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Alignment Overview

Query: NF0707_1D_low_46 (Length: 213)

Name: NF0707_1D_low_46
Description: NF0707_1D
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0707_1D_low_46
NF0707_1D_low_46
[»] chr3 (99 HSPs)
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chr3 (40-176)||(52674099-52674237)
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chr3 (40-133)||(50738969-50739065)
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chr3 (67-159)||(5239408-5239500)
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chr3 (114-176)||(35907023-35907085)
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chr3 (55-113)||(38361585-38361643)
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chr3 (125-176)||(42618159-42618210)
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chr3 (110-138)||(22476250-22476278)
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[»] chr8 (86 HSPs)
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chr8 (110-138)||(44384626-44384654)
[»] chr7 (79 HSPs)
chr7 (40-176)||(5483174-5483313)
chr7 (40-176)||(4406794-4406933)
chr7 (40-176)||(41343485-41343624)
chr7 (55-176)||(47840501-47840622)
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chr7 (55-176)||(4492616-4492737)
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chr7 (60-176)||(16939031-16939147)
chr7 (43-168)||(44652045-44652173)
chr7 (40-176)||(18956894-18957033)
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chr7 (40-176)||(1447738-1447877)
chr7 (40-176)||(38044970-38045109)
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chr7 (56-176)||(27836924-27837044)
chr7 (55-176)||(37310578-37310705)
chr7 (55-173)||(3839882-3839994)
chr7 (55-143)||(20135546-20135634)
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chr7 (85-176)||(6914005-6914096)
chr7 (85-176)||(47575982-47576073)
chr7 (55-159)||(17816123-17816227)
chr7 (55-159)||(19050763-19050867)
chr7 (130-176)||(4404035-4404081)
chr7 (130-176)||(20135653-20135699)
chr7 (56-123)||(1292088-1292155)
chr7 (127-164)||(6547739-6547776)
chr7 (124-165)||(7814199-7814240)
chr7 (125-165)||(10039930-10039970)
chr7 (125-165)||(47439733-47439773)
chr7 (113-175)||(1441581-1441644)
chr7 (125-159)||(13141823-13141857)
chr7 (81-123)||(32358875-32358917)
chr7 (81-123)||(35338374-35338416)
chr7 (109-138)||(9147927-9147956)
chr7 (55-88)||(42994966-42994999)
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[»] chr4 (93 HSPs)
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[»] chr2 (67 HSPs)
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[»] chr1 (77 HSPs)
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chr1 (55-176)||(23911332-23911453)
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chr1 (40-176)||(9574497-9574636)
chr1 (40-176)||(40432823-40432961)
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chr1 (56-176)||(20764065-20764185)
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chr1 (69-176)||(10700786-10700893)
chr1 (55-166)||(31215980-31216091)
chr1 (55-166)||(31221735-31221846)
chr1 (55-168)||(44065538-44065652)
chr1 (55-176)||(16096644-16096764)
chr1 (55-176)||(33374474-33374594)
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[»] chr6 (40 HSPs)
chr6 (40-176)||(7540877-7541016)
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[»] scaffold0009 (2 HSPs)
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Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 126; Significance: 4e-65; HSPs: 99)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Original strand, 46090282 - 46090421
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 136  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46090282 cttttccaattatactgtataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 46090381  T
Q  137 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46090382 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 46090421  T

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Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Original strand, 44762889 - 44763029
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaa-ttttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatattt 135  Q
    |||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  44762889 cttttccaattatactgtataacaaaattttgttataagaatatcatatttttggtgtcatttaaaaagataagaatttatattatatgatattatattt 44762988  T
Q  136 gttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44762989 gttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 44763029  T

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Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 13337011 - 13336872
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 136  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13337011 cttttccaattatactgtataacaaattttgttataagaatatcatattttttgtgtcatttaaaaacataagaatttatattatatgatattatatttg 13336912  T
Q  137 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13336911 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 13336872  T

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Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Original strand, 15496649 - 15496770
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15496649 ataacaaattttgttataagaatatcatatttttggtgtcatttaaaaagataagaatttagattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 15496748  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  15496749 tgaaaaagatatgtttagtttt 15496770  T

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Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Original strand, 47670666 - 47670787
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  47670666 ataacaaattttgttataagaatatcatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattaaatttgttatattgttggtgtcat 47670765  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  47670766 tgaaaaagatatgtttagtttt 47670787  T

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Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Original strand, 41991832 - 41991971
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 136  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  41991832 cttttccaattatacggtataacaaattttgttataagaatatcatattttttgtgtcatttaaaaagataagaatttatattatatgatattatatttg 41991931  T
Q  137 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41991932 tcacattgttggtgtcattgaaaaaaatatgtttagtttt 41991971  T

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Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 54113240 - 54113119
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54113240 ataacaaattttgttataagaataccatattttttatgtcatttgaaaagataagaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 54113141  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  54113140 tgaaaaagatatgtttagtttt 54113119  T

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Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 55 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 37413239 - 37413127
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37413239 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataagaatttatattatatggtattatatttgttacattgttggtgtcat 37413140  T
Q  155 tgaaaaagatatg 167  Q
    |||||||||||||    
T  37413139 tgaaaaagatatg 37413127  T

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Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Original strand, 36987903 - 36988043
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattata-ttt 135  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  36987903 cttttccaattatactgtataacaaattttgttataagaatatcatatttttggtatcatttaaaaagataagaatttatattatatgatattatatttt 36988002  T
Q  136 gttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36988003 gttacattgttgttgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 36988043  T

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Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Original strand, 37013342 - 37013482
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattata-ttt 135  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  37013342 cttttccaattatactgtataacaaattttgttataagaatatcatatttttggtatcatttaaaaagataagaatttatattatatgatattatatttt 37013441  T
Q  136 gttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37013442 gttacattgttgttgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 37013482  T

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Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 39721152 - 39721033
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  39721152 ataacaaattttgttataagaatatcatatttttggtgtcatttaaaaagataagaatttatattatatgatat--tatttgttacattgttggtgtcat 39721055  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  39721054 tgaaaaagatatgtttagtttt 39721033  T

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Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Original strand, 20996498 - 20996637
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 136  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20996498 cttttccaattatactgtataacaaattttgttataagaatatcatatttttgatgtcatttaaaaatataagaatttatattatatgatattatatttg 20996597  T
Q  137 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  20996598 ttacattgttggtgtaattgaaaaagataggtttagtttt 20996637  T

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Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 47719378 - 47719257
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  47719378 ataacaaattttgttataagaatatcatatttttggtgtcctttaaaaagataagaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgttat 47719279  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||||||| |||||||||||||    
T  47719278 tgaaaaaggtatgtttagtttt 47719257  T

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Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 40 - 173
Target Start/End: Original strand, 54196169 - 54196304
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Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 136  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||    
T  54196169 cttttccaattatactgtataacaaattttgttataagaataccatatttttg-tgtcatttaaaaagataagaatttatattatacgatgttatatttg 54196267  T
Q  137 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagt 173  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  54196268 ttacattgttggtgtcgttgaaaaagatatgtttagt 54196304  T

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Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Original strand, 35530001 - 35530122
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Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  35530001 ataacaaattttgttacaagaatatcatatttttagtgtcatttaaaaagataagaatttatattatatgatataatatttgttacattgttggtgtcat 35530100  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  35530101 tgagaaagatatgtttagtttt 35530122  T

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Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Original strand, 46089219 - 46089340
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Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46089219 ataacaaattttgttataagaatatcatatttttggtgtcatttaaagagataagaatttatattatataatattatatttgttacattgttggtgtcat 46089318  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||| ||||||||| ||||    
T  46089319 tgaaaaatatatgtttaatttt 46089340  T

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Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 55 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 10617078 - 10616962
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||     
T  10617078 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcattcaaaaagataagaatttatattatatgatgttatatttgttacattgttgttgtcaa 10616979  T
Q  155 tgaaaaagatatgttta 171  Q
    |||||||||||||||||    
T  10616978 tgaaaaagatatgttta 10616962  T

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Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 55 - 171
Target Start/End: Original strand, 12101641 - 12101757
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  12101641 ataacaaattttgttataagaatatcatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatacgatattatatttgttatattgttggtgttat 12101740  T
Q  155 tgaaaaagatatgttta 171  Q
    ||| |||||||||||||    
T  12101741 tgagaaagatatgttta 12101757  T

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Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Original strand, 34433916 - 34434038
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttgg-tgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtca 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34433916 ataacaaattttgttataagaataccataattttgggtgtcatctaaaaatataagaatttatattatatgatattatatttgttacattgttagtgtca 34434015  T
Q  154 ttgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  34434016 ttgaaaaagatatgtttagtttt 34434038  T

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Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Original strand, 43317019 - 43317159
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgata-ttatattt 135  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| |||    
T  43317019 cttttccaattataccgtataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataagaatttatattatataatatttattttt 43317118  T
Q  136 gttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
     |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43317119 tttacatcgttggtgtcattgaaaaaaatatgtttagtttt 43317159  T

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Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 55 - 173
Target Start/End: Original strand, 54203925 - 54204043
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  54203925 ataacaaattttgttataagaatatcatattttttgtgtcatttaaaaagataagaatttaaattatatgatattatatttgttagattgttggtgtcat 54204024  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagt 173  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  54204025 tgaaaaagatatatttagt 54204043  T

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Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 13449627 - 13449488
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 136  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  13449627 cttttccaattatactctataacaaattttgttataagaataccatatttttagtgttggtcaaaaagataagaatttatattatataatattatatttg 13449528  T
Q  137 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13449527 ttacattgctggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 13449488  T

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Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 19536485 - 19536346
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 136  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  19536485 cttttccaattatactctataacaaattttgttataagaataccatatttttagtgttggtcaaaaagataagaatttatattatataatattatatttg 19536386  T
Q  137 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19536385 ttacattgctggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 19536346  T

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Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Original strand, 36592513 - 36592652
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 136  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  36592513 cttttccaattatactctataacaaattttgttataagaataccatatttttagtgttggtcaaaaagataagaatttatattatataatattatatttg 36592612  T
Q  137 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36592613 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttattttt 36592652  T

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Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Original strand, 44540458 - 44540597
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 136  Q
    |||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||| | ||||||||||||||||    
T  44540458 cttttccaattatactctataataaattttgttataagaataccatattttttgtgtcattcaaaaagataagaattcatactgtatgatattatatttg 44540557  T
Q  137 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  44540558 ttacattgttggtgtcattgaaaaagaaatgtttagtttt 44540597  T

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Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Original strand, 45599564 - 45599703
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 136  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  45599564 cttttccaattatactctataacaaattttgttataagaataccatatttttagtgttggtcaaaaagataagaatttatattatataatattatatttg 45599663  T
Q  137 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  45599664 ttacattgttggtatcattgaaaaagatatgtttagtttt 45599703  T

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Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 55 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 48961011 - 48960894
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  48961011 ataacaaattttgttataaaaataccatatttttggtctcatttaaaaagatagaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttgatgtcat 48960912  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttag 172  Q
    ||| |||||||| |||||    
T  48960911 tgagaaagatatatttag 48960894  T

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Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 53022443 - 53022304
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 136  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  53022443 cttttccaattatactctataacaaattttgttataagaataccatatttttagtgttggtcaaaaagataagaatttatattatataatattatatttg 53022344  T
Q  137 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53022343 ttacattgctggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 53022304  T

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Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Original strand, 54510684 - 54510823
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 136  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  54510684 cttttccaattatactttataacaaattttgttataagaataccatatttttagtgttggtcaaaaagataagaatttatattatataatattatatttg 54510783  T
Q  137 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54510784 ttacattgctggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 54510823  T

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Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 915923 - 915802
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  915923 ataacaaatttcgttataagaataccatattttttgtgtctttcaaaaagataagaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 915824  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
     |||| ||||||||||| ||||    
T  915823 ggaaacagatatgtttaatttt 915802  T

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Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 26881400 - 26881261
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 136  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  26881400 cttttccaattatactctataacaaattttgttataagaataccatattttttgtgttggtcaaaaagataagaatttatattatataatattatatttg 26881301  T
Q  137 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26881300 ttacattgctggtgtcattgaaaaatatatgtttagtttt 26881261  T

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Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Original strand, 33932784 - 33932923
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 136  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  33932784 cttttccaattatactttataacaaattttgttataagaataccatatttttagtgttggtcaaaaagataagaatttatattatataatattatatttg 33932883  T
Q  137 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33932884 ttacattgctggtgtcattgaaaaagatatgtttaatttt 33932923  T

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Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Original strand, 42188386 - 42188525
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 136  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  42188386 cttttccaattatactctataacaaattttgttataagaataccatatttttagtgtcagtcaaaaagataagaatttatattatataatattatatttg 42188485  T
Q  137 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  42188486 ttacattgctggtgtcattggaaaatatatgtttaatttt 42188525  T

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Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Original strand, 46851119 - 46851257
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 136  Q
    |||||||||||||||   |||  |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  46851119 cttttccaattatactctatagaaaatttcgttataagtatac-atatttttggtgtcattcaaaaagataataatttatattatatgatattatatttg 46851217  T
Q  137 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  46851218 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttaatttt 46851257  T

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Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Original strand, 54796465 - 54796586
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54796465 ataacaaatttcgttataagaataccatatttttggtgtcattcaaaaatataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 54796564  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
     |||  | |||||| |||||||    
T  54796565 ggaatcaaatatgtgtagtttt 54796586  T

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Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 875287 - 875149
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 136  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   | |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||    
T  875287 cttttccaattatactctataacaaattttgttataagaataccatatttttagtgttggtcaaaaagataagaatttatat-atataatattatatttg 875189  T
Q  137 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  875188 ttacattgctggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 875149  T

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Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 4018371 - 4018233
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 136  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   | |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||    
T  4018371 cttttccaattatactctataacaaattttgttataagaataccatatttttagtgttggtcaaaaagataagaatttatat-atataatattatatttg 4018273  T
Q  137 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4018272 ttacattgctggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 4018233  T

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Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 7264862 - 7264741
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Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  7264862 ataacaaattttgttataagaataccatatttttagtgttggtcaaaaagataagaatttatattatataatattatatatgttacattgctggtgtcat 7264763  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  7264762 tgaaaaagatatgtttagtttt 7264741  T

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Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Original strand, 14588008 - 14588146
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 136  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   | |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||    
T  14588008 cttttccaattatactctataacaaattttgttataagaataccatatttttagtgttggtcaaaaagataagaatttatat-atataatattatatttg 14588106  T
Q  137 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14588107 ttacattgctggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 14588146  T

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Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Original strand, 44075811 - 44075932
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44075811 ataacaaatttcgttataagaataccatattttttgtgtctttcaaaaagataagaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 44075910  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
     |||| | ||||||||| ||||    
T  44075911 ggaaacatatatgtttaatttt 44075932  T

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Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 48544563 - 48544425
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 136  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   | |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||    
T  48544563 cttttccaattatactctataacaaattttgttataagaataccatatttttagtgttggtcaaaaagataagaatttatat-atataatattatatttg 48544465  T
Q  137 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48544464 ttacattgctggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 48544425  T

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Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 52674237 - 52674099
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 136  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   | |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||    
T  52674237 cttttccaattatactctataacaaattttgttataagaataccatatttttagtgttggtcaaaaagataagaatttatat-atataatattatatttg 52674139  T
Q  137 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52674138 ttacattgctggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 52674099  T

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Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 54741581 - 54741442
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 136  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  54741581 cttttccaattatactctataacaaattttgttataagaataccatatttttagtgttggtcaaaaagataagaatttatattatataatattatatttg 54741482  T
Q  137 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  54741481 ttacattgctggtgtcattgaaaaagatatatttaatttt 54741442  T

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Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 29499786 - 29499648
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 136  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||   | |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||    
T  29499786 cttttccaattatactctataacaaattttgttataagaatatcatatttttagtgttggtcaaaaagataagaatttatat-atataatattatatttg 29499688  T
Q  137 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29499687 ttacattgctggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 29499648  T

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Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 46757320 - 46757199
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||   | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  46757320 ataacaaattttgttataagaataccgtatttttagtgttggtcaaaaagataagaatttatattatataatattatatttgttacattgctggtgtcat 46757221  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||||||||||||| ||||    
T  46757220 tgaaaaagatatgtttaatttt 46757199  T

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Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 50932635 - 50932496
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 136  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  50932635 cttttccaattatactctataacaaattttgttataagaataccatatatttagtgtcagtcaaaaagataagaatttatattatataatattatatttg 50932536  T
Q  137 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||||||| |||||| |||| |||| |||||||| |||||    
T  50932535 ttacattgctggtgttattggaaaatatatgtttcgtttt 50932496  T

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Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Original strand, 52468292 - 52468413
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52468292 ataacaaatttcattataagaataccctattttttgtgtctttcaaaaagataagaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 52468391  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
     |||| | ||||||||||||||    
T  52468392 ggaaacatatatgtttagtttt 52468413  T

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Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Original strand, 30269703 - 30269839
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 136  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   | |||||||||| |||||||||   || ||||||||||||    
T  30269703 cttttccaattatactttataacaaattttgttataagaataccatatttttagtgttggtcaaaaagataagaatttatat---ataatattatatttg 30269799  T
Q  137 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30269800 ttacattgctggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 30269839  T

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Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 65 - 176
Target Start/End: Original strand, 35690907 - 35691018
Alignment:
Q  65 ttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcattgaaaaagat 164  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||    
T  35690907 ttgttataagaataccatatttttagtgtcagtcaaaaagataagaatttatattatataatattatatttgttacattgctggtgtcattgagaaatat 35691006  T
Q  165 atgtttagtttt 176  Q
    ||||||||||||    
T  35691007 atgtttagtttt 35691018  T

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Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 55 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 52460767 - 52460652
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |   | ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52460767 ataacaaattttgttataagaataccatatttttagttttggtcaaaaatataagaatttatattatataatattatatttgttacattgttggtgtcat 52460668  T
Q  155 tgaaaaagatatgttt 170  Q
    ||||||||||||||||    
T  52460667 tgaaaaagatatgttt 52460652  T

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Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 2908869 - 2908749
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   | |||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  2908869 ataacaaattttgttataagaataccatatttttagtgttggtcaaaaagataagaatttatat-atataatattatatttgttacattgctggagtcat 2908771  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  2908770 tgaaaaagatatgtttagtttt 2908749  T

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Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 7040316 - 7040196
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   | |||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  7040316 ataacaaattttgttataagaataccatatttttagtgttggtcaaaaagataagaatttatat-atataatattatatttgttacattgctggtatcat 7040218  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  7040217 tgaaaaagatatgtttagtttt 7040196  T

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Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 29450114 - 29449976
Alignment:
Q  40 cttttccaattataca---taacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 136  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||   | |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||    
T  29450114 cttttccaattatacactataacaaattttgttataagaataccatatttttaatgttggtcaaaaagataagaatttatat-atataatattatatttg 29450016  T
Q  137 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29450015 ttacattgctggtgtcattgaaaaatatatgtttagtttt 29449976  T

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Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 56 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 185257 - 185137
Alignment:
Q  56 taacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcatt 155  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  185257 taacaaatttcgttataagaataccatatttttggtgactttcaaaaagataagaatttatattatttgacattatatttgctacattgttggtgtcatt 185158  T
Q  156 gaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||| | | ||||||||||||    
T  185157 gaaacatacatgtttagtttt 185137  T

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Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 22934643 - 22934525
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||    
T  22934643 ataacaaatttcgttataagaataccatattttttgtgttattaaaaaagataagaatttatattatataatattatatttgttaca---ttggtgtcat 22934547  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||| |||||||| |||||    
T  22934546 tgaaaaaaatatgttttgtttt 22934525  T

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Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 55 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 32753721 - 32753606
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32753721 ataactaatttcgttataagaataccatatttttggtgtctttcaaaaagataagaatttatgttatatgatattatatttattacattgttggtgtcat 32753622  T
Q  155 tgaaaaagatatgttt 170  Q
     |||| | ||||||||    
T  32753621 ggaaacatatatgttt 32753606  T

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Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Original strand, 20850053 - 20850174
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || |||||| ||| || | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20850053 ataacaaattttgttataaaaatatcacatttttagtgacagtcaaaaagataagaatttatattatataatattatatttgttacattgctggtgtcat 20850152  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||| ||||||||| ||||    
T  20850153 tgaaaaatatatgtttaatttt 20850174  T

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Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Original strand, 22762713 - 22762834
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||    
T  22762713 ataacaaatttcgttataagaatatcatatttttggtgtctttgaaaaatataagaatttatattatatgatattatatctgttacatcgttagtgtcat 22762812  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
     |||| | ||||||||||||||    
T  22762813 ggaaacatatatgtttagtttt 22762834  T

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Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Original strand, 22347374 - 22347506
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 136  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  22347374 cttttccaattatactctataacaaattttgttataagaataccatatttttagtgttggttaaaaagataagaatttatattatataatattatatttg 22347473  T
Q  137 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||       ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22347474 ttac-------gtgtcattgaaaatgatatgtttagtttt 22347506  T

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Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 57 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 54831687 - 54831568
Alignment:
Q  57 aacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcattg 156  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||||||||| ||||| || |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  54831687 aacaaatttcgttataagaatgtcatatttttcgtgtcgttcaaaacgataataatttatattatatgatattatacttgttacattgttgatgtcattg 54831588  T
Q  157 aaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||| ||||||||| ||||    
T  54831587 aaaaatatatgtttaatttt 54831568  T

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Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 40 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 50739065 - 50738969
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatat 133  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||    
T  50739065 cttttccaattatactgtataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataagaattcatattatattatattatat 50738969  T

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Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 40 - 133
Target Start/End: Original strand, 50773790 - 50773886
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatat 133  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||    
T  50773790 cttttccaattatactgtataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataagaattcatattatattatattatat 50773886  T

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Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 56 - 176
Target Start/End: Original strand, 37617090 - 37617210
Alignment:
Q  56 taacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcatt 155  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  37617090 taacaaatttcgttataagaataccatattttttgtgactttcaaaaagataagaatttatattatttgacattatatttactacattgttggtgtcatt 37617189  T
Q  156 gaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||| | | ||||||||||||    
T  37617190 gaaacatacatgtttagtttt 37617210  T

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Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 85 - 176
Target Start/End: Original strand, 39798987 - 39799078
Alignment:
Q  85 ttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||    
T  39798987 ttttggtgtctttcaaaaagataagaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcatggaaacatatatgtttagtttt 39799078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 67 - 168
Target Start/End: Original strand, 22518697 - 22518798
Alignment:
Q  67 gttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcattgaaaaagatat 166  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| ||||    
T  22518697 gttacaagaatactatatttttggtgtcatttaaaaacataagaatttatattatacgatattatatttattacattgttggtaacattgaaaaaaatat 22518796  T
Q  167 gt 168  Q
    ||    
T  22518797 gt 22518798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 80 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 54831546 - 54831450
Alignment:
Q  80 catatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||| || ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  54831546 catatttgtgttgtcattaaaaaagataagaatttatattatatgatattatatttgttacattattagtgtcattgaaaatgatatgtttaatttt 54831450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 99 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 38361571 - 38361498
Alignment:
Q  99 aaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttag 172  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  38361571 aaaaagttaagaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcattgacaaagatatgtttag 38361498  T

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Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 85 - 176
Target Start/End: Original strand, 5254899 - 5254990
Alignment:
Q  85 ttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||   ||||||||||||||    
T  5254899 ttttggtgtctttcaaaaagataagaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgccatggaaacctatatgtttagtttt 5254990  T

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Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Original strand, 28170597 - 28170708
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||          ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28170597 ataaaaaatttcgttataagaataccatatttttggtgtcttttaaaaagataagaattt----------atattatatttgttacattgttggtgtcat 28170686  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
     |||| | ||||||||||||||    
T  28170687 cgaaacatatatgtttagtttt 28170708  T

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Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 59 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 33899808 - 33899738
Alignment:
Q  59 caaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatatt 129  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33899808 caaattttgttataaaaataccatattttttgtgtcatttaaaaagataagaatttatattatatgatatt 33899738  T

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Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 67 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 5239500 - 5239408
Alignment:
Q  67 gttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcattgaaa 159  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||||| || |||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5239500 gttataagaattctgtatttttggtgtctttaaaaaagataagatattatattgtatgatattatatttgttatattgttggtgtcattgaaa 5239408  T

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Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 113 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 33899648 - 33899585
Alignment:
Q  113 ttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  33899648 ttatattatatgatattatatttgttagactgttggagtcattgaaaaaaatatgtttagtttt 33899585  T

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Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 114 - 176
Target Start/End: Original strand, 35907023 - 35907085
Alignment:
Q  114 tatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  35907023 tatattatatgatattatatttgttatgttgttggtgccattgaaaaatatatgtttagtttt 35907085  T

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Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 58 - 176
Target Start/End: Original strand, 36170439 - 36170547
Alignment:
Q  58 acaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcattga 157  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |  ||||| |||| |||||||||          |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  36170439 acaaatttcgttataagaataccatatttttggtctcttccaaaaatataagaatttatat----------tatatttgttacattgttggtgtcatgga 36170528  T
Q  158 aaaagatatgtttagtttt 176  Q
    || | ||||||||||||||    
T  36170529 aacaaatatgtttagtttt 36170547  T

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Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 38361643 - 38361585
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  38361643 ataacaaattttgttataagaatatcatagttttggtgtcatttaaaaagttaagaatt 38361585  T

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Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 119 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 50738964 - 50738907
Alignment:
Q  119 tatatgatattatatttgttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||||||||||||| |||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  50738964 tatatgatattatatttattacatcgctggtgtcgttgaaaaagatatgtttagtttt 50738907  T

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Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 125 - 176
Target Start/End: Original strand, 12170967 - 12171018
Alignment:
Q  125 atattatatttgttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||    
T  12170967 atattatatttgttacattgttggtgtcatggaaacaaatatgtttagtttt 12171018  T

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Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 125 - 176
Target Start/End: Original strand, 42618159 - 42618210
Alignment:
Q  125 atattatatttgttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  42618159 atattatatttgttacattgttggtgtcattgaaacatatatgtttaatttt 42618210  T

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Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 125 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 34996074 - 34996024
Alignment:
Q  125 atattatatttgttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagttt 175  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  34996074 atattatatttgttgtattgttggtatcattgaaaaagataagtttagttt 34996024  T

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Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 115
Target Start/End: Original strand, 12997574 - 12997634
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaattta 115  Q
    |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||| ||||||    
T  12997574 ataaaaaaatttattataagaataccatattttttgtgtcgttaaaaaagataagaattta 12997634  T

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Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 30333926 - 30333886
Alignment:
Q  125 atattatatttgttacattgttggtgtcattgaaaaagata 165  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  30333926 atattatatttgttgtattgttggtgtcattgaaaaagata 30333886  T

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Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 84 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 34230551 - 34230512
Alignment:
Q  84 tttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatat 123  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  34230551 tttttggtgtcattcaaaaagataagaatttatattatat 34230512  T

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Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 82 - 121
Target Start/End: Original strand, 34413305 - 34413344
Alignment:
Q  82 tatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattat 121  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  34413305 tatttttggtgtcattcaaaaagataataatttatattat 34413344  T

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Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 125 - 175
Target Start/End: Original strand, 13867274 - 13867324
Alignment:
Q  125 atattatatttgttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagttt 175  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| || ||||||    
T  13867274 atattatatttgttatattgttcgtgtcatttaaaaagataagtatagttt 13867324  T

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Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 21363708 - 21363666
Alignment:
Q  81 atatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatat 123  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  21363708 atattgttggtgtcattcaaaaagataaaaatgtatattatat 21363666  T

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Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 57 - 134
Target Start/End: Original strand, 31093065 - 31093142
Alignment:
Q  57 aacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatt 134  Q
    ||||||||||  |||||  ||| ||||||||| |||||||| ||||| |||  | |||||||||||| ||||||||||    
T  31093065 aacaaatttttctataatcatatcatattttttgtgtcattaaaaaatatagtagtttatattatatcatattatatt 31093142  T

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Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 70 - 123
Target Start/End: Original strand, 50585749 - 50585802
Alignment:
Q  70 ataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatat 123  Q
    |||||||||  || || ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  50585749 ataagaatattattttgttggtgttattcaaaaagataaaaatttatattatat 50585802  T

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Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 124 - 165
Target Start/End: Original strand, 51283724 - 51283765
Alignment:
Q  124 gatattatatttgttacattgttggtgtcattgaaaaagata 165  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  51283724 gatattgtatttgttatattgttggtatcattgaaaaagata 51283765  T

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Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 32
Target Start/End: Complemental strand, 4018909 - 4018881
Alignment:
Q  4 tggagttcgaacccgggaccttgcatata 32  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4018909 tggagttcgaacccgggaccttgcatata 4018881  T

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Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 110 - 138
Target Start/End: Original strand, 11952973 - 11953001
Alignment:
Q  110 aatttatattatatgatattatatttgtt 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11952973 aatttatattatatgatattatatttgtt 11953001  T

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Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 97 - 165
Target Start/End: Original strand, 14419027 - 14419093
Alignment:
Q  97 ttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcattgaaaaagata 165  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| |||||||||| ||||| || |||||    
T  14419027 ttaaaaaaataaaaatttatattatat-atatt-tttttgttatattgttggtgccattgcaatagata 14419093  T

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Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 125 - 165
Target Start/End: Original strand, 19226159 - 19226199
Alignment:
Q  125 atattatatttgttacattgttggtgtcattgaaaaagata 165  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||    
T  19226159 atattatatttgttaaattattgttgtcattgaaaaagata 19226199  T

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Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 110 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 22476278 - 22476250
Alignment:
Q  110 aatttatattatatgatattatatttgtt 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22476278 aatttatattatatgatattatatttgtt 22476250  T

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Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 133 - 165
Target Start/End: Original strand, 27042399 - 27042431
Alignment:
Q  133 tttgttacattgttggtgtcattgaaaaagata 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27042399 tttgttacattgttggtgtcattgaaatagata 27042431  T

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Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 41 - 88
Target Start/End: Original strand, 35906844 - 35906894
Alignment:
Q  41 ttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatattttt 88  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  35906844 ttttccaattatactgtataacaaattttgttatgagaatatcatattttt 35906894  T

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Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 110 - 138
Target Start/End: Original strand, 40828626 - 40828654
Alignment:
Q  110 aatttatattatatgatattatatttgtt 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40828626 aatttatattatatgatattatatttgtt 40828654  T

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Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 127 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 47410499 - 47410451
Alignment:
Q  127 attatatttgttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagttt 175  Q
    ||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| || ||||||    
T  47410499 attatatttgttatattgtttgtatcattgaaaaagataggtatagttt 47410451  T

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Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 125 - 165
Target Start/End: Original strand, 54114393 - 54114433
Alignment:
Q  125 atattatatttgttacattgttggtgtcattgaaaaagata 165  Q
    ||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||    
T  54114393 atattatatttgttatatagttgatgtcattgaaaaagata 54114433  T

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Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 110 - 138
Target Start/End: Original strand, 55296407 - 55296435
Alignment:
Q  110 aatttatattatatgatattatatttgtt 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  55296407 aatttatattatatgatattatatttgtt 55296435  T

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Target: chr8 (Bit Score: 124; Significance: 6e-64; HSPs: 86)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 9 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 44908482 - 44908312
Alignment:
Q  9 ttcgaacccgggaccttgcatatannnnnnncttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaaga 105  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||       |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  44908482 ttcgaacccaggaccatgcatatatttttttcttttccaattatactatataacaaattttgttataagaataccataattttggtgtcatttaaaaaga 44908383  T
Q  106 taaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44908382 taaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 44908312  T

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Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 42844188 - 42844049
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 136  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42844188 cttttccaattatactgtataacaaattttgttataagaatatcatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 42844089  T
Q  137 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  42844088 ttacattgttggtgttattgaaaaagatatgtttagtttt 42844049  T

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Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 116; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 41526222 - 41526084
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac--ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgt 137  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41526222 cttttccaattatatgtataacaaattttgttataagaatatcatatttttggtgtcatttaaaaagataagaatttatattatatgatattatatttgt 41526123  T
Q  138 tacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41526122 tacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 41526084  T

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Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 6747067 - 6746928
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 136  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6747067 cttttccaattatactgtataacaaattttgttataagaatatcatatttttggtgtcatttaaaaagataagaatttatattatatgatattatatttg 6746968  T
Q  137 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6746967 ttacattgttggtgtcattgaaaaatatatgtttagtttt 6746928  T

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Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 112; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 55 - 174
Target Start/End: Original strand, 14449785 - 14449904
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Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14449785 ataacaaattttgttataagaatatcatatttttggtgtcatttaaaaagataataatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 14449884  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagtt 174  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  14449885 tgaaaaagatatgtttagtt 14449904  T

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Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 38909195 - 38909055
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 136  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  38909195 cttttccaattatactatataacaaattttgttataagaatatcatatttttggtgtcatttaaaaagataagaatttatattatatgatattatatttg 38909096  T
Q  137 ttacattgttggtgtcattga-aaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38909095 ttacattgttggtgtcattgaaaaaagatatgtttagtttt 38909055  T

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Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Original strand, 38137901 - 38138022
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38137901 ataacaaattttgttataagaatatcatatttttggtgtcatttaaaaagataagaatttatattatattatattatatttgttacattgttggtgtcat 38138000  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  38138001 tgaaaaagatatgtttagtttt 38138022  T

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Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 38139221 - 38139082
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 136  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  38139221 cttttccaattatactgtataacaaattttgttataagaatatcatatttttggtgtcatttaaaaagataagaatttatattatatgatattatatttg 38139122  T
Q  137 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38139121 ttacattgttgatgtcattgaaaaagatatgtttaatttt 38139082  T

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Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Original strand, 40048835 - 40048974
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 136  Q
    |||||||||||||||   ||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  40048835 cttttccaattatactgtataacaagtattgttataagaataccatattttttgtgtcatttaaaaagataagaatttatattatatgatattatatttg 40048934  T
Q  137 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40048935 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 40048974  T

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Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Original strand, 39486192 - 39486333
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttt--tggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatt 134  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  39486192 cttttccaattatactgtataacaaattttgttataagaatatcatatttttttggtgtcatttaaaaagataagaatttatattatatgatattatatt 39486291  T
Q  135 tgttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39486292 tgttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 39486333  T

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Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 40 - 174
Target Start/End: Original strand, 36059442 - 36059579
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 136  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  36059442 cttttccaattatactgtataacaaattttgttataagaataccatattttttgtgtcatttaaaaagataagaatttatattatatgatattatatttg 36059541  T
Q  137 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtt 174  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  36059542 ttacattgttgatgtcattgaaaaagatatgcttagtt 36059579  T

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Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 6657321 - 6657182
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 136  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  6657321 cttttccaattataccgtataacaaattttgttataagaatatcatatttttggtgtcatttaaaaagataagaatttatattatacgatattatatttg 6657222  T
Q  137 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6657221 ttacatttttggtgtcattgaaaaatatatgtttagtttt 6657182  T

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Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 6737723 - 6737584
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 136  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  6737723 cttttccaattataccgtataacaaattttgttataagaatatcatatttttggtgtcatttaaaaagataagaatttatattatacgatattatatttg 6737624  T
Q  137 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6737623 ttacatttttggtgtcattgaaaaatatatgtttagtttt 6737584  T

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Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 11579083 - 11578962
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11579083 ataacaaattttgttataagaatatcatatttttggtgtcatttaaaaagataagaatttatattatatgatattatatttgttatattgttggtgtcat 11578984  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||| ||||||||||||||    
T  11578983 tgaaaaatatatgtttagtttt 11578962  T

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Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 39525361 - 39525222
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 136  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  39525361 cttttccaattatactgtataacaaattttgttataagaatatcatatttttggtgtcatttaaaaagataagaatttatattatatgatattatatttt 39525262  T
Q  137 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  39525261 ttacattgttggtgttattgaaaaagatatgtttaatttt 39525222  T

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Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 44654841 - 44654721
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44654841 ataacaaattttgttataagaatatcatatttttggtgtcatttaaaaa-ataagaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 44654743  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  44654742 tgaaaaagatatgtttagtttt 44654721  T

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Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Original strand, 45139215 - 45139354
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 136  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  45139215 cttttccaattatactgtataacaaattttgtaataagaatatcatatttttggtgtcatttaaaaagataagaatttatattatatgatattatatttg 45139314  T
Q  137 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  45139315 ttacattgtcggtgtcattgaaaaagatatgttttgtttt 45139354  T

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Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 55 - 170
Target Start/End: Original strand, 33848872 - 33848987
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33848872 ataacaaattttgttataagaatatcatatttttggtgtcatttaaaaagataagaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 33848971  T
Q  155 tgaaaaagatatgttt 170  Q
    ||||||| ||||||||    
T  33848972 tgaaaaatatatgttt 33848987  T

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Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Original strand, 1877876 - 1877996
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  1877876 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaa-ataagaatttatattatatgatattatatttgttacatcgttggtgtcaa 1877974  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  1877975 tgaaaaagatatgtttagtttt 1877996  T

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Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 42983889 - 42983769
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42983889 ataacaaattttgttataagaatatcatatttttggtgtcatttaaaaa-ataagaatttatattatatggtattatatttgttacattgttggtgtcat 42983791  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  42983790 tgaaaaagatatgtttagtttt 42983769  T

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Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 42 - 176
Target Start/End: Original strand, 27748178 - 27748315
Alignment:
Q  42 tttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgtt 138  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27748178 tttccaattatactctataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtaattcaaaaatataagaattcatattatatgatattatatttgtt 27748277  T
Q  139 acattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27748278 acattgttggtgtcattgaaaaatatatgtttagtttt 27748315  T

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Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Original strand, 2185020 - 2185159
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 136  Q
    |||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||    
T  2185020 cttttccaattatactctacaacaaattttgttataagaataccatatttttagtgtcagtcaaaaagataagaatttatattatataatattatttttg 2185119  T
Q  137 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2185120 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 2185159  T

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Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Original strand, 12261657 - 12261777
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  12261657 ataacaaattttgttataagaatatcatatttttggtgtcatttaaaaagataagaatttatattatat-atattatatttgttacattgtaggtgttat 12261755  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  12261756 tgaaaaagatatgtttagtttt 12261777  T

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Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Original strand, 28017509 - 28017629
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28017509 ataacaaattttgttataagaataccatatttt-ggtgtcattcaaaaagatcagaattcatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 28017607  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  28017608 tgaaaaagatatgtttagtttt 28017629  T

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Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 34997309 - 34997188
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34997309 ataacaaatgttgttgtaagaataccatatttttgatgtcatttaaaaatataagaatttatattatatgatattatatttgttacattgttgatgtcat 34997210  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  34997209 tgaaaaagatatgtttagtttt 34997188  T

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Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 37034714 - 37034593
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37034714 ataacaaattttgttataagaattccatattttgagtgtcatttaaaaagataagaatttatattatatgatattatatttgttacattgttgatgtcat 37034615  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||||||||||||| ||||    
T  37034614 tgaaaaagatatgtttaatttt 37034593  T

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Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 11924205 - 11924066
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 136  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  11924205 cttttccaattatactctataacaaattttgttataagaataccatatttttaatgtcagtcaaaaagataagaatttatattatataatattatatttg 11924106  T
Q  137 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11924105 ttacattgctggtgtcattcaaaaagatatgtttagtttt 11924066  T

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Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Original strand, 17046325 - 17046446
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17046325 ataacaaattttgttataagaataccatatttttagtgttggtcaaaaagataagaatttatattatataatattatatttgttacattgttggtgtcat 17046424  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  17046425 tgaaaaagatatgtttagtttt 17046446  T

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Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Original strand, 27877328 - 27877448
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27877328 ataacaaattttgttataagaataccatatttt-ggtgtcattcaaaaagatcagaattcatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 27877426  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||||||||||||| |||||||    
T  27877427 tgaaaaagatatgtctagtttt 27877448  T

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Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 39685199 - 39685060
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 136  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  39685199 cttttccaattatactctataacaaattttgttataagaataccatatttttagtgttggtcaaaaagataagaatttatattatataatattatatttg 39685100  T
Q  137 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39685099 ttacattgctggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 39685060  T

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Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 41360766 - 41360627
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 136  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  41360766 cttttccaattatactctataacaaattttgttataagaataccatatttttagtgttggtcaaaaagataagaatttatattatataatattatatttg 41360667  T
Q  137 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41360666 ttacattgctggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 41360627  T

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Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 6815465 - 6815328
Alignment:
Q  40 cttttccaattataca-taacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgtt 138  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6815465 cttttccaattatactctaacaaattttgttataagaataccatatttttagtgtcagtcaaaaagataagaatttatattatataatattatatttgtt 6815366  T
Q  139 acattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||| || |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  6815365 acaatgctggtgtcattgaaaaatatatatttagtttt 6815328  T

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Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 16844771 - 16844650
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||   | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16844771 ataacaaattttgttataagaaaaccatatttttagtgttggtcaaaaagataagaatttatattatataatattatatttgttacattgttggtgtcat 16844672  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  16844671 tgaaaaagatatgtttagtttt 16844650  T

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Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Original strand, 20666018 - 20666139
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20666018 ataacaaatttcgttataagaataccatattttttgtgtctttcaaaaagataagaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 20666117  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
     |||| ||||||||||| ||||    
T  20666118 ggaaacagatatgtttaatttt 20666139  T

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Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Original strand, 30551380 - 30551501
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30551380 ataacaaatttcgttataagaataccatattttttgtgtctttcaaaaagataagaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 30551479  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
     |||| ||||||||||| ||||    
T  30551480 ggaaacagatatgtttaatttt 30551501  T

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Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 7218831 - 7218693
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 136  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   | |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||    
T  7218831 cttttccaattatactctataacaaattttgttataagaataccatatttttagtgttggtcaaaaagataagaatttatat-atataatattatatttg 7218733  T
Q  137 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7218732 ttacattgctggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 7218693  T

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Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 40 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 34805242 - 34805108
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 136  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   | |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||    
T  34805242 cttttccaattatactctataacaaattttgttataagaataccatatttttagtgttggtcaaaaagataagaatttatat-atataatattatatttg 34805144  T
Q  137 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttag 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34805143 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttag 34805108  T

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Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Original strand, 43818618 - 43818738
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   | |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43818618 ataacaaattttgttataagaataccatatttttagtgttggtcaaaaagataagaatttatat-atataatattatatttgttacattgttggtgtcat 43818716  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  43818717 tgaaaaagatatgtttagtttt 43818738  T

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Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Original strand, 44216130 - 44216251
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44216130 ataacaaatttcgttataagaataccatattttttgtgtctttcaaaaagataagaatttatattatatgatattatatttcttacattgttggtgtcat 44216229  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
     |||| ||||||||||| ||||    
T  44216230 ggaaacagatatgtttaatttt 44216251  T

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Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 55 - 167
Target Start/End: Original strand, 27914303 - 27914414
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27914303 ataacaaattttgttataaaaatatcatatttttg-tgtcattcaaaaagataagaattcatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 27914401  T
Q  155 tgaaaaagatatg 167  Q
    |||||||||||||    
T  27914402 tgaaaaagatatg 27914414  T

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Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 55 - 167
Target Start/End: Original strand, 27960722 - 27960833
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27960722 ataacaaattttgttataaaaatatcatatttttg-tgtcattcaaaaagataagaattcatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 27960820  T
Q  155 tgaaaaagatatg 167  Q
    |||||||||||||    
T  27960821 tgaaaaagatatg 27960833  T

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Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Original strand, 2191300 - 2191439
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 136  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  2191300 cttttccaattatactctataacaaattttgttataaaaataccataattttagtgtcagtcaaaaagataaaaatttatattatataatattatttttg 2191399  T
Q  137 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  |||||||| ||||    
T  2191400 ttacattgttggtgtcattggaaaatttatgtttaatttt 2191439  T

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Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 14718687 - 14718566
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||   | |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14718687 ataacaaattttgttataaaaataccatatttttagtgttgatcaaaaagataagaatttatagtatataatattatatttgttacattgctggtgtcat 14718588  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  14718587 tgaaaaagatatgtttagtttt 14718566  T

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Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 27467164 - 27467026
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 136  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   | |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||    
T  27467164 cttttccaattatactctataacaaattttgttataagaataccatatttttagtgttggtaaaaaagataagaatttatat-atataatattatatttg 27467066  T
Q  137 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27467065 ttatattgctggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 27467026  T

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Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Original strand, 36217198 - 36217336
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 136  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||   | |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||    
T  36217198 cttttccaattatactctataacaaattttgttataaaaataccatatttttagtgttggtcaaaaagataagaatttatat-atataatattatatttg 36217296  T
Q  137 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36217297 ttacattgctggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 36217336  T

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Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Original strand, 44603679 - 44603800
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  44603679 ataacaaattttgttataagaataccatatttttagtgttggtcaaaaagataagaatttatattatataatattatatttgttacattgctggtgtcat 44603778  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||| |||| |||||||||    
T  44603779 tgaaaaatatatatttagtttt 44603800  T

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Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 80 - 176
Target Start/End: Original strand, 35916756 - 35916852
Alignment:
Q  80 catatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35916756 catatttttggtgtcatttaaaaacataagaatttgtattatatggtattatatttgttacattgttggtgtcattgaaaaatatatgtttagtttt 35916852  T

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Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 69 - 176
Target Start/End: Original strand, 170391 - 170498
Alignment:
Q  69 tataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgt 168  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  170391 tataagaataccatatttttagtgtcaatcaaaaagataagaatttatattatataatattatatttgttacattgctggtgtcattggaaaatatatgt 170490  T
Q  169 ttagtttt 176  Q
    ||||||||    
T  170491 ttagtttt 170498  T

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Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 39443313 - 39443193
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39443313 ataacaaatttcgttataagaataccatattttttgtgtctttcaaaaatataagaatttatattatatgatattatatttgttacattgtttgtgtcat 39443214  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
     |||| | || |||||||||||    
T  39443213 ggaaacaaat-tgtttagtttt 39443193  T

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Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 67 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 41904410 - 41904301
Alignment:
Q  67 gttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcattgaaaaagatat 166  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| | ||||    
T  41904410 gttataagaataccatattttttgtgtctttcaaaaatataagaatttatattatatgatattatatttgttacattgttgatgtcatggaaacaaatat 41904311  T
Q  167 gtttagtttt 176  Q
    ||||||||||    
T  41904310 gtttagtttt 41904301  T

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Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 60 - 176
Target Start/End: Original strand, 45297206 - 45297322
Alignment:
Q  60 aaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcattgaaa 159  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||| ||||| || || || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  45297206 aaatttcgtcataagaataccatattttttgtgtctttcaagaaaataagaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcatggaaa 45297305  T
Q  160 aagatatgtttagtttt 176  Q
     | ||||||||||||||    
T  45297306 catatatgtttagtttt 45297322  T

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Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 85 - 176
Target Start/End: Original strand, 6303117 - 6303208
Alignment:
Q  85 ttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||    
T  6303117 ttttggtgtctttcaaaaagataagaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgccatggaaacatatatgtttagtttt 6303208  T

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Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 84 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 19245066 - 19244975
Alignment:
Q  84 tttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagttt 175  Q
    ||||||||||| || || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||    
T  19245066 tttttggtgtctttcaagaagataagaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcatggaaacatatatgtttagttt 19244975  T

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Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 84 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 19318250 - 19318159
Alignment:
Q  84 tttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagttt 175  Q
    ||||||||||| || || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||    
T  19318250 tttttggtgtctttcaagaagataagaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcatggaaacatatatgtttagttt 19318159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 85 - 176
Target Start/End: Original strand, 23969033 - 23969124
Alignment:
Q  85 ttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||    
T  23969033 ttttggtgtctttcaaaaagataagaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgccatggaaacatatatgtttagtttt 23969124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 39995771 - 39995635
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 136  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||   | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||       
T  39995771 cttttccaattatactctataacaaattttgttacaagaataccatatttttagtgttggtcaaaaagataataatttatattatataatattatat--- 39995675  T
Q  137 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    || ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39995674 tttcattgctgatgtcattgaaatagatatgtttagtttt 39995635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 100 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 29431414 - 29431338
Alignment:
Q  100 aaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  29431414 aaaatataagaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcatggaaacagatatgtttagtttt 29431338  T

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Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 63 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 39201161 - 39201050
Alignment:
Q  63 ttttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatat--tatatgatattatatttgttacattgttggtgtcattgaaaa 160  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||     
T  39201161 tttttttataagaataccatatttttggtgtctttcaaaaatataagaatttatatattatatgatattatatgtgttacattgttggtctaatggaaac 39201062  T
Q  161 agatatgtttag 172  Q
    ||||||||||||    
T  39201061 agatatgtttag 39201050  T

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Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 85 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 37027342 - 37027251
Alignment:
Q  85 ttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||   ||||||||||||||    
T  37027342 ttttggtgtctttcaaaaagataagaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgccatggaaacctatatgtttagtttt 37027251  T

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Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 85 - 176
Target Start/End: Original strand, 42063307 - 42063398
Alignment:
Q  85 ttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||   ||||||||||||||    
T  42063307 ttttggtgtctttcaaaaagataagaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgccatggaaacctatatgtttagtttt 42063398  T

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Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 85 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 44937916 - 44937825
Alignment:
Q  85 ttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||| ||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||    
T  44937916 ttttagtgtctttcaaaaagataagaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgccatggaaacatatatgtttagtttt 44937825  T

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Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 55 - 159
Target Start/End: Original strand, 22948249 - 22948354
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttt-tggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtca 153  Q
    ||||| |||||  ||||||||||| |||||||| ||||||| || |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22948249 ataactaatttcattataagaatatcatattttttggtgtctttcaaaaagataagaattgatattatatgatattatatttgttacattgttggtatca 22948348  T
Q  154 ttgaaa 159  Q
    | ||||    
T  22948349 tggaaa 22948354  T

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Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 55 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 35004161 - 35004093
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatat 123  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||    
T  35004161 ataacaaattttgttataagaataacatatttttggtgtcattttaaaagataggaatttatattatat 35004093  T

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Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 129 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 35003969 - 35003922
Alignment:
Q  129 tatatttgttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35003969 tatatttgttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 35003922  T

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Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 69 - 165
Target Start/End: Original strand, 6629157 - 6629247
Alignment:
Q  69 tataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcattgaaaaagata 165  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||  ||||||      || ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  6629157 tataagaatactatattgttggtgtcattaaaaaatataggaattta------attatattatatttgttatattgttggtgtcattgaataagata 6629247  T

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Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 125 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 11420434 - 11420392
Alignment:
Q  125 atattatatttgttacattgttggtgtcattgaaaaagatatg 167  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  11420434 atattatatttgttatattgttggtatcattgaaaaagatatg 11420392  T

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Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 15172415 - 15172375
Alignment:
Q  125 atattatatttgttacattgttggtgtcattgaaaaagata 165  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  15172415 atattatatttgctatattgttggtgtcattgaaaaagata 15172375  T

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Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 87 - 123
Target Start/End: Original strand, 34151139 - 34151175
Alignment:
Q  87 ttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatat 123  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34151139 ttggtgtcatttaaaaagataagaatttatattatat 34151175  T

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Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 129 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 9275797 - 9275750
Alignment:
Q  129 tatatttgttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||    
T  9275797 tatagttgttacattgttggtatcattgaaaaaaatatgtatagtttt 9275750  T

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Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 128 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 41368788 - 41368741
Alignment:
Q  128 ttatatttgttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagttt 175  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || ||||||    
T  41368788 ttatatttgttatattgttagtgtcattgaaaaagataagtatagttt 41368741  T

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Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 8082842 - 8082800
Alignment:
Q  81 atatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatat 123  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  8082842 atatttttgttgtcattcaaaaagataaaaatttctattatat 8082800  T

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Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 123
Target Start/End: Original strand, 16338024 - 16338066
Alignment:
Q  81 atatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatat 123  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  16338024 atattgttggtgtcatttaaaaagataaacaattatattatat 16338066  T

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Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 55 - 88
Target Start/End: Original strand, 12251895 - 12251928
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatattttt 88  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12251895 ataacaaatttcgttataagaataccatattttt 12251928  T

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Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 124 - 161
Target Start/End: Original strand, 39199311 - 39199348
Alignment:
Q  124 gatattatatttgttacattgttggtgtcattgaaaaa 161  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  39199311 gatattatatttgttatattgttggtatcattgaaaaa 39199348  T

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Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 87 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 42328706 - 42328640
Alignment:
Q  87 ttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcattgaaaaa 161  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||        ||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  42328706 ttggtgtcttttaaaaagataagaatttatatta--------tatatttgttgtattgttggtgtcattgaaaaa 42328640  T

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Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 125 - 165
Target Start/End: Original strand, 2442299 - 2442339
Alignment:
Q  125 atattatatttgttacattgttggtgtcattgaaaaagata 165  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||    
T  2442299 atattatatttgttatattattggtttcattgaaaaagata 2442339  T

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Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 125 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 3501406 - 3501366
Alignment:
Q  125 atattatatttgttacattgttggtgtcattgaaaaagata 165  Q
    ||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||    
T  3501406 atattatatttgttatattgttagtatcattgaaaaagata 3501366  T

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Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 125 - 161
Target Start/End: Original strand, 9007443 - 9007479
Alignment:
Q  125 atattatatttgttacattgttggtgtcattgaaaaa 161  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  9007443 atattatatttgttatattgttggtatcattgaaaaa 9007479  T

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Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 110 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 12758808 - 12758780
Alignment:
Q  110 aatttatattatatgatattatatttgtt 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12758808 aatttatattatatgatattatatttgtt 12758780  T

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Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 125 - 165
Target Start/End: Original strand, 17950045 - 17950085
Alignment:
Q  125 atattatatttgttacattgttggtgtcattgaaaaagata 165  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||    
T  17950045 atattatatttgttatattgttgatgtcattgacaaagata 17950085  T

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Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 110 - 138
Target Start/End: Original strand, 29644883 - 29644911
Alignment:
Q  110 aatttatattatatgatattatatttgtt 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29644883 aatttatattatatgatattatatttgtt 29644911  T

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Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 125 - 165
Target Start/End: Original strand, 34103488 - 34103528
Alignment:
Q  125 atattatatttgttacattgttggtgtcattgaaaaagata 165  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||    
T  34103488 atattatatttgttatattgttgatgtcattgaaaatgata 34103528  T

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Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 127 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 34142940 - 34142892
Alignment:
Q  127 attatatttgttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagttt 175  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| || ||||||    
T  34142940 attatatttgttatattgttggtatcatttaaaaagataagtatagttt 34142892  T

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Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 110 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 41154478 - 41154450
Alignment:
Q  110 aatttatattatatgatattatatttgtt 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41154478 aatttatattatatgatattatatttgtt 41154450  T

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Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 110 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 41975772 - 41975744
Alignment:
Q  110 aatttatattatatgatattatatttgtt 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41975772 aatttatattatatgatattatatttgtt 41975744  T

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Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 110 - 138
Target Start/End: Original strand, 44384626 - 44384654
Alignment:
Q  110 aatttatattatatgatattatatttgtt 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44384626 aatttatattatatgatattatatttgtt 44384654  T

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Target: chr7 (Bit Score: 118; Significance: 2e-60; HSPs: 79)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 5483313 - 5483174
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 136  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5483313 cttttccaattatactgtataacaaattttgttataagaatatcatattttttgtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 5483214  T
Q  137 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5483213 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 5483174  T

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Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Original strand, 4406794 - 4406933
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 136  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4406794 cttttccaattataccgtataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataagaatttatattatatgatattatatttg 4406893  T
Q  137 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4406894 ttatattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttaatttt 4406933  T

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Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Original strand, 41343485 - 41343624
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 136  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41343485 cttttccaattatactgtataacaaattttgttataagaatatcatatttttggtgtcatttaaaaatataaaaattaatattatatgatattatatttg 41343584  T
Q  137 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41343585 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 41343624  T

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Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 47840622 - 47840501
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47840622 ataacaaattttgttataagaatatcatatttttggtgtcatttaaaaagataagaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 47840523  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  47840522 tgaaaaagatatgtttagtttt 47840501  T

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Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 35910186 - 35910047
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 136  Q
    |||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  35910186 cttttccaattatactgtataacgaattttgttataagaataccatatttttgatgtcatttaaaaagataagaatttatattatatgatattatatttg 35910087  T
Q  137 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35910086 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttaatttt 35910047  T

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Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 36765481 - 36765342
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 136  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  36765481 cttttccaattatactgtataacaaattttgttataagaatatcatatttttggtgccatttaaaaagataagaatttatattatatgatattatatttg 36765382  T
Q  137 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36765381 ttacattgttgatgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 36765342  T

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Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 47139667 - 47139525
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 136  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  47139667 cttttccaattatactgtataacaaattttgttataagaatatcatatttttggtgtcatttaaaaagataagaatttatattatatgatattatatttg 47139568  T
Q  137 ttacatt---gttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47139567 ttacattgttgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 47139525  T

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Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 36769133 - 36768994
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 136  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  36769133 cttttccaattatactgtataacaaattttgttataagaatatcatatttttggtgtcatttaaatagataagaatttatattatatgatattatatttg 36769034  T
Q  137 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36769033 ttacattgttgatgtcattgaaaaatatatgtttagtttt 36768994  T

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Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Original strand, 40036202 - 40036323
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40036202 ataacatattttgttataagaatatcatatttttggtgtcatttaaaaagataagaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 40036301  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||| ||||||||||||||    
T  40036302 tgaaaaaaatatgtttagtttt 40036323  T

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Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 43110925 - 43110804
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43110925 ataacaaattttgttataagaatatcatatttttggtgtcatttaaaaagataagaatttatattatataatattatatttgttacattgttggtgtcat 43110826  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||||||||||||| ||||    
T  43110825 tgaaaaagatatgtttaatttt 43110804  T

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Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Original strand, 4492616 - 4492737
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4492616 ataacaaattttgttataagaatatcatatttttggtgttatttaaaaagataagaatttatattatatgctattatatttgttacattgttggtgtcat 4492715  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||| ||||||||||||||    
T  4492716 tgaaaaatatatgtttagtttt 4492737  T

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Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 60 - 176
Target Start/End: Original strand, 16933648 - 16933764
Alignment:
Q  60 aaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcattgaaa 159  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16933648 aaattttgttataagaatatcatatttttggtgtcatttaaaaagataagaatttatattatatagtattatatttgttacattgttggtgtcattgaaa 16933747  T
Q  160 aagatatgtttagtttt 176  Q
    |||||||||||||||||    
T  16933748 aagatatgtttagtttt 16933764  T

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Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 60 - 176
Target Start/End: Original strand, 16939031 - 16939147
Alignment:
Q  60 aaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcattgaaa 159  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16939031 aaattttgttataagaatatcatatttttggtgtcatttaaaaagataagaatttatattatatagtattatatttgttacattgttggtgtcattgaaa 16939130  T
Q  160 aagatatgtttagtttt 176  Q
    |||||||||||||||||    
T  16939131 aagatatgtttagtttt 16939147  T

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Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 43 - 168
Target Start/End: Original strand, 44652045 - 44652173
Alignment:
Q  43 ttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgtta 139  Q
    ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  44652045 ttccaattatactgtataacaaattttgttataagaatatcatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatacgatattatatttgtta 44652144  T
Q  140 cattgttggtgtcattgaaaaagatatgt 168  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44652145 tattgttggtgtcattgagaaagatatgt 44652173  T

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Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Original strand, 18956894 - 18957033
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 136  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  18956894 cttttccaattatactctataacaaattttgttataagaataccatatttttagtgttgatcaaaaagataagaatttatattatataatattatatttg 18956993  T
Q  137 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18956994 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 18957033  T

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Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 23154549 - 23154411
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 136  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23154549 cttttccaattatactgtataacaaattttgttataagaatatcatatttatgatgtcatttaaaaagataaaa-tttatattatatgatattatatttg 23154451  T
Q  137 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  23154450 ttacattgttggtgtcattgaaaaatatatttttagtttt 23154411  T

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Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 1447877 - 1447738
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 136  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  1447877 cttttccaattatactttataacaaattttgttataagaataccatatttttagtgttggtcaaaaagataagaatttatattatataatattatatttg 1447778  T
Q  137 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1447777 ttacattgctggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 1447738  T

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Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 38045109 - 38044970
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 136  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  38045109 cttttccaattatactctataacaaattttgttataagaataccatatttttagtgttggtcaaaaagataagaatttatattatataatattatatttg 38045010  T
Q  137 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38045009 ttacattgctggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 38044970  T

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Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Original strand, 19036757 - 19036878
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19036757 ataacaaatttcgttataagaataccatattttttgtgtctttcaaaaagataagaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 19036856  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
     |||| ||||||||||| ||||    
T  19036857 ggaaacagatatgtttaatttt 19036878  T

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Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 20717879 - 20717758
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20717879 ataacaaatttcgttataagaataccatattttttgtgtctttcaaaaagataagaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 20717780  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
     |||| ||||||||||| ||||    
T  20717779 ggaaacagatatgtttaatttt 20717758  T

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Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Original strand, 29449337 - 29449475
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 136  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   | |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||    
T  29449337 cttttccaattatactctataacaaattttgttataagaataccatatttttagtgttggtcaaaaagataagaatttatat-atataatattatatttg 29449435  T
Q  137 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29449436 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 29449475  T

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Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 29488126 - 29488005
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29488126 ataacaaatttcgttataagaataccatattttttgtgtctttcaaaaagataagaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 29488027  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
     |||| ||||||||||| ||||    
T  29488026 ggaaacagatatgtttaatttt 29488005  T

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Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Original strand, 33233052 - 33233173
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33233052 ataacaaatttcgttataagaataccatattttttgtgtctttcaaaaagataagaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 33233151  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
     |||| ||||||||||| ||||    
T  33233152 ggaaacagatatgtttaatttt 33233173  T

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Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Original strand, 34285194 - 34285315
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34285194 ataacaaatttcgttataagaataccatattttttgtgtctttcaaaaagataagaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 34285293  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
     |||| ||||||||||| ||||    
T  34285294 ggaaacagatatgtttaatttt 34285315  T

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Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 38035437 - 38035316
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38035437 ataacaaattttgttataagaataccatatttttagtgttggtcaaaaagataagaatttatattatataatattatatttgttacattgctggtgtcat 38035338  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  38035337 tgaaaaagatatgtttagtttt 38035316  T

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Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 55 - 174
Target Start/End: Original strand, 21134539 - 21134662
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacatt----gttggtg 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    |||||||    
T  21134539 ataacaaattttgttataagaataccatattttttgtgttatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttatattgttggttggtg 21134638  T
Q  151 tcattgaaaaagatatgtttagtt 174  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||    
T  21134639 tcattgaaaaatatatgcttagtt 21134662  T

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Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 8791876 - 8791755
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||   | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8791876 ataacaaattttgttataagaataccatatttttaatgttggtcaaaaagataataatttatattatataatattatatttgttacattgctggtgtcat 8791777  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  8791776 tgaaaaagatatgtttagtttt 8791755  T

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Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 10998870 - 10998749
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||   | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10998870 ataacaaattttgttataagaatgccatatttttagtgttggtcaaaaagataagaatttatattatataatattatatttgttacattggtggtgtcat 10998771  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  10998770 tgaaaaagatatgtttagtttt 10998749  T

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Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 17277606 - 17277468
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 136  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   | |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||    
T  17277606 cttttccaattatactctataacaaattttgttataagaataccatatttttagtgttggtcaaaaagataagaatttatat-atataatattatatttg 17277508  T
Q  137 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17277507 ttacattgctggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 17277468  T

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Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 20762560 - 20762439
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20762560 ataacaaatttcgttataagaataccatattttttgtgtctttcaaaaagataagaatttatattatatgatattatatttcttacattgttggtgtcat 20762461  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
     |||| ||||||||||| ||||    
T  20762460 ggaaacagatatgtttaatttt 20762439  T

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Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Original strand, 23639712 - 23639851
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 136  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  23639712 cttttccaattatactctataacaaattttgttataagaataccatatttttagtgttggtcaaaaagataagaatttatattatataatattatatttg 23639811  T
Q  137 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23639812 ttacattgcggatgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 23639851  T

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Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Original strand, 37669891 - 37670029
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 136  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   | |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||    
T  37669891 cttttccaattatactctataacaaattttgttataagaataccatatttttagtgttggtcaaaaagataagaatttatat-atataatattatatttg 37669989  T
Q  137 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37669990 ttacattgctggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 37670029  T

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Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Original strand, 40240552 - 40240672
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   | |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40240552 ataacaaattttgttataagaataccatatttttagtgttggtcaaaaagataagaatttatat-atataatattatatttgttacattgttggtgtcat 40240650  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  40240651 tgaaaaagatatgtttagtttt 40240672  T

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Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 40788956 - 40788817
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 136  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||   | |||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||    
T  40788956 cttttccaattatactctataacaaattttgttataagaataccatattttcagtgttggtcaaaaagataggaatttatattatataatattatatttg 40788857  T
Q  137 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  40788856 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgttttgtttt 40788817  T

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Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 43155644 - 43155506
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 136  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   | |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||    
T  43155644 cttttccaattatactctataacaaattttgttataagaataccatatttttagtgttggtcaaaaagataagaatttatat-atataatattatatttg 43155546  T
Q  137 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43155545 ttacattgctggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 43155506  T

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Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 45620100 - 45619962
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 136  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   | |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||    
T  45620100 cttttccaattatactctataacaaattttgttataagaataccatatttttagtgttggtcaaaaagataagaatttatat-atataatattatatttg 45620002  T
Q  137 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45620001 ttacattgctggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 45619962  T

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Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 5525997 - 5525874
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttata--ttatatgatattatatttgttacattgttggtgtc 152  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5525997 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagaatttatattataatttatatgatattatatttgttacattgtttgtgtc 5525898  T
Q  153 attgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  5525897 attgaaaaagatatgtttagtttt 5525874  T

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Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Original strand, 4408646 - 4408783
Alignment:
Q  40 cttttccaattataca-taacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgtt 138  Q
    |||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  4408646 cttttccagttatactctaacaaattttattataagaataccatatttttagtgtcagtaaaaaagataagagtttatattatataatattatatttgtt 4408745  T
Q  139 acattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||    
T  4408746 acattgttggtgtctttggaaaatatatgtttagtttt 4408783  T

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Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Original strand, 27031482 - 27031602
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27031482 ataacaaattttgttataagaataccatatttttagtgttggtcaaaaagataagaatttatattatataatattatatttgttacattgctggtgtcat 27031581  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||| ||||||||||||||    
T  27031582 tgaaaaa-atatgtttagtttt 27031602  T

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Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 41426421 - 41426281
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatat-tatatgatattatattt 135  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||   | |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  41426421 cttttccaattatactctataacaaattttgttataagaataccatatttttaatgttggtcaaaaagataagaatttatatatatataatattatattt 41426322  T
Q  136 gttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41426321 gttacattgctggtgtcattgaaaaaaatatgtttagtttt 41426281  T

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Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 55 - 167
Target Start/End: Original strand, 38049611 - 38049723
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||   | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  38049611 ataacaaattttgttataagaatatcatatttttagtgttggtcaaaaagataagaatttatattatatgatattatatttgttacattgctggtgtcgt 38049710  T
Q  155 tgaaaaagatatg 167  Q
    |||||||||||||    
T  38049711 tgaaaaagatatg 38049723  T

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Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 58 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 42915007 - 42914896
Alignment:
Q  58 acaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcattga 157  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  42915007 acaaatttcgttataagaataccatattttttgtgtctttcaagaagataagaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcatgga 42914908  T
Q  158 aaaagatatgtt 169  Q
    || | |||||||    
T  42914907 aacatatatgtt 42914896  T

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Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 63 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 4614780 - 4614667
Alignment:
Q  63 ttttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcattgaaaaag 162  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||     
T  4614780 ttttgttataagaataccatatttttagtgtcagtcaaaaatataagaatttatattatataatattatatttgttacattactggtgtcattggaaaat 4614681  T
Q  163 atatgtttagtttt 176  Q
    ||||||||||||||    
T  4614680 atatgtttagtttt 4614667  T

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Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 63 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 6606487 - 6606374
Alignment:
Q  63 ttttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcattgaaaaag 162  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | |||||| | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||     
T  6606487 ttttgttataagaatatcatatttatagtgtcagtcaaaaagataagaatttatattatataatattatatttgttacattgctggtgtcattggaaaat 6606388  T
Q  163 atatgtttagtttt 176  Q
    ||||||||||||||    
T  6606387 atatgtttagtttt 6606374  T

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Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Original strand, 38436265 - 38436386
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  38436265 ataacaaattttgttataagaataccatattttttgtgtctttcaaaaatataagaatttatattatatgatattatgcttgttacgttgttggtgtcat 38436364  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
     |||| | ||||||||| ||||    
T  38436365 ggaaacaaatatgtttaatttt 38436386  T

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Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Original strand, 32961130 - 32961255
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttt---tggtgtcatttaaaaagataaaaatttatatt-atatgatattatatttgttacattgttggtg 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||   | |||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  32961130 ataacaaattttgttataagaataccatattttaattagtgttggtcaaaaagataagaatttatatttatataatattatatttgttacattgttggtg 32961229  T
Q  151 tcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  32961230 tcattgaaaaatatatgtttagtttt 32961255  T

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Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Original strand, 4491458 - 4491580
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaattt-atattatatgatattatatttgttacattgttggtgtca 153  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  4491458 ataacaaatttcgttataaaaataccatgtttttggtgtcttttaaaaaaataagaattttatattatatgatattatatttgttacattgttggtctca 4491557  T
Q  154 ttgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    | |||| | ||||||||| ||||    
T  4491558 tggaaacatatatgtttattttt 4491580  T

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Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 70 - 159
Target Start/End: Original strand, 42829453 - 42829542
Alignment:
Q  70 ataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcattgaaa 159  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42829453 ataagaataccatattttttgtgtctttcaaaaagataagaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcatggaaa 42829542  T

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Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 56 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 27837044 - 27836924
Alignment:
Q  56 taacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcatt 155  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| || ||||||| |||||||    
T  27837044 taacaaatttcgttataagaataccatatttttggtgactttcaaaaagataagaatttatattatttgacattatatttgctaaattgttgctgtcatt 27836945  T
Q  156 gaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||| | | ||||||||||||    
T  27836944 gaaacatacatgtttagtttt 27836924  T

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Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Original strand, 37310578 - 37310705
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattat------atttgttacattgttgg 148  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||      ||||||| |||||||||    
T  37310578 ataacaaatttcgttatacgaataccatattttttgtgtcattaaaaaagataagaatttatattatatgatattattatataatttgttgcattgttgg 37310677  T
Q  149 tgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  37310678 tgtcaatgaaaaaaatatgtttattttt 37310705  T

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Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 55 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 3839994 - 3839882
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||      || |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3839994 ataacaaattttgttatatgaatactatatttttggtgtcattcaaaaagataagaattta------attatattatatttgttacattgttggtgccat 3839901  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagt 173  Q
    |||||||||||||| ||||    
T  3839900 tgaaaaagatatgtatagt 3839882  T

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Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 55 - 143
Target Start/End: Original strand, 20135546 - 20135634
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacatt 143  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  20135546 ataacaaatttcgttataagaataccatatttttagtgtcattcaaaaagataagaatttatattatataatattatacttgttacatt 20135634  T

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Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 55 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 4404187 - 4404096
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgtt 146  Q
    |||||||||||| |||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4404187 ataacaaatttttttataaaaatatcatattttttatgtcatttaaaaagataagaatttatattatatggtattatatttgttacattgtt 4404096  T

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Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 85 - 176
Target Start/End: Original strand, 6914005 - 6914096
Alignment:
Q  85 ttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||    
T  6914005 ttttggtgtctttcaaaaagataagaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgccatggaaacatatatgtttagtttt 6914096  T

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Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 85 - 176
Target Start/End: Original strand, 47575982 - 47576073
Alignment:
Q  85 ttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||    
T  47575982 ttttggtgtctttcaaaaagataagaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgccatggaaacatatatgtttagtttt 47576073  T

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Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 55 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 17816227 - 17816123
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    |||| |||||| ||||||||||| |  ||||||||||||| || |||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17816227 ataataaatttcgttataagaattctgtatttttggtgtctttaaaaaagataagatattatattgtatgatattatatttgttatattgttggtgtcat 17816128  T
Q  155 tgaaa 159  Q
    |||||    
T  17816127 tgaaa 17816123  T

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Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 55 - 159
Target Start/End: Original strand, 19050763 - 19050867
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    |||| |||||| ||||||||||| |  ||||||||||||| || |||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19050763 ataataaatttcgttataagaattctgtatttttggtgtctttaaaaaagataagatattatattgtatgatattatatttgttatattgttggtgtcat 19050862  T
Q  155 tgaaa 159  Q
    |||||    
T  19050863 tgaaa 19050867  T

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Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
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Target Start/End: Complemental strand, 4404081 - 4404035
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Q  130 atatttgttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4404081 atatttgttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 4404035  T

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Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 130 - 176
Target Start/End: Original strand, 20135653 - 20135699
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Q  130 atatttgttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20135653 atatttgttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 20135699  T

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Target: chr7; HSP #60
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Query Start/End: Original strand, 56 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 1292155 - 1292088
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Q  56 taacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatat 123  Q
    ||||||||||  |||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  1292155 taacaaatttacttataagaatgctatattgttggtgtcattaaaaaagataagaatttatattatat 1292088  T

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Target: chr7; HSP #61
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Query Start/End: Original strand, 127 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 6547776 - 6547739
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    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6547776 attatatttgttatattgttggtgtcattgaaaaagat 6547739  T

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Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 124 - 165
Target Start/End: Original strand, 7814199 - 7814240
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Q  124 gatattatatttgttacattgttggtgtcattgaaaaagata 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  7814199 gatattatatttgttacattgttggtattattgaaaaagata 7814240  T

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Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 10039970 - 10039930
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Q  125 atattatatttgttacattgttggtgtcattgaaaaagata 165  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  10039970 atattatatttgctatattgttggtgtcattgaaaaagata 10039930  T

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Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 47439773 - 47439733
Alignment:
Q  125 atattatatttgttacattgttggtgtcattgaaaaagata 165  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  47439773 atattatatttgttatattgttcgtgtcattgaaaaagata 47439733  T

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Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 113 - 175
Target Start/End: Original strand, 1441581 - 1441644
Alignment:
Q  113 ttatattatatga-tattatatttgttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagttt 175  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| ||||| ||||||    
T  1441581 ttatattatttgagtattatatttgttatattgttggtatcattgaagaagttatgtatagttt 1441644  T

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Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 125 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 13141857 - 13141823
Alignment:
Q  125 atattatatttgttacattgttggtgtcattgaaa 159  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13141857 atattatatttgttatattgttggtgtcattgaaa 13141823  T

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Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 123
Target Start/End: Original strand, 32358875 - 32358917
Alignment:
Q  81 atatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatat 123  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  32358875 atatttttgttgtcattgaaaaagataagaatttatattatat 32358917  T

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Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 123
Target Start/End: Original strand, 35338374 - 35338416
Alignment:
Q  81 atatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatat 123  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  35338374 atattgttggtgtcattaaaaaagataagaatttatattatat 35338416  T

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Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 109 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 9147956 - 9147927
Alignment:
Q  109 aaatttatattatatgatattatatttgtt 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9147956 aaatttatattatatgatattatatttgtt 9147927  T

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Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 55 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 42994999 - 42994966
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatattttt 88  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  42994999 ataacaaatttcgttataagaataccatattttt 42994966  T

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Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 110 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 3794076 - 3794048
Alignment:
Q  110 aatttatattatatgatattatatttgtt 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3794076 aatttatattatatgatattatatttgtt 3794048  T

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Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 91 - 123
Target Start/End: Original strand, 7606279 - 7606311
Alignment:
Q  91 tgtcatttaaaaagataaaaatttatattatat 123  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7606279 tgtcattcaaaaagataaaaatttatattatat 7606311  T

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Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 129
Target Start/End: Original strand, 8146071 - 8146119
Alignment:
Q  81 atatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatatt 129  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  8146071 atattgttggtgtcattaaaaaagataagaaattatattatattatatt 8146119  T

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Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 87 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 10039672 - 10039636
Alignment:
Q  87 ttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatat 123  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  10039672 ttggtgtcattagaaaagataaaaatttatattatat 10039636  T

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Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 125 - 161
Target Start/End: Original strand, 24650027 - 24650063
Alignment:
Q  125 atattatatttgttacattgttggtgtcattgaaaaa 161  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  24650027 atattatatttgttatattgttggtatcattgaaaaa 24650063  T

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Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 125 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 38237498 - 38237462
Alignment:
Q  125 atattatatttgttacattgttggtgtcattgaaaaa 161  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  38237498 atattatatttgttatattgtttgtgtcattgaaaaa 38237462  T

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Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 87 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 38237526 - 38237490
Alignment:
Q  87 ttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatat 123  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  38237526 ttggtgtcattgaaaaagataagaatttatattatat 38237490  T

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Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 123 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 39378719 - 39378667
Alignment:
Q  123 tgatattatatttgttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagttt 175  Q
    ||||||||||||| ||| ||| || |||||||| ||||||||| |||||||||    
T  39378719 tgatattatatttattatattttttgtgtcattaaaaaagataagtttagttt 39378667  T

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Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 87 - 123
Target Start/End: Original strand, 43358776 - 43358812
Alignment:
Q  87 ttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatat 123  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43358776 ttggtgtaatttaaaaagataagaatttatattatat 43358812  T

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Target: chr5 (Bit Score: 118; Significance: 2e-60; HSPs: 74)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 19361559 - 19361420
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 136  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19361559 cttttccaattatactgtataacaaattttgttataagaatatcatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 19361460  T
Q  137 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19361459 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttaatttt 19361420  T

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Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 42416595 - 42416474
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42416595 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataagaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 42416496  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  42416495 tgaaaaagatatgtttagtttt 42416474  T

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Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 43396426 - 43396287
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 136  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43396426 cttttccaattatactgtataacaaattttgttataagaatatcatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 43396327  T
Q  137 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43396326 ttacattattggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 43396287  T

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Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Original strand, 28746502 - 28746623
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28746502 ataacaaattttgttataagaatatcatatttttggtgtcatttaaaaagataagaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 28746601  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  28746602 tgaaaaagatatgtttagtttt 28746623  T

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Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 2463535 - 2463414
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2463535 ataacaaattttgttataagaatatcatatttttggtgtcatttaaaaagataagaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 2463436  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  2463435 tgacaaagatatgtttagtttt 2463414  T

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Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 10042702 - 10042563
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 136  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10042702 cttttccaattatactgtataacaaattttgttataagaataccatattttttgtgtcatttaaaaagataagaatttatattatatgatattatatttg 10042603  T
Q  137 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10042602 ttacattgtttgtgtcattgaaaacgatatgtttagtttt 10042563  T

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Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Original strand, 789176 - 789316
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac----ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatattt 135  Q
    |||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  789176 cttttccaattatacttgtataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagatacgaatttatatcatatgatattatattt 789275  T
Q  136 gttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  789276 gttacattgttggtgtcattgaaaaaaatatgtttagtttt 789316  T

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Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 3246719 - 3246598
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3246719 ataacaaattttgttataagaatatcatatttttggtgtcatttaaaaagataagaatttatattatatggtattatatttgttacattgttggtgtcat 3246620  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    | ||||||||||||||||||||    
T  3246619 taaaaaagatatgtttagtttt 3246598  T

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Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 2529973 - 2529852
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2529973 ataacaaattttgttataagaataccatatttttagtgtcatttaaaaatataagaatttatattatatgatattatatttgttaaattgttggtgtcat 2529874  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||||||||||| |||||||||    
T  2529873 tgaaaaagatatatttagtttt 2529852  T

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Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 19518865 - 19518726
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 136  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19518865 cttttccaattatactctataacaaatttcattataacaataccatattttttgtgtcatttaaaaagataaaaatttctattatatgatattatatttg 19518766  T
Q  137 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19518765 ttacattgttggtgtcattgaaaaaaatatgtttagtttt 19518726  T

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Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 37146972 - 37146833
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 136  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37146972 cttttccaattatactgtataacaaattttgttataagaatatcatattttttatgtcacttaaaaagataagaatttatattatatgatattatatttg 37146873  T
Q  137 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37146872 ttacattgttggtgtcattaaaaaagatatgtttagtttt 37146833  T

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Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 41 - 176
Target Start/End: Original strand, 42111976 - 42112114
Alignment:
Q  41 ttttccaattataca---taacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgt 137  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42111976 ttttccaattatacagtataacaaattttgttttaagaatatcatattttttgtgtcatttaaaaatataaaaatttatattatatgatattatatttgt 42112075  T
Q  138 tacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42112076 tatattgttggtgtcattgacaaagatatgtttagtttt 42112114  T

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Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Original strand, 790225 - 790367
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Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 136  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  790225 cttttccaattatactgtataacaaatttcgttataagaatatcatattttttgtgtcatttaaaaagataagaatttatattatatgatattatatttg 790324  T
Q  137 tt---acattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  790325 ttacaacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 790367  T

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Target: chr5; HSP #14
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Target Start/End: Original strand, 2000834 - 2000972
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Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 136  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||    
T  2000834 cttttccaattatactctataacaaattttgttataagaataccatatttttgatgtcattcaaaaagataagaattcatattatatgatattacatttg 2000933  T
Q  137 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2000934 ttacattgtt-gtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 2000972  T

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Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Original strand, 5589764 - 5589903
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Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 136  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  5589764 cttttccaattatactctataacaaattttgttataagaataccatatttttagtgttgatcaaaaagataagaatttatattatataatattatatttg 5589863  T
Q  137 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5589864 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 5589903  T

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Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 69 - 174
Target Start/End: Original strand, 16166472 - 16166577
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Q  69 tataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgt 168  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  16166472 tataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcattgaaaaatatatgc 16166571  T
Q  169 ttagtt 174  Q
    ||||||    
T  16166572 ttagtt 16166577  T

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Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 41 - 176
Target Start/End: Original strand, 31884962 - 31885100
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Q  41 ttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgt 137  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  31884962 ttttccaattatactctataacaaattttgttataagaataccatatttttagtgttggtcaaaaagataagaatttatattatataatattatatttgt 31885061  T
Q  138 tacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31885062 tacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 31885100  T

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Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 36242235 - 36242097
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Q  40 cttttccaattatac--ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgt 137  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36242235 cttttccaattatatgtataacaaattttgttataagaatatcatatttttggtgtcatttaaaaacataagaatttatattatatggtattatatttgt 36242136  T
Q  138 tacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||    
T  36242135 tacattgttgctgtcattgaaaaaattatgtttagtttt 36242097  T

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Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 8314718 - 8314596
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Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgata-ttatatttgttacattgttggtgtca 153  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  8314718 ataacaaattttgttataagaatatcatattttttgtgtcatttaaaaagataaaaatttagattatatgatatttatatttattacattgttggtgtca 8314619  T
Q  154 ttgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  8314618 ttgaaaaagacatgtttagtttt 8314596  T

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Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Original strand, 30503925 - 30504047
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaaga-taaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtca 153  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30503925 ataacaaattttgttataagaatatcatatttttggtgtcatttaaaaaaaataagaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggagtca 30504024  T
Q  154 ttgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  30504025 ttgacaaagatatgtttagtttt 30504047  T

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Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Original strand, 30544268 - 30544390
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaaga-taaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtca 153  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30544268 ataacaaattttgttataagaatatcatatttttggtgtcatttaaaaaaaataagaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggagtca 30544367  T
Q  154 ttgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  30544368 ttgacaaagatatgtttagtttt 30544390  T

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Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Original strand, 4375154 - 4375293
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 136  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  4375154 cttttccaattatactctataacaaattttgttataagaataccatatttttagtgttgatcaaaaagataagaatttatattatataatattatatttg 4375253  T
Q  137 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4375254 ttacattgctggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 4375293  T

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Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Original strand, 6929444 - 6929583
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 136  Q
    |||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  6929444 cttttccaattatactctacaacaaattttgttataagaataccatatttttagtgttggttaaaaagataagaatttatattatataatattatatttg 6929543  T
Q  137 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6929544 ttacattgctggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 6929583  T

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Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 13351178 - 13351057
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13351178 ataacaaatttcgttataataataccatatttttggtgtctttcaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 13351079  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
     |||| | ||||||||||||||    
T  13351078 agaaacatatatgtttagtttt 13351057  T

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Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Original strand, 16051071 - 16051210
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 136  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||   | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  16051071 cttttccaattatactctataacaaattttgttataagaataccatattattagtgttggtcaaaaagataagaatttatattatataatattatatttg 16051170  T
Q  137 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16051171 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 16051210  T

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Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Original strand, 27177353 - 27177492
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 136  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  27177353 cttttccaattatactctataacaaattttgttataagaataccatatttttagtgttggtcaaaaagataagaatttatattatataatattatatttg 27177452  T
Q  137 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27177453 ttacattgctggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 27177492  T

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Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Original strand, 31940150 - 31940271
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31940150 ataacaaattttgttataagaataccatatttttagtgttggtcaaaaagataaaaatttatattatataatattatatttgttacattgctggtgtcat 31940249  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  31940250 tgaaaaagatatgtttagtttt 31940271  T

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Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Original strand, 32262596 - 32262735
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 136  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  32262596 cttttccaattatactctataacaaattttgttataagaataccatatttttagtgttggtcaaaaagataagaatttatattatataatattatatttg 32262695  T
Q  137 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32262696 ttacattgctggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 32262735  T

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Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 63 - 176
Target Start/End: Original strand, 35380605 - 35380718
Alignment:
Q  63 ttttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcattgaaaaag 162  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35380605 tttttttataagaataccatatttttagtgtcatttaaaaagataagaatttatattatatgatattatatttgttacagtgttggtgtcattgaaaaag 35380704  T
Q  163 atatgtttagtttt 176  Q
    |||| |||||||||    
T  35380705 atatttttagtttt 35380718  T

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Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 36515755 - 36515634
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36515755 ataaaaaaatttattataagaataccatatttttggtgtcattcaaaaagataagaattcatattatatgatattatatttgttacattgttgatgtcat 36515656  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  36515655 tgaaaaagatatgtttagtttt 36515634  T

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Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Original strand, 665862 - 666001
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 136  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  665862 cttttccaattatactctataacaaattttgttataagaataccatatttttagtgttggtcaaaaagataagaatttatattatataatattatatttg 665961  T
Q  137 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  665962 ttacattgctggtgtcattgagaaagatatgtttagtttt 666001  T

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Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 15975423 - 15975284
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 136  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | | ||||| |||| ||||||||||| || ||||||||||||    
T  15975423 cttttccaattatactctataacaaattttgttataagaataccatatttttagtgttagtcaaaaaaataagaatttatattagataatattatatttg 15975324  T
Q  137 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15975323 ttacattgctggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 15975284  T

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Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 25820463 - 25820324
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 136  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  25820463 cttttccaattatactctataacaaattttgttataagaataccatatttttagtgttggtcaaaaagataagaatttatattatataatattatatttg 25820364  T
Q  137 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25820363 ttatattgctggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 25820324  T

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Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 26378971 - 26378850
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26378971 ataacaaattttgttataagaataccatatttttagtgttggtcaaaaagataagaatttatattatataatattatatttgttacattgctggtgtcat 26378872  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  26378871 tgaaaaagatatgtttagtttt 26378850  T

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Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 37461517 - 37461396
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37461517 ataacaaatttcgttataagaataccatattttttgtgtctttcaaaaagataagaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 37461418  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
     |||| ||||||||||| ||||    
T  37461417 ggaaacagatatgtttaatttt 37461396  T

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Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 40307751 - 40307630
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  40307751 ataacaaattttgttataagaataccatatttttagtgtcagtcaaaaagataagaatttatattatataatattatatttgttacattgctggtgtcat 40307652  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    || |||| ||||||||||||||    
T  40307651 tggaaaatatatgtttagtttt 40307630  T

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Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Original strand, 40506966 - 40507104
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 136  Q
    |||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  40506966 cttttccaattatactgtatagcaaattttgttataagaatatcatattttttgtgtcatttaaaaagataagaatttatattatatgatattat-tttg 40507064  T
Q  137 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  40507065 ttacattgttggtgtcattgaaaaaaatatatttaatttt 40507104  T

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Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 57 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 7536534 - 7536416
Alignment:
Q  57 aacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcattg 156  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7536534 aacaaattttgttataagaagatcatatttttggtatcatttaaaaagataagaatttatattatatggtattatatttgttaca-tgttggtgtcattg 7536436  T
Q  157 aaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  7536435 aaaaagatatgttaagtttt 7536416  T

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Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Original strand, 3213653 - 3213774
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3213653 ataacaaattttgatataagaataccatattttttgtgtctttcaaaaatataagaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 3213752  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
     |||| | ||||||||||||||    
T  3213753 ggaaacaaatatgtttagtttt 3213774  T

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Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 24758789 - 24758668
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   | |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24758789 ataacaaattttgttataagaataccatatttttagtgttgatcaaaaagataagaatttatagtatataatattatatttgttacattgctggtgtcat 24758690  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  24758689 tgaaaaagatatgtttagtttt 24758668  T

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Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 55 - 175
Target Start/End: Original strand, 3298154 - 3298274
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3298154 ataacaaattttgttataagaataccatatttttagtgttggtcaaaaagataagaatttatattatataatattatatttgttacattgctggtgtcat 3298253  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagttt 175  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  3298254 taaaaaagatatgtttagttt 3298274  T

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Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Original strand, 2475572 - 2475711
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 136  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||   | |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||    
T  2475572 cttttccaattatactctataacaaattttgttataagaatgacatatttttagtgttggtcaaaaagataagaatttatattatataatattgtatttg 2475671  T
Q  137 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2475672 ttacattgctggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 2475711  T

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Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Original strand, 18041617 - 18041738
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  | || || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18041617 ataacaattttcgttataagaataccatattttttatatctttcaaaaagataagaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 18041716  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
     |||| ||||||||||||||||    
T  18041717 ggaaacagatatgtttagtttt 18041738  T

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Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Original strand, 24028484 - 24028622
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 136  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   | |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||    
T  24028484 cttttccaattatactctataacaaattttgttataagaataccatatttttagtgttggtcaaaaagataagaatttatat-atataatattatatttg 24028582  T
Q  137 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24028583 ttacattgctggtgtcattgaaaaagatatatttagtttt 24028622  T

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Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Original strand, 28400339 - 28400460
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | |||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28400339 ataacaaatttggttataagaattctatattttttgtgtgattcaaaaagataagaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 28400438  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||| ||||||| | |||||||    
T  28400439 tgaagaagatatatatagtttt 28400460  T

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Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 42109596 - 42109457
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 136  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   | ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  42109596 cttttccaattatactctataacaaattttgttataagaataccatatttttagtgttggtcaaaaatataagaatttatattatataatattatatttg 42109497  T
Q  137 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  42109496 ttacattgctggtgtcattgaaaaaaatatgtttaatttt 42109457  T

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Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 42322072 - 42321934
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 136  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||   | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||    
T  42322072 cttttccaattatactctataacaaattttgttataa-aataccatatttttagtgttggtaaaaaagataagaatttatattatataatattatatctg 42321974  T
Q  137 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42321973 ttacattgctggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 42321934  T

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Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 42 - 136
Target Start/End: Original strand, 29874834 - 29874931
Alignment:
Q  42 tttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 136  Q
    |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29874834 tttccaattatactgtataacaaattttgttataagaatatcatatttttggtgtcatttaaaaagataagaatttatattatatgatattatatttg 29874931  T

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Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 9699650 - 9699529
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  9699650 ataacaaattttgttataagaataccatattttttgtgtctttcaaaaatataagaatttatattatatgatattatgcttgttacgttgttggtgtcat 9699551  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
     |||| | ||||||||| ||||    
T  9699550 ggaaacaaatatgtttaatttt 9699529  T

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Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Original strand, 34441607 - 34441744
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 136  Q
    |||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||   | |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  34441607 cttttccaattatactctataactaattttgttataagaataccatatttttagtgttggtcaaaaagataagaatttata-tatataatattatatttg 34441705  T
Q  137 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34441706 ttacattgct-gtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 34441744  T

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Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 56 - 176
Target Start/End: Original strand, 36385666 - 36385786
Alignment:
Q  56 taacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcatt 155  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36385666 taacaaatttcgttataagaataccatattttttgtgactttcaaaaagataagaatttatattatttgacattatatttgctacattgttggtgtcatt 36385765  T
Q  156 gaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||| | | ||||||||||||    
T  36385766 gaaacatacatgtttagtttt 36385786  T

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Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 55 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 43354165 - 43354061
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    ||||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43354165 ataacaaatttcgatataagaattccatattttttgtgtctttaaaaaagataagaatttatattgtatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 43354066  T
Q  155 tgaaa 159  Q
    |||||    
T  43354065 tgaaa 43354061  T

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Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Original strand, 29382756 - 29382871
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||   ||||||   ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29382756 ataacaaattttgttataagaatatcatattttttgtgt---ttaaaa---taagaatttatattatatggtattatatttgttacattgctggtgtcat 29382849  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||||||||||| ||||||    
T  29382850 tgaaaaagatatgttaagtttt 29382871  T

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Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 55 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 33928532 - 33928427
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatattttt-ggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtca 153  Q
    ||||| |||||  ||||||||||| ||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33928532 ataactaatttcattataagaatatcatattttttggtgtctttcaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtca 33928433  T
Q  154 ttgaaa 159  Q
    | ||||    
T  33928432 tggaaa 33928427  T

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Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 56 - 176
Target Start/End: Original strand, 22606148 - 22606268
Alignment:
Q  56 taacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcatt 155  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| || ||||||| |||||||    
T  22606148 taacaaatttcgttataagaataccatatttttggtgactttcaaaaagataagaatttatattatttgacattatatttgctaaattgttgttgtcatt 22606247  T
Q  156 gaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||| | | ||||||||||||    
T  22606248 gaaacatacatgtttagtttt 22606268  T

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Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 69 - 176
Target Start/End: Original strand, 12420716 - 12420823
Alignment:
Q  69 tataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgt 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| |||| | ||||||    
T  12420716 tataagaataccatatttttggtgtctttcaaaacgataagaatttatattatatgatattatatttgttgcattgtttgcgtcatggaaacatatatgt 12420815  T
Q  169 ttagtttt 176  Q
    ||||||||    
T  12420816 ttagtttt 12420823  T

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Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 85 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 19393049 - 19392958
Alignment:
Q  85 ttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||    
T  19393049 ttttggtgtctttcaaaaagataagaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcatagaaacatatatgtttagtttt 19392958  T

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Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 99 - 176
Target Start/End: Original strand, 29384150 - 29384227
Alignment:
Q  99 aaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29384150 aaaaagataagaatttatattatataatattatatttgttacattgctggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 29384227  T

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Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 85 - 176
Target Start/End: Original strand, 31298187 - 31298278
Alignment:
Q  85 ttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||   ||||||||||||||    
T  31298187 ttttggtgtctttcaaaaagataagaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgccatggaaacctatatgtttagtttt 31298278  T

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Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 63 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 14205386 - 14205326
Alignment:
Q  63 ttttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatat 123  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14205386 ttttgttataagaatactatatttttggtgtcatttaaaaagataagaatttatattatat 14205326  T

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Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 129 - 176
Target Start/End: Original strand, 29875230 - 29875277
Alignment:
Q  129 tatatttgttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29875230 tatatttgttacattattggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 29875277  T

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Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 40 - 96
Target Start/End: Original strand, 16488204 - 16488263
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcat 96  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16488204 cttttccaattatactgtataacaaattttgttataagaatatcatatttttggtgtcat 16488263  T

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Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 60 - 103
Target Start/End: Original strand, 31959172 - 31959215
Alignment:
Q  60 aaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaa 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31959172 aaattttgttataagaataccatatttttggtgtcattaaaaaa 31959215  T

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Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 56 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 19270598 - 19270546
Alignment:
Q  56 taacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataa 108  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  19270598 taacaaattttgttataaaaatatcatatttttcgtgtcacttaaaaagataa 19270546  T

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Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 68 - 123
Target Start/End: Original strand, 11832432 - 11832487
Alignment:
Q  68 ttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatat 123  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  11832432 ttataacaatacgatattgttggtgtcattaaaaaagataagaatttatattatat 11832487  T

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Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 1385380 - 1385339
Alignment:
Q  82 tatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatat 123  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1385380 tattattggtgtcatttaaaaaaataaaaatttatattatat 1385339  T

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Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 87 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 14000887 - 14000851
Alignment:
Q  87 ttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatat 123  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14000887 ttggtgtcattaaaaaagataaaaatttatattatat 14000851  T

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Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 125 - 176
Target Start/End: Original strand, 35695314 - 35695365
Alignment:
Q  125 atattatatttgttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  35695314 atattatatgtggtatattgttggtgtcattgaaaaagataagtatagtttt 35695365  T

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Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 65 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 39782239 - 39782191
Alignment:
Q  65 ttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaattta 115  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||||    
T  39782239 ttgttataagaataccatattt--ggtgtcattaaaaaagataagaattta 39782191  T

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Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 125 - 159
Target Start/End: Original strand, 29663456 - 29663490
Alignment:
Q  125 atattatatttgttacattgttggtgtcattgaaa 159  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29663456 atattatatttgttatattgttggtgtcattgaaa 29663490  T

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Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 125 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 4353071 - 4353031
Alignment:
Q  125 atattatatttgttacattgttggtgtcattgaaaaagata 165  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  4353071 atattatatttgttatattattggtgtaattgaaaaagata 4353031  T

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Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 125 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 23085355 - 23085315
Alignment:
Q  125 atattatatttgttacattgttggtgtcattgaaaaagata 165  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||    
T  23085355 atattatatttgttatattgttggtatcattaaaaaagata 23085315  T

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Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 87 - 119
Target Start/End: Original strand, 29632706 - 29632738
Alignment:
Q  87 ttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatatt 119  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29632706 ttggtgtcatttaaaaagataagaatttatatt 29632738  T

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Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 87 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 29686267 - 29686231
Alignment:
Q  87 ttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatat 123  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  29686267 ttggtgtcattcaaaaagataagaatttatattatat 29686231  T

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Target: chr4 (Bit Score: 118; Significance: 2e-60; HSPs: 93)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 17976356 - 17976217
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 136  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17976356 cttttccaattatactgtataacaaattttgttataagaatatcatatttttggtgtcatttaaaaagataagaatttatattatatgatattatatttg 17976257  T
Q  137 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17976256 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 17976217  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 39657622 - 39657483
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 136  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39657622 cttttccaattatactgtataacaaattttgttataagaatatcatatttttggtgtcatttaaaaagataagaatttatattatatgatattatatttg 39657523  T
Q  137 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39657522 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 39657483  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 11180816 - 11180677
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 136  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11180816 cttttccaattatactgtataacaaattttgttataagaatatcatattttttgtgtcatttaaaaagataagaatttatattatatgatattatatttg 11180717  T
Q  137 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11180716 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 11180677  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 39651626 - 39651505
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39651626 ataacaaattttgttataagaatatcatatttttggtgtcatttaaaaagataagaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 39651527  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  39651526 tgaaaaagatatgtttagtttt 39651505  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 43117424 - 43117285
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 136  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  43117424 cttttccaattatactgtataacaaattttgttataagaatatcatatttttggtgtcatttaaaaagataagaatttatactatatgatattatatttg 43117325  T
Q  137 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43117324 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 43117285  T

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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Original strand, 46045960 - 46046099
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 136  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  46045960 cttttccaattatactgtataacaaattttgttataagaatatcatatttttggtgtcatttaaaaagataagaatttatattatatgatattatatttg 46046059  T
Q  137 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  46046060 ttacattgttgatgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 46046099  T

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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 43 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 40951961 - 40951825
Alignment:
Q  43 ttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgtta 139  Q
    ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40951961 ttccaattatactgtataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataagaatttatatcatatgatattatatttgtta 40951862  T
Q  140 cattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40951861 cattgttggtgtcattgaaaaagataagtttagtttt 40951825  T

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Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Original strand, 26097834 - 26097955
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26097834 ataacaaattttgttataagaatatcatatttttggtgtcatttaaaaagataagaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 26097933  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||||||||||||| ||||    
T  26097934 tgaaaaagatatgtttaatttt 26097955  T

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Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 51153374 - 51153253
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51153374 ataacaaattttgttataagaatatcatatttttggtgtcatttaaaaagataagaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 51153275  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  51153274 tgaaaaagatatgtttggtttt 51153253  T

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Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 55 - 174
Target Start/End: Original strand, 41144723 - 41144842
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41144723 ataacaaattttgttataagaataccatattttttgtgtcatttaaaaatataagaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 41144822  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagtt 174  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  41144823 tgaaaaagatatgtttagtt 41144842  T

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Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 55 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 51187554 - 51187436
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  51187554 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataagaatttatattatatgatattatatttgttatattgttggtgtcat 51187455  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagt 173  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  51187454 tgaaaaatatatgtttagt 51187436  T

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Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 8151095 - 8150974
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8151095 ataacaaattttgttataagaatatcatattttttatgtcatttaaaaagataagaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 8150996  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  8150995 tgaaaaagatatgtttagtttt 8150974  T

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Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Original strand, 10582076 - 10582197
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10582076 ataacaaattttgttataagaatatcatatttttggtgtcatttaaaaatataagaatttatattatatggtattatatttgttacattgttggtgtcat 10582175  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  10582176 tgaaaaagatatgtttagtttt 10582197  T

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Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 18138245 - 18138106
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 136  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  18138245 cttttccaattatactgtataacaaattttgttataagaataacatattttttgtgtcatttaaaaagataagaatttatatcatatgatattatatttg 18138146  T
Q  137 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18138145 ttacattgttggtgtcattgaaaaatatatgtttagtttt 18138106  T

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Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Original strand, 28361676 - 28361797
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28361676 ataacaaattttgttataagaatatcatattttttgtgtcatttaaaaagataagaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 28361775  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||| ||||||||||||||    
T  28361776 tgaaaaatatatgtttagtttt 28361797  T

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Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Original strand, 29099788 - 29099927
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 136  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  29099788 cttttccaattatactatataacaaattttgtaataagaatatcatatttttggtgtcatttaaaaacataagaatttatattatatggtattatatttg 29099887  T
Q  137 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29099888 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 29099927  T

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Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 49125454 - 49125315
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 136  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  49125454 cttttccaattatactgtataacaaattttgttataagaataacatattttttgtgtcatttaaaaagataagaatttatatcatatgatattatatttg 49125355  T
Q  137 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  49125354 ttacattgttggtgtcattgaaaaatatatgtttagtttt 49125315  T

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Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 52620528 - 52620407
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52620528 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcattgaaaaagatatgaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 52620429  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||| ||||||||||||||    
T  52620428 tgaaaaatatatgtttagtttt 52620407  T

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Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 43 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 20681104 - 20680968
Alignment:
Q  43 ttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgtta 139  Q
    ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  20681104 ttccaattatactgtataacaaattttgttataagaatatcatatttttggtgtcatttaaaaagataagaatttatattatattgtattatatttgtta 20681005  T
Q  140 cattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20681004 cattgttggtgtcattgaaaaatatatgtttagtttt 20680968  T

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Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Original strand, 24304531 - 24304652
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24304531 ataacaaatttggttataagaatacaatattttttgtgtcatttaaaaagataagaatttacattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 24304630  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  24304631 tgaagaagatatgtttagtttt 24304652  T

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Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Original strand, 41105315 - 41105435
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41105315 ataacaaattttgttataagaataccatattttttgtgtcatttaaaaatataagaattcatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 41105414  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||| ||||||||||||||    
T  41105415 tgaaaaa-atatgtttagtttt 41105435  T

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Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 41 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 34664758 - 34664618
Alignment:
Q  41 ttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatg--atattatattt 135  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||    
T  34664758 ttttccaattatactgtataacaaattttgttataagaataaaatatttttggtgtcatttaaaaagataagaatttatattatatggtatattatattt 34664659  T
Q  136 gttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34664658 attacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttaatttt 34664618  T

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Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 43 - 176
Target Start/End: Original strand, 346774 - 346910
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Q  43 ttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgtta 139  Q
    ||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  346774 ttccaattatactgtataataaattttgttataagaatatcatatttttggtgtcatttaaaaagttaagaatttatattatatggtattatatttgtta 346873  T
Q  140 cattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  346874 catcgttggtgtcattgaaaaagatatgcttagtttt 346910  T

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Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 7365248 - 7365109
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Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 136  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  7365248 cttttccaattatactctataacaaattttgttataagaataccatatttttagtgttggtcaaaaagataagaatttatattatataatattatatttg 7365149  T
Q  137 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7365148 ttacattgctggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 7365109  T

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Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Original strand, 11967301 - 11967440
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 136  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  11967301 cttttccaattatactctataacaaattttgttataagaataccatatttttagtgttggtcaaaaagataagaatttatattatataatattatatttg 11967400  T
Q  137 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11967401 ttacattgctggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 11967440  T

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Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Original strand, 13891617 - 13891756
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 136  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  13891617 cttttccaattatactctataacaaattttgttataagaataccatatttttagtgttggtcaaaaagataagaatttatattatataatattatatttg 13891716  T
Q  137 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13891717 ttacattgctggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 13891756  T

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Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 55991596 - 55991457
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 136  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  55991596 cttttccaattatactctataacaaattttgttataagaataccatatttttagtgttggtcaaaaagataagaatttatattatataatattatatttg 55991497  T
Q  137 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55991496 ttacattgctggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 55991457  T

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Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 61 - 169
Target Start/End: Original strand, 18002647 - 18002755
Alignment:
Q  61 aattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcattgaaaa 160  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18002647 aattttgttataagaatatcatattttttgtttcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttgcattgttggtgtcattgaaaa 18002746  T
Q  161 agatatgtt 169  Q
    |||||||||    
T  18002747 agatatgtt 18002755  T

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Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Original strand, 10262424 - 10262545
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10262424 ataacaaatttcgttataagaataccatattttttgtgtctttcaaaaagataagaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 10262523  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
     |||| ||||||||||| ||||    
T  10262524 ggaaacagatatgtttaatttt 10262545  T

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Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 14640263 - 14640142
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14640263 ataacaaattttgttataagaataccatatttttagtgttggtcaaaaagataagaatttatattatataatattatatttgttacattgctggtgtcat 14640164  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  14640163 tgaaaaagatatgtttagtttt 14640142  T

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Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 21562031 - 21561910
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21562031 ataacaaatttcgttataagaataccatattttttgtgtctttcaaaaagataagaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 21561932  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
     |||| ||||||||||| ||||    
T  21561931 ggaaacagatatgtttaatttt 21561910  T

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Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Original strand, 28117770 - 28117909
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 136  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |   | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  28117770 cttttccaattatactctataacaaattttgttataagaataccatatttttagttttggtcaaaaagataagaatttatattatataatattatatttg 28117869  T
Q  137 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28117870 ttacattgctggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 28117909  T

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Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Original strand, 41986704 - 41986825
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41986704 ataacaaatttcgttataagaataccatattttttgtgtctttcaaaaagataagaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtttcat 41986803  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
     |||||| ||||||||||||||    
T  41986804 ggaaaaatatatgtttagtttt 41986825  T

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Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 43329552 - 43329431
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43329552 ataacaaatttcgttataagaataccatattttttgtgtctttcaaaaagataagaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 43329453  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
     |||| ||||||||||| ||||    
T  43329452 ggaaacagatatgtttaatttt 43329431  T

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Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Original strand, 44855950 - 44856089
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 136  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  44855950 cttttccaattatactctataacaaattttgttataagaatatcatttttttggtgtcattcaaaaagataagaattcatattatatgatattatatttg 44856049  T
Q  137 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||||    
T  44856050 ttacattgctggtgtcactgaaaaagaaatgtttaatttt 44856089  T

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Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Original strand, 45019476 - 45019614
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 136  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||   | |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  45019476 cttttccaattatactctataacaaattttgttataagaaaaccatatttttagtgttggtcaaaaagataaaa-tttatattatataatattatatttg 45019574  T
Q  137 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45019575 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 45019614  T

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Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 51449618 - 51449497
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51449618 ataacaaatttcgttataagaataccatattttttgtgtctttcaaaaagataagaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 51449519  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
     |||| ||||||||||| ||||    
T  51449518 ggaaacagatatgtttaatttt 51449497  T

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Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 11200282 - 11200144
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 136  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   | |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||    
T  11200282 cttttccaattatactctataacaaattttgttataagaataccatatttttagtgttggtcaaaaagataagaatttatat-atataatattatatttg 11200184  T
Q  137 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11200183 ttacattgctggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 11200144  T

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Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Original strand, 26927364 - 26927485
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26927364 ataacaaatttcgttataagaataccatattttttgtgcctttcaaaaagataagaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 26927463  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
     |||| ||||||||||| ||||    
T  26927464 ggaaacagatatgtttaatttt 26927485  T

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Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Original strand, 27289094 - 27289232
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 136  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   | |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||    
T  27289094 cttttccaattatactctataacaaattttgttataagaataccatatttttagtgttggtcaaaaagataagaatttatat-atataatattatatttg 27289192  T
Q  137 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27289193 ttacattgctggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 27289232  T

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Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Original strand, 32207229 - 32207367
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 136  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   | |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||    
T  32207229 cttttccaattatactctataacaaattttgttataagaataccatatttttagtgttggtcaaaaagataagaatttatat-atataatattatatttg 32207327  T
Q  137 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32207328 ttacattgctggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 32207367  T

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Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Original strand, 36190370 - 36190491
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||   | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  36190370 ataacaaattttgttataagaatgccatatttttagtgttggtcaaaaagataagaatttatattatataatattatatttgttacattgttggtgtcgt 36190469  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  36190470 tgaaaaagatatgtttagtttt 36190491  T

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Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 40950396 - 40950258
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 136  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   | |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||    
T  40950396 cttttccaattatactctataacaaattttgttataagaataccatatttttagtgttggtcaaaaagataagaatttatat-atataatattatatttg 40950298  T
Q  137 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40950297 ttacattgctggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 40950258  T

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Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 55187914 - 55187794
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  55187914 ataacaaattttgttataagaataccatatttttagtgttggtcaaaaagataagaatttatattatataatattatatttgttacattgtt-gtgtcat 55187816  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  55187815 tgaaaaagatatgtttagtttt 55187794  T

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Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Original strand, 55209109 - 55209247
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 136  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   | |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||    
T  55209109 cttttccaattatactctataacaaattttgttataagaataccatatttttagtgttggtcaaaaagataagaatttatat-atataatattatatttg 55209207  T
Q  137 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55209208 ttacattgctggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 55209247  T

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Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 41 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 32137953 - 32137815
Alignment:
Q  41 ttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgt 137  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  32137953 ttttccaattatactctataacaaatttctttataaaaataccatattttttgtgtcattcaaaaagataagaagttatattatatgatattatatttgt 32137854  T
Q  138 tacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  32137853 tacattgttggtgtcaatgaaaaagataagtttaatttt 32137815  T

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Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 40 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 23628202 - 23628065
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttat---aagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatat 133  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||   ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  23628202 cttttccaattatactgtataacaaattttgttattataagaataccatgtttttg-tgtcatttaaaaagataagaatttatattatattatattatat 23628104  T
Q  134 ttgttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttag 172  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  23628103 ttgttacattgttgttgtcattgaagaagatatgtttag 23628065  T

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Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 59 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 25881900 - 25881782
Alignment:
Q  59 caaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcattgaa 158  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25881900 caaatttggttataagaatactatatttttcatgtcattcaaaaagataagaatttatattacatgatattatatttgttacattgttggtgtcattgaa 25881801  T
Q  159 aaagatatgtttagtttta 177  Q
    ||||||| || ||||||||    
T  25881800 aaagataggtatagtttta 25881782  T

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Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Original strand, 7400462 - 7400583
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   | |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| | |||||||    
T  7400462 ataacaaattttgttataagaataccatatttttagtgttgataaaaaagataagaatttatagtatataatattatatttgttacattgctagtgtcat 7400561  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  7400562 tgaaaaagatatgtttagtttt 7400583  T

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Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 19587562 - 19587441
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| || |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19587562 ataacaaatttcgttataagaataccaaatttttggcgtctttcaaaaagataagaatttatattatattatattatatttgttacattgttggtgtcat 19587463  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
     |||| | ||||||||||||||    
T  19587462 ggaaacaaatatgtttagtttt 19587441  T

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Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Original strand, 34265287 - 34265407
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   | |||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34265287 ataacaaattttgttataagaataccatatttttagtgttggtcaaaaagataagaatttatat-atataatattatatttgttacattgctggtgtcat 34265385  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  34265386 tgaaaaagatatgtttagtttt 34265407  T

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Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 53274080 - 53273942
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 136  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   | |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||    
T  53274080 cttttccaattatactctataacaaattttgttataagaataccatatttttagtgttggtcaaaaagataagaatttatat-atataatattatatttg 53273982  T
Q  137 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  53273981 ttacattgatggtgtcattgaaaaatatatgtttagtttt 53273942  T

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Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Original strand, 10138522 - 10138642
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   | |||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10138522 ataacaaattttgttataagaataccatatttttagtgttggtcaaaaagataagaatttatat-atataatattatatttgttacattgctggtgtcat 10138620  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||| ||||||||||||||    
T  10138621 tgaaaaaaatatgtttagtttt 10138642  T

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Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Original strand, 26872024 - 26872144
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26872024 ataacaaatttcgttataagaataccatattttttgtgtctttcaaaaatataagaatttatattatatgatattatatttgttacattgtttgtgtcat 26872123  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
     |||| | || |||||||||||    
T  26872124 ggaaacaaat-tgtttagtttt 26872144  T

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Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 69 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 40618361 - 40618256
Alignment:
Q  69 tataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgt 168  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||    
T  40618361 tataagaatacaatatttttggtgtctttcaaaaggataagaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcatggaaacatatatgt 40618262  T
Q  169 ttagtt 174  Q
    ||||||    
T  40618261 ttagtt 40618256  T

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Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 63 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 40664912 - 40664799
Alignment:
Q  63 ttttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcattgaaaaag 162  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||     
T  40664912 ttttgttataagaataccatatttttagtgtcagtcaaaaagataagaatttatattatataatattatatttgttacattgctggtattattggaaaat 40664813  T
Q  163 atatgtttagtttt 176  Q
    ||||||||||||||    
T  40664812 atatgtttagtttt 40664799  T

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Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 55 - 155
Target Start/End: Original strand, 29346653 - 29346753
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| || |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29346653 ataacaaattttgatataagaattccatgtttttggtgtctttaaaaaagataagaatttatattgtatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 29346752  T
Q  155 t 155  Q
    |    
T  29346753 t 29346753  T

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Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 3240191 - 3240048
Alignment:
Q  40 cttttccaattataca---taacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattata-----tgatattat 131  Q
    |||||||||||||||    |||||||||| || |||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     | |||||||    
T  3240191 cttttccaattatactctgtaacaaatttcgt-ataagattatcatatttttggtgtcattcaaaaagataaaaatttatattatactatataatattat 3240093  T
Q  132 atttgttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  3240092 atttgttacattgttggtgtcattgaaaaagaaatgtttaatttt 3240048  T

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Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 22556873 - 22556734
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatatt-----atatgatattat 131  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||     |||| |||||||    
T  22556873 cttttccaattatactgtataacaaattttgttataagaataccatattttttgtgtcatttaaaaagataagaatttatattgtattatataatattat 22556774  T
Q  132 atttgttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||| ||||||     ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22556773 atttattacat-----gtgtcgttgaaaaagatatgtttagtttt 22556734  T

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Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Original strand, 24080495 - 24080623
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatat-------tatatgatattatatttgttacattgttg 147  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||| |||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24080495 ataacaaatttcgttataagaataccatattttttgtgtctttcaaaaagataagaatttatattatatgatatatgatattatatttgttacattgttg 24080594  T
Q  148 gtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||| |||| ||||||||||| ||||    
T  24080595 gtgtcatggaaacagatatgtttaatttt 24080623  T

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Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 63 - 176
Target Start/End: Original strand, 32201145 - 32201258
Alignment:
Q  63 ttttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcattgaaaaag 162  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||  ||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||    
T  32201145 tttttttataagaatacgatatttttaatgtcagtcaaaaagataagaatttatattatataatattatatttgttaaattgctgttgtcattgaaaaag 32201244  T
Q  163 atatgtttagtttt 176  Q
    ||||||||||||||    
T  32201245 atatgtttagtttt 32201258  T

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Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 56 - 176
Target Start/End: Original strand, 33489893 - 33490013
Alignment:
Q  56 taacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcatt 155  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| || ||||||| |||||||    
T  33489893 taacaaatttcgttataagaataccatatttttggtgactttcaaaaagataagaatttatattatttgacattatatttgctaaattgttgctgtcatt 33489992  T
Q  156 gaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||| | | ||||||||||||    
T  33489993 gaaacatacatgtttagtttt 33490013  T

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Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 56 - 176
Target Start/End: Original strand, 43018098 - 43018218
Alignment:
Q  56 taacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcatt 155  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| || ||||||| |||||||    
T  43018098 taacaaatttcgttataagaataccatatttttggtgactttcaaaaagataagaatttatattatttgacattatatttgctaaattgttgctgtcatt 43018197  T
Q  156 gaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||| | | ||||||||||||    
T  43018198 gaaacatacatgtttagtttt 43018218  T

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Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 58 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 13860209 - 13860088
Alignment:
Q  58 acaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgata---ttatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||| |||     
T  13860209 acaaatttcgttataagaataccatattttttgtgtcattaaaaaagataagaatttatattatatgatattattatatttgttgcattgttggtttcaa 13860110  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||| |||| |||| ||||    
T  13860109 tgaaaaatatatatttaatttt 13860088  T

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Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 55 - 149
Target Start/End: Original strand, 35832412 - 35832506
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggt 149  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35832412 ataacaaatttcgttataagaattccatattttttgtgtctttaaaaaagataagaatttatattgtatgatattatatttgttacattgttggt 35832506  T

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Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Original strand, 9097920 - 9098041
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| || || ||||| ||    
T  9097920 ataaaaaatttcgttataagaataccatatttttggtgtctttcaaaaagataagaatttatattatatgatattatattggttatatggtgggtgttat 9098019  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
     |||| |  |||||||||||||    
T  9098020 ggaaatatctatgtttagtttt 9098041  T

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Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 16891209 - 16891088
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||  || | || |||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| |    
T  16891209 ataacaaatttcattataagaataccatattttttatgactttcaaaaagataagaatttatattatttgacattatatttattacattgttggtgtcct 16891110  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||| ||| ||||||||||||    
T  16891109 tgaaacagacatgtttagtttt 16891088  T

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Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 85 - 176
Target Start/End: Original strand, 742950 - 743041
Alignment:
Q  85 ttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||    
T  742950 ttttggtgtctttcaaaaagataagaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgccatggaaacatatatgtttagtttt 743041  T

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Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 85 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 15518465 - 15518374
Alignment:
Q  85 ttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||    
T  15518465 ttttggtgtctttcaaaaagataagaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgccatggaaacatatatgtttagtttt 15518374  T

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Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 63 - 138
Target Start/End: Original strand, 8656018 - 8656093
Alignment:
Q  63 ttttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgtt 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  8656018 ttttgttataagaataccatatttttagtgtcagtcaaaaagataagaatttatactatataatattatatttgtt 8656093  T

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Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Original strand, 47723033 - 47723144
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||          ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47723033 ataacaaatttcgttataagaataccatatttttggtctctttcaaaaatataaaaattt----------atattatatttgttacattgttggtgtcat 47723122  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
     |||| | ||||| ||||||||    
T  47723123 ggaaacaaatatggttagtttt 47723144  T

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Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 55 - 107
Target Start/End: Original strand, 37873829 - 37873881
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagata 107  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  37873829 ataacaaattttgttataagaatatcatatttttggtgtcattgaaaaagata 37873881  T

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Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 40 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 40849637 - 40849567
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagata 107  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||    
T  40849637 cttttccaattatactgtataacaaattttgttataagaatatcatattttttgtgtcattgaaaaagata 40849567  T

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Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 57 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 6028694 - 6028627
Alignment:
Q  57 aacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatg 124  Q
    ||||||||||  || |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  6028694 aacaaattttcatacaagaatgctatatttttggtgtcattaaaaaagataagaatttatattatatg 6028627  T

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Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 81 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 32820082 - 32820040
Alignment:
Q  81 atatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatat 123  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  32820082 atatttttggtgttattaaaaaagataaaaatttatattatat 32820040  T

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Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 130 - 175
Target Start/End: Original strand, 5580526 - 5580571
Alignment:
Q  130 atatttgttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagttt 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||    
T  5580526 atatttgttacattgttggtgtcattgaaaaaggtaagtatagttt 5580571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 124 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 46250884 - 46250843
Alignment:
Q  124 gatattatatttgttacattgttggtgtcattgaaaaagata 165  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  46250884 gatattatatttgttatattgttggtatcattgaaaaagata 46250843  T

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Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 165
Target Start/End: Original strand, 26067303 - 26067343
Alignment:
Q  125 atattatatttgttacattgttggtgtcattgaaaaagata 165  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  26067303 atattatatttgttatatcgttggtgtcattgaaaaagata 26067343  T

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Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 129 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 42906461 - 42906425
Alignment:
Q  129 tatatttgttacattgttggtgtcattgaaaaagata 165  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  42906461 tatatttgttatattgttggtgtcattgaaaaagata 42906425  T

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Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 126 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 5105689 - 5105650
Alignment:
Q  126 tattatatttgttacattgttggtgtcattgaaaaagata 165  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  5105689 tattatatttgttatattgttggtatcattgaaaaagata 5105650  T

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Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 123
Target Start/End: Original strand, 1237531 - 1237573
Alignment:
Q  81 atatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatat 123  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  1237531 atattgttggtgtcattaaaaaagataagaatttatattatat 1237573  T

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Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 27746727 - 27746685
Alignment:
Q  81 atatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatat 123  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  27746727 atattattggtgtcattgaaaaagataagaatttatattatat 27746685  T

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Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 82 - 123
Target Start/End: Original strand, 1014916 - 1014957
Alignment:
Q  82 tatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatat 123  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  1014916 tattgttggtgtcattaaaaaagatcaaaatttatattatat 1014957  T

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Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 81 - 122
Target Start/End: Original strand, 39678117 - 39678158
Alignment:
Q  81 atatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattata 122  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  39678117 atatttttggtgtcattctaaatgataaaaatttatattata 39678158  T

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Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 110 - 138
Target Start/End: Original strand, 575715 - 575743
Alignment:
Q  110 aatttatattatatgatattatatttgtt 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  575715 aatttatattatatgatattatatttgtt 575743  T

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Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 87 - 123
Target Start/End: Original strand, 4505827 - 4505863
Alignment:
Q  87 ttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatat 123  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  4505827 ttggtgtcattcaaaaagataagaatttatattatat 4505863  T

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Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 125 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 4608694 - 4608658
Alignment:
Q  125 atattatatttgttacattgttggtgtcattgaaaaa 161  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  4608694 atattatatttgttatattgttggtgtcatttaaaaa 4608658  T

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Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 129 - 165
Target Start/End: Original strand, 11159903 - 11159939
Alignment:
Q  129 tatatttgttacattgttggtgtcattgaaaaagata 165  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  11159903 tatatttgttatattgttggtgttattgaaaaagata 11159939  T

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Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 110 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 16903850 - 16903822
Alignment:
Q  110 aatttatattatatgatattatatttgtt 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16903850 aatttatattatatgatattatatttgtt 16903822  T

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Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 87 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 32006704 - 32006669
Alignment:
Q  87 ttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatat 123  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  32006704 ttggtgtcatt-aaaaagataaaaatttatattatat 32006669  T

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Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 110 - 138
Target Start/End: Original strand, 35713785 - 35713813
Alignment:
Q  110 aatttatattatatgatattatatttgtt 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35713785 aatttatattatatgatattatatttgtt 35713813  T

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Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 148 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 40849584 - 40849556
Alignment:
Q  148 gtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40849584 gtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 40849556  T

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Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 125 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 43028269 - 43028229
Alignment:
Q  125 atattatatttgttacattgttggtgtcattgaaaaagata 165  Q
    ||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  43028269 atattgtatttgttacattgttagtatcattgaaaaagata 43028229  T

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Target: chr2 (Bit Score: 118; Significance: 2e-60; HSPs: 67)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 3079627 - 3079488
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 136  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3079627 cttttccaattatactgtataacaaattttgttataagaatatcatatttttggtgtcatttaaaaagataagaatttatattatatgatattatatttg 3079528  T
Q  137 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3079527 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 3079488  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 40202140 - 40202001
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 136  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  40202140 cttttccaattatactgtataacaaattttgttataagaatatcatatttttggtgtcatttaaaaagataagaatttatattatatgatattatatttg 40202041  T
Q  137 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40202040 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 40202001  T

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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 41452743 - 41452604
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 136  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  41452743 cttttccaattatactgtataacaaattttgttataagaatatcatatttttggtgtcatttaaaaagataagaatttatattatatgatattatatttg 41452644  T
Q  137 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41452643 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 41452604  T

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Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 116; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 9 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 7274658 - 7274488
Alignment:
Q  9 ttcgaacccgggaccttgcatatannnnnnncttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaaga 105  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||       |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  7274658 ttcgaacccaggaccatgcatatatttttttcttttccaattatactatataacaaattttgttataagaataccataattttggtgtaatttaaaaaga 7274559  T
Q  106 taaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7274558 taaaaatttatattatataatattatatttgttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 7274488  T

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Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 4631164 - 4631025
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 136  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4631164 cttttccaattatactatataacaaattttgttataggaataccataattttggtgtcatttaaaaaaataaaaatttatattatatgatattatatttg 4631065  T
Q  137 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4631064 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 4631025  T

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Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 38879047 - 38878910
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac-ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgtt 138  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38879047 cttttccaattatagtataacaaattttgttataagaatatcatatttttggtgtcatttaaaaagataagaatttatattatatgatattatatttgtt 38878948  T
Q  139 acattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38878947 acattgttggtgtcattgataaagatatgtttagtttt 38878910  T

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Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 38709616 - 38709476
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 136  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  38709616 cttttccaattatactgtataacaaattttgttataagaatatcatatttttggtgtcatttaaaaagataagaatttatattatatgatattatatttg 38709517  T
Q  137 ttacattgttggtgtcattga-aaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38709516 ttacattgttggtgtcattgaaaaaagatatgtttagtttt 38709476  T

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Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 59 - 176
Target Start/End: Original strand, 13552089 - 13552206
Alignment:
Q  59 caaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcattgaa 158  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13552089 caaattttgttataagaatatcatatttttggtgtcatttaaaaagataagaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcattgaa 13552188  T
Q  159 aaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||||||||||||||    
T  13552189 aaagatatgtttagtttt 13552206  T

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Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 35423697 - 35423558
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 136  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  35423697 cttttccaattatactgtataacaaattttgttataagtatatcatatttttggtatcatttaaaaagataagaatttatattatatgatattatatttg 35423598  T
Q  137 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35423597 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 35423558  T

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Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 2179911 - 2179790
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  2179911 ataacaaattttgttataagaataccatattttttgtgtcatttaaaaagataagaatttatatcatatgatattatatttgttacattgttggtgtcgt 2179812  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  2179811 tgaaaaagatatgtttagtttt 2179790  T

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Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 10120521 - 10120382
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 136  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  10120521 cttttccaattatactgtataacaaattttgttataagaatatcatatttttggtgtcatttaaaaacataagaatttatattatatggtattatatttg 10120422  T
Q  137 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10120421 ttacattgttggtgtcattgaaaaaaatatgtttagtttt 10120382  T

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Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 26656213 - 26656074
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 136  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  26656213 cttttccaattataccctataacaaatttcgttataagaatatcatatttttggtctcatttaaaaagataagaatttatattatatgatattatattta 26656114  T
Q  137 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26656113 ctacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 26656074  T

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Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 34912544 - 34912423
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34912544 ataacaaattttgttataagaatatcatatttttgatgtcatttaaaaagataagaatctatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 34912445  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||||||||||||| ||||    
T  34912444 tgaaaaagatatgtttaatttt 34912423  T

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Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 56 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 45474352 - 45474232
Alignment:
Q  56 taacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcatt 155  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  45474352 taacaaattttgttttaagaatatcatattttttgtgtcatttaaaaagataataatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtatcatt 45474253  T
Q  156 gaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  45474252 gaaaaagatatgtttagtttt 45474232  T

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Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Original strand, 3243459 - 3243598
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 136  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  3243459 cttttccaattatactgtataacaaattttgttacaagaatatcatatttttggtgccatttaaaaagataagaatttatattatatggtattatatttg 3243558  T
Q  137 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3243559 ttacattgttcgtgtcattgaaaaagatatgtttggtttt 3243598  T

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Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Original strand, 24926382 - 24926521
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 136  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  24926382 cttttccaattatactctataacaaattttgttataagaataccatatttttagtgttggtcaaaaagataagaatttatattatataatattatatttg 24926481  T
Q  137 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24926482 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 24926521  T

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Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 5166025 - 5165904
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5166025 ataacaaattttgttataagaataccatatttttagtgttggtcaaaaagataagaatttatattatataatattatatttgttacattgttggtgtcat 5165926  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  5165925 tgaaaaagatatgtttagtttt 5165904  T

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Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 61 - 169
Target Start/End: Original strand, 20642184 - 20642292
Alignment:
Q  61 aattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcattgaaaa 160  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20642184 aattttgttataagaatatcatattttttgtttcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttgcattgttggtgtcattgaaaa 20642283  T
Q  161 agatatgtt 169  Q
    |||||||||    
T  20642284 agatatgtt 20642292  T

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Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 63 - 176
Target Start/End: Original strand, 668486 - 668599
Alignment:
Q  63 ttttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcattgaaaaag 162  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  668486 tttttttataagaataccatattttttgtgtcatttaaaaagataagaatttatattatatgatattatatttgtcacattgttggtgtcattgaaaaat 668585  T
Q  163 atatgtttagtttt 176  Q
    ||||||||| ||||    
T  668586 atatgtttattttt 668599  T

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Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 3708099 - 3707978
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3708099 ataacaaatttcgttataagaataccatattttttgtgtctttcaaaaagataagaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 3708000  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
     |||| ||||||||||| ||||    
T  3707999 ggaaacagatatgtttaatttt 3707978  T

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Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Original strand, 11869317 - 11869438
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11869317 ataacaaatttcgttataagaataccatattttttgtgtctttcaaaaagataagaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 11869416  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
     |||| ||||||||||| ||||    
T  11869417 ggaaacagatatgtttaatttt 11869438  T

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Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Original strand, 35360710 - 35360831
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35360710 ataacaaatttcgttataagaataccatattttttgtgtctttcaaaaagataagaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 35360809  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
     |||| ||||||||||| ||||    
T  35360810 ggaaacagatatgtttaatttt 35360831  T

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Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Original strand, 38960508 - 38960647
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 136  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||   | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  38960508 cttttccaattatactccataacaaattttgttataagaatatcatatttttagtgttggtcaaaaagataagaatttatattatataatattatatttg 38960607  T
Q  137 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38960608 ttacattgctggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 38960647  T

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Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 37522606 - 37522465
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttg-gtgtcatttaaaaagataa-aaatttatattatatgatattatatt 134  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| || ||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  37522606 cttttccaattatactgtataacaaattttgttataagaatatcacatttttttgtgtcatttaaaaagataagaaatttatattatatgatattatatt 37522507  T
Q  135 tgttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37522506 tgttatattgtttgtgtcattgaaaaatatatgtttagtttt 37522465  T

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Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Original strand, 9799751 - 9799872
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    ||||||||||| || ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9799751 ataacaaatttcgtcataagaatatcatattttttgtgtcattcaaaaagataagaatttatgttatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 9799850  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    | ||||||||||||||| ||||    
T  9799851 tcaaaaagatatgtttaatttt 9799872  T

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Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 87 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 32292269 - 32292180
Alignment:
Q  87 ttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32292269 ttggtgtcatttaaaaagataagaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 32292180  T

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Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 63 - 176
Target Start/End: Original strand, 36079210 - 36079323
Alignment:
Q  63 ttttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcattgaaaaag 162  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||     
T  36079210 ttttgttataagaataccatatttttagtgtcagttaaaaagataagaatttatattatataatattatatttgttacattgctggtgtcattggaaaat 36079309  T
Q  163 atatgtttagtttt 176  Q
    ||||||||||||||    
T  36079310 atatgtttagtttt 36079323  T

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Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 84 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 1117890 - 1117798
Alignment:
Q  84 tttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1117890 ttttttgtgtcatttaaaaagataagaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 1117798  T

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Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 67 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 22078038 - 22077930
Alignment:
Q  67 gttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcattgaaaaagatat 166  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  22078038 gttataagaatatcatatttttggtgtcatttaaaaagataagaatttatattatatggtattatatttgttacattgttgatatcattgaaaaatatat 22077939  T
Q  167 gtttagttt 175  Q
    |||||||||    
T  22077938 gtttagttt 22077930  T

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Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 43 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 7229467 - 7229331
Alignment:
Q  43 ttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgtta 139  Q
    ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||   | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7229467 ttccaattatactctataacaaattttgttataagaatatcatatttttagtgttggtcaaaaagataagaatttatattatataatattatatttgtta 7229368  T
Q  140 cattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7229367 cattgctggtgtcattgaaaaagatatctttagtttt 7229331  T

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Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 969930 - 969792
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 136  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   | ||| |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||    
T  969930 cttttccaattatactctataacaaattttgttataagaataccatatttttagtgttggtcaaacagataagaatttatat-atataatattatatttg 969832  T
Q  137 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  969831 ttacattgctggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 969792  T

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Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Original strand, 1693051 - 1693172
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1693051 ataacaaatttcgttataagaatatcatatttttggtgtctttgaaaaatataagaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtatcat 1693150  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
     |||| | ||||||||||||||    
T  1693151 ggaaacaaatatgtttagtttt 1693172  T

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Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 1835431 - 1835311
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||   | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1835431 ataacaaattt-gttataagaataccatatttttagtgttggtcaaaaagataagaatttatattatataatattatatttgttacattgctggtgtcat 1835333  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  1835332 tgaaaaagatatgtttagtttt 1835311  T

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Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Original strand, 3324903 - 3325023
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   | |||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3324903 ataacaaattttgttataagaataccatatttttagtgttggtcaaaaagataagaatttatat-atataatattatatttgttacattgctggtgtcat 3325001  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  3325002 tgaaaaagatatgtttagtttt 3325023  T

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Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 8877573 - 8877435
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 136  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   | |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||    
T  8877573 cttttccaattatactctataacaaattttgttataagaataccatatttttagtgttggtcaaaaagataagaatttatat-atataatattatatttg 8877475  T
Q  137 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8877474 ttacattgctggtgtcattgaaaaagatatgtttaatttt 8877435  T

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Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 31971703 - 31971583
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   | |||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31971703 ataacaaattttgttataagaataccatatttttagtgttggtcaaaaagataagaatttatat-atataatattatatttgttacattgctggtgtcat 31971605  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  31971604 tgaaaaagatatgtttagtttt 31971583  T

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Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 19491670 - 19491549
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  19491670 ataacaaatttcgttataagaataccatatttttggtgactttcaaaaagataagaatttatattatttgacattatatttgctacattgttggtgtcat 19491571  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||| ||| ||||||| ||||    
T  19491570 tgaaacagacatgtttaatttt 19491549  T

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Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Original strand, 36086280 - 36086401
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   | |||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  36086280 ataacaaattttgttataagaataccatatttttagtgttggtcaaaaagataagaatttatattatataatattgtatttgttacattgctggtgtcat 36086379  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||||| ||||||| ||||    
T  36086380 tgaaaaagacatgtttaatttt 36086401  T

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Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 7360102 - 7359981
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||     
T  7360102 ataacaaatttcattataagaataccatatttttggtgactttcaaaaagataagaatttatattatttgacattatatttgctacattgttggtgtcac 7360003  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
     |||| | | ||||||||||||    
T  7360002 cgaaacatacatgtttagtttt 7359981  T

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Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 85 - 176
Target Start/End: Original strand, 1995582 - 1995673
Alignment:
Q  85 ttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||    
T  1995582 ttttggtgtctttcaaaaagataagaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgccatggaaacatatatgtttagtttt 1995673  T

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Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 85 - 176
Target Start/End: Original strand, 6345377 - 6345468
Alignment:
Q  85 ttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||    
T  6345377 ttttggtgtctttcaaaaagataagaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgccatggaaacatatatgtttagtttt 6345468  T

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Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 85 - 176
Target Start/End: Original strand, 14325854 - 14325945
Alignment:
Q  85 ttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||    
T  14325854 ttttggtgtctttcaaaaagataagaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgccatggaaacatatatgtttagtttt 14325945  T

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Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 40 - 146
Target Start/End: Original strand, 17051301 - 17051410
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 136  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  17051301 cttttccaattatactgtataacaaatttagttataagaatatcattttttttttgtcatttaaaaacataagaatttatattatatggtattatatttg 17051400  T
Q  137 ttacattgtt 146  Q
    ||||||||||    
T  17051401 ttacattgtt 17051410  T

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Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 55 - 159
Target Start/End: Original strand, 35287832 - 35287937
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttg-gtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtca 153  Q
    ||||| |||||  ||||||||||| |||||||||  ||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35287832 ataactaatttcattataagaatatcatatttttttgtgtctttcaaaaagataagaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtca 35287931  T
Q  154 ttgaaa 159  Q
    | ||||    
T  35287932 tggaaa 35287937  T

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Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 40 - 146
Target Start/End: Original strand, 17032976 - 17033085
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 136  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||| ||| || ||  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  17032976 cttttccaattatactgtataacaaatttagttataagaatatcattttctttttgtcatttaaaaacataagaatttatattatatggtattatatttg 17033075  T
Q  137 ttacattgtt 146  Q
    ||||||||||    
T  17033076 ttacattgtt 17033085  T

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Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 85 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 28499932 - 28499841
Alignment:
Q  85 ttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||   ||||||||||||||    
T  28499932 ttttggtgtctttcaaaaagataagaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgccatggaaacctatatgtttagtttt 28499841  T

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Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 130 - 176
Target Start/End: Original strand, 17033099 - 17033145
Alignment:
Q  130 atatttgttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17033099 atatttgttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 17033145  T

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Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 130 - 176
Target Start/End: Original strand, 17051425 - 17051471
Alignment:
Q  130 atatttgttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17051425 atatttgttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 17051471  T

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Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 14750484 - 14750370
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttg--gtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtc 152  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || || || ||||| |||| ||||||||||||||          |||||||||||||||||||    
T  14750484 ataacaaatttcgttataagaataccatatttttgtggtctctttcaaaaatataagaatttatattatat----------ttgttacattgttggtgtc 14750395  T
Q  153 attgaaaaagatatgtttagtttta 177  Q
    || |||| | |||||||||||||||    
T  14750394 atggaaacaaatatgtttagtttta 14750370  T

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Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 57 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 3752550 - 3752487
Alignment:
Q  57 aacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatatta 120  Q
    |||||||||| |||||||||||| | ||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3752550 aacaaattttcttataagaatactacattgttgatgtcatttaaaaagataagaatttatatta 3752487  T

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Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 81 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 744955 - 744913
Alignment:
Q  81 atatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatat 123  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  744955 atattgttggtgttatttaaaaagataaaaatttatattatat 744913  T

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Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 18612426 - 18612390
Alignment:
Q  125 atattatatttgttacattgttggtgtcattgaaaaa 161  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18612426 atattatatttgttatattgttggtgtcattgaaaaa 18612390  T

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Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 60 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 6786792 - 6786729
Alignment:
Q  60 aaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatat 123  Q
    |||||||  ||||||||| | || || |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  6786792 aaattttactataagaatgctattttgttggtgtcatttaaaaagattaaaatttatactatat 6786729  T

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Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 129 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 15502293 - 15502246
Alignment:
Q  129 tatatttgttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| || |||||||    
T  15502293 tatatttgttatattgttggtatcattgaaaaagataagtatagtttt 15502246  T

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Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 124 - 175
Target Start/End: Original strand, 40859870 - 40859921
Alignment:
Q  124 gatattatatttgttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagttt 175  Q
    |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| || ||||||    
T  40859870 gatattatatttgtaatattgttggtatcattgaaaaagataagtatagttt 40859921  T

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Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 123
Target Start/End: Original strand, 2001175 - 2001229
Alignment:
Q  69 tataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatat 123  Q
    ||||||||||  ||||| || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  2001175 tataagaatattatattgtttgtgtcatttaaaaagttaagaatttatattatat 2001229  T

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Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 130 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 740587 - 740542
Alignment:
Q  130 atatttgttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagttt 175  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| || ||||||    
T  740587 atatttgttatattgttggtatcattgaaaaagataagtatagttt 740542  T

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Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 70 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 11694273 - 11694220
Alignment:
Q  70 ataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatat 123  Q
    |||||||| | || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  11694273 ataagaatgctattttgttggtgtcattcaaaaatataaaaatttatattatat 11694220  T

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Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 87 - 120
Target Start/End: Original strand, 27312940 - 27312973
Alignment:
Q  87 ttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatatta 120  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27312940 ttggtgtcattcaaaaagataaaaatttatatta 27312973  T

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Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 130 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 29750356 - 29750311
Alignment:
Q  130 atatttgttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagttt 175  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| || ||||||    
T  29750356 atatttgttatattgttggtatcattgaaaaagataagtatagttt 29750311  T

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Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 125 - 161
Target Start/End: Original strand, 1071713 - 1071749
Alignment:
Q  125 atattatatttgttacattgttggtgtcattgaaaaa 161  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  1071713 atattatatttgttatattgttagtgtcattgaaaaa 1071749  T

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Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 110 - 138
Target Start/End: Original strand, 9918384 - 9918412
Alignment:
Q  110 aatttatattatatgatattatatttgtt 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9918384 aatttatattatatgatattatatttgtt 9918412  T

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Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 87 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 11681682 - 11681646
Alignment:
Q  87 ttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatat 123  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  11681682 ttggtgtcattcaaaaatataaaaatttatattatat 11681646  T

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Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 110 - 138
Target Start/End: Original strand, 18094408 - 18094436
Alignment:
Q  110 aatttatattatatgatattatatttgtt 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18094408 aatttatattatatgatattatatttgtt 18094436  T

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Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 125 - 165
Target Start/End: Original strand, 25527410 - 25527450
Alignment:
Q  125 atattatatttgttacattgttggtgtcattgaaaaagata 165  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  25527410 atattatatttgttatattgtcggtgttattgaaaaagata 25527450  T

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Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 75 - 123
Target Start/End: Original strand, 27649224 - 27649272
Alignment:
Q  75 aataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatat 123  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  27649224 aatactatattgttgatgtcattgaaaaagataagaatttatattatat 27649272  T

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Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 69 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 41860340 - 41860288
Alignment:
Q  69 tataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattat 121  Q
    ||||||||| | ||||| ||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  41860340 tataagaatgctatattgttgatgtcctttaaaaagataagaatttatattat 41860288  T

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Target: chr1 (Bit Score: 118; Significance: 2e-60; HSPs: 77)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Original strand, 7308635 - 7308756
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7308635 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataagaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 7308734  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  7308735 tgaaaaagatatgtttagtttt 7308756  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 34078174 - 34078053
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34078174 ataacaaattttgttataagaatatcatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 34078075  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  34078074 tgaaaaagatatgtttagtttt 34078053  T

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Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Original strand, 31638715 - 31638836
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31638715 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataagaatttatattctatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 31638814  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  31638815 tgaaaaagatatgtttagtttt 31638836  T

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Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Original strand, 46040747 - 46040868
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46040747 ataataaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataagaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 46040846  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  46040847 tgaaaaagatatgtttagtttt 46040868  T

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Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 17248826 - 17248705
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17248826 ataataaattttgttataagaataccatatttttggtgttatttaaaaagataagaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 17248727  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  17248726 tgaaaaagatatgtttagtttt 17248705  T

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Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Original strand, 17366530 - 17366651
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17366530 ataacaaattttgttataagaatatcatatttttggtgtcatttaaaaagataagaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 17366629  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||| ||||||||||||||    
T  17366630 tgaaaaatatatgtttagtttt 17366651  T

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Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Original strand, 39879320 - 39879441
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39879320 ataacaaattttgttataagaatatcatatttttggtgtcatttaaaaagataagaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 39879419  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||||||| ||||||||||    
T  39879420 tgaaaaagatacgtttagtttt 39879441  T

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Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 40 - 209
Target Start/End: Original strand, 24473716 - 24473882
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 136  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24473716 cttttccaattatactatataacaaattttgtaataagaatatcatatttttggtgtcatttaaaaagataagaatttatattatatgatattatatttg 24473815  T
Q  137 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagttttaannnnnnnaataagaaaaagatatgcatagtg 209  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||         ||||||||||||||||||||||||    
T  24473816 ttacattgttggtgtcattgaaaaggatatgtttaatttt------tttaataagaaaaagatatgcatagtg 24473882  T

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Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Original strand, 39729388 - 39729509
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39729388 ataacaaattttgttataagaatattatatttttggtgtcatttaaaaagataagaatttatattatatgatattatatttgttacgttgttggtgtcat 39729487  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  39729488 tgaaaaagatatgtttagtttt 39729509  T

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Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 44821108 - 44820987
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  44821108 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcattcaaaaagataagaatttatattatataatattatatttgttacattgttagtgtcat 44821009  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  44821008 tgaaaaagatatgtttagtttt 44820987  T

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Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 41 - 176
Target Start/End: Original strand, 43119278 - 43119416
Alignment:
Q  41 ttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgt 137  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  43119278 ttttccaattatactatataacaaattttgttataagaatatcatatttttggcgtcatttaaaaatataagaatttatattatatggtattatatttgt 43119377  T
Q  138 tacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43119378 tacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 43119416  T

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Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 33932810 - 33932690
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33932810 ataacaaattt-gttataagaatatcatatttttggtgtcatttaaaaagataagaatttatattatatgatattatattttttacattgttggtgtcat 33932712  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  33932711 tgaaaaagatatgtttagtttt 33932690  T

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Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 55 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 49571097 - 49570982
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49571097 ataataaattttgttataagaatatcatatttttggtgtcatttaaaaagataagaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 49570998  T
Q  155 tgaaaaagatatgttt 170  Q
    ||||||| ||||||||    
T  49570997 tgaaaaatatatgttt 49570982  T

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Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 58 - 176
Target Start/End: Original strand, 11606810 - 11606928
Alignment:
Q  58 acaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcattga 157  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11606810 acaaattttgttataagaataccatattttttgtgtcattcaaaaagataagaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtatcattga 11606909  T
Q  158 aaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||| |||||||||||||||    
T  11606910 aaatgatatgtttagtttt 11606928  T

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Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 67 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 45588971 - 45588862
Alignment:
Q  67 gttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcattgaaaaagatat 166  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  45588971 gttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataagaatttacattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcattgaagaagatat 45588872  T
Q  167 gtttagtttt 176  Q
    ||||||||||    
T  45588871 gtttagtttt 45588862  T

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Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 34652185 - 34652062
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatattttt--ggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtc 152  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34652185 ataacaaattttgttataagaatatcatatttttttgttgtcatttaaaaagataagaatttatattatatgatattatatttgttacattgttgatgtc 34652086  T
Q  153 attgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  34652085 attgaaaaagatatgtttagtttt 34652062  T

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Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Original strand, 39327344 - 39327483
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 136  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  39327344 cttttccaattatactctataacaaattttgttataagaataccatatttttagtgttggtcaaaaagataagaatttatattatataatattatatttg 39327443  T
Q  137 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39327444 ttacattgctggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 39327483  T

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Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 61 - 176
Target Start/End: Original strand, 1322707 - 1322822
Alignment:
Q  61 aattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcattgaaaa 160  Q
    |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1322707 aattttgttataagataatcatatttttggtgtcatttaaaaagataagaatttatattatatggtattatatttgttacattgttggtgtcattgaaaa 1322806  T
Q  161 agatatgtttagtttt 176  Q
    | ||||||||||||||    
T  1322807 atatatgtttagtttt 1322822  T

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Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 11582934 - 11582795
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 136  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||   | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  11582934 cttttccaattatactctataacaaattttgttataagaatgccatatttttagtgttggtcaaaaagataagaatttatattatataatattatatttg 11582835  T
Q  137 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11582834 ttacattgttggtgtcactgaaaaagatatgtttagtttt 11582795  T

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Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Original strand, 11754511 - 11754632
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11754511 ataacaaattttgttataagaataccatatttttagtgttggtcaaaaagataagaatttatattatataatattatatttgttacattgctggtgtcat 11754610  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  11754611 tgaaaaagatatgtttagtttt 11754632  T

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Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 38800035 - 38799896
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 136  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   | ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  38800035 cttttccaattatactctataacaaattttgttataagaataccatatttttagtgtttgtcaaaaaaataataatttatattatataatattatatttg 38799936  T
Q  137 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38799935 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttaatttt 38799896  T

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Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Original strand, 41902014 - 41902135
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41902014 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgttggtcaaaaagataagaatttatattatataatattatatttgttacattgctggtgtcat 41902113  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||||||||||||| ||||    
T  41902114 tgaaaaagatatgtttaatttt 41902135  T

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Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Original strand, 33877864 - 33878004
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatatta-tatgatattatattt 135  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   | |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||    
T  33877864 cttttccaattatactctataacaaattttgttataagaataccatatttttagtgttgatcaaaaagataagaatttatattaatataatattatattt 33877963  T
Q  136 gttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33877964 gttacattgctggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 33878004  T

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Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 18090901 - 18090780
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18090901 ataacaaatttcgttataagagtaccatatttttggtgtctttcaaaaagataagaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcaa 18090802  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||| | ||||||||| ||||    
T  18090801 tgaaacatatatgtttaatttt 18090780  T

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Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Original strand, 23911332 - 23911453
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23911332 ataacaaatttcgttataagaatatcatatttttggtgtctttgaaaaatataagaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 23911431  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
     |||| | ||||||||||||||    
T  23911432 ggaaacaaatatgtttagtttt 23911453  T

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Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Original strand, 25660430 - 25660568
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 136  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   | |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||    
T  25660430 cttttccaattatactctataacaaattttgttataagaataccatatttttagtgttggtaaaaaagataagaatttatat-atataatattatatttg 25660528  T
Q  137 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25660529 ttacattgctggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 25660568  T

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Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 33642064 - 33641926
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 136  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   | |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||    
T  33642064 cttttccaattatactctataacaaattttgttataagaataccatatttttagtgttggtcaaaaagataagaatttatat-atataatattatatttg 33641966  T
Q  137 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33641965 ttacattgctggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 33641926  T

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Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Original strand, 33895838 - 33895976
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 136  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   | |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||    
T  33895838 cttttccaattatactctataacaaattttgttataagaataccatatttttagtgttggtcaaaaagataagaatttatat-atataatattatatttg 33895936  T
Q  137 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33895937 ttacattggtggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 33895976  T

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Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Original strand, 43121400 - 43121538
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 136  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   | |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||    
T  43121400 cttttccaattatactctataacaaattttgttataagaataccatatttttagtgttggtcaaaaagataagaatttatat-atataatattatatttg 43121498  T
Q  137 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43121499 ttacattgctggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 43121538  T

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Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 45103634 - 45103496
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 136  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   | |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||    
T  45103634 cttttccaattatactccataacaaattttgttataagaataccatatttttagtgttggtcaaaaagataagaatttatat-atataatattatatttg 45103536  T
Q  137 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45103535 ttacattgctggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 45103496  T

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Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 41 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 3264892 - 3264754
Alignment:
Q  41 ttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgt 137  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||   | ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  3264892 ttttccaattatactctataacaaattttgttataagaatactatatttttagtgttggtcaaaaaaataagaatttatattatataatattatatttgt 3264793  T
Q  138 tacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3264792 tacattgctggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 3264754  T

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Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 41 - 176
Target Start/End: Original strand, 36165818 - 36165956
Alignment:
Q  41 ttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgt 137  Q
    ||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  36165818 ttttccaattatactctataaaaaattttgttataagaataccatatttttagtgttagtcaaaaagataagaatttatattatataatattatatttgt 36165917  T
Q  138 tacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36165918 tacattgcttgtgtcatttaaaaagatatgtttagtttt 36165956  T

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Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Original strand, 28569181 - 28569302
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    |||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28569181 ataaaaaatttctttataagaataccatatttttgatgtcatttaaaaatataagaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 28569280  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
     |||  | ||||||||||||||    
T  28569281 ggaagcaaatatgtttagtttt 28569302  T

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Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 43122451 - 43122330
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  43122451 ataacaaattttgttacaagaatatcatatttttagtgtcagtcaaaaagataagaatttatattatataatattatatttgttacattgctggtgtcat 43122352  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    || |||| ||||||||||||||    
T  43122351 tggaaaatatatgtttagtttt 43122330  T

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Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 56 - 176
Target Start/End: Original strand, 3933227 - 3933347
Alignment:
Q  56 taacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcatt 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3933227 taacaaattttgttataagaataccatatttttggtgactttcaaaaagataagaatttatattatttgacattatatttgctacattgttggtgtcatt 3933326  T
Q  156 gaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||| | | ||||||||||||    
T  3933327 gaaacatacatgtttagtttt 3933347  T

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Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 55 - 170
Target Start/End: Original strand, 16033618 - 16033733
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16033618 ataactaatttcgttataagaataccatatttttggtgtctttaaaaaatataagaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 16033717  T
Q  155 tgaaaaagatatgttt 170  Q
     |||| | ||||||||    
T  16033718 ggaaacatatatgttt 16033733  T

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Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 9574636 - 9574497
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 136  Q
    |||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||   | |||||||||  |||| ||||||||| ||||||||||||    
T  9574636 cttttccaattatactctataataaattttgttataagaataccatatttttagtgttggtcaaaaagatatgaattaatattatataatattatatttg 9574537  T
Q  137 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9574536 ttacattgctggtgtcattgaaaaagatatgtttaatttt 9574497  T

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Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Original strand, 40432823 - 40432961
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 136  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||   | |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||    
T  40432823 cttttccaattatactctataacaaattttattataagaataccatatttttagtgttggtcaaaaagataagaatttatat-atataatattatatttg 40432921  T
Q  137 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  40432922 ttacattgctggtgtcattgaaaaagatatatttagtttt 40432961  T

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Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 49222706 - 49222585
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||  |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  49222706 ataactaatttcgttataagaatattatatttttggtgtctttaaaaaagataagaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtatcat 49222607  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
     |||| | ||||||||||||||    
T  49222606 ggaaatatatatgtttagtttt 49222585  T

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Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 56 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 20764185 - 20764065
Alignment:
Q  56 taacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcatt 155  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20764185 taacaaatttttttataagaataccatatttttggtgactttcaaaaagataagaatttatattatttgacattatatttgctacattgttggtgtcatt 20764086  T
Q  156 gaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||| | | ||||||||||||    
T  20764085 gaaacatacatgtttagtttt 20764065  T

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Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 55 - 139
Target Start/End: Original strand, 37824234 - 37824318
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgtta 139  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37824234 ataacaaattttgttataaaaatatcatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgtta 37824318  T

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Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 69 - 176
Target Start/End: Original strand, 10695897 - 10696004
Alignment:
Q  69 tataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgt 168  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||    
T  10695897 tataagaataccatttttttggtgtctttcaaaaagatgagaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcatggaaacatatatgt 10695996  T
Q  169 ttagtttt 176  Q
    ||||||||    
T  10695997 ttagtttt 10696004  T

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Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 69 - 176
Target Start/End: Original strand, 10700786 - 10700893
Alignment:
Q  69 tataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgt 168  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||    
T  10700786 tataagaataccatttttttggtgtctttcaaaaagatgagaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcatggaaacatatatgt 10700885  T
Q  169 ttagtttt 176  Q
    ||||||||    
T  10700886 ttagtttt 10700893  T

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Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 55 - 166
Target Start/End: Original strand, 31215980 - 31216091
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||   | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31215980 ataacaaattttgttataagaataccatacttttagtgttggtcaaaaagataagaatttatattatataatattatatttgttacattgctggtgtcat 31216079  T
Q  155 tgaaaaagatat 166  Q
    ||||||||||||    
T  31216080 tgaaaaagatat 31216091  T

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Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 55 - 166
Target Start/End: Original strand, 31221735 - 31221846
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||   | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31221735 ataacaaattttgttataagaataccatacttttagtgttggtcaaaaagataagaatttatattatataatattatatttgttacattgctggtgtcat 31221834  T
Q  155 tgaaaaagatat 166  Q
    ||||||||||||    
T  31221835 tgaaaaagatat 31221846  T

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Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 55 - 168
Target Start/End: Original strand, 44065538 - 44065652
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggt-gtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtca 153  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || |||||  | |||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44065538 ataacaaatttggttataagaatactatttttttttttgtcattcaaaaagataagagtttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtca 44065637  T
Q  154 ttgaaaaagatatgt 168  Q
    |||||||||||||||    
T  44065638 ttgaaaaagatatgt 44065652  T

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Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 16096764 - 16096644
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||  |||    
T  16096764 ataacaaattttgttataagaataccatatttttagtgtcagtcaaaaagataagaatttatattatataatattatatttgttatattggtggt-ccat 16096666  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    || |||| ||||||||||||||    
T  16096665 tggaaaatatatgtttagtttt 16096644  T

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Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Original strand, 33374474 - 33374594
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   | |||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  33374474 ataacaaattttgttataagaataccatatttttagtgttggtcaaaaagataagaatttatat-atataatattatatttgttacattgctggtatcat 33374572  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    | ||||||||||||||||||||    
T  33374573 ttaaaaagatatgtttagtttt 33374594  T

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Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 41 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 43124308 - 43124162
Alignment:
Q  41 ttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatt---------tatattatatgatat 128  Q
    ||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||         ||||| |||||||||    
T  43124308 ttttccaattatactttatgacaaattttgttataagaatatcatattttttgtgtcatttaaaaagataaaaatttataggatttatataatatgatat 43124209  T
Q  129 tatatttgttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43124208 tatatttgttacattgtt-gtgtcattaaaaaagatatgtttagtttt 43124162  T

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Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 56 - 176
Target Start/End: Original strand, 26432646 - 26432766
Alignment:
Q  56 taacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcatt 155  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26432646 taacaaatttcattataagaataccatatttttggtgactttcaaaaagataagaatttatattatttgacattatatttgctacattgttggtgtcatt 26432745  T
Q  156 gaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||| | | ||||||||||||    
T  26432746 gaaacatacatgtttagtttt 26432766  T

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Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 55 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 45003292 - 45003177
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  45003292 ataactaatttcgttataagaataccatatatttggtgtctatcaaaaagataagaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcgt 45003193  T
Q  155 tgaaaaagatatgttt 170  Q
     |||| | ||||||||    
T  45003192 ggaaacatatatgttt 45003177  T

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Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 55 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 36679483 - 36679388
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtg 150  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36679483 ataactaatttcgttataagaataccatatatttggtgtctatcaaaaagataagaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtg 36679388  T

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Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 5541713 - 5541593
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  5541713 ataacaaatttcgttataaaaataccatatttttggtgtctttcaaaaagataagaatttatattaaaagatattata-ttgttatattgttggtgtcat 5541615  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
     ||||   ||||||||||||||    
T  5541614 ggaaacctatatgtttagtttt 5541593  T

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Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 40 - 171
Target Start/End: Original strand, 21966214 - 21966338
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 136  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||          ||||||||||||    
T  21966214 cttttccaattatactctataacaaatttcgttataagaatatcatatttttggtgtcattcaaaaagataagaattt----------atattatatttg 21966303  T
Q  137 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgttta 171  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21966304 ttacattgttggtgtcaatgaaaaagatatgttta 21966338  T

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Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 85 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 18109324 - 18109233
Alignment:
Q  85 ttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||    
T  18109324 ttttggtgtctttcaaaaagataagaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgccatggaaacatatatgtttagtttt 18109233  T

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Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 85 - 176
Target Start/End: Original strand, 43257197 - 43257288
Alignment:
Q  85 ttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||    
T  43257197 ttttggtgtctttcaaaaagataagaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgccatggaaacatatatgtttagtttt 43257288  T

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Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 85 - 176
Target Start/End: Original strand, 50397611 - 50397702
Alignment:
Q  85 ttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||    
T  50397611 ttttggtgtctttcaaaaagataagaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgccatggaaacatatatgtttagtttt 50397702  T

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Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 55 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 15845733 - 15845620
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||   ||||||||||||| || | ||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  15845733 ataacaaatttggttataaaaatattttatttttggtgtctttaagaaatataagaatttatattatacgatattatatttgttaaattgttagtgtcat 15845634  T
Q  155 tgaaaaagatatgt 168  Q
    ||||||||||||||    
T  15845633 tgaaaaagatatgt 15845620  T

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Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Original strand, 33818616 - 33818744
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 136  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   | |||||||||| |||||||||||||           |||    
T  33818616 cttttccaattatactctataacaaattttgttataagaataccatatttttagtgttggtcaaaaagataagaatttatattata-----------ttg 33818704  T
Q  137 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33818705 ttacattggtggtgtcattgaaaaagatatgttttgtttt 33818744  T

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Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Original strand, 33894382 - 33894510
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 136  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   | |||||||||| |||||||||||||           |||    
T  33894382 cttttccaattatactctataacaaattttgttataagaataccatatttttagtgttggtcaaaaagataagaatttatattata-----------ttg 33894470  T
Q  137 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33894471 ttacattggtggtgtcattgaaaaagatatgttttgtttt 33894510  T

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Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 40 - 107
Target Start/End: Original strand, 36952877 - 36952947
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagata 107  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36952877 cttttccaattatactgtataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcattgaaaaagata 36952947  T

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Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 40 - 136
Target Start/End: Original strand, 33832546 - 33832644
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 136  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   | |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  33832546 cttttccaattatactctataacaaattttgttataagaataccatatttttagtgttggtcaaaaagataagaatttata-tatataatattatatttg 33832644  T

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Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 99 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 21728390 - 21728336
Alignment:
Q  99 aaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtca 153  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21728390 aaaaagataagaaattatattatatgatatcatatttgttacattgttggtgtca 21728336  T

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Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 55 - 115
Target Start/End: Original strand, 23731071 - 23731131
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaattta 115  Q
    |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  23731071 ataaaaaaatttgttataagaattccatatttttggtgtcattaaaaaagataagaattta 23731131  T

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Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 116
Target Start/End: Original strand, 41916899 - 41916960
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttat 116  Q
    ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||| |||||||    
T  41916899 ataacaaatttcgatataagaattccatatttttggtgtctttaaaaaagataagaatttat 41916960  T

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Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 145 - 176
Target Start/End: Original strand, 36952927 - 36952958
Alignment:
Q  145 ttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36952927 ttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 36952958  T

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Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 70 - 123
Target Start/End: Original strand, 10427348 - 10427401
Alignment:
Q  70 ataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatat 123  Q
    |||||||| | || || |||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  10427348 ataagaatgctattttgttggtgtcatttaaaaagataagaacttatattatat 10427401  T

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Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 119 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 21728135 - 21728078
Alignment:
Q  119 tatatgatattatatttgttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||  |||| | |||| |||||||||    
T  21728135 tatatgatatcatatttgttatattgttggtgtcacggaaatatatatatttagtttt 21728078  T

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Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 124 - 165
Target Start/End: Original strand, 33218479 - 33218520
Alignment:
Q  124 gatattatatttgttacattgttggtgtcattgaaaaagata 165  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  33218479 gatattatatttgttgtattgttggtatcattgaaaaagata 33218520  T

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Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 124 - 161
Target Start/End: Original strand, 44041041 - 44041078
Alignment:
Q  124 gatattatatttgttacattgttggtgtcattgaaaaa 161  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  44041041 gatattatatttgttatattgttggtatcattgaaaaa 44041078  T

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Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 125 - 161
Target Start/End: Original strand, 8937394 - 8937430
Alignment:
Q  125 atattatatttgttacattgttggtgtcattgaaaaa 161  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  8937394 atattatatttattatattgttggtgtcattgaaaaa 8937430  T

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Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 124 - 160
Target Start/End: Original strand, 12294537 - 12294573
Alignment:
Q  124 gatattatatttgttacattgttggtgtcattgaaaa 160  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  12294537 gatattatatttgttatattgttggtatcattgaaaa 12294573  T

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Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 129 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 18741218 - 18741182
Alignment:
Q  129 tatatttgttacattgttggtgtcattgaaaaagata 165  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  18741218 tatatttgttatattgttggtgtcattgaagaagata 18741182  T

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Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 110 - 138
Target Start/End: Original strand, 29842368 - 29842396
Alignment:
Q  110 aatttatattatatgatattatatttgtt 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29842368 aatttatattatatgatattatatttgtt 29842396  T

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Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 87 - 123
Target Start/End: Original strand, 31239089 - 31239125
Alignment:
Q  87 ttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatat 123  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31239089 ttggtatcatttaaaaagataagaatttatattatat 31239125  T

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Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 125 - 165
Target Start/End: Original strand, 33129468 - 33129508
Alignment:
Q  125 atattatatttgttacattgttggtgtcattgaaaaagata 165  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||    
T  33129468 atattatatttgttaaattattgttgtcattgaaaaagata 33129508  T

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Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 110 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 52308402 - 52308374
Alignment:
Q  110 aatttatattatatgatattatatttgtt 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  52308402 aatttatattatatgatattatatttgtt 52308374  T

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Target: chr6 (Bit Score: 114; Significance: 5e-58; HSPs: 40)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 7541016 - 7540877
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 136  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7541016 cttttccaattatactgtataacaaattttgttataagaatatcatatttttggtgtcatttaaaaagataagaatttatattatatgatattatatttg 7540917  T
Q  137 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7540916 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttaatttt 7540877  T

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Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 17505396 - 17505258
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 136  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17505396 cttttccaattatactgtataacaaattttgttataagaatatcatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaattta-attatatgatattatatttg 17505298  T
Q  137 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17505297 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 17505258  T

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Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Original strand, 6018756 - 6018877
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6018756 ataacaaattttgttataagaatatcatatttttggtgtcatttaaaaagataagaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 6018855  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||||||||||||| ||||    
T  6018856 tgaaaaagatatgtttaatttt 6018877  T

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Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 29043096 - 29042975
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29043096 ataacaaattttgttataagaatatcatatttttggtgtcatttaaaaacataagaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 29042997  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  29042996 tgaaaaagatatgtttagtttt 29042975  T

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Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Original strand, 173245 - 173366
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  173245 ataacaaattttgttacaagaatatcatatttttggtgtcatttaaaaagataagaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 173344  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||| ||||| ||||||||||||    
T  173345 tgacaaagacatgtttagtttt 173366  T

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Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 55 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 10945600 - 10945482
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtca- 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  10945600 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataggaatttatattatatgatattatatttgttacattgttgatgtcat 10945501  T
Q  154 ttgaaaaagatatgtttag 172  Q
    |||||||||||||||||||    
T  10945500 ttgaaaaagatatgtttag 10945482  T

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Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 3850002 - 3849863
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 136  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  3850002 cttttccaattatactctataacaaattttgttataagaataccatatttttagtgttggtcaaaaagataagaatttatattatataatattatatttg 3849903  T
Q  137 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3849902 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 3849863  T

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Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 28471655 - 28471516
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 136  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  28471655 cttttccaattatactctataacaaattttgttataagaataccatatttttagtgttggtcaaaaagataagaatttatattatattatattatatttg 28471556  T
Q  137 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28471555 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 28471516  T

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Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 29859367 - 29859228
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 136  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  29859367 cttttccaattatactatataacaaattttgttataagaataccatatttttagtgttagtcaaaaagataagaatttatattatataatattatatttg 29859268  T
Q  137 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29859267 ttacattgctggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 29859228  T

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Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 55 - 172
Target Start/End: Original strand, 34207186 - 34207302
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34207186 ataacaaattttgttataagaatatcatatttt-ggtgtcatttaaaaagataagaattcatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 34207284  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttag 172  Q
    ||||||||||||||||||    
T  34207285 tgaaaaagatatgtttag 34207302  T

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Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 42 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 29976222 - 29976094
Alignment:
Q  42 tttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgtt 138  Q
    |||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29976222 tttccaattatactgtataacaaactttgttataagaatatcatatttttggtgtcatttaaaaagatccgaatttatattatatgatattatatttgtt 29976123  T
Q  139 acattgttggtgtcattgaaaaagatatg 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29976122 acattgttggtgtcattgaaaaagatatg 29976094  T

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Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 247065 - 246944
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  247065 ataacaaatttcgttataagaataccatattttttgtgtctttcaaaaagataagaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 246966  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
     |||| ||||||||||| ||||    
T  246965 ggaaacagatatgtttaatttt 246944  T

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Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 6833324 - 6833203
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||    
T  6833324 ataacaattttttttataagaataccatatttctggtgtcatttaaaaggataagaatttatattatatgatattatatttgttacgttgatgatgtcat 6833225  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  6833224 tgaaaaagatatgtttagtttt 6833203  T

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Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Original strand, 12582884 - 12583005
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12582884 ataacaaatttcgttataagaataccatattttttgtgtctttcaaaaagataagaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 12582983  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
     |||| ||||||||||| ||||    
T  12582984 ggaaacagatatgtttaatttt 12583005  T

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Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 33975654 - 33975533
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33975654 ataacaaatttcgttataagaataccaaatttttggcgtctttcaaaaagataagaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 33975555  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
     |||| ||||||||||||||||    
T  33975554 ggaaacagatatgtttagtttt 33975533  T

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Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 61 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 19988780 - 19988666
Alignment:
Q  61 aattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcattgaaaa 160  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19988780 aattttgttataagaatatcatattttttgtgtcatttaaaaagatacgaatttatattat-tgatattaaatttgttacattgttggtgtcattgaaaa 19988682  T
Q  161 agatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||||||||||||    
T  19988681 agatatgtttagtttt 19988666  T

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Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 18313647 - 18313526
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18313647 ataacaaatttcgttataagaatatcatatttttggtgtctttgaaaaatataagaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgacat 18313548  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
     |||| ||||||||||||||||    
T  18313547 ggaaacagatatgtttagtttt 18313526  T

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Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 20790999 - 20790861
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 136  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   | |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||    
T  20790999 cttttccaattatactctataacaaattttgttataagaataccatatttttagtgttggtcaaaaagataagaatttatat-atataatattatatttg 20790901  T
Q  137 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20790900 ttacattgctggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 20790861  T

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Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 61 - 170
Target Start/End: Original strand, 28231604 - 28231713
Alignment:
Q  61 aattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcattgaaaa 160  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||     
T  28231604 aatttcgttataagaataccatatttttggtgtctttcaaaaagataagaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgttatggaaac 28231703  T
Q  161 agatatgttt 170  Q
    | ||||||||    
T  28231704 atatatgttt 28231713  T

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Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 55 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 11268770 - 11268653
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||     
T  11268770 ataacaaatttcattataagaataccatatttttggtgacttttaaaaagataagtatttatattatttgacattatatttgctacattgttggtgtcac 11268671  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttag 172  Q
    ||||| | | ||||||||    
T  11268670 tgaaacatacatgtttag 11268653  T

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Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 55 - 166
Target Start/End: Original strand, 3090946 - 3091057
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| || |||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3090946 ataacaaatttcgttataagaatattatatttttggtgtctttcaaaaatctaagaatttatattatacgatattatatttgtgacattgttggtgtcat 3091045  T
Q  155 tgaaaaagatat 166  Q
     |||| ||||||    
T  3091046 ggaaacagatat 3091057  T

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Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 85 - 176
Target Start/End: Original strand, 13459377 - 13459468
Alignment:
Q  85 ttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||    
T  13459377 ttttggtgtctttcaaaaagataagaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgccatggaaacatatatgtttagtttt 13459468  T

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Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 58 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 34318831 - 34318713
Alignment:
Q  58 acaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcattga 157  Q
    ||||||||  ||||||||||| |||||||||  |||| || |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||| ||    
T  34318831 acaaatttcattataagaatatcatattttttatgtctttcaaaaagataagaatttatattatatgatattgtatttgtgacgttgttggtgtcatgga 34318732  T
Q  158 aaaagatatgtttagtttt 176  Q
    || | ||||||||||||||    
T  34318731 aacatatatgtttagtttt 34318713  T

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Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 55 - 127
Target Start/End: Original strand, 5414745 - 5414817
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgata 127  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5414745 ataacaaattttgttataagaatatcatatttttggtgttatttaaaaagataagaatttatattatatgata 5414817  T

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Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 99 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 558321 - 558245
Alignment:
Q  99 aaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  558321 aaaaagataagaatttatat-atataatattatatttgttacattgctggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 558245  T

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Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 55 - 174
Target Start/End: Original strand, 11518914 - 11519033
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| |||||| || ||||||     
T  11518914 ataacaaatttcattataagaataccatatttttggtgactttcaaaaagataagaatttatattatttgacattatatttgctacattattcgtgtcac 11519013  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagtt 174  Q
     |||| | | ||||||||||    
T  11519014 cgaaacatacatgtttagtt 11519033  T

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Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 118 - 176
Target Start/End: Original strand, 34247981 - 34248039
Alignment:
Q  118 ttatatgatattatatttgttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34247981 ttatatgatattatatttgttacattactggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 34248039  T

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Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 1930859 - 1930748
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || || ||||| |||| ||||||||||          ||||||||||||||| |||||||||    
T  1930859 ataacaaatttcgttataagaataccatattttcggtctctttcaaaaatataagaatttatatt----------atatttgttacattgctggtgtcat 1930770  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
     |||| | ||||||||||||||    
T  1930769 ggaaacaaatatgtttagtttt 1930748  T

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Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 125 - 176
Target Start/End: Original strand, 3054407 - 3054458
Alignment:
Q  125 atattatatttgttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||    
T  3054407 atattatatttgttacattgttggtgtcatggaaacaaatatgtttagtttt 3054458  T

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Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 8872606 - 8872525
Alignment:
Q  82 tatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgt 168  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||     ||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||||    
T  8872606 tattgttggtgtcattaaaaaagataagaatttatatt-----atattatatttgttatattgtttgtatcattcaaaaagatatgt 8872525  T

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Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 34603708 - 34603663
Alignment:
Q  125 atattatatttgttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgttt 170  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  34603708 atattatatttgttacattgttgatgtcattgaaaaatatatgttt 34603663  T

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Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 34724985 - 34724940
Alignment:
Q  125 atattatatttgttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgttt 170  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  34724985 atattatatttgttacattgttgatgtcattgaaaaatatatgttt 34724940  T

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Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 41 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 24162702 - 24162636
Alignment:
Q  41 ttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaag 104  Q
    ||||||||||||||   |||| || |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  24162702 ttttccaattatactgtataaaaatttttgttataagaatatcatatttttggtatcatttaaaaag 24162636  T

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Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 125 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 8866882 - 8866839
Alignment:
Q  125 atattatatttgttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgt 168  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8866882 atattatatttgttatattgttggtatcattgaaaaagatatgt 8866839  T

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Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 40 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 559180 - 559129
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatattttt 88  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  559180 cttttccaattatactctataacaaattttgttataagaatagcatattttt 559129  T

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Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 25531799 - 25531745
Alignment:
Q  69 tataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatat 123  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || | ||| |||| ||||||||||||||    
T  25531799 tataagaataccatattttttgtgtctttcataaaaataagaatttatattatat 25531745  T

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Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 82 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 8866915 - 8866874
Alignment:
Q  82 tatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatat 123  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  8866915 tattgttggtgtcattaaaaaagataagaatttatattatat 8866874  T

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Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 40 - 88
Target Start/End: Original strand, 34247920 - 34247971
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatattttt 88  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  34247920 cttttccaattatactgtataacaaattttgttataagaatatgatattttt 34247971  T

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Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 87 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 32279657 - 32279621
Alignment:
Q  87 ttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatat 123  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  32279657 ttggtgtcattaaaaaagataagaatttatattatat 32279621  T

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Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 133 - 165
Target Start/End: Original strand, 34638075 - 34638107
Alignment:
Q  133 tttgttacattgttggtgtcattgaaaaagata 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  34638075 tttgttacattgttggtgtcattgaaatagata 34638107  T

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Target: scaffold0024 (Bit Score: 110; Significance: 1e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0024
Description:

Target: scaffold0024; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Original strand, 110689 - 110828
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 136  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  110689 cttttccaattatactgtataacaaattttgttataagaatatcatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatattta 110788  T
Q  137 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  110789 ttgcattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttaatttt 110828  T

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Target: scaffold0024; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Original strand, 91121 - 91242
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||    
T  91121 ataacaaattttgttataataataccatatttttagtgtcagttaaaaagataagaatttatattatataatgttatatttgttacattgctggtgtcat 91220  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |  |||| ||||||||||||||    
T  91221 ttgaaaatatatgtttagtttt 91242  T

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Target: scaffold0237 (Bit Score: 98; Significance: 2e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 5570 - 5431
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 136  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  5570 cttttccaattatactatataacaaattttgttataagaataccatatttttagtgttagtcaaaaagataagaatttatattatataatattatatttg 5471  T
Q  137 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5470 ttacattgctggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 5431  T

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Target: scaffold0318 (Bit Score: 91; Significance: 3e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0318
Description:

Target: scaffold0318; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Original strand, 474 - 596
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattata-tgatattatatttgttacattgttggtgtca 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  474 ataacaaattttgttataagaataccatagttttggtatcattcaaaaagataagaattcatattataatgatattatatttgttacattgttggtctca 573  T
Q  154 ttgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  574 ttgaaaaagatatgtttagtttt 596  T

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Target: scaffold0244 (Bit Score: 91; Significance: 3e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0244
Description:

Target: scaffold0244; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 56 - 158
Target Start/End: Original strand, 16708 - 16810
Alignment:
Q  56 taacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcatt 155  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16708 taacaaattttgttataagaatatcatattttttgtgtcatttaaaaagataataatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcatt 16807  T
Q  156 gaa 158  Q
    |||    
T  16808 gaa 16810  T

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Target: scaffold0244; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 117 - 176
Target Start/End: Original strand, 16919 - 16978
Alignment:
Q  117 attatatgatattatatttgttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16919 attatatgatattatatttgttacattattggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 16978  T

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Target: scaffold0197 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0197
Description:

Target: scaffold0197; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 25484 - 25345
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 136  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  25484 cttttccaattatactctataacaaattttgttataagaataccatatttttagtgttgatcaaaaagataagaatttatattatataatattatatttg 25385  T
Q  137 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25384 ttacattgctggtgtcattgaaaaaaatatgtttagtttt 25345  T

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Target: scaffold0178 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0178
Description:

Target: scaffold0178; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Original strand, 7589 - 7728
Alignment:
Q  40 cttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttg 136  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||    
T  7589 cttttccaattatactctataacaaattttgttataagaataccatatttttagtgttggtcaaaaagataagaatttatattatataatattatatctg 7688  T
Q  137 ttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7689 ttacattgctggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 7728  T

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Target: scaffold0005 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Original strand, 177029 - 177150
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  177029 ataacaaattttgttataagaataccatatttttagtgttggtcaaaaagataagaatttatattatataatattatatttgttacattgctggtgtcat 177128  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  177129 tgaaaaagatatgtttagtttt 177150  T

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Target: scaffold1793 (Bit Score: 89; Significance: 4e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold1793
Description:

Target: scaffold1793; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 41 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 658 - 520
Alignment:
Q  41 ttttccaattatac---ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgt 137  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  658 ttttccaattatactttataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcattaaaaaatataagaatttatattatatgatattttatttgt 559  T
Q  138 tacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||||| ||  |||||||||||||||||| |||| ||||    
T  558 tacattattattgtcattgaaaaagatatttttaatttt 520  T

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Target: scaffold0078 (Bit Score: 84; Significance: 4e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 55 - 174
Target Start/End: Original strand, 5829 - 5948
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5829 ataacaactttcgttataagaatactatattttttgtgtgattcaaaaagataagaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 5928  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagtt 174  Q
    || ||||||||||| |||||    
T  5929 tggaaaagatatgtatagtt 5948  T

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Target: scaffold0016 (Bit Score: 84; Significance: 4e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 55 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 98926 - 98811
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  98926 ataactaatttcgttataagaataccatatttttggtgtctttcaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgttat 98827  T
Q  155 tgaaaaagatatgttt 170  Q
     |||| | ||||||||    
T  98826 ggaaacatatatgttt 98811  T

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Target: scaffold0166 (Bit Score: 82; Significance: 7e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0166
Description:

Target: scaffold0166; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 1283 - 1162
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||   | |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1283 ataacaaattttgttataataataccatatttttagtgttgatcaaaaagataagaatttatagtatataatattatatttgttacattgctggtgtcat 1184  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  1183 tgaaaaagatatgtttagtttt 1162  T

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Target: scaffold0006 (Bit Score: 82; Significance: 7e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Original strand, 157001 - 157122
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  157001 ataacaaatttcgttttaagaataccttatttttggtctcatttaaaaatacaagaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 157100  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
     |||| | ||||||||||||||    
T  157101 ggaaacaaatatgtttagtttt 157122  T

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Target: scaffold0003 (Bit Score: 82; Significance: 7e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Original strand, 228457 - 228583
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataa----gaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattata-tgatattatatttgttacattgttggt 149  Q
    |||||||||||||||||||    |||||||||| ||||||||||| | |||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  228457 ataacaaattttgttataattaagaataccatagttttggtgtcactcaaaaagataagaattcatattataatgatattatatttgttacattgttggt 228556  T
Q  150 gtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  228557 gtcattgaaaaagatatgtttagtttt 228583  T

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Target: scaffold0179 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0179
Description:

Target: scaffold0179; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 34649 - 34528
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||   | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||    
T  34649 ataacaaattttattacaagaataccatatttttagtgttggtcaaaaagataagaatttatattatataatattatatttgttacatttctggtgtcat 34550  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  34549 tgaaaaagatatgtttagtttt 34528  T

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Target: scaffold0038 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 61 - 170
Target Start/End: Original strand, 32101 - 32210
Alignment:
Q  61 aattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcattgaaaa 160  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||     
T  32101 aatttcgttataagaataccatatttttggtgtctttcaaaaagataagaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgttatggaaac 32200  T
Q  161 agatatgttt 170  Q
    | ||||||||    
T  32201 atatatgttt 32210  T

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Target: scaffold0669 (Bit Score: 74; Significance: 4e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0669
Description:

Target: scaffold0669; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 55 - 176
Target Start/End: Original strand, 7344 - 7464
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcat 154  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7344 ataacaaatttcgttataagaataccatattttttgtgtctttcaaaaatataagaatttatattatatgatattatatttgttacattgtttgtgtcat 7443  T
Q  155 tgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
     |||| | || |||||||||||    
T  7444 agaaacaaat-tgtttagtttt 7464  T

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Target: scaffold0045 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 69 - 176
Target Start/End: Original strand, 14565 - 14672
Alignment:
Q  69 tataagaataccatatttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgt 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||  || ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || | | ||||||    
T  14565 tataagaataccatatttttggtgtgtttcaaaaatataagaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtaatggagacatatatgt 14664  T
Q  169 ttagtttt 176  Q
    ||||||||    
T  14665 ttagtttt 14672  T

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Target: scaffold0283 (Bit Score: 60; Significance: 9e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0283
Description:

Target: scaffold0283; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 85 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 9256 - 9165
Alignment:
Q  85 ttttggtgtcatttaaaaagataaaaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||| ||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||    
T  9256 ttttagtgtctttcaaaaagataagaatttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgccatggaaacatatatgtttagtttt 9165  T

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Target: scaffold0027 (Bit Score: 60; Significance: 9e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0027
Description:

Target: scaffold0027; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 117 - 176
Target Start/End: Original strand, 138201 - 138260
Alignment:
Q  117 attatatgatattatatttgttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  138201 attatatgatattatatttgttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 138260  T

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Target: scaffold1822 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold1822
Description:

Target: scaffold1822; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 111 - 176
Target Start/End: Original strand, 1 - 66
Alignment:
Q  111 atttatattatatgatattatatttgttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| |||| ||||    
T  1 atttatattatatgatattttatttgttacattattattgtcattgaaaaagatatttttaatttt 66  T

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Target: scaffold0198 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 119 - 176
Target Start/End: Original strand, 15978 - 16033
Alignment:
Q  119 tatatgatattatatttgttacattgttggtgtcattgaaaaagatatgtttagtttt 176  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  15978 tatatgatatcatatttgttacattgttggtgtcattgaaaacg--atgtttagtttt 16033  T

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Target: scaffold0481 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0481
Description:

Target: scaffold0481; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 55 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 6106 - 6068
Alignment:
Q  55 ataacaaattttgttataagaataccatatttttggtgt 93  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6106 ataacaaattttgttataagaataccatatttttagtgt 6068  T

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Target: scaffold0047 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 126 - 165
Target Start/End: Original strand, 65606 - 65645
Alignment:
Q  126 tattatatttgttacattgttggtgtcattgaaaaagata 165  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  65606 tattatatttgttatattgttggtatcattgaaaaagata 65645  T

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Target: scaffold0032 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 110 - 138
Target Start/End: Original strand, 5950 - 5978
Alignment:
Q  110 aatttatattatatgatattatatttgtt 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5950 aatttatattatatgatattatatttgtt 5978  T

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Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 110 - 138
Target Start/End: Original strand, 12399 - 12427
Alignment:
Q  110 aatttatattatatgatattatatttgtt 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12399 aatttatattatatgatattatatttgtt 12427  T

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Target: scaffold0018 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 125 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 36535 - 36499
Alignment:
Q  125 atattatatttgttacattgttggtgtcattgaaaaa 161  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  36535 atattatatttgttatattgttggtatcattgaaaaa 36499  T

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Target: scaffold0009 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 91 - 123
Target Start/End: Original strand, 53728 - 53760
Alignment:
Q  91 tgtcatttaaaaagataaaaatttatattatat 123  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  53728 tgtcattaaaaaagataaaaatttatattatat 53760  T

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Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 125 - 165
Target Start/End: Original strand, 55343 - 55383
Alignment:
Q  125 atattatatttgttacattgttggtgtcattgaaaaagata 165  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||    
T  55343 atattatatttgttatattgtttgtgtaattgaaaaagata 55383  T

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