View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0717_low_3 (Length: 511)

Name: NF0717_low_3
Description: NF0717
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0717_low_3
NF0717_low_3
[»] chr4 (63 HSPs)
chr4 (1-504)||(16522749-16523252)
chr4 (64-491)||(8044935-8045365)
chr4 (1-329)||(9295625-9295953)
chr4 (124-496)||(14500046-14500418)
chr4 (64-311)||(14996122-14996368)
chr4 (131-496)||(32460537-32460890)
chr4 (64-315)||(19697383-19697633)
chr4 (64-315)||(19707968-19708218)
chr4 (50-315)||(9795195-9795461)
chr4 (398-504)||(9795533-9795639)
chr4 (398-504)||(19020793-19020899)
chr4 (361-491)||(19697217-19697346)
chr4 (361-491)||(19707802-19707931)
chr4 (47-215)||(7132176-7132342)
chr4 (1-181)||(7185981-7186158)
chr4 (35-215)||(20000690-20000868)
chr4 (168-315)||(34177651-34177797)
chr4 (28-181)||(7964848-7965000)
chr4 (76-198)||(15044834-15044955)
chr4 (93-211)||(22738293-22738410)
chr4 (36-181)||(40905071-40905214)
chr4 (184-334)||(14951875-14952025)
chr4 (76-198)||(15109469-15109590)
chr4 (28-149)||(19821944-19822065)
chr4 (35-198)||(41166066-41166228)
chr4 (398-472)||(15674967-15675041)
chr4 (399-496)||(22738577-22738675)
chr4 (27-179)||(41256508-41256660)
chr4 (78-315)||(54398391-54398627)
chr4 (398-471)||(40885418-40885491)
chr4 (399-472)||(55376452-55376525)
chr4 (184-296)||(5682557-5682669)
chr4 (76-179)||(15013421-15013523)
chr4 (78-181)||(18238294-18238396)
chr4 (28-178)||(18276392-18276541)
chr4 (398-472)||(10104128-10104202)
chr4 (398-472)||(15135865-15135939)
chr4 (398-472)||(15272169-15272243)
chr4 (400-496)||(18248527-18248624)
chr4 (219-296)||(25119237-25119314)
chr4 (398-439)||(33241011-33241052)
chr4 (76-271)||(38764715-38764909)
chr4 (172-315)||(49071788-49071931)
chr4 (401-472)||(31132628-31132699)
chr4 (398-472)||(13246737-13246811)
chr4 (184-334)||(15272304-15272454)
chr4 (28-101)||(37957241-37957314)
chr4 (48-112)||(32460890-32460953)
chr4 (398-430)||(54118168-54118200)
chr4 (398-496)||(8378493-8378592)
chr4 (35-149)||(14901197-14901311)
chr4 (361-430)||(14996409-14996477)
chr4 (364-431)||(26680484-26680550)
chr4 (47-148)||(16732146-16732247)
chr4 (78-180)||(50220078-50220179)
chr4 (76-198)||(52265628-52265749)
chr4 (398-431)||(7850314-7850347)
chr4 (50-181)||(13442813-13442946)
chr4 (398-431)||(14952085-14952118)
chr4 (361-430)||(16327840-16327908)
chr4 (398-431)||(16609012-16609045)
chr4 (130-211)||(26339081-26339161)
chr4 (130-174)||(22352197-22352241)
[»] chr5 (47 HSPs)
chr5 (1-472)||(108686-109157)
chr5 (35-491)||(9730216-9730672)
chr5 (72-496)||(7528902-7529326)
chr5 (1-334)||(16105574-16105906)
chr5 (64-315)||(17909500-17909750)
chr5 (35-215)||(10778081-10778259)
chr5 (361-496)||(17909787-17909921)
chr5 (170-471)||(25004915-25005210)
chr5 (398-491)||(34939595-34939688)
chr5 (35-215)||(23514528-23514706)
chr5 (1-83)||(11583982-11584063)
chr5 (165-334)||(21650789-21650958)
chr5 (28-198)||(7728378-7728547)
chr5 (184-334)||(2031923-2032073)
chr5 (184-334)||(11342798-11342948)
chr5 (27-181)||(24084034-24084187)
chr5 (184-334)||(21205039-21205189)
chr5 (398-472)||(27182429-27182503)
chr5 (64-181)||(29917958-29918075)
chr5 (76-181)||(23493925-23494029)
chr5 (27-181)||(6456580-6456734)
chr5 (400-472)||(18530946-18531018)
chr5 (217-333)||(22662668-22662784)
chr5 (28-181)||(21616974-21617126)
chr5 (398-472)||(22053711-22053785)
chr5 (398-472)||(23507270-23507344)
chr5 (402-472)||(32951016-32951086)
chr5 (395-472)||(23981363-23981440)
chr5 (76-188)||(23981646-23981757)
chr5 (28-181)||(37983325-37983474)
chr5 (27-148)||(1168373-1168495)
chr5 (27-148)||(3673818-3673940)
chr5 (1-39)||(24225596-24225634)
chr5 (27-198)||(5450963-5451134)
chr5 (47-148)||(11337355-11337455)
chr5 (28-65)||(32966399-32966436)
chr5 (400-472)||(2032135-2032207)
chr5 (47-198)||(19862186-19862336)
chr5 (78-181)||(21109758-21109860)
chr5 (86-181)||(26559952-26560046)
chr5 (361-431)||(20623250-20623319)
chr5 (361-431)||(21233441-21233510)
chr5 (361-431)||(25900319-25900388)
chr5 (398-431)||(16105967-16106000)
chr5 (36-100)||(22882391-22882455)
chr5 (398-431)||(37053061-37053094)
chr5 (78-146)||(19873852-19873920)
[»] chr2 (51 HSPs)
chr2 (1-429)||(24826615-24827043)
chr2 (48-491)||(17204309-17204753)
chr2 (48-496)||(28031068-28031516)
chr2 (92-472)||(33128067-33128446)
chr2 (1-334)||(25212978-25213311)
chr2 (64-316)||(15633208-15633459)
chr2 (398-504)||(7507683-7507789)
chr2 (1-198)||(19433452-19433648)
chr2 (398-504)||(23777888-23777994)
chr2 (28-149)||(3409-3529)
chr2 (35-215)||(12635979-12636157)
chr2 (35-215)||(12641753-12641931)
chr2 (35-215)||(42178080-42178258)
chr2 (35-215)||(8943813-8943991)
chr2 (35-215)||(3798714-3798892)
chr2 (1-198)||(43645825-43646020)
chr2 (166-315)||(7321612-7321761)
chr2 (184-296)||(22274835-22274947)
chr2 (27-181)||(24884643-24884796)
chr2 (184-296)||(22284068-22284180)
chr2 (398-472)||(25265261-25265335)
chr2 (184-296)||(9652926-9653038)
chr2 (399-496)||(5888480-5888578)
chr2 (399-496)||(21142203-21142301)
chr2 (398-472)||(24341267-24341341)
chr2 (50-204)||(19669222-19669376)
chr2 (398-472)||(463043-463117)
chr2 (78-271)||(9636753-9636945)
chr2 (184-334)||(21274041-21274191)
chr2 (48-149)||(25305423-25305524)
chr2 (31-198)||(67952-68119)
chr2 (361-430)||(19689315-19689383)
chr2 (399-472)||(32466177-32466249)
chr2 (398-430)||(19794629-19794661)
chr2 (27-149)||(25265573-25265695)
chr2 (78-181)||(6094724-6094826)
chr2 (219-310)||(25595168-25595259)
chr2 (398-472)||(9652754-9652828)
chr2 (361-431)||(14906353-14906422)
chr2 (361-431)||(17396566-17396635)
chr2 (398-472)||(22863235-22863309)
chr2 (361-431)||(23820352-23820421)
chr2 (47-148)||(28974026-28974127)
chr2 (130-211)||(5888744-5888824)
chr2 (76-149)||(23821773-23821846)
chr2 (76-149)||(23830852-23830925)
chr2 (76-181)||(24277767-24277871)
chr2 (76-149)||(24294691-24294764)
chr2 (398-431)||(36982363-36982396)
chr2 (28-103)||(722353-722428)
chr2 (398-430)||(22284278-22284310)
[»] chr6 (56 HSPs)
chr6 (1-504)||(18823209-18823711)
chr6 (1-504)||(18839064-18839566)
chr6 (64-488)||(32276601-32277024)
chr6 (1-334)||(4991003-4991335)
chr6 (52-315)||(19629314-19629575)
chr6 (72-315)||(16299991-16300234)
chr6 (361-491)||(19629612-19629740)
chr6 (361-491)||(16299825-16299953)
chr6 (35-215)||(16231859-16232037)
chr6 (35-215)||(18086934-18087112)
chr6 (398-496)||(13620644-13620743)
chr6 (35-215)||(13620905-13621083)
chr6 (1-121)||(18583265-18583384)
chr6 (165-333)||(22585539-22585707)
chr6 (165-333)||(22590370-22590538)
chr6 (35-215)||(23977736-23977914)
chr6 (1-122)||(17083373-17083495)
chr6 (165-315)||(15889717-15889867)
chr6 (400-491)||(15742058-15742150)
chr6 (398-491)||(18002333-18002427)
chr6 (184-334)||(26089848-26089998)
chr6 (35-149)||(18381851-18381965)
chr6 (28-198)||(22361885-22362054)
chr6 (184-334)||(18002488-18002638)
chr6 (166-296)||(25640585-25640715)
chr6 (398-472)||(26090059-26090133)
chr6 (184-334)||(35015149-35015299)
chr6 (165-333)||(15004900-15005067)
chr6 (27-198)||(18398895-18399065)
chr6 (50-181)||(19854135-19854265)
chr6 (165-291)||(18583411-18583537)
chr6 (28-181)||(25919571-25919723)
chr6 (398-472)||(23148303-23148377)
chr6 (398-472)||(23153754-23153828)
chr6 (398-472)||(27751742-27751816)
chr6 (398-468)||(35009314-35009384)
chr6 (35-198)||(21623133-21623295)
chr6 (217-296)||(19983322-19983401)
chr6 (39-181)||(33538506-33538647)
chr6 (217-334)||(15742211-15742329)
chr6 (398-472)||(23995247-23995321)
chr6 (75-181)||(25651242-25651347)
chr6 (27-199)||(34966823-34966995)
chr6 (184-284)||(23995036-23995136)
chr6 (27-181)||(29605406-29605560)
chr6 (398-472)||(29666181-29666255)
chr6 (398-431)||(1657660-1657693)
chr6 (398-431)||(15862789-15862822)
chr6 (234-315)||(17374930-17375011)
chr6 (50-149)||(33324673-33324772)
chr6 (50-149)||(35136180-35136279)
chr6 (78-181)||(29160440-29160542)
chr6 (130-211)||(29869890-29869970)
chr6 (398-430)||(1650021-1650053)
chr6 (398-430)||(18583640-18583672)
chr6 (219-271)||(23222064-23222116)
[»] chr3 (77 HSPs)
chr3 (35-496)||(16933803-16934263)
chr3 (1-491)||(19946630-19947120)
chr3 (72-496)||(14284963-14285387)
chr3 (1-315)||(9303110-9303424)
chr3 (64-315)||(8275855-8276105)
chr3 (64-315)||(8268755-8269005)
chr3 (48-315)||(11477201-11477467)
chr3 (398-504)||(12901933-12902039)
chr3 (398-504)||(15938320-15938426)
chr3 (1-334)||(7853914-7854245)
chr3 (398-504)||(15936478-15936584)
chr3 (1-334)||(54685293-54685624)
chr3 (361-496)||(11477029-11477163)
chr3 (1-149)||(47784915-47785063)
chr3 (5-296)||(33341817-33342106)
chr3 (35-215)||(18910960-18911138)
chr3 (166-335)||(18970016-18970185)
chr3 (168-370)||(48421674-48421877)
chr3 (435-504)||(9302968-9303036)
chr3 (27-181)||(12952920-12953074)
chr3 (27-334)||(30152898-30153205)
chr3 (165-291)||(38168008-38168134)
chr3 (28-149)||(38811176-38811297)
chr3 (27-181)||(1990759-1990913)
chr3 (176-315)||(15550703-15550842)
chr3 (398-472)||(11986038-11986112)
chr3 (184-334)||(45581744-45581894)
chr3 (27-181)||(6228762-6228916)
chr3 (184-291)||(54038159-54038266)
chr3 (398-472)||(16261777-16261851)
chr3 (398-471)||(51960990-51961063)
chr3 (184-284)||(2844304-2844404)
chr3 (184-296)||(3992663-3992775)
chr3 (184-296)||(28558284-28558396)
chr3 (48-198)||(17191519-17191668)
chr3 (76-198)||(12488846-12488967)
chr3 (37-178)||(17204667-17204807)
chr3 (28-145)||(34559857-34559974)
chr3 (217-315)||(38375699-38375797)
chr3 (184-334)||(53771154-53771304)
chr3 (398-472)||(53771365-53771439)
chr3 (76-181)||(4162342-4162446)
chr3 (234-315)||(12539072-12539153)
chr3 (217-334)||(55513016-55513133)
chr3 (130-315)||(10912945-10913130)
chr3 (78-181)||(41661573-41661675)
chr3 (398-472)||(2050115-2050189)
chr3 (36-149)||(9590922-9591035)
chr3 (184-334)||(16261566-16261716)
chr3 (78-200)||(31412451-31412572)
chr3 (398-472)||(38168237-38168311)
chr3 (398-472)||(54651764-54651838)
chr3 (50-198)||(3576558-3576705)
chr3 (398-431)||(13839200-13839233)
chr3 (28-65)||(17960565-17960602)
chr3 (398-430)||(15857163-15857195)
chr3 (220-284)||(17956026-17956090)
chr3 (200-296)||(23492502-23492598)
chr3 (373-431)||(8268649-8268708)
chr3 (373-431)||(8275749-8275808)
chr3 (78-271)||(43427563-43427753)
chr3 (361-431)||(2449151-2449220)
chr3 (47-148)||(14295415-14295516)
chr3 (398-472)||(33342204-33342278)
chr3 (361-431)||(45861086-45861155)
chr3 (76-149)||(11061174-11061247)
chr3 (48-148)||(11329130-11329230)
chr3 (398-431)||(14842486-14842519)
chr3 (48-148)||(17139486-17139586)
chr3 (398-431)||(17912397-17912430)
chr3 (398-431)||(19260748-19260781)
chr3 (398-431)||(23492696-23492729)
chr3 (398-430)||(7854305-7854337)
chr3 (50-149)||(14080489-14080588)
chr3 (398-430)||(15615137-15615169)
chr3 (398-430)||(17955884-17955916)
chr3 (27-181)||(33369045-33369199)
[»] scaffold0615 (1 HSPs)
scaffold0615 (64-496)||(6043-6477)
[»] chr8 (56 HSPs)
chr8 (35-491)||(3431114-3431570)
chr8 (48-496)||(22886305-22886753)
chr8 (48-496)||(21494290-21494725)
chr8 (64-315)||(18612401-18612651)
chr8 (64-315)||(18619306-18619556)
chr8 (64-315)||(22147433-22147683)
chr8 (64-315)||(2544944-2545191)
chr8 (378-504)||(16038713-16038839)
chr8 (361-504)||(2545229-2545371)
chr8 (361-491)||(22147720-22147849)
chr8 (361-489)||(18612688-18612815)
chr8 (195-315)||(16038892-16039012)
chr8 (35-215)||(13721039-13721217)
chr8 (27-181)||(33528383-33528535)
chr8 (28-181)||(5854572-5854724)
chr8 (35-215)||(16873162-16873340)
chr8 (35-198)||(21198272-21198434)
chr8 (173-315)||(21259502-21259644)
chr8 (28-181)||(38533607-38533759)
chr8 (35-198)||(23837163-23837325)
chr8 (169-335)||(17502259-17502425)
chr8 (28-181)||(26011452-26011604)
chr8 (36-181)||(27233204-27233348)
chr8 (165-334)||(22321438-22321607)
chr8 (27-181)||(18261608-18261762)
chr8 (184-296)||(41506839-41506951)
chr8 (28-149)||(22736006-22736127)
chr8 (168-298)||(23217974-23218104)
chr8 (165-335)||(24385743-24385913)
chr8 (184-296)||(39115388-39115500)
chr8 (28-181)||(15933256-15933408)
chr8 (398-472)||(24385610-24385684)
chr8 (36-181)||(33611190-33611334)
chr8 (398-472)||(43373350-43373424)
chr8 (169-298)||(4233953-4234082)
chr8 (220-296)||(274592-274668)
chr8 (220-296)||(641181-641257)
chr8 (220-296)||(826987-827063)
chr8 (27-181)||(18041669-18041823)
chr8 (36-178)||(37653756-37653895)
chr8 (388-430)||(16404900-16404942)
chr8 (361-431)||(22907127-22907196)
chr8 (87-181)||(38635785-38635878)
chr8 (78-311)||(45558944-45559176)
chr8 (184-296)||(24716892-24717004)
chr8 (50-181)||(45465263-45465393)
chr8 (361-431)||(5238368-5238437)
chr8 (398-428)||(17345887-17345917)
chr8 (361-431)||(24661161-24661230)
chr8 (398-468)||(41506671-41506741)
chr8 (361-431)||(43685827-43685896)
chr8 (399-472)||(7000478-7000551)
chr8 (27-181)||(22742717-22742874)
chr8 (398-431)||(31194216-31194249)
chr8 (48-148)||(39446935-39447034)
chr8 (398-430)||(24716762-24716794)
[»] chr7 (62 HSPs)
chr7 (35-491)||(371055-371511)
chr7 (398-504)||(18253685-18253792)
chr7 (398-504)||(15862226-15862332)
chr7 (35-215)||(18980132-18980310)
chr7 (35-215)||(14251009-14251187)
chr7 (35-215)||(15927535-15927713)
chr7 (397-496)||(47480878-47480977)
chr7 (35-215)||(13758337-13758515)
chr7 (1-148)||(7284229-7284375)
chr7 (163-315)||(13352044-13352196)
chr7 (1-149)||(14272054-14272202)
chr7 (35-198)||(17224058-17224220)
chr7 (169-315)||(39291520-39291666)
chr7 (28-181)||(48356602-48356754)
chr7 (27-198)||(13377485-13377656)
chr7 (398-472)||(13321334-13321408)
chr7 (28-149)||(16915096-16915217)
chr7 (398-472)||(25124450-25124524)
chr7 (184-296)||(126528-126640)
chr7 (28-181)||(34241325-34241477)
chr7 (399-491)||(10000225-10000318)
chr7 (76-181)||(15358803-15358907)
chr7 (184-296)||(111299-111411)
chr7 (184-296)||(32494076-32494188)
chr7 (184-291)||(2029034-2029141)
chr7 (398-472)||(2029244-2029318)
chr7 (27-181)||(4446168-4446322)
chr7 (398-472)||(36052971-36053045)
chr7 (398-472)||(42056146-42056220)
chr7 (76-181)||(20583691-20583795)
chr7 (399-491)||(48622521-48622614)
chr7 (247-315)||(17984759-17984827)
chr7 (165-296)||(3049677-3049807)
chr7 (165-311)||(15977856-15978002)
chr7 (78-181)||(17947729-17947831)
chr7 (361-431)||(7293297-7293366)
chr7 (234-312)||(8563353-8563431)
chr7 (398-472)||(11580619-11580693)
chr7 (398-472)||(13036896-13036970)
chr7 (398-472)||(15709469-15709543)
chr7 (398-472)||(16212071-16212145)
chr7 (399-496)||(16418805-16418903)
chr7 (361-431)||(30262042-30262111)
chr7 (87-181)||(31501190-31501283)
chr7 (184-334)||(42056281-42056431)
chr7 (130-211)||(10000484-10000564)
chr7 (184-284)||(2190228-2190328)
chr7 (50-181)||(13448964-13449094)
chr7 (50-181)||(28390292-28390422)
chr7 (27-181)||(38424175-38424329)
chr7 (398-468)||(36024452-36024523)
chr7 (76-178)||(4484733-4484834)
chr7 (47-144)||(11287394-11287491)
chr7 (361-431)||(11516508-11516577)
chr7 (361-431)||(14113902-14113971)
chr7 (361-431)||(14423553-14423621)
chr7 (27-103)||(14935319-14935396)
chr7 (27-103)||(15362912-15362989)
chr7 (361-431)||(15441477-15441546)
chr7 (48-148)||(13274765-13274865)
chr7 (130-211)||(16418559-16418639)
chr7 (398-430)||(111169-111201)
[»] scaffold0023 (2 HSPs)
scaffold0023 (90-504)||(61048-61461)
scaffold0023 (398-472)||(48903-48977)
[»] scaffold0173 (1 HSPs)
scaffold0173 (72-496)||(5224-5647)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (31-496)||(5411-5875)
[»] chr1 (35 HSPs)
chr1 (35-398)||(21649967-21650329)
chr1 (93-313)||(20254336-20254556)
chr1 (361-504)||(20254595-20254736)
chr1 (35-146)||(17148534-17148644)
chr1 (35-198)||(20177140-20177302)
chr1 (184-334)||(15861418-15861568)
chr1 (36-179)||(21194980-21195122)
chr1 (28-103)||(27674755-27674829)
chr1 (398-472)||(20893509-20893583)
chr1 (76-149)||(36356461-36356534)
chr1 (194-334)||(22367141-22367281)
chr1 (29-103)||(22829638-22829712)
chr1 (28-103)||(38033888-38033962)
chr1 (35-149)||(41229107-41229221)
chr1 (27-315)||(40436272-40436560)
chr1 (200-291)||(44035006-44035097)
chr1 (35-148)||(13377009-13377122)
chr1 (28-181)||(17608886-17609038)
chr1 (398-472)||(20913335-20913409)
chr1 (28-149)||(37234028-37234149)
chr1 (76-181)||(8538047-8538151)
chr1 (76-181)||(8603286-8603390)
chr1 (28-65)||(19603055-19603092)
chr1 (184-296)||(21860124-21860236)
chr1 (50-181)||(49997418-49997548)
chr1 (217-315)||(20194171-20194270)
chr1 (114-181)||(52400675-52400741)
chr1 (398-472)||(20931650-20931724)
chr1 (398-472)||(37844332-37844406)
chr1 (361-431)||(51452773-51452842)
chr1 (130-211)||(7641048-7641128)
chr1 (36-148)||(51627833-51627945)
chr1 (231-315)||(25094019-25094103)
chr1 (398-430)||(41394527-41394559)
chr1 (398-430)||(45051726-45051758)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (64-496)||(17695-18124)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (132-431)||(17208-17506)
[»] scaffold0028 (4 HSPs)
scaffold0028 (1-334)||(130487-130819)
scaffold0028 (50-208)||(79519-79677)
scaffold0028 (398-472)||(89336-89410)
scaffold0028 (398-472)||(107666-107740)
[»] scaffold0118 (2 HSPs)
scaffold0118 (131-496)||(34242-34607)
scaffold0118 (48-112)||(34607-34670)
[»] scaffold0029 (2 HSPs)
scaffold0029 (48-313)||(49860-50124)
scaffold0029 (361-496)||(49686-49820)
[»] scaffold0001 (4 HSPs)
scaffold0001 (63-315)||(164976-165224)
scaffold0001 (361-491)||(164810-164939)
scaffold0001 (398-472)||(172210-172284)
scaffold0001 (398-472)||(177913-177987)
[»] scaffold0162 (5 HSPs)
scaffold0162 (64-316)||(11740-11990)
scaffold0162 (398-472)||(12063-12137)
scaffold0162 (398-471)||(8051-8125)
scaffold0162 (398-472)||(26298-26372)
scaffold0162 (84-149)||(8360-8425)
[»] scaffold0032 (6 HSPs)
scaffold0032 (398-496)||(13201-13299)
scaffold0032 (35-211)||(13398-13575)
scaffold0032 (184-291)||(55694-55801)
scaffold0032 (398-472)||(108033-108107)
scaffold0032 (398-472)||(55904-55978)
scaffold0032 (28-149)||(93940-94061)
[»] scaffold0574 (2 HSPs)
scaffold0574 (361-496)||(9345-9480)
scaffold0574 (184-315)||(9518-9649)
[»] scaffold0150 (2 HSPs)
scaffold0150 (1-198)||(28467-28663)
scaffold0150 (1-50)||(21638-21687)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (398-504)||(108053-108159)
[»] scaffold0833 (1 HSPs)
scaffold0833 (1-148)||(3231-3377)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (361-504)||(48468-48610)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (221-315)||(95129-95223)
scaffold0037 (361-491)||(95262-95392)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (398-496)||(41965-42063)
[»] scaffold0387 (2 HSPs)
scaffold0387 (398-491)||(7034-7127)
scaffold0387 (76-146)||(1117-1187)
[»] scaffold0075 (2 HSPs)
scaffold0075 (398-491)||(34312-34405)
scaffold0075 (35-211)||(4906-5081)
[»] scaffold0120 (2 HSPs)
scaffold0120 (1-144)||(21443-21586)
scaffold0120 (1-148)||(31142-31289)
[»] scaffold1867 (1 HSPs)
scaffold1867 (1-148)||(76-222)
[»] scaffold0158 (2 HSPs)
scaffold0158 (1-148)||(24891-25036)
scaffold0158 (399-472)||(25532-25605)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (168-333)||(1494-1659)
[»] scaffold0310 (2 HSPs)
scaffold0310 (1-148)||(283-429)
scaffold0310 (1-77)||(6603-6678)
[»] scaffold1295 (1 HSPs)
scaffold1295 (168-370)||(203-406)
[»] scaffold0080 (2 HSPs)
scaffold0080 (28-181)||(43935-44087)
scaffold0080 (27-181)||(23809-23963)
[»] scaffold0063 (1 HSPs)
scaffold0063 (165-315)||(44125-44275)
[»] scaffold0303 (3 HSPs)
scaffold0303 (398-496)||(4279-4378)
scaffold0303 (184-334)||(20-170)
scaffold0303 (184-284)||(4489-4589)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (165-312)||(5977-6124)
[»] scaffold0009 (3 HSPs)
scaffold0009 (28-181)||(69415-69567)
scaffold0009 (398-470)||(272330-272402)
scaffold0009 (169-208)||(244920-244959)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (35-198)||(76967-77129)
[»] scaffold0361 (1 HSPs)
scaffold0361 (398-496)||(3505-3601)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (27-271)||(107967-108209)
[»] scaffold0077 (2 HSPs)
scaffold0077 (27-181)||(6500-6654)
scaffold0077 (398-430)||(36837-36869)
[»] scaffold0004 (4 HSPs)
scaffold0004 (184-296)||(193518-193630)
scaffold0004 (184-291)||(186561-186668)
scaffold0004 (27-178)||(27453-27604)
scaffold0004 (398-472)||(193355-193429)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (184-291)||(31315-31422)
[»] scaffold0078 (2 HSPs)
scaffold0078 (184-291)||(41422-41529)
scaffold0078 (398-431)||(36979-37012)
[»] scaffold0066 (2 HSPs)
scaffold0066 (398-496)||(45338-45437)
scaffold0066 (398-491)||(54724-54818)
[»] scaffold0706 (2 HSPs)
scaffold0706 (184-334)||(6535-6685)
scaffold0706 (398-472)||(6401-6475)
[»] scaffold0700 (1 HSPs)
scaffold0700 (28-181)||(2483-2635)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (398-464)||(13824-13890)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (194-296)||(30217-30319)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (28-149)||(103090-103211)
[»] scaffold0465 (2 HSPs)
scaffold0465 (217-334)||(9975-10092)
scaffold0465 (398-472)||(9840-9914)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (76-181)||(4611-4715)
[»] scaffold0160 (1 HSPs)
scaffold0160 (399-472)||(339-412)
[»] scaffold1500 (1 HSPs)
scaffold1500 (107-215)||(1625-1732)
[»] scaffold1272 (1 HSPs)
scaffold1272 (31-198)||(270-436)
[»] scaffold0597 (2 HSPs)
scaffold0597 (184-284)||(1020-1120)
scaffold0597 (398-472)||(836-910)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (184-296)||(17434-17546)
[»] scaffold0034 (3 HSPs)
scaffold0034 (184-296)||(79977-80089)
scaffold0034 (76-148)||(40664-40736)
scaffold0034 (398-430)||(80187-80219)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (35-198)||(35444-35605)
[»] scaffold0601 (1 HSPs)
scaffold0601 (217-315)||(883-981)
[»] scaffold0498 (1 HSPs)
scaffold0498 (398-472)||(9183-9257)
[»] scaffold0251 (2 HSPs)
scaffold0251 (398-472)||(13243-13317)
scaffold0251 (184-334)||(13378-13528)
[»] scaffold0231 (2 HSPs)
scaffold0231 (3-60)||(12990-13048)
scaffold0231 (231-315)||(12736-12820)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (165-291)||(3876-4002)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (398-472)||(123045-123119)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (28-149)||(30978-31099)
[»] scaffold0521 (1 HSPs)
scaffold0521 (76-149)||(11100-11173)
[»] scaffold0516 (1 HSPs)
scaffold0516 (399-491)||(11982-12075)
[»] scaffold0016 (3 HSPs)
scaffold0016 (35-143)||(116687-116795)
scaffold0016 (398-430)||(162078-162110)
scaffold0016 (398-430)||(166164-166196)
[»] scaffold0670 (1 HSPs)
scaffold0670 (27-181)||(7812-7966)
[»] scaffold0253 (2 HSPs)
scaffold0253 (27-177)||(7358-7508)
scaffold0253 (27-177)||(16783-16933)
[»] scaffold0175 (2 HSPs)
scaffold0175 (220-296)||(15098-15174)
scaffold0175 (398-431)||(881-914)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (50-181)||(37538-37668)
[»] scaffold0025 (3 HSPs)
scaffold0025 (27-181)||(85489-85643)
scaffold0025 (398-472)||(9160-9234)
scaffold0025 (398-472)||(146906-146980)
[»] scaffold0686 (3 HSPs)
scaffold0686 (184-291)||(6118-6225)
scaffold0686 (397-430)||(5777-5810)
scaffold0686 (397-430)||(5983-6016)
[»] scaffold0483 (1 HSPs)
scaffold0483 (31-149)||(6622-6740)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (184-296)||(12548-12662)
[»] scaffold0970 (1 HSPs)
scaffold0970 (86-188)||(2471-2572)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (398-472)||(12418-12492)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (398-472)||(1430-1504)
scaffold0266 (398-472)||(3466-3540)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (398-472)||(57350-57424)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (398-472)||(34033-34107)
scaffold0012 (398-472)||(247324-247398)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (399-496)||(7517-7615)
scaffold0003 (130-211)||(7271-7351)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (27-198)||(2436-2607)
[»] scaffold0017 (2 HSPs)
scaffold0017 (399-491)||(54182-54275)
scaffold0017 (1-40)||(12695-12734)
[»] scaffold0447 (2 HSPs)
scaffold0447 (86-150)||(4579-4643)
scaffold0447 (86-150)||(9193-9257)
[»] scaffold0091 (2 HSPs)
scaffold0091 (47-251)||(32180-32383)
scaffold0091 (47-251)||(41920-42123)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (78-181)||(3260-3361)
[»] scaffold0215 (2 HSPs)
scaffold0215 (413-491)||(9203-9282)
scaffold0215 (413-491)||(16101-16180)
[»] scaffold0151 (1 HSPs)
scaffold0151 (130-181)||(22559-22609)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (398-473)||(128052-128127)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (28-181)||(197390-197545)
[»] scaffold0610 (1 HSPs)
scaffold0610 (47-148)||(745-846)
[»] scaffold0467 (1 HSPs)
scaffold0467 (398-468)||(10218-10288)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (220-290)||(487-557)
[»] scaffold0141 (2 HSPs)
scaffold0141 (361-431)||(22821-22890)
scaffold0141 (361-431)||(27076-27145)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (361-431)||(1495-1564)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (1-35)||(3392-3426)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (398-472)||(55971-56045)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (47-148)||(109631-109732)
[»] scaffold1164 (1 HSPs)
scaffold1164 (27-122)||(1337-1433)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (398-431)||(5989-6022)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (47-148)||(11877-11977)
[»] scaffold0195 (1 HSPs)
scaffold0195 (398-427)||(19514-19543)
[»] scaffold0155 (1 HSPs)
scaffold0155 (130-211)||(23863-23943)
[»] scaffold0095 (1 HSPs)
scaffold0095 (48-148)||(33897-33996)
[»] scaffold0389 (1 HSPs)
scaffold0389 (50-149)||(10642-10741)
[»] scaffold0359 (1 HSPs)
scaffold0359 (165-270)||(1411-1516)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (398-434)||(8331-8367)
[»] scaffold0103 (1 HSPs)
scaffold0103 (76-148)||(33668-33740)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 488; Significance: 0; HSPs: 63)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 488; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 504
Target Start/End: Original strand, 16522749 - 16523252
Alignment:
Q  1 catcatcaaaatcaaacttcttctttatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16522749 catcatcaaaatcaaacttcttctttatcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagc 16522848  T
Q  101 cataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16522849 cataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacacctcaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaa 16522948  T
Q  201 gcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcacca 300  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16522949 gcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcacca 16523048  T
Q  301 aaacaagagcacgaaaattagagattgggttcatatgaattctcactcaattaagcactttttcatacaaaccaagaaaaattgcaaacaaacaattatg 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16523049 aaacaagagcacgaaaattagagattgggttcatatgaattctcactcaattaagcactttttcatacaaaccaagaaaaattgcaaacaaacaattatg 16523148  T
Q  401 attatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaattctccaatcttcaagttttcccccttt 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16523149 attatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcataattctccaatcttcaagttttcccccttt 16523248  T
Q  501 gcta 504  Q
    ||||    
T  16523249 gcta 16523252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 64 - 491
Target Start/End: Original strand, 8044935 - 8045365
Alignment:
Q  64 tttctcaacaacaat-catgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacac 162  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8044935 tttctcatcaacaattcatgatatatgaacacccaagccataaatcataatcaacaacatatctcagcagcaacaacatcaattggaacttgattcacac 8045034  T
Q  163 ccc--aattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaa 260  Q
     ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8045035 acctcaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattctcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaa 8045134  T
Q  261 ttcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaaattagagattgggttcatatgaattctcactcaattaagcactt 360  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  8045135 ttcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaaattagagattgggttcatataaattctcacttaattaagcactt 8045234  T
Q  361 tttcatacaaaccaagaaaaattgcaaacaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcac 460  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||    
T  8045235 tttcatacaaaccaagaaaaattgcaaacaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgattaattcaaacttagacttcac 8045334  T
Q  461 tttagctcctaattctccaatcttcaagttt 491  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8045335 tttagctcctaattcttcaatcttcaagttt 8045365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 1 - 329
Target Start/End: Original strand, 9295625 - 9295953
Alignment:
Q  1 catcatcaaaatcaaacttcttctttatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9295625 catcatcaaaatcaaacttcttctttatcaactcattttacataaccaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagc 9295724  T
Q  101 cataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaa 200  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9295725 cataattcattatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaa 9295824  T
Q  201 gcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcacca 300  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9295825 gcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcattaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcacca 9295924  T
Q  301 aaacaagagcacgaaaattagagattggg 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9295925 aaacaagagcacgaaaattagagattggg 9295953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 124 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 14500418 - 14500046
Alignment:
Q  124 tctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcataacaacccatt 223  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  14500418 tctcagcaacaacaacatcaattaaaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcataattcatcaattaagcataatttcacaactacccatt 14500319  T
Q  224 ttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaaattagag 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||    
T  14500318 ttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaataattcatttatcattaaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaaag 14500219  T
Q  324 attgggttcatatgaattctcactcaattaagcactttttcatacaaaccaagaaaaattgcaaac-aaacaattatgattatgatgaagactaaccccc 422  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14500218 attgggttcatataaatacttactcaaacaagcactttttcatacaaacaaag-aaaattgcaagcaaaacaattatgattatgatgaagcctaaccccc 14500120  T
Q  423 ttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaattctccaatcttcaagttttcccc 496  Q
    ||||||||| | ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  14500119 ttaccttagataatgattaatccaaacttaagcttcactttagctcataattcttcaatcttcaagtttccccc 14500046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 64 - 311
Target Start/End: Original strand, 14996122 - 14996368
Alignment:
Q  64 tttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacacc 163  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  14996122 tttctcaccaacaatcatgatatatgaacacccaagccataat-cataaacaacaacatgtctcagcaacaacaacatcaattaaaacttgattctcacc 14996220  T
Q  164 ccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattc 263  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14996221 tcaattcaacaacaacatgtcataattcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattc 14996320  T
Q  264 atttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagca 311  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14996321 ttttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagca 14996368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 131 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 32460890 - 32460537
Alignment:
Q  131 aacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcataacaacccattttcatac 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||             |||||| |||||||||| ||| |||| |||||||||    
T  32460890 aacaacaacatcaattgaaacttgattctcacctcaatccaacaacaacatt------------aattaaccataatttcacaactaccccttttcatac 32460803  T
Q  231 attatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaaattagagattgggt 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| | | |||||||||    
T  32460802 attatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaaattataaccaaaacaagagcacgaaattcaaagattgggt 32460703  T
Q  331 tcatatgaattctcactcaattaagcactttttcatacaaaccaagaaaaattgcaaac-aaacaattatgattatgatgaagactaacccccttacctt 429  Q
    |||||| ||| || ||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32460702 tcatataaatacttactcaattaagcactatttcatacaatccaag-aaaattgcaaacaaaacaatcatgattatgaagaagactaacccccttacctt 32460604  T
Q  430 aggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaattctccaatcttcaagttttcccc 496  Q
    || | ||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  32460603 agataatgattaatccaaacttaggcttcactttagctcctaattcttcaatcttcaagtttccccc 32460537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 64 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 19697633 - 19697383
Alignment:
Q  64 tttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacacc 163  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  19697633 tttctcaccaacaatcatgatatatgaacacccaagccataat-cataaacaacaacatgtctcagcaacaacaacatcaattaaaacttgattctcacc 19697535  T
Q  164 ccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattc 263  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  19697534 tcaattcaacaacaacatgtcataattcatcaattaagcataatttcataacaactcattctcatacattatgaacatgttatttcataactaacaattc 19697435  T
Q  264 atttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaa 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19697434 atttatcattcaattaacatactcaaaattatcaccaaaacaagagcacgaa 19697383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 64 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 19708218 - 19707968
Alignment:
Q  64 tttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacacc 163  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  19708218 tttctcaccaacaatcatgatatatgaacacccaagccataat-cataaacaacaacatgtctcagcaacaacaacatcaattaaaacttgattctcacc 19708120  T
Q  164 ccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattc 263  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  19708119 tcaattcaacaacaacatgtcataattcatcaattaagcataatttcataacaactcattctcatacattatgaacatgttatttcataactaacaattc 19708020  T
Q  264 atttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaa 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19708019 atttatcattcaattaacatactcaaaattatcaccaaaacaagagcacgaa 19707968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 50 - 315
Target Start/End: Original strand, 9795195 - 9795461
Alignment:
Q  50 caacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatct---cagcaacaacaacatcaatt 146  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| | |   || |||||||||||||||||    
T  9795195 caacaacaattcattt-ctcaacaacaatcatgatatatcaacacccaagccataa-tcataaacaacaacatgtatcaacaacaacaacaacatcaatt 9795292  T
Q  147 gaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttat 246  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||| ||| || |||||| | ||||||||||||||||||    
T  9795293 gaaacttgatttccacctcaattcaacaacaacatgtcataattcaccaattaaacataatttcacaactactcattttgacacattatgaacatgttat 9795392  T
Q  247 ttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaa 315  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9795393 ttcatcaccaagaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaa 9795461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 398 - 504
Target Start/End: Original strand, 9795533 - 9795639
Alignment:
Q  398 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaattctccaatcttcaagttttccccc 497  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9795533 atgattatgatgataactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaattctccaatcttcaagttttccccc 9795632  T
Q  498 tttgcta 504  Q
    |||||||    
T  9795633 tttgcta 9795639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 398 - 504
Target Start/End: Original strand, 19020793 - 19020899
Alignment:
Q  398 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaattctccaatcttcaagttttccccc 497  Q
    ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  19020793 atgattatgatggtaactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcaccttagctcctaattctccaatcttcaagtttccccct 19020892  T
Q  498 tttgcta 504  Q
    |||||||    
T  19020893 tttgcta 19020899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 361 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 19697346 - 19697217
Alignment:
Q  361 tttcatacaaaccaagaaaaattgcaaacaaa-caattatgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttca 459  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||||||    
T  19697346 tttcatacaa--caaggaaaattgcaaacaaaacaatcatgattatgaagaacactaacccccttaccttaggttatgattaattcacacttaggcttca 19697249  T
Q  460 ctttagctcctaattctccaatcttcaagttt 491  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  19697248 ctttacctcctaattcttcaatcttcaagttt 19697217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 361 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 19707931 - 19707802
Alignment:
Q  361 tttcatacaaaccaagaaaaattgcaaacaaa-caattatgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttca 459  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||||||    
T  19707931 tttcatacaa--caaggaaaattgcaaacaaaacaatcatgattatgaagaacactaacccccttaccttaggttatgattaattcacacttaggcttca 19707834  T
Q  460 ctttagctcctaattctccaatcttcaagttt 491  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  19707833 ctttacctcctaattcttcaatcttcaagttt 19707802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 47 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 7132342 - 7132176
Alignment:
Q  47 caccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaatt 146  Q
    ||||||||||| || |||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7132342 caccaacaacatcttattt-ctcatcaacaattatggtatatgaacacccaagccataaatcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaatt 7132244  T
Q  147 gaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcataac 215  Q
     | |  ||||| ||| | || |||||  | ||||| ||| |  |||||||||||| |||||||||||||    
T  7132243 -acatatgatttacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataac 7132176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 7186158 - 7185981
Alignment:
Q  1 catcatcaaaatcaaacttcttctttatcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaa 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||   |||||||||||| | |||| || ||| ||||||| ||| |||||||||    
T  7186158 catcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttcacaaaaaca---acaacaactcatat-ctcatcatcaaatcatgatttataaacacccaa 7186063  T
Q  99 gccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacat 181  Q
    ||||| | |||| | ||| || || ||| ||||||||||||||||||| |||| ||| || || | |||||||||||||||||    
T  7186062 gccatgaatcatcaacaataatatctcttagcaacaacaacatcaatt-aaacatgaatctcatcacaattcaacaacaacat 7185981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 35 - 215
Target Start/End: Original strand, 20000690 - 20000868
Alignment:
Q  35 attttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaaca 134  Q
    |||| |||||| |||||| |||| || |||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20000690 atttcacaaaaccaccaataacatcttattt-ctcatcaacaattatggtatatgaacacccaagcctcaaatcatactcaacaacatatctcagcaaca 20000788  T
Q  135 acaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcataac 215  Q
    |||||||| ||| | |  ||||| ||| | || |||||| | ||||| ||| |  |||||||||||| |||||||||||||    
T  20000789 acaacatcgatt-acatatgatttacatctcatttcaaccaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataac 20000868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 168 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 34177797 - 34177651
Alignment:
Q  168 ttcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcattt 267  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||| ||||| | ||||||| |  ||| ||||||||  |||||| |||||||||  |||| |||| |||||||||| ||    
T  34177797 ttcaacaacaacaagtcataattcaccaattgaacataatt-ctcaactacccatttatatacatcatgaacatgcaattttatcatcaacaattcaatt 34177699  T
Q  268 atcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaa 315  Q
    |||||  ||||||||||||||||| |||||| | |||| |||||||||    
T  34177698 atcatgtaattaacatactcaaacatatcactacaacatgagcacgaa 34177651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 28 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 7965000 - 7964848
Alignment:
Q  28 tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaac-aatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatct 126  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| || | ||||||||| ||||||||| |||||||| | |||| | |||||| ||  ||    
T  7965000 tcaacccattttacaaaaccaacaacaacaactca-tttctcatcatcaaatcatgatttatgaacactcaagccatgaatcatcaacaacaatatcact 7964902  T
Q  127 cagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacat 181  Q
     ||||||||||| ||||||| |||| |||||| || |  ||||||||||||||||    
T  7964901 tagcaacaacaaaatcaatt-aaacatgattctcatcataattcaacaacaacat 7964848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 76 - 198
Target Start/End: Original strand, 15044834 - 15044955
Alignment:
Q  76 aatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaa 175  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| | |||| |||||||||||  || |||||||||||||||||||||| | ||| ||  | | |||||||||||    
T  15044834 aatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcatcaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgaa-catgaatcttatcacaattcaacaa 15044932  T
Q  176 caacatgtcataagtcatcaatt 198  Q
    ||||||  ||||| |||||||||    
T  15044933 caacatagcataattcatcaatt 15044955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 93 - 211
Target Start/End: Original strand, 22738293 - 22738410
Alignment:
Q  93 acccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtca 192  Q
    ||||||| |||||||||   |||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | |||||||| ||||||   ||||||  ||    
T  22738293 acccaagtcataattcaccctcaacaacatgtctaagcaacaacaacatccattggaacttgattcaca-ctcaattcaataacaactcatcataaacca 22738391  T
Q  193 tcaattaagcataatttca 211  Q
    |||||||||||||||||||    
T  22738392 tcaattaagcataatttca 22738410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 36 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 40905214 - 40905071
Alignment:
Q  36 ttttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaaca 134  Q
    |||||||||| || ||||||||||| |||| |||| || ||| ||||||| |||||||||||||||||  | |||| | |||||| || ||| |||||||    
T  40905214 ttttacaaaaccaacaacaacaacttattt-ctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccacgagtcatcaacaacaatatctcttagcaaca 40905116  T
Q  135 acaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacat 181  Q
    ||||||||||||  ||| |||||| || | |||||||||||||||||    
T  40905115 acaacatcaatt--aacatgattctcatcacaattcaacaacaacat 40905071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 184 - 334
Target Start/End: Original strand, 14951875 - 14952025
Alignment:
Q  184 cataagtcatcaattaagcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacat 283  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| |||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||    
T  14951875 cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacat 14951974  T
Q  284 actcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaaattagagattgggttcat 334  Q
    | |||||| |||| | | ||||  ||||||||  | | |||||||||||||    
T  14951975 attcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcat 14952025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 76 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 15109590 - 15109469
Alignment:
Q  76 aatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaa 175  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| | |||| |||||||||||  || |||||||||||||||||||||| | ||| ||  | | |||||||||||    
T  15109590 aatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcatcaacaacattacttagcaacaacaacatcaattgaa-catgaatcttatcacaattcaacaa 15109492  T
Q  176 caacatgtcataagtcatcaatt 198  Q
    ||||||  ||||| | |||||||    
T  15109491 caacatagcataatttatcaatt 15109469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 28 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 19822065 - 19821944
Alignment:
Q  28 tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatct 126  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||  |||||| ||||||||||| | |||| | |||||||||  |     
T  19822065 tcaactcattttacaaagtcaccaaaaacaactcattt-ctcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatcaca 19821967  T
Q  127 cagcaacaacaacatcaattgaa 149  Q
     ||||||||||||||||||||||    
T  19821966 tagcaacaacaacatcaattgaa 19821944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 35 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 41166228 - 41166066
Alignment:
Q  35 attttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaac 133  Q
    |||| |||||| |||| |||||||||||||| |||| |||||| |||| |  |||||| ||||||||||| |||||| | |||||||||  || ||||||    
T  41166228 atttcacaaaaccacccacaacaactcattt-ctcatcaacaaatcataagttatgaatacccaagccatgattcatcaacaacaacatcacttagcaac 41166130  T
Q  134 aacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatt 198  Q
    |||||||||||||||| | ||| ||   || |||||||||||||||||  ||||| ||| |||||    
T  41166129 aacaacatcaattgaa-catgactcttgccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 41166066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 398 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 15675041 - 15674967
Alignment:
Q  398 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 472  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    |||||  |||||||||||||||||||    
T  15675041 atgattatgatgaagactaacccccttaccttagattatgattaacctcaacttaggcttcactttagctcctaa 15674967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 399 - 496
Target Start/End: Original strand, 22738577 - 22738675
Alignment:
Q  399 tgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaatt-ctccaatcttcaagttttcccc 496  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||| | |||   |||||  ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||    
T  22738577 tgattatgatgaagacaaacccccttaccttagatgatgtttaatcttaacttaggcttcactttagctcctaattgcttcaatcttcaagtttccccc 22738675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 41256660 - 41256508
Alignment:
Q  27 atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatat 124  Q
    ||||||||||||| | |||| || |||||||||||||||| |||| || ||| ||||||| ||||||||||||| |||| | |||| | |||||| || |    
T  41256660 atcaacccatttttataaaaccaacaacaacaactcattt-ctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaaaccatgaatcatcaacaacaatatct 41256562  T
Q  125 ctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaac 179  Q
    || | ||||||||||||||||| |||| || ||| || | |||||||||||||||    
T  41256561 cttaacaacaacaacatcaatt-aaacatggttctcatcacaattcaacaacaac 41256508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 78 - 315
Target Start/End: Original strand, 54398391 - 54398627
Alignment:
Q  78 tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaaca 177  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||| | |||| | |||||| || ||| | ||||||||||||||||| |||| |||||| || | ||| |||||||||    
T  54398391 tcatgatttataaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaatt-aaacatgattctcatcacaaatcaacaaca 54398489  T
Q  178 acatgtcataagtcatcaatta-agcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaa 276  Q
    ||||  || || ||| |||||| |||| || |||| || |    ||||||||| | ||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||||   |     
T  54398490 acataacacaattcaacaattagagcacaa-ttcacaatatattattttcatatactatgaacatgcaatttcatcaacaacaattcaattatcaccaat 54398588  T
Q  277 ttaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaa 315  Q
    || |  ||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  54398589 ttcatgtactcaaacatatcaacataacaagagcacgaa 54398627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 398 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 40885491 - 40885418
Alignment:
Q  398 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctccta 471  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||    
T  40885491 atgattatgatgaattctaacccccttaccttagataatgattaatccaaacttaggcttcactttagctccta 40885418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 399 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 55376525 - 55376452
Alignment:
Q  399 tgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 472  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||  |||||||  |||||| ||||||||||||    
T  55376525 tgattatgatgaagactaacccccttaccttagataaggatcaacccaaacttaggcttcaatttagctcctaa 55376452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 184 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 5682669 - 5682557
Alignment:
Q  184 cataagtcatcaattaagcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacat 283  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| ||||| |||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||    
T  5682669 cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccaatttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacat 5682570  T
Q  284 actcaaacttatc 296  Q
    | |||||| ||||    
T  5682569 attcaaacatatc 5682557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 15013523 - 15013421
Alignment:
Q  76 aatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaa 175  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| | |||| | |||||| || ||| | ||||||||| ||||||| |||| |||||| || | |||||||||||    
T  15013523 aatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaatatcaatt-aaacatgattctcatcacaattcaacaa 15013425  T
Q  176 caac 179  Q
    ||||    
T  15013424 caac 15013421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 78 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 18238396 - 18238294
Alignment:
Q  78 tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaaca 177  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || | |||| | |||||| || ||| | ||||||||||||||||| |||| |||||| || | |||||||||||||    
T  18238396 tcatgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaatt-aaacatgattctcatcacaattcaacaaca 18238298  T
Q  178 acat 181  Q
    ||||    
T  18238297 acat 18238294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 178
Target Start/End: Original strand, 18276392 - 18276541
Alignment:
Q  28 tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatct 126  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||| |  |||| |  ||| ||||||| |||||||||||||||||| | |||| | |||||| ||  ||    
T  18276392 tcaacccattttacaaaaccaacaacaacaactcaata-ctcatcgtcaaatcatgatttatgaacacccaagccatcaatcatcaacaacaatatcact 18276490  T
Q  127 cagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaa 178  Q
      ||||||||||||||||||| ||| ||| || || | ||||||||||||||    
T  18276491 ttgcaacaacaacatcaattg-aacatgaatctcatcacaattcaacaacaa 18276541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 398 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 10104202 - 10104128
Alignment:
Q  398 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 472  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    |||||  |||| ||||||||||||||    
T  10104202 atgattatgatgaagactaacccccttaccttagattatgattaacctcaacttaggctttactttagctcctaa 10104128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 398 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 15135939 - 15135865
Alignment:
Q  398 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 472  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||| ||| | |||||  |||||||||||||||||||    
T  15135939 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagctcctaa 15135865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 398 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 15272243 - 15272169
Alignment:
Q  398 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 472  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||| ||| | |||||  |||||||||||||||||||    
T  15272243 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagctcctaa 15272169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 400 - 496
Target Start/End: Original strand, 18248527 - 18248624
Alignment:
Q  400 gattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaatt-ctccaatcttcaagttttcccc 496  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||||||||| | ||||| |||   ||||| |||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||    
T  18248527 gattatgataataactaacccccttaccttagatgatgattaatcttaacttaagcttcactttaactcctaattgcttcaatcttcaagtttccccc 18248624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 219 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 25119314 - 25119237
Alignment:
Q  219 ccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatc 296  Q
    |||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||| |||||| ||||    
T  25119314 ccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacatatc 25119237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 398 - 439
Target Start/End: Original strand, 33241011 - 33241052
Alignment:
Q  398 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgat 439  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33241011 atgattatgatgaagactaacccccttaccttagattatgat 33241052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 76 - 271
Target Start/End: Original strand, 38764715 - 38764909
Alignment:
Q  76 aatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaa 175  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| | |||| | |||||| ||  || | ||||||||||||||||| |||| |||||| || |  |||| |||||    
T  38764715 aatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatattccttaacaacaacaacatcaatt-aaacatgattctcatcataattgaacaa 38764813  T
Q  176 caacatgtcataagtcatcaa-ttaagcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatca 271  Q
    ||||||  ||||| ||| ||| || |||| || |||| || |   |||||||| | | ||||||||||| |||||| || |||||||||| ||||||    
T  38764814 caacatcgcataattcaacaatttgagcacaa-ttcacaatataacattttcacatactatgaacatgtaatttcaccaacaacaattcaattatca 38764909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 172 - 315
Target Start/End: Original strand, 49071788 - 49071931
Alignment:
Q  172 acaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcat-aacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatc 270  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||| ||  |  ||| | |||| || |||||||||  ||||||||| ||| |||||| ||| |    
T  49071788 acaacaacatgtcataattcatcaattgagcata-tttcatcaagtattcatatacatatatcatgaacatgcaatttcatcatcaataattcaattaac 49071886  T
Q  271 attcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaa 315  Q
    ||  ||||||||||||||||| |||||| | || | |||||||||    
T  49071887 atcaaattaacatactcaaacatatcactacaatatgagcacgaa 49071931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 401 - 472
Target Start/End: Original strand, 31132628 - 31132699
Alignment:
Q  401 attatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 472  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    |||||  ||| |||||||||||||||    
T  31132628 attatgatgaagactaacccccttaccttagattatgattaacctcaacttaggctccactttagctcctaa 31132699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 398 - 472
Target Start/End: Original strand, 13246737 - 13246811
Alignment:
Q  398 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 472  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||| ||| | |||||  |||||| ||||||||||||    
T  13246737 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaa 13246811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 184 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 15272454 - 15272304
Alignment:
Q  184 cataagtcatcaattaagcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacat 283  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| |||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||| |||| |||| |||  |||||||||    
T  15272454 cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaaccattcgtttaacatcaaattaacat 15272355  T
Q  284 actcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaaattagagattgggttcat 334  Q
    |  ||||| |||| | | ||||  ||||||||  | | |||||||||||||    
T  15272354 atccaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcat 15272304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 37957314 - 37957241
Alignment:
Q  28 tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaac-aatcatgatatatgaacacccaagcc 101  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||  |||| |||||||||||    
T  37957314 tcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactca-tttatcatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagcc 37957241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 48 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 32460953 - 32460890
Alignment:
Q  48 accaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagccataattcataa 112  Q
    |||||||||| |||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||    
T  32460953 accaacaacatctcaatt-ctcaccaacaatcatgatatatgcacacccaagtcataaatcataa 32460890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 398 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 54118200 - 54118168
Alignment:
Q  398 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 430  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54118200 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 54118168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 398 - 496
Target Start/End: Original strand, 8378493 - 8378592
Alignment:
Q  398 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaatt-ctccaatcttcaagttttcccc 496  Q
    ||||||||||| |  ||||| ||||||||||||| | ||| | |||   ||||| |||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||    
T  8378493 atgattatgataataactaatccccttaccttagatgatgtttaatcttaacttaagcttcactttaactcctaattgcttcaatcttcaagtttccccc 8378592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 149
Target Start/End: Original strand, 14901197 - 14901311
Alignment:
Q  35 attttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaac 133  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| || ||| ||||||  |||| ||||||| | ||| | |||| | ||||| |||  || ||||||    
T  14901197 attttacaaaaccaccaacaacaaccca-tttctcatcatcaattcatgaattatgcacacccatgtcatgaatcatcaacaacagcatcacttagcaac 14901295  T
Q  134 aacaacatcaattgaa 149  Q
    ||||||||||||||||    
T  14901296 aacaacatcaattgaa 14901311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 361 - 430
Target Start/End: Original strand, 14996409 - 14996477
Alignment:
Q  361 tttcatacaaaccaagaaaaattgcaaacaaa-caattatgattatgatgaagactaacccccttacctta 430  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  14996409 tttcatacaa--caaggaaaattgcaaacaaaacaatcatgattatgataataactaacccccttacctta 14996477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 364 - 431
Target Start/End: Original strand, 26680484 - 26680550
Alignment:
Q  364 catacaaaccaagaaaaattgcaaacaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttaccttag 431  Q
    |||||||| || ||||||||||||| ||  ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26680484 catacaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaac-atgattatgataaagactaacccccttaccttag 26680550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 47 - 148
Target Start/End: Original strand, 16732146 - 16732247
Alignment:
Q  47 caccaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaat 145  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||   ||| | ||||||||||| | | || |||||||||||  || ||||||||| ||||||||    
T  16732146 caccaacaacatctcattt-ctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaacgacatcaat 16732244  T
Q  146 tga 148  Q
    |||    
T  16732245 tga 16732247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 78 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 50220179 - 50220078
Alignment:
Q  78 tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaaca 177  Q
    ||||||| ||||||||||||| | || | |||| | |||||| || ||| | ||||||||||||||||| |||| |||||| || | ||| |||||||||    
T  50220179 tcatgatttatgaacacccaaactatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaatt-aaacatgattctcatcacaaatcaacaaca 50220081  T
Q  178 aca 180  Q
    |||    
T  50220080 aca 50220078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 76 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 52265749 - 52265628
Alignment:
Q  76 aatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaa 175  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||| | |||| | || ||| ||  || |||||||||||||||||||||| | ||| ||  | | |||||||||||    
T  52265749 aatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaacatcaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaa-catgaatcttatcacaattcaacaa 52265651  T
Q  176 caacatgtcataagtcatcaatt 198  Q
    ||||||  ||||| ||| |||||    
T  52265650 caacattgcataattcaacaatt 52265628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 398 - 431
Target Start/End: Original strand, 7850314 - 7850347
Alignment:
Q  398 atgattatgatgaagactaacccccttaccttag 431  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7850314 atgattatggtgaagactaacccccttaccttag 7850347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 13442946 - 13442813
Alignment:
Q  50 caacaacaactcattttctcaacaacaat-catgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatct---cagcaacaacaacatcaat 145  Q
    |||||||||||||||| |||| || |||| ||| || ||||||||||||||| || | |||| | |||||| || |||   || ||||||||||||||||    
T  13442946 caacaacaactcattt-ctcatcatcaattcataatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaaaatctcttaacaacaacaacaacatcaat 13442848  T
Q  146 tgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacat 181  Q
    | |||| |||||| || | ||||||||||| |||||    
T  13442847 t-aaacatgattctcatcacaattcaacaataacat 13442813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 398 - 431
Target Start/End: Original strand, 14952085 - 14952118
Alignment:
Q  398 atgattatgatgaagactaacccccttaccttag 431  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14952085 atgattatgataaagactaacccccttaccttag 14952118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 361 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 16327908 - 16327840
Alignment:
Q  361 tttcatacaaaccaagaaaaattgcaaacaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttacctta 430  Q
    |||||| |||| || ||||||||||||| ||  ||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16327908 tttcatccaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaac-atgattatgataaagactaacccccttacctta 16327840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 398 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 16609045 - 16609012
Alignment:
Q  398 atgattatgatgaagactaacccccttaccttag 431  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16609045 atgattatgataaagactaacccccttaccttag 16609012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 130 - 211
Target Start/End: Original strand, 26339081 - 26339161
Alignment:
Q  130 caacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttca 211  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||| | || ||||||||| ||||| | ||| || |||| ||||||||| |||||||    
T  26339081 caacaacaacatccattgaaacttgtttctctcctcaattcaac-acaacttatcacaaatcattaattaagcaaaatttca 26339161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 130 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 22352241 - 22352197
Alignment:
Q  130 caacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaaca 174  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||||    
T  22352241 caacaacaacatccattgaaacttgtttctcacctcaattcaaca 22352197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 412; Significance: 0; HSPs: 47)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 412; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 109157 - 108686
Alignment:
Q  1 catcatcaaaatcaaacttcttctttatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  109157 catcatcaaaatcaaacttcttctctatcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagc 109058  T
Q  101 cataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  109057 cataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaa 108958  T
Q  201 gcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcacca 300  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  108957 gcataatttcacaacaatccattttcatacattatgaacatgttaattcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcacca 108858  T
Q  301 aaacaagagcacgaaaattagagattgggttcatatgaattctcactcaattaagcactttttcatacaaaccaagaaaaattgcaaacaaacaattatg 400  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  108857 aaacaagagcacgaaaattagggattgggttcatatgaattctcactcaattaagcactttttcatacaaaccaagaaaaattgcaaacaaacaattatg 108758  T
Q  401 attatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 472  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| ||| | |||||  ||||||||||| |||||||    
T  108757 attatgatgaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttacctcctaa 108686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 370; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 35 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 9730672 - 9730216
Alignment:
Q  35 attttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaaca 134  Q
    |||| |||||| ||||||||||| || |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| || |||||||||||    
T  9730672 atttcacaaaaccaccaacaacatcttattt-ctcacaaacaatcatgatatatgaacacccaagccataaatcataaacaacaatatgtctcagcaaca 9730574  T
Q  135 acaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcataacaacccattttcatacatta 234  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9730573 acaacatcaatcgaaacttgattctcaccttaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacatta 9730474  T
Q  235 tgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaaattagagattgggttcat 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9730473 tgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaatcttatcaccaaaacaagagcacgaaaattagagattgggttcat 9730374  T
Q  335 atgaattctcactcaattaagcactttttcatacaaaccaagaaaaattgcaaacaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttaccttaggtt 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9730373 atgaattctcactcaattaagcactttttcatacaaaccaagaaaaattgcaaacaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttaccttaggtt 9730274  T
Q  435 atgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaatt-ctccaatcttcaagttt 491  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  9730273 atgatcaattcaaacttgggcttcactttagctcctaattgcttcaatcttcaagttt 9730216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 72 - 496
Target Start/End: Original strand, 7528902 - 7529326
Alignment:
Q  72 caacaatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattca 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  7528902 caacaatcatgatatatgaacacccaagtcataaatcataaacaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattctcacctcaattca 7529001  T
Q  172 acaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatca 271  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7529002 acaacaacatgtcataattcatcaattaagcataatttcacaactacccattttcatacactatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatca 7529101  T
Q  272 ttcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaaattagagattgggttcatatgaattctcactcaattaagcactttttcatacaaa 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  | |||||||||||| ||| || ||||||||||||||| |||||||||||    
T  7529102 ttcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaagggttgggttcatataaatacttactcaattaagcactatttcatacaaa 7529201  T
Q  372 ccaagaaaaattgcaaac-aaacaattatgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcct 470  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||     
T  7529202 ccaag-aaaattgcaaacaaaacaattatgattatgaagaagactaacccccttaccttagataatgattaatccaaacttaggcttcactttagctccc 7529300  T
Q  471 aattctccaatcttcaagttttcccc 496  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||    
T  7529301 aattcttcaatcttcaagtttccccc 7529326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Original strand, 16105574 - 16105906
Alignment:
Q  1 catcatcaaaatcaaacttcttctttatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16105574 catcatcaaaatcaaacttcttctttatcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacctaagc 16105673  T
Q  101 cataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16105674 cataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaa 16105773  T
Q  201 gcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcacca 300  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| || ||||||||||||  ||||| |||| | |    
T  16105774 gcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatattatttcatcatcaaccattcatttaaca-tcaattaacatatccaaacatatctcta 16105872  T
Q  301 aaacaagagcacgaaaattagagattgggttcat 334  Q
     ||||  ||||||||  | | |||||||||||||    
T  16105873 caacataagcacgaatttcaaagattgggttcat 16105906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 64 - 315
Target Start/End: Original strand, 17909500 - 17909750
Alignment:
Q  64 tttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacacc 163  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| || || || |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  17909500 tttctcaccaccaatcatgatatatgaacacccaagccataat-cataaacaacaacatgtcgcatcagcaacaacatcaattaaaacttgattctcacc 17909598  T
Q  164 ccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattc 263  Q
     ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17909599 tcaattcaacaacaacatgtcacaattcatcaattaagcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattc 17909698  T
Q  264 atttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaa 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17909699 atttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaa 17909750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 35 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 10778259 - 10778081
Alignment:
Q  35 attttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaaca 134  Q
    |||| |||||| ||||| ||||| || |||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10778259 atttcacaaaaccaccaccaacatcttattt-ctcatcaacaattatggtatatgaacacccaagccataaatcataatcaacaacatatctcagcaaca 10778161  T
Q  135 acaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcataac 215  Q
    |||||||||||| | |  ||||| ||| | || |||||  | ||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  10778160 acaacatcaatt-acatatgatttacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataac 10778081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 361 - 496
Target Start/End: Original strand, 17909787 - 17909921
Alignment:
Q  361 tttcatacaaaccaagaaaaattgcaaacaaa-caattatgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttca 459  Q
    ||||||||||  |||| |||||||| |||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||    
T  17909787 tttcatacaa--caaggaaaattgctaacaaaacaatcatgattatgaagaacactaacccccttaccttaggttatgattaatccaaacttaggcttca 17909884  T
Q  460 ctttagctcctaattctccaatcttcaagttttcccc 496  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  17909885 ctttaactcctaattcttcaatcttcaagtttccccc 17909921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 170 - 471
Target Start/End: Original strand, 25004915 - 25005210
Alignment:
Q  170 caacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatt-tcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcattta 268  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||| |||||||||  ||||||| |  ||||||||| |||    
T  25004915 caacaacaacatgtcataaatcaccaattgagcataattctca-aactacccatttacatacatcatgaacatgcaatttcataattaacaattcaatta 25005013  T
Q  269 tcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaaattagagattgggttcatatgaat-tctcactcaattaagcactttttcata 367  Q
    || || |||||||| |||||||| ||||||   |||| |||||||||  | | |||||||||||| |  |||  || | |||||| ||||||| ||||||    
T  25005014 tccttaaattaacacactcaaacatatcacttcaacatgagcacgaatttcaaagattgggttcacaataatcacttattcaattgagcacttattcata 25005113  T
Q  368 caaaccaagaaaaattgcaaacaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagct 467  Q
    |||     |||||| |  |||| ||     ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| ||| |||||||  ||||||||||||||    
T  25005114 caacaattgaaaaact--aaactaa-----atgattatgatgaagactaacccccttactttagataatgattaatccaaacttaggcttcactttagct 25005206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 398 - 491
Target Start/End: Original strand, 34939595 - 34939688
Alignment:
Q  398 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaattctccaatcttcaagttt 491  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34939595 atgattatgaagaacactaacccccttaccttaggttatgattaattcacacttagacttcactttagctcctaattcttcaatcttcaagttt 34939688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 35 - 215
Target Start/End: Original strand, 23514528 - 23514706
Alignment:
Q  35 attttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaaca 134  Q
    |||| |||||| ||||||||||| || |||| |||| ||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  ||||    
T  23514528 atttcacaaaaccaccaacaacatcttattt-ctcatcaataattatggtatatgaacacccaagccataaatcataatcaacaacatctctcaagaaca 23514626  T
Q  135 acaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcataac 215  Q
    |||||||||||| | |  ||||| ||| | || |||||  | ||||| ||| |  |||||||||||| |||||||||||||    
T  23514627 acaacatcaatt-acatatgatttacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataac 23514706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 83
Target Start/End: Original strand, 11583982 - 11584063
Alignment:
Q  1 catcatcaaaatcaaacttcttctttatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatga 83  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11583982 catcatcaaaaacaaacttcttcatcatcaacccattttacaaaaccacgaacaacaactca-tttctcaacaacaatcatga 11584063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 165 - 334
Target Start/End: Original strand, 21650789 - 21650958
Alignment:
Q  165 caattcaacaacaac-atgtcataagtcatcaattaagcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattc 263  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| |||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||    
T  21650789 caattcaacaacaaccatg-cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattc 21650887  T
Q  264 atttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaaattagagattgggttcat 334  Q
    ||||| |||  |||||||||| |||||| |||| | | ||||  ||||||||  | | |||||||||||||    
T  21650888 atttaacatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcat 21650958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 28 - 198
Target Start/End: Original strand, 7728378 - 7728547
Alignment:
Q  28 tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaat-catgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatct 126  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| | |||| ||||||| |||||  |||| |||||||||| |||| | || |||||||||||  ||    
T  7728378 tcaacccatttttcaaagtcaccaacaacacctcatct-ctcaccaacaattcatgaattatgcacacccaagcgataaattatcatcaacaacatcact 7728476  T
Q  127 cagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatt 198  Q
     |||||||||||||||||||||| | ||| ||  | | |||||||||||||||||  ||||| ||| |||||    
T  7728477 tagcaacaacaacatcaattgaa-catgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 7728547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 184 - 334
Target Start/End: Original strand, 2031923 - 2032073
Alignment:
Q  184 cataagtcatcaattaagcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacat 283  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| |||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||    
T  2031923 cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacat 2032022  T
Q  284 actcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaaattagagattgggttcat 334  Q
    | |||||| |||| | | ||||  ||||||||  | | |||||||||||||    
T  2032023 attcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcat 2032073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 184 - 334
Target Start/End: Original strand, 11342798 - 11342948
Alignment:
Q  184 cataagtcatcaattaagcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacat 283  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| |||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||    
T  11342798 cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacat 11342897  T
Q  284 actcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaaattagagattgggttcat 334  Q
    | |||||| |||| | | ||||  ||||||||  | | |||||||||||||    
T  11342898 attcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcat 11342948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 27 - 181
Target Start/End: Original strand, 24084034 - 24084187
Alignment:
Q  27 atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcattttc-tcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatat 124  Q
    ||||||||||||| |||||| || | ||||||||| |||||| ||| |||  |||||||| ||  |||||||||||||| | || | | |||||| || |    
T  24084034 atcaacccatttttacaaaaccaaccacaacaacttattttcatcatcaa--atcatgatttactaacacccaagccatgaatcttcaacaacaatattt 24084131  T
Q  125 ctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacat 181  Q
    || ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||||    
T  24084132 cttagcaacaacaacatcaatt-aaacatgattcacatcacaattcaacaacaacat 24084187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 184 - 334
Target Start/End: Original strand, 21205039 - 21205189
Alignment:
Q  184 cataagtcatcaattaagcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacat 283  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| |||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||    
T  21205039 cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacat 21205138  T
Q  284 actcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaaattagagattgggttcat 334  Q
    |  ||||| |||| | | ||||  ||||||||  | | |||||||||||||    
T  21205139 atccaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcat 21205189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 398 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 27182503 - 27182429
Alignment:
Q  398 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 472  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| | |||||  |||||| ||||||||||||    
T  27182503 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggtaaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaa 27182429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 64 - 181
Target Start/End: Original strand, 29917958 - 29918075
Alignment:
Q  64 tttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacac 162  Q
    |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| | |||| | |||||| || ||| |||||||||||||||| || |||| |||||| ||     
T  29917958 tttctcaacatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatctcttagcaacaacaacatcagtt-aaacatgattctcat 29918056  T
Q  163 cccaattcaacaacaacat 181  Q
    |  ||||||||||||||||    
T  29918057 cataattcaacaacaacat 29918075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 76 - 181
Target Start/End: Original strand, 23493925 - 23494029
Alignment:
Q  76 aatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaa 175  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||| | |||| |||||||||||  || |||||||||||||||||||||| | ||| ||  | | |||||||||||    
T  23493925 aatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcatcaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgaa-catgaatcttatcacaattcaacaa 23494023  T
Q  176 caacat 181  Q
    ||||||    
T  23494024 caacat 23494029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 27 - 181
Target Start/End: Original strand, 6456580 - 6456734
Alignment:
Q  27 atcaacccattt-tacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatat 124  Q
    |||||||| ||| ||||||| || ||||||||||| |||| |||| || ||| |||||||  ||||||||||||||||| | |||| | |||| | || |    
T  6456580 atcaacccgtttgtacaaaaacaacaacaacaacttattt-ctcatcatcaaatcatgattcatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacgatatct 6456678  T
Q  125 ctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacat 181  Q
    || | ||||||||||||||||| |||| |||||| || | |||||||||||||||||    
T  6456679 cttaacaacaacaacatcaatt-aaacatgattctcatcacaattcaacaacaacat 6456734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 400 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 18531018 - 18530946
Alignment:
Q  400 gattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 472  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    |||||  |||||||||||||||||||    
T  18531018 gattatgatgaagactaacccccttaccttagattatgattaacctcaacttaggcttcactttagctcctaa 18530946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 217 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 22662784 - 22662668
Alignment:
Q  217 acccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaa 316  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||  |||||||||| |||||  |||||| | |||| |||||||||     
T  22662784 acccatttatatacatcatgaacatgcaatttcatcatcaacaattcaattatcatcaaattaacatattcaaatatatcactacaacatgagcacgaat 22662685  T
Q  317 attagagattgggttca 333  Q
     | | ||||||||||||    
T  22662684 ttcaaagattgggttca 22662668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 28 - 181
Target Start/End: Original strand, 21616974 - 21617126
Alignment:
Q  28 tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatct 126  Q
    |||||||||||||||||| || | |||||| |||| || |||| || ||| ||||||  |||||||||||||||||| | |||  | |||||| ||  ||    
T  21616974 tcaacccattttacaaaaccaaccacaacagctcactt-ctcatcatcaaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcaacaacaacaatatcact 21617072  T
Q  127 cagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacat 181  Q
     |||||||||||||||||||| ||| ||| || || | |||||||||||||||||    
T  21617073 tagcaacaacaacatcaattg-aacatgaatctcatcacaattcaacaacaacat 21617126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 398 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 22053785 - 22053711
Alignment:
Q  398 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 472  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    |||||   ||||||||||||||||||    
T  22053785 atgattatgatgaagactaacccccttaccttagattatgattaacctcaacttagacttcactttagctcctaa 22053711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 398 - 472
Target Start/End: Original strand, 23507270 - 23507344
Alignment:
Q  398 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 472  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||| ||||| |||||  ||||||||||| |||||||    
T  23507270 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaattccaacttatgcttcactttaactcctaa 23507344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 402 - 472
Target Start/End: Original strand, 32951016 - 32951086
Alignment:
Q  402 ttatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 472  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||||||   ||||| ||||||||||||    
T  32951016 ttatgatgaagactaacccccttaccttaaataatgattaattcaaacttagacttcaatttagctcctaa 32951086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 395 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 23981440 - 23981363
Alignment:
Q  395 attatgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 472  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | | ||| ||| |||||||  |||||| ||||||||||||    
T  23981440 attatgattttgatgaagactaacccccttacctaagatgaagattaatccaaacttaggcttcaatttagctcctaa 23981363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 76 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 23981757 - 23981646
Alignment:
Q  76 aatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaa 175  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||| | |||| | |||||| ||  || |||||||||||||||||||||| | || ||| || |  ||||||||||    
T  23981757 aatcatgagttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaa-catggttctcatcataattcaacaa 23981659  T
Q  176 caacatgtcataa 188  Q
    |||||| ||||||    
T  23981658 caacatatcataa 23981646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 181
Target Start/End: Original strand, 37983325 - 37983474
Alignment:
Q  28 tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatct 126  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||| || ||| || |||| ||||||||||||||| || | |||| | |||||| ||  ||    
T  37983325 tcaacccattttacaaaa---ccaacaacaactcatttt-tcatcatcaaatcctgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatcact 37983420  T
Q  127 cagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacat 181  Q
     | ||||||||||||||||| |||| |||||| ||   ||||||||||| |||||    
T  37983421 taacaacaacaacatcaatt-aaacatgattctcattacaattcaacaataacat 37983474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 27 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 1168495 - 1168373
Alignment:
Q  27 atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatat 124  Q
    ||||||||||||| |  ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||   ||| | ||||||||||| | | || |||||||||||      
T  1168495 atcaacccattttcatcaaaacaccaacaacatctcattt-ctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatga 1168397  T
Q  125 ctcagcaacaacaacatcaattga 148  Q
    || |||||||||||||||||||||    
T  1168396 cttagcaacaacaacatcaattga 1168373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 27 - 148
Target Start/End: Original strand, 3673818 - 3673940
Alignment:
Q  27 atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatat 124  Q
    ||||||||||||| || ||| || ||||||||||| |||| |||| || ||| || |||| |||||||||||||||||| | |||| |||||| || |      
T  3673818 atcaacccattttcaccaaaccaacaacaacaacttattt-ctcatcatcaaatcgtgatttatgaacacccaagccatgaatcatcatcaaccacctcg 3673916  T
Q  125 ctcagcaacaacaacatcaattga 148  Q
    || |||||||||||||||||||||    
T  3673917 cttagcaacaacaacatcaattga 3673940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 24225634 - 24225596
Alignment:
Q  1 catcatcaaaatcaaacttcttctttatcaacccatttt 39  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24225634 catcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccatttt 24225596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 27 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 5451134 - 5450963
Alignment:
Q  27 atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatat 124  Q
    ||||||||||||| || ||| || ||||||||||| |||| |||| || ||| ||||||| ||||| || ||||||||  | |||| |||||||||||      
T  5451134 atcaacccattttcaccaaaccaacaacaacaacttattt-ctcatcatcaaatcatgatttatgatcatccaagccaagaatcatcatcaacaacatca 5451036  T
Q  125 ctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatt 198  Q
    || |||||||||||||||| ||| ||| ||| |   | | |||||||||||||||||  ||||| |||||||||    
T  5451035 cttagcaacaacaacatcagttg-aacatgaattttatcacaattcaacaacaacatagcataattcatcaatt 5450963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 47 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 11337455 - 11337355
Alignment:
Q  47 caccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaatt 146  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||   ||| | || |||||||| | | || |||||| ||||  || |||||||||||||||||||    
T  11337455 caccaacaacatctcattt-ctcaacaacaatcatgaatcatgtaaactcaagccatgaattatcatcaacgacatgacttagcaacaacaacatcaatt 11337357  T
Q  147 ga 148  Q
    ||    
T  11337356 ga 11337355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 28 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 32966436 - 32966399
Alignment:
Q  28 tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcattt 65  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32966436 tcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcattt 32966399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 400 - 472
Target Start/End: Original strand, 2032135 - 2032207
Alignment:
Q  400 gattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 472  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||| ||  |||||||  |||||| ||||||||||||    
T  2032135 gattatgatgaaaactaacccccttaccttagataaggattaacccaaacttaggcttcaatttagctcctaa 2032207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 47 - 198
Target Start/End: Original strand, 19862186 - 19862336
Alignment:
Q  47 caccaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaat 145  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || ||| ||||||  |||||||||||||| ||| | |||| | ||| || ||  || ||||||||||||||||||    
T  19862186 caccaacaacaactcattt-ctcatcatcaaatcatgaattatgaacacccaagtcatgaatcatcaacaataatatcacttagcaacaacaacatcaat 19862284  T
Q  146 tgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatt 198  Q
    ||  || ||||||  | | |||||||||||||||||  ||||| ||| |||||    
T  19862285 tg-cacatgattcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 19862336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 78 - 181
Target Start/End: Original strand, 21109758 - 21109860
Alignment:
Q  78 tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaaca 177  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || | |||| |  ||||| || ||| | ||||||||||||||||| |||| |||||| || | ||| |||||||||    
T  21109758 tcatgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaataacaatatctcttaacaacaacaacatcaatt-aaacatgattctcatcacaaatcaacaaca 21109856  T
Q  178 acat 181  Q
    ||||    
T  21109857 acat 21109860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 86 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 26560046 - 26559952
Alignment:
Q  86 tatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacat 181  Q
    |||||||||||||||||  | |||| | |||||| || ||| ||||||||||||||||||| |||| | |||| || | ||| |||||||||||||    
T  26560046 tatgaacacccaagccaagaatcatcaccaacaatatctcttagcaacaacaacatcaatt-aaacataattctcatcacaaatcaacaacaacat 26559952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 361 - 431
Target Start/End: Original strand, 20623250 - 20623319
Alignment:
Q  361 tttcatacaaaccaagaaaaattgcaaacaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttaccttag 431  Q
    |||||| |||| || ||||||||||||| ||  ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20623250 tttcatccaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaac-atgattatgataaagactaacccccttaccttag 20623319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 361 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 21233510 - 21233441
Alignment:
Q  361 tttcatacaaaccaagaaaaattgcaaacaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttaccttag 431  Q
    |||||| |||| || ||||||||||||| ||  ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21233510 tttcatccaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaac-atgattatgataaagactaacccccttaccttag 21233441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 361 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 25900388 - 25900319
Alignment:
Q  361 tttcatacaaaccaagaaaaattgcaaacaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttaccttag 431  Q
    |||||| |||| || ||||||||||||| ||  ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25900388 tttcatccaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaac-atgattatgataaagactaacccccttaccttag 25900319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 398 - 431
Target Start/End: Original strand, 16105967 - 16106000
Alignment:
Q  398 atgattatgatgaagactaacccccttaccttag 431  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16105967 atgattatgataaagactaacccccttaccttag 16106000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 100
Target Start/End: Original strand, 22882391 - 22882455
Alignment:
Q  36 ttttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaat-catgatatatgaacacccaagc 100  Q
    |||||||||| || ||||||||||| |||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||    
T  22882391 ttttacaaaaccaacaacaacaacttattt-ctcaacatcaattcatgatttatgaacacccaagc 22882455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 398 - 431
Target Start/End: Original strand, 37053061 - 37053094
Alignment:
Q  398 atgattatgatgaagactaacccccttaccttag 431  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37053061 atgattatgataaagactaacccccttaccttag 37053094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 78 - 146
Target Start/End: Original strand, 19873852 - 19873920
Alignment:
Q  78 tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaatt 146  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || | |||| | |||||| || ||| | |||||||||||||||||    
T  19873852 tcatgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaatt 19873920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 385; Significance: 0; HSPs: 51)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 385; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 24827043 - 24826615
Alignment:
Q  1 catcatcaaaatcaaacttcttctttatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagc 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  24827043 catcatcaatatcaaacttcttctttatcaacccattttacaaaaccaccaacaacagctcattttctcaacaacaatcatgataaatgagcacccaagc 24826944  T
Q  101 cataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaa 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24826943 cataattcataatcaacaacgtatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacacctcaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaa 24826844  T
Q  201 gcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcacca 300  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24826843 gcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcacca 24826744  T
Q  301 aaacaagagcacgaaaattagagattgggttcatatgaattctcactcaattaagcactttttcatacaaaccaagaaaaattgcaaacaaacaattatg 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24826743 aaacaagagcacgaaaattagagattgggttcatatgaattctcactcaattaagcactttttcatacaaaccaagaaaaattgcaagcaaacaattatg 24826644  T
Q  401 attatgatgaagactaacccccttacctt 429  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||    
T  24826643 attatgatgatgactaacccctttacctt 24826615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 365; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 48 - 491
Target Start/End: Original strand, 17204309 - 17204753
Alignment:
Q  48 accaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattg 147  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17204309 accaacaacatctcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacatataagccataattcataatcaacaatatatctcagcaacaacaacatcaattg 17204408  T
Q  148 aaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatt 247  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17204409 aaacttgattcacacctcaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttatt 17204508  T
Q  248 tcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaaattagagattgggttcatatgaattctcact 347  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17204509 tcatcaccaacaattcatttatgatgcaattaacatactcaatcttatcaccaaaacaagagcacgaaaattagagattgggttcatatgaattctcact 17204608  T
Q  348 caattaagcactttttcatacaaaccaagaaaaattgcaaacaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaa 447  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||    
T  17204609 caattaagcactttttcatacaaaccaagaaaaattgcaaacaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttactttaggttatgattaatccaa 17204708  T
Q  448 acttgagcttcactttagctcctaa-ttctccaatcttcaagttt 491  Q
    ||||   |||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||    
T  17204709 acttagacttcactttaactcctaatttcttcaatcttcaagttt 17204753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 48 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 28031516 - 28031068
Alignment:
Q  48 accaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattg 147  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28031516 accaacaacatctcattttctcatcaacaatcatgatatatgaacacccaagccataaatcataaacaacaacatatctcaacaacaacaacatcaattg 28031417  T
Q  148 aaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatt 247  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28031416 aaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatatcataattcatcaattaagcataatttcacaactacccattttcacacattatgaacatgttatt 28031317  T
Q  248 tcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaaattagagattgggttcatatgaattctcact 347  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||| ||  ||    
T  28031316 tcatcaccaacaattcatttatcaatcaattaacatactaaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaaagattgggttcatataaatacttgct 28031217  T
Q  348 caattaagcactttttcatacaaaccaagaaaaattgcaaac-aaacaattatgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattca 446  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  28031216 caattaagcactttctcatacaaaccaag-aaaattgcaaacaaaacaatcatgattatgatgaagactaacccccttaccttaggtaatgattaattca 28031118  T
Q  447 aacttgagcttcactttagctcctaattctccaatcttcaagttttcccc 496  Q
    |||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  28031117 aacttaggcttcactttaactcctaattcttcaatcttcaagtttccccc 28031068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 92 - 472
Target Start/End: Original strand, 33128067 - 33128446
Alignment:
Q  92 cacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtc 191  Q
    |||||||||||| | |||| | |||||| || ||| | | ||||||| ||||||| |||| |||||| || | |||||||||||||||||||||||||||    
T  33128067 cacccaagccatgaatcattaacaacaatatctcttaaccacaacaatatcaatt-aaacatgattctcatcacaattcaacaacaacatgtcataagtc 33128165  T
Q  192 atcaattaagcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaac 291  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33128166 atcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaac 33128265  T
Q  292 ttatcaccaaaacaagagcacgaaaattagagattgggttcatatgaattctcactcaattaagcactttttcatacaaaccaagaaaaattgcaaacaa 391  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33128266 ttatcaccaaaacaagagcacgaaaattaaagattgggttcataaaaattctcactcaattaagcactttttcatacaaaccaagaaaaattgcaaacaa 33128365  T
Q  392 acaattatgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 472  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  33128366 acaattatgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgattaatccaaacttaggcttcactttagctcctaa 33128446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Original strand, 25212978 - 25213311
Alignment:
Q  1 catcatcaaaatcaaacttcttctttatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttt-ctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaag 99  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25212978 catcatcaaaatcaaatttcttctttatcaacccattttacaaaaccaccaccaacaactcatttttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaag 25213077  T
Q  100 ccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatta 199  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25213078 ccataattcattatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatta 25213177  T
Q  200 agcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcacc 299  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| || ||||||||||||  ||||| |||| |     
T  25213178 agcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatattatttcatcatcaaccattcatttaaca-tcaattaacatatccaaacatatctct 25213276  T
Q  300 aaaacaagagcacgaaaattagagattgggttcat 334  Q
    | ||||  ||||||||  | | |||||||||||||    
T  25213277 acaacataagcacgaatttcaaagattgggttcat 25213311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 64 - 316
Target Start/End: Original strand, 15633208 - 15633459
Alignment:
Q  64 tttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacacc 163  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  15633208 tttctcactaacaatcatgatatatgaacacccaagccataaatcatag-caacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgtttctcacc 15633306  T
Q  164 ccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattc 263  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15633307 tcaattcaacaacaacatgtcataattcatcaattaagcataatttcacaactacccattttcaaacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattc 15633406  T
Q  264 atttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaa 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15633407 atttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaa 15633459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 398 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 7507789 - 7507683
Alignment:
Q  398 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaattctccaatcttcaagttttccccc 497  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7507789 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagtttcactttaactcctaattctccaatcttcaagctttccccc 7507690  T
Q  498 tttgcta 504  Q
    |||||||    
T  7507689 tttgcta 7507683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 19433648 - 19433452
Alignment:
Q  1 catcatcaaaatcaaacttcttctttatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaac-aatcatgatatatgaacacccaag 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||    
T  19433648 catcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactca-tttctcatcaacaaatcatgaattatgaacacccaag 19433550  T
Q  100 ccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatt 198  Q
    |||| | |||| | |||||| || ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||  |||||||| ||||||||  ||||| ||| |||||    
T  19433549 ccatgaatcatcaacaacaatatctcttagcaacaacaacatcaattg-aacatgattcttacaacaattcaataacaacatagcataattcaacaatt 19433452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 398 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 23777994 - 23777888
Alignment:
Q  398 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaattctccaatcttcaagttttccccc 497  Q
    |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23777994 atgattatgatgataactaacccctttaccttaggttatgatcaattcaaatttgagcttcactttagctcctaattctccaatcttctagttttccccc 23777895  T
Q  498 tttgcta 504  Q
    |||||||    
T  23777894 tttgcta 23777888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 28 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 3529 - 3409
Alignment:
Q  28 tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctc 127  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||| | |||| |||||||||||  ||     
T  3529 tcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcattt-ctcatctacaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcatcaacaacatcactt 3431  T
Q  128 agcaacaacaacatcaattgaa 149  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  3430 agcaacaacaacatcaattgaa 3409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 35 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 12636157 - 12635979
Alignment:
Q  35 attttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaaca 134  Q
    |||| |||||| ||||||||||| || |||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12636157 atttcacaaaaccaccaacaacatcttattt-ctcatcaacaattatggtatatgaacacccaatccataaatcataatcaacaacatatctcagcaaca 12636059  T
Q  135 acaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcataac 215  Q
    |||||||||||| | |  ||||| ||| | || |||||  | ||||| ||| |  |||||||||||| |||||||||||||    
T  12636058 acaacatcaatt-acatatgatttacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataac 12635979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 35 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 12641931 - 12641753
Alignment:
Q  35 attttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaaca 134  Q
    |||| |||||| ||||||||||| || |||| |||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12641931 atttcacaaaaccaccaacaacatcttattt-ctcatcaacacttatggtatatgaacacccaagccataaatcatactcaacaacatatctcagcaaca 12641833  T
Q  135 acaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcataac 215  Q
    |||||||||||| | |  ||||| ||| | || |||||| | ||||| ||| |  |||||||||||| |||||||||||||    
T  12641832 acaacatcaatt-acatatgatttacatctcatttcaaccaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataac 12641753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 35 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 42178258 - 42178080
Alignment:
Q  35 attttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaaca 134  Q
    |||| |||||| ||||||||||| || |||| |||| |||||||  || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42178258 atttcacaaaaccaccaacaacatcttattt-ctcatcaacaattttggtatatgaacacccaagccataagtcataatcaacaacatatctcagcaaca 42178160  T
Q  135 acaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcataac 215  Q
    |||||||||||| | |  ||||| ||| | || |||||  | ||||| ||| |  |||||||||||| |||||||||||||    
T  42178159 acaacatcaatt-acatatgatttacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataac 42178080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 35 - 215
Target Start/End: Original strand, 8943813 - 8943991
Alignment:
Q  35 attttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaaca 134  Q
    |||| |||||| ||||||||||| || |||| ||||  |||||| ||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8943813 atttcacaaaaccaccaacaacatcttattt-ctcattaacaattatggtatatgaacacccaatccataaatcataatcaacaacatatctcagcaaca 8943911  T
Q  135 acaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcataac 215  Q
    |||||||||||| | |  ||||| ||| | || |||||  | ||||| ||| |  |||||||||||| |||||||||||||    
T  8943912 acaacatcaatt-acatatgatttacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataac 8943991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 35 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 3798892 - 3798714
Alignment:
Q  35 attttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaaca 134  Q
    |||| |||||| |||||| |||| || |||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3798892 atttcacaaaaccaccaataacatcttattt-ctcatcaacaattatggtatatgaacacccaagcctcaaatcatactcaacaacatatctcagcaaca 3798794  T
Q  135 acaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcataac 215  Q
    |||||||||||| | |  ||||| ||| | || |||||| | ||||| ||| |  |||||||||||| |||||||||||||    
T  3798793 acaacatcaatt-acatatgatttacatctcatttcaaccaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataac 3798714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 43645825 - 43646020
Alignment:
Q  1 catcatcaaaatcaaacttcttctttatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagc 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||   |  || ||  ||||||||  ||||||||||||||     
T  43645825 catcatcaaaatcaaactttttcattaccaacccattttacaaaaccaccaccaacaactca-aatgacatcacaaatcatgaattatgaacacccaagt 43645923  T
Q  101 cataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatt 198  Q
    ||| | ||||   |||||||||  || |||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||| || ||||||||||||||  ||||| ||| |||||    
T  43645924 catgaatcatcgacaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattg-aacatgattcttaccacagttcaacaacaacatagcataattcaacaatt 43646020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 166 - 315
Target Start/End: Original strand, 7321612 - 7321761
Alignment:
Q  166 aattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcat 265  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||| |||| ||||    ||| ||||||||  |||||| || ||||||  |||||||||  || ||||||     
T  7321612 aattcaacaacaacatgtcacaattcatcaattgagcacaattcacaaactacccatttatatacatcataaacatgaaatttcatcataaaaaattcaa 7321711  T
Q  266 ttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaa 315  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| |||||| | |||| |||||||||    
T  7321712 ttatcatcaaattaacatactcaaacatatcactacaacatgagcacgaa 7321761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 184 - 296
Target Start/End: Original strand, 22274835 - 22274947
Alignment:
Q  184 cataagtcatcaattaagcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacat 283  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||    
T  22274835 cataattcaccaattgagcataatttacaaacaacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacat 22274934  T
Q  284 actcaaacttatc 296  Q
    | |||||| ||||    
T  22274935 attcaaacatatc 22274947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 27 - 181
Target Start/End: Original strand, 24884643 - 24884796
Alignment:
Q  27 atcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaac-aatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatc 125  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||  || | ||||||||| |||||||||||||| ||| | |||| | |||||| || |     
T  24884643 atcaacccattttacaaaaccaacaacaacaactca-tttctcctcatcaaatcatgatttatgaacacccaagtcatgaatcatcaacaacaatatcta 24884741  T
Q  126 tcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacat 181  Q
    | ||||||||||||||||||| |||| ||| || || | ||||||||||| |||||    
T  24884742 ttagcaacaacaacatcaatt-aaacatgaatctcatcacaattcaacaataacat 24884796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 184 - 296
Target Start/End: Original strand, 22284068 - 22284180
Alignment:
Q  184 cataagtcatcaattaagcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacat 283  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||  |||| |  ||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||    
T  22284068 cataattcaccaattgagcataatttactaactattcattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacattaaattaacat 22284167  T
Q  284 actcaaacttatc 296  Q
    | |||||| ||||    
T  22284168 attcaaacatatc 22284180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 398 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 25265335 - 25265261
Alignment:
Q  398 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 472  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| ||| ||||| |  |||||||||||||||||||    
T  25265335 atgattatgatgaagactaacccccttacattagataatgattaatccaaacctaggcttcactttagctcctaa 25265261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 184 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 9653038 - 9652926
Alignment:
Q  184 cataagtcatcaattaagcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacat 283  Q
    ||||| ||| ||||| || |||||||   ||| |||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||    
T  9653038 cataattcaccaattgagtataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacat 9652939  T
Q  284 actcaaacttatc 296  Q
    | |||||| ||||    
T  9652938 attcaaacatatc 9652926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 399 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 5888578 - 5888480
Alignment:
Q  399 tgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaatt-ctccaatcttcaagttttcccc 496  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||| | ||| | |||   ||||| |||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||    
T  5888578 tgattatgatgaaaacaaacccccttaccttagatgatgtttaatcttaacttaagcttcactttagctcctaattgcgtcaatcttcaagtttccccc 5888480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 399 - 496
Target Start/End: Original strand, 21142203 - 21142301
Alignment:
Q  399 tgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaatt-ctccaatcttcaagttttcccc 496  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||| | ||| | |||   |||||  ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||    
T  21142203 tgattatgatgaaaacaaacccccttaccttagatgatgtttaatcttaacttaggcttcactttagctcctaattgcttcaatcttcaagtttccccc 21142301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 398 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 24341341 - 24341267
Alignment:
Q  398 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 472  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    |||||  |||||| ||||||||||||    
T  24341341 atgattatgatgaagactaacccccttaccttagattatgattaacctcaacttaggcttcattttagctcctaa 24341267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 19669376 - 19669222
Alignment:
Q  50 caacaacaactcattttctcaacaacaat-catgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattga 148  Q
    ||||||||||||||||| ||| || || | |||||  |||||| ||||||||||| | |||| | ||| |||||  || ||||||||||||||||||||     
T  19669376 caacaacaactcatttt-tcatcatcagttcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaataacatcacttagcaacaacaacatcaattg- 19669279  T
Q  149 aacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtc-atcaattaagcat 204  Q
    ||| || |||||| |  |||||||||||||||| |||||| || | |||||||||||    
T  19669278 aacatggttcacatcataattcaacaacaacatatcataattcaaccaattaagcat 19669222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 398 - 472
Target Start/End: Original strand, 463043 - 463117
Alignment:
Q  398 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 472  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||| ||| | |||||  |||||| ||||||||||||    
T  463043 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaa 463117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 78 - 271
Target Start/End: Original strand, 9636753 - 9636945
Alignment:
Q  78 tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaaca 177  Q
    ||||||| |||||| |||||| | || | |||| | |||||| || ||| | ||||||||||||||||| |||| |||||| || | |||||||||||||    
T  9636753 tcatgatttatgaatacccaaactatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaatt-aaacatgattctcatcacaattcaacaaca 9636851  T
Q  178 acatgtcataagtcatcaatta-agcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatca 271  Q
    ||||  || || ||| |||||| ||||||| |||| || |   |||||||| | | ||||||||||  |||||| || |||||||||| ||||||    
T  9636852 acatagcacaattcaacaattagagcataa-ttcacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatca 9636945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 184 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 21274191 - 21274041
Alignment:
Q  184 cataagtcatcaattaagcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacat 283  Q
    ||||| ||| ||||| || |||||||   ||| |||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||| ||||||||| |||  |||||||||    
T  21274191 cataattcaccaattgagtataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaaccattcatttaacatcaaattaacat 21274092  T
Q  284 actcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaaattagagattgggttcat 334  Q
    |  ||||| |||| | | ||||  ||||||||  | | |||||||||||||    
T  21274091 atccaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcat 21274041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 48 - 149
Target Start/End: Original strand, 25305423 - 25305524
Alignment:
Q  48 accaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaatt 146  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||  |||||| ||||| ||||| | |||| | |||||||||  || ||| |||||||||||||||    
T  25305423 accaacaacaactcattt-ctcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaggccatgaatcatcaacaacaacatcacttagccacaacaacatcaatt 25305521  T
Q  147 gaa 149  Q
    |||    
T  25305522 gaa 25305524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 31 - 198
Target Start/End: Original strand, 67952 - 68119
Alignment:
Q  31 acccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctca 128  Q
    ||||||||| |||||| || ||||||||||| |||| |||| || ||| ||||||  ||||||||| |||||||| | |||  | |||||| ||  || |    
T  67952 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttattt-ctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcactta 68050  T
Q  129 gcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatt 198  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||| ||  ||| |||||||||||||||||  ||||| ||| |||||    
T  68051 gcaacaacaacatcaattg-aacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 68119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 361 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 19689383 - 19689315
Alignment:
Q  361 tttcatacaaaccaagaaaaattgcaaacaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttacctta 430  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||| ||  ||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19689383 tttcatacaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaac-atgattatgataaagactaacccccttacctta 19689315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 399 - 472
Target Start/End: Original strand, 32466177 - 32466249
Alignment:
Q  399 tgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 472  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | ||||||  |||||||  |||||| ||||||||||||    
T  32466177 tgattatgatgaagactaa-ccccttaccttagataaggatcaacccaaacttaggcttcaatttagctcctaa 32466249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 398 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 19794661 - 19794629
Alignment:
Q  398 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 430  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19794661 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 19794629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 25265695 - 25265573
Alignment:
Q  27 atcaacccattttaca-aaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaat-catgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatat 124  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||||||||||| |||  |||||| || |||| ||||| ||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||||      
T  25265695 atcaacccattt-acataaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatga-atatgcatacccaagccatgattcataaacaacaacatca 25265598  T
Q  125 ctcagcaacaacaacatcaattgaa 149  Q
     | | ||||||||||||||||||||    
T  25265597 attaacaacaacaacatcaattgaa 25265573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 78 - 181
Target Start/End: Original strand, 6094724 - 6094826
Alignment:
Q  78 tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaaca 177  Q
    ||||||| |||||| |||||||| || | |||| | |||||| || ||| | ||||||||||||||||| |||| |||||| || | ||| |||||||||    
T  6094724 tcatgatttatgaatacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaatt-aaacatgattctcatcacaaatcaacaaca 6094822  T
Q  178 acat 181  Q
    ||||    
T  6094823 acat 6094826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 219 - 310
Target Start/End: Original strand, 25595168 - 25595259
Alignment:
Q  219 ccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagc 310  Q
    ||||||||| | |||||| |||||  ||||||||| |||||||||||||||||   |||| |  ||||||||| ||||| || |||||||||    
T  25595168 ccattttcacatattatggacatgcaatttcatcaacaacaattcatttatcaccaaattcatgtactcaaacatatcatcataacaagagc 25595259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 398 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 9652828 - 9652754
Alignment:
Q  398 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 472  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||| ||| | |||||  | |||| ||||||||||||    
T  9652828 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaatcccaacttaggtttcaatttagctcctaa 9652754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 361 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 14906422 - 14906353
Alignment:
Q  361 tttcatacaaaccaagaaaaattgcaaacaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttaccttag 431  Q
    |||||| |||| || ||||||||||||| ||  ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14906422 tttcatccaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaac-atgattatgataaagactaacccccttaccttag 14906353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 361 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 17396635 - 17396566
Alignment:
Q  361 tttcatacaaaccaagaaaaattgcaaacaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttaccttag 431  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||| ||  ||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  17396635 tttcatacaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaac-atgattatggtaaagactaacccccttaccttag 17396566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 398 - 472
Target Start/End: Original strand, 22863235 - 22863309
Alignment:
Q  398 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 472  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||| ||| | |||||  ||| || ||||||||||||    
T  22863235 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggctgcaatttagctcctaa 22863309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 361 - 431
Target Start/End: Original strand, 23820352 - 23820421
Alignment:
Q  361 tttcatacaaaccaagaaaaattgcaaacaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttaccttag 431  Q
    |||||| |||| || ||||||||||||| ||  ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23820352 tttcatccaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaac-atgattatgataaagactaacccccttaccttag 23820421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 47 - 148
Target Start/End: Original strand, 28974026 - 28974127
Alignment:
Q  47 caccaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaat 145  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||   ||| | ||||||||||| | | || |||||||||||  || ||||||||||||||||||    
T  28974026 caccaacaacatctcattt-ctcatcaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaacaacatcaat 28974124  T
Q  146 tga 148  Q
    |||    
T  28974125 tga 28974127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 130 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 5888824 - 5888744
Alignment:
Q  130 caacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttca 211  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||| ||||| | ||| || |||| ||||| ||| |||||||    
T  5888824 caacaacaacatccattgaaacttgtttctcacctcaattcaac-acaacttatcacaaatcattaattaggcaaaatttca 5888744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 23821846 - 23821773
Alignment:
Q  76 aatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaa 149  Q
    ||||||||  |||||||||||| ||||| | |||| | |||||| ||  || ||||||||||||||||||||||    
T  23821846 aatcatgaattatgaacacccatgccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaa 23821773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 23830925 - 23830852
Alignment:
Q  76 aatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaa 149  Q
    ||||||||  |||||||||||| ||||| | |||| | |||||| ||  || ||||||||||||||||||||||    
T  23830925 aatcatgaattatgaacacccatgccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaa 23830852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 181
Target Start/End: Original strand, 24277767 - 24277871
Alignment:
Q  76 aatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaa 175  Q
    ||||||||| |||||  |||||||| || | |||| | |||||| || ||| | ||||||||||||| ||| |||| |||||| || | |||||||||||    
T  24277767 aatcatgatttatgagtacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatc-atttaaacatgattctcatcacaattcaacaa 24277865  T
Q  176 caacat 181  Q
    ||||||    
T  24277866 caacat 24277871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 24294764 - 24294691
Alignment:
Q  76 aatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaa 149  Q
    ||||||||  |||||| || |||||||| | |||| ||||||| |||  || ||||||||||||||||||||||    
T  24294764 aatcatgaattatgaatactcaagccatgaatcatcatcaacatcatcacttagcaacaacaacatcaattgaa 24294691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 398 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 36982396 - 36982363
Alignment:
Q  398 atgattatgatgaagactaacccccttaccttag 431  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36982396 atgattatgataaagactaacccccttaccttag 36982363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 28 - 103
Target Start/End: Original strand, 722353 - 722428
Alignment:
Q  28 tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaa-caatcatgatatatgaacacccaagccat 103  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| |||  ||||||||  |||| |||||||||||||    
T  722353 tcaaccaattttacaaagtcaccaacaacaactca-tatctcatcaataaatcatgaattatgcacacccaagccat 722428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 398 - 430
Target Start/End: Original strand, 22284278 - 22284310
Alignment:
Q  398 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 430  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22284278 atgattatgataaagactaacccccttacctta 22284310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 384; Significance: 0; HSPs: 56)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 384; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 18823711 - 18823209
Alignment:
Q  1 catcatcaaaatcaaacttcttctttatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||   ||| | ||||||||    
T  18823711 catcatcaaaatcaaacttcttctttatcaagccattttacaaaaccaccaccaacaactcattt-ctccacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagc 18823613  T
Q  101 cataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaa 200  Q
    |||   | || |||||||||||  |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18823612 catggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccgcaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaa 18823513  T
Q  201 gcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcacca 300  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18823512 gcataacttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcacca 18823413  T
Q  301 aaacaagagcacgaaaattagagattgggttcatatgaattctcactcaattaagcactttttcatacaaaccaagaaaaattgcaaacaaacaattatg 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18823412 aaacaagagcacgaaaattagagattgggttcatatgaattctcactcacttaagcactttttcatacaaaccaagaaaaattgcaaacaaacaattatg 18823313  T
Q  401 attatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaattctccaatcttcaagttttcccccttt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18823312 attatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgattaatccaaacttaaacttcactttagctcctaattctccaatctttaagttttcccccttt 18823213  T
Q  501 gcta 504  Q
    ||||    
T  18823212 gcta 18823209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 384; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 18839566 - 18839064
Alignment:
Q  1 catcatcaaaatcaaacttcttctttatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||   ||| | ||||||||    
T  18839566 catcatcaaaatcaaacttcttctttttcaactcattttacaaaaccaccaccaacaactcattt-ctccacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagc 18839468  T
Q  101 cataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaa 200  Q
    |||   | || |||||||||||  |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18839467 catggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaataacatgtcataagtcatcaattaa 18839368  T
Q  201 gcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcacca 300  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18839367 gcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcagttaacatactcaaacttatcacca 18839268  T
Q  301 aaacaagagcacgaaaattagagattgggttcatatgaattctcactcaattaagcactttttcatacaaaccaagaaaaattgcaaacaaacaattatg 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18839267 aaacaagagcacgaaaattagagattgggttcatatgaattctcactcaattaagcactttttcatacaaaccaagaaaaattgcaaacaaacaattatg 18839168  T
Q  401 attatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaattctccaatcttcaagttttcccccttt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18839167 attatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgattaatccaaacttaagcttcactttagcttctaattctccaatctttaagttttcccccttt 18839068  T
Q  501 gcta 504  Q
    ||||    
T  18839067 gcta 18839064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 64 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 32277024 - 32276601
Alignment:
Q  64 tttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacacc 163  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32277024 tttctcaccaacaatcatgatatatgaacacccaagccataat-cataaacaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattctcacc 32276926  T
Q  164 ccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattc 263  Q
     ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32276925 tcaattcaacaataacatgtcacaattcatcaattaagcataatttcacaactacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattc 32276826  T
Q  264 atttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaaattagagattgggttcatatgaattctcactcaattaagcacttttt 363  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||| || ||| ||  ||||||||||||||||||    
T  32276825 atttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaaagattgggttcagataaatacttgctcaattaagcacttttt 32276726  T
Q  364 catacaaaccaagaaaaattgcaaac-aaacaattatgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactt 462  Q
    ||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||| ||||||||||    
T  32276725 catacaaataaag-aaaattgcaaacaaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttaccttagataatgattaatccaaacttaagcttcactt 32276627  T
Q  463 tagctcctaattctccaatcttcaag 488  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  32276626 tagctcctaattcttcaatcttcaag 32276601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Original strand, 4991003 - 4991335
Alignment:
Q  1 catcatcaaaatcaaacttcttctttatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4991003 catcatcaaaatcaaacttcttctttatcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagc 4991102  T
Q  101 cataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaa 200  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4991103 caaaattcatgatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacacaccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaa 4991202  T
Q  201 gcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcacca 300  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| || |||| |||||||  ||||| |||| | |    
T  4991203 gcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatattatttcatcatcaaccattcatttaaca-tcaaataacatatccaaacatatctcta 4991301  T
Q  301 aaacaagagcacgaaaattagagattgggttcat 334  Q
     ||||  ||||||||  | | |||||||||||||    
T  4991302 caacataagcacgaatttcaaagattgggttcat 4991335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 52 - 315
Target Start/End: Original strand, 19629314 - 19629575
Alignment:
Q  52 acaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaac 151  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |    
T  19629314 acaacaactcattt-ctcaccaacaatcatgatatatgaacacccaagccataat-cataaacaacaacatgtctcagcaacaacaacatcaattaaatc 19629411  T
Q  152 ttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcat 251  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19629412 ttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcacaattcatcaattaagcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcat 19629511  T
Q  252 caccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaa 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19629512 caccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccacaacaagagcacgaa 19629575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 72 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 16300234 - 16299991
Alignment:
Q  72 caacaatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattca 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  16300234 caacaatcatgatatatgaacacccaagccataaatcatatacaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattctcacctcaattca 16300135  T
Q  172 acaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatca 271  Q
    || |||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16300134 accacaacatgtcataatttatcaattaggcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatca 16300035  T
Q  272 ttcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaa 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16300034 ttcaattaacatactcaaacttatcaccgaaacaagagcacgaa 16299991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 361 - 491
Target Start/End: Original strand, 19629612 - 19629740
Alignment:
Q  361 tttcatacaaaccaagaaaaattgcaaacaaa-caattatgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttca 459  Q
    ||||||||||  |||| |||||| |||||||| |||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19629612 tttcatacaa--caaggaaaattccaaacaaaacaatcatgattatgaagaacactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaatttgagcttca 19629709  T
Q  460 ctttagctcctaattctccaatcttcaagttt 491  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19629710 c-ttagctcctaattctccaatcttcaagttt 19629740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 361 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 16299953 - 16299825
Alignment:
Q  361 tttcatacaaaccaagaaaaattgcaaacaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcac 460  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||  |||||||    
T  16299953 tttcatacaa--caaggaaaattgcaaacaaacaatcatgattaagaagaagactaacccccttaccttaggtaatgattaatccaaacttaggcttcac 16299856  T
Q  461 tttagctcctaattctccaatcttcaagttt 491  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16299855 tttagctcctaattcttcaatcttcaagttt 16299825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 35 - 215
Target Start/End: Original strand, 16231859 - 16232037
Alignment:
Q  35 attttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaaca 134  Q
    |||| |||||| ||||||||||| || |||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16231859 atttcacaaaaccaccaacaacatcttattt-ctcatcaacaattatggtatatgaacacccaagccataaatcataatcaacaacatatctcagcaaca 16231957  T
Q  135 acaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcataac 215  Q
    |||||||||||| | |  ||||| ||| | || |||||  | ||||| ||| |  |||||||||||| |||||||||||||    
T  16231958 acaacatcaatt-acatatgatttacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataac 16232037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 35 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 18087112 - 18086934
Alignment:
Q  35 attttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaaca 134  Q
    |||| |||||| ||||| ||||| || |||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18087112 atttcacaaaaccaccaccaacatcttattt-ctcatcaacaattatgatatatgaacacccaagccataaatcataatcaacaacatatctcagcaaca 18087014  T
Q  135 acaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcataac 215  Q
    |||||||||||| | |  ||||| ||| | || |||||  | ||||| ||| |  |||||||||||| |||||||||||||    
T  18087013 acaacatcaatt-acatatgatttacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataac 18086934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 398 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 13620743 - 13620644
Alignment:
Q  398 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa-ttctccaatcttcaagttttcccc 496  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  13620743 atgattatgaagaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaactcaggcttcactttagctcctaatttcttcaatcttcaagttttcccc 13620644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 35 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 13621083 - 13620905
Alignment:
Q  35 attttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaaca 134  Q
    |||| |||||| ||||||||||| || |||  |||| ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13621083 atttcacaaaaccaccaacaacatcttattg-ctcatcaacaattatggtatatgaacacccaagtcataattcataatcaacaacatatctcagcaaca 13620985  T
Q  135 acaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcataac 215  Q
    |||||||||||| | |  ||||| ||| | || |||||  | ||||| ||| |  |||||||||||| |||||||||||||    
T  13620984 acaacatcaatt-acatatgatttacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataac 13620905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Original strand, 18583265 - 18583384
Alignment:
Q  1 catcatcaaaatcaaacttcttctttatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||| | ||||||||    
T  18583265 catcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactca-tttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagc 18583363  T
Q  101 cataattcataatcaacaaca 121  Q
    ||| | | || ||||||||||    
T  18583364 catgaattatcatcaacaaca 18583384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 165 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 22585707 - 22585539
Alignment:
Q  165 caattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattca 264  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||    ||| ||||||||  |||||| |||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  22585707 caattcaacaacaacatgtcataattcttcaattgagcataattcacaaactacccatttatatacatcatgaacatgcaatttcatcatcaacaattca 22585608  T
Q  265 tttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaaattagagattgggttca 333  Q
     |||||||  |||||| |||||||||| |||||| | |||| |||||||||  | | ||||||||||||    
T  22585607 attatcatcaaattaaaatactcaaacatatcactacaacatgagcacgaatttcaaagattgggttca 22585539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 165 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 22590538 - 22590370
Alignment:
Q  165 caattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattca 264  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||    ||| ||||||||  |||||| |||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  22590538 caattcaacaacaacatgtcataattcttcaattgagcataattcacaaactacccatttatatacatcatgaacatgcaatttcatcatcaacaattca 22590439  T
Q  265 tttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaaattagagattgggttca 333  Q
     |||||||  |||||| |||||||||| |||||| | |||| |||||||||  | | ||||||||||||    
T  22590438 attatcatcaaattaaaatactcaaacatatcactacaacatgagcacgaatttcaaagattgggttca 22590370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 35 - 215
Target Start/End: Original strand, 23977736 - 23977914
Alignment:
Q  35 attttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaaca 134  Q
    |||| |||||| |||||| |||| || |||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23977736 atttcacaaaaccaccaataacatcttattt-ctcatcaacaattatggtatatgaacacccaagcctcaaatcatactcaacaacatatctcagcaaca 23977834  T
Q  135 acaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcataac 215  Q
    |||||||||||| | |  ||||| ||| | || |||||| | ||||| ||| |  |||||||||||| |||||||||||||    
T  23977835 acaacatcaatt-acatatgatttacatctcatttcaaccaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataac 23977914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 17083495 - 17083373
Alignment:
Q  1 catcatcaaaatcaaacttcttctttatcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaac-aatcatgatatatgaacacccaa 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||| ||||| | || | ||||||||| |||||||||||||    
T  17083495 catcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttcacaaaaacaacaacaacaactca-tttctaatcatcaaatcatgatttatgaacacccaa 17083397  T
Q  99 gccataattcataatcaacaacat 122  Q
    ||||| | |||| | |||||||||    
T  17083396 gccatgaatcatcaacaacaacat 17083373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 165 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 15889867 - 15889717
Alignment:
Q  165 caattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattca 264  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||| || | |||||||    ||| ||||||||  |||||| |||||||||  ||||||||| |||||| |||    
T  15889867 caattcatcaacaacatgtcataattcatcagttgaacataattcacaaactacccatttatatacatcatgaacatgcaatttcatcatcaacaaatca 15889768  T
Q  265 tttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaa 315  Q
     |||||||  ||||||||||||||||| |||||| | |||| |||||||||    
T  15889767 attatcatcaaattaacatactcaaacatatcactacaacatgagcacgaa 15889717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 400 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 15742150 - 15742058
Alignment:
Q  400 gattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcct-aattctccaatcttcaagttt 491  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||    
T  15742150 gattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgattaatccaaacttaggcttcactttagctcctaaatccttcaatcttcaagttt 15742058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 398 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 18002427 - 18002333
Alignment:
Q  398 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcct-aattctccaatcttcaagttt 491  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||   |||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||    
T  18002427 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggttatgattaatctaaacttagccttcactttagctcctaaatccttcaatcttcaagttt 18002333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 184 - 334
Target Start/End: Original strand, 26089848 - 26089998
Alignment:
Q  184 cataagtcatcaattaagcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacat 283  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||    
T  26089848 cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacattatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacat 26089947  T
Q  284 actcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaaattagagattgggttcat 334  Q
    | |||||| |||| | | ||||  ||||||||  | | |||||||||||||    
T  26089948 attcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcat 26089998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 35 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 18381965 - 18381851
Alignment:
Q  35 attttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaac 133  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||  |||||| ||||||||||| | |||| | |||||||||  || ||||||    
T  18381965 atttcacaaaaccaccaacaacaactcattt-ctcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatcacttagcaac 18381867  T
Q  134 aacaacatcaattgaa 149  Q
    ||||||||||||||||    
T  18381866 aacaacatcaattgaa 18381851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 28 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 22362054 - 22361885
Alignment:
Q  28 tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaat-catgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatct 126  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||||||||||| || |||| || |||| |||||  |||||||||||||||||| | |||| | |||||| ||  ||    
T  22362054 tcaacccattttacaaaactaacaacaacaactcaatt-ctcatcatcaattcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcact 22361956  T
Q  127 cagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatt 198  Q
     |||||||||||||||||||||| | ||| |  || | |||||||||||||||||  ||||| |||||||||    
T  22361955 tagcaacaacaacatcaattgaa-catgaatttcatcacaattcaacaacaacatagcataattcatcaatt 22361885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 184 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 18002638 - 18002488
Alignment:
Q  184 cataagtcatcaattaagcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacat 283  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||   ||| |||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||  ||| |||||    
T  18002638 cataattcatcaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaatgaacat 18002539  T
Q  284 actcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaaattagagattgggttcat 334  Q
    | |||||| |||| | | ||||  ||||||||  | | |||||||||||||    
T  18002538 attcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcat 18002488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 166 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 25640715 - 25640585
Alignment:
Q  166 aattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcat 265  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||| |||| ||||    ||| ||||||||   ||||| |||||||||  ||||||||| ||| ||||||     
T  25640715 aattcaacaacaacatgtcacaattcatcaattgagcacaattcacaaactacccatttatctacatcatgaacatgcaatttcatcatcaaaaattcaa 25640616  T
Q  266 ttatcattcaattaacatactcaaacttatc 296  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  25640615 ttatcatcaaattaacatactcaaacatatc 25640585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 398 - 472
Target Start/End: Original strand, 26090059 - 26090133
Alignment:
Q  398 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 472  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||  |||||||||||||||||||    
T  26090059 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaa 26090133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 184 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 35015299 - 35015149
Alignment:
Q  184 cataagtcatcaattaagcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacat 283  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| |||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||    
T  35015299 cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacat 35015200  T
Q  284 actcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaaattagagattgggttcat 334  Q
    | |||||| |||| | | ||||  ||||||||  | | |||||||||||||    
T  35015199 attcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcat 35015149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 165 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 15005067 - 15004900
Alignment:
Q  165 caattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattca 264  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||    ||| ||||||||  |||||| || ||||||  ||||| ||| ||||||||||    
T  15005067 caattcaacaacaacatgtcataattcatcaattgaacataattcacaaactacccatttatatacatcataaacatgcaatttcctcatcaacaattca 15004968  T
Q  265 tttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaaattagagattgggttca 333  Q
     | | || |||| | |||||||||||| |||||| | |||| |||||||||  | | ||||||||||||    
T  15004967 atcaaca-tcaaattacatactcaaacatatcactacaacatgagcacgaatttcaaagattgggttca 15004900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 27 - 198
Target Start/End: Original strand, 18398895 - 18399065
Alignment:
Q  27 atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatc 125  Q
    ||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||| || | ||  | ||||||  |||| ||||||||||||| | | || |||||||||||  |    
T  18398895 atcaacccatttttacaaaaccaacaacaacaactcattt-cttatcacaattcatgaattatgcacacccaagccatgaattatcatcaacaacatcac 18398993  T
Q  126 tcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatt 198  Q
    | |||||||||||||||||||| ||| ||| || || | |||||||||||||||||  ||||| ||| |||||    
T  18398994 ttagcaacaacaacatcaattg-aacatgaatctcatcacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 18399065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 50 - 181
Target Start/End: Original strand, 19854135 - 19854265
Alignment:
Q  50 caacaacaactcattttctcaacaacaat-catgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattga 148  Q
    |||||||||||||||| |||| || |||| |||||| ||||||||||||||| || | |||| | |||||| || ||| ||||||||||||||||||| |    
T  19854135 caacaacaactcattt-ctcatcatcaattcatgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttagcaacaacaacatcaatt-a 19854232  T
Q  149 aacttgattcacaccccaattcaacaacaacat 181  Q
    ||| |||||| || | ||||||||||| |||||    
T  19854233 aacatgattctcatcacaattcaacaataacat 19854265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 165 - 291
Target Start/End: Original strand, 18583411 - 18583537
Alignment:
Q  165 caattcaacaacaac-atgtcataagtcatcaattaagcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattc 263  Q
    ||||||| ||||||| ||| ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| |||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||    
T  18583411 caattcatcaacaaccatg-cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattc 18583509  T
Q  264 atttatcattcaattaacatactcaaac 291  Q
    ||||| |||  |||||||||| ||||||    
T  18583510 atttaacatcaaattaacatattcaaac 18583537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 28 - 181
Target Start/End: Original strand, 25919571 - 25919723
Alignment:
Q  28 tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacat-atc 125  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| |||||| ||||||  |||||| ||||||||||| | |||| | ||||||||| ||     
T  25919571 tcaactcattttacaaagtcaccaacaataactcatttt-tcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatcata 25919669  T
Q  126 tcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacat 181  Q
    | |||||||||||||||||||||| | || ||| || |  ||||||||||||||||    
T  25919670 t-agcaacaacaacatcaattgaa-catggttctcatcataattcaacaacaacat 25919723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 398 - 472
Target Start/End: Original strand, 23148303 - 23148377
Alignment:
Q  398 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 472  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| | |||||  |||||| ||||||||||||    
T  23148303 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggtaaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaa 23148377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 398 - 472
Target Start/End: Original strand, 23153754 - 23153828
Alignment:
Q  398 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 472  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| | |||||  |||||| ||||||||||||    
T  23153754 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggtaaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaa 23153828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 398 - 472
Target Start/End: Original strand, 27751742 - 27751816
Alignment:
Q  398 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 472  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| ||| |||||||  |||||| ||||||||||||    
T  27751742 atgattatgatgaagactaacccccttaccttagataaagattaatccaaacttaggcttcaatttagctcctaa 27751816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 398 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 35009384 - 35009314
Alignment:
Q  398 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctc 468  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| ||| |||||||  |||||||||||||||    
T  35009384 atgattatgatgaagactaacccccttactttagataatgattaatccaaactttggcttcactttagctc 35009314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 198
Target Start/End: Original strand, 21623133 - 21623295
Alignment:
Q  35 attttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaac 133  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||| | |||| ||||||  |||||| ||||||||||| | |||| | || ||||||  || ||||||    
T  21623133 attttaccaaactaccaacaacaactcatttt-tcatccacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgactcattaacatcaacatcacttagcaac 21623231  T
Q  134 aacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatt 198  Q
    |||||||||||| | ||| ||||||  ||| |||||||||||||||||  ||||| ||| |||||    
T  21623232 aacaacatcaatag-aacatgattcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 21623295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 217 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 19983401 - 19983322
Alignment:
Q  217 acccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatc 296  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||| |||||| ||||    
T  19983401 acccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacatatc 19983322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 33538647 - 33538506
Alignment:
Q  39 tacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaaca 137  Q
    ||||||| || |||||||||||||||| |||| || ||| ||||||| ||||||||| |||||||| | |||| | |||||| ||  || ||||| ||||    
T  33538647 tacaaaaccaacaacaacaactcattt-ctcatcatcaaatcatgatttatgaacactcaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaataaca 33538549  T
Q  138 acatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacat 181  Q
    ||||||||| |||| |||||| || | ||||||||||| |||||    
T  33538548 acatcaatt-aaacatgattctcatcacaattcaacaataacat 33538506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 217 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 15742329 - 15742211
Alignment:
Q  217 acccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcattt-atcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaa 315  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||||||| |||||| |||| | | ||||  ||||||||    
T  15742329 acccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaatcatcaaattaacataatcaaacatatctctacaacataagcacgaa 15742230  T
Q  316 aattagagattgggttcat 334  Q
      | | |||||||||||||    
T  15742229 tttcaaagattgggttcat 15742211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 398 - 472
Target Start/End: Original strand, 23995247 - 23995321
Alignment:
Q  398 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 472  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||| ||| | |||||  |||||||||||||||||||    
T  23995247 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagctcctaa 23995321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 75 - 181
Target Start/End: Original strand, 25651242 - 25651347
Alignment:
Q  75 caatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaaca 174  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| | |||| | |||||| ||  || |||||||||||||||||||||| | ||| || || |  |||||||||    
T  25651242 caatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaa-catgaatctcatcataattcaaca 25651340  T
Q  175 acaacat 181  Q
    |||||||    
T  25651341 acaacat 25651347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 27 - 199
Target Start/End: Original strand, 34966823 - 34966995
Alignment:
Q  27 atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatat 124  Q
    ||||||||||||| |||||| || ||||||||||| |||| | || ||  || ||||||| ||||||||||||||| || | |||| | |||||| || |    
T  34966823 atcaacccattttcacaaaaccaacaacaacaacttattt-cacatcacgaactcatgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatct 34966921  T
Q  125 ctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatta 199  Q
    || | ||||||||||||||||| |||| |||||| || | ||| |||||||||||||  ||||| ||| ||||||    
T  34966922 cttaacaacaacaacatcaatt-aaacatgattctcatcacaaatcaacaacaacatagcataattcaacaatta 34966995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 284
Target Start/End: Original strand, 23995036 - 23995136
Alignment:
Q  184 cataagtcatcaattaagcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacat 283  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| |||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||| ||||||||| |||  |||||||||    
T  23995036 cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaaccattcatttaacatcaaattaacat 23995135  T
Q  284 a 284  Q
    |    
T  23995136 a 23995136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 181
Target Start/End: Original strand, 29605406 - 29605560
Alignment:
Q  27 atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaat-catgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatat 124  Q
    ||||||||||||| |||||| || ||| ||||||| |||| ||||  | |||| |||||| |||| |||||||| |||| | |||| | |||||| || |    
T  29605406 atcaacccatttttacaaaaccaacaagaacaacttattt-ctcattatcaattcatgatttatgcacacccaaaccatgaatcatcaacaacaatattt 29605504  T
Q  125 ctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacat 181  Q
    || ||||||||||||||||||| || | ||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  29605505 cttagcaacaacaacatcaatt-aagcatgattcacatcataattcaacaacaacat 29605560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 398 - 472
Target Start/End: Original strand, 29666181 - 29666255
Alignment:
Q  398 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 472  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  |||| | ||||| ||| |||||||  |||||| ||||||||||||    
T  29666181 atgattatgatgaagactaacccacttatgttagataatgattaatccaaacttaggcttcaatttagctcctaa 29666255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 398 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 1657693 - 1657660
Alignment:
Q  398 atgattatgatgaagactaacccccttaccttag 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1657693 atgattatgatgaagactaacccccttaccttag 1657660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 398 - 431
Target Start/End: Original strand, 15862789 - 15862822
Alignment:
Q  398 atgattatgatgaagactaacccccttaccttag 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15862789 atgattatgatgaagactaacccccttaccttag 15862822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 234 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 17375011 - 17374930
Alignment:
Q  234 atgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaa 315  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| |||||| ||||||   ||||| ||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||    
T  17375011 atgaacatgtaatttcatcatcaataattcaattatcaacaaattagcatactcaaacatatcactacaactagagcacgaa 17374930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 50 - 149
Target Start/End: Original strand, 33324673 - 33324772
Alignment:
Q  50 caacaacaactcattttctcaacaacaat-catgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattga 148  Q
    |||||||||||||||| |||| || |||| |||||  |||||| ||||||||||| | |||| | |||||||||  || ||||| |||||||||||||||    
T  33324673 caacaacaactcattt-ctcatcaccaattcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatcacttagcaataacaacatcaattga 33324771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 50 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 35136279 - 35136180
Alignment:
Q  50 caacaacaactcattttctcaacaacaat-catgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattga 148  Q
    |||||||||||||||| |||| || |||| |||||  |||||| ||||||||||| | |||| | |||||||||  || ||||| |||||||||||||||    
T  35136279 caacaacaactcattt-ctcatcaccaattcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatcacttagcaataacaacatcaattga 35136181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 78 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 29160542 - 29160440
Alignment:
Q  78 tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaaca 177  Q
    ||||||| |||||| |||||||| || | |||| | |||||| || ||| | ||||||||||||||||| |||| |||||| || | ||| |||||||||    
T  29160542 tcatgatttatgaatacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaatt-aaacatgattctcatcgcaaatcaacaaca 29160444  T
Q  178 acat 181  Q
    ||||    
T  29160443 acat 29160440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 130 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 29869970 - 29869890
Alignment:
Q  130 caacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttca 211  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||| ||||| | ||| || |||| ||||| ||| |||||||    
T  29869970 caacaacaacatccattgaaacttgtttctcacctcaattcaac-acaacttatcacaaatcattaattaggcaaaatttca 29869890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 398 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 1650053 - 1650021
Alignment:
Q  398 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 430  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1650053 atgattatgataaagactaacccccttacctta 1650021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 398 - 430
Target Start/End: Original strand, 18583640 - 18583672
Alignment:
Q  398 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 430  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18583640 atgattatgatgaaaactaacccccttacctta 18583672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 219 - 271
Target Start/End: Original strand, 23222064 - 23222116
Alignment:
Q  219 ccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatca 271  Q
    ||||||||| | ||||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||||    
T  23222064 ccattttcacatattatgaacatgcaatttcatcaacaacaattcaattatca 23222116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 374; Significance: 0; HSPs: 77)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 374; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 35 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 16934263 - 16933803
Alignment:
Q  35 attttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaaca 134  Q
    |||| |||||| ||||||||||| || |||| ||||  |||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||    
T  16934263 atttcacaaaaccaccaacaacatcttattt-ctcacaaacaatcatgatttatgaatacccaagccataaatcataaacaacaacatgtctcagcaaca 16934165  T
Q  135 acaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcataacaacccattttcatacatta 234  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16934164 acaacatcaattgaaacttgattctcaccttaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacatta 16934065  T
Q  235 tgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaaattagagattgggttcat 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16934064 tgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaatcttatcatcaaaacaagagcacgaaaattagagattgggttcat 16933965  T
Q  335 atgaattctcactcaattaagcactttttcatacaaaccaagaaaaattgcaaacaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttaccttaggtt 434  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16933964 atgaattctcacttaattaagcactttttcatacaaaccaagaaaaattgcaaactaacaattatgattatgataaagactaacccccttaccttaggtt 16933865  T
Q  435 atgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaattctccaatcttcaagttttcccc 496  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16933864 atgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaattctccaatcttcaagttttcccc 16933803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 1 - 491
Target Start/End: Original strand, 19946630 - 19947120
Alignment:
Q  1 catcatcaaaatcaaacttcttctttatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagc 100  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||| | ||||||||    
T  19946630 catcatcaaaatcaaacttctatattatcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcattt-ctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagc 19946728  T
Q  101 cataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaa 200  Q
    |||   | || |||||||||||  |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19946729 catggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacacctcaattcaacaacaacatgtcataaatcatcaattaa 19946828  T
Q  201 gcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcacca 300  Q
    ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19946829 gcataatttcacaactactcattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaatttatcacca 19946928  T
Q  301 aaacaagagcacgaaaattagagattgggttcatatgaattctcactcaattaagcactttttcatacaaaccaagaaaaattgc-aaacaaacaattat 399  Q
    |||||||||||||||| | | ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  19946929 aaacaagagcacgaaattcaaagattgggttcatataaattcttactcaattaagcattttttcaaacaaaccaag-aaaattgcaaaacaaacaattat 19947027  T
Q  400 gattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcct-aattctccaatcttcaagttt 491  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||| ||||| ||| || ||||||||||||||    
T  19947028 gattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgattaatccaaacttaggcttcactttaactcctaaatccttcaatcttcaagttt 19947120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 72 - 496
Target Start/End: Original strand, 14284963 - 14285387
Alignment:
Q  72 caacaatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattca 171  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  14284963 caacattcatgatatatgaacacccaagtcataaatcataaacaacaacatatctgagcaacaacaacatcaattgaaacttgattctcacctcaattca 14285062  T
Q  172 acaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatca 271  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14285063 acaacaacatgtcataattcatcaattaagcatattttcacaactacccattttcatacactatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatca 14285162  T
Q  272 ttcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaaattagagattgggttcatatgaattctcactcaattaagcactttttcatacaaa 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  | |||||||||||| ||| || ||||||||||||||| |||||||||||    
T  14285163 ttcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaagggttgggttcatataaatacttactcaattaagcactatttcatacaaa 14285262  T
Q  372 ccaagaaaaattgcaaac-aaacaattatgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcct 470  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  14285263 ccaag-aaaattgcaaacaaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttaccttagataatgattaatccaaacttaagcttcactttagctcct 14285361  T
Q  471 aattctccaatcttcaagttttcccc 496  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||    
T  14285362 aattcttcaatcttcaagtttccccc 14285387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 9303424 - 9303110
Alignment:
Q  1 catcatcaaaatcaaacttcttctttatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9303424 catcatcaaaatcaaacttcttctttatcaacccgttttacaaaaccaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatggtatatgaacacccaagc 9303325  T
Q  101 cataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaa 200  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9303324 cataattcatagtcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacagcaacatgtcataagtcatcaattaa 9303225  T
Q  201 gcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcacca 300  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9303224 gcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcacca 9303125  T
Q  301 aaacaagagcacgaa 315  Q
    |||||||||||||||    
T  9303124 aaacaagagcacgaa 9303110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 64 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 8276105 - 8275855
Alignment:
Q  64 tttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacacc 163  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  8276105 tttctcaccaacaatcatgatatatgaacacccaagccataat-cataaacaacaacatgtctcagcaacaataacatcaattaaaacttgattctcacc 8276007  T
Q  164 ccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattc 263  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8276006 tcaattcaacaacaacatgtcataattcatcaattaagcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattc 8275907  T
Q  264 atttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaa 315  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8275906 atttatcgttcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaa 8275855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 64 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 8269005 - 8268755
Alignment:
Q  64 tttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacacc 163  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  8269005 tttctcaccaacaatcatgatatatgaacacccaagccataat-cataaacaacaacatgtctcagcaacaataacatcaattaaaacttgattctcacc 8268907  T
Q  164 ccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattc 263  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8268906 tcaattcaacaacaacatgtcataattcatcaattaagcataatttcataacaaccaattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattc 8268807  T
Q  264 atttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaa 315  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8268806 atttatcgttcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaa 8268755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 48 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 11477467 - 11477201
Alignment:
Q  48 accaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattg 147  Q
    |||||||||| || ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11477467 accaacaacatcttatttt-tcatcaacaatcatgatatatgaacacccaagccataaatcataaacaacaacatatctcagcagcaacaacatcaattg 11477369  T
Q  148 aaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatt 247  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11477368 aaacttgattctcacctcaattcaaccacaacatgtcataattcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatgcattatgaacatgttatt 11477269  T
Q  248 tcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaa 315  Q
    | || | | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11477268 ttattaaccacaaatcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaa 11477201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 398 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 12902039 - 12901933
Alignment:
Q  398 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaattctccaatcttcaagttttccccc 497  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12902039 atgattatgatgataactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttaactcctaattctccaatcttcaaattttccccc 12901940  T
Q  498 tttgcta 504  Q
    |||||||    
T  12901939 tttgcta 12901933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 398 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 15938426 - 15938320
Alignment:
Q  398 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaattctccaatcttcaagttttccccc 497  Q
    |||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15938426 atgattataatgataactaacccccttaccttaggctatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaattctccaatcttcaagttttccccc 15938327  T
Q  498 tttgcta 504  Q
    |||||||    
T  15938326 tttgcta 15938320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Original strand, 7853914 - 7854245
Alignment:
Q  1 catcatcaaaatcaaacttcttctttatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| | ||||||||    
T  7853914 catcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactca-tttctcaacaacaatcatgattcatgcaaacccaagc 7854012  T
Q  101 cataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaa-catgtcataagtcatcaatta 199  Q
    ||| | | || |||||| | ||  || | ||||||||||| | |||| | | |||  || | | ||||||| |||||| |||| ||||| ||| |||||     
T  7854013 catgaattatcatcaaccatatgactaaacaacaacaacaaccattg-atcatgaaacatatcacaattcatcaacaatcatg-cataattcaccaattg 7854110  T
Q  200 agcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcacc 299  Q
    | ||||||||   ||  | |||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||| |||||| |||| |     
T  7854111 aacataatttaccaattatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacatatctct 7854210  T
Q  300 aaaacaagagcacgaaaattagagattgggttcat 334  Q
    | ||||  ||||||||  | | |||||||||||||    
T  7854211 acaacataagcacgaatttcaaagattgggttcat 7854245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 398 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 15936584 - 15936478
Alignment:
Q  398 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaattctccaatcttcaagttttccccc 497  Q
    |||||||| ||||  |||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15936584 atgattataatgataactaacccccataccttaggctacgatcaattcaaacttgagcttcacttttgctcctaattctccaatcttcaagttttccccc 15936485  T
Q  498 tttgcta 504  Q
    |||||||    
T  15936484 tttgcta 15936478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 54685624 - 54685293
Alignment:
Q  1 catcatcaaaatcaaacttcttctttatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||   ||| | | ||||||    
T  54685624 catcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccagcaacagcaactca-tttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaatccaagc 54685526  T
Q  101 cataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaa-catgtcataagtcatcaatta 199  Q
    ||| | | || |||||| | ||  || | ||||||||||| | |||| | | |||  || | | ||||||| |||||| |||| ||||| ||| |||||     
T  54685525 catgaattatcatcaaccatatgactaaacaacaacaacaaccattg-atcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatg-cataattcaccaattg 54685428  T
Q  200 agcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcacc 299  Q
    ||||||||||   ||| |||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||| |||||| |||| |     
T  54685427 agcataatttaccaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacatatctct 54685328  T
Q  300 aaaacaagagcacgaaaattagagattgggttcat 334  Q
    | ||||  ||||||||  | | |||||||||||||    
T  54685327 acaacataagcacgaatttcaaagattgggttcat 54685293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 361 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 11477163 - 11477029
Alignment:
Q  361 tttcatacaaaccaagaaaaattgcaaacaaa-caattatgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttca 459  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||    
T  11477163 tttcatacaa--caaggaaaattgcaaacaaaacaatcatgattatgaagaagactaacccccttaccttaggtaatgattaattcaaacttaggcttca 11477066  T
Q  460 ctttagctcctaattctccaatcttcaagttttcccc 496  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  11477065 ctttaactcctaattcttcaatcttcaagtttccccc 11477029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 47785063 - 47784915
Alignment:
Q  1 catcatcaaaatcaaacttcttctttatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaac-aatcatgatatatgaacacccaag 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||    
T  47785063 catcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacagaatcaccaacaacaactca-tttctcaccaacaaatcatgaattatgaacacccaag 47784965  T
Q  100 ccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaa 149  Q
    |||| | |||| | |||||||||  || | ||||||||||||||| ||||    
T  47784964 ccatgaatcattaacaacaacatcacttaacaacaacaacatcaactgaa 47784915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 5 - 296
Target Start/End: Original strand, 33341817 - 33342106
Alignment:
Q  5 atcaaaatcaaacttcttctttatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagccata 104  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||| | |||||||||||     
T  33341817 atcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcattt-ctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatg 33341915  T
Q  105 attcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaa-catgtcataagtcatcaattaagca 203  Q
    | | || |||||| | ||  || | ||||||||||| | |||| | | |||  || | |  |||||| |||||| |||| ||||| ||| ||||| ||||    
T  33341916 aattatcatcaaccatatgactaaacaacaacaacaaccattg-atcatgaaacatatcataattcatcaacaaccatg-cataattcaccaattgagca 33342013  T
Q  204 taatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatc 296  Q
    ||||||   ||| |||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||| | |||  |||||||||| |||||| ||||    
T  33342014 taatttaccaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcattaaacatcaaattaacatattcaaacatatc 33342106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 35 - 215
Target Start/End: Original strand, 18910960 - 18911138
Alignment:
Q  35 attttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaaca 134  Q
    |||| |||||| ||||||||||| || |||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18910960 atttcacaaaaccaccaacaacatcttattt-ctcatcaacaattatggtatatgaacacccaagccataaatcataatcaacaacatatctcagcaaca 18911058  T
Q  135 acaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcataac 215  Q
    |||||||||||| | |  ||||| ||| | || |||||  | ||||| ||| |  |||||||||||| |||||||||||||    
T  18911059 acaacatcaatt-acatatgatttacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataac 18911138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 166 - 335
Target Start/End: Original strand, 18970016 - 18970185
Alignment:
Q  166 aattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcat 265  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    ||| |||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||| ||||||||||     
T  18970016 aattcaacaacaacatgtcataattcatcaattgagcataattcacaaactacccatttacatacatcatgaacatgaaatttcatcatcaacaattcaa 18970115  T
Q  266 ttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaaattagagattgggttcata 335  Q
    ||| |||  |||||||||||| |||| |||||| | |||| |||||||||  | | ||||||||||||||    
T  18970116 ttaacatcaaattaacatacttaaacatatcactacaacatgagcacgaatttcaaagattgggttcata 18970185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 168 - 370
Target Start/End: Original strand, 48421674 - 48421877
Alignment:
Q  168 ttcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatt-tcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatt 266  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||| ||| ||| ||||||||  |||||| |||||||||  |||||||||||||||||||| |    
T  48421674 ttcaacaacaacatgtcataattcaccaattgaacataattctca-aactacccatttatatacatcatgaacatgcaatttcatcaccaacaattcaat 48421772  T
Q  267 tatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaaattagagattgggttcatatgaat-tctcactcaattaagcactttttca 365  Q
    ||||||  ||||||||||||||||| |||||| | |||| ||||| |||  | | |||||||||||| |  |||  || | |||||||||||||| ||||    
T  48421773 tatcatcaaattaacatactcaaacatatcactacaacatgagcatgaatttcaaagattgggttcacaataatcacttattcaattaagcacttattca 48421872  T
Q  366 tacaa 370  Q
    |||||    
T  48421873 tacaa 48421877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 435 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 9303036 - 9302968
Alignment:
Q  435 atgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaattctccaatcttcaagttttccccctttgcta 504  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9303036 atgatcaattcaaacttgagcttcactttaactcctaattctccaatcttcaag-tttccccctttgcta 9302968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 27 - 181
Target Start/End: Original strand, 12952920 - 12953074
Alignment:
Q  27 atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatat 124  Q
    ||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||| |||| || ||| ||||||| |||||||||||||||||| | |||| | |||||| || |    
T  12952920 atcaacccatttttacaaaaccaacaacaacaactcattt-ctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatct 12953018  T
Q  125 ctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacat 181  Q
    || ||||||||||||||||||| |||| | | || || | |||||||||||||||||    
T  12953019 cttagcaacaacaacatcaatt-aaacataaatctcatcacaattcaacaacaacat 12953074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 27 - 334
Target Start/End: Original strand, 30152898 - 30153205
Alignment:
Q  27 atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatat 124  Q
    ||||||||||||| || ||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||   ||| | ||||||||||||  |||| |||||||| ||      
T  30152898 atcaacccattttcaccaaaacaccaacaacaatccattt-ctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatatatcatcatcaacaatatga 30152996  T
Q  125 ctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaac-atgtcataagtcatcaattaagcataatttcataacaacccatt 223  Q
    || | ||||||||||| | |||||  | |||  || | | ||||||| ||||||| ||| ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| |||||||    
T  30152997 ctaaacaacaacaacaaccattgat-catgaaacatatcacaattcatcaacaaccatg-cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccatt 30153094  T
Q  224 ttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaaattagag 323  Q
    ||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||| |||||| |||| | | ||||  ||||||||  | | ||    
T  30153095 ttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaag 30153194  T
Q  324 attgggttcat 334  Q
    |||||||||||    
T  30153195 attgggttcat 30153205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 165 - 291
Target Start/End: Original strand, 38168008 - 38168134
Alignment:
Q  165 caattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattca 264  Q
    ||||||| |||||||||  ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| |||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| ||||||||||    
T  38168008 caattcatcaacaacatagcataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattca 38168107  T
Q  265 tttatcattcaattaacatactcaaac 291  Q
    |||| |||  |||||||||| ||||||    
T  38168108 tttaacatcaaattaacatattcaaac 38168134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 28 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 38811297 - 38811176
Alignment:
Q  28 tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaat-catgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatct 126  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | || |||  |||||  |||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||  ||    
T  38811297 tcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcattt-ctgatcatcaaaacatgaattatgcacacccaagccatgaatcatcatcaacaacatcact 38811199  T
Q  127 cagcaacaacaacatcaattgaa 149  Q
     ||||||||||||||||||||||    
T  38811198 tagcaacaacaacatcaattgaa 38811176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 27 - 181
Target Start/End: Original strand, 1990759 - 1990913
Alignment:
Q  27 atcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaac-aatcatgatatatgaac-acccaagccataattcataatcaacaacatat 124  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| || | ||||||||| ||||||| | ||||||||| | |||| | |||||| || |    
T  1990759 atcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactca-tttctcatcatcaaatcatgatttatgaacaaaccaagccatgaatcatcaacaacaatatct 1990857  T
Q  125 ctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacat 181  Q
    || | ||||||||||||| ||| |||| |||||| || | || ||||||||||||||    
T  1990858 cttaacaacaacaacatc-atttaaacatgattctcatcacagttcaacaacaacat 1990913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 176 - 315
Target Start/End: Original strand, 15550703 - 15550842
Alignment:
Q  176 caacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattca 275  Q
    |||||||||| || ||||||||| |||| ||||    ||| ||||||||  |||||| |||||||||  ||||||||| ||| |||||| |||||||  |    
T  15550703 caacatgtcacaattcatcaattgagcacaattcacaaactacccatttatatacatcatgaacatgcaatttcatcatcaaaaattcaattatcatcaa 15550802  T
Q  276 attaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaa 315  Q
    |||||||||||||||| |||||| | |||| |||||||||    
T  15550803 attaacatactcaaacatatcactacaacatgagcacgaa 15550842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 398 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 11986112 - 11986038
Alignment:
Q  398 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 472  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||  |||||| ||||||||||||    
T  11986112 atgattatgatgaagactaacccccttaccttagataatgattaatccaaacttaggcttcaatttagctcctaa 11986038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 184 - 334
Target Start/End: Original strand, 45581744 - 45581894
Alignment:
Q  184 cataagtcatcaattaagcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacat 283  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| |||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||| |||||  |||||||||    
T  45581744 cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcattaatcatcaaattaacat 45581843  T
Q  284 actcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaaattagagattgggttcat 334  Q
    | |||||| |||| | | ||||  ||||||||  | | |||||||||||||    
T  45581844 attcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcat 45581894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 27 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 6228916 - 6228762
Alignment:
Q  27 atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaac-aatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatat 124  Q
    ||||||||||||| |||||| || ||||||||||| |  |||||| || | ||||||||| |||||||||||||||||| | |||| | |||||| || |    
T  6228916 atcaacccatttttacaaaaccaacaacaacaactta-attctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatattt 6228818  T
Q  125 ctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacat 181  Q
    || ||||||||||||||||||| |||| |||| |||| |  ||||| ||||||||||    
T  6228817 cttagcaacaacaacatcaatt-aaacatgatccacatcataattcgacaacaacat 6228762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 184 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 54038266 - 54038159
Alignment:
Q  184 cataagtcatcaattaagcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacat 283  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| |||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||    
T  54038266 cataattcaccaatttagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacat 54038167  T
Q  284 actcaaac 291  Q
    | ||||||    
T  54038166 attcaaac 54038159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 398 - 472
Target Start/End: Original strand, 16261777 - 16261851
Alignment:
Q  398 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 472  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||| ||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  16261777 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaattccaacttaggcttcactttagctcctaa 16261851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 398 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 51961063 - 51960990
Alignment:
Q  398 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctccta 471  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||   |||||||||| ||||||    
T  51961063 atgattatgatgaagactaacccccttaccttagataatgattaatccaaacttagacttcactttacctccta 51960990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 184 - 284
Target Start/End: Original strand, 2844304 - 2844404
Alignment:
Q  184 cataagtcatcaattaagcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacat 283  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| |||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||    
T  2844304 cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacat 2844403  T
Q  284 a 284  Q
    |    
T  2844404 a 2844404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 184 - 296
Target Start/End: Original strand, 3992663 - 3992775
Alignment:
Q  184 cataagtcatcaattaagcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacat 283  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| |||||||||| ||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||    
T  3992663 cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcctacatcatgaacctgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacat 3992762  T
Q  284 actcaaacttatc 296  Q
    | |||||| ||||    
T  3992763 attcaaacatatc 3992775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 184 - 296
Target Start/End: Original strand, 28558284 - 28558396
Alignment:
Q  184 cataagtcatcaattaagcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacat 283  Q
    ||||| ||| ||||| ||||| ||||   ||| |||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||| |||||||||  |||||||||    
T  28558284 cataattcaccaattgagcatcatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaatttatttatcatcaaattaacat 28558383  T
Q  284 actcaaacttatc 296  Q
    | |||||| ||||    
T  28558384 attcaaacatatc 28558396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 48 - 198
Target Start/End: Original strand, 17191519 - 17191668
Alignment:
Q  48 accaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaatt 146  Q
    |||| ||||||||||||| |||| |||||| ||||||  ||||||||| |||||||| | |||| | |||||||||  || ||||||| |||||||||||    
T  17191519 accaccaacaactcattt-ctcatcaacaaatcatgaattatgaacactcaagccatgaatcatcaacaacaacattacttagcaacagcaacatcaatt 17191617  T
Q  147 gaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatt 198  Q
     |||| ||||||  | | ||||||| |||||||||  ||||| |||||||||    
T  17191618 -aaacatgattcttatcacaattcagcaacaacataacataattcatcaatt 17191668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 76 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 12488967 - 12488846
Alignment:
Q  76 aatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaa 175  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||| | | || |||||||||||  || |||||||||||||||||||| | | ||| ||  | | |||||||||||    
T  12488967 aatcatgaattatgaacacccaagccatgaattatcatcaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattg-atcatgaatcttatcacaattcaacaa 12488869  T
Q  176 caacatgtcataagtcatcaatt 198  Q
    ||||||  ||||| |||||||||    
T  12488868 caacataacataattcatcaatt 12488846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 37 - 178
Target Start/End: Original strand, 17204667 - 17204807
Alignment:
Q  37 tttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaa 135  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| |||||| ||||||  ||| |||||||||||||| | |||| | |||||| ||  || ||||||||    
T  17204667 tttacaaaaccactaacaacaactcattt-ctcatcaacaaatcatgaattataaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatattacttagcaacaa 17204765  T
Q  136 caacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaa 178  Q
    ||||||| ||| |||| ||||||  | | ||||||||||||||    
T  17204766 caacatccatt-aaacatgattcctatcacaattcaacaacaa 17204807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 28 - 145
Target Start/End: Original strand, 34559857 - 34559974
Alignment:
Q  28 tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaac-aatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatct 126  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||  |||||| || | ||| ||||| ||||||||| |||||||| | |||| | |||||| ||  ||    
T  34559857 tcaacccattttacaaaaccaacaacaacaactca-attctcatcatcaaattatgatttatgaacactcaagccatgaatcatcaacaacaatatcact 34559955  T
Q  127 cagcaacaacaacatcaat 145  Q
     ||||||||||||||||||    
T  34559956 tagcaacaacaacatcaat 34559974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 217 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 38375797 - 38375699
Alignment:
Q  217 acccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaa 315  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||  |||||||||| |||||||  |||| |  ||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  38375797 acccattttcacaaattatgaacatgcaatttcatctacaacaattcaattatcatcaaattcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaa 38375699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 184 - 334
Target Start/End: Original strand, 53771154 - 53771304
Alignment:
Q  184 cataagtcatcaattaagcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacat 283  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| |||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||| ||||||||| |||  |||||||||    
T  53771154 cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaaccattcatttaacatcaaattaacat 53771253  T
Q  284 actcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaaattagagattgggttcat 334  Q
    |  ||||| |||| | | ||||  ||||||||  | | |||||||||||||    
T  53771254 atccaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcat 53771304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 398 - 472
Target Start/End: Original strand, 53771365 - 53771439
Alignment:
Q  398 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 472  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||| ||| | |||||  |||||||||||||||||||    
T  53771365 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagctcctaa 53771439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 76 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 4162446 - 4162342
Alignment:
Q  76 aatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaa 175  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| | |||| | |||||| |  ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||  |   |||||||||    
T  4162446 aatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatagttcttagcaacaacaacatcaatt-aaacatgattcacgtcatcattcaacaa 4162348  T
Q  176 caacat 181  Q
    ||||||    
T  4162347 caacat 4162342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 234 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 12539153 - 12539072
Alignment:
Q  234 atgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaa 315  Q
    |||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||||   |||| |||||||||| | |||||| ||||||||||||||||    
T  12539153 atgaacatgcaatttcatcatcaacaattcaattatcaacaaattcacatactcaaccatatcactaaaacaagagcacgaa 12539072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 217 - 334
Target Start/End: Original strand, 55513016 - 55513133
Alignment:
Q  217 acccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaa 316  Q
    |||||||||||||||| || ||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||| |||||| |||| | | ||||  ||||||||     
T  55513016 acccattttcatacatcattaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcgaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaat 55513115  T
Q  317 attagagattgggttcat 334  Q
     | | |||||||||||||    
T  55513116 ttcaaagattgggttcat 55513133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 130 - 315
Target Start/End: Original strand, 10912945 - 10913130
Alignment:
Q  130 caacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatta-agcataatttcataaca-acccattttca 227  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||| || |||| || |||||| |||||||  || || ||| |||||| |||| |||| || || | |||||||||||    
T  10912945 caacaacaacatcaatt-aaacatgaatctcaccacatttcaaccacaacatagcacaattcaacaattagagcacaatt-cacaatatacccattttca 10913042  T
Q  228 tacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaa 315  Q
     | |||||| |||||  ||||||||| |||||||||| ||||||   |||| |  ||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  10913043 catattatggacatgcaatttcatcaacaacaattcaattatcaccaaattcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaa 10913130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 78 - 181
Target Start/End: Original strand, 41661573 - 41661675
Alignment:
Q  78 tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaaca 177  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| || | |||| | |||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| || | ||||||||||| |    
T  41661573 tcatgatttatgaacactcaagctatgaatcatcaacaacaatatctctcaacaacaacaacatcaatt-aaacatgattctcatcacaattcaacaata 41661671  T
Q  178 acat 181  Q
    ||||    
T  41661672 acat 41661675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 398 - 472
Target Start/End: Original strand, 2050115 - 2050189
Alignment:
Q  398 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 472  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||| ||| | |||||  |||||| ||||||||||||    
T  2050115 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaa 2050189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 9591035 - 9590922
Alignment:
Q  36 ttttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaaca 134  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||| |||| || ||| ||||||  |||||||||||||| ||| | |||| | |||||| ||  || | |||||    
T  9591035 ttttacaaaaccaacaacaacaactcattt-ctcatcatcaaatcatgaactatgaacacccaagtcatgaatcatcaacaacaatatcacttaacaaca 9590937  T
Q  135 acaacatcaattgaa 149  Q
    |||||||||||||||    
T  9590936 acaacatcaattgaa 9590922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 184 - 334
Target Start/End: Original strand, 16261566 - 16261716
Alignment:
Q  184 cataagtcatcaattaagcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacat 283  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| |||||||||| ||||| |||||| ||  ||||||||| |||| ||||||||| |||  |||||||||    
T  16261566 cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcgtacatcatgaacttgcaatttcatcatcaaccattcatttaacatcaaattaacat 16261665  T
Q  284 actcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaaattagagattgggttcat 334  Q
    |  ||||| |||| | | ||||  ||||||||  | | |||||||||||||    
T  16261666 atccaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcat 16261716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 78 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 31412572 - 31412451
Alignment:
Q  78 tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaaca 177  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| || | |||| | |||||| || ||| | ||||||||||||||||| |||| | |||| || | |||||||||||||    
T  31412572 tcatgatttatgaacactcaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaatt-aaacctaattctcatcacaattcaacaaca 31412474  T
Q  178 acatgtcataagtcatcaattaa 200  Q
    |||| ||| || ||| |||||||    
T  31412473 acatatcacaattcaacaattaa 31412451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 398 - 472
Target Start/End: Original strand, 38168237 - 38168311
Alignment:
Q  398 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 472  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||| ||| | |||||  |||||| ||||||||||||    
T  38168237 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaa 38168311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 398 - 472
Target Start/End: Original strand, 54651764 - 54651838
Alignment:
Q  398 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 472  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| ||  |||||||  |||||| || |||||||||    
T  54651764 atgattatgatgaagacaaacccccttaccttagatgatgattaacccaaacttttgcttcaattaagctcctaa 54651838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 50 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 3576705 - 3576558
Alignment:
Q  50 caacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattga 148  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||| | |||| | | |||| ||  || ||||||||||||||||| | |    
T  3576705 caacaacaactcattt-ctcatcaacaaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaaccacaatattacttagcaacaacaacatcaa-tca 3576608  T
Q  149 aacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatt 198  Q
    ||| ||| ||  | | |||||||||||||||||  |||||  ||||||||    
T  3576607 aacatgactcttatcacaattcaacaacaacatagcataatccatcaatt 3576558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 398 - 431
Target Start/End: Original strand, 13839200 - 13839233
Alignment:
Q  398 atgattatgatgaagactaacccccttaccttag 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13839200 atgattatgatgaagactaacccccttaccttag 13839233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 28 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 17960602 - 17960565
Alignment:
Q  28 tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcattt 65  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17960602 tcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcattt 17960565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 398 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 15857195 - 15857163
Alignment:
Q  398 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 430  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15857195 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 15857163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 220 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 17956090 - 17956026
Alignment:
Q  220 cattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacata 284  Q
    ||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  17956090 cattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacata 17956026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 296
Target Start/End: Original strand, 23492502 - 23492598
Alignment:
Q  200 agcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatc 296  Q
    ||||||||||   ||| |||||||||||||||| |||||| ||  ||||||| | |||||||||||||| |||  |||||||| | |||||| ||||    
T  23492502 agcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcataatcaacaattcatttaacatcaaattaacacattcaaacatatc 23492598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 373 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 8268708 - 8268649
Alignment:
Q  373 caagaaaaattgcaaacaaa-caattatgattatgatgaagactaacccccttaccttag 431  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||||    
T  8268708 caaggaaaattgcaaacaaaacaatcatgattatgataataactaacccccttaccttag 8268649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 373 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 8275808 - 8275749
Alignment:
Q  373 caagaaaaattgcaaacaaa-caattatgattatgatgaagactaacccccttaccttag 431  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||||    
T  8275808 caaggaaaattgcaaacaaaacaatcatgattatgataataactaacccccttaccttag 8275749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 78 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 43427753 - 43427563
Alignment:
Q  78 tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaaca 177  Q
    ||||||| |||||||||| |||| || | |||| | ||||||  ||||||| ||||||||||||||||| || | |||||| || | ||| |||||||||    
T  43427753 tcatgatttatgaacaccaaagctatgaatcatcaacaacaa--tatctcaacaacaacaacatcaatt-aatcatgattctcatcacaactcaacaaca 43427657  T
Q  178 acatgtcataagtcatcaatta-agcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatca 271  Q
    ||||  || || ||| |||||| |||| ||||| | || |   |||||||| | | ||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||||    
T  43427656 acatagcacaattcaacaattagagcacaattt-acaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttcatcaacaacaattcaattatca 43427563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 361 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 2449220 - 2449151
Alignment:
Q  361 tttcatacaaaccaagaaaaattgcaaacaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttaccttag 431  Q
    |||||| |||| || ||||||||||||| ||  ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2449220 tttcatccaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaac-atgattatgataaagactaacccccttaccttag 2449151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 47 - 148
Target Start/End: Original strand, 14295415 - 14295516
Alignment:
Q  47 caccaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaat 145  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||   ||| | ||||||||||| | | || |||||||||||  || || |||||||||||||||    
T  14295415 caccaacaacatctcattt-ctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatcacttagaaacaacaacatcaat 14295513  T
Q  146 tga 148  Q
    |||    
T  14295514 tga 14295516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 398 - 472
Target Start/End: Original strand, 33342204 - 33342278
Alignment:
Q  398 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 472  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| | | ||| ||| | |||||  |||||| ||||||||||||    
T  33342204 atgattatgataaagactaaccctcttaccttagatgaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaa 33342278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 361 - 431
Target Start/End: Original strand, 45861086 - 45861155
Alignment:
Q  361 tttcatacaaaccaagaaaaattgcaaacaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttaccttag 431  Q
    ||||||||||  || ||||||||||||| ||  ||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  45861086 tttcatacaattcatgaaaaattgcaaagaatgaat-atgattatggtaaagactaacccccttaccttag 45861155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 11061247 - 11061174
Alignment:
Q  76 aatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaa 149  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||| | |||| | |||||| ||  || |||| |||||||||||||||||    
T  11061247 aatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaccaacaacatcaattgaa 11061174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 48 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 11329230 - 11329130
Alignment:
Q  48 accaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaatt 146  Q
    |||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||   ||| | ||||||||||| | | || |||||||||||  || |||||||||||||||||||    
T  11329230 accaacaacatctcattt-ctcatcaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatcaacaacatcacttagcaacaacaacatcaatt 11329132  T
Q  147 ga 148  Q
    ||    
T  11329131 ga 11329130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 398 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 14842519 - 14842486
Alignment:
Q  398 atgattatgatgaagactaacccccttaccttag 431  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14842519 atgattatgataaagactaacccccttaccttag 14842486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 48 - 148
Target Start/End: Original strand, 17139486 - 17139586
Alignment:
Q  48 accaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaatt 146  Q
    |||||||||| ||||||| | ||||||||| ||||||   ||| | ||||||||||| | | || |||||||||||  || |||||||||||||||||||    
T  17139486 accaacaacatctcattt-cgcaacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatcaacaacatcacttagcaacaacaacatcaatt 17139584  T
Q  147 ga 148  Q
    ||    
T  17139585 ga 17139586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 398 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 17912430 - 17912397
Alignment:
Q  398 atgattatgatgaagactaacccccttaccttag 431  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17912430 atgattatgataaagactaacccccttaccttag 17912397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 398 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 19260781 - 19260748
Alignment:
Q  398 atgattatgatgaagactaacccccttaccttag 431  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19260781 atgattatgataaagactaacccccttaccttag 19260748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 398 - 431
Target Start/End: Original strand, 23492696 - 23492729
Alignment:
Q  398 atgattatgatgaagactaacccccttaccttag 431  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23492696 atgattatgataaagactaacccccttaccttag 23492729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 398 - 430
Target Start/End: Original strand, 7854305 - 7854337
Alignment:
Q  398 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 430  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7854305 atgattatgatgaaaactaacccccttacctta 7854337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 50 - 149
Target Start/End: Original strand, 14080489 - 14080588
Alignment:
Q  50 caacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattga 148  Q
    |||||||||||||||| |||| || ||| ||||||  |||||| ||||||||| ||| |||| | |||||||||  ||  |||| |||||||||||||||    
T  14080489 caacaacaactcattt-ctcatcaccaaatcatgaattatgaatacccaagccgtaaatcatcaacaacaacattacttcgcaataacaacatcaattga 14080587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 398 - 430
Target Start/End: Original strand, 15615137 - 15615169
Alignment:
Q  398 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 430  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15615137 atgattatgataaagactaacccccttacctta 15615169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 398 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 17955916 - 17955884
Alignment:
Q  398 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 430  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17955916 atgattatgataaagactaacccccttacctta 17955884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 27 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 33369199 - 33369045
Alignment:
Q  27 atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatat 124  Q
    ||||||||||||| |||||| || ||||||||| | |||| |||| || ||| ||||||| |||||||||||||| ||| | || | | |||||| ||      
T  33369199 atcaacccatttttacaaaaccaacaacaacaatttattt-ctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagtcatgaatcgtcaacaacaatattc 33369101  T
Q  125 ctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacat 181  Q
    || | |||||| |||||||||| |||| |||||| || |  ||||||||||||||||    
T  33369100 cttaacaacaaaaacatcaatt-aaacatgattctcatcataattcaacaacaacat 33369045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0615 (Bit Score: 367; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0615
Description:

Target: scaffold0615; HSP #1
Raw Score: 367; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 64 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 6477 - 6043
Alignment:
Q  64 tttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacacc 163  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6477 tttctcatcaacaattatgatatatgaacacccaagccataaatcataatcaacaacatatctcagcatcaacaacatcaattgaaacttgattcacacc 6378  T
Q  164 ccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattc 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6377 ccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcttaatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattc 6278  T
Q  264 atttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaaattagagattgggttcatatgaattctcac-tcaattaagcactttt 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||    
T  6277 atttatcattcaattaacatactcaatcttatcaccaaaacaagagcacgaaaattagagattgggttcatatgaattctcacttaaactaagcactttt 6178  T
Q  363 tcatacaaaccaagaaaaattgcaaacaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactt 462  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6177 tcatacaaaccaagaaaaattgcaaacaaacaattatgattatgtttaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttcactt 6078  T
Q  463 tagctcctaa-ttctccaatcttcaagttttcccc 496  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  6077 tagctcctaatttcttcaatcttcaagttttcccc 6043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 366; Significance: 0; HSPs: 56)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 366; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 35 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 3431570 - 3431114
Alignment:
Q  35 attttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaaca 134  Q
    |||| |||||| ||||||||||| || |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||    
T  3431570 atttcacaaaaccaccaacaacatcttattt-ctcacaaacaatcatgatatatgaacacccaagccataaatcataaacaacaacatgtctcagcaaca 3431472  T
Q  135 acaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcataacaacccattttcatacatta 234  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  3431471 acaacatcaatcgaaacttgattctcaccttaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaactcattttcatacatta 3431372  T
Q  235 tgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaaattagagattgggttcat 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3431371 tgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaatcttatcaccaaaacaagagcacgaaaattagagattgggttcat 3431272  T
Q  335 atgaattctcactcaattaagcactttttcatacaaaccaagaaaaattgcaaacaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttaccttaggtt 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3431271 atgaattctcactcaattaagcactttttcatacaaaccaagaaaaattgcaaacaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttaccttaggtt 3431172  T
Q  435 atgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaatt-ctccaatcttcaagttt 491  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  3431171 atgatcaatccaaacttgggcttcactttagctcctaattgcttcaatcttcaagttt 3431114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 48 - 496
Target Start/End: Original strand, 22886305 - 22886753
Alignment:
Q  48 accaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattg 147  Q
    |||||||||| || | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22886305 accaacaacatcttaatttctcatcaacaatcatgatatatgaacacccaagtcataaatcataaacaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattg 22886404  T
Q  148 aaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatt 247  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22886405 aaacttgattctcacctcaattca-caacaacatgtcatagttcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttatt 22886503  T
Q  248 tcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaaattagagattgggttcatatgaattctcact 347  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||| |||||| |||    
T  22886504 tcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttattaccaaaacaagagcacgaaattcaaagattggattcatataaattcttact 22886603  T
Q  348 caattaagcactttttcatacaaaccaagaaaaattgc-aaacaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattca 446  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||    
T  22886604 caattaagcactttttcatacaaaccaag-aaaattgcaaaaaaaacaattatgattatgattaagactaacccccttaccttaggtaatgattaatcca 22886702  T
Q  447 aacttgagcttcactttagctcctaa-ttctccaatcttcaagttttcccc 496  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  22886703 aacttaagcttcactttagctcctaatttcttcaatcttcaagtttccccc 22886753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 48 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 21494725 - 21494290
Alignment:
Q  48 accaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattg 147  Q
    |||||||||| |||| || |||| |||||||||||||||||| |||||||||  |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21494725 accaacaacatctcaatt-ctcaccaacaatcatgatatatgcacacccaagttataaatcataaacaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattg 21494627  T
Q  148 aaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatt 247  Q
    ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||            |||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21494626 aaacttgattctcacctcaatccaacaacaacat------------caattaagcataatttcacaactaccccttttcatacattatgaacatgttatt 21494539  T
Q  248 tcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaaattagagattgggttcatatgaattctcact 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||| || |||    
T  21494538 tcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaaattatcaccaaaacaagagcacgaaattcaaagattgggttcatataaatacttact 21494439  T
Q  348 caattaagcactttttcatacaaaccaagaaaaattgcaaac-aaacaattatgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattca 446  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| ||    
T  21494438 caattaagcactatttcatacaaaccaag-aaaattgcaaacaaaacaatcatgattatgaagaagactaacccccttaccttagataatgattaatcca 21494340  T
Q  447 aacttgagcttcactttagctcctaattctccaatcttcaagttttcccc 496  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  21494339 aacttaggcttcactttagctcctaattcttcaatcttcaagtttacccc 21494290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 64 - 315
Target Start/End: Original strand, 18612401 - 18612651
Alignment:
Q  64 tttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacacc 163  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||  ||||    
T  18612401 tttctcaccaacaatcatgatatatgaacactcaagccataat-cataaacaacaacatgtctcagcaacaacaacatcaattaaatcttgatttccacc 18612499  T
Q  164 ccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattc 263  Q
     ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18612500 tcaattcaacaacaacatgtcacaattcatcaattaagcataatttcataacaatccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattc 18612599  T
Q  264 atttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaa 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18612600 atttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaa 18612651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 64 - 315
Target Start/End: Original strand, 18619306 - 18619556
Alignment:
Q  64 tttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacacc 163  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||  ||||    
T  18619306 tttctcaccaacaatcatgatatatgaacactcaagccataat-cataaacaacaacatgtctcagcaacaacaacatcaattaaatcttgatttccacc 18619404  T
Q  164 ccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattc 263  Q
     ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18619405 tcaattcaacaacaacatgtcacaattcatcaattaagcataatttcataacaatccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattc 18619504  T
Q  264 atttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaa 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18619505 atttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaa 18619556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 64 - 315
Target Start/End: Original strand, 22147433 - 22147683
Alignment:
Q  64 tttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacacc 163  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||  |||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||    
T  22147433 tttctcaccaacaatcatgatatatgaacacctaagccataata-atatacaacgacatgtctcagcaacaacaacatcaattaaaatttgattctcacc 22147531  T
Q  164 ccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattc 263  Q
     ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22147532 tcaattcaacaacaacatgtcacaattcatcaattaagcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattc 22147631  T
Q  264 atttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaa 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22147632 atttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaa 22147683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 64 - 315
Target Start/End: Original strand, 2544944 - 2545191
Alignment:
Q  64 tttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacacc 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2544944 tttctcaacaacaatcatgatatatcaacacccaagccataat-cataaacaacaacatgtatca---acaacaacatcaattgaaacttgattcccacc 2545039  T
Q  164 ccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattc 263  Q
     ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2545040 tcaattcaacaacaacatgttataattcatcaattaagcataattttacaactacccattttcacacattatgaatatgttatttcatcaccaacaattc 2545139  T
Q  264 atttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaa 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  2545140 atttatcattcaattaacatactcaaacttattaccaaaataagagcacgaa 2545191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 378 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 16038839 - 16038713
Alignment:
Q  378 aaaattgcaaacaaa-caattatgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaattct 476  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16038839 aaaattgcaaacaaaacaatcatgattatgatgaagacaaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaattct 16038740  T
Q  477 ccaatcttcaagttttccccctttgcta 504  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||    
T  16038739 ccaatcttcaag-tttccccctttgcta 16038713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 361 - 504
Target Start/End: Original strand, 2545229 - 2545371
Alignment:
Q  361 tttcatacaaaccaagaaaaattgcaaacaaa-caattatgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttca 459  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||    
T  2545229 tttcatacaa--caaggaaaattgcaaacaaaacaatcatgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgattaattcaaatttaagcttca 2545326  T
Q  460 ctttagctcctaattctccaatcttcaagttttccccctttgcta 504  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2545327 ctttagctcctaattcttcaatcttcaagttttccccctttgcta 2545371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 361 - 491
Target Start/End: Original strand, 22147720 - 22147849
Alignment:
Q  361 tttcatacaaaccaagaaaaattgcaaacaaa-caattatgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttca 459  Q
    ||||||||||  |||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22147720 tttcatacaa--caaggaaaattgaaaacaaaacaatcatgattatgaagaacactaaaccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttca 22147817  T
Q  460 ctttagctcctaattctccaatcttcaagttt 491  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22147818 ccttagctcctaattcttcaatcttcaagttt 22147849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 361 - 489
Target Start/End: Original strand, 18612688 - 18612815
Alignment:
Q  361 tttcatacaaaccaagaaaaattgcaaacaaa-caattatgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttca 459  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  18612688 tttcatacaa--caaggaaaattgcaaacaaaacaatcatgattgtgaagaacactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaatttgggcttca 18612785  T
Q  460 ctttagctcctaattctccaatcttcaagt 489  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18612786 ctttagctcctaattcttcaatcttcaagt 18612815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 195 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 16039012 - 16038892
Alignment:
Q  195 aattaagcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaactta 294  Q
    |||| ||||||||||   ||| |||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16039012 aattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttc 16038913  T
Q  295 tcaccaaaacaagagcacgaa 315  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  16038912 tcaccaaaacaagagcacgaa 16038892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 35 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 13721217 - 13721039
Alignment:
Q  35 attttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaaca 134  Q
    |||| |||||| ||||||||||| || |||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13721217 atttcacaaaaccaccaacaacatcttattt-ctcatcaacaattatggtatatgaacacccaagccataaatcataatcaacaacatatctcagcaaca 13721119  T
Q  135 acaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcataac 215  Q
    |||||||||||| | |  ||||| ||| | || |||||  | ||||| ||| |  |||||||||||| |||||||||||||    
T  13721118 acaacatcaatt-acatatgatttacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataac 13721039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 27 - 181
Target Start/End: Original strand, 33528383 - 33528535
Alignment:
Q  27 atcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaac-aatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatc 125  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||| || | ||||||||| |||||||||||||||||| |   || |||||||| |||||    
T  33528383 atcaacccattttacaaaatcaacaacaacaaccca-tttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatga---atcatcaacaaaatatc 33528478  T
Q  126 tc--agcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacat 181  Q
    ||  ||||||||||||||||||| |||| ||| || || | |||||||||||||||||    
T  33528479 tcttagcaacaacaacatcaatt-aaacatgaatctcatcacaattcaacaacaacat 33528535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 28 - 181
Target Start/End: Original strand, 5854572 - 5854724
Alignment:
Q  28 tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatct 126  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||| || |||| || ||| ||||||| |||||||||||||||||| | |||| | |||||| ||  ||    
T  5854572 tcaacccattttacaaaaccaacaacaacaactcaatt-ctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcact 5854670  T
Q  127 cagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacat 181  Q
     |||||||||||||||||||| ||| ||| || || | |||||||||||||||||    
T  5854671 tagcaacaacaacatcaattg-aacatgaatctcatcacaattcaacaacaacat 5854724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 35 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 16873340 - 16873162
Alignment:
Q  35 attttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaaca 134  Q
    |||| |||||| |||||| |||| || |||| |||| ||| ||| ||| ||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16873340 atttcacaaaaccaccaataacatcttattt-ctcatcaataattatggtatatgaacacccaagcctcaaatcatactcaacaacatatctcagcaaca 16873242  T
Q  135 acaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcataac 215  Q
    |||||||| ||| | |  ||||| ||| | || |||||| | ||||| ||| |  |||||||||||| |||||||||||||    
T  16873241 acaacatcgatt-acatatgatttacatctcatttcaaccaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataac 16873162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 35 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 21198434 - 21198272
Alignment:
Q  35 attttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaac 133  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||||  |||||||||||||||||| | |||| | || ||||||  || ||||||    
T  21198434 attttaccaaaccaccaacaacaactcattt-ctcatccacaaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcattaacagcaacatcacttagcaac 21198336  T
Q  134 aacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatt 198  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||  ||| |||||||||||||||||  ||||| ||| |||||    
T  21198335 aacaacatcaattg-aacatgattcttaccacaattcaacaacaacataacataattcaacaatt 21198272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 173 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 21259644 - 21259502
Alignment:
Q  173 caacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcat 272  Q
    ||||||||||||| || ||||||||| |||| ||||    ||| ||||||||  |||||| |||||||||  ||||||||| ||| |||||| |||||||    
T  21259644 caacaacatgtcacaattcatcaattgagcacaattcacaaactacccatttatatacatcatgaacatgcaatttcatcatcaaaaattcaattatcat 21259545  T
Q  273 tcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaa 315  Q
      ||||||||||||||||| |||||| | |||| |||||||||    
T  21259544 caaattaacatactcaaacatatcactacaacatgagcacgaa 21259502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 28 - 181
Target Start/End: Original strand, 38533607 - 38533759
Alignment:
Q  28 tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatct 126  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||  |||| ||||||||||||| | | || |||||||||||  |     
T  38533607 tcaacccattttacaaagtctccaacaacatctcattt-ctcatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagccatgaattatcatcaacaacatcacc 38533705  T
Q  127 cagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacat 181  Q
     |||||||||||||||||||| ||| ||| || || | |||||||||||||||||    
T  38533706 tagcaacaacaacatcaattg-aacatgaatctcatcacaattcaacaacaacat 38533759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 35 - 198
Target Start/End: Original strand, 23837163 - 23837325
Alignment:
Q  35 attttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaac 133  Q
    |||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||| |||||| ||||||  |||||| ||||||||||| | |||| | |||||||||  || ||||||    
T  23837163 atttcacaaaaccaccaccaacaactcattt-ctcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatcacttagcaac 23837261  T
Q  134 aacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatt 198  Q
    |||||||||||||| ||| ||| ||  ||| |||||||||||||||||  ||||| ||| |||||    
T  23837262 aacaacatcaattg-aacatgactcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 23837325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 169 - 335
Target Start/End: Original strand, 17502259 - 17502425
Alignment:
Q  169 tcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcattta 268  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||| | |||||||    ||| |||| |||  |||||| |||||||||  |||||||||  ||||||||| | |    
T  17502259 tcaacaaaaacatgtcataattcatcaattgaacataattcacaaactacccttttatatacatcatgaacatgcaatttcatcattaacaattcaatca 17502358  T
Q  269 tcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaaattagagattgggttcata 335  Q
    ||||  ||||||||||||||||| |||||| | |||| |||||| ||  | | ||||||||||||||    
T  17502359 tcatcaaattaacatactcaaacatatcactacaacatgagcacaaatttcaaagattgggttcata 17502425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 28 - 181
Target Start/End: Original strand, 26011452 - 26011604
Alignment:
Q  28 tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaac-aatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatct 126  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||| |  |||||| || | ||||||||| |||||||||||||||||| | |||| | |||||| ||  ||    
T  26011452 tcaacccattttacaaaaccaacaacaacaactta-attctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcact 26011550  T
Q  127 cagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacat 181  Q
     |||||||||||||||||||  ||| ||| || || | |||||||||||||||||    
T  26011551 tagcaacaacaacatcaatt-caacatgaatctcatcacaattcaacaacaacat 26011604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 36 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 27233348 - 27233204
Alignment:
Q  36 ttttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaac-aatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaaca 134  Q
    |||||||||| || ||||||||||| | |||||||  | | ||||||||| |||||||||||||||||| | |||| | |||||| || ||| | |||||    
T  27233348 ttttacaaaaccaacaacaacaactta-tttctcattatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaaca 27233250  T
Q  135 acaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacat 181  Q
    |||||||||||| |||| |||||| || | |||||||||||||||||    
T  27233249 acaacatcaatt-aaacatgattctcatcacaattcaacaacaacat 27233204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 165 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 22321607 - 22321438
Alignment:
Q  165 caattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattca 264  Q
    ||||| ||||| ||||||| |||| ||| ||||| ||||||||||   ||| |||||||||||||| | |||||| ||  ||||||||| ||||||||||    
T  22321607 caatttaacaataacatgttataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacgtcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattca 22321508  T
Q  265 tttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaaattagagattgggttcat 334  Q
     ||| |||  |||||||||| |||||| |||| | | |||  |||||||||  | | |||||||||||||    
T  22321507 attaacatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacctgagcacgaatttcaaagattgggttcat 22321438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 27 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 18261762 - 18261608
Alignment:
Q  27 atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatat 124  Q
    ||||||||||||| |||||| || ||||||||||| | || |||| || ||| ||||||| ||||||||||||||| || | |||| | |||||| || |    
T  18261762 atcaacccatttttacaaaaccaacaacaacaacttaatt-ctcatcatcaactcatgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatct 18261664  T
Q  125 ctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacat 181  Q
    || | ||||||||||||||||| |||| |||||| || | |||||||||||||||||    
T  18261663 cttaacaacaacaacatcaatt-aaacatgattctcatcacaattcaacaacaacat 18261608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 184 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 41506951 - 41506839
Alignment:
Q  184 cataagtcatcaattaagcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacat 283  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| |||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||    
T  41506951 cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacat 41506852  T
Q  284 actcaaacttatc 296  Q
    | |||||| ||||    
T  41506851 attcaaacatatc 41506839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 28 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 22736127 - 22736006
Alignment:
Q  28 tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccat-aattcataatcaacaacatatc 125  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||  |||| ||||||||||||| |||| | || |||||||||       
T  22736127 tcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttt-tcatcaacaattcatgaattatgcacacccaagccatgaattaacaa-caacaacatcag 22736030  T
Q  126 tcagcaacaacaacatcaattgaa 149  Q
    | ||||| ||||||||||||||||    
T  22736029 ttagcaagaacaacatcaattgaa 22736006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 298
Target Start/End: Original strand, 23217974 - 23218104
Alignment:
Q  168 ttcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcattt 267  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||    ||| | ||||||  |||||| || ||||||  |||||||||  ||||||||| |     
T  23217974 ttcaacaacaacatgtcataattcatcaattgaacataattcacaaactagccatttatatacatcattaacatgcaatttcatcattaacaattcaatc 23218073  T
Q  268 atcattcaattaacatactcaaacttatcac 298  Q
    |||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  23218074 atcatcaaattaacatactcaaacatatcac 23218104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 165 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 24385913 - 24385743
Alignment:
Q  165 caattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattca 264  Q
    ||||||| ||||||||   | ||| ||| ||||| ||||||||||   ||| |||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| ||||||||||    
T  24385913 caattcatcaacaacaatgcttaattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattca 24385814  T
Q  265 tttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaaattagagattgggttcata 335  Q
    |||| |||  ||||| |||| |||||| |||| | | ||||  ||||||||  | | ||||||||||||||    
T  24385813 tttaacatcaaattatcatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcata 24385743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 184 - 296
Target Start/End: Original strand, 39115388 - 39115500
Alignment:
Q  184 cataagtcatcaattaagcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacat 283  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||  |||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||    
T  39115388 cataattcaccaattgagcataatttacaaattacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacat 39115487  T
Q  284 actcaaacttatc 296  Q
    | |||||| ||||    
T  39115488 attcaaacatatc 39115500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 28 - 181
Target Start/End: Original strand, 15933256 - 15933408
Alignment:
Q  28 tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatct 126  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||| || |||| |  ||| ||||||| ||  |||||||||||||| | |||| | |||||| ||  ||    
T  15933256 tcaacccattttacaaaaccaacaacaacaactcaatt-ctcatcttcaaatcatgatttacaaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcact 15933354  T
Q  127 cagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacat 181  Q
     |||||||||||||||||||||| | ||| || || |  ||||||||||||||||    
T  15933355 tagcaacaacaacatcaattgaa-catgaatctcatcataattcaacaacaacat 15933408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 398 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 24385684 - 24385610
Alignment:
Q  398 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 472  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||| ||| | |||||  |||||||||||||||||||    
T  24385684 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaatcccaacttaggcttcactttagctcctaa 24385610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 36 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 33611334 - 33611190
Alignment:
Q  36 ttttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaac-aatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaaca 134  Q
    |||||||||| || ||||||||||| | | ||||| || | ||||||||| ||||||||| |||||||| | |||| | |||||| ||  || |||||||    
T  33611334 ttttacaaaaccaacaacaacaactta-tatctcatcatcaaatcatgatttatgaacacacaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaaca 33611236  T
Q  135 acaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacat 181  Q
    |||||||||||| |||| || ||| || | |||||||||||||||||    
T  33611235 acaacatcaatt-aaacatggttctcaacacaattcaacaacaacat 33611190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 398 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 43373424 - 43373350
Alignment:
Q  398 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 472  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||| ||| | |||||  |||||||||||||||||||    
T  43373424 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagctcctaa 43373350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 169 - 298
Target Start/End: Original strand, 4233953 - 4234082
Alignment:
Q  169 tcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcattta 268  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||| |  ||||||    ||| ||||||||  |||||| || ||||||  |||||||||  ||||||||| | |    
T  4233953 tcaacaacaacttgtcataattcatcaattgaaaataattcacaaactacccatttatatacatcataaacatgcaatttcatcattaacaattcaatca 4234052  T
Q  269 tcattcaattaacatactcaaacttatcac 298  Q
    ||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  4234053 tcatcaaattaacatactcaaacatatcac 4234082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 220 - 296
Target Start/End: Original strand, 274592 - 274668
Alignment:
Q  220 cattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatc 296  Q
    ||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||| |||||| ||||    
T  274592 cattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttagcatcaaattaacatattcaaacatatc 274668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 220 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 641257 - 641181
Alignment:
Q  220 cattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatc 296  Q
    ||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||| |||||| ||||    
T  641257 cattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttagcatcaaattaacatattcaaacatatc 641181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 220 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 827063 - 826987
Alignment:
Q  220 cattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatc 296  Q
    ||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||| |||||| ||||    
T  827063 cattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttagcatcaaattaacatattcaaacatatc 826987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 18041823 - 18041669
Alignment:
Q  27 atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatat 124  Q
    ||||||||||||| |||||| || ||||||||||| |||| | || ||  || ||||||| |||||||||| |||| || | |||| | |||||| ||||    
T  18041823 atcaacccattttcacaaaaccaacaacaacaacttattt-cacatcataaactcatgatttatgaacacctaagctatgaatcatcaacaacaatatat 18041725  T
Q  125 ctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacat 181  Q
    || | ||||||||||||||||| |||| |||||| || | ||| |||||||||||||    
T  18041724 cttaacaacaacaacatcaatt-aaacatgattctcatcacaaatcaacaacaacat 18041669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 36 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 37653895 - 37653756
Alignment:
Q  36 ttttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaac-aatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaaca 134  Q
    |||||||||| || ||||||||||| ||||| ||| || | |||||||  ||||||||||||||||||||| |||| | |||||| ||  || | |||||    
T  37653895 ttttacaaaaccaacaacaacaacttatttt-tcatcatcaaatcatg--atatgaacacccaagccataaatcatcaacaacaatattccttaacaaca 37653799  T
Q  135 acaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaa 178  Q
    |||||||||||| |||| |||||| || |  |||||||||||||    
T  37653798 acaacatcaatt-aaacatgattctcaacagaattcaacaacaa 37653756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 388 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 16404942 - 16404900
Alignment:
Q  388 acaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttacctta 430  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16404942 acaaataatgatgattatgatgaagactaacccccttacctta 16404900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 361 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 22907196 - 22907127
Alignment:
Q  361 tttcatacaaaccaagaaaaattgcaaacaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttaccttag 431  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||| ||  ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22907196 tttcatacaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaac-atgattatgataaagactaacccccttaccttag 22907127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 38635878 - 38635785
Alignment:
Q  87 atgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacat 181  Q
    ||||||||||||||||| | |||| | |||||| || ||| | ||||||||||||||||| |||| |||||| || |  ||||||||||||||||    
T  38635878 atgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaatt-aaacatgattctcatcataattcaacaacaacat 38635785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 78 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 45559176 - 45558944
Alignment:
Q  78 tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaaca 177  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| || | |||| | |||||| ||  || | ||||||||||||||||| |||| |||||| || | |||||||||||||    
T  45559176 tcatgatttatgaccacccaagctatgaatcatcaacaacaatatcccttaacaacaacaacatcaatt-aaacatgattctcatcacaattcaacaaca 45559078  T
Q  178 acatgtcataagtcatcaatta-agcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaa 276  Q
    ||||  || || ||| |||||| |||| || |||| || |   |||||||| | | ||||||||||  |||||| || |||||||||| |||||| | |     
T  45559077 acatagcacaattcaacaattagagcacaa-ttcacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcactaat 45558979  T
Q  277 ttaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagca 311  Q
    || |  ||||||||| ||||| || ||||||||||    
T  45558978 ttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagca 45558944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 184 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 24717004 - 24716892
Alignment:
Q  184 cataagtcatcaattaagcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacat 283  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| | ||||||||||||||  ||||| ||  ||||||| | |||||||||||||| |||  |||||||||    
T  24717004 cataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcgtgaacttgcaatttcattatcaacaattcatttaacatcaaattaacat 24716905  T
Q  284 actcaaacttatc 296  Q
    | |||||| ||||    
T  24716904 attcaaacatatc 24716892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 50 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 45465393 - 45465263
Alignment:
Q  50 caacaacaactcattttctcaacaacaat-catgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattga 148  Q
    |||||||||||||||| | || || |||| |||||| ||||||||||||| | || | |||| | |||||| || ||| | ||||||||||||||||| |    
T  45465393 caacaacaactcatttcc-catcatcaattcatgatttatgaacacccaaactatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaatt-a 45465296  T
Q  149 aacttgattcacaccccaattcaacaacaacat 181  Q
    ||| |||||| || | ||||||||||| |||||    
T  45465295 aacatgattctcatcacaattcaacaataacat 45465263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 361 - 431
Target Start/End: Original strand, 5238368 - 5238437
Alignment:
Q  361 tttcatacaaaccaagaaaaattgcaaacaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttaccttag 431  Q
    |||||| |||| || ||||||||||||| ||  ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5238368 tttcatccaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaac-atgattatgataaagactaacccccttaccttag 5238437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 398 - 428
Target Start/End: Original strand, 17345887 - 17345917
Alignment:
Q  398 atgattatgatgaagactaacccccttacct 428  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17345887 atgattatgatgaagactaacccccttacct 17345917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 361 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 24661230 - 24661161
Alignment:
Q  361 tttcatacaaaccaagaaaaattgcaaacaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttaccttag 431  Q
    |||||| |||| || ||||||||||||| ||  ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24661230 tttcatccaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaac-atgattatgataaagactaacccccttaccttag 24661161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 398 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 41506741 - 41506671
Alignment:
Q  398 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctc 468  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||| ||  |||||||  |||||| ||||||||    
T  41506741 atgattatgatgaaaactaacccccttaccttagataaggattaacccaaacttaggcttcaatttagctc 41506671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 361 - 431
Target Start/End: Original strand, 43685827 - 43685896
Alignment:
Q  361 tttcatacaaaccaagaaaaattgcaaacaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttaccttag 431  Q
    |||||| |||| || ||||||||||||| ||  ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43685827 tttcatccaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaac-atgattatgataaagactaacccccttaccttag 43685896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 399 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 7000551 - 7000478
Alignment:
Q  399 tgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 472  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||| | | ||| ||  |||||||  |||||| ||||||||||||    
T  7000551 tgattatgatgaaaactaacccccttactttagataaggattaacccaaacttaggcttcaatttagctcctaa 7000478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 181
Target Start/End: Original strand, 22742717 - 22742874
Alignment:
Q  27 atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaatc-atgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatat 124  Q
    ||||||||||||| |||||| || ||||||||||| |||| |||| |||||| | | ||| |||||||||||||||||  | |||| | |||||| ||      
T  22742717 atcaacccatttttacaaaaccaacaacaacaacttattt-ctcatcaacaaaccaagatttatgaacacccaagccacgaatcatcaacaacaatattc 22742815  T
Q  125 ct---cagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacat 181  Q
    ||   || ||||||||||||||||| |||| |||||| || |  ||||||||||||||||    
T  22742816 ctcaacaacaacaacaacatcaatt-aaacatgattctcatcataattcaacaacaacat 22742874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 398 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 31194249 - 31194216
Alignment:
Q  398 atgattatgatgaagactaacccccttaccttag 431  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31194249 atgattatgatgaaaactaacccccttaccttag 31194216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 48 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 39447034 - 39446935
Alignment:
Q  48 accaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaatt 146  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||  ||| | ||||||||||| | | || |||||||||||  || |||||||||||||||||||    
T  39447034 accaacaacatctcattt-ctcaacaacaaatcataatc-atgcatacccaagccatgaattattatcaacaacatcacttagcaacaacaacatcaatt 39446937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 398 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 24716794 - 24716762
Alignment:
Q  398 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 430  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24716794 atgattatgataaagactaacccccttacctta 24716762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 366; Significance: 0; HSPs: 62)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 366; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 35 - 491
Target Start/End: Original strand, 371055 - 371511
Alignment:
Q  35 attttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaaca 134  Q
    |||| |||||| ||||||||||| || |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||| ||||||    
T  371055 atttcacaaaaccaccaacaacatcttattt-ctcacaaacaatcatgatatatgaacacccaagccataaatcataaacaacaacatgtctcggcaaca 371153  T
Q  135 acaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcataacaacccattttcatacatta 234  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  371154 acaacatcaatcgaaacttgattctcaccttaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacatta 371253  T
Q  235 tgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaaattagagattgggttcat 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  371254 tgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaatcttatcaccaaaacaagagcacgaaaattagagattgggttcat 371353  T
Q  335 atgaattctcactcaattaagcactttttcatacaaaccaagaaaaattgcaaacaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttaccttaggtt 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  371354 atgaattctcactcaattaagcactttttcatacaaaccaagaaaaattgcaaacaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttaccttaggtt 371453  T
Q  435 atgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaatt-ctccaatcttcaagttt 491  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||    
T  371454 atgatcaattcaaacttgggcttcactttagctcctaattgcttcaatattcaagttt 371511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 398 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 18253792 - 18253685
Alignment:
Q  398 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaattctccaatcttcaag-ttttcccc 496  Q
    |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18253792 atgattataatgataactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaatttgagcttcactttagctcctaattctccaatcttcaagtttttcccc 18253693  T
Q  497 ctttgcta 504  Q
    ||||||||    
T  18253692 ctttgcta 18253685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 398 - 504
Target Start/End: Original strand, 15862226 - 15862332
Alignment:
Q  398 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaattctccaatcttcaagttttccccc 497  Q
    ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15862226 atgattatgataataactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcaacttaactcctaattctccaatcttcaagttttccccc 15862325  T
Q  498 tttgcta 504  Q
    |||||||    
T  15862326 tttgcta 15862332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 35 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 18980310 - 18980132
Alignment:
Q  35 attttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaaca 134  Q
    |||| |||||| ||||| ||||| || |||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18980310 atttcacaaaaccaccaccaacatcttattt-ctcatcaacaattatgatatatgaacacccaagccataaatcataatcaacaacatatctcagcaaca 18980212  T
Q  135 acaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcataac 215  Q
    |||||||||||| | |  ||||| ||| | || |||||  | ||||| ||| |  |||||||||||| |||||||||||||    
T  18980211 acaacatcaatt-acatatgatttacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataac 18980132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 35 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 14251187 - 14251009
Alignment:
Q  35 attttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaaca 134  Q
    |||| |||||| ||||||||||| || |||| |||| ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14251187 atttcacaaaaccaccaacaacatcttattt-ctcatcaacaattatggtatctgaacacccaagccataagtcataatcaacaacatatctcagcaaca 14251089  T
Q  135 acaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcataac 215  Q
    |||||||||||| | |  ||||| ||| | || |||||  | ||||| ||| |  |||||||||||| |||||||||||||    
T  14251088 acaacatcaatt-acatatgatttacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataac 14251009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 35 - 215
Target Start/End: Original strand, 15927535 - 15927713
Alignment:
Q  35 attttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaaca 134  Q
    |||| |||||| ||||||||||| || |||| |||| ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15927535 atttcacaaaaccaccaacaacatcttattt-ctcatcaacaattatggtatgtgaacacccaagccatagatcataatcaacaacatatctcagcaaca 15927633  T
Q  135 acaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcataac 215  Q
    |||||||||||| | |  ||||| ||| | || |||||  | ||||| ||| |  |||||||||||| |||||||||||||    
T  15927634 acaacatcaatt-acatatgatttacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataac 15927713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 397 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 47480977 - 47480878
Alignment:
Q  397 tatgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaattctccaatcttcaagttttcccc 496  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  47480977 tatgattatgatgaagactaacccccttaccttagataatgattaatccaaacttaggcttcactttacctcctaattcttcaatcttcaagtttccccc 47480878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 35 - 215
Target Start/End: Original strand, 13758337 - 13758515
Alignment:
Q  35 attttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaaca 134  Q
    |||| |||||| |||||| |||| || |||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13758337 atttcacaaaaccaccaataacatcttattt-ctcatcaacaattatggtatatgaacacccaagcctcaaatcatactcaacaacatatctcagcaaca 13758435  T
Q  135 acaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcataac 215  Q
    |||||||||||| | |  ||||| ||| | || |||||| | ||||| ||| |  |||||||||||| |||||||||||||    
T  13758436 acaacatcaatt-acatatgatttacatctcatttcaaccaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataac 13758515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 7284375 - 7284229
Alignment:
Q  1 catcatcaaaatcaaacttcttctttatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagc 100  Q
    |||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||| | || |||||    
T  7284375 catcgtcaaaatcaaacttctccattatcaacccatttaacaaaaccaccaacaacaactca-tttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaactcaagc 7284277  T
Q  101 cataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattga 148  Q
    ||| | | || |||||||||||  |  | |||||||||||||||||||    
T  7284276 catgaattattatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattga 7284229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 163 - 315
Target Start/End: Original strand, 13352044 - 13352196
Alignment:
Q  163 cccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaatt 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |  || ||||||||  |||||| |||||||||  |||||| || |||||| |    
T  13352044 cccaattcaacaacaacatgtcataattcatcaattgagcataattaaaatactacccatttatatacatcatgaacatgcaatttcaccatcaacaaat 13352143  T
Q  263 catttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaa 315  Q
    ||  ||||||  |||||||||||| |||| |||||| | |||| |||||||||    
T  13352144 caaatatcatcaaattaacatactgaaacatatcactacaacatgagcacgaa 13352196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 14272202 - 14272054
Alignment:
Q  1 catcatcaaaatcaaacttcttctttatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaac-aatcatgatatatgaacacccaag 99  Q
    |||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| || | ||||||||  ||||||||| ||||    
T  14272202 catcattaaaataaaacttcttcatcatcaacccattttacaaaaccaccaccaacaactca-tttctcatcatctaatcatgaattatgaacactcaag 14272104  T
Q  100 ccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaa 149  Q
    |||| | |||| | |||||| ||   | ||||||||||||||||||||||    
T  14272103 ccatgaatcatcaacaacaatatcatttagcaacaacaacatcaattgaa 14272054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 35 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 17224220 - 17224058
Alignment:
Q  35 attttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaac 133  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||  |||||| ||||||||||| | |||| || ||||||||  || ||||||    
T  17224220 attttacaaaaccaccaacaacaactcattt-ctcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcattaacaacatcacttagcaac 17224122  T
Q  134 aacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatt 198  Q
    |||||||||||||||| | ||| ||  ||  |||||||||||||||||  ||||| ||| |||||    
T  17224121 aacaacatcaattgaa-catgactcttacaacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 17224058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 169 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 39291666 - 39291520
Alignment:
Q  169 tcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcattta 268  Q
    |||||||||| |||||| || ||| ||||| |||||||||    ||| ||||||||  |||||| || ||||||  ||||||||| |||||||||| |||    
T  39291666 tcaacaacaatatgtcacaattcaccaattgagcataattcacaaactacccatttatatacatcatcaacatgcaatttcatcatcaacaattcaatta 39291567  T
Q  269 tcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaa 315  Q
    ||||  ||||||||||||||||| |||||| | |||| |||||||||    
T  39291566 tcatcaaattaacatactcaaacatatcactacaacatgagcacgaa 39291520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 28 - 181
Target Start/End: Original strand, 48356602 - 48356754
Alignment:
Q  28 tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatct 126  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||| || |||| || ||| ||||||| |||||||||||||||||| | |||| | |||||| ||  ||    
T  48356602 tcaacccattttacaaaaccaacaacaacaactcaatt-ctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcact 48356700  T
Q  127 cagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacat 181  Q
     |||||||||||||||||||||| | ||| || || |  ||||||||||||||||    
T  48356701 tagcaacaacaacatcaattgaa-catgaatctcatcataattcaacaacaacat 48356754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 27 - 198
Target Start/End: Original strand, 13377485 - 13377656
Alignment:
Q  27 atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatat 124  Q
    ||||||||||||| || ||| || ||||||||||| |||| |||| || ||| ||||||| |||||||||||||||||| | |||| |||||||||||      
T  13377485 atcaacccattttcaccaaaccaacaacaacaacttattt-ctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcatcaacaacatta 13377583  T
Q  125 ctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatt 198  Q
    || |||||||||||||||||||||| | ||| ||  | | |||||||||||||||||  ||||| | |||||||    
T  13377584 cttagcaacaacaacatcaattgaa-catgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattaatcaatt 13377656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 398 - 472
Target Start/End: Original strand, 13321334 - 13321408
Alignment:
Q  398 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 472  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||| |  |||||||||||||||||||    
T  13321334 atgattatgatgaagactaacccccttaccttagataatgattaatccaaacctaggcttcactttagctcctaa 13321408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 28 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 16915217 - 16915096
Alignment:
Q  28 tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatct 126  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||| || |||  || ||| ||||||| |||||||||||||||||| | |||| | |||||| ||  ||    
T  16915217 tcaacccattttacaaaaccaacaacaacaactcaatt-ctcttcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatgact 16915119  T
Q  127 cagcaacaacaacatcaattgaa 149  Q
     ||||||||||||||||||||||    
T  16915118 tagcaacaacaacatcaattgaa 16915096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 398 - 472
Target Start/End: Original strand, 25124450 - 25124524
Alignment:
Q  398 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 472  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||  ||||||  |||||||||||||||||||    
T  25124450 atgattatgatgaagactaacccccttaccttagataatgattaatctaaacttaggcttcactttagctcctaa 25124524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 184 - 296
Target Start/End: Original strand, 126528 - 126640
Alignment:
Q  184 cataagtcatcaattaagcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacat 283  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| |||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||    
T  126528 cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacat 126627  T
Q  284 actcaaacttatc 296  Q
    | |||||| ||||    
T  126628 attcaaacatatc 126640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 34241477 - 34241325
Alignment:
Q  28 tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaac-aatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatct 126  Q
    ||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| ||| || | ||||||||| ||||||||| |||||||| | |||| | ||||||  |  ||    
T  34241477 tcaaccctttttacaaaaccaacaacaacaactcatttt-tcatcatcaaatcatgatttatgaacactcaagccatgaatcatcaacaacaatgtcact 34241379  T
Q  127 cagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacat 181  Q
     | ||||||||||||||||| |||| |||||| || |  ||||||||||||||||    
T  34241378 tatcaacaacaacatcaatt-aaacatgattctcatcataattcaacaacaacat 34241325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 399 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 10000318 - 10000225
Alignment:
Q  399 tgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaatt-ctccaatcttcaagttt 491  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||| | |||   |||||  ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  10000318 tgattatgatgaagacaaacccccttaccttagatgatgtttaatcttaacttaggcttcactttagctcctaattgcttcaatcttcaagttt 10000225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 76 - 181
Target Start/End: Original strand, 15358803 - 15358907
Alignment:
Q  76 aatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaa 175  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| | |||| | |||||| |  ||| | ||||||||||||||||| |||| |||||| || | |||||||||||    
T  15358803 aatcttgatatatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaaaacttcttaacaacaacaacatcaatt-aaacatgattcccatcacaattcaacaa 15358901  T
Q  176 caacat 181  Q
    ||||||    
T  15358902 caacat 15358907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 184 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 111411 - 111299
Alignment:
Q  184 cataagtcatcaattaagcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacat 283  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| |||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||| ||||||||| |||  |||||||||    
T  111411 cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaaccattcatttaacatcaaattaacat 111312  T
Q  284 actcaaacttatc 296  Q
    | |||||| ||||    
T  111311 attcaaacatatc 111299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 184 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 32494188 - 32494076
Alignment:
Q  184 cataagtcatcaattaagcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacat 283  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| |||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||| ||||| |||  |||||||||    
T  32494188 cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaatttatttaacatcaaattaacat 32494089  T
Q  284 actcaaacttatc 296  Q
    | |||||| ||||    
T  32494088 attcaaacatatc 32494076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 184 - 291
Target Start/End: Original strand, 2029034 - 2029141
Alignment:
Q  184 cataagtcatcaattaagcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacat 283  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| |||||||||| ||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||    
T  2029034 cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcgtacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacat 2029133  T
Q  284 actcaaac 291  Q
    | ||||||    
T  2029134 attcaaac 2029141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 398 - 472
Target Start/End: Original strand, 2029244 - 2029318
Alignment:
Q  398 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 472  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||| ||||| |||||  |||||| ||||||||||||    
T  2029244 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaattccaacttaggcttcaatttagctcctaa 2029318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 27 - 181
Target Start/End: Original strand, 4446168 - 4446322
Alignment:
Q  27 atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattca-taatcaacaacata 123  Q
    ||||||||||||| |||||| || ||||||||||||| |||| || || ||| ||||||| |||||||||||||||||| | ||| | | || || |||     
T  4446168 atcaacccatttttacaaaaccaacaacaacaactca-tttcacatcatcaattcatgatttatgaacacccaagccatgaatcattcaacatcagcatc 4446266  T
Q  124 tctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacat 181  Q
    ||| | |||||||||||||||||  ||| |||||| || | |||||||||||||||||    
T  4446267 tcttatcaacaacaacatcaatt--aacatgattctcatcacaattcaacaacaacat 4446322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 398 - 472
Target Start/End: Original strand, 36052971 - 36053045
Alignment:
Q  398 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 472  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||| ||| | |||||  |||||||||||||||||||    
T  36052971 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagctcctaa 36053045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 398 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 42056220 - 42056146
Alignment:
Q  398 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 472  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||| ||| | |||||  |||||||||||||||||||    
T  42056220 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagctcctaa 42056146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 76 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 20583795 - 20583691
Alignment:
Q  76 aatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaa 175  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| | |||| | |||||| ||  || | ||||||||||||||||| |||| |||||| || |  ||||||||||    
T  20583795 aatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcccttaacaacaacaacatcaatt-aaacatgattctcatcataattcaacaa 20583697  T
Q  176 caacat 181  Q
    ||||||    
T  20583696 caacat 20583691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 399 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 48622614 - 48622521
Alignment:
Q  399 tgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaatt-ctccaatcttcaagttt 491  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||| | ||| | |||   |||||  ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  48622614 tgattatgatgaaaacaaacccccttaccttagatgatgtttaatcttaacttaggcttcactttagctcctaattgcttcaatcttcaagttt 48622521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 247 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 17984827 - 17984759
Alignment:
Q  247 ttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaa 315  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||   ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  17984827 ttcatcatcaacaattcaattatcaacaaattaacatacccaaacatatcactaaaacaagagcacgaa 17984759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 165 - 296
Target Start/End: Original strand, 3049677 - 3049807
Alignment:
Q  165 caattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattca 264  Q
    ||||||| |||||||||  ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| |||||| ||||||||| |||||| ||  ||||||||| |  |||||||    
T  3049677 caattcatcaacaacatagcataattcaccaattgagcataatttacaaactacccatattcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcc-caattca 3049775  T
Q  265 tttatcattcaattaacatactcaaacttatc 296  Q
    |||| |||  |||||||||| |||||| ||||    
T  3049776 tttaacatcaaattaacatattcaaacatatc 3049807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 165 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 15978002 - 15977856
Alignment:
Q  165 caattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcat-aacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattc 263  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| || || |||||| ||| ||  | |||| |  |||||  |||||||||  ||||||||| ||| |||||    
T  15978002 caattcaacaacaacatgtcataattcatcatttgagtataatt-catcaagtatccatatatatacaccatgaacatgcaatttcatcatcaataattc 15977904  T
Q  264 atttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagca 311  Q
    | ||||||   ||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||    
T  15977903 aattatcaacaaattaacatactcaaacatatcactacaactagagca 15977856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 78 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 17947831 - 17947729
Alignment:
Q  78 tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaaca 177  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || | |||| | |||||| || ||| | ||||||||||||||||| |||| |||||| || | ||| |||||||||    
T  17947831 tcatgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaatt-aaacatgattctcatcacaaatcaacaaca 17947733  T
Q  178 acat 181  Q
    ||||    
T  17947732 acat 17947729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 361 - 431
Target Start/End: Original strand, 7293297 - 7293366
Alignment:
Q  361 tttcatacaaaccaagaaaaattgcaaacaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttaccttag 431  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||| ||  ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7293297 tttcatacaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaac-atgattatgataaagactaacccccttaccttag 7293366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 234 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 8563431 - 8563353
Alignment:
Q  234 atgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcac 312  Q
    |||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||  |||| | |||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  8563431 atgaacatgcaatttcatcaacaacaattcaattatcatcaaattcatatactcaaacatatcatcataacaagagcac 8563353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 398 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 11580693 - 11580619
Alignment:
Q  398 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 472  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| ||| ||| | |||||  |||||| ||||||||||||    
T  11580693 atgattatgataaagactaatccccttaccttagattaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaa 11580619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 398 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 13036970 - 13036896
Alignment:
Q  398 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 472  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | ||| ||| | |||||  |||||| ||||||||||||    
T  13036970 atgattatggtgaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaa 13036896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 398 - 472
Target Start/End: Original strand, 15709469 - 15709543
Alignment:
Q  398 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 472  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||| ||    |||||  |||||||||||||||||||    
T  15709469 atgattatgatgaagactaatcctcttaccttagattatgattaacctcaacttaggcttcactttagctcctaa 15709543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 398 - 472
Target Start/End: Original strand, 16212071 - 16212145
Alignment:
Q  398 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 472  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||| ||| | |||||  |||||| ||||||||||||    
T  16212071 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaa 16212145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 399 - 496
Target Start/End: Original strand, 16418805 - 16418903
Alignment:
Q  399 tgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaatt-ctccaatcttcaagttttcccc 496  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||| | ||| | |||   ||||  ||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| ||||    
T  16418805 tgattatgatgaaaacaaacccccttaccttagatgatgtttaatcttaactaaagcttcactttagctcctaattgtttcaatcttcaagtttccccc 16418903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 361 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 30262111 - 30262042
Alignment:
Q  361 tttcatacaaaccaagaaaaattgcaaacaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttaccttag 431  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||| ||  ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30262111 tttcatacaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaac-atgattatgataaagactaacccccttaccttag 30262042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 181
Target Start/End: Original strand, 31501190 - 31501283
Alignment:
Q  87 atgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacat 181  Q
    ||||||||||||||||| | |||| | |||||| || ||  | ||||||||||||||||| |||| |||||| || | |||||||||||||||||    
T  31501190 atgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatctcataacaacaacaacatcaatt-aaacatgattctcatcacaattcaacaacaacat 31501283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 184 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 42056431 - 42056281
Alignment:
Q  184 cataagtcatcaattaagcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacat 283  Q
    ||||| ||| ||||| |||||||||    ||| |||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||| ||||||||| |||  |||||||||    
T  42056431 cataattcaccaattgagcataattcacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaaccattcatttaacatcaaattaacat 42056332  T
Q  284 actcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaaattagagattgggttcat 334  Q
    |  ||||| |||| | | ||||  ||||||||  | | |||||||||||||    
T  42056331 atccaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcat 42056281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 130 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 10000564 - 10000484
Alignment:
Q  130 caacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttca 211  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||| ||||| | ||| || |||||||||||||| |||||||    
T  10000564 caacagcaacatccattgaaacttgtttctcacctcaattcaac-acaacttatcacaaatcatcaattaagcaaaatttca 10000484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 184 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 2190328 - 2190228
Alignment:
Q  184 cataagtcatcaattaagcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacat 283  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| | |||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||| ||||||||| |||  |||||||||    
T  2190328 cataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaaccattcatttaacatcaaattaacat 2190229  T
Q  284 a 284  Q
    |    
T  2190228 a 2190228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 50 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 13449094 - 13448964
Alignment:
Q  50 caacaacaactcattttctcaacaacaat-catgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattga 148  Q
    |||||||||||||||| |||| || |||| |||||| ||| ||||||||||| |  | |||| | |||||| || ||| | ||||||||||||||||| |    
T  13449094 caacaacaactcattt-ctcatcatcaattcatgatttatcaacacccaagctacgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaatt-a 13448997  T
Q  149 aacttgattcacaccccaattcaacaacaacat 181  Q
    ||| |||||| || | ||||||||||| |||||    
T  13448996 aacatgattctcatcacaattcaacaataacat 13448964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 50 - 181
Target Start/End: Original strand, 28390292 - 28390422
Alignment:
Q  50 caacaacaactcattttctcaacaacaat-catgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattga 148  Q
    |||||||||||||||| |||| || |||| |||||| ||||||||||||| | || | |||| | |||||| || ||| | ||||||||||||||||| |    
T  28390292 caacaacaactcattt-ctcatcatcaattcatgatttatgaacacccaaactatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaatt-a 28390389  T
Q  149 aacttgattcacaccccaattcaacaacaacat 181  Q
    ||| |||||  || | ||||||||||| |||||    
T  28390390 aacatgattatcatcacaattcaacaataacat 28390422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 181
Target Start/End: Original strand, 38424175 - 38424329
Alignment:
Q  27 atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatat 124  Q
    ||||||||||||| |||||| |  ||||||||||| ||||| ||| || ||| ||||||| |||||||||||||| ||| | |||| | |||||| || |    
T  38424175 atcaacccatttttacaaaacccacaacaacaacttatttt-tcaccatcaaatcatgatttatgaacacccaagtcatgaatcatcaacaacaatatct 38424273  T
Q  125 ctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacat 181  Q
    || | |||||||||||||| || |||| | |||| || |  ||||||||||||||||    
T  38424274 cttaacaacaacaacatcactt-aaacataattctcatcataattcaacaacaacat 38424329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 398 - 468
Target Start/End: Original strand, 36024452 - 36024523
Alignment:
Q  398 atgattatgatgaagactaa-cccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctc 468  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||    |||||  |||||||||||||||    
T  36024452 atgattatgatgaagactaaccccccttaccttagattatgattaacctcaacttaggcttcactttagctc 36024523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 76 - 178
Target Start/End: Original strand, 4484733 - 4484834
Alignment:
Q  76 aatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaa 175  Q
    |||||||||  ||||| |||||||| || | |||| | |||||| || ||| | ||||||||||||||||| |||| |||||| || | |||||||||||    
T  4484733 aatcatgattcatgaatacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaatt-aaacatgattctcatcacaattcaacaa 4484831  T
Q  176 caa 178  Q
    |||    
T  4484832 caa 4484834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 47 - 144
Target Start/End: Original strand, 11287394 - 11287491
Alignment:
Q  47 caccaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaa 144  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||   ||| | ||||||||||| | | || |||||||||||  || |||||||||||||||||    
T  11287394 caccaacaacatctcattt-ctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaacaacatcaa 11287491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 361 - 431
Target Start/End: Original strand, 11516508 - 11516577
Alignment:
Q  361 tttcatacaaaccaagaaaaattgcaaacaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttaccttag 431  Q
    |||||| |||| || ||||||||||||| ||  ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11516508 tttcatccaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaac-atgattatgataaagactaacccccttaccttag 11516577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 361 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 14113971 - 14113902
Alignment:
Q  361 tttcatacaaaccaagaaaaattgcaaacaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttaccttag 431  Q
    |||||| |||| || ||||||||||||| ||  ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14113971 tttcatccaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaac-atgattatgataaagactaacccccttaccttag 14113902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 361 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 14423621 - 14423553
Alignment:
Q  361 tttcatacaaaccaagaaaaattgcaaacaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttaccttag 431  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||| ||  ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14423621 tttcatacaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaac-atgattatgat-aagactaacccccttaccttag 14423553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 27 - 103
Target Start/End: Original strand, 14935319 - 14935396
Alignment:
Q  27 atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccat 103  Q
    ||||||||||||| |||||| || ||||||||||| |||| |||| |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||    
T  14935319 atcaacccatttttacaaaaccaacaacaacaactgattt-ctcatcaacaaatcatgatttatgaacacccaaaccat 14935396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 27 - 103
Target Start/End: Original strand, 15362912 - 15362989
Alignment:
Q  27 atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccat 103  Q
    ||||||||||||| |||||| || ||||||||||| |||| |||| |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||    
T  15362912 atcaacccatttttacaaaaccaacaacaacaactgattt-ctcatcaacaaatcatgatttatgaacacccaaaccat 15362989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 361 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 15441546 - 15441477
Alignment:
Q  361 tttcatacaaaccaagaaaaattgcaaacaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttaccttag 431  Q
    |||||| |||| || ||||||||||||| ||  ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15441546 tttcatccaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaac-atgattatgataaagactaacccccttaccttag 15441477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 48 - 148
Target Start/End: Original strand, 13274765 - 13274865
Alignment:
Q  48 accaacaacaactcattttctcaacaacaat-catgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaatt 146  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||  |||||   ||| | ||| ||||||| | |||| |||||||||||  || |||||||||||||||||||    
T  13274765 accaacaacatctcattt-ctcaacaacaaaacatgaatcatgcataccaaagccatgaatcatcatcaacaacatcacttagcaacaacaacatcaatt 13274863  T
Q  147 ga 148  Q
    ||    
T  13274864 ga 13274865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 130 - 211
Target Start/End: Original strand, 16418559 - 16418639
Alignment:
Q  130 caacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttca 211  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||| ||||| | ||| || |||| ||||| ||| |||||||    
T  16418559 caacaacaacatccattgaaacttgtttctcacctcaattcaac-acaacttatcacaaatcattaattaggcaaaatttca 16418639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 398 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 111201 - 111169
Alignment:
Q  398 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 430  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  111201 atgattatgatgaaaactaacccccttacctta 111169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 327; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 90 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 61461 - 61048
Alignment:
Q  90 aacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataag 189  Q
    ||||| |||||||| | |||| | |||||| || ||| | | ||||||||||||||| |||| |||||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  61461 aacacacaagccatgaatcatcaacaacaatatctcttaaccacaacaacatcaatt-aaacatgattctcatcacaattcaacaacaacatgtcataag 61363  T
Q  190 tcatcaattaagcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaa 289  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  61362 tcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaa 61263  T
Q  290 acttatcaccaaaacaagagcacgaaaattagagattgggttcatatgaattctcactcaattaagcactttttcatacaaaccaagaaaaattgcaaac 389  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  61262 acttatcaccaaaacaagagcacgaaaattaaagattgggttcatacaaattctcactcaattaagcactttttcatacaaaccaagaaaaattgcaaac 61163  T
Q  390 aaacaattatgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaattctccaatcttcaagt 489  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  61162 aaacaattatgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttaactttagctcataattctccaatcttcaagt 61063  T
Q  490 tttccccctttgcta 504  Q
    |||||||||||||||    
T  61062 tttccccctttgcta 61048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 398 - 472
Target Start/End: Original strand, 48903 - 48977
Alignment:
Q  398 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 472  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||  |||| ||||||||||||||    
T  48903 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggctttactttagctcctaa 48977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0173 (Bit Score: 314; Significance: 1e-177; HSPs: 1)
Name: scaffold0173
Description:

Target: scaffold0173; HSP #1
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 72 - 496
Target Start/End: Original strand, 5224 - 5647
Alignment:
Q  72 caacaatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattca 171  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| |||||||    
T  5224 caacaatcatgatatatgaacacccaagccataat-cataaacaacaacatgtctcagcaacaacaacatcaattaaatcttgattctcacctcaattca 5322  T
Q  172 acaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatca 271  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5323 acaacaacatgtcacaattcatcaattaagcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatca 5422  T
Q  272 ttcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaaattagagattgggttcatatgaattctcactcaattaagcactttttcatacaaa 371  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5423 atcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaaagattgggttcatataaattcttactcaattaagcactttttcatacaaa 5522  T
Q  372 ccaagaaaaattgcaaac-aaacaattatgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcct 470  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| |||||| ||||||||||    
T  5523 ccaag-aaaattgcaaacaaaacaatcatgattatgatgaagactaacccccttaccttaggtaatgattaatccaaacttgggcttcattttagctcct 5621  T
Q  471 aattctccaatcttcaagttttcccc 496  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||    
T  5622 aattcttcaatcttcaagtttccccc 5647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 304; Significance: 1e-171; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 31 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 5875 - 5411
Alignment:
Q  31 acccattt-tacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcag 129  Q
    |||||||| |||||||  |||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||    
T  5875 acccatttatacaaaacaaccaacaacatctcattt-ctcaccaacaatcatgacatatgaacacccaagtcataaatcataaacaacaacatttctcag 5777  T
Q  130 caacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcataacaacccattttcata 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5776 caacaacaacatcaattgaaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcataattcattaattaagcataatttcaaaacaacccattttcata 5677  T
Q  230 cattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaaattagagattggg 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| |     
T  5676 cattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaaagattaga 5577  T
Q  330 ttcatatgaattctcactcaattaagcactttttcatacaaaccaagaaaaattgcaaac-aaacaattatgattatgatgaagactaacccccttacct 428  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5576 ttcatataaattcttactcaattaagcactttttcttacaaactaag-aaaattgcaaacaaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttacct 5478  T
Q  429 taggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaattctccaatcttcaagttttcccc 496  Q
    ||||| ||||| ||| ||| |||  ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  5477 taggtaatgattaatccaatcttaggcttcactttagctcctaa-tcttcaatcttcaagtttccccc 5411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 292; Significance: 1e-164; HSPs: 35)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 35 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 21650329 - 21649967
Alignment:
Q  35 attttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaaca 134  Q
    |||| |||||| ||||||||||| || |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  21650329 atttcacaaaaccaccaacaacatcttattt-ctcacaaacaatcatgatatatgaacacccaagccataaatcataaacaacaacatgtctcaacaaca 21650231  T
Q  135 acaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcataacaacccattttcatacatta 234  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21650230 acaacatcaattgaaacttgattctcaccttaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacatta 21650131  T
Q  235 tgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaaattagagattgggttcat 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21650130 tgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaatcttatcaccaaaacaagagcacgaaaattagagattgagttcat 21650031  T
Q  335 atgaattctcactcaattaagcactttttcatacaaaccaagaaaaattgcaaacaaacaatta 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21650030 atgaattctcactcaattaagcactttttcatacaaaccaagaaaaattgcaaacaaacaatta 21649967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 93 - 313
Target Start/End: Original strand, 20254336 - 20254556
Alignment:
Q  93 acccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtca 192  Q
    ||||||| |||||||||    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| || |||    
T  20254336 acccaagtcataattcacccacaacaacatgtctcagcaacaacaacatcaattaaaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcacaattca 20254435  T
Q  193 tcaattaagcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaact 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20254436 tcaattaagcataatttcataacaactcattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaact 20254535  T
Q  293 tatcaccaaaacaagagcacg 313  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  20254536 tatcaccaaaacaagagcacg 20254556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 361 - 504
Target Start/End: Original strand, 20254595 - 20254736
Alignment:
Q  361 tttcatacaaaccaagaaaaattgcaaacaaa-caattatgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttca 459  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20254595 tttcatacaa--caaggaaaattgcaaacaaaacaatcatgattatgaagaacactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttca 20254692  T
Q  460 ctttagctcctaattctccaatcttcaagttttccccctttgcta 504  Q
    ||||||||| ||||||  ||||||||||| |||||||||||||||    
T  20254693 ctttagctcataattcctcaatcttcaag-tttccccctttgcta 20254736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 35 - 146
Target Start/End: Original strand, 17148534 - 17148644
Alignment:
Q  35 attttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaaca 134  Q
    |||| |||||| ||||| ||||| || |||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17148534 atttcacaaaaccaccaccaacatcttattt-ctcatcaacaattatgatatatgaacacccaagccataaatcataatcaacaacatatctcagcaaca 17148632  T
Q  135 acaacatcaatt 146  Q
    ||||||||||||    
T  17148633 acaacatcaatt 17148644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 35 - 198
Target Start/End: Original strand, 20177140 - 20177302
Alignment:
Q  35 attttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaac 133  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||| |||  |||||| ||||||  |||||| | ||||||||| | |||| |||||||||||  || ||||||    
T  20177140 atttcacaaaaccaccaacaacaactcattt-ctcttcaacaaatcatgaattatgaatatccaagccatgaatcatcatcaacaacatcacttagcaac 20177238  T
Q  134 aacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatt 198  Q
    |||||||||||||| ||||||| |   ||| |||||||||||||||||  ||||| ||| |||||    
T  20177239 aacaacatcaattg-aacttgacttttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 20177302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 184 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 15861568 - 15861418
Alignment:
Q  184 cataagtcatcaattaagcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacat 283  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| |||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||    
T  15861568 cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacat 15861469  T
Q  284 actcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaaattagagattgggttcat 334  Q
    | |||||| |||| | | ||||  ||||||||  | | |||||||||||||    
T  15861468 attcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcat 15861418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 36 - 179
Target Start/End: Original strand, 21194980 - 21195122
Alignment:
Q  36 ttttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaaca 134  Q
    ||||| |||| || |||||||||||||||| |||| || ||| ||||||| |||||||||||||||||| | |||| | |||||| || ||| | |||||    
T  21194980 ttttataaaaccaacaacaacaactcattt-ctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaaca 21195078  T
Q  135 acaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaac 179  Q
    ||||||| |||| |||| |||||| || | |||||||||||||||    
T  21195079 acaacattaatt-aaacatgattctcatcacaattcaacaacaac 21195122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 28 - 103
Target Start/End: Original strand, 27674755 - 27674829
Alignment:
Q  28 tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagccat 103  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||  |||| |||||||||||||    
T  27674755 tcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactca-tttctcatcaaaaatcatgaattatgcacacccaagccat 27674829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 398 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 20893583 - 20893509
Alignment:
Q  398 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 472  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| | |||||  |||||| ||||||||||||    
T  20893583 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggtaaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaa 20893509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 76 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 36356534 - 36356461
Alignment:
Q  76 aatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaa 149  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  || || |||||||||||||||||||    
T  36356534 aatcatgaattatgaacacccaagccataaatcatcatcaacaacatcacttagaaacaacaacatcaattgaa 36356461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 194 - 334
Target Start/End: Original strand, 22367141 - 22367281
Alignment:
Q  194 caattaagcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaactt 293  Q
    ||||| ||||||||||   ||| || ||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||| |||||| |    
T  22367141 caattgagcataatttacaaactactcattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacat 22367240  T
Q  294 atcaccaaaacaagagcacgaaaattagagattgggttcat 334  Q
    ||| | | ||||  ||||||||  | | |||||||||||||    
T  22367241 atctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcat 22367281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 22829712 - 22829638
Alignment:
Q  29 caacccattttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaac-aatcatgatatatgaacacccaagccat 103  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||  |||| |||||||||||||    
T  22829712 caacccattttacaaagtcaccaacaacaactca-tttctcatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagccat 22829638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 38033962 - 38033888
Alignment:
Q  28 tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagccat 103  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| |||||||| |||  |||| |||||||||||||    
T  38033962 tcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactta-tttctcatcaacaatcgtgaactatgcacacccaagccat 38033888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 41229221 - 41229107
Alignment:
Q  35 attttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaac 133  Q
    ||||||| |||  |||||||||||||||||| |||| | |||| ||||||  ||||||||| |||||||| | |||| | |||||||||  || ||||||    
T  41229221 attttaccaaactaccaacaacaactcattt-ctcatccacaaatcatgaattatgaacactcaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcaac 41229123  T
Q  134 aacaacatcaattgaa 149  Q
    ||||||||||||||||    
T  41229122 aacaacatcaattgaa 41229107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 27 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 40436560 - 40436272
Alignment:
Q  27 atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatat 124  Q
    ||||||||||||| |||||| || ||||||||||| |||| | || ||  || ||||||| | ||||||||||||| || | |||| | |||||| || |    
T  40436560 atcaacccattttcacaaaaccaacaacaacaacttattt-cacatcataaactcatgatttgtgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatct 40436462  T
Q  125 ctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatta-agcataatttcataacaacccatt 223  Q
    || |  |||||||||||||||| |||| | |||| || | ||| |||||||||||||  || || ||| |||||| |||| |||| || || |   ||||    
T  40436461 cttaaaaacaacaacatcaatt-aaacataattctcatcacaaatcaacaacaacatagcacaattcaacaattagagcacaatt-cacaatatatcatt 40436364  T
Q  224 ttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaa 315  Q
    |||| | ||||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||||   | || | ||| |||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  40436363 ttcacatattatgaacatgcaatttcatcaacaacaattcaattatcaccaatttcatatattcaaacatatcatcataacaagagcacgaa 40436272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 200 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 44035097 - 44035006
Alignment:
Q  200 agcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaac 291  Q
    ||||||||||   ||| |||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||| | |||  |||||||||| ||||||    
T  44035097 agcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcattaaacatcaaattaacatattcaaac 44035006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 13377122 - 13377009
Alignment:
Q  35 attttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaac 133  Q
    |||| |||||| | |||||||||| |||||| |||| |||||| ||||||  |||||| || |||||||| | |||  |||||||||||  || ||||||    
T  13377122 atttcacaaaaccgccaacaacaattcattt-ctcatcaacaaatcatgaattatgaatactcaagccatgaatcaacatcaacaacatcacttagcaac 13377024  T
Q  134 aacaacatcaattga 148  Q
    |||||||||||||||    
T  13377023 aacaacatcaattga 13377009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 181
Target Start/End: Original strand, 17608886 - 17609038
Alignment:
Q  28 tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatct 126  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||||||||||| || ||||  | ||| ||||||| |||||||||||||||||| | |||| | |||||| ||  ||    
T  17608886 tcaacccattttccaaaaccaacaacaacaactcaatt-ctcataatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcact 17608984  T
Q  127 cagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacat 181  Q
     | ||||||||||| |||||||| | ||| || || |  ||||||||||||||||    
T  17608985 taacaacaacaacaacaattgaa-catgaatctcatcataattcaacaacaacat 17609038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 398 - 472
Target Start/End: Original strand, 20913335 - 20913409
Alignment:
Q  398 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 472  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||| | | ||| ||| | |||||  |||||||||||||||||||    
T  20913335 atgattacgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagctcctaa 20913409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 37234149 - 37234028
Alignment:
Q  28 tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatct 126  Q
    |||||||||||||||||| || | |||| |||||| ||| ||| || ||| ||||||| |||| ||||||||| ||| | |||| | |||||| ||  ||    
T  37234149 tcaacccattttacaaaaccaaccacaaaaactcaattt-tcatcatcaaatcatgatttatggacacccaagtcatgaatcatcaacaacaatatcact 37234051  T
Q  127 cagcaacaacaacatcaattgaa 149  Q
     ||||||||||||||||||||||    
T  37234050 tagcaacaacaacatcaattgaa 37234028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 76 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 8538151 - 8538047
Alignment:
Q  76 aatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaa 175  Q
    |||||| || |||||||||||||||||| | |||| | |||||| ||  || | ||||||||||||||||| |||| |||||| || |  ||||||||||    
T  8538151 aatcattatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatattccttaacaacaacaacatcaatt-aaacatgattctcatcataattcaacaa 8538053  T
Q  176 caacat 181  Q
    ||||||    
T  8538052 caacat 8538047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 76 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 8603390 - 8603286
Alignment:
Q  76 aatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaa 175  Q
    |||||| || |||||||||||||||||| | |||| | |||||| ||  || | ||||||||||||||||| |||| |||||| || |  ||||||||||    
T  8603390 aatcattatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatattccttaacaacaacaacatcaatt-aaacatgattctcatcataattcaacaa 8603292  T
Q  176 caacat 181  Q
    ||||||    
T  8603291 caacat 8603286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 28 - 65
Target Start/End: Original strand, 19603055 - 19603092
Alignment:
Q  28 tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcattt 65  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19603055 tcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcattt 19603092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 184 - 296
Target Start/End: Original strand, 21860124 - 21860236
Alignment:
Q  184 cataagtcatcaattaagcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacat 283  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| || ||||||||| ||| |||||| ||  |||||||||  ||||||||||||| |||  |||||||||    
T  21860124 cataattcaccaattgagcataatttacaaactactcattttcattcatcatgaacttgcaatttcatcattaacaattcatttaacatcaaattaacat 21860223  T
Q  284 actcaaacttatc 296  Q
    | |||||| ||||    
T  21860224 attcaaacatatc 21860236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 50 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 49997548 - 49997418
Alignment:
Q  50 caacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctca-gcaacaacaacatcaattga 148  Q
    ||||||||||| |||| |||| |||||| |||||| |||||||||| || |||| | | || | |||||| || ||| | ||||||||||||||| || |    
T  49997548 caacaacaacttattt-ctcatcaacaaccatgatttatgaacaccaaatccatgaatgatcaacaacaatatctcttaagcaacaacaacatcagtt-a 49997451  T
Q  149 aacttgattcacaccccaattcaacaacaacat 181  Q
    ||| |||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  49997450 aacatgattctcaccttaattcaacaacaacat 49997418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 217 - 315
Target Start/End: Original strand, 20194171 - 20194270
Alignment:
Q  217 acccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactc-aaacttatcaccaaaacaagagcacgaa 315  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||||   |||| | |||||| |||| ||||| || ||||||||||||||    
T  20194171 acccattatcacatattatgaacatgcaatttcatcaacaacaattcaattatcaccaaattcatatactcaaaacatatcatcataacaagagcacgaa 20194270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 181
Target Start/End: Original strand, 52400675 - 52400741
Alignment:
Q  114 caacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacat 181  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||| |||||| || |  ||||||||||||||||    
T  52400675 caacaacatctctcagcaacaacaacgtcaatt-aaacatgattctcatcataattcaacaacaacat 52400741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 398 - 472
Target Start/End: Original strand, 20931650 - 20931724
Alignment:
Q  398 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 472  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| | | ||| ||| | |||||  |||||||||||||| ||||    
T  20931650 atgattatgataaaggctaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagctgctaa 20931724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 398 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 37844406 - 37844332
Alignment:
Q  398 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 472  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |  || ||| | |||||  |||||| ||||||||||||    
T  37844406 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaaaattaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaa 37844332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 361 - 431
Target Start/End: Original strand, 51452773 - 51452842
Alignment:
Q  361 tttcatacaaaccaagaaaaattgcaaacaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttaccttag 431  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||| ||  ||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  51452773 tttcatacaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaac-atgattaagataaagactaacccccttaccttag 51452842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 130 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 7641128 - 7641048
Alignment:
Q  130 caacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttca 211  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||| ||||| | ||| || |||| ||||| ||| |||||||    
T  7641128 caacaacaacatccattgaaacttgtttctcacctcaattcaac-acaacttatcacaaatcattaattaggcaaaatttca 7641048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 51627945 - 51627833
Alignment:
Q  36 ttttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaaca 134  Q
    |||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||   ||| | ||||||||||| | | || ||||||| |||  || |||||||    
T  51627945 ttttaccaaaccaccaacaacatctcattt-ctcaacagcaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatcaacatcatcacttagcaaca 51627847  T
Q  135 acaacatcaattga 148  Q
    ||||||||||||||    
T  51627846 acaacatcaattga 51627833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 231 - 315
Target Start/End: Original strand, 25094019 - 25094103
Alignment:
Q  231 attatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaa 315  Q
    |||||| |||||  ||||||||| |||||||||| ||||||   |||| |  ||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  25094019 attatggacatgcaatttcatcaacaacaattcaattatcaccaaattcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaa 25094103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 398 - 430
Target Start/End: Original strand, 41394527 - 41394559
Alignment:
Q  398 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 430  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41394527 atgattatgataaagactaacccccttacctta 41394559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 398 - 430
Target Start/End: Original strand, 45051726 - 45051758
Alignment:
Q  398 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 430  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  45051726 atgattatgataaagactaacccccttacctta 45051758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 288; Significance: 1e-161; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 64 - 496
Target Start/End: Original strand, 17695 - 18124
Alignment:
Q  64 tttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacacc 163  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| | ||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||    
T  17695 tttctcaccaacaatcatgatatatgagcacccaagccataaatcataaacaacaacttgtctcagcaac---aacatcaattgaaacttgattctcacc 17791  T
Q  164 ccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattc 263  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17792 tcaattcaacaacaacatgtcataattcatcaattaagcataatttcacaactacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattc 17891  T
Q  264 atttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaaattagagattgggttcatatgaattctcactcaattaagcacttttt 363  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||    
T  17892 atttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaaagattgggttcatataaatacttactcaattaagcacttttt 17991  T
Q  364 catacaaaccaagaaaaattgcaaac-aaacaattatgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactt 462  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||  |||||||||    
T  17992 catacaaacaaag-aaaattgcaaacaaaataattatgattatgatgaagactaacccccttaccttagataatgattaatccaaacttaggcttcactt 18090  T
Q  463 tagctcctaattctccaatcttcaagttttcccc 496  Q
    || ||||||||||| ||||||||| |||| ||||    
T  18091 taactcctaattcttcaatcttcatgtttccccc 18124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 248; Significance: 1e-137; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 132 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 17506 - 17208
Alignment:
Q  132 acaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcataacaacccattttcataca 231  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  17506 acaacaacatcaatt-aaacatgattctcatcacaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacagcaacccattttcataca 17408  T
Q  232 ttatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaaattagagattgggtt 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  17407 ttatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcatacttatcaccaaaacaagagtacgaaaattaaagattgggtt 17308  T
Q  332 catatgaattctcactcaattaagcactttttcatacaaaccaagaaaaattgcaaacaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttaccttag 431  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17307 catacaaattctcactcaattaagcactttttcatacaaaccaagaaaaattgcaaacaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttaccttag 17208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 246; Significance: 1e-136; HSPs: 4)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Original strand, 130487 - 130819
Alignment:
Q  1 catcatcaaaatcaaacttcttctttatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  130487 catcatcaaaatcaaacttcttctttattaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagc 130586  T
Q  101 cataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  130587 cataattcataatcaacaacatatctcaacaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaa 130686  T
Q  201 gcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcacca 300  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| || ||||||||| ||  ||||| |||| | |    
T  130687 gcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatattatttcatcatcaaccattcatttaaca-tcaattaacgtatccaaacatatctcta 130785  T
Q  301 aaacaagagcacgaaaattagagattgggttcat 334  Q
     |||| |||||||||  | | |||||||||||||    
T  130786 caacatgagcacgaatttcaaagattgggttcat 130819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 50 - 208
Target Start/End: Original strand, 79519 - 79677
Alignment:
Q  50 caacaacaactcattttctcaacaacaat-catgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattga 148  Q
    |||||||||||||||| |||| || |||| |||||  |||||| ||||||||||| | |||| | ||| || ||  || ||||||||||||||||||||     
T  79519 caacaacaactcattt-ctcatcaccaattcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaataatatcacttagcaacaacaacatcaattg- 79616  T
Q  149 aacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtc-atcaattaagcataatt 208  Q
    ||| || |||||| |  |||||||||||||||| |||||| || | |||||||||||||||    
T  79617 aacatggttcacatcataattcaacaacaacatatcataattcaaccaattaagcataatt 79677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 398 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 89410 - 89336
Alignment:
Q  398 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 472  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| | | ||| ||| | |||||  |||||| |||| |||||||    
T  89410 atgatcatgatgaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcaatttaactcctaa 89336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 398 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 107740 - 107666
Alignment:
Q  398 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 472  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| | | ||| ||| | |||||  |||||| |||| |||||||    
T  107740 atgatcatgatgaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcaatttaactcctaa 107666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 231; Significance: 1e-127; HSPs: 2)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 131 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 34607 - 34242
Alignment:
Q  131 aacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcataacaacccattttcatac 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||    
T  34607 aacaacaacatcaattgaaacttgattttcacctcaattcaacaacaacatgtcataattcatcaattaagcataatttcacaactacccattttcacac 34508  T
Q  231 attatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaaattagagattgggt 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |  |||| |||    
T  34507 attatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcattaaaacaagagcacgaaattcaaggattaggt 34408  T
Q  331 tcatatgaattctcactcaattaagcactttttcatacaaaccaagaaaaattgcaaac-aaacaattatgattatgatgaagactaacccccttacctt 429  Q
    || ||| ||| || ||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34407 tcgtataaatacttactcaattaagcactatttcatacaaactaag-aaaattgcaaacaaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttacctt 34309  T
Q  430 aggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaattctccaatcttcaagttttcccc 496  Q
    || | ||||| ||| |||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  34308 agataatgattaatccaaacttaggcttcattttagctcctaattcttcaatctttaagtttccccc 34242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 48 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 34670 - 34607
Alignment:
Q  48 accaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagccataattcataa 112  Q
    |||||||||| |||| || |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  34670 accaacaacatctcaatt-ctcaccaacaatcatgttatatgaacacccaagtcataaatcataa 34607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 2)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 48 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 50124 - 49860
Alignment:
Q  48 accaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattg 147  Q
    |||||||||| || ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50124 accaacaacatcttatttt-tcatcaacaatcatgatatatgaacacccaagccataaatcataaacaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattg 50026  T
Q  148 aaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatt 247  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  50025 aaacttgattctcacctcaattcaaccacaacatgtcataattcatcaattaagtataatttcacaactacccattttcatacactatgaacatgttatt 49926  T
Q  248 tcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacg 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49925 tcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacg 49860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 361 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 49820 - 49686
Alignment:
Q  361 tttcatacaaaccaagaaaaattgcaaacaaa-caattatgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttca 459  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||  ||||||    
T  49820 tttcatacaa--caaggaaaattgcaaacaaaacaatcatgattatgaagaagactaacccccttaccttaggtaatgattaatccaaacttaggcttca 49723  T
Q  460 ctttagctcctaattctccaatcttcaagttttcccc 496  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  49722 ctttagctcctaattcttcaatcttcaagtttccccc 49686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 203; Significance: 1e-110; HSPs: 4)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 63 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 165224 - 164976
Alignment:
Q  63 ttttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacac 162  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  165224 ttttctcaccaacaatcatgatatatgaacacccaagccataat-cataa---acaacatgtctcagcaacaacaacatcaattaaaacttgattctcac 165129  T
Q  163 cccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaatt 262  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  165128 ctcaattcaacaacaacatgtcataattcatcaattaagcataatttcataagaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaatt 165029  T
Q  263 catttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaa 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  165028 catttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaa 164976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 361 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 164939 - 164810
Alignment:
Q  361 tttcatacaaaccaagaaaaattgcaaacaaa-caattatgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttca 459  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||    
T  164939 tttcatacaa--caaggaaaattgcaaacaaaacaatcatgattatgaagaacactaacccccttaccttaggttatgattaattcaaatttaagcttca 164842  T
Q  460 ctttagctcctaattctccaatcttcaagttt 491  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  164841 ctttagctcctaattcttcaatcttcaagttt 164810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 398 - 472
Target Start/End: Original strand, 172210 - 172284
Alignment:
Q  398 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 472  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||| ||| | |||||  |||||||||||||||||||    
T  172210 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagctcctaa 172284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 398 - 472
Target Start/End: Original strand, 177913 - 177987
Alignment:
Q  398 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 472  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||| ||| | |||||  |||||||||||||||||||    
T  177913 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagctcctaa 177987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 193; Significance: 1e-104; HSPs: 5)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 64 - 316
Target Start/End: Original strand, 11740 - 11990
Alignment:
Q  64 tttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacacc 163  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11740 tttctcaccaacaatcatgatatatgaacacccaagccataaatcataa-caacaacatgtctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattctcacc 11838  T
Q  164 ccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattc 263  Q
     ||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11839 tcaattcaacaa-aacatgtcatgattcatcaattaagcataatttcacaactacccattttcaaacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattc 11937  T
Q  264 atttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaa 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11938 atttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaatagcacgaaa 11990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 398 - 472
Target Start/End: Original strand, 12063 - 12137
Alignment:
Q  398 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 472  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| ||| |||||||  |||||| ||||||||||||    
T  12063 atgattatgatgaagactaacccccttatcttagataatgattaatccaaactttggcttcaatttagctcctaa 12137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 398 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 8125 - 8051
Alignment:
Q  398 atgattatgatgaagactaaccccc-ttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctccta 471  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| ||| |||||||  |||||| |||||||||||    
T  8125 atgattatgatgaagactaaccccccttaccttagataatgattaatccaaacttaggcttcattttagctccta 8051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 398 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 26372 - 26298
Alignment:
Q  398 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 472  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||| ||| | | |||  |||||| ||||||||||||    
T  26372 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaatcccatcttaggcttcaatttagctcctaa 26298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 84 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 8425 - 8360
Alignment:
Q  84 tatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaa 149  Q
    |||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||||   | | ||||||||||||||||||||    
T  8425 tatatgcatacccaagccatgattcataaacaacaacatcaattaacaacaacaacatcaattgaa 8360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 91; Significance: 7e-44; HSPs: 6)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 398 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 13299 - 13201
Alignment:
Q  398 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaattctccaatcttcaagttttcccc 496  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13299 atgattatgatgataactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaattctccaatcttcaagttttcccc 13201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 35 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 13575 - 13398
Alignment:
Q  35 attttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatct---cagca 131  Q
    |||| |||||| ||| ||||||||  ||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| | |   || ||    
T  13575 atttcacaaaaccactaacaacaatccattt-ctcaacaagaatcatgatatatcaacacccaagccataa-tcataaacaacaacatgtatcaacaaca 13478  T
Q  132 acaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttca 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  13477 acaacaacatcaattgaaacttgatttccacctcaattcaacaacaacatgtcataattcatcaattaaacataatttca 13398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 184 - 291
Target Start/End: Original strand, 55694 - 55801
Alignment:
Q  184 cataagtcatcaattaagcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacat 283  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| |||||||||| ||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||    
T  55694 cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcctacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacat 55793  T
Q  284 actcaaac 291  Q
    | ||||||    
T  55794 attcaaac 55801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 398 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 108107 - 108033
Alignment:
Q  398 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 472  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||| ||||| |||||  |||||| || |||||||||    
T  108107 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaattccaacttaggcttcaattcagctcctaa 108033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 398 - 472
Target Start/End: Original strand, 55904 - 55978
Alignment:
Q  398 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 472  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||| ||| | || ||  |||||| ||||||||||||    
T  55904 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaatttaggcttcaatttagctcctaa 55978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #6
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 28 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 94061 - 93940
Alignment:
Q  28 tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaac-aatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatct 126  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||  ||||  |||||||  ||| | | || |||||||||||  ||    
T  94061 tcaacccattttacaaagtcaccaacaacatctca-tttctcaccaacaaatcatgaattatgttcacccaaatcatgaattatcatcaacaacatcact 93963  T
Q  127 cagcaacaacaacatcaattgaa 149  Q
     |  || ||||||||||||||||    
T  93962 tattaataacaacatcaattgaa 93940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0574
Description:

Target: scaffold0574; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 361 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 9480 - 9345
Alignment:
Q  361 tttcatacaaaccaagaaaaattgcaaacaaa-caattatgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttca 459  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9480 tttcatacaa--caaggaaaattgcaaacaaaacaatcatgattatgaagaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttca 9383  T
Q  460 ctttagctcctaa-ttctccaatcttcaagttttcccc 496  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  9382 ctttagctcctaatttcttcaatcttcaagtttccccc 9345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 184 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 9649 - 9518
Alignment:
Q  184 cataagtcatcaattaagcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacat 283  Q
    |||||||||  |||| ||||||||||   ||| |||||||||||||||| || ||| ||  ||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||    
T  9649 cataagtcactaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcataaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttagcaatcaattaacat 9550  T
Q  284 actcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaa 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9549 actcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaa 9518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 83; Significance: 4e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 28467 - 28663
Alignment:
Q  1 catcatcaaaatcaaacttcttctttatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaag 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||  ||||||||||||||    
T  28467 catcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcattt-ctcaccaataaatcatgaattatgaacacccaag 28565  T
Q  100 ccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatt 198  Q
    |||| | |||| | |||||||||  || |||||||||||||||||||||| | | ||||  ||  |||||||||||||||||  ||||| ||| |||||    
T  28566 ccatgaatcattaacaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgaa-cataattcttactacaattcaacaacaacataccataattcaacaatt 28663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Original strand, 21638 - 21687
Alignment:
Q  1 catcatcaaaatcaaacttcttctttatcaacccattttacaaaatcacc 50  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  21638 catcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccacc 21687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 79; Significance: 1e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 398 - 504
Target Start/End: Original strand, 108053 - 108159
Alignment:
Q  398 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaattctccaatcttcaagttttccccc 497  Q
    |||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  108053 atgattataatgataactaacccccttaccttaggctataatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaattctccaatcttcaaaatttccccc 108152  T
Q  498 tttgcta 504  Q
    |||||||    
T  108153 tttgcta 108159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0833 (Bit Score: 76; Significance: 6e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0833
Description:

Target: scaffold0833; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Original strand, 3231 - 3377
Alignment:
Q  1 catcatcaaaatcaaacttcttctttatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||| | ||||||||    
T  3231 catcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactca-tttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagc 3329  T
Q  101 cataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattga 148  Q
    ||| | | || |||||||||||  |  | |||||||||||||||||||    
T  3330 catgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattga 3377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 75; Significance: 3e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 361 - 504
Target Start/End: Original strand, 48468 - 48610
Alignment:
Q  361 tttcatacaaaccaagaaaaattgcaaacaaacaatt-atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttca 459  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||| ||||||    
T  48468 tttcatacaa--caaggaaaattgcaaacaaaacattcatgattatgaagaagactaacccccttacattaggttatgattaattcaaatttgggcttca 48565  T
Q  460 ctttagctcctaa-ttctccaatcttcaagttttccccctttgcta 504  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  48566 ctttagctcctaatttcttcaatcttcaag-tttccccctttgcta 48610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 75; Significance: 3e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 221 - 315
Target Start/End: Original strand, 95129 - 95223
Alignment:
Q  221 attttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaa 315  Q
    |||||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  95129 attttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaa 95223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 361 - 491
Target Start/End: Original strand, 95262 - 95392
Alignment:
Q  361 tttcatacaaaccaagaaaaattgcaaacaaa-caattatgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttca 459  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| |  ||||||    
T  95262 tttcatacaa--caaggaaaattgcaaacaaaacaatcatgattatgaagaagactaacccccttaccttaggtaatgattaatccaaacctaggcttca 95359  T
Q  460 ctttagctcct-aattctccaatcttcaagttt 491  Q
    ||||||||||| ||| || ||||||||||||||    
T  95360 ctttagctcctaaatccttcaatcttcaagttt 95392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 71; Significance: 6e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 398 - 496
Target Start/End: Original strand, 41965 - 42063
Alignment:
Q  398 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaattctccaatcttcaagttttcccc 496  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  41965 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggtaatgattaatccaaacttaggcttcactttagctcctaattcttcaatcttcaagtttccccc 42063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0387
Description:

Target: scaffold0387; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 398 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 7127 - 7034
Alignment:
Q  398 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaattctccaatcttcaagttt 491  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7127 atgattatgaagaacactaacccccttaccttaggttatgattaattcaaatttaagcttcactttagctcctaattcttcaatcttcaagttt 7034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 1187 - 1117
Alignment:
Q  76 aatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaatt 146  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| | |||| | |||||| ||  || |||||||||||||||||||    
T  1187 aatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatattccttagcaacaacaacatcaatt 1117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 398 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 34405 - 34312
Alignment:
Q  398 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaattctccaatcttcaagttt 491  Q
    ||||||||||| |  |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34405 atgattatgataataactaaccctcttaccttaggtaatgatcaattcaagcttgagcttcactttagctcctaattctccaatcttcaagttt 34312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 211
Target Start/End: Original strand, 4906 - 5081
Alignment:
Q  35 attttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaac 133  Q
    |||| |||||| ||||||||||||  ||||| |||| || ||| ||||||  |||||||| ||||||||| | | || |||||||||||  || ||||||    
T  4906 atttcacaaaaccaccaacaacaatccattt-ctcatcagcaaatcatgaattatgaacaaccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaac 5004  T
Q  134 aacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttca 211  Q
    |||||||||||||| | | |||  |  | | ||||||||||||||||  |||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  5005 aacaacatcaattg-atcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaatcataattcaccaattaagcatattttca 5081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 69; Significance: 1e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Original strand, 21443 - 21586
Alignment:
Q  1 catcatcaaaatcaaacttcttctttatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaag 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||   ||| | |||||||    
T  21443 catcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactca-tttcttaacaacaattcatgaatcatgcaaacccaag 21541  T
Q  100 ccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaa 144  Q
    |||| | | || |||||||||||  || |||||||||||||||||    
T  21542 ccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaacaacatcaa 21586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Original strand, 31142 - 31289
Alignment:
Q  1 catcatcaaaatcaaacttcttctttatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaag 99  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||   ||| | |||||||    
T  31142 catcatcaaaatcaaactttttcattatcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactca-tttctcaacaacaattcatgaatcatgcaaacccaag 31240  T
Q  100 ccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattga 148  Q
    |||| | | || |||||||||||  || |||||||| ||||||||||||    
T  31241 ccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaaaaacatcaattga 31289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1867 (Bit Score: 68; Significance: 4e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold1867
Description:

Target: scaffold1867; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Original strand, 76 - 222
Alignment:
Q  1 catcatcaaaatcaaacttcttctttatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||   ||| | ||||||||    
T  76 catcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccaacaacaacaactca-tttctcagcaacaatcatgaatcatgcaaacccaagc 174  T
Q  101 cataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattga 148  Q
    ||| | | || |||||||||||  |  | |||||||||||||||||||    
T  175 catgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattga 222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158 (Bit Score: 68; Significance: 4e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0158
Description:

Target: scaffold0158; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Original strand, 24891 - 25036
Alignment:
Q  1 catcatcaaaatcaaacttcttctttatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||| | ||||||||    
T  24891 catcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactca-tttctcaacaacaatcatgaatcatgca-acccaagc 24988  T
Q  101 cataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattga 148  Q
    ||| | | || |||||||||||  |  | ||||||||||| |||||||    
T  24989 catgaattatcatcaacaacatgccatatcaacaacaacaacaattga 25036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 399 - 472
Target Start/End: Original strand, 25532 - 25605
Alignment:
Q  399 tgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 472  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| ||  |||||||  |||||| ||||||||||||    
T  25532 tgattatgatgaagactaacccccttaccttagataaggattaacccaaacttaggcttcaatttagctcctaa 25605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 67; Significance: 2e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 168 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 1659 - 1494
Alignment:
Q  168 ttcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatt-tcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatt 266  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| ||| || |||||  |||||| |||||||||  ||||||||| |||||||||| |    
T  1659 ttcaacaacaacatgtcataattcatcaattgagcataattctca-aactactcatttatatacatcatgaacatgcaatttcatcatcaacaattcaat 1561  T
Q  267 tatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaaattagagattgggttca 333  Q
    ||||||  ||||||||||||||||| |||||| | |||| |||||||||  | | ||||||||||||    
T  1560 tatcatcaaattaacatactcaaacatatcactacaacatgagcacgaatttcaaagattgggttca 1494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 64; Significance: 9e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 429 - 283
Alignment:
Q  1 catcatcaaaatcaaacttcttctttatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||   ||| | ||||||||    
T  429 catcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccaccaacaaaagctca-tttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagc 331  T
Q  101 cataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattga 148  Q
     || | | || |||||||||||  |  | |||||||||||||||||||    
T  330 tatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattga 283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 6678 - 6603
Alignment:
Q  1 catcatcaaaatcaaacttcttctttatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaa 77  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  |||||||||||||    
T  6678 catcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccaccaagaacaactca-attctcaacaacaa 6603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1295 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold1295
Description:

Target: scaffold1295; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 168 - 370
Target Start/End: Original strand, 203 - 406
Alignment:
Q  168 ttcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcattt 267  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||    ||| || |||||  |||||| |||||||||  ||||||||| |||||||||| ||    
T  203 ttcaacaacaacatgtcataattcaacaattgagcataattcacaaactacacatttatatacatcatgaacatgcaatttcatcatcaacaattcaatt 302  T
Q  268 atcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaaattagagattgggttcatatgaat-tctcactcaattaagcactttttcat 366  Q
    |||||  ||||||||||||||||| |||||| | |||| ||||| |||  | | |||||||||||| |  |||  || | |||||||||||||| |||||    
T  303 atcatcaaattaacatactcaaacatatcactacaacatgagcaagaatttcaaagattgggttcacaataatcacttattcaattaagcacttattcat 402  T
Q  367 acaa 370  Q
    ||||    
T  403 acaa 406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 59; Significance: 9e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 28 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 44087 - 43935
Alignment:
Q  28 tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatct 126  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||| || ||| ||||||| |||||||||||||||||| | |||| | |||||| ||  ||    
T  44087 tcaacccattttacaaaaccaacaacaacaactcattt-ctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcact 43989  T
Q  127 cagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacat 181  Q
     ||||||||||||||||||| |||| |||||| || |  ||||||||||||||||    
T  43988 tagcaacaacaacatcaatt-aaacatgattctcatcataattcaacaacaacat 43935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 23963 - 23809
Alignment:
Q  27 atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatat 124  Q
    ||||||||||||| |||||| || ||||||||| | ||||| ||| || ||| | |||||||| |||||| |||||||| | |||| | |||||| ||      
T  23963 atcaacccatttttacaaaaccaacaacaacaatttatttt-tcatcatcaaattatgatatacgaacacacaagccatgaatcatcaacaacaatattc 23865  T
Q  125 ctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacat 181  Q
    || | |||||||||| |||||| |||| |||||| || | |||||||||||||||||    
T  23864 cttaacaacaacaacgtcaatt-aaacatgattctcatcacaattcaacaacaacat 23809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 165 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 44275 - 44125
Alignment:
Q  165 caattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattca 264  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| |    ||| ||  |||| ||||||| |||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  44275 caattcaacaacaacatgtcataattcgtcaattgagcataactcacaaactacttatttacatacatcatgaacatgcaatttcatcatcaacaattca 44176  T
Q  265 tttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaa 315  Q
     ||| |||  ||||||||||||||||| |||||| | |||| |||||||||    
T  44175 attaccatcaaattaacatactcaaacatatcactacaacatgagcacgaa 44125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0303 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 3)
Name: scaffold0303
Description:

Target: scaffold0303; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 398 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 4378 - 4279
Alignment:
Q  398 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcct-aattctccaatcttcaagttttcccc 496  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||| ||||    
T  4378 atgattatgataaagtctaacccccttaccttaggtaatgattaatccaaacttttgcttcactttagctcctaaatccttcaatcttcaagtttacccc 4279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0303; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 184 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 170 - 20
Alignment:
Q  184 cataagtcatcaattaagcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacat 283  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| |||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||    
T  170 cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacat 71  T
Q  284 actcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaaattagagattgggttcat 334  Q
    | |||||| |||| | | ||||  ||||||||  | | |||||||||||||    
T  70 attcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcat 20  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0303; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 184 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 4589 - 4489
Alignment:
Q  184 cataagtcatcaattaagcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacat 283  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| |||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||    
T  4589 cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacat 4490  T
Q  284 a 284  Q
    |    
T  4489 a 4489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 165 - 312
Target Start/End: Original strand, 5977 - 6124
Alignment:
Q  165 caattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattca 264  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||    ||| |||||||| | || || |||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  5977 caattcaactacaacatgtcataaatcatcaattgagcacaattcacaaactacccatttacttatatcatgaacatgcaatttcatcatcaacaattca 6076  T
Q  265 tttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcac 312  Q
     |||||||  | ||||||||||||||| |||||| | |||| ||||||    
T  6077 attatcatcaatttaacatactcaaacatatcactacaacatgagcac 6124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 51; Significance: 5e-20; HSPs: 3)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 28 - 181
Target Start/End: Original strand, 69415 - 69567
Alignment:
Q  28 tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatct 126  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||| |||| || |||| || ||| ||||||| |||||||||||||||||| | |||| | |||||| ||  ||    
T  69415 tcaacccattttacaaaaccaacaacaacacctcaatt-ctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcact 69513  T
Q  127 cagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacat 181  Q
     |||||||||||||||||||| ||| ||| || || | |||||||||||||||||    
T  69514 tagcaacaacaacatcaattg-aacatgaatctcatcacaattcaacaacaacat 69567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 398 - 470
Target Start/End: Original strand, 272330 - 272402
Alignment:
Q  398 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcct 470  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||| ||| | |||||  |||||||||||||||||    
T  272330 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagctcct 272402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 169 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 244959 - 244920
Alignment:
Q  169 tcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatt 208  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  244959 tcaacaacaacatgtcataattcatcaattgagcataatt 244920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 49; Significance: 8e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 35 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 77129 - 76967
Alignment:
Q  35 attttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaac-aatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaac 133  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||  |||||| ||||||||||| | |||| |  ||||| ||  || ||||||    
T  77129 atttcacaaaaccaccaacaacaactca-tttctcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaataacaatatcacttagcaac 77031  T
Q  134 aacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatt 198  Q
    |||||||||||||| ||| ||| || |||| |||||||||||||||||  ||||| ||| |||||    
T  77030 aacaacatcaattg-aacatgaatctcaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 76967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0361 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0361
Description:

Target: scaffold0361; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 398 - 496
Target Start/End: Original strand, 3505 - 3601
Alignment:
Q  398 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaattctccaatcttcaagttttcccc 496  Q
    |||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| | ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  3505 atgattatgaggaagaataacccc-ttaccttagatgatgattaattcaaacttaggcttcactttagctcctaa-tcttcaatcttcaagtttccccc 3601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 27 - 271
Target Start/End: Original strand, 107967 - 108209
Alignment:
Q  27 atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatc 125  Q
    ||||||||||||| | |||| || ||||||||||| |||| |||| ||| | ||||||| ||||||||||||||| || | |||| | |||||| |||||    
T  107967 atcaacccatttttaaaaaaccaacaacaacaacttattt-ctcatcaaaattcatgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatatc 108065  T
Q  126 tcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatta-agcataatttcataacaacccattt 224  Q
    | | ||||||||||||||||| |||| ||||   || | ||||||||||| |||| | ||||| ||| || ||| ||||||| ||||||| |  ||||||    
T  108066 ttaacaacaacaacatcaatt-aaacatgatcttcatcacaattcaacaataacaag-cataattcaacatttagagcataa-ttcataatataccattt 108162  T
Q  225 tcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatca 271  Q
    ||| | | ||||||||||  |||||| || |||||||||| ||||||    
T  108163 tcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatca 108209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 27 - 181
Target Start/End: Original strand, 6500 - 6654
Alignment:
Q  27 atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaac-aatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatat 124  Q
    ||||||||||||| |||||| || ||||||||||| | ||||||| || | ||||||||| |||||||||| ||||||| | |||| | |||||| || |    
T  6500 atcaacccatttttacaaaaccaacaacaacaactta-tttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacctaagccatgaatcatcaacaacaatatct 6598  T
Q  125 ctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacat 181  Q
    || |||||||||| |||||||| |||| |||||| || |  ||||||||||||||||    
T  6599 cttagcaacaacatcatcaatt-aaacatgattctcatcataattcaacaacaacat 6654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 398 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 36869 - 36837
Alignment:
Q  398 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 430  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  36869 atgattatgataaagactaacccccttacctta 36837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 4)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 184 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 193630 - 193518
Alignment:
Q  184 cataagtcatcaattaagcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacat 283  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| |||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||    
T  193630 cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacat 193531  T
Q  284 actcaaacttatc 296  Q
    | |||||| ||||    
T  193530 attcaaacatatc 193518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 184 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 186668 - 186561
Alignment:
Q  184 cataagtcatcaattaagcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacat 283  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| |||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||    
T  186668 cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacat 186569  T
Q  284 actcaaac 291  Q
    | ||||||    
T  186568 attcaaac 186561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 178
Target Start/End: Original strand, 27453 - 27604
Alignment:
Q  27 atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatat 124  Q
    ||||||||||||| |||||| |  |||||||||||||||| | || || ||| ||||||| ||||||||||||||| || | |||| | |||||| || |    
T  27453 atcaacccatttttacaaaaccgacaacaacaactcattt-cacatcatcaactcatgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatct 27551  T
Q  125 ctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaa 178  Q
    || | |||||||| |||||||| |||| |||||| || | ||||||||||||||    
T  27552 cttaacaacaacatcatcaatt-aaacatgattctcatcacaattcaacaacaa 27604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 398 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 193429 - 193355
Alignment:
Q  398 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 472  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||  | | ||| ||| | |||||  |||||||||||||||||||    
T  193429 atgattatgataaagactaacccccttaccttaaatgaagattaatcccaacttaggcttcactttagctcctaa 193355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 44; Significance: 8e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 184 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 31422 - 31315
Alignment:
Q  184 cataagtcatcaattaagcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacat 283  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| |||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||    
T  31422 cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacat 31323  T
Q  284 actcaaac 291  Q
    | ||||||    
T  31322 attcaaac 31315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 44; Significance: 8e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 184 - 291
Target Start/End: Original strand, 41422 - 41529
Alignment:
Q  184 cataagtcatcaattaagcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacat 283  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| |||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||    
T  41422 cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacat 41521  T
Q  284 actcaaac 291  Q
    | ||||||    
T  41522 attcaaac 41529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 398 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 37012 - 36979
Alignment:
Q  398 atgattatgatgaagactaacccccttaccttag 431  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37012 atgattatgataaagactaacccccttaccttag 36979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 44; Significance: 8e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 398 - 496
Target Start/End: Original strand, 45338 - 45437
Alignment:
Q  398 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa-ttctccaatcttcaagttttcccc 496  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | ||| |||||||  |||||| || |||||||||  ||| |||||||||||||| ||||    
T  45338 atgattatgatgaagactaacccccttaccttagataatggttaatccaaacttaggcttcaattaagctcctaagctcttcaatcttcaagtttccccc 45437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 398 - 491
Target Start/End: Original strand, 54724 - 54818
Alignment:
Q  398 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa-ttctccaatcttcaagttt 491  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||| | ||| ||||||| ||||||| || |||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  54724 atgattatgatgaagactaaccaccttaccttagataatggttaatccaaacttaagcttcaattaagctcctaagctcttcaatcttcaagttt 54818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0706 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0706
Description:

Target: scaffold0706; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 184 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 6685 - 6535
Alignment:
Q  184 cataagtcatcaattaagcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacat 283  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| |||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||  |||  |||||||||    
T  6685 cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttgacatcaaattaacat 6586  T
Q  284 actcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaaattagagattgggttcat 334  Q
    | |||||| |||| | | ||||  ||||||||  | | |||||||||||||    
T  6585 attcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcat 6535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0706; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 398 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 6475 - 6401
Alignment:
Q  398 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 472  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||  ||| | |||||  |||||| ||||||||||||    
T  6475 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaggaataatcccaacttaggcttcaatttagctcctaa 6401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0700 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0700
Description:

Target: scaffold0700; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 181
Target Start/End: Original strand, 2483 - 2635
Alignment:
Q  28 tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatct 126  Q
    ||||||||||||| |||| || ||||||||| |||||| |||| || ||| ||||||| ||||||||||||| |||| | |||| | |||||| ||  ||    
T  2483 tcaacccattttagaaaaccaacaacaacaagtcattt-ctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaaaccatgaatcatcaacaacaatatcact 2581  T
Q  127 cagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacat 181  Q
     |||||||||||||||||||||| | ||| || || |  ||||||||||||||||    
T  2582 tagcaacaacaacatcaattgaa-catgaatctcatcataattcaacaacaacat 2635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 398 - 464
Target Start/End: Original strand, 13824 - 13890
Alignment:
Q  398 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcacttta 464  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||  |||||||||||    
T  13824 atgattatgatgaagactaacccccttaccttagataatgattaatccaaacttaggcttcacttta 13890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 194 - 296
Target Start/End: Original strand, 30217 - 30319
Alignment:
Q  194 caattaagcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaactt 293  Q
    ||||| ||||||||||   ||| |||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||| |||||| |    
T  30217 caattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacat 30316  T
Q  294 atc 296  Q
    |||    
T  30317 atc 30319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 103211 - 103090
Alignment:
Q  28 tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatct 126  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| |||||| ||||||  |||| |||||||| |||| | | || |||||||||||  ||    
T  103211 tcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactca-tttatcaccaacaattcatgaattatgcacacccaaaccatgaattatcatcaacaacatcact 103113  T
Q  127 cagcaacaacaacatcaattgaa 149  Q
     || ||||| |||||||||||||    
T  103112 tagaaacaataacatcaattgaa 103090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 217 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 10092 - 9975
Alignment:
Q  217 acccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaa 316  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||| |||||| |||| | | ||||  ||||||||     
T  10092 acccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaat 9993  T
Q  317 attagagattgggttcat 334  Q
     | | |||||||||||||    
T  9992 ttcaaagattgggttcat 9975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 398 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 9914 - 9840
Alignment:
Q  398 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 472  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||| ||| | |||||  |||||| ||||||||||||    
T  9914 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaa 9840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 76 - 181
Target Start/End: Original strand, 4611 - 4715
Alignment:
Q  76 aatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaa 175  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| | |||| | |||||| |  ||| | ||||||||||||||||| |||| |||||| || | |||||||||||    
T  4611 aatcttgatatatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaaaacttcttaacaacaacaacatcaatt-aaacatgattcccatcacaattcaacaa 4709  T
Q  176 caacat 181  Q
    ||||||    
T  4710 caacat 4715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0160 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0160
Description:

Target: scaffold0160; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 399 - 472
Target Start/End: Original strand, 339 - 412
Alignment:
Q  399 tgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 472  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| ||| |||||||  |||||| ||||||||||||    
T  339 tgattatgatgaagactaacccccttaccttagataaggattaatccaaacttaggcttcaatttagctcctaa 412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1500 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold1500
Description:

Target: scaffold1500; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 107 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 1732 - 1625
Alignment:
Q  107 tcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataa 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||| ||| | || |||||  | ||||| ||| |  |||||||||||| ||||    
T  1732 tcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaatt-acatatgatttacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataa 1634  T
Q  207 tttcataac 215  Q
    |||||||||    
T  1633 tttcataac 1625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1272 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold1272
Description:

Target: scaffold1272; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 198
Target Start/End: Original strand, 270 - 436
Alignment:
Q  31 acccattttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaac-aatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcag 129  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||  ||||| |||||||| ||| | | || | ||| |||||  || ||    
T  270 acccagtttacaaaaccaccaacaacaactca-tttctcatcaacaaatcatgaattatgagcacccaaggcatgaataatcaacaaaaacatcacttag 368  T
Q  130 caacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatt 198  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||| ||  ||| ||||||||||| |||||  ||||| ||| |||||    
T  369 caacaacaacatcaattg-aacatgactcttaccacaattcaacaataacatagcataattcaacaatt 436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0597 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0597
Description:

Target: scaffold0597; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 184 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 1120 - 1020
Alignment:
Q  184 cataagtcatcaattaagcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacat 283  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| |||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||    
T  1120 cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacat 1021  T
Q  284 a 284  Q
    |    
T  1020 a 1020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0597; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 398 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 910 - 836
Alignment:
Q  398 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 472  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||| ||| | |||||  |||||| ||||||||||||    
T  910 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaa 836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 184 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 17546 - 17434
Alignment:
Q  184 cataagtcatcaattaagcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacat 283  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| |||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||  ||  |||||||||    
T  17546 cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaaaatcaaattaacat 17447  T
Q  284 actcaaacttatc 296  Q
    | |||||| ||||    
T  17446 attcaaacatatc 17434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 3)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 184 - 296
Target Start/End: Original strand, 79977 - 80089
Alignment:
Q  184 cataagtcatcaattaagcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacat 283  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| |||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||| ||||| |||  |||||||||    
T  79977 cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaatttatttaacatcaaattaacat 80076  T
Q  284 actcaaacttatc 296  Q
    | |||||| ||||    
T  80077 attcaaacatatc 80089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 76 - 148
Target Start/End: Original strand, 40664 - 40736
Alignment:
Q  76 aatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattga 148  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||| | |||| | |||||| ||  || ||||||||||||||| |||||    
T  40664 aatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatccattga 40736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 398 - 430
Target Start/End: Original strand, 80187 - 80219
Alignment:
Q  398 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 430  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  80187 atgattatgataaagactaacccccttacctta 80219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 198
Target Start/End: Original strand, 35444 - 35605
Alignment:
Q  35 attttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaac 133  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||| ||||||  |||||| ||||||||||| | |||| | |||||||||  || ||||||    
T  35444 attttacaaaaccaccaaca-caactcattt-ctcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatcacttagcaac 35541  T
Q  134 aacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatt 198  Q
    || ||||||||||| ||| ||| ||  ||| || ||||||||||||||  ||||| ||| |||||    
T  35542 aaaaacatcaattg-aacatgactcttaccacatttcaacaacaacatagcataaatcaacaatt 35605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0601 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0601
Description:

Target: scaffold0601; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 217 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 981 - 883
Alignment:
Q  217 acccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaa 315  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||||   |||| |  ||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  981 acccattttcacatattatgaacatgcaatttcatcaacaacaattcaattatcaccaaattcatttactcaaacatatcatcataacaagagcacgaa 883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 398 - 472
Target Start/End: Original strand, 9183 - 9257
Alignment:
Q  398 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 472  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||| ||| | |||||  |||||||||||||||||||    
T  9183 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagctcctaa 9257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0251
Description:

Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 398 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 13317 - 13243
Alignment:
Q  398 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 472  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||| ||| | |||||  |||||||||||||||||||    
T  13317 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagctcctaa 13243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 184 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 13528 - 13378
Alignment:
Q  184 cataagtcatcaattaagcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacat 283  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| |||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||| ||||||||| |||  |||||||||    
T  13528 cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaaccattcatttaacatcaaattaacat 13429  T
Q  284 actcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaaattagagattgggttcat 334  Q
    |  ||||| |||| | | ||||  ||||||||  | | |||||||||||||    
T  13428 atccaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcat 13378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 13048 - 12990
Alignment:
Q  3 tcatcaaaatcaaacttcttctttatcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaact 60  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| || |||||||||||    
T  13048 tcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttcacaaaaccatcaacaacaact 12990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 231 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 12820 - 12736
Alignment:
Q  231 attatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaa 315  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||| |||| | | | || | || ||||||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  12820 attatgaacatgcaatttcatcatcaacaattcaattatgaataatttcatatcctcaaacatatcactaaaactagagcacgaa 12736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 165 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 4002 - 3876
Alignment:
Q  165 caattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattca 264  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||    ||| ||||||||  ||| || |||||||||  |||||||||  |||||||||    
T  4002 caattcaataacaacatgtcgtaattcatcaattgaacataattcacaaactacccatttatatatatcatgaacatgcaatttcatcattaacaattca 3903  T
Q  265 tttatcattcaattaacatactcaaac 291  Q
     | |||||  |||||||||||||||||    
T  3902 atcatcatcaaattaacatactcaaac 3876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 398 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 123119 - 123045
Alignment:
Q  398 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 472  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| | |||||  |||||| ||||||||||||    
T  123119 atgattatggtgaagactaacccccttaccttaggtaaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaa 123045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 28 - 149
Target Start/End: Original strand, 30978 - 31099
Alignment:
Q  28 tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaac-aatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatct 126  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||  |||||| || | |||| |||| ||||||||| |||||||| | |||| | |||||  ||  ||    
T  30978 tcaacccattttacaaaagcaacaacaacaactca-attctcatcatcaaatcttgatttatgaacactcaagccatgaatcatcaacaacagtatcact 31076  T
Q  127 cagcaacaacaacatcaattgaa 149  Q
     ||||||||||||||||||||||    
T  31077 tagcaacaacaacatcaattgaa 31099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0521 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0521
Description:

Target: scaffold0521; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 76 - 149
Target Start/End: Original strand, 11100 - 11173
Alignment:
Q  76 aatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaa 149  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||| | |||||| |||||||||  |  ||||||||||||||||||||||    
T  11100 aatcatgatctatgaacacctaagccatgaatcataaacaacaacatcacatagcaacaacaacatcaattgaa 11173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0516 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0516
Description:

Target: scaffold0516; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 399 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 12075 - 11982
Alignment:
Q  399 tgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaatt-ctccaatcttcaagttt 491  Q
    |||||||||| |  ||||||||||||||||||| | ||| | ||||  |||||  ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  12075 tgattatgataataactaacccccttaccttagatgatgtttaattttaacttaggcttcactttagctcctaattgcttcaatcttcaagttt 11982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 3)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 116795 - 116687
Alignment:
Q  35 attttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaac 133  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||| | |||| | |||||| ||  || ||||||    
T  116795 attttacaaaaccaccaacaacaatccatttt-tcatcaacaaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaac 116697  T
Q  134 aacaacatca 143  Q
    ||||||||||    
T  116696 aacaacatca 116687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 398 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 162110 - 162078
Alignment:
Q  398 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 430  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  162110 atgattatgatgaaaactaacccccttacctta 162078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 398 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 166196 - 166164
Alignment:
Q  398 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 430  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  166196 atgattatgatgaaaactaacccccttacctta 166164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0670 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0670
Description:

Target: scaffold0670; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 7966 - 7812
Alignment:
Q  27 atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatat 124  Q
    ||||||||||||| |||||| || ||||||||||| |||| | || ||  || ||||||| ||||||||||||||| || | |||| | |||||| || |    
T  7966 atcaacccattttcacaaaaccaacaacaacaacttattt-cacatcacaaactcatgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatct 7868  T
Q  125 ctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacat 181  Q
    || | ||||||||||||||||| |||| |||||| || | ||| |||||||||||||    
T  7867 cttaacaacaacaacatcaatt-aaacatgattctcatcacaaatcaacaacaacat 7812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0253 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0253
Description:

Target: scaffold0253; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 177
Target Start/End: Original strand, 7358 - 7508
Alignment:
Q  27 atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatat 124  Q
    ||||||||||||| |||||| || ||||||||||| |||| |||| || ||| ||||||| |||||  ||||||||||| | |||| | |||||| || |    
T  7358 atcaacccatttttacaaaaccaacaacaacaacttattt-ctcatcatcaaatcatgatttatgagtacccaagccatgaatcattagcaacaatatct 7456  T
Q  125 ctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaaca 177  Q
    || ||||||| ||||||||||| |||| |||||| || |  ||||||||||||    
T  7457 cttagcaacaccaacatcaatt-aaacatgattctcatcataattcaacaaca 7508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0253; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 177
Target Start/End: Original strand, 16783 - 16933
Alignment:
Q  27 atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatat 124  Q
    ||||||||||||| |||||| || ||||||||||| |||| |||| || ||| ||||||| |||||  ||||||||||| | |||| | |||||| || |    
T  16783 atcaacccatttttacaaaaccaacaacaacaacttattt-ctcatcatcaaatcatgatttatgagtacccaagccatgaatcattagcaacaatatct 16881  T
Q  125 ctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaaca 177  Q
    || ||||||| ||||||||||| |||| |||||| || |  ||||||||||||    
T  16882 cttagcaacaccaacatcaatt-aaacatgattctcatcataattcaacaaca 16933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 220 - 296
Target Start/End: Original strand, 15098 - 15174
Alignment:
Q  220 cattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatc 296  Q
    ||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||| |||||| ||||    
T  15098 cattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacatatc 15174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 398 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 914 - 881
Alignment:
Q  398 atgattatgatgaagactaacccccttaccttag 431  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  914 atgattatgataaagactaacccccttaccttag 881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 181
Target Start/End: Original strand, 37538 - 37668
Alignment:
Q  50 caacaacaactcattttctcaacaacaat-catgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattga 148  Q
    |||||||||||||||| |||| || |||| |||||| ||||||||||||||| || | |||| | |||||| || ||| | ||||||||||||||||| |    
T  37538 caacaacaactcattt-ctcatcatcaattcatgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaatt-a 37635  T
Q  149 aacttgattcacaccccaattcaacaacaacat 181  Q
    ||| |||||| |  | ||||||||||| |||||    
T  37636 aacatgattctcgtctcaattcaacaataacat 37668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 3)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 181
Target Start/End: Original strand, 85489 - 85643
Alignment:
Q  27 atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaatc-atgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatat 124  Q
    ||||||||||||| |||||| || ||||||||||  ||||| ||| |||||| | ||||| |||||||||||||| ||| | |||| | |||||| || |    
T  85489 atcaacccatttttacaaaaccaacaacaacaacctatttt-tcatcaacaaaccatgatttatgaacacccaagtcatgaatcatcaacaacaatatct 85587  T
Q  125 ctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacat 181  Q
    || ||||||||||| |||| || |||| |||||| || |  ||||||||||||||||    
T  85588 cttagcaacaacaatatcactt-aaacatgattctcatcataattcaacaacaacat 85643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 398 - 472
Target Start/End: Original strand, 9160 - 9234
Alignment:
Q  398 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 472  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||    |||||  |||||||||||||||||||    
T  9160 atgattatgatgaagactaacacacttaccttagattatgattaacctcaacttaggcttcactttagctcctaa 9234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 398 - 472
Target Start/End: Original strand, 146906 - 146980
Alignment:
Q  398 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 472  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||| ||| | |||||  |||||| ||||||||||||    
T  146906 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaa 146980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 3)
Name: scaffold0686
Description:

Target: scaffold0686; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 184 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 6225 - 6118
Alignment:
Q  184 cataagtcatcaattaagcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacat 283  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||||  ||||| ||||||| |||  |||||||||    
T  6225 cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcattaacaaatcatttaacatcaaattaacat 6126  T
Q  284 actcaaac 291  Q
    | ||||||    
T  6125 attcaaac 6118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 5810 - 5777
Alignment:
Q  397 tatgattatgatgaagactaacccccttacctta 430  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5810 tatgattatgatgaaaactaacccccttacctta 5777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 6016 - 5983
Alignment:
Q  397 tatgattatgatgaagactaacccccttacctta 430  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6016 tatgattatgatgaaaactaacccccttacctta 5983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 149
Target Start/End: Original strand, 6622 - 6740
Alignment:
Q  31 acccattttacaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaac-aatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcag 129  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||  ||||| |||||||||||| | |||| | ||| |||||  || ||    
T  6622 acccagtttacaaaaccaccaacaacaactca-tttctcatcaacaaatcatgaattatgaccacccaagccatgaatcatcaacaaaaacatcacttag 6720  T
Q  130 caacaacaacatcaattgaa 149  Q
     |  ||||||||||||||||    
T  6721 gagtaacaacatcaattgaa 6740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 184 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 12662 - 12548
Alignment:
Q  184 cataagtcatcaattaagcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaatt--catttatcattcaattaac 281  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| |||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| ||||||||  |||| |||||  |||||||    
T  12662 cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcacattaatcatcaaattaac 12563  T
Q  282 atactcaaacttatc 296  Q
    ||| |||||| ||||    
T  12562 atattcaaacatatc 12548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0970 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0970
Description:

Target: scaffold0970; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 86 - 188
Target Start/End: Original strand, 2471 - 2572
Alignment:
Q  86 tatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtca 185  Q
    |||||| ||||||||||| | |||| | |||||||||  || |||||||||||||||||||||| | || ||| || |  |||||||||||||||| |||    
T  2471 tatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgaa-catggttctcatcataattcaacaacaacatatca 2569  T
Q  186 taa 188  Q
    |||    
T  2570 taa 2572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 398 - 472
Target Start/End: Original strand, 12418 - 12492
Alignment:
Q  398 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 472  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |   ||| ||| | |||||  |||||||||||||||||||    
T  12418 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatagagattaatcctaacttaggcttcactttagctcctaa 12492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 398 - 472
Target Start/End: Original strand, 1430 - 1504
Alignment:
Q  398 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 472  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||| |||   |||||  |||||||||||||||||||    
T  1430 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcacaacttaggcttcactttagctcctaa 1504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 398 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 3540 - 3466
Alignment:
Q  398 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 472  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||| | | ||| ||| | |||||  |||||||||||||||||||    
T  3540 atgattatgacaaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagctcctaa 3466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 398 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 57424 - 57350
Alignment:
Q  398 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 472  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||| ||| | |||||  |||||||||||||| ||||    
T  57424 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagctactaa 57350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 398 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 34107 - 34033
Alignment:
Q  398 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 472  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| ||  ||||||   |||||| ||||||||||||    
T  34107 atgattatgatgaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctcctaa 34033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 398 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 247398 - 247324
Alignment:
Q  398 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 472  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||| ||| | |||||  |||||| ||||||||||||    
T  247398 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaa 247324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 399 - 496
Target Start/End: Original strand, 7517 - 7615
Alignment:
Q  399 tgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaatt-ctccaatcttcaagttttcccc 496  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||| | ||| | |||   ||||  ||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| ||||    
T  7517 tgattatgatgaaaacaaacccccttaccttagatgatgtttaatcttaactaaagcttcactttagctcctaattgtttcaatcttcaagtttccccc 7615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 130 - 211
Target Start/End: Original strand, 7271 - 7351
Alignment:
Q  130 caacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttca 211  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||| ||||| | ||| || |||| ||||| ||| |||||||    
T  7271 caacaacaacatccattgaaacttgtttctcacctcaattcaac-acaacttatcacaaatcattaattaggcaaaatttca 7351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 27 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 2607 - 2436
Alignment:
Q  27 atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaat-catgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatat 124  Q
    ||||||||||||| || ||| || ||||||||||| |||| |||| || |||  |||||  ||||||| |||||||||| | |||| |||||||||||      
T  2607 atcaacccattttcaccaaaccaacaacaacaacttattt-ctcatcatcaaaacatgaattatgaacgcccaagccatgaatcatcatcaacaacatca 2509  T
Q  125 ctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatt 198  Q
    || || ||||||||||||||||| ||| ||| ||  | |  ||||||||||||||||  ||||| |||||||||    
T  2508 cttaggaacaacaacatcaattg-aacatgagtcttatcataattcaacaacaacatagcataattcatcaatt 2436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 399 - 491
Target Start/End: Original strand, 54182 - 54275
Alignment:
Q  399 tgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaatt-ctccaatcttcaagttt 491  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||| | ||| | |||   |||||  |||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||    
T  54182 tgattatgatgaaaacaaacccccttaccttagatgatgtttaatcttaacttaggcttcactatagctcctaattgcttcaatcttcaagttt 54275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 40
Target Start/End: Original strand, 12695 - 12734
Alignment:
Q  1 catcatcaaaatcaaacttcttctttatcaacccatttta 40  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  12695 catcatcaaaatcaaacttcttcactatcaacccatttta 12734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0447
Description:

Target: scaffold0447; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 86 - 150
Target Start/End: Original strand, 4579 - 4643
Alignment:
Q  86 tatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaa 150  Q
    |||||||||||||||||| | |||| | |||||| ||  || |||||||||||||||||||||||    
T  4579 tatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaaa 4643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 86 - 150
Target Start/End: Original strand, 9193 - 9257
Alignment:
Q  86 tatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaa 150  Q
    |||||||||||||||||| | |||| | |||||| ||  || |||||||||||||||||||||||    
T  9193 tatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaaa 9257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 47 - 251
Target Start/End: Original strand, 32180 - 32383
Alignment:
Q  47 caccaacaacaactcattttctcaacaacaatc--atgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaa 144  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||| |  | ||| |||| | ||||||||||| | | || |||||||||||  || | ||||||||||| |||    
T  32180 caccaacaacatctcattt-ctcaacaacaaaccaaggat-tatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacaacaa 32277  T
Q  145 ttgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcataaca-acccattttcatacattatgaacatgt 243  Q
    ||||  | |||  || | | ||||||| ||||||||  |||||| ||| ||||| |||||| ||||| |||| ||||||||||||||| | |||||||||    
T  32278 ttgat-catgaaacatatcacaattcatcaacaacaattcataattcaccaattgagcatattttca-aacatacccattttcatacactttgaacatgt 32375  T
Q  244 tatttcat 251  Q
     |||||||    
T  32376 aatttcat 32383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 47 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 42123 - 41920
Alignment:
Q  47 caccaacaacaactcattttctcaacaacaatc--atgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaa 144  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||| |  | ||| |||| | ||||||||||| | | || |||||||||||  || | ||||||||||| |||    
T  42123 caccaacaacatctcattt-ctcaacaacaaaccaaggat-tatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacaacaa 42026  T
Q  145 ttgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcataaca-acccattttcatacattatgaacatgt 243  Q
    ||||  | |||  || | | ||||||| ||||||||  |||||| ||| ||||| |||||| ||||| |||| ||||||||||||||| | |||||||||    
T  42025 ttgat-catgaaacatatcacaattcatcaacaacaattcataattcaccaattgagcatattttca-aacatacccattttcatacactttgaacatgt 41928  T
Q  244 tatttcat 251  Q
     |||||||    
T  41927 aatttcat 41920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 78 - 181
Target Start/End: Original strand, 3260 - 3361
Alignment:
Q  78 tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaaca 177  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || | |||| | |||||| || ||| | ||||||||||||||||| |||| |||||  || | |||||||||||||    
T  3260 tcatgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaatt-aaacatgatt-tcatcacaattcaacaaca 3357  T
Q  178 acat 181  Q
    ||||    
T  3358 acat 3361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 413 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 9282 - 9203
Alignment:
Q  413 actaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaatt-ctccaatcttcaagttt 491  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| | |||   |||||  ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  9282 actaacccccttaccttagatgatgtttaatcttaacttaggcttcactttagctcctaattgcttcaatcttcaagttt 9203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 413 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 16180 - 16101
Alignment:
Q  413 actaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaatt-ctccaatcttcaagttt 491  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| | |||   |||||  ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  16180 actaacccccttaccttagatgatgtttaatcttaacttaggcttcactttagctcctaattgcttcaatcttcaagttt 16101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0151
Description:

Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 130 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 22609 - 22559
Alignment:
Q  130 caacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacat 181  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||||    
T  22609 caacaacaacatcaatt-aaacatgattcacatctcaattcaacaacaacat 22559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 398 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 128127 - 128052
Alignment:
Q  398 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaat 473  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||| ||| | |||||  |||||| |||| ||||||||    
T  128127 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcattttatctcctaat 128052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 197545 - 197390
Alignment:
Q  28 tcaacccattttacaaaat---caccaacaacaactcattttctcaacaacaat-catgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacata 123  Q
    ||||||||||||||||||    || ||||||||||||| || |||| || |||  |||||| |||||| |||||| |||| | |||| | |||||| ||     
T  197545 tcaacccattttacaaaactaacaacaacaacaactcaatt-ctcatcatcaaagcatgatttatgaagacccaaaccatgaatcatcaacaacaatatc 197447  T
Q  124 tctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacat 181  Q
     || |||||||||||||||||||| ||| ||| || || | |||||||||||||||||    
T  197446 acttagcaacaacaacatcaattg-aacatgaatctcatcacaattcaacaacaacat 197390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 47 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 846 - 745
Alignment:
Q  47 caccaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaat 145  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||   |||   ||||||||||| | | || |||||||||||  || ||||||||||||||||||    
T  846 caccaacaacatctcattt-ctcaacaacaaatcatgaatcatgccaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaacaacatcaat 748  T
Q  146 tga 148  Q
    |||    
T  747 tga 745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0467
Description:

Target: scaffold0467; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 398 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 10288 - 10218
Alignment:
Q  398 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctc 468  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||| | ||||| ||  | |||||  |||||||||||||||    
T  10288 atgattatgaagaagacaaacccccttaccttagatgatgattaaccccaacttaggcttcactttagctc 10218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 220 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 557 - 487
Alignment:
Q  220 cattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaa 290  Q
    ||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| | |||||||||||| |||  |||||||||| |||||    
T  557 cattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatctacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaa 487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 361 - 431
Target Start/End: Original strand, 22821 - 22890
Alignment:
Q  361 tttcatacaaaccaagaaaaattgcaaacaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttaccttag 431  Q
    |||||| |||| || ||||||||||||| ||  ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22821 tttcatccaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaac-atgattatgataaagactaacccccttaccttag 22890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 361 - 431
Target Start/End: Original strand, 27076 - 27145
Alignment:
Q  361 tttcatacaaaccaagaaaaattgcaaacaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttaccttag 431  Q
    |||||| |||| || ||||||||||||| ||  ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27076 tttcatccaaatcatgaaaaattgcaaagaaggaac-atgattatgataaagactaacccccttaccttag 27145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 361 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 1564 - 1495
Alignment:
Q  361 tttcatacaaaccaagaaaaattgcaaacaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttaccttag 431  Q
    |||||| |||| || ||||||||||||| ||  ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1564 tttcatccaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaac-atgattatgataaagactaacccccttaccttag 1495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 35
Target Start/End: Complemental strand, 3426 - 3392
Alignment:
Q  1 catcatcaaaatcaaacttcttctttatcaaccca 35  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3426 catcatcaaaatcaaacttcttcattatcaaccca 3392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 398 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 56045 - 55971
Alignment:
Q  398 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 472  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||| ||| |||||||  |||| | |||| |||||||    
T  56045 atgattatgatgaagactaaccccctgaccgtagataatgattaatccaaacttaggctttaatttatctcctaa 55971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 47 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 109732 - 109631
Alignment:
Q  47 caccaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaat 145  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||   ||| |  |||||||||| | | || |||||||||||  || ||||||||||||||||||    
T  109732 caccaacaacatctcattt-ctcaacaacaaatcatgaatcatgcaatcccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaacaacatcaat 109634  T
Q  146 tga 148  Q
    |||    
T  109633 tga 109631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1164 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1164
Description:

Target: scaffold1164; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 122
Target Start/End: Original strand, 1337 - 1433
Alignment:
Q  27 atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacat 122  Q
    ||||||||||||| || ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||   ||| | ||||||||||| ||| || |||||||||||    
T  1337 atcaacccattttcaccaaaacaccaacaacatctcattt-ctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgatttatcatcaacaacat 1433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 398 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 6022 - 5989
Alignment:
Q  398 atgattatgatgaagactaacccccttaccttag 431  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6022 atgattatgataaagactaacccccttaccttag 5989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 11977 - 11877
Alignment:
Q  47 caccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaatt 146  Q
    |||||| |||| ||||||| ||||||| |||||||||   ||| | || |||||||| | | || |||||||||||  || |||||||||||||||||||    
T  11977 caccaaaaacatctcattt-ctcaacaccaatcatgaaccatgcaaactcaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaacaacatcaatt 11879  T
Q  147 ga 148  Q
    ||    
T  11878 ga 11877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 398 - 427
Target Start/End: Original strand, 19514 - 19543
Alignment:
Q  398 atgattatgatgaagactaacccccttacc 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19514 atgattatgatgaagactaacccccttacc 19543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 130 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 23943 - 23863
Alignment:
Q  130 caacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttca 211  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||| ||||| | ||| || |||| ||||| ||| |||||||    
T  23943 caacaacaacatccattgaaacttgtttctcacctcaattcaac-acaacttatcacaaatcattaattaggcaaaatttca 23863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0095 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0095
Description:

Target: scaffold0095; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 48 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 33996 - 33897
Alignment:
Q  48 accaacaacaactcattttctcaacaacaa-tcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaatt 146  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||  ||| | ||||||||||| | | || |||||||||||  || |||||||||||||||||||    
T  33996 accaacaacatctcattt-ctcaacaacaaatcataatc-atgcatacccaagccatgaattattatcaacaacatcacttagcaacaacaacatcaatt 33899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0389 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0389
Description:

Target: scaffold0389; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 50 - 149
Target Start/End: Original strand, 10642 - 10741
Alignment:
Q  50 caacaacaactcattttctcaacaacaat-catgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattga 148  Q
    ||||||||| ||||||| ||| || |||| |||||  |||||||||||||||||| | | || | |||||||||  || ||||| |||||||||||||||    
T  10642 caacaacaattcatttt-tcatcatcaattcatgaattatgaacacccaagccatgaatgatcaacaacaacatcacttagcaaaaacaacatcaattga 10740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 165 - 270
Target Start/End: Original strand, 1411 - 1516
Alignment:
Q  165 caattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcataaca-accca-ttttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaatt 262  Q
    ||||||||||||||||   ||||| ||| |||||||||||| |||||| ||| ||||| |||||||||  | ||||||||| |||  | |||||||||||    
T  1411 caattcaacaacaacaaagcataattcaccaattaagcatattttcatcacatacccatttttcatac--tttgaacatgtaattcaaccaccaacaatt 1508  T
Q  263 catttatc 270  Q
    || |||||    
T  1509 caattatc 1516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 398 - 434
Target Start/End: Original strand, 8331 - 8367
Alignment:
Q  398 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggtt 434  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  8331 atgattatgatgaattctaacccccttaccttaggtt 8367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0103 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0103
Description:

Target: scaffold0103; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 76 - 148
Target Start/End: Original strand, 33668 - 33740
Alignment:
Q  76 aatcatgatatatgaacacccaagccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattga 148  Q
    ||||||||  ||||||||||| |||||| | |||| | |||||| ||  || |||||||||||||||||||||    
T  33668 aatcatgaattatgaacaccctagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattga 33740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 841 times since January 2019
Visitors: 4356