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 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0718_low_4 (Length: 573)

Name: NF0718_low_4
Description: NF0718
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0718_low_4
NF0718_low_4
[»] chr3 (3 HSPs)
chr3 (1-442)||(18662847-18663288)
chr3 (1-351)||(18663139-18663489)
chr3 (1-351)||(18663340-18663690)
[»] chr4 (6 HSPs)
chr4 (1-442)||(13656367-13656808)
chr4 (1-442)||(13671013-13671454)
chr4 (1-442)||(5739065-5739506)
chr4 (1-351)||(13671305-13671655)
chr4 (1-351)||(13671506-13671856)
chr4 (1-351)||(13656659-13657009)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (6-442)||(22565-23001)
[»] chr5 (2 HSPs)
chr5 (1-442)||(18581552-18581993)
chr5 (1-351)||(18581351-18581701)
[»] chr2 (2 HSPs)
chr2 (1-442)||(37461223-37461664)
chr2 (36-351)||(37461057-37461372)
[»] chr6 (6 HSPs)
chr6 (1-442)||(12923829-12924267)
chr6 (1-351)||(12923427-12923777)
chr6 (1-351)||(12923628-12923975)
chr6 (293-431)||(8571353-8571499)
chr6 (121-382)||(19540461-19540702)
chr6 (121-180)||(19540742-19540801)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 430; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 430; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 18663288 - 18662847
Alignment:
Q  1 atccttatttacaaagcaacctacacatcatcccatatctcaaacacatacaaacttcccacctttcctctctacttcaagtccacaaatgtctactgtc 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18663288 atccctatttacaaagcaacctacacatcatcccatatctcaaacacatacaaacttcccacctttcctctctacttcaagtccacaaatgtctactgtc 18663189  T
Q  101 catgctcccacttctcaaatacctacaaatacccaacaaccccactctacaaggaaacctacacatcatcttacatctaacacaccttcaaatatccaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18663188 catgctcccacttctcaaatacctacaaatacccaacaaccccactctacaaggaaacctacacatcatcttacatctaacacaccttcaaatatccaac 18663089  T
Q  201 ttccacaacctacaaggcaactgaaacatcatcccatatctcaaacatttacaaatttcccacctttgctctctactccaagtccacaaatgtctacaat 300  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18663088 ttccacaacctacaaggcaaccgaaacatcatcccatatctcaaacatttacaaatttcccacctttcctctctactccaagtccacaaatgtctacaat 18662989  T
Q  301 tcatgctcccacctctcaaatacctacaaatatccaatctccccactctactcctagtccaccacatctttctaatacacatagaccatatgatgttgta 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18662988 tcatgctcccacctctcaaatacctacaaatatccaatctccccactctactcctagtccaccacatctttctaatacacatagaccatatgatgttgta 18662889  T
Q  401 tctggtggtgatccacatgcatcatcatcatcatgtgatgat 442  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18662888 tctggtggtgatccacatgcatcatcatcatcatgtgatgat 18662847  T

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Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 18663489 - 18663139
Alignment:
Q  1 atccttatttacaaagcaacctacacatcatcccatatctcaaacacatacaaacttcccacctttcctctctacttcaagtccacaaatgtctactgtc 100  Q
    |||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18663489 atccctatctacaaagcagcctacacatcatcccatatctcaaacacatacaaacttcccacctttcctctctacttcaagtccacaaatgtctactgtc 18663390  T
Q  101 catgctcccacttctcaaatacctacaaatacccaacaaccccactctacaaggaaacctacacatcatcttacatctaacacaccttcaaatatccaac 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18663389 catgctcccacttctcaaatacctacaaatacccaacaaccccactctacaaggaaacctacacatcatcttacatctaaaacaccttcaaatatccaac 18663290  T
Q  201 ttccacaacctacaaggcaactgaaacatcatcccatatctcaaacatttacaaatttcccacctttgctctctactccaagtccacaaatgtctacaat 300  Q
       | | |  ||||| |||||  | ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  |    
T  18663289 aatccctatttacaaagcaacctacacatcatcccatatctcaaacacatacaaacttcccacctttcctctctacttcaagtccacaaatgtctactgt 18663190  T
Q  301 tcatgctcccacctctcaaatacctacaaatatccaatctccccactctac 351  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||    
T  18663189 ccatgctcccacttctcaaatacctacaaatacccaacaaccccactctac 18663139  T

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Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 18663690 - 18663340
Alignment:
Q  1 atccttatttacaaagcaacctacacatcatcccatatctcaaacacatacaaacttcccacctttcctctctacttcaagtccacaaatgtctactgtc 100  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18663690 atccctatctacaaagcaacctacacatcatcccatatctcaaacacatactaacttcccacctttcctctctacttcaagtccacaaatgtctactgtc 18663591  T
Q  101 catgctcccacttctcaaatacctacaaatacccaacaaccccactctacaaggaaacctacacatcatcttacatctaacacaccttcaaatatccaac 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18663590 catgctcccacttctcaaatacctacaaatacccaacaaccccactctacaatgaaacctacacatcatcttacatctaaaacaccttcaaatatccaac 18663491  T
Q  201 ttccacaacctacaaggcaactgaaacatcatcccatatctcaaacatttacaaatttcccacctttgctctctactccaagtccacaaatgtctacaat 300  Q
       | | | |||||| ||| |  | ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  |    
T  18663490 aatccctatctacaaagcagcctacacatcatcccatatctcaaacacatacaaacttcccacctttcctctctacttcaagtccacaaatgtctactgt 18663391  T
Q  301 tcatgctcccacctctcaaatacctacaaatatccaatctccccactctac 351  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||    
T  18663390 ccatgctcccacttctcaaatacctacaaatacccaacaaccccactctac 18663340  T

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Target: chr4 (Bit Score: 422; Significance: 0; HSPs: 6)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 422; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 13656808 - 13656367
Alignment:
Q  1 atccttatttacaaagcaacctacacatcatcccatatctcaaacacatacaaacttcccacctttcctctctacttcaagtccacaaatgtctactgtc 100  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13656808 atccatatatacaaagcaacctacacatcatcccatatctcaaacacatacaaacttcccacctttcctctctacttcaagtccacaaatgtctactgtc 13656709  T
Q  101 catgctcccacttctcaaatacctacaaatacccaacaaccccactctacaaggaaacctacacatcatcttacatctaacacaccttcaaatatccaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13656708 catgctcccacttctcaaatacctacaaatacccaacaaccccactctacaaggaaacctacacatcatcttacatctaacacaccttcaaatatccaac 13656609  T
Q  201 ttccacaacctacaaggcaactgaaacatcatcccatatctcaaacatttacaaatttcccacctttgctctctactccaagtccacaaatgtctacaat 300  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13656608 ttccacaacctacaaggcaaaagaaacatcatcccatatctcaaacatttacaaatttcccacctttcctctctactccaagtccacaaatgtctacaat 13656509  T
Q  301 tcatgctcccacctctcaaatacctacaaatatccaatctccccactctactcctagtccaccacatctttctaatacacatagaccatatgatgttgta 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13656508 tcatgctcccacctctcaaatacctacaaatatccaatctccccactctactcctagtccaccacatctttctaatacacatagaccatatgatgttgta 13656409  T
Q  401 tctggtggtgatccacatgcatcatcatcatcatgtgatgat 442  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13656408 tctggtggtgatccacatgcatcatcatcatcatgtgatgat 13656367  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 422; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 13671454 - 13671013
Alignment:
Q  1 atccttatttacaaagcaacctacacatcatcccatatctcaaacacatacaaacttcccacctttcctctctacttcaagtccacaaatgtctactgtc 100  Q
    |||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13671454 atccctatctacaaagcagcctacacatcatcccatatctcaaacacatacaaacttcccacctttcctctctacttcaagtccacaaatgtctactgtc 13671355  T
Q  101 catgctcccacttctcaaatacctacaaatacccaacaaccccactctacaaggaaacctacacatcatcttacatctaacacaccttcaaatatccaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13671354 catgctcccacttctcaaatacctacaaatacccaacaaccccactctacaaggaaacctacacatcatcttacatctaacacaccttcaaatatccaac 13671255  T
Q  201 ttccacaacctacaaggcaactgaaacatcatcccatatctcaaacatttacaaatttcccacctttgctctctactccaagtccacaaatgtctacaat 300  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13671254 ttccacaacctacaaggcaaccgaaacatcatcccatatctcaaacatttacaaatttcccacctttcctctctactccaagtccacaaatgtctacaat 13671155  T
Q  301 tcatgctcccacctctcaaatacctacaaatatccaatctccccactctactcctagtccaccacatctttctaatacacatagaccatatgatgttgta 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13671154 tcatgctcccacctctcaaatacctacaaatatccaatctccccactctactcctagtccaccacatctttctaatacacatagaccatatgatgttgta 13671055  T
Q  401 tctggtggtgatccacatgcatcatcatcatcatgtgatgat 442  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13671054 tctggtggtgatccacatgcatcatcatcatcatgtgatgat 13671013  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 362; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 5739506 - 5739065
Alignment:
Q  1 atccttatttacaaagcaacctacacatcatcccatatctcaaacacatacaaacttcccacctttcctctctacttcaagtccacaaatgtctactgtc 100  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5739506 atccctatctacaaagcaacctacacatcatcccatatctcaaacacatacaaatttcccacctttcctctctacttcaagtccacaaatgtctactgtc 5739407  T
Q  101 catgctcccacttctcaaatacctacaaatacccaacaaccccactctacaaggaaacctacacatcatcttacatctaacacaccttcaaatatccaac 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5739406 catgctcccacttctcaaatacctacaaatacccaacaaccccactctacaatgaaacctacacatcatcttacatctaacacaccttcaaatatccaac 5739307  T
Q  201 ttccacaacctacaaggcaactgaaacatcatcccatatctcaaacatttacaaatttcccacctttgctctctactccaagtccacaaatgtctacaat 300  Q
       | | | |||||| ||| |  | |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5739306 aatcgctatctacaaagcagcctacacatcatctcatatctcaaacacatacaaatttcccacctttcctctctactccaagtccacaaatgtctacaat 5739207  T
Q  301 tcatgctcccacctctcaaatacctacaaatatccaatctccccactctactcctagtccaccacatctttctaatacacatagaccatatgatgttgta 400  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5739206 tcatactcccacctctcaaatacctacaaatatccaatctccccactctactcctagtccaccacatctttctaatacacatagaccatatgatgttgta 5739107  T
Q  401 tctggtggtgatccacatgcatcatcatcatcatgtgatgat 442  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5739106 tctggtggtgatccacatgcatcatcatcatcatgtgatgat 5739065  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 13671655 - 13671305
Alignment:
Q  1 atccttatttacaaagcaacctacacatcatcccatatctcaaacacatacaaacttcccacctttcctctctacttcaagtccacaaatgtctactgtc 100  Q
    |||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13671655 atccctatctacaaagcagcctacacatcatcccatatctcaaacacatacaaacttcccacctttcctctctacttcaagtccacaaatgtctactgtc 13671556  T
Q  101 catgctcccacttctcaaatacctacaaatacccaacaaccccactctacaaggaaacctacacatcatcttacatctaacacaccttcaaatatccaac 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13671555 catgctcccacttctcaaatacctacaaatacccaacaaccccactctacaaggaaacctacacatcatcttacatctaaaacaccttcaaatatccaac 13671456  T
Q  201 ttccacaacctacaaggcaactgaaacatcatcccatatctcaaacatttacaaatttcccacctttgctctctactccaagtccacaaatgtctacaat 300  Q
       | | | |||||| ||| |  | ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  |    
T  13671455 aatccctatctacaaagcagcctacacatcatcccatatctcaaacacatacaaacttcccacctttcctctctacttcaagtccacaaatgtctactgt 13671356  T
Q  301 tcatgctcccacctctcaaatacctacaaatatccaatctccccactctac 351  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||    
T  13671355 ccatgctcccacttctcaaatacctacaaatacccaacaaccccactctac 13671305  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 13671856 - 13671506
Alignment:
Q  1 atccttatttacaaagcaacctacacatcatcccatatctcaaacacatacaaacttcccacctttcctctctacttcaagtccacaaatgtctactgtc 100  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13671856 atccctatctacaaagcaacctacacatcatcccatatctcaaacacatactaacttcccacctttcctctctacttcaagtccacaaatgtctactgtc 13671757  T
Q  101 catgctcccacttctcaaatacctacaaatacccaacaaccccactctacaaggaaacctacacatcatcttacatctaacacaccttcaaatatccaac 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13671756 catgctcccacttctcaaatacctacaaatacccaacaaccccactctacaatgaaacctacacatcatcttacatctaaaacaccttcaaatatccaac 13671657  T
Q  201 ttccacaacctacaaggcaactgaaacatcatcccatatctcaaacatttacaaatttcccacctttgctctctactccaagtccacaaatgtctacaat 300  Q
       | | | |||||| ||| |  | ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  |    
T  13671656 aatccctatctacaaagcagcctacacatcatcccatatctcaaacacatacaaacttcccacctttcctctctacttcaagtccacaaatgtctactgt 13671557  T
Q  301 tcatgctcccacctctcaaatacctacaaatatccaatctccccactctac 351  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||    
T  13671556 ccatgctcccacttctcaaatacctacaaatacccaacaaccccactctac 13671506  T

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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 13657009 - 13656659
Alignment:
Q  1 atccttatttacaaagcaacctacacatcatcccatatctcaaacacatacaaacttcccacctttcctctctacttcaagtccacaaatgtctactgtc 100  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13657009 atccctatctacaaagcaacctacacatcatcccatatctcaaacacatactaacttcccacctttcctctctacttcaagtccacaaatgtctactgtc 13656910  T
Q  101 catgctcccacttctcaaatacctacaaatacccaacaaccccactctacaaggaaacctacacatcatcttacatctaacacaccttcaaatatccaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13656909 catgctcccacttctcaaatacctacaaatatccaacaaccccactctacaatgaaacctacacatcatcttacatctaaaacaccttcaaatatccaac 13656810  T
Q  201 -ttccacaacctacaaggcaactgaaacatcatcccatatctcaaacatttacaaatttcccacctttgctctctactccaagtccacaaatgtctacaa 299  Q
      ||||  |  ||||| |||||  | ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||      
T  13656809 aatcca-tatatacaaagcaacctacacatcatcccatatctcaaacacatacaaacttcccacctttcctctctacttcaagtccacaaatgtctactg 13656711  T
Q  300 ttcatgctcccacctctcaaatacctacaaatatccaatctccccactctac 351  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||    
T  13656710 tccatgctcccacttctcaaatacctacaaatacccaacaaccccactctac 13656659  T

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Target: scaffold0014 (Bit Score: 421; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 421; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 442
Target Start/End: Original strand, 22565 - 23001
Alignment:
Q  6 tatttacaaagcaacctacacatcatcccatatctcaaacacatacaaacttcccacctttcctctctacttcaagtccacaaatgtctactgtccatgc 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22565 tatttacaaagcaacctacacatcatcccatatctcaaacacatactaacttcccacctttcctctctacttcaagtccacaaatgtctactttccatgc 22664  T
Q  106 tcccacttctcaaatacctacaaatacccaacaaccccactctacaaggaaacctacacatcatcttacatctaacacaccttcaaatatccaacttcca 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22665 tcccacttctcaaatacctacaaatacccaacaaccccactctacaaggaaacctacacatcatcttacatctaacacaccttcaaatatccaatttcca 22764  T
Q  206 caacctacaaggcaactgaaacatcatcccatatctcaaacatttacaaatttcccacctttgctctctactccaagtccacaaatgtctacaattcatg 305  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22765 caacctacaaggcaaccgaaacatcatcccatatctcaaacatttacaaatttcccacctttgctctctactccaagtccacaaatgtctacaattcatg 22864  T
Q  306 ctcccacctctcaaatacctacaaatatccaatctccccactctactcctagtccaccacatctttctaatacacatagaccatatgatgttgtatctgg 405  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22865 ctcccacctctcaaatacctacaaatatccaatctccccactctactcctagtccaccacatctttctaatacacatagaccatatgatgttgtatctgg 22964  T
Q  406 tggtgatccacatgcatcatcatcatcatgtgatgat 442  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22965 tggtgatccacatgcatcatcatcatcatgtgatgat 23001  T

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Target: chr5 (Bit Score: 414; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 414; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 442
Target Start/End: Original strand, 18581552 - 18581993
Alignment:
Q  1 atccttatttacaaagcaacctacacatcatcccatatctcaaacacatacaaacttcccacctttcctctctacttcaagtccacaaatgtctactgtc 100  Q
    |||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18581552 atccctatctacaaagcagcctacacatcatcccatatctcaaacacatacaaacttcccacctttcctctctacttcaagtccacaaatgtctactgtc 18581651  T
Q  101 catgctcccacttctcaaatacctacaaatacccaacaaccccactctacaaggaaacctacacatcatcttacatctaacacaccttcaaatatccaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18581652 catgctcccacttctcaaatacctacaaatacccaacaaccccactctacaaggaaacctacacatcatcttacatctaacacaccttcaaatatccaac 18581751  T
Q  201 ttccacaacctacaaggcaactgaaacatcatcccatatctcaaacatttacaaatttcccacctttgctctctactccaagtccacaaatgtctacaat 300  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18581752 ttccacaacctacaaggcaatcgaaacatcatcccatatctcaaacatttacaaatttcccacctttcctctctactccaagtccacaaatgtctacaat 18581851  T
Q  301 tcatgctcccacctctcaaatacctacaaatatccaatctccccactctactcctagtccaccacatctttctaatacacatagaccatatgatgttgta 400  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18581852 tcatgctctcacctctcaaatacctacaaatatccaatctccccactctactcctagtccaccacatctttctaatacacatagaccatatgatgttgta 18581951  T
Q  401 tctggtggtgatccacatgcatcatcatcatcatgtgatgat 442  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18581952 tctggtggtgatccacatgcatcatcatcatcatgtgatgat 18581993  T

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Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 351
Target Start/End: Original strand, 18581351 - 18581701
Alignment:
Q  1 atccttatttacaaagcaacctacacatcatcccatatctcaaacacatacaaacttcccacctttcctctctacttcaagtccacaaatgtctactgtc 100  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18581351 atccctatctacaaagcaacctacacatcatcccatatctcaaacacatactaacttcccacctttcctctctacttcaagtccacaaatgtctactgtc 18581450  T
Q  101 catgctcccacttctcaaatacctacaaatacccaacaaccccactctacaaggaaacctacacatcatcttacatctaacacaccttcaaatatccaac 200  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18581451 catgctcccatttctcaaatacctacaaatacccaacaaccccgctctacaatgaaacctacacatcatcttacatctaaaacaccttcaaatatccaac 18581550  T
Q  201 ttccacaacctacaaggcaactgaaacatcatcccatatctcaaacatttacaaatttcccacctttgctctctactccaagtccacaaatgtctacaat 300  Q
       | | | |||||| ||| |  | ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  |    
T  18581551 aatccctatctacaaagcagcctacacatcatcccatatctcaaacacatacaaacttcccacctttcctctctacttcaagtccacaaatgtctactgt 18581650  T
Q  301 tcatgctcccacctctcaaatacctacaaatatccaatctccccactctac 351  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||    
T  18581651 ccatgctcccacttctcaaatacctacaaatacccaacaaccccactctac 18581701  T

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Target: chr2 (Bit Score: 414; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 414; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 442
Target Start/End: Original strand, 37461223 - 37461664
Alignment:
Q  1 atccttatttacaaagcaacctacacatcatcccatatctcaaacacatacaaacttcccacctttcctctctacttcaagtccacaaatgtctactgtc 100  Q
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T  37461223 atccttatttacaaagcatcctacacatcatcccatatctcaaacacatacaaacttcccacctttcctctctacttcaagtccacaaatgtctactttc 37461322  T
Q  101 catgctcccacttctcaaatacctacaaatacccaacaaccccactctacaaggaaacctacacatcatcttacatctaacacaccttcaaatatccaac 200  Q
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T  37461323 catgctcccacttctcaaatacctacaaatacccaacaaccccactctacaaggaaacctacacatcatcttacatctaacacaccttcaaatatccaat 37461422  T
Q  201 ttccacaacctacaaggcaactgaaacatcatcccatatctcaaacatttacaaatttcccacctttgctctctactccaagtccacaaatgtctacaat 300  Q
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T  37461423 ttccacaacctacaaggcaactgaaacatcatcccatatctcaaacatttacaaatttcccacctttcctctctactccaagtccacaaatgtctacaat 37461522  T
Q  301 tcatgctcccacctctcaaatacctacaaatatccaatctccccactctactcctagtccaccacatctttctaatacacatagaccatatgatgttgta 400  Q
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T  37461523 tcatgctcccacctctcaaatacctacaaatatccaatctccccactctactcctagtccaccacatctttctaatacacatagaccatatgatgttgta 37461622  T
Q  401 tctggtggtgatccacatgcatcatcatcatcatgtgatgat 442  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  37461623 tcttgtggtgatccacatgtatcatcatcattatgtgatgat 37461664  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 36 - 351
Target Start/End: Original strand, 37461057 - 37461372
Alignment:
Q  36 tatctcaaacacatacaaacttcccacctttcctctctacttcaagtccacaaatgtctactgtccatgctcccacttctcaaatacctacaaataccca 135  Q
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T  37461057 tatctcaaacacatactaacttcccacctttcctctctacttcaagtccacaaatgtctaatgtccatgctcccacttctcaaatacctacaaataccca 37461156  T
Q  136 acaaccccactctacaaggaaacctacacatcatcttacatctaacacaccttcaaatatccaacttccacaacctacaaggcaactgaaacatcatccc 235  Q
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T  37461157 acaaccccactctacaatgaaacctacacatcatcttacatctaaaacaccttcaaatatccaacaatccttatttacaaagcatcctacacatcatccc 37461256  T
Q  236 atatctcaaacatttacaaatttcccacctttgctctctactccaagtccacaaatgtctacaattcatgctcccacctctcaaatacctacaaatatcc 335  Q
    ||||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  37461257 atatctcaaacacatacaaacttcccacctttcctctctacttcaagtccacaaatgtctactttccatgctcccacttctcaaatacctacaaataccc 37461356  T
Q  336 aatctccccactctac 351  Q
    ||   |||||||||||    
T  37461357 aacaaccccactctac 37461372  T

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Target: chr6 (Bit Score: 404; Significance: 0; HSPs: 6)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 404; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 442
Target Start/End: Original strand, 12923829 - 12924267
Alignment:
Q  1 atccttatttacaaagcaacctacacatcatcccatatctcaaacacatacaaacttcccacctttcctctctacttcaagtccacaaatgtctactgtc 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12923829 atccctatttacaaagcaacctacacatcatccc---tctcaaaaaaatacaaacttcccacctttcctctctacttcaagtccacaaatgtctactgtc 12923925  T
Q  101 catgctcccacttctcaaatacctacaaatacccaacaaccccactctacaaggaaacctacacatcatcttacatctaacacaccttcaaatatccaac 200  Q
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T  12923926 catgctcccacttctcaaatacctacaaatacccaacaaccccactctacaaggaaacctacacatcatcttacatctaacacaccttcaaatatccaac 12924025  T
Q  201 ttccacaacctacaaggcaactgaaacatcatcccatatctcaaacatttacaaatttcccacctttgctctctactccaagtccacaaatgtctacaat 300  Q
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T  12924026 ttccacaacctacaaggcaactgaaacatcatcccatatctcaaacatttacaaatttcccacctttcctctctactccaagtccacaaatgtctacaat 12924125  T
Q  301 tcatgctcccacctctcaaatacctacaaatatccaatctccccactctactcctagtccaccacatctttctaatacacatagaccatatgatgttgta 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12924126 tcatgctcccacctctcaaatacctacatatatccaatctccccactctactcctagtccaccacatctttctaatacacatagaccatatgatgttgta 12924225  T
Q  401 tctggtggtgatccacatgcatcatcatcatcatgtgatgat 442  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12924226 tctggtggtgatccacatgcatcatcatcattatgtgatgat 12924267  T

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Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 351
Target Start/End: Original strand, 12923427 - 12923777
Alignment:
Q  1 atccttatttacaaagcaacctacacatcatcccatatctcaaacacatacaaacttcccacctttcctctctacttcaagtccacaaatgtctactgtc 100  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12923427 atccctatctacaaagcaacctacacatcatcccatatctcaaacacatactaacttcccacctttcctctctacttcaagtccacaaatgtctactatc 12923526  T
Q  101 catgctcccacttctcaaatacctacaaatacccaacaaccccactctacaaggaaacctacacatcatcttacatctaacacaccttcaaatatccaac 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12923527 catgctcccacttctcaaatacctacaaatacccaacaaccccactctacaatgaaacctacacatcatcttacatctaaaacaccttcaaatatccaac 12923626  T
Q  201 ttccacaacctacaaggcaactgaaacatcatcccatatctcaaacatttacaaatttcccacctttgctctctactccaagtccacaaatgtctacaat 300  Q
       | | | |||||| ||| |  | ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  |    
T  12923627 aatccctatctacaaagcagcctacacatcatcccatatctcaaacacatacaaacttcccacctttcctctctacttcaagtccacaaatgtctactgt 12923726  T
Q  301 tcatgctcccacctctcaaatacctacaaatatccaatctccccactctac 351  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||    
T  12923727 ccatgctcccacttctcaaatacctacaaatacccaacaaccccactctac 12923777  T

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Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 351
Target Start/End: Original strand, 12923628 - 12923975
Alignment:
Q  1 atccttatttacaaagcaacctacacatcatcccatatctcaaacacatacaaacttcccacctttcctctctacttcaagtccacaaatgtctactgtc 100  Q
    |||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12923628 atccctatctacaaagcagcctacacatcatcccatatctcaaacacatacaaacttcccacctttcctctctacttcaagtccacaaatgtctactgtc 12923727  T
Q  101 catgctcccacttctcaaatacctacaaatacccaacaaccccactctacaaggaaacctacacatcatcttacatctaacacaccttcaaatatccaac 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12923728 catgctcccacttctcaaatacctacaaatacccaacaaccccactctacaaggaaacctacacatcatcttacatctaaaacaccttcaaatatccaac 12923827  T
Q  201 ttccacaacctacaaggcaactgaaacatcatcccatatctcaaacatttacaaatttcccacctttgctctctactccaagtccacaaatgtctacaat 300  Q
       | | |  ||||| |||||  | ||||||||||   ||||||| |  |||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  |    
T  12923828 aatccctatttacaaagcaacctacacatcatccc---tctcaaaaaaatacaaacttcccacctttcctctctacttcaagtccacaaatgtctactgt 12923924  T
Q  301 tcatgctcccacctctcaaatacctacaaatatccaatctccccactctac 351  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||    
T  12923925 ccatgctcccacttctcaaatacctacaaatacccaacaaccccactctac 12923975  T

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Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 293 - 431
Target Start/End: Original strand, 8571353 - 8571499
Alignment:
Q  293 tctacaattcatgctcccacctctcaaatacctacaaatatccaatctccccactctactcctagtccaccacatctttctaatacacatag-------- 384  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||            
T  8571353 tctacaattcatgctcc-acttctcaaatacctacaaatatccaatctccccactctactccaagt---ccacatctttctaatacacatagcctgccac 8571448  T
Q  385 ----accatatgatgttgtatctggtggtgatccacatgcatcatcatcat 431  Q
        ||||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  8571449 atttaccatctgatgttatatctggtggtgattaacatgcatcatcatcat 8571499  T

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Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 121 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 19540702 - 19540461
Alignment:
Q  121 acctacaaatacccaacaaccccactctacaaggaaacctacacatcatcttacatctaacacaccttcaaatatccaacttccacaacctacaaggcaa 220  Q
    ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||| | |||| ||| |   |||||          
T  19540702 acctacaaatatc-aacaacaccactctacaaggaaatctacacatcatcttacatctaaaataccttcaaattttcaacctccgc---ctaca------ 19540613  T
Q  221 ctgaaacatcatcccatatctcaaacatttacaaatttcccacctttgctctctactccaagtccacaaatgtctacaattcatgctcccacctctcaaa 320  Q
          || |||| | |||||||||||  ||||| |||   |||||| | || ||||||||||| |||||| ||||| |||||| |||| |  ||| |||    
T  19540612 ------caccatctcgtatctcaaacaactacaactttataacctttccactttactccaagtcgacaaatttctactattcatactcc-atttctgaaa 19540520  T
Q  321 tacctacaaatatccaatctccccactctactcctagtccaccacatctttctaatacacat 382  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||   |||||||||||||||||||||    
T  19540519 tacctacaaatatccaatctccccactatactccaagt---ccacatctttctaatacacat 19540461  T

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Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 121 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 19540801 - 19540742
Alignment:
Q  121 acctacaaatacccaacaaccccactctacaaggaaacctacacatcatcttacatctaa 180  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||    
T  19540801 acctacaaatacccaacaaccccactctacaaggcaacctacatatcatctcacatctaa 19540742  T

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