View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0692-Insertion-1 (Length: 770)

Name: NF0692-Insertion-1
Description: NF0692
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0692-Insertion-1
NF0692-Insertion-1
[»] chr2 (111 HSPs)
chr2 (214-770)||(27104523-27105080)
chr2 (214-770)||(19501983-19502542)
chr2 (205-770)||(19504318-19504885)
chr2 (239-750)||(42064264-42064776)
chr2 (206-770)||(24162195-24162752)
chr2 (298-770)||(13910017-13910491)
chr2 (239-750)||(21520687-21521201)
chr2 (239-750)||(6258811-6259321)
chr2 (239-750)||(40032047-40032553)
chr2 (317-750)||(22287330-22287764)
chr2 (330-750)||(43623574-43623982)
chr2 (409-750)||(42452702-42453041)
chr2 (409-750)||(45279978-45280321)
chr2 (409-770)||(23452209-23452577)
chr2 (330-750)||(6264142-6264560)
chr2 (410-750)||(19007560-19007901)
chr2 (450-746)||(35215584-35215881)
chr2 (450-746)||(35217961-35218258)
chr2 (409-750)||(42923503-42923847)
chr2 (239-562)||(22407592-22407915)
chr2 (410-750)||(28196557-28196896)
chr2 (410-750)||(11739553-11739895)
chr2 (410-750)||(17849037-17849378)
chr2 (410-750)||(17848365-17848701)
chr2 (413-750)||(3022086-3022433)
chr2 (420-750)||(34979571-34979904)
chr2 (410-748)||(31732772-31733100)
chr2 (410-750)||(14837193-14837529)
chr2 (410-750)||(44289061-44289403)
chr2 (411-654)||(15539566-15539809)
chr2 (540-750)||(5375340-5375550)
chr2 (450-718)||(45239003-45239271)
chr2 (563-748)||(36558860-36559047)
chr2 (563-748)||(36561137-36561324)
chr2 (361-750)||(18800307-18800686)
chr2 (410-716)||(11578136-11578439)
chr2 (563-746)||(45332179-45332364)
chr2 (409-749)||(22874061-22874391)
chr2 (410-585)||(22163109-22163282)
chr2 (411-747)||(20146604-20146941)
chr2 (607-750)||(22407448-22407592)
chr2 (450-585)||(38020162-38020296)
chr2 (206-392)||(36559173-36559358)
chr2 (409-747)||(17897242-17897578)
chr2 (616-741)||(7462950-7463077)
chr2 (409-543)||(5377631-5377769)
chr2 (206-344)||(36561539-36561677)
chr2 (500-750)||(28459184-28459435)
chr2 (206-353)||(45332528-45332675)
chr2 (409-747)||(37962938-37963263)
chr2 (300-746)||(35107110-35107553)
chr2 (626-750)||(22707745-22707872)
chr2 (660-750)||(22163016-22163106)
chr2 (546-747)||(40699429-40699634)
chr2 (214-323)||(43623968-43624077)
chr2 (567-752)||(17943540-17943725)
chr2 (625-750)||(23870951-23871077)
chr2 (357-481)||(12342673-12342798)
chr2 (411-504)||(38020064-38020157)
chr2 (564-679)||(20589763-20589881)
chr2 (309-392)||(36561450-36561532)
chr2 (564-746)||(2736205-2736388)
chr2 (564-752)||(20054757-20054947)
chr2 (466-679)||(43139356-43139564)
chr2 (680-744)||(14699036-14699100)
chr2 (533-632)||(38414194-38414291)
chr2 (398-453)||(45332384-45332439)
chr2 (258-323)||(6264546-6264611)
chr2 (500-674)||(27136195-27136368)
chr2 (567-752)||(27517631-27517818)
chr2 (682-751)||(1345572-1345641)
chr2 (564-746)||(17462436-17462619)
chr2 (564-746)||(39686983-39687166)
chr2 (680-744)||(8390179-8390243)
chr2 (680-744)||(13569332-13569396)
chr2 (700-744)||(17057369-17057413)
chr2 (700-744)||(17085352-17085396)
chr2 (680-744)||(20522224-20522288)
chr2 (409-453)||(36559067-36559111)
chr2 (409-453)||(36561344-36561388)
chr2 (309-344)||(36561518-36561553)
chr2 (443-505)||(38414281-38414337)
chr2 (697-751)||(2838076-2838130)
chr2 (564-752)||(20050013-20050204)
chr2 (564-625)||(22712637-22712698)
chr2 (564-625)||(22717346-22717407)
chr2 (564-625)||(28458949-28459011)
chr2 (380-438)||(28462593-28462651)
chr2 (564-625)||(39680045-39680106)
chr2 (564-625)||(45567409-45567470)
chr2 (717-750)||(15539523-15539556)
chr2 (369-453)||(20147040-20147125)
chr2 (564-623)||(26345677-26345738)
chr2 (679-744)||(34682362-34682427)
chr2 (700-744)||(723744-723788)
chr2 (564-718)||(2740941-2741095)
chr2 (680-744)||(8040064-8040128)
chr2 (680-744)||(10445473-10445537)
chr2 (680-744)||(28259206-28259270)
chr2 (700-744)||(34139770-34139814)
chr2 (609-645)||(38020311-38020347)
chr2 (700-744)||(39284960-39285004)
chr2 (679-746)||(45679838-45679906)
chr2 (701-744)||(11151591-11151634)
chr2 (567-625)||(12781342-12781400)
chr2 (548-625)||(17921754-17921833)
chr2 (567-625)||(17932637-17932695)
chr2 (679-718)||(33670994-33671033)
chr2 (361-440)||(45156922-45157001)
chr2 (352-438)||(35028440-35028527)
chr2 (466-507)||(41304627-41304667)
[»] chr4 (140 HSPs)
chr4 (208-770)||(51015042-51015606)
chr4 (239-750)||(22044385-22044897)
chr4 (214-770)||(37089344-37089906)
chr4 (206-750)||(38408993-38409543)
chr4 (243-770)||(31849571-31850101)
chr4 (206-750)||(11006231-11006781)
chr4 (214-750)||(24888598-24889135)
chr4 (208-750)||(22802728-22803270)
chr4 (206-750)||(11434769-11435293)
chr4 (206-770)||(9174118-9174684)
chr4 (206-750)||(36919578-36920125)
chr4 (293-750)||(22046680-22047135)
chr4 (203-750)||(36921487-36922036)
chr4 (258-750)||(5198266-5198759)
chr4 (239-750)||(9148087-9148591)
chr4 (239-747)||(48486146-48486655)
chr4 (206-770)||(9176446-9177035)
chr4 (237-750)||(40091409-40091923)
chr4 (206-685)||(5637524-5638006)
chr4 (330-750)||(22800856-22801276)
chr4 (206-750)||(7941133-7941662)
chr4 (260-749)||(24880299-24880790)
chr4 (259-749)||(24878836-24879328)
chr4 (206-750)||(18846923-18847491)
chr4 (206-687)||(3824627-3825112)
chr4 (409-770)||(8631391-8631759)
chr4 (332-750)||(47274647-47275064)
chr4 (263-770)||(11008540-11009075)
chr4 (409-770)||(2484845-2485209)
chr4 (409-750)||(40637071-40637413)
chr4 (386-747)||(16934140-16934502)
chr4 (409-746)||(44599836-44600174)
chr4 (409-750)||(24348211-24348557)
chr4 (386-747)||(16931786-16932148)
chr4 (260-747)||(619445-619932)
chr4 (409-770)||(47868398-47868762)
chr4 (409-750)||(6764836-6765183)
chr4 (409-770)||(14633317-14633679)
chr4 (409-747)||(22132389-22132735)
chr4 (450-747)||(18709161-18709458)
chr4 (409-750)||(17662239-17662574)
chr4 (450-770)||(22134590-22134909)
chr4 (411-750)||(33415482-33415821)
chr4 (410-750)||(38928171-38928513)
chr4 (409-767)||(14787406-14787769)
chr4 (410-750)||(12395839-12396180)
chr4 (450-746)||(22780371-22780668)
chr4 (450-746)||(22782736-22783033)
chr4 (410-750)||(12400801-12401142)
chr4 (409-747)||(36378289-36378629)
chr4 (410-750)||(19095880-19096222)
chr4 (409-740)||(47210756-47211082)
chr4 (411-750)||(37313059-37313400)
chr4 (485-770)||(26085949-26086236)
chr4 (409-750)||(16453306-16453649)
chr4 (311-662)||(52942542-52942881)
chr4 (409-750)||(53405124-53405472)
chr4 (420-750)||(19322705-19323034)
chr4 (411-740)||(56030443-56030770)
chr4 (414-747)||(41997494-41997828)
chr4 (316-747)||(8756247-8756679)
chr4 (410-747)||(18409344-18409681)
chr4 (488-750)||(36380425-36380689)
chr4 (411-724)||(13543953-13544272)
chr4 (410-747)||(18537470-18537806)
chr4 (607-770)||(5635448-5635614)
chr4 (607-750)||(11437558-11437701)
chr4 (410-640)||(3937314-3937543)
chr4 (529-752)||(16455358-16455583)
chr4 (410-747)||(18534828-18535164)
chr4 (589-750)||(4215483-4215645)
chr4 (410-630)||(6132871-6133090)
chr4 (561-750)||(2891439-2891631)
chr4 (561-747)||(13547302-13547490)
chr4 (492-747)||(38890221-38890476)
chr4 (495-750)||(27499128-27499381)
chr4 (206-353)||(16932213-16932360)
chr4 (410-574)||(38270158-38270321)
chr4 (204-353)||(22783170-22783319)
chr4 (204-348)||(16934572-16934716)
chr4 (410-574)||(24446756-24446914)
chr4 (409-548)||(5100994-5101133)
chr4 (206-353)||(22780805-22780952)
chr4 (411-747)||(28453686-28454020)
chr4 (410-527)||(2891314-2891432)
chr4 (564-747)||(16185831-16186018)
chr4 (410-747)||(12102088-12102425)
chr4 (613-750)||(5101130-5101267)
chr4 (409-734)||(15032557-15032872)
chr4 (420-747)||(9863716-9864049)
chr4 (500-750)||(30136640-30136889)
chr4 (466-721)||(9022362-9022616)
chr4 (699-767)||(14789405-14789473)
chr4 (660-750)||(47563010-47563100)
chr4 (386-703)||(40998990-40999306)
chr4 (239-323)||(22801262-22801346)
chr4 (660-750)||(49088819-49088910)
chr4 (547-747)||(31983524-31983727)
chr4 (551-718)||(3982202-3982374)
chr4 (371-752)||(25357595-25357984)
chr4 (564-718)||(7050284-7050439)
chr4 (564-762)||(11853549-11853749)
chr4 (680-744)||(10047383-10047447)
chr4 (466-738)||(10112927-10113198)
chr4 (632-707)||(24446678-24446754)
chr4 (680-744)||(39245998-39246062)
chr4 (548-747)||(47150889-47151092)
chr4 (679-750)||(6133105-6133176)
chr4 (650-747)||(26557823-26557922)
chr4 (567-752)||(8529270-8529457)
chr4 (567-752)||(15316961-15317147)
chr4 (409-482)||(16186099-16186173)
chr4 (567-752)||(18586969-18587156)
chr4 (239-289)||(22048492-22048542)
chr4 (564-625)||(55822265-55822326)
chr4 (705-750)||(52942482-52942527)
chr4 (680-744)||(5269220-5269284)
chr4 (680-743)||(36315258-36315321)
chr4 (680-743)||(36329467-36329530)
chr4 (702-748)||(3937270-3937316)
chr4 (567-752)||(4884877-4885064)
chr4 (567-752)||(31300427-31300613)
chr4 (680-744)||(5396700-5396764)
chr4 (700-744)||(5429803-5429847)
chr4 (700-744)||(12739550-12739594)
chr4 (421-481)||(16455296-16455356)
chr4 (700-744)||(26175636-26175680)
chr4 (700-744)||(36463389-36463433)
chr4 (680-744)||(38152468-38152532)
chr4 (700-744)||(48893638-48893682)
chr4 (692-744)||(54867188-54867239)
chr4 (650-747)||(3578668-3578766)
chr4 (567-625)||(4556180-4556238)
chr4 (567-625)||(4558314-4558372)
chr4 (680-743)||(6743444-6743507)
chr4 (604-635)||(38270120-38270151)
chr4 (695-744)||(5143263-5143312)
chr4 (299-348)||(16689331-16689380)
chr4 (721-750)||(24446648-24446677)
chr4 (239-303)||(52942910-52942974)
[»] chr1 (137 HSPs)
chr1 (206-770)||(51749778-51750346)
chr1 (206-750)||(20302198-20302743)
chr1 (206-770)||(13761577-13762143)
chr1 (206-770)||(51752104-51752670)
chr1 (239-770)||(28840451-28840986)
chr1 (239-770)||(28842266-28842801)
chr1 (206-770)||(10399802-10400369)
chr1 (239-750)||(15823319-15823831)
chr1 (206-750)||(6822775-6823299)
chr1 (239-750)||(13214854-13215371)
chr1 (234-662)||(6823651-6824088)
chr1 (263-749)||(41646717-41647204)
chr1 (386-746)||(16226087-16226448)
chr1 (239-750)||(3579613-3580126)
chr1 (409-770)||(31735495-31735863)
chr1 (333-750)||(38925477-38925892)
chr1 (258-750)||(39462310-39462804)
chr1 (410-770)||(2617460-2617823)
chr1 (409-750)||(27336936-27337280)
chr1 (399-750)||(20291390-20291741)
chr1 (313-750)||(28207064-28207500)
chr1 (409-750)||(27339127-27339472)
chr1 (458-750)||(46431702-46431996)
chr1 (331-750)||(14097965-14098385)
chr1 (409-750)||(24325599-24325948)
chr1 (386-746)||(47179629-47179993)
chr1 (409-747)||(9463243-9463588)
chr1 (450-770)||(15294808-15295131)
chr1 (409-747)||(9459416-9459761)
chr1 (412-770)||(39932017-39932381)
chr1 (409-750)||(47906207-47906555)
chr1 (386-746)||(47177278-47177642)
chr1 (409-750)||(17324632-17324974)
chr1 (412-708)||(21948226-21948526)
chr1 (326-742)||(47451508-47451919)
chr1 (410-750)||(50307542-50307884)
chr1 (409-750)||(12302501-12302848)
chr1 (410-750)||(18839531-18839873)
chr1 (409-750)||(2510321-2510666)
chr1 (409-750)||(6995696-6996038)
chr1 (409-750)||(28998249-28998591)
chr1 (409-750)||(29003965-29004307)
chr1 (409-750)||(16428596-16428939)
chr1 (410-750)||(17186123-17186465)
chr1 (410-750)||(50076668-50077009)
chr1 (410-750)||(50078816-50079158)
chr1 (411-750)||(25251270-25251611)
chr1 (410-750)||(11457471-11457812)
chr1 (411-750)||(18307054-18307394)
chr1 (409-750)||(2949228-2949569)
chr1 (450-750)||(4131371-4131676)
chr1 (409-750)||(9241081-9241424)
chr1 (450-750)||(25127856-25128158)
chr1 (431-750)||(31425011-31425335)
chr1 (409-750)||(6756470-6756813)
chr1 (410-750)||(50248566-50248909)
chr1 (409-687)||(48665114-48665400)
chr1 (410-750)||(31489859-31490197)
chr1 (409-750)||(31422856-31423212)
chr1 (411-750)||(17318838-17319172)
chr1 (561-770)||(51757625-51757837)
chr1 (410-752)||(17324009-17324351)
chr1 (459-750)||(40133937-40134230)
chr1 (359-747)||(42922126-42922514)
chr1 (8-205)||(50767533-50767747)
chr1 (533-746)||(16231630-16231843)
chr1 (563-747)||(23785935-23786121)
chr1 (410-747)||(14183589-14183923)
chr1 (607-750)||(23816027-23816171)
chr1 (457-750)||(16432396-16432681)
chr1 (409-718)||(8347300-8347607)
chr1 (561-750)||(16429051-16429243)
chr1 (259-745)||(30790401-30790882)
chr1 (409-718)||(15669421-15669729)
chr1 (533-750)||(25248547-25248766)
chr1 (409-747)||(18800570-18800907)
chr1 (411-747)||(8349049-8349385)
chr1 (214-404)||(16225895-16226083)
chr1 (409-750)||(49495206-49495537)
chr1 (206-404)||(47177078-47177274)
chr1 (206-348)||(47179428-47179570)
chr1 (386-506)||(16231521-16231641)
chr1 (564-747)||(6115101-6115287)
chr1 (206-344)||(23783238-23783376)
chr1 (205-311)||(20291279-20291386)
chr1 (670-770)||(13358778-13358880)
chr1 (411-505)||(25248756-25248850)
chr1 (331-418)||(49687405-49687492)
chr1 (544-747)||(16561544-16561751)
chr1 (567-752)||(21353340-21353525)
chr1 (428-747)||(13125455-13125775)
chr1 (386-747)||(27916417-27916780)
chr1 (234-323)||(16231369-16231458)
chr1 (638-747)||(15916562-15916674)
chr1 (548-747)||(26613237-26613440)
chr1 (420-654)||(26520206-26520445)
chr1 (548-708)||(155788-155950)
chr1 (309-392)||(23783362-23783444)
chr1 (567-752)||(2401213-2401400)
chr1 (564-747)||(30738625-30738815)
chr1 (206-296)||(47451405-47451495)
chr1 (548-625)||(14353047-14353126)
chr1 (692-744)||(13598402-13598454)
chr1 (680-744)||(16124545-16124609)
chr1 (680-744)||(37069774-37069838)
chr1 (680-744)||(47703965-47704029)
chr1 (443-482)||(6115344-6115383)
chr1 (681-744)||(19072932-19072995)
chr1 (681-744)||(19120822-19120885)
chr1 (409-448)||(23783494-23783533)
chr1 (386-481)||(26613503-26613601)
chr1 (681-744)||(47098854-47098917)
chr1 (564-625)||(2232597-2232658)
chr1 (564-752)||(4144675-4144865)
chr1 (660-747)||(13127685-13127774)
chr1 (720-770)||(13447247-13447299)
chr1 (412-453)||(15295142-15295183)
chr1 (679-744)||(21536597-21536662)
chr1 (695-744)||(26644941-26644990)
chr1 (680-741)||(29651818-29651879)
chr1 (700-744)||(834167-834211)
chr1 (680-744)||(9476265-9476329)
chr1 (700-744)||(13659336-13659380)
chr1 (680-744)||(27104401-27104465)
chr1 (700-744)||(28220226-28220270)
chr1 (700-744)||(28265554-28265598)
chr1 (489-687)||(28279292-28279489)
chr1 (567-625)||(9526469-9526527)
chr1 (420-515)||(13127862-13127955)
chr1 (567-625)||(25134074-25134132)
chr1 (608-752)||(46783189-46783336)
chr1 (681-744)||(47102871-47102934)
chr1 (239-305)||(49687334-49687400)
chr1 (695-741)||(3281715-3281761)
chr1 (239-288)||(38925915-38925965)
chr1 (702-744)||(45644354-45644396)
chr1 (299-348)||(13449947-13449996)
[»] chr5 (134 HSPs)
chr5 (239-750)||(38881878-38882390)
chr5 (214-750)||(4236378-4236913)
chr5 (206-750)||(2174680-2175203)
chr5 (239-750)||(16775930-16776442)
chr5 (205-770)||(25921445-25921993)
chr5 (239-750)||(21947803-21948311)
chr5 (206-747)||(31544798-31545362)
chr5 (297-770)||(21684424-21684909)
chr5 (386-747)||(31542655-31543016)
chr5 (350-750)||(2818329-2818731)
chr5 (409-770)||(31179345-31179707)
chr5 (409-770)||(10529070-10529435)
chr5 (409-750)||(39854427-39854768)
chr5 (331-750)||(6756359-6756777)
chr5 (411-770)||(18466625-18466991)
chr5 (450-770)||(34477025-34477349)
chr5 (450-770)||(34479390-34479714)
chr5 (409-770)||(27912473-27912843)
chr5 (331-750)||(36402322-36402741)
chr5 (450-750)||(6745053-6745353)
chr5 (409-750)||(26097676-26098016)
chr5 (420-750)||(18511206-18511539)
chr5 (450-750)||(25804009-25804309)
chr5 (409-750)||(27910388-27910735)
chr5 (409-750)||(6747247-6747589)
chr5 (409-750)||(18468950-18469294)
chr5 (409-747)||(40221465-40221805)
chr5 (450-747)||(15552229-15552527)
chr5 (410-747)||(25904047-25904385)
chr5 (410-750)||(1189601-1189949)
chr5 (410-750)||(17072827-17073169)
chr5 (334-750)||(31465983-31466389)
chr5 (412-750)||(18509312-18509652)
chr5 (331-750)||(12555917-12556337)
chr5 (410-750)||(24126800-24127141)
chr5 (413-750)||(10474317-10474655)
chr5 (420-750)||(17818486-17818814)
chr5 (409-750)||(18596590-18596931)
chr5 (450-750)||(16092193-16092495)
chr5 (410-750)||(31472606-31472948)
chr5 (420-750)||(2954370-2954701)
chr5 (409-750)||(10586782-10587117)
chr5 (409-751)||(37705773-37706116)
chr5 (410-747)||(695833-696160)
chr5 (488-750)||(658350-658610)
chr5 (410-750)||(39397987-39398327)
chr5 (533-750)||(4410090-4410307)
chr5 (239-542)||(20507665-20507968)
chr5 (410-624)||(20042994-20043208)
chr5 (410-697)||(34530712-34531001)
chr5 (563-750)||(10749796-10749985)
chr5 (545-750)||(20505837-20506041)
chr5 (420-750)||(21288718-21289046)
chr5 (410-628)||(20044954-20045172)
chr5 (542-750)||(39798123-39798332)
chr5 (563-750)||(10757273-10757461)
chr5 (563-747)||(38960129-38960314)
chr5 (415-747)||(6661181-6661512)
chr5 (563-748)||(15354571-15354757)
chr5 (563-748)||(23665140-23665326)
chr5 (563-748)||(23793261-23793447)
chr5 (533-750)||(41585738-41585956)
chr5 (563-747)||(3373134-3373320)
chr5 (563-748)||(15356847-15357033)
chr5 (206-401)||(34477438-34477632)
chr5 (409-601)||(26098395-26098587)
chr5 (206-436)||(39797849-39798058)
chr5 (607-748)||(23741855-23741995)
chr5 (529-750)||(2723965-2724178)
chr5 (206-392)||(31542442-31542628)
chr5 (410-763)||(36208524-36208874)
chr5 (206-392)||(10749505-10749690)
chr5 (206-392)||(10756960-10757145)
chr5 (206-392)||(15354880-15355065)
chr5 (206-392)||(15357156-15357341)
chr5 (206-323)||(34479855-34479972)
chr5 (409-506)||(4410000-4410101)
chr5 (205-392)||(23664833-23665019)
chr5 (205-392)||(23793568-23793754)
chr5 (206-392)||(23667109-23667294)
chr5 (466-712)||(17413198-17413441)
chr5 (453-750)||(20053834-20054122)
chr5 (411-750)||(9020167-9020505)
chr5 (263-353)||(31179807-31179897)
chr5 (563-748)||(23667415-23667601)
chr5 (239-323)||(659746-659829)
chr5 (206-323)||(38960487-38960604)
chr5 (660-750)||(26098282-26098373)
chr5 (261-341)||(659850-659929)
chr5 (604-680)||(42770948-42771025)
chr5 (409-505)||(41585946-41586042)
chr5 (567-752)||(22672837-22673024)
chr5 (567-747)||(4897828-4898013)
chr5 (204-304)||(18186489-18186589)
chr5 (562-747)||(15143560-15143750)
chr5 (567-752)||(25452498-25452685)
chr5 (564-746)||(1170811-1170994)
chr5 (466-707)||(2144599-2144840)
chr5 (239-323)||(2818729-2818813)
chr5 (409-454)||(3373332-3373377)
chr5 (697-750)||(20043222-20043275)
chr5 (409-453)||(23665081-23665125)
chr5 (409-453)||(23793462-23793506)
chr5 (569-752)||(25445501-25445686)
chr5 (564-746)||(35385450-35385634)
chr5 (564-625)||(2298122-2298183)
chr5 (409-634)||(42770717-42770934)
chr5 (409-450)||(15354777-15354818)
chr5 (409-450)||(15357053-15357094)
chr5 (680-744)||(9353361-9353425)
chr5 (239-342)||(20504316-20504419)
chr5 (206-270)||(21684905-21684969)
chr5 (409-453)||(23667356-23667400)
chr5 (409-453)||(23742057-23742101)
chr5 (680-744)||(36932379-36932443)
chr5 (409-453)||(38960334-38960378)
chr5 (681-744)||(28832263-28832326)
chr5 (206-311)||(31466391-31466496)
chr5 (409-447)||(10757207-10757245)
chr5 (679-752)||(17841241-17841315)
chr5 (679-744)||(11917000-11917065)
chr5 (695-744)||(17004004-17004053)
chr5 (680-744)||(10281755-10281819)
chr5 (680-744)||(15464536-15464600)
chr5 (700-744)||(19806487-19806531)
chr5 (386-438)||(29748261-29748313)
chr5 (700-744)||(32636948-32636992)
chr5 (386-438)||(34477379-34477431)
chr5 (567-625)||(11962554-11962612)
chr5 (206-304)||(36402747-36402845)
chr5 (409-446)||(10749730-10749767)
chr5 (699-744)||(31300644-31300689)
chr5 (299-348)||(39854317-39854366)
chr5 (299-348)||(42238047-42238096)
[»] chr6 (101 HSPs)
chr6 (206-770)||(14507148-14507716)
chr6 (214-750)||(11983023-11983558)
chr6 (239-750)||(9019735-9020246)
chr6 (239-639)||(19227514-19227915)
chr6 (409-770)||(28241293-28241657)
chr6 (420-770)||(14458739-14459090)
chr6 (239-701)||(15530166-15530628)
chr6 (289-750)||(30728818-30729284)
chr6 (289-750)||(15541134-15541596)
chr6 (450-770)||(4816203-4816526)
chr6 (409-750)||(1230243-1230585)
chr6 (386-770)||(20915329-20915717)
chr6 (409-770)||(30967176-30967543)
chr6 (409-744)||(12195515-12195851)
chr6 (409-750)||(30034597-30034943)
chr6 (331-749)||(32279897-32280316)
chr6 (289-750)||(15532676-15533137)
chr6 (415-770)||(19704539-19704905)
chr6 (409-770)||(2628858-2629226)
chr6 (450-747)||(26065005-26065298)
chr6 (450-747)||(26084974-26085267)
chr6 (410-750)||(13057173-13057515)
chr6 (239-527)||(8995288-8995575)
chr6 (409-750)||(3390357-3390700)
chr6 (410-750)||(25477253-25477602)
chr6 (409-747)||(26932559-26932906)
chr6 (410-750)||(3629859-3630199)
chr6 (410-750)||(13039733-13040075)
chr6 (412-750)||(3631933-3632271)
chr6 (410-735)||(3233739-3234065)
chr6 (410-746)||(24338446-24338783)
chr6 (331-554)||(1072068-1072291)
chr6 (530-747)||(5273213-5273431)
chr6 (410-747)||(12161555-12161889)
chr6 (563-748)||(29754705-29754892)
chr6 (563-747)||(26066121-26066307)
chr6 (409-747)||(3027848-3028186)
chr6 (563-747)||(33308988-33309173)
chr6 (563-747)||(26068392-26068578)
chr6 (563-747)||(33311257-33311442)
chr6 (410-679)||(22490618-22490889)
chr6 (561-767)||(1069694-1069904)
chr6 (443-747)||(15719666-15719961)
chr6 (371-747)||(16455421-16455798)
chr6 (206-353)||(26068735-26068882)
chr6 (206-392)||(33308685-33308870)
chr6 (206-392)||(33310954-33311139)
chr6 (410-749)||(14466312-14466643)
chr6 (410-554)||(32447506-32447651)
chr6 (206-353)||(26066464-26066611)
chr6 (206-392)||(29755094-29755279)
chr6 (386-747)||(12186068-12186429)
chr6 (529-747)||(15367132-15367349)
chr6 (409-539)||(17852520-17852650)
chr6 (263-401)||(4816612-4816749)
chr6 (420-559)||(13870608-13870746)
chr6 (420-747)||(17012033-17012358)
chr6 (410-747)||(19696420-19696759)
chr6 (607-747)||(15346523-15346664)
chr6 (548-747)||(22857949-22858152)
chr6 (626-747)||(25465587-25465710)
chr6 (561-747)||(26945272-26945463)
chr6 (662-747)||(10584227-10584313)
chr6 (307-405)||(24192635-24192733)
chr6 (410-522)||(10584105-10584212)
chr6 (387-481)||(15346347-15346441)
chr6 (307-405)||(24191538-24191636)
chr6 (386-454)||(26066319-26066387)
chr6 (386-454)||(26068590-26068658)
chr6 (656-718)||(12911472-12911535)
chr6 (564-746)||(13878727-13878910)
chr6 (564-746)||(13883475-13883658)
chr6 (564-746)||(16785919-16786102)
chr6 (561-747)||(28037722-28037916)
chr6 (409-458)||(29754983-29755032)
chr6 (680-744)||(5757507-5757571)
chr6 (680-744)||(10077194-10077258)
chr6 (567-752)||(17694844-17695030)
chr6 (564-705)||(20526937-20527081)
chr6 (630-747)||(28078191-28078310)
chr6 (656-718)||(12937220-12937282)
chr6 (567-625)||(22351973-22352031)
chr6 (606-718)||(30445698-30445813)
chr6 (681-744)||(31979517-31979580)
chr6 (564-625)||(26887345-26887406)
chr6 (695-752)||(30443553-30443611)
chr6 (564-625)||(31248835-31248896)
chr6 (564-625)||(35201447-35201508)
chr6 (567-623)||(19701985-19702041)
chr6 (299-348)||(26084818-26084867)
chr6 (386-438)||(4816552-4816604)
chr6 (680-744)||(5572270-5572334)
chr6 (680-744)||(21356040-21356104)
chr6 (700-744)||(33211185-33211229)
chr6 (679-746)||(35201325-35201393)
chr6 (564-625)||(3577636-3577696)
chr6 (567-625)||(17036058-17036116)
chr6 (681-744)||(31936591-31936654)
chr6 (409-443)||(33308932-33308966)
chr6 (409-443)||(33311201-33311235)
chr6 (681-738)||(24436001-24436058)
[»] chr3 (173 HSPs)
chr3 (207-770)||(5191374-5191938)
chr3 (206-750)||(22114297-22114842)
chr3 (206-750)||(18099162-18099707)
chr3 (308-750)||(3859350-3859792)
chr3 (265-770)||(10955997-10956505)
chr3 (239-770)||(5522597-5523119)
chr3 (239-750)||(11170178-11170669)
chr3 (299-770)||(10958293-10958767)
chr3 (239-770)||(26720301-26720834)
chr3 (206-750)||(18096892-18097422)
chr3 (205-744)||(32264035-32264581)
chr3 (299-750)||(45882752-45883205)
chr3 (329-770)||(10084359-10084807)
chr3 (329-770)||(10191282-10191727)
chr3 (205-770)||(38889756-38890327)
chr3 (409-750)||(4308273-4308615)
chr3 (409-770)||(4103866-4104233)
chr3 (409-750)||(43228214-43228556)
chr3 (409-770)||(51726977-51727340)
chr3 (329-747)||(6065791-6066210)
chr3 (409-752)||(43226009-43226352)
chr3 (331-750)||(24979552-24979973)
chr3 (386-747)||(6063441-6063805)
chr3 (330-747)||(18162508-18162925)
chr3 (450-750)||(25533406-25533707)
chr3 (386-746)||(50493899-50494260)
chr3 (206-645)||(35777163-35777581)
chr3 (409-750)||(1313333-1313674)
chr3 (450-750)||(9604599-9604899)
chr3 (450-750)||(42990268-42990569)
chr3 (409-747)||(746674-747019)
chr3 (331-750)||(48361663-48362082)
chr3 (462-747)||(25388882-25389167)
chr3 (409-746)||(458203-458545)
chr3 (450-750)||(30005805-30006106)
chr3 (409-746)||(455826-456168)
chr3 (410-750)||(43423455-43423796)
chr3 (409-750)||(53917656-53917998)
chr3 (371-750)||(12267967-12268338)
chr3 (450-747)||(10621525-10621823)
chr3 (373-767)||(15780747-15781162)
chr3 (410-750)||(1626675-1627016)
chr3 (409-750)||(27101173-27101519)
chr3 (490-770)||(1321483-1321766)
chr3 (411-750)||(43421407-43421747)
chr3 (386-746)||(38210268-38210631)
chr3 (410-750)||(3314608-3314950)
chr3 (409-750)||(53915488-53915830)
chr3 (410-750)||(28101994-28102335)
chr3 (409-749)||(51943294-51943634)
chr3 (410-750)||(5926756-5927097)
chr3 (239-555)||(11162924-11163219)
chr3 (410-750)||(880443-880785)
chr3 (476-747)||(28413027-28413299)
chr3 (508-750)||(7606580-7606822)
chr3 (332-750)||(32218941-32219350)
chr3 (420-701)||(6561744-6562028)
chr3 (409-742)||(35917944-35918283)
chr3 (410-750)||(36011751-36012092)
chr3 (450-747)||(47148890-47149188)
chr3 (410-750)||(53468445-53468788)
chr3 (359-750)||(28761419-28761813)
chr3 (450-706)||(29956650-29956907)
chr3 (239-486)||(1321194-1321441)
chr3 (411-750)||(51674758-51675087)
chr3 (409-750)||(39715393-39715730)
chr3 (409-747)||(42992205-42992532)
chr3 (410-764)||(54691551-54691906)
chr3 (410-736)||(889779-890104)
chr3 (409-750)||(23633383-23633718)
chr3 (562-750)||(5886274-5886463)
chr3 (562-750)||(5899747-5899936)
chr3 (410-641)||(28100143-28100374)
chr3 (499-750)||(6484372-6484625)
chr3 (537-750)||(25688152-25688367)
chr3 (239-585)||(24177032-24177374)
chr3 (561-750)||(11168175-11168366)
chr3 (410-744)||(53591119-53591442)
chr3 (410-749)||(31151271-31151609)
chr3 (410-641)||(28180948-28181177)
chr3 (206-405)||(6063808-6064006)
chr3 (449-750)||(4666488-4666779)
chr3 (409-738)||(13420189-13420506)
chr3 (410-687)||(54884081-54884357)
chr3 (534-750)||(6231849-6232065)
chr3 (223-405)||(5899476-5899657)
chr3 (609-750)||(27635650-27635792)
chr3 (409-738)||(53597164-53597491)
chr3 (493-749)||(17795269-17795523)
chr3 (493-749)||(19103709-19103963)
chr3 (411-662)||(23636952-23637199)
chr3 (457-747)||(561769-562058)
chr3 (205-353)||(50493675-50493823)
chr3 (410-634)||(28137415-28137628)
chr3 (206-353)||(38210067-38210214)
chr3 (458-747)||(36871295-36871583)
chr3 (613-750)||(47701663-47701801)
chr3 (222-335)||(10192401-10192513)
chr3 (411-540)||(27635830-27635959)
chr3 (206-347)||(53896613-53896754)
chr3 (206-405)||(5885983-5886182)
chr3 (451-579)||(41849117-41849244)
chr3 (493-747)||(25635391-25635644)
chr3 (410-540)||(47701798-47701928)
chr3 (263-405)||(25388654-25388795)
chr3 (222-335)||(10085481-10085593)
chr3 (411-539)||(6231374-6231502)
chr3 (669-750)||(41849243-41849324)
chr3 (565-750)||(3306839-3307025)
chr3 (411-527)||(3306724-3306840)
chr3 (678-750)||(35919107-35919179)
chr3 (607-747)||(24181501-24181644)
chr3 (206-323)||(6719532-6719651)
chr3 (678-748)||(53894051-53894121)
chr3 (409-654)||(1673898-1674140)
chr3 (206-289)||(7606880-7606963)
chr3 (567-752)||(29913947-29914132)
chr3 (386-464)||(53896475-53896553)
chr3 (564-718)||(1620485-1620642)
chr3 (409-506)||(4560502-4560599)
chr3 (629-747)||(25634030-25634150)
chr3 (564-762)||(10094056-10094256)
chr3 (564-718)||(5858546-5858699)
chr3 (386-458)||(6719396-6719468)
chr3 (264-323)||(6066195-6066254)
chr3 (330-405)||(6719471-6719546)
chr3 (465-714)||(13419864-13420110)
chr3 (564-762)||(10100073-10100273)
chr3 (564-762)||(10200936-10201136)
chr3 (567-752)||(10897008-10897195)
chr3 (567-752)||(47878163-47878350)
chr3 (680-744)||(1736324-1736388)
chr3 (680-744)||(18552902-18552966)
chr3 (680-744)||(30709809-30709873)
chr3 (548-680)||(14634504-14634638)
chr3 (564-762)||(10207982-10208182)
chr3 (530-626)||(4560401-4560497)
chr3 (680-744)||(8370505-8370569)
chr3 (700-744)||(9666466-9666510)
chr3 (380-440)||(13893287-13893347)
chr3 (630-760)||(15823631-15823763)
chr3 (680-744)||(21711227-21711291)
chr3 (680-744)||(27974971-27975035)
chr3 (680-744)||(27986465-27986529)
chr3 (567-746)||(54193229-54193410)
chr3 (681-744)||(1417510-1417573)
chr3 (204-254)||(3859315-3859365)
chr3 (397-443)||(5886196-5886242)
chr3 (567-752)||(10595026-10595213)
chr3 (564-625)||(16462203-16462264)
chr3 (564-625)||(22626105-22626166)
chr3 (564-625)||(47883003-47883064)
chr3 (386-443)||(5899660-5899717)
chr3 (409-474)||(6484308-6484373)
chr3 (361-438)||(46966940-46967017)
chr3 (680-741)||(48438221-48438282)
chr3 (564-718)||(6303310-6303464)
chr3 (680-744)||(16264354-16264418)
chr3 (700-744)||(16499153-16499197)
chr3 (386-438)||(25388798-25388850)
chr3 (680-744)||(32143325-32143389)
chr3 (680-744)||(33386685-33386749)
chr3 (700-744)||(40913417-40913461)
chr3 (706-750)||(42992607-42992651)
chr3 (700-744)||(44331669-44331713)
chr3 (700-751)||(30236249-30236300)
chr3 (681-744)||(37466295-37466358)
chr3 (409-482)||(1618916-1618992)
chr3 (299-348)||(4308676-4308725)
chr3 (493-585)||(25633930-25634018)
chr3 (695-744)||(25795785-25795834)
chr3 (691-744)||(26298992-26299045)
chr3 (548-585)||(31021304-31021341)
[»] chr8 (94 HSPs)
chr8 (239-770)||(27829126-27829659)
chr8 (239-770)||(27826815-27827348)
chr8 (214-750)||(14807556-14808102)
chr8 (214-750)||(15067785-15068322)
chr8 (206-747)||(15072506-15073049)
chr8 (206-770)||(44720617-44721206)
chr8 (206-770)||(18810483-18811070)
chr8 (309-750)||(28251561-28252002)
chr8 (330-770)||(4423938-4424381)
chr8 (206-770)||(18812668-18813244)
chr8 (409-750)||(3874005-3874351)
chr8 (409-770)||(15809214-15809581)
chr8 (409-770)||(32339304-32339672)
chr8 (420-770)||(608736-609098)
chr8 (409-770)||(22684625-22685002)
chr8 (409-770)||(28283193-28283561)
chr8 (359-750)||(14419184-14419578)
chr8 (410-747)||(27106894-27107232)
chr8 (458-747)||(43079650-43079940)
chr8 (450-747)||(43082013-43082311)
chr8 (239-521)||(12517248-12517532)
chr8 (410-750)||(30480497-30480838)
chr8 (409-747)||(24873178-24873523)
chr8 (362-750)||(13858478-13858868)
chr8 (409-750)||(27911014-27911354)
chr8 (409-750)||(27957433-27957773)
chr8 (409-750)||(1225165-1225508)
chr8 (409-770)||(43530123-43530478)
chr8 (409-750)||(41384744-41385085)
chr8 (410-750)||(25952521-25952862)
chr8 (411-749)||(36865538-36865877)
chr8 (409-750)||(41382672-41383003)
chr8 (410-654)||(14477276-14477520)
chr8 (410-747)||(5372173-5372512)
chr8 (410-750)||(33541404-33541723)
chr8 (409-750)||(15185708-15186046)
chr8 (330-510)||(3886153-3886336)
chr8 (410-747)||(21482322-21482649)
chr8 (409-585)||(26775200-26775375)
chr8 (443-752)||(3005622-3005929)
chr8 (500-750)||(15956051-15956299)
chr8 (443-738)||(21480547-21480832)
chr8 (409-747)||(31162212-31162551)
chr8 (366-601)||(5622882-5623117)
chr8 (206-353)||(43079347-43079494)
chr8 (206-345)||(43081722-43081861)
chr8 (332-482)||(2468361-2468511)
chr8 (410-574)||(35872555-35872713)
chr8 (545-747)||(31035252-31035459)
chr8 (533-709)||(181622-181799)
chr8 (409-505)||(181536-181632)
chr8 (616-747)||(2468126-2468259)
chr8 (443-562)||(37214374-37214512)
chr8 (239-324)||(28252008-28252093)
chr8 (371-583)||(31035029-31035238)
chr8 (548-747)||(31578273-31578476)
chr8 (694-750)||(37214258-37214314)
chr8 (234-315)||(3886330-3886412)
chr8 (239-323)||(4423868-4423952)
chr8 (650-747)||(6376229-6376328)
chr8 (564-752)||(9021099-9021289)
chr8 (564-746)||(16757266-16757449)
chr8 (632-707)||(35872477-35872553)
chr8 (548-676)||(31573794-31573924)
chr8 (564-746)||(4812486-4812669)
chr8 (564-746)||(28327908-28328091)
chr8 (567-752)||(590797-590984)
chr8 (680-744)||(4696625-4696689)
chr8 (680-744)||(9765848-9765912)
chr8 (366-438)||(17847484-17847556)
chr8 (680-744)||(26403259-26403323)
chr8 (700-751)||(10930192-10930243)
chr8 (564-625)||(16752643-16752704)
chr8 (563-718)||(17847677-17847828)
chr8 (564-625)||(28895502-28895563)
chr8 (564-752)||(17799416-17799606)
chr8 (680-744)||(7412345-7412409)
chr8 (700-744)||(15212910-15212954)
chr8 (680-744)||(23799606-23799670)
chr8 (679-746)||(25684758-25684826)
chr8 (700-744)||(27811402-27811446)
chr8 (679-746)||(28890881-28890949)
chr8 (680-744)||(31071258-31071322)
chr8 (700-744)||(33352274-33352318)
chr8 (700-744)||(40321204-40321248)
chr8 (700-743)||(4733830-4733873)
chr8 (681-744)||(19752424-19752487)
chr8 (567-718)||(29554812-29554964)
chr8 (567-625)||(33032657-33032715)
chr8 (564-625)||(28332631-28332692)
chr8 (691-744)||(5702523-5702576)
chr8 (706-750)||(14477547-14477592)
chr8 (721-750)||(35872447-35872476)
chr8 (700-741)||(40221869-40221910)
[»] scaffold0250 (1 HSPs)
scaffold0250 (247-745)||(2670-3168)
[»] chr7 (136 HSPs)
chr7 (206-770)||(3878322-3878894)
chr7 (205-752)||(27306222-27306768)
chr7 (243-770)||(25542317-25542845)
chr7 (239-770)||(35412-35946)
chr7 (239-770)||(44347-44881)
chr7 (330-770)||(1049267-1049710)
chr7 (206-750)||(40836737-40837261)
chr7 (239-750)||(31435040-31435553)
chr7 (409-770)||(38393935-38394303)
chr7 (412-750)||(7470016-7470359)
chr7 (450-770)||(1046896-1047219)
chr7 (410-750)||(44724533-44724874)
chr7 (409-770)||(48457602-48457970)
chr7 (386-747)||(31155908-31156271)
chr7 (412-750)||(7471974-7472317)
chr7 (409-750)||(3035670-3036019)
chr7 (420-750)||(20625998-20626333)
chr7 (420-750)||(20629889-20630224)
chr7 (420-750)||(20642308-20642643)
chr7 (409-750)||(40946277-40946623)
chr7 (450-770)||(1849975-1850298)
chr7 (409-750)||(20299407-20299755)
chr7 (409-770)||(18345490-18345858)
chr7 (410-750)||(11355212-11355553)
chr7 (409-750)||(13099468-13099812)
chr7 (206-645)||(26804345-26804761)
chr7 (409-750)||(42330991-42331335)
chr7 (409-770)||(43253489-43253860)
chr7 (450-747)||(7351649-7351947)
chr7 (409-750)||(20297311-20297657)
chr7 (450-750)||(28487547-28487848)
chr7 (409-732)||(7349285-7349615)
chr7 (410-750)||(20137103-20137444)
chr7 (411-750)||(21990106-21990445)
chr7 (409-770)||(28485515-28485882)
chr7 (409-750)||(443548-443891)
chr7 (410-750)||(4295928-4296271)
chr7 (410-752)||(21678020-21678363)
chr7 (410-735)||(21679981-21680307)
chr7 (411-750)||(37412119-37412462)
chr7 (410-750)||(24748548-24748890)
chr7 (239-575)||(18567396-18567731)
chr7 (443-750)||(21592137-21592445)
chr7 (409-689)||(11757177-11757464)
chr7 (410-747)||(9680768-9681112)
chr7 (410-687)||(25276095-25276374)
chr7 (410-750)||(39145980-39146322)
chr7 (410-767)||(42223110-42223471)
chr7 (411-750)||(9679009-9679354)
chr7 (410-752)||(27832629-27832969)
chr7 (431-732)||(24258438-24258744)
chr7 (534-770)||(38396713-38396951)
chr7 (529-770)||(7092185-7092428)
chr7 (394-687)||(22251602-22251893)
chr7 (409-704)||(22828672-22828969)
chr7 (535-770)||(7094432-7094670)
chr7 (563-747)||(2935374-2935560)
chr7 (359-747)||(7188445-7188833)
chr7 (420-734)||(24817362-24817674)
chr7 (563-748)||(22108173-22108359)
chr7 (563-748)||(40549933-40550119)
chr7 (563-747)||(9027191-9027376)
chr7 (409-711)||(20091580-20091877)
chr7 (563-748)||(22137184-22137370)
chr7 (563-748)||(40552211-40552397)
chr7 (563-747)||(1606486-1606671)
chr7 (485-747)||(24813494-24813755)
chr7 (302-601)||(22392319-22392606)
chr7 (206-353)||(1047356-1047503)
chr7 (206-392)||(9027502-9027687)
chr7 (206-353)||(2935070-2935217)
chr7 (206-392)||(22136878-22137063)
chr7 (206-392)||(40551905-40552090)
chr7 (206-392)||(22107867-22108052)
chr7 (206-392)||(40549627-40549812)
chr7 (607-752)||(26295598-26295745)
chr7 (610-750)||(22393876-22394018)
chr7 (411-747)||(24465503-24465829)
chr7 (456-517)||(38396316-38396377)
chr7 (420-505)||(7094662-7094751)
chr7 (564-752)||(25351353-25351541)
chr7 (607-718)||(6046644-6046757)
chr7 (412-505)||(7092414-7092512)
chr7 (564-747)||(6332326-6332514)
chr7 (692-750)||(11759364-11759422)
chr7 (604-679)||(6348930-6349006)
chr7 (239-320)||(1049699-1049780)
chr7 (564-752)||(25357047-25357235)
chr7 (409-458)||(1606423-1606472)
chr7 (564-752)||(2120899-2121089)
chr7 (466-679)||(6048885-6049094)
chr7 (564-752)||(25410130-25410320)
chr7 (466-747)||(11081522-11081803)
chr7 (564-746)||(3320049-3320232)
chr7 (564-746)||(3324797-3324980)
chr7 (564-746)||(25405393-25405576)
chr7 (409-453)||(22108114-22108158)
chr7 (409-453)||(22137125-22137169)
chr7 (409-453)||(40549874-40549918)
chr7 (409-453)||(40552152-40552196)
chr7 (681-744)||(9190038-9190101)
chr7 (681-744)||(20284093-20284156)
chr7 (293-436)||(42006404-42006545)
chr7 (564-746)||(7069780-7069963)
chr7 (636-747)||(13290470-13290583)
chr7 (564-624)||(16297146-16297207)
chr7 (680-744)||(4796696-4796760)
chr7 (564-718)||(7074787-7074941)
chr7 (409-453)||(9027396-9027440)
chr7 (680-744)||(21983288-21983352)
chr7 (680-744)||(46516339-46516403)
chr7 (681-744)||(2580394-2580457)
chr7 (409-452)||(2935306-2935349)
chr7 (411-478)||(3677235-3677301)
chr7 (681-744)||(9185195-9185258)
chr7 (707-750)||(26804762-26804805)
chr7 (361-436)||(45366451-45366526)
chr7 (564-625)||(42006663-42006724)
chr7 (409-516)||(30906280-30906386)
chr7 (680-744)||(2647725-2647789)
chr7 (410-625)||(26210500-26210710)
chr7 (700-744)||(27347941-27347985)
chr7 (680-744)||(29159807-29159871)
chr7 (700-744)||(41317434-41317478)
chr7 (420-541)||(6348782-6348903)
chr7 (564-746)||(8378502-8378686)
chr7 (681-744)||(28617255-28617318)
chr7 (567-625)||(30246973-30247031)
chr7 (681-744)||(33332480-33332543)
chr7 (567-625)||(44512646-44512704)
chr7 (564-625)||(15541116-15541177)
chr7 (564-601)||(21369642-21369680)
chr7 (680-741)||(55955-56015)
chr7 (691-744)||(35960820-35960873)
chr7 (561-656)||(40281466-40281563)
chr7 (299-348)||(40946167-40946216)
[»] scaffold0025 (3 HSPs)
scaffold0025 (214-770)||(69264-69825)
scaffold0025 (214-561)||(73207-73536)
scaffold0025 (524-573)||(73160-73208)
[»] scaffold0131 (2 HSPs)
scaffold0131 (207-752)||(14768-15315)
scaffold0131 (422-752)||(14374-14707)
[»] scaffold0068 (2 HSPs)
scaffold0068 (297-770)||(29001-29486)
scaffold0068 (206-270)||(28941-29005)
[»] scaffold0472 (1 HSPs)
scaffold0472 (206-747)||(5927-6490)
[»] scaffold0339 (1 HSPs)
scaffold0339 (332-750)||(3872-4289)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (409-770)||(41455-41819)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (412-747)||(79140-79476)
[»] scaffold0005 (3 HSPs)
scaffold0005 (409-770)||(183613-183975)
scaffold0005 (409-767)||(51961-52324)
scaffold0005 (699-767)||(50257-50325)
[»] scaffold0154 (1 HSPs)
scaffold0154 (409-750)||(11467-11809)
[»] scaffold0267 (1 HSPs)
scaffold0267 (450-747)||(34-332)
[»] scaffold0370 (1 HSPs)
scaffold0370 (524-770)||(1425-1673)
[»] scaffold0511 (1 HSPs)
scaffold0511 (409-708)||(1988-2293)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (410-750)||(79812-80153)
scaffold0004 (564-625)||(188363-188424)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (410-750)||(85184-85525)
[»] scaffold0224 (1 HSPs)
scaffold0224 (359-747)||(15817-16205)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (410-637)||(35593-35819)
scaffold0011 (679-747)||(35817-35885)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (411-747)||(16646-16981)
[»] scaffold0140 (7 HSPs)
scaffold0140 (563-748)||(22221-22407)
scaffold0140 (563-748)||(24496-24682)
scaffold0140 (206-392)||(21915-22100)
scaffold0140 (206-392)||(24190-24375)
scaffold0140 (680-744)||(8448-8512)
scaffold0140 (409-453)||(22162-22206)
scaffold0140 (409-453)||(24437-24481)
[»] scaffold0468 (1 HSPs)
scaffold0468 (420-747)||(1638-1957)
[»] scaffold0127 (1 HSPs)
scaffold0127 (206-353)||(12907-13054)
[»] scaffold0552 (1 HSPs)
scaffold0552 (409-522)||(1054-1167)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (420-738)||(4777-5095)
[»] scaffold0891 (1 HSPs)
scaffold0891 (691-748)||(4675-4732)
[»] scaffold0209 (1 HSPs)
scaffold0209 (679-752)||(16978-17052)
[»] scaffold1674 (1 HSPs)
scaffold1674 (710-750)||(1445-1485)
[»] scaffold0256 (1 HSPs)
scaffold0256 (567-746)||(16328-16509)
[»] scaffold0006 (4 HSPs)
scaffold0006 (692-744)||(5687-5739)
scaffold0006 (564-625)||(224819-224880)
scaffold0006 (680-744)||(2496-2560)
scaffold0006 (700-744)||(149097-149141)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (635-718)||(57454-57539)
[»] scaffold1050 (1 HSPs)
scaffold1050 (679-746)||(3068-3136)
[»] scaffold0087 (1 HSPs)
scaffold0087 (680-744)||(43990-44054)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (700-744)||(20415-20459)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 413; Significance: 0; HSPs: 111)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 413; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 214 - 770
Target Start/End: Original strand, 27104523 - 27105080
Alignment:
Q  214 ttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgt 313  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27104523 ttaacttaaaatcagatttctgcagaatcgtggcacgattgaagggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgt 27104622  T
Q  314 ggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttt 413  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27104623 ggcacgatgggatcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcagggaaaaacataaacatatttttgagtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttt 27104722  T
Q  414 tactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagt 513  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27104723 tactataaatatagaccttgtatcagagaaaactttgagatagagggggctgaaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagt 27104822  T
Q  514 ttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagacttt 612  Q
    ||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||    
T  27104823 ttgtctcttcgaaacaaa-actagggtttgtgggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggacttt 27104920  T
Q  613 gggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccaga 712  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27104921 gggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacattactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaga 27105020  T
Q  713 ctaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattc--ttgtatttttctcttctttgtg 770  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||    
T  27105021 ctaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtg 27105080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 402; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 214 - 770
Target Start/End: Complemental strand, 19502542 - 19501983
Alignment:
Q  214 ttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgt 313  Q
    ||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19502542 ttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagttttttaggcaaggcactggaaaaatcgt 19502443  T
Q  314 ggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttt 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | ||||||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| |||| |||    
T  19502442 ggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcgacgaataacagaaacatatttttggttgcagatttgatccaaattttaagggaaaattt 19502343  T
Q  414 tactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagt 513  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19502342 tactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagataaagggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtgtagagt 19502243  T
Q  514 ttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagacttt 612  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  19502242 ttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagacttt 19502144  T
Q  613 gggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccag 711  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  19502143 gggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggatcgaagggctgctctctcccccag 19502044  T
Q  712 actaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattc--ttgtatttttctcttctttgtg 770  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||    
T  19502043 actaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtg 19501983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 387; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 205 - 770
Target Start/End: Complemental strand, 19504885 - 19504318
Alignment:
Q  205 atgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgg 304  Q
    |||||| | ||||||| ||||||| |||  ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||    
T  19504885 atgtgaaagttaacttaaaatcaggtttcagcagaatcatggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggttttaattttttaggcaaggcactgg 19504786  T
Q  305 aaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaag 404  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | ||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  19504785 aaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcgacgaataacagaaacacatttttaggtgcagatttgttccaaattttaag 19504686  T
Q  405 cgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 504  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19504685 ggaaacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 19504586  T
Q  505 gtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggc 603  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  19504585 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacacaagggtttgttggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgg-aagaggc 19504488  T
Q  604 tgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctct 702  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  19504487 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctat 19504388  T
Q  703 ctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattc--ttgtatttttctcttctttgtg 770  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||    
T  19504387 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtg 19504318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 359; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 239 - 750
Target Start/End: Original strand, 42064264 - 42064776
Alignment:
Q  239 aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacga-tggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggc 337  Q
    |||||||||||||| ||  |||||||||| |||| |||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  42064264 aatcgtggcacgattgctgggcaacgtggtacgactggaggtttcaagttt-gaggcaaagcactggaaaaatcgtggcacgatgggatcacatcgtggc 42064362  T
Q  338 acgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatc 437  Q
    ||||||||||| ||||||| || |||| ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42064363 acgatggtgcgctggcagcgaaaaacagaaacatattttttagtgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatc 42064462  T
Q  438 aaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactag 537  Q
    | ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  42064463 agagcaaacttggagatagagggagctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag 42064562  T
Q  538 ggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagactta 636  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  42064563 ggtttgtgggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttggatagaattaggcgggagactta 42064661  T
Q  637 ttcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt-aaatttggaccgaactg 735  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  42064662 ttcttgtaacccattgatttctctttgtaacaatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaaatttggaccgaactg 42064761  T
Q  736 ggtcaacaaattctt 750  Q
    |||||||||||||||    
T  42064762 ggtcaacaaattctt 42064776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 351; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 206 - 770
Target Start/End: Complemental strand, 24162752 - 24162195
Alignment:
Q  206 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagttttt-gaggcaaggcactgg 304  Q
    ||||||| ||||||| ||||||  ||| |||| ||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24162752 tgtgagagttaacttaaaatcaagtttctgcagaatcgtggcacaatggttgggcaacgtggcacgatggaggtttcagttttttgaggcaaggcactgg 24162653  T
Q  305 aaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaag 404  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| || ||||  | |||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  24162652 aaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgattgtgcgctggctgcgaatattagaaacgtatttttgggtgcagatttgtttcaaattttaag 24162553  T
Q  405 cgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 504  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24162552 cgaaacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 24162453  T
Q  505 gtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggc 603  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||          ||    
T  24162452 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt-gggaaacactattaagattgagtctcttggtt----------gc 24162364  T
Q  604 tgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctc 703  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  24162363 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaatgctactcatcatatagtggattggatggctgctctc 24162264  T
Q  704 tcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattc--ttgtatttttctcttctttgtg 770  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||    
T  24162263 tcccccggactaggtcaatttggaccgaattgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtg 24162195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 298 - 770
Target Start/End: Complemental strand, 13910491 - 13910017
Alignment:
Q  298 gcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaa 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| || |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  13910491 gcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcattgtggcacgatggtgcgctggcagcgaaaaacagaaacatatttttgagtgcagatttgttccaaa 13910392  T
Q  398 ttttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaact 497  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13910391 ttttaagggaaacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaact 13910292  T
Q  498 agggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacgga 596  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||     
T  13910291 agggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttatgggttgattcacctt-gggaaacaatattaggattgagtctcttggttacggg 13910193  T
Q  597 aagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggc 696  Q
    ||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||    
T  13910192 aagagactggaactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacaatactcatcatatagtggatcagatggc 13910093  T
Q  697 tgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattc--ttgtatttttctcttctttgtg 770  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||    
T  13910092 tgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtg 13910017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 239 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 21521201 - 21520687
Alignment:
Q  239 aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggc 337  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||    
T  21521201 aatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattggaggtttcagtttt-gaagcaagccactggaaaaatcgtgccacgatgggatcgcaacgtggc 21521103  T
Q  338 acgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatc 437  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  21521102 acgatggtgcgctggcagcgaataacataaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaaatttaagcgatacttttactataaatataaaccttgtatc 21521003  T
Q  438 aaagcaaacttt--gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacact 535  Q
    | |  |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  21521002 agactaaactttgagagatagatggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggcttgtatagagtttgtctctttggaacaaacact 21520903  T
Q  536 agggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagact 634  Q
    |||||||| |||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21520902 agggtttgagggttgattcacctt-aggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagaggctaggactttgggtagaattaggcgggagact 21520804  T
Q  635 tattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaac 733  Q
     |||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | | || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21520803 aattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaac 21520704  T
Q  734 tgggtcaacaaattctt 750  Q
    |  ||||||||||||||    
T  21520703 tttgtcaacaaattctt 21520687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 239 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 6259321 - 6258811
Alignment:
Q  239 aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggc 337  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||| || ||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |    
T  6259321 aatcgtggcacgatggctgtgcaacgtggcactattggatgtttcagtttt-gaggaaagtcactggaaaaatcgtggcacgatgggatcgcaacgtgac 6259223  T
Q  338 acgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatc 437  Q
    ||||||||||| |||| |  ||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||     
T  6259222 acgatggtgcgctggcggtgaataacagaaacatatttttgggtgcagacttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatt 6259123  T
Q  438 aaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactag 537  Q
    | |  ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||    
T  6259122 agactaaactttgagatagaggaggatgaaacaagagtttagaaaggcaacaataaaactagggtttgtatagagtttgtctatttggaataaacactag 6259023  T
Q  538 ggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagactta 636  Q
    |||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||   || | ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6259022 ggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaga--ttggggctttgggtagaattaggtgggagactta 6258926  T
Q  637 ttcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaact 734  Q
    ||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  6258925 ttcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcattattatagtgaaacggagggctgctctct-ccccatactaggtcaatttggaccgaact 6258827  T
Q  735 gggtcaacaaattctt 750  Q
    ||||||||||||||||    
T  6258826 gggtcaacaaattctt 6258811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 239 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 40032553 - 40032047
Alignment:
Q  239 aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggc 337  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||| |||||||    ||||||||||||||| |               
T  40032553 aatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattggaggtttcagtttt-gagacaagtcactggatttttcgtggcacgatgggat----------- 40032466  T
Q  338 acgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatc 437  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40032465 acgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaagttttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatc 40032366  T
Q  438 aaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactag 537  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  40032365 agagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactag 40032266  T
Q  538 ggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagactta 636  Q
    |||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40032265 ggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagaggttaggactttgggtagaattaggcgtgagactta 40032167  T
Q  637 ttcttgtaaaccattga----tttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccg 730  Q
    ||||||||| |||||||    |||||| |||| || ||||||||||| ||||||| | | |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  40032166 ttcttgtaacccattgatatctttctcttttgcaaagttactcatcattatagtgaaacggagggccgctctctccctcagactaggtcaatttggaccg 40032067  T
Q  731 aactgggtcaacaaattctt 750  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  40032066 aactgggtcaacaaattctt 40032047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 317 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 22287764 - 22287330
Alignment:
Q  317 acgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttac 416  Q
    |||||||| ||| | |||||||| |||||||| ||||||| ||||||| |||  ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22287764 acgatgggatcgtaacgtggcaccatggtgcgctggcagcgaataacaaaaatgtatgtttgggtgcatatttgttccaaattttaagcgatacttttac 22287665  T
Q  417 tacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttg 516  Q
    || ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22287664 tataaatatagaccttgtattaaagtaaactttgagatatagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtctg 22287565  T
Q  517 tctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttggg 615  Q
    |||||| |||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||| |||||||  |||||||||||||||| || ||||||| |||||  ||| |||| |||    
T  22287564 tctctttggaacaaacattagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacggtattaggattgagtctcttagttacgggaagagattgacacttcggg 22287466  T
Q  616 tagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagact 714  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||| |||||    
T  22287465 tagaattgggcgggagacttattcttgtaacccgttgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaatggagggctgctctctcccctagact 22287366  T
Q  715 aggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22287365 aggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 22287330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 330 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 43623982 - 43623574
Alignment:
Q  330 atcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagac 429  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| ||||||    
T  43623982 atcgtggcacgatggtgcgctggcagcaaataacataaacgtatttt-gggtgcagatttgttccaaattttaagcaatacttttactataaaaatagac 43623884  T
Q  430 cttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaaga 529  Q
    ||||||||| || |||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             
T  43623883 cttgtatcagagtaaactgggagatagaggggggtgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctc--------- 43623793  T
Q  530 aacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgg 628  Q
       |||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43623792 ---actaggttttgagggttgattcaccttggg-aaacaatattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgg 43623697  T
Q  629 gagacttattcttgtaaaccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttgga 727  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  43623696 gagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccccaaactaggtcaatttgga 43623597  T
Q  728 ccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
T  43623596 ccgaactaggtcaacaaattctt 43623574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 409 - 750
Target Start/End: Original strand, 42452702 - 42453041
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 508  Q
    ||||||| || |||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  42452702 acttttattataaatatagacattgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtat 42452801  T
Q  509 agagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgag 607  Q
    | |||||||||||  | || ||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  42452802 aaagtttgtctct--gtaacaaacactagagtttgtgggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgag 42452898  T
Q  608 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcc 706  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  42452899 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct-c 42452997  T
Q  707 cccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42452998 cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 42453041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 409 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 45280321 - 45279978
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaag-gcaacaacaaaactagggtttgta 507  Q
    ||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  45280321 actttcactataaatatataccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaagcaacaacaaaactagggtttgta 45280222  T
Q  508 tagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctga 606  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||| || | |||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||     
T  45280221 tagagtttgtctctttggaacaaacactaggtttagagggttgattcaccttggg-atacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgg 45280123  T
Q  607 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctc 705  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  45280122 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctc 45280023  T
Q  706 ccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  45280022 ccccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattctt 45279978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 409 - 770
Target Start/End: Complemental strand, 23452577 - 23452209
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 504  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||    |||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23452577 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 23452478  T
Q  505 gtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggc 603  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  23452477 gtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt-gagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggc 23452379  T
Q  604 tgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctct 702  Q
    || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  23452378 tgggactttggatagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggattggagggctgctct 23452279  T
Q  703 ctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattc--ttgtatttttctcttctttgtg 770  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||    
T  23452278 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtg 23452209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 330 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 6264560 - 6264142
Alignment:
Q  330 atcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagac 429  Q
    ||||||||||||||||||  | || || ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||    
T  6264560 atcgtggcacgatggtgcattagcggcgaataacagaaacatatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgatatttttactataaatatagac 6264461  T
Q  430 cttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaaga 529  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||| || | |    
T  6264460 cttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaaaggtttagaaaggcaacaacaa----agggtttgtatagagtttgtctctttggtaca 6264365  T
Q  530 aacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgg 628  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  || ||  || | |||||| ||||||||| |||    
T  6264364 aacactagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattaagtctcttggttacgataaaagattggggctttggatagaattagacgg 6264266  T
Q  629 gagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttgg 726  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6264265 gagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttgg 6264166  T
Q  727 accgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  6264165 accgaactgggtcaacaaattctt 6264142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 410 - 750
Target Start/End: Original strand, 19007560 - 19007901
Alignment:
Q  410 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 509  Q
    ||||||||| |||||||| | |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  19007560 cttttactataaatataggctttgtatcatagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattatggtttgtata 19007659  T
Q  510 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgaga 608  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||| || |||||  || |     
T  19007660 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttaagggttgattcacctt-gggaaacactattagaattgagtttcttggttatgggaagagattgggg 19007758  T
Q  609 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctccc 707  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||    
T  19007759 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacgaagggctgctctctccc 19007858  T
Q  708 ccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19007859 ccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 19007901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 450 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 35215881 - 35215584
Alignment:
Q  450 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggtt 549  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  35215881 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 35215782  T
Q  550 gattctccttggggaaacactattaggattg-agtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaac 647  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||      
T  35215781 gattcaccttggg-aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagtttgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaact 35215683  T
Q  648 cattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaat 746  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  35215682 cattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaat 35215584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 450 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 35218258 - 35217961
Alignment:
Q  450 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggtt 549  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  35218258 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 35218159  T
Q  550 gattctccttggggaaacactattaggattg-agtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaac 647  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  35218158 gattcaccttggg-aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacc 35218060  T
Q  648 cattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaat 746  Q
    | |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  35218059 cgttgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaat 35217961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 409 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 42923847 - 42923503
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 506  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||| || |||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  42923847 acttttactataaatatagaccttgaatcatagtaaaccttgagagatagaggaggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactaggatttgt 42923748  T
Q  507 atagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctg 605  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||  ||    
T  42923747 atagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt-ggaaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagattg 42923649  T
Q  606 agactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctct 704  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||| |||||||||| | | ||||||||||||||    
T  42923648 gggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaaagttactcgtcatatagtgaaacggagggctgctctct 42923549  T
Q  705 cccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    |||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42923548 cccctatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 42923503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 239 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 22407915 - 22407592
Alignment:
Q  239 aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggc 337  Q
    |||||||||||||| | | || ||| ||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| || || |||||| ||||||||||||| || || ||||||    
T  22407915 aatcgtggcacgattgaagggtaacatggcacgattggatgtttcagtttt-gaggcaagtcagtgaaaaaattgtggcacgatgggatcacaacgtggc 22407817  T
Q  338 acgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatc 437  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22407816 acgatggtgcgttggcagcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttcaaaattttaagcaatacttttactataaatatagaccttgtatc 22407717  T
Q  438 aaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactag 537  Q
    | || ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  22407716 agagtaaactgtgagatatagggtgctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactag 22407617  T
Q  538 ggtttgtgggttgattctccttggg 562  Q
    |||||| |||||||||| |||||||    
T  22407616 ggtttgagggttgattcaccttggg 22407592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 410 - 750
Target Start/End: Original strand, 28196557 - 28196896
Alignment:
Q  410 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 509  Q
    ||||||||| |||||||  | |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28196557 cttttactataaatatatgctttgtatcagagtaaacattgagatagagggggctgaaacaaaggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 28196656  T
Q  510 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgaga 608  Q
    ||||||||||||| | || ||||| ||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||  ||||     
T  28196657 gagtttgtctcttggcaacaaacattagggtttaagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagattgagg 28196755  T
Q  609 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctccc 707  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| | |  | ||||||||||||||    
T  28196756 ctttgggtagaattaggcggaagatttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacattactcatcatatagtgaaacgaatggctgctctctccc 28196855  T
Q  708 ccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  28196856 ccagactaggtcaatt--gaccgaactgggtcaacaaattctt 28196896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 410 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 11739895 - 11739553
Alignment:
Q  410 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 509  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||| |  | |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||     
T  11739895 cttttactataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagatagagggggctggaacaagggtttagaaagacaacaacaaaattagggtttgtatg 11739796  T
Q  510 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgaga 608  Q
    ||||||||||||| |||| |||| |||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||  | |||||  || ||    
T  11739795 gagtttgtctctttggaacaaacgctagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgattctcttggttataggaagagattggga 11739697  T
Q  609 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcc 706  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| |||| |||| || ||||||||||| ||||||||| | || | |||||||||||    
T  11739696 ctttgggtagaattaggcgggagaattattcttggaatccattgatatctcttttgaaaggttactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcc 11739597  T
Q  707 cccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11739596 cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 11739553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 172; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 410 - 750
Target Start/End: Original strand, 17849037 - 17849378
Alignment:
Q  410 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 509  Q
    ||||||||| ||||||| || ||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| |||||    
T  17849037 cttttactataaatataaacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagataacaacaaaactagagttcgtata 17849136  T
Q  510 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgaga 608  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | |||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||  |||||    
T  17849137 gagtttgcctctttggaagaaacactagggtttgagggttgattcacctt-gagaaacactattaagattgagtctcttggttacggtaagagattgaga 17849235  T
Q  609 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcc 706  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||| | | | ||||||||||||||    
T  17849236 ctttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaac-gggggctgctctctcc 17849334  T
Q  707 cccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    | || ||||||| |||||||||   |||||||||||||||||||    
T  17849335 cacatactaggtcaatttggacaagactgggtcaacaaattctt 17849378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 167; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 410 - 750
Target Start/End: Original strand, 17848365 - 17848701
Alignment:
Q  410 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 509  Q
    ||||||||| |||||||| | ||||||||  | || | ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17848365 cttttactataaatataggctttgtatca--gtaatccttgagatagagggggctcaaacgagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtata 17848462  T
Q  510 gagtttgtctcttcgg-aagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgag 607  Q
    ||||||||||||| || || ||||||| ||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  ||||    
T  17848463 gagtttgtctctttggcaacaaacacttgggtttgagggttgattc-actttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgag 17848561  T
Q  608 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcc 706  Q
     |||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | | || | |||||||||||    
T  17848562 gctttgggtaga---aggcgggagacttattcttgt-aaccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggatgactgctctctcc 17848657  T
Q  707 cccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    |||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17848658 cccatactaggtcaatttggactgaactgggtcaacaaattctt 17848701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 413 - 750
Target Start/End: Original strand, 3022086 - 3022433
Alignment:
Q  413 ttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagag 512  Q
    |||||| |||||||||| |||||||| || |||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3022086 ttactataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatataggaggctgaaacaagggtttataaaggcaacaacaaaactagagtttgtatagag 3022185  T
Q  513 tttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactt 611  Q
    |||||||||| | || |||||||| |||||| |||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||  ||||  ||    
T  3022186 tttgtctcttggcaacaaacactacggtttgagggttgattcacctt-aggaaacactattaggattgagtctcttggttaccggaagagattgaggttt 3022284  T
Q  612 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatca----------tatagtggatcagagggctgctc 701  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||| |||||||||||          |||| || | |||| ||||||||    
T  3022285 taggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattaatatctctttataaagttactcatcattatcatcgttataatgaaacagatggctgctc 3022384  T
Q  702 tctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3022385 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 3022433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 420 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 34979904 - 34979571
Alignment:
Q  420 aaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtct 519  Q
    |||||||||| |||||| |  | |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  34979904 aaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagcgtttagaaaggtaacaaaaaaactagggtttgtataaagtttgtct 34979805  T
Q  520 cttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtag 618  Q
    ||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||  |  |||||| |||||    
T  34979804 ctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagagattcggactttcggtag 34979706  T
Q  619 aattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctct-ctcccccagacta 715  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||| |  |||||| |||| | |||||| ||||    
T  34979705 aattaggcgggagacttattcttgtaatccatttatatctcttttgtaaggttcctcatcattatagtggaacgaagggctactctccccccccaaacta 34979606  T
Q  716 ggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34979605 ggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattctt 34979571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 410 - 748
Target Start/End: Complemental strand, 31733100 - 31732772
Alignment:
Q  410 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 509  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||| || || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31733100 cttttactataaatatagactttgtaacagagtaaacattgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtata 31733001  T
Q  510 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgaga 608  Q
    ||||||||||||| | || |||||||| |||||| |||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||| ||||||            || ||    
T  31733000 gagtttgtctcttggcaacaaacactaaggtttgagggttgattcacgtt-gggaaacactgttaggattgagtctcttggtt------------tggga 31732914  T
Q  609 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcc 706  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||| ||| | | |||| |||||||||||    
T  31732913 ctttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattattgtgaaacggaggactgctctctcc 31732814  T
Q  707 cccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 748  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||    
T  31732813 cccagactaggtcaatttggaccgagctgggtaaacaaattc 31732772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 155; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 410 - 750
Target Start/End: Original strand, 14837193 - 14837529
Alignment:
Q  410 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 509  Q
    ||||||||  |||||||||| ||||||||  | |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  14837193 cttttactgtaaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggagctgaaacaagggttaaaaaagacaacaacaaaactagggtttgtaca 14837292  T
Q  510 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtctttggttacggaaagaggctgagac 609  Q
     |||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |      || |||||  ||||||    
T  14837293 tagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctct-----tgggaagagattgagac 14837386  T
Q  610 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctccc 707  Q
    |||  ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||| | | || || |||||||||||    
T  14837387 tttaagtagaattaggcgggggacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggatggatgctctctccc 14837486  T
Q  708 ccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14837487 ccagactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaattctt 14837529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 410 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 44289403 - 44289061
Alignment:
Q  410 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 509  Q
    ||||||||| ||||||||   |||||||| ||||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  44289403 cttttactataaatataggttttgtatcatagcaaaccttgatatagaggggactaaaacaaaggtttaggaaggcaacaacaaaactagagtttgtata 44289304  T
Q  510 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtc-tttggttacggaaagaggctgaga 608  Q
    |||| |||||||| | || ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||  || ||    
T  44289303 gagtctgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtcacttggttacgggaagagattggga 44289205  T
Q  609 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcc 706  Q
    ||| ||||||||||| | || | |||||||||||||| || ||||| |||| |||||||  |||||||||| ||||||| | |||| || |||||| |||    
T  44289204 cttagggtagaattaagtggaaaacttattcttgtaacccgttgatatctcttttgtaagattactcatcattatagtgaaacagatggttgctctttcc 44289105  T
Q  707 cccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44289104 cccaaactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 44289061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 145; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 411 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 15539809 - 15539566
Alignment:
Q  411 ttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 510  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||  | |||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  15539809 ttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatatagggggttgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaattagggtttgtatag 15539710  T
Q  511 agtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagac 609  Q
    |||||||||||| | || ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||  ||||||    
T  15539709 agtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgattctcttggttacgggaagagattgagac 15539611  T
Q  610 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgat 654  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15539610 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 15539566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 540 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 5375550 - 5375340
Alignment:
Q  540 tttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttatt 638  Q
    |||| |||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5375550 tttgagggttgattcaccttagg-aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgg-agacttatt 5375453  T
Q  639 cttgtaaaccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactggg 737  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5375452 cttgtaacccattgatatctcttttgtaacattactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactggg 5375353  T
Q  738 tcaacaaattctt 750  Q
    |||||||||||||    
T  5375352 tcaacaaattctt 5375340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 450 - 718
Target Start/End: Complemental strand, 45239271 - 45239003
Alignment:
Q  450 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggtt 549  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| || | || ||||||||||||||| |||||    
T  45239271 gagatagagggggctgaaacaatgatttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagactttctct-ttggcaacaaacactagggtttgagggtt 45239173  T
Q  550 gattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaacc 648  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  || |  ||| |||||||||| |||||| |||||||||||||| ||    
T  45239172 gattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggtttttggtagaattaagcgggatacttattcttgtaaccc 45239074  T
Q  649 attgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt 718  Q
    |||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  45239073 attgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggt 45239003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 563 - 748
Target Start/End: Complemental strand, 36559047 - 36558860
Alignment:
Q  563 gaaacactattaggattg-agtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctct 660  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36559047 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 36558948  T
Q  661 ttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 748  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  36558947 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattc 36558860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 563 - 748
Target Start/End: Complemental strand, 36561324 - 36561137
Alignment:
Q  563 gaaacactattaggattg-agtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctct 660  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36561324 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 36561225  T
Q  661 ttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 748  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  36561224 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattc 36561137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 361 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 18800686 - 18800307
Alignment:
Q  361 aacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagaggg 460  Q
    |||| ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||  | |||| | |||||| ||||    
T  18800686 aacagaaacatatttttaagtgcagatttgttccaaattttaaacgatacttttactataaatatagaccttgtatcagggtaaacatggagatataggg 18800587  T
Q  461 ggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttg 560  Q
    ||||||||||||||||||||||          || ||||||||||||||||| ||| ||||| | || |||||||||||||   |||||||||| |||||    
T  18800586 ggctgaaacaagggtttagaaatc--------aagctagggtttgtatagaggttg-ctcttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttg 18800499  T
Q  561 gggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc 659  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||  || | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  18800498 gg-aaacactattaggattgagtctcttggtcacaggaagagattggggctttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccattgatatctc 18800400  T
Q  660 -tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt-aaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
     ||||||| ||||||| ||| ||||||| | | ||||||| |||||| |||||||| |||| |  |||||||| |||||||| |||||||||||    
T  18800399 ttttgtaaagttactcgtcattatagtgaaacggagggctactctct-ccccagaccaggtcagttttggaccaaactgggtaaacaaattctt 18800307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 410 - 716
Target Start/End: Complemental strand, 11578439 - 11578136
Alignment:
Q  410 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 509  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||  | |||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  11578439 cttttactataaatatagaccttatatcagggtaaatcttgagatagagtgggctgaaacaagggtttag-aagtcaacaaaaaaactagggtttgtata 11578341  T
Q  510 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgaga 608  Q
    || ||| |||||| | || ||  |||||||||   |||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||  || ||    
T  11578340 gaatttttctcttggcaacaa--actagggtt--ggggttgattcacc-tcgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattggga 11578246  T
Q  609 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcc 706  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||| || | |||||||||||| |||    
T  11578245 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtcgaacggagggctgctctttcc 11578146  T
Q  707 cccagactag 716  Q
    ||||||||||    
T  11578145 cccagactag 11578136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 563 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 45332364 - 45332179
Alignment:
Q  563 gaaacactattaggattg-agtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctct 660  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  45332364 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattaggactttgggtagaattaggcgggagacttattattgtaacccattgatttctct 45332265  T
Q  661 ttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaat 746  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  45332264 ttgtaaaggtactcatcatatagtgaattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaat 45332179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 409 - 749
Target Start/End: Original strand, 22874061 - 22874391
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 508  Q
    |||||| ||| ||||| || | |||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||    
T  22874061 acttttgctataaatacaggctttgtatcagagcaaacctggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaatc--------aaactagggtttgtat 22874152  T
Q  509 agagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgag 607  Q
    |||||||| ||||| | || |||||||| ||||   |||||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||||| || || |||| |||||  ||||    
T  22874153 agagtttg-ctcttggcaacaaacactatggtt---gggttgattcaccttgga-aaacagtattaggattgagtctcttagtcacgggaagagattgag 22874247  T
Q  608 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctc 705  Q
     |||| |||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||| | | ||| |||||||||||    
T  22874248 gctttcggtagaattaggtgggagacttatttttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaactgagagctgctctctc 22874347  T
Q  706 ccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 749  Q
    || || ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  22874348 cctcatactaggtcaatttggaccgaattgggtaaacaaattct 22874391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 410 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 22163282 - 22163109
Alignment:
Q  410 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 509  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22163282 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaactttgagatagagggggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaacactagggtttgtata 22163183  T
Q  510 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct 585  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| || ||||||||||||| ||||||||    
T  22163182 gagtttgtctctttagaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt-ggaaaacactattagg-ttgagtct 22163109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 411 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 20146941 - 20146604
Alignment:
Q  411 ttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 508  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||| || |||  ||||| |     |||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||    
T  20146941 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaaccttaagaggtagagagtttgaaaacaagggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttgtat 20146843  T
Q  509 agagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgag 607  Q
    |||||||| | ||| | || |||||||| |||| |  | ||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| |||| || ||  ||||    
T  20146842 agagtttgcc-cttggcaacaaacactatggttgg--gattgattcaccttggg-aaacaatagtaggattgagtctcttggtcacgggaaaagattgag 20146747  T
Q  608 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctc 705  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||    
T  20146746 attttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctc 20146647  T
Q  706 ccccagactaggtaaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 747  Q
    || ||||||| || | | |||||||||||||||| ||| ||||    
T  20146646 cctcagactaagtcagtattggaccgaactgggtaaacgaatt 20146604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 607 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 22407592 - 22407448
Alignment:
Q  607 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctc 705  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||    
T  22407592 gacttttggtagaattaggggggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctc 22407493  T
Q  706 ccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22407492 ccccagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattctt 22407448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 450 - 585
Target Start/End: Original strand, 38020162 - 38020296
Alignment:
Q  450 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggtt 549  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||||||||||||| |||||    
T  38020162 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtgtagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggtt 38020261  T
Q  550 gattctccttggggaaacactattaggattgagtct 585  Q
    ||||| || | || ||||||||||||||||||||||    
T  38020262 gattcaccat-ggtaaacactattaggattgagtct 38020296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 206 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 36559358 - 36559173
Alignment:
Q  206 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgga 305  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||| |||  |||  || |||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  36559358 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcacaatcgtggcacgacggctgggcttcgcggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 36559259  T
Q  306 aaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgtt 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  || || | ||||||||||||||| ||| |||||||    
T  36559258 aaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaata-aaacatatttttgggagcagatttgtt 36559173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 409 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 17897578 - 17897242
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgagatagagggggctga-aacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 506  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| | | |||  ||||| ||||| |  |||| ||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||    
T  17897578 acttttactataaatatagaccttgtatcagatgtaaaacttgaggtagagagt-ctgagaacaagggtttagaa-gtcaacaataaaactagggtttgt 17897481  T
Q  507 atagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctg 605  Q
    |||||||||| ||||||| || ||||||||||  ||| |  ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| | |  || ||  ||    
T  17897480 atagagtttg-ctcttcgcaacaaacactagg--ttgaga-ttgattcaccttggg-aaacactattaggattgagtctcttggtcatgagaaaagattg 17897386  T
Q  606 agactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttct-ctttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctc 703  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||  ||||||| ||||||||||| |||||| || | || ||||||||||    
T  17897385 agattttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccctttgatatctattttgtaaagttactcatcattatagtagaacggatggctgctctc 17897286  T
Q  704 tcccccagactaggtaaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 747  Q
    | ||||||||||||| | | |||| ||||||||||| ||||||||    
T  17897285 t-ccccagactaggtcagtattggtccgaactgggtaaacaaatt 17897242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 616 - 741
Target Start/End: Complemental strand, 7463077 - 7462950
Alignment:
Q  616 tagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagact 714  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7463077 tagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttacccattatatagtggatcggagggctgctctctcccccagact 7462978  T
Q  715 aggt-aaatttggaccgaactgggtcaa 741  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||    
T  7462977 aggtcaattttggaccgaactgggtcaa 7462950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 409 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 5377769 - 5377631
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 504  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5377769 actttcactataaatatagaccttgtttcagagcaaactttgagagagatagaggggactgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaaggttt 5377670  T
Q  505 gtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttg 543  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||    
T  5377669 gtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttg 5377631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 206 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 36561677 - 36561539
Alignment:
Q  206 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgga 305  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||| |||  |||  |  |||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  36561677 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcacaatcgtggcacgacggctgggcttcacggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 36561578  T
Q  306 aaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatgg 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36561577 aaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatgg 36561539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 500 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 28459435 - 28459184
Alignment:
Q  500 ggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaa 598  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | || ||| |||||| |||| |||| ||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  28459435 ggtttgtatagagcttgtctcttggcaacaaaaactaggatttgagggtggattcaccttggc-aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaa 28459337  T
Q  599 gaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggc 696  Q
    |||  || | |||  |||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||| | | ||||||    
T  28459336 gagtttggggcttcaggtataattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttttaaagttactcatcattatagtgaaacggagggc 28459237  T
Q  697 tgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    | ||||||  || ||||||||| |||||||| |||||| | | |||||||||||    
T  28459236 ttctctct-acctagactaggtcaatttggatcgaactagataaacaaattctt 28459184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 206 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 45332675 - 45332528
Alignment:
Q  206 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgga 305  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||| |||  |||  || |||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||    
T  45332675 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcttcgcggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggaactgga 45332576  T
Q  306 aaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggc 353  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  45332575 aaaatcgtggaacgatggggtcacatcgtggcacgatggtgcgctggc 45332528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 409 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 37963263 - 37962938
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 508  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| | || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||          |||||||||||||| |    
T  37963263 acttttactataaatatagactttgtataagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaatc--------aaactagggtttgtgt 37963172  T
Q  509 agagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgag 607  Q
    | |||||| |||||   || |||||| | ||||   | |||||||| |||| |  ||||| ||||  |||||||||| ||||| ||   |||||  ||||    
T  37963171 atagtttg-ctcttgacaacaaacaccatggtt---gtgttgattccccttaga-aaacattattgagattgagtctcttggtcacctgaagagattgag 37963077  T
Q  608 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcc 706  Q
     |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||  | ||||||| |||| |||||| ||||||| | ||| || ||| ||||||     
T  37963076 gctttgggtagaattagacgagagacttattcttgtaatccattgatt--tttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacagtggactgatctctct 37962979  T
Q  707 cccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 747  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37962978 cccacactaggttaatttggaccgaactgggtaaacaaatt 37962938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 300 - 746
Target Start/End: Original strand, 35107110 - 35107553
Alignment:
Q  300 actggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaatt 399  Q
    |||||||||| |||| ||||||||| ||| | |||| |||  ||||||| ||   || |||||||||| | |||||||   |||| ||||||||||||||    
T  35107110 actggaaaaaacgtgtcacgatgggatcgtaacgtgtcacattggtgcgctgaaggcgaataacataatcgtatttttcaatgcagatttgttccaaatt 35107209  T
Q  400 ttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaacta 498  Q
    ||||| || |||||||||| |||||||||| |||||||| || |||| ||||| |||| | | || ||| |||| |||||| ||| |||||| |||||||    
T  35107210 ttaagggatacttttactataaatatagacattgtatcatagtaaaccttgaggtaga-gagtctaaaaccaagagtttag-aagtcaacaagaaaacta 35107307  T
Q  499 gggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaa 597  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | || ||||   ||||||   || ||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||| ||||| |||| |    
T  35107308 gggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaac---agggtt--gggattgattcacctt-gagaaacattattaggattgagtctcttggtcacggga 35107400  T
Q  598 agaggctgagactttgggtagaattag--gcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagag 693  Q
    ||||  || ||||||||||||||||||     | |||||||||||||| |||| ||| | |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||     
T  35107401 agagattgtgactttgggtagaattagattttgaagacttattcttgt-aacctttgttatctcttttgtaatgttactcatcattatagtggaacggat 35107499  T
Q  694 ggctgctctctcccccagactaggtaaat-ttggaccgaactgggtcaacaaat 746  Q
    || || |||||  |||||||||||| | | |||||||||| | ||| |||||||    
T  35107500 ggttgttctctttcccagactaggtcagtattggaccgaaataggtaaacaaat 35107553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 626 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 22707872 - 22707745
Alignment:
Q  626 cgggagacttattcttgtaaaccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccc--cagactaggtaaat 722  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||    
T  22707872 cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctctcctccagactaggtcaat 22707773  T
Q  723 ttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||    
T  22707772 ttggactgaactaggtcaacaaattctt 22707745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 660 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 22163106 - 22163016
Alignment:
Q  660 tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22163106 tttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagagctgctctctcccccagactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattctt 22163016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 546 - 747
Target Start/End: Original strand, 40699429 - 40699634
Alignment:
Q  546 ggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgt 643  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||  |||||  || |||||||||||||||||||   || |||||||| ||||    
T  40699429 ggttgattcaccttggg-aaacactattaggattgagtctcttggtcacgagaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaagacttatttttgt 40699527  T
Q  644 aaaccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcat-atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaat-ttggaccgaactgggtca 740  Q
    || || ||||| ||||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| | | || ||||||||| ||| |    
T  40699528 aatcctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagggatgctctttcccccagactaggtcagtattagaccgaactaggtaa 40699627  T
Q  741 acaaatt 747  Q
    |||||||    
T  40699628 acaaatt 40699634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 214 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 43624077 - 43623968
Alignment:
Q  214 ttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcg 312  Q
    ||||||| ||||||| ||| |||| |||| ||||||||||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  43624077 ttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcatggcacgatggctgggcaacatggcacgattggaggtttcagtttt-gaggcaaggcactgaaaaaatcg 43623979  T
Q  313 tggcacgatgg 323  Q
    |||||||||||    
T  43623978 tggcacgatgg 43623968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 567 - 752
Target Start/End: Original strand, 17943540 - 17943725
Alignment:
Q  567 cactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaaaccattgatttctctttgt 664  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||   || |||| ||||||||||  ||   || |||||||||    
T  17943540 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaactca---atatctctttgt 17943635  T
Q  665 aacgttactcatcat-atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt-aaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttgt 752  Q
    || |  ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |   || ||||||||| ||| |||||||||||||    
T  17943636 aaagaaactcatcattatagtggatcagagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactaggtaaacaaattcttgt 17943725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 625 - 750
Target Start/End: Original strand, 23870951 - 23871077
Alignment:
Q  625 gcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatt 723  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| || ||||||| |||| |||||||||||||||||| | | ||||| |||||||||||  ||| ||||| ||||    
T  23870951 gcggcagacttattcttgtaacccattaatatctctttagtaaggttactcatcatatagtgaaacggagggttgctctctcccttagattaggtcaatt 23871050  T
Q  724 tggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    |||| | |||| |||||||||||||||    
T  23871051 tggatcaaactaggtcaacaaattctt 23871077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 357 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 12342798 - 12342673
Alignment:
Q  357 aaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatag 456  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||| ||||    || |||||||||| ||||||| || |||||||| || |||| |||||||||    
T  12342798 aaataacataatcatatttttggggtcagatttgttccaatttttttaggatacttttactataaatatacacattgtatcagagtaaaccttgagatag 12342699  T
Q  457 agggggctgaaac-aagggtttagaa 481  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||    
T  12342698 agggggctgaaacaaagggtttagaa 12342673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 411 - 504
Target Start/End: Original strand, 38020064 - 38020157
Alignment:
Q  411 ttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 504  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||   | |||| | ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38020064 ttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaacctggagatagagggggttggaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 38020157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 564 - 679
Target Start/End: Original strand, 20589763 - 20589881
Alignment:
Q  564 aaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-t 660  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||  ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||| |||||||| |||| |    
T  20589763 aaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttggagacttattcttttaacccattgatatctctt 20589862  T
Q  661 ttgtaacgttactcatcat 679  Q
    |||| | ||||||||||||    
T  20589863 ttgtgaagttactcatcat 20589881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 309 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 36561532 - 36561450
Alignment:
Q  309 atcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgtt 392  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  || || | ||||||||||||||| ||| |||||||    
T  36561532 atcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaata-aaacatatttttgggagcagatttgtt 36561450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 564 - 746
Target Start/End: Original strand, 2736205 - 2736388
Alignment:
Q  564 aaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctt 661  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||| ||  |||   | ||||||    
T  2736205 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttt-ggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctctt 2736300  T
Q  662 tgtaacgttactca-tca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt-aaatttggaccgaactgggtcaacaaat 746  Q
    ||||| |  ||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |   || ||||||||||||| |||||||    
T  2736301 tgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 2736388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 564 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 20054947 - 20054757
Alignment:
Q  564 aaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctt 661  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||  ||   || ||||||    
T  20054947 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctt 20054852  T
Q  662 tgtaacgttactc--atca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt-aaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttgt 752  Q
    ||||| |  ||||  |||| |||||| |||| ||| |||||||||||| ||||||||||| |   || ||||||||||||| |||||||||||||    
T  20054851 tgtaaagaaactcatatcattatagtagatcggagagctgctctctccaccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattcttgt 20054757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 466 - 679
Target Start/End: Original strand, 43139356 - 43139564
Alignment:
Q  466 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaa 565  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||| |||||||||  ||||||| ||||| | || |||||||||||||    | |||||||  |||||| ||    
T  43139356 aaacaagggtttagaa-gccaacacaaaaacttgggtttgta--gagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttga--gattgattcatcttggg-aa 43139448  T
Q  566 acactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttg 663  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||| |||| ||||   ||||||||| |||||||||||| |   ||||| ||| |||||| |  ||||||||||||||    
T  43139449 acattattaggattgagtctcttggtcacgggaagatattgagactttaggtagaattaggtctaaagactaattattgtaaccttttgatttctctttg 43139548  T
Q  664 taacgttactcatcat 679  Q
    ||| ||||||||||||    
T  43139549 taaagttactcatcat 43139564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 680 - 744
Target Start/End: Original strand, 14699036 - 14699100
Alignment:
Q  680 atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 744  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  14699036 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 14699100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 533 - 632
Target Start/End: Complemental strand, 38414291 - 38414194
Alignment:
Q  533 actagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggag 631  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||  || |||||| ||||||||||||||||||    
T  38414291 actagggtttgagg-ttgattcaccttggg-aaacactattaggattgagtctcttggtcacggaaa-agattgggacttttggtagaattaggcgggag 38414195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 398 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 45332439 - 45332384
Alignment:
Q  398 ttttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 453  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  45332439 ttttaagcagaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttggaga 45332384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 258 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 6264611 - 6264546
Alignment:
Q  258 ggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatgg 323  Q
    |||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6264611 ggcaacgtggcatgattggatgtttcagtttt-gaggcaagtcactggaaaaatcgtggcacgatgg 6264546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 500 - 674
Target Start/End: Complemental strand, 27136368 - 27136195
Alignment:
Q  500 ggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaa 598  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||| | || ||||||||||||| |  |||||||||  |||||  |||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||    
T  27136368 ggtttatatagagcttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcatcttgga-aaacactattaggattgaatctcttggtcacggaaa 27136273  T
Q  599 gaggctgagactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactc 674  Q
    ||   || ||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||| |||||||    
T  27136272 gaaattgggactttgagtagaattaggtttggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactc 27136195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 567 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 27517818 - 27517631
Alignment:
Q  567 cactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgt 664  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||  ||   || |||||||||    
T  27517818 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttgt 27517723  T
Q  665 aacgttactc--atca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt-aaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttgt 752  Q
    || |  ||||  |||| ||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| |   || ||||||||| ||| |||||||||||||    
T  27517722 aaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaacttggtaaacaaattcttgt 27517631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 682 - 751
Target Start/End: Original strand, 1345572 - 1345641
Alignment:
Q  682 agtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttg 751  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1345572 agtggatcggagaggtgctctctcccccagagtaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatttcttg 1345641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 564 - 746
Target Start/End: Original strand, 17462436 - 17462619
Alignment:
Q  564 aaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctt 661  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||  | |   | ||||||    
T  17462436 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcct---tatctctt 17462531  T
Q  662 tgtaacgttactca-tca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt-aaatttggaccgaactgggtcaacaaat 746  Q
    ||||| |  ||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |   || ||||||||||||| |||||||    
T  17462532 tgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 17462619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 564 - 746
Target Start/End: Original strand, 39686983 - 39687166
Alignment:
Q  564 aaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctt 661  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||  |||   | ||||||    
T  39686983 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctctt 39687078  T
Q  662 tgtaacgttactca-tca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt-aaatttggaccgaactgggtcaacaaat 746  Q
    ||||| |  ||||| ||| ||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| |   || ||||||||||||| |||||||    
T  39687079 tgtaaagaaactcattcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 39687166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 680 - 744
Target Start/End: Original strand, 8390179 - 8390243
Alignment:
Q  680 atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 744  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||||||| | ||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  8390179 atagtggattggagagctgctctctcccccaaattaggtcattttggaccgaactgggtcaacaa 8390243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 680 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 13569396 - 13569332
Alignment:
Q  680 atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 744  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  13569396 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 13569332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 700 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 17057413 - 17057369
Alignment:
Q  700 tctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 744  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  17057413 tctctcccccagactaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 17057369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 700 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 17085396 - 17085352
Alignment:
Q  700 tctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 744  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  17085396 tctctcccccagactaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 17085352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 680 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 20522288 - 20522224
Alignment:
Q  680 atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 744  Q
    |||||||||  ||||| |||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  20522288 atagtggattggagggttgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 20522224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 409 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 36559111 - 36559067
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 453  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36559111 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttggaga 36559067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 409 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 36561388 - 36561344
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 453  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36561388 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttggaga 36561344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 309 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 36561553 - 36561518
Alignment:
Q  309 atcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatgg 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36561553 atcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatgg 36561518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 443 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 38414337 - 38414281
Alignment:
Q  443 aaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 505  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38414337 aaaccttgagatagagggggctgaaac------ttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 38414281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 697 - 751
Target Start/End: Original strand, 2838076 - 2838130
Alignment:
Q  697 tgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttg 751  Q
    |||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2838076 tgctctctcccccagagtaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatttcttg 2838130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 564 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 20050204 - 20050013
Alignment:
Q  564 aaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctt 661  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  ||| |||| || |||||||   | ||||| ||||||||||  ||   || ||||||    
T  20050204 aaacactattaggattgagtctcttggtcacggaaagaggctaggac-ttggatataattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctt 20050109  T
Q  662 tgtaacgttactc--atca-tatagtggatcagagggctgctctct-cccccagactaggt-aaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttgt 752  Q
    ||||| |  ||||  |||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| |   || ||||||||||||| |||||||||||||    
T  20050108 tgtaaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctccccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattcttgt 20050013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 564 - 625
Target Start/End: Complemental strand, 22712698 - 22712637
Alignment:
Q  564 aaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg 625  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  22712698 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 22712637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 564 - 625
Target Start/End: Complemental strand, 22717407 - 22717346
Alignment:
Q  564 aaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg 625  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  22717407 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 22717346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 564 - 625
Target Start/End: Complemental strand, 28459011 - 28458949
Alignment:
Q  564 aaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg 625  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||   || |||||||||||||||||||    
T  28459011 aaacactattaggattgagtctcttggtcacggaaagatattgggactttgggtagaattagg 28458949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 380 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 28462651 - 28462593
Alignment:
Q  380 gtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatca 438  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  28462651 gtgcagatttgttccaaattttaagggttacttttactataaatataaaccttgtatca 28462593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 564 - 625
Target Start/End: Original strand, 39680045 - 39680106
Alignment:
Q  564 aaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg 625  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39680045 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgagaagaggctgagac-ttgggtagaattagg 39680106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 564 - 625
Target Start/End: Original strand, 45567409 - 45567470
Alignment:
Q  564 aaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg 625  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  45567409 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 45567470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 717 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 15539556 - 15539523
Alignment:
Q  717 gtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15539556 gtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 15539523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 369 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 20147125 - 20147040
Alignment:
Q  369 catatttttgggtgcaaatttgttccaaattt-taagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 453  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||| ||| | ||  | | |||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  20147125 catatttttgggctcaaatttgttccaattttatgaggaatatttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaaccttgaga 20147040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 564 - 623
Target Start/End: Original strand, 26345677 - 26345738
Alignment:
Q  564 aaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggct-gagactttgggtagaatta 623  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  26345677 aaacactattaggattgagtctcttggtcacggaaagagattcgagactttgggtagaatta 26345738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 679 - 744
Target Start/End: Original strand, 34682362 - 34682427
Alignment:
Q  679 tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 744  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||||||||||| || || |  ||||||||||||||||||||||    
T  34682362 tatagtggattggagagctgctctctcccccagattatgtcatattggaccgaactgggtcaacaa 34682427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 700 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 723788 - 723744
Alignment:
Q  700 tctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 744  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  723788 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 723744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 564 - 718
Target Start/End: Original strand, 2740941 - 2741095
Alignment:
Q  564 aaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaaaccattgatttctctt 661  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| || ||||| |||||||||||||    | |||| ||||||| ||  ||||    ||||||    
T  2740941 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggttgggactt-gggtagaattaggtttaaagactgattcttgaaactcatta---tctctt 2741036  T
Q  662 tgtaacgttactcat-cat-atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt 718  Q
    ||||| |  |||||| ||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2741037 tgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggt 2741095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 680 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 8040128 - 8040064
Alignment:
Q  680 atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 744  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||| |  |||||| |||||||||||||||    
T  8040128 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggactgaactgggtcaacaa 8040064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 680 - 744
Target Start/End: Original strand, 10445473 - 10445537
Alignment:
Q  680 atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 744  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||| |||||||    
T  10445473 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactggatcaacaa 10445537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 680 - 744
Target Start/End: Original strand, 28259206 - 28259270
Alignment:
Q  680 atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 744  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||||||| | ||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  28259206 atagtggattggagagctgctctctcccccaaattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 28259270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 700 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 34139814 - 34139770
Alignment:
Q  700 tctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 744  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  34139814 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 34139770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 609 - 645
Target Start/End: Original strand, 38020311 - 38020347
Alignment:
Q  609 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 645  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38020311 ctttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaa 38020347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 700 - 744
Target Start/End: Original strand, 39284960 - 39285004
Alignment:
Q  700 tctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 744  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  39284960 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 39285004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #103
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 679 - 746
Target Start/End: Original strand, 45679838 - 45679906
Alignment:
Q  679 tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt-aaatttggaccgaactgggtcaacaaat 746  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |   || ||||||||||||| |||||||    
T  45679838 tatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 45679906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #104
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 701 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 11151634 - 11151591
Alignment:
Q  701 ctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 744  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  11151634 ctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 11151591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #105
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 567 - 625
Target Start/End: Complemental strand, 12781400 - 12781342
Alignment:
Q  567 cactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg 625  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  12781400 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 12781342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #106
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 548 - 625
Target Start/End: Original strand, 17921754 - 17921833
Alignment:
Q  548 ttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggct-gagactttgggtagaattagg 625  Q
    ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||  | | |||||||||||||||||||    
T  17921754 ttgattcaccttgaagaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattcgggactttgggtagaattagg 17921833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #107
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 567 - 625
Target Start/End: Original strand, 17932637 - 17932695
Alignment:
Q  567 cactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg 625  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  17932637 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 17932695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #108
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 679 - 718
Target Start/End: Complemental strand, 33671033 - 33670994
Alignment:
Q  679 tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt 718  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33671033 tatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggt 33670994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #109
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 361 - 440
Target Start/End: Original strand, 45156922 - 45157001
Alignment:
Q  361 aacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaa 440  Q
    ||||||||| ||||||| || |   |||||||||||||||| || ||  ||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  45156922 aacataaacgtatttttaggcgtggatttgttccaaattttgagggatgcttttactataaatatagaccttatatcaaa 45157001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #110
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 352 - 438
Target Start/End: Original strand, 35028440 - 35028527
Alignment:
Q  352 gcagcaaataacataaa--catatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatca 438  Q
    ||||||||||| |||||  |||||||| || || | ||||||||||| |||| || || |||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  35028440 gcagcaaataaaataaaatcatattttaggttg-agatttgttccaattttttagggatacttttactataaatatagacattgtatca 35028527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #111
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 466 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 41304667 - 41304627
Alignment:
Q  466 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 507  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  41304667 aaacaagggtttagaa-gccaacaacaaaactagggtttgta 41304627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 411; Significance: 0; HSPs: 140)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 411; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 208 - 770
Target Start/End: Original strand, 51015042 - 51015606
Alignment:
Q  208 tgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaa 307  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  51015042 tgagagttaacttaaaatcagatttctgcagaatcgtggcatgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagttttttaggcaaggcactggaaa 51015141  T
Q  308 aatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcga 407  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  51015142 aattgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacatatttttcagtgcagatttgttccaaattttaagcga 51015241  T
Q  408 aacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 507  Q
     |||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51015242 tacttttactataaatatagactttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 51015341  T
Q  508 tagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctga 606  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||     
T  51015342 tagtgtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgg 51015440  T
Q  607 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcc 706  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  51015441 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacaatactcatcatatagtggatcggaggtctgctctctcc 51015540  T
Q  707 cccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattc--ttgtatttttctcttctttgtg 770  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||    
T  51015541 ctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtg 51015606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 372; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 239 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 22044897 - 22044385
Alignment:
Q  239 aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagttttt--gaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtgg 336  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22044897 aatcgtggcacgattgaagggcaacgtggcacgatggaggtttcattttttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatgggatcgcatcgtgg 22044798  T
Q  337 cacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtat 436  Q
    |||||||||| | ||||||  || |||| |||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||    
T  22044797 cacgatggtgtgctggcagggaaaaacagaaacatatttttag-tgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatataggccttgtat 22044699  T
Q  437 caaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacacta 536  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22044698 cagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacacta 22044599  T
Q  537 gggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagactt 635  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22044598 gggtttgtgggttgattcccctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagactt 22044500  T
Q  636 attcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactg 735  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  22044499 atttttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccctcagactaggtcaatttggaccgaactg 22044400  T
Q  736 ggtcaacaaattctt 750  Q
    |||||||||||||||    
T  22044399 ggtcaacaaattctt 22044385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 367; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 214 - 770
Target Start/End: Complemental strand, 37089906 - 37089344
Alignment:
Q  214 ttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatg-gaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcg 312  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  37089906 ttaacttaaaatcagatttctgcagaatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatgagatgttttagttttttaggtgaggcactggaaaaatcg 37089807  T
Q  313 tggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaactt 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  37089806 tggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttaggtgcagatttgttccaaattttaagcaaaactt 37089707  T
Q  413 ttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt---gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 509  Q
    |||||| |||||||||||||||||||    ||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37089706 ttactataaatatagaccttgtatcaggctaaacttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtata 37089607  T
Q  510 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgaga 608  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| ||    
T  37089606 gagtttgtctctttagaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggg-aaacactattaggattgagtctcttgattacgggaagaggctggga 37089508  T
Q  609 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccc 708  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  37089507 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccc 37089408  T
Q  709 cagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattc--ttgtatttttctcttctttgtg 770  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||    
T  37089407 cagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtg 37089344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 362; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 206 - 750
Target Start/End: Original strand, 38408993 - 38409543
Alignment:
Q  206 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgg 304  Q
    ||||||| ||||||| |||| |||||| |||| |||||||||||||| ||  |||| ||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||| |||||||    
T  38408993 tgtgagagttaacttaaaattagatttctgcagaatcgtggcacgattgctgggcatcgtggcacgattggaggtttcaagttt-gaggcaaagcactgg 38409091  T
Q  305 aaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaag 404  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || || |||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  38409092 aaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgttggcggcgaaaaacagaaacatatttttgagtgcagatttgttccaaattttaag 38409191  T
Q  405 cgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaacta 498  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||      |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  38409192 cgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagggagatagagggggctgaaacaatggtttaaaaaggcaacaacaaaacta 38409291  T
Q  499 gggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaa 597  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  38409292 gggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggg-aaacactattaggattgagtctcttggttacggga 38409390  T
Q  598 agaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggct 697  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  38409391 agaggctgggactttgggtagaattaggctggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggct 38409490  T
Q  698 gctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38409491 gctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 38409543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 358; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 243 - 770
Target Start/End: Complemental strand, 31850101 - 31849571
Alignment:
Q  243 gtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacga 341  Q
    |||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31850101 gtggcacgattgctgggcaacgtggcacgattggaggtttcagttttgg-ggcaaggcactggaaaaatcttggcacgatggggtcgcatcgtggcacga 31850003  T
Q  342 tggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaag 441  Q
    ||||||| ||||||| || |||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||  ||||||||| ||    
T  31850002 tggtgcgctggcagcgaaaaacagaaacatatttttgagtgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactagaaatataggtcttgtatcagag 31849903  T
Q  442 caaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacact-agggt 540  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |    
T  31849902 caaactaggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactaaggtt 31849803  T
Q  541 ttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattc 639  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31849802 ttgtgggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttgcttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaagcgggagacttattc 31849704  T
Q  640 ttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtc 739  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  31849703 ttgtaacccattgatttctctttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttgaaccgaactgggtc 31849604  T
Q  740 aacaaattc--ttgtatttttctcttctttgtg 770  Q
    |||||||||  |||| || ||||||||||||||    
T  31849603 aacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtg 31849571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 206 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 11006781 - 11006231
Alignment:
Q  206 tgtgagatttaacttcaaatcagattt-atgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgg 304  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  11006781 tgtgagagttaacttaaaatcaggttttatgcagaatcgtggcacgatcgctgggcaacgtggcacgatggaggtttcaattttttaggcaaggcactgg 11006682  T
Q  305 aaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaag 404  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||    
T  11006681 aaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcagcaaaaaacagaaacatatttttgggtgcagatttgttacagattttaag 11006582  T
Q  405 cgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt-----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactag 499  Q
    | | |||||||||| ||||||||||||||||||| | | |  ||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11006581 caagacttttactataaatatagaccttgtatcaga-ctattttgagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactag 11006483  T
Q  500 ggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattg-agtct-ttggttacggaa 597  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |    
T  11006482 ggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggg-aaacactattaggattggagtctcttggttacggga 11006384  T
Q  598 agaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggct 697  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||    
T  11006383 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaatggtactcatcatatagtggatcggagggct 11006284  T
Q  698 gctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  11006283 gctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggttaacaaattctt 11006231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 214 - 750
Target Start/End: Original strand, 24888598 - 24889135
Alignment:
Q  214 ttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcg 312  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  24888598 ttaacttaaaatcagatttctgcagaattgtggcacgatggctaggcaacgtggcacgattggaggtttcaagttt-gaggcaaagcactggaaaaatcg 24888696  T
Q  313 tggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaactt 412  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| | ||||    
T  24888697 tggcacgatgggatcgcatcgtggcacgatggtgtgctggcagcgaaaaacagaaacatatttttgagtgcagatttgttccaaattttaagcaatactt 24888796  T
Q  413 ttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagag 512  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24888797 ttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggattgtatagag 24888896  T
Q  513 tttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactt 611  Q
    |||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||  |||||    
T  24888897 tttgtctctttggaacaaacactaggctttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagactaggactt 24888995  T
Q  612 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctccccca 710  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  24888996 tgggtagaattaggcgggagacttattcatgtaacccattgatatctcttttgtaacgttacttatcatatagtggaacggagggctgctctctccccca 24889095  T
Q  711 gactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24889096 gactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 24889135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 208 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 22803270 - 22802728
Alignment:
Q  208 tgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaa 306  Q
    ||||| ||||||| |||||| |||| |  | |||||||| ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  22803270 tgagagttaacttaaaatcaaatttctatagaatcgtggtacgatggctgggcaacgtggcacgattggaggtttcagtttt-gaggaaaggcactggaa 22803172  T
Q  307 aaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcg 406  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||||||    
T  22803171 aaatcgtggctcgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcagcgaataacaaaaacgtatttt-gagtgcagatttgttccaaattttaagcg 22803073  T
Q  407 aaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 506  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22803072 atacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgt 22802973  T
Q  507 atagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctg 605  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  22802972 atagagtttgtctctttggaacaaacattagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctg 22802874  T
Q  606 agactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctct 704  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||| | ||||| | ||||||    
T  22802873 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaatgttactcatcatatagtggaacggagggtttctctct 22802774  T
Q  705 cccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  22802773 cccccagactaggtcaatttgaaccgaactaggtcaacaaattctt 22802728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 206 - 750
Target Start/End: Original strand, 11434769 - 11435293
Alignment:
Q  206 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagttttt-gaggcaaggcactgg 304  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  11434769 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggtacgatggctgggcaacgtggcacgatggaggtttcagttttttgaggcaagacactgg 11434868  T
Q  305 aaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaag 404  Q
    |||||||                     |||||||||||||||| ||||||| || |||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  11434869 aaaaatc---------------------gtggcacgatggtgcgctggcagcgaaaaacagaaacatatttttgagtgcagatttgttccaaattttaag 11434947  T
Q  405 cgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 504  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11434948 cgaaacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 11435047  T
Q  505 gtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggc 603  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||| | ||||| |    
T  11435048 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcctggttaccggaagagtc 11435146  T
Q  604 tgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctc 703  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11435147 taggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctc 11435246  T
Q  704 tcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11435247 tcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 11435293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 206 - 770
Target Start/End: Complemental strand, 9174684 - 9174118
Alignment:
Q  206 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgga 305  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||  |||| ||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||    
T  9174684 tgtgagagttaacttaaaatcaggttc-tgcagaatcgtggcacgacggctaggcaacgtagcacgatggaggttttagtttattaggcaaggcactgga 9174586  T
Q  306 aaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagc 405  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  || |||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||    
T  9174585 aaaatcatggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcagggaaaaacagaaacatatttttgggtgcagatttgttacagtttttaagc 9174486  T
Q  406 gaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 505  Q
     | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9174485 aagacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttg 9174386  T
Q  506 tatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattg-agtct-ttggttacggaaagaggc 603  Q
    ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| ||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||      
T  9174385 tatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggttcgtgagttgattcacctt-gggaaacactattaggattgaagtctcttggttacgggaagagat 9174287  T
Q  604 tgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctc 703  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| ||||    
T  9174286 tgagactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaactcattgatttctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgttctc 9174187  T
Q  704 tcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaatt--cttgtatttttctcttctttgtg 770  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||| || ||||||||||||||    
T  9174186 tgccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttctcttctttgtg 9174118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 332; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 206 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 36920125 - 36919578
Alignment:
Q  206 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgg 304  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| ||||||    
T  36920125 tgtgagagttaacttaaaatcaggttc-tgcaaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattggaggtttcaatttt-gaggcaagtcactgg 36920028  T
Q  305 aaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaag 404  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  | |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36920027 aaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcagcgaatagtagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaag 36919928  T
Q  405 cgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttg--agatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 502  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36919927 cgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgatagatatagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 36919828  T
Q  503 ttgtatagagtttgtctcttcgg-aagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaaga 600  Q
    ||| ||| |||||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  36919827 ttggataaagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaga 36919729  T
Q  601 ggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgc 699  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||    
T  36919728 ggctgggacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacgttattcatcatatagtggaatagatggctgc 36919629  T
Q  700 tctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36919628 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 36919578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 293 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 22047135 - 22046680
Alignment:
Q  293 gcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgtt 392  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||  || |||| |||||||||||| | |||| |||||||    
T  22047135 gcaaggcactggaaaaatc-tggcacgatgggatcgcatcgtggcacgatggtgtgctggcagggaaaaacagaaacatatttttag-tgcagatttgtt 22047038  T
Q  393 ccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaaca 492  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22047037 ccaaattttaagcgatacttttactataaatataggccttgtatcggagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaaca 22046938  T
Q  493 aaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggtt 591  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22046937 aaactagggtttgtatagagtttgtcttttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggtt 22046839  T
Q  592 acggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcag 691  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22046838 acgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcgg 22046739  T
Q  692 agggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22046738 agggctgctctctccctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 22046680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 203 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 36922036 - 36921487
Alignment:
Q  203 taatgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcac 301  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||| ||  |||| |||||||| ||||||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||    
T  36922036 taatgtgagagttaacttaaaatcaggttc-tgcaaaatcgtggtacgatggctgggcaacatggcacgattggaggtttcagtttt-gaggcaagtcac 36921939  T
Q  302 tggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaatttt 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  36921938 tggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcattgtggcacgatggtgcattggcagcgaataacagaaacgtatttttggatgcagatttgttccaaatttt 36921839  T
Q  402 aagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt--gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactag 499  Q
    |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36921838 aagcgatacttttacaataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagagatagaggggg-tgaaacaagggcttagaaaggcaacaacaaaactag 36921740  T
Q  500 ggtttgtatagagtttgtctcttcgg-aagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaa 597  Q
    |||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  36921739 ggtttgtatatagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 36921641  T
Q  598 agaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggc 696  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| | || |||    
T  36921640 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggatggc 36921541  T
Q  697 tgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36921540 tgctctctcccccagactagttaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 36921487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 258 - 750
Target Start/End: Original strand, 5198266 - 5198759
Alignment:
Q  258 ggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagc 356  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||  ||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||    
T  5198266 ggcaacgtggcacgattggagatttcaagttt-gaggcaaagctctggaaaaatcgtggcacgatgggatcacatcgtggcacgatggtgcgctggcagc 5198364  T
Q  357 aaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatag 456  Q
     || |||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5198365 gaaaaacagaaacatatttttgagtgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatag 5198464  T
Q  457 agggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctc 556  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||||||||||      
T  5198465 agggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggatttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattc-a 5198563  T
Q  557 cttggggaaacactattaggattgagtc-tttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatt 655  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  || | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5198564 ctttgggaaacactattaggattgagtcttttggttacgggaagagattggggctttgtgtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatt 5198663  T
Q  656 tctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5198664 tctcttttgtaacgatactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgtgtcaacaaattctt 5198759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 312; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 239 - 750
Target Start/End: Original strand, 9148087 - 9148591
Alignment:
Q  239 aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggc 337  Q
    |||||||| ||||| ||  ||||||||||| |||| ||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9148087 aatcgtggtacgattgctgggcaacgtggcgcgattggaggtttcaagttt-gaggcaaagcactggaaaaatcgtggcacgatggggttgcatcgtggc 9148185  T
Q  338 acgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatc 437  Q
    |||||||        |||||||||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||    
T  9148186 acgatgg--------cagcaaataacagaaacgtatttt-gggtgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatataggccttgtatc 9148276  T
Q  438 aaagcaaactttgaga--tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacact 535  Q
    | ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  9148277 agagcaaactttgagagatagagggggctgaagcaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggatttgtatagagtttgtctctttggaacaaacact 9148376  T
Q  536 agggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagact 634  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  9148377 agggtttgagggttgattcaccttggg-aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttaggtagaattaggcgggagact 9148475  T
Q  635 tattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaact 734  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  9148476 tattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaact 9148575  T
Q  735 gggtcaacaaattctt 750  Q
    ||||||||||||||||    
T  9148576 gggtcaacaaattctt 9148591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 239 - 747
Target Start/End: Original strand, 48486146 - 48486655
Alignment:
Q  239 aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggc 337  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||    |||||||||||||||||| ||  |||||    
T  48486146 aatcgtggcacgatggctgagcaacgtggcacgattggaggtttcagtttt-gaggcaagtcactggatttttcgtggcacgatggggtcacaatgtggc 48486244  T
Q  338 acgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatc 437  Q
    || |||||||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  48486245 acaatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatc 48486344  T
Q  438 aaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactag 537  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||    
T  48486345 agagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttatctctttggaacaaacactag 48486444  T
Q  538 ggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagactta 636  Q
    |||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48486445 ggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagactta 48486543  T
Q  637 ttcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactg 735  Q
    |||||||||  ||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| | | || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  48486544 ttcttgtaacacattgaaatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggactgaactg 48486643  T
Q  736 ggtcaacaaatt 747  Q
    ||||||||||||    
T  48486644 ggtcaacaaatt 48486655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 206 - 770
Target Start/End: Complemental strand, 9177035 - 9176446
Alignment:
Q  206 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgga 305  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  9177035 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggttaggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttaggcaaggcactgga 9176936  T
Q  306 aaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtg----------------------c 383  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  || |||| |||||||||||||||||                      |    
T  9176935 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcagggaaaaacagaaacatatttttgggtgcagatttgttataaatttaaagc 9176836  T
Q  384 aaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaag 483  Q
    | ||||||| ||  |||||||| | || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  9176835 agatttgttacagtttttaagcaagacatttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaa 9176736  T
Q  484 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattg-ag 582  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  9176735 gcaacaacaaaactagggtttgtataaagtttgtctcttaggagcaagcactagggtttgtgggttgattcaccttggg-aaacactattaggattggag 9176637  T
Q  583 tct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatat 681  Q
    ||| |||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9176636 tctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatat 9176537  T
Q  682 agtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaatt--cttgtatttttctcttctttgtg 770  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||   |||| || ||||||||||||||    
T  9176536 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaacagagtcaacaaatttctttgtgttattctcttctttgtg 9176446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 237 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 40091923 - 40091409
Alignment:
Q  237 ataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtg 335  Q
    |||||||||||||| |||   || ||||||||||||| |||| |||||||||| || | ||| || ||||||||||||| || |||||||||||| ||||    
T  40091923 ataatcgtggcacggtggttgggtaacgtggcacgattggagatttcagtttt-gaagtaagccattggaaaaatcgtgccatgatggggtcgcaacgtg 40091825  T
Q  336 gcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgta 435  Q
     |||||||||||  || |||| |||||| ||||| |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  40091824 acacgatggtgcactgacagcgaataacgtaaacgtatttttcagtgcatatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgta 40091725  T
Q  436 tcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacact 535  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||    
T  40091724 tcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggattgtttagagtttgtctctttggaacaaacact 40091625  T
Q  536 agggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagact 634  Q
    | |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40091624 atggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagact 40091526  T
Q  635 tattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaac 733  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  40091525 tattcttgtaacccattgatatctcttttgtaatgttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaac 40091426  T
Q  734 tgggtcaacaaattctt 750  Q
    |||||||||||||||||    
T  40091425 tgggtcaacaaattctt 40091409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 206 - 685
Target Start/End: Complemental strand, 5638006 - 5637524
Alignment:
Q  206 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgga 305  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||| |||  |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5638006 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcggaatcgtggcacgattgctgggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttt-gaggcaaggcactgga 5637908  T
Q  306 aaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagc 405  Q
    |||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||||| | ||||||| || |||| |||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5637907 aaaatcatgtcacgatgggatcgcatcgtggcatgatggtgagctggcagcgaaaaacagaaacgtatttt-gggtgcagatttgttccaaattttaagc 5637809  T
Q  406 gaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggg 501  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5637808 gatacttttactataaatatagaccttgtataagagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactaggg 5637709  T
Q  502 tttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaaga 600  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  5637708 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaga 5637610  T
Q  601 ggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtg 685  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5637609 ggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 5637524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 330 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 22801276 - 22800856
Alignment:
Q  330 atcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagac 429  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| |||||| | ||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  22801276 atcgtggcacgatggtgcgccggcagcaaataacagaaacgtatttt-gagtgcagatttgtttcaaattttaagcgatacttttactataaatatagac 22801178  T
Q  430 cttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaaga 529  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |    
T  22801177 cttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctctttggaaca 22801078  T
Q  530 aacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgg 628  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22801077 aacactagggtttgagggttgattcacctt-ggaaaacactattaggattgagtctcttgattacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgg 22800979  T
Q  629 gagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttgga 727  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22800978 gagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacagagggctgctctctcccccagactaggtcaatttgga 22800879  T
Q  728 ccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  22800878 ccgaactgggtcaacaaattctt 22800856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 206 - 750
Target Start/End: Original strand, 7941133 - 7941662
Alignment:
Q  206 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagttttt-gaggcaaggcactgg 304  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7941133 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgatggaggtttcagttttttgaggcaaggcactgg 7941232  T
Q  305 aaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaag 404  Q
    |||||| |||                     ||||||||||||| |||   | ||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7941233 aaaaatggtg---------------------gcacgatggtgcgctggtgacgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaag 7941311  T
Q  405 cgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 502  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||   ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7941312 cgaaacttttactataaatatagacgttgtatcagagcaaaccgggagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 7941411  T
Q  503 ttgtatagagtttgtctcttcggaagaaa--cactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaag 599  Q
    ||||||||||||||||||||  ||  |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | |||    
T  7941412 ttgtatagagtttgtctcttacgagcaaatgcactagggtttgtgggttgattcaccttggg-aaacactattaggattgagtctcttggttacaggaag 7941510  T
Q  600 aggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctg 698  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  7941511 aggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggattggagggctg 7941610  T
Q  699 ctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7941611 ctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 7941662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 260 - 749
Target Start/End: Original strand, 24880299 - 24880790
Alignment:
Q  260 caacgtggcacga-tggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaa 358  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||    ||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||| |    
T  24880299 caacgtggcacgaatggaggtttcagtttt-gaggcaagtcactggatttttcgcggcacgatgggattgcaacgtggcacgatggtgcgctggcagcga 24880397  T
Q  359 ataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagag 458  Q
    |||||| |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||  || |||||| |||||||||    
T  24880398 ataacagaaacgtatttttggatgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcggagtaaacttggagatagag 24880497  T
Q  459 ggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctcct 558  Q
    |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| ||| |||    
T  24880498 ggggcgtaaactagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttggttcacct 24880597  T
Q  559 tggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttc 657  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  24880598 t-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatc 24880696  T
Q  658 tc-tttgt-aacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 749  Q
    || ||||| |||||||| |||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24880697 tcttttgtaaacgttacgcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 24880790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 287; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 259 - 749
Target Start/End: Original strand, 24878836 - 24879328
Alignment:
Q  259 gcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagca 357  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| || ||||| |     
T  24878836 gcaacgtggcacgattggaggtttcagtttt-gacgcaagtcactggatttttcgtggcacgatgggattgcaacgtggcacgatggtacgctggcatcg 24878934  T
Q  358 aataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagataga 457  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||    
T  24878935 aataacagaaacgtatttttgggtgcatatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatccgagtaaacttggagataga 24879034  T
Q  458 gggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctcc 557  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  24879035 gggggctgaaactagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacaccagggtttgagggttgattcacc 24879134  T
Q  558 ttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgattt 656  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  24879135 tt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatat 24879233  T
Q  657 ctc-tttgt-aacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 749  Q
    ||| ||||| |||| ||| |||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24879234 ctcttttgtaaacgatacacatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 24879328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 206 - 750
Target Start/End: Original strand, 18846923 - 18847491
Alignment:
Q  206 tgtgagatttaacttcaaatcagatttat--gcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcact 302  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||| |  ||| |||||||||||||| |   || | ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  18846923 tgtgagagttaacttaaaatcagatttttctgcagaatcgtggcacgattgttgggaatcgtggcacgattggaggtttcagtttt-gaggcaaggtact 18847021  T
Q  303 ggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattt-- 400  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | || |  || |||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||      
T  18847022 ggaaaaatcgtggtacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctcgcggggaaaaacagaaacatatttttgggtgcagatttgttacaaatttaa 18847121  T
Q  401 --------------------taagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttaga 480  Q
                        ||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18847122 agcagatttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagaccttgtatcaaaacaaactttgagatagagggggttgaaacaagggtttaga 18847221  T
Q  481 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggatt- 579  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||     
T  18847222 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagagtttgtgggttgattcacctt-gggaaacactattagcattg 18847320  T
Q  580 gagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatca 678  Q
    |||||| |||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18847321 gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatca 18847420  T
Q  679 tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18847421 tatagtggattggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 18847491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 206 - 687
Target Start/End: Complemental strand, 3825112 - 3824627
Alignment:
Q  206 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgg 304  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||| |||| ||||||| |||||||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  3825112 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtgacacgatggctgggcaacatggcacgattggaggtttcagtttt-gaggcaaagcactgg 3825014  T
Q  305 aaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaag 404  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | ||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3825013 aaaaatcatggcacaatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgttggcgacgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaag 3824914  T
Q  405 cgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaa-ctttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactag 499  Q
    | | |||||||||| ||||||||||||||||||| || |   ||||||||    |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||    
T  3824913 caatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtatttctttgagagagatagagggggctgaaaca--ggtttagaaaagcaacaacaaaactag 3824816  T
Q  500 ggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaa 598  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  3824815 ggtttgtatagagtttgtctctttggaactaacactagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctattggttacgggaa 3824717  T
Q  599 gaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtgga 687  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3824716 gaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgga 3824627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 409 - 770
Target Start/End: Complemental strand, 8631759 - 8631391
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 504  Q
    ||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8631759 actttcactataaatatagactttgtatcaaagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 8631660  T
Q  505 gtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggc 603  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  8631659 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggc 8631561  T
Q  604 tgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctct 702  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8631560 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 8631461  T
Q  703 ctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattc--ttgtatttttctcttctttgtg 770  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||    
T  8631460 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtg 8631391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 332 - 750
Target Start/End: Original strand, 47274647 - 47275064
Alignment:
Q  332 cgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagacct 431  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||    
T  47274647 cgtggcacgatggtgcgatggcagcgaataacataaacgtatttttgggtgcagatttgtttcaaattttaagcaatacttttactataaatatagacct 47274746  T
Q  432 tgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaa 531  Q
    ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||    
T  47274747 tgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata-agtttgtctctttggaactaa 47274845  T
Q  532 cactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcggga 630  Q
    |||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  47274846 cactagggtttgagggttgattcatctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaagctgggactttgggtagaattaggcggga 47274944  T
Q  631 gacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggacc 729  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  47274945 gacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggacc 47275043  T
Q  730 gaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  47275044 gaaccgggtcaacaaattctt 47275064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 263 - 770
Target Start/End: Complemental strand, 11009075 - 11008540
Alignment:
Q  263 cgtggcacgatggaggtttcagtttttg-aggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaata 361  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |    
T  11009075 cgtggcacaatggaggtttcaatttttttaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcactggcagcaaaaa 11008976  T
Q  362 acataaacatatttttgggtg----------------------caaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaa 439  Q
    ||| |||||||||||||||||                      || ||||||| || ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||     
T  11008975 acagaaacatatttttgggtgcagatttgttacagattttaagcagatttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagaccttgtatcag 11008876  T
Q  440 agcaaacttt-----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacac 534  Q
     || |  ||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11008875 -gctattttgagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacac 11008777  T
Q  535 tagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggatt-gagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggaga 632  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11008776 tagggtttgtgggttgattcacctt-gggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggaga 11008678  T
Q  633 cttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaa 732  Q
    ||||||||||||| |||||||||  ||||||||| | |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11008677 cttattcttgtaacccattgatt--tctttgtaatggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaa 11008580  T
Q  733 ctgggtcaacaaattc--ttgtatttttctcttctttgtg 770  Q
    || |||||||||||||  |||| || ||||||||||||||    
T  11008579 ctaggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtg 11008540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 409 - 770
Target Start/End: Complemental strand, 2485209 - 2484845
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagataga-gggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 507  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2485209 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagctagaagggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 2485110  T
Q  508 tagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctga 606  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||     
T  2485109 tagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttctgggttgattcaccttggg-aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgg 2485011  T
Q  607 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcc 706  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2485010 gactttgggtagagataggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcc 2484911  T
Q  707 cccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattc--ttgtatttttctcttctttgtg 770  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||||||||||||    
T  2484910 cccagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcctttgtgttcttctcttctttgtg 2484845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 409 - 750
Target Start/End: Original strand, 40637071 - 40637413
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 508  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40637071 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 40637170  T
Q  509 agagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgag 607  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||  ||||    
T  40637171 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggatcgagtctcttggttacgggaagagattgag 40637269  T
Q  608 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcc 706  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||    
T  40637270 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggatggctgctctctcc 40637369  T
Q  707 cccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40637370 cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 40637413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 386 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 16934502 - 16934140
Alignment:
Q  386 atttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggc 485  Q
    ||||||| || |||||||||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  16934502 atttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgatacaagggtttagaaaagc 16934403  T
Q  486 aacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggatt-gagtc 584  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||    
T  16934402 aacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcacctt-gagaaacactattaggattggagtc 16934304  T
Q  585 t-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatag 683  Q
    | |||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  16934303 tcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatag 16934204  T
Q  684 tggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 747  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  16934203 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 16934140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 409 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 44600174 - 44599836
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 508  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  44600174 acttttactataaatatagaccttgtattaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 44600075  T
Q  509 agagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggatt-gagtct-ttggttacggaaagaggctga 606  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||  ||     
T  44600074 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt-gggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgg 44599976  T
Q  607 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcc 706  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  44599975 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcc 44599876  T
Q  707 cccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaat 746  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  44599875 cccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaat 44599836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 409 - 750
Target Start/End: Original strand, 24348211 - 24348557
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 504  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24348211 acttttactataaatatagaccttgtatcaagctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaaggttt 24348310  T
Q  505 gtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggc 603  Q
    |||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  24348311 gtatagagtttgtctctttgaaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggc 24348409  T
Q  604 tgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctct 702  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24348410 tgggactttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 24348509  T
Q  703 ctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24348510 ctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 24348557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 386 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 16932148 - 16931786
Alignment:
Q  386 atttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggc 485  Q
    ||||||| || |||||||||   |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  16932148 atttgttacagattttaagcaggacttttactataaatataaaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgatacaagggtttagaaaagc 16932049  T
Q  486 aacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggatt-gagtc 584  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||    
T  16932048 aacaacaaaactagggtttgtatagagtctgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcacctt-gagaaacactattaggattggagtc 16931950  T
Q  585 t-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatag 683  Q
    | |||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  16931949 tcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatag 16931850  T
Q  684 tggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 747  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  16931849 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 16931786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 260 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 619932 - 619445
Alignment:
Q  260 caacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaa 358  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||||||| |||||||| || ||||    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||| || |    
T  619932 caacgtggcacaattggatgtttcagtttt-gaggcaagtcattggatttttcgtggcacgatggggtcgcaacgtggcacaatggtgcgctggcggcga 619834  T
Q  359 ataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagag 458  Q
    |||||| ||||||||||||||||  | |||| ||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  619833 ataacagaaacatatttttgggtagagattttttccaaattttaaacgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagag 619734  T
Q  459 ggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctcct 558  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | || ||||||||||||||| |||||||||  |||    
T  619733 ggggctgaaacaagggtttataaagacaacaacaaaactagggtttgcatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgatttacct 619634  T
Q  559 tggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttc 657  Q
    | ||||||||||||||||||||| | | ||||||| || |||||  || | |||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||||| ||    
T  619633 t-gggaaacactattaggattgactgtcttggttaagggaagagattgggtctttgggtagaattaggcgggaaaattattcttataacccattgatatc 619535  T
Q  658 tc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 747  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| | | || | ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  619534 tcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggatgactgctctctccccta-actaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 619445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 409 - 770
Target Start/End: Original strand, 47868398 - 47868762
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 508  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47868398 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagagggctgaaagaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 47868497  T
Q  509 agagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgag 607  Q
    |||||||||||| | |||| |||||||||| |||| |||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  47868498 agagtttgtctccttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt-ggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgag 47868596  T
Q  608 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcc 706  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | || |||||||||||||    
T  47868597 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggaacggatggctgctctctcc 47868696  T
Q  707 cccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattc--ttgtatttttctcttctttgtg 770  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||||||||||||    
T  47868697 cccatactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcttttgtgttattctcttctttgtg 47868762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 409 - 750
Target Start/End: Original strand, 6764836 - 6765183
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 508  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6764836 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 6764935  T
Q  509 agagtttgtctcttc-----ggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagagg 602  Q
    ||||||||||||||      |||| |||||||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||| || ||||||    
T  6764936 agagtttgtctctttagtttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttggg-aaacactgttaggattgagtctcttggttatgggaagagg 6765034  T
Q  603 ctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctc 701  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  6765035 ctgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggattggagggctgctc 6765134  T
Q  702 tctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6765135 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 6765183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 409 - 770
Target Start/End: Original strand, 14633317 - 14633679
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 508  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14633317 actttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaaggg-ctgaaacaaaggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtat 14633415  T
Q  509 agagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgag 607  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  || |    
T  14633416 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgg-aagagattggg 14633513  T
Q  608 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcc 706  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||    
T  14633514 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaatgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcc 14633613  T
Q  707 cccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattc--ttgtatttttctcttctttgtg 770  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||    
T  14633614 ctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtg 14633679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 409 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 22132735 - 22132389
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagag---------ggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactag 499  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||    ||||||||||| ||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22132735 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagagagatagaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaacttg 22132636  T
Q  500 ggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaa 598  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  22132635 ggtttgtatagagtttgtctcttcg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggg-aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaa 22132538  T
Q  599 gaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctg 698  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  22132537 gaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctg 22132438  T
Q  699 ctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 747  Q
    |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22132437 ctctctcccctatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 22132389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 450 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 18709458 - 18709161
Alignment:
Q  450 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggtt 549  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  18709458 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgagtt 18709359  T
Q  550 gattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaacc 648  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  18709358 gattcaccttggg-aaacactattagggttgagtctcttggttacgggaagagattgcgactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaaccc 18709260  T
Q  649 attgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 747  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  18709259 attgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggaggactgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 18709161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 409 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 17662574 - 17662239
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 504  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17662574 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 17662475  T
Q  505 gtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggc 603  Q
    ||           ||||| | || |||||||||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| |    
T  17662474 gt-----------ctctttgaaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttggg-aaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagac 17662387  T
Q  604 tgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctct 702  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17662386 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 17662287  T
Q  703 ctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17662286 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 17662239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 450 - 770
Target Start/End: Complemental strand, 22134909 - 22134590
Alignment:
Q  450 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggtt 549  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||    
T  22134909 gagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttca-aacaaacactagggtttgtgggtt 22134812  T
Q  550 gattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaacc 648  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| || || |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22134811 gattcaccttggg-aaacactattaggattgagtctcttggttatgggaaaaggctgggacattgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 22134713  T
Q  649 attgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaatt- 747  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  22134712 attgatttctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattt 22134614  T
Q  748 -cttgtatttttctcttctttgtg 770  Q
      |||| || ||||||||||||||    
T  22134613 ctttgtcttcttctcttctttgtg 22134590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 411 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 33415821 - 33415482
Alignment:
Q  411 ttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 510  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33415821 ttttactacaaatataggctttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggtaacaacaaaactagggtttgtatag 33415722  T
Q  511 agtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagac 609  Q
    |||||||||||| |||| |||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| |||||  |||| |    
T  33415721 agtttgtctctt-ggaacaaacactaaggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaagatcgagtctcttggttacgggaagagattgaggc 33415624  T
Q  610 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccc 708  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||     
T  33415623 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccct 33415524  T
Q  709 cagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33415523 caggctaggtcaatttggaccgaactgggtcaataaattctt 33415482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 410 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 38928513 - 38928171
Alignment:
Q  410 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 509  Q
    ||||||||| |||||||| | |||||| | || |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38928513 cttttactataaatataggctttgtattagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 38928414  T
Q  510 gagtttgtctcttcgg-aagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgag 607  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||  || |    
T  38928413 gagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattggg 38928315  T
Q  608 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcc 706  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||  | | ||||||||||||||||    
T  38928314 gctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtaaaacggagggctgctctctcc 38928215  T
Q  707 cccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38928214 cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 38928171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 409 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 14787769 - 14787406
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 506  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14787769 acttttactataaatatagaccttgtatcatactaaactttgagagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgt 14787670  T
Q  507 atagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctg 605  Q
    ||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| || ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  ||    
T  14787669 atagagtttgtctttttggaacaaacactagggtttgaggattgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattg 14787571  T
Q  606 agactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctg--ctct 702  Q
     |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||  ||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||  ||||    
T  14787570 tgactttggatagaattaggtgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctct 14787471  T
Q  703 ctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttgtatttttctcttcttt 767  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  14787470 ctcccccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattcttgtgttcttctcttcttt 14787406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 410 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 12396180 - 12395839
Alignment:
Q  410 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 509  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||| || | |||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12396180 cttttactataaatatagacattgtataaatgtaaaccttgagatagatggggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 12396081  T
Q  510 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgaga 608  Q
    ||||||||||||    || ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  || ||    
T  12396080 gagtttgtctctagccaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgtga 12395982  T
Q  609 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctccc 707  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| | | | |||||||||||||||    
T  12395981 ctttgggtagaattaggcgggagacttattgttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacggggggctgctctctccc 12395882  T
Q  708 ccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  12395881 ccagactaggtcaatttggaccgaacagggtcaacaaactctt 12395839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 450 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 22780668 - 22780371
Alignment:
Q  450 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggtt 549  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  22780668 gagatagagggggctgaaacaggggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 22780569  T
Q  550 gattctccttggggaaacactattaggattg-agtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaac 647  Q
    ||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||||  || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22780568 gattcaccttggg-aaacactgttaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacc 22780470  T
Q  648 cattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaat 746  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  22780469 cattgatttctctttgtaacgatactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaat 22780371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 450 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 22783033 - 22782736
Alignment:
Q  450 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggtt 549  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  22783033 gagatagagggggctgaaacaggggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 22782934  T
Q  550 gattctccttggggaaacactattaggattg-agtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaac 647  Q
    ||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22782933 gattcaccttggg-aaacactgttaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacc 22782835  T
Q  648 cattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaat 746  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||    
T  22782834 cattgatttctctttgtaacgatactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactggatcaacaaat 22782736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 410 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 12401142 - 12400801
Alignment:
Q  410 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 509  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||| || | |||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12401142 cttttactataaatatagacattgtataaatgtaaaccttgagatagatggggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 12401043  T
Q  510 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgaga 608  Q
    ||||||||||||    || ||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||  || ||    
T  12401042 gagtttgtctctggccaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagagattgtga 12400944  T
Q  609 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctccc 707  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| | | | |||||||||||||||    
T  12400943 ctttgggtagaattaggcgggagacttattgttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacggggggctgctctctccc 12400844  T
Q  708 ccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  12400843 ccagactaggtcaatttggaccgaacagggtcaacaaactctt 12400801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 409 - 747
Target Start/End: Original strand, 36378289 - 36378629
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 508  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||| |  |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36378289 acttttactataaatatagactttgtatcagaataaaccttgagatagacggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 36378388  T
Q  509 agagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgag 607  Q
    |||||||||||||| | || |||||||||||||||  ||||||||| |||| || |||||||||||||||| ||||| || ||||||| |||||  || |    
T  36378389 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgaaggttgattcacctt-ggaaaacactattaggattaagtctcttagttacgggaagagattggg 36378487  T
Q  608 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctct-ttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctc 705  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||| | ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||    
T  36378488 actttgggtagaattaagcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctcttgtgaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctc 36378587  T
Q  706 ccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 747  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  36378588 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaatt 36378629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 410 - 750
Target Start/End: Original strand, 19095880 - 19096222
Alignment:
Q  410 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 509  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||    
T  19095880 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaattagggtttgtata 19095979  T
Q  510 gagtttgtctcttcgg-aagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgag 607  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  | ||    
T  19095980 gagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgtg-aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt-ag 19096077  T
Q  608 a-ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctc 705  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| | | ||| |||||||||||    
T  19096078 agctttgggtagaattaggcgggagactaattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttacttatcatatagtgaaacggagagctgctctctc 19096177  T
Q  706 ccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19096178 ccccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattctt 19096222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 409 - 740
Target Start/End: Complemental strand, 47211082 - 47210756
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 502  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||    |||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47211082 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 47210983  T
Q  503 ttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagag 601  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||             | ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||    
T  47210982 ttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtg-------------ttgggaaacactattaggattgagtctcttagttacgggaagag 47210896  T
Q  602 gctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgct 700  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  47210895 gctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgct 47210796  T
Q  701 ctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtca 740  Q
    |||||||||| ||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  47210795 ctctcccccaaactagatcaatttggaccgaactgagtca 47210756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 411 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 37313400 - 37313059
Alignment:
Q  411 ttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 510  Q
    |||||||| ||||||||   ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  37313400 ttttactataaatataggttttgtatcaaagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatag 37313301  T
Q  511 agtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagac 609  Q
    |||||||||||| | || ||||||||||||||| | |||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||     
T  37313300 agtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagagttgattcacctt-gagaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattgggat 37313202  T
Q  610 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctccc 707  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||    
T  37313201 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattaatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctttccc 37313102  T
Q  708 ccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    |||||||| || |||||||||| || ||| |||||||||||||    
T  37313101 ccagactatgtcaatttggaccaaattggatcaacaaattctt 37313059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 485 - 770
Target Start/End: Complemental strand, 26086236 - 26085949
Alignment:
Q  485 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtc 584  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26086236 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggg-aaacactattaggattgagtc 26086138  T
Q  585 t-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatag 683  Q
    | |||||||||| |||||  || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26086137 tcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgttttctctttgtaacgatactcatcatatag 26086038  T
Q  684 tggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattc--ttgtatttttctcttctttgtg 770  Q
    |||||| || |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  |||| || ||||||||||||||    
T  26086037 tggatcggaaggctgctctctccctcagactaggtcaatttggaccgaactgtgtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtg 26085949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 409 - 750
Target Start/End: Original strand, 16453306 - 16453649
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 508  Q
    |||||| ||| |||||||| | |||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||     
T  16453306 acttttgctataaatataggctttgtatcagagcaaaccgagagatagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagagtttgtac 16453405  T
Q  509 agagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgag 607  Q
    | |||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||  || |    
T  16453406 aaagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggg 16453504  T
Q  608 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctc 705  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||| | |||| || |||||||||    
T  16453505 actttgggtagtattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacagatggttgctctctc 16453604  T
Q  706 ccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  16453605 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgcgccaaaaaattctt 16453649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 180; E-Value: 8e-97
Query Start/End: Original strand, 311 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 52942881 - 52942542
Alignment:
Q  311 cgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaac 410  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  | ||    
T  52942881 cgtggcacgatggggtcacaacgtggcacgatgatgcgctggcagcgaataacataaacatattttttggtgcagatttgttccaaattttaagtaatac 52942782  T
Q  411 ttttactacaaatatagaccttgtat--caaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 508  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||  || |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52942781 tttcactataaatatagaccttgtatatcagactaaactttgagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 52942683  T
Q  509 agagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgag 607  Q
    |||||||||||||| | || ||||||||||||||| || ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||                
T  52942682 agagtttgtctctttgaaacaaacactagggtttgaggattgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgg------------ 52942596  T
Q  608 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctcttt 662  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  52942595 -gtttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttt 52942542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 177; E-Value: 5e-95
Query Start/End: Original strand, 409 - 750
Target Start/End: Original strand, 53405124 - 53405472
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagataga---gggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 505  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||    ||||||||||| |||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53405124 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 53405223  T
Q  506 tatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggct 604  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||| |||||| |||| |||||||||| |||| | |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  53405224 tatagagtttgtctctttagaacaaa-actaggttttgagggttgattcacctt-gagaaacactattaagattgagtctcttggttacggaaagaggct 53405321  T
Q  605 gagactttgggtagaattaggcgggaga------cttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggct 697  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||      ||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||| ||||| |||    
T  53405322 gagactttaggtagaattaagcgggagacttattcttattcttgtaacccattgatttctcttttgaaacgatactcatcatatagtggaacagagagct 53405421  T
Q  698 gctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  53405422 g--ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattctt 53405472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 420 - 750
Target Start/End: Original strand, 19322705 - 19323034
Alignment:
Q  420 aaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtct 519  Q
    ||||||||| ||||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  19322705 aaatatagatcttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggatgaaacaagggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ct 19322802  T
Q  520 cttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtag 618  Q
    ||| | || |||||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||  |||||||||||||||    
T  19322803 cttggcaacaaacactagggtttg--ggttgattcaccttggg-aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtag 19322899  T
Q  619 aattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactag 716  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||    
T  19322900 aattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggatgctctctcccccagactag 19322999  T
Q  717 gt-aaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    || |  ||||||||||||||| | |||||||||||    
T  19323000 gtcagttttggaccgaactggataaacaaattctt 19323034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 411 - 740
Target Start/End: Original strand, 56030443 - 56030770
Alignment:
Q  411 ttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 510  Q
    |||||||| |||||||| | |||||||| || |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||    
T  56030443 ttttactataaatataggctttgtatcagagtaaaccttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagagtttgtatag 56030542  T
Q  511 agtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagac 609  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||  ||   |    
T  56030543 agtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtttcttggttacgggaagagattggagc 56030641  T
Q  610 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattg--atttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctccc 707  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||  |||||| |||||||||||| ||||||||   || | | |||||||||||||||||    
T  56030642 tttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatttct-tttgtaacgttattcatcata---tgaaacggagggctgctctctccc 56030737  T
Q  708 ccagactaggtaaatttggaccgaactgggtca 740  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  56030738 ctagactaggtcaatttggaccgaactgggtca 56030770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 414 - 747
Target Start/End: Original strand, 41997494 - 41997828
Alignment:
Q  414 tactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagt 513  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| || |||| |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  41997494 tactataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagataaagggggctgaaacaagtgttcagaaaggaaacaacaaaactagagtttgtatagagt 41997593  T
Q  514 ttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagacttt 612  Q
    ||||||||| | || ||||||||||||||| |||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||  ||||| |||    
T  41997594 ttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt-ggaaaacactattaggattgagtctcttagttacgggaaaagattgagatttt 41997692  T
Q  613 gggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcat-atagtggatcagagggctgctctctccccca 710  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || || |||| ||||||| |||||||||||| |||||| | | |||||| ||||||| |||||    
T  41997693 gggtagaattaggtgggagacttattcttgtaaccctttaatatctcttttgtaaagttactcatcatcatagtgaaacggagggccgctctct-cccca 41997791  T
Q  711 gactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 747  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  41997792 gactaggttaatttggaccgaactggataaacaaatt 41997828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 316 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 8756679 - 8756247
Alignment:
Q  316 cacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaactttta 415  Q
    ||||||| | ||||| |||| || | ||||||| |||  || ||||||| |||||||||| | |||||| |||||||||||||| ||| ||| |||||||    
T  8756679 cacgatgagatcgcaacgtgccatgttggtgcgctggaggcgaataacagaaacatatttctcggtgcagatttgttccaaattataaacgatactttta 8756580  T
Q  416 ctacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 514  Q
    ||| ||||||||||||||||||| || |||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||| |||||| |||| |||| |||||||||||||    
T  8756579 ctataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatagaaggggctgaaaacaagggtttag-aagtcaacaagaaaattaggatttgtatagagtt 8756481  T
Q  515 tgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgag--tctttggttacggaaagaggctgagacttt 612  Q
    || ||||| | || |||||||||||||   |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||| |||||  |||||||||    
T  8756480 tg-ctcttggcaacaaacactagggtt--ggggttgattcacctt-gggaaacactactaggattgagtctctttggtcacgggaagagattgagacttt 8756385  T
Q  613 gggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctccccca 710  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||| |||||| |||| ||||||||| | || || |||||||||| |||    
T  8756384 gagtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactaatcattatagtggaacggatggttgctctctcctcca 8756285  T
Q  711 gactaggt-aaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 747  Q
    ||||||||    |||||| |||||||||| ||||||||    
T  8756284 gactaggtcggttttggagcgaactgggtaaacaaatt 8756247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 145; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 410 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 18409681 - 18409344
Alignment:
Q  410 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 509  Q
    ||||||||| |||||||||  ||||||||  | ||||  |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18409681 cttttactataaatatagaatttgtatcagtgtaaacaatgagatagagagg-ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 18409583  T
Q  510 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgaga 608  Q
    ||||||||| ||| | || ||||||||||||||| |||||||||  |||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||||  | |||||  |||||    
T  18409582 gagtttgtcacttggcaacaaacactagggtttgagggttgattaaccttcggg-aacactattaggattgagtctcttagttataggaagagattgaga 18409484  T
Q  609 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcc 706  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||| ||||| ||||||| | ||||| | ||||||||||    
T  18409483 cttttggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaa-gttacccatcattatagtgaaacagagagttgctctctcc 18409385  T
Q  707 cccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 747  Q
    | |||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||    
T  18409384 ctcagactaggtcaatttggattgaactgggtaaacaaatt 18409344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 488 - 750
Target Start/End: Original strand, 36380425 - 36380689
Alignment:
Q  488 caacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-t 586  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || || || ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| | |    
T  36380425 caacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaaaaaccattagggtttgagggttgattcaccttggg-aaacactattaggattgagtatct 36380523  T
Q  587 tggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcat-atagt 684  Q
    ||||||| | |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | ||||| |||| |||||||||||| |||||    
T  36380524 tggttaccggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatatcttttgtaaagttactcatcattatagt 36380623  T
Q  685 ggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    ||| | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  36380624 ggaactgagtgctgctctctcccccagactaggtcaatttggagcgaactgggtaaacaaattctt 36380689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 411 - 724
Target Start/End: Original strand, 13543953 - 13544272
Alignment:
Q  411 ttttactacaaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 505  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||| | | |||||||||||    |||||||||||||||||||| | ||||| | |||||||||||||||||||||    
T  13543953 ttttactataaatatagatcttgtatcagatgtaaactttgagagagatagagggggctgaaacaaggatctagaatgacaacaacaaaactagggtttg 13544052  T
Q  506 tatagagtttgtctcttcgg-aagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggc 603  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||| || ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||      
T  13544053 tatagagtttgtctctttggcaacaaacacta-ggtttgaggattgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagat 13544150  T
Q  604 tgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctct 702  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| | | |||  |||||||    
T  13544151 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagtactgctct 13544250  T
Q  703 ctcccccagactaggtaaattt 724  Q
    ||  |||||||||||| |||||    
T  13544251 ctttcccagactaggtcaattt 13544272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 410 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 18537806 - 18537470
Alignment:
Q  410 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 508  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||    
T  18537806 cttttactataaatatagatcttgtatcagagtaaacattgagatagagggggctgaaaacaagggtttagaaaca-aacaacaaa-ctagggtttgtat 18537709  T
Q  509 agagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgag 607  Q
    |||||||| ||||| | || || |||||||||| |  ||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||  ||||    
T  18537708 agagtttg-ctcttggcaacaaccactagggttgg--ggttgattcaccttagg-aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgag 18537613  T
Q  608 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctc 705  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||    
T  18537612 acttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctc 18537513  T
Q  706 ccccagactaggt-aaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 747  Q
    ||||| | ||||| |  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  18537512 ccccataataggtcattttttgaccgaactgggtaaacaaatt 18537470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 128; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 607 - 770
Target Start/End: Complemental strand, 5635614 - 5635448
Alignment:
Q  607 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctc 705  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5635614 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctc 5635515  T
Q  706 ccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattc--ttgtatttttctcttctttgtg 770  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||    
T  5635514 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtg 5635448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 128; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 607 - 750
Target Start/End: Original strand, 11437558 - 11437701
Alignment:
Q  607 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcc 706  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11437558 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcc 11437657  T
Q  707 cccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11437658 cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 11437701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 410 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 3937543 - 3937314
Alignment:
Q  410 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 509  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||| || |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  3937543 cttttactataaatatagacttt-tatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaacaagggtttagaaaggcaacaaaaaaactagagtttgtata 3937445  T
Q  510 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgaga 608  Q
    |||||||| |||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||||| | |||||  ||||     
T  3937444 gagtttgtttcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattggaattgagtctcttggttacaggaagagattgagg 3937346  T
Q  609 ctttgggtagaattaggcgggagacttattct 640  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3937345 ctttgggtagaattaggtgggagacttattct 3937314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 529 - 752
Target Start/End: Original strand, 16455358 - 16455583
Alignment:
Q  529 aaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcg 627  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  16455358 aaacactagggtttgatggttgattcaccttggg-aaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcg 16455456  T
Q  628 ggagacttattcttgtaaaccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcat-atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttg 725  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||| ||||||| |||| |||||| | | || | ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16455457 ggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcgtcattatagtgaaacggatgactgctctctcccccagactaggtcaatttg 16455556  T
Q  726 gaccgaactgggtcaacaaattcttgt 752  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  16455557 gaccgaactgggtcaacaaattcttgt 16455583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 410 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 18535164 - 18534828
Alignment:
Q  410 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 508  Q
    ||||||| | |||||||||||| |  ||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||   ||||||||| |||||||||||||    
T  18535164 cttttacaataaatatagacctcgattcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaagtgtttaaaaaca-aacaacaaa-ctagggtttgtat 18535067  T
Q  509 agagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgag 607  Q
    |||||||| ||||| | || ||||||||||||| |  ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| |||  |||||  ||||    
T  18535066 agagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgag-aaacactattaggattgagtctcttggtcacgagaagagattgag 18534971  T
Q  608 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctc 705  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||   ||||||| | ||||||||| | ||||| ||||||| |    
T  18534970 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaaactactcataattatagtggaacggaggggtgctctccc 18534871  T
Q  706 ccccagactaggtaa-atttggaccgaactgggtcaacaaatt 747  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||    
T  18534870 ccccagactaggtaagttttggaccgaacagggtaaacaaatt 18534828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 589 - 750
Target Start/End: Original strand, 4215483 - 4215645
Alignment:
Q  589 gttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcatatagtgga 687  Q
    ||||||| |||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4215483 gttacgggaagaggttgtgacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgga 4215582  T
Q  688 tcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
     | || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4215583 acggatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 4215645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 410 - 630
Target Start/End: Original strand, 6132871 - 6133090
Alignment:
Q  410 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 509  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||   | |||| |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6132871 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaacattgagatagaggaggctgaa-caagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttgtata 6132969  T
Q  510 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgaga 608  Q
    |||||||||| || | || ||||||||||||||| ||||||| || || | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  |||||    
T  6132970 gagtttgtctattggcaacaaacactagggtttgagggttgagtcaccct-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgaga 6133068  T
Q  609 ctttgggtagaattaggcggga 630  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  6133069 ctttgggtagaattaggcggga 6133090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 561 - 750
Target Start/End: Original strand, 2891439 - 2891631
Alignment:
Q  561 gggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc 659  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||| ||||    
T  2891439 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcaggagacttgttcttgtaacccattgatatctc 2891538  T
Q  660 -tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
     ||||||| ||||||||||| ||||||| | |||| | |||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2891539 ttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacagatgactgctctctcccccagactagtacaacttggaccgaactgggtcaacaaattctt 2891631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 561 - 747
Target Start/End: Original strand, 13547302 - 13547490
Alignment:
Q  561 gggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc 659  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| | ||    
T  13547302 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaactcattgatatatc 13547401  T
Q  660 ttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 747  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||| |||||    
T  13547402 ttttgtaaagttactcatcatatagtgaaatggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggatcgaactaggtcaataaatt 13547490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 492 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 38890476 - 38890221
Alignment:
Q  492 aaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggt 590  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| | || ||||| |||||||   ||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  38890476 aaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacattagggtt--ggggttgattcatatt-gggaaacactattaggattgagtctcttgat 38890381  T
Q  591 tacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggat 688  Q
     |||| |||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||     
T  38890380 cacgggaagagattgagactttgggtagaattagaagggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaa 38890281  T
Q  689 cagagggctgctctctcccccagactaggt-aaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 747  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  38890280 cagagggctgctctctccccaagattaggtcagttttggaccgaactgggtaaacaaatt 38890221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 495 - 750
Target Start/End: Original strand, 27499128 - 27499381
Alignment:
Q  495 actagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattc-tccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggtta 592  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||| |||||||||| ||||  | ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27499128 actagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcatcct--gagaaacactattaggattgagtctattggtta 27499225  T
Q  593 cggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatca-tatagtggatcag 691  Q
    ||  |||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| | | | || ||| ||||||| ||||||||||| |||| || | |      
T  27499226 cgataagagattgaggctttgggtataattaggcgggagacttatttttgtaacctaat-atctct-tttgtaaggttactcatcattatattgaaacga 27499323  T
Q  692 agggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27499324 agggctgctct-ttccccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattctt 27499381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 206 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 16932360 - 16932213
Alignment:
Q  206 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgga 305  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  16932360 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 16932261  T
Q  306 aaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggc 353  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  16932260 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggc 16932213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 410 - 574
Target Start/End: Complemental strand, 38270321 - 38270158
Alignment:
Q  410 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 509  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||  | |||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  38270321 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagaagaggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtgta 38270222  T
Q  510 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactatta 574  Q
    |||||||||| || | || ||||||||||||||| |||||||||| |||| || |||||||||||    
T  38270221 gagtttgtcttttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt-ggaaaacactatta 38270158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 204 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 22783319 - 22783170
Alignment:
Q  204 aatgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactg 303  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||| |||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  22783319 aatgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggtacgatagctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactg 22783220  T
Q  304 gaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggc 353  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  22783219 gaaaaatcatggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggc 22783170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 204 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 16934716 - 16934572
Alignment:
Q  204 aatgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactg 303  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  16934716 aatgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacatggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactg 16934617  T
Q  304 gaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcg 348  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  16934616 gaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcctggcacgatggtgcg 16934572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 410 - 574
Target Start/End: Complemental strand, 24446914 - 24446756
Alignment:
Q  410 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 509  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||    
T  24446914 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaac-----aactagggtttgtata 24446820  T
Q  510 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactatta 574  Q
    ||||||||||||| | ||  |||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  24446819 gagtttgtctcttggaaacgaacactagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactatta 24446756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 409 - 548
Target Start/End: Original strand, 5100994 - 5101133
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 508  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||  | |||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  5100994 acttttactataaatatagaccttgaatcagggtaaaccttgagatagaggggactgaaacaaaggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtat 5101093  T
Q  509 agagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggt 548  Q
    |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||    
T  5101094 agagtttgtcactttggaacaaacactagggtttgagggt 5101133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 206 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 22780952 - 22780805
Alignment:
Q  206 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgga 305  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||| |||| |||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  22780952 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggtacgatagctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 22780853  T
Q  306 aaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggc 353  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  22780852 aaaatcatggcacgatggggtctcattgtggcacgatggtgcgctggc 22780805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 411 - 747
Target Start/End: Original strand, 28453686 - 28454020
Alignment:
Q  411 ttttactacaaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 508  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| | |  ||| ||||| ||||| |  |||||| ||||||||||||| | |||||  |||||||||||||| |     
T  28453686 ttttactataaatatagaccttgtatcagatgtgaaccttgaggtagagagt-ctgaaaacaagggtttagaa-gccaacactaaaactagggtttgca- 28453782  T
Q  509 agagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgag 607  Q
     ||||||| ||||| | |||||||||||||||| |  | ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||  |  |    
T  28453783 -gagtttg-ctcttggcaagaaacactagggttgg--gattgattcaccttggg-aaacactgttaggattgagtctcttggttacgggaagagatttgg 28453877  T
Q  608 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctc 705  Q
    || |||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||  ||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| | |||  || |||||||    
T  28453878 accttgggtagaattaggttgaagactaattcttgtaaacttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagaactactctctc 28453977  T
Q  706 ccccagactaggtaaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 747  Q
    ||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||||    
T  28453978 ccccagactaggttagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 28454020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 410 - 527
Target Start/End: Original strand, 2891314 - 2891432
Alignment:
Q  410 cttttactacaaatatagaccttgta-tcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 508  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||| |||  | |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2891314 cttttactataaatatagacattgtaatcagtgtaaaccttaagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 2891413  T
Q  509 agagtttgtctcttcggaa 527  Q
    |||||||||||||| ||||    
T  2891414 agagtttgtctctttggaa 2891432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 564 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 16186018 - 16185831
Alignment:
Q  564 aaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaaaccattgatttctctt 661  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||  ||  ||||||||||||||||||   || |||||||||||| || || ||||| | ||||    
T  16186018 aaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattggaactttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgcaaccctttgatatatctt 16185919  T
Q  662 tgtaacgttactcatcat-atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt-aaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 747  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  16185918 tgtaaagttactcatcattatagtggaacagagggctgctctctcccccagactaggtcagttttggaccgaactgggtaaacaaatt 16185831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 410 - 747
Target Start/End: Original strand, 12102088 - 12102425
Alignment:
Q  410 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagaggggg-ctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 507  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||| |  |||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||   ||||||||| ||||||||| ||    
T  12102088 cttttactataaatatagatcttgtatcagataaaaccttgagatagaggggggctgaaaacaagggtttagaaaca-aacaacaaa-ctagggttt-ta 12102184  T
Q  508 tagag-tttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctg 605  Q
     |||| ||| |||   ||| ||||||  |||||||  ||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| | ||||| | || || ||  ||    
T  12102185 gagagatttctctaagcgggagaaac--tagggttgttg--ttgattcaccttggg-aaacactattaggattgagtatcttggtcatgggaaaagattg 12102279  T
Q  606 agactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaaaccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcat-atagtggatcagagggctgctct 702  Q
      ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| |||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  12102280 gaactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccactgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctct 12102379  T
Q  703 ctcccccagactaggt-aaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 747  Q
    |||||||| ||||||| |  ||||||||||||| ||| ||||||||    
T  12102380 ctcccccatactaggtcagttttggaccgaactaggtaaacaaatt 12102425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 613 - 750
Target Start/End: Original strand, 5101130 - 5101267
Alignment:
Q  613 gggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccag 711  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||| | ||||| ||||  ||||||||||||||||  | | |||||||||| ||||||| ||    
T  5101130 gggtagacttaggcaggagacttattcttgtaacccattgatatgtcttttgtaaatttactcatcatatagtaaaacggagggctgctatctcccc-ag 5101228  T
Q  712 actaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5101229 actaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 5101267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 409 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 15032872 - 15032557
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 508  Q
    |||||||||| |||||||||| | ||| || || |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||    
T  15032872 acttttactataaatatagacttggtaccagagtaaaccttgagataaagggggctgaaacaagggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttgtat 15032774  T
Q  509 agagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgag 607  Q
    |||||||| ||||| | || |||          ||  |||||||||   ||  |||||||||||||||||||||||| ||||  |||  || ||  |  |    
T  15032773 agagtttg-ctctttgcaacaaa----------tg-aggttgattcatatt-tggaaacactattaggattgagtctcttggacacgagaaaagatttgg 15032687  T
Q  608 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctc 705  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||| || |||||| |  || |||||||||||    
T  15032686 acttttggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattacagtggaacgaagagctgctctctc 15032587  T
Q  706 ccccagactaggtaaat-ttggaccgaact 734  Q
    ||||| ||||||| | | ||||||||||||    
T  15032586 ccccaaactaggtcagtattggaccgaact 15032557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 420 - 747
Target Start/End: Original strand, 9863716 - 9864049
Alignment:
Q  420 aaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatag-agggggctgaaa--caagggtttagaaaggcaacaacaaaa-ctagggtttgtatagagttt 515  Q
    ||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||| || | |||||||  ||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||  ||||||    
T  9863716 aaatatagaccttgtatcagatgaaaccttgagatagtagagagctgaaaaacaagggtttagaa-gccaaaaacaaaaactagggtttgta--gagttt 9863812  T
Q  516 gtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtc-tttggttacggaaagaggctgagactttgg 614  Q
    || |||| | || |||||||| |||| |  | ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| |||| |||||  |||||||||||    
T  9863813 gt-tcttggcaacaaacactaaggttgg--gtttgattcaccttggg-aaaccctattaggattgagtcttttggtcacgggaagagattgagactttgg 9863908  T
Q  615 gtagaatt-aggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatca----tatagtggatcagagggctgctctct--ccc 707  Q
    |||||||| ||   | ||||| |||||||||| |  ||||| ||||||||||| |||||||||||    ||||||||| | ||| ||||||||||  |||    
T  9863909 gtagaattaagtttgaagactaattcttgtaaccttttgatatctctttgtaaagttactcatcatcattatagtggaacggagagctgctctctccccc 9864008  T
Q  708 ccagactaggtaaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 747  Q
    |||||||| || | | |||||||||||||||| ||||||||    
T  9864009 ccagactaagtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 9864049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 500 - 750
Target Start/End: Original strand, 30136640 - 30136889
Alignment:
Q  500 ggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaa 598  Q
    ||||||||||||||||  ||||| | || ||||||||||||| |  ||||||||| ||||||| |||||||| || ||||| |||| ||||| |||  ||    
T  30136640 ggtttgtatagagttta-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttggg-aaacactactatgattgggtctcttggtcacgagaa 30136735  T
Q  599 gaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggc 696  Q
    ||   || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||| ||| |||| ||||||| |||| |||||| ||||||| | |||| |||    
T  30136736 gaaattgtgactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtgactcatcgatatctcttttgtaaagttaatcatcattatagtgaaacagatggc 30136835  T
Q  697 tgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    |||||||||| | | ||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||    
T  30136836 tgctctctcctcaatactaggtcaatttggaccgaattggataaacaaattctt 30136889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 466 - 721
Target Start/End: Original strand, 9022362 - 9022616
Alignment:
Q  466 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaa 565  Q
    |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| ||| ||   ||||| | || |||||||| |||| |  | ||||||| |||||| |||    
T  9022362 aaacaagggtttagaa-gtcaacatcaaaactagggtttgtagagaatt---ctcttggcaacaaacactatggttgg--gattgattcaccttggagaa 9022455  T
Q  566 acactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaaacc--attgatttctctt 661  Q
    ||| ||||||||| || | | ||||| |||| |||||  ||||||||||||| ||||||||   || |||| |||||||||| |   |||||| ||||||    
T  9022456 acagtattaggatagaatttcttggtcacgggaagagattgagactttgggttgaattaggtttgaagactaattcttgtaacctctattgatatctctt 9022555  T
Q  662 tgtaacgttactcatcat-atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaa 721  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  9022556 tgtaaagttactcatcattatagtggaacaaagggctgctctctcccccatattaggtaaa 9022616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 699 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 14789473 - 14789405
Alignment:
Q  699 ctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttgtatttttctcttcttt 767  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  14789473 ctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttgtgttcttctcttcttt 14789405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 660 - 750
Target Start/End: Original strand, 47563010 - 47563100
Alignment:
Q  660 tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| | | ||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  47563010 tttgtaaggttactcatcttatagtgaaacggagggctgctctctccccttgactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattctt 47563100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 386 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 40999306 - 40998990
Alignment:
Q  386 atttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaagg 484  Q
    ||||||||||||||||||| |  | |||||||| ||||||| ||||| ||||| || |||| ||||| |||| | | ||| |||||||||||||| | |     
T  40999306 atttgttccaaattttaagggttatttttactataaatataaaccttatatcagagtaaaccttgaggtaga-gagtctgaaaacaagggtttag-acgt 40999209  T
Q  485 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtc 584  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||   || |||||||||| ||    | ||||||| || | || ||||| |||||||||||||||    
T  40999208 caacaagaaaactaggggttgtatagagtttg-ctcttgacaacaaacactaggatt--gagattgattcacc-taggaaaacattattaggattgagtc 40999113  T
Q  585 t-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatc-ata 680  Q
    | ||||| |||| |||||   |||||||||||||||||||||   |||||||   | |||||| || ||||| |||| ||||||| ||||||||||  ||    
T  40999112 tcttggtcacgggaagagatcgagactttgggtagaattaggtttggagactgtgttttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcgtta 40999013  T
Q  681 tagtggatcagagggctgctctc 703  Q
    ||||||| ||||||| |||||||    
T  40999012 tagtggaacagagggatgctctc 40998990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 239 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 22801346 - 22801262
Alignment:
Q  239 aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatgg 323  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22801346 aatcgtggcacgatggttgggcaacgtgacacgattggaggtttcagtttt-gaggcaaggaactggaaaaatcgtggcacgatgg 22801262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 660 - 750
Target Start/End: Original strand, 49088819 - 49088910
Alignment:
Q  660 tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccc-cagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||| | |||||  || |||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  49088819 tttgtaatgttagtcatcatatagtgaaacagagaactactctctccccccagactaggtcaatttgggccgaactgggtcaacaaattctt 49088910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 547 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 31983727 - 31983524
Alignment:
Q  547 gttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 644  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||||| | || |||||  ||||||||||||||||||||||   | ||||||||| |||||    
T  31983727 gttgattcaccttggg-aaacactattaagattaagtctcttggtcatgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttgaagacttatttttgta 31983629  T
Q  645 aaccattgatttc-tctttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaat-ttggaccgaactgggtcaa 741  Q
    | || ||||| || | |||||||  |||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||| | ||||||||| | || |||| |||||||| ||    
T  31983628 accctttgatatcttttttgtaaaattactcatcattatagtggaacggagggctgctctct-cccaatactaggtaagtattagaccaaactgggtaaa 31983530  T
Q  742 caaatt 747  Q
    ||||||    
T  31983529 caaatt 31983524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 551 - 718
Target Start/End: Complemental strand, 3982374 - 3982202
Alignment:
Q  551 attctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggct-gagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaaac 647  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||| |||||  | | ||||||||||||||||| |   || |||| ||||||||||      
T  3982374 attcaccttggagaaacactattaggattgagtttcttggtcacgggaagagatttgggactttgggtagaattaagtttgaagactgattcttgtaaca 3982275  T
Q  648 cattgatttctcttt-gtaacgttactcatcat-atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt 718  Q
    | ||||| ||||||| |||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||| || |||||||    
T  3982274 ctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctccctcatactaggt 3982202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 371 - 752
Target Start/End: Original strand, 25357595 - 25357984
Alignment:
Q  371 tatttttgggtgcaaatttgttccaaatttta--agcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagag-----ggggc 463  Q
    ||||||||||  || ||||||||||| |||||  || || |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||     |||||    
T  25357595 tatttttgggctcagatttgttccaa-ttttacgagggatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaaccttgagagagagtgagaggggc 25357693  T
Q  464 tgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggg 562  Q
    ||||| ||||||||||||||   ||||||||| |||||||||  | |||| || |||||  |   || ||||||||||| |||  ||||||| |||||||    
T  25357694 tgaaaacaagggtttagaaaca-aacaacaaa-ctagggttt--agagagatt-tctctaagtgggagacactagggtt-gtga-ttgattcaccttggg 25357786  T
Q  563 gaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggta----gaattaggcggga-gacttattcttgtaaaccattgattt 656  Q
     ||| |||||||||||||||||| ||||| | || |||||  || |||||||| ||    |||||| |   || ||||||||||||||| || ||||| |    
T  25357787 -aaatactattaggattgagtctcttggtcatgggaagagattgggactttggatatatagaattaagtttgaagacttattcttgtaaccctttgatat 25357885  T
Q  657 ctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaat-ttggaccgaactgggtcaacaaattcttgt 752  Q
    ||| ||||||| ||||||||||| |||||| || | ||  |||||||||||||| ||||||||| | | ||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  25357886 ctcttttgtaaagttactcatcattatagtagaacggatagctgctctctcccctagactaggtcagtattggacctaactgggtaaacaaatttttgt 25357984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 564 - 718
Target Start/End: Complemental strand, 7050439 - 7050284
Alignment:
Q  564 aaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctt 661  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||  ||   || ||||||    
T  7050439 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctt 7050344  T
Q  662 tgtaacgttactc--atca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt 718  Q
    ||||| |  ||||  |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7050343 tgtaaagaaactcatatcattatagtggaacagagagctgctctctcccccagactaggt 7050284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 564 - 762
Target Start/End: Original strand, 11853549 - 11853749
Alignment:
Q  564 aaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctt 661  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||  |||   | ||||||    
T  11853549 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctctt 11853644  T
Q  662 tgtaacgttactca-tca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt-aaatttggaccgaactgggtcaacaaat-tcttgtatttt 757  Q
    ||||| |  ||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |   || ||||||||||||| ||||||| |||||| |||     
T  11853645 tgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatatcttgtgtttc 11853744  T
Q  758 tctct 762  Q
    |||||    
T  11853745 tctct 11853749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 680 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 10047447 - 10047383
Alignment:
Q  680 atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 744  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  10047447 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 10047383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 466 - 738
Target Start/End: Original strand, 10112927 - 10113198
Alignment:
Q  466 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaa 565  Q
    |||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||||||  ||||||| ||||| | || |||||||||||||    | ||||||| |||| || ||    
T  10112927 aaacaagggtttagaa-gccaacacaaaaactagggtttgta--gagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttga--gattgattcaccttagg-aa 10113019  T
Q  566 acactattaggattgagtct-ttggttacgga-aagaggctgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaaaccatt-gatttctctt 661  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||| ||||  |||||  |  ||||||||||||||||||    || |||| |||||||||| |  || ||| ||||||    
T  10113020 acactattatgattgagtctcttggtcacggggaagagattaggactttgggtagaattagatttgaagactaattcttgtaacctttttgatatctctt 10113119  T
Q  662 tgtaacgttactcatcat-atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaat-ttggaccgaactgggt 738  Q
    ||||| |||||| ||||| ||||||||   ||| |||||||||||||| ||||||||| | | ||||||||||||||||    
T  10113120 tgtaatgttactaatcattatagtggaatggagagctgctctctccccaagactaggttagtattggaccgaactgggt 10113198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 632 - 707
Target Start/End: Complemental strand, 24446754 - 24446678
Alignment:
Q  632 acttattcttgtaaaccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctccc 707  Q
    ||||||| |||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  24446754 acttatttttgtaagccattgatatctcttttgtaacattactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccc 24446678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 680 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 39246062 - 39245998
Alignment:
Q  680 atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 744  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  39246062 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 39245998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 548 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 47151092 - 47150889
Alignment:
Q  548 ttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaa 645  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| ||   |||||  ||||| ||||||||||||||||   || |||||||||||||||    
T  47151092 ttgattcaccttggg-aaacactgttaggattgagtctcttggtcacatgaagagattgagaatttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaa 47150994  T
Q  646 accattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaat-ttggaccgaactgggtcaac 742  Q
     || ||||| |||| ||| ||| ||| ||||||| ||||||||| ||||  | || | ||||||| ||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||    
T  47150993 ccctttgatatctcttttctaaagttgctcatcattatagtggaacagatagatgttatctcccctagactaggtcaatattggaccgaattgggtaaac 47150894  T
Q  743 aaatt 747  Q
     ||||    
T  47150893 taatt 47150889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 679 - 750
Target Start/End: Original strand, 6133105 - 6133176
Alignment:
Q  679 tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    ||||||||| | || | |||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  6133105 tatagtggaacggatgactgctctctcacccagactaggtcaatttggatcgaattgggtcaacaaattctt 6133176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 650 - 747
Target Start/End: Original strand, 26557823 - 26557922
Alignment:
Q  650 ttgatttctctttgtaacgttactcatcat-atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 747  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||| | |||||||| | ||| ||||||||||||||||||||| || | | |||||||||||| ||| ||||||||    
T  26557823 ttgatatctctttgtaaagttactcatcgttatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaagtcagtattggaccgaactaggtaaacaaatt 26557922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 567 - 752
Target Start/End: Original strand, 8529270 - 8529457
Alignment:
Q  567 cactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgt 664  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||  ||   || |||||||||    
T  8529270 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactca---atatctctttgt 8529365  T
Q  665 aacgttactc--atca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt-aaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttgt 752  Q
    || |  ||||  |||| ||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| |   || ||||||||||||| |||||||||||||    
T  8529366 aaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattcttgt 8529457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 567 - 752
Target Start/End: Original strand, 15316961 - 15317147
Alignment:
Q  567 cactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgt 664  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||  ||   || |||||||||    
T  15316961 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaactca---atatctctttgt 15317056  T
Q  665 aacgttactc--atca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt-aaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttgt 752  Q
    || |  ||||  |||| ||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| |   || ||||||||||||| |||||||||||||    
T  15317057 aaagaaactcatatcattatagtggaacagagagctgctctct-ccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattcttgt 15317147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 409 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 16186173 - 16186099
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggct-gaaacaagggtttagaaa 482  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||    
T  16186173 acttttactataaatataaaccttgtatcagagtaaaccttgagagagagggggctaaaaacaagggtttagaaa 16186099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 567 - 752
Target Start/End: Original strand, 18586969 - 18587156
Alignment:
Q  567 cactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgt 664  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||   | |||||  ||||||| |  ||   || |||||||||    
T  18586969 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactggttcttgttactca---atatctctttgt 18587064  T
Q  665 aacgttactc--atca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt-aaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttgt 752  Q
    || |  ||||  |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |   || ||||||||||||| |||||||||||||    
T  18587065 aaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattcttgt 18587156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 239 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 22048542 - 22048492
Alignment:
Q  239 aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagttttt 289  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22048542 aatcgtggcacgattgaagggcaacgtggcacgatggaggtttcagttttt 22048492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 564 - 625
Target Start/End: Original strand, 55822265 - 55822326
Alignment:
Q  564 aaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg 625  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  55822265 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgagac-ttgggtagaattagg 55822326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 705 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 52942527 - 52942482
Alignment:
Q  705 cccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  52942527 cccccagactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaattctt 52942482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 680 - 744
Target Start/End: Original strand, 5269220 - 5269284
Alignment:
Q  680 atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 744  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||| |||||||||    
T  5269220 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 5269284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 680 - 743
Target Start/End: Original strand, 36315258 - 36315321
Alignment:
Q  680 atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaaca 743  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  36315258 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaaca 36315321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 680 - 743
Target Start/End: Original strand, 36329467 - 36329530
Alignment:
Q  680 atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaaca 743  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  36329467 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaaca 36329530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 702 - 748
Target Start/End: Complemental strand, 3937316 - 3937270
Alignment:
Q  702 tctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 748  Q
    |||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3937316 tctccctcagactagatcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 3937270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 567 - 752
Target Start/End: Original strand, 4884877 - 4885064
Alignment:
Q  567 cactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgt 664  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||   | ||||| ||||||||||  ||   || |||||||||    
T  4884877 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgagac-ttgggtataatcaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttgt 4884972  T
Q  665 aacgttactc--atca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt-aaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttgt 752  Q
    ||    ||||  |||| ||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| |   || ||||||||||||| |||||||||||||    
T  4884973 aaaaaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattcttgt 4885064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 567 - 752
Target Start/End: Original strand, 31300427 - 31300613
Alignment:
Q  567 cactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgt 664  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||  ||   || |||||||||    
T  31300427 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttgt 31300522  T
Q  665 aacgttactc--atca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt-aaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttgt 752  Q
    || |  ||||  |||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| |   || ||||||||||||| |||||||| ||||    
T  31300523 aaagaaactcatatcattatagtggaacggagggctgctctct-ccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattattgt 31300613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 680 - 744
Target Start/End: Original strand, 5396700 - 5396764
Alignment:
Q  680 atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 744  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||| ||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  5396700 atagtggattggagagctgctctctcctccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 5396764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 700 - 744
Target Start/End: Original strand, 5429803 - 5429847
Alignment:
Q  700 tctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 744  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  5429803 tctctcccccagattaggttaagttggaccgaactgggtcaacaa 5429847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 700 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 12739594 - 12739550
Alignment:
Q  700 tctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 744  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  12739594 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 12739550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 421 - 481
Target Start/End: Original strand, 16455296 - 16455356
Alignment:
Q  421 aatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 481  Q
    ||||||| | |||||||| |||||||   |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16455296 aatataggctttgtatcagagcaaaccgagagataaagggggctgaaacaagggtttagaa 16455356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 700 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 26175680 - 26175636
Alignment:
Q  700 tctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 744  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  26175680 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 26175636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 700 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 36463433 - 36463389
Alignment:
Q  700 tctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 744  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  36463433 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 36463389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 680 - 744
Target Start/End: Original strand, 38152468 - 38152532
Alignment:
Q  680 atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 744  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||||||||| || || |  ||||||||||||||||||||||    
T  38152468 atagtggattggagagctgctctctcccccagattatgtcatattggaccgaactgggtcaacaa 38152532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #130
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 700 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 48893682 - 48893638
Alignment:
Q  700 tctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 744  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  48893682 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 48893638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #131
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 692 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 54867239 - 54867188
Alignment:
Q  692 agggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 744  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  54867239 agggctgctctctcccc-agactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 54867188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #132
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 650 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 3578766 - 3578668
Alignment:
Q  650 ttgatttctctttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 747  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||   ||| |||| ||||||||||||||||||  | | || ||||||||||||| ||||||||    
T  3578766 ttgatatctctttgtaaagttactcatcattatagtggaatggagagctg-tctctcccccagactaggccagtattagaccgaactgggtaaacaaatt 3578668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #133
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 567 - 625
Target Start/End: Complemental strand, 4556238 - 4556180
Alignment:
Q  567 cactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg 625  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  4556238 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttt-ggtagaattagg 4556180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #134
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 567 - 625
Target Start/End: Original strand, 4558314 - 4558372
Alignment:
Q  567 cactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg 625  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  4558314 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 4558372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #135
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 680 - 743
Target Start/End: Original strand, 6743444 - 6743507
Alignment:
Q  680 atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaaca 743  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||  ||| ||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  6743444 atagtggattggagggctgctctctcccgtagattaggtcatattggaccgaactgggtcaaca 6743507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #136
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 604 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 38270151 - 38270120
Alignment:
Q  604 tgagactttgggtagaattaggcgggagactt 635  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38270151 tgagactttgggtagaattaggcgggagactt 38270120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #137
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 695 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 5143312 - 5143263
Alignment:
Q  695 gctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 744  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||| |||||||||    
T  5143312 gctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 5143263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #138
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 299 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 16689380 - 16689331
Alignment:
Q  299 cactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcg 348  Q
    |||||||||||||||| |||||||   ||||| |||||||||||||||||    
T  16689380 cactggaaaaatcgtgccacgatgaaatcgcaacgtggcacgatggtgcg 16689331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #139
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 721 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 24446677 - 24446648
Alignment:
Q  721 atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24446677 atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 24446648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #140
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 239 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 52942974 - 52942910
Alignment:
Q  239 aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactg 303  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||    
T  52942974 aatcgtggcacgatggttgggcaacgtggcacgattggaggtttcagcttt-gaggcaagtcactg 52942910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 411; Significance: 0; HSPs: 137)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 411; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 206 - 770
Target Start/End: Original strand, 51749778 - 51750346
Alignment:
Q  206 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttt-tgaggcaaggcactgg 304  Q
    ||||||| ||||||| ||||||  ||| |||| ||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  51749778 tgtgagagttaacttaaaatcaagtttctgcagaatcgtggcacgatggttgggcaacgtggtacgatggaggtttcagttttttgaggcaaggcactgg 51749877  T
Q  305 aaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaag 404  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| || ||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  51749878 aaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatagtgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaag 51749977  T
Q  405 cgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 504  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51749978 cgaaacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 51750077  T
Q  505 gtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggc 603  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  51750078 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggc 51750176  T
Q  604 tgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctct 702  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  51750177 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 51750276  T
Q  703 ctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattc--ttgtatttttctcttctttgtg 770  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||    
T  51750277 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtg 51750346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 391; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 206 - 750
Target Start/End: Original strand, 20302198 - 20302743
Alignment:
Q  206 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttt-tgaggcaaggcactgg 304  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20302198 tgtgagagttaacttaaaatcagatttctgcagaatcgcggcatgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagttttttgaggcaaggcactgg 20302297  T
Q  305 aaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaag 404  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20302298 aaaaattgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggcgaataacagaaacatatttttgggtgcatatttgttccaaattttaag 20302397  T
Q  405 cgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 504  Q
     |||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20302398 tgaaacttttattataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 20302497  T
Q  505 gtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggc 603  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| |    
T  20302498 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagac 20302596  T
Q  604 tgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctc 703  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||| || |||||    
T  20302597 taggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgatactcatcagatagtggatcggaggactactctc 20302696  T
Q  704 tcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20302697 tcccccagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattctt 20302743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 389; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 206 - 770
Target Start/End: Original strand, 13761577 - 13762143
Alignment:
Q  206 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgga 305  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13761577 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcatgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgga 13761676  T
Q  306 aaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagc 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||| || ||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13761677 aaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgcggcacgatggtgtgctggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagc 13761776  T
Q  406 gaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 505  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13761777 gaaacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagagggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacataactagggtttg 13761876  T
Q  506 tatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggct 604  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||    
T  13761877 tatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgggggttgattcaactt-ggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagtct 13761975  T
Q  605 gagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctct 704  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||    
T  13761976 gtgactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggaccggagggcttctctct 13762075  T
Q  705 cccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattc--ttgtatttttctcttctttgtg 770  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||    
T  13762076 cccccagactaggtcaatttggactgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtg 13762143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 386; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 206 - 770
Target Start/End: Original strand, 51752104 - 51752670
Alignment:
Q  206 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttt-tgaggcaaggcactgg 304  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  51752104 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgatggttgggcaacgtggcacgatggaggtttcagttttttgaggcaaggcactgg 51752203  T
Q  305 aaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaag 404  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  51752204 aaaaatcgtggcacgatggggccgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggcgaataacataaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaag 51752303  T
Q  405 cgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 504  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| ||    
T  51752304 cgaaacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagagtttagaaaggtaacaacaaaattagggctt 51752403  T
Q  505 gtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggc 603  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| |||| | |||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||    
T  51752404 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt-gtgaaacactatta-gattgagtctcttggttacgggaagaggc 51752501  T
Q  604 tgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctc 703  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  51752502 tgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgatactcaccatatagtggattggagggctgctctc 51752601  T
Q  704 tcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattc--ttgtatttttctcttctttgtg 770  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||    
T  51752602 tcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtg 51752670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 384; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 239 - 770
Target Start/End: Original strand, 28840451 - 28840986
Alignment:
Q  239 aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggc 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  28840451 aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgattggaggtttcagttttt-aggcaaggtactggaaaaattgtggcacgatgggatcgcatcgtggc 28840549  T
Q  338 acgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatc 437  Q
    ||||||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28840550 acgatggtgtgctggcagcgaaaaacagaaacatatttttgagtgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatc 28840649  T
Q  438 aaagcaaactttgaga--tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacact 535  Q
    | ||||||||||||||  || |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28840650 agagcaaactttgagagatacagggggatgaaacaagggtttagaaaggaaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacact 28840749  T
Q  536 agggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagact 634  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28840750 agggtttgtgggttgattcaccttggg-aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagact 28840848  T
Q  635 tattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaact 734  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28840849 tattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaact 28840948  T
Q  735 gggtcaacaaattc--ttgtatttttctcttctttgtg 770  Q
    ||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||    
T  28840949 gggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtg 28840986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 372; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 239 - 770
Target Start/End: Original strand, 28842266 - 28842801
Alignment:
Q  239 aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggc 337  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28842266 aatcgtggcacgatggcaaggctacgtggcacgattggaggtttcagttttt-aggcaaggtactggaaaaatcgtggcacgatgggatcgcatcgtggc 28842364  T
Q  338 acgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatc 437  Q
    |||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  28842365 acgatggtgtcctggcagcgaaaaacagaaacatatttttgagtgcaaatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatataaaccttgtatc 28842464  T
Q  438 aaagcaaactttgaga--tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacact 535  Q
    | ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28842465 agagcaaactttgagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacact 28842564  T
Q  536 agggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagact 634  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28842565 agggtttgtgggttgattcacattggg-aaacactattaggattgagtctattggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagact 28842663  T
Q  635 tattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaact 734  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  28842664 tattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctaatctctcccccagactaggtcaatttggacagaact 28842763  T
Q  735 gggtcaacaaattc--ttgtatttttctcttctttgtg 770  Q
     |||||||||||||  |||| || ||||||||||||||    
T  28842764 aggtcaacaaattctattgtgttcttctcttctttgtg 28842801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 367; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 206 - 770
Target Start/End: Complemental strand, 10400369 - 10399802
Alignment:
Q  206 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgg 304  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||| |||  |||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||| |||||||    
T  10400369 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcggaatcgtggcacgattgctgggcaacgtggcacgattggaggtttcaagttt-gaggcaaagcactgg 10400271  T
Q  305 aaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaag 404  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10400270 aaatatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcagcaaataacataaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaag 10400171  T
Q  405 cgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 504  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  10400170 cgaaactttttctataaatatagaccttgtatcagagcaaactgggagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggttt 10400071  T
Q  505 gtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggc 603  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||      
T  10400070 gtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaaggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagat 10399972  T
Q  604 tgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctct 702  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10399971 tgggactttcggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 10399872  T
Q  703 ctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattc--ttgtatttttctcttctttgtg 770  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||    
T  10399871 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtg 10399802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 367; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 239 - 750
Target Start/End: Original strand, 15823319 - 15823831
Alignment:
Q  239 aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggc 337  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15823319 aatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattggaggtttcaagttt-gaggcaaagcactagaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggc 15823417  T
Q  338 acgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatc 437  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15823418 acgatggtgcgctagcagcaaataacagaaacatatttttggatgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatc 15823517  T
Q  438 aaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactag 537  Q
    |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  15823518 aaagtaaacttagagataaagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactag 15823617  T
Q  538 ggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagactta 636  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15823618 ggtttgtgggttgattcacctt-gggaaacactattaatattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagactta 15823716  T
Q  637 ttcttgtaaaccattgatttctct-ttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactg 735  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  15823717 ttcttgtaacccattgatatctctattgtaacgttactcatcatatagtggaacagagggctgctctctcccccagactaggtcaatttagaccgaactg 15823816  T
Q  736 ggtcaacaaattctt 750  Q
    |||||||||||||||    
T  15823817 ggtcaacaaattctt 15823831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 206 - 750
Target Start/End: Original strand, 6822775 - 6823299
Alignment:
Q  206 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagttttt-gaggcaaggcactgg 304  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6822775 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgatggaggtttcagttttttgaggcaaggcactgg 6822874  T
Q  305 aaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaag 404  Q
    |||||||                     |||||||||||||||| |||| || ||||| | |||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6822875 aaaaatc---------------------gtggcacgatggtgcgctggcggcgaataatagaaatgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaag 6822953  T
Q  405 cgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 504  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6822954 cgaaacttttactatttatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 6823053  T
Q  505 gtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggc 603  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| || |||||      
T  6823054 gtatagagtttgtctcttaggaacaaa-actagggtttgtgggttgattcacctt-gggaaatactattaggattgagtctcttggttatgggaagagat 6823151  T
Q  604 tgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctct 702  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6823152 tggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctct 6823251  T
Q  703 ctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6823252 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 6823299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 239 - 750
Target Start/End: Original strand, 13214854 - 13215371
Alignment:
Q  239 aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggc 337  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||    |||||||| |||||| | ||| ||||||    
T  13214854 aatcgtggcacgatggttgggcaacgtggcacgattggaggtttcagtttt-gaggcaagtcactggatttttcgtggcatgatgggattgcaacgtggc 13214952  T
Q  338 acgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatc 437  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13214953 acgatggtgtgttggcagcaaataacaaaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatc 13215052  T
Q  438 aaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactag 537  Q
    | || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  13215053 agagtaaattttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactag 13215152  T
Q  538 ggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagactta 636  Q
    |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13215153 ggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagactta 13215251  T
Q  637 ttcttgtaaaccattga----tttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccg 730  Q
    ||||||||| |||||||    |||||| |||||||  |||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13215252 ttcttgtaacccattgatatttttctcttttgtaaatttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccg 13215351  T
Q  731 aactgggtcaacaaattctt 750  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  13215352 aactgcgtcaacaaattctt 13215371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 234 - 662
Target Start/End: Original strand, 6823651 - 6824088
Alignment:
Q  234 tgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttt-tgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatc 332  Q
    |||| |||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6823651 tgcagaatcatggcacgatggttgggcaacgtggcacgatggaggtttcagttttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcatgatggggtcgcatc 6823750  T
Q  333 gtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagacctt 432  Q
    |||||||||||||||| |||| || |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||    
T  6823751 gtggcacgatggtgcgctggcggcgaataacataaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactatttatatagacctt 6823850  T
Q  433 gtatcaaagcaaactttgagataga-gggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaa 531  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6823851 gtatcagagcaaactttgagatagaggggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaa 6823950  T
Q  532 cactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtcttt--------ggttacggaaagaggctgagactttgggtagaatta 623  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| ||| |        |||||||| |||||  || | |||||||||||||||    
T  6823951 cactagggtttgtgggttgattcacctt-gggaaacactattacgattgaatctcttggttacgggttacgggaagagattggggctttgggtagaatta 6824049  T
Q  624 ggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctcttt 662  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6824050 ggcggcagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 6824088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 263 - 749
Target Start/End: Original strand, 41646717 - 41647204
Alignment:
Q  263 cgtggcacgatg-gaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaata 361  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| |||||||| |||||||    |||||||||| |||| | ||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||    
T  41646717 cgtggcacgattagaggtttcagtttt-gaggcaagtcactggatttttcgtggcacggtgggattgcaacgtggcacgatggtgcactggcagcgaata 41646815  T
Q  362 acataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggg 461  Q
    ||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  41646816 acagaaacatatttttggatgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggg 41646915  T
Q  462 gctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttgg 561  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || |||   ||||||||| |||| |    
T  41646916 gctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacacttggtttttatggttgattcacctt-g 41647014  T
Q  562 ggaaacactattaggattgagtc-tttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc- 659  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| ||||     
T  41647015 ggaaacactattaggattgagtcacttggttacgggaagagattgcgactttgggtagaattaggctggagacttattcttgtaactcattgatatctct 41647114  T
Q  660 tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 749  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41647115 tttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccatcagactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 41647204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 386 - 746
Target Start/End: Original strand, 16226087 - 16226448
Alignment:
Q  386 atttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggc 485  Q
    ||||||| || ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||    
T  16226087 atttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagaggggtctaaaacaagggtttagaaaagc 16226186  T
Q  486 aacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggatt-gagtc 584  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  16226187 aacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt-gggaaacactattaggattggagtc 16226285  T
Q  585 t-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatag 683  Q
    | |||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  16226286 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatag 16226385  T
Q  684 tggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaat 746  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  16226386 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaat 16226448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 239 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 3580126 - 3579613
Alignment:
Q  239 aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggc 337  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||| ||| || ||| ||||||||| | |||||||| || |||||||||||||| ||| |||| | ||| ||||||    
T  3580126 aatcgtggcacgattgcagggcaacgtgacacaattggatgtttcagttat-gaggcaagtcattggaaaaatcgtggtacggtgggattgcaacgtggc 3580028  T
Q  338 acgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatc 437  Q
    ||||||||||| |||| || |||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  3580027 acgatggtgcgctggcggcgaatatcataaacgtattttagagtgcaaatttgttccaaattttaagcgatacttttactttaaatatagaccttgtatc 3579928  T
Q  438 aaagcaaactttgagatagag--ggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacact 535  Q
    |  | ||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||    
T  3579927 agcgtaaaatttgagatagagggggggctgaaacaagggttcagaaaggcagcaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacact 3579828  T
Q  536 agggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagact 634  Q
    |||||||| |||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||  || | ||||||||| ||||||||||||||||    
T  3579827 agggtttgagggttgattcacctt-aggaaacacaattaggattgagtctcttgattacggaaagagattggggctttgggtaaaattaggcgggagact 3579729  T
Q  635 tattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaac 733  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||||| ||||| | | || |  |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  3579728 tattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat-tagtgaaacggatgattgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaac 3579630  T
Q  734 tgggtcaacaaattctt 750  Q
    |||||||||||||||||    
T  3579629 tgggtcaacaaattctt 3579613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 409 - 770
Target Start/End: Complemental strand, 31735863 - 31735495
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttga----gatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 504  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||    |||||||||    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31735863 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgaatgagatagagggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 31735764  T
Q  505 gtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggc 603  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | |||||||| |||||||||| |||||||    
T  31735763 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt-gggaaacactattaaggttgagtctcttggttacgggaagaggc 31735665  T
Q  604 tgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctct 702  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31735664 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctct 31735565  T
Q  703 ctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattc--ttgtatttttctcttctttgtg 770  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||    
T  31735564 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtg 31735495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 333 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 38925892 - 38925477
Alignment:
Q  333 gtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagacctt 432  Q
    |||||||||||| ||| ||||||| || |||| ||   |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  38925892 gtggcacgatggggcgttggcagcgaacaacagaagtgtatttttgggtgcagatttattccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacctt 38925793  T
Q  433 gtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaac 532  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  38925792 gtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac 38925693  T
Q  533 actagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggag 631  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38925692 actagggtttgagggttgattcaccttgga-aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggctggag 38925594  T
Q  632 acttattcttgtaaaccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccg 730  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  ||  | | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  38925593 acttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcata--gtaaaacggagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttggaccg 38925497  T
Q  731 aactgggtcaacaaattctt 750  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  38925496 aactgagtcaacaaattctt 38925477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 258 - 750
Target Start/End: Original strand, 39462310 - 39462804
Alignment:
Q  258 ggcaacgtggcacgatg-gaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagc 356  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| || ||||    ||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||| | ||||     
T  39462310 ggcaacgtggcacgattagaggtttcagtttt-gaggcaagtcagtggatttttcgtggcacgatgggattgcaatgtggcacgatggtgcgcttgcagt 39462408  T
Q  357 aaataacataaacatatttt-tgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagata 455  Q
     ||||||| |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||  | ||||| |||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  39462409 gaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagata 39462508  T
Q  456 gagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattct 555  Q
    |||  ||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||  ||||||||||     
T  39462509 gagaaggctgaaacaaaggtttagaaatgcaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggtttttagggttgattca 39462608  T
Q  556 ccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgat 654  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||    
T  39462609 cctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagaattattcttgtaaccctttgat 39462707  T
Q  655 ttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
     |||| |||| || |||| ||||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39462708 atctcttttgaaaagttattcatcatatagtgaaacggagagctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 39462804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 410 - 770
Target Start/End: Original strand, 2617460 - 2617823
Alignment:
Q  410 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 509  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2617460 ctttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagaggaggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtata 2617559  T
Q  510 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgaga 608  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||    
T  2617560 gagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggga 2617658  T
Q  609 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctccc 707  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2617659 ctttgggtagaattaggatggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccc 2617758  T
Q  708 ccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaat--tcttgtatttttctcttctttgtg 770  Q
     |||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||  | |||| ||||||||||| |||||    
T  2617759 tcagactaggtcaatttggaccgaactgagtcaataaattattttgtgtttttctcttcattgtg 2617823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 409 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 27337280 - 27336936
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 504  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |    |||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27337280 acttttactataaatatagaccttgtattaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 27337181  T
Q  505 gtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggc 603  Q
     |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||    
T  27337180 ttataga-tttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggg-aaacactattaggattgggtctcttggttacgggaagaggc 27337083  T
Q  604 tgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctc 703  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27337082 tgtgactttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctc 27336983  T
Q  704 tcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27336982 tcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 27336936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 399 - 750
Target Start/End: Original strand, 20291390 - 20291741
Alignment:
Q  399 tttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaacta 498  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20291390 tttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtattagagcaaattttgagatagagggagatgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaacta 20291489  T
Q  499 gggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaa 597  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |    
T  20291490 gggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactaagttttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggtcacggga 20291588  T
Q  598 agaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggct 697  Q
    |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |    
T  20291589 agagactaggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgattctcatcatatagtggatcggagggtt 20291688  T
Q  698 gctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    | ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20291689 gttctctcccccacactagatcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 20291741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 313 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 28207500 - 28207064
Alignment:
Q  313 tggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaactt 412  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  28207500 tggcacgatggggtcacaacgtggcacgatggtgcgctggcggcgaataacataaacgtttttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgatactt 28207401  T
Q  413 ttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagag 512  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||    
T  28207400 ttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtgtaaag 28207301  T
Q  513 tttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactt 611  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||| |||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||| | |||||  || | |||    
T  28207300 tttgtctctttggaacaaacactagggtttgagagtttattcacctt-gggaaacactattaggattgtgtctcttggttacaggaagagattggggctt 28207202  T
Q  612 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctccccca 710  Q
    ||  || ||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||  |||| ||||||||||||||||||  |||||| | | ||||||||||||||||||||    
T  28207201 tgaatataattacgcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacggagggctgctctctccccca 28207104  T
Q  711 gactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28207103 gactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 28207064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 409 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 27339472 - 27339127
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 504  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |    |||||||||||    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27339472 acttttactataaatatagaccttgtattaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggcttagaaaggcaacaataaaactagggttt 27339373  T
Q  505 gtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggc 603  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||||||| || ||||||| |||||||    
T  27339372 gtatagagtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggg-aaatactattacgattgagtctcttagttacgggaagaggc 27339274  T
Q  604 tgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctc 703  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  27339273 tgagactttgggtagaattaggcgggcgacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgatctc 27339174  T
Q  704 tcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27339173 tcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 27339127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 458 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 46431996 - 46431702
Alignment:
Q  458 gggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctcc 557  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  46431996 gggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaagtagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacc 46431897  T
Q  558 ttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgattt 656  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  46431896 ttggg-aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggatgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgattt 46431798  T
Q  657 ctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctc--ccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46431797 ctctttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 46431702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 331 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 14098385 - 14097965
Alignment:
Q  331 tcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagacc 430  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||  | ||||| |||| |||||||||||    
T  14098385 tcgttgcacgatggtgcgctggcagcgaataacataaacgtatttttgggtgcagatt-gttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagacc 14098287  T
Q  431 ttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaa 530  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||    
T  14098286 ttgtatcaaactaaactttgagatagaggggactgaaacaatggtttaaaaaggcaactacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttagaacaa 14098187  T
Q  531 acactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgaga-ctttgggtagaattaggcgg 628  Q
    ||||||| ||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  | ||| |||||||||||||||| |||    
T  14098186 acactagagtttgagggttgattcaccttgga-aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt-agagctttgggtagaattagacgg 14098089  T
Q  629 gagacttattcttgtaaaccattgatttctcttt-gtaa-cgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttgg 726  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||    
T  14098088 gagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccacaaactaggtcaatttgg 14097989  T
Q  727 accgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  14097988 accgaactgggtcaacaaattctt 14097965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 409 - 750
Target Start/End: Original strand, 24325599 - 24325948
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagg 500  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24325599 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagagagatagagggggctgaaacaagggtt-agaaaggcaacaacaaaactagg 24325697  T
Q  501 gtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaag 599  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  24325698 gtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt-aggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaag 24325796  T
Q  600 aggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctg 698  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||  | |||||    
T  24325797 aggctgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaatgttactcatcatatagtgaatcgaatggctg 24325896  T
Q  699 ctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24325897 ctctctcccccagactaagtcaattttgaccgaactgggtcaacaaattctt 24325948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 386 - 746
Target Start/End: Original strand, 47179629 - 47179993
Alignment:
Q  386 atttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaa 481  Q
    ||||||| || |||||||||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  47179629 atttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 47179728  T
Q  482 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggatt-g 580  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |    
T  47179729 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaagcactagggtttgtgggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgg 47179827  T
Q  581 agtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcat 679  Q
    ||||| |||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  47179828 agtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcat 47179927  T
Q  680 atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaat 746  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  47179928 atagtggattggagggctgctctct-ccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaat 47179993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 409 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 9463588 - 9463243
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 502  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||    |||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9463588 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 9463489  T
Q  503 ttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattga-gtct-ttggttacggaaaga 600  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||    
T  9463488 ttgtatagagtttgtctcttaggagaaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggg-aaacactattaggattgaagtctcttggttacgggaaga 9463390  T
Q  601 ggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgct 700  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  9463389 gattgagactttgggtagaattaggcgggagacttatccttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgct 9463290  T
Q  701 ctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 747  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  9463289 ctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 9463243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 450 - 770
Target Start/End: Complemental strand, 15295131 - 15294808
Alignment:
Q  450 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggtt 549  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||| |||| |||||    
T  15295131 gagatagagagggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgaaacaaacactaggttttgagggtt 15295032  T
Q  550 gattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaacc 648  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||    
T  15295031 gattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattaggtgggagatttattcttgtaaccc 15294933  T
Q  649 attgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 747  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15294932 attgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 15294833  T
Q  748 c--ttgtatttttctcttctttgtg 770  Q
    |  |||| || ||||||||||||||    
T  15294832 cttttgtgttcttctcttctttgtg 15294808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 409 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 9459761 - 9459416
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 502  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||    |||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9459761 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagtcaacaacaaaactagggt 9459662  T
Q  503 ttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattga-gtct-ttggttacggaaaga 600  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||    
T  9459661 ttgtatagagtttgtctcttaggagaaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggg-aaacactattaggattgaagtctcttggttacgggaaga 9459563  T
Q  601 ggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgct 700  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  9459562 gattgagactttgggtagaattaggcgggagacttatccttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgct 9459463  T
Q  701 ctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 747  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  9459462 ctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 9459416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 412 - 770
Target Start/End: Original strand, 39932017 - 39932381
Alignment:
Q  412 tttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 509  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| | |  |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39932017 tttactataaatatagaccttgtatgagacaaaactttgagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 39932116  T
Q  510 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgaga 608  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||    
T  39932117 gagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattaacctt-gggaaacactattaggattgaatctcttggttacgggaagagactgaga 39932215  T
Q  609 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctc-tcc 706  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||    
T  39932216 ctttgggtagaattaggcgggagactaattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggaacggagggctgctctcttcc 39932315  T
Q  707 cccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattc--ttgtatttttctcttctttgtg 770  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||    
T  39932316 cccatactaggtcaatttggaccgaattgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtg 39932381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 409 - 750
Target Start/End: Original strand, 47906207 - 47906555
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 502  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||    |||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  47906207 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactatggt 47906306  T
Q  503 ttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagag 601  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  47906307 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt-gagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 47906405  T
Q  602 gctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgct 700  Q
      || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  47906406 attggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgct 47906505  T
Q  701 ctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47906506 ctctcccccagacttggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 47906555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 386 - 746
Target Start/End: Original strand, 47177278 - 47177642
Alignment:
Q  386 atttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaa 481  Q
    ||||||| || |||||||||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  47177278 atttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 47177377  T
Q  482 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggat-tg 580  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |    
T  47177378 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaagcactagggtttgtgggttgattcacctt-gggaaacactattaggatggg 47177476  T
Q  581 agtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcat 679  Q
    ||||| |||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  47177477 agtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcat 47177576  T
Q  680 atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaat 746  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||    
T  47177577 atagtggattggagggctgctctct-ccccagactaggtcagattggatcgaactgggtcaacaaat 47177642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 409 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 17324974 - 17324632
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 508  Q
    |||||||||| |||||||||||||| | || || |||| |  ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  17324974 acttttactataaatatagaccttgaaccagagtaaacctgaagatacagggggctaaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactggggtttgtat 17324875  T
Q  509 agagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgag 607  Q
    |||||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  || |    
T  17324874 agagtttgtctctatggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggg 17324776  T
Q  608 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcc 706  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||    
T  17324775 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcc 17324676  T
Q  707 cccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17324675 cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 17324632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 412 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 21948526 - 21948226
Alignment:
Q  412 tttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 507  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21948526 tttactataaatatagaccttgtatcatactaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 21948427  T
Q  508 tagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctga 606  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||     
T  21948426 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt--ggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagacgctgg 21948329  T
Q  607 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctc 705  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  21948328 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctc 21948229  T
Q  706 ccc 708  Q
    |||    
T  21948228 ccc 21948226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 326 - 742
Target Start/End: Original strand, 47451508 - 47451919
Alignment:
Q  326 tcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatat 425  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||| |||| ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||    
T  47451508 tcgcatcgtggcacgatggtgcgctgacagcgaataacagaaacgtattttttggtgcagatttgttccaaatattaagcgatacttttactataaatat 47451607  T
Q  426 agaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgg 525  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  47451608 agaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggcttaaacaagggtttggaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggg 47451707  T
Q  526 aagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattag 624  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||| | || | |        |||||||||||||| |||||||||| |||||  || | ||||||||| ||||||    
T  47451708 aacaaacactagggtttgagggttgattcacattagtg-------tttaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtaaaattag 47451800  T
Q  625 gcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatt 723  Q
    |||||| |||| |||||||||  ||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| | |  | | ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  47451801 gcgggaaactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacgaatgactgctctctcccccatactaggtcaatt 47451900  T
Q  724 tggaccgaactgggtcaac 742  Q
    |||||||||||||||||||    
T  47451901 tggaccgaactgggtcaac 47451919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 410 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 50307884 - 50307542
Alignment:
Q  410 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 509  Q
    ||||||||| |||||||  | ||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  50307884 cttttactataaatataagctttgtatcaaagtaaaccttgagatatatggggctgaaaaaagggtttagaaaggcaataacaaaactagggtttgtata 50307785  T
Q  510 gagtttgtctcttcgg-aagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgag 607  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  || |    
T  50307784 gagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggg-aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggg 50307686  T
Q  608 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcc 706  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||    
T  50307685 gctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcc 50307586  T
Q  707 cccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50307585 cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 50307542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 200; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 409 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 12302848 - 12302501
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 503  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| | | |||| ||||||    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12302848 acttttactataaatatagaccttgtatcagatgtaaaccttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtt 12302749  T
Q  504 tgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagagg 602  Q
    ||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||     
T  12302748 tgtatagagtttgtctcttggtaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaga 12302650  T
Q  603 ctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctc 701  Q
     || |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||    
T  12302649 ttgggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttataactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctc 12302550  T
Q  702 tctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12302549 tctcccccagattaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 12302501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 200; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 410 - 750
Target Start/End: Original strand, 18839531 - 18839873
Alignment:
Q  410 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 509  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||| |  | ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18839531 cttttactataaatatagacattgtattattgtaaaccatgagatagagggggctgaaacaagggtttagataggcaacaacaaaactagggtttgtata 18839630  T
Q  510 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgaga 608  Q
    |||||| |||||| |||| ||||| ||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||  |||||    
T  18839631 gagtttatctctttggaacaaacagtagggttttagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagaatgaga 18839729  T
Q  609 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcc 706  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| |||    
T  18839730 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacagagggctgctctttcc 18839829  T
Q  707 cccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18839830 cccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 18839873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 409 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 2510666 - 2510321
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 504  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||    |||||||    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  2510666 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttataaaggcaaccacaaaactagggttt 2510567  T
Q  505 gtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtc-tttggttacggaaagaggc 603  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||      
T  2510566 gtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt-tggaaacactattaggattgagtcttttggttacgggaagagat 2510468  T
Q  604 tgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctct-ttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctct 702  Q
    |  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| | | || |||||||||    
T  2510467 ttggactttgggtagaattaggc-agagacttattcttgtaacccattgatttctctcttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggatggctgctct 2510369  T
Q  703 ctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2510368 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 2510321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 409 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 6996038 - 6995696
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 508  Q
    ||||||| || |||||||||||||| |||| || |||  |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6996038 acttttattataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggggccgaaacaacggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 6995939  T
Q  509 agagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgag 607  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||  || |    
T  6995938 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttaagggttgattcacctt-gggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagagattggg 6995840  T
Q  608 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcc 706  Q
     |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||    
T  6995839 gctttgggtagaattaggcgggatactttttcttgtaactcattgacatctcttttataacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcc 6995740  T
Q  707 cccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6995739 tccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 6995696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 409 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 28998591 - 28998249
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 508  Q
    |||||||||| |||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  28998591 acttttactataaatatagactttgaatcagagtaaactttgagatagaggaggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtat 28998492  T
Q  509 agagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgag 607  Q
    ||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||  || |    
T  28998491 agagtttgtcttttgcgaataaacactagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattggg 28998393  T
Q  608 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcc 706  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||  |||| |||| ||||||||||||||||| ||| | | ||||| || |||||||    
T  28998392 gctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgcaacgttactcatcatatggtgaaactgagggttgttctctcc 28998293  T
Q  707 cccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28998292 cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 28998249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 409 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 29004307 - 29003965
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 508  Q
    |||||||||| |||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  29004307 acttttactataaatatagactttgaatcagagtaaactttgagatagaggaggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtat 29004208  T
Q  509 agagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgag 607  Q
    ||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||  || |    
T  29004207 agagtttgtcttttgcgaataaacactagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattggg 29004109  T
Q  608 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcc 706  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||  |||| |||| ||||||||||||||||| ||| | | ||||| || |||||||    
T  29004108 gctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgcaacgttactcatcatatggtgaaactgagggttgttctctcc 29004009  T
Q  707 cccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29004008 cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 29003965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 409 - 750
Target Start/End: Original strand, 16428596 - 16428939
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 508  Q
    |||||||||| ||||||||   || ||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16428596 acttttactataaatataggttttatatcagagcaaaccattagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 16428695  T
Q  509 agagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgag 607  Q
    ||||||||||||||   || |||||||| |||||| |||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  || |    
T  16428696 agagtttgtctcttgacaacaaacactaaggtttgagggttgattcacctt-ggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggg 16428794  T
Q  608 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctc 705  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||| | ||||| | | |||||||||||||||    
T  16428795 actttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattttagtgaaacggagggctgctctctc 16428894  T
Q  706 ccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16428895 ccccaaactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaattctt 16428939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 410 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 17186465 - 17186123
Alignment:
Q  410 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 509  Q
    |||||| || |||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17186465 cttttaatataaatatagattttgtatcagagcaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 17186366  T
Q  510 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgaga 608  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||  |   |    
T  17186365 gagtttgtctcttagcaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactatcaggattgagtctcttggttacgggaagagatttgaa 17186267  T
Q  609 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcc 706  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||| ||||||||||| |||| |||| | ||| ||||||||||||    
T  17186266 ctttgggtagaattagaagggagacttattcttgtaacccattaatatctcttttgtaaagttactcatcattataatggaacggagtgctgctctctcc 17186167  T
Q  707 cccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  17186166 cccagactaggtcaatttggaccgaattgggtaaacaaattctt 17186123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 410 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 50077009 - 50076668
Alignment:
Q  410 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 509  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||  | |||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  50077009 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagaaagggctgaaacaaggatttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtata 50076910  T
Q  510 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgaga 608  Q
     |||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  || ||    
T  50076909 aagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggga 50076811  T
Q  609 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcc 706  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| | || | ||||||||| |    
T  50076810 atttgggtagaattaggcgggaaacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-c 50076712  T
Q  707 cccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50076711 cccagactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 50076668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 410 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 50079158 - 50078816
Alignment:
Q  410 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 509  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||| |  | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||    
T  50079158 cttttactataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacagcaacaaaactagggtttgcata 50079059  T
Q  510 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgaga 608  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| || |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||  |  ||    
T  50079058 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt-ggaaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagagatttgga 50078960  T
Q  609 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcc 706  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| |||| |||||| ||||||||| |||| |||||||||||||    
T  50078959 ctttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtggaacagatggctgctctctcc 50078860  T
Q  707 cccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  50078859 cccagactaggtcaatttggaccgaatttggtaaacaaattctt 50078816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 411 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 25251611 - 25251270
Alignment:
Q  411 ttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 510  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  25251611 ttttactataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaaaggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtataa 25251512  T
Q  511 agtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagac 609  Q
     ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||  || |||    
T  25251511 cgtttgtctcttcgaaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt-aggaaacactattaggattgagtctctcggttacgggaagagattgggac 25251413  T
Q  610 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctccc 707  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| | || ||||||| |||||| |||| ||||||| | ||||||| |||||||||||    
T  25251412 tttgggtagaattaggcggaaaacttattcttgtaacccattgatatatcttttgtaaggttacttatcattatagtgaaacagagggttgctctctccc 25251313  T
Q  708 ccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25251312 caatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 25251270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 410 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 11457812 - 11457471
Alignment:
Q  410 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 509  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11457812 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaatggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtata 11457713  T
Q  510 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgaga 608  Q
    |||||||  |||| | || ||  ||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||  |||||  || |     
T  11457712 gagtttgattcttggcaacaattactagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattatgattgagtctcttggttacgcgaagagattgggg 11457614  T
Q  609 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctccc 707  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| | | || | ||||||||||||    
T  11457613 gtttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggatgtctgctctctccc 11457514  T
Q  708 ccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11457513 ccagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattctt 11457471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 411 - 750
Target Start/End: Original strand, 18307054 - 18307394
Alignment:
Q  411 ttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 510  Q
    |||| ||| |||||||||| ||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18307054 ttttgctataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtataa 18307153  T
Q  511 agtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagac 609  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  || | |    
T  18307154 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacc-tcgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggc 18307252  T
Q  610 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctccc 707  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||| | | || ||||||||||| ||    
T  18307253 tttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtgacgcattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggatggctgctctct-cc 18307351  T
Q  708 ccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  18307352 ccagactaggtcaatttggaccgaacggagtcaacaaattctt 18307394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 409 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 2949569 - 2949228
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 508  Q
    |||||||| | |||||||||  ||| |||  || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||    
T  2949569 acttttacaataaatatagatattgaatccgagaaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagagtttgtat 2949470  T
Q  509 agagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgag 607  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||  ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  || ||  || |    
T  2949469 agagtttgtctcttgggaacaaacactaggggttgatggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttgtttacgagaatagattggg 2949371  T
Q  608 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcc 706  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  2949370 gctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcc 2949271  T
Q  707 cccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2949270 ccc-gactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 2949228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 175; E-Value: 8e-94
Query Start/End: Original strand, 450 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 4131676 - 4131371
Alignment:
Q  450 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggtt 549  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||    
T  4131676 gagatagagggggctgaaacaaggatttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 4131577  T
Q  550 gattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaacc 648  Q
    ||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||    
T  4131576 gatttacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagaggctg-gactttgggtagaattaggcgagaaacttattcttgtaaccc 4131479  T
Q  649 attga----tttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaac 742  Q
    |||||    |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||    
T  4131478 attgatatctttctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggactgaactatgtcaac 4131379  T
Q  743 aaattctt 750  Q
    ||||||||    
T  4131378 aaattctt 4131371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 409 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 9241424 - 9241081
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagaggggg-ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 507  Q
    |||||||||| |||||||| | |||||||| || |||| || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9241424 acttttactataaatataggctttgtatcagagtaaaccttaagatagaggggggctgaaacaagg-tttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 9241326  T
Q  508 tagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctga 606  Q
    ||||||||||||||| | || ||||||||||||||| |||||||||| |||| || ||||| |||||||||||||||| |||||||||  |||||  ||     
T  9241325 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt-ggaaaacattattaggattgagtctcttggttacgagaagagattgg 9241227  T
Q  607 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctct 704  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||    
T  9241226 ggctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctct 9241127  T
Q  705 cccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  9241126 cccccatactaggtcaatttggaccgaactggggaaacaaattctt 9241081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 172; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 450 - 750
Target Start/End: Original strand, 25127856 - 25128158
Alignment:
Q  450 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggtt 549  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | || ||||||||||||||| |||||    
T  25127856 gagatagaggggcctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtgtcttggaaacaaacactagggtttgagggtt 25127955  T
Q  550 gattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaacc 648  Q
    ||||| |||| | ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  25127956 gattcacctt-gtgaaacactatttggattgagtctcttggttacgggaagagattgagacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaattc 25128054  T
Q  649 attgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaat 746  Q
    |||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||| || | | ||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  25128055 attgatatctcttttgtaaggttactcatcattatattgaaacggagggctgctctctctcccatactaggtcaattaggaccgaactgggtcaacaaat 25128154  T
Q  747 tctt 750  Q
    ||||    
T  25128155 tctt 25128158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 431 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 31425335 - 31425011
Alignment:
Q  431 ttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgg-aaga 529  Q
    ||||||||| | |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || || |    
T  31425335 ttgtatcaatgtaaaccttgagataaagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtatctttggcaaca 31425236  T
Q  530 aacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagt---ct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg 625  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||    
T  31425235 aacactagggtttgagggttgattcaccttgga-aaacactattaggattgagtgatctcttggttacggaaagagattgggactttgggtagaattagg 31425137  T
Q  626 cgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatt 723  Q
    |||||| |||||||||||||  ||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||| | | || ||||||||||| ||||| ||||||| ||||    
T  31425136 cgggaggcttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggaaggctgctctct-ccccatactaggtcaatt 31425038  T
Q  724 tggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  31425037 tggaccgaactgggtcaacaaattctt 31425011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 409 - 750
Target Start/End: Original strand, 6756470 - 6756813
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 508  Q
    |||||| ||| |||||||||| |||||||   | |||| |||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6756470 acttttgctataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgaaatagaggggactgaaacaagggcttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 6756569  T
Q  509 agagtttgtctcttcgg-aagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtctttggttacggaaagaggctgag 607  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||  |||||  || |    
T  6756570 agagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtc-ttgattacgagaagagattggg 6756667  T
Q  608 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctct- 704  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||| | | || | |||||||||     
T  6756668 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggaagactgctctctc 6756767  T
Q  705 cccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6756768 cccccagactaggtcagtttggaccgaactggatcaacaaattctt 6756813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 410 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 50248909 - 50248566
Alignment:
Q  410 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 509  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||  | |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| | ||| ||||    
T  50248909 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggagctgaaacaaaggtttaaaaagacaacaacaaaactatgatttatata 50248810  T
Q  510 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgaga 608  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||   ||||    
T  50248809 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacatt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagatcgaga 50248711  T
Q  609 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctg--ctctctc 705  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||| ||||||| |||||||||||||||||| | |||| || ||  |||||||    
T  50248710 ctttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgacatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacagatggttgttctctctc 50248611  T
Q  706 ccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    ||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  50248610 ccctagactaggtcaatttggtccgaattgggtcaacaaattctt 50248566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 165; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 409 - 687
Target Start/End: Original strand, 48665114 - 48665400
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggc------tgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 502  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||| || |||| || ||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48665114 acttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaaccttaagatagagggggagggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 48665213  T
Q  503 ttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggtta-cggaaaga 600  Q
    || ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||    
T  48665214 ttatatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt-gagaaacactattaggattgagtctcttggttaccgggaaga 48665312  T
Q  601 ggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtgga 687  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  48665313 ggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgga 48665400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 410 - 750
Target Start/End: Original strand, 31489859 - 31490197
Alignment:
Q  410 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 509  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||| |  | |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  31489859 cttttactataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagatagagggggttgaaacaagggtttagaaaggtaacaacaaaactagggtttgtat- 31489957  T
Q  510 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgaga 608  Q
     |||||||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||  |||||    
T  31489958 -agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgatggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgaatttcttggttacgggaagagattgaga 31490055  T
Q  609 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctccc 707  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||| ||| | | ||||||||||||| |||    
T  31490056 ctttggatagaattaggcggaagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttattcatcatatggtgaaacggagggctgctctc-ccc 31490154  T
Q  708 ccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||    
T  31490155 ccagactaggtcaatttggactgaactagatcaacaaattctt 31490197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 409 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 31423212 - 31422856
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 508  Q
    |||||||||| |||||||  | ||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  31423212 acttttactataaatataagcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttatat 31423113  T
Q  509 agagtttgtctcttcgg-aagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctga 606  Q
    |||||||||||||| || |  |||||||||||||||   |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||  |||    
T  31423112 agagtttgtctctttggcattaaacactagggtttgaaagttgattcacctt-gggaaacactattagaattgagtctcttggttacgggaagagattga 31423014  T
Q  607 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tata------------gtggatcaga 692  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||| ||||||| ||||||||||| ||||            ||| | ||||    
T  31423013 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgacatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaagagagggtgaaacaga 31422914  T
Q  693 gggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  31422913 gggctgctctctcctccagactaggtcaatttggaccgagctgggtgaacaaattctt 31422856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 411 - 750
Target Start/End: Original strand, 17318838 - 17319172
Alignment:
Q  411 ttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 510  Q
    |||||||| ||||||||   |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17318838 ttttactataaatataggttttgtatcatagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtttag 17318937  T
Q  511 agtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagac 609  Q
    |||||||||||| | || ||||||||||||| |  ||||||||| |||| |||||||      |||||||||||| |||||||||| || ||  || |||    
T  17318938 agtttgtctcttggcaacaaacactagggttggaaggttgattcacctt-gggaaac------aggattgagtctcttggttacgggaacagattgggac 17319030  T
Q  610 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctccc 707  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||| |||| ||||| | ||||||||||| ||||||  | | |||||||||||||| ||    
T  17319031 tttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacttattgatatctcttttgttaagttactcatcattatagtaaaacggagggctgctctct-cc 17319129  T
Q  708 ccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17319130 ctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 17319172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 561 - 770
Target Start/End: Original strand, 51757625 - 51757837
Alignment:
Q  561 gggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc 659  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||    
T  51757625 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctatcgatttctc 51757724  T
Q  660 tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattc--ttgtatttt 757  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||  |||| || |    
T  51757725 tttgtaacgatactcaccatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttct 51757824  T
Q  758 tctcttctttgtg 770  Q
    |||||||||||||    
T  51757825 tctcttctttgtg 51757837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 410 - 752
Target Start/End: Original strand, 17324009 - 17324351
Alignment:
Q  410 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 509  Q
    |||||| || |||||||||| |||||| | || |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||  | ||| ||||    
T  17324009 cttttattataaatatagactttgtattagagtaaaccttgagatagagagggctaaaacaagggttcagaaaggccacaacaaaact--gatttttata 17324106  T
Q  510 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgaga 608  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||  || || |||||  ||  |    
T  17324107 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttgaatatgggaagagattggaa 17324205  T
Q  609 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcc 706  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| |||| |||||| ||||||| | | || ||||| |||||||    
T  17324206 ctttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttattcatcattatagtgaaacggaaggctggtctctcc 17324305  T
Q  707 cccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttgt 752  Q
    ||  |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17324306 ccatgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttgt 17324351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 459 - 750
Target Start/End: Original strand, 40133937 - 40134230
Alignment:
Q  459 ggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctcct 558  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| | || ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  40133937 ggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaacgaaggtttgtatagaatttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcacct 40134036  T
Q  559 tggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttc 657  Q
    | |||||| |||| ||||||||||||| ||||| |||| |||||  ||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||    
T  40134037 t-gggaaatactactaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgaggttttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatatc 40134135  T
Q  658 tc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    || ||||||| ||||||||||| ||||||| | | || ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  40134136 tcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggatggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccggactaggtaaacaaattctt 40134230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 359 - 747
Target Start/End: Original strand, 42922126 - 42922514
Alignment:
Q  359 ataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattt-taagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagataga 457  Q
    ||||||||| ||||||||||||   | ||||||||||||||| | || || |||||||||| |||||||||  |||||||| || |||| || |||||||    
T  42922126 ataacataatcatatttttgggctgagatttgttccaaatttatgagggatacttttactataaatatagattttgtatcagagtaaaccttaagataga 42922225  T
Q  458 gggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctcc 557  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | | || |||||||||||||    ||||||||| ||    
T  42922226 gggggttgaaataagggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcctagcaacaaacactagggttga--ggttgattcacc 42922321  T
Q  558 ttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgattt 656  Q
    ||| | ||| |||||||||||||||||| ||||| |||| |||||  || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  42922322 ttgcgaaaa-actattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgatat 42922420  T
Q  657 ctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 747  Q
    ||| ||||||| ||||||||||| || |||||| | |||| ||||||||| |||| |||||||| | | |||||||||||||||| ||||||||    
T  42922421 ctcttttgtaaagttactcatcattagagtggaacggaggactgctctctgcccccgactaggtcagtgttggaccgaactgggtaaacaaatt 42922514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 8 - 205
Target Start/End: Original strand, 50767533 - 50767747
Alignment:
Q  8 gtggataatgaaatatgaatgaatggaatgagatagatggtgcatttttaaattgtacagatgaaaacaaaagacaaatggaataaggacgaaatattca 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50767533 gtggataatgaaatatgaatgaatggaatgagatagatggtgcatttttaaattgtacagatgaaaacaaaagacaaatggaataaggacgaaatattca 50767632  T
Q  108 tgaaaaata-----------------tcacaagggataccgtcataacatgttacattagtagnnnnnnngtaaattcacaaacatctttctctaactat 190  Q
    |||||||||                 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||       ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50767633 tgaaaaatatctctctcaggacgccttcacaagggataccgtcataacatgttacattactagtttttttgtaaattcacaaacatctttctctaactat 50767732  T
Q  191 ataaaagttaattaa 205  Q
    |||||||||||||||    
T  50767733 ataaaagttaattaa 50767747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 533 - 746
Target Start/End: Original strand, 16231630 - 16231843
Alignment:
Q  533 actagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattg-agtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcggga 630  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||||    
T  16231630 actagggtttgtgggttgattcaccttggg-aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagcctttgggtagaattaggcggga 16231728  T
Q  631 gacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccg 730  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||    
T  16231729 gacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccg 16231828  T
Q  731 aactgggtcaacaaat 746  Q
    |||| |||||||||||    
T  16231829 aact-ggtcaacaaat 16231843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 563 - 747
Target Start/End: Original strand, 23785935 - 23786121
Alignment:
Q  563 gaaacactattaggattg-agtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctct 660  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23785935 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 23786034  T
Q  661 ttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 747  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  23786035 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 23786121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 410 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 14183923 - 14183589
Alignment:
Q  410 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 509  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||| || |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||   |||||||||||||||||    
T  14183923 cttttactataaatatagaccatgtatcagagtaaaccttgagatagagagggctgaaacaagggtttagaatg-caacac--aaactagggtttgtata 14183827  T
Q  510 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgaga 608  Q
    ||| ||| ||||| | || ||||||||||||| |  ||||||||| ||||||  |||||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||  |   |    
T  14183826 gaggttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgga-aaacactattataattgagtctcttggttacgggaagagattagaa 14183731  T
Q  609 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcc 706  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||    
T  14183730 ttttgggtagaattaggcggaagacttattcttgcaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctcc 14183631  T
Q  707 cccagactaggt-aaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 747  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  14183630 cccagactaggtcagttttggaccgaactgggtaaacaaatt 14183589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 607 - 750
Target Start/End: Original strand, 23816027 - 23816171
Alignment:
Q  607 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctc 705  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||    
T  23816027 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatataatggatcggagggatgctctctc 23816126  T
Q  706 ccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23816127 ccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 23816171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 457 - 750
Target Start/End: Original strand, 16432396 - 16432681
Alignment:
Q  457 agggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctc 556  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||| |  | ||||||||||||||| |||||||||| |    
T  16432396 agggggcagaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt-----------ctcttggcgacaaacactagggtttgagggttgattcac 16432484  T
Q  557 cttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatt 655  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||| || |||||  ||| |||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| ||||||||     
T  16432485 cttggg-aaacattattaggattgaatctcttggttatgggaagagattgaaactttgggtagaattatgcgggacaattattcttgtaacccattgata 16432583  T
Q  656 tctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctccccc-agactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| ||||||| | | | || |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16432584 tctcttttgtaatgttactcatcattatagtgaaacggcggactgctctctcccccaagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattctt 16432681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 409 - 718
Target Start/End: Complemental strand, 8347607 - 8347300
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 507  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||| | | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||    
T  8347607 acttttactataaa-atagaccttgtatcagatgtaaaccttgagatagagggggttgaaacaagggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttgta 8347510  T
Q  508 tagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctga 606  Q
    ||||| ||| ||||| | || |||||| | |||| |  ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| ||| | |||| |||||  |||    
T  8347509 tagagattg-ctcttggcaacaaacaccaaggttag--ggttgattcaccttagg-aaacactattatgattgagtctcttgatcacgggaagagattga 8347414  T
Q  607 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctct 704  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||| | ||||||||| | ||||| |||||| |    
T  8347413 gactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcattattatagtggaacggagggatgctcttt 8347314  T
Q  705 cccccagactaggt 718  Q
    |||| |||||||||    
T  8347313 cccctagactaggt 8347300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 561 - 750
Target Start/End: Original strand, 16429051 - 16429243
Alignment:
Q  561 gggaaacactattaggattgagtcttt-ggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc 659  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  || || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  16429051 gggaaacactattaggattgagtcttttggttacgggaagagattgggaatttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctc 16429150  T
Q  660 ttt-gtaacgttactcatcat-atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    ||| |||| |||||||||||| |||| | | | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16429151 ttttgtaaggttactcatcattatagcgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaattgggtcaacaaattctt 16429243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 259 - 745
Target Start/End: Complemental strand, 30790882 - 30790401
Alignment:
Q  259 gcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagca 357  Q
    |||| |||||||||| ||| ||||||||| | || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||  |      
T  30790882 gcaatgtggcacgattggatgtttcagttat-gaagcaagtcactggaaaaaacgtggcacgatgggatcgcaatgtggcacgatggtgcgctggagggg 30790784  T
Q  358 aataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagataga 457  Q
    || ||||||||| |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||    
T  30790783 aaaaacataaacgtatttttcagtgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagataga 30790684  T
Q  458 gggggctg-aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctc 556  Q
    ||| |||| ||||||| |||||||||  |||  |  ||||||||||||   ||||| || |||||  |   || ||||||||| |||| ||||||||  |    
T  30790683 gggagctgaaaacaagagtttagaaa--caaacaataaactagggttt---tagagatt-tctctaagagggagacactaggg-ttgt-ggttgatttac 30790592  T
Q  557 cttggggaaacactattaggattgagtc-tttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaaaccattgat 654  Q
    ||| |||||||||| |||||| |||||| ||||||||||  |||||   ||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||    
T  30790591 ctt-gggaaacactgttagga-tgagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgat 30790494  T
Q  655 ttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt-aaatttggaccgaactgggtcaacaaa 745  Q
     |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||   || | |||||||||  |||||||||||| |  ||||||||||||||| | ||||||    
T  30790493 atctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctct-tcccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 30790401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 409 - 718
Target Start/End: Complemental strand, 15669729 - 15669421
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 506  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||| || | | |||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||| | | |||| || ||||| ||||||||||    
T  15669729 acttttactataaatacagaccttgtagcagatgtaaacattgggatagagggggctgaaaactagggtttggga-ggcagca-caaaagtagggtttgt 15669632  T
Q  507 atagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctg 605  Q
    ||| |||||| ||||| | || ||||||||||||| |  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||  ||    
T  15669631 ataaagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttggg-aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattg 15669536  T
Q  606 agactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctct-ttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctc 703  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||| | ||||||||| ||||||||| | || ||||||||||    
T  15669535 agactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctctcgtaaagctactcatcattatagtggaacggatggctgctctc 15669436  T
Q  704 tcccccagactaggt 718  Q
    ||||| |||||||||    
T  15669435 tccccgagactaggt 15669421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 533 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 25248766 - 25248547
Alignment:
Q  533 actagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtcttt-ggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggag 631  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||||| ||||| | |||||| | |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25248766 actagggtttgagggttgattcaccttgga-aaacactattaggattaagtctctcggttacaggaagagattgagacttttggtagaattaggcgggag 25248668  T
Q  632 acttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggacc 729  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||| | ||||||| | | |||| |||||| |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  25248667 acttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcataattatagtgaaacggaggactgctccctcccctagactaggtcaatttggacc 25248568  T
Q  730 gaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  25248567 gaactgggtcaacaaattctt 25248547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 409 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 18800907 - 18800570
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 508  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| |||||||| | ||||||||||||| ||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||||    
T  18800907 acttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatacaaggggctgaaacaaaggtttag-aagtcaacaagaaaactacggtttgtat 18800809  T
Q  509 agagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgag 607  Q
    |||||||| ||||| |  | ||| |||||||||   |||||||||| || | | ||||||||||||||||||||||| | ||| ||||  ||||  |       
T  18800808 agagtttg-ctcttggccacaaatactagggtt--ggggttgattcaccct-gagaaacactattaggattgagtctctaggtcacgggtagagatttga 18800713  T
Q  608 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctc 705  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||| | | |||  ||||||||||    
T  18800712 actttgggtagaattaggcgggacacttattcttgtatcccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaagcggagaactgctctctc 18800613  T
Q  706 ccccagactagg-taaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 747  Q
    ||||| |||||| ||  |||||||| ||| |||| ||||||||    
T  18800612 ccccaaactaggttagttttggaccaaacagggtaaacaaatt 18800570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 411 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 8349385 - 8349049
Alignment:
Q  411 ttttactacaaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 509  Q
    ||||| || ||||||||| ||||||| | | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| |||| || ||||||||||    
T  8349385 ttttattataaatatagatcttgtattagatgcaaaccttgagatagagagggctgaaacaagggtttag-aagtcaacaagaaaattaaggtttgtata 8349287  T
Q  510 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgaga 608  Q
    ||||||| ||||| | || |||||||||||||   ||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| |  |||| |||| |||||  |  ||    
T  8349286 gagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt--ggggtttattcacctt-gggaaacactattaggattgagtttgatggtcacgggaagagattagga 8349191  T
Q  609 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcc 706  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| | |||| ||||| | ||||||||||| |||||||||  |||||| || |||||||    
T  8349190 ctttaggtagaattaggcgggtgacttattcttgtaactcattggtatctcttttgttaagttactcatcattatagtggaatagagggttgttctctcc 8349091  T
Q  707 cccagactaggt-aaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 747  Q
    || |||||| || |  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  8349090 ccaagactatgtcagttttagaccgaactgggtaaacaaatt 8349049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 214 - 404
Target Start/End: Original strand, 16225895 - 16226083
Alignment:
Q  214 ttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgt 313  Q
    ||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  16225895 ttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggttgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactggaaaaatcgt 16225994  T
Q  314 ggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaag 404  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  || || | ||||||| ||||||||||| ||||||| || ||||||||    
T  16225995 ggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaata-aaacata-ttttgggtgcagatttgttacagattttaag 16226083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 409 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 49495537 - 49495206
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 508  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||          ||||||||||||| ||    
T  49495537 acttttactataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttataaatc--------aaactagggtttgcat 49495446  T
Q  509 agagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtcttt-ggttacggaaagaggctgag 607  Q
    | |||||| ||||| | || |||||||| ||||   | |||||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||| ||| |||| |||||  || |    
T  49495445 atagtttg-ctcttggcaacaaacactatggtt---gagttgattcaccttggg-aaacactaataaaattgagtcttttggtcacggtaagagattggg 49495351  T
Q  608 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctc 705  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||| | |  ||||||  ||||||    
T  49495350 gctttgggtagaattaggcgggagactcattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacgaagggcttatctctc 49495251  T
Q  706 ccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    ||| |||||| || ||||| ||||||||| ||| || ||||||||    
T  49495250 cccaagactatgtcaatttagaccgaactaggtaaagaaattctt 49495206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 206 - 404
Target Start/End: Original strand, 47177078 - 47177274
Alignment:
Q  206 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgga 305  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  47177078 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacgactgggcaacgtggcacgatggaggttttagtttttg-ggcaagacactgga 47177176  T
Q  306 aaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaag 404  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |  || || | |||| |||||||||| ||| ||||||| || ||||||||    
T  47177177 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaata-aaacctatttttgggagcagatttgttacagattttaag 47177274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 206 - 348
Target Start/End: Original strand, 47179428 - 47179570
Alignment:
Q  206 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgga 305  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| |    
T  47179428 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgaa 47179527  T
Q  306 aaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcg 348  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  47179528 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcg 47179570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 386 - 506
Target Start/End: Original strand, 16231521 - 16231641
Alignment:
Q  386 atttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggc 485  Q
    ||||||| || ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  16231521 atttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtctagaaaagc 16231620  T
Q  486 aacaacaaaactagggtttgt 506  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  16231621 aacaagaaaactagggtttgt 16231641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 564 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 6115287 - 6115101
Alignment:
Q  564 aaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctcttt 662  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||   |||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||| |||||||    
T  6115287 aaacactattaggattgagtctcttggtcacatgaagagattgagactttgggtagaattaggcgggggacttattcttgtaaccaattgatatctcttt 6115188  T
Q  663 -gtaacgttactcatcat-atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 747  Q
     ||||  ||||||||||| |||||| | | ||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6115187 tgtaaaattactcatcattatagtgaaacggaatgctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaatt 6115101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 206 - 344
Target Start/End: Original strand, 23783238 - 23783376
Alignment:
Q  206 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgga 305  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||  ||  |||  || |||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  23783238 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcacaatcgtggcacgacagctgggcttcgcggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 23783337  T
Q  306 aaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatgg 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23783338 aaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatgg 23783376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 205 - 311
Target Start/End: Original strand, 20291279 - 20291386
Alignment:
Q  205 atgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcag-tttttgaggcaaggcactg 303  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  20291279 atgtgagagttaacttaaaatcagatttctgcagaatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacggtggaggtttcagttttttgaggcatggcactg 20291378  T
Q  304 gaaaaatc 311  Q
    ||||||||    
T  20291379 gaaaaatc 20291386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 670 - 770
Target Start/End: Original strand, 13358778 - 13358880
Alignment:
Q  670 tactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattc--ttgtatttttctcttcttt 767  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| || |||||||||||    
T  13358778 tactcttcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttcttt 13358877  T
Q  768 gtg 770  Q
    |||    
T  13358878 gtg 13358880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 411 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 25248850 - 25248756
Alignment:
Q  411 ttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 505  Q
    |||| ||| |||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25248850 tttttctagaaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 25248756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 331 - 418
Target Start/End: Original strand, 49687405 - 49687492
Alignment:
Q  331 tcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttacta 418  Q
    |||||||||||||||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  49687405 tcgtggcacgatggtgcgctgacagcgaataacataaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttacta 49687492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 544 - 747
Target Start/End: Original strand, 16561544 - 16561751
Alignment:
Q  544 tgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattctt 641  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||| ||  ||||||||||||||||| ||||   | ||||||||||||    
T  16561544 tgggttgattcaccttggg-aaacactattaggattaagtctcttggccacggaaatagattgagactttgggtagaaataggtttgaagacttattctt 16561642  T
Q  642 gtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaat-ttggaccgaactgggt 738  Q
    |||| || ||||| |||| ||||||| ||||||||||| || |||||| || |||| |||||||||||  ||||||||| | | ||||||||||||| ||    
T  16561643 gtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattacagtggaacaaagggttgctctctcccatagactaggtcagtattggaccgaactgtgt 16561742  T
Q  739 caacaaatt 747  Q
     ||||||||    
T  16561743 aaacaaatt 16561751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 567 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 21353525 - 21353340
Alignment:
Q  567 cactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaaaccattgatttctctttgt 664  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||   || |||| ||||||||||  ||   || |||||||||    
T  21353525 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttgt 21353430  T
Q  665 aacgttactcatcat-atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt-aaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttgt 752  Q
    || |  ||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  21353429 aaagaaactcatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatctttagaccgaactgggtaaacaaattcttgt 21353340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 428 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 13125775 - 13125455
Alignment:
Q  428 accttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt-gtatagagtttgtctcttcgga 526  Q
    ||||||||||| || |||  |||||| | |||||||||||||||||||| || ||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||| ||||| |      
T  13125775 accttgtatcagagtaaaacttgagagaaagggggctgaaacaagggttaag-aagccaacaaggaaactagggtttggtatagagtttg-ctcttggcg 13125678  T
Q  527 agaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg 625  Q
    | |||||||||||||    ||||||||| | || ||||||| || ||||||||||| || ||||| | || |||||  || |||||||||||||||||||    
T  13125677 acaaacactagggtt--gaggttgattcacatt-gggaaacgctgttaggattgaggctcttggtcaagggaagagattgggactttgggtagaattagg 13125581  T
Q  626 -cgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaat 722  Q
       | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||| | ||||||| |||||  ||||||| | |    
T  13125580 tttgaagacttattcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagagttgctctcccccccttactaggtcagt 13125481  T
Q  723 -ttggaccgaactgggtcaacaaatt 747  Q
     | |||||||||| ||| ||||||||    
T  13125480 ataggaccgaactaggtaaacaaatt 13125455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 386 - 747
Target Start/End: Original strand, 27916417 - 27916780
Alignment:
Q  386 atttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgagatagagggggctg--aaacaagggtttagaaa 482  Q
    ||||||||||| |||  || || |||||||||| |||||||||| |||||||||| | ||||| ||||| | || | ||    ||||||||||||||||     
T  27916417 atttgttccaattttggagggatacttttactataaatatagacattgtatcaaatgtaaactgtgagaaacagagagccagaaaacaagggtttagaa- 27916515  T
Q  483 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgag 582  Q
    | || ||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||| | || ||||||||||||| |    ||||||| ||||||  |||||||||||| ||||||    
T  27916516 gccagcaagaaaactagggtttgta--gagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttggaa--ttgattcaccttgga-aaacactattagaattgag 27916609  T
Q  583 tct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaaac--cattgatttctctttgtaacgttactcatca 678  Q
    ||| ||||| ||   |||||  || |||||||||| ||||||||   || |||| |||||| ||| |  | ||||| ||||||||||| ||||||||||     
T  27916610 tctcttggtcacatgaagagattgtgactttgggtggaattaggtttgaagactaattcttttaaccttctttgatatctctttgtaaagttactcatcg 27916709  T
Q  679 t-atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 747  Q
    | |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| ||||| ||||||||    
T  27916710 ttatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcagtattggaccgaattgggtaaacaaatt 27916780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 234 - 323
Target Start/End: Original strand, 16231369 - 16231458
Alignment:
Q  234 tgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatgg 323  Q
    |||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16231369 tgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaagacactggaaaaatcgtggcacgatgg 16231458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 638 - 747
Target Start/End: Original strand, 15916562 - 15916674
Alignment:
Q  638 tcttgtaaaccattgatttctctttg-taacgttactcatcat-atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt-aaatttggaccgaact 734  Q
    |||||||| |||||||| |||||||  ||| ||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  15916562 tcttgtaacccattgatatctcttttataaagttactcgtcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaattttggaccgaact 15916661  T
Q  735 gggtcaacaaatt 747  Q
    |||| ||||||||    
T  15916662 gggtaaacaaatt 15916674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 548 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 26613440 - 26613237
Alignment:
Q  548 ttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaa 645  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||| || | |||||  |||| |||||||||||||||||   || |||||||||||||||    
T  26613440 ttgattcaccttggg-aaacactattcggattgagtcacttggtcacaggaagagattgaggctttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaa 26613342  T
Q  646 accattgatttctcttt-gtaacgttactcatcat-atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaat-ttggaccgaactgggtcaac 742  Q
     || ||||| ||||||| | || |||||| ||||| |||||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||| | | || ||||||||||||| |||    
T  26613341 ccctttgatatctcttttggaaagttactaatcattatagtggaacagagagcttctctctcccccagattaggtcagtatttgaccgaactgggtaaac 26613242  T
Q  743 aaatt 747  Q
    |||||    
T  26613241 aaatt 26613237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 420 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 26520445 - 26520206
Alignment:
Q  420 aaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagag-ggggctg-aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 517  Q
    |||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||     
T  26520445 aaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagaggggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttg- 26520348  T
Q  518 ctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttg------gttacggaaagaggctgagact 610  Q
    ||||| | || |||||||| | ||    ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||| |||      || |||| |||||  || ||||    
T  26520347 ctcttggcaacaaacactaagatt--gaggttgattcacctt-gggaaacactattatgattgagtctcttggtcacagtcacgggaagagattgggact 26520251  T
Q  611 ttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaaaccattgat 654  Q
    |||||||||||||||   ||| |||||||||||||| ||||||||    
T  26520250 ttgggtagaattaggtttggaaacttattcttgtaacccattgat 26520206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 548 - 708
Target Start/End: Original strand, 155788 - 155950
Alignment:
Q  548 ttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 645  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||| |||| |||||  || |||||||| ||||||||||   | ||| | ||||||||||    
T  155788 ttgattcaccttggg-aaacactattaggattgaatctcttggtcacgggaagagattgggactttggatagaattaggtttgaagagtaattcttgtaa 155886  T
Q  646 accattgatttctctttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcccc 708  Q
     |  ||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||    
T  155887 ccttttgttatctctttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctcccc 155950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 309 - 392
Target Start/End: Original strand, 23783362 - 23783444
Alignment:
Q  309 atcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgtt 392  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  || || | ||||||||||||||| ||| |||||||    
T  23783362 atcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaata-aaacatatttttgggagcagatttgtt 23783444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 567 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 2401400 - 2401213
Alignment:
Q  567 cactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgt 664  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||  ||   || |||||||||    
T  2401400 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttgt 2401305  T
Q  665 aacgttactc--atca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt-aaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttgt 752  Q
    || |  ||||  |||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| |   || ||||||||||||| |||||||||||||    
T  2401304 aaagaaactcatatcattatagtggaacagagagcttctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattcttgt 2401213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 564 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 30738815 - 30738625
Alignment:
Q  564 aaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-t 660  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |  | |||||  || || ||||||||||||||||   | |||||||||||||||| || ||||| |||| |    
T  30738815 aaacactattaggattgagtctcttggtcataggaagagattgggattttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaaccctttgatgtctctt 30738716  T
Q  661 ttgtaacgttactcatca---tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 747  Q
    |||||| |||||||||||   ||||||| | | ||||| ||||||||| |||| ||||||| | | ||||||| |||| ||| ||||||||    
T  30738715 ttgtaaagttactcatcatattatagtgaaacggagggatgctctctcacccatactaggtcagtattggaccaaacttggtaaacaaatt 30738625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 206 - 296
Target Start/End: Original strand, 47451405 - 47451495
Alignment:
Q  206 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgca-taatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacga-tggaggtttcagtttttgaggcaa 296  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  47451405 tgtgagagttaacttcaaatcagattt-tgcagaaatcgtggcacgatggctgggcaatgtggcacgattggaggtttcag-ttttgaggcaa 47451495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 548 - 625
Target Start/End: Original strand, 14353047 - 14353126
Alignment:
Q  548 ttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggct-gagactttgggtagaattagg 625  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||  | |||||||||||||||||||||    
T  14353047 ttgattcaccttggagaaacactattaggatttagtctcttggtcacggaaagagattcgagactttgggtagaattagg 14353126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 692 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 13598454 - 13598402
Alignment:
Q  692 agggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 744  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  13598454 agggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 13598402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 680 - 744
Target Start/End: Original strand, 16124545 - 16124609
Alignment:
Q  680 atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 744  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||| ||||||||    
T  16124545 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 16124609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 680 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 37069838 - 37069774
Alignment:
Q  680 atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 744  Q
    |||||||||| ||| | |||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  37069838 atagtggatcggagagatgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 37069774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 680 - 744
Target Start/End: Original strand, 47703965 - 47704029
Alignment:
Q  680 atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 744  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  47703965 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 47704029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 443 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 6115383 - 6115344
Alignment:
Q  443 aaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 482  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6115383 aaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 6115344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 681 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 19072995 - 19072932
Alignment:
Q  681 tagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 744  Q
    ||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  19072995 tagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 19072932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 681 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 19120885 - 19120822
Alignment:
Q  681 tagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 744  Q
    ||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  19120885 tagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 19120822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 409 - 448
Target Start/End: Original strand, 23783494 - 23783533
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactt 448  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23783494 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactt 23783533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 386 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 26613601 - 26613503
Alignment:
Q  386 atttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt--gagatagagggggctg-aaacaagggtttagaa 481  Q
    ||||||||||| |||| || ||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| |  |||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26613601 atttgttccaatttttgagggattcttttgctataaatatagaccttgtatcagatgaaaccttgagagatagagggggctgaaaacaagggtttagaa 26613503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 681 - 744
Target Start/End: Original strand, 47098854 - 47098917
Alignment:
Q  681 tagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 744  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||| | ||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  47098854 tagtggattggagggctgctctctcccccagattcggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 47098917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 564 - 625
Target Start/End: Original strand, 2232597 - 2232658
Alignment:
Q  564 aaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg 625  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  2232597 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 2232658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #114
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 564 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 4144865 - 4144675
Alignment:
Q  564 aaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctt 661  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| ||| ||| |||||||||||||||   | ||| | ||||||||||  ||   || | ||||    
T  4144865 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagactgggac-ttgggtagaattaggtttgaagattgattcttgtaactca---atatatctt 4144770  T
Q  662 tgtaacgttactc--atca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt-aaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttgt 752  Q
    ||||| |  ||||  |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| |   || ||||||||||||| |||||||||||||    
T  4144769 tgtaaagaaactcatatcattatagtggaacagagagctgctctctcccccagagtaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattcttgt 4144675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #115
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 660 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 13127774 - 13127685
Alignment:
Q  660 tttgtaacgttactcatcat-atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 747  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| || | ||| |||||||||||| ||||||||||| | | ||||||||||| |||| ||||||||    
T  13127774 tttgtaaagttactcatcattatagtagaacggagagctgctctctcctccagactaggttagtattggaccgaaccgggtaaacaaatt 13127685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #116
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 720 - 770
Target Start/End: Complemental strand, 13447299 - 13447247
Alignment:
Q  720 aatttggaccgaactgggtcaacaaattc--ttgtatttttctcttctttgtg 770  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||    
T  13447299 aatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtg 13447247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #117
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 412 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 15295183 - 15295142
Alignment:
Q  412 tttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 453  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15295183 tttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgaga 15295142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #118
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 679 - 744
Target Start/End: Original strand, 21536597 - 21536662
Alignment:
Q  679 tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 744  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||| | |||  ||||||||||||||||||    
T  21536597 tatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcattttttaccgaactgggtcaacaa 21536662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #119
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 695 - 744
Target Start/End: Original strand, 26644941 - 26644990
Alignment:
Q  695 gctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 744  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  26644941 gctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 26644990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #120
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 680 - 741
Target Start/End: Complemental strand, 29651879 - 29651818
Alignment:
Q  680 atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaa 741  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||    
T  29651879 atagtggattggagtgctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaa 29651818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #121
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 700 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 834211 - 834167
Alignment:
Q  700 tctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 744  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  834211 tctctcccccagagtaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 834167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #122
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 680 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 9476329 - 9476265
Alignment:
Q  680 atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 744  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||||| ||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  9476329 atagtggattggagagctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 9476265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #123
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 700 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 13659380 - 13659336
Alignment:
Q  700 tctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 744  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  13659380 tctctcccccagagtaggttaagttggaccgaactgggtcaacaa 13659336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #124
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 680 - 744
Target Start/End: Original strand, 27104401 - 27104465
Alignment:
Q  680 atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 744  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||| ||||||||    
T  27104401 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggttatattggaccgaactgtgtcaacaa 27104465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #125
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 700 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 28220270 - 28220226
Alignment:
Q  700 tctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 744  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  28220270 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 28220226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #126
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 700 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 28265598 - 28265554
Alignment:
Q  700 tctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 744  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  28265598 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 28265554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #127
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 489 - 687
Target Start/End: Original strand, 28279292 - 28279489
Alignment:
Q  489 aacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgag-tcttt 587  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||||| |||||   || ||||||||||||| |  | ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |  ||    
T  28279292 aacaaaattagggtttgta--gagtttg-ctcttgacaacaaacactagggttgg--gattgattccccttggagaaacactattaggattgagcttctt 28279386  T
Q  588 ggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagt 684  Q
    ||| |||| |||||  || |||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||  |||||   |||| ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  28279387 ggtcacgggaagagattgggacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaactcattggcatctcttttgtaaagttactcatcattatagt 28279486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #128
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 567 - 625
Target Start/End: Original strand, 9526469 - 9526527
Alignment:
Q  567 cactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg 625  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  9526469 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 9526527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #129
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 420 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 13127955 - 13127862
Alignment:
Q  420 aaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 515  Q
    ||||||| ||||||||||  || |||| || ||| |||||||  |||||||||||||||| ||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||    
T  13127955 aaatataaaccttgtatcggagtaaacctttagagagaggggt-tgaaacaagggtttag-aagccaacaagaaaagtagggtttatatagagttt 13127862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #130
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 567 - 625
Target Start/End: Original strand, 25134074 - 25134132
Alignment:
Q  567 cactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg 625  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  25134074 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 25134132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #131
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 608 - 752
Target Start/End: Original strand, 46783189 - 46783336
Alignment:
Q  608 actttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctc 705  Q
    ||||||||||||||||||   | ||||| |||||||||| || ||||| ||| ||||||| |  |||||||| ||||||||| ||||| |||| | ||||    
T  46783189 actttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaaccctttgatatctttttgtaaagaaactcatcattatagtggaacagagagctgttatctc 46783288  T
Q  706 ccccagactaggtaaat-ttggaccgaactgggtcaacaaattcttgt 752  Q
    | ||||| || || ||| ||||| |||||||| | |||||||| ||||    
T  46783289 ctccagagtaagtcaatattggatcgaactggataaacaaattattgt 46783336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #132
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 681 - 744
Target Start/End: Original strand, 47102871 - 47102934
Alignment:
Q  681 tagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 744  Q
    ||||||||  || ||||||||||||||| ||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  47102871 tagtggattggatggctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 47102934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #133
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 239 - 305
Target Start/End: Original strand, 49687334 - 49687400
Alignment:
Q  239 aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacga-tggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgga 305  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  49687334 aatcgtggcatgatggctgggcaacgtggcacaattggaggtttcag-ttttgaggcaagtcactgga 49687400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #134
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 695 - 741
Target Start/End: Complemental strand, 3281761 - 3281715
Alignment:
Q  695 gctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaa 741  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||    
T  3281761 gctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaa 3281715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #135
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 239 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 38925965 - 38925915
Alignment:
Q  239 aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacga-tggaggtttcagtttt 288  Q
    |||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38925965 aatcgtggtacgatggctgggcaacgtggcacgattggaggtttcagtttt 38925915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #136
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 702 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 45644396 - 45644354
Alignment:
Q  702 tctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 744  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  45644396 tctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 45644354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #137
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 299 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 13449996 - 13449947
Alignment:
Q  299 cactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcg 348  Q
    |||||||||||||||| |||||| || ||| |||||| ||||||||||||    
T  13449996 cactggaaaaatcgtgccacgattggatcgaatcgtgccacgatggtgcg 13449947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 398; Significance: 0; HSPs: 134)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 398; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 239 - 750
Target Start/End: Original strand, 38881878 - 38882390
Alignment:
Q  239 aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggca 338  Q
    |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38881878 aatcgtggcacgattgctgggcaacgtggcacgatggaggttttagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggca 38881977  T
Q  339 cgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatca 438  Q
    |||||||||| |||| || ||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38881978 cgatggtgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatca 38882077  T
Q  439 aagcaaactttgagataga-gggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactag 537  Q
     ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  38882078 gagcaaacttggagatagaggggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgaaacaaacactag 38882177  T
Q  538 ggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagactta 636  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38882178 ggtttgtgggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagactta 38882276  T
Q  637 ttcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgg 736  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  38882277 ttcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcctccagactaggtcaatttggaccgaactgg 38882376  T
Q  737 gtcaacaaattctt 750  Q
    ||||||||||||||    
T  38882377 gtcaacaaattctt 38882390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 214 - 750
Target Start/End: Original strand, 4236378 - 4236913
Alignment:
Q  214 ttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcg 312  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  4236378 ttaacttaaaatcagatttctgcagaattgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattggaggtttcagtttta-aggcaaggcactggaaaaatcg 4236476  T
Q  313 tggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaactt 412  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  || |||| |||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  4236477 tggcacaatgggatcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcagggaaaaacagaaacgtatttt-gagtgcagatttgttccaaattttaagcgatactt 4236575  T
Q  413 ttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagag 512  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4236576 ttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagataaagggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagag 4236675  T
Q  513 tttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactt 611  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||    
T  4236676 tttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt-ggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactt 4236774  T
Q  612 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctccccca 710  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4236775 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccccca 4236874  T
Q  711 gactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
     ||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  4236875 aactaggtcaatttggaccgaact-ggtcaataaattctt 4236913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 206 - 750
Target Start/End: Original strand, 2174680 - 2175203
Alignment:
Q  206 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgga 305  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2174680 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagttttttaggcaaggcactgga 2174779  T
Q  306 aaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagc 405  Q
    ||||||                     |||||||||||||||  ||||||| || |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  2174780 aaaatc---------------------gtggcacgatggtgcactggcagcgaaaaacagaaacatatttttgagtgcagatttgttccaaattttaagc 2174858  T
Q  406 gaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 505  Q
    ||  ||||||||| ||||| || |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2174859 gatgcttttactataaatacaggccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 2174958  T
Q  506 tatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggct 604  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  2174959 tatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt-gggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagaggct 2175057  T
Q  605 gagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctct 704  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2175058 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttacttatcatatagtggatcggagggctgctctct 2175157  T
Q  705 cccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2175158 cccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 2175203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 239 - 750
Target Start/End: Original strand, 16775930 - 16776442
Alignment:
Q  239 aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggc 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16775930 aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtgacacgattggaggtttcaagttt-gaggcaaagcactgaaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggc 16776028  T
Q  338 acgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaa-tatagaccttgtat 436  Q
    ||||||||||| ||||| | || |||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  16776029 acgatggtgcgctggcatcgaaaaacagaaacatatttttgagtgaagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaaatatagaccttgtat 16776128  T
Q  437 caaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacacta 536  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  16776129 ctgagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttacaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaataaacacta 16776228  T
Q  537 gggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagactt 635  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16776229 gggtttgtgggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagactt 16776327  T
Q  636 attcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaact 734  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  16776328 attcttgt-aaccattgatttctcttttgtaacgttacttatcatatagtggatcggagggctgctatctcccccagactatgccaatttggaccgaact 16776426  T
Q  735 gggtcaacaaattctt 750  Q
    ||||||||||||||||    
T  16776427 gggtcaacaaattctt 16776442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 205 - 770
Target Start/End: Complemental strand, 25921993 - 25921445
Alignment:
Q  205 atgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagttttt-gaggcaaggcactg 303  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25921993 atgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgatggttggacaacgtggcacgatggaggtttcagttttttgaggcaaggcactg 25921894  T
Q  304 gaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaa 403  Q
    ||||||||                     |||||||||||||||| || |||| ||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25921893 gaaaaatc---------------------gtggcacgatggtgcgctgacagcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaa 25921815  T
Q  404 gcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 503  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25921814 gcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtt 25921715  T
Q  504 tgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagagg 602  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  25921714 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt-gtgaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagg 25921616  T
Q  603 ctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctc 701  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||    
T  25921615 ctgggactctgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagagctgctc 25921516  T
Q  702 tctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattc--ttgtatttttctcttctttgtg 770  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||    
T  25921515 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtg 25921445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 239 - 750
Target Start/End: Original strand, 21947803 - 21948311
Alignment:
Q  239 aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggc 337  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||||     |||||||||||||| | ||| ||||||    
T  21947803 aatcgtggcacgatggctaggcaacgtgacacgattggaggtttcagtttt-gaggtaagtcactggactttacgtggcacgatgggattgcaacgtggc 21947901  T
Q  338 acgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatc 437  Q
    |||||||||   ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21947902 acgatggtg---tggcagcgaataacagaaacatatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatc 21947998  T
Q  438 aaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactag 537  Q
    | || ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  21947999 agagtaaattttgagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactag 21948097  T
Q  538 ggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagactta 636  Q
    |||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21948098 ggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgggactttgggtggaattaggcgggagactta 21948196  T
Q  637 ttcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactg 735  Q
    ||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  21948197 ttcttgtaaccccttgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggactgaactg 21948296  T
Q  736 ggtcaacaaattctt 750  Q
    |||||||||||||||    
T  21948297 ggtcaacaaattctt 21948311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 206 - 747
Target Start/End: Original strand, 31544798 - 31545362
Alignment:
Q  206 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgga 305  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  31544798 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcaaaatcgtggcacgatagctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 31544897  T
Q  306 aaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtg----------------------c 383  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||| |  || |||| |||||||||||||||||                      |    
T  31544898 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgagacacgatggtgcgctggcggataaaaacagaaacatatttttgggtgcagatttattacagattttaagc 31544997  T
Q  384 aaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaag 483  Q
    | ||||||| || ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31544998 agatttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagataaagggggctgaaacaagggtttagaaag 31545097  T
Q  484 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggatt-gag 582  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||    
T  31545098 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt-gggaaacactattaggattagag 31545196  T
Q  583 tct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatat 681  Q
    ||| |||||||||| ||||   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  31545197 tctcttggttacgggaagaaattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacagtactcatcatat 31545296  T
Q  682 agtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 747  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  31545297 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 31545362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 297 - 770
Target Start/End: Complemental strand, 21684909 - 21684424
Alignment:
Q  297 ggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaa 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||    
T  21684909 ggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcagcgaaaaacagaaacatatttttgagtgcagatttgttacaa 21684810  T
Q  397 attttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggca 486  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    |||||||||||          ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21684809 attttaagcaaaacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagagagatagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggca 21684710  T
Q  487 acaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct- 585  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||     
T  21684709 acaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttatgggttgattcgccttggg-atacactattaggattgagtctc 21684611  T
Q  586 ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtg 685  Q
    |||||||||| |||||| || | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  21684610 ttggttacgggaagaggttggggctttgagtagaattaggcaggagacttattcttgtaactcattgatttctctttgtaacaatactcatcatatagtg 21684511  T
Q  686 gatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattc--ttgtatttttctcttctttgtg 770  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||| ||||||    
T  21684510 gatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcgtttgtgttcttctcttttttgtg 21684424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 386 - 747
Target Start/End: Original strand, 31542655 - 31543016
Alignment:
Q  386 atttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggc 485  Q
    ||||||| || ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31542655 atttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggc 31542754  T
Q  486 aacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggatt-gagtc 584  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  31542755 aacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt-gggaaacactattaggattggagtc 31542853  T
Q  585 t-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatag 683  Q
    | |||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  31542854 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattctcg-aacccattgatttctctttgtaacagtactcatcatatag 31542952  T
Q  684 tggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 747  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  31542953 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 31543016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 350 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 2818731 - 2818329
Alignment:
Q  350 tggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt 449  Q
    ||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||    
T  2818731 tggcagcgaataacaaaaacgtattttcgggtgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaacttt 2818632  T
Q  450 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtggg-t 548  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| |    
T  2818631 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggtaacaacaaaactatggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 2818532  T
Q  549 tgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaac 647  Q
    |||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||      
T  2818531 tgattcacctt-ggaaaacactattacgattgagtctcttggttacgggaaaaggctgggactttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaact 2818433  T
Q  648 cattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaat 746  Q
    ||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  2818432 cattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggaggactgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaat 2818333  T
Q  747 tctt 750  Q
    ||||    
T  2818332 tctt 2818329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 409 - 770
Target Start/End: Complemental strand, 31179707 - 31179345
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 508  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31179707 acttttactataaatatagacattgtatcaaagcaaactttgagatagagggagctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 31179608  T
Q  509 agagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggatt-gagtct-ttggttacggaaagaggctga 606  Q
    |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||  ||     
T  31179607 agagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcacctt-gggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgg 31179509  T
Q  607 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcc 706  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  31179508 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattcatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcc 31179409  T
Q  707 cccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttgtatttttctcttctttgtg 770  Q
    |||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||    
T  31179408 cccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctgtgttcttctcttctttgtg 31179345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 409 - 770
Target Start/End: Complemental strand, 10529435 - 10529070
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 508  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  10529435 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagtgggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggatttttat 10529336  T
Q  509 agagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgag 607  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  || |    
T  10529335 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggg 10529237  T
Q  608 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcc 706  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||    
T  10529236 gctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaatcggaaggctgctctctcc 10529137  T
Q  707 cccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattc---ttgtatttttctcttctttgtg 770  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   |||| || ||||||||||||||    
T  10529136 cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctttttgtgttcttctcttctttgtg 10529070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 409 - 750
Target Start/End: Original strand, 39854427 - 39854768
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 508  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39854427 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 39854525  T
Q  509 agagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgag 607  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| |||      
T  39854526 agagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcatggttacgggaagagactgga 39854624  T
Q  608 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcc 706  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39854625 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgctactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcc 39854724  T
Q  707 cccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39854725 cccagactagatcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 39854768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 331 - 750
Target Start/End: Original strand, 6756359 - 6756777
Alignment:
Q  331 tcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagacc 430  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||  | ||||||||||  |||||||| |    
T  6756359 tcgtggcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtattttttggtgcagatttattccaaattttaagttatacttttactattaatatagatc 6756458  T
Q  431 ttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaa 530  Q
    |||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  6756459 ttgtatcatattaaactttgagatagagggagctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactaaggtttgtatagagtttgtctctttggaacaa 6756558  T
Q  531 acactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcggg 629  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  6756559 acactagggtttgagggttgattctcctt-gggaaacactattaggattgagtatcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggg 6756657  T
Q  630 agacttattcttgtaaaccattgatttc-tctttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttgga 727  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| || | ||||||| ||||| ||||| ||||||| | | |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  6756658 agacttattcttgtaa--cattgatatcttttttgtaaggttacacatcattatagtgaaac-gagggctgctctctcccccaaactaggtcaatttgga 6756754  T
Q  728 ccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    |||||||| ||||||||| ||||    
T  6756755 ccgaactgagtcaacaaaatctt 6756777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 411 - 770
Target Start/End: Original strand, 18466625 - 18466991
Alignment:
Q  411 ttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 506  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||    |||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18466625 ttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgg 18466724  T
Q  507 atagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctg 605  Q
    |||||||||||||||| | || |||||||||| |||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18466725 atagagtttgtctctttgaaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagaggctg 18466823  T
Q  606 agactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctct 704  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| | ||| ||||||||||    
T  18466824 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatataatggaacggagagctgctctct 18466923  T
Q  705 cccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattc--ttgtatttttctcttctttgtg 770  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||    
T  18466924 cccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgttttcttctcttctttgtg 18466991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 450 - 770
Target Start/End: Complemental strand, 34477349 - 34477025
Alignment:
Q  450 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggtt 549  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34477349 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 34477250  T
Q  550 gattctccttggggaaacactattaggattg-agtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaaa 646  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||     
T  34477249 gattcaccttggg-aaacactattatgattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaac 34477151  T
Q  647 ccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaat 746  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34477150 ccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 34477051  T
Q  747 --tcttgtatttttctcttctttgtg 770  Q
      |||||| || ||||||||||||||    
T  34477050 tctcttgtgttcttctcttctttgtg 34477025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 450 - 770
Target Start/End: Complemental strand, 34479714 - 34479390
Alignment:
Q  450 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggtt 549  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34479714 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 34479615  T
Q  550 gattctccttggggaaacactattaggattg-agtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaaa 646  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| | |||||  ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||     
T  34479614 gattcaccttggg-aaacactattatgattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaac 34479516  T
Q  647 ccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaat 746  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34479515 ccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 34479416  T
Q  747 tc--ttgtatttttctcttctttgtg 770  Q
    ||  |||| || ||||||||||||||    
T  34479415 tcttttgtgttcttctcttctttgtg 34479390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 409 - 770
Target Start/End: Original strand, 27912473 - 27912843
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 502  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||    |||||||||||      ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27912473 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagatagagggtgctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 27912572  T
Q  503 ttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagag 601  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||| | |||| |||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||    
T  27912573 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaataataggttttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagag 27912671  T
Q  602 gctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgct 700  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||  |||||    
T  27912672 gctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggaacagagaactgct 27912771  T
Q  701 ctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattc--ttgtatttttctcttctttgtg 770  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||    
T  27912772 ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtg 27912843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 331 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 36402741 - 36402322
Alignment:
Q  331 tcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagacc 430  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | ||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  36402741 tcgtggcacgatggtgcgttggcaacgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttc-aaattttaagcgatacttttactataaatatagacc 36402643  T
Q  431 ttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaa 530  Q
    || ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  36402642 ttatatcagagtaaacgttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaatcacgaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaa 36402543  T
Q  531 acactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcggg 629  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||| || ||| |||||||||||||| ||| |||||||||| | |||  ||  |||||||||| |||||||| ||    
T  36402542 acactagggtttgagggttgattcacctt-ggaaaatactattaggattgaatctcttggttacgggaggagattggaactttgggtaaaattaggctgg 36402444  T
Q  630 agacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggac 728  Q
    ||||||||| |||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||     
T  36402443 agacttattattgtaatccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacagatgtctgctctctcccccagactaggtcaatttagat 36402344  T
Q  729 cgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    |||||| |||||||||||||||    
T  36402343 cgaactaggtcaacaaattctt 36402322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 450 - 750
Target Start/End: Original strand, 6745053 - 6745353
Alignment:
Q  450 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggtt 549  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||    
T  6745053 gagataaagggggctgaaacaagtgtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtataaagtttgtctctttggaacaaacactagg-tttgagggtt 6745151  T
Q  550 gattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaacc 648  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6745152 gattcaccttggg-aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 6745250  T
Q  649 attgatttctcttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 747  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6745251 attgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagacaaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 6745350  T
Q  748 ctt 750  Q
    |||    
T  6745351 ctt 6745353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 409 - 750
Target Start/End: Original strand, 26097676 - 26098016
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 508  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  26097676 acttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttggat 26097775  T
Q  509 agagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgag 607  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||| | |||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| || | |||| |    
T  26097776 agagtttgtctctttggaacaaacactagggttagagggttgattcacctt--ggaaacactattaggaatgagtctcttggttacgggaaaatgctggg 26097873  T
Q  608 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcc 706  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  26097874 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacaga-ggctgctctctcc 26097972  T
Q  707 cccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
     ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26097973 tccagactaggtcaatttgaaccgaactgggtcaacaaattctt 26098016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 420 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 18511539 - 18511206
Alignment:
Q  420 aaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 517  Q
    ||||||||||||||||||| |  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18511539 aaatatagaccttgtatcagactaaactttgagagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 18511440  T
Q  518 ctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggt 616  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  || |||||||| |    
T  18511439 ctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttggat 18511341  T
Q  617 agaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagacta 715  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||| ||||||    
T  18511340 agaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagacta 18511241  T
Q  716 ggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18511240 ggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 18511206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 450 - 750
Target Start/End: Original strand, 25804009 - 25804309
Alignment:
Q  450 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggtt 549  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||    
T  25804009 gagatagagggggctcaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggtt 25804108  T
Q  550 gattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaacc 648  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||  || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  25804109 gattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 25804207  T
Q  649 attgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 747  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  25804208 attgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaataaatt 25804306  T
Q  748 ctt 750  Q
    |||    
T  25804307 ctt 25804309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 409 - 750
Target Start/End: Original strand, 27910388 - 27910735
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagag------ggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 502  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||    ||||||||||| ||||      ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  27910388 acttttactataaatatagaccttgtatcaggttaaactttgagagagagatagcgggggctgaaacaagg-tttaaaaaggcaacaacaaaactagggt 27910486  T
Q  503 ttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagag 601  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||    
T  27910487 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgaatctcttggttacgggaagag 27910585  T
Q  602 gctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgct 700  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| | ||| ||||||    
T  27910586 gctgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatataatggaacggagagctgct 27910685  T
Q  701 ctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27910686 ctctcccccagattaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 27910735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 409 - 750
Target Start/End: Original strand, 6747247 - 6747589
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt--gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 506  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  6747247 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaagagaaagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagagtttgt 6747346  T
Q  507 atagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctg 605  Q
    ||| | |||||||||| | || |||||||||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||    
T  6747347 ataaaatttgtctctttgaaacaaacactagg-tttgagggttgattcaccttggg-aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagactg 6747444  T
Q  606 agactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctc 705  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6747445 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctttttgtaacgttactcgtcatatagtggatcggagggctgctctctc 6747544  T
Q  706 ccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
     | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6747545 tctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 6747589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 200; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 409 - 750
Target Start/End: Original strand, 18468950 - 18469294
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 504  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||    |||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18468950 acttttactataaatatagaccttgtatcatgataaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 18469049  T
Q  505 gtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggc 603  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  18469050 gtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggc 18469148  T
Q  604 tgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctct 702  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |  || ||||||||    
T  18469149 tgggactttaggtagaattaggcgggagactttttcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatctagtggaacgaagagctgctct 18469248  T
Q  703 ctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    ||  |||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  18469249 ct--cccagactaggtcaatttggaccgaactggattaacaaattctt 18469294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 409 - 747
Target Start/End: Original strand, 40221465 - 40221805
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 508  Q
    |||||||||| |||||||||| |||  ||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  40221465 acttttactataaatatagacattgactcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtat 40221564  T
Q  509 agagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgag 607  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||  || |    
T  40221565 agagtttgtctctttggaacaaacactaggatttgagggttgattcacctt-ggaaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattggg 40221663  T
Q  608 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctc 705  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||||    
T  40221664 acttttggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctc 40221763  T
Q  706 ccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 747  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40221764 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 40221805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 450 - 747
Target Start/End: Original strand, 15552229 - 15552527
Alignment:
Q  450 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggtt 549  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  15552229 gagatagaggggactgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttatctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 15552328  T
Q  550 gattctccttggggaaacactattaggattg-agtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaac 647  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15552329 gattcaccttggg-aaacactattaggattggagtctcttgattacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacc 15552427  T
Q  648 cattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 747  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  15552428 cattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 15552527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 410 - 747
Target Start/End: Original strand, 25904047 - 25904385
Alignment:
Q  410 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 509  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  25904047 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggattgtata 25904146  T
Q  510 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgaga 608  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  |  |     
T  25904147 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattaggg 25904245  T
Q  609 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctct-ttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctccc 707  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| | | || | ||||||||||||    
T  25904246 ctttgagtataattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctctattgtaacgttacttatcatatagtgaaacggatgactgctctctccc 25904345  T
Q  708 ccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 747  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25904346 ccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaatt 25904385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 410 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 1189949 - 1189601
Alignment:
Q  410 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 504  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| | | |||| ||||||    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1189949 cttttactataaatatagaccttgtatcagatgtaaaccttgagagagatagagggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactacggttt 1189850  T
Q  505 gtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggc 603  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||| | |||||      
T  1189849 gtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattc-actttgggaaacactattatgattgagtctcttggttacaggaagagat 1189751  T
Q  604 tgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctc 701  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||| | ||||||||| | ||||| |||||    
T  1189750 tgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaaggttactcataattatagtggaacggagggatgctc 1189651  T
Q  702 tctcc-cccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1189650 tctcctcccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 1189601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 410 - 750
Target Start/End: Original strand, 17072827 - 17073169
Alignment:
Q  410 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 509  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17072827 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtata 17072926  T
Q  510 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgaga 608  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||  || |     
T  17072927 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgaatctcttggttaggggaagagattgggg 17073025  T
Q  609 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcc 706  Q
    |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||  | | ||||||||||||||||    
T  17073026 ctttcgatagaattaggcggaagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtaaaacggagggctgctctctcc 17073125  T
Q  707 cccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17073126 cccagactcggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 17073169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 334 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 31466389 - 31465983
Alignment:
Q  334 tggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttg 433  Q
    ||||||||||||||  ||||||  |||| ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  31466389 tggcacgatggtgcactggcagggaataccataaatgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgacacttttactataaatatagaccttg 31466290  T
Q  434 tatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaaca 533  Q
    ||||| |  ||||||||||||| | ||||||||||||| |||||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  31466289 tatcagactaaactttgagataaaaggggctgaaacaaaggtttaaaaaagtaacgacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaaca 31466190  T
Q  534 ctagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggaga 632  Q
    | ||||||||  ||||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||  |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  31466189 ccagggtttgacggttgattcacctt-gagaaacagtattaggattgagtctcttggttacgggaagagatttggactttgggtagaattaggcgggaga 31466091  T
Q  633 cttattcttgtaaaccattgatttct-ctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccga 731  Q
    | ||||||||||| |||||||| |||  ||||||| ||||||||||||||          |||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||    
T  31466090 c-tattcttgtaacccattgatatctattttgtaaagttactcatcatat----------agggctgctctcacccccagactagttcaatttggaccga 31466002  T
Q  732 actgggtcaacaaattctt 750  Q
    ||| |||||||||||||||    
T  31466001 actaggtcaacaaattctt 31465983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 412 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 18509652 - 18509312
Alignment:
Q  412 tttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagag-ggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 510  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  18509652 tttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagagatagaggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatag 18509553  T
Q  511 agtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagac 609  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  || |||    
T  18509552 agtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagaatgggac 18509454  T
Q  610 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttct-ctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccc 708  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | ||||| |||  ||||||| |||||||||||||||||| | | | ||||||||||||||||    
T  18509453 tttgggtagaattaagcgggagacttattcttgtaactcgttgatatctattttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggtgggctgctctctcccc 18509354  T
Q  709 cagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
     ||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  18509353 tagactaggtcaatttgaaccgaactaggtcaacaaattctt 18509312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 331 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 12556337 - 12555917
Alignment:
Q  331 tcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagacc 430  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| |||  |||||||| || || ||||||| |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  12556337 tcgtggcacgatgatgcgctggcagcgaataacagaaatgtatttttgtgtacagatttgtttcaaaatttaagcgatacttttactataaatatagacc 12556238  T
Q  431 ttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaa 530  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  12556237 ttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaataagggtttagaatgacaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctcttgggaacaa 12556138  T
Q  531 acactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcggg 629  Q
    |||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||| |||| ||||| |||||  || || ||| ||||||||||| |  |    
T  12556137 acactaaggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgtgtctcttggctacgggaagagattg-gagttttggtagaattagacaag 12556040  T
Q  630 agacttattcttgtaaaccattg--atttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttgga 727  Q
    |||||| |||||||||  |||||  || ||| |||||||||||||||||| || || | | | |||||||||| ||||||||| ||||| | ||||||||    
T  12556039 agactttttcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcttaaagcgaaacggagggctgctatctcccccatactagttcaatttgga 12555940  T
Q  728 ccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    | |||||||||||| ||||||||    
T  12555939 ctgaactgggtcaataaattctt 12555917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 410 - 750
Target Start/End: Original strand, 24126800 - 24127141
Alignment:
Q  410 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 509  Q
    ||||||||| |||||||||| || |||||  | |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24126800 cttttactataaatatagacattatatcagtgtaaaccttgagatagatggggctgaaacaagagtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtata 24126899  T
Q  510 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgaga 608  Q
    |||||||||||||   || ||| |||||||||||  | ||||||  |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||  || ||    
T  24126900 gagtttgtctcttgtcaacaaatactagggtttgaagattgattgacctt-gggaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagagattggga 24126998  T
Q  609 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctccc 707  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  24126999 ctttgggtagaattaggcgatagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccc 24127098  T
Q  708 ccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24127099 ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 24127141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 413 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 10474655 - 10474317
Alignment:
Q  413 ttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagag 512  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||  | |||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10474655 ttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgaaatagagggggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaaatctagggtttgtatagag 10474556  T
Q  513 tttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactt 611  Q
    |||||||||| |||| ||||||| ||||||| |||||||| | |||| |||||||||||||| |||||| ||| |||||||| | |||||  || |||||    
T  10474555 tttgtctctttggaacaaacactggggtttgagggttgatacacctt-gggaaacactattaagattgaatctcttggttacaggaagagattgggactt 10474457  T
Q  612 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctccccca 710  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||| | | || |||||||||||||||||    
T  10474456 tgagtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatatctcttttctaaggttactcatcatatagtgaaacggatggctgctctctccccca 10474357  T
Q  711 gactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
     ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10474356 tactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 10474317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 420 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 17818814 - 17818486
Alignment:
Q  420 aaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtct 519  Q
    |||||||||| ||||||||  | |||| |||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  17818814 aaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagaaagagggg-ctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtatagagttcgtct 17818716  T
Q  520 cttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtag 618  Q
    ||| |||| |||||||||||||||  ||||||||  |||| |||||||||||||| || ||||||| |||||||||| |||||  |||| ||||||||||    
T  17818715 ctttggaacaaacactagggtttgatggttgatttacctt-gggaaacactattaagactgagtctcttggttacgggaagagattgaggctttgggtag 17818617  T
Q  619 aattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactagg 717  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||  ||||||||||| ||||||    
T  17818616 aattatgcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatacagtggaacagagggct--tctctcccccaaactagg 17818519  T
Q  718 taaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17818518 tcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 17818486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 409 - 750
Target Start/End: Original strand, 18596590 - 18596931
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 508  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||| || |||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18596590 acttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaaccttgggatagagggggctgaaacaagggtata--aagacaacaacaaaactagggtttgtat 18596687  T
Q  509 agagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgag 607  Q
    |||||||||||||| |||| ||||| || |||||| |||||||||| |||| || ||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||  || |    
T  18596688 agagtttgtctctttggaacaaacaatatggtttgagggttgattcacctt-ggaaaacactgttaggattgagtctcttggttacgggaagagattggg 18596786  T
Q  608 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctc 705  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||||    
T  18596787 actttgagtagaattaggcgggagacttatttttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctc 18596886  T
Q  706 ccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18596887 ctccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacagattctt 18596931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 172; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 450 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 16092495 - 16092193
Alignment:
Q  450 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggtt 549  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | || ||||||||||||||| |||||    
T  16092495 gagatagagggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtctgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggtt 16092396  T
Q  550 gattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaacc 648  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16092395 gattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 16092297  T
Q  649 attgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaat 746  Q
    |||||  |||| ||||||| ||||||||||| ||||||| | | ||||| |||||||||| | ||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  16092296 attgagatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggttgctctctcctctagactaggtcaatttagactgaactggatcaacaaat 16092197  T
Q  747 tctt 750  Q
    ||||    
T  16092196 tctt 16092193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 172; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 410 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 31472948 - 31472606
Alignment:
Q  410 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 509  Q
    ||||||||| |||||| ||| |||||| |  | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31472948 cttttactataaatatggacattgtattagtgtaaaccttgagatagagggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 31472849  T
Q  510 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgaga 608  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||  || ||    
T  31472848 gagtttgtctcttgggaacaaacactaaggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattggga 31472750  T
Q  609 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcc 706  Q
    |||| |||||||||||||||||  | | ||||| ||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||| | | ||||| ||||||||||    
T  31472749 cttttggtagaattaggcgggatgcatcttcttctaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggttgctctctcc 31472650  T
Q  707 cccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31472649 cccatactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 31472606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 420 - 750
Target Start/End: Original strand, 2954370 - 2954701
Alignment:
Q  420 aaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtct 519  Q
    |||||||| | ||||||||  | ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| || | |||||||    
T  2954370 aaatataggctttgtatcagtgtaaactttgagatagaggagtatgaaacaagggtttagaaagacagcaacaaaactagggtttgtgtataatttgtct 2954469  T
Q  520 cttcgg-aagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggta 617  Q
    ||| || || ||||||||||||||| |||||||||| | ||||  |||||||||||||||||||||| || ||||||  |||||  ||||||||||||||    
T  2954470 ctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcactttgga-aaacactattaggattgagtctcttagttacgagaagagattgagactttgggta 2954568  T
Q  618 gaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactagg 717  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | | ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  2954569 gaattaggcgggagacgtattcttgtaacccattgatatctctttgtaaagttactcatcatatagtgaagcggagggatgctctctcccccaaactagg 2954668  T
Q  718 taaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2954669 tcaattttgaccgaactgggtcaacaaattctt 2954701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 409 - 750
Target Start/End: Original strand, 10586782 - 10587117
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagag---ggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 505  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||    ||||||||||| |||    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||          
T  10586782 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagaggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactag------ 10586875  T
Q  506 tatagagtttgtctcttcgg-aagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggc 603  Q
         |||||||||||| || || ||||  ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||      
T  10586876 -----agtttgtctctttgggaacaaacgatagggtttgagggttgattcaccttggg-aaacactattaggattcagtctcttgcttacggaaagagat 10586969  T
Q  604 tgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctc 703  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10586970 tgagactttgggtagaattaggcaggagacttattcttttaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctc 10587069  T
Q  704 t-cccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10587070 tccccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 10587117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 165; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 409 - 751
Target Start/End: Complemental strand, 37706116 - 37705773
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 508  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  37706116 acttttgctataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaaggcaacgacaaatctagggtttgtat 37706017  T
Q  509 agagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgag 607  Q
    ||| |||||||||| | || ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||  |  |    
T  37706016 agactttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagg 37705918  T
Q  608 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcc 706  Q
      ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| | |  | ||||  |||||||    
T  37705917 gttttggatagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatggctattctctcc 37705818  T
Q  707 cccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttg 751  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37705817 cccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttg 37705773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 410 - 747
Target Start/End: Original strand, 695833 - 696160
Alignment:
Q  410 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 509  Q
    |||||||||  ||||||||| |||||| |  | |||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  695833 cttttactatgaatatagacattgtatgagtgtaaaccttgagataaagggggatgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat- 695931  T
Q  510 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgaga 608  Q
              ||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  |||||    
T  695932 ----------ctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgg--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgaga 696019  T
Q  609 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcc 706  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| |||| |||||| ||||||| | | ||||||||||||||||    
T  696020 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacggagggctgctctctcc 696119  T
Q  707 cccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 747  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  696120 cccagacaaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 696160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 488 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 658610 - 658350
Alignment:
Q  488 caacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-t 586  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||| |    
T  658610 caacaaaactagggtttgtatagagtttgtctatttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgag-aaacactattaggatcgagtctct 658512  T
Q  587 tggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtg 685  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  658511 tggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 658412  T
Q  686 gatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
     | | || |||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  658411 aaacggatggctgctct---ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 658350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 410 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 39398327 - 39397987
Alignment:
Q  410 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 509  Q
    ||||||||| ||||||| || ||||| |   | |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39398327 cttttactataaatataaacattgtaccggtgtaaaccttgagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 39398229  T
Q  510 gagtttgtctcttcgg-aagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgag 607  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||      
T  39398228 gagtttgtctctttggcaacaaacacta-ggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattgga 39398131  T
Q  608 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcc 706  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||  || |||||||  | | || |||||||||||||    
T  39398130 actttgggtagaattaggcagtagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtgacgttaccaattatatagtaaaacggatggctgctctctcc 39398031  T
Q  707 cccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||| |||||| | ||||||    
T  39398030 cacagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaaaacattctt 39397987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 155; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 533 - 750
Target Start/End: Original strand, 4410090 - 4410307
Alignment:
Q  533 actagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggag 631  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4410090 actagggtttgtgggttgattcaccttggg-aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggag 4410188  T
Q  632 acttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccga 731  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  4410189 acttattcttgtaacctattgatttctctttgtaacgatactcatcatatagtggattggagagctgctctctcccccagactaggtcagattggaccga 4410288  T
Q  732 actgggtcaacaaattctt 750  Q
    |||||||||||||||||||    
T  4410289 actgggtcaacaaattctt 4410307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 145; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 239 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 20507968 - 20507665
Alignment:
Q  239 aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggc 337  Q
    |||||||||||||| |   |||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||||||| || ||||    ||||||||||||||| | ||| | ||||    
T  20507968 aatcgtggcacgatagttgggcaacgtagcacgattggaggttttagtttt-gaggcaagtcattggatttttcgtggcacgatgggattgcaacatggc 20507870  T
Q  338 acgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatc 437  Q
    |||| |||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  20507869 acgaaggtgcgctagcagcgaataacagaaacatatttttgggagcagatttgttccaagatttaagcgatacttttactataaatatagatcttgtatc 20507770  T
Q  438 aaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactag 537  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||    
T  20507769 agagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaaaaaaattaaggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacacaag 20507670  T
Q  538 ggttt 542  Q
    |||||    
T  20507669 ggttt 20507665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 410 - 624
Target Start/End: Original strand, 20042994 - 20043208
Alignment:
Q  410 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 509  Q
    ||||||||| |||||||| | |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20042994 cttttactataaatataggctttgtatcatagcaaaccttgagatagagggggctgaaacaagtgtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 20043093  T
Q  510 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgaga 608  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  |||||    
T  20043094 gagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgaga 20043192  T
Q  609 ctttgggtagaattag 624  Q
    |||||| |||||||||    
T  20043193 ctttggatagaattag 20043208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 410 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 34531001 - 34530712
Alignment:
Q  410 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 509  Q
    ||||||||  |||||||||| ||| |||| || |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34531001 cttttactgtaaatatagactttgaatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagtgtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtata 34530902  T
Q  510 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgaga 608  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||  |  ||    
T  34530901 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgaaggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggctacgggaagagattagga 34530803  T
Q  609 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggct 697  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||| ||||||| ||| ||||||| |||||||||  ||||||||    
T  34530802 ctttgagtagaattaggcgggagatttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttgctcatcattatagtggaagagagggct 34530712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 563 - 750
Target Start/End: Original strand, 10749796 - 10749985
Alignment:
Q  563 gaaacactattaggattg-agtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctct 660  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10749796 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 10749895  T
Q  661 ttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10749896 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattctt 10749985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 545 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 20506041 - 20505837
Alignment:
Q  545 gggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgt 643  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20506041 gggttgattcaccttggg-aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgt 20505943  T
Q  644 aaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaac 742  Q
    ||  ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20505942 aacacattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctg--ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaac 20505845  T
Q  743 aaattctt 750  Q
    ||||||||    
T  20505844 aaattctt 20505837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 420 - 750
Target Start/End: Original strand, 21288718 - 21289046
Alignment:
Q  420 aaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtct 519  Q
    |||||||||||||| || | || |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  21288718 aaatatagaccttgaattagagtaaaccttgagatagagggggttgaaataagggtttagaatagcaacaataaaaatagggtttgtatagagtttgtct 21288817  T
Q  520 cttcggaagaaacac------tagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagacttt 612  Q
    ||| |||| ||||||      ||||||||| |||||||||| ||||  | |||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||  |  ||||||    
T  21288818 ctttggaacaaacactagggttagggtttgagggttgattcacctt--gaaaacactattaggattgagtatcttggttacgggaagagattaggacttt 21288915  T
Q  613 gggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccaga 712  Q
    || |||||||| |||||||| || |||||||||  ||      ||| |||||||||||||||||| ||||||| | | ||||||||||||||||||||||    
T  21288916 ggatagaattaagcgggagattttttcttgtaactca------tct-tttgtaacgttactcatcttatagtgaaacggagggctgctctctcccccaga 21289008  T
Q  713 ctaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21289009 ctaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattctt 21289046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 128; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 410 - 628
Target Start/End: Original strand, 20044954 - 20045172
Alignment:
Q  410 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 509  Q
    ||||||||| |||||||| | |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  20044954 cttttactataaatataggctttgtatcagagcaaaccttgagacagagggggctgaaacaagggtttaggaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 20045053  T
Q  510 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgaga 608  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| |||||  || ||    
T  20045054 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattatgattgagtctcttggttccgggaagagattggga 20045152  T
Q  609 ctttgggtagaattaggcgg 628  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  20045153 ctttgggtagaattaggcgg 20045172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 542 - 750
Target Start/End: Original strand, 39798123 - 39798332
Alignment:
Q  542 tgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattct 640  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  || | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39798123 tgtgggttgattcaccttggg-aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgtggctttgggtagaattaggcgggagacttattct 39798221  T
Q  641 tgtaaaccattgatttctctttg-taacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtc 739  Q
    ||||| ||||||||||||||||  ||| | |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||    
T  39798222 tgtaacccattgatttctcttttataatgatactcatcgtatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaagtcaatttggatcgaactgggtc 39798321  T
Q  740 aacaaattctt 750  Q
    |||||||||||    
T  39798322 aacaaattctt 39798332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 563 - 750
Target Start/End: Original strand, 10757273 - 10757461
Alignment:
Q  563 gaaacactattaggattg-agtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctct 660  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  10757273 gaaacactattaggattggagtctcttggttacggaa-gagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttttct 10757371  T
Q  661 ttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||    
T  10757372 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattagaccgaactgggtcaacaaattctt 10757461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 563 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 38960314 - 38960129
Alignment:
Q  563 gaaacactattaggattg-agtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctct 660  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  38960314 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagacgggagact-attcttgtaacccattgatttctct 38960216  T
Q  661 ttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 747  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  38960215 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 38960129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 415 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 6661512 - 6661181
Alignment:
Q  415 actacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 514  Q
    |||| ||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| |||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  6661512 actataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatagagagggttgaaacaagggtttag-aagtcaacaagaaaattagggtatgtatagagtt 6661414  T
Q  515 tgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttg 613  Q
    ||| |||| | || ||||||||| |||   |||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||   ||||| ||||    
T  6661413 tgt-tcttggcaacaaacactagagtt--ggggttgattcaccat-gggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaaattgagattttg 6661318  T
Q  614 ggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccag 711  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||| ||||| | ||||||||| | || | |||||||||||| |||    
T  6661317 ggtacaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttgctcataattatagtggaacggatgactgctctctccctcag 6661218  T
Q  712 actaggt-aaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 747  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| | ||||||||    
T  6661217 actaggtcagatttggaccgaactggataaacaaatt 6661181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 563 - 748
Target Start/End: Complemental strand, 15354757 - 15354571
Alignment:
Q  563 gaaacactattaggattg-agtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctct 660  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  15354757 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctct 15354659  T
Q  661 ttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 748  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  15354658 ttgtaacgttactcattaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattc 15354571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 563 - 748
Target Start/End: Original strand, 23665140 - 23665326
Alignment:
Q  563 gaaacactattaggattg-agtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctct 660  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  23665140 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctct 23665238  T
Q  661 ttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 748  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  23665239 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctcttccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattc 23665326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 563 - 748
Target Start/End: Complemental strand, 23793447 - 23793261
Alignment:
Q  563 gaaacactattaggattg-agtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctct 660  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  23793447 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctct 23793349  T
Q  661 ttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 748  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  23793348 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctcttccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattc 23793261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 533 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 41585956 - 41585738
Alignment:
Q  533 actagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggag 631  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||| |||| ||||| |||||  || | |||||||||||||||||| ||||    
T  41585956 actagggtttgagggttgattcaccttggg-aaacactagtaggattgagtctcttggctacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcaggag 41585858  T
Q  632 acttattcttgtaaaccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccg 730  Q
    ||||||| ||||||  ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  41585857 acttatttttgtaagtcattgatatctcttttgtaatgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccg 41585758  T
Q  731 aactgggtcaacaaattctt 750  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  41585757 aactgggtcaacaaattctt 41585738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 563 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 3373320 - 3373134
Alignment:
Q  563 gaaacactattaggattga-gtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctct 660  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || ||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3373320 gaaacactattaggattgaagtctcttagttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 3373221  T
Q  661 ttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 747  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  3373220 ttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggttgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 3373134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 563 - 748
Target Start/End: Complemental strand, 15357033 - 15356847
Alignment:
Q  563 gaaacactattaggattg-agtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctct 660  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  15357033 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctct 15356935  T
Q  661 ttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 748  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  15356934 ttgtaacgttactcattaaatagtggatcggagggctgctctctcccccggactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattc 15356847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 206 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 34477632 - 34477438
Alignment:
Q  206 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgga 305  Q
    ||||||| ||||||| ||||||  ||| |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  34477632 tgtgagagttaacttaaaatcaagtttctgcagaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttaggcaaggcactgga 34477533  T
Q  306 aaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaatttt 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  || || | ||||||||||||||||||| ||||||| || |||||    
T  34477532 aaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaata-aaacatatttttgggtgcagatttgttacagatttt 34477438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 409 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 26098587 - 26098395
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 508  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||| || |||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  26098587 acttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctggagatagagggggctgaaataagggtttagaatggcaacaagaagactagggtttgtat 26098488  T
Q  509 agagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagag 601  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| |  ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  26098487 agagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt-gacaaacactattatgattgagtctcttggttacggaaagag 26098395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 103; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 206 - 436
Target Start/End: Original strand, 39797849 - 39798058
Alignment:
Q  206 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgga 305  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  39797849 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcataatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcatgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcaccgga 39797948  T
Q  306 aaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagc 405  Q
    |||||| ||||||||                     ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39797949 aaaatcatggcacga---------------------tggtgcgctggcagcgaataacagaaacatatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagc 39798027  T
Q  406 gaaacttttactacaaatatagaccttgtat 436  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39798028 aaaacttttactataaatatagaccttgtat 39798058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 607 - 748
Target Start/End: Complemental strand, 23741995 - 23741855
Alignment:
Q  607 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcc 706  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |    
T  23741995 gactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctcttc 23741897  T
Q  707 cccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 748  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  23741896 cccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattc 23741855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 529 - 750
Target Start/End: Original strand, 2723965 - 2724178
Alignment:
Q  529 aaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcg 627  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||  ||         |||||||||||||    
T  2723965 aaacactagggtttgagggatgattcaccttggg-aaacaccattaggattgagtctcttggttacgggaagagattg---------gtagaattaggcg 2724054  T
Q  628 ggagacttattcttgtaaaccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttgg 726  Q
    || || |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||  ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2724055 ggtgatttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaagattactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttgg 2724154  T
Q  727 accgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  2724155 accgaactgggtcaacaaattctt 2724178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 206 - 392
Target Start/End: Original strand, 31542442 - 31542628
Alignment:
Q  206 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgga 305  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||| |||| ||||||| |||||| ||  |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  31542442 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcaaaatcgtgacacgatagctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 31542541  T
Q  306 aaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgtt 392  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||| |  || |||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  31542542 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgagacacgatggtgcgctggcggataaaaacagaaacatatttttgggtgcagatttgtt 31542628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 410 - 763
Target Start/End: Original strand, 36208524 - 36208874
Alignment:
Q  410 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 508  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| ||||||||| ||     
T  36208524 cttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaagggtttagaaaca-aacaacaaa-ctagggttt-tag 36208620  T
Q  509 agag-tttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctga 606  Q
    |||| ||| |||   ||| ||||||  |||||||  ||  ||||||| ||||||| ||||| || || |||||||||| ||||| |||| |||||  |||    
T  36208621 agagatttctctaagcgggagaaac--tagggttgttg--ttgattcaccttggg-aaacattactaagattgagtctcttggtaacgggaagagattga 36208715  T
Q  607 gactttgggtagaattaggcggg-agacttattcttgtaaaccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcat-atagtggatcagagggctgctctc 703  Q
    |||||||||||||||||||   | |||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| |||||||||||| |||||| | | | ||||||||||     
T  36208716 gactttgggtagaattaggtttgtagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggcgggctgctctt 36208815  T
Q  704 tcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttgtatttttctctt 763  Q
    ||||| | ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||||    
T  36208816 tcccc-atactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaattcttttgtttctctctt 36208874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 206 - 392
Target Start/End: Original strand, 10749505 - 10749690
Alignment:
Q  206 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgga 305  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||| |||  |||  || |||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  10749505 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcacaatcgtggcacgacggctgggcttcgcggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 10749604  T
Q  306 aaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgtt 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  || || | ||||||||||||||| ||| |||||||    
T  10749605 aaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaata-aaacatatttttgggagcagatttgtt 10749690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 206 - 392
Target Start/End: Original strand, 10756960 - 10757145
Alignment:
Q  206 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgga 305  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||| |||| |||||| |||||| |||  |||  || |||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  10756960 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcacaatcgtagcacgacggctgggcttcgcggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 10757059  T
Q  306 aaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgtt 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  || || | ||||||||||||||| ||| |||||||    
T  10757060 aaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaata-aaacatatttttgggagcagatttgtt 10757145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 206 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 15355065 - 15354880
Alignment:
Q  206 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgga 305  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||  ||  |||  || |||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  15355065 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcacaatcgtggcacgacagctgggcttcgcggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 15354966  T
Q  306 aaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgtt 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  || || | ||||||||||||||| ||| |||||||    
T  15354965 aaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaata-aaacatatttttgggagcagatttgtt 15354880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 206 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 15357341 - 15357156
Alignment:
Q  206 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgga 305  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||  ||  |||  || |||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  15357341 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcacaatcgtggcacgacagctgggcttcgcggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 15357242  T
Q  306 aaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgtt 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  || || | ||||||||||||||| ||| |||||||    
T  15357241 aaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaata-aaacatatttttgggagcagatttgtt 15357156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 206 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 34479972 - 34479855
Alignment:
Q  206 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgga 305  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  34479972 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttaggcaaggcactgga 34479873  T
Q  306 aaaatcgtggcacgatgg 323  Q
    ||||||||||||||||||    
T  34479872 aaaatcgtggcacgatgg 34479855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 409 - 506
Target Start/End: Original strand, 4410000 - 4410101
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 504  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4410000 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 4410099  T
Q  505 gt 506  Q
    ||    
T  4410100 gt 4410101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 205 - 392
Target Start/End: Original strand, 23664833 - 23665019
Alignment:
Q  205 atgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgg 304  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||  ||  |||  || |||||||||||| ||| | |||||  || ||||||||||    
T  23664833 atgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcacaatcgtggcacgacagctgggcttcgcggcacgatggagtttttatttttttgggaaaggcactgg 23664932  T
Q  305 aaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgtt 392  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |  || || | ||||||||||||||| ||| |||||||    
T  23664933 aaaaatcgtggcacgatgggatcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaata-aaacatatttttgggagcagatttgtt 23665019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 205 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 23793754 - 23793568
Alignment:
Q  205 atgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgg 304  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||  ||  |||  || |||||||||||| ||| | |||||  || ||||||||||    
T  23793754 atgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcacaatcgtggcacgacagctgggcttcgcggcacgatggagtttttatttttttgggaaaggcactgg 23793655  T
Q  305 aaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgtt 392  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |  || || | ||||||||||||||| ||| |||||||    
T  23793654 aaaaatcgtggcacgatgggatcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaata-aaacatatttttgggagcagatttgtt 23793568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 206 - 392
Target Start/End: Original strand, 23667109 - 23667294
Alignment:
Q  206 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgga 305  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||  ||  |||  || |||||||||||| ||| | |||||  || |||||||||||    
T  23667109 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcacaatcgtggcacgacagctgggcttcgcggcacgatggagtttttatttttttgggaaaggcactgga 23667208  T
Q  306 aaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgtt 392  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |  || || | ||||||||||||||| ||| |||||||    
T  23667209 aaaatcgtggcacgatgggatcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaata-aaacatatttttgggagcagatttgtt 23667294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 466 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 17413441 - 17413198
Alignment:
Q  466 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaa 565  Q
    |||||||||||||||| |||| ||  ||||||| ||||||||  ||||||| ||||| | || ||||||||||||| |  | ||||||| ||||||| ||    
T  17413441 aaacaagggtttagaa-ggcagcactaaaactatggtttgta--gagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--gattgattcaccttggg-aa 17413349  T
Q  566 acactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggaga-cttattcttgtaaaccattgatttctcttt- 662  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | || |||||  ||||||||| ||||||||||||   || | ||||||||||||| || ||||| |||||||     
T  17413348 acactattaggattgagtctcttggtcaagggaagagattgagactttaggtagaattaggtttgaaaacttattcttgtaaccctttgatatctctttt 17413249  T
Q  663 gtaacgttactcatcat-atagtggatcagagggctgctctctcccccaga 712  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  17413248 gtaaagttactcatcattatagtggaacagagggatgctctctcccccaga 17413198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 453 - 750
Target Start/End: Original strand, 20053834 - 20054122
Alignment:
Q  453 atagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgat 552  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| |||| |||| |||||| ||||| | || |||||||||||||    |||||||    
T  20053834 atagagggcgctgaaacaagggtttag-aaggcaacacaaaaactagagtttatataaagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt--gaggttgat 20053929  T
Q  553 tctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccatt 651  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||       |||  || ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||       
T  20053930 tcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggtt-----tggagattgggactttaagtagaattaggtgggagacttattcttgtaaccc--- 20054020  T
Q  652 gatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt-aaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 748  Q
    ||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||| || | || ||||||||||||| ||| ||||||| |  |||||||||||||| || |||||||||    
T  20054021 gatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtagaacggaaggctgctctctcctccatactaggtcagttttggaccgaactgcgtaaacaaattc 20054120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 411 - 750
Target Start/End: Original strand, 9020167 - 9020505
Alignment:
Q  411 ttttactacaaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 508  Q
    |||||||| ||||| | ||||||||||| | | |||| ||| | ||||||| ||||||| ||||||||| | | ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  9020167 ttttactataaatacataccttgtatcagatgtaaaccttgtgctagagggagctgaaaacaagggtttggga-ggcaaca-caaaagtagggtttgtat 9020264  T
Q  509 agagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgag 607  Q
    ||||||   ||||| | || |||||||||||||   |  ||||||| ||||||  ||||||||||| |||||||| | ||||| |||| |||||  ||      
T  9020265 agagttg--ctcttggcaacaaacactagggttgaag--ttgattcaccttgga-aaacactattaagattgagtttcttggtcacgggaagagattgga 9020359  T
Q  608 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctc 705  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||  |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||    
T  9020360 gctttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaaattactcatcattatagtggatcggatggctgctctctc 9020459  T
Q  706 ccccagactaggt-aaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    | ||| | |||||    ||||||||||||||| | ||| |||||||    
T  9020460 ctccaaattaggtctgttttggaccgaactggataaaccaattctt 9020505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 263 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 31179897 - 31179807
Alignment:
Q  263 cgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggc 353  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  31179897 cgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaagacactggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggc 31179807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 563 - 748
Target Start/End: Original strand, 23667415 - 23667601
Alignment:
Q  563 gaaacactattaggattg-agtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctct 660  Q
    |||||||||| ||||||| | ||| ||| |||| |||||||  || ||||||||  |||||||||||  | ||| || |||| || ||||||||||||||    
T  23667415 gaaacactataaggattggactctcttgcttacagaaagagattgggactttggaaagaattaggcgaaaaact-atgcttgcaacccattgatttctct 23667513  T
Q  661 ttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 748  Q
    ||||||||| |||||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||  |  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  23667514 ttgtaacgtcactcatcaaataatggatcggagggctgctctcttccccagactaggacagattggaccgaactgggccaacaaattc 23667601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 239 - 323
Target Start/End: Original strand, 659746 - 659829
Alignment:
Q  239 aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatgg 323  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  659746 aatcgtggcacgatggctaggcaacgtggcacgattggaggtttcagttt--gaggcaagtcactggaaaaatcgtggcacgatgg 659829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 206 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 38960604 - 38960487
Alignment:
Q  206 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgga 305  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||| |||  |||   | |||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  38960604 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcacaatcgtggcacgacggctgggctttgcggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 38960505  T
Q  306 aaaatcgtggcacgatgg 323  Q
    ||||||||||||||||||    
T  38960504 aaaatcgtggcacgatgg 38960487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 660 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 26098373 - 26098282
Alignment:
Q  660 tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctccccc-agactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26098373 tttgtaacgttactcatcatatggtgaaacggagggctgctctctccccccatactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaattctt 26098282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 261 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 659929 - 659850
Alignment:
Q  261 aacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacga 341  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  659929 aacgtggcacgattggaggtttcagttt--gaggcaagtcactggaaaaatcgtggcacgatgaggtcgcattgtggcacga 659850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 604 - 680
Target Start/End: Original strand, 42770948 - 42771025
Alignment:
Q  604 tgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcata 680  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| |||| ||||||| |||||||||||||    
T  42770948 tgagactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacctattgatatctcttttgtaaagttactcatcata 42771025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 409 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 41586042 - 41585946
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 505  Q
    |||||||||| ||||||||   |||||||| || |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||    
T  41586042 acttttactataaatataggttttgtatcagagtaaaccttgagataaagggggctgaaacaagggtttagaataacaagaacaaaactagggtttg 41585946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 567 - 752
Target Start/End: Original strand, 22672837 - 22673024
Alignment:
Q  567 cactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgt 664  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||  ||   || |||||||||    
T  22672837 cactattaggattgagtctcttggtcacgagaagaggctgagac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttgt 22672932  T
Q  665 aacgttactc--atca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt-aaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttgt 752  Q
    || |  ||||  |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |   || ||||||||||||| |||||||||||||    
T  22672933 aaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattcttgt 22673024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 567 - 747
Target Start/End: Original strand, 4897828 - 4898013
Alignment:
Q  567 cactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggc-gggagacttattcttgtaaaccattgatttctct-ttg 663  Q
    |||| |||||||||||| | ||||| |||| |||||  || ||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||||| |  ||||| ||||| |||    
T  4897828 cactgttaggattgagtatcttggtcacgggaagagattgtgactttgggtagaattaggcttgaagactgattcttgtaaccatttgatatctctattg 4897927  T
Q  664 taacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 747  Q
    ||| ||||||||||| ||||| ||| ||| |||||||| ||||||||| ||||||| | | || ||| ||||||||| ||||||||    
T  4897928 taaagttactcatcattatagcggaacagtgggctgctttctcccccatactaggtcagtattcgactgaactgggtaaacaaatt 4898013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 204 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 18186589 - 18186489
Alignment:
Q  204 aatgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacga-tggaggtttcagtttttgaggcaaggcact 302  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||| |||||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  18186589 aatgtgagagttaacttaaaatcaagtttctgcagaatcgtggtacgatggctgggcaacgtggcacgattggaggtttcag-ttttgaggcaagtcact 18186491  T
Q  303 gg 304  Q
    ||    
T  18186490 gg 18186489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 562 - 747
Target Start/End: Original strand, 15143560 - 15143750
Alignment:
Q  562 ggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaaaccattgatttctc 659  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||  |  || ||||||||||||||||   || ||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  15143560 ggaagcactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagatttggattttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaaccctttgatatctc 15143659  T
Q  660 -tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 747  Q
     ||||||| ||||||||||| ||||||||| | | | |||||| ||||||| ||||||||| | | || ||||||| ||||| ||||||||    
T  15143660 ttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggggagctgctttctcccctagactaggtcagtatttgaccgaaatgggtaaacaaatt 15143750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 567 - 752
Target Start/End: Original strand, 25452498 - 25452685
Alignment:
Q  567 cactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgt 664  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||   | ||||| |||||||| |  ||   || |||||||||    
T  25452498 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgttactca---atatctctttgt 25452593  T
Q  665 aacgttactc--atca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt-aaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttgt 752  Q
    || |  ||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |   || ||||||||||||| |||||||||||||    
T  25452594 aaagaaactcatatcattatagtggatcagagagctgctctctcccccagaataggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattcttgt 25452685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 564 - 746
Target Start/End: Original strand, 1170811 - 1170994
Alignment:
Q  564 aaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctt 661  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||  |||   | ||||||    
T  1170811 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctctt 1170906  T
Q  662 tgtaacgttactca-tca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt-aaatttggaccgaactgggtcaacaaat 746  Q
    ||||| |  ||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |   || ||||||||||||| |||||||    
T  1170907 tgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 1170994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 466 - 707
Target Start/End: Complemental strand, 2144840 - 2144599
Alignment:
Q  466 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaa-acactagggtttgtgggttgattctccttgggga 564  Q
    |||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||||||  ||||||| ||||| | || || ||||||||||| |  | ||||||| |||||| ||    
T  2144840 aaacaagggtttagaa-gccaacactaaaactagggtttgta--gagtttg-ctcttggcaacaacacactagggttgg--gattgattcaccttggaga 2144747  T
Q  565 aacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgag-actttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaaaccattg-atttctct 660  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||  ||| |||||  | || ||||||||| ||||||||   || |||| |||||||||| |  ||  || |||||    
T  2144746 aacactattaggatggagtctcttggtcgcgggaagagattcaggactttgggtggaattaggtttgaagactaattcttgtaaccttttttatatctct 2144647  T
Q  661 ttgtaacgttactcatcat-atagtggatcagagggctgctctctccc 707  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||    
T  2144646 ttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctccc 2144599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 239 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 2818813 - 2818729
Alignment:
Q  239 aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacga-tggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatgg 323  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||    ||||||||||||||    
T  2818813 aatcgtggcacgatggctaggcaacatggcacgattggaggtttcag-ttttgaggcaagtcactggatttttcgtggcacgatgg 2818729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 409 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 3373377 - 3373332
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagat 454  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3373377 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagat 3373332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 697 - 750
Target Start/End: Original strand, 20043222 - 20043275
Alignment:
Q  697 tgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20043222 tgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaattctt 20043275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 409 - 453
Target Start/End: Original strand, 23665081 - 23665125
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 453  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23665081 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 23665125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 409 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 23793506 - 23793462
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 453  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23793506 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 23793462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 569 - 752
Target Start/End: Original strand, 25445501 - 25445686
Alignment:
Q  569 ctattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaa 666  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||   || |||| |||||||| |  ||   || |||||||||||    
T  25445501 ctattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgttactca---atatctctttgtaa 25445596  T
Q  667 cgttactcat--cat-atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt-aaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttgt 752  Q
     |  ||||||  ||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |   || ||||||||||||| |||||||||||||    
T  25445597 agaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattcttgt 25445686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 564 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 35385634 - 35385450
Alignment:
Q  564 aaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctt 661  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||| ||  |||   | ||||||    
T  35385634 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttt-ggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctctt 35385539  T
Q  662 tgtaacgttactc--atca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt-aaatttggaccgaactgggtcaacaaat 746  Q
    ||||| |  ||||  |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |   || ||||||||||||| |||||||    
T  35385538 tgtaaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 35385450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 564 - 625
Target Start/End: Complemental strand, 2298183 - 2298122
Alignment:
Q  564 aaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg 625  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2298183 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgagac-ttgggtagaattagg 2298122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 409 - 634
Target Start/End: Original strand, 42770717 - 42770934
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 507  Q
    |||||||||| ||||||| || ||||||| | | |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||||| ||||| |||| ||| ||    
T  42770717 acttttactataaatataaactttgtatcga-gtaaaccttgagatagaggggactgaaaacaagggtttggaa-ggcaaca-caaaattagg-tttata 42770812  T
Q  508 tagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctga 606  Q
    |||| |||| ||||| | || |||||||| |||| |  |||| |||| || |||| ||   ||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||  |||    
T  42770813 tagaatttg-ctcttggcaacaaacactaaggttgg--ggttcattcaccatgggaaa---ctattaggactgagtctcttggtcacgggaagagattga 42770906  T
Q  607 gactttgggtagaattaggcgggagact 634  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||    
T  42770907 gactttgggtagaattagacgagagact 42770934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 409 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 15354818 - 15354777
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttg 450  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15354818 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttg 15354777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #109
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 409 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 15357094 - 15357053
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttg 450  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15357094 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttg 15357053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #110
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 680 - 744
Target Start/End: Original strand, 9353361 - 9353425
Alignment:
Q  680 atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 744  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  9353361 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 9353425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #111
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 239 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 20504419 - 20504316
Alignment:
Q  239 aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacga-tggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggc 337  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| || ||||    ||||||||||||||| | ||| ||||||    
T  20504419 aatcgtggcacgatagctgggcaacgtggcacgattggaggttttag-ttttgaggcaagtcaatggatttttcgtggcacgatgggattgcaacgtggc 20504321  T
Q  338 acgat 342  Q
    |||||    
T  20504320 acgat 20504316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #112
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 206 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 21684969 - 21684905
Alignment:
Q  206 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcac 270  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  21684969 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcac 21684905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #113
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 409 - 453
Target Start/End: Original strand, 23667356 - 23667400
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 453  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23667356 actttaactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 23667400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #114
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 409 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 23742101 - 23742057
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 453  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23742101 acttttactataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgaga 23742057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #115
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 680 - 744
Target Start/End: Original strand, 36932379 - 36932443
Alignment:
Q  680 atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 744  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  36932379 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 36932443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #116
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 409 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 38960378 - 38960334
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 453  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38960378 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttggaga 38960334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #117
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 681 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 28832326 - 28832263
Alignment:
Q  681 tagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 744  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||| ||||||||||    
T  28832326 tagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaaccgggtcaacaa 28832263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #118
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 206 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 31466496 - 31466391
Alignment:
Q  206 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcat-aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatg-gaggtttcagtttttgaggcaaggcactg 303  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||  |||||||||||||| | | ||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||    
T  31466496 tgtgagagttaacttaaaatcaggttt-tgcaggaatcgtggcacgattgaagggcaacgtggcacgatgagatgtttcagttat-gaggcaagtcactg 31466399  T
Q  304 gaaaaatc 311  Q
    ||||||||    
T  31466398 gaaaaatc 31466391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #119
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 409 - 447
Target Start/End: Original strand, 10757207 - 10757245
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaact 447  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10757207 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaact 10757245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #120
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 679 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 17841315 - 17841241
Alignment:
Q  679 tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt-aaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttgt 752  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |   || ||||||||||||| |||||||| ||||    
T  17841315 tatagtggaacagagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattattgt 17841241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #121
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 679 - 744
Target Start/End: Original strand, 11917000 - 11917065
Alignment:
Q  679 tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 744  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||||||||| | ||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  11917000 tatagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 11917065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #122
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 695 - 744
Target Start/End: Original strand, 17004004 - 17004053
Alignment:
Q  695 gctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 744  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  17004004 gctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 17004053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #123
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 680 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 10281819 - 10281755
Alignment:
Q  680 atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 744  Q
    |||||||||  ||| ||||||||||||||||||  |||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  10281819 atagtggattggagagctgctctctcccccagatcaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 10281755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #124
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 680 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 15464600 - 15464536
Alignment:
Q  680 atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 744  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||| | |  ||||||||||||||||||||||    
T  15464600 atagtggattggagagctgctctctcccccagattagatcatattggaccgaactgggtcaacaa 15464536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #125
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 700 - 744
Target Start/End: Original strand, 19806487 - 19806531
Alignment:
Q  700 tctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 744  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  19806487 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 19806531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #126
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 386 - 438
Target Start/End: Original strand, 29748261 - 29748313
Alignment:
Q  386 atttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatca 438  Q
    |||||||||||||||| || ||  ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29748261 atttgttccaaattttgagggatgcttttactataaatatagaccttgtatca 29748313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #127
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 700 - 744
Target Start/End: Original strand, 32636948 - 32636992
Alignment:
Q  700 tctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 744  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  32636948 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 32636992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #128
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 386 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 34477431 - 34477379
Alignment:
Q  386 atttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatca 438  Q
    ||||||| || ||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  34477431 atttgttacagattttaagcgagacttttactataaaaatagaccttgtatca 34477379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #129
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 567 - 625
Target Start/End: Complemental strand, 11962612 - 11962554
Alignment:
Q  567 cactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg 625  Q
    |||||||||||||| |||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11962612 cactattaggattgtgtctcttggtcacgggaagaggctgagac-ttgggtagaattagg 11962554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #130
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 206 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 36402845 - 36402747
Alignment:
Q  206 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacga-tggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgg 304  Q
    ||||||| ||||||| |||| || ||| |||| ||||  |||||||||||  |||||| | |||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  36402845 tgtgagagttaacttaaaattaggtttctgcagaatctaggcacgatggctgggcaacatagcacgattggaggtttcag-ttttgaggcaagtcactgg 36402747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #131
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 409 - 446
Target Start/End: Original strand, 10749730 - 10749767
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaac 446  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  10749730 acttttagtataaatatagaccttgtatcaaagcaaac 10749767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #132
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 699 - 744
Target Start/End: Original strand, 31300644 - 31300689
Alignment:
Q  699 ctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 744  Q
    ||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  31300644 ctctctccctcagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 31300689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #133
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 299 - 348
Target Start/End: Original strand, 39854317 - 39854366
Alignment:
Q  299 cactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcg 348  Q
    |||||||||||||||| |||| | |  |||||||||||||||||||||||    
T  39854317 cactggaaaaatcgtgtcacggttgaatcgcatcgtggcacgatggtgcg 39854366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #134
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 299 - 348
Target Start/End: Original strand, 42238047 - 42238096
Alignment:
Q  299 cactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcg 348  Q
    |||||||||||||||| |||||||   ||||| |||||||||||||||||    
T  42238047 cactggaaaaatcgtgccacgatgaaatcgcaacgtggcacgatggtgcg 42238096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 392; Significance: 0; HSPs: 101)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 392; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 206 - 770
Target Start/End: Complemental strand, 14507716 - 14507148
Alignment:
Q  206 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagttttt--gaggcaaggcactg 303  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||    
T  14507716 tgtgagagttaacttaaaatcagatttctgcagaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttttgatacaaggcactg 14507617  T
Q  304 gaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaa 403  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |||| ||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  14507616 gaaaaatggtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctgccagcgaaaaacagaaacatatttttgagtgtagatttgttccaaattttaa 14507517  T
Q  404 gcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 503  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14507516 gcgatacttttactataaatatagaccttgtattagagcaaactttgagatagagggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 14507417  T
Q  504 tgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagagg 602  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  14507416 tgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagg 14507318  T
Q  603 ctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctct 702  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  14507317 ctgggactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgatacttatcatatagtgaatcggagggctgctct 14507218  T
Q  703 ctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattc--ttgtatttttctcttctttgtg 770  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||    
T  14507217 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtg 14507148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 359; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 214 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 11983558 - 11983023
Alignment:
Q  214 ttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgt 313  Q
    ||||||| ||||||| ||| |||| |||||||| |||||||   |||||| ||| |||||||||||||||||| | |||| ||| |||||||||||||||    
T  11983558 ttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggtacgatggttgggcaacatggtacgatggaggtttcagttgt-gaggtaag-cactggaaaaatcgt 11983461  T
Q  314 ggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttt 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  11983460 ggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcagcgaaaaacagaaacatatttttgagtgcagatttgtttcaaattttaaacgaaacttt 11983361  T
Q  414 tactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagt 513  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11983360 tactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaaaggcttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagt 11983261  T
Q  514 ttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagacttt 612  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||    
T  11983260 ttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggacttt 11983162  T
Q  613 gggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccag 711  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11983161 gggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccag 11983062  T
Q  712 actaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11983061 actaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 11983023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 319; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 239 - 750
Target Start/End: Original strand, 9019735 - 9020246
Alignment:
Q  239 aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggc 337  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9019735 aatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattggaggtttcagtttttg-ggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcacatcgtggc 9019833  T
Q  338 acgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatc 437  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  9019834 acgatggtgcgctgacagcaaataacagaaacgtatttt-gggtgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagatcttgtatc 9019932  T
Q  438 aaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactag 537  Q
    | || |||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||    
T  9019933 agagtaaactgagagatagagggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaatcactag 9020032  T
Q  538 ggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagactta 636  Q
    | |||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||  | |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9020033 gttttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttataggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagactta 9020131  T
Q  637 ttcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactg 735  Q
    ||||||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| | | | |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  9020132 ttcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggggggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccgaactg 9020231  T
Q  736 ggtcaacaaattctt 750  Q
    |||||||||||||||    
T  9020232 ggtcaacaaattctt 9020246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 239 - 639
Target Start/End: Complemental strand, 19227915 - 19227514
Alignment:
Q  239 aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggca 338  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19227915 aatcgtggcacgatggttgggcaacgtggcatgatggaggtttcaatttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggca 19227816  T
Q  339 cgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatattttt-gggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatc 437  Q
    |||||||||| |||| || ||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  19227815 cgatggtgcgctggcggcgaataacagaaacatattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagggaaacttttactataaatatagatcttgtatc 19227716  T
Q  438 aaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactag 537  Q
    | |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  |||||||||    
T  19227715 agagcaaactttgagataaagggggctcaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctttttggatcaaacactag 19227616  T
Q  538 ggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagactta 636  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19227615 ggtttgtgggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagactta 19227517  T
Q  637 ttc 639  Q
    |||    
T  19227516 ttc 19227514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 409 - 770
Target Start/End: Complemental strand, 28241657 - 28241293
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 508  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28241657 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 28241558  T
Q  509 agagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgag 607  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |    
T  28241557 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 28241459  T
Q  608 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcc 706  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  28241458 actttcggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctctcc 28241359  T
Q  707 cccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattc--ttgtatttttctcttctttgtg 770  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||    
T  28241358 cccagactaggtgaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtg 28241293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 420 - 770
Target Start/End: Complemental strand, 14459090 - 14458739
Alignment:
Q  420 aaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtct 519  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14459090 aaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtct 14458991  T
Q  520 cttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtag 618  Q
    ||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  14458990 cttgggaacaaacactagggtttgagggctgat--tcctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtag 14458894  T
Q  619 aattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactagg 717  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14458893 aattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactagg 14458794  T
Q  718 taaatttggaccgaactgggtcaacaaattc--ttgtatttttctcttctttgtg 770  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||    
T  14458793 tcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtg 14458739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 239 - 701
Target Start/End: Complemental strand, 15530628 - 15530166
Alignment:
Q  239 aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggc 337  Q
    |||||||||||||||||  || |||||||||| || ||||||||||  ||| ||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||||||||    
T  15530628 aatcgtggcacgatggctgggtaacgtggcacaattggaggtttcaagttt-gaggcaaagcactcgaaaattcgtggtacgatggggccgcatcgtggc 15530530  T
Q  338 acgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatc 437  Q
    ||||||||| | ||||||  ||| | | |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15530529 acgatggtgtgctggcagtgaattatagaaacatatttttgggtgcaggtttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatc 15530430  T
Q  438 aaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactag 537  Q
    | || |||||  |||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  15530429 agagtaaactgggagatagagggggctgaagcaagggcttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactag 15530330  T
Q  538 ggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagactta 636  Q
    |||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  |||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  15530329 ggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgaggctttgggttgaattaggcgggagactta 15530231  T
Q  637 ttcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctc 701  Q
    ||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  15530230 ttcttgt-aaccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctc 15530166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 289 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 30729284 - 30728818
Alignment:
Q  289 tgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatt 388  Q
    ||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| |||    
T  30729284 tgaggcaagtcactggaaatttcgtgccacgatggggtcacaacgtggcacgatagtgcgctggcagcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatt 30729185  T
Q  389 tgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaac 488  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  30729184 tgttccaaattttaagcggtacttttactataaatatagatcttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtatcgaaagacaac 30729085  T
Q  489 aacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-tt 587  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  30729084 aacaaaacttgggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggatttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgactctctt 30728986  T
Q  588 ggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattga----tttctc-tttgtaacgttactcatcatata 682  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||    |||||| ||||||| |||||||||  ||||    
T  30728985 ggttacgggaagaggctggggctttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaactcattgatatctttctcttttgtaaagttactcatattata 30728886  T
Q  683 gtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    ||||| | || |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30728885 gtggaacggaaggctgctctctcccgcagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattctt 30728818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 289 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 15541596 - 15541134
Alignment:
Q  289 tgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatt 388  Q
    ||||||| | |||||||||  || || ||||||| | ||||| |||||||||||||| || ||||||| |||| || |||||||||||| |||||| |||    
T  15541596 tgaggcacgtcactggaaatttcatgccacgatgagatcgcaacgtggcacgatggtacgctggcagcgaatagcagaaacatatttttaggtgcagatt 15541497  T
Q  389 tgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaac 488  Q
    ||||||||||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  15541496 tgttccaaattttaagttacacttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaaa 15541397  T
Q  489 aacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-tt 587  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  15541396 aacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaataaacactagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattagaattgagtctctt 15541298  T
Q  588 ggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtgg 686  Q
    ||| |||  |||||  || |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||||| |||| |||||||||||||     
T  15541297 ggtcacgagaagagattgggactttgggtaggattaggcgggagacgtattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcatatagtga 15541198  T
Q  687 atcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    | ||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15541197 aacagaaagctgctctctcctccagactaggttaatttggactgaactgggtcaacaaattctt 15541134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 450 - 770
Target Start/End: Complemental strand, 4816526 - 4816203
Alignment:
Q  450 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggtt 549  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4816526 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 4816427  T
Q  550 gattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaacc 648  Q
    ||||| |||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4816426 gattcacctt-ggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 4816328  T
Q  649 attgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 747  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4816327 attgatttctcttttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 4816228  T
Q  748 c--ttgtatttttctcttctttgtg 770  Q
    |  |||| || ||||||||||||||    
T  4816227 cttttgtgttcttctcttctttgtg 4816203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 409 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 1230585 - 1230243
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 508  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1230585 actttcactataaatatagaccttgtatcatagcaaactttgagatagagagggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 1230486  T
Q  509 agagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgag 607  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||  | ||||||||| |    
T  1230485 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgactctcttggttattggaagaggctggg 1230387  T
Q  608 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcc 706  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||    
T  1230386 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggatggctgctctctcc 1230287  T
Q  707 cccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1230286 cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 1230243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 386 - 770
Target Start/End: Complemental strand, 20915717 - 20915329
Alignment:
Q  386 atttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt---gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 482  Q
    ||||||| || ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||  || || ||    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20915717 atttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagaccttgtatcag-gctaaattgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 20915619  T
Q  483 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattg-a 581  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |    
T  20915618 ggcaacaacaaaactaggatttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggg-aaacactattaggattgga 20915520  T
Q  582 gtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcata 680  Q
    |||| |||||||||  |||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20915519 gtctcttggttacgagaagagattgggacttcgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcata 20915420  T
Q  681 tagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattct-tgtatttttctcttctttgtg 770  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||    
T  20915419 tagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctctgtgttcttctcttctttgtg 20915329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 409 - 770
Target Start/End: Original strand, 30967176 - 30967543
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagc-aaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 503  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||  | || |||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  30967176 acttttactataaatatagaccttgtat--aggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactatggtt 30967273  T
Q  504 tgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagagg 602  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  30967274 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagg 30967372  T
Q  603 ctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctc 701  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  30967373 ctgaaactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagagctgctc 30967472  T
Q  702 tctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattc--ttgtatttttctcttctttgtg 770  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||    
T  30967473 tctcccccaaactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtg 30967543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 409 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 12195851 - 12195515
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 508  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12195851 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 12195752  T
Q  509 agagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggatt-gagtct-ttggttacggaaagaggctga 606  Q
    |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||  ||     
T  12195751 agagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcacctt-gggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgg 12195653  T
Q  607 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcc 706  Q
    ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  12195652 gactttgagtagaattaatcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcc 12195553  T
Q  707 cccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 744  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  12195552 cccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 12195515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 409 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 30034943 - 30034597
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 504  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||    |||||||    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  30034943 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttaagagagatagagggagctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagagttt 30034844  T
Q  505 gtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtc-tttggttacggaaagaggc 603  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||| || |||||||    
T  30034843 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtcaattggttaagggaagaggc 30034745  T
Q  604 tgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctct 702  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  30034744 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagcggatcggagggctgctct 30034645  T
Q  703 ctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30034644 ctcccccagactgggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 30034597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 331 - 749
Target Start/End: Original strand, 32279897 - 32280316
Alignment:
Q  331 tcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagacc 430  Q
    |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||    
T  32279897 tcgtggcacgatggtgcgctggcggcgaataacataaatgtatttttgagtgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttcctatatatatagacc 32279996  T
Q  431 ttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaa 530  Q
    |||||||| || |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | || ||    
T  32279997 ttgtatcatagtaaacttggagataga-ggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaa 32280095  T
Q  531 acactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcggg 629  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  || |||||  ||||||||||||||||    
T  32280096 acacttgggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggacttcaggtagaattaggcggg 32280194  T
Q  630 agacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatc-atatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttgga 727  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||  ||||||  | | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32280195 agacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcgttatagtaaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttgga 32280294  T
Q  728 ccgaactgggtcaacaaattct 749  Q
    ||||||| |||||| |||||||    
T  32280295 ccgaacttggtcaaaaaattct 32280316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 289 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 15533137 - 15532676
Alignment:
Q  289 tgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatt 388  Q
    ||||||||| |||||||||  | ||| ||||||| | ||||| |||| ||| |||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||| |||||| |||    
T  15533137 tgaggcaagtcactggaaattttgtgccacgatgagatcgcaacgtgtcacaatggtgcgctggtagcaaataagagaaacatatttttaggtgcagatt 15533038  T
Q  389 tgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaac 488  Q
    ||||||||||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15533037 tgttccaaattttaagttatacttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggtaac 15532938  T
Q  489 aacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-tt 587  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||| ||    
T  15532937 aacaaaactagggtttgtataaagtttgtttctttggaacaaacaatagggtttgagggttgattcacctt-ggaaaacactattaggattgagtctctt 15532839  T
Q  588 ggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtgg 686  Q
    ||| | || |||||  || |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||     
T  15532838 ggtcatgggaagagattgggacttttggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtga 15532739  T
Q  687 atcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    | | |||||||||||| | ||| ||||||||| ||||| ||| ||||| |||||||||||||||    
T  15532738 aacggagggctgctctat-ccctagactaggtcaattttgactgaactaggtcaacaaattctt 15532676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 415 - 770
Target Start/End: Complemental strand, 19704905 - 19704539
Alignment:
Q  415 actacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagag------ggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 508  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19704905 actataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagagatggagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 19704806  T
Q  509 agagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggatt-gagtct-ttggttacggaaagaggctga 606  Q
    |||||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||  ||     
T  19704805 agagtttgtctcttaggagcaaacactagagtttgtgggttgattcacctt-gggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgg 19704707  T
Q  607 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatt--tctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctct 704  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  19704706 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctct 19704607  T
Q  705 cccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaat--tcttgtatttttctcttctttgtg 770  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | |||| || ||||||||||||||    
T  19704606 cccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattattttgtgttcttctcttctttgtg 19704539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 409 - 770
Target Start/End: Complemental strand, 2629226 - 2628858
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagag-----ggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 503  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||    ||||||||||| ||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2629226 acttttactataaatatagaccttgtatcatgttaaactttgagagagagatagaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 2629127  T
Q  504 tgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagagg 602  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||  |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||     
T  2629126 tgtatagagtttgtctcttaggaacaaacactaggttttaagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaga 2629028  T
Q  603 ctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctct 702  Q
     || ||||||||||||||||||||||   | |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2629027 ttgggactttgggtagaattaggcggagaatttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatatagtggatcggagggctgctct 2628928  T
Q  703 ctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattc--ttgtatttttctcttctttgtg 770  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||    
T  2628927 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaattgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtg 2628858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 450 - 747
Target Start/End: Original strand, 26065005 - 26065298
Alignment:
Q  450 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggtt 549  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||| |||||    
T  26065005 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctctttggaa---acactagggtttgagggtt 26065101  T
Q  550 gattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaacc 648  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26065102 gattcaccttggg-aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 26065200  T
Q  649 attgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 747  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26065201 attgacttctctttgtaacgttactcgttatatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 26065298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 450 - 747
Target Start/End: Original strand, 26084974 - 26085267
Alignment:
Q  450 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggtt 549  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||| |||||    
T  26084974 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctctttggaa---acactagggtttgagggtt 26085070  T
Q  550 gattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaacc 648  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26085071 gattcaccttggg-aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 26085169  T
Q  649 attgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 747  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26085170 attgacttctctttgtaacgttactcgttatatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 26085267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 410 - 750
Target Start/End: Original strand, 13057173 - 13057515
Alignment:
Q  410 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 509  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13057173 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaagaacaaaactagggtttgtata 13057272  T
Q  510 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgaga 608  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||  || ||    
T  13057273 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagagattggga 13057371  T
Q  609 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcc 706  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||| | | ||||||| ||||||||    
T  13057372 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctactctctcc 13057471  T
Q  707 cccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13057472 cccaaactaggtcaatttggaccgaactcggtcaacaaattctt 13057515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 239 - 527
Target Start/End: Original strand, 8995288 - 8995575
Alignment:
Q  239 aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggc 337  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8995288 aatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattggaggtttcagtttttg-ggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcacatcgtggc 8995386  T
Q  338 acgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatc 437  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  8995387 acgatggtgcgctgacagcaaataacagaaacgtatttt-gggtgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagatcttgtatc 8995485  T
Q  438 aaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaa 527  Q
    | || |||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8995486 agagtaaactgagagatagagggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaa 8995575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 409 - 750
Target Start/End: Original strand, 3390357 - 3390700
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 508  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3390357 acttttactataaatatagacattgtatcagtataaaccttgagatagacggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 3390456  T
Q  509 agagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgag 607  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  || |    
T  3390457 agagtttttctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacagaaagagattggg 3390555  T
Q  608 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctc 705  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||| || |||| | | |||||||||||||||    
T  3390556 gctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattacagtgaaacggagggctgctctctc 3390655  T
Q  706 ccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  3390656 ccccatactaggtcaatttggaccaaattgggtcaacaaattctt 3390700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 410 - 750
Target Start/End: Original strand, 25477253 - 25477602
Alignment:
Q  410 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 509  Q
    ||||||||  |||||||||| ||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25477253 cttttactgtaaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttatata 25477352  T
Q  510 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgaga 608  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  || |     
T  25477353 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggtcacggaaagagattgggg 25477451  T
Q  609 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaa-------cgttactcatca-tatagtggatcagagggctgc 699  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||       |||||||||||| ||||||| | |||||||||||    
T  25477452 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcgttactcatcattatagtgaaacagagggctgc 25477551  T
Q  700 tctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25477552 tctctcccccatactaggtcaatttggaccgaaatgggtcaacaaattctt 25477602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 409 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 26932906 - 26932559
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagg 500  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||        ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  26932906 actttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagagagatagagggggttgaaacaagggcttagaaaagcaataacaaaactagg 26932807  T
Q  501 gtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattg-agtct-ttggttacggaaa 598  Q
    |||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||    
T  26932806 gtttgtatagagtttgtctcttagaagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgag-aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaa 26932708  T
Q  599 gaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctg 698  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  26932707 gagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggttg 26932608  T
Q  699 ctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 747  Q
    |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  26932607 ctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 26932559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 410 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 3630199 - 3629859
Alignment:
Q  410 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 509  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3630199 cttttactataaatatagacattgtatcaatgtaaaacttgagatagagggggctgaaacatcggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 3630100  T
Q  510 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgaga 608  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||  || |     
T  3630099 gagtttgtctcttagcaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgaatctcttggttacgggaagagattgggg 3630001  T
Q  609 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctccc 707  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| |||||| || |||||||| | | |||||||||||||| ||    
T  3630000 ctttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactaataatatagtgaaactgagggctgctctct-cc 3629902  T
Q  708 ccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3629901 ccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 3629859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 410 - 750
Target Start/End: Original strand, 13039733 - 13040075
Alignment:
Q  410 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 509  Q
    ||||||||| |||||||||  ||||||||  | |||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  13039733 cttttactataaatatagatattgtatcagtgtaaaccttgagatataggaggctgaaacaagggtttagaaaggcaagaacaaaacttgggtttgtata 13039832  T
Q  510 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgaga 608  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| || |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||  |||||    
T  13039833 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt-ggaaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagagattgaga 13039931  T
Q  609 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcc 706  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||| | | ||||||||||||||||    
T  13039932 ctttgcgtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctctcc 13040031  T
Q  707 cccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    || ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13040032 cctagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattctt 13040075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 412 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 3632271 - 3631933
Alignment:
Q  412 tttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtataga 511  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||  | |||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3632271 tttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggagttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtataga 3632172  T
Q  512 gtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagact 610  Q
    ||||||||||| | || ||||||||||||||  ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  || ||||    
T  3632171 gtttgtctcttggcaacaaacactagggtttaagggttgattcatctt-gggaaacactattaggattgagtctctttgttacggaaagagattgggact 3632073  T
Q  611 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcccc 708  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||| | | |||||||||||| |  ||    
T  3632072 ttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctgt--cc 3631975  T
Q  709 cagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3631974 cagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 3631933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 165; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 410 - 735
Target Start/End: Complemental strand, 3234065 - 3233739
Alignment:
Q  410 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 509  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||  | |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  3234065 cttttactataaatatagac-ttgtatcagtgtaaaccttaagatagagggggctgaaacaaggatttagaaagacaacaacaaaactaaggtttgtata 3233967  T
Q  510 gagtttgtctcttcgg-aagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgag 607  Q
     |||||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  ||||    
T  3233966 tagtttgtctctttggtaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgag 3233868  T
Q  608 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcc 706  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||  |||| |||||||||||||||| | ||||||| | | ||||||||||||||||    
T  3233867 gctttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcaccgtatagtgaaacggagggctgctctctcc 3233768  T
Q  707 cccagactaggtaaatttggaccgaactg 735  Q
    |||| ||||||| ||||| ||||||||||    
T  3233767 cccacactaggtcaattttgaccgaactg 3233739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 410 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 24338783 - 24338446
Alignment:
Q  410 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 509  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24338783 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgcata 24338684  T
Q  510 gagtttgtctcttcggaagaaacacta-gggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtc-tttggttacggaaagaggctgag 607  Q
     ||||||| |||| | || |||||||| ||||||| |||||||||  |||| || ||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||  | ||    
T  24338683 aagtttgtgtcttagcaacaaacactaggggtttgagggttgatttacctt-ggaaaacactattaagattgagtcttttggttatggaaagagattaag 24338585  T
Q  608 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctc 705  Q
    ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||| | | ||||||||  |||||    
T  24338584 actttgggtagaattagtcagaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctg--ctctc 24338487  T
Q  706 ccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaat 746  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||| ||| |||||||    
T  24338486 ccccagactatgtcaatttggaccgaactaggtaaacaaat 24338446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 331 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 1072291 - 1072068
Alignment:
Q  331 tcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagacc 430  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||     
T  1072291 tcgtggcacgatggtacgtaggcagcgaataacataaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcaatacttttactataaatatagaca 1072192  T
Q  431 ttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaa 530  Q
    |||||||| || ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  1072191 ttgtatcagagtaaactttgagatagaaggagctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaa 1072092  T
Q  531 acactagggtttgtgggttgattc 554  Q
    ||||||||||||||| ||||||||    
T  1072091 acactagggtttgtgagttgattc 1072068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 530 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 5273431 - 5273213
Alignment:
Q  530 aacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattg-agtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcg 627  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||    
T  5273431 aacactagggtttgtgggttgattcaccttggg-aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcg 5273333  T
Q  628 ggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttgga 727  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5273332 ggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcttatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttgga 5273233  T
Q  728 ccgaactgggtcaacaaatt 747  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  5273232 ccgaactgggtcaacaaatt 5273213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 133; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 410 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 12161889 - 12161555
Alignment:
Q  410 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 509  Q
    ||||||||  |||||||||| ||||||||  | |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12161889 cttttactttaaatatagacattgtatcattgtaaaccttgagataaagggg-ctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtata 12161791  T
Q  510 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgaga 608  Q
    ||||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||| ||| | || |||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| |||||  |||||    
T  12161790 gagtttgtctct--ggaacaaacactagggtttgagggttgtttcacgtt-gggaaacactattaagatcgagtctattggttacgggaagagattgaga 12161694  T
Q  609 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctccc 707  Q
    |||| |||| ||||| | |||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||  |   || ||||| ||||| ||    
T  12161693 ctttaggtataattaagtgggagatttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtaaaatggatggctgttctct-cc 12161595  T
Q  708 ccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 747  Q
    | | ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  12161594 ctaaactaggttaatttggaccgaactgaatcaacaaatt 12161555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 128; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 563 - 748
Target Start/End: Complemental strand, 29754892 - 29754705
Alignment:
Q  563 gaaacactattaggattg-agtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctct 660  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  || |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29754892 gaaacactattaggattggagtctcttggttacggaaagagattgggactttaggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatttctct 29754793  T
Q  661 ttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 748  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  29754792 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattc 29754705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 563 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 26066307 - 26066121
Alignment:
Q  563 gaaacactattaggattg-agtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctct 660  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||  || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26066307 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 26066208  T
Q  661 ttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 747  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26066207 ttgtaacgttacttatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 26066121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 409 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 3028186 - 3027848
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 507  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| | ||||||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||    
T  3028186 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaaccatgagataaaaggggctgaaaacaagggttt-ggaaggcaac-acaaaactagggtttgta 3028089  T
Q  508 tagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctga 606  Q
    ||||||||| ||||| | || |||||||||||||   |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  |||||  |||    
T  3028088 tagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt--ggggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgtgaagagattga 3027993  T
Q  607 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctct 704  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||| |    
T  3027992 gactttgagtagaattaggctggagatttatttttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctcttt 3027893  T
Q  705 -cccccagactaggt-aaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 747  Q
     |||||||||||||| |  ||| ||||||||||| | ||||||||    
T  3027892 ccccccagactaggtcagtttttgaccgaactggataaacaaatt 3027848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 563 - 747
Target Start/End: Original strand, 33308988 - 33309173
Alignment:
Q  563 gaaacactattaggattg-agtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctct 660  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  33308988 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagact-attcttgtaacccattgatttctct 33309086  T
Q  661 ttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 747  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  33309087 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 33309173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 563 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 26068578 - 26068392
Alignment:
Q  563 gaaacactattaggattg-agtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctct 660  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| |||||  || |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26068578 gaaacactattaggattggagtctcttgcttacgggaagagattgggactttaggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 26068479  T
Q  661 ttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 747  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26068478 ttgtaacgttgctcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 26068392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 563 - 747
Target Start/End: Original strand, 33311257 - 33311442
Alignment:
Q  563 gaaacactattaggattg-agtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctct 660  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  33311257 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagact-attcttgtaacccattgatttctct 33311355  T
Q  661 ttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 747  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  33311356 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctttctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 33311442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 410 - 679
Target Start/End: Original strand, 22490618 - 22490889
Alignment:
Q  410 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggttta-gaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 508  Q
    ||||||| | |||||||||| ||| || |  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22490618 cttttaccataaatatagacattgaattagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttttgaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 22490717  T
Q  509 agagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgag 607  Q
    | |||||| ||||| |||| ||||||||||||||| ||    || | |||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || |    
T  22490718 atagtttgcctctttggaacaaacactagggtttgaggaggtatacacctt-gcgaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattggg 22490816  T
Q  608 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcat 679  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||  |||||||||||    
T  22490817 actttgggtagaattatgcgagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaagattactcatcat 22490889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 561 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 1069904 - 1069694
Alignment:
Q  561 gggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc 659  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  1069904 gggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc 1069805  T
Q  660 -tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttgtat-tt 756  Q
     ||||||| ||||||||||| ||||| | | | |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||    
T  1069804 ttttgtaaggttactcatcattatagagaaacggagggctgctctcttccccatactaggtcaatttggaccgaactgaatcaacaaattcttttatgtt 1069705  T
Q  757 ttctcttcttt 767  Q
     ||||||||||    
T  1069704 ctctcttcttt 1069694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 443 - 747
Target Start/End: Original strand, 15719666 - 15719961
Alignment:
Q  443 aaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggttt 542  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||          |||||||||||||||||||||||| || || | || |||||||||||||     
T  15719666 aaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaatc--------aaactagggtttgtatagagtttg-cttttggcaacaaacactagggtt- 15719755  T
Q  543 gtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattctt 641  Q
      | |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15719756 --gagttgattcaccttgga-aaacactattaggattgagtctcttggtcatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattctt 15719852  T
Q  642 gtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctct-cccccagactaggtaaatttggaccgaactgggt 738  Q
    |||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||| | |||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||||| |||    
T  15719853 gtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagagttgctctttccccccatactaggtcaatttggaccgaacttggt 15719952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 371 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 16455798 - 16455421
Alignment:
Q  371 tatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--tagagggggctgaaa 468  Q
    ||||||||||  || ||||||||||| |||| || || || ||||||| ||||||| ||||||||||   | |||| ||||||  ||||| |  ||||||    
T  16455798 tatttttgggctcagatttgttccaatttttcagggatacctttactataaatatataccttgtatcggtgtaaaccttgagaggtagagagt-ctgaaa 16455700  T
Q  469 -caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaac 567  Q
     ||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||| ||||||| |||||| | ||  |||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||||    
T  16455699 acaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtacagagttt-tctcttggcaacgaacactagggtt-gtgg-ttgattcaccttggg-aaac 16455605  T
Q  568 actattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgta 665  Q
    ||| |||||||| ||||| ||| | ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||| ||||||    
T  16455604 actgttaggattaagtctcttgctcacggaaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagatttattcttgtaaccctttgatatctcttttgta 16455505  T
Q  666 acgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 747  Q
    |  |||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||| | | ||||||||||||| || ||||||||    
T  16455504 aaattactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccatactaggtcagtattggaccgaactgagtaaacaaatt 16455421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 206 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 26068882 - 26068735
Alignment:
Q  206 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgga 305  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  26068882 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggcaaggcaacgtggcatgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 26068783  T
Q  306 aaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggc 353  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  26068782 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggc 26068735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 206 - 392
Target Start/End: Original strand, 33308685 - 33308870
Alignment:
Q  206 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgga 305  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||| |||  |||  ||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  33308685 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcttcgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 33308784  T
Q  306 aaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgtt 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  || || | ||||||||||||||| ||| |||||||    
T  33308785 aaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaata-aaacatatttttgggagcagatttgtt 33308870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 206 - 392
Target Start/End: Original strand, 33310954 - 33311139
Alignment:
Q  206 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgga 305  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||| |||  |||  ||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  33310954 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcttcgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 33311053  T
Q  306 aaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgtt 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  || || | ||||||||||||||| ||| |||||||    
T  33311054 aaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaata-aaacatatttttgggagcagatttgtt 33311139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 410 - 749
Target Start/End: Original strand, 14466312 - 14466643
Alignment:
Q  410 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 509  Q
    ||||||||| | |||||||| |||||| | |  |||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||              
T  14466312 cttttactatagatatagactttgtattagaataaaccttgagatagagagggttgaaacaagagtttagaaagacaacagcaaaactag---------- 14466401  T
Q  510 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggttt-gtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgag 607  Q
     ||||||||| || | || |||||||||||||| | || |||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || |    
T  14466402 -agtttgtctattggcaacaaacactagggttttgaggattgattcatcttggg-aaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattggg 14466499  T
Q  608 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctc 705  Q
    | |||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||| |||| ||||||| |||| |||||| ||||||| | | || | ||||| | ||    
T  14466500 agtttgagtagaattaggcgagagacatattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttattcatcattatagtgaaccggatgactgctgtttc 14466599  T
Q  706 ccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 749  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14466600 ccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcagcaaattct 14466643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 410 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 32447651 - 32447506
Alignment:
Q  410 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 509  Q
    ||||||||| |||||||| | |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32447651 cttttactataaatataggctttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 32447552  T
Q  510 gagtttgtctcttcggaagaaacactag-ggtttgtgggttgattc 554  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||| | |||| ||||||||||    
T  32447551 gagtttgtctcttggcaacaaacactagagttttgagggttgattc 32447506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 206 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 26066611 - 26066464
Alignment:
Q  206 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgga 305  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||| || | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||||||||||||    
T  26066611 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgtagaatcgtggcacgacggcaaggcaacgtggcacgatggaggttttagttatttgggcaaggcactgga 26066512  T
Q  306 aaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggc 353  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||    
T  26066511 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacaatggtgcgctggc 26066464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 206 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 29755279 - 29755094
Alignment:
Q  206 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgga 305  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||| |||  |||  || |||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  29755279 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcacaatcgtggcacgacggctgggcttcgcggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 29755180  T
Q  306 aaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgtt 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  || || | ||||||||||||||| ||| |||||||    
T  29755179 aaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaata-aaacatatttttgggagcagatttgtt 29755094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 386 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 12186429 - 12186068
Alignment:
Q  386 atttgttccaaattttaagcgaa-acttttactacaaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaa 482  Q
    ||||||||||| |||| |||||  |||||||||| ||||||| ||||||||||| | | |||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  12186429 atttgttccaattttttagcgattacttttactataaatataaaccttgtatcacatgtaaaccttgagatagaaggggctgaaaacaagggtttagaaa 12186330  T
Q  483 ggca-acaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattga 581  Q
      || |||||||| | ||| |||  | ||| ||| |||   ||| ||||||  |||||||  ||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  12186329 --cagacaacaaaccaaggttttagagaga-tttctctaagcgggagaaac--tagggttgttg--ttgattcaccttggg-aaacactattaggattga 12186238  T
Q  582 gtctttggtt-acggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaaaccattgatttctcttt-gtaacgttactcatca 678  Q
    |||| | ||| |||| |||||  |||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||| |||||||||||    
T  12186237 gtctcttgttcacgggaagagattgagactttgggtacaattaggtttggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactcatca 12186138  T
Q  679 t-atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 747  Q
    | |||||||| | |||||||||||||| || | |||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||    
T  12186137 ttatagtggaacggagggctgctctctgcctcggactaggtcaatttgaaccgaactgggtaaacaaatt 12186068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 529 - 747
Target Start/End: Original strand, 15367132 - 15367349
Alignment:
Q  529 aaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcg 627  Q
    |||||||||||||   |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| || ||  ||| |||||  ||| |||||||||| |||||  ||    
T  15367132 aaacactagggtt---gggttgattcaccttggg-aaacactcttaggattgagtctcttcgtcgcgggaagagattgaaactttgggtaaaattaatcg 15367227  T
Q  628 ggagacttattcttgtaaaccattgatttctct-ttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctc-ccccagactaggtaaatttg 725  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||| |||| ||||||||||||| | | || |||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  15367228 ggagacttattcttgtaacccattaatatctctattgtaaagttattcatcatatagtgaaacggaaggctgctctctctccccagactaggtcaatttg 15367327  T
Q  726 gaccgaactgggtcaacaaatt 747  Q
    ||||||||||||| ||||||||    
T  15367328 gaccgaactgggtaaacaaatt 15367349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 409 - 539
Target Start/End: Original strand, 17852520 - 17852650
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 508  Q
    |||||||||| |||||||||| ||| |||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||    
T  17852520 acttttactataaatatagactttgaatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagagtttgtat 17852619  T
Q  509 agagtttgtctcttcggaagaaacactaggg 539  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  17852620 agagtttgtctctttcgaacaaacactaggg 17852650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 263 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 4816749 - 4816612
Alignment:
Q  263 cgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaata 361  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| |    
T  4816749 cgtggcacgattggaggtttcagtttt-gaggcaaggtactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgtgctggtagcaaa-a 4816652  T
Q  362 acataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaatttt 401  Q
    ||| |||||||||||| |||||| ||||||| || |||||    
T  4816651 acagaaacatattttttggtgcagatttgttacagatttt 4816612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 420 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 13870746 - 13870608
Alignment:
Q  420 aaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtct 519  Q
    |||||||| | |||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  13870746 aaatataggctttgtatcagagcaaaccttgagatagagggg-ctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttatataaagtttgtct 13870648  T
Q  520 cttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctcctt 559  Q
    ||| | || ||||||| ||||||| |||||||||| ||||    
T  13870647 cttggcaacaaacacttgggtttgagggttgattcacctt 13870608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 420 - 747
Target Start/End: Original strand, 17012033 - 17012358
Alignment:
Q  420 aaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaa-acaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtc 518  Q
    ||||||||||||||||||  || |||| |||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |  ||||||||| |||||||||||||| |||||| |    
T  17012033 aaatatagaccttgtatcggagtaaaccttgagatagaggggtctgaataaaagggtttagaa-gtaaacaacaaa-ctagggtttgtataaagtttg-c 17012129  T
Q  519 tcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggta 617  Q
    |||| | || |||||||||||||    ||||||||| ||||  | ||||| |||||||||||||||| ||||| |||  |||||  |||  |||| ||||    
T  17012130 tcttggcaacaaacactagggttga--ggttgattcaccttctg-aaacaatattaggattgagtctcttggtcacgagaagagattgatgcttttggta 17012226  T
Q  618 gaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatc-atatagtggatcagagggctgctctctcccccagacta 715  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||| ||||||||||  ||||| ||| || || | |  ||||||||||||||||    
T  17012227 gaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactcatcgttatag-ggaacatagagatcatctctcccccagacta 17012325  T
Q  716 ggtaaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 747  Q
    ||| | | |||||||||||| ||| ||||||||    
T  17012326 ggtcagtattggaccgaactaggtaaacaaatt 17012358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 410 - 747
Target Start/End: Original strand, 19696420 - 19696759
Alignment:
Q  410 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagaggg--ggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 506  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||   |  |||| |||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||   |||||||||  ||||||||||    
T  19696420 cttttactataaatatagaccttgtatatgatgaaaccttgagagagagggagggctgaaaacaagggtttagaaaca-aacaacaaat-tagggtttgt 19696517  T
Q  507 atagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctg 605  Q
    |||||||||| ||||| | || || ||||||||||      ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| || || || |||||||  ||    
T  19696518 atagagtttg-ctcttggcaacaatcactagggttcaaa--ttgattcaccttggg-aaacactgttaggattgagtctctttgtcactgaaagagattg 19696613  T
Q  606 agactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaaaccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcat-atagtggatcagagggctgctct 702  Q
    ||||||||| ||||||||||   || ||||||||||||||| || ||||| ||||||| |||| |||| ||||||| |||||||| ||||  ||||||||    
T  19696614 agactttggttagaattaggtttgaagacttattcttgtaatcctttgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtggaacagatagctgctct 19696713  T
Q  703 ctcccccagactaggtaaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 747  Q
    ||| |||||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||||    
T  19696714 ctctcccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 19696759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 607 - 747
Target Start/End: Original strand, 15346523 - 15346664
Alignment:
Q  607 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctct-ttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctc 705  Q
    ||||||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||| | | ||  |||||||||||    
T  15346523 gactttgagtaaaattaagcggaagacttattcttgtaacccattgatatctctattgtaaagttattcatcatatagtgaaacggaaagctgctctctc 15346622  T
Q  706 ccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 747  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15346623 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaatt 15346664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 548 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 22858152 - 22857949
Alignment:
Q  548 ttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaa 645  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| ||   |||||  ||||||||| |||||| |||||   || |||| ||||||||||    
T  22858152 ttgattcaccttggg-aaacactattatgattgagtctcttggtcacaagaagagattgagactttaggtagatttaggtttgaagactaattcttgtaa 22858054  T
Q  646 accatt-gatttctctttgtaacgttactcatcat-atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaat-ttggaccgaactgggtcaac 742  Q
     || || ||| | ||||||||| |||||||||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||| || |||    
T  22858053 cccttttgatatatctttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctcccccagactaggtcagtattggaccgaactgtgtaaac 22857954  T
Q  743 aaatt 747  Q
    |||||    
T  22857953 aaatt 22857949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 626 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 25465710 - 25465587
Alignment:
Q  626 cgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaat-t 723  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | |||| |||||||||| |||| |||| || | | |    
T  25465710 cgggagacttattcttgtacccctttgatatctctttgtaaagttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctctcccatactatgtcagtat 25465611  T
Q  724 tggaccgaactgggtcaacaaatt 747  Q
    ||||||||||||||| ||||||||    
T  25465610 tggaccgaactgggtaaacaaatt 25465587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 561 - 747
Target Start/End: Original strand, 26945272 - 26945463
Alignment:
Q  561 gggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcggg-agacttattcttgtaaaccattgatttct 658  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||  || |||||||||||||||||||   | ||||||||| ||||||  ||||||| |||    
T  26945272 gggaaacactattaggattaagtctcttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttgtagacttatttttgtaactcattgatatct 26945371  T
Q  659 cttt-gtaacgttactcatcat-atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaa-tttggaccgaactgggtcaacaaatt 747  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||||| || |  ||||| |||||| |||||||| || || |  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  26945372 cttttgtaaagttactcatcattatagtagaacgaagggcagctctcccccccagattatgtcaggtttggaccgaactgggtaaacaaatt 26945463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 662 - 747
Target Start/End: Original strand, 10584227 - 10584313
Alignment:
Q  662 tgtaacgttactcatcat-atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 747  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| | | |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  10584227 tgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctctcctccagactaggtcaatttggaccgaactgtgtcaacaaatt 10584313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 307 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 24192733 - 24192635
Alignment:
Q  307 aaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagc 405  Q
    |||||||| ||||||||| | |||  |||||| ||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  24192733 aaatcgtgccacgatgggattgcaatgtggcatgatggggcgctggcagcgaataacagaaacatatttttcagtgcaaatttgttccaaattttaagc 24192635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 410 - 522
Target Start/End: Original strand, 10584105 - 10584212
Alignment:
Q  410 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 509  Q
    ||||||||| ||||||| || ||||||||  | |||| |||||||||||||     |||||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  10584105 cttttactataaatataaacattgtatcagtgtaaaccttgagatagaggg-----aaacaaaggtttataaaagcaacaacaaaactagagtttgtata 10584199  T
Q  510 gagtttgtctctt 522  Q
    |||||||||||||    
T  10584200 gagtttgtctctt 10584212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 387 - 481
Target Start/End: Original strand, 15346347 - 15346441
Alignment:
Q  387 tttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 481  Q
    |||||||||| || | || || |||||||||| |||||||||| ||||||||  | |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15346347 tttgttccaatttatgagggatacttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaccaagggtttagaa 15346441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 307 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 24191636 - 24191538
Alignment:
Q  307 aaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagc 405  Q
    |||||||| ||||||||| | |||  |||| | ||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  24191636 aaatcgtgccacgatgggattgcaatgtggtatgatggggcgctggcagcgaataacagaaacatatttttcagtgcaaatttgttccaaattttaagc 24191538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 386 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 26066387 - 26066319
Alignment:
Q  386 atttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagat 454  Q
    ||||||| || |||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26066387 atttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagat 26066319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 386 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 26068658 - 26068590
Alignment:
Q  386 atttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagat 454  Q
    ||||||| || |||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26068658 atttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagat 26068590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 656 - 718
Target Start/End: Complemental strand, 12911535 - 12911472
Alignment:
Q  656 tctctttgtaacgttactcatcat-atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt 718  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12911535 tctctttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggt 12911472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 564 - 746
Target Start/End: Original strand, 13878727 - 13878910
Alignment:
Q  564 aaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctt 661  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||  |||   | ||||||    
T  13878727 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctctt 13878822  T
Q  662 tgtaacgttactca-tca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt-aaatttggaccgaactgggtcaacaaat 746  Q
    ||||| |  ||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |   || ||||||||||||| |||||||    
T  13878823 tgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 13878910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 564 - 746
Target Start/End: Original strand, 13883475 - 13883658
Alignment:
Q  564 aaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctt 661  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||  |||   | ||||||    
T  13883475 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaattcat---tatctctt 13883570  T
Q  662 tgtaacgttactca-tca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt-aaatttggaccgaactgggtcaacaaat 746  Q
    ||||| |  ||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |   || ||||||||||||| |||||||    
T  13883571 tgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 13883658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 564 - 746
Target Start/End: Original strand, 16785919 - 16786102
Alignment:
Q  564 aaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctt 661  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||  |||   | ||||||    
T  16785919 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctctt 16786014  T
Q  662 tgtaacgttactca-tca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt-aaatttggaccgaactgggtcaacaaat 746  Q
    ||||| |  ||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |   || ||||||||||||| |||||||    
T  16786015 tgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 16786102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 561 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 28037916 - 28037722
Alignment:
Q  561 gggaaacactattaggattgagtctttggtt-acggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggaga-cttattcttgtaaaccattgatttct 658  Q
    |||||||||| |||||||||||||  | ||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||    | | ||||||||||||| || ||||| |||    
T  28037916 gggaaacactgttaggattgagtcccttgttcacggaaatagattgagactttgggtagaattaggtttaaaatcttattcttgtaaccctttgatatct 28037817  T
Q  659 c-tttgtaacgttactcatcat-atagtgga---tcagagggctgctctctcccccagactaggt-aaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 747  Q
    | ||||||| |||||||||||| ||||||||    |  | |||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||| ||||||||    
T  28037816 cttttgtaaagttactcatcataatagtggacggacgaaaggctgctctctcccccagtctaggtcagttttggaccgagctgggtaaacaaatt 28037722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 409 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 29755032 - 29754983
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagag 458  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  29755032 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactctgagagagag 29754983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 680 - 744
Target Start/End: Original strand, 5757507 - 5757571
Alignment:
Q  680 atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 744  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  5757507 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 5757571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 680 - 744
Target Start/End: Original strand, 10077194 - 10077258
Alignment:
Q  680 atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 744  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||| |||||||||||    
T  10077194 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaattgggtcaacaa 10077258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 567 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 17695030 - 17694844
Alignment:
Q  567 cactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgt 664  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||  ||   || |||||||||    
T  17695030 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttgt 17694935  T
Q  665 aacgttact-catca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt-aaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttgt 752  Q
    || |  |||  |||| ||||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||| |   || ||||||||||||| |||||||||||||    
T  17694934 aaagaaactatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccctagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattcttgt 17694844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 564 - 705
Target Start/End: Original strand, 20526937 - 20527081
Alignment:
Q  564 aaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctt 661  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||   |||||  | ||||||| ||||||||||||   | ||||| |||||||||| |  ||||| ||||||    
T  20526937 aaacactattaggattgagtctcttggtcacaagaagagattaagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaaccttttgatatctctt 20527036  T
Q  662 tgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctc 705  Q
    ||||| |||| |||||| ||||||||| | ||| |||||||||||    
T  20527037 tgtaaagttattcatcattatagtggaacggagagctgctctctc 20527081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 630 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 28078310 - 28078191
Alignment:
Q  630 agacttattcttgtaaaccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcat-atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt-aaatttgg 726  Q
    |||||||||||||||| || ||||| ||||||| |||| |||||||||||| ||||||||| | | | |||||||||||| || ||||||| || ||| |    
T  28078310 agacttattcttgtaa-cctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggattataagactgctctctccctcatactaggtcaattttag 28078212  T
Q  727 accgaactgggtcaacaaatt 747  Q
    ||||||| |||| ||||||||    
T  28078211 accgaacagggtaaacaaatt 28078191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 656 - 718
Target Start/End: Complemental strand, 12937282 - 12937220
Alignment:
Q  656 tctctttgtaacgttactcatcat-atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt 718  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||    
T  12937282 tctctttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctct-ccccagactaggt 12937220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 567 - 625
Target Start/End: Complemental strand, 22352031 - 22351973
Alignment:
Q  567 cactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg 625  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22352031 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgaga-tttgggtagaattagg 22351973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 606 - 718
Target Start/End: Original strand, 30445698 - 30445813
Alignment:
Q  606 agactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctct 702  Q
    ||||||||||||||||||||   | ||||| |||||||||| || ||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| | |||  |||||||    
T  30445698 agactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagaactgctct 30445797  T
Q  703 ctcccccagactaggt 718  Q
    |||| ||| |||||||    
T  30445798 ctccaccatactaggt 30445813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 681 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 31979580 - 31979517
Alignment:
Q  681 tagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 744  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||| || || |  ||||||||||||||||||||||    
T  31979580 tagtggattggagggctgctctctcccccagattatgtcatattggaccgaactgggtcaacaa 31979517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 564 - 625
Target Start/End: Complemental strand, 26887406 - 26887345
Alignment:
Q  564 aaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg 625  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  26887406 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 26887345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 695 - 752
Target Start/End: Original strand, 30443553 - 30443611
Alignment:
Q  695 gctgctctctcccccagactaggtaaat-ttggaccgaactgggtcaacaaattcttgt 752  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  30443553 gctgctctctccccgagactaggtaagtattggaccgaactgggtaaacaaatttttgt 30443611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 564 - 625
Target Start/End: Complemental strand, 31248896 - 31248835
Alignment:
Q  564 aaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg 625  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  31248896 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 31248835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 564 - 625
Target Start/End: Complemental strand, 35201508 - 35201447
Alignment:
Q  564 aaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg 625  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  35201508 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 35201447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 567 - 623
Target Start/End: Complemental strand, 19702041 - 19701985
Alignment:
Q  567 cactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaatta 623  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  19702041 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgagac-ttgggtagaatta 19701985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 299 - 348
Target Start/End: Original strand, 26084818 - 26084867
Alignment:
Q  299 cactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcg 348  Q
    |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  26084818 cactggaaaaatcgtgccacgattgaatcgcatcgtggcacgatggtgcg 26084867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 386 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 4816604 - 4816552
Alignment:
Q  386 atttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatca 438  Q
    ||||||| || ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4816604 atttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagaccttgtatca 4816552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 680 - 744
Target Start/End: Original strand, 5572270 - 5572334
Alignment:
Q  680 atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 744  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||| ||| ||||| |  |||||||||| |||||||||||    
T  5572270 atagtggattggagggctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaattgggtcaacaa 5572334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 680 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 21356104 - 21356040
Alignment:
Q  680 atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 744  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||| ||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  21356104 atagtggattggagagctgctctctcctccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 21356040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 700 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 33211229 - 33211185
Alignment:
Q  700 tctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 744  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  33211229 tctctcccccagagtaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 33211185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 679 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 35201393 - 35201325
Alignment:
Q  679 tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaat-ttggaccgaactgggtcaacaaat 746  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| | | || ||||||||||||| |||||||    
T  35201393 tatagtggatcggagagctgctctctccccaagactaggtcattattagaccgaactgggtaaacaaat 35201325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 564 - 625
Target Start/End: Complemental strand, 3577696 - 3577636
Alignment:
Q  564 aaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg 625  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  3577696 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt--ggtagaattagg 3577636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 567 - 625
Target Start/End: Original strand, 17036058 - 17036116
Alignment:
Q  567 cactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg 625  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  17036058 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 17036116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 681 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 31936654 - 31936591
Alignment:
Q  681 tagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 744  Q
    ||||||||  ||| ||||||||||| |||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||    
T  31936654 tagtggattggagagctgctctctctcccagactaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 31936591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 409 - 443
Target Start/End: Original strand, 33308932 - 33308966
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagca 443  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33308932 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagca 33308966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #100
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 409 - 443
Target Start/End: Original strand, 33311201 - 33311235
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagca 443  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33311201 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagca 33311235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #101
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 681 - 738
Target Start/End: Original strand, 24436001 - 24436058
Alignment:
Q  681 tagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggt 738  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||| |  ||||| ||||||||||    
T  24436001 tagtggatcggagggctgctctctcccctagagtaggtcatattggatcgaactgggt 24436058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 389; Significance: 0; HSPs: 173)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 389; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 207 - 770
Target Start/End: Original strand, 5191374 - 5191938
Alignment:
Q  207 gtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgga 305  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||  |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  5191374 gtgagagttaacttaaaatcagatttctgcagaatcgtggcacgattgctgggcatcgtggcacgattggaggtttcagtttt-gaggcaaggtactgga 5191472  T
Q  306 aaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagc 405  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| || |||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||     
T  5191473 aaaatcgtggcacgatgggatctcatcgtggcacgatggtgcgctggcagcgaaaaacagaaacatatttttgagtgcagatttgttccaaattttaagg 5191572  T
Q  406 gaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 505  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5191573 gaaacttttactataaatatagaccttgtatctaagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 5191672  T
Q  506 tatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggct 604  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  5191673 tatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct 5191771  T
Q  605 gagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctct 704  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5191772 gggactttgggtagaattaggcgggagactcattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgatactcatcatatagtggatcagagggctgttctct 5191871  T
Q  705 cccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattc--ttgtatttttctcttctttgtg 770  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||    
T  5191872 -ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtg 5191938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 379; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 206 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 22114842 - 22114297
Alignment:
Q  206 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgga 305  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||| || | ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22114842 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgtagaatcgtggcacgatggttgggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgga 22114743  T
Q  306 aaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagc 405  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22114742 aaaattgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgatggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagc 22114643  T
Q  406 gaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 505  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22114642 gaaacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaaaaacaaaactagggtttg 22114543  T
Q  506 tatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggct 604  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  22114542 tatagagtttgtctcttcggaacaaacactaggttttgtgggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct 22114444  T
Q  605 gagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctc 703  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||| || ||||    
T  22114443 gggattttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatataatgaatcggagggatgatctc 22114344  T
Q  704 tcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    ||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22114343 tcccccaaacaaagtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 22114297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 206 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 18099707 - 18099162
Alignment:
Q  206 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgg 304  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  18099707 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcaaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattggaggtttcagtttt-gaggcaagacactgg 18099609  T
Q  305 aaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaag 404  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || || || | |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18099608 aaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggcgaacaatagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaag 18099509  T
Q  405 cgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt-gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 503  Q
    ||| |||||||||| || |||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18099508 cgagacttttactataa-tatagaccttgtatcagagtaaacttgagagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtt 18099410  T
Q  504 tgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagagg 602  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  18099409 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagg 18099311  T
Q  603 ctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctc 701  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  18099310 ctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacattactcatcatatagtggaacggagggctgctc 18099211  T
Q  702 tctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    ||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18099210 tctcccctagactaggtcaatatggaccgaactgggtcaacaaattctt 18099162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 308 - 750
Target Start/End: Original strand, 3859350 - 3859792
Alignment:
Q  308 aatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcga 407  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  3859350 aatcgtggcacgatggggtcacatcgtggcacgatggtgcgctggcggcgaataatataaacgtatttttgggtgcagatttgtttcaaattttaagcga 3859449  T
Q  408 aacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 507  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3859450 aacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 3859549  T
Q  508 tagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctga 606  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  3859550 tagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctga 3859648  T
Q  607 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcc 706  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  3859649 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatttctctttgtaacaatactcatcatatagtggatcgtagggctgctctctcc 3859748  T
Q  707 cccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3859749 cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 3859792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 332; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 265 - 770
Target Start/End: Complemental strand, 10956505 - 10955997
Alignment:
Q  265 tggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataac 363  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  10956505 tggcacgattggaggtttcagttttgg-ggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcagcgaataac 10956407  T
Q  364 ataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggc 463  Q
    |||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |   |||||||| ||||||||||||||||||| || |||| |  |||||||||||||    
T  10956406 ataaacgtatttttaggtgcagatttgttccaaattttaagcaatttttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaacatgaagatagagggggc 10956307  T
Q  464 tgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttgggg 563  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||| |||| |||    
T  10956306 tgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaaggttgattcacctt-ggg 10956208  T
Q  564 aaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tt 661  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||    
T  10956207 aaacattattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttt 10956108  T
Q  662 tgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattc--ttgtatttttc 759  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| || |||    
T  10956107 tgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttc 10956008  T
Q  760 tcttctttgtg 770  Q
    |||||||||||    
T  10956007 tcttctttgtg 10955997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 239 - 770
Target Start/End: Complemental strand, 5523119 - 5522597
Alignment:
Q  239 aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggc 337  Q
    |||||||||| ||| ||  |||||| ||||||||| || |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  5523119 aatcgtggcaagattgctgggcaacatggcacgattggtggtttcagtttt-gaggcaaggtactggaaaaatcgtggcacaatgggatcgcatcgtggc 5523021  T
Q  338 acgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatc 437  Q
    ||||||||||| ||||||| || |||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5523020 acgatggtgcgctggcagcgaaaaacagaaacatatttttgagtgcagatttgtttcaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatc 5522921  T
Q  438 aaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactag 537  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||||||||| ||||||| |    
T  5522920 agagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt-----------ctcttcggaacaaacactcg 5522832  T
Q  538 ggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagactta 636  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5522831 ggtttgtgggttgatttaccttggg-aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagactta 5522733  T
Q  637 ttcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgg 736  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  5522732 ttcttgtaacccattgatttctctttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccgcagactaggtcaatttggaccgaactgg 5522633  T
Q  737 gtcaacaaattc--ttgtatttttctcttctttgtg 770  Q
    ||||||||||||  |||| || ||||||||||||||    
T  5522632 gtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtg 5522597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 239 - 750
Target Start/End: Original strand, 11170178 - 11170669
Alignment:
Q  239 aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggca 338  Q
    |||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||                     |||||     
T  11170178 aatcgtggcacggttgctgggcaacgtggcacgatggaggtttcggtttttgaggcaaggcactggaaaaatc---------------------gtggct 11170256  T
Q  339 cgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatca 438  Q
    |||| ||||| |||| || ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11170257 cgattgtgcgctggcggcgaataacagaaacatatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatca 11170356  T
Q  439 aagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagg 538  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  11170357 gagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagg 11170456  T
Q  539 gtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttat 637  Q
    ||||| || ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11170457 gtttgcggattgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtgtcttggttacgggaagaggctgggactttaggtagaattaggcgggagacttat 11170555  T
Q  638 tcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgg 736  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  11170556 tcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttgggccgaactgg 11170655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 299 - 770
Target Start/End: Complemental strand, 10958767 - 10958293
Alignment:
Q  299 cactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaat 398  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||    
T  10958767 cactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcagccaataacagaaacgtatttttaggtgcagatttgttccaaat 10958668  T
Q  399 tttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaacta 498  Q
    ||||||| |   |||||||| ||||||||||||||||||| || |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10958667 tttaagcaatttttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaacataaagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaacta 10958568  T
Q  499 gggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaa 597  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |    
T  10958567 gggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaaggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttatggga 10958469  T
Q  598 agaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggc 696  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||    
T  10958468 agaggctgacactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttactcttcatatagtggaacggagggc 10958369  T
Q  697 tgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttgta--tttttctcttctttgtg 770  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||||||||||||    
T  10958368 tgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttatgttcttctcttctttgtg 10958293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 239 - 770
Target Start/End: Original strand, 26720301 - 26720834
Alignment:
Q  239 aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggc 337  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||| ||| ||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26720301 aatcgtggcacgatggctgagcaacgtggcaggattggaggtttcaagttt-gaggcaaagcactggaaaaatcgtggcacgatgggatcgcatcgtggc 26720399  T
Q  338 acgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatc 437  Q
    ||||||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26720400 acgatggtgtgctggcagcgaaaaacagaaacatattttttagtgcagatttgttccaaattttaagcaatacttttactataaatatagaccttgtatc 26720499  T
Q  438 aaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactag 537  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||    
T  26720500 agagcaaacttggagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctatttggaacaaacactag 26720599  T
Q  538 ggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagactta 636  Q
    |||||| |||||||||| |||||||  |  |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26720600 ggtttgagggttgattcaccttgggtta--actattaggattgagtttcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagactta 26720697  T
Q  637 ttcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactg 735  Q
    ||||| ||| || |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | || | ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  26720698 ttcttttaaccctttgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggaacggatgactgctctctcccctagattaggtcaatttggaccgaactg 26720797  T
Q  736 ggtcaacaaattc--ttgtatttttctcttctttgtg 770  Q
    ||||| |||||||  |||| || ||||||||||||||    
T  26720798 ggtcaccaaattcttttgtgttcttctcttctttgtg 26720834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 292; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 206 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 18097422 - 18096892
Alignment:
Q  206 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgg 304  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  ||    
T  18097422 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcaaaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattggaggtttcagtttt-gaggcaaggcatagg 18097324  T
Q  305 aaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaag 404  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||                 || ||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  18097323 aaaaatcgtggcacgatggggtcgcatagtggcg----------------gcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgtttcaaattttaag 18097240  T
Q  405 cgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt-gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 503  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18097239 cgagacttttactataaatatagaccttgtatcatagtaaacttgagagatagagggggctcaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtt 18097140  T
Q  504 tgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagagg 602  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  18097139 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagg 18097041  T
Q  603 ctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctc 701  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||    
T  18097040 ctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatttcccttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagagctgctc 18096941  T
Q  702 tctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  18096940 tctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacgaattctt 18096892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 205 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 32264581 - 32264035
Alignment:
Q  205 atgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataa-tcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcact 302  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| ||| |||| || |||||||||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32264581 atgtgagagttaacttaaaatcaggttt-tgcagaaatcgtggcacgatggctggg-aacgtggcacgattggaggtttcagtttttgaggcaagtcact 32264484  T
Q  303 ggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaatttta 402  Q
    |||    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  32264483 ggatttttcgtggcacgatgggcttgcaacgtggcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacatatttttgggtgcagatttgtttcaaatttta 32264384  T
Q  403 agcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagca----aactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaacta 498  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| || |    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32264383 agcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaattaactttgagatagagggggctcaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaacta 32264284  T
Q  499 gggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaa 597  Q
      |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |    
T  32264283 aagtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttatggga 32264185  T
Q  598 agaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc--tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagg 694  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||    
T  32264184 agaggctggaactttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagg 32264085  T
Q  695 gctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 744  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| |||||||    
T  32264084 gctgctctctcccccagactaggtctatttggaccaaactggatcaacaa 32264035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 287; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 299 - 750
Target Start/End: Original strand, 45882752 - 45883205
Alignment:
Q  299 cactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaat 398  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||||||| || || | ||||||| |||| |||||||||||||| |||||||  ||||    
T  45882752 cactggaaaaatcgtgccacgatgggattgcaacgtggcacgatggtgcgctgacaacgaataacagaaacctatttttgggtgcagatttgttgaaaat 45882851  T
Q  399 tttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaacta 498  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45882852 tttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcatagtaaactatgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaacta 45882951  T
Q  499 gggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaa 597  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| || |||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  45882952 gggtttgtatagattttgtctctttggaacaaacaataaggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 45883050  T
Q  598 agaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggc 696  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  45883051 agaggttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggc 45883150  T
Q  697 tgctctctccccc-agactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45883151 tgctctctccccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 45883205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 329 - 770
Target Start/End: Complemental strand, 10084807 - 10084359
Alignment:
Q  329 catcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatataga 428  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| || |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  10084807 catcgtggcacgatggtgcgctggcagcgaaaaacagaaacatatttttgagtgcagatttgttccaaattttaagcgatgcttttactataaatataga 10084708  T
Q  429 ccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcg 524  Q
    |||||||||  ||||||||||||||    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  10084707 ccttgtatcggagcaaactttgagagagatagagggggctggaacaagggtttagaaaggcaataacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttg 10084608  T
Q  525 gaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaatta 623  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  10084607 gaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt-gggaaacactattaggatcgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaatta 10084509  T
Q  624 ggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaat 722  Q
    || ||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  10084508 ggagggagacttattcttgtaacccgttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccccaagactaggtcaat 10084409  T
Q  723 ttggaccgaactgggtcaacaaat--tcttgtatttttctcttctttgtg 770  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | |||| || ||||||||||||||    
T  10084408 ttggaccgaactgggtcaacaaattattttgtgttcttctcttctttgtg 10084359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 329 - 770
Target Start/End: Complemental strand, 10191727 - 10191282
Alignment:
Q  329 catcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatataga 428  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  10191727 catcgtggcacgatggtgcgctggcagcgaaaaacagaaacatatttttgagtgcaaatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatataga 10191628  T
Q  429 ccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcg 524  Q
    |||||||||  ||||||||||    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  10191627 ccttgtatcggagcaaactttgagagagataaagggggctggaacaagggtttagaaaggcaataacaaaactagggtttttatagagtttgtctctttg 10191528  T
Q  525 gaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaatta 623  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||    
T  10191527 gaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt-gggaaacactattaggatcgagtctcttggttacaggaagaggctg-gactttgggtagaatta 10191430  T
Q  624 ggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaat 722  Q
    || ||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||    
T  10191429 ggagggagacttattcttgtaacccgttcatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccctaagactaggtcaat 10191330  T
Q  723 ttggaccgaactgggtcaacaaattcttgtatttttctcttctttgtg 770  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||    
T  10191329 ttggaccgaactgggtcaacaaattattgtgttcttctcttctttgtg 10191282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 205 - 770
Target Start/End: Original strand, 38889756 - 38890327
Alignment:
Q  205 atgtgagatttaacttcaaatcagattta-tgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactg 303  Q
    |||||||| ||||||| |||| || |||  |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  38889756 atgtgagagttaacttaaaattaggttttctgcagaatcgtggtacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagttttttaggcaaggcattg 38889855  T
Q  304 gaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaat---------------- 387  Q
    ||||||||                     |||||||||||||||| |||| || ||||||| ||||||||||||||||||| ||                    
T  38889856 gaaaaatc---------------------gtggcacgatggtgcgctggcggcgaataacagaaacatatttttgggtgcagatttgttacagattttaa 38889934  T
Q  388 ------ttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggttt 477  Q
          ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38889935 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtat---agcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggttt 38890031  T
Q  478 agaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattagga 577  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  38890032 agaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt-gggaaacactattagga 38890130  T
Q  578 ttgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactca 675  Q
    |||||||| |||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38890131 ttgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactca 38890230  T
Q  676 tcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattc--ttgtatttttctcttctttgtg 770  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||    
T  38890231 tcatatagtggatcggagggctgctctctcccctatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtg 38890327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 409 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 4308615 - 4308273
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 508  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4308615 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 4308516  T
Q  509 agagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgag 607  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| || |    
T  4308515 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttggg 4308417  T
Q  608 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcc 706  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  4308416 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcc 4308317  T
Q  707 cccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4308316 cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 4308273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 409 - 770
Target Start/End: Complemental strand, 4104233 - 4103866
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 504  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||    |||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4104233 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 4104134  T
Q  505 gtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggc 603  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  4104133 gtatagagcttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggc 4104035  T
Q  604 tgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctc 703  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  4104034 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctatc 4103935  T
Q  704 tcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattc--ttgtatttttctcttctttgtg 770  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||    
T  4103934 tcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtg 4103866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 409 - 750
Target Start/End: Original strand, 43228214 - 43228556
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 508  Q
    ||||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43228214 actttcactataaatatagacattgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagcgtttgtat 43228313  T
Q  509 agagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgag 607  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |    
T  43228314 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 43228412  T
Q  608 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcc 706  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43228413 actttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcc 43228512  T
Q  707 cccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43228513 cccagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattctt 43228556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 409 - 770
Target Start/End: Complemental strand, 51727340 - 51726977
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 508  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  51727340 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagataaagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtatgtat 51727241  T
Q  509 agagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgag 607  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  51727240 agagtttgtctctttggaacaaacact-gggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacggtaagaggctgag 51727143  T
Q  608 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcc 706  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||    
T  51727142 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggatggctgctctctcc 51727043  T
Q  707 cccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattc--ttgtatttttctcttctttgtg 770  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||  |||| || ||||||||||||||    
T  51727042 cccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtg 51726977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 329 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 6066210 - 6065791
Alignment:
Q  329 catcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatataga 428  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |  || || | |||  |||||||||| ||| ||||||| || |||||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  6066210 catcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaata-aaatgtatttttgggagcagatttgttacagattttaagcagaacttttactataaatataga 6066112  T
Q  429 ccttgtatcaaagcaaactttgagatagaggggg-ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaa 527  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6066111 ccttgtatcaaagcaaactttgagatagaggggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagattttgtctcttcggaa 6066012  T
Q  528 gaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattg-agtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg 625  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||    
T  6066011 caaacactagggtttgtgggttgattcaccttggg-aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 6065913  T
Q  626 cgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttg 725  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||| |  |||    
T  6065912 cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggatggctgctctctcccctagactaggtcagattg 6065813  T
Q  726 gaccgaactgggtcaacaaatt 747  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  6065812 gacagaactgggtcaacaaatt 6065791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 409 - 752
Target Start/End: Original strand, 43226009 - 43226352
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 508  Q
    ||||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  43226009 actttcactataaatatagacattgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactacg-tttgtat 43226107  T
Q  509 agagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgag 607  Q
    |||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |    
T  43226108 agagtttgtctcgttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggg-aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 43226206  T
Q  608 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcc 706  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43226207 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcc 43226306  T
Q  707 cccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttgt 752  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43226307 cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttgt 43226352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 331 - 750
Target Start/End: Original strand, 24979552 - 24979973
Alignment:
Q  331 tcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagacc 430  Q
    ||||||||||||||| || ||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  | ||||| |||| ||||||| |||    
T  24979552 tcgtggcacgatggtacgctggtagcgaataacataaacatattttttggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatatacc 24979651  T
Q  431 ttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaa 530  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  24979652 ttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaa 24979751  T
Q  531 acactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcggg 629  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||    
T  24979752 acactagggtttgagggttgattcacctt-gggaaatactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattgagactttgggtagaattaggcagg 24979850  T
Q  630 agacttattcttgtaaaccattgatttc-tctttgt-aacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttgga 727  Q
    ||||||||||||||||   ||| || || | ||||| ||||||||||||||||||||| | | || ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  24979851 agacttattcttgtaacaaattaatatcttttttgtaaacgttactcatcatatagtgaaacggatggctgctctctcccccaaactaggtcaatttgga 24979950  T
Q  728 ccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
     ||||||||||||||||||||||    
T  24979951 tcgaactgggtcaacaaattctt 24979973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 386 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 6063805 - 6063441
Alignment:
Q  386 atttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--tagagggggctgaaacaagggtttagaaag 483  Q
    ||||||| || ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6063805 atttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaag 6063706  T
Q  484 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattg-ag 582  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  6063705 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtcttttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggg-aaacactattaggattggag 6063607  T
Q  583 tct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatat 681  Q
    ||| |||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  6063606 tctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatat 6063507  T
Q  682 agtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 747  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||    
T  6063506 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtccacaaatt 6063441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 330 - 747
Target Start/End: Original strand, 18162508 - 18162925
Alignment:
Q  330 atcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagac 429  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  18162508 atcgtgccacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagac 18162607  T
Q  430 cttgtatca-aagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaag 528  Q
    |||||||||  || |||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||     
T  18162608 cttgtatcatgagtaaacttggagataga--gggatgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttttgaac 18162705  T
Q  529 aaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcg 627  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||| |    
T  18162706 aaacactagggtttgaggattgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtg 18162804  T
Q  628 ggagacttattcttgtaaaccattgat-ttctctttgt-aacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttg 725  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||   ||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18162805 ggagacttattcttgtaacccattgatatttattttgtaaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttg 18162904  T
Q  726 gaccgaactgggtcaacaaatt 747  Q
    || ||||||| |||||||||||    
T  18162905 ga-cgaactgtgtcaacaaatt 18162925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 450 - 750
Target Start/End: Original strand, 25533406 - 25533707
Alignment:
Q  450 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggtt 549  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||    
T  25533406 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggtt 25533505  T
Q  550 gattctccttggggaaacactattaggattgagtc-tttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaacc 648  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  25533506 gattcacctt-gggaaacactattaggattgagtcttttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 25533604  T
Q  649 attgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 747  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25533605 attgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggactgaactgggtcaacaaatt 25533704  T
Q  748 ctt 750  Q
    |||    
T  25533705 ctt 25533707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 386 - 746
Target Start/End: Original strand, 50493899 - 50494260
Alignment:
Q  386 atttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggc 485  Q
    ||||||| || |||||||||   ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  50493899 atttgttacagattttaagcaggactttcactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactgagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagc 50493998  T
Q  486 aacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggatt-gagtc 584  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  50493999 aacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt-gggaaacactattaggattggagtc 50494097  T
Q  585 t-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatag 683  Q
    | |||||||||| ||| |  || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  50494098 tcttggttacgggaagggattgggactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatag 50494197  T
Q  684 tggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaat 746  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  50494198 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaat 50494260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 206 - 645
Target Start/End: Original strand, 35777163 - 35777581
Alignment:
Q  206 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgga 305  Q
    ||||||| ||||||| |||| |||||| |||| |||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  35777163 tgtgagagttaacttaaaattagatttctgcagaatcgtggcacgacagctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 35777262  T
Q  306 aaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagc 405  Q
    ||||||                     |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  35777263 aaaatc---------------------gtggcacgatggtgcgctggcagcaaa-aacataaacatatttttgggtgcagatttgttacagattttaagc 35777340  T
Q  406 gaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 505  Q
     | |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35777341 aagacttttactataaatatagacattgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttg 35777440  T
Q  506 tatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggatt-gagtct-ttggttacggaaagaggc 603  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||      
T  35777441 tatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt-gggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagat 35777539  T
Q  604 tgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 645  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35777540 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 35777581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 409 - 750
Target Start/End: Original strand, 1313333 - 1313674
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 508  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||| || |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  1313333 acttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagg-tttacaatggcaacaacaaaactagggtttgtat 1313431  T
Q  509 agagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgag 607  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||  || |    
T  1313432 agagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggg-aaacactattaggattgagtctcttagttacgggaagagattggg 1313530  T
Q  608 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcc 706  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||    
T  1313531 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcc 1313630  T
Q  707 cccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1313631 cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 1313674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 450 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 9604899 - 9604599
Alignment:
Q  450 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggtt 549  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| |||||    
T  9604899 gagatagagggggctgaaacaagg-tttagaaaggcaacaacaaaactaggatttgtatagagtttgtctctttgaaagaaacactaggttttgagggtt 9604801  T
Q  550 gattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaacc 648  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  9604800 gattcaccttggg-aaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagaggttgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 9604702  T
Q  649 attgatttctcttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 747  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  9604701 attgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttagaccgaactaggtcaacaaatt 9604602  T
Q  748 ctt 750  Q
    |||    
T  9604601 ctt 9604599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 450 - 750
Target Start/End: Original strand, 42990268 - 42990569
Alignment:
Q  450 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggtt 549  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||| |||| |||||    
T  42990268 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacattaggttttgagggtt 42990367  T
Q  550 gattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaacc 648  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  42990368 gattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactc 42990466  T
Q  649 attgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 747  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42990467 attgatttctcttttgtaacgttactcatcatatggtgaatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 42990566  T
Q  748 ctt 750  Q
    |||    
T  42990567 ctt 42990569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 409 - 747
Target Start/End: Original strand, 746674 - 747019
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 502  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||    |||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  746674 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 746773  T
Q  503 ttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattg-agtct-ttggttacggaaaga 600  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  746774 ttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggg-aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaaga 746872  T
Q  601 ggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgct 700  Q
    |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  746873 gattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggaggactgct 746972  T
Q  701 ctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 747  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  746973 ctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 747019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 331 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 48362082 - 48361663
Alignment:
Q  331 tcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagacc 430  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||| |||| || |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  48362082 tcgtggcatgatggtgcgctggcagcgaatagcagaaacgtatttttggatgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacc 48361983  T
Q  431 ttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaa 530  Q
    |||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  48361982 ttgtatcatagtaaactttgagatacagggggctgaaacaa-ggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaa 48361884  T
Q  531 acactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcggg 629  Q
    | ||||||||||| |||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||  || | |||| |||||||||||||||     
T  48361883 aaactagggtttgagggttgattcacatt-gggaaacactattaggattgagtctcttagttacgggaagagattggggcttttggtagaattaggcgga 48361785  T
Q  630 agacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggac 728  Q
    |||||| |||||||||  ||||||  |||| |||| |||||||||||| |||||||  | | ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  48361784 agactttttcttgtaactcattgacatctcttttgcaacgttactcataatatagtaaaacggagagctgctctctcccccagactaggtcaatttggat 48361685  T
Q  729 cgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  48361684 cgaactgggtcaacaaattctt 48361663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 462 - 747
Target Start/End: Original strand, 25388882 - 25389167
Alignment:
Q  462 gctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttgg 561  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25388882 gctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgg 25388981  T
Q  562 ggaaacactattaggattg-agtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc 659  Q
      ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  25388982 --aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacatattcttgtaacccattgatttctc 25389079  T
Q  660 tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 747  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25389080 tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 25389167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 409 - 746
Target Start/End: Original strand, 458203 - 458545
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 504  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||    |||| ||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  458203 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaaccttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 458302  T
Q  505 gtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattg-agtct-ttggttacggaaagagg 602  Q
    |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||     
T  458303 gtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggg-aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagaga 458401  T
Q  603 ctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctct 702  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  458402 ttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 458501  T
Q  703 ctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaat 746  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  458502 ctcccccagactaggtcaggttggaccgaactgggtcaacaaat 458545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 450 - 750
Target Start/End: Original strand, 30005805 - 30006106
Alignment:
Q  450 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggtt 549  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||    
T  30005805 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 30005904  T
Q  550 gattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaacc 648  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  30005905 gattcacctt-gggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactc 30006003  T
Q  649 attgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 747  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30006004 attgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccctagattagatcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 30006103  T
Q  748 ctt 750  Q
    |||    
T  30006104 ctt 30006106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 409 - 746
Target Start/End: Original strand, 455826 - 456168
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 504  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||    |||| ||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  455826 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaaccttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 455925  T
Q  505 gtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggatt-gagtct-ttggttacggaaagagg 602  Q
    |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||     
T  455926 gtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcacctt-gggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagaga 456024  T
Q  603 ctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctct 702  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  456025 ttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 456124  T
Q  703 ctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaat 746  Q
    ||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||    
T  456125 ctcccccagactaggtcgggttggaccgaactgggtcaacaaat 456168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 410 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 43423796 - 43423455
Alignment:
Q  410 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 509  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||  | |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43423796 cttttactataaatatagacattgtatcactgtaaaccttgagaaagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 43423697  T
Q  510 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgaga 608  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  || |     
T  43423696 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggg 43423598  T
Q  609 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctccc 707  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||| |||||||||||||    
T  43423597 ctttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaactgagagctgctctctccc 43423498  T
Q  708 ccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43423497 tgagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 43423455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 409 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 53917998 - 53917656
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 508  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||| |  |||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  53917998 acttttactataaatatagaccttgaatcagattaaaccttgagatggagggggctgaaacaatggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtat 53917899  T
Q  509 agagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgag 607  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  || |    
T  53917898 agagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggg 53917800  T
Q  608 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcc 706  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||    
T  53917799 attttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcc 53917700  T
Q  707 cccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  53917699 cccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattctt 53917656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 371 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 12268338 - 12267967
Alignment:
Q  371 tatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaaca 470  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||    
T  12268338 tatttttcagtgcaaatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaacttgtatcagagtaaactttgagatagagggagctgaaaca 12268239  T
Q  471 agggtttagaaaggcaacaac-aaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgg-aagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaaca 568  Q
    || |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||||| ||||  |||||||    
T  12268238 agagtttagaaagacaacaacaaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt-cggaaaca 12268140  T
Q  569 ctattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaac 667  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||  || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||          ||| ||||||||    
T  12268139 ctattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa---------ctct-tttgtaac 12268050  T
Q  668 gttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12268049 gttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccaaactagatcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 12267967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 450 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 10621823 - 10621525
Alignment:
Q  450 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggtt 549  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  10621823 gagatagagggtgctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 10621724  T
Q  550 gattctccttggggaaacactattaggattg-agtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaac 647  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  10621723 gattcaccttggg-aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacc 10621625  T
Q  648 cattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 747  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||    
T  10621624 cattgatttctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactagctcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 10621525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 373 - 767
Target Start/End: Original strand, 15780747 - 15781162
Alignment:
Q  373 tttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaag 472  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15780747 tttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaacttggagatagagggggctgaaacaag 15780846  T
Q  473 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag-----------agtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttgg 561  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||           |||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| |    
T  15780847 ggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtataaagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt-g 15780945  T
Q  562 ggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattg----attt 656  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    ||||    
T  15780946 ggaaacactattacgattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttcggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatattt 15781045  T
Q  657 ctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagaggg---ctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttg 751  Q
    ||| ||||||| |||| | |||| ||||||||| |  ||||   ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  15781046 ctcttttgtaaagttatttatcattatagtggaacgaagggcgcctgctctctcccccacactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 15781145  T
Q  752 tatttt-tctcttcttt 767  Q
    | |||| ||||||||||    
T  15781146 tgttttctctcttcttt 15781162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 410 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 1627016 - 1626675
Alignment:
Q  410 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 509  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1627016 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 1626917  T
Q  510 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgaga 608  Q
    |||||| |||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||  || ||    
T  1626916 gagtttatctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcacctt-ggaaaacactattaggattgagtctcttggttacggggagagattggga 1626818  T
Q  609 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctccc 707  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| |    
T  1626817 ctttgggtagaattaagcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcgc 1626718  T
Q  708 ccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1626717 ccagactaggtcgatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 1626675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 409 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 27101519 - 27101173
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaact----ttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 504  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| |    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27101519 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaattgagatagagatagaggaggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 27101420  T
Q  505 gtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggc 603  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||      
T  27101419 gtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagaa 27101321  T
Q  604 tgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctct 702  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| | || |||||||||    
T  27101320 tgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgcaacgttactcatcatatagtggaacggatggctgctct 27101221  T
Q  703 ctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27101220 ctcccccagaataggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattctt 27101173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 490 - 770
Target Start/End: Original strand, 1321483 - 1321766
Alignment:
Q  490 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttg 588  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  1321483 acaaaactcgggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggg-aaacactattaggattgagtctcttg 1321581  T
Q  589 gttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcatatagtgga 687  Q
    ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1321582 gttacaggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgga 1321681  T
Q  688 tcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattc--ttgtatttttctcttctttgtg 770  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||    
T  1321682 tcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtg 1321766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 411 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 43421747 - 43421407
Alignment:
Q  411 ttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 510  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||  | |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43421747 ttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagaaggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 43421648  T
Q  511 agtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagac 609  Q
     ||||||||||| | || ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| || ||  || |      
T  43421647 tgtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattagaattgagtctcttggttacgggaaaagattgggga 43421549  T
Q  610 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccc 708  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||    
T  43421548 tttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacagatggctgctctctcccc 43421449  T
Q  709 cagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43421448 cagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 43421407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 200; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 386 - 746
Target Start/End: Original strand, 38210268 - 38210631
Alignment:
Q  386 atttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt---gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 482  Q
    ||||||| || ||||||||| | |||||||||| |||||||| ||||||||||  || |  ||    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38210268 atttgttacagattttaagcaagacttttactataaatataggccttgtatcag-gctattttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 38210366  T
Q  483 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattg-a 581  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |    
T  38210367 agcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttatctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggg-aaacactattaggattgga 38210465  T
Q  582 gtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcata 680  Q
    |||| |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  38210466 gtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctctttgtaacgaaactcatcata 38210565  T
Q  681 tagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaat 746  Q
    ||||||||  ||| |||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  38210566 tagtggattggagagctgctctctcccccatactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaat 38210631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 410 - 750
Target Start/End: Original strand, 3314608 - 3314950
Alignment:
Q  410 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 509  Q
    ||||||||| |||||||||  ||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3314608 cttttactataaatatagatattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggtaacaacaaaactagggtttgtata 3314707  T
Q  510 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgaga 608  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||  || |     
T  3314708 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattgggg 3314806  T
Q  609 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcc 706  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||  ||| |||||| ||||||| | | ||||||||||||||||    
T  3314807 ctttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaaattattcatcattatagtgaaacggagggctgctctctcc 3314906  T
Q  707 cccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3314907 cccaaactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 3314950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 409 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 53915830 - 53915488
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 508  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||| || |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||    
T  53915830 acttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaaccttaagatagagggggctgaaacaagggtttaggatgacaacaacaaaactagggtttgtat 53915731  T
Q  509 agagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgag 607  Q
    ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||  |||| | |||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||  || |    
T  53915730 agattttgtctcttgggaacaaacactagggtttgatggttgatttacctt-gtgaaacattattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggg 53915632  T
Q  608 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcc 706  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||||| ||||| | | ||||||||||||||||    
T  53915631 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaatgttactcatcatttagtgaaacggagggctgctctctcc 53915532  T
Q  707 cccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    |||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  53915531 cccagactaggtcaattttgactgaactgggtcaacaaattctt 53915488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 410 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 28102335 - 28101994
Alignment:
Q  410 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 509  Q
    ||||||||| |||||||  | |||||| | || || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28102335 cttttactataaatataagcgttgtattagagtaacccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 28102236  T
Q  510 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgaga 608  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||  || |     
T  28102235 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacgctattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggg 28102137  T
Q  609 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctccc 707  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| |||||| ||||||||||||| | || ||||||||||||||    
T  28102136 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttacttatcatatagtggaacggatggctgctctctccc 28102037  T
Q  708 ccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    | |  |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  28102036 caaagctaggtcaatttggaccaaactaggtcaacaaattctt 28101994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 409 - 749
Target Start/End: Original strand, 51943294 - 51943634
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 508  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||| || |||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51943294 acttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctggagatagagggtgctgaaacaaaggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 51943393  T
Q  509 agagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgag 607  Q
    ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||  || |    
T  51943394 agagtttgtctctttagaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggg 51943492  T
Q  608 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcc 706  Q
     |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| | | || |||||||||||||    
T  51943493 gctttaggtagaattaggcgggagactt-ttcttgtaactcattgacgtctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggatggctgctctctcc 51943591  T
Q  707 cccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 749  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51943592 cccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 51943634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 410 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 5927097 - 5926756
Alignment:
Q  410 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 509  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||   | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  5927097 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagagggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagagtttgtata 5926998  T
Q  510 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgaga 608  Q
    |||||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  || ||    
T  5926997 gagtttgtctatttggaacaaacactagggtttgagggttgattcgcctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggga 5926899  T
Q  609 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctccc 707  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | || ||||||| ||||||||||||||| || | | || | ||||||||||||    
T  5926898 cttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatttatatatcttttgtaaggttactcatcatataatgaaacggatgactgctctctccc 5926799  T
Q  708 ccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5926798 gcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 5926756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 239 - 555
Target Start/End: Original strand, 11162924 - 11163219
Alignment:
Q  239 aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggca 338  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||                     |||    
T  11162924 aatcgtggcacgattgctgggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaattgtg---------------------gca 11163002  T
Q  339 cgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatca 438  Q
    |||||||||| |||| || ||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  11163003 cgatggtgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttacgataaatatagaccttgtatca 11163102  T
Q  439 aagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagg 538  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  11163103 gagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagg 11163202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 410 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 880785 - 880443
Alignment:
Q  410 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 509  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||  | |||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  880785 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagaggggtctgaaacaagagtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtata 880686  T
Q  510 gagtttgtctcttcgg-aagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgag 607  Q
    ||||| ||||||| || || ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  || |    
T  880685 gagttcgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattagcattgagtctcttggttacggaaagagattggg 880587  T
Q  608 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcc 706  Q
     |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||  |   ||||||||||||||||    
T  880586 gctttgggtagaattagacgggagagttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtaaaatggagggctgctctctcc 880487  T
Q  707 cccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    || ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  880486 cctagactaggtcaatttggaccgagctgggtcaacaaattctt 880443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 182; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 476 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 28413299 - 28413027
Alignment:
Q  476 ttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattag 575  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  28413299 ttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggg-aaacactattag 28413201  T
Q  576 gattga-gtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttact 673  Q
    |||||| |||| |||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||    
T  28413200 gattgaagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaact 28413101  T
Q  674 catcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 747  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| | ||||||||||||    
T  28413100 catcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaattaggtcaacaaatt 28413027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 180; E-Value: 8e-97
Query Start/End: Original strand, 508 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 7606822 - 7606580
Alignment:
Q  508 tagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctga 606  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||     
T  7606822 tagagtttgtctcttcggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttggg-aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgg 7606724  T
Q  607 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcc 706  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7606723 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatttctatttgtaacgttactcgtcatatagtggatcggagggctgctctctcc 7606624  T
Q  707 cccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7606623 cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 7606580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 180; E-Value: 8e-97
Query Start/End: Original strand, 332 - 750
Target Start/End: Original strand, 32218941 - 32219350
Alignment:
Q  332 cgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagacct 431  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||  | ||||| | || ||||||||||||    
T  32218941 cgtggcacgatggtgcgctggcagcgaataagagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcagtataaatatagacct 32219040  T
Q  432 tgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaa 531  Q
    ||||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||           |||||||||||| | || |||    
T  32219041 tgtatctgactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactag-----------agtttgtctctttgtaacaaa 32219129  T
Q  532 cactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcggga 630  Q
    ||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||| ||| |||||  || ||||||||| |||||||||||| |    
T  32219130 cactagggtttgaaggttgattcaccttggg-aaacactatcaggattgagtctcttggttgcgggaagagattgggactttgggcagaattaggcggaa 32219228  T
Q  631 gacttattcttgtaaaccattgatttctcttt-gtaa-cgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggac 728  Q
    |||||||| |||||| |||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| | | || |||||||||||| ||||||||| |  |||||||||    
T  32219229 gacttatttttgtaacccattgatatcttttttgtaaacgttactcatcatatagtgaaacggatggctgctctctctcccagactatgccaatttggac 32219328  T
Q  729 cgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  32219329 cgaactgggtcaacaaattctt 32219350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 420 - 701
Target Start/End: Original strand, 6561744 - 6562028
Alignment:
Q  420 aaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtct 519  Q
    ||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6561744 aaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtct 6561843  T
Q  520 cttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtag 618  Q
    ||| |||| ||||||| ||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  || ||||||||||||    
T  6561844 ctttggaacaaacactggggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtag 6561942  T
Q  619 aattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc--tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctc 701  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||| || |||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  6561943 aattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctctttttgtaaggtaactcatcattatagtggagcggagggctgctc 6562028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 409 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 35918283 - 35917944
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 508  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35918283 actttcactataaatatagaccttgtatcatagcaaattttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 35918184  T
Q  509 agagtttgtctcttcgga------agaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagag 601  Q
    |||||||||||||| |||      | ||||||||| ||||| |||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||||    
T  35918183 agagtttgtctctttggaacaaacacaaacactagagtttgagggttgattcacctt-gcgaaacactattagaattgagtctcttggttacgagaagag 35918085  T
Q  602 gctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgct 700  Q
     ||| || ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| | ||| ||||||    
T  35918084 actgggaatttgggtagaaataggagggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcattatatagtggaacggagagctgct 35917985  T
Q  701 ctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaac 742  Q
    ||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  35917984 ctctccctcagact-ggtcaatttagaccgaactggatcaac 35917944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 410 - 750
Target Start/End: Original strand, 36011751 - 36012092
Alignment:
Q  410 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 509  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||| |  | |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||    
T  36011751 cttttactataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagataaagggggctgaaacaaggatttagaaagacaacaacgaaactaaggtttgtata 36011850  T
Q  510 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgaga 608  Q
    |||||||||||||  ||| |||||||| |||||| |||||||||| | || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||  || ||    
T  36011851 gagtttgtctctttagaacaaacactatggtttgagggttgattcacgtt-gggaaacactattaggattgaatatcttggttacgggaagagattgtga 36011949  T
Q  609 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctccc 707  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |     
T  36011950 ctttgggtagaattagttgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacagagggctgctctcttct 36012049  T
Q  708 ccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  36012050 tcagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattctt 36012092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 450 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 47149188 - 47148890
Alignment:
Q  450 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgg-aagaaacactagggtttgtgggt 548  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||| || ||||  |||    
T  47149188 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaaacaaacactgggatttgatggt 47149089  T
Q  549 tgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaac 647  Q
    |||||| ||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||  || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  47149088 tgattcacctt--ggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgggtctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacc 47148991  T
Q  648 cattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaat 746  Q
    ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||||    
T  47148990 cattgatatctcttttgtatcgttactcatcatatagtgaaacagaggactgctctctcccccagactatgtcaatttggcccgaactaggtcaacaaat 47148891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 410 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 53468788 - 53468445
Alignment:
Q  410 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 509  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||  | |||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||    
T  53468788 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaacctttagataaagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaacca-ggtttgtata 53468690  T
Q  510 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgaga 608  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||||  || ||    
T  53468689 gagtttgtctctttggaagaaacactagggtttgagcattgattcacctt-gggaaacactattaggattgaatctcttggttacggggagagattggga 53468591  T
Q  609 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcc 706  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||| | | ||||||||||||  ||    
T  53468590 ctttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctaccc 53468491  T
Q  707 cccag--actaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    |||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53468490 cccagacactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 53468445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 359 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 28761813 - 28761419
Alignment:
Q  359 ataacataaacatatttttggg-tgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagataga 457  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||  | |||||||||| || | || || |||||||||| |||||||||| ||| |||| || |||| ||||||||||    
T  28761813 ataacaaaaacatatttttgggctgagattttgttccaatttatgagggatacttttactataaatatagactttgcatcagagtaaaccttgagataga 28761714  T
Q  458 gggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctcc 557  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | || |||||| |||||||| | |||||||| ||    
T  28761713 gggggttgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatatagtttg-ctcttggcaacaaacacaagggtttgagagttgattcacc 28761615  T
Q  558 ttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgattt 656  Q
    || || |||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||   ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |    
T  28761614 tt-ggaaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagatattgagactttaggtagaattaggcgggatacttattcttgtaacccattgatat 28761516  T
Q  657 ctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt-aaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    ||| ||||||| ||||||||||| ||||||| | | |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| |||||||||||    
T  28761515 ctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggaggactgctctctcccccagactaggtcaattttggatcgaactgggtaaacaaattctt 28761419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 167; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 450 - 706
Target Start/End: Original strand, 29956650 - 29956907
Alignment:
Q  450 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggtt 549  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||| |||| |||||    
T  29956650 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaattcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacattaggttttgagggtt 29956749  T
Q  550 gattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaacc 648  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  29956750 gattcacctt-gggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactc 29956848  T
Q  649 attgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcc 706  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  29956849 attgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcc 29956907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 239 - 486
Target Start/End: Original strand, 1321194 - 1321441
Alignment:
Q  239 aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatg-gaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggc 337  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||  |||||||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1321194 aatcgtggcacgattgctgggcaacgtggcacgattagaggtttcaagttt-gaggcaaagcactgaaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggc 1321292  T
Q  338 acgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatc 437  Q
    ||||||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||    
T  1321293 acgatggtgtgctggcagcgaaaaacagaaacatatttttgagtgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagactttgtatc 1321392  T
Q  438 aaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggca 486  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1321393 agagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggca 1321441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 411 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 51675087 - 51674758
Alignment:
Q  411 ttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 510  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||        
T  51675087 ttttactataaatatagacgttgtatcaatgtaaacgttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactaaggtttgt---- 51674992  T
Q  511 agtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagac 609  Q
           | ||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||  || ||     
T  51674991 -------ccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgga-aaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattgggat 51674900  T
Q  610 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccc 708  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| || |   ||||||||||||||||||    
T  51674899 tttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaatgttactcatcatatactgaaatggagggctgctctctcccc 51674800  T
Q  709 cagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    || || |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  51674799 cataccaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattctt 51674758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 150; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 409 - 750
Target Start/End: Original strand, 39715393 - 39715730
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 508  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||||  | |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  39715393 acttttgctataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggg-ctgaaataagggtttagagaggcaacaccaaaactagggtttgtat 39715491  T
Q  509 agagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgag 607  Q
    ||||||||||| || | || ||||||||||||||| |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  || |    
T  39715492 agagtttgtctatttgaaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt-gagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggg 39715590  T
Q  608 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcc 706  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||| ||||||||||  |||||| | |||| || ||  ||||||    
T  39715591 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgcaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatc--atagtgaaacagatggttg--ctctcc 39715686  T
Q  707 cccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    |||| ||||| | | |||||||| |||| |||||||||||||||    
T  39715687 cccatactagatcattttggaccaaactaggtcaacaaattctt 39715730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 409 - 747
Target Start/End: Original strand, 42992205 - 42992532
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 504  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||    |||||||    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  42992205 acttttactataaatatataccttgtatcatgctaaactttaagagagatagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagggttt 42992304  T
Q  505 gtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggc 603  Q
    |||||||||||||||||| | || |||||||||| |||| |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||      
T  42992305 gtatagagtttgtctctttgaaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt-gagaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagag 42992403  T
Q  604 tgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctct 702  Q
    || ||||||||||||               ||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||||||||||    
T  42992404 tg-gactttgggtag---------------ttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttagtcatcatatagtgaatcggggggctgctct 42992487  T
Q  703 ctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 747  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42992488 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 42992532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 410 - 764
Target Start/End: Complemental strand, 54691906 - 54691551
Alignment:
Q  410 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 509  Q
    ||||||||| |||||||| | |||||||| || |||| || |||||||||||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  54691906 cttttactataaatataggctttgtatcagagtaaaccttaagatagaggggg-taaaacaaggttttagaaaggcgacaacaaaactagggtttgtata 54691808  T
Q  510 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtcttt-ggttacggaaagaggctgaga 608  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| | ||| ||||| || |||||  |  |     
T  54691807 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggg-aaacactattaggattgaattttttggttatgggaagagattaggg 54691709  T
Q  609 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctccc 707  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||  | | |||||||||||||||||    
T  54691708 ctttgagttgaattaggcgggagacttattcttgtatttcattgatatctcttttgtaacgttacccatcatatagttaaacggagggctgctctctccc 54691609  T
Q  708 ccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttgtat-ttttctcttc 764  Q
    | |||||| || |||||| || ||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||    
T  54691608 ctagactatgtcaatttgaactgaactaggtcgacaaattcttttatgttttctcttc 54691551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 410 - 736
Target Start/End: Complemental strand, 890104 - 889779
Alignment:
Q  410 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 509  Q
    ||||||||| |||||||||  ||||||||  | |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||||    
T  890104 cttttactataaatatagatattgtatcagtgtaaaccttgagatagaggaagctgaaacaagggtttagaatggcaacaa--aacctagggtttgtata 890007  T
Q  510 gagtttgtctcttcgg-aagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgag 607  Q
    |||||||||| || || || ||||||| |||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  || |    
T  890006 gagtttgtctatttggcaacaaacactggggtttgatggttgattcaccttggg-aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagt-tggg 889909  T
Q  608 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcc 706  Q
     |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| |||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| | | |||||||| | |||||    
T  889908 gctttgggtagaattaggcaggagagttattcttgtaacccactgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgatttctcc 889809  T
Q  707 cccagactaggtaaatttggaccgaactgg 736  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||    
T  889808 cgcagactaggtcaatttggaccgaactgg 889779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 409 - 750
Target Start/End: Original strand, 23633383 - 23633718
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 508  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| | |||||| |||||||||||||||||    
T  23633383 acttttactataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagagagggctaaaacaaggatttagaa-gccaacaagaaaactagggtttgtat 23633481  T
Q  509 agagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgag 607  Q
    || ||||| ||||| | || ||||||||||||| |  ||||||||  ||   ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||  ||||    
T  23633482 agtgtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgatttacc---gggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgag 23633575  T
Q  608 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcc 706  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |   |||||||||||||| |    
T  23633576 actttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccgatgatatctctttgtaaagttactcatcattatagtgaaaaggagggctgctctct-c 23633674  T
Q  707 cccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| ||||| |||||||||||    
T  23633675 cccagactaggtcaatttagaccgaaatgggtaaacaaattctt 23633718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 562 - 750
Target Start/End: Original strand, 5886274 - 5886463
Alignment:
Q  562 ggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctct 660  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||  || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  5886274 ggaaacactattagggttgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttgtct 5886373  T
Q  661 ttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5886374 ttgaaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 5886463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 562 - 750
Target Start/End: Original strand, 5899747 - 5899936
Alignment:
Q  562 ggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctct 660  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| |  || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5899747 ggaaacactattagggttgagtctcttggttacgggaagtgattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 5899846  T
Q  661 ttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5899847 ttgcaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 5899936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 410 - 641
Target Start/End: Complemental strand, 28100374 - 28100143
Alignment:
Q  410 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 509  Q
    ||||||||| |||||||  | |||||||| || || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28100374 cttttactataaatataagcgttgtatcagagtaacccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 28100275  T
Q  510 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtc-tttggttacggaaagaggctgaga 608  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| || |||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||  || |     
T  28100274 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt-ggaaaacgctattaggattgagtcttttggttacgggaagagattgggg 28100176  T
Q  609 ctttgggtagaattaggcgggagacttattctt 641  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28100175 ctttgggtagaattaggcgggagacttattctt 28100143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 499 - 750
Target Start/End: Original strand, 6484372 - 6484625
Alignment:
Q  499 gggtttgtatagagtttgtctcttcgg-aagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacgga 596  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||     
T  6484372 gggtttgtgtagagtttgtctcttcggcaacaaataccggggtttgagggttgattcaccttggg-aaacactattaggtttgagtctcttggttacggg 6484470  T
Q  597 aagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcagaggg 695  Q
    |||||  || |  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||| | | |||||    
T  6484471 aagagattggggttttgggtagaattaggcgggaaacttattcttgtaacccattgatatcttttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggaggg 6484570  T
Q  696 ctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6484571 ctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 6484625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 537 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 25688367 - 25688152
Alignment:
Q  537 gggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagactt 635  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25688367 gggtttgagggttgattcaccttggg-aaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagactt 25688269  T
Q  636 attcttgtaaaccattgatttctcttt-gtaa-cgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaac 733  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25688268 attcttgtaacccattgatatctcttttgtaaacgttacgcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaac 25688169  T
Q  734 tgggtcaacaaattctt 750  Q
    |||||||| || |||||    
T  25688168 tgggtcaaaaagttctt 25688152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 239 - 585
Target Start/End: Original strand, 24177032 - 24177374
Alignment:
Q  239 aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggc 337  Q
    |||||||||||| | ||| |||||||||||||||| ||  ||||||||| | || ||||| |||||||||||  ||||||||||||| |||||  |||||    
T  24177032 aatcgtggcacgtttgcagggcaacgtggcacgattggttgtttcagttct-gaagcaagtcactggaaaaaatgtggcacgatgggatcgcaatgtggc 24177130  T
Q  338 acgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatc 437  Q
    ||||||||||| |||  || || ||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||||||||||||||    
T  24177131 acgatggtgcgttggaggcgaaaaacataaacgtatttttaagtgcagatttgttccaaattttaagggatacttttattataaatatagaccttgtatc 24177230  T
Q  438 aaagcaaactttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacacta 536  Q
    | || |||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | | |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||    
T  24177231 atagtaaacattgagctagagggggctgaaaacaagagtttag-atgtcaacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacacta 24177328  T
Q  537 gggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct 585  Q
     ||||   |||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||    
T  24177329 aggtt--ggggttgattcacctt-ggaaaacactattaggattgagtct 24177374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 561 - 750
Target Start/End: Original strand, 11168175 - 11168366
Alignment:
Q  561 gggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc 659  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11168175 gggaaacactattaggattgagtgtcttggttacgggaagaggctgggaatttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgatttctc 11168274  T
Q  660 ttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    ||| ||||||||||| |||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  11168275 ttttgtaacgttacttatcatatattggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccaaacttggtcaacaaattctt 11168366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 410 - 744
Target Start/End: Original strand, 53591119 - 53591442
Alignment:
Q  410 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 509  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||| |  | |||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||       
T  53591119 cttttactataaatatagacattgtataagtgtaaaccttgagatagaggaggctgaaacaagagtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgt--- 53591215  T
Q  510 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgaga 608  Q
            |||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||| | ||||||||| |||||||||  || ||  |  ||    
T  53591216 --------ctctttagaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggg-aaacactattcgaattgagtctcttggttacgagaatagatttgga 53591306  T
Q  609 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctccc 707  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | |  |||| |||||||| ||    
T  53591307 ttttgggtagaattaggcgggagacttattcttctaatccattgatatctcatttgtaacgttactcatcatatagtgaaacgaagggatgctctct-cc 53591405  T
Q  708 ccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 744  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||    
T  53591406 ccagactaggtcaatttggatcgaactaggtcaacaa 53591442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 410 - 749
Target Start/End: Original strand, 31151271 - 31151609
Alignment:
Q  410 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 507  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| | | |||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  31151271 cttttactataaatatagactttgtatcagatgtaaacctcgagatagagggggctgaaaacaagggtttagaaat-caacaagaaaactagggtttgta 31151369  T
Q  508 tagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctga 606  Q
    ||||||||| ||||| | || |||||| |||||| |  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||| || ||  ||     
T  31151370 tagagtttg-ctcttggcaacaaacaccagggttgg--ggttgattcaccttggg-aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaaaagattgg 31151465  T
Q  607 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactca-tcatatagtggatcagagggctgctctct 704  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  |||| |||| ||||||| |||||||| |  ||||||||| | ||||||||||||||    
T  31151466 gactttgggtagaattaggcgggtgacttattcttgtaaccc--tgatatctcttttgtaaagttactcattgttatagtggaacggagggctgctctct 31151563  T
Q  705 cccccagactaggt-aaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 749  Q
    |||||||||||||| |  ||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  31151564 cccccagactaggtcagttttgggctgaactgggtaaacaaattct 31151609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 410 - 641
Target Start/End: Original strand, 28180948 - 28181177
Alignment:
Q  410 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 509  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28180948 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaata--ggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtata 28181045  T
Q  510 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgaga 608  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||| || |||| ||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||  || ||    
T  28181046 gagtttgtctctttggaacaaacactgggatttgagggttgattc-actttgggaaacaccattaggattgagtctattggttacgggaagagattggga 28181144  T
Q  609 ctttgggtagaattaggcgggagacttattctt 641  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  28181145 ctttggatagaattaggcgggagacgtattctt 28181177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 206 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 6064006 - 6063808
Alignment:
Q  206 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgga 305  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  |||||||||||| |    
T  6064006 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttatgcagaatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacaatggaggttttagttttttgggcaaggcactgaa 6063907  T
Q  306 aaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagc 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| |  || || | ||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  6063906 aaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtggactggcggataaaaata-aaacatatttttgggtgcagatttgttacagattttaagc 6063808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 449 - 750
Target Start/End: Original strand, 4666488 - 4666779
Alignment:
Q  449 tgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggt 548  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||           |||||   || | ||||||||||||| ||||    
T  4666488 tgagatagagggggctgaaagaagggtctagtaagacaacaacaaaaatagggtttgt-----------ctcttgacaacagacactagggtttgagggt 4666576  T
Q  549 tgattctccttggggaaacactattaggattgagtcttt-ggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggaga--cttattcttgtaa 645  Q
    ||||||  |||||| ||||||||||| |||||||||| | |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  4666577 tgattcatcttggg-aaacactattatgattgagtctctaggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagatccttattcttgtaa 4666675  T
Q  646 accattgatttctcttt-gtaacgttactcatcat-atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaaca 743  Q
     |||||||| ||||||| |||| |||||||||||| |||||| | | |||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  4666676 tccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctc---cccagactaggtcaatttggaccgaactggatcaaca 4666772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 409 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 13420506 - 13420189
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 508  Q
    |||||||||| ||||||||   |||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||          ||  ||||||||||||||||    
T  13420506 acttttactataaatataggttttgtatcaaagcaaaccttgagatataggaggctgaaacaagggttta----------aatcaaactagggtttgtat 13420417  T
Q  509 agagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgag 607  Q
    ||||||| |||||  | || |||||||||||||   | |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||  ||||    
T  13420416 agagttt-tctctaggcaacaaacactagggtt---gagttgattcaccttggg-aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgag 13420322  T
Q  608 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctc 705  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||| ||||||||| | |||| |||| | ||| ||||||||||     
T  13420321 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactcattattataatggaacggagagctgctctct- 13420223  T
Q  706 ccccagactaggt-aaatttggaccgaactgggt 738  Q
    | ||||||||||| |  ||||||||||| |||||    
T  13420222 caccagactaggtcagttttggaccgaaatgggt 13420189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 410 - 687
Target Start/End: Original strand, 54884081 - 54884357
Alignment:
Q  410 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 509  Q
    ||||||| | ||||||| || ||| ||||  | |||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||    
T  54884081 cttttaccataaatataaacattggatcattgtaaaccttgagatagagggagctcgaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagaatttg--ta 54884178  T
Q  510 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgaga 608  Q
    |||||||| |||| |||| |||||||||||||||  |||||||||  ||| || |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||| |    
T  54884179 gagtttgtttctttggaacaaacactagggtttgatggttgattcatctt-ggaaaacactattaggattgagtctcttggttacagaaagagattgaaa 54884277  T
Q  609 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtgga 687  Q
    |||||  |||||||||| |||||||||||| |||||| | |||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  54884278 ctttgaatagaattaggagggagacttatt-ttgtaatctattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgga 54884357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 534 - 750
Target Start/End: Original strand, 6231849 - 6232065
Alignment:
Q  534 ctagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggaga 632  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||  |||||||| |||||||||| |||||  || || |||||||||||||||||||||||    
T  6231849 ctagggtttgagggttgattcaccttggg-aaacactattagtgttgagtctcttggttacgggaagagattggga-tttgggtagaattaggcgggaga 6231946  T
Q  633 cttattcttgtaaaccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcat-atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccg 730  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| | |||||||||| | |||| | | |||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||    
T  6231947 cttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagctactcatcattacagtgaa-cggagggctgctgtctccccccgattaggtcaatttggaccg 6232045  T
Q  731 aactgggtcaacaaattctt 750  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  6232046 aactgggtcaacaaattctt 6232065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 223 - 405
Target Start/End: Original strand, 5899476 - 5899657
Alignment:
Q  223 aatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatg 322  Q
    |||||| ||| ||||||||| ||||||||| | | ||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5899476 aatcaggtttctgcataatcatggcacgattgaagggcaacgtggcacgatggatgttttagttttttaggcaaggcactggaaaaatcatggcacgatg 5899575  T
Q  323 gggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagc 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||  || || | |||| ||||||||||| || ||||||| || |||||||||    
T  5899576 gggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcagataaaaata-aaacgtatttttgggtacagatttgttacagattttaagc 5899657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 609 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 27635792 - 27635650
Alignment:
Q  609 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctccc 707  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||  ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  27635792 ctttgggtaaaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccc 27635693  T
Q  708 ccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27635692 ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 27635650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 409 - 738
Target Start/End: Original strand, 53597164 - 53597491
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 508  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||  ||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  53597164 acttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagataga-ggggatgaaacaagggttta-taagtcaacaagaaaactaggggttgtat 53597261  T
Q  509 agagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgag 607  Q
    ||||||| |||||| | || |||||||||||||     |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| | |  || ||  ||||    
T  53597262 agagttt-tctcttggcaacaaacactagggtt--gaagttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggtcatgagaatagattgag 53597357  T
Q  608 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctc 705  Q
    | |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||| | || ||||||| ||||||||||| |||||||||   ||||| |||||||||    
T  53597358 attttgagtagaattaggcaagagacttattcttgtaacccgttgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggagggttgctctctc 53597457  T
Q  706 ccccagactaggtaaat-ttggaccgaactgggt 738  Q
    || || ||||||| | | |||||||||| |||||    
T  53597458 ccacaaactaggtcagtattggaccgaattgggt 53597491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 493 - 749
Target Start/End: Original strand, 17795269 - 17795523
Alignment:
Q  493 aaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggtt 591  Q
    ||||||| || ||||||||||||| || || | || |||||||||||||   |||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||     
T  17795269 aaactagagtctgtatagagtttg-cttttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcactttgggaaaa-actattaggattgagtctcttggtc 17795363  T
Q  592 acggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatc 689  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||| || | |    
T  17795364 acggaaagagattgaggctttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattataatgaaac 17795463  T
Q  690 agagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 749  Q
     || ||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||| | ||| ||||||||||    
T  17795464 ggaaggctgctctctcccctagactaggtcaatttgaaccgaattaggtaaacaaattct 17795523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 493 - 749
Target Start/End: Original strand, 19103709 - 19103963
Alignment:
Q  493 aaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggtt 591  Q
    ||||||| || ||||||||||||| || || | || |||||||||||||   |||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||     
T  19103709 aaactagagtctgtatagagtttg-cttttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcactttgggaaaa-actattaggattgagtctcttggtc 19103803  T
Q  592 acggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatc 689  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||| || | |    
T  19103804 acggaaagagattgaggctttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattataatgaaac 19103903  T
Q  690 agagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 749  Q
     || ||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||| | ||| ||||||||||    
T  19103904 ggaaggctgctctctcccctagactaggtcaatttgaaccgaattaggtaaacaaattct 19103963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 411 - 662
Target Start/End: Original strand, 23636952 - 23637199
Alignment:
Q  411 ttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 510  Q
    ||||| || ||||||| || |||||||| || |||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  23636952 ttttaatataaatatatactttgtatcagagtaaaccttgagatagaggaggctaaaacaagggtttag-aagccaacaagaaaactagggtttgtatag 23637050  T
Q  511 agtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagac 609  Q
    ||| || ||||| | || |||||||||||||  ||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||| ||| | | || ||||   |  |||    
T  23637051 agtctg-ctcttggcaacaaacactagggtt--tgggttgatttacctt-gagaaacactattaggattgagtctcttgttcatgggaagatattaggac 23637146  T
Q  610 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctcttt 662  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  23637147 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttt 23637199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 457 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 562058 - 561769
Alignment:
Q  457 agggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctc 556  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||  ||| |||||||||||||||||||| |||||| | || |||||||||||||    ||||||||| |    
T  562058 agggggttgaaacaagggtttagaa-gtcaacatgaaa-ctagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacaaacactagggtt--caggttgattcac 561964  T
Q  557 cttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatt 655  Q
     || ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||  |||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||     
T  561963 att-gggaaacactattaggatttagtctcttggtcacgtgaagagattgagactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaagtcattgata 561865  T
Q  656 tc-tctttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctccc-ccagactaggt-aaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 747  Q
    || | ||||||| ||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||| |||| ||||||||    
T  561864 tcttttttgtaaagttactcatcattatagtggaacgaagggctgctctctccctccagactaggtcagttttggaccgaaccgggtaaacaaatt 561769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 205 - 353
Target Start/End: Original strand, 50493675 - 50493823
Alignment:
Q  205 atgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgg 304  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||    
T  50493675 atgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgatagctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgg 50493774  T
Q  305 aaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggc 353  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  50493775 aaaaatcgtggcacgatggagtctcatcgtggcacgatggtgcgctggc 50493823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 410 - 634
Target Start/End: Complemental strand, 28137628 - 28137415
Alignment:
Q  410 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 509  Q
    ||||||||| |||||||  | |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||    
T  28137628 cttttactataaatatatgcgttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaac-----------ta 28137540  T
Q  510 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgaga 608  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| || ||||||| |||| ||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||  || |     
T  28137539 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaggattgattcacctt-gggaaacactattaggatgaagtctcttggttacgggaagagattgggg 28137441  T
Q  609 ctttgggtagaattaggcgggagact 634  Q
    |||||||||||||||||||| |||||    
T  28137440 ctttgggtagaattaggcggaagact 28137415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 206 - 353
Target Start/End: Original strand, 38210067 - 38210214
Alignment:
Q  206 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgga 305  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  38210067 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 38210166  T
Q  306 aaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggc 353  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  38210167 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatagtgcgctggc 38210214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 458 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 36871583 - 36871295
Alignment:
Q  458 gggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctcc 557  Q
    ||||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| | || |||||| |||||| |  | ||||||| ||    
T  36871583 gggggctgaaacaagggtttacaa-gccaacaagaaaactagggcttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacaccagggttag--gattgattcacc 36871488  T
Q  558 ttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaaaccattgatt 655  Q
    ||||  ||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||||  || |||||||||||||||||||   || |||||||||||| || || ||| |     
T  36871487 ttgga-aaacactgttaagattgagtctcttggtcacggaaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgcaaccctttgtta 36871389  T
Q  656 tctctttgtaacgttactcatcat-atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 747  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||| ||||    
T  36871388 tctctttgtaaagttaatcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacgaatt 36871295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 613 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 47701801 - 47701663
Alignment:
Q  613 gggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccag 711  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||    
T  47701801 gggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccag 47701702  T
Q  712 actaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    | ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  47701701 attaggtcaatttggatcgaactggatcaacaaattctt 47701663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 222 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 10192513 - 10192401
Alignment:
Q  222 aaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgat 321  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10192513 aaatcagatttatgcggaatcgtggcacgatcgcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcag-ttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgat 10192415  T
Q  322 ggggtcgcatcgtg 335  Q
    ||| ||||||||||    
T  10192414 gggatcgcatcgtg 10192401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 411 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 27635959 - 27635830
Alignment:
Q  411 ttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 510  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  27635959 ttttactacaaatatagaccttgaattagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgcaaacaacaaaactagggtttgtatag 27635860  T
Q  511 agtttgtctcttcggaagaaacactagggt 540  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  27635859 agtttgtctcttgggaacaaacactagggt 27635830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 206 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 53896754 - 53896613
Alignment:
Q  206 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgga 305  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||    
T  53896754 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgattgctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggtactgga 53896655  T
Q  306 aaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgc 347  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  53896654 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgc 53896613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 206 - 405
Target Start/End: Original strand, 5885983 - 5886182
Alignment:
Q  206 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaa-cgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgg 304  Q
    ||||||| ||||||| |||| || ||| | || |||||||||||||| | |  |||| |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||| |||||    
T  5885983 tgtgagagttaacttaaaattaggtttttacagaatcgtggcacgattgaagcgcaaacgtggcacgatggatgttttagttttttaggcaaggtactgg 5886082  T
Q  305 aaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaag 404  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  || || | |||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  5886083 aaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggtacgatggtgcgctggcagataaaaata-aaacgtatttttgggtgcaaatttgttacagattttaag 5886181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 451 - 579
Target Start/End: Original strand, 41849117 - 41849244
Alignment:
Q  451 agatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttg 550  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  41849117 agatagagggggctgaaacaagggtttagaataacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttg 41849216  T
Q  551 attctccttggggaaacactattaggatt 579  Q
    |||| |||| ||||||| |||||||||||    
T  41849217 attcacctt-gggaaactctattaggatt 41849244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 493 - 747
Target Start/End: Original strand, 25635391 - 25635644
Alignment:
Q  493 aaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggtt 591  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||| | || ||||||||||||| |  | ||| ||| ||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||     
T  25635391 aaactagggtttgtatatagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--gattggttcaccttggg-aaacactattaggatttagtctcttggtc 25635486  T
Q  592 acggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttct-ctttgtaacgttactcatca-tatagtggatc 689  Q
    |||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||  ||||||| ||||||||||| ||| ||| | |    
T  25635487 acgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctattttgtaaagttactcatcattatggtgaaac 25635586  T
Q  690 agagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 747  Q
    |||||| ||||||||||||  | |||||  |||||||||| ||||| || ||||||||    
T  25635587 agagggttgctctctcccctcggctaggccaatttggaccaaactgcgtaaacaaatt 25635644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 410 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 47701928 - 47701798
Alignment:
Q  410 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 509  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||  | |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47701928 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagataaagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 47701829  T
Q  510 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggt 540  Q
    |||||||||| || |||| |||||| |||||    
T  47701828 gagtttgtctatttggaacaaacaccagggt 47701798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 263 - 405
Target Start/End: Original strand, 25388654 - 25388795
Alignment:
Q  263 cgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataa 362  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  || ||    
T  25388654 cgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggcagataaaaa 25388753  T
Q  363 cataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagc 405  Q
     | ||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||    
T  25388754 ta-aaacatatttttgggagcagatttgttacagattttaagc 25388795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 222 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 10085593 - 10085481
Alignment:
Q  222 aaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgat 321  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10085593 aaatcagatttatgcggaatcgtggcatgatcgcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcag-ttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgat 10085495  T
Q  322 ggggtcgcatcgtg 335  Q
    ||| || |||||||    
T  10085494 gggatcacatcgtg 10085481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 411 - 539
Target Start/End: Original strand, 6231374 - 6231502
Alignment:
Q  411 ttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 510  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||  | |||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6231374 ttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaatcttgagatagagcgggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 6231473  T
Q  511 agtttgtctcttcggaagaaacactaggg 539  Q
    |||||||||||| | || |||||||||||    
T  6231474 agtttgtctcttggcaacaaacactaggg 6231502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 669 - 750
Target Start/End: Original strand, 41849243 - 41849324
Alignment:
Q  669 ttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41849243 ttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 41849324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 565 - 750
Target Start/End: Original strand, 3306839 - 3307025
Alignment:
Q  565 aacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-ttt 662  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||   ||    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| |||    
T  3306839 aacactattaggattgagtctcttggttacagaaagatattggagttttgggtagaattaggcgggagagttattcttgtaacccattgatatctctttt 3306938  T
Q  663 gtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |   || || ||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  3306939 gtaaagttactcatcattatagtgaaaaggatggttgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactaggttaacaaattctt 3307025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 411 - 527
Target Start/End: Original strand, 3306724 - 3306840
Alignment:
Q  411 ttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 510  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||  | |||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||    
T  3306724 ttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaacctagagatatagggggctgaaacaagggtttagaaatacaacaacaaaactaggatttgaatag 3306823  T
Q  511 agtttgtctcttcggaa 527  Q
    |||||||||||| ||||    
T  3306824 agtttgtctctttggaa 3306840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 678 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 35919179 - 35919107
Alignment:
Q  678 atatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35919179 atatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 35919107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 607 - 747
Target Start/End: Original strand, 24181501 - 24181644
Alignment:
Q  607 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctct 704  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | || ||||||| ||||||||||| ||||||||| | || | |||||||||    
T  24181501 gactttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatgactgctctct 24181600  T
Q  705 cccccagactaggt-aaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 747  Q
    || ||| ||||||| |  ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  24181601 cctccaaactaggtcagttttggaccgaattgggtaaacaaatt 24181644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 206 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 6719651 - 6719532
Alignment:
Q  206 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat---ggaggtttcagtttttgaggcaaggcact 302  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||||| | | |||| |||||||||||    ||||||||||||||| |||||| |||||    
T  6719651 tgtgagaattaacttaaaatcaggtttctgcttaatcgtggcacgattgaagggcatcgtggcacgattggagaggtttcagttttt-aggcaatgcact 6719553  T
Q  303 ggaaaaatcgtggcacgatgg 323  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  6719552 ggaaaaatcgtggcacgatgg 6719532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 678 - 748
Target Start/End: Complemental strand, 53894121 - 53894051
Alignment:
Q  678 atatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 748  Q
    ||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  53894121 atatattggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 53894051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 409 - 654
Target Start/End: Original strand, 1673898 - 1674140
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgagatagagggggctgaaac-aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 506  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||| | |||| ||||  ||||| |  ||||||  |||||||||||| |  ||||| |||||||| ||||||    
T  1673898 acttttactataaatatagaacttgtatcaaaagtaaaccttgatgtagagagt-ctgaaaataagggtttagaa-gttaacaagaaaactagtgtttgt 1673995  T
Q  507 atagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctg 605  Q
    ||| |||||| ||||| | || ||||||||||||| |  | ||||||| || |||| |||||||||||||||||||||| ||| | |||| |||||  ||    
T  1673996 atatagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttag--gattgattcaccatggg-aaacactattaggattgagtctcttgatcacgggaagagattg 1674091  T
Q  606 agactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgat 654  Q
     |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| || |||||    
T  1674092 ggactttgggtagaaatagacgggagacttattcgtgtaaccctttgat 1674140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 206 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 7606963 - 7606880
Alignment:
Q  206 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagttttt 289  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||| |||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7606963 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtgacacgatggctgggcaacgtggcacgatggaggtttcagttttt 7606880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 567 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 29914132 - 29913947
Alignment:
Q  567 cactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaaaccattgatttctctttgt 664  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||   || |||| ||||||||||  ||   || |||||||||    
T  29914132 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttgt 29914037  T
Q  665 aacgttactcatcat-atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt-aaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttgt 752  Q
    || |  ||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| |   || ||||||||||||| |||||||||||||    
T  29914036 aaagaaactcatcattatagtggatcgaagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattcttgt 29913947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 386 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 53896553 - 53896475
Alignment:
Q  386 atttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggct 464  Q
    ||||||| || |||||||||   ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53896553 atttgttacagattttaagcaggactttcactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggct 53896475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 564 - 718
Target Start/End: Complemental strand, 1620642 - 1620485
Alignment:
Q  564 aaacactattaggattgagtcttt-ggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaaaccattgatttctctt 661  Q
    ||||||||||||||||  |||||| ||| |||| |||||  || |||||||||||||||||||   || | ||  ||||||||| || ||||| ||||||    
T  1620642 aaacactattaggattaggtcttttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaaggctagttcttgtaaccctttgatatctctt 1620543  T
Q  662 tgtaacgttactcatcat-atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt 718  Q
    |||||  ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||    
T  1620542 tgtaaacttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccctagactaggt 1620485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 409 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 4560599 - 4560502
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 506  Q
    ||||| |||| || |||||||  ||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  4560599 actttcactataagtatagactatgtatcatagtaaacattgagatagagggggctgaaacaatggtttataaaggtaacaacaaaactagagtttgt 4560502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 629 - 747
Target Start/End: Original strand, 25634030 - 25634150
Alignment:
Q  629 gagacttattcttgtaaaccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcat-atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttgg 726  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| |||||||||||| |||||| | |  | ||||||||||||| ||||||||||  ||||||     
T  25634030 gagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacgaatggctgctctctccaccagactaggacaatttgc 25634129  T
Q  727 accgaactgggtcaacaaatt 747  Q
    |||||||| ||| ||||||||    
T  25634130 accgaactaggtaaacaaatt 25634150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 564 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 10094256 - 10094056
Alignment:
Q  564 aaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctt 661  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||  |||   | ||||||    
T  10094256 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctctt 10094161  T
Q  662 tgtaacgttactca-tca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt-aaatttggaccgaactgggtcaacaaat-tcttgtatttt 757  Q
    ||||| |  ||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |   || ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  10094160 tgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatatcttgtgtttt 10094061  T
Q  758 tctct 762  Q
    |||||    
T  10094060 tctct 10094056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 564 - 718
Target Start/End: Original strand, 5858546 - 5858699
Alignment:
Q  564 aaacactattaggattgagtctttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaaaccattgatttctcttt 662  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||   || |||| ||||||||||  ||   || |||||||    
T  5858546 aaacactattaggattgagtctt-ggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctcttt 5858640  T
Q  663 gtaacgttactcat--cat-atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt 718  Q
    |||| |  ||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5858641 gtaaagaaactcatatcattatagtggatcagagagctgctctctcccccagactaggt 5858699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 386 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 6719468 - 6719396
Alignment:
Q  386 atttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagag 458  Q
    ||||||| || ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  6719468 atttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagag 6719396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 264 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 6066254 - 6066195
Alignment:
Q  264 gtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatgg 323  Q
    |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6066254 gtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactggaaacatcgtggcacgatgg 6066195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 330 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 6719546 - 6719471
Alignment:
Q  330 atcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagc 405  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||    
T  6719546 atcgtggcacgatggtgcgctggcggcgaataacagaaacatatttttgggtgcagatttgatacagattttaagc 6719471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 465 - 714
Target Start/End: Original strand, 13419864 - 13420110
Alignment:
Q  465 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttgggga 564  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||| | || |||||||||||||   || ||||||| |||| ||||    
T  13419864 gaaacaaaggttta-aaagccaacaagaaaactagggtttg--tagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt--gggattgattcacctt-ggga 13419956  T
Q  565 aacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa-accattgatttctctt 661  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||  | | | ||||||||||||| ||  || ||| | ||| |||||| |   ||||| ||||||    
T  13419957 aacactattaggatcaagtctcttggtcacggaaagagattcaaattttgggtagaatttggttggaagaataatttttgtaacatttttgatatctctt 13420056  T
Q  662 tgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagact 714  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||  || || || ||||||||||||||||    
T  13420057 tgtaaagttactcatcattatagtggaatagtggactcctctctcccccagact 13420110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 564 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 10100273 - 10100073
Alignment:
Q  564 aaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaaaccattgatttctctt 661  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||   || |||| ||||||| ||  ||||    ||||||    
T  10100273 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtaaaattaggtttgaagactgattcttgaaactcatta---tctctt 10100178  T
Q  662 tgtaacgttactcat-cat-atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt-aaatttggaccgaactgggtcaacaaat-tcttgtatttt 757  Q
    ||||| |  |||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |   || ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  10100177 tgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatatcttgtgtttt 10100078  T
Q  758 tctct 762  Q
    |||||    
T  10100077 tctct 10100073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 564 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 10201136 - 10200936
Alignment:
Q  564 aaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctt 661  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||  |||   | ||||||    
T  10201136 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctctt 10201041  T
Q  662 tgtaacgttactca-tca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt-aaatttggaccgaactgggtcaacaaat-tcttgtatttt 757  Q
    || || |  ||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |   || ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  10201040 tggaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatatcttgtgtttt 10200941  T
Q  758 tctct 762  Q
    |||||    
T  10200940 tctct 10200936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 567 - 752
Target Start/End: Original strand, 10897008 - 10897195
Alignment:
Q  567 cactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaaaccattgatttctctttgt 664  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||   || |||| ||||||||||  ||   || |||||||||    
T  10897008 cactattaggattgattctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttgt 10897103  T
Q  665 aacgttactcat--cat-atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt-aaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttgt 752  Q
    || |  ||||||  ||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |   || ||||||||||||| |||||||||||||    
T  10897104 aaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattcttgt 10897195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 567 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 47878350 - 47878163
Alignment:
Q  567 cactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaaaccattgatttctctttgt 664  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||   || |||| ||||||||||  ||   || |||||||||    
T  47878350 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttgt 47878255  T
Q  665 aacgttactcat--cat-atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaat-ttggaccgaactgggtcaacaaattcttgt 752  Q
    || |  ||||||  ||| |||||||| | ||| |||||||||||| ||||||||||| | | || ||||||||||||| |||||||||||||    
T  47878254 aaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcctccagactaggtcattattagaccgaactgggtaaacaaattcttgt 47878163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 680 - 744
Target Start/End: Original strand, 1736324 - 1736388
Alignment:
Q  680 atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 744  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  1736324 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 1736388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 680 - 744
Target Start/End: Original strand, 18552902 - 18552966
Alignment:
Q  680 atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 744  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  18552902 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 18552966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 680 - 744
Target Start/End: Original strand, 30709809 - 30709873
Alignment:
Q  680 atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 744  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  30709809 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 30709873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 548 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 14634638 - 14634504
Alignment:
Q  548 ttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaa 645  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| || || |||  |||||  ||||||||||||||| ||||||   || |||| ||||||||||    
T  14634638 ttgattcaccttggg-aaacactattaggattgtgtctcttagtcacgagaagagattgagactttgggtagcattaggtttgaagactgattcttgtaa 14634540  T
Q  646 accattgatttctc-tttgtaacgttactcatcata 680  Q
    ||| ||||| |||| ||||||| |||||||||||||    
T  14634539 acctttgatatctcttttgtaaagttactcatcata 14634504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 564 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 10208182 - 10207982
Alignment:
Q  564 aaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctt 661  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||  |||   | ||||||    
T  10208182 aaacactattacgattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctctt 10208087  T
Q  662 tgtaacgttactca-tca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt-aaatttggaccgaactgggtcaacaaat-tcttgtatttt 757  Q
    ||||| |  ||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| |   || ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  10208086 tgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccgcagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatatcttgtgtttt 10207987  T
Q  758 tctct 762  Q
    |||||    
T  10207986 tctct 10207982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 530 - 626
Target Start/End: Complemental strand, 4560497 - 4560401
Alignment:
Q  530 aacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggc 626  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||| || ||||||||||||||||||| || |||||||| | |||||  ||   ||||||||||||||||||    
T  4560497 aacactagggtttgagggttgattcacctt-ggaaaacactattaggattgagcctgttggttaccggaagagattggagctttgggtagaattaggc 4560401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 680 - 744
Target Start/End: Original strand, 8370505 - 8370569
Alignment:
Q  680 atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 744  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  8370505 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 8370569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 700 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 9666510 - 9666466
Alignment:
Q  700 tctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 744  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9666510 tctctcccccagattaggtaaagttggaccgaactgggtcaacaa 9666466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 380 - 440
Target Start/End: Original strand, 13893287 - 13893347
Alignment:
Q  380 gtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaa 440  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  13893287 gtgcagatttgttccaaattttaagggttacttttactataaatatagacattgtatcaaa 13893347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 630 - 760
Target Start/End: Complemental strand, 15823763 - 15823631
Alignment:
Q  630 agacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcat-atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaat-ttgga 727  Q
    ||||| |||||||||| || ||||  ||||||||||| |  |||| |||| |||||||| |  || ||||||||||| || ||| || || ||| |||||    
T  15823763 agactaattcttgtaaccctttgacatctctttgtaaagaaactcttcattatagtggaacgtagagctgctctctctccaagagtaagtcaatattgga 15823664  T
Q  728 ccgaactgggtcaacaaattcttgtatttttct 760  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  15823663 ccgaattgggtaaacaaattcttgtatttttct 15823631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 680 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 21711291 - 21711227
Alignment:
Q  680 atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 744  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  21711291 atagtggatttgagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 21711227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 680 - 744
Target Start/End: Original strand, 27974971 - 27975035
Alignment:
Q  680 atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 744  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  27974971 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 27975035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 680 - 744
Target Start/End: Original strand, 27986465 - 27986529
Alignment:
Q  680 atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 744  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  27986465 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 27986529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 567 - 746
Target Start/End: Original strand, 54193229 - 54193410
Alignment:
Q  567 cactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgt 664  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||  ||   || |||||||||    
T  54193229 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttgt 54193324  T
Q  665 aacgttactc--atca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt-aaatttggaccgaactgggtcaacaaat 746  Q
    || |  || |  |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |   || ||||||||||||| |||||||    
T  54193325 aaagaaacccatatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 54193410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #146
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 681 - 744
Target Start/End: Original strand, 1417510 - 1417573
Alignment:
Q  681 tagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 744  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  1417510 tagtggattggagggatgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 1417573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #147
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Original strand, 3859315 - 3859365
Alignment:
Q  204 aatgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatgg 254  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  3859315 aatgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcataatcgtggcacgatgg 3859365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #148
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 397 - 443
Target Start/End: Original strand, 5886196 - 5886242
Alignment:
Q  397 attttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagca 443  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||    
T  5886196 attttaagcgaaacttttactataaatatagaccttttatcagagca 5886242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #149
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 567 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 10595213 - 10595026
Alignment:
Q  567 cactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgt 664  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||| |||||| |||  ||   || |||||||||    
T  10595213 cactattaggattaagtctcttggtcacgggaagaggctgagac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttataactca---atatctctttgt 10595118  T
Q  665 aacgttactca--tca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt-aaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttgt 752  Q
    || |  |||||  ||| ||||||||| | ||| |||||||||||||||| ||||||| |   || ||||||||||||| |||||||||||||    
T  10595117 aaagaaactcatgtcattatagtggaacggagagctgctctctcccccatactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattcttgt 10595026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #150
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 564 - 625
Target Start/End: Original strand, 16462203 - 16462264
Alignment:
Q  564 aaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg 625  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  16462203 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 16462264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #151
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 564 - 625
Target Start/End: Complemental strand, 22626166 - 22626105
Alignment:
Q  564 aaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg 625  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  22626166 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 22626105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #152
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 564 - 625
Target Start/End: Complemental strand, 47883064 - 47883003
Alignment:
Q  564 aaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg 625  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  47883064 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 47883003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #153
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 386 - 443
Target Start/End: Original strand, 5899660 - 5899717
Alignment:
Q  386 atttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagca 443  Q
    ||||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||    
T  5899660 atttgttacagattttaagcgagacttttactataaatatagaccttttatcagagca 5899717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #154
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 409 - 474
Target Start/End: Original strand, 6484308 - 6484373
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaaggg 474  Q
    |||||| ||| |||||||| | ||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6484308 acttttgctataaatataggcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaaggg 6484373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #155
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 361 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 46967017 - 46966940
Alignment:
Q  361 aacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatca 438  Q
    |||| ||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||| || ||||||||    
T  46967017 aacagaaacatatttttcaatgcagatttgttccaaattttaagggttacttttactataaatataaacattgtatca 46966940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #156
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 680 - 741
Target Start/End: Complemental strand, 48438282 - 48438221
Alignment:
Q  680 atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaa 741  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||| ||||||    
T  48438282 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaa 48438221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #157
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 564 - 718
Target Start/End: Original strand, 6303310 - 6303464
Alignment:
Q  564 aaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaaaccattgatttctctt 661  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||| ||||| | |||||   || |||| ||||||| ||  ||||    ||||||    
T  6303310 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtatagttaggtttgaagactgattcttgaaactcatta---tctctt 6303405  T
Q  662 tgtaacgttactcat-cat-atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt 718  Q
    ||||| |  |||||| ||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6303406 tgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggt 6303464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #158
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 680 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 16264418 - 16264354
Alignment:
Q  680 atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 744  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||| |||||||||    
T  16264418 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 16264354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #159
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 700 - 744
Target Start/End: Original strand, 16499153 - 16499197
Alignment:
Q  700 tctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 744  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  16499153 tctctcccccagagtaggttaagttggaccgaactgggtcaacaa 16499197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #160
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 386 - 438
Target Start/End: Original strand, 25388798 - 25388850
Alignment:
Q  386 atttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatca 438  Q
    ||||||| || ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25388798 atttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagaccttgtatca 25388850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #161
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 680 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 32143389 - 32143325
Alignment:
Q  680 atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 744  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||| |||||||||    
T  32143389 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 32143325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #162
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 680 - 744
Target Start/End: Original strand, 33386685 - 33386749
Alignment:
Q  680 atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 744  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||| |||||||    
T  33386685 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactggatcaacaa 33386749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #163
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 700 - 744
Target Start/End: Original strand, 40913417 - 40913461
Alignment:
Q  700 tctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 744  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  40913417 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 40913461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #164
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 706 - 750
Target Start/End: Original strand, 42992607 - 42992651
Alignment:
Q  706 ccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  42992607 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgagtcaaaaaattctt 42992651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #165
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 700 - 744
Target Start/End: Original strand, 44331669 - 44331713
Alignment:
Q  700 tctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 744  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  44331669 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 44331713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #166
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 700 - 751
Target Start/End: Original strand, 30236249 - 30236300
Alignment:
Q  700 tctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttg 751  Q
    ||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  30236249 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactaggtcaacaatttcttg 30236300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #167
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 681 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 37466358 - 37466295
Alignment:
Q  681 tagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 744  Q
    ||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||| ||||||||    
T  37466358 tagtggattggagggctactctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgtgtcaacaa 37466295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #168
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 409 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 1618992 - 1618916
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt--gagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaa 482  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||| || || |||| ||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1618992 actttgactataaatatagaccttgtaccatagtaaaccttgagagacagagggggctgaaaacaagggtttagaaa 1618916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #169
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 299 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 4308725 - 4308676
Alignment:
Q  299 cactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcg 348  Q
    |||||||||||||||| |||||| || ||| |||||| ||||||||||||    
T  4308725 cactggaaaaatcgtgccacgattggatcgaatcgtgccacgatggtgcg 4308676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #170
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 493 - 585
Target Start/End: Original strand, 25633930 - 25634018
Alignment:
Q  493 aaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct 585  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||| |   || ||||||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||    
T  25633930 aaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggct--gggattgattcacctt-gggagacattattaggattgagtct 25634018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #171
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 695 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 25795834 - 25795785
Alignment:
Q  695 gctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 744  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||| |||||||||    
T  25795834 gctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 25795785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #172
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 691 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 26299045 - 26298992
Alignment:
Q  691 gagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 744  Q
    |||||||||||||||||||||| || || |  ||| ||||||||||||||||||    
T  26299045 gagggctgctctctcccccagattatgtcatattgaaccgaactgggtcaacaa 26298992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #173
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 548 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 31021341 - 31021304
Alignment:
Q  548 ttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct 585  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31021341 ttgattcaccttggagaaacactattaggattgagtct 31021304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 384; Significance: 0; HSPs: 94)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 384; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 239 - 770
Target Start/End: Original strand, 27829126 - 27829659
Alignment:
Q  239 aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggca 338  Q
    |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27829126 aatcgtggcacgattgctgggcaacgtggcacgatggaggtttcattttttgaggcaaaacactggaaaaatcgtggcacgatgggatcgcatcgtggca 27829225  T
Q  339 cgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatca 438  Q
    |||||||||| ||||||| || |||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  27829226 cgatggtgcgctggcagcgaaaaacaaaaacatatttttgagtgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatataggccttgtatca 27829325  T
Q  439 aagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagg 538  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  27829326 gagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagg 27829425  T
Q  539 gtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttat 637  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27829426 gtttgtgggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggaccttgggtagaattaggcgggagacttat 27829524  T
Q  638 tcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactggg 737  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27829525 tcttgtaacccattgatttctctttgtaacaatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactggg 27829624  T
Q  738 tcaacaaattc--ttgtatttttctcttctttgtg 770  Q
    |||||||||||  |||| || ||||||||||||||    
T  27829625 tcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtg 27829659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 376; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 239 - 770
Target Start/End: Original strand, 27826815 - 27827348
Alignment:
Q  239 aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggca 338  Q
    |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27826815 aatcgtggcacgattgctgggcaacgtggcacgatggaggtttcattttttgaagcaaagcactggaaaaatcgtggcacgatgggatcgcatcgtggca 27826914  T
Q  339 cgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatca 438  Q
    |||||||||| ||||||| || |||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  27826915 cgatggtgcgctggcagcgaaaaacaaaaacatatttttgagtgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatataggccttgtatca 27827014  T
Q  439 aagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagg 538  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  27827015 gagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagg 27827114  T
Q  539 gtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttat 637  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27827115 gtttgtgggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagaggctgggaccttgggtagaattaggcgggagacttat 27827213  T
Q  638 tcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactggg 737  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  27827214 tcttgtaacccattgatttctctttgtaacaatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaagtcaatttggaccgaactggg 27827313  T
Q  738 tcaacaaattc--ttgtatttttctcttctttgtg 770  Q
    |||||||||||  |||| || ||||||||||||||    
T  27827314 tcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtg 27827348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 214 - 750
Target Start/End: Original strand, 14807556 - 14808102
Alignment:
Q  214 ttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcg 312  Q
    ||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||| |||||   ||||||||| |||||| ||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  14807556 ttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcatgatggttgggcaacgtgacacgattggaggtttcaagttt-gaggcaaagcactggaaaaatcg 14807654  T
Q  313 tggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaactt 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| || ||||||||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  14807655 tggcacgatggggtcgcatcgtggcacggtggtgcgctggcagcgaaaaacataaacgtatttt-gagtgcagatttgttccaaattttaagcgatactt 14807753  T
Q  413 ttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagag 512  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14807754 ttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagag 14807853  T
Q  513 tttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactt 611  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||    
T  14807854 tttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactt 14807952  T
Q  612 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctg----------ct 700  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||          ||    
T  14807953 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctccccct 14808052  T
Q  701 ctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14808053 ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 14808102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 214 - 750
Target Start/End: Original strand, 15067785 - 15068322
Alignment:
Q  214 ttaacttcaaatcagatttatgcat-aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatc 311  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||| ||||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  15067785 ttaacttaaaatcagattt-tgcaggaatcgtggcaagatggctgggcaacatggcacgattggaggtttcagtttt-gaagcaagccactggaaaaatc 15067882  T
Q  312 gtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaact 411  Q
     || ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  15067883 atgccacgatgggatcgcaacgtggcacgatggtgcgctggcagcgaataacaaaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgatact 15067982  T
Q  412 tttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtataga 511  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15067983 tttactataaatataaaccttgtatcaacctaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaaccagggtttgtataga 15068082  T
Q  512 gtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtc-tttggttacggaaagaggctgagact 610  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  15068083 gtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttaattcacctt-gggaaatactattaggattgagtcttttggttacggaaagaggttgagact 15068181  T
Q  611 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctccccc 709  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||    
T  15068182 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatataatggaacggagggctgctctctccccc 15068281  T
Q  710 agactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  15068282 agactaggtcaatttggactgaactgggccaacaaattctt 15068322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 206 - 747
Target Start/End: Original strand, 15072506 - 15073049
Alignment:
Q  206 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcat-aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactg 303  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||  ||||  ||||||| |||||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||| || ||||| ||||     
T  15072506 tgtgagagttaacttaaaatcagattc-tgcaggaatcgtgacacgatggctgggcaacgtgacacgattggaggtttcagtttt-gaagcaagccacta 15072603  T
Q  304 gaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaa 403  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15072604 gaaaaatcgtgtcacgatgggatcgcaacgtggcatgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaa 15072703  T
Q  404 gcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 503  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15072704 gcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactatggtt 15072803  T
Q  504 tgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaaga-g 601  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| |    
T  15072804 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggttttagggttgattcacctt-ggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagg 15072902  T
Q  602 gctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgct 700  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||    
T  15072903 gttgggactttgggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatacagtggaacggagggctgct 15073002  T
Q  701 ctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 747  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15073003 ctctcccccagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaatt 15073049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 206 - 770
Target Start/End: Original strand, 44720617 - 44721206
Alignment:
Q  206 tgtgagatttaacttcaaatcagattta-tgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactg 303  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| |||  |||| |||||||||| ||| ||  ||||  |||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  44720617 tgtgagagttaacttaaaatcaggttttctgcagaatcgtggcatgattgctgggcattgtggcacgtttggaggtttcagtttt-gaggcaaggtactg 44720715  T
Q  304 gaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtg--------------------- 382  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||                         
T  44720716 gaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcagcaaa-aacagaaacatatttttgggtgcagatttgttacagattttaa 44720814  T
Q  383 -caaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 481  Q
     || ||||||| || ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44720815 gcagatttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagaccttatatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 44720914  T
Q  482 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattga 581  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  44720915 aggcaacaacaaaactatgttttgtatagagtctgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaaacactattaggattga 44721014  T
Q  582 gtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcata 680  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  44721015 gtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcata 44721114  T
Q  681 tagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaatt--cttgtatttttctcttctttgtg 770  Q
    ||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||| || ||||||||||||||    
T  44721115 tagtggattggagagctgctctctcccgcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttcttctcttctttgtg 44721206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 206 - 770
Target Start/End: Original strand, 18810483 - 18811070
Alignment:
Q  206 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgga 305  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  18810483 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttatttttttaggcaaggcactgga 18810582  T
Q  306 aaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttcca---------- 395  Q
    ||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |  || || | ||||| ||||||||||||| ||||||| ||              
T  18810583 aaaattgcggcacgatggggtcacatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaata-aaacacatttttgggtgcagatttgttacagattttgagc 18810681  T
Q  396 ------------aattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaag 483  Q
                ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18810682 agatttgttacaaattttaagggaaacttttactataaatatagatcttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaag 18810781  T
Q  484 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagt 583  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  18810782 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgaaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagt 18810880  T
Q  584 ct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatata 682  Q
    || |||||||||| || |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  18810881 ctcttggttacgggaataggctgggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacaatactcatcatata 18810980  T
Q  683 gtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattc--ttgtatttttctcttctttgtg 770  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||    
T  18810981 gtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcaatttgaaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtg 18811070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 309 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 28252002 - 28251561
Alignment:
Q  309 atcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaa 408  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| || |||| |||| |||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||     
T  28252002 atcgtggcacgatgggatcgcatcgtggtacgatggtgcgttggcagcgaaaaacagaaacgtatttt-gagtgcagatttgttccaaattttaagcgat 28251904  T
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 508  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28251903 acttttactataaatatagaccttgtatcatagtaaactttgagatagagtgggttgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtat 28251804  T
Q  509 agagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgag 607  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |    
T  28251803 agagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgtgggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 28251705  T
Q  608 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcc 706  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28251704 actttgggtaaaattaggcgggagacttattcttataacccattgatttctcttttgtaatgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcc 28251605  T
Q  707 cccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28251604 cccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 28251561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 330 - 770
Target Start/End: Original strand, 4423938 - 4424381
Alignment:
Q  330 atcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagac 429  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| || || | ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||    
T  4423938 atcgtggcacgatggtgcgctggcagcgaaaaatagaaacatatttttgagtgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatacagac 4424037  T
Q  430 cttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaaga 529  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |    
T  4424038 cttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtcgcttcgaaaca 4424137  T
Q  530 aacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgg 628  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  ||   |||||| |||||||||||||    
T  4424138 aacactagggtttgtgggttgattcaccgt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttggatagaattaggcgg 4424236  T
Q  629 gagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttgga 727  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4424237 gagacttattcttgtaacccattgatttatcttttgtaacattactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtcaatttgga 4424336  T
Q  728 ccgaactgggtcaacaaattc--ttgtatttttctcttctttgtg 770  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||    
T  4424337 ccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtg 4424381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 282; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 206 - 770
Target Start/End: Original strand, 18812668 - 18813244
Alignment:
Q  206 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgga 305  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||| || | ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  18812668 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgaagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttaggcaaggcactgga 18812767  T
Q  306 aaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtg----------------------c 383  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  || || | |||||||||||||||||                      |    
T  18812768 aaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaata-aaacatatttttgggtgcagatttgttacagattttgagc 18812866  T
Q  384 aaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaag 483  Q
    | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18812867 agatttgttacaaattttaagggaaacttttactataaatatagatcttgtatcagagcaaacttggagatagaggaggctgaaacaagggtttagaaag 18812966  T
Q  484 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagt 583  Q
    ||||||||||||||||           ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18812967 gcaacaacaaaactag-----------agtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggg-aaacactattaggattgagt 18813054  T
Q  584 ct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatata 682  Q
    || |||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  18813055 ctcttgggtacgggaagaggctgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacaatactcatcatata 18813154  T
Q  683 gtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattc--ttgtatttttctcttctttgtg 770  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||  |||| || ||||||||||||||    
T  18813155 gtggattggagggctgctctctcccccatattaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtg 18813244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 409 - 750
Target Start/End: Original strand, 3874005 - 3874351
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagataga----gggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 504  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||    ||||||||||| |||    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||    
T  3874005 acttttactataaatatagactttgtatcaggctaaactttgagagagatagcgggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactaaagttt 3874104  T
Q  505 gtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggc 603  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||    
T  3874105 gtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt-gggaaacactattaggatttagtctcttggttacgggaagaggc 3874203  T
Q  604 tgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctct 702  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3874204 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 3874303  T
Q  703 ctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3874304 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 3874351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 409 - 770
Target Start/End: Original strand, 15809214 - 15809581
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 504  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||    |||||||    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15809214 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagataaagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 15809313  T
Q  505 gtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggc 603  Q
    ||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  |    
T  15809314 gtatagagtttgtct-tttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt-ggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaaac 15809411  T
Q  604 tgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctct 702  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15809412 taggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctct 15809511  T
Q  703 ctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattc--ttgtatttttctcttctttgtg 770  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||    
T  15809512 cttccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtg 15809581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 409 - 770
Target Start/End: Original strand, 32339304 - 32339672
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 504  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||    |||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32339304 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 32339403  T
Q  505 gtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggc 603  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||      
T  32339404 gtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt-ggtaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagat 32339502  T
Q  604 tgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctct 702  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32339503 tggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctct 32339602  T
Q  703 ctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattc--ttgtatttttctcttctttgtg 770  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||  |||| || ||||||||||||||    
T  32339603 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggttaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtg 32339672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 420 - 770
Target Start/End: Original strand, 608736 - 609098
Alignment:
Q  420 aaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtataga 511  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  608736 aaatatagaccttatatcatagcaaactttgagagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaattagggtttgtataga 608835  T
Q  512 gtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagact 610  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||| ||||    
T  608836 gtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt-aggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgggact 608934  T
Q  611 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctccccc 709  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  608935 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccccc 609034  T
Q  710 agactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattc---ttgtatttttctcttctttgtg 770  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||   |||| || ||||||||||||||    
T  609035 agactaagtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctttttgtgttcttctcttctttgtg 609098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 409 - 770
Target Start/End: Complemental strand, 22685002 - 22684625
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaacta 498  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||          |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22685002 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagagagagatagaggaggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaacta 22684903  T
Q  499 gggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaa 597  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  22684902 gggtttgtatagagtttgtctttttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 22684804  T
Q  598 agaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaacc---attgatttctct-ttgtaacgttactcatcatatagtggatcagag 693  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  22684803 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccaatattgatttctctattgtaacgttactcatcatatagtggaacggag 22684704  T
Q  694 ggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattc--ttgtatttttctcttctttgtg 770  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||    
T  22684703 ggctgctctctcccccagattaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtg 22684625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 409 - 770
Target Start/End: Complemental strand, 28283561 - 28283193
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 502  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||    |||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28283561 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggt 28283462  T
Q  503 ttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagag 601  Q
    |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| | || ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||    
T  28283461 ttgtatagagtttgactctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacatt-gggaaacactattaggattgaatctcttggttacgggaagag 28283363  T
Q  602 gctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctc 701  Q
      || | ||||||||||||||||| || ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28283362 attggggctttgggtagaattaggtggtagacttattcttgcaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctc 28283263  T
Q  702 tctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattc--ttgtatttttctcttctttgtg 770  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||    
T  28283262 tct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtg 28283193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 359 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 14419578 - 14419184
Alignment:
Q  359 ataacataaacatatttttggg-tgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagataga 457  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||  | |||||||||| || | || || |||||||||| |||||||||| ||||||||  | |||| ||||||||||    
T  14419578 ataacagaaacatatttttgggctgagattttgttccaatttatgagtgatacttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagataga 14419479  T
Q  458 gggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctcc 557  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| | ||||||| |||||||||| ||    
T  14419478 gggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaaaaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggagcaaacattggggtttgagggttgattcacc 14419379  T
Q  558 ttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgattt 656  Q
    || |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |    
T  14419378 tt-gggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattaatat 14419280  T
Q  657 ctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
     || ||||||| ||||||||||| ||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14419279 gtcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacagatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 14419184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 410 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 27107232 - 27106894
Alignment:
Q  410 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 509  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27107232 cttttactataaatatagacattgtatcagtataaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 27107133  T
Q  510 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgaga 608  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  || ||    
T  27107132 gagtttgtctcttcggaacaaacactagagtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgtga 27107034  T
Q  609 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctccc 707  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||| ||||||  |||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||     
T  27107033 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatagatatctcttttgtagggttactcatcatatagtgaaacggagggctgctatctcct 27106934  T
Q  708 ccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 747  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  27106933 ccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaatt 27106894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 458 - 747
Target Start/End: Original strand, 43079650 - 43079940
Alignment:
Q  458 gggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctcc 557  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  43079650 gggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacc 43079749  T
Q  558 ttggggaaacactattaggattg-agtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatt 655  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  43079750 ttggg-aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatt 43079848  T
Q  656 tctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 747  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  43079849 tctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 43079940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 450 - 747
Target Start/End: Original strand, 43082013 - 43082311
Alignment:
Q  450 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggtt 549  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  43082013 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactaaggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 43082112  T
Q  550 gattctccttggggaaacactattaggattg-agtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaac 647  Q
    ||||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  43082113 gattcaccttggg-aaacactatcaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacc 43082211  T
Q  648 cattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 747  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  43082212 cattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 43082311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 239 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 12517532 - 12517248
Alignment:
Q  239 aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggc 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12517532 aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgattggaggtttcagtttt-gaggcaatgtactggaaaaatcgtggcacgatgggatcgcatcgtggc 12517434  T
Q  338 acgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatc 437  Q
    ||||||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||| ||||||||||    
T  12517433 acgatggtgtgctggcagcgaaaaacagaaacatatttttgagtgcaaatttgttccaaattttaagcgatacttttactatatatatataccttgtatc 12517334  T
Q  438 aaagcaaacttt--gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctct 521  Q
    | ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12517333 agagcaaactttgagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctct 12517248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 410 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 30480838 - 30480497
Alignment:
Q  410 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 509  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||| |  | |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  30480838 cttttactataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagatagaaggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaaagtttgtata 30480739  T
Q  510 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgaga 608  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||  ||||     
T  30480738 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagg 30480640  T
Q  609 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctccc 707  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||| |   || ||||||||||||||    
T  30480639 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttagtcatcatatagtgaaatggatggctgctctctccc 30480540  T
Q  708 ccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30480539 ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 30480497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 200; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 409 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 24873523 - 24873178
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 502  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||    |||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24873523 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 24873424  T
Q  503 ttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattg-agtct-ttggttacggaaaga 600  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  24873423 ttgtatagagtttgtctcttgggagcaaacactagggtttgtgggttgattcacctttgg-aaacactattaggattggagtctcttggttacggaaaga 24873325  T
Q  601 ggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgct 700  Q
    |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  24873324 gattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccgattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgct 24873225  T
Q  701 ctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 747  Q
    |||||||||| ||||||| |  |||||||||| || |||||||||||    
T  24873224 ctctcccccatactaggtcagattggaccgaattgagtcaacaaatt 24873178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 362 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 13858868 - 13858478
Alignment:
Q  362 acataaacatatttttggg-tgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagaggg 460  Q
    ||||||||||||||||||| ||  | |||||||||| || | || || |||||||||| |||||||||| |||||||| || |||| |||||||||||||    
T  13858868 acataaacatatttttgggctgagattttgttccaatttatgagggatacttttactataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagaggg 13858769  T
Q  461 ggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttg 560  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||| |||||||||| ||||     
T  13858768 ggatgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgacaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt- 13858670  T
Q  561 gggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc 659  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||  || | ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  ||||| || ||||    
T  13858669 gggaaacactattaggattgagtttcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaagcgggagacttattcttgcagcccatt-atatctc 13858571  T
Q  660 -tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
     ||||||| ||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  13858570 ttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggacagaactgggtaaacaaattctt 13858478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 409 - 750
Target Start/End: Original strand, 27911014 - 27911354
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 508  Q
    |||||||| | |||||| ||| ||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27911014 acttttacaataaatattgacattgtatcaatgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa-ggcaacaacaaaactagggtttgtat 27911112  T
Q  509 agagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgag 607  Q
    |||||||||||||| | || ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  || |    
T  27911113 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggg 27911211  T
Q  608 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctct-ttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcc 706  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||| | | ||||| |||||||| |    
T  27911212 actttgggtagaattaggcgggagagttattcttgtaactcattgatatctctattgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggttgctctct-c 27911310  T
Q  707 cccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27911311 cccagactaagtcaatttggaccgaactgggtcaaaaaattctt 27911354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 409 - 750
Target Start/End: Original strand, 27957433 - 27957773
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 508  Q
    |||||||| | |||||| ||| ||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27957433 acttttacaataaatattgacattgtatcaatgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa-ggcaacaacaaaactagggtttgtat 27957531  T
Q  509 agagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgag 607  Q
    |||||||||||||| | || ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  || |    
T  27957532 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggg 27957630  T
Q  608 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctct-ttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcc 706  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||| | | ||||| |||||||| |    
T  27957631 actttgggtagaattaggcgggagagttattcttgtaactcattgatatctctattgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggttgctctct-c 27957729  T
Q  707 cccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27957730 cccagactaagtcaatttggaccgaactgggtcaaaaaattctt 27957773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 409 - 750
Target Start/End: Original strand, 1225165 - 1225508
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 508  Q
    |||||||||| |||||||| | ||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  1225165 acttttactataaatataggcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaa 1225264  T
Q  509 agagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgag 607  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  || |    
T  1225265 agagtttgtctctttggaacaaacactacggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggg 1225363  T
Q  608 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattg--atttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctc 705  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||  || ||| |||||||||||||||||||||||||| | | || ||| ||||||||    
T  1225364 gctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggatggccgctctctc 1225463  T
Q  706 ccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    || || ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1225464 cctcatactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 1225508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 409 - 770
Target Start/End: Original strand, 43530123 - 43530478
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 504  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||                 
T  43530123 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaac------------- 43530209  T
Q  505 gtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtcttt-ggttacggaaagaggc 603  Q
    || ||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||    
T  43530210 gtgtagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgaaggttgattcaccttggg-aaacactattaggattgagtctctcggttacgggaagaggc 43530308  T
Q  604 tgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctct 702  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  43530309 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcctgtaacccattgatttctcttttgtaacgctactcatcatatagtggatcggagggctgctgt 43530408  T
Q  703 ctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattc--ttgtatttttctcttctttgtg 770  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||    
T  43530409 ctctcccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtg 43530478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 409 - 750
Target Start/End: Original strand, 41384744 - 41385085
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 508  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||    
T  41384744 acttttactataaatatagaccttgaatcaaagtaaaaattgagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaattagggtttgtat 41384842  T
Q  509 agagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgag 607  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||  ||      
T  41384843 agagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttggg-aaacaccattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgga 41384941  T
Q  608 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcc 706  Q
     |||| |||||||||||| |||||| || |||||||||  ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  41384942 gctttaggtagaattaggtgggagaatttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcc 41385041  T
Q  707 cccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41385042 cccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 41385085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 172; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 410 - 750
Target Start/End: Original strand, 25952521 - 25952862
Alignment:
Q  410 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 509  Q
    ||||||||| |||||||  | |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||    
T  25952521 cttttactataaatataagctttgtatcagaggaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaataaaattagggtt-gtata 25952619  T
Q  510 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgaga 608  Q
     |||||||||||| | || ||||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||||| |||||||||  ||||   |||||    
T  25952620 tagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgga-aaacaatattaggattgagtctcttggttacgagaagaaattgaga 25952718  T
Q  609 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcat-atagtggatcagagggctgctctctcc 706  Q
    | |||||||||||||||| | ||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||  ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||    
T  25952719 cattgggtagaattaggcagaagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaaattactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcc 25952818  T
Q  707 cccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25952819 cccagactaggtaaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 25952862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 172; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 411 - 749
Target Start/End: Original strand, 36865538 - 36865877
Alignment:
Q  411 ttttactacaaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 509  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||| | | |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36865538 ttttactataaatatagacattgtatcagatgtaaaccttaagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 36865637  T
Q  510 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtctttggttacggaaagaggctgagac 609  Q
    ||||||||||||| | || ||||| ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |  | |||| |||||  ||  ||    
T  36865638 gagtttgtctcttggcaacaaacattagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctct--tcacgggaagagattggaac 36865734  T
Q  610 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctccc 707  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||| ||||||||||| ||||||| | | ||  |||||||||||||    
T  36865735 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattaatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggaatgctgctctctccc 36865834  T
Q  708 cc-agactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 749  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36865835 ccaagactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaattct 36865877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 409 - 750
Target Start/End: Original strand, 41382672 - 41383003
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 508  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||| || |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||    
T  41382672 acttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaaccttgagatagatggggctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaattagggtttgtat 41382771  T
Q  509 agagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgag 607  Q
    ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| ||| |||            |||| |||||||||| |||||||||| |||||  || |    
T  41382772 agaatttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgtttcacct------------attatgattgagtctcttggttacgggaagagattggg 41382859  T
Q  608 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcc 706  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  41382860 gctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcc 41382959  T
Q  707 cccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41382960 cccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 41383003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 162; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 410 - 654
Target Start/End: Original strand, 14477276 - 14477520
Alignment:
Q  410 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 509  Q
    ||||||||| |||||||| | |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14477276 cttttactataaatataggctttgtatcagagcaaaccttgagatagagggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 14477375  T
Q  510 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgaga 608  Q
     |||||||||||| | || ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||  |||||    
T  14477376 aagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacgctattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgaga 14477474  T
Q  609 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgat 654  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14477475 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgat 14477520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 410 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 5372512 - 5372173
Alignment:
Q  410 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 509  Q
    ||||||||| || ||||||| ||||||||  | |||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  5372512 cttttactataattatagacattgtatcagtgtaaatcttgagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttatata 5372414  T
Q  510 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgaga 608  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||  || ||    
T  5372413 gagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttaattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagattggga 5372315  T
Q  609 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttc-tctttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctct-c 705  Q
    ||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| || | ||||||| ||||||||||| ||||||| | | ||||| | |||||| |    
T  5372314 ctttgagtataattaggcggcagacttattcttgtaactcattgatatcttttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggttactctctcc 5372215  T
Q  706 ccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 747  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||    
T  5372214 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgagtcaataaatt 5372173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 410 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 33541723 - 33541404
Alignment:
Q  410 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 509  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33541723 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaacattgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 33541624  T
Q  510 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgaga 608  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||  || ||    
T  33541623 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacatt-gggaaacactattaggattgagtatcttggttacgggaagagattggga 33541525  T
Q  609 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctccc 707  Q
    |||| ||||||||||||                      ||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| | | || ||||||||||||||    
T  33541524 cttttggtagaattagg----------------------cattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacggaaggctgctctctccc 33541447  T
Q  708 ccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| || |||||    
T  33541446 ccagactaggtcaatttggaccgaattgggtcaaaaatttctt 33541404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 409 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 15186046 - 15185708
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 508  Q
    |||||||||| ||||||| || |||||||| || |||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||  || |||||||||| ||||| |||    
T  15186046 acttttactataaatataaactttgtatcagagtaaaccttgagataaaggtgactgaaacaagggtttagaaagaaaataacaaaactatggtttatat 15185947  T
Q  509 agagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct---ttggttacggaaagaggctg 605  Q
    | |||||||||||| | || ||||||||||||||| |||||||||| |||| |  |||||||||||| |||||||||   |||||||||| |||||        
T  15185946 aaagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt-gtaaaacactattagaattgagtctctcttggttacgggaagag---- 15185852  T
Q  606 agactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctc 703  Q
        |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||| | | |||| ||| ||||    
T  15185851 ---atttgggtagaattaggcgagagacctattcttgtaacccattgatatctcttttttaaggttactcatcattatagtgaaacggaggactgttctc 15185755  T
Q  704 tcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15185754 tcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 15185708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 330 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 3886336 - 3886153
Alignment:
Q  330 atcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatattttt---gggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatata 426  Q
    ||||||| ||||||||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  3886336 atcgtggtacgatggtgtgctggcagcgaataacagaaacatattttttttgggtgcatatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatata 3886237  T
Q  427 gaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 510  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3886236 gactttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 3886153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 410 - 747
Target Start/End: Original strand, 21482322 - 21482649
Alignment:
Q  410 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 509  Q
    ||||||||| |||||||||  |||||||| || |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||          |||||||||||||||||    
T  21482322 cttttactataaatatagaatttgtatcagagtaaactttgagatagagtggactgaaacaagggtttagaaatc--------aaactagggtttgtata 21482413  T
Q  510 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgaga 608  Q
     |||||| ||||| | || |||||||||||||   ||||||| || ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| || |||||  || |     
T  21482414 aagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt---gggttgagtcaccttggg-aaacactattaagattgagtctcttggttatgggaagagattgggg 21482508  T
Q  609 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcat-atagtggatcagagggctgctctctcc 706  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| |||||||||||| |||  | | | ||||||||||||||||    
T  21482509 ctttgggtagaattaggcgagtgacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattataaagaaacggagggctgctctctcc 21482608  T
Q  707 cccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 747  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21482609 cccaaactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaatt 21482649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 409 - 585
Target Start/End: Original strand, 26775200 - 26775375
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 508  Q
    |||||||||| |||||||| | |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26775200 acttttactataaatataggctttgtatcagagcaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaatactagggtttgtat 26775299  T
Q  509 agagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct 585  Q
    | |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||| |||| || |||||||||||| |||||||||    
T  26775300 atagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttaattcacctt-ggaaaacactattagaattgagtct 26775375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 443 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 3005929 - 3005622
Alignment:
Q  443 aaactttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtt 541  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||  |  ||||||| |||||||||||||||| |||||   || ||||| |||||||    
T  3005929 aaaccttgagatagagggggctggaaacaagggtttagaaa--caaataacaaactagagtttgtatagagtttg-ctcttaacaacaaacaatagggtt 3005833  T
Q  542 tgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattct 640  Q
       || ||||||| | ||||  |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3005832 ---ggattgattcactttgga-aaacactattagcattgagtctcttggtcacggaaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattct 3005737  T
Q  641 tgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt-aaatttggaccgaactggg 737  Q
    ||||| |||||||| |||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||    
T  3005736 tgtaatccattgatatctcttttgtaaagttgctcatcattatagtggaacggaggggtgctctctcccccagaccaggtcagttttggaccgaactggg 3005637  T
Q  738 tcaacaaattcttgt 752  Q
    | |||||||||||||    
T  3005636 taaacaaattcttgt 3005622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 500 - 750
Target Start/End: Original strand, 15956051 - 15956299
Alignment:
Q  500 ggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtcttt-ggttacggaaa 598  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||||||   |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||| |||| ||    
T  15956051 ggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttggg-aaacactgttaggattgaatcttttggtcacgggaa 15956145  T
Q  599 gaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggc 696  Q
    |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||| | | |||||     
T  15956146 gagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggt 15956245  T
Q  697 tgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    | ||||||||| |||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15956246 ttctctctccctcagattaggtcaatttggactgaactgggtcaacaaattctt 15956299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 443 - 738
Target Start/End: Original strand, 21480547 - 21480832
Alignment:
Q  443 aaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggttt 542  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||          |||||||||||||||| ||||||| ||||| | || |||||||||| ||     
T  21480547 aaaccttgagatagatggggctgaaacaagggtttagaaatc--------aaactagggtttgtatggagtttg-ctcttggcaacaaacactaggttt- 21480636  T
Q  543 gtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattctt 641  Q
      |||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||   || |  ||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  21480637 --gggttgattcaccttggg-aaacactattagaattgagtctcttggttacgggaagatattggggtttttggtagaattaggcgggtgacttattctt 21480733  T
Q  642 gtaaaccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcat-atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggt 738  Q
    |||| |||||||| ||||||| |||| |||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  21480734 gtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaacgaactgggt 21480832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 409 - 747
Target Start/End: Original strand, 31162212 - 31162551
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaa-caacaaaactagggtttgt 506  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| |||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||  ||| |||||||  ||| ||||||    
T  31162212 acttttactataaatatagaccttgtatcatagtaaaccttgagaaagagggggctaaaaacaaaggtttagaaa--caagcaacaaat-tagtgtttgt 31162308  T
Q  507 atagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctg 605  Q
    ||| |||||| ||||| | || ||||||||  ||| |  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||  ||    
T  31162309 ataaagtttg-ctcttggcaacaaacactaacgttag--ggttgattcaccttggg-aaacactattaggattgagtctcttggtcaccggaagagattg 31162404  T
Q  606 agactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctc 703  Q
     ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  31162405 ggactttgggtagaattaggtggaagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaaattactcatcattatagtggaacagagggctgctctc 31162504  T
Q  704 t--cccccagactaggtaaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 747  Q
    |  |||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||||    
T  31162505 tcccccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 31162551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 366 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 5623117 - 5622882
Alignment:
Q  366 aaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctg 465  Q
    |||||||||||||||   || |||||||||| || | || ||  ||||||||| ||||||||   |||||||| |  |||| ||||||||||||||||||    
T  5623117 aaacatatttttgggcctaattttgttccaatttatgagtgattcttttactataaatataggttttgtatcagaataaaccttgagatagagggggctg 5623018  T
Q  466 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaa 565  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| ||||||||||  |||  ||||    
T  5623017 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctattgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatctt-tggaa 5622919  T
Q  566 acactattaggattgagtct-ttggttacggaaagag 601  Q
    ||| |||| ||||||||||| ||| |||||| |||||    
T  5622918 acattatttggattgagtctcttgattacgggaagag 5622882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 206 - 353
Target Start/End: Original strand, 43079347 - 43079494
Alignment:
Q  206 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgga 305  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  43079347 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggcaaggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 43079446  T
Q  306 aaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggc 353  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  43079447 aaaatcgtggtacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggc 43079494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 206 - 345
Target Start/End: Original strand, 43081722 - 43081861
Alignment:
Q  206 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgga 305  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  43081722 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggcaaggcaaagtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 43081821  T
Q  306 aaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggt 345  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  43081822 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggt 43081861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 332 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 2468511 - 2468361
Alignment:
Q  332 cgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagacct 431  Q
    ||||||||||||||||| |||  || ||||||| |||| |||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  2468511 cgtggcacgatggtgcgctggatgcgaataacagaaacgtattttttagtgcagatttgttccaaatgttaagcgatacttttactataaatatagacct 2468412  T
Q  432 tgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 482  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  2468411 tgtatcaaagtaaactttgagatagagggagctgaaacaaggatttagaaa 2468361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 410 - 574
Target Start/End: Complemental strand, 35872713 - 35872555
Alignment:
Q  410 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 509  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||    
T  35872713 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaac-----aactagggtttgtata 35872619  T
Q  510 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactatta 574  Q
    ||||||||||||| | ||  |||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  35872618 gagtttgtctcttggaaacgaacactagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactatta 35872555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 545 - 747
Target Start/End: Original strand, 31035252 - 31035459
Alignment:
Q  545 gggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttg 642  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||||| ||||| || | |||||  ||||||||| ||||||||||||   || ||||||||||||    
T  31035252 gggttgattcaccttggg-aaacaccgttatgattgagtctcttggtcacaggaagagattgagactttaggtagaattaggtttgaagacttattcttg 31035350  T
Q  643 taaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcat-atagtggatcagagggctgctctctcccccagacta--ggtaaat-ttggaccgaactgggt 738  Q
    ||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||  ||| | | ||||||||||||||||    
T  31035351 taaccctttgatatctctttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactataggtcagtattggaccgaactgggt 31035450  T
Q  739 caacaaatt 747  Q
     ||||||||    
T  31035451 aaacaaatt 31035459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 533 - 709
Target Start/End: Original strand, 181622 - 181799
Alignment:
Q  533 actagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactatt-aggattgagtct-ttggttacg--gaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgg 628  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||| |||||| ||||| || ||||||  | |||||  || ||||||||||||||||||||||    
T  181622 actagggtttgaaggttgattcaccttggg-aaacactatttaggattaagtctcttagttacgcgggaagagaatgggactttgggtagaattaggcgg 181720  T
Q  629 gagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctccccc 709  Q
     |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||| | |||| | ||||||||||||||    
T  181721 aagacttattcttgtaacccattgatatctctttgtaaagttactcatc--atagtgaaacagatgactgctctctccccc 181799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 409 - 505
Target Start/End: Original strand, 181536 - 181632
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 505  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  181536 acttttactataaatatagactttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggcttagaatggcaacaataaaactagggtttg 181632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 616 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 2468259 - 2468126
Alignment:
Q  616 tagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcat-atagtggatcagagggctgctctctcccccagac 713  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||| |||||||||||| |||||| |  |||||||||||||||| ||||||     
T  2468259 tagaattagacgggagacttattcttgtagcccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaatagagggctgctctctctcccagat 2468160  T
Q  714 taggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 747  Q
    ||||| ||||||||| ||||| ||| ||||||||    
T  2468159 taggtcaatttggacagaactaggtaaacaaatt 2468126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 443 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 37214512 - 37214374
Alignment:
Q  443 aaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaact-------------------agggtttgtatagagtttgtctcttc 523  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                   |||||||||||||||||||||||||     
T  37214512 aaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaacttggttacgggaagagattgagggtttgtatagagtttgtctcttt 37214413  T
Q  524 ggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggg 562  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  37214412 ggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggg 37214374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 239 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 28252093 - 28252008
Alignment:
Q  239 aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggg 324  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28252093 aatcgtggcacgatggctaggcaacgtggtacgattggaggtttcaagttt-gaggcaaagcactggaaaaatcgtggcacgatggg 28252008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 371 - 583
Target Start/End: Original strand, 31035029 - 31035238
Alignment:
Q  371 tatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgaga--tagagggggctgaa 467  Q
    ||||||||||  || ||||||||||| |||| || || | |||||||| ||||||||||||||||||| | | |||||||||||  ||||| |  |||||    
T  31035029 tatttttgggctcagatttgttccaattttttag-gatatttttactataaatatagaccttgtatcagatgtaaactttgagaggtagagagt-ctgaa 31035126  T
Q  468 a-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaa 566  Q
    | ||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||||||   || ||||||| |||| ||||||    
T  31035127 aacaatggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt--gggattgattcacctt-gggaaa 31035221  T
Q  567 cactattaggattgagt 583  Q
    ||| |||||||||||||    
T  31035222 caccattaggattgagt 31035238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 548 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 31578476 - 31578273
Alignment:
Q  548 ttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaa 645  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||| ||||| | || |||||  || |||||||||||||||||||   || |||| ||||||||||    
T  31578476 ttgattcaccttggg-aaacactgttatgattgagtctcttggtcatgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaa 31578378  T
Q  646 accattgatttctcttt-gtaacgttactcatcat-atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaat-ttggaccgaactgggtcaac 742  Q
     |  ||||| ||||||| |||| |||||||||||| |||||||| | |||  ||||||||||||| ||||||||| | | | |||||||||||||| |||    
T  31578377 ccttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagaactgctctctcccctagactaggtcagtataggaccgaactgggtaaac 31578278  T
Q  743 aaatt 747  Q
    |||||    
T  31578277 aaatt 31578273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 694 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 37214314 - 37214258
Alignment:
Q  694 ggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37214314 ggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 37214258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 234 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 3886412 - 3886330
Alignment:
Q  234 tgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagt-ttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtgg 315  Q
    |||| ||||||| || ||||||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3886412 tgcagaatcgtgacatgatggctggacaacgtggcacgatggaggtttcagttttttgaggcaagacactggaaaaatcgtgg 3886330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 239 - 323
Target Start/End: Original strand, 4423868 - 4423952
Alignment:
Q  239 aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatgg 323  Q
    ||||||||||| || ||  ||||||||||||| || |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4423868 aatcgtggcacaattgctgggcaacgtggcacaattggaggtttcagtttta-aggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatgg 4423952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 650 - 747
Target Start/End: Original strand, 6376229 - 6376328
Alignment:
Q  650 ttgatttctctttgtaacgttactcatcat-atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 747  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||| | | ||||||||||||  || ||||||||    
T  6376229 ttgatatctctttgtaaagttactcatcattatagtggaacagaaggctgctctctccctcagactaggtcagtattggaccgaacttagtaaacaaatt 6376328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 564 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 9021289 - 9021099
Alignment:
Q  564 aaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctt 661  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||  ||   || ||||||    
T  9021289 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctt 9021194  T
Q  662 tgtaacgttactc--atca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt-aaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttgt 752  Q
    ||||| |  ||||  |||| |||||| |||| ||| |||||||||||| ||||||||||| |   || ||||||||||||| |||||||||||||    
T  9021193 tgtaaagaaactcatatcattatagtagatcggagagctgctctctccaccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattcttgt 9021099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 564 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 16757449 - 16757266
Alignment:
Q  564 aaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctt 661  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||  |||   | ||||||    
T  16757449 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctctt 16757354  T
Q  662 tgtaacgttactca-tca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt-aaatttggaccgaactgggtcaacaaat 746  Q
    ||||| |  ||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |   || ||||||||||||| |||||||    
T  16757353 tgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 16757266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 632 - 707
Target Start/End: Complemental strand, 35872553 - 35872477
Alignment:
Q  632 acttattcttgtaaaccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctccc 707  Q
    ||||||| |||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  35872553 acttatttttgtaagccattgatatctcttttgtaacattactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccc 35872477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 548 - 676
Target Start/End: Complemental strand, 31573924 - 31573794
Alignment:
Q  548 ttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 645  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||  ||||||||||||||||||||||   | ||||| ||||||||||    
T  31573924 ttgattcaccttggg-aaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaa 31573826  T
Q  646 accattgatttctc-tttgtaacgttactcat 676  Q
      | ||||| |||| ||||||| |||||||||    
T  31573825 ttctttgatatctcttttgtaaagttactcat 31573794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 564 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 4812669 - 4812486
Alignment:
Q  564 aaacactattaggattgagtc-tttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctt 661  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||  |||   | ||||||    
T  4812669 aaacactattaggattgagtcttttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctctt 4812574  T
Q  662 tgtaacgttactca-tca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt-aaatttggaccgaactgggtcaacaaat 746  Q
    ||||| |  | ||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| | | || ||||||||||||| |||||||    
T  4812573 tgtaaagaaaatcattcattatagtggatcggagagctgctctctccccaagactaggtcataattagaccgaactgggtaaacaaat 4812486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 564 - 746
Target Start/End: Original strand, 28327908 - 28328091
Alignment:
Q  564 aaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctt 661  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||  |||   | ||||||    
T  28327908 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctctt 28328003  T
Q  662 tgtaacgttactca-tca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt-aaatttggaccgaactgggtcaacaaat 746  Q
    ||||| |  ||||| ||| ||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| |   || ||||||||||||| |||||||    
T  28328004 tgtaaagaaactcattcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 28328091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 567 - 752
Target Start/End: Original strand, 590797 - 590984
Alignment:
Q  567 cactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgt 664  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||  |||   | |||||||||    
T  590797 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctctttgt 590892  T
Q  665 aacgttactc--atca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaat--ttggaccgaactgggtcaacaaattcttgt 752  Q
    || |  ||||  |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| | ||  || ||||||||||||| || ||||||||||    
T  590893 aaagaaactcatatcattatagtggatcagagagctgttctctcccccagactagg-acatcattagaccgaactgggtaaataaattcttgt 590984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 680 - 744
Target Start/End: Original strand, 4696625 - 4696689
Alignment:
Q  680 atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 744  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||| ||||||||||||||||    
T  4696625 atagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggatcgaactgggtcaacaa 4696689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 680 - 744
Target Start/End: Original strand, 9765848 - 9765912
Alignment:
Q  680 atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 744  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  9765848 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 9765912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 366 - 438
Target Start/End: Original strand, 17847484 - 17847556
Alignment:
Q  366 aaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatca 438  Q
    |||||||||||  | | || |||||||||||||||| || || |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17847484 aaacatattttcagcttcagatttgttccaaattttgagggatacttttactataaatatagaccttgtatca 17847556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 680 - 744
Target Start/End: Original strand, 26403259 - 26403323
Alignment:
Q  680 atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 744  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  26403259 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 26403323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 700 - 751
Target Start/End: Complemental strand, 10930243 - 10930192
Alignment:
Q  700 tctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttg 751  Q
    ||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10930243 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatttcttg 10930192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 564 - 625
Target Start/End: Complemental strand, 16752704 - 16752643
Alignment:
Q  564 aaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg 625  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  16752704 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 16752643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 563 - 718
Target Start/End: Original strand, 17847677 - 17847828
Alignment:
Q  563 gaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc- 659  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||| | |||| |||||  ||||||||||||||||||||||   | ||||| |||||||| |||| ||||| ||||     
T  17847677 gaaacactattaggattgaatctcttgatcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgt-aacctttgatatctct 17847775  T
Q  660 tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt 718  Q
    |||||||    | ||||  |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17847776 tttgtaa----aatcat--tatagtggaatggagggctgctctctcccccagactaggt 17847828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 564 - 625
Target Start/End: Original strand, 28895502 - 28895563
Alignment:
Q  564 aaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg 625  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  28895502 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 28895563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 564 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 17799606 - 17799416
Alignment:
Q  564 aaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctt 661  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||| ||| |||||||   | ||||| |||||| |||  ||   || ||||||    
T  17799606 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgagac-ttgagtataattaggtttgaagactgattcttataactca---atatctctt 17799511  T
Q  662 tgtaacgttactc--atca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt-aaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttgt 752  Q
    ||||| |  ||||  |||| ||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||| |   || ||||||||||||| |||||||||||||    
T  17799510 tgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctctcccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattcttgt 17799416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 680 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 7412409 - 7412345
Alignment:
Q  680 atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 744  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||||||| | ||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  7412409 atagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 7412345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 700 - 744
Target Start/End: Original strand, 15212910 - 15212954
Alignment:
Q  700 tctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 744  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  15212910 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 15212954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 680 - 744
Target Start/End: Original strand, 23799606 - 23799670
Alignment:
Q  680 atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 744  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| ||| | ||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  23799606 atagtggattggagggctgctctctcctccaaattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 23799670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 679 - 746
Target Start/End: Original strand, 25684758 - 25684826
Alignment:
Q  679 tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt-aaatttggaccgaactgggtcaacaaat 746  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |   || ||||||||||||| |||||||    
T  25684758 tatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 25684826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 700 - 744
Target Start/End: Original strand, 27811402 - 27811446
Alignment:
Q  700 tctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 744  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  27811402 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 27811446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 679 - 746
Target Start/End: Original strand, 28890881 - 28890949
Alignment:
Q  679 tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt-aaatttggaccgaactgggtcaacaaat 746  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |   || ||||||||||||| |||||||    
T  28890881 tatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 28890949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 680 - 744
Target Start/End: Original strand, 31071258 - 31071322
Alignment:
Q  680 atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 744  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||| |||||||||    
T  31071258 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactcggtcaacaa 31071322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 700 - 744
Target Start/End: Original strand, 33352274 - 33352318
Alignment:
Q  700 tctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 744  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  33352274 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 33352318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 700 - 744
Target Start/End: Original strand, 40321204 - 40321248
Alignment:
Q  700 tctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 744  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  40321204 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 40321248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 700 - 743
Target Start/End: Original strand, 4733830 - 4733873
Alignment:
Q  700 tctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaaca 743  Q
    ||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  4733830 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaaca 4733873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 681 - 744
Target Start/End: Original strand, 19752424 - 19752487
Alignment:
Q  681 tagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 744  Q
    ||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||| |||||||||    
T  19752424 tagtggattggagagctgctctctcccctagactaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 19752487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 567 - 718
Target Start/End: Complemental strand, 29554964 - 29554812
Alignment:
Q  567 cactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaatta-ggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgt 664  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||||||| |   | | ||||||||||| ||  ||   || |||||||||    
T  29554964 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattatgtttgaatacttattcttggaactca---atatctctttgt 29554869  T
Q  665 aacgttactc--atca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt 718  Q
    || |  ||||  |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29554868 aaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggt 29554812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 567 - 625
Target Start/End: Original strand, 33032657 - 33032715
Alignment:
Q  567 cactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg 625  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  33032657 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 33032715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 564 - 625
Target Start/End: Original strand, 28332631 - 28332692
Alignment:
Q  564 aaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg 625  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||  ||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  28332631 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgagaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 28332692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 691 - 744
Target Start/End: Original strand, 5702523 - 5702576
Alignment:
Q  691 gagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 744  Q
    ||||| |||||||||||||| | ||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  5702523 gagggatgctctctcccccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 5702576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 706 - 750
Target Start/End: Original strand, 14477547 - 14477592
Alignment:
Q  706 ccccagactaggtaaatttggaccgaactg-ggtcaacaaattctt 750  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  14477547 ccccagactaggtcaatttggatcgaactgcggtcaacaaattctt 14477592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 721 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 35872476 - 35872447
Alignment:
Q  721 atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35872476 atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 35872447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 700 - 741
Target Start/End: Original strand, 40221869 - 40221910
Alignment:
Q  700 tctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaa 741  Q
    ||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||    
T  40221869 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaa 40221910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0250 (Bit Score: 361; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0250
Description:

Target: scaffold0250; HSP #1
Raw Score: 361; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 247 - 745
Target Start/End: Original strand, 2670 - 3168
Alignment:
Q  247 cacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggt 345  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2670 cacgattgctaggcaacgtggcacgattggaggtttcagtttt-gaggcaaggtactggaaaaatcgtggcacgatgggatcgcatcgtggcacgatggt 2768  T
Q  346 gcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaa 445  Q
    ||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||    
T  2769 gcgctggcagcgaataacataaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaacttgtatcagagcaaa 2868  T
Q  446 ctttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtg 545  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2869 ctttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtg 2968  T
Q  546 ggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgta 644  Q
    ||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2969 ggttgattcacctt-ggaaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggcttggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgta 3067  T
Q  645 aaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 744  Q
    | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  3068 acccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctatctccccgagactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaa 3167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 361; Significance: 0; HSPs: 136)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 361; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 206 - 770
Target Start/End: Original strand, 3878322 - 3878894
Alignment:
Q  206 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgg 304  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||| |||||||    
T  3878322 tgtgagagttaacttaaaatcagatttctgcagaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcacgattggaggtttcaagttt-gaggcaaagcactgg 3878420  T
Q  305 aaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaag 404  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  3878421 aaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtacgctggcagcgaataacagaaacgtatttt-gggtgcagatttgttccaaattttaag 3878519  T
Q  405 cgaaacttttactacaaat----atagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaacta 498  Q
    ||| |||||||||| ||||    ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3878520 cgatacttttactataaattaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaacta 3878619  T
Q  499 gggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaa 597  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||| |||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  3878620 gggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacgctagggcttgtgggttgattcacctt-ggtaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 3878718  T
Q  598 agaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggc 696  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3878719 agaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggc 3878818  T
Q  697 tgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattc--ttgtatttttctcttctttgtg 770  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||    
T  3878819 tgctctctcccccagactatgttaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtg 3878894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 205 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 27306768 - 27306222
Alignment:
Q  205 atgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactg 303  Q
    |||||||| ||||||| |||| || ||| |||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| || ||    
T  27306768 atgtgagagttaacttaaaataaggttt-tgcaaaatcgtggcacgatggctggacaacgtggcacgattggaggtttcagtttt-gaggcaagtcattg 27306671  T
Q  304 gaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaa 403  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27306670 gaaaaatcgtggcacgatggggtcgcttcgtggcacgatggtgcgctagcagcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaa 27306571  T
Q  404 gcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 503  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27306570 gcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 27306471  T
Q  504 tgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagagg 602  Q
    | ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  27306470 t-tatagagtttgtctctttggaacaaaaactagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagg 27306373  T
Q  603 ctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctc 701  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  27306372 ctgggactttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgcaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctc 27306273  T
Q  702 tctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttgt 752  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27306272 tctcccctagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattcttgt 27306222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 243 - 770
Target Start/End: Original strand, 25542317 - 25542845
Alignment:
Q  243 gtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacga 341  Q
    |||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25542317 gtggcacgattgctgggcaacgtggcacgattggaggtttcagtttta-aggcaaggcacttgaaaaatcgtggcacgatgggatcgcatcgtggcacga 25542415  T
Q  342 tggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgg-gtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaa 440  Q
    ||||||| ||||||| || |||| |||||||||||| | ||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  25542416 tggtgcgctggcagcgaaaaacagaaacatattttttgagtgtagatttattccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcaga 25542515  T
Q  441 gcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggt 540  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25542516 gcaaactttgagatagagggg-ctgaaacaaaggtttagaaaggtaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaaaaaacactagggt 25542614  T
Q  541 ttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattc 639  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||| |||||||| | ||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25542615 ttgtgggttgattcaccttgg--aaagactattaggattgagtctcttggttacaggaagagactgggactttgggtagaattatgcgggagacttattc 25542712  T
Q  640 ttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtc 739  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25542713 ttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagagctgctctctcccctagactaggttaatttggaccgaactgggtc 25542812  T
Q  740 aacaaattc--ttgtatttttctcttctttgtg 770  Q
    |||||||||  |||| |||||||||||||||||    
T  25542813 aacaaattcttttgtgtttttctcttctttgtg 25542845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 239 - 770
Target Start/End: Original strand, 35412 - 35946
Alignment:
Q  239 aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggc 337  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35412 aatcgtggcacgattgctaggcaacgtggcacgattggaggtttcaagttt-gaggcaaagcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggc 35510  T
Q  338 acgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatc 437  Q
     |||| ||||| |||||||||||| || |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35511 ccgatcgtgcgctggcagcaaatagcagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatc 35610  T
Q  438 aaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactag 537  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  35611 agagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggttcagaaagacaacaacaaaactagggtttgtgtagagtttgtctctttggaacaaacactag 35710  T
Q  538 ggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagactta 636  Q
    | |||| |||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35711 gttttgagggttgattcacctt-gggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagactta 35809  T
Q  637 ttcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactg 735  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  35810 ttcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagagctgctttctcccctagactaggtcaatttggaccgaactg 35909  T
Q  736 ggtcaacaaa--ttcttgtatttttctcttctttgtg 770  Q
    | ||||||||  || |||| || ||||||||||||||    
T  35910 gatcaacaaatttttttgtgttcttctcttctttgtg 35946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 239 - 770
Target Start/End: Original strand, 44347 - 44881
Alignment:
Q  239 aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggc 337  Q
    ||||||||||||||  |  ||||| |||||||||| ||||||||||  ||| || |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  44347 aatcgtggcacgatttctgggcaatgtggcacgattggaggtttcaagttt-gacgcaaagcactggaaaaatcatggcacgatggggtcgcatcgtggc 44445  T
Q  338 acgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatc 437  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44446 acgatggtgcgctggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcagatttgtaccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatc 44545  T
Q  438 aaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactag 537  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  44546 agagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtgtagagtttgtctctttggaacaaacactag 44645  T
Q  538 ggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtc-tttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagactta 636  Q
    | |||| |||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  44646 gttttgagggttgattcacctt-aggaaacactattatgattgagtcttttggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattatgtgggagactta 44744  T
Q  637 ttcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactg 735  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||  |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  44745 ttcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggatagctgctttctcccccagactaggtcaatttggaccgaactg 44844  T
Q  736 ggtcaacaaattc--ttgtatttttctcttctttgtg 770  Q
    |||||||||||||  |||| || ||||||||||||||    
T  44845 ggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtg 44881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 330 - 770
Target Start/End: Complemental strand, 1049710 - 1049267
Alignment:
Q  330 atcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagac 429  Q
    |||||||||||| |||||| |||| || ||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1049710 atcgtggcacgaaggtgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagac 1049611  T
Q  430 cttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaaga 529  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1049610 cttgtattagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaata 1049511  T
Q  530 aacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgg 628  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1049510 aacactagggtttgtgggttgattcacctt-gggaaacactatcaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgg 1049412  T
Q  629 gagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggac 728  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1049411 gagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgatactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggac 1049312  T
Q  729 cgaactgggtcaacaaattcttgt---atttttctcttctttgtg 770  Q
    |||||||||||||||||||||| |    |||||||||||||||||    
T  1049311 cgaactgggtcaacaaattcttttgtgttttttctcttctttgtg 1049267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 206 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 40837261 - 40836737
Alignment:
Q  206 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgga 305  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40837261 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgatggtcggacaacgtggcacgatggaggtttcagttttttaggcaaggcactgga 40837162  T
Q  306 aaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgg-gtgcaaatttgttccaaattttaag 404  Q
    ||||||                     |||||||||||||| | ||||||| || || | |||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||    
T  40837161 aaaatc---------------------gtggcacgatggtgtgctggcagcgaaaaatagaaacatattttttgagtgcagatttgttccaaattttaag 40837083  T
Q  405 cgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 504  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40837082 ggaaacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaatttggagattgagggggctgaaagaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 40836983  T
Q  505 gtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggc 603  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  40836982 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggc 40836884  T
Q  604 tgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctc 703  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40836883 tgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctc 40836784  T
Q  704 tcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40836783 tcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 40836737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 239 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 31435553 - 31435040
Alignment:
Q  239 aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggc 337  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||    |||||||||||||||||| || | ||||    
T  31435553 aatcgtggcacgatagctgggcaaagtggcacgattggaggtttcagtttt-gaggcaagtcactggatttttcgtggcacgatggggtcacaacttggc 31435455  T
Q  338 acgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttg-ggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtat 436  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||||| |||| |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||    
T  31435454 acgatggtgcgctggcaacgaataacagaaacgtatttttttggtgcaaatt-gttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagatcttgtat 31435356  T
Q  437 caaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacacta 536  Q
    || || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||    
T  31435355 cagagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacgcta 31435256  T
Q  537 gggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagactt 635  Q
    ||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| || ||||||    
T  31435255 gggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggaactttgggtagaattaggtggaagactt 31435157  T
Q  636 attcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaac 733  Q
    |||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  31435156 attcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccaaactaggtcaatttgtaccgaac 31435057  T
Q  734 tgggtcaacaaattctt 750  Q
    |||||||||||||||||    
T  31435056 tgggtcaacaaattctt 31435040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 409 - 770
Target Start/End: Original strand, 38393935 - 38394303
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 504  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||    |||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38393935 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 38394034  T
Q  505 gtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggc 603  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  38394035 gtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggc 38394133  T
Q  604 tgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctct 702  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  38394134 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 38394233  T
Q  703 ctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattc--ttgtatttttctcttctttgtg 770  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||    
T  38394234 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtg 38394303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 412 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 7470359 - 7470016
Alignment:
Q  412 tttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 507  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7470359 tttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 7470260  T
Q  508 tagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctga 606  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  7470259 tagagattgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt-gtgaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctga 7470161  T
Q  607 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctc 705  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  7470160 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctccctc 7470061  T
Q  706 ccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7470060 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 7470016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 450 - 770
Target Start/End: Complemental strand, 1047219 - 1046896
Alignment:
Q  450 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggtt 549  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1047219 gagatagagggggctgaaacaggggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 1047120  T
Q  550 gattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaacc 648  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1047119 gattcaccttggg-aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 1047021  T
Q  649 attgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 748  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1047020 attgatttctctttgtaacgatactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccacactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 1046921  T
Q  749 ttgt---atttttctcttctttgtg 770  Q
    || |    |||||||||||||||||    
T  1046920 ttttgtgttttttctcttctttgtg 1046896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 410 - 750
Target Start/End: Original strand, 44724533 - 44724874
Alignment:
Q  410 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 509  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||  | |||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44724533 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaacctggagatatagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 44724632  T
Q  510 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgaga 608  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| ||    
T  44724633 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagaggctggga 44724731  T
Q  609 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctccc 707  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  44724732 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctccc 44724831  T
Q  708 ccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44724832 ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 44724874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 409 - 770
Target Start/End: Original strand, 48457602 - 48457970
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 504  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||    |||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48457602 actttcactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 48457701  T
Q  505 gtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggc 603  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||| || | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  48457702 gtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttcattcacc-tagggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggc 48457800  T
Q  604 tgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctct 702  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  48457801 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 48457900  T
Q  703 ctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattc--ttgtatttttctcttctttgtg 770  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||    
T  48457901 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtg 48457970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 386 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 31156271 - 31155908
Alignment:
Q  386 atttgttccaaattt-taagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagg 484  Q
    ||||||||||||||| | ||| | |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31156271 atttgttccaaatttatgagctatacttttactataaatatagagcttgtatcaaggcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagg 31156172  T
Q  485 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggatt-gagt 583  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  31156171 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactaggatttgtgggttgattcacctt-gggaaacactattaggattggagt 31156073  T
Q  584 ct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatata 682  Q
    || |||| ||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  31156072 ctcttgggtacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcctata 31155973  T
Q  683 gtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 747  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  31155972 gtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 31155908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 412 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 7472317 - 7471974
Alignment:
Q  412 tttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 507  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7472317 tttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgta 7472218  T
Q  508 tagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctga 606  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||     
T  7472217 tagagattgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgg 7472119  T
Q  607 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctc 705  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  7472118 aactttgggtagaattaggcgggacacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctctc 7472019  T
Q  706 ccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7472018 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 7471974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 409 - 750
Target Start/End: Original strand, 3035670 - 3036019
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 504  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||    |||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3035670 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 3035769  T
Q  505 gtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacgg---aaaga 600  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    ||||    
T  3035770 ttatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaaga 3035868  T
Q  601 ggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgc 699  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||  |||||||||    
T  3035869 ggctgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgcaacgatactcatcatatagtggattggagggctgc 3035968  T
Q  700 tctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3035969 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 3036019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 420 - 750
Target Start/End: Original strand, 20625998 - 20626333
Alignment:
Q  420 aaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 515  Q
    ||||||||||||| ||||| |  |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20625998 aaatatagaccttctatcagactaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 20626097  T
Q  516 gtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgg 614  Q
    |||| || |||| |||||||||| |||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  20626098 gtctgtttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgg 20626196  T
Q  615 gtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagac 713  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20626197 gtagaattaggatggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagac 20626296  T
Q  714 taggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20626297 taggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 20626333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 420 - 750
Target Start/End: Original strand, 20629889 - 20630224
Alignment:
Q  420 aaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 515  Q
    ||||||||||||| ||||| |  |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20629889 aaatatagaccttctatcagactaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 20629988  T
Q  516 gtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgg 614  Q
    |||| || |||| |||||||||| |||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  20629989 gtctgtttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgg 20630087  T
Q  615 gtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagac 713  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20630088 gtagaattaggatggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagac 20630187  T
Q  714 taggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20630188 taggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 20630224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 420 - 750
Target Start/End: Original strand, 20642308 - 20642643
Alignment:
Q  420 aaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 515  Q
    ||||||||||||| ||||| |  |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20642308 aaatatagaccttctatcagactaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 20642407  T
Q  516 gtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgg 614  Q
    |||| || |||| |||||||||| |||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  20642408 gtctgtttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgg 20642506  T
Q  615 gtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagac 713  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20642507 gtagaattaggatggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagac 20642606  T
Q  714 taggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20642607 taggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 20642643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 409 - 750
Target Start/End: Original strand, 40946277 - 40946623
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagat----agagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 504  Q
    ||||| |||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40946277 actttcactataaatataaaccttgtttcatagcaaactttgagagggacagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 40946376  T
Q  505 gtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggc 603  Q
    |||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||| | ||| || |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||    
T  40946377 gtatagagtttgtctcttagaaacaaacactagggtttgtgggttgatt-tactttggaaaacactattaggattgagtctcttagttacgggaagaggc 40946475  T
Q  604 tgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctct 702  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  40946476 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcgaagggctgctct 40946575  T
Q  703 ctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40946576 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 40946623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 450 - 770
Target Start/End: Original strand, 1849975 - 1850298
Alignment:
Q  450 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggtt 549  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  1849975 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaaaaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgtgggtt 1850074  T
Q  550 gattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaacc 648  Q
    ||||| |||| || |||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1850075 gattcacctt-ggaaaacactattaggattgagtttcttgcttacgggaagaggctgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 1850173  T
Q  649 attgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 747  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1850174 attgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 1850273  T
Q  748 c--ttgtatttttctcttctttgtg 770  Q
    |  |||| || ||||||||||||||    
T  1850274 cttttgtgttcttctcttctttgtg 1850298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 409 - 750
Target Start/End: Original strand, 20299407 - 20299755
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaa-gggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 503  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||    |||||||    |||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  20299407 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaaggggtttagaatgacaacaacaaaactagggtt 20299506  T
Q  504 tgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactaggg-tttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagag 601  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  20299507 tgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggttttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 20299605  T
Q  602 gctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgct 700  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  20299606 gctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggttgct 20299705  T
Q  701 ctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20299706 ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 20299755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 409 - 770
Target Start/End: Original strand, 18345490 - 18345858
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgag----atagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 504  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||     |||||||||    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18345490 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctgaactttgagggagatagagggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 18345589  T
Q  505 gtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggc 603  Q
    |||||||||||||||||| | || ||| |||||| |||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||    
T  18345590 gtatagagtttgtctctttgcaacaaatactaggttttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagaggc 18345688  T
Q  604 tgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctct 702  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  18345689 tgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgttct 18345788  T
Q  703 ctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattc--ttgtatttttctcttctttgtg 770  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||    
T  18345789 ctcccccagactaggtcaatttggaccgagctgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtg 18345858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 410 - 750
Target Start/End: Original strand, 11355212 - 11355553
Alignment:
Q  410 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 509  Q
    ||||||||| |||||||| | ||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11355212 cttttactataaatataggctttgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 11355311  T
Q  510 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgaga 608  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||  |||||    
T  11355312 gagtttgtctcttggcaataaacactagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattgaga 11355410  T
Q  609 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttc-tctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctccc 707  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || | ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  11355411 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatcttttttgtaacgtttctcatcatatagtggaacagagagctgctctctccc 11355510  T
Q  708 ccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    | |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11355511 ctagactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 11355553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 409 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 13099812 - 13099468
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 508  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13099812 acttttactataaatatagaccttgaatcaaagtaaaccttgagatagagggggttgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtat 13099713  T
Q  509 agagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgag 607  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||  || |    
T  13099712 agagtttgtctctttggaacaaacactagagtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagagattggg 13099614  T
Q  608 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc--tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctct 704  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||  ||||||| ||||||||||| ||||||| | | ||||||||||||||    
T  13099613 gctttgggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctct 13099514  T
Q  705 cccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13099513 cccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 13099468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 206 - 645
Target Start/End: Original strand, 26804345 - 26804761
Alignment:
Q  206 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgg 304  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||| | || |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  26804345 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctacagaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggtacgattggaggtttcagtttt-gaggcaaggcagtgg 26804443  T
Q  305 aaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaag 404  Q
    |||||||                     |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  26804444 aaaaatc---------------------gtggcacgatggtgcgctggcagcaaataacagaaacgtatttt-gggtgcagatttgttccaaattttaag 26804521  T
Q  405 cgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 504  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||     || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26804522 cgatacttttactataaatatagaccttgtg----agtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 26804617  T
Q  505 gtatagagtttgtctcttcggaagaaacac---tagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaaga 600  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||   ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  26804618 gtatagagtttgtctctttggaacaaacactagtagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggatttagtctcttggttacgggaaga 26804716  T
Q  601 ggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 645  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26804717 ggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 26804761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 409 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 42331335 - 42330991
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 508  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||    
T  42331335 acttttactataaatatagactttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactaaggtttgtat 42331236  T
Q  509 agagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggtt--acggaaagaggctg 605  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||  ||    
T  42331235 agagtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacacgggaagagattg 42331137  T
Q  606 agactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctct 704  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||| |||||||| | | |||||||  |||||    
T  42331136 agactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcattatatagtgaaacggagggctattctct 42331037  T
Q  705 cccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42331036 cccccagattaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 42330991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 409 - 770
Target Start/End: Complemental strand, 43253860 - 43253489
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagaggg--------ggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagg 500  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||    ||||||||||| |||| |        ||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||    
T  43253860 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagagagaaagagggctgaaacaaggttttagaatgacaacaacaaaactagg 43253761  T
Q  501 gtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaag 599  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  43253760 gtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagg-tttgagggttgattcaccttggg-aaacactattaggattgagtctcttgattacggaaag 43253663  T
Q  600 aggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctg 698  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43253662 aggctgagactttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctg 43253563  T
Q  699 ctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattc--ttgtatttttctcttctttgtg 770  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||  |||| || ||||||||||||||    
T  43253562 ctctctccctcagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaataaattcttttgtgttcttctcttctttgtg 43253489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 450 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 7351947 - 7351649
Alignment:
Q  450 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggtt 549  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  7351947 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggctttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 7351848  T
Q  550 gattctccttggggaaacactattaggattg-agtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaac 647  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  7351847 gattcaccttggg-aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacc 7351749  T
Q  648 cattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 747  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  7351748 cattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccatactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 7351649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 409 - 750
Target Start/End: Original strand, 20297311 - 20297657
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 504  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||    |||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  20297311 acttttactaaaaatatggaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaataaaactagggttt 20297410  T
Q  505 gtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggc 603  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||      
T  20297411 gtatagagtttgtctcttgggaacaaacagtagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagat 20297509  T
Q  604 tgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctct 702  Q
    || | |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  20297510 tggggctttgggtagaaataggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggattggagggctgctct 20297609  T
Q  703 ctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20297610 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaataaattctt 20297657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 450 - 750
Target Start/End: Original strand, 28487547 - 28487848
Alignment:
Q  450 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggtt 549  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||||||    
T  28487547 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggtaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctcttcgaaactaacactagggttcgtgggtt 28487646  T
Q  550 gattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaacc 648  Q
    ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||  || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28487647 gattcacctt-tggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 28487745  T
Q  649 attgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 747  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28487746 attgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaatcagagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaatt 28487845  T
Q  748 ctt 750  Q
    |||    
T  28487846 ctt 28487848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 409 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 7349615 - 7349285
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 502  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||    |||||||||||      ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7349615 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagatagagggggctgaaacaggggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 7349516  T
Q  503 ttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattg-agtct-ttggttacggaaaga 600  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  7349515 ttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggg-aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaaga 7349417  T
Q  601 ggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgct 700  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  7349416 gattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgct 7349317  T
Q  701 ctctcccccagactaggtaaatttggaccgaa 732  Q
    |||||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  7349316 ctctcccccagactaggtcagattggaccgaa 7349285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 200; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 410 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 20137444 - 20137103
Alignment:
Q  410 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 509  Q
    ||||||||| |||||| | | |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20137444 cttttactataaatattggctttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtata 20137345  T
Q  510 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgaga 608  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||| ||| |||||| |||||  || ||    
T  20137344 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaagattgagtctcttgattacgggaagagattggga 20137246  T
Q  609 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcc 706  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||| | | |||||||||||||| |    
T  20137245 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctct-c 20137147  T
Q  707 cccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20137146 cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 20137103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 411 - 750
Target Start/End: Original strand, 21990106 - 21990445
Alignment:
Q  411 ttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 510  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||| || |||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| | |||||||||    
T  21990106 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctggagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactatgatttgtatag 21990204  T
Q  511 agtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagac 609  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||  |||| |    
T  21990205 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgag-aaacactattagaattgagtctcttggttacgggaagagattgaggc 21990303  T
Q  610 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccc 708  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21990304 tttgagtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacagagggctgctctctcccc 21990403  T
Q  709 cagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21990404 aagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 21990445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 409 - 770
Target Start/End: Original strand, 28485515 - 28485882
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 504  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||    |||||||    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28485515 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagaaggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 28485614  T
Q  505 gtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggc 603  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||      
T  28485615 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgcgggttgattcacctt-tggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagat 28485713  T
Q  604 tgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctct 702  Q
    || | ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||    
T  28485714 tggggctttgagtataattaggcgggagatttattcttgtaatccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatataatgaatcagagggttgctct 28485813  T
Q  703 ctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattc--ttgtatttttctcttctttgtg 770  Q
    || || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||    
T  28485814 ct-cctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttattctcttctttgtg 28485882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 409 - 750
Target Start/End: Original strand, 443548 - 443891
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 508  Q
    |||||||||| |||||||||| ||| |||| || |||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  443548 acttttactataaatatagactttgaatcagagtaaaccttgagatagagggagctaaaacaatggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtat 443647  T
Q  509 agagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgag 607  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||  || |    
T  443648 agagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttgattacgggaagagattggg 443746  T
Q  608 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctct-c 705  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||| |    
T  443747 actttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatctcttttataacgttactcatcatatagtgaaacgaagggctgctctctcc 443846  T
Q  706 ccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  443847 cccccgactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 443891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 410 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 4296271 - 4295928
Alignment:
Q  410 cttttactacaaatatagacctt-gtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 508  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  4296271 cttttactataaatatagacatttgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtat 4296172  T
Q  509 agagtttgtctcttcgg-aagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctga 606  Q
    |||||||||||||| || || |||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  ||     
T  4296171 agagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgatggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgg 4296073  T
Q  607 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctc 705  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||    
T  4296072 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacagagggctgctatctc 4295973  T
Q  706 ccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4295972 ccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtgaacaaattctt 4295928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 410 - 752
Target Start/End: Original strand, 21678020 - 21678363
Alignment:
Q  410 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 509  Q
    ||||||||| |||||||||  ||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21678020 cttttactataaatatagatattgtatcaatgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacatcaaaactagggtttgtata 21678119  T
Q  510 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgaga 608  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||   || ||    
T  21678120 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagatattggga 21678218  T
Q  609 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctccc 707  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | || ||||||| |||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  21678219 ctttgggtagcattaggcgggagacgtattcttgtaacccattgatatatcttttgtaaggttacttatcatatagtgaaacagtgggctgctctctccc 21678318  T
Q  708 ccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttgt 752  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21678319 ctagactaggttaatttggaccgaactgggacaacaaattcttgt 21678363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 410 - 735
Target Start/End: Original strand, 21679981 - 21680307
Alignment:
Q  410 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 509  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||| |  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21679981 cttttactataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 21680080  T
Q  510 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgaga 608  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||  || ||    
T  21680081 gagtttgtctcttggtaacaaacactagggtttgagggttgattcatctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttaccggaagagattggga 21680179  T
Q  609 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctccc 707  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  21680180 ctttgggtagaattagacgggagatttattcttgtaacccaatgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacagagagctgctctctccc 21680279  T
Q  708 ccagactaggtaaatttggaccgaactg 735  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21680280 ccagactaggtgaatttggaccgaactg 21680307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 411 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 37412462 - 37412119
Alignment:
Q  411 ttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 510  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||| || |||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37412462 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctggagatatagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatag 37412363  T
Q  511 agtttgtctc-ttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgaga 608  Q
    |||||||||| || | || ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| ||| ||    
T  37412362 agtttgtctctttagcaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagactggga 37412264  T
Q  609 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc--tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctc 705  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||||    
T  37412263 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctc 37412164  T
Q  706 ccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    ||| ||||| ||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  37412163 ccctagactgggtcaatttggaccgaactggatcaataaattctt 37412119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 410 - 750
Target Start/End: Original strand, 24748548 - 24748890
Alignment:
Q  410 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 509  Q
    |||||| || |||||||||| ||||||||  | |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  24748548 cttttattataaatatagacattgtatcagtgtaaactttgacttagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaataaaactagggtttgtata 24748647  T
Q  510 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgaga 608  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| || | |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| |||||  || ||    
T  24748648 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccct-gggaaacactattacgattgagtctcttggttccgggaagagattggga 24748746  T
Q  609 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcc 706  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||| | | ||||||||||||||||    
T  24748747 ctttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctctcc 24748846  T
Q  707 cccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
     ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24748847 tccagattaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaattctt 24748890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 239 - 575
Target Start/End: Original strand, 18567396 - 18567731
Alignment:
Q  239 aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggc 337  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||    |||||||||||||||||| || | ||||    
T  18567396 aatcgtggcacgatagctgggcaaagtggcacgattggaggtttcagtttt-gaggcaagtcactggatttttcgtggcacgatggggtcacaacttggc 18567494  T
Q  338 acgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttg-ggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtat 436  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||||| |||| |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||    
T  18567495 acgatggtgcgctggcaacgaataacagaaacgtatttttttggtgcaaatt-gttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagatcttgtat 18567593  T
Q  437 caaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacacta 536  Q
    || || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||    
T  18567594 cagagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacgcta 18567693  T
Q  537 gggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattag 575  Q
    ||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  18567694 gggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattag 18567731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 182; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 443 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 21592445 - 21592137
Alignment:
Q  443 aaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggttt 542  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  21592445 aaactttgagatagagggggctgaaacaaaggtttagaaatgcaacaacaaaagtaggatttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggttt 21592346  T
Q  543 gtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattctt 641  Q
    | |||||||||| |||| || || ||||||||||||| ||||| |||||||||  |||||  || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21592345 gagggttgattcacctt-ggcaagcactattaggatttagtctcttggttacgcgaagagattgggactttgggtagaattaggtgggagacttattctt 21592247  T
Q  642 gtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtca 740  Q
    ||||  ||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21592246 gtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtca 21592147  T
Q  741 acaaattctt 750  Q
    ||||||||||    
T  21592146 acaaattctt 21592137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 409 - 689
Target Start/End: Original strand, 11757177 - 11757464
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaa-gggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 503  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||    |||||||    |||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  11757177 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaaggggtttagaatgacaacaacaaaactagggtt 11757276  T
Q  504 tgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactaggg-tttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagag 601  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  11757277 tgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggttttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 11757375  T
Q  602 gctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatc 689  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11757376 gctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatc 11757464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 410 - 747
Target Start/End: Original strand, 9680768 - 9681112
Alignment:
Q  410 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 504  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| | | |||| ||||||    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  9680768 cttttactataaatatagaccttgtatcagatgtaaaccttgagagagatagagggggttgaaacaagggtttagaagggcaacaacaaaactatggttt 9680867  T
Q  505 gtatagagtttgtctcttcgg-aagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagagg 602  Q
    |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||     
T  9680868 gtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcacc-tcgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaga 9680966  T
Q  603 ctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctc 701  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| | || ||||||| |||||||||||||||||| |   |||||||||||    
T  9680967 ttgagactttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaactcattgatatatcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaatggagggctgctc 9681066  T
Q  702 tctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 747  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||| |||||    
T  9681067 tctcccccagactaggtcaatttggatcgaactaggtcaataaatt 9681112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 410 - 687
Target Start/End: Original strand, 25276095 - 25276374
Alignment:
Q  410 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 509  Q
    ||||||||| |||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25276095 cttttactataaatatatgctttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctaaaacaataatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 25276194  T
Q  510 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgaga 608  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  |||||    
T  25276195 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcatctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgaga 25276293  T
Q  609 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtgga 687  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  25276294 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgga 25276374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 410 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 39146322 - 39145980
Alignment:
Q  410 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 509  Q
    ||||||||| ||||||||||  |||||||  | |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  39146322 cttttactataaatatagacactgtatcagtgtaaaccttgagatggagggggctgaaacaagggtttagatagacaacaacaaaactagggtttgtata 39146223  T
Q  510 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgaga 608  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||  ||  |    
T  39146222 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgaaggttgattcacctt-ggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattggaa 39146124  T
Q  609 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcc 706  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||| | | | |||||||||| | |    
T  39146123 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggggggctgctcttttc 39146024  T
Q  707 cccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    || | ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39146023 cctaaactaggtcaatttgtaccgaactgggtcaacaaattctt 39145980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 410 - 767
Target Start/End: Original strand, 42223110 - 42223471
Alignment:
Q  410 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagg-gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 508  Q
    ||||||||| |||||||| | |||||||| || |||| |||||||||| | ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  42223110 cttttactataaatataggctttgtatcagagtaaaccttgagatagatgtgggatgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtat 42223209  T
Q  509 agagtttgtctcttcgg-aagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctga 606  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  ||     
T  42223210 agagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt-ggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgg 42223308  T
Q  607 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctc 705  Q
      |||||| ||||||||||||| | ||||||||||| || | |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |   || ||||||||||||    
T  42223309 agctttggatagaattaggcggaaaacttattcttgaaacctattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaatggatggctgctctctc 42223408  T
Q  706 ccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttgtatttt-tctcttcttt 767  Q
    ||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||    
T  42223409 ccccatactaggtcaattttgatcgaactgggtcaacaaattcttttgttttctctcttcttt 42223471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 411 - 750
Target Start/End: Original strand, 9679009 - 9679354
Alignment:
Q  411 ttttactacaaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 505  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||| | | |||||||||||    |||||||||||||||||||| | ||||| | |||||||||||||||||||||    
T  9679009 ttttactataaatatagatcttgtatcagatgtaaactttgagagagatagagggggctgaaacaaggatctagaatgacaacaacaaaactagggtttg 9679108  T
Q  506 tatagagtttgtctcttcgg-aagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggc 603  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||| || ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||      
T  9679109 tatagagtttgtctctttggcaacaaacacta-ggtttgaggattgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagat 9679206  T
Q  604 tgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctct 702  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| | | |||  |||||||    
T  9679207 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagtactgctct 9679306  T
Q  703 ctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    ||  |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  9679307 ctttcccagactaggtcaatttggaccagactgggtcaacaaattctt 9679354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 410 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 27832969 - 27832629
Alignment:
Q  410 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggg-gctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 508  Q
    ||||||||| ||||||||    ||||||| ||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  27832969 cttttactataaatataggttgtgtatcagagcaaaccttgtgatagagtggagctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacagaactaaggtttgtat 27832870  T
Q  509 agagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgag 607  Q
    |||||||||||||| | || | ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  ||||    
T  27832869 agagtttgtctcttggcaacatacactagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgag 27832771  T
Q  608 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctt-tgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctc 705  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||| |   ||||||| |||||||    
T  27832770 actttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttctgtaaagttactcatcattatagtgaaatggagggcttctctctc 27832671  T
Q  706 ccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttgt 752  Q
    ||||||||||||| |||||     ||||||||| |||||||||||||    
T  27832670 ccccagactaggtcaattt-----gaactgggtaaacaaattcttgt 27832629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 155; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 431 - 732
Target Start/End: Original strand, 24258438 - 24258744
Alignment:
Q  431 ttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaa 530  Q
    |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | || ||    
T  24258438 ttgtatcagagtaaacattgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaa 24258537  T
Q  531 acactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcggg 629  Q
    |||||| |||||| |||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||| ||||| |||| || ||  ||||||||||| |||||||||||||     
T  24258538 acactatggtttgagggttgattcacctt-ggaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaaaagattgagactttggatagaattaggcgga 24258636  T
Q  630 agacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca----tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaattt 724  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||||    ||||||||| | |||||||||||||||   |||||||||| |||||    
T  24258637 aaacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattattatagtggaacggagggctgctctctctttcagactaggtcaattt 24258736  T
Q  725 ggaccgaa 732  Q
    ||||||||    
T  24258737 ggaccgaa 24258744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 534 - 770
Target Start/End: Original strand, 38396713 - 38396951
Alignment:
Q  534 ctagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggaga 632  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  38396713 ctaggttttgtgggttgattcaccttggg-aaacactgttaggatcgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggaga 38396811  T
Q  633 cttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaa 732  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  38396812 cttatttttgtaacccattgatttctctttgtaactttactcatcatatagtggatcggagggcttctctctccctcagactaggtcaatttggaccgaa 38396911  T
Q  733 ctgggtcaacaaattc--ttgtatttttctcttctttgtg 770  Q
    ||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||    
T  38396912 ctgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtg 38396951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 529 - 770
Target Start/End: Complemental strand, 7092428 - 7092185
Alignment:
Q  529 aaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcg 627  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||  || | |||||||||||||||||||    
T  7092428 aaacactagggtttgagggttgattcaccttggg-aaatactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcg 7092330  T
Q  628 ggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttgg 726  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  7092329 ggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaatgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttgg 7092231  T
Q  727 accgaactgggtcaacaaattc--ttgtatttttctcttctttgtg 770  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||    
T  7092230 accgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtg 7092185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 394 - 687
Target Start/End: Complemental strand, 22251893 - 22251602
Alignment:
Q  394 caaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaa 493  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22251893 caaattttaagcgacacttttactataaatataaaccttgaatcagagtaaactttgagatagaggaggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaa 22251794  T
Q  494 aactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggtta 592  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||  |||||||||| |||||||          ||||||||||||| |||||||    
T  22251793 aactagagtttgtatagagtttgtctatttggaacaaacactagggtttaagggttgattcaccttggg---------ataggattgagtctcttggtta 22251703  T
Q  593 cggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattga----tttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtgg 686  Q
    ||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  22251702 cgggaagagattgaggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctttctcttttgtaaagttactcatcattatagtgg 22251603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 409 - 704
Target Start/End: Complemental strand, 22828969 - 22828672
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 508  Q
    |||||||||| |||||||| | |||||||  || |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22828969 acttttactataaatataggctttgtatccgagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactaaggtttgtat 22828870  T
Q  509 agagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgag 607  Q
    ||||||| ||||||   || ||||||||| |||||  |||||||||   ||  | |||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||  ||||    
T  22828869 agagtttatctcttgaaaacaaacactagagtttgatggttgattcagatt-agaaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagattgag 22828771  T
Q  608 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctct 704  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||  |||||||| | ||||||| | ||||||||||||||||    
T  22828770 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaaattactcattattatagtgaaacagagggctgctctct 22828672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 133; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 535 - 770
Target Start/End: Complemental strand, 7094670 - 7094432
Alignment:
Q  535 tagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagac 633  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||| |||||  || | |||||||||||||||||||||||||    
T  7094670 tagggtttgagggttgattcaccttggg-aaacactattaggattgagtctcttaattacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagac 7094572  T
Q  634 ttattcttgtaaaccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaa 732  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  7094571 ttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaatgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggactgaa 7094472  T
Q  733 ctgggtcaacaaattc--ttgtatttttctcttctttgtg 770  Q
    ||||||||| ||||||  |||| || ||||||||||||||    
T  7094471 ctgggtcaataaattcttttgtgttcttctcttctttgtg 7094432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 563 - 747
Target Start/End: Original strand, 2935374 - 2935560
Alignment:
Q  563 gaaacactattaggattg-agtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctct 660  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2935374 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 2935473  T
Q  661 ttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 747  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  2935474 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 2935560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 359 - 747
Target Start/End: Original strand, 7188445 - 7188833
Alignment:
Q  359 ataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattt-taagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagataga 457  Q
    ||||||||||| ||||||||||   | ||||||||||| ||| | || || |||||||||| |||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||    
T  7188445 ataacataaacgtatttttgggctgagatttgttccaattttatgagggatacttttactataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagataga 7188544  T
Q  458 gggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctcc 557  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||| | || |||||||||||||   |||||||||| ||    
T  7188545 gggggctgaaacaagggtttag-aagtcaacaataaaaatagggtttgtatagggtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt--ggggttgattcacc 7188640  T
Q  558 ttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgattt 656  Q
    || || |||||||||||||||||||||| ||||| |||| || ||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| |||||||| |    
T  7188641 tt-ggaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaatagattgagactttgggtagaattaagcgggagacttatttttataacccattgatat 7188739  T
Q  657 ctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt-aaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 747  Q
     || ||||||| |||| |||||| ||||||||| | || ||||||||||| |||||| ||| || |  ||||||| ||||| ||| ||||||||    
T  7188740 ttcttttgtaaagttattcatcattatagtggaacggaaggctgctctcttccccagtctatgtcagttttggactgaactaggtaaacaaatt 7188833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 420 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 24817674 - 24817362
Alignment:
Q  420 aaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtc 518  Q
    ||||||||||||||||||| | | |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||| | ||||||||||||||||||||||| |    
T  24817674 aaatatagaccttgtatcagatgtaaaccttgagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaa-gtcaacaagagaactagggtttgtatagagtttg-c 24817578  T
Q  519 tcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggta 617  Q
    |||| | || |||||||||||||   |||||||||| ||||||  || || |||||||||||||||| ||||| |||| |||||  ||||||||||||||    
T  24817577 tctttgcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttgga-aagcagtattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggta 24817482  T
Q  618 gaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagacta 715  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||||||||| ||||    
T  24817481 gaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatgtctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctcccccatacta 24817382  T
Q  716 ggt-aaatttggaccgaact 734  Q
    ||| |  |||||||||||||    
T  24817381 ggtcagttttggaccgaact 24817362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 563 - 748
Target Start/End: Original strand, 22108173 - 22108359
Alignment:
Q  563 gaaacactattaggattg-agtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctct 660  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  22108173 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctct 22108271  T
Q  661 ttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 748  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  22108272 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattc 22108359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 563 - 748
Target Start/End: Original strand, 40549933 - 40550119
Alignment:
Q  563 gaaacactattaggattg-agtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctct 660  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  40549933 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctct 40550031  T
Q  661 ttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 748  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  40550032 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattc 40550119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 563 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 9027376 - 9027191
Alignment:
Q  563 gaaacactattaggattg-agtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctct 660  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  9027376 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagact-attcttgtaacccattgatttctct 9027278  T
Q  661 ttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 747  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  9027277 ttgtaacgttactcatcaaatagtggataggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 9027191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 409 - 711
Target Start/End: Complemental strand, 20091877 - 20091580
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 507  Q
    |||||||||| |||||||||| || ||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| | | ||||||| |||||||||||||||||    
T  20091877 acttttactataaatatagactttttatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaagggtttcgga-ggcaaca-caaaactagggtttgta 20091780  T
Q  508 tagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctga 606  Q
    ||||||||| || || | || ||| | ||||||| |  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | ||| ||||| |||| |||||  |||    
T  20091779 tagagtttg-ctattggcaacaaagattagggttgg--ggttgattcaccttggg-aaacactattaggattaaatctcttggtcacgggaagagattga 20091684  T
Q  607 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctc 705  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||  |||||||| | |||||||||||||||    
T  20091683 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatc--atagtggaacggagggctgctctctc 20091586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 563 - 748
Target Start/End: Original strand, 22137184 - 22137370
Alignment:
Q  563 gaaacactattaggattg-agtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctct 660  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  22137184 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctct 22137282  T
Q  661 ttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 748  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  22137283 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattc 22137370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 563 - 748
Target Start/End: Original strand, 40552211 - 40552397
Alignment:
Q  563 gaaacactattaggattg-agtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctct 660  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  40552211 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctct 40552309  T
Q  661 ttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 748  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  40552310 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattc 40552397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 563 - 747
Target Start/End: Original strand, 1606486 - 1606671
Alignment:
Q  563 gaaacactattaggattg-agtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctct 660  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  1606486 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagact-attcttgtaacccattgatttctct 1606584  T
Q  661 ttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 747  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||    
T  1606585 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactagatcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 1606671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 485 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 24813755 - 24813494
Alignment:
Q  485 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtc 584  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||   |||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||    
T  24813755 caacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaagaaacactagggtt---gggttgattcaccttggg-aagcactattaggattgagtc 24813661  T
Q  585 t-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttct-ctttgtaacgttactcatca-tat 681  Q
    | ||||| |||| ||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||||| ||||||||||| |||    
T  24813660 tcttggtgacgggaagtgattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatttatatctcctttgtaaagttactcatcattat 24813561  T
Q  682 agtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt-aaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 747  Q
    |||||| | || ||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  24813560 agtggagcggatggctgctttctcccccagactaggtcagttttggaccgaactgggtaaacaaatt 24813494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 302 - 601
Target Start/End: Original strand, 22392319 - 22392606
Alignment:
Q  302 tggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaatttt 401  Q
    |||| |||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||  ||||| |||| |||  |||||||  ||||| |||||||||||||| |    
T  22392319 tggagaaatcgtgccacgatgggatcgcaacgtggtacgatggtgcgctggaggcaaaaaacagaaatgtatttttcagtgcagatttgttccaaattgt 22392418  T
Q  402 aagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggg 501  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        ||  |||||||||    
T  22392419 aagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttata--------aatcaaactaggg 22392510  T
Q  502 tttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaaga 600  Q
    |||||||||| |||| || || | || ||||||||||||   ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  22392511 tttgtatagaatttg-ctattggcaacaaacactagggt---tgggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaaga 22392605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 206 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 1047503 - 1047356
Alignment:
Q  206 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgga 305  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  1047503 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgacggctgggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 1047404  T
Q  306 aaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggc 353  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  1047403 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggc 1047356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 206 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 9027687 - 9027502
Alignment:
Q  206 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgga 305  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||| |||  |||  || |||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  9027687 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcacaatcgtggcacgacggctgggcttcgcggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 9027588  T
Q  306 aaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgtt 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  || || | ||||||||||||||| ||| |||||||    
T  9027587 aaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaata-aaacatatttttgggagcagatttgtt 9027502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 206 - 353
Target Start/End: Original strand, 2935070 - 2935217
Alignment:
Q  206 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgga 305  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||| |||  |||  || |||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  2935070 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcacaatcgtggcacgacggctgggcttcgcggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 2935169  T
Q  306 aaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggc 353  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2935170 aaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggc 2935217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 206 - 392
Target Start/End: Original strand, 22136878 - 22137063
Alignment:
Q  206 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgga 305  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||  ||  |||  || |||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  22136878 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcacaatcgtggcacgacagctgggcttcgcggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 22136977  T
Q  306 aaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgtt 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  || || | ||||||||||||||| ||| |||||||    
T  22136978 aaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaata-aaacatatttttgggagcagatttgtt 22137063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 206 - 392
Target Start/End: Original strand, 40551905 - 40552090
Alignment:
Q  206 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgga 305  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||  ||  |||  || |||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  40551905 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcacaatcgtggcacgacagctgggcttcgcggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 40552004  T
Q  306 aaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgtt 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  || || | ||||||||||||||| ||| |||||||    
T  40552005 aaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaata-aaacatatttttgggagcagatttgtt 40552090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 206 - 392
Target Start/End: Original strand, 22107867 - 22108052
Alignment:
Q  206 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgga 305  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||  ||  |||  || ||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  22107867 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcacaatcgtggcacgacagctgggcttcgcggcacgatgcaggttttagttttttgggcaaggcactgga 22107966  T
Q  306 aaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgtt 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  || || | ||||||||||||||| ||| |||||||    
T  22107967 aaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaata-aaacatatttttgggagcagatttgtt 22108052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 206 - 392
Target Start/End: Original strand, 40549627 - 40549812
Alignment:
Q  206 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgga 305  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||  ||  |||  || ||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  40549627 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcacaatcgtggcacgacagctgggcttcgcggcacgatgcaggttttagttttttgggcaaggcactgga 40549726  T
Q  306 aaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgtt 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  || || | ||||||||||||||| ||| |||||||    
T  40549727 aaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaata-aaacatatttttgggagcagatttgtt 40549812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 607 - 752
Target Start/End: Original strand, 26295598 - 26295745
Alignment:
Q  607 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctct 704  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||| | |||| | |||||||||    
T  26295598 gactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagatgactgctctct 26295697  T
Q  705 cccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttgt 752  Q
    || ||||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||||    
T  26295698 cctccagactaggtcaatttggactgaactggataaacaaattcttgt 26295745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 610 - 750
Target Start/End: Original strand, 22393876 - 22394018
Alignment:
Q  610 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctccc 707  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||| | | ||||| || ||||||||    
T  22393876 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggttgttctctccc 22393975  T
Q  708 ccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    | ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  22393976 ctagactaggtcaatttggaccaaactgggtaaacaaattctt 22394018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 411 - 747
Target Start/End: Original strand, 24465503 - 24465829
Alignment:
Q  411 ttttactacaaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 509  Q
    |||||||| | |||||||| |||||||| | | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||          |||||||||||||||||    
T  24465503 ttttactatagatatagactttgtatcagatgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaatc--------aaactagggtttgtata 24465594  T
Q  510 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgaga 608  Q
    | ||||| ||||| | || |||||||||||||   |  ||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| | || |||||  || ||    
T  24465595 gcgtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt---gaattgattcaccttggg-aaacaatattaggattgagtctcttggtcatgggaagagattggga 24465689  T
Q  609 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcc 706  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||  ||||||| | || ||||||| | ||||||||| |||| || | | |  | |||||||||||    
T  24465690 ctttgggtagaattaggtgggagatttattcttttaactcattgatatgtcttttgtaaag-tactcatcattataatgaaacgggtgactgctctctcc 24465788  T
Q  707 cccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 747  Q
    |||||||||| | ||| || ||||||||| || ||||||||    
T  24465789 cccagactagatcaatatgaaccgaactgagtaaacaaatt 24465829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 456 - 517
Target Start/End: Original strand, 38396316 - 38396377
Alignment:
Q  456 gagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 517  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38396316 gagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagtgtttgt 38396377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 420 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 7094751 - 7094662
Alignment:
Q  420 aaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 505  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||    
T  7094751 aaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaacatagggtttg 7094662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 564 - 752
Target Start/End: Original strand, 25351353 - 25351541
Alignment:
Q  564 aaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctt 661  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||  ||   || ||||||    
T  25351353 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctt 25351448  T
Q  662 tgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt-aaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttgt 752  Q
    ||||| |  |||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |   || ||||||||||||| |||||||||||||    
T  25351449 tgtaaagaaactcatcattatagtggatcggagagctgttctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattcttgt 25351541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 607 - 718
Target Start/End: Original strand, 6046644 - 6046757
Alignment:
Q  607 gactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctct 704  Q
    |||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||    || ||||||||||    
T  6046644 gactttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaaacctttgatatctctttgtaaagttactcatcattatagtggaatgaagagctgctctct 6046743  T
Q  705 cccccagactaggt 718  Q
    ||||||||||||||    
T  6046744 cccccagactaggt 6046757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 412 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 7092512 - 7092414
Alignment:
Q  412 tttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaa-actagggtttg 505  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||    
T  7092512 tttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagatggagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaacactagggtttg 7092414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 564 - 747
Target Start/End: Original strand, 6332326 - 6332514
Alignment:
Q  564 aaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaaaccattgatttctctt 661  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| ||   |||||  ||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||| || || || ||||||    
T  6332326 aaacactattaagattgagtctcttggtcacaagaagagattgagactttaggtagaattaggcttgaagacttattcttgtaaccctttaatatctctt 6332425  T
Q  662 t-gtaacgttactcatcat-atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 747  Q
    | |||| |||||||||||| |||||||| | || | ||| ||||||||| ||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||||    
T  6332426 ttgtaaagttactcatcattatagtggaacggaagactgttctctcccctagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 6332514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 692 - 750
Target Start/End: Original strand, 11759364 - 11759422
Alignment:
Q  692 agggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11759364 agggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 11759422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 604 - 679
Target Start/End: Original strand, 6348930 - 6349006
Alignment:
Q  604 tgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcat 679  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| |||||||  |||||||||||    
T  6348930 tgagactttgggtagaattaggcgggagacttattattgtaacccattgatatctcttttgtaaaattactcatcat 6349006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 239 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 1049780 - 1049699
Alignment:
Q  239 aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcgtggcacga 320  Q
    |||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||    
T  1049780 aatcgtggcacgattgctgggcaacgtggcacgattggaggtttcagtttt-gaagcaaggtactggaaaaatcgtggcacga 1049699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 564 - 752
Target Start/End: Original strand, 25357047 - 25357235
Alignment:
Q  564 aaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctt 661  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||  ||   || ||||||    
T  25357047 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctt 25357142  T
Q  662 tgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt-aaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttgt 752  Q
    ||||| |  |||||||| |||||||||||  || | || ||||||||||||||||||| |   || ||||||||||||| |||||||||||||    
T  25357143 tgtaaagaaactcatcattatagtggatcgaagagatgatctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattcttgt 25357235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 409 - 458
Target Start/End: Original strand, 1606423 - 1606472
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagag 458  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1606423 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagag 1606472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 564 - 752
Target Start/End: Original strand, 2120899 - 2121089
Alignment:
Q  564 aaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctt 661  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||  ||   || ||||||    
T  2120899 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctt 2120994  T
Q  662 tgtaacgttactc--atca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt-aaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttgt 752  Q
    ||||| |  ||||  |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |   || ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  2120995 tgtaaagaaactcatatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaattgggtaaacaaattcttgt 2121089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 466 - 679
Target Start/End: Original strand, 6048885 - 6049094
Alignment:
Q  466 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaa 565  Q
    |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| ||| ||   ||||| | || |||||||||| |||| || ||||||| |||||  |||    
T  6048885 aaacaagggtttagaa-gccaacatcaaaactagggtttgtaaagaatt---ctcttggcaacaaacactagg-tttg-ggattgattcaccttgaagaa 6048978  T
Q  566 acactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttg 663  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||| |||  ||||   ||||||||||| ||||||||||   | |||| ||||||| ||| || ||||| || |||||    
T  6048979 acactattaggattgaatctcttggtcacgagaagatattgagactttggatagaattaggtttgaagacgtattcttataaccctttgatatccctttg 6049078  T
Q  664 taacgttactcatcat 679  Q
    ||| ||||||||||||    
T  6049079 taaagttactcatcat 6049094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 564 - 752
Target Start/End: Original strand, 25410130 - 25410320
Alignment:
Q  564 aaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctt 661  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||  ||   || ||||||    
T  25410130 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctt 25410225  T
Q  662 tgtaacgttactc--atca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt-aaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttgt 752  Q
    ||||| |  ||||  |||| ||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| |   || ||||||||||||| |||||||||||||    
T  25410226 tgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattcttgt 25410320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 466 - 747
Target Start/End: Original strand, 11081522 - 11081803
Alignment:
Q  466 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaa 565  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| ||   ||||| | || |||||||||||||    | ||||||| | ||||| ||    
T  11081522 aaacaagggtttagaa-gccaacaacaaaactagggtttgtagagaatt---ctcttggcaacaaacactagggttga--gattgattcactttggg-aa 11081614  T
Q  566 acactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaaaccatt--gatttctctt 661  Q
    |||||||||||||||||||| ||| | |||| |||||  |  || |||| ||| |||||||   || |||| |||||||||| || ||  ||| ||||||    
T  11081615 acactattaggattgagtctcttgatcacgggaagagattaggattttgtgtaaaattaggtttgaagactaattcttgtaaccctttttgatatctctt 11081714  T
Q  662 -tgtaacgttactcatcat-atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 747  Q
     ||||| |||||||||| | | | |||| | || || |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  11081715 gtgtaaagttactcatctttaaaatggaacggatggttgctctctcccccagactaggtcaatattggaccgaactgggtaaacaaatt 11081803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 564 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 3320232 - 3320049
Alignment:
Q  564 aaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctt 661  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||  |||   | ||||||    
T  3320232 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctctt 3320137  T
Q  662 tgtaacgttactca-tca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt-aaatttggaccgaactgggtcaacaaat 746  Q
    ||||| |  ||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |   || ||||||||||||| |||||||    
T  3320136 tgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 3320049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 564 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 3324980 - 3324797
Alignment:
Q  564 aaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctt 661  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||  |||   | ||||||    
T  3324980 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctctt 3324885  T
Q  662 tgtaacgttactca-tca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt-aaatttggaccgaactgggtcaacaaat 746  Q
    ||||| |  ||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |   || ||||||||||||| |||||||    
T  3324884 tgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 3324797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 564 - 746
Target Start/End: Original strand, 25405393 - 25405576
Alignment:
Q  564 aaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctt 661  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||  |||   | ||||||    
T  25405393 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctctt 25405488  T
Q  662 tgtaacgttactca-tca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt-aaatttggaccgaactgggtcaacaaat 746  Q
    ||||| |  ||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |   || ||||||||||||| |||||||    
T  25405489 tgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 25405576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 409 - 453
Target Start/End: Original strand, 22108114 - 22108158
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 453  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22108114 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 22108158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 409 - 453
Target Start/End: Original strand, 22137125 - 22137169
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 453  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22137125 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 22137169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 409 - 453
Target Start/End: Original strand, 40549874 - 40549918
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 453  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40549874 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 40549918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 409 - 453
Target Start/End: Original strand, 40552152 - 40552196
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 453  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40552152 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 40552196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 681 - 744
Target Start/End: Original strand, 9190038 - 9190101
Alignment:
Q  681 tagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 744  Q
    ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  9190038 tagtggattggagagctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 9190101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 681 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 20284156 - 20284093
Alignment:
Q  681 tagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 744  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  20284156 tagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 20284093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 293 - 436
Target Start/End: Original strand, 42006404 - 42006545
Alignment:
Q  293 gcaaggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgtt 392  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||| | || | || ||||||||||||| || ||||  ||| | |||||||    
T  42006404 gcaagtcactgaaaaaatcgtggcacgatggaatcgtaacgtggcacgatggtac-gttgaaggaaataacataaacgta-ttttcagtgaagatttgtt 42006501  T
Q  393 ccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtat 436  Q
    ||| |||||||| |  |||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  42006502 ccatattttaagggttacttttactataaatataaaccgtgtat 42006545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 564 - 746
Target Start/End: Original strand, 7069780 - 7069963
Alignment:
Q  564 aaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctt 661  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||  |||   | ||||||    
T  7069780 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctctt 7069875  T
Q  662 tgtaacgttactca-tca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt-aaatttggaccgaactgggtcaacaaat 746  Q
    ||||| |  ||||| ||| |||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| |   || ||||||||||||| |||||||    
T  7069876 tgtaaagaaactcattcattatagtggatcgaagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 7069963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 636 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 13290583 - 13290470
Alignment:
Q  636 attcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaat-ttggaccgaac 733  Q
    |||||||||| |  ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||| ||| | ||||||| |||||| ||| | | |||||||||||    
T  13290583 attcttgtaaccttttgatatctctttgtaaagttactcatcattatagcggaacagagagctacactctccctcagacttggtcagtattggaccgaac 13290484  T
Q  734 tgggtcaacaaatt 747  Q
    ||||| ||||||||    
T  13290483 tgggtaaacaaatt 13290470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 564 - 624
Target Start/End: Complemental strand, 16297207 - 16297146
Alignment:
Q  564 aaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattag 624  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||  |||||||||||||||||||||    
T  16297207 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattag 16297146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 680 - 744
Target Start/End: Original strand, 4796696 - 4796760
Alignment:
Q  680 atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 744  Q
    |||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| |||||    
T  4796696 atagtggatttgagggctgctttctcccccagattaggtcattttggaccgaactgggttaacaa 4796760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 564 - 718
Target Start/End: Original strand, 7074787 - 7074941
Alignment:
Q  564 aaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctt 661  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||  |||   | ||||||    
T  7074787 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctctt 7074882  T
Q  662 tgtaacgttactca-tca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt 718  Q
    ||||| |  ||||| ||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  7074883 tgtaaagaaactcattcattatagtggatcggagagctgcactctcccccagactaggt 7074941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 409 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 9027440 - 9027396
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 453  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9027440 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttggaga 9027396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 680 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 21983352 - 21983288
Alignment:
Q  680 atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 744  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  21983352 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 21983288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 680 - 744
Target Start/End: Original strand, 46516339 - 46516403
Alignment:
Q  680 atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 744  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||| ||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  46516339 atagtggattggagggctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 46516403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 681 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 2580457 - 2580394
Alignment:
Q  681 tagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 744  Q
    ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||    
T  2580457 tagtggattggagagctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaattgggtcaacaa 2580394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 409 - 452
Target Start/End: Original strand, 2935306 - 2935349
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgag 452  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2935306 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactctgag 2935349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 411 - 478
Target Start/End: Original strand, 3677235 - 3677301
Alignment:
Q  411 ttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggttta 478  Q
    |||||||| ||||||||| |||| |||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3677235 ttttactataaatatagatcttgaatcagagtaaacttggagataga-ggggctgaaacaagggttta 3677301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 681 - 744
Target Start/End: Original strand, 9185195 - 9185258
Alignment:
Q  681 tagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 744  Q
    ||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  9185195 tagtggattggagagcttctctctcccccagactaggttatattggaccgaactgggtcaacaa 9185258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 707 - 750
Target Start/End: Original strand, 26804762 - 26804805
Alignment:
Q  707 cccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26804762 cccagactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattctt 26804805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 361 - 436
Target Start/End: Original strand, 45366451 - 45366526
Alignment:
Q  361 aacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtat 436  Q
    |||| |||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||| |||||||||    
T  45366451 aacagaaacgtatttttcagtgcagatttgttccaaattttaagggttacttttactataaatataaaccttgtat 45366526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 564 - 625
Target Start/End: Original strand, 42006663 - 42006724
Alignment:
Q  564 aaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg 625  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  42006663 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 42006724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 409 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 30906386 - 30906280
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 507  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| | || |||  |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||  |||  |  ||||||| |||||||    
T  30906386 acttttgctataaatatagaccttgtataagagtaaatcttgagatagagggggctgaaaacaagaatttagaaa--caaataacaaactagagtttgta 30906289  T
Q  508 tagagtttg 516  Q
    |||||||||    
T  30906288 tagagtttg 30906280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 680 - 744
Target Start/End: Original strand, 2647725 - 2647789
Alignment:
Q  680 atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 744  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| |  |||| ||||| |||||||||||    
T  2647725 atagtggattggagggctgctctctcccccagaataggtcatattgggccgaattgggtcaacaa 2647789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 410 - 625
Target Start/End: Original strand, 26210500 - 26210710
Alignment:
Q  410 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 508  Q
    |||||| || ||||||||| ||||||||||| | |||| |||||| || |||||  ||||||||| |||||||   ||||  |||||||||||||||||     
T  26210500 cttttagtataaatatagaacttgtatcaaatgtaaaccttgagagag-gggggaggaaacaaggttttagaatc-caacctcaaaactagggtttgtag 26210597  T
Q  509 agagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggct-ga 606  Q
    ||| ||   ||||| | || || |||||||||| |||  ||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  | |     
T  26210598 agaatt---ctcttggcaacaa-cactagggtt-gtga-ttgattcaccttggagaaatactattaggattgagtctcttggtaacggaaagagattcgg 26210691  T
Q  607 gactttgggtagaattagg 625  Q
    |||||| ||||||||||||    
T  26210692 gactttcggtagaattagg 26210710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 700 - 744
Target Start/End: Original strand, 27347941 - 27347985
Alignment:
Q  700 tctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 744  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  27347941 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 27347985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #123
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 680 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 29159871 - 29159807
Alignment:
Q  680 atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 744  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||||| ||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  29159871 atagtggattggagagctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 29159807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #124
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 700 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 41317478 - 41317434
Alignment:
Q  700 tctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 744  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  41317478 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 41317434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #125
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 420 - 541
Target Start/End: Original strand, 6348782 - 6348903
Alignment:
Q  420 aaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 517  Q
    ||||||| ||||||||||| | | |||| ||||||||||| || |||||| ||||||||||||| |  || || ||||||||||||||||| |||||||     
T  6348782 aaatataaaccttgtatcagatgtaaacattgagatagagaggactgaaaacaagggtttagaa-gtaaaaaagaaaactagggtttgtatcgagtttg- 6348879  T
Q  518 ctcttcggaagaaacactagggtt 541  Q
    ||||| | || ||||| |||||||    
T  6348880 ctcttggcaacaaacattagggtt 6348903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #126
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 564 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 8378686 - 8378502
Alignment:
Q  564 aaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctt 661  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||  |||   | ||||||    
T  8378686 aaacactattaagattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaaactcat---tatctctt 8378591  T
Q  662 tgtaacgttactc--atca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt-aaatttggaccgaactgggtcaacaaat 746  Q
    ||||| |  ||||  |||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||| |   || ||||||||||||| |||||||    
T  8378590 tgtaaagaaactcatatcattatagtggatcggagagttgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 8378502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #127
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 681 - 744
Target Start/End: Original strand, 28617255 - 28617318
Alignment:
Q  681 tagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 744  Q
    ||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||| |||||    
T  28617255 tagtggattggagagctgctctctcccccagagtaggtcatattggaccgaactgggtaaacaa 28617318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #128
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 567 - 625
Target Start/End: Original strand, 30246973 - 30247031
Alignment:
Q  567 cactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg 625  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  30246973 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 30247031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #129
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 681 - 744
Target Start/End: Original strand, 33332480 - 33332543
Alignment:
Q  681 tagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 744  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| |  || || ||||||||||||||||    
T  33332480 tagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattagatcgaactgggtcaacaa 33332543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #130
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 567 - 625
Target Start/End: Complemental strand, 44512704 - 44512646
Alignment:
Q  567 cactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg 625  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  44512704 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 44512646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #131
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 564 - 625
Target Start/End: Complemental strand, 15541177 - 15541116
Alignment:
Q  564 aaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg 625  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||    
T  15541177 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtataattagg 15541116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #132
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 564 - 601
Target Start/End: Original strand, 21369642 - 21369680
Alignment:
Q  564 aaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagag 601  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21369642 aaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagag 21369680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #133
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 680 - 741
Target Start/End: Complemental strand, 56015 - 55955
Alignment:
Q  680 atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaa 741  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||    
T  56015 atagtggattggagggctgctctct-ccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaa 55955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #134
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 691 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 35960873 - 35960820
Alignment:
Q  691 gagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 744  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |  ||| |||||||| |||||||||    
T  35960873 gagggctgctctctcccccagattaggtcatattgaaccgaactcggtcaacaa 35960820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #135
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 561 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 40281563 - 40281466
Alignment:
Q  561 gggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaaaccattgattt 656  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||||| |||| |||||  ||||||||| ||| ||||||||   || ||||||||||||||| || |||||||    
T  40281563 gggaaacaccgttaggattgagtctgttggtcacgggaagagattgagacttttggtggaattaggtttgaagacttattcttgtaaccctttgattt 40281466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #136
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 299 - 348
Target Start/End: Original strand, 40946167 - 40946216
Alignment:
Q  299 cactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcg 348  Q
    |||||||||||||||| |||||| || ||| |||||| ||||||||||||    
T  40946167 cactggaaaaatcgtgtcacgattggatcgaatcgtgccacgatggtgcg 40946216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 357; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 214 - 770
Target Start/End: Complemental strand, 69825 - 69264
Alignment:
Q  214 ttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcg 312  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  69825 ttaacttaaaatcagatttctgcagaatcgtggcacgatggctaggcaacgtggcacgattggaggtttcaagttt-gaggcaaagcactggaaaaatcg 69727  T
Q  313 tggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaactt 412  Q
    | |||| ||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||| || |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  69726 tagcacaatgggatcgcatcgttgcacgatggtgtgctggcagcgaaaaacagaaacatatttt-gggtgcagatttgttccaaattttaagcgatactt 69628  T
Q  413 ttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 508  Q
    |||| | ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  69627 ttacaataaatatagaccttatatcagagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 69528  T
Q  509 agagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgag 607  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| || |    
T  69527 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggg-aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttggg 69429  T
Q  608 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctccc 707  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  69428 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagagctgctctctccc 69329  T
Q  708 ccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattc--ttgtatttttctcttctttgtg 770  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||    
T  69328 ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtg 69264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 214 - 561
Target Start/End: Complemental strand, 73536 - 73207
Alignment:
Q  214 ttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgat-ggaggtttcagtttttgaggcaaggcactggaaaaatcg 312  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||| |    
T  73536 ttaacttaaaatcagatttatgcagaatcgtggcacgatggctaggcaacgtggcacgattggaggtttcaagttt-gaggcaaagcactggaaaaattg 73438  T
Q  313 tggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaactt 412  Q
    ||                     ||||||||||| | ||||||| || |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || ||||    
T  73437 tg---------------------gcacgatggtgtgctggcagcgaaaaacagaaacatatttt-gggtgcagatttgttccaaattttaagagatactt 73360  T
Q  413 ttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 508  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  73359 ttactataaatatagaccgtgtatcaaaggaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaatctagggtttgtat 73260  T
Q  509 agagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttgg 561  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  73259 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgg 73207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 524 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 73208 - 73160
Alignment:
Q  524 ggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactatt 573  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||    
T  73208 ggaaaaaacactagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactatt 73160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 298; Significance: 1e-167; HSPs: 2)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 207 - 752
Target Start/End: Original strand, 14768 - 15315
Alignment:
Q  207 gtgagatttaacttcaaatcagatttatgcat-aatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatgg-aggtttcagtttttgaggcaaggcactgg 304  Q
    |||||| ||||||| |||||||  || ||||  |||||||||||||| | | |||||||||| ||||||| | ||||||||| | |||||||| ||||||    
T  14768 gtgagagttaacttaaaatcaggattctgcaggaatcgtggcacgattgaagggcaacgtggaacgatgggaagtttcagttat-gaggcaagtcactgg 14866  T
Q  305 aaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaag 404  Q
    |||  ||||||||||||||| || || |||| |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14867 aaatttcgtggcacgatgggatcacaacgtgacacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacatatttttgggtgcagatttgttccaaattttaag 14966  T
Q  405 cgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 504  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14967 cgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaatgatttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 15066  T
Q  505 gtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggc 603  Q
     |||| |||||||||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||      
T  15067 ttataaagtttgtctctttggaacaaacactagagtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagat 15165  T
Q  604 tgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctct 702  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||| | || ||||||| |    
T  15166 tcagactttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtggaacggaaggctgctgt 15265  T
Q  703 ctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttgt 752  Q
    ||||||||  |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  15266 ctcccccatgctaggtcaatttggaccgaactgactcaacaaattcttgt 15315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131; HSP #2
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 422 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 14707 - 14374
Alignment:
Q  422 atatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtct 519  Q
    ||||||||||||| | | ||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14707 atatagaccttgttttagagcaaactttgagagatagagggggatgaaacaatggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtct 14608  T
Q  520 cttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtag 618  Q
    ||| | || ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14607 ctttgaaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggatttagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtag 14509  T
Q  619 aattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactagg 717  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||    
T  14508 aattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccctagactagg 14409  T
Q  718 taaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttgt 752  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14408 tcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttgt 14374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 293; Significance: 1e-164; HSPs: 2)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 297 - 770
Target Start/End: Original strand, 29001 - 29486
Alignment:
Q  297 ggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaa 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||    
T  29001 ggcactggaaaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcagcgaaaaacagaaacatatttttgagtgcagatttgttacaa 29100  T
Q  397 attttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga----------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggca 486  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    |||||||||||          ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29101 attttaagcaaaacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagagagatagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggca 29200  T
Q  487 acaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct- 585  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||     
T  29201 acaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttatgggttgattcgccttggg-atacactattaggattgagtctc 29299  T
Q  586 ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtg 685  Q
    |||||||||| |||||| || | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  29300 ttggttacgggaagaggttggggctttgagtagaattaggcaggagacttattcttgtaactcattgatttctctttgtaacaatactcatcatatagtg 29399  T
Q  686 gatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattc--ttgtatttttctcttctttgtg 770  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||| ||||||    
T  29400 gatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcgtttgtgttcttctcttttttgtg 29486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 206 - 270
Target Start/End: Original strand, 28941 - 29005
Alignment:
Q  206 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcac 270  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  28941 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgatggctgggcaacgtggcac 29005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0472 (Bit Score: 287; Significance: 1e-160; HSPs: 1)
Name: scaffold0472
Description:

Target: scaffold0472; HSP #1
Raw Score: 287; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 206 - 747
Target Start/End: Original strand, 5927 - 6490
Alignment:
Q  206 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgga 305  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||| |||  |||  || |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  5927 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcacaatcgtggcacgacggctgggcttcgcggcacgatggaggttttagttttttaggcaaggcactgga 6026  T
Q  306 aaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaa-------- 397  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |  || || | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||            
T  6027 aaaatcgtggcatgatggggtctcatcatggcacgatggtgcgctggcggataaaaata-aaacatatttttgggtgcagatttgttacaaatttaaagc 6125  T
Q  398 --------------ttttaagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaag 483  Q
                  ||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  6126 agatttgttacagtttttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaa 6225  T
Q  484 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattg-ag 582  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||    
T  6226 gcaacaataaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgaag 6324  T
Q  583 tct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatat 681  Q
    ||| |||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6325 tctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcaaat 6424  T
Q  682 agtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 747  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||||||    
T  6425 agtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgagtcaacaaatt 6490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0339 (Bit Score: 269; Significance: 1e-150; HSPs: 1)
Name: scaffold0339
Description:

Target: scaffold0339; HSP #1
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 332 - 750
Target Start/End: Original strand, 3872 - 4289
Alignment:
Q  332 cgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgaaacttttactacaaatatagacct 431  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||    
T  3872 cgtggcacgatggtgcgatggcagcgaataacataaacgtatttttgggtgcagatttgtttcaaattttaagcaatacttttactataaatatagacct 3971  T
Q  432 tgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaa 531  Q
    ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||    
T  3972 tgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata-agtttgtctctttggaactaa 4070  T
Q  532 cactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcggga 630  Q
    |||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4071 cactagggtttgagggttgattcatctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaagctgggactttgggtagaattaggcggga 4169  T
Q  631 gacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggacc 729  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  4170 gacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggacc 4268  T
Q  730 gaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  4269 gaaccgggtcaacaaattctt 4289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 263; Significance: 1e-146; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 409 - 770
Target Start/End: Complemental strand, 41819 - 41455
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 508  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41819 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 41720  T
Q  509 agagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgag 607  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |    
T  41719 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 41621  T
Q  608 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcc 706  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  41620 actttcggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctctcc 41521  T
Q  707 cccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattc--ttgtatttttctcttctttgtg 770  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||    
T  41520 cccagactaggtgaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtg 41455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 238; Significance: 1e-131; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 412 - 747
Target Start/End: Original strand, 79140 - 79476
Alignment:
Q  412 tttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtataga 511  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||| || |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  79140 tttactataaatatagaccttgaatcagagtaaaacttgagatagagggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtataga 79239  T
Q  512 gtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagact 610  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |    
T  79240 gtttgtctctttggaacaaacactagggtttaagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagaat 79338  T
Q  611 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctccccc 709  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  79339 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctccccc 79438  T
Q  710 agactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 747  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  79439 agactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaatt 79476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 223; Significance: 1e-122; HSPs: 3)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 409 - 770
Target Start/End: Complemental strand, 183975 - 183613
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 508  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  183975 actttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaaggg-ctgaaacaaaggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtat 183877  T
Q  509 agagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgag 607  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  || |    
T  183876 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgg-aagagattggg 183779  T
Q  608 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcc 706  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||    
T  183778 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaatgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcc 183679  T
Q  707 cccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattc--ttgtatttttctcttctttgtg 770  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||    
T  183678 ctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtg 183613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 409 - 767
Target Start/End: Original strand, 51961 - 52324
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga--tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 506  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  51961 acttttactataaatatagaccttgtatcatactaaactttgagagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgt 52060  T
Q  507 atagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctg 605  Q
    ||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| || ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  ||    
T  52061 atagagtttgtctttttggaacaaacactagggtttgaggattgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattg 52159  T
Q  606 agactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctg--ctct 702  Q
     |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||  ||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||  ||||    
T  52160 tgactttggatagaattaggtgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctct 52259  T
Q  703 ctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttgtatttttctcttcttt 767  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  52260 ctcccccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattcttgtgttcttctcttcttt 52324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 699 - 767
Target Start/End: Original strand, 50257 - 50325
Alignment:
Q  699 ctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttgtatttttctcttcttt 767  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  50257 ctctctcccccagactaggtcaatttggacctaactgggtcaacaaattcttgtgttcttctcttcttt 50325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 1)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 409 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 11809 - 11467
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 508  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||| || |||| | ||||||||||||||||||||| || ||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  11809 acttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctggagatagagggggctgaaacagggatttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtat 11710  T
Q  509 agagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgag 607  Q
    ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  || |    
T  11709 agagtttgtctctttcgaacaaacactagggtttgagggttgattttcctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggg 11611  T
Q  608 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcc 706  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  11610 actttgggtagaattaggcgggatacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggattggagagctgctctctcc 11511  T
Q  707 cccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11510 cccagactaggtcaatttggaccgaaccgggtcaacaaattctt 11467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0267 (Bit Score: 208; Significance: 1e-113; HSPs: 1)
Name: scaffold0267
Description:

Target: scaffold0267; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 450 - 747
Target Start/End: Original strand, 34 - 332
Alignment:
Q  450 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggtt 549  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  34 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggtt 133  T
Q  550 gattctccttggggaaacactattaggattg-agtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaac 647  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  134 gattcaccttggg-aaacactattaggattggagtctcttggttacgtgaagagattgagactttgggtagaattaggcgggaaacttattcttgtaacc 232  T
Q  648 cattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 747  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  233 cattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0370 (Bit Score: 183; Significance: 1e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0370
Description:

Target: scaffold0370; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 524 - 770
Target Start/End: Complemental strand, 1673 - 1425
Alignment:
Q  524 ggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaatt 622  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  1673 ggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggg-aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaatt 1575  T
Q  623 aggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaat 722  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  1574 aggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaat 1475  T
Q  723 ttggaccgaactgggtcaacaaattc--ttgtatttttctcttctttgtg 770  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||    
T  1474 ttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcttctcttctttgtg 1425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0511 (Bit Score: 181; Significance: 2e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0511
Description:

Target: scaffold0511; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 409 - 708
Target Start/End: Original strand, 1988 - 2293
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 502  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||      || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1988 actttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagaaagatatagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 2087  T
Q  503 ttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagag 601  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||    
T  2088 ttgtacagagtttgtctcttcggaataaa-actagggtttgtgggttgattcacctt-gggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaag 2185  T
Q  602 gctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgct 700  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||    
T  2186 gctgggactttgggtagaattaggcgggaaacttattcttgtaacccattaatttctcttttgtaacgttcctcatcatatagtgaatcggagggctact 2285  T
Q  701 ctctcccc 708  Q
    ||||||||    
T  2286 ctctcccc 2293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 168; Significance: 1e-89; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 410 - 750
Target Start/End: Original strand, 79812 - 80153
Alignment:
Q  410 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 509  Q
    ||||||||| ||||||||   ||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  79812 cttttactataaatatagtttttgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaataaaactagggtttgtata 79911  T
Q  510 gagtttgtctcttcgg-aagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgag 607  Q
    ||||||||||||| || || ||| | ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||  || |    
T  79912 gagtttgtctctttggcaacaaaaattagggtttgagggttgattcacctt-gggaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagagattggg 80010  T
Q  608 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcc 706  Q
     |||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||  ||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||    
T  80011 gctttgggtag-attaggcaggagacttattcctgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcc 80109  T
Q  707 cccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  80110 cccagactaggtcaatttggattgaactgggtcaacaaattctt 80153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 564 - 625
Target Start/End: Complemental strand, 188424 - 188363
Alignment:
Q  564 aaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg 625  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  188424 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 188363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 140; Significance: 6e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 410 - 750
Target Start/End: Original strand, 85184 - 85525
Alignment:
Q  410 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 509  Q
    ||||||||| |||||||| | ||||||||||| |||| |||||||||| | ||  ||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  85184 cttttactataaatataggctttgtatcaaagtaaaccttgagatagaagagga-gaaacaaggatttaaaaagacaacaacaaaactagggtttgtata 85282  T
Q  510 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtc-tttggttacggaaagaggctgaga 608  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||  ||||| |||||||||| |||| || |||||||| |||||||||||| ||||||||||  |||||  || ||    
T  85283 gagtttgtctcttagcaacaaacactaaagtttgagggttgattcacctt-ggaaaacactactaggattgagtcttttggttacgagaagagattgtga 85381  T
Q  609 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctcttt-gtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcc 706  Q
    ||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| | || | |||||||||||    
T  85382 ctttgagtagaatcagacgggagacttattcttgtaacccattgatatctctttcgtaaagttactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcc 85481  T
Q  707 cccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    |||||||||||| |||||| || ||||  ||| |||||||||||    
T  85482 cccagactaggtcaatttgaactgaaccaggtaaacaaattctt 85525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0224 (Bit Score: 135; Significance: 6e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0224
Description:

Target: scaffold0224; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 359 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 16205 - 15817
Alignment:
Q  359 ataacataaacatatttttgggtgcaaatttgttccaaattt-taagcgaaacttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagataga 457  Q
    ||||||||| ||||||||||||   | ||||||||||||||| | || || |||||||||| |||||||||  |||||||| || |||| || |||||||    
T  16205 ataacataatcatatttttgggctgagatttgttccaaatttatgagggatacttttactataaatatagattttgtatcagagtaaaccttaagataga 16106  T
Q  458 gggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctcc 557  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | | || |||||||||||||    ||||||||| ||    
T  16105 gggggttgaaataagggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcctagcaacaaacactagggttga--ggttgattcacc 16010  T
Q  558 ttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgattt 656  Q
    ||| | ||| |||||||||||||||||| ||||| |||| |||||  || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  16009 ttgcgaaaa-actattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgatat 15911  T
Q  657 ctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 747  Q
    ||| ||||||| ||||||||||| || |||||| | |||| ||||||||| |||| |||||||| | | |||||||||||||||| ||||||||    
T  15910 ctcttttgtaaagttactcatcattagagtggaacggaggactgctctctgcccccgactaggtcagtgttggaccgaactgggtaaacaaatt 15817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 129; Significance: 2e-66; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 410 - 637
Target Start/End: Original strand, 35593 - 35819
Alignment:
Q  410 cttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 509  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||   |||||   | |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35593 cttttactataaatatagacattgtatcagtacaaaccgggtgatagaggcg-ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 35691  T
Q  510 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgaga 608  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||| || | ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| ||    
T  35692 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttaattcacc-tagggaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagaggctggga 35790  T
Q  609 ctttgggtagaattaggcgggagacttat 637  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35791 ctttgggtagaattaggcgggagacttat 35819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 679 - 747
Target Start/End: Original strand, 35817 - 35885
Alignment:
Q  679 tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 747  Q
    ||||||||| | |||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35817 tatagtggaacggagggctgctctcttccttagactaggtcaatttggaccgaattgggtcaacaaatt 35885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 119; Significance: 2e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 411 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 16981 - 16646
Alignment:
Q  411 ttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 509  Q
    ||||| || ||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  16981 ttttaatataaatataaaccttgtatcagagtaaaccttgagatagaggaggctgaaaacaagggttt-gaaagacaaca-caaaactagggtttgtata 16884  T
Q  510 gagtttgtctcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgaga 608  Q
    ||||||| ||||| | || ||||||||||||| |  | ||||||| |||| || |||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||||  |||||    
T  16883 gagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--gattgattcaccttagg-aaacactattaggattgagtcacttggtgacgggaagagattgaga 16788  T
Q  609 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcc 706  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||  || |||| |  |||||||    
T  16787 ctttgggtagaattaggccagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgggacaaagggtttatctctcc 16688  T
Q  707 cccagactaggt-aaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 747  Q
    ||||||| |||| |  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  16687 cccagaccaggtcagttttggaccgaactgggtaaacaaatt 16646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 116; Significance: 1e-58; HSPs: 7)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 563 - 748
Target Start/End: Original strand, 22221 - 22407
Alignment:
Q  563 gaaacactattaggattg-agtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctct 660  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||    
T  22221 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaactcattgatttctct 22319  T
Q  661 ttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 748  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  22320 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattc 22407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 563 - 748
Target Start/End: Original strand, 24496 - 24682
Alignment:
Q  563 gaaacactattaggattg-agtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctct 660  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||    
T  24496 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaactcattgatttctct 24594  T
Q  661 ttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 748  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  24595 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattc 24682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #3
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 206 - 392
Target Start/End: Original strand, 21915 - 22100
Alignment:
Q  206 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgga 305  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||  ||  |||  || |||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  21915 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcacaatcgtggcacgacagctgggcttcgcggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 22014  T
Q  306 aaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgtt 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  || || | ||||||||||||||| ||| |||||||    
T  22015 aaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaata-aaacatatttttgggagcagatttgtt 22100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #4
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 206 - 392
Target Start/End: Original strand, 24190 - 24375
Alignment:
Q  206 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgga 305  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||  ||  |||  || |||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  24190 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcacaatcgtggcacgacagctgggcttcgcggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 24289  T
Q  306 aaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggcagcaaataacataaacatatttttgggtgcaaatttgtt 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  || || | ||||||||||||||| ||| |||||||    
T  24290 aaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcgctggcggataaaaata-aaacatatttttgggagcagatttgtt 24375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #5
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 680 - 744
Target Start/End: Original strand, 8448 - 8512
Alignment:
Q  680 atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 744  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  8448 atagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 8512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #6
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 409 - 453
Target Start/End: Original strand, 22162 - 22206
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 453  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22162 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttggaga 22206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #7
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 409 - 453
Target Start/End: Original strand, 24437 - 24481
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 453  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24437 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttggaga 24481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0468 (Bit Score: 113; Significance: 8e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0468
Description:

Target: scaffold0468; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 420 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 1957 - 1638
Alignment:
Q  420 aaatatagaccttgtatcaaa-gcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtc 518  Q
    ||||||||||||||||||| | | |||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||       
T  1957 aaatatagaccttgtatcagatgtaaacctagagatagaggtggctgaaacaagggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttgtatagagtttc-- 1861  T
Q  519 tcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggta 617  Q
           || ||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| | ||||| |||| |||||  || |||||||||||    
T  1860 -------aacaaacactagggtt-gtgg-ttgattcaccttggg-aaacacaattaggattgagtttcttggtcacgggaagagattgggactttgggta 1771  T
Q  618 gaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagacta 715  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||    
T  1770 gaattaggcgggagagttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacgtagggctgctctctcccccatacta 1671  T
Q  716 ggt-aaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 747  Q
    ||| |  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  1670 ggtcagtttttgaccgaactgggtaaacaaatt 1638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0127 (Bit Score: 104; Significance: 2e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0127
Description:

Target: scaffold0127; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 206 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 13054 - 12907
Alignment:
Q  206 tgtgagatttaacttcaaatcagatttatgcataatcgtggcacgatggcaaggcaacgtggcacgatggaggtttcagtttttgaggcaaggcactgga 305  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  13054 tgtgagagttaacttaaaatcaggtttctgcagaatcgtggcacgatgtcaaggcaacgtggcacgatggaggttttagttttttgggcaaggcactgga 12955  T
Q  306 aaaatcgtggcacgatggggtcgcatcgtggcacgatggtgcggtggc 353  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  12954 aaaatcgtggcacgatggggtctcatcgtggcacgatggtgcgctggc 12907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0552 (Bit Score: 98; Significance: 7e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0552
Description:

Target: scaffold0552; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 409 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 1167 - 1054
Alignment:
Q  409 acttttactacaaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 508  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1167 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 1068  T
Q  509 agagtttgtctctt 522  Q
    ||||||||||||||    
T  1067 agagtttgtctctt 1054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 63; Significance: 6e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 420 - 738
Target Start/End: Original strand, 4777 - 5095
Alignment:
Q  420 aaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaaggg-tttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtc 518  Q
    ||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||| |||||| || || ||||||| |  | ||||||| ||||||||| ||||| |||| ||    
T  4777 aaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatagaggggtctgaaaaaaaggatttagaa-gtaagcaacaaa-ctagggtttatatagcgttt-tc 4873  T
Q  519 tcttcggaagaaacactagggtttgtgggttgattctccttggggaaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggta 617  Q
    |||  | || ||||||||| |||    | |||||||   ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| | |  |||||  |||  |||| ||||    
T  4874 tctcagcaacaaacactagagttga--gtttgattcatgttggg-aaacactattaggattgagtctcttggtcatgagaagagattgaagcttttggta 4970  T
Q  618 gaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatttctc--tttgtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagact 714  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||  ||||||| | ||||||||| ||||||||| || ||  ||||||||| |||||||||    
T  4971 gaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatatctctttttgtaaagatactcatcattatagtggaacatagaactgctctctgccccagact 5070  T
Q  715 aggtaaat-ttggaccgaactgggt 738  Q
    |||| | | |||||||||| |||||    
T  5071 aggtcagtattggaccgaattgggt 5095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0891 (Bit Score: 50; Significance: 3e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0891
Description:

Target: scaffold0891; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 691 - 748
Target Start/End: Complemental strand, 4732 - 4675
Alignment:
Q  691 gagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 748  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4732 gagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattc 4675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0209 (Bit Score: 39; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0209
Description:

Target: scaffold0209; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 679 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 17052 - 16978
Alignment:
Q  679 tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt-aaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttgt 752  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |   || ||||||||||||| |||||||||||||    
T  17052 tatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattcttgt 16978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1674 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1674
Description:

Target: scaffold1674; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 710 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 1485 - 1445
Alignment:
Q  710 agactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 750  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1485 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 1445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0256
Description:

Target: scaffold0256; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 567 - 746
Target Start/End: Original strand, 16328 - 16509
Alignment:
Q  567 cactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaaaccattgatttctctttgt 664  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||  ||   || |||||||||    
T  16328 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactaattcttggaactca---atatctctttgt 16423  T
Q  665 aacgttactc--atca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt-aaatttggaccgaactgggtcaacaaat 746  Q
    || |  ||||  |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |   || ||||||||||||| |||||||    
T  16424 aaagaaactcatatcattatagtggaacagagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 16509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000002; HSPs: 4)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 692 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 5739 - 5687
Alignment:
Q  692 agggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 744  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  5739 agggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 5687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 564 - 625
Target Start/End: Original strand, 224819 - 224880
Alignment:
Q  564 aaacactattaggattgagtct-ttggttacggaaagaggctgagactttgggtagaattagg 625  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  224819 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 224880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 680 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 2560 - 2496
Alignment:
Q  680 atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 744  Q
    |||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||| |  ||||| ||||||||||||||||    
T  2560 atagtggattggagggctgctgtctcccccagattaggtcatattggagcgaactgggtcaacaa 2496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 700 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 149141 - 149097
Alignment:
Q  700 tctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 744  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  149141 tctctcccccagagtaggttaagttggaccgaactgggtcaacaa 149097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 34; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 635 - 718
Target Start/End: Complemental strand, 57539 - 57454
Alignment:
Q  635 tattcttgtaaaccattgatttctcttt-gtaacgttactcatca-tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt 718  Q
    ||||||||||| || ||||| ||| ||| |||| ||||||||| | |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  57539 tattcttgtaaccctttgatatctattttgtaaagttactcattaatataatggaacagagagctgctctctcccccagactaggt 57454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1050 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold1050
Description:

Target: scaffold1050; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 679 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 3136 - 3068
Alignment:
Q  679 tatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggt-aaatttggaccgaactgggtcaacaaat 746  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |   || ||||||||||||| |||||||    
T  3136 tatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 3068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0087
Description:

Target: scaffold0087; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 680 - 744
Target Start/End: Original strand, 43990 - 44054
Alignment:
Q  680 atagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 744  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||| | |  ||||||||||||||||||||||    
T  43990 atagtggattggagagctgctctctcccccagaatagatcatattggaccgaactgggtcaacaa 44054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 700 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 20459 - 20415
Alignment:
Q  700 tctctcccccagactaggtaaatttggaccgaactgggtcaacaa 744  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  20459 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 20415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 851 times since January 2019
Visitors: 4356