View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0715_low_14 (Length: 375)

Name: NF0715_low_14
Description: NF0715
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0715_low_14
NF0715_low_14
[»] chr7 (24 HSPs)
chr7 (15-301)||(14222824-14223110)
chr7 (1-301)||(16326888-16327188)
chr7 (15-301)||(539868-540157)
chr7 (1-301)||(5395933-5396234)
chr7 (15-301)||(10439447-10439736)
chr7 (15-301)||(12565819-12566108)
chr7 (10-301)||(13355047-13355344)
chr7 (15-301)||(9581721-9582006)
chr7 (1-292)||(8783219-8783510)
chr7 (15-301)||(23513885-23514173)
chr7 (15-301)||(4311543-4311829)
chr7 (15-160)||(13741237-13741385)
chr7 (15-118)||(9729573-9729676)
chr7 (17-157)||(16403565-16403708)
chr7 (15-285)||(4461845-4462117)
chr7 (100-298)||(8716755-8716953)
chr7 (100-298)||(18286516-18286714)
chr7 (126-298)||(16466740-16466912)
chr7 (100-298)||(14549987-14550185)
chr7 (126-298)||(48802983-48803156)
chr7 (126-298)||(13656850-13657022)
chr7 (263-301)||(10432871-10432909)
chr7 (117-298)||(13672765-13672946)
chr7 (126-298)||(15917893-15918066)
[»] chr1 (6 HSPs)
chr1 (15-301)||(27045683-27045972)
chr1 (15-301)||(21785573-21785841)
chr1 (126-298)||(19876799-19876971)
chr1 (100-298)||(20236372-20236570)
chr1 (126-298)||(8651942-8652116)
chr1 (126-298)||(20392409-20392584)
[»] chr8 (18 HSPs)
chr8 (15-301)||(20001117-20001403)
chr8 (15-301)||(17619557-17619846)
chr8 (15-301)||(20040178-20040467)
chr8 (15-301)||(21854885-21855174)
chr8 (100-298)||(22034655-22034853)
chr8 (100-297)||(22100751-22100948)
chr8 (126-298)||(21954996-21955168)
chr8 (126-298)||(22098140-22098312)
chr8 (126-298)||(16419725-16419897)
chr8 (127-298)||(21826303-21826477)
chr8 (100-298)||(21380984-21381182)
chr8 (100-298)||(8313359-8313557)
chr8 (126-272)||(22831959-22832105)
chr8 (100-298)||(8323976-8324174)
chr8 (50-255)||(11348116-11348321)
chr8 (126-298)||(19766414-19766587)
chr8 (100-189)||(22368848-22368937)
chr8 (50-155)||(22903351-22903456)
[»] chr4 (14 HSPs)
chr4 (15-298)||(15348955-15349239)
chr4 (15-301)||(14686881-14687167)
chr4 (15-301)||(11497722-11498011)
chr4 (15-301)||(18290836-18291125)
chr4 (15-298)||(10629563-10629849)
chr4 (15-301)||(42710887-42711173)
chr4 (56-301)||(45235340-45235585)
chr4 (15-220)||(45240047-45240255)
chr4 (126-298)||(15253263-15253435)
chr4 (128-298)||(3353536-3353707)
chr4 (117-295)||(13821817-13821998)
chr4 (100-298)||(22109851-22110049)
chr4 (126-298)||(15261208-15261383)
chr4 (126-298)||(15864422-15864595)
[»] chr5 (17 HSPs)
chr5 (15-301)||(20445957-20446243)
chr5 (15-301)||(23601749-23602038)
chr5 (15-301)||(24939346-24939635)
chr5 (2-301)||(22827868-22828170)
chr5 (15-301)||(18487172-18487461)
chr5 (14-298)||(24218644-24218931)
chr5 (15-301)||(21282020-21282308)
chr5 (19-301)||(23711814-23712095)
chr5 (100-298)||(25007908-25008106)
chr5 (126-298)||(22318609-22318781)
chr5 (100-298)||(15734425-15734623)
chr5 (100-298)||(23746942-23747140)
chr5 (100-298)||(20621054-20621252)
chr5 (126-298)||(30760764-30760939)
chr5 (126-189)||(22947348-22947411)
chr5 (117-295)||(24954302-24954483)
chr5 (242-298)||(21387316-21387373)
[»] chr6 (14 HSPs)
chr6 (15-301)||(22062622-22062909)
chr6 (14-301)||(18852832-18853122)
chr6 (15-301)||(17818332-17818621)
chr6 (15-297)||(18188686-18188967)
chr6 (1-301)||(19586709-19586995)
chr6 (15-282)||(23518879-23519149)
chr6 (15-298)||(25966447-25966733)
chr6 (100-298)||(24856369-24856567)
chr6 (91-156)||(29685446-29685511)
chr6 (130-298)||(30672872-30673039)
chr6 (126-298)||(21561569-21561747)
chr6 (117-295)||(22166680-22166861)
chr6 (117-295)||(20017365-20017546)
chr6 (227-293)||(23344507-23344572)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (15-301)||(51655-51942)
[»] chr3 (27 HSPs)
chr3 (14-301)||(6813677-6813967)
chr3 (15-306)||(9362061-9362355)
chr3 (1-301)||(20562142-20562442)
chr3 (1-301)||(20564450-20564750)
chr3 (1-301)||(20559834-20560134)
chr3 (15-306)||(13096526-13096817)
chr3 (15-301)||(12777613-12777899)
chr3 (15-301)||(13089916-13090205)
chr3 (15-301)||(3246625-3246911)
chr3 (2-95)||(15024497-15024590)
chr3 (100-298)||(7599247-7599445)
chr3 (84-298)||(10145886-10146100)
chr3 (84-298)||(13137294-13137508)
chr3 (100-298)||(13188542-13188740)
chr3 (100-298)||(15630081-15630279)
chr3 (126-298)||(13196554-13196726)
chr3 (126-298)||(13689584-13689756)
chr3 (128-298)||(12188200-12188370)
chr3 (84-298)||(12194614-12194828)
chr3 (50-96)||(20154880-20154926)
chr3 (126-298)||(13505637-13505812)
chr3 (126-298)||(13693796-13693969)
chr3 (100-189)||(16374713-16374802)
chr3 (174-298)||(16654682-16654807)
chr3 (126-298)||(3340341-3340516)
chr3 (127-272)||(12161215-12161360)
chr3 (126-298)||(15945532-15945707)
[»] scaffold0026 (3 HSPs)
scaffold0026 (15-301)||(17173-17462)
scaffold0026 (256-301)||(10218-10263)
scaffold0026 (100-189)||(132518-132607)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (15-301)||(9434-9723)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (15-301)||(8381-8670)
scaffold0012 (15-301)||(12553-12842)
[»] scaffold0566 (1 HSPs)
scaffold0566 (15-299)||(1423-1710)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (15-213)||(29580-29778)
[»] scaffold0485 (1 HSPs)
scaffold0485 (1-301)||(11026-11325)
[»] chr2 (16 HSPs)
chr2 (15-301)||(25339225-25339513)
chr2 (22-187)||(24501140-24501304)
chr2 (100-298)||(12739-12937)
chr2 (100-298)||(22045785-22045983)
chr2 (100-298)||(25356403-25356601)
chr2 (126-299)||(25368744-25368918)
chr2 (126-298)||(24821226-24821400)
chr2 (130-298)||(116425-116596)
chr2 (100-298)||(27626485-27626683)
chr2 (54-91)||(20354200-20354237)
chr2 (128-298)||(23160497-23160670)
chr2 (128-298)||(23571754-23571927)
chr2 (117-295)||(16774565-16774746)
chr2 (117-298)||(27630415-27630599)
chr2 (126-298)||(24170251-24170424)
chr2 (126-255)||(27769969-27770098)
[»] scaffold0206 (1 HSPs)
scaffold0206 (220-301)||(17734-17815)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (164-247)||(22215-22298)
[»] scaffold0402 (1 HSPs)
scaffold0402 (126-298)||(6803-6976)
[»] scaffold0375 (1 HSPs)
scaffold0375 (100-298)||(11420-11619)
[»] scaffold0974 (1 HSPs)
scaffold0974 (126-296)||(41-211)
[»] scaffold0473 (1 HSPs)
scaffold0473 (100-303)||(12929-13132)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (127-276)||(90202-90351)
[»] scaffold0506 (1 HSPs)
scaffold0506 (126-298)||(3179-3353)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (126-298)||(19392-19566)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (126-298)||(19097-19272)
scaffold0004 (126-298)||(253009-253182)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (126-298)||(38864-39037)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (126-298)||(115564-115735)
scaffold0020 (126-298)||(119868-120039)
[»] scaffold0346 (1 HSPs)
scaffold0346 (100-298)||(4715-4914)
[»] scaffold0577 (1 HSPs)
scaffold0577 (100-186)||(4997-5083)
[»] scaffold0525 (1 HSPs)
scaffold0525 (130-298)||(1061-1230)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (126-298)||(32702-32874)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (126-298)||(24487-24662)
[»] scaffold1095 (1 HSPs)
scaffold1095 (100-298)||(2167-2366)
[»] scaffold1571 (1 HSPs)
scaffold1571 (100-189)||(1513-1602)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (126-180)||(21835-21889)
[»] scaffold0216 (1 HSPs)
scaffold0216 (100-298)||(10308-10506)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (225-298)||(12497-12570)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (15-44)||(38002-38031)
[»] scaffold0146 (1 HSPs)
scaffold0146 (126-189)||(21799-21862)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 247; Significance: 1e-137; HSPs: 24)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 15 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 14223110 - 14222824
Alignment:
Q  15 atgatggtggtgatgaagaggaggtaggtgtacaacaccatgaacaagaagccggtggaaactataatgatgaacggtgggccttgatgcaaaccaaagt 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  14223110 atgatggtggtgatgaagaggaggtaggtgcacaacaccatgaacaaaaagccggtggaaactataatgatgaacggtgggcatggatgcaaaccaaagt 14223011  T
Q  115 tcaaagaacatgcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaatgaataaaacaatcaa 214  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14223010 tcaaagaacatgcaccaagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaatgaatgaataaaacaatcaa 14222911  T
Q  215 atgttccgatacatgatgcaacatcttcacctccaaggtccaccttaaggacttcaataaaattgtgagctctcctcttcctctact 301  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14222910 atgttccgatacatgatgcaacaccttcacctccaaggtccaccttatggactacaataaaattgtgagctctcttcttcctctact 14222824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 16327188 - 16326888
Alignment:
Q  1 cccacaggtacacaatgatggtggtgatgaagaggaggtaggtgtacaacaccatgaacaagaagccggtggaaactataatgatgaacggtgggccttg 100  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |    
T  16327188 cccacaggtacaagatgatggtggtgatgaagaggaggtaggtgcacaacaccatgaacaaaaagccggtggacactataatgatgaacggtgggcatgg 16327089  T
Q  101 atgcaaaccaaagttcaaagaacatgcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaatg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  16327088 atgcaaaccaaagttcaaagaacatgcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggagcaatcaaatgaatg 16326989  T
Q  201 aataaaacaatcaaatgttccgatacatgatgcaacatcttcacctccaaggtccaccttaaggacttcaataaaattgtgagctctcctcttcctctac 300  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16326988 aataaaacaatccaatgttccgatacatgatgcaacaccttcacctccaaggtccaccttatggactacaataaaattctgagctctcctcttcctctac 16326889  T
Q  301 t 301  Q
    |    
T  16326888 t 16326888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 15 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 540157 - 539868
Alignment:
Q  15 atgatggtggtgatgaagaggaggtaggtgtacaa---caccatgaacaagaagccggtggaaactataatgatgaacggtgggccttgatgcaaaccaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |    
T  540157 atgatggtggtgatgaagaggaggtaggtgcaaacttgcaccattaacaagaagctggtggaaactataatgatgaacggtaggcattgatgcaaaccga 540058  T
Q  112 agttcaaagaacatgcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaatgaataaaacaat 211  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  540057 agttcaaagaacatgcatcgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaatgaataaaacaat 539958  T
Q  212 caaatgttccgatacatgatgcaacatcttcacctccaaggtccaccttaaggacttcaataaaattgtgagctctcctcttcctctact 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  539957 caaatgttccgatacatgatgcaacatcttcacctccaaggtccaccttatggacttcaataaaattgtgagctctcctcttcctttact 539868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 5395933 - 5396234
Alignment:
Q  1 cccacaggtacacaatgatggtggtgatgaagaggaggtaggtgtacaa---caccatgaacaagaagccggtggaaactataatgatgaacggtgggcc 97  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| | |    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  5395933 cccacaggtacacaatgatggtg---atgaagaggaggtaggtgcaaacttgcaccattaacaagaagccggtggaaactataatgatgaacggtgggca 5396029  T
Q  98 ttgatgcaaaccaaagttcaaagaacatgcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatc-aaata 196  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5396030 tggatgcaaaccgaagttcaaagaacatgcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaaata 5396129  T
Q  197 aatgaataaaacaatcaaatgttccgatacatgatgcaacatcttcacctccaaggtccaccttaaggacttcaataaaattgtgagctctcctcttcct 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5396130 aatgaataaaacaatcaaatgttccgatacatgatgcaacacattcacctccaaggtccaccttatgaacttcaataaaattgtgagctctcctcttcct 5396229  T
Q  297 ctact 301  Q
    |||||    
T  5396230 ctact 5396234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 15 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 10439736 - 10439447
Alignment:
Q  15 atgatggtggtgatgaagaggaggtaggtgtacaa---caccatgaacaagaagccggtggaaactataatgatgaacggtgggccttgatgcaaaccaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |    
T  10439736 atgatggtggtgatgaagaggaggtaggtgcaaacttgcaccattaacaagtagccggtggaaactataatgatgaacggtgggcattgatgcaaactta 10439637  T
Q  112 agttcaaagaacatgcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaatgaataaaacaat 211  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  10439636 agttcaaagaacatgcaccgagcatcaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcactcaaataaatgcataaaacaat 10439537  T
Q  212 caaatgttccgatacatgatgcaacatcttcacctccaaggtccaccttaaggacttcaataaaattgtgagctctcctcttcctctact 301  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10439536 caaatgttctgatacatgatgcaacaccttcacctccaaggtctaccttttggacttcaataaaattgtgagctctcctcttcctctact 10439447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 15 - 301
Target Start/End: Original strand, 12565819 - 12566108
Alignment:
Q  15 atgatggtggtgatgaagaggaggtaggtgtaca---acaccatgaacaagaagccggtggaaactataatgatgaacggtgggccttgatgcaaaccaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |   ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |    
T  12565819 atgatggtggtgatgaagaggaggtaggtgcaaacttacaccattaagaagaagctggtggaaactataatgatgaacggtgggcatggatgcaaaccga 12565918  T
Q  112 agttcaaagaacatgcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaatgaataaaacaat 211  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12565919 agttcaaagaacatgcaccaagcaacaaagacaaagtgttgaaacgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaatgaataaaacaat 12566018  T
Q  212 caaatgttccgatacatgatgcaacatcttcacctccaaggtccaccttaaggacttcaataaaattgtgagctctcctcttcctctact 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12566019 caaatgttccgatacatgatgcaacaccttcacctccaagttctaccttatggacttcaataaaattgtgagctctcctcttcctatact 12566108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 10 - 301
Target Start/End: Original strand, 13355047 - 13355344
Alignment:
Q  10 acacaatgatggtggtgatgaagaggaggtaggtgtacaa---caccatgaacaagaagccggtggaaactataatgatgaacggtgggccttgatgcaa 106  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||    
T  13355047 acacaatgatggtggtgatgaagacgaggtaggtgcaaacttgcaccattaacaagtagccggtggaaactataatgatgaacggtgggaatggatgcaa 13355146  T
Q  107 ---accaaagttcaaagaacatgcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaatgaat 203  Q
       ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  13355147 caaaccgaagttcaaagaacatgcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcacttaaataaatgaat 13355246  T
Q  204 aaaacaatcaaatgttccgatacatgatgcaacatcttcacctccaaggtccaccttaaggacttcaataaaattgtgagctctcctcttcctctact 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13355247 aaaacaatcaaatgttccgatacatgatgcaacaccttcacctccaaggtctaccttatggacttcaataaaattgtgagctctcctcttcctctact 13355344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 15 - 301
Target Start/End: Original strand, 9581721 - 9582006
Alignment:
Q  15 atgatggtggtgatgaagaggaggtaggtgtacaacaccatgaacaagaagccggtggaaactataatgatgaacggtgggccttgatgcaaaccaaagt 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||    
T  9581721 atgatggtggtgatgaagaggaggtaggtgcacaacaccatgaacaaaaagccggtggaaactataatgataaacggtgggcatggatgcaaaccaaagt 9581820  T
Q  115 tcaaagaacatgcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaatgaataaaacaatcaa 214  Q
    ||||| || || ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9581821 tcaaataatatacactgagcaacaaaaacaaggtgttgaaatggtcgggataagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaatgaataacacaatcaa 9581920  T
Q  215 atgttccgatacatgatgcaacatcttcacctccaaggtccaccttaaggacttcaataaaattgtgagctctcctcttcctctact 301  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9581921 atgttccgat-catgatgcaacaccttcacctccaaggtccaccttgtggatttccataaaattgtgagctctcctcttcctctact 9582006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 8783510 - 8783219
Alignment:
Q  1 cccacaggtacacaatgatggtggtgatgaagaggaggtaggtgtacaacaccatgaacaagaagccggtggaaactataatgatgaacggtgggccttg 100  Q
    |||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  8783510 cccacatgtacaagatcatggtggtgatgaagaggaggtaggtgcacaacaccatgaacaagaatccggtggaaactataatgatgaacggtgggcgtgg 8783411  T
Q  101 atgcaaaccaaagttcaaagaacatgcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaatg 200  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  8783410 atgcaaaccgaagttcaaagaatatgcaccgagcaacaaagacaaagtgttgaaatggtcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcaattgaataaatg 8783311  T
Q  201 aataaaacaatcaaatgttccgatacatgatgcaacatcttcacctccaaggtccaccttaaggacttcaataaaattgtgagctctcctct 292  Q
    || |||| ||||||||| ||  | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  8783310 aagaaaataatcaaatgctctaaaacatgatgctacaccttcacctccaaggtccaccttatggacctcaataaaattgtgagctttcctct 8783219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 15 - 301
Target Start/End: Original strand, 23513885 - 23514173
Alignment:
Q  15 atgatggtggtgatgaagaggaggtaggtgtacaa---caccatgaacaagaagccggtggaaactataatgatgaacggtgggccttgatgcaaaccaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |    |||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||| | ||||||||||||    
T  23513885 atgatggtggtgatgaagaggaggtaggtgcaaacttgcaccatgaacaaaaagccggtggaaactataa-gaagaacggtgggcatggatgcaaaccaa 23513983  T
Q  112 agttcaaagaacatgcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaatgaataaaacaat 211  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23513984 agttcaaagaatattcaccgagcaacaatgacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaatgatgtcctaaggggcaatcaaataaatgaataacacaat 23514083  T
Q  212 caaatgttccgatacatgatgcaacatcttcacctccaaggtccaccttaaggacttcaataaaattgtgagctctcctcttcctctact 301  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23514084 ccaatgttccgatacatgatgcaacaccttcacctctaaggtccaccttctagacttcaataaaattgtgagctttcctcttcctctact 23514173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 15 - 301
Target Start/End: Original strand, 4311543 - 4311829
Alignment:
Q  15 atgatggtggtgatgaagaggaggtaggtgtacaacaccatgaacaagaagccggtggaaactataatgatgaacggtgggccttgatgcaaaccaaagt 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| ||||    
T  4311543 atgatggtggtgatgaagaggaggtaggtgcacaacgccatgaaaaagaagctggtggaaactataatgatgaacggtgggcatggatgtaaaccgaagt 4311642  T
Q  115 tcaaagaacatgcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaatgaataaaacaatcaa 214  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4311643 tcaaggaatatgcaccgagcaacaaaaacaaggtgttgaaatggtcgggataagaaacgatgtcctaaggggcaatcgaataaatgaataaaacaatcaa 4311742  T
Q  215 atgttccgatacatgatgcaacatcttcacctccaaggtccaccttaaggacttcaataaaattgtgagctctcctcttcctctact 301  Q
    ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | || |||||||||||||||| | |||||||||| ||||    
T  4311743 atgctccgaaacatgatgcaacaccttcacctccaaggtccacctaatgaacctcaataaaattgtgagttttcctcttcctttact 4311829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 15 - 160
Target Start/End: Original strand, 13741237 - 13741385
Alignment:
Q  15 atgatggtggtgatgaagaggaggtaggtgtacaa---caccatgaacaagaagccggtggaaactataatgatgaacggtgggccttgatgcaaaccaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |    
T  13741237 atgatggtggtgatgaagaggaggtaggtgcaaacttgcaccatgaacaagaagccggtggaaactataatgatgaacggtgggcatggatgcaaaccga 13741336  T
Q  112 agttcaaagaacatgcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatc 160  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13741337 agttcaaagaatatgcaccgagcaacgaagacaaggtgttgaaatgatc 13741385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 118
Target Start/End: Original strand, 9729573 - 9729676
Alignment:
Q  15 atgatggtggtgatgaagaggaggtaggtgtacaacaccatgaacaagaagccggtggaaactataatgatgaacggtgggccttgatgcaaaccaaagt 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||    
T  9729573 atgatggtggtgatgaagaggaggtaggtgcacaacaccatgaacaaaaagccggtggaaactataatgataaacggtgggcatggatgcaaaccaaagt 9729672  T
Q  115 tcaa 118  Q
    ||||    
T  9729673 tcaa 9729676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 17 - 157
Target Start/End: Original strand, 16403565 - 16403708
Alignment:
Q  17 gatggtggtgatgaagaggaggtaggtgtacaa---caccatgaacaagaagccggtggaaactataatgatgaacggtgggccttgatgcaaaccaaag 113  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||    |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  16403565 gatgatggtgatgaagaggaggtaggtgcacacttgcaccataaacaagatgccggtgggaactataatgatgaacggtgggcatggatgcaaaccaaag 16403664  T
Q  114 ttcaaagaacatgcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatg 157  Q
    ||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  16403665 ttcaaagaataagcaccgaacaacaaagacatggtgctgaaatg 16403708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 4462117 - 4461845
Alignment:
Q  15 atgatggtggtgatgaagaggaggtaggtgtacaa---caccatgaacaagaagccggtggaaactataatgatgaacggtgggccttgatgcaaaccaa 111  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || || |||    ||| |||||||||||| ||||||  ||||| |||||||| ||||||| | |||||||||| |    
T  4462117 atgatgatggtgatgaagaggaggaagatgcacacttgcactatgaacaagaagtcggtgggcactatgatgatgaatggtgggcatggatgcaaaccga 4462018  T
Q  112 agttcaaagaacatgcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaatgaataaaacaat 211  Q
    | | |||||||   || | |||||||||||| ||||| |||||||   ||||||  | || ||||||| |||||| ||||||||| ||||| |||||||     
T  4462017 actacaaagaatgagccctgagcaacaaagataaggttttgaaatctccgggctgcggaatgatgtccaaaggggaaatcaaatacatgaagaaaacaac 4461918  T
Q  212 caaatgttccgatacatgatgcaacatcttcacctccaaggtccaccttaaggacttcaataaaattgtgagct 285  Q
    |  |||||   |   ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| || ||| ||| | ||||||||||||    
T  4461917 cgcatgttattaaggatgatgcaacatcttaacctccaaggtcctcctcaatgacctcagt-aaattgtgagct 4461845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 100 - 298
Target Start/End: Original strand, 8716755 - 8716953
Alignment:
Q  100 gatgcaaaccaaagttcaaagaacatgcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaat 199  Q
    |||||||||| | || ||||| | | |||||||||||||||| |||||||||||| |   |||||||||||| ||||||||| ||||||| |  |||       
T  8716755 gatgcaaaccgaggtacaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattatccgggctaagaaatgatgtcctacggggcaaccgcatatcc 8716854  T
Q  200 gaataaaacaatcaaatgttccgatacatgatgcaacatcttc-acctccaaggtccaccttaaggacttcaataaaattgtgagctctcctcttcctct 298  Q
    ||| |||| || |||||| | ||  ||||||||||||| |||| |||||||||| || || || |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  8716855 gaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaaca-cttcaacctccaaggccctccctatggacctcaataaaaatgtgagctttcctcttcctct 8716953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 100 - 298
Target Start/End: Original strand, 18286516 - 18286714
Alignment:
Q  100 gatgcaaaccaaagttcaaagaacatgcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaat 199  Q
    |||||||||| | || ||||| | | |||||||||||||||| |||||||||||| |   |||||||||||| ||||||||| ||||||| |  |||       
T  18286516 gatgcaaaccgaggtacaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattatccgggctaagaaatgatgtcctacggggcaaccgcatatcc 18286615  T
Q  200 gaataaaacaatcaaatgttccgatacatgatgcaacatcttc-acctccaaggtccaccttaaggacttcaataaaattgtgagctctcctcttcctct 298  Q
    ||| |||| || |||||| |  |  ||||||||||||| |||| |||||||||| || || || |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  18286616 gaagaaaataaccaaatgctttggaacatgatgcaaca-cttcaacctccaaggccctccctatggacctcaataaaaatgtgagctttcctcttcctct 18286714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 126 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 16466912 - 16466740
Alignment:
Q  126 gcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaatgaataaaacaatcaaatgttccgata 225  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |   |||||||||||| ||||||||| ||||||| |  |||   ||| |||| || |||||| | ||  |    
T  16466912 gcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattatccgggctaagaaatgatgtcctacggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggca 16466813  T
Q  226 catgatgcaacatcttc-acctccaaggtccaccttaaggacttcaataaaattgtgagctctcctcttcctct 298  Q
    |||||||||||| |||| ||||||| || || || || |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  16466812 catgatgcaaca-cttcaacctccatggccctccctatggacctcaataaaaatgtgagctttcctcttcctct 16466740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 100 - 298
Target Start/End: Original strand, 14549987 - 14550185
Alignment:
Q  100 gatgcaaaccaaagttcaaagaacatgcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaat 199  Q
    |||||||||| | || ||||| | | |||||||||||||||| |||||||||||| |   ||||||||||||  |||||||| ||||||| |  |||       
T  14549987 gatgcaaaccgaggtacaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattatccgggctaagaaataatgtcctacggggcaaccgcatatcc 14550086  T
Q  200 gaataaaacaatcaaatgttccgatacatgatgcaacatcttc-acctccaaggtccaccttaaggacttcaataaaattgtgagctctcctcttcctct 298  Q
    ||| |||| || |||||| | ||  ||||||||||||| |||| |||||||||| || || || |||| ||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  14550087 gaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaaca-cttcaacctccaaggccctccctatggacctcaataaaaatgtgagatttcctcttcctct 14550185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 126 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 48803156 - 48802983
Alignment:
Q  126 gcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaatgaataaaacaatcaaatgttccgata 225  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |   |||||||||||| ||||| ||| ||||||| |  || |  ||| | || ||||||||| | ||  |    
T  48803156 gcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattatccgggctaagaaatgatgttctacggggcaaccgcatcaccgaagagaataatcaaatgcttcggaa 48803057  T
Q  226 catgatgcaacatcttcacctccaaggtccaccttaaggacttcaat-aaaattgtgagctctcctcttcctct 298  Q
    ||||||||||||  | |||||||||||||| || || |||| ||||| || | |||||||| ||||||||||||    
T  48803056 catgatgcaacacttccacctccaaggtcctccctatggacctcaatgaacaatgtgagctttcctcttcctct 48802983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 126 - 298
Target Start/End: Original strand, 13656850 - 13657022
Alignment:
Q  126 gcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaatgaataaaacaatcaaatgttccgata 225  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||| |   ||||||||| || ||||||||||| ||||| |  |||   ||| | || || |||||| | ||  |    
T  13656850 gcaccgaacaacaaaggcaaggtgttgaattatccgggctaaggaatgatgtcctaagaggcaaccgcatatccgaagagaataaccaaatgcttcggaa 13656949  T
Q  226 catgatgcaacatcttcacctccaaggtccaccttaaggacttcaataaaattgtgagctctcctcttcctct 298  Q
    ||||||| ||||  | |||||||||||||| || || |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  13656950 catgatggaacacttccacctccaaggtcctccctatggacctcaataaaaatgtgagctttcctcttcctct 13657022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 263 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 10432909 - 10432871
Alignment:
Q  263 ggacttcaataaaattgtgagctctcctcttcctctact 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10432909 ggacttcaataaaattgtgagctctcctcttcctctact 10432871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 117 - 298
Target Start/End: Original strand, 13672765 - 13672946
Alignment:
Q  117 aaagaacatgcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatc-gggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaatgaataaaacaatcaaa 215  Q
    |||||| | |||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| |  |||   ||| |||| || ||||    
T  13672765 aaagaataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttg-aattatctgggctaagaaatgatgtcctacggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaa 13672863  T
Q  216 tgttccgatacatgatgcaacatcttcacctccaaggtccaccttaaggacttcaataaaattgtgagctctcctcttcctct 298  Q
    || | ||  |||||||||||||  | ||||| || || ||  | || |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  13672864 tgcttcggaacatgatgcaacacttgcaccttcagggccctacctatggacctcaataaaaatgtgagctttcctcttcctct 13672946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 126 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 15918066 - 15917893
Alignment:
Q  126 gcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcggg-ctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaatgaataaaacaatcaaatgttccgat 224  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||| ||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||| |  |||   ||| |||| || |||||| | ||      
T  15918066 gcaccgagcaactaaggcaaggtgttg-aattatcgggactaaggaatgatgtcctaaggggcaaccgcatattcgaagaaaataaccaaatgcttcgga 15917968  T
Q  225 acatgatgcaacatcttcacctccaaggtccaccttaaggacttcaat-aaaattgtgagctctcctcttcctct 298  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| ||||| || ||  ||  ||||| |||| |||||||| ||||||||||||    
T  15917967 acatgatgcaccattttcacctccacggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtgagctttcctcttcctct 15917893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 244; Significance: 1e-135; HSPs: 6)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 15 - 301
Target Start/End: Original strand, 27045683 - 27045972
Alignment:
Q  15 atgatggtggtgatgaagaggaggtaggtgtacaa---caccatgaacaagaagccggtggaaactataatgatgaacggtgggccttgatgcaaaccaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |    
T  27045683 atgatggtggtgatgaagaggaggtaggtgcaaacttgcaccattaacaagaagccggtggaaactataatgatgaatggtgggcattgatgcaaaccga 27045782  T
Q  112 agttcaaagaacatgcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaatgaataaaacaat 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27045783 agttcaaagaacatgcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaatgaataaaacaat 27045882  T
Q  212 caaatgttccgatacatgatgcaacatcttcacctccaaggtccaccttaaggacttcaataaaattgtgagctctcctcttcctctact 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27045883 caaatgttccgatacatgatgcaacatcttcacctccaaggtccaccttaaggacttcaataaaattgtgagctctcctcttcctttact 27045972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 15 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 21785841 - 21785573
Alignment:
Q  15 atgatggtggtgatgaagaggaggtaggtgtacaa---caccatgaacaagaagccggtggaaactataatgatgaacggtgggccttgatgcaaaccaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |    
T  21785841 atgatggtggtgatgaagaggaggtaggtgcaaacttgcaccattaacaagaagtcggtggaaactataatgatgaacggtgggcatggatgcaaaccga 21785742  T
Q  112 agttcaaagaacatgcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaatgaataaaacaat 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||                       
T  21785741 agttcaaagaacatgcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggttaagaaacgatgtcctaaggggcaatca------------------- 21785661  T
Q  212 caaatgttccgatacatgatgcaacatcttcacctccaaggtccaccttaaggacttcaataaaattgtgagctctcctcttcctctact 301  Q
      |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21785660 --aatgttccgatacatgatgcaacaccttcacctccaagatccaccttatggactacaataaaattgtgagctctcatcttcctctact 21785573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 126 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 19876971 - 19876799
Alignment:
Q  126 gcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaatgaataaaacaatcaaatgttccgata 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |   | |||||||||| ||||||||||||||||| || || |  ||| |||||||||||||| | ||| |    
T  19876971 gcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaactctccaggctaagaaatgatgtcctaaggggcaaccacatgaccgaagaaaacaatcaaatgcttcgaaa 19876872  T
Q  226 catgatgcaacatcttcacctccaaggtccaccttaaggacttcaataaaattgtgagctctcctcttcctct 298  Q
    ||||||| | ||  | |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  19876871 catgatggagcacttccacctccaaggtcctccttatggacctcaataaaaatgtgagatttcctcttcctct 19876799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 100 - 298
Target Start/End: Original strand, 20236372 - 20236570
Alignment:
Q  100 gatgcaaaccaaagttcaaagaacatgcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaat 199  Q
    |||||||||| | || ||||| | | |||||||||||||||| |||||||||||| |   |||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||       
T  20236372 gatgcaaaccgaggtacaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattatccgggctaagaaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatcc 20236471  T
Q  200 gaataaaacaatcaaatgttccgatacatgatgcaacatcttc-acctccaaggtccaccttaaggacttcaataaaattgtgagctctcctcttcctct 298  Q
    ||| |||| || |||||| | ||  ||||||||||||| |||| |||||||||| || || || |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  20236472 gaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaaca-cttcaacctccaaggccctccctatggacctcaataaaaatgtgagctttcctcttcctct 20236570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 126 - 298
Target Start/End: Original strand, 8651942 - 8652116
Alignment:
Q  126 gcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaatgaataaaacaatcaaatgttccgata 225  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |  |||   ||| | || ||||||||| | ||  |    
T  8651942 gcaccgagcaacaaaggcaatgtgttgaact-atcgggctaagaaatgatgtcctaagggacaaccgtatatccgaagagaataatcaaatgcttcggaa 8652040  T
Q  226 catgatgcaacatcttcacctccaaggtccaccttaaggacttcaataa---aattgtgagctctcctcttcctct 298  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| | ||||| |||| ||||| |   || |||||||| ||||||||||||    
T  8652041 catgatgcaacatctcaacctccaaggttctccttatggacctcaatgaatcaaatgtgagctttcctcttcctct 8652116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 126 - 298
Target Start/End: Original strand, 20392409 - 20392584
Alignment:
Q  126 gcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaatgaataaaacaatcaaatgttccgata 225  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| | || ||  |||| |||||||||| ||||||||| |  |||   ||| | ||||| |||||| | ||  |    
T  20392409 gcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattaatgggaataaggaacgatgtccaaaggggcaaccgcatatccgaagagaacaaccaaatgcttcggaa 20392508  T
Q  226 catgatgcaacatcttcacctccaaggtccaccttaaggacttca---ataaaattgtgagctctcctcttcctct 298  Q
    ||||||||| ||  |||||||||||||||| || || |||| |||   |||||| | |||||| ||||||||||||    
T  20392509 catgatgcaccactttcacctccaaggtcctccatatggacctcaatgataaaaatttgagctttcctcttcctct 20392584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 243; Significance: 1e-134; HSPs: 18)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 15 - 301
Target Start/End: Original strand, 20001117 - 20001403
Alignment:
Q  15 atgatggtggtgatgaagaggaggtaggtgtacaacaccatgaacaagaagccggtggaaactataatgatgaacggtgggccttgatgcaaaccaaagt 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  20001117 atgatggtggtgatgaagaggaggtaggtgcacaacaccatgaacaaaaagccggtggaaactataatgatgaacggtgggcatggatgcaaaccaaagt 20001216  T
Q  115 tcaaagaacatgcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaatgaataaaacaatcaa 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |    
T  20001217 tcaaagaacatgcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaatgaatgaatcaaacaatcca 20001316  T
Q  215 atgttccgatacatgatgcaacatcttcacctccaaggtccaccttaaggacttcaataaaattgtgagctctcctcttcctctact 301  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20001317 atgttccgatacatgatgcaacaccttcacctccaaggtccaccttatggactacaataaaattgtgagctctcctcttcttctact 20001403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 15 - 301
Target Start/End: Original strand, 17619557 - 17619846
Alignment:
Q  15 atgatggtggtgatgaagaggaggtaggtgtacaa---caccatgaacaagaagccggtggaaactataatgatgaacggtgggccttgatgcaaaccaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||    
T  17619557 atgatggtggtgatgaagaggaggtaggtgcaaacttgcaccattaacaagaagccggtggaaactataatgatgaacggtgggcatggatgcaaatcaa 17619656  T
Q  112 agttcaaagaacatgcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaatgaataaaacaat 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17619657 agttcaaagaacatgcaccgagcaataaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcagtcaaataaatgaataaaacaat 17619756  T
Q  212 caaatgttccgatacatgatgcaacatcttcacctccaaggtccaccttaaggacttcaataaaattgtgagctctcctcttcctctact 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17619757 caaatgttccgatacatgatgcaacaccttcacctccaaggtctaccttatggacttcaataaaattgtgagctctcctcttcctctact 17619846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 15 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 20040467 - 20040178
Alignment:
Q  15 atgatggtggtgatgaagaggaggtaggtgtacaa---caccatgaacaagaagccggtggaaactataatgatgaacggtgggccttgatgcaaaccaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  20040467 atgatggtggtgatgaagaggaggtaggtgcaaacttgcaccattaacaagaagccggtggaaactataatgatgaacggtgggcattgatgcaaaccga 20040368  T
Q  112 agttcaaagaacatgcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaatgaataaaacaat 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20040367 agttcaaagaacatgcaccgagcaataaagacaaggtgttgaaatgatcaggctaagaaacgatttcctaaggggcaatcaaataaatgaataaaacaat 20040268  T
Q  212 caaatgttccgatacatgatgcaacatcttcacctccaaggtccaccttaaggacttcaataaaattgtgagctctcctcttcctctact 301  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20040267 caaatgtttcgatacatgatgcaacatcttcacctccaaggtccaccttatggacttcaataaaattgtgagctctcctcttcctttact 20040178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 15 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 21855174 - 21854885
Alignment:
Q  15 atgatggtggtgatgaagaggaggtaggtgtacaac----accatgaacaagaagccggtggaaactataatgatgaacggtgggccttgatgcaaacca 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  21855174 atgatggtggtgatgaagaggaggtaggtgca-aacttgtaccattaacaagaagccggtggaaactataatgatgaacggtgggcatggatgcaaacca 21855076  T
Q  111 aagttcaaagaacatgcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaatgaataaaacaa 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  21855075 aagttcaaagaacatgcaccgagcaataaagacaagatgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcactcaaataaacgaataaaacaa 21854976  T
Q  211 tcaaatgttccgatacatgatgcaacatcttcacctccaaggtccaccttaaggacttcaataaaattgtgagctctcctcttcctctact 301  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21854975 tcaaatgtttcgatacatgatgcaacaccttcacctccaaggtctaccttatggacttcaataaaattgtgagctctcctcttcctctact 21854885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 100 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 22034853 - 22034655
Alignment:
Q  100 gatgcaaaccaaagttcaaagaacatgcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaat 199  Q
    |||||||||| | || ||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||| |   |||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||       
T  22034853 gatgcaaaccgaggtacaaagaataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattatccgggctaagaaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatcc 22034754  T
Q  200 gaataaaacaatcaaatgttccgatacatgatgcaacatcttc-acctccaaggtccaccttaaggacttcaataaaattgtgagctctcctcttcctct 298  Q
    ||| |||| ||||||||| | ||  ||||||||||||| |||| ||||||||| ||| || || |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  22034753 gaagaaaataatcaaatgcttcggaacatgatgcaaca-cttcaacctccaagttcctccctatggacctcaataaaaatgtgagctttcctcttcctct 22034655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 100 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 22100948 - 22100751
Alignment:
Q  100 gatgcaaaccaaagttcaaagaacatgcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaat 199  Q
    |||||||||| | || ||||| | | |||||||||||||||| |||||||||||| |   |||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||       
T  22100948 gatgcaaaccgaggtacaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattatccgggctaagaaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatcc 22100849  T
Q  200 gaataaaacaatcaaatgttccgatacatgatgcaacatcttc-acctccaaggtccaccttaaggacttcaataaaattgtgagctctcctcttcctc 297  Q
    ||| |||| || |||||| | ||  ||||||||||||| |||| ||||||||||||| || || |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  22100848 gaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaaca-cttcaacctccaaggtcctccctatggacctcaataaaaatgtgagctttcctcttcctc 22100751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 126 - 298
Target Start/End: Original strand, 21954996 - 21955168
Alignment:
Q  126 gcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaatgaataaaacaatcaaatgttccgata 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||   ||| |||| || |||||| |  |  |    
T  21954996 gcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaattatccgggctaagaaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttaggaa 21955095  T
Q  226 catgatgcaacatcttc-acctccaaggtccaccttaaggacttcaataaaattgtgagctctcctcttcctct 298  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||| || || || |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  21955096 catgatgcaaca-cttcaacctccaaggccctccctatggacctcaataaaaatgtgagctttcctcttcctct 21955168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 126 - 298
Target Start/End: Original strand, 22098140 - 22098312
Alignment:
Q  126 gcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaatgaataaaacaatcaaatgttccgata 225  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||| |   |||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||   ||| |||| || |||||| | ||  |    
T  22098140 gcactgagcaacaaaggcaaggtgttgaattatccgggctaagaaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaa 22098239  T
Q  226 catgatgcaacatcttc-acctccaaggtccaccttaaggacttcaataaaattgtgagctctcctcttcctct 298  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||| || || |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  22098240 catgatgcaaca-cttcaacctccaaggtcctccctatggacctcaataaaaatgtgagctttcctcttcctct 22098312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 126 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 16419897 - 16419725
Alignment:
Q  126 gcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaatgaataaaacaatcaaatgttccgata 225  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||| |   ||||||||| || ||||||||||| ||||| |  |||   ||| | || || |||||| | ||  |    
T  16419897 gcaccgaacaacaaaggcaaggtgttgaattatccgggctaaggaatgatgtcctaagaggcaaccgcatatccgaagagaataaccaaatgcttcggaa 16419798  T
Q  226 catgatgcaacatcttcacctccaaggtccaccttaaggacttcaataaaattgtgagctctcctcttcctct 298  Q
    ||||||||||||  | |||||||||||||| || || |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  16419797 catgatgcaacacttccacctccaaggtcctccctatggacctcaataaaaatgtgagctttcctcttcctct 16419725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 127 - 298
Target Start/End: Original strand, 21826303 - 21826477
Alignment:
Q  127 caccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaatgaataaaacaatcaaatgttccgatac 226  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | || ||  |||| |||||||||| ||||||||| || |||   ||| ||||||| |||||| | ||  ||    
T  21826303 caccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattaatgggaataaggaacgatgtccaaaggggcaaccacatatccgaagaaaacaaccaaatgcttcggaac 21826402  T
Q  227 atgatgcaacatcttcacctccaaggtccaccttaaggacttca---ataaaattgtgagctctcctcttcctct 298  Q
    |||||||| ||  |||||||||||||||| || || ||||  ||   |||||| |||||||| ||||||||||||    
T  21826403 atgatgcaccactttcacctccaaggtcctccatatggaccccaatgataaaaatgtgagctttcctcttcctct 21826477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 100 - 298
Target Start/End: Original strand, 21380984 - 21381182
Alignment:
Q  100 gatgcaaaccaaagttcaaagaacatgcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatc-gggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaa 198  Q
    |||||||||| | || ||||| | | |||||||||||||||| |||||||| ||| | ||| ||||||||||| ||||||||| | ||||| |  |||      
T  21380984 gatgcaaaccgaggtacaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgtcgaatt-atctgggctaagaaatgatgtcctacgaggcaaccgcatatc 21381082  T
Q  199 tgaataaaacaatcaaatgttccgatacatgatgcaacatcttc-acctccaaggtccaccttaaggacttcaataaaattgtgagctctcctcttcctc 297  Q
     ||| |||| || |||||| | ||  ||||||||||||| |||| |||||||||| || || || |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  21381083 cgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaaca-cttcaacctccaaggccctccctatggacctcaataaaaatgtgagctttcctcttcctc 21381181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 100 - 298
Target Start/End: Original strand, 8313359 - 8313557
Alignment:
Q  100 gatgcaaaccaaagttcaaagaacatgcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatc-gggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaa 198  Q
    |||||||||| | || ||||| | | |||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||  ||||||| |  |||      
T  8313359 gatgcaaaccgaggtacaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttg-aattatctgggctaagaaatgatgtccttcggggcaaccgcatatc 8313457  T
Q  199 tgaataaaacaatcaaatgttccgatacatgatgcaacatcttcacctccaaggtccaccttaaggacttcaataaaattgtgagctctcctcttcctct 298  Q
     ||| |||| || || ||| | ||  |||||||||||||| | ||||| || || || || || |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  8313458 cgaagaaaataaccacatgcttcggaacatgatgcaacatttacaccttcagggccctccctatggacctcaataaaaatgtgagctttcctcttcctct 8313557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 126 - 272
Target Start/End: Original strand, 22831959 - 22832105
Alignment:
Q  126 gcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaatgaataaaacaatcaaatgttccgata 225  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||| |   | |||||||||| ||||||||||||||||| || ||    ||| | || ||||||||  | ||| |    
T  22831959 gcaccgagcaacaaaggcaagatgttgaattacccaggctaagaaatgatgtcctaaggggcaaccacatcttcgaagagaataatcaaatacttcgaaa 22832058  T
Q  226 catgatgcaacatcttcacctccaaggtccaccttaaggacttcaat 272  Q
    ||||||||||||  | |||||||||||||| ||||| |||| |||||    
T  22832059 catgatgcaacacttccacctccaaggtcctccttatggacctcaat 22832105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 100 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 8324174 - 8323976
Alignment:
Q  100 gatgcaaaccaaagttcaaagaacatgcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatc-gggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaa 198  Q
    |||||||||| | || ||||| | | |||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||| | ||||| |  |||      
T  8324174 gatgcaaaccgaggtacaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttg-aattatctgggctaagaaatgatgtcctacgaggcaaccgcatatc 8324076  T
Q  199 tgaataaaacaatcaaatgttccgatacatgatgcaacatcttcacctccaaggtccaccttaaggacttcaataaaattgtgagctctcctcttcctct 298  Q
     ||| |||| || | |||| | ||  |||||||||||||  | ||||| || || || || || |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  8324075 cgaagaaaataaccgaatgcttcggaacatgatgcaacacttacaccttcagggccctccctatggacctcaataaaaatgtgagctttcctcttcctct 8323976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 11348321 - 11348116
Alignment:
Q  50 caccatgaacaagaagccggtggaaactataatgatgaacggtgggccttgatgcaaaccaaagttcaaagaacatgcaccgagcaacaaagacaaggtg 149  Q
    |||||||| || ||| |||| |||||| || || ||||| | ||| | | |||||||||| | ||| |||| | | |||||||||||| ||| |||||||    
T  11348321 caccatgaccatgaaaccggaggaaacaatgataatgaaagatggacatggatgcaaaccgaggttgaaaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtg 11348222  T
Q  150 ttgaaatgatcggg-ctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaatgaataaaacaatcaaatgttccgatacatgatgcaacatcttcacctcc 248  Q
     | |||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||| |  |||   ||| |||| || |||||| | ||  |||||||||| ||| |||||||||    
T  11348221 -tcaaattatcgggactaaggaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctcc 11348123  T
Q  249 aaggtcc 255  Q
    |||||||    
T  11348122 aaggtcc 11348116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 126 - 298
Target Start/End: Original strand, 19766414 - 19766587
Alignment:
Q  126 gcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcggg-ctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaatgaataaaacaatcaaatgttccgat 224  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||| || ||||| ||||| || |||||||||| ||| ||||  |||   ||| |||| || |||||| | ||      
T  19766414 gcaccgagcaaaaaaggcaaggtgttgaattg-tcgggactaaggaatgatgtcctaaagggaaatcgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcgga 19766512  T
Q  225 acatgatgcaacatcttcacctccaaggtccaccttaaggacttcaat-aaaattgtgagctctcctcttcctct 298  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||| |||| || || | || ||||| |||| |||||||| ||||||||||||    
T  19766513 acatgatgcaccattttcacctccaaagtcctccctatgaacctcaatgaaaaatgtgagctttcctcttcctct 19766587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 100 - 189
Target Start/End: Original strand, 22368848 - 22368937
Alignment:
Q  100 gatgcaaaccaaagttcaaagaacatgcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcaa 189  Q
    |||||||||| | ||| |||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||| |    |||||  |||| |||||||||||||||||    
T  22368848 gatgcaaaccgaggttgaaaggatatgcaccgagtaacaaaggcaaggtgttgaattatgagggctccgaaatgatgtcctaaggggcaa 22368937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 155
Target Start/End: Original strand, 22903351 - 22903456
Alignment:
Q  50 caccatgaacaagaagccggtggaaactataatgatgaacggtgggccttgatgcaaaccaaagttcaaagaacatgcaccgagcaacaaagacaaggtg 149  Q
    |||||||| ||||||||||||||| | ||| |  | || |||||| | | |||||||| | || | ||||||| | |||| |||||||||||||||||||    
T  22903351 caccatgaccaagaagccggtggacaatatgacaaggatcggtggacatggatgcaaaacgaaatccaaagaataagcactgagcaacaaagacaaggtg 22903450  T
Q  150 ttgaaa 155  Q
     |||||    
T  22903451 ctgaaa 22903456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 241; Significance: 1e-133; HSPs: 14)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 15 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 15349239 - 15348955
Alignment:
Q  15 atgatggtggtgatgaagaggaggtaggtgtacaacaccatgaacaagaagccggtggaaactataatgatgaacggtgggccttgatgcaaaccaaagt 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||    
T  15349239 atgatggtggtgatgaagaggaggtaggtgcacaacaccatgaacaaaaagccggtggaaactataatgatgaacggtgggcatggatgcaaaccgaagt 15349140  T
Q  115 tcaaagaacatgcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatc-aaataaatgaataaaacaatca 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  15349139 tcaaagaacatgcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaaataaatgaataaaataatca 15349040  T
Q  214 aatgttccgatacatgatgcaacatcttcacctccaaggtccaccttaaggacttcaataaaattgtgagctctcctcttcctct 298  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15349039 aatgttccgatacatgatgcaacaccttcacctccaaggtccaccttatgaacttcaataaaattgtgagctctcctcttcctct 15348955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 15 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 14687167 - 14686881
Alignment:
Q  15 atgatggtggtgatgaagaggaggtaggtgtacaacaccatgaacaagaagccggtggaaactataatgatgaacggtgggccttgatgcaaaccaaagt 114  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||    
T  14687167 atgatggtggtgatgaataggaggtaggtgcacaacaccatgaacaaaaagccggtggaaactataatgatgaacagtgggcatggatgcaaaccaaagt 14687068  T
Q  115 tcaaagaacatgcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaatgaataaaacaatcaa 214  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  14687067 taaaagaacatgcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcaggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatacaataaatgaataaaacaatcaa 14686968  T
Q  215 atgttccgatacatgatgcaacatcttcacctccaaggtccaccttaaggacttcaataaaattgtgagctctcctcttcctctact 301  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14686967 atgttctgatacatgatgcaacaccttcacctccaaggtccaccttatggacttcaataaaattgtgagctctcctcttcctctact 14686881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 15 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 11498011 - 11497722
Alignment:
Q  15 atgatggtggtgatgaagaggaggtaggtgtacaa---caccatgaacaagaagccggtggaaactataatgatgaacggtgggccttgatgcaaaccaa 111  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| | |    |||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |    
T  11498011 atgatggtggtgataaagaggaggtaggtgcaaacttgcaccattaacaacaagacggtggaaactataatgatgaacggtgggcatggatgcaaaccga 11497912  T
Q  112 agttcaaagaacatgcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaatgaataaaacaat 211  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11497911 tgttcaaagaacatgcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaatgaataaaacaat 11497812  T
Q  212 caaatgttccgatacatgatgcaacatcttcacctccaaggtccaccttaaggacttcaataaaattgtgagctctcctcttcctctact 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11497811 caaatgttccgatacatgatgcaacaccttcacctccaaggtccaccttatggacttcaataaaattgtgagctctcctcttcctctact 11497722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 15 - 301
Target Start/End: Original strand, 18290836 - 18291125
Alignment:
Q  15 atgatggtggtgatgaagaggaggtaggtgtacaa---caccatgaacaagaagccggtggaaactataatgatgaacggtgggccttgatgcaaaccaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| |    
T  18290836 atgatggtggtgatgaagaggaggtaggtgcaaacttgcaccattaacaagaagccggtggaaactataatgatgaacgatgggcatggatgcaaaccga 18290935  T
Q  112 agttcaaagaacatgcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaatgaataaaacaat 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18290936 agttcaaagaacatgcaccgagcaacaatgacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggaaatcaaataaatgaataaaacaat 18291035  T
Q  212 caaatgttccgatacatgatgcaacatcttcacctccaaggtccaccttaaggacttcaataaaattgtgagctctcctcttcctctact 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18291036 caaatgttccgatacatgatgcaacaccttaacctctaaggtccaccttatggacttcaataaaattgtgagctctcctcttcctctact 18291125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 15 - 298
Target Start/End: Original strand, 10629563 - 10629849
Alignment:
Q  15 atgatggtggtgatgaagaggaggtaggtgtacaa---caccatgaacaagaagccggtggaaactataatgatgaacggtgggccttgatgcaaaccaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |    
T  10629563 atgatggtggtgatgaagaggaggtaggtgcaaacttgcaccattaacaagtagccggtggaaactataatgatgaacggtgggcatggatgcaaaccga 10629662  T
Q  112 agttcaaagaacatgcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaatgaataaaacaat 211  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10629663 agttcaaagaacatgcactgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacggtgtcctaaggggcactcaaataaatgaataaaacaat 10629762  T
Q  212 caaatgttccgatacatgatgcaacatcttcacctccaaggtccaccttaaggacttcaataaaattgtgagctctcctcttcctct 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10629763 caaatgttccgatacatgatgcaacaccttcacctccaaggtctaccttatggacttcaataaaattgtgagctctcctcttcctct 10629849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 15 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 42711173 - 42710887
Alignment:
Q  15 atgatggtggtgatgaagaggaggtaggtgtacaacaccatgaacaagaagccggtggaaactataatgatgaacggtgggccttgatgcaaaccaaagt 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | | |||||||||||||||    
T  42711173 atgatggtggtgatgaagaggaggtaggtgcacaacaccatgaacaaaaagccggtggaaactataatgataaacggtggacatggatgcaaaccaaagt 42711074  T
Q  115 tcaaagaacatgcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaatgaataaaacaatcaa 214  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  42711073 tcaaataatatgcatcgagcaacaaaaacaaggtgttgaaatggtcgggataagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaatgaataacacaatcaa 42710974  T
Q  215 atgttccgatacatgatgcaacatcttcacctccaaggtccaccttaaggacttcaataaaattgtgagctctcctcttcctctact 301  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42710973 atgttccaatacatgatgcaacaccttcacctccaaggtccaccttgtggatttccataaaattgtgagctctcctcttcctctact 42710887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 56 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 45235585 - 45235340
Alignment:
Q  56 gaacaagaagccggtggaaactataatgatgaacggtgggccttgatgcaaaccaaagttcaaagaacatgcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaa 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  45235585 gaacaagaagccggtggaaactataatgatgaacggtgggcatggatgcaaaccgaagttcaaagaacatgcatcgagcaataaagacaaggtgttgaaa 45235486  T
Q  156 tgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaatgaataaaacaatcaaatgttccgatacatgatgcaacatcttcacctccaaggtcc 255  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||     
T  45235485 tgatcgggctaagaaacgatttcctaaggggcaatcaaataaatgaataaaacaatcaaatgttctgatacatgatgcaacaccttcacctcaaaggtct 45235386  T
Q  256 accttaaggacttcaataaaattgtgagctctcctcttcctctact 301  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||    
T  45235385 accttatggacttcattaaaattgtgagcttttctcttcctctact 45235340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 15 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 45240255 - 45240047
Alignment:
Q  15 atgatggtggtgatgaagaggaggtaggtgtacaa---caccatgaacaagaagccggtggaaactataatgatgaacggtgggccttgatgcaaaccaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |    
T  45240255 atgatggtggtgatgaagaggaggtaggtgcaaacttgcaccatgaacaagaagccggtggaaactataatgatgaacggtgggcatggatgcaaaccga 45240156  T
Q  112 agttcaaagaacatgcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaatgaataaaacaat 211  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45240155 agttcaaagaacatgcatcgagcaataaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaatgaataaaacaat 45240056  T
Q  212 caaatgttc 220  Q
    |||||||||    
T  45240055 caaatgttc 45240047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 126 - 298
Target Start/End: Original strand, 15253263 - 15253435
Alignment:
Q  126 gcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaatgaataaaacaatcaaatgttccgata 225  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |   |||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||   ||| | || || |||||| ||||  |    
T  15253263 gcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattatccgggctaagaaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagagaataaccaaatgctccggaa 15253362  T
Q  226 catgatgcaacatcttc-acctccaaggtccaccttaaggacttcaataaaattgtgagctctcctcttcctct 298  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||| || || || |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  15253363 catgatgcaaca-cttcaacctccaaggccctccctatggacctcaataaaaatgtgagctttcctcttcctct 15253435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 128 - 298
Target Start/End: Original strand, 3353536 - 3353707
Alignment:
Q  128 accgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcggg-ctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaatgaataaaacaatcaaatgttccgatac 226  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| || ||||| ||||| || |||||||||| ||| || |  |||   ||| |||| || |||||| | ||  ||    
T  3353536 accgagcaacaaaggcaaggtgttgaattg-tcgggactaaggaatgatgtcctaaagggaaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaac 3353634  T
Q  227 atgatgcaacatcttcacctccaaggtccaccttaaggacttcaat-aaaattgtgagctctcctcttcctct 298  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||| || ||  ||| ||||| |||| |||||||| ||||||||||||    
T  3353635 atgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagacctcaatgaaaaatgtgagctttcctcttcctct 3353707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 117 - 295
Target Start/End: Original strand, 13821817 - 13821998
Alignment:
Q  117 aaagaacatgcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaatgaataaaacaatcaaat 216  Q
    |||||| | |||||||||||||||| |||||||||||| | ||  |  ||||| ||||||||| ||||||||| |  |||   ||| |||| || |||||    
T  13821817 aaagaataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaactcatgagcataagacacgatgtccaaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaat 13821916  T
Q  217 gttccgatacatgatgcaacatcttcacctccaaggtccaccttaaggacttca---ataaaattgtgagctctcctcttcc 295  Q
    | | ||  |||||||||| ||  |||||||||||||||| || || |||| |||   |||||| |||||||| |||||||||    
T  13821917 gcttcggaacatgatgcaccactttcacctccaaggtcctccatatggacctcaatgataaaaatgtgagctttcctcttcc 13821998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 100 - 298
Target Start/End: Original strand, 22109851 - 22110049
Alignment:
Q  100 gatgcaaaccaaagttcaaagaacatgcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatc-gggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaa 198  Q
    |||||||||| | || ||||| | | |||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||   |||||| |  |||      
T  22109851 gatgcaaaccgaggtacaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttg-aattatctgggctaagaaatgatgtccttcagggcaaccgcatatc 22109949  T
Q  199 tgaataaaacaatcaaatgttccgatacatgatgcaacatcttcacctccaaggtccaccttaaggacttcaataaaattgtgagctctcctcttcctct 298  Q
     ||| |||| || |||||| | ||  |||||||||||||  | ||||| || || || || || |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  22109950 cgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaacacttacaccttcagggccctccctatggacctcaataaaaatgtgagctttcctcttcctct 22110049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 126 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 15261383 - 15261208
Alignment:
Q  126 gcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaatgaataaaacaatcaaatgttccgata 225  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| | || ||  |||| || ||||||| | ||||||| |  |||   ||| ||||||| |||||| | ||  |    
T  15261383 gcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattaatgggcataaggaatgatgtccaacggggcaaccgcatatccgaagaaaacaaccaaatgcttcggaa 15261284  T
Q  226 catgatgcaacatcttcacctccaaggtccaccttaaggacttca---ataaaattgtgagctctcctcttcctct 298  Q
    ||||||||| ||  |||||||||||||||| || || ||||  ||   | ||||||||||||| ||||||||||||    
T  15261283 catgatgcaccactttcacctccaaggtcctccatatggaccccattgacaaaattgtgagctttcctcttcctct 15261208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 126 - 298
Target Start/End: Original strand, 15864422 - 15864595
Alignment:
Q  126 gcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaatgaataaaacaatcaaatgttccgata 225  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||| |   ||| ||| |||||||||||||||||||||| || |||    || |||| ||  ||||| | ||  |    
T  15864422 gcactgagcaacaatgacaaggtgttgaattatccggactacgaaacgatgtcctaaggggcaaccacatatccaaagaaaataactaaatgcttcggaa 15864521  T
Q  226 catgatgcaacatcttcacctccaaggtccaccttaaggacttcaat-aaaattgtgagctctcctcttcctct 298  Q
    ||||||||| ||  | |||||||||||||| || || |||| || || |||| |||||||| ||||||||||||    
T  15864522 catgatgcaccacttccacctccaaggtcctccctatggacctccatgaaaaatgtgagctttcctcttcctct 15864595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 239; Significance: 1e-132; HSPs: 17)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 15 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 20446243 - 20445957
Alignment:
Q  15 atgatggtggtgatgaagaggaggtaggtgtacaacaccatgaacaagaagccggtggaaactataatgatgaacggtgggccttgatgcaaaccaaagt 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  20446243 atgatggtggtgatgaagaggaggtaggtgcacaacaccattaacaagaagccggtggaaactataatgatgaacggtgggcatggatgcaaaccaaagt 20446144  T
Q  115 tcaaagaacatgcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaatgaataaaacaatcaa 214  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||    
T  20446143 tcaaagaacatgcaccgagcaataaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcactcaagtaaatgaataaagcaatcaa 20446044  T
Q  215 atgttccgatacatgatgcaacatcttcacctccaaggtccaccttaaggacttcaataaaattgtgagctctcctcttcctctact 301  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20446043 atgttccgatacatgatgcaacaccttcacctccaaggtctaccttatggacttcaataaacttgtgagctctcctcttcctctact 20445957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 15 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 23602038 - 23601749
Alignment:
Q  15 atgatggtggtgatgaagaggaggtaggtgtacaa---caccatgaacaagaagccggtggaaactataatgatgaacggtgggccttgatgcaaaccaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  23602038 atgatggtggtgatgaagaggaggtaggtgcaaacttgcaccattaacaagtagccggtggaaactataatgatgaacggtgggcattgatgcaaaccga 23601939  T
Q  112 agttcaaagaacatgcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaatgaataaaacaat 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23601938 agttcaaagaacatgcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaatgaataaaacaat 23601839  T
Q  212 caaatgttccgatacatgatgcaacatcttcacctccaaggtccaccttaaggacttcaataaaattgtgagctctcctcttcctctact 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23601838 caaatgttccgatacatgatgcaacatcttcatctccaaggtccaccttatggacttcaataaaattgtgagctctcctcttcctttact 23601749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 15 - 301
Target Start/End: Original strand, 24939346 - 24939635
Alignment:
Q  15 atgatggtggtgatgaagaggaggtaggtgtacaa---caccatgaacaagaagccggtggaaactataatgatgaacggtgggccttgatgcaaaccaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |    
T  24939346 atgatggtggtgatgaagaggaggtaggtgcaaacttgcaccattaacaagtagccggtggaaactataatgatgaacggtgggcatggatgcaaaccga 24939445  T
Q  112 agttcaaagaacatgcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaatgaataaaacaat 211  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24939446 agttcaaagaacatgcaccgagaaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcactcaaataaatgaataaaacaat 24939545  T
Q  212 caaatgttccgatacatgatgcaacatcttcacctccaaggtccaccttaaggacttcaataaaattgtgagctctcctcttcctctact 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24939546 caaatgttccgatacatgatgcaacaccttcacctccaaggtctaccttatggacttcaataaaattgtgagctctcctcttcctctact 24939635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 2 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 22828170 - 22827868
Alignment:
Q  2 ccacaggtacacaatgatggtggtgatgaagaggaggtaggtgtacaa---caccatgaacaagaagccggtggaaactataatgatgaacggtgggcct 98  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||| | |    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22828170 ccacaagtacacaatgatggtggtgatgaaaatgaggtaggtgcaaacttgcaccattaacaagaagccgatggaaactataatgatgaacggtgggcat 22828071  T
Q  99 tgatgcaaaccaaagttcaaagaacatgcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaa 198  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22828070 ggatgcaaaccgaagttcaaagaacatgcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaa 22827971  T
Q  199 tgaataaaacaatcaaatgttccgatacatgatgcaacatcttcacctccaaggtccaccttaaggacttcaataaaattgtgagctctcctcttcctct 298  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  22827970 tgaataaaataatcaaatgttctgatacatgatgcaacaccttcacctccaaggtctaccttatggacttcattaaaattgtgagctttcctcttcctct 22827871  T
Q  299 act 301  Q
    |||    
T  22827870 act 22827868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 15 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 18487461 - 18487172
Alignment:
Q  15 atgatggtggtgatgaagaggaggtaggtgtacaa---caccatgaacaagaagccggtggaaactataatgatgaacggtgggccttgatgcaaaccaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| | |    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |    
T  18487461 atgatggtggtgatgaagaggagttaggtgcaaacttgcaccattaacaagaagtcggtggaaactataatgatgaacggtgggcatggatgcaaaccga 18487362  T
Q  112 agttcaaagaacatgcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaatgaataaaacaat 211  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18487361 tgttcaaagaacatgcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaatgaataaaacaat 18487262  T
Q  212 caaatgttccgatacatgatgcaacatcttcacctccaaggtccaccttaaggacttcaataaaattgtgagctctcctcttcctctact 301  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18487261 caaatgttctgatacatgatgcaacaccttcacctccaaggtccaccttatggactacaataaaattgtgagctctcctgttcctctact 18487172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 14 - 298
Target Start/End: Original strand, 24218644 - 24218931
Alignment:
Q  14 aatgatggtggtgatgaagaggaggtaggtgtacaa---caccatgaacaagaagccggtggaaactataatgatgaacggtgggccttgatgcaaacca 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| | |    |||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  24218644 aatgatggtggtgatgaagaggaggtacgtgcaaacttgcaccattaacaaaaagccgatggaaactataatgatgaacggtgggcatggatgcaaacca 24218743  T
Q  111 aagttcaaagaacatgcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaatgaataaaacaa 210  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24218744 aagttcaaagaatatgtaccaagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaatgaataaaacaa 24218843  T
Q  211 tcaaatgttccgatacatgatgcaacatcttcacctccaaggtccaccttaaggacttcaataaaattgtgagctctcctcttcctct 298  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24218844 tcaaatgttctgatacatgatgcaacaccttcacctccaaggtccaccttatggacttcaataaaattgtgagctctcctcttcctct 24218931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 15 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 21282308 - 21282020
Alignment:
Q  15 atgatggtggtgatgaagaggaggtaggtgtacaa---caccatgaacaagaagccggtggaaactataatgatgaacggtgggccttgatgcaaaccaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||   |||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| |    
T  21282308 atgatggtggtgatgaagaggaggtaggtgcaaaattgcaccattaacaagtagctggtggaaactataatgatgaacggtgtgcatggatgcaaaccga 21282209  T
Q  112 agttcaaagaacatgcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaatgaataaaacaat 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||    
T  21282208 agttcaaagaacatgcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggaactcaaataaatgaataaaa-aat 21282110  T
Q  212 caaatgttccgatacatgatgcaacatcttcacctccaaggtccaccttaaggacttcaataaaattgtgagctctcctcttcctctact 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21282109 caaatgttccgatacatgatgcaacaccttcacctccaaggtctatcttatggacttcaataaaattgtgagctctcctcttcctctact 21282020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 19 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 23712095 - 23711814
Alignment:
Q  19 tggtggtgatgaagaggaggtaggtgtacaacaccatgaacaagaagccggtggaaactataatgatgaacggtgggccttgatgcaaaccaaagttcaa 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  23712095 tggtggtgatgaagaggaggtaggtgcacaacaccatgaacaaaaagccggtggaaactataatgataaacggtgggcatggatgcaaaccaaagttcaa 23711996  T
Q  119 agaacatgcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaatgaataaaacaatcaaatgt 218  Q
    | || || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23711995 ataatatacaccgagcaacaaaaacaaggtgttgaaatggtcgggataagaaacgatgtcctaaggggcaaccaaataaatgaataacacaatcaaatgt 23711896  T
Q  219 tccgatacatgatgcaacatcttcacctccaaggtccaccttaaggacttcaataaaattgtgagctctcctcttcctctact 301  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23711895 tccgat-catgatgcaacaccttcacctccaaggtccaccttgtggatttccataaaattgtgagctctcctcttcctctact 23711814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 100 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 25008106 - 25007908
Alignment:
Q  100 gatgcaaaccaaagttcaaagaacatgcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaat 199  Q
    |||||||||| | || ||||| | | |||||||||||||||| |||||||||||| |   |||||||||||| ||||||||| ||||||| |  |||       
T  25008106 gatgcaaaccgaggtacaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattatccgggctaagaaatgatgtcctacggggcaaccgcatatcc 25008007  T
Q  200 gaataaaacaatcaaatgttccgatacatgatgcaacatcttc-acctccaaggtccaccttaaggacttcaataaaattgtgagctctcctcttcctct 298  Q
    ||| |||| || |||||||| ||  ||||||||||||| |||| |||||||||| || || || |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  25008006 gaagaaaataaccaaatgtttcggaacatgatgcaaca-cttcaacctccaaggccctccctatggacctcaataaaaatgtgagctttcctcttcctct 25007908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 126 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 22318781 - 22318609
Alignment:
Q  126 gcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaatgaataaaacaatcaaatgttccgata 225  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |   |||||||||||| || |||||||||||||| |  |||   ||| | || || |||||| | ||  |    
T  22318781 gcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattatccgggctaagaaatgacgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagagaataaccaaatgcttcggca 22318682  T
Q  226 catgatgcaacatcttcacctccaaggtccaccttaaggacttcaataaaattgtgagctctcctcttcctct 298  Q
    ||||||||||||  | |||||||||||||| || || |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  22318681 catgatgcaacacttccacctccaaggtcctccctatggacctcaataaaaatgtgagctttcctcttcctct 22318609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 100 - 298
Target Start/End: Original strand, 15734425 - 15734623
Alignment:
Q  100 gatgcaaaccaaagttcaaagaacatgcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaat 199  Q
    |||||||||| | || ||||| | | |||||||||||||||| |||||||||||| |   |||||||||||| ||||||||| ||||||| |  |||       
T  15734425 gatgcaaaccgaggtacaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattatccgggctaagaaatgatgtcctacggggcaaccgcatatcc 15734524  T
Q  200 gaataaaacaatcaaatgttccgatacatgatgcaacatcttc-acctccaaggtccaccttaaggacttcaataaaattgtgagctctcctcttcctct 298  Q
    ||| |||| || |||||| | ||  ||||||||||||| |||| |||||||||| || || || |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  15734525 gaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaaca-cttcaacctccaaggccctccctatggacctcaataaaaatgtgagctttcctcttcctct 15734623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 100 - 298
Target Start/End: Original strand, 23746942 - 23747140
Alignment:
Q  100 gatgcaaaccaaagttcaaagaacatgcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaat 199  Q
    |||||||||| | || ||||| | | |||||||||||||||| |||||||||||| |   |||||||||||| ||||||||| ||||||| |  |||       
T  23746942 gatgcaaaccgaggtacaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattatccgggctaagaaatgatgtcctacggggcaaccgcatatcc 23747041  T
Q  200 gaataaaacaatcaaatgttccgatacatgatgcaacatcttc-acctccaaggtccaccttaaggacttcaataaaattgtgagctctcctcttcctct 298  Q
    ||| |||| || |||||| | ||  ||||||||||||| |||| |||||||||| || || || |||| ||||||| | |||||||| ||||||||||||    
T  23747042 gaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaaca-cttcaacctccaaggccctccctatggacctcaataacaatgtgagctttcctcttcctct 23747140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 100 - 298
Target Start/End: Original strand, 20621054 - 20621252
Alignment:
Q  100 gatgcaaaccaaagttcaaagaacatgcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatc-gggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaa 198  Q
    |||||||||| | || ||||| | | |||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| |  |||      
T  20621054 gatgcaaaccgaggtacaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttg-aattatctgggctaagaaatgatgtcctacggggcaaccgcatatc 20621152  T
Q  199 tgaataaaacaatcaaatgttccgatacatgatgcaacatcttcacctccaaggtccaccttaaggacttcaataaaattgtgagctctcctcttcctct 298  Q
     ||| |||| || |||||| | ||  |||||||||||||  | ||||| || || || || || |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  20621153 cgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaacacttacaccttcagggccctccctatggacctcaataaaaatgtgagctttcctcttcctct 20621252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 126 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 30760939 - 30760764
Alignment:
Q  126 gcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaatgaataaaacaatcaaatgttccgata 225  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| | || || |||||||| ||||||| |||||| || |  |||   ||| |||| || |||||| | ||  |    
T  30760939 gcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattaatgggactaagaaatgatgtccgaaggggtaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaa 30760840  T
Q  226 catgatgcaacatcttcacctccaaggtccaccttaaggacttca---ataaaattgtgagctctcctcttcctct 298  Q
    ||||||||| ||  |||||||||||||||| || || |||| |||   |||||| |||||||| |||||| |||||    
T  30760839 catgatgcaccactttcacctccaaggtcctccatatggacctcaatgataaaaatgtgagctttcctctacctct 30760764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 126 - 189
Target Start/End: Original strand, 22947348 - 22947411
Alignment:
Q  126 gcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcaa 189  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||   |||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  22947348 gcaccaagcaacaaaggcaaggtgttgaaatatccggggtaagaaatgatgtcctaaggggcaa 22947411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 117 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 24954483 - 24954302
Alignment:
Q  117 aaagaacatgcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaatgaataaaacaatcaaat 216  Q
    |||||| | |||||||||||||||| |||||||||||| | ||  |  ||||| | ||||||| ||||||||| |  |||  |||| |||| || |||||    
T  24954483 aaagaataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaactcataagcataagacaggatgtccaaaggggcaaccgcatatctgaagaaaataaccaaat 24954384  T
Q  217 gttccgatacatgatgcaacatcttcacctccaaggtccaccttaaggacttc---aataaaattgtgagctctcctcttcc 295  Q
    | | ||  |||||||||| ||  |||||||||||||||| || || |||| ||   ||||||| |||||||| |||||||||    
T  24954383 gcttcggaacatgatgcaccactttcacctccaaggtcctccatatggacctcaataataaaaatgtgagctttcctcttcc 24954302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 242 - 298
Target Start/End: Original strand, 21387316 - 21387373
Alignment:
Q  242 cacctccaaggtccaccttaaggacttcaat-aaaattgtgagctctcctcttcctct 298  Q
    |||||||||||||| ||||| |||| ||||| |||| |||||||| ||||||||||||    
T  21387316 cacctccaaggtcctccttatggacctcaatgaaaaatgtgagctttcctcttcctct 21387373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 237; Significance: 1e-131; HSPs: 14)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 15 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 22062909 - 22062622
Alignment:
Q  15 atgatggtggtgatgaagaggaggtaggtgtacaa---caccatgaacaagaagccggtggaaactataatgatgaacggtgggccttgatgcaaaccaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  22062909 atgatggtggtgatgaagaggaggtaggtgcaaacttgcaccattaacaagaagccggtggaaactataatgatgaacggtgggcattgatgcaaaccga 22062810  T
Q  112 agttcaaagaacatgcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaatgaataaaacaat 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  22062809 agttcaaagaacatgcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaatgaat--aacaat 22062712  T
Q  212 caaatgttccgatacatgatgcaacatcttcacctccaaggtccaccttaaggacttcaataaaattgtgagctctcctcttcctctact 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22062711 caaatgttccgatacatgatgcaacatcttcacctccaaggtccaccttaaggacttcaataaaattgtgagctctcctcttcctttact 22062622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 14 - 301
Target Start/End: Original strand, 18852832 - 18853122
Alignment:
Q  14 aatgatggtggtgatgaagaggaggtaggtgtacaa---caccatgaacaagaagccggtggaaactataatgatgaacggtgggccttgatgcaaacca 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  18852832 aatgatggtggtgatgaagaggaggtaggtgcaaacttgcaccattaacaagaagccggtggaaaccataatgatgaacggtgggcatggatgcaaacca 18852931  T
Q  111 aagttcaaagaacatgcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaatgaataaaacaa 210  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18852932 aagttcaaagaatatgtaccgagcaataaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcaattaaataaatgaataaaacaa 18853031  T
Q  211 tcaaatgttccgatacatgatgcaacatcttcacctccaaggtccaccttaaggacttcaataaaattgtgagctctcctcttcctctact 301  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18853032 tcaaatgttctgatacatgatgcaacaccttcacctccaaggtccaccttatggacttcaataaaattgtgagctctcctcttcctctact 18853122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 15 - 301
Target Start/End: Original strand, 17818332 - 17818621
Alignment:
Q  15 atgatggtggtgatgaagaggaggtaggtgtacaa---caccatgaacaagaagccggtggaaactataatgatgaacggtgggccttgatgcaaaccaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||  |    
T  17818332 atgatggtggtgatgaagaggaggtaggtgcaaacttgcaccattaacaagtagccggtggaaactataatgatgaacggtgtgcatggatgcaaactga 17818431  T
Q  112 agttcaaagaacatgcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaatgaataaaacaat 211  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  17818432 agttcaaagaacatgtaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcactcaaataaatgaataaaaaaat 17818531  T
Q  212 caaatgttccgatacatgatgcaacatcttcacctccaaggtccaccttaaggacttcaataaaattgtgagctctcctcttcctctact 301  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17818532 caaatgttctgatacatgatgcaacaccttcacctccaaggtctaccttatggacttcaataaaattgtgagctctcctcttcctctact 17818621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 15 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 18188967 - 18188686
Alignment:
Q  15 atgatggtggtgatgaagaggaggtaggtgtacaa---caccatgaacaagaagccggtggaaactataatgatgaacggtgggccttgatgcaaaccaa 111  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| | |    ||| || |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||    | |    
T  18188967 atgatggtggtgatgacgaggaggtaggtgcaaacttgcacaattaacaagtagccggtggaaaccataatgatgaacggtgggcatggatgc----cga 18188872  T
Q  112 agttcaaagaacatgcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaatgaataaaacaat 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18188871 agttcaaagaacatgcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcactcaaataaatgaataaaacaat 18188772  T
Q  212 caaatgttccgatacatgatgcaacatcttcacctccaaggtccaccttaaggacttcaataaaattgtgagctctcctcttcctc 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18188771 caaatgttccgatacatgatgcaacaccttcacctccaaggtctaccttatggacttcaataaaattgtgagctctcctcttcctc 18188686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 19586995 - 19586709
Alignment:
Q  1 cccacaggtacacaatgatggtggtgatgaagaggaggtaggtgtacaacaccatgaacaagaagccggtggaaactataatgatgaacggtgggccttg 100  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| | |    
T  19586995 cccacaggtacaagatgatgggggtgatgaagaggaggtaggtgcacaacaccatgaacaagaagccg-tggaaaatataatgatgaacggtgggcatgg 19586897  T
Q  101 atgcaaaccaaagttcaaagaacatgcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaatg 200  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19586896 atgcaaaccgaagttcaaagaatatgcaccgaacaacaaagacaaggtgttgaaatggccgggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcgaataaatg 19586797  T
Q  201 aataaaacaatcaaatgttccgatacatgatgcaacatcttcacctccaaggtccaccttaaggacttcaataaaattgtgagctctcctcttcctctac 300  Q
    ||| ||||||||||||||||            ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| | ||||||||  |||||| |||||||||| |||    
T  19586796 aat-aaacaatcaaatgttc------------caacaccttcacctctaaggtccaccttatggaccttaataaaatattgagctttcctcttcctttac 19586710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 15 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 23519149 - 23518879
Alignment:
Q  15 atgatggtggtgatgaagaggaggtaggtgtacaa---caccatgaacaagaagccggtggaaactataatgatgaacggtgggccttgatgcaaaccaa 111  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| |||    ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| | ||||||| | |||||||||| |    
T  23519149 atgatggtggtgatgataaggaggtaggtgcacacttgcacgatgaacaagaagtcggtgggaactataatgatgtatggtgggcatggatgcaaaccga 23519050  T
Q  112 agttcaaagaacatgcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaatgaataaaacaat 211  Q
    ||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||   | |||||||||| ||||||| |||| ||||||| || |  ||| |||| |||    
T  23519049 agttcaaagaataagcaccgagtaacaaagacaaggtgttgaaatctccaggctaagaaatgatgtccaaaggagcaatcacatgaccgaagaaaataat 23518950  T
Q  212 caaatgttccgatacatgatgcaacatcttcacctccaaggtccaccttaaggacttcaataaaattgtga 282  Q
     ||||  ||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  23518949 aaaattctccggaacatgatgcaacaacttcacctacaaggtccaccttatggacctcaataaaattgtga 23518879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 15 - 298
Target Start/End: Original strand, 25966447 - 25966733
Alignment:
Q  15 atgatggtggtgatgaagaggaggtaggtgtacaa---caccatgaacaagaagccggtggaaactataatgatgaacggtgggccttgatgcaaaccaa 111  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||| |||    ||||||||||||||||||| ||| |||||| || ||||| | || || | |||||||||  |    
T  25966447 atgatggtagtgatgaagaggaggaaggtgcacacttgcaccatgaacaagaagccgttggtaactatgataatgaaagatgagcatggatgcaaactga 25966546  T
Q  112 agttcaaagaacatgcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatc-gggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaatgaataaaacaa 210  Q
    |||| | || | | ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| |  || |  ||| |||| ||    
T  25966547 agttgagaggataagcaccgagcaacaaagacaaggtgttg-aattatctgggctaagaaatgatgtcataagaggcaaccgcatgaccgaagaaaataa 25966645  T
Q  211 tcaaatg-ttccgatacatgatgcaacatcttcacctccaaggtccaccttaaggacttcaataaaattgtgagctctcctcttcctct 298  Q
     |||||| ||| || |||||||| | ||  |||||||||||||||| ||||| |||| ||||| | | |||||||| ||||||||||||    
T  25966646 ccaaatgcttcaga-acatgatggagcaaattcacctccaaggtcctccttatggacctcaatgataatgtgagctttcctcttcctct 25966733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 100 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 24856567 - 24856369
Alignment:
Q  100 gatgcaaaccaaagttcaaagaacatgcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatc-gggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaa 198  Q
    |||||||||| | || ||||| | | |||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||  ||||||| |  |||      
T  24856567 gatgcaaaccgaggtacaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttg-aattatctgggctaagaaatgatgtccttcggggcaaccgcatatc 24856469  T
Q  199 tgaataaaacaatcaaatgttccgatacatgatgcaacatcttcacctccaaggtccaccttaaggacttcaataaaattgtgagctctcctcttcctct 298  Q
     ||| |||| || |||||| | ||  |||||||||||||  | ||||| || || || || || |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  24856468 cgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaacacttacaccttcagggccctccctatggacctcaataaaaatgtgagctttcctcttcctct 24856369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 156
Target Start/End: Original strand, 29685446 - 29685511
Alignment:
Q  91 gtgggccttgatgcaaaccaaagttcaaagaacatgcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaat 156  Q
    |||||| | |||||||||| |||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29685446 gtgggcatggatgcaaaccgaagttcaaaggataatcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaat 29685511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 130 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 30673039 - 30672872
Alignment:
Q  130 cgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaatgaataaaacaatcaaatgttccgatacatg 229  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| |   ||||||| |||| ||||||||||| ||||| || |||   |||   || ||||||||||| ||  |||||    
T  30673039 cgagcaacaaaggaaaggtgttgaattatccgggctaggaaatgatgtcctaagaggcaaccacatatccgaagtgaataatcaaatgtttcggaacatg 30672940  T
Q  230 atgcaacatcttcacctccaaggtccaccttaaggacttcaataaaattgtgagctctcctcttcctct 298  Q
    ||||| ||| | |||||||||||||| ||||| || | ||||| | | |||||||| ||||||||||||    
T  30672939 atgca-catttccacctccaaggtcctccttatgggcctcaatgataatgtgagctttcctcttcctct 30672872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 126 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 21561747 - 21561569
Alignment:
Q  126 gcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaatgaataaaacaatcaaatgttccgata 225  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||   || ||||| || ||||||||||||||||| |  |||   ||| |||| || |||||| | ||  |    
T  21561747 gcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattgtcaggactaaggaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaa 21561648  T
Q  226 catgatgcaacatcttcacctccaaggtccaccttaaggacttcaat------aaaattgtgagctctcctcttcctct 298  Q
    ||||||||| ||  |||||||||||||||| || || |||| |||||      |||| |||||||| ||||||||||||    
T  21561647 catgatgcaccactttcacctccaaggtcctccctatggacctcaatggaaaaaaaaatgtgagctttcctcttcctct 21561569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 117 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 22166861 - 22166680
Alignment:
Q  117 aaagaacatgcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaatgaataaaacaatcaaat 216  Q
    |||||| | |||||||||||||||| |||||||||||| | ||  |  ||||| ||||||||| ||||||||| |  |||   ||| |||| || |||||    
T  22166861 aaagaataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaactcatgagcataagacacgatgtccaaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaat 22166762  T
Q  217 gttccgatacatgatgcaacatcttcacctccaaggtccaccttaaggacttca---ataaaattgtgagctctcctcttcc 295  Q
    | | ||  |||||||||| ||  |||||||||||||||| || || |||| |||   |||||| |||||||| |||||||||    
T  22166761 gcttcggaacatgatgcaccactttcacctccaaggtcctccatatggacctcaatgataaaaatgtgagctttcctcttcc 22166680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 117 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 20017546 - 20017365
Alignment:
Q  117 aaagaacatgcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaatgaataaaacaatcaaat 216  Q
    |||||| | |||||||||||||||| |||||||||||| | ||  |  ||||| ||||||||| |||||||||    |||   ||| |||| || |||||    
T  20017546 aaagaataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaactcatgagcataagacacgatgtccaaaggggcaactgcatatccgaagaaaataaccaaat 20017447  T
Q  217 gttccgatacatgatgcaacatcttcacctccaaggtccaccttaaggacttca---ataaaattgtgagctctcctcttcc 295  Q
    | | ||  |||||||||| ||  |||||||||||||||| || || |||| |||   |||||| |||||||| |||||||||    
T  20017446 gcttcggaacatgatgcaccactttcacctccaaggtcctccatatggacctcaatgataaaaatgtgagctttcctcttcc 20017365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 227 - 293
Target Start/End: Original strand, 23344507 - 23344572
Alignment:
Q  227 atgatgcaacatcttcacctccaaggtccaccttaaggacttcaataaaattgtgagctctcctctt 293  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||   |||| |||| |||||||||||| |||||||    
T  23344507 atgatgcaacaccttcacctccaaggtcccccttttagactccaat-aaattgtgagctttcctctt 23344572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 236; Significance: 1e-130; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 15 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 51942 - 51655
Alignment:
Q  15 atgatggtggtgatgaagaggaggtaggtgtacaacaccatgaacaagaagccggtggaaactataatgatgaacggtgggccttgatgcaaaccaaagt 114  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  51942 atgatggtggtgataaagaggaggtaggtgcacaacaccatgaacaaaaatccggtggaaactataatgatgaacggtgggcatggatgcaaaccaaagt 51843  T
Q  115 tcaaagaacatgcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatc-aaataaatgaataaaacaatca 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  51842 tcaaagaacatgcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaaatacatgaataaaacaatca 51743  T
Q  214 aatgttccgatacatgatgcaacatcttcacctccaaggtccaccttaaggacttcaataaaattgtgagctctcctcttcctctact 301  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  51742 aatgttccgatacatgatgcaacaccttcacctccaaggtccaccttatggacttcaatacaattgtgagctctcttcttcctctact 51655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 233; Significance: 1e-129; HSPs: 27)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 14 - 301
Target Start/End: Original strand, 6813677 - 6813967
Alignment:
Q  14 aatgatggtggtgatgaagaggaggtaggtgtacaa---caccatgaacaagaagccggtggaaactataatgatgaacggtgggccttgatgcaaacca 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||     
T  6813677 aatgatggtggtgatgaagaggaggtaggtgcaaacttgcaccattaacaagaagccggtggaaactataatgatgaatggtgggcattaatgcaaaccg 6813776  T
Q  111 aagttcaaagaacatgcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaatgaataaaacaa 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6813777 aagttcaaagaacatgcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaatgaataaaacaa 6813876  T
Q  211 tcaaatgttccgatacatgatgcaacatcttcacctccaaggtccaccttaaggacttcaataaaattgtgagctctcctcttcctctact 301  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6813877 tcaaatgttctgatacatgatgcaacatcttcacctccaaggtccactttaaggacttcaataaaattgtgagctctcctcttcctttact 6813967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 15 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 9362355 - 9362061
Alignment:
Q  15 atgatggtggtgatgaagaggaggtaggtgtacaa---caccatgaacaagaagccggtggaaactataatgatgaacggtgggccttgatgcaaaccaa 111  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| | |    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  9362355 atgatggtggtaatgaagaggaggtaggtgcaaacttgcaccattaacaagaagccggtggcaactataatgatgaacggtgggcatggatgcaaaccaa 9362256  T
Q  112 agttcaaagaacatgcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaatgaataaaacaat 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9362255 agttcaaagaacatgcaccgagcaataaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcactcaaataaatgaataaaacaat 9362156  T
Q  212 caaatgttccgatacatgatgcaacatcttcacctccaaggtccaccttaaggacttcaataaaattgtgagctctcctcttcctctacttctct 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9362155 caaatgttccgatacatgatgcaacaccttcacctccaaggtctaccttatggacttcaataaaattgtgagctctcctcttcctctacttctct 9362061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 20562142 - 20562442
Alignment:
Q  1 cccacaggtacacaatgatggtggtgatgaagaggaggtaggtgtacaa---caccatgaacaagaagccggtggaaactataatgatgaacggtgggcc 97  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| | ||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20562142 cccacaggtacacaatgatggtg---atgaagaggaggtaggtgcaaaattgcaccattaacaagaagccggtggaaactataatgatgaacggtgggca 20562238  T
Q  98 ttgatgcaaaccaaagttcaaagaacatgcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataa 197  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  20562239 tggatgcaaaccaaagttcaaagaacatgcaccgagcaataaagacaaggtgttaaaatgatcgggctaagaaatgatgtcctaaggggcactcaaataa 20562338  T
Q  198 atgaataaaacaatcaaatgttccgatacatgatgcaacatcttcacctccaaggtccaccttaaggacttcaataaaattgtgagctctcctcttcctc 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20562339 atgaataaaacaatcaaatgttccgatacatgatgcaacaccttcacctccaaggtccaccttatggacttcaataaaattgtgagctctcctcttcctt 20562438  T
Q  298 tact 301  Q
    ||||    
T  20562439 tact 20562442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 20564450 - 20564750
Alignment:
Q  1 cccacaggtacacaatgatggtggtgatgaagaggaggtaggtgtacaa---caccatgaacaagaagccggtggaaactataatgatgaacggtgggcc 97  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| | ||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20564450 cccacaggtacacaatgatggtg---atgaagaggaggtaggtgcaaaattgcaccattaacaagaagccggtggaaactataatgatgaacggtgggca 20564546  T
Q  98 ttgatgcaaaccaaagttcaaagaacatgcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataa 197  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  20564547 tggatgcaaaccaaagttcaaagaacatgcaccgagcaataaagacaaggtgttaaaatgatcgggctaagaaatgatgtcctaaggggcactcaaataa 20564646  T
Q  198 atgaataaaacaatcaaatgttccgatacatgatgcaacatcttcacctccaaggtccaccttaaggacttcaataaaattgtgagctctcctcttcctc 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20564647 atgaataaaacaatcaaatgttccgatacatgatgcaacaccttcacctccaaggtccaccttatggacttcaataaaattgtgagctctcctcttcctt 20564746  T
Q  298 tact 301  Q
    ||||    
T  20564747 tact 20564750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 20559834 - 20560134
Alignment:
Q  1 cccacaggtacacaatgatggtggtgatgaagaggaggtaggtgtacaa---caccatgaacaagaagccggtggaaactataatgatgaacggtgggcc 97  Q
    ||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||| | ||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20559834 cccacagatacacaatgatggtg---atgaagaggaggtaggtgcaaaattgcaccattaacaagaagccggtggaaactataatgatgaacggtgggca 20559930  T
Q  98 ttgatgcaaaccaaagttcaaagaacatgcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataa 197  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  20559931 tggatgcaaaccaaagttcaaagaacatgcaccgagcaataaagacaaggtgttaaaatgatcgggctaagaaatgatgtcctaaggggcactcaaataa 20560030  T
Q  198 atgaataaaacaatcaaatgttccgatacatgatgcaacatcttcacctccaaggtccaccttaaggacttcaataaaattgtgagctctcctcttcctc 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20560031 atgaataaaacaatcaaatgttccgatacatgatgcaacaccttcacctccaaggtccaccttatggacttcaataaaattgtgagctctcctcttcctt 20560130  T
Q  298 tact 301  Q
    ||||    
T  20560131 tact 20560134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 15 - 306
Target Start/End: Original strand, 13096526 - 13096817
Alignment:
Q  15 atgatggtggtgatgaagaggaggtaggtgtacaa---caccatgaacaagaagccggtggaaactataatgatgaacggtgggccttgatgcaaaccaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  13096526 atgatggtggtgatgaagaggaggtaggtgcaaacttgcaccattaacaagaagccggtggaaactataatgatgaacggtgggcatggatgcaaaccaa 13096625  T
Q  112 agttcaaagaacatgcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaatgaataaaacaat 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13096626 agttcaaagaacatgcaccgagcaataaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcactcaaataaatgaataaaacaat 13096725  T
Q  212 caaatgttccgatacatgatgcaacatcttcacctccaaggtccaccttaaggacttcaataaaattgtgagctctcctcttcctctacttctct 306  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13096726 caaatgttccgatacatgatggaaca---ccacctccaaggtctaccttatggacttcaataaaattgtgagctctcctcttcctctacttctct 13096817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 15 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 12777899 - 12777613
Alignment:
Q  15 atgatggtggtgatgaagaggaggtaggtgtacaacaccatgaacaagaagccggtggaaactataatgatgaacggtgggccttgatgcaaaccaaagt 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||    
T  12777899 atgatggtggtgatgaagaggaggtaggtgcacaacaccatgaacaaaaagccggtggaaactataatgataaacggtgggcatggatgcaaaccaaagt 12777800  T
Q  115 tcaaagaacatgcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaatgaataaaacaatcaa 214  Q
    ||||| || |||||| |||||||||| || ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  12777799 tcaaataatatgcactgagcaacaaaaactaggtgttgaaatggtcgggataagaaacgatgtgctaaggggcaatcaaataaatgcataagacaatcaa 12777700  T
Q  215 atgttccgatacatgatgcaacatcttcacctccaaggtccaccttaaggacttcaataaaattgtgagctctcctcttcctctact 301  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12777699 atgttccgatacatgatacaacaccttcacctccaaggtccaccttatggacttcaataaaattgtgagctctcctcttcctctact 12777613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 15 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 13090205 - 13089916
Alignment:
Q  15 atgatggtggtgatgaagaggaggtaggtgtacaa---caccatgaacaagaagccggtggaaactataatgatgaacggtgggccttgatgcaaaccaa 111  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| | |    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||    
T  13090205 atgatggtggtcatgaagaggaggtaggtgcaaatttgcaccattaacaagaagccggtggaaactataataatgaacggtgggcatcgatgcaaaccaa 13090106  T
Q  112 agttcaaagaacatgcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaatgaataaaacaat 211  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13090105 agttcaaagaacatgaaccgagcaataaagacaaggtgttgaaatgaccgggctaagaaacgatgtcctaaggggcactcaaataaatgaataaaacaat 13090006  T
Q  212 caaatgttccgatacatgatgcaacatcttcacctccaaggtccaccttaaggacttcaataaaattgtgagctctcctcttcctctact 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13090005 caaatgttccgatacatgatgcaacaccttcacctccaaggtctaccttatggacttcaataaaattgtgagctctcatcttcctctact 13089916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 15 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 3246911 - 3246625
Alignment:
Q  15 atgatggtggtgatgaagaggaggtaggtgtacaacaccatgaacaagaagccggtggaaactataatgatgaacggtgggccttgatgcaaaccaaagt 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||    
T  3246911 atgatggtggtgatgaagaggaggtaggtgcacatcaccatgaacaagaagccgatggaaactataatgatgaacggtgggcatgcatgcaaaccgaagt 3246812  T
Q  115 tcaaagaacatgcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaatgaataaaacaatcaa 214  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3246811 tcaacgaatatgcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaataatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcgaataaatgaataaaacaatcaa 3246712  T
Q  215 atgttccgatacatgatgcaacatcttcacctccaaggtccaccttaaggacttcaataaaattgtgagctctcctcttcctctact 301  Q
    ||| || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | || || |||| ||| |||||| |||||||||||||||    
T  3246711 atgctctgaaacatgatgcaacaccttcacctccaaggtccaccttatgaacctccataacattttgagctttcctcttcctctact 3246625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 2 - 95
Target Start/End: Original strand, 15024497 - 15024590
Alignment:
Q  2 ccacaggtacacaatgatggtggtgatgaagaggaggtaggtgtacaacaccatgaacaagaagccggtggaaactataatgatgaacggtggg 95  Q
    ||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15024497 ccacatgtacaagatgatggaggtgatgaagaggaggtaggtgcacaacaccatgaacaagaagccggtggaaactataatgatgaacggtggg 15024590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 100 - 298
Target Start/End: Original strand, 7599247 - 7599445
Alignment:
Q  100 gatgcaaaccaaagttcaaagaacatgcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaat 199  Q
    |||||||||| | || ||||| | | |||||||||||||||| |||||||||||| |   |||||||||||| ||||||||| ||||||| |  |||       
T  7599247 gatgcaaaccgaggtacaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattatccgggctaagaaatgatgtcctacggggcaaccgcatatcc 7599346  T
Q  200 gaataaaacaatcaaatgttccgatacatgatgcaacatcttc-acctccaaggtccaccttaaggacttcaataaaattgtgagctctcctcttcctct 298  Q
    ||| |||| || |||||| | ||  ||||||||||||| |||| |||||||||| || || || |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  7599347 gaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaaca-cttcaacctccaaggccctccctatggacctcaataaaaatgtgagctttcctcttcctct 7599445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 84 - 298
Target Start/End: Original strand, 10145886 - 10146100
Alignment:
Q  84 atgaacggtgggccttgatgcaaaccaaagttcaaagaacatgcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatc-gggctaagaaacgatgtcctaa 182  Q
    ||||||| ||||| | |||||||||| | || ||||| | | |||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||     
T  10145886 atgaacgatgggcatggatgcaaaccgaggtacaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttg-aattatctgggctaagaaatgatgtcctac 10145984  T
Q  183 ggggcaatcaaataaatgaataaaacaatcaaatgttccgatacatgatgcaacatcttcacctccaaggtccaccttaaggacttcaataaaattgtga 282  Q
    ||||||| |  |||   ||| |||| || |||||| | ||  |||||||||||||| | ||||| || || || || || |||| ||||||||| |||||    
T  10145985 ggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaacatttacaccttcagggccctccctatggacctcaataaaaatgtga 10146084  T
Q  283 gctctcctcttcctct 298  Q
    ||| ||||||||||||    
T  10146085 gctttcctcttcctct 10146100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 84 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 13137508 - 13137294
Alignment:
Q  84 atgaacggtgggccttgatgcaaaccaaagttcaaagaacatgcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaag 183  Q
    ||||||| ||||| | |||||||||| | || ||||| | | |||||||||||||||| |||||||||||| |   |||||||||||| |||||||||      
T  13137508 atgaacgatgggcatggatgcaaaccgaggtacaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattatccgggctaagaaatgatgtcctaca 13137409  T
Q  184 gggcaatcaaataaatgaataaaacaatcaaatgttccgatacatgatgcaacatcttc-acctccaaggtccaccttaaggacttcaataaaattgtga 282  Q
    |||||| |  |||    || |||| || |||||| | ||  ||||||||||||| |||| |||||||||| || || || |||| ||||||||| |||||    
T  13137408 gggcaaccgcatatccaaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaaca-cttcaacctccaaggccctccctatggacctcaataaaaatgtga 13137310  T
Q  283 gctctcctcttcctct 298  Q
    ||| ||||||||||||    
T  13137309 gctttcctcttcctct 13137294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 100 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 13188740 - 13188542
Alignment:
Q  100 gatgcaaaccaaagttcaaagaacatgcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatc-gggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaa 198  Q
    |||||||||| | || ||||| | | |||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| |  |||      
T  13188740 gatgcaaaccgaggtacaaaggataggcaccgagcaacaaaggcaaggtgttg-aattatctgggctaagaaatgatgtcctacggggcaaccgcatatc 13188642  T
Q  199 tgaataaaacaatcaaatgttccgatacatgatgcaacatcttcacctccaaggtccaccttaaggacttcaataaaattgtgagctctcctcttcctct 298  Q
     ||| |||| || |||||| | ||  |||||||||||||| | ||||| || || || || || |||| ||||||||  |||||||| ||||||||||||    
T  13188641 cgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaacatttacaccttcagggccctccctatggacctcaataaatatgtgagctttcctcttcctct 13188542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 100 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 15630279 - 15630081
Alignment:
Q  100 gatgcaaaccaaagttcaaagaacatgcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaat 199  Q
    |||||||||| | || ||||| | | |||||||||||||||| |||||||||||| |   | ||| |||||| ||||||||| ||||||| |  |||       
T  15630279 gatgcaaaccgaggtacaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattatccaggcaaagaaatgatgtcctacggggcaaccgcatatcc 15630180  T
Q  200 gaataaaacaatcaaatgttccgatacatgatgcaacatcttca-cctccaaggtccaccttaaggacttcaataaaattgtgagctctcctcttcctct 298  Q
    ||| |||| || |||||| | ||  ||||||||||||| ||||| ||||||||| || || || |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  15630179 gaagaaaaaaaccaaatgcttcggaacatgatgcaaca-cttcaacctccaaggccctccctatggacctcaataaaaatgtgagctttcctcttcctct 15630081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 126 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 13196726 - 13196554
Alignment:
Q  126 gcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaatgaataaaacaatcaaatg-ttccgat 224  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |   | ||||||| || ||||||||||| ||||| |  |||   ||| | || || |||||| ||| ||     
T  13196726 gcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattatccaggctaaggaatgatgtcctaagaggcaaccgcatatccgaagagaataaccaaatgcttcaga- 13196628  T
Q  225 acatgatgcaacatcttcacctccaaggtccaccttaaggacttcaataaaattgtgagctctcctcttcctct 298  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||| || || |||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  13196627 acatgatgcaacatttccacctccaaggtcctccctatggaactcaataaaaatgtgagctttcctcttcctct 13196554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 126 - 298
Target Start/End: Original strand, 13689584 - 13689756
Alignment:
Q  126 gcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaatgaataaaacaatcaaatgttccgata 225  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||| |   ||||||||| || ||||||||||| ||||| |  |||   ||| | || || |||||| | ||  |    
T  13689584 gcaccgaacaacaaaggcaaggtgttgaattatccgggctaaggaatgatgtcctaagaggcaaccgcatatccgaagagaataaccaaatgcttcggaa 13689683  T
Q  226 catgatgcaacatcttcacctccaaggtccaccttaaggacttcaataaaattgtgagctctcctcttcctct 298  Q
    ||||||| ||||  | |||||||||||||| || || |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  13689684 catgatggaacacttccacctccaaggtcctccctatggacctcaataaaaatgtgagctttcctcttcctct 13689756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 128 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 12188370 - 12188200
Alignment:
Q  128 accgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatc-gggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaatgaataaaacaatcaaatgttccgatac 226  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  | ||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| |  |||   ||| |||| || |||||| | ||  ||    
T  12188370 accgagcaacaaaggcaaggtgttgactt-atctgggctaagaaatgatgtcctacggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaac 12188272  T
Q  227 atgatgcaacatcttcacctccaaggtccaccttaaggacttcaataaaattgtgagctctcctcttcctct 298  Q
    |||||||||||| | ||||| || || || || || |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  12188271 atgatgcaacatttacaccttcagggccctccctatggacctcaataaaaatgtgagctttcctcttcctct 12188200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 84 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 12194828 - 12194614
Alignment:
Q  84 atgaacggtgggccttgatgcaaaccaaagttcaaagaacatgcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatc-gggctaagaaacgatgtcctaa 182  Q
    ||||| ||||||| | |||||||||| | || ||||| | | | |||||||||||||| |||||||||||  | ||| ||||||||||| |||||||||     
T  12194828 atgaaaggtgggcatggatgcaaaccgaggtacaaaggataagaaccgagcaacaaaggcaaggtgttgactt-atctgggctaagaaatgatgtcctac 12194730  T
Q  183 ggggcaatcaaataaatgaataaaacaatcaaatgttccgatacatgatgcaacatcttcacctccaaggtccaccttaaggacttcaataaaattgtga 282  Q
    ||||||| |  |||   ||| |||| || |||||| | ||  |||||||||||||| | ||||| || ||  | || || |||| ||||||||| |||||    
T  12194729 ggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaacatttacaccttcagggctctccctatggacctcaataaaaatgtga 12194630  T
Q  283 gctctcctcttcctct 298  Q
    ||| ||||||||||||    
T  12194629 gctttcctcttcctct 12194614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 50 - 96
Target Start/End: Original strand, 20154880 - 20154926
Alignment:
Q  50 caccatgaacaagaagccggtggaaactataatgatgaacggtgggc 96  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20154880 caccattaacaagaagctggtggaaactataatgatgaacggtgggc 20154926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 126 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 13505812 - 13505637
Alignment:
Q  126 gcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaatgaataaaacaatcaaatgttccgata 225  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| | || ||  |||| || ||||||| ||||||||| |  |||   ||| ||||||| |||||| | ||  |    
T  13505812 gcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattaatgggaataaggaatgatgtccaaaggggcaaccgcatatccgaagaaaacaaccaaatgcttcggaa 13505713  T
Q  226 catgatgcaacatcttcacctccaaggtccaccttaaggacttca---ataaaattgtgagctctcctcttcctct 298  Q
    ||||||||| ||  |||||||||||||||| || || ||||  ||   |||||| |||||||| ||||||||||||    
T  13505712 catgatgcaccactttcacctccaaggtcctccatatggaccacaatgataaaaatgtgagctttcctcttcctct 13505637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 126 - 298
Target Start/End: Original strand, 13693796 - 13693969
Alignment:
Q  126 gcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaatgaataaaacaatcaaatgttccgata 225  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |   ||| ||  |||| |||||||||| |||||| || || |  ||| | || ||||||||| | ||  |    
T  13693796 gcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaactatccggactccgaaatgatgtcctaaagggcaaccacatcatcgaagagaataatcaaatgcttcggaa 13693895  T
Q  226 catgatgcaacatcttcacctccaaggtccaccttaaggacttcaat-aaaattgtgagctctcctcttcctct 298  Q
    ||||||| |||| ||  ||||||||||||| || || |||| ||||| |||| |||||||| ||||||||||||    
T  13693896 catgatgaaacacctcaacctccaaggtcctccctatggacctcaatgaaaaatgtgagctttcctcttcctct 13693969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 100 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 16374802 - 16374713
Alignment:
Q  100 gatgcaaaccaaagttcaaagaacatgcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatc-gggctaagaaacgatgtcctaaggggcaa 189  Q
    |||||||||| | || ||||| | | |||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  16374802 gatgcaaaccgaggtacaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttg-aattatctgggctaagaaatgatgtcctacggggcaa 16374713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 174 - 298
Target Start/End: Original strand, 16654682 - 16654807
Alignment:
Q  174 atgtcctaaggggcaatcaaataaatgaataaaacaatcaaatgttccgatacatgatgcaacatcttcacctccaaggtcc-accttaaggacttcaat 272  Q
    ||||||||||||||||||  |||   ||| |||| ||||||||| | ||  |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  || || |||||    
T  16654682 atgtcctaaggggcaatcgcatatccgaagaaaataatcaaatgcttcggaacatgatgcaccatcttcacctccaaggtcctacctatagaac-tcaat 16654780  T
Q  273 -aaaattgtgagctctcctcttcctct 298  Q
     |||| |||||||| ||||||||||||    
T  16654781 gaaaaatgtgagctttcctcttcctct 16654807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 126 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 3340516 - 3340341
Alignment:
Q  126 gcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaatgaataaaacaatcaaatgttccgata 225  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| | || ||  |||| || ||||||| | ||||||| |  |||   ||| ||||||| |||||| | ||  |    
T  3340516 gcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattaatgggaataaggaatgatgtccaacggggcaaccgcatatccgaagaaaacaaccaaatgcttcggaa 3340417  T
Q  226 catgatgcaacatcttcacctccaaggtccaccttaaggacttca---ataaaattgtgagctctcctcttcctct 298  Q
    ||||||||| ||  |||||||||||||||| || || ||||  ||   |||||| |||||||| ||||||||||||    
T  3340416 catgatgcaccactttcacctccaaggtcctccatatggaccccaatgataaaaatgtgagctttcctcttcctct 3340341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 12161360 - 12161215
Alignment:
Q  127 caccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaatgaataaaacaatcaaatgttccgatac 226  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||  || ||||| || ||||||||||| ||||| |  |||   ||| |||| || |||||| | ||  ||    
T  12161360 caccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattgacgggactaaggaatgatgtcctaagtggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaac 12161261  T
Q  227 atgatgcaacatcttcacctccaaggtccaccttaaggacttcaat 272  Q
    |||||||| ||  |||||||||||||||| || || |||| |||||    
T  12161260 atgatgcaccactttcacctccaaggtcctccctatggacctcaat 12161215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 126 - 298
Target Start/End: Original strand, 15945532 - 15945707
Alignment:
Q  126 gcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaatgaataaaacaatcaaatgttccgata 225  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| | || ||  |||| || ||||||| | ||||||| |  |||   ||| ||||||| |||||| | ||  |    
T  15945532 gcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattaatgggaataaggaatgatgtccaacggggcaaccgcatatccgaagaaaacaaccaaatgcttcggaa 15945631  T
Q  226 catgatgcaacatcttcacctccaaggtccaccttaaggacttca---ataaaattgtgagctctcctcttcctct 298  Q
    ||||||||| ||  |||||||||||||||| || || |||| |||   |||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  15945632 catgatgcaccactttcacctccaaggtcctccatatggacctcaatgataaaaatgtgagctttcctcctcctct 15945707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 228; Significance: 1e-126; HSPs: 3)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 15 - 301
Target Start/End: Original strand, 17173 - 17462
Alignment:
Q  15 atgatggtggtgatgaagaggaggtaggtgtacaa---caccatgaacaagaagccggtggaaactataatgatgaacggtgggccttgatgcaaaccaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |    
T  17173 atgatggtggtgatgaagaggaggtaggtgcaaacttgcaccattaacaagtagccggtggaaactataatgatgaacggtgggcatggatgcaaaccga 17272  T
Q  112 agttcaaagaacatgcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaatgaataaaacaat 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17273 agttcaaagaacatgcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaatgaatacaacaat 17372  T
Q  212 caaatgttccgatacatgatgcaacatcttcacctccaaggtccaccttaaggacttcaataaaattgtgagctctcctcttcctctact 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17373 caaatgttccgatacatgatgcaacaccttcacctccaaggtctaccttatggacttcaataaaattgtgagctctcctcttcctctact 17462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 256 - 301
Target Start/End: Original strand, 10218 - 10263
Alignment:
Q  256 accttaaggacttcaataaaattgtgagctctcctcttcctctact 301  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10218 accttatggacttcaataaaattgtgagctctcctcttcctctact 10263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 100 - 189
Target Start/End: Original strand, 132518 - 132607
Alignment:
Q  100 gatgcaaaccaaagttcaaagaacatgcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcggg-ctaagaaacgatgtcctaaggggcaa 189  Q
    |||||||||| | ||| |||| | | |||||||||||| ||| |||||||||| ||| |||||| ||||| || |||||||||||||||||    
T  132518 gatgcaaaccgaggttgaaaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttg-aattatcgggactaaggaatgatgtcctaaggggcaa 132607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 15 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 9723 - 9434
Alignment:
Q  15 atgatggtggtgatgaagaggaggtaggtgtacaa---caccatgaacaagaagccggtggaaactataatgatgaacggtgggccttgatgcaaaccaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || | |    ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |    
T  9723 atgatggtggtgatgaagaggaggtagttgcaaacttgcaccatttacaagtagccggtggaaactataatgatgaacggttggcattgatgcaaaccga 9624  T
Q  112 agttcaaagaacatgcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaatgaataaaacaat 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9623 agttcaaagaacatgcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaatgaataaaacaat 9524  T
Q  212 caaatgttccgatacatgatgcaacatcttcacctccaaggtccaccttaaggacttcaataaaattgtgagctctcctcttcctctact 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9523 caaatgttccgatacatgatgcaacatattcacctccaaggtccaacttatggacttcaataaaattgtgagctctcctcttcctctact 9434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 15 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 8670 - 8381
Alignment:
Q  15 atgatggtggtgatgaagaggaggtaggtgtacaa---caccatgaacaagaagccggtggaaactataatgatgaacggtgggccttgatgcaaaccaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  8670 atgatggtggtgatgaagaggaggtaggtgcaaacttgcaccattaacaagaagccggtggaaactataatgatgaacggtgggcatggatgcaaaccaa 8571  T
Q  112 agttcaaagaacatgcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaatgaataaaacaat 211  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8570 agttcaaagaatatgcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaatgggcaatcaaataaatgaataaaacaat 8471  T
Q  212 caaatgttccgatacatgatgcaacatcttcacctccaaggtccaccttaaggacttcaataaaattgtgagctctcctcttcctctact 301  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8470 caaatgttccaatacatgatgcaacaccttcacctccaaggtctaccttatggacttcaataaaattgtgagctctcctcttcctatact 8381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 15 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 12842 - 12553
Alignment:
Q  15 atgatggtggtgatgaagaggaggtaggtgtacaa---caccatgaacaagaagccggtggaaactataatgatgaacggtgggccttgatgcaaaccaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  12842 atgatggtggtgatgaagaggaggtaggtgcaaacttgcaccattaacaagaagccggtggaaactataatgatgaacggtgggcatggatgcaaaccaa 12743  T
Q  112 agttcaaagaacatgcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaatgaataaaacaat 211  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12742 agttcaaagaatatgcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaatgggcaatcaaataaatgaataaaacaat 12643  T
Q  212 caaatgttccgatacatgatgcaacatcttcacctccaaggtccaccttaaggacttcaataaaattgtgagctctcctcttcctctact 301  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12642 caaatgttccaatacatgatgcaacaccttcacctccaaggtctaccttatggacttcaataaaattgtgagctctcctcttcctatact 12553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0566 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 1)
Name: scaffold0566
Description:

Target: scaffold0566; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 15 - 299
Target Start/End: Original strand, 1423 - 1710
Alignment:
Q  15 atgatggtggtgatgaagaggaggtaggtgtacaa---caccatgaacaagaagccggtggaaactataatgatgaacggtgggccttgatgcaaaccaa 111  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| || | |    |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |    
T  1423 atgatggtggtgataaagaggaggtagttgcaaacttgcaccattaacaacaacccggtggaaactataatgatgaacggtgggcatggatgcaaaccga 1522  T
Q  112 agttcaaagaacatgcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaatgaataaaacaat 211  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1523 tgttcaaagaacatgcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaatgatgtcctaaggggcaatcaaataaatgaataaaacaat 1622  T
Q  212 caaatgttccgatacatgatgcaacatcttcacctccaaggtccaccttaaggacttcaataaaattgtgagctctcctcttcctcta 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1623 caaatgttccgatacatgatgcaacaccttcacctccaaagtccaccttatggactacaataaaattgtgacctctcctcttcctcta 1710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 159; Significance: 1e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Original strand, 29580 - 29778
Alignment:
Q  15 atgatggtggtgatgaagaggaggtaggtgtacaacaccatgaacaagaagccggtggaaactataatgatgaacggtgggccttgatgcaaaccaaagt 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||    
T  29580 atgatggtggtgatgaagaggaggtaggtgcacaacaccataaacaaaaagccggtggaaactataatgatgaacggtgggcatggatgcaaaacaaagt 29679  T
Q  115 tcaaagaacatgcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaatgaataaaacaatca 213  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29680 tcaaagaaaatacaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcggactaagaaactatgtcctaaggggcaatcaaataaatgaataaaacaatca 29778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0485 (Bit Score: 149; Significance: 1e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0485
Description:

Target: scaffold0485; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 11325 - 11026
Alignment:
Q  1 cccacaggtacacaatgatggtggtgatgaagaggaggtaggtgtacaacaccatgaacaagaagccggtggaaactataatgatgaacggtgggccttg 100  Q
    ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |    
T  11325 cccacaggtacaaggtgatggtggtgatgaagaggaggtacgtgcacaataccatgaacaa-aagccggtggaagctataatgatgaacggtgggcatgg 11227  T
Q  101 atgcaaaccaaagttcaaagaacatgcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaatg 200  Q
    ||||||||||| |||||||||| | | || |||||||||||||||||||||||||||  || |||||  ||| |||||  ||||||||||| ||||||||    
T  11226 atgcaaaccaatgttcaaagaataagtactgagcaacaaagacaaggtgttgaaatggccgagctaatgaacaatgtctaaaggggcaatcgaataaatg 11127  T
Q  201 aataaaacaatcaaatgttccgatacatgatgcaacatcttcacctccaaggtccaccttaaggacttcaataaaattgtgagctctcctcttcctctac 300  Q
     | |||| ||||||||| || |  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  11126 tagaaaataatcaaatgctctggaacatgctgcaacaccttcacctccaaggtccaccttatggacctcaataaaattgtgagatttcctcttcctctac 11027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 116; Significance: 6e-59; HSPs: 16)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 15 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 25339513 - 25339225
Alignment:
Q  15 atgatggtggtgatgaagaggaggtaggtgtacaa---caccatgaacaagaagccggtggaaactataatgatgaacggtgggccttgatgcaaaccaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||    |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||  | ||||||||||||    
T  25339513 atgatggtggtgatgaagaggaggtaggtgcacacttgcaccatgaacaagaagccggtgggcactttaatgatgaacagtgggaatggatgcaaaccaa 25339414  T
Q  112 agttcaaagaacatgcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaatgaataaaacaat 211  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||  | || ||||||| |||||||||||  || | |||  |||||||     
T  25339413 agttcaaagaataagcaccgagcaacaaatacaaggtgttgaaatggacgggctgcggaatgatgtccaaaggggcaatcgcatgactgaggaaaacaac 25339314  T
Q  212 caaatgttccgatacatgatgcaacatcttcacctccaaggtccaccttaaggacttcaataaaattgtgagctctcctcttcctctact 301  Q
    |||||| || |  ||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| |||| ||||| |||||||||||| |||||||||| ||||    
T  25339313 caaatgctctggaacatgatgcaacaccttcatctgcaaggtcccccttatggacctcaat-aaattgtgagctttcctcttcctttact 25339225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 22 - 187
Target Start/End: Original strand, 24501140 - 24501304
Alignment:
Q  22 tggtgatgaagaggaggtaggtgtacaacaccatgaacaagaagccggtggaaactataatgatgaacggtgggccttgatgcaaaccaaagttcaaaga 121  Q
    ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  |||||| | ||||||| | || |||||||||    
T  24501140 tggtgatgaagaggaggtacgtacacaacaccatgaacaagaagccggtggaagcaataatgatgaattgtgggcatggatgcaatcgaa-gttcaaaga 24501238  T
Q  122 acatgcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggc 187  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24501239 atatgcaccgagaaacaaagacaaggtgttgaaatggccgggctaagaaacgatgtcctaaggggc 24501304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 100 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 12937 - 12739
Alignment:
Q  100 gatgcaaaccaaagttcaaagaacatgcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaat 199  Q
    |||||||||| | || ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||| ||| ||||||||||||||||| |  |||       
T  12937 gatgcaaaccgaggtacaaagaataagcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaattatccgggctaataaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatcc 12838  T
Q  200 gaataaaacaatcaaatgttccgatacatgatgcaacatcttc-acctccaaggtccaccttaaggacttcaataaaattgtgagctctcctcttcctct 298  Q
     || |||| || |||||| | ||  ||||||||||||| |||| |||||||||| || || || |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  12837 aaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaaca-cttcaacctccaaggccctccctatggacctcaataaaaatgtgagctttcctcttcctct 12739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 100 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 22045983 - 22045785
Alignment:
Q  100 gatgcaaaccaaagttcaaagaacatgcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaat 199  Q
    |||||||||| | || ||||| | | |||||||||||||||| |||||||||||| |   |||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||       
T  22045983 gatgcaaaccgaggtacaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattatccgggctaagaaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatcc 22045884  T
Q  200 gaataaaacaatcaaatgttccgatacatgatgcaacatcttc-acctccaaggtccaccttaaggacttcaataaaattgtgagctctcctcttcctct 298  Q
    ||| |||| || |||||| | ||  ||||||||||||| |||| |||||||||| || || || |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  22045883 gaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaaca-cttcaacctccaaggccctccctatggacctcaataaaaatgtgagctttcctcttcctct 22045785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 100 - 298
Target Start/End: Original strand, 25356403 - 25356601
Alignment:
Q  100 gatgcaaaccaaagttcaaagaacatgcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaat 199  Q
    |||||||||| | || ||||| | | |||||||||||||||| |||||||||||| |   |||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||       
T  25356403 gatgcaaaccgaggtacaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattatccgggctaagaaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatcc 25356502  T
Q  200 gaataaaacaatcaaatgttccgatacatgatgcaacatcttc-acctccaaggtccaccttaaggacttcaataaaattgtgagctctcctcttcctct 298  Q
    ||| |||| || |||||| | ||  ||||||||||||| |||| |||||||||| || || || |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  25356503 gaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaaca-cttcaacctccaaggccctccctatggacctcaataaaaatgtgagctttcctcttcctct 25356601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 126 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 25368918 - 25368744
Alignment:
Q  126 gcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaatgaataaaacaatcaaatg-ttccgat 224  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||| |||||| ||||||||||||| ||| |  |||   ||| | || ||||||||| ||| ||     
T  25368918 gcaccgagcaacaaaggcaagatgttgaaatattcgggcaaagaaatgatgtcctaagggccaaccgcatatccgaagagaataatcaaatgcttcaga- 25368820  T
Q  225 acatgatgcaacatcttcacctccaaggtccaccttaaggacttcaat-aaaattgtgagctctcctcttcctcta 299  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||| ||||| || | |||||||| |||||||||||||    
T  25368819 acatgatgcaacatctcaacctccaaggtcctccttatggacctcaatgaataatgtgagctttcctcttcctcta 25368744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 126 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 24821400 - 24821226
Alignment:
Q  126 gcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcggg-ctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaatgaataaaac-aatcaaatgttccga 223  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||| | |||||| ||||| || ||||||||||||||||| |  |||   ||| ||||  || |||||| | ||     
T  24821400 gcaccgagcatcaaaggcaaggtgttgaatt-atcgggactaaggaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaaataaccaaatgcttcgg 24821302  T
Q  224 tacatgatgcaacatcttcacctccaaggtccaccttaaggacttcaat-aaaattgtgagctctcctcttcctct 298  Q
     |||||||||| ||| |||||||||||||||| || || |||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  24821301 aacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatggacctcaatgaaaaatgtgagctctcctcttcctct 24821226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 130 - 298
Target Start/End: Original strand, 116425 - 116596
Alignment:
Q  130 cgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaatgaataaaacaatcaaatgttccgatacatg 229  Q
    |||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| || ||||||| ||||||||| |  |||   ||| |||| || |||||||| ||  |||||    
T  116425 cgagcaacaaaggcaaggtgttgaattaatgggactaaggaatgatgtccaaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgtttcggaacatg 116524  T
Q  230 atgcaacatcttcacctccaaggtccaccttaaggacttca---ataaaattgtgagctctcctcttcctct 298  Q
    ||||| ||  |||||||||||||||| || || |||| |||   |||||| |||||||| ||||||||||||    
T  116525 atgcaccactttcacctccaaggtcctccatatggacctcaatgataaaaatgtgagctttcctcttcctct 116596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 100 - 298
Target Start/End: Original strand, 27626485 - 27626683
Alignment:
Q  100 gatgcaaaccaaagttcaaagaacatgcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatc-gggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaa 198  Q
    |||||||||| | || ||||| | | |||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||  ||||||| |  |||      
T  27626485 gatgcaaaccgaggtacaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttg-aattatctgggctaagaaatgatgtccttcggggcaaccgcatatc 27626583  T
Q  199 tgaataaaacaatcaaatgttccgatacatgatgcaacatcttcacctccaaggtccaccttaaggacttcaataaaattgtgagctctcctcttcctct 298  Q
     ||| |||| || |||||| | ||  |||||||||||||  | ||||| || || || || || |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  27626584 cgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaacacttacaccttcagggccctccctatggacctcaataaaaatgtgagctttcctcttcctct 27626683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 91
Target Start/End: Original strand, 20354200 - 20354237
Alignment:
Q  54 atgaacaagaagccggtggaaactataatgatgaacgg 91  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20354200 atgaacaagaagccggtggaaactataatgatgaacgg 20354237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 128 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 23160670 - 23160497
Alignment:
Q  128 accgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaatgaataaaacaatcaaatg-ttccgatac 226  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || ||  |||| |||||||||| ||||||||| |  |||   ||| ||||||| |||||| ||| || ||    
T  23160670 accgagcaacaaaggcaaggtgttgaactaatgggcataaggaacgatgtccaaaggggcaaccgcatatccgaagaaaacaaccaaatgcttcaga-ac 23160572  T
Q  227 atgatgcaacatcttcacctccaaggtccaccttaaggacttca---ataaaattgtgagctctcctcttcctct 298  Q
    |||||||| ||  |||||||||||||||| || || ||||  ||   |||||| |||||||| ||||||||||||    
T  23160571 atgatgcaccactttcacctccaaggtcctccatatggaccccaatgataaaaatgtgagctttcctcttcctct 23160497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 128 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 23571927 - 23571754
Alignment:
Q  128 accgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaatgaataaaacaatcaaatg-ttccgatac 226  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | || ||  |||| |||||||||| ||||||||| |  |||   ||| ||||||| |||||| ||| || ||    
T  23571927 accgagcaacaaaggcaaggtgttgaactaatgggcataaggaacgatgtccaaaggggcaaccgcatatccgaagaaaacaaccaaatgcttcaga-ac 23571829  T
Q  227 atgatgcaacatcttcacctccaaggtccaccttaaggacttca---ataaaattgtgagctctcctcttcctct 298  Q
    |||||||| ||  |||||||||||||||| || || ||||  ||   |||||| |||||||| ||||||||||||    
T  23571828 atgatgcaccactttcacctccaaggtcctccatatggaccccaatgataaaaatgtgagctttcctcttcctct 23571754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 117 - 295
Target Start/End: Original strand, 16774565 - 16774746
Alignment:
Q  117 aaagaacatgcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaatgaataaaacaatcaaat 216  Q
    |||||| | |||||||||||||||| |||||||||||| | ||  |  ||||| ||||||||| ||||||||| |  |||   ||| |||| || |||||    
T  16774565 aaagaataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaactcatgagcataagacacgatgtccaaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaat 16774664  T
Q  217 gttccgatacatgatgcaacatcttcacctccaaggtccaccttaaggacttca---ataaaattgtgagctctcctcttcc 295  Q
    | | ||  |||||||||| ||  |||||||||||||||| || || |||| |||   |||||| |||||||| |||||||||    
T  16774665 gattcggaacatgatgcaccactttcacctccaaggtcctccatatggacctcaatgataaaaatgtgagctttcctcttcc 16774746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 117 - 298
Target Start/End: Original strand, 27630415 - 27630599
Alignment:
Q  117 aaagaacatgcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaatgaataaaacaatcaaat 216  Q
    |||||| | |||||||||||||||| |||||||||||| | || ||  |||| ||| |||||| ||||||||| |  |||   ||| ||||||| |||||    
T  27630415 aaagaataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaactaatgggcataaggaacaatgtccaaaggggcaaccgcatatccgaagaaaacaaccaaat 27630514  T
Q  217 gttccgatacatgatgcaacatcttcacctccaaggtccaccttaaggacttca---ataaaattgtgagctctcctcttcctct 298  Q
    | | ||  | |||||||| ||  |||||||||||||||| || || ||||  ||   |||||| |||||||| ||||||||||||    
T  27630515 gcttcggaaaatgatgcaccactttcacctccaaggtcctccatatggaccccaatgataaaaatgtgagctttcctcttcctct 27630599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 126 - 298
Target Start/End: Original strand, 24170251 - 24170424
Alignment:
Q  126 gcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaatgaataaaacaatcaaatgttccgata 225  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| ||| |   |||||||||||||||||||||| ||||||| || |||   |||   || ||||||||| | ||  |    
T  24170251 gcactgagcaacaaaggcaaggtgtcgaactatccgggctaagaaacgatgtcctacggggcaaccacatatccgaagtgaataatcaaatgcttcggaa 24170350  T
Q  226 catgatgcaacatcttcacctccaaggtccaccttaaggacttcaat-aaaattgtgagctctcctcttcctct 298  Q
    |||||| || |||||  ||||||| ||||| || || |||| ||||| |||| |||||| | ||||||||||||    
T  24170351 catgatacaccatctcaacctccacggtcctccctatggacctcaatgaaaaatgtgagttttcctcttcctct 24170424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 126 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 27770098 - 27769969
Alignment:
Q  126 gcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaatgaataaaacaatcaaatgttccgata 225  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| | || ||  |||| || ||||||| | ||||||| |  |||   ||| ||||||| |||||| | ||  |    
T  27770098 gcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattaatgggaataaggaatgatgtccaacggggcaaccgcatatccgaagaaaacaaccaaatgcttcggaa 27769999  T
Q  226 catgatgcaacatcttcacctccaaggtcc 255  Q
    ||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  27769998 catgatgcaccactttcacctccaaggtcc 27769969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0206 (Bit Score: 74; Significance: 7e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0206
Description:

Target: scaffold0206; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 220 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 17815 - 17734
Alignment:
Q  220 ccgatacatgatgcaacatcttcacctccaaggtccaccttaaggacttcaataaaattgtgagctctcctcttcctctact 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17815 ccgatacatgatgcaacatcttcacctccaaggtccaccttatggacttcaataaaattgtgagctctcctcttcctttact 17734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 164 - 247
Target Start/End: Original strand, 22215 - 22298
Alignment:
Q  164 ctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaatgaataaaacaatcaaatgttccgatacatgatgcaacatcttcacctc 247  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  22215 ctaagaaacaatgtcctaaggggcgatcaaataaatgaataaaacaatcaaattctccgaaacatgatgcaacaccttcacctc 22298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0402 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0402
Description:

Target: scaffold0402; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 126 - 298
Target Start/End: Original strand, 6803 - 6976
Alignment:
Q  126 gcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaatgaataaaacaatcaaatgttccgata 225  Q
    ||||||||||| |||  |||| ||||||| |  ||||||||||||| |||||||||||||| || || |||   ||| | || ||||||||| | ||| |    
T  6803 gcaccgagcaataaaagcaagatgttgaattattcgggctaagaaatgatgtcctaaggggaaaccacatatccgaagagaataatcaaatgcttcgaaa 6902  T
Q  226 catgatgcaacatcttcacctccaaggtccaccttaaggacttcaat-aaaattgtgagctctcctcttcctct 298  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||| || |||| ||||| |||| |||||||| ||||||||||||    
T  6903 catgatgcaacatctcaacctccaaggtccaccctatggacctcaataaaaaatgtgagctttcctcttcctct 6976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0375
Description:

Target: scaffold0375; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 100 - 298
Target Start/End: Original strand, 11420 - 11619
Alignment:
Q  100 gatgcaaaccaaagttcaaagaacatgcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaat 199  Q
    |||||||||| | || ||||| | | ||||||| |||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||       
T  11420 gatgcaaaccgaggtacaaaggataagcaccgaacaacaaaggcaaggtgttgaattattcgggctaagaaatgatgtcctaaggggcaatcacatatcc 11519  T
Q  200 gaataaaacaatcaaatgttccgatacatgatgcaacatcttcacctccaaggtccaccttaaggacttcaat-aaaattgtgagctctcctcttcctct 298  Q
    ||| |||| |||| |||| | ||  |||||||| |||||||  ||||||||||||| || || |||| ||||| |||| | |||||| |||| |||||||    
T  11520 gaagaaaataatcgaatgcttcggaacatgatgtaacatctcaacctccaaggtcctccctatggacctcaatgaaaaatctgagctttccttttcctct 11619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0974 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0974
Description:

Target: scaffold0974; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 126 - 296
Target Start/End: Original strand, 41 - 211
Alignment:
Q  126 gcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaatgaataaaacaatcaaatg-ttccgat 224  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |   |||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||   ||| |||| || |||||| ||| ||     
T  41 gcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattatccgggctaagaaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcaga- 139  T
Q  225 acatgatgcaacatcttcacctccaaggtccaccttaaggacttcaataaaattgtgagctctcctcttcct 296  Q
    |||||||||||||  | |||||||||||||| || || |||| ||||||||| ||||| || ||||||||||    
T  140 acatgatgcaacacttccacctccaaggtcctccctatggacctcaataaaaatgtgatctttcctcttcct 211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0473 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0473
Description:

Target: scaffold0473; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 100 - 303
Target Start/End: Original strand, 12929 - 13132
Alignment:
Q  100 gatgcaaaccaaagttcaaagaacatgcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaat 199  Q
    |||||||||| | || ||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||| |   |  ||||||||| ||||||||||||||||| |  |||       
T  12929 gatgcaaaccgaggtacaaaggataagcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaattatccaagctaagaaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatcc 13028  T
Q  200 gaataaaacaatcaaatgttccgatacatgatgcaacatcttcacctccaaggtccaccttaaggacttcaataaaattgtgagctctcctcttcctcta 299  Q
    ||| | || || |||||| | ||   ||||||||||||  | |||||||||||||| ||  | |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||     
T  13029 gaagagaataaccaaatgcttcggaccatgatgcaacacttccacctccaaggtcctcccgatggacctcaataaaaatgtgagctttcctcttcctctc 13128  T
Q  300 cttc 303  Q
    ||||    
T  13129 cttc 13132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 127 - 276
Target Start/End: Original strand, 90202 - 90351
Alignment:
Q  127 caccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaatgaataaaacaatcaaatgttccgatac 226  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||  || ||||| || ||||||||||||||||| |  |||   ||| |||| || |||||| | ||| ||    
T  90202 caccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattgacgggactaaggaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcgaaac 90301  T
Q  227 atgatgcaacatcttcacctccaaggtccaccttaaggacttcaataaaa 276  Q
    |||||||| ||  |||||||||||||||| || || |||| |||||||||    
T  90302 atgatgcaccactttcacctccaaggtcctccctatggacctcaataaaa 90351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0506 (Bit Score: 44; Significance: 6e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0506
Description:

Target: scaffold0506; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 126 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 3353 - 3179
Alignment:
Q  126 gcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaatgaataaaacaatcaaatgttccgata 225  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||  || ||||| || ||||||||||||||||| |  |||   ||| |||| || |||||| | ||  |    
T  3353 gcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattgacgggactaaggaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaa 3254  T
Q  226 catgatgcaacatcttcacctccaaggtccaccttaaggacttcaat--aaaattgtgagctctcctcttcctct 298  Q
    ||||||||| ||  ||||||| |||||||| || || |||| |||||  |||| |||||||| ||||||||||||    
T  3253 catgatgcaccactttcaccttcaaggtcctccctatggacctcaatgaaaaaatgtgagctttcctcttcctct 3179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 44; Significance: 6e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 126 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 19566 - 19392
Alignment:
Q  126 gcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcggg-ctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaatgaataaaac-aatcaaatgttccga 223  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||| | |||||| ||||| || ||||||||||||||||| |  |||   ||| ||||  || |||||| | ||     
T  19566 gcaccgagcatcaaaggcaaggtgttgaatt-atcgggactaaggaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaaataaccaaatgcttcgg 19468  T
Q  224 tacatgatgcaacatcttcacctccaaggtccaccttaaggacttcaat-aaaattgtgagctctcctcttcctct 298  Q
     |||||||||| ||| |||||||||||||||| || || |||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  19467 aacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatggacctcaatgaaaaatgtgagctctcctcttcctct 19392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 126 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 19272 - 19097
Alignment:
Q  126 gcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcggg-ctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaatgaataaaacaatcaaatgttccgat 224  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |  |||   ||| |||| || |||||| | ||      
T  19272 gcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattg-tcgggactaagaaatgatgtcctaagcggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcgga 19174  T
Q  225 acatgatgcaacatcttcacctccaaggtccaccttaaggacttcaat---aaaattgtgagctctcctcttcctct 298  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||| || || |||| |||||   || | |||||||| ||||||||||||    
T  19173 acatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatggacctcaatgaaaacaatgtgagctttcctcttcctct 19097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 126 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 253182 - 253009
Alignment:
Q  126 gcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaatgaataaaacaatcaaatgttccgata 225  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |   ||| || | ||| |||||||||| |||||| || || |  ||| | || ||||||||||| ||  |    
T  253182 gcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaactatccggactcataaatgatgtcctaaagggcaaccacatcaccgaagagaataatcaaatgtttcggaa 253083  T
Q  226 catgatgcaacatcttcacctccaaggtccaccttaaggacttcaa-taaaattgtgagctctcctcttcctct 298  Q
    |||||||||||| ||  ||||||| ||||| |  || |||| ||||  |||| |||||||| ||||||||||||    
T  253082 catgatgcaacacctcaacctccacggtcctcactatggacctcaacgaaaaatgtgagctttcctcttcctct 253009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 126 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 39037 - 38864
Alignment:
Q  126 gcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaatgaataaaacaatcaaatgttccgata 225  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||| |   |||  ||||||||||||||||| |||| || |  |||   ||| | || ||||||||| | ||  |    
T  39037 gcaccgagcaacaaaggcaaggtgtcgaactatccggtttaagaaacgatgtcctacggggtaaccgcatatccgaagagaataatcaaatgcttcggaa 38938  T
Q  226 catgatgcaacatcttcacctccaaggtccaccttaaggacttcaat-aaaattgtgagctctcctcttcctct 298  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| || || |||| ||||| |||| |||||||| ||||||||||||    
T  38937 catgatgcaacatctcaacctccaaggtcctccctatggacctcaatgaaaaatgtgagctttcctcttcctct 38864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 126 - 298
Target Start/End: Original strand, 115564 - 115735
Alignment:
Q  126 gcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaatgaataaaacaatcaaatgttccgata 225  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||| |   |||||||||||| |||||||||||||| || |  |||   ||| | || || |||||| | ||  |    
T  115564 gcaccgagcaacaagg-caaggtgttgaattatccgggctaagaaatgatgtcctaaggggaaaccgcatatccgaagagaataaccaaatgcttcggaa 115662  T
Q  226 catgatgcaacatcttcacctccaaggtccaccttaaggacttcaataaaattgtgagctctcctcttcctct 298  Q
    ||||||||||||  | |||||||||||||| || || |||| ||||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  115663 catgatgcaacacttccacctccaaggtcctccctatggacctcaataaaaatgtgagcattcctcttcctct 115735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 126 - 298
Target Start/End: Original strand, 119868 - 120039
Alignment:
Q  126 gcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaatgaataaaacaatcaaatgttccgata 225  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||| |   |||||||||||| |||||||||||||| || |  |||   ||| | || || |||||| | ||  |    
T  119868 gcaccgagcaacaagg-caaggtgttgaattatccgggctaagaaatgatgtcctaaggggaaaccgcatatccgaagagaataaccaaatgcttcggaa 119966  T
Q  226 catgatgcaacatcttcacctccaaggtccaccttaaggacttcaataaaattgtgagctctcctcttcctct 298  Q
    ||||||||||||  | |||||||||||||| || || |||| ||||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  119967 catgatgcaacacttccacctccaaggtcctccctatggacctcaataaaaatgtgagcattcctcttcctct 120039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0346 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0346
Description:

Target: scaffold0346; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 100 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 4914 - 4715
Alignment:
Q  100 gatgcaaaccaaagttcaaagaacatgcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaat 199  Q
    |||||||||| | ||| |||| | | |||||||||||||||| |||||||||||| |   | | ||   ||| ||||||||||||||||| || || |      
T  4914 gatgcaaaccgaggttgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattatccagactccaaaatgatgtcctaaggggcaaccacatcacc 4815  T
Q  200 gaataaaacaatcaaatgttccgatacatgatgcaacatcttcacctccaaggtccaccttaaggacttcaat-aaaattgtgagctctcctcttcctct 298  Q
    ||| | || ||||||||| | ||  ||||||||||||| ||  ||||||||||||| || || |||| ||||| ||||||||||||| || |||||||||    
T  4814 gaagagaataatcaaatgcttcggcacatgatgcaacacctaaacctccaaggtcctccctatggacctcaatgaaaattgtgagctttcatcttcctct 4715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0577 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0577
Description:

Target: scaffold0577; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 100 - 186
Target Start/End: Original strand, 4997 - 5083
Alignment:
Q  100 gatgcaaaccaaagttcaaagaacatgcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaagggg 186  Q
    |||||||||| | || ||||| | | |||||||||||||||| |||||||||||| |   |||||||||||| ||||||||||||||    
T  4997 gatgcaaaccgaggtacaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattatccgggctaagaaatgatgtcctaagggg 5083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0525
Description:

Target: scaffold0525; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 130 - 298
Target Start/End: Original strand, 1061 - 1230
Alignment:
Q  130 cgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcggg-ctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaatgaataaaacaatcaaatgttccgatacat 228  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||||| |  |||   |||||||| || |||||  | ||  ||||    
T  1061 cgagcaactaaggcaaggtgttgaattg-tcgggactaaggaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaataaaataaccaaatacttcggaacat 1159  T
Q  229 gatgcaacatcttcacctccaaggtccaccttaaggacttcaat-aaaattgtgagctctcctcttcctct 298  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||| |||||  ||  ||||| |||| |||||||| ||||||||||||    
T  1160 gatgcaccattttcacctccaaggtcctccttatagaactcaatgaaaaatgtgagctttcctcttcctct 1230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 126 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 32874 - 32702
Alignment:
Q  126 gcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaatgaataaaacaatcaaatgttccgata 225  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||| |   |||||||||||| ||||||||| ||||||| |  |||   ||| | || ||| ||||  | ||  |    
T  32874 gcaccgagcaacaagg-caaggtgttgaactatccgggctaagaaatgatgtcctacggggcaaccgcatatccgaagagaataattaaattcttcggaa 32776  T
Q  226 catgatgcaacatcttcacctccaaggtccaccttaaggacttcaat-aaaattgtgagctctcctcttcctct 298  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| || || |||| ||||| |||| |||||||| ||||||||||||    
T  32775 catgatgcaacatctcaacctccaaggtcctccctatggacctcaatgaaaaatgtgagctttcctcttcctct 32702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 126 - 298
Target Start/End: Original strand, 24487 - 24662
Alignment:
Q  126 gcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaatgaataaaacaatcaaatgttccgata 225  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||| || ||||||| ||||||||| |  |||   ||| |||| || |||||| | ||  |    
T  24487 gcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattaatgggactaaggaatgatgtccaaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaa 24586  T
Q  226 catgatgcaacatcttcacctccaaggtccaccttaaggacttcaat---aaaattgtgagctctcctcttcctct 298  Q
    ||||||||| ||  |||||||||||||||| || || ||||  ||||   |||| |||||||| ||||||||||||    
T  24587 catgatgcaccactttcacctccaaggtcctccatacggaccccaatgacaaaaatgtgagctttcctcttcctct 24662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1095 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1095
Description:

Target: scaffold1095; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 100 - 298
Target Start/End: Original strand, 2167 - 2366
Alignment:
Q  100 gatgcaaaccaaagttcaaagaacatgcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaat 199  Q
    |||||||||| | ||| |||| | | |||||||||||||||| |||| ||||||| |   ||||||  |||| ||||||||||||||||| || ||        
T  2167 gatgcaaaccgaggttgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaagatgttgaattatccgggctccgaaatgatgtcctaaggggcaaccacatcgcc 2266  T
Q  200 gaataaaacaatcaaatgttccgatacatgatgcaacatcttcacctccaaggtccaccttaaggacttcaat-aaaattgtgagctctcctcttcctct 298  Q
    ||| | || ||||||||| | ||  ||||||||||||| ||  ||||||||||||| |  || |||| ||||| |||| |||||||  ||||||||||||    
T  2267 gaagagaataatcaaatgattcggaacatgatgcaacacctcaacctccaaggtcctcgctatggacctcaatgaaaaatgtgagccttcctcttcctct 2366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1571 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1571
Description:

Target: scaffold1571; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 100 - 189
Target Start/End: Original strand, 1513 - 1602
Alignment:
Q  100 gatgcaaaccaaagttcaaagaacatgcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatc-gggctaagaaacgatgtcctaaggggcaa 189  Q
    |||||||||| | || ||||| | | |||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  1513 gatgcaaaccgaggtacaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttg-aattatctgggctaagaaatgatgtcctacggggcaa 1602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 126 - 180
Target Start/End: Original strand, 21835 - 21889
Alignment:
Q  126 gcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcct 180  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||    
T  21835 gcaccgaacaacaaaggcaaggtgttgaaataaccgggctaaggaacgatgtcct 21889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0216
Description:

Target: scaffold0216; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 100 - 298
Target Start/End: Original strand, 10308 - 10506
Alignment:
Q  100 gatgcaaaccaaagttcaaagaacatgcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcgggctaagaaacgatgtcctaaggggcaatcaaataaat 199  Q
    |||||||||| | || ||||| | | |||||||||||||||| |||||||||||| |   |||| | |||||  ||||||||||||||||||  |||       
T  10308 gatgcaaaccgaggtacaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattatccgggtttagaaataatgtcctaaggggcaatcgcatatcc 10407  T
Q  200 gaataaaacaatcaaatgttccgatacatgatgcaacatcttcacctccaaggtccaccttaaggacttcaataaaattgtgagctctcctcttcctct 298  Q
    ||| |||| || |||||| | ||  |||||||||||||  | |  ||||||||||| || || ||||  |||| |||  ||||||| ||||||||||||    
T  10408 gaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaacacttccgactccaaggtcctccctatggaccccaatgaaaaagtgagctttcctcttcctct 10506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 298
Target Start/End: Original strand, 12497 - 12570
Alignment:
Q  225 acatgatgcaacatcttcacctccaaggtccaccttaaggacttcaataaaattgtgagctctcctcttcctct 298  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||| || ||  ||  ||||| ||| |||||||| ||||||||||||    
T  12497 acatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaatgtgagctttcctcttcctct 12570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 38031 - 38002
Alignment:
Q  15 atgatggtggtgatgaagaggaggtaggtg 44  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38031 atgatggtggtgatgaagaggaggtaggtg 38002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0146
Description:

Target: scaffold0146; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 126 - 189
Target Start/End: Original strand, 21799 - 21862
Alignment:
Q  126 gcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcggg-ctaagaaacgatgtcctaaggggcaa 189  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||||||    
T  21799 gcaccgagcaacaaaggaaaggtgttgaattg-tcgggactaaggaatgatgtcctaaggggcaa 21862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 778 times since January 2019
Visitors: 4393