View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0697_low_21 (Length: 289)

Name: NF0697_low_21
Description: NF0697
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0697_low_21
NF0697_low_21
[»] chr6 (13 HSPs)
chr6 (49-229)||(11206691-11206871)
chr6 (49-229)||(23613301-23613481)
chr6 (50-229)||(18007380-18007559)
chr6 (50-228)||(24859750-24859928)
chr6 (50-229)||(2652415-2652594)
chr6 (51-228)||(20020641-20020818)
chr6 (50-228)||(22771643-22771821)
chr6 (49-228)||(20165730-20165909)
chr6 (50-228)||(8728505-8728683)
chr6 (50-180)||(19562313-19562443)
chr6 (50-227)||(25776359-25776536)
chr6 (50-180)||(22599797-22599927)
chr6 (66-226)||(23522284-23522444)
[»] scaffold0634 (1 HSPs)
scaffold0634 (49-229)||(1151-1331)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (50-229)||(45613-45792)
[»] chr4 (6 HSPs)
chr4 (50-229)||(6032-6211)
chr4 (50-228)||(1650-1828)
chr4 (50-226)||(15303560-15303736)
chr4 (50-228)||(15249865-15250043)
chr4 (50-228)||(22106493-22106671)
chr4 (50-228)||(15264598-15264776)
[»] chr7 (10 HSPs)
chr7 (50-229)||(13653537-13653716)
chr7 (50-225)||(16527540-16527715)
chr7 (50-229)||(13373280-13373459)
chr7 (50-228)||(18275557-18275735)
chr7 (50-229)||(12737188-12737367)
chr7 (50-228)||(18597828-18598006)
chr7 (50-228)||(13669369-13669547)
chr7 (50-224)||(12387783-12387957)
chr7 (50-228)||(16470013-16470191)
chr7 (50-226)||(11966594-11966770)
[»] scaffold0346 (2 HSPs)
scaffold0346 (51-225)||(18140-18314)
scaffold0346 (49-229)||(833-1013)
[»] chr5 (12 HSPs)
chr5 (50-229)||(22321963-22322142)
chr5 (50-226)||(21275116-21275292)
chr5 (50-205)||(26773829-26773984)
chr5 (50-229)||(21276660-21276839)
chr5 (50-225)||(25120706-25120881)
chr5 (50-225)||(25179797-25179972)
chr5 (50-228)||(24967705-24967883)
chr5 (50-228)||(20617694-20617872)
chr5 (50-228)||(30767635-30767813)
chr5 (50-228)||(20442708-20442886)
chr5 (50-226)||(21383806-21383982)
chr5 (50-120)||(16102706-16102776)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (49-229)||(116484-116664)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (49-228)||(187746-187925)
[»] chr8 (10 HSPs)
chr8 (49-229)||(18400822-18401002)
chr8 (50-228)||(8310001-8310179)
chr8 (50-229)||(25468834-25469013)
chr8 (50-228)||(22094774-22094952)
chr8 (50-228)||(8327356-8327534)
chr8 (50-228)||(21822906-21823084)
chr8 (50-228)||(22827445-22827623)
chr8 (50-228)||(21951601-21951779)
chr8 (49-181)||(22286536-22286668)
chr8 (50-228)||(22038024-22038202)
[»] scaffold0759 (1 HSPs)
scaffold0759 (50-225)||(742-917)
[»] chr1 (8 HSPs)
chr1 (49-229)||(52952315-52952494)
chr1 (50-228)||(8951941-8952119)
chr1 (50-228)||(22843255-22843433)
chr1 (58-228)||(21803208-21803378)
chr1 (50-228)||(19786626-19786801)
chr1 (50-228)||(20233052-20233230)
chr1 (50-149)||(19878540-19878639)
chr1 (185-229)||(22467489-22467533)
[»] chr3 (16 HSPs)
chr3 (50-225)||(13201190-13201365)
chr3 (50-229)||(14455509-14455688)
chr3 (50-228)||(14070065-14070243)
chr3 (49-228)||(10164686-10164865)
chr3 (49-228)||(13140684-13140863)
chr3 (49-228)||(13191900-13192079)
chr3 (50-228)||(11878848-11879026)
chr3 (49-228)||(12197977-12198156)
chr3 (50-228)||(15640607-15640785)
chr3 (49-228)||(10142590-10142769)
chr3 (49-228)||(12191333-12191512)
chr3 (49-228)||(15633418-15633597)
chr3 (50-228)||(13510868-13511046)
chr3 (50-229)||(13666559-13666738)
chr3 (50-120)||(12159423-12159493)
chr3 (50-105)||(537-592)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (49-229)||(367868-368048)
[»] scaffold1102 (1 HSPs)
scaffold1102 (50-225)||(91-266)
[»] chr2 (12 HSPs)
chr2 (49-228)||(27619098-27619277)
chr2 (50-228)||(113040-113218)
chr2 (50-228)||(22049175-22049353)
chr2 (50-228)||(24799844-24800022)
chr2 (50-229)||(18992815-18992994)
chr2 (50-228)||(27623126-27623304)
chr2 (50-228)||(25137621-25137799)
chr2 (50-224)||(16771180-16771354)
chr2 (49-226)||(22289748-22289925)
chr2 (50-228)||(23013443-23013620)
chr2 (50-213)||(24176080-24176243)
chr2 (119-178)||(21515104-21515163)
[»] scaffold0112 (1 HSPs)
scaffold0112 (50-228)||(6831-7009)
[»] scaffold0164 (1 HSPs)
scaffold0164 (50-228)||(35006-35184)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (50-226)||(25370-25549)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (65-226)||(55085-55246)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (50-228)||(26033-26211)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (110-225)||(5687-5802)
[»] scaffold1092 (1 HSPs)
scaffold1092 (50-226)||(75-251)
[»] scaffold1058 (1 HSPs)
scaffold1058 (50-226)||(1452-1628)
[»] scaffold1589 (1 HSPs)
scaffold1589 (114-229)||(1077-1192)
[»] scaffold0381 (1 HSPs)
scaffold0381 (50-147)||(16650-16747)
[»] scaffold0213 (1 HSPs)
scaffold0213 (67-226)||(23135-23294)
[»] scaffold0556 (1 HSPs)
scaffold0556 (119-229)||(1-111)
[»] scaffold0054 (1 HSPs)
scaffold0054 (50-120)||(62257-62327)
[»] scaffold0091 (1 HSPs)
scaffold0091 (50-90)||(48590-48630)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (67-111)||(169717-169761)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 149; Significance: 1e-78; HSPs: 13)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 49 - 229
Target Start/End: Original strand, 11206691 - 11206871
Alignment:
Q  49 ttatactactaagatgtctgttgatgcagccgtaggtggagcactaatgaataagaactacacggaggcttatgctttgattgaagatatggctcagaat 148  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11206691 ttatactactaagatgtctgttgatgcagctgcaggtggagcactaatgaataagaactacacggagccttatgctttgattgaagatatggctcagaat 11206790  T
Q  149 cactaccaatggaccaacgaaagagccatcaccacctctacgccctccaaaaaggagtcaggtatttacgaagtctctgat 229  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  11206791 cactaccaatggaccaatgaaagagccatcaccgcctctacaccctccaaaaaggaggcaggtatttacgaggtctctgat 11206871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 49 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 23613481 - 23613301
Alignment:
Q  49 ttatactactaagatgtctgttgatgcagccgtaggtggagcactaatgaataagaactacacggaggcttatgctttgattgaagatatggctcagaat 148  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23613481 ttatactactaagatgtctgttgatgcagctgcagggggagcactaatgaataagaactacacggaggattatgctttgattgaagatatggctcaaaat 23613382  T
Q  149 cactaccaatggaccaacgaaagagccatcaccacctctacgccctccaaaaaggagtcaggtatttacgaagtctctgat 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  23613381 cactaccaatggaccaacgaaagagccatcatcgcctctacaccctctaaaaaggaggcaggtatttacgaggtctctgat 23613301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 50 - 229
Target Start/End: Original strand, 18007380 - 18007559
Alignment:
Q  50 tatactactaagatgtctgttgatgcagccgtaggtggagcactaatgaataagaactacacggaggcttatgctttgattgaagatatggctcagaatc 149  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||  | ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  18007380 tataccactaagatgtctgttgatgcagctgcaggtggagccttgatgaacaagaactatacggaggcttacgcattgattgaagacatggctcagaatc 18007479  T
Q  150 actaccaatggaccaacgaaagagccatcaccacctctacgccctccaaaaaggagtcaggtatttacgaagtctctgat 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  18007480 actaccaatggaccaacgaaagagccatcaccgcctctacaccctccaaaaaggaggcaggtatttacgagatctctgat 18007559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 50 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 24859928 - 24859750
Alignment:
Q  50 tatactactaagatgtctgttgatgcagccgtaggtggagcactaatgaataagaactacacggaggcttatgctttgattgaagatatggctcagaatc 149  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  24859928 tataccactaagatgtctgttgatgcagctgcaggtggagctctaatgaacaaaaactacacggaggcttatgctttgattgaggacatggctcagaatc 24859829  T
Q  150 actaccaatggaccaacgaaagagccatcaccacctctacgccctccaaaaaggagtcaggtatttacgaagtctctga 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||| ||||| || || ||| |||||||  |||||||||||||    
T  24859828 actaccaatggaccaacgaaagagccgtcaccactcctactccctctaagaaagaggcaggtatacacgaagtctctga 24859750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 50 - 229
Target Start/End: Original strand, 2652415 - 2652594
Alignment:
Q  50 tatactactaagatgtctgttgatgcagccgtaggtggagcactaatgaataagaactacacggaggcttatgctttgattgaagatatggctcagaatc 149  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||| | ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| || | ||||||||||||  ||||||| ||||    
T  2652415 tataccactaagatgtctattgatgcagctgcaggtggagccctaatgaacaagaactatacggaggcatacgttttgattgaagacgtggctcataatc 2652514  T
Q  150 actaccaatggaccaacgaaagagccatcaccacctctacgccctccaaaaaggagtcaggtatttacgaagtctctgat 229  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||| ||||||| || ||||||||||||    
T  2652515 actaccaatggaccaacgaatgagccatcaccacttctacaccctctaaaaaagaggcaggtatgtatgaagtctctgat 2652594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 51 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 20020818 - 20020641
Alignment:
Q  51 atactactaagatgtctgttgatgcagccgtaggtggagcactaatgaataagaactacacggaggcttatgctttgattgaagatatggctcagaatca 150  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  20020818 ataccactaaaatgtctgttgatgcagctgcaggtggagctctaatgaacaaaaactacacggaggcttatgctttgattgaggacatggctcaaaatca 20020719  T
Q  151 ctaccaatggaccaacgaaagagccatcaccacctctacgccctccaaaaaggagtcaggtatttacgaagtctctga 228  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||  |||| ||||| || || ||| |||||||  |||||||||||||    
T  20020718 ctatcaatggaccaacgaaagagccgtcaccactcctaccccctctaagaaagaggcaggtatacacgaagtctctga 20020641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 50 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 22771821 - 22771643
Alignment:
Q  50 tatactactaagatgtctgttgatgcagccgtaggtggagcactaatgaataagaactacacggaggcttatgctttgattgaagatatggctcagaatc 149  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||    
T  22771821 tataccactaaaatgtctgttgatgcagctgcaggtggagccctaatgaacaaaaactacacggaggcttacgctttaattgaggacatggctcaaaatc 22771722  T
Q  150 actaccaatggaccaacgaaagagccatcaccacctctacgccctccaaaaaggagtcaggtatttacgaagtctctga 228  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||  |||| ||||| || || ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  22771721 actatcaatggaccaacgaaagagccgtcaccactcctactccctctaagaaagaggcaggtatatacgaagtctctga 22771643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 49 - 228
Target Start/End: Original strand, 20165730 - 20165909
Alignment:
Q  49 ttatactactaagatgtctgttgatgcagccgtaggtggagcactaatgaataagaactacacggaggcttatgctttgattgaagatatggctcagaat 148  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||    
T  20165730 ttataccactaaaatgtctgttgatgcagctgcaggtggagctctaatgaacaaaaactacacggaggcttacgctttgattgaggacatggctcaaaat 20165829  T
Q  149 cactaccaatggaccaacgaaagagccatcaccacctctacgccctccaaaaaggagtcaggtatttacgaagtctctga 228  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| |||| ||  |||| ||||| || || ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  20165830 cactatcaatggacgaacgaaagagccgtcacaactcctactccctctaagaaagaggcaggtatatacgaagtctctga 20165909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 50 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 8728683 - 8728505
Alignment:
Q  50 tatactactaagatgtctgttgatgcagccgtaggtggagcactaatgaataagaactacacggaggcttatgctttgattgaagatatggctcagaatc 149  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || || || |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  8728683 tataccactaagatgtctgttgatgcagctgtaggcggagctctaatgaacaaaaattatacggaggcttatgccttgattgaagacatgactcagaatc 8728584  T
Q  150 actaccaatggaccaacgaaagagccatcaccacctctacgccctccaaaaaggagtcaggtatttacgaagtctctga 228  Q
    ||||| ||||||||||| | |||||| ||||| | ||||| ||||| || || ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  8728583 actactaatggaccaacaagagagccgtcaccgcttctactccctctaagaaagaggcaggtatatacgaagtctctga 8728505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 50 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 19562443 - 19562313
Alignment:
Q  50 tatactactaagatgtctgttgatgcagccgtaggtggagcactaatgaataagaactacacggaggcttatgctttgattgaagatatggctcagaatc 149  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||| | |||||||||  | ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  19562443 tataccactaagatgtctgttgatgtagctgcaggtggagccttgatgaacaataactatacggaggcttacgctttgattgaagacatggctcagaatc 19562344  T
Q  150 actaccaatggaccaacgaaagagccatcac 180  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19562343 actaccaatggaccaacgagagagccatcac 19562313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 50 - 227
Target Start/End: Original strand, 25776359 - 25776536
Alignment:
Q  50 tatactactaagatgtctgttgatgcagccgtaggtggagcactaatgaataagaactacacggaggcttatgctttgattgaagatatggctcagaatc 149  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||| | | ||||||||| ||||| || ||||||||  | || ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||    
T  25776359 tataccactaagatatatgttgatgcaactgcaggtggagctctaataaacaagaactatgcagaagcttacgctttgattgaagacatgactcagaatc 25776458  T
Q  150 actaccaatggaccaacgaaagagccatcaccacctctacgccctccaaaaaggagtcaggtatttacgaagtctctg 227  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| | |||  |||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  25776459 actatcaatggaccaacgagagagccatcaccgcctctacactctcttaaaaagaggcaggtatgtacgaagtctctg 25776536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 50 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 22599927 - 22599797
Alignment:
Q  50 tatactactaagatgtctgttgatgcagccgtaggtggagcactaatgaataagaactacacggaggcttatgctttgattgaagatatggctcagaatc 149  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| || |||||| ||||||    
T  22599927 tataccactaagatgactgttgatgcagctgcaggtggagctctaatgaacaagaactatacagaggcgtacgctttgattgaggaaatggcttagaatc 22599828  T
Q  150 actaccaatggaccaacgaaagagccatcac 180  Q
    | |  |||||||||| ||| |||||||||||    
T  22599827 attgtcaatggaccagcgagagagccatcac 22599797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 66 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 23522444 - 23522284
Alignment:
Q  66 ctgttgatgcagccgtaggtggagcactaatgaataagaactacacggaggcttatgctttgattgaagatatggctcagaatcactaccaatggaccaa 165  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||  ||||||| |||||||| || ||| | |  ||||||||||| || |||||  |||| |||||||||||||| ||    
T  23522444 ctgttgatgcagctgtagatggagctttaatgaacaagaactatacagagacatccgctttgattgaggacatggcctagaaccactaccaatggactaa 23522345  T
Q  166 cgaaagagccatcaccacctctacgccctccaaaaaggagtcaggtatttacgaagtctct 226  Q
     || |||||||||||  | ||| | || ||  |||| ||| ||||||| ||||||||||||    
T  23522344 tgagagagccatcactgcttcttcaccttcttaaaaagaggcaggtatgtacgaagtctct 23522284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0634 (Bit Score: 145; Significance: 2e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0634
Description:

Target: scaffold0634; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 49 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 1331 - 1151
Alignment:
Q  49 ttatactactaagatgtctgttgatgcagccgtaggtggagcactaatgaataagaactacacggaggcttatgctttgattgaagatatggctcagaat 148  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1331 ttatactactaagatgtttgttgatgtagccgcaggtggagcactaatgaataagaactacacggagacttatgctttgattgaagatatggctcagaat 1232  T
Q  149 cactaccaatggaccaacgaaagagccatcaccacctctacgccctccaaaaaggagtcaggtatttacgaagtctctgat 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  1231 cactaccaatggaccaacgaaagagccatcactgcctctacaccctccaaaaaggaggcaggtatttacgaggtctctgat 1151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 144; Significance: 9e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 50 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 45792 - 45613
Alignment:
Q  50 tatactactaagatgtctgttgatgcagccgtaggtggagcactaatgaataagaactacacggaggcttatgctttgattgaagatatggctcagaatc 149  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45792 tataccactaagatgtctgttgatgcagctgcaggtggagcactaatgaataagaactacacagaggcttatgctttgattgaagatatggctcagaatc 45693  T
Q  150 actaccaatggaccaacgaaagagccatcaccacctctacgccctccaaaaaggagtcaggtatttacgaagtctctgat 229  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  45692 actaccaatggaccaacgagagagccatcaccgcctctacaccctccaaaaaggaggcaggtatttacgaggtctctgat 45613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 144; Significance: 9e-76; HSPs: 6)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 50 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 6211 - 6032
Alignment:
Q  50 tatactactaagatgtctgttgatgcagccgtaggtggagcactaatgaataagaactacacggaggcttatgctttgattgaagatatggctcagaatc 149  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6211 tataccactaagatgtctgttgatgcagctgcaggtggagcactaatgaataagaactacacagaggcttatgctttgattgaagatatggctcagaatc 6112  T
Q  150 actaccaatggaccaacgaaagagccatcaccacctctacgccctccaaaaaggagtcaggtatttacgaagtctctgat 229  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  6111 actaccaatggaccaacgagagagccatcaccgcctctacaccctccaaaaaggaggcaggtatttacgaggtctctgat 6032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 50 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 1828 - 1650
Alignment:
Q  50 tatactactaagatgtctgttgatgcagccgtaggtggagcactaatgaataagaactacacggaggcttatgctttgattgaagatatggctcagaatc 149  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  1828 tataccactaaaatgtctgttgatgcagctgcaggtggagctctaatgaacaaaaactacacggaggcttatgctttgattgaggacatggctcaaaatc 1729  T
Q  150 actaccaatggaccaacgaaagagccatcaccacctctacgccctccaaaaaggagtcaggtatttacgaagtctctga 228  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||  |||| ||||| || || ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  1728 actatcaatggaccaacgaaagagccgtcaccactcctactccctctaagaaagaggcaggtatatacgaagtctctga 1650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 50 - 226
Target Start/End: Original strand, 15303560 - 15303736
Alignment:
Q  50 tatactactaagatgtctgttgatgcagccgtaggtggagcactaatgaataagaactacacggaggcttatgctttgattgaagatatggctcagaatc 149  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| || || || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  15303560 tataccactaagatgtctgttgatgcagctgcaggtggagctctaatgaacaaaaattatacggaggcttatgccttgattgaagacatggctcagaatc 15303659  T
Q  150 actaccaatggaccaacgaaagagccatcaccacctctacgccctccaaaaaggagtcaggtatttacgaagtctct 226  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |||| ||||| || || ||| ||||||| ||||||||||||    
T  15303660 actaccaatggaccaacgagagagccgtcaccactcctactccctctaagaaagaggcaggtatatacgaagtctct 15303736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 50 - 228
Target Start/End: Original strand, 15249865 - 15250043
Alignment:
Q  50 tatactactaagatgtctgttgatgcagccgtaggtggagcactaatgaataagaactacacggaggcttatgctttgattgaagatatggctcagaatc 149  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15249865 tataccactaagatgtctgttgatgcagctgcaggtggagctctaatgaacaaaaactatacggaggcttatgctttgattgaagacatggctcagaatc 15249964  T
Q  150 actaccaatggaccaacgaaagagccatcaccacctctacgccctccaaaaaggagtcaggtatttacgaagtctctga 228  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  ||||| |  |||| ||||| || || ||| |||||||  |||||||||||||    
T  15249965 actaccaatggaccaacgagagagcggtcaccgctcctactccctctaagaaagagacaggtatacacgaagtctctga 15250043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 50 - 228
Target Start/End: Original strand, 22106493 - 22106671
Alignment:
Q  50 tatactactaagatgtctgttgatgcagccgtaggtggagcactaatgaataagaactacacggaggcttatgctttgattgaagatatggctcagaatc 149  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| ||| | ||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  22106493 tataccactaaaatgtctgttgatgtagctgcaggtggagctctaatgaacaaaaactacacggaggcttatgctttgattgaggacatggctcaaaatc 22106592  T
Q  150 actaccaatggaccaacgaaagagccatcaccacctctacgccctccaaaaaggagtcaggtatttacgaagtctctga 228  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||  |||| ||||| || || ||| |||||||  |||||||||||||    
T  22106593 actatcaatggaccaacgaaagagccgtcaccactcctactccctctaagaaagaggcaggtatacacgaagtctctga 22106671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 50 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 15264776 - 15264598
Alignment:
Q  50 tatactactaagatgtctgttgatgcagccgtaggtggagcactaatgaataagaactacacggaggcttatgctttgattgaagatatggctcagaatc 149  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||| || || || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  15264776 tataccactaagatgtctgttgatgcagctgcagggggagctctaatgaacaaaaaatatacggaggcttatgccttgattgaagacatggctcagaatc 15264677  T
Q  150 actaccaatggaccaacgaaagagccatcaccacctctacgccctccaaaaaggagtcaggtatttacgaagtctctga 228  Q
    | ||||||||||||||||| |||||| ||||| |  |||| ||||| ||||| ||| |||||||  |||||||||||||    
T  15264676 attaccaatggaccaacgagagagccgtcaccgctcctactccctctaaaaaagaggcaggtatacacgaagtctctga 15264598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 10)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 50 - 229
Target Start/End: Original strand, 13653537 - 13653716
Alignment:
Q  50 tatactactaagatgtctgttgatgcagccgtaggtggagcactaatgaataagaactacacggaggcttatgctttgattgaagatatggctcagaatc 149  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13653537 tataccactaagatgtctgttgatgcagctgcaggtggagcactaatgaataagaactacacggaggcttatgctttgattgaagatatggctcagaatc 13653636  T
Q  150 actaccaatggaccaacgaaagagccatcaccacctctacgccctccaaaaaggagtcaggtatttacgaagtctctgat 229  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| |||| ||||    
T  13653637 actaccaatggaccaacgagagagccatcaccgcctctacaccctccaaaagggaggcaggtatttacgaggtctttgat 13653716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 50 - 225
Target Start/End: Original strand, 16527540 - 16527715
Alignment:
Q  50 tatactactaagatgtctgttgatgcagccgtaggtggagcactaatgaataagaactacacggaggcttatgctttgattgaagatatggctcagaatc 149  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  16527540 tataccactaagatgtctgttgatgcagctgcaggtggagcgctaatgaataagaactacacggaggcctatgctttgatcgaagacatggctcagaatc 16527639  T
Q  150 actaccaatggaccaacgaaagagccatcaccacctctacgccctccaaaaaggagtcaggtatttacgaagtctc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||    
T  16527640 actaccaatggaccaacgaaagagccactactgcctctactccctccaaaaaggaggcaggtatgtacgaggtctc 16527715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 50 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 13373459 - 13373280
Alignment:
Q  50 tatactactaagatgtctgttgatgcagccgtaggtggagcactaatgaataagaactacacggaggcttatgctttgattgaagatatggctcagaatc 149  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| | |||||||||  | ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||    
T  13373459 tataccaccaagatgtctgttgatgcagctgcaggtggagccttgatgaacaagaactacacggaggcttacgcattgattgaagacatggcttagaatc 13373360  T
Q  150 actaccaatggaccaacgaaagagccatcaccacctctacgccctccaaaaaggagtcaggtatttacgaagtctctgat 229  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  13373359 actacgaatggaccaacgaaagagccatcatcgcctctacaccctccaaaaaggaggcaggtatttacgagatctctgat 13373280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 50 - 228
Target Start/End: Original strand, 18275557 - 18275735
Alignment:
Q  50 tatactactaagatgtctgttgatgcagccgtaggtggagcactaatgaataagaactacacggaggcttatgctttgattgaagatatggctcagaatc 149  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  18275557 tataccactaagatgtctgttgatgcagctgcaggtggagctctaatgaacaaaaactacacggaggcttatgctttgattgaggacatggctcagaatc 18275656  T
Q  150 actaccaatggaccaacgaaagagccatcaccacctctacgccctccaaaaaggagtcaggtatttacgaagtctctga 228  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |||| ||||  || || ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  18275657 actaccaatggaccaacgagagagccgtcaccactcctactccctttaagaaagaggcaggtatatacgaagtctctga 18275735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 50 - 229
Target Start/End: Original strand, 12737188 - 12737367
Alignment:
Q  50 tatactactaagatgtctgttgatgcagccgtaggtggagcactaatgaataagaactacacggaggcttatgctttgattgaagatatggctcagaatc 149  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||| | | ||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||| ||||||||    
T  12737188 tataccactaagatgtttgttgatgcagctgcatgtggagccctaatgaacaagaactatacggaggcttacgctttgattgaaaacatggttcagaatc 12737287  T
Q  150 actaccaatggaccaacgaaagagccatcaccacctctacgccctccaaaaaggagtcaggtatttacgaagtctctgat 229  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  12737288 actaccaatggaccaacgagagagccatcaccacttctacaccttctaaaaaagaggcaggtatgtacgaagtctctgat 12737367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 50 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 18598006 - 18597828
Alignment:
Q  50 tatactactaagatgtctgttgatgcagccgtaggtggagcactaatgaataagaactacacggaggcttatgctttgattgaagatatggctcagaatc 149  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| | | ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  18598006 tataccactaagatgtctgttgatgcagctgcatgtggagctctaatgaacaaaaactacacggaggcttatgctttgattgaggacatggctcaaaatc 18597907  T
Q  150 actaccaatggaccaacgaaagagccatcaccacctctacgccctccaaaaaggagtcaggtatttacgaagtctctga 228  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||  |||| ||||| || || ||| |||||||  |||||||||||||    
T  18597906 actatcaatggaccaacgaaagagccgtcaccactcctactccctctaagaaagaggcaggtatacacgaagtctctga 18597828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 50 - 228
Target Start/End: Original strand, 13669369 - 13669547
Alignment:
Q  50 tatactactaagatgtctgttgatgcagccgtaggtggagcactaatgaataagaactacacggaggcttatgctttgattgaagatatggctcagaatc 149  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  13669369 tataccactaaaatgtccgttgatgcagctgcaggtggagctctaatgaacaaaaactacacggaggcttatgctttgattgaggacatggctcaaaatc 13669468  T
Q  150 actaccaatggaccaacgaaagagccatcaccacctctacgccctccaaaaaggagtcaggtatttacgaagtctctga 228  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||  |||| ||||| || || ||| |||||||  |||||||||||||    
T  13669469 actatcaatggaccaacgaaagagccgtcaccactcctactccctctaagaaagaggcaggtatacacgaagtctctga 13669547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 50 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 12387957 - 12387783
Alignment:
Q  50 tatactactaagatgtctgttgatgcagccgtaggtggagcactaatgaataagaactacacggaggcttatgctttgattgaagatatggctcagaatc 149  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||  | ||||| |||||||| || |||||||| || || |||||||| ||| |||||||||    
T  12387957 tataccactaagatgtctgttgatgcagctgcaggtggagccttgatgaacaagaactatacagaggcttacgcattaattgaagacatgactcagaatc 12387858  T
Q  150 actaccaatggaccaacgaaagagccatcaccacctctacgccctccaaaaaggagtcaggtatttacgaagtct 224  Q
    | | ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  12387857 attgccaatggaccagcgaaagagccatcaccgcctctacaccctccaaaaaggaggcaggtatgtacgaggtct 12387783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 50 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 16470191 - 16470013
Alignment:
Q  50 tatactactaagatgtctgttgatgcagccgtaggtggagcactaatgaataagaactacacggaggcttatgctttgattgaagatatggctcagaatc 149  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||    
T  16470191 tataccactaagatgtctgttgatgcagctgcaggaggagctctaatgaacaaaaactatacggaggcttatgccctgattgaagacatggctcagaatc 16470092  T
Q  150 actaccaatggaccaacgaaagagccatcaccacctctacgccctccaaaaaggagtcaggtatttacgaagtctctga 228  Q
    | ||||||||||||||||| |||||| ||||| |  |||| ||||| || || ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  16470091 attaccaatggaccaacgagagagccgtcaccgctcctactccctctaagaaagaggcaggtatatacgaagtctctga 16470013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 50 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 11966770 - 11966594
Alignment:
Q  50 tatactactaagatgtctgttgatgcagccgtaggtggagcactaatgaataagaactacacggaggcttatgctttgattgaagatatggctcagaatc 149  Q
    ||||| || ||||||| |||||||| ||| | ||| |||||  | ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||    
T  11966770 tataccacaaagatgtttgttgatgtagctgcaggaggagccttgatgaacaagaactatacggaggcttacgcattgatcgaagacatggctcaaaatc 11966671  T
Q  150 actaccaatggaccaacgaaagagccatcaccacctctacgccctccaaaaaggagtcaggtatttacgaagtctct 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  11966670 actaccaatggaccaacgaaagagccatcatcgcctctacaccctctaaaaaggaggcaggtatgtacgaggtctct 11966594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0346 (Bit Score: 139; Significance: 9e-73; HSPs: 2)
Name: scaffold0346
Description:

Target: scaffold0346; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 51 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 18314 - 18140
Alignment:
Q  51 atactactaagatgtctgttgatgcagccgtaggtggagcactaatgaataagaactacacggaggcttatgctttgattgaagatatggctcagaatca 150  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18314 ataccactaagatgtctgttgatgcagctgcaggtggagcactaatgaacaagaactatacggaggcttatgctttgattgaagatatggctcagaatca 18215  T
Q  151 ctaccaatggaccaacgaaagagccatcaccacctctacgccctccaaaaaggagtcaggtatttacgaagtctc 225  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||    
T  18214 ctaccaatggaccaacaaaagagccatcaccacctctacgccctccaaaaaggaggcaggtatgtacgaggtctc 18140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0346; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 49 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 1013 - 833
Alignment:
Q  49 ttatactactaagatgtctgttgatgcagccgtaggtggagcactaatgaataagaactacacggaggcttatgctttgattgaagatatggctcagaat 148  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| |||||||| | | ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||    
T  1013 ttatactaccaagatgtctgttgatgcagctgcaggtggagccctaatgaacaagaactatatgaaggcttacgcattgattgaagacatggctcagaat 914  T
Q  149 cactaccaatggaccaacgaaagagccatcaccacctctacgccctccaaaaaggagtcaggtatttacgaagtctctgat 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||| || || |||||||||    
T  913 cactaccaatggaccaacgaaagagccatcaccgcctctacacccaccaaaaaggaggcaggtatgtatgaggtctctgat 833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 136; Significance: 5e-71; HSPs: 12)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 50 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 22322142 - 22321963
Alignment:
Q  50 tatactactaagatgtctgttgatgcagccgtaggtggagcactaatgaataagaactacacggaggcttatgctttgattgaagatatggctcagaatc 149  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22322142 tataccactaagatgtctgttgatgcagctgcaggtggagcactaatgaataagaactacacggaggcttatgctttgattgaagacatggctcagaatc 22322043  T
Q  150 actaccaatggaccaacgaaagagccatcaccacctctacgccctccaaaaaggagtcaggtatttacgaagtctctgat 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | || || ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||    
T  22322042 actaccaatggaccaacgaaagagccatcaccgcttccacaccctccaaaaaggaggcaggtatgtacgaggtctctgat 22321963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 50 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 21275292 - 21275116
Alignment:
Q  50 tatactactaagatgtctgttgatgcagccgtaggtggagcactaatgaataagaactacacggaggcttatgctttgattgaagatatggctcagaatc 149  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||  | ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||    
T  21275292 tataccactaagatgtctgttgatgcagctgcaggtggagccttgatgaacaataactatacggaggcttatgcattgattgaagacatggctcaaaatc 21275193  T
Q  150 actaccaatggaccaacgaaagagccatcaccacctctacgccctccaaaaaggagtcaggtatttacgaagtctct 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  21275192 actaccaatggaccaacgaaagagccatcaccgcctctacaccctccaaaaaggaggcaggtatttacgaggtctct 21275116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 50 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 26773984 - 26773829
Alignment:
Q  50 tatactactaagatgtctgttgatgcagccgtaggtggagcactaatgaataagaactacacggaggcttatgctttgattgaagatatggctcagaatc 149  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| ||||| || ||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  26773984 tataccactaagatgtctgttgatgcagctgcaggtggagaactaatgaacaagaattatacggaggtttacgcattgattgaagatatggctcagaatc 26773885  T
Q  150 actaccaatggaccaacgaaagagccatcaccacctctacgccctccaaaaaggag 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  26773884 actaccaatggaccaacgaaagagccatcaccgcctctacaccctccaaaaaggag 26773829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 50 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 21276839 - 21276660
Alignment:
Q  50 tatactactaagatgtctgttgatgcagccgtaggtggagcactaatgaataagaactacacggaggcttatgctttgattgaagatatggctcagaatc 149  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||| |  | ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||    
T  21276839 tataccactaagatgtctgttgatgcagctgcaggtggaactttgatgaacaagaactatacggaggcttacgcattgattgaagatatggcttagaatc 21276740  T
Q  150 actaccaatggaccaacgaaagagccatcaccacctctacgccctccaaaaaggagtcaggtatttacgaagtctctgat 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| ||| | ||| |||||||||    
T  21276739 actaccaatggaccaacgaaagagccatcaccgcctctacaccctccaaaaaggaggcagatatgttcgaggtctctgat 21276660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 50 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 25120881 - 25120706
Alignment:
Q  50 tatactactaagatgtctgttgatgcagccgtaggtggagcactaatgaataagaactacacggaggcttatgctttgattgaagatatggctcagaatc 149  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||    
T  25120881 tataccactaagatgtctgttgatgcagctgcaggtggagcgctaatgaacaagaattatacggaggcttacgcattgattgaagacatggctcaaaatc 25120782  T
Q  150 actaccaatggaccaacgaaagagccatcaccacctctacgccctccaaaaaggagtcaggtatttacgaagtctc 225  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||    
T  25120781 actatcaatggaccaacgaaagggccatcaccgcctctacaccctccaaaaaggaggcaggtatgtacgaggtctc 25120706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 50 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 25179972 - 25179797
Alignment:
Q  50 tatactactaagatgtctgttgatgcagccgtaggtggagcactaatgaataagaactacacggaggcttatgctttgattgaagatatggctcagaatc 149  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||    
T  25179972 tataccactaagatgtctgttgatgcagctgcaggtggagcgctaatgaacaagaattatacggaggcttacgcattgattgaagacatggctcaaaatc 25179873  T
Q  150 actaccaatggaccaacgaaagagccatcaccacctctacgccctccaaaaaggagtcaggtatttacgaagtctc 225  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||    
T  25179872 actatcaatggaccaacgaaagggccatcaccgcctctacaccctccaaaaaggaggcaggtatgtacgaggtctc 25179797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 50 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 24967883 - 24967705
Alignment:
Q  50 tatactactaagatgtctgttgatgcagccgtaggtggagcactaatgaataagaactacacggaggcttatgctttgattgaagatatggctcagaatc 149  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  24967883 tataccactaaaatgtctgttgatgcagccgcaggtggagctctaatgaacaaaaactacacggaggcttatgctttgattgaagacatggctcaaaatc 24967784  T
Q  150 actaccaatggaccaacgaaagagccatcaccacctctacgccctccaaaaaggagtcaggtatttacgaagtctctga 228  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||  |||| ||||| || || ||| |||||||  |||||||||||||    
T  24967783 actatcaatggaccaacgaaagagccgtcaccactcctactccctctaagaaagaggcaggtatacacgaagtctctga 24967705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 50 - 228
Target Start/End: Original strand, 20617694 - 20617872
Alignment:
Q  50 tatactactaagatgtctgttgatgcagccgtaggtggagcactaatgaataagaactacacggaggcttatgctttgattgaagatatggctcagaatc 149  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  20617694 tataccactaaaatgtctgttgatgcagctgcaggtggagctctaatgaacaaaaactacacggaggcttatgctttgattgaggacatggctcaaaatc 20617793  T
Q  150 actaccaatggaccaacgaaagagccatcaccacctctacgccctccaaaaaggagtcaggtatttacgaagtctctga 228  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||  |||| ||||| || || ||| |||||||  |||||||||||||    
T  20617794 actatcaatggaccaacgaaagagccgtcaccactcctactccctctaagaaagaggcaggtatacacgaagtctctga 20617872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 50 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 30767813 - 30767635
Alignment:
Q  50 tatactactaagatgtctgttgatgcagccgtaggtggagcactaatgaataagaactacacggaggcttatgctttgattgaagatatggctcagaatc 149  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| || || || || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  30767813 tataccactaagatgtctgttgatgcagctgcaggtggagctctaattaacaaaaattatacggaggcttatgccttgattgaagacatggctcagaatc 30767714  T
Q  150 actaccaatggaccaacgaaagagccatcaccacctctacgccctccaaaaaggagtcaggtatttacgaagtctctga 228  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||| |  |||| ||||| || || ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  30767713 actaccaatggaccaacgagagagccgtcaccgctcctactccctctaagaaagaggcaggtatatacgaagtctctga 30767635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 50 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 20442886 - 20442708
Alignment:
Q  50 tatactactaagatgtctgttgatgcagccgtaggtggagcactaatgaataagaactacacggaggcttatgctttgattgaagatatggctcagaatc 149  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||| || || || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  20442886 tataccactaagatgtctgttgatgcagctgcaggcggagctctaatgaacaaaaattatacggaggcttatgccttgattgaagacatggctcagaatc 20442787  T
Q  150 actaccaatggaccaacgaaagagccatcaccacctctacgccctccaaaaaggagtcaggtatttacgaagtctctga 228  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||   ||||| | ||||| ||||| || || ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  20442786 actactaatggaccaacgagagagttgtcaccgcttctactccctctaagaaagaggcaggtatatacgaagtctctga 20442708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 50 - 226
Target Start/End: Original strand, 21383806 - 21383982
Alignment:
Q  50 tatactactaagatgtctgttgatgcagccgtaggtggagcactaatgaataagaactacacggaggcttatgctttgattgaagatatggctcagaatc 149  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| |||  ||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||    
T  21383806 tataccactaagatgactgttgatacagttgtaggtggagctctaatgaacaagaactatactgaggcgtacgctttgattgaagacatggctcagaatc 21383905  T
Q  150 actaccaatggaccaacgaaagagccatcaccacctctacgccctccaaaaaggagtcaggtatttacgaagtctct 226  Q
    | |  |||||||||||||| |||||||||||  | ||| | ||||| ||||| |||  |||||| ||||||||||||    
T  21383906 attgtcaatggaccaacgagagagccatcactgcttcttcaccctctaaaaaagagggaggtatgtacgaagtctct 21383982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 16102776 - 16102706
Alignment:
Q  50 tatactactaagatgtctgttgatgcagccgtaggtggagcactaatgaataagaactacacggaggctta 120  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||    
T  16102776 tataccactaaaatgtctgttgatgcagctgcaggtggagctctaatgaacaaaaactacacggaggctta 16102706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 49 - 229
Target Start/End: Original strand, 116484 - 116664
Alignment:
Q  49 ttatactactaagatgtctgttgatgcagccgtaggtggagcactaatgaataagaactacacggaggcttatgctttgattgaagatatggctcagaat 148  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  116484 ttatactactaagatgtctgttgatgcagctgcacgtggagcattaatgaataagaactacatggaggcttacgctttgattgaagatatggctcagaac 116583  T
Q  149 cactaccaatggaccaacgaaagagccatcaccacctctacgccctccaaaaaggagtcaggtatttacgaagtctctgat 229  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||    
T  116584 cactgccaatggaccaacgaaagagccatcaccacctctacaccctccaaaaaggaggcaggtatgtacgaggtctctgat 116664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 49 - 228
Target Start/End: Original strand, 187746 - 187925
Alignment:
Q  49 ttatactactaagatgtctgttgatgcagccgtaggtggagcactaatgaataagaactacacggaggcttatgctttgattgaagatatggctcagaat 148  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  187746 ttatactaataagatgtctgttgatgcagttgcaggtggagcactaatgaataagaactacacggaggcttatgctttaattgaagatatggctcagaac 187845  T
Q  149 cactaccaatggaccaacgaaagagccatcaccacctctacgccctccaaaaaggagtcaggtatttacgaagtctctga 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||    
T  187846 cactaccaatggaccaacgaaagagccatcatcgcctctacaccctccaaaaaggaggcaggtatgtacgaggtctctga 187925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 129; Significance: 8e-67; HSPs: 10)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 49 - 229
Target Start/End: Original strand, 18400822 - 18401002
Alignment:
Q  49 ttatactactaagatgtctgttgatgcagccgtaggtggagcactaatgaataagaactacacggaggcttatgctttgattgaagatatggctcagaat 148  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18400822 ttatactactaagatgtctgttgatgcagctgcaggtggagctctaatgaacaagaactatacggaggcttatgcgttgattgaagatatggctcagaat 18400921  T
Q  149 cactaccaatggaccaacgaaagagccatcaccacctctacgccctccaaaaaggagtcaggtatttacgaagtctctgat 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  18400922 cactaccaatggaccaacgagagagccatcaccgcttctacaccctccaaaaaggaggtaggtatatacgaagtctctgat 18401002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 50 - 228
Target Start/End: Original strand, 8310001 - 8310179
Alignment:
Q  50 tatactactaagatgtctgttgatgcagccgtaggtggagcactaatgaataagaactacacggaggcttatgctttgattgaagatatggctcagaatc 149  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  8310001 tataccactaagatgtctgttgatgcagctgcaggtggagctctaatgaacaaaaactacacggaggcttatgctttgattgaggacatggctcagaatc 8310100  T
Q  150 actaccaatggaccaacgaaagagccatcaccacctctacgccctccaaaaaggagtcaggtatttacgaagtctctga 228  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||| ||||| || || ||| |||||||  |||||||||||||    
T  8310101 attaccaatggaccaacgaaagagccgtcaccactcctactccctctaagaaagaggcaggtatacacgaagtctctga 8310179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 50 - 229
Target Start/End: Original strand, 25468834 - 25469013
Alignment:
Q  50 tatactactaagatgtctgttgatgcagccgtaggtggagcactaatgaataagaactacacggaggcttatgctttgattgaagatatggctcagaatc 149  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||  | ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  25468834 tataccactaagatgtctgttaatgcagctgcaggtggagccttgatgaacaagaactatacggaggcttacgcattgattgaagacatggctcagaatc 25468933  T
Q  150 actaccaatggaccaacgaaagagccatcaccacctctacgccctccaaaaaggagtcaggtatttacgaagtctctgat 229  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||||||  |||||| || || |||||||||    
T  25468934 actaccaatggaccaacgaaagaaccatcaccgcctctacaccctctaaaaaggaggaaggtatgtatgaggtctctgat 25469013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 50 - 228
Target Start/End: Original strand, 22094774 - 22094952
Alignment:
Q  50 tatactactaagatgtctgttgatgcagccgtaggtggagcactaatgaataagaactacacggaggcttatgctttgattgaagatatggctcagaatc 149  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  22094774 tataccactaagatgtctgttgatgcagctgcaggtggagctctaatgaacaaaaactatacggaggcttatgctttgattgaggacatggctcaaaatc 22094873  T
Q  150 actaccaatggaccaacgaaagagccatcaccacctctacgccctccaaaaaggagtcaggtatttacgaagtctctga 228  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |||| ||||| || || ||| ||||||| ||| ||||||||||    
T  22094874 actaccaatggaccaacgagagagccgtcaccactcctactccctctaagaaagaggcaggtatatacaaagtctctga 22094952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 50 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 8327534 - 8327356
Alignment:
Q  50 tatactactaagatgtctgttgatgcagccgtaggtggagcactaatgaataagaactacacggaggcttatgctttgattgaagatatggctcagaatc 149  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||    
T  8327534 tataccactaaaatgtctgttgatgcagctgcaggtggagctctaatgaacaaaaactacacggaggcttacgctttgattgaggacatggctcaaaatc 8327435  T
Q  150 actaccaatggaccaacgaaagagccatcaccacctctacgccctccaaaaaggagtcaggtatttacgaagtctctga 228  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  |||||||  |||| ||||| || || ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  8327434 actatcaatggaccaacgaaagagcggtcaccactcctactccctctaagaaagaggcaggtatatacgaagtctctga 8327356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 50 - 228
Target Start/End: Original strand, 21822906 - 21823084
Alignment:
Q  50 tatactactaagatgtctgttgatgcagccgtaggtggagcactaatgaataagaactacacggaggcttatgctttgattgaagatatggctcagaatc 149  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  21822906 tataccactaagatgtctgttgatgcagctgcaggtggagctctaatgaacaaaaactatacggaggcttatgccttgattgaagacatggctcagaatc 21823005  T
Q  150 actaccaatggaccaacgaaagagccatcaccacctctacgccctccaaaaaggagtcaggtatttacgaagtctctga 228  Q
    | ||||||||||||||||| |||||| ||||| |  |||| ||||| || || ||| |||||||  |||||||||||||    
T  21823006 attaccaatggaccaacgagagagccgtcaccgctcctactccctctaagaaagaggcaggtatacacgaagtctctga 21823084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 50 - 228
Target Start/End: Original strand, 22827445 - 22827623
Alignment:
Q  50 tatactactaagatgtctgttgatgcagccgtaggtggagcactaatgaataagaactacacggaggcttatgctttgattgaagatatggctcagaatc 149  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||| | | ||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||||    
T  22827445 tataccactaagatgtttgttgatgcagctgcaagtggagctctaatgaacaagaactatacggaggcttacgctttgattgaagacatggcttaaaatc 22827544  T
Q  150 actaccaatggaccaacgaaagagccatcaccacctctacgccctccaaaaaggagtcaggtatttacgaagtctctga 228  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||| ||||| ||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  22827545 actatcaatggaccaacgagagagccatcaccgcttctacaccctctaaaaaagaggcagatatgtacgaagtctctga 22827623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 50 - 228
Target Start/End: Original strand, 21951601 - 21951779
Alignment:
Q  50 tatactactaagatgtctgttgatgcagccgtaggtggagcactaatgaataagaactacacggaggcttatgctttgattgaagatatggctcagaatc 149  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| | | | ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||    
T  21951601 tataccactaagatgtctgttgatgcagctgcatgaggagctctaatgaacaagaactatacagaggcttatgccctgattgaagacatggctcaaaatc 21951700  T
Q  150 actaccaatggaccaacgaaagagccatcaccacctctacgccctccaaaaaggagtcaggtatttacgaagtctctga 228  Q
    | ||||||||||||||||| |||||| ||||| |  |||| ||||| || || ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  21951701 attaccaatggaccaacgagagagccgtcaccgctcctactccctctaagaaagaggcaggtatatacgaagtctctga 21951779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 49 - 181
Target Start/End: Original strand, 22286536 - 22286668
Alignment:
Q  49 ttatactactaagatgtctgttgatgcagccgtaggtggagcactaatgaataagaactacacggaggcttatgctttgattgaagatatggctcagaat 148  Q
    |||||| |||||||||||| || ||||||| | ||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||    
T  22286536 ttataccactaagatgtctatttatgcagctgcaggtggagctctaatgaacaagaactatacggaggcttacgctttgattgaagacatggctcataat 22286635  T
Q  149 cactaccaatggaccaacgaaagagccatcacc 181  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| |||||||    
T  22286636 cactatcaatggaccaacgagagagtcatcacc 22286668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 50 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 22038202 - 22038024
Alignment:
Q  50 tatactactaagatgtctgttgatgcagccgtaggtggagcactaatgaataagaactacacggaggcttatgctttgattgaagatatggctcagaatc 149  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| | | ||||||| |||||||| || ||  | |||||||| ||| | || |||||||| |||||||||||||    
T  22038202 tataccactaagatgtctgttgatgcagctgcatgtggagctctaatgaacaaaaatcatacggaggcctattccttaattgaagacatggctcagaatc 22038103  T
Q  150 actaccaatggaccaacgaaagagccatcaccacctctacgccctccaaaaaggagtcaggtatttacgaagtctctga 228  Q
    | ||||||||||||||||| |||||| ||||| |  |||| ||||| || || ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  22038102 attaccaatggaccaacgagagagccgtcaccgctcctactccctctaagaaagaggcaggtatatacgaagtctctga 22038024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0759 (Bit Score: 128; Significance: 3e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0759
Description:

Target: scaffold0759; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 50 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 917 - 742
Alignment:
Q  50 tatactactaagatgtctgttgatgcagccgtaggtggagcactaatgaataagaactacacggaggcttatgctttgattgaagatatggctcagaatc 149  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  917 tataccactaagatgtctgttgatgcagctgcaggtggagcactaatgaataagaactacacggaggcttatgctttgattgaagacatggctctgaatc 818  T
Q  150 actaccaatggaccaacgaaagagccatcaccacctctacgccctccaaaaaggagtcaggtatttacgaagtctc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||||| ||||||| ||||| |||||    
T  817 actaccaatggaccaacgaaagagccattaccgcctctactccatccaaaaaggaggcaggtatgtacgaggtctc 742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 8)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 49 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 52952494 - 52952315
Alignment:
Q  49 ttatactactaagatgtctgttgatgcagccgtaggtggagcactaatgaataagaactacacggaggcttatgctttgattgaagatatggctcagaat 148  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| | ||||||||||    
T  52952494 ttatactactaagatgtctgttgatgcagctgcaggtggagcactaatgaataagaattatacggaggcttacgcattgattgaagaca-ggctcagaat 52952396  T
Q  149 cactaccaatggaccaacgaaagagccatcaccacctctacgccctccaaaaaggagtcaggtatttacgaagtctctgat 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||    
T  52952395 cactaccaatggaccaacgaaagagccatcaccgcctctacgccctccaaaaaggaggtaggtatgtacgaggtctctgat 52952315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 50 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 8952119 - 8951941
Alignment:
Q  50 tatactactaagatgtctgttgatgcagccgtaggtggagcactaatgaataagaactacacggaggcttatgctttgattgaagatatggctcagaatc 149  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| |||| ||||||||||   | ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  8952119 tataccactaagatgtatgttgattcagctgtaggtggagtcttgatgaacaagaactatacggaggcttacgctttgattgaagacatggctcagaatc 8952020  T
Q  150 actaccaatggaccaacgaaagagccatcaccacctctacgccctccaaaaaggagtcaggtatttacgaagtctctga 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  8952019 actaccaatggaccaacgaaagagccatcaccgcctctacaccctctaaaaaggaggcaggtatgtacgaagtctctga 8951941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 50 - 228
Target Start/End: Original strand, 22843255 - 22843433
Alignment:
Q  50 tatactactaagatgtctgttgatgcagccgtaggtggagcactaatgaataagaactacacggaggcttatgctttgattgaagatatggctcagaatc 149  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  22843255 tataccactaagatgtctgttgatgcagctgcaggtggagctctaatgaacaaaaactacacggaggcttatgctttgattgaggacatggctcaaaatc 22843354  T
Q  150 actaccaatggaccaacgaaagagccatcaccacctctacgccctccaaaaaggagtcaggtatttacgaagtctctga 228  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||  |||| ||||| || || ||| |||||||  |||||||||||||    
T  22843355 actatcaatggaccaacgaaagagccgtcaccactcctactccctctaagaaagaggcaggtatacacgaagtctctga 22843433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 58 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 21803378 - 21803208
Alignment:
Q  58 taagatgtctgttgatgcagccgtaggtggagcactaatgaataagaactacacggaggcttatgctttgattgaagatatggctcagaatcactaccaa 157  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  21803378 taagatgtctgttgatgcagctgcaggtggagctctaatgaacaaaaactacacggaggcttatgctttgattgaggacatggctcagaatcattaccaa 21803279  T
Q  158 tggaccaacgaaagagccatcaccacctctacgccctccaaaaaggagtcaggtatttacgaagtctctga 228  Q
    |||||||||||||||||| |||||||  |||| ||||| || || |||  ||||||  |||||||||||||    
T  21803278 tggaccaacgaaagagccgtcaccactcctactccctctaagaaagaggtaggtatacacgaagtctctga 21803208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 50 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 19786801 - 19786626
Alignment:
Q  50 tatactactaagatgtctgttgatgcagccgtaggtggagcactaatgaataagaactacacggaggcttatgctttgattgaagatatggctcagaatc 149  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||   |||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||  | ||||||||||| || |||||||| ||||    
T  19786801 tataccactaagatgtctattgatgcag---taggtggagctctaatgaactagaactatacggaggcgcacgctttgattgaggacatggctcaaaatc 19786705  T
Q  150 actaccaatggaccaacgaaagagccatcaccacctctacgccctccaaaaaggagtcaggtatttacgaagtctctga 228  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  19786704 actatcaatggaccaacgagagagccatcaccacttctacaccctctaaaaaagaggcagctatgtacgaagtctctga 19786626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 50 - 228
Target Start/End: Original strand, 20233052 - 20233230
Alignment:
Q  50 tatactactaagatgtctgttgatgcagccgtaggtggagcactaatgaataagaactacacggaggcttatgctttgattgaagatatggctcagaatc 149  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||| |  |||||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  20233052 tataccactaagatgtctgttgatgtagctgctggtggagctctaatgaacaaaaactatacggaggcctatgccttgattgaagacatggctcagaatc 20233151  T
Q  150 actaccaatggaccaacgaaagagccatcaccacctctacgccctccaaaaaggagtcaggtatttacgaagtctctga 228  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||  |   ||| ||||| || || ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  20233152 attaccaatggaccaacgagagagccatcactgctcttactccctctaagaaagaggcaggtatatacgaagtctctga 20233230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 50 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 19878639 - 19878540
Alignment:
Q  50 tatactactaagatgtctgttgatgcagccgtaggtggagcactaatgaataagaactacacggaggcttatgctttgattgaagatatggctcagaatc 149  Q
    ||||| |||| ||||| |||||||||||| | ||||||| | |||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||| |  ||||||||||||    
T  19878639 tataccactatgatgtttgttgatgcagctgcaggtggatctctaatgaacaagaactatacggaggcatacgctttgattgaaaacttggctcagaatc 19878540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 185 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 22467533 - 22467489
Alignment:
Q  185 tctacgccctccaaaaaggagtcaggtatttacgaagtctctgat 229  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||    
T  22467533 tctacaccctccaaaaaggaggcaggtatgtacgaggtctctgat 22467489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 16)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 50 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 13201365 - 13201190
Alignment:
Q  50 tatactactaagatgtctgttgatgcagccgtaggtggagcactaatgaataagaactacacggaggcttatgctttgattgaagatatggctcagaatc 149  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| |||||||||||||    
T  13201365 tataccactaagatgtctgttgatgcagctgcaggtggagcactaatgaacaagaactatacggaggcttacacattgattgaagacatggctcagaatc 13201266  T
Q  150 actaccaatggaccaacgaaagagccatcaccacctctacgccctccaaaaaggagtcaggtatttacgaagtctc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  13201265 actaccaatggaccaacgaaagagccatcaccacctctacactctccaaaaaggaggcaggtatgtacgaattctc 13201190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 50 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 14455688 - 14455509
Alignment:
Q  50 tatactactaagatgtctgttgatgcagccgtaggtggagcactaatgaataagaactacacggaggcttatgctttgattgaagatatggctcagaatc 149  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||  | ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||    
T  14455688 tataccactaagatgtctgttgatgcagctgcaggtggagccttgatgaacaagaactacacggaggcttacgcattgattgaagacatggctcataatc 14455589  T
Q  150 actaccaatggaccaacgaaagagccatcaccacctctacgccctccaaaaaggagtcaggtatttacgaagtctctgat 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||    
T  14455588 actaccaatggaccaacgaaagagccatcaccgtctctacaccctccaaaaaggaggcagatatgtacgaggtctctgat 14455509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 50 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 14070243 - 14070065
Alignment:
Q  50 tatactactaagatgtctgttgatgcagccgtaggtggagcactaatgaataagaactacacggaggcttatgctttgattgaagatatggctcagaatc 149  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||    
T  14070243 tataccactaagatgtctgttgatgcagctgcaggtggagctctaatgaacaagaactatacggaggcttacgctttgattgaagacatggctaagaatc 14070144  T
Q  150 actaccaatggaccaacgaaagagccatcaccacctctacgccctccaaaaaggagtcaggtatttacgaagtctctga 228  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||| ||||| |||  |||||| ||||||||||||||    
T  14070143 actatcaatggaccaacgagagagccatcaccgcttctacaccctctaaaaaagaggaaggtatgtacgaagtctctga 14070065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 49 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 10164865 - 10164686
Alignment:
Q  49 ttatactactaagatgtctgttgatgcagccgtaggtggagcactaatgaataagaactacacggaggcttatgctttgattgaagatatggctcagaat 148  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  10164865 ttataccactaagatgtctgttgatgcagctgcaggtggagctctaatgatcaaaaactacacggaggcttatgctttgattgaggacatggctcagaat 10164766  T
Q  149 cactaccaatggaccaacgaaagagccatcaccacctctacgccctccaaaaaggagtcaggtatttacgaagtctctga 228  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  |||| ||||| || || ||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  10164765 cactatcaatggaccaacgaaagagccgtcaccactcctactccctctaagaaagaggcagatatatacgaagtctctga 10164686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 49 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 13140863 - 13140684
Alignment:
Q  49 ttatactactaagatgtctgttgatgcagccgtaggtggagcactaatgaataagaactacacggaggcttatgctttgattgaagatatggctcagaat 148  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13140863 ttataccactaagatgtctgttgatgcagctgcaggtggagctctaatgaacaaaaactacacggaggcttatgctttgattgaagacatggctcagaat 13140764  T
Q  149 cactaccaatggaccaacgaaagagccatcaccacctctacgccctccaaaaaggagtcaggtatttacgaagtctctga 228  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| || |||||||  |||| ||||| || || ||| ||||||| || |||||||||||    
T  13140763 cactactaatggaccaacgagagaaccgtcaccactcctactccctctaagaaagaggcaggtatatatgaagtctctga 13140684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 49 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 13192079 - 13191900
Alignment:
Q  49 ttatactactaagatgtctgttgatgcagccgtaggtggagcactaatgaataagaactacacggaggcttatgctttgattgaagatatggctcagaat 148  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||    
T  13192079 ttataccactaaaatgtctgttgatgcagctgcaggtggagcactaatgaacaaaaactacacggaggcttacgctttgattgaggacatggctcaaaat 13191980  T
Q  149 cactaccaatggaccaacgaaagagccatcaccacctctacgccctccaaaaaggagtcaggtatttacgaagtctctga 228  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  |||| ||||| || || ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  13191979 cactatcaatggaccaacgaaagagccgtcaccactcctactccctctaagaaagaggcaggtatatacgaagtctctga 13191900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 50 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 11879026 - 11878848
Alignment:
Q  50 tatactactaagatgtctgttgatgcagccgtaggtggagcactaatgaataagaactacacggaggcttatgctttgattgaagatatggctcagaatc 149  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  11879026 tataccactaagatgtctgttgatgcagctgcaggtggagctctaatgaacaaaaactacacggaggcttatgctttgattgaggacatggctcaaaatc 11878927  T
Q  150 actaccaatggaccaacgaaagagccatcaccacctctacgccctccaaaaaggagtcaggtatttacgaagtctctga 228  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||  |||| ||||| || || ||| |||||||  |||||||||||||    
T  11878926 actatcaatggaccaacgaaagagccgtcaccactcctactccctctaagaaagaggcaggtatacacgaagtctctga 11878848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 49 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 12198156 - 12197977
Alignment:
Q  49 ttatactactaagatgtctgttgatgcagccgtaggtggagcactaatgaataagaactacacggaggcttatgctttgattgaagatatggctcagaat 148  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||    
T  12198156 ttataccactaaaatgtctgttgatgcagctgcaggtggagcactaatgaacaaaaactacacggaggcttacgctttgattgaggacatggctcaaaat 12198057  T
Q  149 cactaccaatggaccaacgaaagagccatcaccacctctacgccctccaaaaaggagtcaggtatttacgaagtctctga 228  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||| |||||||  |||| ||||| || || ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  12198056 cactatcaatggcccaacgaaagagccgtcaccactcctactccctctaagaaagaggcaggtatatacgaagtctctga 12197977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 50 - 228
Target Start/End: Original strand, 15640607 - 15640785
Alignment:
Q  50 tatactactaagatgtctgttgatgcagccgtaggtggagcactaatgaataagaactacacggaggcttatgctttgattgaagatatggctcagaatc 149  Q
    ||||| |||||||||| ||| |||||||| | ||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  15640607 tataccactaagatgtttgtcgatgcagctgcaggtggagctctaatgaacaaaaactacacggaggcttatgctttgattgaggacatggctcagaatc 15640706  T
Q  150 actaccaatggaccaacgaaagagccatcaccacctctacgccctccaaaaaggagtcaggtatttacgaagtctctga 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||  |||| ||||| || || ||| |||||||  |||||||||||||    
T  15640707 actaccaatggaccaacgaaagagctgtcaccactcctactccctctaagaaagaggcaggtatacacgaagtctctga 15640785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 49 - 228
Target Start/End: Original strand, 10142590 - 10142769
Alignment:
Q  49 ttatactactaagatgtctgttgatgcagccgtaggtggagcactaatgaataagaactacacggaggcttatgctttgattgaagatatggctcagaat 148  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||    
T  10142590 ttataccactaaaatgtctgttgatgcagctgcaggtggagctctaatgaacaaaaactacacggaggcttacgctttgattgaggacatggctcaaaat 10142689  T
Q  149 cactaccaatggaccaacgaaagagccatcaccacctctacgccctccaaaaaggagtcaggtatttacgaagtctctga 228  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||  |||| ||||| || || ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  10142690 cactatcaatggaccaacgaaagagccgtcacaactcctactccctctaagaaagaggcaggtatatacgaagtctctga 10142769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 49 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 12191512 - 12191333
Alignment:
Q  49 ttatactactaagatgtctgttgatgcagccgtaggtggagcactaatgaataagaactacacggaggcttatgctttgattgaagatatggctcagaat 148  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||| |||    
T  12191512 ttataccactaaaatgtctgttgatgcagctgcaggtggagctctaatgaacaaaaactacacggaggcttacgctttgattgaggacatgactcaaaat 12191413  T
Q  149 cactaccaatggaccaacgaaagagccatcaccacctctacgccctccaaaaaggagtcaggtatttacgaagtctctga 228  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  |||| ||||| || || ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  12191412 cactatcaatggaccaacgaaagagccgtcaccactcctactccctctaagaaagaggcaggtatatacgaagtctctga 12191333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 49 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 15633597 - 15633418
Alignment:
Q  49 ttatactactaagatgtctgttgatgcagccgtaggtggagcactaatgaataagaactacacggaggcttatgctttgattgaagatatggctcagaat 148  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||| | ||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  15633597 ttataccactaagatgtttgttgatgcagctgcaggtggagctcttatgaacaaaaactacacggaggcttatgctttgattgaagacatggcttagaat 15633498  T
Q  149 cactaccaatggaccaacgaaagagccatcaccacctctacgccctccaaaaaggagtcaggtatttacgaagtctctga 228  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| |||||||  |||| ||||| || || ||| ||||||| || |||||||||||    
T  15633497 cactaccaatggaccaacaagagagccgtcaccactcctactccctctaagaaagaggcaggtatatatgaagtctctga 15633418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 50 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 13511046 - 13510868
Alignment:
Q  50 tatactactaagatgtctgttgatgcagccgtaggtggagcactaatgaataagaactacacggaggcttatgctttgattgaagatatggctcagaatc 149  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||  |||    
T  13511046 tataccactaagatgtctgttgatgcagctgcaggtggagctctaatgaacaaaaactatacggaggcttatgacttgattgaagacatggctcaatatc 13510947  T
Q  150 actaccaatggaccaacgaaagagccatcaccacctctacgccctccaaaaaggagtcaggtatttacgaagtctctga 228  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| |||||||  |||| ||||| || || ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  13510946 actatcaatggaccaacgagagagccgtcaccactcctactccctctaagaaagaggcaggtatatacgaagtctctga 13510868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 50 - 229
Target Start/End: Original strand, 13666559 - 13666738
Alignment:
Q  50 tatactactaagatgtctgttgatgcagccgtaggtggagcactaatgaataagaactacacggaggcttatgctttgattgaagatatggctcagaatc 149  Q
    ||||| |||||||||| |||||| | ||| |||||||||||  | ||||| |||||| | ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||    
T  13666559 tataccactaagatgtttgttgaggtagctgtaggtggagccttgatgaacaagaacaatacggaggcttacgcattaattgaagacatggctcagaatc 13666658  T
Q  150 actaccaatggaccaacgaaagagccatcaccacctctacgccctccaaaaaggagtcaggtatttacgaagtctctgat 229  Q
    ||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||    
T  13666659 acagccaatggaccaacgaaaaagccatcaccgcctctacactctccaaaaaggaggcaggaatttacgaggtctctgat 13666738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 50 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 12159493 - 12159423
Alignment:
Q  50 tatactactaagatgtctgttgatgcagccgtaggtggagcactaatgaataagaactacacggaggctta 120  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  12159493 tataccactaagatgtctgttgatgcagctgcaggtggagcactaatgaacaagaactatacggaggctta 12159423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 50 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 592 - 537
Alignment:
Q  50 tatactactaagatgtctgttgatgcagccgtaggtggagcactaatgaataagaa 105  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||    
T  592 tataccactaagatgtctgttgatgcagctgcaggtggagcagtaatgaacaagaa 537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 49 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 368048 - 367868
Alignment:
Q  49 ttatactactaagatgtctgttgatgcagccgtaggtggagcactaatgaataagaactacacggaggcttatgctttgattgaagatatggctcagaat 148  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||  | ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||    
T  368048 ttataccactaagatgtctgttgatgcagctgcaggtggagccttgatgaacaagaactatacggaggcttacgcattgattgaagacatggctcagaat 367949  T
Q  149 cactaccaatggaccaacgaaagagccatcaccacctctacgccctccaaaaaggagtcaggtatttacgaagtctctgat 229  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||    
T  367948 cattaccaatggaccaacgaaagagccatcaccgcctctacgccctccaaaaaggaggcaggtatgtacgaggtctctgat 367868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1102 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold1102
Description:

Target: scaffold1102; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 50 - 225
Target Start/End: Original strand, 91 - 266
Alignment:
Q  50 tatactactaagatgtctgttgatgcagccgtaggtggagcactaatgaataagaactacacggaggcttatgctttgattgaagatatggctcagaatc 149  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||    
T  91 tatactactaagatgtcggttgatgcagctgtaggtggagaactaatgaataagaactatacggaggcttacgcgttgattgaagacatggctgagaatc 190  T
Q  150 actaccaatggaccaacgaaagagccatcaccacctctacgccctccaaaaaggagtcaggtatttacgaagtctc 225  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| || |||| ||||| |||||    
T  191 agtaccaatggaccaacgaaagagccatcaccgcctctgctccctccaaaaaggaggcaagtatgtacgaggtctc 266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 12)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 49 - 228
Target Start/End: Original strand, 27619098 - 27619277
Alignment:
Q  49 ttatactactaagatgtctgttgatgcagccgtaggtggagcactaatgaataagaactacacggaggcttatgctttgattgaagatatggctcagaat 148  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27619098 ttataccactaagatgtctgttgatgcagctgcaggtggagctctaatgaacaaaaactacacggaggcttatgctttgattgaagacatggctcagaat 27619197  T
Q  149 cactaccaatggaccaacgaaagagccatcaccacctctacgccctccaaaaaggagtcaggtatttacgaagtctctga 228  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |||| ||||| || || ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  27619198 cactaccaatggaccaacgagagagccgtcaccactcctactccctctaagaaagaggcaggtatatacgaagtctctga 27619277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 50 - 228
Target Start/End: Original strand, 113040 - 113218
Alignment:
Q  50 tatactactaagatgtctgttgatgcagccgtaggtggagcactaatgaataagaactacacggaggcttatgctttgattgaagatatggctcagaatc 149  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  113040 tataccactaagatgtctgttgatgcagctgcaggtggagctctaatgaacaaaaactatacggaggcttatgctttgattgaagacatggctcagaatc 113139  T
Q  150 actaccaatggaccaacgaaagagccatcaccacctctacgccctccaaaaaggagtcaggtatttacgaagtctctga 228  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |||| ||||| || || ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  113140 actaccaatggaccaacgagagagccgtcaccactcctactccctctaagaaagaggcaggtatatacgaagtctctga 113218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 50 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 22049353 - 22049175
Alignment:
Q  50 tatactactaagatgtctgttgatgcagccgtaggtggagcactaatgaataagaactacacggaggcttatgctttgattgaagatatggctcagaatc 149  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  22049353 tataccactaagatgtctgttgatgcagctgcaggtggagctctaatgaacaaaaactacacggaggcttatgctttgattgaggacatggctcagaatc 22049254  T
Q  150 actaccaatggaccaacgaaagagccatcaccacctctacgccctccaaaaaggagtcaggtatttacgaagtctctga 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||| ||||| || || ||| |||||||  |||||||||||||    
T  22049253 actaccaatggaccaacgaaagagccgtcaccactcctactccctctaagaaagaggcaggtatacacgaagtctctga 22049175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 50 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 24800022 - 24799844
Alignment:
Q  50 tatactactaagatgtctgttgatgcagccgtaggtggagcactaatgaataagaactacacggaggcttatgctttgattgaagatatggctcagaatc 149  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  24800022 tataccactaagatgtctgttgatgcagctgcaggtggagctctaatgaacaaaaactacacggaggcttatgctttgattgaggacatggctcagaatc 24799923  T
Q  150 actaccaatggaccaacgaaagagccatcaccacctctacgccctccaaaaaggagtcaggtatttacgaagtctctga 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||| ||||| || || ||| |||||||  |||||||||||||    
T  24799922 actaccaatggaccaacgaaagagccgtcaccactcctactccctctaagaaagaggcaggtatacacgaagtctctga 24799844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 50 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 18992994 - 18992815
Alignment:
Q  50 tatactactaagatgtctgttgatgcagccgtaggtggagcactaatgaataagaactacacggaggcttatgctttgattgaagatatggctcagaatc 149  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||| | ||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  18992994 tataccactaagatgtctattgatgcagctgcaggtggagccctaatgaacaagaactatacggaggcttacgctttgattgaagacatggctcataatc 18992895  T
Q  150 actaccaatggaccaacgaaagagccatcaccacctctacgccctccaaaaaggagtcaggtatttacgaagtctctgat 229  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||| ||||    
T  18992894 actaccaatggaccaacgagagagccatcactacttctacaccctctaaaaaagaggcaggtatgtacgaagtctttgat 18992815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 50 - 228
Target Start/End: Original strand, 27623126 - 27623304
Alignment:
Q  50 tatactactaagatgtctgttgatgcagccgtaggtggagcactaatgaataagaactacacggaggcttatgctttgattgaagatatggctcagaatc 149  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  27623126 tataccactaagatgtctgttgatgcagctgcaggtggagctctaatgaacaaaaactacacggaagcttatgctttgattgaggacatggctcagaatc 27623225  T
Q  150 actaccaatggaccaacgaaagagccatcaccacctctacgccctccaaaaaggagtcaggtatttacgaagtctctga 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||| ||||| || || ||| |||||||  |||||||||||||    
T  27623226 actaccaatggaccaacgaaagagccgtcaccactcctactccctctaagaaagaggcaggtatacacgaagtctctga 27623304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 50 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 25137799 - 25137621
Alignment:
Q  50 tatactactaagatgtctgttgatgcagccgtaggtggagcactaatgaataagaactacacggaggcttatgctttgattgaagatatggctcagaatc 149  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  25137799 tataccactaagatgtctattgatgcagctgtaggaggagctctaatgaataagaactatacggaggcttacgcttggattgaagacatggctcagaatc 25137700  T
Q  150 actaccaatggaccaacgaaagagccatcaccacctctacgccctccaaaaaggagtcaggtatttacgaagtctctga 228  Q
    |||| |||||||||||||| |||| ||||||  ||||||| ||||| || || ||| ||||||| || |||||||||||    
T  25137699 actatcaatggaccaacgagagaggcatcactgcctctacaccctctaagaaagaggcaggtatgtatgaagtctctga 25137621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 50 - 224
Target Start/End: Original strand, 16771180 - 16771354
Alignment:
Q  50 tatactactaagatgtctgttgatgcagccgtaggtggagcactaatgaataagaactacacggaggcttatgctttgattgaagatatggctcagaatc 149  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||    
T  16771180 tataccactaaaatgtctgttgatgcagctgcaggtggagctctaatgaacaaaaactacacggaggcttatgctttgattgaggacatgggtcaaaatc 16771279  T
Q  150 actaccaatggaccaacgaaagagccatcaccacctctacgccctccaaaaaggagtcaggtatttacgaagtct 224  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||  |||| ||||| || || ||| |||||||  |||||||||    
T  16771280 actatcaatggaccaacgaaagagccgtcaccactcctactccctctaagaaagaggcaggtatacacgaagtct 16771354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 49 - 226
Target Start/End: Original strand, 22289748 - 22289925
Alignment:
Q  49 ttatactactaagatgtctgttgatgcagccgtaggtggagcactaatgaataagaactacacggaggcttatgctttgattgaagatatggctcagaat 148  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| | ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||    
T  22289748 ttataccactaagatgtctgttgatgcagctgcaggtggagctctaatggacaagaactacacagaggcttacgccttgatagaagacatggctcagaat 22289847  T
Q  149 cactaccaatggaccaacgaaagagccatcaccacctctacgccctccaaaaaggagtcaggtatttacgaagtctct 226  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||    ||  ||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  22289848 cattaccaatggaccaatgaaagagccatcaccgcttccgtacctcccaaaaaggaggcaggtatgtacgaagtctct 22289925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 50 - 228
Target Start/End: Original strand, 23013443 - 23013620
Alignment:
Q  50 tatactactaagatgtctgttgatgcagccgtaggtggagcactaatgaataagaactacacggaggcttatgctttgattgaagatatggctcagaatc 149  Q
    ||||| |||||||||| |||||| | ||| | | ||||||| |||||||| |||||||| | | ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  23013443 tataccactaagatgtttgttgacgtagctgcaagtggagccctaatgaacaagaactataag-aggcttacgctttgatagaagacatggctcagaatc 23013541  T
Q  150 actaccaatggaccaacgaaagagccatcaccacctctacgccctccaaaaaggagtcaggtatttacgaagtctctga 228  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  23013542 actaccaattgaccaacgagagagccatcacgacttctacaccctctagaaaagagtcaggtatgtacgaagtctctga 23013620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 50 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 24176243 - 24176080
Alignment:
Q  50 tatactactaagatgtctgttgatgcagccgtaggtggagcactaatgaataagaactacacggaggcttatgctttgattgaagatatggctcagaatc 149  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||| | ||||||||| |||||||| |||||||| || ||||  |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  24176243 tataccactaagatgattgttgatgcagctgcaggtggagctctaatgaacaagaactatacagaggtgtatgctttgattgaggacatggctcagaatc 24176144  T
Q  150 actaccaatggaccaacgaaagagccatcaccacctctacgccctccaaaaaggagtcaggtat 213  Q
    ||   |||||||||| ||| |||||||||||  | ||| | ||||| ||||| ||| |||||||    
T  24176143 accgtcaatggaccagcgagagagccatcacagcttcttcaccctctaaaaaagaggcaggtat 24176080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 119 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 21515163 - 21515104
Alignment:
Q  119 tatgctttgattgaagatatggctcagaatcactaccaatggaccaacgaaagagccatc 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  || |||||||||    
T  21515163 tatgctttgattgaagatatggctcaaaatcactaccagtggaccagtgagagagccatc 21515104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0112 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0112
Description:

Target: scaffold0112; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 50 - 228
Target Start/End: Original strand, 6831 - 7009
Alignment:
Q  50 tatactactaagatgtctgttgatgcagccgtaggtggagcactaatgaataagaactacacggaggcttatgctttgattgaagatatggctcagaatc 149  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  6831 tataccactaagatgtctgttgatgcagctgcaggtggagctctaatgaacaaaaactacacggaggcttatgctttgattgaggacatggctcagaatc 6930  T
Q  150 actaccaatggaccaacgaaagagccatcaccacctctacgccctccaaaaaggagtcaggtatttacgaagtctctga 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||| ||||| || || ||| |||||||  |||||||||||||    
T  6931 actaccaatggaccaacgaaagagccgtcaccactcctactccctctaagaaagaggcaggtatacacgaagtctctga 7009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0164 (Bit Score: 103; Significance: 3e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0164
Description:

Target: scaffold0164; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 50 - 228
Target Start/End: Original strand, 35006 - 35184
Alignment:
Q  50 tatactactaagatgtctgttgatgcagccgtaggtggagcactaatgaataagaactacacggaggcttatgctttgattgaagatatggctcagaatc 149  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| | || |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  35006 tataccactaagatgtctgttgatgcagctgcagatggagctctaatgaataaaaactatacggaggcttatgctttgattgaagacatggctcagaatc 35105  T
Q  150 actaccaatggaccaacgaaagagccatcaccacctctacgccctccaaaaaggagtcaggtatttacgaagtctctga 228  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||| |  |||| ||||| || || ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  35106 actaccaatggaccaacgagagagccgtcaccgctcctactccctctaagaaagaggcaggtatatacgaagtctctga 35184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 50 - 226
Target Start/End: Original strand, 25370 - 25549
Alignment:
Q  50 tatactactaagatgtctgttgatgcagccgtaggtggagcactaatgaataagaactacacggaggcttat---gctttgattgaagatatggctcaga 146  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||    |||||||||||||| ||||||||||    
T  25370 tataccactaagatgtctgttgatgcagctgtaggtggagctctaatgaaaaagaactatacggaggcttactacgctttgattgaagacatggctcaga 25469  T
Q  147 atcactaccaatggaccaacgaaagagccatcaccacctctacgccctccaaaaaggagtcaggtatttacgaagtctct 226  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||    
T  25470 atcactatcaatggaccaacgagagatccatcaccacttctacaccctctaaaaaagaggcaggtatgtacgaagtctct 25549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 94; Significance: 6e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 65 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 55246 - 55085
Alignment:
Q  65 tctgttgatgcagccgtaggtggagcactaatgaataagaactacacggaggcttatgctttgattgaagatatggctcagaatcactaccaatggacca 164  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  | ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  55246 tctgttgatgcagctgcaggtggagccttgatgaacaagaactatacggaggcttacgctttgattgaagacatggctcagaatcactaccaatggacca 55147  T
Q  165 acgaaagagccatcaccacctctacgccctccaaaaaggagtcaggtatttacgaagtctct 226  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||| ||| ||||||| ||||| ||||||    
T  55146 acgaaagagccatcaccgcctctacaccctctagaaaagaggcaggtatgtacgaggtctct 55085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 50 - 228
Target Start/End: Original strand, 26033 - 26211
Alignment:
Q  50 tatactactaagatgtctgttgatgcagccgtaggtggagcactaatgaataagaactacacggaggcttatgctttgattgaagatatggctcagaatc 149  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||| || | ||| ||||| |||||||| || || || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  26033 tataccactaagatgtctattgatgctgctgcaggcggagctctaatgaacaaaaattatacggaggcttatgccttgattgaagacatggctcagaatc 26132  T
Q  150 actaccaatggaccaacgaaagagccatcaccacctctacgccctccaaaaaggagtcaggtatttacgaagtctctga 228  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||| | ||||| ||||| || || ||| |||| || ||||||||||||||    
T  26133 actaccaatggaccaacgagagagccgtcaccgcttctactccctctaagaaagaggcaggcatatacgaagtctctga 26211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 110 - 225
Target Start/End: Original strand, 5687 - 5802
Alignment:
Q  110 acggaggcttatgctttgattgaagatatggctcagaatcactaccaatggaccaacgaaagagccatcaccacctctacgccctccaaaaaggagtcag 209  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||    
T  5687 acggaggcttacgcattgattgaagacatggctcagaatcactatcaatggaccaacgaaagagccatcaccgcctctacaccctccaaaaaggaggcag 5786  T
Q  210 gtatttacgaagtctc 225  Q
    |||| ||||| |||||    
T  5787 gtatgtacgaggtctc 5802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1092 (Bit Score: 77; Significance: 9e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold1092
Description:

Target: scaffold1092; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 50 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 251 - 75
Alignment:
Q  50 tatactactaagatgtctgttgatgcagccgtaggtggagcactaatgaataagaactacacggaggcttatgctttgattgaagatatggctcagaatc 149  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||||||||||| || ||| |||||||||    
T  251 tataccactaagatgactgttgatgcagctgcaggtggagctctaatgaacaagaattatacagaggcatacgctttgattgaggacatgactcagaatc 152  T
Q  150 actaccaatggaccaacgaaagagccatcaccacctctacgccctccaaaaaggagtcaggtatttacgaagtctct 226  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||   ||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||    
T  151 actatcaatggaccaacgagagagccatcactacttctttaccctctaaaaaagaggcaggtatgtacgaagtctct 75  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1058 (Bit Score: 77; Significance: 9e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold1058
Description:

Target: scaffold1058; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 50 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 1628 - 1452
Alignment:
Q  50 tatactactaagatgtctgttgatgcagccgtaggtggagcactaatgaataagaactacacggaggcttatgctttgattgaagatatggctcagaatc 149  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||||||||||| || ||| |||||||||    
T  1628 tataccactaagatgactgttgatgcagctgcaggtggagctctaatgaacaagaattatacagaggcatacgctttgattgaggacatgactcagaatc 1529  T
Q  150 actaccaatggaccaacgaaagagccatcaccacctctacgccctccaaaaaggagtcaggtatttacgaagtctct 226  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||   ||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||    
T  1528 actatcaatggaccaacgagagagccatcactacttctttaccctctaaaaaagaggcaggtatgtacgaagtctct 1452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1589 (Bit Score: 76; Significance: 4e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold1589
Description:

Target: scaffold1589; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 114 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 1192 - 1077
Alignment:
Q  114 aggcttatgctttgattgaagatatggctcagaatcactaccaatggaccaacgaaagagccatcaccacctctacgccctccaaaaaggagtcaggtat 213  Q
    ||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  1192 aggcttacgcattaattgaagacatggctcagaatcactaccaatggaccaacgaaagagccatcaccgcttctacaccctccaaaaaggaggcaggtat 1093  T
Q  214 ttacgaagtctctgat 229  Q
     ||||| |||||||||    
T  1092 gtacgaggtctctgat 1077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0381 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0381
Description:

Target: scaffold0381; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 50 - 147
Target Start/End: Original strand, 16650 - 16747
Alignment:
Q  50 tatactactaagatgtctgttgatgcagccgtaggtggagcactaatgaataagaactacacggaggcttatgctttgattgaagatatggctcagaa 147  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  16650 tataccactaagatgtctgttgatgcagctgcaggtggagcactaatgaacaagaattatacggaggcttacgcattgattgaagatatggctcagaa 16747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 52; Significance: 7e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 67 - 226
Target Start/End: Original strand, 23135 - 23294
Alignment:
Q  67 tgttgatgcagccgtaggtggagcactaatgaataagaactacacggaggcttatgctttgattgaagatatggctcagaatcactaccaatggaccaac 166  Q
    |||||||||||  | |||||||||  ||||||| |||||||| || |  || |||||||||||| | |||||||| ||||||||||| || ||||| |||    
T  23135 tgttgatgcagttgcaggtggagctttaatgaacaagaactataccgcagcatatgctttgattaaggatatggcccagaatcactatcagtggactaac 23234  T
Q  167 gaaagagccatcaccacctctacgccctccaaaaaggagtcaggtatttacgaagtctct 226  Q
    || |||||||||||  | ||| | |||| |||||| ||| ||||||| ||||||||||||    
T  23235 gagagagccatcactgcttcttcacccttcaaaaaagaggcaggtatgtacgaagtctct 23294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 47; Significance: 7e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 119 - 229
Target Start/End: Original strand, 1 - 111
Alignment:
Q  119 tatgctttgattgaagatatggctcagaatcactaccaatggaccaacgaaagagccatcaccacctctacgccctccaaaaaggagtcaggtatttacg 218  Q
    ||||| ||||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| |  |||| ||||| || || ||| ||||||| ||||    
T  1 tatgccttgattgaagacatggcctagaatcattaccaatggaccaacgagagagccgtcaccgctcctactccctctaagaaagaggcaggtatatacg 100  T
Q  219 aagtctctgat 229  Q
    |||||||||||    
T  101 aagtctctgat 111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0054
Description:

Target: scaffold0054; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 120
Target Start/End: Original strand, 62257 - 62327
Alignment:
Q  50 tatactactaagatgtctgttgatgcagccgtaggtggagcactaatgaataagaactacacggaggctta 120  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||    
T  62257 tataccactaagatgtctgttgatgcagctgcaggtggagctctaatgaacaaaaactatacggaggctta 62327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 50 - 90
Target Start/End: Original strand, 48590 - 48630
Alignment:
Q  50 tatactactaagatgtctgttgatgcagccgtaggtggagc 90  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  48590 tataccactaagatgtctgttgatgcagctgcaggtggagc 48630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 67 - 111
Target Start/End: Original strand, 169717 - 169761
Alignment:
Q  67 tgttgatgcagccgtaggtggagcactaatgaataagaactacac 111  Q
    |||||||||||| | |||||||||  |||||||||||||||||||    
T  169717 tgttgatgcagctgcaggtggagctttaatgaataagaactacac 169761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 1606 times since January 2019
Visitors: 4425