View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0715_low_26 (Length: 272)

Name: NF0715_low_26
Description: NF0715
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0715_low_26
NF0715_low_26
[»] chr3 (62 HSPs)
chr3 (40-250)||(33341812-33342022)
chr3 (40-238)||(7853913-7854111)
chr3 (40-250)||(54685415-54685625)
chr3 (75-245)||(17956103-17956274)
chr3 (62-245)||(30152893-30153078)
chr3 (83-245)||(45581604-45581767)
chr3 (83-245)||(54038243-54038406)
chr3 (95-239)||(16996176-16996321)
chr3 (87-239)||(19570805-19570957)
chr3 (40-179)||(19946629-19946768)
chr3 (87-236)||(16182065-16182215)
chr3 (99-239)||(50112168-50112309)
chr3 (87-236)||(317628-317778)
chr3 (87-239)||(22144389-22144542)
chr3 (83-245)||(3992522-3992686)
chr3 (115-239)||(12349847-12349970)
chr3 (87-239)||(13817492-13817642)
chr3 (83-245)||(23492346-23492509)
chr3 (93-245)||(53771023-53771177)
chr3 (119-245)||(16261463-16261589)
chr3 (87-239)||(35123674-35123826)
chr3 (87-239)||(6154448-6154600)
chr3 (87-239)||(14298399-14298551)
chr3 (87-239)||(14304026-14304178)
chr3 (93-245)||(2844173-2844327)
chr3 (93-239)||(53898572-53898718)
chr3 (87-239)||(6146863-6147015)
chr3 (87-239)||(17523006-17523159)
chr3 (87-239)||(14295415-14295569)
chr3 (93-245)||(38167897-38168050)
chr3 (40-179)||(47784924-47785064)
chr3 (93-239)||(17100636-17100783)
chr3 (93-239)||(17101321-17101468)
chr3 (83-236)||(11329081-11329235)
chr3 (76-217)||(17139474-17139616)
chr3 (83-217)||(14528151-14528286)
chr3 (83-230)||(12560362-12560510)
chr3 (83-239)||(54423986-54424142)
chr3 (40-121)||(9303343-9303425)
chr3 (93-184)||(28558189-28558282)
chr3 (93-239)||(19260956-19261103)
chr3 (83-209)||(55440996-55441123)
chr3 (87-239)||(14301042-14301196)
chr3 (93-239)||(12349656-12349808)
chr3 (77-216)||(17204667-17204807)
chr3 (88-230)||(14059339-14059482)
chr3 (115-217)||(12488865-12488967)
chr3 (120-231)||(8631801-8631912)
chr3 (186-239)||(34439460-34439513)
chr3 (117-236)||(17938582-17938701)
chr3 (68-194)||(38811170-38811297)
chr3 (67-179)||(1990759-1990873)
chr3 (76-217)||(15876034-15876176)
chr3 (68-149)||(17960520-17960602)
chr3 (76-192)||(9590918-9591035)
chr3 (117-217)||(16880131-16880231)
chr3 (76-217)||(12952930-12953072)
chr3 (88-217)||(17191519-17191649)
chr3 (93-217)||(3576577-3576702)
chr3 (209-239)||(28558271-28558301)
chr3 (115-239)||(11061122-11061247)
chr3 (68-179)||(34559857-34559969)
[»] chr5 (28 HSPs)
chr5 (41-239)||(11583982-11584184)
chr5 (83-245)||(2031783-2031946)
chr5 (87-245)||(11342661-11342821)
chr5 (87-239)||(1168321-1168474)
chr5 (87-239)||(28261498-28261651)
chr5 (94-239)||(21397073-21397222)
chr5 (83-245)||(21204898-21205062)
chr5 (87-238)||(21646857-21647009)
chr5 (87-239)||(11337303-11337455)
chr5 (87-239)||(24475560-24475708)
chr5 (87-239)||(4865239-4865393)
chr5 (83-239)||(20712049-20712206)
chr5 (83-245)||(21650668-21650831)
chr5 (118-238)||(21906729-21906846)
chr5 (40-122)||(16105573-16105656)
chr5 (40-122)||(109075-109158)
chr5 (115-239)||(24183249-24183370)
chr5 (76-230)||(19405503-19405658)
chr5 (87-209)||(23466434-23466557)
chr5 (68-236)||(7728378-7728547)
chr5 (83-230)||(23493892-23494040)
chr5 (67-236)||(3673818-3673989)
chr5 (84-236)||(19862183-19862336)
chr5 (76-151)||(16595474-16595550)
chr5 (68-217)||(21616974-21617124)
chr5 (68-151)||(32966352-32966436)
chr5 (41-79)||(24225596-24225634)
chr5 (79-217)||(6456593-6456732)
[»] scaffold1867 (1 HSPs)
scaffold1867 (40-239)||(75-274)
[»] scaffold0833 (1 HSPs)
scaffold0833 (40-217)||(3230-3407)
[»] chr6 (31 HSPs)
chr6 (40-245)||(18583264-18583453)
chr6 (75-245)||(35015276-35015447)
chr6 (75-239)||(19983416-19983581)
chr6 (40-179)||(18823573-18823712)
chr6 (87-238)||(25744331-25744483)
chr6 (40-179)||(18839428-18839567)
chr6 (84-245)||(26089710-26089871)
chr6 (99-239)||(32898779-32898920)
chr6 (83-245)||(18002615-18002777)
chr6 (87-239)||(22440911-22441064)
chr6 (93-245)||(23994905-23995059)
chr6 (87-236)||(31628245-31628395)
chr6 (83-245)||(15742339-15742505)
chr6 (83-238)||(18777119-18777275)
chr6 (87-239)||(13014826-13014979)
chr6 (40-122)||(4991002-4991085)
chr6 (90-236)||(18432623-18432770)
chr6 (90-236)||(16085998-16086144)
chr6 (75-236)||(18381803-18381965)
chr6 (76-236)||(18398905-18399065)
chr6 (102-239)||(18570271-18570409)
chr6 (40-151)||(17083383-17083496)
chr6 (87-236)||(16106499-16106643)
chr6 (68-236)||(22361885-22362054)
chr6 (93-217)||(25367376-25367501)
chr6 (83-215)||(28195234-28195367)
chr6 (88-149)||(15740207-15740269)
chr6 (76-181)||(18629786-18629892)
chr6 (80-217)||(25651207-25651345)
chr6 (74-151)||(25919577-25919655)
chr6 (75-155)||(18087032-18087112)
[»] chr8 (38 HSPs)
chr8 (83-245)||(41506928-41507091)
chr8 (75-245)||(24716981-24717152)
chr8 (102-245)||(39115267-39115411)
chr8 (87-236)||(41246635-41246785)
chr8 (87-239)||(19993171-19993324)
chr8 (93-239)||(22234920-22235067)
chr8 (87-239)||(20573309-20573461)
chr8 (115-239)||(37611675-37611798)
chr8 (83-239)||(20481578-20481735)
chr8 (83-238)||(274416-274572)
chr8 (83-238)||(641277-641433)
chr8 (83-238)||(827083-827239)
chr8 (83-245)||(16039000-16039163)
chr8 (99-236)||(20647949-20648087)
chr8 (99-236)||(20654025-20654163)
chr8 (76-230)||(39446892-39447046)
chr8 (75-236)||(23837163-23837325)
chr8 (87-155)||(20567200-20567268)
chr8 (87-179)||(20567335-20567427)
chr8 (87-179)||(20573528-20573620)
chr8 (87-191)||(25122513-25122618)
chr8 (68-230)||(38533607-38533770)
chr8 (88-228)||(21680980-21681121)
chr8 (68-217)||(5854572-5854722)
chr8 (87-172)||(29759919-29760005)
chr8 (68-217)||(22735977-22736127)
chr8 (87-151)||(15969796-15969860)
chr8 (119-245)||(24385871-24385988)
chr8 (68-217)||(26011452-26011602)
chr8 (183-236)||(20561751-20561804)
chr8 (75-146)||(21198362-21198434)
chr8 (67-217)||(33528383-33528533)
chr8 (78-192)||(23226240-23226355)
chr8 (75-144)||(24929018-24929087)
chr8 (76-217)||(27233206-27233348)
chr8 (75-192)||(31194488-31194606)
chr8 (75-151)||(17285232-17285309)
chr8 (78-193)||(23149749-23149865)
[»] scaffold0120 (2 HSPs)
scaffold0120 (40-239)||(21442-21642)
scaffold0120 (40-239)||(31141-31341)
[»] scaffold0158 (2 HSPs)
scaffold0158 (40-239)||(24890-25088)
scaffold0158 (109-239)||(25212-25341)
[»] chr7 (34 HSPs)
chr7 (83-245)||(111388-111550)
chr7 (40-236)||(7284180-7284376)
chr7 (87-245)||(126392-126551)
chr7 (83-245)||(32494165-32494328)
chr7 (87-239)||(39046740-39046893)
chr7 (83-239)||(11287390-11287547)
chr7 (93-245)||(42056408-42056562)
chr7 (87-239)||(35094794-35094946)
chr7 (93-245)||(2190305-2190459)
chr7 (87-239)||(12758965-12759117)
chr7 (83-245)||(2028893-2029057)
chr7 (93-245)||(3049566-3049719)
chr7 (87-239)||(15822548-15822701)
chr7 (87-217)||(45452305-45452435)
chr7 (83-239)||(3894998-3895155)
chr7 (93-236)||(26070384-26070528)
chr7 (93-236)||(26094171-26094315)
chr7 (87-239)||(47289758-47289911)
chr7 (83-239)||(12248237-12248395)
chr7 (76-239)||(16570122-16570287)
chr7 (76-239)||(16595375-16595540)
chr7 (87-239)||(44865204-44865360)
chr7 (75-245)||(1937131-1937290)
chr7 (40-193)||(14272049-14272203)
chr7 (76-217)||(49047813-49047955)
chr7 (76-239)||(13274753-13274918)
chr7 (87-239)||(143622-143769)
chr7 (75-245)||(17224048-17224220)
chr7 (95-239)||(12369957-12370102)
chr7 (68-217)||(16915067-16915217)
chr7 (68-217)||(48356602-48356752)
chr7 (67-245)||(13377485-13377666)
chr7 (132-239)||(13863046-13863154)
chr7 (75-155)||(18980230-18980310)
[»] scaffold0686 (1 HSPs)
scaffold0686 (75-245)||(6202-6373)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (75-245)||(31399-31570)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (75-245)||(41274-41445)
[»] scaffold0310 (2 HSPs)
scaffold0310 (40-236)||(234-430)
scaffold0310 (40-116)||(6603-6679)
[»] scaffold0039 (2 HSPs)
scaffold0039 (83-245)||(12639-12802)
scaffold0039 (83-216)||(19049-19183)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (75-220)||(30056-30202)
[»] scaffold0034 (3 HSPs)
scaffold0034 (93-245)||(79847-80000)
scaffold0034 (115-239)||(46171-46295)
scaffold0034 (115-239)||(40664-40788)
[»] chr4 (38 HSPs)
chr4 (62-245)||(14951713-14951898)
chr4 (75-238)||(25119333-25119498)
chr4 (87-239)||(53704850-53705003)
chr4 (75-245)||(5682646-5682817)
chr4 (75-239)||(34395222-34395387)
chr4 (99-243)||(55376710-55376855)
chr4 (87-243)||(23270047-23270204)
chr4 (87-239)||(44055892-44056045)
chr4 (87-239)||(16732146-16732299)
chr4 (99-239)||(44346816-44346957)
chr4 (87-237)||(53907818-53907966)
chr4 (87-239)||(30457880-30458033)
chr4 (90-239)||(820033-820180)
chr4 (102-239)||(21959580-21959718)
chr4 (93-245)||(15272431-15272585)
chr4 (131-239)||(8872588-8872699)
chr4 (88-239)||(12837317-12837468)
chr4 (40-142)||(16522748-16522851)
chr4 (83-217)||(18494467-18494602)
chr4 (93-239)||(30232613-30232760)
chr4 (76-230)||(13809636-13809791)
chr4 (115-238)||(45458973-45459096)
chr4 (40-142)||(9295624-9295727)
chr4 (76-216)||(27960938-27961078)
chr4 (40-217)||(7185983-7186159)
chr4 (115-236)||(52265628-52265749)
chr4 (68-151)||(37957230-37957314)
chr4 (115-236)||(15044834-15044955)
chr4 (115-245)||(15109459-15109590)
chr4 (68-177)||(7964890-7965000)
chr4 (74-151)||(19821981-19822059)
chr4 (75-151)||(14901197-14901274)
chr4 (75-151)||(47535251-47535328)
chr4 (169-239)||(10104382-10104452)
chr4 (75-236)||(41166066-41166228)
chr4 (68-216)||(18276392-18276541)
chr4 (76-236)||(41256489-41256650)
chr4 (167-239)||(15675221-15675293)
[»] scaffold0016 (4 HSPs)
scaffold0016 (75-245)||(162297-162469)
scaffold0016 (99-239)||(164204-164345)
scaffold0016 (75-245)||(166383-166547)
scaffold0016 (75-179)||(116690-116795)
[»] chr1 (25 HSPs)
chr1 (83-245)||(21859984-21860147)
chr1 (62-245)||(22366970-22367154)
chr1 (62-245)||(15861545-15861728)
chr1 (80-245)||(44035090-44035255)
chr1 (87-239)||(49967628-49967780)
chr1 (87-239)||(35522436-35522588)
chr1 (87-239)||(41212046-41212202)
chr1 (87-239)||(21718206-21718358)
chr1 (88-239)||(22403227-22403379)
chr1 (83-239)||(35054729-35054886)
chr1 (76-215)||(51627805-51627945)
chr1 (83-239)||(27329872-27330026)
chr1 (68-151)||(27674755-27674838)
chr1 (115-217)||(9784239-9784341)
chr1 (73-151)||(22829629-22829708)
chr1 (68-217)||(17608886-17609036)
chr1 (68-151)||(19603055-19603139)
chr1 (68-148)||(38033882-38033962)
chr1 (75-236)||(20177140-20177302)
chr1 (169-236)||(9784184-9784248)
chr1 (76-236)||(21194980-21195141)
chr1 (75-193)||(13377003-13377122)
chr1 (91-155)||(36356494-36356559)
chr1 (75-155)||(17148534-17148614)
chr1 (75-146)||(41229149-41229221)
[»] chr2 (26 HSPs)
chr2 (75-245)||(22274688-22274858)
chr2 (87-239)||(23836822-23836975)
chr2 (87-239)||(32465835-32465988)
chr2 (75-245)||(22283921-22284091)
chr2 (83-239)||(25876036-25876193)
chr2 (83-245)||(9653015-9653179)
chr2 (40-193)||(19433495-19433649)
chr2 (87-243)||(6879414-6879571)
chr2 (95-245)||(21274168-21274319)
chr2 (87-239)||(28974026-28974179)
chr2 (87-239)||(271148-271300)
chr2 (87-238)||(4448251-4448402)
chr2 (75-239)||(25601989-25602154)
chr2 (83-236)||(36890805-36890959)
chr2 (40-142)||(25212977-25213081)
chr2 (87-202)||(27261783-27261899)
chr2 (76-216)||(22579999-22580140)
chr2 (40-122)||(24826961-24827044)
chr2 (76-239)||(24571408-24571572)
chr2 (40-236)||(43645824-43646020)
chr2 (68-194)||(3403-3529)
chr2 (80-236)||(67962-68119)
chr2 (75-151)||(722360-722437)
chr2 (81-151)||(25305416-25305487)
chr2 (67-108)||(24884643-24884684)
chr2 (167-239)||(24341521-24341593)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (80-245)||(570-736)
[»] scaffold0091 (2 HSPs)
scaffold0091 (87-239)||(32180-32333)
scaffold0091 (87-239)||(41970-42123)
[»] scaffold0021 (3 HSPs)
scaffold0021 (87-239)||(132367-132520)
scaffold0021 (83-239)||(11660-11818)
scaffold0021 (123-238)||(88289-88404)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (87-239)||(70739-70892)
scaffold0001 (87-243)||(60784-60940)
[»] scaffold0480 (2 HSPs)
scaffold0480 (87-239)||(5363-5516)
scaffold0480 (83-239)||(8998-9156)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (87-239)||(22668-22821)
[»] scaffold0673 (2 HSPs)
scaffold0673 (87-239)||(6962-7118)
scaffold0673 (87-239)||(939-1092)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (83-236)||(109582-109736)
scaffold0035 (83-238)||(118081-118237)
[»] scaffold0597 (1 HSPs)
scaffold0597 (83-245)||(1097-1261)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (94-239)||(11825-11970)
[»] scaffold0251 (2 HSPs)
scaffold0251 (83-245)||(13505-13669)
scaffold0251 (93-245)||(21479-21633)
[»] scaffold0175 (1 HSPs)
scaffold0175 (83-245)||(14921-15085)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (87-239)||(254931-255084)
scaffold0011 (87-239)||(261537-261690)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (83-245)||(17523-17686)
[»] scaffold0083 (2 HSPs)
scaffold0083 (87-239)||(14854-15004)
scaffold0083 (87-180)||(14194-14288)
[»] scaffold0014 (2 HSPs)
scaffold0014 (99-236)||(85321-85459)
scaffold0014 (83-245)||(159275-159436)
[»] scaffold0610 (1 HSPs)
scaffold0610 (87-239)||(693-846)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (99-239)||(38287-38428)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (75-239)||(253106-253271)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (76-239)||(9903-10067)
[»] scaffold0359 (2 HSPs)
scaffold0359 (90-236)||(1297-1444)
scaffold0359 (87-239)||(11771-11921)
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (94-239)||(7556-7699)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (83-239)||(15588-15748)
[»] scaffold0338 (1 HSPs)
scaffold0338 (83-239)||(8960-9117)
[»] scaffold0195 (1 HSPs)
scaffold0195 (87-239)||(635-788)
[»] scaffold0032 (2 HSPs)
scaffold0032 (83-245)||(55553-55717)
scaffold0032 (68-155)||(93973-94061)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (83-236)||(10094-10248)
[»] scaffold0706 (1 HSPs)
scaffold0706 (93-245)||(6662-6815)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (83-245)||(193607-193770)
scaffold0004 (93-245)||(186645-186798)
[»] scaffold0574 (1 HSPs)
scaffold0574 (83-245)||(9626-9789)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (83-245)||(94948-95111)
scaffold0037 (83-239)||(24845-25002)
[»] scaffold0022 (3 HSPs)
scaffold0022 (87-239)||(112662-112812)
scaffold0022 (76-217)||(109556-109698)
scaffold0022 (68-230)||(103048-103211)
[»] scaffold0150 (2 HSPs)
scaffold0150 (40-146)||(28466-28573)
scaffold0150 (40-90)||(21637-21687)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (83-239)||(146574-146731)
[»] scaffold0160 (2 HSPs)
scaffold0160 (101-239)||(12-151)
scaffold0160 (83-179)||(3492-3589)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (75-236)||(4906-5068)
[»] scaffold1164 (1 HSPs)
scaffold1164 (62-213)||(1332-1485)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (87-236)||(11688-11837)
[»] scaffold0068 (2 HSPs)
scaffold0068 (87-239)||(48124-48277)
scaffold0068 (87-239)||(61572-61725)
[»] scaffold0095 (1 HSPs)
scaffold0095 (76-230)||(33854-34008)
[»] scaffold0028 (3 HSPs)
scaffold0028 (40-142)||(130486-130589)
scaffold0028 (170-239)||(89586-89655)
scaffold0028 (93-217)||(79522-79647)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (76-214)||(31010-31149)
scaffold0031 (172-230)||(70676-70734)
[»] scaffold0303 (1 HSPs)
scaffold0303 (93-245)||(147-300)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (83-181)||(24372-24471)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (75-236)||(76967-77129)
[»] scaffold0554 (1 HSPs)
scaffold0554 (83-215)||(1889-2022)
[»] scaffold0103 (1 HSPs)
scaffold0103 (115-236)||(33668-33789)
[»] scaffold0740 (2 HSPs)
scaffold0740 (175-238)||(4351-4414)
scaffold0740 (87-155)||(4284-4353)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (99-209)||(3308-3419)
[»] scaffold1272 (1 HSPs)
scaffold1272 (77-236)||(276-436)
[»] scaffold0589 (1 HSPs)
scaffold0589 (83-153)||(7807-7878)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (68-217)||(69415-69565)
[»] scaffold0483 (1 HSPs)
scaffold0483 (77-156)||(6628-6708)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (68-179)||(43975-44087)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (43-100)||(12990-13048)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (75-151)||(35444-35520)
[»] scaffold0700 (1 HSPs)
scaffold0700 (68-230)||(2483-2646)
[»] scaffold1734 (1 HSPs)
scaffold1734 (75-132)||(1364-1422)
[»] scaffold0162 (1 HSPs)
scaffold0162 (75-206)||(7175-7307)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (40-80)||(12694-12734)
[»] scaffold0244 (1 HSPs)
scaffold0244 (83-153)||(22715-22786)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (40-71)||(3396-3427)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 183; Significance: 5e-99; HSPs: 62)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 40 - 250
Target Start/End: Original strand, 33341812 - 33342022
Alignment:
Q  40 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaaaccattttacaaaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagc 139  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33341812 acataatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagc 33341911  T
Q  140 catgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 239  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33341912 catgaattatcatcaaccatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcataattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 33342011  T
Q  240 tataatctacc 250  Q
     ||||| ||||    
T  33342012 cataatttacc 33342022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 40 - 238
Target Start/End: Original strand, 7853913 - 7854111
Alignment:
Q  40 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaaaccattttacaaaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagc 139  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7853913 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcatttctcaacaacaatcatgattcatgcaaacccaagc 7854012  T
Q  140 catgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattga 238  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7854013 catgaattatcatcaaccatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaatcatgcataattcaccaattga 7854111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 40 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 54685625 - 54685415
Alignment:
Q  40 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaaaccattttacaaaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagc 139  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  54685625 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccagcaacagcaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaatccaagc 54685526  T
Q  140 catgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 239  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54685525 catgaattatcatcaaccatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 54685426  T
Q  240 tataatctacc 250  Q
     ||||| ||||    
T  54685425 cataatttacc 54685415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 75 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 17956274 - 17956103
Alignment:
Q  75 attttacaaaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaaca 173  Q
    |||| |||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||  ||||||||||||||||    
T  17956274 atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagtcatgtatcatcatcaacaatatgactaaacaaca 17956175  T
Q  174 acaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagtataat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17956174 acaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataatacaccaattgagtataat 17956103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 62 - 245
Target Start/End: Original strand, 30152893 - 30153078
Alignment:
Q  62 tcattatcaaaccatttt-acaaaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacat 159  Q
    |||| ||||| ||||||| || ||| ||||| ||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||  ||    
T  30152893 tcataatcaacccattttcaccaaaacaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatatatcatcatcaacaat 30152992  T
Q  160 atgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagtataat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30152993 atgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataat 30153078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 83 - 245
Target Start/End: Original strand, 45581604 - 45581767
Alignment:
Q  83 aaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaac 181  Q
    |||||| || |||||| | ||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  45581604 aaaccaacaacaacaatttatttctcaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatcaaccatatgactaaacaacaacaacaac 45581703  T
Q  182 cattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagtataat 245  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  45581704 cattaatcatgaaacatatcacaattcatcaacaatcatgcataattcaccaattgagcataat 45581767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 83 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 54038406 - 54038243
Alignment:
Q  83 aaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaac 181  Q
    |||||| || |||||| | |||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  54038406 aaaccaacaacaacaatttatttcttaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatcaactatatgactaaacaacaacaacaac 54038307  T
Q  182 cattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagtataat 245  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  54038306 cattaatcatgaaacatatcacatttcatcaacaaccatgcataattcaccaatttagcataat 54038243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 95 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 16996321 - 16996176
Alignment:
Q  95 acaactcatttctcaacaacaatc-atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatga 193  Q
    |||||||||||||||||||||| | | |||| |||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16996321 acaactcatttctcaacaacaaaccaagaattatgcaaactcaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacaacaattgatcatga 16996222  T
Q  194 aacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 239  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16996221 aacatatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgag 16996176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 87 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 19570957 - 19570805
Alignment:
Q  87 caccaccaacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattg 186  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  19570957 caccaacaacatctcatttctcaacaacaaccaagaattatgcaaactcaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacaacaattg 19570858  T
Q  187 atcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 239  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19570857 atcatgaaacttatcacaattcaccaacaacaatgcataattcaccaattgag 19570805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 40 - 179
Target Start/End: Original strand, 19946629 - 19946768
Alignment:
Q  40 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaaaccattttacaaaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagc 139  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19946629 acatcatcaaaatcaaacttctatattatcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagc 19946728  T
Q  140 catgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaaca 179  Q
    |||| |||||||||||  | |||||  | |||||||||||    
T  19946729 catggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaaca 19946768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 87 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 16182215 - 16182065
Alignment:
Q  87 caccaccaacaactcatttctcaacaacaatc-atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccatt 185  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||||| |||    
T  16182215 caccaccaacatctcatttctcaacaacaatccaagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaaaaacaacaacaacaatt 16182116  T
Q  186 gatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaatt 236  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  16182115 gatcattaaacttatcacaattcatcaacgacaatgcataattcaccaatt 16182065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 99 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 50112309 - 50112168
Alignment:
Q  99 ctcatttctcaacaacaatc-atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaaca 197  Q
    |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||     
T  50112309 ctcatttctcaaaaacaaaccatgaatcatgcaaactcaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacatcaattgatcatgaaact 50112210  T
Q  198 tatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 239  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  50112209 tatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgag 50112168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 87 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 317778 - 317628
Alignment:
Q  87 caccaccaacaactcatttctcaacaacaatc-atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccatt 185  Q
    ||||| ||||| |||||||||| ||||||| | | |||| || ||||| |||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||    
T  317778 caccaacaacatctcatttctccacaacaaaccaagaattatacaaactcaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacaacaatt 317679  T
Q  186 gatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaatt 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  317678 gatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaatt 317628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 87 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 22144542 - 22144389
Alignment:
Q  87 caccaccaacaactcatttctcaacaacaatc-atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccatt 185  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||| || ||||||||||||||| |||    
T  22144542 caccaacaacatctcatttctcaaccacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgtattatcatcaacaacatggcttaacaacaacaacaacaatt 22144443  T
Q  186 gatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 239  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  22144442 gatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcatacttcaccaattgag 22144389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 83 - 245
Target Start/End: Original strand, 3992522 - 3992686
Alignment:
Q  83 aaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaa--tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaa 180  Q
    |||||| || |||||||| ||||| |||||||||  | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |  | || ||| |||||||||||||     
T  3992522 aaaccaacaacaacaacttatttcacaacaacaaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacat 3992621  T
Q  181 ccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagtataat 245  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3992622 ctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataat 3992686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 115 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 12349970 - 12349847
Alignment:
Q  115 aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaac 214  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12349970 aatcatgaatcatgcaa-cccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttaacaacaacaacaacaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaac 12349872  T
Q  215 aaccatgcataattcaccaattgag 239  Q
     || |||||||||||||||||||||    
T  12349871 tacgatgcataattcaccaattgag 12349847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 87 - 239
Target Start/End: Original strand, 13817492 - 13817642
Alignment:
Q  87 caccaccaacaactcatttctcaacaacaatc-atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccatt 185  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||| | | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||   |||||||| |||    
T  13817492 caccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccaagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaaca---acaacaacaatt 13817588  T
Q  186 gatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 239  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13817589 gatcatgaaacttatcacaattcaccaacaacaatgcataattcaccaattgag 13817642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 83 - 245
Target Start/End: Original strand, 23492346 - 23492509
Alignment:
Q  83 aaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaatc-atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaac 181  Q
    |||||| || |||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |  | || ||| ||||||||||||| |    
T  23492346 aaaccaacaacaacaacttatttcacaacaacaaactatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatc 23492445  T
Q  182 cattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagtataat 245  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||    
T  23492446 tattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatccataattcaccatttgagcataat 23492509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 93 - 245
Target Start/End: Original strand, 53771023 - 53771177
Alignment:
Q  93 caacaactcatttctcaacaacaa--tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatca 190  Q
    |||||||| ||||| |||||||||  | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||  |  | || ||| ||||||||||||| | ||||||||    
T  53771023 caacaacttatttcacaacaacaaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcattcataacatcacttaacaacaacaacatctattgatca 53771122  T
Q  191 tgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagtataat 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  53771123 tgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataat 53771177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 119 - 245
Target Start/End: Original strand, 16261463 - 16261589
Alignment:
Q  119 atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacc 218  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |  | || ||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16261463 atgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacc 16261562  T
Q  219 atgcataattcaccaattgagtataat 245  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||    
T  16261563 atgcataattcaccaattgagcataat 16261589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 87 - 239
Target Start/End: Original strand, 35123674 - 35123826
Alignment:
Q  87 caccaccaacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattg 186  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||  | ||||||||||| | ||||    
T  35123674 caccaacaacatctcatttctcaacacaaatcatgaatcatgcaaacccaaaccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattg 35123773  T
Q  187 atcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 239  Q
    |||||||||| ||||||||||||  |||||| | |||||||||||||||||||    
T  35123774 atcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgag 35123826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 87 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 6154600 - 6154448
Alignment:
Q  87 caccaccaacaactcatttctcaaca-acaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccatt 185  Q
    ||||| ||||| |||||||||| | | | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | |||||| ||||| ||||||||| |||    
T  6154600 caccaacaacatctcatttctccatacaaaattatgaatcatgcaa-cccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttaacaataacaacaacaatt 6154502  T
Q  186 gatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 239  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  6154501 gatcatgaaacttatcacaattcatcaataacaatgcataattcaccaattgag 6154448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 87 - 239
Target Start/End: Original strand, 14298399 - 14298551
Alignment:
Q  87 caccaccaacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattg 186  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||  |  || ||||||| | ||||    
T  14298399 caccaacaacatctcatttctcaacacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatattaataacaacatcaattg 14298498  T
Q  187 atcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 239  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||||||    
T  14298499 atcatgaaacttatcacaattcgacaacaacaaagcataattcaccaattgag 14298551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 87 - 239
Target Start/End: Original strand, 14304026 - 14304178
Alignment:
Q  87 caccaccaacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattg 186  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||  |  || ||||||| | ||||    
T  14304026 caccaacaacatctcatttctcaacacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatattaataacaacatcaattg 14304125  T
Q  187 atcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 239  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||||||    
T  14304126 atcatgaaacttatcacaattcgacaacaacaaagcataattcaccaattgag 14304178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 93 - 245
Target Start/End: Original strand, 2844173 - 2844327
Alignment:
Q  93 caacaactcatttctcaacaacaa--tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatca 190  Q
    |||||||| | ||| |||||||||  | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |  | || ||| ||||||||||||| | ||||||||    
T  2844173 caacaacttacttcacaacaacaaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgatca 2844272  T
Q  191 tgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagtataat 245  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2844273 tgaaacttatcacaattcatcaagaaccatgcataattcaccaattgagcataat 2844327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 93 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 53898718 - 53898572
Alignment:
Q  93 caacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatg 192  Q
    ||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  | |||||  | |||||||||||   ||||||||||    
T  53898718 caacatctcatttctcaacataaatcatgaatcttgcaaacccaagccatgaattatcaccaacaacatgacatatcaacaacaacattaattgatcatg 53898619  T
Q  193 aaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 239  Q
    |||| ||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  53898618 aaacttatcacaatgcaacaacaacaatgcataattcaccaattgag 53898572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 87 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 6147015 - 6146863
Alignment:
Q  87 caccaccaacaactcatttctcaaca-acaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccatt 185  Q
    ||||| ||||| |||||||||| | | | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  | |||||| |||||||||| |||| |||    
T  6147015 caccaacaacatctcatttctccatacaaaatcatgaatcatg-aaacccaagccatgaattattatcaacaacatgacttaacaacaacagcaacaatt 6146917  T
Q  186 gatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 239  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  6146916 gaccatgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcatgattcaccaattgag 6146863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 87 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 17523159 - 17523006
Alignment:
Q  87 caccaccaacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaa-acatatgactaaacaacaacaacaaccatt 185  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||| | ||||||||||| | |||    
T  17523159 caccaacaacatctcatttctcaacacaaatcataaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaaaattgacttagcaacaacaacatcaatt 17523060  T
Q  186 gatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 239  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||    
T  17523059 ggtcatgaaacttatcacaattcatcaataacatagcataattcaccaattgag 17523006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 87 - 239
Target Start/End: Original strand, 14295415 - 14295569
Alignment:
Q  87 caccaccaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccatt 185  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | || ||| |  |||||||||| | |||    
T  14295415 caccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatcacttagaaacaacaacatcaatt 14295514  T
Q  186 gatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattc-accaattgag 239  Q
    ||||||||| | |||||||||||| |||||||   ||||||||| ||||||||||    
T  14295515 gatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaaccaattgag 14295569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 93 - 245
Target Start/End: Original strand, 38167897 - 38168050
Alignment:
Q  93 caacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcat 191  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |  | || ||| ||||||||||||| | |||||||||    
T  38167897 caacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattaacatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgatcat 38167996  T
Q  192 gaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagtataat 245  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||    
T  38167997 gaaacttattacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattgagcataat 38168050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 40 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 47785064 - 47784924
Alignment:
Q  40 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaaaccattttacaaaaccaccaccaacaactcatttctcaacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaag 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| | |||||||    
T  47785064 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacagaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaacacccaag 47784965  T
Q  139 ccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaaca 179  Q
    |||||||| || | |||  | || ||| |||||||||||||    
T  47784964 ccatgaatcattaacaacaacatcacttaacaacaacaaca 47784924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 93 - 239
Target Start/End: Original strand, 17100636 - 17100783
Alignment:
Q  93 caacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcat 191  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |  | || ||| |||||||| |||| | |||||||||    
T  17100636 caacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattaacatccataacatcacttaacaacaataacatcaattgatcat 17100735  T
Q  192 gaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 239  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  17100736 gaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattgag 17100783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 93 - 239
Target Start/End: Original strand, 17101321 - 17101468
Alignment:
Q  93 caacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcat 191  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |  | || ||| |||||||| |||| | |||||||||    
T  17101321 caacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattaacatccataacatcacttaacaacaataacatcaattgatcat 17101420  T
Q  192 gaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 239  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  17101421 gaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattgag 17101468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 83 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 11329235 - 11329081
Alignment:
Q  83 aaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaac 181  Q
    |||| |||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | || ||| | ||||||||||| |    
T  11329235 aaactaccaacaacatctcatttctcatcaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatcaacaacatcacttagcaacaacaacatc 11329136  T
Q  182 cattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaatt 236  Q
     |||||||||||| | |||||||||||| |||||||   |||||||||| |||||    
T  11329135 aattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 11329081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 76 - 217
Target Start/End: Original strand, 17139474 - 17139616
Alignment:
Q  76 ttttacaaaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaa 174  Q
    |||||| |||| |||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | || ||| | ||||||    
T  17139474 ttttaccaaactaccaacaacatctcatttcgcaacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatcaacaacatcacttagcaacaa 17139573  T
Q  175 caacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaac 217  Q
    ||||| | |||||||||||| | |||||||||||| |||||||    
T  17139574 caacatcaattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaac 17139616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 83 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 14528286 - 14528151
Alignment:
Q  83 aaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaac 181  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||  | || ||| | ||||||||||| |    
T  14528286 aaaccaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcattcatacccaagccatgaattaccatcaacaacatcacttagcaacaacaacatc 14528187  T
Q  182 cattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaac 217  Q
     |||||||||||| | |||||||||||| |||||||    
T  14528186 aattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaac 14528151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 83 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 12560510 - 12560362
Alignment:
Q  83 aaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaac 181  Q
    |||| |||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| |||| |  | || ||| | ||||||||||| |    
T  12560510 aaactaccaacaacatctcatttctcaacatcaaatcatgaatcatgcatacccaagccaggaattaacatccacaacatcacttagcaacaacaacatc 12560411  T
Q  182 cattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattca 230  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||   ||||||||||    
T  12560410 cattgatcatgaatcatatcacaattcaacaacaacatagcataattca 12560362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 83 - 239
Target Start/End: Original strand, 54423986 - 54424142
Alignment:
Q  83 aaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaacc 182  Q
    |||||| || |||||||| ||||||||  |  |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |  |  | ||| | ||| ||||||| |     
T  54423986 aaaccaacaacaacaacttatttctcataacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaataatcatccacaacgtcacttagcaataacaacatca 54424085  T
Q  183 attgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 239  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  54424086 attgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattgag 54424142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 40 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 9303425 - 9303343
Alignment:
Q  40 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaaaccattttacaaaaccaccaccaacaactca-tttctcaacaacaatcatg 121  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9303425 acatcatcaaaatcaaacttcttctttatcaacccgttttacaaaaccaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatg 9303343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 93 - 184
Target Start/End: Original strand, 28558189 - 28558282
Alignment:
Q  93 caacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaa-caacaaccat 184  Q
    |||||| | ||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28558189 caacaatttatttctcaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatcaaccatatgactaaacaacaatcaacaaccat 28558282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 93 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 19261103 - 19260956
Alignment:
Q  93 caacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcat 191  Q
    |||||||| |||||  |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||  |  | || | | ||||||||||||| | |||||||||    
T  19261103 caacaacttatttcataacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattaacattcataacatcatttaacaacaacaacatctattgatcat 19261004  T
Q  192 gaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 239  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||    
T  19261003 gaaacttatcacaattcatcaacaacttagtataattcaccaattgag 19260956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 83 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 55441123 - 55440996
Alignment:
Q  83 aaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaac 181  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||  | || ||| | || |||||||| |    
T  55441123 aaaccaccaacaacatctcatttctcaacaaaaaatcatgaattatgcatacccaagtcatgaattatcatcaacaacatcacttagcatcaacaacatc 55441024  T
Q  182 cattgatcatgaaacatatcacaattca 209  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||    
T  55441023 aattgatcatgaaacttatcacaattca 55440996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 87 - 239
Target Start/End: Original strand, 14301042 - 14301196
Alignment:
Q  87 caccaccaacaactcatttctcaacaacaat-catgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccatt 185  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||  | || ||| |  |||||||||| | |||    
T  14301042 caccaacaacatctcatttctcaacaacaaaacatgaatcatgcaaaccaaagacatgaataatcatcaacaacatcacttagaaacaacaacatcaatt 14301141  T
Q  186 gatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattc-accaattgag 239  Q
    ||||||||| | |||||||||||| |||||||   ||||||||| ||||||||||    
T  14301142 gatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaaccaattgag 14301196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 93 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 12349808 - 12349656
Alignment:
Q  93 caacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacc-----caagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattg 186  Q
    |||||||| |||||||| || ||| | ||||||||||||||||     |||||||||| |||||||| |  | |||||  | ||||||||||| | ||||    
T  12349808 caacaacttatttctcatcatcaaattatgaatcatgcaaaccatggccaagccatgatttatcatctacaacatgacatatcaacaacaacatcaattg 12349709  T
Q  187 atcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 239  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||    
T  12349708 atcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaccaattgag 12349656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 77 - 216
Target Start/End: Original strand, 17204667 - 17204807
Alignment:
Q  77 tttacaaaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaac 175  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||  | ||||||||||||||| |||| |||  |||| ||| | |||||||    
T  17204667 tttacaaaaccactaacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattataaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatattacttagcaacaac 17204766  T
Q  176 aacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaa 216  Q
    |||| ||||| | |||||  | |||||||||||| ||||||    
T  17204767 aacatccattaaacatgattcctatcacaattcaacaacaa 17204807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 88 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 14059482 - 14059339
Alignment:
Q  88 accaccaacaactcatttctcaacaaca-atcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattg 186  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | || ||  | |||||| |||| | ||||    
T  14059482 accaacaacatctcatttctcatcaacagatcatgaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatcacatagcaacaataacatcaattg 14059383  T
Q  187 atcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattca 230  Q
    | ||||||   |||||||||||| |||||||   ||||||||||    
T  14059382 aacatgaatattatcacaattcaacaacaacatagcataattca 14059339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 115 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 12488967 - 12488865
Alignment:
Q  115 aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaac 214  Q
    |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||  | || ||| | ||||||||||| | |||||||||||| | |||||||||||| ||||    
T  12488967 aatcatgaattatgaacacccaagccatgaattatcatcaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgatcatgaatcttatcacaattcaacaac 12488868  T
Q  215 aac 217  Q
    |||    
T  12488867 aac 12488865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 120 - 231
Target Start/End: Original strand, 8631801 - 8631912
Alignment:
Q  120 tgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacca 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||  | ||||||||||| | |||  | ||||||| ||||||||| || ||||||| |    
T  8631801 tgaatcatgcaaacccaagccatgaatgatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaatttgttatgaaacttatcacaatccaacaacaacaa 8631900  T
Q  220 tgcataattcac 231  Q
     |||||||||||    
T  8631901 agcataattcac 8631912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 186 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 34439513 - 34439460
Alignment:
Q  186 gatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 239  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34439513 gatcatgaaacttatcataattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgag 34439460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 117 - 236
Target Start/End: Original strand, 17938582 - 17938701
Alignment:
Q  117 tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaa 216  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||  | |||||  | ||||||||||| | |||||||||||||   | |||||| || ||||||    
T  17938582 tcatgaatcatgtaaacccaagccatgaatgattatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgatcatgaaaataaccacaatccaacaacaa 17938681  T
Q  217 ccatgcataattcaccaatt 236  Q
    | | |||||||||| |||||    
T  17938682 caaagcataattcatcaatt 17938701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 68 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 38811297 - 38811170
Alignment:
Q  68 tcaaaccattttacaaaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaat-catgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgacta 166  Q
    |||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| | || |||  ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||  | || |||     
T  38811297 tcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttctgatcatcaaaacatgaattatgcacacccaagccatgaatcatcatcaacaacatcactt 38811198  T
Q  167 aacaacaacaacaaccattgatcatgaa 194  Q
    | ||||||||||| | ||||| ||||||    
T  38811197 agcaacaacaacatcaattgaacatgaa 38811170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 67 - 179
Target Start/End: Original strand, 1990759 - 1990873
Alignment:
Q  67 atcaaaccattttacaaaaccaccaccaacaactcatttctcaacaac-aatcatgaatcatgca-aacccaagccatgaattatcatcaaacatatgac 164  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || | |||||||| | ||| | || ||||||||||||| |||| |||  ||||  |    
T  1990759 atcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacaaaccaagccatgaatcatcaacaacaatatctc 1990858  T
Q  165 taaacaacaacaaca 179  Q
    | |||||||||||||    
T  1990859 ttaacaacaacaaca 1990873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 76 - 217
Target Start/End: Original strand, 15876034 - 15876176
Alignment:
Q  76 ttttacaaaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaa 174  Q
    |||||| |||| |||| || |||||||||||||| | |||| |||||||| ||| | ||| ||||||||||| ||||| ||  | || ||| | ||||||    
T  15876034 ttttaccaaactaccaacaccaactcatttctcatccacaaatcatgaattatgaatacctaagccatgaatcatcattaacaacatcacttaccaacaa 15876133  T
Q  175 caacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaac 217  Q
    ||||| | ||||| |||||| | |||||||||||| |||||||    
T  15876134 caacatcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaac 15876176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 68 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 17960602 - 17960520
Alignment:
Q  68 tcaaaccattttacaaaaccaccaccaacaactcatttctcaacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattat 149  Q
    |||| ||||||||||||  ||||| |||||||||||||| || |||| |||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||    
T  17960602 tcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagtcatgaattat 17960520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 9591035 - 9590918
Alignment:
Q  76 ttttacaaaaccaccaccaacaactcatttctcaacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaa 174  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||| || | |||||||||  ||| | ||||||| ||||||| |||| |||  |||| ||| ||||||||    
T  9591035 ttttacaaaaccaacaacaacaactcatttctcatcatcaaatcatgaactatgaacacccaagtcatgaatcatcaacaacaatatcacttaacaacaa 9590936  T
Q  175 caacaaccattgatcatg 192  Q
    ||||| | ||||| ||||    
T  9590935 caacatcaattgaacatg 9590918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 117 - 217
Target Start/End: Original strand, 16880131 - 16880231
Alignment:
Q  117 tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaa 216  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |  | || ||| | |||||| |||| | ||||| |||||| | |||||||||||| ||||||    
T  16880131 tcatgaattatgcacacccaagccatgaattatcatccacaacatcacttagcaacaataacatcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaa 16880230  T
Q  217 c 217  Q
    |    
T  16880231 c 16880231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 76 - 217
Target Start/End: Original strand, 12952930 - 12953072
Alignment:
Q  76 ttttacaaaaccaccaccaacaactcatttctcaacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaa 174  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||| || | |||||||| | ||| | ||||||||||||||| |||| |||  ||||  || | ||||||    
T  12952930 ttttacaaaaccaacaacaacaactcatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatctcttagcaacaa 12953029  T
Q  175 caacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaac 217  Q
    ||||| | ||| | ||| || |  ||||||||||| |||||||    
T  12953030 caacatcaattaaacataaatctcatcacaattcaacaacaac 12953072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 88 - 217
Target Start/End: Original strand, 17191519 - 17191649
Alignment:
Q  88 accaccaacaactcatttctcaacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattg 186  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| | || |||||||||||| |||| |||  | || ||| | ||||| ||||| | |||     
T  17191519 accaccaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaacactcaagccatgaatcatcaacaacaacattacttagcaacagcaacatcaatta 17191618  T
Q  187 atcatgaaacatatcacaattcatcaacaac 217  Q
    | |||||  | |||||||||||| |||||||    
T  17191619 aacatgattcttatcacaattcagcaacaac 17191649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 93 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 3576702 - 3576577
Alignment:
Q  93 caacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcat 191  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||| |||| | |  |||| ||| | ||||||||||| | ||  | |||    
T  3576702 caacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaaccacaatattacttagcaacaacaacatcaatcaaacat 3576603  T
Q  192 gaaacatatcacaattcatcaacaac 217  Q
    ||  | |||||||||||| |||||||    
T  3576602 gactcttatcacaattcaacaacaac 3576577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 209 - 239
Target Start/End: Original strand, 28558271 - 28558301
Alignment:
Q  209 atcaacaaccatgcataattcaccaattgag 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28558271 atcaacaaccatgcataattcaccaattgag 28558301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 115 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 11061247 - 11061122
Alignment:
Q  115 aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaac 214  Q
    |||||||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||  |||| ||| | || |||||||| | ||||| |||||    |||||||||||| ||||    
T  11061247 aatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaccaacaacatcaattgaacatgactattatcacaattcaacaac 11061148  T
Q  215 aaccatgcataattc-accaattgag 239  Q
    |||   ||||||||| ||||||||||    
T  11061147 aacatagcataattcaaccaattgag 11061122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 68 - 179
Target Start/End: Original strand, 34559857 - 34559969
Alignment:
Q  68 tcaaaccattttacaaaaccaccaccaacaactcatttctcaacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgacta 166  Q
    |||| |||||||||||||||| || |||||||||| |||||| || | ||| |||| | ||| | || |||||||||||| |||| |||  |||| |||     
T  34559857 tcaacccattttacaaaaccaacaacaacaactcaattctcatcatcaaattatgatttatgaacactcaagccatgaatcatcaacaacaatatcactt 34559956  T
Q  167 aacaacaacaaca 179  Q
    | |||||||||||    
T  34559957 agcaacaacaaca 34559969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 145; Significance: 2e-76; HSPs: 28)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 41 - 239
Target Start/End: Original strand, 11583982 - 11584184
Alignment:
Q  41 catcatcaaaatcaaacttcttcattatcaaaccattttacaaaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaa-cccaagc 139  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11583982 catcatcaaaaacaaacttcttcatcatcaacccattttacaaaaccacgaacaacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaaacccaagc 11584081  T
Q  140 catgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccat---gcataattcaccaatt 236  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    ||||||||||||||||    
T  11584082 catgaattatcatcaaccatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcaacaacaacaacaaagcataattcaccaatt 11584181  T
Q  237 gag 239  Q
    |||    
T  11584182 gag 11584184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 83 - 245
Target Start/End: Original strand, 2031783 - 2031946
Alignment:
Q  83 aaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaac 181  Q
    ||||||||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  2031783 aaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaatatgactaaacaacaacaacaac 2031882  T
Q  182 cattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagtataat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2031883 cattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataat 2031946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 87 - 245
Target Start/End: Original strand, 11342661 - 11342821
Alignment:
Q  87 caccaccaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaa-caacaacaaccat 184  Q
    ||||| ||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||    
T  11342661 caccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatatatcatcatcaacaatatgactaaacaaacaacaacaaccat 11342760  T
Q  185 tgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagtataat 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11342761 tgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataat 11342821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 87 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 1168474 - 1168321
Alignment:
Q  87 caccaccaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccatt 185  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| | ||||||||||| | |||    
T  1168474 caccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaacaacatcaatt 1168375  T
Q  186 gatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 239  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  1168374 gatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacattgcataattcaccaattgag 1168321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 87 - 239
Target Start/End: Original strand, 28261498 - 28261651
Alignment:
Q  87 caccaccaacaactcatttctcaacaacaatc-atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccatt 185  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||| | | |||| |||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||| |||    
T  28261498 caccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccaagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcagcaacatgactaaacaacaacaacaacaatt 28261597  T
Q  186 gatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 239  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28261598 gatcataaaacatatcacaatttatcaacaacaatgcataattcaccaattgag 28261651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 94 - 239
Target Start/End: Original strand, 21397073 - 21397222
Alignment:
Q  94 aacaactcatttctcaacaacaatc-atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaa---caacaaccattgatc 189  Q
    |||| |||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||   ||||||| |||||||    
T  21397073 aacatctcatttctcaataacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttaacaacaataacaacaacaattgatc 21397172  T
Q  190 atgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 239  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21397173 atgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgag 21397222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 83 - 245
Target Start/End: Original strand, 21204898 - 21205062
Alignment:
Q  83 aaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaa--tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaa 180  Q
    |||||| || |||||||| ||||| |||||||||  | |||||||||||| |||||||||||||||||  || ||  | || ||| ||||||||||||||    
T  21204898 aaaccaacaacaacaacttatttcacaacaacaaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagaataaataacatcacttaacaacaacaacaa 21204997  T
Q  181 ccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagtataat 245  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21204998 atattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataat 21205062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 87 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 21647009 - 21646857
Alignment:
Q  87 caccaccaacaactcatttctcaacaacaatc-atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacat-atgactaaacaacaacaacaaccat 184  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||| | |  ||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| ||    
T  21647009 caccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccaataattatacaaacccaagccatgaattatcatcaa-catcatgactaaacaacaacagcaacaat 21646911  T
Q  185 tgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattga 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  21646910 tgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacgatacataattcaccaattga 21646857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 87 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 11337455 - 11337303
Alignment:
Q  87 caccaccaacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattg 186  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  | |||||| | ||||||||||| | ||||    
T  11337455 caccaacaacatctcatttctcaacaacaatcatgaatcatgtaaactcaagccatgaattatcatcaacgacatgacttagcaacaacaacatcaattg 11337356  T
Q  187 atcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 239  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||    ||||||||||||| ||||    
T  11337355 atcatgaaacttatcacaattcatcaacaacataacataattcaccaaatgag 11337303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 87 - 239
Target Start/End: Original strand, 24475560 - 24475708
Alignment:
Q  87 caccaccaacaactcatttctcaacaacaatc-atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccatt 185  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||| | | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||   |||    
T  24475560 caccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccaagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaaca---att 24475656  T
Q  186 gatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 239  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24475657 gatcatgaaacata--acaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgag 24475708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 87 - 239
Target Start/End: Original strand, 4865239 - 4865393
Alignment:
Q  87 caccaccaacaactcatttctcaacaacaat-catgaatcatgcaaacccaagccatgaa-ttatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccat 184  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  | |||| |||||||| | |||||| ||    
T  4865239 caccaacaacacctcatctctcaacaacaattcaagaattatgcaaacccaagccatgaaattatcatcaacaacatgaataaacaaccataacaacaat 4865338  T
Q  185 tgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  4865339 tgatcatgaaacatatcacaattcatcaaccacaatgcataattcaccaattgag 4865393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 83 - 239
Target Start/End: Original strand, 20712049 - 20712206
Alignment:
Q  83 aaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaac 181  Q
    |||||| || |||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  | |||||| ||||||||||||| |    
T  20712049 aaaccaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattaacatcaacaacatgacttaacaacaacaacatc 20712148  T
Q  182 cattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 239  Q
     |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  20712149 aattgatcatgcaacttatcacaattcatcaacaacaaagcataattcaccaattgag 20712206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 83 - 245
Target Start/End: Original strand, 21650668 - 21650831
Alignment:
Q  83 aaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaac 181  Q
    |||||| || |||||||| ||||| | ||||||| | |||||||||||| |||||| |||||||||| |||  |  | || ||| ||||||||||||| |    
T  21650668 aaaccaacaacaacaacttatttcaccacaacaaattatgaatcatgcatacccaaaccatgaattagcattcataacatcacttaacaacaacaacatc 21650767  T
Q  182 cattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagtataat 245  Q
     |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21650768 tattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaaccatgcataattcaccaattgagcataat 21650831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 118 - 238
Target Start/End: Original strand, 21906729 - 21906846
Alignment:
Q  118 catgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaac 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||| ||   |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21906729 catgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttaacaacaacatca---attgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaac 21906825  T
Q  218 catgcataattcaccaattga 238  Q
       |||||||||| |||||||    
T  21906826 atagcataattcatcaattga 21906846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 40 - 122
Target Start/End: Original strand, 16105573 - 16105656
Alignment:
Q  40 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaaaccattttacaaaaccaccaccaacaactca-tttctcaacaacaatcatga 122  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16105573 acatcatcaaaatcaaacttcttctttatcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatga 16105656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 40 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 109158 - 109075
Alignment:
Q  40 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaaaccattttacaaaaccaccaccaacaactca-tttctcaacaacaatcatga 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  109158 acatcatcaaaatcaaacttcttctctatcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatga 109075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 115 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 24183370 - 24183249
Alignment:
Q  115 aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    |||||  | |||||||| || | ||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  24183370 aatcatgaatcatgcaaacccaagccattaattatcatcaac---atgacatatcaacaacaccatcaattgatcatgaaactcatcacaattcaacaac 24183274  T
Q  215 aaccatgcataattcaccaattgag 239  Q
    ||| | |||||||||||||||||||    
T  24183273 aacaaagcataattcaccaattgag 24183249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 76 - 230
Target Start/End: Original strand, 19405503 - 19405658
Alignment:
Q  76 ttttacaaaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaa 174  Q
    |||||| ||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | || ||  | ||  ||    
T  19405503 ttttaccaaaacaccaacaacatctcatttctccacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatcaacaacatcacataccagtaa 19405602  T
Q  175 caacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattca 230  Q
    ||| | | |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |  |||||||||    
T  19405603 caatatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacgaatcataattca 19405658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 87 - 209
Target Start/End: Original strand, 23466434 - 23466557
Alignment:
Q  87 caccaccaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacat-atgactaaacaacaacaacaaccat 184  Q
    ||||| |||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| || ||| | ||||||||||| | ||    
T  23466434 caccaacaacatatcattcctcaacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaactatcatc-aacatcatcacttagcaacaacaacatcaat 23466532  T
Q  185 tgatcatgaaacatatcacaattca 209  Q
    |||||||||||| ||||||||||||    
T  23466533 tgatcatgaaacttatcacaattca 23466557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 68 - 236
Target Start/End: Original strand, 7728378 - 7728547
Alignment:
Q  68 tcaaaccattttacaaaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaat-catgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgacta 166  Q
    |||| ||||||| ||||  ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||  | || |||     
T  7728378 tcaacccatttttcaaagtcaccaacaacacctcatctctcaccaacaattcatgaattatgcacacccaagcgataaattatcatcaacaacatcactt 7728477  T
Q  167 aacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaatt 236  Q
    | ||||||||||| | ||||| |||||| | |||||||||||| |||||||   |||||||||| |||||    
T  7728478 agcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 7728547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 83 - 230
Target Start/End: Original strand, 23493892 - 23494040
Alignment:
Q  83 aaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaac 181  Q
    |||||| || |||||||| |||||||| || ||| |||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||  | || ||| | ||||||||||| |    
T  23493892 aaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcatcaacaacatcacttagcaacaacaacatc 23493991  T
Q  182 cattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattca 230  Q
     ||||| |||||| | |||||||||||| |||||||   ||||||||||    
T  23493992 aattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattca 23494040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 67 - 236
Target Start/End: Original strand, 3673818 - 3673989
Alignment:
Q  67 atcaaaccatttt-acaaaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgac 164  Q
    ||||| ||||||| || |||||| || |||||||| |||||||| || ||| || ||| | ||| | ||||||||||||||| |||||||| ||  |  |    
T  3673818 atcaacccattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcgtgatttatgaacacccaagccatgaatcatcatcaaccacctcgc 3673917  T
Q  165 taaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaatt 236  Q
    | | ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| |||||||   |||||||||| |||||    
T  3673918 ttagcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 3673989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 84 - 236
Target Start/End: Original strand, 19862183 - 19862336
Alignment:
Q  84 aaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaacc 182  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| || ||| |||||||| ||| | ||||||| ||||||| |||| |||  |||| ||| | ||||||||||| |     
T  19862183 aaccaccaacaacaactcatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacccaagtcatgaatcatcaacaataatatcacttagcaacaacaacatca 19862282  T
Q  183 attgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaatt 236  Q
    ||||  |||||  | |||||||||||| |||||||   |||||||||| |||||    
T  19862283 attgcacatgattcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 19862336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 76 - 151
Target Start/End: Original strand, 16595474 - 16595550
Alignment:
Q  76 ttttacaaaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaat-catgaatcatgcaaacccaagccatgaattatca 151  Q
    |||||| |||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  16595474 ttttaccaaactaccaacaacatctcatttctcatcaacaattcatgaatcatgcacacccaagtcatgaattatca 16595550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 68 - 217
Target Start/End: Original strand, 21616974 - 21617124
Alignment:
Q  68 tcaaaccattttacaaaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgacta 166  Q
    |||| |||||||||||||||| |  ||||| |||| |||||| || ||| |||||||| ||| | ||||||||||||||| | || |||  |||| |||     
T  21616974 tcaacccattttacaaaaccaaccacaacagctcacttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcaacaacaacaatatcactt 21617073  T
Q  167 aacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaac 217  Q
    | ||||||||||| | ||||| |||||| |  ||||||||||| |||||||    
T  21617074 agcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcacaattcaacaacaac 21617124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 68 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 32966436 - 32966352
Alignment:
Q  68 tcaaaccattttacaaaaccaccaccaacaactcatttctcaacaa-caatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatca 151  Q
    |||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||| |||| |||||| |||||  | |||||||||||||||||    
T  32966436 tcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttctcatcaaccaattatgaattatgcacgctcaagccatgaattatca 32966352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 41 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 24225634 - 24225596
Alignment:
Q  41 catcatcaaaatcaaacttcttcattatcaaaccatttt 79  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24225634 catcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccatttt 24225596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 79 - 217
Target Start/End: Original strand, 6456593 - 6456732
Alignment:
Q  79 tacaaaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaa 177  Q
    ||||||| || || |||||||| |||||||| || ||| |||||| ||||| | ||||||||||||||| |||| |||  ||||  || |||||||||||    
T  6456593 tacaaaaacaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgattcatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacgatatctcttaacaacaacaa 6456692  T
Q  178 caaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaac 217  Q
    || | ||| | |||||  |  ||||||||||| |||||||    
T  6456693 catcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaac 6456732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1867 (Bit Score: 136; Significance: 5e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold1867
Description:

Target: scaffold1867; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 40 - 239
Target Start/End: Original strand, 75 - 274
Alignment:
Q  40 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaaaccattttacaaaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagc 139  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  75 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccaacaacaacaactcatttctcagcaacaatcatgaatcatgcaaacccaagc 174  T
Q  140 catgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 239  Q
    ||||||||||||||||  | |||||  | ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||    
T  175 catgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaccaattgag 274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0833 (Bit Score: 134; Significance: 8e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0833
Description:

Target: scaffold0833; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 40 - 217
Target Start/End: Original strand, 3230 - 3407
Alignment:
Q  40 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaaaccattttacaaaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagc 139  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3230 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagc 3329  T
Q  140 catgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaac 217  Q
    ||||||||||||||||  | |||||  | ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3330 catgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaac 3407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 31)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 40 - 245
Target Start/End: Original strand, 18583264 - 18583453
Alignment:
Q  40 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaaaccattttacaaaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagc 139  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18583264 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagc 18583363  T
Q  140 catgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 239  Q
    |||||||||||||                ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18583364 catgaattatcat----------------caacaacaacatcaattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 18583447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 75 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 35015447 - 35015276
Alignment:
Q  75 attttacaaaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaaca 173  Q
    |||| |||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  ||||||||||||||||    
T  35015447 atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgtatcatcatcaacaatatgactaaacaaca 35015348  T
Q  174 acaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagtataat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  35015347 acaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataat 35015276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 75 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 19983581 - 19983416
Alignment:
Q  75 attttacaaaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaatc-atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaaca 173  Q
    |||| |||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  ||||||||||||||||    
T  19983581 atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgtatcatcatcaacaatatgactaaacaaca 19983482  T
Q  174 acaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 239  Q
    |||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  19983481 acaacaaccactaaccatgaaacatatcacaattcatcaacaatcatgcataattcactaattgag 19983416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 40 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 18823712 - 18823573
Alignment:
Q  40 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaaaccattttacaaaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagc 139  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18823712 acatcatcaaaatcaaacttcttctttatcaagccattttacaaaaccaccaccaacaactcatttctccacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagc 18823613  T
Q  140 catgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaaca 179  Q
    |||| |||||||||||  | |||||  | |||||||||||    
T  18823612 catggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaaca 18823573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 87 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 25744483 - 25744331
Alignment:
Q  87 caccaccaacaactcatttctcaacaacaatc-atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccatt 185  Q
    ||||| ||||| |||||||||| ||||||| | | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||  ||    
T  25744483 caccaacaacatctcatttctctacaacaaaccaagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacaacattt 25744384  T
Q  186 gatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  25744383 gatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccacttga 25744331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 40 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 18839567 - 18839428
Alignment:
Q  40 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaaaccattttacaaaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagc 139  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18839567 acatcatcaaaatcaaacttcttctttttcaactcattttacaaaaccaccaccaacaactcatttctccacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagc 18839468  T
Q  140 catgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaaca 179  Q
    |||| |||||||||||  | |||||  | |||||||||||    
T  18839467 catggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaaca 18839428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 84 - 245
Target Start/End: Original strand, 26089710 - 26089871
Alignment:
Q  84 aaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaacca 183  Q
    ||||| || |||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||| |||| |  | || ||| ||||||||||||| | |    
T  26089710 aaccaacaacaacaacttatttcacaacaacaattatgaatcatgcatacccaaaccatgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatcta 26089809  T
Q  184 ttgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagtataat 245  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26089810 ttgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataat 26089871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 99 - 239
Target Start/End: Original strand, 32898779 - 32898920
Alignment:
Q  99 ctcatttctcaacaacaatc-atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaaca 197  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||     
T  32898779 ctcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccattaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacttcaattgatcatgaaact 32898878  T
Q  198 tatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 239  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  32898879 tatcacaattcatcaacaataatgcataattcaccaattgag 32898920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 83 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 18002777 - 18002615
Alignment:
Q  83 aaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaacc 182  Q
    |||||| || |||||||| ||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |  |  | ||| ||||||||||||| |     
T  18002777 aaaccaacaacaacaacttatttcacaacaacaagtatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacgtcacttaacaacaacaacatct 18002678  T
Q  183 attgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagtataat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  18002677 attgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcatcaattgagcataat 18002615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 87 - 239
Target Start/End: Original strand, 22440911 - 22441064
Alignment:
Q  87 caccaccaacaactcatttctcaacaacaa--tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccat 184  Q
    ||||| ||||| |||||||||| | |||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||||| ||    
T  22440911 caccaacaacatctcatttctccataacaaaatcatgaatcatgcaa-cccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttaacaacaacaacaacaat 22441009  T
Q  185 tgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 239  Q
    |||||||||||| |||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  22441010 tgatcatgaaacttatcacaaatcatgaacaacaatgcataattcaccaattgag 22441064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 93 - 245
Target Start/End: Original strand, 23994905 - 23995059
Alignment:
Q  93 caacaactcatttctcaacaacaa--tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatca 190  Q
    |||||||| ||||| |||||||||  | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||  |  | || ||| ||||||||||||| | ||||||||    
T  23994905 caacaacttatttcacaacaacaaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcattcataacatcacttaacaacaacaacatctattgatca 23995004  T
Q  191 tgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagtataat 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23995005 tgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataat 23995059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 87 - 236
Target Start/End: Original strand, 31628245 - 31628395
Alignment:
Q  87 caccaccaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccatt 185  Q
    ||||| ||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||  | ||||||||||| | |||    
T  31628245 caccaacaacatctcatttctccacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaatt 31628344  T
Q  186 gatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaatt 236  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||    
T  31628345 gatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaccaatt 31628395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 83 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 15742505 - 15742339
Alignment:
Q  83 aaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaa- 180  Q
    |||||| || |||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||  |  | || ||| ||||||||||||||     
T  15742505 aaaccagcaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcattcataacatcacttaacaacaacaacaac 15742406  T
Q  181 --ccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagtataat 245  Q
      | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15742405 atctattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataat 15742339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 83 - 238
Target Start/End: Original strand, 18777119 - 18777275
Alignment:
Q  83 aaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaac 181  Q
    |||||| || |||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |  | || ||| |||||||||||||      
T  18777119 aaaccaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatt 18777218  T
Q  182 cattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattga 238  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  18777219 cattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattga 18777275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 87 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 13014979 - 13014826
Alignment:
Q  87 caccaccaacaactcatttctcaacaacaa--tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccat 184  Q
    ||||| ||||| |||||||||| | |||||  ||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  | |||||| |||| || ||||||| ||    
T  13014979 caccaacaacatctcatttctccataacaaaatcaagaatcatgcaa-cccaagccacgaattatcatcaacaacatgacttaacatcagcaacaacaat 13014881  T
Q  185 tgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 239  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13014880 tgatcttgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgag 13014826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 40 - 122
Target Start/End: Original strand, 4991002 - 4991085
Alignment:
Q  40 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaaaccattttacaaaaccaccaccaacaactca-tttctcaacaacaatcatga 122  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4991002 acatcatcaaaatcaaacttcttctttatcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatga 4991085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 90 - 236
Target Start/End: Original strand, 18432623 - 18432770
Alignment:
Q  90 caccaacaactcatttctcaacaacaatc-atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgat 188  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| || | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | || ||  | |||||||| || | ||||||    
T  18432623 caccaacatctcatttttcaacaataaaccattaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacataacatatcaacaacatcatcaattgat 18432722  T
Q  189 catgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaatt 236  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||    
T  18432723 catgaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaccaatt 18432770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 90 - 236
Target Start/End: Original strand, 16085998 - 16086144
Alignment:
Q  90 caccaacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatc 189  Q
    |||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  | |||||  | ||||||||||| | | |||||    
T  16085998 caccaacatctcatttctccacataaatcatgaatcatgcaaacccaagtcatgaattatcattaacaacatgacatatcaacaacaacatcaaatgatc 16086097  T
Q  190 atgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaatt 236  Q
    ||||||| ||||| |||||| ||||||| | | ||||||||||||||    
T  16086098 atgaaacttatcataattcaacaacaacaaggtataattcaccaatt 16086144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 75 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 18381965 - 18381803
Alignment:
Q  75 attttacaaaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaaca 173  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||  | || ||| | |||||    
T  18381965 atttcacaaaaccaccaacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatcacttagcaaca 18381866  T
Q  174 acaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaatt 236  Q
    |||||| | ||||| |||||  | |||||||||||| ||||||| | |||||||||| |||||    
T  18381865 acaacatcaattgaacatgactcttatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaacaatt 18381803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 76 - 236
Target Start/End: Original strand, 18398905 - 18399065
Alignment:
Q  76 ttttacaaaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaac 175  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||  | |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  | || ||| | |||||||    
T  18398905 ttttacaaaaccaacaacaacaactcatttcttatcacaattcatgaattatgcacacccaagccatgaattatcatcaacaacatcacttagcaacaac 18399004  T
Q  176 aacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaatt 236  Q
    |||| | ||||| |||||| |  ||||||||||| |||||||   |||||||||| |||||    
T  18399005 aacatcaattgaacatgaatctcatcacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 18399065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 102 - 239
Target Start/End: Original strand, 18570271 - 18570409
Alignment:
Q  102 atttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatat 200  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |  | || ||| ||||||||| ||  | |||||||||||||| |||    
T  18570271 atttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaggccatgaattagcatccataacatcacttaacaacaactacttctattgatcatgaaacttat 18570370  T
Q  201 cacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 239  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  18570371 cacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattgag 18570409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 40 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 17083496 - 17083383
Alignment:
Q  40 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaaaccatttt-acaaaaccaccaccaacaactcatttctcaacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaa 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || || ||||||||||||||| | || | |||||||| | ||| | ||||||    
T  17083496 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttcacaaaaacaacaacaacaactcatttctaatcatcaaatcatgatttatgaacacccaa 17083397  T
Q  138 gccatgaattatca 151  Q
    ||||||||| ||||    
T  17083396 gccatgaatcatca 17083383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 87 - 236
Target Start/End: Original strand, 16106499 - 16106643
Alignment:
Q  87 caccaccaacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattg 186  Q
    ||||| ||||| |||||||||| |||  ||||||||||||||||||     | ||||||||||||| ||  | |||||  | ||||||||||| | | ||    
T  16106499 caccaacaacatctcatttctccacataaatcatgaatcatgcaaa-----gtcatgaattatcattaacaacatgacatatcaacaacaacatcaaatg 16106593  T
Q  187 atcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaatt 236  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||| | | ||||||||||||||    
T  16106594 atcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaggtataattcaccaatt 16106643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 68 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 22362054 - 22361885
Alignment:
Q  68 tcaaaccattttacaaaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaat-catgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgacta 166  Q
    |||| |||||||||||||| | || |||||||||| |||||| || |||| ||||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||  |||| |||     
T  22362054 tcaacccattttacaaaactaacaacaacaactcaattctcatcatcaattcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcactt 22361955  T
Q  167 aacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaatt 236  Q
    | ||||||||||| | ||||| ||||||    ||||||||||| |||||||   |||||||||| |||||    
T  22361954 agcaacaacaacatcaattgaacatgaatttcatcacaattcaacaacaacatagcataattcatcaatt 22361885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 93 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 25367501 - 25367376
Alignment:
Q  93 caacaactcatttctcaacaacaat-catgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcat 191  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||  | || ||| | ||||||||||| | ||||| |||    
T  25367501 caacatctcatttctcatcaacaattcatgaatcatgcacacccaagccatgaattatcgataacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgaacat 25367402  T
Q  192 gaaacatatcacaattcatcaacaac 217  Q
    ||| | |||||||||||| |||||||    
T  25367401 gaatcttatcacaattcaacaacaac 25367376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 83 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 28195367 - 28195234
Alignment:
Q  83 aaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaac 181  Q
    |||| |||| ||||| ||||||||||||||| || |||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||  | || ||| | ||||||| |||||    
T  28195367 aaactaccaacaacatctcatttctcaacaataaatcat-aattatgcaaactcaagccatgaattatcatcaacaacatcacttagcaacaaccacaac 28195269  T
Q  182 cattgatcatgaaa-catatcacaattcatcaaca 215  Q
     ||||||||| ||| |  ||||||||||| |||||    
T  28195268 aattgatcataaaatctcatcacaattcaacaaca 28195234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 88 - 149
Target Start/End: Original strand, 15740207 - 15740269
Alignment:
Q  88 accaccaacaactcatttctcaacaacaat-catgaatcatgcaaacccaagccatgaattat 149  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  15740207 accaacaacatctcatttctcatcaacaattcatgaatcatgcacacccaaaccatgaattat 15740269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 76 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 18629892 - 18629786
Alignment:
Q  76 ttttacaaaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaa 174  Q
    ||||||||||||| || |||||||| |||||||| || ||| |||||| | ||| | |||||| |||||||| |||| |||  |||| ||| ||||||||    
T  18629892 ttttacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaaaccatgaatcatcaacaacaatatcacttaacaacaa 18629793  T
Q  175 caacaac 181  Q
    |||||||    
T  18629792 caacaac 18629786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 217
Target Start/End: Original strand, 25651207 - 25651345
Alignment:
Q  80 acaaaaccaccaccaacaactcatttctcaacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaac 178  Q
    ||||||||| || |||||||| | |||||| || | |||||||| | ||| | ||||||||||||||| |||| |||  |||| ||| | ||||||||||    
T  25651207 acaaaaccaacaacaacaacttaattctcatcatccaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaac 25651306  T
Q  179 aaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaac 217  Q
    | | ||||| |||||| |  |||| |||||| |||||||    
T  25651307 atcaattgaacatgaatctcatcataattcaacaacaac 25651345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 151
Target Start/End: Original strand, 25919577 - 25919655
Alignment:
Q  74 cattttacaaaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatca 151  Q
    |||||||||||  ||||| ||| ||||||||| ||| |||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||    
T  25919577 cattttacaaagtcaccaacaataactcatttttcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatca 25919655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 75 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 18087112 - 18087032
Alignment:
Q  75 attttacaaaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaa 155  Q
    |||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| ||||   ||| | ||||||||||| ||| || |||||    
T  18087112 atttcacaaaaccaccaccaacatcttatttctcatcaacaattatgatatatgaacacccaagccataaatcataatcaa 18087032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 38)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 83 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 41507091 - 41506928
Alignment:
Q  83 aaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaac 181  Q
    ||||||||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  41507091 aaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaatatgactaaacaacaacaacaac 41506992  T
Q  182 cattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagtataat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41506991 cattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataat 41506928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 75 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 24717152 - 24716981
Alignment:
Q  75 attttacaaaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaaca 173  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  ||||||||||||| ||    
T  24717152 attttacaaaaccaccaacaacaatccatttatcaacaacaaattatgaatcatgcaaacccaagccatgtatcatcatcaacaatatgactaaacatca 24717053  T
Q  174 acaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagtataat 245  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24717052 acaacaaccattgaacatgaaacaaatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataat 24716981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 102 - 245
Target Start/End: Original strand, 39115267 - 39115411
Alignment:
Q  102 atttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatat 200  Q
    |||||||||||| || | |||||||||||| || |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39115267 atttctcaacaataaattatgaatcatgcatacacaagtcatgaattatcatcaaccatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatat 39115366  T
Q  201 cacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagtataat 245  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  39115367 cacgattcatcaacaactatgcataattcaccaattgagcataat 39115411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 87 - 236
Target Start/End: Original strand, 41246635 - 41246785
Alignment:
Q  87 caccaccaacaactcatttctcaacaacaatc-atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccatt 185  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||| | |||    
T  41246635 caccaacaacatttcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttaacaacaacaacatcaatt 41246734  T
Q  186 gatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaatt 236  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41246735 gatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaatt 41246785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 87 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 19993324 - 19993171
Alignment:
Q  87 caccaccaacaactcatttctcaacaacaatc-atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccatt 185  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||    
T  19993324 caccaacaacatctcatttctcaacaacaatccaagaattatgcaaaccctagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacaacaatt 19993225  T
Q  186 gatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 239  Q
    ||| ||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19993224 gatgatgaaatttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgag 19993171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 93 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 22235067 - 22234920
Alignment:
Q  93 caacaactcatttctcaacaacaatc-atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcat 191  Q
    ||||| |||| | ||||||||||| | | |||| |||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22235067 caacatctcaatcctcaacaacaaaccaagaattatgcaaacccaatccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacaacaattgatcat 22234968  T
Q  192 gaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22234967 gaaacatatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgag 22234920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 87 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 20573461 - 20573309
Alignment:
Q  87 caccaccaacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattg 186  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||  | ||||||||||| | ||||    
T  20573461 caccaacaacatctcatttctcaacacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattg 20573362  T
Q  187 atcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 239  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||| | | |||||||||||||||||    
T  20573361 atcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaaggataattcaccaattgag 20573309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 115 - 239
Target Start/End: Original strand, 37611675 - 37611798
Alignment:
Q  115 aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaac 214  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  37611675 aatcatgaattatgcaa-cccaagccatgaattatcatcaaccacatgacttaacaacaacaacaacaattgatcatgaaacttttcacaattcatcaac 37611773  T
Q  215 aaccatgcataattcaccaattgag 239  Q
    ||| | |||||||||||||||||||    
T  37611774 aacaaagcataattcaccaattgag 37611798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 83 - 239
Target Start/End: Original strand, 20481578 - 20481735
Alignment:
Q  83 aaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaac 181  Q
    |||||| || |||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  | |||||| ||||||||||||| |    
T  20481578 aaaccaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattaacatcaacaacatgacttaacaacaacaacatc 20481677  T
Q  182 cattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 239  Q
     |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  20481678 aattgatcatgcaacttatcacaattcatcaacaacaaagtataattcaccaattgag 20481735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 83 - 238
Target Start/End: Original strand, 274416 - 274572
Alignment:
Q  83 aaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaac 181  Q
    |||||| || |||||||| ||||| ||||||||| | |||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| |  | || ||| ||||| ||||||| |    
T  274416 aaaccaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgattcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaataacaacatc 274515  T
Q  182 cattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattga 238  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  274516 tattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattga 274572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 83 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 641433 - 641277
Alignment:
Q  83 aaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaac 181  Q
    |||||| || |||||||| ||||| ||||||||| | |||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| |  | || ||| ||||| ||||||| |    
T  641433 aaaccaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgattcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaataacaacatc 641334  T
Q  182 cattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattga 238  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  641333 tattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattga 641277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 83 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 827239 - 827083
Alignment:
Q  83 aaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaac 181  Q
    |||||| || |||||||| ||||| ||||||||| | |||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| |  | || ||| ||||| ||||||| |    
T  827239 aaaccaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgattcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaataacaacatc 827140  T
Q  182 cattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattga 238  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  827139 tattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattga 827083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 83 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 16039163 - 16039000
Alignment:
Q  83 aaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaac 181  Q
    |||||| || |||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||| | ||||||||| ||||| |||| |  | || ||| ||||||||||||| |    
T  16039163 aaaccaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatatccaagccataaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatc 16039064  T
Q  182 cattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagtataat 245  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  16039063 tattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaaccatgcataattcactaattgagcataat 16039000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 99 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 20648087 - 20647949
Alignment:
Q  99 ctcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaaca 197  Q
    |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  | |||||  | ||||||| ||| | ||||||||||||||     
T  20648087 ctcacttctccacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatggattaacatcaacaacatgacctagcaacaacgacatcaattgatcatgaaact 20647988  T
Q  198 tatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaatt 236  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  20647987 tatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaatt 20647949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 99 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 20654163 - 20654025
Alignment:
Q  99 ctcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaaca 197  Q
    |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  | |||||  | ||||||| ||| | ||||||||||||||     
T  20654163 ctcacttctccacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagcaatgaattaacatcaacaacatgacctagcaacaacgacatcaattgatcatgaaact 20654064  T
Q  198 tatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaatt 236  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  20654063 tatcacaattcatcaacaacttagcataattcaccaatt 20654025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 76 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 39447046 - 39446892
Alignment:
Q  76 ttttacaaaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaa 174  Q
    |||||| |||| |||| ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||  | || ||| | ||||||    
T  39447046 ttttaccaaactaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcat-aatcatgcatacccaagccatgaattattatcaacaacatcacttagcaacaa 39446948  T
Q  175 caacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattca 230  Q
    ||||| | |||||||||||| | |||||||||||| |||||||   ||||||||||    
T  39446947 caacatcaattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattca 39446892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 75 - 236
Target Start/End: Original strand, 23837163 - 23837325
Alignment:
Q  75 attttacaaaaccaccaccaacaactcatttctcaacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaaca 173  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||  | || ||| | |||||    
T  23837163 atttcacaaaaccaccaccaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatcacttagcaaca 23837262  T
Q  174 acaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaatt 236  Q
    |||||| | ||||| |||||  | || ||||||||| |||||||   |||||||||| |||||    
T  23837263 acaacatcaattgaacatgactcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 23837325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 87 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 20567268 - 20567200
Alignment:
Q  87 caccaccaacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaa 155  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20567268 caccaacaacatctcatttctcaacacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaa 20567200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 87 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 20567427 - 20567335
Alignment:
Q  87 caccaccaacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaaca 179  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||  | |||||||||||    
T  20567427 caccaacaacatctcatttctcaacacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaaca 20567335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 87 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 20573620 - 20573528
Alignment:
Q  87 caccaccaacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaaca 179  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||  | |||||||||||    
T  20573620 caccaacaacatctcatttctcaacacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaaca 20573528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 87 - 191
Target Start/End: Original strand, 25122513 - 25122618
Alignment:
Q  87 caccaccaacaactcatttctcaacaacaa--tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccat 184  Q
    ||||| ||||| |||||||||| | |||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| | ||    
T  25122513 caccaacaacatctcatttctccataacaaaatcatgaatcatgcaa-cccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacatctat 25122611  T
Q  185 tgatcat 191  Q
    |||||||    
T  25122612 tgatcat 25122618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 68 - 230
Target Start/End: Original strand, 38533607 - 38533770
Alignment:
Q  68 tcaaaccattttacaaaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgacta 166  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  | || ||      
T  38533607 tcaacccattttacaaagtctccaacaacatctcatttctcatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagccatgaattatcatcaacaacatcacct 38533706  T
Q  167 aacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattca 230  Q
    | ||||||||||| | ||||| |||||| |  ||||||||||| |||||||   ||||||||||    
T  38533707 agcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcacaattcaacaacaacatagcataattca 38533770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 88 - 228
Target Start/End: Original strand, 21680980 - 21681121
Alignment:
Q  88 accaccaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattg 186  Q
    |||| ||||| || ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | || ||  | ||  ||||||| | ||||    
T  21680980 accaacaacatcttatttctccacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatcaacaacatcacataccagtaacaacatcaattg 21681079  T
Q  187 atcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataatt 228  Q
    ||||||||||  ||||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  21681080 atcatgaaactaatcacaattcaacaacaacaaagcataatt 21681121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 68 - 217
Target Start/End: Original strand, 5854572 - 5854722
Alignment:
Q  68 tcaaaccattttacaaaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgacta 166  Q
    |||| |||||||||||||||| || |||||||||| |||||| || ||| |||||| | ||| | ||||||||||||||| |||| |||  |||| |||     
T  5854572 tcaacccattttacaaaaccaacaacaacaactcaattctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcactt 5854671  T
Q  167 aacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaac 217  Q
    | ||||||||||| | ||||| |||||| |  ||||||||||| |||||||    
T  5854672 agcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcacaattcaacaacaac 5854722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 87 - 172
Target Start/End: Original strand, 29759919 - 29760005
Alignment:
Q  87 caccaccaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaac 172  Q
    ||||| ||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||  |||||||||||||||    
T  29759919 caccaacaacaaaccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatatatcatcatcaacaatatgactaaacaac 29760005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 68 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 22736127 - 22735977
Alignment:
Q  68 tcaaaccattttacaaaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgacta 166  Q
    |||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||  | || | |     
T  22736127 tcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttttcatcaacaattcatgaattatgcacacccaagccatgaattaacaacaacaacatcagtt 22736028  T
Q  167 aacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaac 217  Q
    | ||| ||||||| | ||||| |||||| | ||||||||| || |||||||    
T  22736027 agcaagaacaacatcaattgaacatgaatcttatcacaatccaacaacaac 22735977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 87 - 151
Target Start/End: Original strand, 15969796 - 15969860
Alignment:
Q  87 caccaccaacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatca 151  Q
    ||||| ||||||||||||||||  | |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  15969796 caccaacaacaactcatttctcctctacaatcatgaattatgcacacccaagccatgaattatca 15969860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 119 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 24385988 - 24385871
Alignment:
Q  119 atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacc 218  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |  | || ||| ||||||||||||| | |||||||         || ||||||||||||||||     
T  24385988 atgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataaaatcacttaacaacaacaacatctattgatc---------attacaattcatcaacaaca 24385898  T
Q  219 atgcataattcaccaattgagtataat 245  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||    
T  24385897 atgcttaattcaccaattgagcataat 24385871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 68 - 217
Target Start/End: Original strand, 26011452 - 26011602
Alignment:
Q  68 tcaaaccattttacaaaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgacta 166  Q
    |||| |||||||||||||||| || |||||||| | |||||| || ||| |||||| | ||| | ||||||||||||||| |||| |||  |||| |||     
T  26011452 tcaacccattttacaaaaccaacaacaacaacttaattctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcactt 26011551  T
Q  167 aacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaac 217  Q
    | ||||||||||| | ||| | |||||| |  ||||||||||| |||||||    
T  26011552 agcaacaacaacatcaattcaacatgaatctcatcacaattcaacaacaac 26011602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 183 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 20561804 - 20561751
Alignment:
Q  183 attgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaatt 236  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  20561804 attgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaatt 20561751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 75 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 21198434 - 21198362
Alignment:
Q  75 attttacaaaaccaccaccaacaactcatttctcaacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaat 146  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| | || |||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  21198434 attttaccaaaccaccaacaacaactcatttctcatccacaaatcatgaattatgaacacccaagccatgaat 21198362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 217
Target Start/End: Original strand, 33528383 - 33528533
Alignment:
Q  67 atcaaaccattttacaaaaccaccaccaacaactcatttctcaacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgact 165  Q
    ||||| ||||||||||||| || || ||||||| ||||||||| || | |||||||| | ||| | ||||||||||||||| |||| |||| ||||  ||    
T  33528383 atcaacccattttacaaaatcaacaacaacaacccatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaaa-atatctct 33528481  T
Q  166 aaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaac 217  Q
     | ||||||||||| | ||| | |||||| |  ||||||||||| |||||||    
T  33528482 tagcaacaacaacatcaattaaacatgaatctcatcacaattcaacaacaac 33528533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 78 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 23226355 - 23226240
Alignment:
Q  78 ttacaaaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaaca 176  Q
    ||||||||||| || ||||||  |||||||||  | ||| |||||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||  |||| ||| ||||||||||    
T  23226355 ttacaaaaccaacaacaacaatccatttctcataatcaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttaacaacaaca 23226256  T
Q  177 acaaccattgatcatg 192  Q
    ||| | ||||| ||||    
T  23226255 acatcaattgaacatg 23226240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 24929087 - 24929018
Alignment:
Q  75 attttacaaaaccaccaccaacaactcatttctcaacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaagccatga 144  Q
    |||| |||||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  24929087 atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaat-atgcatacccaagcaatga 24929018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 27233348 - 27233206
Alignment:
Q  76 ttttacaaaaccaccaccaacaactcatttctcaacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaa 174  Q
    ||||||||||||| || |||||||| ||||||||  | | |||||||| | ||| | ||||||||||||||| |||| |||  ||||  || ||||||||    
T  27233348 ttttacaaaaccaacaacaacaacttatttctcattatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaa 27233249  T
Q  175 caacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaac 217  Q
    ||||| | ||| | |||||  |  ||||||||||| |||||||    
T  27233248 caacatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaac 27233206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 31194606 - 31194488
Alignment:
Q  75 attttacaaaaccaccaccaacaactcatttctcaacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaaca 173  Q
    ||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||   |||||||| |||||| |||| |||  |||| | | | |||||    
T  31194606 attttacaaagtcaccaacaacaactcatttttcaccaacaaatcatgaatcatgtgcacccaagctatgaatcatcaacaacaatatcatttagcaaca 31194507  T
Q  174 acaacaaccattgatcatg 192  Q
    |||||| | ||||| ||||    
T  31194506 acaacatcaattgaacatg 31194488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 75 - 151
Target Start/End: Original strand, 17285232 - 17285309
Alignment:
Q  75 attttacaaaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatca 151  Q
    ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |  ||| |||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||    
T  17285232 attttgcaaaactaccaacaacaactcatttctcatcctcaagtcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatca 17285309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 78 - 193
Target Start/End: Original strand, 23149749 - 23149865
Alignment:
Q  78 ttacaaaaccaccaccaacaactcatttctcaacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaaca 176  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||| ||| || | |||||||||| ||| | || |||||||||||| |||| |||  | || ||| | |||||| |    
T  23149749 ttacaaaaccaacaacaacaactcatttttcatcatcaaatcatgaattatgaatactcaagccatgaatcatcaacaacaacatcacttagcaacaaaa 23149848  T
Q  177 acaaccattgatcatga 193  Q
    ||||| ||||| |||||    
T  23149849 acaactattgaacatga 23149865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 129; Significance: 8e-67; HSPs: 2)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 40 - 239
Target Start/End: Original strand, 21442 - 21642
Alignment:
Q  40 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaaaccattttacaaaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaat-catgaatcatgcaaacccaag 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21442 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcatttcttaacaacaattcatgaatcatgcaaacccaag 21541  T
Q  139 ccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattga 238  Q
    |||||||||||||||||  | |||||| | ||||||||||| | | | |||||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  21542 ccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaacaacatcaaataatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattga 21641  T
Q  239 g 239  Q
    |    
T  21642 g 21642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 40 - 239
Target Start/End: Original strand, 31141 - 31341
Alignment:
Q  40 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaaaccattttacaaaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaag 138  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31141 acatcatcaaaatcaaactttttcattatcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcatttctcaacaacaattcatgaatcatgcaaacccaag 31240  T
Q  139 ccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattga 238  Q
    |||||||||||||||||  | |||||| | |||||| |||| | |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||   | |||||| |||||||||    
T  31241 ccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaaaaacatcaattgataatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagtataatttaccaattga 31340  T
Q  239 g 239  Q
    |    
T  31341 g 31341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158 (Bit Score: 128; Significance: 3e-66; HSPs: 2)
Name: scaffold0158
Description:

Target: scaffold0158; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 40 - 239
Target Start/End: Original strand, 24890 - 25088
Alignment:
Q  40 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaaaccattttacaaaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagc 139  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24890 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgc-aacccaagc 24988  T
Q  140 catgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 239  Q
    ||||||||||||||||  | ||| |  | ||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  24989 catgaattatcatcaacaacatgccatatcaacaacaacaacaattgatcgtgaaacttatcacaattcaacaacaacaaaacataattcaccaattgag 25088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 109 - 239
Target Start/End: Original strand, 25212 - 25341
Alignment:
Q  109 aacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattc 208  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | ||| |  | ||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||    
T  25212 aacaacaatcatgaatcatgcaa-cccaagccatgaattatcatcaacaacatgccatatcaacaacaacaacaattgatcgtgaaacttatcacaattc 25310  T
Q  209 atcaacaaccatgcataattcaccaattgag 239  Q
    | ||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  25311 aacaacaacaaaacataattcaccaattgag 25341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 123; Significance: 3e-63; HSPs: 34)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 83 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 111550 - 111388
Alignment:
Q  83 aaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaacc 182  Q
    |||||| || |||||| | |||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  111550 aaaccaacaacaacaatttatttctcaacaacaaatttgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatcaaccatatgactaaacaacaacaacaacc 111451  T
Q  183 attgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagtataat 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  111450 attgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataat 111388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 40 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 7284376 - 7284180
Alignment:
Q  40 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaaaccattttacaaaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagc 139  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7284376 acatcgtcaaaatcaaacttctccattatcaacccatttaacaaaaccaccaacaacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaactcaagc 7284277  T
Q  140 catgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaatt 236  Q
    |||||||||| |||||  | |||||  | ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| | | ||||||||||||||    
T  7284276 catgaattattatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaaggataattcaccaatt 7284180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 87 - 245
Target Start/End: Original strand, 126392 - 126551
Alignment:
Q  87 caccaccaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccatt 185  Q
    ||||| ||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  126392 caccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgtatcatcatcaacagtatgactaaacaacaacaacaaccatt 126491  T
Q  186 gatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagtataat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  126492 gatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataat 126551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 83 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 32494328 - 32494165
Alignment:
Q  83 aaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaac 181  Q
    |||||| || |||||| | ||||||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  32494328 aaaccaacaacaacaatttatttctcaacaacaaattatgaatcatgcatacacaagccatgaattatcatcaatcatatgactaaacaacaacaacaac 32494229  T
Q  182 cattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagtataat 245  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32494228 cattaatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataat 32494165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 87 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 39046893 - 39046740
Alignment:
Q  87 caccaccaacaactcatttctcaacaaca-atcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccatt 185  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||    
T  39046893 caccaacaacatctcatttctcaacaacagatcaagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacaacaatt 39046794  T
Q  186 gatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39046793 gatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgag 39046740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 83 - 239
Target Start/End: Original strand, 11287390 - 11287547
Alignment:
Q  83 aaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaac 181  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| | ||||||||||| |    
T  11287390 aaaccaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaacaacatc 11287489  T
Q  182 cattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 239  Q
     | |||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  11287490 aactgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattgag 11287547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 93 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 42056562 - 42056408
Alignment:
Q  93 caacaactcatttctcaacaacaa--tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatca 190  Q
    |||||||| ||||| |||||||||  | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||  |  |||| ||| ||||||||||||| | ||||||||    
T  42056562 caacaacttatttcacaacaacaaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcattcataatatcacttaacaacaacaacatctattgatca 42056463  T
Q  191 tgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagtataat 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42056462 tgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataat 42056408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 87 - 239
Target Start/End: Original strand, 35094794 - 35094946
Alignment:
Q  87 caccaccaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccatt 185  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||| |||| |||    
T  35094794 caccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcaagaattatgcaaacccaagccatgatttatcatcaacaacatgactaaacaacaacagcaac-att 35094892  T
Q  186 gatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 239  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  35094893 gatcatgaaacatttaacaattcatcaacaacagtgcataattcaccaattgag 35094946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 93 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 2190459 - 2190305
Alignment:
Q  93 caacaactcatttctcaacaacaa--tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatca 190  Q
    |||||||| | ||| |||||||||  | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |  | || ||| ||||||| ||||| | ||||||||    
T  2190459 caacaacttacttcacaacaacaaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaacatcaacatctattgatca 2190360  T
Q  191 tgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagtataat 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2190359 tgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataat 2190305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 87 - 239
Target Start/End: Original strand, 12758965 - 12759117
Alignment:
Q  87 caccaccaacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattg 186  Q
    ||||| ||||| |||||||||| |||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||  | |||||| ||||||||||||||| ||||    
T  12758965 caccaacaacatctcatttctccacacaaatcataaatcctgcaaacccaagccatgaattatcaccaacaacatgacttaacaacaacaacaacaattg 12759064  T
Q  187 atcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 239  Q
    |||||||||| ||||| |||||| |||||||   |||||||||||||||||||    
T  12759065 atcatgaaacttatcataattcaccaacaacatagcataattcaccaattgag 12759117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 83 - 245
Target Start/End: Original strand, 2028893 - 2029057
Alignment:
Q  83 aaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaa--tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaa 180  Q
    |||||| || |||||||| ||||| |||||||||  | |||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| |  | || ||| |||||| ||||||     
T  2028893 aaaccaacaacaacaacttatttcacaacaacaaaattatgaatcatgcatacccaagtcatgaattagcatccataacatcacttaacaacgacaacat 2028992  T
Q  181 ccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagtataat 245  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  2028993 ctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaatcatgcataattcaccaattgagcataat 2029057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 93 - 245
Target Start/End: Original strand, 3049566 - 3049719
Alignment:
Q  93 caacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcat 191  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |  | || ||| ||||||||||||| | |||||||||    
T  3049566 caacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattaacatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgatcat 3049665  T
Q  192 gaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagtataat 245  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||    
T  3049666 gaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattgagcataat 3049719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 87 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 15822701 - 15822548
Alignment:
Q  87 caccaccaacaactcatttctcaacaacaatc-atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccatt 185  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||  | ||||||||||| | |||    
T  15822701 caccaacaacatctcatttctcaaccacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgaatgatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaatt 15822602  T
Q  186 gatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 239  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| |||||    
T  15822601 gatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaccatttgag 15822548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 87 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 45452435 - 45452305
Alignment:
Q  87 caccaccaacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattg 186  Q
    ||||| ||||| |||||||||| |||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | |||||  | |||||||||| || ||||    
T  45452435 caccaacaacatctcatttctccacacaaatcatgaatcatgccaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacgacaattg 45452336  T
Q  187 atcatgaaacatatcacaattcatcaacaac 217  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  45452335 atcatgaaacttatcacaattcatcaacaac 45452305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 83 - 239
Target Start/End: Original strand, 3894998 - 3895155
Alignment:
Q  83 aaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaac 181  Q
    |||||| || |||||||| ||||  ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |  | || ||| ||||||||||||| |    
T  3894998 aaaccaacaacaacaacttattttacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatc 3895097  T
Q  182 cattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 239  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  3895098 tattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattgag 3895155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 93 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 26070528 - 26070384
Alignment:
Q  93 caacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcat 191  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |  | || ||| | ||||||||||| | |||||||||    
T  26070528 caacaacttatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaataatcatccacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgatcat 26070429  T
Q  192 gaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaatt 236  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||    |||||||||||||||    
T  26070428 gaaacttatcacaattcatcaacaacataacataattcaccaatt 26070384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 93 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 26094315 - 26094171
Alignment:
Q  93 caacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcat 191  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |  | || ||| | ||||||||||| | |||||||||    
T  26094315 caacaacttatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaataatcatccacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgatcat 26094216  T
Q  192 gaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaatt 236  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||    |||||||||||||||    
T  26094215 gaaacttatcacaattcatcaacaacataacataattcaccaatt 26094171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 87 - 239
Target Start/End: Original strand, 47289758 - 47289911
Alignment:
Q  87 caccaccaacaactcatttctcaacaacaa--tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccat 184  Q
    ||||| ||||| |||||||||| | |||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||   | |||||| |||| ||||| |||| ||    
T  47289758 caccaacaacatctcatttctccataacaaaatcatgaatcatgcaa-cacaagccatgaattatcatcatcaacatgacttaacagcaacagcaacaat 47289856  T
Q  185 tgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 239  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  47289857 tgatcatgaaacttttcacaattcatcaacaacaaagcataattcaccaattgag 47289911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 83 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 12248395 - 12248237
Alignment:
Q  83 aaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaac 181  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| |  | || ||| | ||||||||||| |    
T  12248395 aaaccaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagtcatgcattatcatccacaacatcacttagcaacaacaacatc 12248296  T
Q  182 cattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattc-accaattgag 239  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||| |||||||   ||||||||| ||||||||||    
T  12248295 cattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaaccaattgag 12248237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 76 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 16570287 - 16570122
Alignment:
Q  76 ttttacaaaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaa 174  Q
    |||||| ||| ||||  ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  | || ||| | ||||||    
T  16570287 ttttaccaaaacacccacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatccacgacatcacttagcaacaa 16570188  T
Q  175 caacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattc-accaattgag 239  Q
    ||||| | |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||   ||||||||| ||||||||||    
T  16570187 caacatcaattgatcatgaaacttatctcaattcaacaacaacatagcataattcaaccaattgag 16570122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 76 - 239
Target Start/End: Original strand, 16595375 - 16595540
Alignment:
Q  76 ttttacaaaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaa 174  Q
    |||||| ||| ||||  ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  | || ||| | ||||||    
T  16595375 ttttaccaaaacacccacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatccacgacatcacttagcaacaa 16595474  T
Q  175 caacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattc-accaattgag 239  Q
    ||||| | |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||   ||||||||| ||||||||||    
T  16595475 caacatcaattgatcatgaaacttatctcaattcaacaacaacatagcataattcaaccaattgag 16595540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 87 - 239
Target Start/End: Original strand, 44865204 - 44865360
Alignment:
Q  87 caccaccaacaactcatttctcaacaacaa--tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgact---aaacaacaacaacaac 181  Q
    ||||| ||||| |||||||||| | |||||  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||  | ||||||    |||||||||||||||    
T  44865204 caccaacaacatctcatttctccataacaaaatcatgaattatgcaa-cccaagccatgaattatcataaactacatgacttaacaacaacaacaacaac 44865302  T
Q  182 cattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 239  Q
     ||| |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  44865303 aattaatcatgaaacttatcacaattcatcaacaaaaatgcataattcaccaattgag 44865360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 75 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 1937290 - 1937131
Alignment:
Q  75 attttacaaaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaaca 173  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||  ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||| |||| || ||||||||  ||||||||||||| ||    
T  1937290 atttcacaaaaccaccaacaataatccatttctcaacaaaaaattatgaatcatgcaaacccaagtcatgtatcatcatcaacaatatgactaaacatca 1937191  T
Q  174 acaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagtataat 245  Q
    ||||||||||||||||||            ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  1937190 acaacaaccattgatcat------------aattcatcaacaaccatacataattcaccaattgagcataat 1937131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 40 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 14272203 - 14272049
Alignment:
Q  40 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaaaccattttacaaaaccaccaccaacaactcatttctcaacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaag 138  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| ||| | || ||||    
T  14272203 acatcattaaaataaaacttcttcatcatcaacccattttacaaaaccaccaccaacaactcatttctcatcatctaatcatgaattatgaacactcaag 14272104  T
Q  139 ccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatga 193  Q
    |||||||| |||| |||  |||| | | | ||||||||||| | ||||| |||||    
T  14272103 ccatgaatcatcaacaacaatatcatttagcaacaacaacatcaattgaacatga 14272049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 76 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 49047955 - 49047813
Alignment:
Q  76 ttttacaaaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaa 174  Q
    |||||| |||| |||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  | || ||| | ||||||    
T  49047955 ttttaccaaactaccaacaacatctcgtttctcaacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcagcaacaacatcacttagcaacaa 49047856  T
Q  175 caacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaac 217  Q
    ||||| | |||||||||||| | |||||||||||| |||||||    
T  49047855 caacatcaattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaac 49047813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 76 - 239
Target Start/End: Original strand, 13274753 - 13274918
Alignment:
Q  76 ttttacaaaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaat-catgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaa 174  Q
    |||||| |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||  | || ||| | ||||||    
T  13274753 ttttaccaaactaccaacaacatctcatttctcaacaacaaaacatgaatcatgcataccaaagccatgaatcatcatcaacaacatcacttagcaacaa 13274852  T
Q  175 caacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattc-accaattgag 239  Q
    ||||| | |||||||||||| | |||||||||||| |||||||   ||||||||| ||||||||||    
T  13274853 caacatcaattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaaccaattgag 13274918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 87 - 239
Target Start/End: Original strand, 143622 - 143769
Alignment:
Q  87 caccaccaacaactcatttctcaacaacaa--tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccat 184  Q
    ||||| ||||| |||||||||| | |||||  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||  | |||||| |||||||||||      |    
T  143622 caccaacaacatctcatttctccataacaaaatcatgaattatgcaa-cccaagccatgaattatcattaacaacatgacttaacaacaacaa------t 143714  T
Q  185 tgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 239  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  143715 tgatcatgaaacttttcacaattcatcaacaacaaagcataattcaccaattgag 143769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 75 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 17224220 - 17224048
Alignment:
Q  75 attttacaaaaccaccaccaacaactcatttctcaacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaaca 173  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||| ||  | || ||| | |||||    
T  17224220 attttacaaaaccaccaacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcattaacaacatcacttagcaaca 17224121  T
Q  174 acaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaa-ttgagtataat 245  Q
    |||||| | ||||| |||||  | ||  |||||||| |||||||   |||||||||| ||| |||||||||||    
T  17224120 acaacatcaattgaacatgactcttacaacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagtataat 17224048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 95 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 12370102 - 12369957
Alignment:
Q  95 acaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatga 193  Q
    |||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||  |  | || ||| | ||||||||||| | ||| |||||||    
T  12370102 acaacttatttctcaataacaaatcatgaatcatgcatacctaagccatgaataattatgcacaacatcacttagcaacaacaacatcaattaatcatga 12370003  T
Q  194 aacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 239  Q
    ||  |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||    
T  12370002 aagttatcacaattcaacaacaacaaggcataattcaccaattgag 12369957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 68 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 16915217 - 16915067
Alignment:
Q  68 tcaaaccattttacaaaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgacta 166  Q
    |||| |||||||||||||||| || |||||||||| |||||  || ||| |||||| | ||| | ||||||||||||||| |||| |||  ||||||||     
T  16915217 tcaacccattttacaaaaccaacaacaacaactcaattctcttcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatgactt 16915118  T
Q  167 aacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaac 217  Q
    | ||||||||||| | ||||| |||||| |  |||| |||||| |||||||    
T  16915117 agcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcataattcaacaacaac 16915067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 68 - 217
Target Start/End: Original strand, 48356602 - 48356752
Alignment:
Q  68 tcaaaccattttacaaaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgacta 166  Q
    |||| |||||||||||||||| || |||||||||| |||||| || ||| |||||| | ||| | ||||||||||||||| |||| |||  |||| |||     
T  48356602 tcaacccattttacaaaaccaacaacaacaactcaattctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcactt 48356701  T
Q  167 aacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaac 217  Q
    | ||||||||||| | ||||| |||||| |  |||| |||||| |||||||    
T  48356702 agcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcataattcaacaacaac 48356752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 67 - 245
Target Start/End: Original strand, 13377485 - 13377666
Alignment:
Q  67 atcaaaccatttt-acaaaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgac 164  Q
    ||||| ||||||| || |||||| || |||||||| |||||||| || ||| |||||| | ||| | ||||||||||||||| ||||||||  | || ||    
T  13377485 atcaacccattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcatcaacaacattac 13377584  T
Q  165 taaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaa-ttgagtataat 245  Q
    | | ||||||||||| | ||||| |||||| | |||||||||||| |||||||   |||||||| | ||| |||||||||||    
T  13377585 ttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattaatcaatttgagtataat 13377666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 132 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 13863154 - 13863046
Alignment:
Q  132 acccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattc-a 230  Q
    |||||||||||| || || | |||  |||| ||| | ||||||||||||| ||||| ||||||   |||||||||||| |||||||   ||||||||| |    
T  13863154 acccaagccatgcatcattaacaacaatatcacttagcaacaacaacaacaattgaacatgaatattatcacaattcaacaacaacatagcataattcaa 13863055  T
Q  231 ccaattgag 239  Q
    |||||||||    
T  13863054 ccaattgag 13863046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 75 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 18980310 - 18980230
Alignment:
Q  75 attttacaaaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaa 155  Q
    |||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| ||||   ||| | ||||||||||| ||| || |||||    
T  18980310 atttcacaaaaccaccaccaacatcttatttctcatcaacaattatgatatatgaacacccaagccataaatcataatcaa 18980230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0686
Description:

Target: scaffold0686; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 75 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 6373 - 6202
Alignment:
Q  75 attttacaaaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaaca 173  Q
    |||| |||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||  |||| |||||||||||    
T  6373 atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagtcatgtatcatcatcaacaatattactaaacaaca 6274  T
Q  174 acaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagtataat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6273 acaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataat 6202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 75 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 31570 - 31399
Alignment:
Q  75 attttacaaaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaaca 173  Q
    |||| |||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| || ||||||||  ||||||||||||||||    
T  31570 atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaattatgaatcatgcaaacctaagccatgtatcatcatcaacaatatgactaaacaaca 31471  T
Q  174 acaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagtataat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31470 acaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataat 31399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 75 - 245
Target Start/End: Original strand, 41274 - 41445
Alignment:
Q  75 attttacaaaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaaca 173  Q
    |||| |||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| || ||||||||  ||||||||||||||||    
T  41274 atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaattatgaatcatgcaaacctaagccatgtatcatcatcaacaatatgactaaacaaca 41373  T
Q  174 acaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagtataat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41374 acaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataat 41445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 40 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 430 - 234
Alignment:
Q  40 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaaaccattttacaaaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagc 139  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  430 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccaccaacaaaagctcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagc 331  T
Q  140 catgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaatt 236  Q
     |||||||||||||||  | |||||  | ||||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| |  |||||||||| ||||    
T  330 tatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgatcattaaacttatcacaattcaacaacaacaaaacataattcacgaatt 234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 40 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 6679 - 6603
Alignment:
Q  40 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaaaccattttacaaaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaa 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  6679 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccaccaagaacaactcaattctcaacaacaa 6603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 83 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 12802 - 12639
Alignment:
Q  83 aaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaac 181  Q
    |||||| || |||||| | ||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12802 aaaccaacaacaacaatttatttctcaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatcaaccatatgactaaacaacaacaacaac 12703  T
Q  182 cattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagtataat 245  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  12702 cattaatcatgaaacatatcacaattcatcaacaatcatgcataattcaccaattgagcataat 12639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 83 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 19183 - 19049
Alignment:
Q  83 aaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaac 181  Q
    |||||| || |||||| | ||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19183 aaaccaacaacaacaatttatttctcaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatcaaccatatgactaaacaacaacaacaac 19084  T
Q  182 cattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaa 216  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19083 cattaatcatgaaacatatcacaattcatcaacaa 19049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 75 - 220
Target Start/End: Original strand, 30056 - 30202
Alignment:
Q  75 attttacaaaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaaca 173  Q
    |||| |||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  30056 atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaatatgactaaacaaca 30155  T
Q  174 acaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccat 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30156 acaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccat 30202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 114; Significance: 7e-58; HSPs: 3)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 93 - 245
Target Start/End: Original strand, 79847 - 80000
Alignment:
Q  93 caacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcat 191  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  79847 caacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatcaaccatatgactaaacaacaacaacaaccattaatcat 79946  T
Q  192 gaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagtataat 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  79947 gaaacatatcacaattcatcaacaatcatgcataattcaccaattgagcataat 80000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 115 - 239
Target Start/End: Original strand, 46171 - 46295
Alignment:
Q  115 aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaac 214  Q
    |||||||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||  |||| ||| |  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | ||||    
T  46171 aatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagaaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttaacaac 46270  T
Q  215 aaccatgcataattcaccaattgag 239  Q
    |||   |||||||||||||||||||    
T  46271 aacatagcataattcaccaattgag 46295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 115 - 239
Target Start/End: Original strand, 40664 - 40788
Alignment:
Q  115 aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaac 214  Q
    |||||||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||  |||| ||| | ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||  | ||||    
T  40664 aatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatgtaacaac 40763  T
Q  215 aaccatgcataattcaccaattgag 239  Q
    ||    |||||||||||||||||||    
T  40764 aatatagcataattcaccaattgag 40788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 114; Significance: 7e-58; HSPs: 38)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 62 - 245
Target Start/End: Original strand, 14951713 - 14951898
Alignment:
Q  62 tcattatcaaaccatttt-acaaaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacat 159  Q
    |||| ||||| ||||||| || ||| ||||| ||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||  ||    
T  14951713 tcataatcaacccattttcaccaaaacaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatatatcatcatcaacaat 14951812  T
Q  160 atgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagtataat 245  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14951813 atgactaaataacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataat 14951898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 75 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 25119498 - 25119333
Alignment:
Q  75 attttacaaaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaa--tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaac 172  Q
    |||| |||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| || || |||||  |||||||||||||||    
T  25119498 atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaaattatgaatcatgcaaacccaagccatgtatcattatcaacaatatgactaaacaac 25119399  T
Q  173 aacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattga 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25119398 aacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaaaaaccatgcataattcaccaattga 25119333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 87 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 53705003 - 53704850
Alignment:
Q  87 caccaccaacaactcatttctcaacaacaatc-atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccatt 185  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||| | | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||    
T  53705003 caccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccaagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacaacaatt 53704904  T
Q  186 gatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53704903 gatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 53704850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 75 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 5682817 - 5682646
Alignment:
Q  75 attttacaaaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaaca 173  Q
    |||| |||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  || ||||||||  |||||| |||| ||||    
T  5682817 atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagacatatatcatcatcaacaatatgaataaaaaaca 5682718  T
Q  174 acaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagtataat 245  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5682717 acaacaaccaataatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataat 5682646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 75 - 239
Target Start/End: Original strand, 34395222 - 34395387
Alignment:
Q  75 attttacaaaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaaca 173  Q
    |||| |||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||  | |||||    
T  34395222 atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaactcaagccatgaattatcatcaacaacatgacatagcaaca 34395321  T
Q  174 acaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 239  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34395322 acaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgag 34395387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 99 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 55376855 - 55376710
Alignment:
Q  99 ctcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaaca 197  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | || | | ||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  55376855 ctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacataatttaacaacaacaacaacaattgatcatgaaact 55376756  T
Q  198 tatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagtata 243  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  55376755 tatcacaattcatcaacaacaatgtataattcaccaattgagtata 55376710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 87 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 23270204 - 23270047
Alignment:
Q  87 caccaccaacaactcatttctcaacaacaatc-atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccatt 185  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||| | |||    
T  23270204 caccaacaacatctcatttctcaaccacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttaacaacaacaacatcaatt 23270105  T
Q  186 gatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagtata 243  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  23270104 gatcatgatacttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcatcaattgagtata 23270047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 87 - 239
Target Start/End: Original strand, 44055892 - 44056045
Alignment:
Q  87 caccaccaacaactcatttctcaacaacaatc-atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccatt 185  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| |||||| ||||||||| | |||    
T  44055892 caccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatggctaaaccacaacaacatcaatt 44055991  T
Q  186 gatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 239  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  44055992 gatcatgaaacttatcacaattcatcaacaataatgcataattcaccaattgag 44056045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 87 - 239
Target Start/End: Original strand, 16732146 - 16732299
Alignment:
Q  87 caccaccaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccatt 185  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| | ||||||| ||| | |||    
T  16732146 caccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaacgacatcaatt 16732245  T
Q  186 gatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 239  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  16732246 gatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattgag 16732299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 99 - 239
Target Start/End: Original strand, 44346816 - 44346957
Alignment:
Q  99 ctcatttctcaacaacaatc-atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaaca 197  Q
    |||||||||||||||||| | | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  44346816 ctcatttctcaacaacaaaccaagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacgacatcactaaacaacaacaacaacatttgatcatgaaaca 44346915  T
Q  198 tatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 239  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||    
T  44346916 tatcacaattcatgaacaacaatgtataattcaccaattgag 44346957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 87 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 53907966 - 53907818
Alignment:
Q  87 caccaccaacaactcatttctcaacaacaatc-atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccatt 185  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||| | | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||   ||    
T  53907966 caccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccaagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaatcaacaacaacaa---tt 53907870  T
Q  186 gatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattg 237  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  53907869 gatcatgaaacatttcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattg 53907818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 87 - 239
Target Start/End: Original strand, 30457880 - 30458033
Alignment:
Q  87 caccaccaacaactcatttctcaacaacaa--tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccat 184  Q
    ||||| ||||| |||||||||| | |||||  | |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||| ||    
T  30457880 caccaacaacatctcatttctctataacaaaataatgaattatgcaa-cccaagccatgaattatcatcaaccacatgacttaacaacaacaacaacaat 30457978  T
Q  185 tgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 239  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  30457979 tgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcgtaattcaccaattgag 30458033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 90 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 820180 - 820033
Alignment:
Q  90 caccaacaactcatttctcaacaacaa--tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattga 187  Q
    |||||||| |||||||||| | |||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||||   ||||    
T  820180 caccaacatctcatttctccataacaaaatcatgaatcatgcaa-cccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttaacaacaacaacaa---ttga 820085  T
Q  188 tcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 239  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  820084 tcatgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgag 820033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 102 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 21959718 - 21959580
Alignment:
Q  102 atttctcaacaacaatc-atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatat 200  Q
    |||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||    
T  21959718 atttctcaaccacaaactatgaatcatgcaagcccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacatcaattgatcatgaaacttat 21959619  T
Q  201 cacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 239  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  21959618 cacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattgag 21959580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 93 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 15272585 - 15272431
Alignment:
Q  93 caacaactcatttctcaacaacaa--tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatca 190  Q
    |||||||| ||||| |||||||||  | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||  |  | || ||| ||||||||||||| | ||||||||    
T  15272585 caacaacttatttcacaacaacaaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcattcataacatcacttaacaacaacaacatctattgatca 15272486  T
Q  191 tgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagtataat 245  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15272485 tggaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataat 15272431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 131 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 8872699 - 8872588
Alignment:
Q  131 aacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaacca---ttgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataat 227  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  | |||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  8872699 aacccaagccatgagttatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacaacaacaattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaacgcataat 8872600  T
Q  228 tcaccaattgag 239  Q
    ||||||||||||    
T  8872599 tcaccaattgag 8872588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 88 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 12837468 - 12837317
Alignment:
Q  88 accaccaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattg 186  Q
    |||| |||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |  | || ||| ||||||||||||| ||||||    
T  12837468 accaacaacaacttatttctca-caacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattaacatccataacatcacttaacaacaacaacatccattg 12837370  T
Q  187 atcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 239  Q
    | |||||||| |||||||||| | |||||||   |||||||||||||||||||    
T  12837369 accatgaaacttatcacaatttaacaacaacatagcataattcaccaattgag 12837317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 40 - 142
Target Start/End: Original strand, 16522748 - 16522851
Alignment:
Q  40 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaaaccattttacaaaaccaccaccaacaactcattt-ctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaag 138  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||   ||| | |||||||    
T  16522748 acatcatcaaaatcaaacttcttctttatcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaag 16522847  T
Q  139 ccat 142  Q
    ||||    
T  16522848 ccat 16522851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 83 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 18494602 - 18494467
Alignment:
Q  83 aaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaac 181  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||  | || ||| |||||||||| ||||    
T  18494602 aaaccaccaacaacatctcatttctcaacaacaagtcatgaatcatgcatacccaagccatgagttaccatcaacaacatcacttaacaacaacagcaac 18494503  T
Q  182 cattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaac 217  Q
     |||||||||||| | || ||||||||| |||||||    
T  18494502 aattgatcatgaatcttaacacaattcaacaacaac 18494467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 93 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 30232760 - 30232613
Alignment:
Q  93 caacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcat 191  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| |  | || ||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  30232760 caacaacttatttcacaacaacaaattatgaataatgcatacccaagccatgaattaacatccataacatcacttaacaacaacaacatccattgatcat 30232661  T
Q  192 gaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 239  Q
    ||||| |||||||||| | |||||||   |||||||||||||||||||    
T  30232660 gaaacttatcacaatttaacaacaacatagcataattcaccaattgag 30232613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 76 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 13809791 - 13809636
Alignment:
Q  76 ttttacaaaaccaccaccaacaactcatttctcaacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaa 174  Q
    |||||| |||| || | ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  | || | | | ||||||    
T  13809791 ttttaccaaactactaacaacatctcatttctcaacaaccaatcatgaatcatgcatatccaagccatgaattatcatcaacaacatcaattagcaacaa 13809692  T
Q  175 caacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattca 230  Q
    ||||| | |||||||||||| | |||||||||||| |||||||   ||||||||||    
T  13809691 caacatcaattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattca 13809636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 115 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 45459096 - 45458973
Alignment:
Q  115 aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaac 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  | |||||  | ||||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||| ||||    
T  45459096 aatcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcttcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattggtcatgaaacttatcacaattcaacaac 45458997  T
Q  215 aaccatgcataattcaccaattga 238  Q
    | | | ||||||||||||||||||    
T  45458996 agcaaagcataattcaccaattga 45458973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 40 - 142
Target Start/End: Original strand, 9295624 - 9295727
Alignment:
Q  40 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaaaccattttacaaaaccaccaccaacaactcattt-ctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaag 138  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||   ||| | |||||||    
T  9295624 acatcatcaaaatcaaacttcttctttatcaactcattttacataaccaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaag 9295723  T
Q  139 ccat 142  Q
    ||||    
T  9295724 ccat 9295727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 76 - 216
Target Start/End: Original strand, 27960938 - 27961078
Alignment:
Q  76 ttttacaaaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaa 174  Q
    |||||| |||| |||| ||| | ||||||||||||||| || |||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||  | || ||| ||||||||    
T  27960938 ttttaccaaactaccaacaatatctcatttctcaacaataaatcat-aatcatgcatacccaaaccatgaattatcatcaacaacatcacttaacaacaa 27961036  T
Q  175 caacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaa 216  Q
    ||||| | |||||||||||| | ||| |||||||| ||||||    
T  27961037 caacatcaattgatcatgaatcttataacaattcaacaacaa 27961078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 40 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 7186159 - 7185983
Alignment:
Q  40 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaaaccatttt-acaaaaccaccaccaacaactcatttctcaacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaa 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||   | || ||||||||||| ||||| || | |||||||| | ||  | ||||||    
T  7186159 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttcacaaa---aacaacaacaactcatatctcatcatcaaatcatgatttataaacacccaa 7186063  T
Q  138 gccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaac 217  Q
    ||||||||| |||| |||  ||||  || | ||||||||||| | ||| | |||||| |  ||||||||||| |||||||    
T  7186062 gccatgaatcatcaacaataatatctcttagcaacaacaacatcaattaaacatgaatctcatcacaattcaacaacaac 7185983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 52265749 - 52265628
Alignment:
Q  115 aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaac 214  Q
    |||||||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||   |||| ||| | ||||||||||| | ||||| |||||| | |||||||||||| ||||    
T  52265749 aatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaacatcaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaac 52265650  T
Q  215 aaccatgcataattcaccaatt 236  Q
    |||  ||||||||||| |||||    
T  52265649 aacattgcataattcaacaatt 52265628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 68 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 37957314 - 37957230
Alignment:
Q  68 tcaaaccattttacaaaaccaccaccaacaactcatttctcaacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatca 151  Q
    |||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  37957314 tcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttatcatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagccgtgaattatca 37957230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 236
Target Start/End: Original strand, 15044834 - 15044955
Alignment:
Q  115 aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaac 214  Q
    |||||||| | ||| | ||||||||||||||| ||||||||  | || ||| | ||||||||||| | ||||| |||||| | |||||||||||| ||||    
T  15044834 aatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcatcaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaac 15044933  T
Q  215 aaccatgcataattcaccaatt 236  Q
    |||   |||||||||| |||||    
T  15044934 aacatagcataattcatcaatt 15044955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 15109590 - 15109459
Alignment:
Q  115 aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaac 214  Q
    |||||||| | ||| | ||||||||||||||| ||||||||  | || ||| | ||||||||||| | ||||| |||||| | |||||||||||| ||||    
T  15109590 aatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcatcaacaacattacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaac 15109491  T
Q  215 aaccatgcataattcaccaa-ttgagtataat 245  Q
    |||   |||||||| | ||| |||||||||||    
T  15109490 aacatagcataatttatcaatttgagtataat 15109459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 68 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 7965000 - 7964890
Alignment:
Q  68 tcaaaccattttacaaaaccaccaccaacaactcatttctcaacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgacta 166  Q
    |||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || | |||||||| | ||| | || |||||||||||| |||| |||  |||| |||     
T  7965000 tcaacccattttacaaaaccaacaacaacaactcatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacactcaagccatgaatcatcaacaacaatatcactt 7964901  T
Q  167 aacaacaacaa 177  Q
    | |||||||||    
T  7964900 agcaacaacaa 7964890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 74 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 19822059 - 19821981
Alignment:
Q  74 cattttacaaaaccaccaccaacaactcatttctcaacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatca 151  Q
    |||||||||||  |||||  |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||    
T  19822059 cattttacaaagtcaccaaaaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatca 19821981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 75 - 151
Target Start/End: Original strand, 14901197 - 14901274
Alignment:
Q  75 attttacaaaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatca 151  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || ||| |||||||| ||||| ||||| | ||||||| ||||    
T  14901197 attttacaaaaccaccaacaacaacccatttctcatcatcaattcatgaattatgcacacccatgtcatgaatcatca 14901274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 75 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 47535328 - 47535251
Alignment:
Q  75 attttacaaaaccaccaccaacaactcatttctcaacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatca 151  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||| | || |||||||||||| ||||    
T  47535328 attttacaaaaccatcaacaacaactcatttctcattaacaaatcatgaattatgaacactcaagccatgaatcatca 47535251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 169 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 10104452 - 10104382
Alignment:
Q  169 caacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 239  Q
    ||||||||||| | ||||| |||||| |||||| ||||||| |||||||   ||| |||||||||||||||    
T  10104452 caacaacaacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgag 10104382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 41166228 - 41166066
Alignment:
Q  75 attttacaaaaccaccaccaacaactcatttctcaacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaaca 173  Q
    |||| |||||||||||  ||||||||||||||||| |||| |||||| | | ||| | ||||||||||||| | |||| |||  | || ||| | |||||    
T  41166228 atttcacaaaaccacccacaacaactcatttctcatcaacaaatcataagttatgaatacccaagccatgattcatcaacaacaacatcacttagcaaca 41166129  T
Q  174 acaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaatt 236  Q
    |||||| | ||||| |||||  | |  ||||||||| |||||||   |||||||||| |||||    
T  41166128 acaacatcaattgaacatgactcttgccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 41166066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 68 - 216
Target Start/End: Original strand, 18276392 - 18276541
Alignment:
Q  68 tcaaaccattttacaaaaccaccaccaacaactcatttctcaacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgacta 166  Q
    |||| |||||||||||||||| || |||||||||| | |||| |  | |||||||| | ||| | ||||||||||| ||| |||| |||  |||| |||     
T  18276392 tcaacccattttacaaaaccaacaacaacaactcaatactcatcgtcaaatcatgatttatgaacacccaagccatcaatcatcaacaacaatatcactt 18276491  T
Q  167 aacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaa 216  Q
      ||||||||||| | ||||| |||||| |  ||||||||||| ||||||    
T  18276492 tgcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcacaattcaacaacaa 18276541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 76 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 41256650 - 41256489
Alignment:
Q  76 ttttacaaaaccaccaccaacaactcatttctcaacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaa 174  Q
    ||||| ||||||| || ||||||||||||||||| || | |||||||| | ||| | |||||| |||||||| |||| |||  ||||  || ||||||||    
T  41256650 ttttataaaaccaacaacaacaactcatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaaaccatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaa 41256551  T
Q  175 caacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaatt 236  Q
    ||||| | ||| | ||||   |  ||||||||||| ||||||||  ||| |||||| |||||    
T  41256550 caacatcaattaaacatggttctcatcacaattcaacaacaacctagcacaattcaacaatt 41256489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 167 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 15675293 - 15675221
Alignment:
Q  167 aacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 239  Q
    |||||||| |||| | ||||| |||||| |||||| ||||||| |||||||   ||| |||||||||||||||    
T  15675293 aacaacaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgag 15675221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 113; Significance: 3e-57; HSPs: 4)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 75 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 162469 - 162297
Alignment:
Q  75 attttacaaaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaa-c 172  Q
    |||| |||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||  |||||||||||||| |    
T  162469 atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatatatcatcatcaacaatatgactaaacaaac 162370  T
Q  173 aacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagtataat 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  162369 aacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcagaattcaccaattgagcataat 162297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 99 - 239
Target Start/End: Original strand, 164204 - 164345
Alignment:
Q  99 ctcatttctcaacaacaatc-atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaaca 197  Q
    |||||||||||||||||| | | |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  164204 ctcatttctcaacaacaaaccaagaattatgcaaacccaagccatgaattaccatcaacaacatgactaaacaacaacaacaacatttgatcatgaaaca 164303  T
Q  198 tatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 239  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  164304 tatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgag 164345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #3
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 75 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 166547 - 166383
Alignment:
Q  75 attttacaaaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaaca 173  Q
    |||| |||||||||||| ||||||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  |||| |       |||    
T  166547 atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttttcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgtatcatcatcaacaatatta-------aca 166455  T
Q  174 acaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagtataat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  166454 acaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcagaattcaccaattgagcataat 166383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 116795 - 116690
Alignment:
Q  75 attttacaaaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaaca 173  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||| |||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||  |||| ||| | |||||    
T  116795 attttacaaaaccaccaacaacaatccatttttcatcaacaaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaaca 116696  T
Q  174 acaaca 179  Q
    ||||||    
T  116695 acaaca 116690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 25)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 83 - 245
Target Start/End: Original strand, 21859984 - 21860147
Alignment:
Q  83 aaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaac 181  Q
    |||||| || |||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  21859984 aaaccaacaacaacaattcatttctcaacaacaaattatgaatcatgcaaacccgagccatgtatcatcatcaacaatatgactaaacaacaacaacaac 21860083  T
Q  182 cattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagtataat 245  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21860084 cattaatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataat 21860147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 62 - 245
Target Start/End: Original strand, 22366970 - 22367154
Alignment:
Q  62 tcattatcaaaccatttt-acaaaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacat 159  Q
    |||| ||||| ||||||| || ||| ||||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||  ||    
T  22366970 tcataatcaacccattttcaccaaaacaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagtcatgtatcatcatcaacaat 22367069  T
Q  160 atgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagtataat 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  22367070 atgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcat-attcaccaattgagcataat 22367154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 62 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 15861728 - 15861545
Alignment:
Q  62 tcattatcaaaccatttt-acaaaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacat 159  Q
    |||| ||||| ||||||| || ||| ||||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||  ||    
T  15861728 tcataatcaacccattttcaccaaaacaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagtcatgcatcatcatcaacaat 15861629  T
Q  160 atgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagtataat 245  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15861628 atgactaaacaa--acaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataat 15861545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 80 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 44035255 - 44035090
Alignment:
Q  80 acaaaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaac 178  Q
    |||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| | | ||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  44035255 acaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaattatgaatcatgcaaactcaagccatta-tcatcatcaactatatgactaaacaacaacaac 44035157  T
Q  179 aaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagtataat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  44035156 aaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaaatgagcataat 44035090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 87 - 239
Target Start/End: Original strand, 49967628 - 49967780
Alignment:
Q  87 caccaccaacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattg 186  Q
    ||||| ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||| | ||||    
T  49967628 caccaacaacatctcattcctcaacaacaaccatgaatcatgcaaaccgaagcaatgaattatcatcaacaacatgacttaacaacaacaacatcaattg 49967727  T
Q  187 atcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 239  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  49967728 atcatgaaacgtatcacaattcatcaacaacaatgtataattcaccaattgag 49967780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 87 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 35522588 - 35522436
Alignment:
Q  87 caccaccaacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattg 186  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||  | ||||||||||| | ||||    
T  35522588 caccaacaacatctcatttctcaacacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacgtatcaacaacaacatcaattg 35522489  T
Q  187 atcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 239  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||    
T  35522488 atcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaccaattgag 35522436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 87 - 239
Target Start/End: Original strand, 41212046 - 41212202
Alignment:
Q  87 caccaccaacaactcatttctcaacaacaatc-atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaaca---acaacaacaacc 182  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||| | | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||   |||||||||||     
T  41212046 caccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccaagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacaacaaca 41212145  T
Q  183 attgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||    
T  41212146 attgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacagtgcataattcactaattgag 41212202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 87 - 239
Target Start/End: Original strand, 21718206 - 21718358
Alignment:
Q  87 caccaccaacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattg 186  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||  | ||||||||||| | ||||    
T  21718206 caccaacaacatctcatttctcaagaacaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattg 21718305  T
Q  187 atcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 239  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  21718306 atcatgaaacttatcacaaatcatcaacaacatagcataattcaccaattgag 21718358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 88 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 22403379 - 22403227
Alignment:
Q  88 accaccaacaactcatttctcaacaacaa--tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccatt 185  Q
    |||| ||||| |||||||||| | |||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||  ||    
T  22403379 accaacaacatctcatttctccataacaaaatcatgaatcatg-aaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttaacaacaacaacaacagtt 22403281  T
Q  186 gatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 239  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22403280 aatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgag 22403227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 83 - 239
Target Start/End: Original strand, 35054729 - 35054886
Alignment:
Q  83 aaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaac 181  Q
    |||||| || |||||||| ||| | ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |  | || ||| ||||||||||||| |    
T  35054729 aaaccaacaacaacaacttattccacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatc 35054828  T
Q  182 cattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 239  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||   |||||||||||||||||||    
T  35054829 cattgatcatgaaacttatcacagttcatcaactacatagcataattcaccaattgag 35054886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 76 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 51627945 - 51627805
Alignment:
Q  76 ttttacaaaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacat-atgactaaacaaca 173  Q
    |||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || ||| | |||||    
T  51627945 ttttaccaaaccaccaacaacatctcatttctcaacagcaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatc-aacatcatcacttagcaaca 51627847  T
Q  174 acaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaaca 215  Q
    |||||| | |||||||||||| | |||||||||||| |||||    
T  51627846 acaacatcaattgatcatgaatcttatcacaattcaacaaca 51627805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 83 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 27330026 - 27329872
Alignment:
Q  83 aaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaacc 182  Q
    |||||| || |||||||| ||||  ||||||  || |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |  | || ||| ||||||||||||| ||    
T  27330026 aaaccaacaacaacaacttatttgacaacaa--attatgaatcatgcatacccaagccatgaattaacatccataacatcacttaacaacaacaacatcc 27329929  T
Q  183 attgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 239  Q
    |||||||||||||| |||||||||| | |||||||   |||||||||||||||||||    
T  27329928 attgatcatgaaacttatcacaatttaacaacaacatagcataattcaccaattgag 27329872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 68 - 151
Target Start/End: Original strand, 27674755 - 27674838
Alignment:
Q  68 tcaaaccattttacaaaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatca 151  Q
    |||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  27674755 tcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttctcatcaaaaatcatgaattatgcacacccaagccatgaattatca 27674838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 115 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 9784341 - 9784239
Alignment:
Q  115 aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaac 214  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  | |||||  | ||||||||||| | ||||||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  9784341 aatcatgaatcatgcaagcccaagccatgaatgatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgatcttgaaacttatcacaattcaacaac 9784242  T
Q  215 aac 217  Q
    |||    
T  9784241 aac 9784239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 73 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 22829708 - 22829629
Alignment:
Q  73 ccattttacaaaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatca 151  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  22829708 ccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagccatgaattatca 22829629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 68 - 217
Target Start/End: Original strand, 17608886 - 17609036
Alignment:
Q  68 tcaaaccattttacaaaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgacta 166  Q
    |||| ||||||| |||||||| || |||||||||| ||||||  | ||| |||||| | ||| | ||||||||||||||| |||| |||  |||| |||     
T  17608886 tcaacccattttccaaaaccaacaacaacaactcaattctcataatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcactt 17608985  T
Q  167 aacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaac 217  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||| |  |||| |||||| |||||||    
T  17608986 aacaacaacaacaacaattgaacatgaatctcatcataattcaacaacaac 17609036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 68 - 151
Target Start/End: Original strand, 19603055 - 19603139
Alignment:
Q  68 tcaaaccattttacaaaaccaccaccaacaactcatttctcaacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatca 151  Q
    |||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||| || || ||||||| ||||||||||||    
T  19603055 tcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattattcacacccaagtcatgaattatca 19603139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 68 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 38033962 - 38033882
Alignment:
Q  68 tcaaaccattttacaaaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaatta 148  Q
    |||| ||||||||||||  ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  38033962 tcaacccattttacaaagtcaccaacaacaacttatttctcatcaacaatcgtgaactatgcacacccaagccatgaatta 38033882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 75 - 236
Target Start/End: Original strand, 20177140 - 20177302
Alignment:
Q  75 attttacaaaaccaccaccaacaactcatttctcaacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaaca 173  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||| ||| | | ||||||||||||| ||||||||  | || ||| | |||||    
T  20177140 atttcacaaaaccaccaacaacaactcatttctcttcaacaaatcatgaattatgaatatccaagccatgaatcatcatcaacaacatcacttagcaaca 20177239  T
Q  174 acaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaatt 236  Q
    |||||| | ||||| | |||    || ||||||||| |||||||   |||||||||| |||||    
T  20177240 acaacatcaattgaacttgacttttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 20177302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 169 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 9784248 - 9784184
Alignment:
Q  169 caacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaatt 236  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||   |||||||| | ||||||||||||||||    
T  9784248 caacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaat---tcaacaacaaagcataattcaccaatt 9784184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 76 - 236
Target Start/End: Original strand, 21194980 - 21195141
Alignment:
Q  76 ttttacaaaaccaccaccaacaactcatttctcaacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaa 174  Q
    ||||| ||||||| || ||||||||||||||||| || | |||||||| | ||| | ||||||||||||||| |||| |||  ||||  || ||||||||    
T  21194980 ttttataaaaccaacaacaacaactcatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaa 21195079  T
Q  175 caacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaatt 236  Q
    |||||   ||| | |||||  |  ||||||||||| ||||||||  ||| |||||| |||||    
T  21195080 caacattaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaacctagcacaattcaacaatt 21195141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 75 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 13377122 - 13377003
Alignment:
Q  75 attttacaaaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaaca 173  Q
    |||| |||||||| ||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||| ||| | || |||||||||||| | ||||||  | || ||| | |||||    
T  13377122 atttcacaaaaccgccaacaacaattcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaatactcaagccatgaatcaacatcaacaacatcacttagcaaca 13377023  T
Q  174 acaacaaccattgatcatga 193  Q
    |||||| | ||||| |||||    
T  13377022 acaacatcaattgagcatga 13377003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 91 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 36356559 - 36356494
Alignment:
Q  91 accaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaa 155  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| |||||||| ||| | ||||||||||| ||| ||||||||    
T  36356559 accaacaactcatttctcatccacaaatcatgaattatgaacacccaagccataaatcatcatcaa 36356494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 75 - 155
Target Start/End: Original strand, 17148534 - 17148614
Alignment:
Q  75 attttacaaaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaa 155  Q
    |||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| ||||   ||| | ||||||||||| ||| || |||||    
T  17148534 atttcacaaaaccaccaccaacatcttatttctcatcaacaattatgatatatgaacacccaagccataaatcataatcaa 17148614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 75 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 41229221 - 41229149
Alignment:
Q  75 attttacaaaaccaccaccaacaactcatttctcaacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaat 146  Q
    ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||| | || |||||||||| ||| | || ||||||||||||    
T  41229221 attttaccaaactaccaacaacaactcatttctcatccacaaatcatgaattatgaacactcaagccatgaat 41229149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 108; Significance: 3e-54; HSPs: 26)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 75 - 245
Target Start/End: Original strand, 22274688 - 22274858
Alignment:
Q  75 attttacaaaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaat-catgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaaca 173  Q
    |||| |||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||  ||||||||||||| ||    
T  22274688 atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaattcatgaatcatgcaa-cccaagccatctatcatcatcaacaatatgactaaacatca 22274786  T
Q  174 acaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagtataat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22274787 acaacaaccattgatcatgaaacacatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataat 22274858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 87 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 23836975 - 23836822
Alignment:
Q  87 caccaccaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccatt 185  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||    
T  23836975 caccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcaagaattatgcaaacccaagtcatgaattatcatcaacaaaatgactaaacaacaacaacaacaatt 23836876  T
Q  186 gatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23836875 gatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgag 23836822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 87 - 239
Target Start/End: Original strand, 32465835 - 32465988
Alignment:
Q  87 caccaccaacaactcatttctcaacaacaatc-atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccatt 185  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| | |||    
T  32465835 caccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacatcaatt 32465934  T
Q  186 gatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 239  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  32465935 gatcatgaaacttatcacaattcatcaagaacaatgcataattcaccaattgag 32465988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 75 - 245
Target Start/End: Original strand, 22283921 - 22284091
Alignment:
Q  75 attttacaaaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaat-catgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaaca 173  Q
    |||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||  ||| ||||||||| ||    
T  22283921 atttcacaaaaccaccaacaacaattcatttctcaacagcaattcatgaatcatgcaa-cccaagccatgtatcatcatcaacaataagactaaacatca 22284019  T
Q  174 acaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagtataat 245  Q
    | |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22284020 aaaacaacgattgatcatgaaacacatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataat 22284091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 83 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 25876193 - 25876036
Alignment:
Q  83 aaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaatc-atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaac 181  Q
    |||||| || |||||||| ||||| ||| ||||| | | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||| |||||||||    
T  25876193 aaaccaacaacaacaacttatttcacaataacaagccaagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaataacaacaac 25876094  T
Q  182 cattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 239  Q
      ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25876093 atttgatcatgaagcatatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgag 25876036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 83 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 9653179 - 9653015
Alignment:
Q  83 aaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaa--tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaa 180  Q
    |||||| || |||||||| ||||| |||||||||  | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |  | || ||| ||||||| |||||     
T  9653179 aaaccaacaacaacaacttatttcacaacaacaaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaacatcaacat 9653080  T
Q  181 ccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagtataat 245  Q
    | ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9653079 ctattgatcatgaaaaatatcgcaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagtataat 9653015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 40 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 19433649 - 19433495
Alignment:
Q  40 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaaaccattttacaaaaccaccaccaacaactcatttctcaacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaag 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| | |||||||    
T  19433649 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaacacccaag 19433550  T
Q  139 ccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatga 193  Q
    |||||||| |||| |||  ||||  || | ||||||||||| | ||||| |||||    
T  19433549 ccatgaatcatcaacaacaatatctcttagcaacaacaacatcaattgaacatga 19433495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 87 - 243
Target Start/End: Original strand, 6879414 - 6879571
Alignment:
Q  87 caccaccaacaactcatttctcaacaacaatc-atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccatt 185  Q
    ||||| ||||| |||| ||||||||||||| | | |||| ||  ||||||||| |||| |||||||||||  | ||||||||| |||||||||||| |||    
T  6879414 caccaacaacatctcaattctcaacaacaaaccaagaattatttaaacccaagacatgtattatcatcaacaacatgactaaataacaacaacaacaatt 6879513  T
Q  186 gatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagtata 243  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6879514 gatcattaaacatatcacaattcatcaataacaatgcataattcaccaattgagtata 6879571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 95 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 21274319 - 21274168
Alignment:
Q  95 acaactcatttctcaacaacaa--tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatg 192  Q
    |||||| ||||| |||||||||  | ||||||||||| | |||||||||||||||| |||| |  | || ||| ||||||||||||| | ||||||||||    
T  21274319 acaacttatttcacaacaacaaaattatgaatcatgcta-cccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgatcatg 21274221  T
Q  193 aaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagtataat 245  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21274220 aaacatattacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagtataat 21274168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 87 - 239
Target Start/End: Original strand, 28974026 - 28974179
Alignment:
Q  87 caccaccaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccatt 185  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| | ||||||||||| | |||    
T  28974026 caccaacaacatctcatttctcatcaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaacaacatcaatt 28974125  T
Q  186 gatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 239  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||   ||||||||| |||| ||||    
T  28974126 gatcatgaaacttaccacaattcatcaacaacatagcataattcgccaaatgag 28974179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 87 - 239
Target Start/End: Original strand, 271148 - 271300
Alignment:
Q  87 caccaccaacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattg 186  Q
    ||||| ||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | |||||  | ||||||||||| | ||||    
T  271148 caccaacaacatctcattcctcaacacaaatcatgaatcatgcaaacccaagctatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattg 271247  T
Q  187 atcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 239  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  271248 atcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaaacataattcaccaattgag 271300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 87 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 4448402 - 4448251
Alignment:
Q  87 caccaccaacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattg 186  Q
    ||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||  | ||||||||||| | ||||    
T  4448402 caccaacaacatctcatttttcaacacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattg 4448303  T
Q  187 atcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattga 238  Q
    |||||||||| ||||| |||||| ||||||| | |||| |||||||||||||    
T  4448302 atcatgaaacttatcataattcaacaacaacaaagcatcattcaccaattga 4448251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 75 - 239
Target Start/End: Original strand, 25601989 - 25602154
Alignment:
Q  75 attttacaaaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaaca 173  Q
    |||| |||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||  | |||||  | |||||    
T  25601989 atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacctaagccatgatttatcataaacaacatgacatagcaaca 25602088  T
Q  174 acaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 239  Q
    |||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||   |||||| ||||||||||||    
T  25602089 acaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaaccacatagcataactcaccaattgag 25602154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 83 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 36890959 - 36890805
Alignment:
Q  83 aaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaac 181  Q
    |||||| || |||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||| |  | || ||| | |||||||||||||    
T  36890959 aaaccaacaacaacaacttatttctcaacaacaaatcaagaatcatgcatacccaagccatgaataatcatccacaacatcacttagcaacaacaacaac 36890860  T
Q  182 cattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaatt 236  Q
     |||||||||||||| |||||||||| |||||||||   ||||||||||||||||    
T  36890859 aattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacatagcataattcaccaatt 36890805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 40 - 142
Target Start/End: Original strand, 25212977 - 25213081
Alignment:
Q  40 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaaaccattttacaaaaccaccaccaacaactcattt--ctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaa 137  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||   ||| | ||||||    
T  25212977 acatcatcaaaatcaaatttcttctttatcaacccattttacaaaaccaccaccaacaactcatttttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaa 25213076  T
Q  138 gccat 142  Q
    |||||    
T  25213077 gccat 25213081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 87 - 202
Target Start/End: Original strand, 27261783 - 27261899
Alignment:
Q  87 caccaccaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccatt 185  Q
    ||||| ||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| | ||||||||| | | |||    
T  27261783 caccaacaacatctcatttcttaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaacaatatcaatt 27261882  T
Q  186 gatcatgaaacatatca 202  Q
    ||||||||||| |||||    
T  27261883 gatcatgaaacttatca 27261899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 76 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 22580140 - 22579999
Alignment:
Q  76 ttttacaaaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaa 174  Q
    |||||| ||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | || ||  | || ||     
T  22580140 ttttaccaaaacaccaacaacatctcatttctccacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatcaacaacatcacatatcagcag 22580041  T
Q  175 caacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaa 216  Q
    ||||| | |||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  22580040 caacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaa 22579999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 40 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 24827044 - 24826961
Alignment:
Q  40 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaaaccattttacaaaaccaccaccaacaactca-tttctcaacaacaatcatga 122  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  24827044 acatcatcaatatcaaacttcttctttatcaacccattttacaaaaccaccaacaacagctcattttctcaacaacaatcatga 24826961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 76 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 24571572 - 24571408
Alignment:
Q  76 ttttacaaaaccaccaccaacaactcatttctcaacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaa 174  Q
    |||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| || | ||||| ||||| ||||||||||  | || ||| ||||||||    
T  24571572 ttttaccaaaccaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatacatagccaag-catgagttatcatcaacaacatcacttaacaacaa 24571474  T
Q  175 caacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattc-accaattgag 239  Q
    ||||| | |||||||||||| | || ||||||||| ||| |||   ||||||||| ||||||||||    
T  24571473 caacatcaattgatcatgaatcttaacacaattcaacaaaaacatagcataattcaaccaattgag 24571408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 40 - 236
Target Start/End: Original strand, 43645824 - 43646020
Alignment:
Q  40 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaaaccattttacaaaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagc 139  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |  || ||  |||||||||| ||| | |||||||     
T  43645824 acatcatcaaaatcaaactttttcattaccaacccattttacaaaaccaccaccaacaactcaaatgacatcacaaatcatgaattatgaacacccaagt 43645923  T
Q  140 catgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaatt 236  Q
    ||||||| |||  |||  | || ||| | ||||||||||| | ||||| |||||  | || |||| |||| |||||||   |||||||||| |||||    
T  43645924 catgaatcatcgacaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgattcttaccacagttcaacaacaacatagcataattcaacaatt 43646020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 68 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 3529 - 3403
Alignment:
Q  68 tcaaaccattttacaaaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaa 167  Q
    |||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||  | || ||| |    
T  3529 tcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttctcatctacaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcatcaacaacatcactta 3430  T
Q  168 acaacaacaacaaccattgatcatgaa 194  Q
     ||||||||||| | ||||| ||||||    
T  3429 gcaacaacaacatcaattgaacatgaa 3403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 236
Target Start/End: Original strand, 67962 - 68119
Alignment:
Q  80 acaaaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaac 178  Q
    ||||||||| || |||||||| |||||||| || ||| |||||||| ||| | || |||||||||||| | || |||  |||| ||| | ||||||||||    
T  67962 acaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttagcaacaacaac 68061  T
Q  179 aaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaatt 236  Q
    | | ||||| |||||| | || ||||||||| |||||||   |||||||||| |||||    
T  68062 atcaattgaacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 68119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 151
Target Start/End: Original strand, 722360 - 722437
Alignment:
Q  75 attttacaaaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatca 151  Q
    ||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  722360 attttacaaagtcaccaacaacaactcatatctcatcaataaatcatgaattatgcacacccaagccatgaattatca 722437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 81 - 151
Target Start/End: Original strand, 25305416 - 25305487
Alignment:
Q  81 caaaaccaccaccaacaactcatttctcaacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatca 151  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| | ||||| ||||||||| ||||    
T  25305416 caaaactaccaacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaggccatgaatcatca 25305487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 67 - 108
Target Start/End: Original strand, 24884643 - 24884684
Alignment:
Q  67 atcaaaccattttacaaaaccaccaccaacaactcatttctc 108  Q
    ||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  24884643 atcaacccattttacaaaaccaacaacaacaactcatttctc 24884684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 167 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 24341593 - 24341521
Alignment:
Q  167 aacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 239  Q
    |||||||| |||| | ||||| |||||| |||||| ||||||| |||||||   ||| |||||||||||||||    
T  24341593 aacaacaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgag 24341521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 103; Significance: 3e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 80 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 736 - 570
Alignment:
Q  80 acaaaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaac 178  Q
    |||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||| || ||||||||  |||||| |||| | |||||||    
T  736 acaaaaccaccaacaataatccatttctcaacaacaaattattaatcatgcaaacccaagccatgtatcatcatcaacaatatgagtaaatatcaacaac 637  T
Q  179 aaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagtataat 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  636 aaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataat 570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091 (Bit Score: 98; Significance: 2e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 87 - 239
Target Start/End: Original strand, 32180 - 32333
Alignment:
Q  87 caccaccaacaactcatttctcaacaacaatc-atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccatt 185  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||| | | | || ||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||    
T  32180 caccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccaaggattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacaacaatt 32279  T
Q  186 gatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  32280 gatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaattcataattcaccaattgag 32333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091; HSP #2
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 87 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 42123 - 41970
Alignment:
Q  87 caccaccaacaactcatttctcaacaacaatc-atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccatt 185  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||| | | | || ||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||    
T  42123 caccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccaaggattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacaacaatt 42024  T
Q  186 gatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  42023 gatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaattcataattcaccaattgag 41970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 98; Significance: 2e-48; HSPs: 3)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 87 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 132520 - 132367
Alignment:
Q  87 caccaccaacaactcatttctcaacaacaatc-atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccatt 185  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||| | |||    
T  132520 caccaacaacatttcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttaacaacaacaacatcaatt 132421  T
Q  186 gatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 239  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  132420 gatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacgatgcataattcaccaattgag 132367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 83 - 239
Target Start/End: Original strand, 11660 - 11818
Alignment:
Q  83 aaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaac 181  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  |  | ||| | ||||||||||| |    
T  11660 aaaccaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcataaccaagccatgaattatcatcaacaacgtcacttagcaacaacaacatc 11759  T
Q  182 cattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattc-accaattgag 239  Q
     |||||||||||||| |||||||||||  |||||||   ||||||||| ||||||||||    
T  11760 aattgatcatgaaacttatcacaattctacaacaacatagcataattcaaccaattgag 11818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 123 - 238
Target Start/End: Original strand, 88289 - 88404
Alignment:
Q  123 atcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgc 222  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| |||| |  | || ||| ||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||    
T  88289 atcatgcatacccaagccaagaattagcatccataacatcacttaacaacagcaacatctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagc 88388  T
Q  223 ataattcaccaattga 238  Q
    ||||||||||||||||    
T  88389 ataattcaccaattga 88404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 98; Significance: 2e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 87 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 70892 - 70739
Alignment:
Q  87 caccaccaacaactcatttctcaacaacaatc-atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccatt 185  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||| |    
T  70892 caccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaagtcatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacatccaat 70793  T
Q  186 gatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 239  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  70792 gatcatgaaacttatcacaattcatcaacaataatgcataattcaccaattgag 70739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 87 - 243
Target Start/End: Original strand, 60784 - 60940
Alignment:
Q  87 caccaccaacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattg 186  Q
    ||||| ||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | |||||  | ||||||||||| | ||||    
T  60784 caccaacaacatctcatttctccacacaaatcatgaatcatgcaaacccaagtcatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattg 60883  T
Q  187 atcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagtata 243  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| ||||||    
T  60884 atcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaccaattaagtata 60940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0480 (Bit Score: 94; Significance: 6e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0480
Description:

Target: scaffold0480; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 87 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 5516 - 5363
Alignment:
Q  87 caccaccaacaactcatttctcaacaacaatc-atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccatt 185  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||| | ||||||||||| | |||    
T  5516 caccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaaaccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaacaacatcaatt 5417  T
Q  186 gatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  5416 gatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaatgcctaattcaccaattgag 5363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0480; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 83 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 9156 - 8998
Alignment:
Q  83 aaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaac 181  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||  | || ||| | ||||||||||| |    
T  9156 aaaccaccgacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcatacctaagccatgaattatcatcaacaacatcacttagcaacaacaacatc 9057  T
Q  182 cattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattc-accaattgag 239  Q
     |||||||||||||| |||||||||| | |||||||   ||||||||| ||||||||||    
T  9056 aattgatcatgaaacttatcacaatttaacaacaacatagcataattcaaccaattgag 8998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 94; Significance: 6e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 87 - 239
Target Start/End: Original strand, 22668 - 22821
Alignment:
Q  87 caccaccaacaactcatttctcaacaacaatc-atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccatt 185  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||| | |||    
T  22668 caccaacaacatctcatttctcaataacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacaaaacaacaacaacatcaatt 22767  T
Q  186 gatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 239  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  22768 gatcatgaaacttatcacaattcatcaacaaaaatgcataattcaccaattgag 22821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673 (Bit Score: 91; Significance: 4e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0673
Description:

Target: scaffold0673; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 87 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 7118 - 6962
Alignment:
Q  87 caccaccaacaactcatttctcaacaacaatc-atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaacca-- 183  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||| | | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| |      
T  7118 caccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccaagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacaacaaca 7019  T
Q  184 -ttgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 239  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7018 attgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgag 6962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 87 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 1092 - 939
Alignment:
Q  87 caccaccaacaactcatttctcaacaacaatc-atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccatt 185  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||  | ||||||||||||| |||    
T  1092 caccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacaacaatt 993  T
Q  186 gatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 239  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  992 gatcatgaaacttatcacaaatcatcaataacaatgcataattcaccaattgag 939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 91; Significance: 4e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 83 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 109736 - 109582
Alignment:
Q  83 aaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaac 181  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | |||||| | ||||||||||| |    
T  109736 aaaccaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaatcccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaacaacatc 109637  T
Q  182 cattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaatt 236  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  109636 aattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacttagcataattcaccaatt 109582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 83 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 118237 - 118081
Alignment:
Q  83 aaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaac 181  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | |||||| | ||||||||||| |    
T  118237 aaaccaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaccccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaacaacatc 118138  T
Q  182 cattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattga 238  Q
     | |||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  118137 aactgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattga 118081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0597 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0597
Description:

Target: scaffold0597; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 83 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 1261 - 1097
Alignment:
Q  83 aaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaa--tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaa 180  Q
    |||||| || |||||||| |||||||||||||||  | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||  |  | || ||| |||||||||||||     
T  1261 aaaccaacaacaacaacttatttctcaacaacaaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcattcataacatcacttaacaacaacaacat 1162  T
Q  181 ccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagtataat 245  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1161 ctattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataat 1097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 94 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 11970 - 11825
Alignment:
Q  94 aacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatga 193  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||| | ||||||||||| | |||||||||||    
T  11970 aacatctcatttctcaacaccaatcatgaaccatgcaaactcaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaacaacatcaattgatcatga 11871  T
Q  194 aacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 239  Q
    ||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11870 aacttatcaaaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgag 11825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0251
Description:

Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 83 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 13669 - 13505
Alignment:
Q  83 aaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaa--tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaa 180  Q
    |||||| || |||||||| ||||| |||||||||  | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |  | || ||| |||||||||||||     
T  13669 aaaccaacaacaacaacttatttcacaacaacaaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacat 13570  T
Q  181 ccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagtataat 245  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13569 ctattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataat 13505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 93 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 21633 - 21479
Alignment:
Q  93 caacaactcatttctcaacaacaa--tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatca 190  Q
    |||||||| ||||| |||||||||  | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||  |  | || ||| ||||||||||||| | ||||||||    
T  21633 caacaacttatttcacaacaacaaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcattcataacatcacttaacaacaacaacatctattgatca 21534  T
Q  191 tgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagtataat 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21533 tgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataat 21479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 83 - 245
Target Start/End: Original strand, 14921 - 15085
Alignment:
Q  83 aaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaa--tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaa 180  Q
    |||||| || |||||||| ||||| |||||||||  | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |  | || ||| |||||||||||||     
T  14921 aaaccaacaacaacaacttatttcacaacaacaaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacat 15020  T
Q  181 ccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagtataat 245  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15021 ctattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataat 15085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 87 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 255084 - 254931
Alignment:
Q  87 caccaccaacaactcatttctcaacaacaatc-atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccatt 185  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||  | ||||||||||| | |||    
T  255084 caccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaactcaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaatt 254985  T
Q  186 gatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 239  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  254984 gatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgag 254931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 87 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 261690 - 261537
Alignment:
Q  87 caccaccaacaactcatttctcaacaacaatc-atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccatt 185  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||  | ||||||||||| | |||    
T  261690 caccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaactcaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaatt 261591  T
Q  186 gatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 239  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  261590 gatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgag 261537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 83 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 17686 - 17523
Alignment:
Q  83 aaaccaccaccaacaactcatttctcaacaaca-atcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaac 181  Q
    |||||| || |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |  | || ||| ||||||||||||| |    
T  17686 aaaccaacaacaacaacttatttcacaacaacatattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatc 17587  T
Q  182 cattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagtataat 245  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17586 tattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataat 17523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 87 - 239
Target Start/End: Original strand, 14854 - 15004
Alignment:
Q  87 caccaccaacaactcatttctcaacaacaatcat-gaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccatt 185  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||| |   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||   |||||||| |||    
T  14854 caccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccgagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaaca---acaacaacaatt 14950  T
Q  186 gatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14951 gatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgag 15004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 87 - 180
Target Start/End: Original strand, 14194 - 14288
Alignment:
Q  87 caccaccaacaactcatttctcaacaacaatcat-gaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaa 180  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||| |   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||    
T  14194 caccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccgagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacaa 14288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 87; Significance: 9e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 99 - 236
Target Start/End: Original strand, 85321 - 85459
Alignment:
Q  99 ctcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaaca 197  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||| | ||||||||||| | ||||||||||||||     
T  85321 ctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaaaccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaacaacatcaattgatcatgaaact 85420  T
Q  198 tatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaatt 236  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  85421 tatcacaattcatcaacaacctagcataattcaccaatt 85459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 83 - 245
Target Start/End: Original strand, 159275 - 159436
Alignment:
Q  83 aaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaac 181  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||   | || ||| | ||||||||||| |    
T  159275 aaaccaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccaaaaattatcatca---acatcacttagcaacaacaacatc 159371  T
Q  182 cattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattc-accaattgagtataat 245  Q
     |||||||||||||| |||||||||||| || ||||   ||||||||| |||||||||| |||||    
T  159372 aattgatcatgaaacttatcacaattcaacatcaacatagcataattcaaccaattgagcataat 159436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 86; Significance: 4e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 87 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 846 - 693
Alignment:
Q  87 caccaccaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccatt 185  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | |||||| | ||||||||||| | |||    
T  846 caccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgccaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaacaacatcaatt 747  T
Q  186 gatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 239  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||    
T  746 gatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaaatgag 693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 86; Significance: 4e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 99 - 239
Target Start/End: Original strand, 38287 - 38428
Alignment:
Q  99 ctcatttctcaacaacaatc-atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaaca 197  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||     
T  38287 ctcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaagttatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacgtcaattgatcatgaaact 38386  T
Q  198 tatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 239  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  38387 tatcacaattcatcaacaacaatgcataattcgccaattgag 38428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 86; Significance: 4e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 75 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 253271 - 253106
Alignment:
Q  75 attttacaaaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaaca 173  Q
    |||| |||||||||||| ||||||  ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | |||||| ||||| |    
T  253271 atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcatcaagaaatcatgaatcatgcaaacccaagccttgaattatcatcaacaacatgacttaacaaaa 253172  T
Q  174 acaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 239  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  253171 acaacaacaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcatgattcaccaattgag 253106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 76 - 239
Target Start/End: Original strand, 9903 - 10067
Alignment:
Q  76 ttttacaaaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaa 174  Q
    |||||| ||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||  | ||||||    
T  9903 ttttaccaaaacaccaacaacatctcatttctccacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaataatcatcaacaacatgacatatcaacaa 10002  T
Q  175 caacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 239  Q
    ||||| | |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||    
T  10003 caacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaccaattgag 10067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 84; Significance: 6e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 90 - 236
Target Start/End: Original strand, 1297 - 1444
Alignment:
Q  90 caccaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgat 188  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||  | ||||||||||| | ||||||    
T  1297 caccaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaatgatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgat 1396  T
Q  189 catgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaatt 236  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||    
T  1397 catgaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaccaatt 1444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 87 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 11921 - 11771
Alignment:
Q  87 caccaccaacaactcatttctcaacaacaa--tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccat 184  Q
    ||||| ||||| |||||||||| | |||||  |||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||||   |    
T  11921 caccaacaacatctcatttctccataacaaaatcatgagttatgcaa-cccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttaacaacaacaacaa---t 11826  T
Q  185 tgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 239  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  11825 tgatcatgaaacttttcacaattcatcaacaacaatgcataattcactaattgag 11771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 94 - 239
Target Start/End: Original strand, 7556 - 7699
Alignment:
Q  94 aacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatga 193  Q
    |||| |||||||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||| | |||||||||||    
T  7556 aacatctcatttctcaacaaccaac--gaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttaacaacaacaacatcaattgatcatga 7653  T
Q  194 aacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 239  Q
    ||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7654 aacttatcataatttatcaacaacaatgcataattcaccaattgag 7699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 83 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 15748 - 15588
Alignment:
Q  83 aaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaac 181  Q
    |||||| || |||||| | |||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |  | ||||||||||||||||||||||    
T  15748 aaaccaacaacaacaatttatttctcaacaaaaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatctataacatgactaaacaacaacaacaac 15649  T
Q  182 ca---ttgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 239  Q
     |   |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15648 aacaattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgag 15588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338 (Bit Score: 82; Significance: 9e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0338
Description:

Target: scaffold0338; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 83 - 239
Target Start/End: Original strand, 8960 - 9117
Alignment:
Q  83 aaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaac 181  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| | ||||||||||| |    
T  8960 aaaccaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcaagcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaacaacatc 9059  T
Q  182 cattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 239  Q
     | ||||| |||||| |||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  9060 aagtgatcttgaaacttatcacaaatcatcaacaacatagcataattcaccaattgag 9117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 82; Significance: 9e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 87 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 788 - 635
Alignment:
Q  87 caccaccaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccatt 185  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | |||||| |  |||||||||| | |||    
T  788 caccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgccaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagtaacaacaacatcaatt 689  T
Q  186 gatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 239  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||    
T  688 gatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaaatgag 635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 82; Significance: 9e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 83 - 245
Target Start/End: Original strand, 55553 - 55717
Alignment:
Q  83 aaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaa--tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaa 180  Q
    |||||| || |||||||| ||||  |||||||||  | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |  | || ||| |||||||||||||     
T  55553 aaaccaacaacaacaacttattttacaacaacaaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacat 55652  T
Q  181 ccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagtataat 245  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  55653 ctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataat 55717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 68 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 94061 - 93973
Alignment:
Q  68 tcaaaccattttacaaaaccaccaccaacaactcatttctcaacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaa 155  Q
    |||| ||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||   ||||||  ||||||||||||||||    
T  94061 tcaacccattttacaaagtcaccaacaacatctcatttctcaccaacaaatcatgaattatgttcacccaaatcatgaattatcatcaa 93973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 79; Significance: 5e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 83 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 10248 - 10094
Alignment:
Q  83 aaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaac 181  Q
    |||||| || |||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |  | || ||| ||||||||||||| |    
T  10248 aaaccatcaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatc 10149  T
Q  182 cattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaatt 236  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  10148 cattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaaccaagcataattcgccaatt 10094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0706 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0706
Description:

Target: scaffold0706; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 93 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 6815 - 6662
Alignment:
Q  93 caacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcat 191  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |  | || ||| ||||||||||| | | |||||||||    
T  6815 caacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaagatctattgatcat 6716  T
Q  192 gaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagtataat 245  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6715 caaacttatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataat 6662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 83 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 193770 - 193607
Alignment:
Q  83 aaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaa--tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaa 180  Q
    |||||| || |||||||| ||||| |||||||||  | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |  | || ||| |||||||||||||     
T  193770 aaaccaacaacaacaacttatttcgcaacaacaaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacat 193671  T
Q  181 ccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagtataat 245  Q
    | ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  193670 ctattgatcatgaaacatatcacaa-taatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataat 193607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 93 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 186798 - 186645
Alignment:
Q  93 caacaactcatttctcaacaacaa--tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatca 190  Q
    |||||||| ||||| |||||||||  | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |  | || ||| ||||||||||||| | ||||||||    
T  186798 caacaacttatttcacaacaacaaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgatca 186699  T
Q  191 tgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagtataat 245  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  186698 tgaaacatatcacaa-taatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcataat 186645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0574
Description:

Target: scaffold0574; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 83 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 9789 - 9626
Alignment:
Q  83 aaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaac 181  Q
    |||||| || |||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |  |  | ||| ||||||||||||| |    
T  9789 aaaccaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacgtcacttaacaacaacaacatc 9690  T
Q  182 cattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagtataat 245  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||    
T  9689 tattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaaccatgcataagtcactaattgagcataat 9626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 83 - 245
Target Start/End: Original strand, 94948 - 95111
Alignment:
Q  83 aaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaac 181  Q
    |||||| || |||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||| |||||| |||||||||| |||| |  | || ||| | ||||||||||| |    
T  94948 aaaccaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaaaccatgaattagcatccataacatcacttatcaacaacaacatc 95047  T
Q  182 cattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagtataat 245  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  95048 tattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaaccatgcataattcactaattgagcataat 95111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 83 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 25002 - 24845
Alignment:
Q  83 aaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaac 181  Q
    |||||| || |||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||| | |||||||||| |||||| |||| |  | || ||| ||||||||||||| |    
T  25002 aaaccaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgaatacccaagccaagaattaacatccataacatcacttaacaacaacaacatc 24903  T
Q  182 cattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 239  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  24902 tattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattgag 24845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 87 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 112812 - 112662
Alignment:
Q  87 caccaccaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccatt 185  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    |||||| |||||||||||||   |||    
T  112812 caccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcaacaac---atgacttaacaacaacaacataaatt 112716  T
Q  186 gatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 239  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||   ||||||||||| |||||||    
T  112715 gatcatgaaacttatcacaattcatcaaccacatagcataattcactaattgag 112662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 76 - 217
Target Start/End: Original strand, 109556 - 109698
Alignment:
Q  76 ttttacaaaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaa 174  Q
    |||||| |||| |||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  | || ||| | ||||||    
T  109556 ttttaccaaactaccaacaacatctcatttctcatcaacaaatcatgaatcgtgcatacccaagccatgaattatcatcaacaacatcacttagcaacaa 109655  T
Q  175 caacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaac 217  Q
    ||||| | | |||||||||| | |||||||||||| |||||||    
T  109656 caacatcaactgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaac 109698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 68 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 103211 - 103048
Alignment:
Q  68 tcaaaccattttacaaaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaat-catgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgacta 166  Q
    |||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||  | || |||     
T  103211 tcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttatcaccaacaattcatgaattatgcacacccaaaccatgaattatcatcaacaacatcactt 103112  T
Q  167 aacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattca 230  Q
    |  ||||| |||| | ||||| ||||||   |||||||||||| |||||||   ||||||||||    
T  103111 agaaacaataacatcaattgaacatgaatgttatcacaattcaacaacaacatagcataattca 103048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 72; Significance: 8e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 40 - 146
Target Start/End: Original strand, 28466 - 28573
Alignment:
Q  40 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaaaccattttacaaaaccaccaccaacaactcatttctcaacaa-caatcatgaatcatgcaaacccaag 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||| | |||||||    
T  28466 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcatttctcaccaataaatcatgaattatgaacacccaag 28565  T
Q  139 ccatgaat 146  Q
    ||||||||    
T  28566 ccatgaat 28573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 40 - 90
Target Start/End: Original strand, 21637 - 21687
Alignment:
Q  40 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaaaccattttacaaaaccacc 90  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21637 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccacc 21687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 83 - 239
Target Start/End: Original strand, 146574 - 146731
Alignment:
Q  83 aaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaac 181  Q
    |||||| || |||||||| ||||| ||| ||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||  |  | || ||| ||||||||||||| |    
T  146574 aaaccaacaacaacaacttatttcacaaaaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattaacatgcataacatcacttaacaacaacaacatc 146673  T
Q  182 cattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 239  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  146674 tattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacctagcataattcaccaattgag 146731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0160 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0160
Description:

Target: scaffold0160; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 101 - 239
Target Start/End: Original strand, 12 - 151
Alignment:
Q  101 catttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacata 199  Q
    |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||  | ||||||||||| | |||||||||||||| ||    
T  12 catttctcaacaacaaataatgaaacatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaagatgacatagcaacaacaacatcaattgatcatgaaactta 111  T
Q  200 tcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 239  Q
    ||||||||||||||| ||   ||||||||||| |||||||    
T  112 tcacaattcatcaaccacgtagcataattcacgaattgag 151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0160; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 83 - 179
Target Start/End: Original strand, 3492 - 3589
Alignment:
Q  83 aaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaaca 179  Q
    ||||||||| |||||   |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||  | |||||||||||    
T  3492 aaaccaccaacaacattccatttctcaacaacaaataatgaaacatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaagatgacatagcaacaacaaca 3589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 67; Significance: 8e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 75 - 236
Target Start/End: Original strand, 4906 - 5068
Alignment:
Q  75 attttacaaaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaaca 173  Q
    |||| |||||||||||| ||||||  ||||||||| || ||| |||||||| ||| | | ||||||||||||||||||||||  | |||||| | |||||    
T  4906 atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcatcagcaaatcatgaattatgaacaaccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaaca 5005  T
Q  174 acaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaatt 236  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |  |||||||||||||||    
T  5006 acaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaatcataattcaccaatt 5068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1164 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold1164
Description:

Target: scaffold1164; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 62 - 213
Target Start/End: Original strand, 1332 - 1485
Alignment:
Q  62 tcattatcaaaccatttt-acaaaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacat 159  Q
    |||| ||||| ||||||| || ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |     
T  1332 tcataatcaacccattttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgatttatcatcaacaac 1431  T
Q  160 atgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaa 213  Q
    |||||  | ||||| |||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1432 atgacatagcaacagcaacatttattgatcatgaaacttatcacaattcatcaa 1485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 87 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 11837 - 11688
Alignment:
Q  87 caccaccaacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattg 186  Q
    ||||| ||||| |||||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  | |||||  | |||||||||||   ||||    
T  11837 caccaacaacatctcatttctccacacaaatcatgaattatgcaaacccaagtcatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacataaattg 11738  T
Q  187 atcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaatt 236  Q
    ||||||||||  ||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||    
T  11737 atcatgaaactgatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaccaatt 11688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 64; Significance: 5e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 87 - 239
Target Start/End: Original strand, 48124 - 48277
Alignment:
Q  87 caccaccaacaactcatttctcaacaacaa--tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccat 184  Q
    ||||| ||||| |||||||||| | |||||  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||  | ||| || |||||||| || ||| ||    
T  48124 caccaacaacatctcatttctccataacaaaatcatgaattatgcaa-cccaagccatgaattatcatcaacaacatggcttaacaacaataataacaat 48222  T
Q  185 tgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 239  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  48223 tgatcatgaaacttttcacaattcatcaacaacaaaacataattcaccaattgag 48277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 87 - 239
Target Start/End: Original strand, 61572 - 61725
Alignment:
Q  87 caccaccaacaactcatttctcaacaacaa--tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccat 184  Q
    ||||| ||||| |||||||||| | |||||  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||  | ||| || |||||||| || ||| ||    
T  61572 caccaacaacatctcatttctccataacaaaatcatgaattatgcaa-cccaagccatgaattatcatcaacaacatggcttaacaacaataataacaat 61670  T
Q  185 tgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 239  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  61671 tgatcatgaaacttttcacaattcatcaacaacaaaacataattcaccaattgag 61725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0095 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0095
Description:

Target: scaffold0095; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 76 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 34008 - 33854
Alignment:
Q  76 ttttacaaaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaa 174  Q
    |||||| |||| |||| ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||  | || ||| | ||||||    
T  34008 ttttaccaaactaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcat-aatcatgcatacccaagccatgaattattatcaacaacatcacttagcaacaa 33910  T
Q  175 caacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattca 230  Q
    ||||| | |||||||||||| | |||||||||||| |||||||   ||||||||||    
T  33909 caacatcaattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattca 33854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 3)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 40 - 142
Target Start/End: Original strand, 130486 - 130589
Alignment:
Q  40 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaaaccattttacaaaaccaccaccaacaactcattt-ctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaag 138  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||   ||| | |||||||    
T  130486 acatcatcaaaatcaaacttcttctttattaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaag 130585  T
Q  139 ccat 142  Q
    ||||    
T  130586 ccat 130589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 170 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 89655 - 89586
Alignment:
Q  170 aacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag 239  Q
    |||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||| | ||||||| | |||||||||||||||||||    
T  89655 aacaacaacatcaattgttcatgaaacttatcacaatttaacaacaacaaagcataattcaccaattgag 89586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 93 - 217
Target Start/End: Original strand, 79522 - 79647
Alignment:
Q  93 caacaactcatttctcaacaacaat-catgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcat 191  Q
    ||||||||||||||||| || |||| ||||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||  |||| ||| | ||||||||||| | ||||| |||    
T  79522 caacaactcatttctcatcaccaattcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaataatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacat 79621  T
Q  192 gaaacatatcacaattcatcaacaac 217  Q
    |   || |||| |||||| |||||||    
T  79622 ggttcacatcataattcaacaacaac 79647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 76 - 214
Target Start/End: Original strand, 31010 - 31149
Alignment:
Q  76 ttttacaaaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaa 174  Q
    |||||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |  | ||  | || |||    
T  31010 ttttaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaagtcatgaatcatgcatacccaagccataaattatcatcaaaaacctcacatatcagcaa 31109  T
Q  175 caacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaac 214  Q
    ||||| | ||| |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  31110 caacatcaattaatcatgaaacttatcacaattcaacaac 31149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 172 - 230
Target Start/End: Original strand, 70676 - 70734
Alignment:
Q  172 caacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattca 230  Q
    |||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  70676 caacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcataattca 70734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0303 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0303
Description:

Target: scaffold0303; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 93 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 300 - 147
Alignment:
Q  93 caacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcat 191  Q
    |||||||| ||||| |||||| || | |||||||||||| || |||||||||||||| |||| |  | || ||| |||||||||||||   |||||||||    
T  300 caacaacttatttcacaacaataaattatgaatcatgcatactcaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatttattgatcat 201  T
Q  192 gaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagtataat 245  Q
    ||||| ||||| ||||||||||  |  ||||||||||||||||||||| |||||    
T  200 gaaacttatcataattcatcaattattatgcataattcaccaattgagcataat 147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 52; Significance: 7e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 83 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 24471 - 24372
Alignment:
Q  83 aaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaac 181  Q
    ||||||||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | |||||  | |||||||||||||    
T  24471 aaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagacatgaattatcatcaacaacatgacatagcaacaacaacaac 24372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 75 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 77129 - 76967
Alignment:
Q  75 attttacaaaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaaca 173  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||  ||  |||| ||| | |||||    
T  77129 atttcacaaaaccaccaacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaataacaatatcacttagcaaca 77030  T
Q  174 acaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaatt 236  Q
    |||||| | ||||| |||||| |  | ||||||||| |||||||   |||||||||| |||||    
T  77029 acaacatcaattgaacatgaatctcaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 76967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0554 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0554
Description:

Target: scaffold0554; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 83 - 215
Target Start/End: Original strand, 1889 - 2022
Alignment:
Q  83 aaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaac 181  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||   | |||||| | ||||||||||| |    
T  1889 aaaccactaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcatactcaagccaagaattatcatcatcaacatgacttagcaacaacaacatc 1988  T
Q  182 cattgatcatgaaacatatcacaattcatcaaca 215  Q
     |||||||||||| | ||| |||| ||| |||||    
T  1989 aattgatcatgaatcttataacaaatcaacaaca 2022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0103 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0103
Description:

Target: scaffold0103; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 115 - 236
Target Start/End: Original strand, 33668 - 33789
Alignment:
Q  115 aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaac 214  Q
    |||||||||| ||| | |||| |||||||||| |||| |||  |||| ||| | ||||||||||| | |||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  33668 aatcatgaattatgaacaccctagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcaaaattcatcaac 33767  T
Q  215 aaccatgcataattcaccaatt 236  Q
    |||   ||||||||||||||||    
T  33768 aacatagcataattcaccaatt 33789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0740 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0740
Description:

Target: scaffold0740; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 175 - 238
Target Start/End: Original strand, 4351 - 4414
Alignment:
Q  175 caacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattga 238  Q
    ||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4351 caacaacaattgatcataaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattga 4414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0740; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 155
Target Start/End: Original strand, 4284 - 4353
Alignment:
Q  87 caccaccaacaactcatttctcaacaacaatc-atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaa 155  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||| | | |||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4284 caccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccaagaattatgcaaacccaaaccatgaattatcatcaa 4353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 99 - 209
Target Start/End: Original strand, 3308 - 3419
Alignment:
Q  99 ctcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaacaacaaccattgatcatgaaaca 197  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |  | || ||| | ||||| ||||| | |||||||||||| |     
T  3308 ctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattaacatccacaacatcacttagcaacatcaacatcaattgatcatgaatct 3407  T
Q  198 tatcacaattca 209  Q
    ||||||||||||    
T  3408 tatcacaattca 3419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1272 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold1272
Description:

Target: scaffold1272; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 77 - 236
Target Start/End: Original strand, 276 - 436
Alignment:
Q  77 tttacaaaaccaccaccaacaactcatttctcaacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaacaac 175  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||   ||||||| ||||||| |||| |||| | || ||| | |||||||    
T  276 tttacaaaaccaccaacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgagcacccaaggcatgaataatcaacaaaaacatcacttagcaacaac 375  T
Q  176 aacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaatt 236  Q
    |||| | ||||| |||||  | || ||||||||| ||| |||   |||||||||| |||||    
T  376 aacatcaattgaacatgactcttaccacaattcaacaataacatagcataattcaacaatt 436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0589
Description:

Target: scaffold0589; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 83 - 153
Target Start/End: Original strand, 7807 - 7878
Alignment:
Q  83 aaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatc 153  Q
    |||| |||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  7807 aaactaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattaacatc 7878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 68 - 217
Target Start/End: Original strand, 69415 - 69565
Alignment:
Q  68 tcaaaccattttacaaaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgacta 166  Q
    |||| |||||||||||||||| || ||||| |||| |||||| || ||| |||||| | ||| | ||||||||||||||| |||| |||  |||| |||     
T  69415 tcaacccattttacaaaaccaacaacaacacctcaattctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcactt 69514  T
Q  167 aacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaac 217  Q
    | ||||||||||| | ||||| |||||| |  ||||||||||| |||||||    
T  69515 agcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcacaattcaacaacaac 69565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 77 - 156
Target Start/End: Original strand, 6628 - 6708
Alignment:
Q  77 tttacaaaaccaccaccaacaactcatttctcaacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaa 156  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||   ||||||||||||||| |||| ||||    
T  6628 tttacaaaaccaccaacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaccacccaagccatgaatcatcaacaaa 6708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 68 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 44087 - 43975
Alignment:
Q  68 tcaaaccattttacaaaaccaccaccaacaactcatttctcaacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgacta 166  Q
    |||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || | |||||||| | ||| | ||||||||||||||| |||| |||  |||| |||     
T  44087 tcaacccattttacaaaaccaacaacaacaactcatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcactt 43988  T
Q  167 aacaacaacaaca 179  Q
    | |||||||||||    
T  43987 agcaacaacaaca 43975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 43 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 13048 - 12990
Alignment:
Q  43 tcatcaaaatcaaacttcttcattatcaaaccatttt-acaaaaccaccaccaacaact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||    
T  13048 tcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttcacaaaaccatcaacaacaact 12990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 151
Target Start/End: Original strand, 35444 - 35520
Alignment:
Q  75 attttacaaaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatca 151  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||    
T  35444 attttacaaaaccaccaaca-caactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatca 35520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0700 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0700
Description:

Target: scaffold0700; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 68 - 230
Target Start/End: Original strand, 2483 - 2646
Alignment:
Q  68 tcaaaccattttacaaaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgacta 166  Q
    |||| |||||||| ||||||| || |||||| |||||||||| || ||| |||||| | ||| | |||||| |||||||| |||| |||  |||| |||     
T  2483 tcaacccattttagaaaaccaacaacaacaagtcatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaaaccatgaatcatcaacaacaatatcactt 2582  T
Q  167 aacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattca 230  Q
    | ||||||||||| | ||||| |||||| |  |||| |||||| |||||||   ||||||||||    
T  2583 agcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcataattcaacaacaacatagcataattca 2646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1734 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1734
Description:

Target: scaffold1734; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 75 - 132
Target Start/End: Original strand, 1364 - 1422
Alignment:
Q  75 attttacaaaaccaccaccaacaactcatttctcaacaac-aatcatgaatcatgcaaa 132  Q
    |||| |||||||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1364 atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaa 1422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 7307 - 7175
Alignment:
Q  75 attttacaaaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaacatatgactaaacaaca 173  Q
    |||||||||||||| ||   ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| | || |||||||||||| |||| |||  |||| ||| | || ||    
T  7307 attttacaaaaccatcattcacaactcatttctcatcaacaattcatgaattatgaacactcaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcagca 7208  T
Q  174 acaacaaccattgatcatgaaacatatcacaat 206  Q
    |||||| | ||||| |||||  | |||||||||    
T  7207 acaacatcaattgaacatgattcttatcacaat 7175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 40 - 80
Target Start/End: Original strand, 12694 - 12734
Alignment:
Q  40 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaaaccatttta 80  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  12694 acatcatcaaaatcaaacttcttcactatcaacccatttta 12734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0244
Description:

Target: scaffold0244; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 83 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 22786 - 22715
Alignment:
Q  83 aaaccaccaccaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatc 153  Q
    |||||| || |||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||| |||||| |||||||||| ||||    
T  22786 aaaccaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaaaccatgaattagcatc 22715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 40 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 3427 - 3396
Alignment:
Q  40 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaa 71  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3427 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaa 3396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University