View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0714_low_27 (Length: 361)

Name: NF0714_low_27
Description: NF0714
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0714_low_27
NF0714_low_27
[»] chr8 (26 HSPs)
chr8 (98-361)||(22006176-22006440)
chr8 (95-361)||(13662180-13662447)
chr8 (95-355)||(13720843-13721104)
chr8 (95-355)||(16872966-16873227)
chr8 (98-361)||(271278-271542)
chr8 (98-361)||(644378-644642)
chr8 (98-361)||(830113-830377)
chr8 (98-361)||(22088712-22088976)
chr8 (98-361)||(15319077-15319341)
chr8 (98-361)||(15499446-15499710)
chr8 (90-361)||(16195304-16195577)
chr8 (95-299)||(24549120-24549319)
chr8 (98-299)||(6774175-6774371)
chr8 (100-298)||(21844490-21844684)
chr8 (98-298)||(21851881-21852077)
chr8 (95-317)||(16674305-16674524)
chr8 (98-268)||(30120890-30121060)
chr8 (99-315)||(17345690-17345917)
chr8 (178-268)||(16404981-16405071)
chr8 (178-268)||(24928797-24928887)
chr8 (179-299)||(16193723-16193841)
chr8 (92-172)||(22907123-22907204)
chr8 (92-153)||(5238380-5238441)
chr8 (92-153)||(24661157-24661218)
chr8 (222-299)||(43373518-43373593)
chr8 (92-153)||(43685839-43685900)
[»] chr7 (33 HSPs)
chr7 (98-361)||(15950709-15950973)
chr7 (95-355)||(18979936-18980197)
chr7 (95-355)||(15927648-15927909)
chr7 (95-361)||(15760029-15760296)
chr7 (95-355)||(13758450-13758711)
chr7 (98-361)||(7822802-7823066)
chr7 (98-361)||(7830113-7830377)
chr7 (98-361)||(27101555-27101819)
chr7 (98-361)||(27108903-27109167)
chr7 (98-361)||(27176507-27176771)
chr7 (98-361)||(38783647-38783911)
chr7 (95-355)||(14250813-14251074)
chr7 (89-303)||(48622575-48622788)
chr7 (89-316)||(10000279-10000505)
chr7 (89-316)||(16418618-16418844)
chr7 (98-268)||(2437625-2437794)
chr7 (95-298)||(13572816-13573015)
chr7 (98-317)||(13910939-13911156)
chr7 (96-268)||(18253759-18253931)
chr7 (98-268)||(10989577-10989746)
chr7 (98-299)||(16478879-16479075)
chr7 (94-317)||(13321134-13321369)
chr7 (96-181)||(15862174-15862259)
chr7 (94-299)||(47480941-47481156)
chr7 (92-299)||(16211904-16212108)
chr7 (172-268)||(295966-296062)
chr7 (92-172)||(7293289-7293370)
chr7 (92-172)||(30262038-30262119)
chr7 (222-268)||(11580789-11580835)
chr7 (178-268)||(13037020-13037110)
chr7 (92-153)||(11516520-11516581)
chr7 (92-153)||(14113898-14113959)
chr7 (92-153)||(15441473-15441534)
[»] chr4 (26 HSPs)
chr4 (98-361)||(18169044-18169308)
chr4 (95-355)||(7131980-7132241)
chr4 (96-361)||(19020560-19020826)
chr4 (95-355)||(20000803-20001064)
chr4 (95-361)||(15287160-15287427)
chr4 (95-361)||(15294269-15294536)
chr4 (90-361)||(18248292-18248564)
chr4 (95-361)||(17145572-17145839)
chr4 (89-315)||(22738390-22738616)
chr4 (95-301)||(22351979-22352184)
chr4 (95-316)||(26339140-26339360)
chr4 (107-222)||(8378365-8378480)
chr4 (220-361)||(8374582-8374724)
chr4 (98-297)||(10644360-10644554)
chr4 (95-268)||(47357822-47357992)
chr4 (222-317)||(40885604-40885698)
chr4 (96-173)||(9795490-9795566)
chr4 (178-268)||(54118250-54118340)
chr4 (89-140)||(8378482-8378533)
chr4 (178-268)||(15675095-15675185)
chr4 (178-268)||(10104256-10104346)
chr4 (178-299)||(122027-122146)
chr4 (222-317)||(13048271-13048365)
chr4 (222-317)||(31115748-31115842)
chr4 (92-299)||(26680338-26680554)
chr4 (92-153)||(16609008-16609069)
[»] chr5 (35 HSPs)
chr5 (95-361)||(1219435-1219702)
chr5 (98-355)||(10777888-10778146)
chr5 (95-355)||(23514641-23514902)
chr5 (95-361)||(7425398-7425665)
chr5 (98-361)||(17471506-17471770)
chr5 (98-361)||(21932299-21932563)
chr5 (98-361)||(21938469-21938733)
chr5 (98-361)||(35582110-35582374)
chr5 (95-361)||(35791013-35791281)
chr5 (102-361)||(22883006-22883266)
chr5 (98-361)||(36989688-36989952)
chr5 (98-361)||(11211983-11212247)
chr5 (95-316)||(23328678-23328898)
chr5 (95-316)||(24616282-24616502)
chr5 (95-316)||(24712658-24712878)
chr5 (95-316)||(24745676-24745896)
chr5 (95-298)||(27009981-27010180)
chr5 (98-268)||(25426796-25426965)
chr5 (98-299)||(29188201-29188397)
chr5 (98-268)||(18777907-18778076)
chr5 (98-268)||(19500067-19500236)
chr5 (98-268)||(22366396-22366565)
chr5 (98-317)||(4199900-4200117)
chr5 (98-268)||(12542-12711)
chr5 (98-268)||(21073510-21073679)
chr5 (98-268)||(43443312-43443479)
chr5 (178-361)||(32950767-32950952)
chr5 (178-299)||(23507103-23507222)
chr5 (96-315)||(34939398-34939628)
chr5 (178-268)||(18531073-18531163)
chr5 (178-268)||(22053839-22053929)
chr5 (92-269)||(25900315-25900503)
chr5 (92-153)||(20623262-20623323)
chr5 (92-153)||(21233437-21233498)
chr5 (92-153)||(37053037-37053098)
[»] chr2 (26 HSPs)
chr2 (95-361)||(34824549-34824816)
chr2 (95-361)||(12728466-12728733)
chr2 (95-355)||(8943926-8944187)
chr2 (95-361)||(16935667-16935934)
chr2 (95-361)||(17006327-17006594)
chr2 (95-355)||(12635783-12636044)
chr2 (95-355)||(42177884-42178145)
chr2 (98-361)||(11231256-11231520)
chr2 (92-355)||(12641554-12641818)
chr2 (98-361)||(22513103-22513367)
chr2 (98-361)||(24685699-24685963)
chr2 (98-361)||(28775725-28775989)
chr2 (95-355)||(3798518-3798779)
chr2 (96-361)||(23777961-23778227)
chr2 (145-361)||(21141969-21142187)
chr2 (95-316)||(23774257-23774477)
chr2 (89-316)||(5888539-5888765)
chr2 (98-268)||(19886576-19886745)
chr2 (96-299)||(7507756-7507969)
chr2 (94-299)||(462876-463078)
chr2 (94-268)||(25265300-25265486)
chr2 (178-268)||(43642963-43643053)
chr2 (92-298)||(17396562-17396776)
chr2 (92-153)||(14906349-14906410)
chr2 (178-267)||(20627319-20627408)
chr2 (92-153)||(23820364-23820425)
[»] chr3 (29 HSPs)
chr3 (98-361)||(49232510-49232774)
chr3 (98-361)||(25058813-25059077)
chr3 (95-355)||(18911073-18911334)
chr3 (98-361)||(22275283-22275547)
chr3 (98-361)||(1467657-1467921)
chr3 (98-361)||(15468258-15468522)
chr3 (98-361)||(12264710-12264975)
chr3 (96-361)||(12902006-12902272)
chr3 (95-361)||(5228387-5228653)
chr3 (98-338)||(12811938-12812179)
chr3 (90-361)||(54651531-54651803)
chr3 (89-361)||(44229059-44229332)
chr3 (98-266)||(18896962-18897130)
chr3 (96-268)||(15936551-15936723)
chr3 (98-268)||(55316387-55316555)
chr3 (96-268)||(15938393-15938565)
chr3 (98-268)||(41270243-41270411)
chr3 (98-297)||(16821280-16821474)
chr3 (92-298)||(15614973-15615174)
chr3 (178-306)||(11986172-11986300)
chr3 (222-353)||(17912532-17912662)
chr3 (178-299)||(51158024-51158143)
chr3 (178-268)||(15859030-15859120)
chr3 (319-361)||(18897139-18897181)
chr3 (92-268)||(13839061-13839237)
chr3 (178-268)||(12030153-12030243)
chr3 (178-299)||(14842567-14842686)
chr3 (92-172)||(13954799-13954880)
chr3 (92-153)||(2449147-2449208)
[»] scaffold0023 (4 HSPs)
scaffold0023 (95-361)||(153922-154189)
scaffold0023 (101-210)||(169830-169938)
scaffold0023 (98-265)||(36264-36430)
scaffold0023 (96-268)||(48765-48936)
[»] chr6 (27 HSPs)
chr6 (95-355)||(18086738-18086999)
chr6 (95-355)||(16231972-16232233)
chr6 (95-361)||(1556079-1556346)
chr6 (98-361)||(16376291-16376555)
chr6 (98-361)||(16383615-16383879)
chr6 (98-361)||(22225656-22225920)
chr6 (98-361)||(10488773-10489037)
chr6 (98-361)||(16556057-16556321)
chr6 (98-361)||(16632613-16632877)
chr6 (95-355)||(23977849-23978110)
chr6 (96-355)||(13620710-13620970)
chr6 (95-361)||(19610092-19610359)
chr6 (98-298)||(19299375-19299575)
chr6 (98-262)||(22251484-22251648)
chr6 (121-353)||(29665955-29666189)
chr6 (95-316)||(29869691-29869911)
chr6 (92-268)||(1650016-1650189)
chr6 (98-268)||(25175731-25175901)
chr6 (109-235)||(16825678-16825803)
chr6 (98-268)||(27653898-27654067)
chr6 (178-299)||(14626124-14626243)
chr6 (95-315)||(15862592-15862823)
chr6 (95-315)||(1657659-1657890)
chr6 (253-317)||(27740957-27741021)
chr6 (94-268)||(35009349-35009535)
chr6 (178-268)||(23153614-23153704)
chr6 (94-172)||(27751698-27751777)
[»] chr1 (20 HSPs)
chr1 (98-361)||(18059676-18059940)
chr1 (98-361)||(17004712-17004976)
chr1 (95-361)||(46523463-46523729)
chr1 (105-355)||(17148647-17148898)
chr1 (98-361)||(38055009-38055273)
chr1 (98-298)||(19962417-19962617)
chr1 (98-299)||(22227947-22228146)
chr1 (98-299)||(22232644-22232843)
chr1 (95-316)||(22035568-22035788)
chr1 (95-316)||(7640849-7641069)
chr1 (92-299)||(2116393-2116595)
chr1 (98-268)||(5072304-5072472)
chr1 (92-299)||(45051561-45051763)
chr1 (134-268)||(18601068-18601202)
chr1 (178-268)||(20445846-20445936)
chr1 (178-299)||(20913168-20913287)
chr1 (178-299)||(20931483-20931602)
chr1 (178-268)||(20531611-20531701)
chr1 (94-268)||(37844371-37844546)
chr1 (178-268)||(20893632-20893722)
[»] scaffold1500 (1 HSPs)
scaffold1500 (95-355)||(1429-1690)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (95-355)||(1490-1751)
[»] scaffold0213 (1 HSPs)
scaffold0213 (98-361)||(29236-29500)
[»] scaffold0107 (2 HSPs)
scaffold0107 (98-361)||(31383-31647)
scaffold0107 (147-361)||(39720-39935)
[»] scaffold0076 (2 HSPs)
scaffold0076 (98-361)||(39177-39441)
scaffold0076 (98-298)||(43137-43333)
[»] scaffold0467 (1 HSPs)
scaffold0467 (90-361)||(10249-10521)
[»] scaffold0383 (1 HSPs)
scaffold0383 (95-361)||(2466-2734)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (92-361)||(34070-34340)
[»] scaffold0191 (1 HSPs)
scaffold0191 (98-361)||(7374-7638)
[»] scaffold0066 (2 HSPs)
scaffold0066 (94-361)||(45104-45373)
scaffold0066 (94-361)||(54490-54759)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (90-268)||(3890-4068)
[»] scaffold1666 (1 HSPs)
scaffold1666 (185-361)||(1-178)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (89-303)||(54008-54221)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (98-299)||(5130-5329)
[»] scaffold0183 (1 HSPs)
scaffold0183 (95-316)||(6718-6938)
[»] scaffold0892 (1 HSPs)
scaffold0892 (134-303)||(3547-3715)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (98-298)||(21031-21228)
scaffold0139 (98-298)||(13977-14173)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (98-210)||(10666-10778)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (89-316)||(7330-7556)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (95-268)||(3130-3302)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (98-299)||(13242-13438)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (96-268)||(107914-108086)
scaffold0026 (95-298)||(64436-64640)
[»] scaffold0155 (1 HSPs)
scaffold0155 (95-316)||(23664-23884)
[»] scaffold0215 (2 HSPs)
scaffold0215 (89-299)||(9257-9462)
scaffold0215 (89-299)||(16155-16360)
[»] scaffold1711 (1 HSPs)
scaffold1711 (98-268)||(1220-1388)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (101-317)||(31593-31807)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (95-296)||(177-372)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (178-306)||(56105-56233)
[»] scaffold0516 (1 HSPs)
scaffold0516 (89-202)||(12036-12149)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (96-173)||(13266-13342)
[»] scaffold0361 (1 HSPs)
scaffold0361 (178-301)||(3324-3447)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (96-268)||(34372-34556)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (94-317)||(13625-13859)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (178-268)||(123170-123260)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (178-299)||(3588-3707)
scaffold0266 (178-299)||(1262-1381)
[»] scaffold0175 (1 HSPs)
scaffold0175 (178-317)||(962-1100)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (96-268)||(41815-41998)
[»] scaffold0772 (1 HSPs)
scaffold0772 (172-298)||(5668-5792)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (178-269)||(12279-12370)
[»] scaffold1542 (1 HSPs)
scaffold1542 (178-268)||(540-630)
[»] scaffold0498 (1 HSPs)
scaffold0498 (178-299)||(9016-9135)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (178-268)||(6070-6160)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (178-268)||(89460-89550)
[»] scaffold0025 (2 HSPs)
scaffold0025 (178-268)||(9016-9106)
scaffold0025 (222-299)||(148859-148934)
[»] scaffold0195 (2 HSPs)
scaffold0195 (178-299)||(19344-19463)
scaffold0195 (178-299)||(21428-21547)
[»] scaffold0162 (1 HSPs)
scaffold0162 (178-264)||(8186-8272)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (178-268)||(48354-48444)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (178-268)||(51188-51278)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (178-299)||(36919-37038)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (92-269)||(22706-22894)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (92-153)||(1491-1552)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 245; Significance: 1e-136; HSPs: 26)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 98 - 361
Target Start/End: Original strand, 22006176 - 22006440
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 197  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22006176 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 22006275  T
Q  198 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 297  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22006276 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 22006375  T
Q  298 aattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccatt 361  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22006376 aattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccatt 22006440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 95 - 361
Target Start/End: Original strand, 13662180 - 13662447
Alignment:
Q  95 tctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcg 194  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13662180 tctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgataaacaattgttgctaaattcg 13662279  T
Q  195 tgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtta 294  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13662280 tgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaatgnatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtta 13662379  T
Q  295 tgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccatt 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13662380 tgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccatt 13662447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 95 - 355
Target Start/End: Original strand, 13720843 - 13721104
Alignment:
Q  95 tctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcg 194  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13720843 tctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcg 13720942  T
Q  195 tgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtta 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13720943 tgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtta 13721042  T
Q  295 tgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatat 355  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  13721043 tgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatat 13721104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 95 - 355
Target Start/End: Original strand, 16872966 - 16873227
Alignment:
Q  95 tctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcg 194  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16872966 tctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaattcg 16873065  T
Q  195 tgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtta 294  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16873066 tgctcttgttgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtta 16873165  T
Q  295 tgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatat 355  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  16873166 tgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttggttgaaatgagatgtaaatcatat 16873227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 98 - 361
Target Start/End: Original strand, 271278 - 271542
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 197  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  271278 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgc 271377  T
Q  198 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 297  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  271378 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 271477  T
Q  298 aattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccatt 361  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  271478 aattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatattccatt 271542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 98 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 644642 - 644378
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 197  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  644642 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgc 644543  T
Q  198 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 297  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  644542 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 644443  T
Q  298 aattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccatt 361  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  644442 aattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatattccatt 644378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 98 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 830377 - 830113
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 197  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  830377 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgc 830278  T
Q  198 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 297  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  830277 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 830178  T
Q  298 aattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccatt 361  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  830177 aattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatattccatt 830113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 98 - 361
Target Start/End: Original strand, 22088712 - 22088976
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 197  Q
    ||||||||||||||||| || | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  22088712 aaggtaagggggttagttatcatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgtgttggtgaacaattgttgttaaattcgtgc 22088811  T
Q  198 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 297  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22088812 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttataggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 22088911  T
Q  298 aattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccatt 361  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22088912 aattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaaagagatgtgattcatattccatt 22088976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 98 - 361
Target Start/End: Original strand, 15319077 - 15319341
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 197  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  15319077 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgc 15319176  T
Q  198 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 297  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  15319177 tcttgctgtgatactattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttctaagtatgtataaatgttgagttatga 15319276  T
Q  298 aattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccatt 361  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  15319277 aattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaaagagatgtgattcatgttccatt 15319341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 98 - 361
Target Start/End: Original strand, 15499446 - 15499710
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 197  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  15499446 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgc 15499545  T
Q  198 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 297  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  15499546 tcttgctgtgatactattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttctaagtatgtataaatgttgagttatga 15499645  T
Q  298 aattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccatt 361  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  15499646 aattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaaagagatgtgattcatgttccatt 15499710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 90 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 16195577 - 16195304
Alignment:
Q  90 catcatctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaa 189  Q
    |||| |||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16195577 catcttctaaggtaagggggttaattattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaa 16195478  T
Q  190 attcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgtta 289  Q
    |||||| ||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16195477 attcgttctcgtgctgtgatgctatgttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgtta 16195378  T
Q  290 agttatgaaattatgcttaattgatgaaa--ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccatt 361  Q
    |||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||||||| |  ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16195377 agttatgagattatacttaatttatgaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccatt 16195304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 95 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 24549319 - 24549120
Alignment:
Q  95 tctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcg 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||    
T  24549319 tctaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtaa---ttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagattcg 24549223  T
Q  195 tgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtta 294  Q
    |||||||  ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||     
T  24549222 tgctcttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttg 24549125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 98 - 299
Target Start/End: Original strand, 6774175 - 6774371
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 197  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||    
T  6774175 aaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtaa---ttttgcattttctcatgttatatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagattcgtgc 6774271  T
Q  198 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 297  Q
    ||||  ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| |||    
T  6774272 tcttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtga 6774369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 100 - 298
Target Start/End: Original strand, 21844490 - 21844684
Alignment:
Q  100 ggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctc 199  Q
    ||||||||||||||| |||| || |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||  ||||||||||||    
T  21844490 ggtaagggggttagttattatcacaatcatgta--atttttgcatttgctcatgttgtatgaaattgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctc 21844587  T
Q  200 ttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa 298  Q
    ||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||||||  || |||||| ||||| |||||||||||    
T  21844588 ttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgttt--aaatatgtaaaaatgataagttatgaa 21844684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 98 - 298
Target Start/End: Original strand, 21851881 - 21852077
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 197  Q
    ||||||||||||||||| |||| || |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||  ||||||||||    
T  21851881 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgta--atttttgcatttgctcatgttgtatgaaattgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 21851978  T
Q  198 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 297  Q
    ||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||| ||||||  || |||||| ||||| ||||||||||    
T  21851979 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattaaatgttt--aaatatgtaaaaatgataagttatga 21852076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 95 - 317
Target Start/End: Original strand, 16674305 - 16674524
Alignment:
Q  95 tctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcg 194  Q
    |||||||||||||||||||| |||| || |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  16674305 tctaaggtaagggggttagttattatcacaatcatgta--atttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgttgaacaattcatgctaaattcg 16674402  T
Q  195 tgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtta 294  Q
    |||||||  ||||||| ||| || || |||||||||| ||| |  | ||||| |||| |||||||||||||| |||| | |||| | ||||| |||||||    
T  16674403 tgctctttctgtgatgttatgtttttatgcatgaatttatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcata-tatgcaaaaatgataagtta 16674500  T
Q  295 tgaa-attatgcttaattgatgaa 317  Q
    |||| ||| |||||||||| ||||    
T  16674501 tgaatattgtgcttaattggtgaa 16674524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 98 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 30121060 - 30120890
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 197  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  30121060 aaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaatttttgtataatctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgc 30120961  T
Q  198 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 268  Q
    ||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||| ||| |  | ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  30120960 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaatttatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgtt 30120890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 17345917 - 17345690
Alignment:
Q  99 aggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcat--gttgtatgaaaatgggttga----------tgaacaattgttgc 186  Q
    ||||||||||||||||  | | ||||||||||| || || ||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||          || | |||||||||    
T  17345917 aggtaagggggttagtcttcatcataatcatgttcatttattgcaatttctcatttgttgtatgaatatgggttgaattgaataaatggataattgttgc 17345818  T
Q  187 taaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatg 286  Q
     |||||||||||||   ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||| |||||||   || |||||| |||||    
T  17345817 gaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttatatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgtt--caattatgtaaaaatg 17345720  T
Q  287 ttaagttatg-aaattatgcttaattgatg 315  Q
    | |||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  17345719 tgaagttatgaaaattgtgctcaattgatg 17345690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 178 - 268
Target Start/End: Original strand, 16404981 - 16405071
Alignment:
Q  178 aattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 268  Q
    |||| |||||||||||||||||    ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  16404981 aattattgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 16405071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 178 - 268
Target Start/End: Original strand, 24928797 - 24928887
Alignment:
Q  178 aattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 268  Q
    ||||||||||||||||||||||    ||||||  ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  24928797 aattgttgctaaattcgtgctccaactgtgattatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 24928887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 299
Target Start/End: Original strand, 16193723 - 16193841
Alignment:
Q  179 attgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatg 278  Q
    |||||||||||||||||||||    | ||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| || ||||||||||| |||||| ||||    
T  16193723 attgttgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggggaaattacatg-ttcaaa-tatg 16193820  T
Q  279 tataaatgttaagttatgaaa 299  Q
    || ||||| |||||| |||||    
T  16193821 taaaaatgataagttgtgaaa 16193841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 92 - 172
Target Start/End: Original strand, 22907123 - 22907204
Alignment:
Q  92 tcatctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatg--ttgtatgaaaatgggttga 172  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| || | |||||| ||| |||||  ||||||| |||||||||||    
T  22907123 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatgttcattctttgcaatttttcatgatttgtatg-aaatgggttga 22907204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 92 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 5238441 - 5238380
Alignment:
Q  92 tcatctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatg 153  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| || | |||||| ||| |||||    
T  5238441 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatgttcattctttgcaatttttcatg 5238380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 92 - 153
Target Start/End: Original strand, 24661157 - 24661218
Alignment:
Q  92 tcatctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatg 153  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| || | |||||| ||| |||||    
T  24661157 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatgttcattctttgcaatttttcatg 24661218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 222 - 299
Target Start/End: Original strand, 43373518 - 43373593
Alignment:
Q  222 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 299  Q
    |||||||||||||||| ||  |||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  43373518 tgcatgaattgatgataattatatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 43373593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 92 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 43685900 - 43685839
Alignment:
Q  92 tcatctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatg 153  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| || | |||||| ||| |||||    
T  43685900 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatgttcattctttgcaatttttcatg 43685839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 245; Significance: 1e-136; HSPs: 33)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 98 - 361
Target Start/End: Original strand, 15950709 - 15950973
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 197  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15950709 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 15950808  T
Q  198 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 297  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15950809 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 15950908  T
Q  298 aattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccatt 361  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15950909 aattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccatt 15950973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 95 - 355
Target Start/End: Original strand, 18979936 - 18980197
Alignment:
Q  95 tctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcg 194  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18979936 tctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcg 18980035  T
Q  195 tgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtta 294  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18980036 tgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtta 18980135  T
Q  295 tgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatat 355  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  18980136 tgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatat 18980197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 95 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 15927909 - 15927648
Alignment:
Q  95 tctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcg 194  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  15927909 tctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatggattgatgatcaattgttgctaaattcg 15927810  T
Q  195 tgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtta 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15927809 tgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgcttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtta 15927710  T
Q  295 tgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatat 355  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  15927709 tgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatat 15927648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 95 - 361
Target Start/End: Original strand, 15760029 - 15760296
Alignment:
Q  95 tctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcg 194  Q
    |||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15760029 tctaaggtaagggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattattgctaaattcg 15760128  T
Q  195 tgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtta 294  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15760129 tgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatgatatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtta 15760228  T
Q  295 tgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccatt 361  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15760229 tgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttaattgaaatgagatgtaattcatattccatt 15760296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 95 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 13758711 - 13758450
Alignment:
Q  95 tctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcg 194  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13758711 tctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaattcg 13758612  T
Q  195 tgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtta 294  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13758611 tgctcttgttgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtta 13758512  T
Q  295 tgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatat 355  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  13758511 tgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttggttgaaatgagatgtaaatcatat 13758450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 98 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 7823066 - 7822802
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 197  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  7823066 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgc 7822967  T
Q  198 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 297  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7822966 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 7822867  T
Q  298 aattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccatt 361  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7822866 aattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatattccatt 7822802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 98 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 7830377 - 7830113
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 197  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  7830377 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgc 7830278  T
Q  198 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 297  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7830277 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 7830178  T
Q  298 aattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccatt 361  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7830177 aattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatattccatt 7830113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 98 - 361
Target Start/End: Original strand, 27101555 - 27101819
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 197  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  27101555 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgc 27101654  T
Q  198 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 297  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27101655 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 27101754  T
Q  298 aattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccatt 361  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27101755 aattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatattccatt 27101819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 98 - 361
Target Start/End: Original strand, 27108903 - 27109167
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 197  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  27108903 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgc 27109002  T
Q  198 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 297  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27109003 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 27109102  T
Q  298 aattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccatt 361  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27109103 aattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatattccatt 27109167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 98 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 27176771 - 27176507
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 197  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  27176771 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgc 27176672  T
Q  198 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 297  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27176671 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 27176572  T
Q  298 aattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccatt 361  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27176571 aattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatattccatt 27176507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 98 - 361
Target Start/End: Original strand, 38783647 - 38783911
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 197  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  38783647 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgc 38783746  T
Q  198 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 297  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38783747 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 38783846  T
Q  298 aattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccatt 361  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38783847 aattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatattccatt 38783911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 95 - 355
Target Start/End: Original strand, 14250813 - 14251074
Alignment:
Q  95 tctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcg 194  Q
    |||||||||||||||||||| || | | ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14250813 tctaaggtaagggggttagttatcatcgtaatcatgttcattttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcg 14250912  T
Q  195 tgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtta 294  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14250913 tgctcttgttgtaatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttttgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtta 14251012  T
Q  295 tgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatat 355  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  14251013 tgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatat 14251074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 89 - 303
Target Start/End: Original strand, 48622575 - 48622788
Alignment:
Q  89 acatcatctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgcta 188  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  | | ||||||||  |  |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  48622575 acatcatctaaggtaagggggtttgttttcatcataatcaattcaaatttttgcattttctcatgttttacgaaaatgggttgatgaacaattgatgcta 48622674  T
Q  189 aattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgtt 288  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||    
T  48622675 aattcgtgctcttactgtgatgatattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatg-ttcaaagcatgcataattgtt 48622773  T
Q  289 aagttatgaaattat 303  Q
    ||||| |||||||||    
T  48622774 aagttgtgaaattat 48622788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 89 - 316
Target Start/End: Original strand, 10000279 - 10000505
Alignment:
Q  89 acatcatctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgcta 188  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  | | ||||||||  | ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||  |    
T  10000279 acatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcaatttcaaattttgcatcttctcatgttgtataaaaatgggttgatgaacaatttatgtca 10000378  T
Q  189 aattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgtt 288  Q
    |||||||||||||||| || || | ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  10000379 aattcgtgctcttgttatgttgttgttt-cttatacatgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtc 10000477  T
Q  289 aagttatgaaattatgcttaattgatga 316  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  10000478 aagttgtgaaattttgcttaattgatga 10000505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 89 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 16418844 - 16418618
Alignment:
Q  89 acatcatctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgcta 188  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  | | ||||||||  | ||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  |    
T  16418844 acatcatctaaggtaagggggtttgttttcatcataatcaatttcaaattttacatcttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtca 16418745  T
Q  189 aattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgtt 288  Q
    |||||||||||||||| || |||| ||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  16418744 aattcgtgctcttgttatgttgctgttg-cttatacatgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtc 16418646  T
Q  289 aagttatgaaattatgcttaattgatga 316  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||| ||||    
T  16418645 aagttgtgaaattttgcctaattaatga 16418618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 98 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 2437794 - 2437625
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 197  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||    
T  2437794 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggataatgaacaattcttgctaaattcgtgc 2437696  T
Q  198 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 268  Q
    ||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  2437695 tcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgtt 2437625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 95 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 13573015 - 13572816
Alignment:
Q  95 tctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcg 194  Q
    |||||||||||||||||||| |||| || |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  |||||||    
T  13573015 tctaaggtaagggggttagttattatcacaatcatgta--atttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcg 13572918  T
Q  195 tgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtta 294  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || || || |||| |||||||||||||||||  || |||||| ||||| |||||||    
T  13572917 tgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtgtgattgttggtgaaattacatgttt--aaatatgtaaaaatgataagtta 13572820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 98 - 317
Target Start/End: Original strand, 13910939 - 13911156
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 197  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  13910939 aaggtaagggggttattgattatcataatcatgtgtaatttt-gcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgc 13911037  T
Q  198 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 297  Q
    ||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| | || ||||| |||| |||||||||||||| |||| | |||| | ||||| ||||||||||    
T  13911038 tcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttaattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcata-tatgcaaaaatgataagttatga 13911135  T
Q  298 a-attatgcttaattgatgaa 317  Q
    | |||||||| ||||| ||||    
T  13911136 atattatgctcaattggtgaa 13911156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 96 - 268
Target Start/End: Original strand, 18253759 - 18253931
Alignment:
Q  96 ctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgt 195  Q
    ||||||||||||||||||| || |  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18253759 ctaaggtaagggggttagttatcattataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttactaaattcgt 18253858  T
Q  196 gctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 268  Q
    ||||    ||| ||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  18253859 gctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 18253931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 98 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 10989746 - 10989577
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 197  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  10989746 aaggtatgggggttagtgattatcataatcatgtataatttt-gcatattctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaaatcatgctaaattcgtgc 10989648  T
Q  198 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 268  Q
    ||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  10989647 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgtt 10989577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 98 - 299
Target Start/End: Original strand, 16478879 - 16479075
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 197  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || || ||||||||    
T  16478879 aaggtaagggggttagtgattatcataatcatttaa---ttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgttagattcgtgc 16478975  T
Q  198 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 297  Q
    ||||  || |||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| |||    
T  16478976 tcttactgcgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtga 16479073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 94 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 13321369 - 13321134
Alignment:
Q  94 atctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcat--gttgtatgaaaatgggttga----------tgaacaatt 181  Q
    |||||||||||||||||||||  | | ||||||||||| || || ||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||          || | ||||    
T  13321369 atctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatgttcatttattgcaatttctcatttgttgtatgaatatgggttgaattgaataagtggataatt 13321270  T
Q  182 gttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtat 281  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13321269 gttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtttcaaagtatgtat 13321170  T
Q  282 aaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaa 317  Q
    |||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||||    
T  13321169 aaatgtcaagttatgaaattgtgctcaattggtgaa 13321134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 96 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 15862259 - 15862174
Alignment:
Q  96 ctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaatt 181  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15862259 ctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtataatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaatt 15862174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 94 - 299
Target Start/End: Original strand, 47480941 - 47481156
Alignment:
Q  94 atctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcat--gttgtatgaaaatgggttga----------tgaacaatt 181  Q
    |||||||||||||||||||||  | | ||||||||| | || || ||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||          || | ||||    
T  47480941 atctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatattcatttattgcaatttctcatttgttgtatgaatatgggttgaattgaataaatggataatt 47481040  T
Q  182 gttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtat 281  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| ||||  ||||||||||||| |||||| ||||||     
T  47481041 gttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaa 47481138  T
Q  282 aaatgttaagttatgaaa 299  Q
    ||||| |||||| |||||    
T  47481139 aaatgataagttgtgaaa 47481156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 92 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 16212108 - 16211904
Alignment:
Q  92 tcatctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaat 191  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||   || ||| || | ||||  ||||||||||||  | | || ||| ||||||||||||||||    
T  16212108 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaattttgctt-atggacaattgttgctaaat 16212010  T
Q  192 tcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaag 291  Q
    ||||||||    ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||| | ||||  |||||||| |||| |||||| |||||| ||||| ||||    
T  16212009 tcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgtttgtgaaattgcatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataag 16211912  T
Q  292 ttatgaaa 299  Q
    || |||||    
T  16211911 ttgtgaaa 16211904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 172 - 268
Target Start/End: Original strand, 295966 - 296062
Alignment:
Q  172 atgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 268  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||  ||| | || ||| ||  ||||||||||| |||||| ||| |||| |||| ||||||||| ||||||    
T  295966 atgaataattgttgctaaattcgtgttctaattgaggtgttatgtttgtgtgcatgaatcgatgataatgttatgattgttggtgaaatttcatgtt 296062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 92 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 7293370 - 7293289
Alignment:
Q  92 tcatctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatg--ttgtatgaaaatgggttga 172  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| || | |||||| ||| |||||  ||||||| |||||||||||    
T  7293370 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatgttcattctttgcaatttttcatgatttgtatg-aaatgggttga 7293289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 92 - 172
Target Start/End: Original strand, 30262038 - 30262119
Alignment:
Q  92 tcatctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatg--ttgtatgaaaatgggttga 172  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| || | |||||| ||| |||||  ||||||| |||||||||||    
T  30262038 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatgttcattctttgcaatttttcatgatttgtatg-aaatgggttga 30262119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 222 - 268
Target Start/End: Original strand, 11580789 - 11580835
Alignment:
Q  222 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 268  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  11580789 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 11580835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 178 - 268
Target Start/End: Original strand, 13037020 - 13037110
Alignment:
Q  178 aattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 268  Q
    ||||||||||||||||||||||    ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| | ||||||| ||||||    
T  13037020 aattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttgatgaaattgcatgtt 13037110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 92 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 11516581 - 11516520
Alignment:
Q  92 tcatctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatg 153  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| || | |||||| ||| |||||    
T  11516581 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatgttcattctttgcaatttttcatg 11516520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 92 - 153
Target Start/End: Original strand, 14113898 - 14113959
Alignment:
Q  92 tcatctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatg 153  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| || | |||||| ||| |||||    
T  14113898 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatgttcattctttgcaatttttcatg 14113959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 92 - 153
Target Start/End: Original strand, 15441473 - 15441534
Alignment:
Q  92 tcatctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatg 153  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| || | |||||| ||| |||||    
T  15441473 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatgttcattctttgcaatttttcatg 15441534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 245; Significance: 1e-136; HSPs: 26)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 98 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 18169308 - 18169044
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 197  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18169308 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 18169209  T
Q  198 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 297  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18169208 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 18169109  T
Q  298 aattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccatt 361  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18169108 aattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccatt 18169044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 95 - 355
Target Start/End: Original strand, 7131980 - 7132241
Alignment:
Q  95 tctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcg 194  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7131980 tctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttatatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcg 7132079  T
Q  195 tgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtta 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7132080 tgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtta 7132179  T
Q  295 tgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatat 355  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  7132180 tgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatat 7132241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 96 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 19020826 - 19020560
Alignment:
Q  96 ctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgt 195  Q
    ||||||||||||||||||| |  | ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19020826 ctaaggtaagggggttagttaccatcataatcatgttcaatttttgcattttgtcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgt 19020727  T
Q  196 gctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 295  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19020726 gctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 19020627  T
Q  296 gaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccatt 361  Q
    |||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19020626 gaaattatccttaatggatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccatt 19020560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 95 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 20001064 - 20000803
Alignment:
Q  95 tctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcg 194  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20001064 tctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaattcg 20000965  T
Q  195 tgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtta 294  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20000964 tgctcttgttgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttctgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtta 20000865  T
Q  295 tgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatat 355  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  20000864 tgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttggttgaaatgagatgtaaatcatat 20000803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 95 - 361
Target Start/End: Original strand, 15287160 - 15287427
Alignment:
Q  95 tctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcg 194  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  15287160 tctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggatgatgaacaattatagctaaattcg 15287259  T
Q  195 tgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtta 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15287260 tgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaatcgatggttatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtta 15287359  T
Q  295 tgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccatt 361  Q
    ||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15287360 tgaaattatactccattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccatt 15287427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 95 - 361
Target Start/End: Original strand, 15294269 - 15294536
Alignment:
Q  95 tctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcg 194  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  15294269 tctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggatgatgaacaattatagctaaattcg 15294368  T
Q  195 tgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtta 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15294369 tgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaatcgatggttatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatatataaatgttaagtta 15294468  T
Q  295 tgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccatt 361  Q
    ||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15294469 tgaaattatactccattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccatt 15294536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 90 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 18248564 - 18248292
Alignment:
Q  90 catcatctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaa 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  18248564 catcatctaaggtaagggggttagttattatcataatcttgtacaatttttacattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgatgttaa 18248465  T
Q  190 attcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgtta 289  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18248464 attcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgaggattatggtatgtttgtggatgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgtta 18248365  T
Q  290 agttatgaaattatgcttaattgatgaa-attgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccatt 361  Q
    || ||||||||||| || ||||  ||||  || ||||||| |  ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18248364 agatatgaaattatactcaattagtgaattttaatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccatt 18248292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 95 - 361
Target Start/End: Original strand, 17145572 - 17145839
Alignment:
Q  95 tctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcg 194  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  17145572 tctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattgatgttaaattcg 17145671  T
Q  195 tgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtta 294  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  17145672 tgctcttactgtgatgctattttcttgtacatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttg 17145771  T
Q  295 tgaaattatgcttaattgatgaa-attgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccatt 361  Q
    ||||||||| || ||||  ||||  |||||||||| |  ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17145772 tgaaattatactcaattagtgaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccatt 17145839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 89 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 22738616 - 22738390
Alignment:
Q  89 acatcatctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgcta 188  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  | | ||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || ||    
T  22738616 acatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcaatttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggctgaggaacaattgatgtta 22738517  T
Q  189 aattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgtt 288  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22738516 aattcgtgttcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgtt 22738417  T
Q  289 aagttatgaaattatgcttaattgatg 315  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||    
T  22738416 aagttgtgaaattatgcttaattgatg 22738390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 95 - 301
Target Start/End: Original strand, 22351979 - 22352184
Alignment:
Q  95 tctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcg 194  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||  | ||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||     
T  22351979 tctaaggtaagggggttagttattatcataatcaatttcaaattttacatcttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattca 22352078  T
Q  195 tgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtta 294  Q
    |||||||||| || |||| ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||     
T  22352079 tgctcttgttatgttgctgttt-cttatacatgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttg 22352177  T
Q  295 tgaaatt 301  Q
    |||||||    
T  22352178 tgaaatt 22352184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 95 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 26339360 - 26339140
Alignment:
Q  95 tctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcg 194  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||  | ||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  |||||||    
T  26339360 tctaaggtaagggggttagttattatcataatcaatttcaaattttacatcttttcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcg 26339261  T
Q  195 tgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtta 294  Q
    |||||||||| || |||| ||| ||| | | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||     
T  26339260 tgctcttgttatgttgctgttt-cttatacttgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatctatgtataaatgtcaagttg 26339162  T
Q  295 tgaaattatgcttaattgatga 316  Q
    ||||||| ||||||||| ||||    
T  26339161 tgaaattttgcttaattaatga 26339140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 107 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 8378480 - 8378365
Alignment:
Q  107 gggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgt 206  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  8378480 gggttagttattatcataatcatgtacaatttttacattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgt 8378381  T
Q  207 gatgctattttcttgt 222  Q
    ||||||||||||||||    
T  8378380 gatgctattttcttgt 8378365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 220 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 8374724 - 8374582
Alignment:
Q  220 tgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaa-a 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||      
T  8374724 tgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgcttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatactcaattagtgaatt 8374625  T
Q  319 ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccatt 361  Q
    || ||||||| |  ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8374624 ttaatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccatt 8374582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 98 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 10644554 - 10644360
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 197  Q
    ||||||||||||||||| |||| || |||||||||    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||    
T  10644554 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgtaa---ttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 10644458  T
Q  198 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 297  Q
    ||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| ||||  ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  10644457 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 10644360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 95 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 47357992 - 47357822
Alignment:
Q  95 tctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcg 194  Q
    |||||||||||||||||||| |||| || |||||||||    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  47357992 tctaaggtaagggggttagttattatcacaatcatgtaa---ttttgcatttcctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcg 47357896  T
Q  195 tgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 268  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||  | |||||| ||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  47357895 tgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatggattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 47357822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 222 - 317
Target Start/End: Original strand, 40885604 - 40885698
Alignment:
Q  222 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaa 317  Q
    ||||||||||| |||| || | |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  40885604 tgcatgaattggtgataattgaatgtttgttggtgaaattacatgtt-caaagtatgtataaatgtcaagttatgaaattatgctcaattggtgaa 40885698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 96 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 9795566 - 9795490
Alignment:
Q  96 ctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgat 173  Q
    ||||||||||||||||||| || | ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9795566 ctaaggtaagggggttagttatcatcataatcatgttcaattttttcattttctcatgttgtatg-aaatgggttgat 9795490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 178 - 268
Target Start/End: Original strand, 54118250 - 54118340
Alignment:
Q  178 aattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 268  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  54118250 aattgttgctaaattcgtgctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 54118340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 89 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 8378533 - 8378482
Alignment:
Q  89 acatcatctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaattttt 140  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  8378533 acatcatctaaggtaaggggattagttattatcataatcatgtacaattttt 8378482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 178 - 268
Target Start/End: Original strand, 15675095 - 15675185
Alignment:
Q  178 aattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 268  Q
    ||||||||||||||||||||||    ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  15675095 aattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 15675185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 178 - 268
Target Start/End: Original strand, 10104256 - 10104346
Alignment:
Q  178 aattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 268  Q
    |||||||||||||| |||||||    ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  10104256 aattgttgctaaatccgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 10104346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 178 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 122146 - 122027
Alignment:
Q  178 aattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtat 277  Q
    ||||||||||||||| ||||||    ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||| | |||| |||||||||||||| |||||| |||    
T  122146 aattgttgctaaatttgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tat 122049  T
Q  278 gtataaatgttaagttatgaaa 299  Q
    ||| ||||| |||||| |||||    
T  122048 gtaaaaatgataagttgtgaaa 122027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 222 - 317
Target Start/End: Original strand, 13048271 - 13048365
Alignment:
Q  222 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa-attatgcttaattgatgaa 317  Q
    ||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||||||||||||||  || |||||| ||| | ||||||||||| ||| |||| ||||||||||    
T  13048271 tgcatgatttgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgttt--aaatatgtaaaaaggataagttatgaatattgtgctcaattgatgaa 13048365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 222 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 31115842 - 31115748
Alignment:
Q  222 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatg-aaattatgcttaattgatgaa 317  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||||| |  | |||||| |||||| ||||| || |||||||||| ||||| ||||    
T  31115842 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcc--attatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattatgctcaattggtgaa 31115748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 92 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 26680554 - 26680338
Alignment:
Q  92 tcatctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatg--ttgtatgaaaatgggttg----------atgaacaa 179  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| || | |||||| ||| |||||  |||||||  |||||||||          ||| | ||    
T  26680554 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatgttcattctttgcaatttttcatgatttgtatg-gaatgggttgaaatgaatgaatggataa 26680456  T
Q  180 ttgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 279  Q
    ||||||||||||||||||||    | ||||| ||| ||  | ||||||||||||| || || ||||| |||| ||| |||||||||||||  || |||||    
T  26680455 ttgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgttt--aaatatgt 26680358  T
Q  280 ataaatgttaagttatgaaa 299  Q
    | |||||  |||||||||||    
T  26680357 aaaaatgaaaagttatgaaa 26680338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 92 - 153
Target Start/End: Original strand, 16609008 - 16609069
Alignment:
Q  92 tcatctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatg 153  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| || | |||||| ||| |||||    
T  16609008 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatgttcattctttgcaatttttcatg 16609069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 244; Significance: 1e-135; HSPs: 35)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 95 - 361
Target Start/End: Original strand, 1219435 - 1219702
Alignment:
Q  95 tctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcg 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1219435 tctaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcg 1219534  T
Q  195 tgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtta 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1219535 tgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcattaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtta 1219634  T
Q  295 tgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccatt 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1219635 tgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatatttcatt 1219702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 98 - 355
Target Start/End: Original strand, 10777888 - 10778146
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 197  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10777888 aaggtaaggggggtagtgattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 10777987  T
Q  198 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 297  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10777988 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 10778087  T
Q  298 aattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatat 355  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  10778088 aattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatat 10778146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 95 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 23514902 - 23514641
Alignment:
Q  95 tctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcg 194  Q
    |||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23514902 tctaaggtaagggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcg 23514803  T
Q  195 tgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtta 294  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23514802 tgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtta 23514703  T
Q  295 tgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatat 355  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  23514702 tgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatat 23514641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 95 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 7425665 - 7425398
Alignment:
Q  95 tctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcg 194  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7425665 tctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattattgctaaattcg 7425566  T
Q  195 tgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtta 294  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7425565 tgctcttgctgtgatgttattttcttgtgcatgaatcgatggttatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtta 7425466  T
Q  295 tgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccatt 361  Q
    ||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7425465 tgaaattatacttcattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccatt 7425398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 98 - 361
Target Start/End: Original strand, 17471506 - 17471770
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 197  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17471506 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaaattttgtattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgataaattcgtgc 17471605  T
Q  198 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 297  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17471606 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtaatga 17471705  T
Q  298 aattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccatt 361  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  17471706 aattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaataagatgtaattcatattccatt 17471770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 98 - 361
Target Start/End: Original strand, 21932299 - 21932563
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 197  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  21932299 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgc 21932398  T
Q  198 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 297  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21932399 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 21932498  T
Q  298 aattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccatt 361  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21932499 aattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatattccatt 21932563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 98 - 361
Target Start/End: Original strand, 21938469 - 21938733
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 197  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  21938469 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgc 21938568  T
Q  198 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 297  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21938569 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 21938668  T
Q  298 aattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccatt 361  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21938669 aattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatattccatt 21938733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 98 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 35582374 - 35582110
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 197  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  35582374 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgc 35582275  T
Q  198 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 297  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35582274 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 35582175  T
Q  298 aattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccatt 361  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35582174 aattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatattccatt 35582110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 95 - 361
Target Start/End: Original strand, 35791013 - 35791281
Alignment:
Q  95 tctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcg 194  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35791013 tctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcg 35791112  T
Q  195 tgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtta 294  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35791113 tgctcttgctgtgatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgagtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtta 35791212  T
Q  295 tgaaattatgcttaattgatgaaa--ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccatt 361  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||| |  ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  35791213 tgagattatacttaattgatgaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccatt 35791281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 102 - 361
Target Start/End: Original strand, 22883006 - 22883266
Alignment:
Q  102 taagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctctt 201  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  22883006 taagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaatttgtgctctt 22883105  T
Q  202 gttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaatt 301  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22883106 gctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatggatgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaatt 22883205  T
Q  302 atgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccatt 361  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22883206 atgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaaagagatgtgattcatattccatt 22883266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 98 - 361
Target Start/End: Original strand, 36989688 - 36989952
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 197  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  36989688 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgc 36989787  T
Q  198 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 297  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36989788 tctagctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 36989887  T
Q  298 aattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccatt 361  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36989888 aattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatattccatt 36989952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 98 - 361
Target Start/End: Original strand, 11211983 - 11212247
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 197  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11211983 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgc 11212082  T
Q  198 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 297  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11212083 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtgtgtataaatgttaagttatga 11212182  T
Q  298 aattatgcttaattgatgaa-attgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccatt 361  Q
    |||||| || || |  ||||  || ||||||| |  ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11212183 aattatactcaagtagtgaattttaatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccatt 11212247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 95 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 23328898 - 23328678
Alignment:
Q  95 tctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcg 194  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||  | ||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  |||||||    
T  23328898 tctaaggtaagggggttagttattatcataatcaatttcaaattttacatcttttcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcg 23328799  T
Q  195 tgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtta 294  Q
    |||||||||| || |||| ||| ||| | | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||     
T  23328798 tgctcttgttatgttgctgttt-cttatacttgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttg 23328700  T
Q  295 tgaaattatgcttaattgatga 316  Q
    ||||||| ||| ||||| ||||    
T  23328699 tgaaattttgcctaattaatga 23328678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 95 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 24616502 - 24616282
Alignment:
Q  95 tctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcg 194  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||  | ||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  |||||||    
T  24616502 tctaaggtaagggggttagttattatcataatcaatttcaaattttacatcttttcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcg 24616403  T
Q  195 tgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtta 294  Q
    |||||||||| || ||||  |||||| | | ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||     
T  24616402 tgctcttgttatgttgct-gtttcttatacttgaattgataattatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttg 24616304  T
Q  295 tgaaattatgcttaattgatga 316  Q
    ||||||| ||| ||||| ||||    
T  24616303 tgaaattttgcctaattaatga 24616282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 95 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 24712878 - 24712658
Alignment:
Q  95 tctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcg 194  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||  | ||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  |||||||    
T  24712878 tctaaggtaagggggttagttattatcataatcaatttcaaattttacatcttttcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcg 24712779  T
Q  195 tgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtta 294  Q
    |||||||||| || ||||  |||||| | | ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||     
T  24712778 tgctcttgttatgttgct-gtttcttatacttgaattgataattatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttg 24712680  T
Q  295 tgaaattatgcttaattgatga 316  Q
    ||||||| ||| ||||| ||||    
T  24712679 tgaaattttgcctaattaatga 24712658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 95 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 24745896 - 24745676
Alignment:
Q  95 tctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcg 194  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||  | ||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  |||||||    
T  24745896 tctaaggtaagggggttagttattatcataatcaatttcaaattttacatcttttcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcg 24745797  T
Q  195 tgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtta 294  Q
    |||||||||| || ||||  |||||| | | ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||     
T  24745796 tgctcttgttatgttgct-gtttcttatacttgaattgataattatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttg 24745698  T
Q  295 tgaaattatgcttaattgatga 316  Q
    ||||||| ||| ||||| ||||    
T  24745697 tgaaattttgcctaattaatga 24745676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 95 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 27010180 - 27009981
Alignment:
Q  95 tctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcg 194  Q
    |||||||||||||||||||| |||| || |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  |||||||    
T  27010180 tctaaggtaagggggttagttattatcacaatcatgta--atttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcg 27010083  T
Q  195 tgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtta 294  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || |||||  ||| |||||||||||||||||  || |||||| ||||| |||||||    
T  27010082 tgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgagtgttggtgaaattacatgttt--aaatatgtaaaaatgataagtta 27009985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 98 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 25426965 - 25426796
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 197  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  25426965 aaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgc 25426867  T
Q  198 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 268  Q
    ||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  25426866 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 25426796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 98 - 299
Target Start/End: Original strand, 29188201 - 29188397
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 197  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| ||||||||    
T  29188201 aaggtaagggggttagtgattattataatcatgtaa---ttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggtcgatgaacaattcatgctagattcgtgc 29188297  T
Q  198 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 297  Q
    ||||  ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| |||    
T  29188298 tcttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtga 29188395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 98 - 268
Target Start/End: Original strand, 18777907 - 18778076
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 197  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  18777907 aaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgttaaattcgtgc 18778005  T
Q  198 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 268  Q
    ||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  18778006 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 18778076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 98 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 19500236 - 19500067
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 197  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  19500236 aaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacacttcatgctaaattcgtgc 19500138  T
Q  198 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 268  Q
    ||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  19500137 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 19500067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 98 - 268
Target Start/End: Original strand, 22366396 - 22366565
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 197  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||    
T  22366396 aaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgagcaattcatgctaaattcgtgc 22366494  T
Q  198 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 268  Q
    ||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  22366495 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 22366565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 98 - 317
Target Start/End: Original strand, 4199900 - 4200117
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 197  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  4199900 aaggtaagggggttagggattatcataatcatgtgtaatttt-gcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgc 4199998  T
Q  198 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 297  Q
    ||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| |||| |||||||||||||| |||| | |||| | ||||| ||||||||||    
T  4199999 tcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcata-tatgcaaaaatgataagttatga 4200096  T
Q  298 a-attatgcttaattgatgaa 317  Q
    | |||||||| ||||| ||||    
T  4200097 atattatgctaaattggtgaa 4200117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 98 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 12711 - 12542
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 197  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||  |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  12711 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gtattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgc 12613  T
Q  198 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 268  Q
    ||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  12612 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 12542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 98 - 268
Target Start/End: Original strand, 21073510 - 21073679
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 197  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||    
T  21073510 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttaatgaacaattcatgctaaattcgtgc 21073608  T
Q  198 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 268  Q
    ||||| ||||||| ||| ||  | ||||||||| |||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  21073609 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaatggatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 21073679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 98 - 268
Target Start/End: Original strand, 43443312 - 43443479
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 197  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||   |||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  || |||||||||||    
T  43443312 aaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaatt---gcatattctcatgttatatgaaaatggattgatgaacaattcatgttaaattcgtgc 43443408  T
Q  198 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 268  Q
    ||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  43443409 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgtt 43443479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 178 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 32950952 - 32950767
Alignment:
Q  178 aattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtat 277  Q
    |||||||| ||||||||||||||   ||||||| ||||||| |||| |||| |||||||| || ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32950952 aattgttgttaaattcgtgctctaactgtgatgttattttcgtgtgtatgatttgatgataattgtatgattgtggttgaaattacatgtttcaaagtat 32950853  T
Q  278 gtataaatgt-taagttatgaaattatgcttaattgatgaaattga-tatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccatt 361  Q
    ||||||| ||  ||||||||||||| |||| || || |||| || | |||||| |  |||||| |||||||||||||| |||||||    
T  32950852 gtataaaggtcaaagttatgaaattgtgctcaaatggtgaattttactatgttgttgttgaaaagagatgtgattcatgttccatt 32950767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 178 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 23507222 - 23507103
Alignment:
Q  178 aattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtat 277  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||    
T  23507222 aattgttgctaaattcgtgctccatttgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tat 23507125  T
Q  278 gtataaatgttaagttatgaaa 299  Q
    ||| ||||| |||||| |||||    
T  23507124 gtaaaaatgataagttgtgaaa 23507103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 96 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 34939628 - 34939398
Alignment:
Q  96 ctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcat--gttgtatgaaaatgggttga----------tgaacaattgt 183  Q
    |||||||||||||||||||| |   ||||||||||| || || ||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||          || | || |||    
T  34939628 ctaaggtaagggggttagtgttcttcataatcatgttcatttattgcaatttctcatttgttgtatgaatatgggttgaattgaataaatggataactgt 34939529  T
Q  184 tgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataa 283  Q
    |||||||||||||||||   ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||| |||||||   || |||||| ||    
T  34939528 tgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgtt--caattatgtaaaa 34939431  T
Q  284 atgttaagttatg-aaattatgcttaattgatg 315  Q
    |||| |||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  34939430 atgtgaagttatgaaaattgtgctcaattgatg 34939398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 178 - 268
Target Start/End: Original strand, 18531073 - 18531163
Alignment:
Q  178 aattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 268  Q
    ||||||||||||||||||||||    ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  18531073 aattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 18531163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 178 - 268
Target Start/End: Original strand, 22053839 - 22053929
Alignment:
Q  178 aattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 268  Q
    ||||||||||||||||||||||    ||||||| ||| ||  | || |||||||||||||  | ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  22053839 aattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgtatgaattgatgatagttgtatgattgttggtgaaattacatgtt 22053929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 92 - 269
Target Start/End: Original strand, 25900315 - 25900503
Alignment:
Q  92 tcatctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatg--ttgtatgaaaatgggttg------atgaac----aa 179  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| || | |||||| ||| |||||  ||| ||| ||||||||||      ||||||    ||    
T  25900315 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatgttcattctttgcaatttttcatgatttggatg-aaatgggttgaaatgaatgaacggataa 25900413  T
Q  180 ttgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgttt 269  Q
    ||||||||||||||||||||    | ||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||| |||||| ||||||    
T  25900414 ttgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggttaaattatatgttt 25900503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 92 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 20623323 - 20623262
Alignment:
Q  92 tcatctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatg 153  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| || | |||||| ||| |||||    
T  20623323 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatgttcattctttgcaatttttcatg 20623262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 92 - 153
Target Start/End: Original strand, 21233437 - 21233498
Alignment:
Q  92 tcatctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatg 153  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| || | |||||| ||| |||||    
T  21233437 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatgttcattctttgcaatttttcatg 21233498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 92 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 37053098 - 37053037
Alignment:
Q  92 tcatctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatg 153  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| || | |||||| ||| |||||    
T  37053098 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatgttcattctttgcaatttttcatg 37053037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 244; Significance: 1e-135; HSPs: 26)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 95 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 34824816 - 34824549
Alignment:
Q  95 tctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcg 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34824816 tctaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcg 34824717  T
Q  195 tgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtta 294  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34824716 tgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtta 34824617  T
Q  295 tgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccatt 361  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34824616 tgaaattattcttaattgatgaaatttgatatgtttttattgaaatgagatgtgattcatattccatt 34824549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 95 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 12728733 - 12728466
Alignment:
Q  95 tctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcg 194  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12728733 tctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcg 12728634  T
Q  195 tgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtta 294  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12728633 tgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtta 12728534  T
Q  295 tgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccatt 361  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12728533 tgaaattattcttaattgatgaaatttgatatgtttttattgaaatgagatgtgattcatattccatt 12728466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 95 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 8944187 - 8943926
Alignment:
Q  95 tctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcg 194  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8944187 tctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcg 8944088  T
Q  195 tgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtta 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8944087 tgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatatttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtta 8943988  T
Q  295 tgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatat 355  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  8943987 tgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatat 8943926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 95 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 16935934 - 16935667
Alignment:
Q  95 tctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcg 194  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  16935934 tctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattca 16935835  T
Q  195 tgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtta 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16935834 tgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgcgtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtta 16935735  T
Q  295 tgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccatt 361  Q
    ||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16935734 tgaaattatactttattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccatt 16935667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 95 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 17006594 - 17006327
Alignment:
Q  95 tctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcg 194  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  17006594 tctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattca 17006495  T
Q  195 tgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtta 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17006494 tgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgcgtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtta 17006395  T
Q  295 tgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccatt 361  Q
    ||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17006394 tgaaattatactttattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccatt 17006327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 95 - 355
Target Start/End: Original strand, 12635783 - 12636044
Alignment:
Q  95 tctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcg 194  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12635783 tctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcatttcctcatgttgtatgaaaataggttgatgaacaattgttgctaaattcg 12635882  T
Q  195 tgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtta 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12635883 tgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtta 12635982  T
Q  295 tgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatat 355  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  12635983 tgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatat 12636044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 95 - 355
Target Start/End: Original strand, 42177884 - 42178145
Alignment:
Q  95 tctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcg 194  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42177884 tctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcg 42177983  T
Q  195 tgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtta 294  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42177984 tgctcttgttgtaatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttttgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtta 42178083  T
Q  295 tgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatat 355  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  42178084 tgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatat 42178145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 98 - 361
Target Start/End: Original strand, 11231256 - 11231520
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 197  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  11231256 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgc 11231355  T
Q  198 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 297  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11231356 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 11231455  T
Q  298 aattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccatt 361  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11231456 aattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaaagagatgtgattcatattccatt 11231520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 92 - 355
Target Start/End: Original strand, 12641554 - 12641818
Alignment:
Q  92 tcatctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaat 191  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12641554 tcatctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaat 12641653  T
Q  192 tcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaag 291  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12641654 tcgtgctcttgttgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtggctgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaag 12641753  T
Q  292 ttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatat 355  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  12641754 ttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttggttgaaatgagatgtaaatcatat 12641818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 98 - 361
Target Start/End: Original strand, 22513103 - 22513367
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 197  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  22513103 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgc 22513202  T
Q  198 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 297  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22513203 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 22513302  T
Q  298 aattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccatt 361  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22513303 aattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatattccatt 22513367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 98 - 361
Target Start/End: Original strand, 24685699 - 24685963
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 197  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  24685699 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgc 24685798  T
Q  198 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 297  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24685799 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 24685898  T
Q  298 aattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccatt 361  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24685899 aattatgcttaattgatgaaatttgatgtgttttgattgaaaagagatgtgattcatattccatt 24685963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 98 - 361
Target Start/End: Original strand, 28775725 - 28775989
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 197  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  28775725 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgc 28775824  T
Q  198 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 297  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28775825 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 28775924  T
Q  298 aattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccatt 361  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28775925 aattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatattccatt 28775989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 95 - 355
Target Start/End: Original strand, 3798518 - 3798779
Alignment:
Q  95 tctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcg 194  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3798518 tctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtataatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaattcg 3798617  T
Q  195 tgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtta 294  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3798618 tgctcttgttgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtta 3798717  T
Q  295 tgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatat 355  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  3798718 tgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttggttgaaatgagatgtaaatcatat 3798779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 96 - 361
Target Start/End: Original strand, 23777961 - 23778227
Alignment:
Q  96 ctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgt 195  Q
    ||||||||| ||||||||| || | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23777961 ctaaggtaaaggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgt 23778060  T
Q  196 gctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 295  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23778061 gctcttgctgtgatgctattttcttatgcatgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 23778160  T
Q  296 gaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccatt 361  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23778161 gaaattatacttaattgatgaaatttgatatgatttgattgaaatgagatgtaattcatattccatt 23778227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 145 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 21142187 - 21141969
Alignment:
Q  145 tttctcatg-ttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggt 243  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21142187 tttctcatggttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgatgttaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgaggattatggt 21142088  T
Q  244 atgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaa-attgatatgttttgattgaaatgag 342  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||  ||||  |||||||||| |  || |||||||    
T  21142087 atgtttgtggatgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgtcaagctatgaaattatactcaattagtgaatcttgatatgttgttgttaaaatgag 21141988  T
Q  343 atgtgattcatattccatt 361  Q
    ||||||||||| |||||||    
T  21141987 atgtgattcatgttccatt 21141969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 95 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 23774477 - 23774257
Alignment:
Q  95 tctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcg 194  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||| || ||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  |||||||    
T  23774477 tctaaggtaagggggttagttattatcataatcaagttcaaattttacatcttttcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcg 23774378  T
Q  195 tgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtta 294  Q
    |||||||||| || ||||  |||||| | | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||     
T  23774377 tgctcttgttatgttgct-gtttcttatacttgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttg 23774279  T
Q  295 tgaaattatgcttaattgatga 316  Q
    ||||||| ||| ||||| ||||    
T  23774278 tgaaattttgcctaattaatga 23774257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 89 - 316
Target Start/End: Original strand, 5888539 - 5888765
Alignment:
Q  89 acatcatctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgcta 188  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  | | ||||||||  | ||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  |    
T  5888539 acatcatctaaggtaagggggtttgttttcatcataatcaatttcaaattttacatcttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtca 5888638  T
Q  189 aattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgtt 288  Q
    |||||||||||||||| || |||| ||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  5888639 aattcgtgctcttgttatgttgctgttg-cttatacatgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtc 5888737  T
Q  289 aagttatgaaattatgcttaattgatga 316  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||| ||||    
T  5888738 aagttgtgaaattttgcctaattaatga 5888765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 98 - 268
Target Start/End: Original strand, 19886576 - 19886745
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 197  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  19886576 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgc 19886674  T
Q  198 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 268  Q
    ||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  19886675 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 19886745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 96 - 299
Target Start/End: Original strand, 7507756 - 7507969
Alignment:
Q  96 ctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcat--gttgtatgaaaatgggttga----------tgaacaattgt 183  Q
    |||||||||||||||||||  | | ||||||||||| || || ||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||          |||| |||| |    
T  7507756 ctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatgttcatttattgcaatttctcatttgttgtatgaatatgggttgaattgaatgaatgaataattat 7507855  T
Q  184 tgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataa 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||    
T  7507856 tgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaa 7507953  T
Q  284 atgttaagttatgaaa 299  Q
    ||  ||||||||||||    
T  7507954 ataataagttatgaaa 7507969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 94 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 463078 - 462876
Alignment:
Q  94 atctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattc 193  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| |||||||||   || ||| |  ||||||  ||||||||||||  | | || ||| | ||||||||||||||||    
T  463078 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgctt-atggataattgttgctaaattc 462980  T
Q  194 gtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtt 293  Q
    ||||||    ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||| | |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||    
T  462979 gtgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagtt 462882  T
Q  294 atgaaa 299  Q
     |||||    
T  462881 gtgaaa 462876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 94 - 268
Target Start/End: Original strand, 25265300 - 25265486
Alignment:
Q  94 atctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcat--gttgtatgaaaatgggttga----------tgaacaatt 181  Q
    |||||| ||||||||||||||  | | ||||||||||| || || ||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||          || | ||||    
T  25265300 atctaatgtaagggggttagtcttcatcataatcatgttcatttattgcaatttctcatttgttgtatgaatatgggttgaattgaataaatggataatt 25265399  T
Q  182 gttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 268  Q
    |||||||||||||||||||   | ||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  25265400 gttgctaaattcgtgctctaactttgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 25265486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 178 - 268
Target Start/End: Original strand, 43642963 - 43643053
Alignment:
Q  178 aattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 268  Q
    ||||||||||||||| ||||||   |||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  43642963 aattgttgctaaatttgtgctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 43643053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 92 - 298
Target Start/End: Original strand, 17396562 - 17396776
Alignment:
Q  92 tcatctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatg--ttgtatgaaaatgggttg----------atgaacaa 179  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| || | |||||| ||| |||||  ||||||| ||||||||||          ||| | ||    
T  17396562 tcatctaaggtaagggggttagtctttaccataatcatgttcattctttgcaatttttcatgatttgtatg-aaatgggttgacatgaatgaatggataa 17396660  T
Q  180 ttgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 279  Q
    ||||||||||||||||||||    | ||||| ||| ||  | ||||||||||| |||| || ||||| |||| |||||||||||||||||  || || ||    
T  17396661 ttgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtt-gtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgttt--aaataagt 17396757  T
Q  280 ataaatgttaagttatgaa 298  Q
    | ||||| |||||||||||    
T  17396758 aaaaatgataagttatgaa 17396776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 92 - 153
Target Start/End: Original strand, 14906349 - 14906410
Alignment:
Q  92 tcatctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatg 153  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| || | |||||| ||| |||||    
T  14906349 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatgttcattctttgcaatttttcatg 14906410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 178 - 267
Target Start/End: Original strand, 20627319 - 20627408
Alignment:
Q  178 aattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgt 267  Q
    |||||||| |||||||||||||    ||||||| ||| ||  | |||| ||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||||    
T  20627319 aattgttgttaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcacgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgt 20627408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 92 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 23820425 - 23820364
Alignment:
Q  92 tcatctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatg 153  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| || | |||||| ||| |||||    
T  23820425 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatgttcattctttgcaatttttcatg 23820364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 241; Significance: 1e-133; HSPs: 29)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 98 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 49232774 - 49232510
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 197  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49232774 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 49232675  T
Q  198 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 297  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49232674 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 49232575  T
Q  298 aattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccatt 361  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49232574 aattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccatt 49232510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 98 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 25059077 - 25058813
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 197  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25059077 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgcacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 25058978  T
Q  198 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 297  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25058977 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 25058878  T
Q  298 aattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccatt 361  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25058877 aattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccatt 25058813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 95 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 18911334 - 18911073
Alignment:
Q  95 tctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcg 194  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18911334 tctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcg 18911235  T
Q  195 tgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtta 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18911234 tgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtta 18911135  T
Q  295 tgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatat 355  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  18911134 tgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatat 18911073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 98 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 22275547 - 22275283
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 197  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22275547 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 22275448  T
Q  198 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 297  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22275447 tcttgctgtgatgccattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtcatga 22275348  T
Q  298 aattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccatt 361  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22275347 aattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccatt 22275283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 98 - 361
Target Start/End: Original strand, 1467657 - 1467921
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 197  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  1467657 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgc 1467756  T
Q  198 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 297  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1467757 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 1467856  T
Q  298 aattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccatt 361  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1467857 aattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaaagagatgtgattcatattccatt 1467921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 98 - 361
Target Start/End: Original strand, 15468258 - 15468522
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 197  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15468258 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgaggaacaattgttgctaaattcgtgc 15468357  T
Q  198 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 297  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15468358 tcttgctatgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtcatga 15468457  T
Q  298 aattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccatt 361  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15468458 aattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccatt 15468522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 98 - 361
Target Start/End: Original strand, 12264710 - 12264975
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 197  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12264710 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 12264809  T
Q  198 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 297  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12264810 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 12264909  T
Q  298 aattatgcttaattgatgaaa--ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccatt 361  Q
     ||||| ||||||||||||||  |||||||||| |  ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12264910 gattatacttaattgatgaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccatt 12264975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 96 - 361
Target Start/End: Original strand, 12902006 - 12902272
Alignment:
Q  96 ctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgt 195  Q
    ||||||||||||||||||| || | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  12902006 ctaaggtaagggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataatttttgctaaattcgt 12902105  T
Q  196 gctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 295  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12902106 gctcttgctgtgatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 12902205  T
Q  296 gaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccatt 361  Q
    |||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12902206 gaaattatacttaattgattaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccatt 12902272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 95 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 5228653 - 5228387
Alignment:
Q  95 tctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcg 194  Q
    |||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5228653 tctaaggtaagggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgtgttatgaaaatgggttgatgaaca-ttgttgctaaattcg 5228555  T
Q  195 tgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtta 294  Q
    |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5228554 tgctcttgctgtgatgttatttccttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaaatatgtataaatgttaagtta 5228455  T
Q  295 tgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccatt 361  Q
    ||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  5228454 tgagattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgaggtgtaattcatattccatt 5228387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 98 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 12812179 - 12811938
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 197  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  12812179 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatattgtatgaaaatgggttgatggacaattgttgttaaattcgtgc 12812080  T
Q  198 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 297  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12812079 tcttgctgtaatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtggaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 12811980  T
Q  298 aattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaa 338  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12811979 atttatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaa 12811938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 90 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 54651803 - 54651531
Alignment:
Q  90 catcatctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaa 189  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  | | ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  54651803 catcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaa 54651704  T
Q  190 attcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgtta 289  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  54651703 attcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgtgagtgaaattgcatgttgcaaagtatgtataaatgtta 54651604  T
Q  290 agttatgaaattatgcttaattgatgaa-attgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccatt 361  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||  |||||||||| |  |||||||||||||| |||||| |||||||    
T  54651603 agttatgaaattatactcaattggtgaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtaattcatgttccatt 54651531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 89 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 44229332 - 44229059
Alignment:
Q  89 acatcatctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatg-ttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgct 187  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  | | ||||||||  |  ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  44229332 acatcatctaaggtaagggggtttgttttcatcataatcaattcaaattttttcattt-ctcatggttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgatgtt 44229234  T
Q  188 aaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgt 287  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44229233 aaatccgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgt 44229134  T
Q  288 taagttatgaaattatgcttaattgatgaa-attgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccatt 361  Q
     ||| ||||||||||| || ||||  ||||  |||||||||| |  || |||||||||||||||||| |||||||    
T  44229133 caagctatgaaattatactcaattagtgaatcttgatatgttgttgttaaaatgagatgtgattcatgttccatt 44229059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 98 - 266
Target Start/End: Original strand, 18896962 - 18897130
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 197  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18896962 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaagttttgtattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgataaattcgtgc 18897061  T
Q  198 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatg 266  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18897062 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtggaattacatg 18897130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 96 - 268
Target Start/End: Original strand, 15936551 - 15936723
Alignment:
Q  96 ctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgt 195  Q
    |||||||| |||||||||| || |  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15936551 ctaaggtatgggggttagttatcattataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttactaaattcgt 15936650  T
Q  196 gctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 268  Q
    ||||    ||| ||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  15936651 gctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 15936723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 98 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 55316555 - 55316387
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 197  Q
    ||||||| ||||||||| |||| || |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  55316555 aaggtaaaggggttagttattatcacaatcatgta--atttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgc 55316458  T
Q  198 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 268  Q
    ||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  55316457 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgtt 55316387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 96 - 268
Target Start/End: Original strand, 15938393 - 15938565
Alignment:
Q  96 ctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgt 195  Q
    ||||||||||||||||||| || |  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  15938393 ctaaggtaagggggttagttatcattataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttactaaatacgt 15938492  T
Q  196 gctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 268  Q
    ||||    ||| ||| ||| ||  |   |||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  15938493 gctccaactgtaatgatatgtttgtaatcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 15938565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 98 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 41270411 - 41270243
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 197  Q
    ||||||||||||||||| |||| || |||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  41270411 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgta--atttttgcatctactcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgc 41270314  T
Q  198 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 268  Q
    ||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| |||| |||| |||||||||||    
T  41270313 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtggaattacatgtt 41270243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 98 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 16821474 - 16821280
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 197  Q
    ||||||||||||||||| |||| || |||||||||    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  |||| |||||    
T  16821474 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgtaa---ttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaatttatgtcaaatccgtgc 16821378  T
Q  198 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 297  Q
    ||||| ||||||| ||| ||  | ||||| |||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||| |||||    
T  16821377 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcataaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagctatga 16821280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 92 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 15615174 - 15614973
Alignment:
Q  92 tcatctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaat 191  Q
    |||| ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  15615174 tcatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatgtaa---ttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagat 15615078  T
Q  192 tcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaag 291  Q
    | ||||||||  |||| || ||| ||  | |||||||||||||||| || ||| | |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||    
T  15615077 ttgtgctcttactgtggtgttatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaggattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataag 15614980  T
Q  292 ttatgaa 298  Q
    || ||||    
T  15614979 ttgtgaa 15614973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 178 - 306
Target Start/End: Original strand, 11986172 - 11986300
Alignment:
Q  178 aattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtat 277  Q
    |||||||| ||||||||||||||   ||||||| ||||||| ||||||||| || ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  11986172 aattgttgttaaattcgtgctctaactgtgatgttattttcgtgtgcatgatttaatgataattgtatgattgtggttgaaattacatgttttaaagtat 11986271  T
Q  278 gtataaatgttaagttatgaaattatgct 306  Q
    |||| ||||| ||||||||||||| ||||    
T  11986272 gtattaatgtcaagttatgaaattgtgct 11986300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 222 - 353
Target Start/End: Original strand, 17912532 - 17912662
Alignment:
Q  222 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatg-aaattatgcttaattgatgaaatt 320  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||||||  || |||||| |||||  |||||||| ||||| |||  |||||||||| ||    
T  17912532 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttt--aaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaattgatgaattt 17912629  T
Q  321 gatatgttttgattgaaatgagatgtgattcat 353  Q
    |||||||| |  ||||| |||| | ||||||||    
T  17912630 gatatgttgtagttgaattgagctatgattcat 17912662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 178 - 299
Target Start/End: Original strand, 51158024 - 51158143
Alignment:
Q  178 aattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtat 277  Q
    ||||||||||||||||||||||    ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||    
T  51158024 aattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tat 51158121  T
Q  278 gtataaatgttaagttatgaaa 299  Q
    ||| ||||| |||||| |||||    
T  51158122 gtaaaaatgataagttgtgaaa 51158143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 178 - 268
Target Start/End: Original strand, 15859030 - 15859120
Alignment:
Q  178 aattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 268  Q
    ||||||||||||||||||||||    ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  15859030 aattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 15859120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 319 - 361
Target Start/End: Original strand, 18897139 - 18897181
Alignment:
Q  319 ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccatt 361  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18897139 ttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccatt 18897181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 13839237 - 13839061
Alignment:
Q  92 tcatctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgca-ttttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaa 190  Q
    |||||||||||||||||||||||  | | |||||||||   || ||| || | |||||  ||||||||||||  | | || ||||| |||||||||||||    
T  13839237 tcatctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcattttgtgaaattttcaaatgttgtatgaattttgatt-atgaataattgttgctaaa 13839139  T
Q  191 ttcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 268  Q
    |||||||||    ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||  ||||||||||||||||    
T  13839138 ttcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgatggtgaaattacatgtt 13839061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 178 - 268
Target Start/End: Original strand, 12030153 - 12030243
Alignment:
Q  178 aattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 268  Q
    ||||||||||||||||||||||    ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||| | |||| ||||||||||||||||    
T  12030153 aattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgtt 12030243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 178 - 299
Target Start/End: Original strand, 14842567 - 14842686
Alignment:
Q  178 aattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtat 277  Q
    ||||||||||||||||||||||    ||||||| ||| ||  | |||||||||||| ||| || ||||| |||| ||||||||| |||| |||||| | |    
T  14842567 aattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgaagataattgtatgattgttggtgaaattgcatg-ttcaaa-tgt 14842664  T
Q  278 gtataaatgttaagttatgaaa 299  Q
    ||| ||||| ||||||||||||    
T  14842665 gtaaaaatgataagttatgaaa 14842686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 92 - 172
Target Start/End: Original strand, 13954799 - 13954880
Alignment:
Q  92 tcatctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatg--ttgtatgaaaatgggttga 172  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| || | |||||| ||| |||||  ||||||| |||||||||||    
T  13954799 tcatctaaggtaagggggttagtctttaccataatcatgttcattctttgcaatttttcatgaattgtatg-aaatgggttga 13954880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 92 - 153
Target Start/End: Original strand, 2449147 - 2449208
Alignment:
Q  92 tcatctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatg 153  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| || | |||||| ||| |||||    
T  2449147 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatgttcattctttgcaatttttcatg 2449208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 240; Significance: 1e-133; HSPs: 4)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 95 - 361
Target Start/End: Original strand, 153922 - 154189
Alignment:
Q  95 tctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcg 194  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  153922 tctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcg 154021  T
Q  195 tgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtta 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  154022 tgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaagttacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtta 154121  T
Q  295 tgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccatt 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  154122 tgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgaatcatattccatt 154189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 101 - 210
Target Start/End: Original strand, 169830 - 169938
Alignment:
Q  101 gtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctct 200  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  169830 gtaagggggttagtgattatcataatcatgtataatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctct 169928  T
Q  201 tgttgtgatg 210  Q
    || |||||||    
T  169929 tgctgtgatg 169938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 98 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 36430 - 36264
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 197  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  36430 aaggtaagggggttaatgattatcataatcatgtgtaatttt-gcatattctcatgttgtatgaaactgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgc 36332  T
Q  198 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacat 265  Q
    |||||| |||||| ||| ||  | || ||||||||||| |  | ||||| |||| |||||||||||||    
T  36331 tcttgtagtgatgttatgtttgtatgtatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacat 36264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 96 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 48936 - 48765
Alignment:
Q  96 ctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgt 195  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |||||||||   || ||| |  ||||||  ||||||||||||  | | || ||| | ||||||||||||||||||    
T  48936 ctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgctt-atggataattgttgctaaattcgt 48838  T
Q  196 gctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 268  Q
    ||||    ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  48837 gctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 48765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 234; Significance: 1e-129; HSPs: 27)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 95 - 355
Target Start/End: Original strand, 18086738 - 18086999
Alignment:
Q  95 tctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcg 194  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18086738 tctaaggtaagggggttagttattagtataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcg 18086837  T
Q  195 tgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtta 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18086838 tgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtta 18086937  T
Q  295 tgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatat 355  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  18086938 tgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatat 18086999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 95 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 16232233 - 16231972
Alignment:
Q  95 tctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcg 194  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16232233 tctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcg 16232134  T
Q  195 tgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtta 294  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16232133 tgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtta 16232034  T
Q  295 tgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatat 355  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  16232033 tgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatat 16231972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 95 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 1556346 - 1556079
Alignment:
Q  95 tctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcg 194  Q
    |||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1556346 tctaaggtaagggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcg 1556247  T
Q  195 tgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtta 294  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1556246 tgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtta 1556147  T
Q  295 tgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccatt 361  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1556146 tgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttaattgaaatgagatgtaattcatattccatt 1556079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 98 - 361
Target Start/End: Original strand, 16376291 - 16376555
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 197  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  16376291 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgc 16376390  T
Q  198 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 297  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16376391 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 16376490  T
Q  298 aattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccatt 361  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16376491 aattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaaagagatgtgattcatattccatt 16376555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 98 - 361
Target Start/End: Original strand, 16383615 - 16383879
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 197  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  16383615 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgc 16383714  T
Q  198 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 297  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16383715 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 16383814  T
Q  298 aattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccatt 361  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16383815 aattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaaagagatgtgattcatattccatt 16383879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 98 - 361
Target Start/End: Original strand, 22225656 - 22225920
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 197  Q
    |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22225656 aaggtatgggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgc 22225755  T
Q  198 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 297  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22225756 tctttctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 22225855  T
Q  298 aattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccatt 361  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22225856 aattatgcttaattgatgaaatttgaaatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccatt 22225920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 98 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 10489037 - 10488773
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 197  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  10489037 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgc 10488938  T
Q  198 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 297  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10488937 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 10488838  T
Q  298 aattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccatt 361  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10488837 aattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatattccatt 10488773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 98 - 361
Target Start/End: Original strand, 16556057 - 16556321
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 197  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  16556057 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgc 16556156  T
Q  198 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 297  Q
    || || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16556157 tcctgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 16556256  T
Q  298 aattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccatt 361  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16556257 aattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaaagagatgtgattcatattccatt 16556321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 98 - 361
Target Start/End: Original strand, 16632613 - 16632877
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 197  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  16632613 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgc 16632712  T
Q  198 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 297  Q
    || || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16632713 tcctgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 16632812  T
Q  298 aattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccatt 361  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16632813 aattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaaagagatgtgattcatattccatt 16632877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 95 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 23978110 - 23977849
Alignment:
Q  95 tctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcg 194  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23978110 tctaaggtaagggcgttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaattcg 23978011  T
Q  195 tgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtta 294  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23978010 tgctcttgttgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtta 23977911  T
Q  295 tgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatat 355  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  23977910 tgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttggttgaaatgagatgtaaatcatat 23977849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 96 - 355
Target Start/End: Original strand, 13620710 - 13620970
Alignment:
Q  96 ctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgt 195  Q
    |||||||||||||||||||  |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13620710 ctaaggtaagggggttagtcttcttcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgt 13620809  T
Q  196 gctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 295  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13620810 gctcttgttgtaatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattgcatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 13620909  T
Q  296 gaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatat 355  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  13620910 gaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatat 13620970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 95 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 19610359 - 19610092
Alignment:
Q  95 tctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcg 194  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19610359 tctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctgatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattattgctaaattcg 19610260  T
Q  195 tgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtta 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19610259 tgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaatcgatggttatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtta 19610160  T
Q  295 tgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccatt 361  Q
    | ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  19610159 taaaattatacttcattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtagttcatattccatt 19610092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 98 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 19299575 - 19299375
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 197  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  19299575 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatggacaattgttgttaaattcgtgc 19299476  T
Q  198 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 297  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19299475 tcttgctgtaatgctattttcttgtgtttgaattgatgattatggtatgtttatgggtggaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 19299376  T
Q  298 a 298  Q
    |    
T  19299375 a 19299375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 98 - 262
Target Start/End: Original strand, 22251484 - 22251648
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 197  Q
    |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22251484 aaggtatgggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgc 22251583  T
Q  198 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaatta 262  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22251584 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaatta 22251648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 121 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 29666189 - 29665955
Alignment:
Q  121 cataatcatgtacaatttttgcattttctcat-gttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttct 219  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  29666189 cataatcatgttcaattattgcaatttctcattgttgtatgaaaatggggtgatggataattgttgttaaattcgtgctctagctgtgatgttattttct 29666090  T
Q  220 tgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaa-a 318  Q
    | || ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| | || ||||| ||||      
T  29666089 tatgtatgaattgatgataattgtatgattgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgcataaatgtcaagttatgaaattgtactcaattggtgaatt 29665990  T
Q  319 ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcat 353  Q
    ||| || ||| |  |||||||||||| ||||||||    
T  29665989 ttgctaagttgttgttgaaatgagatatgattcat 29665955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 95 - 316
Target Start/End: Original strand, 29869691 - 29869911
Alignment:
Q  95 tctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcg 194  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||  |  || |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  |||||||    
T  29869691 tctaaggtaagggggttagttattatcataatcaatttaaaattttacatcttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcg 29869790  T
Q  195 tgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtta 294  Q
    |||||||||| || |||| ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |||||     
T  29869791 tgctcttgttatgttgctgttt-cttatacatgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataagtgtcaagttg 29869889  T
Q  295 tgaaattatgcttaattgatga 316  Q
    ||||||| ||| ||||| ||||    
T  29869890 tgaaattttgcctaattaatga 29869911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 92 - 268
Target Start/End: Original strand, 1650016 - 1650189
Alignment:
Q  92 tcatctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaat 191  Q
    |||| ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  1650016 tcatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatgtaa---ttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagat 1650112  T
Q  192 tcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 268  Q
    ||||||||||  ||||||| ||  ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  1650113 tcgtgctcttactgtgatgttacgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 1650189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 98 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 25175901 - 25175731
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcatttt-ctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtg 196  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||    
T  25175901 aaggtaagggggttagtgattaccataatcatgtataatttt-gcatttttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtg 25175803  T
Q  197 ctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 268  Q
    |||||| |||| || ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  25175802 ctcttgctgtgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 25175731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 109 - 235
Target Start/End: Original strand, 16825678 - 16825803
Alignment:
Q  109 gttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtga 208  Q
    ||||||||||| |||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||    
T  16825678 gttagtgattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtga 16825776  T
Q  209 tgctattttcttgtgcatgaattgatg 235  Q
    || ||| ||  | ||||||||||||||    
T  16825777 tgttatgtttgtatgcatgaattgatg 16825803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 98 - 268
Target Start/End: Original strand, 27653898 - 27654067
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 197  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  27653898 aaggtgagggggttagtgattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaaatcatgctaaattcgtgc 27653996  T
Q  198 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 268  Q
    ||||| ||||||| |||  |  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  27653997 tcttgctgtgatgttatgcttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 27654067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 178 - 299
Target Start/End: Original strand, 14626124 - 14626243
Alignment:
Q  178 aattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtat 277  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||    
T  14626124 aattattgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tat 14626221  T
Q  278 gtataaatgttaagttatgaaa 299  Q
    ||| ||||| ||||||||||||    
T  14626222 gtaaaaatgataagttatgaaa 14626243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 95 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 15862823 - 15862592
Alignment:
Q  95 tctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcat--gttgtatgaaaatgggttga----------tgaacaattg 182  Q
    ||||||||||||||||||||  | | ||||||||||| || || ||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||          || | |||||    
T  15862823 tctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatgttcatttattgcaatttctcatttgttgtatgaatatgggttgaattgaataaatggataattg 15862724  T
Q  183 ttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtata 282  Q
    || |||||||||||||||   ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||| |||||||   || ||||||||    
T  15862723 ttactaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgtt--caattatgtata 15862626  T
Q  283 aatgttaagttatg-aaattatgcttaattgatg 315  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  15862625 aatgtgaagttatgaaaattgtgctcaattgatg 15862592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 95 - 315
Target Start/End: Original strand, 1657659 - 1657890
Alignment:
Q  95 tctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcat--gttgtatgaaaatgggttga----------tgaacaattg 182  Q
    ||||||||||||||||||||  | | ||||||||||| || || ||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||          || | |||||    
T  1657659 tctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatgttcatttattgcaatttctcatttgttgtatgaatatgggttgaattgaataaatggataattg 1657758  T
Q  183 ttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtata 282  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||| |||||||   || |||||| |    
T  1657759 ttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttggatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgtt--caattatgtaaa 1657856  T
Q  283 aatgttaagttatg-aaattatgcttaattgatg 315  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  1657857 aatgtgaagttatgaaaattgtgctcaattgatg 1657890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 253 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 27741021 - 27740957
Alignment:
Q  253 ggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaa 317  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||||    
T  27741021 ggtgaaattacatgtttcgaagtatgtataaatgtcaagttatgaaattgtgctcaattggtgaa 27740957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 94 - 268
Target Start/End: Original strand, 35009349 - 35009535
Alignment:
Q  94 atctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcat--gttgtatgaaaatgggttga----------tgaacaatt 181  Q
    |||||| ||||||||||||||  | | ||||||||||| || || ||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||          || | ||||    
T  35009349 atctaaagtaagggggttagtcttcatcataatcatgttcatttattgcaatttctcatttgttgtatgaatatgggttgaattgaagaaatggataatt 35009448  T
Q  182 gttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 268  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||| ||  ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  35009449 gttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttaagtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 35009535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 178 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 23153704 - 23153614
Alignment:
Q  178 aattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 268  Q
    ||||||| ||||||||||||||    ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  23153704 aattgtttctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 23153614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 94 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 27751777 - 27751698
Alignment:
Q  94 atctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgt-tgtatgaaaatgggttga 172  Q
    |||||||||||||||||||||  | | ||||||||||| || || ||||| |||||||| | |||||||| |||||||||    
T  27751777 atctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatgttcatttattgcaatttctcatttgtgtatgaatatgggttga 27751698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 20)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 98 - 361
Target Start/End: Original strand, 18059676 - 18059940
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 197  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18059676 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtataatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgc 18059775  T
Q  198 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 297  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18059776 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 18059875  T
Q  298 aattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccatt 361  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18059876 aattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccatt 18059940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 98 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 17004976 - 17004712
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 197  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  17004976 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgc 17004877  T
Q  198 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 297  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17004876 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 17004777  T
Q  298 aattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccatt 361  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17004776 aattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatattccatt 17004712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 95 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 46523729 - 46523463
Alignment:
Q  95 tctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcg 194  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46523729 tctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgttccatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcg 46523631  T
Q  195 tgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtta 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46523630 tgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgtttatgttatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtta 46523531  T
Q  295 tgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccatt 361  Q
    ||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  46523530 tgaaattatacttcattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccatt 46523463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 105 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 17148898 - 17148647
Alignment:
Q  105 gggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgtt 204  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17148898 gggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaattcgtgctcttgtt 17148799  T
Q  205 gtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatg 304  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  17148798 gtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattata 17148699  T
Q  305 cttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatat 355  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  17148698 cttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaatgagatgtaaatcatat 17148647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 98 - 361
Target Start/End: Original strand, 38055009 - 38055273
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 197  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  38055009 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcatcttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgc 38055108  T
Q  198 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 297  Q
    | ||  ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38055109 ttttactgtgatgttattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 38055208  T
Q  298 aattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccatt 361  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38055209 aattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaaagagatgtgattcatattccatt 38055273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 98 - 298
Target Start/End: Original strand, 19962417 - 19962617
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 197  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  19962417 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatggacaattgttgttaaattcgtgc 19962516  T
Q  198 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 297  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19962517 tcttgctgtaatgctattttcttgtgtttgaattgatgattatggtatgtttatgggtggaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 19962616  T
Q  298 a 298  Q
    |    
T  19962617 a 19962617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 98 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 22228146 - 22227947
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 197  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22228146 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgc 22228047  T
Q  198 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 297  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||  ||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  22228046 tcttgctgtgatgttattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttatga 22227949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 98 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 22232843 - 22232644
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 197  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22232843 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgc 22232744  T
Q  198 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 297  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||  ||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  22232743 tcttgctgtgatgttattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttatga 22232646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 95 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 22035788 - 22035568
Alignment:
Q  95 tctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcg 194  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||  | ||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  |||||||    
T  22035788 tctaaggtaagggggttagttattatcataatcaatttcaaattttacatcttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcg 22035689  T
Q  195 tgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtta 294  Q
    |||||||||| || ||||  |||||| | | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||     
T  22035688 tgctcttgttatgttgct-gtttcttatacttgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttg 22035590  T
Q  295 tgaaattatgcttaattgatga 316  Q
    ||||||| ||| ||||| ||||    
T  22035589 tgaaattttgcctaattaatga 22035568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 95 - 316
Target Start/End: Original strand, 7640849 - 7641069
Alignment:
Q  95 tctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcg 194  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||  | ||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  |||||||    
T  7640849 tctaaggtaagggggttagttattatcataatcaatttcaaattttacatcttttcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcg 7640948  T
Q  195 tgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtta 294  Q
    |||||||||| || |||| ||| ||| | | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||     
T  7640949 tgctcttgttatgttgctgttt-cttatacttgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttg 7641047  T
Q  295 tgaaattatgcttaattgatga 316  Q
    ||||||| ||| ||||| ||||    
T  7641048 tgaaattttgcctaattaatga 7641069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 92 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 2116595 - 2116393
Alignment:
Q  92 tcatctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaat 191  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  2116595 tcatttaaggtaaaggggttagtgattatcataatcatgtaa---ttttgcattttctcatgttgtataaaaatgggttgatgaacaattcatgctagat 2116499  T
Q  192 tcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaag 291  Q
    ||||||| ||  ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||    
T  2116498 tcgtgcttttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataag 2116401  T
Q  292 ttatgaaa 299  Q
    || |||||    
T  2116400 ttgtgaaa 2116393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 98 - 268
Target Start/End: Original strand, 5072304 - 5072472
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 197  Q
    ||||||||||||||||| |||| || |||||||||  |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  5072304 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgta--atttttgcatttactcaagttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgc 5072401  T
Q  198 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 268  Q
    ||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  5072402 tcttgctgtgatgttatgtttatatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgtt 5072472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 92 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 45051763 - 45051561
Alignment:
Q  92 tcatctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaat 191  Q
    |||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  45051763 tcatttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatgt---gattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagat 45051667  T
Q  192 tcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaag 291  Q
    ||||| ||||  ||||||| ||  ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||    
T  45051666 tcgtgttcttactgtgatgttacgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataag 45051569  T
Q  292 ttatgaaa 299  Q
    || |||||    
T  45051568 ttgtgaaa 45051561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 134 - 268
Target Start/End: Original strand, 18601068 - 18601202
Alignment:
Q  134 aatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattga 233  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||  | ||||||||||||    
T  18601068 aatttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattga 18601167  T
Q  234 tgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 268  Q
    || |  | ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  18601168 tgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgtt 18601202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 178 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 20445936 - 20445846
Alignment:
Q  178 aattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 268  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  20445936 aattgttgctaaattcgtgctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 20445846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 178 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 20913287 - 20913168
Alignment:
Q  178 aattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtat 277  Q
    ||||||||||||||||||||||    ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||| | |||| |||||||||||||| |||| | |||    
T  20913287 aattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatg-ttcata-tat 20913190  T
Q  278 gtataaatgttaagttatgaaa 299  Q
    ||| ||||| ||||||||||||    
T  20913189 gtaaaaatgataagttatgaaa 20913168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 178 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 20931602 - 20931483
Alignment:
Q  178 aattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtat 277  Q
    ||||||||||||||||||||||    ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||| | |||| |||||||||||||| |||| | |||    
T  20931602 aattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatg-ttcata-tat 20931505  T
Q  278 gtataaatgttaagttatgaaa 299  Q
    ||| ||||| ||||||||||||    
T  20931504 gtaaaaatgataagttatgaaa 20931483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 178 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 20531701 - 20531611
Alignment:
Q  178 aattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 268  Q
    ||||||||||||||||||||||    ||||||  ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  20531701 aattgttgctaaattcgtgctccaaatgtgataatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 20531611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 94 - 268
Target Start/End: Original strand, 37844371 - 37844546
Alignment:
Q  94 atctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggt-tgatgaacaattgttgctaaatt 192  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| |||||||||   || ||| || ||||||  ||||||||||||  |  |  | ||| | |||||||||||||||    
T  37844371 atctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaatt 37844470  T
Q  193 cgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 268  Q
    | |||||    | ||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  37844471 catgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 37844546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 178 - 268
Target Start/End: Original strand, 20893632 - 20893722
Alignment:
Q  178 aattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 268  Q
    |||||||||||||||| |||||    ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| | ||||||||||||||    
T  20893632 aattgttgctaaattcttgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttgttgaaattacatgtt 20893722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1500 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 1)
Name: scaffold1500
Description:

Target: scaffold1500; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 95 - 355
Target Start/End: Original strand, 1429 - 1690
Alignment:
Q  95 tctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcg 194  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1429 tctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcg 1528  T
Q  195 tgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtta 294  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1529 tgctcttgttgtaatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtta 1628  T
Q  295 tgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatat 355  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  1629 tgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatat 1690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 218; Significance: 1e-120; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 95 - 355
Target Start/End: Original strand, 1490 - 1751
Alignment:
Q  95 tctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcg 194  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  1490 tctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaaatcg 1589  T
Q  195 tgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtta 294  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1590 tgcacttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtta 1689  T
Q  295 tgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatat 355  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  1690 tgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatat 1751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 1)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 98 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 29500 - 29236
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 197  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29500 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgc 29401  T
Q  198 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 297  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29400 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgttgattatgttatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtgtaaatgttaagttatga 29301  T
Q  298 aattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccatt 361  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29300 aattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccatt 29236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 2)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 98 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 31647 - 31383
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 197  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  31647 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgc 31548  T
Q  198 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 297  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31547 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 31448  T
Q  298 aattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccatt 361  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31447 aattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatattccatt 31383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #2
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 147 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 39935 - 39720
Alignment:
Q  147 tctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatg 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  39935 tctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgattctattttcctgtgcatgaattgatgattatggtatt 39836  T
Q  247 tttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatg 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  39835 tttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattattcttaattgatgaaatttgatatgttttttttgaaatgagatg 39736  T
Q  346 tgattcatattccatt 361  Q
    | ||||||||| ||||    
T  39735 ttattcatatttcatt 39720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 2)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 98 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 39441 - 39177
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 197  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  39441 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgc 39342  T
Q  198 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 297  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39341 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 39242  T
Q  298 aattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccatt 361  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39241 aattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatattccatt 39177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 98 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 43333 - 43137
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgca-ttttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtg 196  Q
    ||||||||||||||||| | || || || |||||   | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||  |||||||||    
T  43333 aaggtaagggggttagttactatcacaaacatgt---aattttgcatttttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgagcaattcatgtcaaattcgtg 43237  T
Q  197 ctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatg 296  Q
    |||||| || |||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||    
T  43236 ctcttgctgggatgttatgtttctatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatg 43139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 1)
Name: scaffold0467
Description:

Target: scaffold0467; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 90 - 361
Target Start/End: Original strand, 10249 - 10521
Alignment:
Q  90 catcatctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaa 189  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  |   ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10249 catcatctaaggtaagggggtttgtcttcttcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaa 10348  T
Q  190 attcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgtta 289  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10349 attcgtgctcttgctgtgatgatattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgcta 10448  T
Q  290 agttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccatt 361  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10449 agttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccatt 10521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 1)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 95 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 2734 - 2466
Alignment:
Q  95 tctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaa-tttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattc 193  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2734 tctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctcaattc 2635  T
Q  194 gtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtt 293  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  2634 gtgctcttgccgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgcttatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtc 2535  T
Q  294 atgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccatt 361  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2534 atgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgtttttattgaaatgagatgtaattcatattccatt 2466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 184; Significance: 2e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 92 - 361
Target Start/End: Original strand, 34070 - 34340
Alignment:
Q  92 tcatctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcat-gttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaa 190  Q
    |||||||||||||||||||||||  | | ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  34070 tcatctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcattgttgtatgaaa-tgggttgatgaaaaattgttgctaaa 34168  T
Q  191 ttcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaa 290  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34169 ttcgtgctcttgctgtgaagctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaa 34268  T
Q  291 gttatgaaattatgcttaattgatgaaatt-gatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccatt 361  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||| || |||||||| |  |||||||||||| |||||||| |||||||    
T  34269 gttatgaagttatacttaattgatgaatttggatatgttgttgttgaaatgagatatgattcatgttccatt 34340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0191 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0191
Description:

Target: scaffold0191; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 98 - 361
Target Start/End: Original strand, 7374 - 7638
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 197  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  7374 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgttccatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattattactaaattcgtgc 7473  T
Q  198 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  7474 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgaagattatggtatgtttgtggatgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgtcaagctatga 7573  T
Q  298 aattatgcttaattgatgaa-attgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccatt 361  Q
    |||||| || ||||  ||||  |||||||||| |  || |||||||||||||||||| |||||||    
T  7574 aattatactcaattagtgaatcttgatatgttgttgttaaaatgagatgtgattcatgttccatt 7638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 150; Significance: 3e-79; HSPs: 2)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 94 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 45373 - 45104
Alignment:
Q  94 atctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcat-gttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatt 192  Q
    |||||||||||||||||||||  | | ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  45373 atctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatgttcaattattgcaatttctcattgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgttaaatt 45274  T
Q  193 cgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagt 292  Q
    ||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  45273 cgtgcccttgttgtgatgctattttgatgtgcatgaattgatgataattgtatgattgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgtcaagt 45174  T
Q  293 tatgaaattatgcttaattgatgaa-attgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccatt 361  Q
    | ||||||| | || ||||| ||||  |||||||||| |  ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  45173 tttgaaattgtactcaattggtgaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccatt 45104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066; HSP #2
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 94 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 54759 - 54490
Alignment:
Q  94 atctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcat-gttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatt 192  Q
    ||||||||||||| |||||||  | | ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  54759 atctaaggtaaggtggttagtcttcatcataatcatgttcaattattgcaatttctcattgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgttaaatt 54660  T
Q  193 cgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagt 292  Q
    ||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  54659 cgtgtccttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgtgggtgaaattgcatgtttcaaagtatgtataaatgtcaagt 54560  T
Q  293 tatgaaattatgcttaattgatgaa-attgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccatt 361  Q
    ||||||||| | || ||||| ||||  |||||||||| |  ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  54559 tatgaaattgtactcaattggtgaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccatt 54490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 143; Significance: 5e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 90 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 4068 - 3890
Alignment:
Q  90 catcatctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaa 189  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4068 catcttctaaggtaaggggtttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaa 3969  T
Q  190 attcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  3968 attcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 3890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1666 (Bit Score: 142; Significance: 2e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold1666
Description:

Target: scaffold1666; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 185 - 361
Target Start/End: Original strand, 1 - 178
Alignment:
Q  185 gctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaa 284  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1 gctaaattcgtgctcttgctgtgaggctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtgtaaa 100  T
Q  285 tgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccatt 361  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  101 tgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttaattgaaatgagatgtaattcatattacatt 178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 89 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 54221 - 54008
Alignment:
Q  89 acatcatctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgcta 188  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  | | ||||||||  |  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  54221 acatcatctaaggtaagggggtttgttttcatcataatcaattcaaatttttgcattttctcatgttttatgaaaatgggttgatgaacaattgatgcta 54122  T
Q  189 aattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgtt 288  Q
    |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  54121 aattcgtgctcttactgtgatgctgttttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatg-ttcaaagcatgtataattgtt 54023  T
Q  289 aagttatgaaattat 303  Q
    ||||| |||||||||    
T  54022 aagttgtgaaattat 54008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 98 - 299
Target Start/End: Original strand, 5130 - 5329
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 197  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  5130 aaggtaagggagttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcacgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgttaaattcgtgc 5229  T
Q  198 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 297  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  5230 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttatga 5327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183 (Bit Score: 118; Significance: 4e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0183
Description:

Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 95 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 6938 - 6718
Alignment:
Q  95 tctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcg 194  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||  | ||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  |||||||    
T  6938 tctaaggtaagggggttagttattatcataatcaatttcaaattttacatcttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcg 6839  T
Q  195 tgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtta 294  Q
    |||||||||| || |||| ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||     
T  6838 tgctcttgttatgttgctgttt-cttatacatgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttg 6740  T
Q  295 tgaaattatgcttaattgatga 316  Q
    ||||||| ||||||||| ||||    
T  6739 tgaaattttgcttaattaatga 6718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0892 (Bit Score: 114; Significance: 9e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0892
Description:

Target: scaffold0892; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 134 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 3715 - 3547
Alignment:
Q  134 aatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattga 233  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  ||||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  3715 aatttttgcattttctcatgttttatgaaaatgggttgatgaacaattgatgctaaattagtgctcttactgtgatgttgttttcttgtccatgaattga 3616  T
Q  234 tgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattat 303  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||    
T  3615 tgattatggtatgattgtgggtgaaattacatg-ttcaaagcatgtataattgttaagttgtgaaattat 3547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 98 - 298
Target Start/End: Original strand, 21031 - 21228
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 197  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21031 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgc 21129  T
Q  198 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 297  Q
    ||||||||||||| ||| ||  | | ||| |||||||||| ||  |||| ||||  ||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  21130 tcttgttgtgatgttatgtttgtatccattaattgatgataattatatgattgttagtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttatga 21227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 98 - 298
Target Start/End: Original strand, 13977 - 14173
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 197  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||    
T  13977 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgcacaattcttgctaaa-tcgtgc 14074  T
Q  198 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 297  Q
    ||||| ||||||| ||| |   | |||||||||||||||| ||  |||| ||||  |||||||||||||||   || |||||| ||||| ||||||||||    
T  14075 tcttgctgtgatgttatgtctgtatgcatgaattgatgataattatatgattgttagtgaaattacatgtt--gaaatatgtaaaaatgataagttatga 14172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 98 - 210
Target Start/End: Original strand, 10666 - 10778
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 197  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10666 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 10765  T
Q  198 tcttgttgtgatg 210  Q
    |||||||||||||    
T  10766 tcttgttgtgatg 10778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 104; Significance: 9e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 89 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 7556 - 7330
Alignment:
Q  89 acatcatctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgcta 188  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  | | ||||||||  | ||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  |    
T  7556 acatcatctaaggtaagggggtttgttttcatcataatcaatttcaaattttacatcttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtca 7457  T
Q  189 aattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgtt 288  Q
    |||||||||||||||| || |||| ||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  7456 aattcgtgctcttgttatgttgctgttg-cttatacatgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtc 7358  T
Q  289 aagttatgaaattatgcttaattgatga 316  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||| ||||    
T  7357 aagttgtgaaattttgcctaattaatga 7330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 95 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 3302 - 3130
Alignment:
Q  95 tctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcg 194  Q
    |||||||||||||||||| | |||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3302 tctaaggtaagggggttaattattatcataattatgtacaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcg 3204  T
Q  195 tgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 268  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||  | | |||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  3203 tgctcttgctgtgatgttatgtttgtatccatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 3130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 98 - 299
Target Start/End: Original strand, 13242 - 13438
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 197  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||    
T  13242 aaggtaagggggttagtgattatcataatcatgta--attttt-cattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagattcgtgc 13338  T
Q  198 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 297  Q
    ||||  ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| |||    
T  13339 tcttagtgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtga 13436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 96 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 108086 - 107914
Alignment:
Q  96 ctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgt 195  Q
    ||||||||||||||||||| || |  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  108086 ctaaggtaagggggttagttatcattataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttactaaattcgt 107987  T
Q  196 gctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 268  Q
    ||||    ||| ||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  107986 gctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 107914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 95 - 298
Target Start/End: Original strand, 64436 - 64640
Alignment:
Q  95 tctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcg 194  Q
    |||||||||||||||||||| |||| || |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  |||||||    
T  64436 tctaaggtaagggggttagttattatcacaatcatgta--atttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcg 64533  T
Q  195 tgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatga-----attgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgtta 289  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||  | |||||||     ||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||||||  || |||||| ||||| ||    
T  64534 tgctcttgctgtgatgttatgtttatatgcatgaattatattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgttt--aaatatgtaaaaatgata 64631  T
Q  290 agttatgaa 298  Q
    |||||||||    
T  64632 agttatgaa 64640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 95 - 316
Target Start/End: Original strand, 23664 - 23884
Alignment:
Q  95 tctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcg 194  Q
    |||||| ||||||||||||| |||| |||| |||  | ||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||  |||||||    
T  23664 tctaagttaagggggttagttattatcatattcaatttcaaattttacatcttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaactcatgtcaaattcg 23763  T
Q  195 tgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtta 294  Q
    |||||| ||| || || | ||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||     
T  23764 tgctctggttatgttgttgttt-cttatacatggattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttg 23862  T
Q  295 tgaaattatgcttaattgatga 316  Q
    ||||||| ||| ||||| ||||    
T  23863 tgaaattttgcctaattaatga 23884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 89; Significance: 8e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 89 - 299
Target Start/End: Original strand, 9257 - 9462
Alignment:
Q  89 acatcatctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgcta 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  |    
T  9257 acatcatctaaggtaagggggttagttattatcacaatcatgtaa---ttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtca 9353  T
Q  189 aattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgtt 288  Q
    |||||||||| ||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |    
T  9354 aattcgtgcttttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgat 9451  T
Q  289 aagttatgaaa 299  Q
    ||||| |||||    
T  9452 aagttgtgaaa 9462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 89 - 299
Target Start/End: Original strand, 16155 - 16360
Alignment:
Q  89 acatcatctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgcta 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  |    
T  16155 acatcatctaaggtaagggggttagttattatcacaatcatgtaa---ttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtca 16251  T
Q  189 aattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgtt 288  Q
    |||||||||| ||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |    
T  16252 aattcgtgcttttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgat 16349  T
Q  289 aagttatgaaa 299  Q
    ||||| |||||    
T  16350 aagttgtgaaa 16360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1711 (Bit Score: 84; Significance: 7e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold1711
Description:

Target: scaffold1711; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 98 - 268
Target Start/End: Original strand, 1220 - 1388
Alignment:
Q  98 aaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 197  Q
    |||||| |||||||||| |||| || |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  1220 aaggtaggggggttagttattatcacaatcatgta--atttttgcatttactcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgc 1317  T
Q  198 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 268  Q
    ||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  1318 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgtt 1388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 101 - 317
Target Start/End: Original strand, 31593 - 31807
Alignment:
Q  101 gtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctct 200  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  31593 gtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaatttt-gcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctct 31691  T
Q  201 tgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa-a 299  Q
    ||| |||||| ||| ||    |||||||||||||| |  | ||||| |||| |||||||||||||  |||| | |||| | ||||| ||||||||||| |    
T  31692 tgtggtgatgttatgtttgaatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacat-attcata-tatgcaaaaatgataagttatgaata 31789  T
Q  300 ttatgcttaattgatgaa 317  Q
    ||||||| ||||| ||||    
T  31790 ttatgctcaattggtgaa 31807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 95 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 372 - 177
Alignment:
Q  95 tctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcg 194  Q
    |||||||||||||||||||| |||| || |||||||||    |||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||  |||||||    
T  372 tctaaggtaagggggttagttattatcaaaatcatgtaa---ttttgcattg-ctcatgttatatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcg 277  T
Q  195 tgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtta 294  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||||||  || |||||| ||||| |||||||    
T  276 tgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgttt--aaatatgtaaaaatgataagtta 179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 178 - 306
Target Start/End: Original strand, 56105 - 56233
Alignment:
Q  178 aattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtat 277  Q
    |||||||| ||||||||||||||   ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| || ||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  56105 aattgttgttaaattcgtgctctaactgtgatgttattttcgtgtgcatgatttgatgataattgtatgattgtggctgaaattacatgttttaaagtat 56204  T
Q  278 gtataaatgttaagttatgaaattatgct 306  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  56205 gtataaatgtcaagttatgaaattgtgct 56233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0516 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0516
Description:

Target: scaffold0516; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 89 - 202
Target Start/End: Original strand, 12036 - 12149
Alignment:
Q  89 acatcatctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatg-ttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgct 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  | ||| |||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  12036 acatcatctaaggtaagggggttagttattatcataatcaatttcaaatttttcattt-ctcatggttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgatgtt 12134  T
Q  188 aaattcgtgctcttg 202  Q
    |||||||||||||||    
T  12135 aaattcgtgctcttg 12149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 54; Significance: 6e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 96 - 173
Target Start/End: Original strand, 13266 - 13342
Alignment:
Q  96 ctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgat 173  Q
    ||||||||||||||||||| || | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13266 ctaaggtaagggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatg-aaatgggttgat 13342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0361 (Bit Score: 52; Significance: 9e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0361
Description:

Target: scaffold0361; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 178 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 3447 - 3324
Alignment:
Q  178 aattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtat 277  Q
    ||||| ||||||||||||||||| | ||||||| ||  ||  | |||||||||| |||||  | ||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  3447 aattgatgctaaattcgtgctctagctgtgatgttaagtttgtatgcatgaattaatgatatttgtatgattgttggtgaaattacatatttcaaagtat 3348  T
Q  278 gtataaatgttaagttatgaaatt 301  Q
    |||||||| | |||||||||||||    
T  3347 gtataaatatcaagttatgaaatt 3324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 47; Significance: 9e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 96 - 268
Target Start/End: Original strand, 34372 - 34556
Alignment:
Q  96 ctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcat--gttgtatgaaaatgggttga----------tgaacaattgt 183  Q
    |||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||          || | |||| |    
T  34372 ctaaggtaagagggttagttattatcataatcatgttcatttattgcaatttctcatttgttgtatgaatatgggttgaattgaatgaatggataattat 34471  T
Q  184 tgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 268  Q
    |||||||||||||||||   ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  34472 tgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 34556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 44; Significance: 6e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 94 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 13859 - 13625
Alignment:
Q  94 atctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcat--gttgtatgaaaatgggttga----------tgaacaatt 181  Q
    |||||||||||||||||||||  | | |||||||||||  | || ||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||          || | ||||    
T  13859 atctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatgtttatttattgcaatttctcatttgttgtatgaatatgggttgaattgaataaatggataatt 13760  T
Q  182 gttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtat 281  Q
    |||||||||||||||||||   | ||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||   || ||||||     
T  13759 gttgctaaattcgtgctctaactttgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt--caattatgtaa 13662  T
Q  282 aaatgttaagttatg-aaattatgcttaattgatgaa 317  Q
    |||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||||    
T  13661 aaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaa 13625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 178 - 268
Target Start/End: Original strand, 123170 - 123260
Alignment:
Q  178 aattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 268  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  123170 aattgttgctaaattcgtgctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 123260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000009; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 178 - 299
Target Start/End: Original strand, 3588 - 3707
Alignment:
Q  178 aattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtat 277  Q
    ||||||||||||||||||||||    ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||    
T  3588 aattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tat 3685  T
Q  278 gtataaatgttaagttatgaaa 299  Q
    ||| ||||| |||||| |||||    
T  3686 gtaaaaatgataagttgtgaaa 3707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 178 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 1381 - 1262
Alignment:
Q  178 aattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtat 277  Q
    ||||||||||||||||||||||    | ||||| ||| ||  | ||||||||||||| || || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||    
T  1381 aattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgttagtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tat 1284  T
Q  278 gtataaatgttaagttatgaaa 299  Q
    ||| ||||| |||||| |||||    
T  1283 gtaaaaatgataagttgtgaaa 1262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 178 - 317
Target Start/End: Original strand, 962 - 1100
Alignment:
Q  178 aattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtat 277  Q
    ||||||||||||||||||||||    ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||    
T  962 aattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tat 1059  T
Q  278 gtataaatgttaagttatg-aaattatgcttaattgatgaa 317  Q
    ||| ||||  |||||| || ||||| |||| ||||||||||    
T  1060 gtaaaaataataagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaa 1100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 96 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 41998 - 41815
Alignment:
Q  96 ctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcat-gttgtatgaaaatgggttga----------tgaacaattgtt 184  Q
    |||||||||||||||||||  | | ||||||||||| || || || || |||||||| |||||||||| |||||||||          || | |||||||    
T  41998 ctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatgttcatttatttcaatttctcattgttgtatgaatatgggttgaattgaataaatggataattgtt 41899  T
Q  185 gctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 268  Q
    | ||||||||||||||   ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  41898 gttaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 41815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0772
Description:

Target: scaffold0772; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 172 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 5792 - 5668
Alignment:
Q  172 atgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttca 271  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||    | ||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||||||      
T  5792 atgaataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgttt-- 5695  T
Q  272 aagtatgtataaatgttaagttatgaa 298  Q
    || |||||| ||||| ||||| |||||    
T  5694 aaatatgtaaaaatgataagtcatgaa 5668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 178 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 12370 - 12279
Alignment:
Q  178 aattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgttt 269  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||| |||||||||    
T  12370 aattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaaatacatgttt 12279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1542 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold1542
Description:

Target: scaffold1542; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 178 - 268
Target Start/End: Original strand, 540 - 630
Alignment:
Q  178 aattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 268  Q
    ||||||||||||||||||||||    ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  540 aattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 178 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 9135 - 9016
Alignment:
Q  178 aattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtat 277  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||||| ||| ||  | ||||||||| |||||| || ||| | |||| ||||||||||||||||   || |||    
T  9135 aattgttgctaaattcgtgctccatttgtgatgttatgtttgtatgcatgaatcgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgtt--caattat 9038  T
Q  278 gtataaatgttaagttatgaaa 299  Q
    ||| |||||||||||| |||||    
T  9037 gtaaaaatgttaagttgtgaaa 9016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 178 - 268
Target Start/End: Original strand, 6070 - 6160
Alignment:
Q  178 aattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 268  Q
    ||||||||||||||||||||||    ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  6070 aattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 6160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 178 - 268
Target Start/End: Original strand, 89460 - 89550
Alignment:
Q  178 aattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 268  Q
    ||||||||||||||||||||||    ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  89460 aattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 89550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 178 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 9106 - 9016
Alignment:
Q  178 aattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 268  Q
    ||||||||||||||||||||||    ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  9106 aattgttgctaaattcgtgctccatctgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 9016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 222 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 148934 - 148859
Alignment:
Q  222 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 299  Q
    |||||||||||||||| || ||| | |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  148934 tgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaa 148859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 178 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 19463 - 19344
Alignment:
Q  178 aattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtat 277  Q
    ||||||||||||||||||||||    ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||| | |||| |||||||||||||| |||||| |||    
T  19463 aattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tat 19366  T
Q  278 gtataaatgttaagttatgaaa 299  Q
    ||| ||||| |||||| |||||    
T  19365 gtaaaaatgataagttgtgaaa 19344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 178 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 21547 - 21428
Alignment:
Q  178 aattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtat 277  Q
    ||||||||||||||||||||||    ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||| | |||| |||||||||||||| |||||| |||    
T  21547 aattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tat 21450  T
Q  278 gtataaatgttaagttatgaaa 299  Q
    ||| ||||| |||||| |||||    
T  21449 gtaaaaatgataagttgtgaaa 21428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 178 - 264
Target Start/End: Original strand, 8186 - 8272
Alignment:
Q  178 aattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattaca 264  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||||||| ||| ||  | ||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||||||    
T  8186 aattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattggtgataattgtatgattgttggtgaaattaca 8272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 178 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 48444 - 48354
Alignment:
Q  178 aattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 268  Q
    ||||||||||||||||||||||    ||| ||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  48444 aattgttgctaaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 48354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 178 - 268
Target Start/End: Original strand, 51188 - 51278
Alignment:
Q  178 aattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 268  Q
    ||||||||||||||||||||||    ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||| | |||| ||||||||||||||||    
T  51188 aattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgtt 51278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 178 - 299
Target Start/End: Original strand, 36919 - 37038
Alignment:
Q  178 aattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtat 277  Q
    |||||||| |||||||||||||    ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||| | |||| |||||||||||||| |||||| |||    
T  36919 aattgttgttaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagcttgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tat 37016  T
Q  278 gtataaatgttaagttatgaaa 299  Q
    ||| ||||| |||||| |||||    
T  37017 gtaaaaatgataagttgtgaaa 37038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 92 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 22894 - 22706
Alignment:
Q  92 tcatctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatg--ttgtatgaaaatgggttg----------atgaacaa 179  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| || | |||||| ||| |||||  ||| ||| ||||||||||          ||||| ||    
T  22894 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatgttcattctttgcaatttttcatgatttggatg-aaatgggttgaaatgaatgaatgaataa 22796  T
Q  180 ttgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgttt 269  Q
    ||||||||||||||||||||    | ||||| ||| ||  | ||||||||||||| || || ||||| |||| ||| |||||||||||||    
T  22795 ttgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgttt 22706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 92 - 153
Target Start/End: Original strand, 1491 - 1552
Alignment:
Q  92 tcatctaaggtaagggggttagtgattagcataatcatgtacaatttttgcattttctcatg 153  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| || | |||||| ||| |||||    
T  1491 tcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatgttcattctttgcaatttttcatg 1552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 1046 times since January 2019
Visitors: 4362