View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0718_high_25 (Length: 269)

Name: NF0718_high_25
Description: NF0718
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0718_high_25
NF0718_high_25
[»] chr5 (21 HSPs)
chr5 (1-243)||(25426628-25426870)
chr5 (1-243)||(12374-12616)
chr5 (1-243)||(18778002-18778244)
chr5 (1-243)||(19499899-19500141)
chr5 (1-243)||(22366491-22366733)
chr5 (1-243)||(21073605-21073847)
chr5 (1-243)||(43443405-43443647)
chr5 (1-243)||(4199995-4200237)
chr5 (1-243)||(27009841-27010083)
chr5 (11-243)||(23506965-23507196)
chr5 (10-243)||(27182578-27182810)
chr5 (1-191)||(29188294-29188483)
chr5 (10-243)||(22053864-22054096)
chr5 (10-243)||(18531098-18531330)
chr5 (1-232)||(34939289-34939518)
chr5 (13-111)||(20623100-20623198)
chr5 (13-111)||(21233562-21233660)
chr5 (13-111)||(25900440-25900538)
chr5 (13-111)||(16536328-16536426)
chr5 (13-111)||(37052875-37052973)
chr5 (199-239)||(29190482-29190522)
[»] chr2 (15 HSPs)
chr2 (1-243)||(19886671-19886913)
chr2 (24-243)||(17396697-17396916)
chr2 (10-243)||(19794735-19794967)
chr2 (10-238)||(462743-462970)
chr2 (10-243)||(8891242-8891474)
chr2 (10-243)||(20627344-20627576)
chr2 (10-243)||(36982472-36982704)
chr2 (11-243)||(43642989-43643220)
chr2 (10-243)||(24341420-24341652)
chr2 (1-243)||(7507866-7508107)
chr2 (13-243)||(25265424-25265653)
chr2 (13-111)||(19689435-19689533)
chr2 (13-111)||(23820202-23820300)
chr2 (13-111)||(14906474-14906572)
chr2 (13-111)||(20015142-20015240)
[»] chr6 (12 HSPs)
chr6 (1-243)||(25175563-25175805)
chr6 (1-243)||(27653993-27654235)
chr6 (1-243)||(16825762-16826006)
chr6 (1-239)||(14626140-14626377)
chr6 (1-239)||(1650115-1650352)
chr6 (10-232)||(23153458-23153679)
chr6 (1-232)||(1657770-1657999)
chr6 (1-243)||(35009461-35009702)
chr6 (1-232)||(15862484-15862712)
chr6 (1-175)||(29665941-29666115)
chr6 (11-64)||(27751603-27751656)
chr6 (19-79)||(29605612-29605672)
[»] chr4 (16 HSPs)
chr4 (1-243)||(47357654-47357896)
chr4 (1-243)||(10644219-10644461)
chr4 (19-235)||(13048261-13048477)
chr4 (10-243)||(13246430-13246662)
chr4 (11-243)||(54118276-54118507)
chr4 (10-243)||(15675120-15675352)
chr4 (10-243)||(31115629-31115861)
chr4 (10-143)||(121989-122121)
chr4 (10-175)||(10104281-10104445)
chr4 (13-243)||(26680201-26680429)
chr4 (146-243)||(111395-111492)
chr4 (13-111)||(10488693-10488791)
chr4 (13-111)||(16327960-16328058)
chr4 (10-175)||(40885585-40885749)
chr4 (199-243)||(10104450-10104494)
chr4 (10-42)||(33240900-33240932)
[»] chr7 (19 HSPs)
chr7 (1-243)||(10989410-10989651)
chr7 (1-243)||(2437457-2437699)
chr7 (1-243)||(13911034-13911277)
chr7 (1-243)||(13572676-13572918)
chr7 (10-243)||(18253866-18254098)
chr7 (13-237)||(25292372-25292595)
chr7 (1-243)||(16478972-16479213)
chr7 (1-243)||(47481053-47481294)
chr7 (10-243)||(13037045-13037277)
chr7 (10-238)||(11580770-11580997)
chr7 (10-241)||(16211768-16211998)
chr7 (10-243)||(36052667-36052896)
chr7 (10-243)||(3059966-3060198)
chr7 (1-243)||(13321014-13321257)
chr7 (13-243)||(7293017-7293245)
chr7 (13-111)||(11516358-11516456)
chr7 (13-111)||(15441598-15441696)
chr7 (13-111)||(30262163-30262261)
chr7 (16-100)||(296003-296087)
[»] chr8 (19 HSPs)
chr8 (1-243)||(30120722-30120964)
chr8 (53-243)||(222753-222943)
chr8 (53-243)||(736376-736566)
chr8 (53-243)||(860271-860461)
chr8 (1-243)||(16674402-16674644)
chr8 (1-243)||(21844582-21844824)
chr8 (1-243)||(21851975-21852217)
chr8 (10-243)||(43373499-43373731)
chr8 (1-239)||(6774268-6774505)
chr8 (1-239)||(24548986-24549223)
chr8 (13-244)||(16193750-16193980)
chr8 (10-232)||(24928822-24929043)
chr8 (10-243)||(16405006-16405235)
chr8 (1-232)||(17345581-17345810)
chr8 (13-243)||(22907248-22907476)
chr8 (53-115)||(691908-691970)
chr8 (13-111)||(5238218-5238316)
chr8 (13-111)||(24661282-24661380)
chr8 (13-111)||(43685677-43685775)
[»] chr3 (25 HSPs)
chr3 (1-243)||(55316219-55316461)
chr3 (1-243)||(41270075-41270317)
chr3 (1-243)||(16821139-16821381)
chr3 (10-243)||(14842592-14842824)
chr3 (24-243)||(13975766-13975985)
chr3 (24-243)||(45860805-45861024)
chr3 (10-243)||(15936658-15936890)
chr3 (10-244)||(51158049-51158282)
chr3 (10-243)||(15859055-15859287)
chr3 (24-243)||(13954934-13955153)
chr3 (10-240)||(15938500-15938729)
chr3 (10-243)||(12030178-12030410)
chr3 (1-239)||(15614838-15615075)
chr3 (10-243)||(2049810-2050042)
chr3 (10-232)||(13838905-13839126)
chr3 (13-243)||(17912516-17912744)
chr3 (13-111)||(2449272-2449370)
chr3 (13-243)||(16744149-16744377)
chr3 (130-243)||(47984650-47984763)
chr3 (130-243)||(47993937-47994050)
chr3 (130-243)||(48003224-48003337)
chr3 (130-243)||(48012510-48012623)
chr3 (1-75)||(12902104-12902178)
chr3 (1-75)||(54651625-54651699)
chr3 (202-243)||(15468555-15468596)
[»] chr1 (14 HSPs)
chr1 (2-243)||(18601129-18601370)
chr1 (1-243)||(5072398-5072640)
chr1 (1-243)||(22227809-22228050)
chr1 (1-243)||(22232506-22232747)
chr1 (10-243)||(20931345-20931577)
chr1 (10-243)||(20913037-20913262)
chr1 (1-239)||(2116258-2116496)
chr1 (10-243)||(20893657-20893889)
chr1 (13-243)||(41394222-41394451)
chr1 (11-243)||(20445679-20445910)
chr1 (19-243)||(20531444-20531667)
chr1 (5-177)||(45051489-45051660)
chr1 (13-243)||(37844484-37844714)
chr1 (13-111)||(51452623-51452721)
[»] scaffold0023 (3 HSPs)
scaffold0023 (1-243)||(36093-36335)
scaffold0023 (10-243)||(48598-48830)
scaffold0023 (1-30)||(169922-169951)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (1-243)||(42997-43239)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (1-243)||(35-277)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (1-243)||(31685-31928)
scaffold0008 (10-243)||(128200-128431)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (1-243)||(64533-64780)
scaffold0026 (10-243)||(107747-107979)
[»] scaffold0772 (1 HSPs)
scaffold0772 (13-228)||(5544-5758)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (1-243)||(14071-14312)
scaffold0139 (1-243)||(21126-21367)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (10-241)||(3613-3843)
scaffold0266 (13-243)||(1124-1353)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (1-243)||(5226-5466)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (10-243)||(6095-6326)
[»] scaffold0175 (1 HSPs)
scaffold0175 (10-243)||(987-1218)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (10-243)||(48187-48419)
[»] scaffold0498 (1 HSPs)
scaffold0498 (11-243)||(8878-9109)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (1-243)||(12115-12354)
[»] scaffold0215 (2 HSPs)
scaffold0215 (1-239)||(9359-9596)
scaffold0215 (1-239)||(16257-16494)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (1-243)||(3722-3964)
[»] scaffold0025 (2 HSPs)
scaffold0025 (10-243)||(148721-148953)
scaffold0025 (10-243)||(8849-9081)
[»] scaffold1711 (1 HSPs)
scaffold1711 (1-137)||(1314-1450)
[»] scaffold0195 (2 HSPs)
scaffold0195 (10-243)||(19206-19438)
scaffold0195 (10-243)||(21290-21522)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (11-243)||(123196-123427)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (10-243)||(36944-37176)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (10-243)||(5092-5324)
[»] scaffold0162 (2 HSPs)
scaffold0162 (13-243)||(26449-26678)
scaffold0162 (1-126)||(8202-8327)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (10-232)||(247473-247694)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (10-232)||(171916-172137)
scaffold0001 (10-232)||(177619-177840)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (1-239)||(2966-3204)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (10-239)||(41733-41961)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (10-237)||(272031-272257)
[»] scaffold1542 (1 HSPs)
scaffold1542 (10-243)||(565-797)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (1-147)||(13335-13480)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (1-243)||(34482-34724)
[»] scaffold1560 (1 HSPs)
scaffold1560 (137-243)||(9-115)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (1-243)||(41648-41889)
[»] scaffold0104 (1 HSPs)
scaffold0104 (137-243)||(48514-48620)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (10-125)||(51213-51328)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (13-243)||(13506-13735)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (10-125)||(89485-89600)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (13-243)||(37100-37328)
[»] scaffold0622 (1 HSPs)
scaffold0622 (146-243)||(9382-9479)
[»] scaffold0361 (1 HSPs)
scaffold0361 (1-72)||(3360-3431)
[»] scaffold0141 (2 HSPs)
scaffold0141 (13-111)||(22671-22769)
scaffold0141 (13-111)||(26926-27024)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (13-111)||(1616-1714)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (1-142)||(56121-56262)
[»] scaffold0066 (2 HSPs)
scaffold0066 (29-75)||(45198-45244)
scaffold0066 (6-75)||(54584-54653)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 239; Significance: 1e-132; HSPs: 21)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 25426870 - 25426628
Alignment:
Q  1 gtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25426870 gtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttat 25426771  T
Q  101 gaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25426770 gaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgatt 25426671  T
Q  201 gatgaataattgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25426670 gatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 25426628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 12616 - 12374
Alignment:
Q  1 gtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12616 gtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttat 12517  T
Q  101 gaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12516 gaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgatt 12417  T
Q  201 gatgaataattgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12416 gatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 12374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 18778002 - 18778244
Alignment:
Q  1 gtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18778002 gtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttat 18778101  T
Q  101 gaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgatt 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18778102 gaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatattatttgatattatgatt 18778201  T
Q  201 gatgaataattgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18778202 gatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 18778244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 19500141 - 19499899
Alignment:
Q  1 gtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19500141 gtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttat 19500042  T
Q  101 gaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19500041 gaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgatt 19499942  T
Q  201 gatgaataattgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 243  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  19499941 gattaataattgctttggtatgcatattcatggattgatgatg 19499899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 22366491 - 22366733
Alignment:
Q  1 gtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22366491 gtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttat 22366590  T
Q  101 gaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgatt 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22366591 gaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgatt 22366690  T
Q  201 gatgaataattgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22366691 gatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 22366733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 21073605 - 21073847
Alignment:
Q  1 gtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21073605 gtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaatggatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttat 21073704  T
Q  101 gaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgatt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21073705 gaagattgtgctaaagtggtgaatttcttctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatcaatgttatttgatattatgatt 21073804  T
Q  201 gatgaataattgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21073805 gatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 21073847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 43443405 - 43443647
Alignment:
Q  1 gtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43443405 gtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttat 43443504  T
Q  101 gaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgatt 200  Q
    ||| |||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43443505 gaatattgtgctcaattggtgaatttcttctaagttgttgttgatttgagatgtgagtcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgatt 43443604  T
Q  201 gatgaataattgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 243  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  43443605 gatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 43443647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 4199995 - 4200237
Alignment:
Q  1 gtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttat 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4199995 gtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttat 4200094  T
Q  101 gaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgatt 200  Q
    ||| ||| ||||||| ||||||||||||| || ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4200095 gaatattatgctaaattggtgaatttctcttatgttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgatt 4200194  T
Q  201 gatgaataattgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 243  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| |||||| |||||||||    
T  4200195 gatgaatgattgcttgggtttgcatattcatgggttgatgatg 4200237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 27010083 - 27009841
Alignment:
Q  1 gtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| | |||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||    
T  27010083 gtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgagtgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttat 27009984  T
Q  101 gaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgatt 200  Q
    ||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27009983 gaatattgtactcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgatt 27009884  T
Q  201 gatgaataattgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 243  Q
     |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||    
T  27009883 aatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgttgatg 27009841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 11 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 23507196 - 23506965
Alignment:
Q  11 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtg 110  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||    
T  23507196 tgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtg 23507097  T
Q  111 ctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataat 210  Q
    || || |||||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||||||||    
T  23507096 ctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaataat 23506998  T
Q  211 tgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 243  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  23506997 tgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 23506965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 10 - 243
Target Start/End: Original strand, 27182578 - 27182810
Alignment:
Q  10 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgt 109  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| |||| |||||    
T  27182578 ctgtgatgatatgtttgtatgcatgaactgatgataattgtatgattgttgatgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgt 27182677  T
Q  110 gctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataa 209  Q
    ||| || |||||||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||||| |    
T  27182678 gctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatca 27182776  T
Q  210 ttgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 243  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||    
T  27182777 ttgcttgagtatgcatattcatgaattgatgatg 27182810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 29188294 - 29188483
Alignment:
Q  1 gtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttat 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |    
T  29188294 gtgctcttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgt 29188393  T
Q  101 gaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgat 191  Q
    ||| || ||||| || |||||||||| | ||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| |||||    
T  29188394 gaaaatggtgctcaattggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattgat 29188483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 10 - 243
Target Start/End: Original strand, 22053864 - 22054096
Alignment:
Q  10 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgt 109  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||  ||||| |||| |||||    
T  22053864 ctgtgatgatatgtttgtatgtatgaattgatgatagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgt 22053963  T
Q  110 gctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataa 209  Q
    ||| || |||||||||| | ||||||||||||| | ||||| | |||||| ||||||| |||||||||   ||||| ||||| || |  ||||||||| |    
T  22053964 gctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatgaatca 22054062  T
Q  210 ttgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 243  Q
    |||||||||| | |||| ||||| ||||||||||    
T  22054063 ttgcttgggtctacatattcatgaattgatgatg 22054096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 243
Target Start/End: Original strand, 18531098 - 18531330
Alignment:
Q  10 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgt 109  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||  ||||| |||| |||||    
T  18531098 ctgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgt 18531197  T
Q  110 gctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataa 209  Q
    | | || |||||||||| | ||||||||||||| | ||||| | |||||| ||||||| |||||||||   ||||| ||||| || |  ||||||||| |    
T  18531198 gttcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatgaatca 18531296  T
Q  210 ttgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 243  Q
    ||||| |||||| |||| ||||| ||||||||||    
T  18531297 ttgctcgggtatacatattcatgaattgatgatg 18531330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 34939518 - 34939289
Alignment:
Q  1 gtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttat 100  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| |||||||||  |||| |||||||  |||||||    
T  34939518 gtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttat 34939419  T
Q  101 gaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgatt 200  Q
    ||| |||||||| || || || |||| | ||||||  |||| || ||||||| |||||||||||||  |||||||||   ||||| ||||| || |  ||    
T  34939418 gaaaattgtgctcaattgatggattt-tgctaagtcattgtgaa-ttgagttatgattcttgttcagttgatgttattgctgttaattgatgttgttgtt 34939321  T
Q  201 gatgaataattgcttgggtatgcataatcatg 232  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| |||||    
T  34939320 gatgaatcactgcttgggtatgcatattcatg 34939289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 20623198 - 20623100
Alignment:
Q  13 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgc 111  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||  ||||||| |||||||||| |||||||    
T  20623198 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 20623100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 111
Target Start/End: Original strand, 21233562 - 21233660
Alignment:
Q  13 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgc 111  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||  ||||||| |||||||||| |||||||    
T  21233562 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 21233660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 111
Target Start/End: Original strand, 25900440 - 25900538
Alignment:
Q  13 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgc 111  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||||| |||||   |||||  ||||||| |||||||||| |||||||    
T  25900440 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggttaaattatatgtttgaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 25900538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 16536426 - 16536328
Alignment:
Q  13 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgc 111  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||   |||||  ||||||| |||||||||| |||||||    
T  16536426 tgatgatatgtttgtatgcatgaatttataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 16536328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 37052973 - 37052875
Alignment:
Q  13 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgc 111  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||   |||||   |||||| |||||||||| |||||||    
T  37052973 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtggaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 37052875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 239
Target Start/End: Original strand, 29190482 - 29190522
Alignment:
Q  199 ttgatgaataattgcttgggtatgcataatcatggattgat 239  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  29190482 ttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgat 29190522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 235; Significance: 1e-130; HSPs: 15)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 19886671 - 19886913
Alignment:
Q  1 gtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19886671 gtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttat 19886770  T
Q  101 gaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19886771 gaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgatt 19886870  T
Q  201 gatgaataattgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19886871 gatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 19886913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 24 - 243
Target Start/End: Original strand, 17396697 - 17396916
Alignment:
Q  24 ttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaa 123  Q
    |||||||||||||||| || |  |||||| |||||||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||    
T  17396697 ttgtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaataagtaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaa 17396796  T
Q  124 tttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgc 223  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||    
T  17396797 tttctcctaagttgtcattaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattaatggataattgcttgggtttgc 17396896  T
Q  224 ataatcatggattgatgatg 243  Q
    ||| |||||||||| |||||    
T  17396897 atattcatggattgttgatg 17396916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 10 - 243
Target Start/End: Original strand, 19794735 - 19794967
Alignment:
Q  10 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgt 109  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| |||| |||||    
T  19794735 ctgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgt 19794834  T
Q  110 gctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataa 209  Q
    ||| || |||||||||| | ||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| |||||||||    |||| ||||| ||||  ||||||||| |    
T  19794835 gctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagttatgattcttgttcaattgatgttatttccgttaattgatgttatagttgatgaatca 19794933  T
Q  210 ttgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 243  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19794934 ttgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 19794967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 10 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 462970 - 462743
Alignment:
Q  10 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgt 109  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  462970 ctgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgt 462871  T
Q  110 gctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataa 209  Q
    | | || |||||||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| |  |||||||||||| |    
T  462870 gttcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgtcgtgattgatgaatca 462772  T
Q  210 ttgcttgggtatgcataatcatggattga 238  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  462771 ttgcttgggtatgcatattcatgaattga 462743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 8891474 - 8891242
Alignment:
Q  10 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgt 109  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| |||| |||||    
T  8891474 ctgtgataatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggcgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgt 8891375  T
Q  110 gctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataa 209  Q
    ||| || |||||||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||  | ||| ||||| || || ||||||||| |    
T  8891374 gctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctattaattgatgttgtggttgatgaatca 8891276  T
Q  210 ttgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 243  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  8891275 ttgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 8891242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 10 - 243
Target Start/End: Original strand, 20627344 - 20627576
Alignment:
Q  10 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgt 109  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || |||| |||||    
T  20627344 ctgtgatgatatgtttgtatgcacgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtccaaatatgtaaaaatgataacttgtgaaaattgt 20627443  T
Q  110 gctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataa 209  Q
    ||| || |||||||||| |  |||||||||||||||||||| | | |||||||||||| |||| |||||  ||||| ||| | || || ||||||||| |    
T  20627444 gctcaattggtgaattt-tgttaagttgttgttaatttgagatttaattcttgttcaattgattttatggttgttaattggtgttgtggttgatgaatca 20627542  T
Q  210 ttgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 243  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||    
T  20627543 ttgcttgggtatggatattcatgaattgaggatg 20627576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 10 - 243
Target Start/End: Original strand, 36982472 - 36982704
Alignment:
Q  10 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgt 109  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |||||  |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  36982472 ctgtgatgatatgtttgtattcatgaattgatgataattgtaagattgctggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgt 36982571  T
Q  110 gctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataa 209  Q
    ||| || |||||||||| | | ||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||| |||||||||   ||||| ||||| || |  ||||||||| |    
T  36982572 gctcaattggtgaattt-tgccaagttgttgttgaattgagttatgattcctgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttgttgttgatgaatca 36982670  T
Q  210 ttgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 243  Q
    ||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  36982671 ttgtttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 36982704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 11 - 243
Target Start/End: Original strand, 43642989 - 43643220
Alignment:
Q  11 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtg 110  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | ||||| |||||| |||| ||||||    
T  43642989 tgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgttaagttgtgaaaattgtg 43643088  T
Q  111 ctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataat 210  Q
    || || |||||||||| | || ||||||| |||||||||| | |||||||||||||| ||||| |||   ||||| ||||| || |  ||||||||| |     
T  43643089 ctcaattggtgaattt-ttcttagttgttattaatttgagatatgattcttgttcaattgatgctattgctgttaattgatgttgtagttgatgaatcac 43643187  T
Q  211 tgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 243  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  43643188 tgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 43643220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 243
Target Start/End: Original strand, 24341420 - 24341652
Alignment:
Q  10 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgt 109  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| |||||||  |||| |||||||  ||||| |||| |||||    
T  24341420 ctgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattatatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgt 24341519  T
Q  110 gctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataa 209  Q
    ||| || |||||||||| | ||||||||||||| | ||||| | |||||| ||||||| |||||||||   ||||| ||||| ||    ||||||||| |    
T  24341520 gctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttcctgttgatgaatca 24341618  T
Q  210 ttgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 243  Q
    |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||    
T  24341619 ttgcttgggtatacatattcatgaattgatgatg 24341652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 7507866 - 7508107
Alignment:
Q  1 gtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttat 100  Q
    ||||||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  7507866 gtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttat 7507965  T
Q  101 gaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttg-ttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgat 199  Q
    ||| |||||| | || ||||||||||   ||||||||||||||| ||||| | |||||| || || || |||||||||   ||||||||||| || |  |    
T  7507966 gaaaattgtgttcaattggtgaattt-ggctaagttgttgttaa-ttgagatatgattcatgttttaattgatgttattgttgttatttgatgttgttgt 7508063  T
Q  200 tgatgaataattgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 243  Q
    |||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7508064 tgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 7508107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 243
Target Start/End: Original strand, 25265424 - 25265653
Alignment:
Q  13 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgct 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||  ||||| |||| ||||||||    
T  25265424 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgct 25265523  T
Q  113 aaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattg 212  Q
     || |||||||||| | ||| ||||||||| | ||  | || ||  | ||||||| ||||||| |   ||||| ||||| || |  || |||||| || |    
T  25265524 caattggtgaattt-tgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttgttgttaattgatgttgttgtttatgaatcatgg 25265622  T
Q  213 cttgggtatgcataatcatggattgatgatg 243  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  25265623 cttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 25265653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 111
Target Start/End: Original strand, 19689435 - 19689533
Alignment:
Q  13 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgc 111  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||  ||||||| |||||||||| |||||||    
T  19689435 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 19689533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 23820300 - 23820202
Alignment:
Q  13 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgc 111  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||  ||||||| |||||||||| |||||||    
T  23820300 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 23820202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 111
Target Start/End: Original strand, 14906474 - 14906572
Alignment:
Q  13 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgc 111  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||   |||||  ||||||| |||||||||| |||||||    
T  14906474 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 14906572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 20015240 - 20015142
Alignment:
Q  13 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgc 111  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||  || |||| | ||||||||| ||||||||||||   |||||  ||||||| |||||||||| |||||||    
T  20015240 tgatgatatgtttgcatgcatgaattgataataattgtgtgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 20015142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 231; Significance: 1e-127; HSPs: 12)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 25175805 - 25175563
Alignment:
Q  1 gtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttat 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25175805 gtgctcttgctgtgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttat 25175706  T
Q  101 gaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgatt 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25175705 gaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgatt 25175606  T
Q  201 gatgaataattgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25175605 gatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 25175563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 27653993 - 27654235
Alignment:
Q  1 gtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttat 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27653993 gtgctcttgctgtgatgttatgcttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttat 27654092  T
Q  101 gaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgatt 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27654093 gaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttccaatgatgttatgaatgttatttgatattatgatt 27654192  T
Q  201 gatgaataattgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  27654193 gatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattaatgatg 27654235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 16825762 - 16826006
Alignment:
Q  1 gtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgta--taattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagtt 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16825762 gtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtaattaattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagtt 16825861  T
Q  99 atgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatga 198  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16825862 atgaagattgtgctaaattggtggatttctcctaatttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatctgatattatga 16825961  T
Q  199 ttgatgaataattgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 243  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||    
T  16825962 ttgatgaataattgctttgttatgcatattcatggattgatgatg 16826006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Original strand, 14626140 - 14626377
Alignment:
Q  1 gtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  14626140 gtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttat 14626239  T
Q  101 gaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgatt 200  Q
    ||| ||||||   || ||||||| || | ||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||| || |  ||    
T  14626240 gaaaattgtgtgcaattggtgaa-ttatgctaagttgttgttaacttgagatttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtagtt 14626338  T
Q  201 gatgaataattgcttgggtatgcataatcatggattgat 239  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  14626339 gatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgat 14626377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Original strand, 1650115 - 1650352
Alignment:
Q  1 gtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttat 100  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |    
T  1650115 gtgctcttactgtgatgttacgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaagaatgataagttgt 1650214  T
Q  101 gaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgatt 200  Q
    ||| |||||||| || |||||||||| | ||||||| | ||||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||   ||||||||||| || |  ||    
T  1650215 gaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttatggttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttattgttgttatttgatgttgttgtt 1650313  T
Q  201 gatgaataattgcttgggtatgcataatcatggattgat 239  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  1650314 gatgaatcactgcttgggtatgcatattcatgaattgat 1650352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 23153679 - 23153458
Alignment:
Q  10 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgt 109  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| |||| |||||    
T  23153679 ctgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgt 23153580  T
Q  110 gctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataa 209  Q
    ||| || |||||||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||| |||||  ||||| ||||| || || ||||||||| |    
T  23153579 gctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatattatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatca 23153481  T
Q  210 ttgcttgggtatgcataatcatg 232  Q
    || ||||||||| |||| |||||    
T  23153480 ttacttgggtatacatattcatg 23153458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 1657770 - 1657999
Alignment:
Q  1 gtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttat 100  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| |||||||||  |||| |||||||  |||||||    
T  1657770 gtgctctaactgtgatgttatgtttggatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttat 1657869  T
Q  101 gaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgatt 200  Q
    ||| |||||||| || || || |||| | ||||||| |||| || ||||||| |||||||||||||  |||||||||   ||||| ||||| || |  ||    
T  1657870 gaaaattgtgctcaattgatggattt-tgctaagttattgtgaa-ttgagttatgattcttgttcagttgatgttattgttgttaattgatgttgttgtt 1657967  T
Q  201 gatgaataattgcttgggtatgcataatcatg 232  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| |||||    
T  1657968 gatgaatcactgcttgggtatgcatattcatg 1657999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 35009461 - 35009702
Alignment:
Q  1 gtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttat 100  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||  ||||| |    
T  35009461 gtgctctaactgtgatgttaagtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagtttt 35009560  T
Q  101 gaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgatt 200  Q
    ||| |||||||| || |||||||||| | ||| ||||||||| | ||  | || ||  | ||||||| ||||||| |   ||||| ||||| || |  ||    
T  35009561 gaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttgttgttaattgatgttgttgtt 35009659  T
Q  201 gatgaataattgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 243  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  35009660 gatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 35009702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 15862712 - 15862484
Alignment:
Q  1 gtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttat 100  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| |||||||||  |||| | |||||  |||||||    
T  15862712 gtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaattatgtataaatgtgaagttat 15862613  T
Q  101 gaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgatt 200  Q
    ||| |||||||| || || || |||| | ||||||| |||| || ||||||| |||||||||||| | | |||||||   || || ||||| || |  ||    
T  15862612 gaaaattgtgctcaattgatggattt-tgctaagttattgtgaa-ttgagttatgattcttgttc-atttatgttattgctgataattgatgttgttgtt 15862516  T
Q  201 gatgaataattgcttgggtatgcataatcatg 232  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| |||||    
T  15862515 gatgaatcactgcttgggtatgcatattcatg 15862484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 29666115 - 29665941
Alignment:
Q  1 gtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatg-ttcata-tatgcaaaaatgataagtt 98  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||  |||| ||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||| |||| | |||||| |||||  |||||    
T  29666115 gtgctctagctgtgatgttattttcttatgtatgaattgatgataattgtatgattgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgcataaatgtcaagtt 29666016  T
Q  99 atgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgtt 175  Q
    ||||| ||||| || || |||||||||| | ||||||||||||| |  |||| | |||||| ||||||| |||||||    
T  29666015 atgaa-attgtactcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaaatgagatatgattcatgttcaattgatgtt 29665941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 27751656 - 27751603
Alignment:
Q  11 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtga 64  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||    
T  27751656 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgacaattgtatgattgttggtga 27751603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 29605672 - 29605612
Alignment:
Q  19 tatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcata 79  Q
    |||||||| |||||||||||  || || ||| ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  29605672 tatgtttgaatgcatgaattagtgataattgaattgttgttggtgaaattacatgttcata 29605612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 223; Significance: 1e-123; HSPs: 16)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 47357896 - 47357654
Alignment:
Q  1 gtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47357896 gtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatggattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttat 47357797  T
Q  101 gaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgatt 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47357796 gaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgatt 47357697  T
Q  201 gatgaataattgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 243  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  47357696 gatgaataattgattgggtatgtatattcatggattgatgatg 47357654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 10644461 - 10644219
Alignment:
Q  1 gtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  10644461 gtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttat 10644362  T
Q  101 gaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgatt 200  Q
    ||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10644361 gagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgatt 10644262  T
Q  201 gatgaataattgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 243  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  10644261 gatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 10644219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 19 - 235
Target Start/End: Original strand, 13048261 - 13048477
Alignment:
Q  19 tatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaagtg 118  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||| || ||    
T  13048261 tatgtttgtatgcatgatttgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaaggataagttatgaatattgtgctcaattg 13048360  T
Q  119 gtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttggg 218  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  13048361 atgaatttctcctaagttgttgttagtttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttattagataatatgattaatgaataattgcttggg 13048460  T
Q  219 tatgcataatcatggat 235  Q
    | |||||| ||||||||    
T  13048461 tttgcatattcatggat 13048477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 10 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 13246662 - 13246430
Alignment:
Q  10 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgt 109  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| |||| |||||    
T  13246662 ctgtgatgatatgtttgtatgcatgaattaatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgt 13246563  T
Q  110 gctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataa 209  Q
    ||| || |||||||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||||| |    
T  13246562 gctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatca 13246464  T
Q  210 ttgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 243  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  13246463 ttgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 13246430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 11 - 243
Target Start/End: Original strand, 54118276 - 54118507
Alignment:
Q  11 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtg 110  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | || ||||||||| |||| ||||||    
T  54118276 tgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaattgataagttgtgaaaattgtg 54118375  T
Q  111 ctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataat 210  Q
    || || |||||||||| | ||||||||||||||  || |||| |||||||||||||| |||||||||   ||||| ||||| || || ||||||||| ||    
T  54118376 ctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagatttagttatgattcttgttcaattgatgttatagttgttaattgatgttgtggttgatgaatcat 54118474  T
Q  211 tgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 243  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  54118475 tgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 54118507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 10 - 243
Target Start/End: Original strand, 15675120 - 15675352
Alignment:
Q  10 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgt 109  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||  ||||| |||| |||||    
T  15675120 ctgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgt 15675219  T
Q  110 gctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataa 209  Q
    ||| || |||||||||| | ||||||||||||| | ||||| | |||||| ||||||| |||||||||   ||||| ||||| || |  ||||||||| |    
T  15675220 gctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttgttgttgatgaatca 15675318  T
Q  210 ttgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 243  Q
    |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||    
T  15675319 ttgcttgggtatacatattcatgaattgatgatg 15675352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 10 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 31115861 - 31115629
Alignment:
Q  10 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgt 109  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||   |||| |||||||  ||||| |||| ||| |    
T  31115861 ctgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttccattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattat 31115762  T
Q  110 gctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataa 209  Q
    ||| || |||||||||| ||||||||||||||| | ||||| | |||||| ||||||| |||||||||   ||||| ||||| || |  ||||||||| |    
T  31115761 gctcaattggtgaattt-tcctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttgttgttgatgaatca 31115663  T
Q  210 ttgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 243  Q
    |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||    
T  31115662 ttgcttgggtatacatattcatgaattgatgatg 31115629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 10 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 122121 - 121989
Alignment:
Q  10 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgt 109  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  122121 ctgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgt 122022  T
Q  110 gctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgtta 143  Q
    ||| || |||||||||| | ||||||||||||||    
T  122021 gctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgtta 121989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 10 - 175
Target Start/End: Original strand, 10104281 - 10104445
Alignment:
Q  10 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgt 109  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||  ||||| |||| |||||    
T  10104281 ctgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgt 10104380  T
Q  110 gctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgtt 175  Q
    ||| || |||||||||| | ||||||||||||| | ||||| | |||||| ||||||| |||||||    
T  10104381 gctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgtt 10104445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 26680429 - 26680201
Alignment:
Q  13 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgct 112  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||||| |||||||     
T  26680429 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgca 26680330  T
Q  113 aaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattg 212  Q
    |||  | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||| || |  ||||||||| ||||    
T  26680329 aaatagatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcattg 26680232  T
Q  213 cttgggtatgcataatcatggattgatgatg 243  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  26680231 cttgggtatacatattcatggattgatgatg 26680201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 146 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 111492 - 111395
Alignment:
Q  146 ttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 243  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  111492 ttgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 111395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 10488791 - 10488693
Alignment:
Q  13 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgc 111  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||   |||||  ||||||| |||||||||| |||||||    
T  10488791 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 10488693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 111
Target Start/End: Original strand, 16327960 - 16328058
Alignment:
Q  13 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgc 111  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||   |||||  ||||||| |||||||||| |||||||    
T  16327960 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 16328058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 175
Target Start/End: Original strand, 40885585 - 40885749
Alignment:
Q  10 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcata-tatgcaaaaatgataagttatgaagattg 108  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||| || || ||| ||  ||||||||||||||||||||||| | |||| | |||||  |||||||||| |||     
T  40885585 ctgtggtgctatgtttgtatgcatgaattggtgataattgaatgtttgttggtgaaattacatgttcaaagtatgtataaatgtcaagttatgaa-atta 40885683  T
Q  109 tgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgtt 175  Q
    |||| || ||||||| || | ||||||| ||||| | ||||| | |||||| ||||||| |||||||    
T  40885684 tgctcaattggtgaactt-tgctaagttattgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgtt 40885749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 243
Target Start/End: Original strand, 10104450 - 10104494
Alignment:
Q  199 ttgatgaataattgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 243  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||    
T  10104450 ttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatgaattgatgatg 10104494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 10 - 42
Target Start/End: Complemental strand, 33240932 - 33240900
Alignment:
Q  10 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatg 42  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33240932 ctgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatg 33240900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 211; Significance: 1e-116; HSPs: 19)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 10989651 - 10989410
Alignment:
Q  1 gtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10989651 gtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttat 10989552  T
Q  101 gaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgatt 200  Q
    ||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10989551 gaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttg-taatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgatt 10989453  T
Q  201 gatgaataattgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 243  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  10989452 gatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 10989410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 2437699 - 2437457
Alignment:
Q  1 gtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttat 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2437699 gtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttat 2437600  T
Q  101 gaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgatt 200  Q
    |||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2437599 gaagattgtgttcaattggtgaatttttcctaagttgttgttaatatgagatttgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgatt 2437500  T
Q  201 gatgaataattgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 243  Q
    |||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||    
T  2437499 gatgaataattgcttgagtttgcatattcatggattgatgatg 2437457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 13911034 - 13911277
Alignment:
Q  1 gtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttat 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13911034 gtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttaattgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttat 13911133  T
Q  101 gaagattgtgctaaagtggtgaatttctcct-aagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgat 199  Q
    ||| ||| |||| || ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13911134 gaatattatgctcaattggtgaatttctcctaaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgat 13911233  T
Q  200 tgatgaataattgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 243  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  13911234 tgatgaataatttcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 13911277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 13572918 - 13572676
Alignment:
Q  1 gtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| | |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||    
T  13572918 gtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtgtgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttat 13572819  T
Q  101 gaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgatt 200  Q
    ||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13572818 gaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgatt 13572719  T
Q  201 gatgaataattgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 243  Q
     |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||    
T  13572718 aatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgttgatg 13572676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 10 - 243
Target Start/End: Original strand, 18253866 - 18254098
Alignment:
Q  10 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgt 109  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||| |||||    
T  18253866 ctgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgtaaaaatgataagttgtgaaaattgt 18253965  T
Q  110 gctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataa 209  Q
    ||| || |||||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  18253966 gctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaattgatgttgtgattgatgaataa 18254064  T
Q  210 ttgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 243  Q
    |||| || ||||||||| ||||||||||||||||    
T  18254065 ttgcctgagtatgcatattcatggattgatgatg 18254098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Original strand, 25292372 - 25292595
Alignment:
Q  13 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgct 112  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||| || |  |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||| |||||| ||||||||    
T  25292372 tgatgatatgtttgtatgtatgaattgttgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaaggataagctatgaatattgtgct 25292471  T
Q  113 aaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattg 212  Q
     || ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  25292472 caattggtgaatt-ctcctaggttgtcgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgactaatgaataattg 25292570  T
Q  213 cttgggtatgcataatcatggattg 237  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||    
T  25292571 cttgggtttgcatattcatggattg 25292595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 16478972 - 16479213
Alignment:
Q  1 gtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttat 100  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |    
T  16478972 gtgctcttactgcgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgt 16479071  T
Q  101 gaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgatt 200  Q
    ||| |||||||| || |||||||||| |  |||||| || |||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||   ||||||||||| || |  ||    
T  16479072 gaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgttaagttatttttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttattgttgttatttgatgttgttgtt 16479170  T
Q  201 gatgaataattgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 243  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16479171 gatgaatcactgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 16479213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 47481053 - 47481294
Alignment:
Q  1 gtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttat 100  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |    
T  47481053 gtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgt 47481152  T
Q  101 gaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgatt 200  Q
    ||| |||||| | || |||||||||| | ||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| |||||||||   | ||| ||||| || |  ||    
T  47481153 gaaaattgtgttcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagttatgattcttgttcaattgatgttatcgctcttaattgatgtttttgtt 47481251  T
Q  201 gatgaataattgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 243  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  47481252 gatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 47481294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 10 - 243
Target Start/End: Original strand, 13037045 - 13037277
Alignment:
Q  10 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgt 109  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||| | | |||||||||||| |||| |||||    
T  13037045 ctgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttgatgaaattgcatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgt 13037144  T
Q  110 gctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataa 209  Q
    ||| || |||||||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||||| || || ||||||||| |    
T  13037145 gctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattaatgttatgaatattaattgatgttgtggttgatgaatca 13037243  T
Q  210 ttgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 243  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  13037244 ttgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 13037277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 10 - 238
Target Start/End: Original strand, 11580770 - 11580997
Alignment:
Q  10 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgt 109  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| |||| |||||    
T  11580770 ctgtgataatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgt 11580869  T
Q  110 gctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataa 209  Q
    ||| || |||||||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||||| |    
T  11580870 gctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatca 11580968  T
Q  210 ttgcttgggtatgcataatcatggattga 238  Q
    |||||||||||| |||| ||||| |||||    
T  11580969 ttgcttgggtatacatattcatgaattga 11580997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 10 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 16211998 - 16211768
Alignment:
Q  10 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgt 109  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  16211998 ctgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgtttgtgaaattgcatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgt 16211899  T
Q  110 gctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataa 209  Q
    ||| || |||||||||| | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||| | |    
T  16211898 gctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttaaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgattca 16211800  T
Q  210 ttgcttgggtatgcataatcatggattgatga 241  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  16211799 ttgcttgggtatgcatattcatgaattaatga 16211768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 10 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 36052896 - 36052667
Alignment:
Q  10 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgt 109  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||| || || ||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  36052896 ctgtgatgatacgtttgtatgcatgaattgatgataattatatgattgttggtaaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgt 36052797  T
Q  110 gctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataa 209  Q
    ||| || |||||||||| | ||||   |||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| ||  ||||| ||||| || || |||||||||||    
T  36052796 gctcaattggtgaattt-tgctaa---gttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttgtggttgttaattgatgttgtggttgatgaataa 36052701  T
Q  210 ttgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 243  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  36052700 ttgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 36052667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 10 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 3060198 - 3059966
Alignment:
Q  10 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgt 109  Q
    |||||||  ||| ||||||||||| |||||||| || |||||  | |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||| ||| |    
T  3060198 ctgtgataatatatttgtatgcattaattgatgataattgtaatactgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataaattgtgaaaattat 3060099  T
Q  110 gctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataa 209  Q
    ||| || |||||||||| |  |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||| |    
T  3060098 gctcaaatggtgaattt-tgttaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatgactgttaattgatgttgtggttgatgaatca 3060000  T
Q  210 ttgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 243  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  3059999 ttgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 3059966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 13321257 - 13321014
Alignment:
Q  1 gtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatg-ttcata-tatgcaaaaatgataagtt 98  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| |||| | |||| | |||||  |||||    
T  13321257 gtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgtcaagtt 13321158  T
Q  99 atgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttg-ttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatg 197  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||| | |||||||| ||||| | ||||| | |||||| ||||||| |||||||||   ||||| ||||| || |     
T  13321157 atgaa-attgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgattgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttgtt 13321060  T
Q  198 attgatgaataattgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 243  Q
     ||||||||| ||  ||||||| |||| | ||||| ||||||||||    
T  13321059 gttgatgaatcatgacttgggtttgcacattcatgaattgatgatg 13321014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 7293245 - 7293017
Alignment:
Q  13 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgct 112  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||  ||||||| |||||||||| |||||||     
T  7293245 tgatgatatgtttgtatgcatgaattaataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgca 7293146  T
Q  113 aaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattg 212  Q
    |||  | |||||||  |  | ||||||||| | ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||| || |  ||||||||| ||||    
T  7293145 aaatggatgaatttgac--atgttgttgttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcattg 7293048  T
Q  213 cttgggtatgcataatcatggattgatgatg 243  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  7293047 cttgggtatacatattcatggattgatgatg 7293017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 11516456 - 11516358
Alignment:
Q  13 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgc 111  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||  ||||||| |||||||||| |||||||    
T  11516456 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 11516358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 111
Target Start/End: Original strand, 15441598 - 15441696
Alignment:
Q  13 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgc 111  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||  ||||||| |||||||||| |||||||    
T  15441598 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 15441696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 111
Target Start/End: Original strand, 30262163 - 30262261
Alignment:
Q  13 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgc 111  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||  ||||||| |||||||||| |||||||    
T  30262163 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 30262261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 100
Target Start/End: Original strand, 296003 - 296087
Alignment:
Q  16 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttat 100  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||| || |  ||| ||||||||||||||| |||||| |  |||| |||||||| |||||||    
T  296003 tgttatgtttgtgtgcatgaatcgatgataatgttatgattgttggtgaaatttcatgttgaattatgtaaaaatgagaagttat 296087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 19)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 30120964 - 30120722
Alignment:
Q  1 gtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30120964 gtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaatttatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttat 30120865  T
Q  101 gaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgatt 200  Q
    ||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30120864 gaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgatt 30120765  T
Q  201 gatgaataattgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 243  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||    
T  30120764 gatgaataattgcttgggtttgcatattcatcgattgatgatg 30120722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 53 - 243
Target Start/End: Original strand, 222753 - 222943
Alignment:
Q  53 aattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagtt 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  222753 aattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagtt 222852  T
Q  153 gtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  222853 gtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 222943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 53 - 243
Target Start/End: Original strand, 736376 - 736566
Alignment:
Q  53 aattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagtt 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  736376 aattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagtt 736475  T
Q  153 gtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  736476 gtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 736566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 53 - 243
Target Start/End: Original strand, 860271 - 860461
Alignment:
Q  53 aattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagtt 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  860271 aattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagtt 860370  T
Q  153 gtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  860371 gtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 860461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 16674402 - 16674644
Alignment:
Q  1 gtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttat 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16674402 gtgctctttctgtgatgttatgtttttatgcatgaatttatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttat 16674501  T
Q  101 gaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgatt 200  Q
    ||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16674502 gaatattgtgcttaattggtgaatttctcctaagttgttgttaagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgataatatgatt 16674601  T
Q  201 gatgaataattgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 243  Q
     ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||    
T  16674602 aatgaataattgcttgagtttgcatattcatggattgatgatg 16674644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 21844582 - 21844824
Alignment:
Q  1 gtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||    
T  21844582 gtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttat 21844681  T
Q  101 gaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgatt 200  Q
    ||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21844682 gaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatttttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgatt 21844781  T
Q  201 gatgaataattgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 243  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||    
T  21844782 gatgaataattgcttgggtttgcatattcattgattgttgatg 21844824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 21851975 - 21852217
Alignment:
Q  1 gtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||||||||    
T  21851975 gtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattaaatgtttaaatatgtaaaaatgataagttat 21852074  T
Q  101 gaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgatt 200  Q
    ||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21852075 gaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgatt 21852174  T
Q  201 gatgaataattgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 243  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||    
T  21852175 gatgaataattgcttgggtttgcatattcattgattgttgatg 21852217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 10 - 243
Target Start/End: Original strand, 43373499 - 43373731
Alignment:
Q  10 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgt 109  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||| || || ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  43373499 ctgtgatgatacgtttgtatgcatgaattgatgataattatatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgt 43373598  T
Q  110 gctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataa 209  Q
    ||| || |||||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| || || |||||||||||    
T  43373599 gctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgctatggttgttaattgatgttgtggttgatgaataa 43373697  T
Q  210 ttgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 243  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  43373698 ttgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 43373731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Original strand, 6774268 - 6774505
Alignment:
Q  1 gtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttat 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |    
T  6774268 gtgctcttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgt 6774367  T
Q  101 gaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgatt 200  Q
    ||| |||||||| || |||||||||| | ||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||   ||||||||||| || |  ||    
T  6774368 gaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttattgttgttatttgatgttgttgtt 6774466  T
Q  201 gatgaataattgcttgggtatgcataatcatggattgat 239  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  6774467 gatgaatcactgcttgggtatgcatattcatgaattgat 6774505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 24549223 - 24548986
Alignment:
Q  1 gtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttat 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |    
T  24549223 gtgctcttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgt 24549124  T
Q  101 gaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgatt 200  Q
    ||| || ||||| || |||||||||| | ||||||| ||||||||||| | | ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||| || |  ||    
T  24549123 gaaaatggtgctcaattggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgggatttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtagtt 24549025  T
Q  201 gatgaataattgcttgggtatgcataatcatggattgat 239  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  24549024 gatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgat 24548986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 13 - 244
Target Start/End: Original strand, 16193750 - 16193980
Alignment:
Q  13 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgct 112  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||    
T  16193750 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggggaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgct 16193849  T
Q  113 aaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattg 212  Q
     || |||||||||| | | || |||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||||| ||||    
T  16193850 caattggtgaattt-tgccaaattgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattg 16193948  T
Q  213 cttgggtatgcataatcatggattgatgatgt 244  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  16193949 cttgggtatgcatattcatgaattgaggatgt 16193980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Original strand, 24928822 - 24929043
Alignment:
Q  10 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgt 109  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| |||| |||||    
T  24928822 ctgtgattatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgt 24928921  T
Q  110 gctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataa 209  Q
    ||| || |||||||||||  ||||||||| |||   ||||||| ||  |||||||||| ||| ||||||  ||||| ||||| || |||||||||||| |    
T  24928922 gctcaattggtgaatttc-gctaagttgtggttggattgagttatgtctcttgttcaattgaggttatggttgttaattgatgttgtgattgatgaatca 24929020  T
Q  210 ttgcttgggtatgcataatcatg 232  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  24929021 ttgcttgggtatgcatattcatg 24929043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 10 - 243
Target Start/End: Original strand, 16405006 - 16405235
Alignment:
Q  10 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgt 109  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | ||||| |||||| |||| |||||    
T  16405006 ctgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgttaagttgtgaaaattgt 16405105  T
Q  110 gctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataa 209  Q
    ||| || |||||||||| | ||||   |||||||| ||||  | |||||||||||||| |||||||||   ||||| ||||| || |  ||||||||| |    
T  16405106 gctcaattggtgaattt-tgctaa---gttgttaaattgacatatgattcttgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttttagttgatgaatca 16405201  T
Q  210 ttgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 243  Q
     |||||||||||||| | ||||| ||||||||||    
T  16405202 ctgcttgggtatgcaaattcatgaattgatgatg 16405235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 17345810 - 17345581
Alignment:
Q  1 gtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttat 100  Q
    |||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| |||||||||  |||| |||||||  |||||||    
T  17345810 gtgctctaactgtgatgttatgtttatatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttat 17345711  T
Q  101 gaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgatt 200  Q
    ||| |||||||| || || || |||| | ||||||| |||| || ||||||| |||||||||||||  |||| ||||   ||||| ||||| || |  ||    
T  17345710 gaaaattgtgctcaattgatggattt-tgctaagttattgtgaa-ttgagttatgattcttgttcagttgatattattgttgttaattgatgttgttgtt 17345613  T
Q  201 gatgaataattgcttgggtatgcataatcatg 232  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| |||||    
T  17345612 gatgaatcactgcttgggtatgcatattcatg 17345581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 243
Target Start/End: Original strand, 22907248 - 22907476
Alignment:
Q  13 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgct 112  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||  ||||||| |||||||||| |||||||     
T  22907248 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgca 22907347  T
Q  113 aaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattg 212  Q
    |||  | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||| || |  ||||||||| ||||    
T  22907348 aaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcattg 22907445  T
Q  213 cttgggtatgcataatcatggattgatgatg 243  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  22907446 cttgggtatacatattcatggattgatgatg 22907476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 53 - 115
Target Start/End: Original strand, 691908 - 691970
Alignment:
Q  53 aattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  691908 aattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 691970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 5238316 - 5238218
Alignment:
Q  13 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgc 111  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||  ||||||| |||||||||| |||||||    
T  5238316 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 5238218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 111
Target Start/End: Original strand, 24661282 - 24661380
Alignment:
Q  13 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgc 111  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||  ||||||| |||||||||| |||||||    
T  24661282 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 24661380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 43685775 - 43685677
Alignment:
Q  13 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgc 111  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||  ||||||| |||||||||| |||||||    
T  43685775 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 43685677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 25)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 55316461 - 55316219
Alignment:
Q  1 gtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55316461 gtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttat 55316362  T
Q  101 gaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgatt 200  Q
    ||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  55316361 gaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgataatatgatt 55316262  T
Q  201 gatgaataattgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 243  Q
     |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  55316261 aatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 55316219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 41270317 - 41270075
Alignment:
Q  1 gtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41270317 gtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtggaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttat 41270218  T
Q  101 gaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgatt 200  Q
    ||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41270217 gaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgataatatgatt 41270118  T
Q  201 gatgaataattgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 243  Q
     |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  41270117 aatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 41270075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 16821381 - 16821139
Alignment:
Q  1 gtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |||    
T  16821381 gtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcataaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagctat 16821282  T
Q  101 gaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgatt 200  Q
    ||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16821281 gagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgatt 16821182  T
Q  201 gatgaataattgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 243  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||    
T  16821181 gatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattaatgatg 16821139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 10 - 243
Target Start/End: Original strand, 14842592 - 14842824
Alignment:
Q  10 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgt 109  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| | || |||||| ||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||| |||||    
T  14842592 ctgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgaagataattgtatgattgttggtgaaattgcatgttcaaatgtgtaaaaatgataagttatgaaaattgt 14842691  T
Q  110 gctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataa 209  Q
    ||| || |||||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  14842692 gctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaattgatgttatgattgatgaataa 14842790  T
Q  210 ttgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 243  Q
    ||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  14842791 ttgattgggtttgcatattcatggattgatgatg 14842824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 24 - 243
Target Start/End: Original strand, 13975766 - 13975985
Alignment:
Q  24 ttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaa 123  Q
    |||||||||||||||| || |  |||||| |||||||||| ||||||||||| | ||| | ||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||    
T  13975766 ttgtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtggaattacatgtttaaataagtaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaa 13975865  T
Q  124 tttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgc 223  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  13975866 tttctcctaagttgtcattaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgataatatgattaatgaataattgcttgggtttgc 13975965  T
Q  224 ataatcatggattgatgatg 243  Q
    ||| |||||||||| |||||    
T  13975966 atattcatggattgttgatg 13975985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 24 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 45861024 - 45860805
Alignment:
Q  24 ttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaa 123  Q
    |||||||||||||||| || |  |||||| |||||||||| ||||||||||| | ||| | ||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||    
T  45861024 ttgtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtggaattacatgtttaaataagtaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaa 45860925  T
Q  124 tttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgc 223  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  45860924 tttctcctaagttgtcattaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgataatatgattaatgaataattgcttgggtttgc 45860825  T
Q  224 ataatcatggattgatgatg 243  Q
    ||| |||||||||| |||||    
T  45860824 atattcatggattgttgatg 45860805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 10 - 243
Target Start/End: Original strand, 15936658 - 15936890
Alignment:
Q  10 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgt 109  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||| |||||    
T  15936658 ctgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgtaaaaatgataagttgtgaaaattgt 15936757  T
Q  110 gctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataa 209  Q
    ||| || |||||||||| |  |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  15936758 gctcaattggtgaattt-tgataagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaattgatgttgtgattgatgaataa 15936856  T
Q  210 ttgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 243  Q
    |||| || ||||||||| ||||||||||||||||    
T  15936857 ttgcctgagtatgcatattcatggattgatgatg 15936890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 10 - 244
Target Start/End: Original strand, 51158049 - 51158282
Alignment:
Q  10 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgt 109  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  51158049 ctgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgt 51158148  T
Q  110 gctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataa 209  Q
    ||| || |||||||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||||| |    
T  51158149 gctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatca 51158247  T
Q  210 ttgcttgggtatgcataatcatggattgatgatgt 244  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  51158248 ttgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatgt 51158282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 10 - 243
Target Start/End: Original strand, 15859055 - 15859287
Alignment:
Q  10 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgt 109  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||| |||||    
T  15859055 ctgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgaacaaatgataagttgtgaaaattgt 15859154  T
Q  110 gctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataa 209  Q
    ||| || |||||||||| | ||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||||| |    
T  15859155 gctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatca 15859253  T
Q  210 ttgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 243  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  15859254 ttgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 15859287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 24 - 243
Target Start/End: Original strand, 13954934 - 13955153
Alignment:
Q  24 ttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaa 123  Q
    |||||||||||||||| || |  |||||| |||||||||| ||||||||||| | ||| | ||||||||| ||||||||| |||||||| || || ||||    
T  13954934 ttgtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtggaattacatgtttaaataagtaaaaatgatcagttatgaatattgtgctcaattgatgaa 13955033  T
Q  124 tttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgc 223  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  13955034 tttctcctaagttgtcattaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgataatatgattaatgaataattgcttgggtttgc 13955133  T
Q  224 ataatcatggattgatgatg 243  Q
    ||| |||||||||| |||||    
T  13955134 atattcatggattgttgatg 13955153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 10 - 240
Target Start/End: Original strand, 15938500 - 15938729
Alignment:
Q  10 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgt 109  Q
    |||| ||| ||||||||||  |||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||| |||||    
T  15938500 ctgtaatgatatgtttgtaatcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgtaaaaatgataagttgtgaaaattgt 15938599  T
Q  110 gctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataa 209  Q
    ||| || |||||||||| |  |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  15938600 gctcaattggtgaattt-tgataagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaattgatgttgtgattgatgaataa 15938698  T
Q  210 ttgcttgggtatgcataatcatggattgatg 240  Q
    |||| || ||||||||| |||||||||||||    
T  15938699 ttgcctgagtatgcatattcatggattgatg 15938729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 10 - 243
Target Start/End: Original strand, 12030178 - 12030410
Alignment:
Q  10 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgt 109  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||  ||||    
T  12030178 ctgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaagtgataagttgtgaaagttgt 12030277  T
Q  110 gctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataa 209  Q
    ||| || |||||||||| | ||||||| ||||||||||||  | |||||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| ||||| ||||||||| |    
T  12030278 gctcaattggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgatatttgattcttgttcaattgatgctatggttgttaattgatgttatggttgatgaatca 12030376  T
Q  210 ttgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 243  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  12030377 ttgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 12030410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 15615075 - 15614838
Alignment:
Q  1 gtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttat 100  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |    
T  15615075 gtgctcttactgtggtgttatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaggattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgt 15614976  T
Q  101 gaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgatt 200  Q
    ||| || ||||| || |||||||||| | ||||||| ||||||||||| | | ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||| || |  ||    
T  15614975 gaatatggtgctcaattggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgggatttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtagtt 15614877  T
Q  201 gatgaataattgcttgggtatgcataatcatggattgat 239  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  15614876 gatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgat 15614838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 2050042 - 2049810
Alignment:
Q  10 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgt 109  Q
    |||||| | ||||||||||||| |||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| || |||| |||||    
T  2050042 ctgtgacgatatgtttgtatgcctgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaacatgataacttgtgaaaattgt 2049943  T
Q  110 gctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataa 209  Q
    ||| || |||||||||| | ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| || || ||||||||| |    
T  2049942 gctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgatttttgttcaattgatgctatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatca 2049844  T
Q  210 ttgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 243  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  2049843 ttgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 2049810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 13839126 - 13838905
Alignment:
Q  10 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgt 109  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| |||| |||||    
T  13839126 ctgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgatggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgt 13839027  T
Q  110 gctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataa 209  Q
    ||| || |||||||||| | ||||||||| |||   ||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||||| |    
T  13839026 gctcaattggtgaattt-tgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatca 13838928  T
Q  210 ttgcttgggtatgcataatcatg 232  Q
    ||| ||||||||||||| |||||    
T  13838927 ttgtttgggtatgcatattcatg 13838905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 243
Target Start/End: Original strand, 17912516 - 17912744
Alignment:
Q  13 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgct 112  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||||| |||||||     
T  17912516 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgca 17912615  T
Q  113 aaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattg 212  Q
    ||| || |||||||    || ||||| ||| | ||||| | |||||| |||||||  ||||||||   ||||| ||||| || |  ||||||||| | ||    
T  17912616 aaattgatgaatttga--tatgttgtagttgaattgagctatgattcatgttcaatcgatgttattgttgttaattgatgttgttgttgatgaatcactg 17912713  T
Q  213 cttgggtatgcataatcatggattgatgatg 243  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  17912714 cttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 17912744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 111
Target Start/End: Original strand, 2449272 - 2449370
Alignment:
Q  13 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgc 111  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||   |||||  ||||||| |||||||||| |||||||    
T  2449272 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 2449370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 243
Target Start/End: Original strand, 16744149 - 16744377
Alignment:
Q  13 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgct 112  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||  ||  ||||| ||||||||| ||||||||| || | ||||| |||||||| |||||||||| |||||||     
T  16744149 tgatgatatgtttgtatccatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgca 16744248  T
Q  113 aaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattg 212  Q
    |||  | |||||||  |  | ||| | ||| | ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || |  || || |  ||||||||| ||||    
T  16744249 aaatggatgaatttgac--atgttatagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataaatgttgtagttgatgaatcattg 16744346  T
Q  213 cttgggtatgcataatcatggattgatgatg 243  Q
    ||||||||| |||  ||||||||||||||||    
T  16744347 cttgggtatacatgttcatggattgatgatg 16744377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 130 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 47984763 - 47984650
Alignment:
Q  130 ctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcataatc 229  Q
    |||||||||||||   ||||| |||||||| ||||||| ||||||| |   ||||| ||||| || |  ||||||||| ||  |||||||||||||| ||    
T  47984763 ctaagttgttgttggattgagatgtgattcatgttcaattgatgtttttgttgttaattgatgttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatattc 47984664  T
Q  230 atggattgatgatg 243  Q
    ||| ||||||||||    
T  47984663 atgaattgatgatg 47984650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 130 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 47994050 - 47993937
Alignment:
Q  130 ctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcataatc 229  Q
    |||||||||||||   ||||| |||||||| ||||||| ||||||| |   ||||| ||||| || |  ||||||||| ||  |||||||||||||| ||    
T  47994050 ctaagttgttgttggattgagatgtgattcatgttcaattgatgtttttgttgttaattgattttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatattc 47993951  T
Q  230 atggattgatgatg 243  Q
    ||| ||||||||||    
T  47993950 atgaattgatgatg 47993937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 130 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 48003337 - 48003224
Alignment:
Q  130 ctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcataatc 229  Q
    |||||||||||||   ||||| |||||||| ||||||| ||||||| |   ||||| ||||| || |  ||||||||| ||  |||||||||||||| ||    
T  48003337 ctaagttgttgttggattgagatgtgattcatgttcaattgatgtttttgttgttaattgatgttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatattc 48003238  T
Q  230 atggattgatgatg 243  Q
    ||| ||||||||||    
T  48003237 atgaattgatgatg 48003224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 130 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 48012623 - 48012510
Alignment:
Q  130 ctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcataatc 229  Q
    |||||||||||||   ||||| |||||||| ||||||| ||||||| |   ||||| ||||| || |  ||||||||| ||  |||||||||||||| ||    
T  48012623 ctaagttgttgttggattgagatgtgattcatgttcaattgatgtttttgttgttaattgattttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatattc 48012524  T
Q  230 atggattgatgatg 243  Q
    ||| ||||||||||    
T  48012523 atgaattgatgatg 48012510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 75
Target Start/End: Original strand, 12902104 - 12902178
Alignment:
Q  1 gtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 75  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  12902104 gtgctcttgctgtgatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 12902178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 54651699 - 54651625
Alignment:
Q  1 gtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 75  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| || |||||| |||||  |||||||| ||||||    
T  54651699 gtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgtgagtgaaattgcatgtt 54651625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 202 - 243
Target Start/End: Original strand, 15468555 - 15468596
Alignment:
Q  202 atgaataattgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 243  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  15468555 atgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 15468596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 14)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 2 - 243
Target Start/End: Original strand, 18601129 - 18601370
Alignment:
Q  2 tgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatg 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18601129 tgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatg 18601228  T
Q  102 aagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattg 201  Q
    || |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  18601229 aatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgataatatgatta 18601328  T
Q  202 atgaataattgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 243  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  18601329 atgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 18601370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 5072398 - 5072640
Alignment:
Q  1 gtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5072398 gtgctcttgctgtgatgttatgtttatatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttat 5072497  T
Q  101 gaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgatt 200  Q
    ||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5072498 gaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgataatatgatt 5072597  T
Q  201 gatgaataattgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 243  Q
     |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  5072598 aatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 5072640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 22228050 - 22227809
Alignment:
Q  1 gtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  22228050 gtgctcttgctgtgatgttattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttat 22227951  T
Q  101 gaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgatt 200  Q
    ||| ||||||   || || ||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  22227950 gaaaattgtgtccaattgttgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattgatgttatgatt 22227852  T
Q  201 gatgaataattgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 243  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  22227851 gatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 22227809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 22232747 - 22232506
Alignment:
Q  1 gtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  22232747 gtgctcttgctgtgatgttattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttat 22232648  T
Q  101 gaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgatt 200  Q
    ||| ||||||   || || ||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  22232647 gaaaattgtgtccaattgttgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattgatgttatgatt 22232549  T
Q  201 gatgaataattgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 243  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  22232548 gatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 22232506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 10 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 20931577 - 20931345
Alignment:
Q  10 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgt 109  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  20931577 ctgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcatatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgt 20931478  T
Q  110 gctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataa 209  Q
    |||||| |||||||||| | |||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || |||||||||||    
T  20931477 gctaaattggtgaattt-tgctaaattgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaataa 20931379  T
Q  210 ttgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 243  Q
    || |||||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  20931378 tttcttgggtatgcatattcatgaattaatgatg 20931345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 10 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 20913262 - 20913037
Alignment:
Q  10 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgt 109  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  20913262 ctgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcatatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgt 20913163  T
Q  110 gctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataa 209  Q
    ||| || |||||||||| | | |||||||||||||||       |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || |||||||||||    
T  20913162 gctcaattggtgaattt-tgcaaagttgttgttaatt-------tgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatcttgtggttgatgaataa 20913071  T
Q  210 ttgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 243  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  20913070 ttgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 20913037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 2116496 - 2116258
Alignment:
Q  1 gtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttat 100  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |    
T  2116496 gtgcttttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgt 2116397  T
Q  101 gaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttga-gttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgat 199  Q
    ||| || ||||| || |||||||||| | ||||||| ||||||||||||  || ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||| || |  |    
T  2116396 gaaaatggtgctcaattggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgatattttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtagt 2116298  T
Q  200 tgatgaataattgcttgggtatgcataatcatggattgat 239  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  2116297 tgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgat 2116258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 10 - 243
Target Start/End: Original strand, 20893657 - 20893889
Alignment:
Q  10 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgt 109  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| |||| |||||    
T  20893657 ctgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttgttgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgt 20893756  T
Q  110 gctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataa 209  Q
    ||| || |||||||||| | ||||||||||||||  |||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||| |    
T  20893757 gctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgatttatgattcttgttcaattgatgttatgactgttaattgatgttgtggttgatgaatca 20893855  T
Q  210 ttgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 243  Q
    ||| ||||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  20893856 ttgtttgggtatgcatattcataaattgatgatg 20893889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 13 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 41394451 - 41394222
Alignment:
Q  13 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgct 112  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||    
T  41394451 tgatgatatgtttgtatgcataaattgatgataattgtatgattgttggtgaagttacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgct 41394352  T
Q  113 aaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattg 212  Q
     || |||||||||| | ||||||| ||||||  ||||| | ||||||||| |||| |||||||||   ||||||||||| || |  ||||||||| | ||    
T  41394351 caattggtgaattt-tgctaagttattgttatgttgagatttgattcttgctcaattgatgttattgttgttatttgatgttgttgttgatgaatcactg 41394253  T
Q  213 cttgggtatgcataatcatggattgatgatg 243  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41394252 attgggtatgcatattcatggattgatgatg 41394222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 11 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 20445910 - 20445679
Alignment:
Q  11 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtg 110  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  || | | |||||||||||  |||| ||||||    
T  20445910 tgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaagtaggaacaaatgataagtggtgaaaattgtg 20445811  T
Q  111 ctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataat 210  Q
    || || |||||||||| | ||||||||||||| | ||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||| || |  ||||||||| ||    
T  20445810 ctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgtgttatgattcttgatcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtagttgatgaatcat 20445712  T
Q  211 tgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 243  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  20445711 tgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 20445679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 19 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 20531667 - 20531444
Alignment:
Q  19 tatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaagtg 118  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  || | | |||||||||||  |||| |||||||| || ||    
T  20531667 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaagtaggaacaaatgataagtggtgaaaattgtgctcaattg 20531568  T
Q  119 gtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttggg 218  Q
    |||||||| | ||||||||||||| | ||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||| || |  ||||||||| ||||||||||    
T  20531567 gtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgtgttatgattcttgatcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtagttgatgaatcattgcttggg 20531469  T
Q  219 tatgcataatcatggattgatgatg 243  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||    
T  20531468 tatgcatattcatgaattgaggatg 20531444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 5 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 45051660 - 45051489
Alignment:
Q  5 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaag 104  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||     
T  45051660 tcttactgtgatgttacgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaa 45051561  T
Q  105 attgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttat 177  Q
    |||||||| || |||||||||| | ||||||| | ||||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||    
T  45051560 attgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttatggttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttat 45051489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 13 - 243
Target Start/End: Original strand, 37844484 - 37844714
Alignment:
Q  13 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagtta-tgaagattgtgc 111  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  || | | |||||||||  || |||| |||||||    
T  37844484 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaagtaggaacaaatgataaaatagtgaaaattgtgc 37844583  T
Q  112 taaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataatt 211  Q
    | || |  ||||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||| | |||    
T  37844584 tcaattaatgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgagtcatt 37844682  T
Q  212 gcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 243  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  37844683 gcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 37844714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 51452721 - 51452623
Alignment:
Q  13 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgc 111  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||  ||||||| |||||||||| |||||||    
T  51452721 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 51452623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 191; Significance: 1e-104; HSPs: 3)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 36335 - 36093
Alignment:
Q  1 gtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttat 100  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  36335 gtgctcttgtagtgatgttatgtttgtatgtatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatattcatatatgcaaaaatgataagttat 36236  T
Q  101 gaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgatt 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  36235 gaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgattcatgttcaatagatgttatgaatgttatttgataatatgatt 36136  T
Q  201 gatgaataattgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 243  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  36135 gatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 36093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 10 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 48830 - 48598
Alignment:
Q  10 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgt 109  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| |||| |||||    
T  48830 ctgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaaaaaatgataagttgtgaaaattgt 48731  T
Q  110 gctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataa 209  Q
    ||| |  |||||||||| | ||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||  | ||| ||||| || || ||||||||| |    
T  48730 gctcagttggtgaattt-tgctaagttgttgctagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctattaattgatgttgtggttgatgaatca 48632  T
Q  210 ttgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 243  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  48631 ttgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 48598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 30
Target Start/End: Original strand, 169922 - 169951
Alignment:
Q  1 gtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatg 30  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  169922 gtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatg 169951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 43239 - 42997
Alignment:
Q  1 gtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttat 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  43239 gtgctcttgctgggatgttatgtttctatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttat 43140  T
Q  101 gaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgatt 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43139 gaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgattcgtgttcaagtgatgttatgaatgttatttgatattatgatt 43040  T
Q  201 gatgaataattgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 243  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  43039 gatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 42997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 171; Significance: 7e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 277 - 35
Alignment:
Q  1 gtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||    
T  277 gtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttat 178  T
Q  101 gaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgatt 200  Q
    | | |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  177 gtatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgatt 78  T
Q  201 gatgaataattgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 243  Q
     |||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| |||||    
T  77 aatgaataattgcttgggtttgcatattcatgaattgttgatg 35  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 168; Significance: 4e-90; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 31685 - 31928
Alignment:
Q  1 gtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttat 100  Q
    |||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31685 gtgctcttgtggtgatgttatgtttgaatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatattcatatatgcaaaaatgataagttat 31784  T
Q  101 gaagattgtgctaaagtggtgaatttctcct-aagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgat 199  Q
    ||| ||| |||| || ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31785 gaatattatgctcaattggtgaatttctcctaaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttaatattatgat 31884  T
Q  200 tgatgaataattgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 243  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||    
T  31885 tgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattaatgatg 31928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 10 - 243
Target Start/End: Original strand, 128200 - 128431
Alignment:
Q  10 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgt 109  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| || || |||  || |||||| |||| |||||    
T  128200 ctgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgtaaaggtgttaagttgtgaaaattgt 128299  T
Q  110 gctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataa 209  Q
    ||| || ||| |||||| |  || ||||||||||||| ||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||| || ||||||||||||||    
T  128300 gctcaattggcgaattt-tgttaggttgttgttaatt-gagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaatggatgttgtgattgatgaataa 128397  T
Q  210 ttgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 243  Q
    ||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  128398 ttgattgggtatgcatattcatgaattgatgatg 128431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 160; Significance: 2e-85; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 64533 - 64780
Alignment:
Q  1 gtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaatt-----gatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataa 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     |||| |  |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  64533 gtgctcttgctgtgatgttatgtttatatgcatgaattatattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataa 64632  T
Q  96 gttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatatta 195  Q
    |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  64633 gttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatatta 64732  T
Q  196 tgattgatgaataattgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 243  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||    
T  64733 tgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgttgatg 64780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 10 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 107979 - 107747
Alignment:
Q  10 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgt 109  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | || |||||    
T  107979 ctgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgcaaaaatgataagttgtaaaaattgt 107880  T
Q  110 gctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataa 209  Q
    ||| || |||||||||| |  |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  107879 gctcaattggtgaattt-tgataagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaattgatgttgtgattgatgaataa 107781  T
Q  210 ttgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 243  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  107780 ttgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 107747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772 (Bit Score: 148; Significance: 4e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0772
Description:

Target: scaffold0772; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 13 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 5758 - 5544
Alignment:
Q  13 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgct 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  5758 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagtcatgaatattgtgct 5659  T
Q  113 aaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattg 212  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  5658 caattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgataatatgattaatgaataattg 5559  T
Q  213 cttgggtatgcataat 228  Q
    ||||||| ||||||||    
T  5558 cttgggt-tgcataat 5544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 147; Significance: 1e-77; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 14071 - 14312
Alignment:
Q  1 gtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || ||| |||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||    
T  14071 gtgctcttgctgtgatgttatgtctgtatgcatgaattgatgataattatatgattgttagtgaaattacatgttgaaatatgtaaaaatgataagttat 14170  T
Q  101 gaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgatt 200  Q
    |||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |  ||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  14171 gaagattgtgctcaattggtgaattt-tcctaagttgttgataatttgagattggattcttgttcaattaatgttatgaatgttgtttgatgttatgatt 14269  T
Q  201 gatgaataattgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 243  Q
    |||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||    
T  14270 gatgaataattgcttgagtttgcatattcatggattgatgatg 14312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 21126 - 21367
Alignment:
Q  1 gtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttat 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||| || || ||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  21126 gtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatccattaattgatgataattatatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttat 21225  T
Q  101 gaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgatt 200  Q
    |||||||| ||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21226 gaagattgagctcaattggtgaattt-tcctaagttgttgttaatttgagattggattcttgttcaattgatgttatgaatgttatttgatgttatgatt 21324  T
Q  201 gatgaataattgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 243  Q
    |||||||||||||||| || |||||| ||||||||| ||||||    
T  21325 gatgaataattgcttgagtttgcatattcatggattaatgatg 21367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 136; Significance: 5e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 10 - 241
Target Start/End: Original strand, 3613 - 3843
Alignment:
Q  10 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgt 109  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  3613 ctgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgt 3712  T
Q  110 gctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataa 209  Q
    ||| || |||| ||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  3713 gctcaattggtaaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaattgatgttgtgattgaggaataa 3811  T
Q  210 ttgcttgggtatgcataatcatggattgatga 241  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  3812 ttgcttgggtatgcatattgatggattgatga 3843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 13 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 1353 - 1124
Alignment:
Q  13 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgct 112  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||  || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||    
T  1353 tgatgatatgttagtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgct 1254  T
Q  113 aaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattg 212  Q
     || |||||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  1253 caattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatattgtggttgatgaataattg 1155  T
Q  213 cttgggtatgcataatcatggattgatgatg 243  Q
    ||||||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  1154 cttgggtgtgcatattcatgaattgatgatg 1124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 131; Significance: 5e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 5226 - 5466
Alignment:
Q  1 gtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttat 100  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  5226 gtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttat 5325  T
Q  101 gaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgatt 200  Q
    ||| |||||| | || |||||||||| | || |||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  5326 gaaaattgtgttcaattggtgaattt-tgctgagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattgatgttgtgatt 5424  T
Q  201 gatgaataattgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 243  Q
     |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  5425 aatgaataattgcttgggt-tgcatattcatggattgatgatg 5466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 10 - 243
Target Start/End: Original strand, 6095 - 6326
Alignment:
Q  10 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgt 109  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| | || |||||    
T  6095 ctgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttgtaaaaattgt 6194  T
Q  110 gctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataa 209  Q
    ||| || |||||||||| | ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||  | |||||||||||||||||    
T  6195 gctgaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaa-ttgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttttgttatgattgatgaataa 6292  T
Q  210 ttgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 243  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6293 ttgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 6326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 10 - 243
Target Start/End: Original strand, 987 - 1218
Alignment:
Q  10 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgt 109  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||| |||||    
T  987 ctgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttgtgaaaattgt 1086  T
Q  110 gctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataa 209  Q
    ||| || || ||||||| | ||||||||||||||| ||||| | | |||||||||||| |||||||||| |||||| || || |||||||||||||||||    
T  1087 gctcaattgatgaattt-tgctaagttgttgttaa-ttgagattttattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatgaataa 1184  T
Q  210 ttgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 243  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1185 ttgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 1218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 10 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 48419 - 48187
Alignment:
Q  10 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgt 109  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||| |||||    
T  48419 ctgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgtaaaaatgataagttgtgaaaattgt 48320  T
Q  110 gctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataa 209  Q
    ||| || |||||||||| |  |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  48319 gctcaattggtgaattt-tgttaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatagatgttaattgatgttgtgattgatgaataa 48221  T
Q  210 ttgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 243  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  48220 ttgcctgggtatgcatattcatggattgatgatg 48187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 129; Significance: 8e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 11 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 9109 - 8878
Alignment:
Q  11 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||| |||||| |||| ||||||    
T  9109 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaatcgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgttaagttgtgaaaattgtg 9010  T
Q  111 ctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataat 210  Q
    || || |||||||||| |  |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  9009 ctcaattggtgaattt-tgttaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaattgatgttgtgattgatgaataat 8911  T
Q  211 tgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 243  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  8910 tgcttgggtatgcatattcatgtattgatgatg 8878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 128; Significance: 3e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 12354 - 12115
Alignment:
Q  1 gtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttat 100  Q
    |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| |||||||| | || || |||||||||||||| |    
T  12354 gtgctctaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaaatacatgtttaaatgtgtaaaaatgataagttgt 12255  T
Q  101 gaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgatt 200  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||| |  ||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  12254 gaaaattgtgctaaattggtgaattt-tgttaagttgttgtaa--ttgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattgatgttatgatt 12158  T
Q  201 gatgaataattgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 243  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12157 catgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 12115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Original strand, 9359 - 9596
Alignment:
Q  1 gtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttat 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |    
T  9359 gtgcttttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgt 9458  T
Q  101 gaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgatt 200  Q
    ||| || ||||| || |||||||||| | ||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||| || |  ||    
T  9459 gaaaatggtgctcaattggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgagatttgattcttgctcaaatgatgttatggttgttaattgatgttgtagtt 9557  T
Q  201 gatgaataattgcttgggtatgcataatcatggattgat 239  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  9558 gatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgat 9596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Original strand, 16257 - 16494
Alignment:
Q  1 gtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttat 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |    
T  16257 gtgcttttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgt 16356  T
Q  101 gaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgatt 200  Q
    ||| || ||||| || |||||||||| | ||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||| || |  ||    
T  16357 gaaaatggtgctcaattggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgagatttgattcttgctcaaatgatgttatggttgttaattgatgttgtagtt 16455  T
Q  201 gatgaataattgcttgggtatgcataatcatggattgat 239  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  16456 gatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgat 16494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 124; Significance: 7e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 3964 - 3722
Alignment:
Q  1 gtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaa-tgataagtta 99  Q
    ||||||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  3964 gtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaaatgataagtta 3865  T
Q  100 tgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgat 199  Q
    || | ||||||   || |||||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  3864 tggaaattgtgtccaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattgatgttatgat 3766  T
Q  200 tgatgaataattgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 243  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  3765 tgatgaataattacttgggtttgcatattcatggattgatgatg 3722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 10 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 148953 - 148721
Alignment:
Q  10 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgt 109  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  148953 ctgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgt 148854  T
Q  110 gctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataa 209  Q
    ||| || |||||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||  || || ||||||||| |    
T  148853 gctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgaagttgtggttgatgaatca 148755  T
Q  210 ttgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 243  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||    
T  148754 ttgcttgggtatgtatattcatgaattgatgatg 148721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 9081 - 8849
Alignment:
Q  10 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgt 109  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||  ||||| |||| |||||    
T  9081 ctgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgt 8982  T
Q  110 gctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataa 209  Q
    ||| || |||||||||| | ||||||||||||| | ||||| | |||||  ||||||| |||||||||   | ||| ||||| || |  ||||||||| |    
T  8981 gctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattaatgttcaattgatgttattgctattaattgatgttgttgttgatgaatca 8883  T
Q  210 ttgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 243  Q
    |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||    
T  8882 ttgcttgggtatacatattcatgaattgatgatg 8849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1711 (Bit Score: 121; Significance: 5e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold1711
Description:

Target: scaffold1711; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Original strand, 1314 - 1450
Alignment:
Q  1 gtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1314 gtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttat 1413  T
Q  101 gaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttg 137  Q
    ||| |||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  1414 gaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttg 1450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 114; Significance: 7e-58; HSPs: 2)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 10 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 19438 - 19206
Alignment:
Q  10 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgt 109  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  19438 ctgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgt 19339  T
Q  110 gctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataa 209  Q
    ||| || |||||||||| | ||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||| |||||||||   ||||| ||||| || |  ||||||||| |    
T  19338 gctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagttatgattcctgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatgaatca 19240  T
Q  210 ttgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 243  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  19239 ttgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 19206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 10 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 21522 - 21290
Alignment:
Q  10 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgt 109  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  21522 ctgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgt 21423  T
Q  110 gctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataa 209  Q
    ||| || |||||||||| | ||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||| |||||||||   ||||| ||||| || |  ||||||||| |    
T  21422 gctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagttatgattcctgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatgaatca 21324  T
Q  210 ttgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 243  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  21323 ttgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 21290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 113; Significance: 3e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 11 - 243
Target Start/End: Original strand, 123196 - 123427
Alignment:
Q  11 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtg 110  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| |||| ||||||    
T  123196 tgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtg 123295  T
Q  111 ctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataat 210  Q
    || || |||||||||| | ||||||||||||||  || |||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||||||||    
T  123296 ctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattaagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaataat 123394  T
Q  211 tgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 243  Q
     ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  123395 ggcttgggtatgcatattcatgaattgaagatg 123427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 10 - 243
Target Start/End: Original strand, 36944 - 37176
Alignment:
Q  10 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgt 109  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||   ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  36944 ctgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagcttgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgt 37043  T
Q  110 gctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataa 209  Q
    |||||| |||||||||| | ||||||||| |||   ||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||  ||||| ||||| || || ||||||||| |    
T  37044 gctaaattggtgaattt-tgctaagttgtggttggattgagttatgaatcttgttcaattgacgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatca 37142  T
Q  210 ttgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 243  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  37143 ttgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 37176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 106; Significance: 4e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 243
Target Start/End: Original strand, 5092 - 5324
Alignment:
Q  10 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgt 109  Q
    |||||| | ||||||||||||| |||||||||| || |||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  5092 ctgtgacgatatgtttgtatgcgtgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaagtacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgt 5191  T
Q  110 gctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataa 209  Q
    ||| || |||||||||| | | ||||||||||||   |||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || |||||||||||| |    
T  5192 gctcaattggtgaattt-tgcaaagttgttgttagaatgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtgattgatgaatca 5290  T
Q  210 ttgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 243  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  5291 ttgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 5324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 99; Significance: 6e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 13 - 243
Target Start/End: Original strand, 26449 - 26678
Alignment:
Q  13 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgct 112  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||| || |||||  ||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||| ||    
T  26449 tgatgatatgtttgtatgcgtgaattgatgataattgtaagattattggtgaaagtacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgttct 26548  T
Q  113 aaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattg 212  Q
     || |||||||||| | ||||||||||||||   |||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || |||||||||||| ||||    
T  26549 caattggtgaattt-tgctaagttgttgttagaatgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtgattgatgaatcattg 26647  T
Q  213 cttgggtatgcataatcatggattgatgatg 243  Q
    |||||||||||||| | ||| ||||| ||||    
T  26648 cttgggtatgcatattgatgaattgaggatg 26678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Original strand, 8202 - 8327
Alignment:
Q  1 gtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttat 100  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||||||| |||||  |||| |||||||  ||||| |    
T  8202 gtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattggtgataattgtatgattgttggtgaaattacaggttcaattatgtaaaaatgtgaagttgt 8301  T
Q  101 gaagattgtgctaaagtggtgaattt 126  Q
    ||| |||||||| || ||||||||||    
T  8302 gaaaattgtgctcaattggtgaattt 8327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 99; Significance: 6e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Original strand, 247473 - 247694
Alignment:
Q  10 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgt 109  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||  ||||||||| |||||||| ||| | | |||||||||||| |||| |||||    
T  247473 ctgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgagggtgaaatttcatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgt 247572  T
Q  110 gctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataa 209  Q
    ||| || |||| ||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||| |    
T  247573 gctcaattggtaaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatgactgttaattgatgttgtggttgatgaatca 247671  T
Q  210 ttgcttgggtatgcataatcatg 232  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  247672 ttgcttgggtatgcatattcatg 247694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 99; Significance: 6e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 172137 - 171916
Alignment:
Q  10 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgt 109  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| |||| |||||    
T  172137 ctgtgatgatatgtttgtatggatgaattgatgataattgtatgattgatggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgt 172038  T
Q  110 gctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataa 209  Q
    |||||| |||||||||| | ||||||||| ||| | |||||||  ||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||||| |    
T  172037 gctaaattggtgaattt-tgctaagttgtggttgaattgagttacgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatca 171939  T
Q  210 ttgcttgggtatgcataatcatg 232  Q
    |||||| |||||||||| |||||    
T  171938 ttgcttaggtatgcatattcatg 171916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 177840 - 177619
Alignment:
Q  10 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgt 109  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| |||| |||||    
T  177840 ctgtgatgatatgtttgtatggatgaattgatgataattgtatgattgatggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgt 177741  T
Q  110 gctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataa 209  Q
    |||||| |||||||||| | ||||||||| ||| | |||||||  ||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||||| |    
T  177740 gctaaattggtgaattt-tgctaagttgtggttgaattgagttacgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatca 177642  T
Q  210 ttgcttgggtatgcataatcatg 232  Q
    |||||| |||||||||| |||||    
T  177641 ttgcttaggtatgcatattcatg 177619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 92; Significance: 9e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 3204 - 2966
Alignment:
Q  1 gtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||  ||||| |    
T  3204 gtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatccatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttgt 3105  T
Q  101 gaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttg-ttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgat 199  Q
    ||| |||||||| || |||||||||| | ||||||||||||| | ||||| | |||||| || || || |||||||||   ||||||||||| || |  |    
T  3104 gaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttttaattgatgttattgttgttatttgatgttgttgt 3006  T
Q  200 tgatgaataattgcttgggtatgcataatcatggattgat 239  Q
    |||||||| | |||||| ||||||||| ||||| ||||||    
T  3005 tgatgaatcactgcttgtgtatgcatattcatgaattgat 2966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 41961 - 41733
Alignment:
Q  10 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgt 109  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||   |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| || |||| |||||    
T  41961 ctgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtcatattgttggtgaaattacatgctcaaatatgtaaaaatgataatttgtgaaaattgt 41862  T
Q  110 gctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataa 209  Q
    ||| || |||||||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||| | || |   |||||||| |    
T  41861 gctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgctatggctgttaattgttgttgtagatgatgaatca 41763  T
Q  210 ttgcttgggtatgcataatcatggattgat 239  Q
    ||| ||||||||||||| ||||| ||||||    
T  41762 ttggttgggtatgcatattcatgaattgat 41733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 10 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 272257 - 272031
Alignment:
Q  10 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgt 109  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| |||| |||||    
T  272257 ctgtaatgatatgtttgtatgaatgaattgatgataattgtatgattgatggagaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgt 272158  T
Q  110 gctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataa 209  Q
    |||||| |||||||||| | ||||||||| |||   ||||||| |||||||||||||| || ||||||   ||||| ||||| || || ||||||||| |    
T  272157 gctaaattggtgaattt-tgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattggtgttatagctgttaattgatgttgtggttgatgaatca 272059  T
Q  210 ttgcttgggtatgcataatcatggattg 237  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  272058 ttgcttgggtatgcatattcatgaattg 272031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1542 (Bit Score: 86; Significance: 3e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold1542
Description:

Target: scaffold1542; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 10 - 243
Target Start/End: Original strand, 565 - 797
Alignment:
Q  10 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgt 109  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | ||||||| |||| |||| |||||    
T  565 ctgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgatgagttgtgaaaattgt 664  T
Q  110 gctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataa 209  Q
     || || |||||||||| | |||||||  |||||  || |||| ||||||||||| || ||||||||||  || || ||||| || || ||||||||| |    
T  665 actcaattggtgaattt-tgctaagttactgttagattaagttatgattcttgtttaattgatgttatggctgctaattgatgttgtggttgatgaatca 763  T
Q  210 ttgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 243  Q
    ||||||||||||||||| ||| | ||||| ||||    
T  764 ttgcttgggtatgcatattcaggaattgaggatg 797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Original strand, 13335 - 13480
Alignment:
Q  1 gtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttat 100  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |    
T  13335 gtgctcttagtgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgt 13434  T
Q  101 gaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaattt 147  Q
    ||| || ||||| || |||||||||| | ||||||| ||||||||||    
T  13435 gaaaatggtgctcaattggtgaattt-tgctaagttattgttaattt 13480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 34482 - 34724
Alignment:
Q  1 gtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttat 100  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  | || ||||||   ||||| |    
T  34482 gtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattgtgtaaaaatatgaagttgt 34581  T
Q  101 gaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttg-ttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgat 199  Q
    ||| ||||| || ||  ||||||||| | ||||||||||||| | ||||| | |||||| || || || |||||||||   ||||||||||| || |  |    
T  34582 gaaaattgttctcaataggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttttaattgatgttattgttgttatttgatgttgttgt 34680  T
Q  200 tgatgaataattgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 243  Q
    |||||||| | | |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34681 tgatgaatcactacttgggtatgcatattcatggattgatgatg 34724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1560 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold1560
Description:

Target: scaffold1560; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 137 - 243
Target Start/End: Original strand, 9 - 115
Alignment:
Q  137 gttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcataatcatggatt 236  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  9 gttgttaatttgatatttgattcttgttcaaatgatattatgaatgttaattgatgttatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggatt 108  T
Q  237 gatgatg 243  Q
    |||||||    
T  109 gatgatg 115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 41889 - 41648
Alignment:
Q  1 gtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttat 100  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||  ||||| |    
T  41889 gtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttgt 41790  T
Q  101 gaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgatt 200  Q
    ||| |||||| | || |||||||||| | ||| ||||||||| | ||  | || ||  | ||||||| ||||||| |   |||||  |||| || |  ||    
T  41789 gaaaattgtgttcaattggtgaattt-tgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttgttgttaaatgatgttgttgtt 41691  T
Q  201 gatgaataattgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 243  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  41690 gatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 41648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 137 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 48620 - 48514
Alignment:
Q  137 gttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcataatcatggatt 236  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  48620 gttgttaatttgagatttgattcttgttcacttgatgttatggatgttaattgatgttatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggatt 48521  T
Q  237 gatgatg 243  Q
    |||||||    
T  48520 gatgatg 48514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 64; Significance: 5e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 125
Target Start/End: Original strand, 51213 - 51328
Alignment:
Q  10 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgt 109  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| |||| |||||    
T  51213 ctgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaataggtaaaaatgataagttgtgaaaattgt 51312  T
Q  110 gctaaagtggtgaatt 125  Q
    ||| || |||||||||    
T  51313 gctcaattggtgaatt 51328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 13735 - 13506
Alignment:
Q  13 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgct 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||  ||||| |||| ||||||||    
T  13735 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgct 13636  T
Q  113 aaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattg 212  Q
     || || ||||||| | ||| ||||||||| | ||  | || ||  | ||||||| ||||||| |   ||||| ||||| || |  ||||||||| ||      
T  13635 caattgatgaattt-tgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttgttgttaattgatgttgttgttgatgaatcatga 13537  T
Q  213 cttgggtatgcataatcatggattgatgatg 243  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  13536 cttgggtatgcatattcatgaattgacgatg 13506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 125
Target Start/End: Original strand, 89485 - 89600
Alignment:
Q  10 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgt 109  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | |||| ||||||| |||| |||||    
T  89485 ctgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaattataagttgtgaaaattgt 89584  T
Q  110 gctaaagtggtgaatt 125  Q
    ||| || |||||||||    
T  89585 gctcaattggtgaatt 89600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 243
Target Start/End: Original strand, 37100 - 37328
Alignment:
Q  13 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgct 112  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||   |||||  ||||||| |||||||||| |||||||     
T  37100 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgca 37199  T
Q  113 aaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattg 212  Q
    |||  | |||||||  |  | ||||| |||   ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||| || |  ||||||||| ||||    
T  37200 aaatggatgaatttgac--atgttgtagttggattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcattg 37297  T
Q  213 cttgggtatgcataatcatggattgatgatg 243  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  37298 cttgggtatacatattcatggattgatgatg 37328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0622
Description:

Target: scaffold0622; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 146 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 9479 - 9382
Alignment:
Q  146 ttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcataatcatggattgatgatg 243  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  9479 ttgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 9382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0361 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0361
Description:

Target: scaffold0361; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 3431 - 3360
Alignment:
Q  1 gtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacat 72  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || |||||| |||||||||||||||||||    
T  3431 gtgctctagctgtgatgttaagtttgtatgcatgaattaatgatatttgtatgattgttggtgaaattacat 3360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 47; Significance: 7e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 22769 - 22671
Alignment:
Q  13 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgc 111  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||   |||||  ||||||| |||||||||| |||||||    
T  22769 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 22671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 27024 - 26926
Alignment:
Q  13 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgc 111  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||   |||||  ||||||| |||||||||| |||||||    
T  27024 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 26926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 47; Significance: 7e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 111
Target Start/End: Original strand, 1616 - 1714
Alignment:
Q  13 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgc 111  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||   |||||  ||||||| |||||||||| |||||||    
T  1616 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgc 1714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Original strand, 56121 - 56262
Alignment:
Q  1 gtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatg--ttcatatatgcaaaaatgataagtt 98  Q
    |||||||  |||||||||||| || || ||||||| |||||| || |||||| ||||| | ||||||||||||  || |  |||| | |||||  |||||    
T  56121 gtgctctaactgtgatgttattttcgtgtgcatgatttgatgataattgtatgattgtggctgaaattacatgttttaaagtatgtataaatgtcaagtt 56220  T
Q  99 atgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgtt 142  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||| | |||||||||||||    
T  56221 atgaa-attgtgctcaaatggtgaattt-tgctaagttgttgtt 56262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 45244 - 45198
Alignment:
Q  29 tgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 75  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  45244 tgcatgaattgatgataattgtatgattgtgggtgaaattacatgtt 45198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 6 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 54653 - 54584
Alignment:
Q  6 cttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 75  Q
    |||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| || |||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  54653 cttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgtgggtgaaattgcatgtt 54584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 34 times since January 2019
Visitors: 4368