View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0718_low_15 (Length: 403)

Name: NF0718_low_15
Description: NF0718
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0718_low_15
NF0718_low_15
[»] chr2 (23 HSPs)
chr2 (91-403)||(21141895-21142207)
chr2 (91-383)||(12728392-12728683)
chr2 (91-383)||(34824475-34824766)
chr2 (91-383)||(23778010-23778301)
chr2 (91-383)||(11231303-11231594)
chr2 (91-383)||(16935593-16935884)
chr2 (91-383)||(17006253-17006544)
chr2 (91-383)||(22513150-22513441)
chr2 (91-383)||(28775772-28776063)
chr2 (91-383)||(24685746-24686037)
chr2 (180-383)||(8943935-8944137)
chr2 (180-374)||(12635841-12636035)
chr2 (180-383)||(3798568-3798770)
chr2 (180-383)||(12641607-12641809)
chr2 (180-383)||(42177934-42178136)
chr2 (226-374)||(5888603-5888750)
chr2 (226-374)||(23774272-23774419)
chr2 (259-340)||(7507859-7507940)
chr2 (294-383)||(19886622-19886710)
chr2 (91-144)||(5888832-5888885)
chr2 (91-144)||(23774137-23774190)
chr2 (91-305)||(24341439-24341652)
chr2 (91-349)||(25265396-25265653)
[»] chr3 (25 HSPs)
chr3 (91-403)||(44228985-44229297)
chr3 (91-383)||(12264757-12265049)
chr3 (91-383)||(49232436-49232727)
chr3 (91-383)||(1467704-1467995)
chr3 (91-383)||(25058739-25059030)
chr3 (91-383)||(12902055-12902346)
chr3 (169-384)||(54651535-54651749)
chr3 (134-383)||(22275252-22275500)
chr3 (91-383)||(15468305-15468596)
chr3 (180-383)||(18911082-18911284)
chr3 (113-349)||(11986172-11986408)
chr3 (95-370)||(5228317-5228591)
chr3 (224-373)||(12811974-12812123)
chr3 (261-383)||(18897009-18897130)
chr3 (230-374)||(16821280-16821422)
chr3 (259-374)||(55316387-55316502)
chr3 (294-374)||(41270278-41270358)
chr3 (138-383)||(15936600-15936843)
chr3 (259-383)||(15615001-15615124)
chr3 (91-207)||(18897139-18897255)
chr3 (91-200)||(47984650-47984759)
chr3 (91-200)||(48003224-48003333)
chr3 (138-383)||(15938442-15938685)
chr3 (91-200)||(47993937-47994046)
chr3 (91-200)||(48012510-48012619)
[»] scaffold0191 (1 HSPs)
scaffold0191 (91-383)||(7421-7712)
[»] chr4 (22 HSPs)
chr4 (91-383)||(18248218-18248509)
chr4 (91-383)||(17145622-17145913)
chr4 (91-307)||(8374508-8374724)
chr4 (91-383)||(15287210-15287501)
chr4 (91-383)||(15294319-15294610)
chr4 (91-374)||(19020486-19020769)
chr4 (91-383)||(18168970-18169261)
chr4 (180-383)||(7132030-7132232)
chr4 (224-383)||(22738402-22738560)
chr4 (180-383)||(20000812-20001014)
chr4 (226-374)||(22352037-22352184)
chr4 (226-374)||(26339155-26339302)
chr4 (305-383)||(8378365-8378442)
chr4 (259-374)||(10644387-10644502)
chr4 (91-349)||(15675095-15675352)
chr4 (317-374)||(47357880-47357937)
chr4 (169-305)||(40885604-40885739)
chr4 (91-144)||(22352249-22352302)
chr4 (91-305)||(31115629-31115842)
chr4 (91-144)||(22738269-22738322)
chr4 (91-144)||(26339020-26339073)
chr4 (169-305)||(10104300-10104435)
[»] chr5 (33 HSPs)
chr5 (91-383)||(11212030-11212321)
chr5 (91-383)||(35791063-35791355)
chr5 (91-383)||(7425324-7425615)
chr5 (91-383)||(1219485-1219776)
chr5 (91-383)||(22883049-22883340)
chr5 (91-383)||(35582036-35582327)
chr5 (91-384)||(36989734-36990026)
chr5 (91-383)||(21932346-21932637)
chr5 (91-383)||(21938516-21938807)
chr5 (180-383)||(23514650-23514852)
chr5 (134-383)||(17471553-17471801)
chr5 (224-383)||(10777935-10778093)
chr5 (115-349)||(32950717-32950952)
chr5 (226-374)||(23328693-23328840)
chr5 (226-374)||(24616297-24616444)
chr5 (226-374)||(24712673-24712820)
chr5 (226-374)||(24745691-24745838)
chr5 (258-374)||(27010008-27010124)
chr5 (294-383)||(18777953-18778041)
chr5 (294-383)||(12577-12665)
chr5 (294-383)||(25426831-25426919)
chr5 (259-383)||(29188245-29188368)
chr5 (259-370)||(43443368-43443479)
chr5 (294-383)||(19500102-19500190)
chr5 (294-383)||(22366442-22366530)
chr5 (91-349)||(18531073-18531330)
chr5 (317-383)||(21073556-21073621)
chr5 (91-349)||(22053839-22054096)
chr5 (259-374)||(4199954-4200069)
chr5 (91-144)||(23328558-23328611)
chr5 (93-144)||(24616165-24616216)
chr5 (93-144)||(24712541-24712592)
chr5 (93-144)||(24745559-24745610)
[»] scaffold0066 (3 HSPs)
scaffold0066 (91-384)||(54416-54709)
scaffold0066 (136-384)||(45075-45323)
scaffold0066 (91-157)||(45011-45077)
[»] chr8 (17 HSPs)
chr8 (91-383)||(16195230-16195522)
chr8 (91-383)||(22006223-22006514)
chr8 (91-383)||(13662230-13662521)
chr8 (91-383)||(271325-271616)
chr8 (91-383)||(644304-644595)
chr8 (91-383)||(830039-830330)
chr8 (91-383)||(15319124-15319415)
chr8 (91-383)||(15499493-15499784)
chr8 (91-383)||(22088759-22089050)
chr8 (180-383)||(13720893-13721095)
chr8 (180-383)||(16873016-16873218)
chr8 (258-374)||(21844541-21844657)
chr8 (258-374)||(21851934-21852050)
chr8 (259-383)||(24549149-24549272)
chr8 (259-383)||(6774219-6774342)
chr8 (259-374)||(16674361-16674476)
chr8 (259-374)||(30120890-30121005)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (91-383)||(34123-34414)
[»] chr6 (27 HSPs)
chr6 (91-383)||(1556005-1556296)
chr6 (91-383)||(22225703-22225994)
chr6 (91-383)||(16376338-16376629)
chr6 (91-383)||(16383662-16383953)
chr6 (91-374)||(19610018-19610301)
chr6 (91-383)||(10488699-10488990)
chr6 (91-383)||(16556104-16556395)
chr6 (91-383)||(16632660-16632951)
chr6 (180-383)||(16231981-16232183)
chr6 (180-383)||(18086788-18086990)
chr6 (180-383)||(13620759-13620961)
chr6 (180-383)||(23977858-23978060)
chr6 (169-384)||(29665951-29666166)
chr6 (229-383)||(19299375-19299528)
chr6 (265-383)||(22251531-22251648)
chr6 (226-374)||(29869749-29869896)
chr6 (91-272)||(27740838-27741019)
chr6 (294-383)||(16825713-16825801)
chr6 (259-383)||(1650066-1650189)
chr6 (294-383)||(25175766-25175854)
chr6 (317-383)||(27653944-27654009)
chr6 (259-340)||(14626133-14626214)
chr6 (91-144)||(29869978-29870031)
chr6 (91-151)||(33314414-33314474)
chr6 (91-349)||(35009445-35009702)
chr6 (91-146)||(29665892-29665947)
chr6 (228-340)||(15862609-15862719)
[»] chr7 (26 HSPs)
chr7 (91-383)||(15760079-15760370)
chr7 (91-383)||(15950756-15951047)
chr7 (91-383)||(7822728-7823019)
chr7 (91-383)||(7830039-7830330)
chr7 (91-383)||(27101602-27101893)
chr7 (91-383)||(27108950-27109241)
chr7 (91-383)||(27176433-27176724)
chr7 (91-383)||(38783694-38783985)
chr7 (180-383)||(18979986-18980188)
chr7 (180-383)||(14250863-14251065)
chr7 (180-383)||(13758459-13758661)
chr7 (180-383)||(15927657-15927859)
chr7 (111-367)||(48622646-48622901)
chr7 (115-349)||(13321038-13321273)
chr7 (226-374)||(16418633-16418780)
chr7 (226-374)||(10000343-10000490)
chr7 (258-374)||(13572843-13572959)
chr7 (259-383)||(16478923-16479046)
chr7 (259-374)||(10989577-10989692)
chr7 (259-374)||(13910993-13911108)
chr7 (91-144)||(10000572-10000625)
chr7 (91-144)||(16418498-16418551)
chr7 (259-383)||(18253808-18253931)
chr7 (259-383)||(2437625-2437748)
chr7 (91-129)||(15852456-15852494)
chr7 (346-383)||(15862174-15862210)
[»] scaffold0467 (1 HSPs)
scaffold0467 (91-383)||(10304-10595)
[»] chr1 (17 HSPs)
chr1 (91-383)||(18059723-18060014)
chr1 (96-383)||(46523394-46523680)
chr1 (91-383)||(17004638-17004929)
chr1 (91-374)||(38055064-38055347)
chr1 (221-383)||(17148697-17148858)
chr1 (229-383)||(19962464-19962617)
chr1 (226-374)||(7640907-7641054)
chr1 (226-374)||(22035583-22035730)
chr1 (259-383)||(22227976-22228099)
chr1 (259-383)||(22232673-22232796)
chr1 (259-374)||(5072357-5072472)
chr1 (259-374)||(18601087-18601202)
chr1 (91-144)||(20254312-20254365)
chr1 (259-383)||(2116422-2116545)
chr1 (259-383)||(45051590-45051713)
chr1 (91-144)||(22035448-22035501)
chr1 (91-144)||(7641136-7641189)
[»] scaffold0383 (1 HSPs)
scaffold0383 (91-383)||(2392-2683)
[»] scaffold0023 (3 HSPs)
scaffold0023 (91-383)||(153972-154263)
scaffold0023 (317-383)||(169873-169938)
scaffold0023 (325-374)||(36327-36376)
[»] scaffold0107 (2 HSPs)
scaffold0107 (91-383)||(31309-31600)
scaffold0107 (91-374)||(39646-39929)
[»] scaffold0076 (2 HSPs)
scaffold0076 (91-383)||(39103-39394)
scaffold0076 (259-383)||(43165-43288)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (91-383)||(1540-1831)
[»] scaffold0213 (1 HSPs)
scaffold0213 (91-383)||(29162-29453)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (113-349)||(56105-56341)
[»] scaffold1500 (1 HSPs)
scaffold1500 (180-383)||(1479-1681)
[»] scaffold1666 (1 HSPs)
scaffold1666 (91-340)||(3-252)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (111-383)||(53895-54165)
[»] scaffold0892 (1 HSPs)
scaffold0892 (111-383)||(3434-3704)
[»] scaffold0183 (2 HSPs)
scaffold0183 (226-374)||(6733-6880)
scaffold0183 (91-144)||(6598-6651)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (259-374)||(5185-5300)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (226-374)||(7345-7492)
scaffold0003 (91-144)||(7210-7263)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (259-383)||(3890-4013)
[»] scaffold0155 (2 HSPs)
scaffold0155 (226-374)||(23722-23869)
scaffold0155 (91-144)||(23951-24004)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (170-383)||(3042-3253)
[»] scaffold0516 (1 HSPs)
scaffold0516 (325-388)||(12086-12149)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (258-370)||(202-314)
[»] scaffold0215 (2 HSPs)
scaffold0215 (259-374)||(9318-9433)
scaffold0215 (259-374)||(16216-16331)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (91-349)||(8849-9106)
[»] scaffold1711 (1 HSPs)
scaffold1711 (259-374)||(1273-1388)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (259-383)||(13286-13409)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (296-374)||(64492-64570)
scaffold0026 (259-383)||(107914-108037)
[»] scaffold0361 (1 HSPs)
scaffold0361 (192-349)||(3290-3447)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (317-383)||(10713-10778)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (317-383)||(21077-21142)
scaffold0139 (259-383)||(14023-14145)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (325-374)||(31644-31693)
[»] scaffold0195 (2 HSPs)
scaffold0195 (91-349)||(19206-19463)
scaffold0195 (91-349)||(21290-21547)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (91-349)||(41648-41905)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (113-349)||(13528-13763)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (91-340)||(34475-34724)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 285; Significance: 1e-160; HSPs: 23)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 285; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 91 - 403
Target Start/End: Original strand, 21141895 - 21142207
Alignment:
Q  91 catcatcaatccataattaagtatacccaagtcataattcacccacaacaacatcagttaatagcaataaccttaatagaacatgaatcacatctcattt 190  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21141895 catcatcaatccataattatgtatacccaagtcgtaattcacccacaacaacatcagttaatagcaataaccttaatggaacatgaatcacatctcattt 21141994  T
Q  191 taacaacaacatatcaagattcactaaatgagtataatttcatagcttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcatccacaaacataccataa 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21141995 taacaacaacatatcaagattcactaattgagtataatttcatagcttgacatttatacatactttgaaacatgtaatttcatccacaaacataccataa 21142094  T
Q  291 tcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaaccatgagaaatgaaatt 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21142095 tcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaaccatgagaaatgaaaat 21142194  T
Q  391 ttttgaattgatt 403  Q
    |||||||||||||    
T  21142195 ttttgaattgatt 21142207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 91 - 383
Target Start/End: Original strand, 12728392 - 12728683
Alignment:
Q  91 catcatcaatccataattaagtatacccaagtcataattcacccacaacaacatcagttaatagcaataaccttaatagaacatgaatcacatctcattt 190  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||| ||||| | |||||||||| |  ||  || | ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  12728392 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcatgattcactcacaatagcatcagttaacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcattt 12728491  T
Q  191 taacaacaacatatcaagattcactaaatgagtataatttcatagcttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcatccacaaacataccataa 290  Q
     || || ||||||||||  ||||  || | || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12728492 caataaaaacatatcaaatttcatcaattaagaataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataa 12728591  T
Q  291 tcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaaccatgagaaa 383  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12728592 tcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaa-catgagaaa 12728683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 91 - 383
Target Start/End: Original strand, 34824475 - 34824766
Alignment:
Q  91 catcatcaatccataattaagtatacccaagtcataattcacccacaacaacatcagttaatagcaataaccttaatagaacatgaatcacatctcattt 190  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||| ||||| | |||||||||| |  ||  || | ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  34824475 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcatgattcactcacaatagcatcagttaacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcattt 34824574  T
Q  191 taacaacaacatatcaagattcactaaatgagtataatttcatagcttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcatccacaaacataccataa 290  Q
     || || ||||||||||  ||||  || | || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34824575 caataaaaacatatcaaatttcatcaattaagaataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataa 34824674  T
Q  291 tcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaaccatgagaaa 383  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34824675 tcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaa-catgagaaa 34824766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 91 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 23778301 - 23778010
Alignment:
Q  91 catcatcaatccataattaagtatacccaagtcataattcacccacaacaacatcagttaatagcaataaccttaatagaacatgaatcacatctcattt 190  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||| ||||| | |||||||||| |  || ||| | ||| ||| |||||| |||||||||||    
T  23778301 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcatgattcactcacaatagcatcagttaacaataacaacatcaatggaatatgaattacatctcattt 23778202  T
Q  191 taacaacaacatatcaagattcactaaatgagtataatttcatagcttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcatccacaaacataccataa 290  Q
     ||  | | ||||||||  ||||  || | |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23778201 caatcaaatcatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcatccacaaacataccataa 23778102  T
Q  291 tcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaaccatgagaaa 383  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23778101 tcatcaattcatgcataagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaagaattgttcatcaacccattttcatacaa-catgagaaa 23778010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 91 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 11231594 - 11231303
Alignment:
Q  91 catcatcaatccataattaagtatacccaagtcataattcacccacaacaacatcagttaatagcaataaccttaatagaacatgaatcacatctcattt 190  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  |||| | |||||||||| |  ||  || ||||| ||| |||||||||||||| |||    
T  11231594 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctctttt 11231495  T
Q  191 taacaacaacatatcaagattcactaaatgagtataatttcatagcttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcatccacaaacataccataa 290  Q
     ||  | ||||||||||  ||||  || | || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  11231494 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 11231395  T
Q  291 tcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaaccatgagaaa 383  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  11231394 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaa-catgagaaa 11231303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 91 - 383
Target Start/End: Original strand, 16935593 - 16935884
Alignment:
Q  91 catcatcaatccataattaagtatacccaagtcataattcacccacaacaacatcagttaatagcaataaccttaatagaacatgaatcacatctcattt 190  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||| ||||| | ||||| |||| |  ||  || | ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  16935593 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcatgattcactcacaatagcatcatttaacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcattt 16935692  T
Q  191 taacaacaacatatcaagattcactaaatgagtataatttcatagcttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcatccacaaacataccataa 290  Q
     ||  | ||||||||||  ||||  ||   |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  16935693 caatcaaaacatatcaaatttcatcaataaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacgcacaaacataccataa 16935792  T
Q  291 tcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaaccatgagaaa 383  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16935793 tcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcatgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaa-catgagaaa 16935884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 91 - 383
Target Start/End: Original strand, 17006253 - 17006544
Alignment:
Q  91 catcatcaatccataattaagtatacccaagtcataattcacccacaacaacatcagttaatagcaataaccttaatagaacatgaatcacatctcattt 190  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||| ||||| | ||||| |||| |  ||  || | ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  17006253 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcatgattcactcacaatagcatcatttaacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcattt 17006352  T
Q  191 taacaacaacatatcaagattcactaaatgagtataatttcatagcttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcatccacaaacataccataa 290  Q
     ||  | ||||||||||  ||||  ||   |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  17006353 caatcaaaacatatcaaatttcatcaataaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacgcacaaacataccataa 17006452  T
Q  291 tcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaaccatgagaaa 383  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17006453 tcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcatgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaa-catgagaaa 17006544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 91 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 22513441 - 22513150
Alignment:
Q  91 catcatcaatccataattaagtatacccaagtcataattcacccacaacaacatcagttaatagcaataaccttaatagaacatgaatcacatctcattt 190  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  |||| | |||||||||| |  ||  || ||||| ||| |||||||||||||| |||    
T  22513441 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctctttt 22513342  T
Q  191 taacaacaacatatcaagattcactaaatgagtataatttcatagcttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcatccacaaacataccataa 290  Q
     ||  | | ||||||||  ||||  || | || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  22513341 caatcaaagcatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 22513242  T
Q  291 tcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaaccatgagaaa 383  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  22513241 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaa-catgagaaa 22513150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 91 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 28776063 - 28775772
Alignment:
Q  91 catcatcaatccataattaagtatacccaagtcataattcacccacaacaacatcagttaatagcaataaccttaatagaacatgaatcacatctcattt 190  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  |||| | |||||||||| |  ||  || ||||| ||| |||||||||||||| |||    
T  28776063 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctctttt 28775964  T
Q  191 taacaacaacatatcaagattcactaaatgagtataatttcatagcttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcatccacaaacataccataa 290  Q
     ||  | | ||||||||  ||||  || | || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  28775963 caatcaaagcatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 28775864  T
Q  291 tcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaaccatgagaaa 383  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  28775863 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaa-catgagaaa 28775772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 91 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 24686037 - 24685746
Alignment:
Q  91 catcatcaatccataattaagtatacccaagtcataattcacccacaacaacatcagttaatagcaataaccttaatagaacatgaatcacatctcattt 190  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||  |||| | |||||||||| |  ||  || ||||| ||| |||||||||||||| |||    
T  24686037 catcatcaatccacaattaagtatacctaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctctttt 24685938  T
Q  191 taacaacaacatatcaagattcactaaatgagtataatttcatagcttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcatccacaaacataccataa 290  Q
     ||  | |||| |||||  ||||  || | || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  24685937 caatcaaaacacatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 24685838  T
Q  291 tcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaaccatgagaaa 383  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  24685837 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaa-catgagaaa 24685746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 180 - 383
Target Start/End: Original strand, 8943935 - 8944137
Alignment:
Q  180 acatctcattttaacaacaacatatcaagattcactaaatgagtataatttcatagcttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcatccacaa 279  Q
    ||||||||||| ||  | ||||||||||  ||||  || | |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  8943935 acatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaa 8944034  T
Q  280 acataccataatcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaaccatga 379  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8944035 atataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaa-catga 8944133  T
Q  380 gaaa 383  Q
    ||||    
T  8944134 gaaa 8944137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 180 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 12636035 - 12635841
Alignment:
Q  180 acatctcattttaacaacaacatatcaagattcactaaatgagtataatttcatagcttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcatccacaa 279  Q
    ||||||||||| ||  | ||||||||||  ||||  || | |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  12636035 acatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaa 12635936  T
Q  280 acataccataatcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaac 374  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12635935 acataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacctattttcatacaac 12635841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 180 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 3798770 - 3798568
Alignment:
Q  180 acatctcattttaacaacaacatatcaagattcactaaatgagtataatttcatagcttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcatccacaa 279  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||||||  ||||  || | |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  3798770 acatctcatttcaaccaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaa 3798671  T
Q  280 acataccataatcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaaccatga 379  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3798670 acataccataatcatcaattcatgcacaagaaaataacattacaacaagagcacgaatttagccacaattgttcatcaacccattttcatacaa-catga 3798572  T
Q  380 gaaa 383  Q
    ||||    
T  3798571 gaaa 3798568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 180 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 12641809 - 12641607
Alignment:
Q  180 acatctcattttaacaacaacatatcaagattcactaaatgagtataatttcatagcttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcatccacaa 279  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||||||  ||||  || | |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  12641809 acatctcatttcaaccaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcagccacaa 12641710  T
Q  280 acataccataatcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaaccatga 379  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12641709 acataccataatcatcaattcatgcacaagaaaataacattacaacaagagcacgaatttagccacaattgttcatcaacccattttcatacaa-catga 12641611  T
Q  380 gaaa 383  Q
    ||||    
T  12641610 gaaa 12641607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 180 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 42178136 - 42177934
Alignment:
Q  180 acatctcattttaacaacaacatatcaagattcactaaatgagtataatttcatagcttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcatccacaa 279  Q
    ||||||||||| ||  | ||||||||||  ||||  || | |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||    
T  42178136 acatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccaaaa 42178037  T
Q  280 acataccataatcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaaccatga 379  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42178036 acataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcattacaacaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaa-catga 42177938  T
Q  380 gaaa 383  Q
    ||||    
T  42177937 gaaa 42177934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 226 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 5888750 - 5888603
Alignment:
Q  226 aatttcatagcttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcatccacaaacataccataatcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagc 325  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||  || |||| || | |    
T  5888750 aatttcacaacttgacatttatacatacattgaaccatgtaatttcatccacaaacataccataatcatcaattcatgtataag-caacagcaacataac 5888652  T
Q  326 aagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaac 374  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5888651 aagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaac 5888603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 226 - 374
Target Start/End: Original strand, 23774272 - 23774419
Alignment:
Q  226 aatttcatagcttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcatccacaaacataccataatcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagc 325  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | | ||| ||| |||| || | |    
T  23774272 aatttcacaacttgacatttatacatacattgaaccatgtaatttcatccacaaacataccataatcatcaattcaagtataag-aaacagcaacataac 23774370  T
Q  326 aagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaac 374  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23774371 aagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaac 23774419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 259 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 7507940 - 7507859
Alignment:
Q  259 aacatgtaatttcatccacaaacataccataatcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaattta 340  Q
    |||||||||||||| | |||| ||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7507940 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaattta 7507859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 294 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 19886710 - 19886622
Alignment:
Q  294 tcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaaccatgagaaa 383  Q
    |||||||||||| |  || ||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19886710 tcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaa-catgagaaa 19886622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 91 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 5888885 - 5888832
Alignment:
Q  91 catcatcaatccataattaagtatacccaagtcataattcacccacaacaacat 144  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5888885 catcatcaatccataattatgtatacccaagtcataattcactcacaacaacat 5888832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 91 - 144
Target Start/End: Original strand, 23774137 - 23774190
Alignment:
Q  91 catcatcaatccataattaagtatacccaagtcataattcacccacaacaacat 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  23774137 catcatcaatccataattaagtatacccaagttataattcactcacaacaacat 23774190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 91 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 24341652 - 24341439
Alignment:
Q  91 catcatcaatccataattaagtatacccaagtcataattcacccacaacaacatcagttaatagcaataaccttaatagaacatgaatcacatctcattt 190  Q
    |||||||||| ||| | || |||||||||||  || ||||| | |||  ||||||| |||| | ||||||| | ||| |||||||||||| |||||| ||    
T  24341652 catcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaacaggaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaatt 24341553  T
Q  191 taacaacaacatatcaagattcactaaatgagtataa-tttcatagcttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcatccacaaacataccata 289  Q
     ||||||||| || ||| |||||| || |||| | || ||||| | ||| |||||| |||||| ||   ||||| |||||||| | |||| ||||| ||     
T  24341552 caacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataatt--gaacatataatttcaccaacaatcatacaatt 24341455  T
Q  290 atcctcaattcatgca 305  Q
    ||| ||||||||||||    
T  24341454 atcatcaattcatgca 24341439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 25265653 - 25265396
Alignment:
Q  91 catcatcaatccataattaagtatacccaagtcataattcacccacaacaacatcagttaatagcaataaccttaatagaacatgaatcacatctcattt 190  Q
    |||||||||| ||| | || | ||||||||| ||| |||||   |||||||||||| |||| | ||| ||| | ||| |||||||  || ||||  | ||    
T  25265653 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagccatgattcataaacaacaacatcaattaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataatt 25265554  T
Q  191 taacaacaacatatcaagattcactaaatgagtataattt-catagcttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcatccacaaacataccata 289  Q
     |||||||||||| ||| |||||| || |||| | ||||| || | ||| |||||| |||||| || ||  |||||||||||| | |||| ||||| ||     
T  25265553 caacaacaacatagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaa--catgtaatttcaccaacaatcatacaatt 25265456  T
Q  290 atcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaatt 349  Q
    ||| |||||||||||| |  || ||| ||||| ||  |||||||||||||| || |||||    
T  25265455 atcatcaattcatgcatacaaacataacatcaaagttagagcacgaatttagcaacaatt 25265396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 273; Significance: 1e-152; HSPs: 25)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 91 - 403
Target Start/End: Original strand, 44228985 - 44229297
Alignment:
Q  91 catcatcaatccataattaagtatacccaagtcataattcacccacaacaacatcagttaatagcaataaccttaatagaacatgaatcacatctcattt 190  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44228985 catcatcaatccataattatgtatacccaagtcataattcacccacaacaacatcagttaatagcaataaccttaatggaacatgaatcacatctcattt 44229084  T
Q  191 taacaacaacatatcaagattcactaaatgagtataatttcatagcttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcatccacaaacataccataa 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44229085 taacaacaacatatcaagattcactaattgagtataatttcatagcttgacatttatacatactttgaaacatgtaatttcatccacaaacataccataa 44229184  T
Q  291 tcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaaccatgagaaatgaaatt 390  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  44229185 tcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacggatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaaccatgagaaatgaaaaa 44229284  T
Q  391 ttttgaattgatt 403  Q
     ||||||||||||    
T  44229285 atttgaattgatt 44229297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 91 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 12265049 - 12264757
Alignment:
Q  91 catcatcaatccataattaagtatacccaagtcataattcacccacaacaacatcagttaatagcaataaccttaatagaacatgaatcacatctcattt 190  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||||    
T  12265049 catcatcaatccataattatgtatacccaagtcataattcacccacaacaacatcagttaatagcaacaacatcaatggaacatgaatcacatctcattt 12264950  T
Q  191 taacaacaacatatcaagatt-cactaaatgagtataatttcatagcttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcatccacaaacataccata 289  Q
     |||||||||||||||| ||| ||  || | |||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12264949 caacaacaacatatcaaaatttcatcaattaagtataatctcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccata 12264850  T
Q  290 atcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaaccatgagaaa 383  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12264849 atcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaa-catgagaaa 12264757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 91 - 383
Target Start/End: Original strand, 49232436 - 49232727
Alignment:
Q  91 catcatcaatccataattaagtatacccaagtcataattcacccacaacaacatcagttaatagcaataaccttaatagaacatgaatcacatctcattt 190  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  |||| | |||||||||| |  ||  || | ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  49232436 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcattt 49232535  T
Q  191 taacaacaacatatcaagattcactaaatgagtataatttcatagcttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcatccacaaacataccataa 290  Q
     ||  | ||||||||||  ||||  || | || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  49232536 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataa 49232635  T
Q  291 tcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaaccatgagaaa 383  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  49232636 tcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaa-catgagaaa 49232727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 91 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 1467995 - 1467704
Alignment:
Q  91 catcatcaatccataattaagtatacccaagtcataattcacccacaacaacatcagttaatagcaataaccttaatagaacatgaatcacatctcattt 190  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  |||| | |||||||||| |  ||  || ||||| ||| |||||||||||||| |||    
T  1467995 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctctttt 1467896  T
Q  191 taacaacaacatatcaagattcactaaatgagtataatttcatagcttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcatccacaaacataccataa 290  Q
     ||  | ||||||||||  ||||  || | || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  1467895 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 1467796  T
Q  291 tcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaaccatgagaaa 383  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  1467795 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaa-catgagaaa 1467704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 91 - 383
Target Start/End: Original strand, 25058739 - 25059030
Alignment:
Q  91 catcatcaatccataattaagtatacccaagtcataattcacccacaacaacatcagttaatagcaataaccttaatagaacatgaatcacatctcattt 190  Q
    |||||||||| || |||||||||||| ||| |||| |||||| ||||| | ||| |||||| |  || ||| | ||| ||| |||||| |||||||||||    
T  25058739 catcatcaattcacaattaagtatactcaaatcatgattcactcacaatagcataagttaacaataacaacatcaatggaatatgaattacatctcattt 25058838  T
Q  191 taacaacaacatatcaagattcactaaatgagtataatttcatagcttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcatccacaaacataccataa 290  Q
     ||  | ||||||||||  ||||  || | || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25058839 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataa 25058938  T
Q  291 tcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaaccatgagaaa 383  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25058939 tcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaa-catgagaaa 25059030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 91 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 12902346 - 12902055
Alignment:
Q  91 catcatcaatccataattaagtatacccaagtcataattcacccacaacaacatcagttaatagcaataaccttaatagaacatgaatcacatctcattt 190  Q
    |||||| |||||| ||||||||||| |||| |||| |||||| ||||| |  |||||||||||  || ||| | ||| ||| |||||| |||||||||||    
T  12902346 catcattaatccacaattaagtatatccaaatcatgattcactcacaatagtatcagttaataataacaacatcaatggaatatgaattacatctcattt 12902247  T
Q  191 taacaacaacatatcaagattcactaaatgagtataatttcatagcttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcatccacaaacataccataa 290  Q
     ||  | ||||||||||  || |  || | |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12902246 caatcaaaacatatcaaatttaatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataa 12902147  T
Q  291 tcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaaccatgagaaa 383  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12902146 tcatcaattcatgcacaagaaaataacatcacagcaagagcacgaatttagcaaaaattattcatcaacccattttcatacaa-catgagaaa 12902055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 169 - 384
Target Start/End: Original strand, 54651535 - 54651749
Alignment:
Q  169 gaacatgaatcacatctcattttaacaacaacatatcaagattcactaaatgagtataatttcatagcttgacatttatacatactttaaaacatgtaat 268  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||||| |||    
T  54651535 gaacatgaattacatctcatttcaacaacaacatatcaaaattcaccaattgagtataatttcataacttaacatttatacatactttgcaacatgcaat 54651634  T
Q  269 ttcatccacaaacataccataatcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttca 368  Q
    ||||  ||||| ||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  54651635 ttcactcacaatcatacaattatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattattcatcaacccattttca 54651734  T
Q  369 tacaaccatgagaaat 384  Q
    ||||| ||||||||||    
T  54651735 tacaa-catgagaaat 54651749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 134 - 383
Target Start/End: Original strand, 22275252 - 22275500
Alignment:
Q  134 cacaacaacatcagttaatagcaataaccttaatagaacatgaatcacatctcattttaacaacaacatatcaagattcactaaatgagtataatttcat 233  Q
    ||||| |||||||||||| |  || ||| | ||| ||| |||||| ||||||||||| ||  | ||||||||||  ||||  || | |||||||||||||    
T  22275252 cacaataacatcagttaacaataacaacatcaatggaatatgaattacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcat 22275351  T
Q  234 agcttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcatccacaaacataccataatcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcac 333  Q
      ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22275352 gacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatggcatcacagcaagagcac 22275451  T
Q  334 gaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaaccatgagaaa 383  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22275452 gaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaa-catgagaaa 22275500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 91 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 15468596 - 15468305
Alignment:
Q  91 catcatcaatccataattaagtatacccaagtcataattcacccacaacaacatcagttaatagcaataaccttaatagaacatgaatcacatctcattt 190  Q
    |||||||||| ||| | || | |||||||||  || |||||  ||||| |||||||||||| |  || ||| | ||| ||| |||||| |||||||||||    
T  15468596 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcattcacaataacatcagttaacaataacaacatcaatggaatatgaattacatctcattt 15468497  T
Q  191 taacaacaacatatcaagattcactaaatgagtataatttcatagcttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcatccacaaacataccataa 290  Q
     ||  | ||||||||||  ||||  || | |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15468496 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcatgacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataa 15468397  T
Q  291 tcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaaccatgagaaa 383  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15468396 tcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcatagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcctcaacccattttcatacaa-catgagaaa 15468305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 180 - 383
Target Start/End: Original strand, 18911082 - 18911284
Alignment:
Q  180 acatctcattttaacaacaacatatcaagattcactaaatgagtataatttcatagcttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcatccacaa 279  Q
    ||||||||||| ||  | ||||||||||  ||||  || | |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  18911082 acatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaa 18911181  T
Q  280 acataccataatcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaaccatga 379  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18911182 acataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaa-catga 18911280  T
Q  380 gaaa 383  Q
    ||||    
T  18911281 gaaa 18911284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 113 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 11986408 - 11986172
Alignment:
Q  113 atacccaagtcataattcacccacaacaacatcagttaatagcaataaccttaatagaacatgaatcacatctcattttaacaacaacatatcaagattc 212  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | ||| ||||||||||||||| || ||| ||||||||| || ||| ||||    
T  11986408 atacccaagtcatgattcacccacaacaacatcagttaatagcatcaacatcaatggaacatgaatcacatatcttttcaacaacaacttagcaaaattc 11986309  T
Q  213 actaaatgagtataatttcatagcttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcatccacaaacataccataatcctcaattcatgcacaagaaa 312  Q
    ||||  |||| | ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||| | || ||||||||| ||||    
T  11986308 actatttgagcacaatttcataacttgacattaatacatactttaaaacatgtaatttcaaccacaatcatacaattatcattaaatcatgcacacgaaa 11986209  T
Q  313 atagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaatt 349  Q
    ||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  11986208 ataacatcacagttagagcacgaatttaacaacaatt 11986172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 95 - 370
Target Start/End: Original strand, 5228317 - 5228591
Alignment:
Q  95 atcaatccataattaagtatacccaagtcataattcacccacaacaacatcagttaatagcaataaccttaatagaacatgaatcacatctcattttaac 194  Q
    |||||| || |||||||||||||||| |||| |||||| ||||| | |||||||||| |  || ||| | ||| ||| |||||| ||| ||||||| ||     
T  5228317 atcaattcacaattaagtatacccaaatcatgattcactcacaatagcatcagttaacaataacaacatcaatggaatatgaattacacctcatttcaat 5228416  T
Q  195 aacaacatatcaagattcactaaatgagtataatttcatagcttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcatccacaaacataccataatcct 294  Q
     | ||||||||||  ||||  || | |||||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  5228417 caaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatctcataacttaacatttatacatattttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcat 5228516  T
Q  295 caattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcata 370  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||    
T  5228517 caattcatgcacaaggaaataacatcacagcaagagcacgaatttagcaacaa-tgttcatcaacccattttcata 5228591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 224 - 373
Target Start/End: Original strand, 12811974 - 12812123
Alignment:
Q  224 ataatttcatagcttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcatccacaaacataccataatcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcaca 323  Q
    |||| |||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| || ||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  12811974 ataaattcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattccacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcattaca 12812073  T
Q  324 gcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaa 373  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12812074 gcaagagcacgaatttaacaacaattgtccatcaacccattttcatacaa 12812123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 261 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 18897130 - 18897009
Alignment:
Q  261 catgtaatttcatccacaaacataccataatcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacc 360  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  18897130 catgtaattccacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttatcaacaattgttcatcaacc 18897031  T
Q  361 cattttcatacaaccatgagaaa 383  Q
    ||||||||||||| |||||||||    
T  18897030 cattttcatacaa-catgagaaa 18897009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 230 - 374
Target Start/End: Original strand, 16821280 - 16821422
Alignment:
Q  230 tcatagcttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcatccacaaacataccataatcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaaga 329  Q
    ||||||||| |||||| |||||| || ||  |||||||||||| | |||| ||||| || ||| |||||| ||||| |  || ||| |||||||||||||    
T  16821280 tcatagcttaacatttttacatatttgaa--catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaatttatgcatacaaacataacatcacagcaaga 16821377  T
Q  330 gcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaac 374  Q
    ||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16821378 gcacggatttgacataaattgttcatcaacccattttcatacaac 16821422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 259 - 374
Target Start/End: Original strand, 55316387 - 55316502
Alignment:
Q  259 aacatgtaatttcatccacaaacataccataatcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaa 358  Q
    |||||||||||||| | |||| ||||| |  | | |||||||||||| |  || ||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  55316387 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaa 55316486  T
Q  359 cccattttcatacaac 374  Q
    ||||||||||||||||    
T  55316487 cccattttcatacaac 55316502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 294 - 374
Target Start/End: Original strand, 41270278 - 41270358
Alignment:
Q  294 tcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaac 374  Q
    |||||||||||| |  || ||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41270278 tcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaac 41270358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 138 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 15936843 - 15936600
Alignment:
Q  138 acaacatcagttaatagcaataaccttaatagaacatgaatcacatctcattttaacaacaacatatcaagattcactaaatgagtataattt-catagc 236  Q
    ||||||||| |||| | | ||||| | ||| ||||| |||||| ||||||  ||||||||||| |||||| |||||| || |||| | ||||| || | |    
T  15936843 acaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttatcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaac 15936744  T
Q  237 ttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcatccacaaacataccataatcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaa 336  Q
    ||  ||||| |||| | || ||  |||||||||||| | |||| ||||| || ||| |||||||||||| |  || ||| ||| ||||   |||||||||    
T  15936743 ttatcatttttacacatttgaa--catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaa 15936646  T
Q  337 tttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaaccatgagaaa 383  Q
    ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15936645 tttagtaacaattgttcatcaacccattttcatacaa-catgagaaa 15936600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 259 - 383
Target Start/End: Original strand, 15615001 - 15615124
Alignment:
Q  259 aacatgtaatttcatccacaaacataccataatcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaa 358  Q
    |||||||||||||| | |||| | ||| || ||| |||||||||||| |  || ||| || ||||| |||||||| ||| || ||| |||||||||||||    
T  15615001 aacatgtaatttcaccaacaatcctacaattatcatcaattcatgcatacaaatataacaccacagtaagagcacaaatctagcatgaattgttcatcaa 15615100  T
Q  359 cccattttcatacaaccatgagaaa 383  Q
    ||||||||||||||| |||||||||    
T  15615101 cccattttcatacaa-catgagaaa 15615124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 91 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 18897255 - 18897139
Alignment:
Q  91 catcatcaatccataattaagtatacccaagtcataattcacccacaacaacatcagttaatagcaataaccttaatagaacatgaatcacatctcattt 190  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||| ||||| | |||||||||| |  || ||| | ||| ||| |||||| |||||||||||    
T  18897255 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcatgattcactcacaatagcatcagttaacaataacaacatcaatggaatatgaattacatctcattt 18897156  T
Q  191 taacaacaacatatcaa 207  Q
     ||  | ||||||||||    
T  18897155 caatcaaaacatatcaa 18897139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 200
Target Start/End: Original strand, 47984650 - 47984759
Alignment:
Q  91 catcatcaatccataattaagtatacccaagtcataattcacccacaacaacatcagttaatagcaataaccttaatagaacatgaatcacatctcattt 190  Q
    |||||||||| ||| | || | ||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||| | ||| ||| | ||| ||||||||||||||||||| |     
T  47984650 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaaaaacatcaattgaacatgaatcacatctcaatc 47984749  T
Q  191 taacaacaac 200  Q
     |||||||||    
T  47984750 caacaacaac 47984759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 200
Target Start/End: Original strand, 48003224 - 48003333
Alignment:
Q  91 catcatcaatccataattaagtatacccaagtcataattcacccacaacaacatcagttaatagcaataaccttaatagaacatgaatcacatctcattt 190  Q
    |||||||||| ||| | || | ||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||| | ||| ||| | ||| ||||||||||||||||||| |     
T  48003224 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaaaaacatcaattgaacatgaatcacatctcaatc 48003323  T
Q  191 taacaacaac 200  Q
     |||||||||    
T  48003324 caacaacaac 48003333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 138 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 15938685 - 15938442
Alignment:
Q  138 acaacatcagttaatagcaataaccttaatagaacatgaatcacatctcattttaacaacaacatatcaagattcactaaatgagtataattt-catagc 236  Q
    ||||||||| |||| | | ||||| | ||| ||||| |||||| ||||||  ||||||||||| |||||| |||||| || |||| | ||||| || | |    
T  15938685 acaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttatcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaac 15938586  T
Q  237 ttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcatccacaaacataccataatcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaa 336  Q
    ||  ||||| |||| | || ||  |||||||||||| | |||| ||||| || ||| ||||||||||   |  || ||| ||| ||||   ||||||| |    
T  15938585 ttatcatttttacacatttgaa--catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgattacaaacatatcattacagttggagcacgta 15938488  T
Q  337 tttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaaccatgagaaa 383  Q
    ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15938487 tttagtaacaattgttcatcaacccattttcatacaa-catgagaaa 15938442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 91 - 200
Target Start/End: Original strand, 47993937 - 47994046
Alignment:
Q  91 catcatcaatccataattaagtatacccaagtcataattcacccacaacaacatcagttaatagcaataaccttaatagaacatgaatcacatctcattt 190  Q
    |||||||||| ||| | || | ||||||||||||| ||||| | ||||||| |||| |||| | ||| ||| | ||| ||||||||||||||||||| |     
T  47993937 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaaaatcaattaacaacaaaaacatcaattgaacatgaatcacatctcaatc 47994036  T
Q  191 taacaacaac 200  Q
     |||||||||    
T  47994037 caacaacaac 47994046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 91 - 200
Target Start/End: Original strand, 48012510 - 48012619
Alignment:
Q  91 catcatcaatccataattaagtatacccaagtcataattcacccacaacaacatcagttaatagcaataaccttaatagaacatgaatcacatctcattt 190  Q
    |||||||||| ||| | || | ||||||||||||| ||||| | ||||||| |||| |||| | ||| ||| | ||| ||||||||||||||||||| |     
T  48012510 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaaaatcaattaacaacaaaaacatcaattgaacatgaatcacatctcaatc 48012609  T
Q  191 taacaacaac 200  Q
     |||||||||    
T  48012610 caacaacaac 48012619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0191 (Bit Score: 237; Significance: 1e-131; HSPs: 1)
Name: scaffold0191
Description:

Target: scaffold0191; HSP #1
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 91 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 7712 - 7421
Alignment:
Q  91 catcatcaatccataattaagtatacccaagtcataattcacccacaacaacatcagttaatagcaataaccttaatagaacatgaatcacatctcattt 190  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7712 catcatcaatccataattatgtatacccaagtcataattcactcacaacaacatcagttaataacaataaccttaatggaacatgaatcacatctcattt 7613  T
Q  191 taacaacaacatatcaagattcactaaatgagtataatttcatagcttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcatccacaaacataccataa 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7612 taacaacaacatatcaagattcactaattgagtataatttcatagcttgacatttatacatactttgaaacatgtaatttcatccacaaacataccataa 7513  T
Q  291 tcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaaccatgagaaa 383  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7512 tcttcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttagtaataattgttcatcaacccattttcatacaa-catgagaaa 7421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 22)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 91 - 383
Target Start/End: Original strand, 18248218 - 18248509
Alignment:
Q  91 catcatcaatccataattaagtatacccaagtcataattcacccacaacaacatcagttaatagcaataaccttaatagaacatgaatcacatctcattt 190  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||||    
T  18248218 catcatcaatcgataattatgtataccaaagtcataattcacccacaacaacatcagttaatagcaacaacatcaatggaacatgaatcacatctcattt 18248317  T
Q  191 taacaacaacatatcaagattcactaaatgagtataatttcatagcttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcatccacaaacataccataa 290  Q
     ||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18248318 caacaacaacatattaaaattcactaattgagtataatttcatatcttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcatccacaaacataccataa 18248417  T
Q  291 tcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaaccatgagaaa 383  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18248418 tcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaa-catgagaaa 18248509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 91 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 17145913 - 17145622
Alignment:
Q  91 catcatcaatccataattaagtatacccaagtcataattcacccacaacaacatcagttaatagcaataaccttaatagaacatgaatcacatctcattt 190  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||||    
T  17145913 catcatcaatccgtaattatgtatacccaagtcataattcacccacaacaacatcagttaatagcaacaacatcaatggaacatgaatcacatctcattt 17145814  T
Q  191 taacaacaacatatcaagattcactaaatgagtataatttcatagcttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcatccacaaacataccataa 290  Q
     |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17145813 caacaacaacatatcaaaattcactaattgagtataatttcacaacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataa 17145714  T
Q  291 tcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaaccatgagaaa 383  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  17145713 tcatcaattcatgtacaagaaaatagcatcacagtaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaactcattttcatacaa-catgagaaa 17145622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 91 - 307
Target Start/End: Original strand, 8374508 - 8374724
Alignment:
Q  91 catcatcaatccataattaagtatacccaagtcataattcacccacaacaacatcagttaatagcaataaccttaatagaacatgaatcacatctcattt 190  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||||    
T  8374508 catcatcaatcgataattatgtatacccaagccataattcacccacaacaacatcagttaatagcaacaacatcaatggaacatgaatcacatctcattt 8374607  T
Q  191 taacaacaacatatcaagattcactaaatgagtataatttcatagcttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcatccacaaacataccataa 290  Q
     ||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8374608 caacaacaacatattaaaattcactaattgagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaagcatgtaatttcacccacaaacataccataa 8374707  T
Q  291 tcctcaattcatgcaca 307  Q
    || ||||||||||||||    
T  8374708 tcatcaattcatgcaca 8374724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 91 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 15287501 - 15287210
Alignment:
Q  91 catcatcaatccataattaagtatacccaagtcataattcacccacaacaacatcagttaatagcaataaccttaatagaacatgaatcacatctcattt 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| |  || ||| | ||| ||| |||||| |||||||||||    
T  15287501 catcatcaatccataattaagtatacccaagtcatgattcactcacaacagcatcagttaacaataacaacatcaatggaatatgaattacatctcattt 15287402  T
Q  191 taacaacaacatatcaagattcactaaatgagtataatttcatagcttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcatccacaaacataccataa 290  Q
     ||  | ||||||||||  ||||  ||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15287401 caatcaaaacatatcaaatttcatcaatggagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataa 15287302  T
Q  291 tcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaaccatgagaaa 383  Q
     | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  15287301 ccatcgattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagctataattgttcatcatcccattttcatacaa-catgagaaa 15287210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 91 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 15294610 - 15294319
Alignment:
Q  91 catcatcaatccataattaagtatacccaagtcataattcacccacaacaacatcagttaatagcaataaccttaatagaacatgaatcacatctcattt 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| |  || ||| | ||| ||| |||||| |||||||||||    
T  15294610 catcatcaatccataattaagtatacccaagtcatgattcactcacaacagcatcagttaacaataacaacatcaatggaatatgaattacatctcattt 15294511  T
Q  191 taacaacaacatatcaagattcactaaatgagtataatttcatagcttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcatccacaaacataccataa 290  Q
     ||  | ||||||||||  ||||  ||  ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15294510 caatcaaaacatatcaaatttcatcaatggagtataatttcataacttaacatttatatatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataa 15294411  T
Q  291 tcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaaccatgagaaa 383  Q
     | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  15294410 ccatcgattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagctataattgttcatcatcccattttcatacaa-catgagaaa 15294319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 91 - 374
Target Start/End: Original strand, 19020486 - 19020769
Alignment:
Q  91 catcatcaatccataattaagtatacccaagtcataattcacccacaacaacatcagttaatagcaataaccttaatagaacatgaatcacatctcattt 190  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||| |||| |||||| ||||| | |||||||||| |  || ||| | ||| ||| |||||| |||||||||||    
T  19020486 catcatcaatccacaattaagtatactcaaatcatgattcactcacaatagcatcagttaacaataacaacatcaatggaatatgaattacatctcattt 19020585  T
Q  191 taacaacaacatatcaagattcactaaatgagtataatttcatagcttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcatccacaaacataccataa 290  Q
     ||  | ||||||||||  ||||   | | || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19020586 caatcaaaacatatcaaatttcatccattaaggataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataa 19020685  T
Q  291 tcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaac 374  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19020686 tcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaagaattgttcatcaacccattttcatacaac 19020769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 91 - 383
Target Start/End: Original strand, 18168970 - 18169261
Alignment:
Q  91 catcatcaatccataattaagtatacccaagtcataattcacccacaacaacatcagttaatagcaataaccttaatagaacatgaatcacatctcattt 190  Q
    |||||||||| || ||||||||||| |||| |||| |||||| ||||| | ||| | |||| |  ||  || | ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  18168970 catcatcaattcacaattaagtatatccaaatcatgattcactcacaatagcattatttaacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcattt 18169069  T
Q  191 taacaacaacatatcaagattcactaaatgagtataatttcatagcttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcatccacaaacataccataa 290  Q
     ||  | ||||||||||  ||||  || | || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18169070 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataa 18169169  T
Q  291 tcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaaccatgagaaa 383  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18169170 tcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaa-catgagaaa 18169261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 180 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 7132232 - 7132030
Alignment:
Q  180 acatctcattttaacaacaacatatcaagattcactaaatgagtataatttcatagcttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcatccacaa 279  Q
    ||||||||||| ||  | ||||||||||  ||||  || | |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  7132232 acatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaa 7132133  T
Q  280 acataccataatcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaaccatga 379  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  7132132 acataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatataa-catga 7132034  T
Q  380 gaaa 383  Q
    ||||    
T  7132033 gaaa 7132030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 224 - 383
Target Start/End: Original strand, 22738402 - 22738560
Alignment:
Q  224 ataatttcatagcttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcatccacaaacataccataatcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcaca 323  Q
    ||||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22738402 ataatttcacaacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcaca 22738501  T
Q  324 gcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaaccatgagaaa 383  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  22738502 gcaagaacacgaatttaacatcaattgttcctcagcccattttcatacaa-catgagaaa 22738560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 180 - 383
Target Start/End: Original strand, 20000812 - 20001014
Alignment:
Q  180 acatctcattttaacaacaacatatcaagattcactaaatgagtataatttcatagcttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcatccacaa 279  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||||||  ||||  || | |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||    
T  20000812 acatctcatttcaaccaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccagaa 20000911  T
Q  280 acataccataatcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaaccatga 379  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20000912 acataccataatcatcaattcatgcacaagaaaataacattacaacaagagcacgaatttagccacaattgttcatcaacccattttcatacaa-catga 20001010  T
Q  380 gaaa 383  Q
    ||||    
T  20001011 gaaa 20001014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 226 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 22352184 - 22352037
Alignment:
Q  226 aatttcatagcttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcatccacaaacataccataatcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagc 325  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||| ||| |||| || | |    
T  22352184 aatttcacaacttgacatttatacatacattgaaccatgtaatttcatccacaaacataccataatcatcaattcatgtataag-aaacagcaacataac 22352086  T
Q  326 aagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaac 374  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22352085 aagagcatgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaac 22352037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 226 - 374
Target Start/End: Original strand, 26339155 - 26339302
Alignment:
Q  226 aatttcatagcttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcatccacaaacataccataatcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagc 325  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||  || || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | | ||| ||| |||| || | |    
T  26339155 aatttcacaacttgacatttatacatagattgaaccatgtaatttcatccacaaacataccataatcatcaattcaagtataag-aaacagcaacataac 26339253  T
Q  326 aagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaac 374  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26339254 aagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaac 26339302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 305 - 383
Target Start/End: Original strand, 8378365 - 8378442
Alignment:
Q  305 acaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaaccatgagaaa 383  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8378365 acaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaa-catgagaaa 8378442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 259 - 374
Target Start/End: Original strand, 10644387 - 10644502
Alignment:
Q  259 aacatgtaatttcatccacaaacataccataatcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaa 358  Q
    ||||||||||||||   |||| ||||| || ||| |||||||||||| |  || ||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  10644387 aacatgtaatttcactaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaa 10644486  T
Q  359 cccattttcatacaac 374  Q
    ||||||||||||||||    
T  10644487 cccattttcatacaac 10644502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 91 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 15675352 - 15675095
Alignment:
Q  91 catcatcaatccataattaagtatacccaagtcataattcacccacaacaacatcagttaatagcaataaccttaatagaacatgaatcacatctcattt 190  Q
    |||||||||| ||| | || |||||||||||  || ||||| | |||||||||||| |||| | ||||||| | ||| |||||||||||| |||||| ||    
T  15675352 catcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaatt 15675253  T
Q  191 taacaacaacatatcaagattcactaaatgagtataa-tttcatagcttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcatccacaaacataccata 289  Q
     ||||||||| || ||| |||||| || |||| | || ||||| | ||| |||||| |||||| ||   |||||||||||||| | |||| ||||| ||     
T  15675252 caacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataatt--gaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatt 15675155  T
Q  290 atcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaatt 349  Q
    ||| |||||||||||| |  || ||| ||||||||   ||||||||||||| || |||||    
T  15675154 atcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaatt 15675095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 317 - 374
Target Start/End: Original strand, 47357880 - 47357937
Alignment:
Q  317 catcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaac 374  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  47357880 catcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaac 47357937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 169 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 40885739 - 40885604
Alignment:
Q  169 gaacatgaatcacatctcattttaacaacaacatatcaagattcactaaatgagtataatttcatagcttgacatttatacatactttaaaacatgtaat 268  Q
    |||||||||||| |||||| || ||||| ||| || |||  ||||| || |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  40885739 gaacatgaatcatatctcaattcaacaataacttagcaaagttcaccaattgagcataatttcataacttgacatttatacatacttt-gaacatgtaat 40885641  T
Q  269 ttcatccacaaacataccataatcctcaattcatgca 305  Q
    |||| | |||||||| | || |||  |||||||||||    
T  40885640 ttcaccaacaaacattcaattatcaccaattcatgca 40885604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 91 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 22352302 - 22352249
Alignment:
Q  91 catcatcaatccataattaagtatacccaagtcataattcacccacaacaacat 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  22352302 catcatcaatccataattaagtatacccaagttataattcactcacaacaacat 22352249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 91 - 305
Target Start/End: Original strand, 31115629 - 31115842
Alignment:
Q  91 catcatcaatccataattaagtatacccaagtcataattcacccacaacaacatcagttaatagcaataaccttaatagaacatgaatcacatctcattt 190  Q
    |||||||||| ||| | || |||||||||||  || ||||| | |||||||||||| |||| | ||||||| | ||| |||||||||||| |||||| ||    
T  31115629 catcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaatt 31115728  T
Q  191 taacaacaacatatcaagattcactaaatgagtataa-tttcatagcttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcatccacaaacataccata 289  Q
     ||||||||| ||  || |||||| || |||| |||| ||||| | ||| |||||| ||||||   |  |||||||||||||| | |||| ||||| ||     
T  31115729 caacaacaacttaggaaaattcaccaattgagcataattttcacaacttcacatttttacata--atggaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatt 31115826  T
Q  290 atcctcaattcatgca 305  Q
    ||| ||||||||||||    
T  31115827 atcatcaattcatgca 31115842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 144
Target Start/End: Original strand, 22738269 - 22738322
Alignment:
Q  91 catcatcaatccataattaagtatacccaagtcataattcacccacaacaacat 144  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22738269 catcattaatccacaattaagtatacccaagtcataattcaccctcaacaacat 22738322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 144
Target Start/End: Original strand, 26339020 - 26339073
Alignment:
Q  91 catcatcaatccataattaagtatacccaagtcataattcacccacaacaacat 144  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  26339020 catcattaatccataattaagtatacccaagttataattcactcacaacaacat 26339073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 169 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 10104435 - 10104300
Alignment:
Q  169 gaacatgaatcacatctcattttaacaacaacatatcaagattcactaaatgagtataattt-catagcttgacatttatacatactttaaaacatgtaa 267  Q
    |||||||||||| |||||| || ||||||||| || ||| |||||| || |||| | ||||| || | ||| |||||| |||||| || ||  |||||||    
T  10104435 gaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaa--catgtaa 10104338  T
Q  268 tttcatccacaaacataccataatcctcaattcatgca 305  Q
    ||||| | |||| ||||| || ||| ||||||||||||    
T  10104337 tttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgca 10104300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 33)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 91 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 11212321 - 11212030
Alignment:
Q  91 catcatcaatccataattaagtatacccaagtcataattcacccacaacaacatcagttaatagcaataaccttaatagaacatgaatcacatctcattt 190  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||||    
T  11212321 catcatcaatccataattatgtatacccaagtcataatccacccacaacaacatcagttaatagcaacaacatcaatggaacatgaatcacatctcattt 11212222  T
Q  191 taacaacaacatatcaagattcactaaatgagtataatttcatagcttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcatccacaaacataccataa 290  Q
     ||||||||||||| || ||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11212221 caacaacaacatattaaaattcactacttgagtataatttcataacttaacatttatacacactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataa 11212122  T
Q  291 tcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaaccatgagaaa 383  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11212121 tcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaagaattgttcatcaacccattttcatacaa-catgagaaa 11212030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 91 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 35791355 - 35791063
Alignment:
Q  91 catcatcaatccataattaagtatacccaagtcataattcacccacaacaacatcagttaatagcaataaccttaatagaacatgaatcacatctcattt 190  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||||    
T  35791355 catcatcaatccataattatgtatacccaagtcataattcaccctcaacaacatcagttaatagcaacaacatcaatggaacatgaatcacatctcattt 35791256  T
Q  191 taacaacaacatatcaagatt-cactaaatgagtataatttcatagcttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcatccacaaacataccata 289  Q
     |||||||||||||||| ||| ||  || | |||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  35791255 caacaacaacatatcaaaatttcatcaattaagtataatctcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcactcacaaacataccata 35791156  T
Q  290 atcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaaccatgagaaa 383  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  35791155 atcatcaattcatgcacaagaaaataacatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaa-catgagaaa 35791063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 91 - 383
Target Start/End: Original strand, 7425324 - 7425615
Alignment:
Q  91 catcatcaatccataattaagtatacccaagtcataattcacccacaacaacatcagttaatagcaataaccttaatagaacatgaatcacatctcattt 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| |  || ||| | ||| ||| |||||| |||||||||||    
T  7425324 catcatcaatccataattaagtatatccaagtcatgattcactcacaacagcatcagttaacaataacaacatcaatggaatatgaattacatctcattt 7425423  T
Q  191 taacaacaacatatcaagattcactaaatga-gtataatttcatagcttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcatccacaaacataccata 289  Q
     ||  | ||||||||||  |||| | ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7425424 caatcaaaacatatcaaatttca-tcaatgaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccata 7425522  T
Q  290 atcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaaccatgagaaa 383  Q
    | | || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7425523 accatcgattcatgcacaagaaaataacatcacagcaagagcacgaatttagcaataattgttcatcaacccattttcatacaa-catgagaaa 7425615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 91 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 1219776 - 1219485
Alignment:
Q  91 catcatcaatccataattaagtatacccaagtcataattcacccacaacaacatcagttaatagcaataaccttaatagaacatgaatcacatctcattt 190  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||| ||||| | |||||||||| |  ||  || | |||  || ||||||||||||||||||    
T  1219776 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcatgattcactcacaatagcatcagttaacaataaccacatcaatgaaatatgaatcacatctcattt 1219677  T
Q  191 taacaacaacatatcaagattcactaaatgagtataatttcatagcttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcatccacaaacataccataa 290  Q
     ||  | ||||||||||  ||||  || | || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1219676 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataa 1219577  T
Q  291 tcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaaccatgagaaa 383  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1219576 tcatcaattaatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaa-catgagaaa 1219485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 91 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 22883340 - 22883049
Alignment:
Q  91 catcatcaatccataattaagtatacccaagtcataattcacccacaacaacatcagttaatagcaataaccttaatagaacatgaatcacatctcattt 190  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  |||| | |||||||||| |  ||  || ||||| ||| |||||||||||||| |||    
T  22883340 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctctttt 22883241  T
Q  191 taacaacaacatatcaagattcactaaatgagtataatttcatagcttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcatccacaaacataccataa 290  Q
     ||  | ||||||||||  ||||  || | || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22883240 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcatccataaacataccataa 22883141  T
Q  291 tcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaaccatgagaaa 383  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  22883140 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacaaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaa-catgagaaa 22883049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 91 - 383
Target Start/End: Original strand, 35582036 - 35582327
Alignment:
Q  91 catcatcaatccataattaagtatacccaagtcataattcacccacaacaacatcagttaatagcaataaccttaatagaacatgaatcacatctcattt 190  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  |||| | |||||||||| |  ||  || ||||| ||| |||||||||||||| |||    
T  35582036 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctctttt 35582135  T
Q  191 taacaacaacatatcaagattcactaaatgagtataatttcatagcttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcatccacaaacataccataa 290  Q
     ||  | | ||||||||  ||||  || | || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  35582136 caatcaaagcatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 35582235  T
Q  291 tcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaaccatgagaaa 383  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  35582236 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaa-catgagaaa 35582327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 91 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 36990026 - 36989734
Alignment:
Q  91 catcatcaatccataattaagtatacccaagtcataattcacccacaacaacatcagttaatagcaataaccttaatagaacatgaatcacatctcattt 190  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  |||| | |||||||||| |  ||  || ||||| ||| |||||||||||||| |||    
T  36990026 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctctttt 36989927  T
Q  191 taacaacaacatatcaagattcactaaatgagtataatttcatagcttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcatccacaaacataccataa 290  Q
     ||  | | ||||||||  ||||  || | || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  36989926 caatcaaagcatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 36989827  T
Q  291 tcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaaccatgagaaat 384  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36989826 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagctagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaa-catgagaaat 36989734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 91 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 21932637 - 21932346
Alignment:
Q  91 catcatcaatccataattaagtatacccaagtcataattcacccacaacaacatcagttaatagcaataaccttaatagaacatgaatcacatctcattt 190  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  ||||   |||||||||| |  ||  || ||||| ||| |||||||||||||| |||    
T  21932637 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatggcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctctttt 21932538  T
Q  191 taacaacaacatatcaagattcactaaatgagtataatttcatagcttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcatccacaaacataccataa 290  Q
     ||  | | ||||||||  ||||  || | || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  21932537 caatcaaagcatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 21932438  T
Q  291 tcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaaccatgagaaa 383  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  21932437 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaa-catgagaaa 21932346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 91 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 21938807 - 21938516
Alignment:
Q  91 catcatcaatccataattaagtatacccaagtcataattcacccacaacaacatcagttaatagcaataaccttaatagaacatgaatcacatctcattt 190  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  ||||   |||||||||| |  ||  || ||||| ||| |||||||||||||| |||    
T  21938807 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatggcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctctttt 21938708  T
Q  191 taacaacaacatatcaagattcactaaatgagtataatttcatagcttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcatccacaaacataccataa 290  Q
     ||  | | ||||||||  ||||  || | || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  21938707 caatcaaagcatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 21938608  T
Q  291 tcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaaccatgagaaa 383  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  21938607 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaa-catgagaaa 21938516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 180 - 383
Target Start/End: Original strand, 23514650 - 23514852
Alignment:
Q  180 acatctcattttaacaacaacatatcaagattcactaaatgagtataatttcatagcttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcatccacaa 279  Q
    ||||||||||| ||  | ||||||||||  ||||  || | |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  23514650 acatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaa 23514749  T
Q  280 acataccataatcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaaccatga 379  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23514750 acataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaa-catga 23514848  T
Q  380 gaaa 383  Q
    ||||    
T  23514849 gaaa 23514852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 134 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 17471801 - 17471553
Alignment:
Q  134 cacaacaacatcagttaatagcaataaccttaatagaacatgaatcacatctcattttaacaacaacatatcaagattcactaaatgagtataatttcat 233  Q
    ||||| |||||||||||| |  || ||| | ||| ||| |||||| |||||| |||| ||  | ||||||||||  ||||  || | |||||||||||||    
T  17471801 cacaataacatcagttaacaataacaacatcaatggaatatgaattacatcttatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcat 17471702  T
Q  234 agcttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcatccacaaacataccataatcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcac 333  Q
      ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17471701 tacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcac 17471602  T
Q  334 gaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaaccatgagaaa 383  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17471601 gaatttatcaacaattgttcatcaacccattttcatacaa-catgagaaa 17471553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 224 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 10778093 - 10777935
Alignment:
Q  224 ataatttcatagcttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcatccacaaacataccataatcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcaca 323  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10778093 ataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcaca 10777994  T
Q  324 gcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaaccatgagaaa 383  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10777993 gcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaa-catgagaaa 10777935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 115 - 349
Target Start/End: Original strand, 32950717 - 32950952
Alignment:
Q  115 acccaagtcataattcacccacaacaacatcagttaatagcaataaccttaatagaacatgaatcacatctcattttaacaacaacatatcaagattcac 214  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | ||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  || ||||||    
T  32950717 acccaagtcatgattcacccacaacaacatcagttaatagcatcaacatcaatggaacatgaatcacatctcttttcaacaacaacatagtaaaattcac 32950816  T
Q  215 taaatgagtataatttcatagc-ttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcatccacaaacataccataatcctcaattcatgcacaagaaaa 313  Q
     |  |||| | ||||||||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||| || ||| |||| |||| |||| |||||    
T  32950817 catttgagcacaatttcataactttgacctttatacatactttgaaacatgtaatttcaaccacaatcatacaattatcatcaaatcatacacacgaaaa 32950916  T
Q  314 tagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaatt 349  Q
    || ||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  32950917 taacatcacagttagagcacgaatttaacaacaatt 32950952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 226 - 374
Target Start/End: Original strand, 23328693 - 23328840
Alignment:
Q  226 aatttcatagcttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcatccacaaacataccataatcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagc 325  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | | ||| ||| |||| || | |    
T  23328693 aatttcacaacttgacatttatacatacattgaaccatgtaatttcatccacaaacataccataatcatcaattcaagtataag-aaacagcaacataac 23328791  T
Q  326 aagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaac 374  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23328792 aagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaac 23328840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 226 - 374
Target Start/End: Original strand, 24616297 - 24616444
Alignment:
Q  226 aatttcatagcttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcatccacaaacataccataatcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagc 325  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| | | ||| ||| |||| || | |    
T  24616297 aatttcacaacttgacatttatacatacattgaaccatgtaatttcatccacaaacataccataattatcaattcaagtataag-aaacagcaacataac 24616395  T
Q  326 aagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaac 374  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24616396 aagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaac 24616444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 226 - 374
Target Start/End: Original strand, 24712673 - 24712820
Alignment:
Q  226 aatttcatagcttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcatccacaaacataccataatcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagc 325  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| | | ||| ||| |||| || | |    
T  24712673 aatttcacaacttgacatttatacatacattgaaccatgtaatttcatccacaaacataccataattatcaattcaagtataag-aaacagcaacataac 24712771  T
Q  326 aagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaac 374  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24712772 aagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaac 24712820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 226 - 374
Target Start/End: Original strand, 24745691 - 24745838
Alignment:
Q  226 aatttcatagcttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcatccacaaacataccataatcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagc 325  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| | | ||| ||| |||| || | |    
T  24745691 aatttcacaacttgacatttatacatacattgaaccatgtaatttcatccacaaacataccataattatcaattcaagtataag-aaacagcaacataac 24745789  T
Q  326 aagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaac 374  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24745790 aagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaac 24745838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 258 - 374
Target Start/End: Original strand, 27010008 - 27010124
Alignment:
Q  258 aaacatgtaatttcatccacaaacataccataatcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatca 357  Q
    ||||||||||||||| | |||  ||||| || ||| |||||||||||| |  || ||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  27010008 aaacatgtaatttcaccaacactcatacaatcatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatca 27010107  T
Q  358 acccattttcatacaac 374  Q
    |||||||||||||||||    
T  27010108 acccattttcatacaac 27010124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 294 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 18778041 - 18777953
Alignment:
Q  294 tcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaaccatgagaaa 383  Q
    |||||||||||| |  || ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18778041 tcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttaacatgaattgttcatcaacccattttcatacaa-catgagaaa 18777953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 294 - 383
Target Start/End: Original strand, 12577 - 12665
Alignment:
Q  294 tcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaaccatgagaaa 383  Q
    |||||||||||| |  || ||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12577 tcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaa-catgagaaa 12665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 294 - 383
Target Start/End: Original strand, 25426831 - 25426919
Alignment:
Q  294 tcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaaccatgagaaa 383  Q
    |||||||||||| |  || ||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25426831 tcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaa-catgagaaa 25426919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 259 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 29188368 - 29188245
Alignment:
Q  259 aacatgtaatttcatccacaaacataccataatcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaa 358  Q
    |||||||||||||| | |||| ||||| || ||| |||||||||||| |  || ||| |||||||| |||||||||||| || ||| ||||||||||| |    
T  29188368 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagtaagagcacgaatctagcatgaattgttcatcga 29188269  T
Q  359 cccattttcatacaaccatgagaaa 383  Q
    ||||||||||||||| |||||||||    
T  29188268 cccattttcatacaa-catgagaaa 29188245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 259 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 43443479 - 43443368
Alignment:
Q  259 aacatgtaatttcatccacaaacataccataatcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaa 358  Q
    |||||||||||||| | |||| ||||| |  | | |||||||||||| |  || ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43443479 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttaacatgaattgttcatcaa 43443380  T
Q  359 cccattttcata 370  Q
     |||||||||||    
T  43443379 tccattttcata 43443368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 294 - 383
Target Start/End: Original strand, 19500102 - 19500190
Alignment:
Q  294 tcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaaccatgagaaa 383  Q
    |||||||||||| |  || ||| |||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19500102 tcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaagtgttcatcaacccattttcatacaa-catgagaaa 19500190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 294 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 22366530 - 22366442
Alignment:
Q  294 tcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaaccatgagaaa 383  Q
    |||||||||||| |  || ||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22366530 tcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgctcatcaacccattttcatacaa-catgagaaa 22366442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 91 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 18531330 - 18531073
Alignment:
Q  91 catcatcaatccataattaagtatacccaagtcataattcacccacaacaacatcagttaatagcaataaccttaatagaacatgaatcacatctcattt 190  Q
    |||||||||| ||| | || |||||||| ||  || ||||| | |||||||||||| |||| ||||||||| | ||| |||||||||||| |||||| ||    
T  18531330 catcatcaattcatgaatatgtatacccgagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaatt 18531231  T
Q  191 taacaacaacatatcaagattcactaaatgagtataa-tttcatagcttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcatccacaaacataccata 289  Q
     ||||||||| || ||| |||||| || |||  | || ||||| | ||| |||||| |||||| ||   |||||||||||||| | |||| ||||| ||     
T  18531230 caacaacaacttagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttcacatttttacataatt--gaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatt 18531133  T
Q  290 atcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaatt 349  Q
    ||| |||||||||||| |  || ||| ||||||||   ||||||||||||| || |||||    
T  18531132 atcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaatt 18531073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 317 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 21073621 - 21073556
Alignment:
Q  317 catcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaaccatgagaaa 383  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  21073621 catcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcattaacccattttcatacaa-catgagaaa 21073556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 91 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 22054096 - 22053839
Alignment:
Q  91 catcatcaatccataattaagtatacccaagtcataattcacccacaacaacatcagttaatagcaataaccttaatagaacatgaatcacatctcattt 190  Q
    |||||||||| ||| | || ||| |||||||  || ||||| | |||||||||||| |||| ||||||||| | ||| |||||||||||| |||||| ||    
T  22054096 catcatcaattcatgaatatgtagacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaatt 22053997  T
Q  191 taacaacaacatatcaagattcactaaatgagtataa-tttcatagcttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcatccacaaacataccata 289  Q
     ||||||||| || ||| |||||| || |||| | || ||||| | ||| |||||| |||||| ||   |||||||||||||| | |||| ||||| |      
T  22053996 caacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataatt--gaacatgtaatttcaccaacaatcatacaact 22053899  T
Q  290 atcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaatt 349  Q
    ||| ||||||||| || |  || ||| ||||||||   ||||||||||||| || |||||    
T  22053898 atcatcaattcatacatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaatt 22053839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 259 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 4200069 - 4199954
Alignment:
Q  259 aacatgtaatttcatccacaaacataccataatcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaa 358  Q
    |||||||||||||| | |||| ||||| |  | | |||||||||||| |  || ||| ||||||| |||||||||||||||| ||| |||| ||||||||    
T  4200069 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacaacaagagcacgaatttagcatgaattattcatcaa 4199970  T
Q  359 cccattttcatacaac 374  Q
    | ||||||||||||||    
T  4199969 ctcattttcatacaac 4199954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 144
Target Start/End: Original strand, 23328558 - 23328611
Alignment:
Q  91 catcatcaatccataattaagtatacccaagtcataattcacccacaacaacat 144  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  23328558 catcatcaatccacaattaagtatacccaagttataattcactcacaacaacat 23328611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 93 - 144
Target Start/End: Original strand, 24616165 - 24616216
Alignment:
Q  93 tcatcaatccataattaagtatacccaagtcataattcacccacaacaacat 144  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  24616165 tcatcaatccacaattaagtatacccaagttataattcactcacaacaacat 24616216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 93 - 144
Target Start/End: Original strand, 24712541 - 24712592
Alignment:
Q  93 tcatcaatccataattaagtatacccaagtcataattcacccacaacaacat 144  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  24712541 tcatcaatccacaattaagtatacccaagttataattcactcacaacaacat 24712592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 93 - 144
Target Start/End: Original strand, 24745559 - 24745610
Alignment:
Q  93 tcatcaatccataattaagtatacccaagtcataattcacccacaacaacat 144  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  24745559 tcatcaatccacaattaagtatacccaagttataattcactcacaacaacat 24745610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 3)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 91 - 384
Target Start/End: Original strand, 54416 - 54709
Alignment:
Q  91 catcatcaatccataattaagtatacccaagtcataattcacccacaacaacatcagttaatagcaataaccttaatagaacatgaatcacatctcattt 190  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||||    
T  54416 catcatcaatccataaatatgtatacccaactcatgattcacccacaacaacatcagttaatagcaacaacatcaatggaacatgaatcacatctcattt 54515  T
Q  191 taacaacaacatatcaagattcactaaatgagtataatttcatagcttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcatccacaaacataccataa 290  Q
     |||||||||||||||| |||||| || |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||||| || |    
T  54516 caacaacaacatatcaaaattcaccaattgagtacaatttcataacttgacatttatacatactttgaaacatgcaatttcacccacaatcatacaatta 54615  T
Q  291 tcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaaccatgagaaat 384  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  54616 tcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaaggacacgaatttaacaacaattattcatcaacccattttcatacaacaatgagaaat 54709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 136 - 384
Target Start/End: Original strand, 45075 - 45323
Alignment:
Q  136 caacaacatcagttaatagcaataaccttaatagaacatgaatcacatctcattttaacaacaacatatcaagattcactaaatgagtataatttcatag 235  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| || |||||| ||||||| |     
T  45075 caacaacatcagttaatagcaacaacatcaatggaacatgaatcacatctcatttcaacaacaacatatcaaaattcaccaattgagtacaatttcaaaa 45174  T
Q  236 cttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcatccacaaacataccataatcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacga 335  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||| || ||| ||||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||||||    
T  45175 cttgacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaatcatacaattatcatcaattcatgcacatcaaaatagcatcacaacaagggcacga 45274  T
Q  336 atttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaaccatgagaaat 384  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  45275 atttaacaacaattattcatcaacccattttcatacaacaatgagaaat 45323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066; HSP #3
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 91 - 157
Target Start/End: Original strand, 45011 - 45077
Alignment:
Q  91 catcatcaatccataattaagtatacccaagtcataattcacccacaacaacatcagttaatagcaa 157  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45011 catcatcaatccataaatatgtatacccaagtcatgattcacccacaacaacatcagttaatagcaa 45077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 178; Significance: 7e-96; HSPs: 17)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 91 - 383
Target Start/End: Original strand, 16195230 - 16195522
Alignment:
Q  91 catcatcaatccataattaagtatacccaagtcataattcacccacaacaacatcagttaatagcaataaccttaatagaacatgaatcacatctcattt 190  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||||    
T  16195230 catcatcaatccataattatatatacctaagtcataattcaccctcaacaacatcagttaatagcaacaacatcaatggaacatgaatcacatctcattt 16195329  T
Q  191 taacaacaacatatcaagattcactaaatga-gtataatttcatagcttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcatccacaaacataccata 289  Q
     |||||||||||||||| |||   ||||| | ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16195330 caacaacaacatatcaaaatttcataaattaagtataatctcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccata 16195429  T
Q  290 atcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaaccatgagaaa 383  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16195430 atcatcaattcatgcacaagaacatagcatcacagcacgagaacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaa-catgagaaa 16195522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 91 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 22006514 - 22006223
Alignment:
Q  91 catcatcaatccataattaagtatacccaagtcataattcacccacaacaacatcagttaatagcaataaccttaatagaacatgaatcacatctcattt 190  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||| |  ||  || | ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  22006514 catcatcagtccacaattaagtatacccaaatcatgattcactcacaataacatcagttaacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcattt 22006415  T
Q  191 taacaacaacatatcaagattcactaaatgagtataatttcatagcttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcatccacaaacataccataa 290  Q
     ||  | ||||||||||  ||||  || | || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22006414 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataa 22006315  T
Q  291 tcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaaccatgagaaa 383  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22006314 tcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaa-catgagaaa 22006223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 91 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 13662521 - 13662230
Alignment:
Q  91 catcatcaatccataattaagtatacccaagtcataattcacccacaacaacatcagttaatagcaataaccttaatagaacatgaatcacatctcattt 190  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||| ||||| | |||||||||| |  ||  || | ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  13662521 catcatcaatccataattatgtatacccaaatcatgattcactcacaatagcatcagttaacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcattt 13662422  T
Q  191 taacaacaacatatcaagattcactaaatgagtataatttcatagcttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcatccacaaacataccataa 290  Q
     ||  | ||||||||||  ||||  || | || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13662421 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataa 13662322  T
Q  291 tcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaaccatgagaaa 383  Q
    || |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13662321 tcatncattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgtttatcaacccattttcatacaa-catgagaaa 13662230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 91 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 271616 - 271325
Alignment:
Q  91 catcatcaatccataattaagtatacccaagtcataattcacccacaacaacatcagttaatagcaataaccttaatagaacatgaatcacatctcattt 190  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  |||| | |||||||||| |  ||  || ||||| ||| |||||||||||||| |||    
T  271616 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctctttt 271517  T
Q  191 taacaacaacatatcaagattcactaaatgagtataatttcatagcttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcatccacaaacataccataa 290  Q
     ||  | | ||||||||  ||||  || | || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  271516 caatcaaagcatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 271417  T
Q  291 tcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaaccatgagaaa 383  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  271416 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaa-catgagaaa 271325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 91 - 383
Target Start/End: Original strand, 644304 - 644595
Alignment:
Q  91 catcatcaatccataattaagtatacccaagtcataattcacccacaacaacatcagttaatagcaataaccttaatagaacatgaatcacatctcattt 190  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  |||| | |||||||||| |  ||  || ||||| ||| |||||||||||||| |||    
T  644304 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctctttt 644403  T
Q  191 taacaacaacatatcaagattcactaaatgagtataatttcatagcttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcatccacaaacataccataa 290  Q
     ||  | | ||||||||  ||||  || | || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  644404 caatcaaagcatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 644503  T
Q  291 tcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaaccatgagaaa 383  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  644504 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaa-catgagaaa 644595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 91 - 383
Target Start/End: Original strand, 830039 - 830330
Alignment:
Q  91 catcatcaatccataattaagtatacccaagtcataattcacccacaacaacatcagttaatagcaataaccttaatagaacatgaatcacatctcattt 190  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  |||| | |||||||||| |  ||  || ||||| ||| |||||||||||||| |||    
T  830039 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctctttt 830138  T
Q  191 taacaacaacatatcaagattcactaaatgagtataatttcatagcttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcatccacaaacataccataa 290  Q
     ||  | | ||||||||  ||||  || | || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  830139 caatcaaagcatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 830238  T
Q  291 tcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaaccatgagaaa 383  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  830239 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaa-catgagaaa 830330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 91 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 15319415 - 15319124
Alignment:
Q  91 catcatcaatccataattaagtatacccaagtcataattcacccacaacaacatcagttaatagcaataaccttaatagaacatgaatcacatctcattt 190  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  |||| | |||||||||| |  ||  || ||||| |||||||||||||||||| |||    
T  15319415 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaacatgaatcacatctctttt 15319316  T
Q  191 taacaacaacatatcaagattcactaaatgagtataatttcatagcttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcatccacaaacataccataa 290  Q
     ||  | ||||||||||  ||||  || | || ||||||||||| ||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  15319315 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataactcaacatttatacatacttagaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 15319216  T
Q  291 tcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaaccatgagaaa 383  Q
    || |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  15319215 tcatcaattcaagcacaagaaaatagtatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaa-catgagaaa 15319124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 91 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 15499784 - 15499493
Alignment:
Q  91 catcatcaatccataattaagtatacccaagtcataattcacccacaacaacatcagttaatagcaataaccttaatagaacatgaatcacatctcattt 190  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  |||| | |||||||||| |  ||  || ||||| |||||||||||||||||| |||    
T  15499784 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaacatgaatcacatctctttt 15499685  T
Q  191 taacaacaacatatcaagattcactaaatgagtataatttcatagcttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcatccacaaacataccataa 290  Q
     ||  | ||||||||||  ||||  || | || ||||||||||| ||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  15499684 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataactcaacatttatacatacttagaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 15499585  T
Q  291 tcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaaccatgagaaa 383  Q
    || |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  15499584 tcatcaattcaagcacaagaaaatagtatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaa-catgagaaa 15499493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 91 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 22089050 - 22088759
Alignment:
Q  91 catcatcaatccataattaagtatacccaagtcataattcacccacaacaacatcagttaatagcaataaccttaatagaacatgaatcacatctcattt 190  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  |||| | |||||||||| |  ||  || ||||| ||| |||||||||||||| |||    
T  22089050 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctctttt 22088951  T
Q  191 taacaacaacatatcaagattcactaaatgagtataatttcatagcttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcatccacaaacataccataa 290  Q
     ||  | ||||||||||  ||||  || | || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | | |||||||||||||    
T  22088950 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacctataaacataccataa 22088851  T
Q  291 tcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaaccatgagaaa 383  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||    
T  22088850 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacacattttcatacaa-catgagaaa 22088759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 180 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 13721095 - 13720893
Alignment:
Q  180 acatctcattttaacaacaacatatcaagattcactaaatgagtataatttcatagcttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcatccacaa 279  Q
    ||||||||||| ||  | ||||||||||  ||||  || | |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  13721095 acatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaa 13720996  T
Q  280 acataccataatcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaaccatga 379  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13720995 acataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaa-catga 13720897  T
Q  380 gaaa 383  Q
    ||||    
T  13720896 gaaa 13720893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 180 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 16873218 - 16873016
Alignment:
Q  180 acatctcattttaacaacaacatatcaagattcactaaatgagtataatttcatagcttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcatccacaa 279  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||||||  ||||  || | |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  16873218 acatctcatttcaaccaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaa 16873119  T
Q  280 acataccataatcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaaccatga 379  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16873118 acataccataatcatcaattcatgcacaagaaaataacattacaacaagagcacgaatttagccacaattgttcatcaacccattttcatacaa-catga 16873020  T
Q  380 gaaa 383  Q
    ||||    
T  16873019 gaaa 16873016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 258 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 21844657 - 21844541
Alignment:
Q  258 aaacatgtaatttcatccacaaacataccataatcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatca 357  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||||| || ||| |||||||||||| |  || ||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  21844657 aaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatca 21844558  T
Q  358 acccattttcatacaac 374  Q
    ||||| |||||||||||    
T  21844557 acccaatttcatacaac 21844541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 258 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 21852050 - 21851934
Alignment:
Q  258 aaacatgtaatttcatccacaaacataccataatcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatca 357  Q
    |||||| |||||||| | |||| ||||| || ||| |||||||||||| |  || ||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  21852050 aaacatttaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatca 21851951  T
Q  358 acccattttcatacaac 374  Q
    ||||| |||||||||||    
T  21851950 acccaatttcatacaac 21851934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 259 - 383
Target Start/End: Original strand, 24549149 - 24549272
Alignment:
Q  259 aacatgtaatttcatccacaaacataccataatcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaa 358  Q
    |||||||||||||| | |||| ||||| || ||| |||||||||||| |  || ||| |||||||| |||||||||||| || ||| |||||||||||||    
T  24549149 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagtaagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaa 24549248  T
Q  359 cccattttcatacaaccatgagaaa 383  Q
    ||||||||||||||| |||||||||    
T  24549249 cccattttcatacaa-catgagaaa 24549272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 259 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 6774342 - 6774219
Alignment:
Q  259 aacatgtaatttcatccacaaacataccataatcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaa 358  Q
    |||||||||||||| | |||| ||||| || ||| |||||||||||| |  || ||| |||||||| |||||||||||| || ||| |||||||||||||    
T  6774342 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagtaagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaa 6774243  T
Q  359 cccattttcatacaaccatgagaaa 383  Q
    |||||||||||| || |||||||||    
T  6774242 cccattttcatataa-catgagaaa 6774219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 259 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 16674476 - 16674361
Alignment:
Q  259 aacatgtaatttcatccacaaacataccataatcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaa 358  Q
    |||||||||||||| | |||| ||||| |  | | | |||||||||| || || ||| |||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| |||    
T  16674476 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacataaattcatgcataaaaacataacatcacagaaagagcacgaatttagcatgaattgttcaacaa 16674377  T
Q  359 cccattttcatacaac 374  Q
    ||||||||||||||||    
T  16674376 cccattttcatacaac 16674361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 259 - 374
Target Start/End: Original strand, 30120890 - 30121005
Alignment:
Q  259 aacatgtaatttcatccacaaacataccataatcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaa 358  Q
    |||||||||||||| | |||| ||||| |  | | | |||||||||| |  || ||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  30120890 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacataaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaa 30120989  T
Q  359 cccattttcatacaac 374  Q
    | ||||||||||||||    
T  30120990 ctcattttcatacaac 30121005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 177; Significance: 3e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 91 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 34414 - 34123
Alignment:
Q  91 catcatcaatccataattaagtatacccaagtcataattcacccacaacaacatcagttaatagcaataaccttaatagaacatgaatcacatctcattt 190  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| | |||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| |||||||||    
T  34414 catcatcaatccataatttagtatacccaagtcatgattcactcacaatagcatcagttaatagcaacaacattaatggaacatgaatcatatctcattt 34315  T
Q  191 taacaacaacatatcaagattcactaaatgagtataatttcatagcttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcatccacaaacataccataa 290  Q
     |||||||||||||| | |||||  || | ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34314 caacaacaacatatccaaattcatcaattaagtataacttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataa 34215  T
Q  291 tcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaaccatgagaaa 383  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  34214 tcatcaattcatgcacaagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttagcaacaatttttcatcaaccca-tttcatacaacaatgagaaa 34123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 165; Significance: 4e-88; HSPs: 27)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 91 - 383
Target Start/End: Original strand, 1556005 - 1556296
Alignment:
Q  91 catcatcaatccataattaagtatacccaagtcataattcacccacaacaacatcagttaatagcaataaccttaatagaacatgaatcacatctcattt 190  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| |  || ||| | ||| ||| |||||| |||||||||||    
T  1556005 catcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcactcacaataacatcagttaacaataacaacatcaatggaatatgaattacatctcattt 1556104  T
Q  191 taacaacaacatatcaagattcactaaatgagtataatttcatagcttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcatccacaaacataccataa 290  Q
     ||  | ||||||||||  ||||  || | |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1556105 caattaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataa 1556204  T
Q  291 tcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaaccatgagaaa 383  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1556205 tcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaa-catgagaaa 1556296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 91 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 22225994 - 22225703
Alignment:
Q  91 catcatcaatccataattaagtatacccaagtcataattcacccacaacaacatcagttaatagcaataaccttaatagaacatgaatcacatctcattt 190  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  |||| | |||||||||| |  ||  || ||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  22225994 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcattt 22225895  T
Q  191 taacaacaacatatcaagattcactaaatgagtataatttcatagcttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcatccacaaacataccataa 290  Q
     ||  | ||||| ||||  ||||  || | || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  22225894 caatcaaaacatttcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 22225795  T
Q  291 tcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaaccatgagaaa 383  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22225794 tcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagaaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaa-catgagaaa 22225703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 91 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 16376629 - 16376338
Alignment:
Q  91 catcatcaatccataattaagtatacccaagtcataattcacccacaacaacatcagttaatagcaataaccttaatagaacatgaatcacatctcattt 190  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  |||| | |||||||||| |  ||  || ||||| ||| |||||||||||||| |||    
T  16376629 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctctttt 16376530  T
Q  191 taacaacaacatatcaagattcactaaatgagtataatttcatagcttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcatccacaaacataccataa 290  Q
     ||  | ||||||||||  ||||  || | || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  16376529 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 16376430  T
Q  291 tcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaaccatgagaaa 383  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  16376429 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaa-catgagaaa 16376338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 91 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 16383953 - 16383662
Alignment:
Q  91 catcatcaatccataattaagtatacccaagtcataattcacccacaacaacatcagttaatagcaataaccttaatagaacatgaatcacatctcattt 190  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  |||| | |||||||||| |  ||  || ||||| ||| |||||||||||||| |||    
T  16383953 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctctttt 16383854  T
Q  191 taacaacaacatatcaagattcactaaatgagtataatttcatagcttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcatccacaaacataccataa 290  Q
     ||  | ||||||||||  ||||  || | || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  16383853 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 16383754  T
Q  291 tcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaaccatgagaaa 383  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  16383753 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaa-catgagaaa 16383662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 91 - 374
Target Start/End: Original strand, 19610018 - 19610301
Alignment:
Q  91 catcatcaatccataattaagtatacccaagtcataattcacccacaacaacatcagttaatagcaataaccttaatagaacatgaatcacatctcattt 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| |  || ||| | ||| ||| |||||  |||||||||||    
T  19610018 catcatcaatccataattaagtatacccaagtcatgattcactcacaacagcatcagttaacaataacaacatcaatggaatatgaactacatctcattt 19610117  T
Q  191 taacaacaacatatcaagattcactaaatga-gtataatttcatagcttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcatccacaaacataccata 289  Q
     ||  | ||||||||||  |||| | ||||| ||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19610118 caatcaaaacatatcaaatttca-tcaatgaagtataattttataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccata 19610216  T
Q  290 atcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaac 374  Q
    | | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19610217 accatcgattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaataattgttcatcaacccattttcatacaac 19610301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 91 - 383
Target Start/End: Original strand, 10488699 - 10488990
Alignment:
Q  91 catcatcaatccataattaagtatacccaagtcataattcacccacaacaacatcagttaatagcaataaccttaatagaacatgaatcacatctcattt 190  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  |||| | |||||||||| |  ||  || ||||| ||| |||||||||||||| |||    
T  10488699 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctctttt 10488798  T
Q  191 taacaacaacatatcaagattcactaaatgagtataatttcatagcttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcatccacaaacataccataa 290  Q
     ||  | | ||||||||  ||||  || | || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  10488799 caatcaaagcatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 10488898  T
Q  291 tcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaaccatgagaaa 383  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  10488899 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaa-catgagaaa 10488990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 91 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 16556395 - 16556104
Alignment:
Q  91 catcatcaatccataattaagtatacccaagtcataattcacccacaacaacatcagttaatagcaataaccttaatagaacatgaatcacatctcattt 190  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  |||| | |||||||||| |  ||  || ||||| ||| |||||||||||||| |||    
T  16556395 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctctttt 16556296  T
Q  191 taacaacaacatatcaagattcactaaatgagtataatttcatagcttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcatccacaaacataccataa 290  Q
     ||  | ||||||||||  ||||  || | || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  16556295 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 16556196  T
Q  291 tcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaaccatgagaaa 383  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  16556195 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaggagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaa-catgagaaa 16556104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 91 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 16632951 - 16632660
Alignment:
Q  91 catcatcaatccataattaagtatacccaagtcataattcacccacaacaacatcagttaatagcaataaccttaatagaacatgaatcacatctcattt 190  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  |||| | |||||||||| |  ||  || ||||| ||| |||||||||||||| |||    
T  16632951 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctctttt 16632852  T
Q  191 taacaacaacatatcaagattcactaaatgagtataatttcatagcttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcatccacaaacataccataa 290  Q
     ||  | ||||||||||  ||||  || | || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  16632851 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 16632752  T
Q  291 tcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaaccatgagaaa 383  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  16632751 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaggagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaa-catgagaaa 16632660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 180 - 383
Target Start/End: Original strand, 16231981 - 16232183
Alignment:
Q  180 acatctcattttaacaacaacatatcaagattcactaaatgagtataatttcatagcttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcatccacaa 279  Q
    ||||||||||| ||  | ||||||||||  ||||  || | |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  16231981 acatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaa 16232080  T
Q  280 acataccataatcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaaccatga 379  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16232081 acataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaa-catga 16232179  T
Q  380 gaaa 383  Q
    ||||    
T  16232180 gaaa 16232183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 180 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 18086990 - 18086788
Alignment:
Q  180 acatctcattttaacaacaacatatcaagattcactaaatgagtataatttcatagcttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcatccacaa 279  Q
    ||||||||||| ||  | ||||||||||  ||||  || | |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  18086990 acatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaa 18086891  T
Q  280 acataccataatcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaaccatga 379  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18086890 acataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaa-catga 18086792  T
Q  380 gaaa 383  Q
    ||||    
T  18086791 gaaa 18086788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 180 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 13620961 - 13620759
Alignment:
Q  180 acatctcattttaacaacaacatatcaagattcactaaatgagtataatttcatagcttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcatccacaa 279  Q
    ||||||||||| ||  | ||||||||||  ||||  || | |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||    
T  13620961 acatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgcaatttcacccacaa 13620862  T
Q  280 acataccataatcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaaccatga 379  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13620861 acataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcattacaacaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaa-catga 13620763  T
Q  380 gaaa 383  Q
    ||||    
T  13620762 gaaa 13620759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 180 - 383
Target Start/End: Original strand, 23977858 - 23978060
Alignment:
Q  180 acatctcattttaacaacaacatatcaagattcactaaatgagtataatttcatagcttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcatccacaa 279  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||||||  ||||  || | |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  23977858 acatctcatttcaaccaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaa 23977957  T
Q  280 acataccataatcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaaccatga 379  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23977958 acataccataatcatcaattcatgcacaagaaaataacattacaacaagagcacgaatttagccacaattgttcatcaacccattttcatacaa-catga 23978056  T
Q  380 gaaa 383  Q
    ||||    
T  23978057 gaaa 23978060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 169 - 384
Target Start/End: Original strand, 29665951 - 29666166
Alignment:
Q  169 gaacatgaatcacatctcattttaacaacaacatatcaagattcactaaatgagtataatttcatagcttgacatttatacatactttaaaacatgtaat 268  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||| || ||| |||||| || |||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  29665951 gaacatgaatcatatctcatttcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagtacaatttcataacttgacatttatgcatactttgaaacatgtaat 29666050  T
Q  269 ttcatccacaaacataccataatcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttca 368  Q
    |||| |||||| ||||| || ||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||    
T  29666051 ttcacccacaatcatacaattatcatcaattcatacataagaaaataacatcacagctagagcacgaatttaacaacaattatccatcaccccattttca 29666150  T
Q  369 tacaaccatgagaaat 384  Q
    |||||| |||||||||    
T  29666151 tacaacaatgagaaat 29666166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 229 - 383
Target Start/End: Original strand, 19299375 - 19299528
Alignment:
Q  229 ttcatagcttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcatccacaaacataccataatcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaag 328  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| || ||| ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  19299375 ttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattccacccataaacataccataatcatcaattcaaacacaagaaaatagcattacagcaag 19299474  T
Q  329 agcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaaccatgagaaa 383  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19299475 agcacgaatttaacaacaattgtccatcaacccattttcatacaa-catgagaaa 19299528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 265 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 22251648 - 22251531
Alignment:
Q  265 taatttcatccacaaacataccataatcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccatt 364  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22251648 taatttcacccataaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccatt 22251549  T
Q  365 ttcatacaaccatgagaaa 383  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  22251548 ttcatacaa-catgagaaa 22251531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 226 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 29869896 - 29869749
Alignment:
Q  226 aatttcatagcttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcatccacaaacataccataatcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagc 325  Q
    ||||||| | ||||||| |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||| ||| |||| || | |    
T  29869896 aatttcacaacttgacacttatacatacattgaaccatgtaatttcatccacaaacataccataatcatcaattcatgtataag-aaacagcaacataac 29869798  T
Q  326 aagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaac 374  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29869797 aagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaac 29869749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 91 - 272
Target Start/End: Original strand, 27740838 - 27741019
Alignment:
Q  91 catcatcaatccataattaagtatacccaagtcataattcacccacaacaacatcagttaatagcaataaccttaatagaacatgaatcacatctcattt 190  Q
    |||||||||| ||| | || | ||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||  || | ||| |||||||||||| |||||| ||    
T  27740838 catcatcaattcatgaatatgcatacccaaaccatgattcatccacaacaacatcagataatagcaaccacatcaattgaacatgaatcatatctcaatt 27740937  T
Q  191 taacaacaacatatcaagattcactaaatgagtataatttcatagcttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttca 272  Q
     |||||| || || ||| |||||| || |||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  27740938 caacaacgacttagcaaaattcaccaattgagcacaatttcataacttgacatttatacatacttcgaaacatgtaatttca 27741019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 294 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 16825801 - 16825713
Alignment:
Q  294 tcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaaccatgagaaa 383  Q
    |||||||||||| |  || ||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16825801 tcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaa-catgagaaa 16825713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 259 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 1650189 - 1650066
Alignment:
Q  259 aacatgtaatttcatccacaaacataccataatcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaa 358  Q
    |||||||||||||| | |||| ||||| || ||| |||||||||||| |  ||  || |||||||| |||||||||||| || ||| |||||||||||||    
T  1650189 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacgtaacatcacagtaagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaa 1650090  T
Q  359 cccattttcatacaaccatgagaaa 383  Q
    ||||||||||||||| |||||||||    
T  1650089 cccattttcatacaa-catgagaaa 1650066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 294 - 383
Target Start/End: Original strand, 25175766 - 25175854
Alignment:
Q  294 tcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaaccatgagaaa 383  Q
    |||||||||||| |  || ||| || ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  25175766 tcaattcatgcatacaaacataacaacacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaatccattttcatacaa-catgagaaa 25175854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 317 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 27654009 - 27653944
Alignment:
Q  317 catcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaaccatgagaaa 383  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  27654009 catcacagcaagagcacgaatttagcatgatttgttcatcaatccattttcatacaa-catgagaaa 27653944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 259 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 14626214 - 14626133
Alignment:
Q  259 aacatgtaatttcatccacaaacataccataatcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaattta 340  Q
    |||||||||||||| | |||| ||||| || ||| |||||||||||| |  || ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14626214 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattta 14626133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 29870031 - 29869978
Alignment:
Q  91 catcatcaatccataattaagtatacccaagtcataattcacccacaacaacat 144  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  29870031 catcatcaatccatcattaagtacacccaagttataattcactcacaacaacat 29869978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 33314474 - 33314414
Alignment:
Q  91 catcatcaatccataattaagtatacccaagtcataattcacccacaacaacatcagttaa 151  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||  |||| | ||||||||||    
T  33314474 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcatgattcacttacaatagcatcagttaa 33314414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 35009702 - 35009445
Alignment:
Q  91 catcatcaatccataattaagtatacccaagtcataattcacccacaacaacatcagttaatagcaataaccttaatagaacatgaatcacatctcattt 190  Q
    |||||||||| ||| | || | |||||||||  || ||||| | |||||||||||| |||| | ||| ||| | ||| |||||||  || ||||  | ||    
T  35009702 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataatt 35009603  T
Q  191 taacaacaacatatcaagattcactaaatgagtataattt-catagcttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcatccacaaacataccata 289  Q
     |||||||||||| ||| |||||| || |||| | ||||| || | ||| |||||| |||||| || ||  |||||||||||| | |||| ||||| ||     
T  35009602 caacaacaacatagcaaaattcaccaattgagcacaattttcaaaacttcacatttttacataattgaa--catgtaatttcaccaacaatcatacaatt 35009505  T
Q  290 atcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaatt 349  Q
    ||| |||||||||||| |  ||  || ||||||||  |||||||||||||| || |||||    
T  35009504 atcatcaattcatgcatacaaacttaacatcacagttagagcacgaatttagcaacaatt 35009445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 91 - 146
Target Start/End: Original strand, 29665892 - 29665947
Alignment:
Q  91 catcatcaatccataattaagtatacccaagtcataattcacccacaacaacatca 146  Q
    ||||| |||||||| | || | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29665892 catcaccaatccatgaatatgcatacccaagtcatgattcacccacaacaacatca 29665947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 228 - 340
Target Start/End: Original strand, 15862609 - 15862719
Alignment:
Q  228 tttcatagcttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcatccacaaacataccataatcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaa 327  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| || ||  ||||| |||||| | |||| ||||| || ||| |||||||||||| |  || ||| ||||||||  |    
T  15862609 tttcataacttcacatttatacataattgaa--catgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagtta 15862706  T
Q  328 gagcacgaattta 340  Q
    |||||||||||||    
T  15862707 gagcacgaattta 15862719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 153; Significance: 6e-81; HSPs: 26)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 91 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 15760370 - 15760079
Alignment:
Q  91 catcatcaatccataattaagtatacccaagtcataattcacccacaacaacatcagttaatagcaataaccttaatagaacatgaatcacatctcattt 190  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||| |  || ||| | ||| ||| |||||| |||||||||||    
T  15760370 catcatcaatccacaattaagtatacccaattcattattcactcacaataacatcagttaacaataacaacatcaatggaatatgaattacatctcattt 15760271  T
Q  191 taacaacaacatatcaagattcactaaatgagtataatttcatagcttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcatccacaaacataccataa 290  Q
     ||  | ||||||||||  ||||  || | |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  15760270 caattaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacatatcataa 15760171  T
Q  291 tcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaaccatgagaaa 383  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15760170 tcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaataattgttcatcaacccattttcatacaa-catgagaaa 15760079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 91 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 15951047 - 15950756
Alignment:
Q  91 catcatcaatccataattaagtatacccaagtcataattcacccacaacaacatcagttaatagcaataaccttaatagaacatgaatcacatctcattt 190  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||  |||| | |||||||||| |  ||| || | ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  15951047 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcatgattcacttacaatagcatcagttaacaataatcacatcaatggaatatgaatcacatctcattt 15950948  T
Q  191 taacaacaacatatcaagattcactaaatgagtataatttcatagcttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcatccacaaacataccataa 290  Q
     ||  | ||||||||||  ||||  || | || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15950947 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataa 15950848  T
Q  291 tcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaaccatgagaaa 383  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15950847 tcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaa-catgagaaa 15950756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 91 - 383
Target Start/End: Original strand, 7822728 - 7823019
Alignment:
Q  91 catcatcaatccataattaagtatacccaagtcataattcacccacaacaacatcagttaatagcaataaccttaatagaacatgaatcacatctcattt 190  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  |||| | |||||||||| |  ||  || ||||| ||| |||||||||||||| |||    
T  7822728 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctctttt 7822827  T
Q  191 taacaacaacatatcaagattcactaaatgagtataatttcatagcttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcatccacaaacataccataa 290  Q
     ||  | | ||||||||  ||||  || | || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  7822828 caatcaaagcatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 7822927  T
Q  291 tcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaaccatgagaaa 383  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  7822928 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaa-catgagaaa 7823019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 91 - 383
Target Start/End: Original strand, 7830039 - 7830330
Alignment:
Q  91 catcatcaatccataattaagtatacccaagtcataattcacccacaacaacatcagttaatagcaataaccttaatagaacatgaatcacatctcattt 190  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  |||| | |||||||||| |  ||  || ||||| ||| |||||||||||||| |||    
T  7830039 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctctttt 7830138  T
Q  191 taacaacaacatatcaagattcactaaatgagtataatttcatagcttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcatccacaaacataccataa 290  Q
     ||  | | ||||||||  ||||  || | || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  7830139 caatcaaagcatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 7830238  T
Q  291 tcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaaccatgagaaa 383  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  7830239 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaa-catgagaaa 7830330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 91 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 27101893 - 27101602
Alignment:
Q  91 catcatcaatccataattaagtatacccaagtcataattcacccacaacaacatcagttaatagcaataaccttaatagaacatgaatcacatctcattt 190  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  |||| | |||||||||| |  ||  || ||||| ||| |||||||||||||| |||    
T  27101893 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctctttt 27101794  T
Q  191 taacaacaacatatcaagattcactaaatgagtataatttcatagcttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcatccacaaacataccataa 290  Q
     ||  | | ||||||||  ||||  || | || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  27101793 caatcaaagcatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 27101694  T
Q  291 tcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaaccatgagaaa 383  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  27101693 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaa-catgagaaa 27101602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 91 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 27109241 - 27108950
Alignment:
Q  91 catcatcaatccataattaagtatacccaagtcataattcacccacaacaacatcagttaatagcaataaccttaatagaacatgaatcacatctcattt 190  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  |||| | |||||||||| |  ||  || ||||| ||| |||||||||||||| |||    
T  27109241 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctctttt 27109142  T
Q  191 taacaacaacatatcaagattcactaaatgagtataatttcatagcttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcatccacaaacataccataa 290  Q
     ||  | | ||||||||  ||||  || | || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  27109141 caatcaaagcatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 27109042  T
Q  291 tcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaaccatgagaaa 383  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  27109041 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaa-catgagaaa 27108950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 91 - 383
Target Start/End: Original strand, 27176433 - 27176724
Alignment:
Q  91 catcatcaatccataattaagtatacccaagtcataattcacccacaacaacatcagttaatagcaataaccttaatagaacatgaatcacatctcattt 190  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  |||| | |||||||||| |  ||  || ||||| ||| |||||||||||||| |||    
T  27176433 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctctttt 27176532  T
Q  191 taacaacaacatatcaagattcactaaatgagtataatttcatagcttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcatccacaaacataccataa 290  Q
     ||  | | ||||||||  ||||  || | || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  27176533 caatcaaagcatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 27176632  T
Q  291 tcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaaccatgagaaa 383  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  27176633 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaa-catgagaaa 27176724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 91 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 38783985 - 38783694
Alignment:
Q  91 catcatcaatccataattaagtatacccaagtcataattcacccacaacaacatcagttaatagcaataaccttaatagaacatgaatcacatctcattt 190  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  |||| | |||||||||| |  ||  || ||||| ||| |||||||||||||| |||    
T  38783985 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctctttt 38783886  T
Q  191 taacaacaacatatcaagattcactaaatgagtataatttcatagcttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcatccacaaacataccataa 290  Q
     ||  | | ||||||||  ||||  || | || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  38783885 caatcaaagcatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 38783786  T
Q  291 tcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaaccatgagaaa 383  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  38783785 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaa-catgagaaa 38783694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 180 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 18980188 - 18979986
Alignment:
Q  180 acatctcattttaacaacaacatatcaagattcactaaatgagtataatttcatagcttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcatccacaa 279  Q
    ||||||||||| ||  | ||||||||||  ||||  || | |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  18980188 acatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaa 18980089  T
Q  280 acataccataatcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaaccatga 379  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18980088 acataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaa-catga 18979990  T
Q  380 gaaa 383  Q
    ||||    
T  18979989 gaaa 18979986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 180 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 14251065 - 14250863
Alignment:
Q  180 acatctcattttaacaacaacatatcaagattcactaaatgagtataatttcatagcttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcatccacaa 279  Q
    ||||||||||| ||  | ||||||||||  ||||  || | |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||    
T  14251065 acatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccaaaa 14250966  T
Q  280 acataccataatcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaaccatga 379  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14250965 acataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcattacaacaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaa-catga 14250867  T
Q  380 gaaa 383  Q
    ||||    
T  14250866 gaaa 14250863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 180 - 383
Target Start/End: Original strand, 13758459 - 13758661
Alignment:
Q  180 acatctcattttaacaacaacatatcaagattcactaaatgagtataatttcatagcttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcatccacaa 279  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||||||  ||||  || | |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  13758459 acatctcatttcaaccaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaa 13758558  T
Q  280 acataccataatcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaaccatga 379  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13758559 acataccataatcatcaattcatgcacaagaaaataacattacaacaagagcacgaatttagccacaattgttcatcaacccattttcatacaa-catga 13758657  T
Q  380 gaaa 383  Q
    ||||    
T  13758658 gaaa 13758661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 180 - 383
Target Start/End: Original strand, 15927657 - 15927859
Alignment:
Q  180 acatctcattttaacaacaacatatcaagattcactaaatgagtataatttcatagcttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcatccacaa 279  Q
    ||||||||||| ||  | ||||||||||  ||||  || | |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  15927657 acatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaa 15927756  T
Q  280 acataccataatcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaaccatga 379  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||    
T  15927757 gcataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttagcaacaattgatcatcaatccattttcatacaa-catga 15927855  T
Q  380 gaaa 383  Q
    ||||    
T  15927856 gaaa 15927859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 111 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 48622901 - 48622646
Alignment:
Q  111 gtatacccaagtcataattcacccacaacaa-catcagttaatagcaataaccttaatagaacatgaatcacatctcattttaacaacaacatatcaaga 209  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||||| || ||||| |||| | ||| ||| | || ||| |||||||||||||| ||||   |||||||| ||||| |    
T  48622901 gtatacccaagtcatggttcactcacaataatcatcatttaacaacaacaacatcaa-agagcatgaatcacatcttatttct-caacaacacatcaaaa 48622804  T
Q  210 -ttcactaaatgagtataatttcatagcttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcatccacaaacataccataatcctcaattcatgcacaa 308  Q
     ||||| || ||  |||||||||| | ||| ||| |||| ||| |||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  48622803 attcacaaattggttataatttcacaacttaacaattatgcatgctttgaa-catgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaa 48622705  T
Q  309 gaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttc 367  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  48622704 gaaaatatcatcacagtaagagcacgaatttagcatcaattgttcatcaacccattttc 48622646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 115 - 349
Target Start/End: Original strand, 13321038 - 13321273
Alignment:
Q  115 acccaagtcataattcacccacaacaacatcagttaatagcaataaccttaatagaacatgaatcacatctcattttaacaa-caacatatcaagattca 213  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||| | ||||||| | ||| |||||||||||| |||||| || ||||| |||| || ||| |||||    
T  13321038 acccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaatcaacttagcaaaattca 13321137  T
Q  214 ctaaatgagtataatttcatagcttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcatccacaaacataccataatcctcaattcatgcacaagaaaa 313  Q
    | || |||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||| ||||| || ||| |||||||||||| |  || |    
T  13321138 ccaattgagcacaatttcataacttgacatttatacatactttgaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaaca 13321237  T
Q  314 tagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaatt 349  Q
    || ||||||||  |||||||||||||| || |||||    
T  13321238 taacatcacagttagagcacgaatttagcaacaatt 13321273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 226 - 374
Target Start/End: Original strand, 16418633 - 16418780
Alignment:
Q  226 aatttcatagcttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcatccacaaacataccataatcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagc 325  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||  || |||| || | |    
T  16418633 aatttcacaacttgacatttatacatacattgaaccatgtaatttcatccacaaacataccataatcatcaattcatgtataag-caacagcaacataac 16418731  T
Q  326 aagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaac 374  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16418732 aagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaac 16418780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 226 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 10000490 - 10000343
Alignment:
Q  226 aatttcatagcttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcatccacaaacataccataatcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagc 325  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||  | || || | |    
T  10000490 aatttcacaacttgacatttatacatacattgaaccatgtaatttcatccacaaacataccataatcatcaattcatgtataagaaacaa-caacataac 10000392  T
Q  326 aagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaac 374  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10000391 aagagcacgaatttgacataaattgttcatcaacccatttttatacaac 10000343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 258 - 374
Target Start/End: Original strand, 13572843 - 13572959
Alignment:
Q  258 aaacatgtaatttcatccacaaacataccataatcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatca 357  Q
    ||||||||||||||| | |||| || || || ||| |||||||||||| |  || ||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  13572843 aaacatgtaatttcaccaacaatcacacaatcatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatca 13572942  T
Q  358 acccattttcatacaac 374  Q
    |||||||||||||||||    
T  13572943 acccattttcatacaac 13572959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 259 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 16479046 - 16478923
Alignment:
Q  259 aacatgtaatttcatccacaaacataccataatcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaa 358  Q
    |||||||||||||| | |||| ||||| || ||| |||||||||||| |  || ||| |||| ||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  16479046 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcgcagtaagagcacgaatctaacatgaattgttcatcaa 16478947  T
Q  359 cccattttcatacaaccatgagaaa 383  Q
    ||||||||||||||| |||||||||    
T  16478946 cccattttcatacaa-catgagaaa 16478923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 259 - 374
Target Start/End: Original strand, 10989577 - 10989692
Alignment:
Q  259 aacatgtaatttcatccacaaacataccataatcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaa 358  Q
    |||||||||||||| | |||| ||||| |  | | |||||||||||| |  || ||| |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||    
T  10989577 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgatttgttcatcaa 10989676  T
Q  359 cccattttcatacaac 374  Q
    ||||||||||||||||    
T  10989677 cccattttcatacaac 10989692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 259 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 13911108 - 13910993
Alignment:
Q  259 aacatgtaatttcatccacaaacataccataatcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaa 358  Q
    |||||||||||||| | |||| ||||| || | | |||||||||||| |  || ||| ||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  13911108 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacaacaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaa 13911009  T
Q  359 cccattttcatacaac 374  Q
    | ||||||||||||||    
T  13911008 ctcattttcatacaac 13910993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 91 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 10000625 - 10000572
Alignment:
Q  91 catcatcaatccataattaagtatacccaagtcataattcacccacaacaacat 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  10000625 catcatcaatccataattaagtatacccaagttataattcactcacaacaacat 10000572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 91 - 144
Target Start/End: Original strand, 16418498 - 16418551
Alignment:
Q  91 catcatcaatccataattaagtatacccaagtcataattcacccacaacaacat 144  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16418498 catcatcaatccataattatgtatacccaagtcataattcactcacaacaacat 16418551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 259 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 18253931 - 18253808
Alignment:
Q  259 aacatgtaatttcatccacaaacataccataatcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaa 358  Q
    |||||||||||||| | |||| ||||| || ||| |||||||||||| |  || ||| ||| ||||   |||||||||||||  | ||||||||||||||    
T  18253931 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagtaacaattgttcatcaa 18253832  T
Q  359 cccattttcatacaaccatgagaaa 383  Q
    ||||||||||||||| |||||||||    
T  18253831 cccattttcatacaa-catgagaaa 18253808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 259 - 383
Target Start/End: Original strand, 2437625 - 2437748
Alignment:
Q  259 aacatgtaatttcatccacaaacataccataatcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaa 358  Q
    |||||||||||||| | |||| ||||| |  | | |||||||||||| |  || ||| ||||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||| |     
T  2437625 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacaacaagagcacgaatttagcaagaattgttcattat 2437724  T
Q  359 cccattttcatacaaccatgagaaa 383  Q
    ||||||||||||||| |||||||||    
T  2437725 cccattttcatacaa-catgagaaa 2437748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 129
Target Start/End: Original strand, 15852456 - 15852494
Alignment:
Q  91 catcatcaatccataattaagtatacccaagtcataatt 129  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15852456 catcatcaatccataattatgtatacccaagtcataatt 15852494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 346 - 383
Target Start/End: Original strand, 15862174 - 15862210
Alignment:
Q  346 aattgttcatcaacccattttcatacaaccatgagaaa 383  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15862174 aattgttcatcaacccattttcatacaa-catgagaaa 15862210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467 (Bit Score: 149; Significance: 1e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0467
Description:

Target: scaffold0467; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 91 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 10595 - 10304
Alignment:
Q  91 catcatcaatccataattaagtatacccaagtcataattcacccacaacaacatcagttaatagcaataaccttaatagaacatgaatcacatctcattt 190  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | ||||| | |||||||||| | ||| ||| | ||| ||| |||||| |||||||||||    
T  10595 catcatcaatccacaattaagtatacccaagtcatgattccctcacaatagcatcagttaacaacaacaacatcaatggaatatgaattacatctcattt 10496  T
Q  191 taacaacaacatatcaagattcactaaatgagtataatttcatagcttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcatccacaaacataccataa 290  Q
     ||  | ||||||||||  ||||  || | |||||||||||||| |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10495 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttagcatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataa 10396  T
Q  291 tcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaaccatgagaaa 383  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10395 tcatcaattcatgcacaagaaaatatcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattattcatcaacccattttcatacaa-catgagaaa 10304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 149; Significance: 1e-78; HSPs: 17)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 91 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 18060014 - 18059723
Alignment:
Q  91 catcatcaatccataattaagtatacccaagtcataattcacccacaacaacatcagttaatagcaataaccttaatagaacatgaatcacatctcattt 190  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  |||| | |||||||| | |  ||  || | ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  18060014 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcattt 18059915  T
Q  191 taacaacaacatatcaagattcactaaatgagtataatttcatagcttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcatccacaaacataccataa 290  Q
     ||  | ||||||||||  ||||  || | || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  18059914 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 18059815  T
Q  291 tcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaaccatgagaaa 383  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18059814 tcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaa-catgagaaa 18059723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 96 - 383
Target Start/End: Original strand, 46523394 - 46523680
Alignment:
Q  96 tcaatccataattaagtatacccaagtcataattcacccacaacaacatcagttaatagcaataaccttaatagaacatgaatcacatctcattttaaca 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| |  || ||| | ||| ||| |||||| ||||||||||| ||      
T  46523394 tcaatccataattaagtatacccaagtcatgattcactcacaacagcatcagttaacaataacaacatcaatggaatatgaattacatctcatttcaatc 46523493  T
Q  196 acaacatatcaagattcactaaatga-gtataatttcatagcttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcatccacaaacataccataatcct 294  Q
    | ||||||||||  |||| | ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| | |    
T  46523494 aaaacatatcaaatttca-tcaatgaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataacataaacat 46523592  T
Q  295 caattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaaccatgagaaa 383  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  46523593 caattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaa-catgagaaa 46523680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 91 - 383
Target Start/End: Original strand, 17004638 - 17004929
Alignment:
Q  91 catcatcaatccataattaagtatacccaagtcataattcacccacaacaacatcagttaatagcaataaccttaatagaacatgaatcacatctcattt 190  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  |||| | |||||||||| |  ||  || ||||| ||| |||||||||||||| |||    
T  17004638 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctctttt 17004737  T
Q  191 taacaacaacatatcaagattcactaaatgagtataatttcatagcttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcatccacaaacataccataa 290  Q
     ||  | | ||||||||  ||||  || | || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  17004738 caatcaaagcatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 17004837  T
Q  291 tcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaaccatgagaaa 383  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  17004838 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaa-catgagaaa 17004929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 91 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 38055347 - 38055064
Alignment:
Q  91 catcatcaatccataattaagtatacccaagtcataattcacccacaacaacatcagttaatagcaataaccttaatagaacatgaatcacatctcattt 190  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  |||| | |||||||||| |  ||  || ||||| ||| |||||||||||||| |||    
T  38055347 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctctttt 38055248  T
Q  191 taacaacaacatatcaagattcactaaatgagtataatttcatagcttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcatccacaaacataccataa 290  Q
     ||  | ||||||||||  ||||  || | || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  38055247 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 38055148  T
Q  291 tcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaac 374  Q
    || |||||||| ||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38055147 tcatcaattcaagcacaagaaaataacatcacagtaaaagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaac 38055064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 221 - 383
Target Start/End: Original strand, 17148697 - 17148858
Alignment:
Q  221 agtataatttcatagcttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcatccacaaacataccataatcctcaattcatgcacaagaaaatagcatc 320  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||     
T  17148697 agtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaataacatt 17148796  T
Q  321 acagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaaccatgagaaa 383  Q
    ||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17148797 acaacaagagcacgaatttagccacaattgttcatcaacccattttcatacaa-catgagaaa 17148858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 229 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 19962617 - 19962464
Alignment:
Q  229 ttcatagcttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcatccacaaacataccataatcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaag 328  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| || ||| ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  19962617 ttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattccacccataaacataccataatcatcaattcaaacacaagaaaatagcattacagcaag 19962518  T
Q  329 agcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaaccatgagaaa 383  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19962517 agcacgaatttaacaacaattgtccatcaacccattttcatacaa-catgagaaa 19962464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 226 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 7641054 - 7640907
Alignment:
Q  226 aatttcatagcttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcatccacaaacataccataatcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagc 325  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | | ||| ||| |||| || | |    
T  7641054 aatttcacaacttgacatttatacatacattgaaccatgtaatttcatccacaaacataccataatcatcaattcaagtataag-aaacagcaacataac 7640956  T
Q  326 aagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaac 374  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7640955 aagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaac 7640907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 226 - 374
Target Start/End: Original strand, 22035583 - 22035730
Alignment:
Q  226 aatttcatagcttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcatccacaaacataccataatcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagc 325  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | | ||| ||| |||| || | |    
T  22035583 aatttcacaacttgacatttatacatacattgaaccatgtaatttcatccacaaacataccataatcatcaattcaagtataag-aaacagcaacataac 22035681  T
Q  326 aagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaac 374  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22035682 aagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaac 22035730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 259 - 383
Target Start/End: Original strand, 22227976 - 22228099
Alignment:
Q  259 aacatgtaatttcatccacaaacataccataatcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaa 358  Q
    ||||||||||||||   |||| ||||| || ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  22227976 aacatgtaatttcactaacaatcatacaattatcatcaattcatgcacaagaaaataacatcacagcaagagcacgaatttagcaagaattgttcatcaa 22228075  T
Q  359 cccattttcatacaaccatgagaaa 383  Q
    ||||||||||||||| |||||||||    
T  22228076 cccattttcatacaa-catgagaaa 22228099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 259 - 383
Target Start/End: Original strand, 22232673 - 22232796
Alignment:
Q  259 aacatgtaatttcatccacaaacataccataatcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaa 358  Q
    ||||||||||||||   |||| ||||| || ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  22232673 aacatgtaatttcactaacaatcatacaattatcatcaattcatgcacaagaaaataacatcacagcaagagcacgaatttagcaagaattgttcatcaa 22232772  T
Q  359 cccattttcatacaaccatgagaaa 383  Q
    ||||||||||||||| |||||||||    
T  22232773 cccattttcatacaa-catgagaaa 22232796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 259 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 5072472 - 5072357
Alignment:
Q  259 aacatgtaatttcatccacaaacataccataatcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaa 358  Q
    |||||||||||||| | |||| ||||| |  | | |||||||||||| |  || ||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  5072472 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatataaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaa 5072373  T
Q  359 cccattttcatacaac 374  Q
    ||||||||||||||||    
T  5072372 cccattttcatacaac 5072357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 259 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 18601202 - 18601087
Alignment:
Q  259 aacatgtaatttcatccacaaacataccataatcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaa 358  Q
    |||||||||||||| | |||| ||||| |  | | |||||||||||| |  || ||| |||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  18601202 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcatgaatttagcatgaattgttcatcaa 18601103  T
Q  359 cccattttcatacaac 374  Q
    ||||||||||||||||    
T  18601102 cccattttcatacaac 18601087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 91 - 144
Target Start/End: Original strand, 20254312 - 20254365
Alignment:
Q  91 catcatcaatccataattaagtatacccaagtcataattcacccacaacaacat 144  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20254312 catcatcaatccataattatgtatacccaagtcataattcacccacaacaacat 20254365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 259 - 383
Target Start/End: Original strand, 2116422 - 2116545
Alignment:
Q  259 aacatgtaatttcatccacaaacataccataatcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaa 358  Q
    |||||||||||||| | |||| ||||| || ||| |||||||||||| |  || ||| |||||||| || ||||||||| || ||| |||||||||||||    
T  2116422 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagtaaaagcacgaatctagcatgaattgttcatcaa 2116521  T
Q  359 cccattttcatacaaccatgagaaa 383  Q
    |||||||| |||||| |||||||||    
T  2116522 cccatttttatacaa-catgagaaa 2116545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 259 - 383
Target Start/End: Original strand, 45051590 - 45051713
Alignment:
Q  259 aacatgtaatttcatccacaaacataccataatcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaa 358  Q
    |||||||||||||| | |||| ||||| || ||| |||||||||||| |  ||  || |||||||| |||| ||||||| || ||| |||||||||||||    
T  45051590 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacgtaacatcacagtaagaacacgaatctagcatgaattgttcatcaa 45051689  T
Q  359 cccattttcatacaaccatgagaaa 383  Q
    ||||||||||||||| |||||||||    
T  45051690 cccattttcatacaa-catgagaaa 45051713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 91 - 144
Target Start/End: Original strand, 22035448 - 22035501
Alignment:
Q  91 catcatcaatccataattaagtatacccaagtcataattcacccacaacaacat 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  22035448 catcatcaatccataattaagtatacccaagttataattcactcacaacaacat 22035501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 7641189 - 7641136
Alignment:
Q  91 catcatcaatccataattaagtatacccaagtcataattcacccacaacaacat 144  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  7641189 catcatcaatccataattaagtacacccaagttataattcactcacaacaacat 7641136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 145; Significance: 3e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 91 - 383
Target Start/End: Original strand, 2392 - 2683
Alignment:
Q  91 catcatcaatccataattaagtatacccaagtcataattcacccacaacaacatcagttaatagcaataaccttaatagaacatgaatcacatctcattt 190  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||| ||||| |||||||||||| |  || ||| | ||| ||| |||||| |||||||||||    
T  2392 catcatcaatccacaattaagtatacccaaaccatgattcactcacaataacatcagttaacaataacaacatcaatggaatatgaattacatctcattt 2491  T
Q  191 taacaacaacatatcaagattcactaaatgagtataatttcatagcttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcatccacaaacataccataa 290  Q
     || || ||||||||||  ||||  || | |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2492 caataaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcatgacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataa 2591  T
Q  291 tcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaaccatgagaaa 383  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2592 gcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacggcaagagcacgaattgagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaa-catgagaaa 2683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 145; Significance: 3e-76; HSPs: 3)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 91 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 154263 - 153972
Alignment:
Q  91 catcatcaatccataattaagtatacccaagtcataattcacccacaacaacatcagttaatagcaataaccttaatagaacatgaatcacatctcattt 190  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||| | ||| |||||| |  ||  || | ||| ||| |||| |||||||||||||    
T  154263 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcatgattcacccacaatagcataagttaacaataaccacatcaatggaatatgattcacatctcattt 154164  T
Q  191 taacaacaacatatcaagattcactaaatgagtataatttcatagcttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcatccacaaacataccataa 290  Q
     ||  | ||||||||||  ||||  || | || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  154163 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaacttcacccacaaacataccataa 154064  T
Q  291 tcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaaccatgagaaa 383  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  154063 tcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaa-catgagaaa 153972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 317 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 169938 - 169873
Alignment:
Q  317 catcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaaccatgagaaa 383  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  169938 catcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaa-catgagaaa 169873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 325 - 374
Target Start/End: Original strand, 36327 - 36376
Alignment:
Q  325 caagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaac 374  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  36327 caagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccagtttcatacaac 36376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 141; Significance: 8e-74; HSPs: 2)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 91 - 383
Target Start/End: Original strand, 31309 - 31600
Alignment:
Q  91 catcatcaatccataattaagtatacccaagtcataattcacccacaacaacatcagttaatagcaataaccttaatagaacatgaatcacatctcattt 190  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  |||| | |||||||||| |  ||  || ||||| ||| |||||||||||||| |||    
T  31309 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctctttt 31408  T
Q  191 taacaacaacatatcaagattcactaaatgagtataatttcatagcttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcatccacaaacataccataa 290  Q
     ||  | | ||||||||  ||||  || | || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  31409 caatcaaagcatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 31508  T
Q  291 tcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaaccatgagaaa 383  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  31509 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaa-catgagaaa 31600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #2
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 91 - 374
Target Start/End: Original strand, 39646 - 39929
Alignment:
Q  91 catcatcaatccataattaagtatacccaagtcataattcacccacaacaacatcagttaatagcaataaccttaatagaacatgaatcacatctcattt 190  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||| ||||| | |||||||||| |  || ||| | |||  || |||||| |||||||||||    
T  39646 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcatgattcactcacaatagcatcagttaacaataacaacatcaatgaaatatgaataacatctcattt 39745  T
Q  191 taacaacaacatatcaagattcactaaatgagtataatttcatagcttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcatccacaaacataccataa 290  Q
     || || ||||||||||  ||||  || | || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  39746 caaaaaaaacatatcaaatttcatcaattaagaataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaaaataccataa 39845  T
Q  291 tcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaac 374  Q
    || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39846 tcatcaattcatgcacaggaaaatagaatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaac 39929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 141; Significance: 8e-74; HSPs: 2)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 91 - 383
Target Start/End: Original strand, 39103 - 39394
Alignment:
Q  91 catcatcaatccataattaagtatacccaagtcataattcacccacaacaacatcagttaatagcaataaccttaatagaacatgaatcacatctcattt 190  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  |||| | |||||||||| |  ||  || ||||| ||| |||||||||||||| |||    
T  39103 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcagttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctctttt 39202  T
Q  191 taacaacaacatatcaagattcactaaatgagtataatttcatagcttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcatccacaaacataccataa 290  Q
     ||  | | ||||||||  ||||  || | || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  39203 caatcaaagcatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataa 39302  T
Q  291 tcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaaccatgagaaa 383  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  39303 tcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcaccaacccattttcatacaa-catgagaaa 39394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 259 - 383
Target Start/End: Original strand, 43165 - 43288
Alignment:
Q  259 aacatgtaatttcatccacaaacataccataatcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaa 358  Q
    |||||||||||||| | |||| ||||| || ||| |||||||||||| |  || ||| |||| |||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||    
T  43165 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatagaaacataacatcccagcaagagcacgaatttgacatgaattgctcatcaa 43264  T
Q  359 cccattttcatacaaccatgagaaa 383  Q
    ||||||||||||||| |||||||||    
T  43265 cccattttcatacaa-catgagaaa 43288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 91 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 1831 - 1540
Alignment:
Q  91 catcatcaatccataattaagtatacccaagtcataattcacccacaacaacatcagttaatagcaataaccttaatagaacatgaatcacatctcattt 190  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||| ||||| | |||||||||| |  || ||| | |||   | |||| | |||||||||||    
T  1831 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcatgattcactcacaatagcatcagttaacaataacaacatcaattttatatgatttacatctcattt 1732  T
Q  191 taacaacaacatatcaagattcactaaatgagtataatttcatagcttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcatccacaaacataccataa 290  Q
     ||  | ||||||||||  ||||  || | |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1731 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataa 1632  T
Q  291 tcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaaccatgagaaa 383  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1631 tcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagtgcacgattttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaa-catgagaaa 1540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 125; Significance: 3e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 91 - 383
Target Start/End: Original strand, 29162 - 29453
Alignment:
Q  91 catcatcaatccataattaagtatacccaagtcataattcacccacaacaacatcagttaatagcaataaccttaatagaacatgaatcacatctcattt 190  Q
    |||||||||| || ||||||||||| |||| |||||||||||  |||| ||||| | |||| |  ||  || | ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  29162 catcatcaatacacaattaagtataaccaaatcataattcactaacaataacataaattaacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcattt 29261  T
Q  191 taacaacaacatatcaagattcactaaatgagtataatttcatagcttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcatccacaaacataccataa 290  Q
     ||  | ||||||||||  ||||  || | || ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||    
T  29262 caatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttacacatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataacataa 29361  T
Q  291 tcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaaccatgagaaa 383  Q
    ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29362 tcaacaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcatacaa-catgagaaa 29453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 117; Significance: 2e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 113 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 56341 - 56105
Alignment:
Q  113 atacccaagtcataattcacccacaacaacatcagttaatagcaataaccttaatagaacatgaatcacatctcattttaacaacaacatatcaagattc 212  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  ||| | ||| ||||||||||||||| || ||| ||||||||| || ||| ||||    
T  56341 atacccaagtcatgattcacccacaacaacatcaattaatagcatcaacatcaatggaacatgaatcacatatcttttcaacaacaacttagcaaaattc 56242  T
Q  213 actaaatgagtataatttcatagcttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcatccacaaacataccataatcctcaattcatgcacaagaaa 312  Q
    || |  |||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||| |||| ||||||||| ||||    
T  56241 accatttgagcacaatttcataacttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcagccacaatcatacaattatcatcaaatcatgcacacgaaa 56142  T
Q  313 atagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaatt 349  Q
    ||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  56141 ataacatcacagttagagcacgaatttaacaacaatt 56105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1500 (Bit Score: 116; Significance: 7e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold1500
Description:

Target: scaffold1500; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 180 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 1681 - 1479
Alignment:
Q  180 acatctcattttaacaacaacatatcaagattcactaaatgagtataatttcatagcttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcatccacaa 279  Q
    ||||||||||| ||  | ||||||||||  ||||  || | |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||    
T  1681 acatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccataa 1582  T
Q  280 acataccataatcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaaccatga 379  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1581 acataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcattacaacaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaa-catga 1483  T
Q  380 gaaa 383  Q
    ||||    
T  1482 gaaa 1479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1666 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold1666
Description:

Target: scaffold1666; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 91 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 252 - 3
Alignment:
Q  91 catcatcaatccataattaagtatacccaagtcataattcacccacaacaacatcagttaatagcaataaccttaatagaacatgaatcacatctcattt 190  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||| ||||| | |||||||||| |  ||  || | |||  || |||||| |||||||||||    
T  252 catcatcaatccacaattaagtatacccaaatcatgattcactcacaatagcatcagttaacaataactacatcaatgtaatatgaattacatctcattt 153  T
Q  191 taacaacaacatatcaagattcactaaatgagtataatttcatagcttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcatccacaaacataccataa 290  Q
     ||  | ||||||||||  ||||  || | |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  152 caattaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttacacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataa 53  T
Q  291 tcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaattta 340  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  52 tcatcaattcatgcacaagaaaatagcctcacagcaagagcacgaattta 3  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 103; Significance: 4e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 111 - 383
Target Start/End: Original strand, 53895 - 54165
Alignment:
Q  111 gtatacccaagtcataattcacccacaacaa-catcagttaatagcaataaccttaatagaacatgaatcacatctcattttaacaacaacatatcaaga 209  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||||| || ||||| |||| | ||| ||| | || ||| |||||||||||||| ||||   |||||||| ||||| |    
T  53895 gtatacccaagtcatggttcactcacaataatcatcaattaacaacaacaacatcaa-agagcatgaatcacatcttatttct-caacaacacatcaaaa 53992  T
Q  210 -ttcactaaatgagtataatttcatagcttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcatccacaaacataccataatcctcaattcatgcacaa 308  Q
     ||||| || || ||||||||||| | ||| ||| |||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  53993 attcaccaattgggtataatttcacaacttaacaattatacatgctttgaa-catgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaa 54091  T
Q  309 gaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaaccatgagaaa 383  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  54092 gaaaacagcatcacagtaagagcacgaatttagcatcaattgttcatcaacccattttcata-aaacatgagaaa 54165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0892 (Bit Score: 91; Significance: 6e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0892
Description:

Target: scaffold0892; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 111 - 383
Target Start/End: Original strand, 3434 - 3704
Alignment:
Q  111 gtatacccaagtcataattcacccacaacaa-catcagttaatagcaataaccttaatagaacatgaatcacatctcattttaacaacaacatatcaaga 209  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||||| || |||||||||| | ||| ||| | || ||| |||||||||||||| ||||   |||||||| ||||| |    
T  3434 gtatacccaagtcatggttcactcacaataatcatcagttaacaacaacaacatcaa-agagcatgaatcacatcttatttct-caacaacacatcaaaa 3531  T
Q  210 -ttcactaaatgagtataatttcatagcttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcatccacaaacataccataatcctcaattcatgcacaa 308  Q
     ||||| || || ||||||||||| | ||| ||| |||||||| |||| || |||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||    
T  3532 attcaccaattgggtataatttcacaacttaacaattatacatgctttgaa-catgtaatttcacccacaatcataccataatcatcaattcatggacaa 3630  T
Q  309 gaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaaccatgagaaa 383  Q
    ||||| | |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  3631 gaaaacaacatcacagtaagagcactaatttagcatcaattgttcatcaacccattttcata-aaacatgagaaa 3704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0183
Description:

Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 226 - 374
Target Start/End: Original strand, 6733 - 6880
Alignment:
Q  226 aatttcatagcttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcatccacaaacataccataatcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagc 325  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||| ||| |||| || | |    
T  6733 aatttcacaacttgacatttatacatacattgaaccatgtaatttcatccacaaacataccataatcatcaattcatgtataag-aaacagcaacataac 6831  T
Q  326 aagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaac 374  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6832 aagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaac 6880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 144
Target Start/End: Original strand, 6598 - 6651
Alignment:
Q  91 catcatcaatccataattaagtatacccaagtcataattcacccacaacaacat 144  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  6598 catcatcaatccacaattaagtatacccaagttataattcactcacaacaacat 6651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 84; Significance: 8e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 259 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 5300 - 5185
Alignment:
Q  259 aacatgtaatttcatccacaaacataccataatcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaa 358  Q
    |||||||||||||| | |||| ||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  5300 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaagaattgttcatcaa 5201  T
Q  359 cccattttcatacaac 374  Q
    ||||||||||||||||    
T  5200 cccattttcatacaac 5185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 81; Significance: 5e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 226 - 374
Target Start/End: Original strand, 7345 - 7492
Alignment:
Q  226 aatttcatagcttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcatccacaaacataccataatcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagc 325  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||  || |||| || | |    
T  7345 aatttcacaacttgacatttatacatacattgaaccatgtaatttcatccacaaacataccataatcatcaattcatgtataag-caacagcaacataac 7443  T
Q  326 aagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaac 374  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7444 aagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaac 7492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 91 - 144
Target Start/End: Original strand, 7210 - 7263
Alignment:
Q  91 catcatcaatccataattaagtatacccaagtcataattcacccacaacaacat 144  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7210 catcatcaatccataattatgtatacccaagtcataattcactcacaacaacat 7263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 259 - 383
Target Start/End: Original strand, 3890 - 4013
Alignment:
Q  259 aacatgtaatttcatccacaaacataccataatcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaa 358  Q
    |||||||||||||| | |||| ||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  3890 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttagcaagaattgttcatcaa 3989  T
Q  359 cccattttcatacaaccatgagaaa 383  Q
    ||||||||||||||| |||||||||    
T  3990 cccattttcatacaa-catgagaaa 4013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 69; Significance: 7e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 226 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 23869 - 23722
Alignment:
Q  226 aatttcatagcttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcatccacaaacataccataatcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagc 325  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | ||| ||| | || || | |    
T  23869 aatttcacaacttgacatttatacatacattgaaccatgtaatttcatccacaaacataccataatcatcaatccatgtataag-aaacaacaacataac 23771  T
Q  326 aagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaac 374  Q
     ||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  23770 cagagcacgaatttgacatgagttgttcatcaacccattttcatacaac 23722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 24004 - 23951
Alignment:
Q  91 catcatcaatccataattaagtatacccaagtcataattcacccacaacaacat 144  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  24004 catcatcaatccataattaagtacacccaagttataattcactcacaacaacat 23951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 64; Significance: 7e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 170 - 383
Target Start/End: Original strand, 3042 - 3253
Alignment:
Q  170 aacatgaatcacatctcattttaacaacaacatatcaagattcactaaatgagtataattt-catagcttgacatttatacatactttaaaacatgtaat 268  Q
    ||||||||||| |||||| || ||||||||| || ||| |||||| || |||| | ||||| || | ||| |||||| |||||| || ||  ||||||||    
T  3042 aacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaa--catgtaat 3139  T
Q  269 ttcatccacaaacataccataatcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttca 368  Q
    |||| | |||| ||||| || ||| |||||||||| | |  || ||| |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  3140 ttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatggatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaagaattgttcatcaacccattttca 3239  T
Q  369 tacaaccatgagaaa 383  Q
    ||||| |||||||||    
T  3240 tacaa-catgagaaa 3253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0516 (Bit Score: 64; Significance: 7e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0516
Description:

Target: scaffold0516; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 325 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 12149 - 12086
Alignment:
Q  325 caagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaaccatgagaaatgaaa 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12149 caagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaaccatgagaaatgaaa 12086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 258 - 370
Target Start/End: Original strand, 202 - 314
Alignment:
Q  258 aaacatgtaatttcatccacaaacataccataatcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatca 357  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||||| || ||| |||||||||||| |  || ||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  202 aaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatca 301  T
Q  358 acccattttcata 370  Q
    |||||||||||||    
T  302 acccattttcata 314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 259 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 9433 - 9318
Alignment:
Q  259 aacatgtaatttcatccacaaacataccataatcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaa 358  Q
    |||||||||||||| | |||| ||||| || ||| |||||||||||| |  || ||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  9433 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaaaagcacgaatttgacatgaattgttcatcaa 9334  T
Q  359 cccattttcatacaac 374  Q
    ||||||||||||||||    
T  9333 cccattttcatacaac 9318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 259 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 16331 - 16216
Alignment:
Q  259 aacatgtaatttcatccacaaacataccataatcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaa 358  Q
    |||||||||||||| | |||| ||||| || ||| |||||||||||| |  || ||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  16331 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaaaagcacgaatttgacatgaattgttcatcaa 16232  T
Q  359 cccattttcatacaac 374  Q
    ||||||||||||||||    
T  16231 cccattttcatacaac 16216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 91 - 349
Target Start/End: Original strand, 8849 - 9106
Alignment:
Q  91 catcatcaatccataattaagtatacccaagtcataattcacccacaacaacatcagttaatagcaataaccttaatagaacatgaatcacatctcattt 190  Q
    |||||||||| ||| | || |||||||||||  || ||||| | |||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||||| ||||| |||||| ||    
T  8849 catcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaatagcaataacatcaattgaacattaatcatatctcaatt 8948  T
Q  191 taacaacaacatatcaagattcactaaatgagtataa-tttcatagcttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcatccacaaacataccata 289  Q
     ||||||||| || ||| |||||| || |||| | || ||||| | ||| |||||| |||||| ||   |||||||||||||| | |||| ||||| ||     
T  8949 caacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataatt--gaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatt 9046  T
Q  290 atcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaatt 349  Q
    ||| |||||||||||| |  || ||| ||||||||   ||||||||||||| || |||||    
T  9047 atcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagatggagcacgaatttagcaacaatt 9106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1711 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold1711
Description:

Target: scaffold1711; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 259 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 1388 - 1273
Alignment:
Q  259 aacatgtaatttcatccacaaacataccataatcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaa 358  Q
    |||||||||||||| | |||| ||||| |  | | |||||||||||| |  || ||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  1388 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaa 1289  T
Q  359 cccattttcatacaac 374  Q
    ||||||||||||||||    
T  1288 cccattttcatacaac 1273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 259 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 13409 - 13286
Alignment:
Q  259 aacatgtaatttcatccacaaacataccataatcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaa 358  Q
    |||||||||||||| | |||| ||||| || ||| |||||||||||| |  || ||| |||||||  |||||||||||| || ||| |||||||||||||    
T  13409 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacactaagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaa 13310  T
Q  359 cccattttcatacaaccatgagaaa 383  Q
    ||||||||||||||| |||||||||    
T  13309 cccattttcatacaa-catgagaaa 13286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 296 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 64570 - 64492
Alignment:
Q  296 aattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaac 374  Q
    |||||||||| |  || ||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  64570 aattcatgcatataaacataacatcacagcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaac 64492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 259 - 383
Target Start/End: Original strand, 107914 - 108037
Alignment:
Q  259 aacatgtaatttcatccacaaacataccataatcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaa 358  Q
    |||||||||||||| | |||| ||||| || ||| |||||||||||| |  || ||| ||| ||||   |||||||||||||  | ||||||||||||||    
T  107914 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagtaacaattgttcatcaa 108013  T
Q  359 cccattttcatacaaccatgagaaa 383  Q
    ||||||||||||||| |||||||||    
T  108014 cccattttcatacaa-catgagaaa 108037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0361 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0361
Description:

Target: scaffold0361; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 192 - 349
Target Start/End: Original strand, 3290 - 3447
Alignment:
Q  192 aacaacaacatatcaagattcactaaatgagtataatttcatagcttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcatccacaaacataccataat 291  Q
    ||||||||| || ||| |||||| |  |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||| | |||| ||||| |  ||    
T  3290 aacaacaacttagcaaaattcaccatttgagtacaatttcataacttgatatttatacatactttgaaatatgtaatttcaccaacaatcatacaaatat 3389  T
Q  292 cctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaatt 349  Q
    | | |||||||||| |  ||  || ||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  3390 cattaattcatgcatacaaacttaacatcacagctagagcacgaatttagcatcaatt 3447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 317 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 10778 - 10713
Alignment:
Q  317 catcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaaccatgagaaa 383  Q
    ||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10778 catcacaacaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaa-catgagaaa 10713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 317 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 21142 - 21077
Alignment:
Q  317 catcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaaccatgagaaa 383  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21142 catcacaacaagagcacgaatttagcaagaattgttcatcaacccattttcatacaa-catgagaaa 21077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 259 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 14145 - 14023
Alignment:
Q  259 aacatgtaatttcatccacaaacataccataatcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaa 358  Q
    ||||||||||||||   |||| ||||  || ||| |||||||||||| |   | ||| ||||||||||||||||||| |||| ||  |||||| ||||||    
T  14145 aacatgtaatttcactaacaatcatataattatcatcaattcatgcatacagacataacatcacagcaagagcacga-tttagcaagaattgtgcatcaa 14047  T
Q  359 cccattttcatacaaccatgagaaa 383  Q
    ||||||||||||||| |||||||||    
T  14046 cccattttcatacaa-catgagaaa 14023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 325 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 31693 - 31644
Alignment:
Q  325 caagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaac 374  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31693 caagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaactcattttcatacaac 31644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000009; HSPs: 2)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 91 - 349
Target Start/End: Original strand, 19206 - 19463
Alignment:
Q  91 catcatcaatccataattaagtatacccaagtcataattcacccacaacaacatcagttaatagcaataaccttaatagaacatgaatcacatctcattt 190  Q
    |||||||||| ||| | || | |||||||||  || ||||| | |||||||||||| |||| ||||||||| | ||| ||||| |||||| | |||| ||    
T  19206 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaattgaacaggaatcataactcaatt 19305  T
Q  191 taacaacaacatatcaagattcactaaatgagtataa-tttcatagcttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcatccacaaacataccata 289  Q
     ||||||||| || ||| |||||| || |||| | || ||||| | |||  ||||| ||||||  ||  |||||||||||||| | |||| | ||| ||     
T  19306 caacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacata--tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatt 19403  T
Q  290 atcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaatt 349  Q
    ||| |||||||||||| |  || ||| ||||||||   ||||||||||||| || |||||    
T  19404 atcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaatt 19463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 91 - 349
Target Start/End: Original strand, 21290 - 21547
Alignment:
Q  91 catcatcaatccataattaagtatacccaagtcataattcacccacaacaacatcagttaatagcaataaccttaatagaacatgaatcacatctcattt 190  Q
    |||||||||| ||| | || | |||||||||  || ||||| | |||||||||||| |||| ||||||||| | ||| ||||| |||||| | |||| ||    
T  21290 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaattgaacaggaatcataactcaatt 21389  T
Q  191 taacaacaacatatcaagattcactaaatgagtataa-tttcatagcttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcatccacaaacataccata 289  Q
     ||||||||| || ||| |||||| || |||| | || ||||| | |||  ||||| ||||||  ||  |||||||||||||| | |||| | ||| ||     
T  21390 caacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacata--tttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatt 21487  T
Q  290 atcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaatt 349  Q
    ||| |||||||||||| |  || ||| ||||||||   ||||||||||||| || |||||    
T  21488 atcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaatt 21547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 91 - 349
Target Start/End: Original strand, 41648 - 41905
Alignment:
Q  91 catcatcaatccataattaagtatacccaagtcataattcacccacaacaacatcagttaatagcaataaccttaatagaacatgaatcacatctcattt 190  Q
    |||||||||| ||| | || | |||||||||  || ||||| | |||||||||||| |||| | ||| ||| | ||| |||||||  || ||||  | ||    
T  41648 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcatttaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataatt 41747  T
Q  191 taacaacaacatatcaagattcactaaatgagtataattt-catagcttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcatccacaaacataccata 289  Q
     |||||||||||| ||| |||||| || |||  | ||||| || | ||| |||||| |||||| || ||  |||||||||||| | |||| ||||| ||     
T  41748 caacaacaacatagcaaaattcaccaattgaacacaattttcacaacttcacatttttacataattgaa--catgtaatttcaccaacaatcatacaatt 41845  T
Q  290 atcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaatt 349  Q
    ||| |||||||||||| |  || ||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  41846 atcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttaacaacaatt 41905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 113 - 349
Target Start/End: Original strand, 13528 - 13763
Alignment:
Q  113 atacccaagtcataattcacccacaacaacatcagttaatagcaataaccttaatagaacatgaatcacatctcattttaacaacaacatatcaagattc 212  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||| | ||| ||| | ||| |||||||  || ||||  | || |||||||||||| ||| ||||    
T  13528 atacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataattcaacaacaacatagcaaaattc 13627  T
Q  213 actaaatgagtataa-tttcatagcttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcatccacaaacataccataatcctcaattcatgcacaagaa 311  Q
    |  || |||| | || ||||| | ||| |||||| |||||| ||   |||||||||||||| | |||| ||||| || ||| |||||||||||| |  ||    
T  13628 atcaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataatt--gaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaa 13725  T
Q  312 aatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaatt 349  Q
     ||| ||||| ||  |||||||||||||| || |||||    
T  13726 cataacatcaaagttagagcacgaatttagcaacaatt 13763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 34724 - 34475
Alignment:
Q  91 catcatcaatccataattaagtatacccaagtcataattcacccacaacaacatcagttaatagcaataaccttaat-agaacatgaatcacatctcatt 189  Q
    |||||||||||||| | || | ||||||||||  | ||||| | ||||||||||||  ||| | ||||||| | ||| | ||||||||||| |||||| |    
T  34724 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagtagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattaaaacatgaatcatatctcaat 34625  T
Q  190 ttaacaacaacatatcaagattcactaaatgagtataattt-catagcttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcatccacaaacataccat 288  Q
    | ||||||||| || ||| ||||||  | |||| | ||||| || | ||| | |||| |||| | || ||  |||||||||||| | |||| ||||| ||    
T  34624 tcaacaacaacttagcaaaattcacctattgagaacaattttcacaacttcatatttttacacaattgaa--catgtaatttcaccaacaatcatacaat 34527  T
Q  289 aatcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaattta 340  Q
     ||| |||||||||||| |  || ||| ||||||||  ||||||||||||||    
T  34526 tatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaattta 34475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 138 times since January 2019
Visitors: 4370