View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0714_low_4 (Length: 518)

Name: NF0714_low_4
Description: NF0714
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0714_low_4
NF0714_low_4
[»] chr3 (74 HSPs)
chr3 (11-395)||(16743998-16744382)
chr3 (128-391)||(17912483-17912745)
chr3 (54-379)||(13838905-13839232)
chr3 (54-391)||(14842487-14842825)
chr3 (54-391)||(2049809-2050147)
chr3 (54-395)||(12030073-12030415)
chr3 (91-395)||(15858986-15859292)
chr3 (128-294)||(2449238-2449404)
chr3 (118-390)||(51158008-51158281)
chr3 (11-190)||(19231982-19232164)
chr3 (135-395)||(15936634-15936895)
chr3 (135-387)||(15938476-15938729)
chr3 (54-174)||(19260749-19260869)
chr3 (128-260)||(13975722-13975853)
chr3 (128-260)||(45860937-45861068)
chr3 (128-275)||(13954890-13955036)
chr3 (53-395)||(15614829-15615170)
chr3 (162-391)||(16821138-16821369)
chr3 (11-89)||(15857120-15857198)
chr3 (140-260)||(55316351-55316471)
chr3 (11-86)||(3992873-3992948)
chr3 (11-86)||(55513193-55513268)
chr3 (140-260)||(41270207-41270327)
chr3 (11-86)||(2844514-2844589)
chr3 (11-86)||(54037981-54038056)
chr3 (11-86)||(17955837-17955916)
chr3 (11-86)||(7854305-7854380)
chr3 (25-86)||(45581954-45582016)
chr3 (281-395)||(47984645-47984759)
chr3 (281-395)||(48003219-48003333)
chr3 (460-511)||(2449402-2449453)
chr3 (460-511)||(16744447-16744498)
chr3 (55-394)||(12264710-12265053)
chr3 (281-395)||(47993932-47994046)
chr3 (281-395)||(48012505-48012619)
chr3 (144-198)||(14080701-14080756)
chr3 (54-224)||(54651625-54651796)
chr3 (135-225)||(11986173-11986263)
chr3 (13-70)||(17205019-17205076)
chr3 (13-86)||(38810868-38810941)
chr3 (135-395)||(15468339-15468601)
chr3 (13-68)||(12031849-12031904)
chr3 (54-253)||(12902007-12902209)
chr3 (55-253)||(25058876-25059077)
chr3 (13-86)||(13301323-13301396)
chr3 (13-86)||(13311979-13312052)
chr3 (13-70)||(17191879-17191936)
chr3 (135-253)||(49232573-49232693)
chr3 (54-86)||(2449152-2449184)
chr3 (279-394)||(11329098-11329214)
chr3 (54-86)||(16261777-16261809)
chr3 (54-86)||(16933869-16933901)
chr3 (54-86)||(17912398-17912430)
chr3 (54-86)||(23492696-23492728)
chr3 (54-86)||(38168237-38168269)
chr3 (54-86)||(53771365-53771397)
chr3 (135-251)||(5228452-5228570)
chr3 (279-373)||(17139524-17139618)
chr3 (349-395)||(22275204-22275250)
chr3 (349-395)||(41270070-41270116)
chr3 (349-395)||(55316214-55316260)
chr3 (13-70)||(3576290-3576347)
chr3 (20-85)||(15550922-15550987)
chr3 (144-224)||(4145814-4145894)
chr3 (54-86)||(11986080-11986112)
chr3 (54-86)||(13954804-13954836)
chr3 (54-86)||(14285289-14285321)
chr3 (54-86)||(19947026-19947058)
chr3 (54-86)||(30153265-30153297)
chr3 (54-86)||(33342204-33342236)
chr3 (302-366)||(38811168-38811232)
chr3 (54-86)||(45861122-45861154)
chr3 (145-224)||(47784767-47784847)
chr3 (54-86)||(51961031-51961063)
[»] chr8 (46 HSPs)
chr8 (128-395)||(22907214-22907481)
chr8 (54-390)||(16193643-16193979)
chr8 (11-391)||(16404857-16405236)
chr8 (54-395)||(43373392-43373736)
chr8 (54-379)||(24928716-24929043)
chr8 (128-294)||(5238184-5238350)
chr8 (128-294)||(24661248-24661414)
chr8 (128-294)||(43685643-43685809)
chr8 (140-395)||(6774258-6774514)
chr8 (140-395)||(24548977-24549233)
chr8 (128-379)||(17345581-17345832)
chr8 (144-260)||(21844576-21844692)
chr8 (144-395)||(21851969-21852222)
chr8 (11-86)||(274766-274841)
chr8 (11-86)||(641008-641083)
chr8 (11-86)||(826814-826889)
chr8 (11-86)||(24716719-24716794)
chr8 (140-391)||(30120721-30120974)
chr8 (140-260)||(16674392-16674512)
chr8 (203-395)||(222754-222948)
chr8 (203-395)||(736377-736571)
chr8 (203-395)||(860272-860466)
chr8 (460-511)||(5238135-5238186)
chr8 (460-511)||(24661412-24661463)
chr8 (460-511)||(22907546-22907597)
chr8 (460-511)||(43685594-43685645)
chr8 (11-86)||(39115598-39115673)
chr8 (55-253)||(22006176-22006377)
chr8 (203-260)||(691909-691966)
chr8 (13-70)||(17285543-17285600)
chr8 (13-70)||(21198005-21198062)
chr8 (279-368)||(23837219-23837308)
chr8 (144-224)||(26011660-26011741)
chr8 (54-86)||(5238404-5238436)
chr8 (54-86)||(22907128-22907160)
chr8 (54-86)||(24385652-24385684)
chr8 (54-86)||(24661162-24661194)
chr8 (54-86)||(43685863-43685895)
chr8 (135-251)||(16195370-16195488)
chr8 (144-198)||(23226076-23226131)
chr8 (464-510)||(22321608-22321654)
chr8 (144-185)||(23149985-23150026)
chr8 (54-86)||(2545265-2545297)
chr8 (54-86)||(3431176-3431208)
chr8 (145-224)||(17285370-17285450)
chr8 (54-86)||(22886654-22886686)
[»] chr4 (41 HSPs)
chr4 (128-395)||(26680196-26680463)
chr4 (11-395)||(54118125-54118512)
chr4 (54-395)||(13246425-13246769)
chr4 (54-391)||(15675009-15675353)
chr4 (54-260)||(122020-122226)
chr4 (128-294)||(10488659-10488825)
chr4 (128-294)||(16327926-16328092)
chr4 (54-326)||(10104170-10104449)
chr4 (155-391)||(31115628-31115865)
chr4 (128-275)||(13048221-13048368)
chr4 (144-395)||(10644214-10644467)
chr4 (54-201)||(33240890-33241043)
chr4 (140-395)||(47357649-47357906)
chr4 (11-86)||(25119064-25119139)
chr4 (144-326)||(40885570-40885753)
chr4 (54-160)||(31132545-31132657)
chr4 (292-391)||(111394-111493)
chr4 (11-86)||(5682385-5682460)
chr4 (460-511)||(26680080-26680131)
chr4 (460-511)||(10488610-10488661)
chr4 (460-505)||(16328090-16328135)
chr4 (13-86)||(41165808-41165881)
chr4 (347-391)||(10104451-10104495)
chr4 (279-366)||(15044851-15044938)
chr4 (55-253)||(18169107-18169308)
chr4 (279-368)||(41166083-41166172)
chr4 (13-70)||(47534933-47534990)
chr4 (54-86)||(14952085-14952117)
chr4 (54-86)||(15135907-15135939)
chr4 (54-86)||(15272211-15272243)
chr4 (54-86)||(16327840-16327872)
chr4 (54-86)||(16609013-16609045)
chr4 (54-86)||(26680517-26680549)
chr4 (279-366)||(15109486-15109573)
chr4 (279-373)||(13809647-13809741)
chr4 (143-260)||(7850131-7850248)
chr4 (139-253)||(19020623-19020739)
chr4 (54-86)||(8045272-8045304)
chr4 (145-185)||(13809511-13809551)
chr4 (145-228)||(15044990-15045074)
chr4 (54-86)||(16523146-16523178)
[»] scaffold0078 (4 HSPs)
scaffold0078 (128-395)||(37066-37333)
scaffold0078 (11-86)||(41632-41707)
scaffold0078 (460-504)||(37398-37442)
scaffold0078 (54-86)||(36980-37012)
[»] chr7 (58 HSPs)
chr7 (128-395)||(7293012-7293279)
chr7 (13-391)||(3059965-3060344)
chr7 (54-395)||(16211761-16212103)
chr7 (54-395)||(11580661-11581007)
chr7 (54-395)||(13036938-13037282)
chr7 (54-395)||(36052662-36053003)
chr7 (128-294)||(11516324-11516490)
chr7 (128-294)||(15441564-15441730)
chr7 (128-294)||(30262129-30262295)
chr7 (128-391)||(47481031-47481295)
chr7 (135-395)||(18253842-18254103)
chr7 (129-395)||(13321009-13321278)
chr7 (146-391)||(16478968-16479214)
chr7 (128-260)||(25292338-25292470)
chr7 (144-260)||(13572808-13572924)
chr7 (140-395)||(13911024-13911282)
chr7 (140-395)||(10989405-10989661)
chr7 (11-86)||(32493903-32493978)
chr7 (139-259)||(2437590-2437710)
chr7 (56-256)||(295893-296094)
chr7 (11-86)||(126738-126813)
chr7 (11-86)||(1936874-1936949)
chr7 (460-511)||(15441728-15441779)
chr7 (460-511)||(30262293-30262344)
chr7 (11-86)||(111126-111201)
chr7 (13-120)||(13377819-13377924)
chr7 (460-511)||(7292896-7292947)
chr7 (460-511)||(11516275-11516326)
chr7 (11-85)||(7283913-7283987)
chr7 (128-170)||(14113989-14114031)
chr7 (128-170)||(14423639-14423681)
chr7 (13-70)||(13389693-13389750)
chr7 (54-160)||(36024372-36024485)
chr7 (54-253)||(18979938-18980140)
chr7 (55-253)||(15950709-15950910)
chr7 (279-373)||(49047811-49047905)
chr7 (144-224)||(16914928-16915009)
chr7 (135-224)||(48622665-48622754)
chr7 (54-86)||(2029244-2029276)
chr7 (54-86)||(7293333-7293365)
chr7 (54-86)||(11516544-11516576)
chr7 (54-86)||(14113903-14113935)
chr7 (54-86)||(15441478-15441510)
chr7 (54-123)||(15709428-15709501)
chr7 (13-69)||(16919870-16919926)
chr7 (54-86)||(30262043-30262075)
chr7 (54-86)||(42056188-42056220)
chr7 (279-366)||(13377552-13377639)
chr7 (279-373)||(13274803-13274897)
chr7 (144-224)||(9611474-9611555)
chr7 (144-224)||(9839045-9839126)
chr7 (54-86)||(371417-371449)
chr7 (54-86)||(3049905-3049937)
chr7 (54-86)||(13321334-13321366)
chr7 (145-224)||(13377695-13377775)
chr7 (58-86)||(15516765-15516793)
chr7 (54-86)||(25124450-25124482)
chr7 (54-86)||(47480944-47480976)
[»] chr1 (27 HSPs)
chr1 (11-391)||(41394221-41394602)
chr1 (54-395)||(20931340-20931682)
chr1 (54-395)||(20445674-20446019)
chr1 (54-395)||(20913032-20913367)
chr1 (54-395)||(37844374-37844719)
chr1 (54-395)||(20531439-20531783)
chr1 (54-395)||(20893551-20893894)
chr1 (128-294)||(51452589-51452755)
chr1 (140-395)||(2116249-2116506)
chr1 (55-391)||(22227808-22228146)
chr1 (55-391)||(22232505-22232843)
chr1 (53-260)||(45051554-45051759)
chr1 (11-86)||(21860334-21860409)
chr1 (12-86)||(44034829-44034903)
chr1 (140-260)||(5072388-5072508)
chr1 (140-260)||(18601118-18601238)
chr1 (13-120)||(27675086-27675191)
chr1 (11-86)||(41218728-41218803)
chr1 (460-511)||(51452540-51452591)
chr1 (13-70)||(13376711-13376768)
chr1 (13-70)||(20177513-20177570)
chr1 (55-86)||(15861327-15861358)
chr1 (349-395)||(5072599-5072645)
chr1 (349-395)||(18601329-18601375)
chr1 (144-185)||(22143361-22143402)
chr1 (347-395)||(45051437-45051485)
chr1 (54-86)||(51452809-51452841)
[»] chr2 (44 HSPs)
chr2 (11-395)||(19794586-19794972)
chr2 (11-391)||(20627195-20627577)
chr2 (54-395)||(36982364-36982709)
chr2 (11-391)||(43642838-43643221)
chr2 (54-395)||(462733-463075)
chr2 (54-395)||(8891237-8891581)
chr2 (128-294)||(19689401-19689567)
chr2 (128-294)||(23820168-23820334)
chr2 (128-294)||(14906440-14906606)
chr2 (54-391)||(24341309-24341653)
chr2 (128-294)||(20015108-20015274)
chr2 (128-395)||(25265390-25265658)
chr2 (128-260)||(17396653-17396784)
chr2 (178-391)||(7507894-7508108)
chr2 (54-150)||(22863169-22863267)
chr2 (140-395)||(19886661-19886918)
chr2 (11-86)||(22275045-22275120)
chr2 (11-86)||(22284278-22284353)
chr2 (11-85)||(15633538-15633612)
chr2 (460-511)||(14906604-14906655)
chr2 (460-511)||(20015059-20015110)
chr2 (460-511)||(23820119-23820170)
chr2 (13-70)||(43646232-43646289)
chr2 (54-253)||(12728529-12728731)
chr2 (460-495)||(19689565-19689600)
chr2 (54-253)||(34824612-34824814)
chr2 (53-86)||(19689314-19689347)
chr2 (54-86)||(9652796-9652828)
chr2 (54-86)||(14906354-14906386)
chr2 (13-65)||(19660221-19660273)
chr2 (54-86)||(23820388-23820420)
chr2 (55-86)||(25213372-25213403)
chr2 (13-86)||(19666848-19666921)
chr2 (139-253)||(23778048-23778164)
chr2 (144-224)||(24884852-24884933)
chr2 (13-70)||(25305769-25305826)
chr2 (13-120)||(31146032-31146138)
chr2 (145-224)||(68158-68238)
chr2 (54-86)||(7507757-7507789)
chr2 (54-86)||(17396567-17396599)
chr2 (54-86)||(20015328-20015360)
chr2 (54-86)||(28031134-28031166)
chr2 (54-86)||(33128372-33128404)
chr2 (145-228)||(43646055-43646139)
[»] scaffold0023 (4 HSPs)
scaffold0023 (54-395)||(48593-48935)
scaffold0023 (162-395)||(36088-36323)
scaffold0023 (54-253)||(153924-154126)
scaffold0023 (54-86)||(61122-61154)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (54-395)||(1119-1462)
scaffold0266 (54-393)||(3508-3848)
[»] scaffold0195 (2 HSPs)
scaffold0195 (57-395)||(19201-19543)
scaffold0195 (128-395)||(21285-21553)
[»] scaffold0077 (2 HSPs)
scaffold0077 (53-395)||(36836-37181)
scaffold0077 (11-85)||(15324-15398)
[»] chr5 (49 HSPs)
chr5 (54-395)||(23506960-23507302)
chr5 (54-395)||(27182471-27182815)
chr5 (54-391)||(18530988-18531331)
chr5 (54-391)||(22053753-22054097)
chr5 (128-294)||(20623066-20623232)
chr5 (128-294)||(21233528-21233694)
chr5 (128-294)||(16536294-16536460)
chr5 (128-291)||(37052844-37053007)
chr5 (130-294)||(25900408-25900571)
chr5 (128-379)||(34939289-34939540)
chr5 (140-260)||(29188284-29188404)
chr5 (140-395)||(4199985-4200242)
chr5 (140-395)||(22366481-22366738)
chr5 (140-395)||(25426623-25426880)
chr5 (143-395)||(18777995-18778249)
chr5 (140-395)||(12369-12626)
chr5 (144-258)||(27009975-27010089)
chr5 (140-395)||(19499894-19500151)
chr5 (140-395)||(21073595-21073852)
chr5 (143-392)||(43443398-43443649)
chr5 (460-511)||(20623017-20623068)
chr5 (460-511)||(21233692-21233743)
chr5 (461-511)||(37052792-37052842)
chr5 (460-511)||(25900569-25900620)
chr5 (11-85)||(11584374-11584448)
chr5 (135-394)||(32950689-32950951)
chr5 (460-511)||(16536245-16536296)
chr5 (54-394)||(35791015-35791359)
chr5 (279-394)||(23493913-23494029)
chr5 (54-253)||(23514698-23514900)
chr5 (13-86)||(5450695-5450768)
chr5 (135-253)||(10777969-10778089)
chr5 (13-70)||(21222462-21222519)
chr5 (144-224)||(21310709-21310790)
chr5 (144-224)||(29918131-29918212)
chr5 (54-86)||(16105967-16105999)
chr5 (54-86)||(20623286-20623318)
chr5 (54-86)||(21233442-21233474)
chr5 (54-86)||(25900320-25900352)
chr5 (347-395)||(29190483-29190531)
chr5 (54-86)||(37053061-37053093)
chr5 (54-253)||(1219437-1219639)
chr5 (144-366)||(23981516-23981740)
chr5 (349-395)||(17471803-17471849)
chr5 (144-224)||(19862375-19862456)
chr5 (54-86)||(108728-108760)
chr5 (279-343)||(7728466-7728530)
chr5 (54-86)||(9730278-9730310)
chr5 (54-86)||(16536514-16536546)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (54-379)||(171916-172242)
scaffold0001 (54-379)||(177619-177945)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (54-395)||(41724-42066)
[»] scaffold0175 (1 HSPs)
scaffold0175 (54-391)||(882-1219)
[»] chr6 (42 HSPs)
chr6 (54-395)||(23153442-23153786)
chr6 (55-395)||(14626045-14626386)
chr6 (128-395)||(35009439-35009707)
chr6 (128-379)||(1657748-1657999)
chr6 (53-395)||(1650020-1650361)
chr6 (128-379)||(15862484-15862734)
chr6 (140-395)||(25175558-25175815)
chr6 (140-395)||(27653983-27654240)
chr6 (54-123)||(23148266-23148335)
chr6 (11-86)||(19983149-19983224)
chr6 (11-86)||(35015014-35015089)
chr6 (140-265)||(16825752-16825879)
chr6 (128-326)||(29665937-29666137)
chr6 (11-86)||(18583640-18583715)
chr6 (128-211)||(27751605-27751688)
chr6 (13-70)||(21623506-21623563)
chr6 (54-253)||(1556142-1556344)
chr6 (54-253)||(16232029-16232231)
chr6 (144-224)||(18629608-18629689)
chr6 (13-70)||(22361619-22361676)
chr6 (13-85)||(14152632-14152704)
chr6 (54-86)||(18002395-18002427)
chr6 (280-368)||(18381821-18381909)
chr6 (54-86)||(23995247-23995279)
chr6 (54-86)||(26090059-26090091)
chr6 (287-391)||(27740837-27740941)
chr6 (144-224)||(29605616-29605696)
chr6 (55-86)||(4991396-4991427)
chr6 (144-198)||(16887792-16887847)
chr6 (146-217)||(17083200-17083271)
chr6 (144-198)||(35136013-35136068)
chr6 (54-84)||(15742120-15742150)
chr6 (303-395)||(22361926-22362019)
chr6 (144-185)||(33324898-33324939)
chr6 (54-86)||(1657661-1657693)
chr6 (54-86)||(15862789-15862821)
chr6 (347-395)||(16825963-16826011)
chr6 (54-86)||(18823283-18823315)
chr6 (54-86)||(18839138-18839170)
chr6 (279-343)||(25367374-25367438)
chr6 (54-86)||(27751742-27751774)
chr6 (54-86)||(32276659-32276691)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (54-395)||(12110-12450)
[»] scaffold0162 (3 HSPs)
scaffold0162 (54-395)||(26340-26683)
scaffold0162 (128-395)||(8180-8445)
scaffold0162 (13-70)||(6877-6934)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (54-391)||(5990-6327)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (54-395)||(128095-128436)
scaffold0008 (162-395)||(31697-31933)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (54-384)||(272031-272362)
[»] scaffold0498 (1 HSPs)
scaffold0498 (54-395)||(8873-9215)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (64-395)||(4996-5329)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (54-395)||(247366-247710)
scaffold0012 (54-326)||(34075-34350)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (56-260)||(51110-51314)
[»] scaffold0141 (6 HSPs)
scaffold0141 (128-294)||(26892-27058)
scaffold0141 (135-294)||(22637-22796)
scaffold0141 (460-511)||(22588-22639)
scaffold0141 (460-511)||(26843-26894)
scaffold0141 (54-86)||(22857-22889)
scaffold0141 (54-86)||(27112-27144)
[»] scaffold0124 (3 HSPs)
scaffold0124 (128-294)||(1582-1748)
scaffold0124 (460-511)||(1746-1797)
scaffold0124 (54-86)||(1496-1528)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (54-395)||(123087-123432)
[»] scaffold0025 (3 HSPs)
scaffold0025 (54-391)||(8848-9192)
scaffold0025 (102-395)||(148716-149012)
scaffold0025 (54-154)||(146838-146938)
[»] scaffold0028 (4 HSPs)
scaffold0028 (54-260)||(89378-89586)
scaffold0028 (54-179)||(107708-107835)
scaffold0028 (144-198)||(79731-79786)
scaffold0028 (55-86)||(130880-130911)
[»] scaffold0049 (2 HSPs)
scaffold0049 (135-395)||(48182-48443)
scaffold0049 (11-85)||(20493-20567)
[»] scaffold0132 (3 HSPs)
scaffold0132 (128-395)||(13501-13769)
scaffold0132 (11-86)||(42677-42749)
scaffold0132 (54-86)||(13824-13856)
[»] scaffold0026 (3 HSPs)
scaffold0026 (135-391)||(107746-108003)
scaffold0026 (144-260)||(64527-64648)
scaffold0026 (143-185)||(89863-89905)
[»] scaffold0125 (2 HSPs)
scaffold0125 (128-395)||(41643-41911)
scaffold0125 (54-94)||(41957-41997)
[»] scaffold1542 (1 HSPs)
scaffold1542 (128-395)||(534-802)
[»] scaffold0772 (2 HSPs)
scaffold0772 (135-260)||(5660-5785)
scaffold0772 (54-86)||(5846-5878)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (128-391)||(34460-34725)
[»] scaffold0215 (2 HSPs)
scaffold0215 (162-395)||(9371-9605)
scaffold0215 (162-395)||(16269-16503)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (139-395)||(2957-3215)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (163-395)||(42992-43226)
[»] scaffold0022 (2 HSPs)
scaffold0022 (178-391)||(5254-5467)
scaffold0022 (145-185)||(102923-102963)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (140-260)||(13325-13445)
[»] scaffold0116 (2 HSPs)
scaffold0116 (144-260)||(167-283)
scaffold0116 (11-86)||(30417-30492)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (178-391)||(3721-3936)
[»] scaffold1711 (1 HSPs)
scaffold1711 (140-260)||(1304-1424)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (11-86)||(80187-80262)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (162-260)||(14083-14181)
scaffold0139 (139-391)||(21115-21368)
[»] scaffold0016 (3 HSPs)
scaffold0016 (11-87)||(166121-166197)
scaffold0016 (12-87)||(162036-162111)
scaffold0016 (13-86)||(116410-116483)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (11-86)||(31137-31212)
[»] scaffold0686 (2 HSPs)
scaffold0686 (12-86)||(5735-5809)
scaffold0686 (12-86)||(5941-6015)
[»] scaffold0622 (1 HSPs)
scaffold0622 (292-395)||(9377-9480)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (11-87)||(309-385)
[»] scaffold0066 (4 HSPs)
scaffold0066 (178-394)||(54412-54630)
scaffold0066 (178-326)||(45094-45244)
scaffold0066 (350-394)||(45007-45051)
scaffold0066 (54-86)||(45338-45370)
[»] scaffold0361 (1 HSPs)
scaffold0361 (128-221)||(3360-3453)
[»] scaffold1164 (1 HSPs)
scaffold1164 (11-85)||(1701-1775)
[»] scaffold0122 (2 HSPs)
scaffold0122 (11-85)||(19807-19881)
scaffold0122 (11-85)||(24111-24185)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (135-253)||(56106-56226)
[»] scaffold0467 (1 HSPs)
scaffold0467 (54-253)||(10256-10458)
[»] scaffold0876 (1 HSPs)
scaffold0876 (15-85)||(94-164)
[»] scaffold0310 (2 HSPs)
scaffold0310 (11-85)||(6261-6335)
scaffold0310 (48-85)||(4-41)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (13-86)||(1363-1436)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (144-224)||(8176-8257)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (13-70)||(35816-35873)
[»] scaffold0104 (1 HSPs)
scaffold0104 (301-391)||(48513-48603)
[»] scaffold0058 (2 HSPs)
scaffold0058 (144-197)||(70307-70361)
scaffold0058 (54-86)||(57392-57424)
[»] scaffold1295 (1 HSPs)
scaffold1295 (13-70)||(442-499)
[»] scaffold0456 (2 HSPs)
scaffold0456 (144-185)||(1546-1587)
scaffold0456 (144-185)||(8691-8732)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (13-70)||(76699-76756)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (53-86)||(193396-193429)
[»] scaffold0706 (1 HSPs)
scaffold0706 (54-86)||(6443-6475)
[»] scaffold0597 (1 HSPs)
scaffold0597 (54-86)||(878-910)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (54-86)||(9882-9914)
[»] scaffold0251 (1 HSPs)
scaffold0251 (54-86)||(13285-13317)
[»] scaffold0032 (4 HSPs)
scaffold0032 (54-86)||(55904-55936)
scaffold0032 (54-86)||(108075-108107)
scaffold0032 (144-185)||(93773-93814)
scaffold0032 (144-211)||(104623-104691)
[»] scaffold0409 (2 HSPs)
scaffold0409 (144-222)||(1348-1427)
scaffold0409 (144-222)||(9603-9682)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (54-97)||(18015-18058)
[»] scaffold0389 (1 HSPs)
scaffold0389 (145-198)||(10854-10908)
[»] scaffold0151 (1 HSPs)
scaffold0151 (144-197)||(22422-22476)
[»] scaffold1272 (1 HSPs)
scaffold1272 (13-70)||(632-689)
[»] scaffold0700 (1 HSPs)
scaffold0700 (144-224)||(2691-2772)
[»] scaffold0483 (1 HSPs)
scaffold0483 (13-70)||(6999-7056)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (144-224)||(22429-22510)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (13-70)||(43651-43708)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (13-70)||(31357-31414)
[»] scaffold1560 (1 HSPs)
scaffold1560 (347-391)||(72-116)
[»] scaffold0970 (1 HSPs)
scaffold0970 (312-368)||(2476-2532)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (54-86)||(17209-17241)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (54-86)||(5476-5508)
[»] scaffold0303 (1 HSPs)
scaffold0303 (54-86)||(4346-4378)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (145-224)||(2317-2397)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (54-86)||(17304-17336)
[»] scaffold0173 (1 HSPs)
scaffold0173 (54-86)||(5549-5581)
[»] scaffold0118 (1 HSPs)
scaffold0118 (54-86)||(34308-34340)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (54-86)||(12418-12450)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 341; Significance: 0; HSPs: 74)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 395
Target Start/End: Original strand, 16743998 - 16744382
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatg 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16743998 cataggagctaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaacgaggttagtctttaccataatcatcatcattttgtaaattttcaaatg 16744097  T
Q  111 ttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttgg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16744098 ttgtatgaattttgattatggatgattgttgttaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatccatgaattgataataagtgtatgattgttgg 16744197  T
Q  211 ttaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgt 310  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16744198 ttaaattacatttttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttatagttgaattgagctatgattcttgt 16744297  T
Q  311 gcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagctgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaat 395  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16744298 gcaattgatgttgttgatgctaataaatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaat 16744382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 128 - 391
Target Start/End: Original strand, 17912483 - 17912745
Alignment:
Q  128 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 227  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17912483 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactt-gatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaa 17912581  T
Q  228 atatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttga 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||| |||     
T  17912582 atatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaattgatgaatttgatatgttgtagttgaattgagctatgattcatgttcaatcgatgttattgt 17912681  T
Q  328 tgctaatagatgttgtagctgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatga 391  Q
    || |||| |||||||| | |||||||||| ||||||||||| ||| |||||| |||||||||||    
T  17912682 tgttaattgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatga 17912745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 54 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 13839232 - 13838905
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgt-aaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtg 152  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  13839232 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcattttgtgaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatgaataattgttgctaaattcgtg 13839133  T
Q  153 ctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaa 252  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| | | |||||| ||||| ||||    
T  13839132 ctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgatggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaa 13839033  T
Q  253 aattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagctgatg 351  Q
    ||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| |||| |||||| |||||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||||| | |||||    
T  13839032 aattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatg 13838933  T
Q  352 aatcattgcttgggtatacatgttcatg 379  Q
    |||||||| |||||||| ||| ||||||    
T  13838932 aatcattgtttgggtatgcatattcatg 13838905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 54 - 391
Target Start/End: Original strand, 14842487 - 14842825
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14842487 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcttcactttgcaaattctcaaatgttgtatgaattgtgattatggataattgttgctaaattcgtgc 14842586  T
Q  154 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaa 253  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||    
T  14842587 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgaagataattgtatgattgttggtgaaattgcatgttcaaatgtgtaaaaatgataagttatgaaa 14842686  T
Q  254 attgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagctgatga 352  Q
    |||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | |||| |||| |||||| |   ||||||    
T  14842687 attgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaattgatgttatgattgatga 14842786  T
Q  353 atcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatga 391  Q
    || |||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||    
T  14842787 ataattgattgggtttgcatattcatggattgatgatga 14842825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 54 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 2050147 - 2049809
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  2050147 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatcaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgc 2050048  T
Q  154 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaa 253  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| || || |||||    
T  2050047 tccaactgtgacgatatgtttgtatgcctgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaacatgataacttgtgaaa 2049948  T
Q  254 attgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagctgatga 352  Q
    |||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||| | ||||| | ||||| |||| ||||||||| | | | || |||| |||||||| | ||||||    
T  2049947 attgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgatttttgttcaattgatgctatggttgttaattgatgttgtggttgatga 2049848  T
Q  353 atcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatga 391  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||    
T  2049847 atcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatga 2049809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 54 - 395
Target Start/End: Original strand, 12030073 - 12030415
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 153  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  12030073 taaggtaagggggttaatcattatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgacttttgcttatggataattgttgctaaattcgtgc 12030172  T
Q  154 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaa 253  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| |||||    
T  12030173 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaagtgataagttgtgaaa 12030272  T
Q  254 attgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagctgatga 352  Q
     ||||||  ||| | |||| ||||  | ||| | ||| | ||||  | |||||||||| ||||||||| | | | || |||| |||||| | | ||||||    
T  12030273 gttgtgctcaattggtgaattttgctaagttattgttaatttgatatttgattcttgttcaattgatgctatggttgttaattgatgttatggttgatga 12030372  T
Q  353 atcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaat 395  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||    
T  12030373 atcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatgagaat 12030415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 91 - 395
Target Start/End: Original strand, 15858986 - 15859292
Alignment:
Q  91 attttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattg 188  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15858986 attttgtaaattt-caattgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattg 15859084  T
Q  189 ataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtag 287  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| |    
T  15859085 atgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttg 15859184  T
Q  288 ttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagctgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatg 387  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||    
T  15859185 ttgaattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatg 15859284  T
Q  388 atgagaat 395  Q
    ||||||||    
T  15859285 atgagaat 15859292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 128 - 294
Target Start/End: Original strand, 2449238 - 2449404
Alignment:
Q  128 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 227  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  2449238 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 2449337  T
Q  228 atatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 294  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2449338 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 2449404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 118 - 390
Target Start/End: Original strand, 51158008 - 51158281
Alignment:
Q  118 aattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaatt 217  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  51158008 aattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatt 51158107  T
Q  218 acatgtttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaatt 316  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| |||  |||||| |||||||||||| |||||    
T  51158108 acatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaatt 51158207  T
Q  317 gatgttgttgatgctaatagatgttgtagctgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatg 390  Q
    |||||| | | || |||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||    
T  51158208 gatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 51158281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 11 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 19232164 - 19231982
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgt-aaattttcaaat 109  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19232164 cataggagcaaaagtgaagttagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcttaatcatcatcattttgtgaaattttcaaat 19232065  T
Q  110 gttgtatgaatttt--gattatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgat 190  Q
    ||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  19232064 gttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttatattcatgaattgat 19231982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 135 - 395
Target Start/End: Original strand, 15936634 - 15936895
Alignment:
Q  135 attgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgta 234  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||    
T  15936634 attgttactaaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgta 15936733  T
Q  235 aaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaa 333  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||| | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | |||| |||    
T  15936734 aaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgataagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaa 15936833  T
Q  334 tagatgttgtagctgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaat 395  Q
    | ||||||||   |||||||| ||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  15936834 ttgatgttgtgattgatgaataattgcctgagtatgcatattcatggattgatgatgagaat 15936895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 135 - 387
Target Start/End: Original strand, 15938476 - 15938729
Alignment:
Q  135 attgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgta 234  Q
    |||||| |||||| |||||||||||| | ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||    
T  15938476 attgttactaaatacgtgctccaactgtaatgatatgtttgtaatcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgta 15938575  T
Q  235 aaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaa 333  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||| | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | |||| |||    
T  15938576 aaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgataagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaa 15938675  T
Q  334 tagatgttgtagctgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatg 387  Q
    | ||||||||   |||||||| ||||| || |||| ||| ||||||||||||||    
T  15938676 ttgatgttgtgattgatgaataattgcctgagtatgcatattcatggattgatg 15938729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 54 - 174
Target Start/End: Original strand, 19260749 - 19260869
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||    
T  19260749 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaagttttcaaatgttgtatgaattttttttatggataattgttgctaaattcgtgc 19260848  T
Q  154 tccaactttgatgatatgttt 174  Q
    || || | |||||||||||||    
T  19260849 tctaattatgatgatatgttt 19260869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 128 - 260
Target Start/End: Original strand, 13975722 - 13975853
Alignment:
Q  128 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 227  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | || |||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  13975722 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtt-gtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtggaattacatgtttaa 13975820  T
Q  228 atatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 260  Q
    ||| |||||||||| |||||||||| |||||||    
T  13975821 ataagtaaaaatgataagttatgaatattgtgc 13975853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 128 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 45861068 - 45860937
Alignment:
Q  128 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 227  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | || |||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  45861068 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtt-gtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtggaattacatgtttaa 45860970  T
Q  228 atatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 260  Q
    ||| |||||||||| |||||||||| |||||||    
T  45860969 ataagtaaaaatgataagttatgaatattgtgc 45860937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 128 - 275
Target Start/End: Original strand, 13954890 - 13955036
Alignment:
Q  128 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 227  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | || |||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  13954890 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtt-gtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtggaattacatgtttaa 13954988  T
Q  228 atatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 275  Q
    ||| ||||||||||  ||||||||| |||||||  ||| |||||||||    
T  13954989 ataagtaaaaatgatcagttatgaatattgtgctcaattgatgaattt 13955036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 53 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 15615170 - 15614829
Alignment:
Q  53 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatt-atggatgattgttgctaaattcgt 151  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| |  |||||  ||||||||||||  | | || ||| |  |||  ||||| ||| ||    
T  15615170 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatg-taattttgca--ttttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagatttgt 15615074  T
Q  152 gctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgaaaagttatga 251  Q
    ||||  ||| || || ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||    
T  15615073 gctcttactgtggtgttatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaggattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtga 15614974  T
Q  252 aaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagctgat 350  Q
    | || ||||  ||| | |||| ||||  | ||| | ||| | ||| | | |||||||||  ||||||||||| | | || |||| |||||||||| ||||    
T  15614973 atatggtgctcaattggtgaattttgctaagttattgttaatttgggatttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgat 15614874  T
Q  351 gaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaat 395  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||| |||||| ||||||||    
T  15614873 gaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgattatgagaat 15614829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 162 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 16821369 - 16821138
Alignment:
Q  162 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgca 261  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||  |||||||     
T  16821369 tgatgttatgtttgtatgcataaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagctatgagtattgtgct 16821270  T
Q  262 aaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagctgatgaatcattg 359  Q
    |||| | |||||||  |  | ||||| ||||| ||||| | |||||| ||| ||||||||||| |  ||| || | ||| || |   |||||||| ||||    
T  16821269 aaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattg 16821170  T
Q  360 cttgggtatacatgttcatggattgatgatga 391  Q
    ||||||| | ||| |||||||||| |||||||    
T  16821169 cttgggtttgcatattcatggattaatgatga 16821138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 11 - 89
Target Start/End: Original strand, 15857120 - 15857198
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcat 89  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15857120 cataggagctaaagtgaagctagagctaatacttggagataattaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcat 15857198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 140 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 55316471 - 55316351
Alignment:
Q  140 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtaaaaat 239  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||    
T  55316471 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 55316372  T
Q  240 gaaaagttatgaaaattgtgc 260  Q
    || |||||||||| |||||||    
T  55316371 gataagttatgaatattgtgc 55316351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 3992948 - 3992873
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3992948 cataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 3992873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 55513268 - 55513193
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  55513268 cataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 55513193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 140 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 41270327 - 41270207
Alignment:
Q  140 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtaaaaat 239  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||| ||||||    
T  41270327 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtggaattacatgttcatatatgcaaaaat 41270228  T
Q  240 gaaaagttatgaaaattgtgc 260  Q
    || |||||||||| |||||||    
T  41270227 gataagttatgaatattgtgc 41270207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 2844589 - 2844514
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2844589 cataggagcaaaagtgaagctagagctaatagtttgagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 2844514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 11 - 86
Target Start/End: Original strand, 54037981 - 54038056
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  54037981 cataggagcaaaagtgaagcttgagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 54038056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 86
Target Start/End: Original strand, 17955837 - 17955916
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctag----agctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||| |||||||||||||    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17955837 cataggagcaaaagtgaagctaggtagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 17955916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 11 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 7854380 - 7854305
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  7854380 cataggagcaaaagtgaagcttgagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcat 7854305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 25 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 45582016 - 45581954
Alignment:
Q  25 tgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaag-ggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  45582016 tgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaaggggggttagtttttatcataatcat 45581954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 281 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 47984759 - 47984645
Alignment:
Q  281 gttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagctgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatgg 380  Q
    ||||| |||| |||||| | |||||| ||| ||||||||||| ||| || |||| |||||||| | |||||||||||  ||||||||| ||| ||||||     
T  47984759 gttgttgttggattgagatgtgattcatgttcaattgatgtttttgttgttaattgatgttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatattcatga 47984660  T
Q  381 attgatgatgagaat 395  Q
    |||||||||||||||    
T  47984659 attgatgatgagaat 47984645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 281 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 48003333 - 48003219
Alignment:
Q  281 gttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagctgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatgg 380  Q
    ||||| |||| |||||| | |||||| ||| ||||||||||| ||| || |||| |||||||| | |||||||||||  ||||||||| ||| ||||||     
T  48003333 gttgttgttggattgagatgtgattcatgttcaattgatgtttttgttgttaattgatgttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatattcatga 48003234  T
Q  381 attgatgatgagaat 395  Q
    |||||||||||||||    
T  48003233 attgatgatgagaat 48003219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 460 - 511
Target Start/End: Original strand, 2449402 - 2449453
Alignment:
Q  460 attatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgattgatgatgt 511  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2449402 attatgatggagggtatgattatatgttatgattgtagttgattgatgatgt 2449453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 460 - 511
Target Start/End: Original strand, 16744447 - 16744498
Alignment:
Q  460 attatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgattgatgatgt 511  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  16744447 attatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgatagttgatgt 16744498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 55 - 394
Target Start/End: Original strand, 12264710 - 12265053
Alignment:
Q  55 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatt-atggatgattgttgctaaattcgtgc 153  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||   || ||| |  ||||||  ||||||||||||  | | || ||| |  |||||||||||||||||||    
T  12264710 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 12264809  T
Q  154 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgttt--aaatatgtaaaaatgaaaagttatga 251  Q
    ||   || ||||| ||| ||  | ||||||||||||| || || ||||| |||| ||| |||||||||||||  || |||||| |||||  ||||||||     
T  12264810 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatg- 12264908  T
Q  252 aaattgtgcaaaatggatgaa--tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagctga 349  Q
    | ||| | |  ||| ||||||  ||||| ||||||| |||||| |||| | |||||| ||| | ||||||||||||| |  |||  |||||||| |  |     
T  12264909 agattatacttaattgatgaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccattgatgttgttgctattaactgatgttgttgtggg 12265008  T
Q  350 tgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaa 394  Q
    ||||| ||  |||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  12265009 tgaattatgacttgggtatacataattatggattgatgatgagaa 12265053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 281 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 47994046 - 47993932
Alignment:
Q  281 gttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagctgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatgg 380  Q
    ||||| |||| |||||| | |||||| ||| ||||||||||| ||| || |||| ||| |||| | |||||||||||  ||||||||| ||| ||||||     
T  47994046 gttgttgttggattgagatgtgattcatgttcaattgatgtttttgttgttaattgattttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatattcatga 47993947  T
Q  381 attgatgatgagaat 395  Q
    |||||||||||||||    
T  47993946 attgatgatgagaat 47993932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 281 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 48012619 - 48012505
Alignment:
Q  281 gttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagctgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatgg 380  Q
    ||||| |||| |||||| | |||||| ||| ||||||||||| ||| || |||| ||| |||| | |||||||||||  ||||||||| ||| ||||||     
T  48012619 gttgttgttggattgagatgtgattcatgttcaattgatgtttttgttgttaattgattttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatattcatga 48012520  T
Q  381 attgatgatgagaat 395  Q
    |||||||||||||||    
T  48012519 attgatgatgagaat 48012505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 14080756 - 14080701
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatg-aattgataataattg 198  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  14080756 aaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaaattgatgataattg 14080701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 54651796 - 54651625
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatt-atggatgattgttgctaaattcgtg 152  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||| ||| |  | ||||  ||||||||||||  | | || ||| || ||||||||||||||||||    
T  54651796 taaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtg 54651697  T
Q  153 ctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtt 224  Q
    |||   || ||||| ||| ||  | ||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||| ||||||    
T  54651696 ctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgtgagtgaaattgcatgtt 54651625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 135 - 225
Target Start/End: Original strand, 11986173 - 11986263
Alignment:
Q  135 attgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgttt 225  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||| || || ||||||| || || |||||||||||||||| | | |||||||||||||    
T  11986173 attgttgttaaattcgtgctctaactgtgatgttattttcgtgtgcatgatttaatgataattgtatgattgtggttgaaattacatgttt 11986263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 17205076 - 17205019
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttag 70  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||    
T  17205076 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggggttag 17205019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 86
Target Start/End: Original strand, 38810868 - 38810941
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | |||| ||||| |||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  38810868 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataactaaggtaagggggttagaattcatcataatcat 38810941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 395
Target Start/End: Original strand, 15468339 - 15468601
Alignment:
Q  135 attgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaa--tatg 232  Q
    |||||||||||||||||||||   || ||||| ||| ||  | ||||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||||||||||| ||  ||||    
T  15468339 attgttgctaaattcgtgctcttgctatgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatg 15468438  T
Q  233 taaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgct 331  Q
    || |||||  |||| |||||| || | |  ||| |||||| ||||| ||||| |  ||||| |||| | | |||| | | | ||||||||||||  || |    
T  15468439 tataaatgttaagtcatgaaa-ttatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgttattgtt 15468537  T
Q  332 aatagatgttgtagctgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaat 395  Q
    ||  |||||| | |   |||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||    
T  15468538 aactgatgttattgtgaatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatgagaat 15468601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 13 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 12031904 - 12031849
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggtt 68  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  12031904 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggggtt 12031849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 253
Target Start/End: Original strand, 12902007 - 12902209
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatt-atggatgattgttgctaaattcgtg 152  Q
    ||||||||||||||||||  | |||||||||||  ||| ||| |  ||||||  ||||||||||||  | | || ||| || ||| ||||||||||||||    
T  12902007 taaggtaagggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataatttttgctaaattcgtg 12902106  T
Q  153 ctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgttt--aaatatgtaaaaatgaaaagttatg 250  Q
    |||   || ||||| ||| ||  | ||||||||||||| || || ||||| |||| ||| |||||||||||||  || |||||| |||||  ||||||||    
T  12902107 ctcttgctgtgatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatg 12902206  T
Q  251 aaa 253  Q
    |||    
T  12902207 aaa 12902209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 55 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 25059077 - 25058876
Alignment:
Q  55 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatt-atggatgattgttgctaaattcgtgc 153  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||   || ||| |  ||||||  ||||||||||||  | | || ||| |  |||||||||||||||||||    
T  25059077 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgcacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 25058978  T
Q  154 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgttt--aaatatgtaaaaatgaaaagttatga 251  Q
    ||   || ||||| ||| ||  | ||||||||||||| || || ||||| |||| ||| |||||||||||||  || |||||| |||||  |||||||||    
T  25058977 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 25058878  T
Q  252 aa 253  Q
    ||    
T  25058877 aa 25058876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 13 - 86
Target Start/End: Original strand, 13301323 - 13301396
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | || | | |||||||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  13301323 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaatttgtgctaattaaggtaagggggttagaattcatcataatcat 13301396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 13 - 86
Target Start/End: Original strand, 13311979 - 13312052
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | || | | |||||||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  13311979 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaatttgtgctaattaaggtaagggggttagaattcatcataatcat 13312052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 13 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 17191936 - 17191879
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttag 70  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||    
T  17191936 taggagctaaagtgaagtttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggggttag 17191879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 135 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 49232693 - 49232573
Alignment:
Q  135 attgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgttt--aaatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||||   || ||||| ||| ||  | ||||||||||||| || || ||||| |||| ||| |||||||||||||  || ||||    
T  49232693 attgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatg 49232594  T
Q  233 taaaaatgaaaagttatgaaa 253  Q
    || |||||  |||||||||||    
T  49232593 tataaatgttaagttatgaaa 49232573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 2449152 - 2449184
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2449152 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 2449184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 279 - 394
Target Start/End: Original strand, 11329098 - 11329214
Alignment:
Q  279 atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagctgatgaatcattgcttgggtatacatg-ttca 377  Q
    ||||||| ||||||||| | || ||||| ||  ||||||||||||||| ||||||  |||||||| | |||| | |||| |||||||||| |||| ||||    
T  11329098 atgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgataattcatggcttgggtatgcatgattca 11329197  T
Q  378 tggattgatgatgagaa 394  Q
    ||  ||| |||||||||    
T  11329198 tgatttgttgatgagaa 11329214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 16261809 - 16261777
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16261809 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 16261777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 16933869 - 16933901
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16933869 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 16933901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 17912398 - 17912430
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17912398 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 17912430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 23492728 - 23492696
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23492728 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 23492696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 38168269 - 38168237
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38168269 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 38168237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 53771397 - 53771365
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53771397 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 53771365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 5228570 - 5228452
Alignment:
Q  135 attgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgttt--aaatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||||   || ||||| ||| |   | ||||||||||||| || || ||||| |||| ||| |||||||||||||  |||||||    
T  5228570 attgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatttccttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaaatatg 5228471  T
Q  233 taaaaatgaaaagttatga 251  Q
    || |||||  |||||||||    
T  5228470 tataaatgttaagttatga 5228452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 279 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 17139618 - 17139524
Alignment:
Q  279 atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagctgatgaatcattgcttgggtatacatg 373  Q
    ||||||| ||||||||| | || ||||| ||  ||||||||||||||| ||||||  |||||||| | |||| | |||| |||||||||| ||||    
T  17139618 atgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgataattcatggcttgggtatgcatg 17139524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 349 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 22275250 - 22275204
Alignment:
Q  349 atgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaat 395  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| |||||| |||||||||||||||    
T  22275250 atgaatcattgcttaggtatgcatattcatgaattgatgatgagaat 22275204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 349 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 41270116 - 41270070
Alignment:
Q  349 atgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaat 395  Q
    |||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||    
T  41270116 atgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatgagaat 41270070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 349 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 55316260 - 55316214
Alignment:
Q  349 atgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaat 395  Q
    |||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||    
T  55316260 atgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatgagaat 55316214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 70
Target Start/End: Original strand, 3576290 - 3576347
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttag 70  Q
    |||||| |||||||||||| | ||||| | || | |||||||||||||||||||||||    
T  3576290 taggaggtaaagtgaagcttgggctaggaatttgtgataattaaggtaagggggttag 3576347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 15550987 - 15550922
Alignment:
Q  20 taaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatca 85  Q
    |||||||||||| | ||||| | |||| |||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||    
T  15550987 taaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaagataagggggttagaattcatcataatca 15550922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 144 - 224
Target Start/End: Original strand, 4145814 - 4145894
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtt 224  Q
    |||||||| |||||| | || ||||||||||| || ||||||||| | ||||||| ||  |||||| | ||||||||||||    
T  4145814 aaattcgtactccaattatggtgatatgtttgaatacatgaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattacatgtt 4145894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 11986080 - 11986112
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11986080 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 11986112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 13954804 - 13954836
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13954804 taaggtaagggggttagtctttaccataatcat 13954836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 14285321 - 14285289
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14285321 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 14285289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 19947058 - 19947026
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19947058 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 19947026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 30153297 - 30153265
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30153297 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 30153265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 33342236 - 33342204
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33342236 taaggtaagagggttagtctttatcataatcat 33342204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 302 - 366
Target Start/End: Original strand, 38811168 - 38811232
Alignment:
Q  302 gattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagctgatgaatcattgcttgggt 366  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||| | |||||| |||| ||||||||    
T  38811168 gattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgatgattcatggcttgggt 38811232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 45861154 - 45861122
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  45861154 taaggtaagggggttagtctttaccataatcat 45861122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 145 - 224
Target Start/End: Original strand, 47784767 - 47784847
Alignment:
Q  145 aattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtt 224  Q
    ||||||||||| || | |||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||| ||  |||||||| ||||| ||||||    
T  47784767 aattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgtt 47784847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 51961031 - 51961063
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  51961031 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 51961063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 252; Significance: 1e-140; HSPs: 46)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 128 - 395
Target Start/End: Original strand, 22907214 - 22907481
Alignment:
Q  128 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 227  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22907214 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 22907313  T
Q  228 atatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttga 327  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22907314 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttga 22907413  T
Q  328 tgctaatagatgttgtagctgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaat 395  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22907414 tgctaatagatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatggattgatgatgagaat 22907481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 54 - 390
Target Start/End: Original strand, 16193643 - 16193979
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 153  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16193643 taaggtaagggg-ttagtctttatcataatcatcatcatttggtaaattttcaaatattgtatgaattttgcttatggatgattgttgctaaattcgtgc 16193741  T
Q  154 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaa 253  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||    
T  16193742 tccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggggaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaa 16193841  T
Q  254 attgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagctgatga 352  Q
    |||||||  ||| | |||| |||| ||  |||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||||| | ||||||    
T  16193842 attgtgctcaattggtgaattttgccaaattgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatga 16193941  T
Q  353 atcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatg 390  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||    
T  16193942 atcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 16193979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 11 - 391
Target Start/End: Original strand, 16404857 - 16405236
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatg 110  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  16404857 cataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcattattt-gtaaattttcaaatg 16404955  T
Q  111 ttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgtt 208  Q
    |||||||||||||   || |||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16404956 ttgtatgaatttttgcatgatggataattattgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgtt 16405055  T
Q  209 ggttaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattct 307  Q
    ||| |||||||||||| ||||| | | |||||  ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | |||   ||| ||||||  |||||||||    
T  16405056 ggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgttaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagtt---gttaaattgacatatgattct 16405152  T
Q  308 tgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagctgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatga 391  Q
    ||| ||||||||||| ||| || |||| |||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||  |||||| |||||||||||    
T  16405153 tgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttttagttgatgaatcactgcttgggtatgcaaattcatgaattgatgatga 16405236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 54 - 395
Target Start/End: Original strand, 43373392 - 43373736
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgt 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||   || |||||| |||  ||||||||||||    
T  43373392 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaatttttgtataatggataattaatgctaaattcgt 43373491  T
Q  152 gctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgaaaagttatga 251  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||    
T  43373492 gctccaactgtgatgatacgtttgtatgcatgaattgatgataattatatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtga 43373591  T
Q  252 aaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagctgat 350  Q
    |||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||| | | | || |||| |||||||| | ||||    
T  43373592 aaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgctatggttgttaattgatgttgtggttgat 43373691  T
Q  351 gaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaat 395  Q
    |||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||    
T  43373692 gaataattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatgagaat 43373736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 54 - 379
Target Start/End: Original strand, 24928716 - 24929043
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgt-aaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtg 152  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24928716 taaggtaatggggttagtctttatcataatcatcgtcattttgtgaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggataattgttgctaaattcgtg 24928815  T
Q  153 ctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaa 252  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| | | |||||| ||||| ||||    
T  24928816 ctccaactgtgattatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaa 24928915  T
Q  253 aattgtgcaaaatggatgaattt-gacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagctgatg 351  Q
    ||||||||  ||| | ||||||| |  | ||||| |||| |||||| ||||  |||||| ||||||| ||| | | || |||| ||||||||   |||||    
T  24928916 aattgtgctcaattggtgaatttcgctaagttgtggttggattgagttatgtctcttgttcaattgaggttatggttgttaattgatgttgtgattgatg 24929015  T
Q  352 aatcattgcttgggtatacatgttcatg 379  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  24929016 aatcattgcttgggtatgcatattcatg 24929043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 128 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 5238350 - 5238184
Alignment:
Q  128 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 227  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5238350 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 5238251  T
Q  228 atatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 294  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5238250 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 5238184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 128 - 294
Target Start/End: Original strand, 24661248 - 24661414
Alignment:
Q  128 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 227  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24661248 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 24661347  T
Q  228 atatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 294  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24661348 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 24661414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 128 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 43685809 - 43685643
Alignment:
Q  128 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 227  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43685809 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 43685710  T
Q  228 atatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 294  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43685709 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 43685643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 140 - 395
Target Start/End: Original strand, 6774258 - 6774514
Alignment:
Q  140 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtaaaaat 239  Q
    ||||| ||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  6774258 tgctagattcgtgctcttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 6774357  T
Q  240 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagat 338  Q
    || ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||| | ||| | ||||| | |||||||||  ||||||||||| ||| || || | |||    
T  6774358 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttattgttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttattgttgttatttgat 6774457  T
Q  339 gttgtagctgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaat 395  Q
    ||||| | |||||||||| ||||||||||| ||| |||||| |||||| ||||||||    
T  6774458 gttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatgaattgattatgagaat 6774514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 140 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 24549233 - 24548977
Alignment:
Q  140 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtaaaaat 239  Q
    ||||| ||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  24549233 tgctagattcgtgctcttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 24549134  T
Q  240 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagat 338  Q
    || ||||| ||||||| ||||  ||| | |||| ||||  | ||| | ||| | ||| | | |||||||||  ||||||||||| | | || |||| |||    
T  24549133 gataagttgtgaaaatggtgctcaattggtgaattttgctaagttattgttaatttgggatttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattgat 24549034  T
Q  339 gttgtagctgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaat 395  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||| ||||||||    
T  24549033 gttgtagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgattatgagaat 24548977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 128 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 17345832 - 17345581
Alignment:
Q  128 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 227  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||    
T  17345832 atggataattgttgcgaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttatatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaa 17345733  T
Q  228 atatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggat-gaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttg 326  Q
     ||||||||||||  ||||||||||||||||||  ||| ||| || ||||  | ||| | | ||||||||| |||||||||||| || ||||| || |||    
T  17345732 ttatgtaaaaatgtgaagttatgaaaattgtgctcaattgatggattttgctaagttattg-tgaattgagttatgattcttgttcagttgatattattg 17345634  T
Q  327 atgctaatagatgttgtagctgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatg 379  Q
     || |||| |||||||| | |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||    
T  17345633 ttgttaattgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatg 17345581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 144 - 260
Target Start/End: Original strand, 21844576 - 21844692
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgaaa 243  Q
    ||||||||||||   || ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21844576 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgata 21844675  T
Q  244 agttatgaaaattgtgc 260  Q
    ||||||||| |||||||    
T  21844676 agttatgaatattgtgc 21844692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 144 - 395
Target Start/End: Original strand, 21851969 - 21852222
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgaaa 243  Q
    ||||||||||||   || ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  21851969 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattaaatgtttaaatatgtaaaaatgata 21852068  T
Q  244 agttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgtt 341  Q
    ||||||||| |||||||  ||| | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||| ||    
T  21852069 agttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatatt 21852168  T
Q  342 gtagctgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaat 395  Q
     |   |||||||| ||||||||||| | ||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  21852169 atgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcattgattgttgatgagaat 21852222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 274841 - 274766
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  274841 cataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 274766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 86
Target Start/End: Original strand, 641008 - 641083
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  641008 cataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 641083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 86
Target Start/End: Original strand, 826814 - 826889
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  826814 cataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 826889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 86
Target Start/End: Original strand, 24716719 - 24716794
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24716719 cataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 24716794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 140 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 30120974 - 30120721
Alignment:
Q  140 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtaaaaat 239  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||| ||  || |||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||    
T  30120974 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaatttatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 30120875  T
Q  240 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 337  Q
    || |||||||||| |||||||  ||| | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||||| ||| ||||||||||| |  ||| || | ||    
T  30120874 gataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttga 30120775  T
Q  338 tgttgtagctgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatga 391  Q
    | || |   |||||||| ||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||    
T  30120774 tattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatcgattgatgatga 30120721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 140 - 260
Target Start/End: Original strand, 16674392 - 16674512
Alignment:
Q  140 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtaaaaat 239  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| ||||||| |||||||||||| ||  || |||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||    
T  16674392 tgctaaattcgtgctctttctgtgatgttatgtttttatgcatgaatttatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 16674491  T
Q  240 gaaaagttatgaaaattgtgc 260  Q
    || |||||||||| |||||||    
T  16674492 gataagttatgaatattgtgc 16674512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 203 - 395
Target Start/End: Original strand, 222754 - 222948
Alignment:
Q  203 attgttggttaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagcta 300  Q
    ||||||||| |||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||||| ||||||| |||| | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| |     
T  222754 attgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttg 222853  T
Q  301 tgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagctgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaat 395  Q
    |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||| || |   |||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  222854 tgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatgagaat 222948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 203 - 395
Target Start/End: Original strand, 736377 - 736571
Alignment:
Q  203 attgttggttaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagcta 300  Q
    ||||||||| |||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||||| ||||||| |||| | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| |     
T  736377 attgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttg 736476  T
Q  301 tgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagctgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaat 395  Q
    |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||| || |   |||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  736477 tgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatgagaat 736571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 203 - 395
Target Start/End: Original strand, 860272 - 860466
Alignment:
Q  203 attgttggttaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagcta 300  Q
    ||||||||| |||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||||| ||||||| |||| | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| |     
T  860272 attgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttg 860371  T
Q  301 tgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagctgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaat 395  Q
    |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||| || |   |||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  860372 tgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatgagaat 860466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 460 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 5238186 - 5238135
Alignment:
Q  460 attatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgattgatgatgt 511  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5238186 attatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgattgatgatgt 5238135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 460 - 511
Target Start/End: Original strand, 24661412 - 24661463
Alignment:
Q  460 attatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgattgatgatgt 511  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24661412 attatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgattgatgatgt 24661463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 460 - 511
Target Start/End: Original strand, 22907546 - 22907597
Alignment:
Q  460 attatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgattgatgatgt 511  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22907546 attatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgattgttgatgt 22907597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 460 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 43685645 - 43685594
Alignment:
Q  460 attatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgattgatgatgt 511  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  43685645 attatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgattgttgatgt 43685594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 39115673 - 39115598
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||| |||||| || |||||||||||    
T  39115673 cataggagcaaaagtgaagcttgagctaatagttggtaataattaaggtaagggtgttagttttcatcataatcat 39115598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 55 - 253
Target Start/End: Original strand, 22006176 - 22006377
Alignment:
Q  55 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatt-atggatgattgttgctaaattcgtgc 153  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||   || ||| |  ||||||  ||||||||||||  | | || ||| |  |||||||||||||||||||    
T  22006176 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 22006275  T
Q  154 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgttt--aaatatgtaaaaatgaaaagttatga 251  Q
    ||   || ||||| ||| ||  | ||||||||||||| || || ||||| |||| ||| |||||||||||||  || |||||| |||||  |||||||||    
T  22006276 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 22006375  T
Q  252 aa 253  Q
    ||    
T  22006376 aa 22006377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 203 - 260
Target Start/End: Original strand, 691909 - 691966
Alignment:
Q  203 attgttggttaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 260  Q
    ||||||||| |||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||||| |||||||    
T  691909 attgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgc 691966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 13 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 17285600 - 17285543
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttag 70  Q
    ||||||||||||||||||| | | ||| | |||| |||||||||||||||||||||||    
T  17285600 taggagctaaagtgaagcttgggttaggaattggtgataattaaggtaagggggttag 17285543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 13 - 70
Target Start/End: Original strand, 21198005 - 21198062
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttag 70  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | |||| |||||||||| ||||||||||||    
T  21198005 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaagataagggggttag 21198062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 279 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 23837308 - 23837219
Alignment:
Q  279 atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagctgatgaatcattgcttgggtat 368  Q
    ||||||| ||||||||| | || || || ||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||| | |||||| |||| ||||||||||    
T  23837308 atgttgttgttgaattgtggtaagagtcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgttgatgattcatggcttgggtat 23837219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 144 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 26011741 - 26011660
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatg-aattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtt 224  Q
    |||||||||||| || | |||||||||||||| ||||||| ||||| | ||||||| ||  |||||||| ||||||||||||    
T  26011741 aaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattacatgtt 26011660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 5238436 - 5238404
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5238436 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 5238404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 22907128 - 22907160
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22907128 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 22907160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 24385652 - 24385684
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24385652 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 24385684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 24661162 - 24661194
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24661162 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 24661194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 43685895 - 43685863
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43685895 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 43685863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 16195488 - 16195370
Alignment:
Q  135 attgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgttt--aaatatg 232  Q
    ||||||||||||||||| |||   || ||||| ||||||  | ||||||||||||| || || ||||| |||| ||| |||||||||||||  || ||||    
T  16195488 attgttgctaaattcgttctcgtgctgtgatgctatgttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatg 16195389  T
Q  233 taaaaatgaaaagttatga 251  Q
    || |||||  |||||||||    
T  16195388 tataaatgttaagttatga 16195370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 198
Target Start/End: Original strand, 23226076 - 23226131
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatg-aattgataataattg 198  Q
    ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  23226076 aaatttgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcatgaaattgatgataattg 23226131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 464 - 510
Target Start/End: Original strand, 22321608 - 22321654
Alignment:
Q  464 tgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgattgatgatg 510  Q
    ||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  22321608 tgatggaatgcatgattatatgttgtgattgtggttgattgttgatg 22321654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 23150026 - 23149985
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa 185  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||    
T  23150026 aaattcgtgctccaattatgatgatatgtttgaatgcatgaa 23149985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 2545297 - 2545265
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2545297 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 2545265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 3431176 - 3431208
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3431176 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 3431208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 145 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 17285450 - 17285370
Alignment:
Q  145 aattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtt 224  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||  ||||||||| ||| | ||||||| ||  |||||||| ||||| ||||||    
T  17285450 aattcgtgctccaattatgatgatatgtttaaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgtt 17285370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 22886686 - 22886654
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22886686 taaggtaagggggttagtcttaatcataatcat 22886654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 252; Significance: 1e-140; HSPs: 41)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 128 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 26680463 - 26680196
Alignment:
Q  128 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 227  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26680463 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 26680364  T
Q  228 atatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttga 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26680363 atatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatagatgaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttga 26680264  T
Q  328 tgctaatagatgttgtagctgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaat 395  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26680263 tgctaatagatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatggattgatgatgagaat 26680196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 11 - 395
Target Start/End: Original strand, 54118125 - 54118512
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatg 110  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  54118125 cataagagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcattattttgtgaattttcaaatg 54118224  T
Q  111 ttgtatgaatttt--gattatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgtt 208  Q
    |||||||||||||   || |||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  54118225 ttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgtgctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgtt 54118324  T
Q  209 ggttaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattct 307  Q
    ||| |||||||||||| ||||| | | || ||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| |||  ||| || |||||||||    
T  54118325 ggtgaaattacatgttcaaataggaacaattgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagatttagttatgattct 54118424  T
Q  308 tgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagctgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaat 395  Q
    ||| ||||||||||| | | || |||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||    
T  54118425 tgttcaattgatgttatagttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatgagaat 54118512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 54 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 13246769 - 13246425
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgt 151  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||| |||||||||    
T  13246769 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgttaaattcgt 13246670  T
Q  152 gctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgaaaagttatga 251  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| | | |||||| ||||| |||    
T  13246669 gctacaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattaatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtga 13246570  T
Q  252 aaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagctgat 350  Q
    |||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| |||  |||||| |||||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||||| | ||||    
T  13246569 aaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgat 13246470  T
Q  351 gaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaat 395  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||    
T  13246469 gaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatgagaat 13246425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 54 - 391
Target Start/End: Original strand, 15675009 - 15675353
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcat----tttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatta--tggatgattgttgctaaat 147  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    |||| || ||||||||||| |||||||||||   ||  ||||| |||||||||||||    
T  15675009 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcatcatttttgcaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgttgctaaat 15675108  T
Q  148 tcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgaaaagtt 247  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||  |||||    
T  15675109 tcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagtt 15675208  T
Q  248 atgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagc 346  Q
     ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||| || |||| |||||||| |     
T  15675209 gtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttgttgt 15675308  T
Q  347 tgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatga 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  15675309 tgatgaatcattgcttgggtatacatattcatgaattgatgatga 15675353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 54 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 122226 - 122020
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 153  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  122226 taaggtaaggggattagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaatttgtgc 122127  T
Q  154 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaa 253  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||    
T  122126 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaa 122027  T
Q  254 attgtgc 260  Q
    |||||||    
T  122026 attgtgc 122020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 128 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 10488825 - 10488659
Alignment:
Q  128 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 227  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  10488825 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 10488726  T
Q  228 atatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 294  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10488725 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 10488659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 128 - 294
Target Start/End: Original strand, 16327926 - 16328092
Alignment:
Q  128 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 227  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16327926 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 16328025  T
Q  228 atatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 294  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16328026 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 16328092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 54 - 326
Target Start/End: Original strand, 10104170 - 10104449
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcat----tttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatta--tggatgattgttgctaaat 147  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    |||  || ||||||||||| |||||||||||   ||  ||||| |||||||||||||    
T  10104170 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcatcatttttacaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgttgctaaat 10104269  T
Q  148 tcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgaaaagtt 247  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||  |||||    
T  10104270 ccgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagtt 10104369  T
Q  248 atgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttg 326  Q
     ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  10104370 gtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttgttg 10104449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 155 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 31115865 - 31115628
Alignment:
Q  155 ccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaaa 254  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  | ||||||||||||  ||||| ||||||    
T  31115865 ccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttccattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaa 31115766  T
Q  255 ttgtgcaaaatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagctgatgaa 353  Q
    || |||  ||| | |||||||  | | ||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||| || |||| |||||||| | |||||||    
T  31115765 ttatgctcaattggtgaattttcctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttgttgttgatgaa 31115666  T
Q  354 tcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatga 391  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  31115665 tcattgcttgggtatacatattcatgaattgatgatga 31115628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 128 - 275
Target Start/End: Original strand, 13048221 - 13048368
Alignment:
Q  128 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 227  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13048221 atggataattgttgctaaattcatgctccaacttcaatgatatgtttgtatgcatgatttgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaa 13048320  T
Q  228 atatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 275  Q
    ||||||||||| || |||||||||| |||||||  ||| |||||||||    
T  13048321 atatgtaaaaaggataagttatgaatattgtgctcaattgatgaattt 13048368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 144 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 10644467 - 10644214
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgaaa 243  Q
    ||||||||||||   || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||  |    
T  10644467 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgtta 10644368  T
Q  244 agttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgtt 341  Q
    ||||||||  ||||||| |||| | |||||||  |  | ||||| ||||| ||||| | |||||| ||| ||||||||||| |  ||| || | ||| ||    
T  10644367 agttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatatt 10644268  T
Q  342 gtagctgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaat 395  Q
     |   |||||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||    
T  10644267 atgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatgagaat 10644214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 54 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 33241043 - 33240890
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcat----tttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatta--tggatgattgttgctaaat 147  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    |||| || ||||||||||| |||||||||||   ||  ||||| |||||||||||||    
T  33241043 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcatcatttttgcaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgttgctaaat 33240944  T
Q  148 tcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtat 201  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  33240943 tcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtat 33240890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 140 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 47357906 - 47357649
Alignment:
Q  140 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtaaaaat 239  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||| ||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||    
T  47357906 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatggattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 47357807  T
Q  240 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 337  Q
    || |||||||||| ||||||| |||| | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||    
T  47357806 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 47357707  T
Q  338 tgttgtagctgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaat 395  Q
    | || |   |||||||| |||| ||||||||  || ||||||||||||||||||||||    
T  47357706 tattatgattgatgaataattgattgggtatgtatattcatggattgatgatgagaat 47357649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 86
Target Start/End: Original strand, 25119064 - 25119139
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  25119064 cataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggagttagtttttatcataatcat 25119139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 144 - 326
Target Start/End: Original strand, 40885570 - 40885753
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaa-tatgtaaaaatgaa 242  Q
    |||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||      
T  40885570 aaattcgtactccaactgtggtgctatgtttgtatgcatgaattggtgataattgaatgtttgttggtgaaattacatgttcaaagtatgtataaatgtc 40885669  T
Q  243 aagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttg 326  Q
    |||||||| ||||| |||  ||| | |||| ||||  | ||| | ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  40885670 aagttatg-aaattatgctcaattggtgaactttgctaagttattgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttgttg 40885753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 54 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 31132657 - 31132545
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcat----tttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatta--tggatgattgttgctaaat 147  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    |||| || ||||||||||| |||||||||||   ||  ||||| |||||||||||||    
T  31132657 taaggtaagggggttagtcttcatcataattatcatcatcatttttgcaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgttgctaaat 31132558  T
Q  148 tcgtgctccaact 160  Q
    |||||||||||||    
T  31132557 tcgtgctccaact 31132545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 292 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 111493 - 111394
Alignment:
Q  292 attgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagctgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatga 391  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||    
T  111493 attgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatga 111394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 86
Target Start/End: Original strand, 5682385 - 5682460
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||| ||||||||||  |||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  5682385 cataggagcaaaagtgaagcatgagctaatagttggtgataattaaggtaagtgggttagtttttatcataatcat 5682460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 460 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 26680131 - 26680080
Alignment:
Q  460 attatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgattgatgatgt 511  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26680131 attatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgattgttgatgt 26680080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 460 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 10488661 - 10488610
Alignment:
Q  460 attatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgattgatgatgt 511  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10488661 attatgatggagggtatgattatatgttatgattgtagttgattgatgatgt 10488610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 460 - 505
Target Start/End: Original strand, 16328090 - 16328135
Alignment:
Q  460 attatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgattga 505  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16328090 attatgatggagggtatgattatatgttatgattgtagttgattga 16328135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 86
Target Start/End: Original strand, 41165808 - 41165881
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||  || |||||||||||    
T  41165808 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaacgtaagggggttagaattcatcataatcat 41165881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 347 - 391
Target Start/End: Original strand, 10104451 - 10104495
Alignment:
Q  347 tgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatga 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  10104451 tgatgaatcattgcttgggtatacatattcatgaattgatgatga 10104495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 279 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 15044938 - 15044851
Alignment:
Q  279 atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagctgatgaatcattgcttgggt 366  Q
    ||||||| ||||||||| | || ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||| | |||||| |||| ||||||||    
T  15044938 atgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgatgattcatggcttgggt 15044851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 55 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 18169308 - 18169107
Alignment:
Q  55 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatt-atggatgattgttgctaaattcgtgc 153  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||   || ||| |  ||||||  ||||||||||||  | | || ||| |  |||||||||||||||||||    
T  18169308 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 18169209  T
Q  154 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgttt--aaatatgtaaaaatgaaaagttatga 251  Q
    ||   || ||||| ||| ||  | ||||||||||||| || || ||||| |||| ||| |||||||||||||  || |||||| |||||  |||||||||    
T  18169208 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 18169109  T
Q  252 aa 253  Q
    ||    
T  18169108 aa 18169107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 279 - 368
Target Start/End: Original strand, 41166083 - 41166172
Alignment:
Q  279 atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagctgatgaatcattgcttgggtat 368  Q
    ||||||| ||||||||| |  | || || ||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||| | ||||||||||| ||||||||||    
T  41166083 atgttgttgttgaattgtggcaagagtcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgttgatgaatcatggcttgggtat 41166172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 13 - 70
Target Start/End: Original strand, 47534933 - 47534990
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttag 70  Q
    ||||||||||||||||||| | || || | |||| |||||||||||||||||||||||    
T  47534933 taggagctaaagtgaagcttgggcgaggaattggtgataattaaggtaagggggttag 47534990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 14952117 - 14952085
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14952117 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 14952085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 15135907 - 15135939
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15135907 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 15135939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 15272211 - 15272243
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15272211 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 15272243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 16327840 - 16327872
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16327840 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 16327872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 16609013 - 16609045
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16609013 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 16609045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 26680549 - 26680517
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26680549 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 26680517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 279 - 366
Target Start/End: Original strand, 15109486 - 15109573
Alignment:
Q  279 atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagctgatgaatcattgcttgggt 366  Q
    ||||||| ||||||||| | || ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||   ||||||| | |||||| |||| ||||||||    
T  15109486 atgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtaatgttgttgatgatgattcatggcttgggt 15109573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 279 - 373
Target Start/End: Original strand, 13809647 - 13809741
Alignment:
Q  279 atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagctgatgaatcattgcttgggtatacatg 373  Q
    ||||||| ||||||||| | || ||||| ||  ||||||||||||||| ||||||| |||||||| | |||| | |||| |||||| ||| ||||    
T  13809647 atgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaattgatgttgttgatgataattcatggcttggatatgcatg 13809741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 143 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 7850248 - 7850131
Alignment:
Q  143 taaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgaa 242  Q
    ||||||||||||||||    |||| |||||||| ||| ||| |||||| | || ||| |||||||||||  ||||  ||||  || ||||| ||||||      
T  7850248 taaattcgtgctccaatggagatgttatgtttgaatgaatgtattgatgaaaactgtgtgattgttggtggaattgtatgtccaattatgtgaaaatgtg 7850149  T
Q  243 aagttatgaaaattgtgc 260  Q
    ||||||||||||||||||    
T  7850148 aagttatgaaaattgtgc 7850131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 19020739 - 19020623
Alignment:
Q  139 ttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgttt--aaatatgtaaa 236  Q
    |||||||||||||||||   || ||||| ||| ||  | ||||||||||||| || || ||||| |||| ||| |||||||||||||  || |||||| |    
T  19020739 ttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtata 19020640  T
Q  237 aatgaaaagttatgaaa 253  Q
    ||||  |||||||||||    
T  19020639 aatgttaagttatgaaa 19020623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 8045304 - 8045272
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8045304 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 8045272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 145 - 185
Target Start/End: Original strand, 13809511 - 13809551
Alignment:
Q  145 aattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa 185  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||    
T  13809511 aattcgtgctccaattatgatgatatgtttgaatgcatgaa 13809551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 145 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 15045074 - 15044990
Alignment:
Q  145 aattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaa 228  Q
    |||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||||||| ||| | ||||||| ||  |||||||| ||||| |||||| |||    
T  15045074 aattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaa 15044990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 16523178 - 16523146
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16523178 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 16523146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 244; Significance: 1e-135; HSPs: 4)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 128 - 395
Target Start/End: Original strand, 37066 - 37333
Alignment:
Q  128 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 227  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  37066 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 37165  T
Q  228 atatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttga 327  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37166 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttggattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttga 37265  T
Q  328 tgctaatagatgttgtagctgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaat 395  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37266 tgctaatagatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatggattgatgatgagaat 37333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 41707 - 41632
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  41707 cataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcacaatcat 41632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 460 - 504
Target Start/End: Original strand, 37398 - 37442
Alignment:
Q  460 attatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgattg 504  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37398 attatgatggagtgtatgattatatgttgtgattgtggttgattg 37442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 36980 - 37012
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36980 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 37012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 244; Significance: 1e-135; HSPs: 58)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 128 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 7293279 - 7293012
Alignment:
Q  128 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 227  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7293279 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattaataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 7293180  T
Q  228 atatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttga 327  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7293179 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttga 7293080  T
Q  328 tgctaatagatgttgtagctgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaat 395  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7293079 tgctaatagatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatggattgatgatgagaat 7293012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 13 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 3060344 - 3059965
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgtt 112  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3060344 taggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataatgaaggtaagggggtaagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgtt 3060245  T
Q  113 gtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggtt 212  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||  | |||||||     
T  3060244 atatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgataatatatttgtatgcattaattgatgataattgtaatactgttggtg 3060145  T
Q  213 aaattacatgtttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc-aaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgt 310  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| || || |||||||| |||  |||||| |||| ||||  | ||||| |||  |||||| ||||||||||||    
T  3060144 aaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataaattgtgaaaattatgctcaaatgg-tgaattttgttaagttgttgttagattgagttatgattcttgt 3060046  T
Q  311 gcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagctgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatga 391  Q
     ||||||||||| |   || |||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||    
T  3060045 tcaattgatgttatgactgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatga 3059965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 54 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 16212103 - 16211761
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  16212103 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaattttgcttatggacaattgttgctaaattcgtgc 16212004  T
Q  154 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaa 253  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| || ||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||    
T  16212003 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgtttgtgaaattgcatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaa 16211904  T
Q  254 attgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagctgatga 352  Q
    |||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||| | ||||| | ||||||||||  |||||||||| | | || |||| |||||||| | ||||||    
T  16211903 attgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttaaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatga 16211804  T
Q  353 atcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaat 395  Q
     ||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||| ||||||    
T  16211803 ttcattgcttgggtatgcatattcatgaattaatgaagagaat 16211761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 54 - 395
Target Start/End: Original strand, 11580661 - 11581007
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcatttt-gtaaattttcaaatgttgtatgaattttg---attatggatgattgttgctaaattc 149  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    || |||||| ||| |||||||||||    
T  11580661 taaggtaaggggattagtctttatcataatcatcatcatttttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttttgcataatggataattattgctaaattc 11580760  T
Q  150 gtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgaaaagttat 249  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| | | |||||| ||||| |    
T  11580761 gtgctccaactgtgataatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgt 11580860  T
Q  250 gaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagctg 348  Q
    |||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| |||  |||||| |||||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||||| | ||    
T  11580861 gaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttg 11580960  T
Q  349 atgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaat 395  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||    
T  11580961 atgaatcattgcttgggtatacatattcatgaattgaggacgagaat 11581007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 54 - 395
Target Start/End: Original strand, 13036938 - 13037282
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgt 151  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||||||    
T  13036938 taaggtaagggggttagtcttcaccataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgt 13037037  T
Q  152 gctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgaaaagttatga 251  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||| | | |||||| ||||| |||    
T  13037038 gctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttgatgaaattgcatgttcaaataggaacaaatgataagttgtga 13037137  T
Q  252 aaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagctgat 350  Q
    |||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| |||  |||||| |||||||||||| ||||| ||||| |  ||  |||| |||||||| | ||||    
T  13037138 aaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattaatgttatgaatattaattgatgttgtggttgat 13037237  T
Q  351 gaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaat 395  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||    
T  13037238 gaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatgagaat 13037282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 54 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 36053003 - 36052662
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgt 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||  |    
T  36053003 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaatttttgtataatggataattgttgctaaatttat 36052904  T
Q  152 gctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgaaaagttatga 251  Q
     |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||    
T  36052903 actccaactgtgatgatacgtttgtatgcatgaattgatgataattatatgattgttggtaaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtga 36052804  T
Q  252 aaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagctgat 350  Q
    |||||||||  ||| | |||| ||||  | |||   ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||||| | || |||| |||||||| | ||||    
T  36052803 aaattgtgctcaattggtgaattttgctaagtt---gttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttgtggttgttaattgatgttgtggttgat 36052707  T
Q  351 gaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaat 395  Q
    |||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||    
T  36052706 gaataattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatgagaat 36052662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 128 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 11516490 - 11516324
Alignment:
Q  128 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 227  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11516490 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 11516391  T
Q  228 atatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 294  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11516390 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 11516324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 128 - 294
Target Start/End: Original strand, 15441564 - 15441730
Alignment:
Q  128 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 227  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15441564 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 15441663  T
Q  228 atatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 294  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15441664 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 15441730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 128 - 294
Target Start/End: Original strand, 30262129 - 30262295
Alignment:
Q  128 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 227  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30262129 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 30262228  T
Q  228 atatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 294  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30262229 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 30262295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 128 - 391
Target Start/End: Original strand, 47481031 - 47481295
Alignment:
Q  128 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 227  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||| ||    
T  47481031 atggataattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaa 47481130  T
Q  228 atatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttg 326  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||   ||| | |||| ||||  | ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | |    
T  47481131 atatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgttcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagttatgattcttgttcaattgatgttatcg 47481230  T
Q  327 atgctaatagatgttgtagctgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatga 391  Q
     |  |||| |||||| | | |||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||    
T  47481231 ctcttaattgatgtttttgttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatga 47481295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 135 - 395
Target Start/End: Original strand, 18253842 - 18254103
Alignment:
Q  135 attgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgta 234  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||    
T  18253842 attgttactaaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgta 18253941  T
Q  235 aaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaa 333  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | |||| |||    
T  18253942 aaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaa 18254041  T
Q  334 tagatgttgtagctgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaat 395  Q
    | ||||||||   |||||||| ||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  18254042 ttgatgttgtgattgatgaataattgcctgagtatgcatattcatggattgatgatgagaat 18254103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 129 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 13321278 - 13321009
Alignment:
Q  129 tggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgttt--a 226  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |    
T  13321278 tggataattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtttcaa 13321179  T
Q  227 aatatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttg-tagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgt 324  Q
    | |||||| |||||  |||||||| |||||||||  ||| | |||| ||||  | |||| | ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |    
T  13321178 agtatgtataaatgtcaagttatg-aaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgattgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttat 13321080  T
Q  325 tgatgctaatagatgttgtagctgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaat 395  Q
    || || |||| |||||||| | |||||||||||  ||||||| | ||  |||||| |||||||||||||||    
T  13321079 tgttgttaattgatgttgttgttgatgaatcatgacttgggtttgcacattcatgaattgatgatgagaat 13321009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 146 - 391
Target Start/End: Original strand, 16478968 - 16479214
Alignment:
Q  146 attcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgaaaag 245  Q
    ||||||||||  |||  |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  16478968 attcgtgctcttactgcgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataag 16479067  T
Q  246 ttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgta 344  Q
    || ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||| |  || | ||||| | |||||||||  ||||||||||| ||| || || | ||||||||     
T  16479068 ttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgttaagttatttttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttattgttgttatttgatgttgtt 16479167  T
Q  345 gctgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatga 391  Q
    | |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  16479168 gttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatggattgatgatga 16479214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 128 - 260
Target Start/End: Original strand, 25292338 - 25292470
Alignment:
Q  128 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 227  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | || ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25292338 atggataattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgtatgaattgttgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaa 25292437  T
Q  228 atatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 260  Q
    ||||||||||| || ||| |||||| |||||||    
T  25292438 atatgtaaaaaggataagctatgaatattgtgc 25292470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 144 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 13572924 - 13572808
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgaaa 243  Q
    ||||||||||||   || ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13572924 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtgtgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgata 13572825  T
Q  244 agttatgaaaattgtgc 260  Q
    ||||||||| |||||||    
T  13572824 agttatgaatattgtgc 13572808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 140 - 395
Target Start/End: Original strand, 13911024 - 13911282
Alignment:
Q  140 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtaaaaat 239  Q
    ||||||||||||||||    | ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||    
T  13911024 tgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttaattgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 13911123  T
Q  240 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac---atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatag 336  Q
    || |||||||||| ||| |||  ||| | |||||||  |   | ||||| ||||| ||||| | |||||| ||| ||||||||||| |  ||| || | |    
T  13911124 gataagttatgaatattatgctcaattggtgaatttctcctaaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttg 13911223  T
Q  337 atgttgtagctgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaat 395  Q
    || || |   |||||||| ||| ||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||    
T  13911224 atattatgattgatgaataatttcttgggtttgcatattcatggattgatgatgagaat 13911282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 140 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 10989661 - 10989405
Alignment:
Q  140 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtaaaaat 239  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||    
T  10989661 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 10989562  T
Q  240 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 337  Q
    || |||||||||| |||||||  ||| | |||||||  |  | ||||| | | | ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||    
T  10989561 gataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttg-taatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 10989463  T
Q  338 tgttgtagctgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaat 395  Q
    | || |   |||||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||    
T  10989462 tattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatgagaat 10989405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 86
Target Start/End: Original strand, 32493903 - 32493978
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32493903 cataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 32493978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 139 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 2437710 - 2437590
Alignment:
Q  139 ttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtaaaaa 238  Q
    |||||||||||||||||    | ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| |||||    
T  2437710 ttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaa 2437611  T
Q  239 tgaaaagttatgaaaattgtg 259  Q
    ||| |||||||||| ||||||    
T  2437610 tgataagttatgaagattgtg 2437590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 56 - 256
Target Start/End: Original strand, 295893 - 296094
Alignment:
Q  56 aggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaa-ttttg-attatggatgattgttgctaaattcgtgc 153  Q
    ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||||||| |  |||||||||  ||||||||| ||||| || ||| || ||||||||||||||||||     
T  295893 aggtaagggggtttgtcttcaacataattctcatcatttt-tgcattttcaaactttgtatgaaattttgcataatgaataattgttgctaaattcgtgt 295991  T
Q  154 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaa 253  Q
    || || |  | || ||||||||| ||||||||| ||| |||||  ||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||||||| ||||||| |||    
T  295992 tctaattgaggtgttatgtttgtgtgcatgaatcgatgataatgttatgattgttggtgaaatttcatgttgaattatgtaaaaatgagaagttataaaa 296091  T
Q  254 att 256  Q
    |||    
T  296092 att 296094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 11 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 126813 - 126738
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  126813 cataggagcaaaaatgaagttagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 126738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 11 - 86
Target Start/End: Original strand, 1936874 - 1936949
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  1936874 catagaagcaaaagtgaagctagagttaatagttggagataattaaggtaaggaggttagtttttatcataatcat 1936949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 460 - 511
Target Start/End: Original strand, 15441728 - 15441779
Alignment:
Q  460 attatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgattgatgatgt 511  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15441728 attatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgattgatgatgt 15441779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 460 - 511
Target Start/End: Original strand, 30262293 - 30262344
Alignment:
Q  460 attatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgattgatgatgt 511  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30262293 attatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgattgatgatgt 30262344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 86
Target Start/End: Original strand, 111126 - 111201
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  111126 cataggagcaaaagtgaagcttgagctaaaagttggtgataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcat 111201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 13377924 - 13377819
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgtt 112  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||  |  |  ||||||||||||| ||||    
T  13377924 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggggttagaattcatcataatcat--ttttagtgtaaattttcaattgtt 13377827  T
Q  113 gtatgaat 120  Q
    ||||||||    
T  13377826 gtatgaat 13377819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 460 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 7292947 - 7292896
Alignment:
Q  460 attatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgattgatgatgt 511  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  7292947 attatgatggagtgtatgattatatgttgtgattgtggttgattgttgatgt 7292896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 460 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 11516326 - 11516275
Alignment:
Q  460 attatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgattgatgatgt 511  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11516326 attatgatggagtgtatgagtatatgttatgattgtggttgattgttgatgt 11516275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 85
Target Start/End: Original strand, 7283913 - 7283987
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatca 85  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| || || |||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  7283913 cataggagcaaaagtgaagcttgagttaataattggtgataattaaggtaagggggttagttttcatcataatca 7283987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 128 - 170
Target Start/End: Original strand, 14113989 - 14114031
Alignment:
Q  128 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatat 170  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14113989 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatat 14114031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 128 - 170
Target Start/End: Original strand, 14423639 - 14423681
Alignment:
Q  128 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatat 170  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14423639 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatat 14423681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 13389750 - 13389693
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttag 70  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||    
T  13389750 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggggttag 13389693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 36024485 - 36024372
Alignment:
Q  54 taaggtaaggggg-ttagtctttatcataatcatcatcat----tttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatta--tggatgattgttgctaaa 146  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    |||  || ||||||||||| |||||||||||   ||  ||||| |||||| |||||    
T  36024485 taaggtaaggggggttagtcttcatcataatcatcatcatcatttttacaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgtttctaaa 36024386  T
Q  147 ttcgtgctccaact 160  Q
    ||||||||||||||    
T  36024385 ttcgtgctccaact 36024372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 253
Target Start/End: Original strand, 18979938 - 18980140
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatt-atggatgattgttgctaaattcgtg 152  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||   || ||| |  ||||||  ||||||||||||  | | || ||| |  ||||||||||||||||||    
T  18979938 taaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtg 18980037  T
Q  153 ctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgttt--aaatatgtaaaaatgaaaagttatg 250  Q
    |||   || ||||| ||| ||  | ||||||||||||| || || ||||| |||| ||| |||||||||||||  || |||||| |||||  ||||||||    
T  18980038 ctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatg 18980137  T
Q  251 aaa 253  Q
    |||    
T  18980138 aaa 18980140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 55 - 253
Target Start/End: Original strand, 15950709 - 15950910
Alignment:
Q  55 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatt-atggatgattgttgctaaattcgtgc 153  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||   || ||| |  ||||||  ||||||||||||  | | || ||| |  |||||||||||||||||||    
T  15950709 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 15950808  T
Q  154 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgttt--aaatatgtaaaaatgaaaagttatga 251  Q
    ||   || ||||| ||| ||  | ||||||||||||| || || ||||| |||| ||| |||||||||||||  || |||||| |||||  |||||||||    
T  15950809 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 15950908  T
Q  252 aa 253  Q
    ||    
T  15950909 aa 15950910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 279 - 373
Target Start/End: Original strand, 49047811 - 49047905
Alignment:
Q  279 atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagctgatgaatcattgcttgggtatacatg 373  Q
    ||||||| ||||||||| | || ||||| ||  ||||||||||||||| ||||||  |||||||| |||||| | |||| |||||||||| ||||    
T  49047811 atgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgctgataattcatggcttgggtatgcatg 49047905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 144 - 224
Target Start/End: Original strand, 16914928 - 16915009
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatg-aattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtt 224  Q
    |||||||||||| || | |||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||  |||||||| ||||| ||||||    
T  16914928 aaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattgatgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgtt 16915009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 135 - 224
Target Start/End: Original strand, 48622665 - 48622754
Alignment:
Q  135 attgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtt 224  Q
    |||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||  | ||||||||||||| || || ||||| |||| ||| ||||||||||||    
T  48622665 attgatgctaaattcgtgctcttactgtgatgatattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 48622754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 2029276 - 2029244
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2029276 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 2029244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 7293365 - 7293333
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7293365 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 7293333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 11516576 - 11516544
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11516576 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 11516544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 14113903 - 14113935
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14113903 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 14113935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 15441478 - 15441510
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15441478 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 15441510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 15709501 - 15709428
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatc----attttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttt 123  Q
    ||||||||| || |||||||| |||||||||||||||    |||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  15709501 taaggtaagaggattagtcttcatcataatcatcatcatcaattttgcaatttttcaaatgtggtatgaatttt 15709428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 16919926 - 16919870
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggtta 69  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | |||| |||||||||| |||||||||||    
T  16919926 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaagataagggggtta 16919870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 30262043 - 30262075
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30262043 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 30262075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 42056188 - 42056220
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42056188 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 42056220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 279 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 13377639 - 13377552
Alignment:
Q  279 atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagctgatgaatcattgcttgggt 366  Q
    ||||||| ||||||||| | || ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||   ||||||| | |||||| |||| ||||||||    
T  13377639 atgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtaatgttgttgatgatgattcatggcttgggt 13377552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 279 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 13274897 - 13274803
Alignment:
Q  279 atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagctgatgaatcattgcttgggtatacatg 373  Q
    ||||||| ||||||||| | || ||||| ||  ||||||||||||||| ||||||  |||||||| | |||||| |||| |||| ||||| ||||    
T  13274897 atgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgatgattcatggctttggtatgcatg 13274803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 9611555 - 9611474
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatg-aattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtt 224  Q
    |||||||||||| || | |||||||||||||| ||||||| ||||| | ||||||| ||  |||||||| ||||| ||||||    
T  9611555 aaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgtt 9611474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 9839126 - 9839045
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatg-aattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtt 224  Q
    |||||||||||| || | |||||||||||||| ||||||| ||||| | ||||||| ||  |||||||| ||||| ||||||    
T  9839126 aaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgtt 9839045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 371449 - 371417
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  371449 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 371417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 3049937 - 3049905
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3049937 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 3049905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 13321366 - 13321334
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13321366 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 13321334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 145 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 13377775 - 13377695
Alignment:
Q  145 aattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtt 224  Q
    |||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||||||| ||| | ||||||| ||  |||||||| ||||| ||||||    
T  13377775 aattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgtt 13377695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 58 - 86
Target Start/End: Original strand, 15516765 - 15516793
Alignment:
Q  58 gtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15516765 gtaagggggttagtctttatcataatcat 15516793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 25124482 - 25124450
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25124482 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 25124450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 47480944 - 47480976
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  47480944 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 47480976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 230; Significance: 1e-127; HSPs: 27)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 11 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 41394602 - 41394221
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatg 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41394602 cataggagctaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatg 41394503  T
Q  111 ttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttgg 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  41394502 ttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcataaattgatgataattgtatgattgttgg 41394403  T
Q  211 ttaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttg 309  Q
    | || ||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||| | |||   ||||| | |||||||||    
T  41394402 tgaagttacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttattgttatgttgagatttgattcttg 41394303  T
Q  310 tgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagctgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatga 391  Q
      ||||||||||| ||| || || | |||||||| | |||||||||| || |||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  41394302 ctcaattgatgttattgttgttatttgatgttgttgttgatgaatcactgattgggtatgcatattcatggattgatgatga 41394221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 54 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 20931682 - 20931340
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 153  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  20931682 taaggtaagggggttagcctttatcataatcatcctcattttgcaaattttcaattgttgtatgaagtttgcttatggataattgttgctaaattcgtgc 20931583  T
Q  154 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaa 253  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||    
T  20931582 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcatatatgtaaaaatgataagttatgaaa 20931483  T
Q  254 attgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagctgatga 352  Q
    ||||||| |||| | |||| ||||  |  |||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||||| | ||||||    
T  20931482 attgtgctaaattggtgaattttgctaaattgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatga 20931383  T
Q  353 atcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaat 395  Q
    || ||| ||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||    
T  20931382 ataatttcttgggtatgcatattcatgaattaatgatgagaat 20931340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 54 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 20446019 - 20445674
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgt-aaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcg 150  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||||    
T  20446019 taaggtaagggagttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcg 20445920  T
Q  151 tgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgaaaagttatg 250  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| || || | | |||||| ||||  ||    
T  20445919 tgctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaagtaggaacaaatgataagtggtg 20445820  T
Q  251 aaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagctga 349  Q
    ||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||||||||| | |||||||||||  ||||||||||| | | || |||| |||||||||| |||    
T  20445819 aaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgtgttatgattcttgatcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtagttga 20445720  T
Q  350 tgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaat 395  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||    
T  20445719 tgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatgagaat 20445674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 54 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 20913367 - 20913032
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||    
T  20913367 taaggtaagggggttagtctttatcgtaatcatcctcattttgcaaattttcaattgttgtatgaattttgcttacggataattgttgctaaattcgtgc 20913268  T
Q  154 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaa 253  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||    
T  20913267 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcatatatgtaaaaatgataagttatgaaa 20913168  T
Q  254 attgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagctgatga 352  Q
    |||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||| ||||      |||||||||| ||||||||||| | | || |||| ||| |||| | ||||||    
T  20913167 attgtgctcaattggtgaattttgcaaagttgttgtt-aatt------tgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatcttgtggttgatga 20913075  T
Q  353 atcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaat 395  Q
    || ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||    
T  20913074 ataattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatgagaat 20913032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 54 - 395
Target Start/End: Original strand, 37844374 - 37844719
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgt 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||| |    
T  37844374 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcat 37844473  T
Q  152 gctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtaaaaatga-aaagttatg 250  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| || || | | |||||| ||| |  ||    
T  37844474 gctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaagtaggaacaaatgataaaatagtg 37844573  T
Q  251 aaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagctga 349  Q
    ||||||||||  |||  ||||| ||||  | ||||| |||  |||||| |||||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||||| | |||    
T  37844574 aaaattgtgctcaattaatgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttga 37844673  T
Q  350 tgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaat 395  Q
    ||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||    
T  37844674 tgagtcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatgagaat 37844719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 158; E-Value: 8e-84
Query Start/End: Original strand, 54 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 20531783 - 20531439
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgt 151  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||||||    
T  20531783 taaggtaaggaaattagtctttatcataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgt 20531684  T
Q  152 gctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgaaaagttatga 251  Q
    ||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| || || | | |||||| ||||  |||    
T  20531683 gctccaaatgtgataatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaagtaggaacaaatgataagtggtga 20531584  T
Q  252 aaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagctgat 350  Q
    |||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||||||||| | |||||||||||  ||||||||||| | | || |||| |||||||||| ||||    
T  20531583 aaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgtgttatgattcttgatcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtagttgat 20531484  T
Q  351 gaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaat 395  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||    
T  20531483 gaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatgagaat 20531439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 54 - 395
Target Start/End: Original strand, 20893551 - 20893894
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgt 151  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||| |    
T  20893551 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcattttgtaa-ttttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattctt 20893649  T
Q  152 gctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgaaaagttatga 251  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| | | |||||| ||||| |||    
T  20893650 gctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttgttgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtga 20893749  T
Q  252 aaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagctgat 350  Q
    |||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| |||  |||||  |||||||||||| ||||||||||| |   || |||| |||||||| | ||||    
T  20893750 aaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagattgatttatgattcttgttcaattgatgttatgactgttaattgatgttgtggttgat 20893849  T
Q  351 gaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaat 395  Q
    ||||||||| |||||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  20893850 gaatcattgtttgggtatgcatattcataaattgatgatgagaat 20893894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 128 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 51452755 - 51452589
Alignment:
Q  128 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 227  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51452755 atggataattgttgctaaattcgtgcttcaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 51452656  T
Q  228 atatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 294  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  51452655 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 51452589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 140 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 2116506 - 2116249
Alignment:
Q  140 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtaaaaat 239  Q
    ||||| |||||||||   ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  2116506 tgctagattcgtgcttttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 2116407  T
Q  240 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattga-gctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 337  Q
    || ||||| ||||||| ||||  ||| | |||| ||||  | ||| | ||| | ||||   | |||||||||  ||||||||||| | | || |||| ||    
T  2116406 gataagttgtgaaaatggtgctcaattggtgaattttgctaagttattgttaatttgatattttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattga 2116307  T
Q  338 tgttgtagctgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaat 395  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||| ||||||||    
T  2116306 tgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgattatgagaat 2116249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 55 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 22228146 - 22227808
Alignment:
Q  55 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatt-atggatgattgttgctaaattcgtgc 153  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||   || ||| |  ||||||  ||||||||||||  | | || ||| |  ||| |||||||||||||||    
T  22228146 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgc 22228047  T
Q  154 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaa 253  Q
    ||   || ||||| ||| ||  | ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  22228046 tcttgctgtgatgttattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaa 22227947  T
Q  254 attgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagctgatga 352  Q
    ||||||   ||| | |||| ||||  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| |  ||| |||| |||||| |   ||||||    
T  22227946 attgtgtccaattgttgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattgatgttatgattgatga 22227847  T
Q  353 atcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatga 391  Q
    || ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||    
T  22227846 ataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatga 22227808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 55 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 22232843 - 22232505
Alignment:
Q  55 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatt-atggatgattgttgctaaattcgtgc 153  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||   || ||| |  ||||||  ||||||||||||  | | || ||| |  ||| |||||||||||||||    
T  22232843 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgc 22232744  T
Q  154 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaa 253  Q
    ||   || ||||| ||| ||  | ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  22232743 tcttgctgtgatgttattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaa 22232644  T
Q  254 attgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagctgatga 352  Q
    ||||||   ||| | |||| ||||  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| |  ||| |||| |||||| |   ||||||    
T  22232643 attgtgtccaattgttgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattgatgttatgattgatga 22232544  T
Q  353 atcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatga 391  Q
    || ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||    
T  22232543 ataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatga 22232505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 53 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 45051759 - 45051554
Alignment:
Q  53 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatt-atggatgattgttgctaaattcgt 151  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| |  |||||  ||||||||||||  | | || ||| |  |||  ||||| ||||||    
T  45051759 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatg-tgattttgca--ttttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagattcgt 45051663  T
Q  152 gctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgaaaagttatga 251  Q
    | ||  ||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||    
T  45051662 gttcttactgtgatgttacgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtga 45051563  T
Q  252 aaattgtgc 260  Q
    |||||||||    
T  45051562 aaattgtgc 45051554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 21860409 - 21860334
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21860409 cataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 21860334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 86
Target Start/End: Original strand, 44034829 - 44034903
Alignment:
Q  12 ataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44034829 ataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 44034903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 140 - 260
Target Start/End: Original strand, 5072388 - 5072508
Alignment:
Q  140 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtaaaaat 239  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| ||||||| |||||||||||||||  || |||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||    
T  5072388 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttatatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 5072487  T
Q  240 gaaaagttatgaaaattgtgc 260  Q
    || |||||||||| |||||||    
T  5072488 gataagttatgaatattgtgc 5072508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 140 - 260
Target Start/End: Original strand, 18601118 - 18601238
Alignment:
Q  140 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtaaaaat 239  Q
    |||||||||| |||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||    
T  18601118 tgctaaattcatgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 18601217  T
Q  240 gaaaagttatgaaaattgtgc 260  Q
    || |||||||||| |||||||    
T  18601218 gataagttatgaatattgtgc 18601238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 27675191 - 27675086
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgtt 112  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |  |  |  ||||||||||||| ||||    
T  27675191 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggagataattaaggtaagggggttagaatttatcataatcgt--ttttagtgtaaattttcaattgtt 27675094  T
Q  113 gtatgaat 120  Q
    ||||||||    
T  27675093 gtatgaat 27675086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 41218803 - 41218728
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||    
T  41218803 cataggagcaaaagtgaagcttgagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagttttcatcatgatcat 41218728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 460 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 51452591 - 51452540
Alignment:
Q  460 attatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgattgatgatgt 511  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  51452591 attatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtagttgattgatgatgt 51452540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 13 - 70
Target Start/End: Original strand, 13376711 - 13376768
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttag 70  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||    
T  13376711 taggagctaaagtgaagtttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggggttag 13376768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 13 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 20177570 - 20177513
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttag 70  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  20177570 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaatggggttag 20177513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 86
Target Start/End: Original strand, 15861327 - 15861358
Alignment:
Q  55 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15861327 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 15861358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 349 - 395
Target Start/End: Original strand, 5072599 - 5072645
Alignment:
Q  349 atgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaat 395  Q
    |||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||    
T  5072599 atgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatgagaat 5072645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 349 - 395
Target Start/End: Original strand, 18601329 - 18601375
Alignment:
Q  349 atgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaat 395  Q
    |||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||    
T  18601329 atgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatgagaat 18601375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 185
Target Start/End: Original strand, 22143361 - 22143402
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa 185  Q
    |||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  22143361 aaattcgtgctctaactatgatgatgtgtttgtatgcatgaa 22143402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 347 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 45051485 - 45051437
Alignment:
Q  347 tgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaat 395  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| |||||| |||||| ||||||||    
T  45051485 tgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatgaattgattatgagaat 45051437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 51452841 - 51452809
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  51452841 taaggtaagggggttagtctttatcttaatcat 51452809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 44)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 11 - 395
Target Start/End: Original strand, 19794586 - 19794972
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatg 110  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  19794586 cataagagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcattattttgtaaattt-caaatg 19794684  T
Q  111 ttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgtt 208  Q
    |||||||||||||   || |||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19794685 ttgtatgaatttttgcataatggataattgtcgttaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgtt 19794784  T
Q  209 ggttaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattct 307  Q
    ||| |||||||||||| ||||| | | |||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  19794785 ggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagttatgattct 19794884  T
Q  308 tgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagctgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaat 395  Q
    ||| ||||||||||| ||   | |||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  19794885 tgttcaattgatgttatttccgttaattgatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatgagaat 19794972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 11 - 391
Target Start/End: Original strand, 20627195 - 20627577
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaa-ttttcaaat 109  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20627195 cataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaacggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaaattttcaaat 20627294  T
Q  110 gttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttg 209  Q
     ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  20627295 attgtatgaattatgattatggataattgttgttaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcacgaattgatgataattgtatgattgttg 20627394  T
Q  210 gttaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattctt 308  Q
    || |||||||||||  |||||||||||||||| || || ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||| | ||||| | | ||||||    
T  20627395 gtgaaattacatgtccaaatatgtaaaaatgataacttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgttaagttgttgttaatttgagatttaattctt 20627494  T
Q  309 gtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagctgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatga 391  Q
    || |||||||| || | | || |||| | |||||| | ||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||| |||||    
T  20627495 gttcaattgattttatggttgttaattggtgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatggatattcatgaattgaggatga 20627577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 54 - 395
Target Start/End: Original strand, 36982364 - 36982709
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcatttt-gtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcg 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||||    
T  36982364 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcatttttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcg 36982463  T
Q  151 tgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgaaaagttatg 250  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||    
T  36982464 tgctccaactgtgatgatatgtttgtattcatgaattgatgataattgtaagattgctggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtg 36982563  T
Q  251 aaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagctga 349  Q
    ||||||||||  ||| | |||| |||| || ||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||| || |||| |||||||| | |||    
T  36982564 aaaattgtgctcaattggtgaattttgccaagttgttgttgaattgagttatgattcctgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttgttgttga 36982663  T
Q  350 tgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaat 395  Q
    |||||||||| |||||||| ||| |||||| |||||||||||||||    
T  36982664 tgaatcattgtttgggtatgcatattcatgaattgatgatgagaat 36982709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 11 - 391
Target Start/End: Original strand, 43642838 - 43643221
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatg 110  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  43642838 cataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaagggaaggaggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaattttcaaatg 43642937  T
Q  111 ttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgtt 208  Q
    |||||||||||||   ||  ||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  43642938 ttgtatgaatttttgcatagtggataattgttgctaaatttgtgctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgtt 43643037  T
Q  209 ggttaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacat-gttgtagttgaattgagctatgattct 307  Q
    ||| |||||||||||| ||||| | | |||||  ||||| ||||||||||||  ||| | |||||||  | | |||||  || | ||||| |||||||||    
T  43643038 ggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgttaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaatttttcttagttgttattaatttgagatatgattct 43643137  T
Q  308 tgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagctgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatga 391  Q
    ||| ||||||||| | ||| || |||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| |||||| |||||||||||    
T  43643138 tgttcaattgatgctattgctgttaattgatgttgtagttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatga 43643221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 54 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 463075 - 462733
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  463075 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgc 462976  T
Q  154 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaa 253  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||    
T  462975 tccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaa 462876  T
Q  254 attgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagctgatga 352  Q
    ||||||   ||| | |||| ||||  | ||||| |||  |||||| |||||||||||| ||||||||||| | | || |||| ||||| ||   ||||||    
T  462875 attgtgttcaattggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgtcgtgattgatga 462776  T
Q  353 atcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaat 395  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||| |||||    
T  462775 atcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggataagaat 462733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 54 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 8891581 - 8891237
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgt 151  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||||||    
T  8891581 taaggtaaaggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgt 8891482  T
Q  152 gctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgaaaagttatga 251  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||| | | |||||| ||||| |||    
T  8891481 gctccaactgtgataatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggcgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtga 8891382  T
Q  252 aaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagctgat 350  Q
    |||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| |||  |||||| |||||||||||| ||||||||||| | | |  |||| |||||||| | ||||    
T  8891381 aaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctattaattgatgttgtggttgat 8891282  T
Q  351 gaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaat 395  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||    
T  8891281 gaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatgagaat 8891237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 128 - 294
Target Start/End: Original strand, 19689401 - 19689567
Alignment:
Q  128 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 227  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19689401 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 19689500  T
Q  228 atatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 294  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19689501 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 19689567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 128 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 23820334 - 23820168
Alignment:
Q  128 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 227  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23820334 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 23820235  T
Q  228 atatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 294  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23820234 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 23820168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 128 - 294
Target Start/End: Original strand, 14906440 - 14906606
Alignment:
Q  128 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 227  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14906440 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 14906539  T
Q  228 atatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 294  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14906540 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 14906606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 54 - 391
Target Start/End: Original strand, 24341309 - 24341653
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcat----tttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatta--tggatgattgttgctaaat 147  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    |||| || ||||||||||| |||||||||||   ||  ||||| |||||||||||||    
T  24341309 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcatcatttttgcaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgttgctaaat 24341408  T
Q  148 tcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgaaaagtt 247  Q
    || |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||  |||||    
T  24341409 tcatgcttcaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattatatgttcaattatgtaaaaatgtgaagtt 24341508  T
Q  248 atgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagc 346  Q
     ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||| || |||| ||||||   |     
T  24341509 gtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttcctgt 24341608  T
Q  347 tgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatga 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  24341609 tgatgaatcattgcttgggtatacatattcatgaattgatgatga 24341653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 128 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 20015274 - 20015108
Alignment:
Q  128 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 227  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  20015274 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgcatgcatgaattgataataattgtgtgattgttggttaaattacatgtttga 20015175  T
Q  228 atatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 294  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20015174 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 20015108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 128 - 395
Target Start/End: Original strand, 25265390 - 25265658
Alignment:
Q  128 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 227  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  25265390 atggataattgttgctaaattcgtgctctaactttgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 25265489  T
Q  228 atatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttg 326  Q
     ||||||||||||  ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  ||||||| ||||||||  | |  ||  | ||| |||||||||||||||    
T  25265490 ttatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttg 25265589  T
Q  327 atgctaatagatgttgtagctgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaat 395  Q
     || |||| |||||||| | | ||||||||| |||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||    
T  25265590 ttgttaattgatgttgttgtttatgaatcatggcttgggtatgcatattcatgaattgatgatgagaat 25265658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 128 - 260
Target Start/End: Original strand, 17396653 - 17396784
Alignment:
Q  128 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 227  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | || ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17396653 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtt-gtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaa 17396751  T
Q  228 atatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 260  Q
    ||| |||||||||| |||||||||| |||||||    
T  17396752 ataagtaaaaatgataagttatgaatattgtgc 17396784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 178 - 391
Target Start/End: Original strand, 7507894 - 7508108
Alignment:
Q  178 tgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttga 277  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||   ||| | ||||||||     
T  7507894 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttatgaaaattgtgttcaattggtgaatttgg 7507993  T
Q  278 c-atgttgtagttgaattgagctatgattcttg-tgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagctgatgaatcattgcttgggtatacatgtt 375  Q
    | | ||||| ||| ||||||| |||||||| || |  |||||||||| ||| || || | |||||||| | |||||||||| ||||||||||| ||| ||    
T  7507994 ctaagttgttgtt-aattgagatatgattcatgttttaattgatgttattgttgttatttgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatatt 7508092  T
Q  376 catggattgatgatga 391  Q
    ||||||||||||||||    
T  7508093 catggattgatgatga 7508108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 54 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 22863267 - 22863169
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttt--gattatggatgattgttgctaaattcg 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||||    
T  22863267 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaattgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcg 22863169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 140 - 395
Target Start/End: Original strand, 19886661 - 19886918
Alignment:
Q  140 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtaaaaat 239  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||| |||| |    
T  19886661 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 19886760  T
Q  240 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 337  Q
    || |||||||||| ||||||| |||  | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||    
T  19886761 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 19886860  T
Q  338 tgttgtagctgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaat 395  Q
    | || |   |||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  19886861 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatgagaat 19886918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 22275120 - 22275045
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22275120 cataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagcctttatcataatcat 22275045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 22284353 - 22284278
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22284353 cataggagcaaaagtgaagttagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 22284278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 15633612 - 15633538
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatca 85  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15633612 cataggagcaaaagtgaagctagagttaatagttggagataattaaggtaaggaggttagtctttatcataatca 15633538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 460 - 511
Target Start/End: Original strand, 14906604 - 14906655
Alignment:
Q  460 attatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgattgatgatgt 511  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14906604 attatgatggagggtatgattatatgttatgattgtagttgattgatgatgt 14906655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 460 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 20015110 - 20015059
Alignment:
Q  460 attatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgattgatgatgt 511  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20015110 attatgatggagggtatgattatatgttatgattgtagttgattgatgatgt 20015059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 460 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 23820170 - 23820119
Alignment:
Q  460 attatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgattgatgatgt 511  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23820170 attatgatggagggtatgattatatgttatgattgtagttgattgatgatgt 23820119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 43646289 - 43646232
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttag 70  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||    
T  43646289 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggggttag 43646232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 12728731 - 12728529
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatt-atggatgattgttgctaaattcgtg 152  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||   || ||| |  ||||||  ||||||||||||  | | || ||| |  ||||||||||||||||||    
T  12728731 taaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtg 12728632  T
Q  153 ctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgttt--aaatatgtaaaaatgaaaagttatg 250  Q
    |||   || ||||| ||| ||  | ||||||||||||| || || ||||| |||| ||| |||||||||||||  || |||||| |||||  ||||||||    
T  12728631 ctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatg 12728532  T
Q  251 aaa 253  Q
    |||    
T  12728531 aaa 12728529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 460 - 495
Target Start/End: Original strand, 19689565 - 19689600
Alignment:
Q  460 attatgatggagtgtatgattatatgttatgattgt 495  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19689565 attatgatggagtgtatgattatatgttatgattgt 19689600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 34824814 - 34824612
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatt-atggatgattgttgctaaattcgtg 152  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||   || ||| |  ||||||  ||||||||||||  | | || ||| |  ||||||||||||||||||    
T  34824814 taaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtg 34824715  T
Q  153 ctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgttt--aaatatgtaaaaatgaaaagttatg 250  Q
    |||   || ||||| ||| ||  | ||||||||||||| || || ||||| |||| ||| |||||||||||||  || |||||| |||||  ||||||||    
T  34824714 ctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatg 34824615  T
Q  251 aaa 253  Q
    |||    
T  34824614 aaa 34824612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 53 - 86
Target Start/End: Original strand, 19689314 - 19689347
Alignment:
Q  53 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19689314 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 19689347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 9652796 - 9652828
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9652796 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 9652828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 14906354 - 14906386
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14906354 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 14906386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 19660273 - 19660221
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg 65  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | |||| ||||||||||||||||||    
T  19660273 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggg 19660221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 23820420 - 23820388
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23820420 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 23820388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 25213403 - 25213372
Alignment:
Q  55 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25213403 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 25213372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 19666921 - 19666848
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||| | || | | |||||||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  19666921 taggagctaaagtgaagtttgggctaggaatttgtgctaattaaggtaagggggttagaattcatcataatcat 19666848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 253
Target Start/End: Original strand, 23778048 - 23778164
Alignment:
Q  139 ttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgttt--aaatatgtaaa 236  Q
    |||||||||||||||||   || ||||| ||| ||  ||||||||||||||| || || ||||| |||| | | |||||||||||||  || |||||| |    
T  23778048 ttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttatgcatgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatgtttcaaagtatgtata 23778147  T
Q  237 aatgaaaagttatgaaa 253  Q
    ||||  |||||||||||    
T  23778148 aatgttaagttatgaaa 23778164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 24884933 - 24884852
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcat-gaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtt 224  Q
    ||||| |||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| | ||||||| ||  |||||||| ||||| ||||||    
T  24884933 aaatttgtgctctaactatgatgatatgtttgaatgcatggaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgtt 24884852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 25305826 - 25305769
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttag 70  Q
    |||||| |||||||||||| | ||||  | |||| |||||||||||||||||||||||    
T  25305826 taggagttaaagtgaagcttgggctatgaattggtgataattaaggtaagggggttag 25305769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 120
Target Start/End: Original strand, 31146032 - 31146138
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaa-tgt 111  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||    | ||  ||| |||||||||||||||||  || |||||||||||| |  || |||||||||||||| |||    
T  31146032 taggagctaaagtgaagcttgggctagagaattgatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatctt--ttgtgtaaattttcaaattgt 31146129  T
Q  112 tgtatgaat 120  Q
    |||||||||    
T  31146130 tgtatgaat 31146138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 145 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 68238 - 68158
Alignment:
Q  145 aattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtt 224  Q
    |||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||||||| ||| | ||||||| ||  |||||||| ||||| ||||||    
T  68238 aattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgtt 68158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 7507757 - 7507789
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7507757 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 7507789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 17396567 - 17396599
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17396567 taaggtaagggggttagtctttaccataatcat 17396599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 20015360 - 20015328
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20015360 taaggtaagggggttagtctttatcatgatcat 20015328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 28031134 - 28031166
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28031134 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 28031166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 33128404 - 33128372
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33128404 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 33128372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 145 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 43646139 - 43646055
Alignment:
Q  145 aattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaa 228  Q
    ||||||||||| || | || ||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||| ||  |||||||| ||||| ||||||||||    
T  43646139 aattcgtgctctaattatgttgatatgtttgaatgcatgaagttgttgataattggattgttgttggtgaaatttcatgtttaaa 43646055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 4)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 54 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 48935 - 48593
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  48935 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgc 48836  T
Q  154 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaa 253  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| | |||||||| ||||| |||||    
T  48835 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaaaaaatgataagttgtgaaa 48736  T
Q  254 attgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagctgatga 352  Q
    |||||||  | | | |||| ||||  | ||||| | |  |||||| |||||||||||| ||||||||||| | | |  |||| |||||||| | ||||||    
T  48735 attgtgctcagttggtgaattttgctaagttgttgctagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctattaattgatgttgtggttgatga 48636  T
Q  353 atcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaat 395  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||    
T  48635 atcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatgagaat 48593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 162 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 36323 - 36088
Alignment:
Q  162 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgca 261  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||| ||||||||| || | ||||| |||||||| |||||||||| |||||||     
T  36323 tgatgttatgtttgtatgtatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatattcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgct 36224  T
Q  262 aaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagctgatgaatcattg 359  Q
    |||| | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||||| ||| |||| |||||| |  ||| || | |||  | |   |||||||| ||||    
T  36223 aaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgattcatgttcaatagatgttatgaatgttatttgataatatgattgatgaataattg 36124  T
Q  360 cttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaat 395  Q
    ||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||    
T  36123 cttgggtttgcatattcatggattgatgatgagaat 36088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 54 - 253
Target Start/End: Original strand, 153924 - 154126
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatt-atggatgattgttgctaaattcgtg 152  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||   || ||| |  ||||||  ||||||||||||  | | || ||| |  ||||||||||||||||||    
T  153924 taaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtg 154023  T
Q  153 ctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgttt--aaatatgtaaaaatgaaaagttatg 250  Q
    |||   || ||||| ||| ||  | ||||||||||||| || || ||||| |||| ||| || ||||||||||  || |||||| |||||  ||||||||    
T  154024 ctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaagttacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatg 154123  T
Q  251 aaa 253  Q
    |||    
T  154124 aaa 154126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 61122 - 61154
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  61122 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 61154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 54 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 1462 - 1119
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgt-aaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtg 152  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  1462 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaattttcaaatgttgtatgaatttttcttatggataattgttgctaaattcgtg 1363  T
Q  153 ctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaa 252  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||    
T  1362 ctccaactttgatgatatgttagtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaa 1263  T
Q  253 aattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagctgatg 351  Q
    ||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | | || |||| ||| |||| | |||||    
T  1262 aattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatattgtggttgatg 1163  T
Q  352 aatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaat 395  Q
    ||| ||||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||    
T  1162 aataattgcttgggtgtgcatattcatgaattgatgatgagaat 1119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 54 - 393
Target Start/End: Original strand, 3508 - 3848
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 153  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  3508 taaggtaagggggttagtctttgtcataatcatcttcattttgtaaattttcaaaagttgtatgaattttgattatagataattgttgctaaattcgtgc 3607  T
Q  154 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaa 253  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||    
T  3608 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaa 3707  T
Q  254 attgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagctgatga 352  Q
    |||||||  ||| | | || ||||  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | |||| |||| ||||||||   ||| ||    
T  3708 attgtgctcaattggtaaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaattgatgttgtgattgagga 3807  T
Q  353 atcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgaga 393  Q
    || ||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||    
T  3808 ataattgcttgggtatgcatattgatggattgatgaggaga 3848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 2)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 57 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 19543 - 19201
Alignment:
Q  57 ggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcatttt-gtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgtgc 153  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||||||||    
T  19543 ggtaagggggttagtcttcatcataatcatcataatttttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgtgc 19444  T
Q  154 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaa 253  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||    
T  19443 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaa 19344  T
Q  254 attgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagctgatga 352  Q
    |||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||| || |||| |||||||| | ||||||    
T  19343 attgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagttatgattcctgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatga 19244  T
Q  353 atcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaat 395  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||    
T  19243 atcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatgagaat 19201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 128 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 21553 - 21285
Alignment:
Q  128 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 227  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||    
T  21553 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaa 21454  T
Q  228 atatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttg 326  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||    
T  21453 atatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagttatgattcctgttcaattgatgttattg 21354  T
Q  327 atgctaatagatgttgtagctgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaat 395  Q
     || |||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||    
T  21353 ctgttaattgatgttgttgttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatgagaat 21285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 183; Significance: 9e-99; HSPs: 2)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 53 - 395
Target Start/End: Original strand, 36836 - 37181
Alignment:
Q  53 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcg 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||| ||||||||    
T  36836 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgttaaattcg 36935  T
Q  151 tgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgaaaagttatg 250  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||    
T  36936 tgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagcttgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtg 37035  T
Q  251 aaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagctga 349  Q
    |||||||||| |||| | |||| ||||  | ||||| |||| |||||| ||||| |||||| ||||||| ||| | | || |||| |||||||| | |||    
T  37036 aaaattgtgctaaattggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgaatcttgttcaattgacgttatggctgttaattgatgttgtggttga 37135  T
Q  350 tgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaat 395  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||    
T  37136 tgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatgagaat 37181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 85
Target Start/End: Original strand, 15324 - 15398
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatca 85  Q
    ||||||||| ||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  15324 cataggagcaaaagtgaagcttgggctaatagttggagataattaaggtaagggggttagcattcatcataatca 15398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 183; Significance: 9e-99; HSPs: 49)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 54 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 23507302 - 23506960
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  23507302 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatctccattttgtaagatttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgc 23507203  T
Q  154 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaa 253  Q
    ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||    
T  23507202 tccatttgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaa 23507103  T
Q  254 attgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagctgatga 352  Q
    |||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||||| | ||||||    
T  23507102 attgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatga 23507003  T
Q  353 atcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaat 395  Q
    || ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||    
T  23507002 ataattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatgagaat 23506960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 54 - 395
Target Start/End: Original strand, 27182471 - 27182815
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgt 151  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||| |    
T  27182471 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcat 27182570  T
Q  152 gctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgaaaagttatga 251  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| | | |||||| ||||| |||    
T  27182571 gctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaactgatgataattgtatgattgttgatgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtga 27182670  T
Q  252 aaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagctgat 350  Q
    |||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| |||  |||||| |||||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||||| | ||||    
T  27182671 aaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgat 27182770  T
Q  351 gaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaat 395  Q
    ||||||||||||| |||| ||| |||||| |||||||||||||||    
T  27182771 gaatcattgcttgagtatgcatattcatgaattgatgatgagaat 27182815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 54 - 391
Target Start/End: Original strand, 18530988 - 18531331
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatc---atcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaat-tttgattat-ggatgattgttgctaaatt 148  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||| || || |||| ||||||||||||||    
T  18530988 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcgtcatcatcattttgcaatttttcaaatgtggtatgaatgtttcataattggataattgttgctaaatt 18531087  T
Q  149 cgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgaaaagtta 248  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||  |||||     
T  18531088 cgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttg 18531187  T
Q  249 tgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagct 347  Q
    |||||||||||   ||| | |||| ||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||| || |||| |||||||| | |    
T  18531188 tgaaaattgtgttcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgtt 18531287  T
Q  348 gatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatga 391  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||    
T  18531288 gatgaatcattgctcgggtatacatattcatgaattgatgatga 18531331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 54 - 391
Target Start/End: Original strand, 22053753 - 22054097
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcat----tttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatta--tggatgattgttgctaaat 147  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    |||| || ||||||||||| |||||||||||   ||  ||||| |||||||||||||    
T  22053753 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcatcatttttgaaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgttgctaaat 22053852  T
Q  148 tcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgaaaagtt 247  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||  |||||    
T  22053853 tcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgtatgaattgatgatagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagtt 22053952  T
Q  248 atgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagc 346  Q
     ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||| || |||| |||||||| |     
T  22053953 gtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgt 22054052  T
Q  347 tgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatga 391  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||    
T  22054053 tgatgaatcattgcttgggtctacatattcatgaattgatgatga 22054097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 128 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 20623232 - 20623066
Alignment:
Q  128 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 227  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20623232 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 20623133  T
Q  228 atatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 294  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20623132 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 20623066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 128 - 294
Target Start/End: Original strand, 21233528 - 21233694
Alignment:
Q  128 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 227  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21233528 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 21233627  T
Q  228 atatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 294  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21233628 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 21233694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 128 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 16536460 - 16536294
Alignment:
Q  128 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 227  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16536460 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaatttataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 16536361  T
Q  228 atatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 294  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16536360 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 16536294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 128 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 37053007 - 37052844
Alignment:
Q  128 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 227  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  37053007 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 37052908  T
Q  228 atatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttga 291  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37052907 atatgtggaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttga 37052844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 130 - 294
Target Start/End: Original strand, 25900408 - 25900571
Alignment:
Q  130 ggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaat 229  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  25900408 ggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggttaaattatatgtttgaat 25900507  T
Q  230 atgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 294  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  25900508 atgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-ttgacatgttgttgttgaatt 25900571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 128 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 34939540 - 34939289
Alignment:
Q  128 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 227  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||    
T  34939540 atggataactgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaa 34939441  T
Q  228 atatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggat-gaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttg 326  Q
     ||||||||||||  ||||||||||||||||||  ||| ||| || ||||  | ||  | | ||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||    
T  34939440 ttatgtaaaaatgtgaagttatgaaaattgtgctcaattgatggattttgctaagtcattg-tgaattgagttatgattcttgttcagttgatgttattg 34939342  T
Q  327 atgctaatagatgttgtagctgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatg 379  Q
     || |||| |||||||| | |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||    
T  34939341 ctgttaattgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatg 34939289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 140 - 260
Target Start/End: Original strand, 29188284 - 29188404
Alignment:
Q  140 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtaaaaat 239  Q
    ||||| ||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  29188284 tgctagattcgtgctcttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 29188383  T
Q  240 gaaaagttatgaaaattgtgc 260  Q
    || ||||| ||||||| ||||    
T  29188384 gataagttgtgaaaatggtgc 29188404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 140 - 395
Target Start/End: Original strand, 4199985 - 4200242
Alignment:
Q  140 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtaaaaat 239  Q
    ||||||||||||||||    | ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||    
T  4199985 tgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 4200084  T
Q  240 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 337  Q
    || |||||||||| ||| ||| |||| | |||||||  |  ||||||| ||||| ||||| | |||||| ||| ||||||||||| |  ||| || | ||    
T  4200085 gataagttatgaatattatgctaaattggtgaatttctcttatgttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttga 4200184  T
Q  338 tgttgtagctgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaat 395  Q
    | || |   |||||||| ||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  4200185 tattatgattgatgaatgattgcttgggtttgcatattcatgggttgatgatgagaat 4200242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 140 - 395
Target Start/End: Original strand, 22366481 - 22366738
Alignment:
Q  140 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtaaaaat 239  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||    
T  22366481 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 22366580  T
Q  240 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 337  Q
    || |||||||||| ||||||| |||| | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||| ||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||    
T  22366581 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 22366680  T
Q  338 tgttgtagctgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaat 395  Q
    | || |   |||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  22366681 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatgagaat 22366738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 140 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 25426880 - 25426623
Alignment:
Q  140 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtaaaaat 239  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||    
T  25426880 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 25426781  T
Q  240 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 337  Q
    || |||||||||| ||||||| |||  | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||    
T  25426780 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 25426681  T
Q  338 tgttgtagctgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaat 395  Q
    | || |   |||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  25426680 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatgagaat 25426623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 143 - 395
Target Start/End: Original strand, 18777995 - 18778249
Alignment:
Q  143 taaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgaa 242  Q
    |||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||||     
T  18777995 taaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgat 18778094  T
Q  243 aagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgt 340  Q
    |||||||||| ||||||| |||| | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |  ||  || | ||| |    
T  18778095 aagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatattatttgatat 18778194  T
Q  341 tgtagctgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaat 395  Q
    | |   |||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  18778195 tatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatgagaat 18778249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 140 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 12626 - 12369
Alignment:
Q  140 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtaaaaat 239  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||| |||| |    
T  12626 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 12527  T
Q  240 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 337  Q
    || |||||||||| ||||||| |||  | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||    
T  12526 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 12427  T
Q  338 tgttgtagctgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaat 395  Q
    | || |   |||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  12426 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatgagaat 12369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 144 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 27010089 - 27009975
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgaaa 243  Q
    ||||||||||||   || ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27010089 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgagtgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgata 27009990  T
Q  244 agttatgaaaattgt 258  Q
    ||||||||| |||||    
T  27009989 agttatgaatattgt 27009975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 140 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 19500151 - 19499894
Alignment:
Q  140 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtaaaaat 239  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||    
T  19500151 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 19500052  T
Q  240 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 337  Q
    || |||||||||| ||||||| |||  | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||    
T  19500051 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 19499952  T
Q  338 tgttgtagctgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaat 395  Q
    | || |   |||| ||| ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  19499951 tattatgattgattaataattgctttggtatgcatattcatggattgatgatgagaat 19499894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 140 - 395
Target Start/End: Original strand, 21073595 - 21073852
Alignment:
Q  140 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtaaaaat 239  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| ||||||||||||||||||| |||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||    
T  21073595 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaatggatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 21073694  T
Q  240 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatt--tgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 337  Q
    || |||||||||| ||||||| |||  | ||||||  |   | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||    
T  21073695 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttcttctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatcaatgttatttga 21073794  T
Q  338 tgttgtagctgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaat 395  Q
    | || |   |||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  21073795 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatgagaat 21073852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 143 - 392
Target Start/End: Original strand, 43443398 - 43443649
Alignment:
Q  143 taaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgaa 242  Q
    |||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||||     
T  43443398 taaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgat 43443497  T
Q  243 aagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatt--tgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgt 340  Q
    |||||||||| |||||||  ||| | ||||||  |   | ||||| ||||| ||||| | ||| |||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||| |    
T  43443498 aagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttcttctaagttgttgttgatttgagatgtgagtcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatat 43443597  T
Q  341 tgtagctgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgag 392  Q
    | |   |||||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||    
T  43443598 tatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatgag 43443649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 460 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 20623068 - 20623017
Alignment:
Q  460 attatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgattgatgatgt 511  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20623068 attatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgattgatgatgt 20623017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 460 - 511
Target Start/End: Original strand, 21233692 - 21233743
Alignment:
Q  460 attatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgattgatgatgt 511  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21233692 attatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgattgatgatgt 21233743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 461 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 37052842 - 37052792
Alignment:
Q  461 ttatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgattgatgatgt 511  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37052842 ttatgatggagggtatgattatatgttatgattgtggttgattgatgatgt 37052792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 460 - 511
Target Start/End: Original strand, 25900569 - 25900620
Alignment:
Q  460 attatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgattgatgatgt 511  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25900569 attatgatggagggtatgattatatgttatgattgtagttgattgatgatgt 25900620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 11584448 - 11584374
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatca 85  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  11584448 cataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagaattcatcataatca 11584374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 32950951 - 32950689
Alignment:
Q  135 attgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgttt--aaatatg 232  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||| || || || |||| ||||| |||||||||||||||| | | |||||||||||||  || ||||    
T  32950951 attgttgttaaattcgtgctctaactgtgatgttattttcgtgtgtatgatttgatgataattgtatgattgtggttgaaattacatgtttcaaagtatg 32950852  T
Q  233 taaaaatg-aaaagttatgaaaattgtgc-aaaatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatg 329  Q
    || ||| |  ||||||||| |||||||||  |||||| ||||||| || ||||||| ||||||  ||| | |||||| ||| | |||||||||| || |     
T  32950851 tataaaggtcaaagttatg-aaattgtgctcaaatgg-tgaattttactatgttgttgttgaaaagagatgtgattcatgttccattgatgttgatgcta 32950754  T
Q  330 ctaatagatgttgtagctgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaa 394  Q
     |||  |||||||| |  | ||||||||  ||||||| | ||| |||||||||||| ||||||||    
T  32950753 ttaactgatgttgttgtgggtgaatcatgacttgggtctgcatattcatggattgaagatgagaa 32950689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 460 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 16536296 - 16536245
Alignment:
Q  460 attatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgattgatgatgt 511  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16536296 attatgatggagggtatgattgtatgttatgattgtagttgattgatgatgt 16536245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 394
Target Start/End: Original strand, 35791015 - 35791359
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatt-atggatgattgttgctaaattcgtg 152  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||   || ||| |  ||||||  ||||||||||||  | | || ||| |  ||||||||||||||||||    
T  35791015 taaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtg 35791114  T
Q  153 ctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaa--tatgtaaaaatgaaaagttatg 250  Q
    |||   || ||||| ||| ||  | ||||||||||||| || || ||||| ||||  || ||||||||||||| ||  |||||| |||||  ||||||||    
T  35791115 ctcttgctgtgatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgagtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatg 35791214  T
Q  251 aaaattgtgcaaaatggatgaa--tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagctg 348  Q
    | | || | |  ||| ||||||  ||||| ||||||| |||||| |||| | |||||| ||| | ||||||||||||| |  |||  |||||||| |  |    
T  35791215 aga-ttatacttaattgatgaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccattgatgttgttgctattaactgatgttgttgagg 35791313  T
Q  349 atgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaa 394  Q
     ||||| ||  |||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  35791314 gtgaattatgacttgggtatacataattatggattgatgatgagaa 35791359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 279 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 23494029 - 23493913
Alignment:
Q  279 atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagctgatgaatcattgcttgggtatacat-gttca 377  Q
    ||||||| ||||||||| | || ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||| | |||||| |||| |||||||| | |||  ||||    
T  23494029 atgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgatgattcatggcttgggtgttcataattca 23493930  T
Q  378 tggattgatgatgagaa 394  Q
    ||  |||||||||||||    
T  23493929 tgatttgatgatgagaa 23493913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 23514900 - 23514698
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatt-atggatgattgttgctaaattcgtg 152  Q
    ||||||||||||||||||  | |||||||||||  ||| ||| |  ||||||  ||||||||||||  | | || ||| |  ||||||||||||||||||    
T  23514900 taaggtaagggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtg 23514801  T
Q  153 ctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgttt--aaatatgtaaaaatgaaaagttatg 250  Q
    |||   || ||||| ||| ||  | ||||||||||||| || || ||||| |||| ||| |||||||||||||  || |||||| |||||  ||||||||    
T  23514800 ctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatg 23514701  T
Q  251 aaa 253  Q
    |||    
T  23514700 aaa 23514698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 13 - 86
Target Start/End: Original strand, 5450695 - 5450768
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | |||   ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  5450695 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattgataataattaaggtaagggggttagaattcatcataatcat 5450768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 135 - 253
Target Start/End: Original strand, 10777969 - 10778089
Alignment:
Q  135 attgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgttt--aaatatg 232  Q
    |||||||||||||||||||||   || ||||| ||| ||  | ||||||||||||| || || ||||| |||| ||| |||||||||||||  || ||||    
T  10777969 attgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatg 10778068  T
Q  233 taaaaatgaaaagttatgaaa 253  Q
    || |||||  |||||||||||    
T  10778069 tataaatgttaagttatgaaa 10778089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 13 - 70
Target Start/End: Original strand, 21222462 - 21222519
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttag 70  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | |||| ||||||||||||| |||||||||    
T  21222462 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtatgggggttag 21222519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 144 - 224
Target Start/End: Original strand, 21310709 - 21310790
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatg-aattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtt 224  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||||| | ||||||| ||  |||||||| ||||| ||||||    
T  21310709 aaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgtt 21310790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 144 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 29918212 - 29918131
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatg-aattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtt 224  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||| || |||| ||||||| ||||||| ||  |||||||| ||||| ||||||    
T  29918212 aaattcgtgctccaattatgatgatatgtttgaatacatgaaattgatgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgtt 29918131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 16105999 - 16105967
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16105999 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 16105967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 20623318 - 20623286
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20623318 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 20623286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 21233442 - 21233474
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21233442 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 21233474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 25900320 - 25900352
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25900320 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 25900352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 347 - 395
Target Start/End: Original strand, 29190483 - 29190531
Alignment:
Q  347 tgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaat 395  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||| ||||||||    
T  29190483 tgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgattatgagaat 29190531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 37053093 - 37053061
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37053093 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 37053061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 54 - 253
Target Start/End: Original strand, 1219437 - 1219639
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatt-atggatgattgttgctaaattcgtg 152  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||   || ||| |  ||||||  ||||||||||||  | | || ||| |  ||||||||||||||||||    
T  1219437 taaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtg 1219536  T
Q  153 ctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgttt--aaatatgtaaaaatgaaaagttatg 250  Q
    |||   || ||||| ||| ||  | ||||| ||||||| || || ||||| |||| ||| |||||||||||||  || |||||| |||||  ||||||||    
T  1219537 ctcttgctgtgatgctattttcttgtgcattaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatg 1219636  T
Q  251 aaa 253  Q
    |||    
T  1219637 aaa 1219639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 366
Target Start/End: Original strand, 23981516 - 23981740
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatg-aattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaa-tatgtaaaaatga 241  Q
    |||||||||||| || | |||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| ||  |||||||| || || |||||| ||| |||||| |||||     
T  23981516 aaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgtatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaatttgcatgttcaaagtatgtataaatgt 23981615  T
Q  242 aaagttatgaaaattgtgc-aaaatggatgaatt-tgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatg 339  Q
     || |||||  |||| |||  |||||| |||||| ||| ||||||| ||||||||  | |  ||  | ||| ||||||||||||||| ||||||  |||     
T  23981616 taacttatg--aattatgctcaaatggttgaattatgatatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgata 23981713  T
Q  340 ttgtagctgatgaatcattgcttgggt 366  Q
    |||| | |||||| |||| ||||||||    
T  23981714 ttgttgttgatgattcatggcttgggt 23981740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 349 - 395
Target Start/End: Original strand, 17471803 - 17471849
Alignment:
Q  349 atgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaat 395  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |||||| |||||||||||||||    
T  17471803 atgaatcattgcttgggtacgcatattcatgaattgatgatgagaat 17471849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 19862456 - 19862375
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtt 224  Q
    |||||||||||| || | |||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||| ||  |||||||| ||||| ||||||    
T  19862456 aaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgtt 19862375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 108728 - 108760
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  108728 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 108760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 279 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 7728530 - 7728466
Alignment:
Q  279 atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgt 343  Q
    ||||||| ||||||||| | || ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  7728530 atgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgt 7728466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 9730278 - 9730310
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9730278 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 9730310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 16536546 - 16536514
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16536546 taagataagggggttagtctttatcataatcat 16536514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 179; Significance: 2e-96; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 54 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 172242 - 171916
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  172242 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtataaattttgattatggataactgttgctaaatacgtgc 172143  T
Q  154 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaa 253  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| | | |||||| ||||| |||||    
T  172142 tccaactgtgatgatatgtttgtatggatgaattgatgataattgtatgattgatggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaa 172043  T
Q  254 attgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagctgatga 352  Q
    ||||||| |||| | |||| ||||  | ||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||||| | ||||||    
T  172042 attgtgctaaattggtgaattttgctaagttgtggttgaattgagttacgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatga 171943  T
Q  353 atcattgcttgggtatacatgttcatg 379  Q
    |||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  171942 atcattgcttaggtatgcatattcatg 171916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 54 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 177945 - 177619
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  177945 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtataaattttgattatggataactgttgctaaatacgtgc 177846  T
Q  154 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaa 253  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| | | |||||| ||||| |||||    
T  177845 tccaactgtgatgatatgtttgtatggatgaattgatgataattgtatgattgatggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaa 177746  T
Q  254 attgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagctgatga 352  Q
    ||||||| |||| | |||| ||||  | ||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||||| | ||||||    
T  177745 attgtgctaaattggtgaattttgctaagttgtggttgaattgagttacgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatga 177646  T
Q  353 atcattgcttgggtatacatgttcatg 379  Q
    |||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  177645 atcattgcttaggtatgcatattcatg 177619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 175; Significance: 5e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 54 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 42066 - 41724
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 153  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  42066 taaggtaagggggttggtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgc 41967  T
Q  154 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaa 253  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||| || || |||||    
T  41966 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtcatattgttggtgaaattacatgctcaaatatgtaaaaatgataatttgtgaaa 41867  T
Q  254 attgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagctgatga 352  Q
    |||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| |||  |||||| |||||||||||| ||||||||| | | | || |||| | |||||||| ||||||    
T  41866 attgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgctatggctgttaattgttgttgtagatgatga 41767  T
Q  353 atcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaat 395  Q
    ||||||| |||||||| ||| |||||| |||||| || |||||    
T  41766 atcattggttgggtatgcatattcatgaattgattattagaat 41724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 171; Significance: 1e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 54 - 391
Target Start/End: Original strand, 882 - 1219
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  882 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcttcactttacaaattctcaaatgttgtatgaattgtgattatggataattgttgctaaattcgtgc 981  T
Q  154 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaa 253  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | ||||| |||||    
T  982 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttgtgaaa 1081  T
Q  254 attgtgcaaaatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagctgatga 352  Q
    |||||||  ||| |||||||||  | | ||||| ||| ||||||| | | |||||||| ||| ||||||| | |||| ||||  ||||| |   ||||||    
T  1082 attgtgctcaattgatgaattttgctaagttgttgtt-aattgagattttattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatga 1180  T
Q  353 atcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatga 391  Q
    || ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  1181 ataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatga 1219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 170; Significance: 5e-91; HSPs: 42)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 54 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 23153786 - 23153442
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgt 151  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||| ||||||||||    
T  23153786 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgtttctaaattcgt 23153687  T
Q  152 gctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgaaaagttatga 251  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| | | |||||| ||||| |||    
T  23153686 gctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtga 23153587  T
Q  252 aaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagctgat 350  Q
    |||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| |||  |||||| |||||||||||| |||||||| || | | || |||| |||||||| | ||||    
T  23153586 aaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatattatggctgttaattgatgttgtggttgat 23153487  T
Q  351 gaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaat 395  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||    
T  23153486 gaatcattacttgggtatacatattcatgaattaaggatgagaat 23153442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 55 - 395
Target Start/End: Original strand, 14626045 - 14626386
Alignment:
Q  55 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgct 154  Q
    |||||||||||||||||  |||||| ||||||| ||| |||  ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  14626045 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatcttcactttacaaattctcaaatgttgtttgaattgtgattatggataattattgctaaattcgtgct 14626144  T
Q  155 ccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaaa 254  Q
    |   || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14626145 cttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaa 14626244  T
Q  255 ttgtgcaaaatggatgaatt-tgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagctgatgaa 353  Q
    |||||   ||| | |||||| ||  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||  ||||||||||| | | || |||| |||||||||| |||||||    
T  14626245 ttgtgtgcaattggtgaattatgctaagttgttgttaacttgagatttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatgaa 14626344  T
Q  354 tcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaat 395  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| |||||| ||||||||    
T  14626345 tcattgcttgggtatgcatattcatgaattgattatgagaat 14626386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 128 - 395
Target Start/End: Original strand, 35009439 - 35009707
Alignment:
Q  128 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 227  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  35009439 atggataattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttaagtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 35009538  T
Q  228 atatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttg 326  Q
     ||||||||||||  ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  ||||||| ||||||||  | |  ||  | ||| |||||||||||||||    
T  35009539 ttatgtaaaaatgtgaagttttgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttg 35009638  T
Q  327 atgctaatagatgttgtagctgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaat 395  Q
     || |||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||    
T  35009639 ttgttaattgatgttgttgttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatgagaat 35009707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 128 - 379
Target Start/End: Original strand, 1657748 - 1657999
Alignment:
Q  128 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 227  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||    
T  1657748 atggataattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttggatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaa 1657847  T
Q  228 atatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggat-gaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttg 326  Q
     ||||||||||||  ||||||||||||||||||  ||| ||| || ||||  | ||| | | ||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||    
T  1657848 ttatgtaaaaatgtgaagttatgaaaattgtgctcaattgatggattttgctaagttattg-tgaattgagttatgattcttgttcagttgatgttattg 1657946  T
Q  327 atgctaatagatgttgtagctgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatg 379  Q
     || |||| |||||||| | |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||    
T  1657947 ttgttaattgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatg 1657999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 53 - 395
Target Start/End: Original strand, 1650020 - 1650361
Alignment:
Q  53 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatt-atggatgattgttgctaaattcgt 151  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| |  |||||  ||||||||||||  | | || ||| |  |||  ||||| ||||||    
T  1650020 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatg-taattttgca--ttttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagattcgt 1650116  T
Q  152 gctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgaaaagttatga 251  Q
    ||||  ||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||    
T  1650117 gctcttactgtgatgttacgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaagaatgataagttgtga 1650216  T
Q  252 aaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagctgat 350  Q
    |||||||||  ||| | |||| ||||  | ||| | ||| | ||||| | |||||||||  ||||||||||| ||| || || | |||||||| | ||||    
T  1650217 aaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttatggttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttattgttgttatttgatgttgttgttgat 1650316  T
Q  351 gaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaat 395  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||||| |||||| ||||||||    
T  1650317 gaatcactgcttgggtatgcatattcatgaattgattatgagaat 1650361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 128 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 15862734 - 15862484
Alignment:
Q  128 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 227  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||    
T  15862734 atggataattgttactaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaa 15862635  T
Q  228 atatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggat-gaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttg 326  Q
     |||||| |||||  ||||||||||||||||||  ||| ||| || ||||  | ||| | | ||||||||| |||||||||||| | ||| ||||| |||    
T  15862634 ttatgtataaatgtgaagttatgaaaattgtgctcaattgatggattttgctaagttattg-tgaattgagttatgattcttgttc-atttatgttattg 15862537  T
Q  327 atgctaatagatgttgtagctgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatg 379  Q
     || |||| |||||||| | |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||    
T  15862536 ctgataattgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatg 15862484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 140 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 25175815 - 25175558
Alignment:
Q  140 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtaaaaat 239  Q
    ||||||||||||||||   || || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||    
T  25175815 tgctaaattcgtgctcttgctgtgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 25175716  T
Q  240 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 337  Q
    || |||||||||| ||||||| |||| | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||    
T  25175715 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 25175616  T
Q  338 tgttgtagctgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaat 395  Q
    | || |   |||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  25175615 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatgagaat 25175558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 140 - 395
Target Start/End: Original strand, 27653983 - 27654240
Alignment:
Q  140 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtaaaaat 239  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||| ||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||    
T  27653983 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgcttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 27654082  T
Q  240 gaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 337  Q
    || |||||||||| ||||||| |||| | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| | | ||||||| |  ||| || | ||    
T  27654083 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttccaatgatgttatgaatgttatttga 27654182  T
Q  338 tgttgtagctgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaat 395  Q
    | || |   |||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||    
T  27654183 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattaatgatgagaat 27654240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 54 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 23148335 - 23148266
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttt 123  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23148335 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttt 23148266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 86
Target Start/End: Original strand, 19983149 - 19983224
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19983149 cataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 19983224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 86
Target Start/End: Original strand, 35015014 - 35015089
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35015014 cataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 35015089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 140 - 265
Target Start/End: Original strand, 16825752 - 16825879
Alignment:
Q  140 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgta--tgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtaaaa 237  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||  | ||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||    
T  16825752 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtaattaattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaa 16825851  T
Q  238 atgaaaagttatgaaaattgtgcaaaat 265  Q
    |||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  16825852 atgataagttatgaagattgtgctaaat 16825879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 128 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 29666137 - 29665937
Alignment:
Q  128 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgttt-- 225  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||| | || ||||| ||| ||  |||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||      
T  29666137 atggataattgttgttaaattcgtgctctagctgtgatgttattttcttatgtatgaattgatgataattgtatgattgtgggtgaaattacatgtttca 29666038  T
Q  226 aaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgt 324  Q
    || |||| | |||||  |||||||| ||||||| |  ||| | |||| ||||  | ||||| |||||| |||| |||||||| ||| |||||||||||||    
T  29666037 aagtatgcataaatgtcaagttatg-aaattgtactcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaaatgagatatgattcatgttcaattgatgttgt 29665939  T
Q  325 tg 326  Q
    ||    
T  29665938 tg 29665937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 18583715 - 18583640
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  18583715 cataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcat 18583640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 128 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 27751688 - 27751605
Alignment:
Q  128 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggt 211  Q
    |||||| | ||| ||||||||||||||| || | ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  27751688 atggataaatgtagctaaattcgtgctctaattgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgacaattgtatgattgttggt 27751605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 21623563 - 21623506
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttag 70  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||    
T  21623563 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggggttag 21623506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 1556344 - 1556142
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatt-atggatgattgttgctaaattcgtg 152  Q
    ||||||||||||||||||  | |||||||||||  ||| ||| |  ||||||  ||||||||||||  | | || ||| |  ||||||||||||||||||    
T  1556344 taaggtaagggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtg 1556245  T
Q  153 ctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgttt--aaatatgtaaaaatgaaaagttatg 250  Q
    |||   || ||||| ||| ||  | ||||||||||||| || || ||||| |||| ||| |||||||||||||  || |||||| |||||  ||||||||    
T  1556244 ctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatg 1556145  T
Q  251 aaa 253  Q
    |||    
T  1556144 aaa 1556142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 16232231 - 16232029
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatt-atggatgattgttgctaaattcgtg 152  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||   || ||| |  ||||||  ||||||||||||  | | || ||| |  ||||||||||||||||||    
T  16232231 taaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtg 16232132  T
Q  153 ctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgttt--aaatatgtaaaaatgaaaagttatg 250  Q
    |||   || ||||| ||| ||  | ||||||||||||| || || ||||| |||| ||| |||||||||||||  || |||||| |||||  ||||||||    
T  16232131 ctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatg 16232032  T
Q  251 aaa 253  Q
    |||    
T  16232031 aaa 16232029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 144 - 224
Target Start/End: Original strand, 18629608 - 18629689
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatg-aattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtt 224  Q
    |||||||||||| || | |||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||  |||||||| ||||| ||||||    
T  18629608 aaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattgatgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgtt 18629689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 13 - 70
Target Start/End: Original strand, 22361619 - 22361676
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttag 70  Q
    ||||||||||||||||||| |  |||| | |||| |||||||||||||||||||||||    
T  22361619 taggagctaaagtgaagcttggcctaggaattggtgataattaaggtaagggggttag 22361676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 14152704 - 14152632
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatca 85  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | || | | ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||    
T  14152704 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaatttgtgctaattaaggcaagggggttattcttcatcataatca 14152632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 18002395 - 18002427
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18002395 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 18002427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 280 - 368
Target Start/End: Original strand, 18381821 - 18381909
Alignment:
Q  280 tgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagctgatgaatcattgcttgggtat 368  Q
    |||||| ||||||||| | || || || ||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||| | |||||| |||| ||||||||||    
T  18381821 tgttgttgttgaattgtgataagagtcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgttgatgattcatggcttgggtat 18381909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 23995279 - 23995247
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23995279 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 23995247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 26090091 - 26090059
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26090091 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 26090059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 287 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 27740941 - 27740837
Alignment:
Q  287 gttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagctgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgat 386  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| |||| |  ||   |||||||| |  |||||||||| | |||||||| ||| |||||| ||||||    
T  27740941 gttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgtggttgctattatctgatgttgttgtggatgaatcatggtttgggtatgcatattcatgaattgat 27740842  T
Q  387 gatga 391  Q
    |||||    
T  27740841 gatga 27740837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 144 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 29605696 - 29605616
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtt 224  Q
    |||||||||||| || | || ||||||||||| |||||||||||  | ||||||| ||  |||||||| ||||||||||||    
T  29605696 aaattcgtgctctaattatggtgatatgtttgaatgcatgaattagtgataattgaattgttgttggtgaaattacatgtt 29605616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 4991427 - 4991396
Alignment:
Q  55 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4991427 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 4991396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 198
Target Start/End: Original strand, 16887792 - 16887847
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatg-aattgataataattg 198  Q
    |||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  16887792 aaattcgtgctctaactatgataatatgtttgtatgcatgaaattgatgataattg 16887847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 146 - 217
Target Start/End: Original strand, 17083200 - 17083271
Alignment:
Q  146 attcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaatt 217  Q
    |||||||||| || | |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||| ||  |||||||| |||||    
T  17083200 attcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatt 17083271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 198
Target Start/End: Original strand, 35136013 - 35136068
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatg-aattgataataattg 198  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  35136013 aaattcgtgctctaactaggatgatatgtttgtatgcatgaaattgatgataattg 35136068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 84
Target Start/End: Original strand, 15742120 - 15742150
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatc 84  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15742120 taaggtaagggggttagtctttatcataatc 15742150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 303 - 395
Target Start/End: Original strand, 22361926 - 22362019
Alignment:
Q  303 attcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagctgatgaatcattgcttgggtatacat-gttcatggattgatgatgagaat 395  Q
    |||| ||| ||||||||||||||| ||||||  ||| |||| | |||||| |||| |||||||| | |||  |||||| |||||||||||||||    
T  22361926 attcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataattcatgaattgatgatgagaat 22362019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 33324939 - 33324898
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa 185  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  33324939 aaattcgtgctctaactaggatgatatgtttgtatgcatgaa 33324898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 1657661 - 1657693
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1657661 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 1657693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 15862821 - 15862789
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15862821 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 15862789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 347 - 395
Target Start/End: Original strand, 16825963 - 16826011
Alignment:
Q  347 tgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaat 395  Q
    |||||||| ||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  16825963 tgatgaataattgctttgttatgcatattcatggattgatgatgagaat 16826011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 18823283 - 18823315
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18823283 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 18823315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 18839138 - 18839170
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18839138 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 18839170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 279 - 343
Target Start/End: Original strand, 25367374 - 25367438
Alignment:
Q  279 atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgt 343  Q
    ||||||| ||||||||| | || ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  25367374 atgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgt 25367438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 27751774 - 27751742
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27751774 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 27751742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 32276659 - 32276691
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32276659 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 32276691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 165; Significance: 5e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 54 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 12450 - 12110
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaa-ttttgattatggatgattgttgctaaattcgtg 152  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12450 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcttaattttgtaacttt-caaatgctgtatgaaattttgattatggataattgttgctaaattcgtg 12352  T
Q  153 ctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaa 252  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  12351 ctctaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaaatacatgtttaaatgtgtaaaaatgataagttgtgaa 12252  T
Q  253 aattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagctgatg 351  Q
    |||||||| |||| | |||| ||||  | ||||| ||  ||||||| | |||||||||| ||||||||||| |  ||| |||| |||||| |   | |||    
T  12251 aattgtgctaaattggtgaattttgttaagttgttgt--aattgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattgatgttatgattcatg 12154  T
Q  352 aatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaat 395  Q
    ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  12153 aataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatgagaat 12110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 164; Significance: 2e-87; HSPs: 3)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 54 - 395
Target Start/End: Original strand, 26340 - 26683
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg-attatggatgattgttgctaaattcgtg 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| || ||||||||||||||||||    
T  26340 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatgatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttcataatgtataattgttgctaaattcgtg 26439  T
Q  153 ctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaa 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||| ||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||    
T  26440 ctccaactttgatgatatgtttgtatgcgtgaattgatgataattgtaagattattggtgaaagtacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaa 26539  T
Q  253 aattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagctgatg 351  Q
    |||||| |  ||| | |||| ||||  | ||||| |||  | |||| |||||||||||| ||||||||||| | | || |||| ||||||||   |||||    
T  26540 aattgttctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagaatgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtgattgatg 26639  T
Q  352 aatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaat 395  Q
    ||||||||||||||||| ||| || ||| ||||| |||||||||    
T  26640 aatcattgcttgggtatgcatattgatgaattgaggatgagaat 26683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 128 - 395
Target Start/End: Original strand, 8180 - 8445
Alignment:
Q  128 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 227  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||    
T  8180 atggataattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattggtgataattgtatgattgttggtgaaattacaggttcaa 8279  T
Q  228 atatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttg 326  Q
     ||||||||||||  ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  |||||   ||||||||  | |  ||  | ||| |||||||||||||||    
T  8280 ttatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctatgtt---gttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttg 8376  T
Q  327 atgctaatagatgttgtagctgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaat 395  Q
     || |||| |||||||| | | ||||||||| |||||||||| ||| | |||| |||||||||||||||    
T  8377 ttgttaattgatgttgttgtttatgaatcatggcttgggtatgcatatacatgaattgatgatgagaat 8445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 13 - 70
Target Start/End: Original strand, 6877 - 6934
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttag 70  Q
    |||||| |||||||||||| | ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||    
T  6877 taggagttaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggggttag 6934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 163; Significance: 8e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 54 - 391
Target Start/End: Original strand, 5990 - 6327
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5990 taaggtaagggggttagtctttatcataatcattttcactttgcaaattctcaaatgttgtatgaattgtgattatggataattgttgctaaattcgtgc 6089  T
Q  154 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaa 253  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | ||||| | |||    
T  6090 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttgtaaaa 6189  T
Q  254 attgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagctgatga 352  Q
    |||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||| ||||||| | |||||||||| ||| ||||||| | |||| ||||   |||| |   ||||||    
T  6190 attgtgctgaattggtgaattttgctaagttgttgtt-aattgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttttgttatgattgatga 6288  T
Q  353 atcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatga 391  Q
    || ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  6289 ataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatga 6327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 163; Significance: 8e-87; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 54 - 395
Target Start/End: Original strand, 128095 - 128436
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  128095 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcttcattttgcaaattttcaaaagttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgc 128194  T
Q  154 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaa 253  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||| ||||||  ||  ||||| |||||    
T  128195 ttcaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgtaaaggtgttaagttgtgaaa 128294  T
Q  254 attgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagctgatga 352  Q
    |||||||  ||| |  ||| ||||  | ||||| ||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||| | |||| |||| ||||||||   ||||||    
T  128295 attgtgctcaattggcgaattttgttaggttgttgtt-aattgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaatggatgttgtgattgatga 128393  T
Q  353 atcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaat 395  Q
    || |||| |||||||| ||| |||||| |||||||||||||||    
T  128394 ataattgattgggtatgcatattcatgaattgatgatgagaat 128436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 162 - 395
Target Start/End: Original strand, 31697 - 31933
Alignment:
Q  162 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgca 261  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||  || |||||||||||||||| ||||||||| || | ||||| |||||||| |||||||||| ||| |||     
T  31697 tgatgttatgtttgaatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatattcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatgct 31796  T
Q  262 aaatggatgaatttgac---atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagctgatgaatcatt 358  Q
     ||| | |||||||  |   | ||||| ||||| ||||| | |||||| ||| ||||||||||| |  ||| || |  || || |   |||||||| |||    
T  31797 caattggtgaatttctcctaaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttaatattatgattgatgaataatt 31896  T
Q  359 gcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaat 395  Q
    |||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||    
T  31897 gcttgggtttgcatattcatggattaatgatgagaat 31933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 160; Significance: 5e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 54 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 272362 - 272031
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| | | ||||||||| ||| |    
T  272362 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatattgtataaattttgattatggataaatattgctaaatacgtac 272263  T
Q  154 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaa 253  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||| | | |||||| ||||| |||||    
T  272262 tccaactgtaatgatatgtttgtatgaatgaattgatgataattgtatgattgatggagaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaa 272163  T
Q  254 attgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagctgatga 352  Q
    ||||||| |||| | |||| ||||  | ||||| |||| |||||| |||||||||||| |||||| |||| | | || |||| |||||||| | ||||||    
T  272162 attgtgctaaattggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattggtgttatagctgttaattgatgttgtggttgatga 272063  T
Q  353 atcattgcttgggtatacatgttcatggattg 384  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| ||||    
T  272062 atcattgcttgggtatgcatattcatgaattg 272031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 159; Significance: 2e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 54 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 9215 - 8873
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  9215 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcttcattttgcaaattttcaaaagttgtacgaattttgcttatggaaaattgttgctaaattcgtgc 9116  T
Q  154 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaa 253  Q
    ||||  | ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||  ||||| |||||    
T  9115 tccatttgtgatgttatgtttgtatgcatgaatcgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgttaagttgtgaaa 9016  T
Q  254 attgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagctgatga 352  Q
    |||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | |||| |||| ||||||||   ||||||    
T  9015 attgtgctcaattggtgaattttgttaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaattgatgttgtgattgatga 8916  T
Q  353 atcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaat 395  Q
    || ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||    
T  8915 ataattgcttgggtatgcatattcatgtattgatgatgagaat 8873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 158; Significance: 8e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 8e-84
Query Start/End: Original strand, 64 - 395
Target Start/End: Original strand, 4996 - 5329
Alignment:
Q  64 gggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg-attatggatgattgttgctaaattcgtgctccaacttt 162  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  4996 gggttagtctttatcataatcattatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttcataatggataattgttgctaaattcgtactccaactgt 5095  T
Q  163 gatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaa 262  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||      
T  5096 gacgatatgtttgtatgcgtgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaagtacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctc 5195  T
Q  263 aatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagctgatgaatcattgct 361  Q
    ||| | |||| ||||  | ||||| |||  | |||| |||||||||||| ||||||||||| | | || |||| ||||||||   |||||||||||||||    
T  5196 aattggtgaattttgcaaagttgttgttagaatgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtgattgatgaatcattgct 5295  T
Q  362 tgggtatacatgttcatggattgatgatgagaat 395  Q
    ||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||    
T  5296 tgggtatgcatattcatgaattgaggatgagaat 5329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 158; Significance: 8e-84; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 8e-84
Query Start/End: Original strand, 54 - 395
Target Start/End: Original strand, 247366 - 247710
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgt 151  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||||||    
T  247366 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgt 247465  T
Q  152 gctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgaaaagttatga 251  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||| |||||| ||||| | | |||||| ||||| |||    
T  247466 gctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgagggtgaaatttcatgttcaaataggaacaaatgataagttgtga 247565  T
Q  252 aaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagctgat 350  Q
    |||||||||  ||| | | || ||||  | ||||| |||  |||||| |||||||||||| ||||||||||| |   || |||| |||||||| | ||||    
T  247566 aaattgtgctcaattggtaaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatgactgttaattgatgttgtggttgat 247665  T
Q  351 gaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaat 395  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||| | ||| |||||||||    
T  247666 gaatcattgcttgggtatgcatattcatgaactgaggatgagaat 247710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 326
Target Start/End: Original strand, 34075 - 34350
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttc-aaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtg 152  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| ||| |  ||||||  | ||||||||||| |  | | ||| |  ||||||||||||||||||    
T  34075 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcattgttgtatgaaatgggttgatgaaaaattgttgctaaattcgtg 34174  T
Q  153 ctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgttt--aaatatgtaaaaatgaaaagttatg 250  Q
    |||   || ||| | ||| ||  | ||||||||||||| || || ||||| |||| ||| |||||||||||||  || |||||| |||||  ||||||||    
T  34175 ctcttgctgtgaagctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatg 34274  T
Q  251 aaaattgtgcaaaatggatgaattt-gacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttg 326  Q
     || || | |  ||| ||||||||| || ||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | ||| |||||||||    
T  34275 -aagttatacttaattgatgaatttggatatgttgttgttgaaatgagatatgattcatgttccattaatgttgttg 34350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 153; Significance: 7e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 56 - 260
Target Start/End: Original strand, 51110 - 51314
Alignment:
Q  56 aggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgctc 155  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  51110 aggtaaggagattagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgctc 51209  T
Q  156 caactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaaat 255  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  51210 caactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaataggtaaaaatgataagttgtgaaaat 51309  T
Q  256 tgtgc 260  Q
    |||||    
T  51310 tgtgc 51314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 151; Significance: 1e-79; HSPs: 6)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 128 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 27058 - 26892
Alignment:
Q  128 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 227  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27058 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 26959  T
Q  228 atatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 294  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26958 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 26892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 135 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 22796 - 22637
Alignment:
Q  135 attgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgta 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  22796 attgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtg 22697  T
Q  235 aaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22696 aaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 22637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 460 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 22639 - 22588
Alignment:
Q  460 attatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgattgatgatgt 511  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22639 attatgatggagggtatgattatatgttatgattgtagttgattgatgatgt 22588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #4
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 460 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 26894 - 26843
Alignment:
Q  460 attatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgattgatgatgt 511  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26894 attatgatggagggtatgattatatgttatgattgtagttgattgatgatgt 26843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #5
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 22889 - 22857
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22889 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 22857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #6
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 27144 - 27112
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27144 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 27112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 151; Significance: 1e-79; HSPs: 3)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 128 - 294
Target Start/End: Original strand, 1582 - 1748
Alignment:
Q  128 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 227  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1582 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 1681  T
Q  228 atatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 294  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1682 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 1748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 460 - 511
Target Start/End: Original strand, 1746 - 1797
Alignment:
Q  460 attatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgattgatgatgt 511  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1746 attatgatggagggtatgattatatgttatgattgtagttgattgatgatgt 1797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 1496 - 1528
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1496 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 1528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 147; Significance: 3e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 54 - 395
Target Start/End: Original strand, 123087 - 123432
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcatttt-gtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcg 150  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||||    
T  123087 taaggtaagggggttagtcttcaccataatcatcataatttttgtaaatttgcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcg 123186  T
Q  151 tgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgaaaagttatg 250  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| | | |||||| ||||| ||    
T  123187 tgctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtg 123286  T
Q  251 aaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagctga 349  Q
    ||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| |||  ||| || |||||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||||| | |||    
T  123287 aaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagattaagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttga 123386  T
Q  350 tgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaat 395  Q
    ||||| || |||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||    
T  123387 tgaataatggcttgggtatgcatattcatgaattgaagatgagaat 123432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 145; Significance: 4e-76; HSPs: 3)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 54 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 9192 - 8848
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcat----tttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatta--tggatgattgttgctaaat 147  Q
    ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||    |||| || ||||||||||| ||||| |||||   ||  ||||| |||||||||||||    
T  9192 taaggtaagtgtgttagtcttcatcataatcatcatcatcatttttgcaatttttcaaatgtggtatgtatttttcataattggataattgttgctaaat 9093  T
Q  148 tcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgaaaagtt 247  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||  |||||    
T  9092 tcgtgctccatctgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagtt 8993  T
Q  248 atgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagc 346  Q
     ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||||||||||| |||||||  ||| ||||||||||| ||| |  |||| |||||||| |     
T  8992 gtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattaatgttcaattgatgttattgctattaattgatgttgttgt 8893  T
Q  347 tgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatga 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  8892 tgatgaatcattgcttgggtatacatattcatgaattgatgatga 8848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 102 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 149012 - 148716
Alignment:
Q  102 tttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||   || || ||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  149012 tttcaaatgttgtatgaatttttgcataattgataattgttgttaaatttgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgt 148913  T
Q  200 atgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagc 298  Q
    | |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||| | |||||     
T  148912 aagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttaatttgaga 148813  T
Q  299 tatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagctgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaat 395  Q
    | |||||||||| ||||||||||| | | || |||| || ||||| | ||||||||||||||||||||||  || |||||| |||||||||||||||    
T  148812 tttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgaagttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgtatattcatgaattgatgatgagaat 148716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 54 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 146938 - 146838
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| |||    
T  146938 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttcctaaattcatgc 146839  T
Q  154 t 154  Q
    |    
T  146838 t 146838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 130; Significance: 4e-67; HSPs: 4)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 54 - 260
Target Start/End: Original strand, 89378 - 89586
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgt 151  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   || |||||| |||||||||||||||||    
T  89378 taaggtaagggggttagtcttcatcatgatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttctatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgt 89477  T
Q  152 gctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgaaaagttatga 251  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| | | |||| | ||||| |||    
T  89478 gctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaattataagttgtga 89577  T
Q  252 aaattgtgc 260  Q
    |||||||||    
T  89578 aaattgtgc 89586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 54 - 179
Target Start/End: Original strand, 107708 - 107835
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttt--gattatggatgattgttgctaaattcgt 151  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||| ||| |||||||||||||    
T  107708 taaggtaagggggttagtcttcatcatgatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataatttttgctaaattcgt 107807  T
Q  152 gctccaactttgatgatatgtttgtatg 179  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  107808 gctccaactgtgatgatatatttgtatg 107835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 79786 - 79731
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatg-aattgataataattg 198  Q
    |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  79786 aaattcgtgcactaactatgatgatatgtttgtatgcatgaaattgatgataattg 79731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 130911 - 130880
Alignment:
Q  55 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  130911 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 130880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 126; Significance: 9e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 135 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 48443 - 48182
Alignment:
Q  135 attgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgta 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||    
T  48443 attgttgctaaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgta 48344  T
Q  235 aaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaa 333  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | |||| |||    
T  48343 aaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgttaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatagatgttaa 48244  T
Q  334 tagatgttgtagctgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaat 395  Q
    | ||||||||   |||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  48243 ttgatgttgtgattgatgaataattgcctgggtatgcatattcatggattgatgatgagaat 48182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 20567 - 20493
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatca 85  Q
    ||||||||| ||| ||||||| ||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  20567 cataggagcaaaaatgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 20493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 117; Significance: 2e-59; HSPs: 3)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 128 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 13769 - 13501
Alignment:
Q  128 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 227  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  13769 atggataattgttgctaaattcgtgctctaactttgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 13670  T
Q  228 atatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttg 326  Q
     ||||||||||||  ||||| ||||||||||||  ||| |||||| ||||  ||||||| ||||||||  | |  ||  | ||| |||||||||||||||    
T  13669 ttatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattttgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttg 13570  T
Q  327 atgctaatagatgttgtagctgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaat 395  Q
     || |||| |||||||| | |||||||||||  ||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||    
T  13569 ttgttaattgatgttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatattcatgaattgacgatgagaat 13501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 42749 - 42677
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42749 cataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagata---aaggtaagggggttagtttttatcataatcat 42677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 13856 - 13824
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13856 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 13824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 3)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 135 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 108003 - 107746
Alignment:
Q  135 attgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgta 234  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || |    
T  108003 attgttactaaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgca 107904  T
Q  235 aaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaa 333  Q
    ||||||| ||||| | ||||||||||  ||| | |||| ||||| | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | |||| |||    
T  107903 aaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaattggtgaattttgataagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaa 107804  T
Q  334 tagatgttgtagctgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatga 391  Q
    | ||||||||   |||||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||    
T  107803 ttgatgttgtgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatga 107746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 144 - 260
Target Start/End: Original strand, 64527 - 64648
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaatt-----gataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtaaaaa 238  Q
    ||||||||||||   || ||||| ||||||| ||||||||||||     ||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  64527 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttatatgcatgaattatattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaa 64626  T
Q  239 tgaaaagttatgaaaattgtgc 260  Q
    ||| |||||||||| |||||||    
T  64627 tgataagttatgaatattgtgc 64648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 143 - 185
Target Start/End: Original strand, 89863 - 89905
Alignment:
Q  143 taaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa 185  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  89863 taaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa 89905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 109; Significance: 1e-54; HSPs: 2)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 128 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 41911 - 41643
Alignment:
Q  128 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 227  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  41911 atggataattgttgttaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 41812  T
Q  228 atatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttg 326  Q
     ||||||||||||  ||||| |||||||||||   ||| | |||| ||||  ||||||| ||||||||  | |  ||  | ||| |||||||||||||||    
T  41811 ttatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgttcaattggtgaattttgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttg 41712  T
Q  327 atgctaatagatgttgtagctgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaat 395  Q
     || |||  |||||||| | |||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||    
T  41711 ttgttaaatgatgttgttgttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatgagaat 41643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 41997 - 41957
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattt 94  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||    
T  41997 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatgttcattt 41957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1542 (Bit Score: 105; Significance: 3e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold1542
Description:

Target: scaffold1542; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 128 - 395
Target Start/End: Original strand, 534 - 802
Alignment:
Q  128 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 227  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  534 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 633  T
Q  228 atatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttg 326  Q
    ||| | | ||||||  |||| |||||||||| |  ||| | |||| ||||  | |||   |||  ||| || ||||||||||||  |||||||||| | |    
T  634 ataggaacaaatgatgagttgtgaaaattgtactcaattggtgaattttgctaagttactgttagattaagttatgattcttgtttaattgatgttatgg 733  T
Q  327 atgctaatagatgttgtagctgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaat 395  Q
     ||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| ||| |||| | ||||| |||||||||    
T  734 ctgctaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcaggaattgaggatgagaat 802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772 (Bit Score: 98; Significance: 5e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0772
Description:

Target: scaffold0772; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 135 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 5785 - 5660
Alignment:
Q  135 attgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgta 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5785 attgttgctaaattcgtgctccaactttgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgta 5686  T
Q  235 aaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 260  Q
    ||||||| |||| ||||| |||||||    
T  5685 aaaatgataagtcatgaatattgtgc 5660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 5878 - 5846
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5878 taaggtaagggggttagtctttaccataatcat 5846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 98; Significance: 5e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 128 - 391
Target Start/End: Original strand, 34460 - 34725
Alignment:
Q  128 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 227  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  34460 atggataattattgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 34559  T
Q  228 atatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttg-tgcaattgatgttgtt 325  Q
     | |||||||||   ||||| |||||||||| |  ||| | |||| ||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| || |  |||||||||| ||    
T  34560 ttgtgtaaaaatatgaagttgtgaaaattgttctcaataggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttttaattgatgttatt 34659  T
Q  326 gatgctaatagatgttgtagctgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatga 391  Q
    | || || | |||||||| | |||||||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  34660 gttgttatttgatgttgttgttgatgaatcactacttgggtatgcatattcatggattgatgatga 34725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 95; Significance: 3e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 162 - 395
Target Start/End: Original strand, 9371 - 9605
Alignment:
Q  162 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgca 261  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||     
T  9371 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggtgct 9470  T
Q  262 aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagctgatgaatcattgc 360  Q
     ||| | |||| ||||  | ||| | ||| | ||||| | |||||||||  ||| ||||||| | | || |||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  9471 caattggtgaattttgctaagttattgttaatttgagatttgattcttgctcaaatgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatgaatcattgc 9570  T
Q  361 ttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaat 395  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||| ||||||||    
T  9571 ttgggtatgcatattcatgaattgattatgagaat 9605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 162 - 395
Target Start/End: Original strand, 16269 - 16503
Alignment:
Q  162 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgca 261  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||     
T  16269 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggtgct 16368  T
Q  262 aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagctgatgaatcattgc 360  Q
     ||| | |||| ||||  | ||| | ||| | ||||| | |||||||||  ||| ||||||| | | || |||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  16369 caattggtgaattttgctaagttattgttaatttgagatttgattcttgctcaaatgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatgaatcattgc 16468  T
Q  361 ttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaat 395  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||| ||||||||    
T  16469 ttgggtatgcatattcatgaattgattatgagaat 16503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 91; Significance: 7e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 139 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 3215 - 2957
Alignment:
Q  139 ttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtaaaaa 238  Q
    |||||||||||||||||   || ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||    
T  3215 ttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatccatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaa 3116  T
Q  239 tgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttg-tgcaattgatgttgttgatgctaatag 336  Q
    ||  ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| || |  |||||||||| ||| || || | |    
T  3115 tgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttttaattgatgttattgttgttatttg 3016  T
Q  337 atgttgtagctgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaat 395  Q
    ||||||| | |||||||||| |||||| |||| ||| |||||| |||||| ||||||||    
T  3015 atgttgttgttgatgaatcactgcttgtgtatgcatattcatgaattgattatgagaat 2957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 76; Significance: 6e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 163 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 43226 - 42992
Alignment:
Q  163 gatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaa 262  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| ||||||| |    
T  43226 gatgttatgtttctatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgaagattgtgcta 43127  T
Q  263 aatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagctgatgaatcattgc 360  Q
    ||| | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||||| ||| ||| ||||||| |  ||| || | ||| || |   |||||||| |||||    
T  43126 aattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgattcgtgttcaagtgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgc 43027  T
Q  361 ttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaat 395  Q
    |||||| | ||| ||||||||||||||||||||||    
T  43026 ttgggtttgcatattcatggattgatgatgagaat 42992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 75; Significance: 3e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 178 - 391
Target Start/End: Original strand, 5254 - 5467
Alignment:
Q  178 tgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tttg 276  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||| | |||| ||||    
T  5254 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaattggtgaattttg 5353  T
Q  277 acatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagctgatgaatcattgcttgggtatacatgttc 376  Q
        ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| |  ||| |||| ||||||||   | |||||| ||||||||||| | ||| |||    
T  5354 ctgagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattgatgttgtgattaatgaataattgcttgggt-tgcatattc 5452  T
Q  377 atggattgatgatga 391  Q
    |||||||||||||||    
T  5453 atggattgatgatga 5467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 145 - 185
Target Start/End: Original strand, 102923 - 102963
Alignment:
Q  145 aattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa 185  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||    
T  102923 aattcgtgctccaattatgatgatatgtttgaatgcatgaa 102963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 73; Significance: 4e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 140 - 260
Target Start/End: Original strand, 13325 - 13445
Alignment:
Q  140 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtaaaaat 239  Q
    ||||| ||||||||||  | | ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  13325 tgctagattcgtgctcttagtgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 13424  T
Q  240 gaaaagttatgaaaattgtgc 260  Q
    || ||||| ||||||| ||||    
T  13425 gataagttgtgaaaatggtgc 13445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 73; Significance: 4e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 144 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 283 - 167
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgaaa 243  Q
    ||||||||||||   || ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  283 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgata 184  T
Q  244 agttatgaaaattgtgc 260  Q
    ||||||| | |||||||    
T  183 agttatgtatattgtgc 167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 30492 - 30417
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||| ||| ||||||||||| ||| || || |||| |||||||||||||||||||||| | || |||||||||||    
T  30492 catagaagcaaaagtgaagcttgagttaataattggtgataattaaggtaagggggttatttttcatcataatcat 30417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 68; Significance: 4e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 178 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 3936 - 3721
Alignment:
Q  178 tgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgta-aaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-ttt 275  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||   ||| | |||| |||    
T  3936 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaaatgataagttatggaaattgtgtccaattggtgaatttt 3837  T
Q  276 gacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagctgatgaatcattgcttgggtatacatgtt 375  Q
    |  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| |  ||| |||| |||||| |   |||||||| ||| ||||||| | ||| ||    
T  3836 gctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattgatgttatgattgatgaataattacttgggtttgcatatt 3737  T
Q  376 catggattgatgatga 391  Q
    ||||||||||||||||    
T  3736 catggattgatgatga 3721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1711 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold1711
Description:

Target: scaffold1711; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 140 - 260
Target Start/End: Original strand, 1304 - 1424
Alignment:
Q  140 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtaaaaat 239  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||    
T  1304 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 1403  T
Q  240 gaaaagttatgaaaattgtgc 260  Q
    || |||||||||| |||||||    
T  1404 gataagttatgaatattgtgc 1424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 64; Significance: 9e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 80262 - 80187
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  80262 cataggagcaaaagtgaagcttgagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 80187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 63; Significance: 4e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 162 - 260
Target Start/End: Original strand, 14083 - 14181
Alignment:
Q  162 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 260  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  14083 tgatgttatgtctgtatgcatgaattgatgataattatatgattgttagtgaaattacatgttgaaatatgtaaaaatgataagttatgaagattgtgc 14181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 139 - 391
Target Start/End: Original strand, 21115 - 21368
Alignment:
Q  139 ttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtaaaaa 238  Q
    |||||||||||||||||    | ||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||||| |||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||    
T  21115 ttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatccattaattgatgataattatatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaa 21214  T
Q  239 tgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 337  Q
    ||| |||||||||| |||| ||  ||| | |||||||  | | ||||| ||| | ||||| |  ||||||||| ||||||||||| |  ||| || | ||    
T  21215 tgataagttatgaagattgagctcaattggtgaattttcctaagttgttgttaatttgagattggattcttgttcaattgatgttatgaatgttatttga 21314  T
Q  338 tgttgtagctgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatga 391  Q
    |||| |   |||||||| |||||||| || | ||| |||||||||| |||||||    
T  21315 tgttatgattgatgaataattgcttgagtttgcatattcatggattaatgatga 21368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 61; Significance: 6e-26; HSPs: 3)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 11 - 87
Target Start/End: Original strand, 166121 - 166197
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcatc 87  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  166121 cataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcatc 166197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 12 - 87
Target Start/End: Original strand, 162036 - 162111
Alignment:
Q  12 ataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcatc 87  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  162036 ataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcatc 162111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 86
Target Start/End: Original strand, 116410 - 116483
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  116410 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggggttagatttcatcataatcat 116483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 86
Target Start/End: Original strand, 31137 - 31212
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  31137 cataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcacaatcat 31212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686 (Bit Score: 59; Significance: 9e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0686
Description:

Target: scaffold0686; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 12 - 86
Target Start/End: Original strand, 5735 - 5809
Alignment:
Q  12 ataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  5735 ataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcat 5809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 12 - 86
Target Start/End: Original strand, 5941 - 6015
Alignment:
Q  12 ataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  5941 ataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcat 6015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622 (Bit Score: 56; Significance: 6e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0622
Description:

Target: scaffold0622; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 292 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 9480 - 9377
Alignment:
Q  292 attgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagctgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatga 391  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||    
T  9480 attgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatga 9381  T
Q  392 gaat 395  Q
    ||||    
T  9380 gaat 9377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 87
Target Start/End: Original strand, 309 - 385
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcatc 87  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  309 cataggagcaaaagtgaagcttgagctaatagttggtgataattaaggtaacggggttattctttatcataatcatc 385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 4)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 178 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 54630 - 54412
Alignment:
Q  178 tgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgttt--aaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tt 274  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| |||||||  || |||||| |||||  |||||||| ||||||| |  ||| | |||| ||    
T  54630 tgcatgaattgatgataattgtatgattgtgggtgaaattgcatgtttcaaagtatgtataaatgtcaagttatg-aaattgtactcaattggtgaattt 54532  T
Q  275 tgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagctgatgaatcattgcttgggtatacatgt 374  Q
    ||| ||||||| |||||| |||| | |||||| ||| | ||||||||||||| |  |||  |||||||| |  | ||||||||   |||||||||||| |    
T  54531 tgatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccattgatgttgttgctattaactgatgttgttgtgggtgaatcatgagttgggtatacatat 54432  T
Q  375 tcatggattgatgatgagaa 394  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  54431 ttatggattgatgatgagaa 54412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 178 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 45244 - 45094
Alignment:
Q  178 tgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgttt--aaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-tt 274  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||  || |||||| |||||  ||||| || ||||||| |  ||| | |||| ||    
T  45244 tgcatgaattgatgataattgtatgattgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgtcaagttttg-aaattgtactcaattggtgaattt 45146  T
Q  275 tgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttg 326  Q
    ||| ||||||| |||||| |||| | |||||| ||| | |||||||||||||    
T  45145 tgatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccattgatgttgttg 45094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 350 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 45051 - 45007
Alignment:
Q  350 tgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaa 394  Q
    ||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  45051 tgaatcatgacttgggtatacatatttatggattgatgatgagaa 45007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 45370 - 45338
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  45370 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 45338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0361 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0361
Description:

Target: scaffold0361; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 128 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 3453 - 3360
Alignment:
Q  128 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacat 221  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||| | || ||||| || ||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  3453 atggataattgatgctaaattcgtgctctagctgtgatgttaagtttgtatgcatgaattaatgatatttgtatgattgttggtgaaattacat 3360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1164 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold1164
Description:

Target: scaffold1164; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 1775 - 1701
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatca 85  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  1775 cataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 1701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 85
Target Start/End: Original strand, 19807 - 19881
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatca 85  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  19807 cataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 19881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 85
Target Start/End: Original strand, 24111 - 24185
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatca 85  Q
    ||||||||| ||| ||||||| ||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  24111 cataggagcaaaaatgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 24185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 46; Significance: 5e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 135 - 253
Target Start/End: Original strand, 56106 - 56226
Alignment:
Q  135 attgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgttt--aaatatg 232  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||| || || ||||||| ||||| |||||||||||||||| | | |||||||||||||  || ||||    
T  56106 attgttgttaaattcgtgctctaactgtgatgttattttcgtgtgcatgatttgatgataattgtatgattgtggctgaaattacatgttttaaagtatg 56205  T
Q  233 taaaaatgaaaagttatgaaa 253  Q
    || |||||  |||||||||||    
T  56206 tataaatgtcaagttatgaaa 56226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467 (Bit Score: 44; Significance: 8e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0467
Description:

Target: scaffold0467; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 54 - 253
Target Start/End: Original strand, 10256 - 10458
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatt-atggatgattgttgctaaattcgtg 152  Q
    ||||||||||||||| |||||  ||||||||||  ||| ||| |  ||||||  ||||||||||||  | | || ||| || ||||||||||||||||||    
T  10256 taaggtaagggggtttgtcttcttcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtg 10355  T
Q  153 ctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgttt--aaatatgtaaaaatgaaaagttatg 250  Q
    |||   || ||||||||| ||  | ||||||||||||| || || ||||| |||| ||| |||||||||||||  || |||||| |||||  ||||||||    
T  10356 ctcttgctgtgatgatattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgctaagttatg 10455  T
Q  251 aaa 253  Q
    |||    
T  10456 aaa 10458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0876 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0876
Description:

Target: scaffold0876; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 164 - 94
Alignment:
Q  15 ggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatca 85  Q
    ||||| ||||||||||| ||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  164 ggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 94  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 85
Target Start/End: Original strand, 6261 - 6335
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatca 85  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| || |||| || |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  6261 cataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagtgggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 6335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 48 - 85
Target Start/End: Original strand, 4 - 41
Alignment:
Q  48 gataattaaggtaagggggttagtctttatcataatca 85  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  4 gataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 41  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 86
Target Start/End: Original strand, 1363 - 1436
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||| | |||| ||||||| |||||||||||||||  || |||||||||||    
T  1363 taggaactaaagtgaagcttgagctaggaattggtgataattgaggtaagggggttagaattcatcataatcat 1436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 144 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 8257 - 8176
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatg-aattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtt 224  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||  |||||||| || || ||||||    
T  8257 aaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcatgaaattgatgataattgaattgttgttggtgaatttgcatgtt 8176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 35873 - 35816
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttag 70  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||    
T  35873 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggggttag 35816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 301 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 48603 - 48513
Alignment:
Q  301 tgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagctgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatga 391  Q
    |||||||||| || |||||||| | |||| |||| |||||| |   |||||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||    
T  48603 tgattcttgttcacttgatgttatggatgttaattgatgttatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatga 48513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 197
Target Start/End: Original strand, 70307 - 70361
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatg-aattgataataatt 197  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  70307 aaattcgtactccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaaattgatgataatt 70361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 57392 - 57424
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  57392 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 57424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1295 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold1295
Description:

Target: scaffold1295; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 13 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 499 - 442
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttag 70  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| | |||| ||||| | |||||||||||||||    
T  499 taggagctaaagtgaagcttgagctaggaattggtgataactgaggtaagggggttag 442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 144 - 185
Target Start/End: Original strand, 1546 - 1587
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa 185  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1546 aaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa 1587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 144 - 185
Target Start/End: Original strand, 8691 - 8732
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa 185  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8691 aaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa 8732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 13 - 70
Target Start/End: Original strand, 76699 - 76756
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttag 70  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | |||  |||||||||||||||||||||||    
T  76699 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattgctgataattaaggtaagggggttag 76756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 53 - 86
Target Start/End: Original strand, 193396 - 193429
Alignment:
Q  53 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  193396 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 193429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0706 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0706
Description:

Target: scaffold0706; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 6443 - 6475
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6443 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 6475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0597 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0597
Description:

Target: scaffold0597; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 878 - 910
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  878 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 9882 - 9914
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9882 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 9914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0251
Description:

Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 13285 - 13317
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13285 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 13317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 4)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 55936 - 55904
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55936 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 55904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 108075 - 108107
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  108075 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 108107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 185
Target Start/End: Original strand, 93773 - 93814
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa 185  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||    
T  93773 aaattcgtgctccaattatgatgatatgtatgtatgcatgaa 93814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 144 - 211
Target Start/End: Original strand, 104623 - 104691
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgca-tgaattgataataattgtatgattgttggt 211  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||| ||  ||||||||    
T  104623 aaattcatgctctaactatgatgatatgtttgtatgcattaaattgatgataattgaattgttgttggt 104691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0409
Description:

Target: scaffold0409; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 222
Target Start/End: Original strand, 1348 - 1427
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcat-gaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatg 222  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  ||||| | ||||||| ||  |||||||| ||||| ||||    
T  1348 aaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcataaaattggtgataattggattgttgttggtgaaattgcatg 1427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 222
Target Start/End: Original strand, 9603 - 9682
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcat-gaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatg 222  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  ||||| | ||||||| ||  |||||||| ||||| ||||    
T  9603 aaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcataaaattggtgataattggattgttgttggtgaaattgcatg 9682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 54 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 18058 - 18015
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgt 97  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  18058 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcataattattttgt 18015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0389 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0389
Description:

Target: scaffold0389; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 145 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 10908 - 10854
Alignment:
Q  145 aattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatg-aattgataataattg 198  Q
    ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  10908 aattcgtgctctatctatgatgatatgtttgtatgcatgaaattgatgataattg 10854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0151
Description:

Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 144 - 197
Target Start/End: Original strand, 22422 - 22476
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatg-aattgataataatt 197  Q
    |||||||||||| || | |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  22422 aaattcgtgctctaaatatgatgatatgtttgtatgcatgaaattgatgataatt 22476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1272 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1272
Description:

Target: scaffold1272; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 689 - 632
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttag 70  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | || | |||||||| ||||||||||||||    
T  689 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattagtgataattatggtaagggggttag 632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0700 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0700
Description:

Target: scaffold0700; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 2772 - 2691
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatg-aattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtt 224  Q
    |||||||||||| || | |||||||||||||| ||||||| ||||| | ||||||| ||  |||||||| ||||| ||||||    
T  2772 aaattcgtgctctaattatgatgatatgtttggatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgtt 2691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 7056 - 6999
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttag 70  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||| | |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  7056 taggagctaaagtgaaggttgggctaggaattggtgataattatggtaagggggttag 6999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 224
Target Start/End: Original strand, 22429 - 22510
Alignment:
Q  144 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatg-aattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtt 224  Q
    |||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||  |||||||| || || ||||||    
T  22429 aaattcgtgctctaactaggataatatgtttgtatgcatgaaattgatgataattgaattgttgttggtgaatttgcatgtt 22510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 70
Target Start/End: Original strand, 43651 - 43708
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttag 70  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | || | | |||||||||||||||||||||    
T  43651 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaatttgtgctaattaaggtaagggggttag 43708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 31414 - 31357
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttag 70  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | || | | |||||||||||||||||||||    
T  31414 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaatttgtgctaattaaggtaagggggttag 31357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1560 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold1560
Description:

Target: scaffold1560; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 347 - 391
Target Start/End: Original strand, 72 - 116
Alignment:
Q  347 tgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatga 391  Q
    |||||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||    
T  72 tgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatga 116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0970 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0970
Description:

Target: scaffold0970; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 312 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 2532 - 2476
Alignment:
Q  312 caattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagctgatgaatcattgcttgggtat 368  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||| | |||||| |||| ||||||||||    
T  2532 caattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgttgatgattcatggcttgggtat 2476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 17209 - 17241
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17209 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 17241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 5476 - 5508
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5476 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 5508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0303 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0303
Description:

Target: scaffold0303; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 4346 - 4378
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4346 taaggtaagggggttagactttatcataatcat 4378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 145 - 224
Target Start/End: Original strand, 2317 - 2397
Alignment:
Q  145 aattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtt 224  Q
    |||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||||||| ||| | ||||||| ||  |||||||| ||||| ||||||    
T  2317 aattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgtt 2397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 17304 - 17336
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17304 taaggtaagcgggttagtctttatcataatcat 17336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0173 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0173
Description:

Target: scaffold0173; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 5581 - 5549
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5581 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 5549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 34308 - 34340
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34308 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 34340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 12418 - 12450
Alignment:
Q  54 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 86  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12418 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 12450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 892 times since January 2019
Visitors: 4357