View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0692_low_9 (Length: 267)

Name: NF0692_low_9
Description: NF0692
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0692_low_9
NF0692_low_9
[»] chr3 (230 HSPs)
chr3 (2-242)||(6501348-6501588)
chr3 (2-242)||(9994238-9994478)
chr3 (2-242)||(9982230-9982470)
chr3 (2-242)||(12249784-12250024)
chr3 (2-242)||(6490694-6490934)
chr3 (2-242)||(12237958-12238198)
chr3 (2-242)||(39673228-39673468)
chr3 (2-242)||(23756948-23757188)
chr3 (2-242)||(23767544-23767784)
chr3 (2-242)||(4175102-4175342)
chr3 (2-242)||(6180873-6181113)
chr3 (2-242)||(6221047-6221287)
chr3 (2-242)||(13557224-13557464)
chr3 (2-242)||(19788672-19788912)
chr3 (2-242)||(37866095-37866335)
chr3 (2-242)||(37885228-37885468)
chr3 (2-242)||(13121312-13121552)
chr3 (2-242)||(13131554-13131794)
chr3 (2-242)||(14475871-14476111)
chr3 (2-242)||(19778035-19778275)
chr3 (2-242)||(24383864-24384106)
chr3 (2-242)||(5537366-5537606)
chr3 (2-242)||(5547950-5548190)
chr3 (2-242)||(5866041-5866283)
chr3 (2-242)||(5876640-5876882)
chr3 (8-242)||(23635359-23635593)
chr3 (2-236)||(504513-504749)
chr3 (2-236)||(526879-527115)
chr3 (2-236)||(4743392-4743628)
chr3 (2-236)||(4753979-4754215)
chr3 (2-242)||(10627286-10627527)
chr3 (2-236)||(16385729-16385965)
chr3 (2-236)||(18483698-18483934)
chr3 (2-242)||(23647398-23647639)
chr3 (2-236)||(35187031-35187267)
chr3 (2-236)||(41683332-41683568)
chr3 (2-236)||(41693901-41694137)
chr3 (2-242)||(5579979-5580221)
chr3 (2-242)||(20720761-20721003)
chr3 (2-236)||(20684124-20684358)
chr3 (2-236)||(8774311-8774547)
chr3 (2-236)||(10098722-10098958)
chr3 (2-242)||(10655608-10655849)
chr3 (2-236)||(24659554-24659790)
chr3 (2-242)||(37759319-37759560)
chr3 (2-242)||(5628363-5628605)
chr3 (2-236)||(5510350-5510586)
chr3 (2-236)||(5520528-5520764)
chr3 (2-236)||(24670134-24670370)
chr3 (2-236)||(38194378-38194614)
chr3 (2-236)||(38204914-38205150)
chr3 (2-236)||(39382344-39382580)
chr3 (2-242)||(12297146-12297389)
chr3 (2-242)||(11272729-11272971)
chr3 (2-242)||(13373011-13373253)
chr3 (2-242)||(13394199-13394441)
chr3 (2-236)||(39371707-39371943)
chr3 (2-242)||(12287324-12287567)
chr3 (2-236)||(20673539-20673774)
chr3 (2-236)||(28314577-28314814)
chr3 (8-242)||(29472416-29472650)
chr3 (2-242)||(13383605-13383847)
chr3 (8-239)||(29461564-29461795)
chr3 (8-242)||(1794835-1795069)
chr3 (8-242)||(9391555-9391789)
chr3 (8-242)||(11217076-11217310)
chr3 (2-242)||(19887698-19887939)
chr3 (8-242)||(24706906-24707141)
chr3 (8-242)||(1784422-1784656)
chr3 (8-242)||(9381009-9381243)
chr3 (8-242)||(11206425-11206659)
chr3 (8-242)||(48336891-48337125)
chr3 (2-236)||(28325193-28325428)
chr3 (9-242)||(11163480-11163712)
chr3 (7-242)||(4403923-4404157)
chr3 (8-242)||(7794958-7795193)
chr3 (9-242)||(8740478-8740710)
chr3 (8-242)||(7804869-7805104)
chr3 (9-242)||(933276-933510)
chr3 (8-242)||(9535258-9535493)
chr3 (9-242)||(13262024-13262258)
chr3 (7-240)||(38314346-38314583)
chr3 (27-242)||(4433410-4433624)
chr3 (9-242)||(14258416-14258650)
chr3 (8-242)||(17910353-17910591)
chr3 (9-242)||(16076578-16076811)
chr3 (9-242)||(8996309-8996542)
chr3 (9-242)||(27883032-27883265)
chr3 (2-151)||(14465332-14465481)
chr3 (9-242)||(1053358-1053591)
chr3 (9-242)||(9006861-9007094)
chr3 (9-242)||(14322043-14322276)
chr3 (9-242)||(16671515-16671747)
chr3 (9-242)||(17281787-17282019)
chr3 (9-235)||(29933913-29934138)
chr3 (9-235)||(29983067-29983292)
chr3 (9-242)||(1063787-1064020)
chr3 (9-235)||(29906534-29906759)
chr3 (9-235)||(29947699-29947924)
chr3 (9-235)||(29996853-29997078)
chr3 (9-242)||(2246016-2246248)
chr3 (2-145)||(8784989-8785132)
chr3 (9-242)||(13199598-13199830)
chr3 (9-189)||(15663059-15663240)
chr3 (9-187)||(15651424-15651603)
chr3 (9-242)||(31114340-31114574)
chr3 (9-235)||(51989499-51989726)
chr3 (15-161)||(17961073-17961223)
chr3 (29-242)||(17006640-17006854)
chr3 (134-242)||(15194516-15194625)
chr3 (152-242)||(13601883-13601973)
chr3 (24-242)||(22150692-22150911)
chr3 (21-235)||(14580796-14581012)
chr3 (9-132)||(21735868-21735992)
chr3 (9-161)||(28168811-28168965)
chr3 (130-236)||(8784925-8785034)
chr3 (29-234)||(13953718-13953923)
chr3 (148-242)||(18857426-18857519)
chr3 (133-242)||(28168760-28168870)
chr3 (100-242)||(15663180-15663320)
chr3 (29-234)||(15832863-15833068)
chr3 (24-242)||(41045189-41045408)
chr3 (24-145)||(18006038-18006158)
chr3 (29-209)||(49989742-49989921)
chr3 (29-189)||(15848700-15848862)
chr3 (29-189)||(51340509-51340671)
chr3 (24-234)||(11909535-11909745)
chr3 (29-234)||(12753121-12753326)
chr3 (100-242)||(15651545-15651685)
chr3 (21-161)||(27172565-27172706)
chr3 (30-144)||(52919976-52920091)
chr3 (30-187)||(8729489-8729648)
chr3 (30-187)||(9081376-9081535)
chr3 (9-159)||(45862066-45862220)
chr3 (25-189)||(13931456-13931620)
chr3 (24-132)||(12410292-12410399)
chr3 (24-161)||(10528871-10529010)
chr3 (30-144)||(15902736-15902853)
chr3 (132-242)||(17017476-17017586)
chr3 (135-242)||(27172517-27172622)
chr3 (29-159)||(37412134-37412266)
chr3 (39-189)||(932343-932492)
chr3 (30-144)||(16032137-16032252)
chr3 (30-145)||(21606157-21606275)
chr3 (191-242)||(24393356-24393407)
chr3 (30-144)||(26418178-26418293)
chr3 (30-144)||(29951939-29952054)
chr3 (30-144)||(30001093-30001208)
chr3 (30-144)||(12963586-12963703)
chr3 (30-144)||(22140304-22140420)
chr3 (30-144)||(49643263-49643380)
chr3 (132-242)||(10528821-10528931)
chr3 (30-193)||(14077822-14077986)
chr3 (30-143)||(30054683-30054799)
chr3 (30-144)||(8874621-8874737)
chr3 (24-115)||(13147838-13147930)
chr3 (30-186)||(13698868-13699026)
chr3 (186-242)||(19121370-19121426)
chr3 (30-144)||(22804523-22804641)
chr3 (132-209)||(45862162-45862237)
chr3 (30-144)||(49554003-49554119)
chr3 (30-140)||(12967854-12967965)
chr3 (30-144)||(14072240-14072354)
chr3 (30-184)||(27849689-27849843)
chr3 (191-242)||(33650850-33650901)
chr3 (131-234)||(37412091-37412193)
chr3 (30-140)||(41494543-41494654)
chr3 (30-144)||(2025627-2025744)
chr3 (30-144)||(14954969-14955085)
chr3 (29-161)||(17017526-17017660)
chr3 (30-144)||(17239424-17239541)
chr3 (132-189)||(18006023-18006081)
chr3 (30-144)||(21640406-21640523)
chr3 (30-144)||(28581645-28581761)
chr3 (30-144)||(38178147-38178263)
chr3 (30-144)||(40799437-40799553)
chr3 (30-145)||(17697158-17697274)
chr3 (30-69)||(1728518-1728557)
chr3 (30-187)||(7833129-7833287)
chr3 (105-144)||(11074019-11074058)
chr3 (30-69)||(13410549-13410588)
chr3 (30-69)||(15961132-15961171)
chr3 (30-69)||(16881906-16881945)
chr3 (30-69)||(19249914-19249953)
chr3 (30-144)||(20724630-20724745)
chr3 (30-69)||(21638746-21638785)
chr3 (30-69)||(22128662-22128701)
chr3 (30-69)||(22463595-22463634)
chr3 (30-69)||(22465053-22465092)
chr3 (30-69)||(24776035-24776074)
chr3 (30-69)||(25398759-25398798)
chr3 (30-69)||(29855026-29855065)
chr3 (30-69)||(40850594-40850633)
chr3 (30-69)||(46796870-46796909)
chr3 (30-69)||(47207321-47207360)
chr3 (30-69)||(47405925-47405964)
chr3 (33-144)||(50299773-50299887)
chr3 (33-130)||(1463847-1463942)
chr3 (30-144)||(11223103-11223220)
chr3 (30-144)||(13947877-13947994)
chr3 (104-234)||(15848597-15848726)
chr3 (34-132)||(16305651-16305749)
chr3 (30-144)||(53057232-53057349)
chr3 (104-161)||(18005989-18006049)
chr3 (30-144)||(2784604-2784722)
chr3 (104-144)||(8710404-8710444)
chr3 (104-144)||(9062291-9062331)
chr3 (33-69)||(18122119-18122155)
chr3 (31-193)||(23538666-23538830)
chr3 (34-69)||(2560804-2560839)
chr3 (30-69)||(3238309-3238348)
chr3 (131-189)||(4243694-4243753)
chr3 (30-69)||(5213195-5213234)
chr3 (30-69)||(6174954-6174993)
chr3 (30-69)||(11078307-11078346)
chr3 (30-69)||(13781087-13781126)
chr3 (30-69)||(16659120-16659159)
chr3 (30-69)||(16879634-16879673)
chr3 (30-69)||(18143248-18143287)
chr3 (30-69)||(20627936-20627975)
chr3 (81-187)||(22770414-22770521)
chr3 (152-189)||(8710418-8710455)
chr3 (152-189)||(9062305-9062342)
chr3 (101-185)||(12756018-12756103)
chr3 (133-189)||(13410623-13410680)
chr3 (102-189)||(10928536-10928624)
chr3 (163-242)||(21735820-21735896)
chr3 (130-189)||(22770433-22770493)
chr3 (33-69)||(33582848-33582884)
chr3 (41-69)||(49669003-49669031)
[»] chr6 (155 HSPs)
chr6 (2-242)||(26043812-26044052)
chr6 (2-242)||(9112851-9113091)
chr6 (2-242)||(9123488-9123728)
chr6 (2-242)||(27372432-27372672)
chr6 (2-242)||(27462782-27463022)
chr6 (2-242)||(27505542-27505782)
chr6 (2-242)||(32962290-32962530)
chr6 (2-242)||(32972909-32973149)
chr6 (2-236)||(31982982-31983218)
chr6 (2-242)||(12854621-12854861)
chr6 (2-242)||(12865147-12865387)
chr6 (2-242)||(12717192-12717434)
chr6 (2-242)||(12727841-12728083)
chr6 (2-236)||(4630475-4630711)
chr6 (2-236)||(26025063-26025299)
chr6 (2-236)||(26035637-26035873)
chr6 (2-236)||(27341298-27341534)
chr6 (2-236)||(27402038-27402274)
chr6 (2-236)||(27412697-27412933)
chr6 (2-236)||(32301399-32301635)
chr6 (2-236)||(32312088-32312324)
chr6 (2-242)||(3660983-3661223)
chr6 (2-242)||(3671647-3671887)
chr6 (2-242)||(25985680-25985922)
chr6 (2-242)||(34818148-34818390)
chr6 (2-236)||(16930055-16930291)
chr6 (2-236)||(16959226-16959462)
chr6 (2-242)||(34807516-34807759)
chr6 (2-242)||(17982857-17983099)
chr6 (2-242)||(17985066-17985308)
chr6 (2-236)||(29384356-29384592)
chr6 (2-242)||(33198927-33199168)
chr6 (2-236)||(26864390-26864626)
chr6 (2-236)||(26875014-26875250)
chr6 (2-236)||(28251919-28252152)
chr6 (2-236)||(28357066-28357299)
chr6 (2-236)||(7751591-7751825)
chr6 (8-242)||(12827292-12827526)
chr6 (8-242)||(25787302-25787535)
chr6 (8-242)||(20030266-20030500)
chr6 (8-242)||(20063017-20063251)
chr6 (2-236)||(27384040-27384273)
chr6 (8-242)||(18926126-18926359)
chr6 (8-242)||(7376120-7376355)
chr6 (9-242)||(16123897-16124132)
chr6 (9-242)||(31572015-31572247)
chr6 (2-174)||(27504013-27504185)
chr6 (9-242)||(27166806-27167038)
chr6 (9-242)||(29765136-29765368)
chr6 (9-242)||(17746147-17746380)
chr6 (9-242)||(32757000-32757232)
chr6 (9-242)||(5844686-5844919)
chr6 (9-242)||(18826602-18826834)
chr6 (9-242)||(18834997-18835229)
chr6 (2-174)||(27474515-27474686)
chr6 (9-238)||(22308392-22308621)
chr6 (9-235)||(25687113-25687338)
chr6 (9-242)||(25518288-25518520)
chr6 (8-145)||(12353252-12353389)
chr6 (9-235)||(17742067-17742292)
chr6 (9-242)||(11235098-11235331)
chr6 (9-147)||(4292420-4292558)
chr6 (100-236)||(27474424-27474559)
chr6 (100-236)||(27503922-27504057)
chr6 (9-242)||(21127679-21127913)
chr6 (8-132)||(11147612-11147736)
chr6 (9-234)||(7586623-7586849)
chr6 (9-161)||(31931101-31931255)
chr6 (150-242)||(10404043-10404135)
chr6 (9-142)||(18554968-18555102)
chr6 (9-142)||(12953495-12953628)
chr6 (9-234)||(14070539-14070765)
chr6 (149-242)||(12353183-12353277)
chr6 (2-88)||(31543252-31543338)
chr6 (9-132)||(9934036-9934159)
chr6 (154-242)||(25583512-25583600)
chr6 (163-242)||(11147708-11147787)
chr6 (9-187)||(14051858-14052039)
chr6 (24-242)||(19453005-19453224)
chr6 (29-234)||(20635177-20635382)
chr6 (24-209)||(22386286-22386470)
chr6 (9-132)||(25735921-25736044)
chr6 (21-145)||(17063895-17064019)
chr6 (29-189)||(17608795-17608957)
chr6 (28-189)||(18027209-18027370)
chr6 (130-242)||(31931053-31931163)
chr6 (132-242)||(17047189-17047297)
chr6 (9-161)||(11205623-11205778)
chr6 (130-242)||(18554900-18555010)
chr6 (29-145)||(17047254-17047371)
chr6 (132-242)||(11205575-11205683)
chr6 (9-142)||(19289744-19289879)
chr6 (30-144)||(12715913-12716030)
chr6 (130-242)||(12953586-12953696)
chr6 (15-131)||(15478259-15478374)
chr6 (30-144)||(7763196-7763311)
chr6 (135-235)||(17063837-17063935)
chr6 (30-144)||(19085700-19085817)
chr6 (130-242)||(19289837-19289947)
chr6 (30-115)||(19625382-19625468)
chr6 (30-142)||(21034534-21034647)
chr6 (30-193)||(32335330-32335494)
chr6 (30-189)||(15551487-15551646)
chr6 (39-193)||(17446155-17446310)
chr6 (30-144)||(29597615-29597731)
chr6 (30-147)||(15395178-15395297)
chr6 (30-144)||(9717383-9717499)
chr6 (190-236)||(12416901-12416947)
chr6 (30-144)||(13601708-13601825)
chr6 (30-144)||(15301756-15301873)
chr6 (30-115)||(18172720-18172806)
chr6 (30-115)||(18226995-18227081)
chr6 (30-144)||(24116369-24116486)
chr6 (30-144)||(26589139-26589256)
chr6 (31-69)||(31127801-31127839)
chr6 (81-193)||(23006548-23006661)
chr6 (81-193)||(23781705-23781818)
chr6 (30-193)||(24729014-24729179)
chr6 (30-131)||(25595733-25595833)
chr6 (30-142)||(26941981-26942094)
chr6 (30-189)||(14923703-14923863)
chr6 (2-78)||(26023151-26023227)
chr6 (30-69)||(10631721-10631760)
chr6 (30-69)||(10705025-10705064)
chr6 (30-69)||(12422880-12422919)
chr6 (30-69)||(16265643-16265682)
chr6 (30-193)||(16463143-16463310)
chr6 (30-69)||(17317016-17317055)
chr6 (30-69)||(18435158-18435197)
chr6 (30-69)||(19066510-19066549)
chr6 (30-144)||(19470209-19470324)
chr6 (30-69)||(19482370-19482409)
chr6 (33-115)||(20113192-20113275)
chr6 (30-69)||(20731197-20731236)
chr6 (30-69)||(21234776-21234815)
chr6 (30-69)||(21617862-21617901)
chr6 (30-69)||(22076898-22076937)
chr6 (131-189)||(24719301-24719360)
chr6 (30-69)||(32543882-32543921)
chr6 (132-189)||(14051954-14052012)
chr6 (9-55)||(25679024-25679070)
chr6 (163-242)||(9934131-9934208)
chr6 (112-144)||(10820696-10820728)
chr6 (33-144)||(14100933-14101045)
chr6 (33-144)||(17927333-17927445)
chr6 (30-142)||(19623523-19623638)
chr6 (30-69)||(7811631-7811670)
chr6 (30-69)||(15532118-15532157)
chr6 (31-66)||(16876525-16876560)
chr6 (30-69)||(19688397-19688436)
chr6 (30-69)||(19952064-19952103)
chr6 (33-144)||(33352723-33352837)
chr6 (101-143)||(22563160-22563202)
chr6 (197-238)||(22292497-22292538)
chr6 (96-144)||(13435423-13435471)
[»] chr4 (147 HSPs)
chr4 (2-242)||(18752840-18753080)
chr4 (2-239)||(5022408-5022645)
chr4 (2-242)||(18763450-18763690)
chr4 (2-242)||(27815296-27815536)
chr4 (2-242)||(48370800-48371040)
chr4 (2-242)||(450245-450485)
chr4 (2-242)||(4948006-4948246)
chr4 (2-242)||(15561430-15561670)
chr4 (2-242)||(21996082-21996322)
chr4 (2-242)||(22006680-22006920)
chr4 (2-242)||(14844004-14844244)
chr4 (2-242)||(19955313-19955553)
chr4 (2-242)||(30926845-30927085)
chr4 (2-242)||(30937423-30937663)
chr4 (2-242)||(17917720-17917961)
chr4 (2-242)||(17928368-17928609)
chr4 (2-242)||(24028436-24028679)
chr4 (2-236)||(36018009-36018245)
chr4 (2-236)||(36028562-36028798)
chr4 (2-236)||(49517808-49518044)
chr4 (2-242)||(460826-461066)
chr4 (2-242)||(19944678-19944918)
chr4 (2-236)||(29042007-29042243)
chr4 (2-242)||(40470937-40471178)
chr4 (2-242)||(52703457-52703697)
chr4 (2-242)||(27656267-27656509)
chr4 (2-242)||(27666840-27667082)
chr4 (2-242)||(40454698-40454940)
chr4 (2-236)||(10740945-10741181)
chr4 (2-236)||(10954714-10954950)
chr4 (2-236)||(55745603-55745839)
chr4 (2-242)||(18130590-18130833)
chr4 (2-236)||(16255540-16255775)
chr4 (8-242)||(10909076-10909310)
chr4 (2-236)||(10751519-10751755)
chr4 (2-236)||(10965288-10965524)
chr4 (2-236)||(24639921-24640157)
chr4 (2-242)||(25656804-25657045)
chr4 (2-236)||(55756214-55756450)
chr4 (2-236)||(16266133-16266368)
chr4 (8-242)||(18078263-18078499)
chr4 (8-242)||(16316999-16317233)
chr4 (9-242)||(10695310-10695542)
chr4 (8-242)||(16304775-16305009)
chr4 (9-242)||(3370382-3370617)
chr4 (8-242)||(14836459-14836693)
chr4 (9-242)||(5873040-5873272)
chr4 (9-242)||(3390122-3390357)
chr4 (7-242)||(19580909-19581144)
chr4 (25-242)||(4986784-4987001)
chr4 (10-242)||(15207746-15207978)
chr4 (9-242)||(10300203-10300436)
chr4 (9-242)||(11535513-11535746)
chr4 (9-238)||(31267150-31267379)
chr4 (9-242)||(11514704-11514936)
chr4 (9-242)||(24713096-24713332)
chr4 (8-242)||(49002338-49002570)
chr4 (9-242)||(55650993-55651224)
chr4 (117-242)||(25008564-25008689)
chr4 (9-242)||(19241692-19241926)
chr4 (8-132)||(4987052-4987176)
chr4 (130-242)||(47152528-47152639)
chr4 (9-242)||(18775036-18775269)
chr4 (9-142)||(23508884-23509018)
chr4 (151-242)||(19143504-19143595)
chr4 (9-161)||(47152436-47152589)
chr4 (9-142)||(16819732-16819867)
chr4 (9-242)||(18007441-18007675)
chr4 (9-114)||(8997637-8997743)
chr4 (9-143)||(17994173-17994310)
chr4 (24-159)||(1671908-1672045)
chr4 (32-209)||(33377886-33378062)
chr4 (29-132)||(39532174-39532277)
chr4 (130-242)||(23508816-23508926)
chr4 (130-242)||(16819825-16819935)
chr4 (14-234)||(9751982-9752205)
chr4 (9-161)||(14711159-14711315)
chr4 (25-189)||(18394034-18394198)
chr4 (30-193)||(41115216-41115381)
chr4 (30-173)||(16939534-16939681)
chr4 (14-189)||(17526825-17527000)
chr4 (130-242)||(14711253-14711365)
chr4 (130-242)||(14778917-14779029)
chr4 (30-144)||(17788498-17788613)
chr4 (30-193)||(19889443-19889608)
chr4 (30-144)||(23750060-23750175)
chr4 (30-144)||(3105879-3105995)
chr4 (25-189)||(7222001-7222165)
chr4 (30-193)||(13890317-13890482)
chr4 (30-173)||(14154455-14154601)
chr4 (13-161)||(14778827-14778979)
chr4 (30-193)||(17057573-17057737)
chr4 (39-144)||(23123055-23123163)
chr4 (24-161)||(36210508-36210647)
chr4 (30-144)||(29120900-29121016)
chr4 (30-144)||(40860205-40860322)
chr4 (197-242)||(8183486-8183531)
chr4 (30-189)||(13693302-13693459)
chr4 (130-209)||(17994267-17994345)
chr4 (30-143)||(37986070-37986186)
chr4 (30-144)||(12811635-12811751)
chr4 (30-189)||(18473522-18473682)
chr4 (30-189)||(55731335-55731497)
chr4 (30-144)||(56034107-56034223)
chr4 (30-69)||(6641297-6641336)
chr4 (191-242)||(10290294-10290345)
chr4 (30-144)||(15014845-15014960)
chr4 (48-142)||(18775816-18775911)
chr4 (30-144)||(55379847-55379961)
chr4 (30-144)||(16853039-16853155)
chr4 (30-115)||(17539965-17540051)
chr4 (30-144)||(17701215-17701332)
chr4 (132-242)||(36210587-36210697)
chr4 (24-68)||(1674476-1674520)
chr4 (30-144)||(14605364-14605480)
chr4 (30-144)||(37436000-37436115)
chr4 (30-69)||(3395202-3395241)
chr4 (29-144)||(3500111-3500229)
chr4 (30-69)||(6517098-6517137)
chr4 (30-69)||(8105250-8105289)
chr4 (152-242)||(8997740-8997827)
chr4 (30-69)||(11900803-11900842)
chr4 (30-140)||(11915242-11915353)
chr4 (30-69)||(17399134-17399173)
chr4 (130-189)||(18773578-18773637)
chr4 (30-69)||(19884314-19884353)
chr4 (30-69)||(21350659-21350698)
chr4 (30-69)||(29681005-29681044)
chr4 (55-189)||(32491310-32491444)
chr4 (30-69)||(36470441-36470480)
chr4 (30-69)||(38513490-38513529)
chr4 (30-69)||(54679540-54679579)
chr4 (30-144)||(10072468-10072584)
chr4 (30-144)||(15475603-15475720)
chr4 (30-144)||(22190380-22190497)
chr4 (30-68)||(45832998-45833036)
chr4 (105-189)||(9266769-9266854)
chr4 (94-193)||(16325024-16325124)
chr4 (30-69)||(16324974-16325013)
chr4 (30-69)||(20977070-20977109)
chr4 (30-69)||(22675982-22676021)
chr4 (30-69)||(25651555-25651594)
chr4 (30-69)||(39420195-39420234)
chr4 (30-69)||(56533520-56533559)
chr4 (132-189)||(1671908-1671966)
chr4 (39-69)||(15135342-15135372)
chr4 (134-189)||(24619175-24619231)
[»] chr5 (183 HSPs)
chr5 (2-242)||(10754957-10755197)
chr5 (2-242)||(40390822-40391062)
chr5 (2-242)||(40401484-40401724)
chr5 (2-242)||(27602973-27603213)
chr5 (2-242)||(34772375-34772615)
chr5 (2-242)||(34783320-34783560)
chr5 (2-242)||(5290130-5290371)
chr5 (2-242)||(5300701-5300942)
chr5 (2-242)||(30069458-30069699)
chr5 (2-242)||(39352953-39353193)
chr5 (2-242)||(39364946-39365186)
chr5 (2-242)||(15992884-15993124)
chr5 (2-242)||(16003446-16003686)
chr5 (2-242)||(22559902-22560142)
chr5 (2-242)||(27622322-27622562)
chr5 (2-242)||(14557570-14557812)
chr5 (2-242)||(14568207-14568449)
chr5 (2-242)||(6131256-6131496)
chr5 (2-242)||(9347007-9347247)
chr5 (2-242)||(23362576-23362816)
chr5 (2-236)||(9377021-9377257)
chr5 (2-236)||(14041062-14041298)
chr5 (2-236)||(14446560-14446796)
chr5 (2-236)||(14457172-14457408)
chr5 (2-236)||(15693591-15693827)
chr5 (2-236)||(15740433-15740669)
chr5 (2-236)||(15769593-15769829)
chr5 (2-236)||(17607524-17607760)
chr5 (2-236)||(17618139-17618375)
chr5 (2-236)||(24567554-24567790)
chr5 (2-236)||(24816445-24816681)
chr5 (2-236)||(24827033-24827269)
chr5 (2-236)||(27041771-27042007)
chr5 (2-236)||(27052395-27052631)
chr5 (2-236)||(27460626-27460862)
chr5 (2-236)||(27471025-27471261)
chr5 (2-236)||(31348998-31349234)
chr5 (2-236)||(31359612-31359848)
chr5 (2-236)||(35215971-35216207)
chr5 (2-236)||(35226555-35226791)
chr5 (2-242)||(36582112-36582353)
chr5 (2-242)||(36592667-36592908)
chr5 (2-242)||(9336420-9336660)
chr5 (2-242)||(31419128-31419368)
chr5 (2-242)||(23296742-23296984)
chr5 (2-242)||(23307310-23307552)
chr5 (2-242)||(23707907-23708149)
chr5 (2-242)||(30227049-30227291)
chr5 (2-242)||(30237576-30237818)
chr5 (2-242)||(39490503-39490745)
chr5 (2-242)||(39501693-39501935)
chr5 (2-242)||(40513542-40513784)
chr5 (2-236)||(22146988-22147222)
chr5 (2-236)||(22157571-22157805)
chr5 (2-236)||(14030509-14030745)
chr5 (2-236)||(17719382-17719618)
chr5 (2-236)||(17730034-17730270)
chr5 (2-236)||(36688159-36688395)
chr5 (2-236)||(36698725-36698961)
chr5 (2-236)||(37728811-37729047)
chr5 (2-236)||(37740127-37740363)
chr5 (2-242)||(27204257-27204497)
chr5 (2-242)||(23697249-23697491)
chr5 (2-242)||(31833948-31834192)
chr5 (2-242)||(31844426-31844670)
chr5 (2-242)||(33951353-33951595)
chr5 (2-242)||(42043249-42043491)
chr5 (2-242)||(42053824-42054066)
chr5 (8-242)||(20798167-20798401)
chr5 (2-236)||(24808377-24808613)
chr5 (2-242)||(22676581-22676824)
chr5 (2-242)||(22686472-22686715)
chr5 (8-242)||(43043226-43043460)
chr5 (2-242)||(6976273-6976516)
chr5 (2-242)||(6986763-6987006)
chr5 (2-242)||(31449019-31449259)
chr5 (8-242)||(1121457-1121691)
chr5 (8-242)||(23406917-23407151)
chr5 (8-242)||(8522312-8522547)
chr5 (8-242)||(1108699-1108933)
chr5 (8-238)||(36084932-36085162)
chr5 (23-242)||(42395470-42395689)
chr5 (8-242)||(43621448-43621683)
chr5 (8-242)||(36229210-36229444)
chr5 (7-242)||(17446251-17446486)
chr5 (8-242)||(19464442-19464677)
chr5 (8-242)||(34063092-34063326)
chr5 (8-242)||(19478472-19478707)
chr5 (8-242)||(20552286-20552521)
chr5 (8-242)||(20562796-20563031)
chr5 (8-242)||(34052431-34052665)
chr5 (7-242)||(17456867-17457102)
chr5 (8-242)||(21702679-21702918)
chr5 (8-242)||(24925692-24925928)
chr5 (8-242)||(24982973-24983209)
chr5 (36-242)||(23392900-23393106)
chr5 (8-227)||(21705541-21705765)
chr5 (9-242)||(37407119-37407352)
chr5 (9-238)||(106592-106820)
chr5 (9-238)||(20625238-20625467)
chr5 (9-242)||(20417376-20417607)
chr5 (2-161)||(7031762-7031921)
chr5 (9-242)||(32753502-32753733)
chr5 (130-242)||(7031711-7031823)
chr5 (24-242)||(20215591-20215810)
chr5 (33-242)||(40228102-40228312)
chr5 (9-142)||(36096122-36096257)
chr5 (9-142)||(36097579-36097714)
chr5 (29-242)||(23477819-23478032)
chr5 (9-142)||(35543599-35543733)
chr5 (9-142)||(13522737-13522872)
chr5 (29-234)||(25112357-25112562)
chr5 (29-234)||(25171448-25171653)
chr5 (9-131)||(20168537-20168661)
chr5 (31-234)||(32160201-32160404)
chr5 (24-234)||(11208484-11208693)
chr5 (9-132)||(13533474-13533599)
chr5 (24-161)||(1914940-1915079)
chr5 (30-144)||(20550432-20550547)
chr5 (130-242)||(13522669-13522779)
chr5 (132-242)||(40033321-40033431)
chr5 (128-238)||(21420322-21420431)
chr5 (30-144)||(643184-643299)
chr5 (130-242)||(13403705-13403817)
chr5 (29-193)||(20567296-20567461)
chr5 (133-242)||(35543694-35543801)
chr5 (130-242)||(36096215-36096325)
chr5 (130-242)||(36097672-36097782)
chr5 (29-161)||(40033247-40033381)
chr5 (29-145)||(23488061-23488178)
chr5 (30-144)||(2156757-2156872)
chr5 (47-189)||(12078357-12078502)
chr5 (30-144)||(21072720-21072835)
chr5 (30-144)||(21199484-21199599)
chr5 (30-172)||(22586466-22586609)
chr5 (30-144)||(10848309-10848426)
chr5 (30-174)||(16607020-16607166)
chr5 (130-242)||(20168630-20168740)
chr5 (25-115)||(26056004-26056093)
chr5 (30-144)||(33932805-33932921)
chr5 (30-161)||(34637976-34638109)
chr5 (30-189)||(34637068-34637226)
chr5 (30-144)||(12353279-12353393)
chr5 (44-161)||(13403755-13403874)
chr5 (30-144)||(23880604-23880719)
chr5 (30-189)||(7746177-7746339)
chr5 (30-144)||(23392088-23392205)
chr5 (30-144)||(28464821-28464938)
chr5 (132-242)||(1914890-1915000)
chr5 (30-114)||(6498806-6498891)
chr5 (30-69)||(3245925-3245964)
chr5 (30-69)||(4886637-4886676)
chr5 (33-144)||(6512916-6513030)
chr5 (30-69)||(9088583-9088622)
chr5 (30-144)||(9399099-9399214)
chr5 (30-69)||(13546008-13546047)
chr5 (30-69)||(15516584-15516623)
chr5 (30-69)||(21100186-21100225)
chr5 (30-69)||(21659826-21659865)
chr5 (132-235)||(23488002-23488104)
chr5 (30-69)||(25740725-25740764)
chr5 (30-69)||(28139221-28139260)
chr5 (30-69)||(29138889-29138928)
chr5 (30-69)||(31117493-31117532)
chr5 (30-69)||(31146118-31146157)
chr5 (30-69)||(35932490-35932529)
chr5 (30-69)||(35986716-35986755)
chr5 (33-147)||(89907-90024)
chr5 (30-68)||(13736618-13736656)
chr5 (30-144)||(26765041-26765157)
chr5 (30-144)||(30116320-30116437)
chr5 (30-144)||(23413457-23413573)
chr5 (130-189)||(23589238-23589298)
chr5 (30-69)||(17814580-17814619)
chr5 (30-69)||(26783969-26784008)
chr5 (30-69)||(30742596-30742635)
chr5 (30-69)||(39799359-39799398)
chr5 (39-69)||(25097319-25097349)
chr5 (39-69)||(25155289-25155319)
chr5 (94-186)||(17263182-17263275)
chr5 (8-37)||(42395450-42395479)
chr5 (14-69)||(25930622-25930678)
chr5 (33-69)||(31487850-31487886)
[»] chr8 (142 HSPs)
chr8 (2-242)||(6318895-6319135)
chr8 (2-242)||(26110892-26111132)
chr8 (2-242)||(3220293-3220533)
chr8 (2-242)||(19128409-19128649)
chr8 (2-242)||(43247986-43248226)
chr8 (2-242)||(18449031-18449271)
chr8 (2-242)||(19138941-19139181)
chr8 (2-242)||(32078075-32078315)
chr8 (2-242)||(32088648-32088888)
chr8 (2-242)||(36292580-36292822)
chr8 (2-242)||(36303183-36303425)
chr8 (2-236)||(3349006-3349242)
chr8 (2-236)||(3359603-3359839)
chr8 (2-236)||(9340809-9341045)
chr8 (2-236)||(9367953-9368189)
chr8 (2-242)||(9856851-9857096)
chr8 (2-236)||(44480756-44480992)
chr8 (2-236)||(44491372-44491608)
chr8 (2-242)||(252068-252310)
chr8 (2-242)||(849346-849588)
chr8 (2-236)||(6160690-6160924)
chr8 (2-242)||(15791678-15791919)
chr8 (2-242)||(26120567-26120810)
chr8 (2-236)||(29076396-29076632)
chr8 (2-236)||(29086647-29086883)
chr8 (2-236)||(36077602-36077838)
chr8 (2-236)||(36088188-36088424)
chr8 (2-242)||(210532-210774)
chr8 (2-242)||(241483-241725)
chr8 (2-242)||(724155-724397)
chr8 (2-242)||(794838-795080)
chr8 (2-242)||(13688947-13689189)
chr8 (2-236)||(6150735-6150969)
chr8 (2-242)||(15781089-15781330)
chr8 (2-242)||(31214673-31214914)
chr8 (8-242)||(20161616-20161850)
chr8 (8-242)||(23469846-23470080)
chr8 (8-242)||(16746661-16746895)
chr8 (8-242)||(19224595-19224829)
chr8 (9-242)||(30315082-30315320)
chr8 (8-242)||(18769522-18769757)
chr8 (8-242)||(19418012-19418247)
chr8 (8-242)||(19428587-19428822)
chr8 (9-242)||(18153398-18153631)
chr8 (9-242)||(18157917-18158150)
chr8 (9-242)||(40213555-40213788)
chr8 (9-242)||(22167409-22167641)
chr8 (9-242)||(22136244-22136476)
chr8 (9-242)||(3843184-3843415)
chr8 (8-161)||(20195697-20195851)
chr8 (9-242)||(20260005-20260236)
chr8 (9-242)||(21046635-21046866)
chr8 (129-242)||(13697185-13697300)
chr8 (9-189)||(7018768-7018954)
chr8 (149-242)||(20195646-20195739)
chr8 (24-234)||(45568410-45568620)
chr8 (9-142)||(22211776-22211911)
chr8 (24-242)||(17519552-17519770)
chr8 (24-234)||(40002674-40002885)
chr8 (100-242)||(7018894-7019034)
chr8 (29-234)||(21287851-21288056)
chr8 (29-189)||(21298504-21298666)
chr8 (114-242)||(23363793-23363920)
chr8 (30-189)||(28902958-28903119)
chr8 (9-161)||(19460707-19460862)
chr8 (9-161)||(19558385-19558540)
chr8 (30-140)||(19956838-19956949)
chr8 (30-173)||(15934132-15934277)
chr8 (29-209)||(21540427-21540606)
chr8 (9-69)||(23370386-23370446)
chr8 (30-189)||(1210243-1210405)
chr8 (30-143)||(18321659-18321773)
chr8 (30-144)||(19942770-19942884)
chr8 (132-242)||(19460659-19460767)
chr8 (132-242)||(19558337-19558445)
chr8 (132-242)||(23271689-23271797)
chr8 (9-161)||(23271594-23271749)
chr8 (130-242)||(22211869-22211979)
chr8 (33-193)||(26832560-26832722)
chr8 (30-144)||(29692846-29692963)
chr8 (25-182)||(33052374-33052531)
chr8 (30-173)||(18152148-18152295)
chr8 (30-145)||(14990563-14990681)
chr8 (24-161)||(29379097-29379236)
chr8 (9-115)||(8031593-8031702)
chr8 (132-235)||(29379054-29379157)
chr8 (30-144)||(45538938-45539055)
chr8 (30-165)||(22462138-22462275)
chr8 (30-189)||(1744640-1744802)
chr8 (30-173)||(14989952-14990099)
chr8 (30-144)||(25163605-25163721)
chr8 (14-144)||(33560699-33560833)
chr8 (30-146)||(2810340-2810458)
chr8 (30-132)||(19505938-19506040)
chr8 (30-144)||(20256011-20256128)
chr8 (30-144)||(20382894-20383011)
chr8 (30-144)||(30421934-30422050)
chr8 (30-144)||(40845888-40846005)
chr8 (30-189)||(17687473-17687631)
chr8 (81-193)||(18557517-18557630)
chr8 (29-144)||(18679348-18679465)
chr8 (29-144)||(18718537-18718654)
chr8 (30-193)||(25850494-25850659)
chr8 (34-189)||(12541134-12541289)
chr8 (30-69)||(12193524-12193563)
chr8 (30-69)||(12437952-12437991)
chr8 (30-69)||(13431121-13431160)
chr8 (30-69)||(17701352-17701391)
chr8 (30-69)||(17928664-17928703)
chr8 (39-144)||(18121618-18121725)
chr8 (30-69)||(19707119-19707158)
chr8 (30-69)||(21932492-21932531)
chr8 (30-69)||(43639392-43639431)
chr8 (30-69)||(43644507-43644546)
chr8 (30-69)||(43773730-43773769)
chr8 (30-69)||(45292445-45292484)
chr8 (30-144)||(17796954-17797070)
chr8 (30-174)||(18772196-18772342)
chr8 (39-144)||(22707865-22707971)
chr8 (131-184)||(24678970-24679024)
chr8 (39-76)||(17879237-17879274)
chr8 (24-69)||(24634929-24634974)
chr8 (130-242)||(8031495-8031608)
chr8 (30-144)||(16206831-16206947)
chr8 (29-69)||(17442319-17442359)
chr8 (30-173)||(22662619-22662766)
chr8 (30-189)||(39693021-39693184)
chr8 (30-69)||(15336589-15336628)
chr8 (30-69)||(15425654-15425693)
chr8 (30-69)||(15516958-15516997)
chr8 (30-69)||(17526233-17526272)
chr8 (30-69)||(19155854-19155893)
chr8 (30-69)||(23264126-23264165)
chr8 (30-69)||(24498610-24498649)
chr8 (34-69)||(24645942-24645977)
chr8 (30-69)||(27739493-27739532)
chr8 (30-65)||(36104811-36104846)
chr8 (140-189)||(17879155-17879205)
chr8 (104-234)||(21298431-21298560)
chr8 (102-187)||(28888788-28888874)
chr8 (33-69)||(6407336-6407372)
chr8 (131-187)||(27739408-27739464)
[»] chr2 (138 HSPs)
chr2 (2-242)||(16768567-16768807)
chr2 (6-242)||(43082278-43082514)
chr2 (2-242)||(43092887-43093127)
chr2 (2-242)||(24328098-24328338)
chr2 (2-242)||(24338768-24339008)
chr2 (2-239)||(29254428-29254665)
chr2 (2-242)||(1099559-1099799)
chr2 (2-242)||(7006171-7006411)
chr2 (2-242)||(9773668-9773908)
chr2 (2-242)||(11389173-11389413)
chr2 (2-242)||(22915228-22915468)
chr2 (2-242)||(22960696-22960936)
chr2 (2-242)||(29243846-29244086)
chr2 (2-242)||(30489188-30489428)
chr2 (2-242)||(4099438-4099678)
chr2 (2-242)||(4209513-4209753)
chr2 (2-242)||(4220105-4220345)
chr2 (2-242)||(9763132-9763372)
chr2 (2-242)||(17857801-17858041)
chr2 (2-242)||(34790581-34790821)
chr2 (2-242)||(34804724-34804964)
chr2 (2-242)||(11395536-11395778)
chr2 (2-242)||(11405852-11406094)
chr2 (2-242)||(18393001-18393243)
chr2 (2-236)||(10266622-10266858)
chr2 (2-236)||(10277199-10277435)
chr2 (2-242)||(36252208-36252448)
chr2 (2-242)||(32217496-32217738)
chr2 (2-242)||(34477552-34477793)
chr2 (2-236)||(39170459-39170695)
chr2 (2-242)||(40221956-40222197)
chr2 (2-242)||(40250817-40251058)
chr2 (2-242)||(9897938-9898181)
chr2 (2-242)||(9908526-9908769)
chr2 (2-236)||(35263219-35263455)
chr2 (2-236)||(35273844-35274080)
chr2 (2-236)||(27221009-27221245)
chr2 (2-236)||(43345036-43345272)
chr2 (2-236)||(43354651-43354887)
chr2 (2-236)||(35252610-35252846)
chr2 (8-242)||(2561112-2561346)
chr2 (8-242)||(24415391-24415625)
chr2 (8-242)||(24427956-24428190)
chr2 (8-242)||(18769275-18769508)
chr2 (8-242)||(28732272-28732506)
chr2 (9-242)||(26866696-26866929)
chr2 (8-242)||(28721686-28721920)
chr2 (8-242)||(21172836-21173072)
chr2 (9-242)||(26879285-26879518)
chr2 (9-242)||(27978753-27978985)
chr2 (9-242)||(28065282-28065514)
chr2 (9-242)||(36785170-36785403)
chr2 (9-233)||(22763288-22763511)
chr2 (9-242)||(38586457-38586693)
chr2 (9-235)||(22773990-22774215)
chr2 (9-242)||(967875-968107)
chr2 (9-242)||(24274651-24274882)
chr2 (9-235)||(1041781-1042006)
chr2 (9-242)||(17970641-17970872)
chr2 (9-242)||(19355945-19356177)
chr2 (108-236)||(21650975-21651105)
chr2 (2-86)||(21650895-21650979)
chr2 (9-161)||(19313389-19313544)
chr2 (9-242)||(20646980-20647214)
chr2 (24-234)||(24801988-24802198)
chr2 (24-234)||(24814955-24815165)
chr2 (29-234)||(23393113-23393318)
chr2 (9-161)||(19300382-19300537)
chr2 (9-161)||(19498362-19498517)
chr2 (29-233)||(1083465-1083669)
chr2 (30-189)||(21911311-21911473)
chr2 (9-69)||(17969581-17969641)
chr2 (132-242)||(19302918-19303026)
chr2 (132-242)||(19498457-19498565)
chr2 (39-144)||(24843741-24843847)
chr2 (30-165)||(26619548-26619685)
chr2 (130-242)||(38033296-38033407)
chr2 (9-145)||(22755009-22755148)
chr2 (30-144)||(18431386-18431501)
chr2 (30-144)||(18702278-18702393)
chr2 (25-131)||(15671053-15671157)
chr2 (101-186)||(16587510-16587596)
chr2 (130-242)||(19313482-19313592)
chr2 (39-193)||(22382968-22383125)
chr2 (30-144)||(24575571-24575688)
chr2 (33-131)||(25918265-25918363)
chr2 (30-193)||(22271619-22271784)
chr2 (30-161)||(14794307-14794438)
chr2 (30-144)||(28141049-28141165)
chr2 (179-242)||(30794433-30794497)
chr2 (132-209)||(19300477-19300553)
chr2 (30-144)||(24376644-24376758)
chr2 (30-144)||(10010198-10010315)
chr2 (30-144)||(20569197-20569314)
chr2 (30-144)||(22786103-22786220)
chr2 (30-144)||(38780931-38781048)
chr2 (30-143)||(20152449-20152564)
chr2 (24-69)||(22525269-22525314)
chr2 (30-144)||(19539953-19540069)
chr2 (29-69)||(31328410-31328450)
chr2 (29-69)||(31335131-31335171)
chr2 (30-69)||(6574576-6574615)
chr2 (30-69)||(14581171-14581210)
chr2 (30-144)||(21537699-21537813)
chr2 (105-144)||(21548821-21548860)
chr2 (131-189)||(21845679-21845738)
chr2 (30-69)||(21845771-21845810)
chr2 (30-69)||(22188551-22188590)
chr2 (30-69)||(22802083-22802122)
chr2 (33-144)||(23234543-23234656)
chr2 (30-69)||(28551367-28551406)
chr2 (30-69)||(31801336-31801375)
chr2 (30-69)||(40331722-40331761)
chr2 (30-69)||(44840046-44840085)
chr2 (33-115)||(44880734-44880817)
chr2 (30-144)||(22317127-22317243)
chr2 (25-194)||(22682882-22683051)
chr2 (12-130)||(38033205-38033326)
chr2 (30-67)||(22257817-22257854)
chr2 (30-114)||(22455436-22455521)
chr2 (130-209)||(22754976-22755054)
chr2 (29-69)||(1088980-1089020)
chr2 (34-69)||(13964431-13964466)
chr2 (30-69)||(23184750-23184789)
chr2 (30-69)||(23596013-23596052)
chr2 (30-69)||(30557769-30557808)
chr2 (30-140)||(39038089-39038200)
chr2 (30-69)||(45087430-45087469)
chr2 (39-69)||(10898980-10899010)
chr2 (39-69)||(24441173-24441203)
chr2 (30-68)||(27939600-27939638)
chr2 (81-193)||(20567646-20567759)
chr2 (30-67)||(35744426-35744463)
chr2 (94-161)||(19302910-19302978)
chr2 (104-144)||(22312304-22312344)
chr2 (33-69)||(28701664-28701700)
chr2 (33-69)||(33240296-33240332)
chr2 (33-69)||(33248217-33248253)
[»] scaffold0747 (1 HSPs)
scaffold0747 (2-242)||(2321-2561)
[»] chr1 (157 HSPs)
chr1 (2-242)||(4177493-4177733)
chr1 (2-242)||(51629576-51629818)
chr1 (2-242)||(51656837-51657079)
chr1 (2-242)||(5640099-5640339)
chr1 (2-242)||(19178537-19178777)
chr1 (2-242)||(19187416-19187656)
chr1 (2-242)||(33084139-33084380)
chr1 (2-242)||(12730125-12730365)
chr1 (2-242)||(12740718-12740958)
chr1 (2-242)||(12898370-12898610)
chr1 (2-242)||(21863239-21863479)
chr1 (2-242)||(5650656-5650896)
chr1 (2-242)||(10998173-10998413)
chr1 (2-242)||(12624170-12624410)
chr1 (2-242)||(35649080-35649322)
chr1 (2-242)||(38094652-38094894)
chr1 (2-242)||(38105277-38105519)
chr1 (2-236)||(5832800-5833036)
chr1 (2-236)||(5843402-5843638)
chr1 (2-242)||(21877344-21877585)
chr1 (2-242)||(12614705-12614945)
chr1 (2-242)||(35012506-35012741)
chr1 (2-242)||(7506878-7507120)
chr1 (2-242)||(7517475-7517717)
chr1 (2-242)||(36236818-36237060)
chr1 (2-242)||(36247365-36247607)
chr1 (2-236)||(3171204-3171440)
chr1 (2-236)||(3181806-3182042)
chr1 (2-236)||(47608320-47608556)
chr1 (2-236)||(47618928-47619164)
chr1 (2-210)||(4166869-4167077)
chr1 (8-242)||(7689854-7690091)
chr1 (2-242)||(35404781-35405023)
chr1 (2-236)||(2538118-2538354)
chr1 (2-242)||(35638428-35638667)
chr1 (8-242)||(5973336-5973570)
chr1 (8-242)||(148608-148843)
chr1 (8-242)||(154683-154918)
chr1 (8-242)||(20441711-20441945)
chr1 (8-242)||(4250959-4251197)
chr1 (7-242)||(18382297-18382532)
chr1 (8-242)||(39194488-39194724)
chr1 (27-242)||(7677422-7677637)
chr1 (9-242)||(12944787-12945020)
chr1 (8-242)||(39586549-39586782)
chr1 (9-242)||(17956816-17957051)
chr1 (9-242)||(11195464-11195697)
chr1 (9-242)||(20196088-20196321)
chr1 (8-186)||(47194896-47195074)
chr1 (9-242)||(22610371-22610602)
chr1 (9-242)||(14388523-14388757)
chr1 (9-242)||(675025-675256)
chr1 (9-242)||(18311369-18311602)
chr1 (2-145)||(23580715-23580857)
chr1 (9-242)||(41133013-41133246)
chr1 (133-242)||(23580816-23580925)
chr1 (9-242)||(5929157-5929390)
chr1 (9-161)||(9050882-9051036)
chr1 (9-161)||(46181275-46181429)
chr1 (26-234)||(34255935-34256142)
chr1 (104-242)||(47194781-47194919)
chr1 (9-242)||(23926509-23926744)
chr1 (149-242)||(9050994-9051087)
chr1 (29-242)||(28379440-28379654)
chr1 (24-189)||(22642392-22642559)
chr1 (9-142)||(20884278-20884412)
chr1 (33-242)||(22018777-22018987)
chr1 (24-233)||(26548673-26548883)
chr1 (29-234)||(17370496-17370701)
chr1 (9-142)||(20867249-20867383)
chr1 (12-194)||(19037499-19037685)
chr1 (9-161)||(28473756-28473912)
chr1 (9-142)||(45071024-45071159)
chr1 (130-242)||(46181367-46181477)
chr1 (9-143)||(52351080-52351217)
chr1 (24-174)||(22654989-22655141)
chr1 (14-189)||(31358825-31358999)
chr1 (29-242)||(19170747-19170960)
chr1 (124-189)||(19965760-19965825)
chr1 (9-69)||(20798689-20798749)
chr1 (30-144)||(10756966-10757081)
chr1 (33-186)||(8698357-8698510)
chr1 (130-242)||(20884370-20884480)
chr1 (130-242)||(28473708-28473818)
chr1 (9-145)||(44200559-44200697)
chr1 (19-159)||(7745493-7745634)
chr1 (30-193)||(17025386-17025551)
chr1 (104-234)||(22642318-22642448)
chr1 (14-161)||(20251301-20251452)
chr1 (29-159)||(21543566-21543698)
chr1 (30-187)||(26280474-26280633)
chr1 (25-147)||(2819728-2819849)
chr1 (30-144)||(21215100-21215217)
chr1 (30-189)||(7309312-7309475)
chr1 (30-189)||(26703073-26703233)
chr1 (30-144)||(18897017-18897131)
chr1 (2-60)||(21894963-21895022)
chr1 (30-174)||(16233552-16233698)
chr1 (30-144)||(30892633-30892750)
chr1 (130-242)||(45071117-45071227)
chr1 (30-146)||(48703741-48703859)
chr1 (30-174)||(14263854-14264002)
chr1 (132-242)||(20251251-20251361)
chr1 (12-144)||(25448961-25449097)
chr1 (130-209)||(52351174-52351252)
chr1 (30-131)||(18130434-18130537)
chr1 (30-144)||(36133742-36133858)
chr1 (34-144)||(21028336-21028447)
chr1 (9-69)||(24029083-24029145)
chr1 (30-140)||(2834230-2834343)
chr1 (30-115)||(14293107-14293193)
chr1 (30-144)||(21205296-21205413)
chr1 (30-144)||(23024332-23024449)
chr1 (30-131)||(27858295-27858397)
chr1 (30-144)||(33256773-33256890)
chr1 (30-144)||(33276945-33277062)
chr1 (30-144)||(35039705-35039822)
chr1 (130-242)||(44200490-44200604)
chr1 (30-144)||(2268070-2268186)
chr1 (132-209)||(21543549-21543624)
chr1 (14-69)||(37640627-37640683)
chr1 (30-234)||(42284091-42284297)
chr1 (30-69)||(2327859-2327898)
chr1 (131-189)||(9346299-9346358)
chr1 (30-69)||(10250603-10250642)
chr1 (131-189)||(16233624-16233683)
chr1 (30-69)||(18517583-18517622)
chr1 (30-69)||(21121488-21121527)
chr1 (30-69)||(22202157-22202196)
chr1 (30-69)||(22427761-22427800)
chr1 (30-69)||(23036930-23036969)
chr1 (30-69)||(38282181-38282220)
chr1 (30-69)||(44824185-44824224)
chr1 (30-69)||(48570654-48570693)
chr1 (30-144)||(16235732-16235848)
chr1 (196-242)||(16710411-16710457)
chr1 (30-187)||(22639779-22639934)
chr1 (30-144)||(46088528-46088645)
chr1 (31-144)||(19215153-19215268)
chr1 (31-145)||(23053913-23054026)
chr1 (30-69)||(1577483-1577522)
chr1 (30-69)||(12284042-12284081)
chr1 (30-69)||(12624977-12625016)
chr1 (30-69)||(18515612-18515651)
chr1 (30-69)||(19717140-19717179)
chr1 (30-69)||(21702431-21702470)
chr1 (33-144)||(21984135-21984249)
chr1 (30-69)||(28492824-28492863)
chr1 (30-69)||(30571814-30571853)
chr1 (30-69)||(32786363-32786402)
chr1 (130-171)||(20867341-20867383)
chr1 (30-132)||(21684477-21684579)
chr1 (132-189)||(26280547-26280605)
chr1 (39-159)||(23917355-23917477)
chr1 (102-143)||(35895704-35895745)
chr1 (30-70)||(2266714-2266753)
chr1 (130-193)||(18130506-18130570)
[»] chr7 (159 HSPs)
chr7 (2-239)||(21003434-21003671)
chr7 (2-242)||(37343834-37344074)
chr7 (2-242)||(166529-166769)
chr7 (2-242)||(177121-177361)
chr7 (2-242)||(5685153-5685393)
chr7 (2-242)||(9432898-9433138)
chr7 (2-242)||(20989287-20989527)
chr7 (2-242)||(48710917-48711157)
chr7 (2-242)||(468007-468247)
chr7 (2-242)||(6867651-6867891)
chr7 (2-242)||(6878283-6878523)
chr7 (2-242)||(9084918-9085158)
chr7 (2-242)||(9094632-9094872)
chr7 (2-242)||(9443494-9443734)
chr7 (2-242)||(26653751-26653991)
chr7 (2-242)||(26700080-26700320)
chr7 (8-242)||(14746101-14746336)
chr7 (2-242)||(26390522-26390764)
chr7 (2-242)||(26401164-26401406)
chr7 (2-242)||(24931029-24931270)
chr7 (2-242)||(26294455-26294696)
chr7 (2-242)||(22099372-22099612)
chr7 (2-242)||(2706038-2706280)
chr7 (2-242)||(17961150-17961392)
chr7 (2-242)||(24734385-24734627)
chr7 (2-242)||(24744332-24744574)
chr7 (2-242)||(40042534-40042776)
chr7 (2-242)||(40053083-40053325)
chr7 (2-242)||(8627581-8627823)
chr7 (2-236)||(1987178-1987414)
chr7 (2-236)||(1997799-1998035)
chr7 (2-236)||(42865465-42865701)
chr7 (2-236)||(42876091-42876327)
chr7 (2-242)||(22088757-22088997)
chr7 (2-242)||(17950544-17950786)
chr7 (2-236)||(11004823-11005059)
chr7 (2-242)||(2716642-2716884)
chr7 (8-242)||(1367264-1367498)
chr7 (2-236)||(4222246-4222482)
chr7 (2-236)||(8002491-8002727)
chr7 (2-236)||(8013136-8013372)
chr7 (2-242)||(8617019-8617260)
chr7 (8-242)||(3165369-3165603)
chr7 (8-242)||(15888760-15888994)
chr7 (8-242)||(30049154-30049388)
chr7 (2-206)||(455225-455429)
chr7 (8-242)||(588847-589081)
chr7 (8-242)||(31116942-31117176)
chr7 (8-242)||(20490641-20490875)
chr7 (8-242)||(21770374-21770608)
chr7 (8-242)||(9159365-9159599)
chr7 (8-242)||(9169820-9170054)
chr7 (2-186)||(11095744-11095928)
chr7 (9-242)||(40055185-40055419)
chr7 (9-238)||(18418753-18418981)
chr7 (9-238)||(18440834-18441062)
chr7 (9-242)||(38403644-38403877)
chr7 (9-242)||(3476774-3477005)
chr7 (9-242)||(48381821-48382054)
chr7 (2-161)||(540798-540959)
chr7 (9-242)||(8933199-8933430)
chr7 (9-242)||(15215952-15216183)
chr7 (9-242)||(29589627-29589859)
chr7 (81-242)||(17064034-17064195)
chr7 (8-161)||(44280209-44280363)
chr7 (9-242)||(13681955-13682186)
chr7 (9-242)||(12734598-12734829)
chr7 (9-242)||(26209982-26210213)
chr7 (2-161)||(4211724-4211883)
chr7 (9-242)||(8999370-8999606)
chr7 (9-161)||(38594144-38594298)
chr7 (130-236)||(4211677-4211785)
chr7 (133-242)||(540747-540857)
chr7 (9-161)||(24882853-24883007)
chr7 (149-242)||(44280158-44280251)
chr7 (14-242)||(11087485-11087716)
chr7 (29-234)||(4433039-4433244)
chr7 (25-234)||(4412462-4412671)
chr7 (149-242)||(38594256-38594348)
chr7 (24-242)||(13175058-13175277)
chr7 (130-242)||(24882945-24883055)
chr7 (29-236)||(602215-602421)
chr7 (30-114)||(2501517-2501600)
chr7 (30-144)||(13302397-13302514)
chr7 (30-193)||(25687345-25687509)
chr7 (30-137)||(19237540-19237648)
chr7 (25-189)||(25806885-25807051)
chr7 (30-187)||(5034880-5035039)
chr7 (30-144)||(13027406-13027521)
chr7 (30-144)||(13034342-13034457)
chr7 (30-144)||(12174844-12174961)
chr7 (30-194)||(13172858-13173023)
chr7 (30-189)||(13731178-13731341)
chr7 (30-144)||(15088085-15088202)
chr7 (30-112)||(18362071-18362153)
chr7 (92-189)||(23125439-23125537)
chr7 (30-144)||(32265224-32265341)
chr7 (30-144)||(48063316-48063433)
chr7 (30-147)||(16472227-16472342)
chr7 (30-144)||(4494113-4494229)
chr7 (40-189)||(13263274-13263421)
chr7 (30-138)||(16315043-16315154)
chr7 (33-189)||(9802671-9802829)
chr7 (33-144)||(16112392-16112506)
chr7 (30-144)||(2914114-2914231)
chr7 (39-144)||(7488418-7488524)
chr7 (30-144)||(10883675-10883792)
chr7 (30-144)||(16557094-16557211)
chr7 (30-144)||(16608451-16608568)
chr7 (30-144)||(27871253-27871370)
chr7 (30-144)||(28622863-28622980)
chr7 (30-144)||(29935849-29935964)
chr7 (30-192)||(2499526-2499690)
chr7 (40-144)||(16317070-16317175)
chr7 (30-174)||(22579719-22579866)
chr7 (130-189)||(16308289-16308349)
chr7 (30-69)||(4821098-4821137)
chr7 (30-69)||(8182544-8182583)
chr7 (30-69)||(11015575-11015614)
chr7 (30-69)||(11319020-11319059)
chr7 (30-144)||(11792447-11792562)
chr7 (14-69)||(12222922-12222977)
chr7 (30-69)||(13261118-13261157)
chr7 (30-144)||(13473002-13473117)
chr7 (30-69)||(14187304-14187343)
chr7 (30-69)||(14425070-14425109)
chr7 (30-69)||(14426161-14426200)
chr7 (30-69)||(15467530-15467569)
chr7 (30-69)||(15704993-15705032)
chr7 (30-69)||(15871583-15871622)
chr7 (30-69)||(19711517-19711556)
chr7 (30-69)||(21381933-21381972)
chr7 (30-69)||(23280465-23280504)
chr7 (30-69)||(24795219-24795258)
chr7 (30-69)||(30945864-30945903)
chr7 (30-69)||(33692206-33692245)
chr7 (33-184)||(9762184-9762337)
chr7 (92-189)||(11572762-11572860)
chr7 (34-174)||(44466570-44466712)
chr7 (30-144)||(13683134-13683250)
chr7 (47-159)||(15304135-15304249)
chr7 (197-242)||(25212471-25212516)
chr7 (30-189)||(13138401-13138564)
chr7 (30-234)||(48806384-48806590)
chr7 (30-69)||(1292644-1292683)
chr7 (30-69)||(1878763-1878802)
chr7 (30-69)||(2266020-2266059)
chr7 (34-69)||(13879785-13879820)
chr7 (30-69)||(16105470-16105509)
chr7 (30-69)||(19339753-19339792)
chr7 (30-69)||(21691945-21691984)
chr7 (39-69)||(12367250-12367280)
chr7 (94-144)||(16310477-16310527)
chr7 (39-69)||(16411617-16411647)
chr7 (124-189)||(20094640-20094706)
chr7 (100-161)||(23125437-23125499)
chr7 (39-76)||(9065113-9065150)
chr7 (202-242)||(457618-457658)
chr7 (30-66)||(19328518-19328554)
[»] scaffold0386 (1 HSPs)
scaffold0386 (2-242)||(11988-12228)
[»] scaffold0322 (1 HSPs)
scaffold0322 (2-242)||(7269-7509)
[»] scaffold0133 (2 HSPs)
scaffold0133 (2-242)||(30761-31003)
scaffold0133 (8-242)||(42911-43150)
[»] scaffold0047 (3 HSPs)
scaffold0047 (2-242)||(40838-41078)
scaffold0047 (8-242)||(33293-33527)
scaffold0047 (30-69)||(8253-8292)
[»] scaffold0027 (1 HSPs)
scaffold0027 (2-242)||(7227-7467)
[»] scaffold0105 (2 HSPs)
scaffold0105 (2-242)||(7590-7832)
scaffold0105 (2-242)||(37343-37585)
[»] scaffold0072 (1 HSPs)
scaffold0072 (8-242)||(37125-37359)
[»] scaffold0028 (4 HSPs)
scaffold0028 (8-242)||(14214-14448)
scaffold0028 (8-242)||(54514-54748)
scaffold0028 (30-69)||(81015-81054)
scaffold0028 (31-69)||(6056-6094)
[»] scaffold0391 (1 HSPs)
scaffold0391 (8-242)||(2609-2844)
[»] scaffold0068 (4 HSPs)
scaffold0068 (23-242)||(11012-11231)
scaffold0068 (23-227)||(8165-8369)
scaffold0068 (8-37)||(8145-8174)
scaffold0068 (8-37)||(10992-11021)
[»] scaffold0407 (1 HSPs)
scaffold0407 (9-242)||(12509-12742)
[»] scaffold0739 (1 HSPs)
scaffold0739 (9-242)||(1626-1857)
[»] scaffold0154 (1 HSPs)
scaffold0154 (9-242)||(35170-35401)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (9-242)||(40133-40365)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (9-242)||(4928-5159)
[»] scaffold0084 (3 HSPs)
scaffold0084 (9-242)||(57175-57408)
scaffold0084 (24-234)||(833-1043)
scaffold0084 (30-144)||(48874-48991)
[»] scaffold0012 (4 HSPs)
scaffold0012 (9-235)||(127284-127510)
scaffold0012 (9-242)||(16236-16469)
scaffold0012 (9-69)||(140608-140668)
scaffold0012 (9-115)||(8045-8154)
[»] scaffold0497 (1 HSPs)
scaffold0497 (9-238)||(10680-10908)
[»] scaffold0410 (1 HSPs)
scaffold0410 (9-242)||(15359-15591)
[»] scaffold0163 (1 HSPs)
scaffold0163 (9-242)||(29106-29337)
[»] scaffold0185 (1 HSPs)
scaffold0185 (9-209)||(32472-32674)
[»] scaffold0099 (2 HSPs)
scaffold0099 (8-181)||(17346-17525)
scaffold0099 (13-228)||(18857-19084)
[»] scaffold0017 (4 HSPs)
scaffold0017 (9-242)||(59286-59520)
scaffold0017 (9-242)||(40740-40976)
scaffold0017 (9-132)||(175062-175188)
scaffold0017 (179-242)||(175012-175074)
[»] scaffold0544 (2 HSPs)
scaffold0544 (9-142)||(10183-10317)
scaffold0544 (130-242)||(10275-10385)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (9-142)||(29190-29324)
scaffold0001 (130-242)||(29282-29392)
[»] scaffold0002 (3 HSPs)
scaffold0002 (24-242)||(475697-475916)
scaffold0002 (24-242)||(482217-482436)
scaffold0002 (24-69)||(157072-157117)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (2-77)||(2725-2800)
[»] scaffold0655 (1 HSPs)
scaffold0655 (24-234)||(4572-4783)
[»] scaffold2071 (2 HSPs)
scaffold2071 (22-142)||(877-997)
scaffold2071 (130-242)||(955-1065)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (24-242)||(61178-61398)
[»] scaffold0547 (2 HSPs)
scaffold0547 (9-142)||(447-582)
scaffold0547 (130-242)||(379-489)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (29-234)||(4349-4554)
[»] scaffold0570 (3 HSPs)
scaffold0570 (24-234)||(2119-2329)
scaffold0570 (127-235)||(1-108)
scaffold0570 (104-132)||(38-66)
[»] scaffold0018 (2 HSPs)
scaffold0018 (24-189)||(6899-7066)
scaffold0018 (104-234)||(7010-7139)
[»] scaffold0149 (2 HSPs)
scaffold0149 (9-142)||(38390-38523)
scaffold0149 (135-242)||(38487-38591)
[»] scaffold0050 (2 HSPs)
scaffold0050 (29-189)||(35145-35307)
scaffold0050 (104-242)||(35064-35201)
[»] scaffold0007 (4 HSPs)
scaffold0007 (9-142)||(59683-59817)
scaffold0007 (30-173)||(63881-64027)
scaffold0007 (30-173)||(46207-46353)
scaffold0007 (130-207)||(59775-59851)
[»] scaffold0443 (2 HSPs)
scaffold0443 (9-161)||(1431-1587)
scaffold0443 (130-242)||(1525-1635)
[»] scaffold0752 (4 HSPs)
scaffold0752 (9-115)||(961-1069)
scaffold0752 (9-115)||(1576-1684)
scaffold0752 (130-242)||(866-976)
scaffold0752 (130-242)||(1481-1591)
[»] scaffold1263 (1 HSPs)
scaffold1263 (24-189)||(1574-1741)
[»] scaffold0622 (1 HSPs)
scaffold0622 (25-189)||(3844-4011)
[»] scaffold0090 (4 HSPs)
scaffold0090 (9-161)||(355-510)
scaffold0090 (9-161)||(4735-4890)
scaffold0090 (132-242)||(307-415)
scaffold0090 (132-242)||(4687-4795)
[»] scaffold0081 (1 HSPs)
scaffold0081 (30-187)||(13542-13701)
[»] scaffold0040 (4 HSPs)
scaffold0040 (30-189)||(4464-4625)
scaffold0040 (30-115)||(1962-2048)
scaffold0040 (102-172)||(8260-8331)
scaffold0040 (150-189)||(8279-8318)
[»] scaffold0073 (2 HSPs)
scaffold0073 (45-142)||(58065-58162)
scaffold0073 (130-242)||(57997-58107)
[»] scaffold0207 (5 HSPs)
scaffold0207 (29-159)||(10250-10382)
scaffold0207 (29-187)||(20123-20283)
scaffold0207 (104-234)||(20018-20147)
scaffold0207 (132-189)||(10250-10308)
scaffold0207 (132-189)||(20151-20209)
[»] scaffold0177 (1 HSPs)
scaffold0177 (29-209)||(20824-21003)
[»] scaffold1321 (1 HSPs)
scaffold1321 (24-189)||(1381-1548)
[»] scaffold0422 (2 HSPs)
scaffold0422 (29-189)||(11259-11421)
scaffold0422 (104-242)||(11178-11315)
[»] scaffold0220 (2 HSPs)
scaffold0220 (24-145)||(2259-2381)
scaffold0220 (132-234)||(2338-2439)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (9-161)||(60751-60907)
scaffold0005 (130-242)||(60701-60813)
[»] scaffold0210 (1 HSPs)
scaffold0210 (30-144)||(1201-1317)
[»] scaffold0132 (2 HSPs)
scaffold0132 (29-187)||(38535-38695)
scaffold0132 (132-189)||(38609-38667)
[»] scaffold0116 (2 HSPs)
scaffold0116 (30-144)||(21429-21544)
scaffold0116 (30-144)||(2427-2544)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (30-187)||(144405-144564)
[»] scaffold0771 (2 HSPs)
scaffold0771 (29-130)||(5901-6003)
scaffold0771 (30-144)||(17-134)
[»] scaffold0011 (5 HSPs)
scaffold0011 (81-242)||(165135-165296)
scaffold0011 (30-144)||(65859-65976)
scaffold0011 (30-144)||(144904-145021)
scaffold0011 (39-186)||(59060-59208)
scaffold0011 (25-66)||(251224-251265)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (169-242)||(1-73)
[»] scaffold0004 (5 HSPs)
scaffold0004 (30-165)||(244734-244870)
scaffold0004 (30-144)||(219782-219897)
scaffold0004 (30-144)||(210940-211057)
scaffold0004 (30-144)||(377999-378116)
scaffold0004 (30-193)||(87898-88063)
[»] scaffold0330 (1 HSPs)
scaffold0330 (30-144)||(107-223)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (30-189)||(7591-7749)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (34-144)||(158653-158764)
[»] scaffold0349 (2 HSPs)
scaffold0349 (149-242)||(13978-14068)
scaffold0349 (104-161)||(14026-14084)
[»] scaffold0324 (1 HSPs)
scaffold0324 (30-143)||(9501-9615)
[»] scaffold0205 (2 HSPs)
scaffold0205 (30-144)||(393-510)
scaffold0205 (30-69)||(279-318)
[»] scaffold0426 (1 HSPs)
scaffold0426 (30-143)||(13114-13230)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (29-234)||(9424-9631)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (189-242)||(23402-23455)
[»] scaffold0269 (1 HSPs)
scaffold0269 (29-145)||(6825-6942)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (30-193)||(32239-32404)
[»] scaffold0035 (3 HSPs)
scaffold0035 (30-189)||(99660-99823)
scaffold0035 (30-69)||(19921-19960)
scaffold0035 (30-69)||(29413-29452)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (30-146)||(59556-59675)
scaffold0026 (30-69)||(7544-7583)
[»] scaffold1657 (1 HSPs)
scaffold1657 (30-144)||(1384-1498)
[»] scaffold0359 (1 HSPs)
scaffold0359 (30-144)||(6144-6261)
[»] scaffold0273 (2 HSPs)
scaffold0273 (30-115)||(5202-5288)
scaffold0273 (132-183)||(22546-22598)
[»] scaffold0211 (2 HSPs)
scaffold0211 (132-189)||(1-59)
scaffold0211 (102-189)||(1-89)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (30-144)||(88054-88171)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (30-144)||(263-380)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (30-115)||(268353-268439)
scaffold0009 (30-69)||(84011-84050)
[»] scaffold0878 (1 HSPs)
scaffold0878 (117-154)||(4829-4866)
[»] scaffold0758 (1 HSPs)
scaffold0758 (30-189)||(3770-3931)
[»] scaffold0738 (1 HSPs)
scaffold0738 (146-242)||(5331-5424)
[»] scaffold0280 (1 HSPs)
scaffold0280 (30-143)||(3183-3298)
[»] scaffold0627 (1 HSPs)
scaffold0627 (198-242)||(8650-8694)
[»] scaffold0146 (1 HSPs)
scaffold0146 (30-144)||(14659-14775)
[»] scaffold1359 (1 HSPs)
scaffold1359 (30-69)||(1109-1148)
[»] scaffold0859 (1 HSPs)
scaffold0859 (30-69)||(2599-2638)
[»] scaffold0772 (1 HSPs)
scaffold0772 (30-69)||(1331-1370)
[»] scaffold0664 (1 HSPs)
scaffold0664 (29-143)||(908-1023)
[»] scaffold0607 (1 HSPs)
scaffold0607 (30-69)||(5625-5664)
[»] scaffold0530 (1 HSPs)
scaffold0530 (30-69)||(2440-2479)
[»] scaffold0515 (1 HSPs)
scaffold0515 (30-69)||(5801-5840)
[»] scaffold0414 (1 HSPs)
scaffold0414 (30-69)||(7611-7650)
[»] scaffold0306 (1 HSPs)
scaffold0306 (30-69)||(5811-5850)
[»] scaffold0217 (2 HSPs)
scaffold0217 (30-69)||(18648-18687)
scaffold0217 (30-69)||(22584-22623)
[»] scaffold0161 (2 HSPs)
scaffold0161 (30-144)||(10561-10676)
scaffold0161 (30-144)||(15225-15340)
[»] scaffold0069 (1 HSPs)
scaffold0069 (30-69)||(5778-5817)
[»] scaffold0488 (1 HSPs)
scaffold0488 (30-144)||(11738-11855)
[»] scaffold0247 (2 HSPs)
scaffold0247 (30-144)||(16170-16287)
scaffold0247 (30-144)||(25830-25947)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (30-143)||(74126-74240)
[»] scaffold1200 (1 HSPs)
scaffold1200 (201-242)||(1-42)
[»] scaffold0251 (1 HSPs)
scaffold0251 (30-67)||(7443-7480)
[»] scaffold0176 (1 HSPs)
scaffold0176 (30-144)||(8697-8813)
[»] scaffold0498 (1 HSPs)
scaffold0498 (33-144)||(729-841)
[»] scaffold0352 (1 HSPs)
scaffold0352 (33-69)||(1277-1313)
[»] scaffold0249 (1 HSPs)
scaffold0249 (14-69)||(18202-18258)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (29-69)||(44342-44382)
[»] scaffold0683 (1 HSPs)
scaffold0683 (15-69)||(9-64)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (30-69)||(2246-2285)
[»] scaffold0471 (1 HSPs)
scaffold0471 (30-65)||(2928-2963)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (30-69)||(31356-31395)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (30-69)||(35258-35297)
[»] scaffold1339 (1 HSPs)
scaffold1339 (100-189)||(1755-1845)
[»] scaffold0388 (1 HSPs)
scaffold0388 (32-114)||(4968-5048)
[»] scaffold0351 (1 HSPs)
scaffold0351 (40-189)||(9486-9636)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (39-69)||(329-359)
scaffold0003 (33-69)||(90513-90549)
[»] scaffold1026 (1 HSPs)
scaffold1026 (32-69)||(2702-2739)
[»] scaffold0290 (1 HSPs)
scaffold0290 (32-69)||(19078-19115)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 241; Significance: 1e-133; HSPs: 230)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Original strand, 6501348 - 6501588
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6501348 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 6501447  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6501448 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 6501547  T
Q  202 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6501548 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 6501588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Original strand, 9994238 - 9994478
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9994238 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 9994337  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9994338 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 9994437  T
Q  202 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9994438 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 9994478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Original strand, 9982230 - 9982470
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9982230 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 9982329  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9982330 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 9982429  T
Q  202 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9982430 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttatgat 9982470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Original strand, 12249784 - 12250024
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12249784 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 12249883  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 201  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12249884 tataagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 12249983  T
Q  202 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12249984 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 12250024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Original strand, 6490694 - 6490934
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6490694 aaattcaaagtccagagtctttattgtattgtattgagaacaccactaattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 6490793  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6490794 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 6490893  T
Q  202 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6490894 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 6490934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Original strand, 12237958 - 12238198
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12237958 aaattcaaagtctatagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 12238057  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12238058 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgttcttgagcagttttgtgaagt 12238157  T
Q  202 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12238158 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 12238198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Original strand, 39673228 - 39673468
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39673228 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 39673327  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 201  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  39673328 cagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 39673427  T
Q  202 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39673428 ctcatacttagatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 39673468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 23757188 - 23756948
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23757188 aaattcaaagtctagagtctttactgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 23757089  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23757088 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 23756989  T
Q  202 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23756988 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 23756948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 23767784 - 23767544
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23767784 aaattcaaagtctagagtctttactgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 23767685  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23767684 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 23767585  T
Q  202 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23767584 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 23767544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Original strand, 4175102 - 4175342
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4175102 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaactcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 4175201  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 201  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4175202 cagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 4175301  T
Q  202 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4175302 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 4175342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Original strand, 6180873 - 6181113
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6180873 aaattcaaagtctagagtctttactgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaactcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 6180972  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6180973 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 6181072  T
Q  202 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6181073 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 6181113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Original strand, 6221047 - 6221287
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6221047 aaattcaaagtctagagtctttactgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaactcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 6221146  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6221147 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 6221246  T
Q  202 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6221247 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 6221287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 13557464 - 13557224
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13557464 aaattcaaagtctagagtctgtactgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 13557365  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13557364 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 13557265  T
Q  202 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13557264 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 13557224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 19788912 - 19788672
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19788912 aaattcaaagtctagagtctgtactgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 19788813  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19788812 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 19788713  T
Q  202 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19788712 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 19788672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 37866335 - 37866095
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37866335 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaactcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 37866236  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 201  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37866235 cagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 37866136  T
Q  202 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37866135 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 37866095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 37885468 - 37885228
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37885468 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaactcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 37885369  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 201  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37885368 cagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 37885269  T
Q  202 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37885268 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 37885228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 13121552 - 13121312
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13121552 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 13121453  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13121452 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 13121353  T
Q  202 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13121352 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 13121312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 13131794 - 13131554
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13131794 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 13131695  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13131694 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 13131595  T
Q  202 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13131594 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 13131554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 14476111 - 14475871
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14476111 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 14476012  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14476011 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 14475912  T
Q  202 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14475911 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 14475871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 19778275 - 19778035
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    |||||||||||||||||||| || | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19778275 aaattcaaagtctagagtctgtactttattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 19778176  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19778175 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 19778076  T
Q  202 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19778075 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 19778035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Original strand, 24383864 - 24384106
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24383864 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 24383963  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca--gttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  24383964 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 24384063  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24384064 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 24384106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Original strand, 5537366 - 5537606
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5537366 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtattgttgtttgat 5537465  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5537466 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 5537565  T
Q  202 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5537566 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 5537606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Original strand, 5547950 - 5548190
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5547950 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtattgttgtttgat 5548049  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5548050 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 5548149  T
Q  202 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5548150 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 5548190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Original strand, 5866041 - 5866283
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5866041 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 5866140  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca--gttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  5866141 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcttgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 5866240  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5866241 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 5866283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Original strand, 5876640 - 5876882
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5876640 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 5876739  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca--gttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  5876740 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcttgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 5876839  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5876840 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 5876882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 8 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 23635593 - 23635359
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||    
T  23635593 aaagtctagagtctttatcgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttaattctttgtatttttgtttgatcagaag 23635494  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcata 207  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23635493 actcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcata 23635394  T
Q  208 ctttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23635393 cttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgat 23635359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 2 - 236
Target Start/End: Original strand, 504513 - 504749
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  504513 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 504612  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca--gttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  504613 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 504712  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctt 236  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  504713 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatctt 504749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 2 - 236
Target Start/End: Original strand, 526879 - 527115
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  526879 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 526978  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca--gttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  526979 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 527078  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctt 236  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  527079 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatctt 527115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 2 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 4743628 - 4743392
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4743628 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 4743529  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca--gttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  4743528 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 4743429  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctt 236  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  4743428 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatctt 4743392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 2 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 4754215 - 4753979
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4754215 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 4754116  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca--gttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  4754115 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 4754016  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctt 236  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  4754015 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatctt 4753979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Original strand, 10627286 - 10627527
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttt-tgtttga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10627286 aaattcaaagtctagagtctttactgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtattttttgtttga 10627385  T
Q  101 ttagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaag 200  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  10627386 tcagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatctttgtgaag 10627485  T
Q  201 tctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    |||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  10627486 tctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatcgttgtgat 10627527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 2 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 16385965 - 16385729
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16385965 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 16385866  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagc--agttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  16385865 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaa 16385766  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctt 236  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  16385765 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatctt 16385729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 2 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 18483934 - 18483698
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18483934 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 18483835  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagc--agttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  18483834 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaa 18483735  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctt 236  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  18483734 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatctt 18483698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 23647639 - 23647398
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23647639 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 23647540  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca-gttttgtgaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  23647539 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattttttgtgaag 23647440  T
Q  201 tctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23647439 tctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 23647398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 2 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 35187267 - 35187031
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35187267 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 35187168  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca--gttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  35187167 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 35187068  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctt 236  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  35187067 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatctt 35187031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 2 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 41683568 - 41683332
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41683568 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 41683469  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca--gttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  41683468 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 41683369  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctt 236  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  41683368 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatctt 41683332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 2 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 41694137 - 41693901
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41694137 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 41694038  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca--gttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  41694037 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 41693938  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctt 236  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  41693937 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatctt 41693901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Original strand, 5579979 - 5580221
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5579979 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 5580078  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagc--agttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  5580079 tagaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaa 5580178  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5580179 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 5580221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 20721003 - 20720761
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20721003 aaattcaaagtctagagtcttttctatattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 20720904  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca--gttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  20720903 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcttgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 20720804  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20720803 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 20720761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 2 - 236
Target Start/End: Original strand, 20684124 - 20684358
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20684124 aaattcaaagtctagagtcttttctgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 20684223  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20684224 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 20684323  T
Q  202 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctt 236  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  20684324 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctt 20684358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 2 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 8774547 - 8774311
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8774547 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 8774448  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagc--agttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  8774447 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaa 8774348  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctt 236  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  8774347 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctt 8774311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 2 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 10098958 - 10098722
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10098958 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 10098859  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagc--agttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  10098858 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaa 10098759  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctt 236  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  10098758 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctt 10098722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Original strand, 10655608 - 10655849
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttt-tgtttga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10655608 aaattcaaagtctagagtctttactgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtattttttgtttga 10655707  T
Q  101 ttagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaag 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||    
T  10655708 tcagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgtttgagcatctttgtgaag 10655807  T
Q  201 tctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    |||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  10655808 tctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatcgttgtgat 10655849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 2 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 24659790 - 24659554
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24659790 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttctgtttgat 24659691  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca--gttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  24659690 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 24659591  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctt 236  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  24659590 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatctt 24659554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 37759560 - 37759319
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttat-tgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttga 100  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37759560 aaattcaaagtctagagtctttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttga 37759461  T
Q  101 ttagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37759460 ttagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaag 37759361  T
Q  201 tctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||| |||| || ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  37759360 tctcacacttagaaagtattgaggagttgtaatctttgtgat 37759319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Original strand, 5628363 - 5628605
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    |||||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5628363 aaattctaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 5628462  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagc--agttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  5628463 tagaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaa 5628562  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5628563 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 5628605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 2 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 5510586 - 5510350
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5510586 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 5510487  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagc--agttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  5510486 tagaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaa 5510387  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctt 236  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  5510386 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctt 5510350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 2 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 5520764 - 5520528
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5520764 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 5520665  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagc--agttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  5520664 tagaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaa 5520565  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctt 236  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  5520564 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctt 5520528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 2 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 24670370 - 24670134
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24670370 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattatatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttctgtttgat 24670271  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca--gttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  24670270 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 24670171  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctt 236  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  24670170 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatctt 24670134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 2 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 38194614 - 38194378
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38194614 aaattcatagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 38194515  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagc--agttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  38194514 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaa 38194415  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctt 236  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  38194414 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctt 38194378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 2 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 38205150 - 38204914
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38205150 aaattcatagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 38205051  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagc--agttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  38205050 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaa 38204951  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctt 236  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  38204950 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctt 38204914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 2 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 39382580 - 39382344
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39382580 aaattcatagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 39382481  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagc--agttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  39382480 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaa 39382381  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctt 236  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  39382380 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctt 39382344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Original strand, 12297146 - 12297389
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagt-caaactcaattctctgtatttttgtttga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12297146 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaatttcaaactcaattctctgtatttttgtttga 12297245  T
Q  101 ttagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagc--agttttgtga 198  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  12297246 ttagaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtga 12297345  T
Q  199 agtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12297346 agtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 12297389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Original strand, 11272729 - 11272971
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11272729 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 11272828  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagc--agttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||    
T  11272829 tagaagtctctcgcctgagtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcttgtgtgcttgagcatagttttgtgaa 11272928  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11272929 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 11272971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Original strand, 13373011 - 13373253
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13373011 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 13373110  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca--gttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||    
T  13373111 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcttgtgtgcttgagcatttttttgtgaa 13373210  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  13373211 gtctcatacttagaaagtactgagcagttgtaatctttgtgat 13373253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Original strand, 13394199 - 13394441
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13394199 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 13394298  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca--gttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||    
T  13394299 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcttgtgtgcttgagcatttttttgtgaa 13394398  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  13394399 gtctcatacttagaaagtactgagcagttgtaatctttgtgat 13394441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 2 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 39371943 - 39371707
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39371943 aaattcatagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 39371844  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagc--agttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  39371843 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtatgcttgagcatagttttgtgaa 39371744  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctt 236  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  39371743 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctt 39371707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Original strand, 12287324 - 12287567
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagt-caaactcaattctctgtatttttgtttga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12287324 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaatttcaaactcaattctctgtatttttgtttga 12287423  T
Q  101 ttagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagc--agttttgtga 198  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  12287424 ttagaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttggttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtga 12287523  T
Q  199 agtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12287524 agtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 12287567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 2 - 236
Target Start/End: Original strand, 20673539 - 20673774
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20673539 aaattcaaagtctagagtcttttctgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 20673638  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca-gttttgtgaag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  20673639 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttacttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattttttgtgaag 20673738  T
Q  201 tctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctt 236  Q
    |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  20673739 tctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctt 20673774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 2 - 236
Target Start/End: Original strand, 28314577 - 28314814
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttt-tgtttga 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28314577 aaattcatagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtattttttgtttga 28314676  T
Q  101 ttagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagc--agttttgtga 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  28314677 ttagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtga 28314776  T
Q  199 agtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctt 236  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  28314777 agtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctt 28314814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 8 - 242
Target Start/End: Original strand, 29472416 - 29472650
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||    
T  29472416 aaagtctagagtcttaattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttaattcattgtatttttgtttgatcagaag 29472515  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcata 207  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  29472516 cctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcata 29472615  T
Q  208 ctttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29472616 cttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgat 29472650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Original strand, 13383605 - 13383847
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13383605 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 13383704  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca--gttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||   |||||||||    
T  13383705 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagttcttgagcattggaagactcttacttgtgtgcttgagcatttttttgtgaa 13383804  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  13383805 gtctcatacttagaaagtactgagcagttgtaatctttgtgat 13383847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 8 - 239
Target Start/End: Original strand, 29461564 - 29461795
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||    
T  29461564 aaagtctagagtcttaattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttaattcattgtatttttgtttgatcagaag 29461663  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcata 207  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  29461664 cctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcata 29461763  T
Q  208 ctttgatagtattgagcatttgtaatctttgt 239  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  29461764 cttagagagtattgagcatttgtaatctttgt 29461795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 8 - 242
Target Start/End: Original strand, 1794835 - 1795069
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||| |||||||||||||||| |||||    
T  1794835 aaagtctagagtctttattgtattgtattgtgaacactactgattgtatatcaagtgtttaagtcaaacttatttctttgtatttttgtttgatcagaag 1794934  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcata 207  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  1794935 actcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcata 1795034  T
Q  208 ctttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1795035 cttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgat 1795069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 8 - 242
Target Start/End: Original strand, 9391555 - 9391789
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||| |||||    
T  9391555 aaagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttatttcattgtatttttgtttgatcagaag 9391654  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcata 207  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  9391655 actcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcatgggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcata 9391754  T
Q  208 ctttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9391755 cttagatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 9391789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 8 - 242
Target Start/End: Original strand, 11217076 - 11217310
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||| |||||    
T  11217076 aaagtctagagtctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttatttcattgtatttttgtttgatcagaag 11217175  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcata 207  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  11217176 actcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgagtgcttgagcatttttgagaagtctcata 11217275  T
Q  208 ctttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11217276 cttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgat 11217310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Original strand, 19887698 - 19887939
Alignment:
Q  2 aaattcaa-agtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttga 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||    
T  19887698 aaattcaagagtctagagtctttatcgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttatttcattgtatttttgtttga 19887797  T
Q  101 ttagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaag 200  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  19887798 tcagaagactcttgcctgcgtgcttgagcattagaagattcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaag 19887897  T
Q  201 tctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19887898 tctcatacttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgat 19887939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 8 - 242
Target Start/End: Original strand, 24706906 - 24707141
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  24706906 aaagtctagagtctttaacgtattatattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttaattcactgtatttttgtttgatcagaag 24707005  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca-gttttgtgaagtctcat 206  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  24707006 cctcttgcctgcgtgcttgagcattagaaatctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattttttgagaagtctcat 24707105  T
Q  207 actttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24707106 acttagatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 24707141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 8 - 242
Target Start/End: Original strand, 1784422 - 1784656
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||| ||||||||||||| || |||||    
T  1784422 aaagtctagagtctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgtttaagtcaaacttatttctttgtatttttgtttaatcagaag 1784521  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcata 207  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  1784522 actcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcata 1784621  T
Q  208 ctttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1784622 cttagagagtatcgagcatttgtaatctttgtgat 1784656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 8 - 242
Target Start/End: Original strand, 9381009 - 9381243
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||| |||||    
T  9381009 aaagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttatttcattgtatttttgtttgatcagaag 9381108  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcata 207  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  9381109 actcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcacttttaagaagtctcata 9381208  T
Q  208 ctttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9381209 cttagatagtactgagcatttgtaatctttgtgat 9381243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 8 - 242
Target Start/End: Original strand, 11206425 - 11206659
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||| |||||    
T  11206425 aaagtctagagtctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttatttcattgtatttttgtttgatcagaag 11206524  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcata 207  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  11206525 actcttgcctgcgtgcttgagtattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtatgtgcttgagcatttttgagaagtctcata 11206624  T
Q  208 ctttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11206625 cttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgat 11206659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 8 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 48337125 - 48336891
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||| |||||    
T  48337125 aaagtctagagtctttaacgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactaatttcattgtatttttgtttgatcagaag 48337026  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcata 207  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  48337025 cctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcata 48336926  T
Q  208 ctttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  48336925 cttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgat 48336891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 2 - 236
Target Start/End: Original strand, 28325193 - 28325428
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgta-tttttgtttga 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28325193 aaattcatagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtattttttgtttga 28325292  T
Q  101 ttagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagc--agttttgtga 198  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  28325293 ttagaagtctcttgcct--gtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtga 28325390  T
Q  199 agtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctt 236  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  28325391 agtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctt 28325428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 9 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 11163712 - 11163480
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagt 108  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||| |||||     
T  11163712 aagtctagagtctttatggtattatattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacatatttccctgtatttttgtttgatcagaaga 11163613  T
Q  109 ctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatac 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  11163612 ctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca-ttttgagaagtctcatac 11163514  T
Q  209 tttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11163513 ttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgat 11163480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 7 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 4404157 - 4403923
Alignment:
Q  7 caaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaa 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  4404157 caaagtctagagtctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatgaagtgttcaagtcaaacatatttccctgtatttttgtttgatcagaa 4404058  T
Q  107 gtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcat 206  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  4404057 gactcttgcctgcgtgcttgagcattggaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcctgtgtgcttgagca-ttttgagaagtctcat 4403959  T
Q  207 actttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4403958 acttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgat 4403923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 8 - 242
Target Start/End: Original strand, 7794958 - 7795193
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||| |||||    
T  7794958 aaagtctagagtctttaacgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttatttcattgtatttttgtttgatcagaag 7795057  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcata 207  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7795058 cctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcata 7795157  T
Q  208 ctttgatagtattgagca-tttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||| || ||||||||||| | |||||||||||||||    
T  7795158 cttagagagtattgagcactgtgtaatctttgtgat 7795193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 9 - 242
Target Start/End: Original strand, 8740478 - 8740710
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagt 108  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||| ||||||     
T  8740478 aagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacatttttctctgtatttttgtttgaatagaagc 8740577  T
Q  109 ctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatac 208  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  8740578 ctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcctgtgtgcttgagca-ttttgagaagtctcatac 8740676  T
Q  209 tttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8740677 ttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgat 8740710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 8 - 242
Target Start/End: Original strand, 7804869 - 7805104
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  | |||||||||||||| |||||    
T  7804869 aaagtctagagtctttaacgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttatttcattatatttttgtttgatcagaag 7804968  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcata 207  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7804969 cctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcata 7805068  T
Q  208 ctttgatagtattgagca-tttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||| || ||||||||||| | |||||||||||||||    
T  7805069 cttagagagtattgagcactgtgtaatctttgtgat 7805104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 9 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 933510 - 933276
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagt 108  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||  |||||||||||||||| |||||     
T  933510 aagtctagagtctttaacgtaatgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacctatttcattgtatttttgtttgatcagaagc 933411  T
Q  109 ctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatac 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  933410 ctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcatac 933311  T
Q  209 tttgatagtattgagca-tttgtaatctttgtgat 242  Q
    || || ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  933310 ttagagagtattgagcattttgtaatctttgtgat 933276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 8 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 9535493 - 9535258
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||| |||||    
T  9535493 aaagtctagagtctttaacgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttatttcattgtatttttgtttgatcagaag 9535394  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcata 207  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  9535393 cctcttgcctgcatgcttgagcattagaagactcttgcttagcgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattttttagaagtctcata 9535294  T
Q  208 ctttgatagtattgagca-tttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||| || ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9535293 cttagagagtattgagcattttgtaatctttgtgat 9535258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 9 - 242
Target Start/End: Original strand, 13262024 - 13262258
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtatt-gagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaa 106  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    ||||||||||||||||||||  ||||    
T  13262024 aagtctagagtctttattgcattgtatttgtgaacaccactgattgtatatcaagtgtttaaggtcaaacatt-ttctctgtatttttgtttgaacagaa 13262122  T
Q  107 gtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcat 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  13262123 gtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcctgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcat 13262222  T
Q  207 actttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13262223 acttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgat 13262258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 7 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 38314583 - 38314346
Alignment:
Q  7 caaagtctagagtctttattgtattgtattga-----gaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||    
T  38314583 caaagtctagagtctttattgtattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacatatttccctgtatttttgtttgat 38314484  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 201  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||    
T  38314483 cagaagactcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggtagactcttgtctgtgtgcttgagca-ttttgagaagt 38314385  T
Q  202 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtg 240  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  38314384 ctcatacttagagagtattgagcatttgtaatctttgtg 38314346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 27 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 4433624 - 4433410
Alignment:
Q  27 gtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  4433624 gtattgtattgtgaacaccactgattgtatatgaagtgttcaagtcaaacatatttccctgtatttttgtttgatcagaagactcttgcctgcgtgcttg 4433525  T
Q  127 agcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatactttgatagtattgagcat 226  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||    
T  4433524 agcattggaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcctgtgtgcttgagca-ttttgagaagtctcatacttagagagtattgagcat 4433426  T
Q  227 ttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||||||||||    
T  4433425 ttgtaatctttgtgat 4433410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 9 - 242
Target Start/End: Original strand, 14258416 - 14258650
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaatt-ctctgtatttt-tgtttgattagaa 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | || | ||||||||| |||||||| ||||    
T  14258416 aagtctagagtctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaagatattttccctgtattttttgtttgatcagaa 14258515  T
Q  107 gtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcat 206  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  14258516 gactcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcctgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcctgtgtgcttgagca-ttttgagaagtctcat 14258614  T
Q  207 actttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    |||| || |||||| |||||||||||||||||||||    
T  14258615 acttagagagtattcagcatttgtaatctttgtgat 14258650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 8 - 242
Target Start/End: Original strand, 17910353 - 17910591
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtattttt---gtttgattag 104  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||   | |||  |||||||||   ||||||| ||    
T  17910353 aaagtctagagtctttaacgtattgtagtgtgaacaccactgattgcatatcaagtgttcaaatcaaaaatatttcattgtatttttcttgtttgatcag 17910452  T
Q  105 aagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctc 204  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17910453 aagcctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctc 17910552  T
Q  205 atactttgatagtattgagca-tttgtaatctttgtgat 242  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17910553 atacttagagagtattgagcagtttgtaatctttgtgat 17910591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 9 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 16076811 - 16076578
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||||||||||||||||||| ||||||    
T  16076811 aagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacatcaaacatt-ttctctgtatttttgtttgaatagaag 16076713  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcat 206  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  16076712 cctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagactctcgcctgcgtgcttgagca-ttttgagaagtctcat 16076614  T
Q  207 actttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16076613 acttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgat 16076578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 9 - 242
Target Start/End: Original strand, 8996309 - 8996542
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||||    |||||||||||||||||||| ||||||    
T  8996309 aagtctagagtctttattgcattgtattgagaaaaccactgattgtatatcaagtgttcatcatcaaacatt-ttctctgtatttttgtttgaatagaag 8996407  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcat 206  Q
     |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  8996408 cctcttgcctgcgtgcttgagcattagtagactcttgctttagtgcttgagcattggaaaactcttgcctgcgtgcttgagca-ttttgagaagtctcat 8996506  T
Q  207 actttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8996507 acttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgat 8996542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 9 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 27883265 - 27883032
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    ||||||||||||||||||||  |||||    
T  27883265 aagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaggtcaaacatt-ttctctgtatttttgtttgaacagaag 27883167  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcat 206  Q
     |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  27883166 cctctcgcctgcgtgcttgagcattagtagactcttgctttagtgcttgagcattggaagactctcgcctgcgtgcttgagca-ttttgagaagtctcat 27883068  T
Q  207 actttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27883067 acttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgat 27883032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 2 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 14465481 - 14465332
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14465481 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 14465382  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtg 151  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14465381 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtg 14465332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 9 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 1053591 - 1053358
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| ||| |||| |||||||||||||    
T  1053591 aagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacatt-ttctgtgtcttttcgtttgattagaag 1053493  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcat 206  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  1053492 cctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagactctcgcctgcgtgcttgagca-ttttgagaagtctcat 1053394  T
Q  207 actttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1053393 acttagagagtattgagcatttgtaatctgtgtgat 1053358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 9 - 242
Target Start/End: Original strand, 9006861 - 9007094
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||    |||||||||||||||||||| ||||||    
T  9006861 aagtctagagtctttattgcattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcatcatcaaacatt-ttctctgtatttttgtttgaatagaag 9006959  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcat 206  Q
     |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  9006960 cctcttgcctgcgtgcttgagcattagtagactcttgctttagagcttgagcattggaagactcttgcctgcatgcttgagca-ttttgagaagtctcat 9007058  T
Q  207 actttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    |||  || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9007059 actcagagagtattgagcatttgtaatctttgtgat 9007094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 9 - 242
Target Start/End: Original strand, 14322043 - 14322276
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtatt-gagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaa 106  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    ||||||||||||||||||||  ||||    
T  14322043 aagtctagagtctttattgcattgtatttgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaggtcaaacatt-ttctctgtatttttgtttgaacagaa 14322141  T
Q  107 gtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcat 206  Q
    | |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||||||||||    
T  14322142 gcctctagcctacgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattagaagactcttgcctgtgtggttgagca-ttttgagaagtctcat 14322240  T
Q  207 actttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    | || || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14322241 agttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgat 14322276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 9 - 242
Target Start/End: Original strand, 16671515 - 16671747
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagt 108  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    ||||||||||||||||||||  |||||     
T  16671515 aagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaatcaaacatt-ttctctgtatttttgtttgaaaagaagc 16671613  T
Q  109 ctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcata 207  Q
    |||| || || |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||| | |||||||||||    
T  16671614 ctctcgcatgtgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgtgtgcttgagca-tttagagaagtctcata 16671712  T
Q  208 ctttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16671713 cttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgat 16671747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 9 - 242
Target Start/End: Original strand, 17281787 - 17282019
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttc-aagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  17281787 aagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccactgatagtatatcaagtgttcaaagtcaaac-attttctgtgtatttttgtttgaatagaag 17281885  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcat 206  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||    
T  17281886 cctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcat 17281983  T
Q  207 actttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    |||  || ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17281984 actaagagagtattgagcatttgtaatctgtgtgat 17282019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 9 - 235
Target Start/End: Original strand, 29933913 - 29934138
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagt 108  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||     |||| |||| |||||||||||| |||||    
T  29933913 aagtctagagtctttattgcattgtattgtaaacaccactgattgtatatcaagtgttcaatcccaaacattttctgtgtaattttgtttgattggaagt 29934012  T
Q  109 ctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcata 207  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||  ||||||||||||||||    
T  29934013 ctcttgcctacgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctcttgcctgcgtgcttgagca--tttgtgaagtctcata 29934110  T
Q  208 ctttgatagtattgagcatttgtaatct 235  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||    
T  29934111 cttagagagtattgagcatttgtaatct 29934138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 9 - 235
Target Start/End: Original strand, 29983067 - 29983292
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagt 108  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||     |||| |||| |||||||||||| |||||    
T  29983067 aagtctagagtctttattgcattgtattgtaaacaccactgattgtatatcaagtgttcaatcccaaacattttctgtgtaattttgtttgattggaagt 29983166  T
Q  109 ctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcata 207  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||  ||||||||||||||||    
T  29983167 ctcttgcctacgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctcttgcctgcgtgcttgagca--tttgtgaagtctcata 29983264  T
Q  208 ctttgatagtattgagcatttgtaatct 235  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||    
T  29983265 cttagagagtattgagcatttgtaatct 29983292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 9 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 1064020 - 1063787
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    |||| ||| |||| |||||||||||||    
T  1064020 aagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccacttattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacatt-ttctgtgtcttttcgtttgattagaag 1063922  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcat 206  Q
     |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  1063921 cctctcgcctacgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagactctcgcctgcgtgcttgagca-ttttgagaagtctcat 1063823  T
Q  207 actttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1063822 acttagagagtattgagcatttgtaatctgtgtgat 1063787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 9 - 235
Target Start/End: Original strand, 29906534 - 29906759
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| |||||||||||| ||||    
T  29906534 aagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaatctcaaacatt-ttctgtgtaattttgtttgattggaag 29906632  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcat 206  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||  |||||||||||||||    
T  29906633 tcgcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagggcttgagcattggaagtctcttgcctgcgtgcttgagca--tttgtgaagtctcat 29906730  T
Q  207 actttgatagtattgagcatttgtaatct 235  Q
    |||| || |||||||| ||||||||||||    
T  29906731 acttagagagtattgaacatttgtaatct 29906759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 9 - 235
Target Start/End: Original strand, 29947699 - 29947924
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| |||||||||||| ||||    
T  29947699 aagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaatctcaaacatt-ttctgtgtaattttgtttgattggaag 29947797  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcat 206  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||  |||||||||||||||    
T  29947798 tcgcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagggcttgagcattggaagtctcttgcctgcgtgcttgagca--tttgtgaagtctcat 29947895  T
Q  207 actttgatagtattgagcatttgtaatct 235  Q
    |||| || |||||||| ||||||||||||    
T  29947896 acttagagagtattgaacatttgtaatct 29947924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 9 - 235
Target Start/End: Original strand, 29996853 - 29997078
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| |||||||||||| ||||    
T  29996853 aagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaatctcaaacatt-ttctgtgtaattttgtttgattggaag 29996951  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcat 206  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||  |||||||||||||||    
T  29996952 tcgcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagggcttgagcattggaagtctcttgcctgcgtgcttgagca--tttgtgaagtctcat 29997049  T
Q  207 actttgatagtattgagcatttgtaatct 235  Q
    |||| || |||||||| ||||||||||||    
T  29997050 acttagagagtattgaacatttgtaatct 29997078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 9 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 2246248 - 2246016
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttc-aagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    |||| |||| || ||||||||||||||    
T  2246248 aagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccactaattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacaattttctgtgtaattctgtttgattagaag 2246149  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcat 206  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||    
T  2246148 tctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcat 2246051  T
Q  207 actttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    || |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  2246050 ac-ttgagagtattgagcagttgtaatctgtgtgat 2246016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 2 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 8785132 - 8784989
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8785132 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 8785033  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  8785032 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattggaagactcttgc 8784989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 9 - 242
Target Start/End: Original strand, 13199598 - 13199830
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttc-aagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    |||| |||| |||||||||||||||||    
T  13199598 aagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacaattttctgtgtaattttgtttgattagaag 13199697  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcat 206  Q
    ||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||    
T  13199698 tctctcgcctgcgtgcttgacgattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcat 13199795  T
Q  207 actttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    || | || |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  13199796 ac-tagagagtattaagcatttgtaatctgtgtgat 13199830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 9 - 189
Target Start/End: Original strand, 15663059 - 15663240
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagt 108  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||| |||| || |||||||||||||||    
T  15663059 aagtctagagtctgtattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacatttttctgtgtaattctgtttgattagaagt 15663158  T
Q  109 ctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca 189  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |  |||||||||||    
T  15663159 ctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagca 15663240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 9 - 187
Target Start/End: Original strand, 15651424 - 15651603
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagt 108  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||| |||| || |||||||||||||||    
T  15651424 aagtctagagtctgtattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacatttttctgtgtaattctgtttgattagaagt 15651523  T
Q  109 ctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgag 187  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| |  |||||||||    
T  15651524 ctctcgcctacgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtccttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgag 15651603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 9 - 242
Target Start/End: Original strand, 31114340 - 31114574
Alignment:
Q  9 aagtctagagtcttt--attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattaga 105  Q
    |||||||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||||||||    
T  31114340 aagtctagagtctttcaattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgattaga 31114439  T
Q  106 agtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctc 204  Q
    |||||||||| |  ||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||| || |||||||||||  ||  |||||||||    
T  31114440 agtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttgagca--ttattgaagtctc 31114537  T
Q  205 atactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    |||| | | |||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  31114538 atac-taggtagtattgagcagttgtaatctgtgtgat 31114574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 9 - 235
Target Start/End: Original strand, 51989499 - 51989726
Alignment:
Q  9 aagtctagagtcttt--attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattaga 105  Q
    |||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||    | || |||| || ||||||||||||    
T  51989499 aagtctagagtctttcaattgcattgtattgtgaacaccactgatagtatatcaagtgttcaaactcaaacaatttactgtgtaattctgtttgattaga 51989598  T
Q  106 agtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctc 204  Q
    |||||||||  |  |||||||||||   |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  51989599 agtctcttgttttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgcctgtgtgcttgagca--tttgtgaagtctc 51989696  T
Q  205 atactttgatagtattgagcatttgtaatct 235  Q
    |||| | | |||||||||||| |||||||||    
T  51989697 atac-taggtagtattgagcagttgtaatct 51989726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 17961223 - 17961073
Alignment:
Q  15 agagtcttt-attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctctt 113  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  | |||| | ||||||||||||| ||||||||||||    
T  17961223 agagtctttcattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtccaaccaatttctttatatttttgtttgaatagaagtctctt 17961124  T
Q  114 gcctgcgtgcttgagcatt--agaagtctcttgc-ttagtgcttgagcatt 161  Q
    ||||| |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17961123 gcctgtgtgcttgagcatttgagaagtctcttgctttagtgcttgagcatt 17961073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 29 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 17006854 - 17006640
Alignment:
Q  29 attgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttga 127  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| || ||||||||||| |  ||||||||    
T  17006854 attgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatataagtctcttgctttagtgcttga 17006755  T
Q  128 gcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatactttg-atagtattgagca 225  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||| || |||||||||||  ||||||||||||||||||  |  ||||||||||||    
T  17006754 gcataagaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttgagca--tttgtgaagtctcatactaggtgtagtattgagca 17006657  T
Q  226 tttgtaatctttgtgat 242  Q
     ||||||||| ||||||    
T  17006656 gttgtaatctgtgtgat 17006640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 134 - 242
Target Start/End: Original strand, 15194516 - 15194625
Alignment:
Q  134 gaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatactttgatagtattgagca-tttgtaa 232  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||    
T  15194516 gaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgtgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcatacttagagagtattgagcattttgtaa 15194615  T
Q  233 tctttgtgat 242  Q
    ||||||||||    
T  15194616 tctttgtgat 15194625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 152 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 13601973 - 13601883
Alignment:
Q  152 cttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13601973 cttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcatacttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgat 13601883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 24 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 22150911 - 22150692
Alignment:
Q  24 attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtg 122  Q
    |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| |||||||||||||| |  |||    
T  22150911 attgcattgttttgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttgctttagtg 22150812  T
Q  123 cttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatactttg-atagtatt 220  Q
    |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||| | || |||||||||||  ||||||||||||||||||  |  |||||||    
T  22150811 cttgagcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctctttcctgcgtgcttgagca--tttgtgaagtctcatactaggtgtagtatt 22150714  T
Q  221 gagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||| ||||||||| ||||||    
T  22150713 gagcagttgtaatctgtgtgat 22150692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 21 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 14581012 - 14580796
Alignment:
Q  21 tttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaatt-ctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctg 118  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  | || || |||| || ||||||| |||||||||||||| |     
T  14581012 tttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacatattttctgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttgcttt 14580913  T
Q  119 cgtgcttgagcattagaagtctcttg-cttagtgcttgagcatt--ggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatactttgata 215  Q
     ||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||   |||| ||||||| || |||||||||||  |||| |||||||||||| |||| |    
T  14580912 agtgcttgagcattggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcttgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcatac-ttgaaa 14580816  T
Q  216 gtattgagcatttgtaatct 235  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  14580815 gtattgagcagttgtaatct 14580796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 9 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 21735992 - 21735868
Alignment:
Q  9 aagtctagagtcttt-attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    || | |||| || ||||||||||||||    
T  21735992 aagtctagagtcttttattgcattgtattgtgaacaccaccgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacaattttttgtgtaattctgtttgattagaag 21735893  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcatt 132  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  21735892 tctcttgcctgcgtgcttgagcatt 21735868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 9 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 28168965 - 28168811
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtatt-gagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaa 106  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    ||||||||||||||||||||  ||||    
T  28168965 aagtctagagtttttattgcattgtatttgtgaacactactgattgtatatcaagtgttcaaggtcaaacatt-ttctctgtatttttgtttgaacagaa 28168867  T
Q  107 gtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcatt 161  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||||||||    
T  28168866 gtctcttgcctgtgtgcttgagcattagaagactcttgcgtgcgtgcttgagcatt 28168811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 130 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 8785034 - 8784925
Alignment:
Q  130 attagaagtctcttgctta-gtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagc--agttttgtgaagtctcatactttgatagtattgagcat 226  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| || |||||||||||     
T  8785034 attagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaagtctcatacttagaaagtattgagcag 8784935  T
Q  227 ttgtaatctt 236  Q
    ||||||||||    
T  8784934 ttgtaatctt 8784925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 29 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 13953923 - 13953718
Alignment:
Q  29 attgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttga 127  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| |||||||||||||| |  ||||||||    
T  13953923 attgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctatgtaattctgtttgaatagaagtctcttgctttagtgcttga 13953824  T
Q  128 gcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatactttg-atagtattgagca 225  Q
    ||||  ||||||||||||||  |||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||| ||   ||||||||||||||  |  ||||||||||||    
T  13953823 gcataggaagtctcttgcttgtgtgcttgagcaaaggaagtctcttgcttgtgtgcttgagcaatt---tgaagtctcatactaggtgtagtattgagca 13953727  T
Q  226 tttgtaatc 234  Q
     ||||||||    
T  13953726 gttgtaatc 13953718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 148 - 242
Target Start/End: Original strand, 18857426 - 18857519
Alignment:
Q  148 agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18857426 agtgcttgagcattggaagactcttgcctgtgtgcttgagca-ttttgagaagtctcatacttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgat 18857519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 133 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 28168870 - 28168760
Alignment:
Q  133 agaagtctcttgctta-gtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatactttgatagtattgagcatttgta 231  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  28168870 agaagtctcttgcctgtgtgcttgagcattagaagactcttgcgtgcgtgcttgagcatttttgagaagtctcatacttagagagtattgagcatttgta 28168771  T
Q  232 atctttgtgat 242  Q
    |||||||||||    
T  28168770 atctttgtgat 28168760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 100 - 242
Target Start/End: Original strand, 15663180 - 15663320
Alignment:
Q  100 attagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtga 198  Q
    |||||||| ||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||    
T  15663180 attagaagactcttgctttagtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgaga 15663277  T
Q  199 agtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    |||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15663278 agtctcatac-tagagagtattgagcatttgtaatctttgtgat 15663320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 29 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 15833068 - 15832863
Alignment:
Q  29 attgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttga 127  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| |||||||||||||| |  || |||||    
T  15833068 attgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttgctttagttcttga 15832969  T
Q  128 gcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatactttg-atagtattgagca 225  Q
    ||||  |||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||| || ||||||||||| ||   ||||||||||||||  |  ||||||||||||    
T  15832968 gcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcaatt---tgaagtctcatactaggtgtagtattgagca 15832872  T
Q  226 tttgtaatc 234  Q
     ||||||||    
T  15832871 gttgtaatc 15832863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 24 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 41045408 - 41045189
Alignment:
Q  24 attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtg 122  Q
    |||| ||||||||| |||||||||  || |||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||||||||||||||||| |   ||    
T  41045408 attgcattgtattgtgaacaccaccaatagtatatcaagtgttcaaactcaaacaactttctgtgtaattctgtttgattagaagtctcttgctttaatg 41045309  T
Q  123 cttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatactttg-atagtatt 220  Q
    |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||| || |||||||| ||  ||||||||||||||||||  |  |||||||    
T  41045308 cttgagcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttgaaca--tttgtgaagtctcatactaggtgtagtatt 41045211  T
Q  221 gagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||| ||||||||| ||||||    
T  41045210 gagcagttgtaatctgtgtgat 41045189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 24 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 18006158 - 18006038
Alignment:
Q  24 attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgc 123  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||| ||||||| |||||||||||||| |  ||||    
T  18006158 attgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaac-caatttcttgtatttgtgtttgaatagaagtctcttgctttagtgc 18006060  T
Q  124 ttgagcattagaagtctcttgc 145  Q
    ||||||||  ||||||||||||    
T  18006059 ttgagcataggaagtctcttgc 18006038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 29 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 49989921 - 49989742
Alignment:
Q  29 attgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttga 127  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    || | |||| || ||||||| |||||||||||||| |  ||||||||    
T  49989921 attgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttatgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttgctttagtgcttga 49989822  T
Q  128 gcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatact 209  Q
    ||||  |||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||| || ||||||||||| ||   ||||||||||||||    
T  49989821 gcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcaatt---tgaagtctcatact 49989742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 29 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 15848862 - 15848700
Alignment:
Q  29 attgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttga 127  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| |||||||||||||  |  ||||||||    
T  15848862 attgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctatgtaattctgtttgaatagaagtctcttgttttagtgcttga 15848763  T
Q  128 gcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca 189  Q
    ||||  |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| |  |||||||||||    
T  15848762 gcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgctttagtgcttgagca 15848700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 29 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 51340671 - 51340509
Alignment:
Q  29 attgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttga 127  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    || | |||| || ||||||| |||||||||||||| |   |||||||    
T  51340671 attgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttatgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttgctttaatgcttga 51340572  T
Q  128 gcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca 189  Q
    ||||  |||||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  51340571 gcataggaagtctcttgctttaatgcttgagcataggaagtctcttgcctgtgtgcttgagca 51340509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 24 - 234
Target Start/End: Original strand, 11909535 - 11909745
Alignment:
Q  24 attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttca-agtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtg 122  Q
    |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    |||| |||| || ||||||| |||||||||||||| |  |||    
T  11909535 attgcattgtgttgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcacactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttgctttagtg 11909634  T
Q  123 cttgagcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatactttg-atagtatt 220  Q
    |||||||||  ||||||||||||||  | |||||||||  |||||  |||||| |||||||||||||| ||   ||||||||||||||  |  |||||||    
T  11909635 cttgagcataggaagtctcttgcttgtgggcttgagcaaaggaagtttcttgcctgtgtgcttgagcaatt---tgaagtctcatactaggtgtagtatt 11909731  T
Q  221 gagcatttgtaatc 234  Q
    ||||| ||||||||    
T  11909732 gagcagttgtaatc 11909745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 29 - 234
Target Start/End: Original strand, 12753121 - 12753326
Alignment:
Q  29 attgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttga 127  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| |||||||||||||| |  ||||||||    
T  12753121 attgtattgtgaacaccaatgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttgctttagtgcttga 12753220  T
Q  128 gcattagaagtctc-ttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatactttg-atagtattgagca 225  Q
    ||||  |||||||| || ||  |||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||| ||   ||||||||||||||  |  ||||||||||||    
T  12753221 gcataggaagtctctttcctgtgtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgtgtgcttgagcaatt---tgaagtctcatactaggtgtagtattgagca 12753317  T
Q  226 tttgtaatc 234  Q
     ||||||||    
T  12753318 gttgtaatc 12753326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 100 - 242
Target Start/End: Original strand, 15651545 - 15651685
Alignment:
Q  100 attagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtga 198  Q
    |||||||| ||||||| |  || ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| |||| || |  |||||||||||  |||| ||    
T  15651545 attagaagactcttgctttagtccttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagtattggaagtctctcgcctacgtgcttgagca--tttgaga 15651642  T
Q  199 agtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15651643 agtctcatacta-gagagtattgagcatttgtaatctttgtgat 15651685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 21 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 27172706 - 27172565
Alignment:
Q  21 tttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctc-tgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctg 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| || |||| || ||||||| || ||||||||||| |     
T  27172706 tttattgcattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacgtcaaa--caattttcttgtaattctgtttgaatataagtctcttgcttt 27172609  T
Q  119 cgtgcttgagcattagaagtctcttg-cttagtgcttgagcatt 161  Q
     ||||||||||||  ||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  27172608 agtgcttgagcataggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcatt 27172565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 52920091 - 52919976
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||||||||||||||||||    |||||||||    
T  52920091 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgattagaagtctcttgcagttgtgcttgag 52919992  T
Q  129 cattagaagtctcttg 144  Q
    ||||||||||||||||    
T  52919991 cattagaagtctcttg 52919976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 30 - 187
Target Start/End: Original strand, 8729489 - 8729648
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||  | |||| |||| || |||||| ||||||||||||| | |  ||||||||     
T  8729489 ttgtattgtgaacaccactgattatatatcaagtgttcaacctcaaacatatttctgtgtaattgtgtttgtttagaagtctcttacttttgtgcttgaa 8729588  T
Q  129 cattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgag 187  Q
    ||| ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||  ||||||| | |||| |||||    
T  8729589 cataagaagtctcttgcgtcagtgcttgagcataggaaacctcttgcttttgtgtttgag 8729648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 30 - 187
Target Start/End: Original strand, 9081376 - 9081535
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||  | |||| |||| || |||||| ||||||||||||| | |  ||||||||     
T  9081376 ttgtattgtgaacaccactgattatatatcaagtgttcaacctcaaacatatttctgtgtaattgtgtttgtttagaagtctcttacttttgtgcttgaa 9081475  T
Q  129 cattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgag 187  Q
    ||| ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||  ||||||| | |||| |||||    
T  9081476 cataagaagtctcttgcgtcagtgcttgagcataggaaacctcttgcttttgtgtttgag 9081535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 9 - 159
Target Start/End: Original strand, 45862066 - 45862220
Alignment:
Q  9 aagtctagagtcttt--attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttc-aagtcaaactcaattctctgtat--ttttgtttgatta 103  Q
    |||| ||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||  ||||| |||||||  || ||||||| ||    
T  45862066 aagtatagagtctttcaattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatattaagtgttcaaactcaaa--caattttctgtataattctgtttgaata 45862163  T
Q  104 gaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagca 159  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||    
T  45862164 gaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgcttgtgtgcttgagca 45862220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 25 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 13931620 - 13931456
Alignment:
Q  25 ttgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgct 124  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| | |||| ||||  |||||||| ||||||||||||| | |   ||||    
T  13931620 ttgttttgtattgtgaacaacactgattgtatatcaagtgttcaaaccaaacttatttctttgta-atttgtttgtttagaagtctcttacttttttgct 13931522  T
Q  125 tgagcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca 189  Q
    |||||||  ||  |||||| |||  ||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||    
T  13931521 tgagcataggatatctctttcttgtgtgcttgagtatttgaagtctcttgcttgtgtgcttgagca 13931456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 24 - 132
Target Start/End: Original strand, 12410292 - 12410399
Alignment:
Q  24 attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgc 123  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||  |||||| | |||| ||||  |||||||| ||||||||||||||| || ||||    
T  12410292 attgttttgtattgtgaacaccactgattgtatataaattgttcaaaccaaacttatttctttgta-atttgtttgtttagaagtctcttgcttgtgtgc 12410390  T
Q  124 ttgagcatt 132  Q
    |||||||||    
T  12410391 ttgagcatt 12410399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 24 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 10529010 - 10528871
Alignment:
Q  24 attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtg 122  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| |||||||||||||| |  |||    
T  10529010 attgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatagaagtctcttgctttagtg 10528911  T
Q  123 cttgagcattagaagtctcttg-cttagtgcttgagcatt 161  Q
    ||||||||   ||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  10528910 cttgagcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcatt 10528871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 15902853 - 15902736
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| ||||||||||  || ||||||||||||    |||||||    
T  15902853 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattttgtttgaatttggaagtctcttgcaattgtgcttg 15902754  T
Q  127 agcattagaagtctcttg 144  Q
    ||||||||||||||||||    
T  15902753 agcattagaagtctcttg 15902736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 132 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 17017586 - 17017476
Alignment:
Q  132 tagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatactttg-atagtattgagcatttg 229  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||| || |||||||||||  ||||||||||||||||||  |  |||||||||||| |||    
T  17017586 tagaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttgagca--tttgtgaagtctcatactaggtgtagtattgagcagttg 17017489  T
Q  230 taatctttgtgat 242  Q
    |||||| ||||||    
T  17017488 taatctgtgtgat 17017476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 135 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 27172622 - 27172517
Alignment:
Q  135 aagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatactttgatagtattgagcatttgtaat 233  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| || |||||||||||  |||| |||||||||||| | || ||||||||||| |||||||    
T  27172622 aagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcatac-tagagagtattgagcagttgtaat 27172526  T
Q  234 ctttgtgat 242  Q
    || ||||||    
T  27172525 ctgtgtgat 27172517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 29 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 37412266 - 37412134
Alignment:
Q  29 attgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttga 127  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||| ||||||||||||||| |  ||||||||    
T  37412266 attgtattgtgaacaccgctgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgtttagaagtctcttgctttagtgcttga 37412167  T
Q  128 gcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagca 159  Q
    |||   ||||||||||||||  |||||||||||    
T  37412166 gcaaaggaagtctcttgcttgtgtgcttgagca 37412134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 39 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 932492 - 932343
Alignment:
Q  39 gaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagt 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||  ||| |||  |||| ||||||||||||||| |  |||||||||||| |||| |    
T  932492 gaacaccactgattgtatatcaagtgttcaac-caaacttatttctaagtaatttc-tttgtttagaagtctcttgcttttgtgcttgagcataagaaat 932395  T
Q  139 ctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca 189  Q
    |||||||||  ||| ||||| ||| |||| ||| | | ||||||||||||||    
T  932394 ctcttgcttgtgtgattgagtatttgaagtctcgtacttgtgtgcttgagca 932343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 16032252 - 16032137
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| ||||||||||||||    |||||||||    
T  16032252 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatagaagtctcttgcagttgtgcttgag 16032153  T
Q  129 cattagaagtctcttg 144  Q
    |||  |||||||||||    
T  16032152 cataggaagtctcttg 16032137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 145
Target Start/End: Original strand, 21606157 - 21606275
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  | ||||||||||||| |  |||||||    
T  21606157 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaattcagaagtctcttgcatttgtgcttg 21606256  T
Q  127 agcattagaagtctcttgc 145  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  21606257 agcaatagaagtctcttgc 21606275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 191 - 242
Target Start/End: Original strand, 24393356 - 24393407
Alignment:
Q  191 ttttgtgaagtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24393356 ttttgtgaagtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 24393407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #146
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Original strand, 26418178 - 26418293
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||  ||||||  | |||| |||| |||||||||| ||||||||||||||    |||||||||    
T  26418178 ttgtattgtgaacaccactgattgtatattaggtgttcaacctcaaacatatttctttgtaattttgtttgaatagaagtctcttgcagttgtgcttgag 26418277  T
Q  129 cattagaagtctcttg 144  Q
    |||  |||||||||||    
T  26418278 cataggaagtctcttg 26418293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #147
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Original strand, 29951939 - 29952054
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| | || |||||||||| ||||||||| ||||    |||||||||    
T  29951939 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctttctaattttgtttgaatagaagtcttttgcagttgtgcttgag 29952038  T
Q  129 cattagaagtctcttg 144  Q
    ||| ||||||||||||    
T  29952039 cataagaagtctcttg 29952054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #148
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Original strand, 30001093 - 30001208
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| | || |||||||||| ||||||||| ||||    |||||||||    
T  30001093 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctttctaattttgtttgaatagaagtcttttgcagttgtgcttgag 30001192  T
Q  129 cattagaagtctcttg 144  Q
    ||| ||||||||||||    
T  30001193 cataagaagtctcttg 30001208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #149
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Original strand, 12963586 - 12963703
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  | |||||||||||||    |||||||    
T  12963586 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttg 12963685  T
Q  127 agcattagaagtctcttg 144  Q
    ||||||||||||||||||    
T  12963686 agcattagaagtctcttg 12963703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #150
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 22140420 - 22140304
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttc-aagtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||   ||||| |||| || |||||||  | |||||||||||||    |||||||    
T  22140420 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaac-atattctttgtaattctgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttg 22140322  T
Q  127 agcattagaagtctcttg 144  Q
    ||||||||||||||||||    
T  22140321 agcattagaagtctcttg 22140304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #151
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Original strand, 49643263 - 49643380
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| ||||||||||  || ||||||||||||    |||||||    
T  49643263 ttgtattgtgaacaccaccgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattttgtttgaatttggaagtctcttgcagttgtgcttg 49643362  T
Q  127 agcattagaagtctcttg 144  Q
    ||||||||||||||||||    
T  49643363 agcattagaagtctcttg 49643380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #152
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 132 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 10528931 - 10528821
Alignment:
Q  132 tagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatactttg-atagtattgagcatttg 229  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||| || |||||||||||  ||| ||||||||||||||  |  |||||||||||| |||    
T  10528931 tagaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttgagca--tttatgaagtctcatactaggtgtagtattgagcagttg 10528834  T
Q  230 taatctttgtgat 242  Q
    |||||| ||||||    
T  10528833 taatctgtgtgat 10528821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #153
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 30 - 193
Target Start/End: Original strand, 14077822 - 14077986
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| |||||||||| ||||||||| ||||     ||||||||    
T  14077822 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaac-attttctttgtaattttgtttgagtagaagtcttttgcagttatgcttgag 14077920  T
Q  129 cattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttt 193  Q
    |||  ||||||||||||  | |||||||||||| ||||  |||||||   |||||||||| |||||    
T  14077921 cataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcataggaaacctcttgcagttgtgcttgagtagttt 14077986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #154
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 30 - 143
Target Start/End: Original strand, 30054683 - 30054799
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| ||||||||||  | |||||||||||||    |||||||    
T  30054683 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattttgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttg 30054782  T
Q  127 agcattagaagtctctt 143  Q
    |||| ||||||||||||    
T  30054783 agcaatagaagtctctt 30054799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #155
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Original strand, 8874621 - 8874737
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttg-attagaagtctcttgcctgcgtgcttga 127  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||| ||||||||||||||||    |||||| |    
T  8874621 ttgtattgtgaacaccacttattgtatatcaagtgttcaatctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcagttgtgcttaa 8874720  T
Q  128 gcattagaagtctcttg 144  Q
    |||||||||||||||||    
T  8874721 gcattagaagtctcttg 8874737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #156
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 13147930 - 13147838
Alignment:
Q  24 attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgc 115  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| ||||||||||||||    
T  13147930 attgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttgc 13147838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #157
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 13699026 - 13698868
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactca--attctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttga 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  | || |||   |||| |||| || |||||| ||||||||||||||  |  ||||||||    
T  13699026 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaccccaa-tcatttttctgtgtaattgtgtttgtttagaagtctcttgtttttgtgcttga 13698928  T
Q  128 gcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttga 186  Q
    ||||  ||| ||||||||||  ||||||||| ||| ||||  || ||| |||||||||||    
T  13698927 gcatatgaaatctcttgcttgtgtgcttgagtatttgaagtttcatgcttgtgtgcttga 13698868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #158
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 242
Target Start/End: Original strand, 19121370 - 19121426
Alignment:
Q  186 agcagttttgtgaagtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19121370 agcatttttgagaagtctcatacttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgat 19121426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #159
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Original strand, 22804523 - 22804641
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga---ttagaagtctcttgcctgcgtgctt 125  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||  | ||||  ||| || |||||||   |||||||||||||||    ||||||    
T  22804523 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaaatgttcaacctcaaacaaatttcttagtaattctgtttgaattttagaagtctcttgcagttgtgctt 22804622  T
Q  126 gagcattagaagtctcttg 144  Q
    |||||||||||||||||||    
T  22804623 gagcattagaagtctcttg 22804641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #160
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 209
Target Start/End: Original strand, 45862162 - 45862237
Alignment:
Q  132 tagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatact 209  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| ||   ||||||||||||||    
T  45862162 tagaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgcttgtgtgcttgagcaatt---tgaagtctcatact 45862237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #161
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Original strand, 49554003 - 49554119
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttga-ttagaagtctcttgcctgcgtgcttga 127  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| |||||||||||||||    ||||||||    
T  49554003 ttgtattgtgaacaccgctgattgtaaatcaagtgttcaacctcaaacatttttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcagttgtgcttga 49554102  T
Q  128 gcattagaagtctcttg 144  Q
    |||||||||||||||||    
T  49554103 gcattagaagtctcttg 49554119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #162
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 12967965 - 12967854
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||  | |||| |||| || ||||||| ||||||||||||||    |||||||||    
T  12967965 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatgaagtgttcaacctcaaacaaatttctttgtaattctgtttgaatagaagtctcttgcagttgtgcttgag 12967866  T
Q  129 cattagaagtct 140  Q
     ||| |||||||    
T  12967865 aattggaagtct 12967854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #163
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 14072354 - 14072240
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||    || | ||||||||||||||| || ||||||||||| |  |||||||||    
T  14072354 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagttttcaacctcaaac-attttttatgtatttttgtttgaatataagtctcttgcttttgtgcttgag 14072256  T
Q  129 cattagaagtctcttg 144  Q
    |||  |||||||||||    
T  14072255 cataggaagtctcttg 14072240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #164
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 27849843 - 27849689
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgagc 129  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| | || | ||||  |||||||| ||||||||||||||  |  |||||| |||    
T  27849843 ttgtattgttaacaccactgattgtatatcaagtgtccaaaccaaacttatttatgtgta-atttgtttgtttagaagtctcttgtttttgtgcttaagc 27849745  T
Q  130 attagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgctt 184  Q
    ||  ||| ||||||||||  ||||||||| ||| |||| ||||||| | |||||||    
T  27849744 ataggaaatctcttgcttgtgtgcttgagtatttgaagtctcttgcttttgtgctt 27849689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #165
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 191 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 33650901 - 33650850
Alignment:
Q  191 ttttgtgaagtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33650901 ttttgtgaagtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 33650850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #166
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 131 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 37412193 - 37412091
Alignment:
Q  131 ttagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatactttg-atagtattgagcattt 228  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||| ||   ||||||||||||||  |  |||||||||||| ||    
T  37412193 ttagaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgcttgtgtgcttgagcaatt---tgaagtctcatactaggtgtagtattgagcagtt 37412097  T
Q  229 gtaatc 234  Q
    ||||||    
T  37412096 gtaatc 37412091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #167
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 41494654 - 41494543
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||  |||| || ||||| | |||||||||||||| |  |||||||||    
T  41494654 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttcattgtaattatgtttaaatagaagtctcttgcatttgtgcttgag 41494555  T
Q  129 cattagaagtct 140  Q
    ||| ||||||||    
T  41494554 cataagaagtct 41494543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #168
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 2025744 - 2025627
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  | |||||||||||||    |||||||    
T  2025744 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaattgagaagtctcttgcagttgtgcttg 2025645  T
Q  127 agcattagaagtctcttg 144  Q
    |||| |||||||||||||    
T  2025644 agcaatagaagtctcttg 2025627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #169
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 14955085 - 14954969
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttc-aagtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||   ||||| |||| || |||||||  | ||||||||||||| |  |||||||    
T  14955085 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaac-atattctttgtaattctgtttgaattcagaagtctcttgcatttgtgcttg 14954987  T
Q  127 agcattagaagtctcttg 144  Q
    |||| |||| ||||||||    
T  14954986 agcaatagaggtctcttg 14954969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #170
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 29 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 17017660 - 17017526
Alignment:
Q  29 attgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttc-aagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttga 127  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || | |||     |||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| |  ||||||||    
T  17017660 attgtattgtgaacaccactcattgtatatcaagtgttcaaacttaaataattttctgtgtatttctgtttgaatagaagtctcttgctttagtgcttga 17017561  T
Q  128 gcattagaagtctcttg-cttagtgcttgagcatt 161  Q
    |||   ||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  17017560 gcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcatt 17017526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #171
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Original strand, 17239424 - 17239541
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  | |||||||||||||    |||||||    
T  17239424 ttgtattgtgaacgccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttg 17239523  T
Q  127 agcattagaagtctcttg 144  Q
    ||||||||||||||||||    
T  17239524 agcattagaagtctcttg 17239541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #172
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 132 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 18006081 - 18006023
Alignment:
Q  132 tagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca 189  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  18006081 tagaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgcctgtgtgcttgagca 18006023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #173
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 21640523 - 21640406
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||   ||||| |||| || |||||||  | |||||||||||||    |||||||    
T  21640523 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaatattctttgtaattctgtttgaattcagaagtctcttgcagttgtgcttg 21640424  T
Q  127 agcattagaagtctcttg 144  Q
    |||| || ||||||||||    
T  21640423 agcaatataagtctcttg 21640406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #174
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 28581761 - 28581645
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  | |||||||||||||    |||||||    
T  28581761 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttct-tgtaattatgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttg 28581663  T
Q  127 agcattagaagtctcttg 144  Q
    ||||||||||||||||||    
T  28581662 agcattagaagtctcttg 28581645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #175
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Original strand, 38178147 - 38178263
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  | |||||||||||||    |||||||    
T  38178147 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttct-tgtaattctgtttgaagtaagaagtctcttgcagttgtgcttg 38178245  T
Q  127 agcattagaagtctcttg 144  Q
    ||||||||||||||||||    
T  38178246 agcattagaagtctcttg 38178263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #176
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 40799553 - 40799437
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  | |||||||||||||    |||||||    
T  40799553 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttct-tgtaattctgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttg 40799455  T
Q  127 agcattagaagtctcttg 144  Q
    ||||||||||||||||||    
T  40799454 agcattagaagtctcttg 40799437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #177
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 30 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 17697274 - 17697158
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||    || | |||| || ||||||| ||||||||||||||    |||||||||    
T  17697274 ttgtattgtgaacaccactgattgtatattaagtgttcaacctcaaacaattttttttgtaattctgtttgaatagaagtctcttgcagttgtgcttgag 17697175  T
Q  129 cattagaagtctcttgc 145  Q
    |||  ||||||||||||    
T  17697174 cataggaagtctcttgc 17697158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #178
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 1728518 - 1728557
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1728518 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 1728557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #179
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 187
Target Start/End: Original strand, 7833129 - 7833287
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| ||||||||| |||||||| |||||| |  ||||||| |    
T  7833129 ttgtattgtaaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctgtgtaattttgtttgtttagaagtatcttgcatttgtgcttgtg 7833228  T
Q  129 cattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgag 187  Q
    |||  ||  ||||||||    ||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||    
T  7833229 cataggacatctcttgcaagtgtgcttgagtattggaagtctcttg-atgtgtgcttgag 7833287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #180
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 105 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 11074058 - 11074019
Alignment:
Q  105 aagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttg 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11074058 aagtctcttgcctgcgtgcttgagcaatagaagtctcttg 11074019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #181
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 13410549 - 13410588
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13410549 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 13410588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #182
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 15961132 - 15961171
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15961132 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 15961171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #183
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 16881945 - 16881906
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16881945 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 16881906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #184
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 19249914 - 19249953
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19249914 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 19249953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #185
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 20724745 - 20724630
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||  |||||||||||||| ||||||| | ||||||  ||||||  | |||| |||| || ||||||| ||||||| |||||| || |||||||||    
T  20724745 ttgtattatgaacaccactgattatatatcaggcgttcaacctcaaacatatttctttgtaattctgtttgaatagaagtatcttgcttgtgtgcttgag 20724646  T
Q  129 cattagaagtctcttg 144  Q
    |||  |||||||||||    
T  20724645 cataggaagtctcttg 20724630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #186
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 21638746 - 21638785
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21638746 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 21638785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #187
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 22128701 - 22128662
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22128701 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 22128662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #188
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 22463595 - 22463634
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22463595 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 22463634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #189
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 22465053 - 22465092
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22465053 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 22465092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #190
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 24776035 - 24776074
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24776035 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 24776074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #191
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 25398759 - 25398798
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25398759 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 25398798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #192
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 29855065 - 29855026
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29855065 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 29855026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #193
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 40850633 - 40850594
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40850633 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 40850594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #194
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 46796870 - 46796909
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46796870 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 46796909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #195
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 47207360 - 47207321
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47207360 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 47207321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #196
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 47405925 - 47405964
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47405925 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 47405964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #197
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 50299887 - 50299773
Alignment:
Q  33 tattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttgagc 129  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  | ||||||||||||| |  ||||||||||    
T  50299887 tattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaattcagaagtctcttgcatttgtgcttgagc 50299788  T
Q  130 attagaagtctcttg 144  Q
    | || ||||||||||    
T  50299787 aatataagtctcttg 50299773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #198
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 33 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 1463942 - 1463847
Alignment:
Q  33 tattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgatta-gaagtctcttgcctgcgtgcttgagca 130  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||| ||||  |||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||    
T  1463942 tattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ccaaact-tattctttgta-atttgtttgtttaggaagtctcttgcttgtgtgcttgagca 1463847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #199
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 11223220 - 11223103
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  | |||||||||||||    |||||||    
T  11223220 ttgtattgtgaacaccacttattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttg 11223121  T
Q  127 agcattagaagtctcttg 144  Q
    | ||||||||||||||||    
T  11223120 accattagaagtctcttg 11223103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #200
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 13947994 - 13947877
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  ||| |||||||||||    |||||||    
T  13947994 ttgtattgtgaacaccactgactgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatttataagtctcttgcagttgtgcttg 13947895  T
Q  127 agcattagaagtctcttg 144  Q
    | ||||||||||||||||    
T  13947894 aacattagaagtctcttg 13947877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #201
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 104 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 15848726 - 15848597
Alignment:
Q  104 gaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtc 202  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||   |||| ||||||| || ||||||||||| ||   |||||||    
T  15848726 gaagtctcttgctttagtgcttgagcatagaaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcaatt---tgaagtc 15848630  T
Q  203 tcatactttg-atagtattgagcatttgtaatc 234  Q
    |||||||  |  |||||||||||| ||||||||    
T  15848629 tcatactaggtgtagtattgagcagttgtaatc 15848597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #202
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 34 - 132
Target Start/End: Original strand, 16305651 - 16305749
Alignment:
Q  34 attgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcatt 132  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| || |||||||  |||||    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |  |||||| ||||||    
T  16305651 attgtgaacaccattgattgtatattaattgttcaaaccaaacatctttctctgtagttttgtttgtttagaagtctcttgcttttgtgcttcagcatt 16305749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #203
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Original strand, 53057232 - 53057349
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  | |||||||||||||    |||| ||    
T  53057232 ttgtattgtgaacaccactgactgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattatgtttgaattaagaagtctcttgcaattgtgcctg 53057331  T
Q  127 agcattagaagtctcttg 144  Q
    ||||||||||||||||||    
T  53057332 agcattagaagtctcttg 53057349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #204
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 104 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 18006049 - 18005989
Alignment:
Q  104 gaagtctcttgcctgcgtgcttgagca--ttagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcatt 161  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18006049 gaagtctcttgcctgtgtgcttgagcatctgagaagtctcttgctttagtgcttgagcatt 18005989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #205
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 2784722 - 2784604
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa--gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgctt 125  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||    |||| |||| || |||||||  | |||||||||||||    ||||||    
T  2784722 ttgtattatgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaattcagaagtctcttgcagttgtgctt 2784623  T
Q  126 gagcattagaagtctcttg 144  Q
    ||||| |||||||||||||    
T  2784622 gagcaatagaagtctcttg 2784604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #206
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 104 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 8710444 - 8710404
Alignment:
Q  104 gaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttg 144  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  8710444 gaagtctcttgcctgtgtgcttgagcaatagaagtctcttg 8710404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #207
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 104 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 9062331 - 9062291
Alignment:
Q  104 gaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttg 144  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  9062331 gaagtctcttgcctgtgtgcttgagcaatagaagtctcttg 9062291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #208
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 69
Target Start/End: Original strand, 18122119 - 18122155
Alignment:
Q  33 tattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18122119 tattgcgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 18122155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #209
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 193
Target Start/End: Original strand, 23538666 - 23538830
Alignment:
Q  31 tgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgagc 129  Q
    ||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||||  ||||||  | |||| |||| || | ||||| ||||||||||||||    ||||||||||    
T  23538666 tgtattgtgaacaccgcttattgtatatcaggtgttcaacctcaaacatatttctttgtaattctatttgaatagaagtctcttgcagttgtgcttgagc 23538765  T
Q  130 attagaagtctcttg-cttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttt 193  Q
    ||  |||||||||||  ||||| |||||||||  |||  |||||||   |||||||||| |||||    
T  23538766 ataggaagtctcttgatttagttcttgagcataagaaatctcttgcagttgtgcttgagtagttt 23538830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #210
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 34 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 2560839 - 2560804
Alignment:
Q  34 attgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2560839 attgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 2560804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #211
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 3238348 - 3238309
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3238348 ttgtattgtgaacaccactgtttgtatatcaagtgttcaa 3238309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #212
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 131 - 189
Target Start/End: Original strand, 4243694 - 4243753
Alignment:
Q  131 ttagaagtctcttgctta-gtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca 189  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4243694 ttagaagtctcttgcttttgtggttgaacataggaagactcttgcgtgtgtgcttaagca 4243753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #213
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 5213234 - 5213195
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5213234 ttgtattgtgaacactactgattgtatatcaagtgttcaa 5213195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #214
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 6174993 - 6174954
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6174993 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtcttcaa 6174954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #215
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 11078346 - 11078307
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11078346 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagttttcaa 11078307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #216
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 13781087 - 13781126
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13781087 ttgtattgtgaacatcactgattgtatatcaagtgttcaa 13781126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #217
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 16659120 - 16659159
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16659120 ttgtattgtaaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 16659159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #218
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 16879673 - 16879634
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16879673 ttgtattgtgaacaccactgattttatatcaagtgttcaa 16879634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #219
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 18143248 - 18143287
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18143248 ttgtattgtgaacaccattgattgtatatcaagtgttcaa 18143287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #220
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 20627936 - 20627975
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20627936 ttgtattgtgaacaccactaattgtatatcaagtgttcaa 20627975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #221
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 81 - 187
Target Start/End: Original strand, 22770414 - 22770521
Alignment:
Q  81 ttctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtg 179  Q
    |||| |||| || |||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||||  ||||||||||||  | |||||||||||| ||||  ||||| | | ||    
T  22770414 ttctttgtaattctgttcgattagaagtctcttgcttttgtgcttgagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcataggaaacctcttccttttg 22770513  T
Q  180 tgcttgag 187  Q
    ||||||||    
T  22770514 tgcttgag 22770521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #222
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 152 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 8710455 - 8710418
Alignment:
Q  152 cttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca 189  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  8710455 cttgagcattggaagtctcttgcctgtgtgcttgagca 8710418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #223
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 152 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 9062342 - 9062305
Alignment:
Q  152 cttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca 189  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  9062342 cttgagcattggaagtctcttgcctgtgtgcttgagca 9062305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #224
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 101 - 185
Target Start/End: Original strand, 12756018 - 12756103
Alignment:
Q  101 ttagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttg 185  Q
    ||||||||||||||| || |||||| |||||| |||||||||| |  | ||| |||||||||| ||  ||||||| ||||||||||    
T  12756018 ttagaagtctcttgcttgtgtgcttaagcattggaagtctctttcaattgtgattgagcattgaaaatctcttgcttgtgtgcttg 12756103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #225
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 133 - 189
Target Start/End: Original strand, 13410623 - 13410680
Alignment:
Q  133 agaagtctcttgct-tagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca 189  Q
    |||||| ||||||| | |||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||    
T  13410623 agaagtttcttgctcttgtgcttgagcataggaaaactcttgcgtttgtgcttgagca 13410680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #226
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 102 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 10928624 - 10928536
Alignment:
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca 189  Q
    ||||||| |||||| || ||||||||||||| |||||||||| |  | ||| |||||| || |||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  10928624 tagaagtttcttgcttgtgtgcttgagcattggaagtctctttcagttgtgattgagcgttagaagtctcttgcttgtgtgcttaagca 10928536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #227
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 163 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 21735896 - 21735820
Alignment:
Q  163 gaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    |||| ||||||| || |||||||||||  |||| |||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  21735896 gaagtctcttgcctgcgtgcttgagca--tttgggaagtctcatacta-gatagtattgagcagttgtaatttgtgtgat 21735820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #228
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 130 - 189
Target Start/End: Original strand, 22770433 - 22770493
Alignment:
Q  130 attagaagtctcttgctta-gtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca 189  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||| |||||||   ||||||||||||    
T  22770433 attagaagtctcttgcttttgtgcttgagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagca 22770493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #229
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 33 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 33582884 - 33582848
Alignment:
Q  33 tattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33582884 tattgtgaacaccacttattgtatatcaagtgttcaa 33582848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #230
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 41 - 69
Target Start/End: Original strand, 49669003 - 49669031
Alignment:
Q  41 acaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  49669003 acaccactgattgtatatcaagtgttcaa 49669031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 237; Significance: 1e-131; HSPs: 155)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 26044052 - 26043812
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26044052 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 26043953  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26043952 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagctttgtgaagt 26043853  T
Q  202 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26043852 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 26043812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Original strand, 9112851 - 9113091
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9112851 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 9112950  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 201  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9112951 cagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 9113050  T
Q  202 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9113051 ctcatacttagaaagtattgagcatttgtaatctttgtgat 9113091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Original strand, 9123488 - 9123728
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9123488 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 9123587  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 201  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9123588 cagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 9123687  T
Q  202 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9123688 ctcatacttagaaagtattgagcatttgtaatctttgtgat 9123728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 27372672 - 27372432
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27372672 aaattcaaagtctagagtctttactgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 27372573  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 201  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  27372572 cagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatctttgtgaagt 27372473  T
Q  202 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27372472 ctcacacttagatagtattgagcagttgtaatctttgtgat 27372432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 27463022 - 27462782
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27463022 aaattcaaagtctagagtctttactgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 27462923  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 201  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  27462922 cagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatctttgtgaagt 27462823  T
Q  202 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27462822 ctcacacttagatagtattgagcagttgtaatctttgtgat 27462782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 27505782 - 27505542
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27505782 aaattcaaagtctagagtctttactgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 27505683  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 201  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  27505682 cagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatctttgtgaagt 27505583  T
Q  202 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27505582 ctcacacttagatagtattgagcagttgtaatctttgtgat 27505542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Original strand, 32962290 - 32962530
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32962290 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 32962389  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32962390 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 32962489  T
Q  202 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32962490 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 32962530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Original strand, 32972909 - 32973149
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32972909 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 32973008  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32973009 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 32973108  T
Q  202 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32973109 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 32973149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 2 - 236
Target Start/End: Original strand, 31982982 - 31983218
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31982982 aaattcaaagtctagagtcttttttgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 31983081  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca--gttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  31983082 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 31983181  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctt 236  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  31983182 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatctt 31983218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 12854861 - 12854621
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12854861 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 12854762  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  12854761 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttctgaagt 12854662  T
Q  202 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12854661 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 12854621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 12865387 - 12865147
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12865387 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 12865288  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  12865287 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttctgaagt 12865188  T
Q  202 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12865187 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 12865147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Original strand, 12717192 - 12717434
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12717192 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 12717291  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagc--agttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  12717292 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaa 12717391  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12717392 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 12717434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Original strand, 12727841 - 12728083
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12727841 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 12727940  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagc--agttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  12727941 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaa 12728040  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12728041 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 12728083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 2 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 4630711 - 4630475
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4630711 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 4630612  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca--gttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  4630611 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 4630512  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctt 236  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  4630511 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatctt 4630475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 2 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 26025299 - 26025063
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26025299 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 26025200  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca--gttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  26025199 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 26025100  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctt 236  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  26025099 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatctt 26025063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 2 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 26035873 - 26035637
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26035873 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 26035774  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca--gttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  26035773 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 26035674  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctt 236  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  26035673 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatctt 26035637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 2 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 27341534 - 27341298
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27341534 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 27341435  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca--gttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  27341434 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 27341335  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctt 236  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  27341334 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatctt 27341298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 2 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 27402274 - 27402038
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27402274 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 27402175  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca--gttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  27402174 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 27402075  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctt 236  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  27402074 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatctt 27402038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 2 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 27412933 - 27412697
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27412933 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 27412834  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca--gttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  27412833 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 27412734  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctt 236  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  27412733 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatctt 27412697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 2 - 236
Target Start/End: Original strand, 32301399 - 32301635
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32301399 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 32301498  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca--gttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  32301499 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 32301598  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctt 236  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  32301599 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatctt 32301635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 2 - 236
Target Start/End: Original strand, 32312088 - 32312324
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32312088 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 32312187  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca--gttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  32312188 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 32312287  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctt 236  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  32312288 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatctt 32312324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 3661223 - 3660983
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3661223 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 3661124  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3661123 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgctttgtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 3661024  T
Q  202 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3661023 ctcatacttaggaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 3660983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 3671887 - 3671647
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3671887 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 3671788  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3671787 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgctttgtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 3671688  T
Q  202 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3671687 ctcatacttaggaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 3671647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 25985922 - 25985680
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25985922 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 25985823  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca--gttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||    
T  25985822 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttttgtgaa 25985723  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25985722 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 25985680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Original strand, 34818148 - 34818390
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34818148 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 34818247  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca--gttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||    
T  34818248 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttttgtgaa 34818347  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34818348 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 34818390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 2 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 16930291 - 16930055
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16930291 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgcattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 16930192  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagc--agttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  16930191 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaa 16930092  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctt 236  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  16930091 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatctt 16930055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 2 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 16959462 - 16959226
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16959462 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgcattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 16959363  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagc--agttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  16959362 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaa 16959263  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctt 236  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  16959262 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatctt 16959226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Original strand, 34807516 - 34807759
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34807516 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 34807615  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca---gttttgtga 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||    
T  34807616 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattttttttgtga 34807715  T
Q  199 agtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34807716 agtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 34807759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Original strand, 17982857 - 17983099
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    |||||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17982857 aaattcaaagtccagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 17982956  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagc--agttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  17982957 tagaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaa 17983056  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17983057 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 17983099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Original strand, 17985066 - 17985308
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    |||||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17985066 aaattcaaagtccagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 17985165  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagc--agttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  17985166 tagaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaa 17985265  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17985266 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 17985308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 2 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 29384592 - 29384356
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29384592 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 29384493  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagc--agttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  29384492 tagaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaa 29384393  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctt 236  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  29384392 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctt 29384356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 33199168 - 33198927
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33199168 aaattcaaagtctagagtctttactgtattgttttgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaactcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 33199069  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca-gttttgtgaag 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  33199068 tagaagtctcttgcctgcatgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattttttgtgaag 33198969  T
Q  201 tctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    |||||||||| || ||||||||||| |||||||||| |||||    
T  33198968 tctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatcttggtgat 33198927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 2 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 26864626 - 26864390
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26864626 aaattcaaagtctagagtcttttctgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 26864527  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagc--agttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  26864526 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaa 26864427  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctt 236  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  26864426 gtctcttacttagaaagtattgagcagttgtaatctt 26864390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 2 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 26875250 - 26875014
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26875250 aaattcaaagtctagagtcttttctgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 26875151  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagc--agttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  26875150 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaa 26875051  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctt 236  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  26875050 gtctcttacttagaaagtattgagcagttgtaatctt 26875014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 2 - 236
Target Start/End: Original strand, 28251919 - 28252152
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28251919 aaattcaaagtctagagtctttactgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattgtctgtatttttgtttgat 28252018  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 201  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  28252019 tagaagtctcttg-cttagtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcagtggaagtctcttgcgtgtgtgcttgagcatctttgtgaagt 28252117  T
Q  202 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctt 236  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  28252118 ctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatctt 28252152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 2 - 236
Target Start/End: Original strand, 28357066 - 28357299
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28357066 aaattcaaagtctagagtctttactgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattgtctgtatttttgtttgat 28357165  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 201  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  28357166 tagaagtctcttg-cttagtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcagtggaagtctcttgcgtgtgtgcttgagcatctttgtgaagt 28357264  T
Q  202 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctt 236  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  28357265 ctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatctt 28357299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 2 - 236
Target Start/End: Original strand, 7751591 - 7751825
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  7751591 aaattcaaagtctagagtctttactgtattgtattgagaacatcactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattgtctgtacttttgtttgat 7751690  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 201  Q
    |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  7751691 tagaagtctcttgcttttgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagtctcttgcgtgtgtgcttgagcatctttgtgaagt 7751790  T
Q  202 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctt 236  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  7751791 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctt 7751825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 8 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 12827526 - 12827292
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||| |||||    
T  12827526 aaagtctagagtctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttatttcattgtatttttgtttgatcagaag 12827427  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcata 207  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  12827426 actcttgcctgtgtgcttgagcattagaagactattgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcata 12827327  T
Q  208 ctttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12827326 cttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgat 12827292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 8 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 25787535 - 25787302
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||| |||||    
T  25787535 aaagtctagagtctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttatttcattgtatttttgtttgatcagaag 25787436  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcata 207  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  25787435 actcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca-ttttgagaagtgtcata 25787337  T
Q  208 ctttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25787336 cttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgat 25787302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 8 - 242
Target Start/End: Original strand, 20030266 - 20030500
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||   ||||||||||||||| |||||    
T  20030266 aaagtctagagtctttaacgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttatttcatagtatttttgtttgatcagaag 20030365  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcata 207  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  20030366 cctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcata 20030465  T
Q  208 ctttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20030466 cttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgat 20030500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 8 - 242
Target Start/End: Original strand, 20063017 - 20063251
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||   |||||||||||||||||||||    
T  20063017 aaagtctagagtctttaacgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttatttcatagtatttttgtttgattagaag 20063116  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcata 207  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  20063117 cctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtacttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcata 20063216  T
Q  208 ctttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20063217 cttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgat 20063251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 2 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 27384273 - 27384040
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  27384273 aaattcaaagtctagagtctttactgtattgtattgagaacatcactgattgtatatcaagtgttcaaatcaaactcaattgtctgtacttttgtttgat 27384174  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 201  Q
    ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  27384173 tagaagtctcttg-cttagtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagtctcttgcgtgtgtgcttgagcatctttgtgaagt 27384075  T
Q  202 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctt 236  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  27384074 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctt 27384040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 8 - 242
Target Start/End: Original strand, 18926126 - 18926359
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||| |||||    
T  18926126 aaagtctagagtctgtatcgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttatttcattgtatttttgtttgatcagaag 18926225  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcata 207  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  18926226 actcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcctgtgtgcttgag-aattttgagaagtctcata 18926324  T
Q  208 ctttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18926325 cttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgat 18926359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 8 - 242
Target Start/End: Original strand, 7376120 - 7376355
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||| |||||    
T  7376120 aaagtctagagtctttaacgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttatttcattgtatttttgtttgatcagaag 7376219  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcata 207  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||    
T  7376220 cctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttaagcatttttgagaagtctcata 7376319  T
Q  208 ctttgatagtattgagca-tttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  7376320 cttagagagtattgagcattttgtaatcttcgtgat 7376355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 9 - 242
Target Start/End: Original strand, 16123897 - 16124132
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtatt-gagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaa 106  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    |||||||||||||||||||| |||||    
T  16123897 aagtctagagtctttattacattgtatttgtgaacatcactgattgtacatcaagtgttcaaggtcaaacatttttctctgtatttttgtttgaatagaa 16123996  T
Q  107 gtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcat 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  16123997 gtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgctttagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcat 16124096  T
Q  207 actttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16124097 acttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgat 16124132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 9 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 31572247 - 31572015
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagt 108  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||| ||||||     
T  31572247 aagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacatt-ttctctgtatttttgtttgaatagaagc 31572149  T
Q  109 ctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcata 207  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  31572148 ctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagactctcgcctgcgtgcttgagca-ttttgagaagtctcata 31572050  T
Q  208 ctttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31572049 cttagatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 31572015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 2 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 27504185 - 27504013
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27504185 aaattcaaagtctagagtctttactgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaatcaaactcaattgtctgtatttttgtttgat 27504086  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgc 174  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  27504085 cagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattagaagtctcttgc 27504013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 9 - 242
Target Start/End: Original strand, 27166806 - 27167038
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagt 108  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    |||||||||||||||||||| ||||||     
T  27166806 aagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtgtatcaagtgttcaattcaaacatt-ttctctgtatttttgtttgaatagaagc 27166904  T
Q  109 ctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcata 207  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  27166905 ctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagactctcgcctgcgtgcttgagca-ttttgagaagtctcata 27167003  T
Q  208 ctttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27167004 cttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgat 27167038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 9 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 29765368 - 29765136
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagt 108  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    |||| ||||||||||||||| ||||||     
T  29765368 aagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaacatt-ttctttgtatttttgtttgaatagaagc 29765270  T
Q  109 ctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcata 207  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  29765269 ctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagactctcgcctgcgtgcttgagca-ttttgagaagtctcata 29765171  T
Q  208 ctttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29765170 cttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgat 29765136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 9 - 242
Target Start/End: Original strand, 17746147 - 17746380
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    |||||||||||||||||||| ||||||    
T  17746147 aagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccactgattatatatcaagtgttcaaagtcaaacatt-ttctctgtatttttgtttgaatagaag 17746245  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcat 206  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  17746246 cctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagactctcgcctgcgtgcttgagca-ttttgagaagtctcat 17746344  T
Q  207 actttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17746345 acttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgat 17746380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 9 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 32757232 - 32757000
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtatt-gagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaa 106  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    ||||||||||||||||||||  ||||    
T  32757232 aagtctagagtctttattgcattatatttgtgaaaaccactgattgtatatcaagtgttcaaggtcaaacatt-ttctctgtatttttgtttgaacagaa 32757134  T
Q  107 gtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcat 206  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  32757133 gtctcttgtctgcgtacttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcctgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcat 32757034  T
Q  207 actttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32757033 actt--agagtattgagcatttgtaatctttgtgat 32757000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 9 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 5844919 - 5844686
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    ||||||||||||||||||||  |||||    
T  5844919 aagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccaccgattgtatatcaagtgttcaaggtcaaacatt-ttctctgtatttttgtttgaacagaag 5844821  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcat 206  Q
     |||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  5844820 cctctcgcctgcgtgcttgagcattagtagagtcttgctttagtgcttgagcattggaagactcttgcctgcgtgcttgagca-ttttgagaagtctcat 5844722  T
Q  207 actttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5844721 acttagaaagtattgagcatttgtaatctttgtgat 5844686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 9 - 242
Target Start/End: Original strand, 18826602 - 18826834
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagt 108  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    ||||||||||||||||||||  ||||||    
T  18826602 aagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaatcaaacatt-ttctctgtatttttgtttgaaaagaagt 18826700  T
Q  109 ctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcata 207  Q
    || | ||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||| ||| |||||||    
T  18826701 ctgtcgcctgtgtgcttgagtattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgtgtgcttgagca-ttttgagaaatctcata 18826799  T
Q  208 ctttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18826800 cttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgat 18826834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 9 - 242
Target Start/End: Original strand, 18834997 - 18835229
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagt 108  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    ||||||||||||||||||||  |||||     
T  18834997 aagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaatcaaacatt-ttctctgtatttttgtttgaaaagaagc 18835095  T
Q  109 ctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcata 207  Q
    |||| || |  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  18835096 ctctcgcttctgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgtgtgcttgagca-ttttgagaagtctcata 18835194  T
Q  208 ctttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18835195 cttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgat 18835229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 2 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 27474686 - 27474515
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  27474686 aaattcaaagtctagagtctttactgtattgtattgagaacatcactgattgtatatcaagtgttcaaatcaaactcaattgtctgtacttttgtttgat 27474587  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgc 174  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  27474586 tagaagtctcttg-cttagtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattagaagtctcttgc 27474515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 9 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 22308621 - 22308392
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttc-aagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    |||| ||||||| ||||||||||||||    
T  22308621 aagtctagagtctttattgcattgcattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaac-attttctgtgtatttctgtttgattagaag 22308523  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcat 206  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  22308522 cctcttgcctgcttgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca-ttttgagaagtctcat 22308424  T
Q  207 actttgatagtattgagcatttgtaatctttg 238  Q
    |||  || ||||||||||||||||||||||||    
T  22308423 actaagagagtattgagcatttgtaatctttg 22308392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 9 - 235
Target Start/End: Original strand, 25687113 - 25687338
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    || | |||| |||||||||||||||||    
T  25687113 aagtctagagtctttattgcattatattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaatctcaaacatt-ttatgtgtaattttgtttgattagaag 25687211  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcat 206  Q
     ||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||  |||||||||||||||    
T  25687212 actcttgctttagtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctcttgcctgagtgcttgagca--tttgtgaagtctcat 25687309  T
Q  207 actttgatagtattgagcatttgtaatct 235  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||    
T  25687310 acttagagagtattgagcatttgtaatct 25687338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 9 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 25518520 - 25518288
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttc-aagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    |||| |||| || ||||||||||||||    
T  25518520 aagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacaattttctgtgtaattctgtttgattagaag 25518421  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgct-tagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcat 206  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| || |||| || || ||||||||  |||| ||||||||||    
T  25518420 tctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctgtagtgcttgagcattgaaagtcttttgcctgcgtacttgagca--tttgagaagtctcat 25518323  T
Q  207 actttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    || | | |||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  25518322 ac-taggtagtattgagcagttgtaatctgtgtgat 25518288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 8 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 12353389 - 12353252
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||    
T  12353389 aaagtctagagtctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaacttaattctttgtatttttgtttgatcagaag 12353290  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc 145  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  12353289 cctcttgcctgcgtgcttgagcattggaagactcttgc 12353252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 9 - 235
Target Start/End: Original strand, 17742067 - 17742292
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgatta-gaa 106  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||||| |||    
T  17742067 aagtctagagtctttattgcattgtattgtgagcaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacatt-ttctatgtaattctgtttgattaagaa 17742165  T
Q  107 gtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctca 205  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||  || || |||||||||||  |||| |||||||||    
T  17742166 gtctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctcccgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctca 17742263  T
Q  206 tactttgatagtattgagcatttgtaatct 235  Q
    ||| | || |||||||||||||||||||||    
T  17742264 tac-tagagagtattgagcatttgtaatct 17742292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 9 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 11235331 - 11235098
Alignment:
Q  9 aagtctagagtcttt-attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaa 106  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||||||||    
T  11235331 aagtctagagtctttcattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgattagaa 11235232  T
Q  107 gtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctca 205  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| || |||||||||||  ||||||||||||||    
T  11235231 gtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgcctgcgtgcttgagca--tttgtgaagtctca 11235134  T
Q  206 tactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||| | |||||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  11235133 tac-tagatagtattgagcagttgtaatttgtgtgat 11235098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 9 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 4292558 - 4292420
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagt 108  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||| |||||||||||||||| ||||||     
T  4292558 aagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaaaaaatttcgctgtatttttgtttgaatagaagc 4292459  T
Q  109 ctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgctt 147  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4292458 ctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctt 4292420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 100 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 27474559 - 27474424
Alignment:
Q  100 attagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  27474559 attagaagtctcttgctta-gtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagtctcttgcgtgtgtgcttgagcatctttgtgaa 27474461  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctt 236  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  27474460 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctt 27474424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 100 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 27504057 - 27503922
Alignment:
Q  100 attagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  27504057 attagaagtctcttgctta-gtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagtctcttgcgtgtgtgcttgagcatctttgtgaa 27503959  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctt 236  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  27503958 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctt 27503922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 21127913 - 21127679
Alignment:
Q  9 aagtctagagtcttt--attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattaga 105  Q
    |||||||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||||||||    
T  21127913 aagtctagagtctttcaattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgattaga 21127814  T
Q  106 agtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctc 204  Q
    |||||||||| |  ||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||||||| || |||||||||||  |||||||||||||    
T  21127813 agtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcgtaggaagtctcttgcctgcgtgcttgagca--tttgtgaagtctc 21127716  T
Q  205 atactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    |||| | | |||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  21127715 atac-taggtagtattgagcagttgtaatctgtgtgat 21127679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 8 - 132
Target Start/End: Original strand, 11147612 - 11147736
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||    
T  11147612 aaagtctagagtctttaacgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttaattctttgtatttttgtttgataagaag 11147711  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcatt 132  Q
     ||||||| || |||||||||||||    
T  11147712 actcttgcgtgtgtgcttgagcatt 11147736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Original strand, 7586623 - 7586849
Alignment:
Q  9 aagtctagagtcttt--attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattaga 105  Q
    |||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||    |||| ||||  | ||||||||||||    
T  7586623 aagtctagagtctttcaattgcattgtattgtgaacaccactgatagtatatcaagcgttcaaactcaaacaattttctgtgtaaatctgtttgattaga 7586722  T
Q  106 agtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctc 204  Q
    |||||||||| |  ||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||||||| || |||||||||||  |||||||||||||    
T  7586723 agtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcgtaggaagtctcttgcctgcgtgcttgagca--tttgtgaagtctc 7586820  T
Q  205 atactttgatagtattgagcatttgtaatc 234  Q
    |||| | | |||||||||||| ||||||||    
T  7586821 atac-taggtagtattgagcagttgtaatc 7586849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 9 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 31931255 - 31931101
Alignment:
Q  9 aagtctagagtcttt-attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||| |||| || ||||||||||||||    
T  31931255 aagtctagagtcttttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacaattttctgtgtaattctgtttgattagaag 31931156  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttg-cttagtgcttgagcatt 161  Q
    |||||||| |  ||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  31931155 tctcttgctttagtgcttgagcattggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcatt 31931101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 150 - 242
Target Start/End: Original strand, 10404043 - 10404135
Alignment:
Q  150 tgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10404043 tgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcatacttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgat 10404135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 9 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 18555102 - 18554968
Alignment:
Q  9 aagtctagagtcttt-attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||| |||| || ||||||||||||||    
T  18555102 aagtctagagtcttttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacaattttctgtgtaattctgtttgattagaag 18555003  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctct 142  Q
    |||||||| |  ||||||||||||| |||||||||    
T  18555002 tctcttgctttagtgcttgagcattggaagtctct 18554968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 9 - 142
Target Start/End: Original strand, 12953495 - 12953628
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagt 108  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | || | |||| || ||||||||||||||     
T  12953495 aagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaacaaatttttgtgtaattctgtttgattagaagc 12953594  T
Q  109 ctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctct 142  Q
    ||||||| |  ||||||||||||| |||||||||    
T  12953595 ctcttgctttagtgcttgagcattggaagtctct 12953628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Original strand, 14070539 - 14070765
Alignment:
Q  9 aagtctagagtcttt--attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattaga 105  Q
    |||||||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| ||||    
T  14070539 aagtctagagtctttcaattgcattgtattgtgaacaccactaattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaataga 14070638  T
Q  106 agtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctc 204  Q
    |||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||   || |||||||||    
T  14070639 agtctcttgctttagtgcttgagcataagaagtctcttgcttgtgtgcttgagcataggaagtctcttg-ttgtgtgcttgagca---ttttgaagtctc 14070734  T
Q  205 atact--ttgatagtattgagcatttgtaatc 234  Q
     ||||  |||| ||||||||||| ||||||||    
T  14070735 gtacttgttga-agtattgagcagttgtaatc 14070765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 149 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 12353277 - 12353183
Alignment:
Q  149 gtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagc-agttttgtgaagtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12353277 gtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcaatttttgagaagtctcatacttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgat 12353183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 2 - 88
Target Start/End: Original strand, 31543252 - 31543338
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgt 88  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  31543252 aaattcaaagtctagagtctttactgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaactgaaactcaattctctgt 31543338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 9 - 132
Target Start/End: Original strand, 9934036 - 9934159
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttc-aagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    |||| |||| || ||||||||||||||    
T  9934036 aagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaac-attttctgtgtaattctgtttgattagaag 9934134  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcatt 132  Q
     |||| |||||||||||||||||||    
T  9934135 actctcgcctgcgtgcttgagcatt 9934159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 154 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 25583600 - 25583512
Alignment:
Q  154 tgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25583600 tgagcattggaagactcatgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 25583512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 163 - 242
Target Start/End: Original strand, 11147708 - 11147787
Alignment:
Q  163 gaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||    
T  11147708 gaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatacttagagagtattaagcatttgtaatctttgtgat 11147787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 9 - 187
Target Start/End: Original strand, 14051858 - 14052039
Alignment:
Q  9 aagtctagagtcttt--attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattaga 105  Q
    |||||||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| ||||    
T  14051858 aagtctagagtctttcaattgcattgtattgtgaacaccactaattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaataga 14051957  T
Q  106 agtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgag 187  Q
    |||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||| | ||||||  ||||||||||||    
T  14051958 agtctcttgctttagtgcttgagcataagaagtctcttgcttgtgtgcttgagcataggatgtctcttg-ttgtgtgcttgag 14052039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 24 - 242
Target Start/End: Original strand, 19453005 - 19453224
Alignment:
Q  24 attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagt-caaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtg 122  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||    |||| |||| || ||||||| |||||||||||||  |  |||    
T  19453005 attgcattgtattatgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaacacaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttgatttagtg 19453104  T
Q  123 cttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatactttg-atagtatt 220  Q
    |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||   ||||  |||||| || |||||||||||  ||||||||||||||||||  |  |||||||    
T  19453105 cttgagcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaagaagtatcttgcctgcgtgcttgagca--tttgtgaagtctcatactaggtgtagtatt 19453202  T
Q  221 gagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||| ||||||||| ||||||    
T  19453203 gagcagttgtaatctgtgtgat 19453224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 29 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 20635382 - 20635177
Alignment:
Q  29 attgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttga 127  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| |||||||||||||| |  ||||||||    
T  20635382 attgtattgtgaacaccactgattgtatttcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttgctttagtgcttga 20635283  T
Q  128 gcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatactttg-atagtattgagca 225  Q
    ||||  |||||||||||| ||||| ||||||||   |||| ||||||| || ||||||||||||||   ||||||||||||||  |  ||||||||||||    
T  20635282 gcataggaagtctcttgctttagtacttgagcaaatgaagtctcttgcctgcgtgcttgagcagtt---tgaagtctcatactaggtgtagtattgagca 20635186  T
Q  226 tttgtaatc 234  Q
     ||||||||    
T  20635185 gttgtaatc 20635177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 24 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 22386470 - 22386286
Alignment:
Q  24 attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtg 122  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| |||||||||||||| |  |||    
T  22386470 attgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatagaagtctcttgctttagtg 22386371  T
Q  123 cttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatact 209  Q
    |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||| ||| || || |||||||| ||   ||||||||||||||    
T  22386370 cttgagcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcatgcctgcgtacttgagcaatt---tgaagtctcatact 22386286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 9 - 132
Target Start/End: Original strand, 25735921 - 25736044
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| |||||||||||||||||    
T  25735921 aagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaatctcaaac-attttctgtgtaattttgtttgattagaag 25736019  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcatt 132  Q
     ||||||| |  |||||||||||||    
T  25736020 actcttgctttagtgcttgagcatt 25736044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 21 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 17064019 - 17063895
Alignment:
Q  21 tttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctc-tgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctg 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| || |||| || ||||||| || ||||||||||| |     
T  17064019 tttattgcattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacgtcaaa--caattttcttgtaattctgtttgaatataagtctcttgcttt 17063922  T
Q  119 cgtgcttgagcattagaagtctcttgc 145  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||    
T  17063921 agtgcttgagcattggaagtctcttgc 17063895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 29 - 189
Target Start/End: Original strand, 17608795 - 17608957
Alignment:
Q  29 attgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttga 127  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||    || | |||| || ||||||| |||||||||||||| |  ||||||||    
T  17608795 attgtattgtgaacaccattgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttatgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttgctttagtgcttga 17608894  T
Q  128 gcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca 189  Q
    ||||  |||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||| || |||||||||||    
T  17608895 gcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttgagca 17608957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 28 - 189
Target Start/End: Original strand, 18027209 - 18027370
Alignment:
Q  28 tattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttga 127  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| | |||| ||||  |||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||    
T  18027209 tattgtattatgaacaccactgattttatatcaagtgttcaaaccaaacttatttctgtgta-atttgtttgtttagaagtctcttgcttttgtgcttga 18027307  T
Q  128 gcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca 189  Q
    ||||  ||| ||||||||||  ||||||||| ||| |||| | ||||| ||||||||||||||    
T  18027308 gcatatgaaatctcttgcttgtgtgcttgagtatttgaagtcccttgcttgtgtgcttgagca 18027370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 130 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 31931163 - 31931053
Alignment:
Q  130 attagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatactttgatagtattgagcattt 228  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||  |||| |||||||||||| | |||||||||||||| ||    
T  31931163 attagaagtctcttgctttagtgcttgagcattggaagtctcttgcctgcgtgcttgagca--tttgggaagtctcatac-tagatagtattgagcagtt 31931067  T
Q  229 gtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||| ||||||    
T  31931066 gtaatctgtgtgat 31931053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 132 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 17047297 - 17047189
Alignment:
Q  132 tagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatactttgatagtattgagcatttgt 230  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  17047297 tagaagtctcttgctttagtgcttgagcattggaagtctcttgcctgcatgcttgagca--tttgagaagtctcatac-ttgatagtattgagcagttgt 17047201  T
Q  231 aatctttgtgat 242  Q
    ||||| ||||||    
T  17047200 aatctgtgtgat 17047189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 9 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 11205778 - 11205623
Alignment:
Q  9 aagtctagagtcttt-attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttc-aagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaa 106  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||    |||| |||| || ||||||| |||||    
T  11205778 aagtctagagtctttgattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaacacaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatagaa 11205679  T
Q  107 gtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttg-cttagtgcttgagcatt 161  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||  ||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  11205678 gtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcatt 11205623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 130 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 18555010 - 18554900
Alignment:
Q  130 attagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatactttgatagtattgagcattt 228  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| |||||||||||| | |||||||||||||| ||    
T  18555010 attagaagtctcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgggaagtctcatac-tagatagtattgagcagtt 18554914  T
Q  229 gtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||| ||||||    
T  18554913 gtaatctgtgtgat 18554900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 29 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 17047371 - 17047254
Alignment:
Q  29 attgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttga 127  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||     |||| |||| || ||||||| |||||||||||||| |  ||||||||    
T  17047371 attgtattgagaacaccattgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaataattttctgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttgctttagtgcttga 17047272  T
Q  128 gcattagaagtctcttgc 145  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  17047271 gcattggaagtctcttgc 17047254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 132 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 11205683 - 11205575
Alignment:
Q  132 tagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatactttgatagtattgagcatttgt 230  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| || |||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||    
T  11205683 tagaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgcctgcgtgcttgagca--tttgtgaagtctcatac-tagatagtattgagcagttgt 11205587  T
Q  231 aatctttgtgat 242  Q
    ||| | ||||||    
T  11205586 aatatgtgtgat 11205575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 9 - 142
Target Start/End: Original strand, 19289744 - 19289879
Alignment:
Q  9 aagtctagagtcttt-attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgtt-caagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaa 106  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    |||| |||| || |||||||||||||    
T  19289744 aagtccagagtcttttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttaaaagtcaaacaattttctgtgtaattctgtttgattagaa 19289843  T
Q  107 gtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctct 142  Q
    ||||||| | |  ||||||||||||  |||||||||    
T  19289844 gtctcttcctttagtgcttgagcataggaagtctct 19289879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Original strand, 12715913 - 12716030
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||  | |||||||    
T  12715913 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctatgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcaggtgtgcttg 12716012  T
Q  127 agcattagaagtctcttg 144  Q
    ||||||||||||||||||    
T  12716013 agcattagaagtctcttg 12716030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 130 - 242
Target Start/End: Original strand, 12953586 - 12953696
Alignment:
Q  130 attagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatactttgatagtattgagcattt 228  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| |||||||||||| | |||||||||||||| ||    
T  12953586 attagaagcctcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctagcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcatac-tagatagtattgagcaatt 12953682  T
Q  229 gtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||| ||||||    
T  12953683 gtaatctgtgtgat 12953696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 15 - 131
Target Start/End: Original strand, 15478259 - 15478374
Alignment:
Q  15 agagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttg 114  Q
    |||||||  ||||| |||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||  |||||| | |||| ||||  |||||||| ||||||||||||||    
T  15478259 agagtctgaattgttttgtattgtgaacaccattgattgtatagcaagtgttcaaaccaaacttatttctttgta-atttgtttgtttagaagtctcttg 15478357  T
Q  115 cctgcgtgcttgagcat 131  Q
    | |  ||||||||||||    
T  15478358 cttttgtgcttgagcat 15478374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 7763311 - 7763196
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| ||||||||||||||    |||||||||    
T  7763311 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatagaagtctcttgcagttgtgcttgag 7763212  T
Q  129 cattagaagtctcttg 144  Q
    |||  |||||||||||    
T  7763211 cataggaagtctcttg 7763196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 17063935 - 17063837
Alignment:
Q  135 aagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatactttgatagtattgagcatttgtaat 233  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || ||| |||||||  |||| ||||||||||||  |||||||||||| || |||||||    
T  17063935 aagtctcttgctttagtgcttgagcattggaagtctcttgcctgcgtgtttgagca--tttgagaagtctcatac-atgatagtattgaacaattgtaat 17063839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 19085817 - 19085700
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  | |||||||||||||    |||||||    
T  19085817 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctttgtaattctgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttg 19085718  T
Q  127 agcattagaagtctcttg 144  Q
    ||||||||||||||||||    
T  19085717 agcattagaagtctcttg 19085700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 130 - 242
Target Start/End: Original strand, 19289837 - 19289947
Alignment:
Q  130 attagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatactttgatagtattgagcattt 228  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| |||| || || |||||||||||  |||| |||||||||||| | |||||||||||||| ||    
T  19289837 attagaagtctcttcctttagtgcttgagcataggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgggaagtctcatac-tagatagtattgagcagtt 19289933  T
Q  229 gtaatctttgtgat 242  Q
    ||||| | ||||||    
T  19289934 gtaatatgtgtgat 19289947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #100
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 19625468 - 19625382
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgc 115  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  | |||| |||| || ||||||| ||||||||||||||    
T  19625468 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaaatttctttgtaattctgtttgaatagaagtctcttgc 19625382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #101
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 30 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 21034647 - 21034534
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| ||||||||||||||    |||||||||    
T  21034647 ttgtattgcgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaatagaagtctcttgcagttgtgcttgag 21034548  T
Q  129 cattagaagtctct 142  Q
    |||  |||||||||    
T  21034547 cataggaagtctct 21034534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #102
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 30 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 32335494 - 32335330
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||||| ||||||||||| |  |||||||||    
T  32335494 ttgtattgtgaacaccactaattgtatatcaagtgttcaacctcaaac-attttctttgtaattctgtttgattataagtctcttgcttttgtgcttgag 32335396  T
Q  129 cattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttt 193  Q
    |||  ||||||| |||| || ||||||||||||  ||   ||||||| | |||||||||| |||||    
T  32335395 cataggaagtctattgcgtttgtgcttgagcatatgagacctcttgcttttgtgcttgagtagttt 32335330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #103
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 15551646 - 15551487
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgagc 129  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| | |||| ||||  ||||| || ||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  15551646 ttgtattatgaacaccactgattgtatatcaattgttcaaaccaaacttatttctttgta-atttgtctgtttagaagtctcttgctttggtgcttgagc 15551548  T
Q  130 attagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca 189  Q
    ||  ||| | ||||| ||   |||||||| ||| ||||  |||||| ||||||||||||||    
T  15551547 ataggaaatttcttgtttctatgcttgagtatttgaagtatcttgcttgtgtgcttgagca 15551487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #104
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 193
Target Start/End: Original strand, 17446155 - 17446310
Alignment:
Q  39 gaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaag 137  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| || ||||||||||| |  ||||||||||||  ||||    
T  17446155 gaacactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatt-ttctttgtaattctgtttgaatataagtctcttgcttttgtgcttgagcatatgaag 17446253  T
Q  138 tctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttt 193  Q
    |||||||| || |||||||||||| ||||  |||||||   |||||||||| |||||    
T  17446254 tctcttgcatttgtgcttgagcataggaaacctcttgctgttgtgcttgagtagttt 17446310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #105
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 29597731 - 29597615
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttg-attagaagtctcttgcctgcgtgcttga 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||| ||||||||||||||||    ||||||||    
T  29597731 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcagttgtgcttga 29597632  T
Q  128 gcattagaagtctcttg 144  Q
     ||||| ||||||||||    
T  29597631 acattaaaagtctcttg 29597615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #106
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 147
Target Start/End: Original strand, 15395178 - 15395297
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| |||||| ||  |||||||||||||| ||  ||||||||    
T  15395178 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctgtgtaattttgtatgtctagaagtctcttgcttgtctgcttgag 15395277  T
Q  129 ca-ttagaagtctcttgctt 147  Q
     | || ||||||||||||||    
T  15395278 tatttggaagtctcttgctt 15395297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #107
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 9717499 - 9717383
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||    |||||||    
T  9717499 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttct-tgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttgtgcttg 9717401  T
Q  127 agcattagaagtctcttg 144  Q
    |||| |||||||||||||    
T  9717400 agcaatagaagtctcttg 9717383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #108
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 190 - 236
Target Start/End: Original strand, 12416901 - 12416947
Alignment:
Q  190 gttttgtgaagtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctt 236  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  12416901 gttttgtgaagtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatctt 12416947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #109
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 13601825 - 13601708
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  ||||||||||||||     || ||||    
T  13601825 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattatgtttgaatttagaagtctcttggagttgtacttg 13601726  T
Q  127 agcattagaagtctcttg 144  Q
    ||||||||||||||||||    
T  13601725 agcattagaagtctcttg 13601708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #110
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 15301873 - 15301756
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||    |||||||    
T  15301873 ttgtattgtgaacaccattgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttgtgcttg 15301774  T
Q  127 agcattagaagtctcttg 144  Q
    |||||||||| |||||||    
T  15301773 agcattagaattctcttg 15301756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #111
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 115
Target Start/End: Original strand, 18172720 - 18172806
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgc 115  Q
    |||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||  | |||| |||| || ||||||||||||||||||||||    
T  18172720 ttgttttgtgaacaccattgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatatttctgtgtaattctgtttgattagaagtctcttgc 18172806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #112
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 18227081 - 18226995
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgc 115  Q
    |||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||  | |||| |||| || ||||||||||||||||||||||    
T  18227081 ttgttttgtgaacaccattgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatatttctgtgtaattctgtttgattagaagtctcttgc 18226995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #113
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 24116486 - 24116369
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||     || | |||| ||||||||||  |||||||||||||||    |||||||    
T  24116486 ttgtattgtaaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaataattttttgtgtaattttgtttgaatttagaagtctcttgcagctgtgcttg 24116387  T
Q  127 agcattagaagtctcttg 144  Q
    ||||||||||||||||||    
T  24116386 agcattagaagtctcttg 24116369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #114
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 26589256 - 26589139
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||  |||| ||||||||||  |||||| ||||||||    |||||||    
T  26589256 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttcattgtaattttgtttgaatttagaattctcttgcagttgtgcttg 26589157  T
Q  127 agcattagaagtctcttg 144  Q
    |||| |||||||||||||    
T  26589156 agcaatagaagtctcttg 26589139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #115
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 31 - 69
Target Start/End: Original strand, 31127801 - 31127839
Alignment:
Q  31 tgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31127801 tgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 31127839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #116
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 193
Target Start/End: Original strand, 23006548 - 23006661
Alignment:
Q  81 ttctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttg-cttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtg 179  Q
    |||| |||| || |||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||  ||||||||| | ||| |||||||||||| ||||  ||||||| | ||    
T  23006548 ttctgtgtaattatgtttgattagaagtctcttgttttagtgcttgagcataggaagtctctcgcctttgtgcttgagcataggaaacctcttgcttttg 23006647  T
Q  180 tgcttgagcagttt 193  Q
    |||||||| |||||    
T  23006648 tgcttgagtagttt 23006661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #117
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 23781818 - 23781705
Alignment:
Q  81 ttctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttg-cttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtg 179  Q
    |||| |||| || |||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||  ||||||||| | ||| |||||||||||| ||||  ||||||| | ||    
T  23781818 ttctgtgtaattatgtttgattagaagtctcttgttttagtgcttgagcataggaagtctctcgcctttgtgcttgagcataggaaacctcttgcttttg 23781719  T
Q  180 tgcttgagcagttt 193  Q
    |||||||| |||||    
T  23781718 tgcttgagtagttt 23781705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #118
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 193
Target Start/End: Original strand, 24729014 - 24729179
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||  ||||| || |||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||| |||| || |||||| ||||||||||||||| |  |||||||||    
T  24729014 ttgtattatgaacatcattgattgtacatcaagtgttcaacctcaaacatatttctgtgtaattgtgtttgtttagaagtctcttgcttttgtgcttgag 24729113  T
Q  129 cattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttt 193  Q
    |||  |||| ||||||| |  | |||||||||| ||||  ||||||| | |||||||||| |||||    
T  24729114 catacgaagactcttgcgtgtgggcttgagcataggaaacctcttgcttttgtgcttgagtagttt 24729179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #119
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 25595833 - 25595733
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgagc 129  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||    |||| |||| ||||| ||| ||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  25595833 ttgtattgtgaacatcactgcttgtatatcaagtgttcaaatcaaacatttttctgtgtaattttg-ttgtttagaagtctcttgcttttgtgcttgagc 25595735  T
Q  130 at 131  Q
    ||    
T  25595734 at 25595733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #120
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 26942094 - 26941981
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| | || || ||||||| ||||||||||||||    |||||||||    
T  26942094 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttataattctgtttgaatagaagtctcttgcagttgtgcttgag 26941995  T
Q  129 cattagaagtctct 142  Q
    |||  |||||||||    
T  26941994 catatgaagtctct 26941981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #121
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 30 - 189
Target Start/End: Original strand, 14923703 - 14923863
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgagc 129  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |  |||||    || | |||| ||||||||| ||||||||||||||| |  |||||| |||    
T  14923703 ttgtattgtgaacaccactgatagtatatcaagtgttcgaaccaaacatctttatgtgtaattttgtttgtttagaagtctcttgcttttgtgcttaagc 14923802  T
Q  130 attagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca 189  Q
    ||  ||| ||| ||||||  ||||||||  ||| |||| ||||| | |||||| |||||||    
T  14923803 ataggaaatctattgcttgtgtgcttgaatatttgaagtctctttcttgtgtgattgagca 14923863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #122
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 2 - 78
Target Start/End: Original strand, 26023151 - 26023227
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactc 78  Q
    |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||    
T  26023151 aaatccaaaggctagagtctttatggtattgtatggagaacacccctaatggtttatcaggtgttcaagtccaactc 26023227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #123
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 10631760 - 10631721
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10631760 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 10631721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #124
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 10705025 - 10705064
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10705025 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 10705064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #125
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 12422919 - 12422880
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12422919 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 12422880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #126
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 16265643 - 16265682
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16265643 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 16265682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #127
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 193
Target Start/End: Original strand, 16463143 - 16463310
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacacca-ctgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaac-tcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||  |||||| |   || | |||| || ||||||| ||||||||||||||    |||||||    
T  16463143 ttgtattgtgaacaccaactgattttatatcaagtgttcaacctcaaacattttttttttgtaattctgtttgaatagaagtctcttgcaattgtgcttg 16463242  T
Q  127 agcattagaagtctcttgct-tagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttt 193  Q
    || ||  |||||||||||   |||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| |||||    
T  16463243 agtataggaagtctcttgtagtagtgcttgagcataggaaacctcttgcgtttgtgcttgagtagttt 16463310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #128
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 17317016 - 17317055
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17317016 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 17317055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #129
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 18435197 - 18435158
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18435197 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 18435158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #130
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 19066510 - 19066549
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19066510 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 19066549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #131
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 19470324 - 19470209
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| ||||||||||||||     ||||||||    
T  19470324 ttgtattgtgaacaccactaattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaatagaagtctcttgcagttttgcttgag 19470225  T
Q  129 cattagaagtctcttg 144  Q
    |||  |||||||||||    
T  19470224 cataggaagtctcttg 19470209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #132
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 19482409 - 19482370
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19482409 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 19482370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #133
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 115
Target Start/End: Original strand, 20113192 - 20113275
Alignment:
Q  33 tattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgc 115  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||   ||||| |||| || ||||||| ||||||||||||||    
T  20113192 tattgtgaacaccactaattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaatattctttgtaattctgtttgaatagaagtctcttgc 20113275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #134
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 20731197 - 20731236
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20731197 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 20731236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #135
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 21234815 - 21234776
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21234815 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 21234776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #136
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 21617901 - 21617862
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21617901 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 21617862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #137
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 22076898 - 22076937
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22076898 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 22076937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #138
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 131 - 189
Target Start/End: Original strand, 24719301 - 24719360
Alignment:
Q  131 ttagaagtctcttgctta-gtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca 189  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||    
T  24719301 ttagaagtctcttgcttttgtgcttgagcataggaagactcttgtgtgtgggcttgagca 24719360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #139
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 32543921 - 32543882
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32543921 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 32543882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #140
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 132 - 189
Target Start/End: Original strand, 14051954 - 14052012
Alignment:
Q  132 tagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca 189  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||  |||| ||||||| ||||||||||||||    
T  14051954 tagaagtctcttgctttagtgcttgagcataagaagtctcttgcttgtgtgcttgagca 14052012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #141
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 9 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 25679070 - 25679024
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgta 55  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  25679070 aagtctagagtcttaattgcattgtattgtgaacaccactgattgta 25679024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #142
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 242
Target Start/End: Original strand, 9934131 - 9934208
Alignment:
Q  163 gaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||| || || |||||||||||  |||| |||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9934131 gaagactctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcgtactaagagagtattgagcatttgtaatctgtgtgat 9934208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #143
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 112 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 10820728 - 10820696
Alignment:
Q  112 ttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttg 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10820728 ttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttg 10820696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #144
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 144
Target Start/End: Original strand, 14100933 - 14101045
Alignment:
Q  33 tattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcat 131  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||||| |||  ||||||    |||| | || || ||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||    
T  14100933 tattgtgaataccactgattgtatttcaagtgtccaacctcaaacatttttctttataattctgtttgaatagaagtctcttgcagttgtgcttgagcat 14101032  T
Q  132 tagaagtctcttg 144  Q
    |||||||||||||    
T  14101033 tagaagtctcttg 14101045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #145
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 17927445 - 17927333
Alignment:
Q  33 tattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcat 131  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||  | |||| |||| || ||||| | ||||||||||||||    ||||||||||||    
T  17927445 tattgtgaacaccactgattgtttatcaagtattcaacctcaaacatatttctttgtaattctgtttaaatagaagtctcttgcagttgtgcttgagcat 17927346  T
Q  132 tagaagtctcttg 144  Q
      |||||||||||    
T  17927345 gggaagtctcttg 17927333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #146
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 19623638 - 19623523
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||    |||| |||| || |||||||  ||||||| |||||||    |||||||    
T  19623638 ttgtattttgaacaccactgattgtatatcaagtgtttaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatttagaagactcttgcagttgtgcttg 19623539  T
Q  127 agcattagaagtctct 142  Q
    ||||||||||||||||    
T  19623538 agcattagaagtctct 19623523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #147
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 7811670 - 7811631
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7811670 ttgtattgttaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 7811631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #148
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 15532118 - 15532157
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15532118 ttgtaatgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 15532157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #149
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 31 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 16876560 - 16876525
Alignment:
Q  31 tgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgtt 66  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16876560 tgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgtt 16876525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #150
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 19688436 - 19688397
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19688436 ttgtattgtgaacatcactgattgtatatcaagtgttcaa 19688397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #151
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 19952064 - 19952103
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19952064 ttgtattgtgaacaccactgattttatatcaagtgttcaa 19952103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #152
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 33 - 144
Target Start/End: Original strand, 33352723 - 33352837
Alignment:
Q  33 tattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttgagc 129  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  | |||||||||||||    ||||||||||    
T  33352723 tattgtgaacaccactgattgtatatcgagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaattcagaagtctcttgcagttgtgcttgagc 33352822  T
Q  130 attagaagtctcttg 144  Q
    | |||||||||||||    
T  33352823 aatagaagtctcttg 33352837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #153
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 101 - 143
Target Start/End: Original strand, 22563160 - 22563202
Alignment:
Q  101 ttagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctctt 143  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  22563160 ttagaattctcttgcatgcgtgcttgagcattggaagtctctt 22563202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #154
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 197 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 22292538 - 22292497
Alignment:
Q  197 gaagtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttg 238  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||    
T  22292538 gaagtctcatactaagagagtattgagcatttgtaatctttg 22292497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #155
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 96 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 13435471 - 13435423
Alignment:
Q  96 tttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttg 144  Q
    ||||| ||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||    
T  13435471 tttgaatagaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttg 13435423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 237; Significance: 1e-131; HSPs: 147)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Original strand, 18752840 - 18753080
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18752840 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 18752939  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18752940 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 18753039  T
Q  202 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18753040 ctcatactttgatagtattgagcagttgtaatctttgtgat 18753080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 2 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 5022645 - 5022408
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5022645 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 5022546  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5022545 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattaaaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 5022446  T
Q  202 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgt 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5022445 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgt 5022408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Original strand, 18763450 - 18763690
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18763450 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 18763549  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 201  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18763550 tagaagtctcttgcctgcatgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 18763649  T
Q  202 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18763650 ctcatactttgatagtattgagcagttgtaatctttgtgat 18763690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Original strand, 27815296 - 27815536
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27815296 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 27815395  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 201  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27815396 cagaagtctcttgcctgcgtgcttgaacattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 27815495  T
Q  202 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27815496 ctcatacttagaaagtattgagcatttgtaatctttgtgat 27815536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 48371040 - 48370800
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48371040 aaattcaaagtccagagtctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 48370941  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 201  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  48370940 cagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 48370841  T
Q  202 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  48370840 ctcatacttagaaagtattgagcatttgtaatctttgtgat 48370800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 450485 - 450245
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  450485 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 450386  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  450385 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 450286  T
Q  202 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  450285 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 450245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 4948246 - 4948006
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4948246 aaattcaaagtctagagtctttactgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaactcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 4948147  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 201  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4948146 tagaagtctcttgcctgtgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 4948047  T
Q  202 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4948046 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 4948006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Original strand, 15561430 - 15561670
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15561430 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 15561529  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15561530 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 15561629  T
Q  202 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15561630 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 15561670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 21996322 - 21996082
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21996322 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 21996223  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21996222 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 21996123  T
Q  202 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21996122 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 21996082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 22006920 - 22006680
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22006920 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 22006821  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22006820 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 22006721  T
Q  202 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22006720 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 22006680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Original strand, 14844004 - 14844244
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14844004 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 14844103  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14844104 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 14844203  T
Q  202 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||    
T  14844204 ctcatacttagaaagtattaagcagttgtaatctttgtgat 14844244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Original strand, 19955313 - 19955553
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19955313 aaattcatagtctagagtctttactgtattgttttgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaactcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 19955412  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19955413 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 19955512  T
Q  202 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19955513 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 19955553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Original strand, 30926845 - 30927085
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30926845 aaattcaaagtctagagtcttttctgtcttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 30926944  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30926945 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 30927044  T
Q  202 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30927045 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 30927085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Original strand, 30937423 - 30937663
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30937423 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctccgtatttttgtttgat 30937522  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30937523 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 30937622  T
Q  202 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30937623 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 30937663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 17917961 - 17917720
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17917961 aaattcaaagtctagagtctttactgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaactcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 17917862  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagc-agttttgtgaag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  17917861 tagaagtctcttgcctgcgtgcttaagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcaatttttgtgaag 17917762  T
Q  201 tctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17917761 tctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 17917720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 17928609 - 17928368
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17928609 aaattcaaagtctagagtctttactgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaactcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 17928510  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagc-agttttgtgaag 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  17928509 tggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcaatttttgtgaag 17928410  T
Q  201 tctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17928409 tctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 17928368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Original strand, 24028436 - 24028679
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24028436 aaattcaaagtctagagtctttactgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaactcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 24028535  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca---gttttgtga 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||    
T  24028536 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattttttttgtga 24028635  T
Q  199 agtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24028636 agtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 24028679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 2 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 36018245 - 36018009
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36018245 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 36018146  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca--gttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  36018145 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 36018046  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctt 236  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  36018045 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatctt 36018009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 2 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 36028798 - 36028562
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36028798 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 36028699  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca--gttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  36028698 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 36028599  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctt 236  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  36028598 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatctt 36028562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 2 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 49518044 - 49517808
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49518044 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 49517945  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca--gttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  49517944 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 49517845  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctt 236  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  49517844 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatctt 49517808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 461066 - 460826
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  461066 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 460967  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 201  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  460966 tagaattctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 460867  T
Q  202 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||| || ||||||||||| | ||||||||||||||    
T  460866 ctcatacttagaaagtattgagcagtagtaatctttgtgat 460826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Original strand, 19944678 - 19944918
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19944678 aaattcatagtctagagtctttactgtattgttttgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaactcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 19944777  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19944778 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgaacattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 19944877  T
Q  202 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19944878 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 19944918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 2 - 236
Target Start/End: Original strand, 29042007 - 29042243
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29042007 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 29042106  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagc--agttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  29042107 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaa 29042206  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctt 236  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  29042207 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctt 29042243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Original strand, 40470937 - 40471178
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgt-attgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttga 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40470937 aaattcaaagtctagagactttattgtttttttattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttaattctctgtatttttgtttga 40471036  T
Q  101 ttagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaag 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  40471037 tcagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaag 40471136  T
Q  201 tctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40471137 tctcatacttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgat 40471178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 52703697 - 52703457
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  52703697 aaattcaaagtctagagtctgtactgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgtttaactcaaactcaattctctgtatttttgtttcat 52703598  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 201  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  52703597 cagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 52703498  T
Q  202 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  52703497 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 52703457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 27656509 - 27656267
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27656509 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 27656410  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagc--agttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||    
T  27656409 tagaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcttgtgtgcttgagcatagttttgtgaa 27656310  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27656309 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 27656267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 27667082 - 27666840
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27667082 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 27666983  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagc--agttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||    
T  27666982 tagaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcttgtgtgcttgagcatagttttgtgaa 27666883  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27666882 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 27666840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Original strand, 40454698 - 40454940
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgt--attgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttg 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40454698 aaattcaaagtctagagtctttattgttttttttattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttaattctctgtatttttgtttg 40454797  T
Q  100 attagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaa 199  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  40454798 atcagaagtctcttgcatgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaa 40454897  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40454898 gtctcatacttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgat 40454940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 2 - 236
Target Start/End: Original strand, 10740945 - 10741181
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  10740945 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttctgtttaat 10741044  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca--gttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  10741045 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 10741144  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctt 236  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  10741145 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatctt 10741181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 2 - 236
Target Start/End: Original strand, 10954714 - 10954950
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  10954714 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttctgtttaat 10954813  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca--gttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  10954814 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 10954913  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctt 236  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  10954914 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatctt 10954950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 2 - 236
Target Start/End: Original strand, 55745603 - 55745839
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55745603 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 55745702  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca--gttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  55745703 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcttgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 55745802  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctt 236  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  55745803 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctt 55745839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Original strand, 18130590 - 18130833
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgttt-ga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18130590 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgttttga 18130689  T
Q  101 ttagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagc--agttttgtga 198  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  18130690 ttagaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtga 18130789  T
Q  199 agtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18130790 agtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 18130833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 2 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 16255775 - 16255540
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgta-tttttgtttga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16255775 aaattcaaagtctagagtcttttctgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtaatttttgtttga 16255676  T
Q  101 ttagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16255675 ttagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaag 16255576  T
Q  201 tctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctt 236  Q
    |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  16255575 tctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctt 16255540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 8 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 10909310 - 10909076
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||    
T  10909310 aaagtctagagtctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttaattcattgtatttttgtttgatcagaag 10909211  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcata 207  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  10909210 cctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcata 10909111  T
Q  208 ctttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10909110 cttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgat 10909076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 2 - 236
Target Start/End: Original strand, 10751519 - 10751755
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  10751519 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttctgtttaat 10751618  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca--gttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  10751619 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattaaaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 10751718  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctt 236  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  10751719 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatctt 10751755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 2 - 236
Target Start/End: Original strand, 10965288 - 10965524
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  10965288 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttctgtttaat 10965387  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca--gttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  10965388 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattaaaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 10965487  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctt 236  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  10965488 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatctt 10965524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 2 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 24640157 - 24639921
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24640157 aaattcatagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 24640058  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagc--agttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  24640057 tagaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaa 24639958  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctt 236  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  24639957 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctt 24639921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 25657045 - 25656804
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgt-attgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25657045 aaattcaaagtctagagtctttattgtttttttattgagaacaccgctgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttaattctctgtatttttgtttga 25656946  T
Q  101 ttagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaag 200  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  25656945 tcagaagtctcttgcctgtgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaag 25656846  T
Q  201 tctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    | |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25656845 tttcatacttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgat 25656804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 2 - 236
Target Start/End: Original strand, 55756214 - 55756450
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  55756214 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctttgtatttttgtttgat 55756313  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca--gttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  55756314 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcttgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 55756413  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctt 236  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  55756414 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctt 55756450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 2 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 16266368 - 16266133
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgta-tttttgtttga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||  |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16266368 aaattcaaagtctagagtcttttctacattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtaatttttgtttga 16266269  T
Q  101 ttagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16266268 ttagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaag 16266169  T
Q  201 tctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctt 236  Q
    |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  16266168 tctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctt 16266133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 8 - 242
Target Start/End: Original strand, 18078263 - 18078499
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||    
T  18078263 aaagtctagagtctttaacgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagcgttcaagtcaaacttaattctttgtatttttgtttgatcagaag 18078362  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagc--agttttgtgaagtctca 205  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  18078363 cctcttgcttgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagcctcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaagtctca 18078462  T
Q  206 tactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18078463 tacttagatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 18078499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 8 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 16317233 - 16316999
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||| |||||    
T  16317233 aaagtctagagtctttattgtattctattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttatttcattgtatttttgtttgatcagaag 16317134  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcata 207  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  16317133 actcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcctgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcata 16317034  T
Q  208 ctttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16317033 cttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgat 16316999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 9 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 10695542 - 10695310
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagt 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||| |||||     
T  10695542 aagtctagagtctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacatatttccctgtatttttgtttgatcagaaga 10695443  T
Q  109 ctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatac 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  10695442 ctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcttgtgtgcttgagca-ttttgagaagtctcatac 10695344  T
Q  209 tttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10695343 ttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgat 10695310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 8 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 16305009 - 16304775
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||||||||| |||||| |||||    
T  16305009 aaagtctagagtctttattgtattctattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttatttcattgtatttttatttgatcagaag 16304910  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcata 207  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  16304909 actcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcctgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcata 16304810  T
Q  208 ctttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16304809 cttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgat 16304775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 9 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 3370617 - 3370382
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttca-agtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    ||||||||||||||||||||  |||||    
T  3370617 aagtctagagtctttattgcattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcataatcaaacatttttctctgtatttttgtttgaacagaag 3370518  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca-gttttgtgaagtctcat 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  3370517 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctaagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattttttgagaagtctcat 3370418  T
Q  207 actttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3370417 acttagatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 3370382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 8 - 242
Target Start/End: Original strand, 14836459 - 14836693
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||| |||||    
T  14836459 aaagtttatagtctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttatttctttgtatttttgtttgatcagaag 14836558  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcata 207  Q
     |||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||| |||||||||||    
T  14836559 actctagcctgtgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttaagtatttttgagaagtctcata 14836658  T
Q  208 ctttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14836659 cttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgat 14836693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 9 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 5873272 - 5873040
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagt 108  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||| ||||||||||||||| ||||||     
T  5873272 aagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacatatttctttgtatttttgtttgaatagaagc 5873173  T
Q  109 ctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatac 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | ||||| ||||||||||||    
T  5873172 ctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcctgcgtgcttgagta-ttttgagaagtctcatac 5873074  T
Q  209 tttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5873073 ttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgat 5873040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 9 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 3390357 - 3390122
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||    ||||||||||||||||||||  |||||    
T  3390357 aagtctagagtctttattgcattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcatcatcaaacatttttctctgtatttttgtttgaacagaag 3390258  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca-gttttgtgaagtctcat 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  3390257 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctaagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattttttgagaagtctcat 3390158  T
Q  207 actttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3390157 acttagatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 3390122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 7 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 19581144 - 19580909
Alignment:
Q  7 caaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtattt-ttgtttgattaga 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||| || |||||| | |    
T  19581144 caaagtctagagtctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacatatttccctgtatttcttttttgatcaaa 19581045  T
Q  106 agtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctca 205  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  19581044 agactcttgcccgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactctttcctgtgtgcttgagca-ttttgagaagtctca 19580946  T
Q  206 tactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19580945 tacttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgat 19580909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 25 - 242
Target Start/End: Original strand, 4986784 - 4987001
Alignment:
Q  25 ttgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgct 124  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | |||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  4986784 ttgtaatgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaactcaaacatatttcattgtatttttgtttgatcagaagactcttgcctgcgtgct 4986883  T
Q  125 tgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatactttgatagtattgagc 224  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  4986884 tgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgtttgagcatttttgagaagtctcatacttagagagtattgagc 4986983  T
Q  225 atttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||||||||||||    
T  4986984 atttgtaatctttgtgat 4987001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 10 - 242
Target Start/End: Original strand, 15207746 - 15207978
Alignment:
Q  10 agtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttt-tgtttgattagaagt 108  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||| |||||||| |||||     
T  15207746 agtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacatatttccctgtattttttgtttgatcagaaga 15207845  T
Q  109 ctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatac 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  15207846 ctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcctgcatgcttgagca-ttttgagaagtctcatac 15207944  T
Q  209 tttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    || || |||||||||||||||||||||| |||||    
T  15207945 ttagagagtattgagcatttgtaatcttagtgat 15207978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 9 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 10300436 - 10300203
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagt 108  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||| ||||||     
T  10300436 aagtctagagtctttattgcattgaattttgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacatttttctctgtatttttgtttgaatagaagc 10300337  T
Q  109 ctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcata 207  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  10300336 ctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagactctagcctgcgtgcttgagca-ttttgagaagtctcata 10300238  T
Q  208 ctttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10300237 cttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgat 10300203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 9 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 11535746 - 11535513
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||||||||||||||||||| ||||||    
T  11535746 aagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacatt-ttctctgtatttttgtttgaatagaag 11535648  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcat 206  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  11535647 cctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagactctcgcctgcgtgcttgagca-ttttgagaagtctcat 11535549  T
Q  207 actttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11535548 acttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgat 11535513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 9 - 238
Target Start/End: Original strand, 31267150 - 31267379
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||||||||||||||||||| ||||||    
T  31267150 aagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacatt-ttctctgtatttttgtttgaatagaag 31267248  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcat 206  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  31267249 cctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca-ttttgagaagtctcat 31267347  T
Q  207 actttgatagtattgagcatttgtaatctttg 238  Q
    |||| || | ||||||||||||||||||||||    
T  31267348 acttagagaatattgagcatttgtaatctttg 31267379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 9 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 11514936 - 11514704
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  11514936 aagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccaccgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacatt-ttctatgtatttttgtttgaatagaag 11514838  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcat 206  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||    
T  11514837 cctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcat 11514740  T
Q  207 actttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11514739 acttagagagtattgagcatttgtaatctgtgtgat 11514704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 9 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 24713332 - 24713096
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgatt----a 103  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    ||||||||||||||||||||      |    
T  24713332 aagtctagagtctttattgcattatattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaggtcaaacatt-ttctctgtatttttgtttgaacgtaca 24713234  T
Q  104 gaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtct 203  Q
    |||| |||| | ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||| |||||  ||||||    
T  24713233 gaagcctctcgtctgcgtgcttgagcattagtagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactctttcctgcgtgcttgagca-ttttgaaaagtct 24713135  T
Q  204 catactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24713134 catacttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgat 24713096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 8 - 242
Target Start/End: Original strand, 49002338 - 49002570
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaa 106  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| |||||||||| |||||    
T  49002338 aaagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacatt-ttctgtgtaattttgtttgaatagaa 49002436  T
Q  107 gtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctca 205  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| |||||||||    
T  49002437 gtctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcatgcgtgcttgagca--tttgagaagtctca 49002534  T
Q  206 tactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||| | || |||||||||||| |||||||| ||||||    
T  49002535 tac-tagagagtattgagcatctgtaatctgtgtgat 49002570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 9 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 55651224 - 55650993
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| |||||||||| ||||||    
T  55651224 aagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaatgtcaaacatt-ttctgtgtaattttgtttgaatagaag 55651126  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcat 206  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||    
T  55651125 tctcttgccttcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcat 55651028  T
Q  207 actttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    || | || |||||||||||| |||||||| ||||||    
T  55651027 ac-tagagagtattgagcatctgtaatctgtgtgat 55650993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 117 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 25008689 - 25008564
Alignment:
Q  117 tgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatactttgatag 216  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||    
T  25008689 tgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcatacttagagag 25008590  T
Q  217 tattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  25008589 tattgagcatttgtaatctttgtgat 25008564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 9 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 19241926 - 19241692
Alignment:
Q  9 aagtctagagtcttt--attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattaga 105  Q
    |||||||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||||||||    
T  19241926 aagtctagagtctttcaattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgattaga 19241827  T
Q  106 agtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctc 204  Q
    |||||||||| |  ||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| || |||||||||||  |||||||||||||    
T  19241826 agtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgcctgcgtgcttgagca--tttgtgaagtctc 19241729  T
Q  205 atactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    |||| | | |||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  19241728 atac-taggtagtattgagcagttgtaatctgtgtgat 19241692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 8 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 4987176 - 4987052
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | |||  |||||||||||||||| |||||    
T  4987176 aaagtctagagtctttattgtaatgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaactcaaacatatttcattgtatttttgtttgatcagaag 4987077  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcatt 132  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  4987076 actcttgcctgcgtgcttgagcatt 4987052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 130 - 242
Target Start/End: Original strand, 47152528 - 47152639
Alignment:
Q  130 attagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatactttgatagtattgagcatttg 229  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  47152528 attagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcctgtgtgcttgagca-ttttgagaagtctcatacttagagagtattgagcatttg 47152626  T
Q  230 taatctttgtgat 242  Q
    |||||||||||||    
T  47152627 taatctttgtgat 47152639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 9 - 242
Target Start/End: Original strand, 18775036 - 18775269
Alignment:
Q  9 aagtctagagtcttta-ttgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttc-aagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaa 106  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    |||| |||| || |||||||||||||    
T  18775036 aagtctagagtctttaattgcattgtattgtgaacaccattgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacaattttctgtgtaattctgtttgattagaa 18775135  T
Q  107 gtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttg-cttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctca 205  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||  ||||||||||| ||  |||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||     
T  18775136 gtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcc 18775233  T
Q  206 tactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
     || | |  ||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  18775234 cac-taggcagtattgagcagttgtaatctgtgtgat 18775269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 9 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 23509018 - 23508884
Alignment:
Q  9 aagtctagagtcttt-attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||| |||| || ||||||||||||||    
T  23509018 aagtctagagtcttttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacaattttctgtgtaattctgtttgattagaag 23508919  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctct 142  Q
    |||||||| |  ||||||||||||| |||||||||    
T  23508918 tctcttgctttagtgcttgagcattggaagtctct 23508884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 151 - 242
Target Start/End: Original strand, 19143504 - 19143595
Alignment:
Q  151 gcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19143504 gcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgtttgagcatttttgagaagtctcatacttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgat 19143595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 9 - 161
Target Start/End: Original strand, 47152436 - 47152589
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaac-tcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |   ||| |||||| ||||||||||||||||    
T  47152436 aagtttagagtctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcatgtgttcaagtcaaacatattttccctgtatctttgtttgattagaag 47152535  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttg-cttagtgcttgagcatt 161  Q
     |||||| ||  ||||||||||||| |||| |||||| ||  |||||||||||||    
T  47152536 actcttg-cttagtgcttgagcattggaagactcttgcctgtgtgcttgagcatt 47152589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 9 - 142
Target Start/End: Original strand, 16819732 - 16819867
Alignment:
Q  9 aagtctagagtcttt-attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttc-aagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaa 106  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    |||| |||| || |||||||||||||    
T  16819732 aagtctagagtcttttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacaattttctgtgtaattctgtttgattagaa 16819831  T
Q  107 gtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctct 142  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| |||||||||    
T  16819832 gtctcttgctttagtgcttgagcattggaagtctct 16819867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 9 - 242
Target Start/End: Original strand, 18007441 - 18007675
Alignment:
Q  9 aagtctagagtcttta--ttgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattaga 105  Q
    |||||||||||||||   ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| ||||    
T  18007441 aagtctagagtctttcatttgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaataga 18007540  T
Q  106 agtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttg-cttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctc 204  Q
    |||||||| | |  ||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||  ||||| ||||||| || ||||||||||| |||   ||||||||    
T  18007541 agtctcttactttagtgcttgagcataggaagtctcttgatttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcaattt--ggaagtctc 18007638  T
Q  205 atactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    |||| | | ||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  18007639 atac-taggtagtattaagcagttgtaatctgtgtgat 18007675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 9 - 114
Target Start/End: Original strand, 8997637 - 8997743
Alignment:
Q  9 aagtctagagtcttt-attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    |||| |||| || ||||||||||||||    
T  8997637 aagtctagagtcttttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagacaaacaattttctgtgtaattctgtttgattagaag 8997736  T
Q  108 tctcttg 114  Q
    |||||||    
T  8997737 tctcttg 8997743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 9 - 143
Target Start/End: Original strand, 17994173 - 17994310
Alignment:
Q  9 aagtctagagtcttt--attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattaga 105  Q
    |||||||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||||||||    
T  17994173 aagtctagagtctttcaattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgattaga 17994272  T
Q  106 agtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctctt 143  Q
    |||||||||| |  ||||||||||||  ||||||||||    
T  17994273 agtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctctt 17994310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 24 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 1672045 - 1671908
Alignment:
Q  24 attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtg 122  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| |||||||||||||| |  |||    
T  1672045 attgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttgctttagtg 1671946  T
Q  123 cttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagca 159  Q
    |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  1671945 cttgagcataggaagtctcttgctttagtgcttgagca 1671908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 32 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 33378062 - 33377886
Alignment:
Q  32 gtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgagca 130  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    ||||  ||| || | ||||| |||||||||||||| |  |||||||||||    
T  33378062 gtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgcgtaattctatttgaatagaagtctcttgctttagtgcttgagca 33377963  T
Q  131 ttagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatact 209  Q
    |  |||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||| || ||||||||||| ||   ||||||||||||||    
T  33377962 taggaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcaatt---tgaagtctcatact 33377886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 29 - 132
Target Start/End: Original strand, 39532174 - 39532277
Alignment:
Q  29 attgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttc-aagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttga 127  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    |||||||||| ||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||    
T  39532174 attgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaac-attttctctgtatctttgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttga 39532272  T
Q  128 gcatt 132  Q
    |||||    
T  39532273 gcatt 39532277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 130 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 23508926 - 23508816
Alignment:
Q  130 attagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatactttgatagtattgagcattt 228  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| |||||||||||| | |||||||||||||| ||    
T  23508926 attagaagtctcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcatac-tagatagtattgagcagtt 23508830  T
Q  229 gtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||| ||||||    
T  23508829 gtaatctgtgtgat 23508816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 130 - 242
Target Start/End: Original strand, 16819825 - 16819935
Alignment:
Q  130 attagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatactttgatagtattgagcattt 228  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| |||||||||||| | | |||||||||||| ||    
T  16819825 attagaagtctcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgggaagtctcatac-tagttagtattgagcagtt 16819921  T
Q  229 gtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||| ||||||    
T  16819922 gtaatctgtgtgat 16819935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 14 - 234
Target Start/End: Original strand, 9751982 - 9752205
Alignment:
Q  14 tagagtctttat-tgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtc 109  Q
    |||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||  |||| || |||||||  |||||||||    
T  9751982 tagagtctttatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaatctcaaacatttttcattgtaattctgtttgaatttagaagtc 9752081  T
Q  110 tcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgct-tagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatac 208  Q
    ||||||    ||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||||||| ||| | |||||||   |||||||||||| ||   |||||||||||||    
T  9752082 tcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttgatcttgttcttgagcataggatgtctcttgcagttgtgcttgagcaatt---tgaagtctcatac 9752178  T
Q  209 tttg-atagtattgagcatttgtaatc 234  Q
    |  |  |||||||||||||||||||||    
T  9752179 taagtttagtattgagcatttgtaatc 9752205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 9 - 161
Target Start/End: Original strand, 14711159 - 14711315
Alignment:
Q  9 aagtctagagtcttt--attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattaga 105  Q
    |||||||||||||||  |||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||||||||    
T  14711159 aagtctagagtctttcaattgcattgttttgtgaacaccactgatagtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgattaga 14711258  T
Q  106 agtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttg-cttagtgcttgagcatt 161  Q
    |||||||||| |  |||||||||||   ||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  14711259 agtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcatt 14711315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 25 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 18394198 - 18394034
Alignment:
Q  25 ttgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgct 124  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | || |  |||  |||||||| || |||||||||||  |  |||||    
T  18394198 ttgttttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaaccaaacttattttttcgta-atttgtttgttttgaagtctcttgtttttgtgct 18394100  T
Q  125 tgagcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca 189  Q
    ||||||| |||| ||| ||||||  ||||||||| ||| |||| ||||||| ||||| ||||||||    
T  18394099 tgagcataagaaatctgttgcttgtgtgcttgagtatttgaagtctcttgcttgtgttcttgagca 18394034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 30 - 193
Target Start/End: Original strand, 41115216 - 41115381
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||| |||| || ||||||| ||||||||||||||    |||||||||    
T  41115216 ttgtattgtgaacaccactgattgtacatcaagtgttcaacctcaaacatatttctttgtaattctgtttgaatagaagtctcttgcagttgtgcttgag 41115315  T
Q  129 cattagaagtctcttg-cttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttt 193  Q
    ||| ||||||||||||  ||||| ||| ||||| ||||  |||||||   |||||||||| |||||    
T  41115316 cataagaagtctcttgatttagttcttaagcataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtagttt 41115381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 30 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 16939681 - 16939534
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  | ||||||||||||| |  |||||||    
T  16939681 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaattcagaagtctcttgcatttgtgcttg 16939582  T
Q  127 agcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttg 173  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||||| | |||| ||||||    
T  16939581 agcaatagaagtctcttgcatttgtgcttgagcaatagaagtctcttg 16939534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 14 - 189
Target Start/End: Original strand, 17526825 - 17527000
Alignment:
Q  14 tagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctctt 113  Q
    ||||||||  ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||| ||||  |||||||| |||||||||| ||    
T  17526825 tagagtctgaattgttttgtattatgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaaccaaactgaattctttgta-atttgtttgtttagaagtctttt 17526923  T
Q  114 gcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca 189  Q
    || |  ||||||||| ||  ||| | ||| | ||  ||||||||| ||| |||| ||||||| ||| ||||||||||    
T  17526924 gcttttgtgcttgagaatacgaaatatctagtttgtgtgcttgagtatttgaagtctcttgcttgtatgcttgagca 17527000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 130 - 242
Target Start/End: Original strand, 14711253 - 14711365
Alignment:
Q  130 attagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatactttg-atagtattgagcatt 227  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||| || |||||||||||  ||||||||||||||||||  |  |||||||||||| |    
T  14711253 attagaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttgagca--tttgtgaagtctcatactaggtgtagtattgagcagt 14711350  T
Q  228 tgtaatctttgtgat 242  Q
    |||||||| ||||||    
T  14711351 tgtaatctgtgtgat 14711365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 130 - 242
Target Start/End: Original strand, 14778917 - 14779029
Alignment:
Q  130 attagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatactttg-atagtattgagcatt 227  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||| || |||||||||||  ||||||||||||||||||  |  |||||||||||| |    
T  14778917 attagaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttgagca--tttgtgaagtctcatactaggtgtagtattgagcagt 14779014  T
Q  228 tgtaatctttgtgat 242  Q
    |||||||| ||||||    
T  14779015 tgtaatctgtgtgat 14779029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Original strand, 17788498 - 17788613
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  | |||| |||| || ||||||| ||||||||||||||    |||||||||    
T  17788498 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaatctcaaacatatttctttgtaattctgtttgaatagaagtctcttgcagttgtgcttgag 17788597  T
Q  129 cattagaagtctcttg 144  Q
    ||| |||| |||||||    
T  17788598 cataagaattctcttg 17788613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 30 - 193
Target Start/End: Original strand, 19889443 - 19889608
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag--tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttga 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||    |||| |||| || |||||||||||||||||||||| |  ||||||||    
T  19889443 ttgtattgtgaacaccactgattgtatgtcaagtgttcaaacctcaaacatt-ttctgtgtaattctgtttgattagaagtctcttgcttttgtgcttga 19889541  T
Q  128 gcattagaagtctcttg-cttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttt 193  Q
    ||||  |||| |||||| ||| |||||||||||| ||||  ||||||  | |||||||||| |||||    
T  19889542 gcataggaagactcttgtctttgtgcttgagcataggaaacctcttgattttgtgcttgagtagttt 19889608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 23750175 - 23750060
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| ||||||||||||||   ||||||||||    
T  23750175 ttgtattgtgatcaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatagaagtctcttgcagtcgtgcttgag 23750076  T
Q  129 cattagaagtctcttg 144  Q
    ||| ||||||||||||    
T  23750075 cataagaagtctcttg 23750060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Original strand, 3105879 - 3105995
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttga 127  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  | ||||||||||||| |  ||||||||    
T  3105879 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcatttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaattcagaagtctcttgcatttgtgcttga 3105978  T
Q  128 gcattagaagtctcttg 144  Q
    ||| |||||||||||||    
T  3105979 gcaatagaagtctcttg 3105995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 25 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 7222165 - 7222001
Alignment:
Q  25 ttgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgct 124  Q
    |||| |||||||  |||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||| | |||| ||||  |||||||| |||||| |||||||| |  |||||    
T  7222165 ttgttttgtattatgaacaccagtgattgcatatcaagtgttcaaataaaacttatttctgtgta-atttgtttgtttagaaatctcttgcttttgtgct 7222067  T
Q  125 tgagcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca 189  Q
    |||||||  ||| ||||||||||  |||||||||  || |||| ||||||| | ||||||||||||    
T  7222066 tgagcataggaaatctcttgcttgtgtgcttgagtgtttgaagtctcttgcttatgtgcttgagca 7222001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 30 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 13890482 - 13890317
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgtt-caagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||  | |||| |||| || |||||| ||||||| ||||||| |  |||||||||    
T  13890482 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttccacctcaaacatatttctgtgtaattgtgtttgtttagaagactcttgcttttgtgcttgag 13890383  T
Q  129 cattagaagtctcttg-cttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttt 193  Q
    |||  |||| || |||  || |||||||||||| ||||  ||||||| | |||||||||| |||||    
T  13890382 cataggaagactattgtgtttgtgcttgagcataggaaacctcttgcttttgtgcttgagtagttt 13890317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 30 - 173
Target Start/End: Original strand, 14154455 - 14154601
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctc--tgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgct 124  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||   ||| ||  |||| || |||||||  ||||||||||||||| |  |||||    
T  14154455 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaac---attttccttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcatttgtgct 14154551  T
Q  125 tgagcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttg 173  Q
    |||||||||||||||||||| ||  || ||||||||| ||||| ||||||    
T  14154552 tgagcattagaagtctcttgattgtgttcttgagcataggaagtctcttg 14154601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 13 - 161
Target Start/End: Original strand, 14778827 - 14778979
Alignment:
Q  13 ctagagtcttt--attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtc 109  Q
    |||||||||||  |||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||||||||||||    
T  14778827 ctagagtctttcaattgcattgttttgtgaacaccactgatagtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgattagaagtc 14778926  T
Q  110 tcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttg-cttagtgcttgagcatt 161  Q
    |||||| |  |||||||||||   ||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  14778927 tcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcatt 14778979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 30 - 193
Target Start/End: Original strand, 17057573 - 17057737
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| || ||||||||||| |  |||||||||    
T  17057573 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaac-attttctttgtaattctgtttgaataaaagtctcttgcttttgtgcttgag 17057671  T
Q  129 cattagaagtctcttg-cttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttt 193  Q
    |||  ||||||| |||  || |||||||||||| ||||  ||||||| | |||||||||| |||||    
T  17057672 catatgaagtcttttgtgtttgtgcttgagcataggaaacctcttgcttttgtgcttgagtagttt 17057737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 39 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 23123163 - 23123055
Alignment:
Q  39 gaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattaga 135  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  ||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  23123163 gaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacatttttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgccattgtgcttgagcattaga 23123064  T
Q  136 agtctcttg 144  Q
    |||||||||    
T  23123063 agtctcttg 23123055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 24 - 161
Target Start/End: Original strand, 36210508 - 36210647
Alignment:
Q  24 attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtg 122  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| |||||||||||||| |  |||    
T  36210508 attgcattgtattgtgaacaccactgattgtatattaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttgctttagtg 36210607  T
Q  123 cttgagcattagaagtctcttg-cttagtgcttgagcatt 161  Q
    ||||||||   ||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  36210608 cttgagcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcatt 36210647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 29121016 - 29120900
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||   ||||||||    
T  29121016 ttgtactgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttct-tgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagtcgtgcttg 29120918  T
Q  127 agcattagaagtctcttg 144  Q
    ||||||||||||||||||    
T  29120917 agcattagaagtctcttg 29120900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 40860322 - 40860205
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || || ||||  | |||||||||||||    |||||||    
T  40860322 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacgtcaaacatttttctttgtaattctgattgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttg 40860223  T
Q  127 agcattagaagtctcttg 144  Q
    ||||||||||||||||||    
T  40860222 agcattagaagtctcttg 40860205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 197 - 242
Target Start/End: Original strand, 8183486 - 8183531
Alignment:
Q  197 gaagtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8183486 gaagtctcatacttagatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 8183531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 30 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 13693459 - 13693302
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgagc 129  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||  | ||||| |  ||||||| |||||||||||| || |  ||||||||||    
T  13693459 ttgtattgcgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaaccaaa--catctttctgtgtaattgtttgtttagaagtctctagcttttgtgcttgagc 13693362  T
Q  130 attagaagtctcttgctta-gtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca 189  Q
    ||   || ||||||||||| ||| ||||| ||| |||| ||||||| |||||| |||||||    
T  13693361 atacaaaatctcttgcttatgtg-ttgagtatttgaagtctcttgcttgtgtgtttgagca 13693302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 130 - 209
Target Start/End: Original strand, 17994267 - 17994345
Alignment:
Q  130 attagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatact 209  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| | || |||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  17994267 attagaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttacctgcgtgcttgagca--tttgtgaagtctcatact 17994345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 30 - 143
Target Start/End: Original strand, 37986070 - 37986186
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    || | |||| ||||||||||  |||||||||||||||    || ||||    
T  37986070 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttttttgtaattttgtttgaatttagaagtctcttgcagttgtacttg 37986169  T
Q  127 agcattagaagtctctt 143  Q
    |||||||||||||||||    
T  37986170 agcattagaagtctctt 37986186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Original strand, 12811635 - 12811751
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttg-attagaagtctcttgcctgcgtgcttga 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||  |||| || | |||| ||||||||||||||||    ||||||||    
T  12811635 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaatctcaaacatttttcgttgtaattctatttgaattagaagtctcttgcaattgtgcttga 12811734  T
Q  128 gcattagaagtctcttg 144  Q
    |||||||||||||||||    
T  12811735 gcattagaagtctcttg 12811751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 18473682 - 18473522
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgagc 129  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |    |||| |||| |||| |||| | | ||||||||||| |  ||||||||||    
T  18473682 ttgtagtgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaaccaaccatctttctatgtaattttatttgttcataagtctcttgcttttgtgcttgagc 18473583  T
Q  130 attagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca 189  Q
    ||  ||| ||||||||||  ||| ||||| ||| |||| ||||||| ||| ||||||||||    
T  18473582 ataggaaatctcttgcttgtgtggttgagtatttgaagtctcttgcttgtatgcttgagca 18473522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 55731497 - 55731335
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttc-aagtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||   ||||| |||| || |||||||  | ||||||||||||| |  |||||||    
T  55731497 ttgtattgtgaacaccactaattgtatatcaagtgttcaaactcaaac-atattctttgtaattatgtttgaattcagaagtctcttgcatttgtgcttg 55731399  T
Q  127 agcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca 189  Q
    |||| ||||||||||||| ||  || |  |||||| ||||| ||||||| | ||||||||||||    
T  55731398 agcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcatttgtgcttgagca 55731335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 56034223 - 56034107
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttg-attagaagtctcttgcctgcgtgcttga 127  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||| ||||||||||||||||    ||||||||    
T  56034223 ttgtattgtgaataccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcaattgtgcttga 56034124  T
Q  128 gcattagaagtctcttg 144  Q
    ||||| |||||||||||    
T  56034123 gcatttgaagtctcttg 56034107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 6641336 - 6641297
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6641336 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 6641297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 191 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 10290345 - 10290294
Alignment:
Q  191 ttttgtgaagtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10290345 ttttgagaagtctcatacttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgat 10290294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Original strand, 15014845 - 15014960
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||    |||| |||| || ||||| | ||||||||||||||    |||||||||    
T  15014845 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgtttaacctcaaacaattttctttgtaattctgtttcaatagaagtctcttgcagttgtgcttgag 15014944  T
Q  129 cattagaagtctcttg 144  Q
    ||| ||||||||||||    
T  15014945 cataagaagtctcttg 15014960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 48 - 142
Target Start/End: Original strand, 18775816 - 18775911
Alignment:
Q  48 tgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctct 142  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||| ||| |||||||||    
T  18775816 tgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacaatcttctgtgtaattctgtttgattagaagtctctcgcccgagtgcttgagtattggaagtctct 18775911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 55379961 - 55379847
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||  |||| || ||||||| ||||||||||||||    |||||||||    
T  55379961 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttccgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttgcagttgtgcttgag 55379862  T
Q  129 cattagaagtctcttg 144  Q
    || |||||||||||||    
T  55379861 ca-tagaagtctcttg 55379847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 16853155 - 16853039
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||   ||||| |||| || |||||||  | ||||||||||||| |  |||||||    
T  16853155 ttgtattgtgaacaccattgattgtatatcaagtgttcaacctcaaac-atattctttgtacttctgtttgaagtgagaagtctcttgcatttgtgcttg 16853057  T
Q  127 agcattagaagtctcttg 144  Q
    |||| |||||||||||||    
T  16853056 agcaatagaagtctcttg 16853039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 17540051 - 17539965
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgc 115  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||||  | |||| |||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  17540051 ttgtattgtgaacatcactgattatatatcaagtgttcaacctcaaacatatttctttgtaattttgtttgaatagaagtctcttgc 17539965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Original strand, 17701215 - 17701332
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||  |||| || |||||||  |||||||||||||||    |||||||    
T  17701215 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttcattgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttgtgcttg 17701314  T
Q  127 agcattagaagtctcttg 144  Q
    |||| |||||||||||||    
T  17701315 agcaatagaagtctcttg 17701332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 242
Target Start/End: Original strand, 36210587 - 36210697
Alignment:
Q  132 tagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatactttg-atagtattgagcatttg 229  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||| || |||||||||||  |||||||| |||||||||  |  |||| ||||||| |||    
T  36210587 tagaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttgagca--tttgtgaattctcatactaggtgtagtcttgagcagttg 36210684  T
Q  230 taatctttgtgat 242  Q
    |||||| ||||||    
T  36210685 taatctgtgtgat 36210697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 24 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 1674520 - 1674476
Alignment:
Q  24 attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttca 68  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1674520 attgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttca 1674476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Original strand, 14605364 - 14605480
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttg-attagaagtctcttgcctgcgtgcttga 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||  || |||||| |||||||||||||||     ||||||||    
T  14605364 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctgtgtcattctgtttgaattagaagtctcttgtagttgtgcttga 14605463  T
Q  128 gcattagaagtctcttg 144  Q
    ||||| |||||||||||    
T  14605464 gcatttgaagtctcttg 14605480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Original strand, 37436000 - 37436115
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga-ttagaagtctcttgcctgcgtgcttga 127  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| |||||||||||||||    ||||||||    
T  37436000 ttgtatcgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgagttagaagtctcttgcagttgtgcttga 37436099  T
Q  128 gcattagaagtctcttg 144  Q
    ||| |||||||||||||    
T  37436100 gca-tagaagtctcttg 37436115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 3395241 - 3395202
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3395241 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 3395202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 144
Target Start/End: Original strand, 3500111 - 3500229
Alignment:
Q  29 attgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgctt 125  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||  |||| || |||||||  |||||||||||||||    ||||||    
T  3500111 attgtattgtaaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttcattgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttgtgctt 3500210  T
Q  126 gagcattagaagtctcttg 144  Q
    ||||| |||||||||||||    
T  3500211 gagcaatagaagtctcttg 3500229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 6517137 - 6517098
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6517137 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 6517098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 8105289 - 8105250
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8105289 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 8105250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 242
Target Start/End: Original strand, 8997740 - 8997827
Alignment:
Q  152 cttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| |||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  8997740 cttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcgtacta-gatagtattgagcaattgtaatctgtgtgat 8997827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 11900842 - 11900803
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11900842 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 11900803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 11915353 - 11915242
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||  ||||||  | |||| |||| || ||||||| ||||||||||||||    |||||||||    
T  11915353 ttgtattgtgaccaccactggttgtatatcaagtgttcaacctcaaacaaatttctttgtaattctgtttgaatagaagtctcttgcagttgtgcttgag 11915254  T
Q  129 cattagaagtct 140  Q
    ||| | ||||||    
T  11915253 cataacaagtct 11915242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 17399134 - 17399173
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17399134 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 17399173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 130 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 18773637 - 18773578
Alignment:
Q  130 attagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca 189  Q
    ||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||    
T  18773637 attagaagtctattgatttgtgcttgagcataggaagtctcttgtgtgtgtgcttgagca 18773578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 19884353 - 19884314
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19884353 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 19884314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 21350659 - 21350698
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21350659 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 21350698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 29681005 - 29681044
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29681005 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 29681044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 55 - 189
Target Start/End: Original strand, 32491310 - 32491444
Alignment:
Q  55 atatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgctta-gtgct 153  Q
    |||||||||||||||   ||||| | |||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||  |  ||| ||||||||  ||| ||||||||||| | |||    
T  32491310 atatcaagtgttcaaactaaacttatttctttgtaattt-gtttgtttagaagtctcttgtttttgtgtttgagcataggaaatctcttgcttatgagct 32491408  T
Q  154 tgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca 189  Q
    |||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||    
T  32491409 tgagtatttgaagtctcttgcttgtgtgcttgagca 32491444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #130
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 36470480 - 36470441
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36470480 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 36470441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #131
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 38513529 - 38513490
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38513529 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 38513490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #132
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 54679579 - 54679540
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54679579 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 54679540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #133
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 10072584 - 10072468
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  | |||||||||||||    |||||||    
T  10072584 ttgtattgtgaacatcactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttct-tgtaattctgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttg 10072486  T
Q  127 agcattagaagtctcttg 144  Q
    ||||||||||||||||||    
T  10072485 agcattagaagtctcttg 10072468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #134
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Original strand, 15475603 - 15475720
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||    |||  |||| ||||||||||  |||||||||||||||    |||||||    
T  15475603 ttgtattatgaacaccactgattgtatatcaagtgtttaatctcaaacatttttcattgtaattttgtttgaatttagaagtctcttgcagttgtgcttg 15475702  T
Q  127 agcattagaagtctcttg 144  Q
    |||| |||||||||||||    
T  15475703 agcaatagaagtctcttg 15475720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #135
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 22190497 - 22190380
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  | |||||||||||||    |||||||    
T  22190497 ttgttttgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttg 22190398  T
Q  127 agcattagaagtctcttg 144  Q
    |||| |||||||||||||    
T  22190397 agcaatagaagtctcttg 22190380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #136
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 30 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 45833036 - 45832998
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttca 68  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45833036 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttca 45832998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #137
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 105 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 9266854 - 9266769
Alignment:
Q  105 aagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca 189  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||||| |||| ||| ||||||  ||||||||||||||    
T  9266854 aagtctcttgcttttgtgcttgagcatatgaagtctcttgcttgtgtgcttgagtattgaaagtctcttgtatgtgtgcttgagca 9266769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #138
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 94 - 193
Target Start/End: Original strand, 16325024 - 16325124
Alignment:
Q  94 tgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttg-cttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagtt 192  Q
    ||||||||||||||||| |||| |  |||||||||||| |||||  |||||  || |||||||||||| ||||  ||||||| | |||||||||| ||||    
T  16325024 tgtttgattagaagtctattgcttttgtgcttgagcataagaagaatcttgtgtttgtgcttgagcataggaaacctcttgcttttgtgcttgagtagtt 16325123  T
Q  193 t 193  Q
    |    
T  16325124 t 16325124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #139
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 16324974 - 16325013
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16324974 ttgtattgtgaacaccactaattgtatatcaagtgttcaa 16325013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #140
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 20977109 - 20977070
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20977109 ttgtattgtgaacaccactaattgtatatcaagtgttcaa 20977070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #141
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 22675982 - 22676021
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22675982 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaaatgttcaa 22676021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #142
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 25651555 - 25651594
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25651555 ttgtactgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 25651594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #143
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 39420195 - 39420234
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39420195 ttgtattgttaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 39420234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #144
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 56533520 - 56533559
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  56533520 ttgtattgtgaacaccactaattgtatatcaagtgttcaa 56533559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #145
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 1671966 - 1671908
Alignment:
Q  132 tagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca 189  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |  |||||||||||    
T  1671966 tagaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgctttagtgcttgagca 1671908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #146
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 15135372 - 15135342
Alignment:
Q  39 gaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15135372 gaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 15135342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #147
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 134 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 24619231 - 24619175
Alignment:
Q  134 gaagtctcttgctta-gtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca 189  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  24619231 gaagtctcttgcttttgtgcttgagcatttaaagtctcttgcttgtgtgcttgagca 24619175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 183)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Original strand, 10754957 - 10755197
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10754957 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattaagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 10755056  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10755057 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagttcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcgtgagcagttttgtgaagt 10755156  T
Q  202 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10755157 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 10755197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Original strand, 40390822 - 40391062
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40390822 aaattcaaagtctagagtctttactgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaactcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 40390921  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40390922 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 40391021  T
Q  202 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40391022 ctcatacttagatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 40391062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Original strand, 40401484 - 40401724
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40401484 aaattcaaagtctagagtctttactgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaactcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 40401583  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40401584 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 40401683  T
Q  202 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40401684 ctcatacttagatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 40401724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 27603213 - 27602973
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27603213 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 27603114  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 201  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27603113 cagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 27603014  T
Q  202 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27603013 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 27602973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Original strand, 34772375 - 34772615
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34772375 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 34772474  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 201  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34772475 cagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 34772574  T
Q  202 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34772575 ctcatacttagaaagtattgagcatttgtaatttttgtgat 34772615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Original strand, 34783320 - 34783560
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34783320 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 34783419  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 201  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34783420 cagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 34783519  T
Q  202 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34783520 ctcatacttagaaagtattgagcatttgtaatttttgtgat 34783560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 5290371 - 5290130
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5290371 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 5290272  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca-gttttgtgaag 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  5290271 cagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattttttgtgaag 5290172  T
Q  201 tctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5290171 tctcatacttagaaagtattgagcatttgtaatctttgtgat 5290130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 5300942 - 5300701
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5300942 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 5300843  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca-gttttgtgaag 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  5300842 cagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattttttgtgaag 5300743  T
Q  201 tctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5300742 tctcatacttagaaagtattgagcatttgtaatctttgtgat 5300701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 30069699 - 30069458
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30069699 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 30069600  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca-gttttgtgaag 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  30069599 cagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcgtgagcattttttgtgaag 30069500  T
Q  201 tctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30069499 tctcatacttagaaagtattgagcatttgtaatctttgtgat 30069458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Original strand, 39352953 - 39353193
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39352953 aaattcaaagtctagagtctttactgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaactcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 39353052  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  39353053 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 39353152  T
Q  202 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39353153 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 39353193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Original strand, 39364946 - 39365186
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39364946 aaattcaaagtctagagtctttactgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaactcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 39365045  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  39365046 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 39365145  T
Q  202 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39365146 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 39365186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 15993124 - 15992884
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15993124 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 15993025  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15993024 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 15992925  T
Q  202 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15992924 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 15992884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 16003686 - 16003446
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16003686 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 16003587  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16003586 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 16003487  T
Q  202 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16003486 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 16003446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Original strand, 22559902 - 22560142
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22559902 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctttgtatttttgtttgat 22560001  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 201  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22560002 cagaagtctcttgcctgtgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 22560101  T
Q  202 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22560102 ctcatacttagaaagtattgagcatttgtaatctttatgat 22560142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 27622562 - 27622322
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27622562 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatataaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 27622463  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 201  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  27622462 cagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttatgaagt 27622363  T
Q  202 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27622362 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 27622322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 14557812 - 14557570
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14557812 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 14557713  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca--gttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  14557712 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 14557613  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14557612 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 14557570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 14568449 - 14568207
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14568449 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 14568350  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca--gttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  14568349 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 14568250  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14568249 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 14568207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Original strand, 6131256 - 6131496
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6131256 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 6131355  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6131356 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 6131455  T
Q  202 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6131456 ctcttacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 6131496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Original strand, 9347007 - 9347247
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9347007 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtattgttgtttgat 9347106  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9347107 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 9347206  T
Q  202 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9347207 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 9347247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Original strand, 23362576 - 23362816
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23362576 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctatatttttgtttgat 23362675  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23362676 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 23362775  T
Q  202 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23362776 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 23362816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 2 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 9377257 - 9377021
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9377257 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 9377158  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca--gttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  9377157 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 9377058  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctt 236  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  9377057 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatctt 9377021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 2 - 236
Target Start/End: Original strand, 14041062 - 14041298
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14041062 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 14041161  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca--gttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  14041162 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 14041261  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctt 236  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  14041262 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatctt 14041298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 2 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 14446796 - 14446560
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14446796 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 14446697  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca--gttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  14446696 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 14446597  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctt 236  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  14446596 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatctt 14446560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 2 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 14457408 - 14457172
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14457408 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 14457309  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca--gttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  14457308 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 14457209  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctt 236  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  14457208 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatctt 14457172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 2 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 15693827 - 15693591
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15693827 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 15693728  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca--gttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  15693727 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 15693628  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctt 236  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  15693627 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatctt 15693591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 2 - 236
Target Start/End: Original strand, 15740433 - 15740669
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15740433 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 15740532  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca--gttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  15740533 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 15740632  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctt 236  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  15740633 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatctt 15740669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 2 - 236
Target Start/End: Original strand, 15769593 - 15769829
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15769593 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 15769692  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca--gttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  15769693 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 15769792  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctt 236  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  15769793 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatctt 15769829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 2 - 236
Target Start/End: Original strand, 17607524 - 17607760
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17607524 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 17607623  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca--gttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  17607624 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 17607723  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctt 236  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  17607724 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatctt 17607760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 2 - 236
Target Start/End: Original strand, 17618139 - 17618375
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17618139 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 17618238  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca--gttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  17618239 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 17618338  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctt 236  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  17618339 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatctt 17618375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 2 - 236
Target Start/End: Original strand, 24567554 - 24567790
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24567554 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 24567653  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca--gttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  24567654 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 24567753  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctt 236  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  24567754 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatctt 24567790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 2 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 24816681 - 24816445
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24816681 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 24816582  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca--gttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  24816581 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 24816482  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctt 236  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  24816481 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatctt 24816445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 2 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 24827269 - 24827033
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24827269 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 24827170  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca--gttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  24827169 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 24827070  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctt 236  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  24827069 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatctt 24827033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 2 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 27042007 - 27041771
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27042007 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 27041908  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca--gttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  27041907 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 27041808  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctt 236  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  27041807 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatctt 27041771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 2 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 27052631 - 27052395
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27052631 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 27052532  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca--gttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  27052531 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 27052432  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctt 236  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  27052431 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatctt 27052395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 2 - 236
Target Start/End: Original strand, 27460626 - 27460862
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27460626 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 27460725  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca--gttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  27460726 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 27460825  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctt 236  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  27460826 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatctt 27460862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 2 - 236
Target Start/End: Original strand, 27471025 - 27471261
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27471025 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 27471124  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca--gttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  27471125 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 27471224  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctt 236  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  27471225 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatctt 27471261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 2 - 236
Target Start/End: Original strand, 31348998 - 31349234
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31348998 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 31349097  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca--gttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  31349098 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 31349197  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctt 236  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  31349198 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatctt 31349234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 2 - 236
Target Start/End: Original strand, 31359612 - 31359848
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31359612 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 31359711  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca--gttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  31359712 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 31359811  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctt 236  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  31359812 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatctt 31359848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 2 - 236
Target Start/End: Original strand, 35215971 - 35216207
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35215971 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 35216070  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca--gttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  35216071 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 35216170  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctt 236  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  35216171 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatctt 35216207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 2 - 236
Target Start/End: Original strand, 35226555 - 35226791
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35226555 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 35226654  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca--gttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  35226655 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 35226754  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctt 236  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  35226755 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatctt 35226791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 36582353 - 36582112
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtattttt-gtttga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36582353 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtattttttgtttga 36582254  T
Q  101 ttagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36582253 ttagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaag 36582154  T
Q  201 tctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36582153 tctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 36582112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 36592908 - 36592667
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtattttt-gtttga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36592908 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtattttttgtttga 36592809  T
Q  101 ttagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36592808 ttagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaag 36592709  T
Q  201 tctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36592708 tctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 36592667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Original strand, 9336420 - 9336660
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9336420 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtattgttgtttgat 9336519  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 201  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9336520 tagaagtatcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 9336619  T
Q  202 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9336620 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 9336660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Original strand, 31419128 - 31419368
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  31419128 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttaattctttgtatttttgtttgat 31419227  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 201  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  31419228 cagaagtctcttgcttgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatctttgtgaagt 31419327  T
Q  202 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  31419328 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatccttgtgat 31419368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Original strand, 23296742 - 23296984
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23296742 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 23296841  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagc--agttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  23296842 tagaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaa 23296941  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23296942 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 23296984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Original strand, 23307310 - 23307552
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23307310 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 23307409  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagc--agttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  23307410 tagaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaa 23307509  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23307510 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 23307552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Original strand, 23707907 - 23708149
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23707907 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 23708006  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagc--agttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  23708007 tagaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaa 23708106  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23708107 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 23708149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 30227291 - 30227049
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30227291 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 30227192  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagc--agttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  30227191 tagaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaa 30227092  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30227091 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 30227049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 30237818 - 30237576
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30237818 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 30237719  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagc--agttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  30237718 tagaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaa 30237619  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30237618 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 30237576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 39490745 - 39490503
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39490745 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 39490646  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagc--agttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  39490645 tagaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaa 39490546  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39490545 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 39490503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 39501935 - 39501693
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39501935 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 39501836  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagc--agttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  39501835 tagaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaa 39501736  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39501735 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 39501693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 40513784 - 40513542
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40513784 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 40513685  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagc--agttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  40513684 tagaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaa 40513585  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40513584 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 40513542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 2 - 236
Target Start/End: Original strand, 22146988 - 22147222
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22146988 aaattcaaagtctagagtcttttctgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 22147087  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22147088 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 22147187  T
Q  202 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctt 236  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  22147188 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctt 22147222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 2 - 236
Target Start/End: Original strand, 22157571 - 22157805
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22157571 aaattcaaagtctagagtcttttctgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 22157670  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22157671 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 22157770  T
Q  202 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctt 236  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  22157771 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctt 22157805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 2 - 236
Target Start/End: Original strand, 14030509 - 14030745
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14030509 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 14030608  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca--gttttgtgaa 199  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  14030609 taaaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 14030708  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctt 236  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  14030709 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatctt 14030745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 2 - 236
Target Start/End: Original strand, 17719382 - 17719618
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17719382 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtactgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 17719481  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca--gttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  17719482 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 17719581  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctt 236  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  17719582 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatctt 17719618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 2 - 236
Target Start/End: Original strand, 17730034 - 17730270
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17730034 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtactgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 17730133  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca--gttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  17730134 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 17730233  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctt 236  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  17730234 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatctt 17730270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 2 - 236
Target Start/End: Original strand, 36688159 - 36688395
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36688159 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 36688258  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca--gttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||    
T  36688259 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgagtgtgcttgagcattgttttgtgaa 36688358  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctt 236  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  36688359 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatctt 36688395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 2 - 236
Target Start/End: Original strand, 36698725 - 36698961
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36698725 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 36698824  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca--gttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||    
T  36698825 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgagtgtgcttgagcattgttttgtgaa 36698924  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctt 236  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  36698925 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatctt 36698961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 2 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 37729047 - 37728811
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37729047 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 37728948  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagc--agttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  37728947 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaa 37728848  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctt 236  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  37728847 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctt 37728811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 2 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 37740363 - 37740127
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37740363 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 37740264  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagc--agttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  37740263 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaa 37740164  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctt 236  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  37740163 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctt 37740127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Original strand, 27204257 - 27204497
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27204257 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 27204356  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 201  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  27204357 tagaagtctcttgcatgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgtttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgtttgagcatttttgtgaagt 27204456  T
Q  202 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27204457 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 27204497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Original strand, 23697249 - 23697491
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23697249 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 23697348  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagc--agttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  23697349 tagaagtctctagcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcgtgagcatagttttgtgaa 23697448  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23697449 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 23697491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Original strand, 31833948 - 31834192
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31833948 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 31834047  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca----gttttgtg 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||    
T  31834048 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttttttgtg 31834147  T
Q  198 aagtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31834148 aagtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 31834192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Original strand, 31844426 - 31844670
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31844426 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 31844525  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca----gttttgtg 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||    
T  31844526 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttttttgtg 31844625  T
Q  198 aagtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31844626 aagtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 31844670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 33951595 - 33951353
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33951595 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 33951496  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagc--agttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||    
T  33951495 tagaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcttgtgtgcttgagcatagttttgtgaa 33951396  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33951395 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 33951353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Original strand, 42043249 - 42043491
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42043249 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcgattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 42043348  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagc--agttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  42043349 tagaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaa 42043448  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42043449 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 42043491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Original strand, 42053824 - 42054066
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42053824 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcgattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 42053923  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagc--agttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  42053924 tagaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaa 42054023  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42054024 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 42054066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 8 - 242
Target Start/End: Original strand, 20798167 - 20798401
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||    
T  20798167 aaagtctagagtctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttaattctttgtatttttgtttgatcagaag 20798266  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcata 207  Q
     |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20798267 cctcttgcctgtgtgcttgagcagtagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcata 20798366  T
Q  208 ctttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20798367 cttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgat 20798401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 2 - 236
Target Start/End: Original strand, 24808377 - 24808613
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24808377 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgcattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 24808476  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagc--agttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  24808477 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaa 24808576  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctt 236  Q
    |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||    
T  24808577 gtctcatactttaaaagtattgagcagttgtaatctt 24808613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Original strand, 22676581 - 22676824
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagt-caaactcaattctctgtatttttgtttga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22676581 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaatttcaaactcaattctctgtatttttgtttga 22676680  T
Q  101 ttagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagc--agttttgtga 198  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  22676681 ttagaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtga 22676780  T
Q  199 agtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22676781 agtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 22676824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Original strand, 22686472 - 22686715
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagt-caaactcaattctctgtatttttgtttga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22686472 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaatttcaaactcaattctctgtatttttgtttga 22686571  T
Q  101 ttagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagc--agttttgtga 198  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  22686572 ttagaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtga 22686671  T
Q  199 agtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22686672 agtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 22686715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 8 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 43043460 - 43043226
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||    
T  43043460 aaagtctagagtctttaacgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttaattccttgtatttttgtttgatcagaag 43043361  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcata 207  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  43043360 actcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttattgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcata 43043261  T
Q  208 ctttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43043260 cttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgat 43043226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Original strand, 6976273 - 6976516
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagt-caaactcaattctctgtatttttgtttga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6976273 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaatttcaaactcaattctctgtatctttgtttga 6976372  T
Q  101 ttagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagc--agttttgtga 198  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  6976373 ttagaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtga 6976472  T
Q  199 agtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6976473 agtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 6976516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Original strand, 6986763 - 6987006
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagt-caaactcaattctctgtatttttgtttga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6986763 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaatttcaaactcaattctctgtatctttgtttga 6986862  T
Q  101 ttagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagc--agttttgtga 198  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  6986863 ttagaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtga 6986962  T
Q  199 agtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6986963 agtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 6987006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Original strand, 31449019 - 31449259
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  31449019 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattatatatcaagtgttcaagtcaaacttaattctttgtatttttgtttgat 31449118  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 201  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  31449119 cagaagtctcttgcctgcgttcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtggttgagcatctttgtgaagt 31449218  T
Q  202 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||| || |||||||| || |||||||| |||||||    
T  31449219 ctcatacttagaaagtattgatcagttgtaatccttgtgat 31449259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 8 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 1121691 - 1121457
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||    
T  1121691 aaagtctagagtcttaattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttaattcattgtatttttgtttgatcagaag 1121592  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcata 207  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  1121591 cctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcata 1121492  T
Q  208 ctttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||| || ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1121491 cttagagagtattgagtatttgtaatctttgtgat 1121457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 8 - 242
Target Start/End: Original strand, 23406917 - 23407151
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||| | |||    
T  23406917 aaagtctagagtctttatcgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttatttcattgtatttttgtttgatcaaaag 23407016  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcata 207  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  23407017 actcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcata 23407116  T
Q  208 ctttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23407117 cttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgat 23407151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 8 - 242
Target Start/End: Original strand, 8522312 - 8522547
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||    
T  8522312 aaagtctagagtctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttaattcattgtatttttgtttgatcagaag 8522411  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca-gttttgtgaagtctcat 206  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  8522412 cctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttaatgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattttttgagaagtctcat 8522511  T
Q  207 actttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8522512 acttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgat 8522547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 8 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 1108933 - 1108699
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||    
T  1108933 aaagtctagagtcttaattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttaattcattgtatttttgtttgatcagaag 1108834  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcata 207  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  1108833 cctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagacttttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcata 1108734  T
Q  208 ctttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||| || ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1108733 cttagagagtattgagtatttgtaatctttgtgat 1108699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 8 - 238
Target Start/End: Original strand, 36084932 - 36085162
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||| |||||    
T  36084932 aaagtctagagtctttaacgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttatttcattgtatttttgtttgatcagaag 36085031  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcata 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  36085032 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtttcata 36085131  T
Q  208 ctttgatagtattgagcatttgtaatctttg 238  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  36085132 cttagagagtattgagcatttgtaatctttg 36085162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 23 - 242
Target Start/End: Original strand, 42395470 - 42395689
Alignment:
Q  23 tattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtg 122  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  42395470 tattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttaattcattgtatttttgtttgatcagaagcctcttgcctgcgtg 42395569  T
Q  123 cttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatactttgatagtattga 222  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| || ||||||||    
T  42395570 cttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatctttgagaagtctcatacttagagagtattga 42395669  T
Q  223 gcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  42395670 gcatttgtaatctttgtgat 42395689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 8 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 43621683 - 43621448
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||| |||||    
T  43621683 aaagtctagagtctttaacgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttatttcattgtatttttgtttgatcagaag 43621584  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcata 207  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  43621583 cctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcata 43621484  T
Q  208 ctttgatagtattgagca-tttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||| || ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  43621483 cttagagagtattgagcattttgtaatctttgtgat 43621448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 8 - 242
Target Start/End: Original strand, 36229210 - 36229444
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||| |||||    
T  36229210 aaagtctagagtttttaacgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttatttcattgtatttttgtttgatcagaag 36229309  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcata 207  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  36229310 cctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcatgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcata 36229409  T
Q  208 ctttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36229410 cttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgat 36229444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 7 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 17446486 - 17446251
Alignment:
Q  7 caaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtattttt-gtttgattaga 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||| |||||||||| ||||||| |||    
T  17446486 caaagtctagagtctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttccctgtattttttgtttgatcaga 17446387  T
Q  106 agtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctca 205  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  17446386 agactcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcctgtgtgcttgagca-ttttgagaagtctca 17446288  T
Q  206 tactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17446287 tacttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgat 17446251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 8 - 242
Target Start/End: Original strand, 19464442 - 19464677
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||| |||||    
T  19464442 aaagtctagagtctttatcgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttatttcattgtatttttgtttgatcagaag 19464541  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcata 207  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||    
T  19464542 actcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagtagtctcata 19464641  T
Q  208 ctttgatagtattgagca-tttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  19464642 cttagagagtattgagcattttgtaatcttcgtgat 19464677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 8 - 242
Target Start/End: Original strand, 34063092 - 34063326
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttt-tgtttgattagaa 106  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||| |||||||| ||||    
T  34063092 aaagtctagagtctttatcgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttatttcattgtattttttgtttgatcagaa 34063191  T
Q  107 gtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcat 206  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  34063192 gactcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcctgtgtgcttgagca-ttttgagaagtctcat 34063290  T
Q  207 actttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34063291 acttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgat 34063326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 8 - 242
Target Start/End: Original strand, 19478472 - 19478707
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||| |||||    
T  19478472 aaagtctagagtctttatcgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttatttcattgtatttttgtttgatcagaag 19478571  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcata 207  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||    
T  19478572 actcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagtagtctcata 19478671  T
Q  208 ctttgatagtattgagca-tttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||| || |||||||| || ||||||||||| |||||    
T  19478672 cttagagagtattgaacattttgtaatcttcgtgat 19478707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 8 - 242
Target Start/End: Original strand, 20552286 - 20552521
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||| |||||    
T  20552286 aaagtctagagtctttaacgtattttattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttatttcattgtatttttgtttgatcagaag 20552385  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcata 207  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  20552386 cctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtacttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcata 20552485  T
Q  208 ctttgatagtattgagca-tttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||| || ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20552486 cttagagagtattgagcattttgtaatctttgtgat 20552521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 8 - 242
Target Start/End: Original strand, 20562796 - 20563031
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||| |||||    
T  20562796 aaagtctagagtctttaacgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttatttcattgtatttttgtttgatcagaag 20562895  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcata 207  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  20562896 cctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtacttgagcattggaagactcttgcttgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcata 20562995  T
Q  208 ctttgatagtattgagca-tttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||| || ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20562996 cttagagagtattgagcattttgtaatctttgtgat 20563031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 8 - 242
Target Start/End: Original strand, 34052431 - 34052665
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttt-tgtttgattagaa 106  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||| |||||||| ||||    
T  34052431 aaagtctagagtctttatcgtattgtattgtgaacaccactaattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttatttcattgtattttttgtttgatcagaa 34052530  T
Q  107 gtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcat 206  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  34052531 gactcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcctgtgtgcttgagca-ttttgagaagtctcat 34052629  T
Q  207 actttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34052630 acttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgat 34052665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 7 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 17457102 - 17456867
Alignment:
Q  7 caaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtattttt-gtttgattaga 105  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | | | |||||||||| ||||||| |||    
T  17457102 caaagtctagagtatttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacatattcccctgtattttttgtttgatcaga 17457003  T
Q  106 agtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctca 205  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  17457002 agactcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttacttagtgcttgagcattggaagactcttgcctgtgtgcttgagca-ttttgagaagtctca 17456904  T
Q  206 tactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17456903 tacttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgat 17456867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 8 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 21702918 - 21702679
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgt-----attgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgatt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||  ||||||||||||||||     
T  21702918 aaagtctagagtctttattgtattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacatatttcattgtatttttgtttgatc 21702819  T
Q  103 agaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtc 202  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||    
T  21702818 agaagactcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcatgagcatttttgagaagtc 21702719  T
Q  203 tcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21702718 tcatacttaaagagtattgagcatttgtaatctttgtgat 21702679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 8 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 24925928 - 24925692
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||| |||||    
T  24925928 aaagtctagagtctctaacgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttatttcattgtatttttgtttgatcagaag 24925829  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca-gttttgtgaagtctcat 206  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||    
T  24925828 cctcttgcctgtgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatattttgagaaatctcat 24925729  T
Q  207 actttgatagtattgagca-tttgtaatctttgtgat 242  Q
    |||| || ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24925728 acttagagagtattgagcattttgtaatctttgtgat 24925692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 8 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 24983209 - 24982973
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||| |||||    
T  24983209 aaagtctagagtctctaacgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttatttcattgtatttttgtttgatcagaag 24983110  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca-gttttgtgaagtctcat 206  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  24983109 cctcttgcctgtgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatattttgagaagtctcat 24983010  T
Q  207 actttgatagtattgagca-tttgtaatctttgtgat 242  Q
     ||| || ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24983009 gcttagagagtattgagcattttgtaatctttgtgat 24982973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 36 - 242
Target Start/End: Original strand, 23392900 - 23393106
Alignment:
Q  36 tgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattaga 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23392900 tgagaacaccactgattgtatatcaagcgttcaagtcaaacttatttcattgtatttttgtttgatcagaagactcttgcctgcgtgcttgagcattaga 23392999  T
Q  136 agtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatct 235  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||    
T  23393000 agactcttgcttagtgcttgagcattggaagacttttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcaaacttagagagtattgagcatttgtaatct 23393099  T
Q  236 ttgtgat 242  Q
    |||||||    
T  23393100 ttgtgat 23393106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 8 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 21705765 - 21705541
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgt-----attgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgatt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||  ||||||||||||||||     
T  21705765 aaagtctagagtctttattgtattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacatatttcattgtatttttgtttgatc 21705666  T
Q  103 agaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtc 202  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||    
T  21705665 agaagactcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcatgagcatttttgagaagtc 21705566  T
Q  203 tcatactttgatagtattgagcatt 227  Q
    ||||||||  | |||||||||||||    
T  21705565 tcatacttaaagagtattgagcatt 21705541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 9 - 242
Target Start/End: Original strand, 37407119 - 37407352
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtatt-gagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaa 106  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    |||||||||||||||||||| |||||    
T  37407119 aagtctagagtctttattgcattatatttgtgaacaccactgattatatatcaagtgttcaaggtcaaacatt-ttctctgtatttttgtttgaatagaa 37407217  T
Q  107 gtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcat 206  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  37407218 gcctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcctgcgtgcttgagca-ttttgagaagtctcat 37407316  T
Q  207 actttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    |||| || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  37407317 acttagagagtattgaacatttgtaatctttgtgat 37407352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 9 - 238
Target Start/End: Original strand, 106592 - 106820
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttc-aagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  |||| ||||||| ||||||||||||||    
T  106592 aagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacac-tttctgtgtatttctgtttgattagaag 106690  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcat 206  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || ||||||||| |  |||| ||||||||||    
T  106691 cctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagaa--tttgagaagtctcat 106788  T
Q  207 actttgatagtattgagcatttgtaatctttg 238  Q
    |||  || ||||||||||||||||||||||||    
T  106789 actaagagagtattgagcatttgtaatctttg 106820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 9 - 238
Target Start/End: Original strand, 20625238 - 20625467
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttc-aagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  20625238 aagtctatagtctttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaac-attttctgtgtatttttgtttgaatagaag 20625336  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcat 206  Q
     |||| || ||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  20625337 cctctcgcatgcatgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagcctcttgcctgcgtgcttgagca-ttttgagaagtctcat 20625435  T
Q  207 actttgatagtattgagcatttgtaatctttg 238  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  20625436 acttagagagtattgagcatttgtaatctttg 20625467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 9 - 242
Target Start/End: Original strand, 20417376 - 20417607
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| |||||||||| ||||||    
T  20417376 aagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacatt-ttctgtgtaattttgtttgaatagaag 20417474  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcat 206  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||    
T  20417475 tctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcatgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcat 20417572  T
Q  207 actttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    || | || ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20417573 ac-tagagagtattgagcatttgtaatctgtgtgat 20417607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 2 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 7031921 - 7031762
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7031921 aaattcaaagtctagagtctttactgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaactcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 7031822  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcatt 161  Q
    ||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||| ||||||| |  |||||||||||||    
T  7031821 tagaagtctcttg-cttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatt 7031762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 9 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 32753733 - 32753502
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| |||||||||| ||||||    
T  32753733 aagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacatcactgattgtatatcaagtgttcaaaatcaaacatt-ttctgtgtaattttgtttgaatagaag 32753635  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcat 206  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||    
T  32753634 tctcttgcctacgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcat 32753537  T
Q  207 actttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    || | || |||||||||||| |||||||| ||||||    
T  32753536 ac-tagagagtattgagcatctgtaatctgtgtgat 32753502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 130 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 7031823 - 7031711
Alignment:
Q  130 attagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatactttgatagtattgagcatttg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7031823 attagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatacttagatagtattgagcatttg 7031724  T
Q  230 taatctttgtgat 242  Q
    |||||||||||||    
T  7031723 taatctttgtgat 7031711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 24 - 242
Target Start/End: Original strand, 20215591 - 20215810
Alignment:
Q  24 attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttc-aagtcaaactcaattctctgtat--ttttgtttgattagaagtctcttgcctgcg 120  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||| |||||||  || ||||||| || ||||||||||| |  |    
T  20215591 attgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaa--caattttctgtataattctgtttgaataaaagtctcttgctttag 20215688  T
Q  121 tgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatactttg-atagta 218  Q
    |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |  |||||    
T  20215689 tgcttgagcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgtgtgcttgagca--tttgtgaagtctcatactaggtgtagta 20215786  T
Q  219 ttgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||    
T  20215787 ttgagcagttgtaatctgtgtgat 20215810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 33 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 40228312 - 40228102
Alignment:
Q  33 tattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcat 131  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  40228312 tattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttgctttagtgcttgagcat 40228213  T
Q  132 tagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatactttg-atagtattgagcatttg 229  Q
      |||||||||||| ||||||||||||||  || || ||||||| || |||||||||||  ||||||||||||||||||  |  |||||||||||| |||    
T  40228212 aggaagtctcttgctttagtgcttgagcaaagggagtctcttgcctgcgtgcttgagca--tttgtgaagtctcatactaggtgtagtattgagcagttg 40228115  T
Q  230 taatctttgtgat 242  Q
    |||||| ||||||    
T  40228114 taatctgtgtgat 40228102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 9 - 142
Target Start/End: Original strand, 36096122 - 36096257
Alignment:
Q  9 aagtctagagtcttt-attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttc-aagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaa 106  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    |||| |||| ||||||||||||||||    
T  36096122 aagtctagagtcttttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacaattttctgtgtaattttgtttgattagaa 36096221  T
Q  107 gtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctct 142  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||  |||||||||    
T  36096222 gtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctct 36096257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 9 - 142
Target Start/End: Original strand, 36097579 - 36097714
Alignment:
Q  9 aagtctagagtcttt-attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttc-aagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaa 106  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    |||| |||| ||||||||||||||||    
T  36097579 aagtctagagtcttttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacaattttctgtgtaattttgtttgattagaa 36097678  T
Q  107 gtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctct 142  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||  |||||||||    
T  36097679 gtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctct 36097714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #109
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 29 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 23478032 - 23477819
Alignment:
Q  29 attgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttga 127  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||  |||| || ||||||| |||||||||||||| |  ||||||||    
T  23478032 attgtattctgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttcagtgtaattctgtttgaatagaagtctcttgctttagtgcttga 23477933  T
Q  128 gcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatactttg-atagtattgagca 225  Q
    ||||  |||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||| || ||||||||||| ||   ||||||||||||||  |  ||||||||||||    
T  23477932 gcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcaatt---tgaagtctcatactaggtgtagtattgagca 23477836  T
Q  226 tttgtaatctttgtgat 242  Q
     ||||||||| ||||||    
T  23477835 gttgtaatctgtgtgat 23477819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #110
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 9 - 142
Target Start/End: Original strand, 35543599 - 35543733
Alignment:
Q  9 aagtctagagtcttt-attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||| |||| || |||||||| |||||    
T  35543599 aagtctatagtcttttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacaattttctgtgtaattctgtttgatcagaag 35543698  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctct 142  Q
    |||||||| |  ||||||||||||| |||||||||    
T  35543699 tctcttgctttagtgcttgagcattggaagtctct 35543733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #111
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 9 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 13522872 - 13522737
Alignment:
Q  9 aagtctagagtcttt-attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttc-aagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaa 106  Q
    |||||| |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    |||| |||| || |||||||||||||    
T  13522872 aagtctggagtcttttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacaattttctgtgtaattctgtttgattagaa 13522773  T
Q  107 gtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctct 142  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| |||||||||    
T  13522772 gtctcttgctttagtgcttgagcattggaagtctct 13522737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #112
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 29 - 234
Target Start/End: Original strand, 25112357 - 25112562
Alignment:
Q  29 attgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttga 127  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| |||||||||||||| |  ||||||||    
T  25112357 attgtattgtgaacaccactgattgtatatcaggtgttcaaactcaaacaattttctatgtaattctgtttgaatagaagtctcttgctttagtgcttga 25112456  T
Q  128 gcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatactttg-atagtattgagca 225  Q
    ||||  |||||||||||| ||||||||||||||  |||||  |||||| || ||||||||||| ||   ||||||||||||||  |  ||||||||||||    
T  25112457 gcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtatcttgcctgcgtgcttgagcaatt---tgaagtctcatactaggtgtagtattgagca 25112553  T
Q  226 tttgtaatc 234  Q
     ||||||||    
T  25112554 gttgtaatc 25112562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #113
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 29 - 234
Target Start/End: Original strand, 25171448 - 25171653
Alignment:
Q  29 attgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttga 127  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| |||||||||||||| |  ||||||||    
T  25171448 attgtattgtgaacaccactgattgtatatcaggtgttcaaactcaaacaattttctatgtaattctgtttgaatagaagtctcttgctttagtgcttga 25171547  T
Q  128 gcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatactttg-atagtattgagca 225  Q
    ||||  |||||||||||| ||||||||||||||  |||||  |||||| || ||||||||||| ||   ||||||||||||||  |  ||||||||||||    
T  25171548 gcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtatcttgcctgcgtgcttgagcaatt---tgaagtctcatactaggtgtagtattgagca 25171644  T
Q  226 tttgtaatc 234  Q
     ||||||||    
T  25171645 gttgtaatc 25171653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #114
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 9 - 131
Target Start/End: Original strand, 20168537 - 20168661
Alignment:
Q  9 aagtctagagtcttt-attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttca-agtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaa 106  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    |||| |||| || |||||||||||||    
T  20168537 aagtctagagtcttttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcagagtcaaacaattttctgtgtaattctgtttgattagaa 20168636  T
Q  107 gtctcttgcctgcgtgcttgagcat 131  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||    
T  20168637 gtctcttgctttagtgcttgagcat 20168661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #115
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 31 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 32160404 - 32160201
Alignment:
Q  31 tgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgagc 129  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||    
T  32160404 tgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttgctttagtgcttgagc 32160305  T
Q  130 attagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatactttg-atagtattgagcatt 227  Q
    ||  ||||||||||||||  |||||||||||  ||||  ||||||| |||||||||||| | ||   ||||||||||||||  |  |||||||||||| |    
T  32160304 ataggaagtctcttgcttgtgtgcttgagcaaaggaaatctcttgcctgtgtgcttgagtaatt---tgaagtctcatactaggtgtagtattgagcagt 32160208  T
Q  228 tgtaatc 234  Q
    |||||||    
T  32160207 tgtaatc 32160201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #116
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 24 - 234
Target Start/End: Original strand, 11208484 - 11208693
Alignment:
Q  24 attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtat--ttttgtttgattagaagtctcttgcctgcg 120  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||| ||||||   || | ||||| |||||||||||||| |  |    
T  11208484 attgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaac--aattttctgtacaattctatttgaatagaagtctcttgctttag 11208581  T
Q  121 tgcttgagcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatact--ttgatagt 217  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| |  |||||  |||||| ||||||||||||||   || ||||||||||||||  ||| ||||    
T  11208582 tgcttgagcataagaagtctcttgcttgtgtgcttgagtaaaggaagtatcttgc-tgtgtgcttgagca---ttttgaagtctcatactagttg-tagt 11208676  T
Q  218 attgagcatttgtaatc 234  Q
    |||||||| ||||||||    
T  11208677 attgagcagttgtaatc 11208693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #117
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 9 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 13533599 - 13533474
Alignment:
Q  9 aagtctagagtcttt-attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaa 106  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||  || |||||||||||||    
T  13533599 aagtctagagtcttttattgcattgtattgtgaacactattgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacaattttctgtgttattctgtttgattagaa 13533500  T
Q  107 gtctcttgcctgcgtgcttgagcatt 132  Q
    |||||| |||||||||||||||||||    
T  13533499 gtctctcgcctgcgtgcttgagcatt 13533474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #118
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 24 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 1915079 - 1914940
Alignment:
Q  24 attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtg 122  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| |||||||||| |||||||||||||| |  |||    
T  1915079 attgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattttgtttgaatagaagtctcttgctttagtg 1914980  T
Q  123 cttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcatt 161  Q
    ||||||||   |||||||||||| |||||||| |||||||    
T  1914979 cttgagcaaaggaagtctcttgctttagtgctcgagcatt 1914940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #119
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 20550547 - 20550432
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||    |||||||||    
T  20550547 ttgtattgtgaacaccactgcttgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattttgtttgattagaagtctcttgcagttgtgcttgag 20550448  T
Q  129 cattagaagtctcttg 144  Q
    ||||||||||||||||    
T  20550447 cattagaagtctcttg 20550432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #120
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 130 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 13522779 - 13522669
Alignment:
Q  130 attagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatactttgatagtattgagcattt 228  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| |||||||||||| | |||||||||||||| ||    
T  13522779 attagaagtctcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgggaagtctcatac-tagatagtattgagcagtt 13522683  T
Q  229 gtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||| ||||||    
T  13522682 gtaatctgtgtgat 13522669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #121
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 132 - 242
Target Start/End: Original strand, 40033321 - 40033431
Alignment:
Q  132 tagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatactttg-atagtattgagcatttg 229  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| || |||||||||||  ||||||||||||||||||  |  |||||||||||| |||    
T  40033321 tagaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgcctgcgtgcttgagca--tttgtgaagtctcatactaggtgtagtattgagcagttg 40033418  T
Q  230 taatctttgtgat 242  Q
    |||||| ||||||    
T  40033419 taatctgtgtgat 40033431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #122
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 128 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 21420431 - 21420322
Alignment:
Q  128 gcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatactttgatagtattgagcat 226  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || || |||||||| ||  |||| |||||||||||||  || || |||||||||    
T  21420431 gcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgacca--tttgagaagtctcatactaagagagaattgagcat 21420334  T
Q  227 ttgtaatctttg 238  Q
    ||||||||||||    
T  21420333 ttgtaatctttg 21420322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #123
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Original strand, 643184 - 643299
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    |||| |||| || ||||||| ||||||||||||||    |||||||||    
T  643184 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaaatgttcaagctcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatagaagtctcttgcagttgtgcttgag 643283  T
Q  129 cattagaagtctcttg 144  Q
    ||| ||||||||||||    
T  643284 catgagaagtctcttg 643299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #124
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 130 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 13403817 - 13403705
Alignment:
Q  130 attagaagtctcttgctta-gtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatactttg-atagtattgagcatt 227  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||| ||||||| || |||||||||||  ||||||||||||||||||  |  |||||||||||| |    
T  13403817 attagaagtctcttgctttcgtgcttgagcataggaagtctcttgcctgcgtgcttgagca--tttgtgaagtctcatactaggtgtagtattgagcagt 13403720  T
Q  228 tgtaatctttgtgat 242  Q
    |||||||| ||||||    
T  13403719 tgtaatctgtgtgat 13403705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #125
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 29 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 20567461 - 20567296
Alignment:
Q  29 attgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtattttt--gtttgattagaagtctcttgcctgcgtgctt 125  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||   ||| ||| |||| ||  ||||||||||||||||||||  |  ||||||    
T  20567461 attgtattgtgaacaccactgaatgtatatcaagtgttcaacctcaaac---attttctttattattctgtttgattagaagtctcttggttttgtgctt 20567365  T
Q  126 gagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttt 193  Q
    ||||||  |||||||||||| || |||||||||||  ||||  ||||||| | |||||||||| |||||    
T  20567364 gagcatatgaagtctcttgcgtttgtgcttgagcaaaggaaacctcttgcttttgtgcttgagtagttt 20567296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #126
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 133 - 242
Target Start/End: Original strand, 35543694 - 35543801
Alignment:
Q  133 agaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatactttgatagtattgagcatttgta 231  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || ||  ||||||||||  |||| |||||||||||| | |||||||||||||| |||||    
T  35543694 agaagtctcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcatgcttgagca--tttgggaagtctcatac-tagatagtattgagcagttgta 35543790  T
Q  232 atctttgtgat 242  Q
    |||| ||||||    
T  35543791 atctgtgtgat 35543801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #127
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 130 - 242
Target Start/End: Original strand, 36096215 - 36096325
Alignment:
Q  130 attagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatactttgatagtattgagcattt 228  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| || || |||||||||||  |||| |||||||||||| | | |||||||||||| ||    
T  36096215 attagaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgggaagtctcatac-taggtagtattgagcagtt 36096311  T
Q  229 gtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||| ||||||    
T  36096312 gtaatctgtgtgat 36096325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #128
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 130 - 242
Target Start/End: Original strand, 36097672 - 36097782
Alignment:
Q  130 attagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatactttgatagtattgagcattt 228  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| || || |||||||||||  |||| |||||||||||| | | |||||||||||| ||    
T  36097672 attagaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgggaagtctcatac-taggtagtattgagcagtt 36097768  T
Q  229 gtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||| ||||||    
T  36097769 gtaatctgtgtgat 36097782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #129
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 29 - 161
Target Start/End: Original strand, 40033247 - 40033381
Alignment:
Q  29 attgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttga 127  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| |||||||||||||| |  ||||||||    
T  40033247 attgtattgtgaacaccactaattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttgctttagtgcttga 40033346  T
Q  128 gcattagaagtctcttg-cttagtgcttgagcatt 161  Q
    ||||  ||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  40033347 gcataggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcatt 40033381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #130
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 29 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 23488178 - 23488061
Alignment:
Q  29 attgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttga 127  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| |||||||||||||| |  ||||||||    
T  23488178 attgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttgctttagtgcttga 23488079  T
Q  128 gcattagaagtctcttgc 145  Q
    |||   ||||||||||||    
T  23488078 gcaaaggaagtctcttgc 23488061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #131
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Original strand, 2156757 - 2156872
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    || | |||| |||||||||| ||||||||||||||    |||||||||    
T  2156757 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttatttgtaattttgtttgaatagaagtctcttgcagttgtgcttgag 2156856  T
Q  129 cattagaagtctcttg 144  Q
    |||  |||||||||||    
T  2156857 catatgaagtctcttg 2156872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #132
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 47 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 12078502 - 12078357
Alignment:
Q  47 ctgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatt-tttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttg--agcattagaagtctctt 143  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||| | || | |||||||| ||| ||||||||||| |  |||||||  |||||  ||||||||||    
T  12078502 ctgattgtatatcaagtgttcaattcaaacaatattctttataatctttgtttg-ttaaaagtctcttgcttttgtgcttgcaagcataggaagtctctt 12078404  T
Q  144 gctta-gtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca 189  Q
    ||||  |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  12078403 gcttgtgtgcttgagcataggaagtctcttgcttgtgtgcttgagca 12078357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #133
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Original strand, 21072720 - 21072835
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| |||||||||| || |||||||||||    |||||||||    
T  21072720 ttgtattgtgaacaccacttattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattttgtttgaatataagtctcttgcagttgtgcttgag 21072819  T
Q  129 cattagaagtctcttg 144  Q
    ||||| ||||||||||    
T  21072820 cattaaaagtctcttg 21072835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #134
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Original strand, 21199484 - 21199599
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| ||||||||||||||    |||||||||    
T  21199484 ttgtattatgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatagaagtctcttgcaattgtgcttgag 21199583  T
Q  129 cattagaagtctcttg 144  Q
    ||| ||||||||||||    
T  21199584 cataagaagtctcttg 21199599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #135
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 172
Target Start/End: Original strand, 22586466 - 22586609
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgagc 129  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    || | |||| || |||||| ||||||||||||||  |  ||||||||||    
T  22586466 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacccaaacatttttatgtgtaattgtgtttgtttagaagtctcttggttttgtgcttgagc 22586565  T
Q  130 attagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactctt 172  Q
    ||  ||| ||||||||||  ||||||||| ||| |||| |||||    
T  22586566 ataggaaatctcttgcttgtgtgcttgagtatttgaagtctctt 22586609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #136
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 10848426 - 10848309
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| ||||||||||  |||||||||||||||    |||||||    
T  10848426 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattttgtttgaatttagaagtctcttgcagttgtgcttg 10848327  T
Q  127 agcattagaagtctcttg 144  Q
    |||| || ||||||||||    
T  10848326 agcaataaaagtctcttg 10848309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #137
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 16607166 - 16607020
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||  | |||| |||| || ||||||| ||||||| ||||||    |||||||||    
T  16607166 ttgtattgtgaacacccctgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatatttctttgtagttctgtttgaatagaagtatcttgcaattgtgcttgag 16607067  T
Q  129 cattagaagtctcttg-cttagtgcttgagcattggaagactcttgc 174  Q
    |||  |||||||||||  ||||| ||||||||| ||||  |||||||    
T  16607066 cataggaagtctcttgatttagttcttgagcataggaaatctcttgc 16607020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #138
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 130 - 242
Target Start/End: Original strand, 20168630 - 20168740
Alignment:
Q  130 attagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatactttgatagtattgagcattt 228  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| |||| || || |||||||||||  |||| |||||||||||||  | |||||||||||| ||    
T  20168630 attagaagtctcttgctttagtgcttgagcatagaaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgggaagtctcatactagg-tagtattgagcagtt 20168726  T
Q  229 gtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||| ||||||    
T  20168727 gtaatctgtgtgat 20168740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #139
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 115
Target Start/End: Original strand, 26056004 - 26056093
Alignment:
Q  25 ttgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgc 115  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | | |||| ||||  |||||||| |||||||||||||||    
T  26056004 ttgttttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaaccaaagttatttctgtgta-atttgtttgtttagaagtctcttgc 26056093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #140
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 33932921 - 33932805
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttc-aagtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||   ||||| |||| || |||||||  | ||||||||||||| |  |||||||    
T  33932921 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaac-atattctttgtaattctgtttgaattcagaagtctcttgcatttgtgcttg 33932823  T
Q  127 agcattagaagtctcttg 144  Q
    |||| |||||||||||||    
T  33932822 agcaatagaagtctcttg 33932805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #141
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 30 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 34638109 - 34637976
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||   | |||| |||| || ||||||| |||||||||||||| |  ||| || ||    
T  34638109 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaaaaaatttctttgtaattctgtttgaatagaagtctcttgcatttgtggttaag 34638010  T
Q  129 cattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcatt 161  Q
    |||  ||||||||||||  | |||||||||||||    
T  34638009 catatgaagtctcttgcagttgtgcttgagcatt 34637976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #142
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 34637226 - 34637068
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgagc 129  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  | |||| ||||  |||||||| | ||||||||||||| |  ||| ||||||    
T  34637226 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ccaaacatatttctttgta-atttgtttgttcagaagtctcttgcttttgtgtttgagc 34637129  T
Q  130 attagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca 189  Q
    ||  ||| ||||||| ||  ||||||||| ||| ||||  | |||| ||||||||||||||    
T  34637128 atatgaaatctcttgtttgtgtgcttgagtatttgaagttttttgcttgtgtgcttgagca 34637068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #143
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Original strand, 12353279 - 12353393
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| ||||||||||||||    |||||||||    
T  12353279 ttgtattgtgaacaccactaattgtatatcaagtgttcaatctcaaac-attttctttgtaattctgtttgaatagaagtctcttgcagttgtgcttgag 12353377  T
Q  129 cattagaagtctcttg 144  Q
    ||| ||||||||||||    
T  12353378 cataagaagtctcttg 12353393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #144
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 13403874 - 13403755
Alignment:
Q  44 ccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctct 142  Q
    |||||||| |||||||||||||||||  ||||||    || | |||| || |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  |||||||||    
T  13403874 ccactgatagtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttttgtgtaattctgtttgattagaagtctcttgctttcgtgcttgagcataggaagtctct 13403775  T
Q  143 tg-cttagtgcttgagcatt 161  Q
    || ||  |||||||||||||    
T  13403774 tgcctgcgtgcttgagcatt 13403755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #145
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 23880719 - 23880604
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||| || ||||||||||||||    |||||||||    
T  23880719 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctttgtaattctgttcgaatagaagtctcttgcagttgtgcttgag 23880620  T
Q  129 cattagaagtctcttg 144  Q
     || ||||||||||||    
T  23880619 tatcagaagtctcttg 23880604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #146
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 189
Target Start/End: Original strand, 7746177 - 7746339
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttg-attagaagtctcttgcctgcgtgcttga 127  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||| |||| |||||||||||    ||||||||    
T  7746177 ttgtattgtgaacatcactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaattataagtctcttgcagttgtgcttga 7746276  T
Q  128 gcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca 189  Q
    |||||| |||||||||| ||  || |  |||||| |||||||||||||   ||||||||||||    
T  7746277 gcattataagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagactcttgcagttgtgcttgagca 7746339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #147
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Original strand, 23392088 - 23392205
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||  |||| ||||||||||  |||||||||||||||    |||||||    
T  23392088 ttgtactgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttcattgtaattttgtttgaatttagaagtctcttgcagttgtgcttg 23392187  T
Q  127 agcattagaagtctcttg 144  Q
    |||| |||||||||||||    
T  23392188 agcaatagaagtctcttg 23392205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #148
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Original strand, 28464821 - 28464938
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  | |||||||||||||    |||||||    
T  28464821 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaattcagaagtctcttgcagttgtgcttg 28464920  T
Q  127 agcattagaagtctcttg 144  Q
    |||| |||||||||||||    
T  28464921 agcaatagaagtctcttg 28464938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #149
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 1915000 - 1914890
Alignment:
Q  132 tagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatactttga-tagtattgagcatttg 229  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||| |  ||||| |||||  ||||||||||||||||||  |  |||||||||||| |||    
T  1915000 tagaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgctttagtgctcgagca--tttgtgaagtctcatactaggtgtagtattgagcagttg 1914903  T
Q  230 taatctttgtgat 242  Q
    |||||| ||||||    
T  1914902 taatctgtgtgat 1914890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #150
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 6498891 - 6498806
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttg 114  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||   ||||| |||| || ||||||| | |||||||||||    
T  6498891 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaatattctttgtaattctgtttgaatggaagtctcttg 6498806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #151
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 3245925 - 3245964
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3245925 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 3245964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #152
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 4886676 - 4886637
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4886676 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 4886637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #153
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 144
Target Start/End: Original strand, 6512916 - 6513030
Alignment:
Q  33 tattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttgagc 129  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || | |||||  || ||||||||||||    ||||||||||    
T  6512916 tattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctatttgaatttggaagtctcttgcagttgtgcttgagc 6513015  T
Q  130 attagaagtctcttg 144  Q
    |||||||||||||||    
T  6513016 attagaagtctcttg 6513030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #154
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 9088622 - 9088583
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9088622 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 9088583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #155
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Original strand, 9399099 - 9399214
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| ||||||||| ||||    |||||||||    
T  9399099 ttgtattgtgaacaccactgattgtatataaagtgttcaacctcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatagaagtcttttgcagttgtgcttgag 9399198  T
Q  129 cattagaagtctcttg 144  Q
    |||  |||||||||||    
T  9399199 catatgaagtctcttg 9399214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #156
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 13546008 - 13546047
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13546008 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 13546047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #157
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 15516623 - 15516584
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15516623 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 15516584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #158
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 21100186 - 21100225
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21100186 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 21100225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #159
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 21659865 - 21659826
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21659865 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 21659826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #160
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 23488104 - 23488002
Alignment:
Q  132 tagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatactttg-atagtattgagcatttg 229  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||| || ||||||||||| ||   ||||||||||||||  |  |||||||||||| |||    
T  23488104 tagaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcaatt---tgaagtctcatactaggtgtagtattgagcagttg 23488008  T
Q  230 taatct 235  Q
    ||||||    
T  23488007 taatct 23488002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #161
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 25740764 - 25740725
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25740764 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 25740725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #162
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 28139260 - 28139221
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28139260 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 28139221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #163
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 29138889 - 29138928
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29138889 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 29138928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #164
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 31117532 - 31117493
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31117532 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 31117493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #165
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 31146118 - 31146157
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31146118 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 31146157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #166
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 35932490 - 35932529
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35932490 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 35932529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #167
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 35986716 - 35986755
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35986716 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 35986755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #168
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 33 - 147
Target Start/End: Original strand, 89907 - 90024
Alignment:
Q  33 tattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttgagc 129  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||    |||| |||| || |||||||  | |||||||||||||    ||||||||||    
T  89907 tattgtgaacaccactaattgtatatcaagtgttcaaccttaaacaattttctttgtaattctgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttgagc 90006  T
Q  130 attagaagtctcttgctt 147  Q
    ||||||||||||||||||    
T  90007 attagaagtctcttgctt 90024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #169
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 30 - 68
Target Start/End: Original strand, 13736618 - 13736656
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttca 68  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13736618 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttca 13736656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #170
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 26765157 - 26765041
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgatt--agaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||||  |||||||||||||    |||||||    
T  26765157 ttgtattgtgaacaccattgattgtatatcaagtgttcaatctcaaacatttttct-tgtaattctgtttgatttgagaagtctcttgcagttgtgcttg 26765059  T
Q  127 agcattagaagtctcttg 144  Q
    |||| |||||||||||||    
T  26765058 agcaatagaagtctcttg 26765041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #171
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Original strand, 30116320 - 30116437
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  | |||||||||||||    |||||||    
T  30116320 ttgtattgtgaataccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttg 30116419  T
Q  127 agcattagaagtctcttg 144  Q
    |||| |||||||||||||    
T  30116420 agcaatagaagtctcttg 30116437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #172
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Original strand, 23413457 - 23413573
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttca-agtcaaactcaattctctgtatttttgtttg-attagaagtctcttgcctgcgtgcttga 127  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||    || | |||| || |||||| ||| ||||||||||||    ||||||||    
T  23413457 ttgtattgtgaacaccagtgattgtatatcaagtgttcatcctcaaacaattttttgtgtaattctgtttgaatttgaagtctcttgcagttgtgcttga 23413556  T
Q  128 gcattagaagtctcttg 144  Q
    |||||||||||||||||    
T  23413557 gcattagaagtctcttg 23413573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #173
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 130 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 23589298 - 23589238
Alignment:
Q  130 attagaagtctcttgctta-gtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca 189  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||    
T  23589298 attagaagtctcttgcttttgtgcttgagcttaggaagacttttgcgtttgtgcttgagca 23589238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #174
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 17814619 - 17814580
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17814619 ttgtattgtgaacaccacttattgtatatcaagtgttcaa 17814580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #175
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 26784008 - 26783969
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26784008 ttgtattgtgaacaccattgattgtatatcaagtgttcaa 26783969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #176
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 30742635 - 30742596
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30742635 ttgtattgtgaacatcactgattgtatatcaagtgttcaa 30742596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #177
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 39799359 - 39799398
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  39799359 ttgtattgtgaacatcactgattgtatatcaagtgttcaa 39799398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #178
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 69
Target Start/End: Original strand, 25097319 - 25097349
Alignment:
Q  39 gaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25097319 gaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 25097349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #179
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 69
Target Start/End: Original strand, 25155289 - 25155319
Alignment:
Q  39 gaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25155289 gaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 25155319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #180
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 94 - 186
Target Start/End: Original strand, 17263182 - 17263275
Alignment:
Q  94 tgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttga 186  Q
    |||||| ||||||||||||||| |  |||||||||| |  ||| ||||||||||  ||||||||| ||| |||| ||||||| |||||| ||||    
T  17263182 tgtttgtttagaagtctcttgcttttgtgcttgagcgtatgaaatctcttgcttgtgtgcttgagtatttgaagtctcttgcttgtgtgtttga 17263275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #181
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 8 - 37
Target Start/End: Original strand, 42395450 - 42395479
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattg 37  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42395450 aaagtctagagtctttattgtattgtattg 42395479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #182
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 14 - 69
Target Start/End: Original strand, 25930622 - 25930678
Alignment:
Q  14 tagagtctttat-tgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||||||| ||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  25930622 tagagtctttatctgatttgtattgtgaacatcactgattgtatatcaactgttcaa 25930678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #183
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 33 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 31487886 - 31487850
Alignment:
Q  33 tattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31487886 tattgtgaacaccactgattttatatcaagtgttcaa 31487850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 142)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Original strand, 6318895 - 6319135
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6318895 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 6318994  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 201  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6318995 cagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 6319094  T
Q  202 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6319095 ctcatacttagaaagtattgagcatttgtaatctttgtgat 6319135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 26111132 - 26110892
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26111132 aaattcaaagtctagagtctttactgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 26111033  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26111032 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 26110933  T
Q  202 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26110932 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 26110892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 3220533 - 3220293
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3220533 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 3220434  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 201  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3220433 cagaagtctcttgcctgcgtgtttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 3220334  T
Q  202 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3220333 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 3220293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 19128649 - 19128409
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19128649 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaactcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 19128550  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 201  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19128549 cagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 19128450  T
Q  202 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19128449 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 19128409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 43248226 - 43247986
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43248226 aaattcaaagtctagagtctttactgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 43248127  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  43248126 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattaaaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 43248027  T
Q  202 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43248026 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 43247986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 18449271 - 18449031
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18449271 aaattcaaagtctagagtctttactgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaactcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 18449172  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18449171 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 18449072  T
Q  202 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  18449071 ctcatacttagaaagtattgcgcagttgtaatctttgtgat 18449031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 19139181 - 19138941
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19139181 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaactcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 19139082  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 201  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  19139081 cagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagcgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagaatttttgtgaagt 19138982  T
Q  202 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19138981 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 19138941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Original strand, 32078075 - 32078315
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32078075 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtattgttgtttgat 32078174  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32078175 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 32078274  T
Q  202 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32078275 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 32078315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Original strand, 32088648 - 32088888
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32088648 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtattgttgtttgat 32088747  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32088748 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 32088847  T
Q  202 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32088848 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 32088888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 36292822 - 36292580
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36292822 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaactctctgtatttttgtttgat 36292723  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca--gttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  36292722 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 36292623  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36292622 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 36292580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 36303425 - 36303183
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36303425 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaactctctgtatttttgtttgat 36303326  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca--gttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  36303325 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 36303226  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36303225 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 36303183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 2 - 236
Target Start/End: Original strand, 3349006 - 3349242
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3349006 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 3349105  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca--gttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  3349106 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 3349205  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctt 236  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  3349206 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatctt 3349242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 2 - 236
Target Start/End: Original strand, 3359603 - 3359839
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3359603 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 3359702  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca--gttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  3359703 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 3359802  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctt 236  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  3359803 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatctt 3359839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 2 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 9341045 - 9340809
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9341045 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 9340946  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca--gttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  9340945 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 9340846  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctt 236  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  9340845 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatctt 9340809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 2 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 9368189 - 9367953
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9368189 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 9368090  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca--gttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  9368089 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 9367990  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctt 236  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  9367989 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatctt 9367953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Original strand, 9856851 - 9857096
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtcttt-----attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgt 96  Q
    ||||||||||||||||||||||     |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9856851 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgt 9856950  T
Q  97 ttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgt 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9856951 ttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgt 9857050  T
Q  197 gaagtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9857051 gaagtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 9857096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 2 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 44480992 - 44480756
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44480992 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 44480893  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca--gttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  44480892 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 44480793  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctt 236  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  44480792 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatctt 44480756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 2 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 44491608 - 44491372
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44491608 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 44491509  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca--gttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  44491508 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 44491409  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctt 236  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  44491408 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatctt 44491372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 252310 - 252068
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  252310 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgtttaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 252211  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagc--agttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  252210 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaa 252111  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  252110 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 252068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Original strand, 849346 - 849588
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  849346 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgtttaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 849445  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagc--agttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  849446 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaa 849545  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  849546 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 849588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 2 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 6160924 - 6160690
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6160924 aaattcaaagtctagagtcttttctgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 6160825  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6160824 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 6160725  T
Q  202 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctt 236  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  6160724 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctt 6160690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Original strand, 15791678 - 15791919
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15791678 aaattcaaagtctagagtctttactgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 15791777  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca-gttttgtgaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  15791778 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcttgtgtgcttgagcattttttgtgaag 15791877  T
Q  201 tctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    |||||||||| || |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  15791878 tctcatacttagaaagtactgagcagttgtaatctttgtgat 15791919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 26120810 - 26120567
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26120810 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 26120711  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca---gttttgtga 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||    
T  26120710 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcaatttttttgtga 26120611  T
Q  199 agtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26120610 agtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 26120567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 2 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 29076632 - 29076396
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29076632 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 29076533  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca--gttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  29076532 tagaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 29076433  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctt 236  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  29076432 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatctt 29076396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 2 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 29086883 - 29086647
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29086883 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 29086784  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca--gttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  29086783 tagaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 29086684  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctt 236  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  29086683 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatctt 29086647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 2 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 36077838 - 36077602
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36077838 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 36077739  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagc--agttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  36077738 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaa 36077639  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctt 236  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  36077638 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctt 36077602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 2 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 36088424 - 36088188
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36088424 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 36088325  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagc--agttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  36088324 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaa 36088225  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctt 236  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  36088224 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctt 36088188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Original strand, 210532 - 210774
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  210532 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgtttaattcaatctcaattctctgtatttttgtttgat 210631  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagc--agttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  210632 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaa 210731  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  210732 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 210774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 241725 - 241483
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  241725 aaatttaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgtttaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 241626  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagc--agttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  241625 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaa 241526  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  241525 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 241483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Original strand, 724155 - 724397
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  724155 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgtttaattcaatctcaattctctgtatttttgtttgat 724254  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagc--agttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  724255 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaa 724354  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  724355 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 724397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 795080 - 794838
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  795080 aaatttaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgtttaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 794981  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagc--agttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  794980 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaa 794881  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  794880 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 794838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Original strand, 13688947 - 13689189
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13688947 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 13689046  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagc--agttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||    
T  13689047 tagaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcttgtgtgcttgagcatagttttgtgaa 13689146  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13689147 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 13689189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 2 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 6150969 - 6150735
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  || ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6150969 aaattcaaagtctagagtcttttctgcattgtattgtgaacatcactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 6150870  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6150869 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 6150770  T
Q  202 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctt 236  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  6150769 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctt 6150735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Original strand, 15781089 - 15781330
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15781089 aaattcaaagtctagagtctttactgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 15781188  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca-gttttgtgaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  15781189 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcttgtgtgcttgagcattttttgtgaag 15781288  T
Q  201 tctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    |||||||||| || |||| |||||| ||| ||||||||||||    
T  15781289 tctcatacttagaaagtactgagcagttgcaatctttgtgat 15781330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 31214914 - 31214673
Alignment:
Q  2 aaattcaa-agtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttga 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  31214914 aaattcaatagtctagagtctttattatattgtattgcgaacaccactgattgtatatcaagtgtttaagtcaaacttaattctttgtatttttgtttga 31214815  T
Q  101 ttagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaag 200  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31214814 tcagaagcctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaag 31214715  T
Q  201 tctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31214714 tctcatacttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgat 31214673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 8 - 242
Target Start/End: Original strand, 20161616 - 20161850
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  20161616 aaagtctagagtcttaattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttaattcattgtatttttgtttgattagaag 20161715  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcata 207  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  20161716 cctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcata 20161815  T
Q  208 ctttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20161816 cttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgat 20161850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 8 - 242
Target Start/End: Original strand, 23469846 - 23470080
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||    
T  23469846 aaagtctagagtctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttaattcattgtatttttgtttgatcagaag 23469945  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcata 207  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  23469946 cctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcata 23470045  T
Q  208 ctttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23470046 cttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgat 23470080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 8 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 16746895 - 16746661
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||| |||||    
T  16746895 aaagtctagagtctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttatttctttgtatttttgtttgatcagaag 16746796  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcata 207  Q
      |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  16746795 agtcttgcatgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcata 16746696  T
Q  208 ctttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16746695 cttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgat 16746661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 8 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 19224829 - 19224595
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||    
T  19224829 aaagtctagagtctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttaattcattgtatttttgtttgatcagaag 19224730  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcata 207  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||    
T  19224729 cctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttaagcatttttgagaagtctcata 19224630  T
Q  208 ctttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    |||  | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19224629 cttaaagagtattgagcatttgtaatctttgtgat 19224595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 9 - 242
Target Start/End: Original strand, 30315082 - 30315320
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagt 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||    
T  30315082 aagtctagagtctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttaattcattgtatttttgtttgatcagaagt 30315181  T
Q  109 ctctt-----gcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtct 203  Q
    |||||     |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||    
T  30315182 ctcttatcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcatcggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatctttgagaagtct 30315281  T
Q  204 catactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30315282 catacttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgat 30315320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 8 - 242
Target Start/End: Original strand, 18769522 - 18769757
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttt-tgtttgattagaa 106  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||  |||||||| |||||||||||||    
T  18769522 aaagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacatatttcattgtattttttgtttgattagaa 18769621  T
Q  107 gtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcat 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  18769622 gtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtctgtgcttgagcatttttgagaagtctcat 18769721  T
Q  207 actttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    |||| || |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  18769722 acttagagagtattgaacatttttaatctttgtgat 18769757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 8 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 19418247 - 19418012
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    |||||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||| |||||    
T  19418247 aaagtctacagtctttaacgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttatttcattgtatttttgtttgatcagaag 19418148  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcata 207  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  19418147 cctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcata 19418048  T
Q  208 ctttgatagtattgagca-tttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||| || ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19418047 cttagagagtattgagcattttgtaatctttgtgat 19418012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 8 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 19428822 - 19428587
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||| |||||    
T  19428822 aaagtctagagtctttaacgtattgtattatgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttatttcattgtatttttgtttgatcagaag 19428723  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcata 207  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  19428722 cctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcata 19428623  T
Q  208 ctttgatagtattgagca-tttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||| || ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19428622 cttagagagtattgagcattttgtaatctttgtgat 19428587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 9 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 18153631 - 18153398
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgta-tttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||  ||||| |||||||||||| |||||    
T  18153631 aagtctagagtctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacatattttcctgtaatttttgtttgatcagaag 18153532  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcata 207  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  18153531 actcttgcctgcgtgcttgagtattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcttgtgtgcttgagca-ttttgagaagtctcata 18153433  T
Q  208 ctttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18153432 cttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgat 18153398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 9 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 18158150 - 18157917
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgta-tttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||  ||||| |||||||||||| |||||    
T  18158150 aagtctagagtctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacatattttcctgtaatttttgtttgatcagaag 18158051  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcata 207  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  18158050 actcttgcctgcgtgcttgagtattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcttgtgtgcttgagca-ttttgagaagtctcata 18157952  T
Q  208 ctttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18157951 cttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgat 18157917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 9 - 242
Target Start/End: Original strand, 40213555 - 40213788
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaatt-ctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||||||  ||| | ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||| || |||    
T  40213555 aagtctagagtctttattacattat-ttgtgaacaccactgattgcatatcaagtgttcaagtcaaacatattttctctgtatttttgtttgaatataag 40213653  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcata 207  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  40213654 cctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagacttttgcctgcgtgcttgagcatttttgagaagtctcata 40213753  T
Q  208 ctttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40213754 cttagagagtattgagcatttgtaatctttctgat 40213788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 9 - 242
Target Start/End: Original strand, 22167409 - 22167641
Alignment:
Q  9 aagtctagagtcttt-attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||| |||| || ||||||||||||||    
T  22167409 aagtctagagtcttttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacaattttctgtgtaattctgtttgattagaag 22167508  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcat 206  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||    
T  22167509 tctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcat 22167606  T
Q  207 actttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    || | |||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  22167607 ac-tagatagtattgagcagttgtaatctgtgtgat 22167641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 9 - 242
Target Start/End: Original strand, 22136244 - 22136476
Alignment:
Q  9 aagtctagagtcttt-attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||| |||| || ||||||||||||||    
T  22136244 aagtctagagtcttttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacaattttctgtgtaattctgtttgattagaag 22136343  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcat 206  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||    
T  22136344 tctctcgcctgcctgcttgagcattagaagtctcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcat 22136441  T
Q  207 actttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    || | |||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  22136442 ac-tagatagtattgagcagttgtaatctgtgtgat 22136476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 9 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 3843415 - 3843184
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| |||||||||| ||||||    
T  3843415 aagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacatt-ttctgtgtaattttgtttgaatagaag 3843317  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcat 206  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||    
T  3843316 cctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcat 3843219  T
Q  207 actttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    || | || ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3843218 ac-tagagagtattgagcatttgtaatctgtgtgat 3843184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 8 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 20195851 - 20195697
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  20195851 aaagtctagagtcttaattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttaattcattgtatttttgtttgattagaag 20195752  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcatt 161  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||||||||    
T  20195751 cctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatt 20195697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 9 - 242
Target Start/End: Original strand, 20260005 - 20260236
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| |||||||||||||||||    
T  20260005 aagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacatt-ttctgtgtaattttgtttgattagaag 20260103  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcat 206  Q
     |||| |||||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||    
T  20260104 cctctcgcctgcatgcttgagcattaaaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcat 20260201  T
Q  207 actttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    || | |  |||| |||||||||||||||| ||||||    
T  20260202 ac-tagtgagtactgagcatttgtaatctgtgtgat 20260236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 9 - 242
Target Start/End: Original strand, 21046635 - 21046866
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| |||||||||||||||||    
T  21046635 aagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacatt-ttctgtgtaattttgtttgattagaag 21046733  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcat 206  Q
     |||| |||||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||    
T  21046734 cctctcgcctgcatgcttgagcattaaaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcat 21046831  T
Q  207 actttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    || | |  |||| |||||||||||||||| ||||||    
T  21046832 ac-tagtgagtactgagcatttgtaatctgtgtgat 21046866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 129 - 242
Target Start/End: Original strand, 13697185 - 13697300
Alignment:
Q  129 cattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagc--agttttgtgaagtctcatactttgatagtattgagcat 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| || |||||||||||     
T  13697185 cattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcttgtgtgcttgagcatagttttgtgaagtctcatacttagaaagtattgagcag 13697284  T
Q  227 ttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||||||||||    
T  13697285 ttgtaatctttgtgat 13697300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 9 - 189
Target Start/End: Original strand, 7018768 - 7018954
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttc-aagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    |||| |||| || ||||||||||||||    
T  7018768 aagtctagagtttttattgcattgtattgtaaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacaattttctgtgtaattatgtttgattagaag 7018867  T
Q  108 tctc----ttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca 189  Q
    ||||    | |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |  |||||||||||    
T  7018868 tctctcgatcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagca 7018954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 149 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 20195739 - 20195646
Alignment:
Q  149 gtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20195739 gtgcttgagcattagaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcatacttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgat 20195646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 24 - 234
Target Start/End: Original strand, 45568410 - 45568620
Alignment:
Q  24 attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtg 122  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| |||||||||| |||||||||||||| |  |||    
T  45568410 attgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattttgtttgaatagaagtctcttgctttagtg 45568509  T
Q  123 cttgagcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatactttg-atagtatt 220  Q
    |||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||  ||||| || |||| |||||||||||||| ||   ||||||||||||||  |  |||||||    
T  45568510 cttgagcataggaagtctcttgcttgtgtgcttgagcaaaggaagtcttttgcctgtgtgcttgagcaatt---tgaagtctcatactaggtgtagtatt 45568606  T
Q  221 gagcatttgtaatc 234  Q
    ||||| ||||||||    
T  45568607 gagcagttgtaatc 45568620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 9 - 142
Target Start/End: Original strand, 22211776 - 22211911
Alignment:
Q  9 aagtctagagtcttt-attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttc-aagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaa 106  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    |||| |||| || |||||||||||||    
T  22211776 aagtctagagtcttttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacaattttctgtgtaattctgtttgattagaa 22211875  T
Q  107 gtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctct 142  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| |||||||||    
T  22211876 gtctcttgctttagtgcttgagcattggaagtctct 22211911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 24 - 242
Target Start/End: Original strand, 17519552 - 17519770
Alignment:
Q  24 attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtg 122  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    || | |||| || ||||||| |||||||||||||| |  |||    
T  17519552 attgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttatgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttgctttagtg 17519651  T
Q  123 cttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatactttg-atagtatt 220  Q
    |||||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||||  ||||| ||||||| || |||||||||||  ||||||||||||||||||  |  |||||||    
T  17519652 cttgagca-tagaagtcttttgctttagtgctttagcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttgagca--tttgtgaagtctcatactaggtgtagtatt 17519748  T
Q  221 gagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    || || ||||||||| ||||||    
T  17519749 gatcagttgtaatctgtgtgat 17519770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 24 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 40002885 - 40002674
Alignment:
Q  24 attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtg 122  Q
    |||| |||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| |||||||||||||| |  |||    
T  40002885 attgcattgtactgtgaacatcactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttgctttagtg 40002786  T
Q  123 cttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatactttg-atagtatt 220  Q
    |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||| || ||||||||||| |||  ||||||||||||||  |  |||||||    
T  40002785 cttgagcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcaattt--tgaagtctcatactaggtgtagtatt 40002688  T
Q  221 gagcatttgtaatc 234  Q
    ||||| ||||||||    
T  40002687 gagcagttgtaatc 40002674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 100 - 242
Target Start/End: Original strand, 7018894 - 7019034
Alignment:
Q  100 attagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtga 198  Q
    |||||||| ||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||    
T  7018894 attagaagactcttgctttagtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgaga 7018991  T
Q  199 agtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    |||||||||| | || ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7018992 agtctcatac-tagagagtattgagcatttgtaatctgtgtgat 7019034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 29 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 21288056 - 21287851
Alignment:
Q  29 attgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttga 127  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    || | |||| || ||||||| |||||||||||||| |  ||||||||    
T  21288056 attgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttatgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttgctttagtgcttga 21287957  T
Q  128 gcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatactttg-atagtattgagca 225  Q
    ||||  ||||||||||||||  |||||||||||  ||||| ||||||| ||||| |||||||| ||   ||||||||||||||  |  ||||||||||||    
T  21287956 gcataggaagtctcttgcttgtgtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgtgtacttgagcaatt---tgaagtctcatactaggtgtagtattgagca 21287860  T
Q  226 tttgtaatc 234  Q
     ||||||||    
T  21287859 gttgtaatc 21287851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 29 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 21298666 - 21298504
Alignment:
Q  29 attgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttga 127  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| |||||||||||||| |  ||||| ||    
T  21298666 attgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttgctttagtgctcga 21298567  T
Q  128 gcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca 189  Q
    ||||  ||||||||||||||  |||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  21298566 gcataggaagtctcttgcttgtgtgcttgagcaaaggaagtctcttgcttgtgtgcttgagca 21298504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 114 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 23363920 - 23363793
Alignment:
Q  114 gcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatactttg 212  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || | |||||||||  |||| |||||||||||||  |    
T  23363920 gcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgcgcttgagca--tttgagaagtctcatactaag 23363823  T
Q  213 atagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    | |||||||| |||||||||||| ||||||    
T  23363822 agagtattgaacatttgtaatctgtgtgat 23363793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 30 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 28903119 - 28902958
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| |||||||||||||| |  |||||||||    
T  28903119 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatagaagtctcttgctttagtgcttgag 28903020  T
Q  129 cattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca 189  Q
    |||  |||||||||||| |||||||||||| |  ||||| ||||||| || |||||||||||    
T  28903019 cataggaagtctcttgctttagtgcttgagtaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttgagca 28902958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 9 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 19460862 - 19460707
Alignment:
Q  9 aagtctagagtcttt-attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaa 106  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| |||||    
T  19460862 aagtctagagtctttcattgcattgtattgtgaacaccactgatagtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatagaa 19460763  T
Q  107 gtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttg-cttagtgcttgagcatt 161  Q
    |||||||||  | ||||||||||||  ||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  19460762 gtctcttgctcgagtgcttgagcataggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcatt 19460707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 9 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 19558540 - 19558385
Alignment:
Q  9 aagtctagagtcttt-attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaa 106  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| |||||    
T  19558540 aagtctagagtctttcattgcattgtattgtgaacaccactgatagtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatagaa 19558441  T
Q  107 gtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttg-cttagtgcttgagcatt 161  Q
    |||||||||  | ||||||||||||  ||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  19558440 gtctcttgctcgagtgcttgagcataggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcatt 19558385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 30 - 140
Target Start/End: Original strand, 19956838 - 19956949
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  | |||| |||| || ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  19956838 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaaatttctttgtaattatgtttgaatagaagtctcttgcttgcgtgcttgag 19956937  T
Q  129 cattagaagtct 140  Q
    |||  |||||||    
T  19956938 cataggaagtct 19956949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 30 - 173
Target Start/End: Original strand, 15934132 - 15934277
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| |||||||||| ||||||||||||||    |||||||||    
T  15934132 ttgtattgtgaacaccattgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctttgtaattttgtttgaatagaagtctcttgcagttgtgcttgag 15934231  T
Q  129 cattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttg 173  Q
    ||| |||||||||||||  | |||||||||||| ||||| ||||||    
T  15934232 cataagaagtctcttgcagttgtgcttgagcataggaagtctcttg 15934277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 29 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 21540606 - 21540427
Alignment:
Q  29 attgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttga 127  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| |||||||||||| | |  ||||||||    
T  21540606 attgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtattcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatagaagtctctttctttagtgcttga 21540507  T
Q  128 gcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatact 209  Q
    ||||  |||||||||||| |  |||||||||||  ||||| ||||||| || ||||||||||| ||   ||||||||||||||    
T  21540506 gcataggaagtctcttgcatgtgtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcaatt---tgaagtctcatact 21540427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 9 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 23370446 - 23370386
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23370446 aagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 23370386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 30 - 189
Target Start/End: Original strand, 1210243 - 1210405
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgagc 129  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||  |||||    |||| |||| ||||||||| |||||||||| |||| |  ||||||||||    
T  1210243 ttgtattgtgaacatcactgattgtatatcaagtgtccaaaccaaacatctttctgtgtaattttgtttgtttagaagtcttttgcttctgtgcttgagc 1210342  T
Q  130 at-ta-gaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca 189  Q
    || || ||| ||||||||||  ||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||    
T  1210343 atataggaaatctcttgcttgtgtgcttgagtatttgaagtctcttgcttgtgtgcttgagca 1210405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 30 - 143
Target Start/End: Original strand, 18321659 - 18321773
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| ||||||||||||||    |||||||||    
T  18321659 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattatgtttgaatagaagtctcttgcagttgtgcttgag 18321758  T
Q  129 cattagaagtctctt 143  Q
    |||||||||||||||    
T  18321759 cattagaagtctctt 18321773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 19942884 - 19942770
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgagc 129  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||||| |||||||||||    |||||||| |    
T  19942884 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgattataagtctcttgcagttgtgcttgacc 19942785  T
Q  130 attagaagtctcttg 144  Q
    |||||||||||||||    
T  19942784 attagaagtctcttg 19942770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 132 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 19460767 - 19460659
Alignment:
Q  132 tagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatactttgatagtattgagcatttgt 230  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||||| || |||||||||||  ||||||||||||||||| | | |||||||||||| ||||    
T  19460767 tagaagtctcttgctcgagtgcttgagcataggaagtctcttgcctgcgtgcttgagca--tttgtgaagtctcatac-taggtagtattgagcagttgt 19460671  T
Q  231 aatctttgtgat 242  Q
    ||||| ||||||    
T  19460670 aatctgtgtgat 19460659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 132 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 19558445 - 19558337
Alignment:
Q  132 tagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatactttgatagtattgagcatttgt 230  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||||| || |||||||||||  ||||||||||||||||| | | |||||||||||| ||||    
T  19558445 tagaagtctcttgctcgagtgcttgagcataggaagtctcttgcctgcgtgcttgagca--tttgtgaagtctcatac-taggtagtattgagcagttgt 19558349  T
Q  231 aatctttgtgat 242  Q
    ||||| ||||||    
T  19558348 aatctgtgtgat 19558337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 132 - 242
Target Start/End: Original strand, 23271689 - 23271797
Alignment:
Q  132 tagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatactttgatagtattgagcatttgt 230  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| || |||||||||||  ||||||||||||||||| | | |||||||||| | ||||    
T  23271689 tagaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgcctgcgtgcttgagca--tttgtgaagtctcatac-taggtagtattgagtagttgt 23271785  T
Q  231 aatctttgtgat 242  Q
    ||||| ||||||    
T  23271786 aatctgtgtgat 23271797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 9 - 161
Target Start/End: Original strand, 23271594 - 23271749
Alignment:
Q  9 aagtctagagtcttt-attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttc-aagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaa 106  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||    || | |||| |  ||||||| |||||    
T  23271594 aagtctagagtctttcattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatgtcaagtgttcaaactcaaacaattttttgtgtaatcctgtttgaatagaa 23271693  T
Q  107 gtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttg-cttagtgcttgagcatt 161  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||  ||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  23271694 gtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcatt 23271749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 130 - 242
Target Start/End: Original strand, 22211869 - 22211979
Alignment:
Q  130 attagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatactttgatagtattgagcattt 228  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || || |||| ||||||  |||| |||||||||||| | || ||||||||||| ||    
T  22211869 attagaagtctcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcctgagca--tttgggaagtctcatac-tagagagtattgagcagtt 22211965  T
Q  229 gtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||| ||||||    
T  22211966 gtaatctgtgtgat 22211979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 33 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 26832722 - 26832560
Alignment:
Q  33 tattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcat 131  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||  | |||| |||| || ||||||| ||||||||||||||     |||||||||||    
T  26832722 tattgtgaacaccactaattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaaatttctttgtaattctgtttgaatagaagtctcttgcagttttgcttgagcat 26832623  T
Q  132 tagaagtctcttg-cttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttt 193  Q
      ||||||||||| |||||| ||||||||| ||||  |||||||   |||||||||| |||||    
T  26832622 aggaagtctcttgacttagttcttgagcataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtagttt 26832560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 29692963 - 29692846
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| ||||||||||  || ||||||||||||    |||||||    
T  29692963 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattttgtttgaatttggaagtctcttgcagttgtgcttg 29692864  T
Q  127 agcattagaagtctcttg 144  Q
    ||||||||||||||||||    
T  29692863 agcattagaagtctcttg 29692846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 25 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 33052531 - 33052374
Alignment:
Q  25 ttgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgct 124  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||| | |||| | ||  |||||||| ||||||||||||||| |   ||||    
T  33052531 ttgttttgtattgtgaacaccactgattgtacatcaaatgttcaatccaaactgatttctgtata-atttgtttgtttagaagtctcttgcatttttgct 33052433  T
Q  125 tgagcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgc 182  Q
    |||||||  ||| ||||||||||  ||||||||| ||| |||| ||||||| |||||||    
T  33052432 tgagcatatgaaatctcttgcttgtgtgcttgagtatttgaagtctcttgcttgtgtgc 33052374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 173
Target Start/End: Original strand, 18152148 - 18152295
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  | ||||||||||||| |  |||||||    
T  18152148 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaaccattttctttgtaattctgtttgaattcagaagtctcttgcatttgtgcttg 18152247  T
Q  127 agcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttg 173  Q
    |||| ||||||||||||||  | ||||||||||| | |||| ||||||    
T  18152248 agcaatagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttg 18152295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 145
Target Start/End: Original strand, 14990563 - 14990681
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| ||||||||||  | | ||||||||||| |  |||||||    
T  14990563 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattttgtttgaattcataagtctcttgcatttgtgcttg 14990662  T
Q  127 agcattagaagtctcttgc 145  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  14990663 agcaatagaagtctcttgc 14990681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 24 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 29379236 - 29379097
Alignment:
Q  24 attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttc-aagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtg 122  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||     |||| |||| || ||||||| |||||||||||||| |  |||    
T  29379236 attgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaataattttctgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttgctttagtg 29379137  T
Q  123 cttgagcattagaagtctcttg-cttagtgcttgagcatt 161  Q
    ||||||||   ||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  29379136 cttgagcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcatt 29379097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 8031702 - 8031593
Alignment:
Q  9 aagtctagagtcttt--attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattaga 105  Q
    |||| ||||||||||  |||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||||||||    
T  8031702 aagtttagagtctttcaattgcattgtattgtgaacaccactgatagtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgattaga 8031603  T
Q  106 agtctcttgc 115  Q
    ||||||||||    
T  8031602 agtctcttgc 8031593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 29379157 - 29379054
Alignment:
Q  132 tagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatactttg-atagtattgagcatttg 229  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||| || |||||||||||  ||||||||||||||||||  |  |||||||||||| |||    
T  29379157 tagaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttgagca--tttgtgaagtctcatactaggtgtagtattgagcagttg 29379060  T
Q  230 taatct 235  Q
    ||||||    
T  29379059 taatct 29379054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Original strand, 45538938 - 45539055
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  | |||||||||||||    |||||||    
T  45538938 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttg 45539037  T
Q  127 agcattagaagtctcttg 144  Q
    ||||||||||||||||||    
T  45539038 agcattagaagtctcttg 45539055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 30 - 165
Target Start/End: Original strand, 22462138 - 22462275
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  | |||| |||| || ||||| | |||||||||||||   | |||||||||    
T  22462138 ttgtatggtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatatttctttgtaattctgtttaaatagaagtctcttgtaggtgtgcttgag 22462237  T
Q  129 cattagaagtctcttg-cttagtgcttgagcattggaa 165  Q
    |||  |||||||||||  ||||| ||||||||| ||||    
T  22462238 catatgaagtctcttgatttagttcttgagcataggaa 22462275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 1744802 - 1744640
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttc-aagtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||   ||||| |||| ||||||||||  | |||||||||||||     || |||    
T  1744802 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaac-atattctttgtaattttgtttgaattgagaagtctcttgcagttttgattg 1744704  T
Q  127 agcattagaagtctcttgctta-gtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca 189  Q
    |||| ||||||||||||| ||| || | ||||||| ||||| |||||||   ||||||||||||    
T  1744703 agcaatagaagtctcttgattatgttcatgagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagca 1744640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 173
Target Start/End: Original strand, 14989952 - 14990099
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  | ||||||||||||| |  |||||||    
T  14989952 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaattcagaagtctcttgcatttgtgcttg 14990051  T
Q  127 agcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttg 173  Q
    | || ||||||||||||||  | ||||||||||| | |||| ||||||    
T  14990052 atcaatagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttg 14990099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 25163721 - 25163605
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttg-attagaagtctcttgcctgcgtgcttga 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||| ||| ||||||||||||    ||||||||    
T  25163721 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatttgaagtctcttgcaattgtgcttga 25163622  T
Q  128 gcattagaagtctcttg 144  Q
    ||||||||| |||||||    
T  25163621 gcattagaaatctcttg 25163605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 144
Target Start/End: Original strand, 33560699 - 33560833
Alignment:
Q  14 tagagtctttat-tgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtc 109  Q
    |||||||||||| ||  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||  |||| || |||||||  |||||||||    
T  33560699 tagagtctttatctgatttgtattgtgaacatcactgattgtatatcaagtgttcaatctcaaacatttttcattgtaattctgtttgaatttagaagtc 33560798  T
Q  110 tcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttg 144  Q
    |||||| |  ||||||||||| |||||||||||||    
T  33560799 tcttgcatttgtgcttgagcaatagaagtctcttg 33560833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 2810458 - 2810340
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||  | |||| |||| || |||||||||| || ||||||||    |||||||||    
T  2810458 ttgtattgtgaacaccactaattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatatttctttgtaattctgtttgattataactctcttgcagttgtgcttgag 2810359  T
Q  129 ca-ttagaagtctcttgct 146  Q
    || || |||||||||||||    
T  2810358 cagtttgaagtctcttgct 2810340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 132
Target Start/End: Original strand, 19505938 - 19506040
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgagc 129  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||||    |||| |||| ||||||||| ||||||||||||| | || ||| ||||||    
T  19505938 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaaatgtttaaaccaaacatctttctatgtaattttgtttgtttagaagtctcttacttgtgtgtttgagc 19506037  T
Q  130 att 132  Q
    |||    
T  19506038 att 19506040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Original strand, 20256011 - 20256128
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||  ||||||    || | |||| ||||||||||  |||||||||||||||    |||||||    
T  20256011 ttgtattgtgaacatcgctgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttatttgtaattttgtttgaatttagaagtctcttgcagttgtgcttg 20256110  T
Q  127 agcattagaagtctcttg 144  Q
    ||||||||||||||||||    
T  20256111 agcattagaagtctcttg 20256128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Original strand, 20382894 - 20383011
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||  |||| || |||||||  |||||||||||||||    |||||||    
T  20382894 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttcgttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttgtgcttg 20382993  T
Q  127 agcattagaagtctcttg 144  Q
    |||||||||| |||||||    
T  20382994 agcattagaaatctcttg 20383011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Original strand, 30421934 - 30422050
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttc-aagtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||    |||| |||| ||||||||||  |||||||||||| ||    |||||||    
T  30421934 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcgacctcaaac-attttctttgtaattttgtttgaatttagaagtctctcgcagttgtgcttg 30422032  T
Q  127 agcattagaagtctcttg 144  Q
    ||||||||||||||||||    
T  30422033 agcattagaagtctcttg 30422050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Original strand, 40845888 - 40846005
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  | |||||||||||||    |||||||    
T  40845888 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctttgtaattctgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttg 40845987  T
Q  127 agcattagaagtctcttg 144  Q
    |||| |||||||||||||    
T  40845988 agcaatagaagtctcttg 40846005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 17687631 - 17687473
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgatta-gaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||  ||||| ||||  |||||||| ||| |||||||||||| |  ||||||| |    
T  17687631 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagttctcaa-ccaaact-tattctttgta-atttgtttgtttaggaagtctcttgcttttgtgcttggg 17687535  T
Q  129 cattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca 189  Q
    |||  ||| ||||||||||   |||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||    
T  17687534 cataggaaatctcttgcttgtatgcttgagtatttgaagtctcttgcttgtgtgcttgagca 17687473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 18557630 - 18557517
Alignment:
Q  81 ttctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtg 179  Q
    |||| |||| || ||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||  |||||||||||| || |||||||| ||| ||||  ||||||| | ||    
T  18557630 ttctttgtaattctgtttgaatagaagtctcttgcttttgtgcttgagcatatgaagtctcttgcgtttgtgcttgaacataggaaacctcttgcttttg 18557531  T
Q  180 tgcttgagcagttt 193  Q
    |||||||| |||||    
T  18557530 tgcttgagtagttt 18557517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 18679465 - 18679348
Alignment:
Q  29 attgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttg-attagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||    || | |||| || |||||| |||||||||||||| |    |||||||    
T  18679465 attgtattgtgaacaccactcattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttatgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttacagttgtgcttg 18679366  T
Q  127 agcattagaagtctcttg 144  Q
    ||||||||||||||||||    
T  18679365 agcattagaagtctcttg 18679348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #102
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 18718654 - 18718537
Alignment:
Q  29 attgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttg-attagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||    || | |||| || |||||| |||||||||||||| |    |||||||    
T  18718654 attgtattgtgaacaccactcattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttatgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttacagttgtgcttg 18718555  T
Q  127 agcattagaagtctcttg 144  Q
    ||||||||||||||||||    
T  18718554 agcattagaagtctcttg 18718537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #103
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 193
Target Start/End: Original strand, 25850494 - 25850659
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||  | || | |||| || |||||| ||||||| ||||||| |  |||||||||    
T  25850494 ttgtattgtgaacaccacttattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatatttttgtgtaattgtgtttgtttagaagactcttgcttttgtgcttgag 25850593  T
Q  129 cattagaagtctcttg-cttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttt 193  Q
     ||  |||| ||||||  ||  ||||||||||| ||||  ||||||| | |||||||||| |||||    
T  25850594 tataggaagactcttgtgtttatgcttgagcataggaaacctcttgcttttgtgcttgagtagttt 25850659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #104
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 34 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 12541289 - 12541134
Alignment:
Q  34 attgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcatta 133  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | || | ||||  |||||||| || |||||||||||| |  |||||| |||||      
T  12541289 attgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaaccaaacttatttttgtgta-atttgtttgttttgaagtctcttgcttttgtgcttaagcatag 12541191  T
Q  134 gaagtctcttgct-tagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca 189  Q
    ||| | |||| || | ||||||||| ||| |||| |||| || | ||||||||||||    
T  12541190 gaaatatctttctattgtgcttgagtatttgaagtctctagcttttgtgcttgagca 12541134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #105
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 12193563 - 12193524
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12193563 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 12193524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #106
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 12437991 - 12437952
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12437991 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 12437952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #107
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 13431121 - 13431160
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13431121 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 13431160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #108
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 17701391 - 17701352
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17701391 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 17701352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #109
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 17928703 - 17928664
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17928703 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 17928664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #110
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 144
Target Start/End: Original strand, 18121618 - 18121725
Alignment:
Q  39 gaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctct-gtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattag 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  || || ||| ||| ||||||||||  | |||||||||||||    |||||||||||||||    
T  18121618 gaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaa--catttttctagtaattttgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttgagcattag 18121715  T
Q  135 aagtctcttg 144  Q
    ||||||||||    
T  18121716 aagtctcttg 18121725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #111
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 19707158 - 19707119
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19707158 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 19707119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #112
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 21932531 - 21932492
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21932531 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 21932492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #113
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 43639431 - 43639392
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43639431 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 43639392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #114
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 43644546 - 43644507
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43644546 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 43644507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #115
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 43773769 - 43773730
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43773769 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 43773730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #116
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 45292484 - 45292445
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45292484 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 45292445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #117
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 17797070 - 17796954
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||     |||| |||| ||||||||||  | |||||||||||||    |||||||    
T  17797070 ttgtattgtgaacaccgctgattgtatatcaagtgttcaacctcaaatatttttct-tgtaattttgtttgaattcagaagtctcttgcagttgtgcttg 17796972  T
Q  127 agcattagaagtctcttg 144  Q
    ||||||||||||||||||    
T  17796971 agcattagaagtctcttg 17796954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #118
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 30 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 18772342 - 18772196
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  | ||||  | |||| |||| || ||||||| || |||||||||||     ||||||||    
T  18772342 ttgtattgtgaacaccgctgattgtatatcaagtgttcaacctgaaacaaatttctttgtaattctgtttgaataaaagtctcttgcagttatgcttgag 18772243  T
Q  129 cattagaagtctcttg-cttagtgcttgagcattggaagactcttgc 174  Q
    |||  |||||||||||  ||||| ||||||||| ||||  |||||||    
T  18772242 cataggaagtctcttgatttagttcttgagcataggaaatctcttgc 18772196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #119
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 39 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 22707971 - 22707865
Alignment:
Q  39 gaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaag 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| | || || ||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||  ||||    
T  22707971 gaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctttataattatgtttgaatagaagtctcttgcagttgtgcttgagcatatgaag 22707872  T
Q  138 tctcttg 144  Q
    |||||||    
T  22707871 tctcttg 22707865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #120
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 131 - 184
Target Start/End: Original strand, 24678970 - 24679024
Alignment:
Q  131 ttagaagtctcttgcttagt-gcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgctt 184  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24678970 ttagaagtctcttgcttttttgcttgagcataggaagactcttgcgtgtgtgctt 24679024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #121
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 39 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 17879274 - 17879237
Alignment:
Q  39 gaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaac 76  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17879274 gaacaccactgattgtatatcaagtgttcaactcaaac 17879237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #122
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 24 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 24634974 - 24634929
Alignment:
Q  24 attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24634974 attgttttgtattgtgaacaccactaattgtatatcaagtgttcaa 24634929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #123
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 130 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 8031608 - 8031495
Alignment:
Q  130 attagaagtctcttgctt-ag-tgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatactttga-tagtattgagcat 226  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||| |||||   || |||||||||||  ||||||||||||||||||  |  ||||||||||||     
T  8031608 attagaagtctcttgctttagctgcttgagcaaaggaagtctcttttctgcgtgcttgagca--tttgtgaagtctcatactaggtgtagtattgagcag 8031511  T
Q  227 ttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||| ||||||    
T  8031510 ttgtaatctgtgtgat 8031495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #124
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 16206947 - 16206831
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctct-gtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgctt 125  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||  || || ||| ||| || |||||||  | ||||||||||||| |   |||||    
T  16206947 ttgtattgtgaaaaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaa--catttttctagtaattctgtttgaattaagaagtctcttgcatttttgctt 16206850  T
Q  126 gagcattagaagtctcttg 144  Q
    |||||||||||||||||||    
T  16206849 gagcattagaagtctcttg 16206831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #125
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 29 - 69
Target Start/End: Original strand, 17442319 - 17442359
Alignment:
Q  29 attgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17442319 attgtattgtgaacaccactgattgtgtatcaagtgttcaa 17442359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #126
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 22662766 - 22662619
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  | | ||||||||||| |  |||||||    
T  22662766 ttgtattgtgaacaccattgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaattcaaaagtctcttgcatttgtgcttg 22662667  T
Q  127 agcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttg 173  Q
    || | ||||||||||||||  | ||||||||||| | |||| ||||||    
T  22662666 agtaatagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttg 22662619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #127
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 39693184 - 39693021
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  || |||||||||| |    | |||||    
T  39693184 ttgtattgtgaacaccaatgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttggaagtctcttacagttgcgcttg 39693085  T
Q  127 agcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca 189  Q
    |||||||||||||||||| ||  || |  |||||| |||||||||||||   ||||||||||||    
T  39693084 agcattagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagactcttgcagttgtgcttgagca 39693021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #128
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 15336589 - 15336628
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15336589 ttgtattttgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 15336628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #129
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 15425654 - 15425693
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15425654 ttgtattttgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 15425693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #130
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 15516958 - 15516997
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15516958 ttgtattttgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 15516997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #131
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 17526233 - 17526272
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17526233 ttgtattgtgaacatcactgattgtatatcaagtgttcaa 17526272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #132
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 19155893 - 19155854
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19155893 ttgtattgtgagcaccactgattgtatatcaagtgttcaa 19155854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #133
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 23264126 - 23264165
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23264126 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgctcaa 23264165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #134
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 24498610 - 24498649
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24498610 ttgtattgtgaacaccactgattatatatcaagtgttcaa 24498649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #135
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 34 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 24645977 - 24645942
Alignment:
Q  34 attgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24645977 attgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 24645942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #136
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 27739532 - 27739493
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27739532 ttgtattgtgatcaccactgattgtatatcaagtgttcaa 27739493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #137
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 30 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 36104846 - 36104811
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgt 65  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  36104846 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgt 36104811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #138
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 17879205 - 17879155
Alignment:
Q  140 tcttgctta-gtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca 189  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  17879205 tcttgcttatgtgcttgagcattgaaagtctcttgcttgtgtgcttgagca 17879155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #139
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 104 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 21298560 - 21298431
Alignment:
Q  104 gaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgctta-gtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtc 202  Q
    |||||||||||| || |||||||||||   ||||||||||||||  |||||||||||  ||||| ||||||| | ||||||  |||| |||   ||||||    
T  21298560 gaagtctcttgcttgtgtgcttgagcaaaggaagtctcttgcttgtgtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctttgtgctgtagcaattt---gaagtc 21298464  T
Q  203 tcatactttga-tagtattgagcatttgtaatc 234  Q
    |||||||  |  |||||||||||| ||||||||    
T  21298463 tcatactaggtgtagtattgagcagttgtaatc 21298431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #140
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 102 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 28888874 - 28888788
Alignment:
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgct-tagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgag 187  Q
    ||||||| |||||| || |||||||| | || |||||||||| |  | ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  28888874 tagaagtatcttgcttgtgtgcttgatcgttggaagtctctttcagttgtgattgagcattggaagtctcttgcatgtgtgcttgag 28888788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #141
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 33 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 6407372 - 6407336
Alignment:
Q  33 tattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6407372 tattgtgaacaccattgattgtatatcaagtgttcaa 6407336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #142
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 131 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 27739464 - 27739408
Alignment:
Q  131 ttagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgag 187  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||  ||||| | ||||||||||||    
T  27739464 ttagaagtctcttgctttctgcttgagcataggaaatctcttacttgtgtgcttgag 27739408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 138)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 16768807 - 16768567
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16768807 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 16768708  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 201  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16768707 cagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 16768608  T
Q  202 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16768607 ctcatacttagaaagtattgagcatttgtaatctttgtgat 16768567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 6 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 43082514 - 43082278
Alignment:
Q  6 tcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattaga 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  43082514 tcaaagtctagagtctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgatcaga 43082415  T
Q  106 agtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctca 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  43082414 agtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctca 43082315  T
Q  206 tactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43082314 tacttagaaagtattgagcatttgtaatctttgtgat 43082278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 43093127 - 43092887
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43093127 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 43093028  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 201  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  43093027 cagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttacttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 43092928  T
Q  202 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43092927 ctcatacttagaaagtattgagcatttgtaatctttgtgat 43092887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Original strand, 24328098 - 24328338
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24328098 aaattcaaagtctagagtctttactgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaactcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 24328197  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24328198 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 24328297  T
Q  202 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24328298 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 24328338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Original strand, 24338768 - 24339008
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24338768 aaattcaaagtctagagtctttactgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaactcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 24338867  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24338868 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcaattttgtgaagt 24338967  T
Q  202 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24338968 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 24339008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 2 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 29254665 - 29254428
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29254665 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaactcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 29254566  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 201  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29254565 cagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 29254466  T
Q  202 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgt 239  Q
    ||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  29254465 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgt 29254428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Original strand, 1099559 - 1099799
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1099559 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 1099658  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1099659 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 1099758  T
Q  202 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1099759 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 1099799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Original strand, 7006171 - 7006411
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7006171 aaattcaaagtctagagtctgtactgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaactcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 7006270  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7006271 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 7006370  T
Q  202 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7006371 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 7006411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Original strand, 9773668 - 9773908
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9773668 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 9773767  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9773768 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 9773867  T
Q  202 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9773868 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 9773908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Original strand, 11389173 - 11389413
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11389173 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 11389272  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11389273 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 11389372  T
Q  202 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11389373 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 11389413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Original strand, 22915228 - 22915468
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22915228 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 22915327  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22915328 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 22915427  T
Q  202 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22915428 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 22915468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Original strand, 22960696 - 22960936
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22960696 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 22960795  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22960796 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 22960895  T
Q  202 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22960896 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 22960936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 29244086 - 29243846
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29244086 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaactcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 29243987  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 201  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29243986 cagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctctttcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 29243887  T
Q  202 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29243886 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 29243846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Original strand, 30489188 - 30489428
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30489188 aaattcatagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctcagtatttttgtttgat 30489287  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  30489288 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagtcttttgaagt 30489387  T
Q  202 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30489388 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 30489428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 4099678 - 4099438
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4099678 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgaatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 4099579  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4099578 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 4099479  T
Q  202 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4099478 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 4099438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 4209753 - 4209513
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4209753 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattatatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 4209654  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4209653 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 4209554  T
Q  202 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4209553 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 4209513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 4220345 - 4220105
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4220345 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 4220246  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4220245 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 4220146  T
Q  202 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  4220145 ctcatacttagaaagtattgagtagttgtaatctttgtgat 4220105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Original strand, 9763132 - 9763372
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9763132 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 9763231  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9763232 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 9763331  T
Q  202 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    |||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9763332 ctcatatttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 9763372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Original strand, 17857801 - 17858041
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17857801 aaattcaaagtctagagtctttactgtattgtattgtgaacatcactgattgtatatcaagtgttcaactcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 17857900  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17857901 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 17858000  T
Q  202 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||| || | ||||||||| ||||||||||||||||    
T  17858001 ctcatacttagaaaatattgagcagttgtaatctttgtgat 17858041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Original strand, 34790581 - 34790821
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34790581 aaattcaaagtctagagtctttactgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 34790680  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  34790681 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcttgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 34790780  T
Q  202 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||| || |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  34790781 ctcatacttagaaagtactgagcagttgtaatctttgtgat 34790821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Original strand, 34804724 - 34804964
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34804724 aaattcaaagtctagagtctttactgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 34804823  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  34804824 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcttgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 34804923  T
Q  202 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||| || |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  34804924 ctcatacttagaaagtactgagcagttgtaatctttgtgat 34804964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Original strand, 11395536 - 11395778
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11395536 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 11395635  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca--gttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  11395636 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcttgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 11395735  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11395736 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 11395778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Original strand, 11405852 - 11406094
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11405852 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 11405951  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca--gttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  11405952 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcttgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 11406051  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11406052 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 11406094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Original strand, 18393001 - 18393243
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18393001 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 18393100  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagc--agttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  18393101 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaa 18393200  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18393201 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 18393243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 2 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 10266858 - 10266622
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10266858 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 10266759  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca--gttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  10266758 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 10266659  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctt 236  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  10266658 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatctt 10266622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 2 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 10277435 - 10277199
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10277435 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 10277336  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca--gttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  10277335 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 10277236  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctt 236  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  10277235 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatctt 10277199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Original strand, 36252208 - 36252448
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36252208 aaattcaaagtctagagtctttactgtattgtgttgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 36252307  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 201  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  36252308 tagaagcctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttacgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 36252407  T
Q  202 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36252408 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 36252448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 32217738 - 32217496
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32217738 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 32217639  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca--gttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||    
T  32217638 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttttgtgaa 32217539  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32217538 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 32217496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 34477793 - 34477552
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34477793 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtattgttgtttgat 34477694  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca-gttttgtgaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  34477693 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattttttgtgaag 34477594  T
Q  201 tctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34477593 tctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 34477552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 2 - 236
Target Start/End: Original strand, 39170459 - 39170695
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  39170459 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttctgtttgat 39170558  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca--gttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  39170559 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 39170658  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctt 236  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  39170659 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatctt 39170695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 40222197 - 40221956
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtata-tcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40222197 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtataatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttga 40222098  T
Q  101 ttagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40222097 ttagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaag 40221998  T
Q  201 tctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||| |||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40221997 tcttatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 40221956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 40251058 - 40250817
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtata-tcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40251058 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtataatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttga 40250959  T
Q  101 ttagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaag 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40250958 ttagaagtcgcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaag 40250859  T
Q  201 tctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40250858 tctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 40250817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Original strand, 9897938 - 9898181
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9897938 aaattcaaagtctagagtctttactgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatgaagtgttcaacttaaactcaattctctgtatttttgtttgat 9898037  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca---gttttgtga 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||    
T  9898038 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattttttttgtga 9898137  T
Q  199 agtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9898138 agtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 9898181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Original strand, 9908526 - 9908769
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9908526 aaattcaaagtctagagtctttactgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatgaagtgttcaactcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 9908625  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca---gttttgtga 198  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||    
T  9908626 tagaagtctcttgtctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattttttttgtga 9908725  T
Q  199 agtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9908726 agtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 9908769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 2 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 35263455 - 35263219
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35263455 aaattcatagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 35263356  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagc--agttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  35263355 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaa 35263256  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctt 236  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  35263255 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctt 35263219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 2 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 35274080 - 35273844
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35274080 aaattcatagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 35273981  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagc--agttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  35273980 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaa 35273881  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctt 236  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  35273880 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctt 35273844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 2 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 27221245 - 27221009
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27221245 aaattcatagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctatatttttgtttgat 27221146  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagc--agttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  27221145 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaa 27221046  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctt 236  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  27221045 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctt 27221009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 2 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 43345272 - 43345036
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43345272 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 43345173  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagc--agttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |    
T  43345172 tagaagtctctagcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgta 43345073  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctt 236  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  43345072 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctt 43345036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 2 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 43354887 - 43354651
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43354887 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 43354788  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagc--agttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |    
T  43354787 tagaagtctctagcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgta 43354688  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctt 236  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  43354687 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctt 43354651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 2 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 35252846 - 35252610
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35252846 aaattcatagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaattcaactcaattctctgtatttttgtttgat 35252747  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagc--agttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  35252746 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaa 35252647  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctt 236  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  35252646 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctt 35252610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 8 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 2561346 - 2561112
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||| |||||    
T  2561346 aaagtctagagtcttaattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaatttaattcattgtatttttgtttgatcagaag 2561247  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcata 207  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  2561246 cctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcata 2561147  T
Q  208 ctttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2561146 cttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgat 2561112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 8 - 242
Target Start/End: Original strand, 24415391 - 24415625
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||| |||||    
T  24415391 aaagtctagagtctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttatctctttgtatttttgtttgatcagaag 24415490  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcata 207  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  24415491 actcttgcctgtgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcata 24415590  T
Q  208 ctttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24415591 cttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgat 24415625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 8 - 242
Target Start/End: Original strand, 24427956 - 24428190
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||| |||||    
T  24427956 aaagtctagagtctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttatctctttgtatttttgtttgatcagaag 24428055  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcata 207  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  24428056 actcttgcctgtgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcata 24428155  T
Q  208 ctttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24428156 cttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgat 24428190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 8 - 242
Target Start/End: Original strand, 18769275 - 18769508
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||| |||||    
T  18769275 aaagtctagagtctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttatttcattgtatttttgtttgatcagaag 18769374  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcata 207  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  18769375 actcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcctgtgtgcttgagca-ttttgagaagtctcata 18769473  T
Q  208 ctttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||| || || |||||||||||||||||||||||||    
T  18769474 cttagagagcattgagcatttgtaatctttgtgat 18769508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 8 - 242
Target Start/End: Original strand, 28732272 - 28732506
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||| |||||    
T  28732272 aaagtctagagtctttaacgtattatattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttatttcattgtatttttgtttgatcagaag 28732371  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcata 207  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  28732372 cctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcata 28732471  T
Q  208 ctttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28732472 cttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgat 28732506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 9 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 26866929 - 26866696
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtattttt-gtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||| ||||||| |||||    
T  26866929 aagtctagagtctttattgcattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacatatttccctgtattttttgtttgatcagaag 26866830  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcata 207  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  26866829 actcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgaggattggaagactcttgcctgtgtgcttgagca-ttttgagaagtctcata 26866731  T
Q  208 ctttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26866730 cttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgat 26866696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 8 - 242
Target Start/End: Original strand, 28721686 - 28721920
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |  ||  |||||||||||||||| |||||    
T  28721686 aaagtctagagtctttaacgtattatattgtgaacaccactaattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttatatcattgtatttttgtttgatcagaag 28721785  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcata 207  Q
     || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  28721786 ccttttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcata 28721885  T
Q  208 ctttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||| || ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28721886 cttagagagtattgagcatttgcaatctttgtgat 28721920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 8 - 242
Target Start/End: Original strand, 21172836 - 21173072
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||| | |||    
T  21172836 aaagtctagagtctttaacgtattgtgttgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttatttcattgtatttttgtttgatcataag 21172935  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca-gttttgtgaagtctcat 206  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  21172936 cctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattttttgagaagtctcat 21173035  T
Q  207 actttgatagtattgagca-tttgtaatctttgtgat 242  Q
    |||| || ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21173036 acttagagagtattgagcattttgtaatctttgtgat 21173072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 9 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 26879518 - 26879285
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtattttt-gtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| || ||||||| ||||||| |||||    
T  26879518 aagtctagagtctttattgcattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacatatttccctatattttttgtttgatcagaag 26879419  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcata 207  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  26879418 actcttgcctacgtgcttgagcattagaaaactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcctatgtgcttgagca-ttttgagaagtctcata 26879320  T
Q  208 ctttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26879319 cttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgat 26879285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 9 - 242
Target Start/End: Original strand, 27978753 - 27978985
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    ||||||||||||||||||||  |||||    
T  27978753 aagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaggtcaaacatt-ttctctgtatttttgtttgaacagaag 27978851  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcata 207  Q
     |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  27978852 actctcgcctgcgtgcttgagcattagtagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcctgcgtgcttgagca-ttttgagaagtctcata 27978950  T
Q  208 ctttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27978951 cttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgat 27978985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 9 - 242
Target Start/End: Original strand, 28065282 - 28065514
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    ||||||||||||||||||||  |||||    
T  28065282 aagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaggtcaaacatt-ttctctgtatttttgtttgaacagaag 28065380  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcata 207  Q
     |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  28065381 actctcgcctgcgtgcttgagcattagtagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcctgcgtgcttgagca-ttttgagaagtctcata 28065479  T
Q  208 ctttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28065480 cttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgat 28065514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 9 - 242
Target Start/End: Original strand, 36785170 - 36785403
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||    |||||||||||||||||||| ||||||    
T  36785170 aagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccactgttagtatatcaagtgttcaaagtcaaacatt-ttctctgtatttttgtttgaatagaag 36785268  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcat 206  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  36785269 cctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgaccattggaagactcttgcctgcgtgcttgagca-ttttgagaagtctcat 36785367  T
Q  207 actttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    |||| || ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  36785368 acttagagagtattgagcatttgtaatttttgtgat 36785403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 9 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 22763511 - 22763288
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| |||||||||||| ||||    
T  22763511 aagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaatctcaaacatt-ttctgtgtaattttgtttgattggaag 22763413  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcat 206  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  22763412 tctcttgcttgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctcttgcctgtgtgcttgagca--tttgtgaagtctcat 22763315  T
Q  207 actttgatagtattgagcatttgtaat 233  Q
    |||| || |||||||||||||||||||    
T  22763314 acttagagagtattgagcatttgtaat 22763288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 9 - 242
Target Start/End: Original strand, 38586457 - 38586693
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtatt-gagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaa 106  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    ||||||||||||||||||||  | ||    
T  38586457 aagtctagagtctttattgcattatatttgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaggtcaaacatt-ttctctgtatttttgtttgaacataa 38586555  T
Q  107 gtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca--gttttgtgaagtctc 204  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||   ||||| ||||||||    
T  38586556 gtctcttgcttgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcctgcgtgcttgagcatttttttgagaagtctc 38586655  T
Q  205 atactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    |||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38586656 atacttagagagtattgagcacttgtaatctttgtgat 38586693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 9 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 22774215 - 22773990
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| |||||||| ||| ||||    
T  22774215 aagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaatctcaaacatt-ttctgtgtaattttgtttaattggaag 22774117  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcat 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  22774116 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctttcctgtgtgcttgagca--tttgtgaagtctcat 22774019  T
Q  207 actttgatagtattgagcatttgtaatct 235  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||    
T  22774018 acttagagagtattgagcatttgtaatct 22773990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 9 - 242
Target Start/End: Original strand, 967875 - 968107
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| |||||||||||||||||    
T  967875 aagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacatt-ttctgtgtaattttgtttgattagaag 967973  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcat 206  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||    
T  967974 cctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcat 968071  T
Q  207 actttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    |||  || ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  968072 actaagagagtattgagcatttgtaatctgtgtgat 968107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 9 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 24274882 - 24274651
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttc-aagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||| |||| |||||||||| ||||||    
T  24274882 aagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaac-atattctgtgtaattttgtttgaatagaag 24274784  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcat 206  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||    
T  24274783 tctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcat 24274686  T
Q  207 actttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    || | |  ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24274685 ac-tagtgagtattgagcatttgtaatctgtgtgat 24274651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 9 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 1042006 - 1041781
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttc-aagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||| |||||| |||||||||||||||    
T  1042006 aagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaact-ttttctgtgtattgttgtttgattagaag 1041908  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcat 206  Q
     |||| ||||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||    
T  1041907 cctctcgcctgtgtgcttgagcattataagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcat 1041810  T
Q  207 actttgatagtattgagcatttgtaatct 235  Q
    |||  || |||||||||||||||||||||    
T  1041809 actaagagagtattgagcatttgtaatct 1041781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 9 - 242
Target Start/End: Original strand, 17970641 - 17970872
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| |||||||||||||||||    
T  17970641 aagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacatt-ttctgtgtaattttgtttgattagaag 17970739  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcat 206  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||| ||||    
T  17970740 cctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtttcat 17970837  T
Q  207 actttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    || | | |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17970838 ac-tagttagtattgagcatttgtaatctgtgtgat 17970872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 9 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 19356177 - 19355945
Alignment:
Q  9 aagtctagagtcttt-attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||| |||| || ||||||||||||||    
T  19356177 aagtctagagtcttttactgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacaattttctgtgtaattctgtttgattagaag 19356078  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcat 206  Q
    |||||||| |  ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||||||  |||  ||||||||||    
T  19356077 tctcttgctttagtgcttgagcattggaagtctcttgctttagtgcctgagcattggaagtctcttgcctgcgtgcttgagca--tttaggaagtctcat 19355980  T
Q  207 actttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    || | |||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  19355979 ac-tagatagtattgagcagttgtaatctgtgtgat 19355945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 108 - 236
Target Start/End: Original strand, 21650975 - 21651105
Alignment:
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagc--agttttgtgaagtctca 205  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  21650975 tctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaagtctca 21651074  T
Q  206 tactttgatagtattgagcatttgtaatctt 236  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  21651075 tacttagaaagtattgagcagttgtaatctt 21651105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 2 - 86
Target Start/End: Original strand, 21650895 - 21650979
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctct 86  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21650895 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctct 21650979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 9 - 161
Target Start/End: Original strand, 19313389 - 19313544
Alignment:
Q  9 aagtctagagtcttt-attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttc-aagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaa 106  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    |||| |||| ||||||||||||||||    
T  19313389 aagtctagagtcttttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacaattttctgtgtaattttgtttgattagaa 19313488  T
Q  107 gtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttg-cttagtgcttgagcatt 161  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||  ||| ||||||| ||  |||||||||||||    
T  19313489 gtctcttgctttagtgcttgagcataggaaatctcttgcctgcgtgcttgagcatt 19313544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 9 - 242
Target Start/End: Original strand, 20646980 - 20647214
Alignment:
Q  9 aagtctagagtcttta--ttgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattaga 105  Q
    |||||||||||||||   ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| ||||    
T  20646980 aagtctagagtctttcatttgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaataga 20647079  T
Q  106 agtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttg-cttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctc 204  Q
    |||||||| | |  ||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||  ||||| ||||||| || ||||||||||| |||   ||||||||    
T  20647080 agtctcttactttagtgcttgagcataggaagtctcttgatttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcaattt--ggaagtctc 20647177  T
Q  205 atactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    |||| | | ||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  20647178 atac-taggtagtattaagcagttgtaatctgtgtgat 20647214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 24 - 234
Target Start/End: Original strand, 24801988 - 24802198
Alignment:
Q  24 attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtg 122  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| |||||||||||||| |  |||    
T  24801988 attgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctatgtaattctgtttgaatagaagtctcttgctttagtg 24802087  T
Q  123 cttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatactttg-atagtatt 220  Q
    |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||| || |||| ||||||   || ||||||||||||||  |  |||||||    
T  24802088 cttgagcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcatgagca---ttttgaagtctcatactaggtgtagtatt 24802184  T
Q  221 gagcatttgtaatc 234  Q
    ||||| ||||||||    
T  24802185 gagcagttgtaatc 24802198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 24 - 234
Target Start/End: Original strand, 24814955 - 24815165
Alignment:
Q  24 attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtg 122  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| |||||||||||||| |  |||    
T  24814955 attgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctatgtaattctgtttgaatagaagtctcttgctttagtg 24815054  T
Q  123 cttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatactttg-atagtatt 220  Q
    |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||  ||||| | ||||| || ||||||||||| ||   ||||||||||||||  |  |||||||    
T  24815055 cttgagcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtcacttgcctgcgtgcttgagcaatt---tgaagtctcatactaggtgtagtatt 24815151  T
Q  221 gagcatttgtaatc 234  Q
    ||||| ||||||||    
T  24815152 gagcagttgtaatc 24815165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 29 - 234
Target Start/End: Original strand, 23393113 - 23393318
Alignment:
Q  29 attgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttga 127  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| |||||||||||| | |  ||||||||    
T  23393113 attgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttactttagtgcttga 23393212  T
Q  128 gcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatactttg-atagtattgagca 225  Q
    ||||  |||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||| || ||||||||||| ||   ||||||||||||||  |  ||||||||||||    
T  23393213 gcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcaatt---tgaagtctcatactaggtgtagtattgagca 23393309  T
Q  226 tttgtaatc 234  Q
     ||||||||    
T  23393310 gttgtaatc 23393318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 9 - 161
Target Start/End: Original strand, 19300382 - 19300537
Alignment:
Q  9 aagtctagagtcttt-attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttc-aagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaa 106  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    |||| |||| || ||||||| |||||    
T  19300382 aagtctagagtcttttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatagaa 19300481  T
Q  107 gtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttg-cttagtgcttgagcatt 161  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||  ||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  19300482 gtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcatt 19300537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 9 - 161
Target Start/End: Original strand, 19498362 - 19498517
Alignment:
Q  9 aagtctagagtcttt-attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaa 106  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| |||||    
T  19498362 aagtctagagtctttcattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaactttctgtgtaattctgtttgaatagaa 19498461  T
Q  107 gtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttg-cttagtgcttgagcatt 161  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||  ||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  19498462 gtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcatt 19498517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 29 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 1083669 - 1083465
Alignment:
Q  29 attgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttga 127  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| |||||||||||||| |  ||||||||    
T  1083669 attgtattgtgaacaccattgattgtatatcaaatgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttgctttagtgcttga 1083570  T
Q  128 gcattagaagtctcttg-cttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatactttg-atagtattgagca 225  Q
    ||||  ||||||||||| ||  |||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||| ||   ||||||||||||||  |  ||||||||||||    
T  1083569 gcataggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgtgtgcttgagcaatt---tgaagtctcatactaggtgtagtattgagca 1083473  T
Q  226 tttgtaat 233  Q
     |||||||    
T  1083472 gttgtaat 1083465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 30 - 189
Target Start/End: Original strand, 21911311 - 21911473
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  21911311 ttgtattgtgaacaccactgattgggtatcaagtgttcaacctcaaacatttttctgtgtaattttgtttgattagaagtctcttgcttttgtgcttgag 21911410  T
Q  129 cattagaagtctcttgctt-agtgcttgagca-ttggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca 189  Q
    |||  ||| ||||||||||  ||||||||| | ||||||| |||||||  |||||||||||||    
T  21911411 cataggaaatctcttgcttgtgtgcttgagtatttggaagtctcttgctagtgtgcttgagca 21911473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 9 - 69
Target Start/End: Original strand, 17969581 - 17969641
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17969581 aagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 17969641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 132 - 242
Target Start/End: Original strand, 19302918 - 19303026
Alignment:
Q  132 tagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatactttgatagtattgagcatttgt 230  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| || |||||||||||  ||||||||||||||||| | | |||||||||||| ||||    
T  19302918 tagaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgcctgcgtgcttgagca--tttgtgaagtctcatac-taggtagtattgagcagttgt 19303014  T
Q  231 aatctttgtgat 242  Q
    ||||| ||||||    
T  19303015 aatctgtgtgat 19303026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 132 - 242
Target Start/End: Original strand, 19498457 - 19498565
Alignment:
Q  132 tagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatactttgatagtattgagcatttgt 230  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| || |||||||||||  |||| |||||||||||| | |||||||||||||| ||||    
T  19498457 tagaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgcctgcgtgcttgagca--tttgggaagtctcatac-tagatagtattgagcagttgt 19498553  T
Q  231 aatctttgtgat 242  Q
    ||||| ||||||    
T  19498554 aatctgtgtgat 19498565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 39 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 24843847 - 24843741
Alignment:
Q  39 gaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaag 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  | |||| |||| || ||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||  ||||    
T  24843847 gaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaaatttctttgtaattctgtttgaatagaagtctcttgccgttgtgcttgagcataggaag 24843748  T
Q  138 tctcttg 144  Q
    |||||||    
T  24843747 tctcttg 24843741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 30 - 165
Target Start/End: Original strand, 26619548 - 26619685
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||  | |||| |||| || ||||||| ||||||||||||||    |||||||||    
T  26619548 ttgtattgtgaacatcactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatatttctttgtaattctgtttgaatagaagtctcttgcagttgtgcttgag 26619647  T
Q  129 cattagaagtctcttg-cttagtgcttgagcattggaa 165  Q
    |||  |||||||||||  ||||| ||||||||| ||||    
T  26619648 catatgaagtctcttgatttagttcttgagcataggaa 26619685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 130 - 242
Target Start/End: Original strand, 38033296 - 38033407
Alignment:
Q  130 attagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatactttgatagtattgagcattt 228  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| || |||| || ||||||||||| |||| ||||||||||||| | | |||||||||||| ||    
T  38033296 attagaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtcttttgcctgcgtgcttgagca-ttttttgaagtctcatac-taggtagtattgagcagtt 38033393  T
Q  229 gtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||| ||||||    
T  38033394 gtaatctgtgtgat 38033407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 9 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 22755148 - 22755009
Alignment:
Q  9 aagtctagagtcttt--attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattaga 105  Q
    |||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || | ||||||||||    
T  22755148 aagtctagagtctttcaattgcattgtattgtgaacaccgctgattttatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctatttgattaga 22755049  T
Q  106 agtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc 145  Q
    |||||||||| |  |||||||||||   ||||||||||||    
T  22755048 agtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgc 22755009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Original strand, 18431386 - 18431501
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  | |||| |||| || ||||||| ||||||||| ||||    |||||||||    
T  18431386 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaaatttctttgtaattctgtttgaatagaagtctgttgcagttgtgcttgag 18431485  T
Q  129 cattagaagtctcttg 144  Q
    |||  |||||||||||    
T  18431486 cataggaagtctcttg 18431501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 18702393 - 18702278
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  | |||| |||| || ||||||| ||||||||||||||     ||||||||    
T  18702393 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaaatttctttgtaattctgtttgaatagaagtctcttgcagttatgcttgag 18702294  T
Q  129 cattagaagtctcttg 144  Q
    |||  |||||||||||    
T  18702293 cataggaagtctcttg 18702278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 131
Target Start/End: Original strand, 15671053 - 15671157
Alignment:
Q  25 ttgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgct 124  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | |||| ||||  |||||||| ||||||||||||||  |  |||||    
T  15671053 ttgttttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaatccaaacttatttct-tgta-atttgtttgtttagaagtctcttgtttttgtgct 15671150  T
Q  125 tgagcat 131  Q
    |||||||    
T  15671151 tgagcat 15671157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 101 - 186
Target Start/End: Original strand, 16587510 - 16587596
Alignment:
Q  101 ttagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttga 186  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| || | || ||| |||||||||||||| ||||||  |||||||||||    
T  16587510 ttagaagtctcttgcatgcgtgcttgagcattggaagtctgtttcatttgtgattgagcattggaagtctcttgtttgtgtgcttga 16587596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 130 - 242
Target Start/End: Original strand, 19313482 - 19313592
Alignment:
Q  130 attagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatactttgatagtattgagcattt 228  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  ||||||| || |||||||||||  |||| |||||||||||| | | |||||||||||| ||    
T  19313482 attagaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaaatctcttgcctgcgtgcttgagca--tttgggaagtctcatac-tcggtagtattgagcagtt 19313578  T
Q  229 gtaatctttgtgat 242  Q
     |||||| ||||||    
T  19313579 ataatctgtgtgat 19313592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 22383125 - 22382968
Alignment:
Q  39 gaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag--tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaa 136  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||   ||||||  | || | |||| || |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||  |||    
T  22383125 gaacaacactgatagtatatcaagtgttcaaccctcaaacaaatttttgtgtaattctgtttgattagaagtctcttgcttttgtgcttgagcataggaa 22383026  T
Q  137 gtctcttg-cttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttt 193  Q
    ||||||||  || |||||||||||| ||||   |||||| | |||||||||| |||||    
T  22383025 gtctcttgtgtttgtgcttgagcataggaaacgtcttgcttttgtgcttgagtagttt 22382968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 24575688 - 24575571
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  || ||||||||||||    |||||||    
T  24575688 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaatttggaagtctcttgcagttgtgcttg 24575589  T
Q  127 agcattagaagtctcttg 144  Q
    ||||||||||||||||||    
T  24575588 agcattagaagtctcttg 24575571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 25918363 - 25918265
Alignment:
Q  33 tattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcat 131  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    |||| |||| ||||||||  ||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  25918363 tattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaaccaaacatccttctatgtaattttgtttatttagaagtctcttgcttttgtgcttgagcat 25918265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 30 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 22271784 - 22271619
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  | || | |||| || ||||||| || |||||||||||     |||||| |    
T  22271784 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatatttatatgtaattctgtttgaatataagtctcttgcagttatgcttggg 22271685  T
Q  129 cattagaagtctcttg-cttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttt 193  Q
    ||| ||||||||||||  ||||| ||||||||| ||||  |||||||   |||||||||| |||||    
T  22271684 cataagaagtctcttgatttagttcttgagcataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtagttt 22271619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 161
Target Start/End: Original strand, 14794307 - 14794438
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgagc 129  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| | || | ||||  |||||||| |||||||| |||| | |  |||||||||     
T  14794307 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagttttcaaaccaaacttatttgtgtgta-atttgtttgtttagaagtatcttacttttgtgcttgagt 14794405  T
Q  130 attagaagtctcttgctt-agtgcttgagcatt 161  Q
    ||| |||||||||| |||  |||||||||||||    
T  14794406 atttgaagtctcttacttgtgtgcttgagcatt 14794438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Original strand, 28141049 - 28141165
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttg-attagaagtctcttgcctgcgtgcttga 127  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||    |||| |||| || |||||| ||||||||||||||||    ||||||||    
T  28141049 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaaatgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcagttgtgcttga 28141148  T
Q  128 gcattagaagtctcttg 144  Q
    |||||| ||||||||||    
T  28141149 gcattaaaagtctcttg 28141165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 30794497 - 30794433
Alignment:
Q  179 gtgcttgagcagttttgtgaagtctcatactttgatagtattgagca-tttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30794497 gtgcttgagcatttttgagaagtctcatacttagagagtattgagcattttgtaatctttgtgat 30794433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 132 - 209
Target Start/End: Original strand, 19300477 - 19300553
Alignment:
Q  132 tagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatact 209  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| || |||||||||||  |||| |||||||||||||    
T  19300477 tagaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgcctgcgtgcttgagca--tttgggaagtctcatact 19300553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 24376758 - 24376644
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| ||||||||||||||    |||||||||    
T  24376758 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttgcagttgtgcttgag 24376659  T
Q  129 cattagaagtctcttg 144  Q
    || || ||||||||||    
T  24376658 ca-tataagtctcttg 24376644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Original strand, 10010198 - 10010315
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||     |||| |||| || |||||||  |||||| ||||||||    |||||||    
T  10010198 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaatatttttctgtgtaattctgtttgaatttagaaatctcttgcagttgtgcttg 10010297  T
Q  127 agcattagaagtctcttg 144  Q
    ||||||||||||||||||    
T  10010298 agcattagaagtctcttg 10010315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Original strand, 20569197 - 20569314
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttca-agtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||    |||| |||| ||||||||||  || ||||||||||||    |||| ||    
T  20569197 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcagcctcaaacatttttctttgtaattttgtttgaatttggaagtctcttgcagttgtgcctg 20569296  T
Q  127 agcattagaagtctcttg 144  Q
    ||||||||||||||||||    
T  20569297 agcattagaagtctcttg 20569314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Original strand, 22786103 - 22786220
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  | |||||||||||||    |||||||    
T  22786103 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttg 22786202  T
Q  127 agcattagaagtctcttg 144  Q
    |||| |||||||||||||    
T  22786203 agcaatagaagtctcttg 22786220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 38781048 - 38780931
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  | ||||||||||||     |||||||    
T  38781048 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacctttttctttgtaattctgtttgaattaagaagtctcttgtagttgtgcttg 38780949  T
Q  127 agcattagaagtctcttg 144  Q
    ||||||||||||||||||    
T  38780948 agcattagaagtctcttg 38780931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 143
Target Start/End: Original strand, 20152449 - 20152564
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  | |||||||||||||    |||||||    
T  20152449 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacatcaaacatttttct-tgtaattctgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttg 20152547  T
Q  127 agcattagaagtctctt 143  Q
    |||||||||||||||||    
T  20152548 agcattagaagtctctt 20152564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 69
Target Start/End: Original strand, 22525269 - 22525314
Alignment:
Q  24 attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22525269 attgttttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 22525314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 19540069 - 19539953
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttg-attagaagtctcttgcctgcgtgcttga 127  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    || | |||| || |||||| ||| ||||||||||||    ||||||||    
T  19540069 ttgtattatgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttatgtgtaattctgtttgaatttgaagtctcttgcagttgtgcttga 19539970  T
Q  128 gcattagaagtctcttg 144  Q
    |||||||||||||||||    
T  19539969 gcattagaagtctcttg 19539953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 29 - 69
Target Start/End: Original strand, 31328410 - 31328450
Alignment:
Q  29 attgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31328410 attgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 31328450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 29 - 69
Target Start/End: Original strand, 31335131 - 31335171
Alignment:
Q  29 attgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31335131 attgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 31335171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 6574576 - 6574615
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6574576 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 6574615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #103
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 14581210 - 14581171
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14581210 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 14581171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #104
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Original strand, 21537699 - 21537813
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| ||||||||||||||    |||||||||    
T  21537699 ttgtattgtaaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttgcagttgtgcttgag 21537798  T
Q  129 cattagaagtctcttg 144  Q
    || || ||||||||||    
T  21537799 ca-taaaagtctcttg 21537813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #105
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 105 - 144
Target Start/End: Original strand, 21548821 - 21548860
Alignment:
Q  105 aagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttg 144  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21548821 aagtctcttgcttgcgtgcttgagcattagaagtctcttg 21548860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #106
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 131 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 21845738 - 21845679
Alignment:
Q  131 ttagaagtctcttgctta-gtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca 189  Q
    |||||||||| ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21845738 ttagaagtcttttgcttttgtgcttgagcataggaagactcttgcgtttgtgcttgagca 21845679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #107
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 21845810 - 21845771
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21845810 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 21845771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #108
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 22188551 - 22188590
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22188551 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 22188590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #109
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 22802122 - 22802083
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22802122 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 22802083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #110
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 23234656 - 23234543
Alignment:
Q  33 tattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttgagc 129  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||   |||| |||| || |||||||  ||| |||||||||||    ||||||||||    
T  23234656 tattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacttttttctttgtaattctgtttgaatttaaaagtctcttgcagttgtgcttgagc 23234557  T
Q  130 attagaagtctcttg 144  Q
    | |||||||||||||    
T  23234556 a-tagaagtctcttg 23234543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #111
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 28551367 - 28551406
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28551367 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 28551406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #112
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 31801336 - 31801375
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31801336 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 31801375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #113
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 40331761 - 40331722
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40331761 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 40331722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #114
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 44840085 - 44840046
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44840085 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 44840046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #115
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 44880817 - 44880734
Alignment:
Q  33 tattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgc 115  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||  | |||| |||| || ||||||| ||||||||||||||    
T  44880817 tattgtgaacaccactgattgcatatcaagtgttcaacctcaaacatatttctttgtaattatgtttgaatagaagtctcttgc 44880734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #116
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 22317243 - 22317127
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  | |||||||||||||    |||||||    
T  22317243 ttgtattgtgaaaaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttct-tgtaattctgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttg 22317145  T
Q  127 agcattagaagtctcttg 144  Q
    ||||||||||||||||||    
T  22317144 agcattagaagtctcttg 22317127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #117
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 25 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 22683051 - 22682882
Alignment:
Q  25 ttgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgct 124  Q
    |||| |||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||| | || | ||||  |||||||| || |||||||||||| |  ||| |    
T  22683051 ttgttttgtattctgaacaccacttattgtatatcaagtgtttaaaccaaacttatttatgtgta-atttgtttgtttggaagtctcttgcttttgtgtt 22682953  T
Q  125 tgagcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagtttt 194  Q
    |||||||  ||| ||||||| ||  ||||||||| |||  ||| |||| || |||||||||||||| ||||    
T  22682952 tgagcataggaaatctcttggttgtgtgcttgagtattttaagtctctagcttgtgtgcttgagcattttt 22682882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #118
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 12 - 130
Target Start/End: Original strand, 38033205 - 38033326
Alignment:
Q  12 tctagagtcttt--attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttc-aagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagt 108  Q
    ||||||||||||  |||| ||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||    |||| | || || | |||||||||||||    
T  38033205 tctagagtctttcaattgcattatattgtgaacaccactgattgtatttcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtttaattctatttgattagaagt 38033304  T
Q  109 ctcttgcctgcgtgcttgagca 130  Q
    ||||||| |  |||||||||||    
T  38033305 ctcttgctttagtgcttgagca 38033326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #119
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 22257854 - 22257817
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttc 67  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22257854 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttc 22257817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #120
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 114
Target Start/End: Original strand, 22455436 - 22455521
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttg 114  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| |||||||||||||    
T  22455436 ttgtattgtgaagaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatagaagtctcttg 22455521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #121
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 130 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 22755054 - 22754976
Alignment:
Q  130 attagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatact 209  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||| || |||||| ||||  | ||||||||||||||||    
T  22755054 attagaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttaagca--tctgtgaagtctcatact 22754976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #122
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 29 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 1089020 - 1088980
Alignment:
Q  29 attgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1089020 attgtattgtgaacaccattgattgtatatcaagtgttcaa 1088980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #123
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 34 - 69
Target Start/End: Original strand, 13964431 - 13964466
Alignment:
Q  34 attgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13964431 attgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 13964466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #124
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 23184750 - 23184789
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23184750 ttgtattgtgaacaccgctgattgtatatcaagtgttcaa 23184789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #125
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 23596013 - 23596052
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23596013 ttgtattgtgaacaccgctgattgtatatcaagtgttcaa 23596052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #126
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 30557769 - 30557808
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30557769 ttgtattgtggacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 30557808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #127
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 30 - 140
Target Start/End: Original strand, 39038089 - 39038200
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||||    |||| |||| || ||||||| ||||||||||||||    |||||||||    
T  39038089 ttgtattgtgaacatcactgattgtatatcaagtgtttaacctcaaacaattttctttgtaattatgtttgaatagaagtctcttgcagttgtgcttgag 39038188  T
Q  129 cattagaagtct 140  Q
    ||| | ||||||    
T  39038189 cataacaagtct 39038200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #128
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 45087430 - 45087469
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45087430 ttgtattgtgaacactactgattgtatatcaagtgttcaa 45087469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #129
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 69
Target Start/End: Original strand, 10898980 - 10899010
Alignment:
Q  39 gaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10898980 gaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 10899010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #130
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 69
Target Start/End: Original strand, 24441173 - 24441203
Alignment:
Q  39 gaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24441173 gaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 24441203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #131
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 27939638 - 27939600
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttca 68  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27939638 ttgtattgtgaacaccactgattgaatatcaagtgttca 27939600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #132
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 81 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 20567759 - 20567646
Alignment:
Q  81 ttctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttg-cttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtg 179  Q
    |||| |||| |||||||||| |||||||||||||     |||||||||||| ||||||||||||  || || ||||||||| ||||  |||||||   ||    
T  20567759 ttctttgtaattttgtttgaatagaagtctcttgtagttgtgcttgagcataagaagtctcttgattttgtccttgagcatgggaaatctcttgcagttg 20567660  T
Q  180 tgcttgagcagttt 193  Q
    |||||||| |||||    
T  20567659 tgcttgagtagttt 20567646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #133
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 30 - 67
Target Start/End: Original strand, 35744426 - 35744463
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttc 67  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  35744426 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcgagtgttc 35744463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #134
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 94 - 161
Target Start/End: Original strand, 19302910 - 19302978
Alignment:
Q  94 tgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttg-cttagtgcttgagcatt 161  Q
    ||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||  ||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  19302910 tgtttgaatagaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcatt 19302978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #135
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 104 - 144
Target Start/End: Original strand, 22312304 - 22312344
Alignment:
Q  104 gaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttg 144  Q
    |||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22312304 gaagtctctatcctgtgtgcttgagcattagaagtctcttg 22312344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #136
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 33 - 69
Target Start/End: Original strand, 28701664 - 28701700
Alignment:
Q  33 tattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28701664 tattgtgaacaccactcattgtatatcaagtgttcaa 28701700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #137
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 33 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 33240332 - 33240296
Alignment:
Q  33 tattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33240332 tattgtgaacaccactaattgtatatcaagtgttcaa 33240296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #138
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 33 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 33248253 - 33248217
Alignment:
Q  33 tattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33248253 tattgtgaacaccactaattgtatatcaagtgttcaa 33248217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 1)
Name: scaffold0747
Description:

Target: scaffold0747; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 2561 - 2321
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2561 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 2462  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 201  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2461 cagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcatagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 2362  T
Q  202 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  2361 ctcatactttgaaagtattgagcatttgtaatcttggtgat 2321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 157)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 4177733 - 4177493
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4177733 aaattcaaagtctagagtctttactgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 4177634  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4177633 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 4177534  T
Q  202 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4177533 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 4177493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 216; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Original strand, 51629576 - 51629818
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51629576 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 51629675  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca--gttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  51629676 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 51629775  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51629776 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 51629818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 216; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Original strand, 51656837 - 51657079
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51656837 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 51656936  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca--gttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  51656937 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 51657036  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51657037 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 51657079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Original strand, 5640099 - 5640339
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5640099 aaattcaaagtctagagtctttactgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 5640198  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5640199 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 5640298  T
Q  202 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5640299 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 5640339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 19178777 - 19178537
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19178777 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaactcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 19178678  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 201  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19178677 cagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 19178578  T
Q  202 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19178577 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 19178537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 19187656 - 19187416
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19187656 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaactcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 19187557  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 201  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19187556 cagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 19187457  T
Q  202 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19187456 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 19187416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 33084380 - 33084139
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33084380 aaattcaaagtctagagtctttactgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 33084281  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca-gttttgtgaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  33084280 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattttttgtgaag 33084181  T
Q  201 tctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33084180 tctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 33084139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 12730365 - 12730125
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12730365 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 12730266  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12730265 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 12730166  T
Q  202 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12730165 ctcatacttagagagtattgagcagttgtaatctttgtgat 12730125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 12740958 - 12740718
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12740958 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 12740859  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12740858 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 12740759  T
Q  202 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12740758 ctcatacttagagagtattgagcagttgtaatctttgtgat 12740718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Original strand, 12898370 - 12898610
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12898370 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 12898469  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12898470 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 12898569  T
Q  202 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12898570 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 12898610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 21863479 - 21863239
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21863479 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 21863380  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21863379 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 21863280  T
Q  202 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21863279 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 21863239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Original strand, 5650656 - 5650896
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5650656 aaattcaaagtctagggtctttactgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaactcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 5650755  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  5650756 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttgtgaagt 5650855  T
Q  202 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5650856 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 5650896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Original strand, 10998173 - 10998413
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10998173 aaattcaaagtctagagtcttttctgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 10998272  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10998273 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 10998372  T
Q  202 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10998373 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 10998413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Original strand, 12624170 - 12624410
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12624170 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 12624269  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12624270 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcagtagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 12624369  T
Q  202 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12624370 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 12624410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Original strand, 35649080 - 35649322
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35649080 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 35649179  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagc--agttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  35649180 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaa 35649279  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35649280 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 35649322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 38094894 - 38094652
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38094894 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 38094795  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagc--agttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  38094794 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaa 38094695  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38094694 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 38094652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 38105519 - 38105277
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38105519 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 38105420  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagc--agttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  38105419 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaa 38105320  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38105319 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 38105277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 2 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 5833036 - 5832800
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5833036 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 5832937  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca--gttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  5832936 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 5832837  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctt 236  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  5832836 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatctt 5832800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 2 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 5843638 - 5843402
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5843638 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 5843539  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca--gttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  5843538 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 5843439  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctt 236  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  5843438 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatctt 5843402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 21877585 - 21877344
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgttt-ga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21877585 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgttttga 21877486  T
Q  101 ttagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21877485 ttagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaag 21877386  T
Q  201 tctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21877385 tctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 21877344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Original strand, 12614705 - 12614945
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    |||||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12614705 aaattcaaagtctagagttttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 12614804  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12614805 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcagtagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 12614904  T
Q  202 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12614905 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 12614945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 35012741 - 35012506
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35012741 aaattcaaagtctagagtccttattgtattgt-----gaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 35012647  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 201  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  35012646 cagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 35012547  T
Q  202 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35012546 ctcatacttagaaagtattgagcatttgtaatctttgtgat 35012506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 7507120 - 7506878
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7507120 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 7507021  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagc--agttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  7507020 tagaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaa 7506921  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7506920 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 7506878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 7517717 - 7517475
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7517717 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 7517618  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagc--agttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  7517617 tagaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaa 7517518  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7517517 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 7517475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Original strand, 36236818 - 36237060
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36236818 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 36236917  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagc--agttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  36236918 tagaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaa 36237017  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36237018 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 36237060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Original strand, 36247365 - 36247607
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36247365 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 36247464  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagc--agttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  36247465 tagaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaa 36247564  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36247565 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 36247607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 2 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 3171440 - 3171204
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3171440 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 3171341  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagc--agttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  3171340 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaa 3171241  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctt 236  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  3171240 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctt 3171204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 2 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 3182042 - 3181806
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3182042 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 3181943  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagc--agttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  3181942 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaa 3181843  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctt 236  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  3181842 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctt 3181806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 2 - 236
Target Start/End: Original strand, 47608320 - 47608556
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47608320 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 47608419  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca--gttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  47608420 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttattgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 47608519  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctt 236  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  47608520 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatctt 47608556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 2 - 236
Target Start/End: Original strand, 47618928 - 47619164
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47618928 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 47619027  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca--gttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  47619028 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttattgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 47619127  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctt 236  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  47619128 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatctt 47619164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 2 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 4167077 - 4166869
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4167077 aaattcaaagtctagagtctttactgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 4166978  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4166977 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 4166878  T
Q  202 ctcatactt 210  Q
    |||||||||    
T  4166877 ctcatactt 4166869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 8 - 242
Target Start/End: Original strand, 7689854 - 7690091
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7689854 aaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 7689953  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagc---agttttgtgaagtctc 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  7689954 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattagttttgtgaagtctc 7690053  T
Q  205 atactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    |||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7690054 atacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 7690091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Original strand, 35404781 - 35405023
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||| ||||||||||||||  |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35404781 aaattcatagtctagagtcttttctgtactgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 35404880  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagc--agttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  35404881 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaa 35404980  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35404981 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 35405023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 2 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 2538354 - 2538118
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2538354 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 2538255  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagc--agttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  2538254 tagaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaa 2538155  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctt 236  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  2538154 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctt 2538118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Original strand, 35638428 - 35638667
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  35638428 aaattaaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctg-atttttgtttgat 35638526  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  35638527 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcagtagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 35638626  T
Q  202 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35638627 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 35638667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 8 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 5973570 - 5973336
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||||| |||||    
T  5973570 aaagtctagagtctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttaattcattgcatttttgtttgatcagaag 5973471  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcata 207  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  5973470 cctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattagaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcata 5973371  T
Q  208 ctttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5973370 cttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgat 5973336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 8 - 242
Target Start/End: Original strand, 148608 - 148843
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||    
T  148608 aaagtctagagtcttaattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttaattcattgtatttttgtttgatcagaag 148707  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca-gttttgtgaagtctcat 206  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  148708 cctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattttttgagaagtctcat 148807  T
Q  207 actttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  148808 acttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgat 148843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 8 - 242
Target Start/End: Original strand, 154683 - 154918
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||    
T  154683 aaagtctagagtcttaattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttaattcattgtatttttgtttgatcagaag 154782  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca-gttttgtgaagtctcat 206  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||    
T  154783 cctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgtttgagcattttttgagaagtctcat 154882  T
Q  207 actttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  154883 acttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgat 154918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 8 - 242
Target Start/End: Original strand, 20441711 - 20441945
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||| |||||    
T  20441711 aaagtctagagtctttatcgtattgtattttgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttatttcattgtatttttgtttgatcagaag 20441810  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcata 207  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  20441811 actcttgcctgcgtgcttgagcattataagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcata 20441910  T
Q  208 ctttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20441911 cttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgat 20441945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 8 - 242
Target Start/End: Original strand, 4250959 - 4251197
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||    
T  4250959 aaagtctagagtctttattgtattgtattatgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttaattcattgtatttttgtttgatcagaag 4251058  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgt----gaagtct 203  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    |||||||    
T  4251059 cctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattttttttttagaagtct 4251158  T
Q  204 catactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4251159 catacttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgat 4251197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 7 - 242
Target Start/End: Original strand, 18382297 - 18382532
Alignment:
Q  7 caaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttt-tgtttgattaga 105  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||| ||||||||| |||||||| |||    
T  18382297 caaagtctaaagtctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacatgtttccctgtattttttgtttgatcaga 18382396  T
Q  106 agtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctca 205  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  18382397 agactcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcatgtgtgcttgagca-ttttgagaagtctca 18382495  T
Q  206 tactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18382496 tacttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgat 18382532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 8 - 242
Target Start/End: Original strand, 39194488 - 39194724
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||| |||||    
T  39194488 aaagtctagagtctctaacgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttatttcattgtatttttgtttgatcagaag 39194587  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca-gttttgtgaagtctcat 206  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  39194588 cctcttgcctgtgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattttttgagaagtctcat 39194687  T
Q  207 actttgatagtattgagca-tttgtaatctttgtgat 242  Q
    |||| || ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39194688 acttagagagtattgagcattttgtaatctttgtgat 39194724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 27 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 7677637 - 7677422
Alignment:
Q  27 gtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||    
T  7677637 gtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttatttctttgtatttttgtttgatcagaagactcttgcctgtgtgcttg 7677538  T
Q  127 agcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatactttgatagtattgagcat 226  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||    
T  7677537 agcattggaagactcttgcttagtgcttgagcattggaaaactcttgcgtgtgtgtttgagcatttttgagaagtctcatacttagagagtattgagcat 7677438  T
Q  227 ttgtaatctttgtgat 242  Q
    | ||||||||||||||    
T  7677437 tcgtaatctttgtgat 7677422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 9 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 12945020 - 12944787
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagt 108  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||| ||||||     
T  12945020 aagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacatttttctctgtatttttgtttgaatagaagc 12944921  T
Q  109 ctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcata 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  12944920 ctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattgtaagtctcttgcctgcgtgcttgagta-ttttgagaagtctcata 12944822  T
Q  208 ctttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12944821 cttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgat 12944787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 8 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 39586782 - 39586549
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | |||   ||||||||||||||| | |||    
T  39586782 aaagtctagagtctgtatcgtattgtattgtgaacaccactgatagtatatcaagtgttcaaatcaaacttatttcatggtatttttgtttgatcataag 39586683  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcata 207  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  39586682 actcttgcctgcgtgcttgagcattaaaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcctgtgtgcttgagca-ttttgagaagtctcata 39586584  T
Q  208 ctttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39586583 cttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgat 39586549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 9 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 17957051 - 17956816
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtatt-gagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaa 106  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    ||||||||||||||||||||  ||||    
T  17957051 aagtctagagtctttattacattgtatttgtgaacaccactgattgtatatcaagtattcaagatcaaacatt-ttctctgtatttttgtttgaacagaa 17956953  T
Q  107 gtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgc-ttgagcagttttgtgaagtctca 205  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||    
T  17956952 gtctcttgcctacgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgtttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgctttgagcatttttgagaagtctca 17956853  T
Q  206 tactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17956852 tacttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgat 17956816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 9 - 242
Target Start/End: Original strand, 11195464 - 11195697
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    |||||||||||||||||||| ||||||    
T  11195464 aagtctagagtctttattgcattgtattgataacaccactgatagtatatcaagtgttcaaagtcaaacatt-ttctctgtatttttgtttgaatagaag 11195562  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcat 206  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  11195563 cctcttgcctgcttgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgatcattggaagactcttgcctgtgtgcttgagca-ttttgagaagtctcat 11195661  T
Q  207 actttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11195662 acttagagagtattgagcatttgtaatctgtgtgat 11195697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 9 - 242
Target Start/End: Original strand, 20196088 - 20196321
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttt-tgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    ||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  20196088 aagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaacatt-ttctctgtattttttgtttgaatagaag 20196186  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcat 206  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  20196187 cctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagactctcgcctgcgtgcttgagca-ttttgagaagtctcat 20196285  T
Q  207 actttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20196286 acttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgat 20196321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 8 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 47195074 - 47194896
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||| |||||    
T  47195074 aaagtctagagtctttatcgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttatttcattgtatttttgtttgatcagaag 47194975  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttga 186  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  47194974 actcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcctatgtgcttga 47194896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 9 - 242
Target Start/End: Original strand, 22610371 - 22610602
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagt 108  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||| |||| || |||||||||||||||    
T  22610371 aagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacaattttctgtgtaattctgtttgattagaagt 22610470  T
Q  109 ctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcata 207  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| |||||||||||    
T  22610471 ctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcctgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcata 22610568  T
Q  208 ctttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    | | || ||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  22610569 c-tagaaagtattgagcagttgtaatctgtgtgat 22610602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 9 - 242
Target Start/End: Original strand, 14388523 - 14388757
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgatta-gaa 106  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    || | |||| || |||||||||| |||    
T  14388523 aagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacattttt-tgtgtaattctgtttgattaagaa 14388621  T
Q  107 gtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctca 205  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  14388622 gcctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca-ttttgagaagtctca 14388720  T
Q  206 tactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14388721 tacttagagagtattgagcatttgtaatctgtgtgat 14388757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 9 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 675256 - 675025
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    || | |||| |||||||||||||||||    
T  675256 aagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacatt-ttatgtgtaattttgtttgattagaag 675158  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcat 206  Q
     |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||    
T  675157 cctctcgcctgcgtgcttgagcgttagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcat 675060  T
Q  207 actttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    || | || ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  675059 ac-tagagagtattgagcatttgtaatctgtgtgat 675025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 9 - 242
Target Start/End: Original strand, 18311369 - 18311602
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    |||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || ||||||| ||||||    
T  18311369 aagtttagagtccttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacatt-ttctgtgtaattatgtttgaatagaag 18311467  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcat 206  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  18311468 cctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca-ttttgagaagtctcat 18311566  T
Q  207 actttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    |||| || ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  18311567 acttagagagtattgagcatttgtaatatgtgtgat 18311602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 2 - 145
Target Start/End: Original strand, 23580715 - 23580857
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23580715 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 23580814  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc 145  Q
     |||||||||||| ||  ||||||||||||| |||| |||||||    
T  23580815 cagaagtctcttg-cttagtgcttgagcattggaagactcttgc 23580857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 9 - 242
Target Start/End: Original strand, 41133013 - 41133246
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttc-aagtcaaactcaattctctgt---atttttgtttgattag 104  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||| |||||   |||| |||||||||||    
T  41133013 aagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagagttcaaagtcaaa--caattttctgtgtaatttatgtttgattag 41133110  T
Q  105 aagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttg-cttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtct 203  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| | || || || |||||||||||  |||| |||||||    
T  41133111 aagtctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgttttagtgcttgagcattggaagtccctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtct 41133208  T
Q  204 catactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||| | || ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41133209 catac-tagagagtattgagcatttgtaatctgtgtgat 41133246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 133 - 242
Target Start/End: Original strand, 23580816 - 23580925
Alignment:
Q  133 agaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatactttgatagtattgagcatttgtaa 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  23580816 agaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttaagcatttttgtgaagtctcatacttagaaagtattgagcatttgtaa 23580915  T
Q  233 tctttgtgat 242  Q
    ||||||||||    
T  23580916 tctttgtgat 23580925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 9 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 5929390 - 5929157
Alignment:
Q  9 aagtctagagtcttt--attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattaga 105  Q
    |||||||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    || | |||| || ||||||||||||    
T  5929390 aagtctagagtctttcaattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttttgtgtaattctgtttgattaga 5929291  T
Q  106 agtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctc 204  Q
    |||||||||| |  ||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||  |||| ||||||||    
T  5929290 agtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcattggaagtctcttgcctgcgtgcttgagca--tttgggaagtctc 5929193  T
Q  205 atactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    |||| | | |||||||||||| || |||||| ||||||    
T  5929192 atac-taggtagtattgagcagtt-taatctgtgtgat 5929157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 9 - 161
Target Start/End: Original strand, 9050882 - 9051036
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtatt-gagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    |||||||||||| | |||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||    
T  9050882 aagtctagagtcataattacattgtatttgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaaaatatttctctgtatttttgtttgattagaag 9050981  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttg-cttagtgcttgagcatt 161  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||  |||||||||||||    
T  9050982 cctcttgcctgcgtgcttgagcattggaagactcttgcctgtgtgcttgagcatt 9051036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 9 - 161
Target Start/End: Original strand, 46181275 - 46181429
Alignment:
Q  9 aagtctagagtcttt-attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||| |||| || ||||||||||||||    
T  46181275 aagtctagagtcttttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacaattttctgtgtaattctgtttgattagaag 46181374  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcatt 161  Q
    |||||||| |  ||||||||||||| |||||||||||| |  |||||||||||||    
T  46181375 tctcttgctttagtgcttgagcattggaagtctcttgcatgcgtgcttgagcatt 46181429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 26 - 234
Target Start/End: Original strand, 34255935 - 34256142
Alignment:
Q  26 tgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgct 124  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||| ||||||||||||| |  |||||    
T  34255935 tgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaatctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgataagaagtctcttgctttagtgct 34256034  T
Q  125 tgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatactttg-atagtattgag 223  Q
    ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||  ||||| ||||||| || ||||||||||| ||   ||||||||||||||  |  ||||||||||    
T  34256035 tgagcataagaagtctcttgctgtgtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcaatt---tgaagtctcatactaggtgtagtattgag 34256131  T
Q  224 catttgtaatc 234  Q
    || ||||||||    
T  34256132 cagttgtaatc 34256142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 104 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 47194919 - 47194781
Alignment:
Q  104 gaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgctta-gtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtc 202  Q
    |||| |||||||||  |||||||| |||| |||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| ||||||    
T  47194919 gaagactcttgcctatgtgcttgatcattggaagactcttgcctatgtgcttgagcattggaagactcttgcctatgtgcttgagca-ttttgagaagtc 47194821  T
Q  203 tcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  47194820 tcatacttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgat 47194781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 9 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 23926744 - 23926509
Alignment:
Q  9 aagtctagagtcttt-attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaa 106  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||||||||    
T  23926744 aagtctagagtcttttattgcattgtactgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgattagaa 23926645  T
Q  107 gtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttg-cttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctca 205  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||  ||||| ||||||| || || ||||||||   ||| |||||||||    
T  23926644 gtctcttgctttagtgcttgagcattggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgcgtccttgagca--attgagaagtctca 23926547  T
Q  206 tactttg-atagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||  |  |||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  23926546 tactaggtgtagtattgagcagttgtaatctgtgtgat 23926509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 149 - 242
Target Start/End: Original strand, 9050994 - 9051087
Alignment:
Q  149 gtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9050994 gtgcttgagcattggaagactcttgcctgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcatacttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgat 9051087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 29 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 28379654 - 28379440
Alignment:
Q  29 attgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttga 127  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    || | |||| || ||||||| |||||||||||||| |  ||||||||    
T  28379654 attgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttttgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttgctttagtgcttga 28379555  T
Q  128 gcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatactttg-atagtattgagca 225  Q
    ||||  |||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |  ||||||||| ||    
T  28379554 gcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgtttgtgtgcttgagca--tttgtgaagtctcatactaggtgtagtattgaaca 28379457  T
Q  226 tttgtaatctttgtgat 242  Q
     ||||||||| ||||||    
T  28379456 gttgtaatctgtgtgat 28379440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 24 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 22642559 - 22642392
Alignment:
Q  24 attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtg 122  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| |||||||||||||| |  |||    
T  22642559 attgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttgctttagtg 22642460  T
Q  123 cttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca 189  Q
    |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| || |||||||||||    
T  22642459 cttgagcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgcttgagtgcttgagca 22642392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 9 - 142
Target Start/End: Original strand, 20884278 - 20884412
Alignment:
Q  9 aagtctagagtcttt-attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||| |||| || ||||||||||||||    
T  20884278 aagtctagagtcttttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacatttttctgtgtaattctgtttgattagaag 20884377  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctct 142  Q
    |||||||| |  ||||||||||||| ||| |||||    
T  20884378 tctcttgctttagtgcttgagcattggaattctct 20884412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 33 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 22018987 - 22018777
Alignment:
Q  33 tattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcat 131  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  22018987 tattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttgctttagtgcttgagcat 22018888  T
Q  132 tagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatactttg-atagtattgagcatttg 229  Q
      |||||||||| | ||||||||||||||  |||||  |||||| || |||||||||||  ||||||||||||||||||  |  |||||||||||| |||    
T  22018887 aggaagtctctttctttagtgcttgagcaaaggaagtgtcttgcctgcgtgcttgagca--tttgtgaagtctcatactaggtgtagtattgagcagttg 22018790  T
Q  230 taatctttgtgat 242  Q
    |||||| ||||||    
T  22018789 taatctgtgtgat 22018777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 24 - 233
Target Start/End: Original strand, 26548673 - 26548883
Alignment:
Q  24 attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtg 122  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| |||||||||||||  |  |||    
T  26548673 attgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaaatcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttggtttagtg 26548772  T
Q  123 cttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatactttg-atagtatt 220  Q
    |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||  || |||||||||||  ||||||||||||||||||  |  |||||||    
T  26548773 cttgagcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgactgcgtgcttgagca--tttgtgaagtctcatactaggtgtagtatt 26548870  T
Q  221 gagcatttgtaat 233  Q
    ||||| |||||||    
T  26548871 gagcagttgtaat 26548883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 29 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 17370701 - 17370496
Alignment:
Q  29 attgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttga 127  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || | ||||| |||||||||||||| |  ||||||||    
T  17370701 attgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctatttgaatagaagtctcttgctttagtgcttga 17370602  T
Q  128 gcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatactttg-atagtattgagca 225  Q
    ||||  |||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||| || ||||||||||| ||   ||||||||||||||  |  ||||||||||||    
T  17370601 gcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcaatt---tgaagtctcatactaggtgtagtattgagca 17370505  T
Q  226 tttgtaatc 234  Q
     ||||||||    
T  17370504 gttgtaatc 17370496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 9 - 142
Target Start/End: Original strand, 20867249 - 20867383
Alignment:
Q  9 aagtctagagtcttt-attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||| | || ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    |||| |||| || ||||||||||||||    
T  20867249 aagtctagagtcttttactgcattgtattgtgaacactactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacaattttctgtgtaattctgtttgattagaag 20867348  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctct 142  Q
    |||||||| |  ||||||||||||| |||||||||    
T  20867349 tctcttgctttagtgcttgagcattggaagtctct 20867383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 12 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 19037685 - 19037499
Alignment:
Q  12 tctagagtcttt--attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagt 108  Q
    ||||||||||||  |||| ||| ||||| |||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||||||||||    
T  19037685 tctagagtctttcaattgcattttattgtgaacaccacttatagtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgattagaagt 19037586  T
Q  109 ctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagtttt 194  Q
    ||||||| |  |||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||||| ||||    
T  19037585 ctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattttt 19037499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 9 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 28473912 - 28473756
Alignment:
Q  9 aagtctagagtcttt--attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattaga 105  Q
    |||||||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||||||||    
T  28473912 aagtctagagtctttcaattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgattaga 28473813  T
Q  106 agtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttg-cttagtgcttgagcatt 161  Q
    |||||||||| |  ||||||||||||  ||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  28473812 agtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcatt 28473756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 9 - 142
Target Start/End: Original strand, 45071024 - 45071159
Alignment:
Q  9 aagtctagagtcttt-attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgtt-caagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaa 106  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    |||| |||| || |||||||||||||    
T  45071024 aagtctagagtcttttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttaaaagtcaaacaattttctgtgtaattctgtttgattagaa 45071123  T
Q  107 gtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctct 142  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||  |||||||||    
T  45071124 gtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctct 45071159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 130 - 242
Target Start/End: Original strand, 46181367 - 46181477
Alignment:
Q  130 attagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatactttgatagtattgagcattt 228  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||  |||| |||||||||||| | |||||||||||||| ||    
T  46181367 attagaagtctcttgctttagtgcttgagcattggaagtctcttgcatgcgtgcttgagca--tttgggaagtctcatac-tagatagtattgagcagtt 46181463  T
Q  229 gtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||| ||||||    
T  46181464 gtaatctgtgtgat 46181477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 9 - 143
Target Start/End: Original strand, 52351080 - 52351217
Alignment:
Q  9 aagtctagagtcttt--attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattaga 105  Q
    |||||||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||||||||    
T  52351080 aagtctagagtctttcaattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgattaga 52351179  T
Q  106 agtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctctt 143  Q
    |||||||||| |  ||||||||||||  ||||||||||    
T  52351180 agtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctctt 52351217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 24 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 22655141 - 22654989
Alignment:
Q  24 attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtg 122  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| |||||||||||||  |  |||    
T  22655141 attgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttggtttagtg 22655042  T
Q  123 cttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgc 174  Q
    |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  22655041 cttgagcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgc 22654989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 14 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 31358999 - 31358825
Alignment:
Q  14 tagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctctt 113  Q
    ||||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | |||| ||||  |||||||| |||||||||||||    
T  31358999 tagagtctcaattgttttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ccaaacttatttctttgta-atttgtttgtttagaagtctctt 31358902  T
Q  114 gcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca 189  Q
    || |  | ||||||||||  ||| ||||||||||  ||||||||| ||| ||||  | |||| ||||||||||||||    
T  31358901 gcttttgcgcttgagcataggaaatctcttgcttgtgtgcttgagaatttgaagttttttgcttgtgtgcttgagca 31358825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 29 - 242
Target Start/End: Original strand, 19170747 - 19170960
Alignment:
Q  29 attgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttga 127  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||    || | |||| || ||||||| |||||||||||||| |  ||||||||    
T  19170747 attgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttaaaactcaaacaattttttgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttgctttagtgcttga 19170846  T
Q  128 gcattagaagtctcttg-cttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatactttg-atagtattgagca 225  Q
    |||   ||||||||||| ||  |||||||||||  ||||| ||||||| || ||||||||||| ||   ||||||||||||||  |  ||||||||||||    
T  19170847 gcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcaatt---tgaagtctcatactaggtgtagtattgagca 19170943  T
Q  226 tttgtaatctttgtgat 242  Q
     ||||||||| ||||||    
T  19170944 gttgtaatctgtgtgat 19170960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 124 - 189
Target Start/End: Original strand, 19965760 - 19965825
Alignment:
Q  124 ttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca 189  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  19965760 ttgagcattagaagtctcctgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcttgcgtgcttgagca 19965825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 9 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 20798749 - 20798689
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20798749 aagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 20798689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 10757081 - 10756966
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| ||||||||||||||    |||||||||    
T  10757081 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttgcagttgtgcttgag 10756982  T
Q  129 cattagaagtctcttg 144  Q
    ||||||||||||||||    
T  10756981 cattagaagtctcttg 10756966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 33 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 8698510 - 8698357
Alignment:
Q  33 tattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcatt 132  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||| ||||  ||||||||  |||||||||||||| |  ||||||||||||     
T  8698510 tattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaacgaaacttaattctttgta-atttgtttgtctagaagtctcttgcttttgtgcttgagcata 8698412  T
Q  133 agaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttga 186  Q
     ||| |||||||| || ||||||||| ||| |||| || || | |||||||||||    
T  8698411 ggaaatctcttgcttttgtgcttgagtatttgaagtctttttcttgtgtgcttga 8698357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 130 - 242
Target Start/End: Original strand, 20884370 - 20884480
Alignment:
Q  130 attagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatactttgatagtattgagcattt 228  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| || || |||||||||||  |||| |||||||||||| | |||||||||||||| ||    
T  20884370 attagaagtctcttgctttagtgcttgagcattggaattctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgggaagtctcatac-tagatagtattgagcagtt 20884466  T
Q  229 gtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||| ||||||    
T  20884467 gtaatctgtgtgat 20884480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 130 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 28473818 - 28473708
Alignment:
Q  130 attagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatactttgatagtattgagcattt 228  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| || |||||||||||  ||||||||||||||||| | | |||||||||| | ||    
T  28473818 attagaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgcctgcgtgcttgagca--tttgtgaagtctcatac-taggtagtattgagtagtt 28473722  T
Q  229 gtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||| ||||||    
T  28473721 gtaatctgtgtgat 28473708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 9 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 44200697 - 44200559
Alignment:
Q  9 aagtctagagtcttta-ttgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttc-aagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaa 106  Q
    |||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    || | |||| || |||||||||||||    
T  44200697 aagtctagagtctttccttgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttatgtgtaattctgtttgattagaa 44200598  T
Q  107 gtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc 145  Q
     |||||||| |  ||||||||||||  ||||||||||||    
T  44200597 atctcttgctttagtgcttgagcatatgaagtctcttgc 44200559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 159
Target Start/End: Original strand, 7745493 - 7745634
Alignment:
Q  19 tctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcct 117  Q
    |||| |||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||||  |||| ||||||| |    
T  7745493 tcttcattgcattgtattgtgaacacccctgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctttgtaattctgtttgataggaagactcttgctt 7745592  T
Q  118 gcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagca 159  Q
    | ||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||    
T  7745593 gtgtgcttgagcataggaagtctcttgctgtgtgcttgagca 7745634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 30 - 193
Target Start/End: Original strand, 17025386 - 17025551
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||    |||  |||| || ||||||| |||||||||||||| || |||||||||    
T  17025386 ttgtattgtgaacaccattgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttccttgtaattctgtttgaatagaagtctcttgcttgtgtgcttgag 17025485  T
Q  129 cattagaagtctcttg-cttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttt 193  Q
    |||  |||||||||||  ||||| ||||||||| ||||  |||||||   |||||||||| |||||    
T  17025486 cataggaagtctcttgatttagttcttgagcataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtagttt 17025551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 104 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 22642448 - 22642318
Alignment:
Q  104 gaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtc 202  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||| || |||||||||||  |||||||||||    
T  22642448 gaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgcttgagtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttgagca--tttgtgaagtc 22642351  T
Q  203 tcatactttg-atagtattgagcatttgtaatc 234  Q
    |||||||  |  |||||||||||| ||||||||    
T  22642350 tcatactaggtgtagtattgagcagttgtaatc 22642318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 14 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 20251452 - 20251301
Alignment:
Q  14 tagagtcttt--attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtct 110  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| |||||||||    
T  20251452 tagagtctttcaattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatagaagtct 20251353  T
Q  111 cttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttg-cttagtgcttgagcatt 161  Q
    ||||| |  |||||||||||   ||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  20251352 cttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcatt 20251301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 29 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 21543698 - 21543566
Alignment:
Q  29 attgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttga 127  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| |||||||||||||| |  ||||||||    
T  21543698 attgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttgctttagtgcttga 21543599  T
Q  128 gcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagca 159  Q
    ||||   |||||||||||||  |||||||||||    
T  21543598 gcatagaaagtctcttgcttgtgtgcttgagca 21543566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 30 - 187
Target Start/End: Original strand, 26280474 - 26280633
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| |||||||||  |||||||||||||| |  |||||||||    
T  26280474 ttgtatcgtgaacacctctgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctgtgtaattttgtttgtctagaagtctcttgcttttgtgcttgag 26280573  T
Q  129 cattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgag 187  Q
    |||  |||||||||||| || ||||||||||||  |||  ||||||| | ||||||||||    
T  26280574 catatgaagtctcttgcgtttgtgcttgagcataagaaatctcttgcttttgtgcttgag 26280633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 25 - 147
Target Start/End: Original strand, 2819728 - 2819849
Alignment:
Q  25 ttgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgct 124  Q
    |||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  | |||| ||||  |||||||| ||||||||||||||| |  |||||    
T  2819728 ttgttttgtactgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaaccaaacatatttctttgta-atttgtttgtttagaagtctcttgcttttgtgct 2819826  T
Q  125 tgagcattagaagtctcttgctt 147  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||    
T  2819827 tgagcattggaaatcttttgctt 2819849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Original strand, 21215100 - 21215217
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||||||||||||||  | |||||||||||||    |||||||    
T  21215100 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtatttttgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttg 21215199  T
Q  127 agcattagaagtctcttg 144  Q
    |||| |||||||||||||    
T  21215200 agcaatagaagtctcttg 21215217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 7309475 - 7309312
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||    |||| |||| || |||||||  ||||||||||||||| |  |||||||    
T  7309475 ttgtaatgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcagacaattttctgtgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcatttgtgcttg 7309376  T
Q  127 agcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca 189  Q
    | |||||||||||||||| ||  || ||||||||| ||||| |||||||   ||||||||||||    
T  7309375 aacattagaagtctcttgattgtgttcttgagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagca 7309312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 26703233 - 26703073
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgagc 129  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    || | |||| ||||||||| ||| ||||||||||| |  ||||||||||    
T  26703233 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaaccaaacatctttatatgtaattttgtttgtttataagtctcttgcttttgtgcttgagc 26703134  T
Q  130 attagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca 189  Q
    ||   || |||||||| |  | ||||||| ||| |||| ||||||| |||||| |||||||    
T  26703133 atagaaaatctcttgcatgtgcgcttgagtatttgaagtctcttgcttgtgtgtttgagca 26703073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Original strand, 18897017 - 18897131
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  | |||| |||| ||||| |||| ||||||||||||||    |||||||||    
T  18897017 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatatttctttgtaattttg-ttgaatagaagtctcttgcagttgtgcttgag 18897115  T
Q  129 cattagaagtctcttg 144  Q
    ||| | ||||||||||    
T  18897116 cataaaaagtctcttg 18897131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 21895022 - 21894963
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtcttta-ttgtattgtattgagaacaccactgattgtatatca 60  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21895022 aaattcaaagtctagagtcttttcttgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatca 21894963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 174
Target Start/End: Original strand, 16233552 - 16233698
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||  | |||| |||| || |||||| |||||||| |||||| |  |||||||||    
T  16233552 ttgtattgtgaacaccactgatagtatgtcaagtgttcaacctcaaacatatttctatgtaattgtgtttgtttagaagtttcttgcttttgtgcttgag 16233651  T
Q  129 cattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgc 174  Q
    |||  |||| ||||||| || |||||||||||| ||||  |||||||    
T  16233652 cataggaagactcttgcgtttgtgcttgagcataggaaacctcttgc 16233698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 30892750 - 30892633
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || | |||||  |||||||||||||||    |||||||    
T  30892750 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaatcttctgtgtaattctatttgaatttagaagtctcttgcaattgtgcttg 30892651  T
Q  127 agcattagaagtctcttg 144  Q
    ||||||||||||||||||    
T  30892650 agcattagaagtctcttg 30892633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 130 - 242
Target Start/End: Original strand, 45071117 - 45071227
Alignment:
Q  130 attagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatactttgatagtattgagcattt 228  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| || || |||||||||||  |||| |||||||||||||  | |||||||||||| ||    
T  45071117 attagaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctctagcctgcgtgcttgagca--tttgggaagtctcatactacg-tagtattgagcagtt 45071213  T
Q  229 gtaatctttgtgat 242  Q
    ||||| | ||||||    
T  45071214 gtaatttgtgtgat 45071227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 48703859 - 48703741
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttga-ttagaagtctcttgcctgcgtgcttga 127  Q
    |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| |||||||||| |||||||||||||||    ||||||||    
T  48703859 ttgtatcgtgaacaccattgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattttgtttgaattagaagtctcttgcagttgtgcttga 48703760  T
Q  128 gcattagaagtctcttgct 146  Q
    ||||| |||||||||||||    
T  48703759 gcatttgaagtctcttgct 48703741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 30 - 174
Target Start/End: Original strand, 14263854 - 14264002
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttca-agtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||    |||| |||| || |||||||  | ||||||||||||| |  |||||||    
T  14263854 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcagtctcaaacaattttctttgtaattctgtttgaattgagaagtctcttgcttttgtgcttg 14263953  T
Q  127 agcattagaagtctcttg-cttagtgcttgagcattggaagactcttgc 174  Q
    |||| ||||||||||||| |||||| |  |||||| ||||| |||||||    
T  14263954 agcaatagaagtctcttgacttagttcaggagcataggaagtctcttgc 14264002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 132 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 20251361 - 20251251
Alignment:
Q  132 tagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatactttg-atagtattgagcatttg 229  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||| || |||||||||||  ||| ||||||||||||||  |  |||||||||||| |||    
T  20251361 tagaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttgagca--tttttgaagtctcatactaggtgtagtattgagcagttg 20251264  T
Q  230 taatctttgtgat 242  Q
    |||||| ||||||    
T  20251263 taatctgtgtgat 20251251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 12 - 144
Target Start/End: Original strand, 25448961 - 25449097
Alignment:
Q  12 tctagagtctttat-tgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaag 107  Q
    |||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  | ||||     
T  25448961 tctagagtctttatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaattcagaaa 25449060  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttg 144  Q
    |||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||    
T  25449061 tctcttgcatttgtgcttgagcaatagaagtctcttg 25449097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 130 - 209
Target Start/End: Original strand, 52351174 - 52351252
Alignment:
Q  130 attagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatact 209  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| | || |||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  52351174 attagaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttacctgcgtgcttgagca--tttgtgaagtctcatact 52351252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 131
Target Start/End: Original strand, 18130434 - 18130537
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa--gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttga 127  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||    |||| |||| || |||||||||||||||||||||| |  ||||||||    
T  18130434 ttgtattgtgaacaccactaattgtatatcaagtgttcaaacctcaaacatttttctgtgtaattctgtttgattagaagtctcttgcttttgtgcttga 18130533  T
Q  128 gcat 131  Q
    ||||    
T  18130534 gcat 18130537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 36133858 - 36133742
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttg-attagaagtctcttgcctgcgtgcttga 127  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||| |||||||||||||||     ||||||||    
T  36133858 ttgtattgtgaacaccactgaatgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctatgtaattctgtttgaattagaagtctcttgtagttgtgcttga 36133759  T
Q  128 gcattagaagtctcttg 144  Q
    |||||||||||||||||    
T  36133758 gcattagaagtctcttg 36133742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 21028447 - 21028336
Alignment:
Q  34 attgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcatt 132  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| |||| || ||||||| ||||||| ||||||     |||||||||||     
T  21028447 attgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaactatattctttgtaattctgtttgaatagaagtatcttgcagttatgcttgagcata 21028348  T
Q  133 agaagtctcttg 144  Q
    | ||||||||||    
T  21028347 aaaagtctcttg 21028336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 69
Target Start/End: Original strand, 24029083 - 24029145
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttat--tgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    ||||||||||||||||   || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24029083 aagtctagagtctttaaactgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 24029145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 2834343 - 2834230
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  | |||||||||||||    |||||||    
T  2834343 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattgtgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttg 2834244  T
Q  127 agcattagaagtct 140  Q
    ||||||||||||||    
T  2834243 agcattagaagtct 2834230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 115
Target Start/End: Original strand, 14293107 - 14293193
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgc 115  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||   ||||| |||| || ||||||| ||||||||| ||||    
T  14293107 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaatattctttgtaattctgtttgaatagaagtcttttgc 14293193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Original strand, 21205296 - 21205413
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||    |||| |||| ||||||||||  | |||||||||||||    |||||||    
T  21205296 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagggttcaacctcaaacatttttctttgtaattttgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttg 21205395  T
Q  127 agcattagaagtctcttg 144  Q
    |||| |||||||||||||    
T  21205396 agcaatagaagtctcttg 21205413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 23024449 - 23024332
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  | |||||||||||||    |||||||    
T  23024449 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttg 23024350  T
Q  127 agcattagaagtctcttg 144  Q
    |||| |||||||||||||    
T  23024349 agcaatagaagtctcttg 23024332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #114
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 27858397 - 27858295
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||    || | |||| ||||||||| ||||||||||||||| |  |||||||||    
T  27858397 ttgtattgtgaacaccactaattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttttgtgtaattttgtttgtttagaagtctcttgcttttgtgcttgag 27858298  T
Q  129 cat 131  Q
    |||    
T  27858297 cat 27858295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #115
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Original strand, 33256773 - 33256890
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||    |  ||||    
T  33256773 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagctggacttg 33256872  T
Q  127 agcattagaagtctcttg 144  Q
    ||||||||||||||||||    
T  33256873 agcattagaagtctcttg 33256890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #116
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Original strand, 33276945 - 33277062
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||    |  ||||    
T  33276945 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagctggacttg 33277044  T
Q  127 agcattagaagtctcttg 144  Q
    ||||||||||||||||||    
T  33277045 agcattagaagtctcttg 33277062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #117
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 35039822 - 35039705
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||    |||||||    
T  35039822 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttgtgcttg 35039723  T
Q  127 agcattagaagtctcttg 144  Q
    | ||||| ||||||||||    
T  35039722 aacattataagtctcttg 35039705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #118
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 130 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 44200604 - 44200490
Alignment:
Q  130 attagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtg----tgcttgagcagttttgtgaagtctcatactttgatagtattgagc 224  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||  |||| |||||||||| |    ||||||||||  ||||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  44200604 attagaaatctcttgctttagtgcttgagcatatgaagtctcttgcgtgcgcgcatgcttgagca--tttgtgaagtctcatactagg-tagtattgagc 44200508  T
Q  225 atttgtaatctttgtgat 242  Q
    | ||||||||| ||||||    
T  44200507 agttgtaatctgtgtgat 44200490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #119
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 2268186 - 2268070
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttg-attagaagtctcttgcctgcgtgcttga 127  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||    || | |||| || |||||| |||||||||||||||     ||||||||    
T  2268186 ttgtattgtgaacaccactaattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttatgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgaagttgtgcttga 2268087  T
Q  128 gcattagaagtctcttg 144  Q
    |||||||||||||||||    
T  2268086 gcattagaagtctcttg 2268070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #120
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 132 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 21543624 - 21543549
Alignment:
Q  132 tagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatact 209  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||| ||   ||||||||||||||    
T  21543624 tagaagtctcttgctttagtgcttgagcatagaaagtctcttgcttgtgtgcttgagcaatt---tgaagtctcatact 21543549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #121
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 14 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 37640683 - 37640627
Alignment:
Q  14 tagagtctttat-tgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37640683 tagagtctttatctgatttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 37640627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #122
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 30 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 42284297 - 42284091
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||    |||  |||| || |||||||  |||||||||||||||    |||||||    
T  42284297 ttgtattgtgaacaccattgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttcattgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttgtgcttg 42284198  T
Q  127 agcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatactttg-atagtattgagc 224  Q
    |||| ||||||||||||| ||  || |  |||||| ||||| |||||||   |||||||||||| ||   ||||||||||||||  |  ||||| |||||    
T  42284197 agcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatt---tgaagtctcatactaagtttagtagtgagc 42284101  T
Q  225 atttgtaatc 234  Q
    ||||||||||    
T  42284100 atttgtaatc 42284091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #123
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 2327859 - 2327898
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2327859 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 2327898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #124
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 131 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 9346358 - 9346299
Alignment:
Q  131 ttagaagtctcttgctta-gtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca 189  Q
    |||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9346358 ttagaagtctcttgtttttgtgcttgagcataggaagactcttgcgtgtatgcttgagca 9346299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #125
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 10250642 - 10250603
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10250642 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 10250603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #126
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 131 - 189
Target Start/End: Original strand, 16233624 - 16233683
Alignment:
Q  131 ttagaagtctcttgctta-gtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca 189  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16233624 ttagaagtttcttgcttttgtgcttgagcataggaagactcttgcgtttgtgcttgagca 16233683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #127
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 18517583 - 18517622
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18517583 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 18517622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #128
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 21121488 - 21121527
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21121488 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 21121527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #129
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 22202157 - 22202196
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22202157 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 22202196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #130
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 22427761 - 22427800
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22427761 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 22427800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #131
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 23036930 - 23036969
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23036930 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 23036969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #132
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 38282220 - 38282181
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38282220 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 38282181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #133
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 44824185 - 44824224
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44824185 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 44824224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #134
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 48570654 - 48570693
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48570654 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 48570693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #135
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Original strand, 16235732 - 16235848
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  | |||||||||||||    |||||||    
T  16235732 ttgtattgtgaacaccactaattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttct-tgtaattctgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttg 16235830  T
Q  127 agcattagaagtctcttg 144  Q
    ||||||||||||||||||    
T  16235831 agcattagaagtctcttg 16235848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #136
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 196 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 16710457 - 16710411
Alignment:
Q  196 tgaagtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16710457 tgaagtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 16710411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #137
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 30 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 22639934 - 22639779
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgagc 129  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||  ||||| ||||  ||| |||| |  |||||||  ||| |  ||||||| ||    
T  22639934 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgtttaa-ccaaact-tattctttgta-atttatttgttaggaagtcttctgcttttgtgcttgtgc 22639838  T
Q  130 attagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgag 187  Q
    ||   ||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||    
T  22639837 atagaaagtctcttgcttttgtgcttgagcatttgaagtctcttgcttgtgtgcttgag 22639779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #138
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 46088645 - 46088528
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  | |||||||||||||    |||||||    
T  46088645 ttgtattatgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttg 46088546  T
Q  127 agcattagaagtctcttg 144  Q
    |||| |||||||||||||    
T  46088545 agcaatagaagtctcttg 46088528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #139
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 31 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 19215268 - 19215153
Alignment:
Q  31 tgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttc-aagtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttga 127  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||   ||||| |||| || |||||||  | |||||||||||||    ||||||||    
T  19215268 tgtattgtgaacatcactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaac-atattctttgtaattctgtttgaattgagaagtctcttgcaattgtgcttga 19215170  T
Q  128 gcattagaagtctcttg 144  Q
    ||| |||||||||||||    
T  19215169 gcaatagaagtctcttg 19215153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #140
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 23054026 - 23053913
Alignment:
Q  31 tgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgagc 129  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||  || |||| | || || ||||||| ||||||||||||||    ||||||||||    
T  23054026 tgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagcgttcaacctcaaa--catttctttttaattctgtttgaatagaagtctcttgcaattgtgcttgagc 23053929  T
Q  130 attagaagtctcttgc 145  Q
    ||  ||||||| ||||    
T  23053928 ataggaagtctattgc 23053913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #141
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 1577522 - 1577483
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1577522 ttgtattttgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 1577483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #142
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 12284081 - 12284042
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12284081 ttgtattgtgaataccactgattgtatatcaagtgttcaa 12284042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #143
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 12624977 - 12625016
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12624977 ttgtattgtgaacaccactgattgtatattaagtgttcaa 12625016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #144
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 18515651 - 18515612
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18515651 ttgtgttgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 18515612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #145
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 19717179 - 19717140
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19717179 ttgtattgtgaacaccactgattgcatatcaagtgttcaa 19717140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #146
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 21702470 - 21702431
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21702470 ttgtattgtgaacaccactgattgtacatcaagtgttcaa 21702431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #147
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 33 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 21984249 - 21984135
Alignment:
Q  33 tattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttgagc 129  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  | |||||||||||||    ||||||||||    
T  21984249 tattgtgaacaccactaattgtatatcaagtgttcaatctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaattaagaagtctcttgcaattgtgcttgagc 21984150  T
Q  130 attagaagtctcttg 144  Q
    | |||||||||||||    
T  21984149 aatagaagtctcttg 21984135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #148
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 28492824 - 28492863
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28492824 ttgtattgtgaacaccgctgattgtatatcaagtgttcaa 28492863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #149
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 30571853 - 30571814
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30571853 ttgtattgtaaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 30571814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #150
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 32786363 - 32786402
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32786363 ttgtattgcgaacaccattgattgtatatcaagtgttcaa 32786402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #151
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 130 - 171
Target Start/End: Original strand, 20867341 - 20867383
Alignment:
Q  130 attagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactct 171  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  20867341 attagaagtctcttgctttagtgcttgagcattggaagtctct 20867383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #152
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 132
Target Start/End: Original strand, 21684477 - 21684579
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgagc 129  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||  |||||    |||| |||| ||||||||  |||||| |||||| | |  ||||||||||    
T  21684477 ttgtattgtgaacatcagtgattgtatatcaagtgttcaaagcaaacatctttctgtgtaattttgtttatttagaaatctctttcttttgtgcttgagc 21684576  T
Q  130 att 132  Q
    |||    
T  21684577 att 21684579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #153
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 189
Target Start/End: Original strand, 26280547 - 26280605
Alignment:
Q  132 tagaagtctcttgctta-gtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca 189  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| ||||||||| ||||||||||||    
T  26280547 tagaagtctcttgcttttgtgcttgagcatatgaagtctcttgcgtttgtgcttgagca 26280605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #154
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 39 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 23917477 - 23917355
Alignment:
Q  39 gaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaa--actcaattctctgtatt-tttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattaga 135  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||   ||  ||| | |||| |||| | |||||||| |||||||||| |||| ||  ||||||||||| |||    
T  23917477 gaacacctctgattgtatatcaagtgttcaaccaaacaact-atttctttgtaatctttgtttg-ttagaagtcttttgcttgtctgcttgagcataaga 23917380  T
Q  136 agtctcttgctt-agtgcttgagca 159  Q
    ||||||||||||  |||||||||||    
T  23917379 agtctcttgcttgtgtgcttgagca 23917355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #155
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 102 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 35895745 - 35895704
Alignment:
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctctt 143  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||    
T  35895745 tagaagtctcttgcttgtgtgcttgagcattggaagtctctt 35895704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #156
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 2266753 - 2266714
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag 70  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2266753 ttgtattgtgaacac-actgattgtatatcaagtgttcaag 2266714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #157
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 130 - 193
Target Start/End: Original strand, 18130506 - 18130570
Alignment:
Q  130 attagaagtctcttgctta-gtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttt 193  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||  ||||||| | |||||||||| |||||    
T  18130506 attagaagtctcttgcttttgtgcttgagcataggaaacctcttgcttttgtgcttgagtagttt 18130570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 159)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 2 - 239
Target Start/End: Original strand, 21003434 - 21003671
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21003434 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgtgaacatcactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 21003533  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 201  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21003534 cagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 21003633  T
Q  202 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgt 239  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  21003634 ctcatacttagaaagtattgagcatttgtaatctttgt 21003671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 37344074 - 37343834
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37344074 aaattcaaagtctagagtctttactgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaactcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 37343975  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37343974 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 37343875  T
Q  202 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37343874 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 37343834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 166769 - 166529
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  166769 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 166670  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  166669 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 166570  T
Q  202 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  166569 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 166529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 177361 - 177121
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  177361 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 177262  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  177261 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 177162  T
Q  202 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  177161 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 177121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 5685393 - 5685153
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5685393 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 5685294  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 201  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  5685293 cagaagtctcttgcctgcgtgcttgtgcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaaat 5685194  T
Q  202 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5685193 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 5685153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 9433138 - 9432898
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9433138 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgaatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 9433039  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 201  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  9433038 cagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttgtgtgaagt 9432939  T
Q  202 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9432938 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 9432898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 20989527 - 20989287
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20989527 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgtgaacatcactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 20989428  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 201  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20989427 cagaagtctcttgtctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 20989328  T
Q  202 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||    
T  20989327 ctcatacttagaaagtattgagcatctgtaatctttgtgat 20989287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Original strand, 48710917 - 48711157
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48710917 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 48711016  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  48711017 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 48711116  T
Q  202 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  48711117 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 48711157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Original strand, 468007 - 468247
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  468007 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 468106  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  468107 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 468206  T
Q  202 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  468207 ctcatacttaggaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 468247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Original strand, 6867651 - 6867891
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6867651 aaattcaaagtctagagtctgtactgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaactcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 6867750  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6867751 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 6867850  T
Q  202 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  6867851 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatccttgtgat 6867891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Original strand, 6878283 - 6878523
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6878283 aaattcaaagtctagagtctgtactgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaactcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 6878382  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6878383 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 6878482  T
Q  202 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  6878483 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatccttgtgat 6878523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 9085158 - 9084918
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9085158 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgcattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 9085059  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9085058 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 9084959  T
Q  202 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9084958 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 9084918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 9094872 - 9094632
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9094872 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgcattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 9094773  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9094772 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 9094673  T
Q  202 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9094672 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 9094632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 9443734 - 9443494
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9443734 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgaatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 9443635  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 201  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  9443634 cagaagtctctttcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttgtgtgaagt 9443535  T
Q  202 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9443534 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 9443494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Original strand, 26653751 - 26653991
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26653751 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 26653850  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 201  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26653851 tagaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 26653950  T
Q  202 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26653951 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 26653991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Original strand, 26700080 - 26700320
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26700080 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 26700179  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 201  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26700180 tagaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 26700279  T
Q  202 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26700280 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 26700320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 8 - 242
Target Start/End: Original strand, 14746101 - 14746336
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14746101 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtaaaactcaattctctgtatttttgtttgatcagaag 14746200  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgc-ttgagcagttttgtgaagtctcat 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  14746201 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgtttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgctttgagcatttttgtgaagtctcat 14746300  T
Q  207 actttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14746301 acttagaaagtattgagcatttgtaatctttgtgat 14746336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Original strand, 26390522 - 26390764
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26390522 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 26390621  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca--gttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  26390622 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcttgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 26390721  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26390722 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 26390764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Original strand, 26401164 - 26401406
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26401164 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 26401263  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca--gttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  26401264 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcttgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 26401363  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26401364 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 26401406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Original strand, 24931029 - 24931270
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24931029 aaattcaaagtctagagtctttactgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaactcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 24931128  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagc-agttttgtgaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||    
T  24931129 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcttgtgtgcttgagcaatttttgtgaag 24931228  T
Q  201 tctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24931229 tctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 24931270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Original strand, 26294455 - 26294696
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26294455 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 26294554  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca-gttttgtgaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  26294555 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattttttgtgaag 26294654  T
Q  201 tctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26294655 tctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 26294696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 22099612 - 22099372
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22099612 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 22099513  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  22099512 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcatgcgtgcttgagcatttttgtgaagt 22099413  T
Q  202 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22099412 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 22099372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Original strand, 2706038 - 2706280
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2706038 aaattcaaagtctagagtcttttctgttttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 2706137  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagc--agttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  2706138 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaa 2706237  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2706238 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 2706280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Original strand, 17961150 - 17961392
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17961150 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 17961249  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca--gttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||    
T  17961250 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttttgtgaa 17961349  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17961350 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 17961392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 24734627 - 24734385
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24734627 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 24734528  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca--gttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  24734527 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcttgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 24734428  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24734427 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 24734385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 24744574 - 24744332
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24744574 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 24744475  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca--gttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  24744474 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcttgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 24744375  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24744374 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 24744332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Original strand, 40042534 - 40042776
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40042534 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 40042633  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagc--agttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  40042634 tagaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaa 40042733  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40042734 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 40042776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Original strand, 40053083 - 40053325
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40053083 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 40053182  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagc--agttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  40053183 tagaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaa 40053282  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40053283 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 40053325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 8627823 - 8627581
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8627823 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 8627724  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca-gttttgtgaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  8627723 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattttttgtgaag 8627624  T
Q  201 tctcatactttgatagtattgagca-tttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||    
T  8627623 tctcatactttgaaagtattgagcagtatgtaatctttgtgat 8627581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 2 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 1987414 - 1987178
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1987414 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 1987315  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagc--agttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  1987314 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaa 1987215  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctt 236  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  1987214 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctt 1987178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 2 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 1998035 - 1997799
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1998035 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 1997936  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagc--agttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  1997935 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaa 1997836  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctt 236  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  1997835 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctt 1997799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 2 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 42865701 - 42865465
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42865701 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 42865602  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagc--agttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  42865601 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaa 42865502  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctt 236  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  42865501 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctt 42865465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 2 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 42876327 - 42876091
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42876327 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 42876228  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagc--agttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  42876227 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaa 42876128  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctt 236  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  42876127 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctt 42876091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 22088997 - 22088757
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22088997 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 22088898  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||    
T  22088897 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcatgcatgcttgagcatttttgtgaagt 22088798  T
Q  202 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22088797 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 22088757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Original strand, 17950544 - 17950786
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17950544 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 17950643  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca--gttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||    
T  17950644 tagaagtctcttgcatgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttttgtgaa 17950743  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17950744 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 17950786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 2 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 11005059 - 11004823
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11005059 aaattcatagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 11004960  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagc--agttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  11004959 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaa 11004860  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctt 236  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  11004859 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctt 11004823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Original strand, 2716642 - 2716884
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2716642 aaattcaaagtctagagtcttttctgttttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 2716741  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagc--agttttgtgaa 199  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  2716742 tagaagtctcttgcctgcatgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgaccattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaa 2716841  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2716842 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 2716884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 8 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 1367498 - 1367264
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||    
T  1367498 aaagtctagagtctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttaattcattgtatttttgtttgatcagaag 1367399  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcata 207  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  1367398 cctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcata 1367299  T
Q  208 ctttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1367298 cttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgat 1367264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 2 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 4222482 - 4222246
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4222482 aaattcaaagtctagagtcttttctgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 4222383  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca--gttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||    
T  4222382 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttttgtgaa 4222283  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctt 236  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  4222282 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctt 4222246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 2 - 236
Target Start/End: Original strand, 8002491 - 8002727
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8002491 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 8002590  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagc--agttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||    
T  8002591 tagaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagtgttgtgaa 8002690  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctt 236  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  8002691 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctt 8002727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 2 - 236
Target Start/End: Original strand, 8013136 - 8013372
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8013136 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 8013235  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagc--agttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||    
T  8013236 tagaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagtgttgtgaa 8013335  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctt 236  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  8013336 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctt 8013372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 8617260 - 8617019
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8617260 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacactactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 8617161  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca-gttttgtgaag 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  8617160 tagaagtctcttgcctgcgtgattgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagaattttttgtgaag 8617061  T
Q  201 tctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8617060 tctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 8617019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 8 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 3165603 - 3165369
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||    
T  3165603 aaagtctagagtcttaattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttaattcattgtatttttgtttgatcagaag 3165504  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcata 207  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  3165503 cctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcata 3165404  T
Q  208 ctttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3165403 cttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgat 3165369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 8 - 242
Target Start/End: Original strand, 15888760 - 15888994
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||| |||||    
T  15888760 aaagtctagagtctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactaatttcattgtatttttgtttgatcagaag 15888859  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcata 207  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  15888860 cctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcata 15888959  T
Q  208 ctttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15888960 cttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgat 15888994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 8 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 30049388 - 30049154
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||| |||||    
T  30049388 aaagtctagagtctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttatttctttgtatttttgtttgatcagaag 30049289  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcata 207  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  30049288 actcttgcatgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcata 30049189  T
Q  208 ctttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30049188 cttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgat 30049154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 2 - 206
Target Start/End: Original strand, 455225 - 455429
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  455225 aaattcaaagtctagagtcttttttgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 455324  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 201  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  455325 tagaagtcttttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 455424  T
Q  202 ctcat 206  Q
    |||||    
T  455425 ctcat 455429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 8 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 589081 - 588847
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||| |||||    
T  589081 aaagtttagagtctttaacgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacataattcattgtatttttgtttgatcagaag 588982  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcata 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  588981 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgaacattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcata 588882  T
Q  208 ctttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  588881 cttagatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 588847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 8 - 242
Target Start/End: Original strand, 31116942 - 31117176
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||| |||||    
T  31116942 aaagtctagagtctttaacgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttatttcattgtatttttgtttgatcagaag 31117041  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcata 207  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31117042 actcttgcctgcgcgcttgagcattagaagtctcttgcttattgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcata 31117141  T
Q  208 ctttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31117142 cttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgat 31117176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 8 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 20490875 - 20490641
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||    
T  20490875 aaagtctagagtcttaattgtattgtattgtgaaccccactgattgtatatcaagtgttcgagtcaaacttaattcattgtatttttgtttgatcagaag 20490776  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcata 207  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  20490775 cctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcata 20490676  T
Q  208 ctttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20490675 cttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgat 20490641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 8 - 242
Target Start/End: Original strand, 21770374 - 21770608
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||| |||||    
T  21770374 aaagtctagagtctttaacgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttatttcattgtatttttgtttgatcagaag 21770473  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcata 207  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  21770474 cctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcata 21770573  T
Q  208 ctttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21770574 cttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgat 21770608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 8 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 9159599 - 9159365
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||| |||||    
T  9159599 aaagtctagagtctttaacgtattatattgtgaacaccactgattgtttatcaagtgttcaagtcaaacttatttcattgtatttttgtttgatcagaag 9159500  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcata 207  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  9159499 cctcttgcttgcgtgcttgagcattagaagcctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcata 9159400  T
Q  208 ctttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||| || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  9159399 cttagagagtattgatcatttgtaatctttgtgat 9159365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 8 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 9170054 - 9169820
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||| |||||    
T  9170054 aaagtctagagtctttaacgtattatattgtgaacaccactgattgtttatcaagtgttcaagtcaaacttatttcattgtatttttgtttgatcagaag 9169955  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcata 207  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  9169954 cctcttgcttgcgtgcttgagcattagaagcctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcata 9169855  T
Q  208 ctttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||| || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  9169854 cttagagagtattgatcatttgtaatctttgtgat 9169820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 2 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 11095928 - 11095744
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    |||||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11095928 aaattcaaagtccagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 11095829  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttga 186  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11095828 tacaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattataagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttga 11095744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 9 - 242
Target Start/End: Original strand, 40055185 - 40055419
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtatt-gagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaa 106  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||||||||  ||||    
T  40055185 aagtctagagtctttattgcattgtatttgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaggtcaaacttt-ttctgtgtatttttgtttgaacagaa 40055283  T
Q  107 gtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcat 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  40055284 gtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactattgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcctgcgtgcttgagcatttttgagaagtctcat 40055383  T
Q  207 actttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40055384 acttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgat 40055419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 9 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 18418981 - 18418753
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttc-aagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  |||| ||||||| ||||||||||||||    
T  18418981 aagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacac-tttctgtgtatttctgtttgattagaag 18418883  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcat 206  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||    
T  18418882 cctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcat 18418785  T
Q  207 actttgatagtattgagcatttgtaatctttg 238  Q
    |||  || ||||||||||||||||||||||||    
T  18418784 actaagagagtattgagcatttgtaatctttg 18418753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 9 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 18441062 - 18440834
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttc-aagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  |||| ||||||| ||||||||||||||    
T  18441062 aagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacac-tttctgtgtatttctgtttgattagaag 18440964  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcat 206  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||    
T  18440963 cctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcat 18440866  T
Q  207 actttgatagtattgagcatttgtaatctttg 238  Q
    |||  || ||||||||||||||||||||||||    
T  18440865 actaagagagtattgagcatttgtaatctttg 18440834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 9 - 242
Target Start/End: Original strand, 38403644 - 38403877
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    || ||||||| ||||||||| ||||||    
T  38403644 aagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaaatcaaacattttt-tctgtatctttgtttgaatagaag 38403742  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcat 206  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | ||||| ||||||||||    
T  38403743 cctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagactcttgcctgcgtgcttgagta-ttttgagaagtctcat 38403841  T
Q  207 actttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38403842 acttagagagtattgagcatttgtaatctgtgtgat 38403877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 9 - 242
Target Start/End: Original strand, 3476774 - 3477005
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagt 108  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    |||| |||| || |||||||||||||||    
T  3476774 aagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccgctgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacaattttctgtgtaattctgtttgattagaagt 3476873  T
Q  109 ctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcata 207  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| |||||||||||    
T  3476874 ctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttaagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcata 3476971  T
Q  208 ctttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    | | || ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3476972 c-tagagagtattgagcatttgtaatctgtgtgat 3477005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 9 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 48382054 - 48381821
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || ||||||||||||||    
T  48382054 aagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccattgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacatt-ttctgtgtaattctgtttgattagaag 48381956  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcat 206  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | || || || ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  48381955 cctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtccctcgcctgcgtgcttgagca-ttttgagaagtctcat 48381857  T
Q  207 actttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  48381856 acttagagagtattgagcatttgtaatctgtgtgat 48381821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 2 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 540959 - 540798
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtat-ttttgtttga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  540959 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtattttttgtttga 540860  T
Q  101 ttagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcatt 161  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |  |||||||||||||    
T  540859 tcagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatt 540798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 9 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 8933430 - 8933199
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| |||||||||| ||||||    
T  8933430 aagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacatt-ttctgtgtaattttgtttgaatagaag 8933332  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcat 206  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||    
T  8933331 tctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcat 8933234  T
Q  207 actttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    || | || ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8933233 ac-tagagagtattgagcatttgtaatctgtgtgat 8933199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 9 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 15216183 - 15215952
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttc-aagtcaaactcaattctctgtat--ttttgtttgattaga 105  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||| |||||||  |||||||||| ||||    
T  15216183 aagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaac---attttctgtataattttgtttgaataga 15216087  T
Q  106 agtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctc 204  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||    
T  15216086 agtctctagcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgctttagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctc 15215989  T
Q  205 atactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    |||| | || ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15215988 atac-tagagagtattgagcatttgtaatctgtgtgat 15215952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 9 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 29589859 - 29589627
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || ||||||||||||||    
T  29589859 aagtctagagtctttattgcattgtaatgtgaacaccacttattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacaattttctgtgtaattctgtttgattagaag 29589760  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcat 206  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||    
T  29589759 tctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcat 29589662  T
Q  207 actttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    || | ||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  29589661 ac-tagatagtattgagcatttgtgatctgtgtgat 29589627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 81 - 242
Target Start/End: Original strand, 17064034 - 17064195
Alignment:
Q  81 ttctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtg 179  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  17064034 ttctctgtatttttgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagactcttgcttgcg 17064133  T
Q  180 tgcttgagcagttttgtgaagtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17064134 tgcttgagca-ttttgagaagtctcatacttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgat 17064195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 8 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 44280363 - 44280209
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  44280363 aaagtctagagtcttaattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttaattcattgtatttttgtttgattagaag 44280264  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcatt 161  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||||||||    
T  44280263 cctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatt 44280209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 9 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 13682186 - 13681955
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctc--tgtatttttgtttgattaga 105  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||   ||| ||  |||| |||||||||||||||    
T  13682186 aagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccattgattgtatatcaagtgtttaaagtcaaac---attttcggtgtaattttgtttgattaga 13682090  T
Q  106 agtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctc 204  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||    
T  13682089 agcctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctc 13681992  T
Q  205 atactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    |||| | || ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13681991 atac-tagagagtattgagcatttgtaatctgtgtgat 13681955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 9 - 242
Target Start/End: Original strand, 12734598 - 12734829
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| ||||  ||||||||| ||||||    
T  12734598 aagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacatt-ttctgtgtaactttgtttgaatagaag 12734696  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcat 206  Q
     |||| |||||||||||||||| |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||    
T  12734697 cctctcgcctgcgtgcttgagccttagaagaatcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcat 12734794  T
Q  207 actttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    || | || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12734795 ac-tagagagtattgagcatttgtaatctttgtgat 12734829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 9 - 242
Target Start/End: Original strand, 26209982 - 26210213
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| |||||||||| ||| ||    
T  26209982 aagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacatt-ttctgtgtaattttgtttgaatagtag 26210080  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcat 206  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||    
T  26210081 tctctcccctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcat 26210178  T
Q  207 actttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    || | || |||||||||||| |||||||| ||||||    
T  26210179 ac-tagagagtattgagcatctgtaatctgtgtgat 26210213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 2 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 4211883 - 4211724
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4211883 aaattcaaagtctagagtcttttctgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 4211784  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcatt 161  Q
    ||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||| ||||||| |  |||||||||||||    
T  4211783 tagaagtctcttg-cttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatt 4211724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 9 - 242
Target Start/End: Original strand, 8999370 - 8999606
Alignment:
Q  9 aagtctagagtcttt--attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattaga 105  Q
    |||||||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||||||||    
T  8999370 aagtctagagtctttcaattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgattaga 8999469  T
Q  106 agtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctc 204  Q
    |||||||||| |  ||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| ||||  |||||| || |||||||||||  |||||||||||||    
T  8999470 agtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcatttgaagtttcttgcctgcgtgcttgagca--tttgtgaagtctc 8999567  T
Q  205 atactttg-atagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    |||||  |  |||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  8999568 atactaggtgtagtattgagcagttgtaatctgtgtgat 8999606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 9 - 161
Target Start/End: Original strand, 38594144 - 38594298
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttca-agtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||   |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  38594144 aagtctagagtctttattgcattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcattatcaaacttttttctttgtatttttgtttgaatagaag 38594243  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttg-cttagtgcttgagcatt 161  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  |||||||||||||    
T  38594244 cctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcctgcgtgcttgagcatt 38594298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 130 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 4211785 - 4211677
Alignment:
Q  130 attagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca--gttttgtgaagtctcatactttgatagtattgagcatt 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |    
T  4211785 attagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttttgtgaagtctcatacttagaaagtattgagcagt 4211686  T
Q  228 tgtaatctt 236  Q
    |||||||||    
T  4211685 tgtaatctt 4211677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 133 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 540857 - 540747
Alignment:
Q  133 agaagtctcttgctta-gtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatactttgatagtattgagcatttgta 231  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  540857 agaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatacttagaaagtattgagcagttgta 540758  T
Q  232 atctttgtgat 242  Q
    |||||||||||    
T  540757 atctttgtgat 540747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 9 - 161
Target Start/End: Original strand, 24882853 - 24883007
Alignment:
Q  9 aagtctagagtcttt-attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    |||| |||| || ||||||||||||||    
T  24882853 aagtctagagtcttttattgcattgtattgtgaacaccgctgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacaattttctgtgtaattctgtttgattagaag 24882952  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttg-cttagtgcttgagcatt 161  Q
    |||||||| |  ||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  24882953 tctcttgctttagtgcttgagcattggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcatt 24883007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 149 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 44280251 - 44280158
Alignment:
Q  149 gtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44280251 gtgcttgagcattagaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcatacttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgat 44280158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 11087485 - 11087716
Alignment:
Q  14 tagagtcttt--attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtct 110  Q
    ||||||||||  |||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    ||||  ||| || ||||||| |||||||||    
T  11087485 tagagtctttcaattgcattgcattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgggtaattctgtttgaatagaagtct 11087584  T
Q  111 cttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatact 209  Q
    ||||| |  |||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||| || |||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  11087585 cttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttgagca--tttgtgaagtctcatact 11087682  T
Q  210 ttg-atagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
      |  |||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  11087683 aggtgtagtattgagcagttgtaatctgtgtgat 11087716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 29 - 234
Target Start/End: Original strand, 4433039 - 4433244
Alignment:
Q  29 attgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttga 127  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| |||||||||||||| |  ||||||||    
T  4433039 attgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttgctttagtgcttga 4433138  T
Q  128 gcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatactttg-atagtattgagca 225  Q
    ||||   || |||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||| ||   ||||||||||||||  |  ||||||||||||    
T  4433139 gcatagaaattctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgtgtgcttgagcaatt---tgaagtctcatactaggtgtagtattgagca 4433235  T
Q  226 tttgtaatc 234  Q
    |||||||||    
T  4433236 tttgtaatc 4433244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 25 - 234
Target Start/End: Original strand, 4412462 - 4412671
Alignment:
Q  25 ttgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgc 123  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| | || || ||||||| |||||||||||||| |  ||||    
T  4412462 ttgtattgtattgtgaacaccattgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtttaattctgtttgaatagaagtctcttgctttagtgc 4412561  T
Q  124 ttgagcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatactttg-atagtattg 221  Q
    ||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||| ||   ||||||||||||||  |  ||||||||    
T  4412562 ttgagcatagaaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgtgtgcttgagcaatt---tgaagtctcatactaggtgtagtattg 4412658  T
Q  222 agcatttgtaatc 234  Q
    |||| ||||||||    
T  4412659 agcagttgtaatc 4412671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 149 - 242
Target Start/End: Original strand, 38594256 - 38594348
Alignment:
Q  149 gtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38594256 gtgcttgagcattagaagactcttgcctgcgtgcttgagca-ttttgagaagtctcatacttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgat 38594348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 24 - 242
Target Start/End: Original strand, 13175058 - 13175277
Alignment:
Q  24 attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtg 122  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| ||||||||||||   |  |||    
T  13175058 attgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttaatttagtg 13175157  T
Q  123 cttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatactttg-atagtatt 220  Q
    |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||  ||||| || | || || |||||||||||  |||||||||||||| |||  |  ||||| |    
T  13175158 cttgagcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctatagcctgcgtgcttgagca--tttgtgaagtctcagactaggtgtagtact 13175255  T
Q  221 gagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||| ||||||||| ||||||    
T  13175256 gagcagttgtaatctgtgtgat 13175277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 130 - 242
Target Start/End: Original strand, 24882945 - 24883055
Alignment:
Q  130 attagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatactttgatagtattgagcattt 228  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||  |||| |||||||||||| | |||||||||||||| ||    
T  24882945 attagaagtctcttgctttagtgcttgagcattggaagtctcttgcctgcgtgcttgagca--tttgggaagtctcatac-tagatagtattgagcagtt 24883041  T
Q  229 gtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||| ||||||    
T  24883042 gtaatctgtgtgat 24883055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 29 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 602421 - 602215
Alignment:
Q  29 attgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagt-caaactcaattctctgtatttttgtttga-ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    |||| |||| || ||||||| ||||||||||||||| |  |||||||    
T  602421 attgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaattcaaacaattttctatgtaattctgtttgaattagaagtctcttgctttagtgcttg 602322  T
Q  127 agcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatactt-tgatagtattgagc 224  Q
    |||||  |||||||||| |||  ||| ||||||| | |||| ||||||| ||||||||||||||    | ||||||||||||||| |   ||||||||||    
T  602321 agcatctgaagtctcttacttgtgtgtttgagca-tagaagtctcttgc-tgtgtgcttgagca---atctgaagtctcatacttgtttaagtattgagc 602227  T
Q  225 atttgtaatctt 236  Q
    | ||||||||||    
T  602226 agttgtaatctt 602215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 30 - 114
Target Start/End: Original strand, 2501517 - 2501600
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttg 114  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  2501517 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaactcaaact-tattctttgtaatttcgtttgtttagaagtctcttg 2501600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 13302514 - 13302397
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||    |||||||    
T  13302514 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttgtgcttg 13302415  T
Q  127 agcattagaagtctcttg 144  Q
    ||||||||||||||||||    
T  13302414 agcattagaagtctcttg 13302397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 30 - 193
Target Start/End: Original strand, 25687345 - 25687509
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| || |||||||||||    |||||||||    
T  25687345 ttgtattgggaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaac-attttctttgtaattatgtttgaataaaagtctcttgcagttgtgcttgag 25687443  T
Q  129 cattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttt 193  Q
    ||| ||||| |||||||  | |||||||||||| ||||  ||||||| | |||||||||| |||||    
T  25687444 cataagaagcctcttgcagttgtgcttgagcataggaaacctcttgcatttgtgcttgagtagttt 25687509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 137
Target Start/End: Original strand, 19237540 - 19237648
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  | |||| | || ||| |||||| |||||||||||||| |  |||||||||    
T  19237540 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatatttctttataatttagtttgaatagaagtctcttgcttatgtgcttgag 19237639  T
Q  129 cattagaag 137  Q
    ||| |||||    
T  19237640 cataagaag 19237648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 25 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 25807051 - 25806885
Alignment:
Q  25 ttgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgct 124  Q
    |||| |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| | |||| | ||  |||||||| ||||||||||||||  |  |||||    
T  25807051 ttgttttgtattatgaacatcactgattgtatatcaagtgttcaaaccaaacttatttctttata-atttgtttgtttagaagtctcttgtttttgtgct 25806953  T
Q  125 tgagcattagaagtctcttgctt-agtgctt--gagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca 189  Q
    |||||||  ||| ||||||||||  ||||||  ||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||    
T  25806952 tgagcataggaaatctcttgcttgtgtgcttgagagtatttgaagtctcttgcttgtgtgcttgagca 25806885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 5035039 - 5034880
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||    |||| | || |||||||||  ||||||| |||||| |  |||||||||    
T  5035039 ttgtattgtgaacaccacttattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctgtataattttgtttgtctagaagtatcttgcttttgtgcttgag 5034940  T
Q  129 cattagaagtctcttg-cttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgag 187  Q
    |||  |||||||||||  || |||||||||||| ||||  ||||||| | ||||||||||    
T  5034939 cataggaagtctcttgtgtttgtgcttgagcataggaaacctcttgcttttgtgcttgag 5034880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Original strand, 13027406 - 13027521
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| ||||||||||||||    |||||||||    
T  13027406 ttgtattatgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatagaagtctcttgcagttgtgcttgag 13027505  T
Q  129 cattagaagtctcttg 144  Q
    ||| ||||||||||||    
T  13027506 cataagaagtctcttg 13027521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Original strand, 13034342 - 13034457
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| ||||||||||||||    |||||||||    
T  13034342 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatagaagtctcttgcagttgtgcttgag 13034441  T
Q  129 cattagaagtctcttg 144  Q
    ||| | ||||||||||    
T  13034442 cataataagtctcttg 13034457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Original strand, 12174844 - 12174961
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  | ||||||||||||| |  |||||||    
T  12174844 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctttgtaattatgtttgaattcagaagtctcttgcatttgtgcttg 12174943  T
Q  127 agcattagaagtctcttg 144  Q
    |||| |||||||||||||    
T  12174944 agcaatagaagtctcttg 12174961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 194
Target Start/End: Original strand, 13172858 - 13173023
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagt-caaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||    |||| |||| || ||||||| |||||||||||||| |  |||||||||    
T  13172858 ttgtattttgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaccacaaacatt-ttctttgtaattctgtttgaatagaagtctcttgcttttgtgcttgag 13172956  T
Q  129 cattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagtttt 194  Q
     ||  ||||||||||||  | |||||||||||| ||||  ||||||| | |||||||||| ||||||    
T  13172957 tataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcatcggaaacctcttgcttttgtgcttgagtagtttt 13173023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 189
Target Start/End: Original strand, 13731178 - 13731341
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  || ||||||||||||    |||||||    
T  13731178 ttgtattgtgaacaccattgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaatttggaagtctcttgcagttgtgcttg 13731277  T
Q  127 agcattagaagtctcttgcttagtgctt--gagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca 189  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||| ||||| |||||||   ||||||||||||    
T  13731278 agcattagaagtctcttgctt-gtgtttaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagca 13731341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 15088202 - 15088085
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  | |||||||||||||    |||||||    
T  15088202 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttg 15088103  T
Q  127 agcattagaagtctcttg 144  Q
    ||||||||||||||||||    
T  15088102 agcattagaagtctcttg 15088085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 112
Target Start/End: Original strand, 18362071 - 18362153
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctct 112  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    |||| |||| ||||||||| ||||||| ||||    
T  18362071 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaatcaaacatctttctgtgtaattttgtttgtttagaagcctct 18362153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 23125537 - 23125439
Alignment:
Q  92 tttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgctta-gtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca 189  Q
    |||||||| ||||||||||||| | |  | ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||    
T  23125537 tttgtttgtttagaagtctcttacttttgggcttgagcattagaaatctcttgcttgtgtgcttgagtatttgaagtctcttgcttgtgtgcttgagca 23125439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Original strand, 32265224 - 32265341
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||    |||| |||| ||||||||||  |||||||||||||||    |||||||    
T  32265224 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagggttcaacttcaaacaattttctttgtaattttgtttgaatttagaagtctcttgcagttgtgcttg 32265323  T
Q  127 agcattagaagtctcttg 144  Q
    |||| |||||||||||||    
T  32265324 agcaatagaagtctcttg 32265341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Original strand, 48063316 - 48063433
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||    |||||||    
T  48063316 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttgtgcttg 48063415  T
Q  127 agcattagaagtctcttg 144  Q
    |||| |||||||||||||    
T  48063416 agcaatagaagtctcttg 48063433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 30 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 16472342 - 16472227
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgagc 129  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | |||| ||||  |||||||| ||| ||||||||||| |  ||| ||||||    
T  16472342 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaaccaaacttatttctgtgta-atttgtttg-ttataagtctcttgcttttgtggttgagc 16472245  T
Q  130 attagaagtctcttgctt 147  Q
    ||  ||| ||||||||||    
T  16472244 atgggaaatctcttgctt 16472227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 4494229 - 4494113
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctc-ttgcctgcgtgcttga 127  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||||||||||||| ||||    ||||||||    
T  4494229 ttgtattgtgaacaccactgactgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgattagaagtctctttgcaattgtgcttga 4494130  T
Q  128 gcattagaagtctcttg 144  Q
    |||| ||||||||||||    
T  4494129 gcataagaagtctcttg 4494113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 40 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 13263421 - 13263274
Alignment:
Q  40 aacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtc 139  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||  | ||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||  ||||||    
T  13263421 aacacctctgattgtatatcaagtgttcatctcaaact-tattctttgta-atctgtttga-tagaagtctcttgcttttgtgcttgagcataggaagtc 13263325  T
Q  140 tcttgcttagtg--cttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca 189  Q
    |||||| |||||  |||||| ||| |||| || |||| ||||||||||||||    
T  13263324 tcttgc-tagtgtacttgagaatttgaagtcttttgcttgtgtgcttgagca 13263274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 138
Target Start/End: Original strand, 16315043 - 16315154
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    || | |||| ||||||||||  |||||||||||||||    |||||||    
T  16315043 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttttgtgtaattttgtttgaatttagaagtctcttgcagttgtgcttg 16315142  T
Q  127 agcattagaagt 138  Q
    ||||||||||||    
T  16315143 agcattagaagt 16315154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 9802829 - 9802671
Alignment:
Q  33 tattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaa-actcaattctctgtattttt-gtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgagca 130  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| | || | | | |||  |||| || | ||||| ||| |||| |||||| || |||||||||||    
T  9802829 tattgtgaacaccacttattgtatatcaagtgttcaactaaacaattatttccttgtaattctagtttg-ttataagtgtcttgcttgtgtgcttgagca 9802731  T
Q  131 ttagaagtctcttgctta-gtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca 189  Q
    |  ||||||||||||||  |||||||||||| ||||| ||||||| | ||||||||||||    
T  9802730 tgtgaagtctcttgcttgtgtgcttgagcataggaagtctcttgcttatgtgcttgagca 9802671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 144
Target Start/End: Original strand, 16112392 - 16112506
Alignment:
Q  33 tattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttgagc 129  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||    ||||||||||    
T  16112392 tattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttgtgcttgagc 16112491  T
Q  130 attagaagtctcttg 144  Q
    | |||||||||||||    
T  16112492 agtagaagtctcttg 16112506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Original strand, 2914114 - 2914231
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  || ||||||||||||    |||||||    
T  2914114 ttgtattgtgaacaccactaattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaatttggaagtctcttgcagttgtgcttg 2914213  T
Q  127 agcattagaagtctcttg 144  Q
    ||||||||||||||||||    
T  2914214 agcattagaagtctcttg 2914231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 39 - 144
Target Start/End: Original strand, 7488418 - 7488524
Alignment:
Q  39 gaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaag 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||  ||||    
T  7488418 gaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatagaagtctcttgcagttgtgcttgagcataggaag 7488517  T
Q  138 tctcttg 144  Q
    |||||||    
T  7488518 tctcttg 7488524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Original strand, 10883675 - 10883792
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| | || || |||||||  || ||||||||||||    |||||||    
T  10883675 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttataattctgtttgaatttggaagtctcttgcagttgtgcttg 10883774  T
Q  127 agcattagaagtctcttg 144  Q
    ||||||||||||||||||    
T  10883775 agcattagaagtctcttg 10883792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Original strand, 16557094 - 16557211
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  | |||||||||||||    |||||||    
T  16557094 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttg 16557193  T
Q  127 agcattagaagtctcttg 144  Q
    |||||| |||||||||||    
T  16557194 agcattcgaagtctcttg 16557211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 16608568 - 16608451
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  | |||||||||||||    |||||||    
T  16608568 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttg 16608469  T
Q  127 agcattagaagtctcttg 144  Q
    |||||| |||||||||||    
T  16608468 agcattcgaagtctcttg 16608451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 27871370 - 27871253
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  ||| |||||||||||    |||||||    
T  27871370 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaatttaaaagtctcttgcagttgtgcttg 27871271  T
Q  127 agcattagaagtctcttg 144  Q
    |||| |||||||||||||    
T  27871270 agcaatagaagtctcttg 27871253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Original strand, 28622863 - 28622980
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  | |||||| ||||||    |||||||    
T  28622863 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaattaagaagtgtcttgcagttgtgcttg 28622962  T
Q  127 agcattagaagtctcttg 144  Q
    ||||||||||||||||||    
T  28622963 agcattagaagtctcttg 28622980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Original strand, 29935849 - 29935964
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctct-gtatttttgtttg-attagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||||| ||| ||| || |||||| ||||||||||||||||     ||||||    
T  29935849 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaa--caattttctggtaattctgtttgaattagaagtctcttgcagttatgcttg 29935946  T
Q  127 agcattagaagtctcttg 144  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  29935947 agcattaaaagtctcttg 29935964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 2499690 - 2499526
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttg-attagaagtctcttgcctgcgtgcttga 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||| |||||||||||||||     ||||||||    
T  2499690 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaattagaagtctcttgtagttgtgcttga 2499591  T
Q  128 gcattagaagtctcttgcttagtg-cttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagtt 192  Q
    |||| |||| ||||||| || ||| |  |||||| ||||| |||||||   |||||||||||||||    
T  2499590 gcataagaaatctcttgatt-gtgtcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcagtt 2499526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 40 - 144
Target Start/End: Original strand, 16317070 - 16317175
Alignment:
Q  40 aacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagt 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||| || ||| ||||||||||    |||||||||||||||||||    
T  16317070 aacaccactgattgtatatcaagtgttcaatctcaaacaattttctatgtaattatgttcgaatagtagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaagt 16317169  T
Q  139 ctcttg 144  Q
    ||||||    
T  16317170 ctcttg 16317175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 174
Target Start/End: Original strand, 22579719 - 22579866
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |  ||||  |||||||||||||||    |||||||    
T  22579719 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattcttcttgaatttagaagtctcttgcagttgtgcttg 22579818  T
Q  127 agcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgc 174  Q
    |||| ||||||||||||||  | ||||||||||||| |||| |||||||    
T  22579819 agca-tagaagtctcttgcagttgtgcttgagcatttgaagtctcttgc 22579866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 130 - 189
Target Start/End: Original strand, 16308289 - 16308349
Alignment:
Q  130 attagaagtctcttgctta-gtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca 189  Q
    |||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16308289 attagaagtctcttacttttgtgcttgagcataggaagactcttacgtgtgtgcttgagca 16308349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 4821137 - 4821098
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4821137 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 4821098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 8182583 - 8182544
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8182583 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 8182544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 11015614 - 11015575
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11015614 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 11015575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 11319059 - 11319020
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11319059 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 11319020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 11792562 - 11792447
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||  ||||||    || | |||| || | ||||| ||||||||||||||    |||||||||    
T  11792562 ttgtattgtgaacaccattgattgtataccaagtgttcaacctcaaacaattttttgtgtaattctatttgaatagaagtctcttgcagttgtgcttgag 11792463  T
Q  129 cattagaagtctcttg 144  Q
    ||||||||||||||||    
T  11792462 cattagaagtctcttg 11792447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 69
Target Start/End: Original strand, 12222922 - 12222977
Alignment:
Q  14 tagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    ||||||||  ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12222922 tagagtctaaattgttttgtattgttaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 12222977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #123
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 13261118 - 13261157
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13261118 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 13261157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #124
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Original strand, 13473002 - 13473117
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||    |||| |||| || ||||||| ||||||||||||||    |||||||||    
T  13473002 ttgtattgtgaacaccattgattgtatatcaagtgttcaggctcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatagaagtctcttgcagttgtgcttgag 13473101  T
Q  129 cattagaagtctcttg 144  Q
    ||| | | ||||||||    
T  13473102 cataaaatgtctcttg 13473117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #125
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 14187343 - 14187304
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14187343 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 14187304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #126
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 14425109 - 14425070
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14425109 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 14425070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #127
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 14426200 - 14426161
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14426200 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 14426161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #128
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 15467569 - 15467530
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15467569 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 15467530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #129
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 15704993 - 15705032
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15704993 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 15705032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #130
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 15871583 - 15871622
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15871583 ttgtattgagaacatcactgattgtatatcaagtgttcaa 15871622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #131
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 19711517 - 19711556
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19711517 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 19711556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #132
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 21381933 - 21381972
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21381933 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 21381972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #133
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 23280465 - 23280504
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23280465 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 23280504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #134
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 24795219 - 24795258
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24795219 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 24795258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #135
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 30945864 - 30945903
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30945864 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 30945903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #136
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 33692206 - 33692245
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33692206 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 33692245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #137
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 33 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 9762337 - 9762184
Alignment:
Q  33 tattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaa-actcaattctctgtattt-ttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgagca 130  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| | || | | | |||  |||| || ||||||| ||| |||| |||||| || |||||||||||    
T  9762337 tattgtgaacaccacttattgtatatcaagtgttcaactaaacaattatttccttgtaattcttgtttg-ttataagtttcttgcttgtgtgcttgagca 9762239  T
Q  131 ttagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgctt 184  Q
    |  ||||||||||||||  || |||||||||  |||| ||||||| |||||||||    
T  9762238 tgtgaagtctcttgcttgtgtacttgagcatatgaagtctcttgcttgtgtgctt 9762184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #138
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 92 - 189
Target Start/End: Original strand, 11572762 - 11572860
Alignment:
Q  92 tttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgctta-gtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca 189  Q
    |||||||| |||||||| |||||| |  ||| ||||||||  ||| ||||||||||  ||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||    
T  11572762 tttgtttgtttagaagtgtcttgcttttgtgattgagcatatgaaatctcttgcttgtgtgcttgagtatttgaagtctcttgcttgtgtgcttgagca 11572860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #139
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 34 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 44466712 - 44466570
Alignment:
Q  34 attgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcatt 132  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| |||||||| || ||||||||||||  || || |  ||||||     
T  44466712 attgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattttgttttatcagaagtctcttgattgtgttcaagagcata 44466613  T
Q  133 agaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgc 174  Q
     ||||||||||||  | ||| ||||||||| |||| |||||||    
T  44466612 ggaagtctcttgcagttgtgtttgagcatttgaagtctcttgc 44466570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #140
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 13683250 - 13683134
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttga 127  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||    |||| |||| || |||||||  || ||||||||||||    ||||||||    
T  13683250 ttgtattttgaacaccactgattgtatatcaagtgttaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaatttggaagtctcttgcagttgtgcttga 13683151  T
Q  128 gcattagaagtctcttg 144  Q
    | |||||||||||||||    
T  13683150 gtattagaagtctcttg 13683134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #141
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 47 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 15304249 - 15304135
Alignment:
Q  47 ctgattgtatatcaagtgttcaagtcaaac--tcaattctctgta-tttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctctt 143  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||  | | |||| |||| |||||||||| |||||||| |||||| || ||||||||||||  ||||||||||    
T  15304249 ctgattgtatatcaagtgttcaac-caaacaattatttctttgtaatttttgtttg-ttagaagtttcttgcttgtgtgcttgagcatatgaagtctctt 15304152  T
Q  144 gctt-agtgcttgagca 159  Q
    ||||  |||||||||||    
T  15304151 gcttgtgtgcttgagca 15304135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #142
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 242
Target Start/End: Original strand, 25212471 - 25212516
Alignment:
Q  197 gaagtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25212471 gaagtctcatacttagagagtattgagcagttgtaatctttgtgat 25212516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #143
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 189
Target Start/End: Original strand, 13138401 - 13138564
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||    |||  |||  ||||||||||  || |||| |||||||    |||||||    
T  13138401 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcatgtgttcaacctcaaacatttttcattgtgattttgtttgaatttggaagcctcttgcagttgtgcttg 13138500  T
Q  127 agcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca 189  Q
    |||||||||||||||||| ||  || |  |||||| |||||||||||||   ||||||||||||    
T  13138501 agcattagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagactcttgcagttgtgcttgagca 13138564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #144
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 234
Target Start/End: Original strand, 48806384 - 48806590
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||    |||  |||| || |||||||  | |||||||||||||    |||||||    
T  48806384 ttgtattgtgaacaccactgcttgtatatcaagtgttcaacatcaaacatttttcattgtaattctgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttg 48806483  T
Q  127 agcattagaagtctcttgctta-gtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatactttg-atagtattgagc 224  Q
    |||| ||||||||||||| | | || |  |||||| ||||| |||||||   ||||||||| || ||   ||||||||||||||  |  |||||||||||    
T  48806484 agcaatagaagtctcttgataatgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgaacaatt---tgaagtctcatactaagtttagtattgagc 48806580  T
Q  225 atttgtaatc 234  Q
    ||||||||||    
T  48806581 atttgtaatc 48806590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #145
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 1292683 - 1292644
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1292683 ttgtattgtgaacaccactaattgtatatcaagtgttcaa 1292644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #146
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 1878763 - 1878802
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1878763 ttgtactgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 1878802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #147
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 2266020 - 2266059
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2266020 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaaatgttcaa 2266059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #148
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 34 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 13879820 - 13879785
Alignment:
Q  34 attgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13879820 attgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 13879785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #149
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 16105470 - 16105509
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16105470 ttgtattgtgaacaccactcattgtatatcaagtgttcaa 16105509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #150
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 19339753 - 19339792
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19339753 ttgtattatgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 19339792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #151
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 21691984 - 21691945
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21691984 ttgtattgtgaacaccactgattgtatttcaagtgttcaa 21691945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #152
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 69
Target Start/End: Original strand, 12367250 - 12367280
Alignment:
Q  39 gaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12367250 gaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 12367280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #153
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 94 - 144
Target Start/End: Original strand, 16310477 - 16310527
Alignment:
Q  94 tgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttg 144  Q
    ||||||| ||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||    
T  16310477 tgtttgaatagaagtctcttgcagttgtgcttgagcattagaagtctcttg 16310527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #154
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 16411647 - 16411617
Alignment:
Q  39 gaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16411647 gaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 16411617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #155
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 20094706 - 20094640
Alignment:
Q  124 ttgagcattagaagtctcttgctta-gtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca 189  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||  ||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||    
T  20094706 ttgagtattagaagtctattgcttgtgtgctcgagcattgaaagactcttgtttgtgtgcttgagca 20094640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #156
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 23125499 - 23125437
Alignment:
Q  100 attagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcatt 161  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  23125499 attagaaatctcttgcttgtgtgcttgagtatttgaagtctcttgcttgtgtgcttgagcatt 23125437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #157
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 39 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 9065150 - 9065113
Alignment:
Q  39 gaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaac 76  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9065150 gaacatcactgattgtatatcaagtgttcaattcaaac 9065113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #158
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 202 - 242
Target Start/End: Original strand, 457618 - 457658
Alignment:
Q  202 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  457618 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 457658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #159
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 66
Target Start/End: Original strand, 19328518 - 19328554
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgtt 66  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  19328518 ttgtattgtgaacaccactgattatatatcaagtgtt 19328554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0386 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 1)
Name: scaffold0386
Description:

Target: scaffold0386; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 12228 - 11988
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12228 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 12129  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12128 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 12029  T
Q  202 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12028 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 11988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 1)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Original strand, 7269 - 7509
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7269 aaattcaaagtctagagtctttattgttttgtattgagaacaccactaattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttaattctctgtatttttgtttgat 7368  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 201  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7369 cagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 7468  T
Q  202 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7469 ctcttacttagaaagtattgagcatttgtaatctttgtgat 7509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 208; Significance: 1e-114; HSPs: 2)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 31003 - 30761
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31003 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 30904  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca--gttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  30903 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaa 30804  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30803 gtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 30761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133; HSP #2
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 8 - 242
Target Start/End: Original strand, 42911 - 43150
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  ||||||||||||||| |||||    
T  42911 aaagtctagagtctttaacgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttatttcttggtatttttgtttgatcagaag 43010  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca----gttttgtgaagtct 203  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||| ||||||||    
T  43011 cctctggcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttttttttgaagtct 43110  T
Q  204 catactttgatagtattgagc-atttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||| || |||||| |||  |||||||||||||||||    
T  43111 catacttagagagtattaagcgttttgtaatctttgtgat 43150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 3)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Original strand, 40838 - 41078
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40838 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 40937  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40938 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 41037  T
Q  202 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||    
T  41038 ctcatacttagaaagtattaagcagttgtaatctttgtgat 41078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 8 - 242
Target Start/End: Original strand, 33293 - 33527
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||| |||||    
T  33293 aaagtttatagtctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttatttctttgtatttttgtttgatcagaag 33392  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcata 207  Q
     |||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||| |||||||||||    
T  33393 actctagcctgtgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttaagtatttttgagaagtctcata 33492  T
Q  208 ctttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33493 cttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgat 33527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 8292 - 8253
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8292 ttgtattgggaacaccactgattgtatattaagtgttcaa 8253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0027 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold0027
Description:

Target: scaffold0027; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Original strand, 7227 - 7467
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7227 aaattcaaagtctagagtctttactgtattgtattgtgaacatcactgattgtatatcaagtgttcaactcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 7326  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagt 201  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7327 tagaagtttcttgcctgcgtgcttgatcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagt 7426  T
Q  202 ctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7427 ctcatacttagacagtattgagcatttgtaatctttgtgat 7467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0105 (Bit Score: 196; Significance: 1e-107; HSPs: 2)
Name: scaffold0105
Description:

Target: scaffold0105; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 7832 - 7590
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7832 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 7733  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagc--agttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  7732 tagaagtctctcgcctgcgtgcttgagcaatagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaa 7633  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7632 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 7590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0105; HSP #2
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Original strand, 37343 - 37585
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37343 aaattcaaagtctagagtcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgat 37442  T
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagc--agttttgtgaa 199  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  37443 tagaagtctctcgcctgcgtgcttgagcaatagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaa 37542  T
Q  200 gtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37543 gtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 37585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 191; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 8 - 242
Target Start/End: Original strand, 37125 - 37359
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||| |||||    
T  37125 aaagtctagagtctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttatttctttgtatttttgtttgatcagaag 37224  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcata 207  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  37225 actcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcata 37324  T
Q  208 ctttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37325 cttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgat 37359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 4)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 8 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 14448 - 14214
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||    
T  14448 aaagtctagagtcttaattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttaattcattgtatttttgtttgatcagaag 14349  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcata 207  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  14348 cctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcata 14249  T
Q  208 ctttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14248 cttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgat 14214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 8 - 242
Target Start/End: Original strand, 54514 - 54748
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||| |||||    
T  54514 aaagtctagagtcttaattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaagttaattcattgtatttttgtttgatcagaag 54613  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcata 207  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  54614 cctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcata 54713  T
Q  208 ctttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  54714 cttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgat 54748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 81054 - 81015
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  81054 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 81015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 69
Target Start/End: Original strand, 6056 - 6094
Alignment:
Q  31 tgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6056 tgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtattcaa 6094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391 (Bit Score: 164; Significance: 1e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0391
Description:

Target: scaffold0391; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 8 - 242
Target Start/End: Original strand, 2609 - 2844
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||  |||||||||||||||| |||||    
T  2609 aaagtctagagtctttaacgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacatatttcattgtatttttgtttgatcagaag 2708  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcata 207  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  2709 cctcttgcttgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcata 2808  T
Q  208 ctttgatagtattgagca-tttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||| || ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2809 cttagagagtattgagcattttgtaatctttgtgat 2844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 160; Significance: 2e-85; HSPs: 4)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 23 - 242
Target Start/End: Original strand, 11012 - 11231
Alignment:
Q  23 tattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtg 122  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  11012 tattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacatatttcattgtatttttgtttgatcagaagactcttgcctgcgtg 11111  T
Q  123 cttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatactttgatagtattga 222  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||||||    
T  11112 cttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcatgagcatttttgagaagtctcatacttaaagagtattga 11211  T
Q  223 gcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  11212 gcatttgtaatctttgtgat 11231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 23 - 227
Target Start/End: Original strand, 8165 - 8369
Alignment:
Q  23 tattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtg 122  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  8165 tattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacatatttcattgtatttttgtttgatcagaagactcttgcctgcgtg 8264  T
Q  123 cttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatactttgatagtattga 222  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||||||    
T  8265 cttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcatgagcatttttgagaagtctcatacttaaagagtattga 8364  T
Q  223 gcatt 227  Q
    |||||    
T  8365 gcatt 8369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 8 - 37
Target Start/End: Original strand, 8145 - 8174
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattg 37  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8145 aaagtctagagtctttattgtattgtattg 8174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 8 - 37
Target Start/End: Original strand, 10992 - 11021
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtattg 37  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10992 aaagtctagagtctttattgtattgtattg 11021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0407 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0407
Description:

Target: scaffold0407; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 9 - 242
Target Start/End: Original strand, 12509 - 12742
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||    |||||||||||||||||||| ||||||    
T  12509 aagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccactgatagaatatcaagtgttcaaagtcaaacatt-ttctctgtatttttgtttgaatagaag 12607  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcat 206  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  12608 cctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtccttgagcattggaagactcttgcctgcgtgcttgagca-ttttgagaagtctcat 12706  T
Q  207 actttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12707 acttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgat 12742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0739 (Bit Score: 128; Significance: 3e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0739
Description:

Target: scaffold0739; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 9 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 1857 - 1626
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagt 108  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    |||| |||| || |||||||||||||||    
T  1857 aagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccattgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacaattttctgtgtaattctgtttgattagaagt 1758  T
Q  109 ctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcata 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| |||||||||||    
T  1757 ctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcata 1660  T
Q  208 ctttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    | | |  ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1659 c-tagtgagtattgagcatttgtaatctgtgtgat 1626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154 (Bit Score: 128; Significance: 3e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 9 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 35401 - 35170
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagt 108  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||| |||| || |||||||||||||||    
T  35401 aagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtctaactattttctgtgtaattctgtttgattagaagt 35302  T
Q  109 ctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcata 207  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| |||||||||||    
T  35301 ctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcata 35204  T
Q  208 ctttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    | | || |||||||| |||||||||||| ||||||    
T  35203 c-tagagagtattgaacatttgtaatctgtgtgat 35170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 9 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 40365 - 40133
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||||||||||||||||||| ||||||    
T  40365 aagtctagagtctttattgcattgtattgtaaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacatt-ttctctgtatttttgtttgaatagaag 40267  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcat 206  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||    
T  40266 cctcttgcctgtgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagtattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcat 40169  T
Q  207 actttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40168 acttagagagtattgagcatttgtaatctgtgtgat 40133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 121; Significance: 5e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 9 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 5159 - 4928
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttc-aagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  5159 aagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaac-attttctgtgtatttttgtttgaatagaag 5061  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcat 206  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||    
T  5060 cctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcat 4963  T
Q  207 actttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    || | || ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4962 ac-tagagagtattgagcatttgtaatctgtgtgat 4928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 3)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 9 - 242
Target Start/End: Original strand, 57175 - 57408
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttc-aagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    |||| ||||||||||||| | ||||||    
T  57175 aagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaac-attttctgtgtatttttgttttaatagaag 57273  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcat 206  Q
     |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  57274 cctctcgcctgcgtgcttgtgcattagaagactcttgcattagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca-ttttgagaagtatcat 57372  T
Q  207 actttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  57373 acttagagagtattgagcatttgtaatctgtgtgat 57408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 24 - 234
Target Start/End: Original strand, 833 - 1043
Alignment:
Q  24 attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtg 122  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| ||||||||||||   |  |||    
T  833 attgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttaatttagtg 932  T
Q  123 cttgagcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatactttg-atagtatt 220  Q
    |||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||  ||||| ||||||  |||||||||||| | ||   ||||||||||||||  |  |||||||    
T  933 cttgagcataggaagtctcttgcttgtgtgcttgagcaaaggaagtctcttgtctgtgtgcttgagtaatt---tgaagtctcatactaggtgtagtatt 1029  T
Q  221 gagcatttgtaatc 234  Q
    ||||| ||||||||    
T  1030 gagcagttgtaatc 1043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 48991 - 48874
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||||||    |||| |||| || |||||||  || ||||||||||||    |||||||    
T  48991 ttgtattgtgaacaccacttattgtatatcaagtgtttaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaatttggaagtctcttgcagttgtgcttg 48892  T
Q  127 agcattagaagtctcttg 144  Q
    ||||||||||||||||||    
T  48891 agcattagaagtctcttg 48874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 111; Significance: 4e-56; HSPs: 4)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 9 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 127510 - 127284
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    || | |||| |||||||||||| ||||    
T  127510 aagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacatt-ttatgtgtaattttgtttgattggaag 127412  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcat 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||  |||| ||||||||||    
T  127411 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgtgtgcttgagca--tttgagaagtctcat 127314  T
Q  207 actttg-atagtattgagcatttgtaatct 235  Q
    |||  |  |||||||||||| |||||||||    
T  127313 actaggtgtagtattgagcagttgtaatct 127284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 9 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 16469 - 16236
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgatta-gaa 106  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||||| |||    
T  16469 aagtcgagagtctttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacatt-ttctgtgtaattctgtttgattaagaa 16371  T
Q  107 gtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctca 205  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || | |||||||||  |||| |||||||||    
T  16370 gtctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgcgcttgagca--tttgagaagtctca 16273  T
Q  206 tactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||  || ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16272 tactaagagagtattgagcatttgtaatctgtgtgat 16236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #3
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 9 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 140668 - 140608
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  140668 aagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 140608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #4
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 9 - 115
Target Start/End: Original strand, 8045 - 8154
Alignment:
Q  9 aagtctagagtcttta--ttgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattaga 105  Q
    |||||||||||||||   ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||||||||    
T  8045 aagtctagagtctttcacttgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgattaga 8144  T
Q  106 agtctcttgc 115  Q
    ||||||||||    
T  8145 agtctcttgc 8154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0497 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0497
Description:

Target: scaffold0497; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 9 - 238
Target Start/End: Original strand, 10680 - 10908
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| ||||||||| ||||| ||||||    
T  10680 aagtctagagaatttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaatgtcaaac-attttctgtgtatttttatttgaatagaag 10778  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcat 206  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  | || |||||||||||  | || ||||||||||    
T  10779 cctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcacctgcgtgcttgagca--tctgagaagtctcat 10876  T
Q  207 actttgatagtattgagcatttgtaatctttg 238  Q
    |||  || ||||||||||||||||||||||||    
T  10877 actaagagagtattgagcatttgtaatctttg 10908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0410 (Bit Score: 101; Significance: 4e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0410
Description:

Target: scaffold0410; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 9 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 15591 - 15359
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| ||||||||||| |||||    
T  15591 aagtctagagtctttgttgcattatattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacatt-ttctgtgtaattttgtttgatcagaag 15493  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcat 206  Q
     |||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||| ||||  |||| ||||||||||    
T  15492 cctctcgcctgcgtgcttgaccattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttcagca--tttgagaagtctcat 15395  T
Q  207 actttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    |||  || |||||||||||| |||||||| ||||||    
T  15394 actaagagagtattgagcatctgtaatctgtgtgat 15359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0163 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0163
Description:

Target: scaffold0163; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 9 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 29337 - 29106
Alignment:
Q  9 aagtctagagtcttt-attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    |||| |||| || ||||||||||||||    
T  29337 aagtctagagtctttcattgcattgtattgtgaacacacttgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacaattttctgtgtaattctgtttgattagaag 29238  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcat 206  Q
    ||||| |||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  | || |||||||||||  |||| ||||||||||    
T  29237 tctctcgcctgcgtgcctaagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctctcctgcgtgcttgagca--tttgggaagtctcat 29140  T
Q  207 actttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    || | ||| |||||||||| ||||||||| ||||||    
T  29139 ac-tagat-gtattgagcagttgtaatctgtgtgat 29106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0185 (Bit Score: 87; Significance: 9e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0185
Description:

Target: scaffold0185; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 9 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 32674 - 32472
Alignment:
Q  9 aagtctagagtcttta--ttgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattaga 105  Q
    |||||||||||||||   ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||||||||    
T  32674 aagtctagagtctttcatttgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgattaga 32575  T
Q  106 agtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctc 204  Q
    |||||||||| |  ||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| || |||||||||||  |||||||||||||    
T  32574 agtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgcctgcgtgcttgagca--tttgtgaagtctc 32477  T
Q  205 atact 209  Q
    |||||    
T  32476 atact 32472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 8 - 181
Target Start/End: Original strand, 17346 - 17525
Alignment:
Q  8 aaagtctagagtctttattgtattgtatt-gagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaa-ctcaattctctgtatttttgtttg--atta 103  Q
    |||||||||||||| ||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||  |||||||||||||   || |    
T  17346 aaagtctagagtctctaacgtattgtatttgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaaacttatttcattgtatttttgttttgtatca 17445  T
Q  104 gaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgcttg-agcattggaagactc-ttgcgtgtgtg 181  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  17446 gaagcctcttgcctgtgtgcttgagcattagaagactcttgcttagtgcttgtagcattggaagactctttgcgtgtgtg 17525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 19084 - 18857
Alignment:
Q  13 ctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtat-atcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtattttt-gtttgattagaagtct 110  Q
    ||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||  ||||||||| ||||||| ||||| ||    
T  19084 ctagagtctctaacgtattgtattgtgaacaccactgattgtattatcaagtgttcaagtcaaacttatttcattgtattttttgtttgatcagaagcct 18985  T
Q  111 ctt-gcctgcgtgcttgagc-attagaagtctcttg-cttagt-gcttgagcatt--ggaagactcttgcgtgtgtgcttgagc---agttttgtgaagt 201  Q
    ||| ||||| |||||||||| |||||||| |||||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||   | ||||| ||| |    
T  18984 ctttgcctgtgtgcttgagctattagaagactcttgtcttagttgcttgagcatttgggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcataatttttgagaaat 18885  T
Q  202 ctcatactttgatagtatt-gagcattt 228  Q
    ||||||||| || |||||| ||||||||    
T  18884 ctcatacttagagagtattagagcattt 18857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 84; Significance: 5e-40; HSPs: 4)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 9 - 242
Target Start/End: Original strand, 59286 - 59520
Alignment:
Q  9 aagtctagagtcttt--attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattaga 105  Q
    |||||||||||||||  |||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||    || | |||| || ||||||| ||||    
T  59286 aagtctagagtctttcaattgcattgtattgtaaacatcactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttatgtgtaattctgtttgaataga 59385  T
Q  106 agtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctc 204  Q
    |||||||||| |  ||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||| || |||||||||||  |||||||||||||    
T  59386 agtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttgagca--tttgtgaagtctc 59483  T
Q  205 atactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    |||| | | |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  59484 atac-taggtagtattgagcatttgtaatctgtgtgat 59520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 9 - 242
Target Start/End: Original strand, 40740 - 40976
Alignment:
Q  9 aagtctagagtcttt--attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattaga 105  Q
    |||||||||||||||  |||| ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||||||||    
T  40740 aagtctagagtctttcaattgcattgtattgtgaaaaccactgatagtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgattaga 40839  T
Q  106 agtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctc 204  Q
    |||||||||| |  ||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||  ||||| ||||||| |  |||||||||||  |||||||||||||    
T  40840 agtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgctttattgcttgagcaaaggaagtctcttgcctacgtgcttgagca--tttgtgaagtctc 40937  T
Q  205 atactttg-atagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    |||||  |  || ||||||||| ||||||||| ||||||    
T  40938 atactaggtgtaatattgagcagttgtaatctgtgtgat 40976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #3
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 9 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 175188 - 175062
Alignment:
Q  9 aagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgatt---gtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattaga 105  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||| ||||    
T  175188 aagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacatcactgattattgtatatcaagtgttcaagtcaaacatttttctctgtatttttgtttgaataga 175089  T
Q  106 agtctcttgcctgcgtgcttgagcatt 132  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||    
T  175088 agcctcttgcctacgtgcttgagcatt 175062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #4
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 179 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 175074 - 175012
Alignment:
Q  179 gtgcttgagcagttttgtgaagtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  175074 gtgcttgagca-ttttgagaagtctcatacttagagagtattgagcatttgtaatctgtgtgat 175012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0544 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0544
Description:

Target: scaffold0544; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 9 - 142
Target Start/End: Original strand, 10183 - 10317
Alignment:
Q  9 aagtctagagtcttt-attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||| |||| || ||||||||||||||    
T  10183 aagtctagagtcttttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacaattttctgtgtaattctgtttgattagaag 10282  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctct 142  Q
    |||||||| |  ||||||||||||| |||||||||    
T  10283 tctcttgctttagtgcttgagcattggaagtctct 10317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0544; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 130 - 242
Target Start/End: Original strand, 10275 - 10385
Alignment:
Q  130 attagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatactttgatagtattgagcattt 228  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| |||||||||||| | |||||||||||||| ||    
T  10275 attagaagtctcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgggaagtctcatac-tagatagtattgagcagtt 10371  T
Q  229 gtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||| ||||||    
T  10372 gtaatctgtgtgat 10385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 9 - 142
Target Start/End: Original strand, 29190 - 29324
Alignment:
Q  9 aagtctagagtcttt-attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||| |||| || ||||||||||||||    
T  29190 aagtctagagtcttttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacaattttctgtgtaattctgtttgattagaag 29289  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctct 142  Q
    |||||||| |  ||||||||||||| |||||||||    
T  29290 tctcttgctttagtgcttgagcattggaagtctct 29324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 130 - 242
Target Start/End: Original strand, 29282 - 29392
Alignment:
Q  130 attagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatactttgatagtattgagcattt 228  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || ||  ||||||||||  |||| |||||||||||| | |||||||||||||| ||    
T  29282 attagaagtctcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctagcatgcatgcttgagca--tttgggaagtctcatac-tagatagtattgagcagtt 29378  T
Q  229 gtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||| ||||||    
T  29379 gtaatctgtgtgat 29392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 3)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 24 - 242
Target Start/End: Original strand, 475697 - 475916
Alignment:
Q  24 attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtg 122  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || | ||||| |||||||||||||| |  |||    
T  475697 attgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctttttgaatagaagtctcttgctttagtg 475796  T
Q  123 cttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatactttg-atagtatt 220  Q
    |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||  || |||||||||||  ||||||||||||||||||  |  |||||||    
T  475797 cttgagcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgtctgcgtgcttgagca--tttgtgaagtctcatactaggtgtagtatt 475894  T
Q  221 gagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||| ||||||| | ||||||    
T  475895 gagcagttgtaatatgtgtgat 475916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 24 - 242
Target Start/End: Original strand, 482217 - 482436
Alignment:
Q  24 attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtg 122  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || | ||||| |||||||||||||| |  |||    
T  482217 attgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctttttgaatagaagtctcttgctttagtg 482316  T
Q  123 cttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatactttg-atagtatt 220  Q
    |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||  || |||||||||||  ||||||||||||||||||  |  |||||||    
T  482317 cttgagcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgtctgcgtgcttgagca--tttgtgaagtctcatactaggtgtagtatt 482414  T
Q  221 gagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||| ||||||| | ||||||    
T  482415 gagcagttgtaatatgtgtgat 482436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 69
Target Start/End: Original strand, 157072 - 157117
Alignment:
Q  24 attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  157072 attgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 157117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 2 - 77
Target Start/End: Original strand, 2725 - 2800
Alignment:
Q  2 aaattcaaagtctagagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaact 77  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2725 aaattcaaagtcgagagtctttattgttttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaact 2800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0655 (Bit Score: 67; Significance: 8e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0655
Description:

Target: scaffold0655; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 24 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 4783 - 4572
Alignment:
Q  24 attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtg 122  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||     |||| |||| || ||||||| |||||||||||||| |  |||    
T  4783 attgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaataattttctgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttgctttagtg 4684  T
Q  123 cttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatactttg-atagtatt 220  Q
    |||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||  ||||| ||||||| || ||||||||||| |||  ||||||||||||||  |  |||||||    
T  4683 cttgagcataggaagtctcttgctttaatgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcaattt--tgaagtctcatactaggtgtagtatt 4586  T
Q  221 gagcatttgtaatc 234  Q
    ||||| ||||||||    
T  4585 gagcagttgtaatc 4572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2071 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold2071
Description:

Target: scaffold2071; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 22 - 142
Target Start/End: Original strand, 877 - 997
Alignment:
Q  22 ttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 121  Q
    |||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||| |||| || |||||||||||||||||||||| |  ||    
T  877 ttattgcattgtattgtgaaaaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacaattttctgtgtaattctgtttgattagaagtctcttgctttagt 976  T
Q  122 gcttgagcattagaagtctct 142  Q
    ||||||||||| |||||||||    
T  977 gcttgagcattggaagtctct 997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2071; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 130 - 242
Target Start/End: Original strand, 955 - 1065
Alignment:
Q  130 attagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatactttgatagtattgagcattt 228  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| |||||||||||| | |||||||||||||| ||    
T  955 attagaagtctcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgggaagtctcatac-tagatagtattgagcagtt 1051  T
Q  229 gtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||| ||||||    
T  1052 gtaatctgtgtgat 1065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 24 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 61398 - 61178
Alignment:
Q  24 attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtg 122  Q
    |||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| |||||||||||||| |  |||    
T  61398 attgcattgtattgtgaacaccactaattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttgctttagtg 61299  T
Q  123 cttgagcattagaagtctcttgc--ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatactttg-atagtat 219  Q
    |||||||||  ||||||||||||  || |||||||||||  ||||| ||||||| || |||||||||||  |||| |||||||||||||  |  ||||||    
T  61298 cttgagcataggaagtctcttgctttttgtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttgagca--tttgcgaagtctcatactaggtgtagtat 61201  T
Q  220 tgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    |||||| || |||||| ||||||    
T  61200 tgagcagttataatctgtgtgat 61178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0547 (Bit Score: 64; Significance: 5e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0547
Description:

Target: scaffold0547; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 9 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 582 - 447
Alignment:
Q  9 aagtctagagtcttt-attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttc-aagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaa 106  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    |||| |||| || |||||||||||||    
T  582 aagtctagagtcttttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacaattttctgtgtaattctgtttgattagaa 483  T
Q  107 gtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctct 142  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||  |||||||||    
T  482 gtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctct 447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0547; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 130 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 489 - 379
Alignment:
Q  130 attagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatactttgatagtattgagcattt 228  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| || || |||||||||||  |||| |||||||||||| | | |||||||||||| ||    
T  489 attagaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgggaagtctcatac-taggtagtattgagcagtt 393  T
Q  229 gtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||| ||||||    
T  392 gtaatctgtgtgat 379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 29 - 234
Target Start/End: Original strand, 4349 - 4554
Alignment:
Q  29 attgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttga 127  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||    |||| |||| || ||||||| |||||||||||||| |  ||||||||    
T  4349 attgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgtttaaactcaaacaattttctatgtaattctgtttgaatagaagtctcttgctttagtgcttga 4448  T
Q  128 gcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatactttg-atagtattgagca 225  Q
    ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||| ||   ||||||||||||||  |  ||||||||||||    
T  4449 gcataggaaatctcttgcttgtgtgcttgagcaaaggaagtctcttgcttgtgtgcttgagcaatt---tgaagtctcatactaggtgtagtattgagca 4545  T
Q  226 tttgtaatc 234  Q
     ||||||||    
T  4546 gttgtaatc 4554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0570 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 3)
Name: scaffold0570
Description:

Target: scaffold0570; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 24 - 234
Target Start/End: Original strand, 2119 - 2329
Alignment:
Q  24 attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtg 122  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    || | |||| || | ||||| |||||||||||||| |  |||    
T  2119 attgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttatgtgtaattctatttgaatagaagtctcttgctttagtg 2218  T
Q  123 cttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatactttg-atagtatt 220  Q
    |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||| ||  ||||||||||  ||||||||||||||||||  |  |||||||    
T  2219 cttgagca-tagaagcctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgcatgcatgcttgagca--tttgtgaagtctcatactaggtgtagtatt 2315  T
Q  221 gagcatttgtaatc 234  Q
    ||||| ||||||||    
T  2316 gagcagttgtaatc 2329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0570; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 127 - 235
Target Start/End: Original strand, 1 - 108
Alignment:
Q  127 agcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatactttgatagtattgagca 225  Q
    ||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||  ||||||||||||||||||| || |||||||| ||    
T  1 agcattagaagactcttgttttagtgcttgagcattggaagtctcttgcctgcgtgcttgagca--tttgtgaagtctcatacttagagagtattgaaca 98  T
Q  226 tttgtaatct 235  Q
    ||||||||||    
T  99 tttgtaatct 108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0570; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 104 - 132
Target Start/End: Original strand, 38 - 66
Alignment:
Q  104 gaagtctcttgcctgcgtgcttgagcatt 132  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38 gaagtctcttgcctgcgtgcttgagcatt 66  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 24 - 189
Target Start/End: Original strand, 6899 - 7066
Alignment:
Q  24 attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtg 122  Q
    |||| |||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| |||||||||||||| |  |||    
T  6899 attgcattgtaatgtgaacaacactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctatgtaattctgtttgaatagaagtctcttgctttagtg 6998  T
Q  123 cttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca 189  Q
    |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| |  |||||||||||    
T  6999 cttgagcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgctttagtgcttgagca 7066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 104 - 234
Target Start/End: Original strand, 7010 - 7139
Alignment:
Q  104 gaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtc 202  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||  ||||| | ||||| || ||||||||||| ||   |||||||    
T  7010 gaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtcacttgcctgcgtgcttgagcaatt---tgaagtc 7106  T
Q  203 tcatactttg-atagtattgagcatttgtaatc 234  Q
    |||||||  |  |||||||||||| ||||||||    
T  7107 tcatactaggtgtagtattgagcagttgtaatc 7139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 9 - 142
Target Start/End: Original strand, 38390 - 38523
Alignment:
Q  9 aagtctagagtcttt-attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||| || | || |||||||||  |||    
T  38390 aagtctagagtcttttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacaattttctatgcaattctgtttgatttaaag 38489  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctct 142  Q
    |||||||| |  ||||||||||||| |||||||||    
T  38490 tctcttgctttagtgcttgagcatt-gaagtctct 38523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 242
Target Start/End: Original strand, 38487 - 38591
Alignment:
Q  135 aagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatactttgatagtattgagcatttgtaat 233  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||| |||||  |||||||||||||| |||||||    
T  38487 aagtctcttgctttagtgcttgagcattg-aagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgggaagtcttatacta-gatagtattgagcagttgtaat 38582  T
Q  234 ctttgtgat 242  Q
    || ||||||    
T  38583 ctgtgtgat 38591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0050 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0050
Description:

Target: scaffold0050; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 29 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 35307 - 35145
Alignment:
Q  29 attgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttga 127  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    || | |||| || ||||||| |||||||||||||| |  ||||||||    
T  35307 attgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttatgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttgctttagtgcttga 35208  T
Q  128 gcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca 189  Q
    ||||  |||||||||||| ||||||||||||||| | ||| ||||||| |  |||||||||||    
T  35207 gcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcatagaaagtctcttgctttagtgcttgagca 35145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0050; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 104 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 35201 - 35064
Alignment:
Q  104 gaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtc 202  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||   |||| ||||||| || ||||||||||| |||   ||||||    
T  35201 gaagtctcttgctttagtgcttgagcatagaaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcaattt---gaagtc 35105  T
Q  203 tcatactttga-tagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    |||||||  |  |||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  35104 tcatactaggtgtagtattgagcagttgtaatctgtgtgat 35064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 4)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 9 - 142
Target Start/End: Original strand, 59683 - 59817
Alignment:
Q  9 aagtctagagtcttt-attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaag 107  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    || | |||  || ||||||||||||||    
T  59683 aagtctagagtcttttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacaattttttgtgtcattctgtttgattagaag 59782  T
Q  108 tctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctct 142  Q
    ||||||   |  ||||||||||||| |||||||||    
T  59783 tctctttttttagtgcttgagcattggaagtctct 59817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 64027 - 63881
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttc-aagtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  || ||| |||| || |||||||  | |||||||||||||    |||||||    
T  64027 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacataa-tctttgtaattctgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttg 63929  T
Q  127 agcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttg 173  Q
    |||| ||||||||||||||  | ||||||||||| | |||| ||||||    
T  63928 agcaatagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttg 63881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 46353 - 46207
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttc-aagtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||   || ||| |||| || |||||||  | |||||||||||||    |||||||    
T  46353 ttgtattatgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaagataa-tctttgtaattctgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttg 46255  T
Q  127 agcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttg 173  Q
    |||| ||||||||||||||  | ||||||||||| | |||| ||||||    
T  46254 agcaatagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctcttg 46207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 130 - 207
Target Start/End: Original strand, 59775 - 59851
Alignment:
Q  130 attagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcata 207  Q
    ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| |||||||||||    
T  59775 attagaagtctctttttttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgggaagtctcata 59851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0443 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0443
Description:

Target: scaffold0443; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 9 - 161
Target Start/End: Original strand, 1431 - 1587
Alignment:
Q  9 aagtctagagtcttt--attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattaga 105  Q
    ||||||||||||| |  |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||||||||    
T  1431 aagtctagagtctctcaattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgattaga 1530  T
Q  106 agtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttg-cttagtgcttgagcatt 161  Q
    |||||||||| |  ||||||||||||  ||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  1531 agtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcatt 1587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0443; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 130 - 242
Target Start/End: Original strand, 1525 - 1635
Alignment:
Q  130 attagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatactttgatagtattgagcattt 228  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| || |||||||||||  ||||||||||||||||| | | |||||||||||| ||    
T  1525 attagaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgcctgcgtgcttgagca--tttgtgaagtctcatac-taggtagtattgagcagtt 1621  T
Q  229 gtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||| ||||||    
T  1622 gtaatctgtgtgat 1635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0752 (Bit Score: 57; Significance: 7e-24; HSPs: 4)
Name: scaffold0752
Description:

Target: scaffold0752; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 9 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 1069 - 961
Alignment:
Q  9 aagtctagagtcttta-ttgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttc-aagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaa 106  Q
    |||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    |||| |||| ||||||||||||||||    
T  1069 aagtctagagtcttttgttgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacaattttctgtgtaattttgtttgattagaa 970  T
Q  107 gtctcttgc 115  Q
    |||||||||    
T  969 gtctcttgc 961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0752; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 9 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 1684 - 1576
Alignment:
Q  9 aagtctagagtcttta-ttgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttc-aagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaa 106  Q
    |||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    |||| |||| ||||||||||||||||    
T  1684 aagtctagagtcttttgttgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacaattttctgtgtaattttgtttgattagaa 1585  T
Q  107 gtctcttgc 115  Q
    |||||||||    
T  1584 gtctcttgc 1576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0752; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 130 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 976 - 866
Alignment:
Q  130 attagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatactttgatagtattgagcattt 228  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||| ||| ||||| |||| || || |||||||||||  |||| | | |||||||||  | |||||||||||| ||    
T  976 attagaagtctcttgctttagtccttgaacataggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgggcattctcatactagg-tagtattgagcagtt 880  T
Q  229 gtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||| ||||||    
T  879 gtaatctgtgtgat 866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0752; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 130 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 1591 - 1481
Alignment:
Q  130 attagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatactttgatagtattgagcattt 228  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||| ||| ||||| |||| || || |||||||||||  |||| | | |||||||||  | |||||||||||| ||    
T  1591 attagaagtctcttgctttagttcttgatcataggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgggcattctcatactagg-tagtattgagcagtt 1495  T
Q  229 gtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||| ||||||    
T  1494 gtaatctgtgtgat 1481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1263 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold1263
Description:

Target: scaffold1263; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 24 - 189
Target Start/End: Original strand, 1574 - 1741
Alignment:
Q  24 attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtg 122  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| |||||||||||||| |  |||    
T  1574 attgcattgtattctgaacaccactgactgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttgctttagtg 1673  T
Q  123 cttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca 189  Q
    |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||  | ||| ||||||| || |||||||||||    
T  1674 cttgagcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcaaagaaagtctcttgcctgcgtgcttgagca 1741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0622
Description:

Target: scaffold0622; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 25 - 189
Target Start/End: Original strand, 3844 - 4011
Alignment:
Q  25 ttgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgc 123  Q
    |||| |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||   ||||| |||| || |||||| ||| ||||||||||| |  ||||    
T  3844 ttgttttgtattgtgaacaccgctgattgtatattaagtgttcaatctcaaacattattctgtgtaattgtgtttgtttataagtctcttgcttttgtgc 3943  T
Q  124 ttgagcattagaagtctcttgctta-gtgcttgagca-ttggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca 189  Q
    ||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  3944 ttgagcatatgaaatctcttgcttatgtgcttgagtatttggaagtctcttgcttgtgtgcttgagca 4011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 4)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 9 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 510 - 355
Alignment:
Q  9 aagtctagagtcttt-attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttc-aagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaa 106  Q
    |||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    |||| |||| || ||||||| |||||    
T  510 aagtttagagtcttttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacaattttctgtgtaattatgtttgaatagaa 411  T
Q  107 gtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttg-cttagtgcttgagcatt 161  Q
    ||||||||| |  || |||||||||  ||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  410 gtctcttgctttagttcttgagcataggaagtctcttgcctgtgtgcttgagcatt 355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 9 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 4890 - 4735
Alignment:
Q  9 aagtctagagtcttt-attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttc-aagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaa 106  Q
    |||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    |||| |||| || ||||||| |||||    
T  4890 aagtttagagtcttttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacaattttctgtgtaattatgtttgaatagaa 4791  T
Q  107 gtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttg-cttagtgcttgagcatt 161  Q
    ||||||||| |  || |||||||||  ||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  4790 gtctcttgctttagttcttgagcataggaagtctcttgcctgtgtgcttgagcatt 4735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 132 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 415 - 307
Alignment:
Q  132 tagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatactttgatagtattgagcatttgt 230  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||  |||| |||||||||||| | | |||||||||||| ||||    
T  415 tagaagtctcttgctttagttcttgagcataggaagtctcttgcctgtgtgcttgagca--tttgggaagtctcatac-taggtagtattgagcagttgt 319  T
Q  231 aatctttgtgat 242  Q
    ||| | ||||||    
T  318 aatatgtgtgat 307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #4
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 132 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 4795 - 4687
Alignment:
Q  132 tagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatactttgatagtattgagcatttgt 230  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||  |||| |||||||||||| | | |||||||||||| ||||    
T  4795 tagaagtctcttgctttagttcttgagcataggaagtctcttgcctgtgtgcttgagca--tttgggaagtctcatac-taggtagtattgagcagttgt 4699  T
Q  231 aatctttgtgat 242  Q
    ||| | ||||||    
T  4698 aatatgtgtgat 4687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 30 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 13701 - 13542
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  | |||| | ||||||||||| | |||||||||||||| || || ||||||    
T  13701 ttgtattgtgagcaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatatttctttatatttttgttttaatagaagtctcttgcttgtgtacttgag 13602  T
Q  129 cattagaagtctcttg-cttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgag 187  Q
    ||| ||||||||||||  ||||| ||||||||| ||||  |||||||   ||||||||||    
T  13601 cataagaagtctcttgatttagttcttgagcataggaaatctcttgcagttgtgcttgag 13542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 4)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 30 - 189
Target Start/End: Original strand, 4464 - 4625
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||| ||||||||||||||| |  |||||||||    
T  4464 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttct-tgtaattgtgtttgtttagaagtctcttgctttggtgcttgag 4562  T
Q  129 cattagaagtctcttgctt-agtgcttgagca-ttggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca 189  Q
    |||  ||| ||||||||||  ||||||||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  4563 cataggaaatctcttgcttgtgtgcttgagtatttggaagtctcttgcttgtgtgcttgagca 4625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 30 - 115
Target Start/End: Original strand, 1962 - 2048
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgc 115  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||  ||||||  |||| | |||| || ||||||| ||||||||||||||    
T  1962 ttgtattgtgaacaccgctgattgtataccaagtgttcaacctcaaacaaaattttttgtaattctgtttgaatagaagtctcttgc 2048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 102 - 172
Target Start/End: Original strand, 8260 - 8331
Alignment:
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactctt 172  Q
    |||||||||||| | ||  |||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||||    
T  8260 tagaagtctctttcttgtatgcttgagcattggaagcctcttgcttgtgtgcttgagcattggaagtctctt 8331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 150 - 189
Target Start/End: Original strand, 8279 - 8318
Alignment:
Q  150 tgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca 189  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  8279 tgcttgagcattggaagcctcttgcttgtgtgcttgagca 8318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0073 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0073
Description:

Target: scaffold0073; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 45 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 58162 - 58065
Alignment:
Q  45 cactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctct 142  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    |||| |||| || |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||||    
T  58162 cactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacaattttctgtgtaattctgtttgattagaagtctcttgctttagtgcttgagcattggaagtctct 58065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0073; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 130 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 58107 - 57997
Alignment:
Q  130 attagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatactttgatagtattgagcattt 228  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || |   ||||||||||  |||| |||||||||||| | |||||||||||||| ||    
T  58107 attagaagtctcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctacatgcttgagca--tttgggaagtctcatac-tagatagtattgagcagtt 58011  T
Q  229 gtaatctttgtgat 242  Q
     |||||| ||||||    
T  58010 ataatctgtgtgat 57997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 5)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 29 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 10382 - 10250
Alignment:
Q  29 attgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttc-aagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttga 127  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||     |||| |||| || ||||||| |||||||||||||| |  ||||||||    
T  10382 attgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaataattttctgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttgctttagtgcttga 10283  T
Q  128 gcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagca 159  Q
    ||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  10282 gcataggaagtctcttgctttagtgcttgagca 10250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 29 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 20283 - 20123
Alignment:
Q  29 attgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttga 127  Q
    ||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| ||  |||||| |||||||||||||| |  ||||||||    
T  20283 attgtattgtgaacaccacaaattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattcagtttgaatagaagtctcttgctttagtgcttga 20184  T
Q  128 gcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgag 187  Q
    ||||  |||||||||||||| | ||||||||||  ||||| ||||||| || |||||||||    
T  20183 gcataggaagtctcttgcttgattgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttgag 20123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 104 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 20147 - 20018
Alignment:
Q  104 gaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtc 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |   | |||||||||||| |||||||||| |  ||||| ||||||| || ||||||||||| ||   |||||||    
T  20147 gaagtctcttgcctgcgtgcttgagaaaagggagtctcttgctttagtgcttgagaaaaggaagtctcttgcttgcgtgcttgagcaatt---tgaagtc 20051  T
Q  203 tcatactttg-atagtattgagcatttgtaatc 234  Q
    |||||||  |  |||||||||||| ||||||||    
T  20050 tcatactaggtgtagtattgagcagttgtaatc 20018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 10308 - 10250
Alignment:
Q  132 tagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca 189  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |  |||||||||||    
T  10308 tagaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgctttagtgcttgagca 10250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 20209 - 20151
Alignment:
Q  132 tagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca 189  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||  ||||||||||    
T  20209 tagaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgcttgattgcttgagca 20151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0177 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0177
Description:

Target: scaffold0177; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 29 - 209
Target Start/End: Original strand, 20824 - 21003
Alignment:
Q  29 attgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttga 127  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||  ||||||    || | |||| || ||||||| |||||||||||||| |  ||||||||    
T  20824 attgtattgtgaacaccactgattgtatattatttgttcaaactcaaacaattttttgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttgctttagtgcttga 20923  T
Q  128 gcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatact 209  Q
    ||||  |||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||| || ||||||||||| ||   ||||||||||||||    
T  20924 gcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcaatt---tgaagtctcatact 21003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1321 (Bit Score: 52; Significance: 7e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold1321
Description:

Target: scaffold1321; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 24 - 189
Target Start/End: Original strand, 1381 - 1548
Alignment:
Q  24 attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtg 122  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| |||||||||||| | |  |||    
T  1381 attgcattgtattctgaacaccactgactgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttactttagtg 1480  T
Q  123 cttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca 189  Q
    |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||  | ||| ||||||| || |||||||||||    
T  1481 cttgagcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcaaagaaagtctcttgcctgcgtgcttgagca 1548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0422 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0422
Description:

Target: scaffold0422; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 29 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 11421 - 11259
Alignment:
Q  29 attgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttga 127  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| ||||||||| |||| |  ||||||||    
T  11421 attgtattgtgaacaccactgattgcatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatagaagtctattgctttagtgcttga 11322  T
Q  128 gcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca 189  Q
    ||||  |||||||||||| ||||||||||||||  ||||| || |||| |  |||||||||||    
T  11321 gcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctattgctttagtgcttgagca 11259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0422; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 104 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 11315 - 11178
Alignment:
Q  104 gaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtc 202  Q
    |||||||||||| |  |||||||||||   ||||||| |||||| ||||||||||||  ||||| ||||||| || ||||||||||| ||   |||||||    
T  11315 gaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctattgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcaatt---tgaagtc 11219  T
Q  203 tcatactttg-atagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    |||||||  |  | |||||||||| ||||||||| ||||||    
T  11218 tcatactaggtgtggtattgagcagttgtaatctgtgtgat 11178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 24 - 145
Target Start/End: Original strand, 2259 - 2381
Alignment:
Q  24 attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttca-agtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtg 122  Q
    |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    |||| |||| || ||||||| |||||||||||||| || |||    
T  2259 attgcattgtgttgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcacactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttgcttgtgtg 2358  T
Q  123 cttgagcattagaagtctcttgc 145  Q
    |||||||||  ||||||||||||    
T  2359 cttgagcataggaagtctcttgc 2381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 132 - 234
Target Start/End: Original strand, 2338 - 2439
Alignment:
Q  132 tagaagtctcttgctta-gtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatactttg-atagtattgagcatttg 229  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| ||   ||||||||||||||  |  |||||||||||| |||    
T  2338 tagaagtctcttgcttgtgtgcttgagcataggaagtctcttgcctgtgtgcttgagcaatt---tgaagtctcatactaggtgtagtattgagcagttg 2434  T
Q  230 taatc 234  Q
    |||||    
T  2435 taatc 2439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 9 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 60907 - 60751
Alignment:
Q  9 aagtctagagtcttt--attgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattaga 105  Q
    |||||||||||||||  |||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||||||||    
T  60907 aagtctagagtctttcaattgcattgttttgtgaacaccactgatagtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgattaga 60808  T
Q  106 agtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttg-cttagtgcttgagcatt 161  Q
    |||||||||| |  |||||||||||   ||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  60807 agtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcatt 60751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 130 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 60813 - 60701
Alignment:
Q  130 attagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatactttg-atagtattgagcatt 227  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||| || |||||||||||  ||||||||||||||||||  |  |||||||||||| |    
T  60813 attagaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttgagca--tttgtgaagtctcatactaggtgtagtattgagcagt 60716  T
Q  228 tgtaatctttgtgat 242  Q
    |||||||| ||||||    
T  60715 tgtaatctgtgtgat 60701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0210
Description:

Target: scaffold0210; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 1317 - 1201
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttg-attagaagtctcttgcctgcgtgcttga 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||| ||||||||||||||||   |||||||||    
T  1317 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctatgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcagtcgtgcttga 1218  T
Q  128 gcattagaagtctcttg 144  Q
    ||||| |||||||||||    
T  1217 gcatttgaagtctcttg 1201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 29 - 187
Target Start/End: Original strand, 38535 - 38695
Alignment:
Q  29 attgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttga 127  Q
    ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| |||||||||||||| |  ||||||||    
T  38535 attgtatagtgaacaccactaattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctatgtaattctgtttgaatagaagtctcttgctttagtgcttga 38634  T
Q  128 gcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgag 187  Q
    ||||   |||||||||||||  |||||||||||  ||||| ||||||| ||||||| ||||    
T  38635 gcatagaaagtctcttgcttgtgtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgtgtgcctgag 38695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 132 - 189
Target Start/End: Original strand, 38609 - 38667
Alignment:
Q  132 tagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca 189  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  38609 tagaagtctcttgctttagtgcttgagcatagaaagtctcttgcttgtgtgcttgagca 38667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Original strand, 21429 - 21544
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| ||||||||||||||    | |||||||    
T  21429 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaatctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaatagaagtctcttgcagttgggcttgag 21528  T
Q  129 cattagaagtctcttg 144  Q
    ||||||||||||||||    
T  21529 cattagaagtctcttg 21544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Original strand, 2427 - 2544
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtg-ttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  | | ||||||||||| |  |||||||    
T  2427 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgtttcacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaattcaaaagtctcttgcatttgtgcttg 2526  T
Q  127 agcattagaagtctcttg 144  Q
    |||| |||||||||||||    
T  2527 agcaatagaagtctcttg 2544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 30 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 144564 - 144405
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||  | |||| |||| || ||||||| ||||||||||||||    |||||||||    
T  144564 ttgtattgtggacaccaatgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaaatttctttgtaattctgtttgaatagaagtctcttgcagttgtgcttgag 144465  T
Q  129 cattagaagtctcttg-cttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgag 187  Q
    ||| ||||||||||||  ||||| ||| ||||| ||||  ||||||| | ||||||||||    
T  144464 cataagaagtctcttgatttagttcttcagcataggaaatctcttgcatttgtgcttgag 144405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0771 (Bit Score: 47; Significance: 7e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0771
Description:

Target: scaffold0771; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 29 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 6003 - 5901
Alignment:
Q  29 attgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttga 127  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| |||||||||||||| || ||||||||    
T  6003 attgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctatgtaattctgtttgaatagaagtctcttgcttgtgtgcttga 5904  T
Q  128 gca 130  Q
    |||    
T  5903 gca 5901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0771; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 134 - 17
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  ||| |||||||||||    |||||||    
T  134 ttgtattgtgaacaccactgactgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatttataagtctcttgcagttgtgcttg 35  T
Q  127 agcattagaagtctcttg 144  Q
    | ||||||||||||||||    
T  34 aacattagaagtctcttg 17  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 47; Significance: 7e-18; HSPs: 5)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 81 - 242
Target Start/End: Original strand, 165135 - 165296
Alignment:
Q  81 ttctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctc-ttgcttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtg 179  Q
    |||| |||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||  |||||||| || ||  |||||||||||  ||||| ||||||| ||||    
T  165135 ttctgtgtaattttgtttgaatagaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctctttcctgtgtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgtg 165234  T
Q  180 tgcttgagcagttttgtgaagtctcatactttg-atagtattgagcatttgtaatc-tttgtgat 242  Q
    |||||||||| ||   ||||||||||||||  |  |||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  165235 tgcttgagcaatt---tgaagtctcatactaggtgtagtattgagcagttgtaatcatttgtgat 165296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Original strand, 65859 - 65976
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  | |||||||||||||    |||||||    
T  65859 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaattcagaagtctcttgcagttgtgcttg 65958  T
Q  127 agcattagaagtctcttg 144  Q
    |||| |||||||||||||    
T  65959 agcaatagaagtctcttg 65976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Original strand, 144904 - 145021
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  | |||||||||||||    |||||||    
T  144904 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaattcagaagtctcttgcagttgtgcttg 145003  T
Q  127 agcattagaagtctcttg 144  Q
    |||| |||||||||||||    
T  145004 agcaatagaagtctcttg 145021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 59208 - 59060
Alignment:
Q  39 gaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaag 137  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||  ||||    
T  59208 gaacaccactgattgtatgtcaaatgttcaacctcaaacatt-ttctttgtaattctgtttgattagaagtctcttgcttttgtggttgagcataggaag 59110  T
Q  138 tctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttga 186  Q
    | |||||| || |||||||||||| ||||  ||||||| | |||||||||    
T  59109 tatcttgcatttgtgcttgagcataggaaacctcttgcttttgtgcttga 59060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 25 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 251265 - 251224
Alignment:
Q  25 ttgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgtt 66  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  251265 ttgttttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaaatgtt 251224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 169 - 242
Target Start/End: Original strand, 1 - 73
Alignment:
Q  169 tcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    |||||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1 tcttgcctatgtgcttgagca-ttttgagaagtctcatacttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgat 73  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 5)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 30 - 165
Target Start/End: Original strand, 244734 - 244870
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||  | |||| |||| || ||||||| ||||| |||||||| || |||||||||    
T  244734 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagt-ttcaacctcaaacatatttctttgtaattctgtttgaatagaactctcttgcttgtgtgcttgag 244832  T
Q  129 cattagaagtctcttg-cttagtgcttgagcattggaa 165  Q
    |||  |||||||||||  ||||| ||||||||| ||||    
T  244833 cataggaagtctcttgatttagttcttgagcataggaa 244870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 219897 - 219782
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| ||  | |||| |||| || ||||||| ||||||||||||||    ||||||||     
T  219897 ttgtattgtgaacaccgctgattgtatatcaagtgttcaacctcacacaaatttctttgtaattctgtttgaatagaagtctcttgcagttgtgcttgaa 219798  T
Q  129 cattagaagtctcttg 144  Q
    ||| ||||||||||||    
T  219797 cataagaagtctcttg 219782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 211057 - 210940
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  | |||||||||||||    |||||||    
T  211057 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttg 210958  T
Q  127 agcattagaagtctcttg 144  Q
    |||| |||||||||||||    
T  210957 agcaatagaagtctcttg 210940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Original strand, 377999 - 378116
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||    |||| |||| || | |||||  || ||||||||||||    |||||||    
T  377999 ttgtattgtgaacaccactgattgtatgtcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctatttgaatttggaagtctcttgcagttgtgcttg 378098  T
Q  127 agcattagaagtctcttg 144  Q
    ||||||||||||||||||    
T  378099 agcattagaagtctcttg 378116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #5
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 88063 - 87898
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||    || |||||| || | ||||| ||||||||||||||    | |||||||    
T  88063 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgtttaacctcaaacattgttatctgtaattctatttgaatagaagtctcttgcagttgcgcttgag 87964  T
Q  129 cattagaagtctcttg-cttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttt 193  Q
    |||  |||||||||||  || || ||||||||| ||||  |||||||   |||||||||| |||||    
T  87963 cataggaagtctcttgattttgttcttgagcataggaaacctcttgcagttgtgcttgagtagttt 87898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0330 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0330
Description:

Target: scaffold0330; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Original strand, 107 - 223
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttg-attagaagtctcttgcctgcgtgcttga 127  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||    |||| |||| || |||||| ||||||||||||||||    ||||||||    
T  107 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaattgttcaacttcaaacatttttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcagttgtgcttga 206  T
Q  128 gcattagaagtctcttg 144  Q
    |||||||||||||||||    
T  207 gcattagaagtctcttg 223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 7749 - 7591
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgagc 129  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| |||   |||||||| ||||||||||||||| |   |||||||||    
T  7749 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-tcaaacttatttctgtgt-gatttgtttgtttagaagtctcttgcttttatgcttgagc 7652  T
Q  130 attagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca 189  Q
    ||  ||| | ||||||||  || |||||| ||| ||||  |||||| |||| |||||||||    
T  7651 ataggaaatttcttgcttgtgtacttgagtatttgaagtatcttgcttgtgcgcttgagca 7591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 34 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 158764 - 158653
Alignment:
Q  34 attgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcatt 132  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||  | |||| |||| || ||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||     
T  158764 attgtgaacaccactgattgtatatcaagttttcaacctcaaacaaatttctttgtaattctgtttgaatagaagtctctttcttgtgtgcttgagcata 158665  T
Q  133 agaagtctcttg 144  Q
     |||||||||||    
T  158664 ggaagtctcttg 158653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 149 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 14068 - 13978
Alignment:
Q  149 gtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||  ||||||||||| | || |||||||||||| |||||||| ||||||    
T  14068 gtgcttgagcattggaagtctcttgcctgtgtgcttgagca--tttgataagtctcatac-tagagagtattgagcatctgtaatctgtgtgat 13978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 104 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 14084 - 14026
Alignment:
Q  104 gaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttg-cttagtgcttgagcatt 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  14084 gaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattggaagtctcttgcctgtgtgcttgagcatt 14026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 9615 - 9501
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| ||||||||||||||    |||||||||    
T  9615 ttgtattgtgaacaccactaattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatagaagtctcttgcagttgtgcttgag 9516  T
Q  129 cattagaagtctctt 143  Q
    ||| |||||||||||    
T  9515 cataagaagtctctt 9501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0205
Description:

Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Original strand, 393 - 510
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| ||||||||||  |||||| ||||||||    |||||||    
T  393 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattttgtttgaatttagaattctcttgcagttgtgcttg 492  T
Q  127 agcattagaagtctcttg 144  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  493 agcattacaagtctcttg 510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 318 - 279
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  318 ttgtattttgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0426 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0426
Description:

Target: scaffold0426; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 30 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 13230 - 13114
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||    |||||||    
T  13230 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttgtgcttg 13131  T
Q  127 agcattagaagtctctt 143  Q
    | |||||||||||||||    
T  13130 aacattagaagtctctt 13114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 29 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 9631 - 9424
Alignment:
Q  29 attgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgc--gtgctt 125  Q
    |||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| |  ||||||| |||||||||||||| |    ||||||    
T  9631 attgtactgtgaacaccactgatggtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaatactgtttgaatagaagtctcttgctttttagtgctt 9532  T
Q  126 gagcattagaagtctcttg-cttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatactttg-atagtattgag 223  Q
    ||||||  ||||||||||| ||  |||||||||||  || || ||||||| |||||||||||||| ||   ||||||||||||||  |  ||||||||||    
T  9531 gagcataggaagtctcttgtctgtgtgcttgagcaaagggagtctcttgcctgtgtgcttgagcaatt---tgaagtctcatactaggtgtagtattgag 9435  T
Q  224 catttgtaatc 234  Q
    || ||||||||    
T  9434 cagttgtaatc 9424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 189 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 23455 - 23402
Alignment:
Q  189 agttttgtgaagtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23455 agttttgtgaagtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgat 23402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0269
Description:

Target: scaffold0269; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 29 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 6942 - 6825
Alignment:
Q  29 attgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttga 127  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| |||||||||||||| |  ||||||||    
T  6942 attgtattgtgaacaccactgattgtatattatgtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttgctttagtgcttga 6843  T
Q  128 gcattagaagtctcttgc 145  Q
    ||||  ||||||||||||    
T  6842 gcataggaagtctcttgc 6825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 30 - 193
Target Start/End: Original strand, 32239 - 32404
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||  | |||  |||| || ||||||||||||||||||||||    |||||||||    
T  32239 ttgtattatgaaaaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaaatttcattgtaattctgtttgattagaagtctcttgcagttgtgcttgag 32338  T
Q  129 cattagaagtctcttg-cttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttt 193  Q
    |||  |||||||||||  ||||| |||||| || ||||  |||||||   |||||||||| |||||    
T  32339 catatgaagtctcttgatttagttcttgagtataggaaatctcttgcagttgtgcttgagtagttt 32404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 3)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 189
Target Start/End: Original strand, 99660 - 99823
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  | |||||||| |||| |  |||||||    
T  99660 ttgtattgtgaacaccattgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaattcagaagtctattgcatttgtgcttg 99759  T
Q  127 agcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca 189  Q
    |||| ||||||||||||||  | ||||||||||| | |||| |||||||   ||||||||||||    
T  99760 agcaatagaagtctcttgcaattgtgcttgagcaatagaagtctcttgccgttgtgcttgagca 99823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 19921 - 19960
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19921 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 19960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 29452 - 29413
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29452 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 29413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 59675 - 59556
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||    |||||||    
T  59675 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaattgttcaacctcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttgtgcttg 59576  T
Q  127 agcattagaagtctcttgct 146  Q
    || |||||||||||||||||    
T  59575 agaattagaagtctcttgct 59556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 7583 - 7544
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7583 ttgtattgtgaacaccattgattgtatatcaagtgttcaa 7544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1657 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1657
Description:

Target: scaffold1657; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 1498 - 1384
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||| |||| |||||||||||||||| | |||||| |  ||| |||||    
T  1498 ttgtattgtgaacaccactgattgtagatcaagtgttcaacctcaaacatatttctttgtaattttgtttgattagaattttcttgcttatgtggttgag 1399  T
Q  129 cattagaagtctcttg 144  Q
    || |||| ||||||||    
T  1398 ca-tagaggtctcttg 1384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Original strand, 6144 - 6261
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  | |||||||||||||    |||||||    
T  6144 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacatttttctttgtaattctgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttg 6243  T
Q  127 agcattagaagtctcttg 144  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  6244 agcattaaaagtctcttg 6261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0273
Description:

Target: scaffold0273; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 5288 - 5202
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgc 115  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  | |||| |||| || ||||||| ||||||||||||||    
T  5288 ttgtattgtgcacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatatttctttgtaattatgtttgaatagaagtctcttgc 5202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 132 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 22598 - 22546
Alignment:
Q  132 tagaagtctcttgctta-gtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgct 183  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  22598 tagaagtctcttgcttttgtgcttgagcataggaagtctcttgcgtttgtgct 22546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 132 - 189
Target Start/End: Original strand, 1 - 59
Alignment:
Q  132 tagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca 189  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  1 tagaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgcttgtgtgcttgagca 59  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 102 - 189
Target Start/End: Original strand, 1 - 89
Alignment:
Q  102 tagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca 189  Q
    |||||||||||||| |  ||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||  ||||| ||||||  ||||||||||||||    
T  1 tagaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgcttgtgtgcttgagcaaaggaagtctcttgtctgtgtgcttgagca 89  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Original strand, 88054 - 88171
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| || |||||||  | |||||||||||||    |||||||    
T  88054 ttgtatcgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacgtcaaacatttttctttgtaattctgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttg 88153  T
Q  127 agcattagaagtctcttg 144  Q
    |||| |||||||||||||    
T  88154 agcaatagaagtctcttg 88171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 380 - 263
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||  |||| ||||||||||  |||||||||||||||    |||||||    
T  380 ttgtactgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttcattgtaattttgtttgaatttagaagtctcttgcagttgtgcttg 281  T
Q  127 agcattagaagtctcttg 144  Q
    |||| |||||||||||||    
T  280 agcaatagaagtctcttg 263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 268439 - 268353
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgc 115  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| ||||||||||||||    
T  268439 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatagaagtctcttgc 268353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 84050 - 84011
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  84050 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 84011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0878 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0878
Description:

Target: scaffold0878; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 117 - 154
Target Start/End: Original strand, 4829 - 4866
Alignment:
Q  117 tgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgctt 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4829 tgcgtgcttgagcattagaagtctcttgcttagtgctt 4866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0758 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0758
Description:

Target: scaffold0758; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 3931 - 3770
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaa-ctcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||  |   | || |||| || |||||| ||||||||||||||| |  |||||||||    
T  3931 ttgtattgtgaacaccactgactgtatatcaagtgttcaatccaaatatttttcctgtgtaattgtgtttgtttagaagtctcttgcttttgtgcttgag 3832  T
Q  129 cattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca 189  Q
    |||  ||| ||| ||||||  ||||||||| |||  ||| ||||||| |||||| |||||||    
T  3831 cataggaaatcttttgcttgtgtgcttgagtattttaagtctcttgcttgtgtgattgagca 3770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0738 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0738
Description:

Target: scaffold0738; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 146 - 242
Target Start/End: Original strand, 5331 - 5424
Alignment:
Q  146 ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| || || ||||||||| |  |||| |||||||||||| | || ||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  5331 ttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagaa--tttgggaagtctcatac-tagagagtattgagcagttgtaatctgtgtgat 5424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0280 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0280
Description:

Target: scaffold0280; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 143
Target Start/End: Original strand, 3183 - 3298
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| ||||||||||  | |||||||||||||    |||||||    
T  3183 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttct-tgtaattttgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttg 3281  T
Q  127 agcattagaagtctctt 143  Q
    |||||| ||||||||||    
T  3282 agcatttgaagtctctt 3298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0627 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0627
Description:

Target: scaffold0627; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 198 - 242
Target Start/End: Original strand, 8650 - 8694
Alignment:
Q  198 aagtctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8650 aagtctcatacttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgat 8694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0146
Description:

Target: scaffold0146; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 14775 - 14659
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttg-attagaagtctcttgcctgcgtgcttga 127  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||| ||| ||||| ||||||    ||||||||    
T  14775 ttgtattgtgaacgccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatttgaagtttcttgcagttgtgcttga 14676  T
Q  128 gcattagaagtctcttg 144  Q
    |||||||||||||||||    
T  14675 gcattagaagtctcttg 14659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1359 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1359
Description:

Target: scaffold1359; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 1109 - 1148
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1109 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 1148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0859 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0859
Description:

Target: scaffold0859; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 2638 - 2599
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2638 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 2599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0772
Description:

Target: scaffold0772; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 1331 - 1370
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1331 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 1370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0664 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0664
Description:

Target: scaffold0664; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 1023 - 908
Alignment:
Q  29 attgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttga 127  Q
    ||||||||| |||||||||  |||||||||||||| |||||  ||||||    |||| |||| || ||||||| |||||||||||||| |  ||||||||    
T  1023 attgtattgtgaacaccacatattgtatatcaagttttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttgctttagtgcttga 924  T
Q  128 gcattagaagtctctt 143  Q
    ||||  ||||||||||    
T  923 gcataggaagtctctt 908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0607 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0607
Description:

Target: scaffold0607; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 5664 - 5625
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5664 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 5625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 2440 - 2479
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2440 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 2479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0515 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0515
Description:

Target: scaffold0515; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 5840 - 5801
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5840 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 5801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0414 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0414
Description:

Target: scaffold0414; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 7611 - 7650
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7611 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 7650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0306
Description:

Target: scaffold0306; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 5850 - 5811
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5850 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 5811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 18687 - 18648
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18687 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 18648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 22584 - 22623
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22584 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 22623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Original strand, 10561 - 10676
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || | |||||||||||||||||||     |||||||||    
T  10561 ttgtattgtgaacaccaatggttgtatatcaagtgttcaaactcaaacatttttctttgtaattatctttgattagaagtctcttgtagttgtgcttgag 10660  T
Q  129 cattagaagtctcttg 144  Q
    ||| ||||||||||||    
T  10661 catcagaagtctcttg 10676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Original strand, 15225 - 15340
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || | |||||||||||||||||||     |||||||||    
T  15225 ttgtattgtgaacaccaatggttgtatatcaagtgttcaaactcaaacatttttctttgtaattatctttgattagaagtctcttgtagttgtgcttgag 15324  T
Q  129 cattagaagtctcttg 144  Q
    ||| ||||||||||||    
T  15325 catcagaagtctcttg 15340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0069
Description:

Target: scaffold0069; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 5778 - 5817
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5778 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 5817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0488 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0488
Description:

Target: scaffold0488; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 11855 - 11738
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||    |||| |||| || |||||||  | |||||||||||||    |||||||    
T  11855 ttgtattgtgaacaccactgattgtttatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttg 11756  T
Q  127 agcattagaagtctcttg 144  Q
    |||| |||||||||||||    
T  11755 agcaatagaagtctcttg 11738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000009; HSPs: 2)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Original strand, 16170 - 16287
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||    |||| |||| || |||||||  | ||||||||||||||   |||||||    
T  16170 ttgtagtgtgaacaccactgattgtatatcaagtgtttaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaattaagaagtctcttgccgttgtgcttg 16269  T
Q  127 agcattagaagtctcttg 144  Q
    |||| |||||||||||||    
T  16270 agcaatagaagtctcttg 16287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Original strand, 25830 - 25947
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttga--ttagaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||    |||| |||| || |||||||  | |||||||||||||    |||||||    
T  25830 ttgtagtgtgaacaccactgattgtatatcaagtgtttaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttg 25929  T
Q  127 agcattagaagtctcttg 144  Q
    |||| |||||||||||||    
T  25930 agcaatagaagtctcttg 25947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 30 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 74240 - 74126
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgag 128  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||    |||| |||| || ||||||| ||||||||||||||    |||||||||    
T  74240 ttgtattgtgatcaccactgattgtatatcaagtgtttaacctcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatagaagtctcttgcagttgtgcttgag 74141  T
Q  129 cattagaagtctctt 143  Q
    |||  ||||||||||    
T  74140 cataggaagtctctt 74126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1200 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold1200
Description:

Target: scaffold1200; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 201 - 242
Target Start/End: Original strand, 1 - 42
Alignment:
Q  201 tctcatactttgatagtattgagcatttgtaatctttgtgat 242  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1 tctcatacttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgat 42  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0251
Description:

Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 7480 - 7443
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttc 67  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7480 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttc 7443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 8813 - 8697
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaag-tcaaactcaattctctgtatttttgtttg-atta-gaagtctcttgcctgcgtgcttg 126  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    |||| |||| || |||||| |||| ||||||||||||    |||||||    
T  8813 ttgtattgtgaacaccactgattatatatcaagtgttcaagctcaaacatttttct-tgtaattctgtttgaattatgaagtctcttgcagttgtgcttg 8715  T
Q  127 agcattagaagtctcttg 144  Q
    |||| |||||||||||||    
T  8714 agcaatagaagtctcttg 8697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 144
Target Start/End: Original strand, 729 - 841
Alignment:
Q  33 tattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-gtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcat 131  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||  | |||| |||| || | ||||| ||||||| ||||||    ||||||||||||    
T  729 tattgtgaacactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaaatttctttgtaattctatttgaatagaagtatcttgcagttgtgcttgagcat 828  T
Q  132 tagaagtctcttg 144  Q
      |||||||||||    
T  829 aggaagtctcttg 841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0352 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0352
Description:

Target: scaffold0352; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 69
Target Start/End: Original strand, 1277 - 1313
Alignment:
Q  33 tattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1277 tattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 1313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0249
Description:

Target: scaffold0249; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 69
Target Start/End: Original strand, 18202 - 18258
Alignment:
Q  14 tagagtctttat-tgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18202 tagagtctttatctgatttgtattgtgaacaccactgattatatatcaagtgttcaa 18258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 29 - 69
Target Start/End: Original strand, 44342 - 44382
Alignment:
Q  29 attgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44342 attgtattgtgaacaccactgattgtttatcaagtgttcaa 44382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0683 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0683
Description:

Target: scaffold0683; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 15 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 64 - 9
Alignment:
Q  15 agagtctttattgtatt-gtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    ||||||| |||| |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  64 agagtctgtattttattcgtattgtgaacaccactgatagtatatcaagtgttcaa 9  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 2246 - 2285
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2246 ttgtactgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 2285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0471 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0471
Description:

Target: scaffold0471; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 30 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 2963 - 2928
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgt 65  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2963 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgt 2928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 31395 - 31356
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31395 ttgtattgtgaacaccattgattgtatatcaagtgttcaa 31356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 30 - 69
Target Start/End: Original strand, 35258 - 35297
Alignment:
Q  30 ttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35258 ttgtactgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 35297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1339 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1339
Description:

Target: scaffold1339; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 1845 - 1755
Alignment:
Q  100 attagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca 189  Q
    |||| ||| ||||||| || |||||||||||| | ||||||||||| || |||||||||||| ||||| | ||||| ||||| ||| ||||    
T  1845 attataagactcttgcttgtgtgcttgagcataaaaagtctcttgcttttgtgcttgagcataggaagtcgcttgcttgtgttcttaagca 1755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0388 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0388
Description:

Target: scaffold0388; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 5048 - 4968
Alignment:
Q  32 gtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttg 114  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||  ||||| | ||  |||||||| ||||||||||||||    
T  5048 gtattgtgaacaccactgattgtatatcaagttttcaaaccaaact-tattctttcta-atttgtttgtttagaagtctcttg 4968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0351
Description:

Target: scaffold0351; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 40 - 189
Target Start/End: Original strand, 9486 - 9636
Alignment:
Q  40 aacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtc 139  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||  |||||    |||| |||| ||||||||| |||||||||| |||| |  ||| ||||||||   || ||    
T  9486 aacacaactgatagtatatcaagtgttcaaaccaaacatttttctgtgtaattttgtttgtttagaagtcttttgcttttgtgattgagcatagaaaatc 9585  T
Q  140 tcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca 189  Q
    |||| |||  ||||||||| ||| | || ||||| | ||||||||||||||    
T  9586 tctttcttctgtgcttgagtatttgcagtctcttacttgtgtgcttgagca 9636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 359 - 329
Alignment:
Q  39 gaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  359 gaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 33 - 69
Target Start/End: Original strand, 90513 - 90549
Alignment:
Q  33 tattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  90513 tattgtgaacactactgattgtatatcaagtgttcaa 90549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1026 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold1026
Description:

Target: scaffold1026; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 32 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 2739 - 2702
Alignment:
Q  32 gtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2739 gtattgtgaacagcactgattgtatatcaagtgttcaa 2702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0290 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0290
Description:

Target: scaffold0290; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 32 - 69
Target Start/End: Original strand, 19078 - 19115
Alignment:
Q  32 gtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 69  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19078 gtattgtgaacaccactgactgtatatcaagtgttcaa 19115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 1155 times since January 2019
Visitors: 4365