View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0716_low_3 (Length: 510)

Name: NF0716_low_3
Description: NF0716
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0716_low_3
NF0716_low_3
[»] chr3 (42 HSPs)
chr3 (1-500)||(16744007-16744508)
chr3 (108-396)||(17912483-17912771)
chr3 (35-402)||(2049777-2050147)
chr3 (35-402)||(14842487-14842856)
chr3 (35-412)||(13838852-13839232)
chr3 (35-402)||(12030073-12030443)
chr3 (82-413)||(15858996-15859331)
chr3 (98-413)||(51158008-51158325)
chr3 (108-273)||(2449238-2449404)
chr3 (115-402)||(15936634-15936922)
chr3 (115-402)||(15938476-15938764)
chr3 (2-170)||(19231982-19232154)
chr3 (120-395)||(15614808-15615085)
chr3 (35-154)||(19260749-19260869)
chr3 (328-489)||(15468555-15468717)
chr3 (108-240)||(13975722-13975853)
chr3 (108-240)||(45860937-45861068)
chr3 (108-402)||(13954890-13955185)
chr3 (328-489)||(22275088-22275250)
chr3 (260-395)||(47984624-47984759)
chr3 (260-395)||(48003198-48003333)
chr3 (260-395)||(47993911-47994046)
chr3 (260-395)||(48012484-48012619)
chr3 (428-500)||(2449391-2449463)
chr3 (142-410)||(16821099-16821369)
chr3 (120-402)||(55316187-55316471)
chr3 (120-402)||(41270043-41270327)
chr3 (2-66)||(3992873-3992938)
chr3 (1-69)||(15857129-15857198)
chr3 (2-66)||(55513193-55513258)
chr3 (2-66)||(2844514-2844579)
chr3 (350-402)||(19231945-19231997)
chr3 (12-66)||(17955861-17955916)
chr3 (6-66)||(45581954-45582016)
chr3 (2-66)||(54037991-54038056)
chr3 (328-402)||(13975944-13976017)
chr3 (340-402)||(45860773-45860834)
chr3 (2-66)||(7854305-7854370)
chr3 (124-165)||(14080715-14080756)
chr3 (381-413)||(22144532-22144564)
chr3 (252-370)||(12264932-12265050)
chr3 (409-489)||(18969968-18970048)
[»] chr8 (32 HSPs)
chr8 (108-500)||(22907214-22907607)
chr8 (35-395)||(16193643-16194005)
chr8 (2-402)||(16404867-16405268)
chr8 (35-402)||(43373392-43373761)
chr8 (35-412)||(24928716-24929096)
chr8 (108-273)||(5238184-5238350)
chr8 (108-273)||(24661248-24661414)
chr8 (108-273)||(43685643-43685809)
chr8 (108-399)||(17345540-17345832)
chr8 (120-395)||(24548956-24549233)
chr8 (120-395)||(6774258-6774535)
chr8 (142-402)||(21844594-21844856)
chr8 (142-402)||(21851987-21852249)
chr8 (428-500)||(5238125-5238197)
chr8 (428-500)||(24661401-24661473)
chr8 (120-402)||(30120690-30120974)
chr8 (428-500)||(43685584-43685656)
chr8 (183-402)||(222754-222975)
chr8 (183-402)||(736377-736598)
chr8 (183-402)||(860272-860493)
chr8 (2-66)||(274766-274831)
chr8 (2-66)||(641018-641083)
chr8 (2-66)||(826824-826889)
chr8 (2-66)||(24716729-24716794)
chr8 (258-412)||(23837154-23837308)
chr8 (120-240)||(16674392-16674512)
chr8 (329-410)||(13662481-13662561)
chr8 (349-398)||(16674624-16674672)
chr8 (124-165)||(23226076-23226117)
chr8 (376-413)||(41246613-41246650)
chr8 (432-489)||(22321597-22321654)
chr8 (2-66)||(39115598-39115663)
[»] chr4 (28 HSPs)
chr4 (108-500)||(26680070-26680463)
chr4 (2-413)||(54118135-54118551)
chr4 (35-413)||(13246386-13246769)
chr4 (35-398)||(15675009-15675381)
chr4 (35-240)||(122020-122226)
chr4 (135-395)||(31115603-31115865)
chr4 (108-273)||(10488659-10488825)
chr4 (108-273)||(16327926-16328092)
chr4 (35-398)||(10104170-10104523)
chr4 (142-402)||(10644187-10644449)
chr4 (108-240)||(13048221-13048353)
chr4 (271-402)||(111362-111493)
chr4 (35-170)||(33240901-33241043)
chr4 (120-402)||(47357622-47357906)
chr4 (428-500)||(10488600-10488672)
chr4 (2-66)||(25119074-25119139)
chr4 (428-484)||(16328079-16328135)
chr4 (324-399)||(7849970-7850044)
chr4 (124-305)||(40885570-40885753)
chr4 (258-352)||(41166083-41166177)
chr4 (2-66)||(5682395-5682460)
chr4 (258-402)||(15044794-15044938)
chr4 (381-413)||(44055870-44055902)
chr4 (258-373)||(8374504-8374619)
chr4 (258-402)||(15109486-15109630)
chr4 (252-373)||(17145796-17145917)
chr4 (258-322)||(13809647-13809711)
chr4 (258-369)||(52265645-52265757)
[»] chr7 (31 HSPs)
chr7 (108-500)||(7292886-7293279)
chr7 (35-414)||(13036938-13037322)
chr7 (35-402)||(16211733-16212103)
chr7 (2-402)||(3059933-3060336)
chr7 (35-402)||(36052634-36053003)
chr7 (35-402)||(11580661-11581035)
chr7 (108-395)||(47481031-47481320)
chr7 (108-273)||(11516324-11516490)
chr7 (108-273)||(15441564-15441730)
chr7 (108-273)||(30262129-30262295)
chr7 (115-402)||(18253842-18254130)
chr7 (109-395)||(13320988-13321278)
chr7 (143-399)||(16478985-16479244)
chr7 (108-240)||(25292338-25292470)
chr7 (142-402)||(13572644-13572906)
chr7 (428-500)||(15441717-15441789)
chr7 (428-500)||(30262282-30262354)
chr7 (142-402)||(2437425-2437687)
chr7 (120-402)||(10989378-10989661)
chr7 (43-399)||(295900-296257)
chr7 (428-500)||(11516265-11516337)
chr7 (142-384)||(13911046-13911292)
chr7 (2-66)||(32493913-32493978)
chr7 (2-66)||(1936884-1936949)
chr7 (6-66)||(126738-126799)
chr7 (108-150)||(14113989-14114031)
chr7 (108-150)||(14423639-14423681)
chr7 (381-413)||(15822691-15822723)
chr7 (328-402)||(25292560-25292633)
chr7 (2-66)||(111136-111201)
chr7 (258-413)||(17224075-17224230)
[»] scaffold0078 (2 HSPs)
scaffold0078 (108-500)||(37066-37459)
scaffold0078 (2-66)||(41632-41697)
[»] chr1 (23 HSPs)
chr1 (1-399)||(41394191-41394593)
chr1 (35-402)||(20445646-20446019)
chr1 (47-402)||(20531411-20531770)
chr1 (35-402)||(20931312-20931682)
chr1 (35-413)||(20893551-20893933)
chr1 (35-402)||(20913004-20913367)
chr1 (35-402)||(37844374-37844746)
chr1 (108-273)||(51452589-51452755)
chr1 (158-402)||(22227777-22228022)
chr1 (158-402)||(22232474-22232719)
chr1 (142-395)||(2116228-2116484)
chr1 (428-500)||(51452530-51452602)
chr1 (142-240)||(45051554-45051652)
chr1 (2-66)||(21860334-21860399)
chr1 (2-66)||(44034838-44034903)
chr1 (142-402)||(18601140-18601402)
chr1 (315-395)||(45051416-45051496)
chr1 (120-402)||(5072388-5072672)
chr1 (2-46)||(41218749-41218793)
chr1 (381-412)||(49967607-49967638)
chr1 (292-373)||(20254308-20254389)
chr1 (1-46)||(27675139-27675184)
chr1 (291-370)||(22143531-22143611)
[»] chr2 (30 HSPs)
chr2 (2-413)||(19794596-19795011)
chr2 (35-402)||(36982364-36982737)
chr2 (2-402)||(43642848-43643250)
chr2 (2-402)||(20627205-20627609)
chr2 (35-402)||(462706-463075)
chr2 (41-402)||(8891209-8891574)
chr2 (35-398)||(24341309-24341681)
chr2 (108-273)||(19689401-19689567)
chr2 (108-273)||(23820168-23820334)
chr2 (108-273)||(14906440-14906606)
chr2 (108-395)||(25265390-25265679)
chr2 (108-273)||(20015108-20015274)
chr2 (158-399)||(7507894-7508138)
chr2 (108-240)||(17396653-17396784)
chr2 (120-402)||(19886661-19886945)
chr2 (35-128)||(22863171-22863267)
chr2 (428-500)||(14906593-14906665)
chr2 (428-500)||(20015049-20015121)
chr2 (428-500)||(23820109-23820181)
chr2 (428-473)||(19689554-19689599)
chr2 (2-66)||(22275045-22275110)
chr2 (2-66)||(22284278-22284343)
chr2 (2-65)||(15633538-15633602)
chr2 (340-402)||(17396887-17396948)
chr2 (291-373)||(19669279-19669362)
chr2 (1-50)||(19660217-19660266)
chr2 (292-352)||(9636761-9636821)
chr2 (291-370)||(19666525-19666605)
chr2 (292-336)||(24884718-24884762)
chr2 (381-413)||(32465813-32465845)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (35-402)||(1091-1462)
scaffold0266 (35-402)||(3508-3877)
[»] scaffold0023 (2 HSPs)
scaffold0023 (35-402)||(48565-48935)
scaffold0023 (142-398)||(36065-36323)
[»] scaffold0077 (2 HSPs)
scaffold0077 (34-402)||(36836-37209)
scaffold0077 (2-46)||(15334-15378)
[»] scaffold0195 (2 HSPs)
scaffold0195 (43-402)||(19173-19537)
scaffold0195 (108-402)||(21257-21553)
[»] chr6 (23 HSPs)
chr6 (35-413)||(23153403-23153786)
chr6 (79-395)||(14626089-14626407)
chr6 (108-402)||(35009439-35009735)
chr6 (108-399)||(1657748-1658040)
chr6 (108-399)||(15862443-15862734)
chr6 (120-395)||(1650105-1650382)
chr6 (266-399)||(27740808-27740941)
chr6 (148-402)||(25175531-25175787)
chr6 (120-402)||(27653983-27654267)
chr6 (35-103)||(23148266-23148335)
chr6 (2-66)||(19983159-19983224)
chr6 (2-66)||(35015024-35015089)
chr6 (259-413)||(18381821-18381975)
chr6 (349-402)||(16825986-16826038)
chr6 (108-191)||(27751605-27751688)
chr6 (282-388)||(22361926-22362032)
chr6 (108-305)||(29665937-29666137)
chr6 (2-66)||(18583640-18583705)
chr6 (384-413)||(32898745-32898774)
chr6 (258-413)||(21623123-21623278)
chr6 (258-322)||(25367374-25367438)
chr6 (291-370)||(33324690-33324770)
chr6 (291-370)||(35136182-35136262)
[»] chr5 (30 HSPs)
chr5 (35-402)||(23506932-23507302)
chr5 (35-413)||(27182471-27182854)
chr5 (35-394)||(18530988-18531355)
chr5 (35-398)||(22053753-22054125)
chr5 (108-273)||(20623066-20623232)
chr5 (108-273)||(21233528-21233694)
chr5 (108-270)||(37052844-37053007)
chr5 (108-273)||(16536294-16536460)
chr5 (108-399)||(34939248-34939540)
chr5 (110-273)||(25900408-25900571)
chr5 (120-402)||(22366481-22366765)
chr5 (120-402)||(25426596-25426880)
chr5 (142-402)||(18778014-18778276)
chr5 (120-402)||(12342-12626)
chr5 (428-500)||(20623007-20623079)
chr5 (428-500)||(21233681-21233753)
chr5 (120-402)||(19499867-19500151)
chr5 (120-402)||(21073595-21073879)
chr5 (142-383)||(4200007-4200251)
chr5 (328-412)||(17471803-17471887)
chr5 (142-402)||(27009809-27010071)
chr5 (120-240)||(29188284-29188404)
chr5 (142-402)||(43443417-43443679)
chr5 (428-500)||(25900558-25900630)
chr5 (428-500)||(37052782-37052854)
chr5 (322-395)||(29190479-29190552)
chr5 (428-500)||(16536235-16536307)
chr5 (258-370)||(23493916-23494029)
chr5 (258-322)||(7728466-7728530)
chr5 (2-46)||(11584394-11584438)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (35-413)||(41686-42066)
[»] scaffold0175 (1 HSPs)
scaffold0175 (35-402)||(882-1250)
[»] scaffold0008 (3 HSPs)
scaffold0008 (35-402)||(128095-128464)
scaffold0008 (142-383)||(31697-31942)
scaffold0008 (381-409)||(22650-22678)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (35-402)||(5990-6358)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (35-402)||(247366-247738)
[»] scaffold0011 (3 HSPs)
scaffold0011 (35-402)||(123087-123460)
scaffold0011 (381-413)||(255074-255106)
scaffold0011 (381-413)||(261680-261712)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (35-412)||(171863-172242)
scaffold0001 (35-412)||(177566-177945)
scaffold0001 (381-413)||(70882-70914)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (35-402)||(12083-12450)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (44-402)||(4996-5356)
[»] scaffold0025 (3 HSPs)
scaffold0025 (46-398)||(8820-9180)
scaffold0025 (76-402)||(148688-149018)
scaffold0025 (35-128)||(146844-146938)
[»] scaffold0498 (1 HSPs)
scaffold0498 (35-402)||(8846-9215)
[»] scaffold0162 (2 HSPs)
scaffold0162 (35-402)||(26340-26710)
scaffold0162 (108-395)||(8180-8466)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (35-412)||(271983-272362)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (47-240)||(51121-51314)
[»] scaffold0141 (4 HSPs)
scaffold0141 (108-273)||(26892-27058)
scaffold0141 (115-273)||(22637-22796)
scaffold0141 (428-500)||(22578-22650)
scaffold0141 (428-500)||(26833-26905)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (108-273)||(1582-1748)
scaffold0124 (428-500)||(1735-1807)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (115-402)||(48155-48443)
[»] scaffold0026 (3 HSPs)
scaffold0026 (115-402)||(107715-108003)
scaffold0026 (177-402)||(64585-64812)
scaffold0026 (123-165)||(89863-89905)
[»] scaffold0132 (2 HSPs)
scaffold0132 (108-395)||(13480-13769)
scaffold0132 (2-66)||(42677-42739)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (108-395)||(41622-41911)
[»] scaffold1542 (1 HSPs)
scaffold1542 (108-400)||(534-828)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (108-399)||(34460-34755)
[»] scaffold0028 (2 HSPs)
scaffold0028 (35-240)||(89378-89586)
scaffold0028 (35-159)||(107708-107835)
[»] scaffold0215 (2 HSPs)
scaffold0215 (142-395)||(9371-9626)
scaffold0215 (142-395)||(16269-16524)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (119-395)||(2936-3215)
[»] scaffold0622 (1 HSPs)
scaffold0622 (271-413)||(9338-9480)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (158-402)||(5254-5498)
[»] scaffold0772 (1 HSPs)
scaffold0772 (115-240)||(5660-5785)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (158-402)||(3690-3936)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (143-402)||(42965-43226)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (142-402)||(14083-14344)
scaffold0139 (142-402)||(21138-21399)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (142-402)||(3-265)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (142-240)||(13347-13445)
[»] scaffold0104 (1 HSPs)
scaffold0104 (280-402)||(48482-48603)
[»] scaffold1560 (1 HSPs)
scaffold1560 (280-402)||(26-147)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (158-370)||(54415-54630)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (2-66)||(80187-80252)
[»] scaffold1711 (1 HSPs)
scaffold1711 (120-240)||(1304-1424)
[»] scaffold0361 (2 HSPs)
scaffold0361 (315-394)||(3183-3262)
scaffold0361 (108-191)||(3370-3453)
[»] scaffold0016 (3 HSPs)
scaffold0016 (2-67)||(162045-162111)
scaffold0016 (2-67)||(166131-166197)
scaffold0016 (295-414)||(116687-116806)
[»] scaffold1404 (1 HSPs)
scaffold1404 (349-402)||(1815-1867)
[»] scaffold0686 (2 HSPs)
scaffold0686 (2-66)||(5744-5809)
scaffold0686 (2-66)||(5950-6015)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (2-66)||(31147-31212)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (2-67)||(319-385)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (258-413)||(76984-77139)
[»] scaffold0021 (1 HSPs)
scaffold0021 (376-413)||(132505-132542)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (258-393)||(197390-197525)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (292-370)||(104793-104872)
[»] scaffold0389 (1 HSPs)
scaffold0389 (291-388)||(10642-10739)
[»] scaffold0970 (1 HSPs)
scaffold0970 (291-352)||(2471-2532)
[»] scaffold0456 (2 HSPs)
scaffold0456 (124-165)||(1546-1587)
scaffold0456 (124-165)||(8691-8732)
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (384-413)||(7522-7551)
[»] scaffold0123 (2 HSPs)
scaffold0123 (124-165)||(8216-8257)
scaffold0123 (291-370)||(8007-8087)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (115-233)||(56106-56226)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (124-165)||(70307-70348)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (384-413)||(38253-38282)
[»] scaffold1164 (1 HSPs)
scaffold1164 (2-46)||(1721-1765)
[»] scaffold0876 (1 HSPs)
scaffold0876 (2-46)||(114-158)
[»] scaffold0700 (1 HSPs)
scaffold0700 (281-345)||(2548-2612)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (2-46)||(19817-19861)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 394; Significance: 0; HSPs: 42)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 394; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 500
Target Start/End: Original strand, 16744007 - 16744508
Alignment:
Q  1 taaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagg-ggttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaa 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16744007 taaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaacgaggttagtctttaccataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaa 16744106  T
Q  100 ttttgattatggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattcc 199  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  16744107 ttttgattatggatgattgttgttaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatccatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattac 16744206  T
Q  200 atgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaa-tggatgaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgat 298  Q
    || |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16744207 atttttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttatagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgat 16744306  T
Q  299 gttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggt 398  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16744307 gttgttgatgctaataaatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggt 16744406  T
Q  399 gaaatttgtgaattgaagaaatatgataagttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattggggttgattgatgatgtccatctca 498  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||  ||||||    
T  16744407 gaaatttgtgaattgaggaaatatgataagttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgatagttgatgttgatctca 16744506  T
Q  499 tt 500  Q
    ||    
T  16744507 tt 16744508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 108 - 396
Target Start/End: Original strand, 17912483 - 17912771
Alignment:
Q  108 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 207  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  17912483 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactt-gatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaa 17912581  T
Q  208 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaa-tggatgaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttga 306  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||| |||     
T  17912582 atatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaattgatgaatttgatatgttgtagttgaattgagctatgattcatgttcaatcgatgttattgt 17912681  T
Q  307 tgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttg 396  Q
    || |||| |||||||| ||||||||||||  | |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17912682 tgttaattgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatgaaaatttgaattgttgtgggtgttttg 17912771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 35 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 2050147 - 2049777
Alignment:
Q  35 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgc 133  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  2050147 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatcaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgc 2050048  T
Q  134 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaa 233  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||||||| | ||| |||||| ||||||||| | |||| || || |||||    
T  2050047 tccaactgtgacgatatgtttgtatgcctgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaacatgataacttgtgaaa 2049948  T
Q  234 attgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatga 331  Q
    |||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||| | ||||| | ||||| |||| ||||||||| | | | || |||| |||||||| ||||||||    
T  2049947 attgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgatttttgttcaattgatgctatggttgttaattgatgttgtggttgatga 2049848  T
Q  332 atcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 402  Q
    ||||| | |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2049847 atcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 2049777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 35 - 402
Target Start/End: Original strand, 14842487 - 14842856
Alignment:
Q  35 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgc 133  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  14842487 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcttcactttgcaaattctcaaatgttgtatgaattgtgattatggataattgttgctaaattcgtgc 14842586  T
Q  134 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaa 233  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| |||| |||| |||||| |||||||||||    
T  14842587 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgaagataattgtatgattgttggtgaaattgcatgttcaaatgtgtaaaaatgataagttatgaaa 14842686  T
Q  234 attgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatga 331  Q
    |||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | |||| |||| |||||| |  |||||||    
T  14842687 attgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaattgatgttatgattgatga 14842786  T
Q  332 atcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 402  Q
    || || | |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14842787 ataattgattgggtttgcatattcatggattgatgatgaaaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 14842856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 35 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 13839232 - 13838852
Alignment:
Q  35 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaa-ttttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtg 132  Q
    |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||    
T  13839232 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcattttgtgaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatgaataattgttgctaaattcgtg 13839133  T
Q  133 ctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaa 232  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| | ||| |||||| ||||| | | |||||| ||||| ||||    
T  13839132 ctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgatggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaa 13839033  T
Q  233 aattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatg 330  Q
    ||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| |||| |||||| |||||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||||| |||||||    
T  13839032 aattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatg 13838933  T
Q  331 aatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaatt 412  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||  ||| || ||| ||  || ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||    
T  13838932 aatcattgtttgggtatgcatattcatgatttgttgttgagaa-atggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaatt 13838852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 35 - 402
Target Start/End: Original strand, 12030073 - 12030443
Alignment:
Q  35 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgc 133  Q
    |||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  12030073 taaggtaagggggttaatcattatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgacttttgcttatggataattgttgctaaattcgtgc 12030172  T
Q  134 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaa 233  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| | ||| |||||| ||||||||| || ||| ||||| |||||    
T  12030173 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaagtgataagttgtgaaa 12030272  T
Q  234 attgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatga 331  Q
     ||||||  ||| | |||| ||||  | ||| | ||| | ||||  | |||||||||| ||||||||| | | | || |||| |||||| | ||||||||    
T  12030273 gttgtgctcaattggtgaattttgctaagttattgttaatttgatatttgattcttgttcaattgatgctatggttgttaattgatgttatggttgatga 12030372  T
Q  332 atcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 402  Q
    ||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12030373 atcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 12030443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 82 - 413
Target Start/End: Original strand, 15858996 - 15859331
Alignment:
Q  82 tttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgt 179  Q
    |||||| |||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  15858996 tttcaattgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgt 15859095  T
Q  180 atgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagc 277  Q
    |||||||||||| | ||| |||||| ||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| |||||||||||     
T  15859096 atgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagt 15859195  T
Q  278 tatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttg 377  Q
    |||||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  15859196 tatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatgagaatttg 15859295  T
Q  378 aattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 413  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||    
T  15859296 aattgttgttgttgttttggtgaaaatggtgaattg 15859331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 98 - 413
Target Start/End: Original strand, 51158008 - 51158325
Alignment:
Q  98 aattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagatt 197  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | |||    
T  51158008 aattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatt 51158107  T
Q  198 ccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaatt 295  Q
     |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| |||  |||||| |||||||||||| |||||    
T  51158108 acatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaatt 51158207  T
Q  296 gatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgtt-ggtgttt 394  Q
    |||||| | | || |||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||| ||||  |||||||  |||||||  ||||||    
T  51158208 gatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatgttaatttgagatgttgttaagtgttt 51158307  T
Q  395 tggtgaaatttgtgaattg 413  Q
    || | ||||||||||||||    
T  51158308 tgct-aaatttgtgaattg 51158325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 108 - 273
Target Start/End: Original strand, 2449238 - 2449404
Alignment:
Q  108 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 207  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |    
T  2449238 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 2449337  T
Q  208 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 273  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2449338 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 2449404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 115 - 402
Target Start/End: Original strand, 15936634 - 15936922
Alignment:
Q  115 attgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgta 214  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| |||| ||||    
T  15936634 attgttactaaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgta 15936733  T
Q  215 gaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaa 312  Q
     |||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||| | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | |||| |||    
T  15936734 aaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgataagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaa 15936833  T
Q  313 tagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 402  Q
    | ||||||||  ||||||||| || |  || |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15936834 ttgatgttgtgattgatgaataattgcctgagtatgcatattcatggattgatgatgagaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 15936922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 115 - 402
Target Start/End: Original strand, 15938476 - 15938764
Alignment:
Q  115 attgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgta 214  Q
    |||||| ||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| |||| ||||    
T  15938476 attgttactaaatacgtgctccaactgtaatgatatgtttgtaatcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgta 15938575  T
Q  215 gaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaa 312  Q
     |||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||| | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | |||| |||    
T  15938576 aaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgataagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaa 15938675  T
Q  313 tagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 402  Q
    | ||||||||  ||||||||| || |  || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15938676 ttgatgttgtgattgatgaataattgcctgagtatgcatattcatggattgatgctgaaaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 15938764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 2 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 19232154 - 19231982
Alignment:
Q  2 aaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaa-ttttcaaatgttgtatgaa 99  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19232154 aaagtgaagttagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcttaatcatcatcattttgtgaaattttcaaatgttgtatgaa 19232055  T
Q  100 ttttg--attatggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgat 170  Q
    ||||   || |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  19232054 tttttgcataatggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttatattcatgaattgat 19231982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 120 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 15615085 - 15614808
Alignment:
Q  120 tgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 219  Q
    ||||| ||||||||||  ||| || || ||| ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| | ||| |||||| ||||||||| ||||    
T  15615085 tgctagatttgtgctcttactgtggtgttatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaggattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 15614986  T
Q  220 gagaagttatgaaaattgtgca-aatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagat 317  Q
    || ||||| |||| || ||||  ||| | |||||||  | | ||| | ||| | ||| | | |||||||||  ||||||||||| | | || |||| |||    
T  15614985 gataagttgtgaatatggtgctcaattggtgaattttgctaagttattgttaatttgggatttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattgat 15614886  T
Q  318 gttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgtttt 395  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15614885 gttgtagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgattatgagaatttgaattgttgttggtgtttt 15614808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 35 - 154
Target Start/End: Original strand, 19260749 - 19260869
Alignment:
Q  35 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgc 133  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  19260749 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaagttttcaaatgttgtatgaattttttttatggataattgttgctaaattcgtgc 19260848  T
Q  134 tccaactttgatgatatgttt 154  Q
    || || | |||||||||||||    
T  19260849 tctaattatgatgatatgttt 19260869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 328 - 489
Target Start/End: Original strand, 15468555 - 15468717
Alignment:
Q  328 atgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtg-aattgaagaaatatgata 426  Q
    ||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||| |    
T  15468555 atgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatgagaatttgaattgttgttgttgttttggtgaaatttgtgaaattggtgaattatgaca 15468654  T
Q  427 agttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattggggttgattgatgatg 489  Q
     ||||||||||||  |||||||| |||||||| ||| ||| || ||| |||| |||| |||||    
T  15468655 tgttgttgttgaaacatgatggaatgtatgatcataagttgtggttgtggttaattgttgatg 15468717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 108 - 240
Target Start/End: Original strand, 13975722 - 13975853
Alignment:
Q  108 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 207  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | || | |||||||||||||||   ||| |||||||||    
T  13975722 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtt-gtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtggaattacatgtttaa 13975820  T
Q  208 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 240  Q
    ||| ||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  13975821 ataagtaaaaatgataagttatgaatattgtgc 13975853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 108 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 45861068 - 45860937
Alignment:
Q  108 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 207  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | || | |||||||||||||||   ||| |||||||||    
T  45861068 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtt-gtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtggaattacatgtttaa 45860970  T
Q  208 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 240  Q
    ||| ||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  45860969 ataagtaaaaatgataagttatgaatattgtgc 45860937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 108 - 402
Target Start/End: Original strand, 13954890 - 13955185
Alignment:
Q  108 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 207  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | || | |||||||||||||||   ||| |||||||||    
T  13954890 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatg-ttgtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtggaattacatgtttaa 13954988  T
Q  208 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgtt 304  Q
    ||| ||| ||||||  ||||||||| |||||||  ||| |||||||||  |  | |||||  || | ||||| | |||| ||||| ||| ||||||| |     
T  13954989 ataagtaaaaatgatcagttatgaatattgtgctcaattgatgaatttctcctaagttgtcattaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatg 13955088  T
Q  305 gatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 402  Q
     ||| || | |||  | |  || |||||| || | |||||| | ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  13955089 aatgttatttgataatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgttgatgataatttgagttg-tgttggtgttttggtgaaa 13955185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 328 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 22275250 - 22275088
Alignment:
Q  328 atgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtg-aattgaagaaatatgata 426  Q
    ||||||||| | || ||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||| ||||| |    
T  22275250 atgaatcattgcttaggtatgcatattcatgaattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaaattagtgaattatgaca 22275151  T
Q  427 agttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattggggttgattgatgatg 489  Q
     ||||||||||||  |||||||| || ||||| ||| ||| || ||| |||| |||| |||||    
T  22275150 tgttgttgttgaaacatgatggaatgcatgatcataagttgtggttgtggttaattgttgatg 22275088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 260 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 47984759 - 47984624
Alignment:
Q  260 gttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatgg 359  Q
    ||||| |||| |||||| | |||||| ||| ||||||||||| ||| || |||| |||||||| |||||||||||||   |||||||| ||||||||||     
T  47984759 gttgttgttggattgagatgtgattcatgttcaattgatgtttttgttgttaattgatgttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatattcatga 47984660  T
Q  360 attgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgtttt 395  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||    
T  47984659 attgatgatgagaatttgaattgttgctgatgtttt 47984624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 260 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 48003333 - 48003198
Alignment:
Q  260 gttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatgg 359  Q
    ||||| |||| |||||| | |||||| ||| ||||||||||| ||| || |||| |||||||| |||||||||||||   |||||||| ||||||||||     
T  48003333 gttgttgttggattgagatgtgattcatgttcaattgatgtttttgttgttaattgatgttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatattcatga 48003234  T
Q  360 attgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgtttt 395  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||    
T  48003233 attgatgatgagaatttgaattgttgctgatgtttt 48003198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 260 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 47994046 - 47993911
Alignment:
Q  260 gttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatgg 359  Q
    ||||| |||| |||||| | |||||| ||| ||||||||||| ||| || |||| ||| |||| |||||||||||||   |||||||| ||||||||||     
T  47994046 gttgttgttggattgagatgtgattcatgttcaattgatgtttttgttgttaattgattttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatattcatga 47993947  T
Q  360 attgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgtttt 395  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||    
T  47993946 attgatgatgagaatttgaattgttgctgatgtttt 47993911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 260 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 48012619 - 48012484
Alignment:
Q  260 gttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatgg 359  Q
    ||||| |||| |||||| | |||||| ||| ||||||||||| ||| || |||| ||| |||| |||||||||||||   |||||||| ||||||||||     
T  48012619 gttgttgttggattgagatgtgattcatgttcaattgatgtttttgttgttaattgattttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatattcatga 48012520  T
Q  360 attgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgtttt 395  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||    
T  48012519 attgatgatgagaatttgaattgttgctgatgtttt 48012484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 428 - 500
Target Start/End: Original strand, 2449391 - 2449463
Alignment:
Q  428 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattggggttgattgatgatgtccatctcatt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  ||||||||    
T  2449391 gttgttgttgaattatgatggagggtatgattatatgttatgattgtagttgattgatgatgttgatctcatt 2449463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 142 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 16821369 - 16821099
Alignment:
Q  142 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc- 240  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||  ||| |||||  |||||||     
T  16821369 tgatgttatgtttgtatgcataaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagctatgagtattgtgct 16821270  T
Q  241 aaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcg 338  Q
    |||| | |||||||  |  | ||||| ||||| ||||| | |||||| ||| ||||||||||| |  ||| || | ||| || |  ||||||||| || |    
T  16821269 aaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattg 16821170  T
Q  339 tttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaa 410  Q
     |||||| | |||||||||||||| ||||||| ||  | ||| |||||||||| ||| |||||||| |||||    
T  16821169 cttgggtttgcatattcatggattaatgatgataa-ataaatggttgttggtggttttgtgaaattggtgaa 16821099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 120 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 55316471 - 55316187
Alignment:
Q  120 tgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 219  Q
    ||||||||| ||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| | ||| |||||| | ||||| | ||||    
T  55316471 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 55316372  T
Q  220 gagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 316  Q
    || |||||||||| |||||||  ||| | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||| ||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||    
T  55316371 gataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 55316272  T
Q  317 tgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 402  Q
    |  | |  || |||||| || | |||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  55316271 taatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatgagaatttgagttg-tgttggtgttttggtgaaa 55316187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 120 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 41270327 - 41270043
Alignment:
Q  120 tgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 219  Q
    ||||||||| ||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||   ||| |||||| | ||||| | ||||    
T  41270327 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtggaattacatgttcatatatgcaaaaat 41270228  T
Q  220 gagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 316  Q
    || |||||||||| |||||||  ||| | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||| ||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||    
T  41270227 gataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 41270128  T
Q  317 tgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 402  Q
    |  | |  || |||||| || | |||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  41270127 taatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatgagaatttgagttg-tgttggtgttttggtgaaa 41270043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 2 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 3992938 - 3992873
Alignment:
Q  2 aaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 66  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  3992938 aaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 3992873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 69
Target Start/End: Original strand, 15857129 - 15857198
Alignment:
Q  1 taaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcatcat 69  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||    
T  15857129 taaagtgaagctagagctaatacttggagataattaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcat 15857198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 2 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 55513258 - 55513193
Alignment:
Q  2 aaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 66  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  55513258 aaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 55513193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 2844579 - 2844514
Alignment:
Q  2 aaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 66  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  2844579 aaagtgaagctagagctaatagtttgagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 2844514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 350 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 19231997 - 19231945
Alignment:
Q  350 atattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 402  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19231997 atattcatgaattgatgatgataatttggattgttgttggtgttttggtgaaa 19231945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 66
Target Start/End: Original strand, 17955861 - 17955916
Alignment:
Q  12 tagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 66  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  17955861 tagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 17955916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 45582016 - 45581954
Alignment:
Q  6 tgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa--ggggttagtctttaccataatcat 66  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||    
T  45582016 tgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaaggggggttagtttttatcataatcat 45581954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 66
Target Start/End: Original strand, 54037991 - 54038056
Alignment:
Q  2 aaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 66  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  54037991 aaagtgaagcttgagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 54038056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 328 - 402
Target Start/End: Original strand, 13975944 - 13976017
Alignment:
Q  328 atgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 402  Q
    |||||| || | |||||| | ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  13975944 atgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgttgatgataatttgagttg-tgttggtgttttggtgaaa 13976017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 340 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 45860834 - 45860773
Alignment:
Q  340 ttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 402  Q
    |||||| | ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  45860834 ttgggtttgcatattcatggattgttgatgagaatttgagttg-tgttggtgttttggtgaaa 45860773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 2 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 7854370 - 7854305
Alignment:
Q  2 aaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 66  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||    
T  7854370 aaagtgaagcttgagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcat 7854305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 124 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 14080756 - 14080715
Alignment:
Q  124 aaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa 165  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14080756 aaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa 14080715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 381 - 413
Target Start/End: Original strand, 22144532 - 22144564
Alignment:
Q  381 tgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 413  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22144532 tgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 22144564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 252 - 370
Target Start/End: Original strand, 12264932 - 12265050
Alignment:
Q  252 tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacat 351  Q
    ||||| ||||||| |||||| |||| | |||||| ||| | ||||||||||||| |  |||  |||||||| || | ||||| ||   ||||||||||||    
T  12264932 tttgatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccattgatgttgttgctattaactgatgttgttgtgggtgaattatgacttgggtatacat 12265031  T
Q  352 attcatggattgatgatga 370  Q
    | | |||||||||||||||    
T  12265032 aattatggattgatgatga 12265050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 409 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 18970048 - 18969968
Alignment:
Q  409 aattgaagaaatatgataagttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattggggttgattgatgatg 489  Q
    |||||| ||| ||||| | |||||||||||||| |||||||  | ||||||||| ||| || ||| ||||||||| |||||    
T  18970048 aattgatgaattatgacatgttgttgttgaattctgatggaaagcatgattataagttgtggttgtggttgattgttgatg 18969968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 322; Significance: 0; HSPs: 32)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 108 - 500
Target Start/End: Original strand, 22907214 - 22907607
Alignment:
Q  108 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 207  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  22907214 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 22907313  T
Q  208 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaa-tggatgaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttga 306  Q
    ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22907314 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttga 22907413  T
Q  307 tgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttg 406  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22907414 tgctaatagatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttg 22907513  T
Q  407 tgaattgaagaaatatgataagttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattggggttgattgatgatgtccatctcatt 500  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||    
T  22907514 tgaattgatgaaatatgataagttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgattgttgatgttgatctcatt 22907607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 35 - 395
Target Start/End: Original strand, 16193643 - 16194005
Alignment:
Q  35 taaggtaaggggttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgct 134  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16193643 taaggtaaggggttagtctttatcataatcatcatcatttggtaaattttcaaatattgtatgaattttgcttatggatgattgttgctaaattcgtgct 16193742  T
Q  135 ccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaa 234  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||    
T  16193743 ccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggggaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaa 16193842  T
Q  235 ttgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaa 332  Q
    ||||||  ||| | |||| |||| ||  |||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||||| |||||||||    
T  16193843 ttgtgctcaattggtgaattttgccaaattgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaa 16193942  T
Q  333 tcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgtttt 395  Q
    |||| | |||||||| |||||||||| ||||| ||||  |||||||  |||||||||||||||    
T  16193943 tcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatgttaatttgagatgttgttggtgtttt 16194005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 2 - 402
Target Start/End: Original strand, 16404867 - 16405268
Alignment:
Q  2 aaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaat 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||    
T  16404867 aaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcattattt-gtaaattttcaaatgttgtatgaat 16404965  T
Q  101 tttg--attatggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattc 198  Q
    |||   || |||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | |||     
T  16404966 ttttgcatgatggataattattgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatta 16405065  T
Q  199 catgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattg 296  Q
    |||||| ||||| | | |||||  ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | |||   ||| ||||||  |||||||||||| ||||||    
T  16405066 catgttcaaataggaacaaatgttaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagtt---gttaaattgacatatgattcttgttcaattg 16405162  T
Q  297 atgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttg 396  Q
    ||||| ||| || |||| |||||| ||||||||||||||  | |||||||| || ||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  16405163 atgttattgttgttaattgatgttttagttgatgaatcactgcttgggtatgcaaattcatgaattgatgatgataatttgagatgttgttggtgttttg 16405262  T
Q  397 gtgaaa 402  Q
     |||||    
T  16405263 atgaaa 16405268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 35 - 402
Target Start/End: Original strand, 43373392 - 43373761
Alignment:
Q  35 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaatttgt 131  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   || |||||| |||  ||||||||| ||    
T  43373392 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaatttttgtataatggataattaatgctaaattcgt 43373491  T
Q  132 gctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatga 231  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| |||    
T  43373492 gctccaactgtgatgatacgtttgtatgcatgaattgatgataattatatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtga 43373591  T
Q  232 aaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgat 329  Q
    |||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||| | | | || |||| |||||||| ||||||    
T  43373592 aaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgctatggttgttaattgatgttgtggttgat 43373691  T
Q  330 gaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 402  Q
    |||| || | |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  43373692 gaataattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatgagaatttgaa---ttgttggtgttttggtgaaa 43373761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 35 - 412
Target Start/End: Original strand, 24928716 - 24929096
Alignment:
Q  35 taaggtaa-ggggttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaa-ttttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtg 132  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  24928716 taaggtaatggggttagtctttatcataatcatcgtcattttgtgaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggataattgttgctaaattcgtg 24928815  T
Q  133 ctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaa 232  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||| | | |||||| ||||| ||||    
T  24928816 ctccaactgtgattatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaa 24928915  T
Q  233 aattgtgc-aaatggatgaattt-gacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatg 330  Q
    ||||||||  ||| | ||||||| |  | ||||| |||| |||||| ||||  |||||| ||||||| ||| | | || |||| ||||||||  ||||||    
T  24928916 aattgtgctcaattggtgaatttcgctaagttgtggttggattgagttatgtctcttgttcaattgaggttatggttgttaattgatgttgtgattgatg 24929015  T
Q  331 aatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaatt 412  Q
    |||||| | |||||||| ||||||||||  ||| || ||| ||  || ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||    
T  24929016 aatcattgcttgggtatgcatattcatgatttgttgttgagaa-atggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaatt 24929096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 108 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 5238350 - 5238184
Alignment:
Q  108 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 207  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  5238350 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 5238251  T
Q  208 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 273  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5238250 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 5238184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 108 - 273
Target Start/End: Original strand, 24661248 - 24661414
Alignment:
Q  108 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 207  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  24661248 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 24661347  T
Q  208 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 273  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24661348 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 24661414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 108 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 43685809 - 43685643
Alignment:
Q  108 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 207  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  43685809 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 43685710  T
Q  208 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 273  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43685709 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 43685643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 108 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 17345832 - 17345540
Alignment:
Q  108 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 207  Q
    |||||| |||||||| ||||| |||||| |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||  |||||| ||    
T  17345832 atggataattgttgcgaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttatatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaa 17345733  T
Q  208 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgca-aatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttg 305  Q
     |||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||| |||| ||||  | | ||| | || |||||||| |||||||||||| || ||||| || |||    
T  17345732 ttatgtaaaaatgtgaagttatgaaaattgtgctcaattgatggattttgctaagttattgt-gaattgagttatgattcttgttcagttgatattattg 17345634  T
Q  306 atgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtg 399  Q
     || |||| |||||||| ||||||||||||  | |||||||| |||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17345633 ttgttaattgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatgaataggtgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtg 17345540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 120 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 24549233 - 24548956
Alignment:
Q  120 tgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 219  Q
    ||||| ||| ||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| ||||    
T  24549233 tgctagattcgtgctcttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 24549134  T
Q  220 gagaagttatgaaaattgtgca-aatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagat 317  Q
    || ||||| ||||||| ||||  ||| | |||||||  | | ||| | ||| | ||| | | |||||||||  ||||||||||| | | || |||| |||    
T  24549133 gataagttgtgaaaatggtgctcaattggtgaattttgctaagttattgttaatttgggatttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattgat 24549034  T
Q  318 gttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgtttt 395  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24549033 gttgtagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgattatgagaatttgaattgttgttggtgtttt 24548956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 120 - 395
Target Start/End: Original strand, 6774258 - 6774535
Alignment:
Q  120 tgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 219  Q
    ||||| ||| ||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| ||||    
T  6774258 tgctagattcgtgctcttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 6774357  T
Q  220 gagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagat 317  Q
    || ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||| | ||| | ||||| | |||||||||  ||||||||||| ||| || || | |||    
T  6774358 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttattgttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttattgttgttatttgat 6774457  T
Q  318 gttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgtttt 395  Q
    ||||| ||||||||||||  | |||||||| |||||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  6774458 gttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatgaattgattatgagaatttgatttgttgttggtgtttt 6774535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 142 - 402
Target Start/End: Original strand, 21844594 - 21844856
Alignment:
Q  142 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc- 240  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||     
T  21844594 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaatattgtgct 21844693  T
Q  241 aaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcg 338  Q
     ||| | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | ||||| |||| ||| ||||||| |  ||| || | ||| || |  ||||||||| || |    
T  21844694 caattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatttttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattg 21844793  T
Q  339 tttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 402  Q
     |||||| | ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21844794 cttgggtttgcatattcattgattgttgatgagaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 21844856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 142 - 402
Target Start/End: Original strand, 21851987 - 21852249
Alignment:
Q  142 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc- 240  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||     
T  21851987 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattaaatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaatattgtgct 21852086  T
Q  241 aaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcg 338  Q
     ||| | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||| || |  ||||||||| || |    
T  21852087 caattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattg 21852186  T
Q  339 tttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 402  Q
     |||||| | ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21852187 cttgggtttgcatattcattgattgttgatgagaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 21852249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 428 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 5238197 - 5238125
Alignment:
Q  428 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattggggttgattgatgatgtccatctcatt 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||    
T  5238197 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgattgatgatgttgatctcatt 5238125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 428 - 500
Target Start/End: Original strand, 24661401 - 24661473
Alignment:
Q  428 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattggggttgattgatgatgtccatctcatt 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||    
T  24661401 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgattgatgatgttgatctcatt 24661473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 120 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 30120974 - 30120690
Alignment:
Q  120 tgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 219  Q
    ||||||||| ||||||   || ||||| |||||||||||||||||||| ||  ||  ||||||||||||||| | ||| |||||| | ||||| | ||||    
T  30120974 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaatttatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 30120875  T
Q  220 gagaagttatgaaaattgtgca-aatggatgaatttgacat--gttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 316  Q
    || |||||||||| |||||||  ||| | |||||||  | |  ||||| ||| | ||||| | |||||| ||| ||||||||||| |  ||| || | ||    
T  30120874 gataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttga 30120775  T
Q  317 tgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 402  Q
    | || |  ||||||||| || | |||||| | ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30120774 tattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatcgattgatgatgataatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 30120690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 428 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 43685656 - 43685584
Alignment:
Q  428 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattggggttgattgatgatgtccatctcatt 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||    
T  43685656 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgattgttgatgttgatctcatt 43685584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 183 - 402
Target Start/End: Original strand, 222754 - 222975
Alignment:
Q  183 attgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacat--gttgtagttgaattgagcta 279  Q
    ||||||||| | ||| |||||| | ||||| | |||||| |||||||||| ||||||| |||| | |||||||  | |  ||||| ||| | ||||| |     
T  222754 attgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttg 222853  T
Q  280 tgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaa 379  Q
    |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||| || |  ||||||||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||     
T  222854 tgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatgagaatttgag 222953  T
Q  380 ttgttgttggtgttttggtgaaa 402  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  222954 ttg-tgttggtgttttggtgaaa 222975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 183 - 402
Target Start/End: Original strand, 736377 - 736598
Alignment:
Q  183 attgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacat--gttgtagttgaattgagcta 279  Q
    ||||||||| | ||| |||||| | ||||| | |||||| |||||||||| ||||||| |||| | |||||||  | |  ||||| ||| | ||||| |     
T  736377 attgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttg 736476  T
Q  280 tgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaa 379  Q
    |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||| || |  ||||||||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||     
T  736477 tgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatgagaatttgag 736576  T
Q  380 ttgttgttggtgttttggtgaaa 402  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  736577 ttg-tgttggtgttttggtgaaa 736598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 183 - 402
Target Start/End: Original strand, 860272 - 860493
Alignment:
Q  183 attgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacat--gttgtagttgaattgagcta 279  Q
    ||||||||| | ||| |||||| | ||||| | |||||| |||||||||| ||||||| |||| | |||||||  | |  ||||| ||| | ||||| |     
T  860272 attgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttg 860371  T
Q  280 tgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaa 379  Q
    |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||| || |  ||||||||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||     
T  860372 tgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatgagaatttgag 860471  T
Q  380 ttgttgttggtgttttggtgaaa 402  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  860472 ttg-tgttggtgttttggtgaaa 860493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 2 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 274831 - 274766
Alignment:
Q  2 aaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 66  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  274831 aaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 274766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 2 - 66
Target Start/End: Original strand, 641018 - 641083
Alignment:
Q  2 aaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 66  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  641018 aaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 641083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 2 - 66
Target Start/End: Original strand, 826824 - 826889
Alignment:
Q  2 aaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 66  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  826824 aaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 826889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 2 - 66
Target Start/End: Original strand, 24716729 - 24716794
Alignment:
Q  2 aaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 66  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  24716729 aaagtgaagctagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 24716794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 258 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 23837308 - 23837154
Alignment:
Q  258 atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacat-attca 356  Q
    ||||||| ||||||||| | || || || ||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||| |||||||| |||| | |||||||| ||| |||||    
T  23837308 atgttgttgttgaattgtggtaagagtcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgttgatgattcatggcttgggtattcataattca 23837209  T
Q  357 tggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaatt 412  Q
    ||  ||| |||||| ||  ||| |||||| ||||| ||| |||||||| |||||||    
T  23837208 tgatttgttgatgagaa-atgagttgttggtggtggttttgtgaaattggtgaatt 23837154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 120 - 240
Target Start/End: Original strand, 16674392 - 16674512
Alignment:
Q  120 tgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 219  Q
    ||||||||| ||||||   || ||||| ||||||| |||||||||||| ||  ||  ||||||||||||||| | ||| |||||| | ||||| | ||||    
T  16674392 tgctaaattcgtgctctttctgtgatgttatgtttttatgcatgaatttatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 16674491  T
Q  220 gagaagttatgaaaattgtgc 240  Q
    || |||||||||| |||||||    
T  16674492 gataagttatgaatattgtgc 16674512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 329 - 410
Target Start/End: Original strand, 13662481 - 13662561
Alignment:
Q  329 tgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaa 410  Q
    ||||||||  |||||||||||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| ||| |||||||| |||||    
T  13662481 tgaatcatgatttgggtatacataattatggattgatgatgagaa-ctaaattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaa 13662561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 349 - 398
Target Start/End: Original strand, 16674624 - 16674672
Alignment:
Q  349 catattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggt 398  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  16674624 catattcatggattgatgatgagaatttgagttg-tgttggtgttttggt 16674672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 124 - 165
Target Start/End: Original strand, 23226076 - 23226117
Alignment:
Q  124 aaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa 165  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23226076 aaatttgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa 23226117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 376 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 41246650 - 41246613
Alignment:
Q  376 tgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 413  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41246650 tgaaatgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 41246613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 432 - 489
Target Start/End: Original strand, 22321597 - 22321654
Alignment:
Q  432 ttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattggggttgattgatgatg 489  Q
    ||||| |||| ||||||| || ||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||    
T  22321597 ttgttaaattgtgatggaatgcatgattatatgttgtgattgtggttgattgttgatg 22321654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 39115663 - 39115598
Alignment:
Q  2 aaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaaggg-gttagtctttaccataatcat 66  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||| |||||| || | |||||||||    
T  39115663 aaagtgaagcttgagctaatagttggtaataattaaggtaagggtgttagttttcatcataatcat 39115598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 314; Significance: 1e-177; HSPs: 28)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 108 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 26680463 - 26680070
Alignment:
Q  108 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 207  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  26680463 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 26680364  T
Q  208 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaa-tggatgaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttga 306  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26680363 atatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatagatgaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttga 26680264  T
Q  307 tgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttg 406  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26680263 tgctaatagatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttg 26680164  T
Q  407 tgaattgaagaaatatgataagttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattggggttgattgatgatgtccatctcatt 500  Q
     |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||    
T  26680163 ggaatcgatgaaatatgataagttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgattgttgatgttgatctcatt 26680070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 2 - 413
Target Start/End: Original strand, 54118135 - 54118551
Alignment:
Q  2 aaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaat 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54118135 aaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcattattttgtgaattttcaaatgttgtatgaat 54118234  T
Q  101 tttg--attatggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattc 198  Q
    |||   || |||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | |||     
T  54118235 ttttgcataatggataattgttgctaaattcgtgctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatta 54118334  T
Q  199 catgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattg 296  Q
    |||||| ||||| | | || ||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| |||  ||| || |||||||||||| ||||||    
T  54118335 catgttcaaataggaacaattgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagatttagttatgattcttgttcaattg 54118434  T
Q  297 atgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttg 396  Q
    ||||| | | || |||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  54118435 atgttatagttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttg 54118534  T
Q  397 gtgaaatttgtgaattg 413  Q
    |||||| | ||||||||    
T  54118535 gtgaaaatggtgaattg 54118551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 35 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 13246769 - 13246386
Alignment:
Q  35 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaatttgt 131  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||| |||||| ||    
T  13246769 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgttaaattcgt 13246670  T
Q  132 gctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatga 231  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||| | | |||||| ||||| |||    
T  13246669 gctacaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattaatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtga 13246570  T
Q  232 aaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgat 329  Q
    |||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| |||  |||||| |||||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||||| ||||||    
T  13246569 aaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgat 13246470  T
Q  330 gaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 413  Q
    ||||||| | |||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13246469 gaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 13246386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 35 - 398
Target Start/End: Original strand, 15675009 - 15675381
Alignment:
Q  35 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcat----tttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgatta--tggatgattgttgctaaat 127  Q
    |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||    ||||  | ||||||||||| |||||||||||   ||  ||||| |||||||||||||    
T  15675009 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcatcatttttgcaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgttgctaaat 15675108  T
Q  128 ttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagtt 227  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| || |||||| ||||| ||||||    
T  15675109 tcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagtt 15675208  T
Q  228 atgaaaattgtgca-aatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagt 325  Q
     ||||||||||||  ||| | |||||||  | | ||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||| || |||| |||||||| ||    
T  15675209 gtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttgttgt 15675308  T
Q  326 tgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggt 398  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15675309 tgatgaatcattgcttgggtatacatattcatgaattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggt 15675381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 35 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 122226 - 122020
Alignment:
Q  35 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgc 133  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  122226 taaggtaaggggattagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaatttgtgc 122127  T
Q  134 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaa 233  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  122126 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaa 122027  T
Q  234 attgtgc 240  Q
    |||||||    
T  122026 attgtgc 122020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 135 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 31115865 - 31115603
Alignment:
Q  135 ccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaa 234  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| ||||||  | |||||| ||||| |||||| ||||||    
T  31115865 ccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttccattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaa 31115766  T
Q  235 ttgtgca-aatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaa 332  Q
    || |||  ||| | |||||||  | | ||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||| || |||| |||||||| |||||||||    
T  31115765 ttatgctcaattggtgaattttcctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttgttgttgatgaa 31115666  T
Q  333 tcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgtttt 395  Q
    |||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31115665 tcattgcttgggtatacatattcatgaattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgtttt 31115603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 108 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 10488825 - 10488659
Alignment:
Q  108 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 207  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |    
T  10488825 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 10488726  T
Q  208 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 273  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10488725 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 10488659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 108 - 273
Target Start/End: Original strand, 16327926 - 16328092
Alignment:
Q  108 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 207  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |    
T  16327926 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 16328025  T
Q  208 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 273  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16328026 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 16328092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 35 - 398
Target Start/End: Original strand, 10104170 - 10104523
Alignment:
Q  35 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcat----tttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgatta--tggatgattgttgctaaat 127  Q
    |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||    |||   | ||||||||||| |||||||||||   ||  ||||| |||||||||||||    
T  10104170 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcatcatttttacaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgttgctaaat 10104269  T
Q  128 ttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagtt 227  Q
      ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| || |||||| ||||| ||||||    
T  10104270 ccgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagtt 10104369  T
Q  228 atgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagt 325  Q
     ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||                   ||    
T  10104370 gtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttgtt-------------------gt 10104450  T
Q  326 tgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggt 398  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10104451 tgatgaatcattgcttgggtatacatattcatgaattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggt 10104523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 142 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 10644449 - 10644187
Alignment:
Q  142 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc- 240  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || | ||| |||||| ||||||||| |||||  |||||||||  |||||||     
T  10644449 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgct 10644350  T
Q  241 aaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcg 338  Q
    |||| | |||||||  |  | ||||| ||||| ||||| | |||||| ||| ||||||||||| |  ||| || | ||| || |  ||||||||| || |    
T  10644349 aaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattg 10644250  T
Q  339 tttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 402  Q
     |||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10644249 cttgggtttgcatattcatggattgatgatgagaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 10644187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 108 - 240
Target Start/End: Original strand, 13048221 - 13048353
Alignment:
Q  108 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 207  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  13048221 atggataattgttgctaaattcatgctccaacttcaatgatatgtttgtatgcatgatttgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaa 13048320  T
Q  208 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 240  Q
    ||||||| ||| || |||||||||| |||||||    
T  13048321 atatgtaaaaaggataagttatgaatattgtgc 13048353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 271 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 111493 - 111362
Alignment:
Q  271 attgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatga 370  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||| |||||    
T  111493 attgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatga 111394  T
Q  371 aaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 402  Q
     |||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  111393 taatttgagatgttgttggtgttttgatgaaa 111362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 35 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 33241043 - 33240901
Alignment:
Q  35 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcat----tttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgatta--tggatgattgttgctaaat 127  Q
    |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||    ||||  | ||||||||||| |||||||||||   ||  ||||| |||||||||||||    
T  33241043 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcatcatttttgcaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgttgctaaat 33240944  T
Q  128 ttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgat 170  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33240943 tcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgat 33240901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 120 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 47357906 - 47357622
Alignment:
Q  120 tgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 219  Q
    ||||||||| ||||||   || ||||| |||||||||||||||| ||||||  ||  ||||| ||||||||| | ||| |||||| | ||||| | ||||    
T  47357906 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatggattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 47357807  T
Q  220 gagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacat--gttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 316  Q
    || |||||||||| ||||||| |||| | |||||||  | |  ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||    
T  47357806 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 47357707  T
Q  317 tgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 402  Q
    | || |  ||||||||| || | ||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||    
T  47357706 tattatgattgatgaataattgattgggtatgtatattcatggattgatgatgagaatttgagctg-tgttggtgttttggtgaaa 47357622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 428 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 10488672 - 10488600
Alignment:
Q  428 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattggggttgattgatgatgtccatctcatt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  ||||||||    
T  10488672 gttgttgttgaattatgatggagggtatgattatatgttatgattgtagttgattgatgatgttgatctcatt 10488600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 2 - 66
Target Start/End: Original strand, 25119074 - 25119139
Alignment:
Q  2 aaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaaggg-gttagtctttaccataatcat 66  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||    
T  25119074 aaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggagttagtttttatcataatcat 25119139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 428 - 484
Target Start/End: Original strand, 16328079 - 16328135
Alignment:
Q  428 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattggggttgattga 484  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  16328079 gttgttgttgaattatgatggagggtatgattatatgttatgattgtagttgattga 16328135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 324 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 7850044 - 7849970
Alignment:
Q  324 gttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtg 399  Q
    |||||||||||||   ||| ||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7850044 gttgatgaatcatgacttgagtatacataatcatgaattggtgatgaaaatttgaattg-tgttggtgttttggtg 7849970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 124 - 305
Target Start/End: Original strand, 40885570 - 40885753
Alignment:
Q  124 aaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaa-tatgtagaaatgag 222  Q
    ||||| || |||||||| || || ||||||||||||||||||||| | |||| || ||| |||||||| | ||| |||||| ||| |||||| |||||      
T  40885570 aaattcgtactccaactgtggtgctatgtttgtatgcatgaattggtgataattgaatgtttgttggtgaaattacatgttcaaagtatgtataaatgtc 40885669  T
Q  223 aagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttg 305  Q
    |||||||| ||||| |||  ||| | |||| ||||  | ||| | ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  40885670 aagttatg-aaattatgctcaattggtgaactttgctaagttattgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttgttg 40885753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 258 - 352
Target Start/End: Original strand, 41166083 - 41166177
Alignment:
Q  258 atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacata 352  Q
    ||||||| ||||||||| |  | || || ||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||| | |||||||| ||||    
T  41166083 atgttgttgttgaattgtggcaagagtcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgttgatgaatcatggcttgggtattcata 41166177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 2 - 66
Target Start/End: Original strand, 5682395 - 5682460
Alignment:
Q  2 aaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaag-gggttagtctttaccataatcat 66  Q
    ||||||||||  |||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  5682395 aaagtgaagcatgagctaatagttggtgataattaaggtaagtgggttagtttttatcataatcat 5682460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 258 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 15044938 - 15044794
Alignment:
Q  258 atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacat-attca 356  Q
    ||||||| ||||||||| | || ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||| | |||||| |||| | |||||| | ||| | |||    
T  15044938 atgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgatgattcatggcttgggtgttcataaatca 15044839  T
Q  357 tggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 402  Q
    ||  |||||||||| ||  | ||||||||||| || ||||||||||    
T  15044838 tgatttgatgatgagaa-ataaattgttgttgttgctttggtgaaa 15044794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 381 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 44055902 - 44055870
Alignment:
Q  381 tgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 413  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44055902 tgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 44055870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 258 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 8374619 - 8374504
Alignment:
Q  258 atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcat 357  Q
    ||||||| |||||| |||| | |||||| ||| | ||||||||||||| |  |||  |||||||| || | ||||| || | ||||||||||||| | ||    
T  8374619 atgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccattgatgttgttgctattaactgatgttgttgtgggtgaattatggcttgggtatacataattat 8374520  T
Q  358 ggattgatgatgaaaa 373  Q
     |||||||||||||||    
T  8374519 cgattgatgatgaaaa 8374504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 258 - 402
Target Start/End: Original strand, 15109486 - 15109630
Alignment:
Q  258 atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacat-attca 356  Q
    ||||||| ||||||||| | || ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||   ||||||| | |||||| |||| | |||||| | ||| | |||    
T  15109486 atgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtaatgttgttgatgatgattcatggcttgggtgttcataaatca 15109585  T
Q  357 tggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 402  Q
    ||  |||||||||| ||  | ||||||||||| || ||||||||||    
T  15109586 tgatttgatgatgagaa-ataaattgttgttgttgctttggtgaaa 15109630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 252 - 373
Target Start/End: Original strand, 17145796 - 17145917
Alignment:
Q  252 tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacat 351  Q
    ||||| ||||||| |||||| |||| | |||||| ||| | ||||||||||||| |  |||  |||||||| || | ||||| ||   ||||||||||||    
T  17145796 tttgatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccattgatgttgttgctattaactgatgttgttgtgggtgaattatgacttgggtatacat 17145895  T
Q  352 attcatggattgatgatgaaaa 373  Q
    | | | ||||||||||||||||    
T  17145896 aattacggattgatgatgaaaa 17145917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 258 - 322
Target Start/End: Original strand, 13809647 - 13809711
Alignment:
Q  258 atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgt 322  Q
    ||||||| ||||||||| | || ||||| ||  ||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  13809647 atgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaattgatgttgt 13809711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 258 - 369
Target Start/End: Original strand, 52265645 - 52265757
Alignment:
Q  258 atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacat-attca 356  Q
    ||||||| ||||||||| | || ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||  ||| |||  |||||||| |||| | |||||| | ||| |||||    
T  52265645 atgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgatgttgatgattcatggcttgggtgttcataattca 52265744  T
Q  357 tggattgatgatg 369  Q
    ||  |||||||||    
T  52265745 tgatttgatgatg 52265757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 310; Significance: 1e-174; HSPs: 31)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 108 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 7293279 - 7292886
Alignment:
Q  108 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 207  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  7293279 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattaataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 7293180  T
Q  208 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaa-tggatgaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttga 306  Q
    ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7293179 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttga 7293080  T
Q  307 tgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttg 406  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7293079 tgctaatagatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttg 7292980  T
Q  407 tgaattgaagaaatatgataagttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattggggttgattgatgatgtccatctcatt 500  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||  ||||||||    
T  7292979 tgaattgatgaaatatgataagttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttgtgattgtggttgattgttgatgttgatctcatt 7292886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 35 - 414
Target Start/End: Original strand, 13036938 - 13037322
Alignment:
Q  35 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaatttgt 131  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||| ||    
T  13036938 taaggtaagggggttagtcttcaccataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgt 13037037  T
Q  132 gctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatga 231  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | | ||| |||||| ||||| | | |||||| ||||| |||    
T  13037038 gctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttgatgaaattgcatgttcaaataggaacaaatgataagttgtga 13037137  T
Q  232 aaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgat 329  Q
    |||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| |||  |||||| |||||||||||| ||||| ||||| |  ||  |||| |||||||| ||||||    
T  13037138 aaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattaatgttatgaatattaattgatgttgtggttgat 13037237  T
Q  330 gaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattga 414  Q
    ||||||| | |||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13037238 gaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattga 13037322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 35 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 16212103 - 16211733
Alignment:
Q  35 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgc 133  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||    
T  16212103 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaattttgcttatggacaattgttgctaaattcgtgc 16212004  T
Q  134 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaa 233  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| || | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  16212003 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgtttgtgaaattgcatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaa 16211904  T
Q  234 attgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatga 331  Q
    |||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||| | ||||| | ||||||||||  |||||||||| | | || |||| |||||||| ||||||||    
T  16211903 attgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttaaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatga 16211804  T
Q  332 atcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 402  Q
     |||| | |||||||| |||||||||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16211803 ttcattgcttgggtatgcatattcatgaattaatgaagagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 16211733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 2 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 3060336 - 3059933
Alignment:
Q  2 aaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaaggggtta-gtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaat 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  3060336 aaagtgaagctagagctaatagttggagataatgaaggtaagggggtaagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttatatgaat 3060237  T
Q  101 tttgattatggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattcca 200  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||  | ||||||| | ||| ||    
T  3060236 tttgcttatggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgataatatatttgtatgcattaattgatgataattgtaatactgttggtgaaattaca 3060137  T
Q  201 tgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtg--caaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattga 297  Q
    |||| ||||||||| |||||| || || |||||||| ||  ||||||| |||| ||||  | ||||| |||  |||||| |||||||||||| |||||||    
T  3060136 tgttcaaatatgtaaaaatgataaattgtgaaaattatgctcaaatgg-tgaattttgttaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattga 3060038  T
Q  298 tgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttgg 397  Q
    |||| |   || |||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||  |||||| |||||||||     
T  3060037 tgttatgactgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatgataatttgagatgttgtgggtgttttga 3059938  T
Q  398 tgaaa 402  Q
    |||||    
T  3059937 tgaaa 3059933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 35 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 36053003 - 36052634
Alignment:
Q  35 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaatttgt 131  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||| |    
T  36053003 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaatttttgtataatggataattgttgctaaatttat 36052904  T
Q  132 gctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatga 231  Q
     |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| |||    
T  36052903 actccaactgtgatgatacgtttgtatgcatgaattgatgataattatatgattgttggtaaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtga 36052804  T
Q  232 aaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgat 329  Q
    |||||||||  ||| | |||| ||||  | |||   ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||||| | || |||| |||||||| ||||||    
T  36052803 aaattgtgctcaattggtgaattttgctaagtt---gttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttgtggttgttaattgatgttgtggttgat 36052707  T
Q  330 gaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 402  Q
    |||| || | |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36052706 gaataattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 36052634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 35 - 402
Target Start/End: Original strand, 11580661 - 11581035
Alignment:
Q  35 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcatttt-gtgaattttcaaatgttgtatgaattttg---attatggatgattgttgctaaattt 129  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    || |||||| ||| ||||||||||     
T  11580661 taaggtaaggggattagtctttatcataatcatcatcatttttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttttgcataatggataattattgctaaattc 11580760  T
Q  130 gtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttat 229  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||| | | |||||| ||||| |    
T  11580761 gtgctccaactgtgataatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgt 11580860  T
Q  230 gaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttg 327  Q
    |||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| |||  |||||| |||||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||||| ||||    
T  11580861 gaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttg 11580960  T
Q  328 atgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 402  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11580961 atgaatcattgcttgggtatacatattcatgaattgaggacgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 11581035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 108 - 395
Target Start/End: Original strand, 47481031 - 47481320
Alignment:
Q  108 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 207  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || | ||| |||||| ||    
T  47481031 atggataattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaa 47481130  T
Q  208 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtg--caaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgtt 304  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||||||||||  ||| ||| |||| ||||  | ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |     
T  47481131 atatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgttcaattgg-tgaattttgctaagttgttgttgaattgagttatgattcttgttcaattgatgttatc 47481229  T
Q  305 gatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgtttt 395  Q
    | |  |||| |||||| | ||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  47481230 gctcttaattgatgtttttgttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatgataatttgaattgttgttggtgtttt 47481320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 108 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 11516490 - 11516324
Alignment:
Q  108 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 207  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  11516490 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 11516391  T
Q  208 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 273  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11516390 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 11516324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 108 - 273
Target Start/End: Original strand, 15441564 - 15441730
Alignment:
Q  108 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 207  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  15441564 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 15441663  T
Q  208 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 273  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15441664 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 15441730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 108 - 273
Target Start/End: Original strand, 30262129 - 30262295
Alignment:
Q  108 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 207  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  30262129 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 30262228  T
Q  208 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 273  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30262229 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 30262295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 115 - 402
Target Start/End: Original strand, 18253842 - 18254130
Alignment:
Q  115 attgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgta 214  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| |||| ||||    
T  18253842 attgttactaaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgta 18253941  T
Q  215 gaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaa 312  Q
     |||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | |||| |||    
T  18253942 aaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaa 18254041  T
Q  313 tagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 402  Q
    | ||||||||  ||||||||| || |  || |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18254042 ttgatgttgtgattgatgaataattgcctgagtatgcatattcatggattgatgatgagaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 18254130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 109 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 13321278 - 13320988
Alignment:
Q  109 tggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaa 208  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| ||||||| ||    
T  13321278 tggataattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtttcaa 13321179  T
Q  209 --tatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgca-aatggatgaatttgac-atgttg-tagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgt 303  Q
      |||||| |||||  ||||||||||| ||||||  ||| | |||||||  | | |||| | ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |    
T  13321178 agtatgtataaatgtcaagttatgaaa-ttgtgctcaattggtgaattttgctaagttgattgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttat 13321080  T
Q  304 tgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgtttt 395  Q
    || || |||| |||||||| |||||||||||||   |||||| | || ||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  13321079 tgttgttaattgatgttgttgttgatgaatcatgacttgggtttgcacattcatgaattgatgatgagaatttggattgttgttggtgtttt 13320988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 143 - 399
Target Start/End: Original strand, 16478985 - 16479244
Alignment:
Q  143 gatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgca- 241  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||      
T  16478985 gatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctc 16479084  T
Q  242 aatggatgaattt-gacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtt 340  Q
    ||| | ||||||| |  | ||| |  || | ||||| | |||||||||  ||||||||||| ||| || || | |||||||| ||||||||||||  | |    
T  16479085 aattggtgaattttgttaagttatttttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttattgttgttatttgatgttgttgttgatgaatcactgct 16479184  T
Q  341 tgggtatacatattcatggattgatgatgaaaa-tttgaattgttgttggtgttttggtg 399  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16479185 tgggtatgcatattcatggattgatgatgaaaattttgaattgttgttggtgttttggtg 16479244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 108 - 240
Target Start/End: Original strand, 25292338 - 25292470
Alignment:
Q  108 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 207  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | || | ||||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  25292338 atggataattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgtatgaattgttgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaa 25292437  T
Q  208 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 240  Q
    ||||||| ||| || ||| |||||| |||||||    
T  25292438 atatgtaaaaaggataagctatgaatattgtgc 25292470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 142 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 13572906 - 13572644
Alignment:
Q  142 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc- 240  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||     
T  13572906 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtgtgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaatattgtgct 13572807  T
Q  241 aaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcg 338  Q
     ||| | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||| ||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||| || |  || |||||| || |    
T  13572806 caattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattaatgaataattg 13572707  T
Q  339 tttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 402  Q
     |||||| | ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  13572706 cttgggtttgcatattcatggattgttgatgagaatttgagttg-tgttggtgttttggtgaaa 13572644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 428 - 500
Target Start/End: Original strand, 15441717 - 15441789
Alignment:
Q  428 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattggggttgattgatgatgtccatctcatt 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||    
T  15441717 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgattgatgatgttgatctcatt 15441789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 428 - 500
Target Start/End: Original strand, 30262282 - 30262354
Alignment:
Q  428 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattggggttgattgatgatgtccatctcatt 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||    
T  30262282 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgattgatgatgttgatctcatt 30262354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 142 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 2437687 - 2437425
Alignment:
Q  142 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtg-- 239  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| | ||| |||||| | ||||| | |||||| |||||||||| ||||||      
T  2437687 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgtt 2437588  T
Q  240 caaatggatgaatttgacat--gttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatc 337  Q
    ||| ||| |||||||  | |  ||||| ||| |  |||| | |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||| || |  ||||||||| ||     
T  2437587 caattgg-tgaatttttcctaagttgttgttaatatgagatttgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataatt 2437489  T
Q  338 gtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 402  Q
    | ||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2437488 gcttgagtttgcatattcatggattgatgatgaaaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 2437425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 120 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 10989661 - 10989378
Alignment:
Q  120 tgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 219  Q
    ||||||||| ||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| | ||| |||||| | ||||| | ||||    
T  10989661 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 10989562  T
Q  220 gagaagttatgaaaattgtgca-aatggatgaatttgacat--gttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 316  Q
    || |||||||||| |||||||  ||| | |||||||  | |  ||||| ||  | ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||    
T  10989561 gataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgta-atttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 10989463  T
Q  317 tgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 402  Q
    | || |  ||||||||| || | |||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10989462 tattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatgagaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 10989378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 43 - 399
Target Start/End: Original strand, 295900 - 296257
Alignment:
Q  43 ggggttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaa-ttttg-attatggatgattgttgctaaatttgtgctccaact 140  Q
    |||||| ||||| | ||||||  |||||||||| || |||||||||  ||||||||| ||||| || ||| || |||||||||||||| ||| || || |    
T  295900 ggggtttgtcttcaacataattctcatcatttt-tgcattttcaaactttgtatgaaattttgcataatgaataattgttgctaaattcgtgttctaatt 295998  T
Q  141 ttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaat--tgt 238  Q
      | || ||||||||| ||||||||| ||| ||||   ||||||||||||| | ||| |||||| || |||||| |||||||||||||| |||||  | |    
T  295999 gaggtgttatgtttgtgtgcatgaatcgatgataatgttatgattgttggtgaaatttcatgttgaattatgtaaaaatgagaagttataaaaattatat 296098  T
Q  239 gcaaatggatgaa-tttgacatgttg-tagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcat 336  Q
     ||||||| |||| ||||  |  ||| |  |||||||| | | |||||| ||| ||||||||||||||| |  |||| ||||||   |||||||||| |     
T  296099 ccaaatgg-tgaattttgctaaattgatgtttgaattgtgttgtgattcatgttcaattgatgttgttgctattaattgatgtt---gttgatgaattac 296194  T
Q  337 cgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtg 399  Q
     | |||||||| | |||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  296195 tgattgggtatgcttattcatggattgatgttgaaaaattgaatttgtgttggtgttttggtg 296257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 428 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 11516337 - 11516265
Alignment:
Q  428 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattggggttgattgatgatgtccatctcatt 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||    
T  11516337 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgagtatatgttatgattgtggttgattgttgatgttgatctcatt 11516265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 142 - 384
Target Start/End: Original strand, 13911046 - 13911292
Alignment:
Q  142 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc- 240  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| | ||| |||||| | ||||| | |||||| |||||||||| ||| |||     
T  13911046 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttaattgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatgct 13911145  T
Q  241 aaatggatgaatttgac---atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatc 337  Q
     ||| | |||||||  |   | ||||| ||||| ||||| | |||||| ||| ||||||||||| |  ||| || | ||| || |  ||||||||| ||     
T  13911146 caattggtgaatttctcctaaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataatt 13911245  T
Q  338 gtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgtt 384  Q
      |||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13911246 tcttgggtttgcatattcatggattgatgatgagaatttgaattgtt 13911292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 2 - 66
Target Start/End: Original strand, 32493913 - 32493978
Alignment:
Q  2 aaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 66  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  32493913 aaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 32493978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 66
Target Start/End: Original strand, 1936884 - 1936949
Alignment:
Q  2 aaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagg-ggttagtctttaccataatcat 66  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||    
T  1936884 aaagtgaagctagagttaatagttggagataattaaggtaaggaggttagtttttatcataatcat 1936949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 6 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 126799 - 126738
Alignment:
Q  6 tgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 66  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  126799 tgaagttagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 126738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 150
Target Start/End: Original strand, 14113989 - 14114031
Alignment:
Q  108 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatat 150  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14113989 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatat 14114031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 150
Target Start/End: Original strand, 14423639 - 14423681
Alignment:
Q  108 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatat 150  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14423639 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatat 14423681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 381 - 413
Target Start/End: Original strand, 15822691 - 15822723
Alignment:
Q  381 tgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 413  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15822691 tgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 15822723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 328 - 402
Target Start/End: Original strand, 25292560 - 25292633
Alignment:
Q  328 atgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 402  Q
    |||||| || | |||||| | ||||||||||||||| | |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  25292560 atgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgttaatgagaatttgagttg-tgttggtgttttggtgaaa 25292633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 66
Target Start/End: Original strand, 111136 - 111201
Alignment:
Q  2 aaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 66  Q
    ||||||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||    
T  111136 aaagtgaagcttgagctaaaagttggtgataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcat 111201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 258 - 413
Target Start/End: Original strand, 17224075 - 17224230
Alignment:
Q  258 atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacat-attca 356  Q
    ||||||| |||||||||   || || || ||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||   |||||| |||| | |||||||| ||| |||||    
T  17224075 atgttgttgttgaattgttgtaagagtcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttaatgatgattcatggcttgggtattcataattca 17224174  T
Q  357 tggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 413  Q
    ||  ||| |||||| ||  ||| |||||||||||| ||| || ||||| ||||||||    
T  17224175 tgatttgttgatgagaa-atgagttgttgttggtggttttgtaaaattggtgaattg 17224230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 302; Significance: 1e-170; HSPs: 2)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 108 - 500
Target Start/End: Original strand, 37066 - 37459
Alignment:
Q  108 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 207  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |    
T  37066 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 37165  T
Q  208 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaa-tggatgaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttga 306  Q
    ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37166 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttggattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttga 37265  T
Q  307 tgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttg 406  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37266 tgctaatagatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatggattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttg 37365  T
Q  407 tgaattgaagaaatatgataagttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattggggttgattgatgatgtccatctcatt 500  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | ||||  ||||||||    
T  37366 tgaattgatgaaatatgataagtttttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttgtgattgtggttgattgttaatgttgatctcatt 37459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 41697 - 41632
Alignment:
Q  2 aaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 66  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||    
T  41697 aaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcacaatcat 41632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 23)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 41394593 - 41394191
Alignment:
Q  1 taaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaa 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41394593 taaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaa 41394494  T
Q  100 ttttgattatggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattcc 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| |  || |    
T  41394493 ttttgattatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcataaattgatgataattgtatgattgttggtgaagttac 41394394  T
Q  200 atgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattga 297  Q
    ||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||| | |||   ||||| | |||||||||  |||||||    
T  41394393 atgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttattgttatgttgagatttgattcttgctcaattga 41394294  T
Q  298 tgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaa-tttgaattgttgttggtgttttg 396  Q
    |||| ||| || || | |||||||| ||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41394293 tgttattgttgttatttgatgttgttgttgatgaatcactgattgggtatgcatattcatggattgatgatgaaaattttgaattgttgttggtgttttg 41394194  T
Q  397 gtg 399  Q
    |||    
T  41394193 gtg 41394191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 35 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 20446019 - 20445646
Alignment:
Q  35 taaggtaaggg-gttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaa-ttttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaatttg 130  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||| |    
T  20446019 taaggtaagggagttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcg 20445920  T
Q  131 tgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatg 230  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| || || | | |||||| ||||  ||    
T  20445919 tgctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaagtaggaacaaatgataagtggtg 20445820  T
Q  231 aaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttga 328  Q
    ||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||||||||| | |||||||||||  ||||||||||| | | || |||| ||||||||||||||    
T  20445819 aaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgtgttatgattcttgatcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtagttga 20445720  T
Q  329 tgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 402  Q
    |||||||| | |||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20445719 tgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 20445646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 47 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 20531770 - 20531411
Alignment:
Q  47 ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttga 144  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||    
T  20531770 ttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgtgctccaaatgtga 20531671  T
Q  145 tgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaa 243  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| || || | | |||||| ||||  ||||||||||||  ||    
T  20531670 taatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaagtaggaacaaatgataagtggtgaaaattgtgctcaa 20531571  T
Q  244 tggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttg 342  Q
    | | |||| ||||  | ||||| ||||||||| | |||||||||||  ||||||||||| | | || |||| |||||||||||||||||||||| | |||    
T  20531570 ttggtgaattttgctaagttgttgttgaattgtgttatgattcttgatcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtagttgatgaatcattgcttg 20531471  T
Q  343 ggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 402  Q
    ||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20531470 ggtatgcatattcatgaattgaggatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 20531411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 35 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 20931682 - 20931312
Alignment:
Q  35 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgc 133  Q
    |||||||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  20931682 taaggtaagggggttagcctttatcataatcatcctcattttgcaaattttcaattgttgtatgaagtttgcttatggataattgttgctaaattcgtgc 20931583  T
Q  134 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaa 233  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| | ||| |||||| | ||||||| |||||| |||||||||||    
T  20931582 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcatatatgtaaaaatgataagttatgaaa 20931483  T
Q  234 attgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatga 331  Q
    ||||||| |||| | |||| ||||  |  |||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||||| ||||||||    
T  20931482 attgtgctaaattggtgaattttgctaaattgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatga 20931383  T
Q  332 atcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 402  Q
    || ||   |||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20931382 ataatttcttgggtatgcatattcatgaattaatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 20931312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 35 - 413
Target Start/End: Original strand, 20893551 - 20893933
Alignment:
Q  35 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaatttgt 131  Q
    |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||  |    
T  20893551 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcattttgt-aattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattctt 20893649  T
Q  132 gctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatga 231  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | | ||| |||||| ||||| | | |||||| ||||| |||    
T  20893650 gctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttgttgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtga 20893749  T
Q  232 aaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgat 329  Q
    |||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| |||  |||||  |||||||||||| ||||||||||| |   || |||| |||||||| ||||||    
T  20893750 aaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagattgatttatgattcttgttcaattgatgttatgactgttaattgatgttgtggttgat 20893849  T
Q  330 gaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 413  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  20893850 gaatcattgtttgggtatgcatattcataaattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttgaagaaatttgtgaattg 20893933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 35 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 20913367 - 20913004
Alignment:
Q  35 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgc 133  Q
    |||||||||||| |||||||||| | |||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  20913367 taaggtaagggggttagtctttatcgtaatcatcctcattttgcaaattttcaattgttgtatgaattttgcttacggataattgttgctaaattcgtgc 20913268  T
Q  134 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaa 233  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| | ||| |||||| | ||||||| |||||| |||||||||||    
T  20913267 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcatatatgtaaaaatgataagttatgaaa 20913168  T
Q  234 attgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatga 331  Q
    |||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||| ||||      |||||||||| ||||||||||| | | || |||| ||| |||| ||||||||    
T  20913167 attgtgctcaattggtgaattttgcaaagttgttgtt-aatt------tgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatcttgtggttgatga 20913075  T
Q  332 atcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 402  Q
    || || | |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20913074 ataattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 20913004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 35 - 402
Target Start/End: Original strand, 37844374 - 37844746
Alignment:
Q  35 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaatttgt 131  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||  |    
T  37844374 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcat 37844473  T
Q  132 gctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagtta-tg 230  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| || || | | |||||| ||  || ||    
T  37844474 gctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaagtaggaacaaatgataaaatagtg 37844573  T
Q  231 aaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttga 328  Q
    ||||||||||  |||  ||||| ||||  | ||||| |||  |||||| |||||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||||| |||||    
T  37844574 aaaattgtgctcaattaatgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttga 37844673  T
Q  329 tgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 402  Q
    ||| |||| | |||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  37844674 tgagtcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatgagaatttgaa-tgttgttggtgttttgatgaaa 37844746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 108 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 51452755 - 51452589
Alignment:
Q  108 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 207  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  51452755 atggataattgttgctaaattcgtgcttcaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 51452656  T
Q  208 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 273  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  51452655 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 51452589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 158 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 22228022 - 22227777
Alignment:
Q  158 tgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtg-caaatggatgaatttga 256  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||| || | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| | ||| | |||||||      
T  22228022 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgtccaattgttgaattttg 22227923  T
Q  257 c-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattc 355  Q
    | | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| |  ||| |||| |||||| |  ||||||||| || | |||||| | |||||||    
T  22227922 ctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattgatgttatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattc 22227823  T
Q  356 atggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 402  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22227822 atggattgatgatgaaaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 22227777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 158 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 22232719 - 22232474
Alignment:
Q  158 tgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtg-caaatggatgaatttga 256  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||| || | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| | ||| | |||||||      
T  22232719 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgtccaattgttgaattttg 22232620  T
Q  257 c-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattc 355  Q
    | | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| |  ||| |||| |||||| |  ||||||||| || | |||||| | |||||||    
T  22232619 ctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattgatgttatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattc 22232520  T
Q  356 atggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 402  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22232519 atggattgatgatgaaaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 22232474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 142 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 2116484 - 2116228
Alignment:
Q  142 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgca 241  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||     
T  2116484 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggtgct 2116385  T
Q  242 -aatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctat-gattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcg 338  Q
     ||| | |||||||  | | ||| | ||| | ||||  | | ||||||||  ||||||||||| | | || |||| |||||||||||||||||||||| |    
T  2116384 caattggtgaattttgctaagttattgttaatttgatattttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatgaatcattg 2116285  T
Q  339 tttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgtttt 395  Q
     |||||||| |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2116284 cttgggtatgcatattcatgaattgattatgagaatttgaattgttgttggtgtttt 2116228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 428 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 51452602 - 51452530
Alignment:
Q  428 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattggggttgattgatgatgtccatctcatt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  ||||||||    
T  51452602 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtagttgattgatgatgttgatctcatt 51452530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 142 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 45051652 - 45051554
Alignment:
Q  142 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 240  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  45051652 tgatgttacgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgc 45051554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 2 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 21860399 - 21860334
Alignment:
Q  2 aaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 66  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  21860399 aaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 21860334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 2 - 66
Target Start/End: Original strand, 44034838 - 44034903
Alignment:
Q  2 aaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 66  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  44034838 aaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 44034903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 142 - 402
Target Start/End: Original strand, 18601140 - 18601402
Alignment:
Q  142 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc- 240  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| | ||| |||||| | ||||| | |||||| |||||||||| |||||||     
T  18601140 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgct 18601239  T
Q  241 aaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcg 338  Q
     ||| | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||| ||||| ||| ||||||| |  ||| || | |||  | |  || |||||| || |    
T  18601240 caattggtgaatttctcctaagttgttgttaagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgataatatgattaatgaataattg 18601339  T
Q  339 tttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 402  Q
     |||||| | |||||||||||||||||||||| |||| || ||| |||||||||||||||||||    
T  18601340 cttgggtttgcatattcatggattgatgatgagaattagagttg-tgttggtgttttggtgaaa 18601402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 315 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 45051496 - 45051416
Alignment:
Q  315 gatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgtttt 395  Q
    |||||| | ||||||||||||  | |||||||| |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45051496 gatgttattgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatgaattgattatgagaatttgaattgttgttggtgtttt 45051416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 120 - 402
Target Start/End: Original strand, 5072388 - 5072672
Alignment:
Q  120 tgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 219  Q
    ||||||||| ||||||   || ||||| ||||||| |||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| | ||| |||||| | ||||| | ||||    
T  5072388 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttatatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 5072487  T
Q  220 gagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 316  Q
    || |||||||||| |||||||  ||| | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||| ||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||    
T  5072488 gataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 5072587  T
Q  317 tgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 402  Q
    |  | |  || |||||| || | |||||| | |||||||||||||||||||||| |||| || ||| |||||||||||||||||||    
T  5072588 taatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatgagaattagagttg-tgttggtgttttggtgaaa 5072672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 41218793 - 41218749
Alignment:
Q  2 aaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg 46  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  41218793 aaagtgaagcttgagctaatagttggtgataattaaggtaagggg 41218749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 381 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 49967638 - 49967607
Alignment:
Q  381 tgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaatt 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49967638 tgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaatt 49967607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 292 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 20254389 - 20254308
Alignment:
Q  292 aattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaa 373  Q
    |||||||||||||| |||| | | ||||||| || | ||||| ||   ||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  20254389 aattgatgttgttgttgctgagacatgttgttgtgggtgaattatgacttgggtatacataattatggattgatgatgaaaa 20254308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 27675184 - 27675139
Alignment:
Q  1 taaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg 46  Q
    |||||||||||| | ||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  27675184 taaagtgaagcttgggctaggaattggagataattaaggtaagggg 27675139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 291 - 370
Target Start/End: Original strand, 22143531 - 22143611
Alignment:
Q  291 caattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacat-attcatggattgatgatga 370  Q
    ||||||||||||||| ||||||  ||| |||| |||||||| |||| | |||||||| ||| |||||||  ||||||||||    
T  22143531 caattgatgttgttgctgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtattcataattcatgatttgatgatga 22143611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 30)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 2 - 413
Target Start/End: Original strand, 19794596 - 19795011
Alignment:
Q  2 aaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaat 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  19794596 aaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcattattttgtaaattt-caaatgttgtatgaat 19794694  T
Q  101 tttg--attatggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattc 198  Q
    |||   || |||||| ||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||     
T  19794695 ttttgcataatggataattgtcgttaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggtgaaatta 19794794  T
Q  199 catgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattg 296  Q
    |||||| ||||| | | |||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  19794795 catgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagttatgattcttgttcaattg 19794894  T
Q  297 atgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtg-tttt 395  Q
    ||||| ||   | |||| |||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||    
T  19794895 atgttatttccgttaattgatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatgagaatttgaatttttgttggtgttttt 19794994  T
Q  396 ggtgaaatttgtgaattg 413  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  19794995 ggtgaaa-ttgtgaattg 19795011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 35 - 402
Target Start/End: Original strand, 36982364 - 36982737
Alignment:
Q  35 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcatttt-gtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaatttg 130  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||| |    
T  36982364 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcatttttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcg 36982463  T
Q  131 tgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatg 230  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||| |||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||    
T  36982464 tgctccaactgtgatgatatgtttgtattcatgaattgatgataattgtaagattgctggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtg 36982563  T
Q  231 aaaattgtgca-aatggatgaattt-gacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttga 328  Q
    ||||||||||  ||| | ||||||| | || ||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||| || |||| |||||||| |||||    
T  36982564 aaaattgtgctcaattggtgaattttgccaagttgttgttgaattgagttatgattcctgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttgttgttga 36982663  T
Q  329 tgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 402  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  36982664 tgaatcattgtttgggtatgcatattcatgaattgatgatgagaatttgaattattgttggtgttttagtgaaa 36982737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 2 - 402
Target Start/End: Original strand, 43642848 - 43643250
Alignment:
Q  2 aaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagg-ggttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaat 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43642848 aaagtgaagctagagctaatagttggagataattaagggaaggaggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaat 43642947  T
Q  101 tttg--attatggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattc 198  Q
    |||   ||  ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | |||     
T  43642948 ttttgcatagtggataattgttgctaaatttgtgctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatta 43643047  T
Q  199 catgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacat-gttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattg 296  Q
    |||||| ||||| | | |||||  ||||| ||||||||||||  ||| | |||||||  | | |||||  || | ||||| |||||||||||| ||||||    
T  43643048 catgttcaaataggaacaaatgttaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaatttttcttagttgttattaatttgagatatgattcttgttcaattg 43643147  T
Q  297 atgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttg 396  Q
    ||| | ||| || |||| |||||||||||||||||||||  | |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||   | |||||||||||||    
T  43643148 atgctattgctgttaattgatgttgtagttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatgataatttga---gatgttggtgttttg 43643244  T
Q  397 gtgaaa 402  Q
     |||||    
T  43643245 atgaaa 43643250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 2 - 402
Target Start/End: Original strand, 20627205 - 20627609
Alignment:
Q  2 aaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaa-ttttcaaatgttgtatgaa 99  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||    
T  20627205 aaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaacggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaaattttcaaatattgtatgaa 20627304  T
Q  100 ttttgattatggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattcc 199  Q
    || ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |    
T  20627305 ttatgattatggataattgttgttaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcacgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattac 20627404  T
Q  200 atgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattga 297  Q
    ||||  ||||||||| |||||| || || ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||| | ||||| | | |||||||| |||||||    
T  20627405 atgtccaaatatgtaaaaatgataacttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgttaagttgttgttaatttgagatttaattcttgttcaattga 20627504  T
Q  298 tgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttgg 397  Q
    | || | | || |||| | |||||| ||||||||||||| | ||||||||  ||||||||| ||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||     
T  20627505 ttttatggttgttaattggtgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatggatattcatgaattgaggatgataatttgagatgttgttggtgttttga 20627604  T
Q  398 tgaaa 402  Q
    |||||    
T  20627605 tgaaa 20627609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 35 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 463075 - 462706
Alignment:
Q  35 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgc 133  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  463075 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgc 462976  T
Q  134 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaa 233  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  462975 tccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaa 462876  T
Q  234 attgtg--caaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatg 330  Q
    ||||||  ||| ||| |||| ||||  | ||||| |||  |||||| |||||||||||| ||||||||||| | | || |||| ||||| ||  ||||||    
T  462875 attgtgttcaattgg-tgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgtcgtgattgatg 462777  T
Q  331 aatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 402  Q
    |||||| | |||||||| |||||||||| ||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  462776 aatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggataagaatttgaa-tgttgttggtgttttgatgaaa 462706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 41 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 8891574 - 8891209
Alignment:
Q  41 aaggggttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaatttgtgctccaa 138  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  8891574 aaggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgtgctccaa 8891475  T
Q  139 ctttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgt 238  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  | ||| |||||| ||||| | | |||||| ||||| ||||||||||    
T  8891474 ctgtgataatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggcgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgt 8891375  T
Q  239 gc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcat 336  Q
    ||  ||| | |||| ||||  | ||||| |||  |||||| |||||||||||| ||||||||||| | | |  |||| |||||||| |||||||||||||    
T  8891374 gctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctattaattgatgttgtggttgatgaatcat 8891275  T
Q  337 cgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 402  Q
     | |||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8891274 tgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatgagaatttgaatggttgttggtgttttggtgaaa 8891209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 35 - 398
Target Start/End: Original strand, 24341309 - 24341681
Alignment:
Q  35 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcat----tttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgatta--tggatgattgttgctaaat 127  Q
    |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||    ||||  | ||||||||||| |||||||||||   ||  ||||| |||||||||||||    
T  24341309 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcatcatttttgcaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgttgctaaat 24341408  T
Q  128 ttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagtt 227  Q
    |  |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | |||  ||||| || |||||| ||||| ||||||    
T  24341409 tcatgcttcaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattatatgttcaattatgtaaaaatgtgaagtt 24341508  T
Q  228 atgaaaattgtgca-aatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagt 325  Q
     ||||||||||||  ||| | |||||||  | | ||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||| || |||| ||||||   ||    
T  24341509 gtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttcctgt 24341608  T
Q  326 tgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggt 398  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24341609 tgatgaatcattgcttgggtatacatattcatgaattgatgatgaaaatttgaattattgttggtgttttggt 24341681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 108 - 273
Target Start/End: Original strand, 19689401 - 19689567
Alignment:
Q  108 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 207  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  19689401 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 19689500  T
Q  208 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 273  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19689501 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 19689567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 108 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 23820334 - 23820168
Alignment:
Q  108 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 207  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  23820334 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 23820235  T
Q  208 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 273  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23820234 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 23820168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 108 - 273
Target Start/End: Original strand, 14906440 - 14906606
Alignment:
Q  108 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 207  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |    
T  14906440 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 14906539  T
Q  208 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 273  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14906540 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 14906606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 108 - 395
Target Start/End: Original strand, 25265390 - 25265679
Alignment:
Q  108 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 207  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||    
T  25265390 atggataattgttgctaaattcgtgctctaactttgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 25265489  T
Q  208 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttg 305  Q
     |||||| ||||| |||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  ||||||| ||||||||  | |  ||  | ||| |||||||||||||||    
T  25265490 ttatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttg 25265589  T
Q  306 atgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgtttt 395  Q
     || |||| |||||||| ||| ||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25265590 ttgttaattgatgttgttgtttatgaatcatggcttgggtatgcatattcatgaattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgtttt 25265679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 108 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 20015274 - 20015108
Alignment:
Q  108 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 207  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||| |    
T  20015274 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgcatgcatgaattgataataattgtgtgattgttggttaaattacatgtttga 20015175  T
Q  208 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 273  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20015174 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 20015108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 158 - 399
Target Start/End: Original strand, 7507894 - 7508138
Alignment:
Q  158 tgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtg--caaatggatgaatttg 255  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||    
T  7507894 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttatgaaaattgtgttcaattgg-tgaatttg 7507992  T
Q  256 ac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgc-aattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatat 353  Q
     | | ||||| ||| ||||||| |||||||| |||   |||||||||| ||| || || | |||||||| ||||||||||||  | |||||||| |||||    
T  7507993 gctaagttgttgtt-aattgagatatgattcatgttttaattgatgttattgttgttatttgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatat 7508091  T
Q  354 tcatggattgatgatgaaaa-tttgaattgttgttggtgttttggtg 399  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7508092 tcatggattgatgatgaaaattttgaattgttgttggtgttttggtg 7508138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 108 - 240
Target Start/End: Original strand, 17396653 - 17396784
Alignment:
Q  108 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 207  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | || | ||||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  17396653 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtt-gtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaa 17396751  T
Q  208 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 240  Q
    ||| ||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  17396752 ataagtaaaaatgataagttatgaatattgtgc 17396784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 120 - 402
Target Start/End: Original strand, 19886661 - 19886945
Alignment:
Q  120 tgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 219  Q
    ||||||||| ||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||||| | ||| |||||| | ||||| | || |    
T  19886661 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 19886760  T
Q  220 gagaagttatgaaaattgtgcaaatg-gatgaatttgacat--gttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 316  Q
    || |||||||||| ||||||| || | | |||||||  | |  ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||    
T  19886761 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 19886860  T
Q  317 tgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 402  Q
    | || |  ||||||||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19886861 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatgagaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 19886945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 35 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 22863267 - 22863171
Alignment:
Q  35 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaatttt--gattatggatgattgttgctaaatt 128  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||    
T  22863267 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaattgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaatt 22863171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 428 - 500
Target Start/End: Original strand, 14906593 - 14906665
Alignment:
Q  428 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattggggttgattgatgatgtccatctcatt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  ||||||||    
T  14906593 gttgttgttgaattatgatggagggtatgattatatgttatgattgtagttgattgatgatgttgatctcatt 14906665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 428 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 20015121 - 20015049
Alignment:
Q  428 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattggggttgattgatgatgtccatctcatt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  ||||||||    
T  20015121 gttgttgttgaattatgatggagggtatgattatatgttatgattgtagttgattgatgatgttgatctcatt 20015049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 428 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 23820181 - 23820109
Alignment:
Q  428 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattggggttgattgatgatgtccatctcatt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  ||||||||    
T  23820181 gttgttgttgaattatgatggagggtatgattatatgttatgattgtagttgattgatgatgttgatctcatt 23820109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 428 - 473
Target Start/End: Original strand, 19689554 - 19689599
Alignment:
Q  428 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattg 473  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19689554 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattg 19689599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 2 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 22275110 - 22275045
Alignment:
Q  2 aaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 66  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  22275110 aaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagcctttatcataatcat 22275045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 2 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 22284343 - 22284278
Alignment:
Q  2 aaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 66  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  22284343 aaagtgaagttagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 22284278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 2 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 15633602 - 15633538
Alignment:
Q  2 aaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagg-ggttagtctttaccataatca 65  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  15633602 aaagtgaagctagagttaatagttggagataattaaggtaaggaggttagtctttatcataatca 15633538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 340 - 402
Target Start/End: Original strand, 17396887 - 17396948
Alignment:
Q  340 ttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 402  Q
    |||||| | ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  17396887 ttgggtttgcatattcatggattgttgatgagaatttgagttg-tgttggtgttttggtgaaa 17396948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 291 - 373
Target Start/End: Original strand, 19669279 - 19669362
Alignment:
Q  291 caattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacat-attcatggattgatgatgaaaa 373  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||| | |||||||| |||| | |||||||| ||| ||||||| | ||||||||||||    
T  19669279 caattgatgttgttgttgctaagtgatgttattgttgatgattcatggcttgggtattcataattcatgaactgatgatgaaaa 19669362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 19660266 - 19660217
Alignment:
Q  1 taaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaaggggttag 50  Q
    |||||||||||| | ||||| | |||| ||||||||||||||||||||||    
T  19660266 taaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaaggggttag 19660217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 292 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 9636821 - 9636761
Alignment:
Q  292 aattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacata 352  Q
    |||||||||||||| || ||| |||| |||| |||||||| |||| |||||||||| ||||    
T  9636821 aattgatgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgattcatagtttgggtattcata 9636761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 291 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 19666605 - 19666525
Alignment:
Q  291 caattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacat-attcatggattgatgatga 370  Q
    ||||||||||||||| ||||||  ||| |||| |||||||| |||| | |||||||| ||| |||||||  ||||||||||    
T  19666605 caattgatgttgttgttgctaagtgatattgtcgttgatgattcatggcttgggtattcataattcatgttttgatgatga 19666525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 292 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 24884762 - 24884718
Alignment:
Q  292 aattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcat 336  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  24884762 aattgatgttgttgttgctaatagatattgttgttgatgattcat 24884718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 381 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 32465845 - 32465813
Alignment:
Q  381 tgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32465845 tgttgttggtgttttggtgaaatttatgaattg 32465813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 180; Significance: 6e-97; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 35 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 1462 - 1091
Alignment:
Q  35 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaa-ttttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtg 132  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| |||    
T  1462 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaattttcaaatgttgtatgaatttttcttatggataattgttgctaaattcgtg 1363  T
Q  133 ctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaa 232  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  1362 ctccaactttgatgatatgttagtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaa 1263  T
Q  233 aattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatg 330  Q
    ||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | | || |||| ||| |||| |||||||    
T  1262 aattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatattgtggttgatg 1163  T
Q  331 aatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 402  Q
    ||| || | |||||| | |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1162 aataattgcttgggtgtgcatattcatgaattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 1091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 35 - 402
Target Start/End: Original strand, 3508 - 3877
Alignment:
Q  35 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgc 133  Q
    |||||||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  3508 taaggtaagggggttagtctttgtcataatcatcttcattttgtaaattttcaaaagttgtatgaattttgattatagataattgttgctaaattcgtgc 3607  T
Q  134 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaa 233  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  3608 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaa 3707  T
Q  234 attgtg--caaatggatgaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatga 331  Q
    ||||||  ||| |||   | ||||  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | |||| |||| ||||||||  |||| ||    
T  3708 attgtgctcaattggtaaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaattgatgttgtgattgagga 3807  T
Q  332 atcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 402  Q
    || || | |||||||| |||||| |||||||||||| || | ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3808 ataattgcttgggtatgcatattgatggattgatgaggagagtttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 3877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 179; Significance: 2e-96; HSPs: 2)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 35 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 48935 - 48565
Alignment:
Q  35 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgc 133  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  48935 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgc 48836  T
Q  134 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaa 233  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||| | | |||||| ||||| |||||    
T  48835 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaaaaaatgataagttgtgaaa 48736  T
Q  234 attgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatga 331  Q
    |||||||  | | | |||| ||||  | ||||| | |  |||||| |||||||||||| ||||||||||| | | |  |||| |||||||| ||||||||    
T  48735 attgtgctcagttggtgaattttgctaagttgttgctagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctattaattgatgttgtggttgatga 48636  T
Q  332 atcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 402  Q
    ||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48635 atcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 48565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 142 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 36323 - 36065
Alignment:
Q  142 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc- 240  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||  ||  ||||||||||||||| | ||| ||| || | ||||| | |||||| |||||||||| |||||||     
T  36323 tgatgttatgtttgtatgtatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatattcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgct 36224  T
Q  241 aaatggatgaatttgacat--gttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcg 338  Q
    |||| | |||||||  | |  ||||| ||| | ||||| | |||||| ||| |||| |||||| |  ||| || | |||  | |  ||||||||| || |    
T  36223 aaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgattcatgttcaatagatgttatgaatgttatttgataatatgattgatgaataattg 36124  T
Q  339 tttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggt 398  Q
     |||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||    
T  36123 cttgggtttgcatattcatggattgatgatgagaatttgaattg-tgttggtgttatggt 36065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 175; Significance: 5e-94; HSPs: 2)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 34 - 402
Target Start/End: Original strand, 36836 - 37209
Alignment:
Q  34 ttaaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaatttg 130  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||| |||||| |    
T  36836 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgttaaattcg 36935  T
Q  131 tgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatg 230  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||    
T  36936 tgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagcttgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtg 37035  T
Q  231 aaaattgtgc-aaatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttga 328  Q
    |||||||||| |||| | |||||||  | | ||||| |||| |||||| ||||| |||||| ||||||| ||| | | || |||| |||||||| |||||    
T  37036 aaaattgtgctaaattggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgaatcttgttcaattgacgttatggctgttaattgatgttgtggttga 37135  T
Q  329 tgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 402  Q
    |||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37136 tgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 37209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 46
Target Start/End: Original strand, 15334 - 15378
Alignment:
Q  2 aaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg 46  Q
    ||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15334 aaagtgaagcttgggctaatagttggagataattaaggtaagggg 15378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 170; Significance: 5e-91; HSPs: 2)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 43 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 19537 - 19173
Alignment:
Q  43 ggggttagtctttaccataatcatcatcatttt-gtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaatttgtgctccaac 139  Q
    |||||||||||| | |||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  19537 ggggttagtcttcatcataatcatcataatttttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgtgctccaac 19438  T
Q  140 tttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtg 239  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  19437 tgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtg 19338  T
Q  240 c-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatc 337  Q
    |  ||| | |||| ||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||| || |||| |||||||| |||||||||||||     
T  19337 ctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagttatgattcctgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatgaatcatt 19238  T
Q  338 gtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 402  Q
    | |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19237 gcttgggtatgcatattcatgaattgatgatgagaatttgaattattgttggtgttttggtgaaa 19173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 108 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 21553 - 21257
Alignment:
Q  108 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 207  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| | ||| |||||| ||    
T  21553 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaa 21454  T
Q  208 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgca-aatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttg 305  Q
    ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||||||  | | ||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||    
T  21453 atatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagttatgattcctgttcaattgatgttattg 21354  T
Q  306 atgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 402  Q
     || |||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21353 ctgttaattgatgttgttgttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatgagaatttgaattattgttggtgttttggtgaaa 21257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 169; Significance: 2e-90; HSPs: 23)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 35 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 23153786 - 23153403
Alignment:
Q  35 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaatttgt 131  Q
    |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||| ||||||| ||    
T  23153786 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgtttctaaattcgt 23153687  T
Q  132 gctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatga 231  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||| | | |||||| ||||| |||    
T  23153686 gctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtga 23153587  T
Q  232 aaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgat 329  Q
    |||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| |||  |||||| |||||||||||| |||||||| || | | || |||| |||||||| ||||||    
T  23153586 aaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatattatggctgttaattgatgttgtggttgat 23153487  T
Q  330 gaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 413  Q
    |||||||   ||||||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23153486 gaatcattacttgggtatacatattcatgaattaaggatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 23153403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 79 - 395
Target Start/End: Original strand, 14626089 - 14626407
Alignment:
Q  79 aattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtg 178  Q
    |||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||| |||||||||| ||||||   || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  14626089 aattctcaaatgttgtttgaattgtgattatggataattattgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattg 14626188  T
Q  179 tatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaat--tgtgcaaatggatgaatt-tgacatgttgtagttgaattga 275  Q
    ||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||  ||||||| ||| |||||| ||  | ||||| ||| | ||||    
T  14626189 tatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgtgcaattgg-tgaattatgctaagttgttgttaacttga 14626287  T
Q  276 gctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatt 375  Q
    | | |||||||||  ||||||||||| | | || |||| |||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| |||||| |||| ||||    
T  14626288 gatttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgattatgagaatt 14626387  T
Q  376 tgaattgttgttggtgtttt 395  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  14626388 tgaattgttgttggtgtttt 14626407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 108 - 402
Target Start/End: Original strand, 35009439 - 35009735
Alignment:
Q  108 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 207  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||    
T  35009439 atggataattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttaagtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 35009538  T
Q  208 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgca-aatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttg 305  Q
     |||||| ||||| |||||| ||||||||||||  ||| | |||||||  | ||||||| ||||||||  | |  ||  | ||| |||||||||||||||    
T  35009539 ttatgtaaaaatgtgaagttttgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttg 35009638  T
Q  306 atgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 402  Q
     || |||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35009639 ttgttaattgatgttgttgttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatgagaatttgaattattgttggtgttttggtgaaa 35009735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 108 - 399
Target Start/End: Original strand, 1657748 - 1658040
Alignment:
Q  108 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 207  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||  |||||| ||    
T  1657748 atggataattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttggatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaa 1657847  T
Q  208 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgca-aatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttg 305  Q
     |||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||| |||| ||||  | | ||| | || |||||||| |||||||||||| || |||||||| |||    
T  1657848 ttatgtaaaaatgtgaagttatgaaaattgtgctcaattgatggattttgctaagttattgt-gaattgagttatgattcttgttcagttgatgttattg 1657946  T
Q  306 atgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtg 399  Q
     || |||| |||||||| ||||||||||||  | |||||||| |||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1657947 ttgttaattgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatgaataggtgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtg 1658040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 108 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 15862734 - 15862443
Alignment:
Q  108 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 207  Q
    |||||| |||||| ||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||  |||||| ||    
T  15862734 atggataattgttactaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaa 15862635  T
Q  208 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggat-gaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttg 305  Q
     |||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||| ||| || ||||  | ||| | | ||||||||| |||||||||||| | ||| ||||| |||    
T  15862634 ttatgtataaatgtgaagttatgaaaattgtgctcaattgatggattttgctaagttattg-tgaattgagttatgattcttgttc-atttatgttattg 15862537  T
Q  306 atgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtg 399  Q
     || |||| |||||||| ||||||||||||  | |||||||| |||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15862536 ctgataattgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatgaataggtgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtg 15862443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 120 - 395
Target Start/End: Original strand, 1650105 - 1650382
Alignment:
Q  120 tgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 219  Q
    ||||| ||| ||||||  ||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||  |||    
T  1650105 tgctagattcgtgctcttactgtgatgttacgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaagaat 1650204  T
Q  220 gagaagttatgaaaattgtgca-aatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagat 317  Q
    || ||||| ||||||||||||  ||| | |||||||  | | ||| | ||| | ||||| | |||||||||  ||||||||||| ||| || || | |||    
T  1650205 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttatggttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttattgttgttatttgat 1650304  T
Q  318 gttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgtttt 395  Q
    ||||| ||||||||||||  | |||||||| |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1650305 gttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatgaattgattatgagaatttgaattgttgttggtgtttt 1650382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 266 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 27740941 - 27740808
Alignment:
Q  266 gttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgat 365  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| |||| |  ||   |||||||| || |||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||    
T  27740941 gttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgtggttgctattatctgatgttgttgtggatgaatcatggtttgggtatgcatattcatgaattgat 27740842  T
Q  366 gatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtg 399  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27740841 gatgaaaatttgaattggtgttggtgttttggtg 27740808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 148 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 25175787 - 25175531
Alignment:
Q  148 tatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatgg 246  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||||| | ||| |||||| | ||||| | |||||| |||||||||| ||||||| |||| |    
T  25175787 tatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattg 25175688  T
Q  247 atgaatttgacat--gttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttggg 344  Q
     |||||||  | |  ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||| || |  ||||||||| || | |||||    
T  25175687 gtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttggg 25175588  T
Q  345 tatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 402  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25175587 tatgcatattcatggattgatgatgagaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 25175531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 120 - 402
Target Start/End: Original strand, 27653983 - 27654267
Alignment:
Q  120 tgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 219  Q
    ||||||||| ||||||   || ||||| |||| ||||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||||| | ||| |||||| | ||||| | ||||    
T  27653983 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgcttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 27654082  T
Q  220 gagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacat--gttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 316  Q
    || |||||||||| ||||||| |||| | |||||||  | |  ||||| ||| | ||||| | |||||||||| | | ||||||| |  ||| || | ||    
T  27654083 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttccaatgatgttatgaatgttatttga 27654182  T
Q  317 tgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 402  Q
    | || |  ||||||||| || | |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  27654183 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattaatgatgagaatttgaattg-tgtcggtgttttggtgaaa 27654267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 35 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 23148335 - 23148266
Alignment:
Q  35 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaatttt 103  Q
    |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23148335 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttt 23148266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 2 - 66
Target Start/End: Original strand, 19983159 - 19983224
Alignment:
Q  2 aaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 66  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  19983159 aaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 19983224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 2 - 66
Target Start/End: Original strand, 35015024 - 35015089
Alignment:
Q  2 aaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 66  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  35015024 aaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 35015089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 259 - 413
Target Start/End: Original strand, 18381821 - 18381975
Alignment:
Q  259 tgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacat-attcat 357  Q
    |||||| ||||||||| | || || || ||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||| |||||||| |||| | |||||||| ||| ||||||    
T  18381821 tgttgttgttgaattgtgataagagtcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgttgatgattcatggcttgggtattcataattcat 18381920  T
Q  358 ggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 413  Q
    |  ||| |||||| ||  ||| |||||||||||| ||| |||||||| ||||||||    
T  18381921 gatttgttgatgagaa-atgagttgttgttggtggttttgtgaaattggtgaattg 18381975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 349 - 402
Target Start/End: Original strand, 16825986 - 16826038
Alignment:
Q  349 catattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 402  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16825986 catattcatggattgatgatgagaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 16826038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 27751688 - 27751605
Alignment:
Q  108 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggt 191  Q
    |||||| | ||| |||||||| |||||| || | ||||| ||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||    
T  27751688 atggataaatgtagctaaattcgtgctctaattgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgacaattgtatgattgttggt 27751605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 282 - 388
Target Start/End: Original strand, 22361926 - 22362032
Alignment:
Q  282 attcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacat-attcatggattgatgatgaaaatttgaat 380  Q
    |||| ||| ||||||||||||||| ||||||  ||| |||| |||||||| |||| | |||||| | ||| ||||||| ||||||||||| || |||| |    
T  22361926 attcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataattcatgaattgatgatgagaa-ttgagt 22362024  T
Q  381 tgttgttg 388  Q
    ||||||||    
T  22362025 tgttgttg 22362032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 108 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 29666137 - 29665937
Alignment:
Q  108 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgttt-- 205  Q
    |||||| ||||||| |||||| |||||| | || ||||| ||| ||  |||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||| | ||| |||||||      
T  29666137 atggataattgttgttaaattcgtgctctagctgtgatgttattttcttatgtatgaattgatgataattgtatgattgtgggtgaaattacatgtttca 29666038  T
Q  206 aaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgt 303  Q
    || |||| | |||||  |||||||| ||||||| |  ||| | |||| ||||  | ||||| |||||| |||| |||||||| ||| |||||||||||||    
T  29666037 aagtatgcataaatgtcaagttatg-aaattgtactcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaaatgagatatgattcatgttcaattgatgttgt 29665939  T
Q  304 tg 305  Q
    ||    
T  29665938 tg 29665937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 18583705 - 18583640
Alignment:
Q  2 aaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 66  Q
    ||||||||||| ||| || ||||||| |||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||    
T  18583705 aaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcat 18583640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 384 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 32898774 - 32898745
Alignment:
Q  384 tgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32898774 tgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 32898745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 258 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 21623278 - 21623123
Alignment:
Q  258 atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacat-attca 356  Q
    ||||||| ||||||||| | || || || ||| | ||||||||||||| ||||||  |||||||  ||| |||| |||| | |||||||| ||| |||||    
T  21623278 atgttgttgttgaattgtggtaagaatcatgttctattgatgttgttgttgctaagtgatgttgatgttaatgagtcatggcttgggtattcataattca 21623179  T
Q  357 tggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 413  Q
    ||  |||  ||||||||  ||| |||||||||||  |||||| ||||| ||||||||    
T  21623178 tgatttgtggatgaaaa-atgagttgttgttggtagtttggtaaaattggtgaattg 21623123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 258 - 322
Target Start/End: Original strand, 25367374 - 25367438
Alignment:
Q  258 atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgt 322  Q
    ||||||| ||||||||| | || ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  25367374 atgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgt 25367438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 291 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 33324770 - 33324690
Alignment:
Q  291 caattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacat-attcatggattgatgatga 370  Q
    ||||||||||||||  ||||||  |||||||| |||||||| |||| | |||||||| ||| ||||||| |||| ||||||    
T  33324770 caattgatgttgttattgctaagtgatgttgttgttgatgattcatggcttgggtattcataattcatgaattggtgatga 33324690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 291 - 370
Target Start/End: Original strand, 35136182 - 35136262
Alignment:
Q  291 caattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacat-attcatggattgatgatga 370  Q
    ||||||||||||||  ||||||  |||||||| |||||||| |||| | |||||||| ||| ||||||| |||| ||||||    
T  35136182 caattgatgttgttattgctaagtgatgttgttgttgatgattcatggcttgggtattcataattcatgaattggtgatga 35136262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 167; Significance: 3e-89; HSPs: 30)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 35 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 23507302 - 23506932
Alignment:
Q  35 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgc 133  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||  |||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  23507302 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatctccattttgtaagatttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgc 23507203  T
Q  134 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaa 233  Q
    ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  23507202 tccatttgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaa 23507103  T
Q  234 attgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatga 331  Q
    |||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||||| ||||||||    
T  23507102 attgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatga 23507003  T
Q  332 atcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 402  Q
    || || | |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23507002 ataattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 23506932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 35 - 413
Target Start/End: Original strand, 27182471 - 27182854
Alignment:
Q  35 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaatttgt 131  Q
    |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||  |    
T  27182471 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcat 27182570  T
Q  132 gctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatga 231  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| | | ||| |||||| ||||| | | |||||| ||||| |||    
T  27182571 gctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaactgatgataattgtatgattgttgatgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtga 27182670  T
Q  232 aaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgat 329  Q
    |||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| |||  |||||| |||||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||||| ||||||    
T  27182671 aaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgat 27182770  T
Q  330 gaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 413  Q
    ||||||| | ||| |||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27182771 gaatcattgcttgagtatgcatattcatgaattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttttgaattg 27182854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 35 - 394
Target Start/End: Original strand, 18530988 - 18531355
Alignment:
Q  35 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatc---atcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaat-tttgattat-ggatgattgttgctaaatt 128  Q
    |||||||||||| |||||||| | |||||||   ||||||||||||  | ||||||||||| |||||||| ||| || || |||| ||||||||||||||    
T  18530988 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcgtcatcatcattttgcaatttttcaaatgtggtatgaatgtttcataattggataattgttgctaaatt 18531087  T
Q  129 tgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagtta 228  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| || |||||| ||||| ||||||     
T  18531088 cgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttg 18531187  T
Q  229 tgaaaattgtg--caaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagt 325  Q
    |||||||||||  ||| ||| |||| ||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||| || |||| |||||||| ||    
T  18531188 tgaaaattgtgttcaattgg-tgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgt 18531286  T
Q  326 tgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttt 394  Q
    ||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18531287 tgatgaatcattgctcgggtatacatattcatgaattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttt 18531355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 35 - 398
Target Start/End: Original strand, 22053753 - 22054125
Alignment:
Q  35 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcat--tttgtgaa--ttttcaaatgttgtatgaattttgatta--tggatgattgttgctaaat 127  Q
    |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||  ||| ||||  ||||||||||| |||||||||||   ||  ||||| |||||||||||||    
T  22053753 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcatcatttttgaaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgttgctaaat 22053852  T
Q  128 ttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagtt 227  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||||| | ||| |||||| || |||||| ||||| ||||||    
T  22053853 tcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgtatgaattgatgatagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagtt 22053952  T
Q  228 atgaaaattgtgca-aatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagt 325  Q
     ||||||||||||  ||| | |||||||  | | ||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||| || |||| |||||||| ||    
T  22053953 gtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgt 22054052  T
Q  326 tgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggt 398  Q
    ||||||||||| | |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22054053 tgatgaatcattgcttgggtctacatattcatgaattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggt 22054125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 108 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 20623232 - 20623066
Alignment:
Q  108 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 207  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  20623232 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 20623133  T
Q  208 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 273  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20623132 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 20623066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 108 - 273
Target Start/End: Original strand, 21233528 - 21233694
Alignment:
Q  108 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 207  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  21233528 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 21233627  T
Q  208 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 273  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21233628 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 21233694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 108 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 37053007 - 37052844
Alignment:
Q  108 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 207  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |    
T  37053007 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 37052908  T
Q  208 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttgtagttga 270  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37052907 atatgtggaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttga 37052844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 108 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 16536460 - 16536294
Alignment:
Q  108 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 207  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |    
T  16536460 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaatttataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 16536361  T
Q  208 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 273  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16536360 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 16536294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 108 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 34939540 - 34939248
Alignment:
Q  108 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 207  Q
    |||||| | |||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||  |||||| ||    
T  34939540 atggataactgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaa 34939441  T
Q  208 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgca-aatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttg 305  Q
     |||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||| |||| ||||  | | ||  | || |||||||| |||||||||||| || |||||||| |||    
T  34939440 ttatgtaaaaatgtgaagttatgaaaattgtgctcaattgatggattttgctaagtcattgt-gaattgagttatgattcttgttcagttgatgttattg 34939342  T
Q  306 atgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtg 399  Q
     || |||| |||||||| ||||||||||||  | |||||||| |||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34939341 ctgttaattgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatgaataggtgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtg 34939248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 110 - 273
Target Start/End: Original strand, 25900408 - 25900571
Alignment:
Q  110 ggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaat 209  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||  |||||| |||    
T  25900408 ggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggttaaattatatgtttgaat 25900507  T
Q  210 atgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 273  Q
    ||||  |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  25900508 atgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-ttgacatgttgttgttgaatt 25900571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 120 - 402
Target Start/End: Original strand, 22366481 - 22366765
Alignment:
Q  120 tgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 219  Q
    ||||||||| ||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||||| | ||| |||||| | ||||| | ||||    
T  22366481 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 22366580  T
Q  220 gagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacat--gttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 316  Q
    || |||||||||| ||||||| |||| | |||||||  | |  ||||| ||| | ||||| | |||| ||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||    
T  22366581 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 22366680  T
Q  317 tgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 402  Q
    | || |  ||||||||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22366681 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatgagaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 22366765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 120 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 25426880 - 25426596
Alignment:
Q  120 tgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 219  Q
    ||||||||| ||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||||| | ||| |||||| | ||||| | ||||    
T  25426880 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 25426781  T
Q  220 gagaagttatgaaaattgtgcaaatg-gatgaatttgacat--gttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 316  Q
    || |||||||||| ||||||| || | | |||||||  | |  ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||    
T  25426780 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 25426681  T
Q  317 tgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 402  Q
    | || |  ||||||||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25426680 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatgagaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 25426596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 142 - 402
Target Start/End: Original strand, 18778014 - 18778276
Alignment:
Q  142 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc- 240  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||||| | ||| |||||| | ||||| | |||||| |||||||||| |||||||     
T  18778014 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgct 18778113  T
Q  241 aaatggatgaatttgacat--gttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcg 338  Q
    |||| | |||||||  | |  ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |  ||  || | ||| || |  ||||||||| || |    
T  18778114 aaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatattatttgatattatgattgatgaataattg 18778213  T
Q  339 tttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 402  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18778214 cttgggtatgcatattcatggattgatgatgagaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 18778276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 120 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 12626 - 12342
Alignment:
Q  120 tgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 219  Q
    ||||||||| ||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||||| | ||| |||||| | ||||| | || |    
T  12626 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 12527  T
Q  220 gagaagttatgaaaattgtgcaaatg-gatgaatttgacat--gttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 316  Q
    || |||||||||| ||||||| || | | |||||||  | |  ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||    
T  12526 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 12427  T
Q  317 tgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 402  Q
    | || |  ||||||||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12426 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatgagaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 12342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 428 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 20623079 - 20623007
Alignment:
Q  428 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattggggttgattgatgatgtccatctcatt 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||    
T  20623079 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgattgatgatgttgatctcatt 20623007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 428 - 500
Target Start/End: Original strand, 21233681 - 21233753
Alignment:
Q  428 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattggggttgattgatgatgtccatctcatt 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||    
T  21233681 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattgtggttgattgatgatgttgatctcatt 21233753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 120 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 19500151 - 19499867
Alignment:
Q  120 tgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 219  Q
    ||||||||| ||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||||| | ||| |||||| | ||||| | ||||    
T  19500151 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 19500052  T
Q  220 gagaagttatgaaaattgtgcaaatg-gatgaatttgacat--gttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 316  Q
    || |||||||||| ||||||| || | | |||||||  | |  ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||    
T  19500051 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 19499952  T
Q  317 tgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 402  Q
    | || |  ||||| ||| || | || ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19499951 tattatgattgattaataattgctttggtatgcatattcatggattgatgatgagaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 19499867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 120 - 402
Target Start/End: Original strand, 21073595 - 21073879
Alignment:
Q  120 tgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 219  Q
    ||||||||| ||||||   || ||||| ||||||||||||||||||| |||  ||  ||||| ||||||||| | ||| |||||| | ||||| | ||||    
T  21073595 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaatggatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 21073694  T
Q  220 gagaagttatgaaaattgtgcaaatg-gatgaatttgacat--gttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 316  Q
    || |||||||||| ||||||| || | | |||||||    |  ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||    
T  21073695 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttcttctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatcaatgttatttga 21073794  T
Q  317 tgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 402  Q
    | || |  ||||||||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21073795 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatgagaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 21073879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 142 - 383
Target Start/End: Original strand, 4200007 - 4200251
Alignment:
Q  142 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc- 240  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| | ||| |||||| | ||||| | |||||| |||||||||| ||| |||     
T  4200007 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatgct 4200106  T
Q  241 aaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcg 338  Q
    |||| | |||||||  |  ||||||| ||||| ||||| | |||||| ||| ||||||||||| |  ||| || | ||| || |  ||||||||| || |    
T  4200107 aaattggtgaatttctcttatgttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaatgattg 4200206  T
Q  339 tttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgt 383  Q
     |||||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  4200207 cttgggtttgcatattcatgggttgatgatgagaatttgaattgt 4200251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 328 - 412
Target Start/End: Original strand, 17471803 - 17471887
Alignment:
Q  328 atgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaatt 412  Q
    ||||||||| | |||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17471803 atgaatcattgcttgggtacgcatattcatgaattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaattggtgaatt 17471887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 142 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 27010071 - 27009809
Alignment:
Q  142 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc- 240  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||||||| ||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| |     
T  27010071 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgagtgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaatattgtact 27009972  T
Q  241 aaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcg 338  Q
     ||| | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||| ||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||| || |  || |||||| || |    
T  27009971 caattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattaatgaataattg 27009872  T
Q  339 tttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 402  Q
     |||||| | ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  27009871 cttgggtttgcatattcatggattgttgatgagaatttgagttg-tgttggtgttttggtgaaa 27009809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 120 - 240
Target Start/End: Original strand, 29188284 - 29188404
Alignment:
Q  120 tgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 219  Q
    ||||| ||| ||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| ||||    
T  29188284 tgctagattcgtgctcttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 29188383  T
Q  220 gagaagttatgaaaattgtgc 240  Q
    || ||||| ||||||| ||||    
T  29188384 gataagttgtgaaaatggtgc 29188404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 142 - 402
Target Start/End: Original strand, 43443417 - 43443679
Alignment:
Q  142 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc- 240  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| | ||| |||||| | ||||| | |||||| |||||||||| |||||||     
T  43443417 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgct 43443516  T
Q  241 aaatggatgaatt--tgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcg 338  Q
     ||| | ||||||  |   | ||||| ||||| ||||| | ||| |||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||| || |  ||||||||| || |    
T  43443517 caattggtgaatttcttctaagttgttgttgatttgagatgtgagtcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattg 43443616  T
Q  339 tttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 402  Q
     |||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  43443617 cttgggtttgcatattcatggattgatgatgaggatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 43443679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 428 - 500
Target Start/End: Original strand, 25900558 - 25900630
Alignment:
Q  428 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattggggttgattgatgatgtccatctcatt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  ||||||||    
T  25900558 gttgttgttgaattatgatggagggtatgattatatgttatgattgtagttgattgatgatgttgatctcatt 25900630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 428 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 37052854 - 37052782
Alignment:
Q  428 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattggggttgattgatgatgtccatctcatt 500  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||    
T  37052854 gttgttgttgagttatgatggagggtatgattatatgttatgattgtggttgattgatgatgttgatctcatt 37052782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 322 - 395
Target Start/End: Original strand, 29190479 - 29190552
Alignment:
Q  322 tagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgtttt 395  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29190479 tagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgattatgagaatttgaattgttgttggtgtttt 29190552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 428 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 16536307 - 16536235
Alignment:
Q  428 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattggggttgattgatgatgtccatctcatt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||  ||||||||    
T  16536307 gttgttgttgaattatgatggagggtatgattgtatgttatgattgtagttgattgatgatgttgatctcatt 16536235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 258 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 23494029 - 23493916
Alignment:
Q  258 atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacat-attca 356  Q
    ||||||| ||||||||| | || ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||| | |||||| |||| | |||||| | ||| |||||    
T  23494029 atgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgatgattcatggcttgggtgttcataattca 23493930  T
Q  357 tggattgatgatga 370  Q
    ||  ||||||||||    
T  23493929 tgatttgatgatga 23493916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 258 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 7728530 - 7728466
Alignment:
Q  258 atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgt 322  Q
    ||||||| ||||||||| | || ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  7728530 atgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgt 7728466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 2 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 11584438 - 11584394
Alignment:
Q  2 aaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg 46  Q
    ||||||||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||||    
T  11584438 aaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggg 11584394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 162; Significance: 3e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 35 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 42066 - 41686
Alignment:
Q  35 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgc 133  Q
    |||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  42066 taaggtaagggggttggtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgc 41967  T
Q  134 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaa 233  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||   ||||||||| | ||| |||| | ||||||||| |||||| || || |||||    
T  41966 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtcatattgttggtgaaattacatgctcaaatatgtaaaaatgataatttgtgaaa 41867  T
Q  234 attgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatga 331  Q
    |||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| |||  |||||| |||||||||||| ||||||||| | | | || |||| | |||||||| ||||||    
T  41866 attgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgctatggctgttaattgttgttgtagatgatga 41767  T
Q  332 atcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 413  Q
    ||||| | |||||||| |||||||||| |||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41766 atcattggttgggtatgcatattcatgaattgattattagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa-ttgtgaattg 41686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 155; Significance: 5e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 35 - 402
Target Start/End: Original strand, 882 - 1250
Alignment:
Q  35 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgc 133  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| |||   |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  882 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcttcactttacaaattctcaaatgttgtatgaattgtgattatggataattgttgctaaattcgtgc 981  T
Q  134 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaa 233  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||| | ||||| |||||    
T  982 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttgtgaaa 1081  T
Q  234 attgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatga 331  Q
    |||||||  ||| |||||| ||||  | ||||| ||| ||||||| | | |||||||| ||| ||||||| | |||| ||||  ||||| |  |||||||    
T  1082 attgtgctcaattgatgaattttgctaagttgttgtt-aattgagattttattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatga 1180  T
Q  332 atcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 402  Q
    || || | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1181 ataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgtt-ttggtgttttggtgaaa 1250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 152; Significance: 3e-80; HSPs: 3)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 35 - 402
Target Start/End: Original strand, 128095 - 128464
Alignment:
Q  35 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgc 133  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  128095 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcttcattttgcaaattttcaaaagttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgc 128194  T
Q  134 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaa 233  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| | ||| |||||| |||| |||| |  ||  ||||| |||||    
T  128195 ttcaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgtaaaggtgttaagttgtgaaa 128294  T
Q  234 attgtg--caaatggatgaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatga 331  Q
    ||||||  ||| |||   | ||||  | ||||| ||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||| | |||| |||| ||||||||  |||||||    
T  128295 attgtgctcaattggcgaattttgttaggttgttgtt-aattgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaatggatgttgtgattgatga 128393  T
Q  332 atcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 402  Q
    || || | |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  128394 ataattgattgggtatgcatattcatgaattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 128464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 142 - 383
Target Start/End: Original strand, 31697 - 31942
Alignment:
Q  142 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc- 240  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| | ||| ||| || | ||||| | |||||| |||||||||| ||| |||     
T  31697 tgatgttatgtttgaatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatattcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatgct 31796  T
Q  241 aaatggatgaatttgac---atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatc 337  Q
     ||| | |||||||  |   | ||||| ||||| ||||| | |||||| ||| ||||||||||| |  ||| || |  || || |  ||||||||| ||     
T  31797 caattggtgaatttctcctaaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttaatattatgattgatgaataatt 31896  T
Q  338 gtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgt 383  Q
    | |||||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  31897 gcttgggtttgcatattcatggattaatgatgagaatttgaattgt 31942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 381 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 22678 - 22650
Alignment:
Q  381 tgttgttggtgttttggtgaaatttgtga 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22678 tgttgttggtgttttggtgaaatttgtga 22650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 147; Significance: 3e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 35 - 402
Target Start/End: Original strand, 5990 - 6358
Alignment:
Q  35 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgc 133  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||  ||| ||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  5990 taaggtaagggggttagtctttatcataatcattttcactttgcaaattctcaaatgttgtatgaattgtgattatggataattgttgctaaattcgtgc 6089  T
Q  134 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaa 233  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||| | ||||| | |||    
T  6090 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttgtaaaa 6189  T
Q  234 attgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatga 331  Q
    |||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||| ||||||| | |||||||||| ||| ||||||| | |||| ||||   |||| |  |||||||    
T  6190 attgtgctgaattggtgaattttgctaagttgttgtt-aattgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttttgttatgattgatga 6288  T
Q  332 atcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 402  Q
    || || | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6289 ataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatgaaaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 6358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 147; Significance: 3e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 35 - 402
Target Start/End: Original strand, 247366 - 247738
Alignment:
Q  35 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaatttgt 131  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||| ||    
T  247366 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgt 247465  T
Q  132 gctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatga 231  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||| | ||| |||||| ||||| | | |||||| ||||| |||    
T  247466 gctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgagggtgaaatttcatgttcaaataggaacaaatgataagttgtga 247565  T
Q  232 aaattgtg--caaatggatgaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgat 329  Q
    ||||||||  ||| |||   | ||||  | ||||| |||  |||||| |||||||||||| ||||||||||| |   || |||| |||||||| ||||||    
T  247566 aaattgtgctcaattggtaaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatgactgttaattgatgttgtggttgat 247665  T
Q  330 gaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 402  Q
    ||||||| | |||||||| |||||||||| | ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  247666 gaatcattgcttgggtatgcatattcatgaactgaggatgagaatttgaatggttgttggtgttttggtgaaa 247738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 147; Significance: 3e-77; HSPs: 3)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 35 - 402
Target Start/End: Original strand, 123087 - 123460
Alignment:
Q  35 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcatttt-gtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaatttg 130  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||| |    
T  123087 taaggtaagggggttagtcttcaccataatcatcataatttttgtaaatttgcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcg 123186  T
Q  131 tgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatg 230  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||| | | |||||| ||||| ||    
T  123187 tgctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtg 123286  T
Q  231 aaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttga 328  Q
    ||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| |||  ||| || |||||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||||| |||||    
T  123287 aaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagattaagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttga 123386  T
Q  329 tgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 402  Q
    ||||| || | |||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  123387 tgaataatggcttgggtatgcatattcatgaattgaagatgagaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 123460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 381 - 413
Target Start/End: Original strand, 255074 - 255106
Alignment:
Q  381 tgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 413  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  255074 tgttgttggtgttttcgtgaaatttgtgaattg 255106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 381 - 413
Target Start/End: Original strand, 261680 - 261712
Alignment:
Q  381 tgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 413  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  261680 tgttgttggtgttttcgtgaaatttgtgaattg 261712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 145; Significance: 4e-76; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 35 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 172242 - 171863
Alignment:
Q  35 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgc 133  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||  ||||    
T  172242 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtataaattttgattatggataactgttgctaaatacgtgc 172143  T
Q  134 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaa 233  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| |||| | ||| |||||| ||||| | | |||||| ||||| |||||    
T  172142 tccaactgtgatgatatgtttgtatggatgaattgatgataattgtatgattgatggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaa 172043  T
Q  234 attgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatga 331  Q
    ||||||| |||| | |||| ||||  | ||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||||| ||||||||    
T  172042 attgtgctaaattggtgaattttgctaagttgtggttgaattgagttacgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatga 171943  T
Q  332 atcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaatt 412  Q
    ||||| | || ||||| ||||||||||  ||| || | || |  || ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||    
T  171942 atcattgcttaggtatgcatattcatgatttgttg-ttaagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaatt 171863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 35 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 177945 - 177566
Alignment:
Q  35 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgc 133  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||  ||||    
T  177945 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtataaattttgattatggataactgttgctaaatacgtgc 177846  T
Q  134 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaa 233  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| |||| | ||| |||||| ||||| | | |||||| ||||| |||||    
T  177845 tccaactgtgatgatatgtttgtatggatgaattgatgataattgtatgattgatggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaa 177746  T
Q  234 attgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatga 331  Q
    ||||||| |||| | |||| ||||  | ||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||||| ||||||||    
T  177745 attgtgctaaattggtgaattttgctaagttgtggttgaattgagttacgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatga 177646  T
Q  332 atcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaatt 412  Q
    ||||| | || ||||| ||||||||||  ||| || | || |  || ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||    
T  177645 atcattgcttaggtatgcatattcatgatttgttg-ttaagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattggtgaatt 177566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 381 - 413
Target Start/End: Original strand, 70882 - 70914
Alignment:
Q  381 tgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 413  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  70882 tgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 70914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 141; Significance: 1e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 35 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 12450 - 12083
Alignment:
Q  35 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaa-ttttgattatggatgattgttgctaaatttgtg 132  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||| || ||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  12450 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcttaattttgt-aactttcaaatgctgtatgaaattttgattatggataattgttgctaaattcgtg 12352  T
Q  133 ctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaa 232  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | | | ||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||    
T  12351 ctctaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaaatacatgtttaaatgtgtaaaaatgataagttgtgaa 12252  T
Q  233 aattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatg 330  Q
    |||||||| |||| | |||| ||||  | ||||| ||  ||||||| | |||||||||| ||||||||||| |  ||| |||| |||||| |  || |||    
T  12251 aattgtgctaaattggtgaattttgttaagttgttgt--aattgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattgatgttatgattcatg 12154  T
Q  331 aatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 402  Q
    ||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  12153 aataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatgagaatttgaattg-tgttggtgttttagtgaaa 12083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 138; Significance: 6e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 44 - 402
Target Start/End: Original strand, 4996 - 5356
Alignment:
Q  44 gggttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttg-attatggatgattgttgctaaatttgtgctccaacttt 142  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || |||||| |||||||||||||| || |||||||| |    
T  4996 gggttagtctttatcataatcattatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttcataatggataattgttgctaaattcgtactccaactgt 5095  T
Q  143 gatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-a 241  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||||||| | | | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||      
T  5096 gacgatatgtttgtatgcgtgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaagtacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctc 5195  T
Q  242 aatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtt 340  Q
    ||| | |||| ||||  | ||||| |||  | |||| |||||||||||| ||||||||||| | | || |||| ||||||||  |||||||||||| | |    
T  5196 aattggtgaattttgcaaagttgttgttagaatgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtgattgatgaatcattgct 5295  T
Q  341 tgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 402  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  5296 tgggtatgcatattcatgaattgaggatgagaatttgaa-tgttgttggtgttttgatgaaa 5356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 137; Significance: 3e-71; HSPs: 3)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 46 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 9180 - 8820
Alignment:
Q  46 gttagtctttaccataatcatcatcat----tttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgatta--tggatgattgttgctaaatttgtgctccaac 139  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||    ||||  | ||||||||||| ||||| |||||   ||  ||||| |||||||||||||| |||||||| |    
T  9180 gttagtcttcatcataatcatcatcatcatttttgcaatttttcaaatgtggtatgtatttttcataattggataattgttgctaaattcgtgctccatc 9081  T
Q  140 tttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtg 239  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| || |||||| ||||| |||||| |||||||||||    
T  9080 tgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtg 8981  T
Q  240 ca-aatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatc 337  Q
    |  ||| | |||||||  | | ||||| ||||||||||| |||||||  ||| ||||||||||| ||| |  |||| |||||||| |||||||||||||     
T  8980 ctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattaatgttcaattgatgttattgctattaattgatgttgttgttgatgaatcatt 8881  T
Q  338 gtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggt 398  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8880 gcttgggtatacatattcatgaattgatgatgaaaatttgaatttttgttggtgttttggt 8820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 76 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 149018 - 148688
Alignment:
Q  76 gtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataat 173  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||   || || ||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  149018 gtgaaatttcaaatgttgtatgaatttttgcataattgataattgttgttaaatttgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgat 148919  T
Q  174 aagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaa 271  Q
    || |||| |||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||| |     
T  148918 aattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttaat 148819  T
Q  272 ttgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaa 371  Q
    ||||| | |||||||||| ||||||||||| | | || |||| || ||||| ||||||||||||| | ||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  148818 ttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgaagttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgtatattcatgaattgatgatgag 148719  T
Q  372 aatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 402  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  148718 aatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 148688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 35 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 146938 - 146844
Alignment:
Q  35 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatt 128  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  146938 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttcctaaatt 146844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 135; Significance: 4e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 35 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 9215 - 8846
Alignment:
Q  35 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgc 133  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||| |||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||    
T  9215 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcttcattttgcaaattttcaaaagttgtacgaattttgcttatggaaaattgttgctaaattcgtgc 9116  T
Q  134 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaa 233  Q
    ||||  | ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| |||| |||||||||| | ||| |||||| || |||||| |||||  ||||| |||||    
T  9115 tccatttgtgatgttatgtttgtatgcatgaatcgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgttaagttgtgaaa 9016  T
Q  234 attgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatga 331  Q
    |||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | |||| |||| ||||||||  |||||||    
T  9015 attgtgctcaattggtgaattttgttaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaattgatgttgtgattgatga 8916  T
Q  332 atcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 402  Q
    || || | |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8915 ataattgcttgggtatgcatattcatgtattgatgatgagaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 8846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 35 - 402
Target Start/End: Original strand, 26340 - 26710
Alignment:
Q  35 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttg-attatggatgattgttgctaaatttgtg 132  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || ||| || |||||||||||||| |||    
T  26340 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatgatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttcataatgtataattgttgctaaattcgtg 26439  T
Q  133 ctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaa 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||| ||||| | | | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  26440 ctccaactttgatgatatgtttgtatgcgtgaattgatgataattgtaagattattggtgaaagtacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaa 26539  T
Q  233 aattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatg 330  Q
    |||||| |  ||| | |||| ||||  | ||||| |||  | |||| |||||||||||| ||||||||||| | | || |||| ||||||||  ||||||    
T  26540 aattgttctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagaatgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtgattgatg 26639  T
Q  331 aatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 402  Q
    |||||| | |||||||| |||||| ||| ||||| ||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||    
T  26640 aatcattgcttgggtatgcatattgatgaattgaggatgagaatttg-agtgttgttggtgttttgatgaaa 26710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 108 - 395
Target Start/End: Original strand, 8180 - 8466
Alignment:
Q  108 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 207  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| | ||| || ||| ||    
T  8180 atggataattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattggtgataattgtatgattgttggtgaaattacaggttcaa 8279  T
Q  208 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttg 305  Q
     |||||| ||||| |||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  |||||   ||||||||  | |  ||  | ||| |||||||||||||||    
T  8280 ttatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctatgtt---gttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttg 8376  T
Q  306 atgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgtttt 395  Q
     || |||| |||||||| ||| ||||||||| | |||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  8377 ttgttaattgatgttgttgtttatgaatcatggcttgggtatgcatatacatgaattgatgatgagaatttgaattgttgctggtgtttt 8466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 125; Significance: 4e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 35 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 272362 - 271983
Alignment:
Q  35 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgc 133  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| | | |||||||||  || |    
T  272362 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatattgtataaattttgattatggataaatattgctaaatacgtac 272263  T
Q  134 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaa 233  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| |||  | ||| |||||| ||||| | | |||||| ||||| |||||    
T  272262 tccaactgtaatgatatgtttgtatgaatgaattgatgataattgtatgattgatggagaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaa 272163  T
Q  234 attgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatga 331  Q
    ||||||| |||| | |||| ||||  | ||||| |||| |||||| |||||||||||| |||||| |||| | | || |||| |||||||| ||||||||    
T  272162 attgtgctaaattggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattggtgttatagctgttaattgatgttgtggttgatga 272063  T
Q  332 atcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaatt 412  Q
    ||||| | |||||||| |||||||||| |||| | ||  | |  || ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||    
T  272062 atcattgcttgggtatgcatattcatgaattg-ttatagagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaattagtgaatt 271983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 47 - 240
Target Start/End: Original strand, 51121 - 51314
Alignment:
Q  47 ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatg 146  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  51121 ttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatg 51220  T
Q  147 atatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 240  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| | ||| |||||| ||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  51221 atatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaataggtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgc 51314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 4)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 108 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 27058 - 26892
Alignment:
Q  108 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 207  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |    
T  27058 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 26959  T
Q  208 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 273  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26958 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 26892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 115 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 22796 - 22637
Alignment:
Q  115 attgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgta 214  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||     
T  22796 attgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtg 22697  T
Q  215 gaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 273  Q
     |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22696 aaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 22637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #3
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 428 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 22650 - 22578
Alignment:
Q  428 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattggggttgattgatgatgtccatctcatt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  ||||||||    
T  22650 gttgttgttgaattatgatggagggtatgattatatgttatgattgtagttgattgatgatgttgatctcatt 22578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #4
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 428 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 26905 - 26833
Alignment:
Q  428 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattggggttgattgatgatgtccatctcatt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  ||||||||    
T  26905 gttgttgttgaattatgatggagggtatgattatatgttatgattgtagttgattgatgatgttgatctcatt 26833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 108 - 273
Target Start/End: Original strand, 1582 - 1748
Alignment:
Q  108 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 207  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |    
T  1582 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 1681  T
Q  208 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 273  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1682 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 1748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 428 - 500
Target Start/End: Original strand, 1735 - 1807
Alignment:
Q  428 gttgttgttgaattatgatggagtgtatgattatatgttatgattggggttgattgatgatgtccatctcatt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  ||||||||    
T  1735 gttgttgttgaattatgatggagggtatgattatatgttatgattgtagttgattgatgatgttgatctcatt 1807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 118; Significance: 6e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 115 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 48443 - 48155
Alignment:
Q  115 attgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgta 214  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| |||| ||||    
T  48443 attgttgctaaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgta 48344  T
Q  215 gaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaa 312  Q
     |||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | |||| |||    
T  48343 aaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgttaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatagatgttaa 48244  T
Q  313 tagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 402  Q
    | ||||||||  ||||||||| || |  ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  48243 ttgatgttgtgattgatgaataattgcctgggtatgcatattcatggattgatgatgagaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 48155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 3)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 115 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 108003 - 107715
Alignment:
Q  115 attgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgta 214  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| |||| || |    
T  108003 attgttactaaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgca 107904  T
Q  215 gaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaa 312  Q
     |||||| ||||| | ||||||||||  ||| | |||| ||||| | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | |||| |||    
T  107903 aaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaattggtgaattttgataagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaa 107804  T
Q  313 tagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 402  Q
    | ||||||||  ||||||||| || | |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  107803 ttgatgttgtgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatgaaaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 107715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 177 - 402
Target Start/End: Original strand, 64585 - 64812
Alignment:
Q  177 tgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaatt 273  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||  ||| | |||||||  |  | ||||| ||| | ||    
T  64585 tgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaattt 64684  T
Q  274 gagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaa 373  Q
    ||| | |||| ||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||| || |  || |||||| || | |||||| | ||||||||||||||| |||||| ||    
T  64685 gagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgttgatgagaa 64784  T
Q  374 tttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 402  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  64785 tttgagttg-tgttggtgttttggtgaaa 64812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 165
Target Start/End: Original strand, 89863 - 89905
Alignment:
Q  123 taaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa 165  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  89863 taaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa 89905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 110; Significance: 3e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 108 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 13769 - 13480
Alignment:
Q  108 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 207  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||    
T  13769 atggataattgttgctaaattcgtgctctaactttgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 13670  T
Q  208 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttg 305  Q
     |||||| ||||| |||||| ||||||||||||  ||| |||||| ||||  ||||||| ||||||||  | |  ||  | ||| |||||||||||||||    
T  13669 ttatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattttgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttg 13570  T
Q  306 atgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgtttt 395  Q
     || |||| |||||||| |||||||||||||   |||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||    
T  13569 ttgttaattgatgttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatattcatgaattgacgatgagaatttgaatttttgtaggtgtttt 13480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 42739 - 42677
Alignment:
Q  2 aaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 66  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  42739 aaagtgaagctagagctaatagttggagata---aaggtaagggggttagtttttatcataatcat 42677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 108; Significance: 5e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 108 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 41911 - 41622
Alignment:
Q  108 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 207  Q
    |||||| ||||||| |||||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||    
T  41911 atggataattgttgttaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 41812  T
Q  208 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtg--caaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgtt 304  Q
     |||||| ||||| |||||| |||||||||||  ||| ||| |||| ||||  ||||||| ||||||||  | |  ||  | ||| ||||||||||||||    
T  41811 ttatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgttcaattgg-tgaattttgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgtt 41713  T
Q  305 gatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgtttt 395  Q
    | || |||  |||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41712 gttgttaaatgatgttgttgttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatgagaatttgaattgttgttggtgtttt 41622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1542 (Bit Score: 103; Significance: 5e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold1542
Description:

Target: scaffold1542; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 108 - 400
Target Start/End: Original strand, 534 - 828
Alignment:
Q  108 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 207  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||    
T  534 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 633  T
Q  208 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttg 305  Q
    ||| | | ||||||  |||| |||||||||| |  ||| | |||| ||||  | |||   |||  ||| || ||||||||||||  |||||||||| | |    
T  634 ataggaacaaatgatgagttgtgaaaattgtactcaattggtgaattttgctaagttactgttagattaagttatgattcttgtttaattgatgttatgg 733  T
Q  306 atgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtga 400  Q
     ||||||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||| | ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  734 ctgctaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcaggaattgaggatgagaatttgaatggttgttggtgttttggtga 828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 100; Significance: 3e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 108 - 399
Target Start/End: Original strand, 34460 - 34755
Alignment:
Q  108 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 207  Q
    |||||| ||| |||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||    
T  34460 atggataattattgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 34559  T
Q  208 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgca-aatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgc-aattgatgttgtt 304  Q
     | |||| ||||  |||||| |||||||||| |  ||| | |||||||  | | ||||| ||||||||||| |||||||| |||   |||||||||| ||    
T  34560 ttgtgtaaaaatatgaagttgtgaaaattgttctcaataggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttttaattgatgttatt 34659  T
Q  305 gatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaa-tttgaattgttgttggtgttttggtg 399  Q
    | || || | |||||||| ||||||||||||    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34660 gttgttatttgatgttgttgttgatgaatcactacttgggtatgcatattcatggattgatgatgaaaattttgaattgttgttggtgttttggtg 34755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 98; Significance: 5e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 35 - 240
Target Start/End: Original strand, 89378 - 89586
Alignment:
Q  35 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaatttgt 131  Q
    |||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||   || |||||| |||||||||||||| ||    
T  89378 taaggtaagggggttagtcttcatcatgatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttctatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgt 89477  T
Q  132 gctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatga 231  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||| | | |||| | ||||| |||    
T  89478 gctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaattataagttgtga 89577  T
Q  232 aaattgtgc 240  Q
    |||||||||    
T  89578 aaattgtgc 89586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 35 - 159
Target Start/End: Original strand, 107708 - 107835
Alignment:
Q  35 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaatttt--gattatggatgattgttgctaaatttgt 131  Q
    |||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||| ||| |||||||||| ||    
T  107708 taaggtaagggggttagtcttcatcatgatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataatttttgctaaattcgt 107807  T
Q  132 gctccaactttgatgatatgtttgtatg 159  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  107808 gctccaactgtgatgatatatttgtatg 107835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 92; Significance: 2e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 142 - 395
Target Start/End: Original strand, 9371 - 9626
Alignment:
Q  142 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgca 241  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||     
T  9371 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggtgct 9470  T
Q  242 -aatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgt 339  Q
     ||| | |||||||  | | ||| | ||| | ||||| | |||||||||  ||| ||||||| | | || |||| |||||||||||||||||||||| |     
T  9471 caattggtgaattttgctaagttattgttaatttgagatttgattcttgctcaaatgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatgaatcattgc 9570  T
Q  340 ttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgtttt 395  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9571 ttgggtatgcatattcatgaattgattatgagaatttgaattgttgttggtgtttt 9626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 142 - 395
Target Start/End: Original strand, 16269 - 16524
Alignment:
Q  142 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgca 241  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||     
T  16269 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggtgct 16368  T
Q  242 -aatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgt 339  Q
     ||| | |||||||  | | ||| | ||| | ||||| | |||||||||  ||| ||||||| | | || |||| |||||||||||||||||||||| |     
T  16369 caattggtgaattttgctaagttattgttaatttgagatttgattcttgctcaaatgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatgaatcattgc 16468  T
Q  340 ttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgtttt 395  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16469 ttgggtatgcatattcatgaattgattatgagaatttgaattgttgttggtgtttt 16524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 88; Significance: 4e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 119 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 3215 - 2936
Alignment:
Q  119 ttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaa 218  Q
    |||||||||| ||||||   || ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| || |||||| |||    
T  3215 ttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatccatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaa 3116  T
Q  219 tgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttg-tgcaattgatgttgttgatgctaatag 315  Q
    || |||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| || |  |||||||||| ||| || || | |    
T  3115 tgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttttaattgatgttattgttgttatttg 3016  T
Q  316 atgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgtttt 395  Q
    ||||||| ||||||||||||  | ||| |||| |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3015 atgttgttgttgatgaatcactgcttgtgtatgcatattcatgaattgattatgagaatttgaattgttgttggtgtttt 2936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622 (Bit Score: 83; Significance: 4e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0622
Description:

Target: scaffold0622; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 271 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 9480 - 9338
Alignment:
Q  271 attgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatga 370  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  9480 attgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatga 9381  T
Q  371 aaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 413  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  9380 gaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaaatggtgaattg 9338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 81; Significance: 7e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 158 - 402
Target Start/End: Original strand, 5254 - 5498
Alignment:
Q  158 tgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtg--caaatggatgaatttg 255  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||  ||| ||| |||||||     
T  5254 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaattgg-tgaatttt 5352  T
Q  256 acat-gttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatatt 354  Q
     |   ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| |  ||| |||| ||||||||  || |||||| || | |||||| | ||||||    
T  5353 gctgagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattgatgttgtgattaatgaataattgcttgggt-tgcatatt 5451  T
Q  355 catggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 402  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5452 catggattgatgatgaaaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 5498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772 (Bit Score: 78; Significance: 4e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0772
Description:

Target: scaffold0772; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 115 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 5785 - 5660
Alignment:
Q  115 attgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgta 214  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  5785 attgttgctaaattcgtgctccaactttgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgta 5686  T
Q  215 gaaatgagaagttatgaaaattgtgc 240  Q
     |||||| |||| ||||| |||||||    
T  5685 aaaatgataagtcatgaatattgtgc 5660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 72; Significance: 2e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 158 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 3936 - 3690
Alignment:
Q  158 tgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaa-tgagaagttatgaaaattgtg-caaatggatgaatttg 255  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| ||| ||| |||||||| |||||||| | ||| | |||||||     
T  3936 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaaatgataagttatggaaattgtgtccaattggtgaatttt 3837  T
Q  256 ac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatatt 354  Q
     | | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| |  ||| |||| |||||| |  ||||||||| ||   |||||| | ||||||    
T  3836 gctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattgatgttatgattgatgaataattacttgggtttgcatatt 3737  T
Q  355 catggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 402  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  3736 catggattgatgatgaaaatttgaattg-tgttgatgttttggtgaaa 3690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 68; Significance: 4e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 143 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 43226 - 42965
Alignment:
Q  143 gatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-a 241  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||  |||||||||| ||||||| |    
T  43226 gatgttatgtttctatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgaagattgtgcta 43127  T
Q  242 aatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgt 339  Q
    ||| | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||||| ||| ||| ||||||| |  ||| || | ||| || |  ||||||||| || |     
T  43126 aattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgattcgtgttcaagtgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgc 43027  T
Q  340 ttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 402  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  43026 ttgggtttgcatattcatggattgatgatgagaatttaaattg-tgttggtgttttggtgaaa 42965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 63; Significance: 4e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 142 - 402
Target Start/End: Original strand, 14083 - 14344
Alignment:
Q  142 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc- 240  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| | |||||||||| || | ||| |||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||     
T  14083 tgatgttatgtctgtatgcatgaattgatgataattatatgattgttagtgaaattacatgttgaaatatgtaaaaatgataagttatgaagattgtgct 14182  T
Q  241 aaatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgt 339  Q
     ||| | |||||||  | | ||||| | | | ||||| |  ||||||||| ||||| ||||| |  ||| |  | |||||| |  ||||||||| || |     
T  14183 caattggtgaattttcctaagttgttgataatttgagattggattcttgttcaattaatgttatgaatgttgtttgatgttatgattgatgaataattgc 14282  T
Q  340 ttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 402  Q
    ||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14283 ttgagtttgcatattcatggattgatgatgaaaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 14344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 142 - 402
Target Start/End: Original strand, 21138 - 21399
Alignment:
Q  142 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgca 241  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||| | |||||||||| || | ||| |||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||| ||     
T  21138 tgatgttatgtttgtatccattaattgatgataattatatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaagattgagct 21237  T
Q  242 -aatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgt 339  Q
     ||| | |||||||  | | ||||| ||| | ||||| |  ||||||||| ||||||||||| |  ||| || | |||||| |  ||||||||| || |     
T  21238 caattggtgaattttcctaagttgttgttaatttgagattggattcttgttcaattgatgttatgaatgttatttgatgttatgattgatgaataattgc 21337  T
Q  340 ttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 402  Q
    ||| || | |||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  21338 ttgagtttgcatattcatggattaatgatgaaaatttgaactg-tgttggtgttttggtgaaa 21399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 142 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 265 - 3
Alignment:
Q  142 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc- 240  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| | |||||||     
T  265 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgtatattgtgct 166  T
Q  241 aaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcg 338  Q
     ||| | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||| ||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||| || |  || |||||| || |    
T  165 caattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattaatgaataattg 66  T
Q  339 tttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 402  Q
     |||||| | |||||||||| |||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  65 cttgggtttgcatattcatgaattgttgatgagaatttgagttg-tgttggtgttttggtgaaa 3  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 142 - 240
Target Start/End: Original strand, 13347 - 13445
Alignment:
Q  142 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 240  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||    
T  13347 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggtgc 13445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 280 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 48603 - 48482
Alignment:
Q  280 tgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaa 379  Q
    |||||||||| || |||||||| | |||| |||| |||||| |  ||||||||| || | |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48603 tgattcttgttcacttgatgttatggatgttaattgatgttatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatgaaaatttgaa 48504  T
Q  380 ttgttgttggtgttttggtgaaa 402  Q
    ||| ||||||||||||| |||||    
T  48503 ttg-tgttggtgttttgatgaaa 48482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1560 (Bit Score: 51; Significance: 5e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold1560
Description:

Target: scaffold1560; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 280 - 402
Target Start/End: Original strand, 26 - 147
Alignment:
Q  280 tgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaa 379  Q
    |||||||||| ||| |||| || |  ||| |||| |||||| |  ||||||||| || | |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26 tgattcttgttcaaatgatattatgaatgttaattgatgttatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatgaaaatttgaa 125  T
Q  380 ttgttgttggtgttttggtgaaa 402  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  126 ttgtt-ttggtgttttggtgaaa 147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 46; Significance: 5e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 158 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 54630 - 54415
Alignment:
Q  158 tgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaa--tatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgca-aatggatgaattt 254  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| | ||| ||||||| ||  |||||| |||||  ||||||||||| |||| |  ||| | |||||||    
T  54630 tgcatgaattgatgataattgtatgattgtgggtgaaattgcatgtttcaaagtatgtataaatgtcaagttatgaaa-ttgtactcaattggtgaattt 54532  T
Q  255 -gacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatat 353  Q
     || ||||||| |||||| |||| | |||||| ||| | ||||||||||||| |  |||  |||||||| || | ||||||||   ||||||||||||||    
T  54531 tgatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccattgatgttgttgctattaactgatgttgttgtgggtgaatcatgagttgggtatacatat 54432  T
Q  354 tcatggattgatgatga 370  Q
    | |||||||||||||||    
T  54431 ttatggattgatgatga 54415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 46; Significance: 5e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 2 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 80252 - 80187
Alignment:
Q  2 aaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 66  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  80252 aaagtgaagcttgagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 80187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1711 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold1711
Description:

Target: scaffold1711; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 120 - 240
Target Start/End: Original strand, 1304 - 1424
Alignment:
Q  120 tgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 219  Q
    ||||||||| ||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| | ||| |||||| | ||||| | ||||    
T  1304 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 1403  T
Q  220 gagaagttatgaaaattgtgc 240  Q
    || |||||||||| |||||||    
T  1404 gataagttatgaatattgtgc 1424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0361 (Bit Score: 44; Significance: 8e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0361
Description:

Target: scaffold0361; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 315 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 3262 - 3183
Alignment:
Q  315 gatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttt 394  Q
    ||||||||  |||||||||||| |||||||||  |||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  3262 gatgttgtgattgatgaatcattgtttgggtaggcatattcatgaattgatgaagagaattggaattgttgttggtgttt 3183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0361; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 108 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 3453 - 3370
Alignment:
Q  108 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggt 191  Q
    |||||| |||| ||||||||| |||||| | || ||||| || ||||||||||||||||| || |||  |||||||||||||||    
T  3453 atggataattgatgctaaattcgtgctctagctgtgatgttaagtttgtatgcatgaattaatgatatttgtatgattgttggt 3370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 3)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 67
Target Start/End: Original strand, 162045 - 162111
Alignment:
Q  2 aaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcatc 67  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||    
T  162045 aaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcatc 162111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 67
Target Start/End: Original strand, 166131 - 166197
Alignment:
Q  2 aaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcatc 67  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||    
T  166131 aaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcatc 166197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 295 - 414
Target Start/End: Original strand, 116687 - 116806
Alignment:
Q  295 tgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacata-ttcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgtt 393  Q
    ||||||||||| ||||||  ||| |||| |||||||| |||| | |||||| | |||| ||||||  ||| ||||||||| | || |||||||||||| |    
T  116687 tgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataattcatgatttgttgatgaaaaatgga-ttgttgttggtggt 116785  T
Q  394 ttggtgaaatttgtgaattga 414  Q
    || || ||||| |||||||||    
T  116786 tttgtaaaattggtgaattga 116806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1404 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1404
Description:

Target: scaffold1404; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 349 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 1867 - 1815
Alignment:
Q  349 catattcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaa 402  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1867 catattcatggattgatgatgagaatttgaattg-tgttggtgttttggtgaaa 1815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0686
Description:

Target: scaffold0686; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 66
Target Start/End: Original strand, 5744 - 5809
Alignment:
Q  2 aaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 66  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||    
T  5744 aaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcat 5809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 66
Target Start/End: Original strand, 5950 - 6015
Alignment:
Q  2 aaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 66  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||    
T  5950 aaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcat 6015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 66
Target Start/End: Original strand, 31147 - 31212
Alignment:
Q  2 aaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 66  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||    
T  31147 aaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcacaatcat 31212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 2 - 67
Target Start/End: Original strand, 319 - 385
Alignment:
Q  2 aaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcatc 67  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||    
T  319 aaagtgaagcttgagctaatagttggtgataattaaggtaacggggttattctttatcataatcatc 385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 258 - 413
Target Start/End: Original strand, 76984 - 77139
Alignment:
Q  258 atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacat-attca 356  Q
    ||||||| ||||||||| | |  ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||  ||| ||||  ||||||| |||| | |||||||| ||| |||||    
T  76984 atgttgttgttgaattgtggtgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttattgatgattcatggcttgggtattcataattca 77083  T
Q  357 tggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 413  Q
    ||  ||| |||||| ||  ||| |||||||||||| ||| |||||||| ||||||||    
T  77084 tgatttgttgatgagaa-atgagttgttgttggtggttttgtgaaattggtgaattg 77139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 376 - 413
Target Start/End: Original strand, 132505 - 132542
Alignment:
Q  376 tgaattgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 413  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  132505 tgaaatgttgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 132542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 258 - 393
Target Start/End: Original strand, 197390 - 197525
Alignment:
Q  258 atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacat-attca 356  Q
    ||||||| ||||||||| | |  ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||  ||| |||| |||||||| |||| |||||||| | ||| | |||    
T  197390 atgttgttgttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggtttgggtcttcataaatca 197489  T
Q  357 tggattgatgatgaaaatttgaattgttgttggtgtt 393  Q
    ||  |||||||||| || |||| ||||||||| ||||    
T  197490 tgctttgatgatgagaa-ttgagttgttgttgttgtt 197525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 292 - 370
Target Start/End: Original strand, 104793 - 104872
Alignment:
Q  292 aattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacat-attcatggattgatgatga 370  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||| |||| |||||||| |||| | |||||||| ||| ||||||| |||||||||||    
T  104793 aattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtattcataattcatgaattgatgatga 104872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0389 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0389
Description:

Target: scaffold0389; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 291 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 10739 - 10642
Alignment:
Q  291 caattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacat-attcatggattgatgatgaaaatttgaattgttgttg 388  Q
    ||||||||||||||  ||||||  |||||||| |||||| | |||| | |||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  10739 caattgatgttgtttttgctaagtgatgttgttgttgatcattcatggcttgggtgttcataattcatgaattgatgatgaaaa-atgaattgttgttg 10642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0970 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0970
Description:

Target: scaffold0970; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 291 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 2532 - 2471
Alignment:
Q  291 caattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacata 352  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||| |||||||| |||| | |||||||| ||||    
T  2532 caattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgttgatgattcatggcttgggtattcata 2471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 165
Target Start/End: Original strand, 1546 - 1587
Alignment:
Q  124 aaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa 165  Q
    ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1546 aaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa 1587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 165
Target Start/End: Original strand, 8691 - 8732
Alignment:
Q  124 aaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa 165  Q
    ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8691 aaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa 8732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 384 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 7551 - 7522
Alignment:
Q  384 tgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7551 tgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 7522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 8257 - 8216
Alignment:
Q  124 aaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa 165  Q
    ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8257 aaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa 8216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 291 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 8087 - 8007
Alignment:
Q  291 caattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacat-attcatggattgatgatga 370  Q
    ||||||||||||||| |||||   |||||||| |||||||| |||| | |||||||| ||| ||||||| |||| ||||||    
T  8087 caattgatgttgttgttgctatgtgatgttgttgttgatgattcatagcttgggtattcataattcatgaattggtgatga 8007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 233
Target Start/End: Original strand, 56106 - 56226
Alignment:
Q  115 attgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgttt--aaatatg 212  Q
    ||||||| |||||| |||||| |||| ||||| ||| || || ||||||| ||||| |||| ||||||||||| | | | ||| |||||||  || ||||    
T  56106 attgttgttaaattcgtgctctaactgtgatgttattttcgtgtgcatgatttgatgataattgtatgattgtggctgaaattacatgttttaaagtatg 56205  T
Q  213 tagaaatgagaagttatgaaa 233  Q
    || |||||  |||||||||||    
T  56206 tataaatgtcaagttatgaaa 56226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 165
Target Start/End: Original strand, 70307 - 70348
Alignment:
Q  124 aaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa 165  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  70307 aaattcgtactccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa 70348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 384 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 38282 - 38253
Alignment:
Q  384 tgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38282 tgttggtgttttggtgaaatttgtgaattg 38253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1164 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold1164
Description:

Target: scaffold1164; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 2 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 1765 - 1721
Alignment:
Q  2 aaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg 46  Q
    ||||||||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||||    
T  1765 aaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggg 1721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0876 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0876
Description:

Target: scaffold0876; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 2 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 158 - 114
Alignment:
Q  2 aaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg 46  Q
    ||||||||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||||    
T  158 aaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggg 114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0700 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0700
Description:

Target: scaffold0700; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 281 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 2612 - 2548
Alignment:
Q  281 gattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggt 345  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||  ||| |||| |||||||| |||| ||||||||    
T  2612 gattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggtttgggt 2548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 2 - 46
Target Start/End: Original strand, 19817 - 19861
Alignment:
Q  2 aaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg 46  Q
    ||||||||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||||    
T  19817 aaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggg 19861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 1370 times since January 2019
Visitors: 4368