View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0718_low_54 (Length: 277)

Name: NF0718_low_54
Description: NF0718
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0718_low_54
NF0718_low_54
[»] chr6 (19 HSPs)
chr6 (1-256)||(16376373-16376629)
chr6 (1-256)||(16383697-16383953)
chr6 (1-256)||(10488699-10488955)
chr6 (1-256)||(16556139-16556395)
chr6 (1-256)||(16632695-16632951)
chr6 (1-256)||(22225738-22225994)
chr6 (1-256)||(1556005-1556261)
chr6 (8-256)||(19610018-19610267)
chr6 (1-176)||(16231972-16232148)
chr6 (1-176)||(18086823-18086999)
chr6 (1-176)||(13620794-13620970)
chr6 (8-176)||(23977849-23978018)
chr6 (1-119)||(19299375-19299493)
chr6 (169-256)||(33314387-33314474)
chr6 (1-83)||(22251566-22251648)
chr6 (1-187)||(29665942-29666129)
chr6 (9-137)||(29869784-29869911)
chr6 (74-138)||(27740957-27741021)
chr6 (8-120)||(14626133-14626243)
[»] chr3 (16 HSPs)
chr3 (1-256)||(1467739-1467995)
chr3 (1-256)||(49232436-49232692)
chr3 (1-256)||(25058739-25058995)
chr3 (8-256)||(12902097-12902346)
chr3 (1-252)||(5228317-5228569)
chr3 (1-212)||(15468340-15468552)
chr3 (1-212)||(22275253-22275465)
chr3 (1-256)||(12264792-12265049)
chr3 (1-176)||(18911073-18911249)
chr3 (1-159)||(12811938-12812097)
chr3 (5-256)||(44228985-44229237)
chr3 (1-182)||(54651531-54651713)
chr3 (140-256)||(18897139-18897255)
chr3 (1-87)||(18897044-18897130)
chr3 (1-127)||(11986174-11986300)
chr3 (47-174)||(17912536-17912662)
[»] chr2 (18 HSPs)
chr2 (1-256)||(11231338-11231594)
chr2 (1-256)||(22513185-22513441)
chr2 (1-256)||(28775807-28776063)
chr2 (1-256)||(24685781-24686037)
chr2 (1-256)||(12728392-12728648)
chr2 (1-256)||(34824475-34824731)
chr2 (1-256)||(16935593-16935849)
chr2 (1-256)||(17006253-17006509)
chr2 (8-256)||(23778052-23778301)
chr2 (1-176)||(12635868-12636044)
chr2 (1-176)||(8943926-8944102)
chr2 (1-176)||(42177969-42178145)
chr2 (8-176)||(3798610-3798779)
chr2 (8-176)||(12641649-12641818)
chr2 (5-256)||(21141895-21142147)
chr2 (9-137)||(23774257-23774384)
chr2 (47-137)||(5888675-5888765)
chr2 (8-89)||(7507859-7507940)
[»] scaffold0107 (2 HSPs)
scaffold0107 (1-256)||(31309-31565)
scaffold0107 (1-256)||(39646-39902)
[»] scaffold0076 (2 HSPs)
scaffold0076 (1-256)||(39103-39359)
scaffold0076 (9-119)||(43137-43245)
[»] chr8 (13 HSPs)
chr8 (1-256)||(271360-271616)
chr8 (1-256)||(644304-644560)
chr8 (1-256)||(830039-830295)
chr8 (1-256)||(22088794-22089050)
chr8 (1-256)||(15319159-15319415)
chr8 (1-256)||(15499528-15499784)
chr8 (1-256)||(22006258-22006514)
chr8 (1-256)||(13662265-13662521)
chr8 (1-176)||(13720928-13721104)
chr8 (1-256)||(16195230-16195487)
chr8 (8-176)||(16873058-16873227)
chr8 (9-119)||(21844576-21844684)
chr8 (9-119)||(21851969-21852077)
[»] chr7 (17 HSPs)
chr7 (1-256)||(7822728-7822984)
chr7 (1-256)||(7830039-7830295)
chr7 (1-256)||(27101637-27101893)
chr7 (1-256)||(27108985-27109241)
chr7 (1-256)||(27176433-27176689)
chr7 (1-256)||(38783729-38783985)
chr7 (1-256)||(15950791-15951047)
chr7 (8-256)||(15760121-15760370)
chr7 (1-176)||(18980021-18980197)
chr7 (1-176)||(14250898-14251074)
chr7 (1-176)||(15927648-15927824)
chr7 (8-176)||(13758450-13758619)
chr7 (8-124)||(48622673-48622788)
chr7 (47-137)||(10000415-10000505)
chr7 (1-138)||(13321134-13321271)
chr7 (47-137)||(16418618-16418708)
chr7 (9-119)||(13572816-13572924)
[»] chr5 (23 HSPs)
chr5 (1-256)||(35582036-35582292)
chr5 (1-256)||(21932381-21932637)
chr5 (1-256)||(21938551-21938807)
chr5 (1-256)||(22883084-22883340)
chr5 (1-256)||(36989770-36990026)
chr5 (1-256)||(1219520-1219776)
chr5 (8-256)||(7425324-7425573)
chr5 (1-212)||(17471588-17471800)
chr5 (1-176)||(10777970-10778146)
chr5 (1-256)||(35791098-35791355)
chr5 (1-176)||(23514641-23514817)
chr5 (8-256)||(11212072-11212321)
chr5 (1-232)||(32950717-32950950)
chr5 (9-137)||(23328678-23328805)
chr5 (9-137)||(24616282-24616409)
chr5 (9-137)||(24712658-24712785)
chr5 (9-137)||(24745676-24745803)
chr5 (209-256)||(23328558-23328605)
chr5 (9-119)||(27009981-27010089)
chr5 (209-254)||(24616165-24616210)
chr5 (209-254)||(24712541-24712586)
chr5 (209-254)||(24745559-24745604)
chr5 (5-89)||(43443395-43443479)
[»] chr1 (10 HSPs)
chr1 (1-256)||(17004638-17004894)
chr1 (1-256)||(18059758-18060014)
chr1 (1-256)||(38055091-38055347)
chr1 (1-251)||(46523394-46523645)
chr1 (8-176)||(17148647-17148816)
chr1 (1-119)||(19962499-19962617)
chr1 (9-137)||(7640942-7641069)
chr1 (9-137)||(22035568-22035695)
chr1 (8-120)||(22227947-22228057)
chr1 (8-120)||(22232644-22232754)
[»] scaffold0213 (1 HSPs)
scaffold0213 (1-256)||(29162-29418)
[»] scaffold0023 (1 HSPs)
scaffold0023 (1-256)||(154007-154263)
[»] chr4 (16 HSPs)
chr4 (1-256)||(18168970-18169226)
chr4 (8-256)||(19020486-19020735)
chr4 (8-256)||(15287252-15287501)
chr4 (8-256)||(15294361-15294610)
chr4 (1-176)||(7132065-7132241)
chr4 (5-256)||(17145661-17145913)
chr4 (8-176)||(20000803-20000972)
chr4 (5-256)||(18248218-18248470)
chr4 (5-136)||(22738390-22738521)
chr4 (41-256)||(8374508-8374724)
chr4 (9-137)||(26339140-26339267)
chr4 (47-122)||(22352109-22352184)
chr4 (24-138)||(40885585-40885698)
chr4 (1-43)||(8378365-8378407)
chr4 (9-118)||(10644360-10644467)
chr4 (215-256)||(22738269-22738310)
[»] scaffold1666 (1 HSPs)
scaffold1666 (8-256)||(3-252)
[»] scaffold0467 (1 HSPs)
scaffold0467 (1-256)||(10339-10595)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (1-256)||(1575-1831)
[»] scaffold0383 (1 HSPs)
scaffold0383 (1-256)||(2392-2648)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (1-256)||(34158-34414)
[»] scaffold1500 (1 HSPs)
scaffold1500 (1-176)||(1514-1690)
[»] scaffold0191 (1 HSPs)
scaffold0191 (8-256)||(7463-7712)
[»] scaffold0066 (2 HSPs)
scaffold0066 (1-256)||(54416-54672)
scaffold0066 (1-205)||(45081-45286)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (8-124)||(54008-54123)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (1-187)||(56107-56294)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (4-120)||(5215-5329)
[»] scaffold0892 (1 HSPs)
scaffold0892 (8-124)||(3547-3662)
[»] scaffold0183 (2 HSPs)
scaffold0183 (9-137)||(6718-6845)
scaffold0183 (209-256)||(6598-6645)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (47-137)||(7330-7420)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (8-89)||(3890-3971)
[»] scaffold0155 (1 HSPs)
scaffold0155 (50-137)||(23797-23884)
[»] scaffold0361 (1 HSPs)
scaffold0361 (8-122)||(3324-3438)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (9-90)||(202-283)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (1-89)||(41815-41903)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (8-89)||(3130-3211)
[»] scaffold0215 (2 HSPs)
scaffold0215 (9-89)||(9353-9433)
scaffold0215 (9-89)||(16251-16331)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 233; Significance: 1e-129; HSPs: 19)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 16376373 - 16376629
Alignment:
Q  1 ttgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16376373 ttgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 16376472  T
Q  101 ctaaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaa 199  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16376473 ataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaa 16376572  T
Q  200 ctgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatagttaattgtggattgatgatg 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16376573 ctgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 16376629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 16383697 - 16383953
Alignment:
Q  1 ttgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16383697 ttgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 16383796  T
Q  101 ctaaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaa 199  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16383797 ataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaa 16383896  T
Q  200 ctgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatagttaattgtggattgatgatg 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16383897 ctgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 16383953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 10488955 - 10488699
Alignment:
Q  1 ttgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10488955 ttgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 10488856  T
Q  101 ctaaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaa 199  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10488855 ataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaa 10488756  T
Q  200 ctgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatagttaattgtggattgatgatg 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10488755 ctgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 10488699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 16556139 - 16556395
Alignment:
Q  1 ttgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16556139 ttgttgttaaattcgtgctcctgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 16556238  T
Q  101 ctaaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaa 199  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16556239 ataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaa 16556338  T
Q  200 ctgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatagttaattgtggattgatgatg 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16556339 ctgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 16556395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 16632695 - 16632951
Alignment:
Q  1 ttgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16632695 ttgttgttaaattcgtgctcctgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 16632794  T
Q  101 ctaaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaa 199  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16632795 ataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaa 16632894  T
Q  200 ctgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatagttaattgtggattgatgatg 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16632895 ctgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 16632951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 22225738 - 22225994
Alignment:
Q  1 ttgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22225738 ttgttgttaaattcgtgctctttctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 22225837  T
Q  101 ctaaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaa 199  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22225838 ataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgaaatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaa 22225937  T
Q  200 ctgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatagttaattgtggattgatgatg 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22225938 ctgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 22225994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 1556261 - 1556005
Alignment:
Q  1 ttgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1556261 ttgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 1556162  T
Q  101 ctaaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaa 199  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  1556161 ataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttaattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgttattgttaa 1556062  T
Q  200 ctgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatagttaattgtggattgatgatg 256  Q
    |||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1556061 ctgatgttattgtgagtgaattatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 1556005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 8 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 19610267 - 19610018
Alignment:
Q  8 taaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatg 107  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19610267 taaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaatcgatggttatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatg 19610168  T
Q  108 ttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgc 206  Q
    ||||||||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  19610167 ttaagttataaaattatacttcattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtagttcatattccattgatgttgttattgttaactgatgc 19610068  T
Q  207 tattgtaagtgaattatgatttgggtatagttaattgtggattgatgatg 256  Q
    | |||| ||||||| |||| ||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  19610067 tgttgtgagtgaatcatgacttgggtatacttaattatggattgatgatg 19610018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 16232148 - 16231972
Alignment:
Q  1 ttgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16232148 ttgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 16232049  T
Q  101 ctaaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatat 176  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  16232048 ataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatat 16231972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 18086823 - 18086999
Alignment:
Q  1 ttgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 100  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18086823 ttgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 18086922  T
Q  101 ctaaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatat 176  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  18086923 ataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatat 18086999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 13620794 - 13620970
Alignment:
Q  1 ttgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 100  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13620794 ttgttgctaaattcgtgctcttgttgtaatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattgcatgtttcaaagtatgt 13620893  T
Q  101 ctaaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatat 176  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  13620894 ataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatat 13620970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 8 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 23978018 - 23977849
Alignment:
Q  8 taaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatg 107  Q
    |||||||||||||||| |||  || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23978018 taaattcgtgctcttgttgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatg 23977919  T
Q  108 ttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatat 176  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  23977918 ttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttggttgaaatgagatgtaaatcatat 23977849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 19299493 - 19299375
Alignment:
Q  1 ttgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19299493 ttgttgttaaattcgtgctcttgctgtaatgctattttcttgtgtttgaattgatgattatggtatgtttatgggtggaattacatgtttcaaagtatgt 19299394  T
Q  101 ctaaatgttaagttatgaa 119  Q
     ||||||||||||||||||    
T  19299393 ataaatgttaagttatgaa 19299375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 169 - 256
Target Start/End: Original strand, 33314387 - 33314474
Alignment:
Q  169 attcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatagttaattgtggattgatgatg 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33314387 attcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 33314474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 83
Target Start/End: Original strand, 22251566 - 22251648
Alignment:
Q  1 ttgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaatta 83  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22251566 ttgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaatta 22251648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 29666129 - 29665942
Alignment:
Q  1 ttgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| ||  |||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||     
T  29666129 ttgttgttaaattcgtgctctagctgtgatgttattttcttatgtatgaattgatgataattgtatgattgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgc 29666030  T
Q  101 ctaaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaa-attgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgt 187  Q
     ||||||| ||||||||||||| | || ||||| ||||  ||| || ||| |  |||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||    
T  29666029 ataaatgtcaagttatgaaattgtactcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaaatgagatatgattcatgttcaattgatgt 29665942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 9 - 137
Target Start/End: Original strand, 29869784 - 29869911
Alignment:
Q  9 aaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgt 108  Q
    ||||||||||||||| | || |||| ||| ||| | | |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||| ||| |||    
T  29869784 aaattcgtgctcttgttatgttgctgttt-cttatacatgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataagtgt 29869882  T
Q  109 taagttatgaaattatgcttaattgatga 137  Q
     ||||| ||||||| ||| ||||| ||||    
T  29869883 caagttgtgaaattttgcctaattaatga 29869911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 74 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 27741021 - 27740957
Alignment:
Q  74 ggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaa 138  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||||    
T  27741021 ggtgaaattacatgtttcgaagtatgtataaatgtcaagttatgaaattgtgctcaattggtgaa 27740957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 8 - 120
Target Start/End: Original strand, 14626133 - 14626243
Alignment:
Q  8 taaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatg 107  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||| |||||| |||||  |||||    
T  14626133 taaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatg 14626230  T
Q  108 ttaagttatgaaa 120  Q
     ||||||||||||    
T  14626231 ataagttatgaaa 14626243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 233; Significance: 1e-129; HSPs: 16)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 1467739 - 1467995
Alignment:
Q  1 ttgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1467739 ttgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 1467838  T
Q  101 ctaaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaa 199  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1467839 ataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaa 1467938  T
Q  200 ctgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatagttaattgtggattgatgatg 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1467939 ctgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 1467995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 49232692 - 49232436
Alignment:
Q  1 ttgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  49232692 ttgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 49232593  T
Q  101 ctaaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaa 199  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  49232592 ataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgatgtggttattgttaa 49232493  T
Q  200 ctgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatagttaattgtggattgatgatg 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  49232492 ctgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 49232436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 25058995 - 25058739
Alignment:
Q  1 ttgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25058995 ttgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 25058896  T
Q  101 ctaaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaa 199  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  25058895 ataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgttattgttaa 25058796  T
Q  200 ctgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatagttaattgtggattgatgatg 256  Q
    || |||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  25058795 cttatgctattgtgagtgaatcatgatttgagtatacttaattgtgaattgatgatg 25058739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 8 - 256
Target Start/End: Original strand, 12902097 - 12902346
Alignment:
Q  8 taaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatg 107  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12902097 taaattcgtgctcttgctgtgatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatg 12902196  T
Q  108 ttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgc 206  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||| |    
T  12902197 ttaagttatgaaattatacttaattgattaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgttattattaactgatac 12902296  T
Q  207 tattgtaagtgaattatgatttgggtatagttaattgtggattgatgatg 256  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||    
T  12902297 tattgtgagtgaatcatgatttggatatacttaattgtggattaatgatg 12902346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 5228569 - 5228317
Alignment:
Q  1 ttgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5228569 ttgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatttccttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaaatatgt 5228470  T
Q  101 ctaaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaa 199  Q
     ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  5228469 ataaatgttaagttatgagattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgaggtgtaattcatattccattgatgttgttattgttaa 5228370  T
Q  200 ctgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatagttaattgtggattgat 252  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  5228369 ctgatgctattgtgagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtgaattgat 5228317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 15468340 - 15468552
Alignment:
Q  1 ttgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15468340 ttgttgctaaattcgtgctcttgctatgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 15468439  T
Q  101 ctaaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaa 199  Q
     |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  15468440 ataaatgttaagtcatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgttattgttaa 15468539  T
Q  200 ctgatgctattgt 212  Q
    |||||| ||||||    
T  15468540 ctgatgttattgt 15468552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 22275465 - 22275253
Alignment:
Q  1 ttgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22275465 ttgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgccattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 22275366  T
Q  101 ctaaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaa 199  Q
     |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  22275365 ataaatgttaagtcatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgttattgttaa 22275266  T
Q  200 ctgatgctattgt 212  Q
    |||||| ||||||    
T  22275265 ctgatgttattgt 22275253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 12264792 - 12265049
Alignment:
Q  1 ttgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12264792 ttgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 12264891  T
Q  101 ctaaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa--ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgtta 198  Q
     ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||  | |||    
T  12264892 ataaatgttaagttatgagattatacttaattgatgaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccattgatgttgttgctatta 12264991  T
Q  199 actgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatagttaattgtggattgatgatg 256  Q
    ||||||| | ||||  ||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||    
T  12264992 actgatgttgttgtgggtgaattatgacttgggtatacataattatggattgatgatg 12265049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 18911249 - 18911073
Alignment:
Q  1 ttgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 100  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18911249 ttgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 18911150  T
Q  101 ctaaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatat 176  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  18911149 ataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatat 18911073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 12812097 - 12811938
Alignment:
Q  1 ttgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12812097 ttgttgttaaattcgtgctcttgctgtaatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtggaattacatgtttcaaagtatgt 12811998  T
Q  101 ctaaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaa 159  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12811997 ataaatgttaagttatgaatttatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaa 12811938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 5 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 44229237 - 44228985
Alignment:
Q  5 tgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaa 104  Q
    |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  44229237 tgttaaatccgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatgtttcaaagtatgtataa 44229138  T
Q  105 atgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaa-attgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactga 203  Q
    |||| ||| ||||||||||| || ||||  ||||  |||||||||| |  || |||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||  | ||||||||    
T  44229137 atgtcaagctatgaaattatactcaattagtgaatcttgatatgttgttgttaaaatgagatgtgattcatgttccattaaggttattgctattaactga 44229038  T
Q  204 tgctattgtaagtgaattatgatttgggtatagttaattgtggattgatgatg 256  Q
    || | ||||  ||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||    
T  44229037 tgttgttgtgggtgaattatgacttgggtatacataattatggattgatgatg 44228985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 54651713 - 54651531
Alignment:
Q  1 ttgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| || || |||||||| |||||| ||||||||||    
T  54651713 ttgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgtgagtgaaattgcatgttgcaaagtatgt 54651614  T
Q  101 ctaaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaa-attgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccatt 182  Q
     ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||  |||||||||| |  |||||||||||||| |||||| |||||||    
T  54651613 ataaatgttaagttatgaaattatactcaattggtgaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtaattcatgttccatt 54651531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 140 - 256
Target Start/End: Original strand, 18897139 - 18897255
Alignment:
Q  140 ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatagtta 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||    
T  18897139 ttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgttattgttaactgatgctattgtgagtgaatcatgatttgggtatactta 18897238  T
Q  240 attgtggattgatgatg 256  Q
    |||||||||||||||||    
T  18897239 attgtggattgatgatg 18897255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 87
Target Start/End: Original strand, 18897044 - 18897130
Alignment:
Q  1 ttgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatg 87  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  18897044 ttgttgataaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtggaattacatg 18897130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 127
Target Start/End: Original strand, 11986174 - 11986300
Alignment:
Q  1 ttgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||| ||||| ||| || ||||| || ||||| || ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  11986174 ttgttgttaaattcgtgctctaactgtgatgttattttcgtgtgcatgatttaatgataattgtatgattgtggttgaaattacatgttttaaagtatgt 11986273  T
Q  101 ctaaatgttaagttatgaaattatgct 127  Q
     | ||||| ||||||||||||| ||||    
T  11986274 attaatgtcaagttatgaaattgtgct 11986300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 47 - 174
Target Start/End: Original strand, 17912536 - 17912662
Alignment:
Q  47 tgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgttaagttatg-aaattatgcttaattgatgaaattgata 145  Q
    |||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||||||  || |||||  |||||  |||||||| ||||| |||  |||||||||| ||||||    
T  17912536 tgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttt--aaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaattgatgaatttgata 17912633  T
Q  146 tgttttgattgaaatgagatgtgattcat 174  Q
    |||| |  ||||| |||| | ||||||||    
T  17912634 tgttgtagttgaattgagctatgattcat 17912662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 233; Significance: 1e-129; HSPs: 18)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 11231338 - 11231594
Alignment:
Q  1 ttgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11231338 ttgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 11231437  T
Q  101 ctaaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaa 199  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11231438 ataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaa 11231537  T
Q  200 ctgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatagttaattgtggattgatgatg 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11231538 ctgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 11231594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 22513185 - 22513441
Alignment:
Q  1 ttgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22513185 ttgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 22513284  T
Q  101 ctaaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaa 199  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22513285 ataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaa 22513384  T
Q  200 ctgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatagttaattgtggattgatgatg 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22513385 ctgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 22513441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 28775807 - 28776063
Alignment:
Q  1 ttgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28775807 ttgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 28775906  T
Q  101 ctaaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaa 199  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28775907 ataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaa 28776006  T
Q  200 ctgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatagttaattgtggattgatgatg 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28776007 ctgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 28776063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 24685781 - 24686037
Alignment:
Q  1 ttgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24685781 ttgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 24685880  T
Q  101 ctaaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaa 199  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24685881 ataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatgtgttttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaa 24685980  T
Q  200 ctgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatagttaattgtggattgatgatg 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  24685981 ctgatgctattgtaagtgaattatgatttaggtatacttaattgtggattgatgatg 24686037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 12728648 - 12728392
Alignment:
Q  1 ttgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12728648 ttgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 12728549  T
Q  101 ctaaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaa 199  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12728548 ataaatgttaagttatgaaattattcttaattgatgaaatttgatatgtttttattgaaatgagatgtgattcatattccattgatgtggttattgttaa 12728449  T
Q  200 ctgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatagttaattgtggattgatgatg 256  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12728448 ctgatgctattgtgagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 12728392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 34824731 - 34824475
Alignment:
Q  1 ttgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34824731 ttgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 34824632  T
Q  101 ctaaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaa 199  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34824631 ataaatgttaagttatgaaattattcttaattgatgaaatttgatatgtttttattgaaatgagatgtgattcatattccattgatgtggttattgttaa 34824532  T
Q  200 ctgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatagttaattgtggattgatgatg 256  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34824531 ctgatgctattgtgagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 34824475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 16935849 - 16935593
Alignment:
Q  1 ttgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  16935849 ttgttgttaaattcatgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgcgtgaaattacatgtttcaaagtatgt 16935750  T
Q  101 ctaaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaa 199  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16935749 ataaatgttaagttatgaaattatactttattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgatgtggttattgttaa 16935650  T
Q  200 ctgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatagttaattgtggattgatgatg 256  Q
     |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16935649 atgatgctattgtgagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 16935593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 17006509 - 17006253
Alignment:
Q  1 ttgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  17006509 ttgttgttaaattcatgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgcgtgaaattacatgtttcaaagtatgt 17006410  T
Q  101 ctaaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaa 199  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17006409 ataaatgttaagttatgaaattatactttattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgatgtggttattgttaa 17006310  T
Q  200 ctgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatagttaattgtggattgatgatg 256  Q
     |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17006309 atgatgctattgtgagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 17006253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 8 - 256
Target Start/End: Original strand, 23778052 - 23778301
Alignment:
Q  8 taaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatg 107  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23778052 taaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttatgcatgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatg 23778151  T
Q  108 ttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgc 206  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  23778152 ttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgatttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgttattgttaactgatgc 23778251  T
Q  207 tattgtaagtgaattatgatttgggtatagttaattgtggattgatgatg 256  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23778252 tattgtgagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 23778301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 12635868 - 12636044
Alignment:
Q  1 ttgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 100  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12635868 ttgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 12635967  T
Q  101 ctaaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatat 176  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  12635968 ataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatat 12636044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 8944102 - 8943926
Alignment:
Q  1 ttgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 100  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8944102 ttgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatatttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 8944003  T
Q  101 ctaaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatat 176  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  8944002 ataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatat 8943926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 42177969 - 42178145
Alignment:
Q  1 ttgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 100  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42177969 ttgttgctaaattcgtgctcttgttgtaatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttttgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 42178068  T
Q  101 ctaaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatat 176  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  42178069 ataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatat 42178145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 8 - 176
Target Start/End: Original strand, 3798610 - 3798779
Alignment:
Q  8 taaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatg 107  Q
    |||||||||||||||| |||  || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3798610 taaattcgtgctcttgttgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatg 3798709  T
Q  108 ttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatat 176  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  3798710 ttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttggttgaaatgagatgtaaatcatat 3798779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 8 - 176
Target Start/End: Original strand, 12641649 - 12641818
Alignment:
Q  8 taaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatg 107  Q
    |||||||||||||||| |||  || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12641649 taaattcgtgctcttgttgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtggctgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatg 12641748  T
Q  108 ttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatat 176  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  12641749 ttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttggttgaaatgagatgtaaatcatat 12641818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 5 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 21142147 - 21141895
Alignment:
Q  5 tgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaa 104  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21142147 tgttaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgaggattatggtatgtttgtggatgaaattacatgtttcaaagtatgtataa 21142048  T
Q  105 atgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaa-attgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactga 203  Q
    |||| ||| ||||||||||| || ||||  ||||  |||||||||| |  || |||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||  | ||||||||    
T  21142047 atgtcaagctatgaaattatactcaattagtgaatcttgatatgttgttgttaaaatgagatgtgattcatgttccattaaggttattgctattaactga 21141948  T
Q  204 tgctattgtaagtgaattatgatttgggtatagttaattgtggattgatgatg 256  Q
    || | ||||  |||||||| || |||||||||  ||||| |||||||||||||    
T  21141947 tgttgttgtgggtgaattacgacttgggtatacataattatggattgatgatg 21141895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 9 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 23774384 - 23774257
Alignment:
Q  9 aaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgt 108  Q
    ||||||||||||||| | || |||| ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  23774384 aaattcgtgctcttgttatgttgctgttt-cttatacttgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgt 23774286  T
Q  109 taagttatgaaattatgcttaattgatga 137  Q
     ||||| ||||||| ||| ||||| ||||    
T  23774285 caagttgtgaaattttgcctaattaatga 23774257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 47 - 137
Target Start/End: Original strand, 5888675 - 5888765
Alignment:
Q  47 tgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatga 137  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||| ||||||| ||| ||||| ||||    
T  5888675 tgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaaattttgcctaattaatga 5888765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 8 - 89
Target Start/End: Original strand, 7507859 - 7507940
Alignment:
Q  8 taaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 89  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| || | ||||||||||||||||    
T  7507859 taaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 7507940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 2)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 31565 - 31309
Alignment:
Q  1 ttgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31565 ttgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 31466  T
Q  101 ctaaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaa 199  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31465 ataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaa 31366  T
Q  200 ctgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatagttaattgtggattgatgatg 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31365 ctgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 31309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 39902 - 39646
Alignment:
Q  1 ttgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39902 ttgttgctaaattcgtgctcttgctgtgattctattttcctgtgcatgaattgatgattatggtatttttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 39803  T
Q  101 ctaaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaa 199  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||||||||    
T  39802 ataaatgttaagttatgaaattattcttaattgatgaaatttgatatgttttttttgaaatgagatgttattcatatttcattgatgttgttattgttaa 39703  T
Q  200 ctgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatagttaattgtggattgatgatg 256  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39702 ctgatgctattgtgagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 39646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 2)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 39359 - 39103
Alignment:
Q  1 ttgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39359 ttgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 39260  T
Q  101 ctaaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaa 199  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39259 ataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaa 39160  T
Q  200 ctgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatagttaattgtggattgatgatg 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39159 ctgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 39103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 43245 - 43137
Alignment:
Q  9 aaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgt 108  Q
    |||||||||||||||||| | || ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||| |||||| |||||  ||||||    
T  43245 aaattcgtgctcttgctgggatgttatgtttctatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgt 43148  T
Q  109 taagttatgaa 119  Q
    |||||||||||    
T  43147 taagttatgaa 43137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 13)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 271360 - 271616
Alignment:
Q  1 ttgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  271360 ttgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 271459  T
Q  101 ctaaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaa 199  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  271460 ataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaa 271559  T
Q  200 ctgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatagttaattgtggattgatgatg 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  271560 ctgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 271616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 644560 - 644304
Alignment:
Q  1 ttgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  644560 ttgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 644461  T
Q  101 ctaaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaa 199  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  644460 ataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaa 644361  T
Q  200 ctgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatagttaattgtggattgatgatg 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  644360 ctgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 644304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 830295 - 830039
Alignment:
Q  1 ttgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  830295 ttgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 830196  T
Q  101 ctaaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaa 199  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  830195 ataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaa 830096  T
Q  200 ctgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatagttaattgtggattgatgatg 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  830095 ctgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 830039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 22088794 - 22089050
Alignment:
Q  1 ttgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22088794 ttgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttataggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 22088893  T
Q  101 ctaaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaa 199  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22088894 ataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaa 22088993  T
Q  200 ctgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatagttaattgtggattgatgatg 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22088994 ctgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 22089050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 15319159 - 15319415
Alignment:
Q  1 ttgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15319159 ttgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatactattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttctaagtatgt 15319258  T
Q  101 ctaaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaa 199  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15319259 ataaatgttgagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaaagagatgtgattcatgttccattaatgtggttattgttaa 15319358  T
Q  200 ctgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatagttaattgtggattgatgatg 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15319359 ctgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 15319415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 15499528 - 15499784
Alignment:
Q  1 ttgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15499528 ttgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatactattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttctaagtatgt 15499627  T
Q  101 ctaaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaa 199  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15499628 ataaatgttgagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaaagagatgtgattcatgttccattaatgtggttattgttaa 15499727  T
Q  200 ctgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatagttaattgtggattgatgatg 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15499728 ctgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 15499784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 22006258 - 22006514
Alignment:
Q  1 ttgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22006258 ttgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 22006357  T
Q  101 ctaaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaa 199  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22006358 ataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgatgtggttattgttaa 22006457  T
Q  200 ctgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatagttaattgtggattgatgatg 256  Q
    |||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  22006458 ctgatgttattgtgagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggactgatgatg 22006514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 13662265 - 13662521
Alignment:
Q  1 ttgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13662265 ttgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaatgnatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 13662364  T
Q  101 ctaaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaa 199  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13662365 ataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgatgtggttattgttaa 13662464  T
Q  200 ctgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatagttaattgtggattgatgatg 256  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||    
T  13662465 ctgatgctattgtgagtgaatcatgatttgggtatacataattatggattgatgatg 13662521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 13720928 - 13721104
Alignment:
Q  1 ttgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 100  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13720928 ttgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 13721027  T
Q  101 ctaaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatat 176  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  13721028 ataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatat 13721104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 16195487 - 16195230
Alignment:
Q  1 ttgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 100  Q
    |||||| ||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16195487 ttgttgctaaattcgttctcgtgctgtgatgctatgttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 16195388  T
Q  101 ctaaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa--ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgtta 198  Q
     ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||  | |||    
T  16195387 ataaatgttaagttatgagattatacttaatttatgaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccattgatgttgttgctatta 16195288  T
Q  199 actgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatagttaattgtggattgatgatg 256  Q
    ||||||| | |||   ||||||||||| || ||||||  ||||| |||||||||||||    
T  16195287 actgatgttgttgagggtgaattatgacttaggtatatataattatggattgatgatg 16195230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 8 - 176
Target Start/End: Original strand, 16873058 - 16873227
Alignment:
Q  8 taaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatg 107  Q
    |||||||||||||||| |||  || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16873058 taaattcgtgctcttgttgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatg 16873157  T
Q  108 ttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatat 176  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  16873158 ttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttggttgaaatgagatgtaaatcatat 16873227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 119
Target Start/End: Original strand, 21844576 - 21844684
Alignment:
Q  9 aaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgt 108  Q
    |||||||||||||||||||| || ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||||||  || |||||  |||||     
T  21844576 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgttt--aaatatgtaaaaatga 21844673  T
Q  109 taagttatgaa 119  Q
    |||||||||||    
T  21844674 taagttatgaa 21844684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 9 - 119
Target Start/End: Original strand, 21851969 - 21852077
Alignment:
Q  9 aaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgt 108  Q
    |||||||||||||||||||| || ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||||| || | |||||||||| ||||||  || |||||  |||||     
T  21851969 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattaaatgttt--aaatatgtaaaaatga 21852066  T
Q  109 taagttatgaa 119  Q
    |||||||||||    
T  21852067 taagttatgaa 21852077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 17)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 7822984 - 7822728
Alignment:
Q  1 ttgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7822984 ttgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 7822885  T
Q  101 ctaaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaa 199  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7822884 ataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaa 7822785  T
Q  200 ctgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatagttaattgtggattgatgatg 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7822784 ctgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 7822728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 7830295 - 7830039
Alignment:
Q  1 ttgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7830295 ttgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 7830196  T
Q  101 ctaaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaa 199  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7830195 ataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaa 7830096  T
Q  200 ctgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatagttaattgtggattgatgatg 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7830095 ctgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 7830039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 27101637 - 27101893
Alignment:
Q  1 ttgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27101637 ttgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 27101736  T
Q  101 ctaaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaa 199  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27101737 ataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaa 27101836  T
Q  200 ctgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatagttaattgtggattgatgatg 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27101837 ctgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 27101893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 27108985 - 27109241
Alignment:
Q  1 ttgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27108985 ttgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 27109084  T
Q  101 ctaaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaa 199  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27109085 ataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaa 27109184  T
Q  200 ctgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatagttaattgtggattgatgatg 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27109185 ctgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 27109241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 27176689 - 27176433
Alignment:
Q  1 ttgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27176689 ttgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 27176590  T
Q  101 ctaaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaa 199  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27176589 ataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaa 27176490  T
Q  200 ctgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatagttaattgtggattgatgatg 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27176489 ctgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 27176433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 38783729 - 38783985
Alignment:
Q  1 ttgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38783729 ttgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 38783828  T
Q  101 ctaaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaa 199  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38783829 ataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaa 38783928  T
Q  200 ctgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatagttaattgtggattgatgatg 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38783929 ctgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 38783985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 15950791 - 15951047
Alignment:
Q  1 ttgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15950791 ttgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 15950890  T
Q  101 ctaaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaa 199  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  15950891 ataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgatgtgattattgttaa 15950990  T
Q  200 ctgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatagttaattgtggattgatgatg 256  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15950991 ctgatgctattgtaagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 15951047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 8 - 256
Target Start/End: Original strand, 15760121 - 15760370
Alignment:
Q  8 taaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatg 107  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15760121 taaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatgatatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatg 15760220  T
Q  108 ttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgc 206  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||     
T  15760221 ttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttaattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgttattgttaactgatgt 15760320  T
Q  207 tattgtaagtgaattatgatttgggtatagttaattgtggattgatgatg 256  Q
    |||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15760321 tattgtgagtgaataatgaattgggtatacttaattgtggattgatgatg 15760370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 18980021 - 18980197
Alignment:
Q  1 ttgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18980021 ttgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 18980120  T
Q  101 ctaaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatat 176  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  18980121 ataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatat 18980197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 14250898 - 14251074
Alignment:
Q  1 ttgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14250898 ttgttgttaaattcgtgctcttgttgtaatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttttgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 14250997  T
Q  101 ctaaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatat 176  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  14250998 ataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatat 14251074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 15927824 - 15927648
Alignment:
Q  1 ttgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 100  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15927824 ttgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgcttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 15927725  T
Q  101 ctaaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatat 176  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  15927724 ataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatat 15927648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 8 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 13758619 - 13758450
Alignment:
Q  8 taaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatg 107  Q
    |||||||||||||||| |||  || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13758619 taaattcgtgctcttgttgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatg 13758520  T
Q  108 ttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatat 176  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  13758519 ttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttggttgaaatgagatgtaaatcatat 13758450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 8 - 124
Target Start/End: Original strand, 48622673 - 48622788
Alignment:
Q  8 taaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatg 107  Q
    ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||  ||| ||    
T  48622673 taaattcgtgctcttactgtgatgatattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatg-ttcaaagcatgcataattg 48622771  T
Q  108 ttaagttatgaaattat 124  Q
    ||||||| |||||||||    
T  48622772 ttaagttgtgaaattat 48622788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 47 - 137
Target Start/End: Original strand, 10000415 - 10000505
Alignment:
Q  47 tgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatga 137  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  10000415 tgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaaattttgcttaattgatga 10000505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 13321271 - 13321134
Alignment:
Q  1 ttgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||  ||||| || ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||    
T  13321271 ttgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 13321172  T
Q  101 ctaaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaa 138  Q
     ||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||||    
T  13321171 ataaatgtcaagttatgaaattgtgctcaattggtgaa 13321134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 47 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 16418708 - 16418618
Alignment:
Q  47 tgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatga 137  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||| ||||||| ||| ||||| ||||    
T  16418708 tgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaaattttgcctaattaatga 16418618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 9 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 13572924 - 13572816
Alignment:
Q  9 aaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgt 108  Q
    |||||||||||||||||||| || ||| ||  | ||| |||||||||||| || || || || | |||||||||||||||||  || |||||  |||||     
T  13572924 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtgtgattgttggtgaaattacatgttt--aaatatgtaaaaatga 13572827  T
Q  109 taagttatgaa 119  Q
    |||||||||||    
T  13572826 taagttatgaa 13572816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 23)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 35582292 - 35582036
Alignment:
Q  1 ttgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35582292 ttgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 35582193  T
Q  101 ctaaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaa 199  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35582192 ataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaa 35582093  T
Q  200 ctgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatagttaattgtggattgatgatg 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35582092 ctgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 35582036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 21932381 - 21932637
Alignment:
Q  1 ttgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21932381 ttgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 21932480  T
Q  101 ctaaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaa 199  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21932481 ataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaa 21932580  T
Q  200 ctgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatagttaattgtggattgatgatg 256  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21932581 ctgatgccattgtaagtgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 21932637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 21938551 - 21938807
Alignment:
Q  1 ttgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21938551 ttgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 21938650  T
Q  101 ctaaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaa 199  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21938651 ataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaa 21938750  T
Q  200 ctgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatagttaattgtggattgatgatg 256  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21938751 ctgatgccattgtaagtgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 21938807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 22883084 - 22883340
Alignment:
Q  1 ttgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22883084 ttgttgttaaatttgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatggatgaaattacatgtttcaaagtatgt 22883183  T
Q  101 ctaaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaa 199  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22883184 ataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaa 22883283  T
Q  200 ctgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatagttaattgtggattgatgatg 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22883284 ctgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 22883340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 36989770 - 36990026
Alignment:
Q  1 ttgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36989770 ttgttgttaaattcgtgctctagctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 36989869  T
Q  101 ctaaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaa 199  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36989870 ataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaa 36989969  T
Q  200 ctgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatagttaattgtggattgatgatg 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36989970 ctgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 36990026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 1219520 - 1219776
Alignment:
Q  1 ttgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1219520 ttgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcattaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 1219619  T
Q  101 ctaaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaa 199  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  1219620 ataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatatttcattgatgtggttattgttaa 1219719  T
Q  200 ctgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatagttaattgtggattgatgatg 256  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1219720 ctgatgctattgtgagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 1219776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 8 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 7425573 - 7425324
Alignment:
Q  8 taaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatg 107  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7425573 taaattcgtgctcttgctgtgatgttattttcttgtgcatgaatcgatggttatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatg 7425474  T
Q  108 ttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgc 206  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  7425473 ttaagttatgaaattatacttcattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgttattgttaactgatgc 7425374  T
Q  207 tattgtaagtgaattatgatttgggtatagttaattgtggattgatgatg 256  Q
    | |||| ||||||| |||| |||| |||| |||||| |||||||||||||    
T  7425373 tgttgtgagtgaatcatgacttggatatacttaattatggattgatgatg 7425324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 17471588 - 17471800
Alignment:
Q  1 ttgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17471588 ttgttgataaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 17471687  T
Q  101 ctaaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaa 199  Q
     |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  17471688 ataaatgttaagtaatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaataagatgtaattcatattccattgatgttgttattgttaa 17471787  T
Q  200 ctgatgctattgt 212  Q
    |||||| ||||||    
T  17471788 ctgatgttattgt 17471800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 10777970 - 10778146
Alignment:
Q  1 ttgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10777970 ttgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 10778069  T
Q  101 ctaaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatat 176  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  10778070 ataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatat 10778146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 35791098 - 35791355
Alignment:
Q  1 ttgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  35791098 ttgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgagtgaaattacatgtttcaaagtatgt 35791197  T
Q  101 ctaaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa--ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgtta 198  Q
     ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||  | |||    
T  35791198 ataaatgttaagttatgagattatacttaattgatgaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccattgatgttgttgctatta 35791297  T
Q  199 actgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatagttaattgtggattgatgatg 256  Q
    ||||||| | |||   ||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||    
T  35791298 actgatgttgttgagggtgaattatgacttgggtatacataattatggattgatgatg 35791355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 23514817 - 23514641
Alignment:
Q  1 ttgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23514817 ttgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 23514718  T
Q  101 ctaaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatat 176  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  23514717 ataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatat 23514641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 8 - 256
Target Start/End: Original strand, 11212072 - 11212321
Alignment:
Q  8 taaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatg 107  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  11212072 taaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtgtgtataaatg 11212171  T
Q  108 ttaagttatgaaattatgcttaattgatgaa-attgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgc 206  Q
    ||||||||||||||||| || || |  ||||  || ||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||  | ||||||||||     
T  11212172 ttaagttatgaaattatactcaagtagtgaattttaatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccattgatgttgttgctattaactgatgt 11212271  T
Q  207 tattgtaagtgaattatgatttgggtatagttaattgtggattgatgatg 256  Q
    | ||||  ||| ||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||    
T  11212272 tgttgtgggtggattatgacttgggtatacataattatggattgatgatg 11212321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 32950950 - 32950717
Alignment:
Q  1 ttgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||| ||||  ||| |||||||| || ||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  32950950 ttgttgttaaattcgtgctctaactgtgatgttattttcgtgtgtatgatttgatgataattgtatgattgtggttgaaattacatgtttcaaagtatgt 32950851  T
Q  101 ctaaatgt-taagttatgaaattatgcttaattgatgaaattga-tatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgtta 198  Q
     |||| ||  ||||||||||||| |||| || || |||| || | |||||| |  |||||| |||||||||||||| ||||||| |||| | |  | |||    
T  32950850 ataaaggtcaaagttatgaaattgtgctcaaatggtgaattttactatgttgttgttgaaaagagatgtgattcatgttccattgatgttgatgctatta 32950751  T
Q  199 actgatgctattgtaagtgaattatgatttgggt 232  Q
    ||||||| | ||||  |||||| |||| ||||||    
T  32950750 actgatgttgttgtgggtgaatcatgacttgggt 32950717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 9 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 23328805 - 23328678
Alignment:
Q  9 aaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgt 108  Q
    ||||||||||||||| | || |||| ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  23328805 aaattcgtgctcttgttatgttgctgttt-cttatacttgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgt 23328707  T
Q  109 taagttatgaaattatgcttaattgatga 137  Q
     ||||| ||||||| ||| ||||| ||||    
T  23328706 caagttgtgaaattttgcctaattaatga 23328678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 9 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 24616409 - 24616282
Alignment:
Q  9 aaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgt 108  Q
    ||||||||||||||| | || |||| ||| ||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  24616409 aaattcgtgctcttgttatgttgctgttt-cttatacttgaattgataattatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgt 24616311  T
Q  109 taagttatgaaattatgcttaattgatga 137  Q
     ||||| ||||||| ||| ||||| ||||    
T  24616310 caagttgtgaaattttgcctaattaatga 24616282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 9 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 24712785 - 24712658
Alignment:
Q  9 aaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgt 108  Q
    ||||||||||||||| | || |||| ||| ||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  24712785 aaattcgtgctcttgttatgttgctgttt-cttatacttgaattgataattatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgt 24712687  T
Q  109 taagttatgaaattatgcttaattgatga 137  Q
     ||||| ||||||| ||| ||||| ||||    
T  24712686 caagttgtgaaattttgcctaattaatga 24712658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 9 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 24745803 - 24745676
Alignment:
Q  9 aaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgt 108  Q
    ||||||||||||||| | || |||| ||| ||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  24745803 aaattcgtgctcttgttatgttgctgttt-cttatacttgaattgataattatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgt 24745705  T
Q  109 taagttatgaaattatgcttaattgatga 137  Q
     ||||| ||||||| ||| ||||| ||||    
T  24745704 caagttgtgaaattttgcctaattaatga 24745676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 209 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 23328605 - 23328558
Alignment:
Q  209 ttgtaagtgaattatgatttgggtatagttaattgtggattgatgatg 256  Q
    |||| |||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23328605 ttgtgagtgaattataacttgggtatacttaattgtggattgatgatg 23328558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 9 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 27010089 - 27009981
Alignment:
Q  9 aaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgt 108  Q
    |||||||||||||||||||| || ||| ||  | ||| |||||||||||| || |||||  | | |||||||||||||||||  || |||||  |||||     
T  27010089 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgagtgttggtgaaattacatgttt--aaatatgtaaaaatga 27009992  T
Q  109 taagttatgaa 119  Q
    |||||||||||    
T  27009991 taagttatgaa 27009981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 209 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 24616210 - 24616165
Alignment:
Q  209 ttgtaagtgaattatgatttgggtatagttaattgtggattgatga 254  Q
    |||| |||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24616210 ttgtgagtgaattataacttgggtatacttaattgtggattgatga 24616165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 209 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 24712586 - 24712541
Alignment:
Q  209 ttgtaagtgaattatgatttgggtatagttaattgtggattgatga 254  Q
    |||| |||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24712586 ttgtgagtgaattataacttgggtatacttaattgtggattgatga 24712541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 209 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 24745604 - 24745559
Alignment:
Q  209 ttgtaagtgaattatgatttgggtatagttaattgtggattgatga 254  Q
    |||| |||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24745604 ttgtgagtgaattataacttgggtatacttaattgtggattgatga 24745559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 5 - 89
Target Start/End: Original strand, 43443395 - 43443479
Alignment:
Q  5 tgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 89  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||| || | ||||||||||||||||    
T  43443395 tgttaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgtt 43443479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 10)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 17004894 - 17004638
Alignment:
Q  1 ttgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17004894 ttgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 17004795  T
Q  101 ctaaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaa 199  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17004794 ataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaa 17004695  T
Q  200 ctgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatagttaattgtggattgatgatg 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17004694 ctgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 17004638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 18059758 - 18060014
Alignment:
Q  1 ttgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18059758 ttgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 18059857  T
Q  101 ctaaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaa 199  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  18059858 ataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgatgtggttattgtcaa 18059957  T
Q  200 ctgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatagttaattgtggattgatgatg 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18059958 ctgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 18060014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 38055091 - 38055347
Alignment:
Q  1 ttgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 100  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38055091 ttgttgttaaattcgtgcttttactgtgatgttattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 38055190  T
Q  101 ctaaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaa 199  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38055191 ataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaaagagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaa 38055290  T
Q  200 ctgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatagttaattgtggattgatgatg 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38055291 ctgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 38055347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 46523645 - 46523394
Alignment:
Q  1 ttgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 100  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  46523645 ttgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgtttatgttatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 46523546  T
Q  101 ctaaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaa 199  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  46523545 ataaatgttaagttatgaaattatacttcattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgttattgttaa 46523446  T
Q  200 ctgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatagttaattgtggattga 251  Q
    |||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  46523445 ctgatgctgttgtgagtgaatcatgacttgggtatacttaattatggattga 46523394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 8 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 17148816 - 17148647
Alignment:
Q  8 taaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatg 107  Q
    |||||||||||||||| |||  || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17148816 taaattcgtgctcttgttgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatg 17148717  T
Q  108 ttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatat 176  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  17148716 ttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaatgagatgtaaatcatat 17148647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Original strand, 19962499 - 19962617
Alignment:
Q  1 ttgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19962499 ttgttgttaaattcgtgctcttgctgtaatgctattttcttgtgtttgaattgatgattatggtatgtttatgggtggaattacatgtttcaaagtatgt 19962598  T
Q  101 ctaaatgttaagttatgaa 119  Q
     ||||||||||||||||||    
T  19962599 ataaatgttaagttatgaa 19962617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 9 - 137
Target Start/End: Original strand, 7640942 - 7641069
Alignment:
Q  9 aaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgt 108  Q
    ||||||||||||||| | || |||| ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  7640942 aaattcgtgctcttgttatgttgctgttt-cttatacttgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgt 7641040  T
Q  109 taagttatgaaattatgcttaattgatga 137  Q
     ||||| ||||||| ||| ||||| ||||    
T  7641041 caagttgtgaaattttgcctaattaatga 7641069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 9 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 22035695 - 22035568
Alignment:
Q  9 aaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgt 108  Q
    ||||||||||||||| | || |||| ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  22035695 aaattcgtgctcttgttatgttgctgttt-cttatacttgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgt 22035597  T
Q  109 taagttatgaaattatgcttaattgatga 137  Q
     ||||| ||||||| ||| ||||| ||||    
T  22035596 caagttgtgaaattttgcctaattaatga 22035568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 8 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 22228057 - 22227947
Alignment:
Q  8 taaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatg 107  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||| || ||||| || |  ||||||||||||| |||||| |||||  |||||    
T  22228057 taaattcgtgctcttgctgtgatgttattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatg 22227960  T
Q  108 ttaagttatgaaa 120  Q
     ||||||||||||    
T  22227959 ataagttatgaaa 22227947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 8 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 22232754 - 22232644
Alignment:
Q  8 taaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatg 107  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||| || ||||| || |  ||||||||||||| |||||| |||||  |||||    
T  22232754 taaattcgtgctcttgctgtgatgttattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatg 22232657  T
Q  108 ttaagttatgaaa 120  Q
     ||||||||||||    
T  22232656 ataagttatgaaa 22232644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 201; Significance: 1e-110; HSPs: 1)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 29418 - 29162
Alignment:
Q  1 ttgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29418 ttgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgttgattatgttatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 29319  T
Q  101 ctaaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaa 199  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29318 gtaaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgatgtggttattgttaa 29219  T
Q  200 ctgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatagttaattgtggattgatgatg 256  Q
     | ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||    
T  29218 tttatgttattgttagtgaattatgatttggttatacttaattgtgtattgatgatg 29162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 1)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 154007 - 154263
Alignment:
Q  1 ttgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  154007 ttgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaagttacatgtttcaaagtatgt 154106  T
Q  101 ctaaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaa 199  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  154107 ataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgaatcatattccattgatgtggttattgttaa 154206  T
Q  200 ctgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatagttaattgtggattgatgatg 256  Q
    || ||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  154207 cttatgctattgtgggtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 154263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 16)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 18169226 - 18168970
Alignment:
Q  1 ttgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18169226 ttgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 18169127  T
Q  101 ctaaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaa 199  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18169126 ataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattgatgtggttattgttaa 18169027  T
Q  200 ctgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatagttaattgtggattgatgatg 256  Q
     | |||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||    
T  18169026 ataatgctattgtgagtgaatcatgatttggatatacttaattgtgaattgatgatg 18168970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 8 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 19020735 - 19020486
Alignment:
Q  8 taaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatg 107  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19020735 taaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatg 19020636  T
Q  108 ttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgc 206  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  19020635 ttaagttatgaaattatccttaatggatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgttattgttaactgatgc 19020536  T
Q  207 tattgtaagtgaattatgatttgggtatagttaattgtggattgatgatg 256  Q
    |||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  19020535 tattgtgagtgaatcatgatttgagtatacttaattgtggattgatgatg 19020486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 8 - 256
Target Start/End: Original strand, 15287252 - 15287501
Alignment:
Q  8 taaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatg 107  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15287252 taaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaatcgatggttatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatg 15287351  T
Q  108 ttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgc 206  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  15287352 ttaagttatgaaattatactccattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgttattgttaactgatgc 15287451  T
Q  207 tattgtaagtgaattatgatttgggtatagttaattgtggattgatgatg 256  Q
    | |||| ||||||| |||| ||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  15287452 tgttgtgagtgaatcatgacttgggtatacttaattatggattgatgatg 15287501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 8 - 256
Target Start/End: Original strand, 15294361 - 15294610
Alignment:
Q  8 taaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatg 107  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  15294361 taaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaatcgatggttatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatatataaatg 15294460  T
Q  108 ttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgc 206  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  15294461 ttaagttatgaaattatactccattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgttattgttaactgatgc 15294560  T
Q  207 tattgtaagtgaattatgatttgggtatagttaattgtggattgatgatg 256  Q
    | |||| ||||||| |||| ||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  15294561 tgttgtgagtgaatcatgacttgggtatacttaattatggattgatgatg 15294610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 7132065 - 7132241
Alignment:
Q  1 ttgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 100  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7132065 ttgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 7132164  T
Q  101 ctaaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatat 176  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  7132165 ataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatat 7132241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 5 - 256
Target Start/End: Original strand, 17145661 - 17145913
Alignment:
Q  5 tgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaa 104  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17145661 tgttaaattcgtgctcttactgtgatgctattttcttgtacatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataa 17145760  T
Q  105 atgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaa-attgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactga 203  Q
    |||||||||| ||||||||| || ||||  ||||  |||||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||  | ||||||||    
T  17145761 atgttaagttgtgaaattatactcaattagtgaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccattgatgttgttgctattaactga 17145860  T
Q  204 tgctattgtaagtgaattatgatttgggtatagttaattgtggattgatgatg 256  Q
    || | ||||  ||||||||||| |||||||||  |||||  ||||||||||||    
T  17145861 tgttgttgtgggtgaattatgacttgggtatacataattacggattgatgatg 17145913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 8 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 20000972 - 20000803
Alignment:
Q  8 taaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatg 107  Q
    |||||||||||||||| |||  || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20000972 taaattcgtgctcttgttgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttctgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatg 20000873  T
Q  108 ttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatat 176  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  20000872 ttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttggttgaaatgagatgtaaatcatat 20000803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 5 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 18248470 - 18248218
Alignment:
Q  5 tgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaa 104  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18248470 tgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgaggattatggtatgtttgtggatgaaattacatgtttcaaagtatgtataa 18248371  T
Q  105 atgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaa-attgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactga 203  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||||  ||||  || ||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||  | ||||||||    
T  18248370 atgttaagatatgaaattatactcaattagtgaattttaatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccattgatgttgttgctattaactga 18248271  T
Q  204 tgctattgtaagtgaattatgatttgggtatagttaattgtggattgatgatg 256  Q
    || | ||||  ||||||||||| || ||||||  ||||| | |||||||||||    
T  18248270 tgttgttgtgggtgaattatgactttggtatacataattatcgattgatgatg 18248218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 5 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 22738521 - 22738390
Alignment:
Q  5 tgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaa 104  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22738521 tgttaaattcgtgttcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataa 22738422  T
Q  105 atgttaagttatgaaattatgcttaattgatg 136  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22738421 atgttaagttgtgaaattatgcttaattgatg 22738390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 41 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 8374724 - 8374508
Alignment:
Q  41 tgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaa-a 139  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||      
T  8374724 tgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgcttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatactcaattagtgaatt 8374625  T
Q  140 ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatagtta 239  Q
    || ||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||  | |||||||||| | ||||  ||||||||||  |||||||||  ||    
T  8374624 ttaatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccattgatgttgttgctattaactgatgttgttgtgggtgaattatggcttgggtatacata 8374525  T
Q  240 attgtggattgatgatg 256  Q
    ||| | |||||||||||    
T  8374524 attatcgattgatgatg 8374508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 9 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 26339267 - 26339140
Alignment:
Q  9 aaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgt 108  Q
    ||||||||||||||| | || |||| ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||  ||||| |||||||    
T  26339267 aaattcgtgctcttgttatgttgctgttt-cttatacttgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatctatgtataaatgt 26339169  T
Q  109 taagttatgaaattatgcttaattgatga 137  Q
     ||||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  26339168 caagttgtgaaattttgcttaattaatga 26339140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 47 - 122
Target Start/End: Original strand, 22352109 - 22352184
Alignment:
Q  47 tgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgttaagttatgaaatt 122  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||| |||||||    
T  22352109 tgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaaatt 22352184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 24 - 138
Target Start/End: Original strand, 40885585 - 40885698
Alignment:
Q  24 ctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgttaagttatgaaatta 123  Q
    |||||||||||| ||  | ||| ||||||| |||| || | |||||| | |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  40885585 ctgtggtgctatgtttgtatgcatgaattggtgataattgaatgtttgttggtgaaattacatgtt-caaagtatgtataaatgtcaagttatgaaatta 40885683  T
Q  124 tgcttaattgatgaa 138  Q
    |||| ||||| ||||    
T  40885684 tgctcaattggtgaa 40885698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 43
Target Start/End: Complemental strand, 8378407 - 8378365
Alignment:
Q  1 ttgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgt 43  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8378407 ttgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgt 8378365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 9 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 10644467 - 10644360
Alignment:
Q  9 aaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgt 108  Q
    |||||||||||||||||||| || ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||||| || |  ||||||||||||| |||||| |||||  ||||||    
T  10644467 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgt 10644370  T
Q  109 taagttatga 118  Q
    ||||||||||    
T  10644369 taagttatga 10644360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 215 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 22738310 - 22738269
Alignment:
Q  215 gtgaattatgatttgggtatagttaattgtggattgatgatg 256  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  22738310 gtgaattatgacttgggtatacttaattgtggattaatgatg 22738269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1666 (Bit Score: 186; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold1666
Description:

Target: scaffold1666; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 8 - 256
Target Start/End: Original strand, 3 - 252
Alignment:
Q  8 taaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatg 107  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3 taaattcgtgctcttgctgtgaggctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtgtaaatg 102  T
Q  108 ttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgc 206  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||    
T  103 ttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttaattgaaatgagatgtaattcatattacattgatgtagttattgttaactgatgc 202  T
Q  207 tattgtaagtgaattatgatttgggtatagttaattgtggattgatgatg 256  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  203 tattgtgagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467 (Bit Score: 181; Significance: 7e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0467
Description:

Target: scaffold0467; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 10339 - 10595
Alignment:
Q  1 ttgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10339 ttgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgatattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 10438  T
Q  101 ctaaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaa 199  Q
     |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||||    
T  10439 ataaatgctaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgttgttgttaa 10538  T
Q  200 ctgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatagttaattgtggattgatgatg 256  Q
    ||||||||||||| || |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10539 ctgatgctattgtgagggaatcatgacttgggtatacttaattgtggattgatgatg 10595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 1575 - 1831
Alignment:
Q  1 ttgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 100  Q
    |||||| |||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1575 ttgttgctaaaatcgtgcacttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 1674  T
Q  101 ctaaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaa 199  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||   ||| |||| |||||||||||    
T  1675 ataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatataaaattgatgttgttattgttaa 1774  T
Q  200 ctgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatagttaattgtggattgatgatg 256  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1775 ctgatgctattgtgagtgaatcatgatttgggtatacttaattgtggattgatgatg 1831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 173; Significance: 4e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 2648 - 2392
Alignment:
Q  1 ttgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 100  Q
    |||||| | ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2648 ttgttgctcaattcgtgctcttgccgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgcttatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 2549  T
Q  101 ctaaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaa 199  Q
     |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  2548 ataaatgttaagtcatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgtttttattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgttattgttaa 2449  T
Q  200 ctgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatagttaattgtggattgatgatg 256  Q
    |||||| |||||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2448 ctgatgttattgtgagtgaatcatggtttgggtatacttaattgtggattgatgatg 2392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 153; Significance: 4e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 34158 - 34414
Alignment:
Q  1 ttgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34158 ttgttgctaaattcgtgctcttgctgtgaagctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 34257  T
Q  101 ctaaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatt-gatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaa 199  Q
     |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| || |||||||| |  |||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||  | ||||    
T  34258 ataaatgttaagttatgaagttatacttaattgatgaatttggatatgttgttgttgaaatgagatatgattcatgttccattaatgttgttgctattaa 34357  T
Q  200 ctgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatagttaattgtggattgatgatg 256  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| | |||| |||||||||||||    
T  34358 ctgatgctattgtgagtgaatcatgacttgggtatactaaattatggattgatgatg 34414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1500 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold1500
Description:

Target: scaffold1500; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 1514 - 1690
Alignment:
Q  1 ttgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 100  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1514 ttgttgctaaattcgtgctcttgttgtaatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 1613  T
Q  101 ctaaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaa-ttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatat 176  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  1614 ataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcatat 1690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0191 (Bit Score: 118; Significance: 3e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0191
Description:

Target: scaffold0191; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 8 - 256
Target Start/End: Original strand, 7463 - 7712
Alignment:
Q  8 taaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatg 107  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7463 taaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgaagattatggtatgtttgtggatgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatg 7562  T
Q  108 ttaagttatgaaattatgcttaattgatgaa-attgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaactgatgc 206  Q
    | ||| ||||||||||| || ||||  ||||  |||||||||| |  || |||||||||||||||||| ||||||||| ||  || || ||||||||||     
T  7563 tcaagctatgaaattatactcaattagtgaatcttgatatgttgttgttaaaatgagatgtgattcatgttccattaaggttattgttattaactgatgt 7662  T
Q  207 tattgtaagtgaattatgatttgggtatagttaattgtggattgatgatg 256  Q
    | |||| |||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||    
T  7663 tgttgtgagtgaattatgacttgggtatacataattatggattgatgatg 7712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 109; Significance: 7e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 54672 - 54416
Alignment:
Q  1 ttgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  54672 ttgttgttaaattcgtgtccttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgtgggtgaaattgcatgtttcaaagtatgt 54573  T
Q  101 ctaaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaa-attgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaa 199  Q
     ||||||| ||||||||||||| | || ||||| ||||  |||||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||  | ||||    
T  54572 ataaatgtcaagttatgaaattgtactcaattggtgaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccattgatgttgttgctattaa 54473  T
Q  200 ctgatgctattgtaagtgaattatgatttgggtatagttaattgtggattgatgatg 256  Q
    |||||| | ||||  |||||| |||| |||||||||  || || |||||||||||||    
T  54472 ctgatgttgttgtgggtgaatcatgagttgggtatacatatttatggattgatgatg 54416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 45286 - 45081
Alignment:
Q  1 ttgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||  ||||| |||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  45286 ttgttgttaaattcgtgcccttgttgtgatgctattttgatgtgcatgaattgatgataattgtatgattgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 45187  T
Q  101 ctaaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaa-attgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgtggttattgttaa 199  Q
     ||||||| ||||| ||||||| | || ||||| ||||  |||||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||  | ||||    
T  45186 ataaatgtcaagttttgaaattgtactcaattggtgaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccattgatgttgttgctattaa 45087  T
Q  200 ctgatg 205  Q
    ||||||    
T  45086 ctgatg 45081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 8 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 54123 - 54008
Alignment:
Q  8 taaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatg 107  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||    
T  54123 taaattcgtgctcttactgtgatgctgttttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatg-ttcaaagcatgtataattg 54025  T
Q  108 ttaagttatgaaattat 124  Q
    ||||||| |||||||||    
T  54024 ttaagttgtgaaattat 54008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 64; Significance: 5e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 56107 - 56294
Alignment:
Q  1 ttgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||| ||||| ||| |||||||| || ||||| || ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  56107 ttgttgttaaattcgtgctctaactgtgatgttattttcgtgtgcatgatttgatgataattgtatgattgtggctgaaattacatgttttaaagtatgt 56206  T
Q  101 ctaaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaa-attgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattaatgt 187  Q
     ||||||| ||||||||||||| |||| || || ||||  ||| || ||| |  |||||| || ||||||||||| ||||||| ||||    
T  56207 ataaatgtcaagttatgaaattgtgctcaaatggtgaattttgctaagttgttgttgaaaagatatgtgattcatgttccattgatgt 56294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 4 - 120
Target Start/End: Original strand, 5215 - 5329
Alignment:
Q  4 ttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtcta 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||| |||||| |||||  |    
T  5215 ttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaa 5312  T
Q  104 aatgttaagttatgaaa 120  Q
    |||| ||||||||||||    
T  5313 aatgataagttatgaaa 5329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0892 (Bit Score: 57; Significance: 7e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0892
Description:

Target: scaffold0892; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 8 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 3662 - 3547
Alignment:
Q  8 taaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatg 107  Q
    |||||| |||||||| ||||| || | ||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||    
T  3662 taaattagtgctcttactgtgatgttgttttcttgtccatgaattgatgattatggtatgattgtgggtgaaattacatg-ttcaaagcatgtataattg 3564  T
Q  108 ttaagttatgaaattat 124  Q
    ||||||| |||||||||    
T  3563 ttaagttgtgaaattat 3547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183 (Bit Score: 57; Significance: 7e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0183
Description:

Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 9 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 6845 - 6718
Alignment:
Q  9 aaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgt 108  Q
    ||||||||||||||| | || |||| ||| ||| | | |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  6845 aaattcgtgctcttgttatgttgctgttt-cttatacatgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgt 6747  T
Q  109 taagttatgaaattatgcttaattgatga 137  Q
     ||||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  6746 caagttgtgaaattttgcttaattaatga 6718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 209 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 6645 - 6598
Alignment:
Q  209 ttgtaagtgaattatgatttgggtatagttaattgtggattgatgatg 256  Q
    |||| |||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6645 ttgtgagtgaattataacttgggtatacttaattgtggattgatgatg 6598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 47 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 7420 - 7330
Alignment:
Q  47 tgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatga 137  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||| ||||||| ||| ||||| ||||    
T  7420 tgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaaattttgcctaattaatga 7330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 8 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 3971 - 3890
Alignment:
Q  8 taaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 89  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| || | ||||||||||||||||    
T  3971 taaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 3890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 50 - 137
Target Start/End: Original strand, 23797 - 23884
Alignment:
Q  50 attgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatga 137  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||| ||||||| ||| ||||| ||||    
T  23797 attgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaaattttgcctaattaatga 23884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0361 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0361
Description:

Target: scaffold0361; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 3438 - 3324
Alignment:
Q  8 taaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtctaaatg 107  Q
    |||||||||||||| |||||| || ||  ||  | ||| |||||| |||||  | ||||| || | ||||||||||||| ||||||||||||| |||||     
T  3438 taaattcgtgctctagctgtgatgttaagtttgtatgcatgaattaatgatatttgtatgattgttggtgaaattacatatttcaaagtatgtataaata 3339  T
Q  108 ttaagttatgaaatt 122  Q
    | |||||||||||||    
T  3338 tcaagttatgaaatt 3324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 9 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 283 - 202
Alignment:
Q  9 aaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgttt 90  Q
    |||||||||||||||||||| || ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||||||    
T  283 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgttt 202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 41903 - 41815
Alignment:
Q  1 ttgttgttaaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 89  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| || ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||||| || | ||||||||||||||||    
T  41903 ttgttgttaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 41815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 8 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 3211 - 3130
Alignment:
Q  8 taaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 89  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||| ||  | | | |||||||||||| || ||||| || | ||||||||||||||||    
T  3211 taaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatccatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 3130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 9 - 89
Target Start/End: Original strand, 9353 - 9433
Alignment:
Q  9 aaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 89  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||||| || | ||||||||||||||||    
T  9353 aaattcgtgcttttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 9433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 9 - 89
Target Start/End: Original strand, 16251 - 16331
Alignment:
Q  9 aaattcgtgctcttgctgtggtgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 89  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||| ||  | ||| |||||||||||| || ||||| || | ||||||||||||||||    
T  16251 aaattcgtgcttttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 16331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 338 times since January 2019
Visitors: 4379