View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0720_low_2 (Length: 474)

Name: NF0720_low_2
Description: NF0720
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0720_low_2
NF0720_low_2
[»] chr1 (66 HSPs)
chr1 (152-465)||(296157-296464)
chr1 (172-465)||(36181224-36181520)
chr1 (173-465)||(20630967-20631261)
chr1 (264-465)||(45307034-45307234)
chr1 (172-465)||(14432528-14432819)
chr1 (173-465)||(2333147-2333446)
chr1 (186-465)||(22900426-22900706)
chr1 (172-330)||(2333367-2333527)
chr1 (173-386)||(20579119-20579331)
chr1 (173-386)||(20586812-20587024)
chr1 (303-465)||(37358254-37358417)
chr1 (264-386)||(24087182-24087304)
chr1 (172-326)||(20630926-20631082)
chr1 (173-326)||(20586733-20586887)
chr1 (169-330)||(22900600-22900762)
chr1 (156-331)||(20901001-20901175)
chr1 (173-326)||(20579040-20579194)
chr1 (172-287)||(22900566-22900681)
chr1 (186-330)||(45306915-45307061)
chr1 (186-312)||(293834-293961)
chr1 (161-291)||(24087117-24087248)
chr1 (157-284)||(28312068-28312195)
chr1 (173-326)||(18823462-18823617)
chr1 (158-326)||(293767-293935)
chr1 (158-326)||(21181475-21181643)
chr1 (173-287)||(18823541-18823655)
chr1 (195-332)||(21181430-21181567)
chr1 (158-291)||(28204696-28204830)
chr1 (172-287)||(45306981-45307095)
chr1 (173-326)||(45306863-45307017)
chr1 (213-331)||(20901095-20901215)
chr1 (172-288)||(16400611-16400729)
chr1 (173-325)||(21181397-21181549)
chr1 (156-249)||(18270183-18270275)
chr1 (156-249)||(18274837-18274929)
chr1 (252-377)||(18270240-18270368)
chr1 (252-377)||(18274894-18275022)
chr1 (193-327)||(18823521-18823656)
chr1 (252-323)||(28312124-28312195)
chr1 (212-331)||(18823461-18823582)
chr1 (252-330)||(45306903-45306983)
chr1 (252-326)||(28204700-28204775)
chr1 (231-331)||(21528853-21528957)
chr1 (156-249)||(19209407-19209500)
chr1 (172-218)||(37358201-37358247)
chr1 (252-322)||(19209465-19209536)
chr1 (402-465)||(24087299-24087364)
chr1 (252-326)||(16400652-16400728)
chr1 (186-245)||(19209477-19209536)
chr1 (172-249)||(20631045-20631121)
chr1 (172-249)||(20901133-20901210)
chr1 (400-465)||(294076-294143)
chr1 (193-253)||(18270259-18270319)
chr1 (193-253)||(18274913-18274973)
chr1 (172-331)||(21181350-21181511)
chr1 (250-331)||(36181223-36181306)
chr1 (269-326)||(44823106-44823165)
chr1 (354-395)||(294045-294086)
chr1 (251-326)||(24087128-24087205)
chr1 (290-323)||(25092495-25092528)
chr1 (266-393)||(7792755-7792882)
chr1 (269-331)||(8683035-8683099)
chr1 (234-324)||(24959989-24960081)
chr1 (212-253)||(52983193-52983235)
chr1 (290-323)||(24959926-24959959)
chr1 (432-464)||(20579359-20579391)
[»] chr2 (75 HSPs)
chr2 (172-465)||(23339343-23339635)
chr2 (186-465)||(31755602-31755881)
chr2 (172-465)||(44620583-44620873)
chr2 (186-465)||(24504344-24504632)
chr2 (152-326)||(23339559-23339734)
chr2 (264-465)||(41684937-41685140)
chr2 (172-326)||(25035984-25036139)
chr2 (264-465)||(21239297-21239506)
chr2 (264-465)||(21241847-21242056)
chr2 (264-465)||(20591276-20591486)
chr2 (173-386)||(31503254-31503468)
chr2 (174-330)||(31503137-31503294)
chr2 (173-386)||(31505820-31506034)
chr2 (174-330)||(31505703-31505860)
chr2 (186-324)||(28348743-28348882)
chr2 (152-287)||(20591424-20591560)
chr2 (186-326)||(21239483-21239625)
chr2 (186-326)||(21242033-21242175)
chr2 (173-326)||(31503215-31503368)
chr2 (173-326)||(31505781-31505934)
chr2 (251-386)||(12628124-12628261)
chr2 (172-291)||(24274235-24274354)
chr2 (174-330)||(24504293-24504449)
chr2 (174-330)||(31755551-31755707)
chr2 (158-289)||(23374868-23374999)
chr2 (252-409)||(23374923-23375081)
chr2 (172-289)||(41685075-41685194)
chr2 (158-326)||(28348676-28348844)
chr2 (158-326)||(28352501-28352669)
chr2 (173-326)||(21239523-21239677)
chr2 (173-326)||(21242073-21242227)
chr2 (172-287)||(21239445-21239559)
chr2 (172-287)||(21241995-21242109)
chr2 (172-249)||(12628184-12628261)
chr2 (158-285)||(10040234-10040361)
chr2 (186-289)||(28352568-28352671)
chr2 (206-326)||(24274277-24274399)
chr2 (173-409)||(24274155-24274392)
chr2 (173-328)||(25035942-25036098)
chr2 (251-331)||(22109437-22109518)
chr2 (252-324)||(10040234-10040306)
chr2 (252-330)||(21239557-21239637)
chr2 (252-330)||(21242107-21242187)
chr2 (170-238)||(24275717-24275784)
chr2 (173-291)||(31755629-31755746)
chr2 (170-249)||(22109435-22109513)
chr2 (173-324)||(10040152-10040306)
chr2 (252-331)||(31518274-31518357)
chr2 (234-328)||(25651191-25651289)
chr2 (269-411)||(31518498-31518644)
chr2 (240-331)||(21903151-21903246)
chr2 (213-291)||(22109438-22109517)
chr2 (269-395)||(22841018-22841143)
chr2 (250-331)||(41685112-41685195)
chr2 (402-465)||(12628064-12628129)
chr2 (234-331)||(23085342-23085442)
chr2 (400-465)||(28348948-28349015)
chr2 (269-326)||(23085339-23085397)
chr2 (354-395)||(28348917-28348958)
chr2 (193-253)||(31518500-31518561)
chr2 (290-326)||(23148580-23148616)
chr2 (290-326)||(23560370-23560406)
chr2 (269-331)||(31518252-31518316)
chr2 (290-324)||(24682759-24682793)
chr2 (173-285)||(28348770-28348882)
chr2 (173-249)||(31518274-31518352)
chr2 (173-249)||(31518315-31518393)
chr2 (251-330)||(20591459-20591540)
chr2 (173-250)||(21239444-21239519)
chr2 (173-250)||(21241994-21242069)
chr2 (290-331)||(22840917-22840958)
chr2 (251-330)||(23339633-23339714)
chr2 (432-465)||(31503496-31503529)
chr2 (432-465)||(31506062-31506095)
chr2 (270-331)||(24160247-24160311)
[»] chr4 (100 HSPs)
chr4 (172-465)||(33848559-33848851)
chr4 (173-465)||(16278282-16278573)
chr4 (186-465)||(55502904-55503183)
chr4 (172-465)||(15280257-15280552)
chr4 (172-465)||(28382474-28382769)
chr4 (173-465)||(31117209-31117498)
chr4 (173-465)||(10313366-10313660)
chr4 (173-465)||(16359155-16359449)
chr4 (172-465)||(286739-287035)
chr4 (152-426)||(9388293-9388554)
chr4 (173-465)||(4170654-4170955)
chr4 (173-465)||(14698346-14698647)
chr4 (152-326)||(33848460-33848635)
chr4 (264-457)||(53387899-53388096)
chr4 (264-465)||(47127000-47127203)
chr4 (152-308)||(16278635-16278792)
chr4 (172-326)||(16359114-16359270)
chr4 (264-465)||(41791392-41791601)
chr4 (174-330)||(14698268-14698425)
chr4 (174-330)||(4170576-4170733)
chr4 (172-330)||(16278494-16278654)
chr4 (173-326)||(6511435-6511588)
chr4 (169-331)||(13877703-13877858)
chr4 (186-330)||(15242453-15242599)
chr4 (186-331)||(15989930-15990076)
chr4 (152-287)||(53388033-53388170)
chr4 (173-326)||(14942663-14942817)
chr4 (186-330)||(41791273-41791419)
chr4 (188-324)||(56116029-56116166)
chr4 (174-330)||(55503078-55503234)
chr4 (173-379)||(15448344-15448549)
chr4 (169-291)||(21190073-21190195)
chr4 (186-326)||(56116145-56116286)
chr4 (187-411)||(15242333-15242557)
chr4 (158-326)||(15242497-15242666)
chr4 (156-331)||(15989740-15989914)
chr4 (169-291)||(13881362-13881485)
chr4 (172-291)||(15242415-15242533)
chr4 (158-331)||(27027532-27027712)
chr4 (200-330)||(31117421-31117550)
chr4 (172-326)||(6511394-6511549)
chr4 (156-284)||(24047832-24047960)
chr4 (172-289)||(47127138-47127257)
chr4 (173-411)||(6511474-6511713)
chr4 (193-291)||(14942621-14942719)
chr4 (213-325)||(33684861-33684974)
chr4 (173-288)||(15449758-15449872)
chr4 (158-291)||(33684856-33684989)
chr4 (173-331)||(16278572-16278731)
chr4 (158-324)||(56116187-56116353)
chr4 (173-327)||(27027587-27027748)
chr4 (176-331)||(15989960-15990116)
chr4 (173-326)||(41791220-41791375)
chr4 (251-331)||(20899754-20899835)
chr4 (252-323)||(24047832-24047903)
chr4 (172-287)||(41791339-41791453)
chr4 (173-395)||(56115837-56116063)
chr4 (207-291)||(3337084-3337169)
chr4 (158-253)||(20899755-20899849)
chr4 (173-395)||(14942555-14942777)
chr4 (252-331)||(6511435-6511515)
chr4 (242-325)||(15449798-15449882)
chr4 (173-253)||(15990035-15990115)
chr4 (252-330)||(41791261-41791341)
chr4 (173-264)||(3336989-3337079)
chr4 (252-326)||(3336989-3337064)
chr4 (173-291)||(55503039-55503156)
chr4 (172-324)||(56115949-56116103)
chr4 (264-325)||(21190078-21190138)
chr4 (264-331)||(13881419-13881486)
chr4 (252-330)||(56116219-56116298)
chr4 (158-219)||(18221088-18221149)
chr4 (266-330)||(56116101-56116166)
chr4 (194-411)||(27027653-27027874)
chr4 (264-326)||(21190115-21190178)
chr4 (172-249)||(6511551-6511627)
chr4 (213-305)||(15989835-15989928)
chr4 (197-295)||(3336973-3337072)
chr4 (225-326)||(56115987-56116091)
chr4 (193-256)||(27027691-27027754)
chr4 (173-249)||(8710573-8710651)
chr4 (173-324)||(24047750-24047903)
chr4 (185-253)||(53388029-53388097)
chr4 (225-326)||(15449759-15449861)
chr4 (213-287)||(20899759-20899834)
chr4 (250-331)||(47127175-47127258)
chr4 (251-331)||(53388068-53388150)
chr4 (414-465)||(56115780-56115833)
chr4 (270-330)||(13881385-13881446)
chr4 (251-326)||(16278695-16278772)
chr4 (251-330)||(33848480-33848561)
chr4 (173-205)||(31131813-31131845)
chr4 (280-331)||(15449832-15449882)
chr4 (264-395)||(3337103-3337235)
chr4 (234-326)||(8710554-8710651)
chr4 (234-326)||(18079577-18079674)
chr4 (291-328)||(18229792-18229829)
chr4 (289-326)||(21190155-21190192)
chr4 (251-326)||(33684899-33684975)
chr4 (269-331)||(15416929-15416993)
[»] chr8 (76 HSPs)
chr8 (172-465)||(17795049-17795341)
chr8 (173-465)||(28853604-28853895)
chr8 (173-465)||(6608444-6608745)
chr8 (173-465)||(22145561-22145851)
chr8 (152-330)||(17794950-17795129)
chr8 (250-465)||(24707982-24708199)
chr8 (186-465)||(17614584-17614864)
chr8 (172-386)||(7301312-7301525)
chr8 (173-465)||(22059565-22059843)
chr8 (264-465)||(45135097-45135306)
chr8 (156-411)||(20459858-20460115)
chr8 (169-330)||(17614528-17614690)
chr8 (173-330)||(28853525-28853683)
chr8 (172-326)||(22145735-22145892)
chr8 (175-330)||(6608666-6608822)
chr8 (173-324)||(44431648-44431800)
chr8 (186-324)||(44431543-44431682)
chr8 (172-291)||(44523200-44523320)
chr8 (172-326)||(7301449-7301603)
chr8 (172-326)||(22059729-22059884)
chr8 (186-330)||(7301523-7301668)
chr8 (172-287)||(17614609-17614724)
chr8 (173-291)||(32949583-32949700)
chr8 (186-326)||(45135283-45135425)
chr8 (158-409)||(362098-362351)
chr8 (173-326)||(43111949-43112100)
chr8 (158-331)||(21415539-21415713)
chr8 (158-326)||(43111894-43112062)
chr8 (173-326)||(19881766-19881920)
chr8 (170-409)||(32949540-32949780)
chr8 (157-284)||(38186102-38186230)
chr8 (156-284)||(21861647-21861775)
chr8 (173-326)||(45135323-45135477)
chr8 (173-331)||(19881845-19882003)
chr8 (172-287)||(45135245-45135359)
chr8 (158-395)||(363599-363839)
chr8 (160-331)||(19881713-19881885)
chr8 (158-326)||(44431476-44431644)
chr8 (264-331)||(44523199-44523266)
chr8 (234-330)||(44431512-44431610)
chr8 (213-323)||(21861647-21861758)
chr8 (173-382)||(22521830-22522044)
chr8 (172-326)||(7301567-7301721)
chr8 (252-330)||(7301601-7301680)
chr8 (169-248)||(15004830-15004909)
chr8 (156-259)||(20454246-20454348)
chr8 (173-409)||(19881884-19882123)
chr8 (193-331)||(22434635-22434778)
chr8 (252-323)||(38186102-38186174)
chr8 (252-330)||(45135357-45135437)
chr8 (264-331)||(15004071-15004138)
chr8 (173-395)||(15267118-15267344)
chr8 (234-327)||(22434598-22434696)
chr8 (173-247)||(44431766-44431840)
chr8 (251-330)||(44523239-44523320)
chr8 (252-304)||(20454303-20454355)
chr8 (213-291)||(24708118-24708197)
chr8 (212-327)||(15267117-15267238)
chr8 (251-325)||(15004830-15004906)
chr8 (264-324)||(23647586-23647646)
chr8 (172-326)||(44431608-44431762)
chr8 (400-465)||(44431902-44431969)
chr8 (414-465)||(363843-363896)
chr8 (212-327)||(22521924-22522045)
chr8 (172-209)||(24708161-24708198)
chr8 (354-395)||(44431871-44431912)
chr8 (173-269)||(44523183-44523279)
chr8 (173-253)||(45135241-45135319)
chr8 (226-291)||(15004072-15004138)
chr8 (193-325)||(20385147-20385284)
chr8 (225-324)||(44431738-44431840)
chr8 (432-465)||(7301251-7301284)
chr8 (173-210)||(17272816-17272853)
chr8 (172-249)||(22059690-22059766)
chr8 (345-409)||(43112124-43112189)
chr8 (269-331)||(22616614-22616678)
[»] chr3 (98 HSPs)
chr3 (173-465)||(10554073-10554365)
chr3 (172-465)||(14041294-14041590)
chr3 (172-465)||(14037826-14038122)
chr3 (174-463)||(18958546-18958839)
chr3 (173-465)||(2035158-2035452)
chr3 (172-465)||(2038665-2038959)
chr3 (172-465)||(2042406-2042700)
chr3 (172-386)||(15010390-15010605)
chr3 (173-465)||(16799449-16799752)
chr3 (173-386)||(54973041-54973254)
chr3 (173-386)||(54975651-54975864)
chr3 (173-386)||(54978261-54978474)
chr3 (173-382)||(14951722-14951918)
chr3 (152-326)||(16799348-16799524)
chr3 (158-326)||(179739-179909)
chr3 (251-465)||(55292595-55292819)
chr3 (264-386)||(603880-604002)
chr3 (172-326)||(2035337-2035493)
chr3 (172-326)||(2039078-2039234)
chr3 (172-326)||(2042819-2042975)
chr3 (213-465)||(39230431-39230670)
chr3 (173-326)||(2039039-2039193)
chr3 (173-326)||(2042780-2042934)
chr3 (172-331)||(23396053-23396214)
chr3 (193-324)||(10989915-10990047)
chr3 (172-326)||(2038922-2039076)
chr3 (172-326)||(2038961-2039115)
chr3 (172-326)||(2042663-2042817)
chr3 (172-326)||(2042702-2042856)
chr3 (186-326)||(54972935-54973077)
chr3 (186-326)||(54975545-54975687)
chr3 (186-326)||(54978155-54978297)
chr3 (251-386)||(54046463-54046600)
chr3 (172-291)||(603936-604056)
chr3 (158-331)||(6806014-6806187)
chr3 (173-288)||(52338963-52339078)
chr3 (173-289)||(14951841-14951958)
chr3 (172-287)||(179701-179816)
chr3 (212-326)||(10553994-10554109)
chr3 (194-326)||(52339042-52339175)
chr3 (172-289)||(39230430-39230547)
chr3 (172-287)||(16799487-16799604)
chr3 (158-326)||(10989953-10990121)
chr3 (173-331)||(16799409-16799569)
chr3 (158-326)||(52339082-52339250)
chr3 (172-249)||(7631933-7632010)
chr3 (174-326)||(54972884-54973037)
chr3 (174-326)||(54975494-54975647)
chr3 (174-326)||(54978104-54978257)
chr3 (173-409)||(179616-179854)
chr3 (172-330)||(10554033-10554191)
chr3 (156-283)||(10834465-10834592)
chr3 (156-326)||(23396137-23396308)
chr3 (169-249)||(30206558-30206638)
chr3 (172-249)||(54046463-54046540)
chr3 (152-249)||(55292743-55292839)
chr3 (193-331)||(3394996-3395140)
chr3 (172-326)||(52338964-52339118)
chr3 (226-330)||(54972896-54973003)
chr3 (226-330)||(54975506-54975613)
chr3 (226-330)||(54978116-54978223)
chr3 (157-324)||(1989320-1989491)
chr3 (252-322)||(6819014-6819085)
chr3 (252-330)||(10989987-10990066)
chr3 (158-249)||(17211123-17211213)
chr3 (193-326)||(6819033-6819169)
chr3 (252-322)||(10834465-10834535)
chr3 (251-331)||(30206553-30206635)
chr3 (172-253)||(18958625-18958705)
chr3 (193-324)||(1989281-1989416)
chr3 (158-249)||(6818887-6818976)
chr3 (173-253)||(3394997-3395079)
chr3 (251-331)||(16799368-16799450)
chr3 (252-326)||(14951882-14951958)
chr3 (402-465)||(603820-603885)
chr3 (402-465)||(15010330-15010395)
chr3 (193-325)||(15232141-15232278)
chr3 (193-325)||(15238009-15238146)
chr3 (172-249)||(2035298-2035374)
chr3 (251-326)||(7631933-7632010)
chr3 (173-384)||(10989814-10990027)
chr3 (173-395)||(12855881-12856105)
chr3 (193-325)||(10834381-10834516)
chr3 (401-465)||(10989746-10989812)
chr3 (251-326)||(603979-604056)
chr3 (432-465)||(54973282-54973315)
chr3 (432-465)||(54975892-54975925)
chr3 (432-465)||(54978502-54978535)
chr3 (269-326)||(3395083-3395142)
chr3 (269-330)||(15232180-15232243)
chr3 (269-330)||(15238048-15238111)
chr3 (213-291)||(55292739-55292818)
chr3 (252-313)||(6818941-6819003)
chr3 (200-249)||(43928391-43928441)
chr3 (252-289)||(15446424-15446461)
chr3 (252-289)||(17211178-17211215)
chr3 (432-465)||(54046627-54046660)
chr3 (290-330)||(10553995-10554035)
[»] chr7 (120 HSPs)
chr7 (186-465)||(124348-124627)
chr7 (173-465)||(13395639-13395933)
chr7 (172-465)||(13733707-13733996)
chr7 (172-465)||(48784964-48785258)
chr7 (173-465)||(21743475-21743776)
chr7 (264-465)||(4993230-4993430)
chr7 (173-457)||(17505966-17506254)
chr7 (173-457)||(17546960-17547248)
chr7 (172-465)||(8775991-8776292)
chr7 (264-465)||(16006138-16006347)
chr7 (172-326)||(38827797-38827952)
chr7 (152-326)||(13395857-13396034)
chr7 (173-465)||(38827877-38828176)
chr7 (172-326)||(48784846-48785001)
chr7 (156-331)||(14189350-14189525)
chr7 (173-409)||(16573169-16573405)
chr7 (173-409)||(16592257-16592493)
chr7 (174-330)||(21743697-21743854)
chr7 (152-308)||(17506158-17506315)
chr7 (152-308)||(17546899-17547056)
chr7 (172-326)||(16006007-16006161)
chr7 (160-326)||(14192110-14192276)
chr7 (269-396)||(15725496-15725622)
chr7 (173-326)||(13849920-13850074)
chr7 (186-330)||(16005941-16006087)
chr7 (158-291)||(35365924-35366056)
chr7 (158-325)||(13849999-13850168)
chr7 (173-377)||(14192019-14192223)
chr7 (174-330)||(124522-124678)
chr7 (186-326)||(8775925-8776067)
chr7 (173-326)||(13255668-13255819)
chr7 (235-386)||(35365961-35366111)
chr7 (172-291)||(13849878-13849996)
chr7 (158-326)||(16573075-16573245)
chr7 (158-326)||(16592417-16592587)
chr7 (227-324)||(21065502-21065600)
chr7 (186-330)||(4993111-4993257)
chr7 (174-291)||(48743284-48743401)
chr7 (157-284)||(13255414-13255541)
chr7 (213-323)||(11660764-11660874)
chr7 (186-287)||(4993190-4993291)
chr7 (195-291)||(709606-709702)
chr7 (160-280)||(47976002-47976121)
chr7 (172-287)||(16006085-16006199)
chr7 (156-331)||(48743227-48743402)
chr7 (173-326)||(8775873-8776027)
chr7 (212-326)||(13255628-13255742)
chr7 (172-377)||(14189225-14189431)
chr7 (252-331)||(13850033-13850113)
chr7 (213-323)||(13255430-13255541)
chr7 (213-330)||(14192145-14192263)
chr7 (173-326)||(4993059-4993213)
chr7 (173-326)||(16005889-16006043)
chr7 (252-330)||(4993099-4993179)
chr7 (172-287)||(14192072-14192186)
chr7 (173-284)||(16458947-16459056)
chr7 (159-249)||(711021-711110)
chr7 (170-323)||(16458904-16459056)
chr7 (156-284)||(11660747-11660874)
chr7 (172-253)||(17506096-17506177)
chr7 (172-253)||(17547037-17547118)
chr7 (173-331)||(13849955-13850113)
chr7 (172-288)||(16573208-16573322)
chr7 (172-288)||(16592340-16592454)
chr7 (173-291)||(124483-124600)
chr7 (225-409)||(13849798-13849984)
chr7 (172-293)||(13255705-13255825)
chr7 (226-330)||(16458920-16459025)
chr7 (252-330)||(16005929-16006009)
chr7 (206-331)||(40555751-40555882)
chr7 (234-331)||(12202085-12202186)
chr7 (212-327)||(15689865-15689985)
chr7 (212-327)||(15697458-15697578)
chr7 (252-330)||(8775913-8775993)
chr7 (263-324)||(21519348-21519411)
chr7 (262-331)||(709709-709779)
chr7 (169-219)||(13407736-13407786)
chr7 (212-323)||(21519309-21519424)
chr7 (251-330)||(35365938-35366018)
chr7 (269-396)||(15731733-15731863)
chr7 (193-291)||(15731800-15731902)
chr7 (265-331)||(709605-709670)
chr7 (173-324)||(11660803-11660956)
chr7 (251-331)||(13395932-13396014)
chr7 (251-327)||(38827797-38827875)
chr7 (173-253)||(40555752-40555834)
chr7 (172-249)||(13395779-13395855)
chr7 (193-291)||(15725457-15725557)
chr7 (254-291)||(47975964-47976001)
chr7 (400-465)||(21065333-21065400)
chr7 (159-219)||(21735541-21735601)
chr7 (263-330)||(15689878-15689948)
chr7 (263-330)||(15697471-15697541)
chr7 (173-247)||(21065462-21065536)
chr7 (414-465)||(35366118-35366171)
chr7 (158-219)||(13865424-13865485)
chr7 (265-326)||(21065540-21065600)
chr7 (290-323)||(42041338-42041371)
chr7 (213-288)||(711020-711096)
chr7 (262-326)||(11660775-11660838)
chr7 (269-331)||(12208699-12208763)
chr7 (173-253)||(16006125-16006203)
chr7 (269-331)||(39995847-39995911)
chr7 (273-326)||(709648-709702)
chr7 (290-324)||(14038580-14038614)
chr7 (290-324)||(14348610-14348644)
chr7 (212-297)||(16668610-16668699)
chr7 (290-324)||(16668664-16668698)
chr7 (212-297)||(17642980-17643069)
chr7 (290-324)||(17643034-17643068)
chr7 (225-324)||(21065462-21065564)
chr7 (252-294)||(47976026-47976068)
chr7 (251-326)||(711021-711097)
chr7 (290-323)||(17065656-17065689)
chr7 (251-326)||(17506218-17506295)
chr7 (251-326)||(17546919-17546996)
chr7 (269-331)||(7529106-7529170)
chr7 (194-249)||(8757396-8757452)
chr7 (173-205)||(12757143-12757175)
chr7 (290-326)||(21519387-21519423)
[»] scaffold0141 (3 HSPs)
scaffold0141 (193-465)||(32838-33110)
scaffold0141 (174-330)||(32741-32898)
scaffold0141 (173-291)||(32858-32975)
[»] scaffold0049 (3 HSPs)
scaffold0049 (193-465)||(81702-81974)
scaffold0049 (174-330)||(81914-82071)
scaffold0049 (173-291)||(81837-81954)
[»] chr6 (71 HSPs)
chr6 (172-465)||(16101992-16102288)
chr6 (161-462)||(15686289-15686594)
chr6 (172-465)||(12595607-12595902)
chr6 (152-465)||(2288090-2288414)
chr6 (264-465)||(16829541-16829743)
chr6 (264-465)||(16812521-16812723)
chr6 (264-465)||(29492498-29492700)
chr6 (173-465)||(15538912-15539216)
chr6 (264-465)||(8522652-8522861)
chr6 (156-326)||(13763942-13764112)
chr6 (173-325)||(23621241-23621394)
chr6 (152-326)||(15538811-15538988)
chr6 (186-326)||(8522533-8522675)
chr6 (174-291)||(29492446-29492564)
chr6 (172-291)||(16829487-16829607)
chr6 (172-291)||(16812467-16812587)
chr6 (172-326)||(13764270-13764424)
chr6 (156-284)||(23352115-23352243)
chr6 (212-326)||(13764231-13764346)
chr6 (173-287)||(24440865-24440978)
chr6 (173-326)||(23621201-23621354)
chr6 (173-326)||(8522481-8522635)
chr6 (194-326)||(13764057-13764190)
chr6 (172-287)||(8522599-8522713)
chr6 (252-377)||(29848446-29848573)
chr6 (156-285)||(221618-221747)
chr6 (172-275)||(16804648-16804752)
chr6 (173-331)||(13764349-13764507)
chr6 (252-323)||(23352172-23352243)
chr6 (193-326)||(13764134-13764268)
chr6 (171-287)||(29848499-29848615)
chr6 (156-331)||(24266659-24266823)
chr6 (252-330)||(8522521-8522601)
chr6 (185-331)||(13764244-13764389)
chr6 (212-324)||(29265486-29265602)
chr6 (264-314)||(16804702-16804752)
chr6 (234-324)||(21469789-21469879)
chr6 (255-331)||(24440907-24440983)
chr6 (252-324)||(221675-221747)
chr6 (234-382)||(9185881-9186032)
chr6 (173-331)||(13763999-13764155)
chr6 (251-331)||(15538831-15538913)
chr6 (172-288)||(23621200-23621316)
chr6 (264-324)||(25772710-25772770)
chr6 (193-291)||(1584259-1584361)
chr6 (269-396)||(1584298-1584428)
chr6 (193-326)||(1639059-1639198)
chr6 (234-320)||(22346655-22346743)
chr6 (252-331)||(12389483-12389566)
chr6 (269-326)||(12389543-12389602)
chr6 (173-253)||(13751328-13751411)
chr6 (269-324)||(21469786-21469840)
chr6 (264-330)||(29492458-29492525)
chr6 (250-326)||(16812466-16812544)
chr6 (250-326)||(16829486-16829564)
chr6 (237-331)||(17526253-17526351)
chr6 (212-326)||(9185976-9186096)
chr6 (193-379)||(13751278-13751472)
chr6 (173-253)||(8522639-8522717)
chr6 (290-326)||(16804689-16804725)
chr6 (264-324)||(17027209-17027269)
chr6 (290-322)||(21469726-21469758)
chr6 (193-326)||(25806861-25807000)
chr6 (173-253)||(29848495-29848573)
chr6 (193-288)||(12389545-12389644)
chr6 (354-396)||(1590539-1590581)
chr6 (272-331)||(9186012-9186074)
chr6 (290-324)||(18137480-18137514)
chr6 (290-323)||(21476266-21476299)
chr6 (251-326)||(23352131-23352207)
chr6 (290-326)||(23621358-23621394)
[»] chr5 (67 HSPs)
chr5 (186-465)||(43120842-43121120)
chr5 (186-465)||(43124375-43124653)
chr5 (172-465)||(23693108-23693403)
chr5 (172-465)||(16256108-16256402)
chr5 (172-465)||(26361256-26361553)
chr5 (186-465)||(16259741-16260021)
chr5 (186-465)||(22593460-22593740)
chr5 (186-465)||(22597015-22597295)
chr5 (213-465)||(22589905-22590159)
chr5 (161-326)||(22759080-22759246)
chr5 (290-465)||(4397478-4397654)
chr5 (264-465)||(29325412-29325621)
chr5 (264-465)||(26495606-26495815)
chr5 (169-330)||(16256321-16256483)
chr5 (169-330)||(16259915-16260077)
chr5 (170-331)||(22469774-22469936)
chr5 (169-330)||(22593634-22593796)
chr5 (169-330)||(22597189-22597351)
chr5 (173-330)||(43120790-43120946)
chr5 (173-330)||(43124323-43124479)
chr5 (169-330)||(22590079-22590241)
chr5 (186-326)||(29325598-29325740)
chr5 (172-287)||(16259881-16259996)
chr5 (172-287)||(22590045-22590160)
chr5 (172-287)||(22593600-22593715)
chr5 (172-287)||(22597155-22597270)
chr5 (173-330)||(23671480-23671637)
chr5 (186-326)||(26495487-26495629)
chr5 (187-377)||(22357860-22358051)
chr5 (172-324)||(22759004-22759156)
chr5 (152-326)||(27869773-27869946)
chr5 (173-331)||(27869691-27869847)
chr5 (173-287)||(8953034-8953148)
chr5 (193-326)||(27869734-27869867)
chr5 (158-326)||(24277606-24277777)
chr5 (158-326)||(24384436-24384607)
chr5 (173-326)||(26495435-26495589)
chr5 (172-287)||(26495553-26495667)
chr5 (156-326)||(22357951-22358123)
chr5 (172-285)||(29325562-29325674)
chr5 (173-326)||(29325638-29325792)
chr5 (161-249)||(4397426-4397514)
chr5 (172-298)||(23671518-23671644)
chr5 (225-331)||(22759037-22759144)
chr5 (252-330)||(26495475-26495555)
chr5 (173-395)||(22758892-22759116)
chr5 (416-465)||(22880122-22880171)
chr5 (252-331)||(8953029-8953108)
chr5 (252-330)||(29325672-29325752)
chr5 (234-331)||(7785124-7785224)
chr5 (251-330)||(22759154-22759235)
chr5 (173-253)||(22357907-22357986)
chr5 (264-326)||(23693083-23693145)
chr5 (193-307)||(21559443-21559562)
chr5 (269-331)||(21559459-21559523)
chr5 (290-327)||(17023000-17023037)
chr5 (173-248)||(21981017-21981094)
chr5 (290-331)||(22469950-22469991)
chr5 (269-327)||(26706359-26706419)
chr5 (234-325)||(26706362-26706458)
chr5 (269-327)||(26976093-26976153)
chr5 (234-325)||(26976096-26976192)
chr5 (264-327)||(22469963-22470029)
chr5 (414-461)||(22758839-22758888)
chr5 (251-331)||(24277682-24277763)
chr5 (251-331)||(24384450-24384531)
chr5 (173-250)||(26495593-26495668)
[»] scaffold0525 (7 HSPs)
scaffold0525 (173-465)||(11049-11342)
scaffold0525 (173-465)||(8799-9100)
scaffold0525 (152-326)||(8661-8835)
scaffold0525 (172-326)||(11267-11423)
scaffold0525 (172-289)||(11187-11304)
scaffold0525 (251-330)||(8681-8762)
scaffold0525 (251-331)||(11341-11423)
[»] scaffold0131 (4 HSPs)
scaffold0131 (264-454)||(1443-1634)
scaffold0131 (200-287)||(1417-1505)
scaffold0131 (275-330)||(1414-1470)
scaffold0131 (173-253)||(1430-1509)
[»] scaffold0004 (6 HSPs)
scaffold0004 (158-326)||(59151-59318)
scaffold0004 (186-325)||(59217-59356)
scaffold0004 (172-377)||(59242-59450)
scaffold0004 (193-326)||(205344-205483)
scaffold0004 (173-249)||(205344-205422)
scaffold0004 (290-326)||(384091-384127)
[»] scaffold0500 (2 HSPs)
scaffold0500 (169-326)||(11728-11887)
scaffold0500 (173-331)||(11683-11843)
[»] scaffold0860 (2 HSPs)
scaffold0860 (169-326)||(148-306)
scaffold0860 (213-331)||(231-350)
[»] scaffold0151 (2 HSPs)
scaffold0151 (158-409)||(2106-2359)
scaffold0151 (158-409)||(8950-9203)
[»] scaffold0126 (1 HSPs)
scaffold0126 (158-409)||(5685-5937)
[»] scaffold0381 (1 HSPs)
scaffold0381 (169-331)||(13981-14146)
[»] scaffold0338 (2 HSPs)
scaffold0338 (156-331)||(3978-4153)
scaffold0338 (173-379)||(3888-4096)
[»] scaffold0042 (5 HSPs)
scaffold0042 (160-331)||(50684-50856)
scaffold0042 (216-287)||(50939-51010)
scaffold0042 (172-331)||(50774-50936)
scaffold0042 (234-326)||(50878-50972)
scaffold0042 (264-331)||(50949-51015)
[»] scaffold0008 (7 HSPs)
scaffold0008 (173-377)||(12455-12662)
scaffold0008 (180-331)||(13145-13296)
scaffold0008 (226-331)||(12582-12688)
scaffold0008 (173-331)||(13105-13263)
scaffold0008 (184-331)||(12543-12690)
scaffold0008 (172-331)||(13065-13226)
scaffold0008 (185-249)||(13030-13094)
[»] scaffold0003 (5 HSPs)
scaffold0003 (173-324)||(137562-137714)
scaffold0003 (158-326)||(137468-137638)
scaffold0003 (400-465)||(137816-137883)
scaffold0003 (186-326)||(137535-137676)
scaffold0003 (357-395)||(137788-137826)
[»] scaffold0109 (8 HSPs)
scaffold0109 (187-324)||(2140-2278)
scaffold0109 (186-330)||(2061-2206)
scaffold0109 (158-326)||(1994-2162)
scaffold0109 (252-330)||(2049-2128)
scaffold0109 (227-326)||(2140-2240)
scaffold0109 (173-395)||(2166-2390)
scaffold0109 (414-465)||(2394-2447)
scaffold0109 (172-247)||(2204-2278)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (172-382)||(6032-6243)
[»] scaffold0609 (4 HSPs)
scaffold0609 (169-326)||(4313-4471)
scaffold0609 (172-325)||(4395-4548)
scaffold0609 (173-326)||(4357-4510)
scaffold0609 (172-291)||(4434-4553)
[»] scaffold0058 (4 HSPs)
scaffold0058 (173-326)||(40175-40328)
scaffold0058 (173-325)||(40137-40289)
scaffold0058 (153-326)||(40214-40388)
scaffold0058 (172-291)||(40132-40251)
[»] scaffold0586 (1 HSPs)
scaffold0586 (158-331)||(1488-1662)
[»] scaffold0034 (3 HSPs)
scaffold0034 (169-326)||(34916-35074)
scaffold0034 (193-409)||(34794-35011)
scaffold0034 (173-291)||(34873-34991)
[»] scaffold0026 (9 HSPs)
scaffold0026 (173-326)||(20883-21038)
scaffold0026 (158-315)||(20788-20948)
scaffold0026 (173-291)||(20963-21079)
scaffold0026 (158-316)||(23866-24026)
scaffold0026 (212-324)||(35577-35691)
scaffold0026 (251-331)||(20802-20884)
scaffold0026 (251-331)||(23880-23962)
scaffold0026 (264-325)||(23934-23996)
scaffold0026 (234-324)||(24771-24863)
[»] scaffold0021 (3 HSPs)
scaffold0021 (264-465)||(134142-134326)
scaffold0021 (172-287)||(134263-134380)
scaffold0021 (250-327)||(134302-134381)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (172-331)||(2777-2936)
[»] scaffold0825 (2 HSPs)
scaffold0825 (187-411)||(1719-1945)
scaffold0825 (158-331)||(1840-2013)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (158-331)||(10554-10728)
[»] scaffold0447 (1 HSPs)
scaffold0447 (158-331)||(13898-14073)
[»] scaffold0395 (6 HSPs)
scaffold0395 (173-324)||(8961-9112)
scaffold0395 (185-324)||(8841-8983)
scaffold0395 (226-324)||(8921-9021)
scaffold0395 (400-465)||(8672-8739)
scaffold0395 (354-395)||(8729-8770)
scaffold0395 (290-331)||(10060-10101)
[»] scaffold0383 (1 HSPs)
scaffold0383 (158-331)||(11893-12068)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (156-285)||(223630-223759)
scaffold0012 (252-324)||(223630-223702)
[»] scaffold0491 (2 HSPs)
scaffold0491 (251-331)||(10466-10547)
scaffold0491 (172-253)||(10466-10546)
[»] scaffold0635 (3 HSPs)
scaffold0635 (158-285)||(6709-6836)
scaffold0635 (252-324)||(6764-6836)
scaffold0635 (173-324)||(6764-6918)
[»] scaffold0007 (3 HSPs)
scaffold0007 (193-278)||(165629-165714)
scaffold0007 (271-326)||(165658-165714)
scaffold0007 (264-317)||(165629-165681)
[»] scaffold0556 (1 HSPs)
scaffold0556 (156-331)||(9546-9739)
[»] scaffold1276 (2 HSPs)
scaffold1276 (169-249)||(128-207)
scaffold1276 (251-407)||(131-289)
[»] scaffold1098 (4 HSPs)
scaffold1098 (158-316)||(1050-1210)
scaffold1098 (251-331)||(1064-1146)
scaffold1098 (264-325)||(1118-1180)
scaffold1098 (234-324)||(1955-2047)
[»] scaffold0069 (2 HSPs)
scaffold0069 (212-382)||(34475-34649)
scaffold0069 (269-382)||(29298-29411)
[»] scaffold0364 (1 HSPs)
scaffold0364 (193-326)||(7048-7186)
[»] scaffold0130 (2 HSPs)
scaffold0130 (270-326)||(2812-2869)
scaffold0130 (234-288)||(2811-2867)
[»] scaffold0016 (3 HSPs)
scaffold0016 (158-219)||(120021-120082)
scaffold0016 (269-331)||(183052-183116)
scaffold0016 (213-253)||(174911-174952)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (173-379)||(21715-21926)
scaffold0011 (212-327)||(21806-21927)
[»] scaffold0216 (2 HSPs)
scaffold0216 (272-323)||(21271-21322)
scaffold0216 (156-324)||(21233-21404)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (266-395)||(4843-4972)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (212-324)||(177909-178026)
scaffold0020 (269-319)||(178010-178060)
[»] scaffold2046 (2 HSPs)
scaffold2046 (173-253)||(91-174)
scaffold2046 (193-379)||(30-224)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (193-396)||(33625-33834)
[»] scaffold1336 (1 HSPs)
scaffold1336 (212-320)||(848-958)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (173-245)||(20744-20818)
[»] scaffold0023 (1 HSPs)
scaffold0023 (432-465)||(162359-162392)
[»] scaffold0371 (2 HSPs)
scaffold0371 (234-331)||(5316-5416)
scaffold0371 (290-323)||(7227-7260)
[»] scaffold0322 (1 HSPs)
scaffold0322 (264-324)||(19374-19434)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (234-331)||(28059-28159)
[»] scaffold0273 (1 HSPs)
scaffold0273 (193-328)||(6554-6696)
[»] scaffold0180 (2 HSPs)
scaffold0180 (269-326)||(29361-29420)
scaffold0180 (173-224)||(29346-29398)
[»] scaffold0865 (1 HSPs)
scaffold0865 (290-324)||(30-64)
[»] scaffold0859 (1 HSPs)
scaffold0859 (269-325)||(187-245)
[»] scaffold0575 (1 HSPs)
scaffold0575 (270-324)||(8674-8728)
[»] scaffold0309 (2 HSPs)
scaffold0309 (345-395)||(6004-6054)
scaffold0309 (345-395)||(8156-8206)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (269-323)||(20876-20930)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (290-324)||(17866-17900)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (290-324)||(27043-27077)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (193-247)||(524714-524768)
scaffold0001 (269-324)||(524712-524768)
[»] scaffold0388 (1 HSPs)
scaffold0388 (234-326)||(16074-16171)
[»] scaffold0244 (1 HSPs)
scaffold0244 (266-323)||(13698-13755)
[»] scaffold0071 (1 HSPs)
scaffold0071 (252-289)||(15731-15768)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 275; Significance: 1e-153; HSPs: 66)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 152 - 465
Target Start/End: Original strand, 296157 - 296464
Alignment:
Q  152 ggtagcaccatttccatcgtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacgg 251  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  296157 ggtatcaccatttctatcgtgttgaatgactaagcattccggggcttaagcccccaacaatttgaatgacaagacattccagggcataagccctcaacgg 296256  T
Q  252 ttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactca 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  296257 ttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactca 296356  T
Q  352 acttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacagcaacaacataggcaacgacaacgatcgtgcataataactcactcactccccaacttggtcaaca 451  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  296357 acttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacagcaacaacatagg------caacgatcgtgcataataactcactcactccccaacttggtcaaca 296450  T
Q  452 tcaacaacctatga 465  Q
    ||||||||||||||    
T  296451 tcaacaacctatga 296464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 172 - 465
Target Start/End: Original strand, 36181224 - 36181520
Alignment:
Q  172 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt-gaatgattaa-cattcc 269  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||  |  ||||||    
T  36181224 gttgaatgactaagcatttcggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattcc 36181323  T
Q  270 agggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactcaacttgtgtatatcagcat 369  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  36181324 agggcataagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagattcctaatcatgaa-ggactcaacttgtgtatatcagcat 36181422  T
Q  370 acaactcaactacgacagcaacaacataggcaacgacaacgatcgtgcataataac--tcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 465  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36181423 acaactcaactacgacaacgacaacataggcaacgacaacgaccgtgcataataactatgactcactccccaacttgatcaacatcaacaacctatga 36181520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 173 - 465
Target Start/End: Original strand, 20630967 - 20631261
Alignment:
Q  173 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattccag 271  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||    
T  20630967 ttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaagcattccag 20631066  T
Q  272 ggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactcaacttgtgtatatcagcatac 371  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20631067 ggcataagccctcaacagttgaatgacatagcattccagggcataagccctcaacagattcctaatcatgaa-ggactcaacttgtgtatatcagcatac 20631165  T
Q  372 aactcaactacgacagcaacaacataggcaacgacaacgatcgtgcataataac--tcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 465  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20631166 aactcaactacgacaacgacaacataggcaacgacaacgaccgtgcataataactatgactcactccccaacttgatcaacatcaacaacctatga 20631261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 264 - 465
Target Start/End: Original strand, 45307034 - 45307234
Alignment:
Q  264 cattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactcaacttgtgtatat 363  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  45307034 cattccagggcataagccctcaacggttgaatgacga-gcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactcgacttgtgtatat 45307132  T
Q  364 cagcatacaactcaactacgacagcaacaacataggcaacgacaacgatcgtgcataataactcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctat 463  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45307133 cagcatacaactcaactacgacagcaacaacataggcaacgacaacgatcgtgcataataactcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctat 45307232  T
Q  464 ga 465  Q
    ||    
T  45307233 ga 45307234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 172 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 14432819 - 14432528
Alignment:
Q  172 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-ggttgaatgattaa-cattcc 269  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||  || ||||||    
T  14432819 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaagcattcc 14432720  T
Q  270 agggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactcaacttgtgtatatcagcat 369  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14432719 agggcatgagcccccaacagttgaatgacatagcattccagggcataagccctcaacagattcctaatcatg-aaggactcaacttgtgtatatcagcat 14432621  T
Q  370 acaactcaactacgacagcaacaacataggcaacgacaacgatcgtgcataataac--tcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 465  Q
    ||||||||||||||||| | | |||     |||||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14432620 acaactcaactacgacaacgataac-----caacgacaacgaccgtgcataataactatgactcactccccaacttgatcaacatcaacaacctatga 14432528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 173 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 2333446 - 2333147
Alignment:
Q  173 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagg 272  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||| ||||| |||||  |||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2333446 ttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggttgaatgattaacactccagg 2333348  T
Q  273 gcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactcaacttgtgtatatcagcatac 371  Q
    ||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  2333347 gcacgagccctcgacagattgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacgg-ttcctaatcatgaaaagactccacttgtgtatatcagcatac 2333249  T
Q  372 aactcaactacgacagcaacaacataggcaacg------acaacgatcgtgcataataac--tcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctat 463  Q
    |||| |||||||||| | |||||||  ||||||      |||||||  ||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2333248 aacttaactacgacaacgacaacatgtgcaacgacaaccacaacgacggtgcataataactatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacctat 2333149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 186 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 22900706 - 22900426
Alignment:
Q  186 cattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt-gaatgattaa-cattccagggcatgagccct 283  Q
    |||||| |||||||||||| ||||  || |||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||  || ||||||  |  ||||||||||||||||||||    
T  22900706 cattccagggcataagccctcaacggtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccct 22900608  T
Q  284 caacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactcaacttgtgtatatcagcatacaactcaactacg 383  Q
    |||| |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22900607 caacggttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaa-ggactcaacttgtgtatatcagcatacaactcaactacg 22900510  T
Q  384 acagcaacaacataggcaacgacaacgatcgtgcataataac--tcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 465  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||    
T  22900509 acaacgacaacataggcaacgacaacgaccgtgcataataactatgactcactccccaactcgatcaacatcaaccacctatga 22900426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 172 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 2333527 - 2333367
Alignment:
Q  172 gttgaatgactaagcattccggggcataagccccc-aacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattcca 270  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2333527 gttgaatgactaagcattccggggcataagccccccaacaatttgaatgacaaggcattccaaggcatgagccctcaacgattgaatgattaacattcca 2333428  T
Q  271 gggcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtt 330  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2333427 gggcatgagccctcaacagattgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtt 2333367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 173 - 386
Target Start/End: Original strand, 20579119 - 20579331
Alignment:
Q  173 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattccag 271  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||| ||||| |||||  |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||  || ||||||||    
T  20579119 ttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacaattgaatgacaaaacattccag 20579217  T
Q  272 ggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactcaacttgtgtatatcagcatac 371  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  20579218 ggcataagccctcaacggttgaatgacga-gcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactcgacttgtgtatatcaacatac 20579316  T
Q  372 aactcaactacgaca 386  Q
    |||||||||||||||    
T  20579317 aactcaactacgaca 20579331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 173 - 386
Target Start/End: Original strand, 20586812 - 20587024
Alignment:
Q  173 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattccag 271  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||| ||||| |||||  |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||  || ||||||||    
T  20586812 ttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacaattgaatgacaaaacattccag 20586910  T
Q  272 ggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactcaacttgtgtatatcagcatac 371  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  20586911 ggcataagccctcaacggttgaatgacga-gcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactcgacttgtgtatatcaacatac 20587009  T
Q  372 aactcaactacgaca 386  Q
    |||||||||||||||    
T  20587010 aactcaactacgaca 20587024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 303 - 465
Target Start/End: Original strand, 37358254 - 37358417
Alignment:
Q  303 cattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactcaacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacagcaacaacataggcaa 402  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  37358254 cattccagggcatgagccctcaacagtgtcctaatcatgaa-ggactcaacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacgacaacataggcaa 37358352  T
Q  403 cgacaacgatcgtgcataataac--tcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 465  Q
    ||||||||| |||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37358353 cgacaacgaccgtgcacaataactatgactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 37358417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 264 - 386
Target Start/End: Original strand, 24087182 - 24087304
Alignment:
Q  264 cattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactcaacttgtgtatat 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24087182 cattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattctagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatgaaaggactcaacttgtgtatat 24087281  T
Q  364 cagcatacaactcaactacgaca 386  Q
    |||||||||||||| ||||||||    
T  24087282 cagcatacaactcatctacgaca 24087304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 172 - 326
Target Start/End: Original strand, 20630926 - 20631082
Alignment:
Q  172 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-ggttgaatgattaa-cattcc 269  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||  || ||||||    
T  20630926 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaagcattcc 20631025  T
Q  270 agggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 326  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20631026 agggcataagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaac 20631082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 173 - 326
Target Start/End: Original strand, 20586733 - 20586887
Alignment:
Q  173 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-ggttgaatgattaacattccag 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  20586733 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatga-acattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaacattccag 20586831  T
Q  272 ggcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 326  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20586832 ggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaac 20586887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 169 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 22900762 - 22900600
Alignment:
Q  169 cgtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-catt 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || ||||    
T  22900762 cgtgttgaatgactaagcattccggagcataagcccccaacaatttgaatgatga-acattccagggcataagccctcaacggttgaatgacaaagcatt 22900664  T
Q  268 ccagggcatgagccctcaac-agttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtt 330  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22900663 ccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacggtt 22900600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 156 - 331
Target Start/End: Original strand, 20901001 - 20901175
Alignment:
Q  156 gcaccatttccatcgtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttga 255  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||  | || ||||||||||||| |||||    
T  20901001 gcaccattttcaacgtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccc-aacaatttgaatgataa-acattgaagggaataagccctcaacagttga 20901098  T
Q  256 atgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggttt 331  Q
    ||||  || ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20901099 atgacaaagcattccatggcataagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggttt 20901175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 173 - 326
Target Start/End: Original strand, 20579040 - 20579194
Alignment:
Q  173 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-ggttgaatgattaacattccag 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | || ||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  20579040 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatga-acgttccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaacattccag 20579138  T
Q  272 ggcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 326  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20579139 ggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaac 20579194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 172 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 22900681 - 22900566
Alignment:
Q  172 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccag 271  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22900681 gttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacggttgaatgattaacattccag 22900582  T
Q  272 ggcatgagccctcaac 287  Q
    ||||||||||||||||    
T  22900581 ggcatgagccctcaac 22900566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 186 - 330
Target Start/End: Original strand, 45306915 - 45307061
Alignment:
Q  186 cattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagaca-ttccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagggcatgagccctc 284  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||  |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45306915 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcaattccagggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagggcatgagccctc 45307014  T
Q  285 aac-agttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtt 330  Q
    ||| | ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  45307015 aacaatttgaatggcaaggcattccagggcataagccctcaacggtt 45307061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 186 - 312
Target Start/End: Original strand, 293834 - 293961
Alignment:
Q  186 cattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagggcatgagccctca 285  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  293834 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccaaggcataagccctcaacagttgaatgattaacattccagggcatgagccctca 293933  T
Q  286 ac-agttgaatgacaaagcattccaggg 312  Q
    || | ||||||||||| |||||||||||    
T  293934 acaaattgaatgacaaggcattccaggg 293961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 161 - 291
Target Start/End: Original strand, 24087117 - 24087248
Alignment:
Q  161 atttccatcgtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgat 260  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||| |||||||||     
T  24087117 atttccaacatgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgataaggcattccagggcatgagccctcaacagttgaatgac 24087216  T
Q  261 taa-cattccagggcatgagccctcaacagtt 291  Q
     || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24087217 aaagcattctagggcatgagccctcaacagtt 24087248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 157 - 284
Target Start/End: Original strand, 28312068 - 28312195
Alignment:
Q  157 caccatttccatcgtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaa 256  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28312068 caccattttcaacgtgttgaatgactaagcattccggggcaaaagcccccaacaatttgaatgataa-acattccaaggcataagccctcaacagttgaa 28312166  T
Q  257 tgattaa-cattccagggcatgagccctc 284  Q
    |||  || |||| ||||||||||||||||    
T  28312167 tgacaaagcatttcagggcatgagccctc 28312195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 173 - 326
Target Start/End: Original strand, 18823462 - 18823617
Alignment:
Q  173 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-ggttgaatgatta-acattcca 270  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| | ||||| |||||||||| | ||||||||  |  |||||||    
T  18823462 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgataa-acattctagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattcca 18823560  T
Q  271 gggcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 326  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  18823561 gggcatgaaccctcaacagtttgaatgaaaaggcattccagggcataagccctcaac 18823617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 158 - 326
Target Start/End: Original strand, 293767 - 293935
Alignment:
Q  158 accatttccatcgtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-ggttgaa 256  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||| ||||| |||||||||| | |||||    
T  293767 accattttcaacgagttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatga-tcattccagggcatgagccctcaacagattgaa 293865  T
Q  257 tgatta-acattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 326  Q
    |||  |  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||    
T  293866 tgacaaggcattccaaggcataagccctcaacagttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaac 293935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 158 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 21181643 - 21181475
Alignment:
Q  158 accatttccatcgtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-ggttgaa 256  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||  |||| |||||||||| | |||||    
T  21181643 accattttcaacgtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgataa-accttccagagcatgagccctcaacagtttgaa 21181545  T
Q  257 tgatta-acattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 326  Q
    |||  |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || ||||||| ||||| ||||||||||    
T  21181544 tgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgattaa-cattccatggcataagccctcaac 21181475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 173 - 287
Target Start/End: Original strand, 18823541 - 18823655
Alignment:
Q  173 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagg 272  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||| | ||| ||||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18823541 ttgaatgacaaggcattccagggcatgaaccctcaacagtttgaatgaaaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgattaacattccagg 18823640  T
Q  273 gcatgagccctcaac 287  Q
    |||||||||||||||    
T  18823641 gcatgagccctcaac 18823655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 195 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 21181567 - 21181430
Alignment:
Q  195 gcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaac-agttga 293  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||    
T  21181567 gcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgattaacattccatggcataagccctcaacaatttga 21181468  T
Q  294 atgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttc 332  Q
    || | ||| ||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  21181467 atcataaa-cattctagggcatgagccctcaacagtttc 21181430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 158 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 28204830 - 28204696
Alignment:
Q  158 accatttccatcgtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-ggttgaa 256  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| | ||||| |||||||||| | |||||    
T  28204830 accattttcaacgtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgataa-acattctagggcatgagccctcaacagtttgaa 28204732  T
Q  257 tgatta-acattccagggcatgagccctcaacagtt 291  Q
    |||  |  ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28204731 tgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtt 28204696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 172 - 287
Target Start/End: Original strand, 45306981 - 45307095
Alignment:
Q  172 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccag 271  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||    
T  45306981 gttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatggcaaggcattccagggcataagccctcaacggttgaatgacgagcattccag 45307079  T
Q  272 ggcatgagccctcaac 287  Q
    ||||||||||||||||    
T  45307080 ggcatgagccctcaac 45307095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 173 - 326
Target Start/End: Original strand, 45306863 - 45307017
Alignment:
Q  173 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-ggttgaatgatta--acattcc 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | |||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||  |    |||||    
T  45306863 ttgaatgactaagcattccggggcataagccccccacaatttgaatgatga-acattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcaattcc 45306961  T
Q  270 agggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 326  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||    
T  45306962 agggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaac 45307017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 213 - 331
Target Start/End: Original strand, 20901095 - 20901215
Alignment:
Q  213 ttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccag 310  Q
    |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| |||    
T  20901095 ttgaatgacaaagcattccatggcataagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttgaatgacaaggcattacag 20901194  T
Q  311 ggcatgagccctcaacggttt 331  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  20901195 ggcatgagccctcaacagttt 20901215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 172 - 288
Target Start/End: Original strand, 16400611 - 16400729
Alignment:
Q  172 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-ggttgaatg-attaacattc- 268  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | || |||||     
T  16400611 gttgaatgactaagcattccggggaataagcccccaacaatttgaatgataa-acattccaaggcatgagccctcaacagtttgaatgaactagcattca 16400709  T
Q  269 cagggcatgagccctcaaca 288  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  16400710 cagggcatgagccctcaaca 16400729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 173 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 21181549 - 21181397
Alignment:
Q  173 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt-gaatgattaacattccag 271  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||| || ||||||  | |||||||| ||||||||||||||||  || |||| || ||||||| ||    
T  21181549 ttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtt-gaatgatta-acattccatggcataagccctcaacaatttgaatcataaacattctag 21181452  T
Q  272 ggcatgagccctcaacagttg-aatgacaaagcattccagggcatgagccctcaa 325  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21181451 ggcatgagccctcaacagtttcaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaa 21181397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 156 - 249
Target Start/End: Original strand, 18270183 - 18270275
Alignment:
Q  156 gcaccatttccatcgtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac 249  Q
    |||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||| ||||||||||    
T  18270183 gcactattttcaacgtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgataa-acactccagggcatgagccctcaac 18270275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 156 - 249
Target Start/End: Original strand, 18274837 - 18274929
Alignment:
Q  156 gcaccatttccatcgtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac 249  Q
    |||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||| ||||||||||    
T  18274837 gcactattttcaacgtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgataa-acactccagggcatgagccctcaac 18274929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 252 - 377
Target Start/End: Original strand, 18270240 - 18270368
Alignment:
Q  252 ttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatg-aaaggact 349  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  | |  ||| || |||||    
T  18270240 ttgaatgataaacactccagggcatgagccctcaacagtttgaaagacaaggcattccagggcataagccctcaacggttttatgagtatgcaatggact 18270339  T
Q  350 caac-ttgtgtatatcagcatacaactca 377  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||    
T  18270340 caactttgtgtatatcaacatacaactca 18270368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 252 - 377
Target Start/End: Original strand, 18274894 - 18275022
Alignment:
Q  252 ttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatg-aaaggact 349  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  | |  ||| || |||||    
T  18274894 ttgaatgataaacactccagggcatgagccctcaacagtttgaaagacaaggcattccagggcataagccctcaacggttttatgagtatgcaatggact 18274993  T
Q  350 caac-ttgtgtatatcagcatacaactca 377  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||    
T  18274994 caactttgtgtatatcaacatacaactca 18275022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 193 - 327
Target Start/End: Original strand, 18823521 - 18823656
Alignment:
Q  193 gggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt-gaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagt 290  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||| ||| ||||||  |  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  18823521 gggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattccagggcatgaaccctcaacagtttgaatgaaaaggcattccagggcataagccctcaacagt 18823620  T
Q  291 tgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacg 327  Q
    |||||||  || |||||||||||||||||||||||||    
T  18823621 tgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacg 18823656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 252 - 323
Target Start/End: Original strand, 28312124 - 28312195
Alignment:
Q  252 ttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctc 323  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28312124 ttgaatgataaacattccaaggcataagccctcaacagttgaatgacaaagcatttcagggcatgagccctc 28312195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 212 - 331
Target Start/End: Original strand, 18823461 - 18823582
Alignment:
Q  212 tttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt-gaatgattaacattccagggcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattcca 309  Q
    |||||||||| |  ||||||  ||||||||||| ||||  || ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  18823461 tttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgataaacattctagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattcca 18823560  T
Q  310 gggcatgagccctcaacggttt 331  Q
    |||||||| |||||||| ||||    
T  18823561 gggcatgaaccctcaacagttt 18823582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 252 - 330
Target Start/End: Original strand, 45306903 - 45306983
Alignment:
Q  252 ttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagc-attccagggcatgagccctcaacggtt 330  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||    
T  45306903 ttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcaattccagggcataagccctcaacggtt 45306983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 252 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 28204775 - 28204700
Alignment:
Q  252 ttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 326  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  28204775 ttgaatgataaacattctagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaac 28204700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 231 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 21528957 - 21528853
Alignment:
Q  231 caaggcataagccctcaacggttgaatgat-taacattc-cagggcatgagccctcaacagttg-aatgacaaagcattcc-agggcatgagccctcaac 326  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  || ||||| |||||||| || |||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21528957 caaggcataagccctcaacgattgaatgaactagcattcacagggcataagacctcaacagttggaatgataaagcattcccagggcatgagccctcaac 21528858  T
Q  327 ggttt 331  Q
    |||||    
T  21528857 ggttt 21528853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 156 - 249
Target Start/End: Original strand, 19209407 - 19209500
Alignment:
Q  156 gcaccatttccatcgtgttgaatgact-aagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac 249  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||| ||||||||||    
T  19209407 gcaccattttcaacgtgttgaatgacttaagcattccaggggataagcccccaacaatttgaataataa-acattccagggcatgagccctcaac 19209500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 172 - 218
Target Start/End: Original strand, 37358201 - 37358247
Alignment:
Q  172 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaat 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37358201 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaat 37358247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 252 - 322
Target Start/End: Original strand, 19209465 - 19209536
Alignment:
Q  252 ttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccct 322  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  19209465 ttgaataataaacattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattccaaggcataagccct 19209536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 402 - 465
Target Start/End: Original strand, 24087299 - 24087364
Alignment:
Q  402 acgacaacgatcgtgcataataactc--actcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 465  Q
    |||||||||||||||||||||||||   ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24087299 acgacaacgatcgtgcataataactatgacatactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 24087364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 252 - 326
Target Start/End: Original strand, 16400652 - 16400728
Alignment:
Q  252 ttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattc-cagggcatgagccctcaac 326  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||    
T  16400652 ttgaatgataaacattccaaggcatgagccctcaacagtttgaatgaactagcattcacagggcatgagccctcaac 16400728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 245
Target Start/End: Original strand, 19209477 - 19209536
Alignment:
Q  186 cattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccct 245  Q
    |||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19209477 cattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattccaaggcataagccct 19209536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 172 - 249
Target Start/End: Original strand, 20631045 - 20631121
Alignment:
Q  172 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac 249  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||| | ||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||    
T  20631045 gttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaac-agttgaatgacatagcattccagggcataagccctcaac 20631121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 172 - 249
Target Start/End: Original strand, 20901133 - 20901210
Alignment:
Q  172 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac 249  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||  ||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||    
T  20901133 gttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttgaatgacaaggcattacagggcatgagccctcaac 20901210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 400 - 465
Target Start/End: Original strand, 294076 - 294143
Alignment:
Q  400 caacgacaacgatcgtgcataataactc--actcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 465  Q
    |||||||||| |  |||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  294076 caacgacaacaactgtgcataataactatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 294143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 193 - 253
Target Start/End: Original strand, 18270259 - 18270319
Alignment:
Q  193 gggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt 253  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18270259 gggcatgagccctcaacagtttgaaagacaaggcattccagggcataagccctcaacggtt 18270319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 193 - 253
Target Start/End: Original strand, 18274913 - 18274973
Alignment:
Q  193 gggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt 253  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18274913 gggcatgagccctcaacagtttgaaagacaaggcattccagggcataagccctcaacggtt 18274973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 172 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 21181511 - 21181350
Alignment:
Q  172 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttg-aatgattaa-cattcc 269  Q
    ||||||||| ||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||||| | || |||||| | ||||| |||||||||| |||  |||||  |  ||||||    
T  21181511 gttgaatgattaa-cattccatggcataagccctcaacaatttgaatcataa-acattctagggcatgagccctcaacagtttcaatgacaaggcattcc 21181414  T
Q  270 agggcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattc-cagggcatgagccctcaacggttt 331  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| || ||||| |||||| ||| ||||    
T  21181413 agggcatgagccctcaatagtttgaatgacaaggcattcacaaggcataagcccttaacagttt 21181350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 250 - 331
Target Start/End: Original strand, 36181223 - 36181306
Alignment:
Q  250 ggttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggttt 331  Q
    |||||||||| ||| |||| | |||||| ||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36181223 ggttgaatgactaagcatttcggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagttt 36181306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 269 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 44823165 - 44823106
Alignment:
Q  269 cagggcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattc-cagggcatgagccctcaac 326  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||    
T  44823165 cagggcatgagccctcaacagtttgaatgattaagcattcacagggcatgagccctcaac 44823106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 354 - 395
Target Start/End: Original strand, 294045 - 294086
Alignment:
Q  354 ttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacagcaacaaca 395  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  294045 ttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacgacaaca 294086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 251 - 326
Target Start/End: Original strand, 24087128 - 24087205
Alignment:
Q  251 gttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 326  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||||| ||||| ||||| || |||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  24087128 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgataaggcattccagggcatgagccctcaac 24087205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 290 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 25092528 - 25092495
Alignment:
Q  290 ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctc 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25092528 ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctc 25092495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 266 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 7792882 - 7792755
Alignment:
Q  266 ttccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaa-ggactcaacttgtgtatatc 364  Q
    |||||||||||||||||||     ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| || |||  || | |||  | ||||||||||||||||||||    
T  7792882 ttccagggcatgagccctcccgctttgaacgacaaggcgttccagggcatgagccctcaccgcttta-tatttatgccatggactcaacttgtgtatatc 7792784  T
Q  365 agcatacaactcaactacgacagcaacaa 393  Q
      ||||||||||||| || ||| ||||||    
T  7792783 tacatacaactcaacaacaacaacaacaa 7792755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 269 - 331
Target Start/End: Original strand, 8683035 - 8683099
Alignment:
Q  269 cagggcatgagccctcaacagttg-aatgacaaagcattcc-agggcatgagccctcaacggttt 331  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8683035 cagggcataagccctcaacagttggaacgattaagcattcccagggcatgagccctcaacggttt 8683099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 234 - 324
Target Start/End: Original strand, 24959989 - 24960081
Alignment:
Q  234 ggcataagccctcaacggttgaatg-attaacattc-cagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctca 324  Q
    |||||||||||||| |  ||||||| | || ||||| |||||||| |||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  24959989 ggcataagccctcaccaattgaatgtactagcattcacagggcatcagccctcaccaattgaacgacaaggcgttccagggcatgagccctca 24960081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 212 - 253
Target Start/End: Original strand, 52983193 - 52983235
Alignment:
Q  212 tttgaatgacaagacattc-caaggcataagccctcaacggtt 253  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  52983193 tttgaatgacaagacattcacatggcataagccctcaacggtt 52983235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 323
Target Start/End: Original strand, 24959926 - 24959959
Alignment:
Q  290 ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctc 323  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24959926 ttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctc 24959959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 432 - 464
Target Start/End: Original strand, 20579359 - 20579391
Alignment:
Q  432 actccccaacttggtcaacatcaacaacctatg 464  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20579359 actccccaacttggccaacatcaacaacctatg 20579391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 258; Significance: 1e-143; HSPs: 75)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 172 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 23339635 - 23339343
Alignment:
Q  172 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccag 271  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23339635 gttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgattaacattccag 23339537  T
Q  272 ggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactcaacttgtgtatatcagcatac 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23339536 ggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactcaacttgtgtatatcagcatac 23339437  T
Q  372 aactcaactacgacagcaacaacataggcaacgacaacgatcgtgcataataactcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23339436 aactcaactacgacagcaacaacataggcaacgacaacgatcgtgcataataactcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 23339343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 186 - 465
Target Start/End: Original strand, 31755602 - 31755881
Alignment:
Q  186 cattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagggcatgagccctca 285  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  31755602 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacggttgaatgacgagcattccagggcatgagccctca 31755701  T
Q  286 acagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactcaacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgac 385  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31755702 acggttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatgaaaggactccacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgac 31755801  T
Q  386 agcaacaacataggcaacgacaacgatcgtgcataataactcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 465  Q
    |  |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31755802 aataacaacataggtgacgacaacgattgtgcataataactcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 31755881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 172 - 465
Target Start/End: Original strand, 44620583 - 44620873
Alignment:
Q  172 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatga-ttaacattcca 270  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||  || |||||||    
T  44620583 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacatagcattcca 44620682  T
Q  271 gggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactcaacttgtgtatatcagcata 370  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44620683 gggcataagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagattcctaatcatg-aaggactcaacttgtgtatatcagcata 44620781  T
Q  371 caactcaactacgacagcaacaacataggcaacgacaacgatcgtgcataataac--tcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 465  Q
    |||||||||||||||| | |||||     |||||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44620782 caactcaactacgacaacgacaac-----caacgacaacgaccgtgcataataactatgactcactccccaacttgatcaacatcaacaacctatga 44620873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 186 - 465
Target Start/End: Original strand, 24504344 - 24504632
Alignment:
Q  186 cattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagggcatgagccctca 285  Q
    |||||| ||| || ||||| |||||  |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  24504344 cattccagggtatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacggttgaatgacgagcattccagggcatgagccctca 24504443  T
Q  286 acagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactcaacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgac 385  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24504444 acggttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatgaaaggactccacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgac 24504543  T
Q  386 agcaacaacatagg------caacgacaacgatcgtgcataataac---tcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 465  Q
    | | ||||||||||      ||||||||||||  ||||||||||||   | ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24504544 aacgacaacataggcaacaacaacgacaacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaatctatga 24504632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 152 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 23339734 - 23339559
Alignment:
Q  152 ggtagcaccatttccatcgtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacgg 251  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23339734 ggtagcaccaattccatcgtgttgaatgactaagcattccgtggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccagggcataagccctcaacgg 23339635  T
Q  252 ttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaac-agttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  23339634 ttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaac 23339559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 264 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 41685140 - 41684937
Alignment:
Q  264 cattccagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactcaacttgtgtata 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41685140 cattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagattcctaatcat-aaaggactcaacttgtgtata 41685042  T
Q  363 tcagcatacaactcaactacgacagcaacaacataggcaacgacaacgatcgtgcataataac--tcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacc 460  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  41685041 tcagcatacaactcaactacgacaacgacaacataggcaacgacaacgaccgtgcataataactatgactcactccccaacttgatcaacgtcaacaacc 41684942  T
Q  461 tatga 465  Q
    |||||    
T  41684941 tatga 41684937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 172 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 25036139 - 25035984
Alignment:
Q  172 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccag 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25036139 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacgattgaatgattaacattccag 25036040  T
Q  272 ggcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 326  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  25036039 ggcatgagccctcaacagattgaatgacgaatcattctagggcatgagccctcaac 25035984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 264 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 21239506 - 21239297
Alignment:
Q  264 cattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactcaacttgtgtatat 363  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  21239506 cattccagggcataagccctcaacagttgaatgacga-gcattccagggcatgagccctcaacgatttcctaatcatgaaaggactcgactcgtgtatat 21239408  T
Q  364 cagcatacaactcaactacgacagcaacaacatagg------caacgacaacgatcgtgcataataac---tcactcactccccaacttggtcaacatca 454  Q
    || |||||||||||||||||||| | ||||||||||      ||||||||||||  ||||||||||||   | ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  21239407 caacatacaactcaactacgacaacgacaacataggcaacaacaacgacaacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcatcatca 21239308  T
Q  455 acaacctatga 465  Q
    |||||||||||    
T  21239307 acaacctatga 21239297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 264 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 21242056 - 21241847
Alignment:
Q  264 cattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactcaacttgtgtatat 363  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  21242056 cattccagggcataagccctcaacagttgaatgacga-gcattccagggcatgagccctcaacgatttcctaatcatgaaaggactcgactcgtgtatat 21241958  T
Q  364 cagcatacaactcaactacgacagcaacaacatagg------caacgacaacgatcgtgcataataac---tcactcactccccaacttggtcaacatca 454  Q
    || |||||||||||||||||||| | ||||||||||      ||||||||||||  ||||||||||||   | ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  21241957 caacatacaactcaactacgacaacgacaacataggcaacaacaacgacaacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcatcatca 21241858  T
Q  455 acaacctatga 465  Q
    |||||||||||    
T  21241857 acaacctatga 21241847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 264 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 20591486 - 20591276
Alignment:
Q  264 cattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactcaacttgtgtatat 363  Q
    ||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  20591486 cattccagggcataagccctccacggttgaatgacaaagcatttcagggtatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaagactcgacttgtgtatat 20591387  T
Q  364 cagcatacaactcaactacgacagcaacaa------cataggcaacgacaacgatcgtgcataataac---tcactcactccccaacttggtcaacatca 454  Q
    || |||||||||||||||||||| | ||||      |||   ||||||||||||  ||||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||||    
T  20591386 caacatacaactcaactacgacaacgacaactttttcattttcaacgacaacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacatca 20591287  T
Q  455 acaacctatga 465  Q
    |||||||||||    
T  20591286 acaacctatga 20591276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 173 - 386
Target Start/End: Original strand, 31503254 - 31503468
Alignment:
Q  173 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacgg-ttgaatgattaa-cattcca 270  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||  || ||||||| || ||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||  |  |||||||    
T  31503254 ttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacggtt-gaatgacgag-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattcca 31503351  T
Q  271 gggcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactcaacttgtgtatatcagcat 369  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31503352 gggcataagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtttcctaatcatgaaaggactccacttgtgtatatcagcat 31503451  T
Q  370 acaactcaactacgaca 386  Q
    |||||||||||||||||    
T  31503452 acaactcaactacgaca 31503468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 174 - 330
Target Start/End: Original strand, 31503137 - 31503294
Alignment:
Q  174 tgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-ggttgaatgattaacattccagg 272  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  31503137 tgaatgactaagcattccgaggcataagcccccaacaatttgaatgatga-acattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaacattccagg 31503235  T
Q  273 gcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtt 330  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31503236 gcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacggtt 31503294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 173 - 386
Target Start/End: Original strand, 31505820 - 31506034
Alignment:
Q  173 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacgg-ttgaatgattaa-cattcca 270  Q
    ||||||||| | |||||||  ||||||||||| ||||  || ||||||| || ||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||  |  |||||||    
T  31505820 ttgaatgacaaggcattccatggcataagccctcaacggtt-gaatgacgag-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattcca 31505917  T
Q  271 gggcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactcaacttgtgtatatcagcat 369  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31505918 gggcataagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtttcctaatcatgaaaggactccacttgtgtatatcagcat 31506017  T
Q  370 acaactcaactacgaca 386  Q
    |||||||||||||||||    
T  31506018 acaactcaactacgaca 31506034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 174 - 330
Target Start/End: Original strand, 31505703 - 31505860
Alignment:
Q  174 tgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-ggttgaatgattaacattccagg 272  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  31505703 tgaatgactaagcattccgaggcataagcccccaacaatttgaatgatga-acattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaacattccagg 31505801  T
Q  273 gcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtt 330  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  31505802 gcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccatggcataagccctcaacggtt 31505860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 186 - 324
Target Start/End: Original strand, 28348743 - 28348882
Alignment:
Q  186 cattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagggcatgagccctca 285  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||  |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28348743 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgattaacattccagggcatgagccctca 28348842  T
Q  286 acag-ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctca 324  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28348843 acagattgaatgacaaagcattccagggcataagccctca 28348882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 152 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 20591560 - 20591424
Alignment:
Q  152 ggtagcaccatttccatcgtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacgg 251  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||    
T  20591560 ggtaacaccatttccatcgtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacatggcattccagggcataagccctccacgg 20591461  T
Q  252 ttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaac 287  Q
    ||||||||  || |||| ||||| |||||||||||||    
T  20591460 ttgaatgacaaagcatttcagggtatgagccctcaac 20591424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 186 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 21239625 - 21239483
Alignment:
Q  186 cattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagaca-ttccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagggcatgagccctc 284  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||  |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21239625 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcaattccagggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagggcatgagccctc 21239526  T
Q  285 aac-agttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 326  Q
    ||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  21239525 aacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaac 21239483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 186 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 21242175 - 21242033
Alignment:
Q  186 cattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagaca-ttccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagggcatgagccctc 284  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||  |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21242175 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcaattccagggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagggcatgagccctc 21242076  T
Q  285 aac-agttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 326  Q
    ||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  21242075 aacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaac 21242033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 173 - 326
Target Start/End: Original strand, 31503215 - 31503368
Alignment:
Q  173 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagg 272  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||| ||||| |||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||    
T  31503215 ttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacggttgaatgacgagcattccagg 31503313  T
Q  273 gcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 326  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  31503314 gcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaac 31503368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 173 - 326
Target Start/End: Original strand, 31505781 - 31505934
Alignment:
Q  173 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagg 272  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||| ||||| |||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||    
T  31505781 ttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccatggcataagccctcaacggttgaatgacgagcattccagg 31505879  T
Q  273 gcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 326  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  31505880 gcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaac 31505934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 251 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 12628261 - 12628124
Alignment:
Q  251 gttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggac 348  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||||| ||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12628261 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatgaaaggac 12628162  T
Q  349 tcaacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgaca 386  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12628161 tcaacgtgtgtatatcagcatacaactcatctacgaca 12628124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 172 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 24274354 - 24274235
Alignment:
Q  172 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccag 271  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||  |||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24274354 gttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggtattcgagggcataagccctcaacagttgaatgattaacattccag 24274255  T
Q  272 ggcatgagccctcaacagtt 291  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  24274254 ggcatgagccctcaacagtt 24274235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 174 - 330
Target Start/End: Original strand, 24504293 - 24504449
Alignment:
Q  174 tgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-ggttgaatgatta-acattccag 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| || || |||||||||| | ||||||||  |  ||||||||    
T  24504293 tgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatga-acattccagggtatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccag 24504391  T
Q  272 ggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtt 330  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24504392 ggcatgagccctcaacggttgaatgac-gagcattccagggcatgagccctcaacggtt 24504449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 174 - 330
Target Start/End: Original strand, 31755551 - 31755707
Alignment:
Q  174 tgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-ggttgaatgatta-acattccag 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||  |  ||||||||    
T  31755551 tgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatga-acattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccag 31755649  T
Q  272 ggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtt 330  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31755650 ggcataagccctcaacggttgaatgac-gagcattccagggcatgagccctcaacggtt 31755707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 158 - 289
Target Start/End: Original strand, 23374868 - 23374999
Alignment:
Q  158 accatttccatcgtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaat 257  Q
    ||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||| |||||||    
T  23374868 accattttcaacttgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgataa-acattccagggcatgagccctcaacagttgaat 23374966  T
Q  258 gattaa-cattccagggcatgagccctcaacag 289  Q
    ||  || ||||||||||||||||||||||||||    
T  23374967 gacaaagcattccagggcatgagccctcaacag 23374999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 252 - 409
Target Start/End: Original strand, 23374923 - 23375081
Alignment:
Q  252 ttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactca 351  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||   | |    || ||||||     
T  23374923 ttgaatgataaacattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagcttatgagtatacaatggactcg 23375022  T
Q  352 ac-ttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacagcaacaacataggcaacgacaac 409  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||    
T  23375023 actttgtgtatatcaacatacaactcaactacaacatcaacaacatggacaacgacaac 23375081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 172 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 41685194 - 41685075
Alignment:
Q  172 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-ggttgaatgattaa-cattcc 269  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||  || ||||||    
T  41685194 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaagcattcc 41685095  T
Q  270 agggcatgagccctcaacag 289  Q
    ||||||| ||||||||||||    
T  41685094 agggcataagccctcaacag 41685075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 158 - 326
Target Start/End: Original strand, 28348676 - 28348844
Alignment:
Q  158 accatttccatcgtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-ggttgaa 256  Q
    ||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||| ||||| |||||||||| | |||||    
T  28348676 accattttcaacgggttgaatgactaatcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatga-tcattccagggcatgagccctcaacagattgaa 28348774  T
Q  257 tgatta-acattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 326  Q
    |||  |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||    
T  28348775 tgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaac 28348844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 158 - 326
Target Start/End: Original strand, 28352501 - 28352669
Alignment:
Q  158 accatttccatcgtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-ggttgaa 256  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||| ||||| |||||||||| | |||||    
T  28352501 accattttcaacgggttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatga-tcattccagggcatgagccctcaacagattgaa 28352599  T
Q  257 tgatta-acattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 326  Q
    |||  |  ||||||||| ||| |||| |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||    
T  28352600 tgacaagtcattccaggacataagccatcaacagttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaac 28352669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 173 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 21239677 - 21239523
Alignment:
Q  173 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-ggttgaatgatta--acattcc 269  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||  |    |||||    
T  21239677 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatga-acattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcaattcc 21239579  T
Q  270 agggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 326  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||    
T  21239578 agggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaac 21239523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 173 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 21242227 - 21242073
Alignment:
Q  173 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-ggttgaatgatta--acattcc 269  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||  |    |||||    
T  21242227 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatga-acattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcaattcc 21242129  T
Q  270 agggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 326  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||    
T  21242128 agggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaac 21242073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 172 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 21239559 - 21239445
Alignment:
Q  172 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccag 271  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||  | ||||||||    
T  21239559 gttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacgagcattccag 21239461  T
Q  272 ggcatgagccctcaac 287  Q
    ||||||||||||||||    
T  21239460 ggcatgagccctcaac 21239445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 172 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 21242109 - 21241995
Alignment:
Q  172 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccag 271  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||  | ||||||||    
T  21242109 gttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacgagcattccag 21242011  T
Q  272 ggcatgagccctcaac 287  Q
    ||||||||||||||||    
T  21242010 ggcatgagccctcaac 21241995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 172 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 12628261 - 12628184
Alignment:
Q  172 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||    
T  12628261 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaac 12628184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 158 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 10040361 - 10040234
Alignment:
Q  158 accatttccatcgtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaat 257  Q
    ||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  ||||| |||||||||| |||||||    
T  10040361 accattttcaacgtgatgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgataa-acattcctgggcatgagccctcaacagttgaat 10040263  T
Q  258 gatta-acattccagggcatgagccctca 285  Q
    ||  |  ||||||||||||| ||||||||    
T  10040262 gacaaggcattccagggcataagccctca 10040234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 186 - 289
Target Start/End: Original strand, 28352568 - 28352671
Alignment:
Q  186 cattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagggcatgagccctca 285  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||  |||||||||||| ||||||| | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28352568 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaagtcattccaggacataagccatcaacagttgaatgattaacattccagggcatgagccctca 28352667  T
Q  286 acag 289  Q
    ||||    
T  28352668 acag 28352671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 206 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 24274399 - 24274277
Alignment:
Q  206 caacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaac-agttgaatgacaaagc 303  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  |||||||||  || |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |     
T  24274399 caacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaatagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggt 24274300  T
Q  304 attccagggcatgagccctcaac 326  Q
    |||| ||||||| ||||||||||    
T  24274299 attcgagggcataagccctcaac 24274277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 173 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 24274392 - 24274155
Alignment:
Q  173 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt-gaatgattaac-attcca 270  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||| | || |||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||  || ||||||  |   |||| |    
T  24274392 ttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaatagtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggtattcga 24274294  T
Q  271 gggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatg-aaaggactcaac-ttgtgtatatcagca 368  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||||  |||  ||| || ||||||||| |||||||||||| ||    
T  24274293 gggcataagccctcaacagttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagttt-ataagtatgcaatggactcaactttgtgtatatcaaca 24274196  T
Q  369 tacaactcaactacgacagcaacaacataggcaacgacaac 409  Q
    |||||||||||||| ||| |||| |||| | ||||||||||    
T  24274195 tacaactcaactacaacaacaacgacatggacaacgacaac 24274155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 173 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 25036098 - 25035942
Alignment:
Q  173 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacgg-ttgaatgattaa-cattcca 270  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||| ||||| |||| ||| ||||||  | |||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||  || ||||| |    
T  25036098 ttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacgatt-gaatgatta-acattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacgaatcattcta 25036001  T
Q  271 gggcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacgg 328  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25036000 gggcatgagccctcaacagattgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacgg 25035942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 251 - 331
Target Start/End: Original strand, 22109437 - 22109518
Alignment:
Q  251 gttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggttt 331  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  22109437 gttgaatgactaagcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagttt 22109518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 252 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 10040306 - 10040234
Alignment:
Q  252 ttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctca 324  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  10040306 ttgaatgataaacattcctgggcatgagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagggcataagccctca 10040234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 252 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 21239637 - 21239557
Alignment:
Q  252 ttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagc-attccagggcatgagccctcaacggtt 330  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||    
T  21239637 ttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcaattccagggcataagccctcaacggtt 21239557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 252 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 21242187 - 21242107
Alignment:
Q  252 ttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagc-attccagggcatgagccctcaacggtt 330  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||    
T  21242187 ttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcaattccagggcataagccctcaacggtt 21242107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 170 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 24275784 - 24275717
Alignment:
Q  170 gtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcat 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  24275784 gtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatga-tagacattccagggcat 24275717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 173 - 291
Target Start/End: Original strand, 31755629 - 31755746
Alignment:
Q  173 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattccag 271  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||   ||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  31755629 ttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaac-ggttgaatgacgag-cattccagggcatgagccctcaacggttgaatgacaaagcattccag 31755726  T
Q  272 ggcatgagccctcaacagtt 291  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  31755727 ggcatgagccctcaacagtt 31755746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 170 - 249
Target Start/End: Original strand, 22109435 - 22109513
Alignment:
Q  170 gtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac 249  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| | |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  22109435 gtgttgaatgactaagcattccagggcataagccctcaac-agttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaac 22109513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 173 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 10040306 - 10040152
Alignment:
Q  173 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacgg--ttgaatgattaa--cattc 268  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||| ||||| ||||| || |||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||   ||||||| ||||  |||||    
T  10040306 ttgaatga-taaacattcctgggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaggcattccagggcataagccctcaccgaatttgaatggttaaagcattc 10040209  T
Q  269 -cagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctca 324  Q
     |||||||| |||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  10040208 acagggcataagccctcaccaattgaacgacaaggcgttccagggcatgagccctca 10040152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 252 - 331
Target Start/End: Original strand, 31518274 - 31518357
Alignment:
Q  252 ttgaatgattaa-cattc-cagggcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattc-cagggcatgagccctcaacggttt 331  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  31518274 ttgaatgattaagcattcacagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattcacagggcatgagccctcaacagttt 31518357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 234 - 328
Target Start/End: Original strand, 25651191 - 25651289
Alignment:
Q  234 ggcataagccctcaacggttgaatgat-taacattc-cagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattcc-agggcatgagccctcaacgg 328  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  |  ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25651191 ggcataagccctcaacgattgaatgaacttgcattcacagggcatgagccctcaacagttggaatgattaagcattcctagggcatgagccctcaacgg 25651289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 269 - 411
Target Start/End: Original strand, 31518498 - 31518644
Alignment:
Q  269 cagggcatgagccctcaac-agttgaatgacaaagcattc-cagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatg-aaaggactcaac--ttgtgtatat 363  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||  ||| |||| || |||||||||  ||||||||||    
T  31518498 cagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattcacagggcaaaagccctcaacggttt-ataagcatgcaatggactcaacatttgtgtatat 31518596  T
Q  364 cagcatacaactcaactacgacagcaacaacataggcaacgacaacga 411  Q
    || ||||||||||| | ||  || | ||||| ||| ||||||||||||    
T  31518597 caacatacaactcagcaacatcaacgacaacgtagacaacgacaacga 31518644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 240 - 331
Target Start/End: Original strand, 21903151 - 21903246
Alignment:
Q  240 agccctcaacggttgaatgattaac-attc-cagggcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattc-cagggcatgagccctcaacggttt 331  Q
    |||||||||| ||||||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||| ||||    
T  21903151 agccctcaacagttgaataattaagtattcacagggcatgagccctcaacagtttgaatgactaagcattcacatggcatgagccctcaacagttt 21903246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 291
Target Start/End: Original strand, 22109438 - 22109517
Alignment:
Q  213 ttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagtt 291  Q
    ||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22109438 ttgaatgactaagcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagtt 22109517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 269 - 395
Target Start/End: Original strand, 22841018 - 22841143
Alignment:
Q  269 cagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatg-aaaggactcaacttgtgtatatcagc 367  Q
    |||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||  | || ||| || | |||| |||||||||| ||| |    
T  22841018 cagggcataagccctcaacgattgaacgacaaggcgttccagggcatgagccctcaacagttt-atgattatgcaatgaactccacttgtgtatgtcaac 22841116  T
Q  368 atacaactcaactacgacagcaacaaca 395  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  22841117 atacaactcaactacaaca-caacaaca 22841143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 250 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 41685195 - 41685112
Alignment:
Q  250 ggttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggttt 331  Q
    |||||||||| ||| |||||| |||||| ||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41685195 ggttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagttt 41685112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 402 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 12628129 - 12628064
Alignment:
Q  402 acgacaacgatcgtgcataataactc--actcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 465  Q
    |||||||||| ||||||||||||||   ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12628129 acgacaacgaccgtgcataataactatgacatactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 12628064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 234 - 331
Target Start/End: Original strand, 23085342 - 23085442
Alignment:
Q  234 ggcataagccctcaacggttgaatgat-taacattc-cagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattc-cagggcatgagccctcaacggtt 330  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||| ||||||||||||||||||| |||    
T  23085342 ggcatgagccctcaacaattgaatgaactagcattcacagggcatgagccctcaacagttgaataattaagtattcacagggcatgagccctcaacagtt 23085441  T
Q  331 t 331  Q
    |    
T  23085442 t 23085442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 400 - 465
Target Start/End: Original strand, 28348948 - 28349015
Alignment:
Q  400 caacgacaacgatcgtgcataataactc--actcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 465  Q
    |||||||||| |  |||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28348948 caacgacaacaactgtgcataataactatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 28349015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 269 - 326
Target Start/End: Original strand, 23085339 - 23085397
Alignment:
Q  269 cagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattc-cagggcatgagccctcaac 326  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||    
T  23085339 cagggcatgagccctcaacaattgaatgaactagcattcacagggcatgagccctcaac 23085397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 354 - 395
Target Start/End: Original strand, 28348917 - 28348958
Alignment:
Q  354 ttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacagcaacaaca 395  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  28348917 ttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacgacaaca 28348958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 193 - 253
Target Start/End: Original strand, 31518500 - 31518561
Alignment:
Q  193 gggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattc-caaggcataagccctcaacggtt 253  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||||||    
T  31518500 gggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattcacagggcaaaagccctcaacggtt 31518561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 290 - 326
Target Start/End: Original strand, 23148580 - 23148616
Alignment:
Q  290 ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 326  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23148580 ttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaac 23148616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 290 - 326
Target Start/End: Original strand, 23560370 - 23560406
Alignment:
Q  290 ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 326  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23560370 ttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaac 23560406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 269 - 331
Target Start/End: Original strand, 31518252 - 31518316
Alignment:
Q  269 cagggcatgagccctcaac-agttgaatgacaaagcattc-cagggcatgagccctcaacggttt 331  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  31518252 cagggcatgagccctcaacaatttgaatgattaagcattcacagggcatgagccctcaacagttt 31518316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 290 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 24682793 - 24682759
Alignment:
Q  290 ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctca 324  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24682793 ttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctca 24682759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 173 - 285
Target Start/End: Original strand, 28348770 - 28348882
Alignment:
Q  173 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-ggttgaatgattaa-cattcca 270  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||| | ||||||||  | |||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||  || |||||||    
T  28348770 ttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaac-agttgaatgatta-acattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaagcattcca 28348867  T
Q  271 gggcatgagccctca 285  Q
    |||||| ||||||||    
T  28348868 gggcataagccctca 28348882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 173 - 249
Target Start/End: Original strand, 31518274 - 31518352
Alignment:
Q  173 ttgaatgactaagcattc-cggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattc-caaggcataagccctcaac 249  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||    
T  31518274 ttgaatgattaagcattcacagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattcacagggcatgagccctcaac 31518352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 173 - 249
Target Start/End: Original strand, 31518315 - 31518393
Alignment:
Q  173 ttgaatgactaagcattc-cggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattc-caaggcataagccctcaac 249  Q
    ||||||||| | |||||| | |||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  31518315 ttgaatgacaaggcattcacagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattcacagggcataagccctcaac 31518393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 251 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 20591540 - 20591459
Alignment:
Q  251 gttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtt 330  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||||| ||||| ||||| || ||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  20591540 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacatggcattccagggcataagccctccacggtt 20591459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 173 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 21239519 - 21239444
Alignment:
Q  173 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacg 250  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||| || ||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||    
T  21239519 ttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtt-gaatgacgag-cattccagggcatgagccctcaacg 21239444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 173 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 21242069 - 21241994
Alignment:
Q  173 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacg 250  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||| || ||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||    
T  21242069 ttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtt-gaatgacgag-cattccagggcatgagccctcaacg 21241994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 331
Target Start/End: Original strand, 22840917 - 22840958
Alignment:
Q  290 ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggttt 331  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  22840917 ttgaatgacaaggcattacagggcatgagccctcaacagttt 22840958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 251 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 23339714 - 23339633
Alignment:
Q  251 gttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtt 330  Q
    ||||||||| ||| ||||||  ||||| ||||| ||||| || |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23339714 gttgaatgactaagcattccgtggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccagggcataagccctcaacggtt 23339633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 432 - 465
Target Start/End: Original strand, 31503496 - 31503529
Alignment:
Q  432 actccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31503496 actccccaacttggtcaacatcaacaatctatga 31503529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 432 - 465
Target Start/End: Original strand, 31506062 - 31506095
Alignment:
Q  432 actccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31506062 actccccaacttggtcaacatcaacaatctatga 31506095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 270 - 331
Target Start/End: Original strand, 24160247 - 24160311
Alignment:
Q  270 agggcatgagccctcaacagtt-gaatgaca-aagcattcc-agggcatgagccctcaacggttt 331  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24160247 agggcataagccctcaacagtttgaatgatttaagcattcccagggcatgagccctcaacggttt 24160311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 254; Significance: 1e-141; HSPs: 100)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 172 - 465
Target Start/End: Original strand, 33848559 - 33848851
Alignment:
Q  172 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccag 271  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33848559 gttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgattaacattccag 33848657  T
Q  272 ggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactcaacttgtgtatatcagcatac 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33848658 ggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactcaacttgtgtatatcagcatac 33848757  T
Q  372 aactcaactacgacagcaacaacataggcaacgacaacgatcgtgcataataactcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 465  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33848758 aactcaactacgacaacaacaacataggcaacgacaacgatcgtgcataataactcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 33848851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 173 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 16278573 - 16278282
Alignment:
Q  173 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagg 272  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16278573 ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacaatt-gaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagg 16278475  T
Q  273 gcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactcaacttgtgtatatcagcataca 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16278474 gcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactcaacttgtgtatatcagcataca 16278375  T
Q  373 actcaactacgacagcaacaacataggcaacgacaacgatcgtgcataataactcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16278374 actcaactacgacagcaacaacataggcaacgacaacgatcttgcataataactcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 16278282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 186 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 55503183 - 55502904
Alignment:
Q  186 cattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagggcatgagccctca 285  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  55503183 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacggttgaatgacgagcattccagggcatgagccctca 55503084  T
Q  286 acagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactcaacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgac 385  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55503083 acggttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatgaaaggactccacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgac 55502984  T
Q  386 agcaacaacataggcaacgacaacgatcgtgcataataactcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 465  Q
    | ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55502983 aacaacaacataggtgacgacaacgattgtgcataataactcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 55502904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 172 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 15280552 - 15280257
Alignment:
Q  172 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgat-taacattcca 270  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||| |||||||||  || |||||||    
T  15280552 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcgttccagggcatgagccctcaacagttgaatgacatagcattcca 15280453  T
Q  271 gggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactcaacttgtgtatatcagcata 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15280452 gggcatgagccctcaacagttgaatgacatagcattccagggcatgagccctcaacagtgtcctaatcatgaa-ggactcaacttgtgtatatcagcata 15280354  T
Q  371 caactcaactacgacagcaacaacataggcaacgacaacgatcgtgcataataac--tcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 465  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15280353 caactcaactacgacaacgacaacataggcaacgacaacgaccgtgcacaataactatgactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 15280257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 172 - 465
Target Start/End: Original strand, 28382474 - 28382769
Alignment:
Q  172 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattcca 270  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| |||||||||  || |||||||    
T  28382474 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattcca 28382573  T
Q  271 gggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactcaacttgtgtatatcagcata 370  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28382574 gggcataagccctcaacagttgaatgacatagcattccagggcataagccctcaacagttttctaatcatg-aaggactcaacttgtgtatatcagcata 28382672  T
Q  371 caactcaactacgacagcaacaacataggcaacgacaacgatcgtgcataataac--tcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 465  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28382673 caactcaactacgacaacgacaacataggcaacgacaacgaccgtgcataataactatgactcactccccaacttgatcaacatcaacaacctatga 28382769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 173 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 31117498 - 31117209
Alignment:
Q  173 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagg 272  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||||||||| ||||  || ||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31117498 ttgaatgattaa-cattccagggcataagccctcaacggtt-gaatgacgag-cattccagggcatgagccctcaacggttgaatgattaacattccagg 31117402  T
Q  273 gcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactcaacttgtgtatatcagcataca 372  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  31117401 gcatgagccctcaacggttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagttccctaatcatgaaaggactccacttgtgtatatcaacataca 31117302  T
Q  373 actcaactacgacagcaacaacataggcaacgacaacgatcgtgcataataactcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 465  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31117301 actcaactacgacaacaacaacataggtgacgacaacgatcgtgcataataactcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 31117209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 173 - 465
Target Start/End: Original strand, 10313366 - 10313660
Alignment:
Q  173 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagg 272  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||     
T  10313366 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaag-catcccagggcatgagccctcaacggttgaatgacaagcattccaga 10313464  T
Q  273 gcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactcaacttgtgtatatcagcatac 371  Q
    |||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10313465 gcacaagccctcaacagtttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatgaaaggactcaacttgtgtatatcagcatac 10313564  T
Q  372 aactcaactacgacagcaacaacataggcaacgacaacgatcgtgcataataac--tcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 465  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||  | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10313565 aattcaactacgacagcgacaacataggcaacaacaacgaccgtgtataataactatgactcactcctcaacttggtcaacatcaacaacctatga 10313660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 173 - 465
Target Start/End: Original strand, 16359155 - 16359449
Alignment:
Q  173 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgat-taacattccag 271  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||    
T  16359155 ttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacatagcattccag 16359254  T
Q  272 ggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactcaacttgtgtatatcagcatac 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16359255 ggcatgagccctcaacagttgaatgacatagcattccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatg-aaggactcaacttgtgtatatcagcatac 16359353  T
Q  372 aactcaactacgacagcaacaacataggcaacgacaacgatcgtgcataataac--tcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 465  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16359354 aactcaactacgacaacgacaacataggcaacgacaacgaccgtgcacaataactatgactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 16359449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 172 - 465
Target Start/End: Original strand, 286739 - 287035
Alignment:
Q  172 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt-gaatgattaa-cattcc 269  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||  ||| ||||||  || ||||||    
T  286739 gttgaatgactaagtatttcggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaatagtttgaatgacaaagcattcc 286838  T
Q  270 agggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactcaacttgtgtatatcagcat 369  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  286839 agggcataagccctcaacagttgaatgacatagcattccagggcataagccctcaacagattcctaatcatgaa-ggactcaacttgtgtatatcagcat 286937  T
Q  370 acaactcaactacgacagcaacaacataggcaacgacaacgatcgtgcataataac--tcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 465  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  286938 acaactcaactacgacaacgacaacataggcaacgacaacgaccgtgcataataactatgactcactccccaacttgatcaacatcaacaacctatga 287035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 152 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 9388554 - 9388293
Alignment:
Q  152 ggtagcaccatttccatcgtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacgg 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  9388554 ggtagcaccatttccatcgtgttgaatgactacgcattccggggcataagcccccaacagtt-gaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacgg 9388456  T
Q  252 ttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactca 351  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||            | || ||||||||| |||||    
T  9388455 ttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccatggcataagc------------catagtcatgaaagaactca 9388368  T
Q  352 acttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacagcaacaacataggcaacgacaacgatcgtgcataataact 426  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  9388367 acttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaacataggcaacgacaacaaccgtgcataataact 9388293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 173 - 465
Target Start/End: Original strand, 4170654 - 4170955
Alignment:
Q  173 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagg 272  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||| ||||| |||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||    
T  4170654 ttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacggttgaatgacgagcattccagg 4170752  T
Q  273 gcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactcaacttgtgtatatcagcatac 371  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4170753 gcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatgaaaggactccacttgtgtatatcagcatac 4170852  T
Q  372 aactcaactacgacagcaacaacatagg------caacgacaacgatcgtgcataataac---tcactcactccccaacttggtcaacatcaacaaccta 462  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||      ||||||||||||  ||||||||||||   | ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  4170853 aactcaactacgacaacgacaacataggcaacaacaacgacaacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaatcta 4170952  T
Q  463 tga 465  Q
    |||    
T  4170953 tga 4170955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 173 - 465
Target Start/End: Original strand, 14698346 - 14698647
Alignment:
Q  173 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagg 272  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||| ||||| |||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||    
T  14698346 ttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacggttgaatgacgagcattccagg 14698444  T
Q  273 gcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactcaacttgtgtatatcagcatac 371  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14698445 gcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagattcctaatcatgaaaggactccacttgtgtatatcagcatac 14698544  T
Q  372 aactcaactacgacagcaacaacatagg------caacgacaacgatcgtgcataataac---tcactcactccccaacttggtcaacatcaacaaccta 462  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||      ||||||||||||  ||||||||||||   | ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14698545 aactcaactacgacaacgacaacataggcaacaacaacgacaacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaatcta 14698644  T
Q  463 tga 465  Q
    |||    
T  14698645 tga 14698647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 152 - 326
Target Start/End: Original strand, 33848460 - 33848635
Alignment:
Q  152 ggtagcaccatttccatcgtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacgg 251  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33848460 ggtagcaccaattctatcgtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccagggcataagccctcaacgg 33848559  T
Q  252 ttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaac-agttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  33848560 ttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaac 33848635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 264 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 53388096 - 53387899
Alignment:
Q  264 cattccagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactcaacttgtgtata 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53388096 cattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactcaacttgtgtata 53387997  T
Q  363 tcagcatacaactcaactacgacagcaacaacataggcaacgacaacgatcgtgcataataac---tcactcactccccaacttggtcaacatcaaca 457  Q
    ||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||   | |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  53387996 tcaacatacaactcaactacgacaacgacaacataggcaacgacatcgactgtgcataataacttatgactcactccccaacttggccaacatcaaca 53387899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 264 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 47127203 - 47127000
Alignment:
Q  264 cattccagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactcaacttgtgtata 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  47127203 cattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacatagcattccagggcataagccctcaacagattcctaatcatgaa-ggactcaacttgtgtata 47127105  T
Q  363 tcagcatacaactcaactacgacagcaacaacataggcaacgacaacgatcgtgcataataac--tcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacc 460  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | |||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  47127104 tcagcatacaactcaactacgacaacgacaacataggcaacgacaacgaccgtgcataataactatgactcactctccaacttgatcaacatcaacaacc 47127005  T
Q  461 tatga 465  Q
    |||||    
T  47127004 tatga 47127000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 152 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 16278792 - 16278635
Alignment:
Q  152 ggtagcaccatttccatcgtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacgg 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||      
T  16278792 ggtagcaccatttccatcgtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacaa 16278693  T
Q  252 ttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattcc 308  Q
    ||||||||  || ||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  16278692 ttgaatgacaaagcattccagggcataagccctccacggttgaatgacaaagcattcc 16278635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 172 - 326
Target Start/End: Original strand, 16359114 - 16359270
Alignment:
Q  172 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-ggttgaatgattaa-cattcc 269  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||  || ||||||    
T  16359114 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaagcattcc 16359213  T
Q  270 agggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 326  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16359214 agggcataagccctcaacagttgaatgacatagcattccagggcatgagccctcaac 16359270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 264 - 465
Target Start/End: Original strand, 41791392 - 41791601
Alignment:
Q  264 cattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactcaacttgtgtatat 363  Q
    ||||||||||||| |||||||| | |||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41791392 cattccagggcataagccctcatcggttgaatgacga-gcgttccaaggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactcgacttgtgtatat 41791490  T
Q  364 cagcatacaactcaactacgacagcaacaacatagg------caacgacaacgatcgtgcataataac---tcactcactccccaacttggtcaacatca 454  Q
    || |||||||||||||||||||| | ||||||||||      ||||||||||||  ||||||||||||   | ||| |||||||||| ||||||||||||    
T  41791491 caacatacaactcaactacgacaacgacaacataggcaacaacaacgacaacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacctggtcaacatca 41791590  T
Q  455 acaacctatga 465  Q
    |||||||||||    
T  41791591 acaacctatga 41791601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 174 - 330
Target Start/End: Original strand, 14698268 - 14698425
Alignment:
Q  174 tgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-ggttgaatgattaacattccagg 272  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  14698268 tgaatgactaagcattccgaggcataagcccccaacaatttgaatgatga-acattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaacattccagg 14698366  T
Q  273 gcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtt 330  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14698367 gcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacggtt 14698425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 174 - 330
Target Start/End: Original strand, 4170576 - 4170733
Alignment:
Q  174 tgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-ggttgaatgattaacattccagg 272  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | | |||||| ||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  4170576 tgaatgactaagcattccgaggcataagcccccaacaatttgaatgatga-aaattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaacattccagg 4170674  T
Q  273 gcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtt 330  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4170675 gcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacggtt 4170733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 172 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 16278654 - 16278494
Alignment:
Q  172 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-ggttgaatgattaa-cattcc 269  Q
    |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||  || ||||||    
T  16278654 gttgaatgacaaagcattccggagcgtaagcccccaacattttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaagcattcc 16278555  T
Q  270 agggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtt 330  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16278554 agggcatgagccctcaacaattgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacggtt 16278494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 173 - 326
Target Start/End: Original strand, 6511435 - 6511588
Alignment:
Q  173 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt-gaatgattaacattccag 271  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||  ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||    
T  6511435 ttgaatga-taaacattccagggcacgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtttgaatgataaacattccag 6511533  T
Q  272 ggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6511534 ggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaac 6511588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 169 - 331
Target Start/End: Original strand, 13877703 - 13877858
Alignment:
Q  169 cgtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-catt 267  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||  || ||||    
T  13877703 cgtgttgaatgactaagcattccagggcataagccctcaacaatttgagtgacaaggcattccagggcataagccttcaacggttgaatgacaaagcatt 13877802  T
Q  268 ccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggttt 331  Q
    ||        |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13877803 cc--------agccctcaacggttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggttt 13877858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 186 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 15242599 - 15242453
Alignment:
Q  186 cattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagaca-ttccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagggcatgagccctc 284  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||  |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15242599 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcaattccagggcataagccctcaacagttgaatgattaacattccagggcatgagccctc 15242500  T
Q  285 aacag-ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtt 330  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15242499 aacagattgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacggtt 15242453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 186 - 331
Target Start/End: Original strand, 15989930 - 15990076
Alignment:
Q  186 cattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagggcatgagccctca 285  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| ||| ||||||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15989930 cattccagggcataaaccctcaacatttttaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagttgaatgataaacattccagggcatgagccctca 15990029  T
Q  286 acag-ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggttt 331  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  15990030 acagtttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagttt 15990076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 152 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 53388170 - 53388033
Alignment:
Q  152 ggtagcaccatttccatcgtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-g 250  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| |||||||||| |    
T  53388170 ggtaacaccatttccatcgtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaacgacaaggcattccagggcatgagccctcaacag 53388071  T
Q  251 gttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaac 287  Q
     ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||    
T  53388070 tttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 53388033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 173 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 14942817 - 14942663
Alignment:
Q  173 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-ggttgaatgattaacattccag 271  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||| ||||||| ||    
T  14942817 ttgaatgactaagcattcaggtgcataagcccccaacaatttgaatgataa-acattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgataaacattctag 14942719  T
Q  272 ggcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 326  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  14942718 ggcatgagccctcaatagtttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaac 14942663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 186 - 330
Target Start/End: Original strand, 41791273 - 41791419
Alignment:
Q  186 cattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagaca-ttccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagggcatgagccctc 284  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||  |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41791273 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcaattccagggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagggcatgagccctc 41791372  T
Q  285 aac-agttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtt 330  Q
    ||| | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  41791373 aacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcatcggtt 41791419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 188 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 56116166 - 56116029
Alignment:
Q  188 ttccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaac 287  Q
    |||| |||||| ||||| |||||  |||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  56116166 ttccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaatcattacagggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagggcataagccctcaac 56116067  T
Q  288 ag-ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctca 324  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  56116066 agattgaatgacaaagcattccagggcataagccctca 56116029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 174 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 55503234 - 55503078
Alignment:
Q  174 tgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-ggttgaatgatta-acattccag 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||  |  ||||||||    
T  55503234 tgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatga-acattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccag 55503136  T
Q  272 ggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtt 330  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55503135 ggcataagccctcaacggttgaatgac-gagcattccagggcatgagccctcaacggtt 55503078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 173 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 15448549 - 15448344
Alignment:
Q  173 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagg 272  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||    
T  15448549 ttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatctgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacacttgaatgattaacattctagg 15448451  T
Q  273 gcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatg-aaaggactcaac-ttgtgtatatcagcata 370  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||  || |||||||| ||||||||||| ||| ||||  |||  ||| || ||||||||| |||||||||||| ||||    
T  15448450 gcatgtgccctcaacaattgaatgattaa-cattccagagcatgagcccttaacagttt-ataagtatgcaatggactcaactttgtgtatatcaacata 15448353  T
Q  371 caactcaac 379  Q
    |||||||||    
T  15448352 caactcaac 15448344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 169 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 21190195 - 21190073
Alignment:
Q  169 cgtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattc 268  Q
    ||||||||||||| ||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| |||||||    
T  21190195 cgtgttgaatgaccaagcattctagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagttgaatgataaacattc 21190096  T
Q  269 cagggcatgagccctcaacagtt 291  Q
    |||||||||||||||||| ||||    
T  21190095 cagggcatgagccctcaatagtt 21190073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 186 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 56116286 - 56116145
Alignment:
Q  186 cattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagggcatgagccctca 285  Q
    |||||| | |||| ||||| |||||  ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56116286 cattccagtgcatgagccctcaacagattgaacgacaaggcattccagggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagggcatgagccctca 56116187  T
Q  286 ac-agttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 326  Q
     | | ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  56116186 ccaatttgaacgacaaggcgttccagggcatgagccctcaac 56116145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 187 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 15242557 - 15242333
Alignment:
Q  187 attccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacgg-ttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctc 284  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| || ||||||  | |||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||  |  ||||||||||||| |||||||    
T  15242557 attccagggcataagccctcaacagtt-gaatgatta-acattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcataagccctc 15242460  T
Q  285 aacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaa-ggactcaactt-gtgtatatcagcatacaactcaactac 382  Q
    ||| ||| |||||  || |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  15242459 aacggttaaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagtt-cctaatcataaaatggacttaactttgtgtatatcagcatataactcaactac 15242362  T
Q  383 gacagcaacaacataggcaacgacaacga 411  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  15242361 gacaacgacaacataggcaacgacaacga 15242333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 158 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 15242666 - 15242497
Alignment:
Q  158 accatttccatcgtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-ggttgaa 256  Q
    ||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||| |||||||||| | |||||    
T  15242666 accattttcaacgtgttaaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatga-acattccagggcatgagccctcaacagattgaa 15242568  T
Q  257 tgatta--acattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 326  Q
    |||  |    |||||||||||| ||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||    
T  15242567 tgacaaggcaattccagggcataagccctcaacagttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaac 15242497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 156 - 331
Target Start/End: Original strand, 15989740 - 15989914
Alignment:
Q  156 gcaccatttccatcgtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttga 255  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| |||| ||||  |||||    
T  15989740 gcaccattttcaacgtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgataag-cattccagggcatgagccttcaatagttga 15989838  T
Q  256 atgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggttt 331  Q
    ||||  || ||||| |||| || || |||||||| |||||||| ||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  15989839 atgacaaagcattctagggtataagtcctcaacaattgaatgataaa-catttcagagcatgagccctcaacagttt 15989914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 169 - 291
Target Start/End: Original strand, 13881362 - 13881485
Alignment:
Q  169 cgtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-catt 267  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  || ||||    
T  13881362 cgtgttgaatgactaagcaatctagggcataagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaatggttgaatgacaaagcatt 13881461  T
Q  268 ccagggcatgagccctcaacagtt 291  Q
    |||| |||||||||||||||||||    
T  13881462 ccagagcatgagccctcaacagtt 13881485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 172 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 15242533 - 15242415
Alignment:
Q  172 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccag 271  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||||| ||||| |||||  |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15242533 gttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacggttaaatgattaacattccag 15242435  T
Q  272 ggcatgagccctcaacagtt 291  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  15242434 ggcatgagccctcaacagtt 15242415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 158 - 331
Target Start/End: Original strand, 27027532 - 27027712
Alignment:
Q  158 accatttccatcgtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-ggttgaa 256  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||| | |||||    
T  27027532 accattttcaacgtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgataa-acattccagggcatgagccctcaacagtttgaa 27027630  T
Q  257 tgatta-acattccag------ggcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggttt 331  Q
    |||  |  ||||||||      |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  27027631 tgacaaggcattccagggcataggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaa-catttcagggcatgagccctcaacagttt 27027712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 200 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 31117550 - 31117421
Alignment:
Q  200 agcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-ggttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagttgaatgac 298  Q
    |||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  31117550 agcccccaacaatttgaatgatga-acattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaacattccagggcataagccctcaacggttgaatgac 31117452  T
Q  299 aaagcattccagggcatgagccctcaacggtt 330  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31117451 -gagcattccagggcatgagccctcaacggtt 31117421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 172 - 326
Target Start/End: Original strand, 6511394 - 6511549
Alignment:
Q  172 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-ggttgaatgatta-acattcc 269  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||  |||||||||| | ||||||||  |  ||||||    
T  6511394 gttgaatgactaagcattccggggcataatcccccaacaatttgaatgataa-acattccagggcacgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattcc 6511492  T
Q  270 agggcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 326  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6511493 agggcataagccctcaacagtttgaatgataaa-cattccagggcatgagccctcaac 6511549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 156 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 24047960 - 24047832
Alignment:
Q  156 gcaccatttccatcgtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttga 255  Q
    ||||||||| || | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||  ||||    
T  24047960 gcaccattttcaacttgttgaatgactaagcattctggggcataagcccccaacaatttgaatgataa-acattccagggcataagccctcaacaattga 24047862  T
Q  256 atgattaa-cattccagggcatgagccctc 284  Q
    ||||  || |||||||||||||||||||||    
T  24047861 atgacaaagcattccagggcatgagccctc 24047832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 172 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 47127257 - 47127138
Alignment:
Q  172 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-ggttgaatga-ttaacattcc 269  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||  || ||||||    
T  47127257 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccgacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacatagcattcc 47127158  T
Q  270 agggcatgagccctcaacag 289  Q
    ||||||| ||||||||||||    
T  47127157 agggcataagccctcaacag 47127138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 173 - 411
Target Start/End: Original strand, 6511474 - 6511713
Alignment:
Q  173 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattccag 271  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||    
T  6511474 ttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtttgaatgataa-acattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccag 6511572  T
Q  272 ggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcat-gaaaggactcaac-ttgtgtatatcagca 368  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||||  |||  ||  || |||||| || |||||||||||| ||    
T  6511573 ggcataagccctcaacaatttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagttt-ataagtatacaatggactcgactttgtgtatatcaaca 6511670  T
Q  369 tacaactcaactacgacagcaacaacataggcaacgacaacga 411  Q
    ||||||||||||||  || | ||||| ||| ||||||||||||    
T  6511671 tacaactcaactacatcaacgacaacgtagacaacgacaacga 6511713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 193 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 14942719 - 14942621
Alignment:
Q  193 gggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagtt 291  Q
    |||||| ||||| ||| | ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14942719 gggcatgagccctcaatagtttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagtt 14942621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 213 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 33684974 - 33684861
Alignment:
Q  213 ttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt-gaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagg 311  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||||||||| ||||  || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33684974 ttgaatgactaagcattccatggcataagcccccaacaatttgaatgataaacattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagg 33684875  T
Q  312 gcatgagccctcaa 325  Q
    |||| |||||||||    
T  33684874 gcataagccctcaa 33684861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 173 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 15449872 - 15449758
Alignment:
Q  173 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagg 272  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  15449872 ttgaatga-taaacattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattccagggcataagtcctcaatagttgaatgattaacattccagg 15449774  T
Q  273 gcatgagccctcaaca 288  Q
    ||||||||||||||||    
T  15449773 gcatgagccctcaaca 15449758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 158 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 33684989 - 33684856
Alignment:
Q  158 accatttccatcgtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaat 257  Q
    ||||||| || | |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||| |||||||    
T  33684989 accattttcaacatgttgaatgactaagcattccatggcataagcccccaacaatttgaatgataa-acattccagggcatgagccctcaacagttgaat 33684891  T
Q  258 gattaa-cattccagggcatgagccctcaacagtt 291  Q
    ||  || ||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  33684890 gacaaagcattccagggcataagccctcaatagtt 33684856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 173 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 16278731 - 16278572
Alignment:
Q  173 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattccag 271  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  || |||||| |    
T  16278731 ttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacaatt-gaatgacaaagcattccagggcataagccctccacggttgaatgacaaagcattccgg 16278633  T
Q  272 ggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggttt 331  Q
     || | ||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16278632 agcgtaagcccccaacattttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagttt 16278572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 158 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 56116353 - 56116187
Alignment:
Q  158 accatttccatcgtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-ggttgaa 256  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||  |||| |||||||||| | |||||    
T  56116353 accattttcaacgggttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatga-tcattccagtgcatgagccctcaacagattgaa 56116255  T
Q  257 tgatta-acattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctca 324  Q
     ||  |  ||||||||||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||||||||    
T  56116254 cgacaaggcattccagggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctca 56116187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 173 - 327
Target Start/End: Original strand, 27027587 - 27027748
Alignment:
Q  173 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcata------agccctcaacggtt-gaatgattaaca 265  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||      |||||||||| ||| ||||||  ||||    
T  27027587 ttgaatga-taaacattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattccagggcataggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaaca 27027685  T
Q  266 ttccagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacg 327  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  27027686 tttcagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacg 27027748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 176 - 331
Target Start/End: Original strand, 15989960 - 15990116
Alignment:
Q  176 aatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt-gaatgattaa-cattccaggg 273  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||| ||||| || |||||| || |||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||  || ||||||||||    
T  15989960 aatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagtt-gaatgataa-acattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaagcattccaggg 15990057  T
Q  274 catgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggttt 331  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15990058 cataagccctcaacagtttgaatgacgaggcattccagggcataagccctcaacggttt 15990116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 173 - 326
Target Start/End: Original strand, 41791220 - 41791375
Alignment:
Q  173 ttgaatgactaagcattccgggg-cataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-ggttgaatgatta--acattc 268  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||  |    ||||    
T  41791220 ttgaatgactaagcattccgggggcataagcccccaacaatttgaatgatga-acattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcaattc 41791318  T
Q  269 cagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 326  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||    
T  41791319 cagggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaac 41791375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 251 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 20899835 - 20899754
Alignment:
Q  251 gttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggttt 331  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20899835 gttgaatgactaagcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacggttt 20899754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 252 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 24047903 - 24047832
Alignment:
Q  252 ttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctc 323  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24047903 ttgaatgataaacattccagggcataagccctcaacaattgaatgacaaagcattccagggcatgagccctc 24047832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 172 - 287
Target Start/End: Original strand, 41791339 - 41791453
Alignment:
Q  172 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccag 271  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||  | | |||||     
T  41791339 gttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcatcggttgaatgacgagcgttccaa 41791437  T
Q  272 ggcatgagccctcaac 287  Q
    ||||||||||||||||    
T  41791438 ggcatgagccctcaac 41791453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 173 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 56116063 - 56115837
Alignment:
Q  173 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-ggttgaatgattaa-cattcca 270  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||| || ||||||||| |||||| | ||||| ||||| |||||||||| | ||||||||  || |||||||    
T  56116063 ttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaccaatttgaacgacaaggcgttccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaagcattcca 56115964  T
Q  271 gggcatgagccctcaac-agttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatg-aaaggactcaac-ttgtgtatatcagc 367  Q
    | |||| |||||||| | | ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| || |||  |  | ||| || | |||| || ||||||||||||||    
T  56115963 gagcataagccctcaccaatttgaacgacaaggcgttccagggcatgagccctcaccgcttt-atgtttatgtaatgaactcgactttgtgtatatcagc 56115865  T
Q  368 atacaactcaactacgacagcaacaaca 395  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  56115864 atacaactcaactacgacaacgacaaca 56115837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 207 - 291
Target Start/End: Original strand, 3337084 - 3337169
Alignment:
Q  207 aacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt-gaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagtt 291  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3337084 aacaatttgaatgacaaggcattctagggcataagccctcaacagtttgaatgattaacattccagggtatgagccctcaacagtt 3337169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 158 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 20899849 - 20899755
Alignment:
Q  158 accatttccatcgtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt 253  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  20899849 accattttcaacgtgttgaatgactaagcattccagggcataagccctcaac-agttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacggtt 20899755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 173 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 14942777 - 14942555
Alignment:
Q  173 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt-gaatgattaa-cattcca 270  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||| || |||||| | ||||| |||||||||  ||| ||||||  |  |||||||    
T  14942777 ttgaatga-taaacattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgataa-acattctagggcatgagccctcaatagtttgaatgacaaggcattcca 14942680  T
Q  271 gggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatg-aaaggactcaac-ttgtgtatatcagca 368  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||||  |||  ||| || || |||||| |||||||||||| ||    
T  14942679 gggcataagccctcaacagttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagttt-ataagtatgcaatgggctcaactttgtgtatatcaaca 14942582  T
Q  369 tacaactcaactacgacagcaacaaca 395  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||||    
T  14942581 tacaactcaactacaacaacgacaaca 14942555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 252 - 331
Target Start/End: Original strand, 6511435 - 6511515
Alignment:
Q  252 ttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggttt 331  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  6511435 ttgaatgataaacattccagggcacgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttt 6511515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 242 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 15449882 - 15449798
Alignment:
Q  242 ccctcaacggttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaa 325  Q
    ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||    
T  15449882 ccctcaacaattgaatgataaacattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattccagggcataagtcctcaa 15449798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 173 - 253
Target Start/End: Original strand, 15990035 - 15990115
Alignment:
Q  173 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt 253  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15990035 ttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagtttgaatgacgaggcattccagggcataagccctcaacggtt 15990115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 252 - 330
Target Start/End: Original strand, 41791261 - 41791341
Alignment:
Q  252 ttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagc-attccagggcatgagccctcaacggtt 330  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||    
T  41791261 ttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcaattccagggcataagccctcaacggtt 41791341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 173 - 264
Target Start/End: Original strand, 3336989 - 3337079
Alignment:
Q  173 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaac 264  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  3336989 ttgaatga-taaacattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaataattaac 3337079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 252 - 326
Target Start/End: Original strand, 3336989 - 3337064
Alignment:
Q  252 ttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaac-agttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 326  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  3336989 ttgaatgataaacattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaac 3337064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 173 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 55503156 - 55503039
Alignment:
Q  173 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattccag 271  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||   ||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  55503156 ttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaac-ggttgaatgacgag-cattccagggcatgagccctcaacggttgaatgacaaagcattccag 55503059  T
Q  272 ggcatgagccctcaacagtt 291  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  55503058 ggcatgagccctcaacagtt 55503039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 172 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 56116103 - 56115949
Alignment:
Q  172 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-ggttgaatgatta-acattcc 269  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||||||||||| |||||  |||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |   ||||| ||  |  | ||||    
T  56116103 gttgaatgattaa-cattccagggcataagccctcaacagattgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaccaatttgaacgacaaggcgttcc 56116005  T
Q  270 agggcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctca 324  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  56116004 agggcatgagccctcaacagattgaatgacaaagcattccagagcataagccctca 56115949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 264 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 21190138 - 21190078
Alignment:
Q  264 cattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaa 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  21190138 cattccagggcatgagccctcaacagttgaatgataaa-cattccagggcatgagccctcaa 21190078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 264 - 331
Target Start/End: Original strand, 13881419 - 13881486
Alignment:
Q  264 cattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggttt 331  Q
    ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  13881419 cattccagggcataagccctcaatggttgaatgacaaagcattccagagcatgagccctcaacagttt 13881486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 252 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 56116298 - 56116219
Alignment:
Q  252 ttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtt 330  Q
    ||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  56116298 ttgaatgatgatcattccagtgcatgagccctcaacagattgaacgacaaggcattccagggcataagccctcaacggtt 56116219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 158 - 219
Target Start/End: Original strand, 18221088 - 18221149
Alignment:
Q  158 accatttccatcgtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatg 219  Q
    ||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18221088 accattttcaacgtgttgaatgactgagcattccggggcatgagcccccaacaatttgaatg 18221149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 266 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 56116166 - 56116101
Alignment:
Q  266 ttccagggcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtt 330  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  56116166 ttccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaatcattacagggcataagccctcaacggtt 56116101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 194 - 411
Target Start/End: Original strand, 27027653 - 27027874
Alignment:
Q  194 ggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt-gaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagtt 291  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||| ||| ||||||  |  ||||||||||||| ||||||||||  ||    
T  27027653 ggcatgagccctcaacagtttgaatgacaa-acatttcagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacgatt 27027751  T
Q  292 gaatgacaaagcattc-cagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatg-aaaggactcaac--ttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacag 387  Q
    ||| ||||| || ||| |||||||| |||||||||| ||||  | | |||| || |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||  ||     
T  27027752 gaacgacaaggcgttcacagggcataagccctcaacagttt-atgagcatgcaatggactcaacatttgtgtatatcaacatacaactcaacaacatcaa 27027850  T
Q  388 caacaacataggcaacgacaacga 411  Q
    | ||||| ||| ||||||||||||    
T  27027851 cgacaacgtagacaacgacaacga 27027874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 264 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 21190178 - 21190115
Alignment:
Q  264 cattccagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 326  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21190178 cattctagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaac 21190115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 172 - 249
Target Start/End: Original strand, 6511551 - 6511627
Alignment:
Q  172 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac 249  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  | |||||||| ||||| ||||||||||    
T  6511551 gttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacaatttgaatgatta-acattccagggcatgagccctcaac 6511627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 213 - 305
Target Start/End: Original strand, 15989835 - 15989928
Alignment:
Q  213 ttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcat 305  Q
    |||||||||||  ||||| | || ||||| |||||||  ||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15989835 ttgaatgacaaagcattctagggtataagtcctcaacaattgaatgataaacatttcagagcatgagccctcaacagtttgaatgacaaagcat 15989928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 197 - 295
Target Start/End: Original strand, 3336973 - 3337072
Alignment:
Q  197 ataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-ggttgaatgatta-acattccagggcatgagccctcaacagttgaa 294  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||   ||||||||  |  ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3336973 ataagcccccaacaatttgaatgataa-acattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaa 3337071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 225 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 56116091 - 56115987
Alignment:
Q  225 acattccaaggcataagccctcaacgg-ttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccc 321  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||  || ||||||||||||| |||||||| || || ||| ||||| || |||||||||||||||||    
T  56116091 acattccagggcataagccctcaacagattgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaccaatttgaacgacaaggcgttccagggcatgagccc 56115992  T
Q  322 tcaac 326  Q
    |||||    
T  56115991 tcaac 56115987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 256
Target Start/End: Original strand, 27027691 - 27027754
Alignment:
Q  193 gggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaa 256  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  27027691 gggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacgattgaa 27027754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 173 - 249
Target Start/End: Original strand, 8710573 - 8710651
Alignment:
Q  173 ttgaatgactaagcattc-cggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattc-caaggcataagccctcaac 249  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  8710573 ttgaatgattaagcattcacggggcatgagcccttaacaatttgaatgacaaggcattcacagggcataagccctcaac 8710651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 173 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 24047903 - 24047750
Alignment:
Q  173 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt-gaatgattaa--cattc- 268  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||  ||||||| ||||| |||||||   | || ||||| ||||  |||||     
T  24047903 ttgaatga-taaacattccagggcataagccctcaacaatt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcctggatttgaatggttaaagcattca 24047806  T
Q  269 cagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctca 324  Q
    || ||||| |||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  24047805 catggcataagccctcaccaattgaacgacaaggcgttccagggcatgagccctca 24047750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 185 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 53388097 - 53388029
Alignment:
Q  185 gcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt 253  Q
    ||||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  53388097 gcattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtt 53388029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 225 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 15449861 - 15449759
Alignment:
Q  225 acattccaaggcataagccctcaacggtt-gaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccct 322  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||  |  ||||||||||||| || |||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||||||    
T  15449861 acattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattccagggcataagtcctcaatagttgaatgattaa-cattccagggcatgagccct 15449763  T
Q  323 caac 326  Q
    ||||    
T  15449762 caac 15449759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 213 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 20899834 - 20899759
Alignment:
Q  213 ttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgatta-acattccagggcatgagccctcaac 287  Q
    ||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||| |||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||    
T  20899834 ttgaatgactaagcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaac 20899759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 250 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 47127258 - 47127175
Alignment:
Q  250 ggttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggttt 331  Q
    |||||||||| ||| |||||| |||||| ||||| | ||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  47127258 ggttgaatgactaagcattccggggcataagcccccgacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagttt 47127175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 251 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 53388150 - 53388068
Alignment:
Q  251 gttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggttt 331  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||||| ||||| ||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  53388150 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaacgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagttt 53388068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 414 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 56115833 - 56115780
Alignment:
Q  414 gtgcataataactc--actcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 465  Q
    |||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56115833 gtgcataataactatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 56115780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 270 - 330
Target Start/End: Original strand, 13881385 - 13881446
Alignment:
Q  270 agggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtt 330  Q
    ||||||| ||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  13881385 agggcataagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaatggtt 13881446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 251 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 16278772 - 16278695
Alignment:
Q  251 gttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 326  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||||| ||||| ||||| || ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  16278772 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaac 16278695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 251 - 330
Target Start/End: Original strand, 33848480 - 33848561
Alignment:
Q  251 gttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtt 330  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||||| ||||| ||||| || |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33848480 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccagggcataagccctcaacggtt 33848561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 173 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 31131845 - 31131813
Alignment:
Q  173 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccc 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31131845 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccc 31131813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 280 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 15449882 - 15449832
Alignment:
Q  280 ccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggttt 331  Q
    ||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15449882 ccctcaacaattgaatgataaa-cattccagggcatgagccctcaacagttt 15449832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 264 - 395
Target Start/End: Original strand, 3337103 - 3337235
Alignment:
Q  264 cattccagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatg-aaaggactcaac-ttgtgta 360  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||  || |||||||||| ||||||||||||| ||||  |||  ||| || ||||||||| |||||||    
T  3337103 cattctagggcataagccctcaacagtttgaatgattaa-cattccagggtatgagccctcaacagttt-ataagtatgcaatggactcaactttgtgta 3337200  T
Q  361 tatcagcatacaactcaactacgacagcaacaaca 395  Q
    ||||| |||| | ||||||||| ||  ||||||||    
T  3337201 tatcaacatatagctcaactacaactacaacaaca 3337235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 234 - 326
Target Start/End: Original strand, 8710554 - 8710651
Alignment:
Q  234 ggcataagccctcaac-ggttgaatgattaa-cattc-cagggcatgagccctcaac-agttgaatgacaaagcattc-cagggcatgagccctcaac 326  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||    
T  8710554 ggcataagccctcaacaatttgaatgattaagcattcacggggcatgagcccttaacaatttgaatgacaaggcattcacagggcataagccctcaac 8710651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 234 - 326
Target Start/End: Original strand, 18079577 - 18079674
Alignment:
Q  234 ggcataagccctcaacggttg-aatgattaa-cattcc-agggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattc-cagggcatgagccctcaac 326  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| | | |||||||||||||||||| ||| ||||  || ||| |||||||||||||||||||    
T  18079577 ggcataagccctcaacagttggaatgattaagcattcccacgacatgagccctcaacagtttgaacgacagggcgttcacagggcatgagccctcaac 18079674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 291 - 328
Target Start/End: Original strand, 18229792 - 18229829
Alignment:
Q  291 tgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacgg 328  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  18229792 tgaatgacaaagcactccagggcatgagcccccaacgg 18229829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 289 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 21190192 - 21190155
Alignment:
Q  289 gttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 326  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  21190192 gttgaatgaccaagcattctagggcatgagccctcaac 21190155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 251 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 33684975 - 33684899
Alignment:
Q  251 gttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 326  Q
    ||||||||| ||| ||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33684975 gttgaatgactaagcattccatggcataagcccccaacaatttgaatgataaa-cattccagggcatgagccctcaac 33684899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 269 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 15416993 - 15416929
Alignment:
Q  269 cagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcatt-ccagggcatgagccctcaacggttt 331  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  15416993 cagggcatgaaccctcaacagttggaatgattaagcattcccagggcatgaaccctcaatggttt 15416929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 250; Significance: 1e-139; HSPs: 76)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 172 - 465
Target Start/End: Original strand, 17795049 - 17795341
Alignment:
Q  172 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccag 271  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17795049 gttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaaacattccagggcataagccctccacggttgaatgattaacattccag 17795147  T
Q  272 ggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactcaacttgtgtatatcagcatac 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17795148 ggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactcaacttgtgtatatcaacatac 17795247  T
Q  372 aactcaactacgacagcaacaacataggcaacgacaacgatcgtgcataataactcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 465  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17795248 aactcaactacgacagcgacaacataggcaacgacaacgatcgtgcataataactcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 17795341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 173 - 465
Target Start/End: Original strand, 28853604 - 28853895
Alignment:
Q  173 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagg 272  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||| ||||| |||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||    
T  28853604 ttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaaattgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacggttgaatgacgagcattccagg 28853702  T
Q  273 gcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactcaacttgtgtatatcagcataca 372  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28853703 gcatgagccctcaacggttgaacgacaaagcattccagggcatgagccctcaacaatttcgtaatcatgaaaggactccacttgtgtatatcagcataca 28853802  T
Q  373 actcaactacgacagcaacaacataggcaacgacaacgatcgtgcataataactcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28853803 actcaactacgacagcaacaacatacgcgacggcaacgatcgtgcatcataactcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 28853895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 173 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 6608745 - 6608444
Alignment:
Q  173 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagg 272  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||| ||||| |||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||    
T  6608745 ttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacggttgaatgacgagcattccagg 6608647  T
Q  273 gcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactcaacttgtgtatatcagcatac 371  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6608646 gcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatgaaaggactccacttgtgtatatcagcatac 6608547  T
Q  372 aactcaactacgacagcaacaacatagg------caacgacaacgatcgtgcataataac---tcactcactccccaacttggtcaacatcaacaaccta 462  Q
    |||| |||||||||| | ||||||||||      ||||||||||||  ||||||||||||   | ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6608546 aacttaactacgacaacgacaacataggcaacaacaacgacaacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaatcta 6608447  T
Q  463 tga 465  Q
    |||    
T  6608446 tga 6608444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 173 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 22145851 - 22145561
Alignment:
Q  173 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt-gaatgattaa-cattcca 270  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||  || |||||||    
T  22145851 ttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagtttgaatgacaaagcattcca 22145752  T
Q  271 gggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactcaacttgtgtatatcagcata 370  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22145751 gggcataagccctcaacagttaaatgacatagcattccagggcataagccctcaacagattcctaatcatg-aaggactcaacttgtgtatatcagcata 22145653  T
Q  371 caactcaactacgacagcaacaacataggcaacgacaacgatcgtgcataataac--tcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 465  Q
    |||||||||||||||  | |||||     |||||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22145652 caactcaactacgaccacgacaac-----caacgacaacgaccgtgcataataactatgactcactccccaacttgatcaacatcaacaacctatga 22145561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 152 - 330
Target Start/End: Original strand, 17794950 - 17795129
Alignment:
Q  152 ggtagcaccatttccatcgtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacgg 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  17794950 ggtagcaccatttccatcgtgttgaatgactaagcattccgaggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacgg 17795049  T
Q  252 ttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaac-agttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtt 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  17795050 ttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaaacattccagggcataagccctccacggtt 17795129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 250 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 24708199 - 24707982
Alignment:
Q  250 ggttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggac 348  Q
    |||||||||| ||| |||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  24708199 ggttgaatgactaagcattccggggcataagccctcaacggttgaatgacatagcattctagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatgaa-ggac 24708101  T
Q  349 tcaacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacagcaacaacataggcaacgacaacgatcgtgcataataac--tcactcactccccaacttggt 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||  | |||||||||||||||||||    
T  24708100 tcaacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacgacaacataggcaacaacaacgaccgtgcacaataactatgactcactccccaacttggt 24708001  T
Q  447 caacatcaacaacctatga 465  Q
    |||||||||||||||||||    
T  24708000 caacatcaacaacctatga 24707982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 186 - 465
Target Start/End: Original strand, 17614584 - 17614864
Alignment:
Q  186 cattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt-gaatgattaa-cattccagggcatgagccct 283  Q
    |||||| |||||||||||| ||||  || |||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||  || ||||||  |  ||||||||||||||||||||    
T  17614584 cattccagggcataagccctcaacggtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccct 17614682  T
Q  284 caacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactcaacttgtgtatatcagcatacaactcaactacg 383  Q
    |||| |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17614683 caacggttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaa-ggactcaacttgtgtatatcagcatacaactcgactacg 17614780  T
Q  384 acagcaacaacataggcaacgacaacgatcgtgcataataac--tcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 465  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||    
T  17614781 acaacgacaacataggcaacgacaacgaccgtgcataataactatgactcactccccaactcgatcaacatcaaccacctatga 17614864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 172 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 7301525 - 7301312
Alignment:
Q  172 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattcca 270  Q
    ||||||||| ||| |||||| | |||| ||||| |||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||  || |||||||    
T  7301525 gttgaatgattaa-cattccagagcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacatttgaatgacaaagcattcca 7301427  T
Q  271 gggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactcaacttgtgtatatcagcata 370  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  7301426 gggcataagccctcaacggttgaatgacga-gcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactcgacttgtgtatatcaacata 7301328  T
Q  371 caactcaactacgaca 386  Q
    ||||||||||||||||    
T  7301327 caactcaactacgaca 7301312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 173 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 22059843 - 22059565
Alignment:
Q  173 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgat-taacattccag 271  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||| ||||| |||||  | |||||||||  ||||||| |||||||||| ||||| |||||||||  || ||| || |    
T  22059843 ttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagct-gaatgacaaagcattccagggcataagccatcaacagttgaatgacatagcatccctg 22059745  T
Q  272 ggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactcaacttgtgtatatcagcatac 371  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22059744 ggcataagccctcaacagttgaatgacatagcattccagggcataagccctcaacagtttcctaatcatg-aaggactcaacttgtgtatatcagcatac 22059646  T
Q  372 aactcaactacgacagcaacaacataggcaacgacaacgatcgtgcataataac--tcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 465  Q
    |||||||||||||               |||||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22059645 aactcaactacga---------------caacgacaacgaccgtgcataataactatgactcactccccaacttgatcaacatcaacaacctatga 22059565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 264 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 45135306 - 45135097
Alignment:
Q  264 cattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactcaacttgtgtatat 363  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  45135306 cattccagggcataagccctcaacagttgaatgacga-gcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactcgacttgtgtatat 45135208  T
Q  364 cagcatacaactcaactacgacagcaacaacatagg------caacgacaacgatcgtgcataataac---tcactcactccccaacttggtcaacatca 454  Q
    || |||||||||||||||||||| | ||||| ||||      ||||||||||||  ||||||||||||   | ||| ||| |||||||||||||||||||    
T  45135207 caacatacaactcaactacgacaacgacaacgtaggcaacaacaacgacaacgactgtgcataataacttatgacttacttcccaacttggtcaacatca 45135108  T
Q  455 acaacctatga 465  Q
    |||||||||||    
T  45135107 acaacctatga 45135097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 156 - 411
Target Start/End: Original strand, 20459858 - 20460115
Alignment:
Q  156 gcaccatttccatcgtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttga 255  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  20459858 gcaccattttcaacgtgttgaatgactaagcattccgaggcataagcccccaacaatttgaatgataa-acattccagggcataagccctcaacagttga 20459956  T
Q  256 atgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatg-aaaggactcaac 353  Q
    ||||  || ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  | |  ||| || |||||||||    
T  20459957 atgacaaagcattctagggcataagccgtcaacagttgaatgacaaagcattccagggcataagtcctcaacggttttatgagtatgcaatggactcaac 20460056  T
Q  354 -ttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacagcaacaacataggcaacgacaacga 411  Q
     |||||||||||| ||||||||||| | ||  || | ||||| ||| ||||||||||||    
T  20460057 tttgtgtatatcaacatacaactcagcaacatcaacgacaacgtagacaacgacaacga 20460115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 169 - 330
Target Start/End: Original strand, 17614528 - 17614690
Alignment:
Q  169 cgtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-catt 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || ||||    
T  17614528 cgtgttgaatgactaagcattccggagcgtaagcccccaacaatttgaatgatga-acattccagggcataagccctcaacggttgaatgacaaagcatt 17614626  T
Q  268 ccagggcatgagccctcaac-agttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtt 330  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17614627 ccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacggtt 17614690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 173 - 330
Target Start/End: Original strand, 28853525 - 28853683
Alignment:
Q  173 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-ggttgaatgattaacattccag 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  28853525 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatga-tggacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaacattccag 28853623  T
Q  272 ggcatgagccctcaac-agttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtt 330  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28853624 ggcatgagccctcaacaaattgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacggtt 28853683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 172 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 22145892 - 22145735
Alignment:
Q  172 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-ggttgaatgattaa-cattcc 269  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||  || ||||||    
T  22145892 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaagcattcc 22145793  T
Q  270 agggcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 326  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22145792 agggcataagccctcaacagtttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaac 22145735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 175 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 6608822 - 6608666
Alignment:
Q  175 gaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-ggttgaatgattaacattccaggg 273  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||  | |||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  6608822 gaatgactaagcattccgaggcataagcccccaacactttgaatgatga-acattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaacattccaggg 6608724  T
Q  274 catgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtt 330  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6608723 catgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacggtt 6608666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 173 - 324
Target Start/End: Original strand, 44431648 - 44431800
Alignment:
Q  173 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagg 272  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||| || |  ||||||||||||| | || || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44431648 ttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaccgctttgaatgacaaggcgttacagggcataagccctcaatggttgaatgattaacattccagg 44431747  T
Q  273 gcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctca 324  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44431748 gcatgagccctcaacagattgaatgacaaagcattccagggcataagccctca 44431800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 186 - 324
Target Start/End: Original strand, 44431543 - 44431682
Alignment:
Q  186 cattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagggcatgagccctca 285  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||  |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  44431543 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacggttgaatgattaacatttcagggcatgagccctca 44431642  T
Q  286 acag-ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctca 324  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44431643 acagattgaatgacaaagcattccagggcataagccctca 44431682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 172 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 44523320 - 44523200
Alignment:
Q  172 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattcca 270  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||    
T  44523320 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacggttgaatgacaaagcattcca 44523221  T
Q  271 gggcatgagccctcaacagtt 291  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  44523220 gggcatgagccctcaacagtt 44523200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 172 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 7301603 - 7301449
Alignment:
Q  172 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccag 271  Q
    ||||||||| ||| |||||| | |||| ||||| |||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7301603 gttgaatgattaa-cattccagagcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccag 7301505  T
Q  272 ggcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 326  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  7301504 agcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaac 7301449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 172 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 22059884 - 22059729
Alignment:
Q  172 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattcca 270  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| | |||||||  || |||||||    
T  22059884 gttgaatgactaagcatttcggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagctgaatgacaaagcattcca 22059785  T
Q  271 gggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 326  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||    
T  22059784 gggcataagccatcaacagttgaatgacatagcatccctgggcataagccctcaac 22059729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 186 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 7301668 - 7301523
Alignment:
Q  186 cattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagggcatgagccctca 285  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||  |||||||||||| || | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7301668 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcaattcagggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagagcatgagccctca 7301569  T
Q  286 acag-ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtt 330  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7301568 acagattgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacggtt 7301523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 172 - 287
Target Start/End: Original strand, 17614609 - 17614724
Alignment:
Q  172 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccag 271  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17614609 gttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacggttgaatgattaacattccag 17614708  T
Q  272 ggcatgagccctcaac 287  Q
    ||||||||||||||||    
T  17614709 ggcatgagccctcaac 17614724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 173 - 291
Target Start/End: Original strand, 32949583 - 32949700
Alignment:
Q  173 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagg 272  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32949583 ttgaatga-taaacattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccaaggcataagccctcaacagttgaatgattaacattccagg 32949681  T
Q  273 gcatgagccctcaacagtt 291  Q
    |||||||||||||||||||    
T  32949682 gcatgagccctcaacagtt 32949700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 186 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 45135425 - 45135283
Alignment:
Q  186 cattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagaca-ttccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagggcatgagccctc 284  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||  |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45135425 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcagttccagggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagggcatgagccctc 45135326  T
Q  285 aac-agttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 326  Q
    ||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  45135325 aacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaac 45135283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 158 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 362351 - 362098
Alignment:
Q  158 accatttccatcgtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt-gaa 256  Q
    ||||||| || ||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| | || ||||||||||||| ||| |||    
T  362351 accattttcaacgtgttgaatgactaggtattccggggcttaagcccccaacaatttgaatgataa-acattctagggtataagccctcaacagtttgaa 362253  T
Q  257 tgattaac-attccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactcaac-t 354  Q
    |||  |   |||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   | |    || |||||| || |    
T  362252 tgacaaggtattatagggcataagccctcaatagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttatgagtgtacaatggactcgactt 362153  T
Q  355 tgtgtatatcagcatacaactcaactacgacagcaacaacataggcaacgacaac 409  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||| |||| | ||||||||||    
T  362152 tgtgtatatcaacatacaactcaactacaacaacaacgacatggacaacgacaac 362098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 173 - 326
Target Start/End: Original strand, 43111949 - 43112100
Alignment:
Q  173 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagg 272  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |    
T  43111949 ttgaatga-taaacattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgattaatattccaag 43112047  T
Q  273 gcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| |||||| |||||||    
T  43112048 gcatgagccctcaacagttgaatgattaa-cattccaggacatgagtcctcaac 43112100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 158 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 21415713 - 21415539
Alignment:
Q  158 accatttccatcgtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacgg-ttgaa 256  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||  | |||||||| ||||| |||||||||| | |||||    
T  21415713 accattttcaacgtgttgaatgactaagcattccagggcataagcccccagcaatt-gaatgatga-acattccagggcatgagccctcaacagattgaa 21415616  T
Q  257 tgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggttt 331  Q
    |||  |  |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21415615 tgacaaggcattccagggcatgagccctcaacggtttgaatggcaaagcattccagggcatgagccctcaacggttt 21415539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 158 - 326
Target Start/End: Original strand, 43111894 - 43112062
Alignment:
Q  158 accatttccatcgtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-ggttgaa 256  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||| | |||||    
T  43111894 accattttcaacgtgttgaatgactaagcattccgggggataagcccccaacaatttgaatgataa-acattccagggcatgagccctcaacagtttgaa 43111992  T
Q  257 tgatta-acattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 326  Q
    |||  |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||  |||||| ||||||||||||||||    
T  43111993 tgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgattaa-tattccaaggcatgagccctcaac 43112062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 173 - 326
Target Start/End: Original strand, 19881766 - 19881920
Alignment:
Q  173 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-ggttgaatgattaacattccag 271  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||     
T  19881766 ttgaatga-taaacattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccgtcaacagtttgaatgataaacattccat 19881864  T
Q  272 ggcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 326  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  19881865 ggcataagccctcaacagtttgaatgaaaaagcattccagggcataagcactcaac 19881920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 170 - 409
Target Start/End: Original strand, 32949540 - 32949780
Alignment:
Q  170 gtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-ggttgaatgatta-acatt 267  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||   ||||||||  |  ||||    
T  32949540 gtgttgaatgactaagcattctagggcataagcccccaacaatttgaatgataa-acattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcatt 32949638  T
Q  268 ccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatg-aaaggactc-aacttgtgtatatca 365  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||||  |||  ||| || |||||| || ||||||||||||    
T  32949639 ccaaggcataagccctcaacagttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagttt-ataagtatgcaatggactcaaatttgtgtatatca 32949736  T
Q  366 gcatacaactcaactacgacagcaacaacataggcaacgacaac 409  Q
     |||| ||||||||||| ||| | || |||| | ||||||||||    
T  32949737 acatataactcaactacaacaacgacgacatggacaacgacaac 32949780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 157 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 38186230 - 38186102
Alignment:
Q  157 caccatttccatcgtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaa 256  Q
    |||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  38186230 caccattttcaacatgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgataa-acattccagggcataagccatcaacggttgaa 38186132  T
Q  257 tgattaa-cattcca-gggcatgagccctc 284  Q
    |||  || ||||||| ||||||||||||||    
T  38186131 tgacaaagcattccaggggcatgagccctc 38186102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 156 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 21861775 - 21861647
Alignment:
Q  156 gcaccatttccatcgtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttga 255  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||   |||||    
T  21861775 gcaccattttcaacgtgttgaatgactaagcattccagggcataagcccccaacaatttgaatgataa-acattccagggcataagccctcagtagttga 21861677  T
Q  256 atgattaa-cattccagggcatgagccctc 284  Q
    ||||  || ||||| |||||||||||||||    
T  21861676 atgacaaagcattctagggcatgagccctc 21861647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 173 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 45135477 - 45135323
Alignment:
Q  173 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-ggttgaatgatta-aca-ttcc 269  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||  |  || ||||    
T  45135477 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatga-tggacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcagttcc 45135379  T
Q  270 agggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 326  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||    
T  45135378 agggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaac 45135323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 173 - 331
Target Start/End: Original strand, 19881845 - 19882003
Alignment:
Q  173 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagg 272  Q
    |||||||| ||| ||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||| ||  ||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  19881845 ttgaatga-taaacattccatggcataagccctcaacagtttgaatgaaaaagcattccagggcataagcactcaacaattgaatgataaacattccagg 19881943  T
Q  273 gcatgagccctcaac-agttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggttt 331  Q
    |||||||||||| || | ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||    
T  19881944 gcatgagccctcgacaatttgaatgacaaggcattccggggcataagccctcaacagttt 19882003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 172 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 45135359 - 45135245
Alignment:
Q  172 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccag 271  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||  | ||||||||    
T  45135359 gttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacgagcattccag 45135261  T
Q  272 ggcatgagccctcaac 287  Q
    ||||||||||||||||    
T  45135260 ggcatgagccctcaac 45135245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 158 - 395
Target Start/End: Original strand, 363599 - 363839
Alignment:
Q  158 accatttccatcgtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-ggttgaa 256  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||| ||||| |||||||||| | |||||    
T  363599 accattttcaacgggttgaatgactaagcattccagggcataagcccccaacaatttgaatgatga-tcattccagggcatgagccctcaacagattgaa 363697  T
Q  257 tgattaa-cattccagggcatgagccctcaac-agttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatg-aaaggactcaac 353  Q
    |||  || || |||||||||| |||||||| | | ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| || |||  |  | ||| || | |||| ||    
T  363698 tgacaaagcagtccagggcataagccctcaccaatttgaacgacaaggcgttccagggcatgagccctcaccgcttt-atgtttatgtaatgaactcgac 363796  T
Q  354 -ttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacagcaacaaca 395  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  363797 tttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacgacaaca 363839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 160 - 331
Target Start/End: Original strand, 19881713 - 19881885
Alignment:
Q  160 catttccatcgtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-ggttgaatg 258  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||   |||||||    
T  19881713 cattttcaacgtgttgaatgactaagcattccgtggcataagcccccaacaatttgaatgataa-acattccagggcatgagccctcaacaatttgaatg 19881811  T
Q  259 atta-acattccagggcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggttt 331  Q
    |  |  ||||||||||||| |||| ||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  19881812 acaaggcattccagggcataagccgtcaacagtttgaatgataaa-cattccatggcataagccctcaacagttt 19881885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 158 - 326
Target Start/End: Original strand, 44431476 - 44431644
Alignment:
Q  158 accatttccatcgtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-ggttgaa 256  Q
    ||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |  ||||||| ||||| |||||||||| | |||||    
T  44431476 accattttcaacgtgatgaatgactaagcattccggggcataagccctcaacaatttgaatgatga-tcattccagggcatgagccctcaacagattgaa 44431574  T
Q  257 tgatta-acattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 326  Q
    |||  |  ||||||||||||| |||||||||| |||||||||  || |||| |||||||||||||||||||    
T  44431575 tgacaaggcattccagggcataagccctcaacggttgaatgattaa-catttcagggcatgagccctcaac 44431644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 264 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 44523266 - 44523199
Alignment:
Q  264 cattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggttt 331  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44523266 cattccagggcatgagccctcaacggttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagttt 44523199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 234 - 330
Target Start/End: Original strand, 44431512 - 44431610
Alignment:
Q  234 ggcataagccctcaacggtt-gaatgattaacattccagggcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtt 330  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44431512 ggcataagccctcaacaatttgaatgatgatcattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacggtt 44431610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 213 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 21861758 - 21861647
Alignment:
Q  213 ttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt-gaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagg 311  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||||||||| ||||  || ||||||| ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| |||    
T  21861758 ttgaatgactaagcattccagggcataagcccccaacaatttgaatgataaacattccagggcataagccctcagtagttgaatgacaaagcattctagg 21861659  T
Q  312 gcatgagccctc 323  Q
    ||||||||||||    
T  21861658 gcatgagccctc 21861647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 173 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 22522044 - 22521830
Alignment:
Q  173 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaga-cattc-caaggcataagccctcaacggtt-gaatgat-taacattc 268  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||   | | ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||| || |||||    
T  22522044 ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttgaatggttaaagcattcacagggcatgagccctcaacggtttgaatgatctagcattc 22521945  T
Q  269 -cagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatg-aaaggactcaacttgtgtatatcag 366  Q
     |||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||  | || ||| || | |||| ||||||||||||||     
T  22521944 acagggcataagccctcaacgattgaacgacaaggcgttccagggcatgagccctcaacagttt-atgattatgcaatgaactccacttgtgtatatcaa 22521846  T
Q  367 catacaactcaactac 382  Q
    ||||||||||||||||    
T  22521845 catacaactcaactac 22521830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 172 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 7301721 - 7301567
Alignment:
Q  172 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-ggttgaatgatta-acattcc 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||  | |||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||  |  || | |    
T  7301721 gttgaatgactaagcattccggggcataagccccaacaaatttgaatgatga-acattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcaattc 7301623  T
Q  270 agggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 326  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||  || |||||||| |||||||||||||||    
T  7301622 agggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattccagagcatgagccctcaac 7301567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 252 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 7301680 - 7301601
Alignment:
Q  252 ttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtt 330  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||    
T  7301680 ttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcaattcagggcataagccctcaacggtt 7301601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 169 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 15004909 - 15004830
Alignment:
Q  169 cgtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaa 248  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  15004909 cgtgttgaatgactaagcattccagagcataaaccctcaacaatttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaa 15004830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 156 - 259
Target Start/End: Original strand, 20454246 - 20454348
Alignment:
Q  156 gcaccatttccatcgtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttga 255  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  | ||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||| |||||    
T  20454246 gcaccattttcaacgtgttgaatgactaagcatttcagggcataagcccctgataatttgaatgataa-acatttcagggcataagccctcaacagttga 20454344  T
Q  256 atga 259  Q
    ||||    
T  20454345 atga 20454348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 173 - 409
Target Start/End: Original strand, 19881884 - 19882123
Alignment:
Q  173 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt-gaatgattaa-cattcca 270  Q
    ||||||||  ||||||||| |||||||||| | |||||||| |||||| || |||||||| ||||| ||||||| ||  || ||||||  |  ||||||     
T  19881884 ttgaatgaaaaagcattccagggcataagcactcaacaatt-gaatgataa-acattccagggcatgagccctcgacaatttgaatgacaaggcattccg 19881981  T
Q  271 gggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatg-aaaggactcaac-ttgtgtatatcagc 367  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||||  | |  ||| || ||||||||| |||||||||||| |    
T  19881982 gggcataagccctcaacagtttgaatgacgaggcattctagggcataagccctcaacggttttatgagtatgcaatggactcaactttgtgtatatcaac 19882081  T
Q  368 atacaactcaactacgacagcaacaacataggcaacgacaac 409  Q
    |||||||||||| ||  || | ||||| ||| ||||||||||    
T  19882082 atacaactcaacaacatcaacgacaacgtagacaacgacaac 19882123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 193 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 22434778 - 22434635
Alignment:
Q  193 gggcataagcccccaacaatttgaatga-caagacattc-caaggcataagccctcaacggttgaatgattaac-attc-cagggcatgagccctcaaca 288  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||| || ||||| |||||||||| ||||||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  22434778 gggcataagccctcaacaatttgaatgaactag-cattcacagggcatgagccctcaacagttgaataattaagtattcacagggcatgagccctcaaca 22434680  T
Q  289 gtt-gaatgacaaagcattc-cagggcatgagccctcaacggttt 331  Q
    ||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  22434679 gtttgaatgattaagcattcacagggcatgagccctcaacagttt 22434635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 252 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 38186174 - 38186102
Alignment:
Q  252 ttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattcca-gggcatgagccctc 323  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  38186174 ttgaatgataaacattccagggcataagccatcaacggttgaatgacaaagcattccaggggcatgagccctc 38186102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 252 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 45135437 - 45135357
Alignment:
Q  252 ttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagca-ttccagggcatgagccctcaacggtt 330  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  45135437 ttgaatgatggacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcagttccagggcataagccctcaacggtt 45135357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 264 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 15004138 - 15004071
Alignment:
Q  264 cattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggttt 331  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||    
T  15004138 cattccagggcataagccctcaacagttgaataacaaagcattctagggcataagccctcaacagttt 15004071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 173 - 395
Target Start/End: Original strand, 15267118 - 15267344
Alignment:
Q  173 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaga-cattc-caaggcataagccctcaacggtt-gaatgat-taacattc 268  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||   | | ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||  || |||||    
T  15267118 ttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagtttgaatggttaaagcattcacagggcatgagccctcaacggtttgaatgaactagcattc 15267217  T
Q  269 -cagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatg-aaaggactcaacttgtgtatatcag 366  Q
     |||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||| ||||  | || ||| || | |||| ||||||||||||||     
T  15267218 acagggcataagccctcaacgattgaacgacaaggcgttccaaggcatgagccctcaacagttt-atgattatgcaatgaactccacttgtgtatatcaa 15267316  T
Q  367 catacaactcaactacgacagcaacaaca 395  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  15267317 catacaactcaactacaaca-caacaaca 15267344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 234 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 22434696 - 22434598
Alignment:
Q  234 ggcataagccctcaacggtt-gaatgattaa-cattc-cagggcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattc-cagggcatgagccctcaacg 327  Q
    ||||| |||||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22434696 ggcatgagccctcaacagtttgaatgattaagcattcacagggcatgagccctcaacagtttgaatgattaagcattcacagggcatgagccctcaacg 22434598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 173 - 247
Target Start/End: Original strand, 44431766 - 44431840
Alignment:
Q  173 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctca 247  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||| || ||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||||||    
T  44431766 ttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaccaatttgaacgacaaggcgttccaaggcatgagccctca 44431840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 251 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 44523320 - 44523239
Alignment:
Q  251 gttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtt 330  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||||| ||||| ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44523320 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacggtt 44523239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 252 - 304
Target Start/End: Original strand, 20454303 - 20454355
Alignment:
Q  252 ttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagca 304  Q
    ||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20454303 ttgaatgataaacatttcagggcataagccctcaacagttgaatgacaaagca 20454355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 24708197 - 24708118
Alignment:
Q  213 ttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatga-ttaacattccagggcatgagccctcaacagtt 291  Q
    ||||||||| |  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24708197 ttgaatgactaagcattccggggcataagccctcaacggttgaatgacatagcattctagggcatgagccctcaacagtt 24708118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 212 - 327
Target Start/End: Original strand, 15267117 - 15267238
Alignment:
Q  212 tttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-ggttgaatgattaa--cattc-cagggcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcatt 306  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| | ||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||   ||||||    
T  15267117 tttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagtttgaatggttaaagcattcacagggcatgagccctcaacggtttgaatgaactagcatt 15267216  T
Q  307 c-cagggcatgagccctcaacg 327  Q
    | |||||||| |||||||||||    
T  15267217 cacagggcataagccctcaacg 15267238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 251 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 15004906 - 15004830
Alignment:
Q  251 gttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaa 325  Q
    ||||||||| ||| |||||||| |||| | ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15004906 gttgaatgactaagcattccagagcataaaccctcaacaatttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaa 15004830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 264 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 23647646 - 23647586
Alignment:
Q  264 cattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctca 324  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| || |||||| |||||||||||||    
T  23647646 cattccagggcatgagccctcaccaattgaacgacaaggcgttccagagcatgagccctca 23647586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 172 - 326
Target Start/End: Original strand, 44431608 - 44431762
Alignment:
Q  172 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt-gaatgattaa-cattcc 269  Q
    ||||||||| ||| |||| | |||||| ||||| |||||  |||||||||||  ||||||| |||||||||||||| || || ||||||  |  | || |    
T  44431608 gttgaatgattaa-catttcagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaccgctttgaatgacaaggcgttac 44431706  T
Q  270 agggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 326  Q
    ||||||| |||||||||  |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||    
T  44431707 agggcataagccctcaatggttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaac 44431762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 400 - 465
Target Start/End: Original strand, 44431902 - 44431969
Alignment:
Q  400 caacgacaacgatcgtgcataataactc--actcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 465  Q
    |||||||||| || |||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44431902 caacgacaacaattgtgcataataactatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacatatga 44431969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 414 - 465
Target Start/End: Original strand, 363843 - 363896
Alignment:
Q  414 gtgcataataactc--actcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 465  Q
    |||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  363843 gtgcataataactatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 363896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 22522045 - 22521924
Alignment:
Q  212 tttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-ggttgaatgattaa--cattc-cagggcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcatt 306  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||| | ||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||   ||||||    
T  22522045 tttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttgaatggttaaagcattcacagggcatgagccctcaacggtttgaatgatctagcatt 22521946  T
Q  307 c-cagggcatgagccctcaacg 327  Q
    | |||||||| |||||||||||    
T  22521945 cacagggcataagccctcaacg 22521924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 172 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 24708198 - 24708161
Alignment:
Q  172 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaac 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24708198 gttgaatgactaagcattccggggcataagccctcaac 24708161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 354 - 395
Target Start/End: Original strand, 44431871 - 44431912
Alignment:
Q  354 ttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacagcaacaaca 395  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  44431871 ttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacgacaaca 44431912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 173 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 44523279 - 44523183
Alignment:
Q  173 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt-gaatgattaacattcc 269  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||| ||||| ||||  || |||||||||  ||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  44523279 ttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacggtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgattaacattcc 44523183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 173 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 45135319 - 45135241
Alignment:
Q  173 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt 253  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||| || ||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  45135319 ttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtt-gaatgacgag-cattccagggcatgagccctcaacggtt 45135241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 226 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 15004138 - 15004072
Alignment:
Q  226 cattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagtt 291  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||| |  || ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  15004138 cattccagggcataagccctcaacagttgaataacaaagcattctagggcataagccctcaacagtt 15004072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 193 - 325
Target Start/End: Original strand, 20385147 - 20385284
Alignment:
Q  193 gggcataagcccccaacaatttgaatga-caagacattc-caaggcataagccctcaacggtt-gaatgattaacattc-cagggcatgagccctcaaca 288  Q
    |||||||||||| |||||||||||| || | || ||||| || ||||| || ||||||| ||| ||||||||||||| | || |||||||||||||||||    
T  20385147 gggcataagccctcaacaatttgaacgaactag-cattcacagggcatgagtcctcaacagtttgaatgattaacatccacaaggcatgagccctcaaca 20385245  T
Q  289 g-ttgaatgacaaagcattc-cagggcatgagccctcaa 325  Q
    | ||||| ||||| || ||| |||||||| |||||||||    
T  20385246 gtttgaacgacaaggccttcacagggcataagccctcaa 20385284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 225 - 324
Target Start/End: Original strand, 44431738 - 44431840
Alignment:
Q  225 acattccaaggcataagccctcaacgg-ttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccc 321  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||  || ||||||||||||| |||||||| || || ||| ||||| || ||||| |||||||||||    
T  44431738 acattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaccaatttgaacgacaaggcgttccaaggcatgagccc 44431837  T
Q  322 tca 324  Q
    |||    
T  44431838 tca 44431840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 432 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 7301284 - 7301251
Alignment:
Q  432 actccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 465  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7301284 actccccaacttggccaacatcaacaacctatga 7301251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 173 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 17272853 - 17272816
Alignment:
Q  173 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaaca 210  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  17272853 ttgaatgactaagcattccggagcataaacccccaaca 17272816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 172 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 22059766 - 22059690
Alignment:
Q  172 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac 249  Q
    ||||||||||  ||||| || |||||||||||| |||| | ||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||    
T  22059766 gttgaatgacatagcatccctgggcataagccctcaac-agttgaatgacatagcattccagggcataagccctcaac 22059690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 409
Target Start/End: Original strand, 43112124 - 43112189
Alignment:
Q  345 ggactcaactt-gtgtatatcagcatacaactcaactacgacagcaacaacataggcaacgacaac 409  Q
    |||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| ||| | ||||||||||    
T  43112124 ggactcgactttgtgtatatcaacatacaactcaactacaacaacaacagcatggacaacgacaac 43112189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 269 - 331
Target Start/End: Original strand, 22616614 - 22616678
Alignment:
Q  269 cagggcatgagccctcaacagttg-aatgacaaagcattcc-agggcatgagccctcaacggttt 331  Q
    |||||||| | ||||||||| ||| |||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22616614 cagggcataacccctcaacaattggaatgattaagcattcccagggcatgagccctcaacggttt 22616678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 237; Significance: 1e-131; HSPs: 98)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 173 - 465
Target Start/End: Original strand, 10554073 - 10554365
Alignment:
Q  173 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagg 272  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  | ||||| |||    
T  10554073 ttgaatgacaaagcattccagggcataagcccccaacaatttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggttgaatgacgagcattctagg 10554172  T
Q  273 gcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactcaacttgtgtatatcagcataca 372  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10554173 gcatgagccctcaacggttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatgaaaggactccacttgtgtatatcagcataca 10554272  T
Q  373 actcaactacgacagcaacaacataggcaacgacaacgatcgtgcataataactcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 465  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10554273 actcaactacgacaacaacaacataggcaacgacaacgatcgtgcataataactcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 10554365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 172 - 465
Target Start/End: Original strand, 14041294 - 14041590
Alignment:
Q  172 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt-gaatgattaa-cattcc 269  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||  || ||||||    
T  14041294 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaagcattcc 14041393  T
Q  270 agggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactcaacttgtgtatatcagcat 369  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14041394 agggcataagccctcaacagttgaatgacatagcattccagggcataagccctcaacagtttcctaatcatgaa-ggactcaacttgtgtatatcagcat 14041492  T
Q  370 acaactcaactacgacagcaacaacataggcaacgacaacgatcgtgcataataac--tcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 465  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14041493 acaactcaactacgacaacgacaacataggcaacgacaacgaccgtgcataataactatgactcactccccaacttgatcaacatcaacaacctatga 14041590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 172 - 465
Target Start/End: Original strand, 14037826 - 14038122
Alignment:
Q  172 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt-gaatgattaa-cattcc 269  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||  || ||||||    
T  14037826 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaagcattcc 14037925  T
Q  270 agggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactcaacttgtgtatatcagcat 369  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14037926 agggcataagccctcaacagttgaatgacatagcattccagggcataagccctcaacagattcctaatcatgaa-ggactcaacttgtgtatatcagcat 14038024  T
Q  370 acaactcaactacgacagcaacaacataggcaacgacaacgatcgtgcataataac--tcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 465  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14038025 acaactcaactacgacaacgacaacataggcaacgacaacgaccgtgcataataactatgactcactccccaacttgatcaacatcaacaacctatga 14038122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 174 - 463
Target Start/End: Original strand, 18958546 - 18958839
Alignment:
Q  174 tgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaa-tgacaagacatt-ccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattcca 270  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||| |||||||||| |||||||||  || |||||||    
T  18958546 tgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaaatgacaaggcatttccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattcca 18958645  T
Q  271 gggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactcaacttgtgtatatcagcata 370  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18958646 gggcataagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacggtttcctaatcatg-aaggactcaacttgtgtatatcagcata 18958744  T
Q  371 caactcaactacgacagcaacaacataggcaacgacaacgatcgtgcataataac--tcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctat 463  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  18958745 caactcaactacgacaacgacaacataggcaacgacaacgaccgtgcataataactatgactcactccccaactagatcaacatcaacaacctat 18958839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 173 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 2035452 - 2035158
Alignment:
Q  173 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattccag 271  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||    
T  2035452 ttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaagcattccag 2035353  T
Q  272 ggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactcaacttgtgtatatcagcatac 371  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2035352 ggcataagccctcaacagttgaatgacatagcattccagggcataagccctcaacagattcctaatcatgaa-ggactcaacttgtgtatatcagcatac 2035254  T
Q  372 aactcaactacgacagcaacaacataggcaacgacaacgatcgtgcataataac--tcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 465  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2035253 aactcaactacgacaacgacaacataggcaacgacaacgaccgtgcataataactatgactcactccccaacttgatcaacatcaacaacctatga 2035158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 172 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 2038959 - 2038665
Alignment:
Q  172 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattcca 270  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||| || |||||||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||||||  || |||||||    
T  2038959 gttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaagcattcca 2038861  T
Q  271 gggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactcaacttgtgtatatcagcata 370  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2038860 gggcataagccctcaacagttgaatgacatagcattccagggcataagccctcaacagattcctaatcatgaa-ggactcaacttgtgtatatcagcata 2038762  T
Q  371 caactcaactacgacagcaacaacataggcaacgacaacgatcgtgcataataac--tcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 465  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2038761 caactcaactacgacaacgacaacataggcaacgacaacgaccgtgcataataactatgactcactccccaacttgatcaacatcaacaacctatga 2038665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 172 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 2042700 - 2042406
Alignment:
Q  172 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattcca 270  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||| || |||||||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||||||  || |||||||    
T  2042700 gttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaagcattcca 2042602  T
Q  271 gggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactcaacttgtgtatatcagcata 370  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2042601 gggcataagccctcaacagttgaatgacatagcattccagggcataagccctcaacagattcctaatcatgaa-ggactcaacttgtgtatatcagcata 2042503  T
Q  371 caactcaactacgacagcaacaacataggcaacgacaacgatcgtgcataataac--tcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 465  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2042502 caactcaactacgacaacgacaacataggcaacgacaacgaccgtgcataataactatgactcactccccaacttgatcaacatcaacaacctatga 2042406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 172 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 15010605 - 15010390
Alignment:
Q  172 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattcca 270  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||  || |||||||    
T  15010605 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctgaacagttgaatgacaaagcattcca 15010506  T
Q  271 gggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactcaacttgtgtatatcagcata 370  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  15010505 gggcatgagccctcagcagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatgaagggactcaacgtgtgtatatcagcata 15010406  T
Q  371 caactcaactacgaca 386  Q
    ||||||| ||||||||    
T  15010405 caactcatctacgaca 15010390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 173 - 465
Target Start/End: Original strand, 16799449 - 16799752
Alignment:
Q  173 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt-gaatgattaa-cattcca 270  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||| || |||||||||  ||||||  ||||||||||| ||||  || ||||||  |  |||||||    
T  16799449 ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattcca 16799547  T
Q  271 gggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactcaacttgtgtatatcagcat 369  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16799548 gggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactcaacttgtgtatatcaacat 16799647  T
Q  370 acaactcaactacgacagcaacaacatagg------caacgacaacgatcgtgcataataac---tcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacc 460  Q
    ||||||||||||||||| | |||| |||||      |||||| |||||  ||||||||||||   | ||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16799648 acaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggttaacatcaacaacc 16799747  T
Q  461 tatga 465  Q
    |||||    
T  16799748 tatga 16799752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 173 - 386
Target Start/End: Original strand, 54973041 - 54973254
Alignment:
Q  173 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattccag 271  Q
    ||||||||| ||||||||| | |||| ||||| |||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||  || ||||||||    
T  54973041 ttgaatgacaaagcattccagagcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacatttgaatgacaaagcattccag 54973140  T
Q  272 ggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactcaacttgtgtatatcagcatac 371  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  54973141 ggcataagccctcaacggttgaatgacga-gcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactcgacttgtgtatatcaacatac 54973239  T
Q  372 aactcaactacgaca 386  Q
    |||||||||||||||    
T  54973240 aactcaactacgaca 54973254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 173 - 386
Target Start/End: Original strand, 54975651 - 54975864
Alignment:
Q  173 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattccag 271  Q
    ||||||||| ||||||||| | |||| ||||| |||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||  || ||||||||    
T  54975651 ttgaatgacaaagcattccagagcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacatttgaatgacaaagcattccag 54975750  T
Q  272 ggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactcaacttgtgtatatcagcatac 371  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  54975751 ggcataagccctcaacggttgaatgacga-gcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactcgacttgtgtatatcaacatac 54975849  T
Q  372 aactcaactacgaca 386  Q
    |||||||||||||||    
T  54975850 aactcaactacgaca 54975864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 173 - 386
Target Start/End: Original strand, 54978261 - 54978474
Alignment:
Q  173 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattccag 271  Q
    ||||||||| ||||||||| | |||| ||||| |||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||  || ||||||||    
T  54978261 ttgaatgacaaagcattccagagcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacatttgaatgacaaagcattccag 54978360  T
Q  272 ggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactcaacttgtgtatatcagcatac 371  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  54978361 ggcataagccctcaacggttgaatgacga-gcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactcgacttgtgtatatcaacatac 54978459  T
Q  372 aactcaactacgaca 386  Q
    |||||||||||||||    
T  54978460 aactcaactacgaca 54978474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 173 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 14951918 - 14951722
Alignment:
Q  173 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagg 272  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||| || |||||||||  ||||||| ||||| |||||||||| |            |||||||||    
T  14951918 ttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacag------------cattccagg 14951832  T
Q  273 gcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactcaacttgtgtatatcagcataca 372  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14951831 gcataagccctcaacagttgaatgacaaagcattcaagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactcaacttgtgtatatcagcataca 14951732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 152 - 326
Target Start/End: Original strand, 16799348 - 16799524
Alignment:
Q  152 ggtagcaccatttccatcgtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-g 250  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| |    
T  16799348 ggtaacaccatttccatcgtgttgaatgactaagcattccagggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacag 16799447  T
Q  251 gttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 326  Q
     ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  16799448 tttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccggggcataagcccccaac 16799524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 158 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 179909 - 179739
Alignment:
Q  158 accatttccatcgtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaat 257  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| |||||||    
T  179909 accattttcaacgtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcgtaagccctcaacagttgaat 179810  T
Q  258 gattaa-cattccagggcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 326  Q
    ||  || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  179809 gacaaatcattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaac 179739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 251 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 55292819 - 55292595
Alignment:
Q  251 gttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggact 349  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  55292819 gttgaatgactaagcattccggggcataagccctccacggttgaatgacaaagcatttcagggcataagccctcaacagtttcctaatcatgaaaagact 55292720  T
Q  350 caacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacagcaacaacataggcaacgaca------acgatcgtgcataataac---tcactcactccccaa 440  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||      ||||  ||||||||||||   | ||| |||||||||    
T  55292719 cgacttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaacataggcaacgacaacgacaacgactgtgcataataacttatgacttactccccaa 55292620  T
Q  441 cttggtcaacatcaacaacctatga 465  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  55292619 cttggtcaacatcaacaacctatga 55292595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 264 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 604002 - 603880
Alignment:
Q  264 cattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactcaacttgtgtatat 363  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  604002 cattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatgaaaggactcaacgtgtgtatat 603903  T
Q  364 cagcatacaactcaactacgaca 386  Q
    |||||||||||||| ||||||||    
T  603902 cagcatacaactcatctacgaca 603880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 172 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 2035493 - 2035337
Alignment:
Q  172 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-ggttgaatgattaa-cattcc 269  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||   ||||||||  || ||||||    
T  2035493 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaagcattcc 2035394  T
Q  270 agggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 326  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2035393 agggcataagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaac 2035337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 172 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 2039234 - 2039078
Alignment:
Q  172 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-ggttgaatgattaa-cattcc 269  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||   ||||||||  || ||||||    
T  2039234 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaagcattcc 2039135  T
Q  270 agggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 326  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2039134 agggcataagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaac 2039078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 172 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 2042975 - 2042819
Alignment:
Q  172 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-ggttgaatgattaa-cattcc 269  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||   ||||||||  || ||||||    
T  2042975 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaagcattcc 2042876  T
Q  270 agggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 326  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2042875 agggcataagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaac 2042819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 213 - 465
Target Start/End: Original strand, 39230431 - 39230670
Alignment:
Q  213 ttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagg 311  Q
    ||||||||| |  ||||||  ||||||||||| |||| |||||||||  |  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  39230431 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacagttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacatagcattccagg 39230530  T
Q  312 gcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactcaacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacagcaacaacataggcaacgacaacga 411  Q
    |||| |||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||               ||||||||||||    
T  39230531 gcataagccctcaacagactcctaatcatg-aaggactcaacttgtgtatatcagcatacaactcaactacga---------------caacgacaacga 39230614  T
Q  412 tcgtgcataataac--tcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 465  Q
     |||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39230615 ccgtgcataataactatgactcactccccaacttgatcaacatcaacaacctatga 39230670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 173 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 2039193 - 2039039
Alignment:
Q  173 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattccag 271  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||    
T  2039193 ttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaagcattccag 2039094  T
Q  272 ggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 326  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2039093 ggcataagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaac 2039039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 173 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 2042934 - 2042780
Alignment:
Q  173 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattccag 271  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||    
T  2042934 ttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaagcattccag 2042835  T
Q  272 ggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 326  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2042834 ggcataagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaac 2042780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 172 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 23396214 - 23396053
Alignment:
Q  172 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-ggttgaatgattaacattcca 270  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||    
T  23396214 gttgaatgacaaagcattccagggcataatcccccaacaatttgaatgacaaggcattctagggcataagcccccaacaatttgaatgattaacattcca 23396115  T
Q  271 gggcatgagccctcaaca-gttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggttt 331  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  23396114 gggcatgagccctcaacattttgaatgacaaggcattccagggcataagcgctcaacggttt 23396053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 193 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 10990047 - 10989915
Alignment:
Q  193 gggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacag-tt 291  Q
    |||||| ||||| |||||  |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10990047 gggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagatt 10989948  T
Q  292 gaatgacaaagcattccagggcatgagccctca 324  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  10989947 gaatgacaaagcattacagggcataagccctca 10989915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 172 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 2039076 - 2038922
Alignment:
Q  172 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattcca 270  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||| || |||||||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||||||  || |||||||    
T  2039076 gttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaagcattcca 2038978  T
Q  271 gggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 326  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2038977 gggcataagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaac 2038922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 172 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 2039115 - 2038961
Alignment:
Q  172 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattcca 270  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||| | |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||||||  || |||||||    
T  2039115 gttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaac-agttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaagcattcca 2039017  T
Q  271 gggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 326  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2039016 gggcataagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaac 2038961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 172 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 2042817 - 2042663
Alignment:
Q  172 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattcca 270  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||| || |||||||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||||||  || |||||||    
T  2042817 gttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaagcattcca 2042719  T
Q  271 gggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 326  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2042718 gggcataagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaac 2042663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 172 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 2042856 - 2042702
Alignment:
Q  172 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattcca 270  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||| | |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||||||  || |||||||    
T  2042856 gttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaac-agttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaagcattcca 2042758  T
Q  271 gggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 326  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2042757 gggcataagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaac 2042702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 186 - 326
Target Start/End: Original strand, 54972935 - 54973077
Alignment:
Q  186 cattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagaca-ttccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagggcatgagccctc 284  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||  |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54972935 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcaattccagggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagggcatgagccctc 54973034  T
Q  285 aac-agttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 326  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  54973035 aacaatttgaatgacaaagcattccagagcatgagccctcaac 54973077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 186 - 326
Target Start/End: Original strand, 54975545 - 54975687
Alignment:
Q  186 cattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagaca-ttccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagggcatgagccctc 284  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||  |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54975545 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcaattccagggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagggcatgagccctc 54975644  T
Q  285 aac-agttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 326  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  54975645 aacaatttgaatgacaaagcattccagagcatgagccctcaac 54975687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 186 - 326
Target Start/End: Original strand, 54978155 - 54978297
Alignment:
Q  186 cattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagaca-ttccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagggcatgagccctc 284  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||  |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54978155 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcaattccagggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagggcatgagccctc 54978254  T
Q  285 aac-agttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 326  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  54978255 aacaatttgaatgacaaagcattccagagcatgagccctcaac 54978297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 251 - 386
Target Start/End: Original strand, 54046463 - 54046600
Alignment:
Q  251 gttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggac 348  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  54046463 gttgaatgactaagcattccggggcatgagcccccaacaattcgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatgaaaggac 54046562  T
Q  349 tcaacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgaca 386  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  54046563 tcaacgtgtgtatattagcatacaactcatctacgaca 54046600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 172 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 604056 - 603936
Alignment:
Q  172 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattcca 270  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| |||||||||  || |||||||    
T  604056 gttgaatgactaagcattctggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattcca 603957  T
Q  271 gggcatgagccctcaacagtt 291  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  603956 gggcatgagccctcaacagtt 603936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 158 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 6806187 - 6806014
Alignment:
Q  158 accatttccatcgtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-ggttgaa 256  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||   |||||    
T  6806187 accattttcaacgtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacagtttgaatgataa-acattccagggcatgagccctcaacaatttgaa 6806089  T
Q  257 tgatta-acattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggttt 331  Q
    |||  |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6806088 tgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatga-ttagcattccagggcatgagccctcaacagttt 6806014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 173 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 52339078 - 52338963
Alignment:
Q  173 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagg 272  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  52339078 ttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgattaacattccagg 52338979  T
Q  273 gcatgagccctcaaca 288  Q
    ||||||||||||||||    
T  52338978 gcatgagccctcaaca 52338963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 173 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 14951958 - 14951841
Alignment:
Q  173 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattccag 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||    
T  14951958 ttgaatgactaagcattccggggcataagccctcaacaatttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaagcattccag 14951859  T
Q  272 ggcatgagccctcaacag 289  Q
    ||||||||||||||||||    
T  14951858 ggcatgagccctcaacag 14951841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 172 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 179816 - 179701
Alignment:
Q  172 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccag 271  Q
    |||||||||| || |||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  179816 gttgaatgacaaatcattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgattaacattccag 179717  T
Q  272 ggcatgagccctcaac 287  Q
    ||||||||||||||||    
T  179716 ggcatgagccctcaac 179701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 212 - 326
Target Start/End: Original strand, 10553994 - 10554109
Alignment:
Q  212 tttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccag 310  Q
    |||||| |||||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10553994 tttgaacgacaaggcgttccagggcatgagccctcaacggttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaagcattccag 10554093  T
Q  311 ggcatgagccctcaac 326  Q
    ||||| ||||| ||||    
T  10554094 ggcataagcccccaac 10554109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 194 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 52339175 - 52339042
Alignment:
Q  194 ggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaac-agttg 292  Q
    ||||| ||||| |||||  |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| | |||    
T  52339175 ggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcataagccatcaacagttgaatgattaacatttcagggcatgagctctcaacaatttg 52339076  T
Q  293 aatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 326  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  52339075 aatgacaaggcattccagggcatgagccctcaac 52339042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 172 - 289
Target Start/End: Original strand, 39230430 - 39230547
Alignment:
Q  172 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatga-ttaacattcca 270  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||  || |||||||    
T  39230430 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaac-agttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacatagcattcca 39230528  T
Q  271 gggcatgagccctcaacag 289  Q
    |||||| ||||||||||||    
T  39230529 gggcataagccctcaacag 39230547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 172 - 287
Target Start/End: Original strand, 16799487 - 16799604
Alignment:
Q  172 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-ggttgaatgattaa-cattcc 269  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||  || ||||||    
T  16799487 gttgaatgacaaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaagcattcc 16799586  T
Q  270 agggcatgagccctcaac 287  Q
    ||||||||||||||||||    
T  16799587 agggcatgagccctcaac 16799604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 158 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 10990121 - 10989953
Alignment:
Q  158 accatttccatcgtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-ggttgaa 256  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  ||||| | ||||| |||||||||| | |||||    
T  10990121 accattttcaacgggttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatga-tcattctagggcatgagccctcaacagattgaa 10990023  T
Q  257 tgatta-acattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 326  Q
    |||  |  ||||||||||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||    
T  10990022 tgacaaggcattccagggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaac 10989953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 173 - 331
Target Start/End: Original strand, 16799409 - 16799569
Alignment:
Q  173 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattccag 271  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||| |||||||||  || |||||| |    
T  16799409 ttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccgg 16799508  T
Q  272 ggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggttt 331  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16799509 ggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagttt 16799569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 158 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 52339250 - 52339082
Alignment:
Q  158 accatttccatcgtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-ggttgaa 256  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||| ||||| |||||||||| | |||||    
T  52339250 accattttcaacgggttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatga-tcattccatggcatgagccctcaacagattgaa 52339152  T
Q  257 tgatta-acattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 326  Q
    |||  |  ||||||||||||| |||| |||||||||||||||  || |||| |||||||||||| ||||||    
T  52339151 tgacaaggcattccagggcataagccatcaacagttgaatgattaa-catttcagggcatgagctctcaac 52339082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 172 - 249
Target Start/End: Original strand, 7631933 - 7632010
Alignment:
Q  172 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||    
T  7631933 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaac 7632010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 174 - 326
Target Start/End: Original strand, 54972884 - 54973037
Alignment:
Q  174 tgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-ggttgaatgatta--acattcca 270  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||  |    ||||||    
T  54972884 tgaatgactaagcattccgaggcataagcccccaacaatttgaatgatga-acattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcaattcca 54972982  T
Q  271 gggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 326  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||    
T  54972983 gggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaac 54973037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 174 - 326
Target Start/End: Original strand, 54975494 - 54975647
Alignment:
Q  174 tgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-ggttgaatgatta--acattcca 270  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||  |    ||||||    
T  54975494 tgaatgactaagcattccgaggcataagcccccaacaatttgaatgatga-acattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcaattcca 54975592  T
Q  271 gggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 326  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||    
T  54975593 gggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaac 54975647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 174 - 326
Target Start/End: Original strand, 54978104 - 54978257
Alignment:
Q  174 tgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-ggttgaatgatta--acattcca 270  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||  |    ||||||    
T  54978104 tgaatgactaagcattccgaggcataagcccccaacaatttgaatgatga-acattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcaattcca 54978202  T
Q  271 gggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 326  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||    
T  54978203 gggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaac 54978257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 173 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 179854 - 179616
Alignment:
Q  173 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt-gaatgattaa-cattcca 270  Q
    ||||||||| | ||||||| |||| ||||||| ||||| || |||||||||  ||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||  |  |||||||    
T  179854 ttgaatgacaaggcattccagggcgtaagccctcaacagtt-gaatgacaaatcattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattcca 179756  T
Q  271 gggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcat-gaaaggactcaac--ttgtgtatatcagc 367  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||  || |||||||||  |||||||||||| |    
T  179755 gggcataagccctcaacagttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacggttt-ataagtatacaatggactcaacatttgtgtatatcaac 179658  T
Q  368 atacaactcaactacgacagcaacaacataggcaacgacaac 409  Q
    |||||||||| | ||  || | ||||||||| ||||||||||    
T  179657 atacaactcagcaacatcaacgacaacatagacaacgacaac 179616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 172 - 330
Target Start/End: Original strand, 10554033 - 10554191
Alignment:
Q  172 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-ggttgaatgattaa-cattcc 269  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||||| ||||| |||||  |||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||  || ||||||    
T  10554033 gttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaagcattccagggcataagcccccaacaatttgaatgacaaagcattcc 10554131  T
Q  270 agggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtt 330  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10554132 agggcatgagccctcaacggttgaatgac-gagcattctagggcatgagccctcaacggtt 10554191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 156 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 10834592 - 10834465
Alignment:
Q  156 gcaccatttccatcgtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttga 255  Q
    ||||||||| || | |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| | ||||||||||||||||  ||||    
T  10834592 gcaccattttcaacatgttgaatgactaagcattatggggcataagcccccaacaatttgaatgataa-acattctagggcataagccctcaacaattga 10834494  T
Q  256 atga-ttaacattccagggcatgagccct 283  Q
    ||||   |||| |||||||||||||||||    
T  10834493 atgacaaaacactccagggcatgagccct 10834465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 156 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 23396308 - 23396137
Alignment:
Q  156 gcaccatttccatcgtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttga 255  Q
    |||| |||| || ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| | ||||  |||||    
T  23396308 gcactattttcaacgtgttgaatgactaagtatatcggggcataagcccccaacaatttgaatgataa-acattccagggcataagtcatcaatagttga 23396210  T
Q  256 atgattaa-cattccagggcatgagccctcaac-agttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 326  Q
    ||||  || ||||||||||||| | ||| |||| | ||||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||||    
T  23396209 atgacaaagcattccagggcataatcccccaacaatttgaatgacaaggcattctagggcataagcccccaac 23396137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 169 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 30206638 - 30206558
Alignment:
Q  169 cgtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac 249  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  30206638 cgtgttgaatgactaagcattccagggcataagccctcaacaatttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaac 30206558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 172 - 249
Target Start/End: Original strand, 54046463 - 54046540
Alignment:
Q  172 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||    
T  54046463 gttgaatgactaagcattccggggcatgagcccccaacaattcgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaac 54046540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 152 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 55292839 - 55292743
Alignment:
Q  152 ggtagcaccatttccatcgtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||   |||||||||||  |||| || ||||||||||||||||    
T  55292839 ggtagcaccatttccatcgtgttgaatgactaagcattccggggcataagccctccac-ggttgaatgacaaagcatttcagggcataagccctcaac 55292743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 193 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 3395140 - 3394996
Alignment:
Q  193 gggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattc-caaggcataagccctcaac-ggttgaatgattaa-cattc-cagggcatgagccctcaac- 287  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||   |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||     
T  3395140 gggcatgagccctcaacaatttgaatgacaagtcattcacagggcatgagccctcaacaatttgaatgattaagcattcacagggcatgagccctcaaca 3395041  T
Q  288 agttgaatgacaaagcattc-cagggcatgagccctcaacggttt 331  Q
    | ||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  3395040 atttgaatgacaaggcattcacagggcataagccctcaacggttt 3394996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 172 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 52339118 - 52338964
Alignment:
Q  172 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt-gaatgattaa-cattcc 269  Q
    ||||||||| ||| |||| | |||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||  || ||||||  |  ||||||    
T  52339118 gttgaatgattaa-catttcagggcatgagctctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattcc 52339020  T
Q  270 agggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 326  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||    
T  52339019 agggcataagccctcaacagttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaac 52338964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 226 - 330
Target Start/End: Original strand, 54972896 - 54973003
Alignment:
Q  226 cattccaaggcataagccctcaacggtt-gaatgattaacattccagggcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagc-attccagggcatgagccct 322  Q
    |||||| |||||||||||| ||||  || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||||    
T  54972896 cattccgaggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcaattccagggcataagccct 54972995  T
Q  323 caacggtt 330  Q
    ||||||||    
T  54972996 caacggtt 54973003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 226 - 330
Target Start/End: Original strand, 54975506 - 54975613
Alignment:
Q  226 cattccaaggcataagccctcaacggtt-gaatgattaacattccagggcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagc-attccagggcatgagccct 322  Q
    |||||| |||||||||||| ||||  || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||||    
T  54975506 cattccgaggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcaattccagggcataagccct 54975605  T
Q  323 caacggtt 330  Q
    ||||||||    
T  54975606 caacggtt 54975613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 226 - 330
Target Start/End: Original strand, 54978116 - 54978223
Alignment:
Q  226 cattccaaggcataagccctcaacggtt-gaatgattaacattccagggcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagc-attccagggcatgagccct 322  Q
    |||||| |||||||||||| ||||  || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||||    
T  54978116 cattccgaggcataagcccccaacaatttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcaattccagggcataagccct 54978215  T
Q  323 caacggtt 330  Q
    ||||||||    
T  54978216 caacggtt 54978223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 157 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 1989491 - 1989320
Alignment:
Q  157 caccatttccatcgtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-ggttga 255  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| | ||||| | |||||||| | ||||    
T  1989491 caccattttcaacgtgttgaatgactaagcattccagggcataagcccccaacaatgtgaatgataa-acattctagggcatgaaccctcaacagtttga 1989393  T
Q  256 atgatta-acattccagggcatgagccctcaac-agttgaat-gacaaagcattc-cagggcatgagccctca 324  Q
    ||||  | ||||||||||||||| |||| || | | |||||| |  ||||||||| |||||||||||||||||    
T  1989392 atgacaagacattccagggcatgcgcccccaccaatttgaatggttaaagcattcacagggcatgagccctca 1989320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 252 - 322
Target Start/End: Original strand, 6819014 - 6819085
Alignment:
Q  252 ttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccct 322  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6819014 ttgaatgataaacattctagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattccagggcatgagccct 6819085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 252 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 10990066 - 10989987
Alignment:
Q  252 ttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtt 330  Q
    ||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10990066 ttgaatgatgatcattctagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacggtt 10989987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 158 - 249
Target Start/End: Original strand, 17211123 - 17211213
Alignment:
Q  158 accatttccatcgtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac 249  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||| ||||| ||||||||||    
T  17211123 accattttcaacgggttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatga-tcattccagggcatgagccctcaac 17211213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 193 - 326
Target Start/End: Original strand, 6819033 - 6819169
Alignment:
Q  193 gggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaa-cggttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacag-t 290  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| ||  | ||||||||| |||||| || ||||| |||||||||||| |    
T  6819033 gggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctaaatagtttgaatgataaacatttcatggcataagccctcaacagtt 6819132  T
Q  291 tgaatgacaaagcattc-cagggcatgagccctcaac 326  Q
    |||||||||| |||||| |||||||| | ||||||||    
T  6819133 tgaatgacaaggcattcacagggcataatccctcaac 6819169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 252 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 10834535 - 10834465
Alignment:
Q  252 ttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccct 322  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  10834535 ttgaatgataaacattctagggcataagccctcaacaattgaatgacaaaacactccagggcatgagccct 10834465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 251 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 30206635 - 30206553
Alignment:
Q  251 gttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggttt 331  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  30206635 gttgaatgactaagcattccagggcataagccctcaacaatttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagttt 30206553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 172 - 253
Target Start/End: Original strand, 18958625 - 18958705
Alignment:
Q  172 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt 253  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||| | |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18958625 gttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaac-agttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacggtt 18958705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 193 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 1989416 - 1989281
Alignment:
Q  193 gggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt-gaatgattaa--cattc-cagggcatgagccctcaaca 288  Q
    |||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||| || |  || ||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  1989416 gggcatgaaccctcaacagtttgaatgacaagacattccagggcatgcgcccccaccaatttgaatggttaaagcattcacagggcatgagccctcacca 1989317  T
Q  289 gttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctca 324  Q
     ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1989316 attgaacgacaaagcgttccagggcatgagccctca 1989281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 158 - 249
Target Start/End: Original strand, 6818887 - 6818976
Alignment:
Q  158 accatttccatcgtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac 249  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| || | ||||||||||||||    
T  6818887 accattttcaacgtgttgaatgactaagaattcc-gggtataagcccccaacaatttgaatgataa-acattacaggacataagccctcaac 6818976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 173 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 3395079 - 3394997
Alignment:
Q  173 ttgaatgactaagcattc-cggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattc-caaggcataagccctcaacggtt 253  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  3395079 ttgaatgattaagcattcacagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattcacagggcataagccctcaacggtt 3394997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 251 - 331
Target Start/End: Original strand, 16799368 - 16799450
Alignment:
Q  251 gttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggttt 331  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16799368 gttgaatgactaagcattccagggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagttt 16799450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 252 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 14951958 - 14951882
Alignment:
Q  252 ttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 326  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14951958 ttgaatgactaagcattccggggcataagccctcaacaatttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaac 14951882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 402 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 603885 - 603820
Alignment:
Q  402 acgacaacgatcgtgcataataactc--actcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 465  Q
    |||||||||| ||||||||||||||   ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  603885 acgacaacgaccgtgcataataactatgacatactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 603820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 402 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 15010395 - 15010330
Alignment:
Q  402 acgacaacgatcgtgcataataactc--actcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 465  Q
    |||||||||| ||||||||||||||   ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15010395 acgacaacgaccgtgcataataactatgacatactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 15010330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 193 - 325
Target Start/End: Original strand, 15232141 - 15232278
Alignment:
Q  193 gggcataagcccccaacaatttgaatga-caagacattc-caaggcataagccctcaacggttg-aatgattaa-cattcc-agggcatgagccctcaac 287  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||| | || ||||| || |||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||    
T  15232141 gggcataagccctcaacaaattgaatgaactag-cattcacagggcataagccctcaacagttggaatgattaagcattcctaggtcatgagccctcaac 15232239  T
Q  288 agttgaatgacaaagcattc-cagggcatgagccctcaa 325  Q
     |||||| ||||| || ||| |||||||| |||||||||    
T  15232240 ggttgaacgacaaggcgttcacagggcataagccctcaa 15232278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 193 - 325
Target Start/End: Original strand, 15238009 - 15238146
Alignment:
Q  193 gggcataagcccccaacaatttgaatga-caagacattc-caaggcataagccctcaacggttg-aatgattaa-cattcc-agggcatgagccctcaac 287  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||| | || ||||| || |||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||    
T  15238009 gggcataagccctcaacaaattgaatgaactag-cattcacagggcataagccctcaacagttggaatgattaagcattcctaggtcatgagccctcaac 15238107  T
Q  288 agttgaatgacaaagcattc-cagggcatgagccctcaa 325  Q
     |||||| ||||| || ||| |||||||| |||||||||    
T  15238108 ggttgaacgacaaggcgttcacagggcataagccctcaa 15238146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 172 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 2035374 - 2035298
Alignment:
Q  172 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac 249  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||| | ||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||    
T  2035374 gttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaac-agttgaatgacatagcattccagggcataagccctcaac 2035298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 251 - 326
Target Start/End: Original strand, 7631933 - 7632010
Alignment:
Q  251 gttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 326  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||||| ||||| ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7631933 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaac 7632010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 173 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 10990027 - 10989814
Alignment:
Q  173 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacgg-ttgaatgattaa-cattcca 270  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||  || ||||||  | |||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||  || |||| ||    
T  10990027 ttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacggtt-gaatgatta-acattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaagcattaca 10989930  T
Q  271 gggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaagga-ctcaactt-gtgtatatcagc 367  Q
    |||||| |||||||| || || ||| ||||| || |||||||||||||||||||| || |||  |  | ||| || || ||| |||| ||||||||||||    
T  10989929 gggcataagccctcaccaatttgaacgacaaggcgttccagggcatgagccctcaccgcttta-tgtttatgtaatgaactcgactttgtgtatatcagc 10989831  T
Q  368 atacaactcaactacga 384  Q
    |||||||||||||||||    
T  10989830 atacaactcaactacga 10989814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 173 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 12856105 - 12855881
Alignment:
Q  173 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaat-gacaagacattc-caaggcataagccctcaacggttgaatg-attaacattc- 268  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |  ||  |||||  | ||||| |||||||| |  ||||||| | || |||||     
T  12856105 ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacaatttgaatggttaaagcattcatagggcatgagccctcaccaattgaatgaactagcattca 12856006  T
Q  269 cagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatg-aaaggactcaacttgtgtatatcagc 367  Q
    |||||||| |||||||  || ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||| |||   | || ||| || | |||| |||||||||||||  |    
T  12856005 cagggcataagccctctccaattgaacggcaaggcattccagggcatgagccctcaacagtt--atgattatgcaatgaactccacttgtgtatatcgac 12855908  T
Q  368 atacaactcaactacgacagcaacaaca 395  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  12855907 atacaactcaactacaaca-caacaaca 12855881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 193 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 10834516 - 10834381
Alignment:
Q  193 gggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacgg--ttgaatgattaa--cattc-cagggcatgagccctcaac 287  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| |||| ||||| ||||||   |||  ||||||| ||||  ||||| |||||||| |||||||| |    
T  10834516 gggcataagccctcaacaatt-gaatgacaaaacactccagggcatgagcccttc-cggatttgaatggttaaagcattcacagggcataagccctcacc 10834419  T
Q  288 agttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaa 325  Q
    | ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  10834418 aattgaacgacaaggcgttccagggcatgagccctcaa 10834381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 401 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 10989812 - 10989746
Alignment:
Q  401 aacgacaacgatcgtgcataataactc--actcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 465  Q
    ||||||||| |  |||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10989812 aacgacaacaactgtgcataataactatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 10989746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 251 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 604056 - 603979
Alignment:
Q  251 gttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 326  Q
    ||||||||| ||| |||||  |||||| ||||| ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  604056 gttgaatgactaagcattctggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaac 603979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 432 - 465
Target Start/End: Original strand, 54973282 - 54973315
Alignment:
Q  432 actccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54973282 actccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 54973315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 432 - 465
Target Start/End: Original strand, 54975892 - 54975925
Alignment:
Q  432 actccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54975892 actccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 54975925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 432 - 465
Target Start/End: Original strand, 54978502 - 54978535
Alignment:
Q  432 actccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54978502 actccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 54978535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 269 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 3395142 - 3395083
Alignment:
Q  269 cagggcatgagccctcaac-agttgaatgacaaagcattc-cagggcatgagccctcaac 326  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  3395142 cagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaagtcattcacagggcatgagccctcaac 3395083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 269 - 330
Target Start/End: Original strand, 15232180 - 15232243
Alignment:
Q  269 cagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattcc-agggcatgagccctcaacggtt 330  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  15232180 cagggcataagccctcaacagttggaatgattaagcattcctaggtcatgagccctcaacggtt 15232243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 269 - 330
Target Start/End: Original strand, 15238048 - 15238111
Alignment:
Q  269 cagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattcc-agggcatgagccctcaacggtt 330  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  15238048 cagggcataagccctcaacagttggaatgattaagcattcctaggtcatgagccctcaacggtt 15238111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 213 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 55292818 - 55292739
Alignment:
Q  213 ttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagtt 291  Q
    ||||||||| |  ||||||  ||||||||||||| ||||||||||||  || |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  55292818 ttgaatgactaagcattccggggcataagccctccacggttgaatgacaaagcatttcagggcataagccctcaacagtt 55292739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 252 - 313
Target Start/End: Original strand, 6818941 - 6819003
Alignment:
Q  252 ttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccagggc 313  Q
    ||||||||| |||||| |||| ||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||    
T  6818941 ttgaatgataaacattacaggacataagccctcaacagtttgaatgacaatgcattctagggc 6819003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 200 - 249
Target Start/End: Original strand, 43928391 - 43928441
Alignment:
Q  200 agcccccaacaatttgaatgacaagacattc-caaggcataagccctcaac 249  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  43928391 agccctcaacaatttgaatgacaaggcattcacatggcataagccctcaac 43928441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 252 - 289
Target Start/End: Original strand, 15446424 - 15446461
Alignment:
Q  252 ttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacag 289  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  15446424 ttgaatgatgatcattccagggcatgagccctcaacag 15446461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 252 - 289
Target Start/End: Original strand, 17211178 - 17211215
Alignment:
Q  252 ttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacag 289  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  17211178 ttgaatgatgatcattccagggcatgagccctcaacag 17211215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 432 - 465
Target Start/End: Original strand, 54046627 - 54046660
Alignment:
Q  432 actccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  54046627 actccccaacttggtcaacatcaacaaactatga 54046660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 290 - 330
Target Start/End: Original strand, 10553995 - 10554035
Alignment:
Q  290 ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtt 330  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  10553995 ttgaacgacaaggcgttccagggcatgagccctcaacggtt 10554035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 120)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 186 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 124627 - 124348
Alignment:
Q  186 cattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagggcatgagccctca 285  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  124627 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacggttgaatgacgagcattccagggcatgagccctca 124528  T
Q  286 acagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactcaacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgac 385  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  124527 acggttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatgaaaggactccacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgac 124428  T
Q  386 agcaacaacataggcaacgacaacgatcgtgcataataactcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 465  Q
    | ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  124427 aacaacaacataggtgacgacaacgattgtgcataataactcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 124348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 173 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 13395933 - 13395639
Alignment:
Q  173 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattccag 271  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||    
T  13395933 ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaagcattccag 13395834  T
Q  272 ggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactcaacttgtgtatatcagcatac 371  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13395833 ggcataagccctcaacagttgaatgacatagcattccagggcataagccctcaacagattcctaatcatgaa-ggactcaacttgtgtatatcagcatac 13395735  T
Q  372 aactcaactacgacagcaacaacataggcaacgacaacgatcgtgcataataac--tcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 465  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13395734 aactcaactacgacaacgacaacataggcaacgacaacgaccgtgcataataactatgactcactccccaacttgatcaacatcaacaacctatga 13395639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 172 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 13733996 - 13733707
Alignment:
Q  172 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatga-ttaacattcca 270  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||  ||  ||||||    
T  13733996 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacgattgaatgacatagtattcca 13733897  T
Q  271 gggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactcaacttgtgtatatcagcata 370  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13733896 gggcatgagccctcaacgattgaatgacatagcattccagggcatgagccctcaacagtgtcctaatcatg-aaggactcaacttgtgtatatcagcata 13733798  T
Q  371 caactcaactacgacagcaacaacataggcaacgacaacgatcgtgcataataac--tcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 465  Q
    |||||||||||||      |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13733797 caactcaactacg------acaacataggcaacgacaacgaccgtgcacaataactatgactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 13733707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 172 - 465
Target Start/End: Original strand, 48784964 - 48785258
Alignment:
Q  172 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattcca 270  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||| || |||||||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||||||  || |||||||    
T  48784964 gttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaagcattcca 48785062  T
Q  271 gggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactcaacttgtgtatatcagcata 370  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  48785063 gggcataagccctcaacagttgaatgacatagcattccagggcataagccctcaacagattcctaatcatgaa-ggactcaacttgtgtatatcagcata 48785161  T
Q  371 caactcaactacgacagcaacaacataggcaacgacaacgatcgtgcataataac--tcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 465  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  48785162 caactcaactacgacaacgacaacataggcaacgacaacgaccgtgcataataactatgactcactccccaacttgatcaacatcaacaacctatga 48785258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 173 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 21743776 - 21743475
Alignment:
Q  173 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagg 272  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||| ||||| |||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||    
T  21743776 ttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacggttgaatgacgagcattccagg 21743678  T
Q  273 gcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactcaacttgtgtatatcagcatac 371  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21743677 gcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatgaaaggactccacttgtgtatatcagcatac 21743578  T
Q  372 aactcaactacgacagcaacaacatagg------caacgacaacgatcgtgcataataac---tcactcactccccaacttggtcaacatcaacaaccta 462  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||      ||||||||||||  ||||||||||||   | ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21743577 aactcaactacgacaacgacaacataggcaacaacaacgacaacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaatcta 21743478  T
Q  463 tga 465  Q
    |||    
T  21743477 tga 21743475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 264 - 465
Target Start/End: Original strand, 4993230 - 4993430
Alignment:
Q  264 cattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactcaacttgtgtatat 363  Q
    ||||||||||||| |||||||||  |||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4993230 cattccagggcataagccctcaatggttgaatgattaat-attccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactcaacttgtgtatat 4993328  T
Q  364 cagcatacaactcaactacgacagcaacaacataggcaacgacaacgatcgtgcataataactcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctat 463  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4993329 cagcatacaactcaactacgacagcaacatcttaggcaacgacaacgatcgtgcatattaactcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctat 4993428  T
Q  464 ga 465  Q
    ||    
T  4993429 ga 4993430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 173 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 17506254 - 17505966
Alignment:
Q  173 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattccag 271  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  || |||||| |    
T  17506254 ttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacaatt-gaatgacaaagcattccagggcataagccctccacggttgaatgacaaagcattccgg 17506156  T
Q  272 ggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactcaacttgtgtatatcagcata 370  Q
    | | | ||||| ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17506155 gacgtaagcccccaacattttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactcaacttgtgtatatcaacata 17506056  T
Q  371 caactcaactacgacagcaacaacataggcaacgacaacgatcgtgcataataac---tcactcactccccaacttggtcaacatcaaca 457  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17506055 caactcaactacgacaacgacaacataggcaacgacaacgactgtgcagaataacttatgactcactccccaacttggtcaacatcaaca 17505966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 173 - 457
Target Start/End: Original strand, 17546960 - 17547248
Alignment:
Q  173 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattccag 271  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  || |||||| |    
T  17546960 ttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacaatt-gaatgacaaagcattccagggcataagccctccacggttgaatgacaaagcattccgg 17547058  T
Q  272 ggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactcaacttgtgtatatcagcata 370  Q
    | | | ||||| ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17547059 gacgtaagcccccaacattttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactcaacttgtgtatatcaacata 17547158  T
Q  371 caactcaactacgacagcaacaacataggcaacgacaacgatcgtgcataataac---tcactcactccccaacttggtcaacatcaaca 457  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17547159 caactcaactacgacaacgacaacataggcaacgacaacgactgtgcagaataacttatgactcactccccaacttggtcaacatcaaca 17547248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 172 - 465
Target Start/End: Original strand, 8775991 - 8776292
Alignment:
Q  172 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccag 271  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||  | ||||||||    
T  8775991 gttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacgagcattccag 8776089  T
Q  272 ggcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactcaacttgtgtatatcagcata 370  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  8776090 ggcatgagccctcaacagattgaatggcga-gcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactcgacttgtgtatatcaacata 8776188  T
Q  371 caactcaactacgacagcaacaacatagg------caacgacaacgatcgtgcataataac---tcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacct 461  Q
    |||||||||||||||| | ||||| ||||      ||||||||||||  ||| ||||||||   | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8776189 caactcaactacgacaacgacaacgtaggcaacaacaacgacaacgactgtgaataataacttatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacct 8776288  T
Q  462 atga 465  Q
    ||||    
T  8776289 atga 8776292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 264 - 465
Target Start/End: Original strand, 16006138 - 16006347
Alignment:
Q  264 cattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactcaacttgtgtatat 363  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16006138 cattccagggcataagccctcaacagttgaatgacga-gcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactcgacttgtgtatat 16006236  T
Q  364 cagcatacaactcaactacgacagcaacaacatagg------caacgacaacgatcgtgcataataac---tcactcactccccaacttggtcaacatca 454  Q
    || |||||||||||||||||||| | ||||||||||      ||||||||||||  ||||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||||    
T  16006237 caacatacaactcaactacgacaacgacaacataggcaacaacaacgacaacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacatca 16006336  T
Q  455 acaacctatga 465  Q
    ||||| |||||    
T  16006337 acaacttatga 16006347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 172 - 326
Target Start/End: Original strand, 38827797 - 38827952
Alignment:
Q  172 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccag 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38827797 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacgattgaatgattaacattccag 38827896  T
Q  272 ggcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 326  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  38827897 ggcatgagccctcaacagattgaatgacgaatcattctagggcatgagccctcaac 38827952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 152 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 13396034 - 13395857
Alignment:
Q  152 ggtagcaccatttccatcgtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-g 250  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| |    
T  13396034 ggtaacaccatttccatcgtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacag 13395935  T
Q  251 gttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaac-agttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 326  Q
     ||||||||  || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13395934 tttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaac 13395857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 173 - 465
Target Start/End: Original strand, 38827877 - 38828176
Alignment:
Q  173 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacgg-ttgaatgattaa-cattcca 270  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||| ||||| |||||  ||||||||| |  ||||| | ||||| |||||||||| | ||||||||  || |||||||    
T  38827877 ttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacgaatcattctagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaagcattcca 38827975  T
Q  271 gggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactcaacttgtgtatatcagcata 370  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38827976 gggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagtt-cctaattatgaaaggactccacttgtgtatatcagcata 38828073  T
Q  371 caactcaactacgacagcaacaacataggcaacg------acaacgatcgtgcataataac--tcactcactccccaacttggtcaacatcaacaaccta 462  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| |||||||      |||||||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38828074 caactcaactacgacaacgacaacatgggcaacgacaaccacaacgatggtgcataataactatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaaccta 38828173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 172 - 326
Target Start/End: Original strand, 48784846 - 48785001
Alignment:
Q  172 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattcca 270  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| |||||||||  || |||||||    
T  48784846 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattcca 48784945  T
Q  271 gggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 326  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  48784946 gggcataagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaac 48785001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 156 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 14189525 - 14189350
Alignment:
Q  156 gcaccatttccatcgtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttga 255  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  14189525 gcaccatttccaacgtgttgaatgactaggcgttccggggcataagcccccaacaatttgaatgataa-acattccagggcataagccttcaacggttga 14189427  T
Q  256 atgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggttt 331  Q
    ||||  || ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  14189426 atgacaaagcattccagggcataagccctcaaaagttgaatgacaaggcattctagggcatgagccctcaacagttt 14189350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 173 - 409
Target Start/End: Original strand, 16573169 - 16573405
Alignment:
Q  173 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagg 272  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16573169 ttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacaggttgaatgacaagacattccagggcataagccctcaacagttgaatgattaacattccagg 16573268  T
Q  273 gcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcat-gaaaggactcaac-ttgtgtatatcagcata 370  Q
    | || ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| |||||  |||  |||  ||  || |||||| || || ||||||||| ||||    
T  16573269 gtataagccctcaacagttgaatgattaa-cattccagggcatgagccatcaacaattt-ataagtatacaatggactcgactttatgtatatcaacata 16573366  T
Q  371 caactcaactacgacagcaacaacataggcaacgacaac 409  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||    
T  16573367 caactcaactacaacaacaacaacatggacaacgacaac 16573405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 173 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 16592493 - 16592257
Alignment:
Q  173 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagg 272  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16592493 ttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacaggttgaatgacaagacattccagggcataagccctcaacagttgaatgattaacattccagg 16592394  T
Q  273 gcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcat-gaaaggactcaac-ttgtgtatatcagcata 370  Q
    | || ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| |||||  |||  |||  ||  || |||||| || || ||||||||| ||||    
T  16592393 gtataagccctcaacagttgaatgattaa-cattccagggcatgagccatcaacaattt-ataagtatacaatggactcgactttatgtatatcaacata 16592296  T
Q  371 caactcaactacgacagcaacaacataggcaacgacaac 409  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||    
T  16592295 caactcaactacaacaacaacaacatggacaacgacaac 16592257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 174 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 21743854 - 21743697
Alignment:
Q  174 tgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-ggttgaatgattaacattccagg 272  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  21743854 tgaatgactaagcattccgaggcataagcccccaacaatttgaatgatga-acattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaacattccagg 21743756  T
Q  273 gcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtt 330  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21743755 gcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacggtt 21743697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 152 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 17506315 - 17506158
Alignment:
Q  152 ggtagcaccatttccatcgtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacgg 251  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||      
T  17506315 ggtaacaccatttccatcctgttgaatgactaagcattccgggacataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacaa 17506216  T
Q  252 ttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattcc 308  Q
    ||||||||  || ||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  17506215 ttgaatgacaaagcattccagggcataagccctccacggttgaatgacaaagcattcc 17506158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 152 - 308
Target Start/End: Original strand, 17546899 - 17547056
Alignment:
Q  152 ggtagcaccatttccatcgtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacgg 251  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||      
T  17546899 ggtaacaccatttccatcctgttgaatgactaagcattccgggacataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacaa 17546998  T
Q  252 ttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattcc 308  Q
    ||||||||  || ||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  17546999 ttgaatgacaaagcattccagggcataagccctccacggttgaatgacaaagcattcc 17547056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 172 - 326
Target Start/End: Original strand, 16006007 - 16006161
Alignment:
Q  172 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccag 271  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16006007 gttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggtataagccctcaacggttgaatgattaacattccag 16006105  T
Q  272 ggcatgagccctcaac-agttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 326  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  16006106 ggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaac 16006161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 160 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 14192276 - 14192110
Alignment:
Q  160 catttccatcgtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatga 259  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  |||||||||||||| | |||||||||    
T  14192276 catttccaacgtgttgaatgactaggcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgataa-acattccggggcataagccctcaccagttgaatga 14192178  T
Q  260 tta-acattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 326  Q
      |  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  14192177 caaggcattccagggcataagccctcaacggttgaatgacaaagcattctagggcataagccctcaac 14192110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 269 - 396
Target Start/End: Original strand, 15725496 - 15725622
Alignment:
Q  269 cagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactcaacttgtgtatatcagca 368  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15725496 cagggcatgagccctcaaaagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacag-ttcctaattatgaaaggactccacttgtgtatatcagca 15725594  T
Q  369 tacaactcaactacgacagcaacaacat 396  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||    
T  15725595 tacaactcaactacgacaacgacaacat 15725622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 173 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 13850074 - 13849920
Alignment:
Q  173 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagg 272  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||||| || || | |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  13850074 ttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcaatctagggcataagccctcaatagttgaatgattaacattccagg 13849975  T
Q  273 gcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 326  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  13849974 gcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaac 13849920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 186 - 330
Target Start/End: Original strand, 16005941 - 16006087
Alignment:
Q  186 cattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagaca-ttccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagggcatgagccctc 284  Q
    |||||| |||||| |||||||||||  |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16005941 cattccagggcatgagcccccaacagattgaatgacaaggcaattccagggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagggcatgagccctc 16006040  T
Q  285 aac-agttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtt 330  Q
    ||| | ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  16006041 aacaatttgaatgacaaggcattccagggtataagccctcaacggtt 16006087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 158 - 291
Target Start/End: Original strand, 35365924 - 35366056
Alignment:
Q  158 accatttccatcgtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaat 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| || || || |||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  35365924 accatttccatcgtgttgaatgactaagcattgcagagcataagccctcaccagtt-gaatgacaaggcattccagggcataacccctcaacggttgaat 35366022  T
Q  258 gattaacattccagggcatgagccctcaacagtt 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35366023 gattaacattccagggcatgagccctcaacagtt 35366056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 158 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 13850168 - 13849999
Alignment:
Q  158 accatttccatcgtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-ggttgaa 256  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||| | |||||    
T  13850168 accattttcaacgtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgataa-acattccagggcatgagccctcaacagtttgaa 13850070  T
Q  257 tgatta-acattccagggcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaa 325  Q
    |||  |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||| |||||||||    
T  13850069 tgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcaatctagggcataagccctcaa 13849999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 173 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 14192223 - 14192019
Alignment:
Q  173 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattccag 271  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||| || || || |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || ||||| ||    
T  14192223 ttgaatga-taaacattccggggcataagccctcaccagtt-gaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacggttgaatgacaaagcattctag 14192126  T
Q  272 ggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatg-aaaggactcaac-ttgtgtatatcagcat 369  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  | |  ||| || ||||||||| |||||||||||| |||    
T  14192125 ggcataagccctcaacaattgaatgataaa-cattccagggcatgagccctcaacggttttatgagtatgcaatggactcaactttgtgtatatcaacat 14192027  T
Q  370 acaactca 377  Q
    ||||||||    
T  14192026 acaactca 14192019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 174 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 124678 - 124522
Alignment:
Q  174 tgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-ggttgaatgatta-acattccag 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||  |  ||||||||    
T  124678 tgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatga-acattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccag 124580  T
Q  272 ggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtt 330  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  124579 ggcataagccctcaacggttgaatgac-gagcattccagggcatgagccctcaacggtt 124522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 186 - 326
Target Start/End: Original strand, 8775925 - 8776067
Alignment:
Q  186 cattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagaca-ttccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagggcatgagccctc 284  Q
    |||||| |||||| ||||| ||| |  |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8775925 cattccagggcatgagccctcaatagattgaatgacaaggcagttccagggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagggcatgagccctc 8776024  T
Q  285 aac-agttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 326  Q
    ||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  8776025 aacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaac 8776067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 173 - 326
Target Start/End: Original strand, 13255668 - 13255819
Alignment:
Q  173 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagg 272  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||||||||| ||||| || ||||| |||  ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  13255668 ttgaatga-taaacattccagggcataagccctcaacagtt-gaatgccaaagcattccagggcataagccctcaacaattgaatgataaacattccagg 13255765  T
Q  273 gcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 326  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  13255766 gcataagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcataagcactcaac 13255819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 235 - 386
Target Start/End: Original strand, 35365961 - 35366111
Alignment:
Q  235 gcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcc 333  Q
    ||||||||||||| | |||||||||  |  ||||||||||||| | |||||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  35365961 gcataagccctcaccagttgaatgacaaggcattccagggcataacccctcaacggttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagtt-cc 35366058  T
Q  334 taatcatgaaaggactcaacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgaca 386  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35366059 taatcataaaaggactcaacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgaca 35366111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 172 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 13849996 - 13849878
Alignment:
Q  172 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccag 271  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13849996 gttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgattaacattccag 13849898  T
Q  272 ggcatgagccctcaacagtt 291  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  13849897 ggcatgagccctcaacagtt 13849878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 158 - 326
Target Start/End: Original strand, 16573075 - 16573245
Alignment:
Q  158 accatttccatcgtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacgg-ttgaa 256  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| | ||| |||| ||||||| |||||    
T  16573075 accattttcaacgtgttgaatgactaagcattcctgggcatgagcccccaacaatttgaatgataa-acattccaggacatgagccatcaacggtttgaa 16573173  T
Q  257 tgattaa-cattccagggcatgagccctcaaca-gttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 326  Q
    |||  || ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  16573174 tgacaaagcattccagggcataagccctcaacaggttgaatgacaagacattccagggcataagccctcaac 16573245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 158 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 16592587 - 16592417
Alignment:
Q  158 accatttccatcgtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacgg-ttgaa 256  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| | ||| |||| ||||||| |||||    
T  16592587 accattttcaacgtgttgaatgactaagcattcctgggcatgagcccccaacaatttgaatgataa-acattccaggacatgagccatcaacggtttgaa 16592489  T
Q  257 tgattaa-cattccagggcatgagccctcaaca-gttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 326  Q
    |||  || ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  16592488 tgacaaagcattccagggcataagccctcaacaggttgaatgacaagacattccagggcataagccctcaac 16592417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 227 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 21065600 - 21065502
Alignment:
Q  227 attccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctca 324  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  21065600 attccatggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacagagcattccagggcataagccctca 21065502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 186 - 330
Target Start/End: Original strand, 4993111 - 4993257
Alignment:
Q  186 cattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagaca-ttccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagggcatgagccctc 284  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||  |||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4993111 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcaattccagggcatgagccctcaacggttcaatgattaacattccagggcatgagccctc 4993210  T
Q  285 aac-agttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtt 330  Q
    ||| | ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  4993211 aacaatttgaatggcaaggcattccagggcataagccctcaatggtt 4993257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 174 - 291
Target Start/End: Original strand, 48743284 - 48743401
Alignment:
Q  174 tgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccaggg 273  Q
    |||||||| ||||||||| |||||| ||||| | ||| |||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  48743284 tgaatgacaaagcattccagggcatgagccctccacagtttgaatgacaagggattccagggcataagccctcaacaattgaatgattaacattccaggg 48743383  T
Q  274 catgagccctcaacagtt 291  Q
    ||||||||||||||||||    
T  48743384 catgagccctcaacagtt 48743401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 157 - 284
Target Start/End: Original strand, 13255414 - 13255541
Alignment:
Q  157 caccatttccatcgtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaa 256  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || || |||||||| |||||||||| ||||| ||||||    
T  13255414 caccattttcaacgtgttgaatgactaagcattccggggcataagccctcaacaatttgaaagataa-acattccagggcataagccttcaacagttgaa 13255512  T
Q  257 tgattaa-cattccagggcatgagccctc 284  Q
    |||  || |||||||||||||||||||||    
T  13255513 tgacaaagcattccagggcatgagccctc 13255541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 213 - 323
Target Start/End: Original strand, 11660764 - 11660874
Alignment:
Q  213 ttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccaggg 312  Q
    ||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||  ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11660764 ttgaatgactaaacattccagggcataagccctaaacaattgaatgataaacattccagggcataagctctcaacaattgaatgacaaagcattccaggg 11660863  T
Q  313 catgagccctc 323  Q
    |||||||||||    
T  11660864 catgagccctc 11660874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 186 - 287
Target Start/End: Original strand, 4993190 - 4993291
Alignment:
Q  186 cattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagggcatgagccctca 285  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4993190 cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatggcaaggcattccagggcataagccctcaatggttgaatgattaatattccagggcatgagccctca 4993289  T
Q  286 ac 287  Q
    ||    
T  4993290 ac 4993291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 195 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 709702 - 709606
Alignment:
Q  195 gcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagtt 291  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  709702 gcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggaattccagggcataagccctcaacaattgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagtt 709606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 160 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 47976121 - 47976002
Alignment:
Q  160 catttccatcgtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatga 259  Q
    ||||| || |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||| |||||| ||    
T  47976121 cattttcaacgtgttgaattactaatcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgataa-acattccaaggcatgagtcctcaacagttgaacga 47976023  T
Q  260 ttaacattccagggcatgagc 280  Q
    |||||||| |||| |||||||    
T  47976022 ttaacatttcaggacatgagc 47976002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 172 - 287
Target Start/End: Original strand, 16006085 - 16006199
Alignment:
Q  172 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccag 271  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||  | ||||||||    
T  16006085 gttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacgagcattccag 16006183  T
Q  272 ggcatgagccctcaac 287  Q
    ||||||||||||||||    
T  16006184 ggcatgagccctcaac 16006199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 156 - 331
Target Start/End: Original strand, 48743227 - 48743402
Alignment:
Q  156 gcaccatttccatcgtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-ggttg 254  Q
    ||||||||| || | |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||| ||||||| || | |||    
T  48743227 gcaccattttcaacatgttgaatgactaagcattctggggcataag-ccccaacaatctgaatgacaaagcattccagggcatgagccctccacagtttg 48743325  T
Q  255 aatgatta-acattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggttt 331  Q
    |||||  |   |||||||||||| ||||||||||| ||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  48743326 aatgacaagggattccagggcataagccctcaacaattgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagttt 48743402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 173 - 326
Target Start/End: Original strand, 8775873 - 8776027
Alignment:
Q  173 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaa-cggttgaatgatta-aca-ttcc 269  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||| |||||||||  | ||||||||  |  || ||||    
T  8775873 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatga-tggacattccagggcatgagccctcaatagattgaatgacaaggcagttcc 8775971  T
Q  270 agggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 326  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||    
T  8775972 agggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaac 8776027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 212 - 326
Target Start/End: Original strand, 13255628 - 13255742
Alignment:
Q  212 tttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagg 311  Q
    |||||| |||||| | ||||  ||||| |||||||| |  ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13255628 tttgaacgacaaggcgttcccgggcatgagccctcaccaattgaatgataaacattccagggcataagccctcaacagttgaatgccaaagcattccagg 13255727  T
Q  312 gcatgagccctcaac 326  Q
    |||| ||||||||||    
T  13255728 gcataagccctcaac 13255742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 172 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 14189431 - 14189225
Alignment:
Q  172 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt-gaatgattaa-cattcc 269  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||| ||| ||||||  || ||||||    
T  14189431 gttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaa-aagttgaatgacaaggcattctagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaagcattcc 14189333  T
Q  270 agggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatg-aaaggactcaac-ttgtgtatatcagc 367  Q
    ||||||| | ||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||  | |  ||| || ||||||||| |||||||||||| |    
T  14189332 agggcataatccctcaacaattgaatgataaa-cattctagggcatg-gccctcaacggttttatgagtatgcaatggactcaactttgtgtatatcaac 14189235  T
Q  368 atacaactca 377  Q
    ||||||||||    
T  14189234 atacaactca 14189225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 252 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 13850113 - 13850033
Alignment:
Q  252 ttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggttt 331  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13850113 ttgaatgataaacattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagttt 13850033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 213 - 323
Target Start/End: Original strand, 13255430 - 13255541
Alignment:
Q  213 ttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt-gaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagg 311  Q
    ||||||||| |  ||||||  ||||||||||||||||  || ||| ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13255430 ttgaatgactaagcattccggggcataagccctcaacaatttgaaagataaacattccagggcataagccttcaacagttgaatgacaaagcattccagg 13255529  T
Q  312 gcatgagccctc 323  Q
    ||||||||||||    
T  13255530 gcatgagccctc 13255541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 213 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 14192263 - 14192145
Alignment:
Q  213 ttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt-gaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagg 311  Q
    ||||||||| || ||||||  ||||||||||| ||||  || ||||||| |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  14192263 ttgaatgactaggcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgataaacattccggggcataagccctcaccagttgaatgacaaggcattccagg 14192164  T
Q  312 gcatgagccctcaacggtt 330  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  14192163 gcataagccctcaacggtt 14192145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 173 - 326
Target Start/End: Original strand, 4993059 - 4993213
Alignment:
Q  173 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-ggttgaatgatta--acattcc 269  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||  | |||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||  |    |||||    
T  4993059 ttgaatgactaagcattccttggcataagccccctacaatttgaatgatga-acattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcaattcc 4993157  T
Q  270 agggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 326  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||    
T  4993158 agggcatgagccctcaacggttcaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaac 4993213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 173 - 326
Target Start/End: Original strand, 16005889 - 16006043
Alignment:
Q  173 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-ggttgaatgatta--acattcc 269  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||| ||||| ||||| |||| | ||||||||  |    |||||    
T  16005889 ttgaatgactaaacattccggggcataagctcccaacaatttgaatgatga-acattccagggcatgagcccccaacagattgaatgacaaggcaattcc 16005987  T
Q  270 agggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 326  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||    
T  16005988 agggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaac 16006043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 252 - 330
Target Start/End: Original strand, 4993099 - 4993179
Alignment:
Q  252 ttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagc-attccagggcatgagccctcaacggtt 330  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  4993099 ttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcaattccagggcatgagccctcaacggtt 4993179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 172 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 14192186 - 14192072
Alignment:
Q  172 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccag 271  Q
    |||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||  || |||||||||  ||||| | ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  14192186 gttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacggtt-gaatgacaaagcattctagggcataagccctcaacaattgaatgataaacattccag 14192088  T
Q  272 ggcatgagccctcaac 287  Q
    ||||||||||||||||    
T  14192087 ggcatgagccctcaac 14192072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 173 - 284
Target Start/End: Original strand, 16458947 - 16459056
Alignment:
Q  173 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagg 272  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||| || || ||||| ||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16458947 ttgaatgattaa-cattccagggcatgagacctcaacagtttgaatgataac-cattccagggcataagccctcaacggttgaatgattaacattctagg 16459044  T
Q  273 gcatgagccctc 284  Q
    ||||||||||||    
T  16459045 gcatgagccctc 16459056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 159 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 711110 - 711021
Alignment:
Q  159 ccatttccatcgtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac 249  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  |||| ||||||||||    
T  711110 ccattttcaacgtgttgaatgactaagcattccagggcataagcccccaacaatttgaatgataa-acattccagtgcatgagccctcaac 711021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 170 - 323
Target Start/End: Original strand, 16458904 - 16459056
Alignment:
Q  170 gtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt-gaatgattaacattc 268  Q
    ||||||||| |||||||||||| | ||||| |||| ||||| |||||||||  | |||||||| ||||| || ||||||| ||| ||||||| | |||||    
T  16458904 gtgttgaataactaagcattccagagcatacgccctcaacagtttgaatgatta-acattccagggcatgagacctcaacagtttgaatgataaccattc 16459002  T
Q  269 cagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctc 323  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||  || ||||| |||||||||||||||    
T  16459003 cagggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattctagggcatgagccctc 16459056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 156 - 284
Target Start/End: Original strand, 11660747 - 11660874
Alignment:
Q  156 gcaccatttccatcgtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttga 255  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||  ||||| |||||||| || |||||||| ||||||||| ||||||  ||||    
T  11660747 gcaccattttcaacgtgttgaatgactaaacattccagggcataagccctaaacaa-ttgaatgataa-acattccagggcataagctctcaacaattga 11660844  T
Q  256 atgattaa-cattccagggcatgagccctc 284  Q
    ||||  || |||||||||||||||||||||    
T  11660845 atgacaaagcattccagggcatgagccctc 11660874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 172 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 17506177 - 17506096
Alignment:
Q  172 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt 253  Q
    |||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  17506177 gttgaatgacaaagcattccgggacgtaagcccccaacattttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacggtt 17506096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 172 - 253
Target Start/End: Original strand, 17547037 - 17547118
Alignment:
Q  172 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt 253  Q
    |||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  17547037 gttgaatgacaaagcattccgggacgtaagcccccaacattttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacggtt 17547118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 173 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 13850113 - 13849955
Alignment:
Q  173 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt-gaatgattaa-cattcca 270  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||  |  || || |    
T  13850113 ttgaatga-taaacattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcaatcta 13850015  T
Q  271 gggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggttt 331  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13850014 gggcataagccctcaatagttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagttt 13849955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 172 - 288
Target Start/End: Original strand, 16573208 - 16573322
Alignment:
Q  172 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccag 271  Q
    |||||||||| |  |||||| |||||||||||| ||||| || ||||||  | |||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16573208 gttgaatgacaagacattccagggcataagccctcaacagtt-gaatgatta-acattccagggtataagccctcaacagttgaatgattaacattccag 16573305  T
Q  272 ggcatgagccctcaaca 288  Q
    |||||||||| ||||||    
T  16573306 ggcatgagccatcaaca 16573322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 172 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 16592454 - 16592340
Alignment:
Q  172 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccag 271  Q
    |||||||||| |  |||||| |||||||||||| ||||| || ||||||  | |||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16592454 gttgaatgacaagacattccagggcataagccctcaacagtt-gaatgatta-acattccagggtataagccctcaacagttgaatgattaacattccag 16592357  T
Q  272 ggcatgagccctcaaca 288  Q
    |||||||||| ||||||    
T  16592356 ggcatgagccatcaaca 16592340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 173 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 124600 - 124483
Alignment:
Q  173 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattccag 271  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||   ||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  124600 ttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaac-ggttgaatgacgag-cattccagggcatgagccctcaacggttgaatgacaaagcattccag 124503  T
Q  272 ggcatgagccctcaacagtt 291  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  124502 ggcatgagccctcaacagtt 124483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 225 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 13849984 - 13849798
Alignment:
Q  225 acattccaaggcataagccctcaacggtt-gaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccct 322  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||  |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||    
T  13849984 acattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgattaa-cattccagggcatgagccct 13849886  T
Q  323 caacggtttcctaatcatgaaaggactcaac-ttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacagcaacaacataggcaacgacaac 409  Q
    |||| ||||   | |    || |||||| || |||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||| | ||||||||||    
T  13849885 caacagtttatgagtatacaatggactcgactttgtgtatatcaacatacaactcaactaaaacaacaacaacatggacaacgacaac 13849798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 172 - 293
Target Start/End: Original strand, 13255705 - 13255825
Alignment:
Q  172 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattcca 270  Q
    |||||||| | ||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||| |||||||||  || |||||||    
T  13255705 gttgaatgccaaagcattccagggcataagccctcaacaa-ttgaatgataa-acattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaagcattcca 13255802  T
Q  271 gggcatgagccctcaacagttga 293  Q
    |||||| ||| ||||||| ||||    
T  13255803 gggcataagcactcaacaattga 13255825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 226 - 330
Target Start/End: Original strand, 16458920 - 16459025
Alignment:
Q  226 cattccaaggcataagccctcaacggtt-gaatgattaacattccagggcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctc 323  Q
    |||||||  ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  || ||||||||||||| |||||||    
T  16458920 cattccagagcatacgccctcaacagtttgaatgattaacattccagggcatgagacctcaacagtttgaatga-taaccattccagggcataagccctc 16459018  T
Q  324 aacggtt 330  Q
    |||||||    
T  16459019 aacggtt 16459025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 252 - 330
Target Start/End: Original strand, 16005929 - 16006009
Alignment:
Q  252 ttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagc-attccagggcatgagccctcaacggtt 330  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||    
T  16005929 ttgaatgatgaacattccagggcatgagcccccaacagattgaatgacaaggcaattccagggcataagccctcaacggtt 16006009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 206 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 40555882 - 40555751
Alignment:
Q  206 caacaatttgaatgacaagacattc-caaggcataagccctcaac-ggttgaatgattaa-cattc-cagggcatgagccctcaac-agttgaatgacaa 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||||||||   |||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| | |||||||||||    
T  40555882 caacaatttgaatgacaagacattcacagggcatgaaccctcaacaatttgaatgattaagcattcacaaggcatgagccctcaacaatttgaatgacaa 40555783  T
Q  301 agcattc-cagggcatgagccctcaacggttt 331  Q
     |||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  40555782 ggcattcacagggcataagccctcaacggttt 40555751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 234 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 12202186 - 12202085
Alignment:
Q  234 ggcataagccctcaacggttgaatgat-taacattc-cagggcatgagccctcaacagttg-aatgacaaagcattcc-agggcatgagccctcaacggt 329  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  || ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12202186 ggcataagccctcaacgattgaatgaactagcattcacagggcataagccctcaacagttggaatgattaagcattcccagggcatgagccctcaacggt 12202087  T
Q  330 tt 331  Q
    ||    
T  12202086 tt 12202085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 212 - 327
Target Start/End: Original strand, 15689865 - 15689985
Alignment:
Q  212 tttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-ggttgaatgattaa--cattc-cagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattc 307  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| | ||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||    
T  15689865 tttgaatgacaagacattcaagggcatgagccctcaacagtttgaatggttaaagcattcacagggcatgagccctcaacggttgaatgaactagcattc 15689964  T
Q  308 -cagggcatgagccctcaacg 327  Q
     |||||||| |||||||||||    
T  15689965 acagggcataagccctcaacg 15689985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 212 - 327
Target Start/End: Original strand, 15697458 - 15697578
Alignment:
Q  212 tttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-ggttgaatgattaa--cattc-cagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattc 307  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| | ||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||    
T  15697458 tttgaatgacaagacattcaagggcatgagccctcaacagtttgaatggttaaagcattcacagggcatgagccctcaacggttgaatgaactagcattc 15697557  T
Q  308 -cagggcatgagccctcaacg 327  Q
     |||||||| |||||||||||    
T  15697558 acagggcataagccctcaacg 15697578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 252 - 330
Target Start/End: Original strand, 8775913 - 8775993
Alignment:
Q  252 ttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagca-ttccagggcatgagccctcaacggtt 330  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  8775913 ttgaatgatggacattccagggcatgagccctcaatagattgaatgacaaggcagttccagggcataagccctcaacggtt 8775993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 263 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 21519411 - 21519348
Alignment:
Q  263 acattccagggcatgagccctcaacagttgaat-gacaaagcattc-cagggcatgagccctca 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||    
T  21519411 acattccagggcatgagccctcaacagttgaatagtcaaagcattcacagggcatgagccctca 21519348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 262 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 709779 - 709709
Alignment:
Q  262 aacattccagggcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggttt 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||    
T  709779 aacattccagggcatgagccctcaacagtttaaatgacaaggcattccagggcataagccatcaacagttt 709709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 169 - 219
Target Start/End: Original strand, 13407736 - 13407786
Alignment:
Q  169 cgtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatg 219  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13407736 cgtgttgaatgactgagcattccggggcatgagcccccaacaatttgaatg 13407786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 212 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 21519424 - 21519309
Alignment:
Q  212 tttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa--cattc-cagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattc- 307  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||  | ||  ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||   |||||||     
T  21519424 tttgaatgacaagacattccagggcatgagccctcaacagttgaatagtcaaagcattcacagggcatgagccctcaccaattgaatgaactagcattca 21519325  T
Q  308 cagggcatgagccctc 323  Q
    |||||||| |||||||    
T  21519324 cagggcataagccctc 21519309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 251 - 330
Target Start/End: Original strand, 35365938 - 35366018
Alignment:
Q  251 gttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtt 330  Q
    ||||||||| ||| |||| ||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||    
T  35365938 gttgaatgactaagcattgcagagcataagccctcaccagttgaatgacaaggcattccagggcataacccctcaacggtt 35366018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 269 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 15731863 - 15731733
Alignment:
Q  269 cagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattc-cagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatg-aaaggactcaac-ttgtgtatatc 364  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| ||||  | | |||| || ||||||||| |||||||||||    
T  15731863 cagggcataagccctcaacagtttgaatgattaagcattcacagggcatgagccctcaacagttt-atgagcatgcaatggactcaactttgtgtatatc 15731765  T
Q  365 agcatacaactcaactacgacagcaacaacat 396  Q
    | ||||||||||| |||| ||| | |||||||    
T  15731764 aacatacaactcatctacaacatctacaacat 15731733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 15731902 - 15731800
Alignment:
Q  193 gggcataagcccccaacaatttgaatga-caagacattc-caaggcataagccctcaacggtt-gaatgattaa-cattc-cagggcatgagccctcaac 287  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||| || |||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  15731902 gggcataagccctcaacaatttgaatgaactag-cattcacagggcataagccctcaacagtttgaatgattaagcattcacagggcatgagccctcaac 15731804  T
Q  288 agtt 291  Q
    ||||    
T  15731803 agtt 15731800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 265 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 709670 - 709605
Alignment:
Q  265 attccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggttt 331  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  709670 attccagggcataagccctcaacaattgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagttt 709605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 173 - 324
Target Start/End: Original strand, 11660803 - 11660956
Alignment:
Q  173 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacgg--ttgaatgattaa--cattc 268  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||||||| | |||||||| |||||||||  ||||||| ||||| |||||||  |||  ||||||| ||||  |||||    
T  11660803 ttgaatga-taaacattccagggcataagctctcaacaatt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcc-cggatttgaatggttaaagcattc 11660899  T
Q  269 -cagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctca 324  Q
     |||||||| |||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  11660900 acagggcataagccctcaccaattgaacgacaaggcgttccagggcatgagccctca 11660956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 251 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 13396014 - 13395932
Alignment:
Q  251 gttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggttt 331  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||||| ||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13396014 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagttt 13395932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 251 - 327
Target Start/End: Original strand, 38827797 - 38827875
Alignment:
Q  251 gttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacg 327  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||||| ||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  38827797 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacg 38827875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 173 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 40555834 - 40555752
Alignment:
Q  173 ttgaatgactaagcattc-cggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattc-caaggcataagccctcaacggtt 253  Q
    |||||||| ||||||||| |  ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  40555834 ttgaatgattaagcattcacaaggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattcacagggcataagccctcaacggtt 40555752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 172 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 13395855 - 13395779
Alignment:
Q  172 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac 249  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||| | ||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||    
T  13395855 gttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaac-agttgaatgacatagcattccagggcataagccctcaac 13395779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 193 - 291
Target Start/End: Original strand, 15725457 - 15725557
Alignment:
Q  193 gggcataagcccccaacaatttgaatga-caagacattc-caaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacag 289  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||| || ||||| |||||||||  |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||    
T  15725457 gggcataagccctcaacaatttgaatgaactag-cattcacagggcatgagccctcaaaagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacag 15725555  T
Q  290 tt 291  Q
    ||    
T  15725556 tt 15725557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 254 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 47976001 - 47975964
Alignment:
Q  254 gaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagtt 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47976001 gaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagtt 47975964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 400 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 21065400 - 21065333
Alignment:
Q  400 caacgacaacgatcgtgcataataactc--actcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 465  Q
    |||||||||| |  |||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21065400 caacgacaacaactgtgcataataactatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 21065333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 21735601 - 21735541
Alignment:
Q  159 ccatttccatcgtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatg 219  Q
    |||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||| |||||||||    
T  21735601 ccattttcaacgtgttgaatgactgagcattccagggcatgagcccccaacgatttgaatg 21735541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 263 - 330
Target Start/End: Original strand, 15689878 - 15689948
Alignment:
Q  263 acattccagggcatgagccctcaacagtt-gaatgac-aaagcattc-cagggcatgagccctcaacggtt 330  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15689878 acattcaagggcatgagccctcaacagtttgaatggttaaagcattcacagggcatgagccctcaacggtt 15689948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 263 - 330
Target Start/End: Original strand, 15697471 - 15697541
Alignment:
Q  263 acattccagggcatgagccctcaacagtt-gaatgac-aaagcattc-cagggcatgagccctcaacggtt 330  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15697471 acattcaagggcatgagccctcaacagtttgaatggttaaagcattcacagggcatgagccctcaacggtt 15697541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 173 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 21065536 - 21065462
Alignment:
Q  173 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctca 247  Q
    |||||||||  |||||||| |||||||||||| || ||||||||| |||||| | ||||| ||||| ||||||||    
T  21065536 ttgaatgacagagcattccagggcataagccctcaccaatttgaacgacaaggcgttccagggcatgagccctca 21065462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 414 - 465
Target Start/End: Original strand, 35366118 - 35366171
Alignment:
Q  414 gtgcataataactc--actcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 465  Q
    |||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35366118 gtgcataataactatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 35366171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 158 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 13865485 - 13865424
Alignment:
Q  158 accatttccatcgtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatg 219  Q
    ||||||| || ||| | |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  13865485 accattttcaacgtatcgaatgactgagcattccggcgcatgagcccccaacaatttgaatg 13865424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 265 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 21065600 - 21065540
Alignment:
Q  265 attccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 326  Q
    |||||| ||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||    
T  21065600 attccatggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaac 21065540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 290 - 323
Target Start/End: Original strand, 42041338 - 42041371
Alignment:
Q  290 ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctc 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42041338 ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctc 42041371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 213 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 711096 - 711020
Alignment:
Q  213 ttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt-gaatgattaacattccagggcatgagccctcaaca 288  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||||||||| ||||  || ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  711096 ttgaatgactaagcattccagggcataagcccccaacaatttgaatgataaacattccagtgcatgagccctcaaca 711020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 262 - 326
Target Start/End: Original strand, 11660775 - 11660838
Alignment:
Q  262 aacattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 326  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||    
T  11660775 aacattccagggcataagccctaaacaattgaatgataaa-cattccagggcataagctctcaac 11660838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 269 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 12208763 - 12208699
Alignment:
Q  269 cagggcatgagccctcaacagttg-aatgacaaagcattcc-agggcatgagccctcaacggttt 331  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12208763 cagggcataagccctcaacagttggaacgattaagcattcccagggcatgagccctcaacggttt 12208699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 173 - 253
Target Start/End: Original strand, 16006125 - 16006203
Alignment:
Q  173 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt 253  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||| || ||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  16006125 ttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtt-gaatgacgag-cattccagggcatgagccctcaacggtt 16006203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 269 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 39995911 - 39995847
Alignment:
Q  269 cagggcatgagccctcaacagttg-aatgacaaagcattcc-agggcatgagccctcaacggttt 331  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39995911 cagggcataagccctcaacagttggaacgattaagcattcccagggcatgagccctcaacggttt 39995847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 273 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 709702 - 709648
Alignment:
Q  273 gcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 326  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||    
T  709702 gcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggaattccagggcataagccctcaac 709648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 290 - 324
Target Start/End: Original strand, 14038580 - 14038614
Alignment:
Q  290 ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctca 324  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14038580 ttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctca 14038614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 290 - 324
Target Start/End: Original strand, 14348610 - 14348644
Alignment:
Q  290 ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctca 324  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14348610 ttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctca 14348644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 212 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 16668699 - 16668610
Alignment:
Q  212 tttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacg-gttgaatgattaa--cattc-cagggcatgagccctcaacagttgaatga 297  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||  ||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  16668699 tttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaccgatttgaatggttaaagcattcacagggcatgagccctcaccaattgaatga 16668610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 290 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 16668698 - 16668664
Alignment:
Q  290 ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctca 324  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16668698 ttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctca 16668664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 212 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 17643069 - 17642980
Alignment:
Q  212 tttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacg-gttgaatgattaa--cattc-cagggcatgagccctcaacagttgaatga 297  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||  ||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  17643069 tttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaccgatttgaatggttaaagcattcacagggcatgagccctcaccaattgaatga 17642980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 290 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 17643068 - 17643034
Alignment:
Q  290 ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctca 324  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17643068 ttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctca 17643034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 225 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 21065564 - 21065462
Alignment:
Q  225 acattccaaggcataagccctcaacgg-ttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccc 321  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||   | ||||||||||||| |||||||| || || ||| ||||| || |||||||||||||||||    
T  21065564 acattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacagagcattccagggcataagccctcaccaatttgaacgacaaggcgttccagggcatgagccc 21065465  T
Q  322 tca 324  Q
    |||    
T  21065464 tca 21065462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 252 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 47976068 - 47976026
Alignment:
Q  252 ttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagttgaa 294  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  47976068 ttgaatgataaacattccaaggcatgagtcctcaacagttgaa 47976026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 251 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 711097 - 711021
Alignment:
Q  251 gttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 326  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||| || |||||| ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  711097 gttgaatgactaagcattccagggcataagcccccaacaatttgaatgataaa-cattccagtgcatgagccctcaac 711021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 323
Target Start/End: Original strand, 17065656 - 17065689
Alignment:
Q  290 ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctc 323  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17065656 ttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctc 17065689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 251 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 17506295 - 17506218
Alignment:
Q  251 gttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 326  Q
    ||||||||| ||| |||||| || ||| ||||| ||||| || ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  17506295 gttgaatgactaagcattccgggacataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaac 17506218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 251 - 326
Target Start/End: Original strand, 17546919 - 17546996
Alignment:
Q  251 gttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 326  Q
    ||||||||| ||| |||||| || ||| ||||| ||||| || ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  17546919 gttgaatgactaagcattccgggacataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaac 17546996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 269 - 331
Target Start/End: Original strand, 7529106 - 7529170
Alignment:
Q  269 cagggcatgagccctcaacagttg-aatgacaaagcattcc-agggcatgagccctcaacggttt 331  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| || ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7529106 cagggcataagccctcaacaattggaacgattaagcattcccagggcatgagccctcaacggttt 7529170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 194 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 8757452 - 8757396
Alignment:
Q  194 ggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattc-caaggcataagccctcaac 249  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||    
T  8757452 ggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattcacagtgcataagccctcaac 8757396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 173 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 12757175 - 12757143
Alignment:
Q  173 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccc 205  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12757175 ttgaatgactaagcatttcggggcataagcccc 12757143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 290 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 21519423 - 21519387
Alignment:
Q  290 ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 326  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  21519423 ttgaatgacaagacattccagggcatgagccctcaac 21519387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 3)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 193 - 465
Target Start/End: Original strand, 32838 - 33110
Alignment:
Q  193 gggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagttg 292  Q
    |||||| ||||| |||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32838 gggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacggttgaatgacgagcattccagggcatgagccctcaacggttg 32937  T
Q  293 aatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactcaacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacagcaaca 392  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32938 aatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatgaaaggactccacctgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacaaca 33037  T
Q  393 acataggcaacgacaacgatcgtgcataataactcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 465  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33038 acataggtgacgacaacgatcgtgcataataactcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 33110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 174 - 330
Target Start/End: Original strand, 32741 - 32898
Alignment:
Q  174 tgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-ggttgaatgattaacattccagg 272  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||| |||    
T  32741 tgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatga-acattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaacattctagg 32839  T
Q  273 gcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtt 330  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32840 gcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacggtt 32898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 173 - 291
Target Start/End: Original strand, 32858 - 32975
Alignment:
Q  173 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattccag 271  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||   ||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  32858 ttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaac-ggttgaatgacgag-cattccagggcatgagccctcaacggttgaatgacaaagcattccag 32955  T
Q  272 ggcatgagccctcaacagtt 291  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  32956 ggcatgagccctcaacagtt 32975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 3)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 193 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 81974 - 81702
Alignment:
Q  193 gggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagttg 292  Q
    |||||| ||||| |||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  81974 gggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacggttgaatgacgagcattccagggcatgagccctcaacggttg 81875  T
Q  293 aatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactcaacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacagcaaca 392  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  81874 aatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatgaaaggactccacctgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacaaca 81775  T
Q  393 acataggcaacgacaacgatcgtgcataataactcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 465  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  81774 acataggtgacgacaacgatcgtgcataataactcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 81702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049; HSP #2
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 174 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 82071 - 81914
Alignment:
Q  174 tgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-ggttgaatgattaacattccagg 272  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||| |||    
T  82071 tgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatga-acattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaacattctagg 81973  T
Q  273 gcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtt 330  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  81972 gcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacggtt 81914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 173 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 81954 - 81837
Alignment:
Q  173 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattccag 271  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||   ||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  81954 ttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaac-ggttgaatgacgag-cattccagggcatgagccctcaacggttgaatgacaaagcattccag 81857  T
Q  272 ggcatgagccctcaacagtt 291  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  81856 ggcatgagccctcaacagtt 81837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 203; Significance: 1e-110; HSPs: 71)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 172 - 465
Target Start/End: Original strand, 16101992 - 16102288
Alignment:
Q  172 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt-gaatgattaa-cattcc 269  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||  || ||||||    
T  16101992 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaagcattcc 16102091  T
Q  270 agggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactcaacttgtgtatatcagcat 369  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16102092 agggcataagccctcaacagttgaatgacatagcattccagggcataagccctcaacagtttcctaatcatgaa-ggactcaacttgtgtatatcagcat 16102190  T
Q  370 acaactcaactacgacagcaacaacataggcaacgacaacgatcgtgcataataac--tcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 465  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16102191 acaactcaactacgacaacgacaacataggcaacgacaacgaccgtgcataataactatgactcactccccaacttgatcaacatcaacaacctatga 16102288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 161 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 15686594 - 15686289
Alignment:
Q  161 atttccatcgtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgat 260  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| |||||||||     
T  15686594 atttccaacgggttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagttgaatgac 15686495  T
Q  261 -taacattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactcaacttgtgt 359  Q
     || ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15686494 atagcattccagggcataagccctcaactgttgaatgacatagcattccagggcataagccctcaacggtttcctaatcatggaaggactcaacttgtgt 15686395  T
Q  360 atatcagcatacaactcaactacgacagcaacaacataggcaacgacaacgatcgtgcataataac---tcactcactccccaacttggtcaacatcaac 456  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15686394 atatcagcatacaactcaactacgacaacgacaacataggcaactacaacaactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacatcaac 15686295  T
Q  457 aaccta 462  Q
    ||||||    
T  15686294 aaccta 15686289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 172 - 465
Target Start/End: Original strand, 12595607 - 12595902
Alignment:
Q  172 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattcca 270  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| |||||||||  || ||||| |    
T  12595607 gttgaatgactaagcattctagggcataagtccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattcta 12595706  T
Q  271 gggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactcaacttgtgtatatcagcata 370  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12595707 gagcataagccctcaacagttgaatgacatagcattccagggcataagccctcaacagtttcctaatcatgaa-ggactcaacttgtgtatatcagcata 12595805  T
Q  371 caactcaactacgacagcaacaacataggcaacgacaacgatcgtgcataataac--tcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 465  Q
    || ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12595806 cacctcaactacgacaacgacaacataggcaacgacaacgaccgtgcataataactatgactcactccccaacttgatcaacatcaacaacctatga 12595902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 152 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 2288414 - 2288090
Alignment:
Q  152 ggtagcaccatttccatcgtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacgg 251  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| | |||||||  |    
T  2288414 ggtaacaccatttccatcgtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaagcattccagggcatgaaccctcaatag 2288315  T
Q  252 ttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggact 349  Q
    ||||||||  |  ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2288314 ttgaatgacaaggcattccagggcttgagccctcaacagtttgaatgacaaagcattccagggcataagccttcaacggtttcctaatcatgaaaggact 2288215  T
Q  350 caacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacagcaacaacatagg------caacgacaacgatcgtgcataataac---tcactcactccccaa 440  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||||      |||||| |||||  ||||||||||||   | ||| |||||||||    
T  2288214 caacttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaa 2288115  T
Q  441 cttggtcaacatcaacaacctatga 465  Q
    ||||||||||| |||||||||||||    
T  2288114 cttggtcaacaccaacaacctatga 2288090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 264 - 465
Target Start/End: Original strand, 16829541 - 16829743
Alignment:
Q  264 cattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactcaacttgtgtatat 363  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16829541 cattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatg-aaggactcaacttgtgtatat 16829639  T
Q  364 cagcatacaactcaactacgacagcaacaacataggcaacgacaacgatcgtgcataataac--tcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacct 461  Q
    || |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16829640 caacatacaactcaactacgacaacgacaacataggcaacaacaacgactgtgcacaataactatcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacct 16829739  T
Q  462 atga 465  Q
    ||||    
T  16829740 atga 16829743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 264 - 465
Target Start/End: Original strand, 16812521 - 16812723
Alignment:
Q  264 cattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactcaacttgtgtatat 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16812521 cattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacatagcattccagggcatgagccctcaatagtttcctaatcatgaaa-gactcaacttgtgtatat 16812619  T
Q  364 cagcatacaactcaactacgacagcaacaacataggcaacgacaacgatcgtgcataataac--tcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacct 461  Q
    || |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16812620 catcataaaactcaactacgacaacgacaacataggcaacgacaacgattgtgcacaataactatgactcactccccaacttggtcaacatcaacaacct 16812719  T
Q  462 atga 465  Q
    ||||    
T  16812720 atga 16812723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 264 - 465
Target Start/End: Original strand, 29492498 - 29492700
Alignment:
Q  264 cattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactcaacttgtgtatat 363  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29492498 cattccagggcatgagccctcaacggttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatg-aaggactcaacttgtgtatat 29492596  T
Q  364 cagcatacaactcaactacgacagcaacaacataggcaacgacaacgatcgtgcataataact--cactcactccccaacttggtcaacatcaacaacct 461  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||   ||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  29492597 cagcatacaactcaactacgacaacgacaacataggcaacgacaacgaccgtgcacaatgactacgactcactccccaacttggtcaacgtcaacaactt 29492696  T
Q  462 atga 465  Q
    ||||    
T  29492697 atga 29492700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 173 - 465
Target Start/End: Original strand, 15538912 - 15539216
Alignment:
Q  173 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt-gaatgattaa-cattcca 270  Q
    ||||||||| |||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||||||  | ||||   |||||||||| ||||  || |||||   |  |||||||    
T  15538912 ttgaatgacaaagcatcccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaagctttccggagcataagcccccaacaatttgaatggcaaggcattcca 15539011  T
Q  271 gggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactcaacttgtgtatatcagcat 369  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15539012 gggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactcaacttgtgtatatcaacat 15539111  T
Q  370 acaactcaactacgacagcaacaacatagg------caacgacaacgatcgtgcataataac---tcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacc 460  Q
    ||||| ||||||||||| | ||||||||||      ||||||||||||  ||||||||||||   ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15539112 acaacacaactacgacaacgacaacataggtaacaacaacgacaacgactgtgcataataacttatcacttactccccaacttcgtcaacatcaacaacc 15539211  T
Q  461 tatga 465  Q
    |||||    
T  15539212 tatga 15539216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 264 - 465
Target Start/End: Original strand, 8522652 - 8522861
Alignment:
Q  264 cattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactcaacttgtgtatat 363  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  8522652 cattccagggcataagccctcaacagttgaatgacga-gcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactcgactcgtgtatat 8522750  T
Q  364 cagcatacaactcaactacgacagcaacaacatagg------caacgacaacgatcgtgcataataac---tcactcactccccaacttggtcaacatca 454  Q
    || |||||||||||||||||||| | ||||||||||      ||||||||||||  ||||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||||    
T  8522751 caacatacaactcaactacgacaacgacaacataggcaacaacaacgacaacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacatca 8522850  T
Q  455 acaacctatga 465  Q
    |||||||||||    
T  8522851 acaacctatga 8522861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 156 - 326
Target Start/End: Original strand, 13763942 - 13764112
Alignment:
Q  156 gcaccatttccatcgtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttga 255  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||  ||||    
T  13763942 gcaccattttcaacgtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgataa-acattccagggcataagccctcaacaattga 13764040  T
Q  256 atgattaacattccagggcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 326  Q
    ||||| || |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||    
T  13764041 atgataaaaattccacggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaagcataccagggcataagccatcaac 13764112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 173 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 23621394 - 23621241
Alignment:
Q  173 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattccag 271  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||    
T  23621394 ttgaatgactaagcattccagggcataagccctcaacaatttgaatgacaaggcattacagggcataagccctcaacagttgaatgacaaagcattccag 23621295  T
Q  272 ggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaa 325  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23621294 ggcatgaaccctcaacagttgaatgtcaaagcattccagggcatgagccctcaa 23621241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 152 - 326
Target Start/End: Original strand, 15538811 - 15538988
Alignment:
Q  152 ggtagcaccatttccatcgtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-g 250  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| |    
T  15538811 ggtaacaccatttccatcgtgttgaatgactaagcattccagggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacag 15538910  T
Q  251 gttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaac-agttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 326  Q
     ||||||||  || ||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| | |||| ||||| ||||    
T  15538911 tttgaatgacaaagcatcccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaagctttccggagcataagcccccaac 15538988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 186 - 326
Target Start/End: Original strand, 8522533 - 8522675
Alignment:
Q  186 cattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagaca-ttccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagggcatgagccctc 284  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||  |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8522533 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcaattccagggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagggcatgagccctc 8522632  T
Q  285 aac-agttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 326  Q
    ||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  8522633 aacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaac 8522675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 174 - 291
Target Start/End: Original strand, 29492446 - 29492564
Alignment:
Q  174 tgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattccagg 272  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  29492446 tgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacgaggcattccagggcatgagccctcaacggttgaatgacaaagcattccagg 29492545  T
Q  273 gcatgagccctcaacagtt 291  Q
    |||||||||||||||||||    
T  29492546 gcatgagccctcaacagtt 29492564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 172 - 291
Target Start/End: Original strand, 16829487 - 16829607
Alignment:
Q  172 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattcca 270  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| |||||||||  || |||||||    
T  16829487 gttgaatgactaagcaatccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattcca 16829586  T
Q  271 gggcatgagccctcaacagtt 291  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  16829587 gggcatgagccctcaacagtt 16829607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 172 - 291
Target Start/End: Original strand, 16812467 - 16812587
Alignment:
Q  172 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatga-ttaacattcca 270  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| |||||||||  || |||||||    
T  16812467 gttgaatgactaagcaatccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacatagcattcca 16812566  T
Q  271 gggcatgagccctcaacagtt 291  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  16812567 gggcatgagccctcaatagtt 16812587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 172 - 326
Target Start/End: Original strand, 13764270 - 13764424
Alignment:
Q  172 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccag 271  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||    
T  13764270 gttgaatga-taaacattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaagcattccagggcataagccatcaacaattgaatgataaacattccag 13764368  T
Q  272 ggcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 326  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||    
T  13764369 ggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaatcattctagggcataagccctcaac 13764424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 156 - 284
Target Start/End: Original strand, 23352115 - 23352243
Alignment:
Q  156 gcaccatttccatcgtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttga 255  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||| |||||    
T  23352115 gcaccattttcaacgtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgataa-acattccagggcatgagccctcaacagttga 23352213  T
Q  256 atgattaa-cattccagggcatgagccctc 284  Q
    ||||  || ||||||| |||||||||||||    
T  23352214 atgacaaagcattccaaggcatgagccctc 23352243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 212 - 326
Target Start/End: Original strand, 13764231 - 13764346
Alignment:
Q  212 tttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccag 310  Q
    |||||| ||| || ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13764231 tttgaacgaccaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgataaacattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaagcattccag 13764330  T
Q  311 ggcatgagccctcaac 326  Q
    ||||| |||| |||||    
T  13764331 ggcataagccatcaac 13764346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 173 - 287
Target Start/End: Original strand, 24440865 - 24440978
Alignment:
Q  173 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt-gaatgattaacattccag 271  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  24440865 ttgaatgactacgcattccggggcataagcccc-aacaatttcaatgataa-acattccaaggcatgagccctcaacagtttgaatgattaacattccag 24440962  T
Q  272 ggcatgagccctcaac 287  Q
    ||||||||||||||||    
T  24440963 ggcatgagccctcaac 24440978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 173 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 23621354 - 23621201
Alignment:
Q  173 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattccag 271  Q
    ||||||||| | ||||| | |||||||||||| ||||| || |||||||||  ||||||| ||||| | |||||||| ||||||||   || ||||||||    
T  23621354 ttgaatgacaaggcattacagggcataagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcatgaaccctcaacagttgaatgtcaaagcattccag 23621256  T
Q  272 ggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 326  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23621255 ggcatgagccctcaatagttgaatgaaaaagcattccagggcatgagccctcaac 23621201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 173 - 326
Target Start/End: Original strand, 8522481 - 8522635
Alignment:
Q  173 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-ggttgaatgatta--acattcc 269  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||  |    |||||    
T  8522481 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatga-acattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcaattcc 8522579  T
Q  270 agggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 326  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||    
T  8522580 agggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaac 8522635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 194 - 326
Target Start/End: Original strand, 13764057 - 13764190
Alignment:
Q  194 ggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacag-ttg 292  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||  ||| ||| |||||||||| |||||  ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  13764057 ggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaagcataccagggcataagccatcaacaattgaatgataaacaatccagggcatgagccctcaacagtttg 13764156  T
Q  293 aatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 326  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  13764157 aatgacaaatcattccagggcataagccctcaac 13764190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 172 - 287
Target Start/End: Original strand, 8522599 - 8522713
Alignment:
Q  172 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccag 271  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||  | ||||||||    
T  8522599 gttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacgagcattccag 8522697  T
Q  272 ggcatgagccctcaac 287  Q
    ||||||||||||||||    
T  8522698 ggcatgagccctcaac 8522713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 252 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 29848573 - 29848446
Alignment:
Q  252 ttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatg-aaaggactc 350  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  | |  ||| || ||||||    
T  29848573 ttgaatgataaacattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaagcattcaagggcataagccctcaacggttttatgagtatgcaatggactc 29848474  T
Q  351 aac-ttgtgtatatcagcatacaactca 377  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  29848473 aactttgtgtatatcaacatacaactca 29848446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 156 - 285
Target Start/End: Original strand, 221618 - 221747
Alignment:
Q  156 gcaccatttccatcgtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttga 255  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||| |||||  ||||    
T  221618 gcaccattttcaacgtgttgaatgactaagcattctggggcataagcccccaacaatttgaatgataa-acattccagggcataagccatcaacaattga 221716  T
Q  256 atgattaa-cattccagggcatgagccctca 285  Q
     |||  || ||||||||||||||| ||||||    
T  221717 gtgacgaagcattccagggcatgatccctca 221747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 172 - 275
Target Start/End: Original strand, 16804648 - 16804752
Alignment:
Q  172 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatga-ttaacattcca 270  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| |||||||||  || |||||||    
T  16804648 gttgaatgactaagcaatccggggcataagaccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacatagcattcca 16804747  T
Q  271 gggca 275  Q
    |||||    
T  16804748 gggca 16804752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 173 - 331
Target Start/End: Original strand, 13764349 - 13764507
Alignment:
Q  173 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagg 272  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||||  ||||| | ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||     
T  13764349 ttgaatga-taaacattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaatcattctagggcataagccctcaacaattgaatgataaacattccaga 13764447  T
Q  273 gcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggttt 331  Q
    | ||||||||||| ||| || |||||| | ||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  13764448 gaatgagccctcagcagtttaaatgaccaggcattacagggcataagccctcaacggttt 13764507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 252 - 323
Target Start/End: Original strand, 23352172 - 23352243
Alignment:
Q  252 ttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctc 323  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23352172 ttgaatgataaacattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccaaggcatgagccctc 23352243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 193 - 326
Target Start/End: Original strand, 13764134 - 13764268
Alignment:
Q  193 gggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacag-tt 291  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||||||||||  ||| ||    
T  13764134 gggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaatcattccagggcataagccctcaacaattgaatgataaacattccagagcatgagccctcggcagttt 13764233  T
Q  292 gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 326  Q
    ||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||    
T  13764234 gaacgaccaggcattccagggcataagccctcaac 13764268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 171 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 29848615 - 29848499
Alignment:
Q  171 tgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattcc 269  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||| |||||||||  || |||||     
T  29848615 tgttgaatgactaagcatttcgaggcataagccctcaaaaatttgaatgataa-acattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaagcattca 29848517  T
Q  270 agggcatgagccctcaac 287  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  29848516 agggcataagccctcaac 29848499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 156 - 331
Target Start/End: Original strand, 24266659 - 24266823
Alignment:
Q  156 gcaccatttccatcgtgttgaatgact-aagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttg 254  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||| | ||||||||    
T  24266659 gcaccattttcaacgtgttgaatgacttaagcattatggggcataagcccccaacaatttgaatgataa-acattccagggcatgagccgttaacggttg 24266757  T
Q  255 aatga-ttaacattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggttt 331  Q
    |||||   ||||||||||| ||             ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24266758 aatgacaaaacattccaggaca------------ggttgaatgataaagcattccagggcatgagccctcaacggttt 24266823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 252 - 330
Target Start/End: Original strand, 8522521 - 8522601
Alignment:
Q  252 ttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagc-attccagggcatgagccctcaacggtt 330  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||    
T  8522521 ttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcaattccagggcataagccctcaacggtt 8522601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 185 - 331
Target Start/End: Original strand, 13764244 - 13764389
Alignment:
Q  185 gcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-ggttgaatgattaa-cattccagggcatgagccc 282  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| | |||||||| || |||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||  || ||||||||||||| ||||     
T  13764244 gcattccagggcataagccctcaac-agttgaatgataa-acattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaagcattccagggcataagcca 13764341  T
Q  283 tcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggttt 331  Q
    |||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13764342 tcaacaattgaatgataaa-cattccagggcatgagccctcaacagttt 13764389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 212 - 324
Target Start/End: Original strand, 29265486 - 29265602
Alignment:
Q  212 tttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacg-gttgaatgattaa--cattc-cagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattc 307  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||  ||||| |||||||| |||||||| || ||||| ||||| || |||    
T  29265486 tttgaatgacaaggcattccaaggcataagccctcaccgatttgaatggttaaagcattcacagggcataagccctcaccaattgaacgacaaggcgttc 29265585  T
Q  308 cagggcatgagccctca 324  Q
    |||||||||||||||||    
T  29265586 cagggcatgagccctca 29265602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 264 - 314
Target Start/End: Original strand, 16804702 - 16804752
Alignment:
Q  264 cattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggca 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16804702 cattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacatagcattccagggca 16804752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 234 - 324
Target Start/End: Original strand, 21469789 - 21469879
Alignment:
Q  234 ggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctca 324  Q
    ||||| |||||||| |  |||||||| || |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  21469789 ggcatgagccctcaccaattgaatgactagcattccagggcatgagccctcaccaattgaacgacaaggcgttccagggcatgagccctca 21469879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 255 - 331
Target Start/End: Original strand, 24440907 - 24440983
Alignment:
Q  255 aatgattaacattccagggcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggttt 331  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24440907 aatgataaacattccaaggcatgagccctcaacagtttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacggttt 24440983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 252 - 324
Target Start/End: Original strand, 221675 - 221747
Alignment:
Q  252 ttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctca 324  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||| |||| |||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  221675 ttgaatgataaacattccagggcataagccatcaacaattgagtgacgaagcattccagggcatgatccctca 221747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 234 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 9186032 - 9185881
Alignment:
Q  234 ggcataagccctcaacggtt-gaatgat-taacattc-cagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtt 330  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||  || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||  |||    
T  9186032 ggcatgagccctcaacggtttgaatgaactagcattcacagggcataagccctcaacaattgaacgacaaggcgttccagggcatgagccctcaatagtt 9185933  T
Q  331 tcctaatcatg-aaaggactcaacttgtgtatatcagcatacaactcaactac 382  Q
    |  | || ||| || | |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9185932 t-atgattatgcaatgaactccacttgtgtatatcaacatacaactcaactac 9185881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 173 - 331
Target Start/End: Original strand, 13763999 - 13764155
Alignment:
Q  173 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt-gaatgattaa-cattcca 270  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||||||||| |||||||| |||||| || | |||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||  || ||| |||    
T  13763999 ttgaatga-taaacattccagggcataagccctcaacaatt-gaatgataaaa-attccacggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaagcatacca 13764095  T
Q  271 gggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggttt 331  Q
    |||||| |||| |||||| |||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| ||||    
T  13764096 gggcataagccatcaacaattgaatgataaa-caatccagggcatgagccctcaacagttt 13764155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 251 - 331
Target Start/End: Original strand, 15538831 - 15538913
Alignment:
Q  251 gttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggttt 331  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15538831 gttgaatgactaagcattccagggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagttt 15538913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 172 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 23621316 - 23621200
Alignment:
Q  172 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattcca 270  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| | ||| ||||| || ||||| |||  ||||||| ||||| |||||||||  |||||||||  || |||||||    
T  23621316 gttgaatgacaaagcattccagggcatgaaccctcaacagtt-gaatgtcaaagcattccagggcatgagccctcaatagttgaatgaaaaagcattcca 23621218  T
Q  271 gggcatgagccctcaaca 288  Q
    ||||||||||||||||||    
T  23621217 gggcatgagccctcaaca 23621200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 324
Target Start/End: Original strand, 25772710 - 25772770
Alignment:
Q  264 cattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctca 324  Q
    |||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25772710 cattccagggaatgagccctcaccaattgaacgacaaagcgttccagggcatgagccctca 25772770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 291
Target Start/End: Original strand, 1584259 - 1584361
Alignment:
Q  193 gggcataagcccccaacaatttgaatga-caagacattc-caaggcataagccctcaacggtt-gaatgattaa-cattc-cagggcatgagccctcaac 287  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||| || |||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  1584259 gggcataagccctcaacaatttgaatgaactag-cattcacagggcataagccctcaacagtttgaatgattaagcattcacagggcatgagccctcaac 1584357  T
Q  288 agtt 291  Q
    ||||    
T  1584358 agtt 1584361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 269 - 396
Target Start/End: Original strand, 1584298 - 1584428
Alignment:
Q  269 cagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattc-cagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatg-aaaggactcaac-ttgtgtatatc 364  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| ||||  | | |||| || ||||||||| |||||||||||    
T  1584298 cagggcataagccctcaacagtttgaatgattaagcattcacagggcatgagccctcaacagttt-atgagcatgcaatggactcaactttgtgtatatc 1584396  T
Q  365 agcatacaactcaactacgacagcaacaacat 396  Q
    | ||||||||||| |||| ||| | |||||||    
T  1584397 aacatacaactcatctacaacatctacaacat 1584428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 193 - 326
Target Start/End: Original strand, 1639059 - 1639198
Alignment:
Q  193 gggcataagcccccaacaatttgaatga-caagacattc-caaggcataagccctcaacggtt-gaatgattaa-cattc-cagggcatgagccctcaac 287  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||| || ||||| |||||||||  ||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||     
T  1639059 gggcataagccctcaacaatttgaatgaactag-cattcacagggcatgagccctcaatagtttgaatgattaagcattcacagggcatgagccctcaat 1639157  T
Q  288 ag-ttgaatgacaaagcattc-cagggcatgagccctcaac 326  Q
    || ||||||||||| |||||| |||||||| | ||||||||    
T  1639158 agtttgaatgacaaggcattcacagggcataaaccctcaac 1639198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 234 - 320
Target Start/End: Original strand, 22346655 - 22346743
Alignment:
Q  234 ggcataagccctcaacggttgaatgat-taacattc-cagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagcc 320  Q
    |||||||||||||| |  ||||||||  || ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  22346655 ggcataagccctcaccaattgaatgaactagcattcacagggcatgagccctcaccaattgaatgacaaggcgttccagggcatgagcc 22346743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 252 - 331
Target Start/End: Original strand, 12389483 - 12389566
Alignment:
Q  252 ttgaatgattaa-cattc-cagggcatgagccctcaacagt-tgaatgacaaagcattc-cagggcatgagccctcaacggttt 331  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  12389483 ttgaatgattaagcattcacagggcatgagccctcaacagtctgaatgaactagcattcacagggcatgagccctcaacagttt 12389566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 269 - 326
Target Start/End: Original strand, 12389543 - 12389602
Alignment:
Q  269 cagggcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattc-cagggcatgagccctcaac 326  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||    
T  12389543 cagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattcacagggcataagccctcaac 12389602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 173 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 13751411 - 13751328
Alignment:
Q  173 ttgaatgactaagcattc-cggggcataagcccccaacaattt-gaatgacaagacattc-caaggcataagccctcaacggtt 253  Q
    |||||| | ||||||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  13751411 ttgaataattaagcattcacagggcataagccctcaacaattttgaatgacaaggcattcacagggcataagccctcaacggtt 13751328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 269 - 324
Target Start/End: Original strand, 21469786 - 21469840
Alignment:
Q  269 cagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctca 324  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  21469786 cagggcatgagccctcaccaattgaatgac-tagcattccagggcatgagccctca 21469840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 264 - 330
Target Start/End: Original strand, 29492458 - 29492525
Alignment:
Q  264 cattccagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtt 330  Q
    |||||| |||||| ||||| ||||| || ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29492458 cattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacgaggcattccagggcatgagccctcaacggtt 29492525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 250 - 326
Target Start/End: Original strand, 16812466 - 16812544
Alignment:
Q  250 ggttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 326  Q
    |||||||||| ||| || ||| |||||| ||||| ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16812466 ggttgaatgactaagcaatccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaac 16812544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 250 - 326
Target Start/End: Original strand, 16829486 - 16829564
Alignment:
Q  250 ggttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 326  Q
    |||||||||| ||| || ||| |||||| ||||| ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16829486 ggttgaatgactaagcaatccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaac 16829564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 237 - 331
Target Start/End: Original strand, 17526253 - 17526351
Alignment:
Q  237 ataagccctcaacggttgaatgat-taacattc-cagggcatgagccctcaacagttg-aatgacaaagcattcc-agggcatgagccctcaacggttt 331  Q
    |||||||||||||  ||||||||  || ||||| |||||||||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17526253 ataagccctcaacaattgaatgaactagcattcacagggcatgagcccacaatagttggaatgattaagcattcccagggcatgagccctcaacggttt 17526351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 212 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 9186096 - 9185976
Alignment:
Q  212 tttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-ggttgaatgattaa--cattc-cagggcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcatt 306  Q
    |||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||| | ||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||   ||||||    
T  9186096 tttgaatgacaaggaatttcaaggcatgagccctcaacagtttgaatggttaaagcattcacagggcatgagccctcaacggtttgaatgaactagcatt 9185997  T
Q  307 c-cagggcatgagccctcaac 326  Q
    | |||||||| ||||||||||    
T  9185996 cacagggcataagccctcaac 9185976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 193 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 13751472 - 13751278
Alignment:
Q  193 gggcataagcccccaacaatttgaatga-caagacattc-caaggcataagccctcaacggtt-gaatgattaa-cattc-cagggcatgagccctcaac 287  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||| || ||||| ||||||||||  || |||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  13751472 gggcataagccctcaacaatttgaatgaactagt-attcacagggcatgagccctcaacaatttgaataattaagcattcacagggcataagccctcaac 13751374  T
Q  288 agtt--gaatgacaaagcattc-cagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatg-aaaggactcaact-tgtgtatatcagcatacaactcaac 379  Q
    | ||  ||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||  | |  ||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  13751373 aattttgaatgacaaggcattcacagggcataagccctcaacggttt-ttgagtatgcaatggactcaactctgtgtatatcaacatacaactcaac 13751278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 173 - 253
Target Start/End: Original strand, 8522639 - 8522717
Alignment:
Q  173 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt 253  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||| || ||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  8522639 ttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtt-gaatgacgag-cattccagggcatgagccctcaacggtt 8522717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 290 - 326
Target Start/End: Original strand, 16804689 - 16804725
Alignment:
Q  290 ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 326  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16804689 ttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaac 16804725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 264 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 17027269 - 17027209
Alignment:
Q  264 cattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctca 324  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| || |||  |||||||||||||||    
T  17027269 cattccagggcatgagccctcaccaattgaacgacaaggcgttcttgggcatgagccctca 17027209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 290 - 322
Target Start/End: Original strand, 21469726 - 21469758
Alignment:
Q  290 ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccct 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21469726 ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccct 21469758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 193 - 326
Target Start/End: Original strand, 25806861 - 25807000
Alignment:
Q  193 gggcataagcccccaacaatttgaatg-acaagacattc-caaggcataagccctcaacggtt-gaatgattaa-cattc-cagggcatgagccctcaac 287  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||||||||  || |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||     
T  25806861 gggcataagccttcaacaatttgaatggactag-cattcacagggcatgagccctcaacaatttgaatgattaagcattcacagggcatgagccctcaat 25806959  T
Q  288 ag-ttgaatgacaaagcattc-cagggcatgagccctcaac 326  Q
    || ||||| ||||| |||||| |||||||| ||||||||||    
T  25806960 agtttgaacgacaaggcattcacagggcataagccctcaac 25807000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 173 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 29848573 - 29848495
Alignment:
Q  173 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt 253  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||||||||| ||||| || |||||||||  ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  29848573 ttgaatga-taaacattccagggcataagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattcaagggcataagccctcaacggtt 29848495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 193 - 288
Target Start/End: Original strand, 12389545 - 12389644
Alignment:
Q  193 gggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattc-caaggcataagccctcaac-ggttgaatg-attaacattc-cagggcatgagccctcaaca 288  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||   ||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  12389545 gggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattcacagggcataagccctcaacactttgaatgaactagcattcacagggcatgagccctcaaca 12389644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 354 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 1590581 - 1590539
Alignment:
Q  354 ttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacagcaacaacat 396  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||    
T  1590581 ttgtgtatatcaacatacaactcaactacgacaacgacaacat 1590539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 272 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 9186074 - 9186012
Alignment:
Q  272 ggcatgagccctcaacagtt-gaatgac-aaagcattc-cagggcatgagccctcaacggttt 331  Q
    |||||||||||||||||||| |||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9186074 ggcatgagccctcaacagtttgaatggttaaagcattcacagggcatgagccctcaacggttt 9186012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 290 - 324
Target Start/End: Original strand, 18137480 - 18137514
Alignment:
Q  290 ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctca 324  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18137480 ttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctca 18137514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 323
Target Start/End: Original strand, 21476266 - 21476299
Alignment:
Q  290 ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctc 323  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21476266 ttgaatgacaaagcattccatggcatgagccctc 21476299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 251 - 326
Target Start/End: Original strand, 23352131 - 23352207
Alignment:
Q  251 gttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 326  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||||| ||||| ||||| || |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23352131 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgataaa-cattccagggcatgagccctcaac 23352207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 290 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 23621394 - 23621358
Alignment:
Q  290 ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 326  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  23621394 ttgaatgactaagcattccagggcataagccctcaac 23621358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 67)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 186 - 465
Target Start/End: Original strand, 43120842 - 43121120
Alignment:
Q  186 cattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagggcatgagccctca 285  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||  ||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  43120842 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgatta-acattccagggcataagccctcaacggttgaatgacgagcattccagggcatgagccctca 43120940  T
Q  286 acagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactcaacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgac 385  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43120941 acggttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagttccctaatcatgaaaggactccacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgac 43121040  T
Q  386 agcaacaacataggcaacgacaacgatcgtgcataataactcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 465  Q
    | ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43121041 aacaacaacataggtgacgacaacgatcgtgcataataactcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 43121120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 186 - 465
Target Start/End: Original strand, 43124375 - 43124653
Alignment:
Q  186 cattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagggcatgagccctca 285  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||  ||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  43124375 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgatta-acattccagggcataagccctcaacggttgaatgacgagcattccagggcatgagccctca 43124473  T
Q  286 acagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactcaacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgac 385  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43124474 acggttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagttccctaatcatgaaaggactccacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgac 43124573  T
Q  386 agcaacaacataggcaacgacaacgatcgtgcataataactcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 465  Q
    | ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43124574 aacaacaacataggtgacgacaacgatcgtgcataataactcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 43124653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 172 - 465
Target Start/End: Original strand, 23693108 - 23693403
Alignment:
Q  172 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattcca 270  Q
    |||||||||| | ||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||    
T  23693108 gttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacaatt-gaatgacgaggcattccagggcatgagccctcaacggttgaatgacgaagcattcca 23693206  T
Q  271 gggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactcaacttgtgtatatcagcata 370  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23693207 gggcatgagccctcaacggttgaatgacgaggcattccagggcaagagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactcaacttgtgtatatcaggata 23693306  T
Q  371 caactcaactacgacagcaacaacataggcaacgacaacgatcgtgcataataac--tcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 465  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23693307 caactcaactacgacagcgacaatataggcaacgacaacgaccgtgcataataactatgactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 23693403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 172 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 16256402 - 16256108
Alignment:
Q  172 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattcca 270  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |  |||||||    
T  16256402 gttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacggttgaatgacaaggcattcca 16256303  T
Q  271 gggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactcaacttgtgtatatcagcata 370  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16256302 gggcatgagccctcaacggttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacgatttcctaatcatgaa-ggactcaacttgtgtatatcagcata 16256205  T
Q  371 caactcaactacgacagcaacaacataggcaacgacaacgatcgtgcataataac--tcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 465  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||    
T  16256204 caactcaactacgacaacgacaacataggcaacgacaacgaccgtgcataataactatgactcactccccaactcgatcaacatcaaccacctatga 16256108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 172 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 26361553 - 26361256
Alignment:
Q  172 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt-gaatgat-taacattcc 269  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||  || |||| |    
T  26361553 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttcaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacgatttgaatgacatagcatttc 26361454  T
Q  270 agggcatgagccctcaac-agttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactcaacttgtgtatatcagca 368  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26361453 agggcatgagccctcaacgatttgaatgacatagcattccagggcatgagccctccaccgtgccctaatcatgaa-ggactcaacttgtgtatatcagca 26361355  T
Q  369 tacaactcaactacgacagcaacaacataggcaacgacaacgatcgtgcataataac--tcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 465  Q
    ||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26361354 tacaactcaactacggcaacgacaacataggcaacgacaacgaccgtgcacaataactataactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 26361256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 186 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 16260021 - 16259741
Alignment:
Q  186 cattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt-gaatgattaa-cattccagggcatgagccct 283  Q
    |||||| |||||||||||| ||||  || |||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||  || ||||||  |  ||||||||||||||||||||    
T  16260021 cattccagggcataagccctcaacggtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccct 16259923  T
Q  284 caacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactcaacttgtgtatatcagcatacaactcaactacg 383  Q
    |||| |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16259922 caacggttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaa-ggactcaacttgtgtatatcagcatacaactcaactacg 16259825  T
Q  384 acagcaacaacataggcaacgacaacgatcgtgcataataac--tcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 465  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||    
T  16259824 acaacgacaacataggcaacgacaacgaccgtgcataataactatgactcactccccaactcgatcaacatcaaccacctatga 16259741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 186 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 22593740 - 22593460
Alignment:
Q  186 cattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt-gaatgattaa-cattccagggcatgagccct 283  Q
    |||||| |||||||||||| ||||  || |||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||  || ||||||  |  ||||||||||||||||||||    
T  22593740 cattccagggcataagcccacaacggtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccct 22593642  T
Q  284 caacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactcaacttgtgtatatcagcatacaactcaactacg 383  Q
    |||| |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22593641 caacggttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaa-ggactcaacttgtgtatatcagcatacaactcaactacg 22593544  T
Q  384 acagcaacaacataggcaacgacaacgatcgtgcataataac--tcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 465  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||    
T  22593543 acaacgacaacataggcaacgacaacgaccgtgcataataactatgactcactccccaactcgatcaacatcaaccacctatga 22593460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 186 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 22597295 - 22597015
Alignment:
Q  186 cattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt-gaatgattaa-cattccagggcatgagccct 283  Q
    |||||| |||||||||||| ||||  || |||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||  || ||||||  |  ||||||||||||||||||||    
T  22597295 cattccagggcataagcccacaacggtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccct 22597197  T
Q  284 caacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactcaacttgtgtatatcagcatacaactcaactacg 383  Q
    |||| |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22597196 caacggttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaa-ggactcaacttgtgtatatcagcatacaactcaactacg 22597099  T
Q  384 acagcaacaacataggcaacgacaacgatcgtgcataataac--tcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 465  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||    
T  22597098 acaacgacaacataggcaacgacaacgaccgtgcataataactatgactcactccccaactcgatcaacatcaaccacctatga 22597015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 213 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 22590159 - 22589905
Alignment:
Q  213 ttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt-gaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccag 310  Q
    |||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||  || ||||||  |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||    
T  22590159 ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacggttgaatgattaa-cattccag 22590061  T
Q  311 ggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactcaacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacagcaacaacataggcaacgacaacg 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  22590060 ggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaa-ggactcaacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacgacaacataggcaacgacaacg 22589962  T
Q  411 atcgtgcataataac--tcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 465  Q
    | |||||||||||||  | ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||    
T  22589961 accgtgcataataactatgactcactccccaactcgatcaacatcaaccacctatga 22589905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 161 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 22759246 - 22759080
Alignment:
Q  161 atttccatcgtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgat 260  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  22759246 atttccaacatgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacggttgaatgat 22759147  T
Q  261 taacattccagggcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22759146 taacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaac 22759080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 290 - 465
Target Start/End: Original strand, 4397478 - 4397654
Alignment:
Q  290 ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactcaacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacagca 389  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  4397478 ttgaatgacaaggcatttcagggcatgagccctcaacagtttcctaatcatgaa-ggactcaacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacg 4397576  T
Q  390 acaacataggcaacgacaacgatcgtgcataataac--tcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 465  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4397577 acaacataggcaacgacaacgaccgtgcacaataactatgactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 4397654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 264 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 29325621 - 29325412
Alignment:
Q  264 cattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactcaacttgtgtatat 363  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29325621 cattccagggcataagccctcaacagttgaatgacga-gcattccagggcatgagccctcagcggtttcctaatcatgaaaggactcgacttgtgtatat 29325523  T
Q  364 cagcatacaactcaactacgacagcaacaacatagg------caacgacaacgatcgtgcataataac---tcactcactccccaacttggtcaacatca 454  Q
    || |||||||||||||||||||| | ||||||||||      ||||||||||||  ||||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||||    
T  29325522 caacatacaactcaactacgacaacgacaacataggcaacaacaacgacaacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacatca 29325423  T
Q  455 acaacctatga 465  Q
    |||||||||||    
T  29325422 acaacctatga 29325412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 264 - 465
Target Start/End: Original strand, 26495606 - 26495815
Alignment:
Q  264 cattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactcaacttgtgtatat 363  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  26495606 cattccagggcataagccctcaacagttgaatgacga-gcattccagggcatgagccctcaacgatttcctaatcatgaaaggactcgactcgtgtatat 26495704  T
Q  364 cagcatacaactcaactacgacagcaacaacatagg------caacgacaacgatcgtgcataataac---tcactcactccccaacttggtcaacatca 454  Q
    || |||||||||||||||||||| | ||||||||||      ||||||||||||  ||||||||||||   | ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  26495705 caacatacaactcaactacgacaacgacaacataggcaacaacaacgacaacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcatcatca 26495804  T
Q  455 acaacctatga 465  Q
    |||||||||||    
T  26495805 acaacctatga 26495815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 169 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 16256483 - 16256321
Alignment:
Q  169 cgtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-catt 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || ||||    
T  16256483 cgtgttgaatgactaagcattccggagcataagcccccaacaatttgaatgatga-acattccagggcataagccctcaacggttgaatgacaaagcatt 16256385  T
Q  268 ccagggcatgagccctcaac-agttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtt 330  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16256384 ccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacggtt 16256321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 169 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 16260077 - 16259915
Alignment:
Q  169 cgtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-catt 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || ||||    
T  16260077 cgtgttgaatgactaagcattccggagcataagcccccaacaatttgaatgatga-acattccagggcataagccctcaacggttgaatgacaaagcatt 16259979  T
Q  268 ccagggcatgagccctcaac-agttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtt 330  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16259978 ccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacggtt 16259915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 170 - 331
Target Start/End: Original strand, 22469774 - 22469936
Alignment:
Q  170 gtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattc 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||| |||||||||  || |||||    
T  22469774 gtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgataa-acatttcagggcataagccctcaacagttgaatgacaaagcattc 22469872  T
Q  269 cagggcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggttt 331  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||    
T  22469873 cagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggctttccagggcatgagccctcaacagttt 22469936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 169 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 22593796 - 22593634
Alignment:
Q  169 cgtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-catt 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  || ||||    
T  22593796 cgtgttgaatgactaagcattccggagcataagcccccaacaatttgaatgatga-acattccagggcataagcccacaacggttgaatgacaaagcatt 22593698  T
Q  268 ccagggcatgagccctcaac-agttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtt 330  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22593697 ccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacggtt 22593634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 169 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 22597351 - 22597189
Alignment:
Q  169 cgtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-catt 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  || ||||    
T  22597351 cgtgttgaatgactaagcattccggagcataagcccccaacaatttgaatgatga-acattccagggcataagcccacaacggttgaatgacaaagcatt 22597253  T
Q  268 ccagggcatgagccctcaac-agttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtt 330  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22597252 ccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacggtt 22597189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 173 - 330
Target Start/End: Original strand, 43120790 - 43120946
Alignment:
Q  173 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-ggttgaatgattaacattccag 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  43120790 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatga-acattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaacattccag 43120888  T
Q  272 ggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtt 330  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43120889 ggcataagccctcaacggttgaatgac-gagcattccagggcatgagccctcaacggtt 43120946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 173 - 330
Target Start/End: Original strand, 43124323 - 43124479
Alignment:
Q  173 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-ggttgaatgattaacattccag 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  43124323 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatga-acattccagggcatgagccctcaacagattgaatgattaacattccag 43124421  T
Q  272 ggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtt 330  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43124422 ggcataagccctcaacggttgaatgac-gagcattccagggcatgagccctcaacggtt 43124479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 169 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 22590241 - 22590079
Alignment:
Q  169 cgtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-catt 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | |||||| | ||||||||||| ||||||||||||||  || ||||    
T  22590241 cgtgttgaatgactaagcattccggagcataagcccccaacaatttgaatgatga-acattctagggcataagcccacaacggttgaatgacaaagcatt 22590143  T
Q  268 ccagggcatgagccctcaac-agttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtt 330  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22590142 ccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacggtt 22590079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 186 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 29325740 - 29325598
Alignment:
Q  186 cattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagaca-ttccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagggcatgagccctc 284  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||  |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29325740 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcaattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagggcatgagccctc 29325641  T
Q  285 aac-agttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 326  Q
    ||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  29325640 aacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaac 29325598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 172 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 16259996 - 16259881
Alignment:
Q  172 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccag 271  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16259996 gttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacggttgaatgattaacattccag 16259897  T
Q  272 ggcatgagccctcaac 287  Q
    ||||||||||||||||    
T  16259896 ggcatgagccctcaac 16259881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 172 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 22590160 - 22590045
Alignment:
Q  172 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccag 271  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22590160 gttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacggttgaatgattaacattccag 22590061  T
Q  272 ggcatgagccctcaac 287  Q
    ||||||||||||||||    
T  22590060 ggcatgagccctcaac 22590045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 172 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 22593715 - 22593600
Alignment:
Q  172 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccag 271  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22593715 gttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacggttgaatgattaacattccag 22593616  T
Q  272 ggcatgagccctcaac 287  Q
    ||||||||||||||||    
T  22593615 ggcatgagccctcaac 22593600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 172 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 22597270 - 22597155
Alignment:
Q  172 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccag 271  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22597270 gttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacggttgaatgattaacattccag 22597171  T
Q  272 ggcatgagccctcaac 287  Q
    ||||||||||||||||    
T  22597170 ggcatgagccctcaac 22597155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 173 - 330
Target Start/End: Original strand, 23671480 - 23671637
Alignment:
Q  173 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattccag 271  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| ||||| ||||| || |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||  |  ||||||||    
T  23671480 ttgaatggctaagcattccagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacgattgaatgacgaggcattccag 23671578  T
Q  272 ggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtt 330  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23671579 ggcatgagccctcaacggttgaatgacgaagcattccagggcatgagccctcaacggtt 23671637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 186 - 326
Target Start/End: Original strand, 26495487 - 26495629
Alignment:
Q  186 cattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagaca-ttccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagggcatgagccctc 284  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||  |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26495487 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcaattccagggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagggcatgagccctc 26495586  T
Q  285 aac-agttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 326  Q
    ||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  26495587 aacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaac 26495629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 187 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 22358051 - 22357860
Alignment:
Q  187 attccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt-gaatgattaacattccagggcatgagccctca 285  Q
    ||||| |||||| ||||| ||||| || |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||  || ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22358051 attccagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacaatttgaatgataaacattccagggcatgagccctca 22357953  T
Q  286 acagtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatg-aaaggactcaacttgtgtatatcagcatacaactca 377  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |  ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22357952 acaatttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggttt-atgagtatgcaatggactcaacttgtgtatatcaacatacaactca 22357860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 172 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 22759156 - 22759004
Alignment:
Q  172 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccag 271  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||||| ||||| |||||  |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  22759156 gttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagttgaatgataaacattccag 22759058  T
Q  272 ggcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctca 324  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  22759057 ggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaagcattctagggcatgtgccctca 22759004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 152 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 27869946 - 27869773
Alignment:
Q  152 ggtagcaccatttccatcgtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-g 250  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| || ||||| || ||||||| |    
T  27869946 ggtaccaccatttccatcgtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgata--acatttcagggcatgagtcctcaacag 27869849  T
Q  251 gttgaatgatta-acattccagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 326  Q
     ||||||||  |  ||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  27869848 tttgaatgacaaggcattccagggcatgagctctcaacaattagaatgataa--cattccagggcatgagccctcaac 27869773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 173 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 27869847 - 27869691
Alignment:
Q  173 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattccag 271  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||| ||| | |||||||| |||||| ||  ||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||    
T  27869847 ttgaatgacaaggcattccagggcatgagctctcaacaattagaatgataa--cattccagggcatgagccctcaacagttgaatgataaagcattccag 27869750  T
Q  272 ggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggttt 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  27869749 ggcatgagccctcaacagttgaatgac-aagcattccagggcataagccctcaacagttt 27869691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 173 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 8953148 - 8953034
Alignment:
Q  173 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-ggttgaatgattaacattccag 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||| ||    
T  8953148 ttgaatgactaagcattccggggcataagtccccaacaatttgaatgataa-acattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgattaacattcaag 8953050  T
Q  272 ggcatgagccctcaac 287  Q
    ||||||||||||||||    
T  8953049 ggcatgagccctcaac 8953034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 193 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 27869867 - 27869734
Alignment:
Q  193 gggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt-gaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagtt 291  Q
    |||||| || || ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||  || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27869867 gggcatgagtcctcaacagtttgaatgacaaggcattccagggcatgagctctcaacaattagaatgat-aacattccagggcatgagccctcaacagtt 27869769  T
Q  292 gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 326  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27869768 gaatgataaagcattccagggcatgagccctcaac 27869734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 158 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 24277777 - 24277606
Alignment:
Q  158 accatttccatcgtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-ggttgaa 256  Q
    ||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||| | |||||    
T  24277777 accattttcaacgtgttgaatgaataagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgataa-acattccagggcatgagccctcaacagtttgaa 24277679  T
Q  257 tgatta-acattccagggcatgagccctcaac-agttgaatgacaaagcattc-cagggcatgagccctcaac 326  Q
    |||  |  ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||    
T  24277678 tgacaaggcattccagggcataagccctcaacaatttgaatgaactagcattcacagggcatgagccctcaac 24277606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 158 - 326
Target Start/End: Original strand, 24384436 - 24384607
Alignment:
Q  158 accatttccatcgtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-ggttgaa 256  Q
    ||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||| | |||||    
T  24384436 accattttcaacgtgttgaatgaataagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgataa-acattccagggcatgagccctcaacagtttgaa 24384534  T
Q  257 tgatta-acattccagggcatgagccctcaac-agttgaatgacaaagcattc-cagggcatgagccctcaac 326  Q
    |||  |  ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||    
T  24384535 tgacaaggcattccagggcataagccctcaacaatttgaatgaactagcattcacagggcatgagccctcaac 24384607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 173 - 326
Target Start/End: Original strand, 26495435 - 26495589
Alignment:
Q  173 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-ggttgaatgatta--acattcc 269  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||  |    |||||    
T  26495435 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatga-acattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcaattcc 26495533  T
Q  270 agggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 326  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||    
T  26495534 agggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaac 26495589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 172 - 287
Target Start/End: Original strand, 26495553 - 26495667
Alignment:
Q  172 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccag 271  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||  | ||||||||    
T  26495553 gttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacgagcattccag 26495651  T
Q  272 ggcatgagccctcaac 287  Q
    ||||||||||||||||    
T  26495652 ggcatgagccctcaac 26495667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 156 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 22358123 - 22357951
Alignment:
Q  156 gcaccatttccatcgtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatga-caagacattccaaggcataagccctcaacggttg 254  Q
    ||||||||| || | |||||||| |||||||||||  ||||||||| || |||||||||||||||  || | |||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  22358123 gcaccattttcaacatgttgaataactaagcattctagggcataagacctcaacaatttgaatgataaaaatattccagggcatgagccctcaacagttg 22358024  T
Q  255 aatgattaa-cattccagggcatgagccctcaac-agttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 326  Q
    |||||  || ||||||||||||| |||||||||| | |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22358023 aatgacaaagcattccagggcataagccctcaacaatttgaatgataaa-cattccagggcatgagccctcaac 22357951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 172 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 29325674 - 29325562
Alignment:
Q  172 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccag 271  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||  | ||||||||    
T  29325674 gttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacgagcattccag 29325576  T
Q  272 ggcatgagccctca 285  Q
    ||||||||||||||    
T  29325575 ggcatgagccctca 29325562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 173 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 29325792 - 29325638
Alignment:
Q  173 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-ggttgaatgatta--acattcc 269  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||  |    |||||    
T  29325792 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgatga-acattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcaattcc 29325694  T
Q  270 agggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 326  Q
    | ||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||    
T  29325693 aaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaac 29325638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 161 - 249
Target Start/End: Original strand, 4397426 - 4397514
Alignment:
Q  161 atttccatcgtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac 249  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||    
T  4397426 atttccaacgggttgaatgactaagcattctggggcataagcccccaataatttgaatgacaaggcatttcagggcatgagccctcaac 4397514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 172 - 298
Target Start/End: Original strand, 23671518 - 23671644
Alignment:
Q  172 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattcca 270  Q
    |||||||||| | ||||||| |||||| ||||| |||| ||| ||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||    
T  23671518 gttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacgatt-gaatgacgaggcattccagggcatgagccctcaacggttgaatgacgaagcattcca 23671616  T
Q  271 gggcatgagccctcaacagttgaatgac 298  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  23671617 gggcatgagccctcaacggttgactgac 23671644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 225 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 22759144 - 22759037
Alignment:
Q  225 acattccaaggcataagccctcaacgg-ttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccct 322  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  22759144 acattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagttgaatgataaa-cattccagggcatgagccct 22759046  T
Q  323 caacggttt 331  Q
    |||| ||||    
T  22759045 caacagttt 22759037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 252 - 330
Target Start/End: Original strand, 26495475 - 26495555
Alignment:
Q  252 ttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagc-attccagggcatgagccctcaacggtt 330  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||    
T  26495475 ttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcaattccagggcataagccctcaacggtt 26495555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 173 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 22759116 - 22758892
Alignment:
Q  173 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt-gaatgattaa-cattcca 270  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||| || |||||| || |||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||  || ||||| |    
T  22759116 ttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagtt-gaatgataa-acattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaagcattcta 22759019  T
Q  271 gggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatg-aaaggactcaac-ttgtgtatatcagc 367  Q
    ||||||| ||||||| || || ||| ||||| || |||||||||||||||||||| || |||  |  | ||| || | |||| || ||||||||||||||    
T  22759018 gggcatgtgccctcaccaatttgaacgacaaggcgttccagggcatgagccctcaccgcttt-atgtttatgtaatgaactcgactttgtgtatatcagc 22758920  T
Q  368 atacaactcaactacgacagcaacaaca 395  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  22758919 atacaactcaactacgacaacgacaaca 22758892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 416 - 465
Target Start/End: Original strand, 22880122 - 22880171
Alignment:
Q  416 gcataataactcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22880122 gcataataactcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 22880171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 252 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 8953108 - 8953029
Alignment:
Q  252 ttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggttt 331  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8953108 ttgaatgataaacattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgattaa-cattcaagggcatgagccctcaacggttt 8953029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 252 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 29325752 - 29325672
Alignment:
Q  252 ttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagc-attccagggcatgagccctcaacggtt 330  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  29325752 ttgaatgatgaacattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcaattccaaggcataagccctcaacggtt 29325672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 234 - 331
Target Start/End: Original strand, 7785124 - 7785224
Alignment:
Q  234 ggcataagccctcaacggttgaatgattaacattc-cagggcatgagccctcaacagttg-aatgacaaagcattcc-agggcatgagccctcaacggtt 330  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |  ||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7785124 ggcataagccctcaacgattgaatgacttgcattcacagggcataagccctcaacaattggaatgattaagcattcccagggcatgagccctcaacggtt 7785223  T
Q  331 t 331  Q
    |    
T  7785224 t 7785224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 251 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 22759235 - 22759154
Alignment:
Q  251 gttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtt 330  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||||| ||||| ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22759235 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacggtt 22759154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 173 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 22357986 - 22357907
Alignment:
Q  173 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt 253  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  22357986 ttgaatga-taaacattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtt 22357907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 264 - 326
Target Start/End: Original strand, 23693083 - 23693145
Alignment:
Q  264 cattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 326  Q
    ||||||||||||| | || ||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23693083 cattccagggcatcatccttcacccgttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaac 23693145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 193 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 21559562 - 21559443
Alignment:
Q  193 gggcataagcccccaacaatttgaatga-caagacattc-caaggcataagccctcaacggtt-gaatgattaa-cattc-cagggcatgagccctcaac 287  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||| || ||||| |||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  21559562 gggcataagccctcaacaatttgaatgaactag-cattcacagggcatgagccctcaacagtttgaatgattaagcattcacagggcatgagccctcaac 21559464  T
Q  288 ag-ttgaatgacaaagcattc 307  Q
    || ||||| ||||| ||||||    
T  21559463 agtttgaacgacaaggcattc 21559443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 269 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 21559523 - 21559459
Alignment:
Q  269 cagggcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattc-cagggcatgagccctcaacggttt 331  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  21559523 cagggcatgagccctcaacagtttgaatgattaagcattcacagggcatgagccctcaacagttt 21559459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 290 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 17023037 - 17023000
Alignment:
Q  290 ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacg 327  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17023037 ttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacg 17023000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 173 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 21981094 - 21981017
Alignment:
Q  173 ttgaatgactaagcattc-cggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattc-caaggcataagccctcaa 248  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||| ||| ||| | |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21981094 ttgaatgattaagcattcacagggcataaaccctcaatagtttgaacgacaagacattcacaaggcataagccctcaa 21981017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 290 - 331
Target Start/End: Original strand, 22469950 - 22469991
Alignment:
Q  290 ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggttt 331  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22469950 ttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagttt 22469991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 269 - 327
Target Start/End: Original strand, 26706359 - 26706419
Alignment:
Q  269 cagggcatgagccctcaacagttg-aatgacaaagcattcc-agggcatgagccctcaacg 327  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26706359 cagggcataagccctcaacagttggaatgattaagcattcccagggcatgagccctcaacg 26706419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 234 - 325
Target Start/End: Original strand, 26706362 - 26706458
Alignment:
Q  234 ggcataagccctcaacggttg-aatgattaa-cattcc-agggcatgagccctcaac-agttgaatgacaaagcattc-cagggcatgagccctcaa 325  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||| || ||| |||||||| |||||||||    
T  26706362 ggcataagccctcaacagttggaatgattaagcattcccagggcatgagccctcaacgatttgaacgacaaggcgttcacagggcataagccctcaa 26706458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 269 - 327
Target Start/End: Original strand, 26976093 - 26976153
Alignment:
Q  269 cagggcatgagccctcaacagttg-aatgacaaagcattcc-agggcatgagccctcaacg 327  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26976093 cagggcataagccctcaacagttggaatgattaagcattcccagggcatgagccctcaacg 26976153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 234 - 325
Target Start/End: Original strand, 26976096 - 26976192
Alignment:
Q  234 ggcataagccctcaacggttg-aatgattaa-cattcc-agggcatgagccctcaac-agttgaatgacaaagcattc-cagggcatgagccctcaa 325  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||| || ||| |||||||| |||||||||    
T  26976096 ggcataagccctcaacagttggaatgattaagcattcccagggcatgagccctcaacgatttgaacgacaaggcgttcacagggcataagccctcaa 26976192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 264 - 327
Target Start/End: Original strand, 22469963 - 22470029
Alignment:
Q  264 cattccagggcatgagccctcaacag-ttgaat-gacaaagcattc-cagggcatgagccctcaacg 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  22469963 cattccagggcatgagccctcaacagtttgaatagttaaagcattcacagggcataagccctcaacg 22470029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 414 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 22758888 - 22758839
Alignment:
Q  414 gtgcataataactc--actcactccccaacttggtcaacatcaacaacct 461  Q
    |||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22758888 gtgcataataactatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacct 22758839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 251 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 24277763 - 24277682
Alignment:
Q  251 gttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggttt 331  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||||| ||||| ||||| || |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24277763 gttgaatgaataagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgataaa-cattccagggcatgagccctcaacagttt 24277682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 251 - 331
Target Start/End: Original strand, 24384450 - 24384531
Alignment:
Q  251 gttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggttt 331  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||||| ||||| ||||| || |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24384450 gttgaatgaataagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgataaa-cattccagggcatgagccctcaacagttt 24384531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 173 - 250
Target Start/End: Original strand, 26495593 - 26495668
Alignment:
Q  173 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacg 250  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||| || ||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||    
T  26495593 ttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtt-gaatgacgag-cattccagggcatgagccctcaacg 26495668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525 (Bit Score: 169; Significance: 2e-90; HSPs: 7)
Name: scaffold0525
Description:

Target: scaffold0525; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 173 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 11342 - 11049
Alignment:
Q  173 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattccag 271  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||| || |||||||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||||||  |  ||||||||    
T  11342 ttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaggcattccag 11244  T
Q  272 ggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactcaacttgtgtatatcagcatac 371  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11243 ggcataagccctcaacggttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagattcctaatcatgaa-ggactcaacttgtgtatatcagcatac 11145  T
Q  372 aactcaactacgacagcaacaacataggcaacgacaacgatcgtgcataataac--tcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 465  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11144 aactcaactacgacaacgacaacataggcgacgacaacgaccgtgcataataactatgactcactccccaacttgatcaacatcaacaacctatga 11049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 173 - 465
Target Start/End: Original strand, 8799 - 9100
Alignment:
Q  173 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattccag 271  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||  || ||||||||    
T  8799 ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacaatt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacaattgaatgacaaagcattccag 8897  T
Q  272 ggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactcaacttgtgtatatcagcatac 371  Q
    ||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  8898 ggcataagccctccacggttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactcgacttgtgtatatcaacatac 8997  T
Q  372 aactcaactacgacagcaacaacatagg------caacgacaacgatcgtgcataataac---tcactcactccccaacttggtcaacatcaacaaccta 462  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||      ||||||||||||  ||||||||||||   | ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8998 aactcaactacgacaacgacaacataggcaacaacaacgacaacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacatggtcaacatcaacaaccta 9097  T
Q  463 tga 465  Q
    |||    
T  9098 tga 9100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525; HSP #3
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 152 - 326
Target Start/End: Original strand, 8661 - 8835
Alignment:
Q  152 ggtagcaccatttccatcgtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacgg 251  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  8661 ggtagcaccatttccttcgtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacgg 8760  T
Q  252 ttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 326  Q
    ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8761 ttgaatgacgagcattccagggcatgagccctcaacaattgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 8835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525; HSP #4
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 172 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 11423 - 11267
Alignment:
Q  172 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-ggttgaatgattaa-cattcc 269  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||  || ||||||    
T  11423 gttgaatgactaagcagtccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccaaggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaagcattcc 11324  T
Q  270 agggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 326  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11323 agggcataagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaac 11267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525; HSP #5
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 172 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 11304 - 11187
Alignment:
Q  172 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgatta-acattcca 270  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||    
T  11304 gttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaac-agttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacggttgaatgacaaggcattcca 11206  T
Q  271 gggcatgagccctcaacag 289  Q
    |||||| ||||||||||||    
T  11205 gggcataagccctcaacag 11187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525; HSP #6
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 251 - 330
Target Start/End: Original strand, 8681 - 8762
Alignment:
Q  251 gttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtt 330  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||||| ||||| ||||| || ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8681 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacggtt 8762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525; HSP #7
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 251 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 11423 - 11341
Alignment:
Q  251 gttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggttt 331  Q
    ||||||||| ||| || ||| |||||| ||||| ||||| || ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  11423 gttgaatgactaagcagtccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccaaggcatgagccctcaacagttt 11341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 130; Significance: 4e-67; HSPs: 4)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 264 - 454
Target Start/End: Original strand, 1443 - 1634
Alignment:
Q  264 cattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactcaacttgtgtatat 363  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  1443 cattccagggcataagccctcaacggttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggttacctaaacatgaa-ggactcaacttgtgtatat 1541  T
Q  364 cagcatacaactcaactacgacagcaacaacataggcaacgacaacgatcgtgcataataac--tcactcactccccaacttggtcaacatca 454  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | |||||||||| |||| | |||||||||    
T  1542 cagcatacaactcaactacgacaacgacaacataggcaacgacaacgaccgtgcataataactatgactcactcccaaactcgatcaacatca 1634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 200 - 287
Target Start/End: Original strand, 1417 - 1505
Alignment:
Q  200 agcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaac 287  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||    
T  1417 agccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacggttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 1505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 275 - 330
Target Start/End: Original strand, 1414 - 1470
Alignment:
Q  275 atgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtt 330  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1414 atgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacggtt 1470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 173 - 253
Target Start/End: Original strand, 1430 - 1509
Alignment:
Q  173 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt 253  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||  || |||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  1430 ttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacggtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtt 1509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 107; Significance: 2e-53; HSPs: 6)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 158 - 326
Target Start/End: Original strand, 59151 - 59318
Alignment:
Q  158 accatttccatcgtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaat 257  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||| ||||| |||||||||| |||||||    
T  59151 accattttcaacgtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaattttaatgataa--cattccagggcatgagccctcaacagttgaat 59248  T
Q  258 gattaa-cattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 326  Q
    ||  || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  59249 gacaaaacattccagagcatgagccctcaacaggtgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 59318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 186 - 325
Target Start/End: Original strand, 59217 - 59356
Alignment:
Q  186 cattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctc 284  Q
    |||||| |||||| ||||| ||||| || ||||||||| ||||||||  |||| |||||||||| | |||||||  || |||||||||||||||||||||    
T  59217 cattccagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaaacattccagagcatgagccctcaacaggtgaatgacaaagcattccagggcatgagccctc 59315  T
Q  285 aacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaa 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  59316 aacagttgaatgacaaagcattccagagcatgagccctcaa 59356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 172 - 377
Target Start/End: Original strand, 59242 - 59450
Alignment:
Q  172 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattcca 270  Q
    |||||||||| || |||||| | |||| ||||| |||||  | |||||||||  ||||||| ||||| |||||||||| |||||||||  || |||||||    
T  59242 gttgaatgacaaaacattccagagcatgagccctcaacaggt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattcca 59340  T
Q  271 gggcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatg-aaaggactcaac-ttgtgtatatcagc 367  Q
    | |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  | |  ||| || ||||||||| |||||||||||| |    
T  59341 gagcatgagccctcaataggttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacggttttatgagtatgcaatggactcaactttgtgtatatcaac 59440  T
Q  368 atacaactca 377  Q
    ||||||||||    
T  59441 atacaactca 59450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #4
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 193 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 205483 - 205344
Alignment:
Q  193 gggcataagcccccaacaatttgaatga-caagacattc-caaggcataagccctcaacggtt-gaatgattaa-cattc-cagggcatgagccctcaac 287  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||| || ||||| ||||||||||  || |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  205483 gggcataagccctcaacaatttgaatgaactag-cattcacagggcatgagccctcaacaatttgaatgattaaacattcacagggcatgagccctcaac 205385  T
Q  288 -agttgaatgacaaagcattc-cagggcatgagccctcaac 326  Q
     | ||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||    
T  205384 aatttgaatgacaaggcattcacagggcataagccctcaac 205344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #5
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 173 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 205422 - 205344
Alignment:
Q  173 ttgaatgactaagcattc-cggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattc-caaggcataagccctcaac 249  Q
    |||||||| ||| ||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  205422 ttgaatgattaaacattcacagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattcacagggcataagccctcaac 205344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #6
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 290 - 326
Target Start/End: Original strand, 384091 - 384127
Alignment:
Q  290 ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 326  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  384091 ttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaac 384127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0500 (Bit Score: 104; Significance: 1e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0500
Description:

Target: scaffold0500; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 169 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 11887 - 11728
Alignment:
Q  169 cgtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-catt 267  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||  || ||||    
T  11887 cgtgttgaatgactaagcattccagggcataagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaagcatt 11788  T
Q  268 ccagggcatgagccctcaac-agttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 326  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  11787 ccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaac 11728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0500; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 173 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 11843 - 11683
Alignment:
Q  173 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt-gaatgattaa-cattcca 270  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||| || |||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||  || ||||||  |  |||||||    
T  11843 ttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattcca 11745  T
Q  271 gggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggttt 331  Q
    |||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11744 gggcataagccctcaacaatttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacggttt 11683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0860 (Bit Score: 99; Significance: 1e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0860
Description:

Target: scaffold0860; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 169 - 326
Target Start/End: Original strand, 148 - 306
Alignment:
Q  169 cgtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-catt 267  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||  |||||||||  || ||||    
T  148 cgtgttgaatgactaagcattccagggcataagccctcaacaatttgaatgacaagacattccagggcatgatccctcaatagttgaatgacaaagcatt 247  T
Q  268 ccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||    
T  248 ccagggcatgagccctcaacagttggatgacaaggcatcccagggcataagccctcaac 306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0860; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 213 - 331
Target Start/End: Original strand, 231 - 350
Alignment:
Q  213 ttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagg 311  Q
    |||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||| |||| ||||  |  ||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  231 ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagttggatgacaaggcatcccagggcataagccctcaacagttggatgacaaagcattctagg 330  T
Q  312 gcatgagccctcaacggttt 331  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  331 gcatgagccctcaacagttt 350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151 (Bit Score: 99; Significance: 1e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0151
Description:

Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 158 - 409
Target Start/End: Original strand, 2106 - 2359
Alignment:
Q  158 accatttccatcgtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt-gaa 256  Q
    ||||||| || |||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||  || |||    
T  2106 accattttcaacgtgctgaatgactaagcattccgaggcttaagcccccaacaatttgaatgataa-acattccagggcatgagccctcaacaatttgaa 2204  T
Q  257 tgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactcaac-t 354  Q
    |||  |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   | |    || |||||| || |    
T  2205 tgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttatgagtgtacaatggactcgactt 2304  T
Q  355 tgtgtatatcagcatacaactcaactacgacagcaacaacataggcaacgacaac 409  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||| |||| | ||||||||||    
T  2305 tgtgtatatcaacatacaactcaactacaacaacaacgacatggacaacgacaac 2359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 158 - 409
Target Start/End: Original strand, 8950 - 9203
Alignment:
Q  158 accatttccatcgtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt-gaa 256  Q
    ||||||| || |||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||  || |||    
T  8950 accattttcaacgtgctgaatgactaagcattccgaggcttaagcccccaacaatttgaatgataa-acattccagggcatgagccctcaacaatttgaa 9048  T
Q  257 tgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactcaac-t 354  Q
    |||  |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   | |    || |||||| || |    
T  9049 tgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttatgagtgtacaatggactcgactt 9148  T
Q  355 tgtgtatatcagcatacaactcaactacgacagcaacaacataggcaacgacaac 409  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||| |||| | ||||||||||    
T  9149 tgtgtatatcaacatacaactcaactacaacaacaacgacatggacaacgacaac 9203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 96; Significance: 7e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 158 - 409
Target Start/End: Original strand, 5685 - 5937
Alignment:
Q  158 accatttccatcgtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-ggttgaa 256  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||||| | |||||    
T  5685 accattttcaacgtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttaaatgataa-acattccagggcatgagccctcaacagtttgaa 5783  T
Q  257 tgatta-acattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcat-gaaaggactcaac- 353  Q
    |||| |  ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||||  |||  ||  || |||||| ||     
T  5784 tgataagtcattccagggcataagccctcgacaattgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagttt-ataagtatacaatggactcgact 5881  T
Q  354 ttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacagcaacaacataggcaacgacaac 409  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||    
T  5882 ttgtgtatatcaacatacaactcaactacaacaacaacaacatggacaacgacaac 5937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0381 (Bit Score: 94; Significance: 1e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0381
Description:

Target: scaffold0381; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 169 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 14146 - 13981
Alignment:
Q  169 cgtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-ggttgaatgatta-acat 266  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  |  |||    
T  14146 cgtgttgaatgactaagcattccagggcataagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacaatttgaatgacaaggcat 14047  T
Q  267 tccagggcatgagccctcaac-agttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggttt 331  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14046 tccagggcataagccctcaacaatttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacggttt 13981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338 (Bit Score: 94; Significance: 1e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0338
Description:

Target: scaffold0338; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 156 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 4153 - 3978
Alignment:
Q  156 gcaccatttccatcgtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacgg-ttg 254  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||| |||    
T  4153 gcaccattttcaacgtgttgaatgactaagcatttcggggcataagcccccaacaatttgaatgataa-acattccagggcatgagccctcaacggtttg 4055  T
Q  255 aatgatta-acattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggttt 331  Q
    |||||  |  ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4054 aatgacaaggcattccatggcataagccctcaacaattgaatgataaa-cattccagggcatgagccctcaacggttt 3978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 173 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 4096 - 3888
Alignment:
Q  173 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagg 272  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||| ||||| ||||  ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  4096 ttgaatga-taaacattccagggcatgagccctcaacggtttgaatgacaaggcattccatggcataagccctcaacaattgaatgataaacattccagg 3998  T
Q  273 gcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatg-aaaggactcaac-ttgtgtatatcagcat 369  Q
    ||||||||||||||| | || |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  | |  ||| || ||||||||| |||||||||||| |||    
T  3997 gcatgagccctcaacggtttaaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacggttttatgagtatgcaatggactcaactttgtgtatatcaacat 3898  T
Q  370 acaactcaac 379  Q
    ||||||||||    
T  3897 acaactcaac 3888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 94; Significance: 1e-45; HSPs: 5)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 160 - 331
Target Start/End: Original strand, 50684 - 50856
Alignment:
Q  160 catttccatcgtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatga 259  Q
    ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  50684 cattttcaacgtgttgaatgactgagcattccggggcataagccccaaacaatttgaatgataa-acattccagggcataagccctcaacagttgaatga 50782  T
Q  260 ttaa-cattccagggcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggttt 331  Q
      || ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  50783 caaagcattctagggcataagccctcaacagtttgaatgacaaggcattcaagggcatgagccctcaacagttt 50856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 216 - 287
Target Start/End: Original strand, 50939 - 51010
Alignment:
Q  216 aatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaac 287  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50939 aatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaac 51010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #3
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 172 - 331
Target Start/End: Original strand, 50774 - 50936
Alignment:
Q  172 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt-gaatgattaa--cattc 268  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||| ||| ||||| ||||  |||||    
T  50774 gttgaatgacaaagcattctagggcataagccctcaacagtttgaatgacaaggcattcaagggcatgagccctcaacagtttgaatggttaaagcattc 50873  T
Q  269 -cagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggttt 331  Q
     |||||||| ||||||||||  ||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  50874 acagggcataagccctcaacgattgaacgataaa-catttcagggcatgagccctcaacagttt 50936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #4
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 234 - 326
Target Start/End: Original strand, 50878 - 50972
Alignment:
Q  234 ggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagtt--gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 326  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  50878 ggcataagccctcaacgattgaacgataaacatttcagggcatgagccctcaacagtttaaaatgacaaggcattccagggcataagccctcaac 50972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #5
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 264 - 331
Target Start/End: Original strand, 50949 - 51015
Alignment:
Q  264 cattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggttt 331  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  50949 cattccagggcataagccctcaacagttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacggttt 51015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 93; Significance: 4e-45; HSPs: 7)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 173 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 12662 - 12455
Alignment:
Q  173 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt-gaatgattaacattccag 271  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||| || |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||    
T  12662 ttgaatga-taaacattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcatttcagggcataagccctcaacagtttgaatgataaacattccag 12564  T
Q  272 ggcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatg-aaaggactcaac-ttgtgtatatcagca 368  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||  |||  ||| || ||||||||| |||||||||||| ||    
T  12563 ggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattccaaggcataagccctcaacggttttataagtatgcaatggactcaactttgtgtatatcaaca 12464  T
Q  369 tacaactca 377  Q
    |||||||||    
T  12463 tacaactca 12455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 180 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 13296 - 13145
Alignment:
Q  180 actaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattccagggcatga 278  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||| |    
T  13296 actaagcattctggggcataagccccaaacaatttgaatgataa-acattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcataa 13198  T
Q  279 gccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggttt 331  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||    
T  13197 gccgtcaacagatgaatgacaaagcatttcagggcataagccctcagcggttt 13145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #3
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 226 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 12688 - 12582
Alignment:
Q  226 cattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctca 324  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  12688 cattccagggcataagccctcaacaattgaatgataaacattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcatttcagggcataagccctca 12589  T
Q  325 acggttt 331  Q
    || ||||    
T  12588 acagttt 12582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #4
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 173 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 13263 - 13105
Alignment:
Q  173 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattccag 271  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||||||||| ||||| || |||||||||  ||||||| |||||||||| ||||| | |||||||  || |||| |||    
T  13263 ttgaatga-taaacattccagggcataagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcataagccgtcaacagatgaatgacaaagcatttcag 13166  T
Q  272 ggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggttt 331  Q
    ||||| |||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  13165 ggcataagccctcagcggtttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacagttt 13105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #5
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 184 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 12690 - 12543
Alignment:
Q  184 agcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-ggttgaatgatta-acattccagggcatgagcc 281  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||  |  |||| |||||||| ||||    
T  12690 agcattccagggcataagccctcaacaa-ttgaatgataa-acattccagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcatttcagggcataagcc 12593  T
Q  282 ctcaacag-ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggttt 331  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12592 ctcaacagtttgaatgataaa-cattccagggcatgagccctcaacagttt 12543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #6
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 172 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 13226 - 13065
Alignment:
Q  172 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt-gaatgattaa-cattcc 269  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||  |||||  | |||||||||  |||| || |||||||||||||| ||||| ||||||  |  ||||||    
T  13226 gttgaatgacaaagcattccagggcataagccgtcaacagat-gaatgacaaagcatttcagggcataagccctcagcggtttgaatgacaaggcattcc 13128  T
Q  270 agggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggttt 331  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||| || | |||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  13127 agggcataagccctcaacagtttgaatcacgaggcattccagggcataagccctcaatggttt 13065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #7
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 185 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 13094 - 13030
Alignment:
Q  185 gcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac 249  Q
    ||||||| |||||||||||| |||   ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  13094 gcattccagggcataagccctcaatggtttgaatgacaaggctatccaaggcataagccctcaac 13030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 93; Significance: 4e-45; HSPs: 5)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 173 - 324
Target Start/End: Original strand, 137562 - 137714
Alignment:
Q  173 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagg 272  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||| || ||||||||| |||||| | ||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  137562 ttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaccaatttgaacgacaaggcgttctagggcataagccctcaactgttgaatgattaacattccaga 137661  T
Q  273 gcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctca 324  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  137662 gcatgagccctcaacagattgaatgacaaagcattccagggaataagccctca 137714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 158 - 326
Target Start/End: Original strand, 137468 - 137638
Alignment:
Q  158 accatttccatcgtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-ggttgaa 256  Q
    ||||||| || |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  |  ||||||| ||||| |||||||||| | |||||    
T  137468 accattttcaacgtgatgaatgactaagcattccggagcataagcccccaacaatttgaataatga-tcattccagggcatgagccctcaacagattgaa 137566  T
Q  257 tgattaa-cattccagggcatgagccctcaac-agttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 326  Q
    |||  || ||||||||||||| |||||||| | | ||||| ||||| || ||| ||||||| ||||||||||    
T  137567 tgacaaagcattccagggcataagccctcaccaatttgaacgacaaggcgttctagggcataagccctcaac 137638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 400 - 465
Target Start/End: Original strand, 137816 - 137883
Alignment:
Q  400 caacgacaacgatcgtgcataataactc--actcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 465  Q
    |||||||||| |  |||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  137816 caacgacaacaactgtgcataataactatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 137883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 186 - 326
Target Start/End: Original strand, 137535 - 137676
Alignment:
Q  186 cattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt-gaatgattaa-cattccagggcatgagccct 283  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||  |||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |  || ||| ||  |  | ||| ||||||| ||||||    
T  137535 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaccaatttgaacgacaaggcgttctagggcataagccct 137634  T
Q  284 caacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 326  Q
    |||| |||||||||  || |||||||| |||||||||||||||    
T  137635 caactgttgaatgattaa-cattccagagcatgagccctcaac 137676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 357 - 395
Target Start/End: Original strand, 137788 - 137826
Alignment:
Q  357 tgtatatcagcatacaactcaactacgacagcaacaaca 395  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  137788 tgtatatcagcatacaactcaactacgacaacgacaaca 137826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 91; Significance: 7e-44; HSPs: 8)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 187 - 324
Target Start/End: Original strand, 2140 - 2278
Alignment:
Q  187 attccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaa 286  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||  |||||||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2140 attccagggcatgagccctcaacagattgaatgataaagcattccagggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaa 2239  T
Q  287 cag-ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctca 324  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2240 cagattgaatgacaaagcattccagggcataagccctca 2278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 186 - 330
Target Start/End: Original strand, 2061 - 2206
Alignment:
Q  186 cattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagggcatgagccctca 285  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||  |||||||||||| ||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2061 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattctagggcataatccctcaacggttgaatgattaatattccagggcatgagccctca 2160  T
Q  286 acag-ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtt 330  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2161 acagattgaatgataaagcattccagggcataagccctcaacggtt 2206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #3
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 158 - 326
Target Start/End: Original strand, 1994 - 2162
Alignment:
Q  158 accatttccatcgtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-ggttgaa 256  Q
    ||||||| || || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||| ||||| |||||||||| | |||||    
T  1994 accattttcaacgggttgaatgactaagcattctggggcataagcccccaacaatttgaatgatga-tcattccagggcatgagccctcaacagattgaa 2092  T
Q  257 tgatta-acattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 326  Q
    |||  |  ||||| ||||||| | |||||||| |||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||    
T  2093 tgacaaggcattctagggcataatccctcaacggttgaatgattaa-tattccagggcatgagccctcaac 2162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #4
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 252 - 330
Target Start/End: Original strand, 2049 - 2128
Alignment:
Q  252 ttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtt 330  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| | ||||||||||||    
T  2049 ttgaatgatgatcattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattctagggcataatccctcaacggtt 2128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #5
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 227 - 326
Target Start/End: Original strand, 2140 - 2240
Alignment:
Q  227 attccaaggcataagccctcaacgg-ttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctca 324  Q
    |||||| ||||| |||||||||| | ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||||||||    
T  2140 attccagggcatgagccctcaacagattgaatgataaagcattccagggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctca 2238  T
Q  325 ac 326  Q
    ||    
T  2239 ac 2240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #6
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 173 - 395
Target Start/End: Original strand, 2166 - 2390
Alignment:
Q  173 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacgg-ttgaatgattaa-cattcca 270  Q
    ||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||||  || ||||||  | |||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||  || |||||||    
T  2166 ttgaatgataaagcattccagggcataagccctcaacggtt-gaatgatta-acattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaagcattcca 2263  T
Q  271 gggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatg-aaaggactcaac-ttgtgtatatcagc 367  Q
    |||||| |||||||| || || ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||  |  | ||| || | |||| || ||||||||||||||    
T  2264 gggcataagccctcaccaatttgaacgacaaggcattccagggcatgagccctcaccgcttt-atgtttatgtaatgaactcgactttgtgtatatcagc 2362  T
Q  368 atacaactcaactacgacagcaacaaca 395  Q
    ||| ||||||||||||||| | ||||||    
T  2363 ataaaactcaactacgacaacgacaaca 2390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #7
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 414 - 465
Target Start/End: Original strand, 2394 - 2447
Alignment:
Q  414 gtgcataataactc--actcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 465  Q
    |||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2394 gtgcataataactatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 2447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #8
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 172 - 247
Target Start/End: Original strand, 2204 - 2278
Alignment:
Q  172 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctca 247  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||||| ||||| |||||  |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  2204 gttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaagcattccagggcataagccctca 2278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 91; Significance: 7e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 172 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 6243 - 6032
Alignment:
Q  172 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacgg-ttgaatgattaa-cattcc 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||  |  |||||     
T  6243 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaaagatga-acattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaaggcattct 6145  T
Q  270 agggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaa-ggactcaactt-gtgtatatcagc 367  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||   || |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  6144 agggcataagccctcaacggttgaatgcttaa-cattccagggcatgagccctcaacagtt-cctaattatgaaatggactcaactttgtgtatatcagc 6047  T
Q  368 atacaactcaactac 382  Q
    |||||||||||||||    
T  6046 atacaactcaactac 6032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0609 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 4)
Name: scaffold0609
Description:

Target: scaffold0609; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 169 - 326
Target Start/End: Original strand, 4313 - 4471
Alignment:
Q  169 cgtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-catt 267  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| |||||||||  || ||||    
T  4313 cgtgttgaatgactaagcattccagggcacaagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcatt 4412  T
Q  268 ccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 326  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||    
T  4413 ccagggcattagccctcaatagttggatgacaaggcatcccagggcataagcccgcaac 4471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0609; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 172 - 325
Target Start/End: Original strand, 4395 - 4548
Alignment:
Q  172 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattcca 270  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| ||||| ||| | || || ||||||| ||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||  || |||||||    
T  4395 gttgaatgacaaagcattccagggcattagccctcaatagttgga-tgacaaggcatcccagggcataagcccgcaacagttgaatgacaaagcattcca 4493  T
Q  271 gggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaa 325  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4494 gggcataagccctcaacagttggatgacaaagcattccagggcatgagccctcaa 4548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0609; HSP #3
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 173 - 326
Target Start/End: Original strand, 4357 - 4510
Alignment:
Q  173 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattccag 271  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||| ||||| ||||| || |||||||||  ||||||| ||||| |||||||||  |||| ||||  |  ||| ||||    
T  4357 ttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcattagccctcaatagttggatgacaaggcatcccag 4455  T
Q  272 ggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 326  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4456 ggcataagcccgcaacagttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaac 4510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0609; HSP #4
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 172 - 291
Target Start/End: Original strand, 4434 - 4553
Alignment:
Q  172 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattcca 270  Q
    |||| ||||| | |||| || |||||||||||| ||||| || |||||||||  ||||||| |||||||||||||||| |||| ||||  || |||||||    
T  4434 gttggatgacaaggcatcccagggcataagcccgcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagttggatgacaaagcattcca 4532  T
Q  271 gggcatgagccctcaacagtt 291  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  4533 gggcatgagccctcaatagtt 4553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 83; Significance: 4e-39; HSPs: 4)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 173 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 40328 - 40175
Alignment:
Q  173 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattccag 271  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||| |||||  |||| ||||||||||||| ||||||| ||  |||||||||||| |||||||||  || ||||||||    
T  40328 ttgaatga-taaacattccagggcatgagcccttaacagtttgaatgacaaggcattccagggagtaagccctcaacagttgaatgacaaagcattccag 40230  T
Q  272 ggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40229 ggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcataagccctcaac 40175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 173 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 40289 - 40137
Alignment:
Q  173 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattccag 271  Q
    ||||||||| | ||||||| |||  ||||||| ||||| || |||||||||  ||||||| ||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||||    
T  40289 ttgaatgacaaggcattccagggagtaagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccag 40191  T
Q  272 ggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaa 325  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40190 ggcataagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaa 40137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #3
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 153 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 40388 - 40214
Alignment:
Q  153 gtagcaccatttccatcgtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-gg 251  Q
    |||| ||||||| || |||||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||| ||| |     
T  40388 gtagtaccattttcaacgtgttgaatgacataacattctgggccttaagcccccaacaatttgaatgataa-acattccagggcatgagcccttaacagt 40290  T
Q  252 ttgaatgatta-acattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 326  Q
    ||||||||  |  ||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40289 ttgaatgacaaggcattccagggagtaagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 40214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #4
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 172 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 40251 - 40132
Alignment:
Q  172 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattcca 270  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||| || |||||||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||||||  || |||||||    
T  40251 gttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacagttgaatgacaaagcattcca 40153  T
Q  271 gggcatgagccctcaacagtt 291  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  40152 gggcatgagccctcaatagtt 40132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0586 (Bit Score: 81; Significance: 6e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0586
Description:

Target: scaffold0586; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 158 - 331
Target Start/End: Original strand, 1488 - 1662
Alignment:
Q  158 accatttccatcgtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacgg-ttgaa 256  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||  | |||||||| ||||| |||||||||| | |||||    
T  1488 accattttcaacgtgttgaatgactaagcattccagggcataagcccccagcaatt-gaatgatga-acattccagggcatgagccctcaacagattgaa 1585  T
Q  257 tgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggttt 331  Q
    |||  |  |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1586 tgacaaggcattccagggcatgagccctcaacggtttgaatggcaaagcattccagggcatgagccctcaacggttt 1662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 3)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 169 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 35074 - 34916
Alignment:
Q  169 cgtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-ggttgaatgatta-acat 266  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| | ||||| |||||||||| | ||||||||  |  |||    
T  35074 cgtgttgaatgactaagcatttcggggcataagcccccaacaatttgaatgataa-acattctagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcat 34976  T
Q  267 tccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 326  Q
    || ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  34975 tctagggcataatccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcataaaccctcaac 34916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 193 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 35011 - 34794
Alignment:
Q  193 gggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagtt 291  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||| |||||||| |||||||||  || ||||||||||||| | |||||||| |||    
T  35011 gggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattctagggcataatccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcataaaccctcaactgtt 34912  T
Q  292 gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactcaac-ttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacagcaa 390  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||   | |    || |||||| || |||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||    
T  34911 gaatgacaaagcattccagggcataagccctcaacag-ttaagagtatacaatggactcgactttgtgtatatcaacatacaactcaactacaacatcaa 34813  T
Q  391 caacataggcaacgacaac 409  Q
    |||||| | ||||||||||    
T  34812 caacatggacaacgacaac 34794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 173 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 34991 - 34873
Alignment:
Q  173 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaa-cattccag 271  Q
    ||||||||| | ||||||  |||||||| ||| ||||| || |||||||||  ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||  || ||||||||    
T  34991 ttgaatgacaaggcattctagggcataatccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcataaaccctcaactgttgaatgacaaagcattccag 34893  T
Q  272 ggcatgagccctcaacagtt 291  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  34892 ggcataagccctcaacagtt 34873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 9)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 173 - 326
Target Start/End: Original strand, 20883 - 21038
Alignment:
Q  173 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-ggttgaatgattaacattccag 271  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  20883 ttgaatgacaaggcattccagggcataagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataaatcctcaacagtttgaatgataaacattccag 20982  T
Q  272 ggcatgagccctcaac-agttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 326  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  20983 ggcatgaaccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataaaccctcaac 21038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 158 - 315
Target Start/End: Original strand, 20788 - 20948
Alignment:
Q  158 accatttccatcgtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-ggttgaa 256  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| | |||||    
T  20788 accattttcaacgtgttgaatgactaagcatttcggggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagtttgaa 20887  T
Q  257 tgatta-acattccagggcatgagccctcaac-agttgaatgacaaagcattccagggcat 315  Q
    |||  |  ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  20888 tgacaaggcattccagggcataagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcat 20948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 173 - 291
Target Start/End: Original strand, 20963 - 21079
Alignment:
Q  173 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagg 272  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  20963 ttgaatga-taaacattccagggcatgaaccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcataaaccctcaacagttaaatgattaacattccagg 21061  T
Q  273 gcatgagccctcaacagtt 291  Q
    |||||| ||||||||||||    
T  21062 gcatga-ccctcaacagtt 21079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #4
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 158 - 316
Target Start/End: Original strand, 23866 - 24026
Alignment:
Q  158 accatttccatcgtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-ggttgaa 256  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| ||| | ||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||| | |||||    
T  23866 accattttcaacgtgttgaatgactaagcattctagggcatgagccctcaatagtttgaatgacaaggcattctagggcatgagccctcaacagtttgaa 23965  T
Q  257 tgatta-acattccagggcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccagggcatg 316  Q
    |||  |  ||||| ||||||| ||||||||| || |||||||| ||| ||||||||||||||    
T  23966 tgacaaggcattctagggcataagccctcaatagtttgaatgataaa-cattccagggcatg 24026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #5
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 212 - 324
Target Start/End: Original strand, 35577 - 35691
Alignment:
Q  212 tttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatga-ttaacattc-cagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattcca 309  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| |  ||| || | ||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  35577 tttgaatgacaaggcattccagggcgtaagccctcaccaattggataaattagcattcacagggcatgagccctcaccaattgaatgacaaggcattcca 35676  T
Q  310 gggcatgagccctca 324  Q
    || ||||||||||||    
T  35677 ggacatgagccctca 35691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #6
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 251 - 331
Target Start/End: Original strand, 20802 - 20884
Alignment:
Q  251 gttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggttt 331  Q
    ||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20802 gttgaatgactaagcatttcggggcatgagccctcaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacagttt 20884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #7
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 251 - 331
Target Start/End: Original strand, 23880 - 23962
Alignment:
Q  251 gttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggttt 331  Q
    ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  23880 gttgaatgactaagcattctagggcatgagccctcaatagtttgaatgacaaggcattctagggcatgagccctcaacagttt 23962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #8
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 264 - 325
Target Start/End: Original strand, 23934 - 23996
Alignment:
Q  264 cattccagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaa 325  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| |||||||||    
T  23934 cattctagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattctagggcataagccctcaa 23996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #9
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 234 - 324
Target Start/End: Original strand, 24771 - 24863
Alignment:
Q  234 ggcataagccctcaacggttgaatga-ttaacattc-cagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctca 324  Q
    ||||| |||| ||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||  |||| || ||||||||||||||||||||    
T  24771 ggcatgagccgtcaccgattgaatgaattagcattcacagggcatgagccctcaccaattgaacaacaaggcgttccagggcatgagccctca 24863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 79; Significance: 1e-36; HSPs: 3)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 264 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 134326 - 134142
Alignment:
Q  264 cattccagggcatgagccctcaac-agttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactcaacttgtgtata 362  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||    ||||    
T  134326 cattccagggcatgagccctcaacgatttgaatgacatagcattccagggcatgagccctcaaccgtgtcttaatcatg-aaggactcaact----tata 134232  T
Q  363 tcagcatacaactcaactacgacagcaacaacataggcaacgacaacgatcgtgcataataac--tcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacc 460  Q
    ||||||||||||||||||||               |||||||||||||| |||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  134231 tcagcatacaactcaactac---------------ggcaacgacaacgaccgtgcacaataactatgactcactccccaacttggtcaacatcaacaacc 134147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 172 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 134380 - 134263
Alignment:
Q  172 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacg-gttgaatga-ttaacattcc 269  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||  || ||||||    
T  134380 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacgatttgaatgacatagcattcc 134281  T
Q  270 agggcatgagccctcaac 287  Q
    ||||||||||||||||||    
T  134280 agggcatgagccctcaac 134263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 250 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 134381 - 134302
Alignment:
Q  250 ggttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacg 327  Q
    |||||||||| ||| |||||| |||||| ||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  134381 ggttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacg 134302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 78; Significance: 4e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 172 - 331
Target Start/End: Original strand, 2777 - 2936
Alignment:
Q  172 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-ggttgaatgatta-acattcc 269  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  |  ||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||  | |||||||    
T  2777 gttgaatgactaagcattccgcggcataagcccctaacaatttgaatgatga-tcattccagggcatgagccctcaacagattgaatgacaagacattcc 2875  T
Q  270 agggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggttt 331  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2876 agggcataagccctcaacagttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacggttt 2936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0825 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0825
Description:

Target: scaffold0825; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 187 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 1945 - 1719
Alignment:
Q  187 attccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaa 286  Q
    ||||| |||||| ||||  ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  1945 attccagggcatgagccatcaacagtttgaatgacaaggcattccagggcatcagtcctcaacagttgaatgattaacattctagggtatgagccctcaa 1846  T
Q  287 cag-ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaaggactcaac-ttgtgtatatcagcatacaactcaactacga 384  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||  |||| |||||||||| ||||   | |    || ||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| |||| |    
T  1845 cagtttgaatgacaaggcattccaacgcataagccctcaacagtttataagtagacaatggacttaactttgtgtatatcaacatacaactcagctacaa 1746  T
Q  385 cagcaacaacataggcaacgacaacga 411  Q
    || | ||||| ||| ||||||||||||    
T  1745 caacgacaacctagacaacgacaacga 1719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0825; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 158 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 2013 - 1840
Alignment:
Q  158 accatttccatcgtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-ggttgaa 256  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||| |||| ||||| | |||||    
T  2013 accattttcaacgtgttgaatgactaagcattccggggtgtaagcccccaacaatttgaatgataa-atattccagggcatgagccatcaacagtttgaa 1915  T
Q  257 tgatta-acattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggttt 331  Q
    |||  |  ||||||||||||| || |||||||||||||||||  || ||||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  1914 tgacaaggcattccagggcatcagtcctcaacagttgaatgattaa-cattctagggtatgagccctcaacagttt 1840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 158 - 331
Target Start/End: Original strand, 10554 - 10728
Alignment:
Q  158 accatttccatcgtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaa-cggttgaa 256  Q
    ||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||  | |||||    
T  10554 accattttcaacgtgttgaatgagtaagcattccggggcataagcccccaataatttgaatgataa-acattccagggcatgagccctcaatagtttgaa 10652  T
Q  257 tgatta-acattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggttt 331  Q
    |||  |  ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  | |||| ||||||| |||||||||| ||||    
T  10653 tgacaaggcattccagggcataagccctcaatagttgaatgacagggtattctagggcataagccctcaacagttt 10728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0447
Description:

Target: scaffold0447; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 158 - 331
Target Start/End: Original strand, 13898 - 14073
Alignment:
Q  158 accatttccatcgtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaat 257  Q
    ||||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| || | |||||| ||||| |||||||||| |||||||    
T  13898 accattttcaacatgttgaatgactaagcatttcggggcataag-ccccaacaatttgaatgataa-atattccagggcatgagccctcaacagttgaat 13995  T
Q  258 gatta-acattccagggcatgagccctcaacag-ttgaat-gacaaagcattc-cagggcatgagccctcaacggttt 331  Q
    ||  |  ||||||| |||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13996 gacaatgcattccaaggcatgagccctcaacagtttgaatagttaaagcattcacagggcatgagccctcaacggttt 14073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 6)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 173 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 9112 - 8961
Alignment:
Q  173 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-ggttgaatgattaacattccag 271  Q
    |||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||| ||||||||||   ||||||||||  ||||||||    
T  9112 ttgaatgactgagctttccggggcttaagcccccaacaatttgaatgatga-acattccagggcatgagccctcaacattttgaatgattttcattccag 9014  T
Q  272 ggcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctca 324  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  9013 ggcatgagccctcaacagattgaatga-aaggcattccagggcataagccctca 8961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 185 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 8983 - 8841
Alignment:
Q  185 gcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt-gaatgattaa-cattccagggcatgagccc 282  Q
    ||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || ||||| |||||||| || || ||| ||  |  | ||||||||||| |||||    
T  8983 gcattccagggcataagccctcaccaatttgaatgacaaagcatttcagggcatgagccctcaccgctttgaacgacaaggcgttccagggcataagccc 8884  T
Q  283 tcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctca 324  Q
    ||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8883 tcaccaatttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctca 8841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 226 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 9021 - 8921
Alignment:
Q  226 cattccaaggcataagccctcaacgg-ttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctc 323  Q
    ||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||    ||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9021 cattccagggcatgagccctcaacagattgaatgaaaggcattccagggcataagccctcaccaatttgaatgacaaagcatttcagggcatgagccctc 8922  T
Q  324 a 324  Q
    |    
T  8921 a 8921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395; HSP #4
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 400 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 8739 - 8672
Alignment:
Q  400 caacgacaacgatcgtgcataataactc--actcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 465  Q
    |||||||||| |  |||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8739 caacgacaacaactgtgcataataactatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 8672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395; HSP #5
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 354 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 8770 - 8729
Alignment:
Q  354 ttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacagcaacaaca 395  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  8770 ttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacaacgacaaca 8729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395; HSP #6
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 10101 - 10060
Alignment:
Q  290 ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggttt 331  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  10101 ttgaatgacaaggcattccagggcatgagcccccaacagttt 10060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 158 - 331
Target Start/End: Original strand, 11893 - 12068
Alignment:
Q  158 accatttccatcgtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaat 257  Q
    ||||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| || | |||||| ||||| |||||||||| |||||||    
T  11893 accattttcaacatgttgaatgactaagcatttcggggcataag-ccccaacaatttgaatgataa-atattccagggcatgagccctcaacagttgaat 11990  T
Q  258 gatta-acattccagggcatgagccctcaacag-ttgaat-gacaaagcattc-cagggcatgagccctcaacggttt 331  Q
    ||  |  ||||||| |||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11991 gacaatgcattccaaggcatgagccctcaacagtttgaatagttaaagcattcacagggcatgagccctcaacggttt 12068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 156 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 223759 - 223630
Alignment:
Q  156 gcaccatttccatcgtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttga 255  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| ||||||||  ||||    
T  223759 gcaccattttcaacgtgttgaatgactaagcattctgggacacaagcccccaacaatttgaatgataa-acattccatggcataacccctcaacaattga 223661  T
Q  256 atgattaa-cattccagggcatgagccctca 285  Q
    ||||  || ||||||||||||||||||||||    
T  223660 atgacaaagcattccagggcatgagccctca 223630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 252 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 223702 - 223630
Alignment:
Q  252 ttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctca 324  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  223702 ttgaatgataaacattccatggcataacccctcaacaattgaatgacaaagcattccagggcatgagccctca 223630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491 (Bit Score: 66; Significance: 5e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0491
Description:

Target: scaffold0491; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 251 - 331
Target Start/End: Original strand, 10466 - 10547
Alignment:
Q  251 gttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggttt 331  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10466 gttgaatgactaagcattccggggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggttt 10547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 172 - 253
Target Start/End: Original strand, 10466 - 10546
Alignment:
Q  172 gttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  10466 gttgaatgactaagcattccggggcatgagccctcaac-agttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtt 10546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0635 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 3)
Name: scaffold0635
Description:

Target: scaffold0635; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 158 - 285
Target Start/End: Original strand, 6709 - 6836
Alignment:
Q  158 accatttccatcgtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaat 257  Q
    ||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  ||||| |||||||||| |||||||    
T  6709 accattttcaacgtgatgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgataa-acattcctgggcatgagccctcaacagttgaat 6807  T
Q  258 gatta-acattccagggcatgagccctca 285  Q
    ||  |  ||||||||||||| ||||||||    
T  6808 gacaaggcattccagggcataagccctca 6836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0635; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 252 - 324
Target Start/End: Original strand, 6764 - 6836
Alignment:
Q  252 ttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctca 324  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  6764 ttgaatgataaacattcctgggcatgagccctcaacagttgaatgacaaggcattccagggcataagccctca 6836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0635; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 173 - 324
Target Start/End: Original strand, 6764 - 6918
Alignment:
Q  173 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacgg--ttgaatgattaa--cattc 268  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||| ||||| ||||| || |||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||   ||||||| ||||  |||||    
T  6764 ttgaatga-taaacattcctgggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaggcattccagggcataagccctcaccgaatttgaatggttaaagcattc 6861  T
Q  269 -cagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctca 324  Q
     |||||||| |||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  6862 acagggcataagccctcaccaattgaacgacaaggcgttccagggcatgagccctca 6918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 3)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 193 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 165714 - 165629
Alignment:
Q  193 gggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgattaacattccagggcatga 278  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  165714 gggcatgagccctcaacagtttgaatgacaatgcattccagggcataagccctcaacagttgaatgattaacattccagggcatga 165629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 271 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 165714 - 165658
Alignment:
Q  271 gggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 326  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  165714 gggcatgagccctcaacagtttgaatgacaatgcattccagggcataagccctcaac 165658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 264 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 165681 - 165629
Alignment:
Q  264 cattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatga 317  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||    
T  165681 cattccagggcataagccctcaacagttgaatgattaa-cattccagggcatga 165629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 156 - 331
Target Start/End: Original strand, 9546 - 9739
Alignment:
Q  156 gcaccatttccatcgtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaat----------------gacaagacattccaaggcata 239  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||                |||||  ||| | | |||||     
T  9546 gcaccatttccaatgtgttgaatgactaggcattctggggcataagcccccaacaatttgaattcgtcaacagttgaatgacaaagcatacaagggcatg 9645  T
Q  240 agccctcaacggtt-gaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggttt 331  Q
    |||||||||||||| ||||||  |  |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  9646 agccctcaacggtttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaacggtttaatgacaaagcattccagggcatgagccgtcaacagttt 9739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1276 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold1276
Description:

Target: scaffold1276; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 169 - 249
Target Start/End: Original strand, 128 - 207
Alignment:
Q  169 cgtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||| ||||||||||    
T  128 cgtgttgaatgactaagcattccggggcatgagcccccaacaatttgaatgatga-acattccagggcatgagccctcaac 207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1276; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 251 - 407
Target Start/End: Original strand, 131 - 289
Alignment:
Q  251 gttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatg-aaagga 347  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||||||||||| ||||| || ||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||||  |||  ||| || |||    
T  131 gttgaatgactaagcattccggggcatgagcccccaacaatttgaatgatgaa-cattccagggcatgagccctcaacagttt-ataagtatgcaatgga 228  T
Q  348 ctcaac-ttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacagcaacaacataggcaacgaca 407  Q
    |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||| | ||||||| | ||||||||    
T  229 ctcaactttgtgtatatcaacataaaactcaactacaacaacgacaacatggacaacgaca 289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1098 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 4)
Name: scaffold1098
Description:

Target: scaffold1098; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 158 - 316
Target Start/End: Original strand, 1050 - 1210
Alignment:
Q  158 accatttccatcgtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-ggttgaa 256  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| ||| | ||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||| | |||||    
T  1050 accattttcaacgtgttgaatgactaagcattctagggcatgagccctcaaaagtttgaatgacaaggcattctagggcatgagccctcaacagtttgaa 1149  T
Q  257 tgatta-acattccagggcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcattccagggcatg 316  Q
    |||  |  ||||| ||||||| ||||||||| || |||||||| ||| ||||||||||||||    
T  1150 tgacaaggcattctagggcataagccctcaatagtttgaatgataaa-cattccagggcatg 1210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1098; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 251 - 331
Target Start/End: Original strand, 1064 - 1146
Alignment:
Q  251 gttgaatgattaa-cattccagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggttt 331  Q
    ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  1064 gttgaatgactaagcattctagggcatgagccctcaaaagtttgaatgacaaggcattctagggcatgagccctcaacagttt 1146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1098; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 264 - 325
Target Start/End: Original strand, 1118 - 1180
Alignment:
Q  264 cattccagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaa 325  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| |||||||||    
T  1118 cattctagggcatgagccctcaacagtttgaatgacaaggcattctagggcataagccctcaa 1180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1098; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 234 - 324
Target Start/End: Original strand, 1955 - 2047
Alignment:
Q  234 ggcataagccctcaacggttgaatga-ttaacattc-cagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctca 324  Q
    ||||| |||| ||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||  |||| || ||||||||||||||||||||    
T  1955 ggcatgagccgtcaccgattgaatgaattagcattcacagggcatgagccctcaccaattgaacaacaaggcgttccagggcatgagccctca 2047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0069
Description:

Target: scaffold0069; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 212 - 382
Target Start/End: Original strand, 34475 - 34649
Alignment:
Q  212 tttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggtt-gaatgattaa--cattc-cagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattc 307  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||| ||||  || || |||||||| ||||||||||| || |||||||| |  |||    
T  34475 tttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttgaatggttaaagcagtcacagggcataagccctcaacaattaaatgacaaggtgttc 34574  T
Q  308 cagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatg-aaaggactcaacttgtgtatatcagcatacaactcaactac 382  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  | || ||| || | |||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  34575 cagggcatgagccctcaacagttt-atgattatgcaatgaactccacttgtgtatatcaacatacaattcaactac 34649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 269 - 382
Target Start/End: Original strand, 29298 - 29411
Alignment:
Q  269 cagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatg-aaaggactcaacttgtgtatatcagc 367  Q
    |||||||| | ||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||  | || ||| || | |||| |||||||||||||| |    
T  29298 cagggcataacccctcaacaattgaacgacaaggcgttccagggcatgagccctcaacagttt-atgattatgcaatgaactccacttgtgtatatcaac 29396  T
Q  368 atacaactcaactac 382  Q
    |||||||||||||||    
T  29397 atacaactcaactac 29411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0364 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0364
Description:

Target: scaffold0364; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 193 - 326
Target Start/End: Original strand, 7048 - 7186
Alignment:
Q  193 gggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattc-caaggcataagccctcaacggtt-gaatgattaa-cattc-cagggcatgagccctcaaca 288  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||| | |   ||||| || ||||| ||||||||||  || |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  7048 gggcataagccctcaacaatttaaataaaatagcattcacagggcatgagccctcaacaatttgaatgattaagcattcacagggcatgagccctcaaca 7147  T
Q  289 gttgaatgacaaagcattc-cagggcatgagccctcaac 326  Q
    |||||| ||||| |||||| |||||||| ||||||||||    
T  7148 gttgaacgacaaggcattcacagggcataagccctcaac 7186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 270 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 2869 - 2812
Alignment:
Q  270 agggcatgagccctcaacagttg-aatgacaaagcattccagggcatgagccctcaac 326  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  2869 agggcatgagccctcaacagttggaatgattaagcattccagggcatgagccctcaac 2812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 234 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 2867 - 2811
Alignment:
Q  234 ggcataagccctcaacggttg-aatgattaa-cattccagggcatgagccctcaaca 288  Q
    ||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2867 ggcatgagccctcaacagttggaatgattaagcattccagggcatgagccctcaaca 2811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 3)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 158 - 219
Target Start/End: Original strand, 120021 - 120082
Alignment:
Q  158 accatttccatcgtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatg 219  Q
    ||||||| || |||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  120021 accattttcaacgtgttgaatgactgagcattctggggcatgagcccccaacaatttgaatg 120082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 269 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 183116 - 183052
Alignment:
Q  269 cagggcatgagccctcaacagttg-aatgacaaagcattcc-agggcatgagccctcaacggttt 331  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  183116 cagggcatgagccctcaacagttggaatgattaagcattcccagggcatgagccctcaacggttt 183052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 174952 - 174911
Alignment:
Q  213 ttgaatgacaagacattc-caaggcataagccctcaacggtt 253  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  174952 ttgaatgacaaggcattcacaaggcataagccctcaacggtt 174911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 173 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 21926 - 21715
Alignment:
Q  173 ttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaaga-cattc-caaggcataagccctcaacggtt-gaatgat-taacattc 268  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||   | | ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||  || ||||     
T  21926 ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttgaatggttaaagcattcacagggcatgagccctcaacggtttgaatgaactagcatta 21827  T
Q  269 -cagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatg-aaaggactcaacttgtgtatatcag 366  Q
     |||||||| ||||||||||  || || ||||| || |||||||||||||||||||||  ||||  | || ||| || |||||| ||||||||||||||     
T  21826 acagggcataagccctcaacgattaaacgacaaggcgttccagggcatgagccctcaatagttt-atgattatgcaatggactccacttgtgtatatcaa 21728  T
Q  367 catacaactcaac 379  Q
    |||||||||||||    
T  21727 catacaactcaac 21715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 212 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 21927 - 21806
Alignment:
Q  212 tttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaac-ggttgaatgattaa--cattc-cagggcatgagccctcaacag-ttgaatgacaaagcatt 306  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||| | ||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||   ||||||    
T  21927 tttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacagtttgaatggttaaagcattcacagggcatgagccctcaacggtttgaatgaactagcatt 21828  T
Q  307 -ccagggcatgagccctcaacg 327  Q
      |||||||| |||||||||||    
T  21827 aacagggcataagccctcaacg 21806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0216
Description:

Target: scaffold0216; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 272 - 323
Target Start/End: Original strand, 21271 - 21322
Alignment:
Q  272 ggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctc 323  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  21271 ggcataagccctcaacagttgaatgaaaaagcattctagggcatgagccctc 21322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 156 - 324
Target Start/End: Original strand, 21233 - 21404
Alignment:
Q  156 gcaccatttccatcgtgttgaatgactaagcattccggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacgg--tt 253  Q
    |||||||||  | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||| ||  ||||| | ||||| |||||||  |||  ||    
T  21233 gcaccatttttaacgtgttgaataactaagcattccgaggcataagccctcaacagtt-gaatgaaaaagcattctagggcatgagccctcc-cggattt 21330  T
Q  254 gaatgattaa--cattcc-agggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctca 324  Q
    ||| | ||||  |||||  | ||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21331 gaaaggttaaagcattcatacggcataagccctcaccaattgaacgacaaggcattccagggcatgagccctca 21404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 266 - 395
Target Start/End: Original strand, 4843 - 4972
Alignment:
Q  266 ttccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatga-aaggactcaacttgtgtatatc 364  Q
    ||||||||||||||||||||    ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| || |||  ||   |||| | ||||||||||||||||||||    
T  4843 ttccagggcatgagccctcacgctttgaacgacaaggcgttccagggcatgagccctcaccgcttt-atatatatgacatggactcaacttgtgtatatc 4941  T
Q  365 agcatacaactcaactacgacagcaacaaca 395  Q
      ||||||||||||| || ||| ||||||||    
T  4942 tacatacaactcaacaacaacaacaacaaca 4972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 212 - 324
Target Start/End: Original strand, 177909 - 178026
Alignment:
Q  212 tttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacg-gttgaatgattaa--cattc-cagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattc 307  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||  ||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||   |||||||    
T  177909 tttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctcaccgatttgaatggttaaagcattcacagggcatgagccctcaccaattgaatgaactagcattc 178008  T
Q  308 -cagggcatgagccctca 324  Q
     |||||||||||||||||    
T  178009 acagggcatgagccctca 178026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 269 - 319
Target Start/End: Original strand, 178010 - 178060
Alignment:
Q  269 cagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagc 319  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  178010 cagggcatgagccctcaccaattgaacgacaaggcgttccagggcatgagc 178060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2046 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold2046
Description:

Target: scaffold2046; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 173 - 253
Target Start/End: Original strand, 91 - 174
Alignment:
Q  173 ttgaatgactaagcattc-cggggcataagcccccaacaattt-gaatgacaagacattc-caaggcataagccctcaacggtt 253  Q
    |||||| | ||||||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  91 ttgaataattaagcattcacagggcataagccctcaacaattttgaatgacaaggcattcacagggcataagccctcaacggtt 174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2046; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 193 - 379
Target Start/End: Original strand, 30 - 224
Alignment:
Q  193 gggcataagcccccaacaatttgaatga-caagacattc-caaggcataagccctcaacggtt-gaatgattaa-cattc-cagggcatgagccctcaac 287  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||| || ||||| ||||||||||  || |||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  30 gggcataagccctcaacaatttgaatgaactagt-attcacagggcatgagccctcaacaatttgaataattaagcattcacagggcataagccctcaac 128  T
Q  288 agtt--gaatgacaaagcattc-cagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatg-aaaggactcaact-tgtgtatatcagcatacaactcaac 379  Q
    | ||  ||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||  | |  ||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  129 aattttgaatgacaaggcattcacagggcataagccctcaacggttt-ttgagtatgcaatggactcaactctgtgtatatcaacatacaactcaac 224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 193 - 396
Target Start/End: Original strand, 33625 - 33834
Alignment:
Q  193 gggcataagcccccaacaatttgaatga-caagacattc-caaggcataagccctcaacggttgaatgattaac-attc-cagggcatgagccctcaaca 288  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||| | || ||||| || ||||| |||||||||| ||||||| |||||  |||| || |||||||||||||||||    
T  33625 gggcatgagccctcaacaatttgaatgaactag-cattcacagggcatgagccctcaacagttgaataattaagtattcacatggcatgagccctcaaca 33723  T
Q  289 gtt-gaatgacaaagcattc-cagggcatgagccctcaacggtttcctaatcatgaaa-ggactcaactt-gtgtatatcagcatacaactcaactacga 384  Q
    ||| ||||||| |||||||| ||| |||| |||||| |||  |||   | | ||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |    
T  33724 gtttgaatgactaagcattcacagtgcataagccctaaacaatttatgagt-atgcaatggactcaactttgtgtatatcaacatacaactcaactacaa 33822  T
Q  385 cagcaacaacat 396  Q
    || | |||||||    
T  33823 caacgacaacat 33834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1336 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1336
Description:

Target: scaffold1336; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 958 - 848
Alignment:
Q  212 tttgaatgacaagacattccaaggcataagccctcaacggttgaatgat-taacattc-cagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattcca 309  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||| |  ||||||||  || ||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||| || |||||    
T  958 tttgaatgacaaggcattccagggcatgagtcctcaccaattgaatgaactaccattcacagggcatgagccctcaccaattgaacgacaaggcgttcca 859  T
Q  310 gggcatgagcc 320  Q
     ||||||||||    
T  858 aggcatgagcc 848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 173 - 245
Target Start/End: Original strand, 20744 - 20818
Alignment:
Q  173 ttgaatgactaagcattc-cggggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattc-caaggcataagccct 245  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||| ||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  20744 ttgaatgattaagcattcacagggcatgagccctcaacaatttgaatgacgaggcattcacaaggcataagccct 20818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 432 - 465
Target Start/End: Original strand, 162359 - 162392
Alignment:
Q  432 actccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  162359 actccccaacttggtcaacatcaacaacctatga 162392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0371 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0371
Description:

Target: scaffold0371; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 234 - 331
Target Start/End: Original strand, 5316 - 5416
Alignment:
Q  234 ggcataagccctcaacggttgaatgat-taacattc-cagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattc-cagggcatgagccctcaacggtt 330  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||| || |||||||||||| ||| |||    
T  5316 ggcatgagccctcaacaattgaatgatctagcattcacagggcatgagccctcaacagttgaataattaagtattcacaaggcatgagccctaaacagtt 5415  T
Q  331 t 331  Q
    |    
T  5416 t 5416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0371; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 7260 - 7227
Alignment:
Q  290 ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctc 323  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7260 ttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctc 7227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 264 - 324
Target Start/End: Original strand, 19374 - 19434
Alignment:
Q  264 cattccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctca 324  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| || |||  |||||||||||||||    
T  19374 cattccagggcatgagccctcaccaattgaacgacaaggcgttcttgggcatgagccctca 19434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 234 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 28159 - 28059
Alignment:
Q  234 ggcataagccctcaacggttgaatgat-taacattc-cagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattc-cagggcatgagccctcaacggtt 330  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||| || |||||||||||| ||| |||    
T  28159 ggcatgagccctcaacaattgaatgatctagcattcacagggcatgagccctcaacagttgaataattaagtattcacaaggcatgagccctaaacagtt 28060  T
Q  331 t 331  Q
    |    
T  28059 t 28059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0273
Description:

Target: scaffold0273; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 193 - 328
Target Start/End: Original strand, 6554 - 6696
Alignment:
Q  193 gggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattc-caaggcataagccctcaac-ggttgaatgattaa-cattc-cagggcatgagccctcaaca 288  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||    |||||| || ||||| ||||||||||   |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  6554 gggcataagccctcaacaatttgaatgaactaacattcacagggcatgagccctcaacaatttgaatgattaagcattcacagggcataagccctcaaca 6653  T
Q  289 --gttgaatgacaaagcattc-cagggcatgagccctcaacgg 328  Q
       ||||||||||| |||||| | |||||| |||||| |||||    
T  6654 attttgaatgacaaggcattcacggggcataagcccttaacgg 6696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 269 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 29420 - 29361
Alignment:
Q  269 cagggcatgagccctcaac-agttgaatgacaaagcattc-cagggcatgagccctcaac 326  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||    
T  29420 cagggcatgagccctcaacaatttgaatgattaagcattcacagggcatgagccctcaac 29361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 173 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 29398 - 29346
Alignment:
Q  173 ttgaatgactaagcattc-cggggcataagcccccaacaatttgaatgacaag 224  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  29398 ttgaatgattaagcattcacagggcatgagccctcaacaatttgaatgacaag 29346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0865 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0865
Description:

Target: scaffold0865; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 290 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 64 - 30
Alignment:
Q  290 ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctca 324  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  64 ttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctca 30  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0859 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0859
Description:

Target: scaffold0859; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 269 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 245 - 187
Alignment:
Q  269 cagggcatgagccctcaac-agttgaatgacaaagcattc-cagggcatgagccctcaa 325  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  245 cagggcatgagccctcaacaatttgaatgattaagcattcacagggcatgagccctcaa 187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0575 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0575
Description:

Target: scaffold0575; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 270 - 324
Target Start/End: Original strand, 8674 - 8728
Alignment:
Q  270 agggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctca 324  Q
    |||||||||||||| | || ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||    
T  8674 agggcatgagccctgaccaattgaatgacaaggtgttccagggcatgagccctca 8728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 345 - 395
Target Start/End: Original strand, 6004 - 6054
Alignment:
Q  345 ggactcaacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacagcaacaaca 395  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||| ||||||||    
T  6004 ggactcaacttgtgtatatctacatacaactcaacaacaacaacaacaaca 6054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 345 - 395
Target Start/End: Original strand, 8156 - 8206
Alignment:
Q  345 ggactcaacttgtgtatatcagcatacaactcaactacgacagcaacaaca 395  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||| ||||||||    
T  8156 ggactcaacttgtgtatatctacatacaactcaacaacaacaacaacaaca 8206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 269 - 323
Target Start/End: Original strand, 20876 - 20930
Alignment:
Q  269 cagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctc 323  Q
    |||||||| |||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||||||||    
T  20876 cagggcataagccctcaccaattgaacgacaaggcgttccagggcatgagccctc 20930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 290 - 324
Target Start/End: Original strand, 17866 - 17900
Alignment:
Q  290 ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctca 324  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17866 ttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctca 17900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 290 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 27077 - 27043
Alignment:
Q  290 ttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctca 324  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27077 ttgaatgacaaggcattccagggcatgagccctca 27043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 193 - 247
Target Start/End: Original strand, 524714 - 524768
Alignment:
Q  193 gggcataagcccccaacaatttgaatgacaagacattccaaggcataagccctca 247  Q
    |||||||||||| || ||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||||||||    
T  524714 gggcataagccctcaccaatttgaacgacaaggcattccagggcatgagccctca 524768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 269 - 324
Target Start/End: Original strand, 524712 - 524768
Alignment:
Q  269 cagggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattccagggcatgagccctca 324  Q
    |||||||| |||||||| || || ||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  524712 cagggcataagccctcaccaatttgaacgacaaggcattccagggcatgagccctca 524768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0388 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0388
Description:

Target: scaffold0388; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 234 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 16171 - 16074
Alignment:
Q  234 ggcataagccctcaacggttg-aatgattaa-cattcc-agggcatgagccctcaacagtt-gaatgacaaagcattc-cagggcatgagccctcaac 326  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| | | |||||||||||||||||| ||| ||||  || ||| |||||||||||||||||||    
T  16171 ggcataagccctcaacagttggaatgattaagcattcccacgacatgagccctcaacagtttgaacgacagggcgttcacagggcatgagccctcaac 16074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0244
Description:

Target: scaffold0244; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 266 - 323
Target Start/End: Original strand, 13698 - 13755
Alignment:
Q  266 ttccagggcatgagccctcaacagttgaatgacaaagcattccagggcatgagccctc 323  Q
    |||||||||||||||||||     ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13698 ttccagggcatgagccctcccgctttgaacgacaaggcattccagggcatgagccctc 13755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0071 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0071
Description:

Target: scaffold0071; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 252 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 15768 - 15731
Alignment:
Q  252 ttgaatgattaacattccagggcatgagccctcaacag 289  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  15768 ttgaatgatgatcattccagggcatgagccctcaacag 15731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 1217 times since January 2019
Visitors: 4365