View Alignment
This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
Legend |
| Query |
| Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
|
Alignment Overview
Query: NF0707_low_28 (Length: 371)
Name: NF0707_low_28
Description: NF0707
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
[»] NF0707_low_28 |
 |  |
|
[»] scaffold0040 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0024 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0831 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold1213 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0007 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0280 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0172 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0018 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0002 (4 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0192 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0886 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0009 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0343 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0019 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0001 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0135 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0274 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0325 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0014 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0006 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0471 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0036 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0003 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0236 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold1254 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0419 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold2146 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0102 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 155; Significance: 3e-82; HSPs: 109)
Name: chr5
Description:
Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 146 - 337
Target Start/End: Original strand, 18794745 - 18794938
Alignment:
Q |
146 |
tactccttccatttctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgtttta |
243 |
Q |
|
|
|||||| |||||| |||||||||||| | |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
18794745 |
tactccctccattcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta |
18794844 |
T |
 |
Q |
244 |
ccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttatt |
337 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
18794845 |
ccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttatt |
18794938 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 146 - 328
Target Start/End: Original strand, 12664820 - 12665004
Alignment:
Q |
146 |
tactccttccatttctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgtttta |
243 |
Q |
|
|
|||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |
|
|
T |
12664820 |
tactccctccgtttctttttaagtgttacttttggagaaaatttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgtagtttta |
12664919 |
T |
 |
Q |
244 |
ccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagta |
328 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
12664920 |
ccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagta |
12665004 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 146 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 4175737 - 4175539
Alignment:
Q |
146 |
tactccttccatttctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgtttta |
243 |
Q |
|
|
|||||| ||| || |||||||||||| | |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
4175737 |
tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaaatttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta |
4175638 |
T |
 |
Q |
244 |
ccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgtatc |
342 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
4175637 |
tcaatattgtccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggttattatagtaaaagtatagcttattgtatc |
4175539 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 160 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 26854337 - 26854158
Alignment:
Q |
160 |
ctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtcctt |
257 |
Q |
|
|
|||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
T |
26854337 |
ctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgttcctatttaactgtcacttccaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcctt |
26854238 |
T |
 |
Q |
258 |
agttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
26854237 |
agttatttattgtggagagagaaatatatgaaatg-gatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
26854158 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 146 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 7579925 - 7579731
Alignment:
Q |
146 |
tactccttccatttctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgtttta |
243 |
Q |
|
|
|||||| ||| || |||||||||||| | |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
7579925 |
tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttctatttaactgtcactttcgaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta |
7579826 |
T |
 |
Q |
244 |
ccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
T |
7579825 |
ccaatattgtccttagttatttattgcggaaagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagtttattg |
7579731 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 146 - 338
Target Start/End: Original strand, 8825019 - 8825213
Alignment:
Q |
146 |
tactccttccatttctttttaagtgttatttg--gagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgtttta |
243 |
Q |
|
|
|||||||||| || |||||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
8825019 |
tactccttccgttcctttttaagtgtcattttttgagaaattttttgttcatatttaactgtcattttcgaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta |
8825118 |
T |
 |
Q |
244 |
ccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
T |
8825119 |
ccaatattgtccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagtttattg |
8825213 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 144 - 338
Target Start/End: Original strand, 38702101 - 38702297
Alignment:
Q |
144 |
tttactccttccatttctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttt |
241 |
Q |
|
|
|||||||| ||| || |||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||| |
|
|
T |
38702101 |
tttactccctccgttcctttttaagtgtcaattttggagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcgaagttcaatgcaacaataaatgttgttt |
38702200 |
T |
 |
Q |
242 |
taccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
38702201 |
taccaatattgtccttaattatttattgcggagagagaaatatatgaaataagatattaaataaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
38702297 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 179 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 38017499 - 38017340
Alignment:
Q |
179 |
agaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagag |
278 |
Q |
|
|
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |
|
|
T |
38017499 |
agaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatctttagttatttattgcggagagag |
38017400 |
T |
 |
Q |
279 |
aaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
38017399 |
aaatatatgaaatgtgatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
38017340 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 174 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 1297965 - 1297801
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtgga |
273 |
Q |
|
|
|||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |
|
|
T |
1297965 |
tttggagaaaatttttgttcctatttaactgtcactttcaaaattcaatgcaacattaaatattgttttaccaatattgtccttagttatttattgcgaa |
1297866 |
T |
 |
Q |
274 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
1297865 |
gagataaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
1297801 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 174 - 342
Target Start/End: Original strand, 34261304 - 34261472
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtgga |
273 |
Q |
|
|
|||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |
|
|
T |
34261304 |
tttgcagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacgttaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcgga |
34261403 |
T |
 |
Q |
274 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgtatc |
342 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
34261404 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaatatagcttattgtatc |
34261472 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 146 - 338
Target Start/End: Original strand, 6072414 - 6072608
Alignment:
Q |
146 |
tactccttccatttctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgtttta |
243 |
Q |
|
|
|||||| ||| |||||||||||| || | |||||||||| ||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
6072414 |
tactccctccgtttctttttaagcgtcacttttggagaaaatttttgttcttatttaactgttactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta |
6072513 |
T |
 |
Q |
244 |
ccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
T |
6072514 |
ccaatattgtccttagttatttattacggagagagaaatatattaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattg |
6072608 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 145 - 338
Target Start/End: Original strand, 38363152 - 38363345
Alignment:
Q |
145 |
ttactccttccatttctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgtttt |
242 |
Q |
|
|
||||||| ||| || |||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
38363152 |
ttactccatccgttcctttttaagtgttacttttggagaaaatttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttt |
38363251 |
T |
 |
Q |
243 |
accaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
|||||||| |||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
T |
38363252 |
accaatat--tccttagttattaattgcgaagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaagtcattatagtaaaagtatagtttattg |
38363345 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 146 - 330
Target Start/End: Original strand, 7403816 - 7404000
Alignment:
Q |
146 |
tactccttccatttctttttaagtgttatttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttacc |
245 |
Q |
|
|
|||||| ||| || |||| ||||||| | || |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
7403816 |
tactccctccgttcctttataagtgtcactttgagaaattttttgttcatatttaactctcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttacc |
7403915 |
T |
 |
Q |
246 |
aatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtata |
330 |
Q |
|
|
|||||| ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
7403916 |
aatattatccttagttatttattgcggagaaataaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtata |
7404000 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 186 - 330
Target Start/End: Original strand, 9076075 - 9076219
Alignment:
Q |
186 |
ttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatata |
285 |
Q |
|
|
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
9076075 |
ttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttatcaatattgtccttagttatttattgcggagagagaaatata |
9076174 |
T |
 |
Q |
286 |
tgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtata |
330 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
9076175 |
tgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtata |
9076219 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 174 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 18020995 - 18020831
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtgga |
273 |
Q |
|
|
|||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |
|
|
T |
18020995 |
tttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaaattcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcgga |
18020896 |
T |
 |
Q |
274 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
18020895 |
gagagaaatatatgaaatgagatatcaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
18020831 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 146 - 338
Target Start/End: Original strand, 25343922 - 25344116
Alignment:
Q |
146 |
tactccttccatttctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgtttta |
243 |
Q |
|
|
|||||||||| || |||| ||||||| | |||||||||| ||||| || ||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
25343922 |
tactccttccgttcctttgtaagtgtcacttttggagaaaatttttgtttctatttaaccgttactttcaaatttcaatgcaacattaaatgttgtttta |
25344021 |
T |
 |
Q |
244 |
ccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |
|
|
T |
25344022 |
ccaatattgtccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggttattatagtaaaaatatagcttattg |
25344116 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 146 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 8230060 - 8229866
Alignment:
Q |
146 |
tactccttccatttctttttaagtgt-tatttgga-gaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgtttta |
243 |
Q |
|
|
|||||||| | || |||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
8230060 |
tactcctttcgttcctttttaagtgtctattttgaagaaattttttattcctatttaactgtcattttccaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta |
8229961 |
T |
 |
Q |
244 |
ccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
|||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |
|
|
T |
8229960 |
ccaatattatccttagttatttattccggagagagaaatatatgaaatgagatgttaaatgaataaggtcactatagtaaaagtataacttattg |
8229866 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 174 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 10359462 - 10359298
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtgga |
273 |
Q |
|
|
|||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
T |
10359462 |
tttggagaaaatttttgtttctatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcgga |
10359363 |
T |
 |
Q |
274 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
|| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
10359362 |
gaaaaaaatatatgaaatgatatattaaatgaataaggtcatcatagtaaaagtatagcttattg |
10359298 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 174 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 28024486 - 28024322
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtgga |
273 |
Q |
|
|
|||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |
|
|
T |
28024486 |
tttggagaaaaattttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcgga |
28024387 |
T |
 |
Q |
274 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
T |
28024386 |
gagagaaatatataaaatgagatgttaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattg |
28024322 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 174 - 338
Target Start/End: Original strand, 38910266 - 38910429
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtgga |
273 |
Q |
|
|
|||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |
|
|
T |
38910266 |
tttggagaaattttttgtttctatttaactgtcacttttaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattatgga |
38910365 |
T |
 |
Q |
274 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
|||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
38910366 |
gagataaatatatgaaatg-gatattaaatgaataaagtcattatagtaaaagtatagcttattg |
38910429 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 174 - 338
Target Start/End: Original strand, 40198780 - 40198944
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtgga |
273 |
Q |
|
|
|||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |
|
|
T |
40198780 |
tttggagaaattttttgttactatttaactgtcactttcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttaccaatattatccgtagttatttattgcgga |
40198879 |
T |
 |
Q |
274 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
T |
40198880 |
gagagaaataaatgaaatgagatgttaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattg |
40198944 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 160 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 4427649 - 4427465
Alignment:
Q |
160 |
ctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtcctt |
257 |
Q |
|
|
||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
T |
4427649 |
ctttttaagtgtttcttttggagaaattttttgttcatattcaactgtcactttcaaagttcaatgaaacattaaatgttgttttaccaatattatcctt |
4427550 |
T |
 |
Q |
258 |
agttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgtatc |
342 |
Q |
|
|
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
T |
4427549 |
agttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatgttaaatgagtgaggtcattatagtaaaagtataacttattgtatc |
4427465 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 174 - 342
Target Start/End: Original strand, 6689591 - 6689759
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtgga |
273 |
Q |
|
|
|||||||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||| ||| |
|
|
T |
6689591 |
tttggagaaattttttgtttctgtttatctgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattattcttaattatttattgcgga |
6689690 |
T |
 |
Q |
274 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgtatc |
342 |
Q |
|
|
||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
6689691 |
gagagaaatatataaaatgagatgttaaatgaataagatcattatagtaaaagtatagcttattgtatc |
6689759 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 174 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 14794017 - 14793853
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtgga |
273 |
Q |
|
|
|||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| |
|
|
T |
14794017 |
tttggagaaattttttgtttctatttaaatgttactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttatcaatattatccttagttatttattgcgga |
14793918 |
T |
 |
Q |
274 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
T |
14793917 |
aagagaaatatatgaaatgagatgttaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattg |
14793853 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 195 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 1088139 - 1087996
Alignment:
Q |
195 |
tatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgag |
294 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
1088139 |
tatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgag |
1088040 |
T |
 |
Q |
295 |
atattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||| |
|
|
T |
1088039 |
atattaaatgaataaagtcgttatagtaaaaatatagtttattg |
1087996 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 191 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 12870109 - 12869962
Alignment:
Q |
191 |
ttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaa |
290 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |
|
|
T |
12870109 |
ttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttaccaatattgttcttagttatttattgcggagagagaaatatataaaa |
12870010 |
T |
 |
Q |
291 |
tgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
T |
12870009 |
tgaaatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattg |
12869962 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 191 - 338
Target Start/End: Original strand, 39073053 - 39073200
Alignment:
Q |
191 |
ttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaa |
290 |
Q |
|
|
||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | || ||||||||||||||| |
|
|
T |
39073053 |
ttcctatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcgaagtgagaaatatatgaaa |
39073152 |
T |
 |
Q |
291 |
tgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
39073153 |
tgagatattaaatgaataaggttattatagtaaaagtatagcttattg |
39073200 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 146 - 338
Target Start/End: Original strand, 42911512 - 42911706
Alignment:
Q |
146 |
tactccttccatttctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgtttta |
243 |
Q |
|
|
|||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |
|
|
T |
42911512 |
tactccctccgtttctttttaagtgtctcttttggagaaaatttttgttactatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatattgtttta |
42911611 |
T |
 |
Q |
244 |
ccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
|||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
T |
42911612 |
ccaatattatccttagttatttattgcggagagataaatatatgaaatgagatgttaaatgaatatgatcattatagtaaaagtataacttattg |
42911706 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 181 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 16124480 - 16124323
Alignment:
Q |
181 |
aaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaa |
280 |
Q |
|
|
|||||||||||| |||||||||||| || ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
T |
16124480 |
aaattttttattactatttaactgttaccttcaaagtttaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaa |
16124381 |
T |
 |
Q |
281 |
atatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| |
|
|
T |
16124380 |
atatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaatacaacttattg |
16124323 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 174 - 338
Target Start/End: Original strand, 4017406 - 4017570
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtgga |
273 |
Q |
|
|
|||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |
|
|
T |
4017406 |
tttgaagaaattttttgttcttatttaactgtcacttttaaagttcaatgcaatattaaatgttgatttaccaatattatccttagttatttattgcgga |
4017505 |
T |
 |
Q |
274 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| |
|
|
T |
4017506 |
aagagaaatatatgaaatgagatgttaaatgaataaggttattatagtaaaagaataacttattg |
4017570 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 179 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 2134128 - 2133969
Alignment:
Q |
179 |
agaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagag |
278 |
Q |
|
|
||||||||||| ||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
T |
2134128 |
agaaattttttgttcttatttaattgttactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttgccaatattatccttagttatttattgcggagagag |
2134029 |
T |
 |
Q |
279 |
aaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
T |
2134028 |
aaatatatgaaatgagatgttaaattaataaggtcattatagtaaaagtataacttattg |
2133969 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 174 - 337
Target Start/End: Original strand, 4694756 - 4694919
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtgga |
273 |
Q |
|
|
||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| |
|
|
T |
4694756 |
tttggagaatttttttgttcatatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattagatgttattttactaatattatccttagttatttattgcgga |
4694855 |
T |
 |
Q |
274 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttatt |
337 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
T |
4694856 |
gagagaaatatatgaaatgagatgttaaatgaacaaggtcattatagtaaaagtataacttatt |
4694919 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 145 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 28463643 - 28463445
Alignment:
Q |
145 |
ttactccttccatttctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgtttt |
242 |
Q |
|
|
||||||| ||| || |||||||||||| | |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |
|
|
T |
28463643 |
ttactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttttatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgtttt |
28463544 |
T |
 |
Q |
243 |
accaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgtat |
341 |
Q |
|
|
||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
T |
28463543 |
accaacattacccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgactaaggttattatagtaaaagtataaattattgtat |
28463445 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 174 - 342
Target Start/End: Original strand, 4098323 - 4098491
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtgga |
273 |
Q |
|
|
|||||||||| ||||| || | |||||||||||||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||| |
|
|
T |
4098323 |
tttggagaaaatttttgtttcaatttaactgtcacttttaaagttcagtacaacattaaatgttgttttgccaatattatcctttgttatttattgcgga |
4098422 |
T |
 |
Q |
274 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgtatc |
342 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |
|
|
T |
4098423 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaggtataacttattgtatc |
4098491 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 186 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 6754394 - 6754242
Alignment:
Q |
186 |
ttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatata |
285 |
Q |
|
|
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
6754394 |
ttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttatcaatatcatttttagttatttattgcggagagagaaatata |
6754295 |
T |
 |
Q |
286 |
tgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
6754294 |
tgaaataagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
6754242 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 160 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 4689040 - 4688869
Alignment:
Q |
160 |
ctttttaagtgttatttgga-gaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtcctta |
258 |
Q |
|
|
|||||||||||| |||| || |||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
T |
4689040 |
ctttttaagtgtcattttgaagaaaaattttgttcatatttaactgtcacttttaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcctta |
4688941 |
T |
 |
Q |
259 |
gttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtata |
330 |
Q |
|
|
||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
T |
4688940 |
gttatttattgcagagagaaaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattaaagtaaaagtata |
4688869 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 146 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 38297874 - 38297676
Alignment:
Q |
146 |
tactccttccatttctttttaagtgtta--tttggagaaatttttta-ttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgtttt |
242 |
Q |
|
|
|||||| ||| || |||||||||||| | |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |
|
|
T |
38297874 |
tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaatttttttgttcatatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgtttt |
38297775 |
T |
 |
Q |
243 |
accaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgtat |
341 |
Q |
|
|
||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
T |
38297774 |
accaacattacccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaataagatattacatgattaaggcgattatagtaaaagtataaattattgtat |
38297676 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 140 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 9127614 - 9127414
Alignment:
Q |
140 |
aaactttactccttccatttctttttaagtgt-tatttgga-gaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgtt |
237 |
Q |
|
|
||||| |||||| ||| || |||||||||||| ||||| || |||||||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |
|
|
T |
9127614 |
aaactgtactccctccgttcctttttaagtgtctattttgatgaaattttttgttcgtatttaattgtcacttttaaagttcaatgcaacattaaatgtt |
9127515 |
T |
 |
Q |
238 |
gttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttatt |
337 |
Q |
|
|
||||||||||||| || ||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |
|
|
T |
9127514 |
attttaccaatattatctttaattatttattacggagagagaaatatataaaataagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtacaacttatt |
9127415 |
T |
 |
Q |
338 |
g |
338 |
Q |
|
|
| |
|
|
T |
9127414 |
g |
9127414 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 191 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 4962396 - 4962249
Alignment:
Q |
191 |
ttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaa |
290 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |
|
|
T |
4962396 |
ttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatggaacattaaatgttgttttacaaatattatctttagttatttattgcggagaaagaaatatatgaaa |
4962297 |
T |
 |
Q |
291 |
tgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
|||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
T |
4962296 |
tgagatgttaaatgaataaaatcattatagtaaaagtataacttattg |
4962249 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 160 - 337
Target Start/End: Original strand, 18465677 - 18465852
Alignment:
Q |
160 |
ctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtcctt |
257 |
Q |
|
|
|||||||||||| | |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||| |
|
|
T |
18465677 |
ctttttaagtgtcacttttggagaaaatttttgttcctatttaactgccactttcaaagttcaatgcaacattaaatattgttttaccaatattatcctt |
18465776 |
T |
 |
Q |
258 |
agttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttatt |
337 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||| |||||| |
|
|
T |
18465777 |
agttatttattgtggagagagaaatatatgaaatg----attaaatgaacaaaattattatagtaaaagtataacttatt |
18465852 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 194 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 37303314 - 37303183
Alignment:
Q |
194 |
ctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatga |
293 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
37303314 |
ctatttaactgtcactttcaaaattcaatacaacattaaatgttgtttcaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatga |
37303215 |
T |
 |
Q |
294 |
gatattaaatgaataaggtcattatagtaaaa |
325 |
Q |
|
|
||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
T |
37303214 |
gatattaaatgaataagatcattatagtaaaa |
37303183 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 184 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 4985392 - 4985238
Alignment:
Q |
184 |
ttttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaata |
283 |
Q |
|
|
|||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| |
|
|
T |
4985392 |
ttttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaataatgttttatcaatattacccttaattatttattgaggagagagaaata |
4985293 |
T |
 |
Q |
284 |
tatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |
|
|
T |
4985292 |
tatgaaataagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaatataacttattg |
4985238 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 184 - 338
Target Start/End: Original strand, 36239460 - 36239614
Alignment:
Q |
184 |
ttttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaata |
283 |
Q |
|
|
|||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| |
|
|
T |
36239460 |
ttttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgatgttttatcaatattacccttaattatttattgcggagagagaaata |
36239559 |
T |
 |
Q |
284 |
tatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
|||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |
|
|
T |
36239560 |
tatgaaataagatattaaattaataaggtcattatagtaaaaatataacttattg |
36239614 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 174 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 28447211 - 28447044
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtgga |
273 |
Q |
|
|
|||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||||||| | | |
|
|
T |
28447211 |
tttggagaaaatttttgttcctatttaactctcactttcaaagttaaatgcaacattaaatgttattttataaatattatccttagt-atttattgagaa |
28447113 |
T |
 |
Q |
274 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgtatc |
342 |
Q |
|
|
||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
T |
28447112 |
aagagatatatatgaaatgagatgttaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgtatc |
28447044 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 199 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 2674180 - 2674041
Alignment:
Q |
199 |
taactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatat |
298 |
Q |
|
|
|||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || | ||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
T |
2674180 |
taactgccactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcctcagttatttactgcgaagagagaaatatatgaaattagatat |
2674081 |
T |
 |
Q |
299 |
taaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
2674080 |
taaatgaataaaatcattatagtaaaagtatagcttattg |
2674041 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 174 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 21606485 - 21606318
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtgga |
273 |
Q |
|
|
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| ||| |
|
|
T |
21606485 |
tttggagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacattacccttaattatttattacgga |
21606386 |
T |
 |
Q |
274 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgtat |
341 |
Q |
|
|
|| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||| |
|
|
T |
21606385 |
gaaagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggatattatagtaaaaatataaattattgtat |
21606318 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 196 - 342
Target Start/End: Original strand, 7408345 - 7408491
Alignment:
Q |
196 |
atttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgaga |
295 |
Q |
|
|
|||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
7408345 |
atttaattgtcactttcaaagttcaaagcaatattaaatattgttttaccaatattactcttacttatttattatggagagaaaaatatatgaaatgaga |
7408444 |
T |
 |
Q |
296 |
tattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgtatc |
342 |
Q |
|
|
||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
T |
7408445 |
tattaaatgaataaggttattatagtaaaagtataaattattgtatc |
7408491 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 160 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 19831783 - 19831601
Alignment:
Q |
160 |
ctttttaagtgt--tatttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtcctt |
257 |
Q |
|
|
|||||||||||| | ||| |||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
T |
19831783 |
ctttttaagtgtcttttttagagaaattttttgtttctatttaactctcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattaccctt |
19831684 |
T |
 |
Q |
258 |
agttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgtatc |
342 |
Q |
|
|
| ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |
|
|
T |
19831683 |
aactatttattgtggaaagagaa--atattaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaacatataaattattgtatc |
19831601 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 174 - 338
Target Start/End: Original strand, 5119170 - 5119334
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtgga |
273 |
Q |
|
|
||||||||| |||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| || |
|
|
T |
5119170 |
tttggagaatttttttgtttctatttaactgccactttcaaagttcaatgcatcattaaatattgttttaccaatattatcctttgttatttattactga |
5119269 |
T |
 |
Q |
274 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
|||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
T |
5119270 |
gagaaaaatatatgaaatgagatgttaaattaataaggttattatagtaaaagtataacttattg |
5119334 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 139 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 12784706 - 12784515
Alignment:
Q |
139 |
taaactttactccttccatttctttttaagtgttattt--ggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgt |
236 |
Q |
|
|
|||| |||||||| ||| ||||||||||| ||| |||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| |
|
|
T |
12784706 |
taaattttactccctccgtttctttttaactgtcatttttggagaaaaattttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacactaattgt |
12784607 |
T |
 |
Q |
237 |
tgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagta |
328 |
Q |
|
|
||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| |
|
|
T |
12784606 |
tgttttaccaatattacccttatatatttattgcggagagagaaacatatgaaatgaaatattaaattaataagatcattttagtaaaagta |
12784515 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 174 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 18437550 - 18437394
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtgga |
273 |
Q |
|
|
|||| ||||||||||| || | |||||| ||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |
|
|
T |
18437550 |
tttgaagaaattttttgtttcaatttaagtgtcactttcaaaatccaatgtaacattaaatgttgttttaccaatattacccttagttatttattatgga |
18437451 |
T |
 |
Q |
274 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtata |
330 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
18437450 |
gagagaaatatatgaaatgagataataaataaataaggttattatagtaaaagtata |
18437394 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 174 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 5144225 - 5144058
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtgga |
273 |
Q |
|
|
|||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||||| ||| |
|
|
T |
5144225 |
tttggagaaattttttgttcctatttaagtgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatcttgttttaccaacattacccttaattatttattacgga |
5144126 |
T |
 |
Q |
274 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgtat |
341 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |
|
|
T |
5144125 |
gagagaaatatatgaaataagatattaaatgactaaggctattataataaaagtataaattattgtat |
5144058 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 195 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 24075044 - 24074901
Alignment:
Q |
195 |
tatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgag |
294 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| ||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || |
|
|
T |
24075044 |
tatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgatattttatcaatattactcttaattatttattgcggagagagaaatatatgaaataag |
24074945 |
T |
 |
Q |
295 |
atattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
T |
24074944 |
atattaaatgaataagttcattatagtaaaagtataacttattg |
24074901 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 146 - 342
Target Start/End: Original strand, 31802751 - 31802948
Alignment:
Q |
146 |
tactccttccatttctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgtttta |
243 |
Q |
|
|
|||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
31802751 |
tacttcttccgtttctttttaagtgtctcttttggagaaaattttgtttca-atttaactgtcattttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta |
31802849 |
T |
 |
Q |
244 |
ccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgtatc |
342 |
Q |
|
|
|||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |
|
|
T |
31802850 |
ccaatattacccttagttatttattgtggagagaaaattatatgaaagaagatattaaattaataaggtcattatgataaaagtataaattattgtatc |
31802948 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 146 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 38298056 - 38297873
Alignment:
Q |
146 |
tactccttccatttctttttaagtgt-tatttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttac |
244 |
Q |
|
|
|||||| ||| |||||||||||||| | ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
38298056 |
tactccctccgtttctttttaagtgcctcttttgaataatttttttttcctatttaactgtcactttcaaagtt--atgcatcattaaatgttgttttac |
38297959 |
T |
 |
Q |
245 |
caatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtata |
330 |
Q |
|
|
||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| |||||| |||||||||| |
|
|
T |
38297958 |
caatattatcctttgttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgatatgttaaattaataaggttattatactaaaagtata |
38297873 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 174 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 38503027 - 38502868
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtgga |
273 |
Q |
|
|
|||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| || ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||| |
|
|
T |
38503027 |
tttgaagaaattttttgttcatatttaactgtcactttcaaaattcaatgcaacattaaatattattttaccaatattatccttaactatttattgcgga |
38502928 |
T |
 |
Q |
274 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttatt |
337 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||| |
|
|
T |
38502927 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatg----aggtcattatagtaaaagtacaacttatt |
38502868 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 195 - 328
Target Start/End: Original strand, 32388999 - 32389132
Alignment:
Q |
195 |
tatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgag |
294 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |
|
|
T |
32388999 |
tatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattacccttagatatttattgcggagaaagaaacatatgaaatgaa |
32389098 |
T |
 |
Q |
295 |
atattaaatgaataaggtcattatagtaaaagta |
328 |
Q |
|
|
||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
32389099 |
atattaaattaataaggccattatagtaaaagta |
32389132 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 191 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 39894019 - 39893882
Alignment:
Q |
191 |
ttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaa |
290 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |
|
|
T |
39894019 |
ttcctatttaactgtcacttttaaagttcaatgcaacattaaatattgttttaccaatattacccttaaatatttattgcggagagagaaacatatgaaa |
39893920 |
T |
 |
Q |
291 |
tgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagta |
328 |
Q |
|
|
||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
39893919 |
tgaaatattaaattaataaggtcattatagtaaaagta |
39893882 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 179 - 327
Target Start/End: Original strand, 24228945 - 24229093
Alignment:
Q |
179 |
agaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagag |
278 |
Q |
|
|
||||||||||| |||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| || ||| |||||||||| |||||||| |
|
|
T |
24228945 |
agaaattttttgctcctatttaattgttactttcgaagttcaatgcaacattaaatgttgttttatcaatattatctttacttatttattgcggagagag |
24229044 |
T |
 |
Q |
279 |
aaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagt |
327 |
Q |
|
|
||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
T |
24229045 |
aaatatatgaaattagatattgaatgaataaggttattatagtaaaagt |
24229093 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 146 - 321
Target Start/End: Original strand, 6007845 - 6008022
Alignment:
Q |
146 |
tactccttccatttctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgtttta |
243 |
Q |
|
|
|||||| ||| || |||||||||||| | |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
6007845 |
tactccatccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcatcattaaatgttgtttta |
6007944 |
T |
 |
Q |
244 |
ccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagt |
321 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| |||||||| |
|
|
T |
6007945 |
tcaatattgtctttagttatatattacagagagagaaatatatgaaatgtggtattaaattaataaggctattatagt |
6008022 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 177 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 32440136 - 32439985
Alignment:
Q |
177 |
ggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagag |
276 |
Q |
|
|
||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||| |
|
|
T |
32440136 |
ggagaaaatttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacattacctttagttatttattgcagagag |
32440037 |
T |
 |
Q |
277 |
agaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagta |
328 |
Q |
|
|
||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |
|
|
T |
32440036 |
agaaatacatgaaataagatattaaatgactaaggctattataataaaagta |
32439985 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 146 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 1795374 - 1795177
Alignment:
Q |
146 |
tactccttccatttctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgtttta |
243 |
Q |
|
|
|||||| ||| || |||||||||||| | |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| |
|
|
T |
1795374 |
tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgttctcatttaactgtcactttcaaagttcaatgttacaataaatgttgtttta |
1795275 |
T |
 |
Q |
244 |
ccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgtat |
341 |
Q |
|
|
|||| ||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
T |
1795274 |
ccaacattacccttatttatttattgcgaagagagaaatatacgaaataagatattaaatgactaaagctattatagtaaaagtataaattattgtat |
1795177 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 176 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 40209193 - 40209064
Alignment:
Q |
176 |
tggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggaga |
275 |
Q |
|
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| | |
|
|
T |
40209193 |
tggagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaaattcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacattacccttagttatttattgtggata |
40209094 |
T |
 |
Q |
276 |
gagaaatatatgaaatgagatattaaatga |
305 |
Q |
|
|
|||||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
40209093 |
gagaaatataggaaatatgatattaaatga |
40209064 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 174 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 12723186 - 12723032
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtgga |
273 |
Q |
|
|
|||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||| |
|
|
T |
12723186 |
tttggagaaaaattttgttcctatttaattgtcacttttaaagttcaatgcaacactaattgttgttttaccaatattacccttatatatttattgcgga |
12723087 |
T |
 |
Q |
274 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagta |
328 |
Q |
|
|
|||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| |
|
|
T |
12723086 |
gagagaaacatatgaaatgaaatattaaattaataagatcattttagtaaaagta |
12723032 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 218 - 338
Target Start/End: Original strand, 22582508 - 22582628
Alignment:
Q |
218 |
tcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcatta |
317 |
Q |
|
|
|||||| || |||||||||| ||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
22582508 |
tcaatgtaacattaaatgttattttatcaatattattcttagttatttattgcggagagaaaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcatta |
22582607 |
T |
 |
Q |
318 |
tagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
||||| |||||||| |||||| |
|
|
T |
22582608 |
tagtacaagtatagtttattg |
22582628 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 174 - 304
Target Start/End: Original strand, 425121 - 425251
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtgga |
273 |
Q |
|
|
|||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| |
|
|
T |
425121 |
tttggagaaattttttgtttctgtttaactgtcattttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacatttctcttagttatttattgcgga |
425220 |
T |
 |
Q |
274 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatg |
304 |
Q |
|
|
|||||||||| ||||||| |||||||||||| |
|
|
T |
425221 |
gagagaaataaatgaaataagatattaaatg |
425251 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 174 - 328
Target Start/End: Original strand, 3892805 - 3892958
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtgga |
273 |
Q |
|
|
|||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||| ||| |
|
|
T |
3892805 |
tttggagaaattttttgttcctatttaactatcacttt-aaagttcaatgcaacgttaaatgttattttaccagtattacccttaaatatttattgcgga |
3892903 |
T |
 |
Q |
274 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagta |
328 |
Q |
|
|
|||||||| |||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
3892904 |
gagagaaacatatataataaaatattaaattaataaggtcattatagtaaaagta |
3892958 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 191 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 37306909 - 37306772
Alignment:
Q |
191 |
ttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaa |
290 |
Q |
|
|
|||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| ||||||| |
|
|
T |
37306909 |
ttcctaattaactgtcacttttaaagttcaatgcaacattaaatgatgttttaccaatattacccttagatatttattgcagagagaaaaacatatgaat |
37306810 |
T |
 |
Q |
291 |
tgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagta |
328 |
Q |
|
|
||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
37306809 |
tgaaatattaaattaacaaggtcattatagtaaaagta |
37306772 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 195 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 7735289 - 7735158
Alignment:
Q |
195 |
tatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgag |
294 |
Q |
|
|
||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |
|
|
T |
7735289 |
tatttaactgtcactgtcaaaattcaatgcaaaattcaatgttgttttaccaacattatccttatatatttattgcggagagagaaacatatgaaatgaa |
7735190 |
T |
 |
Q |
295 |
atattaaatgaataaggtcattatagtaaaag |
326 |
Q |
|
|
||||||||| ||||||| ||||||||||||| |
|
|
T |
7735189 |
atattaaattaataaggctattatagtaaaag |
7735158 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 160 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 25027967 - 25027842
Alignment:
Q |
160 |
ctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtcctt |
257 |
Q |
|
|
|||||||||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| |
|
|
T |
25027967 |
ctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgttccaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattaccctt |
25027868 |
T |
 |
Q |
258 |
agttatttattgtggagagagaaata |
283 |
Q |
|
|
|||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
T |
25027867 |
agttatttattgcggagagagaaata |
25027842 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 207 - 328
Target Start/End: Original strand, 7466207 - 7466328
Alignment:
Q |
207 |
actttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaa |
306 |
Q |
|
|
||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || |
|
|
T |
7466207 |
actttcaaacttcaatgcaacattaaatagtgttttaccaatattacccttagatatttattgcggagagagaaacatatgaaatgaaatattaaattaa |
7466306 |
T |
 |
Q |
307 |
taaggtcattatagtaaaagta |
328 |
Q |
|
|
|||||||||||||| ||||||| |
|
|
T |
7466307 |
taaggtcattatagcaaaagta |
7466328 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 195 - 328
Target Start/End: Original strand, 31803337 - 31803470
Alignment:
Q |
195 |
tatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgag |
294 |
Q |
|
|
||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| |
|
|
T |
31803337 |
tatttaactatcactttcaaagttcaatgcaacattaaacgatgttttactaatattatccttagatatttattgcggagagagaaacatatgaattgaa |
31803436 |
T |
 |
Q |
295 |
atattaaatgaataaggtcattatagtaaaagta |
328 |
Q |
|
|
||||||||| || |||||| || ||||||||||| |
|
|
T |
31803437 |
atattaaattaacaaggtcgttttagtaaaagta |
31803470 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 209 - 325
Target Start/End: Original strand, 3243823 - 3243939
Alignment:
Q |
209 |
tttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata |
308 |
Q |
|
|
||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
3243823 |
tttcaaaaatcaatgcaatattaaatgttgttttatcaaatttgtcctttgttatttattgtggagagaaaaatatataaaatgagatattaaatgaata |
3243922 |
T |
 |
Q |
309 |
aggtcattatagtaaaa |
325 |
Q |
|
|
||| ||||||| |||| |
|
|
T |
3243923 |
aggctattataggaaaa |
3243939 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 179 - 319
Target Start/End: Original strand, 25785904 - 25786044
Alignment:
Q |
179 |
agaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagag |
278 |
Q |
|
|
|||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || |||| |||| ||||||||||| ||||||| |
|
|
T |
25785904 |
agaaatttttagtttctaattaactgtcactttcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttggcattattacccttgattatttattgtagagagag |
25786003 |
T |
 |
Q |
279 |
aaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattata |
319 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |
|
|
T |
25786004 |
aaatatatgaaatgagatattaaatgaggaaggttattata |
25786044 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 146 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 42394385 - 42394242
Alignment:
Q |
146 |
tactccttccatttctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgtttta |
243 |
Q |
|
|
|||||| ||| || |||||||||||| | |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |
|
|
T |
42394385 |
tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttgaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgtttta |
42394286 |
T |
 |
Q |
244 |
ccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatg |
287 |
Q |
|
|
|| ||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
42394285 |
tgaacattacccttaggtatttattggggagagagaaatatatg |
42394242 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 194 - 341
Target Start/End: Original strand, 13461022 - 13461169
Alignment:
Q |
194 |
ctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatga |
293 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||| || ||| ||||||| | |||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| | |
|
|
T |
13461022 |
ctatttaactgtcacttttaatgttgaatgcaacaataaatgttgttttaccaacattactcttaattatttattgtggagagagaaatatataaaataa |
13461121 |
T |
 |
Q |
294 |
gatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgtat |
341 |
Q |
|
|
||||||||||||| ||| | |||||| ||||| |||| ||||||||| |
|
|
T |
13461122 |
gatattaaatgaaaaagattattataataaaaatataaattattgtat |
13461169 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 191 - 328
Target Start/End: Original strand, 37809768 - 37809905
Alignment:
Q |
191 |
ttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaa |
290 |
Q |
|
|
|||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |
|
|
T |
37809768 |
ttcctaattaactgtcactttcaaagttcattgcaacattaaatgatgttttaccaatattacccttatatatttattgcagagagagaaacatatgaat |
37809867 |
T |
 |
Q |
291 |
tgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagta |
328 |
Q |
|
|
| | ||||||||| || ||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
37809868 |
taaaatattaaattaacaagatcattatagtaaaagta |
37809905 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 181 - 305
Target Start/End: Original strand, 21150491 - 21150615
Alignment:
Q |
181 |
aaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaa |
280 |
Q |
|
|
||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| |||||| || |
|
|
T |
21150491 |
aaattttttgtttctaattaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttacctttattacccttgattatttattgtagagagataa |
21150590 |
T |
 |
Q |
281 |
atatatgaaatgagatattaaatga |
305 |
Q |
|
|
|||||||||| ||||||||||||| |
|
|
T |
21150591 |
gtatatgaaataagatattaaatga |
21150615 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 145 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 24469894 - 24469708
Alignment:
Q |
145 |
ttactccttccatttctttttaagtgtta-tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaa-gttcaatgcaatattaaatgttgtttt |
242 |
Q |
|
|
||||||||||| || |||||||||| | | |||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| |||||||| || | ||||||||||||| |
|
|
T |
24469894 |
ttactccttccgttcctttttaagtatcactttgaagaaatttttg-ttcatatttaactgtcactttaaaaagttcaatgtaacaataaatgttgtttt |
24469796 |
T |
 |
Q |
243 |
accaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtata |
330 |
Q |
|
|
||||| ||| |||||| |||||||||| ||||| |||| ||| |||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||| |
|
|
T |
24469795 |
accaacattatccttaattatttattgcagagaggaaaatttattaaataagatattaaatgactaaggttattatagtaaaaatata |
24469708 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 203 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 18676613 - 18676491
Alignment:
Q |
203 |
tgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaa |
302 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| |
|
|
T |
18676613 |
tgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttacctttattatccttgattatttattgtagagagagaagtatatgaaataggatattaaa |
18676514 |
T |
 |
Q |
303 |
tgaataaggtcattatagtaaaa |
325 |
Q |
|
|
||| ||||| ||||||| |||| |
|
|
T |
18676513 |
tgatgaaggttattataggaaaa |
18676491 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 178 - 328
Target Start/End: Original strand, 13703091 - 13703242
Alignment:
Q |
178 |
gagaaattttttattcctatttaa--ctgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggaga |
275 |
Q |
|
|
||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||| |
|
|
T |
13703091 |
gagaaattttttatttctatttaagactgttgctttcaaagttcaatgcaacattaaatgtagttttaccaatattacctttagatatttattgcggaga |
13703190 |
T |
 |
Q |
276 |
gagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagta |
328 |
Q |
|
|
|||||| ||||||| ||| || |||||| |||||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
13703191 |
gagaaacatatgaagtgaaat-ttaaatcaataagactattatagtaaaagta |
13703242 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 184 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 18393188 - 18393047
Alignment:
Q |
184 |
ttttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaata |
283 |
Q |
|
|
|||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || |||| |||| ||||||||||| ||||||||| || |
|
|
T |
18393188 |
ttttttgtttctaattaactgtcactttcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttgcctttattacccttgattatttattgtagagagagaagta |
18393089 |
T |
 |
Q |
284 |
tatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaa |
325 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |
|
|
T |
18393088 |
aatgaaatgagatattaaatgatgaaggttattataggaaaa |
18393047 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 181 - 325
Target Start/End: Original strand, 38160291 - 38160432
Alignment:
Q |
181 |
aaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaa |
280 |
Q |
|
|
||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| |
|
|
T |
38160291 |
aaattttttgttcctatttaactgtcgctttcaaagttcaatgcaacattaaatgtagttttaccaatattatccttaaatatttattacggagagag-- |
38160388 |
T |
 |
Q |
281 |
atatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaa |
325 |
Q |
|
|
| ||||||| ||| || |||||| |||||| | |||||||||||| |
|
|
T |
38160389 |
acatatgaagtgaaat-ttaaatcaataagattattatagtaaaa |
38160432 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 185 - 305
Target Start/End: Original strand, 21157636 - 21157756
Alignment:
Q |
185 |
tttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatat |
284 |
Q |
|
|
||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| |||||| || ||| |
|
|
T |
21157636 |
tttttgtttctaattaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttacctttattacccttgattatttattgtagagagataagtat |
21157735 |
T |
 |
Q |
285 |
atgaaatgagatattaaatga |
305 |
Q |
|
|
||||||| ||||||||||||| |
|
|
T |
21157736 |
atgaaataagatattaaatga |
21157756 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 185 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 38308342 - 38308198
Alignment:
Q |
185 |
tttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatat |
284 |
Q |
|
|
||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||| || |||| |||||||||||||| ||| ||| |||||||||| |||||| ||||||| ||| |
|
|
T |
38308342 |
tttttgttcctgtttaactatcactttcaaaattcattgtaataataaatgttgttttatcaacattacccttagttatatattgtaaagagagacatac |
38308243 |
T |
 |
Q |
285 |
atgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtat |
329 |
Q |
|
|
||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
38308242 |
atgaaataagatattaaatgactaaggctattatagtaaaagtat |
38308198 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 185 - 342
Target Start/End: Original strand, 26906494 - 26906650
Alignment:
Q |
185 |
tttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttg-ttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaata |
283 |
Q |
|
|
||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |
|
|
T |
26906494 |
tttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcagcattaaatgttgtttttaccaatatcacccttagttatttat--tacagagagaaata |
26906591 |
T |
 |
Q |
284 |
tatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgtatc |
342 |
Q |
|
|
||||||| ||||||||||||||| | || ||||| | ||||| ||| |||||||||| |
|
|
T |
26906592 |
tatgaaacaagatattaaatgaatgatgttattattggaaaaggataaattattgtatc |
26906650 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 178 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 5843216 - 5843067
Alignment:
Q |
178 |
gagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagaga |
277 |
Q |
|
|
|||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| | |||| ||||||||| ||| || |
|
|
T |
5843216 |
gagaaattttttgttcctatttaactgtcgttttcaaagttcaatgcaatattaaatgtagttttatcaatatcacctttagatatttattgcagagtga |
5843117 |
T |
 |
Q |
278 |
gaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagta |
328 |
Q |
|
|
|||| ||||||| ||| || |||||| |||||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
5843116 |
gaaacatatgaagtgaaat-ttaaatcaataagactattatagtaaaagta |
5843067 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 198 - 328
Target Start/End: Original strand, 37633692 - 37633822
Alignment:
Q |
198 |
ttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagata |
297 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| || ||||||| ||||||| | | ||| |
|
|
T |
37633692 |
ttaactgtcactttcaaagttcattgcaacattaaatgatgttttaccaatattacccttatatatttattgcagaaagagaaacatatgaattaaaata |
37633791 |
T |
 |
Q |
298 |
ttaaatgaataaggtcattatagtaaaagta |
328 |
Q |
|
|
|||||| || ||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
37633792 |
ttaaattaacaagatcattatagtaaaagta |
37633822 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 160 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 10889337 - 10889243
Alignment:
Q |
160 |
ctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattg |
252 |
Q |
|
|
|||||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
10889337 |
ctttttaagtgtcacttttggagaaaatttttgttcctatttaactgtcatttttaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattg |
10889243 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 177 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 31985274 - 31985141
Alignment:
Q |
177 |
ggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagag |
276 |
Q |
|
|
||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||| ||||| |||||||| || | | |
|
|
T |
31985274 |
ggagaaattttttgtttatattcaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaaagttattttaccgatattacccttaattatttatcttgaacaa |
31985175 |
T |
 |
Q |
277 |
agaaatatatgaaatgagatattaaatgaataag |
310 |
Q |
|
|
|||||||||| ||| |||| |||||||||||||| |
|
|
T |
31985174 |
agaaatatataaaacgagacattaaatgaataag |
31985141 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 173 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 9959105 - 9959010
Alignment:
Q |
173 |
atttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttatt |
268 |
Q |
|
|
|||| |||||| ||||| || ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |
|
|
T |
9959105 |
atttagagaaaatttttgtttctatttaaccgtcgctttcaaagttcaatgcaatatcaaatgttgttttaccaatattatccttacctatttatt |
9959010 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 181 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 11413750 - 11413606
Alignment:
Q |
181 |
aaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaa |
280 |
Q |
|
|
||||||||| || || |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | || ||||||||| | ||||||||| |
|
|
T |
11413750 |
aaattttttgtttttaattaactatcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttacatttattacctttgattatttattatagagagagaa |
11413651 |
T |
 |
Q |
281 |
atatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaa |
325 |
Q |
|
|
||| |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |
|
|
T |
11413650 |
gtatgtgaaattagatattaaatgatgaaggttattataggaaaa |
11413606 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 198 - 305
Target Start/End: Original strand, 4609040 - 4609147
Alignment:
Q |
198 |
ttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagata |
297 |
Q |
|
|
|||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || |||| | || ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| |
|
|
T |
4609040 |
ttaagtgtcactttcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttgcctttattacctttgattatttattgtagagagagaagtaaatgaaatgagata |
4609139 |
T |
 |
Q |
298 |
ttaaatga |
305 |
Q |
|
|
|||||||| |
|
|
T |
4609140 |
ttaaatga |
4609147 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 145 - 283
Target Start/End: Original strand, 3686355 - 3686494
Alignment:
Q |
145 |
ttactccttccatttctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcacttt-caaagttcaatgcaatattaaatgttgttt |
241 |
Q |
|
|
||||||| ||| || |||||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||||||| ||| |
|
|
T |
3686355 |
ttactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagat-ttttttgttcctatttaagtgtcactttacatagttcaatgcaacattaaatgttattt |
3686453 |
T |
 |
Q |
242 |
taccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaata |
283 |
Q |
|
|
||| |||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
3686454 |
tactaatattacccttattta-ttattgtggagagagaaata |
3686494 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 195 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 12638146 - 12638037
Alignment:
Q |
195 |
tatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgag |
294 |
Q |
|
|
||||||| ||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| | |||| ||||||||| || ||||||| ||||||||||| |
|
|
T |
12638146 |
tatttaattgttacttttaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttatcaaaattacctttagatatttattgcagaaagagaaacatatgaaatgaa |
12638047 |
T |
 |
Q |
295 |
atattaaatg |
304 |
Q |
|
|
|||||||||| |
|
|
T |
12638046 |
atattaaatg |
12638037 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 220 - 325
Target Start/End: Original strand, 18000377 - 18000482
Alignment:
Q |
220 |
aatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattata |
319 |
Q |
|
|
||||||| |||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||| || |||||||| | | |
|
|
T |
18000377 |
aatgcaacattaaatgatgttttatcaatattaaccttagatatttattgtggagagagaaacatatgtattgaaatattaaattaacaaggtcataaaa |
18000476 |
T |
 |
Q |
320 |
gtaaaa |
325 |
Q |
|
|
|||||| |
|
|
T |
18000477 |
gtaaaa |
18000482 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 184 - 303
Target Start/End: Original strand, 4440091 - 4440210
Alignment:
Q |
184 |
ttttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaata |
283 |
Q |
|
|
|||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||| || ||| || ||||||| |||||||| || || ||||| |
|
|
T |
4440091 |
ttttttgtttctaattaactgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgttatttttcctataatgcccttagtaatttattggagactgaaaaata |
4440190 |
T |
 |
Q |
284 |
tatgaaatgagatattaaat |
303 |
Q |
|
|
||| |||| |||||||||| |
|
|
T |
4440191 |
tataaaatatgatattaaat |
4440210 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 181 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 8849359 - 8849213
Alignment:
Q |
181 |
aaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaa |
280 |
Q |
|
|
||||||||| || ||| |||||| || ||||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||| |
|
|
T |
8849359 |
aaattttttgtttctaattaactatcgttttcaaagttcaatgtatcattaaatgtgactttacctatattacccttatatatttattgcagagagagaa |
8849260 |
T |
 |
Q |
281 |
atatatgaaatgaga--tattaaatgaataaggtcattatagtaaaa |
325 |
Q |
|
|
|| |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||| |
|
|
T |
8849259 |
atgtatgaaatgagaagtattaaatgattaaggttattatagaaaaa |
8849213 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 194 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 17869510 - 17869379
Alignment:
Q |
194 |
ctatttaactgtcacttt-caaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatg |
292 |
Q |
|
|
|||||||| ||||| ||| || |||| |||| || |||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||| || |||||| ||||||||||| |||| |
|
|
T |
17869510 |
ctatttaagtgtcattttacatagttaaatggaacattaaatgttattttactaatattacccttatttatt-atcgtggagtaagaaatatatgtaatg |
17869412 |
T |
 |
Q |
293 |
agatattaaatgaataaggtcattatagtaaaa |
325 |
Q |
|
|
||||||||||| |||||| | |||||| ||||| |
|
|
T |
17869411 |
agatattaaataaataagattattataataaaa |
17869379 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 253 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 10734606 - 10734559
Alignment:
Q |
253 |
tccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatatta |
300 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |
|
|
T |
10734606 |
tccttagttatttattgtggagagagaaatataagaaattagatatta |
10734559 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 282 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 25027694 - 25027634
Alignment:
Q |
282 |
tatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgtatc |
342 |
Q |
|
|
|||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
T |
25027694 |
tatatgaaatgaaatattaaatgaataaggatattatagtaaaagtatcaattattgtatc |
25027634 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 184 - 320
Target Start/End: Original strand, 36481077 - 36481213
Alignment:
Q |
184 |
ttttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaata |
283 |
Q |
|
|
|||||| || ||| |||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||| || ||||||| |||||||| |||||| |||| |
|
|
T |
36481077 |
ttttttgtttctaattaagtgtcattttcaaagttcaatgtaacattaaatgttgtttttcttataatgcccttagtaatttattgcagagagataaatt |
36481176 |
T |
 |
Q |
284 |
tatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatag |
320 |
Q |
|
|
|| ||||| ||||||||| | ||||| ||||||| |
|
|
T |
36481177 |
taagaaatataatattaaataattaaggatattatag |
36481213 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 174 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 10735526 - 10735456
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttac |
244 |
Q |
|
|
|||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||| || |||| ||||||| || |||||| |
|
|
T |
10735526 |
tttggagaaattttttgttcatatttaaatgtcacttttaaagtttaacgcaacattaaatattattttac |
10735456 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 198 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 13957363 - 13957258
Alignment:
Q |
198 |
ttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagata |
297 |
Q |
|
|
|||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||| | |||||| |||||||| |||||| | |||||||||| |||| |
|
|
T |
13957363 |
ttaactgtcactctcaaagttcaatgtaacattaaatgttgttttttctataaagctcttagtaatttattgaagagagaagagtatatgaaatatgata |
13957264 |
T |
 |
Q |
298 |
ttaaat |
303 |
Q |
|
|
|||||| |
|
|
T |
13957263 |
ttaaat |
13957258 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 284 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 42393865 - 42393808
Alignment:
Q |
284 |
tatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgtat |
341 |
Q |
|
|
|||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
T |
42393865 |
tatgaaataagatattaaatgactaaggctattatagtaaaagtataaattattgtat |
42393808 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 282 - 342
Target Start/End: Original strand, 3686790 - 3686850
Alignment:
Q |
282 |
tatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgtatc |
342 |
Q |
|
|
|||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| || | |||||||||| |
|
|
T |
3686790 |
tatatgtaatgagatattaaataaataaggttattatagtaaaaatagaaattattgtatc |
3686850 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 282 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 31546118 - 31546062
Alignment:
Q |
282 |
tatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
||||||||||| | |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||| |
|
|
T |
31546118 |
tatatgaaatgtgttattaattgaatcaggtcattgtagtaaaagtataacttattg |
31546062 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 238 - 307
Target Start/End: Original strand, 23418602 - 23418671
Alignment:
Q |
238 |
gttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaat |
307 |
Q |
|
|
|||||||||||||| | ||||||||||||| || ||||||||||| ||||| | ||||||||||||| |
|
|
T |
23418602 |
gttttaccaatattatggttagttatttattagagatagagaaatatacgaaataaaatattaaatgaat |
23418671 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #109
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 174 - 210
Target Start/End: Original strand, 16965784 - 16965820
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactt |
210 |
Q |
|
|
|||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
16965784 |
tttggagaaattttttgttcttatttaactgtcactt |
16965820 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 78)
Name: chr2
Description:
Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 146 - 338
Target Start/End: Original strand, 26342560 - 26342754
Alignment:
Q |
146 |
tactccttccatttctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgtttta |
243 |
Q |
|
|
|||||| ||| || |||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
26342560 |
tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaatttttggttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta |
26342659 |
T |
 |
Q |
244 |
ccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
26342660 |
ccaatattgtccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
26342754 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 174 - 338
Target Start/End: Original strand, 41885635 - 41885799
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtgga |
273 |
Q |
|
|
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
41885635 |
tttggagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttaccaatattgtccttagttatttattgtgga |
41885734 |
T |
 |
Q |
274 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |
|
|
T |
41885735 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattacagtaaaagtacagcttattg |
41885799 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 146 - 338
Target Start/End: Original strand, 34399182 - 34399376
Alignment:
Q |
146 |
tactccttccatttctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgtttta |
243 |
Q |
|
|
|||||| ||| || |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |
|
|
T |
34399182 |
tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttattcctatttaaccatcactttcaaagttcaatgcaacattaaatattgtttta |
34399281 |
T |
 |
Q |
244 |
ccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
|||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
T |
34399282 |
ccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagtttattg |
34399376 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 146 - 336
Target Start/End: Original strand, 10812179 - 10812371
Alignment:
Q |
146 |
tactccttccatttctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgtttta |
243 |
Q |
|
|
|||||| ||| || |||||||||||| | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
10812179 |
tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaaaattttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta |
10812278 |
T |
 |
Q |
244 |
ccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttat |
336 |
Q |
|
|
|||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
10812279 |
ccaatattatccttaattatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttat |
10812371 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 144 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 14296022 - 14295826
Alignment:
Q |
144 |
tttactccttccatttctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttt |
241 |
Q |
|
|
|||||||| ||| || |||||||||||| | |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |
|
|
T |
14296022 |
tttactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaaatttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatacaacattaaatgttgttt |
14295923 |
T |
 |
Q |
242 |
taccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
T |
14295922 |
taccaatattgtccttagttatttattgcgaagagagaaatatatgaaatgaaatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataccttattg |
14295826 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 174 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 479206 - 479042
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtgga |
273 |
Q |
|
|
|||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| |
|
|
T |
479206 |
tttggagaaaaattttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttatcaatattatccttagttatttattgcgga |
479107 |
T |
 |
Q |
274 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
479106 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
479042 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 160 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 15183250 - 15183070
Alignment:
Q |
160 |
ctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtcctt |
257 |
Q |
|
|
|||||||||||| | ||| |||||||||||| || |||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
15183250 |
ctttttaagtgtcactttttgagaaattttttgtttctatttaattgtcactttcgaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtcctt |
15183151 |
T |
 |
Q |
258 |
agttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
T |
15183150 |
agttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaatatagcttattg |
15183070 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 160 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 28145821 - 28145642
Alignment:
Q |
160 |
ctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtcctt |
257 |
Q |
|
|
|||||||||||| | |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
28145821 |
ctttttaagtgtcacttttggagaaaatttttcttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtcctt |
28145722 |
T |
 |
Q |
258 |
agttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
|||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
28145721 |
agttatttattgcggagagagaattatatgaaatgagatattaaatgaataatgtcattatagt-aaagtatagcttattg |
28145642 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 174 - 338
Target Start/End: Original strand, 3363594 - 3363758
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtgga |
273 |
Q |
|
|
|||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |
|
|
T |
3363594 |
tttggagaaaagttttgttcttatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcgga |
3363693 |
T |
 |
Q |
274 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
3363694 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatcaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
3363758 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 145 - 338
Target Start/End: Original strand, 14288410 - 14288605
Alignment:
Q |
145 |
ttactccttccatttctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgtttt |
242 |
Q |
|
|
||||||| ||| ||||||||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| |
|
|
T |
14288410 |
ttactccctccgtttctttttaagtgtcacttttggagaaaatttttgttcctatttaactgtcattttcaaagttcaatataacattaaatgttgtttt |
14288509 |
T |
 |
Q |
243 |
accaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
| |||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
14288510 |
atcaatattgtccttaattatttatcgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
14288605 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 178 - 338
Target Start/End: Original strand, 19594365 - 19594524
Alignment:
Q |
178 |
gagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagaga |
277 |
Q |
|
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |
|
|
T |
19594365 |
gagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaa-ttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccatagttatttattgcggagaga |
19594463 |
T |
 |
Q |
278 |
gaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
T |
19594464 |
gaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaatatagcttattg |
19594524 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 145 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 11560311 - 11560117
Alignment:
Q |
145 |
ttactccttccatttctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgtttt |
242 |
Q |
|
|
||||||| ||| |||||| |||||||| | |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
11560311 |
ttactccctccgtttcttcttaagtgtcagttttggagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttt |
11560212 |
T |
 |
Q |
243 |
accaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttatt |
337 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| |
|
|
T |
11560211 |
accaatattgtccttagttatttattgtgaagagagaaatatatgcaatgagatattaaatgaataagataattatagtaaaagtacagcttatt |
11560117 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 160 - 338
Target Start/End: Original strand, 37093444 - 37093623
Alignment:
Q |
160 |
ctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtcctt |
257 |
Q |
|
|
|||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
T |
37093444 |
ctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatacaatattaaatgttgttttatcaatattgtcctt |
37093543 |
T |
 |
Q |
258 |
agttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
|||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
T |
37093544 |
agttatttattgcagaaagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataa-gtcattatagtaaaagtataacttattg |
37093623 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 191 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 15893796 - 15893649
Alignment:
Q |
191 |
ttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaa |
290 |
Q |
|
|
||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
15893796 |
ttcctatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaa |
15893697 |
T |
 |
Q |
291 |
tgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
15893696 |
tgagatattaaatgaataaggttattatagtaaaagtatagcttattg |
15893649 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 160 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 30264851 - 30264671
Alignment:
Q |
160 |
ctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtcctt |
257 |
Q |
|
|
|||||||||||| | |||||||||| |||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
30264851 |
ctttttaagtgtcacttttggagaaaaattttgttcttatttaactgtcattttcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttaccaatattgtcctt |
30264752 |
T |
 |
Q |
258 |
agttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
T |
30264751 |
agttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgaaatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagtttattg |
30264671 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 191 - 338
Target Start/End: Original strand, 10263783 - 10263931
Alignment:
Q |
191 |
ttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagtt-atttattgtggagagagaaatatatgaa |
289 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
T |
10263783 |
ttcctatttaactgtcactttcaaatttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattatccttagtttatttattgcggagagagaaatatatgaa |
10263882 |
T |
 |
Q |
290 |
atgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
T |
10263883 |
atgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagtttattg |
10263931 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 174 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 11222549 - 11222385
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtgga |
273 |
Q |
|
|
|||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |
|
|
T |
11222549 |
tttgaagaaattttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcaga |
11222450 |
T |
 |
Q |
274 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| |
|
|
T |
11222449 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatattaaaagtacaacttattg |
11222385 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 174 - 337
Target Start/End: Original strand, 4883613 - 4883776
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtgga |
273 |
Q |
|
|
|||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || |
|
|
T |
4883613 |
tttgaagaaattttttgttcctatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatctttagttatttattgcaga |
4883712 |
T |
 |
Q |
274 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttatt |
337 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |
|
|
T |
4883713 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtacaacttatt |
4883776 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 195 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 38186264 - 38186122
Alignment:
Q |
195 |
tatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgag |
294 |
Q |
|
|
||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
38186264 |
tatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagaaagaaatatatgaaatgag |
38186165 |
T |
 |
Q |
295 |
atattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttatt |
337 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |
|
|
T |
38186164 |
atattaaatgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttatt |
38186122 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 160 - 341
Target Start/End: Original strand, 2012855 - 2013038
Alignment:
Q |
160 |
ctttttaagtgttattt--ggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtcctt |
257 |
Q |
|
|
|||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| |||| |
|
|
T |
2012855 |
ctttttaagtgtcatttttggagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacattaccctt |
2012954 |
T |
 |
Q |
258 |
agttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgtat |
341 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
T |
2012955 |
agttatttattgtggagagagaaatatatgaaataagatattaaattactaaggttattatagtaaaagtataaattattgtat |
2013038 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 146 - 338
Target Start/End: Original strand, 34357158 - 34357352
Alignment:
Q |
146 |
tactccttccatttctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgtttta |
243 |
Q |
|
|
|||||| ||| || |||||||||||| | |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
34357158 |
tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaaaaatttgttcctatttaattgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta |
34357257 |
T |
 |
Q |
244 |
ccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
|||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |
|
|
T |
34357258 |
ccaatattatccttagttatttactgtggaaagagaaatatataaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaatataacttattg |
34357352 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 148 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 25558444 - 25558251
Alignment:
Q |
148 |
ctccttccatttctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttacc |
245 |
Q |
|
|
|||| ||| ||||||||||||||| | |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | |
|
|
T |
25558444 |
ctccctccgtttctttttaagtgtcacttttggagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagtt-aatgcaacattaaatgttgttttatc |
25558346 |
T |
 |
Q |
246 |
aatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgtatc |
342 |
Q |
|
|
|||||| ||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
T |
25558345 |
aatattatccttagttatttattgcggagagata--tatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtctagcttattgtatc |
25558251 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 174 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 15677524 - 15677360
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtgga |
273 |
Q |
|
|
|||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| |
|
|
T |
15677524 |
tttggagaaaaattttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatattattttatcaatattatccttagttatttattgcgga |
15677425 |
T |
 |
Q |
274 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |
|
|
T |
15677424 |
gagagaaatatatgaaatgtgatattaaatgaataaggtcattataataaaagtataacttattg |
15677360 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 196 - 329
Target Start/End: Original strand, 14541363 - 14541496
Alignment:
Q |
196 |
atttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgaga |
295 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
T |
14541363 |
atttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaacgttgttttaccaatattatccttagttatttattgtggagagagaaatatataaaatgaga |
14541462 |
T |
 |
Q |
296 |
tattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtat |
329 |
Q |
|
|
||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
14541463 |
tattaaatgaataaggttattatagtaaaagtat |
14541496 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 160 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 35158600 - 35158416
Alignment:
Q |
160 |
ctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtcctt |
257 |
Q |
|
|
|||||||||||| | |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
T |
35158600 |
ctttttaagtgtcacttttgaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcgaaattcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattatcctt |
35158501 |
T |
 |
Q |
258 |
agttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgtatc |
342 |
Q |
|
|
||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| |
|
|
T |
35158500 |
gcttatttactgtggagaaagaaatatatgaaatgaaatagtaaatgaataaggttattacagtaaaagtatatattattgtatc |
35158416 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 174 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 38072459 - 38072314
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtgga |
273 |
Q |
|
|
|||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |
|
|
T |
38072459 |
tttggagaaattttttgtttctatttaactgtcatttttgaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtctttagttatttattgcgga |
38072360 |
T |
 |
Q |
274 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattata |
319 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
T |
38072359 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagttcattata |
38072314 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 174 - 338
Target Start/End: Original strand, 13965617 - 13965781
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtgga |
273 |
Q |
|
|
|||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||| ||| |
|
|
T |
13965617 |
tttggagaaattttttgttcatatttaactgttacttttaaagttcaatgcaacattaaatgttgatataccaatattatccttagttatttattgcgga |
13965716 |
T |
 |
Q |
274 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |
|
|
T |
13965717 |
gagagaaatatattaaatgagatgttaaatgaacaaggtcattatagtaaaagcataacttattg |
13965781 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 160 - 338
Target Start/End: Original strand, 36375565 - 36375747
Alignment:
Q |
160 |
ctttttaagtgttattt--ggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtc--c |
255 |
Q |
|
|
|||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| | | | |
|
|
T |
36375565 |
ctttttaagtgtcatttttggagaaaaattttgttcctatttgactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttatcaatagtattatc |
36375664 |
T |
 |
Q |
256 |
ttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
|| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
T |
36375665 |
ttggttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaattatagcttattg |
36375747 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 144 - 328
Target Start/End: Original strand, 9369952 - 9370138
Alignment:
Q |
144 |
tttactccttccatttctttttaagtgttattt--ggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttt |
241 |
Q |
|
|
|||||||| || ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
T |
9369952 |
tttactccctcagtttctttttaattgtcatttttggagaaattttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaagtgttgttt |
9370051 |
T |
 |
Q |
242 |
taccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagta |
328 |
Q |
|
|
|| ||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
9370052 |
tatcaatattacccttaaatatttattgcggagagagaaacatatgaaatgaaatattaaattaataaggtcattatagtaaaagta |
9370138 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 174 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 36405075 - 36404910
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttattta-ttgtgg |
272 |
Q |
|
|
|||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || || |
|
|
T |
36405075 |
tttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttattttaccaatattatccttagttatttatttacgg |
36404976 |
T |
 |
Q |
273 |
agagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||| |
|
|
T |
36404975 |
atagataaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggttattatagtaaaaatataacttattg |
36404910 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 174 - 325
Target Start/End: Original strand, 4654729 - 4654880
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtgga |
273 |
Q |
|
|
|||| |||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |
|
|
T |
4654729 |
tttgaagaaatttttcgtttctatttaactgtcacttgcaaagttcaatgcaacattaaatattattttaccaatattatccttagttatttatagcgga |
4654828 |
T |
 |
Q |
274 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaa |
325 |
Q |
|
|
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
4654829 |
gagagaaatgtatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaa |
4654880 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 145 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 31025204 - 31025018
Alignment:
Q |
145 |
ttactccttccatttctttttaagtgttattt--ggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgtttt |
242 |
Q |
|
|
||||||| ||| || |||||||||||| |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||| |
|
|
T |
31025204 |
ttactccctccgttcctttttaagtgtcattttgggagaaattttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatcttgtttt |
31025105 |
T |
 |
Q |
243 |
accaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtat |
329 |
Q |
|
|
||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
31025104 |
accaacattacccttagttatttattatggagagataaatatatgaaataagatattaaatgactaaggctattatagtaaaagtat |
31025018 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 178 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 32855009 - 32854859
Alignment:
Q |
178 |
gagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagaga |
277 |
Q |
|
|
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||| ||||||| |
|
|
T |
32855009 |
gagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattacccttagatgtttattgcggagaga |
32854910 |
T |
 |
Q |
278 |
gaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagta |
328 |
Q |
|
|
|||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| |
|
|
T |
32854909 |
gaaacatatgaaatgaaatattaaattaataaggccattgtagtaaaagta |
32854859 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 196 - 329
Target Start/End: Original strand, 9706819 - 9706952
Alignment:
Q |
196 |
atttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgaga |
295 |
Q |
|
|
|||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |
|
|
T |
9706819 |
atttaactgtcacttttaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattatggagagataaatatataaaatgaga |
9706918 |
T |
 |
Q |
296 |
tattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtat |
329 |
Q |
|
|
||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
9706919 |
tatcaaatgaataaggttattatagtaaaagtat |
9706952 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 174 - 338
Target Start/End: Original strand, 44360444 - 44360607
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtgga |
273 |
Q |
|
|
||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||| ||| |
|
|
T |
44360444 |
tttggagaatttttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgatgttttatcaatatac-ccttaaatatttattgcgga |
44360542 |
T |
 |
Q |
274 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |
|
|
T |
44360543 |
gagagaaatatatgaaataagatattaaatgaataaggtcattataataaaagtataacttattg |
44360607 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 144 - 328
Target Start/End: Original strand, 43077270 - 43077456
Alignment:
Q |
144 |
tttactccttccatttctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttt |
241 |
Q |
|
|
|||||||| || ||| |||||||| ||| | |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |
|
|
T |
43077270 |
tttactccctctattcctttttaattgtcacttttgaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatattgttt |
43077369 |
T |
 |
Q |
242 |
taccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagta |
328 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||| || ||||||||||||| |
|
|
T |
43077370 |
taccaatattacccttagatatttattgcggagagagaaacatatgaaataaaatattaaattaataaggccaatatagtaaaagta |
43077456 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 174 - 328
Target Start/End: Original strand, 13753965 - 13754119
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtgga |
273 |
Q |
|
|
||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| |
|
|
T |
13753965 |
tttggagaacatttttgttccaatttaactgtcactttcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattgcgga |
13754064 |
T |
 |
Q |
274 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagta |
328 |
Q |
|
|
||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
13754065 |
gagagaaatatatgacatgaaatattaaatgaataaggctattatagtaaaagta |
13754119 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 164 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 13001156 - 13000976
Alignment:
Q |
164 |
ttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagtt |
261 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || |||| |||||||| |
|
|
T |
13001156 |
ttaagtgttacttttggagaaattttttgttccaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatcttgttttatcagtattacccttagtt |
13001057 |
T |
 |
Q |
262 |
atttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgtatc |
342 |
Q |
|
|
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||| |
|
|
T |
13001056 |
atttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaataaataaggctattatagcaaaaatattaattattgtatc |
13000976 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 178 - 330
Target Start/End: Original strand, 6013489 - 6013641
Alignment:
Q |
178 |
gagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagaga |
277 |
Q |
|
|
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| ||| |
|
|
T |
6013489 |
gagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacattacccttagttatttattgcggaaaga |
6013588 |
T |
 |
Q |
278 |
gaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtata |
330 |
Q |
|
|
|||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||| |
|
|
T |
6013589 |
gaaatatatgaaataagatattaaatgactaagactattataataaaagtata |
6013641 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 174 - 328
Target Start/End: Original strand, 8443701 - 8443855
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgtttt-accaatattgtccttagttatttattgtgg |
272 |
Q |
|
|
|||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| || |
|
|
T |
8443701 |
tttgaagaaattttttgtccctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaa-attaaatgttgtttttaccaatattacccttagatatttattgcgg |
8443799 |
T |
 |
Q |
273 |
agagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagta |
328 |
Q |
|
|
||||||||| | ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
8443800 |
agagagaaacaaatgaaatgaaatattaaattaataaggtcattatagtaaaagta |
8443855 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 203 - 338
Target Start/End: Original strand, 14308434 - 14308567
Alignment:
Q |
203 |
tgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaa |
302 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||| ||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
14308434 |
tgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatatcgttttatcaat--tgtacttaattatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaa |
14308531 |
T |
 |
Q |
303 |
tgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
14308532 |
tgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
14308567 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 146 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 34309312 - 34309149
Alignment:
Q |
146 |
tactccttccatttctttttaagtgtta-tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttac |
244 |
Q |
|
|
||||||||||||| |||||||||||| | ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
34309312 |
tactccttccattcctttttaagtgtcacttttgaagaatttttttttcctatttaactgtcactttcgaagttcaatgcaacattaaatgttgttttac |
34309213 |
T |
 |
Q |
245 |
caatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata |
308 |
Q |
|
|
|||| || || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |
|
|
T |
34309212 |
caatgttatcattgcttattcattgtggagagagaaatatatgaaatgaaatattaaattaata |
34309149 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 145 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 13849979 - 13849794
Alignment:
Q |
145 |
ttactccttccatttctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgtttt |
242 |
Q |
|
|
||||||| ||| ||||||||||| ||| | ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
13849979 |
ttactccctccgtttctttttaattgtcacttttaaagaaattttttgttcttatttaactgtcactttcaaagttcaatgcatcattaaatgttgtttt |
13849880 |
T |
 |
Q |
243 |
accaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagta |
328 |
Q |
|
|
| ||||||| | |||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
13849879 |
atcaatattacctttagatatttattgcagagagagaaacatatgaaatgaaatattaaattaacaaggtcattatagtaaaagta |
13849794 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 186 - 325
Target Start/End: Original strand, 13215415 - 13215554
Alignment:
Q |
186 |
ttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatata |
285 |
Q |
|
|
|||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
13215415 |
ttttgttcctatttaactgtcactttcgaagttcaatgtaacattaaatgttgttttaccaatattatccttacttatttattacggagagagaaatata |
13215514 |
T |
 |
Q |
286 |
tgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaa |
325 |
Q |
|
|
|||||| |||| |||||| |||| ||| |||||||||||| |
|
|
T |
13215515 |
tgaaattagattttaaattaatagggttattatagtaaaa |
13215554 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 146 - 325
Target Start/End: Original strand, 32674191 - 32674376
Alignment:
Q |
146 |
tactccttccatttctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgtttta |
243 |
Q |
|
|
|||||| ||| || |||||||||||| | |||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
32674191 |
tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgttccaatttaacaatcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta |
32674290 |
T |
 |
Q |
244 |
ccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgaga----tattaaatgaataaggtcattatagtaaaa |
325 |
Q |
|
|
||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
T |
32674291 |
tcaatattacccgtagttatttattgcggagagaaaaatatatgaaatgagaggagtattaaatgaataaggctattatagtaaaa |
32674376 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 146 - 281
Target Start/End: Original strand, 14284108 - 14284245
Alignment:
Q |
146 |
tactccttccatttctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgtttta |
243 |
Q |
|
|
|||||| ||| ||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |
|
|
T |
14284108 |
tactccatccgtttctttttaagtgtcacttttgaagaaattttttattcctgtttagttgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttatttta |
14284207 |
T |
 |
Q |
244 |
ccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaa |
281 |
Q |
|
|
||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |
|
|
T |
14284208 |
ccaatattgtccttaattatttattgcggagagagaaa |
14284245 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 146 - 341
Target Start/End: Original strand, 1395544 - 1395741
Alignment:
Q |
146 |
tactccttccatttctttttaagtgtta--tttggagaaatttttta-ttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgtttt |
242 |
Q |
|
|
|||||| ||| || |||||||||||| | |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||| |
|
|
T |
1395544 |
tactccctccgttcctttttaagtgtcacatttgtagaaattttttcgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgtt-tttt |
1395642 |
T |
 |
Q |
243 |
accaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgtat |
341 |
Q |
|
|
||||| ||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| || |||| |||||||||||| |||| ||||||||| |
|
|
T |
1395643 |
accaacattacccttagttaattattgcggagagagaaatatatgaaataaaatattaaaagactaagactattatagtaaaaatataaattattgtat |
1395741 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 178 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 25187356 - 25187241
Alignment:
Q |
178 |
gagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagaga |
277 |
Q |
|
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| |
|
|
T |
25187356 |
gagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttattttaccaatattactcttaaatatttattgcggagaga |
25187257 |
T |
 |
Q |
278 |
gaaatatatgaaatga |
293 |
Q |
|
|
|||| ||||||||||| |
|
|
T |
25187256 |
gaaacatatgaaatga |
25187241 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 174 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 32544020 - 32543885
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtgga |
273 |
Q |
|
|
||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| || |
|
|
T |
32544020 |
tttggagaatttttttgttctaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacctttagttatttattacaga |
32543921 |
T |
 |
Q |
274 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataa |
309 |
Q |
|
|
|| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
32543920 |
gaaaaaaatatatgaaatgagatattaaatgaataa |
32543885 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 178 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 34884767 - 34884617
Alignment:
Q |
178 |
gagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagaga |
277 |
Q |
|
|
|||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||| | ||||||| ||| ||| |
|
|
T |
34884767 |
gagaaattttttgttcctatttaactttcacttttaaagttcattgcaacattaaatgttgttttatcaatattacctttagatgtttattgcggaaaga |
34884668 |
T |
 |
Q |
278 |
gaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagta |
328 |
Q |
|
|
||| ||||||||| | | ||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
34884667 |
aaaacatatgaaataaaacattaaattaataaggtcattatagtaaaagta |
34884617 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 181 - 325
Target Start/End: Original strand, 30544537 - 30544681
Alignment:
Q |
181 |
aaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaa |
280 |
Q |
|
|
||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| ||| ||| || || |
|
|
T |
30544537 |
aaattttttgtttctaattaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttacctttattacccttgattatttactgtagagggataa |
30544636 |
T |
 |
Q |
281 |
atatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaa |
325 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||||||||||| || || ||||||| |||| |
|
|
T |
30544637 |
gtatatgaaataagatattaaatgaagaaagttattataggaaaa |
30544681 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 179 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 33947657 - 33947516
Alignment:
Q |
179 |
agaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagag |
278 |
Q |
|
|
||||||||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| | || ||| |||||||||| ||||||||| ||||||| |
|
|
T |
33947657 |
agaaattttttgtttctaattaagtgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatggtgttcttcctataatgtccttagtaatttattgtagagagag |
33947558 |
T |
 |
Q |
279 |
aaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatag |
320 |
Q |
|
|
|||||||| |||| |||||||||| | ||||| ||||||| |
|
|
T |
33947557 |
aaatatataaaatatgatattaaataattaaggatattatag |
33947516 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 198 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 38148244 - 38148116
Alignment:
Q |
198 |
ttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagata |
297 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| || |||| |||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
38148244 |
ttaactgtcactttcaaagttcaatacaacattaaatgttatttttcctttattacccttgattatttattgtagagagagaagtatatgaaatgagata |
38148145 |
T |
 |
Q |
298 |
ttaaatgaataaggtcattatagtaaaag |
326 |
Q |
|
|
|||||||| || || ||||||| ||||| |
|
|
T |
38148144 |
ttaaatgatgaaagttattatagaaaaag |
38148116 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 184 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 838293 - 838174
Alignment:
Q |
184 |
ttttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaata |
283 |
Q |
|
|
|||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||| || || |||||||||| |||||||| |||||||||||| |
|
|
T |
838293 |
ttttttgtttctaattaactgtcattttcaaagttcaatgtaacattaaatgttgtttttcctattatgtccttagtaatttattgcagagagagaaata |
838194 |
T |
 |
Q |
284 |
tatgaaatgagatattaaat |
303 |
Q |
|
|
|||||||| |||||||||| |
|
|
T |
838193 |
tatgaaatatgatattaaat |
838174 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 194 - 328
Target Start/End: Original strand, 29041980 - 29042111
Alignment:
Q |
194 |
ctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatga |
293 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| || |||||||||||||||| || ||| ||||||| || ||||||||| ||||||||||| |
|
|
T |
29041980 |
ctatttaactgtcactttcaaagtccaatgcaacattagatattgttttaccaatattacccgtagatatttat--tgcagagagaaacatatgaaatga |
29042077 |
T |
 |
Q |
294 |
gatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagta |
328 |
Q |
|
|
| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |
|
|
T |
29042078 |
-aaattaaattaataacgtcattattgtaaaagta |
29042111 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 178 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 4952917 - 4952775
Alignment:
Q |
178 |
gagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttattt-attgtggagag |
276 |
Q |
|
|
|||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||| |
|
|
T |
4952917 |
gagaaattttttgttcttatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaacattaaatga---------aatattacccttaaatattttattgtggagag |
4952827 |
T |
 |
Q |
277 |
agaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagta |
328 |
Q |
|
|
||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||||| |
|
|
T |
4952826 |
agaaacatatgaaatgaaatattaaattaataaggccgttatagtaaaagta |
4952775 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 198 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 28967440 - 28967313
Alignment:
Q |
198 |
ttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagata |
297 |
Q |
|
|
|||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || |||| |||| |||||||| || ||||||||| || ||||||||||||| |
|
|
T |
28967440 |
ttaaatgtcactttcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttgcctttattacccttgattatttatcgtagagagagaagtaaatgaaatgagata |
28967341 |
T |
 |
Q |
298 |
ttaaatgaataaggtcattatagtaaaa |
325 |
Q |
|
|
|||||||| ||||| ||||||| |||| |
|
|
T |
28967340 |
ttaaatgataaaggttattataggaaaa |
28967313 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 174 - 325
Target Start/End: Original strand, 37077180 - 37077331
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtgga |
273 |
Q |
|
|
|||| ||||||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| |||| || |||| | || ||||||||||| || |
|
|
T |
37077180 |
tttgaagaaattttttgtttttatttaagtgtcattttcaaagttcaatacaacattaaatgttattttgtcattattaccattggttatttattgcaga |
37077279 |
T |
 |
Q |
274 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaa |
325 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||| |||| |
|
|
T |
37077280 |
tagagaaatatatgaaatgagatattaaattatgaaggttattatagaaaaa |
37077331 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 205 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 7529907 - 7529806
Alignment:
Q |
205 |
tcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatg-agatattaaat |
303 |
Q |
|
|
||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| |
|
|
T |
7529907 |
tcactttcaaagttcaacacaatattaaatgatgtgttacctatattacccttagttatttattgcagagagagaaatatatgaaatgaaaatattaaat |
7529808 |
T |
 |
Q |
304 |
ga |
305 |
Q |
|
|
|| |
|
|
T |
7529807 |
ga |
7529806 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 198 - 303
Target Start/End: Original strand, 42088928 - 42089033
Alignment:
Q |
198 |
ttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagata |
297 |
Q |
|
|
|||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || ||| || ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |||| |
|
|
T |
42088928 |
ttaagtgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgttgtttttcctataatgcccttagtaatttattgcagagagagaaatataagaaatatgata |
42089027 |
T |
 |
Q |
298 |
ttaaat |
303 |
Q |
|
|
|||||| |
|
|
T |
42089028 |
ttaaat |
42089033 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 194 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 37116806 - 37116690
Alignment:
Q |
194 |
ctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatga |
293 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| || |||||| || ||||| ||||||| ||| | | ||||| | |
|
|
T |
37116806 |
ctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttatcaatcttacccttagataattattacggagagaaaaacacaagaaataa |
37116707 |
T |
 |
Q |
294 |
gatattaaatgaataag |
310 |
Q |
|
|
||||||||| |||||| |
|
|
T |
37116706 |
aatattaaataaataag |
37116690 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 182 - 291
Target Start/End: Original strand, 2991829 - 2991937
Alignment:
Q |
182 |
aattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaa |
281 |
Q |
|
|
|||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| || ||||||||| | |
|
|
T |
2991829 |
aatttttttttccaatttaacattcactttcaaagttgaat-caacattaaatgttgttttaccaatattacccttagatatttaatgcggagagagaca |
2991927 |
T |
 |
Q |
282 |
tatatgaaat |
291 |
Q |
|
|
||||||||| |
|
|
T |
2991928 |
catatgaaat |
2991937 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 259 - 327
Target Start/End: Original strand, 36824486 - 36824554
Alignment:
Q |
259 |
gttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagt |
327 |
Q |
|
|
||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| |
|
|
T |
36824486 |
gttatttattgcggagaaagaaatatatgaaatgagatattaaataaataagatcattacagtaaaagt |
36824554 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 218 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 31011905 - 31011799
Alignment:
Q |
218 |
tcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcatta |
317 |
Q |
|
|
||||||||| |||||||||| |||||| |||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| || ||||| |||| |
|
|
T |
31011905 |
tcaatgcaacattaaatgttattttactaatattacctttatttatt-attgtggagagagaaatgtatgtaataagatattaaataaacaaggttatta |
31011807 |
T |
 |
Q |
318 |
tagtaaaa |
325 |
Q |
|
|
|||||||| |
|
|
T |
31011806 |
tagtaaaa |
31011799 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 266 - 341
Target Start/End: Original strand, 34721564 - 34721639
Alignment:
Q |
266 |
attgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgtat |
341 |
Q |
|
|
|||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
T |
34721564 |
attgcggagagagaaatatatgaaataatatattaaatgactaaggttattatagtaaaagtataaattattgtat |
34721639 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 275 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 3376409 - 3376347
Alignment:
Q |
275 |
agagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttatt |
337 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||| |
|
|
T |
3376409 |
agagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataatgttattataataaaaatatagcttatt |
3376347 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 184 - 305
Target Start/End: Original strand, 45065092 - 45065213
Alignment:
Q |
184 |
ttttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaata |
283 |
Q |
|
|
|||||| || ||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || |||| |||| ||||||||||| |||||||| || |
|
|
T |
45065092 |
ttttttgtttctaattaagtgttactttcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttgcctttattacccttgattatttattgtaaagagagaagta |
45065191 |
T |
 |
Q |
284 |
tatgaaatgagatattaaatga |
305 |
Q |
|
|
||||||| ||||||||||||| |
|
|
T |
45065192 |
aatgaaataagatattaaatga |
45065213 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 174 - 242
Target Start/End: Original strand, 37660154 - 37660222
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgtttt |
242 |
Q |
|
|
|||| ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
37660154 |
tttgcagaaattttttgtttctaattaactgtcactttcaaagttcaatacaacattaaatgttgtttt |
37660222 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 185 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 928253 - 928115
Alignment:
Q |
185 |
tttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatat |
284 |
Q |
|
|
||||| || ||| ||||||||| ||||||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||| | |||| |||||||||| |||||||||||| |
|
|
T |
928253 |
tttttgtttctaattaactgtcgttttcaaagtctaatacatcattaaatgttgttttacatatattattcttaaatatttattgt--agagagaaatat |
928156 |
T |
 |
Q |
285 |
atgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaa |
325 |
Q |
|
|
|| |||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||| |
|
|
T |
928155 |
attaaatgaagtattaaatgattaaggttattataggaaaa |
928115 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 198 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 42263712 - 42263619
Alignment:
Q |
198 |
ttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaat |
291 |
Q |
|
|
|||| |||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||| || ||| || | ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
42263712 |
ttaagtgtcactttcaaagtttaatgtaacattaaatgttgtttttcctataatgcctttagtaatttattgcagagatagaaatatatgaaat |
42263619 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 198 - 326
Target Start/End: Original strand, 25787371 - 25787499
Alignment:
Q |
198 |
ttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagata |
297 |
Q |
|
|
||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || |
|
|
T |
25787371 |
ttaactgtcgttttcaaagttcaatgtatcattaaatgtgactttacctatattacccttatatatttattgcatagagagaaatatatgaaatgaagta |
25787470 |
T |
 |
Q |
298 |
ttaaatgaataaggtcattatagtaaaag |
326 |
Q |
|
|
|||||||| ||||| ||||||| ||||| |
|
|
T |
25787471 |
ttaaatgattaaggatattataggaaaag |
25787499 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 198 - 303
Target Start/End: Original strand, 37354023 - 37354128
Alignment:
Q |
198 |
ttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagata |
297 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| || ||| | ||||||| ||||||| |||||| |||||||| |||| |||| |
|
|
T |
37354023 |
ttaactgtcactttcaaagttcaacgtgacattaaatgttgtttttcctataaagcccttagtaatttattagagagagaaaaatatataaaatatgata |
37354122 |
T |
 |
Q |
298 |
ttaaat |
303 |
Q |
|
|
|||||| |
|
|
T |
37354123 |
ttaaat |
37354128 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 179 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 18904139 - 18904081
Alignment:
Q |
179 |
agaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgtt |
237 |
Q |
|
|
||||| ||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |
|
|
T |
18904139 |
agaaaatttttgtttctaattaactgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgtt |
18904081 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 272 - 325
Target Start/End: Original strand, 37660845 - 37660898
Alignment:
Q |
272 |
gagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaa |
325 |
Q |
|
|
|||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |
|
|
T |
37660845 |
gagagagaaacatatgaaatgagatattaaatgaggaaggttattataggaaaa |
37660898 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 184 - 284
Target Start/End: Original strand, 36173088 - 36173188
Alignment:
Q |
184 |
ttttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaata |
283 |
Q |
|
|
|||||| || ||| |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||| || ||||||| |||||||| | |||||||||| |
|
|
T |
36173088 |
ttttttgtttctaattaagtgtcattttcaaagttcaatataacattaaatgttgttttttctataatgaccttagtaatttattgcagggagagaaata |
36173187 |
T |
 |
Q |
284 |
t |
284 |
Q |
|
|
| |
|
|
T |
36173188 |
t |
36173188 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 220 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 34242175 - 34242112
Alignment:
Q |
220 |
aatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaata |
283 |
Q |
|
|
||||||||||||||| ||| |||| ||||| | |||||| |||||||||| |||||||||||| |
|
|
T |
34242175 |
aatgcaatattaaatattggtttatcaataatatccttacctatttattgtagagagagaaata |
34242112 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 198 - 310
Target Start/End: Original strand, 3041597 - 3041707
Alignment:
Q |
198 |
ttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagata |
297 |
Q |
|
|
|||||| ||| |||||||||| |||| | ||||||||| | |||||| ||||| ||| | |||||||||| ||||||||||| ||||||||| || |
|
|
T |
3041597 |
ttaactatcattttcaaagtttaatgtatcattaaatgtggctttacctatattaccctaatatatttattgt--agagagaaatacatgaaatgaagta |
3041694 |
T |
 |
Q |
298 |
ttaaatgaataag |
310 |
Q |
|
|
|||||||| |||| |
|
|
T |
3041695 |
ttaaatgattaag |
3041707 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 247 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 20682955 - 20682902
Alignment:
Q |
247 |
atattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatatta |
300 |
Q |
|
|
||||| ||||||| |||||||||| || | |||||||||||||||||| ||||| |
|
|
T |
20682955 |
atattatccttagatatttattgtagatatagaaatatatgaaatgaggtatta |
20682902 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1 (Bit Score: 150; Significance: 3e-79; HSPs: 100)
Name: chr1
Description:
Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 160 - 338
Target Start/End: Original strand, 30686405 - 30686585
Alignment:
Q |
160 |
ctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtcctt |
257 |
Q |
|
|
|||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
30686405 |
ctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtcctt |
30686504 |
T |
 |
Q |
258 |
agttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
T |
30686505 |
agttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattg |
30686585 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 160 - 338
Target Start/End: Original strand, 13507764 - 13507944
Alignment:
Q |
160 |
ctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtcctt |
257 |
Q |
|
|
|||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
T |
13507764 |
ctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgttgttttaccaatattatcctt |
13507863 |
T |
 |
Q |
258 |
agttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
13507864 |
agttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaattaataaagtcattatagtaaaagtatagcttattg |
13507944 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 160 - 338
Target Start/End: Original strand, 13514952 - 13515132
Alignment:
Q |
160 |
ctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtcctt |
257 |
Q |
|
|
|||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
T |
13514952 |
ctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgttgttttaccaatattatcctt |
13515051 |
T |
 |
Q |
258 |
agttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
13515052 |
agttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaattaataaagtcattatagtaaaagtatagcttattg |
13515132 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 160 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 45226820 - 45226641
Alignment:
Q |
160 |
ctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtcctt |
257 |
Q |
|
|
|||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
T |
45226820 |
ctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttatcaatattgtcctt |
45226721 |
T |
 |
Q |
258 |
agttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttatt |
337 |
Q |
|
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
45226720 |
agttatttattgtggaaagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaagtcattataataaaagtatagcttatt |
45226641 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 174 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 35484006 - 35483844
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtgga |
273 |
Q |
|
|
|||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || | |
|
|
T |
35484006 |
tttggagaaaatttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgtaatattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttat--tgca |
35483909 |
T |
 |
Q |
274 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
35483908 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
35483844 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 160 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 37609544 - 37609364
Alignment:
Q |
160 |
ctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtcctt |
257 |
Q |
|
|
|||||||||||| | |||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
T |
37609544 |
ctttttaagtgtcacttttggagaaaatttttgttcttatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaacgttaaatgttgttttaccaatattatcctt |
37609445 |
T |
 |
Q |
258 |
agttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
37609444 |
agttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
37609364 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 174 - 338
Target Start/End: Original strand, 1429294 - 1429458
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtgga |
273 |
Q |
|
|
|||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
T |
1429294 |
tttggagaaaatttttgttcctatttaactgtcacttttaaagttcattgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcgga |
1429393 |
T |
 |
Q |
274 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
1429394 |
gagagaaatatacaaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
1429458 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 145 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 21927954 - 21927759
Alignment:
Q |
145 |
ttactccttccatttctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgtttt |
242 |
Q |
|
|
||||||| ||| || |||||||||||| | |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |
|
|
T |
21927954 |
ttactccctccgttcctttttaagtgtcacttttgcagaaattttttgttcttatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttatttt |
21927855 |
T |
 |
Q |
243 |
accaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
21927854 |
accaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatataaaatgaaatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
21927759 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 177 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 19349603 - 19349442
Alignment:
Q |
177 |
ggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagag |
276 |
Q |
|
|
||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
T |
19349603 |
ggagaaaaattttgttcctatttaacagtcactttcaaagttgaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcggagag |
19349504 |
T |
 |
Q |
277 |
agaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
19349503 |
ataaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
19349442 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 181 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 37437273 - 37437116
Alignment:
Q |
181 |
aaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaa |
280 |
Q |
|
|
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | || |
|
|
T |
37437273 |
aaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgttcttagttatttattgcggagataaaa |
37437174 |
T |
 |
Q |
281 |
atatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
37437173 |
atatattaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
37437116 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 160 - 338
Target Start/End: Original strand, 43500500 - 43500680
Alignment:
Q |
160 |
ctttttaagtgttattt--ggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtcctt |
257 |
Q |
|
|
|||||||||||| |||| ||||||| | ||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
T |
43500500 |
ctttttaagtgtcatttttggagaaaatatttgttcctatttaagtgtcacttttaaagttcaatgcagtattaaatgttgttttaccaatattatcctt |
43500599 |
T |
 |
Q |
258 |
agttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
43500600 |
agttatttattgcagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
43500680 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 146 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 18034083 - 18033888
Alignment:
Q |
146 |
tactccttccatttctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgtttta |
243 |
Q |
|
|
|||||| ||| || |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |
|
|
T |
18034083 |
tactccatccgttcctttttaagtgtcactttttgagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatccaacattaaatattgtttta |
18033984 |
T |
 |
Q |
244 |
ccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagt-aaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |
|
|
T |
18033983 |
tcaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaaatatagcttattg |
18033888 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 145 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 19929724 - 19929529
Alignment:
Q |
145 |
ttactccttccatttctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgtttt |
242 |
Q |
|
|
||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
19929724 |
ttactccctccgtttctttttaagtgtctcttttggagaaattttttgttcctatttaaccgtcactttcaaagttcaatgcatcattaaatgttgtttt |
19929625 |
T |
 |
Q |
243 |
accaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
T |
19929624 |
accaatattattctttgttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatgttaaattaataaggtcattatagtaaaagtataacttattg |
19929529 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 186 - 338
Target Start/End: Original strand, 38648479 - 38648631
Alignment:
Q |
186 |
ttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatata |
285 |
Q |
|
|
|||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
T |
38648479 |
ttttgttcctatttaactgtcactttcaaacttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagaaagaaatata |
38648578 |
T |
 |
Q |
286 |
tgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
38648579 |
tgaaatgagatatcaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
38648631 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 174 - 338
Target Start/End: Original strand, 45368098 - 45368262
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtgga |
273 |
Q |
|
|
||||| |||| ||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |
|
|
T |
45368098 |
tttggggaaaatttttgtttctatttatctgtcactttcaaagttcaatgaaacattgaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcgga |
45368197 |
T |
 |
Q |
274 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
45368198 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
45368262 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 174 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 50825799 - 50825635
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtgga |
273 |
Q |
|
|
|||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |
|
|
T |
50825799 |
tttgaagaaattttttgttcttacttaactgtcactttcaaagtttaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattacgga |
50825700 |
T |
 |
Q |
274 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
T |
50825699 |
gagagaaatatatgaaatgagatgttaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattg |
50825635 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 146 - 330
Target Start/End: Original strand, 28679001 - 28679187
Alignment:
Q |
146 |
tactccttccatttctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgtttta |
243 |
Q |
|
|
|||||| ||| || |||||||||||| | |||||||||| |||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
28679001 |
tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaaaattttgttcttgtttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta |
28679100 |
T |
 |
Q |
244 |
ccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtata |
330 |
Q |
|
|
||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
28679101 |
ccaatattgtctttagttatttattgcggagagagaaatatatcaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtata |
28679187 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 146 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 35531552 - 35531358
Alignment:
Q |
146 |
tactccttccatttctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgtttta |
243 |
Q |
|
|
|||||| ||| || |||||||||||| | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
35531552 |
tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaaaattttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta |
35531453 |
T |
 |
Q |
244 |
ccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
|||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
35531452 |
ccaatattatccttagttatttattgcagagagataaatatatgaaataggatatcaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
35531358 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 157 - 337
Target Start/End: Original strand, 43952779 - 43952961
Alignment:
Q |
157 |
tttctttttaagtgttattt--ggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtc |
254 |
Q |
|
|
||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| || |
|
|
T |
43952779 |
tttctttttaagtgtcatttttggagaaattttttgttcttatttaactgtcactttcaaagttcaatgaaacattaaatgttgttttacaaatattatc |
43952878 |
T |
 |
Q |
255 |
cttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttatt |
337 |
Q |
|
|
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
T |
43952879 |
tttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgcgatgttaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttatt |
43952961 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 181 - 338
Target Start/End: Original strand, 13699191 - 13699348
Alignment:
Q |
181 |
aaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaa |
280 |
Q |
|
|
|||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
T |
13699191 |
aaattttttatttctatttaactgttactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttacgaatactatccttagttatttattacggagagagaa |
13699290 |
T |
 |
Q |
281 |
atatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
T |
13699291 |
atatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattg |
13699348 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 174 - 338
Target Start/End: Original strand, 10675912 - 10676076
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtgga |
273 |
Q |
|
|
|||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| |
|
|
T |
10675912 |
tttgaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcctaagttatttattgcgga |
10676011 |
T |
 |
Q |
274 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| | ||||||| |
|
|
T |
10676012 |
gagagaaatatataaaatgagatattaaataaataaggttattatagtaaaagtacaacttattg |
10676076 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 182 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 32994688 - 32994532
Alignment:
Q |
182 |
aattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaa |
281 |
Q |
|
|
||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
T |
32994688 |
aatttgttgttcttatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaa |
32994589 |
T |
 |
Q |
282 |
tatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |
|
|
T |
32994588 |
tatatgaaatgagatgttaaatgaataaggtcattatagtaaaagtacaacttattg |
32994532 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 155 - 331
Target Start/End: Original strand, 7782940 - 7783117
Alignment:
Q |
155 |
catttctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattg |
252 |
Q |
|
|
|||| |||||||||||| | |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| |
|
|
T |
7782940 |
cattcctttttaagtgtcacttttggagaaaatttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattagatgttgttttatcaatattg |
7783039 |
T |
 |
Q |
253 |
tccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatag |
331 |
Q |
|
|
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
7783040 |
ttcttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaat-aaatgttaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatag |
7783117 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 146 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 31588996 - 31588799
Alignment:
Q |
146 |
tactccttccatttctttttaagtgttatttg--gagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgtttta |
243 |
Q |
|
|
|||||| ||| || |||||||||||| |||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |
|
|
T |
31588996 |
tactccctccgttcctttttaagtgtcatttttagagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttatttta |
31588897 |
T |
 |
Q |
244 |
ccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgtatc |
342 |
Q |
|
|
|||||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
31588896 |
ccaatattatccttagttatttattgcgaagagataaatatatgaaatgagata-taaatgaataaggtcatcatagtaaaagtatagcttattgtatc |
31588799 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 146 - 338
Target Start/End: Original strand, 13566656 - 13566853
Alignment:
Q |
146 |
tactccttccatttctttttaagtgttatttg--gagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgtttta |
243 |
Q |
|
|
|||||| ||| || |||||||||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
13566656 |
tactccctccgttcctttttaagtgtcattttttgagaaaaattttatttttatttaaccgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta |
13566755 |
T |
 |
Q |
244 |
ccaatattgtccttagttatt---tattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
T |
13566756 |
ccaatattgtccttaattattatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaatatagcttattg |
13566853 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 174 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 20605851 - 20605687
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtgga |
273 |
Q |
|
|
|||||||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||| |
|
|
T |
20605851 |
tttggagaaaaattttgttcttattaaactgtcactttcaaacttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcattggttatttattgcgga |
20605752 |
T |
 |
Q |
274 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
20605751 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattataataaaagtatagcttattg |
20605687 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 195 - 338
Target Start/End: Original strand, 1024587 - 1024730
Alignment:
Q |
195 |
tatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgag |
294 |
Q |
|
|
||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
1024587 |
tatttaactgttactttcaaagttcaatgtaacattaaatgttgttttaccaatattgtcgttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgag |
1024686 |
T |
 |
Q |
295 |
atattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
T |
1024687 |
atattaaatgaataagatcattatagtaaaagtatagtttattg |
1024730 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 190 - 338
Target Start/End: Original strand, 12124670 - 12124818
Alignment:
Q |
190 |
attcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaa |
289 |
Q |
|
|
|||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
T |
12124670 |
attcctttttaagtgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttactagtattgtccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaa |
12124769 |
T |
 |
Q |
290 |
atgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
T |
12124770 |
atgagatattaaatgaataagattattatagtaaaagtataacttattg |
12124818 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 174 - 338
Target Start/End: Original strand, 35255496 - 35255660
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtgga |
273 |
Q |
|
|
|||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| | | |
|
|
T |
35255496 |
tttgaagaaattttttgttcctatttaattgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgatttaccaatattatccttagttatttattgcgaa |
35255595 |
T |
 |
Q |
274 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
|||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |
|
|
T |
35255596 |
gagataaatatatgaaatgagatgttaaatgaacaaggtcattatagtaaaagcataacttattg |
35255660 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 145 - 342
Target Start/End: Original strand, 44182739 - 44182937
Alignment:
Q |
145 |
ttactccttccatttctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgtttt |
242 |
Q |
|
|
||||||| ||| || |||||||||||| | |||||||||| ||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
44182739 |
ttactccctccgttcctttttaagtgtcaattttggagaaaaaatttgtttctatttaactgtcactctcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttt |
44182838 |
T |
 |
Q |
243 |
accaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgtatc |
342 |
Q |
|
|
||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |
|
|
T |
44182839 |
accaatattatccttagttatttattgcggagagataaatatatgaaatgagata-taaataaataaggtcattatagtaaaagtatatcttattatatc |
44182937 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 146 - 338
Target Start/End: Original strand, 52748997 - 52749189
Alignment:
Q |
146 |
tactccttccatttctttttaagtgttattt--ggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgtttta |
243 |
Q |
|
|
|||||| ||| ||||||||||| ||| |||| | ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |
|
|
T |
52748997 |
tactccctccgtttctttttaaatgtcatttttgaagaaattttttgttcctatttgactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgatgttata |
52749096 |
T |
 |
Q |
244 |
ccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| |
|
|
T |
52749097 |
tcaatattatccttagttatttattgtg--gagagaaatatatgaaataagatattaaatgaataagattattatagtaaaagtatagtttattg |
52749189 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 146 - 341
Target Start/End: Original strand, 9361953 - 9362150
Alignment:
Q |
146 |
tactccttccatttctttttaagtgttattt--ggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgtttta |
243 |
Q |
|
|
|||||| ||| || |||||||||||| |||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |
|
|
T |
9361953 |
tactccctccgttcctttttaagtgtcatttttgaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgtttta |
9362052 |
T |
 |
Q |
244 |
ccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgtat |
341 |
Q |
|
|
|||| ||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
T |
9362053 |
ccaacattacccttagttatttattacgaagagagaaatatatgaaataagatattaaatgactaaggttattatagtaaaagtataaattattgtat |
9362150 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 174 - 338
Target Start/End: Original strand, 44818464 - 44818628
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtgga |
273 |
Q |
|
|
|||| ||||| | ||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |
|
|
T |
44818464 |
tttgcagaaaatctttgttcctatttaactttcattttcaaagttcaatgcaacattaaatattgttttaccaatattatccttagttatttattgcata |
44818563 |
T |
 |
Q |
274 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |
|
|
T |
44818564 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattacagtaaaactatagcttattg |
44818628 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 174 - 341
Target Start/End: Original strand, 38597601 - 38597768
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtgga |
273 |
Q |
|
|
|||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| |
|
|
T |
38597601 |
tttggagaaacttttcgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatattgttttaccaacattacccttagttatttattatgga |
38597700 |
T |
 |
Q |
274 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgtat |
341 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
T |
38597701 |
gagagaaatatatgaaataagatattaaatgactaaggttattatagtaaaagtataaattattgtat |
38597768 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 179 - 338
Target Start/End: Original strand, 49497167 - 49497326
Alignment:
Q |
179 |
agaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagag |
278 |
Q |
|
|
|||| |||||| ||| ||||||||||| | ||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
T |
49497167 |
agaatttttttgttcttatttaactgttatttttgaagttcaatgaaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcggagagat |
49497266 |
T |
 |
Q |
279 |
aaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
T |
49497267 |
aaatatatgaaatgtgatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattg |
49497326 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 160 - 329
Target Start/End: Original strand, 32347972 - 32348143
Alignment:
Q |
160 |
ctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtcctt |
257 |
Q |
|
|
|||||||||||| | |||||||||| |||| || | ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
T |
32347972 |
ctttttaagtgtcacttttggagaaaaattttgtttcaatttaactgccactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattaccctt |
32348071 |
T |
 |
Q |
258 |
agttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtat |
329 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |
|
|
T |
32348072 |
agttatttattgtggagaaagaaatatataaaatgagatattaaatgaataaggttattctagtaaaagtat |
32348143 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 228 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 12231244 - 12231134
Alignment:
Q |
228 |
attaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagt |
327 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
12231244 |
attaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgggatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagt |
12231145 |
T |
 |
Q |
328 |
atagcttattg |
338 |
Q |
|
|
| ||||||||| |
|
|
T |
12231144 |
acagcttattg |
12231134 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 196 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 51974376 - 51974230
Alignment:
Q |
196 |
atttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgaga |
295 |
Q |
|
|
|||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |
|
|
T |
51974376 |
atttaactgtcattttcgaagttcaatgcaatattaaatattgttttaccaatattatccttgcttatttattgtgaagagagaaatatatgaaatgaaa |
51974277 |
T |
 |
Q |
296 |
tattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgtatc |
342 |
Q |
|
|
||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
T |
51974276 |
tattaaatgaataaggttattatagtaaaagtatacattattgtatc |
51974230 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 160 - 341
Target Start/End: Original strand, 15660581 - 15660764
Alignment:
Q |
160 |
ctttttaagtgttattt--ggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtcctt |
257 |
Q |
|
|
|||||||||||| |||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| |||| |
|
|
T |
15660581 |
ctttttaagtgtcatttttggagaaatattttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacattaccctt |
15660680 |
T |
 |
Q |
258 |
agttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgtat |
341 |
Q |
|
|
||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
T |
15660681 |
agttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgactaagactattatagtaaaagtataaattattgtat |
15660764 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 194 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 49908389 - 49908253
Alignment:
Q |
194 |
ctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatga |
293 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
49908389 |
ctatttaactgtcacttttaaagttcaatgcaacattaaatattgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatga |
49908290 |
T |
 |
Q |
294 |
gatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtata |
330 |
Q |
|
|
||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
T |
49908289 |
gatatcgaattaataaggtcattatagtaaaaatata |
49908253 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 228 - 338
Target Start/End: Original strand, 1677262 - 1677372
Alignment:
Q |
228 |
attaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagt |
327 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
T |
1677262 |
attaaatgttgttttaccaatattatccttaattatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcaatatagtaaaagt |
1677361 |
T |
 |
Q |
328 |
atagcttattg |
338 |
Q |
|
|
||||||||||| |
|
|
T |
1677362 |
atagcttattg |
1677372 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 191 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 35700585 - 35700447
Alignment:
Q |
191 |
ttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaa |
290 |
Q |
|
|
|||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |
|
|
T |
35700585 |
ttccaatttaactgtcactttcaaaattcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattgcggagaaagaaatatatgaaa |
35700486 |
T |
 |
Q |
291 |
tgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtat |
329 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
35700485 |
tgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtat |
35700447 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 146 - 328
Target Start/End: Original strand, 51613391 - 51613575
Alignment:
Q |
146 |
tactccttccatttctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgtttta |
243 |
Q |
|
|
|||||| |||||| |||||||| ||| | ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
51613391 |
tactccctccattcctttttaattgtcacttttagagaaaatttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcatcattaaatgttgtttta |
51613490 |
T |
 |
Q |
244 |
ccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagta |
328 |
Q |
|
|
||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
51613491 |
tcaatattactcttagatatttattgcggatagagaaacatatgaaatgaaatattaaattaacaaggtcattatagtaaaagta |
51613575 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 174 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 51972508 - 51972344
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtgga |
273 |
Q |
|
|
|||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||| || |||| || ||||||||||||| || |||| ||||||||| || |
|
|
T |
51972508 |
tttgaagaaattttttgttcttatttaattgtcactttcaaaattcaatgcaacatgaaatattattttaccaatattatcattagctatttattgcaga |
51972409 |
T |
 |
Q |
274 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
T |
51972408 |
gagataaatatatgaaatgagatattaaatgaataatatcattatagtaaaagtataacttattg |
51972344 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 219 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 24781916 - 24781806
Alignment:
Q |
219 |
caatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattat |
318 |
Q |
|
|
|||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
24781916 |
caatgcaacattaaatgttgttttatcaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgaaatattaaatgaataaggtcattat |
24781817 |
T |
 |
Q |
319 |
agtaaaagtat |
329 |
Q |
|
|
||||||||||| |
|
|
T |
24781816 |
agtaaaagtat |
24781806 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 178 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 32168535 - 32168385
Alignment:
Q |
178 |
gagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagaga |
277 |
Q |
|
|
|||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |
|
|
T |
32168535 |
gagaaaatttttgtttctatttaactgtcagtttcaaagttcaatgcatcattaaatgttgttttatcaatattacccttagatatttattgcggagaga |
32168436 |
T |
 |
Q |
278 |
gaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagta |
328 |
Q |
|
|
|||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
32168435 |
gaaacatatgaaatgaaatattaaattaacaaggtcattatagtaaaagta |
32168385 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 160 - 342
Target Start/End: Original strand, 9127661 - 9127847
Alignment:
Q |
160 |
ctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtcctt |
257 |
Q |
|
|
|||||||||||| | |||||| ||||||||| | ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| |
|
|
T |
9127661 |
ctttttaagtgtcacttttggataaattttttgtgtttatttaattgtcactttcgaagttcaatgcaatattaaatgttgtttttccagtattatcctt |
9127760 |
T |
 |
Q |
258 |
agttatttattgtg--gagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgtatc |
342 |
Q |
|
|
| |||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
T |
9127761 |
gctcatttattgtggagagagagaaatatatgaagtgaaatattaaatgaataaggttattatagtaaaagtatatattattgtatc |
9127847 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 174 - 329
Target Start/End: Original strand, 10506823 - 10506976
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtgga |
273 |
Q |
|
|
|||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||| | |
|
|
T |
10506823 |
tttggagaaattttttgttctaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcgatattacccttagttatttattgcg-- |
10506920 |
T |
 |
Q |
274 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtat |
329 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |
|
|
T |
10506921 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtacaagtat |
10506976 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 239 - 338
Target Start/End: Original strand, 29830828 - 29830927
Alignment:
Q |
239 |
ttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
|||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
29830828 |
ttttaccaatattggtcttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
29830927 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 174 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 4101136 - 4100982
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtgga |
273 |
Q |
|
|
|||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||| |
|
|
T |
4101136 |
tttggaaaaatcttttgttcctatttaactgtcacttttaaagttcaatgtagcattaaatgttgttttaccaatattacccttatatatttattgcgga |
4101037 |
T |
 |
Q |
274 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagta |
328 |
Q |
|
|
|||| ||| ||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
4101036 |
gagaaaaacatatgaaatgaaatattaaattaataagatcattatagtaaaagta |
4100982 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 160 - 341
Target Start/End: Original strand, 1427674 - 1427856
Alignment:
Q |
160 |
ctttttaagtgttatttg--gagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtcctt |
257 |
Q |
|
|
||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||| |
|
|
T |
1427674 |
ctttttaagtgttattttttgagaaatttttg-ttcttatttaactgtcattttcaaaggtcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacattatcctt |
1427772 |
T |
 |
Q |
258 |
agttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgtat |
341 |
Q |
|
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| | ||||||||| |
|
|
T |
1427773 |
agttatttattgcaaagagagaaatatatgaaataagatattaaatgactaatgctattatagtaaaagtaaaaattattgtat |
1427856 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 145 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 30702548 - 30702361
Alignment:
Q |
145 |
ttactccttccatttctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgtttt |
242 |
Q |
|
|
||||||| || ||| ||||||||||||| |||| | ||||||||| || |||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
T |
30702548 |
ttactccctcaattcctttttaagtgtttcttttgcataaattttttgttttaatttaaatctcactttcaaagttcaatgcaacgttaaatgttgtttt |
30702449 |
T |
 |
Q |
243 |
accaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtata |
330 |
Q |
|
|
||||||||| |||||||||||||||||| |||| | |||||||| |||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| |
|
|
T |
30702448 |
accaatattatccttagttatttattgtagagaaaaaaatatataaaatgagataataaataaataatgttattatagtaaaagtata |
30702361 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 178 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 38818148 - 38817996
Alignment:
Q |
178 |
gagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagaga |
277 |
Q |
|
|
||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||| |
|
|
T |
38818148 |
gagaaattttttatttctatttaactgtcacttttaaaattcaatgcaacaataaatgttgttttagcaacattacccttagttatttattacggagaga |
38818049 |
T |
 |
Q |
278 |
gaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtata |
330 |
Q |
|
|
||||||| |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
38818048 |
gaaatatgtgaaataatatattaaatgaataaggctgttatagtaaaagtata |
38817996 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 174 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 8464676 - 8464585
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttattt |
265 |
Q |
|
|
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
8464676 |
tttggagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttattt |
8464585 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 174 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 31570864 - 31570709
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtgga |
273 |
Q |
|
|
|||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||| ||| |
|
|
T |
31570864 |
tttggagaaattttttgttcatatttaactgtcactttcgaagttcaatgcaacattaaatattattttaccaatattatccttacttatttatcacgga |
31570765 |
T |
 |
Q |
274 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtat |
329 |
Q |
|
|
| ||||||| |||||| | || |||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
31570764 |
gtgagaaatgtatgaagttagtgattaaatgaataaggttattatagtaaaagtat |
31570709 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 196 - 330
Target Start/End: Original strand, 18344358 - 18344492
Alignment:
Q |
196 |
atttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgaga |
295 |
Q |
|
|
|||||| ||||| ||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
18344358 |
atttaagtgtcaattttaaaattcaatgtaacattaaatgttgttttaccaatattacccttagttatttattgtgcagagagaaatatatgaaatgaga |
18344457 |
T |
 |
Q |
296 |
tattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtata |
330 |
Q |
|
|
|| |||| |||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
18344458 |
taataaacaaataaggttattatagtaaaagtata |
18344492 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 191 - 324
Target Start/End: Original strand, 12721467 - 12721600
Alignment:
Q |
191 |
ttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaa |
290 |
Q |
|
|
||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| |
|
|
T |
12721467 |
ttcctatttaactatcattttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaagatttcccttagatatttattgcagagagagaaacatatgaaa |
12721566 |
T |
 |
Q |
291 |
tgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaa |
324 |
Q |
|
|
| | ||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
12721567 |
taaaatattaaattaataaggtcattatagtaaa |
12721600 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 191 - 328
Target Start/End: Original strand, 1038110 - 1038248
Alignment:
Q |
191 |
ttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttg-ttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaa |
289 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |
|
|
T |
1038110 |
ttcctatttaactgtcactttcaaagtttaatgcaatattaaatgttgtttttaccaatattatccttgaatatttattacggagagagaaacatatgaa |
1038209 |
T |
 |
Q |
290 |
atgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagta |
328 |
Q |
|
|
|||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |
|
|
T |
1038210 |
atgaaatattaaattaataaaatcattataataaaagta |
1038248 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 191 - 328
Target Start/End: Original strand, 1045016 - 1045154
Alignment:
Q |
191 |
ttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttg-ttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaa |
289 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |
|
|
T |
1045016 |
ttcctatttaactgtcactttcaaagtttaatgcaatattaaatgttgtttttaccaatattatccttgaatatttattacggagagagaaacatatgaa |
1045115 |
T |
 |
Q |
290 |
atgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagta |
328 |
Q |
|
|
|||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |
|
|
T |
1045116 |
atgaaatattaaattaataaaatcattataataaaagta |
1045154 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 191 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 37735349 - 37735215
Alignment:
Q |
191 |
ttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaa |
290 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |
|
|
T |
37735349 |
ttcctatttaactgtcactgtcaaagttcaatgcaaaattaaatattgttttaccaacattacccttatatatttattgcggagagagaaacatatgaaa |
37735250 |
T |
 |
Q |
291 |
tgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaa |
325 |
Q |
|
|
||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| |
|
|
T |
37735249 |
tgaaatattaaattaataaggctattatagtaaaa |
37735215 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 174 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 19455625 - 19455458
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtgga |
273 |
Q |
|
|
||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |
|
|
T |
19455625 |
tttggagaaatttttgtttca-atttaattgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattacccttaattatttattgcgga |
19455527 |
T |
 |
Q |
274 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgtatc |
342 |
Q |
|
|
||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
T |
19455526 |
gagagaaatctatgaaacataatattaaatgaataagactattttagtaaaggtataaattattgtatc |
19455458 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 146 - 342
Target Start/End: Original strand, 48508113 - 48508311
Alignment:
Q |
146 |
tactccttccatttctttttaagtgt-tatttggagaaattttt-tattcctatttaactgtcacttt-caaagttcaatgcaatattaaatgttgtttt |
242 |
Q |
|
|
|||||| ||| || |||||||||||| ||||| || ||||||| | ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||| |
|
|
T |
48508113 |
tactccctccgttcctttttaagtgtctattttgaagaatttttatgttcctatttaattgtcactttacacagttcaatgcaacattaaaagttatttt |
48508212 |
T |
 |
Q |
243 |
accaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgtatc |
342 |
Q |
|
|
|| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| || | |||||||||| |
|
|
T |
48508213 |
actaatattacccttatttatt-attgtggagagagaaatatatgtaatgagatattaaataaataaggttattatagtaaaaataaaaattattgtatc |
48508311 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 196 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 8008374 - 8008240
Alignment:
Q |
196 |
atttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgaga |
295 |
Q |
|
|
|||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |
|
|
T |
8008374 |
atttaactgtcacttttaaagatcaatacaatattaaatgttgttttatcaatattactcttaattatttattgtggagagagaagtatatgaaagaaga |
8008275 |
T |
 |
Q |
296 |
tattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtata |
330 |
Q |
|
|
|||||||| |||||| ||||||| |||||| |||| |
|
|
T |
8008274 |
tattaaattaataagatcattatggtaaaattata |
8008240 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 237 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 2059976 - 2059875
Alignment:
Q |
237 |
tgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttat |
336 |
Q |
|
|
||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |
|
|
T |
2059976 |
tgttttatcaatattatccttagttatttattgcggagagaaaaatatatgaaataagatattaaatgaataaggtcattatagtgaaagtataacttat |
2059877 |
T |
 |
Q |
337 |
tg |
338 |
Q |
|
|
|| |
|
|
T |
2059876 |
tg |
2059875 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 257 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 8464401 - 8464320
Alignment:
Q |
257 |
tagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
8464401 |
tagttatttattgcggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
8464320 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 174 - 328
Target Start/End: Original strand, 43808908 - 43809068
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttg-ttttaccaatattgtccttagttatttattgtgg |
272 |
Q |
|
|
|||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| | |
|
|
T |
43808908 |
tttggagaaattttttgttcctatttaaccatcactttcaaagttcaatacaacattaaatgttgtttttaccaatattacccttagatatttattgcag |
43809007 |
T |
 |
Q |
273 |
agagagaaatatatgaaatgaga-----tattaaatgaataaggtcattatagtaaaagta |
328 |
Q |
|
|
||||||||| ||||||||||| | |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
43809008 |
agagagaaacatatgaaatgaaatactgtattaaattaataaggctattatagtaaaagta |
43809068 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 196 - 329
Target Start/End: Original strand, 46096581 - 46096711
Alignment:
Q |
196 |
atttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgaga |
295 |
Q |
|
|
||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||| ||||||| || ||||||||| ||| ||| ||||||||||||| |||||||| |
|
|
T |
46096581 |
atttaactgtcactt---aaattcaatgcaacattaaatgttgttttatcaatattatctttagttattaattatggggagagaaatatataaaatgaga |
46096677 |
T |
 |
Q |
296 |
tattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtat |
329 |
Q |
|
|
||||||||||||||| | ||| |||||||||||| |
|
|
T |
46096678 |
tattaaatgaataagattattgtagtaaaagtat |
46096711 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 195 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 52649935 - 52649788
Alignment:
Q |
195 |
tatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgag |
294 |
Q |
|
|
||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| || |
|
|
T |
52649935 |
tatttaattatcactttcaaagttcaaagcaatattaaatgttgttttaccaatattacccttagttatttattacagagagtgaaatatatgaaacaag |
52649836 |
T |
 |
Q |
295 |
atattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgtatc |
342 |
Q |
|
|
||||||||||||| ||| ||||| | ||||| ||| |||||||||| |
|
|
T |
52649835 |
atattaaatgaatgaggctattattggaaaaggatatattattgtatc |
52649788 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 160 - 329
Target Start/End: Original strand, 17013416 - 17013591
Alignment:
Q |
160 |
ctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtcctt |
257 |
Q |
|
|
||||||||||||| ||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| || || |
|
|
T |
17013416 |
ctttttaagtgtttcttttggagaattttttttcttctatttaactgtcacttttgaagttcaatgcaacattaaatattgttttaccaatattatcttt |
17013515 |
T |
 |
Q |
258 |
agttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgag---at-attaaatgaataaggtcattatagtaaaagtat |
329 |
Q |
|
|
| ||||||||| |||||||||||| |||||| | || || |||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
17013516 |
acttatttattacggagagagaaatgtatgaagttagtgaatgattaaatgaataaggttattatagtaaaagtat |
17013591 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 195 - 328
Target Start/End: Original strand, 42800139 - 42800269
Alignment:
Q |
195 |
tatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgag |
294 |
Q |
|
|
||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |
|
|
T |
42800139 |
tatttaactgttactttcaaa-ttcaatgtaatattaaatgttgttttaccaatattatccttatatatttat--tggagagagaaacatatgaaatgaa |
42800235 |
T |
 |
Q |
295 |
atattaaatgaataaggtcattatagtaaaagta |
328 |
Q |
|
|
||||||||| ||||| | |||| ||||||||||| |
|
|
T |
42800236 |
atattaaattaataatgccattttagtaaaagta |
42800269 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 195 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 1039573 - 1039445
Alignment:
Q |
195 |
tatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgag |
294 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||| ||| ||||||||||| |
|
|
T |
1039573 |
tatttaactgtcactttcaaagtttaatgcaacattaaatgttgttttaccaagattacacttagatatttattg-caagagaaaaacatatgaaatgaa |
1039475 |
T |
 |
Q |
295 |
atattaaatgaataaggtcattatagtaaa |
324 |
Q |
|
|
||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
1039474 |
atattaaattaataaggtcattatagtaaa |
1039445 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 195 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 1046479 - 1046351
Alignment:
Q |
195 |
tatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgag |
294 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||| ||| ||||||||||| |
|
|
T |
1046479 |
tatttaactgtcactttcaaagtttaatgcaacattaaatgttgttttaccaagattacacttagatatttattg-caagagaaaaacatatgaaatgaa |
1046381 |
T |
 |
Q |
295 |
atattaaatgaataaggtcattatagtaaa |
324 |
Q |
|
|
||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
1046380 |
atattaaattaataaggtcattatagtaaa |
1046351 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 181 - 342
Target Start/End: Original strand, 36318370 - 36318530
Alignment:
Q |
181 |
aaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaa |
280 |
Q |
|
|
||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||| || |
|
|
T |
36318370 |
aaattttttgtttctatttaactgtcgctttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttatcaatattatccttatttatttattacaaagagaaaa |
36318469 |
T |
 |
Q |
281 |
atatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgtatc |
342 |
Q |
|
|
|| |||||||||| | |||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||||| |
|
|
T |
36318470 |
at-tatgaaatgacacattaaacaaataaggttattatagtaaaggtgtaaattattgtatc |
36318530 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 160 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 48174915 - 48174745
Alignment:
Q |
160 |
ctttttaagtgttatttg--gagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtcctt |
257 |
Q |
|
|
|||||||| |||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | ||||| |||||| |||| |
|
|
T |
48174915 |
ctttttaattgttatttttagagaaattttttgtttttatttaactgtcacttttaaagttcaatgcatagttaaatgctcttttatgaatattaccctt |
48174816 |
T |
 |
Q |
258 |
agttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagta |
328 |
Q |
|
|
| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||| || ||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
48174815 |
aaatatttattgcggagagagaaacatatgaaatgaaatgttaaattaacaaggtcattatagtaaaagta |
48174745 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 184 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 48265253 - 48265095
Alignment:
Q |
184 |
ttttttattcctatttaactgtcacttt-caaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaat |
282 |
Q |
|
|
|||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||| |||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |
|
|
T |
48265253 |
ttttttgttcctatttaagtgtcactttacgtagttcaatgcaacattaaatgttattttactaatattacccttatttatt-attatggagagagaaat |
48265155 |
T |
 |
Q |
283 |
atatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgtatc |
342 |
Q |
|
|
||||| ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| || | |||||||||| |
|
|
T |
48265154 |
atatgtaatgagacattaaataaataaggttattatagtaaaaatagaaattattgtatc |
48265095 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 236 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 39412676 - 39412574
Alignment:
Q |
236 |
ttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagctta |
335 |
Q |
|
|
|||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| |
|
|
T |
39412676 |
ttgttttaccaatattatcttttgttatttattgcagagagagaaatatatgaaatgagatgttaaattaataaggtcattatagtaaaaatataactta |
39412577 |
T |
 |
Q |
336 |
ttg |
338 |
Q |
|
|
||| |
|
|
T |
39412576 |
ttg |
39412574 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 178 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 31488002 - 31487838
Alignment:
Q |
178 |
gagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaa-agttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagag |
276 |
Q |
|
|
||||| |||||| |||||||| || ||||||||| | |||||||||||| |||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||| ||||| || || |
|
|
T |
31488002 |
gagaatttttttgttcctattcaagtgtcactttatatagttcaatgcaacattaaatgttattttactaatattacccttatttatt-attgtagaaag |
31487904 |
T |
 |
Q |
277 |
agaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgtatc |
342 |
Q |
|
|
| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| || | |||||||||| |
|
|
T |
31487903 |
aaaaatatatgtaatgagatattaaataaataaggttattatagtaaaaatagaaattattgtatc |
31487838 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 174 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 40926970 - 40926812
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtgga |
273 |
Q |
|
|
||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| | ||||||| ||||||| |||| |||||||| | ||| |
|
|
T |
40926970 |
tttggagaatttttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaacgatgttttatcaatattactctta-ttatttatggcgga |
40926872 |
T |
 |
Q |
274 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgtatc |
342 |
Q |
|
|
||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
T |
40926871 |
gagagaaatatatgaaacgaaat---------ataaggtcgttatagtaaaagtataacttattgtatc |
40926812 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 206 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 42787481 - 42787369
Alignment:
Q |
206 |
cactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatga |
305 |
Q |
|
|
|||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| || | | ||||||||||||| |
|
|
T |
42787481 |
cactttcaaaattcaatggaatattaactgttcttttaccaatattatccttagttatttattacggagagagaaatacattatacaagatattaaatga |
42787382 |
T |
 |
Q |
306 |
ataaggtcattat |
318 |
Q |
|
|
||||||| ||||| |
|
|
T |
42787381 |
ataaggttattat |
42787369 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 254 - 325
Target Start/End: Original strand, 5598145 - 5598216
Alignment:
Q |
254 |
ccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaa |
325 |
Q |
|
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
5598145 |
ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggtcattatagtaaaa |
5598216 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 160 - 263
Target Start/End: Original strand, 19093262 - 19093367
Alignment:
Q |
160 |
ctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtcctt |
257 |
Q |
|
|
|||||||||||| | |||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||| ||||| |
|
|
T |
19093262 |
ctttttaagtgtcacttttggagaaaaattttgttcctatttacctgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatattattttaccaatattatcctt |
19093361 |
T |
 |
Q |
258 |
agttat |
263 |
Q |
|
|
|||||| |
|
|
T |
19093362 |
agttat |
19093367 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 179 - 303
Target Start/End: Original strand, 52759043 - 52759167
Alignment:
Q |
179 |
agaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagag |
278 |
Q |
|
|
||||||||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| | || ||| || ||||||| |||||||| ||||||| |
|
|
T |
52759043 |
agaaattttttgtttctaattaagtgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgatgttcttcctataatgcccttagtaatttattgcagagagag |
52759142 |
T |
 |
Q |
279 |
aaatatatgaaatgagatattaaat |
303 |
Q |
|
|
||||||||||||| |||||||||| |
|
|
T |
52759143 |
aaatatatgaaatatgatattaaat |
52759167 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 174 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 37296952 - 37296838
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtgga |
273 |
Q |
|
|
|||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||| || ||||||||||||| |||||| ||||||||| || |
|
|
T |
37296952 |
tttggagaaattttttgttcatatttaactgtcactttcgaagttcaacgcaacattgaatattattttaccaatattatccttacttatttatt-aggg |
37296854 |
T |
 |
Q |
274 |
gagagaaatatatgaa |
289 |
Q |
|
|
||||||||| |||||| |
|
|
T |
37296853 |
gagagaaatgtatgaa |
37296838 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 198 - 288
Target Start/End: Original strand, 52825311 - 52825401
Alignment:
Q |
198 |
ttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatga |
288 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || ||| || ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
52825311 |
ttaactgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgttgtttttcctataatgcccttaataatttattgtagagagagaaatatatga |
52825401 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 174 - 261
Target Start/End: Original strand, 35605468 - 35605555
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagtt |
261 |
Q |
|
|
|||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
T |
35605468 |
tttgaagaaattttttgtttaaatttaactgtcactttcaaaatttaatgcaaaattaaatgttgttttaccaatattatccttagtt |
35605555 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 181 - 325
Target Start/End: Original strand, 1859112 - 1859254
Alignment:
Q |
181 |
aaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaa |
280 |
Q |
|
|
|||||||||||| || |||| ||||| |||||||||| ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| | |||||||| |
|
|
T |
1859112 |
aaattttttatttttagttaagtgtcattttcaaagtttaatacatcattaaatgttgttttacctatattacccttatatatttattat--agagagaa |
1859209 |
T |
 |
Q |
281 |
atatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaa |
325 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||| |
|
|
T |
1859210 |
gtatatgaaatgagatattagatgattaaggttgttatagaaaaa |
1859254 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 181 - 305
Target Start/End: Original strand, 50152450 - 50152574
Alignment:
Q |
181 |
aaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaa |
280 |
Q |
|
|
|||| |||| || ||| |||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| || | | || |
|
|
T |
50152450 |
aaatgttttgtttctaattaacttttactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttacctttattacccttgattatttattgtagaaatataa |
50152549 |
T |
 |
Q |
281 |
atatatgaaatgagatattaaatga |
305 |
Q |
|
|
|||||||||| ||||||||||||| |
|
|
T |
50152550 |
ttatatgaaataagatattaaatga |
50152574 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 174 - 261
Target Start/End: Original strand, 5597833 - 5597920
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagtt |
261 |
Q |
|
|
||||||||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||||| |
|
|
T |
5597833 |
tttggagaatttttttgtttctatttaactgtcacttccaaagttcaatgcaacattaaataatgttttatcaatattacccttagtt |
5597920 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 198 - 305
Target Start/End: Original strand, 11248815 - 11248922
Alignment:
Q |
198 |
ttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagata |
297 |
Q |
|
|
|||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
11248815 |
ttaagtgtcgctttcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttgtcattattacccttgattatttatttcagagagagaaatatatgaaatgagata |
11248914 |
T |
 |
Q |
298 |
ttaaatga |
305 |
Q |
|
|
||| |||| |
|
|
T |
11248915 |
ttacatga |
11248922 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 229 - 328
Target Start/End: Original strand, 33720582 - 33720680
Alignment:
Q |
229 |
ttaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagta |
328 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
33720582 |
ttaaatgttgttttaccaatattacccttaaatatt-attgcggagagagaaaaacatgaaatgaaatattaaattaataagaccattatagtaaaagta |
33720680 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 178 - 247
Target Start/End: Original strand, 1428233 - 1428302
Alignment:
Q |
178 |
gagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaa |
247 |
Q |
|
|
|||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||| |
|
|
T |
1428233 |
gagaaattttttgtttctattcaactgtcactttcaaagttcaatgcaataataaaggttggtttaccaa |
1428302 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 174 - 268
Target Start/End: Original strand, 36850655 - 36850747
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttatt |
268 |
Q |
|
|
|||| ||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
T |
36850655 |
tttgtagaaattttttgtttctatttaaccgtcactttcaaagttc-atgcaatattaaatg-tattttaccaatattacttttagttatttatt |
36850747 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 209 - 325
Target Start/End: Original strand, 2572016 - 2572132
Alignment:
Q |
209 |
tttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata |
308 |
Q |
|
|
||||||||||||||| | ||||||||| | |||||| ||||| | ||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| | || |
|
|
T |
2572016 |
tttcaaagttcaatgtatcattaaatgtggctttacctatattacctttatatatttattgcagagagtgaaatatatgaaatgaaatattaaataatta |
2572115 |
T |
 |
Q |
309 |
aggtcattatagtaaaa |
325 |
Q |
|
|
|||| ||||||| |||| |
|
|
T |
2572116 |
aggttattatagaaaaa |
2572132 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 209 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 8973643 - 8973547
Alignment:
Q |
209 |
tttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatga |
305 |
Q |
|
|
||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
T |
8973643 |
tttcaaagttcaatgtatcattaaatgtgattttacctatattacccttatatatttattgtagggagagaaatatatgaaatgaagtattaaatga |
8973547 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 278 - 341
Target Start/End: Original strand, 1428519 - 1428582
Alignment:
Q |
278 |
gaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgtat |
341 |
Q |
|
|
|||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
T |
1428519 |
gaaatatatgaaataagatattaaatgactaaggctattatagtaaaagtataaattattgtat |
1428582 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 185 - 251
Target Start/End: Original strand, 3684810 - 3684876
Alignment:
Q |
185 |
tttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatatt |
251 |
Q |
|
|
||||| ||| ||||||||||| | ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
T |
3684810 |
ttttttttcttatttaactgttatttttaaaattcaatgcaatattaaatgttgttttactaatatt |
3684876 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 288 - 329
Target Start/End: Original strand, 35605722 - 35605763
Alignment:
Q |
288 |
aaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtat |
329 |
Q |
|
|
|||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
35605722 |
aaatgaaatattaaatgaataaggttattatagtaaaagtat |
35605763 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 228 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 38569793 - 38569702
Alignment:
Q |
228 |
attaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattata |
319 |
Q |
|
|
||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||| |||||| |
|
|
T |
38569793 |
attaaatgtggttttacctctattacccttatatatttattgccgagagagaaatatatggaatgaagtattaaattattaaggttattata |
38569702 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 146 - 203
Target Start/End: Original strand, 1677196 - 1677255
Alignment:
Q |
146 |
tactccttccatttctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaact |
203 |
Q |
|
|
|||||| ||| || |||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
T |
1677196 |
tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgttcctatttaact |
1677255 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 235 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 22154773 - 22154705
Alignment:
Q |
235 |
gttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaat |
303 |
Q |
|
|
|||||||| || ||| || ||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
T |
22154773 |
gttgtttttcctataatgcccttagtaatttattgcagagaaagaaatatatgaaatatgatattaaat |
22154705 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7 (Bit Score: 148; Significance: 5e-78; HSPs: 80)
Name: chr7
Description:
Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 146 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 17896786 - 17896592
Alignment:
Q |
146 |
tactccttccatttctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgtttta |
243 |
Q |
|
|
|||||| ||| || |||||||||||| | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
17896786 |
tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaaaattttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgtttta |
17896687 |
T |
 |
Q |
244 |
ccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
T |
17896686 |
ccaatattgtccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaatatagcttattg |
17896592 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 146 - 338
Target Start/End: Original strand, 31430539 - 31430733
Alignment:
Q |
146 |
tactccttccatttctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgtttta |
243 |
Q |
|
|
|||||| ||| || |||||||||||| | |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
31430539 |
tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttgtagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta |
31430638 |
T |
 |
Q |
244 |
ccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
31430639 |
ccaatattgtccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggttattatagtaaaagtatagcttattg |
31430733 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 143 - 338
Target Start/End: Original strand, 18470284 - 18470481
Alignment:
Q |
143 |
ctttactccttccatttctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgtt |
240 |
Q |
|
|
||||||||| ||| || |||||||||||| | |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
T |
18470284 |
ctttactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgttcttatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtt |
18470383 |
T |
 |
Q |
241 |
ttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
18470384 |
ttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcgttatagtaaaagtatagcttattg |
18470481 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 161 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 32528576 - 32528397
Alignment:
Q |
161 |
tttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtcctta |
258 |
Q |
|
|
||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
T |
32528576 |
tttttaagtgttacttttgaagaaaatttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgaaatattaaatgttgttttaccaatattatcctta |
32528477 |
T |
 |
Q |
259 |
gttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
32528476 |
gttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaagtatagcttattg |
32528397 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 144 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 32966314 - 32966118
Alignment:
Q |
144 |
tttactccttccatttctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttt |
241 |
Q |
|
|
|||||||| ||| || |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| || |
|
|
T |
32966314 |
tttactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttattcctatttaactgtcattttcaaagttaaatgcaacattaaatgttggtt |
32966215 |
T |
 |
Q |
242 |
taccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
32966214 |
taccaatattgtccttagttatttattacagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
32966118 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 157 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 26632431 - 26632249
Alignment:
Q |
157 |
tttctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtc |
254 |
Q |
|
|
||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| || |
|
|
T |
26632431 |
tttctttttaagtgtcacttttggagaaaatttttat-cctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttaccaatattatc |
26632333 |
T |
 |
Q |
255 |
cttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
26632332 |
cttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
26632249 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 146 - 338
Target Start/End: Original strand, 20035028 - 20035222
Alignment:
Q |
146 |
tactccttccatttctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgtttta |
243 |
Q |
|
|
|||||| ||| || |||||||||||| | |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
20035028 |
tactccatccgttcctttttaagtgtcacttttgcagaaattttttgttcctatttaactggcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta |
20035127 |
T |
 |
Q |
244 |
ccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
|||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
20035128 |
ccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaagtatagcttattg |
20035222 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 146 - 338
Target Start/End: Original strand, 20045439 - 20045633
Alignment:
Q |
146 |
tactccttccatttctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgtttta |
243 |
Q |
|
|
|||||| ||| || |||||||||||| | |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
20045439 |
tactccatccgttcctttttaagtgtcacttttgcagaaattttttgttcctatttaactggcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta |
20045538 |
T |
 |
Q |
244 |
ccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
|||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
20045539 |
ccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaagtatagcttattg |
20045633 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 174 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 33100066 - 33099904
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtgga |
273 |
Q |
|
|
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
33100066 |
tttggagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatcttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtg-- |
33099969 |
T |
 |
Q |
274 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
T |
33099968 |
gagataaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattg |
33099904 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 174 - 338
Target Start/End: Original strand, 7312627 - 7312791
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtgga |
273 |
Q |
|
|
|||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
T |
7312627 |
tttggataaattttttatttctatttaagtgtcactttcgaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcgga |
7312726 |
T |
 |
Q |
274 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
T |
7312727 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaataaataaggtcattatagtaaaagtataacttattg |
7312791 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 186 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 29497755 - 29497605
Alignment:
Q |
186 |
ttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatata |
285 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
29497755 |
ttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttatcaatattgttcttcgttatttattgcggagagagaaatata |
29497656 |
T |
 |
Q |
286 |
tgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttat |
336 |
Q |
|
|
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
29497655 |
tgaaataagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttat |
29497605 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 160 - 338
Target Start/End: Original strand, 36922233 - 36922413
Alignment:
Q |
160 |
ctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtcctt |
257 |
Q |
|
|
|||||||||||| | ||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
T |
36922233 |
ctttttaagtgtcacttttagagaaaatttttatttctatttaactgtcacttttaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcctt |
36922332 |
T |
 |
Q |
258 |
agttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
|||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
T |
36922333 |
agttatttattgcggagaaagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaacatagcttattg |
36922413 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 174 - 342
Target Start/End: Original strand, 33173817 - 33173985
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtgga |
273 |
Q |
|
|
|||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |
|
|
T |
33173817 |
tttgaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcaga |
33173916 |
T |
 |
Q |
274 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgtatc |
342 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||||||||||| |
|
|
T |
33173917 |
gagagaaatatatgaaatgagattttaaatgaataagatcattatattaaaagtacaacttattgtatc |
33173985 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 146 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 12838341 - 12838143
Alignment:
Q |
146 |
tactccttccatttctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgtttta |
243 |
Q |
|
|
|||||| ||| || |||||||||||| | |||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
12838341 |
tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaaaattttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcagtgcaacattaaatgttgttttg |
12838242 |
T |
 |
Q |
244 |
ccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgtatc |
342 |
Q |
|
|
|||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
12838241 |
ccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaataaataaggttattatagtaaaggtatagcttattgtatc |
12838143 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 174 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 7477431 - 7477267
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtgga |
273 |
Q |
|
|
|||| ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | | |
|
|
T |
7477431 |
tttgaagaaaatttttgttcctatttaactgttactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccgatattatccttagttatttattacgaa |
7477332 |
T |
 |
Q |
274 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
T |
7477331 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaattaataaggtcattatagtaaaagtataacttattg |
7477267 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 191 - 338
Target Start/End: Original strand, 41891297 - 41891444
Alignment:
Q |
191 |
ttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaa |
290 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||| |
|
|
T |
41891297 |
ttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattgaatgttgttttaccaatattgtcctgagttatttattgcggagagagaaatatataaaa |
41891396 |
T |
 |
Q |
291 |
tgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
T |
41891397 |
tgatatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattg |
41891444 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 160 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 22951067 - 22950883
Alignment:
Q |
160 |
ctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtcctt |
257 |
Q |
|
|
|||||||||||| | |||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| |
|
|
T |
22951067 |
ctttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaaattcaatgcaacattaaatgtagttttaccaatattctcctt |
22950968 |
T |
 |
Q |
258 |
agttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgtatc |
342 |
Q |
|
|
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
22950967 |
agttatttattacagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataatgtcattataataaaagtatagcttattgtatc |
22950883 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 146 - 338
Target Start/End: Original strand, 26723904 - 26724098
Alignment:
Q |
146 |
tactccttccatttctttttaagtgt-tattt-ggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgtttta |
243 |
Q |
|
|
|||||| |||||| |||||||||||| | ||| |||||| |||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||| |
|
|
T |
26723904 |
tactccctccattcctttttaagtgtctctttcggagaatttttttgtttctatttaactgtcactttcaaaattcaatgcaacattaaatgatatttta |
26724003 |
T |
 |
Q |
244 |
ccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
T |
26724004 |
tcaatattacccttaattatttattgtggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattg |
26724098 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 195 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 44480354 - 44480211
Alignment:
Q |
195 |
tatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgag |
294 |
Q |
|
|
|||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
44480354 |
tatttaaccgtcacttttaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattatccttagttatttattgtgaagagagaaatatatgaaatgag |
44480255 |
T |
 |
Q |
295 |
atattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
T |
44480254 |
atattaaatgaataaggtcattatagtaaaaatatagcttattg |
44480211 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 146 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 31399194 - 31398997
Alignment:
Q |
146 |
tactccttccatttctttttaagtgttattt--ggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgtttta |
243 |
Q |
|
|
|||||| |||||| |||||||||| | |||| ||||||| ||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
31399194 |
tactccctccattcctttttaagtatcatttttggagaaaaaatttgtttctttttaattgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta |
31399095 |
T |
 |
Q |
244 |
ccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgtatc |
342 |
Q |
|
|
|||||||| || |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |
|
|
T |
31399094 |
ccaatattatctttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagata-taaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagtttattatatc |
31398997 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 174 - 338
Target Start/End: Original strand, 10227266 - 10227430
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtgga |
273 |
Q |
|
|
|||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||| |
|
|
T |
10227266 |
tttgaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaaattcaatgcatcattaaatgttattttatcaatattatcctttgttatttattgcgga |
10227365 |
T |
 |
Q |
274 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
| ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
T |
10227366 |
gggagaaatatataaaatgagatgttaaattaataaggtcattatagtaaaagtataacttattg |
10227430 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 160 - 329
Target Start/End: Original strand, 33257875 - 33258046
Alignment:
Q |
160 |
ctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtcctt |
257 |
Q |
|
|
|||||||||||| | |||||||||| |||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
T |
33257875 |
ctttttaagtgtcacttttggagaaaaattttgtttcaatttaactatcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattaccctt |
33257974 |
T |
 |
Q |
258 |
agttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtat |
329 |
Q |
|
|
|||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
33257975 |
ggttatttattatggagagagaaatatataaaatgagatattaaatgaataaggttattatagtaaaagtat |
33258046 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 174 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 33922007 - 33921851
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtgga |
273 |
Q |
|
|
|||| ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| | | |
|
|
T |
33922007 |
tttgaagaaaatttgtgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattgaatgttgttttaccgatattatccttaattatttattacgaa |
33921908 |
T |
 |
Q |
274 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtata |
330 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
T |
33921907 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaatata |
33921851 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 174 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 29722537 - 29722374
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtgga |
273 |
Q |
|
|
|||||||||||||||| || || |||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| |
|
|
T |
29722537 |
tttggagaaattttttgtttatacttaactttcactttcataattcaatgcaatattaaatgttgttttactaatattgtccttaattatttattgcgga |
29722438 |
T |
 |
Q |
274 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
|| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
T |
29722437 |
gatagaaatatatgaaataagatattaaataaataa-gtcattatagtaaaagtataacttattg |
29722374 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 174 - 336
Target Start/End: Original strand, 3837872 - 3838034
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtgga |
273 |
Q |
|
|
|||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||| || |||||||||||||| ||| |
|
|
T |
3837872 |
tttggagaaaaaatttgttcttatttaactgtcactttcaaagtttaatgcaacattaaatattgttttatcaatattatctttagttatttattgcgga |
3837971 |
T |
 |
Q |
274 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttat |
336 |
Q |
|
|
||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
T |
3837972 |
aagataaatatatgaaatgagatgttaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttat |
3838034 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 188 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 36648224 - 36648074
Alignment:
Q |
188 |
ttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatg |
287 |
Q |
|
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
36648224 |
ttatttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttaatttatcaatattatccttagctatttatttcggagagagaaatatatg |
36648125 |
T |
 |
Q |
288 |
aaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |
|
|
T |
36648124 |
aaatgagatgttaaattaacaaggtcattatagtaaaagcataacttattg |
36648074 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 178 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 42842095 - 42841945
Alignment:
Q |
178 |
gagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagaga |
277 |
Q |
|
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |
|
|
T |
42842095 |
gagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcatcattaaatgttattttatcaatattacccttagatatttattgcggagaga |
42841996 |
T |
 |
Q |
278 |
gaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagta |
328 |
Q |
|
|
|||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
42841995 |
gaaacatatgaaatgaaatattaaattaacaaggtcattatagtaaaagta |
42841945 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 146 - 338
Target Start/End: Original strand, 8264927 - 8265123
Alignment:
Q |
146 |
tactccttccatttctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaat----attaaatgttgt |
239 |
Q |
|
|
|||||||||| || |||||||||||| | ||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
T |
8264927 |
tactccttccgttcctttttaagtgtcacttttagagaaaatttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaaccaacattaaatgttgt |
8265026 |
T |
 |
Q |
240 |
tttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||| |||||| |
|
|
T |
8265027 |
tttactaatattatccttagttatttattgcggagagag--agatatgtaatgagatattaaattaataaggttattatagtaaaaatatagtttattg |
8265123 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 174 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 30866969 - 30866802
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtgga |
273 |
Q |
|
|
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| ||| |
|
|
T |
30866969 |
tttggagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttggtttaccaacattacccttagttatttattacgga |
30866870 |
T |
 |
Q |
274 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgtat |
341 |
Q |
|
|
||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |
|
|
T |
30866869 |
gagagaaatatataaaataagatattaaatgactaaggctattatagtaaacatataaattattgtat |
30866802 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 174 - 341
Target Start/End: Original strand, 36406761 - 36406928
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtgga |
273 |
Q |
|
|
|||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| |
|
|
T |
36406761 |
tttgaagaaattttttgttcttatttaactgttactttcaaagttcaatgtaacaataaatgttgttttaccaacattacccttagttatttattgcgga |
36406860 |
T |
 |
Q |
274 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgtat |
341 |
Q |
|
|
|||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
T |
36406861 |
tagagaaatatattaaataagatattaaatgactaaggttattatagtaaaagtataaattattgtat |
36406928 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 146 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 41675449 - 41675255
Alignment:
Q |
146 |
tactccttccatttctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgtttta |
243 |
Q |
|
|
|||||| ||| || |||||||||||| | |||| ||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |
|
|
T |
41675449 |
tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttgcagaaaatttttgttcttgtttaactgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgttgtttta |
41675350 |
T |
 |
Q |
244 |
ccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
|||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
T |
41675349 |
ccaatattatccttagttatttattgcaaagaaataaatatattaaataaaatattaaatgaataaggtcgttatagtaaaactatagcttattg |
41675255 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 146 - 325
Target Start/End: Original strand, 35112409 - 35112590
Alignment:
Q |
146 |
tactccttccatttctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgtttta |
243 |
Q |
|
|
|||||| ||| || |||||||||||| | |||||||||| |||| || | ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| |
|
|
T |
35112409 |
tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaaaattttgtttcaatttaactgtcactttcaaagttcattgcaacattaaatattgtttta |
35112508 |
T |
 |
Q |
244 |
ccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaa |
325 |
Q |
|
|
|||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| |
|
|
T |
35112509 |
ccaatattacccttagttatttattgtggagagaaaaatatataaaatgagatattaaataaataaagttattatagtaaaa |
35112590 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 213 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 5732267 - 5732142
Alignment:
Q |
213 |
aaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggt |
312 |
Q |
|
|
|||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
5732267 |
aaagttcaatgcaacattaaatgctgttttaccaatattatccttagttatttatttcggagagagaaatatatgaaatgagattttaaatgaataaggt |
5732168 |
T |
 |
Q |
313 |
cattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
|||||||||||||||| | ||||||| |
|
|
T |
5732167 |
cattatagtaaaagtacaacttattg |
5732142 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 156 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 36298427 - 36298243
Alignment:
Q |
156 |
atttctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgt |
253 |
Q |
|
|
|||||||||||||||| |||| |||| |||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| || |||| |
|
|
T |
36298427 |
atttctttttaagtgtctcttttgaagaatttttttgtttctatttaactgtcactttcaatgttcaatgcaacattaaatgatgttttatcagtattac |
36298328 |
T |
 |
Q |
254 |
ccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| |
|
|
T |
36298327 |
ccttaattatttatttcggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgaataaagtcattatagtaaaaatataacttattg |
36298243 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 145 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 41889581 - 41889382
Alignment:
Q |
145 |
ttactccttccatttctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgtttt |
242 |
Q |
|
|
||||||| ||| ||||||||||||||| | ||| |||| |||||| |||| |||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||||||| |
|
|
T |
41889581 |
ttactccatccgtttctttttaagtgtcacttttaaagaatttttttgttccaatttaactgtcatttttaaagttcaatgcaactttaaatattgtttt |
41889482 |
T |
 |
Q |
243 |
accaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgtatc |
342 |
Q |
|
|
| ||||||| | ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
T |
41889481 |
atcaatattattcttagttatttattgcgaagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagactattatagtaaaagtatcaattattgtatc |
41889382 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 174 - 323
Target Start/End: Original strand, 6799133 - 6799283
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtgga |
273 |
Q |
|
|
|||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||| |
|
|
T |
6799133 |
tttggagaaattttttgttctcatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttatcaatattatccttaattatttattacgga |
6799232 |
T |
 |
Q |
274 |
gagagaaatatatgaaatgagat-attaaatgaataaggtcattatagtaa |
323 |
Q |
|
|
||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
T |
6799233 |
gagagaaatatataaaatgatataattaaatgaataagaccattatagtaa |
6799283 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 174 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 35746877 - 35746724
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtgga |
273 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| || |
|
|
T |
35746877 |
tttggagaaaatttttatttctatttaaatgtcactttcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttaccaatattacccttagatatttattg-cga |
35746779 |
T |
 |
Q |
274 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagta |
328 |
Q |
|
|
||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
35746778 |
aagagaaacatatgaaatgaaatattaaattaataaggccattatagtaaaagta |
35746724 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 174 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 46286078 - 46285922
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtgga |
273 |
Q |
|
|
|||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||| | | |
|
|
T |
46286078 |
tttggagaaattttttgttcttatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaagaataaatattgttttaccaacattacccttagttatttattgcgta |
46285979 |
T |
 |
Q |
274 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtata |
330 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||| | ||||||||| | ||||| | ||||||||||||||| |
|
|
T |
46285978 |
gagagaaatatatgaaataaaatattaaattactaaggctaatatagtaaaagtata |
46285922 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 224 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 38168972 - 38168858
Alignment:
Q |
224 |
caatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaa |
323 |
Q |
|
|
||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
T |
38168972 |
caatattaagtgttgttttaccaatattatccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatgttaaatgaataaggtcattataataa |
38168873 |
T |
 |
Q |
324 |
aagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
||||||| ||||||| |
|
|
T |
38168872 |
aagtataacttattg |
38168858 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 174 - 325
Target Start/End: Original strand, 1553525 - 1553674
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtgga |
273 |
Q |
|
|
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| | | |
|
|
T |
1553525 |
tttggagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcgaagttcaatgcaacattaaatattgttttaccaatattatccttacttatttat--taca |
1553622 |
T |
 |
Q |
274 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaa |
325 |
Q |
|
|
||||||||| |||||| | || |||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
T |
1553623 |
gagagaaatgtatgaagttagtgattaaatgaataaggttattatagtaaaa |
1553674 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 194 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 31815281 - 31815147
Alignment:
Q |
194 |
ctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatga |
293 |
Q |
|
|
|||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |
|
|
T |
31815281 |
ctatttaactgttactttcaaaattcaatgcaacattaaatattgttttaccaatattacccttagatatttattgcggagagagaaacatatgaaatga |
31815182 |
T |
 |
Q |
294 |
gatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagta |
328 |
Q |
|
|
||||||||| |||||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
31815181 |
aatattaaattaataagaccattatagtaaaagta |
31815147 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 174 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 37354092 - 37353939
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtgga |
273 |
Q |
|
|
|||| ||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
37354092 |
tttgaagaaattatttgatcatatttaactgtcactttcaaagttcaatgc-----------ttgttttaccaatattatccttagttatttattgtgga |
37354004 |
T |
 |
Q |
274 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||| |
|
|
T |
37354003 |
gagagaaatatatgaaatgaaatgttaaatgaataaggtcattatagtaaaaatgtaacttattg |
37353939 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 246 - 338
Target Start/End: Original strand, 8381908 - 8382000
Alignment:
Q |
246 |
aatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
T |
8381908 |
aatattgtccttagttatttattgcggggagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatatcttattg |
8382000 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 174 - 325
Target Start/End: Original strand, 3310226 - 3310377
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtgga |
273 |
Q |
|
|
|||||||| |||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| |
|
|
T |
3310226 |
tttggagattttttttgtttttatttaactgtcacttctaaagttcaatgcaacattaaataatgttttatcaatattactcttagttatttattgcgga |
3310325 |
T |
 |
Q |
274 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaa |
325 |
Q |
|
|
||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
3310326 |
gagagaaatatatgatataaaatattaaatgaataaggtcattatagtaaaa |
3310377 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 198 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 22382281 - 22382153
Alignment:
Q |
198 |
ttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagata |
297 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| || ||||||||| ||||||| ||| ||| |
|
|
T |
22382281 |
ttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgatgttttaccaatattatccttagatatttat--tgcagagagaaacatatgaattgaaata |
22382184 |
T |
 |
Q |
298 |
ttaaatgaataaggtcattatagtaaaagta |
328 |
Q |
|
|
|||||| || ||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
22382183 |
ttaaattaacaaggtcattatagtaaaagta |
22382153 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 146 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 43874345 - 43874164
Alignment:
Q |
146 |
tactccttccatttctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgtttta |
243 |
Q |
|
|
|||||| ||| ||||||||||||||| | ||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||| |
|
|
T |
43874345 |
tactccatccgtttctttttaagtgtcacttttagagaatttttttgttcctatttaactgtcactttcgaaattcaatgcaacattaaatgttattttg |
43874246 |
T |
 |
Q |
244 |
ccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaag |
326 |
Q |
|
|
|||||||| || ||| |||||||||| || | ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
T |
43874245 |
ccaatattatcattacttatttattgcagata-agaaatacatgaaattagatattcaatgaataaggttattatagtaaaag |
43874164 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 195 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 17354238 - 17354105
Alignment:
Q |
195 |
tatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgag |
294 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| | | ||||||| ||||||||||| |
|
|
T |
17354238 |
tatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttacgaatattacccttagatatatattgcgaaaagagaaacatatgaaatgaa |
17354139 |
T |
 |
Q |
295 |
atattaaatgaataaggtcattatagtaaaagta |
328 |
Q |
|
|
||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |
|
|
T |
17354138 |
atattaaattaataaggtcattataagaaaagta |
17354105 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 174 - 318
Target Start/End: Original strand, 42880977 - 42881121
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtgga |
273 |
Q |
|
|
|||||||||| ||||| || |||||||||| ||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| |||| ||| |
|
|
T |
42880977 |
tttggagaaaatttttgtttctatttaactatcactttttaaggtcaatgcaacattaaatgttgttttatcaatattatccttggttattgattgcgga |
42881076 |
T |
 |
Q |
274 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattat |
318 |
Q |
|
|
||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||| |||| |
|
|
T |
42881077 |
gagagaaatatataaaattagatgttaaatgaataaggtcgttat |
42881121 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 191 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 18194430 - 18194295
Alignment:
Q |
191 |
ttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaa |
290 |
Q |
|
|
||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |
|
|
T |
18194430 |
ttcctatttaactatcattttcaaatttcaatgcaaaattaaatgttgttttaccaacattacccttatatatttattgcggagagagaaacatatgaaa |
18194331 |
T |
 |
Q |
291 |
tgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaag |
326 |
Q |
|
|
||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| |
|
|
T |
18194330 |
tgaaatattaaattaataaggctattatagtaaaag |
18194295 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 157 - 339
Target Start/End: Original strand, 47459635 - 47459818
Alignment:
Q |
157 |
tttctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaat-gttgttttaccaatattgt |
253 |
Q |
|
|
||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| || |||| |||||||| | |
|
|
T |
47459635 |
tttctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgttcatatttaactgtcattttcgaagttcaatgcaacattaaatatttttttttccaatattat |
47459734 |
T |
 |
Q |
254 |
ccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgt |
339 |
Q |
|
|
|||| | |||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||||| |
|
|
T |
47459735 |
ccttgctcatttattgtg--gagagaaatatatcaaatgaaatattaaataaataaggttattatagtaaaaatatatattattgt |
47459818 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 174 - 338
Target Start/End: Original strand, 45324038 - 45324198
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtgga |
273 |
Q |
|
|
||||||||| |||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||| || |||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||| ||| |
|
|
T |
45324038 |
tttggagaatttttttgtttctatttaactgttactttcaaagttcaatgc----ttgaatgatgttttatcaatattactcttaattatttattgcgga |
45324133 |
T |
 |
Q |
274 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| ||||||| |
|
|
T |
45324134 |
gagagaaatatataaaataagatattaaataaataaaatcattataataaaagtataacttattg |
45324198 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 195 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 34368871 - 34368738
Alignment:
Q |
195 |
tatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgag |
294 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| | || ||||||||| | ||||| ||| ||||||||||| |
|
|
T |
34368871 |
tatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaatattacctttgaatatttattgcgaagagaaaaacatatgaaatgaa |
34368772 |
T |
 |
Q |
295 |
atattaaatgaataaggtcattatagtaaaagta |
328 |
Q |
|
|
||||||||| |||||||||||| |||||||||| |
|
|
T |
34368771 |
atattaaattaataaggtcattgcagtaaaagta |
34368738 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 174 - 342
Target Start/End: Original strand, 28608605 - 28608772
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtgga |
273 |
Q |
|
|
|||| |||| |||||| ||| ||||||| |||| || || |||||||||||| |||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||| |||||||| |
|
|
T |
28608605 |
tttgtagaatttttttgttcttatttaagtgtcctttacatagttcaatgcaacattaaatgttattttactaatattacccttatttatt-attgtgga |
28608703 |
T |
 |
Q |
274 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgtatc |
342 |
Q |
|
|
|||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||| || | |||||||||| |
|
|
T |
28608704 |
gagagaaatatatgtaatgatatattaaataaataaggttattatagtaaaaataaaaattattgtatc |
28608772 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 174 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 46563356 - 46563205
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtgga |
273 |
Q |
|
|
|||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||| || |||| |||| ||||||||||| || |
|
|
T |
46563356 |
tttgcagaaattttttgtttataattaactgtcactttcaaagttcagtacaacattaaatattgttttgacattattacccttgattatttattgtaga |
46563257 |
T |
 |
Q |
274 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaa |
325 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |
|
|
T |
46563256 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaggaaggttattataggaaaa |
46563205 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 179 - 325
Target Start/End: Original strand, 3177945 - 3178091
Alignment:
Q |
179 |
agaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagag |
278 |
Q |
|
|
|||| |||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || |||| |||| ||||||||||| ||||||| |
|
|
T |
3177945 |
agaatttttttgtttctaattaactgtcactttcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttgccgttattacccttggttatttattgcagagagag |
3178044 |
T |
 |
Q |
279 |
aaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaa |
325 |
Q |
|
|
|||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||| |||| |
|
|
T |
3178045 |
aaatatatgaaaagatatattaaatgacgaaggttattatagaaaaa |
3178091 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 191 - 328
Target Start/End: Original strand, 24283609 - 24283744
Alignment:
Q |
191 |
ttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaa |
290 |
Q |
|
|
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||||||||| | |||||||| |||| || |
|
|
T |
24283609 |
ttcctatttacctgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgatgttttatcaatattacccttagatatttattgcg--gagagaaacatataaat |
24283706 |
T |
 |
Q |
291 |
tgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagta |
328 |
Q |
|
|
||| ||||||||| || || |||||||||||||||||| |
|
|
T |
24283707 |
tgaaatattaaattaacaaagtcattatagtaaaagta |
24283744 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 198 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 8966109 - 8965982
Alignment:
Q |
198 |
ttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagata |
297 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| |
|
|
T |
8966109 |
ttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaacattgttttacctttattacccttgattatttattgtagagagagaaatacatgaaataagata |
8966010 |
T |
 |
Q |
298 |
ttaaatgaataaggtcattatagtaaaa |
325 |
Q |
|
|
|||||||| ||||| ||||||| |||| |
|
|
T |
8966009 |
ttaaatgatgaaggttattataggaaaa |
8965982 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 145 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 19328050 - 19327881
Alignment:
Q |
145 |
ttactccttccatttctttttaagtgt--tatttggagaaattttttattcctatttaactgtcacttt-caaagttcaatgcaatattaaatgttgttt |
241 |
Q |
|
|
||||||| ||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||| |||||||||| ||| |
|
|
T |
19328050 |
ttactccctccgtttctttttaagtgtcttttttggagattttttttgttcctatttaaatgtcattttacatagttcaatgcaacattaaatgttattt |
19327951 |
T |
 |
Q |
242 |
taccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggt |
312 |
Q |
|
|
||| |||||| |||| ||||| | ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |
|
|
T |
19327950 |
tactaatattactcttatttatt-actgtggagggagaaatatatgtaatgagatattaaataaataaggt |
19327881 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 194 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 44820810 - 44820679
Alignment:
Q |
194 |
ctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatga |
293 |
Q |
|
|
|||||||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | |
|
|
T |
44820810 |
ctatttaactgttatttttaaagttcaatgcaacattaaataatgttttatcaatattacatttagttatttatttcggagagaaaaatatatgaaataa |
44820711 |
T |
 |
Q |
294 |
gatattaaatgaataaggtcattatagtaaaa |
325 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
T |
44820710 |
aatattaaatgaataaggttattatagtaaaa |
44820679 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 203 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 22057620 - 22057510
Alignment:
Q |
203 |
tgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttatt---gtg---gagagagaaatatatgaaatgagat |
296 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| |||| |
|
|
T |
22057620 |
tgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttagcaatattacccttagttatttattacagagagagagagagaaatatatgaaacaagat |
22057521 |
T |
 |
Q |
297 |
attaaatgaat |
307 |
Q |
|
|
||||||||||| |
|
|
T |
22057520 |
attaaatgaat |
22057510 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 184 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 9602116 - 9601997
Alignment:
Q |
184 |
ttttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaata |
283 |
Q |
|
|
|||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || ||| || ||||||| |||||||| |||||||||||| |
|
|
T |
9602116 |
ttttttgtttctaattaagtgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgttgtttttcctataatgcccttagtaatttattgcagagagagaaata |
9602017 |
T |
 |
Q |
284 |
tatgaaatgagatattaaat |
303 |
Q |
|
|
|| ||||| |||||||||| |
|
|
T |
9602016 |
taagaaatatgatattaaat |
9601997 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 184 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 9829687 - 9829568
Alignment:
Q |
184 |
ttttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaata |
283 |
Q |
|
|
|||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || ||| || ||||||| |||||||| |||||||||||| |
|
|
T |
9829687 |
ttttttgtttctaattaagtgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgttgtttttcctataatgcccttagtaatttattgcagagagagaaata |
9829588 |
T |
 |
Q |
284 |
tatgaaatgagatattaaat |
303 |
Q |
|
|
|| ||||| |||||||||| |
|
|
T |
9829587 |
taagaaatatgatattaaat |
9829568 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 241 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 8380758 - 8380658
Alignment:
Q |
241 |
ttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgta |
340 |
Q |
|
|
||||||| ||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | |||||||| |
|
|
T |
8380758 |
ttaccaacattacccttagttatttattacggggagagaaatatatgaaataagatattaaatgactaaggttattatagtaaaagtaaaaattattgta |
8380659 |
T |
 |
Q |
341 |
t |
341 |
Q |
|
|
| |
|
|
T |
8380658 |
t |
8380658 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 198 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 26803639 - 26803517
Alignment:
Q |
198 |
ttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagata |
297 |
Q |
|
|
||||||||| |||| |||||||||| ||| ||||||| ||||||| || |||| |||| |||||||| || ||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
T |
26803639 |
ttaactgtcgcttttaaagttcaatacaacattaaatattgttttccccttattacccttgattatttatcgtagagagagaaatatataaaatgagata |
26803540 |
T |
 |
Q |
298 |
ttaaatgaataaggtcattatag |
320 |
Q |
|
|
|||||||| ||||| ||||||| |
|
|
T |
26803539 |
ttaaatgatgaaggttattatag |
26803517 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 228 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 30586855 - 30586758
Alignment:
Q |
228 |
attaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaa |
325 |
Q |
|
|
||||||||||| |||| | ||||| |||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| |
|
|
T |
30586855 |
attaaatgttgatttatctatattacccttagatatttactgcagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgattaaggttattatagaaaaa |
30586758 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 195 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 36339411 - 36339303
Alignment:
Q |
195 |
tatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaa--atgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatg |
292 |
Q |
|
|
||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| || || ||||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
36339411 |
tatttaagtgtcactttcaaagtttaatgcaatattaaatatatttttttaccaatattacccttgattattaattatggagagagaaatatatgaaaca |
36339312 |
T |
 |
Q |
293 |
agatattaa |
301 |
Q |
|
|
||||||||| |
|
|
T |
36339311 |
agatattaa |
36339303 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 278 - 342
Target Start/End: Original strand, 47408227 - 47408291
Alignment:
Q |
278 |
gaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgtatc |
342 |
Q |
|
|
|||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
T |
47408227 |
gaaatatatgaaatgaaatattaaatgaataaggttattatagtaaaagtatatattattgtatc |
47408291 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 179 - 290
Target Start/End: Original strand, 33071921 - 33072032
Alignment:
Q |
179 |
agaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagag |
278 |
Q |
|
|
|||| |||||| || ||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||| || ||| | ||||| | |||||||| ||||||| |
|
|
T |
33071921 |
agaatttttttgtttctaattaactgtcactttcaaagtttaatgtaacattaaatgttgtttttcctataacgcccttaataatttattgcagagagag |
33072020 |
T |
 |
Q |
279 |
aaatatatgaaa |
290 |
Q |
|
|
|||||||||||| |
|
|
T |
33072021 |
aaatatatgaaa |
33072032 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 160 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 2408910 - 2408827
Alignment:
Q |
160 |
ctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttt |
241 |
Q |
|
|
|||||||||||| | |||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
T |
2408910 |
ctttttaagtgtcacttttggagaaaaaatttgttcttatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttt |
2408827 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 174 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 48981613 - 48981461
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtca-ctttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtgg |
272 |
Q |
|
|
|||| |||| |||||| || ||| ||| |||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||| | |
|
|
T |
48981613 |
tttgcagaatttttttgtttctaattacctgtcaactttcaaagttcaatataacattaaatgttgttttgcctttattacccttagttatttattgcag |
48981514 |
T |
 |
Q |
273 |
agagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaa |
325 |
Q |
|
|
||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||| |||| |
|
|
T |
48981513 |
agatgaaaatatatgaaaaaaaatattaaatgatgaaggttattataggaaaa |
48981461 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 198 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 46715511 - 46715384
Alignment:
Q |
198 |
ttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagata |
297 |
Q |
|
|
||||||||| ||||||||| ||||| | ||||||||| |||||| | ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||| | ||| |
|
|
T |
46715511 |
ttaactgtcgttttcaaagtccaatgtatcattaaatgtggttttatctatattacccttatatatttattgctgagagagaaatatatggaataaaata |
46715412 |
T |
 |
Q |
298 |
ttaaatgaataaggtcattatagtaaaa |
325 |
Q |
|
|
|||||| | |||||| ||||||| |||| |
|
|
T |
46715411 |
ttaaattattaaggttattataggaaaa |
46715384 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 260 - 305
Target Start/End: Original strand, 35684249 - 35684294
Alignment:
Q |
260 |
ttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatga |
305 |
Q |
|
|
||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
35684249 |
ttatttattgtagagagagaagtatatgaaatgagatattaaatga |
35684294 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 41409810 - 41409766
Alignment:
Q |
207 |
actttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatatt |
251 |
Q |
|
|
||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
41409810 |
actttcaaagttcaacgcaacattaaatgttgttttaccaatatt |
41409766 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 198 - 303
Target Start/End: Original strand, 35860001 - 35860104
Alignment:
Q |
198 |
ttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagata |
297 |
Q |
|
|
|||| ||||| |||||||||| |||| || ||||||||||||||| || ||| | ||||||| |||||| || ||||||||||||| ||||| |||| |
|
|
T |
35860001 |
ttaagtgtcattttcaaagtttaatgtaacattaaatgttgtttttcctataacgcccttagtaatttat--tgcagagagaaatataagaaatatgata |
35860098 |
T |
 |
Q |
298 |
ttaaat |
303 |
Q |
|
|
|||||| |
|
|
T |
35860099 |
ttaaat |
35860104 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 191 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 13431347 - 13431312
Alignment:
Q |
191 |
ttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaa |
226 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
T |
13431347 |
ttcctatttaactgtcactttcaaaattcaatgcaa |
13431312 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 285 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 41409744 - 41409701
Alignment:
Q |
285 |
atgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagta |
328 |
Q |
|
|
||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
41409744 |
atgaaatgaaatattaaattaataaggccattatagtaaaagta |
41409701 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 186 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 41480710 - 41480628
Alignment:
Q |
186 |
ttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttatt |
268 |
Q |
|
|
|||| |||||||| | ||||| ||| |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| | ||||||||||||||| |
|
|
T |
41480710 |
ttttgttcctattaagttgtcattttgaaagttcaatgcaatattaactattgttttgtcaataatacccttagttatttatt |
41480628 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 146 - 204
Target Start/End: Original strand, 47408118 - 47408178
Alignment:
Q |
146 |
tactccttccatttctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactg |
204 |
Q |
|
|
|||||| ||| || |||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
T |
47408118 |
tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgttcctatttaactg |
47408178 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 209 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 6737302 - 6737262
Alignment:
Q |
209 |
tttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaata |
249 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||| |
|
|
T |
6737302 |
tttcaaagttcaatgcaatattaattattgttttatcaata |
6737262 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 198 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 27235481 - 27235437
Alignment:
Q |
198 |
ttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgtttt |
242 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||| |
|
|
T |
27235481 |
ttaactgtcactttcaaagttcaataaaacattagatgttgtttt |
27235437 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4 (Bit Score: 148; Significance: 5e-78; HSPs: 150)
Name: chr4
Description:
Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 146 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 13629454 - 13629260
Alignment:
Q |
146 |
tactccttccatttctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgtttta |
243 |
Q |
|
|
|||||| ||| || |||||||||||| | |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
13629454 |
tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttgtagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta |
13629355 |
T |
 |
Q |
244 |
ccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
13629354 |
ccaatattgtccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggttattatagtaaaagtatagcttattg |
13629260 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 146 - 338
Target Start/End: Original strand, 48782183 - 48782376
Alignment:
Q |
146 |
tactccttccatttctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgtttta |
243 |
Q |
|
|
|||||| ||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
48782183 |
tactccctccgtttctttttaagtgtcacttttggataaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta |
48782282 |
T |
 |
Q |
244 |
ccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
T |
48782283 |
ccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaat-agatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtattgcttattg |
48782376 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 145 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 38617569 - 38617374
Alignment:
Q |
145 |
ttactccttccatttctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgtttt |
242 |
Q |
|
|
||||||| ||| || |||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
38617569 |
ttactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaatattttgttcctatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttt |
38617470 |
T |
 |
Q |
243 |
accaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
T |
38617469 |
accaatattgtccttagttatttattgcggagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaatatagcttattg |
38617374 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 146 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 16465043 - 16464849
Alignment:
Q |
146 |
tactccttccatttctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgtttta |
243 |
Q |
|
|
|||||| ||| || |||||||||||| | |||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
16465043 |
tactccatccgttcctttttaagtgtcacttttgaagaaattttttgttactatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta |
16464944 |
T |
 |
Q |
244 |
ccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
16464943 |
ccaatattgtccttagttatttagtgcagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
16464849 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 145 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 52677407 - 52677222
Alignment:
Q |
145 |
ttactccttccatttctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgtttt |
242 |
Q |
|
|
||||||| ||| || |||||||||||| | ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
52677407 |
ttactccctccgttcctttttaagtgtcacttttagagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttt |
52677308 |
T |
 |
Q |
243 |
accaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagta |
328 |
Q |
|
|
||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
52677307 |
accaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagta |
52677222 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 144 - 338
Target Start/End: Original strand, 16664222 - 16664418
Alignment:
Q |
144 |
tttactccttccatttctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttt |
241 |
Q |
|
|
|||||||| ||| || |||||||||||| | ||||||||||| |||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
T |
16664222 |
tttactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaatattttgtccctatttaacggtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttt |
16664321 |
T |
 |
Q |
242 |
taccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
16664322 |
taccagtattgtccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
16664418 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 160 - 338
Target Start/End: Original strand, 46871918 - 46872098
Alignment:
Q |
160 |
ctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtcctt |
257 |
Q |
|
|
|||||||||||| | |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
46871918 |
ctttttaagtgtcacttttggataaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtcctt |
46872017 |
T |
 |
Q |
258 |
agttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |
|
|
T |
46872018 |
agttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgaaatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagaataacttattg |
46872098 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 145 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 5374612 - 5374417
Alignment:
Q |
145 |
ttactccttccatttctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgtttt |
242 |
Q |
|
|
||||||| ||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
5374612 |
ttactccctccgtttctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgttcttgtttaactgtcactttcaaagctcaatgcaacattaaatgttgtttt |
5374513 |
T |
 |
Q |
243 |
accaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
T |
5374512 |
accaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatatagcttattg |
5374417 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 160 - 338
Target Start/End: Original strand, 44217703 - 44217883
Alignment:
Q |
160 |
ctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtcctt |
257 |
Q |
|
|
|||||||||||| | |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
T |
44217703 |
ctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttctatttaactgtcactttcgaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcctt |
44217802 |
T |
 |
Q |
258 |
agttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
T |
44217803 |
agttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaagaaggtcattatagtaaaagtatatcttattg |
44217883 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 174 - 338
Target Start/End: Original strand, 39671338 - 39671502
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtgga |
273 |
Q |
|
|
|||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| || |
|
|
T |
39671338 |
tttggagaaattttttgttcttatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgtagttttaccaatattgtccttaattatttattgcaga |
39671437 |
T |
 |
Q |
274 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
39671438 |
gaaagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
39671502 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 174 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 44014144 - 44013980
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtgga |
273 |
Q |
|
|
|||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
44014144 |
tttggagaaaaaatttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgtgga |
44014045 |
T |
 |
Q |
274 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
|||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
44014044 |
gagataaatatatgaaatgagatattaaataaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
44013980 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 145 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 56576365 - 56576171
Alignment:
Q |
145 |
ttactccttccatttctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgtttt |
242 |
Q |
|
|
||||||| ||| || |||||||||||| | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |
|
|
T |
56576365 |
ttactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaaaattttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatattgtttt |
56576266 |
T |
 |
Q |
243 |
accaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
56576265 |
accaatattatccttagttatttattgtggagagaaaaatatatgaaatg-gatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
56576171 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 146 - 338
Target Start/End: Original strand, 29295337 - 29295531
Alignment:
Q |
146 |
tactccttccatttctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgtttta |
243 |
Q |
|
|
|||||| ||| || |||||||||||| | |||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
29295337 |
tactccctcctttcctttttaagtgtcacttttggagaaaaattttgttcctatttaactgtgactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta |
29295436 |
T |
 |
Q |
244 |
ccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
|||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |
|
|
T |
29295437 |
ccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatattaaaagtataacttattg |
29295531 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 146 - 338
Target Start/End: Original strand, 44069014 - 44069208
Alignment:
Q |
146 |
tactccttccatttctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgtttta |
243 |
Q |
|
|
|||||| ||| || |||||||||||| | |||| ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
44069014 |
tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttgtagaaaaattttgttcctatttaagtgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta |
44069113 |
T |
 |
Q |
244 |
ccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
44069114 |
tcaatattgttcttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
44069208 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 146 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 53600047 - 53599853
Alignment:
Q |
146 |
tactccttccatttctttttaagtgttattt--ggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgtttta |
243 |
Q |
|
|
|||||| ||| || |||||||||||| |||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |
|
|
T |
53600047 |
tactccctccgttcctttttaagtgtcatttttggagaaaaattttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatattgtttta |
53599948 |
T |
 |
Q |
244 |
ccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
|||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
T |
53599947 |
ccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgtgatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattg |
53599853 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 160 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 21044994 - 21044814
Alignment:
Q |
160 |
ctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtcctt |
257 |
Q |
|
|
|||||||||||| | ||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || || |
|
|
T |
21044994 |
ctttttaagtgtcactttttgagaaaatttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcttt |
21044895 |
T |
 |
Q |
258 |
agttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
|||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
21044894 |
agttatttattgcggagagagaaatatatgcaatgagatattaaataaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
21044814 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 145 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 26620613 - 26620418
Alignment:
Q |
145 |
ttactccttccatttctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgtttt |
242 |
Q |
|
|
|||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
26620613 |
ttactccttctgtttctttttaagtgtcacatttggagaaaaattttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttt |
26620514 |
T |
 |
Q |
243 |
accaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
||||||||| ||||||||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
26620513 |
accaatattatccttagttatttattgcggataaataaatatatgaaatgagatattaaattaataaggtcattataataaaagtatagcttattg |
26620418 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 160 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 35232544 - 35232365
Alignment:
Q |
160 |
ctttttaagtgttattt-ggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtcctta |
258 |
Q |
|
|
|||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
T |
35232544 |
ctttttaagtgtcattttggagaaaattttggttcctatttaactatcacgttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcctta |
35232445 |
T |
 |
Q |
259 |
gttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
T |
35232444 |
cttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatatcttattg |
35232365 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 148 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 55147320 - 55147128
Alignment:
Q |
148 |
ctccttccatttctttttaagtgt--tatttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttacc |
245 |
Q |
|
|
|||||||| || ||||||||||| | |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
55147320 |
ctccttccgttcttttttaagtgtcttttttggagaaattttttgttttcatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttacc |
55147221 |
T |
 |
Q |
246 |
aatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
|||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
55147220 |
aatattatccttacttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatgttaaatgaataaggtcattacagtaaaagtatagcttattg |
55147128 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 174 - 338
Target Start/End: Original strand, 353979 - 354143
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtgga |
273 |
Q |
|
|
|||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |
|
|
T |
353979 |
tttgaagaaattttttgttcctatttaattgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttaccaatattatccttagttatttattgcgga |
354078 |
T |
 |
Q |
274 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |
|
|
T |
354079 |
gagataaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtacaacttattg |
354143 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 145 - 338
Target Start/End: Original strand, 47428511 - 47428706
Alignment:
Q |
145 |
ttactccttccatttctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgtttt |
242 |
Q |
|
|
||||||| |||||| |||| ||||||| | |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
47428511 |
ttactccctccattcctttataagtgtcacttttggagaaaaattttgttcctatttaactgtcgctttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttt |
47428610 |
T |
 |
Q |
243 |
accaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
T |
47428611 |
accaatattgtccttagttatttattgcggagaaataaatatatgaaatgagatattaaatgaataatgtcattatagtaaaagtattacttattg |
47428706 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 146 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 3436328 - 3436134
Alignment:
Q |
146 |
tactccttccatttctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgtttta |
243 |
Q |
|
|
|||||| ||| || |||||||||||| | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
3436328 |
tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaaaattttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta |
3436229 |
T |
 |
Q |
244 |
ccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
|||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||| |
|
|
T |
3436228 |
ccaatattatccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgaaatattaaattaataaggttattatagtaaaagtatagtttattg |
3436134 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 179 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 19093379 - 19093220
Alignment:
Q |
179 |
agaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagag |
278 |
Q |
|
|
||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
T |
19093379 |
agaaattttttgtttctatttaaccgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagag |
19093280 |
T |
 |
Q |
279 |
aaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |
|
|
T |
19093279 |
gaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtacaacttattg |
19093220 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 195 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 22678519 - 22678376
Alignment:
Q |
195 |
tatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgag |
294 |
Q |
|
|
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
22678519 |
tatttaactgtcgctttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattatccttagtaatttattgcggagagataaatatatgaaatgag |
22678420 |
T |
 |
Q |
295 |
atattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
22678419 |
atattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
22678376 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 146 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 42513287 - 42513093
Alignment:
Q |
146 |
tactccttccatttctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgtttta |
243 |
Q |
|
|
||||| |||| || |||||||||||| | |||||||||| |||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
42513287 |
tactctttccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaaaattttgttactatttaagtgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta |
42513188 |
T |
 |
Q |
244 |
ccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
|||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
42513187 |
ccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatataaaatgtgatattaaatgaataaggtcatgatagtaaaagtatagcttattg |
42513093 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 174 - 338
Target Start/End: Original strand, 6195037 - 6195201
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtgga |
273 |
Q |
|
|
|||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |
|
|
T |
6195037 |
tttggagaaattttttgttcctatttaactgtcacattcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcgga |
6195136 |
T |
 |
Q |
274 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
|||| |||||||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||| |
|
|
T |
6195137 |
gagataaatatatgaaatgagatgttaaataaacaaggtcatcatagtaaaagtataacttattg |
6195201 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 174 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 31862217 - 31862061
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtgga |
273 |
Q |
|
|
|||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| |
|
|
T |
31862217 |
tttggagaaaatttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttatttatttattgcgga |
31862118 |
T |
 |
Q |
274 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtata |
330 |
Q |
|
|
|| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
31862117 |
gaaagaaatatatgaaatgatatgttaaatgaataaggtcattatagtaaaagtata |
31862061 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 161 - 338
Target Start/End: Original strand, 8735388 - 8735566
Alignment:
Q |
161 |
tttttaagtgttatttg-gagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttag |
259 |
Q |
|
|
||||||||||| |||| |||||| |||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| |
|
|
T |
8735388 |
tttttaagtgtcattttagagaaaaattttgtttctatttaattgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatattgttttaccaatattattcttag |
8735487 |
T |
 |
Q |
260 |
ttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
|||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
8735488 |
ttatttattgcggagagaaaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaagtatagcttattg |
8735566 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 174 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 4201549 - 4201385
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtgga |
273 |
Q |
|
|
|||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||| ||| |
|
|
T |
4201549 |
tttgaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaattcaacattaaatgttgttttactaatattatccttaattatttattgcgga |
4201450 |
T |
 |
Q |
274 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
|||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |
|
|
T |
4201449 |
gagataaatatatgaaatgaaatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtacaacttattg |
4201385 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 174 - 338
Target Start/End: Original strand, 35231703 - 35231867
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtgga |
273 |
Q |
|
|
|||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |
|
|
T |
35231703 |
tttggagaaaaattttatttttatttaaccgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttaattatttattgcgga |
35231802 |
T |
 |
Q |
274 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
T |
35231803 |
gagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaagtcattatagtaaaagtatagtttattg |
35231867 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 194 - 342
Target Start/End: Original strand, 50623447 - 50623594
Alignment:
Q |
194 |
ctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatga |
293 |
Q |
|
|
|||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
50623447 |
ctatttaattgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttaattatttattgcggagagataaatatatgaaatga |
50623546 |
T |
 |
Q |
294 |
gatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgtatc |
342 |
Q |
|
|
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
50623547 |
gata-taaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgtatc |
50623594 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 195 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 8741834 - 8741691
Alignment:
Q |
195 |
tatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgag |
294 |
Q |
|
|
||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
8741834 |
tatttaactgtcattttcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttaccaatattatctttagttatttattgtggagagtgaaatatatgaaatgag |
8741735 |
T |
 |
Q |
295 |
atattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
8741734 |
atattaaatgaataaggtcattataataaaagtatagcttattg |
8741691 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 145 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 19527470 - 19527283
Alignment:
Q |
145 |
ttactccttccatttctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgtttt |
242 |
Q |
|
|
||||||| ||| ||||||||||||||| | |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
19527470 |
ttactccctccgtttctttttaagtgtcacttttggagaaaatttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttt |
19527371 |
T |
 |
Q |
243 |
accaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgtatc |
342 |
Q |
|
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
19527370 |
accaatattatccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaa------------atgaataaggtcattatagtaaaattatagcttattgtatc |
19527283 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 146 - 338
Target Start/End: Original strand, 36408706 - 36408900
Alignment:
Q |
146 |
tactccttccatttctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgtttta |
243 |
Q |
|
|
|||||| ||| || |||||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
36408706 |
tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaaatttttgttcctatttaattgtaattttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta |
36408805 |
T |
 |
Q |
244 |
ccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
||||||| || |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
36408806 |
acaatattctctttagttatttatagcggagagagaaatatatgaaatgagatattgaattaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
36408900 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 146 - 338
Target Start/End: Original strand, 36422872 - 36423066
Alignment:
Q |
146 |
tactccttccatttctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgtttta |
243 |
Q |
|
|
|||||| ||| || |||||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
36422872 |
tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaaatttttgttcctatttaattgtaattttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta |
36422971 |
T |
 |
Q |
244 |
ccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
||||||| || |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
36422972 |
acaatattctctttagttatttatagcggagagagaaatatatgaaatgagatattgaattaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
36423066 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 157 - 338
Target Start/End: Original strand, 34464271 - 34464454
Alignment:
Q |
157 |
tttctttttaagtgttattt--ggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtc |
254 |
Q |
|
|
||||||||||||||| |||| | ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |
|
|
T |
34464271 |
tttctttttaagtgtcatttttgaagaaaaaatttgttcctatttaactgtcactttcatagttcaatgcaatattaaatgttgttttatcaatattatc |
34464370 |
T |
 |
Q |
255 |
cttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
|||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
34464371 |
attagttatttattgtgaagagataaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggtcattatattaaaagtatagcttattg |
34464454 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 184 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 35381636 - 35381492
Alignment:
Q |
184 |
ttttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaata |
283 |
Q |
|
|
|||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
T |
35381636 |
ttttttgtttctatttaattgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttactaatattatccttagttatttattgcggagagagaaata |
35381537 |
T |
 |
Q |
284 |
tatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagta |
328 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
T |
35381536 |
tatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattataataaaagta |
35381492 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 174 - 338
Target Start/End: Original strand, 47251426 - 47251590
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtgga |
273 |
Q |
|
|
|||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| ||||||||| ||| |
|
|
T |
47251426 |
tttgaagaaattttttgtttctattcaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttatcaatattattcttagctatttattgcgga |
47251525 |
T |
 |
Q |
274 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| |
|
|
T |
47251526 |
gagataaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattataataaaagtacaacttattg |
47251590 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 146 - 338
Target Start/End: Original strand, 33084461 - 33084655
Alignment:
Q |
146 |
tactccttccatttctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgtttta |
243 |
Q |
|
|
|||||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
33084461 |
tactccctccgtttctttttaagtgtctcttttgaagaaactttttgttcttatttaactgttactttcaaagttcaatacaacattaaatgttgtttta |
33084560 |
T |
 |
Q |
244 |
ccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
|||||||| || |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
T |
33084561 |
ccaatattatctttagttatttgttgcggagagagaaatatatgaaatgagatgttaaataaataaggtcattatagtaaaagtataacttattg |
33084655 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 145 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 52258052 - 52257855
Alignment:
Q |
145 |
ttactccttccatttctttttaagtgttatttg--gagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgtttt |
242 |
Q |
|
|
||||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |
|
|
T |
52258052 |
ttactccctccatttctttt-aagtgtcattttttgagaaattttttatttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgtttt |
52257954 |
T |
 |
Q |
243 |
accaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgtat |
341 |
Q |
|
|
||||| ||| || |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
T |
52257953 |
accaacattatctttagttatttattgcggagagaaaaatatatgaaataagatattaaatgactaaggctattatagtaaaagtataaattattgtat |
52257855 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 145 - 329
Target Start/End: Original strand, 55935089 - 55935275
Alignment:
Q |
145 |
ttactccttccatttctttttaagtgttattt--ggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgtttt |
242 |
Q |
|
|
||||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |
|
|
T |
55935089 |
ttactccatccgttcctttttaagtgttatttttggagaaattttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgtttt |
55935188 |
T |
 |
Q |
243 |
accaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtat |
329 |
Q |
|
|
||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
55935189 |
accaacattacccttagttatttattatggagagagaaatacatgaaataagatattaaatgactaaggctattatagtaaaagtat |
55935275 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 174 - 342
Target Start/End: Original strand, 44549656 - 44549824
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtgga |
273 |
Q |
|
|
|||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||||||||| | | |
|
|
T |
44549656 |
tttggagaaattttttgttattatttaactgtcgctttcaaagtttaatgcaacattaaatgctgttttatcaatattattcttagttatttattgcgaa |
44549755 |
T |
 |
Q |
274 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgtatc |
342 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |
|
|
T |
44549756 |
gagagaaatatatgaaatgagatgttaaatgaataaggtcattataataaaagtataacttattgtatc |
44549824 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 160 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 23720031 - 23719847
Alignment:
Q |
160 |
ctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtcctt |
257 |
Q |
|
|
|||||||||||| | ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| |
|
|
T |
23720031 |
ctttttaagtgtcacttttagagaaattttttgttcctgtttaactgtcactttcgaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattattctt |
23719932 |
T |
 |
Q |
258 |
agttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgtatc |
342 |
Q |
|
|
| |||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
T |
23719931 |
gctcatttattgtggagaaagaaatatatgaaaagaaatattaaatgaataaggttattatagtaaaagtatatattattgtatc |
23719847 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Original strand, 27492344 - 27492512
Alignment:
Q |
148 |
ctccttccatttctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttacc |
245 |
Q |
|
|
|||| ||| ||||||||||||||| | |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
27492344 |
ctccctccgtttctttttaagtgtcacttttggagaaaatttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttacc |
27492443 |
T |
 |
Q |
246 |
aatattgtccttagt-tatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtc |
313 |
Q |
|
|
|||||| | |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
T |
27492444 |
aatattatgcttagtcaatttattgcggagagagaaatatatgaaatgaaatattaaatgaataaggtc |
27492512 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 145 - 342
Target Start/End: Original strand, 37502003 - 37502203
Alignment:
Q |
145 |
ttactccttccatttctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagt-tcaatgcaatattaaatgttgttt |
241 |
Q |
|
|
||||||| ||| || |||||||||||| | |||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
T |
37502003 |
ttactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttctatttaaccgtcactttcaaagggtcaatgcaacattaaatgttgttt |
37502102 |
T |
 |
Q |
242 |
taccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgtat |
341 |
Q |
|
|
|| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
T |
37502103 |
tatcaatattacccttagttatttattatggagagataaatatatgaaatgtaatattaaatgaataaggttattatagtaaaagtataaattattgtat |
37502202 |
T |
 |
Q |
342 |
c |
342 |
Q |
|
|
| |
|
|
T |
37502203 |
c |
37502203 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 201 - 336
Target Start/End: Original strand, 23237667 - 23237805
Alignment:
Q |
201 |
actgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagag---agaaatatatgaaatgagata |
297 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| |
|
|
T |
23237667 |
actgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttaccaatattgtccttaattatttattgcggagagattataaatatatgaaatgagata |
23237766 |
T |
 |
Q |
298 |
ttaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttat |
336 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
23237767 |
ttaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttat |
23237805 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 174 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 38542507 - 38542343
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtgga |
273 |
Q |
|
|
|||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | | |
|
|
T |
38542507 |
tttggagaaaaattttgttcctatttaaatgtcactttcaaaattcagtgcaacattaaatattgttttaccaatattatccttagttatttattgcgaa |
38542408 |
T |
 |
Q |
274 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| |
|
|
T |
38542407 |
gagagaaatatatgaaatgagatgttaaatgaataagttcattatagtaaaagtctaacttattg |
38542343 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 174 - 338
Target Start/End: Original strand, 42099721 - 42099885
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtgga |
273 |
Q |
|
|
||||||||| |||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||| |||||||||| ||| |
|
|
T |
42099721 |
tttggagaatttttttgtttctatttaactatcactttcaaagttcaatgcaacattaaatggtgttttatcaatattacccttaattatttattgcgga |
42099820 |
T |
 |
Q |
274 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |
|
|
T |
42099821 |
aagagaaatatatgaaataagatattaaatgaataaggtcattacagtaaaagtataacttattg |
42099885 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 153 - 338
Target Start/End: Original strand, 47093802 - 47093989
Alignment:
Q |
153 |
tccatttctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatat |
250 |
Q |
|
|
|||||| |||||||||||| | |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
47093802 |
tccattcctttttaagtgtcacttttgaagaaattttttgttcctatttaaccgtcactttcaaagttcaatgcatcattatatgttgttttaccaatat |
47093901 |
T |
 |
Q |
251 |
tgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
| ||||| ||||||||||| | |||||||||||||| |||||| || |||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
T |
47093902 |
tatcctttgttatttattgcgaagagagaaatatataaaatgatatgttaaattaataagatcattatagtaaaagtataacttattg |
47093989 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 174 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 53125469 - 53125305
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtgga |
273 |
Q |
|
|
||||||||| |||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||| |||||||||| ||| |
|
|
T |
53125469 |
tttggagaatttttttgtttctatttaactttcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgatgttttatcaatattacccttaattatttattgcgga |
53125370 |
T |
 |
Q |
274 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
|| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
T |
53125369 |
gaaagaaatgtatgaaataagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattg |
53125305 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 160 - 316
Target Start/End: Original strand, 9834261 - 9834419
Alignment:
Q |
160 |
ctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtcctt |
257 |
Q |
|
|
|||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||||||||| |
|
|
T |
9834261 |
ctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgttcctatttaactgtcacttttaaagttcaatgcaacattaaatcttattttacatatattgtcctt |
9834360 |
T |
 |
Q |
258 |
agttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcatt |
316 |
Q |
|
|
|||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
T |
9834361 |
agttatttattgcggagagagaaatatattaaatgagatattaaatgaataagatcatt |
9834419 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 195 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 26906599 - 26906456
Alignment:
Q |
195 |
tatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgag |
294 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
26906599 |
tatttaactgtcactttcaaggttcaatgcaacattaaatattgttttactaatattattcttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgag |
26906500 |
T |
 |
Q |
295 |
atattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |
|
|
T |
26906499 |
atattaaattaataaggtcattaaagtaaaagtataacttattg |
26906456 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 146 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 39683975 - 39683781
Alignment:
Q |
146 |
tactccttccatttctttttaagtgttattt--ggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgtttta |
243 |
Q |
|
|
|||||||||| || ||||||||||| |||| | ||||| |||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| |
|
|
T |
39683975 |
tactccttccgttcttttttaagtgtcatttttgtagaaaaattttgtttctatttaactgtcacttttaaagttcaatgcaacattaaatattgtttta |
39683876 |
T |
 |
Q |
244 |
ccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
39683875 |
tcaatattgtccttagttatttattacagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcgttatactaaaaatatagcttattg |
39683781 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 178 - 328
Target Start/End: Original strand, 30939172 - 30939322
Alignment:
Q |
178 |
gagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagaga |
277 |
Q |
|
|
|||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||| ||||||| |
|
|
T |
30939172 |
gagaaattttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattacccttggatatttattgcggagaga |
30939271 |
T |
 |
Q |
278 |
gaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagta |
328 |
Q |
|
|
|||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
30939272 |
gaaacgtatgaaatgaaatattaaattaataaggtcattatagtaaaagta |
30939322 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 174 - 338
Target Start/End: Original strand, 32239413 - 32239573
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtgga |
273 |
Q |
|
|
|||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
32239413 |
tttggagaaaaattttgttcatatttaactgtcacttttaaagttcaatgcaacattaaatattgttttaccaatattatccttagttatttattgtgga |
32239512 |
T |
 |
Q |
274 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
|| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
32239513 |
gaaagaaatatatgaaatga-atattaaatgaataaagtc---atagtaaaagtatagcttattg |
32239573 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 174 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 22828632 - 22828468
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtgga |
273 |
Q |
|
|
||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||| ||||| |||||||||| || |
|
|
T |
22828632 |
tttggagaatttttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattacatgatgttttatcaatattacccttaattatttattgcaga |
22828533 |
T |
 |
Q |
274 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
T |
22828532 |
tagagaaatatatgaaataatatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattg |
22828468 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 146 - 338
Target Start/End: Original strand, 12252083 - 12252269
Alignment:
Q |
146 |
tactccttccatttctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgtttta |
243 |
Q |
|
|
|||||| ||| || |||||||||||| | |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
12252083 |
tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta |
12252182 |
T |
 |
Q |
244 |
ccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
|||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
T |
12252183 |
ccaatattatccttagttatttat--------atgaaatatatgaaataagatattaaatgaataaagtcattatagtaaaagtataacttattg |
12252269 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 196 - 338
Target Start/End: Original strand, 18781514 - 18781656
Alignment:
Q |
196 |
atttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgaga |
295 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |
|
|
T |
18781514 |
atttaactgtcactttcaaatttcaatgcaatattaaatattcttttaccaatattatctttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgaaa |
18781613 |
T |
 |
Q |
296 |
tattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
|||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| |
|
|
T |
18781614 |
tattaattgaataaggtaattataataaaagtatatcttattg |
18781656 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 191 - 337
Target Start/End: Original strand, 40411973 - 40412119
Alignment:
Q |
191 |
ttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaa |
290 |
Q |
|
|
||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
40411973 |
ttcctatttaactgtcattttcaaagttcaatgtaacattaaatattgttttatcaatattatccttaattatttattgcggagagagaaatatatgaaa |
40412072 |
T |
 |
Q |
291 |
tgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttatt |
337 |
Q |
|
|
||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |
|
|
T |
40412073 |
tgaaatgttaaatgaataaggtcattatagtaaaaatataacttatt |
40412119 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 160 - 310
Target Start/End: Original strand, 36750174 - 36750326
Alignment:
Q |
160 |
ctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtcctt |
257 |
Q |
|
|
|||||||||||| | |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
T |
36750174 |
ctttttaagtgtcacttttgaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcgaagttcaatacaatattaaatgttgttttaccaatattaatctt |
36750273 |
T |
 |
Q |
258 |
agttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataag |
310 |
Q |
|
|
| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
36750274 |
acttatttattgtggagagacaaatatatgaaatgaaatattaaatgaataag |
36750326 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 196 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 52057660 - 52057527
Alignment:
Q |
196 |
atttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgaga |
295 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |
|
|
T |
52057660 |
atttaactgtcactttcaaagttcaatgcaaaattaaatgttattttatcaatattatccttagttatttattgtggagagagaaatatataaaatgaaa |
52057561 |
T |
 |
Q |
296 |
tattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtat |
329 |
Q |
|
|
|||||||| |||||| | |||||||||||||||| |
|
|
T |
52057560 |
tattaaataaataagattattatagtaaaagtat |
52057527 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 174 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 29833157 - 29833001
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtgga |
273 |
Q |
|
|
||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| || || || ||||||||||| ||| |
|
|
T |
29833157 |
tttggagaaatttcttgttcctatttaactgttacttttaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaatgttatcgttggttatttattgcgga |
29833058 |
T |
 |
Q |
274 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtata |
330 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
T |
29833057 |
gagagaaatatatgaaatgagatgctaaatgaataaaatcattatagtaaaagtata |
29833001 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 178 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 36659654 - 36659494
Alignment:
Q |
178 |
gagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagaga |
277 |
Q |
|
|
|||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||| |
|
|
T |
36659654 |
gagaaattttttgttcctatttaactgttactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgatttattaatattattcttagttatttattgcggagaga |
36659555 |
T |
 |
Q |
278 |
gaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||| ||| || || || |||||||||||||||| ||| ||||||| |
|
|
T |
36659554 |
gaaatatatgaaatgagatgttagataaacaatgtcattatagtaaaagcataacttattg |
36659494 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 174 - 321
Target Start/End: Original strand, 33809100 - 33809247
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtgga |
273 |
Q |
|
|
|||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||| ||| |
|
|
T |
33809100 |
tttggagaaaatttttgttcttatttaactgtcacattcaaagtttaatgcaatagtaaatgttgttttaccaatattacccctagatatttattgcgga |
33809199 |
T |
 |
Q |
274 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagt |
321 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| |
|
|
T |
33809200 |
gagagaaatatatgaaatgaaatattaaattaataaggccattatagt |
33809247 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 160 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 23623742 - 23623601
Alignment:
Q |
160 |
ctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtcctt |
257 |
Q |
|
|
|||||||||||| | ||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
T |
23623742 |
ctttttaagtgtcactttttgagaaaatttttgttactatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcctt |
23623643 |
T |
 |
Q |
258 |
agttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatatt |
299 |
Q |
|
|
| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
23623642 |
aagtatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatatt |
23623601 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 157 - 329
Target Start/End: Original strand, 41415002 - 41415175
Alignment:
Q |
157 |
tttctttttaagtgttattt--ggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtc |
254 |
Q |
|
|
||||||||||||||| |||| | |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| | |
|
|
T |
41415002 |
tttctttttaagtgtcatttttgaagaaatttttgtttc-tatttaattgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacattacc |
41415100 |
T |
 |
Q |
255 |
cttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtat |
329 |
Q |
|
|
||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
41415101 |
cttagctatttattatggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgactaagactattatagtaaaagtat |
41415175 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 146 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 26934032 - 26933848
Alignment:
Q |
146 |
tactccttccatttctttttaagtgttattt--ggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgtttta |
243 |
Q |
|
|
|||||| ||| || ||||||||| ||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
26934032 |
tactccctccgttcctttttaagcgttatttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcatttttaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta |
26933933 |
T |
 |
Q |
244 |
ccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtat |
329 |
Q |
|
|
||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
26933932 |
tcaatattacccttagttatttatcgcagagagagaaatatatgaaatgaaatattaaa-gaataaggatattatagtaaaagtat |
26933848 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 233 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 33755201 - 33755098
Alignment:
Q |
233 |
atgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagc |
332 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
33755201 |
atgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagaga--aatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagc |
33755104 |
T |
 |
Q |
333 |
ttattg |
338 |
Q |
|
|
|||||| |
|
|
T |
33755103 |
ttattg |
33755098 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 178 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 53691881 - 53691731
Alignment:
Q |
178 |
gagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagaga |
277 |
Q |
|
|
|||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||| |
|
|
T |
53691881 |
gagaaattttttgttccaatttaactgtcactttcaaagttcaatacatcattaaatgttgttttatcaatattacccttaaatatttattgtggaaaga |
53691782 |
T |
 |
Q |
278 |
gaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagta |
328 |
Q |
|
|
|||| ||||||||| | ||||||||| || ||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
53691781 |
gaaacatatgaaataaaatattaaattaacaaggtcattatagtaaaagta |
53691731 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 197 - 338
Target Start/End: Original strand, 54231574 - 54231716
Alignment:
Q |
197 |
tttaactgtcactttcaaagttcaatgcaata-ttaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgaga |
295 |
Q |
|
|
||||||||||| ||| |||||||||| ||| | ||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| |
|
|
T |
54231574 |
tttaactgtcatttttaaagttcaattcaacaattaaatgttattttactaatattatccttagttatttattatggaaagagaaatatattaaatgaga |
54231673 |
T |
 |
Q |
296 |
tattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
T |
54231674 |
tgttaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattg |
54231716 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 196 - 341
Target Start/End: Original strand, 19399569 - 19399713
Alignment:
Q |
196 |
atttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgaga |
295 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
T |
19399569 |
atttaactgtcactttcaaagttcaatgcaataataaa-gttgttttaccaacattacccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaataaga |
19399667 |
T |
 |
Q |
296 |
tattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgtat |
341 |
Q |
|
|
|||||||| | ||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |
|
|
T |
19399668 |
tattaaattactaaggctattatattaaaagtataaattattgtat |
19399713 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 181 - 328
Target Start/End: Original strand, 43888003 - 43888149
Alignment:
Q |
181 |
aaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaa |
280 |
Q |
|
|
||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||| |||||| |
|
|
T |
43888003 |
aaattttttgttcctatttaattgtcactttcaaagttcaatacatcattaa-tgttgttttatcaatattacccttagatatttattgcggatagagaa |
43888101 |
T |
 |
Q |
281 |
atatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagta |
328 |
Q |
|
|
| ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
43888102 |
acatatgaaatgaaatattaaattaacaaggtcattatagtaaaagta |
43888149 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 178 - 328
Target Start/End: Original strand, 42133054 - 42133203
Alignment:
Q |
178 |
gagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagaga |
277 |
Q |
|
|
|||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||| || |
|
|
T |
42133054 |
gagaaattttttgttcctatttaactgtcgctttcaaagttcaatgcaacattaaatgtagttttatcaatattatccttagatatttattgcggagtga |
42133153 |
T |
 |
Q |
278 |
gaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagta |
328 |
Q |
|
|
|||| |||||| ||| || |||||| ||||||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
42133154 |
gaaacatatgatgtgaaat-ttaaatcaataaggctattatagtaaaagta |
42133203 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 217 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 44176777 - 44176652
Alignment:
Q |
217 |
ttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcatt |
316 |
Q |
|
|
|||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||| |
|
|
T |
44176777 |
ttcaatgcaaaattaaattttgttttaccaatattattcttgcttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgaaatattaaatgaataaagttatt |
44176678 |
T |
 |
Q |
317 |
atagtaaaagtatagcttattgtatc |
342 |
Q |
|
|
||| |||||||||| |||||||||| |
|
|
T |
44176677 |
ataataaaagtatatattattgtatc |
44176652 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 178 - 326
Target Start/End: Original strand, 30151689 - 30151837
Alignment:
Q |
178 |
gagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagaga |
277 |
Q |
|
|
||||| |||||| ||| ||||||||||||| |||| |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| | | ||| |
|
|
T |
30151689 |
gagaatttttttgttcttatttaactgtcattttcgaagttcaacgcaacattaaatgttgttttatcaatattatccttacttatttattgcgcataga |
30151788 |
T |
 |
Q |
278 |
gaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaag |
326 |
Q |
|
|
|||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
T |
30151789 |
gaaatatatgaaattaaatattgaatgaataaggctattatagtaaaag |
30151837 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 146 - 325
Target Start/End: Original strand, 34361039 - 34361219
Alignment:
Q |
146 |
tactccttccatttctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgtttta |
243 |
Q |
|
|
|||||| ||| ||||||||||| ||| | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |
|
|
T |
34361039 |
tactccctccgtttctttttaattgtcacttttagagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaaattcaatgcaacattaaa---tgtttta |
34361135 |
T |
 |
Q |
244 |
ccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatg--agatattaaatgaataaggtcattatagtaaaa |
325 |
Q |
|
|
|| ||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||| |
|
|
T |
34361136 |
ccgatattacccttagatatttattgcggagagagaaacatatgaaatgaaaaatattaaattaataagaccattatagtaaaa |
34361219 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 195 - 338
Target Start/End: Original strand, 55702954 - 55703097
Alignment:
Q |
195 |
tatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgag |
294 |
Q |
|
|
||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | |||| |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || |
|
|
T |
55702954 |
tatttaactatcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgataatttattaatattacccttaattatttattgcagagagagaaatatatgaaataag |
55703053 |
T |
 |
Q |
295 |
atattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |
|
|
T |
55703054 |
ataataaatgaataaggtcgttatagtaaaaatataacttattg |
55703097 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 182 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 6091578 - 6091417
Alignment:
Q |
182 |
aattttttattcctatttaactgt--cactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagaga |
279 |
Q |
|
|
|||||||| ||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| | ||||| ||||||| ||||||| | |||||||||||||||| ||||||| |
|
|
T |
6091578 |
aatttttttttcctatttaactatatcactttcaaaattcaatgcaacaataaatattgttttttcaatattatttttagttatttattgtgcagagaga |
6091479 |
T |
 |
Q |
280 |
aatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgtat |
341 |
Q |
|
|
|||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
T |
6091478 |
aatatatgaaataagatattaaatgactaaagctattatagtaaaagtataaattattgtat |
6091417 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Original strand, 36750583 - 36750729
Alignment:
Q |
195 |
tatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgag |
294 |
Q |
|
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| | |
|
|
T |
36750583 |
tatttaactgtcacttacaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacattacccttaattatttattgcggagagagaaatatataaaataat |
36750682 |
T |
 |
Q |
295 |
atattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgtat |
341 |
Q |
|
|
||||||||||| ||||| ||||||||| || |||| ||||||||| |
|
|
T |
36750683 |
atattaaatgattaaggctattatagtacaaatataaattattgtat |
36750729 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 191 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 9220255 - 9220118
Alignment:
Q |
191 |
ttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaa |
290 |
Q |
|
|
|||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |
|
|
T |
9220255 |
ttcctaattaactgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgatgttttaccaatattacccttagatatttattgcagagagagaaacatatgaat |
9220156 |
T |
 |
Q |
291 |
tgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagta |
328 |
Q |
|
|
||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||| |
|
|
T |
9220155 |
tgaaatattaaattagcaaggtctttatagtaaaagta |
9220118 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 178 - 330
Target Start/End: Original strand, 42629334 - 42629486
Alignment:
Q |
178 |
gagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagaga |
277 |
Q |
|
|
||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||| || ||||||| |
|
|
T |
42629334 |
gagaaattttttatttcaatttaattgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaattttgttttatcaatattacccttaattatttaatgcggagaga |
42629433 |
T |
 |
Q |
278 |
gaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtata |
330 |
Q |
|
|
||||| ||||||| | |||||||||||| |||| ||| ||||| ||||||| |
|
|
T |
42629434 |
gaaatttatgaaacaaaatattaaatgaaaaaggctattttagtacaagtata |
42629486 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 222 - 338
Target Start/End: Original strand, 52061619 - 52061735
Alignment:
Q |
222 |
tgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagt |
321 |
Q |
|
|
||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
T |
52061619 |
tgcaacattaaatgatgttttatcaatattacccttaattatttattgcggagagaaaaatatatgaaataagatattaaatgaataaagtcattatagt |
52061718 |
T |
 |
Q |
322 |
aaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
||||||||| ||||||| |
|
|
T |
52061719 |
aaaagtataacttattg |
52061735 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 176 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 47885225 - 47885065
Alignment:
Q |
176 |
tggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaa--------agttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttat |
267 |
Q |
|
|
||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||| |||||||| |
|
|
T |
47885225 |
tggagaatttttttgtttctatttaactgtcactttcaagttcaataagtttaatgcaacattaaatgatgttttatcaatattacccttaattatttat |
47885126 |
T |
 |
Q |
268 |
tgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatg-aataaggtcattatagtaaaagt |
327 |
Q |
|
|
|| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
47885125 |
tggagagagagaaatatatgaaataagatattaaatgaaataaggtcattatagtaaaagt |
47885065 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 195 - 329
Target Start/End: Original strand, 31369835 - 31369969
Alignment:
Q |
195 |
tatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgag |
294 |
Q |
|
|
||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| |||||| | || |
|
|
T |
31369835 |
tatttaactgtcattttcgaagttcaatgcaacattaaatattgttttaccaatattatccttacttatttattacggagagagaaatgtatgaagttag |
31369934 |
T |
 |
Q |
295 |
atattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtat |
329 |
Q |
|
|
|||||| |||||||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
31369935 |
tgattaaacaaataaggttattatagtaaaagtat |
31369969 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 160 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 33755329 - 33755223
Alignment:
Q |
160 |
ctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtcctt |
257 |
Q |
|
|
|||||||||||| | ||| |||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
T |
33755329 |
ctttttaagtgtcacttttagagaaaatttttatttctctttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcctt |
33755230 |
T |
 |
Q |
258 |
agttatt |
264 |
Q |
|
|
||||||| |
|
|
T |
33755229 |
agttatt |
33755223 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 198 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 1146256 - 1146136
Alignment:
Q |
198 |
ttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagata |
297 |
Q |
|
|
|||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| || |||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
1146256 |
ttaactatcactttcaaatttcaatgcaacattaaatgttgttttgcctttattacccttgattatttattgtagagagagaaatatatgaaatgagata |
1146157 |
T |
 |
Q |
298 |
ttaaatgaataaggtcattat |
318 |
Q |
|
|
|||||||| ||||| ||||| |
|
|
T |
1146156 |
ttaaatgatgaaggtaattat |
1146136 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 144 - 325
Target Start/End: Original strand, 6150675 - 6150858
Alignment:
Q |
144 |
tttactccttccatttctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttt |
241 |
Q |
|
|
|||||||| |||||| |||||||| ||| | |||| | || |||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |
|
|
T |
6150675 |
tttactccctccattcctttttaattgtcacttttgcataatttttttgtttctaattaactgtcactttcaaagttcaatacaacattaaatgttgttt |
6150774 |
T |
 |
Q |
242 |
taccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaa |
325 |
Q |
|
|
| || |||| |||| ||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |
|
|
T |
6150775 |
tgcctttattacccttgattatttattgtagagagagaagtaaatgaagtgagatattaaatgatgaaggttattataggaaaa |
6150858 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 181 - 292
Target Start/End: Original strand, 51347282 - 51347393
Alignment:
Q |
181 |
aaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaa |
280 |
Q |
|
|
|||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| || |
|
|
T |
51347282 |
aaatattttgttcctatttatctgtcactttcaaagtttaatgtaacattaaatgttgttttaccaatattacccttagatatttattgcggagagaaaa |
51347381 |
T |
 |
Q |
281 |
atatatgaaatg |
292 |
Q |
|
|
| |||||||||| |
|
|
T |
51347382 |
acatatgaaatg |
51347393 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 198 - 325
Target Start/End: Original strand, 54029135 - 54029262
Alignment:
Q |
198 |
ttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagata |
297 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||| |||||| || |||||||||| ||||| |
|
|
T |
54029135 |
ttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttacctttattaaccttgattatttattgtagagagataattatatgaaataagata |
54029234 |
T |
 |
Q |
298 |
ttaaatgaataaggtcattatagtaaaa |
325 |
Q |
|
|
|||||||| ||||| ||||||| |||| |
|
|
T |
54029235 |
ttaaatgatgaaggttattataggaaaa |
54029262 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 174 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 56499845 - 56499712
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtgga |
273 |
Q |
|
|
|||| ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||| || |
|
|
T |
56499845 |
tttgcagaaattttttgtttctaattaactgtcactttcaaagtttaatacaacattaaatgttgtttttcttatattacccttatttatttattgcaga |
56499746 |
T |
 |
Q |
274 |
gagag--aaatatatgaaatgagatattaaatga |
305 |
Q |
|
|
||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
56499745 |
gagagaaaaatatatgaaatgagatattaaatga |
56499712 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 195 - 307
Target Start/End: Original strand, 3036419 - 3036529
Alignment:
Q |
195 |
tatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgag |
294 |
Q |
|
|
||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||| || |
|
|
T |
3036419 |
tatttaattgtcactttcaaagtttaatgtaatattaaatgttattttaccgatattacccttagtaatttattat--agagagaaatatatgaaataag |
3036516 |
T |
 |
Q |
295 |
atattaaatgaat |
307 |
Q |
|
|
||||||||||||| |
|
|
T |
3036517 |
atattaaatgaat |
3036529 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 179 - 320
Target Start/End: Original strand, 34603642 - 34603783
Alignment:
Q |
179 |
agaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagag |
278 |
Q |
|
|
||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||| | ||||||| |||||||| ||||||| |
|
|
T |
34603642 |
agaaattttttgtttctaattaactgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgttgttttttctataatacccttagtaatttattgcagagagag |
34603741 |
T |
 |
Q |
279 |
aaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatag |
320 |
Q |
|
|
||||||||||||| |||||||||| | ||||| ||||||| |
|
|
T |
34603742 |
aaatatatgaaatatgatattaaataattaaggatattatag |
34603783 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 174 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 37394390 - 37394298
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttattta |
266 |
Q |
|
|
|||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |
|
|
T |
37394390 |
tttggagaaattttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacattacccttaattattta |
37394298 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 196 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 18135260 - 18135114
Alignment:
Q |
196 |
atttaactgtcacttt-caaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgag |
294 |
Q |
|
|
|||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||| ||| | |||||||||||||||| ||||| |
|
|
T |
18135260 |
atttaagtgtcactttacatagttcaatgcaacattaaatgttattttactaatattacccttatttatt-attatagagagagaaatatatgtaatgaa |
18135162 |
T |
 |
Q |
295 |
atattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgtatc |
342 |
Q |
|
|
||||||||| |||||||| |||||||||||| || | |||||||||| |
|
|
T |
18135161 |
atattaaataaataaggttattatagtaaaaataaaaattattgtatc |
18135114 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 174 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 37551896 - 37551765
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtgga |
273 |
Q |
|
|
|||| ||||||||||| || ||| |||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| | || |||| |||| ||||||||||| || |
|
|
T |
37551896 |
tttgtagaaattttttgtttctaattaagtgtcactttcaaagttcaatacaacattaaatgttgttgtgcctttattacccttggttatttattgcaga |
37551797 |
T |
 |
Q |
274 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatga |
305 |
Q |
|
|
|||||||| ||||||||||| ||||||||||| |
|
|
T |
37551796 |
gagagaaacatatgaaatgaaatattaaatga |
37551765 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 196 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 41955883 - 41955776
Alignment:
Q |
196 |
atttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgaga |
295 |
Q |
|
|
|||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| | ||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||| | |
|
|
T |
41955883 |
atttaactgtcacttttaaagttcaatgcaacattaaatataattttatcaatattatccttagatatttattgcagagagagaaaaatatgaaatgaaa |
41955784 |
T |
 |
Q |
296 |
tattaaat |
303 |
Q |
|
|
|||||||| |
|
|
T |
41955783 |
tattaaat |
41955776 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 146 - 342
Target Start/End: Original strand, 47751520 - 47751711
Alignment:
Q |
146 |
tactccttccatttctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgtttta |
243 |
Q |
|
|
|||||||||| || |||||||||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| || || |||||||| ||||||||| ||| |
|
|
T |
47751520 |
tactccttccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgttccaatttaactgtcatttttaaggt-caatgcaactttaaatgtt---tta |
47751615 |
T |
 |
Q |
244 |
ccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgtatc |
342 |
Q |
|
|
|||| || |||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
T |
47751616 |
tcaatgttacccttagttattt---gcggagagagaaatatctgaaatgagatattaaatgaataaaactattatagtaaaagtatcaattattgtatc |
47751711 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 196 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 49122470 - 49122324
Alignment:
Q |
196 |
atttaactgtcacttt-caaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgag |
294 |
Q |
|
|
|||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||| ||| | |||||||||||||||| ||||| |
|
|
T |
49122470 |
atttaagtgtcactttacatagttcaatgcaacattaaatgttattttactaatattacccttatttatt-attatagagagagaaatatatgtaatgaa |
49122372 |
T |
 |
Q |
295 |
atattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgtatc |
342 |
Q |
|
|
||||||||| |||||||| |||||||||||| || | |||||||||| |
|
|
T |
49122371 |
atattaaataaataaggttattatagtaaaaataaaaattattgtatc |
49122324 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 181 - 319
Target Start/End: Original strand, 3802180 - 3802318
Alignment:
Q |
181 |
aaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaa |
280 |
Q |
|
|
||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||| ||||||||| |
|
|
T |
3802180 |
aaattttttgtttctaattaaccgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatattgttttacctttattacccttgattatttattgtagagagagaa |
3802279 |
T |
 |
Q |
281 |
atatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattata |
319 |
Q |
|
|
|||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||| |
|
|
T |
3802280 |
gtatatgaaataaaatattaaatgatgaaggttattata |
3802318 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 194 - 327
Target Start/End: Original strand, 7242272 - 7242405
Alignment:
Q |
194 |
ctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatga |
293 |
Q |
|
|
|||| |||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||| |||||||| ||||||| || ||||||||||||| |||||| | |||| |||||||| |
|
|
T |
7242272 |
ctatgtaactgtcgctttcaaagtttaatacaacattaaatattgttttatcaatattatctttagttatttattaatgagagaaatatatgtgaaatga |
7242371 |
T |
 |
Q |
294 |
gatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagt |
327 |
Q |
|
|
|||||||||| ||||||| || ||||||||||| |
|
|
T |
7242372 |
gatattaaattaataaggctatcatagtaaaagt |
7242405 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 198 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 1615260 - 1615135
Alignment:
Q |
198 |
ttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagata |
297 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| || |||| | || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
1615260 |
ttaactgtcactttcaaatttcaatacaacattaaatgttgttttgcctttattaccattgattatttattgt--agagagaaatatatgaaatgagata |
1615163 |
T |
 |
Q |
298 |
ttaaatgaataaggtcattatagtaaaa |
325 |
Q |
|
|
|||||||| ||||| ||||||| |||| |
|
|
T |
1615162 |
ttaaatgatgaaggttattataggaaaa |
1615135 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 184 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 14949305 - 14949169
Alignment:
Q |
184 |
ttttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaata |
283 |
Q |
|
|
|||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || ||| || ||||||| |||||||| |||||||||||| |
|
|
T |
14949305 |
ttttttgtttctaattaagtgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgttgtttttcctataatgcccttagtaatttattgcagagagagaaata |
14949206 |
T |
 |
Q |
284 |
tatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatag |
320 |
Q |
|
|
|| ||||| |||||||||| | ||||| ||||||| |
|
|
T |
14949205 |
taagaaatatgatattaaataattaaggatattatag |
14949169 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 179 - 303
Target Start/End: Original strand, 18091260 - 18091384
Alignment:
Q |
179 |
agaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagag |
278 |
Q |
|
|
||||||||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| | || ||| || ||||||| |||||||| ||||||| |
|
|
T |
18091260 |
agaaattttttgtttctaattaagtgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgatgttcttcctataatgcccttagtaatttattgcagagagag |
18091359 |
T |
 |
Q |
279 |
aaatatatgaaatgagatattaaat |
303 |
Q |
|
|
||||||||||||| |||||||||| |
|
|
T |
18091360 |
aaatatatgaaatatgatattaaat |
18091384 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 194 - 318
Target Start/End: Original strand, 45725569 - 45725693
Alignment:
Q |
194 |
ctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatga |
293 |
Q |
|
|
|||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| ||||| | |
|
|
T |
45725569 |
ctatttaattgtcatttttaaagttcaatgcaatattaaatattattttatcaatattatccttaattatttattacagagagagaaataattgaaacaa |
45725668 |
T |
 |
Q |
294 |
gatattaaatgaataaggtcattat |
318 |
Q |
|
|
|||||||||||||| |||| ||||| |
|
|
T |
45725669 |
gatattaaatgaatgaggttattat |
45725693 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 174 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 47596844 - 47596676
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtgga |
273 |
Q |
|
|
|||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| | | |||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||| |
|
|
T |
47596844 |
tttgtagaaaatttttgtttctatttaattgtcattttcaaagttcaatgcaatattgagtattgttttatcaatattactcttaattatttattacgga |
47596745 |
T |
 |
Q |
274 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgtatc |
342 |
Q |
|
|
|| ||||||| ||||| | |||||||||||||||||| ||||| | ||||| ||| |||||||||| |
|
|
T |
47596744 |
gacagaaataattgaaacaatatattaaatgaataaggttattattggaaaaggataatttattgtatc |
47596676 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 184 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 1181122 - 1180981
Alignment:
Q |
184 |
ttttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaata |
283 |
Q |
|
|
|||||| || ||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| || | || | || |||||||||| |||||||||||| |
|
|
T |
1181122 |
ttttttgtttctaattacctgtcactttcaaagtttaatacaacattaaatgttgttttggcattcttacctttgattatttattgcagagagagaaata |
1181023 |
T |
 |
Q |
284 |
tatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaa |
325 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |
|
|
T |
1181022 |
tatgaaatgagatattaaatgagaaaggttattataggaaaa |
1180981 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 198 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 1391378 - 1391273
Alignment:
Q |
198 |
ttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagata |
297 |
Q |
|
|
|||| ||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||| || ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| |
|
|
T |
1391378 |
ttaagtgtcactttcaaagttcaatgtaacactaaatgttgtttttcctataatgtccttagtaatttattgtagagagagaaatatgtgaaaaatgata |
1391279 |
T |
 |
Q |
298 |
ttaaat |
303 |
Q |
|
|
|||||| |
|
|
T |
1391278 |
ttaaat |
1391273 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 179 - 320
Target Start/End: Original strand, 14090258 - 14090399
Alignment:
Q |
179 |
agaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagag |
278 |
Q |
|
|
||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||| | ||||||| |||||||| ||||||| |
|
|
T |
14090258 |
agaaattttttgtttataattaactgttactttcaaagttcaatgtaacattaaatgttgttttttctataatacccttagtaatttattgcagagagag |
14090357 |
T |
 |
Q |
279 |
aaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatag |
320 |
Q |
|
|
||||||||||||| |||||||||| | ||||| ||||||| |
|
|
T |
14090358 |
aaatatatgaaatatgatattaaataattaaggatattatag |
14090399 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 174 - 307
Target Start/End: Original strand, 27918615 - 27918747
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtgga |
273 |
Q |
|
|
|||| |||||| |||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| | |||||||| ||||| | |
|
|
T |
27918615 |
tttgtagaaatgttttgtttctatttagctgtcactttcaaagttcaatcaaatattaaatgttg-tttatcaatattaccattagttatatattgcaaa |
27918713 |
T |
 |
Q |
274 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaat |
307 |
Q |
|
|
||||||||||||||||| |||||| |||||||| |
|
|
T |
27918714 |
gagagaaatatatgaaacaagatataaaatgaat |
27918747 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 185 - 325
Target Start/End: Original strand, 41813666 - 41813807
Alignment:
Q |
185 |
tttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttacc-aatattgtccttagttatttattgtggagagagaaata |
283 |
Q |
|
|
||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| |||||| || | |
|
|
T |
41813666 |
tttttgtttctaattaagtgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccttttattacccttgattatttattgtagagagataagtg |
41813765 |
T |
 |
Q |
284 |
tatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaa |
325 |
Q |
|
|
|||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||| |||| |
|
|
T |
41813766 |
tatgaaataatatattaaatgatgaaggttattataggaaaa |
41813807 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 201 - 325
Target Start/End: Original strand, 38865944 - 38866067
Alignment:
Q |
201 |
actgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatatta |
300 |
Q |
|
|
||||||| ||||||||| |||| || |||||||||||||| ||| ||||| |||| | ||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
T |
38865944 |
actgtcattttcaaagtccaatacatcattaaatgttgttt-acctatattacccttggatatttgttgtagagagagaaatatatgtaatgagatatta |
38866042 |
T |
 |
Q |
301 |
aatgaataaggtcattatagtaaaa |
325 |
Q |
|
|
||||| |||||| ||||||| |||| |
|
|
T |
38866043 |
aatgattaaggttattatagaaaaa |
38866067 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 209 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 52978421 - 52978306
Alignment:
Q |
209 |
tttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata |
308 |
Q |
|
|
|||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | | || |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
52978421 |
tttcaaagttcaatttaatattaaatgttgttctacaagt-ttaccctttattatttattgtgtagagagaaatatatgaaaagagatattaaatgaata |
52978323 |
T |
 |
Q |
309 |
aggtcattatagtaaaa |
325 |
Q |
|
|
||| ||||||| |||| |
|
|
T |
52978322 |
aggctattatagaaaaa |
52978306 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 191 - 310
Target Start/End: Original strand, 20087206 - 20087325
Alignment:
Q |
191 |
ttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaa |
290 |
Q |
|
|
||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| || | |||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| |
|
|
T |
20087206 |
ttcctatttaactgttacttataaagtttaatgcaatgttaaatgttgttttattaatgttattcttatttatttattgcggagagagaaatatagaaaa |
20087305 |
T |
 |
Q |
291 |
tgagatattaaatgaataag |
310 |
Q |
|
|
| | ||||||||||| |||| |
|
|
T |
20087306 |
taatatattaaatgagtaag |
20087325 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 254 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 19731523 - 19731449
Alignment:
Q |
254 |
ccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagta |
328 |
Q |
|
|
|||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
19731523 |
ccttagatatttattgcggagagagaaacatttgaaatgaaatattaaattaataaggtcattatagtaaaagta |
19731449 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 181 - 303
Target Start/End: Original strand, 48087718 - 48087840
Alignment:
Q |
181 |
aaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaa |
280 |
Q |
|
|
||||||||| || || |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || ||| | ||||||| |||||||| |||||| || |
|
|
T |
48087718 |
aaattttttgtttttaattaactctcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgttgtttttcctataatacccttagtaatttattgcagagagaaaa |
48087817 |
T |
 |
Q |
281 |
atatatgaaatgagatattaaat |
303 |
Q |
|
|
||||||||||| |||||||||| |
|
|
T |
48087818 |
atatatgaaatatgatattaaat |
48087840 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 182 - 291
Target Start/End: Original strand, 17978090 - 17978198
Alignment:
Q |
182 |
aattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaa |
281 |
Q |
|
|
|||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| || ||||||||| | |
|
|
T |
17978090 |
aatttttttttccaatttaacattcactttcaaagttgaat-caacattaaatgttgttttaccaatattacccttagatatttaatgcggagagagaca |
17978188 |
T |
 |
Q |
282 |
tatatgaaat |
291 |
Q |
|
|
||||||||| |
|
|
T |
17978189 |
catatgaaat |
17978198 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 174 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 34925573 - 34925444
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtgga |
273 |
Q |
|
|
|||| ||||||||||| || || |||| ||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||| | | || ||||| |||||||||| || |
|
|
T |
34925573 |
tttgcagaaattttttgtttttaattaattgtcactttcaaaattcaatataacattaaatgttgttttaatattgttatccttgattatttattgcaga |
34925474 |
T |
 |
Q |
274 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaat |
303 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
34925473 |
aagagaaatatatgaaatgagatattaaat |
34925444 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 191 - 292
Target Start/End: Original strand, 38617846 - 38617947
Alignment:
Q |
191 |
ttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaa |
290 |
Q |
|
|
||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| |||| ||| |
|
|
T |
38617846 |
ttcctatttaattgtcactttcaaagtttaatgcaacattaaatattgttttatcaatattatccttatatatttattgcagagagaaaaacatattaaa |
38617945 |
T |
 |
Q |
291 |
tg |
292 |
Q |
|
|
|| |
|
|
T |
38617946 |
tg |
38617947 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 191 - 291
Target Start/End: Original strand, 8752170 - 8752270
Alignment:
Q |
191 |
ttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaa |
290 |
Q |
|
|
||||||||| | ||||| ||||||| || || |||| |||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
8752170 |
ttcctatttgattgtcaatttcaaattttaaagcaacattaaatgttattttagcaatattacccttagttatttattaaggagagagaaatatatgaaa |
8752269 |
T |
 |
Q |
291 |
t |
291 |
Q |
|
|
| |
|
|
T |
8752270 |
t |
8752270 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 185 - 325
Target Start/End: Original strand, 39308955 - 39309095
Alignment:
Q |
185 |
tttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatat |
284 |
Q |
|
|
||||| || ||| |||||||| | ||| ||||| ||||| | ||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| |
|
|
T |
39308955 |
tttttgtttctaattaactgtaatttttaaagtacaatgtatcattaaatgtagttttacctatattatccttatatatttattgcagagagagaaatat |
39309054 |
T |
 |
Q |
285 |
atgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaa |
325 |
Q |
|
|
||||||||| |||||||| | |||||| ||||||| |||| |
|
|
T |
39309055 |
atgaaatgaagtattaaattattaaggttattataggaaaa |
39309095 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 217 - 328
Target Start/End: Original strand, 36292672 - 36292783
Alignment:
Q |
217 |
ttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcatt |
316 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| ||| |
|
|
T |
36292672 |
ttcaatgcaacattaaatgttgttttatcaatattacttttagatatttaatgcggagagagaaacatatgaaatgaaatattaaattaataagacaatt |
36292771 |
T |
 |
Q |
317 |
atagtaaaagta |
328 |
Q |
|
|
||| |||||||| |
|
|
T |
36292772 |
ataataaaagta |
36292783 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 198 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 55430510 - 55430383
Alignment:
Q |
198 |
ttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagata |
297 |
Q |
|
|
||||||||| |||||||||||| || | ||||||||| |||||||| ||||| ||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| | || |
|
|
T |
55430510 |
ttaactgtcgttttcaaagttcattgtatcattaaatgtggttttacctatattatccttagatacttattgtgaagagataaatatatgaaattaagta |
55430411 |
T |
 |
Q |
298 |
ttaaatgaataaggtcattatagtaaaa |
325 |
Q |
|
|
|||||||| | |||| ||||||| |||| |
|
|
T |
55430410 |
ttaaatgattgaggttattataggaaaa |
55430383 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 209 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 7037129 - 7037047
Alignment:
Q |
209 |
tttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaat |
291 |
Q |
|
|
|||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
7037129 |
tttcaaagttcaatacaatattaaatattgctttacctgtattgcccttagttatttattatagagaaagaaatatatgaaat |
7037047 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 198 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 38009973 - 38009868
Alignment:
Q |
198 |
ttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagata |
297 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||| | ||||||| |||||||| |||||| || |||||||||| |||| |
|
|
T |
38009973 |
ttaactgtcactttcaaagttcaatgtaactttaaatgttgtttttcctataaagcccttagtaatttattggagagagaaaagtatatgaaatatgata |
38009874 |
T |
 |
Q |
298 |
ttaaat |
303 |
Q |
|
|
|||||| |
|
|
T |
38009873 |
ttaaat |
38009868 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 209 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 7037235 - 7037159
Alignment:
Q |
209 |
tttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatata |
285 |
Q |
|
|
|||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||||| | |||| ||||||||| |
|
|
T |
7037235 |
tttcaaagttcaatacaatattaaatattgttttacctatattgcccttaattatttattatagagaaagaaatata |
7037159 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 181 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 30152053 - 30151934
Alignment:
Q |
181 |
aaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaa |
280 |
Q |
|
|
||||||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| | || ||| || ||||| | |||||||| |||| |||| |
|
|
T |
30152053 |
aaattttttgtttctaattaagtgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatggtgttattcctataatgcccttaataatttattgcagagatagaa |
30151954 |
T |
 |
Q |
281 |
atatatgaaatgagatatta |
300 |
Q |
|
|
||||||||||| ||||||| |
|
|
T |
30151953 |
atatatgaaatatgatatta |
30151934 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 279 - 338
Target Start/End: Original strand, 42645379 - 42645438
Alignment:
Q |
279 |
aaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| |
|
|
T |
42645379 |
aaatatatgaaataagatattaaatgaataagatcattatggtaaaagtataacttattg |
42645438 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 182 - 325
Target Start/End: Original strand, 56486407 - 56486549
Alignment:
Q |
182 |
aattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaa |
281 |
Q |
|
|
|||||||||||| || |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||| | ||||| | ||| |||||||||| | | ||||| |
|
|
T |
56486407 |
aattttttattc-taattaattgtcattttcaaagttcaatacatcattaaatgttggtttatctatattacctttaaatatttattgtaaataaagaaa |
56486505 |
T |
 |
Q |
282 |
tatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaa |
325 |
Q |
|
|
||||| |||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||| |
|
|
T |
56486506 |
tatataaaatgaaatattaaatgattaaggttattgtagtaaaa |
56486549 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 198 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 8457118 - 8456996
Alignment:
Q |
198 |
ttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagata |
297 |
Q |
|
|
|||| ||||||||||||||||||||| || |||||| | |||| | | ||| || ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||| |
|
|
T |
8457118 |
ttaagtgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaagggtgttcttcttataatgcccttagtaatttattgcagagagagaaatatatgaaatatgata |
8457019 |
T |
 |
Q |
298 |
ttaaatgaataaggtcattatag |
320 |
Q |
|
|
|||||| | ||||| ||||||| |
|
|
T |
8457018 |
ttaaataattaaggatattatag |
8456996 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #130
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 146 - 301
Target Start/End: Original strand, 20294267 - 20294424
Alignment:
Q |
146 |
tactccttccatttctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgtttta |
243 |
Q |
|
|
|||||| ||| ||||||||||| ||| | |||| | || |||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| |
|
|
T |
20294267 |
tactccctccgtttctttttaattgtcacttttgcataatttttttgtttctaattaactatcactttcaaagttcaatacaacattaaatcttgttttg |
20294366 |
T |
 |
Q |
244 |
ccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaa |
301 |
Q |
|
|
| |||| || | ||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
20294367 |
tctttattacccgtgattatttattctagaaagagaaatatatgaaatgagatattaa |
20294424 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #131
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 185 - 325
Target Start/End: Original strand, 43086429 - 43086567
Alignment:
Q |
185 |
tttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatat |
284 |
Q |
|
|
|||||||| || |||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||| || |||| |||| ||||||| || |||||||||||| |
|
|
T |
43086429 |
tttttatttttaattaactgtgactttcaaagttcaatataacattaaatgttgtttttcctttattacccttgattattta--ctgcagagagaaatat |
43086526 |
T |
 |
Q |
285 |
atgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaa |
325 |
Q |
|
|
|||||| || ||||||||||| ||||| ||||||| |||| |
|
|
T |
43086527 |
atgaaaagaaatattaaatgatgaaggttattataggaaaa |
43086567 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #132
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 295 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 23621962 - 23621919
Alignment:
Q |
295 |
atattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
T |
23621962 |
atattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagtttattg |
23621919 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #133
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 229 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 25098423 - 25098341
Alignment:
Q |
229 |
ttaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagg |
311 |
Q |
|
|
||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |
|
|
T |
25098423 |
ttaaatgttgttttattaatattacccttgtttatttattacggagagagaaatgtatgaaataagatattaaataaataagg |
25098341 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #134
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 288 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 31984269 - 31984219
Alignment:
Q |
288 |
aaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |
|
|
T |
31984269 |
aaatgagatgttaaatgaataaggtcattacagtaaaagtataacttattg |
31984219 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #135
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 174 - 235
Target Start/End: Original strand, 17698581 - 17698642
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatg |
235 |
Q |
|
|
|||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |
|
|
T |
17698581 |
tttgaagaaattttttgtttctatttaattgtcacttttaaagttcaatgcaacattaaatg |
17698642 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #136
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 197 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 27654953 - 27654844
Alignment:
Q |
197 |
tttaactgtcactttcaaagttcaatgcaa-tattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgaga |
295 |
Q |
|
|
||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||| | ||||| |||||||||||||||| || || ||||||||||||||| | |
|
|
T |
27654953 |
tttaattgtcactttcaaagttcaacacaaatattaaattatgtgttatctatattacccttagttatttattgcagattgataaatatatgaaatgaaa |
27654854 |
T |
 |
Q |
296 |
tattaaatga |
305 |
Q |
|
|
|||||||||| |
|
|
T |
27654853 |
tattaaatga |
27654844 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #137
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 198 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 48510076 - 48509964
Alignment:
Q |
198 |
ttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagata |
297 |
Q |
|
|
||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| | |||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || |
|
|
T |
48510076 |
ttaactgtcgttttcaaagttcaatgtatcattaaatgtggctttacctatattactcttatatatttattgcatagagagaaatatatgaaatgaagta |
48509977 |
T |
 |
Q |
298 |
ttaaatgaataag |
310 |
Q |
|
|
|||||||| |||| |
|
|
T |
48509976 |
ttaaatgattaag |
48509964 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #138
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 251
Target Start/End: Original strand, 37987544 - 37987645
Alignment:
Q |
157 |
tttctttttaagtgttattt--ggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgca-----atattaaatgttgttttaccaata |
249 |
Q |
|
|
||||||| |||||||||||| | ||||| |||| |||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
37987544 |
tttctttctaagtgttatttttgaagaaaaattttgttcctatttaaccgtcatttttaaagttcaatgcaacattaaattaaatgttgttttaccaata |
37987643 |
T |
 |
Q |
250 |
tt |
251 |
Q |
|
|
|| |
|
|
T |
37987644 |
tt |
37987645 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #139
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 213 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 40592465 - 40592388
Alignment:
Q |
213 |
aaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaa |
290 |
Q |
|
|
||||||||||| ||||||| |||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |
|
|
T |
40592465 |
aaagttcaatgtgatattaattgtttttttatcaataatgtttttagttatttattgtaaagagagaaatagatgaaa |
40592388 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #140
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 194 - 231
Target Start/End: Original strand, 42645340 - 42645377
Alignment:
Q |
194 |
ctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatatta |
231 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
T |
42645340 |
ctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacatta |
42645377 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #141
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 311
Target Start/End: Original strand, 6129008 - 6129115
Alignment:
Q |
203 |
tgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaa |
302 |
Q |
|
|
|||||||||||| |||||||||| ||||| | ||| |||| ||||| | ||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||||| ||| |||| |
|
|
T |
6129008 |
tgtcactttcaagtttcaatgcaacattaattattggtttatcaataatacccttatctatttattgtagagagagaaata-atggaatgaaataataaa |
6129106 |
T |
 |
Q |
303 |
tgaataagg |
311 |
Q |
|
|
||| ||||| |
|
|
T |
6129107 |
tgattaagg |
6129115 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #142
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 174 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 31984332 - 31984296
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactt |
210 |
Q |
|
|
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
31984332 |
tttggagaaattttttgttcctatttaactgtcactt |
31984296 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #143
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 209 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 51655068 - 51654952
Alignment:
Q |
209 |
tttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata |
308 |
Q |
|
|
||||||||| ||||| | ||||||||| | |||| | ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| | || |
|
|
T |
51655068 |
tttcaaagtccaatgtatcattaaatgtggctttatctatattacccttatatatttattgctgagagagaaatatatggaatgaactattaaattatta |
51654969 |
T |
 |
Q |
309 |
aggtcattatagtaaaa |
325 |
Q |
|
|
|||| |||| ||||||| |
|
|
T |
51654968 |
aggttattacagtaaaa |
51654952 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #144
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 272 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 13435294 - 13435247
Alignment:
Q |
272 |
gagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattata |
319 |
Q |
|
|
|||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| |
|
|
T |
13435294 |
gagaaagaaatatatgaaatgagatattaaattaataatgttattata |
13435247 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #145
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 203 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 19692940 - 19692819
Alignment:
Q |
203 |
tgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaa |
302 |
Q |
|
|
|||||||||||| |||||||||| ||||| | ||| |||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||| ||| |||| |
|
|
T |
19692940 |
tgtcactttcaagtttcaatgcaacattaattattggtttatcaataacacccttacttatttattgtagagagagaaata-atagaatgaaataataaa |
19692842 |
T |
 |
Q |
303 |
tgaataaggtcattatagtaaaa |
325 |
Q |
|
|
||| ||||| ||||||| |||| |
|
|
T |
19692841 |
tgagtaaggatattatagaaaaa |
19692819 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #146
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 203 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 19703525 - 19703404
Alignment:
Q |
203 |
tgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaa |
302 |
Q |
|
|
|||||||||||| |||||||||| ||||| | ||| |||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||| ||| |||| |
|
|
T |
19703525 |
tgtcactttcaagtttcaatgcaacattaattattggtttatcaataacacccttacttatttattgtagagagagaaata-atagaatgaaataataaa |
19703427 |
T |
 |
Q |
303 |
tgaataaggtcattatagtaaaa |
325 |
Q |
|
|
||| ||||| ||||||| |||| |
|
|
T |
19703426 |
tgagtaaggatattatagaaaaa |
19703404 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #147
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 273 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 53467684 - 53467650
Alignment:
Q |
273 |
agagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaat |
307 |
Q |
|
|
|||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
53467684 |
agagagaagtatatgaaatgagatattaaatgaat |
53467650 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #148
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 262 - 291
Target Start/End: Original strand, 44173678 - 44173707
Alignment:
Q |
262 |
atttattgtggagagagaaatatatgaaat |
291 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
44173678 |
atttattgtggagagagaaatatatgaaat |
44173707 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #149
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 202 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 1615308 - 1615268
Alignment:
Q |
202 |
ctgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgtttt |
242 |
Q |
|
|
|||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
1615308 |
ctgtcactttcaaatttcaatacaacattaaatgttgtttt |
1615268 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #150
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 187 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 2285697 - 2285584
Alignment:
Q |
187 |
tttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatat |
286 |
Q |
|
|
|||||| | ||||| ||||| |||||||||| ||||| || |||| | ||||||| |||| | |||||||||||||| || |||||||||| ||| |
|
|
T |
2285697 |
tttatttcgatttatctgtctttttcaaagtttaatgcgatgttaactattgttttgtcaatgatagccttagttatttatcgt--agagagaaatttat |
2285600 |
T |
 |
Q |
287 |
gaaatgagatattaaa |
302 |
Q |
|
|
|| ||||||||||||| |
|
|
T |
2285599 |
gacatgagatattaaa |
2285584 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8 (Bit Score: 145; Significance: 3e-76; HSPs: 116)
Name: chr8
Description:
Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 174 - 338
Target Start/End: Original strand, 34981839 - 34982003
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtgga |
273 |
Q |
|
|
|||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
T |
34981839 |
tttggagaaattttttgttcctacttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcgga |
34981938 |
T |
 |
Q |
274 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
34981939 |
gagagaaatacatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
34982003 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 146 - 338
Target Start/End: Original strand, 23429889 - 23430083
Alignment:
Q |
146 |
tactccttccatttctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgtttta |
243 |
Q |
|
|
|||||| ||| || |||||||||||| | |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
23429889 |
tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaaatttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta |
23429988 |
T |
 |
Q |
244 |
ccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
|||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
23429989 |
ccaatattatccttagttatttattgcagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
23430083 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 146 - 338
Target Start/End: Original strand, 14263524 - 14263718
Alignment:
Q |
146 |
tactccttccatttctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgtttta |
243 |
Q |
|
|
|||||| ||| || |||||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
14263524 |
tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaaatttttgttcctatttaactgtcactttaaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta |
14263623 |
T |
 |
Q |
244 |
ccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
|||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
T |
14263624 |
ccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattg |
14263718 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 146 - 338
Target Start/End: Original strand, 34046831 - 34047025
Alignment:
Q |
146 |
tactccttccatttctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgtttta |
243 |
Q |
|
|
|||||| ||| || |||||||||||| | ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |
|
|
T |
34046831 |
tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttagagaaattttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatattgtttta |
34046930 |
T |
 |
Q |
244 |
ccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
T |
34046931 |
ccaatattgtccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagtttattg |
34047025 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 186 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 38483010 - 38482858
Alignment:
Q |
186 |
ttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatata |
285 |
Q |
|
|
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
38483010 |
ttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatata |
38482911 |
T |
 |
Q |
286 |
tgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
38482910 |
tgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
38482858 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 146 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 39303776 - 39303582
Alignment:
Q |
146 |
tactccttccatttctttttaagtgttattt--ggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgtttta |
243 |
Q |
|
|
|||||| ||| || |||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
39303776 |
tactccctccgttcctttttaagtgtcatttttggagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcgaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta |
39303677 |
T |
 |
Q |
244 |
ccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
39303676 |
ccaatattgtctttagttttttattgcggagagagaaatatatgatataagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
39303582 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 147 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 33935319 - 33935126
Alignment:
Q |
147 |
actccttccatttctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttac |
244 |
Q |
|
|
||||| ||| || |||||||||||||| |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |
|
|
T |
33935319 |
actccctccgttcctttttaagtgttacttttgaagaaaatttttgttcctatttaactgtcactttcaaagtttaatgcaacattaaatattgttttac |
33935220 |
T |
 |
Q |
245 |
caatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
T |
33935219 |
caatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaattatagcttattg |
33935126 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 160 - 338
Target Start/End: Original strand, 9954643 - 9954823
Alignment:
Q |
160 |
ctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtcctt |
257 |
Q |
|
|
|||||||||||| | |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
9954643 |
ctttttaagtgtcacttttggagaaaaatttagttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtcctt |
9954742 |
T |
 |
Q |
258 |
agttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |
|
|
T |
9954743 |
agttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatggtaaaagtataacttattg |
9954823 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 186 - 336
Target Start/End: Original strand, 4057310 - 4057460
Alignment:
Q |
186 |
ttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatata |
285 |
Q |
|
|
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
4057310 |
ttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttaattatttattgcggagagagaaatata |
4057409 |
T |
 |
Q |
286 |
tgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttat |
336 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
4057410 |
tgaaatgagatattaaattaataagatcattatagtaaaagtatagcttat |
4057460 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 160 - 338
Target Start/End: Original strand, 26062702 - 26062881
Alignment:
Q |
160 |
ctttttaagtgttatttggagaaa--ttttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtcctt |
257 |
Q |
|
|
|||||||||||| |||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
26062702 |
ctttttaagtgtcatttttagaaaatttttttgttcctatttaactgtcactttcgaagttcaatgcaacattaa-tgttgttttaccaatattgtcctt |
26062800 |
T |
 |
Q |
258 |
agttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
T |
26062801 |
agttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaatatagcttattg |
26062881 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 174 - 338
Target Start/End: Original strand, 35052063 - 35052227
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtgga |
273 |
Q |
|
|
|||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |
|
|
T |
35052063 |
tttggagaaaaaatttgttcatatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttatttatttattgtgga |
35052162 |
T |
 |
Q |
274 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
35052163 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaataaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
35052227 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 146 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 25813008 - 25812815
Alignment:
Q |
146 |
tactccttccatttctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgtttta |
243 |
Q |
|
|
|||||| ||| || |||||||||||| | |||| |||||| |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
25813008 |
tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttgaagaaatattttgttcctatttaactggcattttcaaagttcaatgcagcattaaatgttgtttta |
25812909 |
T |
 |
Q |
244 |
ccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
25812908 |
ccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatga-atattaaatgaataagttcattatagtaaaagtatagcttattg |
25812815 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 174 - 338
Target Start/End: Original strand, 40228305 - 40228469
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtgga |
273 |
Q |
|
|
|||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |
|
|
T |
40228305 |
tttggagaaaaaatttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgttgttttaccaatattattcttagttatttattgtgga |
40228404 |
T |
 |
Q |
274 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
T |
40228405 |
gagagaaatatatgaaatgacatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtacagcttattg |
40228469 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 146 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 25703837 - 25703644
Alignment:
Q |
146 |
tactccttccatttctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgtttta |
243 |
Q |
|
|
|||||| ||| || |||||||||||| | |||| |||||| |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |
|
|
T |
25703837 |
tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttgaagaaatattttgttcctatttaactggcattttcaaagttcaatgcagcattaaatgttatttta |
25703738 |
T |
 |
Q |
244 |
ccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
25703737 |
ccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatga-atattaaatgaataagatcattatagtaaaagtatagcttattg |
25703644 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 184 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 14228541 - 14228390
Alignment:
Q |
184 |
ttttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaata |
283 |
Q |
|
|
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
T |
14228541 |
ttttttcttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttaccaatattatcctt-gttatttattgcggagagagaaata |
14228443 |
T |
 |
Q |
284 |
tatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttat |
336 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
14228442 |
tatgaaatgaaatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttat |
14228390 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 174 - 338
Target Start/End: Original strand, 18291474 - 18291637
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtgga |
273 |
Q |
|
|
|||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| |
|
|
T |
18291474 |
tttgaagaaattttttgttgctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatattgttttacca-tattatccttagttatttattacgga |
18291572 |
T |
 |
Q |
274 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
T |
18291573 |
gagagaaatatatgaaatgaaatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattg |
18291637 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 160 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 21651992 - 21651822
Alignment:
Q |
160 |
ctttttaagtgt--tatttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtcctt |
257 |
Q |
|
|
|||||||||||| | |||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
T |
21651992 |
ctttttaagtgtcttttttgaagaaattttttgttcctatttaaccgccacttttaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcctt |
21651893 |
T |
 |
Q |
258 |
agttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagta |
328 |
Q |
|
|
|||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
21651892 |
agttatttattgcggaaagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagta |
21651822 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 146 - 341
Target Start/End: Original strand, 2335413 - 2335610
Alignment:
Q |
146 |
tactccttccatttctttttaagtgttattt--ggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgtttta |
243 |
Q |
|
|
|||||| ||| || |||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |
|
|
T |
2335413 |
tactccatccgttcctttttaagtgtcatttttggagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgtttta |
2335512 |
T |
 |
Q |
244 |
ccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgtat |
341 |
Q |
|
|
|||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
T |
2335513 |
ccaacattacccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgactaagactattatagtaaaagtatagattattgtat |
2335610 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 191 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 45281590 - 45281444
Alignment:
Q |
191 |
ttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaa |
290 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
T |
45281590 |
ttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttgccaatattatccttagttatttattgtggagagggaaatatatgaaa |
45281491 |
T |
 |
Q |
291 |
tgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
|| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |
|
|
T |
45281490 |
tg-gatattaaatgaataaggtgattatagtaaaagtatagtttattg |
45281444 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 145 - 323
Target Start/End: Original strand, 13327758 - 13327938
Alignment:
Q |
145 |
ttactccttccatttctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgtttt |
242 |
Q |
|
|
||||||| ||| || |||||||||||| | |||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
13327758 |
ttactccatccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaaaattttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttt |
13327857 |
T |
 |
Q |
243 |
accaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaa |
323 |
Q |
|
|
|||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
T |
13327858 |
gccaatattatctttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaataaataaggtcattatagtaa |
13327938 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 160 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 23848802 - 23848622
Alignment:
Q |
160 |
ctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtcctt |
257 |
Q |
|
|
|||||||||||| | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
T |
23848802 |
ctttttaagtgtcacttttggagaaaaattttgttcctatttaactgtcactttcaaaatttaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcctt |
23848703 |
T |
 |
Q |
258 |
agttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |
|
|
T |
23848702 |
ggttatttattgcggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgaataaggtcattataataaaaatatagtttattg |
23848622 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 146 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 167737 - 167554
Alignment:
Q |
146 |
tactccttccatttctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgtttta |
243 |
Q |
|
|
|||||| ||| ||||||||||||||| | |||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
167737 |
tactccctccgtttctttttaagtgtcacttttggagaaaaattttgttttaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta |
167638 |
T |
 |
Q |
244 |
ccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagt |
327 |
Q |
|
|
|||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |
|
|
T |
167637 |
ccaatattatccttagttatttattgtggagagataaatatataaaatgagatattaaattaataaggttattatagtaaaagt |
167554 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 194 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 9808184 - 9808040
Alignment:
Q |
194 |
ctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatga |
293 |
Q |
|
|
|||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
9808184 |
ctatttaactctcattttcaaagttcaatacaatattaaatgttgttttactaatattgtcattagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatga |
9808085 |
T |
 |
Q |
294 |
gatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |
|
|
T |
9808084 |
gatattaaatgaataaggtcattataataaaagtataacttattg |
9808040 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 174 - 338
Target Start/End: Original strand, 10180380 - 10180544
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtgga |
273 |
Q |
|
|
|||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |
|
|
T |
10180380 |
tttgaagaaattttttgttcctatttaattgtcactttcaaagtttaatgcaacattaaacgttattttaccaatattatctttagttatttattgcgga |
10180479 |
T |
 |
Q |
274 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |
|
|
T |
10180480 |
gaaagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtacaacttattg |
10180544 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 174 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 12342844 - 12342680
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtgga |
273 |
Q |
|
|
|||| ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| || ||| ||||||||| ||| |
|
|
T |
12342844 |
tttgaagaaattttttgtttctatttaactatcactttcaaagttcaatgcaacattaaatattgttttaccaatattatctttaactatttattgcgga |
12342745 |
T |
 |
Q |
274 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |
|
|
T |
12342744 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtacaacttattg |
12342680 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 174 - 338
Target Start/End: Original strand, 36058243 - 36058406
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtgga |
273 |
Q |
|
|
|||| ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || |
|
|
T |
36058243 |
tttgaagaaattttttgtttctatttaactatcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttac-aatattatccttagttatttattgctga |
36058341 |
T |
 |
Q |
274 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||| |
|
|
T |
36058342 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaagtacaacttattg |
36058406 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 184 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 43642209 - 43642063
Alignment:
Q |
184 |
ttttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaata |
283 |
Q |
|
|
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| |
|
|
T |
43642209 |
ttttttcttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttaccaatattatccttagttatttattgcggggagagaaata |
43642110 |
T |
 |
Q |
284 |
tatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtata |
330 |
Q |
|
|
|||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
43642109 |
tatgaaattagatgttaaaagaataaggtcattatagtaaaagtata |
43642063 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 189 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 15647614 - 15647466
Alignment:
Q |
189 |
tattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatga |
288 |
Q |
|
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
15647614 |
tattcctttttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgatgttttatcaatattacccttaattatttattgcggagagagaaatatatga |
15647515 |
T |
 |
Q |
289 |
aatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttatt |
337 |
Q |
|
|
||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
T |
15647514 |
aataagatattaaatgaataatgtcattatagtaaaagtataacttatt |
15647466 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 146 - 338
Target Start/End: Original strand, 16656681 - 16656874
Alignment:
Q |
146 |
tactccttccatttctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgtttta |
243 |
Q |
|
|
|||||| ||| ||||||||||||||| | |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
16656681 |
tactccctccgtttctttttaagtgtcacttttggagaaaaaatttgttctcatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaaaattaaatgttgtttta |
16656780 |
T |
 |
Q |
244 |
ccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
||||||| | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
T |
16656781 |
gcaatattattcttagttatt-attgcggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgaataagttcattatagtaaaagtatagtttattg |
16656874 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 196 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 12248978 - 12248832
Alignment:
Q |
196 |
atttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgaga |
295 |
Q |
|
|
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||| | |
|
|
T |
12248978 |
atttaactgtcactttcgaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattatccttgcttatttattgtggagaaagaaatatataaaatgaaa |
12248879 |
T |
 |
Q |
296 |
tattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgtatc |
342 |
Q |
|
|
||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
T |
12248878 |
tattaaatgaataaggttattatagtaaaagtatatattattgtatc |
12248832 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 197 - 342
Target Start/End: Original strand, 3513390 - 3513535
Alignment:
Q |
197 |
tttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagat |
296 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
3513390 |
tttaactgtcactttcaaagtttaatgcaacattaaatgttgttttacctatattatcattagttatttattacagagagataaatatatgaaatgagat |
3513489 |
T |
 |
Q |
297 |
attaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgtatc |
342 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
3513490 |
attaaatgaataaggtcattatagtaaatgtatagcttattgtatc |
3513535 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 146 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 11707741 - 11707559
Alignment:
Q |
146 |
tactccttccatttctttttaagtgttatttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttacc |
245 |
Q |
|
|
|||||| ||| || |||||||||||| ||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | |
|
|
T |
11707741 |
tactccctccgttcctttttaagtgtc--ttggagattttttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgatgttttatc |
11707644 |
T |
 |
Q |
246 |
aatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtata |
330 |
Q |
|
|
|||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
11707643 |
aatattacccttaattatttattgcggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgaataaagtcattatagtaaaagtata |
11707559 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 174 - 330
Target Start/End: Original strand, 6750625 - 6750781
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtgga |
273 |
Q |
|
|
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| |
|
|
T |
6750625 |
tttggagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacattacccttagttatttattacgga |
6750724 |
T |
 |
Q |
274 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtata |
330 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
6750725 |
gagagaaatatatgaaataagatattaaatgactaagactattatagtaaaagtata |
6750781 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 174 - 330
Target Start/End: Original strand, 6757416 - 6757572
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtgga |
273 |
Q |
|
|
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| |
|
|
T |
6757416 |
tttggagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacattacccttagttatttattacgga |
6757515 |
T |
 |
Q |
274 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtata |
330 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
6757516 |
gagagaaatatatgaaataagatattaaatgactaagactattatagtaaaagtata |
6757572 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 174 - 338
Target Start/End: Original strand, 15596354 - 15596518
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtgga |
273 |
Q |
|
|
||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| ||||||| | ||| |||||||||| ||| |
|
|
T |
15596354 |
tttggagaatttttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgtaaaattaaatgatgttttatcaatattacctttaattatttattgcgga |
15596453 |
T |
 |
Q |
274 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
T |
15596454 |
gagagaaatatatgaaataagatattaaatgaataaggttattatagtaaaagtataacttattg |
15596518 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 189 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 15623826 - 15623678
Alignment:
Q |
189 |
tattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatga |
288 |
Q |
|
|
||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
15623826 |
tattcctttttaaccgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgatgttttatcaatattacccttaattatttattgcggagagagaaatatatga |
15623727 |
T |
 |
Q |
289 |
aatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttatt |
337 |
Q |
|
|
||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
T |
15623726 |
aataagatattaaatgaataatgtcattatagtaaaagtataacttatt |
15623678 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 146 - 342
Target Start/End: Original strand, 12763415 - 12763612
Alignment:
Q |
146 |
tactccttccatttctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgtttta |
243 |
Q |
|
|
|||||||||| || |||||||||||| | ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
12763415 |
tactccttccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaatttttgtttca-atttaaccgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta |
12763513 |
T |
 |
Q |
244 |
ccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgtatc |
342 |
Q |
|
|
||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
T |
12763514 |
tcaatattacccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataatgatattatagtaaaagtatcaattattgtatc |
12763612 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 160 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 16701139 - 16700989
Alignment:
Q |
160 |
ctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtcctt |
257 |
Q |
|
|
|||||||||||| | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
T |
16701139 |
ctttttaagtgtcacttttggagaaaaattttgttcctatttaactgtcacttttaaagttcaatacaatattaaatgttgttttaccaatattatcctt |
16701040 |
T |
 |
Q |
258 |
agttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata |
308 |
Q |
|
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
16701039 |
agttatttattgcggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgaata |
16700989 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 186 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 40604069 - 40603918
Alignment:
Q |
186 |
ttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatata |
285 |
Q |
|
|
|||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| ||||||| |
|
|
T |
40604069 |
ttttgttcctatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttaccaatattatccttaattatttattgcggagagataaatata |
40603970 |
T |
 |
Q |
286 |
tgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttatt |
337 |
Q |
|
|
|||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| |
|
|
T |
40603969 |
tgaaatgaaatattaaatgaataaggtcatcatagtaaaagtttagtttatt |
40603918 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 180 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 1202668 - 1202510
Alignment:
Q |
180 |
gaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagaga |
279 |
Q |
|
|
|||| ||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| |
|
|
T |
1202668 |
gaaaatttttgttcatatttaactgtcacttttaaagtttaatgcaacattaaatattgttttatcaatattgtctttagttatttattgcggaaagaga |
1202569 |
T |
 |
Q |
280 |
aatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
T |
1202568 |
aatatataaaataagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattg |
1202510 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 174 - 328
Target Start/End: Original strand, 17718513 - 17718667
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtgga |
273 |
Q |
|
|
|||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||| |
|
|
T |
17718513 |
tttggataaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaacgttgttttaccaatattacccttagatatttattgcgga |
17718612 |
T |
 |
Q |
274 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagta |
328 |
Q |
|
|
|| ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
17718613 |
gaaagaaacatatgaaatgaaatattaaattaataaggccattatagtaaaagta |
17718667 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 200 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 32010288 - 32010158
Alignment:
Q |
200 |
aactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatatt |
299 |
Q |
|
|
|||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
T |
32010288 |
aactgtcactttcaaatttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattattcttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatgtt |
32010189 |
T |
 |
Q |
300 |
aaatgaataaggtcattatagtaaaagtata |
330 |
Q |
|
|
||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
32010188 |
aaatgaacaaggtcattatagtaaaagtata |
32010158 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 195 - 338
Target Start/End: Original strand, 1245343 - 1245486
Alignment:
Q |
195 |
tatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgag |
294 |
Q |
|
|
||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||| |
|
|
T |
1245343 |
tatttaattgtcattttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttaccaatattatccttaattatttattgtggagtgaaaaatatatgaaatgag |
1245442 |
T |
 |
Q |
295 |
atattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
T |
1245443 |
aatttaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattg |
1245486 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 160 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 38128786 - 38128613
Alignment:
Q |
160 |
ctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtcctt |
257 |
Q |
|
|
|||||||||||| | |||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
T |
38128786 |
ctttttaagtgtcacttttggagaaaaattttgtttctatttaactgtcactttcaa-------tgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcctt |
38128694 |
T |
 |
Q |
258 |
agttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
38128693 |
agttatttactacggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
38128613 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 146 - 338
Target Start/End: Original strand, 11993873 - 11994055
Alignment:
Q |
146 |
tactccttccatttctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgtttta |
243 |
Q |
|
|
|||||| |||||| |||||||||||| | |||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
11993873 |
tactccatccattcctttttaagtgtcacttttggagaaaaattttgtttctatttaactgtcactttcaaagtttaatgcaacattaaatgttgtttta |
11993972 |
T |
 |
Q |
244 |
ccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
11993973 |
ccaatattgtccttagttatttatagcggagagagaaat------------atattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
11994055 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 145 - 326
Target Start/End: Original strand, 33314522 - 33314706
Alignment:
Q |
145 |
ttactccttccatttctttttaagtgtta---tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttt |
241 |
Q |
|
|
||||||| ||| || ||||||||||||| |||| ||||||||||| || | |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
T |
33314522 |
ttactccgtccgttcctttttaagtgtttctttttgaagaaattttttgtttccatttgactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttt |
33314621 |
T |
 |
Q |
242 |
taccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaag |
326 |
Q |
|
|
||| | ||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
33314622 |
tactagtatgatccttaattatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaagtcattatagtaaaag |
33314706 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 145 - 329
Target Start/End: Original strand, 7483723 - 7483907
Alignment:
Q |
145 |
ttactccttccatttctttttaagtgttattt--ggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgtttt |
242 |
Q |
|
|
||||||| ||| || |||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |
|
|
T |
7483723 |
ttactccatccgttcctttttaagtgtcatttttggagaaattttttgttcctatttcactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgtttt |
7483822 |
T |
 |
Q |
243 |
accaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtat |
329 |
Q |
|
|
||||| ||| ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
7483823 |
accaacattacccttaattatttattatg--gagagaaatatatgaaataagatattaaatgactaaggctattatagtaaaagtat |
7483907 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 174 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 8731057 - 8730892
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtgga |
273 |
Q |
|
|
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| ||| |
|
|
T |
8731057 |
tttggagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacattacccttag-tatttattgcgga |
8730959 |
T |
 |
Q |
274 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgtat |
341 |
Q |
|
|
|||||||||||||| ||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
T |
8730958 |
gagagaaatatatg-aataagataataaatgattaaggctattatagtaaaagtataaattattgtat |
8730892 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 178 - 328
Target Start/End: Original strand, 13173943 - 13174093
Alignment:
Q |
178 |
gagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagaga |
277 |
Q |
|
|
|||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||| |
|
|
T |
13173943 |
gagaaagtttttgttcctatttaactgtcacttttaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttactaacattacccttagttatttattgcggagaga |
13174042 |
T |
 |
Q |
278 |
gaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagta |
328 |
Q |
|
|
|||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
13174043 |
gaaatatatgaaataagatattaaatgactaaggctattatagtaaaagta |
13174093 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 196 - 342
Target Start/End: Original strand, 43553071 - 43553217
Alignment:
Q |
196 |
atttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgaga |
295 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |
|
|
T |
43553071 |
atttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaacgttgttttatcaatattacccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgaaa |
43553170 |
T |
 |
Q |
296 |
tattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgtatc |
342 |
Q |
|
|
|||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
T |
43553171 |
tattaaatgaataaggatattatagtaaaagtatcaattattgtatc |
43553217 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 174 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 7606127 - 7605965
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtgga |
273 |
Q |
|
|
|||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| || | |
|
|
T |
7606127 |
tttgaagaaattttttgttcttatttaactgtcacttttcaagttcaatacaatattaaatgttattttaccaatattatccttaattatttatggt--a |
7606030 |
T |
 |
Q |
274 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
T |
7606029 |
gagagaaatatatgaaattagatgttaaataaataagatcattatagtaaaagtataacttattg |
7605965 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 174 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 27518937 - 27518779
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtgga |
273 |
Q |
|
|
|||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||| |
|
|
T |
27518937 |
tttgaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatacaacattaaatgttatttta------ttatccttagttatttattgcgga |
27518844 |
T |
 |
Q |
274 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| | ||||||| |
|
|
T |
27518843 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaataaataaagtcattatagtaacagtacaacttattg |
27518779 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 179 - 328
Target Start/End: Original strand, 35296059 - 35296208
Alignment:
Q |
179 |
agaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagag |
278 |
Q |
|
|
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| | ||| | |||||||||||||| |||||||| |
|
|
T |
35296059 |
agaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatattgttttaccgacattacctttagttatttattgcggagagag |
35296158 |
T |
 |
Q |
279 |
aaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagta |
328 |
Q |
|
|
||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
35296159 |
aaatatatgaaataagatattaaatgattaaggctattatagtaaaagta |
35296208 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 181 - 328
Target Start/End: Original strand, 3720697 - 3720844
Alignment:
Q |
181 |
aaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaa |
280 |
Q |
|
|
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || || ||||||||| ||||||||| |
|
|
T |
3720697 |
aaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattactctaagatatttattgcagagagagaa |
3720796 |
T |
 |
Q |
281 |
atatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagta |
328 |
Q |
|
|
| ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
3720797 |
acatatgaaatgaaatattaaattaataaggctattatagtaaaagta |
3720844 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 198 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 27911878 - 27911748
Alignment:
Q |
198 |
ttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagata |
297 |
Q |
|
|
|||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||| ||| |
|
|
T |
27911878 |
ttaattgtcactttcaaagttccatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgcccttagatatttattgcggagagagaaacatataaaatgaaata |
27911779 |
T |
 |
Q |
298 |
ttaaatgaataaggtcattatagtaaaagta |
328 |
Q |
|
|
|||||| ||||||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
27911778 |
ttaaattaataaggccattatagtaaaagta |
27911748 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 198 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 27958297 - 27958167
Alignment:
Q |
198 |
ttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagata |
297 |
Q |
|
|
|||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||| ||| |
|
|
T |
27958297 |
ttaattgtcactttcaaagttccatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgcccttagatatttattgcggagagagaaacatataaaatgaaata |
27958198 |
T |
 |
Q |
298 |
ttaaatgaataaggtcattatagtaaaagta |
328 |
Q |
|
|
|||||| ||||||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
27958197 |
ttaaattaataaggccattatagtaaaagta |
27958167 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 160 - 342
Target Start/End: Original strand, 18842524 - 18842707
Alignment:
Q |
160 |
ctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtcctt |
257 |
Q |
|
|
|||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| |
|
|
T |
18842524 |
ctttttaagtgtcacttttggagaatttttttgttcctatttaagtgtcactttactagttcaatgcaatattaaatgttattttactaatattaccctt |
18842623 |
T |
 |
Q |
258 |
agttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgtatc |
342 |
Q |
|
|
| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| || | |||||||||| |
|
|
T |
18842624 |
atttatt-attgtggagagagaaatatatgtaatgagatattaaataaataaggttattatagtaaaaataaaaattattgtatc |
18842707 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 195 - 328
Target Start/End: Original strand, 31028685 - 31028818
Alignment:
Q |
195 |
tatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgag |
294 |
Q |
|
|
||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |
|
|
T |
31028685 |
tatttaactgtcactttaaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattacccttagatgtttattgcggagagagaaacatatgaaatgaa |
31028784 |
T |
 |
Q |
295 |
atattaaatgaataaggtcattatagtaaaagta |
328 |
Q |
|
|
| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
31028785 |
acattaaattaataaggtcattatagtaaaagta |
31028818 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 174 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 43553473 - 43553318
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtgga |
273 |
Q |
|
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||| |
|
|
T |
43553473 |
tttggagaaattttttgttcctatttaactgtcattttcgaagttcaatgcaacattaaatattattttaccaatattatccttacttatttattacgga |
43553374 |
T |
 |
Q |
274 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtat |
329 |
Q |
|
|
||||||||| |||||| | || ||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
43553373 |
gagagaaatgtatgaagttagtgcttaaatgaataaggttattatagtaaaagtat |
43553318 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 191 - 329
Target Start/End: Original strand, 35051873 - 35052011
Alignment:
Q |
191 |
ttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaa |
290 |
Q |
|
|
||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| |
|
|
T |
35051873 |
ttcctctttaactgtcactttcgaagttcaatgcaacattaaatattgttttaccaatattatccttacttatttattacggagagagaaatgtatgaaa |
35051972 |
T |
 |
Q |
291 |
tgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtat |
329 |
Q |
|
|
| || |||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
35051973 |
ttagtgattaaatgaataaggttattatagtaaaagtat |
35052011 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 174 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 40521473 - 40521337
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtgga |
273 |
Q |
|
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||| ||| |
|
|
T |
40521473 |
tttggagaaatttttt-ttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattacctttaaatatttattgcgga |
40521375 |
T |
 |
Q |
274 |
gagagaa--atatatgaaatgagatattaaatgaataa |
309 |
Q |
|
|
||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| |
|
|
T |
40521374 |
gagagaaacatatatgaaatgaaatattaaattaataa |
40521337 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 188 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 26740353 - 26740213
Alignment:
Q |
188 |
ttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatg |
287 |
Q |
|
|
||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||| |
|
|
T |
26740353 |
ttatttctatttaactctcacttttaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattacccttagatatttattgcggagaaagaaacatatg |
26740254 |
T |
 |
Q |
288 |
aaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagta |
328 |
Q |
|
|
|||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
26740253 |
aaatgaaatattaaattaataaggctattatagtaaaagta |
26740213 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 196 - 342
Target Start/End: Original strand, 23855590 - 23855735
Alignment:
Q |
196 |
atttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgaga |
295 |
Q |
|
|
||||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |
|
|
T |
23855590 |
atttaaccgtcactttcaaagtttattgcaacattaaatgttgttt-atcaatattacccttagttatttattgtggagagataaatatataaaatgaga |
23855688 |
T |
 |
Q |
296 |
tattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgtatc |
342 |
Q |
|
|
|||||||| |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |
|
|
T |
23855689 |
tattaaataaataaggttattatagtaaaagtatgacgtattgtatc |
23855735 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 193 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 2456321 - 2456181
Alignment:
Q |
193 |
cctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatg |
292 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||| ||| |||| | ||||||||||||| |||| |
|
|
T |
2456321 |
cctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcttta---attaattgcg--gagagaaatatataaaata |
2456227 |
T |
 |
Q |
293 |
agatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |
|
|
T |
2456226 |
aaatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtacaacttattg |
2456181 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 194 - 341
Target Start/End: Original strand, 19972309 - 19972456
Alignment:
Q |
194 |
ctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatga |
293 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | |
|
|
T |
19972309 |
ctatttaactgtcactttcaaaattcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacattacccttagttatttattacagagagagaaatatattaaataa |
19972408 |
T |
 |
Q |
294 |
gatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgtat |
341 |
Q |
|
|
||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
T |
19972409 |
gatattaaacgactaaggctattatagtaaaagtataaattattgtat |
19972456 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 194 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 21020524 - 21020377
Alignment:
Q |
194 |
ctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatga |
293 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | |
|
|
T |
21020524 |
ctatttaactgtcactttcaaaattcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacattacccttagttatttattacagagagagaaatatattaaataa |
21020425 |
T |
 |
Q |
294 |
gatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgtat |
341 |
Q |
|
|
||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
T |
21020424 |
gatattaaacgactaaggctattatagtaaaagtataaattattgtat |
21020377 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 181 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 23793498 - 23793351
Alignment:
Q |
181 |
aaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaa |
280 |
Q |
|
|
|||| |||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| || |
|
|
T |
23793498 |
aaatattttgtttctatttaattgtcattttcaaagttcaatgtaacattgaatgttgttttaccaatattatccttagatatttattacggagagaaaa |
23793399 |
T |
 |
Q |
281 |
atatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagta |
328 |
Q |
|
|
| |||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
23793398 |
acatataaaatgaaatattaaattaataaggtcattatagtaaaagta |
23793351 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 174 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 2888698 - 2888530
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcacttt-caaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtgg |
272 |
Q |
|
|
||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||| ||||||| |
|
|
T |
2888698 |
tttggagaatttttttgttcctatttaagtgtcactttacatagttcaatgcaacattaaatgttactttactaatattacccttatttatt-attgtgg |
2888600 |
T |
 |
Q |
273 |
agagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgtatc |
342 |
Q |
|
|
||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| || | |||||||||| |
|
|
T |
2888599 |
agagagaaatatatgtaatgagatattaaataaataaggttattaaagtaaaaatagaaattattgtatc |
2888530 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 179 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 8554241 - 8554078
Alignment:
Q |
179 |
agaaattttttattcctatttaactgtcacttt-caaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagaga |
277 |
Q |
|
|
|||| |||||| ||| ||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||||||| |||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
T |
8554241 |
agaatttttttgttcttatttaagtgtcactttacatagttcaatgcaacattaaatgttattttactaatattatccttatttatt-attgtggagaga |
8554143 |
T |
 |
Q |
278 |
gaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgtatc |
342 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| || | |||||||||| |
|
|
T |
8554142 |
gaaatatatgtaatgagatgttaaataaataaggttattatagtaaaaataaaaattattgtatc |
8554078 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 182 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 17074804 - 17074661
Alignment:
Q |
182 |
aattttttattcctatttaactgtcacttt-caaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaa |
280 |
Q |
|
|
|||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| ||||||||| |||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||||| || |
|
|
T |
17074804 |
aattttttgttcctatttaaatgtcactttacatagttcaatgcaacattaaatgtaattttactaatattatccttatttatt-attgtggagagaaaa |
17074706 |
T |
 |
Q |
281 |
atatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaa |
325 |
Q |
|
|
||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |
|
|
T |
17074705 |
atatatgtaatgagatattaaataaataaggttattatagtaaaa |
17074661 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 182 - 325
Target Start/End: Original strand, 17573466 - 17573609
Alignment:
Q |
182 |
aattttttattcctatttaactgtcacttt-caaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaa |
280 |
Q |
|
|
|||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| ||||||||| |||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||||| || |
|
|
T |
17573466 |
aattttttgttcctatttaaatgtcactttacatagttcaatgcaacattaaatgtaattttactaatattatccttatttatt-attgtggagagaaaa |
17573564 |
T |
 |
Q |
281 |
atatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaa |
325 |
Q |
|
|
||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |
|
|
T |
17573565 |
atatatgtaatgagatattaaataaataaggttattatagtaaaa |
17573609 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 157 - 330
Target Start/End: Original strand, 38221804 - 38221978
Alignment:
Q |
157 |
tttctttttaagtgttatttg--gagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtc |
254 |
Q |
|
|
||||||||||||||| |||| |||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| || ||| | |
|
|
T |
38221804 |
tttctttttaagtgtcatttttagagaaattttttgt-cctatttaattgtcactttcaaagttcaatataacaataaatgttgttttacaaacattacc |
38221902 |
T |
 |
Q |
255 |
cttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtata |
330 |
Q |
|
|
|||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
38221903 |
cttaattatttatcatggagaaagaaatatatgaaataagatattaaatgactaaggctattatagtaaaagtata |
38221978 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 203 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 9687711 - 9687577
Alignment:
Q |
203 |
tgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaa |
302 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
T |
9687711 |
tgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacaataccatta----tttattgtggagagagaaatatatgaaataagatattaaa |
9687616 |
T |
 |
Q |
303 |
tgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgtat |
341 |
Q |
|
|
||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
T |
9687615 |
tgactaaggttattatagtaaaagtataaattattgtat |
9687577 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 197 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 14061356 - 14061211
Alignment:
Q |
197 |
tttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagat |
296 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| || |
|
|
T |
14061356 |
tttaactgtcactttcaaaggtcaatgcaacattaaaagttgttttatcaatattgcccttagttatttattacagagagagaaataaataaaatgtaat |
14061257 |
T |
 |
Q |
297 |
attaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgtatc |
342 |
Q |
|
|
||||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
T |
14061256 |
attaaatgactaaagctattatagtaaaagtataaattattgtatc |
14061211 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 145 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 8954960 - 8954798
Alignment:
Q |
145 |
ttactccttccatttctttttaagtgttattt--ggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgtttt |
242 |
Q |
|
|
||||||||||| ||||||||||| ||| |||| | |||| |||||| || ||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
T |
8954960 |
ttactccttccgtttctttttaattgtcatttttgtagaatttttttgtttctaattaactgttactttcaaagttcaatacaatattaaatgttgtttt |
8954861 |
T |
 |
Q |
243 |
accaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatga |
305 |
Q |
|
|
| | |||| ||||| ||||||||||| |||||| || |||||||||| ||||||||||||| |
|
|
T |
8954860 |
atctttattatccttgattatttattgtagagagataagtatatgaaataagatattaaatga |
8954798 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 178 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 43553677 - 43553534
Alignment:
Q |
178 |
gagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagtta-tttattgtggagag |
276 |
Q |
|
|
||||| |||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||| |||||| |
|
|
T |
43553677 |
gagaatttttttgttcctattaaactgtcactttcgaagttaaatgcaacattaaatgttgttttaccgatatcatccttacttattttattgcggagag |
43553578 |
T |
 |
Q |
277 |
agaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatag |
320 |
Q |
|
|
| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| |
|
|
T |
43553577 |
aaaaatatatgaaattagatattgaatgaataaggctattatag |
43553534 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 184 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 35498290 - 35498144
Alignment:
Q |
184 |
ttttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaata |
283 |
Q |
|
|
|||||| || |||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |
|
|
T |
35498290 |
ttttttgtttctatttaactgtcacttttaaagtttaatgcaacattagatgtagttttatcaatattgtccttagttatttattacagagatagaaata |
35498191 |
T |
 |
Q |
284 |
tatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtata |
330 |
Q |
|
|
||||| ||| |||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
35498190 |
tatgatatgtgatattgaataaataagactattatagtaaaagtata |
35498144 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 194 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 8453444 - 8453310
Alignment:
Q |
194 |
ctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatga |
293 |
Q |
|
|
|||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| | |||||||||||| | |
|
|
T |
8453444 |
ctatttaactgtcaattttaaagttcaatgcaacattaaatgatgttttatcaatattaccctcgattatttattgtggagata--aatatatgaaataa |
8453347 |
T |
 |
Q |
294 |
gatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtata |
330 |
Q |
|
|
|||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |
|
|
T |
8453346 |
gatattaaatgaataatgtcattataataaaagtata |
8453310 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 217 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 14511617 - 14511506
Alignment:
Q |
217 |
ttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcatt |
316 |
Q |
|
|
||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| |||||||||| |||| |||||| ||||||||| |||||||||||| |
|
|
T |
14511617 |
ttcaatgtaatattaaatgttgttttactaatattacccttagatatttattgcggagagagaagcatataaaatgaaatattaaattaataaggtcatt |
14511518 |
T |
 |
Q |
317 |
atagtaaaagta |
328 |
Q |
|
|
|||||||||||| |
|
|
T |
14511517 |
atagtaaaagta |
14511506 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 184 - 325
Target Start/End: Original strand, 11163286 - 11163427
Alignment:
Q |
184 |
ttttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaata |
283 |
Q |
|
|
|||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || |||| |||| ||||||||||| ||||||||| || |
|
|
T |
11163286 |
ttttttgtttctaattaactgtcactttcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttgcctttattacccttgattatttattgtagagagagaagta |
11163385 |
T |
 |
Q |
284 |
tatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaa |
325 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |
|
|
T |
11163386 |
aatgaaatgagatattaaatgatgaaggttattataggaaaa |
11163427 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 179 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 13132341 - 13132200
Alignment:
Q |
179 |
agaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagag |
278 |
Q |
|
|
|||| |||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||| ||||||| |
|
|
T |
13132341 |
agaatttttttgtttctaattaactgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgttgtttttcctataatgtccttagtaatttattgcagagagag |
13132242 |
T |
 |
Q |
279 |
aaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatag |
320 |
Q |
|
|
||||||| ||||| |||||||||| | ||||| ||||||| |
|
|
T |
13132241 |
aaatataggaaatatgatattaaataattaaggatattatag |
13132200 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 241 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 36112104 - 36112004
Alignment:
Q |
241 |
ttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgta |
340 |
Q |
|
|
||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
T |
36112104 |
ttaccaacattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgactaaggttattatagtaaaagtatagattattgta |
36112005 |
T |
 |
Q |
341 |
t |
341 |
Q |
|
|
| |
|
|
T |
36112004 |
t |
36112004 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 181 - 325
Target Start/End: Original strand, 41890539 - 41890683
Alignment:
Q |
181 |
aaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaa |
280 |
Q |
|
|
||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| |||||| |||| |||||| || |
|
|
T |
41890539 |
aaattttttgtttctaattaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttacctttattacacttgattatttcttgtagagagataa |
41890638 |
T |
 |
Q |
281 |
atatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaa |
325 |
Q |
|
|
|||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |
|
|
T |
41890639 |
gtatatgaaataagatattaaatgatgaaggttattatagaaaaa |
41890683 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 213 - 312
Target Start/End: Original strand, 17313126 - 17313225
Alignment:
Q |
213 |
aaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggt |
312 |
Q |
|
|
||||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
17313126 |
aaagttcaacgcaacattaaatgttattttacaaatattaaccttagttatttattgcggagtgagaaatatattaaatgagatattaaatgaataaggt |
17313225 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 174 - 305
Target Start/End: Original strand, 38074286 - 38074417
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtgga |
273 |
Q |
|
|
|||| ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| || |||| |||| |||||||||| || |
|
|
T |
38074286 |
tttgtagaaattttttgtttctaattaactgtcactttcaaagtttaatacaacattaaatgttgttttgacattattacccttgattatttattgcaga |
38074385 |
T |
 |
Q |
274 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatga |
305 |
Q |
|
|
|||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
38074386 |
gagataaatatatgaaatgagatattaaatga |
38074417 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 182 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 39615674 - 39615514
Alignment:
Q |
182 |
aattttttattcctatttaactgtcacttt-caaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaa |
280 |
Q |
|
|
|||||||| || |||||||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||||| |||||| |||||| |||||| ||||| |||||| | ||||| |
|
|
T |
39615674 |
aattttttgttgctatttaagtgtcactttacatcgttcaatgcaacattaaatgttattttactaatattatccttatttatt-attgtgaaatgagaa |
39615576 |
T |
 |
Q |
281 |
atatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgtatc |
342 |
Q |
|
|
|||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| || | |||||||||| |
|
|
T |
39615575 |
atatatataatgagatattaaataaataaggttattatagtaaaaataaaaattattgtatc |
39615514 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 183 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 41701703 - 41701546
Alignment:
Q |
183 |
attttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaat |
282 |
Q |
|
|
||||||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||||||| | |||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||| |
|
|
T |
41701703 |
attttttgttcgtatttaactgacacttttaaagttcaatgcaacaataaatgttcttttaccaacattacttttagttatttattgcagaaagagaaat |
41701604 |
T |
 |
Q |
283 |
atatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgta |
340 |
Q |
|
|
||||||||| | ||||||||||| |||| |||||||||||| |||| |||||||| |
|
|
T |
41701603 |
atatgaaataaaatattaaatgactaagactattatagtaaaaatataaattattgta |
41701546 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 257 - 329
Target Start/End: Original strand, 35029640 - 35029711
Alignment:
Q |
257 |
tagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtat |
329 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
35029640 |
tagttatttattgtggagagagaaatatat-aaatgaaatattaaatgaataaggttattatagtaaaagtat |
35029711 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 186 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 13935294 - 13935151
Alignment:
Q |
186 |
ttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatata |
285 |
Q |
|
|
|||| ||| ||||||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||| ||| || ||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
13935294 |
ttttgttcatatttaactgttactttcgaagttcaatacaacattaaatattattttaccaatattatccctacttatttattatggagagagaaatata |
13935195 |
T |
 |
Q |
286 |
tgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtat |
329 |
Q |
|
|
| || | | ||||||| || ||||| || ||||||||||||| |
|
|
T |
13935194 |
taaagttggtgattaaataaacaaggtaatcatagtaaaagtat |
13935151 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 194 - 251
Target Start/End: Original strand, 8672332 - 8672389
Alignment:
Q |
194 |
ctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatatt |
251 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
8672332 |
ctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatatt |
8672389 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 181 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 9301766 - 9301622
Alignment:
Q |
181 |
aaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaa |
280 |
Q |
|
|
||||||||| || ||| |||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||| | |||| |||| || || ||||| | ||||||| |
|
|
T |
9301766 |
aaattttttgtttctaattaactgtcacttttaaatttcaatacaacattaaatgttgttttgcttttattacccttgatttttaattgtagggagagaa |
9301667 |
T |
 |
Q |
281 |
atatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaa |
325 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |
|
|
T |
9301666 |
atatatgaaatgagatattaaatgatgaaggttattataggaaaa |
9301622 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 195 - 283
Target Start/End: Original strand, 41305675 - 41305763
Alignment:
Q |
195 |
tatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaata |
283 |
Q |
|
|
||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| |
|
|
T |
41305675 |
tatttaactgtcacttttaaagttcaatgcaacattaaatgatgttttatcaatattacccttaattatttattgcggagagataaata |
41305763 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 198 - 325
Target Start/End: Original strand, 29125936 - 29126063
Alignment:
Q |
198 |
ttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagata |
297 |
Q |
|
|
||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || |
|
|
T |
29125936 |
ttaactgtcgttttcaaagtccaatgcattattaaatgtggttttacctatattacgcttatatatttattgcagagagagaaatatatgaaatgaagta |
29126035 |
T |
 |
Q |
298 |
ttaaatgaataaggtcattatagtaaaa |
325 |
Q |
|
|
|||||||| |||||| || |||| |||| |
|
|
T |
29126036 |
ttaaatgattaaggttatcataggaaaa |
29126063 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 197 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 10086362 - 10086256
Alignment:
Q |
197 |
tttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagat |
296 |
Q |
|
|
||||||||||||||| |||||| | ||||| | |||||||||||||||| | || |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| | || |
|
|
T |
10086362 |
tttaactgtcacttttaaagtttagtgcaacaataaatgttgttttaccgacatcatccttaattatttattgcagagagagaaatatatgaaataatat |
10086263 |
T |
 |
Q |
297 |
attaaat |
303 |
Q |
|
|
||||||| |
|
|
T |
10086262 |
attaaat |
10086256 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 282 - 338
Target Start/End: Original strand, 41308013 - 41308069
Alignment:
Q |
282 |
tatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
T |
41308013 |
tatatgaaataagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattg |
41308069 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 184 - 303
Target Start/End: Original strand, 6660973 - 6661092
Alignment:
Q |
184 |
ttttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaata |
283 |
Q |
|
|
|||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||||| |||||| ||||| |
|
|
T |
6660973 |
ttttttgtttctaattaagtgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgttgttttttctataatgtccttagtaatttattgcagagagaaaaata |
6661072 |
T |
 |
Q |
284 |
tatgaaatgagatattaaat |
303 |
Q |
|
|
| ||||| |||||||||| |
|
|
T |
6661073 |
aaagaaatatgatattaaat |
6661092 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 184 - 303
Target Start/End: Original strand, 6741375 - 6741494
Alignment:
Q |
184 |
ttttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaata |
283 |
Q |
|
|
|||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||||| |||||| ||||| |
|
|
T |
6741375 |
ttttttgtttctaattaagtgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgttgttttttctataatgtccttagtaatttattgcagagagaaaaata |
6741474 |
T |
 |
Q |
284 |
tatgaaatgagatattaaat |
303 |
Q |
|
|
| ||||| |||||||||| |
|
|
T |
6741475 |
aaagaaatatgatattaaat |
6741494 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 184 - 269
Target Start/End: Original strand, 30205480 - 30205565
Alignment:
Q |
184 |
ttttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattg |
269 |
Q |
|
|
||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || ||| |||| ||||| |||||||| |
|
|
T |
30205480 |
ttttttatttctaattaagtgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgttgtttttcctataatgtctttagtaatttattg |
30205565 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 198 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 37998316 - 37998224
Alignment:
Q |
198 |
ttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaat |
291 |
Q |
|
|
|||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || || ||| | | |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
37998316 |
ttaactgttactttcaaagttcaatgtaatattaaatgttgtctt-cctataatattcttagtaatttattgcagagagagaaatatatgaaat |
37998224 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 198 - 291
Target Start/End: Original strand, 45317686 - 45317779
Alignment:
Q |
198 |
ttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaat |
291 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || ||| | ||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||| |
|
|
T |
45317686 |
ttaactgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgttgtttttcctataaagcccttaataatttattggagagagaaaaatatatgaaat |
45317779 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 198 - 319
Target Start/End: Original strand, 42352773 - 42352893
Alignment:
Q |
198 |
ttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagata |
297 |
Q |
|
|
|||||| ||| ||| |||||||| | || ||||||||||||||||| | |||| |||||| ||||||||| || || |||||||||||||||| || |
|
|
T |
42352773 |
ttaactctcatttttaaagttcattacatcattaaatgttgttttacta-tattacccttagatatttattgcagaatgataaatatatgaaatgaggta |
42352871 |
T |
 |
Q |
298 |
ttaaatgaataaggtcattata |
319 |
Q |
|
|
||||||||||||||| |||||| |
|
|
T |
42352872 |
ttaaatgaataaggttattata |
42352893 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #102
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 254 - 341
Target Start/End: Original strand, 15281469 - 15281556
Alignment:
Q |
254 |
ccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgtat |
341 |
Q |
|
|
||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||| |||| ||||||||| |
|
|
T |
15281469 |
ccttagttatttattgtagaaagagaaatatataaaatgagatattgaatgactaagactattataataaaaatataaattattgtat |
15281556 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #103
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 254 - 341
Target Start/End: Original strand, 15461838 - 15461925
Alignment:
Q |
254 |
ccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgtat |
341 |
Q |
|
|
||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||| |||| ||||||||| |
|
|
T |
15461838 |
ccttagttatttattgtagaaagagaaatatataaaatgagatattgaatgactaagactattataataaaaatataaattattgtat |
15461925 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #104
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 198 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 40602963 - 40602841
Alignment:
Q |
198 |
ttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagata |
297 |
Q |
|
|
|||| |||||||||||||||||||| || ||||||| |||| | | ||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
T |
40602963 |
ttaagtgtcactttcaaagttcaatataacattaaataatgttctttctataatgtctttagtcatttattgcggagagagaaatatatgaaatataata |
40602864 |
T |
 |
Q |
298 |
ttaaatgaataaggtcattatag |
320 |
Q |
|
|
|||||| | ||||| ||||||| |
|
|
T |
40602863 |
ttaaataattaaggatattatag |
40602841 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #105
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 320
Target Start/End: Original strand, 40608051 - 40608194
Alignment:
Q |
180 |
gaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagaga |
279 |
Q |
|
|
|||||||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| | || ||| || |||| || |||||||| ||||| || |
|
|
T |
40608051 |
gaaattttttgtttctaattaagtgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatggtgttcttcctataatgcccttggtaatttattgcagagaggga |
40608150 |
T |
 |
Q |
280 |
aat---atatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatag |
320 |
Q |
|
|
||| ||||||||| |||||||||| | ||||| ||||||| |
|
|
T |
40608151 |
aatacaatatgaaatatgatattaaataattaaggatattatag |
40608194 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #106
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 253 - 328
Target Start/End: Original strand, 8672583 - 8672658
Alignment:
Q |
253 |
tccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagta |
328 |
Q |
|
|
||||||| || |||||| |||||||||| ||| |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
8672583 |
tccttagataattattgccgagagagaaacataaaaaatgaaatagtaaataaataaggtcattatagtaaaagta |
8672658 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #107
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 251
Target Start/End: Original strand, 35028645 - 35028693
Alignment:
Q |
203 |
tgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatatt |
251 |
Q |
|
|
||||| ||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
35028645 |
tgtcaattttaaagttcaatgcaacattaaatattgttttaccaatatt |
35028693 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #108
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 174 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 41644394 - 41644334
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaat |
234 |
Q |
|
|
|||| |||| |||||| || |||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
41644394 |
tttgtagaatttttttgtttctatttaattgtcattttcaaaattcaatgcaatattaaat |
41644334 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #109
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 198 - 325
Target Start/End: Original strand, 11727617 - 11727744
Alignment:
Q |
198 |
ttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagata |
297 |
Q |
|
|
||||||||| ||||||||||||||| | || |||||| | ||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| || |
|
|
T |
11727617 |
ttaactgtcgttttcaaagttcaatgtatcatcaaatgtggctttacttatattacccttatatatttattgctgagagagaaatatatggaatgaagta |
11727716 |
T |
 |
Q |
298 |
ttaaatgaataaggtcattatagtaaaa |
325 |
Q |
|
|
|||||| | |||| | ||||||| |||| |
|
|
T |
11727717 |
ttaaattattaagattattatagaaaaa |
11727744 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #110
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 209 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 27193248 - 27193137
Alignment:
Q |
209 |
tttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata |
308 |
Q |
|
|
|||||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| | || |
|
|
T |
27193248 |
tttcaaagttcaatttatcattaaatgtgattttacctatattacctttatatatttattgctgagagagaaatatatggaatgaagtattaaattatta |
27193149 |
T |
 |
Q |
309 |
aggtcattatag |
320 |
Q |
|
|
|||| ||||||| |
|
|
T |
27193148 |
aggttattatag |
27193137 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #111
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 256 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 11016013 - 11015940
Alignment:
Q |
256 |
ttagttatttattg-tggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagta |
328 |
Q |
|
|
||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| |||| |
|
|
T |
11016013 |
ttagttatttatttatggaatgagaaatatatgaaatcgaatattaaatgagtaaggttattatagtaatagta |
11015940 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #112
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 203 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 28568136 - 28568056
Alignment:
Q |
203 |
tgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaata |
283 |
Q |
|
|
||||||||| || |||||||||| ||||| | ||| |||| ||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| |
|
|
T |
28568136 |
tgtcactttgaagtttcaatgcaacattaattattggtttatcaatattacccttacctatttattgttgagagagaaata |
28568056 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #113
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 203 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 28575729 - 28575649
Alignment:
Q |
203 |
tgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaata |
283 |
Q |
|
|
||||||||| || |||||||||| ||||| | ||| |||| ||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| |
|
|
T |
28575729 |
tgtcactttgaagtttcaatgcaacattaattattggtttatcaatattacccttacctatttattgttgagagagaaata |
28575649 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #114
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 146 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 32010362 - 32010306
Alignment:
Q |
146 |
tactccttccatttctttttaagtgt-tatttggagaaattttttattcctatttaa |
201 |
Q |
|
|
|||||| ||| || |||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
T |
32010362 |
tactccatccgttcctttttaagtgtctttttggagaaattttttgttcctatttaa |
32010306 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #115
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 209 - 249
Target Start/End: Original strand, 33751245 - 33751285
Alignment:
Q |
209 |
tttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaata |
249 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||| |
|
|
T |
33751245 |
tttcaaagttcaatgcaatattaattattgttttatcaata |
33751285 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #116
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 254 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 41643640 - 41643576
Alignment:
Q |
254 |
ccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattat |
318 |
Q |
|
|
||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |
|
|
T |
41643640 |
ccttagttatttattacgaagagagaaataattgaaacaagatattaaatgaatgaggttattat |
41643576 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6 (Bit Score: 145; Significance: 3e-76; HSPs: 59)
Name: chr6
Description:
Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 174 - 338
Target Start/End: Original strand, 24663389 - 24663553
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtgga |
273 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |
|
|
T |
24663389 |
tttggagaaaatttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgttcttagttatttattgcgga |
24663488 |
T |
 |
Q |
274 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
24663489 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataatgtcattatagtaaaagtatagcttattg |
24663553 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 146 - 338
Target Start/End: Original strand, 17193138 - 17193332
Alignment:
Q |
146 |
tactccttccatttctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgtttta |
243 |
Q |
|
|
|||||| ||| || |||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
17193138 |
tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgttcctatttaaatgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta |
17193237 |
T |
 |
Q |
244 |
ccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |
|
|
T |
17193238 |
ccaatattgtccttagttatttattgcggagagagatatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaataataacttattg |
17193332 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 174 - 338
Target Start/End: Original strand, 373733 - 373897
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtgga |
273 |
Q |
|
|
|||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| |
|
|
T |
373733 |
tttggagaaattttttgttcatatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaattttaaatgttgttttaccaatattgtcattatttatttattgcgga |
373832 |
T |
 |
Q |
274 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
T |
373833 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaagtatagtttattg |
373897 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 174 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 26470954 - 26470790
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtgga |
273 |
Q |
|
|
|||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
26470954 |
tttgaagaaattttttgttcctatttaattgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttgccaatattatccttagttatttattgtgga |
26470855 |
T |
 |
Q |
274 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
T |
26470854 |
gagagaaatatatgaaatgagatgttaaatgaacaaggtcattatagtaaaagtataacttattg |
26470790 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 146 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 1751692 - 1751498
Alignment:
Q |
146 |
tactccttccatttctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgtttta |
243 |
Q |
|
|
|||||| ||| || |||||||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
1751692 |
tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttgaagaaattttttgttcctatttaactttcactttcgaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta |
1751593 |
T |
 |
Q |
244 |
ccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
T |
1751592 |
ccaatattgtccttaattatttattgcagagaaagaaatatatgaaaagagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattg |
1751498 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 146 - 342
Target Start/End: Original strand, 23777276 - 23777474
Alignment:
Q |
146 |
tactccttccatttctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgtttta |
243 |
Q |
|
|
|||||| ||| || |||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
23777276 |
tactccctccgttcctttttaagtgtcaattttggagaaattttttgttcctatttaactatcactttcgaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta |
23777375 |
T |
 |
Q |
244 |
ccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgtatc |
342 |
Q |
|
|
|||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
T |
23777376 |
ccaatattatccttgctcatttattgtggagagagaaatatatgaaatgaaatattaaatgaataaggttattatagtaaaagtatatattattgtatc |
23777474 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 145 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 23923975 - 23923781
Alignment:
Q |
145 |
ttactccttccatttctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgtttt |
242 |
Q |
|
|
||||||| ||| || |||||||||||| | |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| |
|
|
T |
23923975 |
ttactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagagattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatacaacgttaaatgctgtttt |
23923876 |
T |
 |
Q |
243 |
accaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttatt |
337 |
Q |
|
|
| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
23923875 |
atcaatattatccttagttatttattgcggagagaaaaatatatgaaatgagatattaactgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttatt |
23923781 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 146 - 338
Target Start/End: Original strand, 30388701 - 30388895
Alignment:
Q |
146 |
tactccttccatttctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgtttta |
243 |
Q |
|
|
|||||| ||| || |||||||||||| | |||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |
|
|
T |
30388701 |
tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgttcctaattaactgtcactttcaaagttcaatgaaacattaaatgttgtttta |
30388800 |
T |
 |
Q |
244 |
ccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
|||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
30388801 |
ccaatattatgcttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgaataagatcattatagtaaaagtatagcttattg |
30388895 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 146 - 338
Target Start/End: Original strand, 17835873 - 17836067
Alignment:
Q |
146 |
tactccttccatttctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgtttta |
243 |
Q |
|
|
|||||| ||| || |||||||||||| | |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||| |
|
|
T |
17835873 |
tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaaaattttgttcctatttaactgttactttcaaattttaatgcaacattaaatgttttttta |
17835972 |
T |
 |
Q |
244 |
ccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
|||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
17835973 |
ccaatattatccttaattatttattgcggagagagaaatatatgaaatgatatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
17836067 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 146 - 338
Target Start/End: Original strand, 12732157 - 12732349
Alignment:
Q |
146 |
tactccttccatttctttttaagtgt-tatttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttac |
244 |
Q |
|
|
|||||| ||||||||||||||||| | | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| |
|
|
T |
12732157 |
tactccctccatttctttttaagtatatctttggagaaaaattttgttcctatttaactgtcactttcaaagtttaatgtaacattaaatgttgttttac |
12732256 |
T |
 |
Q |
245 |
caatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
|| |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
12732257 |
cactattatcct-agttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgaaatattaaatgaataatatcattatagtaaaagtatagcttattg |
12732349 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 174 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 17124214 - 17124052
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtgga |
273 |
Q |
|
|
|||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |
|
|
T |
17124214 |
tttggagaaaagttttgtttttatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcg-- |
17124117 |
T |
 |
Q |
274 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
T |
17124116 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattg |
17124052 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 174 - 338
Target Start/End: Original strand, 8992558 - 8992722
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtgga |
273 |
Q |
|
|
|||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| |
|
|
T |
8992558 |
tttgaagaaattttttgttcatatttaactatcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttactaatattatccttagttatttattacgga |
8992657 |
T |
 |
Q |
274 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
|||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
T |
8992658 |
gagataaatatatgaaatgagatgttaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattg |
8992722 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 174 - 338
Target Start/End: Original strand, 9017005 - 9017169
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtgga |
273 |
Q |
|
|
|||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| |
|
|
T |
9017005 |
tttgaagaaattttttgttcatatttaactatcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttactaatattatccttagttatttattacgga |
9017104 |
T |
 |
Q |
274 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
|||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
T |
9017105 |
gagataaatatatgaaatgagatgttaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattg |
9017169 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 145 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 9838384 - 9838185
Alignment:
Q |
145 |
ttactccttccatttctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgtttt |
242 |
Q |
|
|
||||||| ||| || |||||||||||| | |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
T |
9838384 |
ttactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgttccaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttt |
9838285 |
T |
 |
Q |
243 |
accaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgtatc |
342 |
Q |
|
|
| ||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
T |
9838284 |
atcaatattacccttagttatttattgcggagagggaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatc |
9838185 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 187 - 338
Target Start/End: Original strand, 3621613 - 3621764
Alignment:
Q |
187 |
tttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatat |
286 |
Q |
|
|
|||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
3621613 |
tttatttctatttaactatcactttcaaagttcaatgcaacattaaatattgttctaccaatattatccttagttatttattgcagagagagaaatatat |
3621712 |
T |
 |
Q |
287 |
gaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
T |
3621713 |
gaaatgagatattaaatgaataatgtcattatagtaaaagtataacttattg |
3621764 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 146 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 22784929 - 22784731
Alignment:
Q |
146 |
tactccttccatttctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgtttta |
243 |
Q |
|
|
|||||||||| || |||||||||||| |||| |||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
22784929 |
tactccttcctttcctttttaagtgtctcttttgaagaatttttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta |
22784830 |
T |
 |
Q |
244 |
ccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgtatc |
342 |
Q |
|
|
|||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
T |
22784829 |
ccaatattatccttacttatttattgtggagagaaaaatatattaaataaattattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatacattattgtatc |
22784731 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 160 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 364790 - 364609
Alignment:
Q |
160 |
ctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgtttt-accaatattgtcct |
256 |
Q |
|
|
|||||||||||| | |||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| | |
|
|
T |
364790 |
ctttttaagtgtcacttttggagaaaatttttgttactatttaactgtcattttcaaaattcaatgcaacattaaatgttgtttttaccaatattgtcat |
364691 |
T |
 |
Q |
257 |
tagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
|| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
364690 |
taattatttattgcggagagagaaatatatgaaatgaaatattaaatgaagaaaatcattatagtaaaagtatagcttattg |
364609 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 146 - 335
Target Start/End: Original strand, 52643 - 52834
Alignment:
Q |
146 |
tactccttccatttctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgtttta |
243 |
Q |
|
|
||||| |||| || ||||||||||||| |||||||| |||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| |
|
|
T |
52643 |
tactctttccgttcctttttaagtgtttcttttggagattttttttgtttctatttaactgtcacttttaaagttcaatgcaacattaaattatgtttta |
52742 |
T |
 |
Q |
244 |
ccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagctta |
335 |
Q |
|
|
||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |
|
|
T |
52743 |
tcaatattacccttaattatttattgtggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgaataaggtcattataataaaagtataactta |
52834 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 145 - 329
Target Start/End: Original strand, 30236957 - 30237143
Alignment:
Q |
145 |
ttactccttccatttctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgtttt |
242 |
Q |
|
|
|||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||| ||| || | |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| |
|
|
T |
30236957 |
ttactccttccattcctttttaaatgttacttttggagaaaaaatttgtttcaatttaactgtcactttcaaaattcaatgcaacattaaacgttgtttt |
30237056 |
T |
 |
Q |
243 |
accaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtat |
329 |
Q |
|
|
||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
30237057 |
accaatattacccttagttatttattgttgaaagagaaatatataaaatgagatattaaattaataaggttattatagtaaaagtat |
30237143 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 196 - 330
Target Start/End: Original strand, 7235472 - 7235606
Alignment:
Q |
196 |
atttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgaga |
295 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
7235472 |
atttaactgtcactttcaaagtttaatgtaatattaaatgttgttttactaatattacccttagttatttattgtggagagagggatatatgaaatgaga |
7235571 |
T |
 |
Q |
296 |
tattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtata |
330 |
Q |
|
|
||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
7235572 |
tattaaatgaataaggttattatagtaaaagtata |
7235606 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 174 - 338
Target Start/End: Original strand, 8176446 - 8176607
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtgga |
273 |
Q |
|
|
|||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||| ||| |
|
|
T |
8176446 |
tttgaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcatcattaaatgtt---ttaccaatattatcttttgttatttattgcgga |
8176542 |
T |
 |
Q |
274 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
T |
8176543 |
gagagaaatatatgaaatgatatgttaaattaataaggtcattatagtaaaagtataacttattg |
8176607 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 174 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 17251487 - 17251333
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtgga |
273 |
Q |
|
|
|||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | |
|
|
T |
17251487 |
tttgaagaaattttttgttcctatttaaccgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattacccttagatatttattgcaaa |
17251388 |
T |
 |
Q |
274 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagta |
328 |
Q |
|
|
|||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
17251387 |
gagagaaacatatgaaatgaaatattaaattaataaggtcattatagtaaaagta |
17251333 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 178 - 328
Target Start/End: Original strand, 33260714 - 33260864
Alignment:
Q |
178 |
gagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagaga |
277 |
Q |
|
|
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||| ||||||| |
|
|
T |
33260714 |
gagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattacccttagatgtttattgcggagaga |
33260813 |
T |
 |
Q |
278 |
gaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagta |
328 |
Q |
|
|
|||| ||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| |||||| |
|
|
T |
33260814 |
gaaacatatgaaatgaaacattaaattaataaggtcattatagtgaaagta |
33260864 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 197 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 7632245 - 7632104
Alignment:
Q |
197 |
tttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagat |
296 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
7632245 |
tttaactgtcactttcaaagttcaaagcaacattaaatattgttttaccaatattatccttagttatttattgcgaagagataaatatatgaaatgagat |
7632146 |
T |
 |
Q |
297 |
attaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
|||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
T |
7632145 |
gttaaataaataaggtcattatagtaaaagtataacttattg |
7632104 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 174 - 338
Target Start/End: Original strand, 22050059 - 22050222
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtgga |
273 |
Q |
|
|
||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||| ||| |
|
|
T |
22050059 |
tttggagaatttttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgatgttttatcaatatac-ccttaaatatttattgcgga |
22050157 |
T |
 |
Q |
274 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |
|
|
T |
22050158 |
gagagaaatatatgaaataagatattaaatgaataaggtcattataataaaagtataacttattg |
22050222 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 178 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 31244976 - 31244826
Alignment:
Q |
178 |
gagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagaga |
277 |
Q |
|
|
|||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
31244976 |
gagaaattttttgtttgtatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaattcttgttttatcaatattattcttagatatttattgtggagaga |
31244877 |
T |
 |
Q |
278 |
gaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagta |
328 |
Q |
|
|
|||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
31244876 |
gaaacatatgaaatgaaatattaaattaataaggtcattatagtaaaagta |
31244826 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 174 - 338
Target Start/End: Original strand, 27313510 - 27313677
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtgga |
273 |
Q |
|
|
|||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |
|
|
T |
27313510 |
tttggagaaattttttgttcctatttaaatgtcactttcaaagttcattgcaacattaaatgttgatttaccaatattatccttagttatttattgcgga |
27313609 |
T |
 |
Q |
274 |
gagagaaa---tatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
|||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||| ||||| ||| ||||||| |
|
|
T |
27313610 |
gagagaaatagtatatgaaatgagatgttaaatgaacaagataattatagaaaaagaataacttattg |
27313677 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 144 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 24356317 - 24356130
Alignment:
Q |
144 |
tttactccttccatttctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttt |
241 |
Q |
|
|
|||||||| ||| || |||||||| ||| | ||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
T |
24356317 |
tttactccctccgttcctttttaattgtcacttttagagaaatttattgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcatcattaaatgttgttt |
24356218 |
T |
 |
Q |
242 |
taccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtat |
329 |
Q |
|
|
|| ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
24356217 |
tatcaatattacccttagatatttattccggagagagaaacatatgaaatgaaatattaaatcaacaaggtcattatagtaaaagtat |
24356130 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 184 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 30416296 - 30416138
Alignment:
Q |
184 |
ttttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaata |
283 |
Q |
|
|
|||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| |
|
|
T |
30416296 |
ttttttgtttctatttaactgttactttcaaagttcaatgcaacattaaatgatgttttatcaatattacccttagttatttatggcggagagagaaata |
30416197 |
T |
 |
Q |
284 |
tatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgtatc |
342 |
Q |
|
|
||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
T |
30416196 |
tatgaaacagaatattaaatgaataaggttattatagtaaaagtataacttattgtatc |
30416138 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 194 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 32359646 - 32359507
Alignment:
Q |
194 |
ctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatga |
293 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |
|
|
T |
32359646 |
ctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaat-ttgttttaccaat--tatccttagttatttattgcggagagaga--tatatgaaatga |
32359552 |
T |
 |
Q |
294 |
gatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
|||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
32359551 |
gatatttaatgaataagatcattatagtaaaagtatagcttattg |
32359507 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 191 - 337
Target Start/End: Original strand, 1252192 - 1252339
Alignment:
Q |
191 |
ttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttattt-attgtggagagagaaatatatgaa |
289 |
Q |
|
|
||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||| |
|
|
T |
1252192 |
ttcctatttaattgtctttttcaaagttcaatgcaacattaaatattgttttaccaatattatccttagttgttttattacggagagagaaatatatgaa |
1252291 |
T |
 |
Q |
290 |
atgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttatt |
337 |
Q |
|
|
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |
|
|
T |
1252292 |
ataagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttatt |
1252339 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 181 - 330
Target Start/End: Original strand, 34607115 - 34607264
Alignment:
Q |
181 |
aaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaa |
280 |
Q |
|
|
|||| |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| |
|
|
T |
34607115 |
aaatattttgttccaatttaactgtcacttttaaagttcaatgtaatattaaatggtgttttaccaatattatccttacttatttattgcagagagagac |
34607214 |
T |
 |
Q |
281 |
atatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtata |
330 |
Q |
|
|
||||||||||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| |
|
|
T |
34607215 |
atatatgaaattagatattaaacgaataagattattatagtaaaagtata |
34607264 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 178 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 7056369 - 7056207
Alignment:
Q |
178 |
gagaaattttttattcctatttaact--gtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggaga |
275 |
Q |
|
|
||||| |||||| || |||||||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| |||| ||||||| || |||||||||||||| ||||| |
|
|
T |
7056369 |
gagaatttttttgtttctatttaactctgtcactttcaaaattcaatccaacattaaatgttgatttatcaatattatctttagttatttattgcggaga |
7056270 |
T |
 |
Q |
276 |
gagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||||| |
|
|
T |
7056269 |
gagaaatatatgaaatgagatattaaatgaccaaggttattatagtaaaagaataacttattg |
7056207 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 194 - 329
Target Start/End: Original strand, 34378889 - 34379024
Alignment:
Q |
194 |
ctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatga |
293 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |
|
|
T |
34378889 |
ctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacattacccttagttatttattatggagagtgaaatatatgaaataa |
34378988 |
T |
 |
Q |
294 |
gatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtat |
329 |
Q |
|
|
|||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
34378989 |
gatattaaatgactaaggcttttatagtaaaagtat |
34379024 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 196 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 11431366 - 11431220
Alignment:
Q |
196 |
atttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgaga |
295 |
Q |
|
|
|||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||| |
|
|
T |
11431366 |
atttaattgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattaaccttagttatttattgtcgagagataaatataggaaataaga |
11431267 |
T |
 |
Q |
296 |
tattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgtatc |
342 |
Q |
|
|
|||||||| | ||| || ||||| ||||||||||| |||||||||| |
|
|
T |
11431266 |
tattaaattagtaaagttattatcgtaaaagtataagttattgtatc |
11431220 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 179 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 11676838 - 11676692
Alignment:
Q |
179 |
agaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagag |
278 |
Q |
|
|
||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| |
|
|
T |
11676838 |
agaaattttttgttcctatttaactgtcactt-caaagttcaatgcaacattaaatgttattttaccaatattactcttagatatttattgc--agagag |
11676742 |
T |
 |
Q |
279 |
aaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagta |
328 |
Q |
|
|
||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
11676741 |
aaacatatgaaatgaaatattaaattaataaggtcattatagtaaaagta |
11676692 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 145 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 17601402 - 17601220
Alignment:
Q |
145 |
ttactccttccatttctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcacttt-caaagttcaatgcaatattaaatgttgttt |
241 |
Q |
|
|
||||||| |||||| |||||||||||| | |||||||| |||||| ||| ||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||||||| ||| |
|
|
T |
17601402 |
ttactccctccattcctttttaagtgtcacttttggagattttttttgttcttatttaagtgtcactttacatagttcaatgcaacattaaatgttattt |
17601303 |
T |
 |
Q |
242 |
taccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaa |
325 |
Q |
|
|
||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |
|
|
T |
17601302 |
tactaatattacccttatttatt-attgtggagagagaaatatatgtaatgagatattaaataaataaggttattatagtaaaa |
17601220 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 174 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 22400795 - 22400640
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtgga |
273 |
Q |
|
|
|||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| || |
|
|
T |
22400795 |
tttggagaaattttttgttcttatttaactgtcacttttgaagttcaatgcaacattaaatattgttttaccaatattatccttacttatttattatgag |
22400696 |
T |
 |
Q |
274 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtat |
329 |
Q |
|
|
||||||||| |||||| | || ||||||||||||| || |||||||||||||||| |
|
|
T |
22400695 |
gagagaaatgtatgaagttagtgattaaatgaataatgttattatagtaaaagtat |
22400640 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 174 - 341
Target Start/End: Original strand, 24635718 - 24635885
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtgga |
273 |
Q |
|
|
|||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| || | | |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || |
|
|
T |
24635718 |
tttggagaaattttttgtttctatttaactgtcattttcaaagttcaatgtaacaatgaatgttgttttaccaacattacccttagttatttattgcaga |
24635817 |
T |
 |
Q |
274 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgtat |
341 |
Q |
|
|
||||||||||| ||| || ||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
T |
24635818 |
gagagaaatatgtgatataagatattaaatgactaaggctattatagtaaatgtataaattattgtat |
24635885 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 178 - 318
Target Start/End: Original strand, 24948257 - 24948397
Alignment:
Q |
178 |
gagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagaga |
277 |
Q |
|
|
|||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||| | ||||||||| ||||||| |
|
|
T |
24948257 |
gagaaattttttgtttctatttaactgtcactttcaaaattcaatgcaacattaaatagtgttttactaatattacccttggatatttattgcggagaga |
24948356 |
T |
 |
Q |
278 |
gaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattat |
318 |
Q |
|
|
|||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
T |
24948357 |
gaaacgtatgaaatgaaatattaaattaataaggtcattat |
24948397 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 146 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 31854752 - 31854564
Alignment:
Q |
146 |
tactccttccatttctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgtttta |
243 |
Q |
|
|
|||||| ||| || |||||||||||||| |||||||||| |||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||| |
|
|
T |
31854752 |
tactccctccgttcctttttaagtgttacttttggagaaaaattttgtttttatttaattgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttatttta |
31854653 |
T |
 |
Q |
244 |
ccaatattgtccttagttatttattg--tggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtata |
330 |
Q |
|
|
|||| ||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
T |
31854652 |
ccaacattacccttagttatttattgcaaagagagataaatatatgaaataagatattaaatgactaaggctattatagtaaaggtata |
31854564 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 196 - 330
Target Start/End: Original strand, 34730592 - 34730726
Alignment:
Q |
196 |
atttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgaga |
295 |
Q |
|
|
|||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||| ||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| |
|
|
T |
34730592 |
atttaactgtcacttttaaagttcaacgtaacattaaatggtgttttatcaatattatccttacttatttattgcaaagagataaatatatgaaattaga |
34730691 |
T |
 |
Q |
296 |
tattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtata |
330 |
Q |
|
|
|||| |||||||||||| |||||||||||| |||| |
|
|
T |
34730692 |
tattgaatgaataaggttattatagtaaaaatata |
34730726 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 213 - 342
Target Start/End: Original strand, 1249588 - 1249717
Alignment:
Q |
213 |
aaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggt |
312 |
Q |
|
|
|||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |
|
|
T |
1249588 |
aaagttcaattcaattttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgaaatattaaatgaatgagac |
1249687 |
T |
 |
Q |
313 |
cattatagtaaaagtatagcttattgtatc |
342 |
Q |
|
|
|||||||||||| ||| |||||||||| |
|
|
T |
1249688 |
aattatagtaaaaatatcaattattgtatc |
1249717 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 195 - 328
Target Start/End: Original strand, 7170183 - 7170316
Alignment:
Q |
195 |
tatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgag |
294 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || || ||||||||| ||||||||||| |||| |||||| |
|
|
T |
7170183 |
tatttaactgtcactttcaaaattcaatgcaacattaaatgttgttttaccattattacccctaaatatttattgcggagagagaaacatataaaatgaa |
7170282 |
T |
 |
Q |
295 |
atattaaatgaataaggtcattatagtaaaagta |
328 |
Q |
|
|
||||||||| ||||||| |||||| |||||||| |
|
|
T |
7170283 |
atattaaatttataaggttattataataaaagta |
7170316 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 210 - 325
Target Start/End: Original strand, 11128877 - 11128992
Alignment:
Q |
210 |
ttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataa |
309 |
Q |
|
|
||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| | ||||||| ||| ||||||||| ||||| |
|
|
T |
11128877 |
ttcaaagttcaattcaacattaaatgatgttttaccaatattacccttagatatttattgcggagagagatacatatgaattgaaatattaaattaataa |
11128976 |
T |
 |
Q |
310 |
ggtcattatagtaaaa |
325 |
Q |
|
|
|||||||||||||||| |
|
|
T |
11128977 |
ggtcattatagtaaaa |
11128992 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 184 - 319
Target Start/End: Original strand, 19811976 - 19812111
Alignment:
Q |
184 |
ttttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaata |
283 |
Q |
|
|
|||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || |||| ||||| ||||||||||| ||||||||| || |
|
|
T |
19811976 |
ttttttgtttctaattaactgtcactttcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttgcctttattacccttaattatttattgtagagagagaagta |
19812075 |
T |
 |
Q |
284 |
tatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattata |
319 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |
|
|
T |
19812076 |
aatgaaatgagatattaaatgatgaaggttattata |
19812111 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 146 - 251
Target Start/End: Original strand, 3849045 - 3849152
Alignment:
Q |
146 |
tactccttccatttctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgtttta |
243 |
Q |
|
|
|||||| ||| || |||||||||||| | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
3849045 |
tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaaaattttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta |
3849144 |
T |
 |
Q |
244 |
ccaatatt |
251 |
Q |
|
|
|||||||| |
|
|
T |
3849145 |
ccaatatt |
3849152 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 197 - 330
Target Start/End: Original strand, 13597443 - 13597575
Alignment:
Q |
197 |
tttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagat |
296 |
Q |
|
|
||||| ||| |||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |
|
|
T |
13597443 |
tttaattgttactttcaaagtttaatgtaaaattaa-tgttattttatcaatattattcttagttatttattgcggagaaagaaatttatgaaatgagat |
13597541 |
T |
 |
Q |
297 |
attaaatgaataaggtcattatagtaaaagtata |
330 |
Q |
|
|
|||||||| | ||||| |||||||||||| |||| |
|
|
T |
13597542 |
attaaatgtaaaaggttattatagtaaaaatata |
13597575 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 185 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 32251170 - 32251031
Alignment:
Q |
185 |
tttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatat |
284 |
Q |
|
|
||||| || ||| ||||||||| ||||||||| |||| || |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| |||| ||||||||||||| |
|
|
T |
32251170 |
tttttgtttctaattaactgtcgttttcaaagtccaatacatcattaaatgttgttttacctatattacccttagatatt-attgcagagagagaaatat |
32251072 |
T |
 |
Q |
285 |
atgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaa |
325 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||| |
|
|
T |
32251071 |
atgaaatgaggtattaaatgattaaggttattataggaaaa |
32251031 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 262 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 26485826 - 26485748
Alignment:
Q |
262 |
atttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgtatc |
342 |
Q |
|
|
|||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
T |
26485826 |
atttattgtggagaga--aatatatgaaatgaaatattaaatgaataaggttattatagtaaaagtatatattattgtatc |
26485748 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 254 - 334
Target Start/End: Original strand, 3850408 - 3850490
Alignment:
Q |
254 |
ccttagttatttattgtggagagagaaatat--atgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagctt |
334 |
Q |
|
|
||||||||||||||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
T |
3850408 |
ccttagttatttattacggagggagatatatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaatatagctt |
3850490 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 182 - 330
Target Start/End: Original strand, 1923869 - 1924018
Alignment:
Q |
182 |
aattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgtttt-accaatattgtccttagttatttattgtggagagagaa |
280 |
Q |
|
|
|||||||| || |||||||| ||||||||| ||| || ||||||| |||||| ||||||| | ||||||| | |||||||||||||| |||| || |
|
|
T |
1923869 |
aattttttgtttctatttaattgtcacttttaaattttaatgcaaccttaaatattgtttttatcaatattacctttagttatttattgcaatgagataa |
1923968 |
T |
 |
Q |
281 |
atatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtata |
330 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
1923969 |
atatatgaaatgagatattaaatgaataatactgttatagtaaaagtata |
1924018 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 198 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 11001016 - 11000889
Alignment:
Q |
198 |
ttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagata |
297 |
Q |
|
|
||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || |
|
|
T |
11001016 |
ttaactgtcgttttcaaagttcaatgtatcattaaatgtggttttacctatattacccttatatatttattgcatagagagaaatatatgaaatgaagta |
11000917 |
T |
 |
Q |
298 |
ttaaatgaataaggtcattatagtaaaa |
325 |
Q |
|
|
|||||||| ||||| ||||||| |||| |
|
|
T |
11000916 |
ttaaatgattaaggatattataggaaaa |
11000889 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 198 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 2381216 - 2381089
Alignment:
Q |
198 |
ttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagata |
297 |
Q |
|
|
||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| | |||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |
|
|
T |
2381216 |
ttaactgtcgttttcaaagttcaatgtattattaaatgtggctttacctatattacccttatatatttattgcaaagagagaaatatatgaaatgaagca |
2381117 |
T |
 |
Q |
298 |
ttaaatgaataaggtcattatagtaaaa |
325 |
Q |
|
|
|||||| | |||||| ||||||| |||| |
|
|
T |
2381116 |
ttaaataattaaggttattataggaaaa |
2381089 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 198 - 325
Target Start/End: Original strand, 15432705 - 15432832
Alignment:
Q |
198 |
ttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagata |
297 |
Q |
|
|
||||||||| ||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| |
|
|
T |
15432705 |
ttaactgtcgttttcaaagtccaatgtatcattaaatgtggttttacctatattacccttatatatttattactgagagataaatatatgaaatgaaata |
15432804 |
T |
 |
Q |
298 |
ttaaatgaataaggtcattatagtaaaa |
325 |
Q |
|
|
|||||| | |||||| ||||||| |||| |
|
|
T |
15432805 |
ttaaattattaaggttattataggaaaa |
15432832 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 160 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 19645919 - 19645846
Alignment:
Q |
160 |
ctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatatta |
231 |
Q |
|
|
|||||||||||| | |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |
|
|
T |
19645919 |
ctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttctatttaactgtcactttcaaaggtcaatgcaacatta |
19645846 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 230 - 305
Target Start/End: Original strand, 7632509 - 7632584
Alignment:
Q |
230 |
taaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatga |
305 |
Q |
|
|
|||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
7632509 |
taaatgttgttttatttatattactcttagatatttattgtagagataaaaatatatgaaatgagatattaaatga |
7632584 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 242
Target Start/End: Original strand, 11835087 - 11835158
Alignment:
Q |
171 |
ttatttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgtttt |
242 |
Q |
|
|
||||| ||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||| |
|
|
T |
11835087 |
ttattcggagaaattctttgttcctatttaagtatcactttcaaagttcaatggagcaataaatgttgtttt |
11835158 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 282 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 19645847 - 19645799
Alignment:
Q |
282 |
tatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtata |
330 |
Q |
|
|
||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
19645847 |
tatatgaaatgtaatattaaatgaacaaggctattatagtaaaagtata |
19645799 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0040 (Bit Score: 144; Significance: 1e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:
Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 146 - 338
Target Start/End: Original strand, 69080 - 69274
Alignment:
Q |
146 |
tactccttccatttctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgtttta |
243 |
Q |
|
|
|||||| ||| ||||||||||||||| | |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
69080 |
tactccctccgtttctttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgttcctatttaattgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgtttta |
69179 |
T |
 |
Q |
244 |
ccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
69180 |
ccaatattgtccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgaataagttcattatagtaaaagtatagcttattg |
69274 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3 (Bit Score: 144; Significance: 1e-75; HSPs: 104)
Name: chr3
Description:
Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 146 - 338
Target Start/End: Original strand, 19550226 - 19550420
Alignment:
Q |
146 |
tactccttccatttctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgtttta |
243 |
Q |
|
|
|||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
19550226 |
tactccatccgttcctttttaaatgttacttttggagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaaaattaaatgttgtttta |
19550325 |
T |
 |
Q |
244 |
ccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
T |
19550326 |
tcaatattgttcttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaatatagcttattg |
19550420 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 146 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 53745547 - 53745354
Alignment:
Q |
146 |
tactccttccatttctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgtttta |
243 |
Q |
|
|
|||||| ||| || |||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
53745547 |
tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta |
53745448 |
T |
 |
Q |
244 |
ccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
|||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
53745447 |
ccaatattatccttagttatttcttgtggagagagaaatatatgaaatg-gatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
53745354 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 145 - 338
Target Start/End: Original strand, 43554369 - 43554563
Alignment:
Q |
145 |
ttactccttccatttctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgtttt |
242 |
Q |
|
|
||||||| ||| || |||||||||||| | |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
43554369 |
ttactccatccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaaatttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttt |
43554468 |
T |
 |
Q |
243 |
accaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
43554469 |
accaatattgtccttagttatttattgcggaaagagaaatatatgaaatga-atattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
43554563 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 161 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 45513866 - 45513687
Alignment:
Q |
161 |
tttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtcctta |
258 |
Q |
|
|
||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
T |
45513866 |
tttttaagtgttacttttggagaaattttttgttcctatttaactgtcacttttaaagttcaatacaacattaaatgttgttttatcaatattgtcctta |
45513767 |
T |
 |
Q |
259 |
gttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |
|
|
T |
45513766 |
gttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattg |
45513687 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 160 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 54898338 - 54898158
Alignment:
Q |
160 |
ctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtcctt |
257 |
Q |
|
|
|||||||||||| | |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
T |
54898338 |
ctttttaagtgtcacttttggagaaaaattttgttcctatttaactatcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcctt |
54898239 |
T |
 |
Q |
258 |
agttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
54898238 |
agttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattataataaaagtatagcttattg |
54898158 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 174 - 338
Target Start/End: Original strand, 52663452 - 52663616
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtgga |
273 |
Q |
|
|
|||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
T |
52663452 |
tttggagaaattttttgttactatttaattgtcattttcaaagttcaaagcaatattaaacgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcgga |
52663551 |
T |
 |
Q |
274 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
52663552 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagcaaaagtatagcttattg |
52663616 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 145 - 338
Target Start/End: Original strand, 54106242 - 54106437
Alignment:
Q |
145 |
ttactccttccatttctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgtttt |
242 |
Q |
|
|
||||||| |||||| |||||||||||| | |||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
54106242 |
ttactccctccattcctttttaagtgtcacttttgaagaaaaattttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttt |
54106341 |
T |
 |
Q |
243 |
accaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
T |
54106342 |
accaatattatccttagttatttattgcatagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagtttattg |
54106437 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 146 - 338
Target Start/End: Original strand, 790530 - 790724
Alignment:
Q |
146 |
tactccttccatttctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgtttta |
243 |
Q |
|
|
|||||| ||| || |||||||||||| | |||||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
790530 |
tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaaatttatgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta |
790629 |
T |
 |
Q |
244 |
ccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
790630 |
ccaatattgtccttagttatttattgcggagagagaattatatgaactgggatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
790724 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 146 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 47070123 - 47069929
Alignment:
Q |
146 |
tactccttccatttctttttaagtgttattt--ggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgtttta |
243 |
Q |
|
|
|||||| |||||| |||||||||||| | || | ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
47070123 |
tactccctccattcctttttaagtgtcactttcgtagaaattttttgttcctatttaaccgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta |
47070024 |
T |
 |
Q |
244 |
ccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
T |
47070023 |
ccaatattgtccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaaattattatagtaaaagtataacttattg |
47069929 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 146 - 338
Target Start/End: Original strand, 7328435 - 7328629
Alignment:
Q |
146 |
tactccttccatttctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgtttta |
243 |
Q |
|
|
|||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
7328435 |
tactccttccgttcctttttaagtgtctcttttggagaaattttttgttcctatttaactatcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta |
7328534 |
T |
 |
Q |
244 |
ccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| |
|
|
T |
7328535 |
ctaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatgttaaatgaataaggtcattataatgaaagtataacttattg |
7328629 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 157 - 338
Target Start/End: Original strand, 29697982 - 29698165
Alignment:
Q |
157 |
tttctttttaagtgttatttg--gagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtc |
254 |
Q |
|
|
||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
T |
29697982 |
tttctttttaagtgtcattttttgagaaagtttttgttcctatttaattgtcattttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttatcaatattgtc |
29698081 |
T |
 |
Q |
255 |
cttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata-aggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
29698082 |
cttagttatttattgcggagagagaaatatatg-aatgagatattaaatgaatagaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
29698165 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 174 - 330
Target Start/End: Original strand, 17102764 - 17102920
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtgga |
273 |
Q |
|
|
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |
|
|
T |
17102764 |
tttggagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcgga |
17102863 |
T |
 |
Q |
274 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtata |
330 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
T |
17102864 |
aagagaaatatatgaaatgagatgttaaatgaataaggtcattataataaaagtata |
17102920 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 146 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 52627504 - 52627310
Alignment:
Q |
146 |
tactccttccatttctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaa-gttcaatgcaatattaaatgttgtttt |
242 |
Q |
|
|
|||||||||| || |||||||||||| | ||||||||| |||||| || |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
52627504 |
tactccttccgttcctttttaagtgtcacttttggagaagttttttgtttctatttaattgtcacttttaaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttt |
52627405 |
T |
 |
Q |
243 |
accaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
T |
52627404 |
accaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatg-gatattaaatgaataaagtcattatagtaaaagtataacttattg |
52627310 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 146 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 42672156 - 42671962
Alignment:
Q |
146 |
tactccttccatttctttttaagtgttattt--ggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgtttta |
243 |
Q |
|
|
|||||| |||||| ||||||||| || |||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
T |
42672156 |
tactccctccattcctttttaagcgtcatttttggagaaaatttttgttcctattcaactgtcacttttaaagttcaatgtaatattaaatgttgtttta |
42672057 |
T |
 |
Q |
244 |
ccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |
|
|
T |
42672056 |
ccaatattgtccttagttatttattgcagaaagagaaatatatgaaataagatattaaatgaataaggttattatagtaaaagtatagtttattg |
42671962 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 160 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 27484038 - 27483860
Alignment:
Q |
160 |
ctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtcctt |
257 |
Q |
|
|
|||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
27484038 |
ctttttaagtgttactttttaagaaagtttttgttcctatttaactgtcacttttaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtcctt |
27483939 |
T |
 |
Q |
258 |
agttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
|||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |
|
|
T |
27483938 |
agttatttattgcg--gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaatataacttattg |
27483860 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 174 - 324
Target Start/End: Original strand, 28885688 - 28885838
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtgga |
273 |
Q |
|
|
|||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |
|
|
T |
28885688 |
tttgaagaaattttttgttcctatttaaccgtcacttttaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcgga |
28885787 |
T |
 |
Q |
274 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaa |
324 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
28885788 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaa |
28885838 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 160 - 314
Target Start/End: Original strand, 20105186 - 20105342
Alignment:
Q |
160 |
ctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtcctt |
257 |
Q |
|
|
|||||||||||| | |||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
20105186 |
ctttttaagtgtcacttttggagaaaatttttgttcctctttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtcctt |
20105285 |
T |
 |
Q |
258 |
agttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtca |
314 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
20105286 |
agttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgggatattaaatgaataaggtca |
20105342 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 186 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 45101582 - 45101430
Alignment:
Q |
186 |
ttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatata |
285 |
Q |
|
|
|||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
45101582 |
ttttgttcctatttaactgtcactttgaaagttccatgaaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatata |
45101483 |
T |
 |
Q |
286 |
tgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
45101482 |
tgaaatgagatattaaatgaataaggtcattataggaaaagtatagcttattg |
45101430 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 174 - 338
Target Start/End: Original strand, 45145139 - 45145302
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtgga |
273 |
Q |
|
|
|||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| |
|
|
T |
45145139 |
tttggagaaaatttttattcttatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattatcctta-ttatttattgcgga |
45145237 |
T |
 |
Q |
274 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
T |
45145238 |
aagagatatatatgaaatgagatgttaaatgaataagatcattatagtaaaagtataacttattg |
45145302 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 160 - 341
Target Start/End: Original strand, 50091939 - 50092122
Alignment:
Q |
160 |
ctttttaagtgttattt--ggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtcctt |
257 |
Q |
|
|
||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
T |
50091939 |
ctttttaagtgttatttttggagaaactttttgttcctacttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaatattttcctt |
50092038 |
T |
 |
Q |
258 |
agttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgtat |
341 |
Q |
|
|
||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
T |
50092039 |
agttatttattacggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgactaaggttattatagtaaaagtataaattattgtat |
50092122 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 186 - 338
Target Start/End: Original strand, 51244646 - 51244798
Alignment:
Q |
186 |
ttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatata |
285 |
Q |
|
|
|||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
51244646 |
ttttgttcttatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatata |
51244745 |
T |
 |
Q |
286 |
tgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| |||||||| |
|
|
T |
51244746 |
tgaaatgagatattaaatgaataagatcattataataaaaatatggcttattg |
51244798 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 194 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 51697780 - 51697635
Alignment:
Q |
194 |
ctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatga |
293 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
51697780 |
ctatttaactgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgttgttttacgaatattgtccttagttatttattgcggggagagaaatatatgaaatga |
51697681 |
T |
 |
Q |
294 |
gatattaaatgaataaggtcattatagt-aaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
51697680 |
gatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaagtatagcttattg |
51697635 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 174 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 33491375 - 33491211
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtgga |
273 |
Q |
|
|
|||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||| |
|
|
T |
33491375 |
tttgaagaaattttttgttcctatttaactgttactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttaattatttattacgga |
33491276 |
T |
 |
Q |
274 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
T |
33491275 |
gagtgaaatatatgaaatgagatattaaataaataaggttattatagtaaaagtataacttattg |
33491211 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 174 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 43775626 - 43775462
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtgga |
273 |
Q |
|
|
|||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||| |
|
|
T |
43775626 |
tttgaagaaattttttgttttcatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatattgttttaccaatattatccttagctatttattgcgga |
43775527 |
T |
 |
Q |
274 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |
|
|
T |
43775526 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtacaacttattg |
43775462 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 179 - 342
Target Start/End: Original strand, 36234382 - 36234545
Alignment:
Q |
179 |
agaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagag |
278 |
Q |
|
|
||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| |
|
|
T |
36234382 |
agaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacgttaaatgttgttttaccaatattatccttagttattttttgcggagagag |
36234481 |
T |
 |
Q |
279 |
aaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgtatc |
342 |
Q |
|
|
||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
36234482 |
aaatatatgaaataggatattaaatgaataagatcattacagtaaaagtatagcttattgtatc |
36234545 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 146 - 338
Target Start/End: Original strand, 29651652 - 29651842
Alignment:
Q |
146 |
tactccttccatttctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgtttta |
243 |
Q |
|
|
||||||||||| || ||||||||||| | |||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |
|
|
T |
29651652 |
tactccttccaattttttttaagtgtcacttttggagaaaatttttgtttttatttaactgt----ttcaaagttcaatgcaacattaaatgttatttta |
29651747 |
T |
 |
Q |
244 |
ccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
29651748 |
tcaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaagtcattatagtaaaagtatagcttattg |
29651842 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 174 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 34266674 - 34266512
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtgga |
273 |
Q |
|
|
|||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |
|
|
T |
34266674 |
tttggagaaaatttttgtttctatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttatcaatattgtccttagttatttat--tgct |
34266577 |
T |
 |
Q |
274 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
T |
34266576 |
gcgagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattg |
34266512 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 210 - 338
Target Start/End: Original strand, 27992286 - 27992414
Alignment:
Q |
210 |
ttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataa |
309 |
Q |
|
|
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
27992286 |
ttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgccgagagagaaatatatgaaatgaaatattaaatgaataa |
27992385 |
T |
 |
Q |
310 |
ggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
27992386 |
ggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
27992414 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 144 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 47104423 - 47104237
Alignment:
Q |
144 |
tttactccttccatttctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttt |
241 |
Q |
|
|
|||||||| ||| || |||||||| ||| | ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
T |
47104423 |
tttactccctccgttcctttttaattgtcacttttagagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttt |
47104324 |
T |
 |
Q |
242 |
taccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagta |
328 |
Q |
|
|
|||||||||| || |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
47104323 |
taccaatattatcattagatatttattgtgaagagagaaacatatgaaatgaaatattaaattaataaagtcattatagtaaaagta |
47104237 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 182 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 39867077 - 39866921
Alignment:
Q |
182 |
aattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaa |
281 |
Q |
|
|
|||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
T |
39867077 |
aatttttttttcctatttaactgtcacttttaaagttcaatgcaacattaaatgttgatttaccaatattattcttagttatttattgcggagagagaaa |
39866978 |
T |
 |
Q |
282 |
tatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |
|
|
T |
39866977 |
tatatgaaatgagatgttaaattaacaaggtcattatagtaaaagcataacttattg |
39866921 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 174 - 338
Target Start/End: Original strand, 46973433 - 46973597
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtgga |
273 |
Q |
|
|
|||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |
|
|
T |
46973433 |
tttggagaaaaattttgttcttatttaactgtcactttcaaagttcaatacaacatcaaatgttattttaccaatattatccttagttatttattgcgga |
46973532 |
T |
 |
Q |
274 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
|| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |
|
|
T |
46973533 |
gaaagaaatatatgaaatgatatattaaatgaataaggtcattataataaaagtataacttattg |
46973597 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 174 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 32854184 - 32854017
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtgga |
273 |
Q |
|
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||| ||| |
|
|
T |
32854184 |
tttggagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgtaacaataaatgttgttttatcaacattacccttagttatttattgcgga |
32854085 |
T |
 |
Q |
274 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgtat |
341 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
T |
32854084 |
gagagaaatatatgaaataaaatattaaatgactaaggttattatagtaaaagtatacattattgtat |
32854017 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 194 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 13158656 - 13158507
Alignment:
Q |
194 |
ctatttaactgtcacttt-caaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatg |
292 |
Q |
|
|
|||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |
|
|
T |
13158656 |
ctatttaactgtcatttttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatataatccttagttatttattgcggagagagaaatataagaaatg |
13158557 |
T |
 |
Q |
293 |
agatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgtatc |
342 |
Q |
|
|
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |
|
|
T |
13158556 |
atatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattatatc |
13158507 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 146 - 338
Target Start/End: Original strand, 24981275 - 24981464
Alignment:
Q |
146 |
tactccttccatttctttttaagtgtta-tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttac |
244 |
Q |
|
|
|||||| |||||| |||||||||||| | |||| ||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| |
|
|
T |
24981275 |
tactccctccattcctttttaagtgtcactttgaagaaattttttgttcaaa----actatcactttcaaagttcgatgcaacattaaatattgttttac |
24981370 |
T |
 |
Q |
245 |
caatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
T |
24981371 |
caatattgtctttagttatttattgcagagagagaaatatatgaaatgatatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagtttattg |
24981464 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 174 - 341
Target Start/End: Original strand, 11473412 - 11473579
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtgga |
273 |
Q |
|
|
|||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| |
|
|
T |
11473412 |
tttggagaaattttttgttcctgtttaactttcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacattacccttagttatttattgcgga |
11473511 |
T |
 |
Q |
274 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgtat |
341 |
Q |
|
|
|||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
T |
11473512 |
aagagaagtatatgaaataagatattaaatgactaaggttattatagtaaaagtataaattattgtat |
11473579 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 174 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 30861778 - 30861611
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtgga |
273 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| ||| |
|
|
T |
30861778 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcattatcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacattacccttagctatttattgcgga |
30861679 |
T |
 |
Q |
274 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgtat |
341 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
T |
30861678 |
gagagaaatatatgaaataagatattaaatgactaagactattatagtaaaagtataaattattgtat |
30861611 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 191 - 322
Target Start/End: Original strand, 41168788 - 41168919
Alignment:
Q |
191 |
ttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaa |
290 |
Q |
|
|
||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
41168788 |
ttcctatttaactgtcattttcaaacttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaatattatctttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaa |
41168887 |
T |
 |
Q |
291 |
tgagatattaaatgaataaggtcattatagta |
322 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
41168888 |
tgagatattaaatgaataaggtcattatagta |
41168919 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 197 - 327
Target Start/End: Original strand, 49123556 - 49123686
Alignment:
Q |
197 |
tttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagat |
296 |
Q |
|
|
||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
49123556 |
tttaagtgtcactttcaaagatcaatgcaacattaaatattgttttactaatattgttcttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagat |
49123655 |
T |
 |
Q |
297 |
attaaatgaataaggtcattatagtaaaagt |
327 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
49123656 |
attaaatgaataaggtcattatagtaaaagt |
49123686 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 196 - 329
Target Start/End: Original strand, 48152017 - 48152150
Alignment:
Q |
196 |
atttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgaga |
295 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| |
|
|
T |
48152017 |
atttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattacccttagttatttattgttgaaagagaaatatataaaatgaga |
48152116 |
T |
 |
Q |
296 |
tattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtat |
329 |
Q |
|
|
||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
48152117 |
tatcaaatgaataaggttattatagtaaaagtat |
48152150 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 146 - 338
Target Start/End: Original strand, 13167996 - 13168191
Alignment:
Q |
146 |
tactccttccatttctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcacttt-caaagttcaatgcaatattaaatgttgtttt |
242 |
Q |
|
|
|||||| ||| || |||||||||||| | ||| |||||| || || ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
13167996 |
tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttagagaaaattattgttcttatttaactgtcatttttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttt |
13168095 |
T |
 |
Q |
243 |
accaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||||| |
|
|
T |
13168096 |
accaatattatccttagttatttattacagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagctaatcatagtaaaagtataacttattg |
13168191 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 174 - 338
Target Start/End: Original strand, 32980650 - 32980814
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtgga |
273 |
Q |
|
|
||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || |
|
|
T |
32980650 |
tttggagaatttttttgtttctatttaactgtcactttcaaaattcaatacaacattaaataatgttttatcaatattacccttagttatttattgtaga |
32980749 |
T |
 |
Q |
274 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| |
|
|
T |
32980750 |
gagagaaatatatgaaataagatattaaatgaataaggtcagtataataaaagtataacttattg |
32980814 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 177 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 27039839 - 27039688
Alignment:
Q |
177 |
ggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagag |
276 |
Q |
|
|
||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||| |||||| |
|
|
T |
27039839 |
ggagaaaatttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacattacccttgattatttattgcggagag |
27039740 |
T |
 |
Q |
277 |
agaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagta |
328 |
Q |
|
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
27039739 |
agaaatatatgaaataagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagta |
27039688 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 195 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 54911516 - 54911373
Alignment:
Q |
195 |
tatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgag |
294 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| ||||||| | ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || |
|
|
T |
54911516 |
tatttaactgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgatgttttatcaatattacctttaattatttattgtggagtgagaaatatatgaaataag |
54911417 |
T |
 |
Q |
295 |
atattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
T |
54911416 |
atattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattg |
54911373 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 184 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 3643421 - 3643278
Alignment:
Q |
184 |
ttttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaata |
283 |
Q |
|
|
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| | |
|
|
T |
3643421 |
ttttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaac-ttaaatgttgttttatcaatattacccttagatatttattgcggagagagaaaca |
3643323 |
T |
 |
Q |
284 |
tatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagta |
328 |
Q |
|
|
|||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
3643322 |
tatgaaatgaaatattaaattaataaggtcattatagtaaaagta |
3643278 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 178 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 33874778 - 33874630
Alignment:
Q |
178 |
gagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagaga |
277 |
Q |
|
|
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |
|
|
T |
33874778 |
gagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatagtgttttaccaatattacccttagatatttattgcggagaga |
33874679 |
T |
 |
Q |
278 |
gaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaag |
326 |
Q |
|
|
|||| |||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |
|
|
T |
33874678 |
gaaacgtatgaaatgaaatattaaattaataaggccattatagtaaaag |
33874630 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 157 - 338
Target Start/End: Original strand, 35315123 - 35315306
Alignment:
Q |
157 |
tttctttttaagtgt--tatttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtc |
254 |
Q |
|
|
||||||||||||||| | ||| |||| |||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || |
|
|
T |
35315123 |
tttctttttaagtgtctttttttaagaatttttttttttctatttaattgtcattttcaaagttcaatacaaccttaaatgttgttttaccaatattatc |
35315222 |
T |
 |
Q |
255 |
cttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
|||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| |
|
|
T |
35315223 |
tttagttatttattgcggagagataaatatatgaaatgagatgttaaatgaacaaggtcattataataaaagtataacttattg |
35315306 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 194 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 3376524 - 3376389
Alignment:
Q |
194 |
ctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagag----aaatatatgaa |
289 |
Q |
|
|
|||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |
|
|
T |
3376524 |
ctatttaactgtcagtttcaaagtccaatgcaacattaaatgttattttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagagaaaaatatatgaa |
3376425 |
T |
 |
Q |
290 |
atgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaa |
325 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
3376424 |
atgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaa |
3376389 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 174 - 328
Target Start/End: Original strand, 51064893 - 51065047
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtgga |
273 |
Q |
|
|
||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||| ||||||| ||||||||| ||| |
|
|
T |
51064893 |
tttggagaatttttttgttcctgattaactgtcactttcaaagttcaatacaatattaaatgttattataccaatattatccttagatatttattgcgga |
51064992 |
T |
 |
Q |
274 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagta |
328 |
Q |
|
|
|||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||||| |
|
|
T |
51064993 |
gagagaaacatatgaaatgaaatattaaattaataagatcattatagtgaaagta |
51065047 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 185 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 5244160 - 5244015
Alignment:
Q |
185 |
tttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatat |
284 |
Q |
|
|
||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
T |
5244160 |
tttttgttcctatttaactatcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacattacccttagttatttattgcagagagagaaatat |
5244061 |
T |
 |
Q |
285 |
atgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtata |
330 |
Q |
|
|
||| ||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
5244060 |
atggaataagatattaaatgactaaggttattatagtaaaagtata |
5244015 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 157 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 55141728 - 55141557
Alignment:
Q |
157 |
tttctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtc |
254 |
Q |
|
|
||||||||||||||| | |||||||||| ||||| || | |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |
|
|
T |
55141728 |
tttctttttaagtgtcacttttggagaaaatttttgtttcaatttaactc---ctttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattacc |
55141632 |
T |
 |
Q |
255 |
cttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtat |
329 |
Q |
|
|
|||||||||||||||| || ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
55141631 |
cttagttatttattgttgaaagataaatatataaaatgagatattaaatgaataaggttattatagtaaaagtat |
55141557 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 198 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 24276 - 24132
Alignment:
Q |
198 |
ttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagata |
297 |
Q |
|
|
||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || || | ||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| |
|
|
T |
24276 |
ttaactgtcactttcgaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatctttgctaatttattttggagaaagaaatatatgaaatgaaata |
24177 |
T |
 |
Q |
298 |
ttaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgtatc |
342 |
Q |
|
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
T |
24176 |
ttaaatgaataaggttattatagtaaaagtatatattattgtatc |
24132 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 178 - 338
Target Start/End: Original strand, 6902292 - 6902452
Alignment:
Q |
178 |
gagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagaga |
277 |
Q |
|
|
|||||| ||||| || ||||||||||||| |||| |||||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| |
|
|
T |
6902292 |
gagaaaatttttgtttctatttaactgtcccttttaaagttcaatttaacattaaattttgttttatcaatattgttcttagttatttattacagagaga |
6902391 |
T |
 |
Q |
278 |
gaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
|||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
T |
6902392 |
gaaatatatgaaatgaaatattaaataaataaggtcattatagtaaaattatagcttattg |
6902452 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 174 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 40140065 - 40139906
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtgga |
273 |
Q |
|
|
||||||||| |||||| || |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||| ||||||| ||||| |||||||||| ||| |
|
|
T |
40140065 |
tttggagaatttttttgtttctatttaactgtcacttt-----ttcaatgcaacattaaatgatattttatcaatattacccttaattatttattgcgga |
40139971 |
T |
 |
Q |
274 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
T |
40139970 |
gagagaaatatatgaaataagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattg |
40139906 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 146 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 54334448 - 54334252
Alignment:
Q |
146 |
tactccttccatttctttttaagtgttattt-ggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttac |
244 |
Q |
|
|
|||||| || ||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |
|
|
T |
54334448 |
tactccctcaattcctttttaagtgtcattttggagaaattttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttac |
54334349 |
T |
 |
Q |
245 |
caatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgtat |
341 |
Q |
|
|
||| ||| ||||| |||||||| | ||||||| |||||||||| || ||||||||||| | ||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |
|
|
T |
54334348 |
caacattacccttatttatttatcgcggagagaaaaatatatgacataagatattaaataactaaggctattataataaaagtataaattattgtat |
54334252 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 178 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 51219316 - 51219201
Alignment:
Q |
178 |
gagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagaga |
277 |
Q |
|
|
|||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
T |
51219316 |
gagaaaatttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatattgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagaga |
51219217 |
T |
 |
Q |
278 |
gaaatatatgaaatga |
293 |
Q |
|
|
|||||||||||||||| |
|
|
T |
51219216 |
gaaatatatgaaatga |
51219201 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 204 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 25983868 - 25983735
Alignment:
Q |
204 |
gtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaat |
303 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||| |||||| |
|
|
T |
25983868 |
gtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcgaagagataaatatataaaatgagaagttaaat |
25983769 |
T |
 |
Q |
304 |
gaataaggtcattatagtaaaagtatagcttatt |
337 |
Q |
|
|
||| || |||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
T |
25983768 |
gaacaaagtcattatagtaaaagtataacttatt |
25983735 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 174 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 41351431 - 41351274
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttca-aagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtgg |
272 |
Q |
|
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| || || | ||||||||| |
|
|
T |
41351431 |
tttggagaaattttttgttcctatttaactgtcactttttgaagttcaatgcatcattaaatattgttttaccaatattatctttgttcgtttattgtga |
41351332 |
T |
 |
Q |
273 |
agagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtata |
330 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
41351331 |
agagagaaatatatgaaatgaaatattaaatgaataaggttattatagtaaaagtata |
41351274 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 227 - 338
Target Start/End: Original strand, 43945442 - 43945553
Alignment:
Q |
227 |
tattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaag |
326 |
Q |
|
|
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |
|
|
T |
43945442 |
tattaaatgttgttttatcaatattgtccttagttatttattgcgaagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattacagtaaaag |
43945541 |
T |
 |
Q |
327 |
tatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
||||| |||||| |
|
|
T |
43945542 |
tatagtttattg |
43945553 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 186 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 40010888 - 40010746
Alignment:
Q |
186 |
ttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatata |
285 |
Q |
|
|
|||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
40010888 |
ttttgttcatatttaactttcattttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccgacattacccttagttatttattgcggagagagaaatata |
40010789 |
T |
 |
Q |
286 |
tgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagta |
328 |
Q |
|
|
|||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
40010788 |
tgaaataagatattaaatgactaaggttattatagtaaaagta |
40010746 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 184 - 342
Target Start/End: Original strand, 45055208 - 45055365
Alignment:
Q |
184 |
ttttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaata |
283 |
Q |
|
|
|||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| || || |||||||||| ||||||||||||| |
|
|
T |
45055208 |
ttttttgttccaatttaac-gtcactttcaaagtttaatgcatcattaaatgttgttttactaatattatcttttattatttattgcggagagagaaata |
45055306 |
T |
 |
Q |
284 |
tatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgtatc |
342 |
Q |
|
|
|| |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
T |
45055307 |
taagaaatgagatgttaaattaataatgtcattatagtaaaagtataacttattgtatc |
45055365 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 185 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 27028240 - 27028097
Alignment:
Q |
185 |
tttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatat |
284 |
Q |
|
|
||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
T |
27028240 |
tttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatattgttttaccaacattacccttggttatttattgcggagagagaaatat |
27028141 |
T |
 |
Q |
285 |
atgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagta |
328 |
Q |
|
|
||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||| |
|
|
T |
27028140 |
atgaaataagatattaaatgaataagactattataataaaagta |
27028097 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 178 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 42515404 - 42515254
Alignment:
Q |
178 |
gagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagaga |
277 |
Q |
|
|
|||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||| | |||| ||| |||| ||||||| |
|
|
T |
42515404 |
gagaaattttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttacaattattacctttagatatctattacggagaga |
42515305 |
T |
 |
Q |
278 |
gaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagta |
328 |
Q |
|
|
|||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
42515304 |
gaaacatatgaaatgaaatattaaattaataaggcgattatagtaaaagta |
42515254 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 146 - 293
Target Start/End: Original strand, 48214047 - 48214196
Alignment:
Q |
146 |
tactccttccatttctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgtttta |
243 |
Q |
|
|
|||||| ||| || |||||||||||| | |||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
48214047 |
tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaaaaatttgtttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta |
48214146 |
T |
 |
Q |
244 |
ccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatga |
293 |
Q |
|
|
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
T |
48214147 |
ccaatattacccttagttatttattgtggagagagaaatatataaaatga |
48214196 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 191 - 328
Target Start/End: Original strand, 52175747 - 52175884
Alignment:
Q |
191 |
ttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaa |
290 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| || || ||||||||| ||||||| ||| |||||||| |
|
|
T |
52175747 |
ttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaatattatctttgaatatttattgcggagagaaaaacatatgaaa |
52175846 |
T |
 |
Q |
291 |
tgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagta |
328 |
Q |
|
|
||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |
|
|
T |
52175847 |
tgaaatattaaattaataaagtcattacagtaaaagta |
52175884 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 191 - 338
Target Start/End: Original strand, 41926704 - 41926852
Alignment:
Q |
191 |
ttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggaga-gagaaatatatgaa |
289 |
Q |
|
|
||||||||||||| |||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| | ||| ||||||| |
|
|
T |
41926704 |
ttcctatttaactatcactttcaaagtttcatgtaacattaaatgttgttttaccaatattatcgttagttatttattgcggagataaaaaaaatatgaa |
41926803 |
T |
 |
Q |
290 |
atgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| |
|
|
T |
41926804 |
atgagatgttaaatgaataagatcatcatagtaaaagtataacttattg |
41926852 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 174 - 342
Target Start/End: Original strand, 41425639 - 41425807
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcacttt-caaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtgg |
272 |
Q |
|
|
||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||| ||||||| |
|
|
T |
41425639 |
tttggagaatttttttgttcctatttaagtgtcactttacatagttcaatgcaacattaaatgttactttactaatattacccttatttatt-attgtgg |
41425737 |
T |
 |
Q |
273 |
agagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgtatc |
342 |
Q |
|
|
||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| || | |||||||||| |
|
|
T |
41425738 |
agagagaaatatatgtaatgagatattaaataaataaggttattaaagtaaaaatagaaattattgtatc |
41425807 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 191 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 20848938 - 20848806
Alignment:
Q |
191 |
ttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaa |
290 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||| ||||||| |||||||| |
|
|
T |
20848938 |
ttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattactcttagat-----ttgcggaaagagaaacatatgaaa |
20848844 |
T |
 |
Q |
291 |
tgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagta |
328 |
Q |
|
|
||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
20848843 |
tgaaatattaaattaataaggccattatagtaaaagta |
20848806 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 182 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 33074506 - 33074346
Alignment:
Q |
182 |
aattttttattcctatttaactgtcacttt-caaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaa |
280 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||| | ||||||| || |||||||||||| |||||||||| |||||| |||||| |||| ||||| |||| |||||||||| |
|
|
T |
33074506 |
aattttttattcctatttaagtatcactttacatagttcaatgcaacattaaatgttattttactaatattactcttatttatt-attgcggagagagaa |
33074408 |
T |
 |
Q |
281 |
atatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgtatc |
342 |
Q |
|
|
||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| || | |||||||||| |
|
|
T |
33074407 |
atatatgtaatgagatattaaataaataaggttattatagtaaaaataaaaattattgtatc |
33074346 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 174 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 40319164 - 40318996
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcacttt-caaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtgg |
272 |
Q |
|
|
||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||| ||||||| |
|
|
T |
40319164 |
tttggagaatttttttgttcctatttaagtgtcactttacatagttcaatgcaacattaaatgttactttactaatattacccttatttatt-attgtgg |
40319066 |
T |
 |
Q |
273 |
agagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgtatc |
342 |
Q |
|
|
|||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| || | |||||||||| |
|
|
T |
40319065 |
agagagaaatatatctaatgagatattaaataaataaggttattaaagtaaaaatagaaattattgtatc |
40318996 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 146 - 330
Target Start/End: Original strand, 53281959 - 53282145
Alignment:
Q |
146 |
tactccttccatttctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgtttta |
243 |
Q |
|
|
|||||||||| || ||||||||| || | |||||||||||| ||| |||||||| | | |||||||||| |||||||||| | |||||||||||||| |
|
|
T |
53281959 |
tactccttccgttcctttttaagggtcacttttggagaaattctttgctcctatttgagtatcactttcaaggttcaatgcagcaataaatgttgtttta |
53282058 |
T |
 |
Q |
244 |
ccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtata |
330 |
Q |
|
|
|||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||| |||| |
|
|
T |
53282059 |
ccaacattacccttaattatttattacggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgactaagactattatagtaaaaatata |
53282145 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 194 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 44544385 - 44544296
Alignment:
Q |
194 |
ctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaata |
283 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
T |
44544385 |
ctatttaactgtcactttcaaaattcaatgcaacattaaatgttattttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaata |
44544296 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 185 - 325
Target Start/End: Original strand, 23771308 - 23771448
Alignment:
Q |
185 |
tttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatat |
284 |
Q |
|
|
||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
T |
23771308 |
tttttgtttctaattaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatattgttttacctttattacccttgattatttattgtagagagagaaatac |
23771407 |
T |
 |
Q |
285 |
atgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaa |
325 |
Q |
|
|
||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |
|
|
T |
23771408 |
atgaaataagatattaaatgatgaaggttattatagaaaaa |
23771448 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 174 - 341
Target Start/End: Original strand, 49168374 - 49168541
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtgga |
273 |
Q |
|
|
|||||||||||||| | || |||||||| ||||| ||| |||||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| |
|
|
T |
49168374 |
tttggagaaattttctgtttctatttaattgtcaattttaaagttcaatgcaacaataaatattgttttaccaacattactcttagttatttattgagga |
49168473 |
T |
 |
Q |
274 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgtat |
341 |
Q |
|
|
|||| |||||| |||||| | ||||||||||| |||| | |||||| ||||| |||| ||||||||| |
|
|
T |
49168474 |
gagaaaaatatttgaaataatatattaaatgactaagattattataataaaaatataaattattgtat |
49168541 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 179 - 320
Target Start/End: Original strand, 35077402 - 35077543
Alignment:
Q |
179 |
agaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagag |
278 |
Q |
|
|
|||| |||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||| ||||||| |
|
|
T |
35077402 |
agaatttttttgtttctaattaactgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgttgtttttcctataatgtccttagtaatttattgcagagagag |
35077501 |
T |
 |
Q |
279 |
aaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatag |
320 |
Q |
|
|
||||||| ||||| |||||||||| | ||||| ||||||| |
|
|
T |
35077502 |
aaatataggaaatatgatattaaataattaaggatattatag |
35077543 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 195 - 328
Target Start/End: Original strand, 52173778 - 52173911
Alignment:
Q |
195 |
tatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgag |
294 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| | || ||||||||| |||||| ||| ||||||||||| |
|
|
T |
52173778 |
tatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaatattacctttgaatatttattgcagagagaaaaacatatgaaatgaa |
52173877 |
T |
 |
Q |
295 |
atattaaatgaataaggtcattatagtaaaagta |
328 |
Q |
|
|
|||||||| |||||||||||| |||||||||| |
|
|
T |
52173878 |
atattaaactaataaggtcattgcagtaaaagta |
52173911 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 184 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 36371054 - 36370896
Alignment:
Q |
184 |
ttttttattcctatttaactgtcacttt-caaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaat |
282 |
Q |
|
|
|||||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||| | |||||||||| |||| |
|
|
T |
36371054 |
ttttttgttcctatttaagtgtcactttacatagttcaatgcaatattaaatgttactttactaatattacccttatttatt-actgtggagagaaaaat |
36370956 |
T |
 |
Q |
283 |
atatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgtatc |
342 |
Q |
|
|
||||| |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| || | |||||||||| |
|
|
T |
36370955 |
atatgttatgagatattaaataaataaggttattaaagtaaaaatagaaattattgtatc |
36370896 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 240 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 28943704 - 28943603
Alignment:
Q |
240 |
tttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgt |
339 |
Q |
|
|
|||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
T |
28943704 |
tttaccaatattatccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgactaagactattatagtaaaagtataaattattgt |
28943605 |
T |
 |
Q |
340 |
at |
341 |
Q |
|
|
|| |
|
|
T |
28943604 |
at |
28943603 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 181 - 320
Target Start/End: Original strand, 28226444 - 28226581
Alignment:
Q |
181 |
aaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaa |
280 |
Q |
|
|
||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || ||| || ||||||| |||||| || |||||||| |
|
|
T |
28226444 |
aaattttttgtttctaattaactgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgttgtttttcctataatgcccttagtaatttat--tgcagagagaa |
28226541 |
T |
 |
Q |
281 |
atatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatag |
320 |
Q |
|
|
||||||||||| |||||||||| | ||||| ||||||| |
|
|
T |
28226542 |
atatatgaaatatgatattaaataattaaggatattatag |
28226581 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 217 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 42671605 - 42671481
Alignment:
Q |
217 |
ttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcatt |
316 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||||||| |||| |||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||| |
|
|
T |
42671605 |
ttcaatgcaacattaaatgttaatttattaatattatccttatttatt-attgtggagagagaaatatatgtaatgagatattaaataaataaagttatt |
42671507 |
T |
 |
Q |
317 |
atagtaaaagtatagcttattgtatc |
342 |
Q |
|
|
|||||| || |||| |||||||||| |
|
|
T |
42671506 |
atagtacaaatataaattattgtatc |
42671481 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 174 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 22100060 - 22099905
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtgga |
273 |
Q |
|
|
|||||||||| ||||| || ||||||||||| | |||| ||||||||||||| ||||||| || ||||| |||||| |||||| ||||||||| |||| |
|
|
T |
22100060 |
tttggagaaaatttttgtttttatttaactgttattttcgaagttcaatgcaacattaaatattactttactaatattatccttacttatttattatgga |
22099961 |
T |
 |
Q |
274 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtat |
329 |
Q |
|
|
|||||||| || ||| | | |||||||||||||| | |||||||||||||||| |
|
|
T |
22099960 |
aagagaaatgtaagaagtttgtgattaaatgaataagattattatagtaaaagtat |
22099905 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 231 - 338
Target Start/End: Original strand, 29803727 - 29803822
Alignment:
Q |
231 |
aaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtata |
330 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
T |
29803727 |
aaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgtggagagagaaatatat------------taaatgaataagatcattatagtaaaagtata |
29803814 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 195 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 43159975 - 43159854
Alignment:
Q |
195 |
tatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgag |
294 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||||||| |||||| ||| |||| |||| | |
|
|
T |
43159975 |
tatttaactgtcactttcaaaattcaatgcaacattaaatgttgatttatcaatattacccttaaatatttattgcagagagaaaaacatataaaataaa |
43159876 |
T |
 |
Q |
295 |
atattaaatgaataaggtcatt |
316 |
Q |
|
|
||||||||| ||||||| |||| |
|
|
T |
43159875 |
atattaaattaataaggccatt |
43159854 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 174 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 22174076 - 22173921
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtgga |
273 |
Q |
|
|
|||||| ||||||||| || ||||||||||| | |||| ||||||||||||| ||||||| || ||||| |||||| || ||| ||||||||| |||| |
|
|
T |
22174076 |
tttggataaattttttgtttttatttaactgttattttcgaagttcaatgcaacattaaatattactttactaatattatctttacttatttattatgga |
22173977 |
T |
 |
Q |
274 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtat |
329 |
Q |
|
|
|||||||| || ||| | | |||||||||||||| | |||||||||||||||| |
|
|
T |
22173976 |
aagagaaatgtaagaagtttgtgattaaatgaataagattattatagtaaaagtat |
22173921 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 181 - 270
Target Start/End: Original strand, 2642727 - 2642816
Alignment:
Q |
181 |
aaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgt |
270 |
Q |
|
|
||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| |
|
|
T |
2642727 |
aaattttttgtttctaattaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttacctttattacccttgattatttattgt |
2642816 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 181 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 47844067 - 47844006
Alignment:
Q |
181 |
aaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgtttt |
242 |
Q |
|
|
|||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
47844067 |
aaattttttatttctaattaactgtcactttcaaagttcaatgtaatattaaatgttgtttt |
47844006 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 191 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 2154258 - 2154198
Alignment:
Q |
191 |
ttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatatt |
251 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| |
|
|
T |
2154258 |
ttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtcttatcaatatt |
2154198 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 195 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 42634562 - 42634427
Alignment:
Q |
195 |
tatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtcctta---gttatttattgtggagagagaaatatatgaaat |
291 |
Q |
|
|
||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||| || ||| ||||||||| || |||||||||||||||| | |
|
|
T |
42634562 |
tatttaactgtcacttttgaagttcagtgcaatattaaatattgttttataaatattatcgttacttcttatttattatg--gagagaaatatatgaagt |
42634465 |
T |
 |
Q |
292 |
gagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtat |
329 |
Q |
|
|
|| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
42634464 |
tagtgattaaataaataaggttattatagtaaaagtat |
42634427 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 186 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 44092253 - 44092181
Alignment:
Q |
186 |
ttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtcctta |
258 |
Q |
|
|
|||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
T |
44092253 |
ttttgttcatatttaactgttacttttaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcctta |
44092181 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 282 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 44544155 - 44544095
Alignment:
Q |
282 |
tatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgtatc |
342 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
T |
44544155 |
tatatgaaatgagatattaaatgaaaaaggttattatagtaaaagtataacttattgtatc |
44544095 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 184 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 31610334 - 31610216
Alignment:
Q |
184 |
ttttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaata |
283 |
Q |
|
|
|||||| || |||||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| | | | |||||||||| | |||||||||||| |
|
|
T |
31610334 |
ttttttctttctatttaagtgtcattttcaaagtttaatacaatattaaatgttattttaccaatatact-catggttatttattatagagagagaaata |
31610236 |
T |
 |
Q |
284 |
tatgaaatgagatattaaat |
303 |
Q |
|
|
||||||| | ||||||||| |
|
|
T |
31610235 |
tatgaaacaatatattaaat |
31610216 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 268 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 29458345 - 29458271
Alignment:
Q |
268 |
tgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgtatc |
342 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| || | |||||||||| |
|
|
T |
29458345 |
tgtggagagagaaatatatgtaatgagatattaaataaataaggttattatagtaaaaatagaaattattgtatc |
29458271 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 198 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 35458716 - 35458594
Alignment:
Q |
198 |
ttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagata |
297 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||| | ||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| |||| |
|
|
T |
35458716 |
ttaactgtcactttcaaagttcaatgtgacattaaatgttgtttttcctataaagcccttagtaatttattagagagagaaaaatatatgaaatatgata |
35458617 |
T |
 |
Q |
298 |
ttaaatgaataaggtcattatag |
320 |
Q |
|
|
|||||| | ||||| ||||||| |
|
|
T |
35458616 |
ttaaataattaaggatattatag |
35458594 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 228 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 32853540 - 32853442
Alignment:
Q |
228 |
attaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagt |
327 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||| |||||||||| || ||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |
|
|
T |
32853540 |
attaaatgttgttttaccaatattacctttaaatatttattgcagagagagaaacat--gaaatgaaatattaaattaataaggtcgttatagtaaaagt |
32853443 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 198 - 325
Target Start/End: Original strand, 26748387 - 26748514
Alignment:
Q |
198 |
ttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagata |
297 |
Q |
|
|
||||||||| ||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| || |
|
|
T |
26748387 |
ttaactgtcgttttcaaagtccaatgtatcattaaatgtggttttacctatattacccttatatatttattgctgagagagaaatatatggaatgaagta |
26748486 |
T |
 |
Q |
298 |
ttaaatgaataaggtcattatagtaaaa |
325 |
Q |
|
|
|||||| | |||||| ||||||| |||| |
|
|
T |
26748487 |
ttaaattattaaggttattatagaaaaa |
26748514 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 272 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 8237033 - 8236975
Alignment:
Q |
272 |
gagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtata |
330 |
Q |
|
|
|||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
8237033 |
gagagaaaaatatatgaaattagatattaaatgaacaaggttattatagtaaaagtata |
8236975 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 198 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 53290973 - 53290851
Alignment:
Q |
198 |
ttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagata |
297 |
Q |
|
|
|||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||| | ||| || ||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||| |||| |
|
|
T |
53290973 |
ttaagtgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgttattttttctataatgcccttaataatttattgcagagagagaaatataagaaatatgata |
53290874 |
T |
 |
Q |
298 |
ttaaatgaataaggtcattatag |
320 |
Q |
|
|
|||||| | ||||| ||||||| |
|
|
T |
53290873 |
ttaaataattaaggatattatag |
53290851 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 303
Target Start/End: Original strand, 24569570 - 24569689
Alignment:
Q |
184 |
ttttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaata |
283 |
Q |
|
|
|||||| || ||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || ||| || |||| | |||||||| |||| | ||||| |
|
|
T |
24569570 |
ttttttgtttctaattaattgttactttcaaagttcaatgtaatattaaatgttatttttcctataatgctcttaataatttattgcagagacaaaaata |
24569669 |
T |
 |
Q |
284 |
tatgaaatgagatattaaat |
303 |
Q |
|
|
|||||||| |||||||||| |
|
|
T |
24569670 |
tatgaaatatgatattaaat |
24569689 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 198 - 325
Target Start/End: Original strand, 34750689 - 34750816
Alignment:
Q |
198 |
ttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagata |
297 |
Q |
|
|
||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| | ||| || ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| | |
|
|
T |
34750689 |
ttaactgtcgttttcaaagttcaatgtatcattaaatgtggctttgcctatattacccttatatatttattgcagagagagaaatatatgaaatgaagca |
34750788 |
T |
 |
Q |
298 |
ttaaatgaataaggtcattatagtaaaa |
325 |
Q |
|
|
|||||| | |||||| ||||||| |||| |
|
|
T |
34750789 |
ttaaataattaaggttattataggaaaa |
34750816 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 198 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 40113459 - 40113366
Alignment:
Q |
198 |
ttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaat |
291 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||| | ||||| | |||||||| |||||| || |||||||||| |
|
|
T |
40113459 |
ttaactgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgttgttttttctataaagcccttaataatttattggagagagaaaagtatatgaaat |
40113366 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 174 - 237
Target Start/End: Original strand, 29803645 - 29803708
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgtt |
237 |
Q |
|
|
|||||||||| ||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
T |
29803645 |
tttggagaaaaaatttgttcatatttaattgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgtt |
29803708 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 184 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 29458946 - 29458865
Alignment:
Q |
184 |
ttttttattcctatttaactgtcacttt-caaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatt |
264 |
Q |
|
|
|||||| ||||||||||| ||||||| | || |||||||||||| |||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||| |
|
|
T |
29458946 |
tttttttttcctatttaagtgtcactctacatagttcaatgcaacattaaatgttattttactaatattacccttatttatt |
29458865 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 272 - 325
Target Start/End: Original strand, 53055339 - 53055392
Alignment:
Q |
272 |
gagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaa |
325 |
Q |
|
|
|||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |
|
|
T |
53055339 |
gagagataaatatatgaaatgagatattaaatgataaaggttattatagaaaaa |
53055392 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 283
Target Start/End: Original strand, 18355927 - 18356007
Alignment:
Q |
203 |
tgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaata |
283 |
Q |
|
|
|||||||||||| |||||||||| ||||| | ||| |||| ||||| | ||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
T |
18355927 |
tgtcactttcaagtttcaatgcaacattaattattgatttatcaataatacccttacttatttattgtagagagagaaata |
18356007 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 184 - 235
Target Start/End: Original strand, 1201083 - 1201134
Alignment:
Q |
184 |
ttttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatg |
235 |
Q |
|
|
|||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |
|
|
T |
1201083 |
ttttttgtttctaattaactgtcactttcaaagttcaatacaacattaaatg |
1201134 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0024 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0024
Description:
Target: scaffold0024; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 160 - 338
Target Start/End: Original strand, 49141 - 49320
Alignment:
Q |
160 |
ctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtcctt |
257 |
Q |
|
|
|||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
T |
49141 |
ctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcctt |
49240 |
T |
 |
Q |
258 |
agttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |
|
|
T |
49241 |
agttatttattgtggagagagaaatatatgaaatga-aaattaaatgaataaggtcattataataaaagtatagtttattg |
49320 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0831 (Bit Score: 125; Significance: 3e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0831
Description:
Target: scaffold0831; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 174 - 338
Target Start/End: Original strand, 2817 - 2981
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtgga |
273 |
Q |
|
|
||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |
|
|
T |
2817 |
tttggagaatttttttatttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattacgga |
2916 |
T |
 |
Q |
274 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |
|
|
T |
2917 |
gagagaaatatatgaaatgagttgttaaatgaataaggtcattataataaaagtataacttattg |
2981 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1213 (Bit Score: 121; Significance: 6e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold1213
Description:
Target: scaffold1213; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 182 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 190 - 34
Alignment:
Q |
182 |
aattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaa |
281 |
Q |
|
|
||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
T |
190 |
aatttgttgttcttatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaa |
91 |
T |
 |
Q |
282 |
tatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |
|
|
T |
90 |
tatatgaaatgagatgttaaatgaataaggtcattatagtaaaagtacaacttattg |
34 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0007 (Bit Score: 120; Significance: 3e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:
Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 191 - 338
Target Start/End: Original strand, 77115 - 77262
Alignment:
Q |
191 |
ttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaa |
290 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
77115 |
ttcctatttaactgtcactttcaaagtccaatgcaatattaaatgttgttttactaatattatctttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaa |
77214 |
T |
 |
Q |
291 |
tgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |
|
|
T |
77215 |
tgagatattaaatgaataaggttattatagtaaaagtatagtttattg |
77262 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0280 (Bit Score: 117; Significance: 2e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0280
Description:
Target: scaffold0280; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 174 - 338
Target Start/End: Original strand, 8164 - 8328
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtgga |
273 |
Q |
|
|
|||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || |
|
|
T |
8164 |
tttgaagaaattttttgtttctatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattcttcttagttatttattgcaga |
8263 |
T |
 |
Q |
274 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
T |
8264 |
gaaagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaagtataacttattg |
8328 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0172 (Bit Score: 117; Significance: 2e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0172
Description:
Target: scaffold0172; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 149 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 26385 - 26194
Alignment:
Q |
149 |
tccttccatttctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttacca |
246 |
Q |
|
|
||||||| || |||||||||||| | |||||||||| ||| || |||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
T |
26385 |
tccttccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaaaaatttgtttctatttaattgtcacttttaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttacca |
26286 |
T |
 |
Q |
247 |
atattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
26285 |
atattgtccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaattgaatattaaatgaataaggtcattataataaaagtatagcttattg |
26194 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0018 (Bit Score: 111; Significance: 6e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:
Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 146 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 184388 - 184191
Alignment:
Q |
146 |
tactccttccatttctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgtttta |
243 |
Q |
|
|
|||||| ||| || |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| |
|
|
T |
184388 |
tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttattcctatttaactgtcgctttcaaagttcaatgcaacaataaatattgtttta |
184289 |
T |
 |
Q |
244 |
ccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgtat |
341 |
Q |
|
|
|||| ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
T |
184288 |
ccaacattacccttagttatttattgcggagagataaatatatgaaataagatattaaatgactaaggctattatagtaaaagtataaattattgtat |
184191 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0002 (Bit Score: 106; Significance: 6e-53; HSPs: 4)
Name: scaffold0002
Description:
Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 194 - 342
Target Start/End: Original strand, 148332 - 148481
Alignment:
Q |
194 |
ctatttaactgtcacttt-caaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatg |
292 |
Q |
|
|
|||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |
|
|
T |
148332 |
ctatttaactgtcatttttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatataatccttagttatttattgcggagagagaaatataagaaatg |
148431 |
T |
 |
Q |
293 |
agatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgtatc |
342 |
Q |
|
|
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |
|
|
T |
148432 |
atatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattatatc |
148481 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 146 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 138992 - 138797
Alignment:
Q |
146 |
tactccttccatttctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcacttt-caaagttcaatgcaatattaaatgttgtttt |
242 |
Q |
|
|
|||||| ||| || |||||||||||| | ||| |||||| || || ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
138992 |
tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttagagaaaattattgttcttatttaactgtcatttttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttt |
138893 |
T |
 |
Q |
243 |
accaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||||| |
|
|
T |
138892 |
accaatattatccttagttatttattacagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagctaatcatagtaaaagtataacttattg |
138797 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0002; HSP #3
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 184 - 305
Target Start/End: Original strand, 369425 - 369544
Alignment:
Q |
184 |
ttttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaata |
283 |
Q |
|
|
|||||| || ||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || |||| |||| ||||||||| || ||||||||||| |
|
|
T |
369425 |
ttttttgtttctagttaagtgtgactttcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttgtcattattacccttggttatttat--tgcagagagaaata |
369522 |
T |
 |
Q |
284 |
tatgaaatgagatattaaatga |
305 |
Q |
|
|
|||||||||| ||||||||||| |
|
|
T |
369523 |
tatgaaatgaaatattaaatga |
369544 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0002; HSP #4
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 198 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 492547 - 492454
Alignment:
Q |
198 |
ttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaat |
291 |
Q |
|
|
|||| |||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||| || ||| || | ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
492547 |
ttaagtgtcactttcaaagtttaatgtaacattaaatgttgtttttcctataatgcctttagtaatttattgcagagatagaaatatatgaaat |
492454 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0192 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:
Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 146 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 14982 - 14784
Alignment:
Q |
146 |
tactccttccatttctttttaagtgttattt--ggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgtttta |
243 |
Q |
|
|
|||||| ||| || |||||||||||| | || ||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
14982 |
tactccctccgttcctttttaagtgtcactttcggagaaactttttgttccaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta |
14883 |
T |
 |
Q |
244 |
ccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgtatc |
342 |
Q |
|
|
||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
T |
14882 |
tcaatattacccctagttatttattgcggagagagaaatatatgacatgagatattaaatgaataagtctattatagtaaaagtatcaattattgtatc |
14784 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0886 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0886
Description:
Target: scaffold0886; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 174 - 338
Target Start/End: Original strand, 4526 - 4689
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtgga |
273 |
Q |
|
|
|||| |||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
4526 |
tttgaagaatttttttgtttttatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgatgttttattaatatac-ccttagttatttattgtgga |
4624 |
T |
 |
Q |
274 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattg |
338 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |
|
|
T |
4625 |
gagagaaatatatgaaataagatattaaataaataaggtcattatagtaaaaatataacttattg |
4689 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0009 (Bit Score: 89; Significance: 8e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:
Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 178 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 147355 - 147207
Alignment:
Q |
178 |
gagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagaga |
277 |
Q |
|
|
|||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
T |
147355 |
gagaaattttttgttcatatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttatcaatattacccttagatatttattgtgaagaga |
147256 |
T |
 |
Q |
278 |
gaaatatatgaaat-gagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaa |
325 |
Q |
|
|
|||| ||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||||||||| |
|
|
T |
147255 |
gaaacatatgaaataaaaatattaaattaataaggccattatagtaaaa |
147207 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0343 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0343
Description:
Target: scaffold0343; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 178 - 328
Target Start/End: Original strand, 7438 - 7588
Alignment:
Q |
178 |
gagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagaga |
277 |
Q |
|
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||||||||| || |||| |
|
|
T |
7438 |
gagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcatcattaaatgttattttatcaatattacccttagatatttattgcggggaga |
7537 |
T |
 |
Q |
278 |
gaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagta |
328 |
Q |
|
|
|||| ||| ||||||| || |||||| || ||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
7538 |
gaaacatacgaaatgaaatcttaaattaacaaggtcattatagtaaaagta |
7588 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0019 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:
Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 144 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 72210 - 72067
Alignment:
Q |
144 |
tttactccttccatttctttttaagtgtta--tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttt |
241 |
Q |
|
|
|||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |
|
|
T |
72210 |
tttactccctccgtttttttttaagtgtatcttttggagaaattttttgttcttatttaattgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgatt |
72111 |
T |
 |
Q |
242 |
taccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatata |
285 |
Q |
|
|
|||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
72110 |
taccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatata |
72067 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0001 (Bit Score: 76; Significance: 5e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:
Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 203 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 419694 - 419555
Alignment:
Q |
203 |
tgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaa |
302 |
Q |
|
|
||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
419694 |
tgtcactttcaaaattcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattactcttagttatttattacggaaagagaaatatatgaaatgagatattaaa |
419595 |
T |
 |
Q |
303 |
tgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgtatc |
342 |
Q |
|
|
| |||||| | |||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
T |
419594 |
taaataagattattatagtaaaagtatcaattattgtatc |
419555 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0135 (Bit Score: 74; Significance: 7e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0135
Description:
Target: scaffold0135; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 191 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 30906 - 30769
Alignment:
Q |
191 |
ttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaa |
290 |
Q |
|
|
|||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |
|
|
T |
30906 |
ttcctaattaactgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgatgttttaccaatattacccttagatatttattgcagagagagaaacatatgaat |
30807 |
T |
 |
Q |
291 |
tgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagta |
328 |
Q |
|
|
||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||| |
|
|
T |
30806 |
tgaaatattaaattagcaaggtctttatagtaaaagta |
30769 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0274 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0274
Description:
Target: scaffold0274; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 196 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 448 - 314
Alignment:
Q |
196 |
atttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgaga |
295 |
Q |
|
|
|||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||| ||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| |
|
|
T |
448 |
atttaactgtcacttttaaagttcaacgtaacattaaatggtgttttatcaatattatccttacttatttattgcaaagagataaatatatgaaattaga |
349 |
T |
 |
Q |
296 |
tattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtata |
330 |
Q |
|
|
|||| |||||||||||| |||||||||||| |||| |
|
|
T |
348 |
tattgaatgaataaggttattatagtaaaaatata |
314 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0325 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0325
Description:
Target: scaffold0325; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 194 - 324
Target Start/End: Original strand, 345 - 475
Alignment:
Q |
194 |
ctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatga |
293 |
Q |
|
|
|||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |
|
|
T |
345 |
ctatttaattgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaaaattacttttagatatttattgcagagagggaaacatatgaaatga |
444 |
T |
 |
Q |
294 |
gatattaaatgaataaggtcattatagtaaa |
324 |
Q |
|
|
||||||||| |||||| |||||||||||| |
|
|
T |
445 |
aatattaaattaataagaccattatagtaaa |
475 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0014 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0014
Description:
Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 253 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 195738 - 195650
Alignment:
Q |
253 |
tccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgtatc |
342 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
T |
195738 |
tccttagttatttattgtggagagaaaaatatatgaaatg-gatattaaatgaataagatcgttatagtaaaagtatagtttattgtatc |
195650 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 145 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 196000 - 195882
Alignment:
Q |
145 |
ttactccttccatttctttttaagtgttattt--ggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgtttt |
242 |
Q |
|
|
||||||| ||| || |||||||||||| |||| ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
196000 |
ttactccctccgttcctttttaagtgtcatttttggagaaaatttttgttcttatttaactgtcacttttaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttt |
195901 |
T |
 |
Q |
243 |
accaatattgtccttagtt |
261 |
Q |
|
|
| ||||||| ||||||||| |
|
|
T |
195900 |
atcaatattatccttagtt |
195882 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0006 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:
Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 184 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 96282 - 96141
Alignment:
Q |
184 |
ttttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaata |
283 |
Q |
|
|
|||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || |||| |||| ||||||||||| ||||||||| || |
|
|
T |
96282 |
ttttttgtttctaattaactgtcactttcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttgcctttattacccttgattatttattgtagagagagaagta |
96183 |
T |
 |
Q |
284 |
tatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaa |
325 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |
|
|
T |
96182 |
aatgaaatgagatattaaatgatgaaggttattataggaaaa |
96141 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0471 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0471
Description:
Target: scaffold0471; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 241 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 1981 - 1881
Alignment:
Q |
241 |
ttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgta |
340 |
Q |
|
|
||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
T |
1981 |
ttaccaacattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgactaaggttattatagtaaaagtatagattattgta |
1882 |
T |
 |
Q |
341 |
t |
341 |
Q |
|
|
| |
|
|
T |
1881 |
t |
1881 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0036 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:
Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 174 - 320
Target Start/End: Original strand, 23146 - 23292
Alignment:
Q |
174 |
tttggagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtgga |
273 |
Q |
|
|
|||| ||||| ||||| || ||| |||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || |||| |||| ||||||||||| || |
|
|
T |
23146 |
tttgaagaaaatttttgtttctaattaagtgtcactttcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttgtcattattacccttggttatttattgccga |
23245 |
T |
 |
Q |
274 |
gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatag |
320 |
Q |
|
|
|||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||| |
|
|
T |
23246 |
gagaaaaatatataaaatgagatattaaatgataaaggttattatag |
23292 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0003 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:
Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 184 - 325
Target Start/End: Original strand, 252614 - 252755
Alignment:
Q |
184 |
ttttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaata |
283 |
Q |
|
|
|||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| | |||| |||| ||||||||||| ||||||||| || |
|
|
T |
252614 |
ttttttgtttctaattaactgtcactttcaaagttcaatacaacattaaatattgttttgtctttattacccttgattatttattgtagagagagaagta |
252713 |
T |
 |
Q |
284 |
tatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaa |
325 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |
|
|
T |
252714 |
aatgaaatgagatattaaatgatgaaggttattataggaaaa |
252755 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0236 (Bit Score: 54; Significance: 6e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0236
Description:
Target: scaffold0236; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 184 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 14471 - 14330
Alignment:
Q |
184 |
ttttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaata |
283 |
Q |
|
|
||||||||| ||| |||| |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | |||| |||| ||||||||||| ||||||||| || |
|
|
T |
14471 |
ttttttatttctaattaagcgtcattttcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttgtctttattacccttgattatttattgtagagagagaagta |
14372 |
T |
 |
Q |
284 |
tatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaa |
325 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |
|
|
T |
14371 |
aatgaaatgagatattaaatgatgaaggttattataggaaaa |
14330 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1254 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold1254
Description:
Target: scaffold1254; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 196 - 300
Target Start/End: Original strand, 1065 - 1169
Alignment:
Q |
196 |
atttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgaga |
295 |
Q |
|
|
|||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| | |
|
|
T |
1065 |
atttaactgtcattttcaaagttcaatacaacattaaatattattttaccaatattaaccttagttatttattacagaaagataaatatatgaaatgaaa |
1164 |
T |
 |
Q |
296 |
tatta |
300 |
Q |
|
|
||||| |
|
|
T |
1165 |
tatta |
1169 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0419 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0419
Description:
Target: scaffold0419; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 196 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 6564 - 6460
Alignment:
Q |
196 |
atttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgaga |
295 |
Q |
|
|
|||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| | |
|
|
T |
6564 |
atttaactgtcattttcaaagttcaatacaacattaaatattattttaccaatattaaccttagttatttattacagaaagataaatatatgaaatgaaa |
6465 |
T |
 |
Q |
296 |
tatta |
300 |
Q |
|
|
||||| |
|
|
T |
6464 |
tatta |
6460 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold2146 (Bit Score: 49; Significance: 6e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold2146
Description:
Target: scaffold2146; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 211 - 307
Target Start/End: Original strand, 599 - 695
Alignment:
Q |
211 |
tcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaat |
307 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||| |
|
|
T |
599 |
tcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttttcaatattacccttaattatttattacaaagagagaaatatatgaaacaatatattaaatgaat |
695 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0102 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:
Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 309
Target Start/End: Original strand, 20996 - 21117
Alignment:
Q |
188 |
ttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatg |
287 |
Q |
|
|
||||| ||||||| | ||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| | | |||||| |||||| | || ||||||||||| |
|
|
T |
20996 |
ttatttctatttagccgtcgttttcaaagttcaatgcaacattaaattttgttttactaatactattcttagtcatttatcctagatagagaaatataaa |
21095 |
T |
 |
Q |
288 |
aaatgagatattaaatgaataa |
309 |
Q |
|
|
|| ||||||| |||||||||| |
|
|
T |
21096 |
taacgagatatcaaatgaataa |
21117 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
© Oklahoma State University
This website was viewed 1014 times since January 2019
Visitors: 4400