    
T  6097726 agagagaaacttgggaaatcaaagggagcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctctttggttgggaaacatggtaaacaccttggtgag 6097627  T
Q  194 agagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaacctcctgtat 292  Q
     || ||||||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||| || |||| | |||||||||||||  |||||||||||||||             
T  6097626 tgaaaatcattgagtgttttggtgagattggaaaaatggtagaaattaggatt-gttctttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaact-------- 6097536  T
Q  293 cccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttggt 392  Q
      ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6097535 --cttttgtaa-gaactcatt-gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggt 6097440  T
Q  393 gcttttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgt 436  Q
    |  ||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  6097439 gtctttgttttcctcttccctctccttg--tatcttgtgattgt 6097398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 96 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 2171823 - 2171525
Alignment:
Q  96 agagagagacttgggaaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaag 193  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   ||    
T  2171823 agagagaaacttgggaaatcaaagggagcaactctagggtttagggt-ctttgattagagtttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgag 2171725  T
Q  194 agagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaagg-ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc 284  Q
     || |||||||||||||||||       ||||||||||||||   |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2171724 tgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacc 2171626  T
Q  285 tcctgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatc 384  Q
       |||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2171625 ctttgtatctcttt-gtaa-gaactcatt-gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatc 2171529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 96 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 31404966 - 31404671
Alignment:
Q  96 agagagagacttgggaaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttg-aaaacatgggaaacaccttgtaaag 193  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || | || |||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||||   ||    
T  31404966 agagagaaacttgggaaatcaaaggaggcaactttagggtttagggtcttttgattagagt-tctcttgggttggaaaacattgtaaacaccttggtgag 31404868  T
Q  194 agagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc- 284  Q
     || |||||||||||||||||       ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  31404867 tgaaaatcattgagtgtcttgttcatcagtgagattgggaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaaccc 31404769  T
Q  285 tcctgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatc 384  Q
    |  |||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31404768 ttttgtatctcttt-gtaa-gaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggccaagtttggaccgaactgggtgaacaatc 31404672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 96 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 5406490 - 5406196
Alignment:
Q  96 agagagagacttgggaaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaag 193  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || | || ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||  |||||| | ||||||||||   ||    
T  5406490 agagagaaacttgggaaatcaaaggaggcaactttagggtttagggt-ctttgattagagt-tctctcgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgag 5406393  T
Q  194 agagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc- 284  Q
     || |||||||||||||||||       ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  5406392 tgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaaccc 5406294  T
Q  285 tcctgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatc 384  Q
    |  |||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  5406293 ttttgtatctcttt-gtaa-gaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaactgggtgaacaatc 5406197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 96 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 5410815 - 5410521
Alignment:
Q  96 agagagagacttgggaaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaag 193  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || | || ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||  |||||| | ||||||||||   ||    
T  5410815 agagagaaacttgggaaatcaaaggaggcaactttagggtttagggt-ctttgattagagt-tctctcgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgag 5410718  T
Q  194 agagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc- 284  Q
     || |||||||||||||||||       ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  5410717 tgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaaccc 5410619  T
Q  285 tcctgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatc 384  Q
    |  |||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  5410618 ttttgtatctcttt-gtaa-gaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaactgggtgaacaatc 5410522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 96 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 30834828 - 30834539
Alignment:
Q  96 agagagagacttgggaaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaag 193  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||  | | || ||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | |||||||| |   ||    
T  30834828 agagagaaacttgagaaatcaaaggaagcaactttagggtttatggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgagaaacattgtaaacacctcggtgag 30834731  T
Q  194 agagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaag--gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac 283  Q
     || |||||||||||||||||       ||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30834730 tgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaac 30834632  T
Q  284 c-tcctgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 378  Q
    | |  |||||| |||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30834631 ccttttgtatctctttgg--aagaactcatt-gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 30834539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 96 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 16452621 - 16452325
Alignment:
Q  96 agagagagacttgggaaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaag 193  Q
    ||||||| ||||||||||||||||   | | || ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||   ||    
T  16452621 agagagaaacttgggaaatcaaagtaagcaactttagagtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttggtgag 16452524  T
Q  194 agagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaag--gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac 283  Q
     || |||||||||||||||||       ||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16452523 tgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaac 16452425  T
Q  284 ctcctg-tatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaa 382  Q
    |   |  |||| |||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16452424 cctttcatatctctttgg--aagaactcatt-gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 16452328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 98 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 5413682 - 5413401
Alignment:
Q  98 agagagacttgggaaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagag 195  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || | || ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||  |||||| | |||||| |||   || |    
T  5413682 agagaaacttgggaaatcaaaggaggcaactttagggtttagggt-ctttgattagagt-tctctcgggttgggaaacattgtaaacacattggtgagtg 5413585  T
Q  196 agaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-tc 286  Q
    | |||||||||||||||||       ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| | | ||||||||||| ||||||||||||||||| |     
T  5413584 aaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaggtagaaattagggtt-gttctttgcgaacttgtcaaagctaatttcttgtaaccctt 5413486  T
Q  287 ctgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgg 374  Q
     |||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5413485 ttgtatctcttt-gtaa-gaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgg 5413401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 212 - 378
Target Start/End: Original strand, 21588931 - 21589095
Alignment:
Q  212 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctcct-gtatcccttttgtaaagaac 308  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||   | ||||| |||| |||| ||||    
T  21588931 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaac 21589027  T
Q  309 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 378  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21589028 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtga 21589095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 212 - 378
Target Start/End: Original strand, 21593664 - 21593828
Alignment:
Q  212 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctcct-gtatcccttttgtaaagaac 308  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||   | ||||| |||| |||| ||||    
T  21593664 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaac 21593760  T
Q  309 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 378  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21593761 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtga 21593828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 212 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 33160521 - 33160348
Alignment:
Q  212 ttggtgagattgggaaagg--ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac-ctcctgtatcccttttgtaaagaa 307  Q
    |||||||||||||||||    |||||||||||| ||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| ||  |||||| | ||||| |||||    
T  33160521 ttggtgagattgggaaaaaaaggtagaaattagagtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaactcttttgtatctc-tttgt-aagaa 33160425  T
Q  308 ctcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 385  Q
    |||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  33160424 ctca-ttgatggtggattggagagatcaatctctcctccagagtatttcaagtttggaccaaactgggtgaacaatct 33160348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 212 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 3808877 - 3808701
Alignment:
Q  212 ttggtgagattgggaaagg-ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc--tcctgtatcccttttgtaaagaa 307  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||| | |||| |||||  || ||||||||||||||||  |  |||||| |||| |||| |||    
T  3808877 ttggtgagattgggaaaataggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaaactaatttcttgtaacccattttgtatctcttt-gtaa-gaa 3808781  T
Q  308 ctcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctt 388  Q
    |||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||||    
T  3808780 ctcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcatgattggaccgaactaggtgaacaatctctt 3808701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 303 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 5409146 - 5409076
Alignment:
Q  303 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgg 374  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5409146 aagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgg 5409076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 129 - 385
Target Start/End: Original strand, 16568953 - 16569193
Alignment:
Q  129 tagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtt-gaaaacatgggaaacaccttgta-aagagagaatcattgagtgtcttggtgagattggga 226  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| | |||||| | ||||||||||   ||| || |||||||||||||||||   |||||| ||    
T  16568953 tagggttaagggt-ctttgattagagt-tctcttgggtttggaaacattgtaaacaccttgggtaagtgaaaatcattgagtgtcttg---agattgaga 16569047  T
Q  227 aag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctcctgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggat 324  Q
    ||  |||||||||||||| ||||||| | |||| |||||  ||||||||||||||||||||            |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  16569048 aaatgggtagaaattaggttttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacct------------ttgtaa-gaactcatt-gatagtggat 16569133  T
Q  325 tggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 385  Q
    |||||||  |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  16569134 tggagagatcaatctctcctccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 16569193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 96 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 9183323 - 9183028
Alignment:
Q  96 agagagagacttgggaaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaa-a 192  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || | || ||||||| ||||| ||||||||||||| |||| |||||||  |||||| | ||||||||||    |    
T  9183323 agagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcctgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtga 9183226  T
Q  193 gagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac 283  Q
    | || |||||||||||||||||       ||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||| ||||  ||||||||||||||||||    
T  9183225 gtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaatttgttgaagctaatttcttgtaac 9183127  T
Q  284 ctcct-gtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaa 382  Q
    |   | ||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| | |||    
T  9183126 ccatttgtatctcttt-gtaa-gaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagattatgtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaa 9183031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 212 - 378
Target Start/End: Original strand, 17762990 - 17763155
Alignment:
Q  212 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctcctgtatcccttttgtaaagaact 309  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||| || | | |  |||||   |||||||    
T  17762990 ttggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaac-tcatttgtatctttttggaagaact 17763087  T
Q  310 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 378  Q
    |||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  17763088 catt-gatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtagatcaagtttggaccgaactaggtga 17763155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 215 - 378
Target Start/End: Original strand, 17758026 - 17758188
Alignment:
Q  215 gtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctcct-gtatcccttttgtaaagaactca 311  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||   | ||||| |||| |||| |||||||    
T  17758026 gtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaactca 17758122  T
Q  312 tttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 378  Q
    || |||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  17758123 tt-gatagtggattggagagatcaatctcccctctagagtagttcaagtttggaccgaactaggtga 17758188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 212 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 2973107 - 2972943
Alignment:
Q  212 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctcct-gtatcccttttgtaaagaac 308  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||   | ||||| |||| |||| ||||    
T  2973107 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaac 2973011  T
Q  309 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 378  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| |||||    
T  2973010 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctcaagagtaggtcaag-ttcgaccgaactaggtga 2972943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 215 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 26954450 - 26954283
Alignment:
Q  215 gtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaac-ctcctgtatcccttttgtaaagaactcat 312  Q
    ||||||||||||||  |||| ||||||||| |||||| | |||| |||| | |||||||||||||||||| |  ||||||| | ||||| |||||||||     
T  26954450 gtgagattgggaaattggtataaattaggg-ttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatctgtatctc-tttgt-aagaactca- 26954355  T
Q  313 ttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 385  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||| | ||||||    
T  26954354 ttgatagtggattggagagatcaatctctcccccaaagtaggtcaag-ttggaccgaactaggtcaacaatct 26954283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 303 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 26830200 - 26830127
Alignment:
Q  303 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 378  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  26830200 aagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccaaagtaggtcaagttt-gactgaactgggtga 26830127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 212 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 22424995 - 22424829
Alignment:
Q  212 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc---tcctgtatcccttttgtaaaga 306  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||   |  |||||| |||| |||| ||    
T  22424995 ttggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttttgtatctcttt-gtaa-ga 22424899  T
Q  307 actcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 378  Q
    |||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||   |||||||| |||||||||    
T  22424898 actcatt--atagtggattggagagatcaatctctccttcagagtaggtcattgttggaccgtactgggtga 22424829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 303 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 33211262 - 33211182
Alignment:
Q  303 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 385  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  33211262 aagaactcattt-ataatggattggagagatcaatctctcccccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 33211182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 212 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 28137576 - 28137420
Alignment:
Q  212 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctcct-gtatcccttttgtaaagaac 308  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||   | ||||  |||| |||| ||||    
T  28137576 ttggtgagaatgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatttcttt-gtaa-gaac 28137480  T
Q  309 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaa 370  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  28137479 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagagtaggtcaag-ttggaccgaa 28137420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 232 - 378
Target Start/End: Original strand, 5043648 - 5043792
Alignment:
Q  232 gtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcctgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggag 329  Q
    |||||||||||| ||||||| | |||| |||||  |||||||||||||||||| |   |||||| |||| |||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  5043648 gtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaa-gaactcatt-gatagtagattggag 5043743  T
Q  330 agtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 378  Q
    ||  |||||||||||||| |||||||||   ||||||||||||||||||    
T  5043744 agatcaatctctcctccatagtaggtcattgttggaccgaactgggtga 5043792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 303 - 374
Target Start/End: Original strand, 26800679 - 26800748
Alignment:
Q  303 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgg 374  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  26800679 aagaactcatt--atagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcattgttggaccgaactgg 26800748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 470 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 6136216 - 6136179
Alignment:
Q  470 atctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgcacaata 507  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6136216 atctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgcacaata 6136179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 313 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 603156 - 603082
Alignment:
Q  313 ttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctt 388  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||    
T  603156 ttgatagtggattggagaaatcaatctctccccaagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatctctt 603082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 212 - 331
Target Start/End: Original strand, 4045423 - 4045542
Alignment:
Q  212 ttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaa-cctcctgtatcccttttgtaaagaact 309  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |  ||| |||| | ||||||||||||||||| | |  | |||| | |||||||| ||||    
T  4045423 ttggagagattgggaaaatggtagaaattagggtttgttctttatgagcttgttgaagctaatttcttgtaatcattttatatctc-tttgtaaataact 4045521  T
Q  310 catttgatagtggattggagag 331  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  4045522 ca-ttgatagtggattggagag 4045542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 370; Significance: 0; HSPs: 47)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 370; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 69 - 507
Target Start/End: Original strand, 25077979 - 25078413
Alignment:
Q  69 tgcaaattttaagggagagaagttggaagagagagacttgggaaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttg 168  Q
    |||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25077979 tgcagatttgaagggagag--gttggaagagagagacttgggaaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttg 25078076  T
Q  169 aaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaag 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25078077 aaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaag 25078176  T
Q  269 ctaatttcttgtaacctcctgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccg 368  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25078177 ctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccg 25078276  T
Q  369 aactgggtgaccaatctctttggtgctt-ttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgtcgctttgtgtttcacacttggttcctggatt 467  Q
    |||||||||| |||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  25078277 aactgggtgaacaatctcttt-gtgtttattgttttcttcttccctctccttg--tatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttgtttcctagatt 25078373  T
Q  468 agatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgcacaata 507  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25078374 agatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgcacaata 25078413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 370; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 69 - 507
Target Start/End: Original strand, 25135948 - 25136382
Alignment:
Q  69 tgcaaattttaagggagagaagttggaagagagagacttgggaaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttg 168  Q
    |||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25135948 tgcagatttgaagggagag--gttggaagagagagacttgggaaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttg 25136045  T
Q  169 aaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaag 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25136046 aaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaag 25136145  T
Q  269 ctaatttcttgtaacctcctgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccg 368  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25136146 ctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccg 25136245  T
Q  369 aactgggtgaccaatctctttggtgctt-ttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgtcgctttgtgtttcacacttggttcctggatt 467  Q
    |||||||||| |||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  25136246 aactgggtgaacaatctcttt-gtgtttattgttttcttcttccctctccttg--tatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttgtttcctagatt 25136342  T
Q  468 agatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgcacaata 507  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25136343 agatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgcacaata 25136382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 83 - 507
Target Start/End: Original strand, 40379963 - 40380383
Alignment:
Q  83 gagagaagttggaagagagagacttgggaaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaac 182  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40379963 gagagaggttggaagagagagacttgggaaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctctcgggttgaaaacatgggaaac 40380062  T
Q  183 accttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaa 282  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  40380063 accttgta--gagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaaactaatttcttgtaa 40380160  T
Q  283 cctcctgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaa 382  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  40380161 cctcttgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagttcaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 40380260  T
Q  383 tctctttggtgctt-ttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgtcgctttgtgtttcacacttggttcctggattagatctaggtggtg 481  Q
    ||||||| ||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40380261 tctcttt-gtgtttattgttttcttcttcc--ctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtg 40380357  T
Q  482 ttttgttgtttcttgcttgcacaata 507  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  40380358 ttttgttgtttcttgcttgcacaata 40380383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 83 - 507
Target Start/End: Original strand, 40382174 - 40382594
Alignment:
Q  83 gagagaagttggaagagagagacttgggaaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaac 182  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40382174 gagagaggttggaagagagagacttgggaaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctctcgggttgaaaacatgggaaac 40382273  T
Q  183 accttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaa 282  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40382274 accttgta--gagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaagttagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaa 40382371  T
Q  283 cctcctgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaa 382  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  40382372 cctcttgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagttcaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 40382471  T
Q  383 tctctttggtgctt-ttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgtcgctttgtgtttcacacttggttcctggattagatctaggtggtg 481  Q
    ||||||| ||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40382472 tctcttt-gtgtttattgttttcttcttcc--ctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtg 40382568  T
Q  482 ttttgttgtttcttgcttgcacaata 507  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  40382569 ttttgttgtttcttgcttgcacaata 40382594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 332; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 96 - 507
Target Start/End: Original strand, 10593142 - 10593550
Alignment:
Q  96 agagagagacttgggaaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagag 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10593142 agagagagacttgggaaatcaaagggggaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtagaaaacatgggaaacaccttgtaaagag 10593241  T
Q  196 agaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcctgtatccc 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  10593242 agaatcattgagtgtcttggtgagattgggagaagggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatccc 10593341  T
Q  296 ttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttggtgct 395  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||      
T  10593342 ttttgt-aagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctc-ttggtgta 10593439  T
Q  396 tttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgtcgctttgtgtttcacacttggttcctggattagatctaggtggtgttttgttgtttctt 495  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10593440 tttgttttctacttccctctccttgtttatcttgtgattgt-gctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttgtt 10593538  T
Q  496 gcttgcacaata 507  Q
    ||||||||||||    
T  10593539 gcttgcacaata 10593550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 90 - 507
Target Start/End: Original strand, 16544287 - 16544703
Alignment:
Q  90 gttggaagagagagacttgggaaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgt 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16544287 gttggaagagagagacttgggaaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgt 16544386  T
Q  190 aaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaacctcct 288  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |    
T  16544387 a--gagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttctcataacctctt 16544484  T
Q  289 gtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctt 388  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16544485 gtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctt 16544584  T
Q  389 tggtgctt-ttgttttcttcttccctctcc-ttgtttatcttgtgatt-gtcgctttgtgtttcacacttggttcctggattagatctaggtggtgtttt 485  Q
    | ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||  ||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  16544585 t-gtgtttattgttttcttcttccctctcctttgtttatcttgtgtttagttgctt--tgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgtttt 16544681  T
Q  486 gttgtttcttgcttgcacaata 507  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  16544682 gttgtttcttgcttgctcaata 16544703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 90 - 507
Target Start/End: Original strand, 16546509 - 16546925
Alignment:
Q  90 gttggaagagagagacttgggaaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgt 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16546509 gttggaagagagagacttgggaaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgt 16546608  T
Q  190 aaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaacctcct 288  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  16546609 a--gagagaatcattgagtgtcttggtgagattaggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctctt 16546706  T
Q  289 gtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctt 388  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16546707 gtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctt 16546806  T
Q  389 tggtgctt-ttgttttcttcttccctctcc-ttgtttatcttgtgatt-gtcgctttgtgtttcacacttggttcctggattagatctaggtggtgtttt 485  Q
    | ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||  ||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||    
T  16546807 t-gtgtttattgttttcttcttccctctcctttgtttatcttgtgtttagttgctt--tgtttcacacttgtttcctagattggatttaggtggtgtttt 16546903  T
Q  486 gttgtttcttgcttgcacaata 507  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  16546904 gttgtttcttgcttgctcaata 16546925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 96 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 22536572 - 22536174
Alignment:
Q  96 agagagagacttgggaaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaaga 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  ||    
T  22536572 agagagagacttgggaaatcaaagggagaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccctgca--ga 22536475  T
Q  195 gagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcctgtatcc 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  22536474 gagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcc 22536375  T
Q  295 cttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttggtgc 394  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  22536374 cttttgt-aagaactc-tttgatagtggattggggagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctc-ttggtgc 22536278  T
Q  395 ttttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgtcgctttgtgtttcacacttggttcctggattagatctaggtggtgttttgttgtttct 494  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| | |||| ||||| |||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||| || |    
T  22536277 ttttgttttcttcttccctcccct--tttatcttgtgattgt-gttttgagtttctcacttgtttcctagattagatctaggt-gttttttgttgattgt 22536182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 96 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 29751445 - 29751040
Alignment:
Q  96 agagagagacttgggaaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaaga 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  29751445 agagagagacttgggaaatcaaagggagcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagaga 29751346  T
Q  195 gagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctcctgtatc 293  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||    
T  29751345 gaaaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaaccttttgtatc 29751246  T
Q  294 ccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttggtg 393  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  29751245 ccttttgt-aagaactc-tttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctc-ttggtg 29751149  T
Q  394 -cttttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgtcgctttgtgtttcacacttggttcctggattagatctaggtggtgttttgttgttt 492  Q
     |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |   |||||||| |||||| || || ||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  29751148 tcttttgttttcttcttccctctcct--tttatcttgtgattgt-gtactgtgtttctcacttgttttctagattatatctaggtggtgttttgttgatt 29751052  T
Q  493 cttgcttgcaca 504  Q
     |||||||||||    
T  29751051 attgcttgcaca 29751040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 89 - 500
Target Start/End: Original strand, 29720238 - 29720647
Alignment:
Q  89 agttggaagagagaga--cttgggaaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacacc 185  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29720238 agttggaagagagagaaacttgggaaatcaaagggagcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacacc 29720337  T
Q  186 ttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc 284  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  29720338 ttgtagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggttagttcattgtgaacttgtctaatctaatttcttgtaacc 29720437  T
Q  285 tcctgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatc 384  Q
    |  |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29720438 ttttgtatcccttttgt-aagaactc-tttgatagtggattggagagtacaatctctcctctagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatc 29720535  T
Q  385 tctttggtgcttttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgtcgctttgtgtttcacacttggttcctggattagatctaggtggtgttt 484  Q
    || ||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |  ||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  29720536 tc-ttggtgtctttgttttcttcttccctctcct--tttatcttgtgattgt-gtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttt 29720631  T
Q  485 tgttgtttcttgcttg 500  Q
    ||||| || |||||||    
T  29720632 tgttgattattgcttg 29720647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 95 - 500
Target Start/End: Original strand, 29722406 - 29722807
Alignment:
Q  95 aagagagagacttgggaaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaag 193  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29722406 aagagagaaacttgggaaatcaaagggagcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagag 29722505  T
Q  194 agagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctcctgtat 292  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||  |||||    
T  29722506 agaaaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggttagttcattgtgaacttgtctaatctaatttcttgtaaccttttgtat 29722605  T
Q  293 cccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttggt 392  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  29722606 cccttttgt-aagaactc-tttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaaatttggaccgaactgggtgaacaatctc-ttggt 29722702  T
Q  393 gcttttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgtcgctttgtgtttcacacttggttcctggattagatctaggtggtgttttgttgttt 492  Q
    |  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |  ||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29722703 gtctttgttttcttcttccctctcct--tttatcttgtgattgt-gtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgatt 29722799  T
Q  493 cttgcttg 500  Q
     |||||||    
T  29722800 attgcttg 29722807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 89 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 9789518 - 9789104
Alignment:
Q  89 agttggaagagagaga--cttgggaaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacac 184  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | | ||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||    
T  9789518 agttggaagagagagaaacttgggaaatcaaagggagtaactctagggtttagagt-ctttgattagagcttctcttgggttgggaaacatgggaaacac 9789420  T
Q  185 cttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaac 283  Q
    ||||   || || ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||| | |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  9789419 cttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttggtgagattggaaaaagggtagaaattaaggtt-gttccttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaac 9789321  T
Q  284 -ctcctgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaa 382  Q
     ||  |||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9789320 tcttttgtatctcttttgtaa-gaactcatt-gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 9789223  T
Q  383 tctctttggtgcttttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgtcgctttgtgtttcacacttggttcctggattagatctaggtggtgt 482  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| |||| |  ||||||||  |||||  ||||| ||||||||||||||| |||    
T  9789222 tctctttggtgtctttgttttcctcttccctctcc--gtttatcttgtgcttgt-gtattgtgtttttcacttctttcctagattagatctaggtgctgt 9789126  T
Q  483 tttgttgtttcttgcttgcaca 504  Q
    ||||||| || |||||||||||    
T  9789125 tttgttgatttttgcttgcaca 9789104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 89 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 18441942 - 18441524
Alignment:
Q  89 agttggaagagagaga--cttgggaaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacac 184  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | | ||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||    
T  18441942 agttggaagagagagaaacttgggaaatcaaagggagtaactctagggtttagagt-ctttgattagagcttctcttgggttgggaaacatgggaaacac 18441844  T
Q  185 cttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaac 283  Q
    ||||   || || ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  18441843 cttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttggtgagattggaaaaagggtagaaattagggtt-gttccttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaac 18441745  T
Q  284 -ctcctgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaa 382  Q
     ||  |||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18441744 tcttttgtatctcttttgtaa-gaactcatt-gatagtggattggagagttcaatctctcctctagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 18441647  T
Q  383 tctctttggtgcttttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgtcgctttgtg----tttcacacttggttcctggattagatctaggtg 478  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| |||| |  |||||    |||  |||||  ||||| |||||||||||||||    
T  18441646 tctctttggtgtctttgttttcctcttccctctcc--gtttatcttgtgcttgt-gtattgtgtttttttttcacttctttcctagattagatctaggtg 18441550  T
Q  479 gtgttttgttgtttcttgcttgcaca 504  Q
     |||||||||| || |||||||||||    
T  18441549 ctgttttgttgattattgcttgcaca 18441524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 89 - 503
Target Start/End: Original strand, 16409349 - 16409764
Alignment:
Q  89 agttggaagagagaga--cttgggaaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacac 184  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | | ||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||  |||||||| ||||||    
T  16409349 agttggaagagagagaaacttgggaaatcaaagggagtaactctagggtttagagt-ctttgattagagcttctcttgggttgggaaacatggtaaacac 16409447  T
Q  185 cttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaac 283  Q
    ||||   || || ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  16409448 cttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttggtgagattggaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaac 16409546  T
Q  284 -ctcctgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaa 382  Q
     ||  |||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16409547 tcttttgtatctcttttgtaa-gaactcatt-gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 16409644  T
Q  383 tctctttggtgcttttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgtcgctttgtgtttcacac-ttggttcctggattagatctaggtggtg 481  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| |||| | ||| || ||  ||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||    
T  16409645 tctctttggtgtctttgttttcctcttccctctcct--tttatcttgtgcttgt-gttttatgcttttcactttgtttcctagattagatctaggtgttg 16409741  T
Q  482 tt-ttgttgtttcttgcttgcac 503  Q
    || |||||| || ||||||||||    
T  16409742 ttattgttgattattgcttgcac 16409764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 89 - 436
Target Start/End: Original strand, 26177757 - 26178103
Alignment:
Q  89 agttggaagagagaga--cttgggaaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacac 184  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | | ||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||  |||||||| ||||||    
T  26177757 agttggaagagagagaaacttgggaaatcaaagggagtaactctagggtttagagt-ctttgattagagcttctcttgggttgggaaacatggtaaacac 26177855  T
Q  185 cttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaac 283  Q
    ||||   || || ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  26177856 cttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttggtgagattggaaaaggg-tagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaac 26177953  T
Q  284 -ctcctgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaa 382  Q
     ||  |||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26177954 tcttttgtatctcttttgtaa-gaactcatt-gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 26178051  T
Q  383 tctctttggtgcttttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgt 436  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  26178052 tctctttggtgtctttgttttcctcttccctctcct--tttatcttgtgcttgt 26178103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 89 - 436
Target Start/End: Original strand, 26170648 - 26170983
Alignment:
Q  89 agttggaagagagaga--cttgggaaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacac 184  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | | ||||||||||||| || ||||||||| ||  ||||||||||||  |||||||| ||||||    
T  26170648 agttggaagagagagaaacttgggaaatcaaagggagtaactctagggtttagagt-ctttgattacagcttctcttgggttgggaaacatggtaaacac 26170746  T
Q  185 cttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaac 283  Q
    ||||   || || ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || |||| | |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  26170747 cttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttggtgagattggaaaaggg-tagaaattaggatt-gttctttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaac 26170844  T
Q  284 ctcctgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaat 383  Q
               ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26170845 t----------cttttgtaa-gaactcatt-gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaat 26170932  T
Q  384 ctctttggtgcttttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgt 436  Q
    ||||||||||  ||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  26170933 ctctttggtgtctttgttttcctcttccctctcct--tttatcttgtgcttgt 26170983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 96 - 385
Target Start/End: Original strand, 25412638 - 25412932
Alignment:
Q  96 agagagagacttgggaaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaag 193  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || | |  ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   ||    
T  25412638 agagagaaacttgggaaatcaaaggaggcaacattagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgag 25412735  T
Q  194 agagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc- 284  Q
     || |||||||||||||||||       |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  25412736 tgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaaccc 25412834  T
Q  285 tcctgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatc 384  Q
    |  |||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  25412835 ttttgtatctcttt-gtaa-gaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggactgaactgggtgaacaatc 25412931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 96 - 385
Target Start/End: Original strand, 13342937 - 13343232
Alignment:
Q  96 agagagagacttgggaaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaag 193  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  | | || ||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   ||    
T  13342937 agagagaaacttgggaaatcaaaggaagcaactttagggtttagggt-ctctgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgag 13343034  T
Q  194 agagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaag--gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaa- 282  Q
     || |||||||||||||||||       ||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||     
T  13343035 tgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaat 13343133  T
Q  283 cctcctgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaa 382  Q
    |||  |||||| ||||    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  13343134 ccttttgtatctctttg---aagaactcatt-gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcatgtttggaccgaactgggtgaacaa 13343229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 96 - 385
Target Start/End: Original strand, 30182465 - 30182760
Alignment:
Q  96 agagagagacttgggaaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaag 193  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  | | || ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   ||    
T  30182465 agagagaaacttgggaaatcaaaggaagcaactttagggattagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgcaaacaccttggtgag 30182562  T
Q  194 agagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaagg-ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc 284  Q
     || |||||||||||||||||       ||||||||||||||   |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30182563 tgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacc 30182661  T
Q  285 -tcctgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaat 383  Q
     |  | |||| |||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  30182662 cttttctatctctttgg--aagaactcatt-gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtatgtcaagtttggaccgaactggatgaacaat 30182758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 96 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 36074336 - 36074039
Alignment:
Q  96 agagagagacttgggaaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaag 193  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  | | || ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   ||    
T  36074336 agagagaaacttgggaaatcaaaggaagcaactttagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgag 36074239  T
Q  194 agagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaag----gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgta 281  Q
     || |||||||||||||||||       ||||||||||||||     ||||||||||||||||| |||| | | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  36074238 tgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgcgaacttgtcaaagctaatttcttgta 36074140  T
Q  282 ac-ctcctgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgacc 380  Q
    || ||  |||||| ||||    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  36074139 actcttttgtatctctttg---aagaactcatt-gatagtggattggagagttcaatctctcctccaaagtaggtcaagtttggaccgaactggatgaac 36074044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 231 - 385
Target Start/End: Original strand, 37439161 - 37439313
Alignment:
Q  231 ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcctgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattgga 328  Q
    |||||||||||||| |||||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||  |||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  37439161 ggtagaaattaggg-ttgttctttgtgaacttgtcaaagttaatttcttgtaactcttttgtatctc-tttgt-aagaactca-ttgatagtggattgga 37439256  T
Q  329 gagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 385  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37439257 gagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 37439313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 142 - 383
Target Start/End: Original strand, 13239674 - 13239921
Alignment:
Q  142 tctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaagg-gg 232  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   || || |||||||||||||||||       |||||||||| |||   ||    
T  13239674 tctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattggaaaaaatgg 13239772  T
Q  233 tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcctgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggaga 330  Q
    ||||||||||||||| ||| | ||||||||||  |||||||||||||||||| ||  |||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13239773 tagaaattagggttt-ttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaactcttttgtatctc-tttgt-aagaactca-ttgatagtggattggaga 13239868  T
Q  331 gtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaat 383  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  13239869 gatcaatctctcctccagagtaggtcaaatttggaccgaactgggtgaacaat 13239921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 212 - 378
Target Start/End: Original strand, 213465 - 213630
Alignment:
Q  212 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacctcct-gtatcccttttgtaaagaac 308  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | |||| ||||| || |||||||||||||||||   | ||||| |||| |||| ||||    
T  213465 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaac 213561  T
Q  309 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 378  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  213562 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccatagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 213630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 212 - 378
Target Start/End: Original strand, 40147261 - 40147425
Alignment:
Q  212 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcctgtatcccttttgtaaagaac 308  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||| |   |||||| |||| |||| ||||    
T  40147261 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttcttcgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaa-gaac 40147357  T
Q  309 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 378  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40147358 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtga 40147425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 212 - 383
Target Start/End: Original strand, 28278316 - 28278485
Alignment:
Q  212 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctcct-gtatcccttttgtaaagaac 308  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||   | ||||| |||| ||||| |||    
T  28278316 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattatggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaaa-aac 28278412  T
Q  309 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaat 383  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  28278413 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaacaat 28278485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 212 - 385
Target Start/End: Original strand, 32636824 - 32636995
Alignment:
Q  212 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacctcct-gtatcccttttgtaaagaac 308  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||   | ||||| |||| |||| ||||    
T  32636824 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattatggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaac 32636920  T
Q  309 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 385  Q
    || ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  32636921 tc-tttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 32636995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 96 - 376
Target Start/End: Original strand, 13488079 - 13488365
Alignment:
Q  96 agagagagacttgggaaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttg-aaaacatgggaaacaccttgtaa-a 192  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || | || ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||||    |    
T  13488079 agagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttggaaaacattgtaaacaccttgggtga 13488176  T
Q  193 gagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac 283  Q
    | || ||| |||||||||||||       || |||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  13488177 gtgaaaattattgagtgtcttgttcattggtaagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaac 13488275  T
Q  284 ctcct-gtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 376  Q
    |   | ||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| | ||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  13488276 ccatttgtatctcttt-gtaa-gaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctccccgagattaggtcaag-ttggaccgaactgggt 13488365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 212 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 13695859 - 13695713
Alignment:
Q  212 ttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaa-cctcctgtatcccttttgtaaagaact 309  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | |||| |||| | ||||||||||||||||| |||  |||||| | |||||||||||||    
T  13695859 ttggagagattgggaaaagggtacaaattagggtttgttctttgtgagcttgttaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctc-tttgtaaagaact 13695761  T
Q  310 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaa 358  Q
    || || |||||||||| |||||   | ||||||||||| ||||||||||    
T  13695760 ca-ttaatagtggattagagagattattctctcctccatagtaggtcaa 13695713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 212 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 42428598 - 42428427
Alignment:
Q  212 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctcct-gtatcccttttgtaaagaac 308  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||   | ||||| |||| |||| ||||    
T  42428598 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattatggttt-ttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaac 42428502  T
Q  309 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 385  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  42428501 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 42428427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 303 - 378
Target Start/End: Original strand, 5058136 - 5058209
Alignment:
Q  303 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 378  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5058136 aagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctctagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtga 5058209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 104 - 376
Target Start/End: Original strand, 31182857 - 31183133
Alignment:
Q  104 acttgggaaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacacctt-gtaaagagagaat 200  Q
    ||||||||||||||||| || | || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||| |   || || |||    
T  31182857 acttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttaggtgagtgaaaat 31182954  T
Q  201 cattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctcctgtat 292  Q
    ||||||||||||||       |||||||||| ||| |||||||||||||| || |||| | ||||  ||||  ||| |||||||||||||||   |||||    
T  31182955 cattgagtgtcttgttcatttgtgagattggaaaatgggtagaaattaggatt-gttctttgtgagtttgtttaagttaatttcttgtaaccatttgtat 31183053  T
Q  293 cccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 376  Q
    |||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||  | |||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||||||    
T  31183054 cccttt-gtaa-gaactcatt-gatactggattggagagatctatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactgggt 31183133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 96 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 30683212 - 30682930
Alignment:
Q  96 agagagagacttgggaaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaag 193  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| || |  | ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   ||    
T  30683212 agagagaaacttgggaaatcagaggaggtaattttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgcgaaacattgtaaacaccttggtgag 30683115  T
Q  194 agagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc 284  Q
     || |||||||||||||||||       ||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||    ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  30683114 tgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaaagggtagaaattagggttcttt----gtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacc 30683019  T
Q  285 -tcctgtatcccttttgtaaaga-actcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgg 374  Q
     |  |||||  |||| ||||  | ||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  30683018 cttttgtatttcttt-gtaagaatactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgg 30682930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 96 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 28750947 - 28750661
Alignment:
Q  96 agagagagacttgggaaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaa-a 192  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || | || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||    |    
T  28750947 agagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgaaaacaccttgggtga 28750850  T
Q  193 gagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac 283  Q
    | || |||||||||||||||||       ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| |  |||| ||||  ||| ||||||| ||||||    
T  28750849 gtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttatgaaattgttgaagttaatttcctgtaac 28750751  T
Q  284 ctcct-gtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 376  Q
    |   | |||||  |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||||    
T  28750750 ccatttgtatct-ttttgtaa-gaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaattgggt 28750661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 104 - 376
Target Start/End: Original strand, 16451965 - 16452242
Alignment:
Q  104 acttgggaaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtt-gaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatc 201  Q
    ||||||||||||||||| || | || ||||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||| | |||||| | ||||||||||  ||| || ||||    
T  16451965 acttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgaggat-ctttgattagagt-tctcttgggttcggaaacattgtaaacaccttggtaagtgacaatc 16452062  T
Q  202 attgagtgtcttggt-------gagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctcct-gta 291  Q
    ||||||||||||| |       |||||||| |||  |||||||||||| | ||||||| |  ||| |||||  |||||||||||||||||||   | |||    
T  16452063 attgagtgtcttgttcattgatgagattggaaaaatgggtagaaattaag-tttgttctttctgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgta 16452161  T
Q  292 tcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 376  Q
    || |||| |||| |||||||||  ||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16452162 tctcttt-gtaa-gaactcattc-atagtggattggagagataaatctctcccccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggt 16452242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 313 - 385
Target Start/End: Original strand, 19806463 - 19806534
Alignment:
Q  313 ttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 385  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  19806463 ttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 19806534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 303 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 27637689 - 27637616
Alignment:
Q  303 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 378  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  27637689 aagaactcatt--atagtggattggagagatcaatctctcctgcagagtaggtcattgttggaccgaactgggtga 27637616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 96 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 39468841 - 39468546
Alignment:
Q  96 agagagagacttgggaaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaa-a 192  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || | || ||||||| ||||| |||| |||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||    |    
T  39468841 agagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttcattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgagtga 39468744  T
Q  193 gagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaa- 282  Q
    | || |||||||||||||||||       ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||     
T  39468743 gtgaaaatcattgagtgtcttgttcattagtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaac 39468645  T
Q  283 cctcctgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaa 382  Q
    ||   |||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||||||| ||| | ||||| ||  |||||| ||||||||| | |||    
T  39468644 ccatttgtatctc-tttgt-aagaactca-ttgatagtggattagagagatcaatctctcccccatattaggttaa-attggactgaactgggtcaacaa 39468549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 313 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 16641008 - 16640961
Alignment:
Q  313 ttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagt 360  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  16641008 ttgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagt 16640961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 212 - 385
Target Start/End: Original strand, 533769 - 533940
Alignment:
Q  212 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctcct-gtatcccttttgtaaagaac 308  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || | | |||| |||||  |||||||||| ||||||||   | ||||| |||| |||| ||||    
T  533769 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttggt-ctttgtgagcttgttgaagctaattttttgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaac 533865  T
Q  309 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 385  Q
    ||||| |||||||||||||| ||  |||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  533866 tcatt-gatagtggattggaaagatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 533940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 316 - 376
Target Start/End: Original strand, 4160702 - 4160762
Alignment:
Q  316 atagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 376  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||    
T  4160702 atagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcattgttggaccaaactgggt 4160762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 129 - 402
Target Start/End: Original strand, 33831590 - 33831866
Alignment:
Q  129 tagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttg-aaaacatgggaaacaccttgtaa-agagagaatcattgagtgtcttg-------gtgag 219  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||||    || || ||||||||||||||||        |||||    
T  33831590 tagggttaagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttggaaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttattcatttgtgag 33831687  T
Q  220 attgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctcct-gtatcccttttgtaaagaactcatttga 316  Q
    ||||| |||  |||||||||||||| ||||||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||   | ||||| |||| |||| ||||||||| ||    
T  33831688 attggaaaaatgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaactcatt-ga 33831783  T
Q  317 tagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttggtgcttttgttt 402  Q
    |||||||||| ||||  |||||||||| ||| | ||||||||| |||||| ||||||||| | |||  ||||||||| ||||||||    
T  33831784 tagtggattgaagagatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggactgaactgggtcaacaa--tctttggtgtttttgttt 33831866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 303 - 378
Target Start/End: Original strand, 27015614 - 27015687
Alignment:
Q  303 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 378  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | ||  |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27015614 aagaactcatt-gatagtggattgtacagatcaatctctcctccaaaataggtcaag-ttggaccgaactgggtga 27015687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 303 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 8566023 - 8565943
Alignment:
Q  303 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 385  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||| ||| | ||||||    
T  8566023 aagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcacccagattaggtcaag-ttggaccgaactaggtcaacaatct 8565943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 218 - 372
Target Start/End: Original strand, 316769 - 316922
Alignment:
Q  218 agattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaa-cctcctgtatcccttttgtaaagaactcatttg 315  Q
    |||||| ||||  ||||||||||||| ||||||| | | || |||||  ||||||||||||||||| |||  |||||| |||| |||||||||||||| |    
T  316769 agattgagaaaaaggtagaaattagg-tttgttcttggagagcttgttgaagctaatttcttgtaatccttttgtatctcttt-gtaaagaactcatt-g 316865  T
Q  316 atagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaact 372  Q
    ||| ||||| |||| |  |||||||||| | |||||||||||   ||||||||||||    
T  316866 ataatggatcggagggatcaatctctcccctagagtaggtcattgttggaccgaact 316922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 212 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 42426403 - 42426255
Alignment:
Q  212 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctcct-gtatcccttttgtaaagaac 308  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||| ||||  |||||||||||||| ||||   | ||||| |||| |||| ||||    
T  42426403 ttggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaaattgttgaagctaatttcttgcaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaac 42426307  T
Q  309 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtt 361  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||||| || || |||||||||||    
T  42426306 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctccccctgattaggtcaagtt 42426255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 303 - 374
Target Start/End: Original strand, 538116 - 538185
Alignment:
Q  303 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgg 374  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||  |||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||||    
T  538116 aagaactcatt-gatagtagattggagagatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactgg 538185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 33906113 - 33906035
Alignment:
Q  297 tttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 376  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||  |||||||| | | ||||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  33906113 tttgtaaagaactcatt-gatagtagattggaaagatcaatctcttccctagagtaggtcaatgttggaccgagctgggt 33906035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 368; Significance: 0; HSPs: 69)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 90 - 507
Target Start/End: Original strand, 3617327 - 3617742
Alignment:
Q  90 gttggaagagagagacttgggaaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgt 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3617327 gttggaagagagagacttgggaaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgt 3617426  T
Q  190 aaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcctg 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3617427 aaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttg 3617526  T
Q  290 tatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttt 389  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3617527 tatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttt 3617626  T
Q  390 ggtgctt-ttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgtcgctttgtgtttcacacttggttcctggattagatctaggtggtgttttgtt 488  Q
     ||| || ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3617627 -gtgtttattgttttcttcttccctctccttg--tatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgtt 3617723  T
Q  489 gtttcttgcttgcacaata 507  Q
    |||||||||||||||||||    
T  3617724 gtttcttgcttgcacaata 3617742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 366; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 96 - 507
Target Start/End: Original strand, 25637312 - 25637722
Alignment:
Q  96 agagagagacttgggaaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagag 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  25637312 agagagagacttgggaaatcaaaggggtatctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgta--gag 25637409  T
Q  196 agaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcctgtatccc 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25637410 agaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatccc 25637509  T
Q  296 ttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttggtgct 395  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25637510 ttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttggtgct 25637609  T
Q  396 tttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattg-tcgctttgtgtttcacacttggttcctggattagatctaggtggtgttttgttgtttct 494  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25637610 tttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgtttgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttcc 25637709  T
Q  495 tgcttgcacaata 507  Q
    |||||||||||||    
T  25637710 tgcttgcacaata 25637722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 89 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 4598814 - 4598399
Alignment:
Q  89 agttggaagagagagacttgggaaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttg 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4598814 agttggaagagagagacttgggaaatcaaagggaaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccctg 4598715  T
Q  189 taaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaacctcc 287  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  4598714 ta--gagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctct 4598617  T
Q  288 tgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctct 387  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4598616 tgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctct 4598517  T
Q  388 ttggtgctt-ttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgtcgctttgtgtttcacacttggttcctggattagatctaggtggtgttttg 486  Q
    || ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||     
T  4598516 tt-gtgtttattgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgttgctt--tgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgtttta 4598420  T
Q  487 ttgtttcttgcttgcacaata 507  Q
    ||||||||||||||| |||||    
T  4598419 ttgtttcttgcttgctcaata 4598399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 90 - 507
Target Start/End: Original strand, 10211273 - 10211687
Alignment:
Q  90 gttggaagagagagacttgggaaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgt 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10211273 gttggaagagagagacttgggaaatcaaagggaaagctctagggtttagggttctttgattagagtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgt 10211372  T
Q  190 aaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaacctcct 288  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  10211373 a--gagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctctt 10211470  T
Q  289 gtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctt 388  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10211471 gtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctt 10211570  T
Q  389 tggtgctt-ttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgtcgctttgtgtttcacacttggttcctggattagatctaggtggtgttttgt 487  Q
    | ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  10211571 t-gtgtttattgttttcatcttccctctccttgtttatcttgtgattgttgctt--tgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgttttgt 10211667  T
Q  488 tgtttcttgcttgcacaata 507  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  10211668 tgtttcttgcttgctcaata 10211687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 89 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 4601035 - 4600620
Alignment:
Q  89 agttggaagagagagacttgggaaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttg 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4601035 agttggaagagagagacttgggaaatcaaagggaaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttg 4600936  T
Q  189 taaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaacctcc 287  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||      
T  4600935 ta--gagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaaccttt 4600838  T
Q  288 tgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctct 387  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4600837 tgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctctagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctct 4600738  T
Q  388 ttggtgctt-ttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgtcgctttgtgtttcacacttggttcctggattagatctaggtggtgttttg 486  Q
    || ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  4600737 tt-gtgtttattgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgttgatt--tgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgttttg 4600641  T
Q  487 ttgtttcttgcttgcacaata 507  Q
    |||||||| |||||| |||||    
T  4600640 ttgtttctggcttgctcaata 4600620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 90 - 507
Target Start/End: Original strand, 10209053 - 10209467
Alignment:
Q  90 gttggaagagagagacttgggaaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgt 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10209053 gttggaagagagagacttgggaaatcaaagggaaagctctagggtttagggttctttgattagagtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgt 10209152  T
Q  190 aaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaacctcct 288  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  10209153 a--gagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctctt 10209250  T
Q  289 gtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctt 388  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10209251 gtagtccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccaaactgggtgaccaatctctt 10209350  T
Q  389 tggtgctt-ttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgtcgctttgtgtttcacacttggttcctggattagatctaggtggtgttttgt 487  Q
    | ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  10209351 t-gtgtttattgttttcatcttccctctccttgtttatcttgtgattgttgctt--tgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgttttgt 10209447  T
Q  488 tgtttcttgcttgcacaata 507  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  10209448 tgtttcttgcttgctcaata 10209467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 90 - 507
Target Start/End: Original strand, 10056097 - 10056511
Alignment:
Q  90 gttggaagagagagacttgggaaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgt 189  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10056097 gttgaaagagagagacttgggaaatcaaaggggaagctctagagtttagggttctttgattagagtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgt 10056196  T
Q  190 aaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaacctcct 288  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  10056197 a--gagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctctt 10056294  T
Q  289 gtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctt 388  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10056295 gtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctt 10056394  T
Q  389 tggtgctt-ttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgatt-gtcgctttgtgtttcacacttggttcctggattagatctaggtggtgttttg 486  Q
    | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||  ||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  10056395 t-gtgtttattgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgtttagttgctt--tgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtg-tttg 10056490  T
Q  487 ttgtttcttgcttgcacaata 507  Q
    ||||||||||||||| |||||    
T  10056491 ttgtttcttgcttgctcaata 10056511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 90 - 507
Target Start/End: Original strand, 10058319 - 10058733
Alignment:
Q  90 gttggaagagagagacttgggaaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgt 189  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10058319 gttgaaagagagagacttgggaaatcaaaggggaagctctagagtttagggttctttgattagagtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgt 10058418  T
Q  190 aaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaacctcct 288  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  10058419 a--gagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctctt 10058516  T
Q  289 gtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctt 388  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10058517 gtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctt 10058616  T
Q  389 tggtgctt-ttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgatt-gtcgctttgtgtttcacacttggttcctggattagatctaggtggtgttttg 486  Q
    | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||  ||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  10058617 t-gtgtttattgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgtttagttgctt--tgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtg-tttg 10058712  T
Q  487 ttgtttcttgcttgcacaata 507  Q
    ||||||||||||||| |||||    
T  10058713 ttgtttcttgcttgctcaata 10058733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 90 - 507
Target Start/End: Original strand, 10060541 - 10060955
Alignment:
Q  90 gttggaagagagagacttgggaaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgt 189  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10060541 gttgaaagagagagacttgggaaatcaaaggggaagctctagagtttagggttctttgattagagtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgt 10060640  T
Q  190 aaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaacctcct 288  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  10060641 a--gagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctctt 10060738  T
Q  289 gtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctt 388  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10060739 gtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctt 10060838  T
Q  389 tggtgctt-ttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgatt-gtcgctttgtgtttcacacttggttcctggattagatctaggtggtgttttg 486  Q
    | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||  ||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  10060839 t-gtgtttattgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgtttagttgctt--tgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtg-tttg 10060934  T
Q  487 ttgtttcttgcttgcacaata 507  Q
    ||||||||||||||| |||||    
T  10060935 ttgtttcttgcttgctcaata 10060955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 90 - 507
Target Start/End: Original strand, 10062763 - 10063177
Alignment:
Q  90 gttggaagagagagacttgggaaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgt 189  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10062763 gttgaaagagagagacttgggaaatcaaaggggaagctctagagtttagggttctttgattagagtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgt 10062862  T
Q  190 aaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaacctcct 288  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  10062863 a--gagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctctt 10062960  T
Q  289 gtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctt 388  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10062961 gtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctt 10063060  T
Q  389 tggtgctt-ttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgatt-gtcgctttgtgtttcacacttggttcctggattagatctaggtggtgttttg 486  Q
    | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||  ||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  10063061 t-gtgtttattgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgtttagttgctt--tgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtg-tttg 10063156  T
Q  487 ttgtttcttgcttgcacaata 507  Q
    ||||||||||||||| |||||    
T  10063157 ttgtttcttgcttgctcaata 10063177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 90 - 507
Target Start/End: Original strand, 10064985 - 10065399
Alignment:
Q  90 gttggaagagagagacttgggaaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgt 189  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10064985 gttgaaagagagagacttgggaaatcaaaggggaagctctagagtttagggttctttgattagagtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgt 10065084  T
Q  190 aaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaacctcct 288  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  10065085 a--gagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctctt 10065182  T
Q  289 gtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctt 388  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10065183 gtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctt 10065282  T
Q  389 tggtgctt-ttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgatt-gtcgctttgtgtttcacacttggttcctggattagatctaggtggtgttttg 486  Q
    | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||  ||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  10065283 t-gtgtttattgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgtttagttgctt--tgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtg-tttg 10065378  T
Q  487 ttgtttcttgcttgcacaata 507  Q
    ||||||||||||||| |||||    
T  10065379 ttgtttcttgcttgctcaata 10065399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 96 - 504
Target Start/End: Original strand, 54635008 - 54635412
Alignment:
Q  96 agagagagacttgggaaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaaga 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54635008 agagagagacttgggaaatcaaagggagcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaaga 54635107  T
Q  195 gagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcctgtatcc 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  54635108 gagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcc 54635207  T
Q  295 cttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttggtgc 394  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  54635208 cttttgt-aagaactc-tttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgc 54635305  T
Q  395 ttttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgtcgctttgtgtttcacacttggttcctggattagatctaggtggtgttttgttgtttct 494  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |  ||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |    
T  54635306 ttttgttttcttcttccctctcct--tttatcttgtgattgt-gtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattat 54635402  T
Q  495 tgcttgcaca 504  Q
    ||||||||||    
T  54635403 tgcttgcaca 54635412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 96 - 505
Target Start/End: Original strand, 45282866 - 45283276
Alignment:
Q  96 agagagagacttgggaaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaaga 194  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  45282866 agagagagacttggggaatcaaagggagcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgcaaaga 45282965  T
Q  195 gagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcctgtatcc 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  45282966 gagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcc 45283065  T
Q  295 cttttgt--aaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttggt 392  Q
    ||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||    
T  45283066 ctttttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaatctc-ttggt 45283164  T
Q  393 gcttttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgtcgctttgtgtttcacacttggttcctggattagatctaggtggtgttttgttgttt 492  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  45283165 gcttttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgt-gtattgtgtttctcactagtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgatt 45283263  T
Q  493 cttgcttgcacaa 505  Q
     ||||||||||||    
T  45283264 attgcttgcacaa 45283276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 96 - 504
Target Start/End: Original strand, 6716383 - 6716789
Alignment:
Q  96 agagagagacttgggaaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaaga 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6716383 agagagagacttgggaaatcaaagggagtaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaaga 6716482  T
Q  195 gagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcctgtatcc 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  6716483 gagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcc 6716582  T
Q  295 cttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttggtgc 394  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6716583 cttttgt-aagaactc-tttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgc 6716680  T
Q  395 ttttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgtcgctttgtgtttcacacttggttcctggattagatctaggtggtgtttt-gttgtttc 493  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||   |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||     
T  6716681 ttttgttttcttcttccctcccct--tttatcttgtgattgtatttttgagtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttggttgatta 6716778  T
Q  494 ttgcttgcaca 504  Q
    |||||||||||    
T  6716779 ttgcttgcaca 6716789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 90 - 315
Target Start/End: Original strand, 10067207 - 10067431
Alignment:
Q  90 gttggaagagagagacttgggaaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgt 189  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10067207 gttgaaagagagagacttgggaaatcaaaggggaagctctagagtttagggttctttgattagagtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgt 10067306  T
Q  190 aaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaacctcct 288  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  10067307 --agagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctctt 10067404  T
Q  289 gtatcccttttgtaaagaactcatttg 315  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||    
T  10067405 gtattccttttgtaaagaactcatttg 10067431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 96 - 504
Target Start/End: Original strand, 800974 - 801376
Alignment:
Q  96 agagagagacttgggaaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaag 193  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||    
T  800974 agagagaaacttgggaaatcaaaggaagaaactctagggtttagagt-ctttgattagagcttctcttgggttgggaaacatgggaaacaccttgaagag 801072  T
Q  194 agagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaa--cctcctgt 290  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||  | |  |||    
T  801073 agaaaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattaggg-ttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgt 801171  T
Q  291 atcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttg 390  Q
    ||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  801172 atctcttttgt-aagaactca-ttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctc-ttg 801268  T
Q  391 gtgcttttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtg-attgtcgctttgtgtttcacacttggttcctggattagatctaggtg--gtgttttgt 487  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||      ||| |||| |||||| ||||| |||||||||||||||  || ||||||    
T  801269 gtgtctttgttttcttcttccctctcct--tttatcttgtgtattg------tgtttttc-cacttgtttcctagattagatctaggtgctgttttttgt 801359  T
Q  488 tgtttcttgcttgcaca 504  Q
    || || |||||||||||    
T  801360 tgattattgcttgcaca 801376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 175 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 7780208 - 7779883
Alignment:
Q  175 tgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaag-ctaat 273  Q
    |||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  |||||    
T  7780208 tgggaaacaccttgaagagagaaaatcattgagtgtcttcgtgagattgggaaaagggtagaaattagggtt-gttcattgtgaacttgtcaaatctaat 7780110  T
Q  274 ttcttgtaacctcctgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactg 373  Q
    ||||||||||||  |||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  7780109 ttcttgtaaccttttgtatctcttttgtaa-gaactcatt-gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccaaagtg 7780012  T
Q  374 ggtgaccaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgtcgctttgtg-tttcacacttggttcctggattagatc 472  Q
    ||||| ||||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| |||| |  ||||| |||  |||||| ||||| |||||||||    
T  7780011 ggtgaacaatctc-ttggtgtctttgttttcctcttccctctcct--tttatcttgtgcttgt-gtattgtgttttttcacttgtttcctagattagatc 7779916  T
Q  473 taggtggtg-ttttgttgtttcttgcttgcaca 504  Q
    |||||| || |||||||| || |||||||||||    
T  7779915 taggtgctgtttttgttgattattgcttgcaca 7779883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 96 - 246
Target Start/End: Original strand, 6718567 - 6718718
Alignment:
Q  96 agagagagacttgggaaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaaga 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6718567 agagagagacttgggaaatcaaagggagtaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaaga 6718666  T
Q  195 gagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6718667 gagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtt 6718718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 89 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 23200438 - 23200020
Alignment:
Q  89 agttggaagagagaga--cttgggaaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacac 184  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||    
T  23200438 agttggaagagagagaaacttgggaaatcaaagggagcaactctagggtttagggt-ctttgattagagtttctcttgggttgggaaacattgtaaacac 23200340  T
Q  185 cttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg------gtgagattgggaaagg-ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttc 276  Q
    ||||   || || |||||||||||||||||      ||||||||||||||   |||||||||||| ||| |||| | ||||||||||||| |||||||||    
T  23200339 cttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcttggtgagattgggaaaaatggtagaaattagagtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttc 23200241  T
Q  277 ttgtaacc-tcctgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactggg 375  Q
    |||||||| |  ||||||  |||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23200240 ttgtaacccttttgtatct-ttttgtaa-gaactcatt-gatagtgaattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactggg 23200144  T
Q  376 tgaccaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgtcgctttgtgtttcaca-cttggttcctggattagatcta 474  Q
    ||| |||  |||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||| || |||| | |||||||||  ||  ||| ||||| |||||||||||    
T  23200143 tgaacaa--tctttggtgtctttgttttcttcttccctctcct--tttatcttatgcttgt-ggtttgtgtttttcattttgtttcctagattagatcta 23200049  T
Q  475 ggtggtgttttgttgtttcttgcttgcac 503  Q
    |||| | | |||||| || ||||||||||    
T  23200048 ggtgttttattgttgattattgcttgcac 23200020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 89 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 23198239 - 23197823
Alignment:
Q  89 agttggaagagagaga--cttgggaaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacac 184  Q
    ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||    
T  23198239 agttggaagagagagaaacttggaaaatcaaagggagcaactctagggtttagggt-ctttgattagagtttctcttgggttgggaaacattgtaaacac 23198141  T
Q  185 cttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg------gtgagattgggaaagg-ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttc 276  Q
    ||||   || || |||||||||||||||||      ||||||||||||||   |||||||||||| ||| |||  | ||||||||||||| |||||||||    
T  23198140 cttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcttggtgagattgggaaaaatggtagaaattagagtt-gttttttgtgaacttgtcaaagctaatttc 23198042  T
Q  277 ttgtaacc-tcctgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactggg 375  Q
    |||||||| |  ||||||  |||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23198041 ttgtaacccttttgtatct-ttttgtaa-gaactcatt-gatagtgaattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactggg 23197945  T
Q  376 tgaccaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgtcgctttgtgtttcaca-cttggttcctggattagatcta 474  Q
    ||| |||  |||||||||  ||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||| |||| | |||||||||  ||  ||| ||||| |||||||||||    
T  23197944 tgaacaa--tctttggtgtctttgttttcctcttctctctcct--tttatcttgtgcttgt-ggtttgtgtttttcattttgtttcctagattagatcta 23197850  T
Q  475 ggtggtgttttgttgtttcttgcttgc 501  Q
     ||| | | |||||| || ||||||||    
T  23197849 tgtgttttattgttgattattgcttgc 23197823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 96 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 5258436 - 5258140
Alignment:
Q  96 agagagagacttgggaaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaag 193  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| ||| || ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   ||    
T  5258436 agagagaaacttgagaaatcaaagggagaaactttagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgag 5258339  T
Q  194 agagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaag--gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac 283  Q
     || |||||||||||||||||       ||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5258338 tgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaac 5258240  T
Q  284 c-tcctgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaa 382  Q
    | |  |||||| |||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  5258239 ccttttgtatctctttgg--aagaactcatt-gatagtggattggagagttcaatctcttctccagagtaggtcaagtttggaccgaacttggtgaacaa 5258143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 89 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 9636428 - 9636119
Alignment:
Q  89 agttggaagagagaga--cttgggaaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacac 184  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||| || ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||| || | ||||||    
T  9636428 agttggaagagagagaaacttgggaaatcaaaggaagaaactttagggtttagggt-ctttgattagagtctctcttgggttgggaaatattgtaaacac 9636330  T
Q  185 cttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggt-------gagattggga--aaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaag-ctaatt 274  Q
    ||||   || || |||||||||||||||||||       ||||||||||  || ||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||  ||||||    
T  9636329 cttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttggtcattggtgagattgggagaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaaactaatt 9636231  T
Q  275 tcttgtaacc-tcctgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactg 373  Q
    |||||||||| |  ||||||  |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  9636230 tcttgtaacccttttgtatct-ttttgtaa-gaactcatt-gatagtggattggagagttcaatctctcctccaaagtaggtcaagtttgaaccgaactg 9636134  T
Q  374 ggtgaccaatctctt 388  Q
    ||||| |||||||||    
T  9636133 ggtgaacaatctctt 9636119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 96 - 385
Target Start/End: Original strand, 45095041 - 45095335
Alignment:
Q  96 agagagagacttgggaaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaag 193  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | || | || ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   ||    
T  45095041 agagagaaacttgggaaatcaaaagaggcaactttagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgag 45095138  T
Q  194 agagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc- 284  Q
     || |||||||||||||||||       ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  45095139 tgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaaccc 45095237  T
Q  285 tcctgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatc 384  Q
    |  |||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  45095238 ttttgtatctcttt-gtaa-gaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctctagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatc 45095334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 342 - 507
Target Start/End: Original strand, 10067435 - 10067598
Alignment:
Q  342 cctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttggtgctt-ttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgatt-gtcgc 439  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||    
T  10067435 cctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttt-gtgtttattgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgtttagttgc 10067533  T
Q  440 tttgtgtttcacacttggttcctggattagatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgcacaata 507  Q
    ||  ||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  10067534 tt--tgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtg-tttgttgtttcttgcttgctcaata 10067598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 96 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 5260615 - 5260319
Alignment:
Q  96 agagagagacttgggaaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaag 193  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || | || ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   ||    
T  5260615 agagagaaacttgggaaatcaaaggaggcaactttagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgag 5260518  T
Q  194 agagaatcattgagtgtcttggt-------gagattgggaaag--gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac 283  Q
     || |||||||||||||||||||       ||||||||||||   ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5260517 tgaaaatcattgagtgtcttggtcattggtgagattgggaaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaac 5260419  T
Q  284 c-tcctgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaa 382  Q
    | |  |||||| |||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  5260418 ccttttgtatctctttgg--aagaactcatt-gatagtggattggagagttcaatctcttctccaaagtaggtcaagtttggaccgaacttggtgaacaa 5260322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 96 - 385
Target Start/End: Original strand, 7762142 - 7762437
Alignment:
Q  96 agagagagacttgggaaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaag 193  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || | || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||| || |  |||||||||   ||    
T  7762142 agagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaatattgtgaacaccttggtgag 7762239  T
Q  194 agagaatcattgagtgtctt-------ggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac- 283  Q
     || ||||||||||||||||       |||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||     
T  7762240 tgaaaatcattgagtgtcttattcattggtgagattgagaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaact 7762338  T
Q  284 ctcctgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaat 383  Q
    ||  |||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7762339 cttttgtatctc-tttgt-aagaactca-ttgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaat 7762435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 96 - 385
Target Start/End: Original strand, 37408335 - 37408630
Alignment:
Q  96 agagagagacttgggaaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaag 193  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || | || ||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | |||||||||    ||    
T  37408335 agagagaaacttgggaaatcaaaggaggcaactttagggtttatggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttagtgag 37408432  T
Q  194 agagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc 284  Q
     || ||| |||||||||||||       ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37408433 tgaaaattattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacc 37408531  T
Q  285 -tcctgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaat 383  Q
     |  |||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  37408532 cttttgtatctcttt-gtaa-gaactcatt-gatagtggattgaagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggatcgaactgggtgaacaat 37408628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 215 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 19684054 - 19683885
Alignment:
Q  215 gtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-tcctgtatcccttttgtaaagaactca 311  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||| |||| |||| |||||||    
T  19684054 gtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaa-gaactca 19683958  T
Q  312 tttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 385  Q
    || |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19683957 tt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccatagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 19683885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 96 - 385
Target Start/End: Original strand, 7764344 - 7764636
Alignment:
Q  96 agagagagacttgggaaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtt-gaaaacatgggaaacaccttgtaaag 193  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || | || ||| ||| ||||| ||||||||||| | ||||||||||| | |||||| | ||||||||||   ||    
T  7764344 agagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagagttgagggt-ctttgattagatt-tctcttgggttaggaaacattgtaaacaccttggtgag 7764441  T
Q  194 agagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaac-c 284  Q
     || |||||||||||||||||       ||||||  |||||| ||||||||||||||| |||||| | ||||||||| | |||||||||||||||||| |    
T  7764442 tgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgaga--gggaaaagggtagaaattaggg-ttgttctttgtgaacttgttaaagctaatttcttgtaactc 7764538  T
Q  285 tcctgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatc 384  Q
    |  |||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||    
T  7764539 ttttgtatctc-tttgt-aagaactca-ttgatagtggattggagagatgaatctctcctccagagtaggtcaaatttagaccgaactgggtgaacaatc 7764635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 104 - 385
Target Start/End: Original strand, 9581167 - 9581454
Alignment:
Q  104 acttgggaaatcaaagggga-agctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaa-agagagaat 200  Q
    ||||||||||||||||| |  | || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||    || || |||    
T  9581167 acttgggaaatcaaaggagttaactttagggttaagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaat 9581264  T
Q  201 cattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctcct-gta 291  Q
    ||||||||||||||       ||| |||| ||||| |||||||||||||| ||||||| | |||| |||||  ||||||||||||| |||||   | |||    
T  9581265 cattgagtgtcttgttcatttgtgggattcggaaatgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttttaacccatttgta 9581363  T
Q  292 tcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 385  Q
    ||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9581364 tcccttt-gtaa-gaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 9581454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 212 - 385
Target Start/End: Original strand, 34491212 - 34491383
Alignment:
Q  212 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcctgtatcccttttgtaaagaac 308  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||| |   |||||| |||| |||| ||||    
T  34491212 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaa-gaac 34491308  T
Q  309 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 385  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  34491309 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaacaatct 34491383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 212 - 376
Target Start/End: Original strand, 4569952 - 4570115
Alignment:
Q  212 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcctgtatcccttttgtaaagaac 308  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| |||| ||| |  |||||||||||||||||| |   |||||| |||| |||| ||||    
T  4569952 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttcattgtgagcttattgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaa-gaac 4570048  T
Q  309 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 376  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4570049 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctactccagagtaggtgaagtttggaccgaactgggt 4570115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 104 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 39153645 - 39153358
Alignment:
Q  104 acttgggaaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttg--taaagagagaa 199  Q
    ||||||||||||||||| || | || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  | ||  || ||    
T  39153645 acttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgaat-gaaaa 39153549  T
Q  200 tcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcctg 289  Q
    |||||||||||||||       ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||| |||| |||||  |||||||||||||||||| |   ||    
T  39153548 tcattgagtgtcttgttcatgtgtgagattgggaaaatgggtagaaattagg-tttgttcattgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaactcatttg 39153450  T
Q  290 tatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 385  Q
    |||||||||    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| ||||||||| | ||||||    
T  39153449 tatccctttat--aagaactcatt-gatagtggattggagagaacaatctctcccccagattaggtcaag-ttggactgaactgggtcaacaatct 39153358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 212 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 49199638 - 49199462
Alignment:
Q  212 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc--tcctgtatcccttttgtaaagaa 307  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  |  |||||| |||| |||| |||    
T  49199638 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattaaggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccattttgtatctcttt-gtaa-gaa 49199542  T
Q  308 ctcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctt 388  Q
    |||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||    
T  49199541 ctcatt-gatagtggattggagagattaatctctcctccagactaggtcatggttggaccgaactgggtgaacaatctctt 49199462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 212 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 29196555 - 29196383
Alignment:
Q  212 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacctcct-gtatcccttttgtaaagaac 308  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| | |||| |||||||| |||||||||||| ||||   | ||||| |||| |||| ||||    
T  29196555 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtttgttctttgtgagcttgtcaaagctaatttcttggaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaac 29196458  T
Q  309 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 385  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  29196457 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccaaattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 29196383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 96 - 385
Target Start/End: Original strand, 40735259 - 40735554
Alignment:
Q  96 agagagagacttgggaaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtt-gaaaacatgggaaacaccttgtaaa- 192  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || | || ||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||| | |||||| | |||||||||| |||     
T  40735259 agagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattaaagt-tctcttgggttaggaaacattgtaaacaccttggaaaa 40735356  T
Q  193 gagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac 283  Q
    | || |||||||||||||||||       ||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||| |||||||    
T  40735357 gtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaac 40735455  T
Q  284 ctcct-gtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaa 382  Q
    |   | ||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||    
T  40735456 cagtttgtatctcttt-gtaa-gaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcagcaa 40735551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 212 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 43401970 - 43401794
Alignment:
Q  212 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc--tcctgtatcccttttgtaaagaa 307  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  ||||||||||||||||||   |  | |||| |||| |||| |||    
T  43401970 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacgcattttttatctcttt-gtaa-gaa 43401874  T
Q  308 ctcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctt 388  Q
    |||||| ||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||    
T  43401873 ctcatt-gatagtggattggagaaattaatctctcctccagagtaggtcatggttggaccgaactgggtgaacaatctctt 43401794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 303 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 43403821 - 43403737
Alignment:
Q  303 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctt 388  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||    
T  43403821 aagaactcatt-gatagtggattggagagattaatctctcctccagagtaggtcatggttggaccgaactgggtgaacaatctctt 43403737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 212 - 385
Target Start/End: Original strand, 40734498 - 40734669
Alignment:
Q  212 ttggtgagattggg-aaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaac-ctcctgtatcccttttgtaaagaac 308  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| | |||| |||| | || ||||||||||||||| |   |||||||| ||||| ||||||    
T  40734498 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattaggg-ttgttctttgtgagcttgttgaacctaatttcttgtaacacatttgtatccc-tttgt-aagaac 40734594  T
Q  309 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 385  Q
    ||| |||||||||||||||||||  |||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  40734595 tca-ttgatagtggattggagagatcaatctctcccccaaattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 40734669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 212 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 41819691 - 41819526
Alignment:
Q  212 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc--tcctgtatcccttttgtaaagaa 307  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||  | |||| |||||| |||||||||||||||||||  |  |||||| |||| |||| |||    
T  41819691 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttttttgtgagcttgtctaagctaatttcttgtaacccattttgtatctcttt-gtaa-gaa 41819595  T
Q  308 ctcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 378  Q
    ||||||  |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||    
T  41819594 ctcatt--atagtggattggagacatcaatctctcctccagagtaggtcattgttggaccaaactgggtga 41819526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 212 - 385
Target Start/End: Original strand, 44331545 - 44331716
Alignment:
Q  212 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaa-cctcctgtatcccttttgtaaagaac 308  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||  ||||||||||||||||| ||   |||||| |||| |||| ||||    
T  44331545 ttggtgagattaggaaaatgggtagaaattagggtt-gttcattgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaagccatttgtatctcttt-gtaa-gaac 44331641  T
Q  309 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 385  Q
    | ||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  44331642 ttatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 44331716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 303 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 6095676 - 6095603
Alignment:
Q  303 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 378  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  6095676 aagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgtgtga 6095603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 216 - 372
Target Start/End: Original strand, 30236129 - 30236283
Alignment:
Q  216 tgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctcct-gtatcccttttgtaaagaactcat 312  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  ||||||||||||||||||||  | ||||| |||| |||| ||||||||    
T  30236129 tgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacctatttgtatctcttt-gtaa-gaactcat 30236225  T
Q  313 ttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaact 372  Q
    | |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  30236226 t-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaact 30236283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 215 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 22835167 - 22835010
Alignment:
Q  215 gtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctcct-gtatcccttttgtaaagaactca 311  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||   | |||||||||| |||| |||||||    
T  22835167 gtgagattgggaaaatgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatcccttt-gtaa-gaactca 22835071  T
Q  312 tttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgg 374  Q
    || |||||||||||||||||  |||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||||    
T  22835070 tt-gatagtggattggagagatcaatctctccgccatattaggtcaag-ttggaccgaactgg 22835010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 104 - 361
Target Start/End: Original strand, 760731 - 760995
Alignment:
Q  104 acttgggaaatcaaagggga-agctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaa-agagagaat 200  Q
    ||||||||||||||||| |  | || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||   |||||||||| |  || || |||    
T  760731 acttgggaaatcaaaggagttaactttagggttaagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattataaacaccttggatgagtgaaaat 760828  T
Q  201 cattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctcct-gt 290  Q
    ||||||||||||||       ||||||||||||||  |||||||||||||| | ||||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||   | ||    
T  760829 cattgagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaatgggtagaaattagg-tctgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgt 760927  T
Q  291 atcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtt 361  Q
    |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||||||    
T  760928 atcccttt-gtaa-gaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagtt 760995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 303 - 378
Target Start/End: Original strand, 54593795 - 54593868
Alignment:
Q  303 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 378  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||    
T  54593795 aagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtatgtcaag-ttggaccaaactgggtga 54593868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 303 - 385
Target Start/End: Original strand, 16499120 - 16499200
Alignment:
Q  303 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 385  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  16499120 aagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagagtaggttaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 16499200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 315 - 388
Target Start/End: Original strand, 40913395 - 40913467
Alignment:
Q  315 gatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctt 388  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||    
T  40913395 gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatctctt 40913467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 230 - 385
Target Start/End: Original strand, 51398833 - 51398985
Alignment:
Q  230 gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcctgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattgg 327  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| |   |||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  51398833 gggtagaaattagggtt-gttcttagtgaacttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctc-tttgt-aagaactca-ttgatagtggattgg 51398928  T
Q  328 agagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 385  Q
    ||||    |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||| | ||||||    
T  51398929 agagatttatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaacttggtcaacaatct 51398985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 96 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 5236748 - 5236454
Alignment:
Q  96 agagagagacttgggaaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaa-a 192  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| || | || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||    |    
T  5236748 agagagaaacttgggaaatcgaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtga 5236651  T
Q  193 gagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaa- 282  Q
    | || |||||||||||||||||       ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||     
T  5236650 gtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaac 5236552  T
Q  283 cctcctgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaa 382  Q
    ||   |||||| | ||||| ||||||||| |||||| |||||| |||||  |||||| ||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| | |||    
T  5236551 ccatttgtatctc-tttgt-aagaactca-ttgataatggattcgagagatcaatctttcc-ccagattaggtcaa-tttggaccaaactgggtcaacaa 5236457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 212 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 44700646 - 44700476
Alignment:
Q  212 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctcct-gtatcccttttgtaaagaac 308  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||  ||||  ||||||||||||||||||||  | ||||| |||| |||| ||||    
T  44700646 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaacctatttgtatctcttt-gtaa-gaac 44700550  T
Q  309 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 385  Q
    || ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||| ||| | ||||||    
T  44700549 tc-tttgatagtggattggagagatcaatctctcc-ccacattaggtcaag-ttggaccgaactaggtcaacaatct 44700476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 314 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 27305777 - 27305719
Alignment:
Q  314 tgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactg 373  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  27305777 tgatagtggattggagagatcaatctctcctccaaagtaggtcaa-tttggaccgaactg 27305719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 104 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 32744710 - 32744433
Alignment:
Q  104 acttgggaaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatc 201  Q
    ||||||||||||||||| || | || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | |||||| |||   || || ||||    
T  32744710 acttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacacattggtgagtgaaaatc 32744613  T
Q  202 attgagtgtcttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcctgtatcccttt 298  Q
    ||||||| | ||| ||||||||  |||  |||||||||||||  ||||||| | |||| |||||  |||||||||||||||||| |   |||||| ||||    
T  32744612 attgagtattttg-tgagattgaaaaaatgggtagaaattag--tttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaactcatttgtatcacttt 32744516  T
Q  299 tgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 385  Q
     |||| |||||| ||||||||||||||| ||||   ||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  32744515 -gtaa-gaactc-tttgatagtggattgaagagataaatctatcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 32744433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 129 - 385
Target Start/End: Original strand, 29682269 - 29682530
Alignment:
Q  129 tagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaa-agagagaatcattgagtgtcttg-------gtgag 219  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||    || || |||||||||||||||||       |||||    
T  29682269 tagggttaagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgtttatttgtgag 29682366  T
Q  220 attgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctcct-gtatcccttttgtaaagaactcatttga 316  Q
    |||||||||  |||||||||||| | ||||||| | |||| |||||  ||||||||||||||| |||   | |||||||||| |||| ||||||||| ||    
T  29682367 attgggaaaatgggtagaaattatg-tttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtcacccatttgtatcccttt-gtaa-gaactcatt-ga 29682462  T
Q  317 tagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 385  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| | ||| ||| ||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  29682463 tagtggattggagagatcaatctctcccctagattagatcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 29682530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 214 - 373
Target Start/End: Original strand, 31314447 - 31314604
Alignment:
Q  214 ggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctcct-gtatcccttttgtaaagaactc 310  Q
    |||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||  |||||||||||||||||||   | |||||  |||||||| ||||||    
T  31314447 ggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggtt-gttcattgtgatcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatct-ttttgtaa-gaactc 31314543  T
Q  311 atttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactg 373  Q
     ||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  31314544 -tttgatagtggattggagagatcaatatctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactg 31314604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 212 - 370
Target Start/End: Original strand, 46860474 - 46860631
Alignment:
Q  212 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctcct-gtatcccttttgtaaagaac 308  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||   | ||||| |||| ||||  |||    
T  46860474 ttggtgagattgagaaaatgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaat-aac 46860570  T
Q  309 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaa 370  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||   ||||||||||    
T  46860571 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctttcctccagagtaggtcattgttggaccgaa 46860631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 303 - 376
Target Start/End: Original strand, 47304342 - 47304413
Alignment:
Q  303 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 376  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| | ||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  47304342 aagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctccccaagattaggtcaagttt-gaccgaactgggt 47304413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 212 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 53921671 - 53921511
Alignment:
Q  212 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac-ctcctgtatcccttttgtaaagaac 308  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||| ||||||  | |||| ||||| || |||||||||||||||| |   ||||||  |||||||| ||||    
T  53921671 ttggtgagattggaaaaatgggtagaaattagg-tttgttgtttgtgagcttgttaaagctaatttcttgtaactcatttgtatca-ttttgtaa-gaac 53921575  T
Q  309 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgg 374  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||||| || |||||| |||||||| |||||||||||    
T  53921574 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccggagtagatcaagttt-gaccgaactgg 53921511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 313 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 55302040 - 55301975
Alignment:
Q  313 ttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 378  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||   |||||||||||| |||||    
T  55302040 ttgatagtggattggagagatcaatctctcctccatagtaggtcattgttggaccgaacttggtga 55301975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 385
Target Start/End: Original strand, 29813083 - 29813234
Alignment:
Q  231 ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctcct-gtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattgga 328  Q
    |||||||||||||||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||   | | ||| |||| |||| |||||||||| |||||||||||||    
T  29813083 ggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgcatctcttt-gtaa-gaactcattt-atagtggattgga 29813178  T
Q  329 gagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 385  Q
    |||  |||||||||| ||||| | ||||| | |||||||||||||||| | ||||||    
T  29813179 gagatcaatctctcccccagatttggtcatg-ttggaccgaactgggtcaacaatct 29813234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 232 - 361
Target Start/End: Original strand, 29810889 - 29811016
Alignment:
Q  232 gtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctcct-gtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggag 329  Q
    ||||||||||| ||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||   | ||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  29810889 gtagaaattagagtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaactcatt-gatagtggattggag 29810984  T
Q  330 agtacaatctctcctccagagtaggtcaagtt 361  Q
    ||  |||||||||| ||||| |||||||||||    
T  29810985 agatcaatctctcccccagattaggtcaagtt 29811016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 313 - 372
Target Start/End: Original strand, 46173457 - 46173515
Alignment:
Q  313 ttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaact 372  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  46173457 ttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaact 46173515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 230 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 9666616 - 9666463
Alignment:
Q  230 gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctcctgtatccct-tttgtaaagaactcatttgatagtggattgg 327  Q
    |||||||||||||  ||||||| | |||| |||||  |||||||||||||||||| || | ||| ||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||    
T  9666616 gggtagaaattagattttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaac-tcatttatacctctttgtaa-gaattc-tttgatagtggattgg 9666520  T
Q  328 agagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 385  Q
    ||||    |||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  9666519 agagattgatctctcccccagattaggtaaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 9666463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 212 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 5434046 - 5433971
Alignment:
Q  212 ttggtgagattggga--aaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaacc 284  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||| | |||| |||| | |||||||||||||||||||    
T  5434046 ttggtgagattgggagaaaatggtagaaattagggtttgttctttgtgagcttgttaaagctaatttcttgtaacc 5433971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 313 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 2075143 - 2075081
Alignment:
Q  313 ttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 376  Q
    ||||||||||||| |||||  |||||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  2075143 ttgatagtggatttgagagatcaatctctccccgagagtaggtcaag-ttggatcgaactgggt 2075081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 214 - 374
Target Start/End: Original strand, 32891105 - 32891264
Alignment:
Q  214 ggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcctgtatcccttttgtaaagaactc 310  Q
    |||||||||| ||||  |||||||||||| | ||||||| | |||| |||||  |||||||||||||||||| |   |||||| |||| |||| ||||||    
T  32891105 ggtgagattgagaaaatgggtagaaattaagttttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaa-gaactc 32891202  T
Q  311 atttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgg 374  Q
     || |||||||||||||||||   ||||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||    
T  32891203 gtt-gatagtggattggagagataaatctctcccccggagtaggtcatg-ttggaccgaactgg 32891264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 303 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 23391986 - 23391906
Alignment:
Q  303 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 385  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||   ||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  23391986 aagaactc-tttgatagtggattgtagagataaatctctcccccaaattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 23391906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 217 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 4055926 - 4055763
Alignment:
Q  217 gagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgt-caagctaatttcttgtaacctc--ctgtatcccttttgtaaagaactcatt 313  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||  |||||| | | ||||||||  ||| |||||||||||||||||   |||||| | |||||||  |||||| |    
T  4055926 gagattgggaaatgggtagaaattagg--ttgttcttggagaacttgtaaaagttaatttcttgtaacctcttttgtatctc-tttgtaagaaactca-t 4055831  T
Q  314 tgatagtggattggagagtacaatctctcctccaga-gtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaa 382  Q
    ||||||||||||| ||||  |  ||||||| ||||| ||||||||   |||| ||||||||||| |||||    
T  4055830 tgatagtggattgaagagatc--tctctcccccagatgtaggtcattgttgggccgaactgggtaaccaa 4055763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 297 - 357
Target Start/End: Original strand, 33191916 - 33191974
Alignment:
Q  297 tttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtca 357  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  |||||||| |||||||| ||||||    
T  33191916 tttgtaaagaactcatt-gatagtggattagagagatcaatctct-ctccagaggaggtca 33191974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 359; Significance: 0; HSPs: 65)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 359; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 84 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 6594853 - 6594434
Alignment:
Q  84 agagaagttggaagagagagacttgggaaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaaca 183  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6594853 agagaggttggaagagagagacttgggaaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaaca 6594754  T
Q  184 ccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaac 283  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6594753 ccttgta--gagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaac 6594656  T
Q  284 ctcctgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaat 383  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6594655 ctcttgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaat 6594556  T
Q  384 ctctttggtgctt-ttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgtcgctttgtgtttcacacttggttcctggattagatctaggtggtgt 482  Q
    |||||| ||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6594555 ctcttt-gtgtttattgttttcttcttcc--ctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgt 6594459  T
Q  483 tttgttgtttcttgcttgcacaata 507  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  6594458 tttgttgtttcttgcttgcacaata 6594434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 358; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 89 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 18392486 - 18392072
Alignment:
Q  89 agttggaagagagagacttgggaaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttg 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18392486 agttggaagagagagacttgggaaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttg 18392387  T
Q  189 taaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcct 288  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18392386 ta--gagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctctt 18392289  T
Q  289 gtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctt 388  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18392288 gtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctt 18392189  T
Q  389 tggtgctt-ttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgtcgctttgtgtttcacacttggttcctggattagatctaggtggtgttttgt 487  Q
    | ||| || ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18392188 t-gtgtttattgttttcttcttccctctccttg--tatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgt 18392092  T
Q  488 tgtttcttgcttgcacaata 507  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  18392091 tgtttcttgcttgcacaata 18392072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 69 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 32060635 - 32060198
Alignment:
Q  69 tgcaaattttaagggagagaagttggaagagagagacttgggaaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttg 168  Q
    |||| |||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32060635 tgcagatttgaaggga-agaggttggaagagagagacttgggaaatcaaagggtaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttg 32060537  T
Q  169 aaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaag 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32060536 aaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaag 32060437  T
Q  269 ctaatttcttgtaacctcctgtatccc--ttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggac 366  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32060436 ctaatttcttgtaacctcttgtatcccctttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggac 32060337  T
Q  367 cgaactgggtgaccaatctctttggtgctt-ttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgtcgctttgtgtttcacacttggttcctgga 465  Q
    |||||| ||||| |||||||||| ||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  32060336 cgaacttggtgaacaatctcttt-gtgtttattgttttcttcttcc--ctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctaga 32060240  T
Q  466 ttagatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgcacaata 507  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32060239 ttagatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgcacaata 32060198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 354; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 89 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 18389050 - 18388636
Alignment:
Q  89 agttggaagagagagacttgggaaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttg 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18389050 agttggaagagagagacttgggaaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttg 18388951  T
Q  189 taaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcct 288  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18388950 ta--gagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctctt 18388853  T
Q  289 gtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctt 388  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18388852 gtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctt 18388753  T
Q  389 tggtgctt-ttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgtcgctttgtgtttcacacttggttcctggattagatctaggtggtgttttgt 487  Q
    | ||| || |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18388752 t-gtgtttattgttttcttcttccctctctttg--tatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgt 18388656  T
Q  488 tgtttcttgcttgcacaata 507  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  18388655 tgtttcttgcttgcacaata 18388636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 83 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 6592636 - 6592216
Alignment:
Q  83 gagagaagttggaagagagagacttgggaaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaac 182  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6592636 gagagaggttggaagagagagacttgggaaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaac 6592537  T
Q  183 accttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaa 282  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6592536 accttgta--gagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaatgggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaa 6592439  T
Q  283 cctcctgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaa 382  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6592438 cctcttgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 6592339  T
Q  383 tctctttggtgctt-ttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgtcgctttgtgtttcacacttggttcctggattagatctaggtggtg 481  Q
    ||||||| ||| || |||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6592338 tctcttt-gtgtttattgttttcttcttcc--ctccttgtttttcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtg 6592242  T
Q  482 ttttgttgtttcttgcttgcacaata 507  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  6592241 ttttgttgtttcttgcttgcacaata 6592216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 96 - 478
Target Start/End: Original strand, 20343780 - 20344158
Alignment:
Q  96 agagagagacttgggaaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaaga 194  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20343780 agagagagacttggggaatcaaagggagcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaaga 20343879  T
Q  195 gagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcctgtatcc 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  20343880 gagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcc 20343979  T
Q  295 cttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttggtgc 394  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20343980 cttttgt-aagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgc 20344077  T
Q  395 ttttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgtcgctttgtgtttcacacttggttcctggattagatctaggtg 478  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||    
T  20344078 ttttgttttcttcttccctctcct--tttatcttgtgattgt-gttttgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtg 20344158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 85 - 449
Target Start/End: Original strand, 24789713 - 24790074
Alignment:
Q  85 gagaagttggaagagagagacttgggaaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaaca 183  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24789713 gagaggttggaagagagagacttgggaaatcaaagggagcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaaca 24789812  T
Q  184 ccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaa 282  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24789813 ccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttggtaagattgggaaaagggtaaaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaa 24789912  T
Q  283 cctcctgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaa 382  Q
    | |  ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24789913 cattttgtatcccttttgtaaa-aactc-tttgatagtggattggagagtactatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 24790010  T
Q  383 tctctttggtg-cttttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgtcgctttgtgtttc 449  Q
    |||| |||||| ||||  |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || |||||||||    
T  24790011 tctc-ttggtgtctttgtttttcttcttccctctcct--tttatcttgtgattgt-gcattgtgtttc 24790074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 289 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 1560757 - 1560540
Alignment:
Q  289 gtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctt 388  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1560757 gtatcccttttgtaa-gaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtaaccaatctctt 1560659  T
Q  389 tggtgcttttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgtcgctttgtgtttcacacttggttcctggattagatctaggtggtgttttgtt 488  Q
     ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1560658 -ggtgtatttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgtt 1560560  T
Q  489 gtttcttgcttgcacaatat 508  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  1560559 gtttcttgcttgcacaatat 1560540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 96 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 1562287 - 1562103
Alignment:
Q  96 agagagagacttgggaaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagag 195  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  1562287 agagagagacttggggaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgt--agag 1562190  T
Q  196 agaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaa 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1562189 agaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaa 1562103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 89 - 503
Target Start/End: Original strand, 39731243 - 39731656
Alignment:
Q  89 agttggaagagagaga--cttgggaaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacac 184  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||  |||||| | ||||||    
T  39731243 agttggaagagagagaaacttgggaaatcaaagggagtaactctagggtttagggt-ctttgattagagcttctcttgggttgggaaacattgtaaacac 39731341  T
Q  185 cttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtca-agctaatttcttgtaac 283  Q
    ||||   || || ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| | |||||||||||||||    
T  39731342 cttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttggtgagattggaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcagatctaatttcttgtaac 39731440  T
Q  284 -ctcctgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaa 382  Q
     ||  |||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  39731441 tcttttgtatctcttttgtaa-gaactcatt-gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 39731538  T
Q  383 tctctttggtgcttttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgtcgctttgtgtttcacac-ttggttcctggattagatctaggtggtg 481  Q
      |||||||||  ||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| |||| | |||||| ||  ||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||    
T  39731539 --tctttggtgtctttgttttcctcttccctctcct--tttatcttgtgcttgt-ggtttgtgcttttcactttgtttcctagattagatctaggtgttg 39731633  T
Q  482 tt-ttgttgtttcttgcttgcac 503  Q
    || |||||| || ||||||||||    
T  39731634 ttattgttgattattgcttgcac 39731656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 90 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 43504448 - 43504102
Alignment:
Q  90 gttggaagagagaga--cttgggaaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacacc 185  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||| |||  ||||||||||||||||    
T  43504448 gttggaagagagagaaacttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagagt-ctttgattagagcttctcttggcttgggaaacatgggaaacacc 43504350  T
Q  186 ttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaa-- 282  Q
    ||| | ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||      
T  43504349 ttgaagagagaaaatcatcgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattaggg-ttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaact 43504251  T
Q  283 cctcctgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaa 382  Q
    | |  |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  43504250 ctttttgtatctcttttgt-aagaactca-ttgatagtgaattggagagttcaatctctcctccatagtaggtcaagtttggatcgaactgggtgaacaa 43504153  T
Q  383 tctctttggtgcttttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgt 436  Q
    |||| ||||||  ||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  43504152 tctc-ttggtgtctttgttttcctcttccctctcct--tttatcttgtgcttgt 43504102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 96 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 25767246 - 25766953
Alignment:
Q  96 agagagagacttgggaaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaaga 194  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||    |||||| | ||||||||||   ||     
T  25767246 agagagaaacttgagaaatcaaagggagcaactctagggtttagggt-ctttgattagagtttctctttggg---aaacattgtaaacaccttggtgagt 25767151  T
Q  195 gagaatcattgagtgtcttggt----gagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacctcct 288  Q
    || ||||||||||||||||| |    |||||||| |||  ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| | |    
T  25767150 gaaaatcattgagtgtcttgttcattgagattggaaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccctt 25767052  T
Q  289 --gtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctc 386  Q
      ||||| ||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  25767051 ttgtatctcttttg--aagaactcatt-gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttagaccgaactgggtgaacaatctc 25766955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 96 - 388
Target Start/End: Original strand, 35853791 - 35854089
Alignment:
Q  96 agagagagacttgggaaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaag 193  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||  | | || ||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   ||    
T  35853791 agagagaaacttaggaaatcaaaggtagcaactttagggtttagggt-ctttgatttgagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgag 35853888  T
Q  194 agagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc 284  Q
     || |||||||||||||||||       ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  35853889 tgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacc 35853987  T
Q  285 -tcctgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaat 383  Q
     |  |||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35853988 cttttgtatctcttt-gtaa-gaactcatt-gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaat 35854084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 96 - 385
Target Start/End: Original strand, 29990931 - 29991225
Alignment:
Q  96 agagagagacttgggaaatcaaagggga-agctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaag 193  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || | || ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   ||    
T  29990931 agagagaaacttgggaaatcaaaggagacaactttagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgag 29991028  T
Q  194 agagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc- 284  Q
     || |||||||||||||||||       |||||||||||||| || |||||||||||||| |||  | ||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  29991029 tgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaggatagaaattagggtt-gttatttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaaccc 29991127  T
Q  285 tcctgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatc 384  Q
    |  |||||| ||||    || |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29991128 ttttgtatctctttct--aataactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatc 29991224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 96 - 388
Target Start/End: Original strand, 48408678 - 48408979
Alignment:
Q  96 agagagagacttgggaaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaag 193  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   ||    
T  48408678 agagagaaacttgggaaatcaaagggagcaactctagggtttagggt-ctttgattagagtttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgag 48408776  T
Q  194 agagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc 284  Q
     || |||||||||||||||||       ||||||||||||||  ||||||||||||  ||| |||| | || |||||||||| |||||||||||||||||    
T  48408777 tgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaagggtagaaattaatgtt-gttctttgtaaacttgtcaaagctaatttcttgtaacc 48408875  T
Q  285 tcct--gtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaa 382  Q
     | |  ||||| |||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  48408876 ccttttgtatctcttttg-aaataactcatt-gatagtggattggagagtttaatctctcctccagagtatgtcaagtttagaccgaactgggtgaacaa 48408973  T
Q  383 tctctt 388  Q
    | ||||    
T  48408974 tttctt 48408979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 96 - 385
Target Start/End: Original strand, 23554916 - 23555212
Alignment:
Q  96 agagagagacttgggaaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaag 193  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || | ||  |||||| | ||| ||||||||||||| ||||||| ||||  |||||| | ||||||||||   ||    
T  23554916 agagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaacttcagggttgaaggt-ctttgattagagt-tctcttgagttgggaaacattgtaaacaccttggtgag 23555013  T
Q  194 agagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaagg--ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac 283  Q
     || |||||||||||||||||       ||||||||||||||    |||||||||||||||| |||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  23555014 tgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaac 23555112  T
Q  284 -ctcctgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaa 382  Q
     ||  |||| | |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23555113 acttttgtacctcttt-gtaa-gaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 23555209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 212 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 34310884 - 34310712
Alignment:
Q  212 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcctgtatcccttttgtaaagaac 308  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||| ||||  |||||||||||||||||| |   ||||||  |||||||| ||||    
T  34310884 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaaattgttgaagctaatttcttgtaacacatttgtatct-ttttgtaa-gaac 34310788  T
Q  309 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 385  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34310787 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 34310712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 142 - 385
Target Start/End: Original strand, 25615785 - 25616025
Alignment:
Q  142 tctttgattagagtatctcttgggttg-aaaacatgggaaacaccttgtaa-agagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaag-gggtagaaa 238  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||||    ||||| |||||||||||||||||   |||||||||||  |||||||||    
T  25615785 tctttgattagagt-tctcttgggttggaaaacattgtaaacaccttgggtgagagaaaatcattgagtgtcttg---agattgggaaaatgggtagaaa 25615880  T
Q  239 ttagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctcct-gtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaa 336  Q
    ||||| |||||||   |||  |||||  |||||||||||||||||||   | |||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||  |||    
T  25615881 ttagg-tttgttctatgtgcgcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatca-ttttgtaa-gaactcatt-gatagtggattagagagatcaa 25615976  T
Q  337 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 385  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  25615977 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggcgaacaatct 25616025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 96 - 385
Target Start/End: Original strand, 4178651 - 4178945
Alignment:
Q  96 agagagagacttgggaaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaag 193  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||  | | || ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   ||    
T  4178651 agagagaaacttgagaaatcaaaggaagcaactttagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgag 4178748  T
Q  194 agagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaagg-ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc 284  Q
     || |||||||||||||||||       ||||||||||||||   |||||||||||||||| |||| | |||||||||  || |||||||||||||||||    
T  4178749 tgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaaggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgggaaagctaatttcttgtaacc 4178847  T
Q  285 -tcctgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaat 383  Q
     |  |||||| ||||    ||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||| ||||| ||||    
T  4178848 cttttgtatctctttg---aagaactcatt-gatagtggattgaacagttcaatctctcctccagagcaggtcaagtttgaaccaaactaggtgaacaat 4178943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 129 - 385
Target Start/End: Original strand, 19502088 - 19502350
Alignment:
Q  129 tagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg-------gtgaga 220  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   || ||||||||||||||||||||       ||||||    
T  19502088 tagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgagaatcattgagtgtcttgttcagtggtgaga 19502185  T
Q  221 ttgggaaag--gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac-ctcctgtatcccttttgtaaagaactcatttga 316  Q
    ||| ||||   || ||||||||| |||| |||  | |||| |||||||| |||||||||||||||| ||  |||||| | ||||| ||||||||| ||||    
T  19502186 ttgcgaaaaaaggttagaaattaaggtt-gttttttgtgagcttgtcaaagctaatttcttgtaactcttttgtatctc-tttgt-aagaactca-ttga 19502281  T
Q  317 tagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 385  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||| ||||||    
T  19502282 tagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaagtcaagtttggaacgaagtgggtgaacaatct 19502350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 212 - 378
Target Start/End: Original strand, 22269973 - 22270137
Alignment:
Q  212 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctcct-gtatcccttttgtaaagaac 308  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||   | ||||| |||| |||| ||||    
T  22269973 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaac 22270069  T
Q  309 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 378  Q
    | ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22270070 tgatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtga 22270137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 212 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 14070001 - 14069830
Alignment:
Q  212 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacctcct-gtatcccttttgtaaagaac 308  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||   | ||||| |||| |||| ||||    
T  14070001 ttggtgagattgggaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaac 14069905  T
Q  309 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 385  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  14069904 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctccccaagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 14069830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 212 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 14380029 - 14379858
Alignment:
Q  212 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacctcct-gtatcccttttgtaaagaac 308  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||   | ||||| |||| |||| ||||    
T  14380029 ttggtgagattgggaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaac 14379933  T
Q  309 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 385  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  14379932 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccctagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 14379858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 212 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 41317602 - 41317431
Alignment:
Q  212 ttggtgagattgggaaagg-ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaa-cctcctgtatcccttttgtaaagaac 308  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||| | |||| |||||||| ||||||||||||||| ||   ||||||||||| |||| ||||    
T  41317602 ttggtgagattgggaaaattggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtcaaagctaatttcttgtaatccatttgtatcccttt-gtaa-gaac 41317506  T
Q  309 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 385  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  41317505 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 41317431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 96 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 30025024 - 30024740
Alignment:
Q  96 agagagagacttgggaaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaa-catgggaaacaccttgtaa-a 192  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || | || ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| | | | ||||||||||    |    
T  30025024 agagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttaggttgaaaaacgttgtaaacaccttgggtga 30024927  T
Q  193 gagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac 283  Q
    | || |||||||||||||||||       ||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  30024926 gtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggtt-gttcattgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaac 30024828  T
Q  284 ctcct-gtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgg 374  Q
    |   | ||||| |||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30024827 ccatttgtatctcttt-gtaa-gaactc-tttgatagtggattggagagatcaatcactcccccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgg 30024740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 212 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 8359485 - 8359319
Alignment:
Q  212 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc--tcctgtatcccttttgtaaagaa 307  Q
    |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||| | |||| |||||  || ||||||||||||||||  |  |||||| |||| |||| |||    
T  8359485 ttggggagattgggaaaatgggtagaaattagggttt-ttctttgtgagcttgtttaaactaatttcttgtaacccattttgtatctcttt-gtaa-gaa 8359389  T
Q  308 ctcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 378  Q
    |||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  8359388 ctcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcattgttggaccgaactgggtga 8359319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 303 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 32358131 - 32358058
Alignment:
Q  303 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 378  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32358131 aagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtga 32358058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 212 - 378
Target Start/End: Original strand, 29608737 - 29608901
Alignment:
Q  212 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcctgtatcccttttgtaaagaac 308  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||| |   |||||| |||| |||| ||||    
T  29608737 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaa-gaac 29608833  T
Q  309 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 378  Q
    ||||| ||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  29608834 tcatt-gatagtggattggagatatcaatcactcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgagtga 29608901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 212 - 361
Target Start/End: Original strand, 48491579 - 48491727
Alignment:
Q  212 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctcct-gtatcccttttgtaaagaac 308  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||   | ||||| ||||   |||||||    
T  48491579 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttg--aaagaac 48491675  T
Q  309 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtt 361  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||||||    
T  48491676 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagtt 48491727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 212 - 385
Target Start/End: Original strand, 27347817 - 27347988
Alignment:
Q  212 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctcct-gtatcccttttgtaaagaac 308  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||| || |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||   | ||||| |||| |||| ||||    
T  27347817 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattaggatt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaac 27347913  T
Q  309 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 385  Q
    ||||| |||||||||||| ||||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  27347914 tcatt-gatagtggattgcagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 27347988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 231 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 41649158 - 41649008
Alignment:
Q  231 ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcct-gtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggag 329  Q
    ||||||||||||| ||||||| | |||| |||||  ||||||||||||||||||   | |||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  41649158 ggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgtttagctaatttcttgtaacccatttgtatcccttt-gtaa-gaactcatt-gatagtggattggag 41649063  T
Q  330 agtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 385  Q
    ||  |||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  41649062 agatcaatctctcccccaaattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 41649008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 96 - 376
Target Start/End: Original strand, 43864120 - 43864406
Alignment:
Q  96 agagagagacttgggaaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaa-a 192  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || | || ||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||    |    
T  43864120 agagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattaaagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtga 43864217  T
Q  193 gagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac 283  Q
    | || |||||||||||||||||       |||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  ||||||||||| ||||||    
T  43864218 gtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattggaaaagtgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcctgtaac 43864316  T
Q  284 ctcct-gtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 376  Q
    |   | ||||| |||| ||||| |||| ||| |||||||||||||||||  |||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  43864317 ccatttgtatctcttt-gtaaa-aactaatt-gatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggt 43864406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 212 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 48599502 - 48599338
Alignment:
Q  212 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcctgtatcccttttgtaaagaac 308  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||| |   |||||| |||| |  |||| |    
T  48599502 ttggtgatattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgg--aagagc 48599406  T
Q  309 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 378  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  48599405 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagcagatcaag-ttggaccgaactgggtga 48599338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 313 - 378
Target Start/End: Original strand, 3259095 - 3259159
Alignment:
Q  313 ttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 378  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  3259095 ttgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttgaaccgaactgggtga 3259159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 316 - 388
Target Start/End: Original strand, 2390385 - 2390456
Alignment:
Q  316 atagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctt 388  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||  ||||||||    
T  2390385 atagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactaggtgaataatctctt 2390456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 313 - 377
Target Start/End: Original strand, 6432071 - 6432134
Alignment:
Q  313 ttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtg 377  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6432071 ttgatagtggattggagagatcaatctctccttcagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtg 6432134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 212 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 4253697 - 4253538
Alignment:
Q  212 ttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctcctgtatccct-tttgtaaagaact 309  Q
    ||||||| ||||| |||  ||||||||||||||||||||| | |||| |||||  ||||||||||| ||||||| | | |||  || |||| ||||||||    
T  4253697 ttggtgaaattggtaaaatggtagaaattagggtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcatgtaacc-cttttatatctctttggaaagaact 4253599  T
Q  310 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaact 372  Q
    |||| |||| |||||| |||||  ||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  4253598 catt-gataatggattagagagatcaatctctcccacagagtaggtcaa-tttggaccgaact 4253538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 212 - 385
Target Start/End: Original strand, 8153342 - 8153513
Alignment:
Q  212 ttggtgagattgggaaaggg-gtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac-ctcctgtatcccttttgtaaagaac 308  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||||||||||| |||| | ||||  ||||||| |||||||||||||||| |   |||||| |||| ||||  |||    
T  8153342 ttggtgagattgggaaaatgagtagaaattagggtt-gttctttgtgagattgtcaaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaat-aac 8153438  T
Q  309 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 385  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||| ||||||||| | ||||||    
T  8153439 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggactgaactgggtcaacaatct 8153513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 212 - 385
Target Start/End: Original strand, 18126644 - 18126815
Alignment:
Q  212 ttggtgagattgggaaaggg-gtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgt-caagctaatttcttgtaa-cctcctgtatcccttttgtaaagaac 308  Q
    ||||||||||||| |||  | ||||||||||||||| |||| | |||||||||| |||||||||||||||||| ||   |||||| | ||||| ||||||    
T  18126644 ttggtgagattggaaaaatgtgtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttcaagctaatttcttgtaacccatttgtatctc-tttgt-aagaac 18126740  T
Q  309 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 385  Q
    ||| |||||||||||||||||    |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||| | ||||||    
T  18126741 tca-ttgatagtggattggaggaatcaatctctcccccagactaggtcaagttt-gaccgacctgggtcaacaatct 18126815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 2361140 - 2360978
Alignment:
Q  212 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcctgtatcccttttgtaaagaac 308  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||| |   |||||| |||| |||| ||||    
T  2361140 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaa-gaac 2361044  T
Q  309 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 376  Q
    ||||| ||||||||||| ||||   |||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  2361043 tcatt-gatagtggatttgagatatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttgaaccgaactgggt 2360978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 212 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 4508874 - 4508710
Alignment:
Q  212 ttggtgagattgggaaaggg-gtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctcct-gtatcccttttgtaaagaac 308  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||||||||||| |||| | |||| ||| |  |||||||||||||||||||   | ||||| |||| |||| ||||    
T  4508874 ttggtgagattgggaaaatgagtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttattgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaac 4508778  T
Q  309 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 378  Q
    ||||| || ||||||||||||||  |||||||| || |||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  4508777 tcatt-gagagtggattggagagatcaatctcttcttcagagtaggttaag-ttggaccgaactgggtga 4508710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 230 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 31733118 - 31732966
Alignment:
Q  230 gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaacctcct-gtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattgg 327  Q
    ||||||||||||||||| |||| | |||| |||| | |||||||||||||||||||   | ||||| |||| |||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  31733118 gggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttggtgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaactcatt-gatactggattgg 31733023  T
Q  328 agagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 385  Q
    ||||  |||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  31733022 agagatcaatctctcccccaaattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 31732966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 142 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 47674189 - 47673953
Alignment:
Q  142 tctttgattagagtatctcttgggttg-aaaacatgggaaacaccttgtaa-agagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaag-gg 231  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||||    || || |||||||||||||||||       ||||||||| ||||  ||    
T  47674189 tctttgattagagt-tctcttgggttggaaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaatgg 47674091  T
Q  232 gtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaa-cctcctgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggag 329  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||||||||  ||||||||||||||||| ||   |||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  47674090 gtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctc-tttgt-aagaactca-ttgatagtggattggag 47673995  T
Q  330 agtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactg 373  Q
    ||  |||||||||| ||| | || |||||| |||||||||||||    
T  47673994 agatcaatctctcc-ccatattaagtcaag-ttggaccgaactg 47673953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 96 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 47676428 - 47676144
Alignment:
Q  96 agagagagacttgggaaatcaaagggga-agctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtt-gaaaacatgggaaacacctt-gtaaa 192  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || | || ||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| | |||||| | ||||||||| |   |    
T  47676428 agagagaaacttgggaaatcaaaggagataactttagggttgaggg-tctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtga 47676331  T
Q  193 gagagaatcattgagtgtc-------ttggtgagattg-ggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaa- 282  Q
    | || ||||| ||||||||       |||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||||| | ||||| ||| | |||||||||||||||||     
T  47676330 gtgaaaatcaatgagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaatgggtagaaattaggg-ttgttctttgtgaatttgttgaagctaatttcttgtaac 47676232  T
Q  283 cctcctgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgg 374  Q
    ||   |||||| | ||||| |||||||||  |||||||||| |||||||  |||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||||    
T  47676231 ccatttgtatctc-tttgt-aagaactca-atgatagtggaatggagagatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactgg 47676144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 316 - 385
Target Start/End: Original strand, 48489534 - 48489602
Alignment:
Q  316 atagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 385  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  48489534 atagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtaaacaatct 48489602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 24515052 - 24514934
Alignment:
Q  96 agagagagacttgggaaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtt-gaaaacatgggaaacaccttgtaaag 193  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  | | || |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| | |||||| | ||||||||||   ||    
T  24515052 agagagaaacttgggaaatcaaaggaagcaactttagggtttaggg-tctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgag 24514955  T
Q  194 agagaatcattgagtgtcttg 214  Q
     || |||||||||||||||||    
T  24514954 tgaaaatcattgagtgtcttg 24514934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 212 - 376
Target Start/End: Original strand, 4586161 - 4586323
Alignment:
Q  212 ttggtgagattggg-aaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaa-cctcctgtatcccttttgtaaagaac 308  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| | ||||||||| | |||||||||| |||||| ||   | |||| | ||||| ||||||    
T  4586161 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattaggg-ttgttctttgtgaacttgttgaagctaattttttgtaacccatttttatctc-tttgt-aagaac 4586257  T
Q  309 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 376  Q
    ||| |||||||||||||||||||  |||||||||| ||| | || |||||  ||||||||||||||||    
T  4586258 tca-ttgatagtggattggagagatcaatctctcccccatattatgtcaa-cttggaccgaactgggt 4586323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 313 - 376
Target Start/End: Original strand, 18396418 - 18396481
Alignment:
Q  313 ttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 376  Q
    ||||||| |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||    
T  18396418 ttgatagaggattggagagatcaatctctcctcaagagtaggtcaatggtggaccgaactgggt 18396481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 313 - 376
Target Start/End: Original strand, 30814536 - 30814598
Alignment:
Q  313 ttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 376  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||||||    
T  30814536 ttgatagtggattggagagatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactgggt 30814598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 233 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 22328538 - 22328395
Alignment:
Q  233 tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcctgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggaga 330  Q
    |||||||||| |||||||| | |||| |||||  |||||||||||||||||| ||  |||||| |||| | || ||| |||||  |||||||||| ||||    
T  22328538 tagaaattagagtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcttttgtatctcttt-gcaaggaagtcatta-atagtggatttgaga 22328441  T
Q  331 gtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 376  Q
    |  |||||||||| | |||||||||||   ||||||||||||||||    
T  22328440 gatcaatctctcccctagagtaggtcattgttggaccgaactgggt 22328395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 212 - 284
Target Start/End: Original strand, 23343975 - 23344048
Alignment:
Q  212 ttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaacc 284  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| ||| | |||| |||| | |||||||||||||||||||    
T  23343975 ttggtgagatttggaaaagggtagaaattaaggtttattctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacc 23344048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 231 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 23565210 - 23565069
Alignment:
Q  231 ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcctgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattgga 328  Q
    |||||||||||||  |||||| | |||| |||||  || ||||||||||||||| ||  |||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  23565210 ggtagaaattaggtcttgttctttgtgagcttgttgaaactaatttcttgtaactcttttgtatctcttt-gtaa-gaactcatt-gatagtggattgga 23565114  T
Q  329 gagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgg 374  Q
    |||  |||||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||||    
T  23565113 gagatcaatctctctcctagagtaggtcaag-ttggactgaactgg 23565069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 303 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 24525579 - 24525508
Alignment:
Q  303 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 376  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| | ||| ||||||||| |||||| |||||||||    
T  24525579 aagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctccccaagattaggtcaag-ttggacggaactgggt 24525508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 212 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 24526065 - 24525992
Alignment:
Q  212 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac 283  Q
    ||||||| |||||||||  |||||||||||||| ||||||| | |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  24526065 ttggtgaaattgggaaaatgggtagaaattaggttttgttctttgtgagcttgtcaaagctaatttcttgtaac 24525992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 303 - 374
Target Start/End: Original strand, 31518993 - 31519063
Alignment:
Q  303 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctc-ctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgg 374  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31518993 aagaactcatt-gacagtggattggagagatcaatctctctccccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgg 31519063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 212 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 36146576 - 36146405
Alignment:
Q  212 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctcct-gtatcccttttgtaaagaac 308  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||  | |||| |||||  |||||||||||| ||||||   | ||||| |||| |||| ||||    
T  36146576 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagtttgttatttgtgagcttgttgaagctaatttct-gtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaac 36146480  T
Q  309 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 385  Q
    ||||| ||||||||||| |||||  |||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||| ||| | ||||||    
T  36146479 tcatt-gatagtggatttgagagatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactaggtcaacaatct 36146405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 303 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 4510625 - 4510552
Alignment:
Q  303 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 378  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||   |||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  4510625 aagaactcatt-gatagtggattgaagaaatcaatctctcctgtagagtaggtcaag-ttggaccgtactgggtga 4510552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 303 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 4512467 - 4512394
Alignment:
Q  303 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 378  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||   |||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  4512467 aagaactcatt-gatagtggattgaagaaatcaatctctcctgtagagtaggtcaag-ttggaccgtactgggtga 4512394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 5513749 - 5513673
Alignment:
Q  297 tttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 376  Q
    ||||||||||||||||| || | || |||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  5513749 tttgtaaagaactcatt-gacactgaattggagaat-caatctcacctccagagtaggtcaa-tttggactgaactgggt 5513673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 303 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 496060 - 496003
Alignment:
Q  303 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtt 361  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| | | |||||||||||||    
T  496060 aagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccctatagtaggtcaagtt 496003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 445 - 503
Target Start/End: Original strand, 24790230 - 24790288
Alignment:
Q  445 gtttcacacttggttcctggattagatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgcac 503  Q
    ||||| ||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||    
T  24790230 gtttctcacctgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattacttgcac 24790288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 303 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 2759274 - 2759207
Alignment:
Q  303 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaact 372  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  2759274 aagaactcatt-gatagtggattggagatatcaatctcttccccagattaggtcaag-ttggaccgaact 2759207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 303 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 31105470 - 31105399
Alignment:
Q  303 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 376  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||   ||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  31105470 aagaactcatt-gatggtggattggagagataaatctctccccaagagtagatcaag-ttggaccgaactgggt 31105399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 303 - 363
Target Start/End: Original strand, 1113748 - 1113807
Alignment:
Q  303 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttg 363  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||  |||||||||| ||| | |||||||||||||    
T  1113748 aagaactcatt-gatagtagattggagagatcaatctctcccccatattaggtcaagtttg 1113807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 317 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 12097931 - 12097864
Alignment:
Q  317 tagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 385  Q
    |||||||||||||||   ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||| | ||||||    
T  12097931 tagtggattggagagatgaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactaggtcaacaatct 12097864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 358; Significance: 0; HSPs: 40)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 358; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 89 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 12647676 - 12647262
Alignment:
Q  89 agttggaagagagagacttgggaaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttg 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12647676 agttggaagagagagacttgggaaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttg 12647577  T
Q  189 taaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcct 288  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12647576 ta--gagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctctt 12647479  T
Q  289 gtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctt 388  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12647478 gtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctt 12647379  T
Q  389 tggtgctt-ttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgtcgctttgtgtttcacacttggttcctggattagatctaggtggtgttttgt 487  Q
    | ||| || ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12647378 t-gtgtttattgttttcttcttccctctccttg--tatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgt 12647282  T
Q  488 tgtttcttgcttgcacaata 507  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  12647281 tgtttcttgcttgcacaata 12647262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 192 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 13656220 - 13655904
Alignment:
Q  192 agagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcctgta 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13656220 agagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgta 13656121  T
Q  292 tcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgg 391  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13656120 tcccttttgt-aagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgg 13656022  T
Q  392 tgctt-ttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgtcgctttgtgtttcacacttggttcctggattagatctaggtggtgttttgttgt 490  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13656021 tgtttgttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgt 13655922  T
Q  491 ttcttgcttgcacaatat 508  Q
    ||||||||||||||||||    
T  13655921 ttcttgcttgcacaatat 13655904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 96 - 504
Target Start/End: Original strand, 6266574 - 6266979
Alignment:
Q  96 agagagagacttgggaaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaaga 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6266574 agagagagacttgggaaatcaaagggagcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagaga 6266673  T
Q  195 gagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctcctgtatc 293  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||    
T  6266674 gaaaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaaccttttgtatc 6266773  T
Q  294 ccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttggtg 393  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  6266774 ccttttgt-aagaactc-tttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctc-ttggtg 6266870  T
Q  394 -cttttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgtcgctttgtgtttcacacttggttcctggattagatctaggtggtgttttgttgttt 492  Q
     ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |  ||||||||  |||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  6266871 tcttttgttttcttcttccctctcc--gtttatcttgtgcttgt-gtattgtgtttttcacttctttcctagattagatctaggtgttgttttgttgatt 6266967  T
Q  493 cttgcttgcaca 504  Q
     |||||| ||||    
T  6266968 tttgcttacaca 6266979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 96 - 503
Target Start/End: Original strand, 32289448 - 32289853
Alignment:
Q  96 agagagagacttgggaaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtt-gaaaacatgggaaacaccttgtaaag 193  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | | ||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||| | |||||||| ||||||||||   ||    
T  32289448 agagagaaacttgggaaatcaaagggagtaactctagggtttagagt-ctttgattagagcttctcttgggtttggaaacatggtaaacaccttggtgag 32289546  T
Q  194 agagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaac-ctcctgta 291  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||  ||||||||||||||| ||  ||||    
T  32289547 tgaaaatcattgagtgtcttggtgagattggaaaaggg-tagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactcttttgta 32289644  T
Q  292 tcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgg 391  Q
    || ||||||||| ||||||||| ||||||  ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32289645 tctcttttgtaa-gaactcatt-gatagtaaattagagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttgg 32289742  T
Q  392 tgcttttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgtcgctttgtgtttcacac-ttggttcctggattagatctaggtggtgtt-ttgttg 489  Q
    ||   |||||||| |||||||||||||  ||||||||||| |||| | ||| || ||  ||| ||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||    
T  32289743 tgtccttgttttcctcttccctctcct--tttatcttgtgcttgt-gttttatgcttttcactttgtttcctagattagatctaggtgttgttattgttg 32289839  T
Q  490 tttcttgcttgcac 503  Q
     || ||||||||||    
T  32289840 attattgcttgcac 32289853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 89 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 4484632 - 4484211
Alignment:
Q  89 agttggaagagagaga--cttgggaaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacac 184  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||  |||||| | ||||||    
T  4484632 agttggaagagagagaaacttgggaaatcaaagggagtaactctagggtttagggt-ctttgattagagcttctcttgggttgggaaacattgtaaacac 4484534  T
Q  185 cttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg------gtgagattggga--aaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaattt 275  Q
    ||||   || |  |||||||||||||||||      |||| |||||||  || ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||    
T  4484533 cttggtgagtgtaaatcattgagtgtcttgttcttggtgaaattgggagaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaattt 4484435  T
Q  276 cttgtaacc-tcctgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgg 374  Q
    ||||||||| |  |||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4484434 cttgtaacccttttgtatctcttttgtaa-gaactcatt-gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggacagaactgg 4484337  T
Q  375 gtgaccaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgtcg-ctttgtgtttcacacttggttcctggattagatct 473  Q
    |||| |||  |||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |  ||||  ||||||  ||| ||||| ||||||||||    
T  4484336 gtgaacaa--tctttggtgtctttgttttcttcttccctctcct--tttatcttgtgcttgtggtttttgcttttcac-tttgtttcctagattagatct 4484242  T
Q  474 aggtggtgtt-ttgttgtttcttgcttgcac 503  Q
    ||||| |||| |||||| || ||||||||||    
T  4484241 aggtgttgttattgttgattattgcttgcac 4484211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 104 - 503
Target Start/End: Original strand, 30833229 - 30833633
Alignment:
Q  104 acttgggaaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatc 201  Q
    |||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||  |||||| | |||||| |||   || |  ||||    
T  30833229 acttgggaaatcaaagggagtaactctagggtttagggtt-tttgattagagcttatcttgggttgggaaacattgtaaacactttggtgagtgtaaatc 30833327  T
Q  202 attgagtgtcttg------gtgagattggga--aaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-tcctgta 291  Q
    |||||||||||||      ||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| | ||||||||||||||| |  ||||    
T  30833328 attgagtgtcttgttcttggtgagattgggagaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagttaatttcttgtaacccttttgta 30833426  T
Q  292 tcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgg 391  Q
    || ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||    
T  30833427 tctcttttgtaa-gaactcatt-gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggactgaactgggtgaacaa--tctttgg 30833522  T
Q  392 tgcttttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgtcgctttgtgtttcacac-ttggttcctggattagatctaggtggtgtt-ttgttg 489  Q
    ||  ||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| |||| | |||||| ||  ||| ||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||    
T  30833523 tgtctttgttttcctcttccctctcct--tttatcttgtgcttgt-ggtttgtgcttttcactttgtttcctagattagatctaggtgttgttattgttg 30833619  T
Q  490 tttcttgcttgcac 503  Q
     || ||||||||||    
T  30833620 attattgcttgcac 30833633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 96 - 385
Target Start/End: Original strand, 45099631 - 45099926
Alignment:
Q  96 agagagagacttgggaaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaag 193  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  | | || ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   ||    
T  45099631 agagagaaacttgggaaatcaaaggaagcaactttagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgag 45099728  T
Q  194 agagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaag--gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac 283  Q
     || |||||||||||||||||       ||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  45099729 tgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaac 45099827  T
Q  284 -ctcctgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaa 382  Q
     ||  |||||| ||||    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  45099828 tcttttgtatctctttg---aagaactcatt-gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 45099923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 96 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 4503424 - 4503017
Alignment:
Q  96 agagagagacttgggaaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaag 193  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  | | || ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   ||    
T  4503424 agagagaaacttgggaaatcaaaggaagcaactttagggtttagg-ttctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgag 4503327  T
Q  194 agagaatcattgagtgtcttggt-------gagattgggaaagg--ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac 283  Q
     || ||||||||||||||||| |       ||||||||||||    |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4503326 tgaaaatcattgagtgtcttgttcattggagagattgggaaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaac 4503228  T
Q  284 -ctcctgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaa 382  Q
     ||  |||||| ||||    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  4503227 tcttttgtatctctttg---aagaactcatt-gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 4503132  T
Q  383 tctctttggtgcttttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgtcgctttgtgtttcacac-ttggttcctggattagatctaggtggtg 481  Q
      |||||||||  |||||||   ||||  |||||||  ||||||||||| |||| | |||||| ||  ||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||    
T  4503131 --tctttggtgtgtttgtttctctctt--ctctcct--tttatcttgtgcttgt-gttttgtgcttttcactttgtttcctagattagatctaggtgctg 4503039  T
Q  482 tt-ttgttgtttcttgcttgca 502  Q
    || |||||| || |||||||||    
T  4503038 ttattgttgattattgcttgca 4503017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 96 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 5723546 - 5723252
Alignment:
Q  96 agagagagacttgggaaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaag 193  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || | || |||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   ||    
T  5723546 agagagaaacttgggaaatcaaaggaggcaactttagggtttggggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgag 5723449  T
Q  194 agagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacct 285  Q
     || |||||||||||||||||       ||||||||| |||| |||||||||||||| || |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5723448 tgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaagggtagaaattaggctt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacct 5723350  T
Q  286 cct-gtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatc 384  Q
      | ||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  5723349 ttttgtatctcttt-gtaa-gaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctctagagtaggttaagtttggaccgaactgggtgaacaatc 5723253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 96 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 36205955 - 36205661
Alignment:
Q  96 agagagagacttgggaaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaag 193  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  | | || ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||||   ||    
T  36205955 agagagaaacttgggaaatcaaaggaagcaactttagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacatggtaaacaccttggtgag 36205858  T
Q  194 agagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaagg-ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac- 283  Q
     || |||||||||||||||||       ||||||||||||||   |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  36205857 tgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaact 36205759  T
Q  284 ctcctgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaat 383  Q
    ||  |||||| ||||    ||||||||||| || || |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36205758 cttttgtatctctttg---aagaactcatt-gacagcggattggagagttcaatctatcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaat 36205663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 96 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 36988367 - 36987961
Alignment:
Q  96 agagagagacttgggaaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaag 193  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || | || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   ||    
T  36988367 agagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacatagtaaacaccttggtgag 36988270  T
Q  194 agagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac- 283  Q
     || |||||||||||||||||       ||| |||||| |||  ||||||||||||||| ||||||   |||| |||||| || |||||||||||||||     
T  36988269 tgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgggattggaaaaaagggtagaaattaggg-ttgttctatgtgagcttgtcaaaactaatttcttgtaact 36988171  T
Q  284 ctcctgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaat 383  Q
    ||  |||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  36988170 cttttgtatctc-tttgt-aagaactca-ttgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa- 36988075  T
Q  384 ctctttggtgcttttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgtcgctttgtgtttcacac-ttggttcctggattagatctaggtggtgt 482  Q
     |||||||||  |||||||   ||||  |||||||  |||||||| || |||| |||||||| ||  ||| ||| ||||| ||||||||||||||| |||    
T  36988074 -tctttggtgtgtttgtttctctctt--ctctcct--tttatcttttgcttgtggctttgtgcttttcactttgattcctagattagatctaggtgttgt 36987980  T
Q  483 t-ttgttgtttcttgcttg 500  Q
    | |||||| || |||||||    
T  36987979 tattgttgattattgcttg 36987961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 96 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 2334709 - 2334414
Alignment:
Q  96 agagagagacttgggaaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaag 193  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || | || ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   ||    
T  2334709 agagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggta-tttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgag 2334612  T
Q  194 agagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattggg-aaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaac- 283  Q
     || |||||||||||||||||       ||||||||||| ||| |||||||||| |||| |||||| | ||||||||| | |||||||||||| |||||     
T  2334611 tgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaataaggg-ttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttctagtaact 2334513  T
Q  284 ctcctgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaat 383  Q
    ||  |||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  2334512 cttttgtatctc-tttgt-aagaactca-ttgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggggaacaat 2334416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 212 - 378
Target Start/End: Original strand, 45726929 - 45727093
Alignment:
Q  212 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctcct-gtatcccttttgtaaagaac 308  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||| | |||| |||||  ||||||||||||||||||||  | ||||| |||| |||| ||||    
T  45726929 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacctatttgtatctcttt-gtaa-gaac 45727025  T
Q  309 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 378  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45727026 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtga 45727093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 231 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 6595154 - 6595002
Alignment:
Q  231 ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc-tcctgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattgga 328  Q
    |||||||||||||||| |||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||| |  || ||| |||| |||| |||||| || ||||||||||||||    
T  6595154 ggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgaatctcttt-gtaa-gaactcgtt-gatagtggattgga 6595059  T
Q  329 gagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 385  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  6595058 gagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaatct 6595002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 230 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 34139920 - 34139767
Alignment:
Q  230 gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctcc-tgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattgg 327  Q
    ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  34139920 gggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatatgtatcccttttgtaa-gaactcatt-gatagtggattgg 34139824  T
Q  328 agagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 385  Q
    ||||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  34139823 agagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 34139767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 212 - 376
Target Start/End: Original strand, 29867869 - 29868031
Alignment:
Q  212 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaa-cctcctgtatcccttttgtaaagaac 308  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||| ||   |||||| | ||||| ||||||    
T  29867869 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctc-tttgt-aagaac 29867965  T
Q  309 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 376  Q
    || ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||||||    
T  29867966 tc-tttgatagtggattggagagatcaatctctcccccaaattaggtcaag-ttggaccgaactgggt 29868031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 217 - 376
Target Start/End: Original strand, 33648176 - 33648335
Alignment:
Q  217 gagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc-tcctgtatcccttttgtaaagaactcattt 314  Q
    ||||||| ||||  |||| |||||||||||||||| | |||| |||||  ||||||||||| ||||||| |  |||||  |||| ||||||||||||||     
T  33648176 gagattgagaaaatggtaaaaattagggtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcctgtaacccttttgtatttcttt-gtaaagaactcatt- 33648273  T
Q  315 gatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 376  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  33648274 gatagcggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcattgttggaccgaactgggt 33648335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 104 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 724028 - 723741
Alignment:
Q  104 acttgggaaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaa-agagagaat 200  Q
    ||||||||||||||||| || | || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||  |||||| | ||||||||||    || || |||    
T  724028 acttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattagagt-tcttttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaat 723931  T
Q  201 cattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctcct-gt 290  Q
    ||||||||||||||       |||||||||| |||  |||||||||||||| ||||||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||   | ||    
T  723930 cattgagtgtcttgttcatttgtgagattggaaaactgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgt 723832  T
Q  291 atcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 385  Q
    |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  723831 atcccttt-gtaa-gaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 723741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 212 - 383
Target Start/End: Original strand, 24398055 - 24398228
Alignment:
Q  212 ttggtgagattgggaa--aggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc-tcctgtatcccttttgtaaagaa 307  Q
    |||||||||||| |||  | |||||||| ||| ||||||||| | |||| |||||  ||||||||||||||||||| |  |||||| |||| ||||||||    
T  24398055 ttggtgagattgtgaagaaagggtagaagttaaggtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaaagaa 24398153  T
Q  308 ctcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaat 383  Q
    |||||| |||| ||||||||||||  |||||||||| ||| |||||||||   |||||||||||||| ||| ||||    
T  24398154 ctcatt-gataatggattggagagatcaatctctcccccatagtaggtcattgttggaccgaactggctgaacaat 24398228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 96 - 385
Target Start/End: Original strand, 38312116 - 38312411
Alignment:
Q  96 agagagagacttgggaaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaa-a 192  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| || | || ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | | |||||||||   |    
T  38312116 agagagaaatttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagg-ttctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtatacaccttgtgtga 38312213  T
Q  193 gagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac 283  Q
    | || |||||||||||||||||       ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  || |||||||||||||||    
T  38312214 gtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaaactaatttcttgtaac 38312312  T
Q  284 ctcct-gtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaa 382  Q
    |   | ||||| |||| |||| || |||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||| | |||    
T  38312313 ccatttgtatctcttt-gtaa-gatctcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattatgtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaa 38312408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 104 - 361
Target Start/End: Original strand, 42362236 - 42362500
Alignment:
Q  104 acttgggaaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaa-agagagaat 200  Q
    ||||||||||||||||| || | || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||    || || |||    
T  42362236 acttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaat 42362333  T
Q  201 cattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctcct-gt 290  Q
    ||||||||||||||       ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||   | ||    
T  42362334 cattgagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaatgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgt 42362432  T
Q  291 atcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtt 361  Q
    |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||| ||||| |||||||||||    
T  42362433 atcccttt-gtaa-gaactcatt-gatagtggattggagagatctatctctcccccagattaggtcaagtt 42362500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 303 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 35446961 - 35446888
Alignment:
Q  303 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 378  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35446961 aagaactcatt-gatagtggattggagagatcactctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtga 35446888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 230 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 14633975 - 14633834
Alignment:
Q  230 gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctcct-gtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattgg 327  Q
    |||||||||||||| || |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||   | ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||    
T  14633975 gggtagaaattaggatt-gttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatcccttttgtaa-gaactcata-gatagtggattgg 14633879  T
Q  328 agagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactg 373  Q
    ||||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  14633878 agagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactg 14633834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 303 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 1631809 - 1631736
Alignment:
Q  303 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 378  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  1631809 aagaactcatt-gatagtggattggagaaatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgagtga 1631736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 303 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 17057446 - 17057366
Alignment:
Q  303 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 385  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  17057446 aagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagactaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 17057366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 303 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 17085429 - 17085349
Alignment:
Q  303 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 385  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  17085429 aagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagactaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 17085349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 212 - 385
Target Start/End: Original strand, 36773562 - 36773733
Alignment:
Q  212 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcctgtatcccttttgtaaagaac 308  Q
    |||||||||||||||||  ||| | ||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||| |   |||||| |||| |||| ||||    
T  36773562 ttggtgagattgggaaaatgggaataaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaa-gaac 36773658  T
Q  309 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 385  Q
    || ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  36773659 tc-tttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattatgtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 36773733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 313 - 385
Target Start/End: Original strand, 39284936 - 39285007
Alignment:
Q  313 ttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 385  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  39284936 ttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 39285007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 303 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 36318086 - 36318006
Alignment:
Q  303 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 385  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  36318086 aagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccttagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 36318006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 303 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 17490225 - 17490154
Alignment:
Q  303 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 376  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17490225 aagaactcatt-gatagtggattgtagagatcaatctctcccctagagtaggtcaa-tttggaccgaactgggt 17490154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 212 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 11151759 - 11151588
Alignment:
Q  212 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctcct-gtatcccttttgtaaagaac 308  Q
    ||||||| |||||||||  |||||||||||||  ||||||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||   | ||||| |||| |||| ||||    
T  11151759 ttggtgaaattgggaaaatgggtagaaattaga-tttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatcacttt-gtaa-gaac 11151663  T
Q  309 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 385  Q
    || || |||||||||||||||||  ||| |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  11151662 tc-ttagatagtggattggagagatcaacctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 11151588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 212 - 347
Target Start/End: Original strand, 13121769 - 13121901
Alignment:
Q  212 ttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaacctcctgtatcccttttgtaaagaactc 310  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| | |||| |||| | ||| ||||||||||||||||  |||||| | |||||| | |||||    
T  13121769 ttggtgagactgggaaaatggtagaaattagggtttgttctttgtgagcttgttgaagataatttcttgtaacct-ttgtatctc-tttgtaga-aactc 13121865  T
Q  311 atttgatagtggattggagagtacaatctctcctcca 347  Q
    | |||||||||||||| |||   ||||||||||||||    
T  13121866 a-ttgatagtggattgaagaaatcaatctctcctcca 13121901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 313 - 385
Target Start/End: Original strand, 17450678 - 17450748
Alignment:
Q  313 ttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 385  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||    
T  17450678 ttgatagtggattggagagatcaatctctcc-acagagtaggtcaag-ttggaccgaactaggtgaacaatct 17450748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 318 - 370
Target Start/End: Original strand, 28672036 - 28672088
Alignment:
Q  318 agtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaa 370  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  28672036 agtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcattgttggaccgaa 28672088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 313 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 42288178 - 42288117
Alignment:
Q  313 ttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 376  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  42288178 ttgataatggattggagagatcaatctctcc-ccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggt 42288117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 303 - 385
Target Start/End: Original strand, 11067396 - 11067476
Alignment:
Q  303 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 385  Q
    |||||||||||| ||| ||||||| ||||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||| | ||||||    
T  11067396 aagaactcattt-ataatggattgaagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactcggtcaacaatct 11067476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 303 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 33162527 - 33162447
Alignment:
Q  303 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 385  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||  |||||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||| ||| | ||||||    
T  33162527 aagaactcatt-gatagtggattagagagatcaatctctcccctagattaggtcaag-ttggaccgaactaggtcaacaatct 33162447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 96 - 188
Target Start/End: Original strand, 39284761 - 39284853
Alignment:
Q  96 agagagagacttgggaaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtt-gaaaacatgggaaacaccttg 188  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || | || ||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| | |||||| | ||||||||||    
T  39284761 agagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgaggg-tctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttg 39284853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 313 - 378
Target Start/End: Original strand, 7451218 - 7451281
Alignment:
Q  313 ttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 378  Q
    |||||||||||||| ||||  |||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  7451218 ttgatagtggattgcagagatcaatctctcctctacagtaggtcaag-ttgga-cgaactgggtga 7451281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 313 - 358
Target Start/End: Original strand, 42412118 - 42412162
Alignment:
Q  313 ttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaa 358  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||    
T  42412118 ttgatagtggattggagagatcaatctctcc-ccagagtaggtcaa 42412162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 358; Significance: 0; HSPs: 57)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 358; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 89 - 507
Target Start/End: Original strand, 44203510 - 44203924
Alignment:
Q  89 agttggaagagagagacttgggaaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttg 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44203510 agttggaagagagagacttgggaaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttg 44203609  T
Q  189 taaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcct 288  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  44203610 ta--gagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctctt 44203707  T
Q  289 gtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctt 388  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  44203708 gtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctt 44203807  T
Q  389 tggtgctt-ttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgtcgctttgtgtttcacacttggttcctggattagatctaggtggtgttttgt 487  Q
    | ||| || ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44203808 t-gtgtttattgttttcttcttccctctccttg--tatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgt 44203904  T
Q  488 tgtttcttgcttgcacaata 507  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  44203905 tgtttcttgcttgcacaata 44203924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 96 - 505
Target Start/End: Original strand, 9036301 - 9036706
Alignment:
Q  96 agagagagacttgggaaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagag 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9036301 agagagagacttgggaaatcaaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagag 9036400  T
Q  196 agaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcctgtatccc 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  9036401 agaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatccc 9036500  T
Q  296 ttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttggtgct 395  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||      
T  9036501 ttttgt-aagaactc-tttgatagtggattgaagagtacaatctctcctcgagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctc-ttggtgta 9036597  T
Q  396 tttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgtcgctttgtgtttcacacttggttcctggattagatctaggtggtgttttgttgtttctt 495  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  9036598 tttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgt-gctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttgtt 9036696  T
Q  496 gcttgcacaa 505  Q
    ||||||||||    
T  9036697 gcttgcacaa 9036706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 89 - 504
Target Start/End: Original strand, 40282251 - 40282664
Alignment:
Q  89 agttggaagagagaga--cttgggaaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacacc 185  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40282251 agttggaagagagagaaacttgggaaatcaaagggagcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacacc 40282350  T
Q  186 ttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc 284  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  40282351 ttgtagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggttagttcattgtgaacttgtctaatctaatttcttgtaacc 40282450  T
Q  285 tcctgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatc 384  Q
    |  |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  40282451 ttttgtatcccttttgt-aagaactc-tttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatc 40282548  T
Q  385 tctttggtgcttttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgtcgctttgtgtttcacacttggttcctggattagatctaggtggtgttt 484  Q
    || ||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |  ||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  40282549 tc-ttggtgtctttgttttcttcttccctctcct--tttatcttgtgattgt-gtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttt 40282644  T
Q  485 tgttgtttcttgcttgcaca 504  Q
    ||||| || |||||||||||    
T  40282645 tgttgattattgcttgcaca 40282664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 96 - 504
Target Start/End: Original strand, 21053841 - 21054245
Alignment:
Q  96 agagagagacttgggaaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaaga 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21053841 agagagagacttgggaaatcaaagggagcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagaga 21053940  T
Q  195 gagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctcctgtatc 293  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||  ||||||    
T  21053941 aaaaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagtgtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgcaaccttttgtatc 21054040  T
Q  294 ccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttggtg 393  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21054041 ccttttgt-aagaactc-tttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctc-ttggtg 21054137  T
Q  394 cttttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgtcgctttgtgtttcacacttggttcctggattagatctaggtggtgttttgttgtttc 493  Q
      |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |  ||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||     
T  21054138 tatttgttttcttcttccctctcct--tttatcttgtgattgt-gtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgatta 21054234  T
Q  494 ttgcttgcaca 504  Q
    |||||||||||    
T  21054235 ttgcttgcaca 21054245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 89 - 504
Target Start/End: Original strand, 9987076 - 9987489
Alignment:
Q  89 agttggaagagaga--gacttgggaaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacacc 185  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9987076 agttggaagagagatagacttgggaaatcaaagggagcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacacc 9987175  T
Q  186 ttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc 284  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  9987176 ttgtagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattaggg-ttgttcattgtgaacttgtctaatctaatttcttgcaacc 9987274  T
Q  285 tcctgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatc 384  Q
    |  |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9987275 ttttgtatcccttttg-caagaactca-ttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatc 9987372  T
Q  385 tctttggtg-cttttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgtcgctttgtgtttcacacttggttcctggattagatctaggtggtgtt 483  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |  | ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  9987373 tc-ttggtgtcttttgttttcttcttccctctcct--tttatcttgtgattgt-gtatagtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgtt 9987468  T
Q  484 ttgttgtttcttgcttgcaca 504  Q
    |||||| || |||||||||||    
T  9987469 ttgttgattattgcttgcaca 9987489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 90 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 20622529 - 20622118
Alignment:
Q  90 gttggaagagagagacttgggaaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttg 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20622529 gttggaagagagagacttgggaaatcaaatggagcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttg 20622430  T
Q  189 taaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctcc 287  Q
    || || || ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||      
T  20622429 tagagggaaaatcattgactgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattaggg-ttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaaccttt 20622331  T
Q  288 tgtatcccttttgt-aaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctc 386  Q
    |||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20622330 tgtatcccttttttgtaagaactc-tttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctc 20622232  T
Q  387 tttggtgcttttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgtcgctttgtgtttcacacttggttcctggattagatctaggtggtgttttg 486  Q
     ||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |  ||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20622231 -ttggtgtctttgttttcttcttccctctcct--tttatcttgtgattgt-gtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttg 20622136  T
Q  487 ttgtttcttgcttgcaca 504  Q
    ||| || |||||||||||    
T  20622135 ttgattattgcttgcaca 20622118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 89 - 503
Target Start/End: Original strand, 51765262 - 51765684
Alignment:
Q  89 agttggaagagagaga--cttgggaaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacacc 185  Q
    ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| |||||| | |||||||    
T  51765262 agttggaagagtgagaaacttgggaaatcaaagggagtaactctagggtttagggt-ctttgattagagcttctcttgggttggaaacattgtaaacacc 51765360  T
Q  186 ttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg------gtgagattggga--aaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttc 276  Q
    |||   || |  |||||||||||||||||      ||  ||||||||  || |||||||||||||||||    | | ||||||||||||| |||||||||    
T  51765361 ttggtgagtgtaaatcattgagtgtcttgttcttggtttgattgggagaaaagggtagaaattagggttgtacctttgtgaacttgtcaaagctaatttc 51765460  T
Q  277 ttgtaacctcct--gtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgg 374  Q
    |||||||| | |  ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  51765461 ttgtaaccccttttgtatctcttttgtaa-gaactcatt-gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggacaagtttggaccgaactgg 51765558  T
Q  375 gtgaccaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgtcgctttgtgtttcacac-ttggttcctggattagatct 473  Q
    |||| |||  |||||||||  ||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| |||| | |||||| ||  ||| ||| ||||| ||||||||||    
T  51765559 gtgaacaa--tctttggtgtctttgttttcctcttccctctcct--tttatcttgtgcttgt-ggtttgtgcttttcactttgtttcctagattagatct 51765653  T
Q  474 aggtggtgtt-ttgttgtttcttgcttgcac 503  Q
    ||||| |||| |||||| || ||||||||||    
T  51765654 aggtgttgttattgttgattattgcttgcac 51765684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 211 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 13316521 - 13316348
Alignment:
Q  211 cttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-tcctgtatcccttttgtaaagaa 307  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||| |||| |  |||||    
T  13316521 cttggtgagattgggaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgg--aagaa 13316425  T
Q  308 ctcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 385  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13316424 ctcatt-gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 13316348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 96 - 385
Target Start/End: Original strand, 20762548 - 20762844
Alignment:
Q  96 agagagagacttgggaaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaag 193  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  | | || ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   ||    
T  20762548 agagagaaacttgggaaatcaaaggaagcaactttagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgag 20762645  T
Q  194 agagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaag--gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac 283  Q
     || ||||||||||| |||||       ||||||||| ||||   ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20762646 tgaaaatcattgagtatcttgttcattggtgagattgagaaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaac 20762744  T
Q  284 c-tcctgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaa 382  Q
    | |  |||||| |||  |||| ||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20762745 ccttttgtatctcttc-gtaa-gaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctacagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaa 20762841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 215 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 8550952 - 8550670
Alignment:
Q  215 gtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcctgtatcccttttgtaaagaactca 311  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| | |||| |||||  |||||||||||||||||| |   |||||||| ||||| |||||||||    
T  8550952 gtgagattgggaaaatgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaactcatttgtatccc-tttgt-aagaactca 8550856  T
Q  312 tttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttggtgcttttgttttct-tcttc 410  Q
     |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||  |||||||||| ||||     
T  8550855 -ttgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa--tctttggtgtgtttgttttctctctt- 8550760  T
Q  411 cctctccttgtttatcttgtgattgtcgctttgtgtttcacac-ttggttcctggattagatctaggtggtgtt-ttgttgtttcttgcttg 500  Q
    | ||||  | ||||||||||| ||||   |||||||||  ||| ||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||    
T  8550759 cttctc--tctttatcttgtgcttgtgattttgtgtttttcactttgattcctagattagatctaggtgttgttattgttgattattgcttg 8550670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 96 - 385
Target Start/End: Original strand, 3189207 - 3189502
Alignment:
Q  96 agagagagacttgggaaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaag 193  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || | || ||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   ||    
T  3189207 agagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattaaagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgag 3189304  T
Q  194 agagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac- 283  Q
     || ||||| |||||||||||       |||||||| |||||  ||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||  ||||||||||| ||||||     
T  3189305 tgaaaatcactgagtgtcttgttcattggtgagatttggaaaaagggtataaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcctgtaact 3189403  T
Q  284 ctcctgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaat 383  Q
    ||  ||||||  |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3189404 cttttgtatct-ttttgtaa-gaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcatccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaat 3189500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 96 - 385
Target Start/End: Original strand, 3198024 - 3198319
Alignment:
Q  96 agagagagacttgggaaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaag 193  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || | || ||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   ||    
T  3198024 agagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattaaagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgag 3198121  T
Q  194 agagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac- 283  Q
     || ||||| |||||||||||       |||||||| |||||  ||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||  ||||||||||| ||||||     
T  3198122 tgaaaatcactgagtgtcttgttcattggtgagatttggaaaaagggtataaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcctgtaact 3198220  T
Q  284 ctcctgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaat 383  Q
    ||  ||||||  |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3198221 cttttgtatct-ttttgtaa-gaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcatccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaat 3198317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 96 - 385
Target Start/End: Original strand, 3206863 - 3207158
Alignment:
Q  96 agagagagacttgggaaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaag 193  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || | || ||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   ||    
T  3206863 agagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattaaagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgag 3206960  T
Q  194 agagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac- 283  Q
     || ||||| |||||||||||       |||||||| |||||  ||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||  ||||||||||| ||||||     
T  3206961 tgaaaatcactgagtgtcttgttcattggtgagatttggaaaaagggtataaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcctgtaact 3207059  T
Q  284 ctcctgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaat 383  Q
    ||  ||||||  |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3207060 cttttgtatct-ttttgtaa-gaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcatccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaat 3207156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 212 - 378
Target Start/End: Original strand, 37168297 - 37168462
Alignment:
Q  212 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc--tcctgtatcccttttgtaaagaa 307  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  |  |||||| |||| |||| |||    
T  37168297 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccattttgtatctcttt-gtaa-gaa 37168393  T
Q  308 ctcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 378  Q
    |||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37168394 ctcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtga 37168462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 96 - 385
Target Start/End: Original strand, 3156742 - 3157036
Alignment:
Q  96 agagagagacttgggaaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtt-gaaaacatgggaaacaccttgtaaag 193  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || | || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| | |||||| | ||||||| ||   ||    
T  3156742 agagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggtttggaaacattgtaaacaccctggtgag 3156839  T
Q  194 agagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc 284  Q
     || |||||||||||||||||       ||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  3156840 tgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacc 3156938  T
Q  285 tcct-gtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaat 383  Q
       | ||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||| | ||||    
T  3156939 catttgtatctcttt-gtaa-gaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaat 3157034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 212 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 13547257 - 13547093
Alignment:
Q  212 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctcct-gtatcccttttgtaaagaac 308  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||| ||||||||||||   | ||||| |||| |||| ||||    
T  13547257 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctattttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaac 13547161  T
Q  309 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 378  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13547160 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtga 13547093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 96 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 28220518 - 28220223
Alignment:
Q  96 agagagagacttgggaaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaa-catgggaaacaccttgtaa-a 192  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || | || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  || ||| | ||||||||||    |    
T  28220518 agagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaagcattgaaaacaccttgggtga 28220421  T
Q  193 gagagaatcattgagtgtctt-------ggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac 283  Q
    | || ||||||||||||||||       ||||||||| |||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  28220420 gtgaaaatcattgagtgtcttattcattggtgagattcggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaac 28220322  T
Q  284 ctcct-gtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaa 382  Q
    |   | ||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||    
T  28220321 ccatttgtatctcttt-gtaa-gaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaa 28220226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 212 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 42298143 - 42297968
Alignment:
Q  212 ttggtgagattgggaaagg-ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcctgtatcccttttgtaaagaac 308  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||  | |||| |||||  |||||||||||||||||| |   |||||| |||| |||| ||||    
T  42298143 ttggtgagattgggaaaattggtagaaattagggtt-gttttttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaa-gaac 42298047  T
Q  309 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctt 388  Q
    ||||| |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||    
T  42298046 tcatt-gatagtggattgaagagatcaatctctcctccagagtaggtcatggttggaccgaactgggtgaacaatctctt 42297968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 212 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 13549168 - 13549004
Alignment:
Q  212 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagc-taatttcttgtaacctcct-gtatcccttttgtaaagaac 308  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | |||| ||||| || | ||||||| |||||||   | ||||| |||| |||| ||||    
T  13549168 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttaaacctaatttcatgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaac 13549072  T
Q  309 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 378  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13549071 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtga 13549004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 212 - 378
Target Start/End: Original strand, 29136247 - 29136412
Alignment:
Q  212 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctcct-gtatcccttttgtaaagaac 308  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||| ||||   | ||||  |||| |||| ||||    
T  29136247 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttggaacccatttgtatttcttt-gtaa-gaac 29136343  T
Q  309 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 378  Q
    ||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29136344 tcatt-gatcgtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtga 29136412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 212 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 47255508 - 47255343
Alignment:
Q  212 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctcct-gtatcccttttgtaaagaac 308  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||   | ||||| |||| |||| ||||    
T  47255508 ttggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaac 47255412  T
Q  309 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 378  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  47255411 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcattgttggaccgaactgggtga 47255343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 212 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 7482399 - 7482234
Alignment:
Q  212 ttggtgagattggg-aaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc--tcctgtatcccttttgtaaagaa 307  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  |  |||||| |||| |||| |||    
T  7482399 ttggtgagattgggtaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccattttgtatctcttt-gtaa-gaa 7482303  T
Q  308 ctcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 378  Q
    |||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  7482302 ctcatt-gatagtgaattggagagatcaatctctccttcagagtaggtcaag-ttggaccgaactaggtga 7482234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 212 - 376
Target Start/End: Original strand, 44455160 - 44455322
Alignment:
Q  212 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcctgtatcccttttgtaaagaac 308  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  || ||||||||||||||| |   ||||||  |||||||| ||||    
T  44455160 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaaactaatttcttgtaactcatttgtatct-ttttgtaa-gaac 44455256  T
Q  309 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 376  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  44455257 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagttt-gaccgaactgggt 44455322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 212 - 378
Target Start/End: Original strand, 11348698 - 11348862
Alignment:
Q  212 ttggtgagattgggaaagg-ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctcct-gtatcccttttgtaaagaac 308  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||   | ||||| ||||    ||||||    
T  11348698 ttggtgagattgggaaaattggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttct--aagaac 11348794  T
Q  309 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 378  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  11348795 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgagtga 11348862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 215 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 834332 - 834164
Alignment:
Q  215 gtgagattgggaaagggg-tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctcct-gtatcccttttgtaaagaactca 311  Q
    ||||||||||||||  || |||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||   | |||||||||| |||| |||||||    
T  834332 gtgagattgggaaaatggatagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatcccttt-gtaa-gaactca 834236  T
Q  312 tttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 385  Q
    || |||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  834235 tt-gatagtggattggagagatctatctctcccccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 834164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 212 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 4552805 - 4552634
Alignment:
Q  212 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctcct-gtatcccttttgtaaagaac 308  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| | | |||| |||||  ||||||||||||||||||| | | |||||||||| |||| ||||    
T  4552805 ttggtgagattgagaaaatgggtagaaattagg-tttgtcctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccctttgtatcccttt-gtaa-gaac 4552709  T
Q  309 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 385  Q
    ||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  4552708 tcatt-gataatggattggagagatcaatctctccctcagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 4552634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 231 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 28265702 - 28265551
Alignment:
Q  231 ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctcct-gtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattgga 328  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||| |||||  |||||||||||||||||||   | ||||| |||| |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  28265702 ggtagaaattagggtt-gttcattgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaactc-tttgatagtggattgga 28265607  T
Q  329 gagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 385  Q
    |||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  28265606 gagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 28265551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 212 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 37503722 - 37503577
Alignment:
Q  212 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctcctgtatcccttttgtaaagaact 309  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||| |||| |||| |||||    
T  37503722 ttggtgagattgggaaaatgggtaaaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacct--tgtatctcttt-gtaa-gaact 37503628  T
Q  310 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtt 361  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| || ||||||||    
T  37503627 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattatgtcaagtt 37503577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 212 - 378
Target Start/End: Original strand, 47115171 - 47115337
Alignment:
Q  212 ttggtgagattgggaaagg-ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc--tcctgtatcccttttgtaaagaa 307  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  |  |||||| |||| ||||| ||    
T  47115171 ttggtgagattgggaaaattggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccattttgtatctcttt-gtaaa-aa 47115267  T
Q  308 ctcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 378  Q
    | |||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  47115268 cccatt-gatagtggattggagagatcaatctctgctccagagtaggtcattgttggaccgaactgggtga 47115337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 230 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 31925856 - 31925711
Alignment:
Q  230 gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctcct-gtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattgg 327  Q
    ||||||||||||||| | |||||| |||| |||||  |||||||||||||||||||   | ||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  31925856 gggtagaaattagggat-gttcattgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaactcatt-gatagtggattgg 31925761  T
Q  328 agagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 378  Q
    ||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  31925760 agagatcaatctctcctctagagtaggtcaag-ttggaccgaactaggtga 31925711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 212 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 37033241 - 37033068
Alignment:
Q  212 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc--tcctgtatcccttttgtaaagaa 307  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  ||||||||||||||||| |  |  || ||| |||| |||| |||    
T  37033241 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaatccattttgcatctcttt-gtaa-gaa 37033145  T
Q  308 ctcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 385  Q
    |||||| |||||||||||||||||   ||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||    
T  37033144 ctcatt-gatagtggattggagagattaatctcttctccatagtaggtcatggttggaccgaactgggtgaacaatct 37033068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 96 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 28223713 - 28223418
Alignment:
Q  96 agagagagacttgggaaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaa-a 192  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || | || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | | ||||||||    |    
T  28223713 agagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgaagacaccttgggtga 28223616  T
Q  193 gagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac 283  Q
    | || |||||||||||||||||       ||||||||||||||  |||||||||||| |||| | || |  |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  28223615 gtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattatggtt-gatctttctgaacttgttgaagctaatttcttgtaac 28223517  T
Q  284 ctcct-gtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaa 382  Q
    |   | ||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||| | |||    
T  28223516 ccatttgtatctcttt-gtaa-gaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaa 28223421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 303 - 378
Target Start/End: Original strand, 28242396 - 28242469
Alignment:
Q  303 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 378  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  28242396 aagaactcatt--atagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcattgttggaccgaactgggtga 28242469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 96 - 385
Target Start/End: Original strand, 31659114 - 31659409
Alignment:
Q  96 agagagagacttgggaaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtt-gaaaacatgggaaacaccttgtaa-a 192  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || | || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| | |||||| | ||||||||||    |    
T  31659114 agagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttcggaaacattgtaaacaccttgggtga 31659211  T
Q  193 gagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac 283  Q
    | || |||||||||||||||||       |||||||||| |||  ||||||||||||||| | |||| | |||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  31659212 gtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggct-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaac 31659310  T
Q  284 ctcct-gtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaa 382  Q
    |   | ||||| |||| |||| ||||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||    
T  31659311 ccatttgtatctcttt-gtaa-gaacttatt-gatagtggattggagagatcaatctctccctcagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaa 31659406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 212 - 385
Target Start/End: Original strand, 49918350 - 49918521
Alignment:
Q  212 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctcct-gtatcccttttgtaaagaac 308  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||   | ||||| |||| |||| ||||    
T  49918350 ttggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaac 49918446  T
Q  309 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 385  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||| ||| | ||||||    
T  49918447 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccaaattaggtcaag-ttggaccgaactaggtcaacaatct 49918521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 303 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 13659413 - 13659333
Alignment:
Q  303 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 385  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  13659413 aagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagagtaggttaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 13659333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 313 - 378
Target Start/End: Original strand, 193711 - 193775
Alignment:
Q  313 ttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 378  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  193711 ttgatagtggattggagagatcaatctcttctccagagtatgtcaag-ttggaccgaactgggtga 193775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 212 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 45644523 - 45644351
Alignment:
Q  212 ttggtgagattgggaaagggg-tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac-ctcctgtatcccttttgtaaagaac 308  Q
    |||||||||||| ||||  || ||||||||| | ||||||| | |||| |||||||| |||||||||||| ||| |   |||||| |||| |||| ||||    
T  45644523 ttggtgagattgagaaaatggatagaaattaagttttgttctttgtgagcttgtcaaagctaatttcttgcaactcatttgtatctcttt-gtaa-gaac 45644426  T
Q  309 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 385  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  45644425 tcatt-gatagtggattggagagatcaatatctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 45644351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 230 - 377
Target Start/End: Original strand, 34603595 - 34603740
Alignment:
Q  230 gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc--tcctgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattg 326  Q
    ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  |  | |||| |||| |||| ||||||||| ||| ||||||||    
T  34603595 gggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccattttttatctcttt-gtaa-gaactcatt-gatggtggattg 34603690  T
Q  327 gagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtg 377  Q
     ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  34603691 aagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactaggtg 34603740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 217 - 357
Target Start/End: Original strand, 22079322 - 22079461
Alignment:
Q  217 gagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-tcctgtatcccttttgtaaagaactcattt 314  Q
    |||||||| |||  ||||||||||| | ||||||| | |||| ||||| || ||||||||||||||||| |  |||||| |||| ||||||||||||||     
T  22079322 gagattggaaaaatggtagaaattatg-tttgttctttgtgagcttgttaaagctaatttcttgtaaccattttgtatctcttt-gtaaagaactcatt- 22079418  T
Q  315 gatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtca 357  Q
    |||| ||||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||    
T  22079419 gatattggattggagagatcaatttctcctccaaagtaggtca 22079461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 303 - 385
Target Start/End: Original strand, 46065009 - 46065089
Alignment:
Q  303 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 385  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||    
T  46065009 aagaactcattc-atagtggattggagagatcaatctctcccccagagtaggtcaag-ttggatcgaactgggtaaacaatct 46065089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 212 - 376
Target Start/End: Original strand, 19754494 - 19754657
Alignment:
Q  212 ttggtgagattgggaaag--gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctcct-gtatcccttttgtaaagaa 307  Q
    |||||||||||| ||||   ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||   | ||||| |||| |||| |||    
T  19754494 ttggtgagattgagaaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaaccgatttgtatctcttt-gtaa-gaa 19754590  T
Q  308 ctcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 376  Q
    |||||| |||||||||||||||||  ||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||| |||||    
T  19754591 ctcatt-gatagtggattggagagatcaatctctccctcagattaggtcaag-ttggaccgaagtgggt 19754657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 212 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 50169378 - 50169218
Alignment:
Q  212 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac-ctcctgtatcccttttgtaaagaac 308  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||||| |||||||||||||||| |   |||||| |||| |||| | ||    
T  50169378 ttggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtcaaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaa-gtac 50169282  T
Q  309 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgg 374  Q
    ||||| |||||||||||| ||||  |||||||||| | ||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  50169281 tcatt-gatagtggattgaagagatcaatctctcccctagattaggtcaag-ttggaccgaactgg 50169218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 212 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 23555433 - 23555286
Alignment:
Q  212 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcctgtatcccttttgtaaagaac 308  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  || |||||||||| |||| |   |||||| |||| |||| ||||    
T  23555433 ttggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaaactaatttcttataactcatttgtatctcttt-gtaa-gaac 23555337  T
Q  309 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtt 361  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||    
T  23555336 tcatt-gatagtggattggagagttcaatctctcc-ccatagtaggtcaagtt 23555286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 212 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 50167343 - 50167172
Alignment:
Q  212 ttggtgagattgggaaaggg-gtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacctcct-gtatcccttttgtaaagaac 308  Q
    |||||||||||||||||    ||||||||||||||| |||  | |||| |||||||| |||||||||||||||||   | ||||| |||| ||||| |||    
T  50167343 ttggtgagattgggaaaattagtagaaattagggtt-gttatttgtgagcttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaaa-aac 50167247  T
Q  309 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 385  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||| ||||| |||||||||||| ||| | ||||||    
T  50167246 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattagctcaag-ttggaccgaactaggtcaacaatct 50167172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 212 - 358
Target Start/End: Original strand, 1833522 - 1833667
Alignment:
Q  212 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaa-cttgtcaagctaatttcttgtaac-ctcctgtatcccttttgtaaagaac 308  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||| ||  | ||||||| |||||||||| |   |||||| |||| |||| ||||    
T  1833522 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaatctattgaagctaaattcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaa-gaac 1833618  T
Q  309 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaa 358  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||    
T  1833619 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctccaccagattaggtcaa 1833667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 313 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 37876834 - 37876770
Alignment:
Q  313 ttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 378  Q
    |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||    
T  37876834 ttgatagtggattgcagagatcaatctctcctccagagtacatcaag-ttgaaccgaactgggtga 37876770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 104 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 3847405 - 3847118
Alignment:
Q  104 acttgggaaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaa-agagagaat 200  Q
    ||||||||||||||||| || | || ||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||    || || |||    
T  3847405 acttgggaaatcaaaggaggtaactttagggtcgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaat 3847308  T
Q  201 cattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctcct-gt 290  Q
    ||||||||||||||       ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||  ||||  ||||||| || ||||||||   | ||    
T  3847307 cattgagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagtttgtttaagctaaatttttgtaacccatttgt 3847209  T
Q  291 atcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 385  Q
    |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||  | |||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||| ||| | ||||||    
T  3847208 atcccttt-gtaa-gaactcatt-gatagtggattggagagatccatctcttccccagattaggtcaag-ttggaccgaacttggtcaacaatct 3847118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 297 - 355
Target Start/End: Original strand, 6808538 - 6808595
Alignment:
Q  297 tttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggt 355  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| |  ||||||||||    
T  6808538 tttgtaaagaactcattt-atagtggattggagagatcaatctcttcctcagagtaggt 6808595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 96 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 13316610 - 13316518
Alignment:
Q  96 agagagagacttgggaaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtt-gaaaacatgggaaacaccttg 188  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  | | || |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| | |||||| | ||||||||||    
T  13316610 agagagaaacttgggaaatcaaaggtagcaactttagggtttaggg-tctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttg 13316518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 303 - 361
Target Start/End: Original strand, 36683771 - 36683828
Alignment:
Q  303 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtt 361  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||   |||||||||| |||||||||||||||||    
T  36683771 aagaactcatt-gatagtggattgtagaaatcaatctctcccccagagtaggtcaagtt 36683828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 313 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 8871130 - 8871074
Alignment:
Q  313 ttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaa 370  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||    
T  8871130 ttgatagtggattggagagatcaatctctcccccatagtaggccaag-ttggaccgaa 8871074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 233 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 928123 - 928071
Alignment:
Q  233 tagaaattagggtttgttcatagtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaacc 284  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| |||| | |||||||||||||||||||    
T  928123 tagaaattagggtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacc 928071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 297 - 353
Target Start/End: Original strand, 5459991 - 5460046
Alignment:
Q  297 tttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtag 353  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||| || |||||||    
T  5459991 tttgtaaagaactca-ttgatagtagattggagagatcaatctctcatctagagtag 5460046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 217 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 12318685 - 12318618
Alignment:
Q  217 gagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc 284  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| | || |||||  |||||||||||||||||||    
T  12318685 gagatttggaaatgggtagaaattagg-tttgttcatggagagcttgttgaagctaatttcttgtaacc 12318618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 313 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 13138044 - 13137973
Alignment:
Q  313 ttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 385  Q
    |||||||||||||| ||||  |||||||||| | |||||||||| |  |||||||||||||||| | ||||||    
T  13138044 ttgatagtggattgaagagagcaatctctcccctagagtaggtc-atattggaccgaactgggtcaacaatct 13137973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 230 - 286
Target Start/End: Original strand, 32736952 - 32737007
Alignment:
Q  230 gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctc 286  Q
    |||||||||||||||||||||| |  ||||||| | |||||||||| ||||||||||    
T  32736952 gggtagaaattagggtttgttctttatgaactt-ttaagctaattttttgtaacctc 32737007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0565 (Bit Score: 354; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0565
Description:

Target: scaffold0565; HSP #1
Raw Score: 354; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 89 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 2894 - 2480
Alignment:
Q  89 agttggaagagagagacttgggaaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttg 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2894 agttggaagagagagacttgggaaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttg 2795  T
Q  189 taaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcct 288  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  2794 ta--gagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctctt 2697  T
Q  289 gtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctt 388  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  2696 gtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct-tt 2598  T
Q  389 tggtgctt-ttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgtcgctttgtgtttcacacttggttcctggattagatctaggtggtgttttgt 487  Q
    | ||| || ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2597 ttgtgtttattgttttcttcttccctctccttg--tatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgt 2500  T
Q  488 tgtttcttgcttgcacaata 507  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  2499 tgtttcttgcttgcacaata 2480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0674 (Bit Score: 351; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0674
Description:

Target: scaffold0674; HSP #1
Raw Score: 351; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 69 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 4037 - 3602
Alignment:
Q  69 tgcaaattttaagggagaga-agttggaagagagagacttgggaaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtt 167  Q
    |||| |||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4037 tgcagatttgaagtgagagagagttggaagagagagacttgggaaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtt 3938  T
Q  168 gaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa 267  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3937 gaaaacatgggaaacaccttgta--gagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacatgtcaa 3840  T
Q  268 gctaatttcttgtaacctcctgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggacc 367  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3839 gctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggacc 3740  T
Q  368 gaactgggtgaccaatctctttggtgctt-ttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgtcgctttgtgtttcacacttggttcctggat 466  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  3739 gaactgggtgaccaatctcttt-gtgtttattgttttcttcttccctctccttg--tatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttgtttcctagat 3643  T
Q  467 tagatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgcacaata 507  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3642 tagatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgcacaata 3602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 343; Significance: 0; HSPs: 64)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 95 - 507
Target Start/End: Original strand, 7124784 - 7125194
Alignment:
Q  95 aagagagagacttgggaaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaaga 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7124784 aagagagagacttgggaaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaaga 7124883  T
Q  195 gagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcctgtatcc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |    
T  7124884 gagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaaactaatttcttgtaacctcttgtattc 7124983  T
Q  295 cttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttggtgc 394  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| |||||||||| |||     
T  7124984 cttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagcaaagaccgaactgggtgaacaatctcttt-gtgt 7125082  T
Q  395 tt-ttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgtcgctttgtgtttcacacttggttcctggattagatctaggtggtgttttgttgtttc 493  Q
    || |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7125083 ttattgttttcttcttcc--ctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttc 7125180  T
Q  494 ttgcttgcacaata 507  Q
    ||||||||||||||    
T  7125181 ttgcttgcacaata 7125194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 336; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 90 - 507
Target Start/End: Original strand, 7122560 - 7122975
Alignment:
Q  90 gttggaagagagagacttgggaaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgt 189  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7122560 gttgaaagagagagacttgggaaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgt 7122659  T
Q  190 aaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcctg 289  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  7122660 aaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaaactaatttcttgtaacctcttg 7122759  T
Q  290 tatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttt 389  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    ||||||||||||||| |||| |||||    
T  7122760 tattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccatagtaggtcaagcaaagaccgaactgggtgaacaatttcttt 7122859  T
Q  390 ggtgctt-ttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgtcgctttgtgtttcacacttggttcctggattagatctaggtggtgttttgtt 488  Q
     ||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7122860 -gtgtttattgttttcttcttcc--ctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgtt 7122956  T
Q  489 gtttcttgcttgcacaata 507  Q
    |||||||||||||||||||    
T  7122957 gtttcttgcttgcacaata 7122975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 332; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 90 - 507
Target Start/End: Original strand, 8395483 - 8395896
Alignment:
Q  90 gttggaagagagagacttgggaaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgt 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8395483 gttggaagagagagacttgggaaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgt 8395582  T
Q  190 aaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcctg 289  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||    
T  8395583 --agagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatagtgaacatgtcaagctaatttcttgtaaccttttg 8395680  T
Q  290 tatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttt 389  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8395681 tatcccttttgt-aagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttt 8395779  T
Q  390 ggtgctt-ttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgtcgctttgtgtttcacacttggttcctggattagatctaggtggtgttttgtt 488  Q
     ||| || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8395780 -gtgtttattgttttcttcttccctctccat-tgtatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgtt 8395877  T
Q  489 gtttcttgcttgcacaata 507  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  8395878 gttttttgcttgcacaata 8395896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 90 - 507
Target Start/End: Original strand, 8393274 - 8393687
Alignment:
Q  90 gttggaagagagagacttgggaaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgt 189  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8393274 gttggaagagagagacctgggaaatcaaaggggaagctctagggtttatggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgt 8393373  T
Q  190 aaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcctg 289  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||    
T  8393374 a--gagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatagtgaacatgtcaagctaatttcttgtaaccttttg 8393471  T
Q  290 tatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttt 389  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8393472 tatcccttttgt-aagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttt 8393570  T
Q  390 ggtgctt-ttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgtcgctttgtgtttcacacttggttcctggattagatctaggtggtgttttgtt 488  Q
     ||| || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8393571 -gtgtttattgttttcttcttccctctccat-tgtatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgtt 8393668  T
Q  489 gtttcttgcttgcacaata 507  Q
    |||||||||||||||||||    
T  8393669 gtttcttgcttgcacaata 8393687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 312; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 83 - 507
Target Start/End: Original strand, 5138161 - 5138583
Alignment:
Q  83 gagagaagttggaagagagagacttgggaaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaac 182  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  5138161 gagagaggttggaagagagaaacttgggaaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaat 5138260  T
Q  183 accttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaac-ttgtcaagctaatttcttgta 281  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5138261 accttgta--gagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgta 5138358  T
Q  282 acctcctgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgacca 381  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5138359 acctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgacca 5138458  T
Q  382 atctctttggtgctt-ttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgatt--gtcgctttgtgtttcacacttggttcctggattagatctaggtg 478  Q
    |||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  5138459 atctcttt-gtgtttattgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgttttggttgctt--tgtttcacacttggttcctagattagatcta-gtg 5138554  T
Q  479 gtgttttgttgtttcttgcttgcacaata 507  Q
     ||||||||||| |||||||||| |||||    
T  5138555 atgttttgttgtctcttgcttgctcaata 5138583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 83 - 507
Target Start/End: Original strand, 5135935 - 5136358
Alignment:
Q  83 gagagaagttggaagagagagacttgggaaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaa-catgggaaa 181  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5135935 gagagaggttggaagagagaaacttgggaaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaaacatgggaaa 5136034  T
Q  182 caccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaac-ttgtcaagctaatttcttgt 280  Q
     ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5136035 taccttgta--gagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgt 5136132  T
Q  281 aacctcctgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgacc 380  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5136133 aacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgacc 5136232  T
Q  381 aatctctttggtgctt-ttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgatt--gtcgctttgtgtttcacacttggttcctggattagatctaggt 477  Q
    ||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  5136233 aatctcttt-gtgtttattgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgttttggttgctt--tgtttcacacttggttcctagattagatcta-gt 5136328  T
Q  478 ggtgttttgttgtttcttgcttgcacaata 507  Q
    | ||||||||||| |||||||||| |||||    
T  5136329 gatgttttgttgtctcttgcttgctcaata 5136358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 89 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 31495611 - 31495188
Alignment:
Q  89 agttggaagagagaga--cttgggaaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacac 184  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | | ||||||||||||  || ||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||    
T  31495611 agttggaagagagagaaacttgggaaatcaaagggagtaactctagggtttatagt-ctttgattagagcttctcttgggttgggaaacatgggaaacac 31495513  T
Q  185 cttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaa- 282  Q
    |||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||     
T  31495512 cttgaagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaatta-ggattgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaac 31495414  T
Q  283 -cctcctgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgacca 381  Q
     | |  |||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  31495413 tctttttgtatctcttttgt-aagaactca-ttgatagttgattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 31495316  T
Q  382 atctctttggtgcttttgttttcttcttccctctcctt------gtttatcttgtgattgtcgctttgtgtttcacac-ttggttcctggattagatcta 474  Q
    ||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||||       ||||||||||| |||| | ||| || ||  ||| ||| ||||| |||||||||||    
T  31495315 atctc-ttggtgtctttgttttcctcttccctctccttttatccttttatcttgtgcttgt-gttttatgcttttcactttgtttcctagattagatcta 31495218  T
Q  475 ggtggtgttttgttgtttcttgcttgcaca 504  Q
    |||| |||||||||| || |||||||||||    
T  31495217 ggtgctgttttgttgattattgcttgcaca 31495188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 96 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 13992578 - 13992289
Alignment:
Q  96 agagagagacttgggaaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaag 193  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  | | || ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   ||    
T  13992578 agagagaaacttgggaaatcaaaggtagcaactttagggtttagggt-ctttgattagagtctctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgag 13992480  T
Q  194 agagaatcattgagtgtcttggtgagattggg--aaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcctg 289  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| || ||||||||||||||| ||  ||    
T  13992479 tgaaaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaaaagggtagaaattaggg-ttgttctttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactcttttg 13992381  T
Q  290 tatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 385  Q
    |||| ||| |   ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  13992380 tatctcttgt---aagaactca-ttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaacaatct 13992289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 96 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 30000097 - 29999809
Alignment:
Q  96 agagagagacttgggaaatcaaagggga-agctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtt-gaaaacatgggaaacaccttgtaaag 193  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || | || ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| | |||||| | ||||||||||   ||    
T  30000097 agagagaaacttgggaaatcaaaggagacaactttagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggtttggaaacattgtaaacaccttggtgag 30000000  T
Q  194 agagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac-c 284  Q
     || |||| ||||||||||||       |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||||| |||||| |||||||||||||||| |    
T  29999999 tgaaaatcgttgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacatgtcaaagctaatttcttgtaactc 29999901  T
Q  285 tcctgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 378  Q
    |  ||||||  |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29999900 ttttgtatcttttttgtaa-gaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 29999809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 96 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 56178928 - 56178633
Alignment:
Q  96 agagagagacttgggaaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaag 193  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || | || ||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   ||    
T  56178928 agagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgaaggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgag 56178831  T
Q  194 agagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc 284  Q
     || |||||||||||||||||       ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  56178830 tgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacc 56178732  T
Q  285 -tcctgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaat 383  Q
     |  |||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  56178731 cttttgtatctcttt-gtaa-gaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaat 56178635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 96 - 385
Target Start/End: Original strand, 48142918 - 48143215
Alignment:
Q  96 agagagagacttgggaaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaa-a 192  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || | || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||    |    
T  48142918 agagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtga 48143015  T
Q  193 gagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaagg--ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaa 282  Q
    | || |||||||||||||||||       ||||||||||||||    |||||||||||||||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||    
T  48143016 gtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaaaggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaa 48143114  T
Q  283 cc-tcctgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgacca 381  Q
    || |  |||||| |||     ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  48143115 cccttttgtatctcttcat--aagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccaaactgggtgaaca 48143211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 96 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 52095654 - 52095361
Alignment:
Q  96 agagagagacttgggaaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaa-a 192  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || | || ||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||    |    
T  52095654 agagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgaggga-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtga 52095557  T
Q  193 gagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac 283  Q
    | || |||||||||||||||||       ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  52095556 gtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaac 52095458  T
Q  284 ctcct-gtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaa 382  Q
    |   | ||||| |||| |||| ||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  52095457 ccatttgtatctcttt-gtaa-gaaatc-tttgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtagg-caagtttggaccgaactgggtgaacaa 52095362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 6 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 31159750 - 31159673
Alignment:
Q  6 atctctctggttgggatatgcgtcataagtaagcaattttctacggattgatggttttacatatgcaaattttaaggg 83  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31159750 atctctctggttgggatatgcatcataagtaagaaattttctacggattgatggttttacatatgcaaattttaaggg 31159673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 226 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 5370237 - 5370079
Alignment:
Q  226 aaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa--gctaatttcttgtaacc-tcctgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtgg 322  Q
    |||| |||||||||||||||| |||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||| |  |||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  5370237 aaagaggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaa-gaactcatt-gatagtgg 5370142  T
Q  323 attggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 385  Q
    | | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  5370141 actagagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaatct 5370079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 216 - 388
Target Start/End: Original strand, 2209717 - 2209889
Alignment:
Q  216 tgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc--tcctgtatcccttttgtaaagaactca 311  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  |  |||||| |||| |||| |||||||    
T  2209717 tgagattgggaaaatgggtagaaattagggttt-ttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccattttgtatctcttt-gtaa-gaactca 2209813  T
Q  312 tttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctt 388  Q
    || |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||    
T  2209814 tt-gatagtggattggagagattaatctctcctccagagtaggtcatggttggaccgaactgggtgaacaatctctt 2209889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 96 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 9927749 - 9927467
Alignment:
Q  96 agagagagacttgggaaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaag 193  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || | || ||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   ||    
T  9927749 agagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattaaagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgag 9927652  T
Q  194 agagaatcattgagtgtctt-------ggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc 284  Q
     || ||||| ||||||||||       |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  9927651 tgaaaatcactgagtgtcttattcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacc 9927553  T
Q  285 tcct-gtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactg 373  Q
       | ||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  9927552 catttgtatctcttt-gtaa-gaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactg 9927467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 212 - 378
Target Start/End: Original strand, 41964415 - 41964580
Alignment:
Q  212 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc--tcctgtatcccttttgtaaagaa 307  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||| ||||||||  |  ||||||||||| |||| |||    
T  41964415 ttggtgaaattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtttaagctaatttattgtaacccattttgtatcccttt-gtaa-gaa 41964511  T
Q  308 ctcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 378  Q
    |||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41964512 ctcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtga 41964580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 96 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 34570706 - 34570411
Alignment:
Q  96 agagagagacttgggaaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaa-a 192  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||| ||||    |    
T  34570706 agagagaaacttgggaaatcaaaggaggtagctttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgaaaacatcttgggtga 34570609  T
Q  193 gagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaagg-ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac 283  Q
    | || |||||||||||||||||       ||||||||||||||   |||||||||||||||| |||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  34570608 gtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaataggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaac 34570510  T
Q  284 ctcct-gtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaa 382  Q
    |   | ||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||| ||| ||||| |||||||||| | |||    
T  34570509 ccaattgtatctcttt-gtaa-gaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggttaag-ttggatcgaactgggtcaacaa 34570414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 212 - 378
Target Start/End: Original strand, 46703500 - 46703666
Alignment:
Q  212 ttggtgagattgggaaaggg-gtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc--tcctgtatcccttttgtaaagaa 307  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  |  |||||| |||| |||| |||    
T  46703500 ttggtgagattgggaaaatgagtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccattttgtatctcttt-gtaa-gaa 46703596  T
Q  308 ctcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 378  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||    
T  46703597 ctcattt-atagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcattgttggaccgaattgggtga 46703666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 232 - 388
Target Start/End: Original strand, 12119559 - 12119714
Alignment:
Q  232 gtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc-tcctgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggag 329  Q
    |||||||||| ||||||||| | |||||||| |  ||||||||||||||||||| |  |||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12119559 gtagaaattatggtttgttctttgtgaactttttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaaagaactcattt-atagtggattggag 12119656  T
Q  330 agtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctt 388  Q
    ||  |||||||||| | |||||||||||   |||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  12119657 agatcaatctctcc-caagagtaggtcattgttggaccgaactaggtgaacaatttctt 12119714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 212 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 47038577 - 47038408
Alignment:
Q  212 ttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctcctgtatcccttttgtaaagaactc 310  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  ||||||||||||||||| |   ||||||  ||| |||| || |||    
T  47038577 ttggtgagattggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaatcatttgtatctgttt-gtaagga-ctc 47038481  T
Q  311 atttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 385  Q
    ||| |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  47038480 att-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagagtaagtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 47038408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 212 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 12739718 - 12739547
Alignment:
Q  212 ttggtgagattgggaaagggg-tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacctcct-gtatcccttttgtaaagaac 308  Q
    |||||||||||||||||  || |||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||   | |||||  ||| |||  ||||    
T  12739718 ttggtgagattgggaaaatggatagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctattt-gtat-gaac 12739622  T
Q  309 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 385  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  12739621 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 12739547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 231 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 12744073 - 12743922
Alignment:
Q  231 ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacctcct-gtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattgga 328  Q
    |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||   | ||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  12744073 ggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaactcatt-gatagtggattgga 12743978  T
Q  329 gagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 385  Q
    |||  |||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  12743977 gagatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 12743922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 231 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 12745462 - 12745311
Alignment:
Q  231 ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacctcct-gtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattgga 328  Q
    |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||   | ||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  12745462 ggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaactcatt-gatagtggattgga 12745367  T
Q  329 gagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 385  Q
    |||  |||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  12745366 gagatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 12745311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 212 - 376
Target Start/End: Original strand, 26364236 - 26364398
Alignment:
Q  212 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcctgtatcccttttgtaaagaac 308  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||| |   |||||| | ||||| ||||||    
T  26364236 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctc-tttgt-aagaac 26364332  T
Q  309 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 376  Q
    ||| || ||||||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  26364333 tca-ttaatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagttt-gactgaactgggt 26364398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 96 - 373
Target Start/End: Original strand, 37740502 - 37740784
Alignment:
Q  96 agagagagacttgggaaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaag 193  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || |  | ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   ||    
T  37740502 agagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaagtttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgag 37740599  T
Q  194 agagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc 284  Q
     || ||||| |||||||||||       |||||||| |||||  ||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  37740600 tgaaaatcactgagtgtcttgttcattggtgagatttggaaaaagggtataaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacc 37740698  T
Q  285 tcct-gtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactg 373  Q
       | ||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| | ||||||| |||||||||||||    
T  37740699 catttgtatctcttt-gtaa-gaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagatttggtcaag-ttggaccgaactg 37740784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 212 - 376
Target Start/End: Original strand, 40632445 - 40632607
Alignment:
Q  212 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctcct-gtatcccttttgtaaagaac 308  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||| | |||| |||||  ||||||||||||||||||||  | ||||| |||| |||| ||||    
T  40632445 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacctatttgtatctcttt-gtaa-gaac 40632541  T
Q  309 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 376  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| | |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  40632542 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctctaaagtaagtcaag-ttggaccgaactgggt 40632607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 303 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 50673924 - 50673851
Alignment:
Q  303 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 378  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  50673924 aagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactaggtga 50673851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 230 - 378
Target Start/End: Original strand, 6655975 - 6656120
Alignment:
Q  230 gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcctgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattgg 327  Q
    |||||||||||| |||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||| |   |||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  6655975 gggtagaaattaaggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaa-gaactcatt-gatagtggattgg 6656070  T
Q  328 agagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 378  Q
    ||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  6656071 agagatcaatctctcatccagagtaggtcaag-ttggaccgaattgggtga 6656120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 212 - 378
Target Start/End: Original strand, 12073392 - 12073557
Alignment:
Q  212 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcctgtatcccttttgtaaagaac 308  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| | |||| |||||  |||||||||| ||||||| |   |||||| |||| |||| ||||    
T  12073392 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaactcatttgtatctcttt-gtaa-gaac 12073488  T
Q  309 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 378  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||| |||||    
T  12073489 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcttccagagtaggtcattgttggaccgaactaggtga 12073557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 212 - 378
Target Start/End: Original strand, 41639426 - 41639590
Alignment:
Q  212 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctcct-gtatcccttttgtaaagaac 308  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | |||||||| |  |||||||||||||||||||   | |||||  ||| |||| ||||    
T  41639426 ttggtaagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaactttttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctattt-gtaa-gaac 41639522  T
Q  309 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 378  Q
    ||||  |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  41639523 tcatc-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgagtga 41639590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 212 - 361
Target Start/End: Original strand, 8665408 - 8665556
Alignment:
Q  212 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctcct-gtatcccttttgtaaagaac 308  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| |||| | | || |||||  |||||||||||||||||||   | ||||| |||| |||| ||||    
T  8665408 ttggtgagaatgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgagagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaac 8665504  T
Q  309 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtt 361  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8665505 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtt 8665556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 212 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 26175804 - 26175633
Alignment:
Q  212 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctcct-gtatcccttttgtaaagaac 308  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| | |||| |||||  || ||||||||||||||||   | ||||| |||| |||| ||||    
T  26175804 ttggtgagattgggaaaatggggagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaaactaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaac 26175708  T
Q  309 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 385  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  26175707 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 26175633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 238 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 26699585 - 26699447
Alignment:
Q  238 attagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcctgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtaca 335  Q
    |||||||||||||| | |||| |||||  |||||||||||||||||| ||  |||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||    
T  26699585 attagggtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcttttgtatctcttt-gtaaagaactcattt-ataatggattggagagatca 26699488  T
Q  336 atctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 376  Q
    ||||||   |||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  26699487 atctctatcccagagtaggtcattgttggaccgaactgggt 26699447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 212 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 36463557 - 36463386
Alignment:
Q  212 ttggtgagattgggaaagggg-tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctcct-gtatcccttttgtaaagaac 308  Q
    |||||||||||||||||  || |||||||||||| | |||||| |||| |||||  |||||||||||||||||||   | ||||| |||| |||| ||||    
T  36463557 ttggtgagattgggaaaatggatagaaattagggct-gttcattgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaac 36463461  T
Q  309 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 385  Q
    || ||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  36463460 tc-tttgacagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 36463386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 219 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 5208003 - 5207848
Alignment:
Q  219 gattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaacctcctgtatccct-tttgtaaagaactcatttga 316  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||| | |||||||||| ||| |||| | |||||  || ||||| ||||||||| ||||    
T  5208003 gattggaaaaagggtagaaattagggtttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttattgcaacc-cttgtatatctatttgt-aagaactca-ttga 5207907  T
Q  317 tagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 376  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  5207906 tagtggattggaaagatcaatctctctcccagagtaggtcaa-tttggactgaattgggt 5207848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 303 - 378
Target Start/End: Original strand, 8648230 - 8648303
Alignment:
Q  303 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 378  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  8648230 aagaactcatt-gatattggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccaaactgggtga 8648303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 212 - 376
Target Start/End: Original strand, 36994524 - 36994686
Alignment:
Q  212 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctcct-gtatcccttttgtaaagaac 308  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||   | |||||||||| |||| ||||    
T  36994524 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattaaggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatcccttt-gtaa-gaac 36994620  T
Q  309 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 376  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||| | ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  36994621 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccatattagatcaag-ttggaccgaactgggt 36994686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 212 - 376
Target Start/End: Original strand, 54883020 - 54883182
Alignment:
Q  212 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctcct-gtatcccttttgtaaagaac 308  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||  | |||| |||||  |||||||||||||||||||   | ||||| |||| |||| ||||    
T  54883020 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttttttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaac 54883116  T
Q  309 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 376  Q
    ||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||    
T  54883117 tcatt-gatagtggattggagggatcaatctctcctccagattaagtcaag-ttggaccgaactgggt 54883182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 230 - 374
Target Start/End: Original strand, 379399 - 379541
Alignment:
Q  230 gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctcct-gtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattgg 327  Q
    |||||||||||||| ||||||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||   | ||||| |||| |||| ||||| ||| |||||||||||||    
T  379399 gggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatcgcttt-gtaa-gaactaatt-gatagtggattgg 379494  T
Q  328 agagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgg 374  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  379495 agagatcaatctctcctccagagtaggtcattgttggaccgaactgg 379541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 212 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 37229890 - 37229731
Alignment:
Q  212 ttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacctcctgtatccct-tttgtaaagaact 309  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| | |||| ||||| || || ||||| ||||||||   | |||  || ||||||| |||||    
T  37229890 ttggtgagattgggaaaatggtagaaattagggtgtgttctttgtgagcttgttaaagcaaatttgttgtaaccctttttatatctctttgtaa-gaact 37229792  T
Q  310 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaact 372  Q
    ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||  || ||||||||||| ||||||||||||    
T  37229791 cattt-atagtggattggagagatcaatctctccctcatagtaggtcaag-ttggaccgaact 37229731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 214 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 46147557 - 46147388
Alignment:
Q  214 ggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcctgtatcccttttgtaaagaactc 310  Q
    ||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||  |||||||||||||||||| |   |||||| |||| |||| ||||||    
T  46147557 ggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggtt-gttcattgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaa-gaactc 46147461  T
Q  311 atttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 385  Q
     |||||||||||||||||||   |||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  46147460 -tttgatagtggattggagacatcaatctctcccccaaattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 46147388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 303 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 48893715 - 48893635
Alignment:
Q  303 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 385  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  48893715 aagaactc-tttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 48893635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 303 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 50262778 - 50262694
Alignment:
Q  303 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctt 388  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||   |||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||    
T  50262778 aagaactcatt-gatagttgattggagatatcaatctttcctccagagtaggtcattgttggaccgaactgggtgaacaatctctt 50262694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 96 - 385
Target Start/End: Original strand, 5429555 - 5429850
Alignment:
Q  96 agagagagacttgggaaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaa-a 192  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  | | || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||    |    
T  5429555 agagagaaacttgggaaatcaaaggaagtaactttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtga 5429652  T
Q  193 gagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaggg-gtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac 283  Q
    | || |||||||||||||||||       ||||||||||||||  | |||||||||||||||  ||| | |||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  5429653 gtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgagtagaaattagggtta-ttcttcgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaac 5429751  T
Q  284 ctcct-gtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaa 382  Q
    |   | |||||  ||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||| | |||    
T  5429752 ccatttgtatctattt-gtaa-gaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggttaag-ttggaccgaactgggtcaacaa 5429847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 212 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 27417133 - 27416974
Alignment:
Q  212 ttggtgagattgggaaaggg-gtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctcct-gtatcccttttgtaaagaac 308  Q
    ||||||||||||| |||  | ||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||   | ||||| |||| ||||| |||    
T  27417133 ttggtgagattggtaaaatgtgtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaaa-aac 27417037  T
Q  309 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactg 373  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  27417036 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactg 27416974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 212 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 45687351 - 45687179
Alignment:
Q  212 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacctcctgtatccct-tttgtaaagaac 308  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||| | |||| |||||||| ||||||||||| |||| || | | |  || ||||||| ||||    
T  45687351 ttggtgagattgggaaaatgggaagaaattaggttttgttctttgtgagcttgtcaaagctaatttcttataac-tcatttgtatctatttgtaa-gaac 45687254  T
Q  309 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 385  Q
    ||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  45687253 tcatt-gatagtggattggagagatctatctctcctccatattatgtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 45687179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 313 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 6542247 - 6542185
Alignment:
Q  313 ttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 376  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  6542247 ttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagggtaggtcaag-ttggaccgaactgggt 6542185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 303 - 385
Target Start/End: Original strand, 5871911 - 5871991
Alignment:
Q  303 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 385  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| | ||||||    
T  5871911 aagaactc-tttgatagtggattagagagatcaatctctcccccagattaggtcaagttt-gaccgaactgggtcaacaatct 5871991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 303 - 373
Target Start/End: Original strand, 35662532 - 35662600
Alignment:
Q  303 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactg 373  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||  |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  35662532 aagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatatctcctcaagagtaggtcaag-ttggaccgaactg 35662600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 312 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 52467423 - 52467351
Alignment:
Q  312 tttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 385  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  52467423 tttgatagtggattggagagatcaatctctccccgagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 52467351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 212 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 54200074 - 54199926
Alignment:
Q  212 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaa-cctcctgtatcccttttgtaaagaac 308  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  ||||||||||||||||| ||   |||||| | ||||| ||||||    
T  54200074 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctc-tttgt-aagaac 54199978  T
Q  309 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtt 361  Q
    ||| ||||||||| ||| |||||  || ||||||| ||||| |||||||||||    
T  54199977 tca-ttgatagtgaattagagagatcattctctcccccagattaggtcaagtt 54199926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 266 - 376
Target Start/End: Original strand, 4588014 - 4588121
Alignment:
Q  266 aagctaatttcttgtaacc-tcctgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttgg 364  Q
    ||||||||||||||||||| |  |||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||| ||| ||||    
T  4588014 aagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaa-gaactcatt-gatagtggattggagagaacaatctctcccccataataggtgaag-ttgg 4588109  T
Q  365 accgaactgggt 376  Q
    ||| ||||||||    
T  4588110 accaaactgggt 4588121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 12747924 - 12747851
Alignment:
Q  212 ttggtgagattgggaaagggg-tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc 284  Q
    |||||||||||||||||  || |||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12747924 ttggtgagattgggaaaatggatagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacc 12747851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 52082949 - 52082752
Alignment:
Q  96 agagagagacttgggaaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaa-a 192  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || | || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||    |    
T  52082949 agagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtga 52082852  T
Q  193 gagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattggg-aaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac 283  Q
    | || ||||||||| |||||||       ||||||||||| ||| ||||||||| ||||| |||||| | ||||||||||| || |||||||||||||||    
T  52082851 gtgaaaatcattgactgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaactaggg-ttgttctttgtgaacttgtcaaaactaatttcttgtaac 52082753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 303 - 376
Target Start/End: Original strand, 31474242 - 31474313
Alignment:
Q  303 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 376  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||   ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  31474242 aagaactcatt-gatagttgattggagagataaatctctccaccagagtagatcaagtt-ggaccgaactgggt 31474313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 231 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 12744195 - 12744087
Alignment:
Q  231 ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaa-cctcctgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattgga 328  Q
    |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||| ||   |||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  12744195 ggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctc-tttgt-aagaactca-ttgatagtggattgga 12744100  T
Q  329 gagtacaatctct 341  Q
    |||  ||||||||    
T  12744099 gagatcaatctct 12744087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 313 - 385
Target Start/End: Original strand, 29254594 - 29254665
Alignment:
Q  313 ttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 385  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||  ||| | ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  29254594 ttgatagtggattggagagatcaatctctctcccaaattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 29254665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 299 - 355
Target Start/End: Original strand, 33089966 - 33090021
Alignment:
Q  299 tgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggt 355  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||    
T  33089966 tgtaaagaactcatt-gatagtggattagagagatcaatctctcctctagagtaggt 33090021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 266 - 357
Target Start/End: Original strand, 33989899 - 33989989
Alignment:
Q  266 aagctaatttcttgtaa-cctcctgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtca 357  Q
    ||||||||||||||||| |||  |||||| |||| ||||| ||||| ||  ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||    
T  33989899 aagctaatttcttgtaatccttttgtatctcttt-gtaaataactcgtta-atagtggattggagagatcaatctctccaccagagtaggtca 33989989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 337 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 52082708 - 52082660
Alignment:
Q  337 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 385  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||    
T  52082708 tctctcctccagagtaggtcaagtttagaccgatttgggtgaacaatct 52082660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 303 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 13009521 - 13009464
Alignment:
Q  303 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtt 361  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||| | |||||||||||    
T  13009521 aagaactcatt-gatagtggattggagagatcgatctctcctccaaattaggtcaagtt 13009464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 42
Target Start/End: Complemental strand, 31034834 - 31034801
Alignment:
Q  9 tctctggttgggatatgcgtcataagtaagcaat 42  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31034834 tctctggatgggatatgcgtcataagtaagcaat 31034801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 52093956 - 52093885
Alignment:
Q  96 agagagagacttgggaaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttg 168  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || | || ||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  52093956 agagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgaggg-tctttgattagagt-tctcttgggttg 52093885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0137 (Bit Score: 330; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0137
Description:

Target: scaffold0137; HSP #1
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 96 - 507
Target Start/End: Original strand, 6158 - 6567
Alignment:
Q  96 agagagagacttgggaaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagag 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  6158 agagagagacttgggaaatcaaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgta--gag 6255  T
Q  196 agaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcctgtatccc 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||    
T  6256 agaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaagcccttgtatccc 6355  T
Q  296 ttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttggtgct 395  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  6356 ttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggttaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttt-gtgtt 6454  T
Q  396 tttgttttcttcttccctctccttg-tttatcttgtgattgtcgctttgtgtttcacacttggttcctggattagatctaggtggtgttttgttgtttct 494  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  6455 attgttttcttcttccctctccttgttttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgtattgttgtttct 6554  T
Q  495 tgcttgcacaata 507  Q
    |||||||||||||    
T  6555 tgcttgcacaata 6567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 322; Significance: 0; HSPs: 47)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 94 - 507
Target Start/End: Original strand, 15290406 - 15290816
Alignment:
Q  94 gaagagagagacttgggaaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaag 193  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  15290406 gaagagagagacttgggaaatcaaagggaaagctctagggtttagggttctttgattagagtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgta--g 15290503  T
Q  194 agagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaacctcctgtat 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15290504 agagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtat 15290603  T
Q  293 cccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttggt 392  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  15290604 tccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgtccaatctcttt-gt 15290702  T
Q  393 gctt-ttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgtcgctttgtgtttcacacttggttcctggattagatctaggtggtgttttgttgtt 491  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  15290703 gtttattgttttcttcttccctctccttg--tatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattcgatctaggtggtgtattgttgtt 15290800  T
Q  492 tcttgcttgcacaata 507  Q
    |||||||||| |||||    
T  15290801 tcttgcttgctcaata 15290816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 94 - 507
Target Start/End: Original strand, 15470775 - 15471185
Alignment:
Q  94 gaagagagagacttgggaaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaag 193  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  15470775 gaagagagagacttgggaaatcaaagggaaagctctagggtttagggttctttgattagagtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgta--g 15470872  T
Q  194 agagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaacctcctgtat 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15470873 agagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtat 15470972  T
Q  293 cccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttggt 392  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  15470973 tccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgtccaatctcttt-gt 15471071  T
Q  393 gctt-ttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgtcgctttgtgtttcacacttggttcctggattagatctaggtggtgttttgttgtt 491  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  15471072 gtttattgttttcttcttccctctccttg--tatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattcgatctaggtggtgtattgttgtt 15471169  T
Q  492 tcttgcttgcacaata 507  Q
    |||||||||| |||||    
T  15471170 tcttgcttgctcaata 15471185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 69 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 42575635 - 42575201
Alignment:
Q  69 tgcaaattttaagggagagaagttggaagagagagacttgggaaatcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttg 168  Q
    |||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  42575635 tgcagatttgaagagagaggagttggaagagagagacttgggaaatcaaagggaaagctctagggtttagggttctttgattagagtacctcttgggttg 42575536  T
Q  169 aaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaac-ttgtcaa 267  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  42575535 aaaacatgggaaacaccttgta--gagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggattgttcatagtgaacattgtcaa 42575438  T
Q  268 gctaatttcttgtaacctcctgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggacc 367  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42575437 gctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggacc 42575338  T
Q  368 gaactgggtgaccaatctctttggtgctt-ttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgatt-gtcgctttgtgtttcacacttggttcctgga 465  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || || ||||  ||||||||||||| ||||| ||    
T  42575337 gaactgggtgaccaatctcttt-gtgtttattgttttcttcttccctctccttg--tatcttgtgtttggttgctt--tgtttcacacttgtttcctaga 42575243  T
Q  466 ttagatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgcacaata 507  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42575242 ttggatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgctcaata 42575201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 90 - 504
Target Start/End: Original strand, 25689832 - 25690243
Alignment:
Q  90 gttggaagagagagacttgggaaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttg 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25689832 gttggaagagagagacttgggaaatcaaagggagaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttg 25689931  T
Q  189 taaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcct 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  25689932 taaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaaaggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctttt 25690031  T
Q  289 gtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctt 388  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25690032 gtatcccttttgt-aagaactc-tttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctt 25690129  T
Q  389 tggtgctt-ttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgtcgctttgtgtttcacacttggttcctggattagatctaggtggtgttttgt 487  Q
    ||||| || |||||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||| | |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25690130 tggtgtttgttgttttcttcttccctcccct--tttatcttgtgagtgt-gttttgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgt 25690226  T
Q  488 tgtttcttgcttgcaca 504  Q
    || ||||||||||||||    
T  25690227 tgattcttgcttgcaca 25690243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 96 - 504
Target Start/End: Original strand, 3439387 - 3439791
Alignment:
Q  96 agagagagacttgggaaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaaga 194  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3439387 agagagagacttgagaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaaga 3439486  T
Q  195 gagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcctgtatcc 294  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||    
T  3439487 gaaaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattatgaacttggcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcc 3439586  T
Q  295 cttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttggtgc 394  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  3439587 cttttgt-aagaactc-tttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactggatgaacaatctctttggtgc 3439684  T
Q  395 ttttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgtcgctttgtgtttcacacttggttcctggattagatctaggtggtgttttgttgtttct 494  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | |||| ||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |    
T  3439685 ttttgttttcttcttccctctcct--tttatcttgtgattgt-gttttgagtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattgt 3439781  T
Q  495 tgcttgcaca 504  Q
    ||||||||||    
T  3439782 tgcttgcaca 3439791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 89 - 503
Target Start/End: Original strand, 2627609 - 2628024
Alignment:
Q  89 agttggaagagagaga--cttgggaaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacac 184  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | | ||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||    
T  2627609 agttggaagagagagaaacttgggaaatcaaagggagtaactctagggtttagagt-ctttgattagagcttctcttgggttgggaaacatgggaaacac 2627707  T
Q  185 cttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaa- 282  Q
    |||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||     
T  2627708 cttgaagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattaggg-ttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgcaac 2627806  T
Q  283 -cctcctgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgacca 381  Q
     | |  |||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  2627807 tctttttgtatctcttgtgt-aagaactca-ttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaata 2627904  T
Q  382 atctctttggtgcttttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgtcgctttgtgtttcacacttggttcctggattagatctaggtggtg 481  Q
    ||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| |||| | ||| || ||  |||||| ||||| ||||||||||||||| ||    
T  2627905 atctc-ttggtgtctttgttttcctcttccctctcct--tttatcttgtgcttgt-gttttatgcttttcacttgtttcctagattagatctaggtgttg 2628000  T
Q  482 tt-ttgttg-tttcttgcttgcac 503  Q
    || |||||| ||| ||||||||||    
T  2628001 ttattgttgattttttgcttgcac 2628024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 96 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 34254620 - 34254327
Alignment:
Q  96 agagagagacttgggaaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaaga 194  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || | || ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | |||| | ||||||||||   ||     
T  34254620 agagagaaacttgggaaatcaaaggaggcaactttagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttggagacattgtaaacaccttggtgagt 34254523  T
Q  195 gagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-t 285  Q
    || |||||||||||||||||       |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| | ||||||||||||||| |    
T  34254522 gaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagttaatttcttgtaaccct 34254424  T
Q  286 cctgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 385  Q
      |||||| |||| |||| ||||| ||| |||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34254423 tttgtatctcttt-gtaa-gaacttatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctctagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 34254327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 96 - 385
Target Start/End: Original strand, 17982529 - 17982825
Alignment:
Q  96 agagagagacttgggaaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaag 193  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  | | || ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   ||    
T  17982529 agagagaaacttgggaaatcaaaggaagcaactttagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgag 17982626  T
Q  194 agagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaag--gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac 283  Q
     || |||||||||||||||||       ||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  17982627 tgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagttaatttcttgtaac 17982725  T
Q  284 c-tcctgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaa 382  Q
    | |  |||||| |||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17982726 ccttttgtatctctttgg--aagaactcatt-gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 17982822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 96 - 385
Target Start/End: Original strand, 31218133 - 31218429
Alignment:
Q  96 agagagagacttgggaaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaag 193  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  | | || ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   ||    
T  31218133 agagagaaacttgggaaatcaaaggaagcaactttagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgag 31218230  T
Q  194 agagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaagg--ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac 283  Q
     || |||||||||||||||||       ||||||||||||||    |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31218231 tgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaac 31218329  T
Q  284 c-tcctgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaa 382  Q
    | |  |||||| |||| |  ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  31218330 ccttttgtatctctttgg--aagaactcatt-gatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 31218426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 104 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 34256788 - 34256503
Alignment:
Q  104 acttgggaaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatca 202  Q
    ||||||||||||||||| || | || ||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||| |||||| | ||||||||||    | || |||||    
T  34256788 acttgggaaatcaaaggaggcaactttagggtttagggt-ctttgattagagt-tatcttgggttggaaacattgtaaacaccttggtgtgtgaaaatca 34256691  T
Q  203 ttgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-tcctgtatc 293  Q
    ||||||||||||       |||||||||| |||  |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| | ||||||||||||||| |  ||||||    
T  34256690 ttgagtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagttaatttcttgtaacccttttgtatc 34256592  T
Q  294 ccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 385  Q
     |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34256591 tcttt-gtaa-gaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctctagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 34256503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 96 - 385
Target Start/End: Original strand, 44303730 - 44304027
Alignment:
Q  96 agagagagacttgggaaatcaaagggga-agctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaag 193  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||  | | || ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   ||    
T  44303730 agagagaaacttgagaaatcaaaggaaacaactttagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgag 44303827  T
Q  194 agagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaag---gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaa 282  Q
     || |||||||||||||||||       ||||||||||||||    |||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44303828 tgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaaagggtagaaattaaggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaa 44303926  T
Q  283 -cctcctgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgacca 381  Q
     |||  |||||| |||||   ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||    
T  44303927 tccttttgtatctcttttt--aagaactcatt-gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggatcgaactaggtgaaca 44304023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 96 - 483
Target Start/End: Original strand, 42498070 - 42498459
Alignment:
Q  96 agagagagacttgggaaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaag 193  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || | || ||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||  |||| | | ||||||||||   ||    
T  42498070 agagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattaaagt-tctcttgggttgggaaacgttgtaaacaccttggtgag 42498167  T
Q  194 agagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaagg--ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac 283  Q
     || |||||||||||||||||       ||||||||||||||    |||||||||||||||| |||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  42498168 tgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaaaggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaac 42498266  T
Q  284 c-tcctgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaa 382  Q
    | |  |||||  |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  42498267 ccttttgtatttcttt-gtaa-gaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 42498363  T
Q  383 tctctttggtgcttttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgtcgctttgtgtttcacac-ttggttcctggattagatctaggtggtg 481  Q
      |||||||||  ||||||| | ||||  |||||||  |||||||| || |||| | |||||||||  ||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||    
T  42498364 --tctttggtgtgtttgtttccctctt--ctctcct--tttatcttttgcttgtggttttgtgtttttcactttgattcctagattagatctaggtgttg 42498457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 104 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 19945644 - 19945355
Alignment:
Q  104 acttgggaaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatc 201  Q
    |||||||||||||||||  | | || |||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||||||||||   || || ||||    
T  19945644 acttgggaaatcaaaggaagcaactttagggtttagagt-ctttgattagagt-tctcttgggtcgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatc 19945547  T
Q  202 attgagtgtcttg-------gtgagattgggaaag--gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacctcct--g 289  Q
    |||||||||||||       ||||||||||||||   |||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| | |  |    
T  19945546 attgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaagggtagaaattatggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaaccacttttg 19945448  T
Q  290 tatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 385  Q
    |||| |||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  19945447 tatctctttgg--aagaactcatt-gatagtggattggagagttcaatctctcctcgagagtaggtcaagtttgaaccgaactgggtgaacaatct 19945355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 96 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 1746510 - 1746216
Alignment:
Q  96 agagagagacttgggaaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaag 193  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  | | || ||||||||||||| ||| ||||||||| |||||| |||||  |||||| | ||||||||||   ||    
T  1746510 agagagaaacttgggaaatcaaaggaagcaactttagggtttagggtcctt-gattagagt-tctctttggttgggaaacattgtaaacaccttggtgag 1746413  T
Q  194 agagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaagg--ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac 283  Q
     || |||||||||||||||||       |||||||||  |||    |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1746412 tgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgaaaaaaaaaggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaac 1746314  T
Q  284 c-tcctgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaa 382  Q
    | |  |||||| ||||    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  1746313 ccttttgtatctctttg---aagaactcatt-gatagtggattggagagttcaatctctcctccatagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 1746218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 96 - 385
Target Start/End: Original strand, 43036299 - 43036594
Alignment:
Q  96 agagagagacttgggaaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaa-a 192  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || | || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||    |    
T  43036299 agagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtga 43036396  T
Q  193 gagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac 283  Q
    | || |||||||||||||||||       ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  || ||||||||||||||     
T  43036397 gtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaaactaatttcttgtaat 43036495  T
Q  284 -ctcctgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaa 382  Q
     |   |||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||    
T  43036496 tcatttgtatctcttt-gtaa-gaactcatt-gatagtggatttgagagatcaatctctcctccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaa 43036591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 212 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 42435159 - 42434995
Alignment:
Q  212 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctcct-gtatcccttttgtaaagaac 308  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||   | ||||| |||| |||| ||||    
T  42435159 ttggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaac 42435063  T
Q  309 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 378  Q
    ||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42435062 tcatt-gatagtggattggagaaatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtga 42434995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 212 - 385
Target Start/End: Original strand, 15212786 - 15212957
Alignment:
Q  212 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctcct-gtatcccttttgtaaagaac 308  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||   | ||||| |||| |||| ||||    
T  15212786 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaac 15212882  T
Q  309 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 385  Q
    ||||| |||| ||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  15212883 tcatt-gataatggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 15212957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 214 - 385
Target Start/End: Original strand, 40321082 - 40321251
Alignment:
Q  214 ggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctcct-gtatcccttttgtaaagaactc 310  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||  ||| |||||||||||||||   | ||||| |||| ||||| |||||    
T  40321082 ggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttcattgtgagcttgttgaagttaatttcttgtaacccattagtatctcttt-gtaaa-aactc 40321178  T
Q  311 atttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 385  Q
     ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  40321179 -tttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 40321251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 212 - 378
Target Start/End: Original strand, 4283524 - 4283688
Alignment:
Q  212 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctcct-gtatcccttttgtaaagaac 308  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||  | |||| |||||  |||||||||||||||||||   | ||||| |||| |||| ||||    
T  4283524 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttttttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaac 4283620  T
Q  309 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 378  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4283621 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctcccctctagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtga 4283688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 212 - 385
Target Start/End: Original strand, 33352150 - 33352321
Alignment:
Q  212 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctcct-gtatcccttttgtaaagaac 308  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||  || ||||||||||||||||   | ||||| |||| |||| ||||    
T  33352150 ttggtgagattgggaaaatgggtaaaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaacctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaac 33352246  T
Q  309 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 385  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  33352247 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 33352321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 96 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 12702930 - 12702631
Alignment:
Q  96 agagagagacttgggaaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaag 193  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || |  | ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   ||    
T  12702930 agagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaaatttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgag 12702833  T
Q  194 agagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaag------gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttg 279  Q
     || ||||||| |||||||||       ||||||||||||||       ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  ||||||||||||||    
T  12702832 tgaaaatcattaagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttg 12702734  T
Q  280 taacc-tcctgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 378  Q
    ||||| |  ||| || |||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||| |    
T  12702733 taacccttttgtgtctcttt-gtaa-gaactcatt-gatattggattggagagatcaatctctcccctagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtca 12702638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 212 - 378
Target Start/End: Original strand, 18655400 - 18655564
Alignment:
Q  212 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctcct-gtatcccttttgtaaagaac 308  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||||| |||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||   | ||||| |||| |||| ||||    
T  18655400 ttggtgagattgagaaaatgggtagaaattaaggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaac 18655496  T
Q  309 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 378  Q
    ||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18655497 tcatt-gatagtggattagagagatcaatctctcctccaaagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtga 18655564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 212 - 385
Target Start/End: Original strand, 27811278 - 27811449
Alignment:
Q  212 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctcct-gtatcccttttgtaaagaac 308  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||   | ||||| |||| |||| ||||    
T  27811278 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaac 27811374  T
Q  309 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 385  Q
     |||| |||||||||||| ||||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  27811375 ccatt-gatagtggattgaagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 27811449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 303 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 4743291 - 4743211
Alignment:
Q  303 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 385  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  4743291 aagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccaaagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 4743211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 212 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 3303838 - 3303667
Alignment:
Q  212 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcctgtatcccttttgtaaagaac 308  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||| | ||||||| | |||| |||||  || ||||||||||||||| |   |||||| |||| |||| ||||    
T  3303838 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattaag-tttgttctttgtgagcttgtttaacctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaa-gaac 3303742  T
Q  309 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 385  Q
    ||||| |||||||||||| ||||  |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  3303741 tcatt-gatagtggattgaagagatcaatctctcccccacagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtaaacaatct 3303667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 302 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 1345449 - 1345391
Alignment:
Q  302 aaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtt 361  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  1345449 aaagaactcatt-gatagtggattgaagagttcaatctctcccccagagtaggtcaagtt 1345391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 313 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 10930267 - 10930205
Alignment:
Q  313 ttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 376  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  10930267 ttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggt 10930205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 313 - 376
Target Start/End: Original strand, 40221845 - 40221907
Alignment:
Q  313 ttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 376  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  40221845 ttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggt 40221907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 303 - 385
Target Start/End: Original strand, 5689362 - 5689442
Alignment:
Q  303 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 385  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| | ||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  5689362 aagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagatttggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 5689442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 215 - 355
Target Start/End: Original strand, 40328782 - 40328922
Alignment:
Q  215 gtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc--tcctgtatcccttttgtaaagaactc 310  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| | |||| |||||  || |||||||||||||||   |  |||||| |||| |||| ||||||    
T  40328782 gtgagattgggaaaatgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgtttaaactaatttcttgtaactcattttgtatctcttt-gtaa-gaactc 40328878  T
Q  311 atttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggt 355  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  40328879 att-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggt 40328922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 104 - 385
Target Start/End: Original strand, 6598856 - 6599143
Alignment:
Q  104 acttgggaaatcaaagggga-agctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaa-agagagaat 200  Q
    ||||||||||||||||| || | || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||    || || |||    
T  6598856 acttgggaaatcaaaggagataactttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaat 6598953  T
Q  201 cattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctcct-gt 290  Q
    |||| |||||||||       ||||||||||||||  |||||||||||| | ||||||| | | || |||||  |||||||||||||||||||   | ||    
T  6598954 cattaagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaatgggtagaaattaag-tttgttctttgcgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgt 6599052  T
Q  291 atcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 385  Q
    || | |||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||  |||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  6599053 atac-ttttgtaa-gaactcatt-gatagtggattagagagatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 6599143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 104 - 385
Target Start/End: Original strand, 6674309 - 6674596
Alignment:
Q  104 acttgggaaatcaaagggga-agctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaa-agagagaat 200  Q
    ||||||||||||||||| || | || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||    || || |||    
T  6674309 acttgggaaatcaaaggagataactttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaat 6674406  T
Q  201 cattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctcct-gt 290  Q
    |||| |||||||||       ||||||||||||||  |||||||||||| | ||||||| | | || |||||  |||||||||||||||||||   | ||    
T  6674407 cattaagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaatgggtagaaattaag-tttgttctttgcgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgt 6674505  T
Q  291 atcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 385  Q
    || | |||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||  |||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  6674506 atac-ttttgtaa-gaactcatt-gatagtggattagagagatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 6674596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 313 - 376
Target Start/End: Original strand, 4733806 - 4733868
Alignment:
Q  313 ttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 376  Q
    |||||||||||||||||||  | |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  4733806 ttgatagtggattggagagatcgatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggt 4733868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 212 - 375
Target Start/End: Original strand, 18141821 - 18141981
Alignment:
Q  212 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctcct-gtatcccttttgtaaagaac 308  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||||  |||||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||   | ||||| |||| |||| ||||    
T  18141821 ttggtgagattgtgaaaatgggtagaaattagg--ttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatcacttt-gtaa-gaac 18141916  T
Q  309 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactggg 375  Q
    || ||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||| ||||||||| ||||||| |||||||    
T  18141917 tc-tttgatagtggattggagagatcaatctctcccctagattaggtcaag-ttggaccaaactggg 18141981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 218 - 361
Target Start/End: Original strand, 30143346 - 30143488
Alignment:
Q  218 agattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctcct-gtatcccttttgtaaagaactcattt 314  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||   | ||||| |||| |||| |||||||||     
T  30143346 agattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaactcatt- 30143441  T
Q  315 gatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtt 361  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| |||||  ||||||||||    
T  30143442 gatagtggattggagagatcaatctctcccccagataaggtcaagtt 30143488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 266 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 41366727 - 41366622
Alignment:
Q  266 aagctaatttcttgtaacctcct-gtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttgg 364  Q
    ||||||||||||| ||||||  | |||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| | ||| ||||||||| ||||    
T  41366727 aagctaatttcttttaacctatttgtatcccttt-gtaa-gaactcattt-atagtggattggagagatcaatctctcc-ctagattaggtcaag-ttgg 41366633  T
Q  365 accgaactggg 375  Q
    |||||||||||    
T  41366632 accgaactggg 41366622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 313 - 378
Target Start/End: Original strand, 11384085 - 11384149
Alignment:
Q  313 ttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 378  Q
    |||||| |||||||||||   | |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  11384085 ttgatactggattggagacatcgatctctcctccagagtaggttaag-ttggaccgaactgggtga 11384149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 212 - 373
Target Start/End: Original strand, 30291606 - 30291767
Alignment:
Q  212 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaac-ctcctgtatcccttttgtaaagaac 308  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||| | |||| |||| | |||||||||||||||||| |   |||||| | ||||| |||||     
T  30291606 ttggtgagattgagaaaatgggtagaaattaggttttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatcac-tttgt-aagaat 30291703  T
Q  309 tcatttgatagtggattggagagtacaatctct-cctccagagtaggtcaagtttggaccgaactg 373  Q
    || ||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| || | |||| |||||||||||||    
T  30291704 tc-tttgatagtggattggagagatcaatctctccctccagattatgccaag-ttggaccgaactg 30291767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 212 - 385
Target Start/End: Original strand, 4731658 - 4731829
Alignment:
Q  212 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctcct-gtatcccttttgtaaagaac 308  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | || | |||| |||||  || ||||||||||||||||   | ||||| |||| |||| ||||    
T  4731658 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gctctttgtgagcttgttgaacctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaac 4731754  T
Q  309 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 385  Q
    ||||| |||||||||||||||||  | |||||||| ||||| | ||||||| |||||||||| ||||| | ||||||    
T  4731755 tcatt-gatagtggattggagagatcgatctctcccccagattcggtcaag-ttggaccgaattgggtcaacaatct 4731829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 212 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 8965859 - 8965820
Alignment:
Q  212 ttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttc 251  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  8965859 ttggtgagattgggaaaaaggtagaaattagggtttgttc 8965820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 313 - 376
Target Start/End: Original strand, 10015180 - 10015241
Alignment:
Q  313 ttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 376  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10015180 ttgatagtggattggagagataaatctct-ctccatagtaggtcaag-ttggaccgaactgggt 10015241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 212 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 1292631 - 1292471
Alignment:
Q  212 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcctgtatcccttttgtaaagaac 308  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||||| | ||||||| | |||| |||||  |||||||||||||||||| |   |||||| |||| |||| ||||    
T  1292631 ttggtgagattgagaaaatgggtagaaattaag-tttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaa-gaac 1292535  T
Q  309 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactggg 375  Q
    ||||| ||||||||||| ||||    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1292534 tcatt-gatagtggatttgagaaataaatctctcc-ccagagtaggtcaag-ttggaccgaactggg 1292471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 212 - 284
Target Start/End: Original strand, 9765745 - 9765818
Alignment:
Q  212 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc 284  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | |||| |||| ||| |||||||||||||||||    
T  9765745 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttggcaaagctaatttcttgtaacc 9765818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 215 - 283
Target Start/End: Original strand, 44353796 - 44353865
Alignment:
Q  215 gtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac 283  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  44353796 gtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaac 44353865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 313 - 374
Target Start/End: Original strand, 7597715 - 7597776
Alignment:
Q  313 ttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgg 374  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||| ||| |||||||||   || |||||||||||    
T  7597715 ttgatagtggattggagagatcaatctctcccccatagtaggtcattgttagaccgaactgg 7597776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 104 - 214
Target Start/End: Original strand, 10929685 - 10929794
Alignment:
Q  104 acttgggaaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgta-aagagagaatc 201  Q
    ||||||||||||||||| || | || |||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||||  ||||| | |||||||||| |  || || ||||    
T  10929685 acttgggaaatcaaaggaggtaactttagggtt--ggggtctttgattagagt-tctcttgggttgggaacattgtaaacaccttggattagtgaaaatc 10929781  T
Q  202 attgagtgtcttg 214  Q
    |||||||||||||    
T  10929782 attgagtgtcttg 10929794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 168
Target Start/End: Original strand, 30143218 - 30143289
Alignment:
Q  96 agagagagacttgggaaatcaaagg-ggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttg 168  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || | || ||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  30143218 agagagaaacttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgaggg-tctttgattagagt-tctcttgggttg 30143289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491 (Bit Score: 128; Significance: 6e-66; HSPs: 2)
Name: scaffold0491
Description:

Target: scaffold0491; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 89 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 11463 - 11042
Alignment:
Q  89 agttggaagagagaga--cttgggaaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacac 184  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | | |||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||  |||||| | ||||||    
T  11463 agttggaagagagagaaacttgggaaatcaaagggagtaactctagggtttatggt-ctttgattagagcttctcttgggttgggaaacattgtaaacac 11365  T
Q  185 cttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg------gtgagattggga--aaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaag-ctaattt 275  Q
    ||||   || |  |||||||||||||||||      ||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||| | |||||||||| ||  |||||||    
T  11364 cttggtgagtgtaaatcattgagtgtcttgttcttggtgagattgggagaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtaaaatctaattt 11266  T
Q  276 cttgtaacc-tcctgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgg 374  Q
    ||||||||| |  |||||| ||||||||| |||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11265 cttgtaacccttttgtatctcttttgtaa-gaactcgtt-gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgg 11168  T
Q  375 gtgaccaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgtcgctttgtgtttcacac-ttggttcctggattagatct 473  Q
    |||| |||  |||||||||  ||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| |||| | |||||||||  ||| ||| ||||| ||||||||||    
T  11167 gtgaacaa--tctttggtgtctttgttttcctcttccctctcct--tttatcttgtgcttgt-ggtttgtgtttttcactttgtttcctagattagatct 11073  T
Q  474 aggtggtgtt-ttgttgtttcttgcttgcac 503  Q
    ||||| |||| |||||| || ||||||||||    
T  11072 aggtgttgttattgttgattattgcttgcac 11042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 89 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 9037 - 8616
Alignment:
Q  89 agttggaagagagaga--cttgggaaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacac 184  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | | ||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||  |||||| | ||| ||    
T  9037 agttggaagagagagaaacttgggaaatcaaagggagtaactctaggctttagggt-ctttgattagagcttctcttgggttgggaaacattgtaaagac 8939  T
Q  185 cttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg------gtgagattggga--aaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaag-ctaattt 275  Q
    ||||   || |  || ||||||||||||||      ||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||| | |||||||| | ||  |||||||    
T  8938 cttggtgagtgtaaaccattgagtgtcttgttcttggtgagattgggagaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttataaaatctaattt 8840  T
Q  276 cttgtaacc-tcctgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgg 374  Q
    ||||||||| |  |||||| ||||||||| |||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8839 cttgtaacccttttgtatctcttttgtaa-gaactcgtt-gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgg 8742  T
Q  375 gtgaccaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgtcgctttgtgtttcacac-ttggttcctggattagatct 473  Q
    |||| |||  |||||||||  ||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||| |||| | |||||| ||  ||| ||| ||||| ||||||||||    
T  8741 gtgaacaa--tctttggtgtctttgttttcctcttccctcttct--tttatcttgtgcttgt-ggtttgtgcttttcactttgtttcctagattagatct 8647  T
Q  474 aggtggtgtt-ttgttgtttcttgcttgcac 503  Q
    ||||| |||| |||||| || ||||||||||    
T  8646 aggtgttgttattgttgattattgcttgcac 8616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1808 (Bit Score: 117; Significance: 2e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold1808
Description:

Target: scaffold1808; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 349 - 507
Target Start/End: Original strand, 1 - 157
Alignment:
Q  349 agtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttggtgctt-ttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgtcgctttgtgtt 447  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  1 agtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttg-tgtttattgttttcttcttccctctccttgt--atcttgtgattgttgctttgtgtt 97  T
Q  448 tcacacttggttcctggattagatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgcacaata 507  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  98 tcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgcacaata 157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 104; Significance: 1e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 96 - 383
Target Start/End: Original strand, 434409 - 434703
Alignment:
Q  96 agagagagacttgggaaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttg-aaaacatgggaaacaccttgtaaag 193  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  | | || ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| ||||||   ||    
T  434409 agagagaaacttgggaaatcaaaggaagcaactttagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttggaaaacatggtaaataccttggtgag 434506  T
Q  194 agagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattggg--aaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac 283  Q
     || |||||||||||||||||       |||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  434507 tgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattggggaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaac 434605  T
Q  284 c-tcctgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaa 382  Q
    | |  |||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  434606 ccttttgtatctcttt-gtaa-gaactcatt-gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 434702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1519 (Bit Score: 98; Significance: 5e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold1519
Description:

Target: scaffold1519; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 96 - 385
Target Start/End: Original strand, 793 - 1087
Alignment:
Q  96 agagagagacttgggaaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaag 193  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  | | || ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   ||    
T  793 agagagaaacttgggaaatcaaaggcagcaactttagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgag 890  T
Q  194 agagaatcattgagtgtcttg------gtgagattgggaaag--gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc 284  Q
     || |||||||||||||||||      ||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  891 tgaaaatcattgagtgtcttgttcttggtgagattgggaaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacc 989  T
Q  285 -tcctgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaat 383  Q
     |  |||||| ||||    || |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  990 cttttgtatctctttg---aacaactcatt-gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaat 1085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0286 (Bit Score: 84; Significance: 1e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0286
Description:

Target: scaffold0286; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 212 - 388
Target Start/End: Original strand, 11557 - 11732
Alignment:
Q  212 ttggtgagattgggaaagg-ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac-ctcctgtatcccttttgtaaagaac 308  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| |   |||||| |||| |||| ||||    
T  11557 ttggtgagattgggaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaa-gaac 11653  T
Q  309 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctt 388  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11654 tcatt-gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctt 11732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0286; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 96 - 162
Target Start/End: Original strand, 22220 - 22286
Alignment:
Q  96 agagagagacttgggaaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctctt 162  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  22220 agagagaaacttgggaaatcaaagggagcaactctagggtttaggg-tctttgattagagtttctctt 22286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 69; Significance: 1e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 212 - 385
Target Start/End: Original strand, 114602 - 114774
Alignment:
Q  212 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac-ctcctgtatcccttttgtaaagaac 308  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| ||  |||||| | ||||| ||||||    
T  114602 ttggtgagattgggaaaaagggtagaaattaaggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacgcttttgtatctc-tttgt-aagaac 114698  T
Q  309 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 385  Q
    ||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||| ||||||    
T  114699 tca-ttgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggttaagtttagaccgaactggatgaacaatct 114774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 231 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 18151 - 18007
Alignment:
Q  231 ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcctgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattgga 328  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||| |||||  |||||||||||||||||| |   |||||| |||| |||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  18151 ggtagaaattagggtt-gttcattgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaaa--actcatt-gatagtggattgga 18057  T
Q  329 gagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 378  Q
    |||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18056 gagatcaatctctcctccagggtaggtcaagtttggatcgaactgggtga 18007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0236 (Bit Score: 44; Significance: 8e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0236
Description:

Target: scaffold0236; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 313 - 376
Target Start/End: Original strand, 10589 - 10651
Alignment:
Q  313 ttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 376  Q
    |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10589 ttgatagtggattgaagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggt 10651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 303 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 149174 - 149094
Alignment:
Q  303 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 385  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  149174 aagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagagtaggttaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 149094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0466 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0466
Description:

Target: scaffold0466; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 212 - 378
Target Start/End: Original strand, 7327 - 7491
Alignment:
Q  212 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctcct-gtatcccttttgtaaagaac 308  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||| |||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||   | ||||| |||| |||| ||||    
T  7327 ttggtgagattggaaaaatgggtagaaattaaggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaac 7423  T
Q  309 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 378  Q
    ||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  7424 tcatt-gatagtggattggaaagatcaatctctcctctagagtaggttaag-ttggaccgaactgggtga 7491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 20583 - 20421
Alignment:
Q  212 ttggtgagattgggaaaggg-gtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctcct-gtatcccttttgtaaagaac 308  Q
    |||||||||||||||||  | | |||||||||| ||||||  | ||||||||||  |||||||||||||||||||   | ||||| |||| |||| ||||    
T  20583 ttggtgagattgggaaaatgagcagaaattagg-tttgttttttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaac 20487  T
Q  309 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 376  Q
    || ||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  20486 tc-tttgatattggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggt 20421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0219 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0219
Description:

Target: scaffold0219; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 313 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 27510 - 27453
Alignment:
Q  313 ttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaa 370  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||| ||| |||||||||   ||||||||||    
T  27510 ttgatagtggattggagagatcaatctctcccccatagtaggtcattgttggaccgaa 27453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 1136 times since January 2019
Visitors: 4365