View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0726_low_6 (Length: 434)

Name: NF0726_low_6
Description: NF0726
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0726_low_6
NF0726_low_6
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (13-432)||(4825-5241)
[»] chr7 (230 HSPs)
chr7 (13-429)||(8933099-8933511)
chr7 (5-431)||(38403554-38403979)
chr7 (13-432)||(18440727-18441144)
chr7 (13-429)||(12734516-12734929)
chr7 (13-429)||(26209900-26210313)
chr7 (13-429)||(29589523-29589941)
chr7 (13-432)||(13681853-13682268)
chr7 (13-404)||(18418674-18419063)
chr7 (13-428)||(3476692-3477104)
chr7 (13-432)||(48381718-48382138)
chr7 (13-428)||(15215852-15216265)
chr7 (3-431)||(40055094-40055520)
chr7 (5-432)||(3165266-3165691)
chr7 (5-413)||(1367182-1367586)
chr7 (5-413)||(15888672-15889076)
chr7 (5-413)||(30049072-30049476)
chr7 (1-432)||(20490538-20490967)
chr7 (3-409)||(21770284-21770686)
chr7 (5-413)||(588765-589169)
chr7 (3-413)||(9169738-9170144)
chr7 (3-413)||(9159283-9159689)
chr7 (5-432)||(9432795-9433219)
chr7 (7-432)||(22099269-22099691)
chr7 (7-432)||(26653672-26654094)
chr7 (7-432)||(26700001-26700423)
chr7 (8-431)||(31116857-31117277)
chr7 (3-413)||(21003351-21003756)
chr7 (3-432)||(20989184-20989610)
chr7 (7-432)||(22088654-22089076)
chr7 (7-413)||(24930950-24931352)
chr7 (7-432)||(37343731-37344153)
chr7 (7-432)||(40042455-40042879)
chr7 (7-432)||(40053004-40053428)
chr7 (7-432)||(48710838-48711260)
chr7 (5-432)||(9443391-9443815)
chr7 (3-432)||(14746011-14746439)
chr7 (7-432)||(2705959-2706383)
chr7 (3-432)||(5685050-5685476)
chr7 (7-432)||(9084815-9085237)
chr7 (7-432)||(9094529-9094951)
chr7 (7-432)||(17961071-17961495)
chr7 (7-413)||(6867572-6867973)
chr7 (7-413)||(6878204-6878605)
chr7 (5-432)||(11004715-11005140)
chr7 (7-432)||(26294376-26294799)
chr7 (7-432)||(4222138-4222561)
chr7 (7-432)||(8002412-8002835)
chr7 (7-432)||(8013057-8013480)
chr7 (7-432)||(17950465-17950889)
chr7 (7-411)||(24734305-24734706)
chr7 (7-411)||(24744252-24744653)
chr7 (7-432)||(26390443-26390867)
chr7 (7-432)||(26401085-26401509)
chr7 (7-432)||(8616916-8617339)
chr7 (6-432)||(1987070-1987494)
chr7 (6-432)||(1997691-1998115)
chr7 (6-432)||(42865357-42865781)
chr7 (6-432)||(42875983-42876407)
chr7 (7-432)||(467928-468350)
chr7 (7-432)||(8627478-8627902)
chr7 (7-432)||(2716563-2716987)
chr7 (153-432)||(17064021-17064297)
chr7 (46-424)||(8999322-8999705)
chr7 (5-432)||(166426-166837)
chr7 (5-432)||(177018-177429)
chr7 (215-432)||(24882945-24883162)
chr7 (5-247)||(44280209-44280451)
chr7 (43-428)||(11087427-11087818)
chr7 (7-278)||(455146-455415)
chr7 (3-247)||(38594053-38594298)
chr7 (70-422)||(13175015-13175373)
chr7 (7-272)||(11095744-11096008)
chr7 (7-247)||(540798-541038)
chr7 (7-247)||(4211724-4211962)
chr7 (217-431)||(38594238-38594449)
chr7 (70-428)||(4432991-4433356)
chr7 (215-432)||(44280055-44280271)
chr7 (114-428)||(4412466-4412784)
chr7 (215-432)||(4211569-4211785)
chr7 (218-432)||(540644-540857)
chr7 (33-247)||(24882792-24883007)
chr7 (339-432)||(6044957-6045050)
chr7 (281-431)||(25212471-25212617)
chr7 (299-432)||(19986159-19986289)
chr7 (3-85)||(9170863-9170945)
chr7 (301-432)||(20967200-20967328)
chr7 (286-432)||(457618-457761)
chr7 (44-394)||(602139-602493)
chr7 (303-432)||(11015335-11015463)
chr7 (333-409)||(1878942-1879018)
chr7 (333-402)||(11572881-11572950)
chr7 (339-416)||(12223124-12223201)
chr7 (346-432)||(23643198-23643286)
chr7 (342-417)||(19711742-19711818)
chr7 (342-407)||(4820848-4820913)
chr7 (115-222)||(19237540-19237648)
chr7 (115-197)||(18362071-18362153)
chr7 (342-395)||(7488634-7488687)
chr7 (342-407)||(13259133-13259198)
chr7 (342-407)||(13266473-13266538)
chr7 (333-406)||(15871759-15871832)
chr7 (344-407)||(13302222-13302285)
chr7 (357-432)||(1251598-1251675)
chr7 (333-403)||(2501667-2501737)
chr7 (338-407)||(11318766-11318836)
chr7 (342-404)||(11792274-11792336)
chr7 (342-413)||(1292445-1292518)
chr7 (360-417)||(9802567-9802624)
chr7 (342-407)||(10883902-10883967)
chr7 (342-407)||(13261346-13261411)
chr7 (346-407)||(13645812-13645873)
chr7 (342-407)||(33604268-33604333)
chr7 (115-279)||(23125435-23125597)
chr7 (342-417)||(23280682-23280757)
chr7 (359-432)||(23303859-23303934)
chr7 (328-407)||(4493936-4494014)
chr7 (328-403)||(14187054-14187128)
chr7 (342-413)||(16105660-16105731)
chr7 (328-407)||(21211262-21211340)
chr7 (329-404)||(29936065-29936138)
chr7 (115-197)||(2501517-2501598)
chr7 (120-257)||(7488414-7488552)
chr7 (115-229)||(13302397-13302514)
chr7 (342-407)||(13879531-13879597)
chr7 (115-229)||(15088085-15088202)
chr7 (341-407)||(16464385-16464451)
chr7 (342-404)||(19237766-19237828)
chr7 (338-404)||(25806794-25806860)
chr7 (342-407)||(44466455-44466521)
chr7 (342-407)||(5001557-5001622)
chr7 (342-413)||(8182314-8182387)
chr7 (115-394)||(12174844-12175121)
chr7 (115-407)||(13731178-13731471)
chr7 (342-403)||(16308440-16308501)
chr7 (342-407)||(16310638-16310703)
chr7 (342-407)||(16317286-16317350)
chr7 (342-403)||(16411374-16411435)
chr7 (115-251)||(25687345-25687481)
chr7 (342-394)||(28623089-28623142)
chr7 (342-407)||(41843155-41843220)
chr7 (329-389)||(14425927-14425986)
chr7 (344-407)||(22579914-22579978)
chr7 (115-413)||(48063316-48063614)
chr7 (115-413)||(331005-331304)
chr7 (344-407)||(12367470-12367533)
chr7 (115-229)||(13027406-13027521)
chr7 (115-197)||(13034342-13034425)
chr7 (344-413)||(15705218-15705289)
chr7 (115-174)||(16472283-16472342)
chr7 (342-404)||(24787725-24787788)
chr7 (342-407)||(2499424-2499490)
chr7 (342-404)||(5034659-5034721)
chr7 (115-288)||(5034866-5035039)
chr7 (342-403)||(13034568-13034630)
chr7 (346-392)||(13902347-13902393)
chr7 (329-407)||(16315258-16315334)
chr7 (115-229)||(16557094-16557211)
chr7 (115-229)||(16608451-16608568)
chr7 (342-407)||(19328741-19328807)
chr7 (345-394)||(19339981-19340031)
chr7 (342-407)||(21284104-21284170)
chr7 (115-229)||(21381933-21382050)
chr7 (115-257)||(22579719-22579863)
chr7 (333-395)||(23125356-23125418)
chr7 (115-229)||(28622863-28622980)
chr7 (345-413)||(32265452-32265522)
chr7 (342-404)||(39285234-39285296)
chr7 (115-187)||(2499617-2499690)
chr7 (366-432)||(12220354-12220422)
chr7 (115-251)||(13172858-13172994)
chr7 (115-187)||(14425036-14425109)
chr7 (115-187)||(14426128-14426200)
chr7 (115-187)||(15467497-15467569)
chr7 (342-394)||(16546065-16546118)
chr7 (342-394)||(16619544-16619597)
chr7 (115-187)||(27871297-27871370)
chr7 (342-394)||(30946088-30946141)
chr7 (342-413)||(33421106-33421179)
chr7 (342-394)||(35954634-35954687)
chr7 (342-394)||(48237570-48237623)
chr7 (339-391)||(10257791-10257843)
chr7 (115-174)||(11318999-11319059)
chr7 (115-197)||(4494146-4494229)
chr7 (115-154)||(4821098-4821137)
chr7 (115-154)||(8182544-8182583)
chr7 (342-388)||(9069140-9069187)
chr7 (115-257)||(9098738-9098881)
chr7 (328-407)||(9098948-9099026)
chr7 (115-257)||(9099544-9099687)
chr7 (328-407)||(9099754-9099832)
chr7 (115-154)||(10883675-10883714)
chr7 (115-154)||(11015575-11015614)
chr7 (115-154)||(13261118-13261157)
chr7 (115-197)||(13473002-13473085)
chr7 (115-154)||(14187304-14187343)
chr7 (115-154)||(15704993-15705032)
chr7 (118-229)||(16112392-16112506)
chr7 (115-154)||(16315043-16315082)
chr7 (115-154)||(19711517-19711556)
chr7 (115-154)||(23280465-23280504)
chr7 (115-154)||(24795219-24795258)
chr7 (115-154)||(29935849-29935888)
chr7 (115-154)||(30945864-30945903)
chr7 (115-154)||(33692206-33692245)
chr7 (115-197)||(41842929-41843012)
chr7 (115-229)||(2914114-2914231)
chr7 (342-407)||(2914341-2914407)
chr7 (205-275)||(9802671-9802741)
chr7 (342-407)||(13138626-13138692)
chr7 (342-403)||(15087916-15087978)
chr7 (349-417)||(21382165-21382235)
chr7 (369-432)||(22499347-22499412)
chr7 (345-417)||(24795447-24795521)
chr7 (345-413)||(27871072-27871142)
chr7 (115-229)||(32265224-32265341)
chr7 (342-394)||(2266243-2266296)
chr7 (342-394)||(9710533-9710586)
chr7 (360-417)||(9762075-9762132)
chr7 (342-394)||(16557318-16557371)
chr7 (342-394)||(16608291-16608344)
chr7 (119-183)||(44466647-44466712)
chr7 (346-394)||(48806613-48806662)
chr7 (371-432)||(1775665-1775728)
chr7 (344-388)||(13173081-13173125)
chr7 (217-257)||(13263322-13263362)
chr7 (115-187)||(13683178-13683250)
chr7 (342-389)||(15467297-15467345)
chr7 (115-163)||(16105470-16105518)
chr7 (342-378)||(21691751-21691787)
chr7 (342-389)||(33692430-33692478)
[»] chr4 (207 HSPs)
chr4 (13-432)||(11514601-11515018)
chr4 (13-432)||(31267068-31267485)
chr4 (3-431)||(5872939-5873363)
chr4 (13-430)||(10300102-10300518)
chr4 (13-428)||(11535415-11535828)
chr4 (1-413)||(10695228-10695635)
chr4 (13-429)||(49002256-49002670)
chr4 (3-410)||(15207654-15208057)
chr4 (13-429)||(55650893-55651306)
chr4 (5-413)||(10908994-10909398)
chr4 (3-414)||(3370299-3370708)
chr4 (5-413)||(16304693-16305097)
chr4 (5-413)||(16316917-16317321)
chr4 (13-432)||(24712993-24713414)
chr4 (3-414)||(3390039-3390448)
chr4 (5-413)||(14836371-14836775)
chr4 (5-432)||(40470856-40471281)
chr4 (5-432)||(40454617-40455043)
chr4 (3-432)||(27815213-27815639)
chr4 (7-432)||(450142-450564)
chr4 (7-432)||(19955234-19955656)
chr4 (7-432)||(48370697-48371119)
chr4 (1-432)||(18752755-18753183)
chr4 (1-432)||(18763365-18763793)
chr4 (7-432)||(4947903-4948325)
chr4 (7-432)||(15561351-15561773)
chr4 (5-432)||(17917617-17918042)
chr4 (5-432)||(17928265-17928690)
chr4 (7-432)||(27656164-27656588)
chr4 (7-432)||(27666737-27667161)
chr4 (3-410)||(19580830-19581234)
chr4 (7-432)||(24028357-24028782)
chr4 (7-432)||(16266025-16266447)
chr4 (7-432)||(25656701-25657124)
chr4 (3-432)||(5022302-5022728)
chr4 (7-432)||(14843925-14844347)
chr4 (7-432)||(19944599-19945021)
chr4 (7-432)||(30926766-30927188)
chr4 (7-432)||(16255432-16255854)
chr4 (7-432)||(18130511-18130936)
chr4 (7-411)||(18078177-18078579)
chr4 (7-432)||(21995979-21996401)
chr4 (7-432)||(22006577-22006999)
chr4 (7-432)||(24639813-24640236)
chr4 (7-432)||(29041928-29042351)
chr4 (7-432)||(30937344-30937766)
chr4 (13-428)||(18774954-18775372)
chr4 (7-432)||(460723-461145)
chr4 (7-432)||(55745524-55745947)
chr4 (7-432)||(49517700-49518123)
chr4 (7-432)||(55756135-55756558)
chr4 (7-432)||(36017901-36018324)
chr4 (7-432)||(36028454-36028877)
chr4 (7-432)||(52703354-52703776)
chr4 (7-432)||(10740866-10741289)
chr4 (7-432)||(10751440-10751863)
chr4 (7-432)||(10954635-10955058)
chr4 (7-432)||(10965209-10965632)
chr4 (13-428)||(19241589-19242008)
chr4 (215-428)||(23508713-23508926)
chr4 (68-428)||(18007415-18007778)
chr4 (215-428)||(16819825-16820038)
chr4 (215-428)||(14711253-14711468)
chr4 (215-428)||(14778917-14779132)
chr4 (1-247)||(47152343-47152589)
chr4 (3-217)||(4987052-4987266)
chr4 (116-375)||(4986790-4987045)
chr4 (202-413)||(25008482-25008689)
chr4 (215-413)||(47152528-47152721)
chr4 (217-417)||(36210587-36210788)
chr4 (253-428)||(18775514-18775689)
chr4 (117-422)||(33377755-33378062)
chr4 (276-432)||(10290191-10290344)
chr4 (237-413)||(19143504-19143677)
chr4 (303-432)||(39532269-39532395)
chr4 (13-247)||(23508864-23509100)
chr4 (13-197)||(8997555-8997741)
chr4 (13-247)||(16819650-16819887)
chr4 (333-428)||(18775925-18776020)
chr4 (113-217)||(39532173-39532277)
chr4 (281-413)||(8183486-8183613)
chr4 (300-409)||(19570607-19570711)
chr4 (238-329)||(8997740-8997830)
chr4 (70-254)||(1671899-1672088)
chr4 (338-432)||(9920972-9921068)
chr4 (338-432)||(28050129-28050225)
chr4 (46-247)||(17994125-17994329)
chr4 (215-292)||(17994267-17994344)
chr4 (347-428)||(17994362-17994442)
chr4 (338-432)||(49509543-49509639)
chr4 (5-247)||(14711068-14711315)
chr4 (338-413)||(17199087-17199162)
chr4 (115-257)||(41115216-41115359)
chr4 (115-257)||(16939536-16939681)
chr4 (351-432)||(3188988-3189071)
chr4 (5-247)||(14778732-14778979)
chr4 (351-432)||(20649445-20649528)
chr4 (115-245)||(17788498-17788629)
chr4 (353-432)||(29030156-29030237)
chr4 (342-413)||(13693201-13693272)
chr4 (115-413)||(14154455-14154753)
chr4 (328-407)||(17788713-17788791)
chr4 (342-407)||(19884093-19884159)
chr4 (44-247)||(36210439-36210647)
chr4 (342-403)||(11900555-11900616)
chr4 (115-251)||(13890345-13890482)
chr4 (342-413)||(16939354-16939427)
chr4 (342-407)||(22089646-22089711)
chr4 (342-407)||(23749884-23749949)
chr4 (342-417)||(36470318-36470395)
chr4 (342-407)||(41115443-41115508)
chr4 (115-318)||(9751999-9752205)
chr4 (342-394)||(19889665-19889717)
chr4 (303-403)||(32491438-32491535)
chr4 (328-404)||(55379673-55379748)
chr4 (344-414)||(11915053-11915124)
chr4 (342-389)||(12600138-12600185)
chr4 (359-417)||(15475850-15475909)
chr4 (115-394)||(16852877-16853155)
chr4 (115-197)||(17539968-17540051)
chr4 (115-251)||(19889443-19889580)
chr4 (344-407)||(20571682-20571745)
chr4 (115-229)||(23750060-23750175)
chr4 (115-411)||(55731203-55731497)
chr4 (328-394)||(15015059-15015124)
chr4 (342-407)||(16631800-16631866)
chr4 (325-394)||(16847921-16847990)
chr4 (333-407)||(17527021-17527095)
chr4 (342-407)||(19665725-19665791)
chr4 (342-407)||(22676207-22676273)
chr4 (342-404)||(29681202-29681264)
chr4 (115-229)||(40860205-40860322)
chr4 (342-407)||(54679288-54679354)
chr4 (70-153)||(1674476-1674563)
chr4 (115-229)||(3105879-3105995)
chr4 (342-413)||(6516841-6516914)
chr4 (342-407)||(14903098-14903163)
chr4 (328-389)||(16476051-16476111)
chr4 (115-251)||(17057573-17057709)
chr4 (342-407)||(18473427-18473492)
chr4 (351-404)||(37986307-37986360)
chr4 (329-389)||(8686117-8686176)
chr4 (121-229)||(23123055-23123166)
chr4 (342-415)||(14190096-14190171)
chr4 (217-275)||(1671908-1671966)
chr4 (342-404)||(3395013-3395075)
chr4 (342-407)||(14605590-14605656)
chr4 (342-407)||(15135089-15135155)
chr4 (115-277)||(18394032-18394193)
chr4 (339-417)||(24619069-24619147)
chr4 (115-229)||(29120900-29121016)
chr4 (351-404)||(2651212-2651265)
chr4 (342-413)||(3106103-3106176)
chr4 (338-403)||(7221910-7221975)
chr4 (329-389)||(8103663-8103723)
chr4 (342-407)||(10661852-10661917)
chr4 (342-407)||(10875997-10876062)
chr4 (115-279)||(13693298-13693459)
chr4 (342-413)||(17399359-17399432)
chr4 (342-407)||(18773455-18773520)
chr4 (342-407)||(19912565-19912630)
chr4 (342-394)||(37436217-37436270)
chr4 (115-279)||(7221997-7222160)
chr4 (115-229)||(12811635-12811751)
chr4 (115-174)||(36470420-36470480)
chr4 (115-229)||(56034107-56034223)
chr4 (115-154)||(3395202-3395241)
chr4 (115-154)||(6517098-6517137)
chr4 (342-389)||(6641063-6641109)
chr4 (115-154)||(8105250-8105289)
chr4 (342-404)||(10072297-10072360)
chr4 (115-154)||(11900803-11900842)
chr4 (115-197)||(11915270-11915353)
chr4 (115-154)||(14605364-14605403)
chr4 (115-229)||(15014845-15014960)
chr4 (342-389)||(16325181-16325228)
chr4 (115-154)||(17399134-17399173)
chr4 (115-154)||(17701215-17701254)
chr4 (115-154)||(19884314-19884353)
chr4 (115-154)||(21350659-21350698)
chr4 (115-154)||(29681005-29681044)
chr4 (115-154)||(37986070-37986109)
chr4 (115-154)||(38513490-38513529)
chr4 (115-154)||(54679540-54679579)
chr4 (115-154)||(55379922-55379961)
chr4 (114-280)||(3500111-3500280)
chr4 (115-279)||(14902906-14903072)
chr4 (115-229)||(22190380-22190497)
chr4 (342-392)||(24628585-24628635)
chr4 (346-414)||(27189332-27189402)
chr4 (345-413)||(40860024-40860094)
chr4 (342-407)||(45832747-45832813)
chr4 (115-153)||(45832998-45833036)
chr4 (346-394)||(9752228-9752277)
chr4 (342-394)||(13576800-13576853)
chr4 (342-394)||(17701440-17701493)
chr4 (215-276)||(19889514-19889575)
chr4 (346-394)||(20976831-20976880)
chr4 (115-187)||(39420195-39420268)
chr4 (216-252)||(13890374-13890410)
chr4 (360-415)||(15193150-15193206)
chr4 (347-407)||(18393940-18394000)
chr4 (219-275)||(24619175-24619231)
chr4 (115-174)||(37436000-37436060)
chr4 (342-389)||(39420389-39420437)
chr4 (342-389)||(56033951-56033999)
chr4 (115-166)||(56533520-56533572)
[»] chr8 (176 HSPs)
chr8 (13-432)||(3843081-3843497)
chr8 (13-432)||(22136163-22136583)
chr8 (13-432)||(22167328-22167748)
chr8 (3-413)||(40213464-40213870)
chr8 (3-413)||(18153316-18153722)
chr8 (13-428)||(20259923-20260335)
chr8 (13-428)||(21046553-21046965)
chr8 (5-413)||(23469758-23470162)
chr8 (3-431)||(18157815-18158241)
chr8 (5-432)||(20161528-20161953)
chr8 (5-413)||(19224513-19224917)
chr8 (1-413)||(19417930-19418339)
chr8 (1-413)||(19428505-19428914)
chr8 (5-413)||(30314993-30315402)
chr8 (5-413)||(16746579-16746983)
chr8 (3-413)||(18769432-18769839)
chr8 (22-432)||(31214570-31214978)
chr8 (3-432)||(6318812-6319238)
chr8 (7-432)||(19128306-19128728)
chr8 (7-432)||(26110789-26111211)
chr8 (7-432)||(43247883-43248305)
chr8 (7-432)||(3220190-3220612)
chr8 (7-432)||(6160582-6161003)
chr8 (7-432)||(15791599-15792022)
chr8 (7-432)||(13688868-13689292)
chr8 (7-432)||(18448928-18449350)
chr8 (7-432)||(32088569-32088991)
chr8 (7-431)||(26120465-26120889)
chr8 (7-432)||(251965-252389)
chr8 (7-432)||(849267-849691)
chr8 (7-432)||(6150627-6151048)
chr8 (7-432)||(19138838-19139260)
chr8 (7-432)||(29076288-29076711)
chr8 (7-432)||(29086539-29086962)
chr8 (7-432)||(32077996-32078418)
chr8 (7-432)||(36077494-36077917)
chr8 (7-432)||(36088080-36088503)
chr8 (7-413)||(9856772-9857178)
chr8 (7-432)||(210453-210877)
chr8 (7-432)||(241380-241804)
chr8 (7-432)||(724076-724500)
chr8 (7-432)||(794735-795159)
chr8 (7-432)||(3348927-3349350)
chr8 (7-432)||(3359524-3359947)
chr8 (7-432)||(36292477-36292901)
chr8 (7-432)||(36303080-36303504)
chr8 (196-432)||(23363687-23363923)
chr8 (7-431)||(15781010-15781432)
chr8 (7-432)||(44480648-44481071)
chr8 (7-432)||(44491264-44491687)
chr8 (7-432)||(9340701-9341124)
chr8 (7-432)||(9367845-9368268)
chr8 (205-432)||(7018914-7019141)
chr8 (5-247)||(20195697-20195939)
chr8 (215-428)||(22211869-22212082)
chr8 (70-428)||(17519509-17519872)
chr8 (217-428)||(19460556-19460767)
chr8 (217-428)||(19558234-19558445)
chr8 (217-428)||(23271689-23271900)
chr8 (70-428)||(40002563-40002928)
chr8 (217-428)||(29378944-29379157)
chr8 (215-428)||(8031392-8031608)
chr8 (115-428)||(28902805-28903119)
chr8 (13-277)||(7018686-7018956)
chr8 (70-428)||(45568367-45568732)
chr8 (215-432)||(20195543-20195759)
chr8 (311-428)||(15969492-15969610)
chr8 (214-432)||(13697185-13697403)
chr8 (113-428)||(21287739-21288057)
chr8 (13-154)||(23370386-23370528)
chr8 (296-413)||(23270528-23270640)
chr8 (5-247)||(19460707-19460952)
chr8 (5-247)||(19558385-19558630)
chr8 (13-227)||(22211694-22211911)
chr8 (295-413)||(15998804-15998917)
chr8 (302-413)||(26735573-26735679)
chr8 (70-422)||(21540305-21540654)
chr8 (299-432)||(23290458-23290587)
chr8 (115-257)||(19956838-19956981)
chr8 (113-275)||(21298504-21298667)
chr8 (205-428)||(21298319-21298544)
chr8 (338-406)||(12541041-12541109)
chr8 (115-257)||(15934132-15934275)
chr8 (328-407)||(15934376-15934454)
chr8 (46-247)||(23271546-23271749)
chr8 (303-415)||(24498761-24498871)
chr8 (44-247)||(29379097-29379305)
chr8 (342-407)||(19942594-19942659)
chr8 (342-407)||(20383065-20383130)
chr8 (115-251)||(22462138-22462275)
chr8 (338-394)||(16376058-16376114)
chr8 (328-407)||(19706874-19706952)
chr8 (115-279)||(1210243-1210409)
chr8 (115-228)||(18321659-18321773)
chr8 (342-415)||(18557400-18557473)
chr8 (357-432)||(21547625-21547702)
chr8 (68-154)||(8031640-8031728)
chr8 (342-407)||(19957065-19957130)
chr8 (342-413)||(22673151-22673224)
chr8 (342-407)||(26832434-26832499)
chr8 (339-415)||(17687370-17687445)
chr8 (329-417)||(18772041-18772127)
chr8 (339-415)||(24634735-24634811)
chr8 (342-393)||(40846115-40846167)
chr8 (115-257)||(14989952-14990097)
chr8 (115-257)||(14990563-14990708)
chr8 (115-257)||(18152148-18152293)
chr8 (115-229)||(19942770-19942884)
chr8 (115-229)||(29692846-29692963)
chr8 (115-229)||(30421934-30422050)
chr8 (115-229)||(45538938-45539055)
chr8 (342-394)||(17796793-17796846)
chr8 (342-407)||(24679115-24679180)
chr8 (342-407)||(25163429-25163494)
chr8 (342-394)||(43773491-43773544)
chr8 (118-257)||(26832582-26832722)
chr8 (352-407)||(12758474-12758529)
chr8 (344-407)||(18679172-18679235)
chr8 (344-407)||(18718361-18718424)
chr8 (342-413)||(19506068-19506139)
chr8 (342-407)||(16206629-16206694)
chr8 (342-407)||(18121835-18121901)
chr8 (342-407)||(29692670-29692736)
chr8 (115-187)||(1744730-1744802)
chr8 (115-187)||(13431121-13431194)
chr8 (342-413)||(14990206-14990279)
chr8 (329-389)||(15336803-15336863)
chr8 (329-389)||(15425868-15425928)
chr8 (329-389)||(15517172-15517232)
chr8 (342-407)||(20256240-20256305)
chr8 (115-251)||(25850494-25850631)
chr8 (342-394)||(33560941-33560994)
chr8 (115-187)||(43639358-43639431)
chr8 (115-187)||(45292411-45292484)
chr8 (338-394)||(45539159-45539215)
chr8 (342-394)||(1210435-1210487)
chr8 (115-174)||(2810398-2810458)
chr8 (115-174)||(16188573-16188633)
chr8 (360-404)||(17879063-17879107)
chr8 (342-406)||(23192498-23192562)
chr8 (347-413)||(36104691-36104759)
chr8 (115-154)||(12193524-12193563)
chr8 (115-154)||(12437952-12437991)
chr8 (115-154)||(17701352-17701391)
chr8 (342-385)||(17928468-17928511)
chr8 (115-154)||(17928664-17928703)
chr8 (342-389)||(19153410-19153456)
chr8 (115-154)||(19707119-19707158)
chr8 (115-154)||(20382894-20382933)
chr8 (115-154)||(21932492-21932531)
chr8 (115-154)||(25163682-25163721)
chr8 (115-154)||(40845888-40845927)
chr8 (342-389)||(43644273-43644320)
chr8 (115-154)||(43644507-43644546)
chr8 (115-154)||(43773730-43773769)
chr8 (205-255)||(16206745-16206795)
chr8 (114-187)||(17442319-17442393)
chr8 (120-162)||(17879236-17879278)
chr8 (115-197)||(19505938-19506020)
chr8 (342-407)||(21932241-21932307)
chr8 (325-407)||(25850700-25850781)
chr8 (333-417)||(27739269-27739355)
chr8 (115-229)||(33560716-33560833)
chr8 (346-417)||(1744534-1744607)
chr8 (342-413)||(6407109-6407182)
chr8 (205-246)||(13697205-13697246)
chr8 (342-413)||(18152402-18152475)
chr8 (344-385)||(18321886-18321927)
chr8 (342-394)||(22662458-22662511)
chr8 (122-246)||(22707848-22707973)
chr8 (342-394)||(30422127-30422180)
chr8 (346-394)||(39692907-39692956)
chr8 (119-167)||(12541241-12541289)
chr8 (120-251)||(18557545-18557676)
chr8 (114-154)||(18679425-18679465)
chr8 (114-154)||(18718614-18718654)
[»] chr5 (214 HSPs)
chr5 (5-429)||(20417286-20417707)
chr5 (14-432)||(106511-106927)
chr5 (13-432)||(20625156-20625574)
chr5 (3-413)||(17446169-17446576)
chr5 (3-431)||(37407028-37407453)
chr5 (21-429)||(32753402-32753807)
chr5 (5-413)||(8522224-8522629)
chr5 (5-413)||(36229122-36229526)
chr5 (5-432)||(1121354-1121779)
chr5 (5-413)||(23406829-23407233)
chr5 (3-413)||(17456785-17457192)
chr5 (5-432)||(1108596-1109021)
chr5 (5-413)||(20552198-20552603)
chr5 (3-413)||(34063002-34063408)
chr5 (5-410)||(20562708-20563110)
chr5 (5-413)||(42395362-42395771)
chr5 (5-413)||(43621366-43621771)
chr5 (5-413)||(20798079-20798483)
chr5 (3-414)||(21702596-21703008)
chr5 (5-413)||(36084844-36085248)
chr5 (5-431)||(19464354-19464779)
chr5 (3-411)||(34052341-34052745)
chr5 (3-432)||(5290027-5290454)
chr5 (3-432)||(5300598-5301025)
chr5 (5-431)||(19478384-19478809)
chr5 (5-432)||(27602870-27603294)
chr5 (5-432)||(34783239-34783663)
chr5 (3-413)||(24925610-24926019)
chr5 (3-413)||(24982891-24983300)
chr5 (5-432)||(34772294-34772718)
chr5 (1-432)||(43043123-43043552)
chr5 (7-432)||(40390743-40391165)
chr5 (7-432)||(40401405-40401827)
chr5 (5-432)||(27622219-27622643)
chr5 (7-432)||(16003343-16003765)
chr5 (7-432)||(22146909-22147330)
chr5 (7-432)||(23296663-23297087)
chr5 (7-432)||(23307231-23307655)
chr5 (7-432)||(23707828-23708252)
chr5 (7-432)||(39352874-39353296)
chr5 (7-432)||(39364867-39365289)
chr5 (7-432)||(40513439-40513863)
chr5 (7-432)||(42043170-42043594)
chr5 (7-432)||(42053745-42054169)
chr5 (3-432)||(30069355-30069783)
chr5 (12-432)||(30226946-30227365)
chr5 (12-432)||(30237473-30237892)
chr5 (7-413)||(22157492-22157892)
chr5 (7-432)||(6131177-6131599)
chr5 (7-432)||(9346928-9347350)
chr5 (7-432)||(15992781-15993203)
chr5 (7-432)||(23362497-23362919)
chr5 (7-432)||(31833869-31834295)
chr5 (7-432)||(33951250-33951674)
chr5 (7-411)||(39490423-39490824)
chr5 (7-411)||(39501613-39502014)
chr5 (3-414)||(21705436-21705855)
chr5 (7-432)||(9336341-9336763)
chr5 (7-432)||(23697170-23697594)
chr5 (7-432)||(27204178-27204600)
chr5 (7-432)||(31844347-31844773)
chr5 (7-431)||(22559823-22560244)
chr5 (7-411)||(22676502-22676904)
chr5 (7-411)||(22686393-22686795)
chr5 (3-432)||(10754874-10755300)
chr5 (7-432)||(14557467-14557891)
chr5 (7-432)||(14568104-14568528)
chr5 (3-432)||(31419045-31419471)
chr5 (7-432)||(37728703-37729126)
chr5 (7-432)||(37740019-37740442)
chr5 (5-432)||(14446452-14446877)
chr5 (5-432)||(14457064-14457489)
chr5 (7-411)||(6976194-6976596)
chr5 (7-411)||(6986684-6987086)
chr5 (7-432)||(36582009-36582432)
chr5 (7-432)||(36592564-36592987)
chr5 (7-432)||(14040983-14041406)
chr5 (7-432)||(15740354-15740777)
chr5 (7-432)||(15769514-15769937)
chr5 (7-432)||(27460547-27460970)
chr5 (7-432)||(27470946-27471369)
chr5 (7-432)||(35215892-35216315)
chr5 (7-432)||(35226476-35226899)
chr5 (5-432)||(17607443-17607868)
chr5 (7-432)||(9376913-9377336)
chr5 (7-432)||(14030430-14030853)
chr5 (7-432)||(15693483-15693906)
chr5 (7-432)||(17719303-17719726)
chr5 (7-432)||(17729955-17730378)
chr5 (7-432)||(24567475-24567898)
chr5 (7-432)||(24816337-24816760)
chr5 (7-432)||(24826925-24827348)
chr5 (7-411)||(27052310-27052710)
chr5 (3-432)||(31448936-31449362)
chr5 (7-432)||(36688080-36688503)
chr5 (7-432)||(36698646-36699069)
chr5 (7-432)||(24808298-24808721)
chr5 (7-411)||(27041686-27042086)
chr5 (7-432)||(31348919-31349342)
chr5 (7-432)||(31359533-31359956)
chr5 (5-432)||(17618057-17618483)
chr5 (218-432)||(35543694-35543908)
chr5 (215-428)||(13522566-13522779)
chr5 (213-432)||(21420215-21420431)
chr5 (44-428)||(20215522-20215912)
chr5 (13-428)||(40227999-40228423)
chr5 (124-413)||(23392903-23393188)
chr5 (215-428)||(20168630-20168843)
chr5 (215-428)||(36096215-36096428)
chr5 (215-428)||(36097672-36097885)
chr5 (113-428)||(23477717-23478033)
chr5 (217-428)||(40033321-40033534)
chr5 (249-428)||(13533323-13533502)
chr5 (7-247)||(7031762-7032000)
chr5 (217-417)||(23487904-23488104)
chr5 (217-428)||(1914787-1915000)
chr5 (215-432)||(7031608-7031823)
chr5 (113-422)||(25112356-25112668)
chr5 (113-422)||(25171447-25171759)
chr5 (70-428)||(32160089-32160454)
chr5 (13-217)||(13533474-13533681)
chr5 (70-428)||(11208441-11208806)
chr5 (13-247)||(13522717-13522954)
chr5 (13-227)||(35543517-35543733)
chr5 (14-247)||(36096041-36096277)
chr5 (14-247)||(36097498-36097734)
chr5 (215-333)||(13403698-13403817)
chr5 (21-216)||(20168463-20168661)
chr5 (70-247)||(1914940-1915122)
chr5 (342-417)||(21659564-21659640)
chr5 (115-257)||(16607023-16607166)
chr5 (342-407)||(7746404-7746469)
chr5 (342-407)||(22000737-22000802)
chr5 (342-394)||(31117254-31117306)
chr5 (115-229)||(20550432-20550547)
chr5 (113-247)||(40033246-40033381)
chr5 (328-417)||(9399313-9399402)
chr5 (342-404)||(13546231-13546293)
chr5 (342-413)||(10848128-10848201)
chr5 (113-245)||(23488046-23488179)
chr5 (342-407)||(25097536-25097601)
chr5 (342-407)||(25155506-25155571)
chr5 (338-407)||(26056193-26056262)
chr5 (328-404)||(90120-90195)
chr5 (342-406)||(31589651-31589715)
chr5 (115-229)||(643184-643299)
chr5 (342-407)||(6498675-6498741)
chr5 (342-407)||(17814326-17814392)
chr5 (115-257)||(22586466-22586608)
chr5 (342-404)||(26120531-26120593)
chr5 (345-413)||(35932718-35932788)
chr5 (342-394)||(11993265-11993318)
chr5 (342-407)||(23413684-23413749)
chr5 (342-407)||(23880428-23880493)
chr5 (346-407)||(26766549-26766610)
chr5 (342-413)||(28465045-28465118)
chr5 (115-247)||(34637976-34638109)
chr5 (115-246)||(2156757-2156889)
chr5 (342-389)||(26764885-26764933)
chr5 (115-279)||(34637064-34637226)
chr5 (342-389)||(643410-643457)
chr5 (344-413)||(4886319-4886390)
chr5 (342-404)||(6513140-6513203)
chr5 (115-229)||(12353279-12353393)
chr5 (115-229)||(21072720-21072835)
chr5 (115-229)||(21199484-21199599)
chr5 (115-279)||(20968700-20968866)
chr5 (115-229)||(33932805-33932921)
chr5 (115-187)||(10848353-10848426)
chr5 (342-406)||(13736782-13736847)
chr5 (358-415)||(26119272-26119329)
chr5 (342-407)||(26783716-26783781)
chr5 (342-413)||(29139112-29139185)
chr5 (342-413)||(30116544-30116617)
chr5 (342-413)||(33932624-33932697)
chr5 (118-278)||(6512916-6513079)
chr5 (342-394)||(21199710-21199762)
chr5 (343-413)||(30742338-30742410)
chr5 (115-174)||(31146118-31146178)
chr5 (342-389)||(33022044-33022092)
chr5 (115-154)||(3245925-3245964)
chr5 (115-154)||(4886637-4886676)
chr5 (115-154)||(6498852-6498891)
chr5 (115-154)||(9088583-9088622)
chr5 (43-136)||(13404753-13404850)
chr5 (115-154)||(13546008-13546047)
chr5 (342-411)||(15516329-15516400)
chr5 (115-154)||(15516584-15516623)
chr5 (342-389)||(19537007-19537054)
chr5 (115-154)||(21100186-21100225)
chr5 (115-154)||(21659826-21659865)
chr5 (115-154)||(23880680-23880719)
chr5 (115-154)||(25740725-25740764)
chr5 (115-154)||(26056009-26056048)
chr5 (115-154)||(28139221-28139260)
chr5 (115-154)||(28464821-28464860)
chr5 (115-154)||(29138889-29138928)
chr5 (115-154)||(31117493-31117532)
chr5 (115-154)||(35932490-35932529)
chr5 (115-154)||(35986716-35986755)
chr5 (115-192)||(9399099-9399177)
chr5 (342-407)||(12353504-12353570)
chr5 (115-153)||(13736618-13736656)
chr5 (342-384)||(16606901-16606943)
chr5 (346-404)||(20968613-20968671)
chr5 (115-229)||(23392088-23392205)
chr5 (342-413)||(3246149-3246222)
chr5 (115-187)||(7746177-7746250)
chr5 (113-154)||(20567421-20567462)
chr5 (342-413)||(28138960-28139033)
chr5 (219-275)||(12078357-12078413)
chr5 (216-280)||(22586537-22586601)
chr5 (123-246)||(23589237-23589360)
chr5 (115-166)||(30742583-30742635)
[»] chr3 (286 HSPs)
chr3 (21-432)||(1053255-1053665)
chr3 (13-432)||(27882930-27883347)
chr3 (13-432)||(17281705-17282122)
chr3 (13-432)||(13199516-13199936)
chr3 (3-414)||(16076493-16076902)
chr3 (13-432)||(1063684-1064102)
chr3 (13-428)||(8740397-8740808)
chr3 (3-428)||(9006770-9007192)
chr3 (13-417)||(2245924-2246330)
chr3 (3-432)||(8996218-8996644)
chr3 (3-431)||(13261933-13262359)
chr3 (3-413)||(11216986-11217392)
chr3 (3-413)||(4403841-4404247)
chr3 (3-431)||(11163379-11163803)
chr3 (3-413)||(9391465-9391871)
chr3 (5-413)||(1794746-1795151)
chr3 (5-413)||(48336809-48337213)
chr3 (5-432)||(29461476-29461901)
chr3 (5-432)||(29472328-29472753)
chr3 (13-428)||(29947617-29948031)
chr3 (13-428)||(29996771-29997185)
chr3 (3-431)||(933174-933601)
chr3 (13-414)||(14321962-14322359)
chr3 (5-413)||(1784334-1784738)
chr3 (3-411)||(9380919-9381323)
chr3 (3-413)||(19887615-19888021)
chr3 (13-413)||(29906452-29906850)
chr3 (13-428)||(29933831-29934245)
chr3 (13-428)||(29982985-29983399)
chr3 (5-413)||(38314262-38314671)
chr3 (3-413)||(7804779-7805186)
chr3 (5-432)||(23635256-23635681)
chr3 (5-413)||(24706818-24707223)
chr3 (5-413)||(9535176-9535581)
chr3 (7-432)||(23767441-23767863)
chr3 (3-413)||(7794868-7795275)
chr3 (5-432)||(4175021-4175445)
chr3 (7-432)||(39673149-39673570)
chr3 (13-330)||(16671433-16671751)
chr3 (3-432)||(9994155-9994581)
chr3 (3-432)||(12237875-12238301)
chr3 (3-432)||(12249701-12250127)
chr3 (7-432)||(13557121-13557543)
chr3 (7-432)||(23756845-23757267)
chr3 (7-432)||(37865992-37866414)
chr3 (7-432)||(37885125-37885547)
chr3 (13-432)||(6180800-6181216)
chr3 (13-432)||(6220974-6221390)
chr3 (7-413)||(19788590-19788991)
chr3 (3-432)||(9982147-9982573)
chr3 (7-432)||(13121209-13121631)
chr3 (7-432)||(14475768-14476190)
chr3 (5-411)||(5579898-5580301)
chr3 (7-432)||(23647295-23647718)
chr3 (7-432)||(5537287-5537709)
chr3 (3-411)||(6501265-6501668)
chr3 (7-432)||(11272650-11273074)
chr3 (3-413)||(17910263-17910673)
chr3 (7-432)||(19777932-19778354)
chr3 (7-432)||(20684045-20684466)
chr3 (7-432)||(38194270-38194693)
chr3 (5-432)||(20720658-20721084)
chr3 (7-432)||(5510242-5510665)
chr3 (7-432)||(5520420-5520843)
chr3 (7-432)||(5547871-5548293)
chr3 (7-432)||(5865962-5866386)
chr3 (7-432)||(5876561-5876985)
chr3 (7-432)||(10098614-10099037)
chr3 (15-432)||(13131451-13131865)
chr3 (5-432)||(8774203-8774628)
chr3 (13-432)||(39382236-39382653)
chr3 (7-411)||(12297067-12297469)
chr3 (7-432)||(38204805-38205229)
chr3 (3-411)||(6490611-6491014)
chr3 (7-432)||(18483590-18484013)
chr3 (7-432)||(24383785-24384209)
chr3 (5-432)||(28314496-28314922)
chr3 (5-411)||(5628282-5628684)
chr3 (7-432)||(20673460-20673882)
chr3 (13-432)||(39371599-39372016)
chr3 (7-411)||(12287245-12287647)
chr3 (7-432)||(37759216-37759639)
chr3 (7-432)||(13372932-13373356)
chr3 (3-432)||(10655525-10655952)
chr3 (7-432)||(504434-504857)
chr3 (7-432)||(526800-527223)
chr3 (7-432)||(4743284-4743707)
chr3 (7-432)||(4753871-4754294)
chr3 (7-432)||(13383526-13383950)
chr3 (7-432)||(13394120-13394544)
chr3 (7-432)||(16385621-16386044)
chr3 (7-432)||(35186923-35187346)
chr3 (7-432)||(41683224-41683647)
chr3 (7-432)||(41693793-41694216)
chr3 (3-431)||(10627203-10627629)
chr3 (5-432)||(28325112-28325536)
chr3 (7-432)||(24659446-24659869)
chr3 (76-413)||(11206408-11206741)
chr3 (7-432)||(24670026-24670449)
chr3 (70-428)||(31114316-31114677)
chr3 (114-413)||(4433328-4433622)
chr3 (44-428)||(17006538-17006928)
chr3 (90-413)||(14258412-14258732)
chr3 (46-426)||(51989451-51989834)
chr3 (205-432)||(15663200-15663427)
chr3 (208-429)||(15651568-15651789)
chr3 (70-428)||(22150590-22150954)
chr3 (3-247)||(28168811-28169056)
chr3 (46-432)||(14580685-14581068)
chr3 (224-415)||(27172426-27172618)
chr3 (13-277)||(15662977-15663242)
chr3 (43-428)||(41045086-41045478)
chr3 (217-422)||(10528724-10528931)
chr3 (5-246)||(8784973-8785213)
chr3 (7-232)||(14465336-14465560)
chr3 (21-257)||(15651350-15651587)
chr3 (217-428)||(17017374-17017586)
chr3 (70-428)||(15832752-15833116)
chr3 (249-432)||(21735713-21735896)
chr3 (70-428)||(49989605-49989969)
chr3 (113-428)||(13953607-13953924)
chr3 (218-431)||(28168659-28168870)
chr3 (238-413)||(13601801-13601973)
chr3 (219-413)||(15194516-15194707)
chr3 (113-428)||(12753120-12753438)
chr3 (234-389)||(18857426-18857577)
chr3 (217-428)||(13147637-13147851)
chr3 (13-217)||(21735868-21736074)
chr3 (276-413)||(19121376-19121508)
chr3 (215-432)||(8784817-8785034)
chr3 (3-111)||(4456781-4456890)
chr3 (205-428)||(15848486-15848710)
chr3 (70-428)||(11909492-11909857)
chr3 (217-423)||(45862162-45862370)
chr3 (100-247)||(17961073-17961223)
chr3 (216-428)||(37411979-37412193)
chr3 (276-432)||(33650747-33650900)
chr3 (249-432)||(17960949-17961133)
chr3 (299-432)||(11530344-11530474)
chr3 (70-276)||(15848699-15848910)
chr3 (338-413)||(13076460-13076535)
chr3 (113-275)||(51340509-51340672)
chr3 (206-412)||(51340340-51340548)
chr3 (113-279)||(18005987-18006154)
chr3 (338-413)||(7608864-7608939)
chr3 (338-432)||(35579015-35579111)
chr3 (13-247)||(27172565-27172796)
chr3 (338-407)||(27849590-27849659)
chr3 (217-288)||(18006010-18006081)
chr3 (70-245)||(45862042-45862220)
chr3 (276-407)||(24393357-24393483)
chr3 (70-247)||(10528871-10529053)
chr3 (327-407)||(23538878-23538957)
chr3 (328-407)||(2560551-2560629)
chr3 (115-257)||(26418178-26418321)
chr3 (44-247)||(17017526-17017734)
chr3 (342-407)||(3238057-3238122)
chr3 (342-407)||(20645519-20645584)
chr3 (342-407)||(52919830-52919895)
chr3 (342-394)||(20724466-20724518)
chr3 (338-401)||(13931367-13931430)
chr3 (344-407)||(17239653-17239716)
chr3 (338-389)||(22804747-22804798)
chr3 (328-407)||(26418392-26418470)
chr3 (115-229)||(52919976-52920091)
chr3 (70-197)||(13147841-13147973)
chr3 (118-394)||(50299613-50299887)
chr3 (342-407)||(6090092-6090157)
chr3 (342-407)||(6174701-6174766)
chr3 (115-251)||(8729489-8729626)
chr3 (115-251)||(9081376-9081513)
chr3 (339-415)||(17769679-17769756)
chr3 (339-415)||(19070980-19071057)
chr3 (347-410)||(1463748-1463811)
chr3 (338-404)||(6252789-6252856)
chr3 (115-257)||(12967822-12967965)
chr3 (115-230)||(21606157-21606275)
chr3 (333-407)||(12410418-12410492)
chr3 (328-394)||(14063705-14063770)
chr3 (115-229)||(15902736-15902853)
chr3 (115-257)||(21638746-21638891)
chr3 (342-407)||(28581471-28581537)
chr3 (345-407)||(29952168-29952230)
chr3 (345-407)||(30001322-30001384)
chr3 (115-280)||(41494488-41494654)
chr3 (115-229)||(47405925-47406042)
chr3 (342-407)||(49554224-49554290)
chr3 (342-407)||(13410766-13410831)
chr3 (342-407)||(13939261-13939326)
chr3 (342-394)||(47207083-47207136)
chr3 (115-280)||(49643263-49643431)
chr3 (342-394)||(11078134-11078186)
chr3 (115-279)||(13931452-13931615)
chr3 (342-389)||(49669216-49669264)
chr3 (115-154)||(5213195-5213234)
chr3 (342-389)||(12396452-12396499)
chr3 (224-279)||(13292159-13292214)
chr3 (115-229)||(14072240-14072354)
chr3 (333-404)||(15647142-15647213)
chr3 (115-197)||(16032169-16032252)
chr3 (115-257)||(20724602-20724745)
chr3 (116-246)||(23538666-23538797)
chr3 (115-229)||(29951939-29952054)
chr3 (115-229)||(30001093-30001208)
chr3 (115-280)||(49554003-49554170)
chr3 (342-407)||(11189378-11189444)
chr3 (115-217)||(12410298-12410399)
chr3 (115-229)||(12963586-12963703)
chr3 (329-407)||(12963802-12963879)
chr3 (342-407)||(13823432-13823498)
chr3 (115-192)||(14077822-14077899)
chr3 (342-407)||(14968729-14968795)
chr3 (205-275)||(15848670-15848740)
chr3 (342-404)||(21316922-21316984)
chr3 (115-229)||(22140304-22140420)
chr3 (115-229)||(28581645-28581761)
chr3 (342-407)||(31302714-31302780)
chr3 (115-229)||(40799437-40799553)
chr3 (345-413)||(40850335-40850405)
chr3 (115-280)||(2025576-2025744)
chr3 (346-413)||(2782837-2782906)
chr3 (115-280)||(11223052-11223220)
chr3 (342-395)||(19198602-19198655)
chr3 (347-404)||(19250085-19250142)
chr3 (342-394)||(20628160-20628213)
chr3 (342-413)||(21639000-21639073)
chr3 (115-187)||(22463595-22463668)
chr3 (345-389)||(22463763-22463808)
chr3 (115-187)||(22465053-22465126)
chr3 (345-389)||(22465221-22465266)
chr3 (115-187)||(30054683-30054756)
chr3 (342-394)||(30054907-30054960)
chr3 (113-245)||(37412134-37412267)
chr3 (115-280)||(38178147-38178314)
chr3 (115-187)||(40850560-40850633)
chr3 (338-406)||(8693512-8693580)
chr3 (338-406)||(9045399-9045467)
chr3 (351-407)||(10849956-10850012)
chr3 (115-166)||(14955033-14955085)
chr3 (115-178)||(25398759-25398823)
chr3 (115-154)||(1728518-1728557)
chr3 (342-388)||(11222947-11222994)
chr3 (115-154)||(13410549-13410588)
chr3 (115-154)||(13698987-13699026)
chr3 (342-404)||(13781314-13781377)
chr3 (115-154)||(15961132-15961171)
chr3 (346-413)||(16305781-16305848)
chr3 (115-154)||(16881906-16881945)
chr3 (115-154)||(19249914-19249953)
chr3 (115-154)||(21640484-21640523)
chr3 (115-154)||(22128662-22128701)
chr3 (115-154)||(24776035-24776074)
chr3 (115-154)||(29855026-29855065)
chr3 (344-394)||(40799276-40799327)
chr3 (115-154)||(46796870-46796909)
chr3 (115-154)||(47207321-47207360)
chr3 (345-394)||(1728746-1728796)
chr3 (115-184)||(7833129-7833199)
chr3 (346-414)||(9700769-9700839)
chr3 (342-407)||(17667771-17667837)
chr3 (215-257)||(22770433-22770475)
chr3 (346-404)||(22770589-22770647)
chr3 (369-432)||(27244975-27245040)
chr3 (115-229)||(46350348-46350465)
chr3 (342-407)||(49643490-49643556)
chr3 (115-229)||(53057232-53057349)
chr3 (333-406)||(932249-932322)
chr3 (123-256)||(932362-932493)
chr3 (342-394)||(2025467-2025520)
chr3 (115-251)||(6174856-6174993)
chr3 (238-275)||(8710418-8710455)
chr3 (238-275)||(9062305-9062342)
chr3 (342-394)||(11222193-11222246)
chr3 (342-394)||(12726963-12727016)
chr3 (342-407)||(13698770-13698835)
chr3 (115-251)||(14007085-14007221)
chr3 (342-395)||(14078043-14078096)
chr3 (342-394)||(29854784-29854837)
chr3 (342-394)||(46797123-46797176)
chr3 (115-187)||(52283315-52283387)
chr3 (342-394)||(53057456-53057509)
chr3 (118-154)||(1463906-1463942)
chr3 (115-174)||(13781087-13781147)
chr3 (342-382)||(16659322-16659362)
chr3 (115-230)||(17697158-17697274)
chr3 (205-257)||(46797022-46797074)
[»] chr2 (182 HSPs)
chr2 (13-432)||(967793-968210)
chr2 (33-432)||(1041671-1042067)
chr2 (13-432)||(36785088-36785506)
chr2 (13-431)||(27978672-27979087)
chr2 (13-431)||(28065201-28065616)
chr2 (13-428)||(24274552-24274964)
chr2 (5-413)||(18769187-18769590)
chr2 (3-413)||(26866614-26867021)
chr2 (5-413)||(24427868-24428272)
chr2 (3-431)||(38586366-38586794)
chr2 (1-429)||(22763176-22763604)
chr2 (1-428)||(22773881-22774308)
chr2 (9-432)||(2561009-2561430)
chr2 (5-413)||(24415303-24415707)
chr2 (5-413)||(28732184-28732588)
chr2 (79-432)||(17970626-17970975)
chr2 (3-413)||(26879203-26879610)
chr2 (3-431)||(21172746-21173174)
chr2 (7-432)||(16768464-16768886)
chr2 (7-432)||(43082175-43082597)
chr2 (7-432)||(43092784-43093206)
chr2 (13-432)||(19355838-19356260)
chr2 (5-413)||(28721598-28722002)
chr2 (7-432)||(24328019-24328441)
chr2 (7-432)||(24338689-24339111)
chr2 (7-432)||(29243743-29244165)
chr2 (7-432)||(29254322-29254744)
chr2 (7-432)||(1099480-1099902)
chr2 (7-432)||(4209410-4209832)
chr2 (7-432)||(11389094-11389516)
chr2 (7-432)||(22915149-22915571)
chr2 (7-431)||(36252129-36252550)
chr2 (7-432)||(4099335-4099757)
chr2 (7-432)||(4220002-4220424)
chr2 (7-432)||(7006092-7006514)
chr2 (7-432)||(9773589-9774011)
chr2 (7-432)||(17857722-17858144)
chr2 (7-432)||(18392922-18393346)
chr2 (7-432)||(22960617-22961039)
chr2 (7-432)||(34790502-34790924)
chr2 (7-432)||(34804645-34805067)
chr2 (7-413)||(32217414-32217817)
chr2 (7-432)||(34477449-34477872)
chr2 (7-432)||(9763053-9763475)
chr2 (7-432)||(27220901-27221324)
chr2 (7-432)||(35263111-35263534)
chr2 (7-432)||(35273736-35274159)
chr2 (7-432)||(40250714-40251137)
chr2 (7-432)||(11395457-11395881)
chr2 (7-432)||(11405773-11406197)
chr2 (7-432)||(30489109-30489531)
chr2 (7-432)||(9908447-9908872)
chr2 (7-432)||(40221853-40222276)
chr2 (7-432)||(35252502-35252925)
chr2 (7-432)||(43344928-43345351)
chr2 (7-432)||(43354543-43354966)
chr2 (7-432)||(9897859-9898284)
chr2 (7-432)||(10277091-10277514)
chr2 (7-432)||(10266514-10266937)
chr2 (7-411)||(39170380-39170780)
chr2 (68-428)||(20646954-20647317)
chr2 (217-428)||(19498457-19498668)
chr2 (217-428)||(19302918-19303129)
chr2 (215-428)||(19313482-19313695)
chr2 (70-412)||(23393065-23393412)
chr2 (70-412)||(24801945-24802293)
chr2 (215-428)||(38033296-38033510)
chr2 (70-412)||(24814912-24815260)
chr2 (194-432)||(21650976-21651213)
chr2 (215-396)||(22754871-22755054)
chr2 (5-161)||(21650814-21650969)
chr2 (299-428)||(38040539-38040669)
chr2 (13-163)||(17969499-17969651)
chr2 (113-412)||(1083368-1083670)
chr2 (265-413)||(30794351-30794497)
chr2 (318-428)||(22615225-22615336)
chr2 (4-247)||(19313299-19313544)
chr2 (5-247)||(19498273-19498517)
chr2 (33-247)||(19300321-19300537)
chr2 (217-292)||(19300477-19300552)
chr2 (333-403)||(22682796-22682866)
chr2 (115-251)||(26619548-26619685)
chr2 (338-404)||(19321030-19321096)
chr2 (115-279)||(21911311-21911477)
chr2 (342-407)||(21537860-21537925)
chr2 (328-407)||(10010413-10010491)
chr2 (115-245)||(18702262-18702393)
chr2 (115-257)||(22271641-22271784)
chr2 (328-407)||(24376467-24376545)
chr2 (120-246)||(24843724-24843851)
chr2 (338-404)||(14794461-14794526)
chr2 (47-154)||(22755086-22755195)
chr2 (342-395)||(24843578-24843631)
chr2 (328-389)||(28141263-28141323)
chr2 (115-246)||(18431386-18431518)
chr2 (328-404)||(18702104-18702179)
chr2 (342-417)||(23184976-23185052)
chr2 (342-417)||(23596239-23596315)
chr2 (342-394)||(24851337-24851389)
chr2 (347-407)||(40781837-40781897)
chr2 (329-407)||(22271491-22271568)
chr2 (115-228)||(25188937-25189051)
chr2 (342-404)||(25828526-25828587)
chr2 (342-406)||(13964647-13964712)
chr2 (342-407)||(19539777-19539842)
chr2 (342-407)||(22257562-22257627)
chr2 (115-280)||(24575520-24575688)
chr2 (342-413)||(44839787-44839860)
chr2 (342-413)||(45087655-45087728)
chr2 (118-197)||(44880737-44880817)
chr2 (115-251)||(21845673-21845810)
chr2 (115-197)||(24376675-24376758)
chr2 (115-154)||(45087430-45087469)
chr2 (115-169)||(15671058-15671112)
chr2 (342-407)||(20569424-20569490)
chr2 (342-388)||(21911503-21911549)
chr2 (342-407)||(22188776-22188842)
chr2 (342-404)||(22382849-22382911)
chr2 (342-407)||(24575395-24575461)
chr2 (118-247)||(25918234-25918363)
chr2 (342-388)||(26623128-26623174)
chr2 (115-229)||(40331644-40331761)
chr2 (328-390)||(44880653-44880714)
chr2 (342-394)||(6574770-6574823)
chr2 (187-280)||(16587511-16587604)
chr2 (115-228)||(20152449-20152564)
chr2 (115-187)||(20569197-20569270)
chr2 (342-407)||(21845523-21845588)
chr2 (215-288)||(21911382-21911454)
chr2 (342-394)||(22786328-22786381)
chr2 (342-394)||(25188772-25188825)
chr2 (342-407)||(26367082-26367147)
chr2 (342-413)||(28551592-28551665)
chr2 (115-187)||(44840012-44840085)
chr2 (342-394)||(18431612-18431664)
chr2 (115-166)||(22802070-22802122)
chr2 (360-415)||(27747147-27747203)
chr2 (114-154)||(31328410-31328450)
chr2 (114-154)||(31335131-31335171)
chr2 (342-389)||(39038315-39038363)
chr2 (115-154)||(6392247-6392286)
chr2 (115-154)||(6574576-6574615)
chr2 (115-154)||(10010198-10010237)
chr2 (342-389)||(10899185-10899232)
chr2 (115-154)||(14581171-14581210)
chr2 (115-197)||(21537699-21537782)
chr2 (115-154)||(22188551-22188590)
chr2 (115-197)||(22455436-22455519)
chr2 (115-154)||(22525275-22525314)
chr2 (115-154)||(22786103-22786142)
chr2 (115-154)||(28551367-28551406)
chr2 (115-154)||(31801336-31801375)
chr2 (342-411)||(34322605-34322676)
chr2 (115-154)||(38781009-38781048)
chr2 (115-154)||(40202838-40202877)
chr2 (115-154)||(40782090-40782129)
chr2 (115-197)||(41122164-41122247)
chr2 (120-197)||(10898976-10899053)
chr2 (345-413)||(16494701-16494771)
chr2 (342-407)||(22316953-22317019)
chr2 (215-257)||(22383020-22383062)
chr2 (342-407)||(22455633-22455699)
chr2 (342-387)||(22782288-22782334)
chr2 (342-407)||(23234370-23234436)
chr2 (342-407)||(25037935-25038001)
chr2 (329-394)||(30557984-30558049)
chr2 (113-154)||(1088980-1089021)
chr2 (329-389)||(6392042-6392102)
chr2 (119-187)||(13964431-13964500)
chr2 (115-152)||(22257817-22257854)
chr2 (328-373)||(27296835-27296879)
chr2 (342-394)||(28701885-28701938)
chr2 (115-152)||(35744426-35744463)
chr2 (342-413)||(40331141-40331214)
chr2 (342-413)||(40331464-40331536)
chr2 (115-167)||(14794307-14794359)
chr2 (342-389)||(20152675-20152723)
chr2 (333-417)||(22525445-22525528)
chr2 (343-394)||(22801845-22801897)
chr2 (118-154)||(23234620-23234656)
chr2 (97-154)||(38033205-38033264)
chr2 (342-385)||(41122360-41122404)
[»] chr1 (208 HSPs)
chr1 (13-432)||(674922-675338)
chr1 (13-432)||(20196006-20196424)
chr1 (13-432)||(22610289-22610709)
chr1 (13-432)||(41132931-41133349)
chr1 (21-432)||(18311295-18311705)
chr1 (46-432)||(14388475-14388860)
chr1 (13-432)||(11195382-11195800)
chr1 (5-432)||(5973233-5973658)
chr1 (3-413)||(18382207-18382614)
chr1 (5-432)||(154595-155021)
chr1 (95-432)||(12944685-12945019)
chr1 (1-431)||(17956715-17957145)
chr1 (7-413)||(4250873-4251279)
chr1 (5-432)||(19178434-19178858)
chr1 (5-413)||(20441623-20442027)
chr1 (5-432)||(19187313-19187737)
chr1 (7-432)||(36236739-36237163)
chr1 (7-432)||(36247286-36247710)
chr1 (5-413)||(7689766-7690173)
chr1 (7-432)||(4177390-4177812)
chr1 (7-432)||(10998094-10998516)
chr1 (7-432)||(21863136-21863558)
chr1 (7-413)||(33084057-33084459)
chr1 (7-432)||(5640020-5640442)
chr1 (7-432)||(5650577-5650999)
chr1 (7-411)||(7506798-7507199)
chr1 (7-411)||(7517395-7517796)
chr1 (7-432)||(12730022-12730444)
chr1 (7-432)||(12740615-12741037)
chr1 (7-432)||(12898291-12898713)
chr1 (7-432)||(35649001-35649425)
chr1 (7-432)||(38094549-38094973)
chr1 (7-432)||(38105174-38105598)
chr1 (5-413)||(39586467-39586870)
chr1 (7-432)||(12624091-12624513)
chr1 (3-432)||(35012403-35012824)
chr1 (7-432)||(51629497-51629921)
chr1 (7-432)||(51656758-51657182)
chr1 (3-413)||(39194398-39194807)
chr1 (6-432)||(3171096-3171520)
chr1 (6-432)||(3181698-3182122)
chr1 (7-432)||(21877241-21877664)
chr1 (5-367)||(148520-148879)
chr1 (7-432)||(2538010-2538433)
chr1 (7-432)||(12614626-12615048)
chr1 (7-432)||(35404702-35405126)
chr1 (7-432)||(5832692-5833115)
chr1 (7-432)||(5843294-5843717)
chr1 (13-428)||(23926406-23926826)
chr1 (7-432)||(47608241-47608664)
chr1 (7-432)||(47618849-47619272)
chr1 (7-432)||(35638349-35638770)
chr1 (68-428)||(5929054-5929416)
chr1 (3-247)||(9050791-9051036)
chr1 (3-277)||(47194891-47195164)
chr1 (7-292)||(4166871-4167156)
chr1 (46-428)||(26548606-26548994)
chr1 (215-432)||(46181367-46181585)
chr1 (114-413)||(7677339-7677635)
chr1 (113-428)||(28379337-28379655)
chr1 (215-428)||(45071117-45071330)
chr1 (118-428)||(22018675-22018987)
chr1 (217-428)||(20251148-20251361)
chr1 (113-428)||(19170746-19171063)
chr1 (3-247)||(23580632-23580874)
chr1 (70-428)||(17370385-17370749)
chr1 (205-413)||(47194699-47194903)
chr1 (205-428)||(22642207-22642432)
chr1 (215-373)||(28473660-28473818)
chr1 (215-353)||(20884370-20884508)
chr1 (13-247)||(46181193-46181429)
chr1 (218-432)||(23580816-23581028)
chr1 (215-387)||(9050974-9051143)
chr1 (13-247)||(20884196-20884432)
chr1 (114-412)||(34255938-34256238)
chr1 (21-227)||(20867175-20867383)
chr1 (13-154)||(20798689-20798831)
chr1 (7-144)||(21894964-21895101)
chr1 (319-428)||(23058938-23059048)
chr1 (13-247)||(45070942-45071179)
chr1 (321-428)||(19037351-19037459)
chr1 (215-372)||(44200443-44200604)
chr1 (70-275)||(22642392-22642602)
chr1 (281-432)||(16710308-16710456)
chr1 (219-394)||(7745579-7745752)
chr1 (299-432)||(4717606-4717736)
chr1 (97-278)||(19037501-19037685)
chr1 (332-428)||(21541148-21541244)
chr1 (338-432)||(9749854-9749950)
chr1 (338-432)||(13223528-13223624)
chr1 (338-432)||(24049133-24049229)
chr1 (338-432)||(25218056-25218152)
chr1 (46-247)||(28473756-28473960)
chr1 (7-92)||(35401475-35401560)
chr1 (338-432)||(36100015-36100111)
chr1 (338-432)||(36551173-36551269)
chr1 (347-428)||(52351269-52351350)
chr1 (47-154)||(44200636-44200744)
chr1 (70-257)||(22654992-22655184)
chr1 (46-247)||(52351032-52351236)
chr1 (215-292)||(52351174-52351251)
chr1 (115-257)||(17025386-17025529)
chr1 (338-407)||(22202380-22202449)
chr1 (339-404)||(23975496-23975561)
chr1 (70-247)||(20251301-20251483)
chr1 (115-413)||(21215100-21215398)
chr1 (327-407)||(22465446-22465525)
chr1 (115-413)||(7309177-7309475)
chr1 (333-407)||(31358730-31358804)
chr1 (113-245)||(21543566-21543699)
chr1 (328-404)||(12283790-12283865)
chr1 (342-406)||(12625203-12625267)
chr1 (328-404)||(22427975-22428050)
chr1 (115-229)||(10756966-10757081)
chr1 (70-154)||(24029059-24029145)
chr1 (209-279)||(19965760-19965829)
chr1 (339-417)||(22639672-22639750)
chr1 (115-288)||(26280474-26280647)
chr1 (342-407)||(26702779-26702845)
chr1 (339-428)||(8698239-8698327)
chr1 (115-251)||(16233552-16233689)
chr1 (342-417)||(22600835-22600912)
chr1 (115-279)||(2819733-2819896)
chr1 (46-256)||(7745441-7745645)
chr1 (115-279)||(31358821-31358983)
chr1 (115-243)||(18130434-18130564)
chr1 (115-197)||(18897017-18897099)
chr1 (215-257)||(20867341-20867383)
chr1 (342-407)||(21192514-21192580)
chr1 (342-406)||(1577233-1577298)
chr1 (118-255)||(8698374-8698510)
chr1 (328-389)||(10756807-10756867)
chr1 (115-279)||(26703069-26703233)
chr1 (342-407)||(28492932-28492996)
chr1 (342-394)||(44824408-44824461)
chr1 (342-389)||(23037154-23037202)
chr1 (343-394)||(25449208-25449260)
chr1 (205-277)||(47194861-47194933)
chr1 (115-222)||(2834233-2834343)
chr1 (217-292)||(21543550-21543624)
chr1 (217-276)||(22642421-22642480)
chr1 (115-257)||(14263854-14263999)
chr1 (342-388)||(18614301-18614347)
chr1 (115-229)||(21121488-21121605)
chr1 (345-394)||(21121716-21121766)
chr1 (115-229)||(21205296-21205413)
chr1 (345-394)||(21983974-21984024)
chr1 (342-407)||(36133569-36133635)
chr1 (115-231)||(48703741-48703859)
chr1 (342-394)||(10250367-10250420)
chr1 (342-407)||(22601233-22601297)
chr1 (115-187)||(33256773-33256846)
chr1 (115-187)||(33276945-33277018)
chr1 (115-187)||(35039749-35039822)
chr1 (115-280)||(44824185-44824352)
chr1 (342-413)||(48570877-48570950)
chr1 (115-166)||(2327859-2327911)
chr1 (342-406)||(17017957-17018021)
chr1 (207-279)||(17497094-17497166)
chr1 (115-229)||(36133742-36133858)
chr1 (115-169)||(2266699-2266753)
chr1 (115-154)||(10250603-10250642)
chr1 (115-154)||(14293107-14293146)
chr1 (342-389)||(16233773-16233820)
chr1 (115-154)||(18517583-18517622)
chr1 (115-229)||(22153398-22153513)
chr1 (115-154)||(22202157-22202196)
chr1 (115-154)||(22427761-22427800)
chr1 (115-154)||(23024410-23024449)
chr1 (115-154)||(23036930-23036969)
chr1 (115-154)||(25448980-25449019)
chr1 (115-229)||(26702552-26702667)
chr1 (342-413)||(26702972-26703043)
chr1 (115-279)||(27858231-27858397)
chr1 (115-154)||(30892711-30892750)
chr1 (115-154)||(37640627-37640666)
chr1 (115-154)||(38282181-38282220)
chr1 (115-154)||(48570654-48570693)
chr1 (342-389)||(48703646-48703693)
chr1 (333-407)||(2819913-2819987)
chr1 (205-247)||(19965785-19965827)
chr1 (337-406)||(20908777-20908847)
chr1 (345-394)||(21205524-21205574)
chr1 (342-407)||(22153220-22153286)
chr1 (217-275)||(22655004-22655062)
chr1 (348-413)||(24218720-24218786)
chr1 (342-407)||(32786587-32786653)
chr1 (342-407)||(33257000-33257066)
chr1 (342-407)||(33277172-33277238)
chr1 (115-229)||(46088528-46088645)
chr1 (342-394)||(2266478-2266530)
chr1 (342-394)||(2328084-2328137)
chr1 (342-407)||(9346143-9346208)
chr1 (342-394)||(14293273-14293326)
chr1 (115-187)||(19717106-19717179)
chr1 (342-394)||(21702193-21702246)
chr1 (224-273)||(22639779-22639828)
chr1 (342-394)||(23024171-23024224)
chr1 (342-407)||(30892459-30892523)
chr1 (346-394)||(37640387-37640436)
chr1 (342-413)||(46088347-46088420)
chr1 (342-389)||(1899730-1899778)
chr1 (371-432)||(19087862-19087925)
chr1 (115-183)||(21684477-21684545)
chr1 (115-151)||(22639898-22639934)
chr1 (342-389)||(29215179-29215227)
chr1 (342-389)||(30571583-30571631)
chr1 (217-257)||(35895705-35895745)
[»] chr6 (211 HSPs)
chr6 (13-428)||(27166724-27167136)
chr6 (3-432)||(31571912-31572337)
chr6 (13-417)||(29765049-29765450)
chr6 (21-432)||(17746072-17746483)
chr6 (13-432)||(18834916-18835331)
chr6 (21-432)||(18826528-18826936)
chr6 (6-432)||(22308285-22308710)
chr6 (11-411)||(5844605-5845001)
chr6 (13-429)||(17741985-17742400)
chr6 (7-431)||(16123810-16124233)
chr6 (5-413)||(25787220-25787623)
chr6 (4-413)||(20030177-20030582)
chr6 (3-413)||(20062927-20063333)
chr6 (5-413)||(12827210-12827614)
chr6 (3-413)||(18926036-18926441)
chr6 (1-428)||(25687020-25687447)
chr6 (5-413)||(7376032-7376437)
chr6 (3-432)||(9123405-9123831)
chr6 (3-413)||(26043730-26044135)
chr6 (3-432)||(9112768-9113194)
chr6 (3-425)||(25518189-25518611)
chr6 (7-432)||(32962211-32962633)
chr6 (5-432)||(12717111-12717537)
chr6 (5-432)||(12727760-12728186)
chr6 (5-432)||(25985577-25986003)
chr6 (7-432)||(3671544-3671966)
chr6 (7-432)||(12865044-12865466)
chr6 (7-432)||(17982778-17983202)
chr6 (7-432)||(17984987-17985411)
chr6 (7-432)||(32972830-32973253)
chr6 (7-432)||(3660880-3661302)
chr6 (3-432)||(27505439-27505865)
chr6 (7-432)||(29384248-29384671)
chr6 (7-432)||(31982903-31983326)
chr6 (7-432)||(34818069-34818493)
chr6 (7-432)||(34807437-34807862)
chr6 (7-432)||(12854518-12854940)
chr6 (7-432)||(26864282-26864705)
chr6 (7-432)||(26874906-26875329)
chr6 (3-432)||(27372329-27372755)
chr6 (3-432)||(27462679-27463105)
chr6 (13-428)||(11234995-11235413)
chr6 (7-432)||(26024955-26025378)
chr6 (7-432)||(26035529-26035952)
chr6 (7-432)||(27341190-27341613)
chr6 (7-432)||(27401930-27402353)
chr6 (7-432)||(27412589-27413012)
chr6 (7-432)||(32301320-32301743)
chr6 (7-432)||(32312009-32312432)
chr6 (7-432)||(16929947-16930370)
chr6 (7-432)||(33198824-33199247)
chr6 (7-432)||(4630367-4630790)
chr6 (7-432)||(16959118-16959541)
chr6 (55-431)||(32756899-32757271)
chr6 (5-428)||(21127576-21128002)
chr6 (3-432)||(27383930-27384356)
chr6 (3-413)||(28251836-28252240)
chr6 (3-413)||(28356983-28357387)
chr6 (46-428)||(7586575-7586960)
chr6 (3-409)||(7751508-7751911)
chr6 (215-428)||(18554797-18555010)
chr6 (215-428)||(12953586-12953799)
chr6 (13-233)||(4292419-4292640)
chr6 (215-428)||(31930950-31931163)
chr6 (217-432)||(17047082-17047297)
chr6 (70-428)||(19452962-19453327)
chr6 (1-245)||(12353237-12353481)
chr6 (217-428)||(11205472-11205683)
chr6 (249-429)||(9934131-9934308)
chr6 (70-428)||(22386149-22386513)
chr6 (3-257)||(27504016-27504268)
chr6 (113-428)||(17608794-17609110)
chr6 (7-217)||(11147526-11147736)
chr6 (70-428)||(20635066-20635430)
chr6 (224-432)||(17063726-17063931)
chr6 (13-217)||(9933954-9934159)
chr6 (3-257)||(27474518-27474769)
chr6 (278-432)||(22292390-22292541)
chr6 (205-432)||(27474314-27474540)
chr6 (205-432)||(27503812-27504038)
chr6 (13-247)||(12953413-12953648)
chr6 (236-413)||(10404043-10404217)
chr6 (56-394)||(14070501-14070843)
chr6 (1-217)||(25735829-25736044)
chr6 (218-432)||(12353080-12353294)
chr6 (13-247)||(31931101-31931337)
chr6 (7-154)||(31543173-31543319)
chr6 (33-247)||(18554948-18555163)
chr6 (299-428)||(21119154-21119284)
chr6 (265-432)||(11147724-11147888)
chr6 (240-413)||(25583430-25583600)
chr6 (1-140)||(25679024-25679162)
chr6 (215-340)||(19289837-19289962)
chr6 (311-428)||(25678911-25679028)
chr6 (70-394)||(14051834-14052152)
chr6 (13-247)||(11205623-11205860)
chr6 (13-247)||(19289662-19289899)
chr6 (7-93)||(8653495-8653581)
chr6 (276-432)||(12416903-12417055)
chr6 (338-432)||(1902231-1902327)
chr6 (8-110)||(26023073-26023174)
chr6 (338-407)||(15551392-15551461)
chr6 (338-432)||(27819068-27819164)
chr6 (5-247)||(17063878-17064117)
chr6 (303-417)||(14757736-14757848)
chr6 (338-413)||(30120496-30120571)
chr6 (347-432)||(12575773-12575860)
chr6 (347-432)||(18720210-18720297)
chr6 (329-407)||(3680479-3680556)
chr6 (46-247)||(17047237-17047435)
chr6 (342-407)||(20113355-20113420)
chr6 (338-406)||(18027396-18027464)
chr6 (333-404)||(15478455-15478525)
chr6 (342-407)||(13435251-13435316)
chr6 (114-279)||(18027210-18027374)
chr6 (342-407)||(25929844-25929909)
chr6 (120-251)||(17446151-17446282)
chr6 (343-407)||(19623345-19623409)
chr6 (115-229)||(12715913-12716030)
chr6 (342-404)||(14101156-14101218)
chr6 (342-404)||(17927161-17927223)
chr6 (115-413)||(12422623-12422919)
chr6 (215-276)||(23006567-23006628)
chr6 (215-276)||(23781738-23781799)
chr6 (342-407)||(24719451-24719516)
chr6 (342-407)||(29917393-29917458)
chr6 (333-414)||(30372715-30372796)
chr6 (344-404)||(12347461-12347521)
chr6 (342-394)||(24116206-24116258)
chr6 (115-246)||(26941962-26942094)
chr6 (342-404)||(16528679-16528742)
chr6 (342-404)||(18377811-18377874)
chr6 (115-197)||(19625385-19625468)
chr6 (342-404)||(15301584-15301646)
chr6 (346-411)||(16739817-16739883)
chr6 (342-392)||(17303990-17304040)
chr6 (115-229)||(20731197-20731313)
chr6 (342-407)||(21624457-21624523)
chr6 (115-257)||(22076898-22077042)
chr6 (342-406)||(12041218-12041283)
chr6 (342-394)||(15954077-15954130)
chr6 (342-394)||(19482131-19482184)
chr6 (328-385)||(19625198-19625254)
chr6 (342-394)||(19952287-19952340)
chr6 (342-394)||(21234538-21234591)
chr6 (115-245)||(15395178-15395310)
chr6 (329-389)||(18434922-18434981)
chr6 (342-406)||(25591989-25592053)
chr6 (115-197)||(7763228-7763311)
chr6 (342-404)||(10631503-10631566)
chr6 (342-389)||(15395340-15395387)
chr6 (115-197)||(19470241-19470324)
chr6 (115-197)||(21034564-21034647)
chr6 (115-278)||(21234650-21234815)
chr6 (339-417)||(24471074-24471153)
chr6 (361-432)||(27720866-27720937)
chr6 (328-405)||(7763020-7763097)
chr6 (115-257)||(10631615-10631760)
chr6 (342-407)||(13601532-13601598)
chr6 (115-229)||(19085700-19085817)
chr6 (342-414)||(26588956-26589030)
chr6 (115-257)||(26589111-26589256)
chr6 (118-394)||(33352723-33352997)
chr6 (338-395)||(7811387-7811444)
chr6 (342-394)||(12716140-12716193)
chr6 (115-187)||(13601752-13601825)
chr6 (342-394)||(17380956-17381009)
chr6 (342-407)||(17446367-17446431)
chr6 (115-187)||(19066510-19066583)
chr6 (115-187)||(19482336-19482409)
chr6 (342-395)||(21034409-21034462)
chr6 (342-413)||(21617605-21617678)
chr6 (339-415)||(24481119-24481196)
chr6 (346-407)||(29537978-29538039)
chr6 (115-187)||(29597658-29597731)
chr6 (118-229)||(16914967-16915079)
chr6 (118-257)||(17927305-17927445)
chr6 (215-247)||(25736012-25736044)
chr6 (363-415)||(31720295-31720347)
chr6 (115-246)||(32335363-32335494)
chr6 (115-154)||(9717460-9717499)
chr6 (115-154)||(10705025-10705064)
chr6 (342-404)||(15532342-15532405)
chr6 (115-154)||(16265643-16265682)
chr6 (115-154)||(17317016-17317055)
chr6 (115-197)||(18172720-18172803)
chr6 (342-389)||(18172939-18172986)
chr6 (342-389)||(18226815-18226862)
chr6 (115-197)||(18226998-18227081)
chr6 (115-154)||(18435158-18435197)
chr6 (342-389)||(19470051-19470098)
chr6 (115-154)||(21617862-21617901)
chr6 (115-174)||(25595774-25595833)
chr6 (342-404)||(32543634-32543697)
chr6 (115-154)||(32543882-32543921)
chr6 (342-407)||(15986719-15986785)
chr6 (342-407)||(25593434-25593500)
chr6 (342-404)||(26185154-26185216)
chr6 (342-407)||(26941801-26941867)
chr6 (351-407)||(14732844-14732901)
chr6 (115-216)||(15478274-15478374)
chr6 (345-389)||(19066738-19066783)
chr6 (383-428)||(19289957-19290002)
chr6 (342-407)||(23296152-23296217)
chr6 (115-251)||(24729014-24729151)
chr6 (342-407)||(32335208-32335273)
chr6 (118-229)||(14100933-14101045)
chr6 (115-279)||(14923703-14923867)
chr6 (342-413)||(14923893-14923964)
chr6 (338-389)||(22801524-22801576)
chr6 (342-389)||(24729236-24729284)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (33-432)||(40030-40426)
[»] scaffold0154 (1 HSPs)
scaffold0154 (13-432)||(35064-35483)
[»] scaffold0084 (4 HSPs)
scaffold0084 (13-432)||(57093-57511)
scaffold0084 (70-428)||(790-1155)
scaffold0084 (342-407)||(31952-32018)
scaffold0084 (342-407)||(48698-48764)
[»] scaffold0407 (1 HSPs)
scaffold0407 (13-432)||(12427-12845)
[»] scaffold0497 (1 HSPs)
scaffold0497 (13-409)||(10598-10992)
[»] scaffold0012 (4 HSPs)
scaffold0012 (55-432)||(16130-16508)
scaffold0012 (13-428)||(127175-127592)
scaffold0012 (13-154)||(140608-140750)
scaffold0012 (68-154)||(8019-8107)
[»] scaffold0410 (1 HSPs)
scaffold0410 (13-429)||(15259-15674)
[»] scaffold0072 (1 HSPs)
scaffold0072 (5-413)||(37037-37441)
[»] scaffold0739 (1 HSPs)
scaffold0739 (13-404)||(1551-1939)
[»] scaffold0028 (5 HSPs)
scaffold0028 (3-432)||(14111-14538)
scaffold0028 (3-432)||(54424-54851)
scaffold0028 (328-404)||(80765-80840)
scaffold0028 (115-154)||(81015-81054)
scaffold0028 (342-389)||(24455-24503)
[»] scaffold0391 (1 HSPs)
scaffold0391 (5-431)||(2521-2946)
[»] scaffold0163 (2 HSPs)
scaffold0163 (3-428)||(29003-29428)
scaffold0163 (328-407)||(25826-25904)
[»] scaffold0068 (2 HSPs)
scaffold0068 (3-414)||(10902-11314)
scaffold0068 (3-414)||(8055-8474)
[»] scaffold0047 (2 HSPs)
scaffold0047 (5-413)||(33205-33609)
scaffold0047 (7-432)||(40759-41181)
[»] scaffold0322 (1 HSPs)
scaffold0322 (5-413)||(7188-7591)
[»] scaffold0386 (1 HSPs)
scaffold0386 (7-432)||(11885-12307)
[»] scaffold0105 (2 HSPs)
scaffold0105 (7-432)||(7487-7911)
scaffold0105 (7-432)||(37264-37688)
[»] scaffold0133 (2 HSPs)
scaffold0133 (7-432)||(30658-31082)
scaffold0133 (5-413)||(42823-43232)
[»] scaffold0027 (1 HSPs)
scaffold0027 (7-432)||(7148-7570)
[»] scaffold0747 (1 HSPs)
scaffold0747 (36-432)||(2218-2611)
[»] scaffold0185 (1 HSPs)
scaffold0185 (68-428)||(32335-32700)
[»] scaffold0017 (4 HSPs)
scaffold0017 (68-428)||(59260-59623)
scaffold0017 (46-425)||(40692-41076)
scaffold0017 (13-217)||(175062-175270)
scaffold0017 (249-432)||(174909-175090)
[»] scaffold0738 (1 HSPs)
scaffold0738 (224-432)||(5323-5531)
[»] scaffold0544 (2 HSPs)
scaffold0544 (215-428)||(10275-10488)
scaffold0544 (46-247)||(10135-10337)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (70-428)||(61075-61441)
[»] scaffold0570 (2 HSPs)
scaffold0570 (212-428)||(1-214)
scaffold0570 (70-428)||(2076-2439)
[»] scaffold0002 (5 HSPs)
scaffold0002 (70-428)||(475654-476018)
scaffold0002 (70-428)||(482174-482538)
scaffold0002 (303-413)||(100167-100272)
scaffold0002 (70-154)||(157029-157117)
scaffold0002 (342-394)||(111786-111838)
[»] scaffold0547 (2 HSPs)
scaffold0547 (215-428)||(276-489)
scaffold0547 (13-247)||(427-664)
[»] scaffold0443 (2 HSPs)
scaffold0443 (215-428)||(1525-1738)
scaffold0443 (44-247)||(1381-1587)
[»] scaffold0073 (3 HSPs)
scaffold0073 (215-428)||(57894-58107)
scaffold0073 (13-89)||(58170-58247)
scaffold0073 (131-227)||(58065-58161)
[»] scaffold0005 (3 HSPs)
scaffold0005 (215-428)||(60598-60813)
scaffold0005 (5-247)||(60751-60998)
scaffold0005 (342-407)||(211722-211788)
[»] scaffold0752 (4 HSPs)
scaffold0752 (215-428)||(763-976)
scaffold0752 (4-197)||(964-1159)
scaffold0752 (4-197)||(1579-1774)
scaffold0752 (215-350)||(1456-1591)
[»] scaffold0149 (2 HSPs)
scaffold0149 (224-429)||(38491-38695)
scaffold0149 (13-162)||(38308-38459)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (215-428)||(29282-29495)
scaffold0001 (13-227)||(29108-29324)
scaffold0001 (370-432)||(411983-412047)
[»] scaffold0655 (1 HSPs)
scaffold0655 (70-428)||(4461-4826)
[»] scaffold2071 (2 HSPs)
scaffold2071 (215-377)||(955-1117)
scaffold2071 (33-247)||(802-1017)
[»] scaffold0090 (4 HSPs)
scaffold0090 (217-428)||(204-415)
scaffold0090 (217-428)||(4584-4795)
scaffold0090 (33-247)||(355-571)
scaffold0090 (33-247)||(4735-4951)
[»] scaffold1263 (1 HSPs)
scaffold1263 (70-412)||(1531-1879)
[»] scaffold1321 (1 HSPs)
scaffold1321 (70-412)||(1338-1686)
[»] scaffold0177 (1 HSPs)
scaffold0177 (70-428)||(20776-21140)
[»] scaffold0050 (3 HSPs)
scaffold0050 (205-428)||(34962-35185)
scaffold0050 (113-275)||(35145-35308)
scaffold0050 (217-276)||(35174-35233)
[»] scaffold0422 (2 HSPs)
scaffold0422 (205-417)||(11087-11299)
scaffold0422 (113-275)||(11259-11422)
[»] scaffold0099 (3 HSPs)
scaffold0099 (22-413)||(18755-19165)
scaffold0099 (21-257)||(17270-17514)
scaffold0099 (343-401)||(17609-17670)
[»] scaffold0382 (1 HSPs)
scaffold0382 (299-428)||(1883-2013)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (3-161)||(2642-2799)
[»] scaffold0349 (3 HSPs)
scaffold0349 (235-367)||(13934-14068)
scaffold0349 (361-432)||(10284-10355)
scaffold0349 (189-247)||(14026-14084)
[»] scaffold0171 (2 HSPs)
scaffold0171 (265-413)||(11-155)
scaffold0171 (342-407)||(28106-28172)
[»] scaffold0627 (1 HSPs)
scaffold0627 (282-431)||(8650-8796)
[»] scaffold0207 (5 HSPs)
scaffold0207 (189-412)||(19923-20147)
scaffold0207 (113-273)||(20123-20284)
scaffold0207 (114-255)||(10240-10382)
scaffold0207 (217-275)||(10250-10308)
scaffold0207 (217-275)||(20151-20209)
[»] scaffold0018 (3 HSPs)
scaffold0018 (205-412)||(7026-7234)
scaffold0018 (70-275)||(6856-7066)
scaffold0018 (217-276)||(6978-7037)
[»] scaffold1200 (1 HSPs)
scaffold1200 (285-413)||(1-124)
[»] scaffold0007 (4 HSPs)
scaffold0007 (13-162)||(59601-59752)
scaffold0007 (215-291)||(59775-59851)
scaffold0007 (115-257)||(63883-64027)
scaffold0007 (329-394)||(46044-46109)
[»] scaffold0771 (2 HSPs)
scaffold0771 (249-428)||(5747-5927)
scaffold0771 (70-215)||(5901-6051)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (113-428)||(38534-38852)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (276-411)||(23322-23452)
[»] scaffold0220 (2 HSPs)
scaffold0220 (217-428)||(2338-2551)
scaffold0220 (70-245)||(2216-2396)
[»] scaffold0011 (7 HSPs)
scaffold0011 (156-422)||(165125-165393)
scaffold0011 (333-406)||(251037-251110)
scaffold0011 (115-280)||(65859-66027)
scaffold0011 (346-413)||(145132-145201)
scaffold0011 (115-154)||(144904-144943)
scaffold0011 (342-404)||(58934-58996)
scaffold0011 (342-394)||(66083-66136)
[»] scaffold1507 (1 HSPs)
scaffold1507 (332-428)||(19-115)
[»] scaffold1409 (1 HSPs)
scaffold1409 (338-413)||(1760-1835)
[»] scaffold0414 (2 HSPs)
scaffold0414 (338-413)||(1437-1512)
scaffold0414 (115-154)||(7611-7650)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (113-428)||(9312-9632)
[»] scaffold0272 (1 HSPs)
scaffold0272 (3-85)||(13907-13989)
[»] scaffold0211 (2 HSPs)
scaffold0211 (205-428)||(19-244)
scaffold0211 (217-275)||(1-59)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (304-432)||(155682-155807)
[»] scaffold0289 (1 HSPs)
scaffold0289 (338-432)||(4255-4351)
[»] scaffold0081 (2 HSPs)
scaffold0081 (115-257)||(13558-13701)
scaffold0081 (342-407)||(13410-13475)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (338-432)||(61149-61245)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (70-318)||(4301-4554)
[»] scaffold0269 (3 HSPs)
scaffold0269 (299-401)||(16338-16441)
scaffold0269 (70-230)||(6825-6990)
scaffold0269 (217-257)||(6828-6868)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (343-413)||(52370-52440)
[»] scaffold0251 (2 HSPs)
scaffold0251 (350-413)||(21367-21430)
scaffold0251 (115-152)||(7443-7480)
[»] scaffold0194 (1 HSPs)
scaffold0194 (338-413)||(4459-4534)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (21-119)||(16349-16448)
[»] scaffold1281 (1 HSPs)
scaffold1281 (342-407)||(2064-2129)
[»] scaffold0004 (9 HSPs)
scaffold0004 (115-251)||(244734-244870)
scaffold0004 (342-407)||(219606-219671)
scaffold0004 (343-407)||(244961-245025)
scaffold0004 (342-395)||(87788-87841)
scaffold0004 (115-280)||(210889-211057)
scaffold0004 (115-197)||(219814-219897)
scaffold0004 (342-389)||(378226-378273)
scaffold0004 (115-251)||(87926-88063)
scaffold0004 (115-174)||(377999-378059)
[»] scaffold1820 (1 HSPs)
scaffold1820 (299-428)||(1178-1309)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (3-53)||(52407-52457)
[»] scaffold0040 (4 HSPs)
scaffold0040 (115-279)||(4464-4629)
scaffold0040 (342-407)||(6815-6880)
scaffold0040 (328-407)||(2726-2804)
scaffold0040 (206-257)||(8279-8330)
[»] scaffold0567 (1 HSPs)
scaffold0567 (342-407)||(9272-9337)
[»] scaffold0525 (1 HSPs)
scaffold0525 (356-413)||(7217-7274)
[»] scaffold0035 (3 HSPs)
scaffold0035 (328-404)||(20136-20211)
scaffold0035 (115-251)||(29315-29452)
scaffold0035 (115-154)||(19921-19960)
[»] scaffold0146 (1 HSPs)
scaffold0146 (344-407)||(14484-14547)
[»] scaffold0116 (2 HSPs)
scaffold0116 (115-229)||(21429-21544)
scaffold0116 (115-151)||(2427-2463)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (115-257)||(144421-144564)
scaffold0020 (328-394)||(144285-144350)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (342-404)||(16808-16870)
[»] scaffold0247 (1 HSPs)
scaffold0247 (342-413)||(16394-16467)
[»] scaffold0120 (1 HSPs)
scaffold0120 (342-407)||(37425-37490)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (342-407)||(76612-76677)
scaffold0037 (131-243)||(76743-76856)
[»] scaffold0498 (2 HSPs)
scaffold0498 (118-257)||(729-869)
scaffold0498 (338-406)||(3934-4001)
[»] scaffold0210 (1 HSPs)
scaffold0210 (115-229)||(1201-1317)
[»] scaffold1747 (2 HSPs)
scaffold1747 (115-229)||(862-976)
scaffold1747 (329-388)||(707-765)
[»] scaffold0330 (2 HSPs)
scaffold0330 (115-280)||(107-274)
scaffold0330 (344-407)||(332-396)
[»] scaffold0273 (3 HSPs)
scaffold0273 (115-197)||(5205-5288)
scaffold0273 (342-395)||(22396-22449)
scaffold0273 (217-257)||(22558-22598)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (342-404)||(59449-59511)
scaffold0026 (342-406)||(7293-7356)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (342-407)||(73948-74014)
[»] scaffold0009 (4 HSPs)
scaffold0009 (342-404)||(268152-268214)
scaffold0009 (115-197)||(268356-268439)
scaffold0009 (342-407)||(83759-83825)
scaffold0009 (115-154)||(84011-84050)
[»] scaffold1657 (2 HSPs)
scaffold1657 (115-191)||(1421-1498)
scaffold1657 (329-407)||(1209-1285)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (342-407)||(2460-2525)
[»] scaffold0351 (1 HSPs)
scaffold0351 (342-407)||(9666-9731)
[»] scaffold0280 (2 HSPs)
scaffold0280 (342-413)||(3346-3419)
scaffold0280 (115-187)||(3183-3255)
[»] scaffold0205 (3 HSPs)
scaffold0205 (115-187)||(393-466)
scaffold0205 (342-394)||(618-671)
scaffold0205 (115-174)||(258-318)
[»] scaffold0078 (2 HSPs)
scaffold0078 (342-407)||(32465-32530)
scaffold0078 (115-257)||(32239-32382)
[»] scaffold0067 (2 HSPs)
scaffold0067 (338-407)||(17009-17078)
scaffold0067 (115-144)||(16827-16856)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (342-403)||(86-147)
scaffold0003 (118-187)||(90513-90582)
[»] scaffold1359 (2 HSPs)
scaffold1359 (329-389)||(1323-1382)
scaffold1359 (115-154)||(1109-1148)
[»] scaffold0161 (2 HSPs)
scaffold0161 (346-413)||(10791-10859)
scaffold0161 (346-413)||(15455-15523)
[»] scaffold0069 (2 HSPs)
scaffold0069 (345-411)||(5950-6018)
scaffold0069 (115-154)||(5778-5817)
[»] scaffold1745 (2 HSPs)
scaffold1745 (329-388)||(646-704)
scaffold1745 (115-229)||(435-549)
[»] scaffold0022 (3 HSPs)
scaffold0022 (119-229)||(158653-158764)
scaffold0022 (342-404)||(36799-36861)
scaffold0022 (342-404)||(134859-134921)
[»] scaffold0488 (2 HSPs)
scaffold0488 (345-413)||(11556-11626)
scaffold0488 (115-229)||(11738-11855)
[»] scaffold0479 (1 HSPs)
scaffold0479 (342-407)||(9330-9396)
[»] scaffold0439 (1 HSPs)
scaffold0439 (329-394)||(7408-7473)
[»] scaffold0359 (2 HSPs)
scaffold0359 (115-229)||(6144-6261)
scaffold0359 (342-407)||(6368-6434)
[»] scaffold0334 (1 HSPs)
scaffold0334 (115-229)||(7367-7484)
[»] scaffold0324 (2 HSPs)
scaffold0324 (115-228)||(9501-9615)
scaffold0324 (342-407)||(9323-9389)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (115-169)||(7696-7749)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (345-413)||(35427-35497)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (115-229)||(88054-88171)
[»] scaffold0859 (2 HSPs)
scaffold0859 (342-394)||(2361-2414)
scaffold0859 (115-154)||(2599-2638)
[»] scaffold0622 (2 HSPs)
scaffold0622 (342-407)||(2027-2092)
scaffold0622 (342-407)||(4041-4106)
[»] scaffold0530 (2 HSPs)
scaffold0530 (342-407)||(2696-2760)
scaffold0530 (115-154)||(2440-2479)
[»] scaffold0275 (1 HSPs)
scaffold0275 (342-394)||(24010-24063)
[»] scaffold0664 (2 HSPs)
scaffold0664 (217-257)||(909-949)
scaffold0664 (113-216)||(920-1024)
[»] scaffold0471 (2 HSPs)
scaffold0471 (347-413)||(2807-2875)
scaffold0471 (115-192)||(2886-2963)
[»] scaffold0036 (2 HSPs)
scaffold0036 (205-257)||(111196-111248)
scaffold0036 (338-394)||(111326-111382)
[»] scaffold0772 (1 HSPs)
scaffold0772 (115-154)||(1331-1370)
[»] scaffold0607 (1 HSPs)
scaffold0607 (115-154)||(5625-5664)
[»] scaffold0515 (1 HSPs)
scaffold0515 (115-154)||(5801-5840)
[»] scaffold0426 (1 HSPs)
scaffold0426 (115-154)||(13191-13230)
[»] scaffold0306 (1 HSPs)
scaffold0306 (115-154)||(5811-5850)
[»] scaffold0261 (1 HSPs)
scaffold0261 (368-432)||(10201-10267)
[»] scaffold0217 (3 HSPs)
scaffold0217 (115-154)||(18648-18687)
scaffold0217 (115-154)||(22584-22623)
scaffold0217 (346-394)||(18411-18460)
[»] scaffold0199 (1 HSPs)
scaffold0199 (366-413)||(17882-17929)
[»] scaffold0176 (1 HSPs)
scaffold0176 (115-169)||(8758-8813)
[»] scaffold0364 (1 HSPs)
scaffold0364 (342-407)||(5581-5647)
[»] scaffold0315 (1 HSPs)
scaffold0315 (342-407)||(8025-8091)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (342-407)||(2597-2663)
[»] scaffold0023 (1 HSPs)
scaffold0023 (344-389)||(102954-103000)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (115-229)||(263-380)
[»] scaffold1339 (1 HSPs)
scaffold1339 (205-254)||(1776-1825)
[»] scaffold1107 (1 HSPs)
scaffold1107 (115-144)||(2767-2796)
[»] scaffold0758 (1 HSPs)
scaffold0758 (342-407)||(3675-3740)
[»] scaffold0290 (1 HSPs)
scaffold0290 (342-394)||(19301-19354)
[»] scaffold0043 (2 HSPs)
scaffold0043 (342-411)||(2441-2510)
scaffold0043 (329-388)||(79024-79083)
[»] scaffold0352 (1 HSPs)
scaffold0352 (118-154)||(1277-1313)
[»] scaffold0340 (1 HSPs)
scaffold0340 (360-415)||(17385-17441)
[»] scaffold0311 (2 HSPs)
scaffold0311 (342-378)||(19473-19509)
scaffold0311 (216-256)||(19621-19661)
[»] scaffold0064 (2 HSPs)
scaffold0064 (114-154)||(44342-44382)
scaffold0064 (342-394)||(44541-44593)


Alignment Details
Target: scaffold0042 (Bit Score: 312; Significance: 1e-176; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 312; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 5241 - 4825
Alignment:
Q  13 aaaagcgtcaaaactctgtcaa-tttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtctttatt 111  Q
    ||||||| |||||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  5241 aaaagcgccaaaactctgccaaatttgattctaaaaagcactttgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcttaagtctagagtctttatt 5142  T
Q  112 acattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgctt 210  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5141 gcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacat-tttctgtgtatttttgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgctt 5043  T
Q  211 gagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagagagtattgagcat 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  5042 gagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcata-ctagagagtattgagcat 4944  T
Q  311 ttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtg 410  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4943 ttgtaatctgtgtgattattt---gtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaaccaggataattgcttgtg 4847  T
Q  411 tctctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||| ||||||||||||||    
T  4846 tctctctttcttttctctgctc 4825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 312; Significance: 1e-176; HSPs: 230)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 312; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 13 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 8933511 - 8933099
Alignment:
Q  13 aaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtctttatta 112  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||     
T  8933511 aaaagcgccaaaactctgccaatttgattctaaaaagcactttgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattctcaagtctagagtctttattg 8933412  T
Q  113 cattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttg 211  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8933411 cattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacat-tttctgtgtaattttgtttgaatagaagtctctcgcctgcgtgcttg 8933313  T
Q  212 agcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagagagtattgagcatt 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  8933312 agcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcata-ctagagagtattgagcatt 8933214  T
Q  312 tgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgt 411  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8933213 tgtaatctgtgtgatta---ttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaaccaggataattgcttgtgt 8933117  T
Q  412 ctctctgtcttttctctg 429  Q
    |||||| |||||||||||    
T  8933116 ctctctttcttttctctg 8933099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 5 - 431
Target Start/End: Original strand, 38403554 - 38403979
Alignment:
Q  5 acaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaa-tttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagag 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38403554 acaagttaaaaagcgccaaaactctgccaaatttgattctacaaagcactttgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcacaagtctagag 38403653  T
Q  104 tctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttc-aagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcct 202  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || |||||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  38403654 tctttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaaatcaaacat-tttttctgtatctttgtttgaatagaagcctctcgcct 38403752  T
Q  203 gcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca-tttgagaagtctcataccaagagagt 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||  |||||||    
T  38403753 gcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagactcttgcctgcgtgcttgagtattttgagaagtctcatacttagagagt 38403852  T
Q  302 attgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataa 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38403853 attgagcatttgtaatctgtgtgatta---ttagtgaaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaaccaggataa 38403949  T
Q  402 ttgcttgtgtctctctgtcttttctctgct 431  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38403950 ttgcttgtgtctctctttcttttctctgct 38403979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 18441144 - 18440727
Alignment:
Q  13 aaaagcgtcaaaactctgtcaa-tttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtctttatt 111  Q
    ||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  18441144 aaaagcgccaaaactctgccaaatttgattctacaaagcactttgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcttaagtctagagtctttatt 18441045  T
Q  112 acattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgctt 210  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||  ||||| |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18441044 gcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacac-tttctgtgtatttctgtttgattagaagcctctcgcctgcgtgctt 18440946  T
Q  211 gagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagagagtattgagcat 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18440945 gagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcatactaagagagtattgagcat 18440846  T
Q  311 ttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtg 410  Q
    ||||||||| || |||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18440845 ttgtaatctttgagatta---ttagtgaaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaaccaggataattgcttgtg 18440749  T
Q  411 tctctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||| ||||||||||||||    
T  18440748 tctctctttcttttctctgctc 18440727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 13 - 429
Target Start/End: Original strand, 12734516 - 12734929
Alignment:
Q  13 aaaagcgtcaaaactctgtcaa-tttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtctttatt 111  Q
    ||||||| ||| |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  12734516 aaaagcgccaacactctgccaaatttgattctataaagcactttgaatttctgcacttatttgatacatcttagaaattctcaagtctagagtctttatt 12734615  T
Q  112 acattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgctt 210  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| ||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12734616 gcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacat-tttctgtgtaactttgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgctt 12734714  T
Q  211 gagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagagagtattgagcat 310  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  12734715 gagccttagaagaatcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcata-ctagagagtattgagcat 12734813  T
Q  311 ttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtg 410  Q
    ||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12734814 ttgtaatctttgtgatta---ttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaaccaggataattgcttgtg 12734910  T
Q  411 tctctctgtcttttctctg 429  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  12734911 tctctctttcttttctctg 12734929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 13 - 429
Target Start/End: Original strand, 26209900 - 26210313
Alignment:
Q  13 aaaagcgtcaaaactctgtcaa-tttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtctttatt 111  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||   |||||||||||||||||    
T  26209900 aaaagcgccaaaactctgtcaaatttgattctataaagcactttgaatttctgcactgatttgatatatcttataaattcttaagtctagagtctttatt 26209999  T
Q  112 acattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgctt 210  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  26210000 gcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacat-tttctgtgtaattttgtttgaatagtagtctctcccctgcgtgctt 26210098  T
Q  211 gagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagagagtattgagcat 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  26210099 gagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcata-ctagagagtattgagcat 26210197  T
Q  311 ttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtg 410  Q
     |||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26210198 ctgtaatctgtgtgatta---ttagtgggaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaaccaggataattgcttgtg 26210294  T
Q  411 tctctctgtcttttctctg 429  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  26210295 tctctctttcttttctctg 26210313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 13 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 29589941 - 29589523
Alignment:
Q  13 aaaagcgtcaaaactctgtcaa-tttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtctttatt 111  Q
    ||||||| |||||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  29589941 aaaagcgccaaaactctgccaaatttgattctaaaaagcactttgaatttctgcactgatttgatatatcttagaaattcttaagtctagagtctttatt 29589842  T
Q  112 acattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgctt 210  Q
     ||||||| ||||||||| ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||  ||||| |||| ||  |||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  29589841 gcattgtaatgtgaacaccacttattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacaattttctgtgtaattctgtttgattagaagtctctcgcctgcgtgctt 29589742  T
Q  211 gagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagagagtattgagcat 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||    
T  29589741 gagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcata-ctagatagtattgagcat 29589643  T
Q  311 ttgtaatctgtgtgattattt-ttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgt 409  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29589642 ttgtgatctgtgtgattatttcttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaaccaggataattgcttgt 29589543  T
Q  410 gtctctctgtcttttctctg 429  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  29589542 gtctctctttcttttctctg 29589523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 13682268 - 13681853
Alignment:
Q  13 aaaagcgtcaaaactctgtcaa-tttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtctttatt 111  Q
    ||||||| |||||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  13682268 aaaagcgccaaaactctgccaaatttgattctataaagcactttgaatttctgcactgatttgatatatcttagaaattcataagtctagagtctttatt 13682169  T
Q  112 acattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgctt 210  Q
     ||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||  |||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13682168 gcattgtattgtgaacaccattgattgtatatcaagtgtttaaagtcaaacat-tttcggtgtaattttgtttgattagaagcctctcgcctgcgtgctt 13682070  T
Q  211 gagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagagagtattgagcat 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  13682069 gagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcata-ctagagagtattgagcat 13681971  T
Q  311 ttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtg 410  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13681970 ttgtaatctgtgtgatta---ttagtggaaatctccttcgaagtgcaa-ggggtctggactacttccggtttgtggaaggaaccaggataattgcttgtg 13681875  T
Q  411 tctctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||| ||||||||||||||    
T  13681874 tctctctttcttttctctgctc 13681853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 13 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 18419063 - 18418674
Alignment:
Q  13 aaaagcgtcaaaactctgtcaa-tttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtctttatt 111  Q
    ||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  18419063 aaaagcgccaaaactctgccaaatttgattctacaaagcactttgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcttaagtctagagtctttatt 18418964  T
Q  112 acattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgctt 210  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||  ||||| |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18418963 gcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacac-tttctgtgtatttctgtttgattagaagcctctcgcctgcgtgctt 18418865  T
Q  211 gagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagagagtattgagcat 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18418864 gagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcatactaagagagtattgagcat 18418765  T
Q  311 ttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    ||||||||| || |||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18418764 ttgtaatctttgagatta---ttagtgaaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaaccaggataattg 18418674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 13 - 428
Target Start/End: Original strand, 3476692 - 3477104
Alignment:
Q  13 aaaagcgtcaaaactctgtcaa-tttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtctttatt 111  Q
    |||||||  ||||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  3476692 aaaagcgctaaaactctgccaaatttgattctaaaaagcactttgaatttctgcactgatttgatatatcttagaaattcttaagtctagagtctttatt 3476791  T
Q  112 acattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttg 211  Q
     |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||| |||| ||  |||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  3476792 gcattgtattgtgaacaccgctgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacaattttctgtgtaattctgtttgattagaagtctctcgcctgcgtgcttg 3476891  T
Q  212 agcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagagagtattgagcatt 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  3476892 agcattagaagactcttgctttagtgcttaagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcata-ctagagagtattgagcatt 3476990  T
Q  312 tgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgt 411  Q
    |||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3476991 tgtaatctgtgtgatta---ttagtgaaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaaccaggataattgcttgtgt 3477087  T
Q  412 ctctctgtcttttctct 428  Q
    || ||| ||||||||||    
T  3477088 ctttctttcttttctct 3477104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 48382138 - 48381718
Alignment:
Q  13 aaaagcgtcaaaactctgtcaa---tttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtcttta 109  Q
    ||||||| |||||||||| |||   |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  48382138 aaaagcgccaaaactctgccaaaaatttgattctacaaagcactttgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcttaagtctagagtcttta 48382039  T
Q  110 ttacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgc 208  Q
    || ||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| |||| ||  |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  48382038 ttgcattgtattgtgaacaccattgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacat-tttctgtgtaattctgtttgattagaagcctcttgcctgcgtgc 48381940  T
Q  209 ttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca-tttgagaagtctcataccaagagagtattgag 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  48381939 ttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtccctcgcctgcgtgcttgagcattttgagaagtctcatacttagagagtattgag 48381840  T
Q  308 catttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  48381839 catttgtaatctgtgtgatta---ttagtgaaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtgaaaggaactaggataattgctt 48381743  T
Q  408 gtgtctctctgtcttttctctgctc 432  Q
    |||||||||| ||||||||||||||    
T  48381742 gtgtctctctttcttttctctgctc 48381718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 13 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 15216265 - 15215852
Alignment:
Q  13 aaaagcgtcaaaactctgtcaa-tttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtctttatt 111  Q
    ||||||| |||||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  15216265 aaaagcgccaaaactctgccaaatttgattctaaaaagcactttgaatttctgcactgatttgatatatcttagaaattcttaagtctagagtctttatt 15216166  T
Q  112 acattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgctt 210  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| | || ||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  15216165 gcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacat-tttctgtataattttgtttgaatagaagtctctagcctgcgtgctt 15216067  T
Q  211 gagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagagagtattgagcat 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  15216066 gagcattagaagactcttgctttagtgctttagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcata-ctagagagtattgagcat 15215968  T
Q  311 ttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtg 410  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15215967 ttgtaatctgtgtgatta--tttagttaaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaaccaggataattgcttgtg 15215870  T
Q  411 tctctctgtcttttctct 428  Q
    ||  ||| ||||||||||    
T  15215869 tccttctttcttttctct 15215852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 3 - 431
Target Start/End: Original strand, 40055094 - 40055520
Alignment:
Q  3 atacaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctaga 102  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40055094 atacaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacatagcacattgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcacaagtctaga 40055193  T
Q  103 gtctttattacattgta-ttgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgc 200  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| | ||||| |||||||| ||||||| ||||| |||| ||    
T  40055194 gtctttattgcattgtatttgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaggtcaaac-tttttctgtgtatttttgtttgaacagaagtctcttgc 40055292  T
Q  201 ctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagag 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||    
T  40055293 ctgcgtgcttgagcattagaagactattgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcctgcgtgcttgagcatttttgagaagtctcatacttagag 40055391  T
Q  299 agtattgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccagga 398  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  40055392 agtattgagcatttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaaccagga 40055486  T
Q  399 taattgcttgtgtctctc-tgtcttttctctgct 431  Q
    ||| |||||||||||| | | |||||||||||||    
T  40055487 taactgcttgtgtctcgcttttcttttctctgct 40055520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 5 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 3165691 - 3165266
Alignment:
Q  5 acaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagt 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  3165691 acaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaaaagtctagagt 3165592  T
Q  105 ctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgc 204  Q
    ||| |||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| || |||  |||||||| ||||||  |||||||||| ||||||    
T  3165591 cttaattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttaattcattgtatttttgtttgatcagaagcctcttgcctgc 3165492  T
Q  205 gtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||    
T  3165491 gtgcttgagcattagaagactcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcatacttagagagta 3165393  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||     
T  3165392 ttgagcatttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaaccaggataac 3165298  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  3165297 tgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 3165266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 5 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 1367586 - 1367182
Alignment:
Q  5 acaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagt 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  1367586 acaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaaaagtctagagt 1367487  T
Q  105 ctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgc 204  Q
    |||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| || |||  |||||||| ||||||  |||||||||| ||||||    
T  1367486 ctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttaattcattgtatttttgtttgatcagaagcctcttgcctgc 1367387  T
Q  205 gtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||    
T  1367386 gtgcttgagcattagaagactcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcatacttagagagta 1367288  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||     
T  1367287 ttgagcatttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccattttgtggaaggaaccaggataac 1367193  T
Q  403 tgcttgtgtct 413  Q
    |||||||||||    
T  1367192 tgcttgtgtct 1367182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 5 - 413
Target Start/End: Original strand, 15888672 - 15889076
Alignment:
Q  5 acaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagt 104  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  15888672 acaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaaattgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaaaagtctagagt 15888771  T
Q  105 ctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgc 204  Q
    |||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||  |||||||| ||||||  |||||||||| ||||||    
T  15888772 ctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactaatttcattgtatttttgtttgatcagaagcctcttgcctgc 15888871  T
Q  205 gtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||    
T  15888872 gtgcttgagcattagaagactcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcatacttagagagta 15888970  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||     
T  15888971 ttgagcatttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgttttgtggaaggaaccaggataac 15889065  T
Q  403 tgcttgtgtct 413  Q
    |||||||||||    
T  15889066 tgcttgtgtct 15889076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 5 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 30049476 - 30049072
Alignment:
Q  5 acaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagt 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  30049476 acaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaaaagtctagagt 30049377  T
Q  105 ctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgc 204  Q
    |||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||  ||||| |||| || |||    
T  30049376 ctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttatttctttgtatttttgtttgatcagaagactcttgcatgc 30049277  T
Q  205 gtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||    
T  30049276 gtgcttgagcattagaagactcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcatacttagagagta 30049178  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||     
T  30049177 ttgagcatttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactactttcgttttgtggaaggaaccaggataac 30049083  T
Q  403 tgcttgtgtct 413  Q
    |||||||||||    
T  30049082 tgcttgtgtct 30049072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 20490967 - 20490538
Alignment:
Q  1 acatacaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtcta 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  20490967 acatacaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaaaagtcta 20490868  T
Q  101 gagtctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgc 200  Q
    ||||||| |||  |||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| |||||||| || |||  |||||||| ||||||  |||||||||| ||    
T  20490867 gagtcttaattgtattgtattgtgaaccccactgattgtatatcaagtgttcgagtcaaacttaattcattgtatttttgtttgatcagaagcctcttgc 20490768  T
Q  201 ctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagag 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||||||||||||||||  ||||    
T  20490767 ctgcgtgcttgagcattagaagactcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcatacttagag 20490669  T
Q  299 agtattgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccagga 398  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  20490668 agtattgagcatttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgttttgtggaaggaaccagga 20490574  T
Q  399 taattgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||| ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  20490573 taactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 20490538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 3 - 409
Target Start/End: Original strand, 21770284 - 21770686
Alignment:
Q  3 atacaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctaga 102  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  21770284 atacaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatatatcttagaaattcaaaagtctaga 21770383  T
Q  103 gtctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcct 202  Q
    |||||||    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||  |||||||||| ||||    
T  21770384 gtctttaacgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttatttcattgtatttttgtttgatcagaagcctcttgcct 21770483  T
Q  203 gcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagag 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||    
T  21770484 gcgtgcttgagcattagaagactcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcatacttagagag 21770582  T
Q  301 tattgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggata 400  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  21770583 tattgagcatttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaaccaggata 21770677  T
Q  401 attgcttgt 409  Q
    | |||||||    
T  21770678 actgcttgt 21770686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 5 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 589169 - 588765
Alignment:
Q  5 acaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagt 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||    
T  589169 acaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaaaagtttagagt 589070  T
Q  105 ctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgc 204  Q
    |||||    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  |||||||| ||||||  ||||| |||| ||||||    
T  589069 ctttaacgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacataattcattgtatttttgtttgatcagaagtctcttgcctgc 588970  T
Q  205 gtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| || || |||||||||||  |||||||||||||||||  ||| ||||    
T  588969 gtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgaacattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcatacttagatagta 588871  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||     
T  588870 ttgagcatttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaaccaggataac 588776  T
Q  403 tgcttgtgtct 413  Q
    |||||||||||    
T  588775 tgcttgtgtct 588765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 3 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 9170144 - 9169738
Alignment:
Q  3 atacaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctaga 102  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||    
T  9170144 atacaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaatttaaaagtctaga 9170045  T
Q  103 gtctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcct 202  Q
    |||||||    ||| |||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||  |||||||||| || |    
T  9170044 gtctttaacgtattatattgtgaacaccactgattgtttatcaagtgttcaagtcaaacttatttcattgtatttttgtttgatcagaagcctcttgctt 9169945  T
Q  203 gcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagag 300  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||    
T  9169944 gcgtgcttgagcattagaagcctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcatacttagagag 9169846  T
Q  301 tattgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggata 400  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  9169845 tattgatcatttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaaccaggata 9169751  T
Q  401 attgcttgtgtct 413  Q
    | || ||||||||    
T  9169750 actgnttgtgtct 9169738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 3 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 9159689 - 9159283
Alignment:
Q  3 atacaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctaga 102  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||    
T  9159689 atacaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaatttaaaagtctaga 9159590  T
Q  103 gtctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcct 202  Q
    |||||||    ||| |||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||  |||||||||| || |    
T  9159589 gtctttaacgtattatattgtgaacaccactgattgtttatcaagtgttcaagtcaaacttatttcattgtatttttgtttgatcagaagcctcttgctt 9159490  T
Q  203 gcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagag 300  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||    
T  9159489 gcgtgcttgagcattagaagcctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcatacttagagag 9159391  T
Q  301 tattgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggata 400  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  9159390 tattgatcatttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaaccaggata 9159296  T
Q  401 attgcttgtgtct 413  Q
    | || ||||||||    
T  9159295 actgtttgtgtct 9159283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 5 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 9433219 - 9432795
Alignment:
Q  5 acaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagt 104  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  9433219 acaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagt 9433121  T
Q  105 ctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgc 204  Q
    |||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||  ||||| |||| ||||||    
T  9433120 ctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgaatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgatcagaagtctcttgcctgc 9433021  T
Q  205 gtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatt--tgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||||  || ||||||||||||  ||| ||||    
T  9433020 gtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttgtgtgaagtctcatacttagaaagta 9432922  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  9432921 ttgagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 9432827  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  9432826 tgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 9432795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 22099691 - 22099269
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  22099691 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 22099593  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  22099592 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 22099493  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagtatt 304  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||  |||| ||||||||||||  ||| ||||||    
T  22099492 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcatgcgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatacttagaaagtatt 22099394  T
Q  305 gagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||    
T  22099393 gagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactg 22099299  T
Q  405 cttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  22099298 cttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 22099269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Original strand, 26653672 - 26654094
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  26653672 aagtttaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 26653770  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||    
T  26653771 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctctcgcctgcgt 26653870  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagtatt 304  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||  ||| ||||||    
T  26653871 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatacttagaaagtatt 26653969  T
Q  305 gagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||    
T  26653970 gagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactg 26654064  T
Q  405 cttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  26654065 cttgtgtccttgtctttcttttctctgctc 26654094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Original strand, 26700001 - 26700423
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  26700001 aagtttaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 26700099  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||    
T  26700100 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctctcgcctgcgt 26700199  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagtatt 304  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||  ||| ||||||    
T  26700200 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatacttagaaagtatt 26700298  T
Q  305 gagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||    
T  26700299 gagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactg 26700393  T
Q  405 cttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  26700394 cttgtgtccttgtctttcttttctctgctc 26700423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 8 - 431
Target Start/End: Original strand, 31116857 - 31117277
Alignment:
Q  8 agttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtctt 107  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  31116857 agttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatatatcttagaaattcaaaagtctagagtctt 31116956  T
Q  108 tattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtg 207  Q
    ||    ||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||  ||||| |||| ||||||| |    
T  31116957 taacgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttatttcattgtatttttgtttgatcagaagactcttgcctgcgcg 31117056  T
Q  208 cttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagtattg 305  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||  |||||||||||    
T  31117057 cttgagcattagaagtctcttgc-ttattgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatacttagagagtattg 31117155  T
Q  306 agcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgc 405  Q
    |||||||||||||| ||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||    
T  31117156 agcatttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgttttgtggaaggaaccaggataactgc 31117250  T
Q  406 ttgtgtctctc-tgtcttttctctgct 431  Q
    ||||||||| | | |||||||||||||    
T  31117251 ttgtgtctcgcttttcttttctctgct 31117277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 3 - 413
Target Start/End: Original strand, 21003351 - 21003756
Alignment:
Q  3 atacaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctaga 102  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  21003351 atacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaaattgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctaga 21003449  T
Q  103 gtctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcct 202  Q
    |||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||  ||||| |||| ||||    
T  21003450 gtctttattgtattgtattgtgaacatcactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgatcagaagtctcttgcct 21003549  T
Q  203 gcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagag 300  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||  ||| ||    
T  21003550 gcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatacttagaaag 21003648  T
Q  301 tattgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggata 400  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  21003649 tattgagcatttgtaatctttgttatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggata 21003743  T
Q  401 attgcttgtgtct 413  Q
    | |||||||||||    
T  21003744 actgcttgtgtct 21003756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 3 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 20989610 - 20989184
Alignment:
Q  3 atacaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctaga 102  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  20989610 atacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaaattgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctaga 20989512  T
Q  103 gtctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcct 202  Q
    |||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||  ||||| |||| | ||    
T  20989511 gtctttattgtattgtattgtgaacatcactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgatcagaagtctcttgtct 20989412  T
Q  203 gcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagag 300  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||  ||| ||    
T  20989411 gcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatacttagaaag 20989313  T
Q  301 tattgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggata 400  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  20989312 tattgagcatctgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggata 20989218  T
Q  401 attgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    | ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  20989217 actgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 20989184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 22089076 - 22088654
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  22089076 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 22088978  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  22088977 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 22088878  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagtatt 304  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||| ||||||||||  |||| ||||||||||||  ||| ||||||    
T  22088877 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcatgcatgcttgagcatttttgtgaagtctcatacttagaaagtatt 22088779  T
Q  305 gagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||    
T  22088778 gagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactg 22088684  T
Q  405 cttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  22088683 cttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 22088654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 7 - 413
Target Start/End: Original strand, 24930950 - 24931352
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  24930950 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 24931048  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  24931049 ttactgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaactcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 24931148  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca---tttgagaagtctcataccaagagagtat 303  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||   |||| ||||||||||||  ||| |||||    
T  24931149 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcttgtgtgcttgagcaatttttgtgaagtctcatacttagaaagtat 24931247  T
Q  304 tgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataatt 403  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| |    
T  24931248 tgagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataact 24931342  T
Q  404 gcttgtgtct 413  Q
    ||||||||||    
T  24931343 gcttgtgtct 24931352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 37344153 - 37343731
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  37344153 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 37344055  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  37344054 ttactgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaactcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 37343955  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagtatt 304  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||  ||| ||||||    
T  37343954 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatacttagaaagtatt 37343856  T
Q  305 gagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||    
T  37343855 gagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaaatgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactg 37343761  T
Q  405 cttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  37343760 cttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 37343731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Original strand, 40042455 - 40042879
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  40042455 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 40042553  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||    
T  40042554 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctctcgcctgcgt 40042653  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||  ||| ||||    
T  40042654 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaagtctcatacttagaaagta 40042752  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  40042753 ttgagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 40042847  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  40042848 tgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 40042879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Original strand, 40053004 - 40053428
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  40053004 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 40053102  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||    
T  40053103 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctctcgcctgcgt 40053202  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||  ||| ||||    
T  40053203 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaagtctcatacttagaaagta 40053301  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  40053302 ttgagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 40053396  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  40053397 tgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 40053428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Original strand, 48710838 - 48711260
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  48710838 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 48710936  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  48710937 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 48711036  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagtatt 304  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||  ||| ||||||    
T  48711037 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatacttagaaagtatt 48711135  T
Q  305 gagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||    
T  48711136 gagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactg 48711230  T
Q  405 cttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  48711231 cttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 48711260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 5 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 9443815 - 9443391
Alignment:
Q  5 acaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagt 104  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  9443815 acaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagt 9443717  T
Q  105 ctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgc 204  Q
    |||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||  ||||| ||||  |||||    
T  9443716 ctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgaatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgatcagaagtctctttcctgc 9443617  T
Q  205 gtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatt--tgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||||  || ||||||||||||  ||| ||||    
T  9443616 gtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttgtgtgaagtctcatacttagaaagta 9443518  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  9443517 ttgagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactgtactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 9443423  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  9443422 tgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 9443391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 3 - 432
Target Start/End: Original strand, 14746011 - 14746439
Alignment:
Q  3 atacaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctaga 102  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  14746011 atacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaaattgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaaaagtctaga 14746110  T
Q  103 gtctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcct 202  Q
    |||||||||  ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||  | ||||||||||||| ||||||  ||||| |||| ||||    
T  14746111 gtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtaaaactcaattctctgtatttttgtttgatcagaagtctcttgcct 14746210  T
Q  203 gcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgc-ttgagca--tttgagaagtctcataccaagaga 299  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| |||| || || |||| |||||||  |||| ||||||||||||  ||| |    
T  14746211 gcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgtttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgctttgagcatttttgtgaagtctcatacttagaaa 14746309  T
Q  300 gtattgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggat 399  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  14746310 gtattgagcatttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggat 14746404  T
Q  400 aattgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    || ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  14746405 aactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 14746439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Original strand, 2705959 - 2706383
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  2705959 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattca-aagtctagagtct 2706057  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |   ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  2706058 tttctgttttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 2706157  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||  ||| ||||    
T  2706158 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaagtctcatacttagaaagta 2706256  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  2706257 ttgagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 2706351  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  2706352 tgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 2706383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 3 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 5685476 - 5685050
Alignment:
Q  3 atacaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctaga 102  Q
    ||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  5685476 atacaagttcaaaagcaccaaaactctgtcaaattgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctaga 5685378  T
Q  103 gtctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcct 202  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||  ||||| |||| ||||    
T  5685377 gtctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgatcagaagtctcttgcct 5685278  T
Q  203 gcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagag 300  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||| ||||||||  ||| ||    
T  5685277 gcgtgcttgtgcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaaatctcatacttagaaag 5685179  T
Q  301 tattgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggata 400  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  5685178 tattgagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggata 5685084  T
Q  401 attgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    | ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  5685083 actgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 5685050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 9085237 - 9084815
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  9085237 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 9085139  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  9085138 tttctgtattgcattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 9085039  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagtatt 304  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||  ||| ||||||    
T  9085038 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatacttagaaagtatt 9084940  T
Q  305 gagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||    
T  9084939 gagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactg 9084845  T
Q  405 cttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  9084844 cttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 9084815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 9094951 - 9094529
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  9094951 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 9094853  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  9094852 tttctgtattgcattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 9094753  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagtatt 304  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||  ||| ||||||    
T  9094752 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatacttagaaagtatt 9094654  T
Q  305 gagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||    
T  9094653 gagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactg 9094559  T
Q  405 cttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  9094558 cttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 9094529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Original strand, 17961071 - 17961495
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  17961071 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 17961169  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  17961170 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 17961269  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||  ||| ||||    
T  17961270 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttttgtgaagtctcatacttagaaagta 17961368  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  17961369 ttgagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 17961463  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  17961464 tgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 17961495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 7 - 413
Target Start/End: Original strand, 6867572 - 6867973
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  6867572 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 6867670  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
     || |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  6867671 gtactgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaactcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 6867770  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagtatt 304  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||  ||| ||||||    
T  6867771 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatacttagaaagtatt 6867869  T
Q  305 gagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||    
T  6867870 gagcagttgtaatccttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactg 6867964  T
Q  405 cttgtgtct 413  Q
    |||||||||    
T  6867965 cttgtgtct 6867973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 7 - 413
Target Start/End: Original strand, 6878204 - 6878605
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  6878204 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 6878302  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
     || |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  6878303 gtactgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaactcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 6878402  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagtatt 304  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||  ||| ||||||    
T  6878403 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatacttagaaagtatt 6878501  T
Q  305 gagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||    
T  6878502 gagcagttgtaatccttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactg 6878596  T
Q  405 cttgtgtct 413  Q
    |||||||||    
T  6878597 cttgtgtct 6878605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 5 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 11005140 - 11004715
Alignment:
Q  5 acaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagt 104  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11005140 acaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgatactacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattca-tagtctagagt 11005042  T
Q  105 ctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgc 204  Q
    ||||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||    
T  11005041 cttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgc 11004942  T
Q  205 gtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagag 300  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||  ||| ||    
T  11004941 gtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaagtctcatacttagaaag 11004843  T
Q  301 tattgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggata 400  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  11004842 tattgagcagttgtaatct-tgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggata 11004749  T
Q  401 attgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    | ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  11004748 actgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 11004715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Original strand, 26294376 - 26294799
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  26294376 aagttcaaaagtgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 26294474  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  26294475 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 26294574  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca---tttgagaagtctcataccaagagagtat 303  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||   |||| ||||||||||||  ||| |||||    
T  26294575 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattttttgtgaagtctcatacttagaaagtat 26294673  T
Q  304 tgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataatt 403  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| |    
T  26294674 tgagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataact 26294768  T
Q  404 gcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    |||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  26294769 gcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 26294799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 4222561 - 4222138
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  4222561 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 4222463  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  4222462 tttctgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 4222363  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||  ||| ||||    
T  4222362 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttttgtgaagtctcatacttagaaagta 4222264  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||     
T  4222263 ttgagcagttgtaatct-tgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccgggataac 4222170  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  4222169 tgcttgtgtctgtgtctttcttttctctgctc 4222138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Original strand, 8002412 - 8002835
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  8002412 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgatactacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 8002510  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||    
T  8002511 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctctcgcctgcgt 8002610  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcat----ttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || ||||||||||||    ||| ||||||||||||  ||| ||||    
T  8002611 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagtgttgtgaagtctcatacttagaaagta 8002709  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  8002710 ttgagcagttgtaatct-tgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 8002803  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  8002804 tgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 8002835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Original strand, 8013057 - 8013480
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  8013057 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgatactacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 8013155  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||    
T  8013156 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctctcgcctgcgt 8013255  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcat----ttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || ||||||||||||    ||| ||||||||||||  ||| ||||    
T  8013256 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagtgttgtgaagtctcatacttagaaagta 8013354  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  8013355 ttgagcagttgtaatct-tgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 8013448  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  8013449 tgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 8013480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Original strand, 17950465 - 17950889
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  17950465 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 17950563  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| || |||||    
T  17950564 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcatgcgt 17950663  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||  ||| ||||    
T  17950664 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttttgtgaagtctcatacttagaaagta 17950762  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  17950763 ttgagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 17950857  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  17950858 tgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 17950889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 7 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 24734706 - 24734305
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  24734706 aagtttaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 24734608  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  24734607 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 24734508  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||  ||| ||||    
T  24734507 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcttgtgtgcttgagcattgttttgtgaagtctcatacttagaaagta 24734409  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  24734408 ttgagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 24734314  T
Q  403 tgcttgtgt 411  Q
    |||||||||    
T  24734313 tgcttgtgt 24734305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 7 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 24744653 - 24744252
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  24744653 aagtttaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 24744555  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  24744554 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 24744455  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||  ||| ||||    
T  24744454 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcttgtgtgcttgagcattgttttgtgaagtctcatacttagaaagta 24744356  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  24744355 ttgagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 24744261  T
Q  403 tgcttgtgt 411  Q
    |||||||||    
T  24744260 tgcttgtgt 24744252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Original strand, 26390443 - 26390867
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  26390443 aagtttaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 26390541  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  26390542 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 26390641  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||   || ||||    
T  26390642 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcttgtgtgcttgagcattgttttgtgaagtctcatactttgaaagta 26390740  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  26390741 ttgagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 26390835  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  26390836 tgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 26390867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Original strand, 26401085 - 26401509
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  26401085 aagtttaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 26401183  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  26401184 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 26401283  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||   || ||||    
T  26401284 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcttgtgtgcttgagcattgttttgtgaagtctcatactttgaaagta 26401382  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  26401383 ttgagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 26401477  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  26401478 tgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 26401509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 8617339 - 8616916
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  8617339 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 8617241  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  8617240 tttctgtattgtattgtgaacactactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 8617141  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca---tttgagaagtctcataccaagagagtat 303  Q
    | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || ||||||||| |   |||| ||||||||||||  ||| |||||    
T  8617140 gattgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagaattttttgtgaagtctcatacttagaaagtat 8617042  T
Q  304 tgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataatt 403  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||||| |    
T  8617041 tgagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttctggaaggaaccaggataact 8616947  T
Q  404 gcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    |||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  8616946 gcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 8616916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 6 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 1987494 - 1987070
Alignment:
Q  6 caagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtc 105  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  1987494 caagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctaaaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtc 1987396  T
Q  106 tttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcg 205  Q
    |||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| |||||||    
T  1987395 ttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcg 1987296  T
Q  206 tgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagt 301  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||  ||| |||    
T  1987295 tgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaagtctcatacttagaaagt 1987197  T
Q  302 attgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataa 401  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  1987196 attgagcagttgtaatct-tgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataa 1987103  T
Q  402 ttgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
     ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  1987102 ctgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 1987070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 6 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 1998115 - 1997691
Alignment:
Q  6 caagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtc 105  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  1998115 caagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctaaaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtc 1998017  T
Q  106 tttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcg 205  Q
    |||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| |||||||    
T  1998016 ttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcg 1997917  T
Q  206 tgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagt 301  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||  ||| |||    
T  1997916 tgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaagtctcatacttagaaagt 1997818  T
Q  302 attgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataa 401  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  1997817 attgagcagttgtaatct-tgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataa 1997724  T
Q  402 ttgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
     ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  1997723 ctgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 1997691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 6 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 42865781 - 42865357
Alignment:
Q  6 caagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtc 105  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  42865781 caagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctaaaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtc 42865683  T
Q  106 tttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcg 205  Q
    |||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| |||||||    
T  42865682 ttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcg 42865583  T
Q  206 tgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagt 301  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||  ||| |||    
T  42865582 tgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaagtctcatacttagaaagt 42865484  T
Q  302 attgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataa 401  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  42865483 attgagcagttgtaatct-tgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataa 42865390  T
Q  402 ttgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
     ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  42865389 ctgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 42865357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 6 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 42876407 - 42875983
Alignment:
Q  6 caagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtc 105  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  42876407 caagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctaaaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtc 42876309  T
Q  106 tttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcg 205  Q
    |||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| |||||||    
T  42876308 ttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcg 42876209  T
Q  206 tgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagt 301  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||  ||| |||    
T  42876208 tgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaagtctcatacttagaaagt 42876110  T
Q  302 attgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataa 401  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  42876109 attgagcagttgtaatct-tgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataa 42876016  T
Q  402 ttgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
     ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  42876015 ctgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 42875983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Original strand, 467928 - 468350
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  467928 aagttcaaaagcaccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 468026  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  468027 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 468126  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagtatt 304  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||  ||  ||||||    
T  468127 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatacttaggaagtatt 468225  T
Q  305 gagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||    
T  468226 gagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggattacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactg 468320  T
Q  405 cttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  468321 cttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 468350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 8627902 - 8627478
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  8627902 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 8627804  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  8627803 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 8627704  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca---tttgagaagtctcataccaagagagtat 303  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||   |||| ||||||||||||   || |||||    
T  8627703 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattttttgtgaagtctcatactttgaaagtat 8627605  T
Q  304 tgagca-tttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    |||||| | |||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  8627604 tgagcagtatgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 8627510  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  8627509 tgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 8627478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Original strand, 2716563 - 2716987
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  2716563 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattca-aagtctagagtct 2716661  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |   ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| |||||| |    
T  2716662 tttctgttttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcat 2716761  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||  ||| ||||    
T  2716762 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgaccattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaagtctcatacttagaaagta 2716860  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  2716861 ttgagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 2716955  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  2716956 tgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 2716987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 153 - 432
Target Start/End: Original strand, 17064021 - 17064297
Alignment:
Q  153 aagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaag 252  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17064021 aagtcaaacatttttctctgtatttttgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaag 17064120  T
Q  253 tctctcgcctgcgtgcttgagca-tttgagaagtctcataccaagagagtattgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttgga 351  Q
     |||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||| ||||||||||||||    
T  17064121 actcttgcttgcgtgcttgagcattttgagaagtctcatacttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgatta---ttagt-gaaatctccttgga 17064216  T
Q  352 agtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtctctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  17064217 agtgcaagggggaatggactacttccgttttgtggaaggaaccaggataattgcttgtgtctttctttcttttctctgctc 17064297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 46 - 424
Target Start/End: Original strand, 8999322 - 8999705
Alignment:
Q  46 aaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtcttt--attacattgtattgtgaacactactgattgtatat 143  Q
    ||||||| ||||||||| |   |||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8999322 aaagcactttgaatttctgtgttgatttgatatatcttagaaattcttaagtctagagtctttcaattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatat 8999421  T
Q  144 ctagtgttcaag-tcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttga 242  Q
    | |||||||||  |||||||  ||||| |||| ||  |||||| |||||| |||| || |  ||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||    
T  8999422 caagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgattagaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgctttagtgcttga 8999521  T
Q  243 gcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagag-agtattgagcatttgtaatctgtgtgattattt-ttagtggaa 340  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | | | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8999522 gcatttgaagtttcttgcctgcgtgcttgagcatttgtgaagtctcatactaggtgtagtattgagcagttgtaatctgtgtgattatttcttagtggaa 8999621  T
Q  341 atctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtctctctgtctttt 424  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  8999622 atctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaatcagtataattgcttgtgtctctctttctttt 8999705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 5 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 166837 - 166426
Alignment:
Q  5 acaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagt 104  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||             |||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  166837 acaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatt-------------gatacatcttagaaattcaa-agtctagagt 166752  T
Q  105 ctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgc 204  Q
    ||||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||    
T  166751 cttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgc 166652  T
Q  205 gtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||  ||| ||||    
T  166651 gtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatacttagaaagta 166553  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  166552 ttgagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 166458  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  166457 tgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 166426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 5 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 177429 - 177018
Alignment:
Q  5 acaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagt 104  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||             |||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  177429 acaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatt-------------gatacatcttagaaattcaa-agtctagagt 177344  T
Q  105 ctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgc 204  Q
    ||||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||    
T  177343 cttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgc 177244  T
Q  205 gtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||  ||| ||||    
T  177243 gtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatacttagaaagta 177145  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  177144 ttgagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 177050  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  177049 tgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 177018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 215 - 432
Target Start/End: Original strand, 24882945 - 24883162
Alignment:
Q  215 attagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagagagtattgagcatttgt 314  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||| ||||    
T  24882945 attagaagtctcttgctttagtgcttgagcattggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcatttgggaagtctcatacta-gatagtattgagcagttgt 24883043  T
Q  315 aatctgtgtgattattt-ttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtct 413  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  24883044 aatctgtgtgattatttcttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaaccgggataattgcttgtgtct 24883143  T
Q  414 ctctgtcttttctctgctc 432  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  24883144 ctctttcttttctctgctc 24883162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 5 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 44280451 - 44280209
Alignment:
Q  5 acaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagt 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  44280451 acaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaaaagtctagagt 44280352  T
Q  105 ctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgc 204  Q
    ||| |||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| || |||  |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||    
T  44280351 cttaattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttaattcattgtatttttgtttgattagaagcctcttgcctgc 44280252  T
Q  205 gtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcatt 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  44280251 gtgcttgagcattagaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatt 44280209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 43 - 428
Target Start/End: Original strand, 11087427 - 11087818
Alignment:
Q  43 tacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtcta--gagtcttt--attacattgtattgtgaacactactgattg 138  Q
    |||||||||| ||||||||| |   | |||||||| |||||||||||||   ||||||  ||||||||  ||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  11087427 tacaaagcactttgaatttctgtgttcatttgatatatcttagaaattcttaagtctatagagtctttcaattgcattgcattgtgaacaccactgattg 11087526  T
Q  139 tatatctagtgttcaag-tcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtg 237  Q
    |||||| |||||||||  |||||||  |||||  ||| ||  ||||||||||||| |||| || |  |||||||||||   |||| ||||||||||||||    
T  11087527 tatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgggtaattctgtttgaatagaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgctttagtg 11087626  T
Q  238 cttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagag-agtattgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagt 336  Q
    ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | | | ||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||     
T  11087627 cttgagcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcatttgtgaagtctcatactaggtgtagtattgagcagttgtaatctgtgtgattaaacttagc 11087726  T
Q  337 ggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtctctctgtcttttctct 428  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  11087727 ggaaatcgccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaaccaatataattgcttgtgtctctctttcttctctct 11087818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 7 - 278
Target Start/End: Original strand, 455146 - 455415
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  455146 aagttcaaaagcaccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 455244  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    || ||  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| || | ||||||||    
T  455245 tttttgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtcttttgcctgcgt 455344  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattt 278  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || ||||||||||||||    
T  455345 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattt 455415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 3 - 247
Target Start/End: Original strand, 38594053 - 38594298
Alignment:
Q  3 atacaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctaga 102  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38594053 atacaagttaaaaagcgcaaaaactctgtcaatttgattccaaaaagcacattgaatttctgtactgatttgatacatcttagaaattcacaagtctaga 38594152  T
Q  103 gtctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttca-agtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcc 201  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||   |||||| | ||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  38594153 gtctttattgcattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcattatcaaacttttttctttgtatttttgtttgaatagaagcctcttgcc 38594252  T
Q  202 tgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcatt 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  38594253 tgcgtgcttgagcattagaagactcttgcctgcgtgcttgagcatt 38594298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 70 - 422
Target Start/End: Original strand, 13175015 - 13175373
Alignment:
Q  70 atttgatacatcttagaaattcactagtctagag--tcttt--attacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaag-tcaaacata 164  Q
    |||||||| ||||||||||||    |||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||      
T  13175015 atttgatatatcttagaaattgttaagtctagagagtctttcaattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaat 13175114  T
Q  165 tttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgc 264  Q
    ||||| |||| ||  ||||||||||||| ||||    |  ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| | ||||||    
T  13175115 tttctgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttaatttagtgcttgagcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctatagcctgc 13175214  T
Q  265 gtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagag-agtattgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaaggggg 363  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| || | | | |||| |||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13175215 gtgcttgagcatttgtgaagtctcagactaggtgtagtactgagcagttgtaatctgtgtgattaaacttagtggaaatctccttggaagtgcaaggggg 13175314  T
Q  364 actggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtctctctgtctt 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  13175315 actggactacttccggtttgtggaaggaaccagtataattgcttgtgtttctctttctt 13175373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 7 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 11096008 - 11095744
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaattt-gattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtc 105  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||    
T  11096008 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaattttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtccagagtc 11095910  T
Q  106 tttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcg 205  Q
    |||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| || ||| ||||||||||||    
T  11095909 ttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattacaagtctctcgcctgcg 11095810  T
Q  206 tgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttga 272  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || ||||||||    
T  11095809 tgcttgagcattataagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttga 11095744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 7 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 541038 - 540798
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  541038 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgaatctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattca-aagtctagagtct 540940  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgta-ttttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcg 205  Q
    |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||| |||| ||||||  ||||| |||| |||||||    
T  540939 ttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtattttttgtttgatcagaagtctcttgcctgcg 540840  T
Q  206 tgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcatt 247  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |  |||||||||||||    
T  540839 tgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatt 540798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 7 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 4211962 - 4211724
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  4211962 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattca-aagtctagagtct 4211864  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| | ||  ||    
T  4211863 tttctgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttg-cttagt 4211765  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcatt 247  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |  |||||||||||||    
T  4211764 gcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatt 4211724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 217 - 431
Target Start/End: Original strand, 38594238 - 38594449
Alignment:
Q  217 tagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattt-gagaagtctcataccaagagagtattgagcatttgta 315  Q
    |||||| ||||||| |  ||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  38594238 tagaagcctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcctgcgtgcttgagcattttgagaagtctcatacttagagagtattgagcatttgta 38594337  T
Q  316 atctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtctct 415  Q
    |||| |||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||     
T  38594338 atctttgtgattat----agtg-aaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctcg 38594432  T
Q  416 c-tgtcttttctctgct 431  Q
    | | |||||||||||||    
T  38594433 cttttcttttctctgct 38594449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 70 - 428
Target Start/End: Original strand, 4432991 - 4433356
Alignment:
Q  70 atttgatacatcttagaaattcactagtctagag--tcttt--attacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaag-tcaaacata 164  Q
    |||||||| |||||||||||||   |||||||||  |||||  ||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||      
T  4432991 atttgatatatcttagaaattcttaagtctagagagtctttcaatggcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaat 4433090  T
Q  165 tttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgc 264  Q
    ||||| |||| ||  ||||||||||||| |||| || |  ||||||||||||   ||  ||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||     
T  4433091 tttctgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttgctttagtgcttgagcatagaaattctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgt 4433190  T
Q  265 gtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagag-agtattgagcatttgtaatctg-tgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggg 362  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||||| | | | |||||||||||||||||||| | ||||||||   |||||| || | |||||||||||||||||||    
T  4433191 gtgcttgagcaatt-tgaagtctcatactaggtgtagtattgagcatttgtaatcagttgtgattaaacttagtgaaactttccttggaagtgcaagggg 4433289  T
Q  363 gactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtctctctgtcttttctct 428  Q
    |||  |||| |||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||||| ||| |||| |||||    
T  4433290 gacatgactgacttccggtttgtggaaggaacctgtataattgcctgtgtctttctttcttctctct 4433356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 215 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 44280271 - 44280055
Alignment:
Q  215 attagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattt--gagaagtctcataccaagagagtattgagcattt 312  Q
    |||||||| ||||||| |  ||||||||||||| |||| |||| || || ||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  44280271 attagaagcctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcatacttagagagtattgagcattt 44280172  T
Q  313 gtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtc 412  Q
    ||||||| |||||||||  |||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  44280171 gtaatctttgtgattatagtta-----aatctccttggaagtgcaagggggactggactacttctgatttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtc 44280077  T
Q  413 --tctctgtcttttctctgctc 432  Q
      | ||| ||||||||||||||    
T  44280076 tttgtctttcttttctctgctc 44280055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 114 - 428
Target Start/End: Original strand, 4412466 - 4412784
Alignment:
Q  114 attgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaag-tcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttga 212  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||  |||||||  ||||| | || ||  ||||||||||||| |||| || |  ||||||||    
T  4412466 attgtattgtgaacaccattgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtttaattctgtttgaatagaagtctcttgctttagtgcttga 4412565  T
Q  213 gcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagag-agtattgagcatt 311  Q
    ||||   ||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||||| ||  |||||||||||| | | | ||||||||||| |    
T  4412566 gcatagaaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgtgtgcttgagcaatt-tgaagtctcatactaggtgtagtattgagcagt 4412664  T
Q  312 tgtaatctg-tgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggact--acttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttg 408  Q
    ||||||| | ||||||||   |||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||    
T  4412665 tgtaatcagttgtgattaaacttagtgaaactctccttggaagtgcaagggggacatgactgaacttccggtttgtggaaggaacctgtataattgcctg 4412764  T
Q  409 tgtctctctgtcttttctct 428  Q
    ||||| ||| |||| |||||    
T  4412765 tgtctttctttcttctctct 4412784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 215 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 4211785 - 4211569
Alignment:
Q  215 attagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattt----gagaagtctcataccaagagagtattgagcat 310  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || || ||||||||||||||    | ||||||||||||  ||| |||||||||||     
T  4211785 attagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttttgtgaagtctcatacttagaaagtattgagcag 4211687  T
Q  311 ttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtg 410  Q
    ||||||||| |||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  4211686 ttgtaatct-tgtgattat----agtg-aaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtg 4211593  T
Q  411 tc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||  | ||| ||||||||||||||    
T  4211592 tctgtgtctttcttttctctgctc 4211569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 218 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 540857 - 540644
Alignment:
Q  218 agaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattt--gagaagtctcataccaagagagtattgagcatttgta 315  Q
    ||||| ||||||| |  |||||||||||||||||| |||| || || ||||||||||||||  | ||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||    
T  540857 agaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatacttagaaagtattgagcagttgta 540758  T
Q  316 atctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtc--t 413  Q
    |||| |||||||||    || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |    
T  540757 atctttgtgattat----agcg-aaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtcttt 540663  T
Q  414 ctctgtcttttctctgctc 432  Q
     ||| ||||||||||||||    
T  540662 gtctttcttttctctgctc 540644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 33 - 247
Target Start/End: Original strand, 24882792 - 24883007
Alignment:
Q  33 aatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtcttt-attacattgtattgtgaacacta 131  Q
    |||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||   |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||      
T  24882792 aatttgattctcaaaagcactttgaatttctgcactaatttgatatatcttagaaattcttaagtctagagtcttttattgcattgtattgtgaacaccg 24882891  T
Q  132 ctgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgct 231  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||| |||| ||  |||||| |||||| |||| || |  ||||||||||||| |||| |||||||     
T  24882892 ctgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacaattttctgtgtaattctgtttgattagaagtctcttgctttagtgcttgagcattggaagtctcttgcc 24882991  T
Q  232 ttagtgcttgagcatt 247  Q
    |  |||||||||||||    
T  24882992 tgcgtgcttgagcatt 24883007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 339 - 432
Target Start/End: Original strand, 6044957 - 6045050
Alignment:
Q  339 aaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtctctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6044957 aaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaaccatgataattgcttgtgtctctctttcttttctctgctc 6045050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 281 - 431
Target Start/End: Original strand, 25212471 - 25212617
Alignment:
Q  281 gaagtctcataccaagagagtattgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggt 380  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  25212471 gaagtctcatacttagagagtattgagcagttgtaatctttgtgattat----agtg-aaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgat 25212565  T
Q  381 ttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtctctc-tgtcttttctctgct 431  Q
    ||||||||| ||||||||||| || ||||||||| | | |||||||||||||    
T  25212566 ttgtggaaggaaccaggataactgtttgtgtctcacttttcttttctctgct 25212617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 299 - 432
Target Start/End: Original strand, 19986159 - 19986289
Alignment:
Q  299 agtattgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccagga 398  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||    
T  19986159 agtattgagcatttgtaatctttgtgattat----agtg-aaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccagga 19986253  T
Q  399 taattgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||| ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  19986254 taactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 19986289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 3 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 9170945 - 9170863
Alignment:
Q  3 atacaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttag 85  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9170945 atacaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttag 9170863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 301 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 20967328 - 20967200
Alignment:
Q  301 tattgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggata 400  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  20967328 tattgagcatttgtaatctttgtgattat----agtg-aaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggata 20967234  T
Q  401 attgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    | ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  20967233 actgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 20967200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 286 - 432
Target Start/End: Original strand, 457618 - 457761
Alignment:
Q  286 ctcataccaagagagtattgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtg 385  Q
    |||||||  ||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||    
T  457618 ctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattat----agtg-aaatctccttggaagtgcaagggggactggattacttccgtgttgtg 457712  T
Q  386 gaagaaaccaggataattgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  457713 gaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 457761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 44 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 602493 - 602139
Alignment:
Q  44 acaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct-ttatta-cattgtattgtgaacactactgattgtat 141  Q
    ||||||||| | ||||||| | ||  |||||||| |||||||||||||   |||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  602493 acaaagcacttagaatttctgtacacatttgataaatcttagaaattctaaagtcaagagtctgttatttgcattgtattgtgaacaccactgattgtat 602394  T
Q  142 atctagtgttcaagt-caaacatatttctctgtattttcgtttgaat-agaagcctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgct 239  Q
    ||| ||||||||| | ||||||  ||||| |||| ||  |||||||| ||||| |||| || |  ||||||||||||  |||| ||||| |||  ||| |    
T  602393 atcaagtgttcaaattcaaacaattttctatgtaattctgtttgaattagaagtctcttgctttagtgcttgagcatctgaagtctcttacttgtgtgtt 602294  T
Q  240 tgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagaga-gtattgagcatttgtaatct-gtgtgattatttttagtg 337  Q
    ||||||| | |||||||| || || ||||||||||| |   ||||||||||||      | |||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||||||    
T  602293 tgagcatag-aagtctcttgc-tgtgtgcttgagcaatct-gaagtctcatacttgtttaagtattgagcagttgtaatcttgtgtgattatacttagtg 602197  T
Q  338 gaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaacc 394  Q
     || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| || |||||||||| ||||    
T  602196 aaactctccttggaagtgcaagggggacaggactgactttcgatttgtggaaggaacc 602139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 303 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 11015463 - 11015335
Alignment:
Q  303 ttgagcatttgtaatc-tgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataa 401  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  11015463 ttgagcatttgtaatcatttgtgattat----agtgaaaatctccttggaagtgcaaggggaactgaactacttccggattgtggaaggaaccaggataa 11015368  T
Q  402 ttgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
     ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  11015367 ctgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 11015335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 333 - 409
Target Start/End: Original strand, 1878942 - 1879018
Alignment:
Q  333 tagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgt 409  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1878942 tagtgaaaatctccttggaagtgcaaggggggctggactacttccgaattgtggaaggaaccaggataattgcttgt 1879018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 333 - 402
Target Start/End: Original strand, 11572881 - 11572950
Alignment:
Q  333 tagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||    
T  11572881 tagtgaaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggaatgtggaaggaaccaggataat 11572950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 339 - 416
Target Start/End: Original strand, 12223124 - 12223201
Alignment:
Q  339 aaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtctctc 416  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12223124 aaatctccttagaagtgcaagggggactggaccacttctggattgtggatgaaaccaggataattgcttgtgtatctc 12223201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 346 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 23643286 - 23643198
Alignment:
Q  346 cttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  23643286 cttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtcattgtctttcttttctctgctc 23643198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 342 - 417
Target Start/End: Original strand, 19711742 - 19711818
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgc-ttgtgtctctct 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||    
T  19711742 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttctggtttatggaaggaaccagtataattgctttgtgtctctct 19711818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 342 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 4820913 - 4820848
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  4820913 tctccttggaagtgcaagggggacaggactacttccggtttgtggaaggaacctgtataattgctt 4820848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 115 - 222
Target Start/End: Original strand, 19237540 - 19237648
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgag 213  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||| | || ||| ||||||||||||| |||| || |  |||||||||    
T  19237540 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatatttctttataatttagtttgaatagaagtctcttgcttatgtgcttgag 19237639  T
Q  214 cattagaag 222  Q
    ||| |||||    
T  19237640 cataagaag 19237648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 115 - 197
Target Start/End: Original strand, 18362071 - 18362153
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctct 197  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||| ||| |||||  |||||||||||    
T  18362071 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaatcaaacatctttctgtgtaattttgtttgtttagaagcctct 18362153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 342 - 395
Target Start/End: Original strand, 7488634 - 7488687
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaacca 395  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7488634 tctccttggaagtgtaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaacca 7488687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 342 - 407
Target Start/End: Original strand, 13259133 - 13259198
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||| | ||||||||||    
T  13259133 tctccttggaagtgcaagggggacaggactacttccgatttgtggaaggaacctgtataattgctt 13259198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 342 - 407
Target Start/End: Original strand, 13266473 - 13266538
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||| | ||||||||||    
T  13266473 tctccttggaagtgcaagggggacaggactacttccgatttgtggaaggaacctgtataattgctt 13266538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 333 - 406
Target Start/End: Original strand, 15871759 - 15871832
Alignment:
Q  333 tagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgct 406  Q
    ||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||    
T  15871759 tagtgaaaatatccttggaagtacaaaggggactggactacttccagattgtggaaggaaccaggataattgct 15871832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 344 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 13302285 - 13302222
Alignment:
Q  344 tccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  13302285 tccttggaagtgcaagggggacatgactacttccggtttgtggaaggaacctgtataattgctt 13302222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 357 - 432
Target Start/End: Original strand, 1251598 - 1251675
Alignment:
Q  357 aagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  1251598 aagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 1251675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 333 - 403
Target Start/End: Original strand, 2501667 - 2501737
Alignment:
Q  333 tagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataatt 403  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   || |||||| |||||||||||||    
T  2501667 tagtgaaaatctccttggaagtgcaagggggacttgactacttccaaattatggaaggaaccaggataatt 2501737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 338 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 11318836 - 11318766
Alignment:
Q  338 gaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||| | ||||||||||    
T  11318836 gaaatctccttggaagtgcaagggggacaggactgacttccgatttgtggaaggaacctgtataattgctt 11318766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 342 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 11792336 - 11792274
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  11792336 tctccttggaagtgcaagggggacaagactacttccggtttgtggaaggaacctgtataattg 11792274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 342 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 1292518 - 1292445
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggat-aattgcttgtgtct 413  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| | || ||||||||||||||    
T  1292518 tctccttggaagtgcaagggggacaggactgacttccggtttgtggaaggaacctgtataaattgcttgtgtct 1292445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 360 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 9802624 - 9802567
Alignment:
Q  360 ggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtctctct 417  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  9802624 ggggactggactacttccggattatggaagcaaccaggataattgtttgtgtctctct 9802567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 342 - 407
Target Start/End: Original strand, 10883902 - 10883967
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||| |||| | ||||||||||    
T  10883902 tctccttggaagtgcaagggggacatgactacttccggtttgtgaaaggaacctgtataattgctt 10883967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 342 - 407
Target Start/End: Original strand, 13261346 - 13261411
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||  | ||||||||||    
T  13261346 tctccttggaagtgcaagggggacaggactacttccagtttgtggaaggaacatgtataattgctt 13261411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 346 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 13645873 - 13645812
Alignment:
Q  346 cttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  13645873 cttggaagtgcaagggggacaggactacttacggtttgtggaaggaacctgtataattgctt 13645812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 342 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 33604333 - 33604268
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    |||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  33604333 tctccttggaagtggaagggggacaagactacttccggtttgtggaaggaacctgtataattgctt 33604268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 115 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 23125597 - 23125435
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgagc 214  Q
    |||||||||||||||  | |||  |||||| |||||||||  ||||||||||||| |||| ||| |||||  |||||| ||||  | |  | ||||||||    
T  23125597 ttgtattgtgaacacggccgataatatatcaagtgttcaac-caaacatatttctttgtaattt-gtttgtttagaagtctcttacttttgggcttgagc 23125500  T
Q  215 attagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttg 279  Q
    |||||||  |||||||||  ||||||||| ||| ||||||||| || || |||||||||||||||    
T  23125499 attagaaatctcttgcttgtgtgcttgagtatttgaagtctcttgcttgtgtgcttgagcatttg 23125435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 342 - 417
Target Start/End: Original strand, 23280682 - 23280757
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtctctct 417  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| |||| | |||||||||| |||||||||    
T  23280682 tctccttggaagtgcaagggggacaggactgactttcggtttgtggaaggaacctgtataattgctt-tgtctctct 23280757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 359 - 432
Target Start/End: Original strand, 23303859 - 23303934
Alignment:
Q  359 gggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  23303859 gggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 23303934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 328 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 4494014 - 4493936
Alignment:
Q  328 atttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    |||||||||| || ||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| |||| | ||||||||||    
T  4494014 atttttagtg-aactctcctttgaagtgcaagggggacaggaatacttccggtttgtgaaaggaacctgtataattgctt 4493936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 328 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 14187128 - 14187054
Alignment:
Q  328 atttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataatt 403  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| |||| | ||||||    
T  14187128 atttttagtg-aactctccttggaagtgcaagggggacaagactacttccgatttgtggaaggaacctgtataatt 14187054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 342 - 413
Target Start/End: Original strand, 16105660 - 16105731
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtct 413  Q
    ||||||| ||||||||||| || | ||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||||    
T  16105660 tctccttagaagtgcaaggagggcaggactacttccggattgtggaaggaacctgtataattgcttgtgtct 16105731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 328 - 407
Target Start/End: Original strand, 21211262 - 21211340
Alignment:
Q  328 atttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    |||||||||| || |||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||  | ||||||||||    
T  21211262 atttttagtg-aactctccttgcaagtgcaagggggacaagactacttccggtttgtggaaggaacttgtataattgctt 21211340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 329 - 404
Target Start/End: Original strand, 29936065 - 29936138
Alignment:
Q  329 tttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  29936065 tttttagtg-aactctccttggaagtgcaagggg-acaggactacttccggtttgtggaaggaacctgtataattg 29936138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 197
Target Start/End: Original strand, 2501517 - 2501598
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctct 197  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| || |||| |||| |||||||||  |||||| ||||    
T  2501517 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaactcaaactta-ttctttgtaatttcgtttgtttagaagtctct 2501598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 120 - 257
Target Start/End: Original strand, 7488414 - 7488552
Alignment:
Q  120 ttgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgagcatta 218  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||  ||||| |||| ||  ||||||||||||| |||| ||    ||||||||||||      
T  7488414 ttgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatagaagtctcttgcagttgtgcttgagcatag 7488513  T
Q  219 gaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctct 257  Q
    |||| |||||| ||| || ||||||||| |||| |||||    
T  7488514 gaagtctcttgattttgttcttgagcataggaaatctct 7488552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #123
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 13302514 - 13302397
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaag-tcaaacatatttctctgtattttcgtttgaat--agaagcctctcgcctgcgtgcttg 211  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||| |||| ||  ||||||||  ||||| |||| ||    |||||||    
T  13302514 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttgtgcttg 13302415  T
Q  212 agcattagaagactcttg 229  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  13302414 agcattagaagtctcttg 13302397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #124
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 342 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 13879597 - 13879531
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  13879597 tctccttagaagtgcaagggggacaggactgacttccggtttgtggaaggaacctgtataattgctt 13879531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #125
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 15088202 - 15088085
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaat--agaagcctctcgcctgcgtgcttg 211  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||| |||| ||  ||||||||  ||||| |||| ||    |||||||    
T  15088202 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttg 15088103  T
Q  212 agcattagaagactcttg 229  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  15088102 agcattagaagtctcttg 15088085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #126
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 341 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 16464451 - 16464385
Alignment:
Q  341 atctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | || |||||| ||| || ||||||||||    
T  16464451 atctccttggaattgcaagggggactggactacttccagattatggaaggaactagtataattgctt 16464385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #127
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 342 - 404
Target Start/End: Original strand, 19237766 - 19237828
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    |||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  19237766 tctcattggaagtgcaagggggacaagactacttccggtttgtggaaggaacctgtataattg 19237828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #128
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 338 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 25806860 - 25806794
Alignment:
Q  338 gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||    
T  25806860 gaaatctcgttggaagtgcaagagggactaaactacttccggattgtggaaggaaccaagataattg 25806794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #129
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 342 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 44466521 - 44466455
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  44466521 tctccttggaagtgcaagggggacaagactgacttccggtttgtggaaggaacctgtataattgctt 44466455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #130
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 342 - 407
Target Start/End: Original strand, 5001557 - 5001622
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||| || |||||||||| |||| | ||||||||||    
T  5001557 tctccttggaagtgcaagggggacaagactactttcgatttgtggaaggaacctgtataattgctt 5001622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #131
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 342 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 8182387 - 8182314
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggat-aattgcttgtgtct 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| |||| | || ||||||||||||||    
T  8182387 tctccttggaagtgcaagggggacaagactgacttccggtttgtggaaggaacctgtataaattgcttgtgtct 8182314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #132
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 394
Target Start/End: Original strand, 12174844 - 12175121
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaag-tcaaacatatttctctgtattttcgtttgaat--agaagcctctcgcctgcgtgcttg 211  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||  ||||| |||| ||  ||||||||  ||||| |||| || |  |||||||    
T  12174844 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctttgtaattatgtttgaattcagaagtctcttgcatttgtgcttg 12174943  T
Q  212 agcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagag-agtattgagcat 310  Q
    |||| |||||| |||||| ||  || |  |||||| |||||||||| ||    ||||||||||||||||  |||||| ||| |||   |||| ||||||     
T  12174944 agcaatagaagtctcttgattgcgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcatttga--agtctcttactaagtttagtagtgagcaa 12175041  T
Q  311 ttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaacc 394  Q
    |||||||| |    ||  |   ||||| || |||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  12175042 ttgtaatcag----atattacatagtg-aactctccttggaagtgcaaggggggcaagactgacttccggtttgtggaagaaacc 12175121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #133
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 407
Target Start/End: Original strand, 13731178 - 13731471
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaag-tcaaacatatttctctgtattttcgtttgaata--gaagcctctcgcctgcgtgcttg 211  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||| |||| ||  ||||||||   |||| |||| ||    |||||||    
T  13731178 ttgtattgtgaacaccattgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaatttggaagtctcttgcagttgtgcttg 13731277  T
Q  212 agcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagag-agtattgagcat 310  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||    |||||| |||||||||| ||    ||||||||||||||||  |||||| | | |||   || ||||| |||    
T  13731278 agcattagaagtctcttgcttgtgtttaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcatttga--agtctcttgctaagtttagcattgaacat 13731375  T
Q  311 ttgtaatctgtgtgattat-ttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    |||||||| |    ||||  |||||||| || ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| | |||||||||||||| | ||||||||||    
T  13731376 ttgtaatcagat--attacattttagtg-aactctccttggaagtgcaagggggacatgactgacttccagcttgtggaagaaacctgtataattgctt 13731471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #134
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 342 - 403
Target Start/End: Original strand, 16308440 - 16308501
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataatt 403  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||    
T  16308440 tctctttggaagtgcaagggggacaggactacttccggattgtggaaggaacctgtataatt 16308501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #135
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 342 - 407
Target Start/End: Original strand, 16310638 - 16310703
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  16310638 tctccatggaattgcaagggggacatgactacttccggtttgtggaaggaacctgtataattgctt 16310703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #136
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 342 - 407
Target Start/End: Original strand, 16317286 - 16317350
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| | || |||||||    
T  16317286 tctccttggaagtgcaagggggac-ggactacttcctgtttgtggaaggaacctgtatgattgctt 16317350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #137
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 342 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 16411435 - 16411374
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataatt 403  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||    
T  16411435 tctccttggaagtgcaagtgggacaggactacttccggattgtggaaggaacctgtataatt 16411374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #138
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 251
Target Start/End: Original strand, 25687345 - 25687481
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgag 213  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||| |||| ||  ||||||||| ||| |||| ||    |||||||||    
T  25687345 ttgtattgggaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacat-tttctttgtaattatgtttgaataaaagtctcttgcagttgtgcttgag 25687443  T
Q  214 cattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaa 251  Q
    ||| ||||| |||||||  | |||||||||||| ||||    
T  25687444 cataagaagcctcttgcagttgtgcttgagcataggaa 25687481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #139
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 342 - 394
Target Start/End: Original strand, 28623089 - 28623142
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaacc 394  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  28623089 tctccttggaagtgcaagggggacaggactgacttccggtttgtggaaggaacc 28623142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #140
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 342 - 407
Target Start/End: Original strand, 41843155 - 41843220
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| |||  | ||||||||||    
T  41843155 tctccttggaagtgcaagggggacatgactacttccggtttatggaaggaacttgtataattgctt 41843220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #141
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 329 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 14425986 - 14425927
Alignment:
Q  329 tttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaag 389  Q
    ||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  14425986 tttttagtg-aactcttcttggaagtgcaagggggacatgactacttccggtttgtggaag 14425927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #142
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 344 - 407
Target Start/End: Original strand, 22579914 - 22579978
Alignment:
Q  344 tccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||| | ||||||||||    
T  22579914 tccttggaagtgcaagggggacaggactgacttccggtttatggaaggaacctgtataattgctt 22579978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #143
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 413
Target Start/End: Original strand, 48063316 - 48063614
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaag-tcaaacatatttctctgtattttcgtttgaat--agaagcctctcgcctgcgtgcttg 211  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||| |||| ||  ||||||||  ||||| |||| ||    |||||||    
T  48063316 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttgtgcttg 48063415  T
Q  212 agcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaag-agagtattgagcat 310  Q
    |||| |||||| |||||| ||  || |  |||||| |||||||||| ||    ||| ||||||| ||  |||||||||||| |||   |||| |||||||    
T  48063416 agcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgattgagcaatt-tgaagtctcatactaagtttagtagtgagcat 48063514  T
Q  311 ttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggataa-ttgcttg 408  Q
    ||||||||     |||  |   |||| ||| || |||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  48063515 ttgtaatc----agatattacatagt-gaactccccttggaagtgcaagggggacatgactgactttcggtttgtggaagaaacctgtataatttgcttg 48063609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #144
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 115 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 331304 - 331005
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaag-tcaaacatatttctctgtattttcgtttgaat--agaagcctctcgcctgcgtgcttg 211  Q
    ||||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||| |||| ||  ||||||||  ||||| |||| ||    |||||||    
T  331304 ttgtattatgaacaccgctgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttgtgcttg 331205  T
Q  212 agcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagag-agtattgagcat 310  Q
    ||||||||||| |||||| ||  || |  |||||| |||||||||| ||    ||||||||||||||||  |||||| | | | |   || | |||||||    
T  331204 agcattagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcatttga--agtctcttgctaggtttagcagtgagcat 331107  T
Q  311 ttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggat-aattgcttg 408  Q
    |||||||| |    |||| || ||||| || ||||||||||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||| |||| | || |||||||||    
T  331106 ttgtaatcagat--attacttatagtg-aactctccttggaagtgccagggggacaagactgacttccggtttgtggaaggaacctgtataaattgcttg 331010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #145
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 344 - 407
Target Start/End: Original strand, 12367470 - 12367533
Alignment:
Q  344 tccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    ||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  12367470 tccttggaagtgcaagggggacataactacttccagtttgtggaaggaacctgtataattgctt 12367533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #146
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 115 - 229
Target Start/End: Original strand, 13027406 - 13027521
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgag 213  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||  ||||| |||| ||  ||||||||||||| |||| ||    |||||||||    
T  13027406 ttgtattatgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatagaagtctcttgcagttgtgcttgag 13027505  T
Q  214 cattagaagactcttg 229  Q
    ||| ||||| ||||||    
T  13027506 cataagaagtctcttg 13027521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #147
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 115 - 197
Target Start/End: Original strand, 13034342 - 13034425
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctct 197  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||  ||||| |||| ||  ||||||||||||| ||||    
T  13034342 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatagaagtctct 13034425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #148
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 344 - 413
Target Start/End: Original strand, 15705218 - 15705289
Alignment:
Q  344 tccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggat-aattgcttgtgtct 413  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| |||| | || ||||||||||||||    
T  15705218 tccttggaagtgcaagggggacaggactgacttacggtttgtggaaggaacctgtataaattgcttgtgtct 15705289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #149
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 115 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 16472342 - 16472283
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgta 174  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||| ||||    
T  16472342 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaaccaaacttatttctgtgta 16472283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #150
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 342 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 24787788 - 24787725
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||| | |||||||    
T  24787788 tctccttggaagtgcaagggggacaggactgacttccgatttgtggaaggaacctgtataattg 24787725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #151
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 342 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 2499490 - 2499424
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| |||| | |||| |||||    
T  2499490 tctccttggaagtgcaagggggtcaggactgacttccggtttgtggaaggaacctgtataaatgctt 2499424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #152
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 342 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 5034721 - 5034659
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| |||| | |||||||    
T  5034721 tctccttggaagtccaagggggacaggactacctccggattgtggaaggaacctgtataattg 5034659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #153
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 5035039 - 5034866
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgag 213  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||  |||||||| ||||| | || ||| |||||  ||||||  ||| || |  |||||||||    
T  5035039 ttgtattgtgaacaccacttattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctgtataattttgtttgtctagaagtatcttgcttttgtgcttgag 5034940  T
Q  214 cattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctc 288  Q
    |||  |||| ||||||  || |||||||||||| ||||  |||| || |  ||||||||| ||||| ||||||||    
T  5034939 cataggaagtctcttgtgtttgtgcttgagcataggaaacctcttgcttttgtgcttgagtatttg-gaagtctc 5034866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #154
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 342 - 403
Target Start/End: Original strand, 13034568 - 13034630
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggataatt 403  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| |||| | ||||||    
T  13034568 tctccttggaagtgcaagggggaaaggactgacttccggtttgtggaaggaacctgtataatt 13034630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #155
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 346 - 392
Target Start/End: Original strand, 13902347 - 13902393
Alignment:
Q  346 cttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaa 392  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  13902347 cttggaagtacaagggggacaggactacttctggtttgtggaagaaa 13902393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #156
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 329 - 407
Target Start/End: Original strand, 16315258 - 16315334
Alignment:
Q  329 tttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| ||| |||| | ||||||||||    
T  16315258 tttttagtg-aattctccttggaagtgcaagggggcatg-actacttccggtttgtgaaaggaacctgtataattgctt 16315334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #157
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 229
Target Start/End: Original strand, 16557094 - 16557211
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaat--agaagcctctcgcctgcgtgcttg 211  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||| |||| ||  ||||||||  ||||| |||| ||    |||||||    
T  16557094 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttg 16557193  T
Q  212 agcattagaagactcttg 229  Q
    |||||| |||| ||||||    
T  16557194 agcattcgaagtctcttg 16557211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #158
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 16608568 - 16608451
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaat--agaagcctctcgcctgcgtgcttg 211  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||| |||| ||  ||||||||  ||||| |||| ||    |||||||    
T  16608568 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttg 16608469  T
Q  212 agcattagaagactcttg 229  Q
    |||||| |||| ||||||    
T  16608468 agcattcgaagtctcttg 16608451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #159
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 342 - 407
Target Start/End: Original strand, 19328741 - 19328807
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| || | | ||||||||||    
T  19328741 tctccttggaagtgcaagggggacatgactaacttccggtttgtggaaggaatctgtataattgctt 19328807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #160
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 394
Target Start/End: Original strand, 19339981 - 19340031
Alignment:
Q  345 ccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaacc 394  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  19339981 ccttggaagtgcaagggggacaggactaacttccggtttgtggaaggaacc 19340031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #161
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 342 - 407
Target Start/End: Original strand, 21284104 - 21284170
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||  | ||||||||||    
T  21284104 tctccttggaagtgcaagggggacaggactgactcccggtttgtggaaggaacatgtataattgctt 21284170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #162
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 229
Target Start/End: Original strand, 21381933 - 21382050
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaat--agaagcctctcgcctgcgtgcttg 211  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||  |||| ||  ||||||||  ||||| |||||||    |||||||    
T  21381933 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaatctcaaacatttttcattgtaattctgtttgaattaagaagtctctcgcagttgtgcttg 21382032  T
Q  212 agcattagaagactcttg 229  Q
    |||| |||||| ||||||    
T  21382033 agcaatagaagtctcttg 21382050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #163
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 257
Target Start/End: Original strand, 22579719 - 22579863
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaa--tagaagcctctcgcctgcgtgcttg 211  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||| |||| ||    |||||  |||||| |||| ||    |||||||    
T  22579719 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattcttcttgaatttagaagtctcttgcagttgtgcttg 22579818  T
Q  212 agcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctct 257  Q
    |||| |||||| |||||||  | ||||||||||||| |||||||||    
T  22579819 agca-tagaagtctcttgcagttgtgcttgagcatttgaagtctct 22579863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #164
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 333 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 23125418 - 23125356
Alignment:
Q  333 tagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaacca 395  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  23125418 tagtgaaaatccccttggaagtgcaagtgagattggactacttccggattgtggaaggaacca 23125356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #165
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 229
Target Start/End: Original strand, 28622863 - 28622980
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaat--agaagcctctcgcctgcgtgcttg 211  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||| |||| ||  ||||||||  |||||  ||| ||    |||||||    
T  28622863 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaattaagaagtgtcttgcagttgtgcttg 28622962  T
Q  212 agcattagaagactcttg 229  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  28622963 agcattagaagtctcttg 28622980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #166
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 413
Target Start/End: Original strand, 32265452 - 32265522
Alignment:
Q  345 ccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggat-aattgcttgtgtct 413  Q
    |||| ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||    
T  32265452 ccttagaagtgcaagggggacaagactgacttccggtttgtggaagaaacctgtataaattgcttgtgtct 32265522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #167
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 342 - 404
Target Start/End: Original strand, 39285234 - 39285296
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  39285234 tctctttggaagtggaagggagacaggactacttccggtttgtggaaggaacctgtataattg 39285296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #168
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 2499690 - 2499617
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaat 187  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||| |||| ||  ||||||||    
T  2499690 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaat 2499617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #169
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 366 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 12220422 - 12220354
Alignment:
Q  366 tggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  12220422 tggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 12220354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #170
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 251
Target Start/End: Original strand, 13172858 - 13172994
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgag 213  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||   ||||||| ||||| |||| ||  ||||||||||||| |||| || |  |||||||||    
T  13172858 ttgtattttgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaccacaaacat-tttctttgtaattctgtttgaatagaagtctcttgcttttgtgcttgag 13172956  T
Q  214 cattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaa 251  Q
     ||  |||| |||||||  | |||||||||||| ||||    
T  13172957 tataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcatcggaa 13172994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #171
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 14425109 - 14425036
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaat 187  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||| |||| ||  ||||||||    
T  14425109 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaat 14425036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #172
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 14426200 - 14426128
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaat 187  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||| |||| ||| ||||||||    
T  14426200 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttct-tgtaattttgtttgaat 14426128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #173
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 15467569 - 15467497
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaat 187  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||| |||| ||| ||||||||    
T  15467569 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaatctcaaacatttttct-tgtaattttgtttgaat 15467497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #174
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 342 - 394
Target Start/End: Original strand, 16546065 - 16546118
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaacc 394  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||| ||||    
T  16546065 tctccttggaagtgcaagggggacagggctaacttccggtttgtggaaggaacc 16546118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #175
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 342 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 16619597 - 16619544
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaacc 394  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||| ||||    
T  16619597 tctccttggaagtgcaagggggacagggctaacttccggtttgtggaaggaacc 16619544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #176
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 27871370 - 27871297
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaat 187  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||| |||| ||  ||||||||    
T  27871370 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaat 27871297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #177
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 342 - 394
Target Start/End: Original strand, 30946088 - 30946141
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaacc 394  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| ||||    
T  30946088 tctccttggaagtgcaagggggacaggactgacttccagtttgtggaaggaacc 30946141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #178
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 342 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 33421179 - 33421106
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggat-aattgcttgtgtct 413  Q
    |||||||||||||||||| |||||  |||| |||||||||||||||||| |||| | || ||||||||||||||    
T  33421179 tctccttggaagtgcaagagggacatgactgacttccggtttgtggaaggaacctgtataaattgcttgtgtct 33421106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #179
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 342 - 394
Target Start/End: Original strand, 35954634 - 35954687
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaacc 394  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  35954634 tctccttggaagtgcaagggggacaggactgacttctggtttgtggaaggaacc 35954687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #180
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 342 - 394
Target Start/End: Original strand, 48237570 - 48237623
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaacc 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  48237570 tctccttggaagtgcaagggggacatgactgacttccggtttgtggaaggaacc 48237623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #181
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 339 - 391
Target Start/End: Original strand, 10257791 - 10257843
Alignment:
Q  339 aaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaa 391  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| || |||||||||||    
T  10257791 aaatgtccttggaagtgcaagggggtttggactacttctggattgtggaagaa 10257843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #182
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 11319059 - 11318999
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgta 174  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||| ||||    
T  11319059 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgta 11318999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #183
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 4494229 - 4494146
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctct 197  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||  |||||||| ||||| |||| ||  |||||| |||||| ||||    
T  4494229 ttgtattgtgaacaccactgactgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgattagaagtctct 4494146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #184
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 4821137 - 4821098
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa 154  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  4821137 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 4821098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #185
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 8182583 - 8182544
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa 154  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  8182583 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 8182544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #186
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 342 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 9069187 - 9069140
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaa 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||    
T  9069187 tctccttggaagtgcaagggggacatgactgacttccggtttgtggaa 9069140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #187
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 257
Target Start/End: Original strand, 9098738 - 9098881
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgag 213  Q
    |||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||||  |||||||||||| | || | ||   |||||||||||| |||| || |  |||||||||    
T  9098738 ttgtattgtgaataccactaattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatatttatttgcaattctatttgaatagaagtctcttgcttttgtgcttgag 9098837  T
Q  214 cattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctct 257  Q
     ||   ||| |||||| |||||| ||||||||| |||| |||||    
T  9098838 tatagaaagtctcttgatttagttcttgagcataggaaatctct 9098881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #188
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 328 - 407
Target Start/End: Original strand, 9098948 - 9099026
Alignment:
Q  328 atttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||| || |   |||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||    
T  9098948 atttttagtggac-tctccttggaagtgcaagaggaatatgactacttccggtttgtggaaggaacctctataattgctt 9099026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #189
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 257
Target Start/End: Original strand, 9099544 - 9099687
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgag 213  Q
    |||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||||  |||||||||||| | || | ||   |||||||||||| |||| || |  |||||||||    
T  9099544 ttgtattgtgaataccactaattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatatttatttgcaattctatttgaatagaagtctcttgcttttgtgcttgag 9099643  T
Q  214 cattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctct 257  Q
     ||   ||| |||||| |||||| ||||||||| |||| |||||    
T  9099644 tatagaaagtctcttgatttagttcttgagcataggaaatctct 9099687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #190
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 328 - 407
Target Start/End: Original strand, 9099754 - 9099832
Alignment:
Q  328 atttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||| || |   |||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||    
T  9099754 atttttagtggac-tctccttggaagtgcaagaggaatatgactacttccggtttgtggaaggaacctctataattgctt 9099832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #191
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 154
Target Start/End: Original strand, 10883675 - 10883714
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa 154  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  10883675 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 10883714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #192
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 11015614 - 11015575
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa 154  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  11015614 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 11015575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #193
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 154
Target Start/End: Original strand, 13261118 - 13261157
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa 154  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  13261118 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 13261157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #194
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 197
Target Start/End: Original strand, 13473002 - 13473085
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaag-tcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctct 197  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| | |||||||  ||||| |||| ||  ||||||||||||| ||||    
T  13473002 ttgtattgtgaacaccattgattgtatatcaagtgttcaggctcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatagaagtctct 13473085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #195
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 14187343 - 14187304
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa 154  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  14187343 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 14187304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #196
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 154
Target Start/End: Original strand, 15704993 - 15705032
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa 154  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  15704993 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 15705032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #197
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 118 - 229
Target Start/End: Original strand, 16112392 - 16112506
Alignment:
Q  118 tattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaag-tcaaacatatttctctgtattttcgtttgaat--agaagcctctcgcctgcgtgcttgagc 214  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||| |||| ||  ||||||||  ||||| |||| ||    ||||||||||    
T  16112392 tattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttgtgcttgagc 16112491  T
Q  215 attagaagactcttg 229  Q
    | |||||| ||||||    
T  16112492 agtagaagtctcttg 16112506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #198
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 154
Target Start/End: Original strand, 16315043 - 16315082
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa 154  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  16315043 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 16315082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #199
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 154
Target Start/End: Original strand, 19711517 - 19711556
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa 154  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  19711517 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 19711556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #200
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 154
Target Start/End: Original strand, 23280465 - 23280504
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa 154  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  23280465 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 23280504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #201
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 154
Target Start/End: Original strand, 24795219 - 24795258
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa 154  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  24795219 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 24795258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #202
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 154
Target Start/End: Original strand, 29935849 - 29935888
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa 154  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  29935849 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 29935888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #203
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 154
Target Start/End: Original strand, 30945864 - 30945903
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa 154  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  30945864 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 30945903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #204
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 154
Target Start/End: Original strand, 33692206 - 33692245
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa 154  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  33692206 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 33692245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #205
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 197
Target Start/End: Original strand, 41842929 - 41843012
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctct 197  Q
    ||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||| |||| ||  ||||||||||||| ||||    
T  41842929 ttgtattttgatcaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaatagaagtctct 41843012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #206
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 115 - 229
Target Start/End: Original strand, 2914114 - 2914231
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaa--tagaagcctctcgcctgcgtgcttg 211  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||  |||||||| ||||| |||| ||  |||||||  | |||| |||| ||    |||||||    
T  2914114 ttgtattgtgaacaccactaattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaatttggaagtctcttgcagttgtgcttg 2914213  T
Q  212 agcattagaagactcttg 229  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  2914214 agcattagaagtctcttg 2914231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #207
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 342 - 407
Target Start/End: Original strand, 2914341 - 2914407
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    |||||||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||   ||||||||||    
T  2914341 tctccttgaaagtgcaagggggacatgactgacttccggtttgtggaaggaacctatataattgctt 2914407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #208
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 205 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 9802741 - 9802671
Alignment:
Q  205 gtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca 275  Q
    ||||||||||||  |||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||| || |  |||||||||||    
T  9802741 gtgcttgagcatgtgaagtctcttgcttgtgtgcttgagcataggaagtctcttgcttatgtgcttgagca 9802671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #209
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 342 - 407
Target Start/End: Original strand, 13138626 - 13138692
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    |||| |||||||||||||||||||  |||| ||||||| |||||||||| |||| | ||||||||||    
T  13138626 tctcgttggaagtgcaagggggacatgactgacttccgatttgtggaaggaacctgtataattgctt 13138692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #210
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 342 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 15087978 - 15087916
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggataatt 403  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||| |||| | ||||||    
T  15087978 tctccttggaagtgcaaggggggcaggactgacttccgatttgtggaaggaacctgtataatt 15087916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #211
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 349 - 417
Target Start/End: Original strand, 21382165 - 21382235
Alignment:
Q  349 ggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggat-aattgcttgtgtctctct 417  Q
    |||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| |||| | || ||||| ||||||||||||    
T  21382165 ggaagtgcaagggggacaagactgacttccggtttgtggaaggaacctgtataaattgattgtgtctctct 21382235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #212
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 369 - 432
Target Start/End: Original strand, 22499347 - 22499412
Alignment:
Q  369 actacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  22499347 actacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 22499412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #213
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 345 - 417
Target Start/End: Original strand, 24795447 - 24795521
Alignment:
Q  345 ccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggat-aattgcttgtgtctctct 417  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||||| |||| | || |||||||||||| |||||    
T  24795447 ccttggaagtgcaagggggacatgactgactttcggtttgtggaaggaacctgtataaattgcttgtgtttctct 24795521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #214
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 345 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 27871142 - 27871072
Alignment:
Q  345 ccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggat-aattgcttgtgtct 413  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||| |||| | || ||||||||||||||    
T  27871142 ccttggaagtgcaagggggacatgactgacttctggtttgtggaaggaacctgtataaattgcttgtgtct 27871072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #215
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 115 - 229
Target Start/End: Original strand, 32265224 - 32265341
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagt-caaacatatttctctgtattttcgtttgaat--agaagcctctcgcctgcgtgcttg 211  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||| | ||||||  ||||| |||| ||| ||||||||  ||||| |||| ||    |||||||    
T  32265224 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagggttcaacttcaaacaattttctttgtaattttgtttgaatttagaagtctcttgcagttgtgcttg 32265323  T
Q  212 agcattagaagactcttg 229  Q
    |||| |||||| ||||||    
T  32265324 agcaatagaagtctcttg 32265341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #216
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 342 - 394
Target Start/End: Original strand, 2266243 - 2266296
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaacc 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||| ||||    
T  2266243 tctccttggaagtgcaagggggacaaggctgacttccggtttgtggaaggaacc 2266296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #217
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 342 - 394
Target Start/End: Original strand, 9710533 - 9710586
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaacc 394  Q
    |||| |||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  9710533 tctctttggaagtgcaagggggacatgactgacttccggtttgtggaaggaacc 9710586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #218
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 360 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 9762132 - 9762075
Alignment:
Q  360 ggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtctctct 417  Q
    ||||||||||||| || ||| || |||||||||||||||||| || |||| |||||||    
T  9762132 ggggactggactatttacggattatggaagaaaccaggataactgtttgtctctctct 9762075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #219
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 342 - 394
Target Start/End: Original strand, 16557318 - 16557371
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaacc 394  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||||    
T  16557318 tctccttggaagtgcaaaggggacaggactgacttccggtttgtgcaaggaacc 16557371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #220
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 342 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 16608344 - 16608291
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaacc 394  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||||    
T  16608344 tctccttggaagtgcaaaggggacaggactgacttccggtttgtgcaaggaacc 16608291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #221
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 119 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 44466712 - 44466647
Alignment:
Q  119 attgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgttt 183  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||| |||| ||| ||||    
T  44466712 attgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattttgttt 44466647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #222
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 346 - 394
Target Start/End: Original strand, 48806613 - 48806662
Alignment:
Q  346 cttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaacc 394  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  48806613 cttggaagtgcaagggggacaagactgacttccggtttgtggaaggaacc 48806662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #223
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 371 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 1775728 - 1775665
Alignment:
Q  371 tacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  1775728 tacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 1775665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #224
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 344 - 388
Target Start/End: Original strand, 13173081 - 13173125
Alignment:
Q  344 tccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaa 388  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | ||||||||    
T  13173081 tccttggaagtgcaagggggagtggacttcttccagattgtggaa 13173125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #225
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 217 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 13263362 - 13263322
Alignment:
Q  217 tagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctct 257  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  13263362 tagaagtctcttgcttttgtgcttgagcataggaagtctct 13263322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #226
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 13683250 - 13683178
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaat 187  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| |  |||||||| ||||| |||| ||  ||||||||    
T  13683250 ttgtattttgaacaccactgattgtatatcaagtgttaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaat 13683178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #227
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 342 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 15467345 - 15467297
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaag 389  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||    
T  15467345 tctccttggaagtgcaagggggacaggactgatttctggtttgtggaag 15467297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #228
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 163
Target Start/End: Original strand, 16105470 - 16105518
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacat 163  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||  |||||||    
T  16105470 ttgtattgtgaacaccactcattgtatatcaagtgttcaaaccaaacat 16105518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #229
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 342 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 21691787 - 21691751
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccg 378  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  21691787 tctccttggaagttcaagggggacaggactacttccg 21691751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #230
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 342 - 389
Target Start/End: Original strand, 33692430 - 33692478
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaag 389  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||    
T  33692430 tctccttggaagtgcaagggggacaaaactgacttccggtttgtggaag 33692478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 308; Significance: 1e-173; HSPs: 207)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 11515018 - 11514601
Alignment:
Q  13 aaaagcgtcaaaactctgtcaa-tttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtctttatt 111  Q
    ||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  11515018 aaaagcgccaaaactctgccaaatttgattctacaaagcactttgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattctcaagtctagagtctttatt 11514919  T
Q  112 acattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgctt 210  Q
     ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11514918 gcattgtattgtgaacaccaccgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacat-tttctatgtatttttgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgctt 11514820  T
Q  211 gagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagagagtattgagcat 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  11514819 gagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcatacttagagagtattgagcat 11514720  T
Q  311 ttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtg 410  Q
    ||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||      
T  11514719 ttgtaatctgtgtgatta---ttagtgaaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaaccaggataattgcttgca 11514623  T
Q  411 tctctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||| ||||||||||||||    
T  11514622 tctctctttcttttctctgctc 11514601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 31267068 - 31267485
Alignment:
Q  13 aaaagcgtcaaaactctgtcaa-tttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtctttatt 111  Q
    ||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  31267068 aaaagcgccaaaactctgccaaatttgattctacaaagcactttgaatttctggactgatttgatacatcttagaaattctcaagtctagagtctttatt 31267167  T
Q  112 acattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgctt 210  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31267168 gcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacat-tttctctgtatttttgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgctt 31267266  T
Q  211 gagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca-tttgagaagtctcataccaagagagtattgagca 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||| |||||||||    
T  31267267 gagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattttgagaagtctcatacttagagaatattgagca 31267366  T
Q  310 tttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgt 409  Q
    |||||||||| || |||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31267367 tttgtaatctttgagatta---ttagtggaaatctccttggaagtgcaa-ggggactggactacttccggtttgtggaaggaaccaggataattgcttgt 31267462  T
Q  410 gtctctctgtcttttctctgctc 432  Q
    |||||||| ||||||||||||||    
T  31267463 gtctctctttcttttctctgctc 31267485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 3 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 5873363 - 5872939
Alignment:
Q  3 atacaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctaga 102  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5873363 atacaagttaaaaagcgccaaaaccctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcacaagtctaga 5873264  T
Q  103 gtctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcct 202  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  5873263 gtctttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacatatttctttgtatttttgtttgaatagaagcctcttgcct 5873164  T
Q  203 gcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca-tttgagaagtctcataccaagagagt 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||  |||||||    
T  5873163 gcgtgcttgagcattagaagactcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcctgcgtgcttgagtattttgagaagtctcatacttagagagt 5873065  T
Q  302 attgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataa 401  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||    
T  5873064 attgagcatttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtgggaggaaccaggataa 5872970  T
Q  402 ttgcttgtgtctc-tctgtcttttctctgct 431  Q
     |||||||||||| | | |||||||||||||    
T  5872969 ctgcttgtgtctcgtttttcttttctctgct 5872939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 13 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 10300518 - 10300102
Alignment:
Q  13 aaaagcgtcaaaactctgtcaa-tttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtctttatt 111  Q
    ||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10300518 aaaagcgccaaaactctgccaaatttgattctacaaagcaccttgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcacaagtctagagtctttatt 10300419  T
Q  112 acattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttg 211  Q
     ||||| ||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10300418 gcattgaattttgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacatttttctctgtatttttgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttg 10300319  T
Q  212 agcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca-tttgagaagtctcataccaagagagtattgagcat 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  10300318 agcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagactctagcctgcgtgcttgagcattttgagaagtctcatacttagagagtattgagcat 10300219  T
Q  311 ttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtg 410  Q
    ||||||||| ||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10300218 ttgtaatctttgtgatta---ttagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaaccaggataattgcttgtg 10300123  T
Q  411 tctctc-tgtcttttctctgc 430  Q
    |||| | | ||||||||||||    
T  10300122 tctcgcttttcttttctctgc 10300102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 13 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 11535828 - 11535415
Alignment:
Q  13 aaaagcgtcaaaactctgtcaa-tttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtctttatt 111  Q
    ||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  11535828 aaaagcgccaaaactctgccaaatttgattctacaaagcactttgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcttaagtctagagtctttatt 11535729  T
Q  112 acattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgctt 210  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11535728 gcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacat-tttctctgtatttttgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgctt 11535630  T
Q  211 gagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca-tttgagaagtctcataccaagagagtattgagca 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  11535629 gagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagactctcgcctgcgtgcttgagcattttgagaagtctcatacttagagagtattgagca 11535530  T
Q  310 tttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgt 409  Q
    |||||||||| ||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11535529 tttgtaatctttgtgatta---ttagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaaccaggataattgcttgt 11535434  T
Q  410 gtctctctgtcttttctct 428  Q
    |||| ||| || |||||||    
T  11535433 gtctttctttcctttctct 11535415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 1 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 10695635 - 10695228
Alignment:
Q  1 acatacaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtcta 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10695635 acatacaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcacaagtcta 10695536  T
Q  101 gagtctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgc 200  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| ||    
T  10695535 gagtctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacatatttccctgtatttttgtttgatcagaagactcttgc 10695436  T
Q  201 ctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca-tttgagaagtctcataccaagaga 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||    
T  10695435 ctgcgtgcttgagcattagaagactcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcttgtgtgcttgagcattttgagaagtctcatacttagaga 10695337  T
Q  300 gtattgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggat 399  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  10695336 gtattgagcatttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgttttgtggaaggaaccaggat 10695242  T
Q  400 aattgcttgtgtct 413  Q
    || |||||||||||    
T  10695241 aactgcttgtgtct 10695228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 13 - 429
Target Start/End: Original strand, 49002256 - 49002670
Alignment:
Q  13 aaaagcgtcaaaactctgtcaa-tttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattc-actagtctagagtctttat 110  Q
    ||||||| |||||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    ||||||||||||||||    
T  49002256 aaaagcgccaaaactctgccaaatttgattctataaagcactttgaatttctgcactgatttgatatatcttagaaattcttaaagtctagagtctttat 49002355  T
Q  111 tacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttc-aagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgct 209  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  49002356 tgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacat-tttctgtgtaattttgtttgaatagaagtctctcgcctgcgtgct 49002454  T
Q  210 tgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagagagtattgagca 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  49002455 tgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcatgcgtgcttgagcatttgagaagtctcata-ctagagagtattgagca 49002553  T
Q  310 tttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgt 409  Q
    | |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||    
T  49002554 tctgtaatctgtgtgatta---ttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaaccagaataattggttgt 49002650  T
Q  410 gtctctctgtcttttctctg 429  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  49002651 gtctctctttcttttctctg 49002670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 3 - 410
Target Start/End: Original strand, 15207654 - 15208057
Alignment:
Q  3 atacaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctaga 102  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15207654 atacaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctaga 15207753  T
Q  103 gtctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgta-ttttcgtttgaatagaagcctctcgcc 201  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||  ||||| |||| |||    
T  15207754 gtctttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacatatttccctgtattttttgtttgatcagaagactcttgcc 15207853  T
Q  202 tgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca-tttgagaagtctcataccaagagag 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||||||    
T  15207854 tgcgtgcttgagcattagaagactcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcctgcatgcttgagcattttgagaagtctcatacttagagag 15207952  T
Q  301 tattgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggata 400  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||     |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  15207953 tattgagcatttgtaatcttagtgattat-----ggtgaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgttttgtggaaggaaccaggata 15208047  T
Q  401 attgcttgtg 410  Q
    | ||||||||    
T  15208048 actgcttgtg 15208057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 13 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 55651306 - 55650893
Alignment:
Q  13 aaaagcgtcaaaactctgtcaa-tttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtctttatt 111  Q
    ||||||| |||||||||| ||| |||| ||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  55651306 aaaagcgccaaaactctgccaaatttgtttctttaaagcactttgaatttctgcactgatttgatatatcttagaaattcttaagtctagagtctttatt 55651207  T
Q  112 acattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgctt 210  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||    
T  55651206 gcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaatgtcaaacat-tttctgtgtaattttgtttgaatagaagtctcttgccttcgtgctt 55651108  T
Q  211 gagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagagagtattgagcat 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  55651107 gagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcata-ctagagagtattgagcat 55651009  T
Q  311 ttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtg 410  Q
     |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||    
T  55651008 ctgtaatctgtgtg---atttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtagaaggaaccaggataattgtttgtg 55650912  T
Q  411 tctctctgtcttttctctg 429  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  55650911 tctctctttcttttctctg 55650893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 5 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 10909398 - 10908994
Alignment:
Q  5 acaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagt 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  10909398 acaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaaaagtctagagt 10909299  T
Q  105 ctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgc 204  Q
    |||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| || |||  |||||||| ||||||  |||||||||| ||||||    
T  10909298 ctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttaattcattgtatttttgtttgatcagaagcctcttgcctgc 10909199  T
Q  205 gtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||    
T  10909198 gtgcttgagcattagaagactcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcatacttagagagta 10909100  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||     
T  10909099 ttgagcatttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgttttgtggaaggaaccaggataac 10909005  T
Q  403 tgcttgtgtct 413  Q
    |||||||||||    
T  10909004 tgcttgtgtct 10908994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 3 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 3370708 - 3370299
Alignment:
Q  3 atacaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctaga 102  Q
    ||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3370708 atacaagttcaaaaacgccaaaactctgtcaatttgattctaaaaagcacattgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcacaagtctaga 3370609  T
Q  103 gtctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttca-agtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcc 201  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||    
T  3370608 gtctttattgcattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcataatcaaacatttttctctgtatttttgtttgaacagaagtctcttgcc 3370509  T
Q  202 tgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca---tttgagaagtctcataccaagag 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||   |||||||||||||||||  |||     
T  3370508 tgcgtgcttgagcattagaagactcttgc-taagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattttttgagaagtctcatacttagat 3370410  T
Q  299 agtattgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccagga 398  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  3370409 agtattgagcatttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaaccagga 3370315  T
Q  399 taattgcttgtgtctc 414  Q
    ||||||||||||||||    
T  3370314 taattgcttgtgtctc 3370299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 5 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 16305097 - 16304693
Alignment:
Q  5 acaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagt 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  16305097 acaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaaaagtctagagt 16304998  T
Q  105 ctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgc 204  Q
    |||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||||||  |||||  ||||| |||| ||||||    
T  16304997 ctttattgtattctattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttatttcattgtatttttatttgatcagaagactcttgcctgc 16304898  T
Q  205 gtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||    
T  16304897 gtgcttgagcattagaagactcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcctgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcatacttagagagta 16304799  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  16304798 ttgagcatttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtacaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 16304704  T
Q  403 tgcttgtgtct 413  Q
    |||||||||||    
T  16304703 tgcttgtgtct 16304693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 5 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 16317321 - 16316917
Alignment:
Q  5 acaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagt 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  16317321 acaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatatgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaaaagtctagagt 16317222  T
Q  105 ctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgc 204  Q
    |||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||  ||||| |||| ||||||    
T  16317221 ctttattgtattctattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttatttcattgtatttttgtttgatcagaagactcttgcctgc 16317122  T
Q  205 gtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||    
T  16317121 gtgcttgagcattagaagactcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcctgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcatacttagagagta 16317023  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  16317022 ttgagcatttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtacaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 16316928  T
Q  403 tgcttgtgtct 413  Q
    |||||||||||    
T  16316927 tgcttgtgtct 16316917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 24713414 - 24712993
Alignment:
Q  13 aaaagcgtcaaaactctgtcaa-tttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtctttatt 111  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24713414 aaaagcgccaaaactctgtcaaatttgattctacaaagcaccttgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcacaagtctagagtctttatt 24713315  T
Q  112 acattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaag-tcaaacatatttctctgtattttcgtttgaat----agaagcctctcgcctgcgt 206  Q
     |||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||     |||||||||||| ||||||    
T  24713314 gcattatattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaggtcaaacat-tttctctgtatttttgtttgaacgtacagaagcctctcgtctgcgt 24713216  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattt-gagaagtctcataccaagagagtattg 305  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| || |||||||||||  |||||||||||    
T  24713215 gcttgagcattagtagactcttgctt-agtgcttgagcattggaagactctttcctgcgtgcttgagcattttgaaaagtctcatacttagagagtattg 24713117  T
Q  306 agcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgc 405  Q
    |||||||||||||| ||||||||||   |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  24713116 agcatttgtaatctttgtgattatt---agtg-aaatctccttggaagtgcaatggggactggactacttccgatttgtggaaggaaccaggataattgc 24713021  T
Q  406 ttgtgtctctc-tgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||| | | ||||||||||||||    
T  24713020 ttgtgtctcgcttttcttttctctgctc 24712993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 3 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 3390448 - 3390039
Alignment:
Q  3 atacaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctaga 102  Q
    ||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3390448 atacaagttcaaaaacgccaaaactctgtcaatttgattctaaaaagcacattgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcacaagtctaga 3390349  T
Q  103 gtctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttca-agtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcc 201  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||   |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||    
T  3390348 gtctttattgcattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcatcatcaaacatttttctctgtatttttgtttgaacagaagtctcttgcc 3390249  T
Q  202 tgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca---tttgagaagtctcataccaagag 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||   |||||||||||||||||  |||     
T  3390248 tgcgtgcttgagcattagaagactcttgc-taagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattttttgagaagtctcatacttagat 3390150  T
Q  299 agtattgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccagga 398  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  3390149 agtattgagcatttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaaccagga 3390055  T
Q  399 taattgcttgtgtctc 414  Q
    ||| |||| |||||||    
T  3390054 taactgctcgtgtctc 3390039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 5 - 413
Target Start/End: Original strand, 14836371 - 14836775
Alignment:
Q  5 acaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagt 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| || |||    
T  14836371 acaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaaaagtttatagt 14836470  T
Q  105 ctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgc 204  Q
    |||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||  ||||| |||| |||||     
T  14836471 ctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttatttctttgtatttttgtttgatcagaagactctagcctgt 14836570  T
Q  205 gtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||| || |  |||||||||||||||||  ||||||||    
T  14836571 gtgcttgagcattagaagactcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttaagtatttttgagaagtctcatacttagagagta 14836669  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||     
T  14836670 ttgagcatttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagagggactggactacttccgttttgtggaaggaaccaggataaa 14836764  T
Q  403 tgcttgtgtct 413  Q
    |||||||||||    
T  14836765 tgcttgtgtct 14836775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 5 - 432
Target Start/End: Original strand, 40470856 - 40471281
Alignment:
Q  5 acaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagt 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||     
T  40470856 acaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagaga 40470954  T
Q  105 ctttattacattgt-attgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctg 203  Q
    |||||||   || | |||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||  ||||| |||| |||||    
T  40470955 ctttattgtttttttattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttaattctctgtatttttgtttgatcagaagtctcttgcctg 40471054  T
Q  204 cgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagt 301  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||||||||||||||||  |||||||    
T  40471055 cgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcatacttagagagt 40471153  T
Q  302 attgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataa 401  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  40471154 attgagcatttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaaccaggataa 40471248  T
Q  402 ttgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
     ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  40471249 ctgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 40471281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 5 - 432
Target Start/End: Original strand, 40454617 - 40455043
Alignment:
Q  5 acaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagt 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  40454617 acaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagt 40454715  T
Q  105 ctttattacattgt--attgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcct 202  Q
    |||||||   || |  |||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||  ||||| |||| || |    
T  40454716 ctttattgttttttttattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttaattctctgtatttttgtttgatcagaagtctcttgcat 40454815  T
Q  203 gcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagag 300  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||    
T  40454816 gcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcatacttagagag 40454914  T
Q  301 tattgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggata 400  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  40454915 tattgagcatttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaaccaggata 40455009  T
Q  401 attgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    | ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  40455010 actgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 40455043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 3 - 432
Target Start/End: Original strand, 27815213 - 27815639
Alignment:
Q  3 atacaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctaga 102  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  27815213 atacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaaattgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctaga 27815311  T
Q  103 gtctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcct 202  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||  ||||| |||| ||||    
T  27815312 gtctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgatcagaagtctcttgcct 27815411  T
Q  203 gcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagag 300  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||  ||| ||    
T  27815412 gcgtgcttgaacattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatacttagaaag 27815510  T
Q  301 tattgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggata 400  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  27815511 tattgagcatttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggata 27815605  T
Q  401 attgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    | ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  27815606 actgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 27815639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 450564 - 450142
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  450564 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 450466  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  450465 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 450366  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagtatt 304  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||  ||| ||||||    
T  450365 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatacttagaaagtatt 450267  T
Q  305 gagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||    
T  450266 gagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactg 450172  T
Q  405 cttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  450171 cttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 450142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Original strand, 19955234 - 19955656
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19955234 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattca-tagtctagagtct 19955332  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||| |  ||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  19955333 ttactgtattgttttgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaactcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 19955432  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagtatt 304  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||  ||| ||||||    
T  19955433 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatacttagaaagtatt 19955531  T
Q  305 gagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||    
T  19955532 gagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactg 19955626  T
Q  405 cttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  19955627 cttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 19955656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 48371119 - 48370697
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||    
T  48371119 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaaattgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtccagagtct 48371021  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||  ||||| |||| ||||||||    
T  48371020 ttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgatcagaagtctcttgcctgcgt 48370921  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagtatt 304  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||  ||| ||||||    
T  48370920 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatacttagaaagtatt 48370822  T
Q  305 gagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    ||||||||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||    
T  48370821 gagcatttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactg 48370727  T
Q  405 cttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  48370726 cttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 48370697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Original strand, 18752755 - 18753183
Alignment:
Q  1 acatacaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtcta 100  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  18752755 acatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaaattgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtcta 18752853  T
Q  101 gagtctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgc 200  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||    
T  18752854 gagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgc 18752953  T
Q  201 ctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagag 298  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||   ||     
T  18752954 ctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatactttgat 18753052  T
Q  299 agtattgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccagga 398  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||    
T  18753053 agtattgagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagagcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccagga 18753147  T
Q  399 taattgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||| ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  18753148 taactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 18753183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Original strand, 18763365 - 18763793
Alignment:
Q  1 acatacaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtcta 100  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  18763365 acatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaaattgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtcta 18763463  T
Q  101 gagtctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgc 200  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||    
T  18763464 gagtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgc 18763563  T
Q  201 ctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagag 298  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||   ||     
T  18763564 ctgcatgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatactttgat 18763662  T
Q  299 agtattgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccagga 398  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||    
T  18763663 agtattgagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccagga 18763757  T
Q  399 taattgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||| ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  18763758 taactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 18763793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 4948325 - 4947903
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  4948325 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 4948227  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||| ||    
T  4948226 ttactgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaactcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgtgt 4948127  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagtatt 304  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||  ||| ||||||    
T  4948126 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatacttagaaagtatt 4948028  T
Q  305 gagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||    
T  4948027 gagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactg 4947933  T
Q  405 cttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  4947932 cttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 4947903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Original strand, 15561351 - 15561773
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  15561351 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 15561449  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  15561450 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 15561549  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagtatt 304  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||  ||| ||||||    
T  15561550 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatacttagaaagtatt 15561648  T
Q  305 gagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||    
T  15561649 gagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactg 15561743  T
Q  405 cttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  15561744 cttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 15561773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 5 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 17918042 - 17917617
Alignment:
Q  5 acaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagt 104  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  17918042 acaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagt 17917944  T
Q  105 ctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgc 204  Q
    ||||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||    
T  17917943 ctttactgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaactcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgc 17917844  T
Q  205 gtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca---tttgagaagtctcataccaagagagt 301  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||   |||| ||||||||||||  ||| |||    
T  17917843 gtgcttaagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcaatttttgtgaagtctcatacttagaaagt 17917745  T
Q  302 attgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataa 401  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  17917744 attgagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataa 17917650  T
Q  402 ttgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
     ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  17917649 ctgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 17917617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 5 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 17928690 - 17928265
Alignment:
Q  5 acaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagt 104  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  17928690 acaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagt 17928592  T
Q  105 ctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgc 204  Q
    ||||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| | |||| |||| ||||||    
T  17928591 ctttactgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaactcaaactcaattctctgtatttttgtttgattggaagtctcttgcctgc 17928492  T
Q  205 gtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca---tttgagaagtctcataccaagagagt 301  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||   |||| ||||||||||||  ||| |||    
T  17928491 gtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcaatttttgtgaagtctcatacttagaaagt 17928393  T
Q  302 attgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataa 401  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  17928392 attgagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataa 17928298  T
Q  402 ttgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
     ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  17928297 ctgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 17928265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 27656588 - 27656164
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  27656588 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 27656490  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||    
T  27656489 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctctcgcctgcgt 27656390  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||  ||| ||||    
T  27656389 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcttgtgtgcttgagcatagttttgtgaagtctcatacttagaaagta 27656291  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  27656290 ttgagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 27656196  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  27656195 tgcttgtgtctttatctttcttttctctgctc 27656164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 27667161 - 27666737
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  27667161 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 27667063  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||    
T  27667062 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctctcgcctgcgt 27666963  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||  ||| ||||    
T  27666962 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcttgtgtgcttgagcatagttttgtgaagtctcatacttagaaagta 27666864  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  27666863 ttgagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 27666769  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  27666768 tgcttgtgtctttatctttcttttctctgctc 27666737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 3 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 19581234 - 19580830
Alignment:
Q  3 atacaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcacta-gtctag 101  Q
    |||||| || ||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||    
T  19581234 atacaaatttaaaagcgccaaaactctatcaatttgattctaaaaagcacattgaatttctgcactgatttggtatatcttagaaattcacaaagtctag 19581135  T
Q  102 agtctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattt-tcgtttgaatagaagcctctcgc 200  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||  | ||| |||| ||    
T  19581134 agtctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacatatttccctgtatttcttttttgatcaaaagactcttgc 19581035  T
Q  201 ctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca-tttgagaagtctcataccaagaga 299  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||    
T  19581034 ccgcgtgcttgagcattagaagactcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactctttcctgtgtgcttgagcattttgagaagtctcatacttagaga 19580936  T
Q  300 gtattgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggat 399  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  19580935 gtattgagcatttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactagactacttccgttttgtggaaggaaccaggat 19580841  T
Q  400 aattgcttgtg 410  Q
    || ||||||||    
T  19580840 aactgcttgtg 19580830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Original strand, 24028357 - 24028782
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  24028357 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 24028455  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  24028456 ttactgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaactcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 24028555  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattt-----gagaagtctcataccaagagagt 301  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || || ||||||||||||||     | ||||||||||||  ||| |||    
T  24028556 gcttgagcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattttttttgtgaagtctcatacttagaaagt 24028654  T
Q  302 attgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataa 401  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  24028655 attgagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtattgtggaaggaaccaggataa 24028749  T
Q  402 ttgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
     ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  24028750 ctgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 24028782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 16266447 - 16266025
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  16266447 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattca-aagtctagagtct 16266349  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgt-attttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcg 205  Q
    ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | |||||||| ||||| |||||| |||||| |||| |||||||    
T  16266348 tttctacattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtaatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcg 16266249  T
Q  206 tgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagtat 303  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||  ||| |||||    
T  16266248 tgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatacttagaaagtat 16266150  T
Q  304 tgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataatt 403  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| |    
T  16266149 tgagcagttgtaatct-tgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataact 16266056  T
Q  404 gcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    |||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  16266055 gcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 16266025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 25657124 - 25656701
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  25657124 aagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 25657026  T
Q  107 ttattacattgt-attgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcg 205  Q
    |||||   || | |||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||  ||||| |||| ||||| |    
T  25657025 ttattgtttttttattgagaacaccgctgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttaattctctgtatttttgtttgatcagaagtctcttgcctgtg 25656926  T
Q  206 tgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagtat 303  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||||||||| ||||||  |||||||||    
T  25656925 tgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtttcatacttagagagtat 25656827  T
Q  304 tgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataatt 403  Q
    |||||||||||||||| ||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |    
T  25656826 tgagcatttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaaccaggataact 25656732  T
Q  404 gcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    || ||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  25656731 gcctgtgtctttgtctttcttttctctgctc 25656701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 3 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 5022728 - 5022302
Alignment:
Q  3 atacaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctaga 102  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  5022728 atacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaaattgattctacaaagcacactgaatttctgcactaatttgatacatcttagaaattcaa-agtctaga 5022630  T
Q  103 gtctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcct 202  Q
    |||||||||  ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||    
T  5022629 gtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcct 5022530  T
Q  203 gcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagag 300  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||   || ||    
T  5022529 gcgtgcttgagcattaaaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatactttgatag 5022431  T
Q  301 tattgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggata 400  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  5022430 tattgagcatttgtaatctttgtaatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggata 5022336  T
Q  401 attgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    | ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  5022335 actgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 5022302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Original strand, 14843925 - 14844347
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  14843925 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 14844023  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  14844024 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 14844123  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagtatt 304  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||  ||| ||||||    
T  14844124 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatacttagaaagtatt 14844222  T
Q  305 gagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
     |||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||    
T  14844223 aagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactg 14844317  T
Q  405 cttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  14844318 cttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 14844347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Original strand, 19944599 - 19945021
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19944599 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattca-tagtctagagtct 19944697  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||| |  ||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  19944698 ttactgtattgttttgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaactcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 19944797  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagtatt 304  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||  ||| ||||||    
T  19944798 gcttgaacattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatacttagaaagtatt 19944896  T
Q  305 gagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||    
T  19944897 gagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactg 19944991  T
Q  405 cttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
     |||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  19944992 tttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 19945021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Original strand, 30926766 - 30927188
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  30926766 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 30926864  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |   ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  30926865 tttctgtcttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 30926964  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagtatt 304  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||  ||| ||||||    
T  30926965 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatacttagaaagtatt 30927063  T
Q  305 gagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||    
T  30927064 gagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactg 30927158  T
Q  405 cttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  30927159 cttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 30927188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 16255854 - 16255432
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  16255854 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattca-aagtctagagtct 16255756  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgt-attttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcg 205  Q
    ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | |||||||| ||||| |||||| |||||| |||| |||||||    
T  16255755 tttctgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtaatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcg 16255656  T
Q  206 tgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagtat 303  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||  ||| |||||    
T  16255655 tgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatacttagaaagtat 16255557  T
Q  304 tgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataatt 403  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| |    
T  16255556 tgagcagttgtaatct-tgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataact 16255463  T
Q  404 gcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    |||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  16255462 gcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 16255432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Original strand, 18130511 - 18130936
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  18130511 aagtttaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattca-aagtctagagtct 18130609  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcg-tttgaatagaagcctctcgcctgcg 205  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| | ||||| |||||| ||||||||||||    
T  18130610 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgttttgattagaagtctctcgcctgcg 18130709  T
Q  206 tgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagt 301  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||  ||| |||    
T  18130710 tgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaagtctcatacttagaaagt 18130808  T
Q  302 attgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataa 401  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  18130809 attgagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataa 18130903  T
Q  402 ttgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
     ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  18130904 ctgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 18130936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 7 - 411
Target Start/End: Original strand, 18078177 - 18078579
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  18078177 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaaaagtctagagtct 18078276  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    |||    |||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||| || |||| |||||||| ||||||  |||||||||| || |||||    
T  18078277 ttaacgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagcgttcaagtcaaacttaattctttgtatttttgtttgatcagaagcctcttgcttgcgt 18078376  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||  ||| ||||    
T  18078377 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagcctcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaagtctcatacttagatagta 18078475  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||||     
T  18078476 ttgagcatttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttctgtgttgtggaaggaaccaggataac 18078570  T
Q  403 tgcttgtgt 411  Q
    |||||||||    
T  18078571 tgcttgtgt 18078579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 21996401 - 21995979
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  21996401 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttaattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttataaattcaa-agtctagagtct 21996303  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  21996302 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 21996203  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagtatt 304  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||  ||| ||||||    
T  21996202 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatacttagaaagtatt 21996104  T
Q  305 gagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||    
T  21996103 gagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactg 21996009  T
Q  405 cttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  21996008 cttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 21995979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 22006999 - 22006577
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  22006999 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttaattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttataaattcaa-agtctagagtct 22006901  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  22006900 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 22006801  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagtatt 304  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||  ||| ||||||    
T  22006800 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatacttagaaagtatt 22006702  T
Q  305 gagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||    
T  22006701 gagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactg 22006607  T
Q  405 cttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  22006606 cttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 22006577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 24640236 - 24639813
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24640236 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgatactaaaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattca-tagtctagagtct 24640138  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||    
T  24640137 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctctcgcctgcgt 24640038  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||  ||| ||||    
T  24640037 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaagtctcatacttagaaagta 24639939  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  24639938 ttgagcagttgtaatct-tgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 24639845  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  24639844 tgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 24639813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Original strand, 29041928 - 29042351
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  29041928 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 29042026  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  29042027 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 29042126  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||  ||| ||||    
T  29042127 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaagtctcatacttagaaagta 29042225  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  29042226 ttgagcagttgtaatct-tgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 29042319  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  29042320 tgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 29042351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Original strand, 30937344 - 30937766
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  30937344 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 30937442  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||| ||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  30937443 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctccgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 30937542  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagtatt 304  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||  ||| ||||||    
T  30937543 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatacttagaaagtatt 30937641  T
Q  305 gagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||    
T  30937642 gagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaaggggaactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactg 30937736  T
Q  405 cttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  30937737 cttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 30937766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 13 - 428
Target Start/End: Original strand, 18774954 - 18775372
Alignment:
Q  13 aaaagcgtcaaaactctgtcaa-tttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtcttta-t 110  Q
    ||||||||| |||||||| ||| |||| ||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||| |    
T  18774954 aaaagcgtccaaactctgccaaatttgtttctcaaaagcactttgaatttctgcactgatttgatatatcttagaaattcttaagtctagagtctttaat 18775053  T
Q  111 tacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgct 209  Q
    | ||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||||  ||||| |||| ||  |||||| |||||| |||| || |  |||||    
T  18775054 tgcattgtattgtgaacaccattgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacaattttctgtgtaattctgtttgattagaagtctcttgctttagtgct 18775153  T
Q  210 tgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagagagtattgagca 309  Q
    |||||||  |||| ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | | ||  |||||||||||    
T  18775154 tgagcataggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctccca-ctaggcagtattgagca 18775252  T
Q  310 tttgtaatctgtgtgattattt-ttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttg 408  Q
     |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18775253 gttgtaatctgtgtgattatttcatagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaaccaggataattgcttg 18775352  T
Q  409 tgtctctctgtcttttctct 428  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  18775353 tgtctctctttcttttctct 18775372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 461145 - 460723
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  461145 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattatacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 461047  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||  |||| ||||||||    
T  461046 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaattctcttgcctgcgt 460947  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagtatt 304  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||  ||| ||||||    
T  460946 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatacttagaaagtatt 460848  T
Q  305 gagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    ||||| | ||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||    
T  460847 gagcagtagtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactg 460753  T
Q  405 cttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  460752 cttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 460723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Original strand, 55745524 - 55745947
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  55745524 aagtttaaaagcgccaaaactctgtcaaattgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 55745622  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  55745623 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 55745722  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||  ||| ||||    
T  55745723 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcttgtgtgcttgagcattgttttgtgaagtctcatacttagaaagta 55745821  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  55745822 ttgagcagttgtaatct-tgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 55745915  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  55745916 tgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 55745947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 49518123 - 49517700
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  49518123 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 49518025  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  49518024 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 49517925  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||   || ||||    
T  49517924 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaagtctcatactttgaaagta 49517826  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  49517825 ttgagcagttgtaatct-tgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 49517732  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||| ||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  49517731 tgcctgtgtctttgtctttcttttctctgctc 49517700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Original strand, 55756135 - 55756558
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  55756135 aagtttaaaagcgccaaaactctgtcaaattgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 55756233  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | |||| |||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  55756234 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctttgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 55756333  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||  ||| ||||    
T  55756334 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcttgtgtgcttgagcattgttttgtgaagtctcatacttagaaagta 55756432  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  55756433 ttgagcagttgtaatct-tgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 55756526  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  55756527 tgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 55756558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 36018324 - 36017901
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  36018324 aagtttaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctaaaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 36018226  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  36018225 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 36018126  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||   || ||||    
T  36018125 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaagtctcatactttgaaagta 36018027  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  36018026 ttgagcagttgtaatct-tgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 36017933  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||| ||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  36017932 tgcctgtgtctttgtctttcttttctctgctc 36017901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 36028877 - 36028454
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  36028877 aagtttaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctaaaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 36028779  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  36028778 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 36028679  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||   || ||||    
T  36028678 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaagtctcatactttgaaagta 36028580  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  36028579 ttgagcagttgtaatct-tgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 36028486  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||| ||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  36028485 tgcctgtgtctttgtctttcttttctctgctc 36028454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 52703776 - 52703354
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  52703776 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattatacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 52703678  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
     || |  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||  | ||||||||||||| |||| |  ||||| |||| ||||||||    
T  52703677 gtactgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgtttaactcaaactcaattctctgtatttttgtttcatcagaagtctcttgcctgcgt 52703578  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagtatt 304  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||  ||| ||||||    
T  52703577 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatacttagaaagtatt 52703479  T
Q  305 gagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||    
T  52703478 gagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtacaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactg 52703384  T
Q  405 cttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  52703383 cttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 52703354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Original strand, 10740866 - 10741289
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  10740866 aagtttaaaagcgccaaaactcggtcaatttgattctaaaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 10740964  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||  |||| | |||||| |||| ||||||||    
T  10740965 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttctgtttaattagaagtctcttgcctgcgt 10741064  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||   || ||||    
T  10741065 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaagtctcatactttgaaagta 10741163  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  10741164 ttgagcagttgtaatct-tgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 10741257  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||| ||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  10741258 tgcctgtgtctttgtctttcttttctctgctc 10741289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Original strand, 10751440 - 10751863
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  10751440 aagtttaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctaaaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattca-aagtctagagtct 10751538  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||  |||| | |||||| |||| ||||||||    
T  10751539 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttctgtttaattagaagtctcttgcctgcgt 10751638  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||   || ||||    
T  10751639 gcttgagcattaaaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaagtctcatactttgaaagta 10751737  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  10751738 ttgagcagttgtaatct-tgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 10751831  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||| ||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  10751832 tgcctgtgtctttgtctttcttttctctgctc 10751863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Original strand, 10954635 - 10955058
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  10954635 aagtttaaaagcgccaaaactcggtcaatttgattctaaaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 10954733  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||  |||| | |||||| |||| ||||||||    
T  10954734 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttctgtttaattagaagtctcttgcctgcgt 10954833  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||   || ||||    
T  10954834 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaagtctcatactttgaaagta 10954932  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  10954933 ttgagcagttgtaatct-tgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 10955026  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||| ||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  10955027 tgcctgtgtctttgtctttcttttctctgctc 10955058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Original strand, 10965209 - 10965632
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  10965209 aagtttaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctaaaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattca-aagtctagagtct 10965307  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||  |||| | |||||| |||| ||||||||    
T  10965308 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttctgtttaattagaagtctcttgcctgcgt 10965407  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||   || ||||    
T  10965408 gcttgagcattaaaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaagtctcatactttgaaagta 10965506  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  10965507 ttgagcagttgtaatct-tgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 10965600  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||| ||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  10965601 tgcctgtgtctttgtctttcttttctctgctc 10965632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 13 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 19242008 - 19241589
Alignment:
Q  13 aaaagcgtcaaaactctgtcaat-ttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtcttt--a 109  Q
    ||||||||| |||||||| |||  ||| ||||  ||||||| ||||||||| |   |||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||  |    
T  19242008 aaaagcgtccaaactctgccaaaattgtttctcaaaagcactttgaatttctgtgttgatttgatatatcttagaaattcttaagtctagagtctttcaa 19241909  T
Q  110 ttacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaag-tcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgc 208  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||  ||||| |||| ||  |||||| |||||| |||| || |  ||||    
T  19241908 ttgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgattagaagtctcttgctttagtgc 19241809  T
Q  209 ttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagagagtattgagc 308  Q
    ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |  ||||||||||    
T  19241808 ttgagcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcatttgtgaagtctcatactaggt-agtattgagc 19241710  T
Q  309 atttgtaatctgtgtgattattt-ttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  19241709 agttgtaatctgtgtgattatttcttagtggaaatctccttggaagtgcaaggaggactggactacttccggtttgtggaaggaaccagtataattgctt 19241610  T
Q  408 gtgtctctctgtcttttctct 428  Q
    |||| | ||| ||||||||||    
T  19241609 gtgtttatctttcttttctct 19241589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 215 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 23508926 - 23508713
Alignment:
Q  215 attagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagagagtattgagcatttgt 314  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||| ||||    
T  23508926 attagaagtctcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcatacta-gatagtattgagcagttgt 23508828  T
Q  315 aatctgtgtgattattt-ttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtct 413  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  23508827 aatctgtgtgattatttcttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggacttgactacttccggtttgtggaatgaaccaggataattgcttgtgtct 23508728  T
Q  414 ctctgtcttttctct 428  Q
    |||| ||||||||||    
T  23508727 ctctttcttttctct 23508713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 68 - 428
Target Start/End: Original strand, 18007415 - 18007778
Alignment:
Q  68 tgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtcttta--ttacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaag-tcaaacata 164  Q
    |||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||   || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||      
T  18007415 tgatttgatatatcttagaaattcttaagtctagagtctttcatttgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaat 18007514  T
Q  165 tttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgc 264  Q
    ||||| |||| ||  ||||||||||||| ||||  | |  ||||||||||||  |||| |||||| |||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  18007515 tttctgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttactttagtgcttgagcataggaagtctcttgatttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgc 18007614  T
Q  265 gtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagagagtattgagcatttgtaatctgtgtgattattt-ttagtggaaatctccttggaagtgcaaggggg 363  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||||| | |  |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18007615 gtgcttgagcaatttggaagtctcatactaggt-agtattaagcagttgtaatctgtgtgattatttcttagtggaaatctccttggaagtgcaaggggg 18007713  T
Q  364 actggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtctctctgtcttttctct 428  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  18007714 actggactacttccggtttgtggaaagaaccagtataattgcctgtgtctctctttcttttctct 18007778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 215 - 428
Target Start/End: Original strand, 16819825 - 16820038
Alignment:
Q  215 attagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagagagtattgagcatttgt 314  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |  ||||||||||| ||||    
T  16819825 attagaagtctcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgggaagtctcatacta-gttagtattgagcagttgt 16819923  T
Q  315 aatctgtgtgattattt-ttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtct 413  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16819924 aatctgtgtgattatttcttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgttttgtggaaggaaccaggataattgcttgtgtct 16820023  T
Q  414 ctctgtcttttctct 428  Q
    || | ||||||||||    
T  16820024 ctgtttcttttctct 16820038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 215 - 428
Target Start/End: Original strand, 14711253 - 14711468
Alignment:
Q  215 attagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagag-agtattgagcatttg 313  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | | | ||||||||||| |||    
T  14711253 attagaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcatttgtgaagtctcatactaggtgtagtattgagcagttg 14711352  T
Q  314 taatctgtgtgattattt-ttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtc 412  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  14711353 taatctgtgtgattatttcttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaaccagtataattgcttgtgtc 14711452  T
Q  413 tctctgtcttttctct 428  Q
    ||||| ||||||||||    
T  14711453 tctctttcttttctct 14711468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 215 - 428
Target Start/End: Original strand, 14778917 - 14779132
Alignment:
Q  215 attagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagag-agtattgagcatttg 313  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | | | ||||||||||| |||    
T  14778917 attagaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcatttgtgaagtctcatactaggtgtagtattgagcagttg 14779016  T
Q  314 taatctgtgtgattattt-ttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtc 412  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  14779017 taatctgtgtgattatttcttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaaccagtataattgcttgtgtc 14779116  T
Q  413 tctctgtcttttctct 428  Q
    ||||| ||||||||||    
T  14779117 tctctttcttttctct 14779132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Original strand, 47152343 - 47152589
Alignment:
Q  1 acatacaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtcta 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  47152343 acatacaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcacaagttta 47152442  T
Q  101 gagtctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacata-tttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcg 199  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||| |||||| |||| |    
T  47152443 gagtctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcatgtgttcaagtcaaacatattttccctgtatctttgtttgattagaagactcttg 47152542  T
Q  200 cctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcatt 247  Q
     ||  ||||||||||||| |||||||||||| |  |||||||||||||    
T  47152543 -cttagtgcttgagcattggaagactcttgcctgtgtgcttgagcatt 47152589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 3 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 4987266 - 4987052
Alignment:
Q  3 atacaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctaga 102  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  4987266 atacaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaaaagtctaga 4987167  T
Q  103 gtctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcct 202  Q
    |||||||||  | |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||||  ||||| |||| ||||    
T  4987166 gtctttattgtaatgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaactcaaacatatttcattgtatttttgtttgatcagaagactcttgcct 4987067  T
Q  203 gcgtgcttgagcatt 217  Q
    |||||||||||||||    
T  4987066 gcgtgcttgagcatt 4987052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 116 - 375
Target Start/End: Original strand, 4986790 - 4987045
Alignment:
Q  116 tgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgagca 215  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||||  ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  4986790 tgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaactcaaacatatttcattgtatttttgtttgatcagaagactcttgcctgcgtgcttgagca 4986889  T
Q  216 ttagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagtattgagcatttg 313  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || ||| |||||||  |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  4986890 ttagaagactcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgtttgagcatttttgagaagtctcatacttagagagtattgagcatttg 4986988  T
Q  314 taatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactactt 375  Q
    |||||| ||||||||    |||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4986989 taatctttgtgatta----tagt-gaaatctgcttggaagtgtaagggggactggactactt 4987045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 202 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 25008689 - 25008482
Alignment:
Q  202 tgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattt--gagaagtctcataccaagaga 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || || ||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||    
T  25008689 tgcgtgcttgagcattagaagactcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcatacttagaga 25008591  T
Q  300 gtattgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggat 399  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  25008590 gtattgagcatttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaaatgcaagggggactggactacttccgttttgtggaaggaaccaggat 25008496  T
Q  400 aattgcttgtgtct 413  Q
    || |||||||||||    
T  25008495 aactgcttgtgtct 25008482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 215 - 413
Target Start/End: Original strand, 47152528 - 47152721
Alignment:
Q  215 attagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattt-gagaagtctcataccaagagagtattgagcatttg 313  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  47152528 attagaagactcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcctgtgtgcttgagcattttgagaagtctcatacttagagagtattgagcatttg 47152626  T
Q  314 taatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtct 413  Q
    |||||| ||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  47152627 taatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtct 47152721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 217 - 417
Target Start/End: Original strand, 36210587 - 36210788
Alignment:
Q  217 tagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagag-agtattgagcatttgta 315  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| | | | ||| ||||||| |||||    
T  36210587 tagaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcatttgtgaattctcatactaggtgtagtcttgagcagttgta 36210686  T
Q  316 atctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtctct 415  Q
    |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| ||||||||||    
T  36210687 atctgtgtgattaaacttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaacgaaccagtataattgtttgtgtctct 36210786  T
Q  416 ct 417  Q
    ||    
T  36210787 ct 36210788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 253 - 428
Target Start/End: Original strand, 18775514 - 18775689
Alignment:
Q  253 tctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagagagtattgagcatttgtaatctgtgtgattatttt-tagtggaaatctccttgga 351  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||    
T  18775514 tctcttgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcatactaggc-agtattgagcagttgtaatctgtgtgattatttcatagtggaaatctcgttgga 18775612  T
Q  352 agtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtctctctgtcttttctct 428  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  18775613 agtgcaagggggactggactacttccggttcgtggaaggaaccaggataattgtttgtgtctctctttcttttctct 18775689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 117 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 33378062 - 33377755
Alignment:
Q  117 gtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaag-tcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgagca 215  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||  |||||  ||| ||   |||||||||||| |||| || |  |||||||||||    
T  33378062 gtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgcgtaattctatttgaatagaagtctcttgctttagtgcttgagca 33377963  T
Q  216 ttagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagag-agtattgagcatttgt 314  Q
    |  |||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||| | | | ||||||||| | ||||    
T  33377962 taggaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcaattt-gaagtctcatactaggtgtagtattgagaagttgt 33377864  T
Q  315 aatctgt-gtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtct 413  Q
    |||| || |||||||   |||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  33377863 aatcagttgtgattaaacttagtgaaactctccttggaagtgtaatggggactggactacttccggtttgtggaaggaaccagtataattgcctgtgtct 33377764  T
Q  414 ctctgtctt 422  Q
     ||| ||||    
T  33377763 ttctatctt 33377755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 276 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 10290344 - 10290191
Alignment:
Q  276 tttgagaagtctcataccaagagagtattgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactactt 375  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10290344 tttgagaagtctcatacttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgattatt---agtg-aaatctccttggaagtgcaagggggactggactactt 10290249  T
Q  376 ccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtctctc-tgtcttttctctgctc 432  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||    
T  10290248 ccgatttgtggaaggaaccaggataattgcttgtgtctcgcttttcttttctctgctc 10290191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 237 - 413
Target Start/End: Original strand, 19143504 - 19143677
Alignment:
Q  237 gcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattt--gagaagtctcataccaagagagtattgagcatttgtaatctgtgtgattattttta 334  Q
    |||||||||||||||| |||| || || ||| ||||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    |    
T  19143504 gcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgtttgagcatttttgagaagtctcatacttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgattat----a 19143599  T
Q  335 gtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtct 413  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  19143600 gtg-aaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtct 19143677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 303 - 432
Target Start/End: Original strand, 39532269 - 39532395
Alignment:
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    |||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39532269 ttgagcatttgtaatctgtgtgatt---tttagtgaaaatctccttgtaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaaccaggataat 39532365  T
Q  403 tgcttgtgtctctctgtcttttctctgctc 432  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||    
T  39532366 tgtttgtgtctctctttcttttctctgctc 39532395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 13 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 23509100 - 23508864
Alignment:
Q  13 aaaagcgtcaaaactctgtcaa-tttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtcttt-at 110  Q
    |||||||  ||||||||| ||| |||||||||  |||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||| ||    
T  23509100 aaaagcgcaaaaactctgccaaatttgattctcaaaagcactctgaatttctgcactgatttgatatatcttagaaattcttaagtctagagtcttttat 23509001  T
Q  111 tacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgctt 210  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||| |||| ||  |||||| |||||| |||| || |  ||||||    
T  23509000 tgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacaattttctgtgtaattctgtttgattagaagtctcttgctttagtgctt 23508901  T
Q  211 gagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcatt 247  Q
    ||||||| |||| |||| || |  |||||||||||||    
T  23508900 gagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatt 23508864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 197
Target Start/End: Original strand, 8997555 - 8997741
Alignment:
Q  13 aaaagcgtcaaaactctgtcaa-tttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtcttt-at 110  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||   ||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||| ||    
T  8997555 aaaagcgtcaaaactctgccaaatttgattctcacaagcactctgaatttctgcactgatttgatatatcttagaaattcttaagtctagagtcttttat 8997654  T
Q  111 tacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctct 197  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||| |||| ||  |||||| |||||| ||||    
T  8997655 tgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagacaaacaattttctgtgtaattctgtttgattagaagtctct 8997741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 247
Target Start/End: Original strand, 16819650 - 16819887
Alignment:
Q  13 aaaagcgtcaaaactctgtcaa-tttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtcttt-at 110  Q
    ||||||| ||||||| || ||| |||| ||||  ||||||| ||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||| ||    
T  16819650 aaaagcgccaaaactttgccaaatttgtttctcaaaagcactttgaatttctgtactgatttgatatatcttagaaattcctaagtctagagtcttttat 16819749  T
Q  111 tacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttc-aagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgct 209  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||| |||| ||  |||||| |||||| |||| || |  |||||    
T  16819750 tgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacaattttctgtgtaattctgtttgattagaagtctcttgctttagtgct 16819849  T
Q  210 tgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcatt 247  Q
    |||||||| |||| |||| || |  |||||||||||||    
T  16819850 tgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatt 16819887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 333 - 428
Target Start/End: Original strand, 18775925 - 18776020
Alignment:
Q  333 tagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtctctctgtcttttctct 428  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  18775925 tagtggaaatctcgttggaagtgcaagggggactggactacttccggttcgtggaaggaaccaggataattgtttgtgtctctctttcttttctct 18776020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 113 - 217
Target Start/End: Original strand, 39532173 - 39532277
Alignment:
Q  113 cattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttg 211  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39532173 cattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacat-tttctctgtatctttgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttg 39532271  T
Q  212 agcatt 217  Q
    ||||||    
T  39532272 agcatt 39532277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 281 - 413
Target Start/End: Original strand, 8183486 - 8183613
Alignment:
Q  281 gaagtctcataccaagagagtattgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggt 380  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |      
T  8183486 gaagtctcatacttagatagtattgagcatttgtaatctttgtgattat----agtg-aaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttctgtg 8183580  T
Q  381 ttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtct 413  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  8183581 ttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtct 8183613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 300 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 19570711 - 19570607
Alignment:
Q  300 gtattgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggat 399  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  19570711 gtattgagcatttgtaatctttgtgattat----agtg-aaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgttttgtggaaggaaccaggat 19570617  T
Q  400 aattgcttgt 409  Q
    || |||||||    
T  19570616 aactgcttgt 19570607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 238 - 329
Target Start/End: Original strand, 8997740 - 8997830
Alignment:
Q  238 cttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagagagtattgagcatttgtaatctgtgtgattat 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8997740 cttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcgta-ctagatagtattgagcaattgtaatctgtgtgattat 8997830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 70 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 1672088 - 1671899
Alignment:
Q  70 atttgatacatcttagaaattcactagtctagag--tcttt--attacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaag-tcaaacata 164  Q
    |||||||| |||||||||||||   |||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||      
T  1672088 atttgatatatcttagaaattcttaagtctagagagtctttcaattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaat 1671989  T
Q  165 tttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtc 254  Q
    ||||| |||| ||  ||||||||||||| |||| || |  ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  1671988 tttctgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtc 1671899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 338 - 432
Target Start/End: Original strand, 9920972 - 9921068
Alignment:
Q  338 gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  9920972 gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 9921068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 338 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 28050225 - 28050129
Alignment:
Q  338 gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  28050225 gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 28050129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 46 - 247
Target Start/End: Original strand, 17994125 - 17994329
Alignment:
Q  46 aaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtcttt--attacattgtattgtgaacactactgattgtatat 143  Q
    ||||||| ||||||||| |   |||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17994125 aaagcactttgaatttctgtgttgatttgatatatcttagaaattcttaagtctagagtctttcaattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatat 17994224  T
Q  144 ctagtgttc-aagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttga 242  Q
    | ||||||| || |||||||  ||||| |||| ||  |||||| |||||| |||| || |  ||||||||||||  |||| ||||| | |  ||||||||    
T  17994225 caagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgattagaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttacctgcgtgcttga 17994324  T
Q  243 gcatt 247  Q
    |||||    
T  17994325 gcatt 17994329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 215 - 292
Target Start/End: Original strand, 17994267 - 17994344
Alignment:
Q  215 attagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcatac 292  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17994267 attagaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttacctgcgtgcttgagcatttgtgaagtctcatac 17994344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 347 - 428
Target Start/End: Original strand, 17994362 - 17994442
Alignment:
Q  347 ttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtctctctgtcttttctct 428  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17994362 ttggaagtgca-gggggactggactacttccggtttgtagaaggaaccagtataattgcttgtgtctctctttcttttctct 17994442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 338 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 49509639 - 49509543
Alignment:
Q  338 gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  49509639 gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcctgtgtctttgtctttcttttctctgctc 49509543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 5 - 247
Target Start/End: Original strand, 14711068 - 14711315
Alignment:
Q  5 acaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaa-tttgattc-tacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctaga 102  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| ||| |||| ||| |||||||||| ||||||||| |   | |||||||| |||||||||||||   ||||||||    
T  14711068 acaagttaaaaagcgcctaaactctgccaaatttgtttcatacaaagcactttgaatttctgtgttcatttgataaatcttagaaattcttaagtctaga 14711167  T
Q  103 gtcttt--attacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttc-aagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcg 199  Q
    ||||||  ||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||| || |||||||  ||||| |||| ||  |||||| |||||| |||| |    
T  14711168 gtctttcaattgcattgttttgtgaacaccactgatagtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgattagaagtctcttg 14711267  T
Q  200 cctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcatt 247  Q
    | |  |||||||||||   |||| ||||||| |  |||||||||||||    
T  14711268 ctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcatt 14711315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 338 - 413
Target Start/End: Original strand, 17199087 - 17199162
Alignment:
Q  338 gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtct 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  17199087 gaaatctccttggaagtgcaagggggattggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtct 17199162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 115 - 257
Target Start/End: Original strand, 41115216 - 41115359
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgag 213  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||  |||||||||||||| |||| ||  ||||||||||||| |||| ||    |||||||||    
T  41115216 ttgtattgtgaacaccactgattgtacatcaagtgttcaacctcaaacatatttctttgtaattctgtttgaatagaagtctcttgcagttgtgcttgag 41115315  T
Q  214 cattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctct 257  Q
    ||| ||||| |||||| |||||| ||| ||||| |||| |||||    
T  41115316 cataagaagtctcttgatttagttcttaagcataggaaatctct 41115359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 115 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 16939681 - 16939536
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaat--agaagcctctcgcctgcgtgcttg 211  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||| |||| ||  ||||||||  ||||| |||| || |  |||||||    
T  16939681 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaattcagaagtctcttgcatttgtgcttg 16939582  T
Q  212 agcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctct 257  Q
    |||| |||||| ||||||| || ||||||||||| | |||||||||    
T  16939581 agcaatagaagtctcttgcatttgtgcttgagcaatagaagtctct 16939536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 351 - 432
Target Start/End: Original strand, 3188988 - 3189071
Alignment:
Q  351 aagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  3188988 aagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 3189071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 5 - 247
Target Start/End: Original strand, 14778732 - 14778979
Alignment:
Q  5 acaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaa-tttgattc-tacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctaga 102  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| ||| |||| ||| | |||||||| ||||||||| |   | |||||||| |||||||||||||   || |||||    
T  14778732 acaagttaaaaagcgcccaaactctgccaaatttgtttcatgcaaagcactttgaatttctgtgttcatttgataaatcttagaaattcttaagactaga 14778831  T
Q  103 gtcttt--attacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttc-aagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcg 199  Q
    ||||||  ||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||| || |||||||  ||||| |||| ||  |||||| |||||| |||| |    
T  14778832 gtctttcaattgcattgttttgtgaacaccactgatagtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgattagaagtctcttg 14778931  T
Q  200 cctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcatt 247  Q
    | |  |||||||||||   |||| ||||||| |  |||||||||||||    
T  14778932 ctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcatt 14778979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 351 - 432
Target Start/End: Original strand, 20649445 - 20649528
Alignment:
Q  351 aagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  20649445 aagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 20649528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 115 - 245
Target Start/End: Original strand, 17788498 - 17788629
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgag 213  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||| |||| ||  ||||||||||||| |||| ||    |||||||||    
T  17788498 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaatctcaaacatatttctttgtaattctgtttgaatagaagtctcttgcagttgtgcttgag 17788597  T
Q  214 cattagaagactcttgctttagtgcttgagca 245  Q
    ||| ||||  |||||| |||| | ||||||||    
T  17788598 cataagaattctcttgatttatttcttgagca 17788629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 353 - 432
Target Start/End: Original strand, 29030156 - 29030237
Alignment:
Q  353 gtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  29030156 gtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 29030237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 342 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 13693272 - 13693201
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtct 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || |||||| |||| | ||||||||||||||||    
T  13693272 tctccttggaagtgcaagggggacatgactacttccggattatggaaggaacctgtataattgcttgtgtct 13693201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 115 - 413
Target Start/End: Original strand, 14154455 - 14154753
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaag-tcaaacatatttctctgtattttcgtttgaat--agaagcctctcgcctgcgtgcttg 211  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||| || || |||| ||  ||||||||  ||||| |||| || |  |||||||    
T  14154455 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacattttcct-tgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcatttgtgcttg 14154553  T
Q  212 agcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagag-agtattgagcat 310  Q
    ||||||||||| |||||| ||  || ||||||||| |||||||||| |     ||||||||||||||||  |||||| | | |||   || | ||| |||    
T  14154554 agcattagaagtctcttgattgtgttcttgagcataggaagtctcttgtagttgtgcttgagcatttga--agtctcttgctaagtttagcagtgaacat 14154651  T
Q  311 ttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggat-aattgcttg 408  Q
    |||||||| ||   ||||    ||||| || ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| |||| | || |||||||||    
T  14154652 ttgtaatcagtt--attacacctagtg-aattctccttggaagtgcaagggggacatgactgacttccggtttgtggaaggaacctgtataaattgcttg 14154748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 328 - 407
Target Start/End: Original strand, 17788713 - 17788791
Alignment:
Q  328 atttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  17788713 atttttagtg-aactctccttggaaatgcaagggggacatgactacttccggtttgtggaaggaacctgtataattgctt 17788791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 342 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 19884159 - 19884093
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  19884159 tctccttggaagtgcaagggggacaggactgacttccggtttgtggaaggaacctgtataattgctt 19884093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 44 - 247
Target Start/End: Original strand, 36210439 - 36210647
Alignment:
Q  44 acaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagag--tcttt--attacattgtattgtgaacactactgattgt 139  Q
    ||||||||| ||||||||| |   | |||||||| ||||| |||||||   |||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  36210439 acaaagcactttgaatttctgtgttcatttgatatatctttgaaattcttaagtctagagagtctttcaattgcattgtattgtgaacaccactgattgt 36210538  T
Q  140 atatctagtgttc-aagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgc 238  Q
    ||||  ||||||| || |||||||  ||||| |||| ||  ||||||||||||| |||| || |  |||||||||||   |||| ||||||| |  ||||    
T  36210539 atattaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgcgtgc 36210638  T
Q  239 ttgagcatt 247  Q
    |||||||||    
T  36210639 ttgagcatt 36210647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 342 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 11900616 - 11900555
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataatt 403  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| | ||||||    
T  11900616 tctccttggaagtgcaagggggacatgactacttccggtttgtggaaggaacctgtataatt 11900555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 13890482 - 13890345
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgtt-caagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgag 213  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||  |||||||||||||| |||| ||  |||||  |||||| |||| || |  |||||||||    
T  13890482 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttccacctcaaacatatttctgtgtaattgtgtttgtttagaagactcttgcttttgtgcttgag 13890383  T
Q  214 cattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaa 251  Q
    |||  ||||||| |||  || |||||||||||| ||||    
T  13890382 cataggaagactattgtgtttgtgcttgagcataggaa 13890345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 342 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 16939427 - 16939354
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggat-aattgcttgtgtct 413  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| | || ||||||||||||||    
T  16939427 tctccttggaagtgcaagggggacaggactgacttccggtttgtggaaggaacctgtataaattgcttgtgtct 16939354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 342 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 22089711 - 22089646
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  22089711 tctccttggaagtgcaagggggacatgactaattccggtttgtggaaggaacctgtataattgctt 22089646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 342 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 23749949 - 23749884
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| || | | ||||||||||    
T  23749949 tctccttggaagtgcaagggggacaagactacttccggtttgtggaaggaatctgtataattgctt 23749884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 342 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 36470395 - 36470318
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggataattgc-ttgtgtctctct 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||||||||||    
T  36470395 tctccttggaagtgcaagggggacaagactgacttccggtttgtggaaggaacctgtataattgctttgtgtctctct 36470318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 342 - 407
Target Start/End: Original strand, 41115443 - 41115508
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||| | ||||||||||    
T  41115443 tctccttggaagtgcaagggggacagggctacttccggtttgaggaaggaacctgtataattgctt 41115508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 115 - 318
Target Start/End: Original strand, 9751999 - 9752205
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaa--tagaagcctctcgcctgcgtgcttg 211  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||  |||| ||  |||||||  |||||| |||| ||    |||||||    
T  9751999 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaatctcaaacatttttcattgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttgtgcttg 9752098  T
Q  212 agcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaag-agagtattgagcat 310  Q
    |||| |||||| |||||| | | || ||||||||| ||| |||||| ||    ||||||||||| ||  |||||||||||| |||   ||||||||||||    
T  9752099 agcaatagaagtctcttgatcttgttcttgagcataggatgtctcttgcagttgtgcttgagcaatt-tgaagtctcatactaagtttagtattgagcat 9752197  T
Q  311 ttgtaatc 318  Q
    ||||||||    
T  9752198 ttgtaatc 9752205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 342 - 394
Target Start/End: Original strand, 19889665 - 19889717
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaacc 394  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  19889665 tctccttggaagtgcaagggggacaggactacttccggattgtggaaggaacc 19889717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 303 - 403
Target Start/End: Original strand, 32491438 - 32491535
Alignment:
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgt-gattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataa 401  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||    |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||||||||  |||||||    
T  32491438 ttgagcatttgtaatcagtgtagattat----agtgaaaatctccttgaaagtgcaagagggactgaactacttctggattgtggaagaaatgaggataa 32491533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 328 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 55379748 - 55379673
Alignment:
Q  328 atttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| |||| | |||||||    
T  55379748 atttttagtg-aactctccttggaagtgcaagggggacatgactacttccgttttgtggaaggaacctgtataattg 55379673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 11915124 - 11915053
Alignment:
Q  344 tccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgct-tgtgtctc 414  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| |||| | ||||||||| ||||||||    
T  11915124 tccttggaagtgcaagggggacaagactacttctggtttgtggaaggaacctgtataattgctctgtgtctc 11915053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 342 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 12600185 - 12600138
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaag 389  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12600185 tctccttggaagttcaagggggacaggactacttccggtttgtggaag 12600138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 359 - 417
Target Start/End: Original strand, 15475850 - 15475909
Alignment:
Q  359 gggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgc-ttgtgtctctct 417  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||    
T  15475850 ggggggctggactacttccggtttgtggaaggaaccagtataattgctttgtgtctctct 15475909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 16853155 - 16852877
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaag-tcaaacatatttctctgtattttcgtttgaat--agaagcctctcgcctgcgtgcttg 211  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||  ||||||||||| || |||| ||  |||||||   ||||| |||| || |  |||||||    
T  16853155 ttgtattgtgaacaccattgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatatt-ctttgtacttctgtttgaagtgagaagtctcttgcatttgtgcttg 16853057  T
Q  212 agcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagag-agtattgagcat 310  Q
    |||| |||||| |||||| ||  || |  |||||| |||||||||| ||    |||||| |||||||||  |||||| ||| ||    |||| ||||||     
T  16853056 agcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttaagcatttga--agtctcttactaaatttagtagtgagcaa 16852959  T
Q  311 ttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaacc 394  Q
    |||||||| |    |||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  16852958 ttgtaatcagat--attacttttagtg-aactctccttggaagtgcaagggggacaggactgacttccggtttgtggaaggaacc 16852877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 17540051 - 17539968
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaag-tcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctct 197  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||  |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  17540051 ttgtattgtgaacatcactgattatatatcaagtgttcaacctcaaacatatttctttgtaattttgtttgaatagaagtctct 17539968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 251
Target Start/End: Original strand, 19889443 - 19889580
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa--gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttga 212  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||   |||||||| ||||| |||| ||  |||||| |||||| |||| || |  ||||||||    
T  19889443 ttgtattgtgaacaccactgattgtatgtcaagtgttcaaacctcaaacat-tttctgtgtaattctgtttgattagaagtctcttgcttttgtgcttga 19889541  T
Q  213 gcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaa 251  Q
    ||||  |||||||||||  || |||||||||||| ||||    
T  19889542 gcataggaagactcttgtctttgtgcttgagcataggaa 19889580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 407
Target Start/End: Original strand, 20571682 - 20571745
Alignment:
Q  344 tccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||    
T  20571682 tccttggaagtgcaagagggacaggactacttccggattgtggaaggaacctgtataattgctt 20571745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 23750175 - 23750060
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgag 213  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||  ||||| |||| ||  ||||||||||||| |||| ||   ||||||||||    
T  23750175 ttgtattgtgatcaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatagaagtctcttgcagtcgtgcttgag 23750076  T
Q  214 cattagaagactcttg 229  Q
    ||| ||||| ||||||    
T  23750075 cataagaagtctcttg 23750060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 55731497 - 55731203
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttc-aagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaat--agaagcctctcgcctgcgtgcttg 211  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||| || ||||||||| |||| |||| ||  ||||||||  ||||| |||| || |  |||||||    
T  55731497 ttgtattgtgaacaccactaattgtatatcaagtgttcaaactcaaacata-ttctttgtaattatgtttgaattcagaagtctcttgcatttgtgcttg 55731399  T
Q  212 agcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaag-agagtattgagcat 310  Q
    |||| |||||| |||||| ||  || |  |||||| |||||||||| || |  ||||||||||||||  |||||||| ||| |||   |||| ||| |||    
T  55731398 agcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcatttgtgcttgagcattt--gaagtctcttactaagtttagtagtgaacat 55731301  T
Q  311 ttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggat-aattgcttg 408  Q
    ||||||||     |||  |   |||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| |||| | || |||||||||    
T  55731300 ttgtaatc----agatattacatagt-gaactctccttggaagtgcaagggggacaggattgacttccggtttgtggaaggaacctgtataaattgcttg 55731206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 328 - 394
Target Start/End: Original strand, 15015059 - 15015124
Alignment:
Q  328 atttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaacc 394  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||    
T  15015059 atttttagtg-aactctccttggaagtgcaaaggggacaggactacttccgatttgtggaaggaacc 15015124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 342 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 16631866 - 16631800
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  16631866 tctccttggaagtgcaagggggacatgactgacttccggtttgtggaaggaacctgtataattgctt 16631800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 325 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 16847990 - 16847921
Alignment:
Q  325 attatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaacc 394  Q
    |||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  16847990 attacttttagtg-aactctccttggaagtgcaagggggacaggactgacttccggtttgtggaaggaacc 16847921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 333 - 407
Target Start/End: Original strand, 17527021 - 17527095
Alignment:
Q  333 tagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | |  |||||| |||||| ||||||||||    
T  17527021 tagtgaaaatctccttggaagtgcaaggggggctggactactttccgatcatggaaggaaccagaataattgctt 17527095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 342 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 19665791 - 19665725
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  19665791 tctccttggaagtgcaagggggacatgactgacttccggtttgtggaaggaacctgtataattgctt 19665725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #130
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 342 - 407
Target Start/End: Original strand, 22676207 - 22676273
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  22676207 tctccttggaagtgcaagggggacaggattgacttccggtttgtggaaggaacctgtataattgctt 22676273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #131
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 342 - 404
Target Start/End: Original strand, 29681202 - 29681264
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| |||| | |||||||    
T  29681202 tctccttggaagtgcaagggggacatgactacttctggtttgtggaaggaacctgtataattg 29681264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #132
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 40860322 - 40860205
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaat--agaagcctctcgcctgcgtgcttg 211  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| |||| ||  | ||||||  ||||| |||| ||    |||||||    
T  40860322 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacgtcaaacatttttctttgtaattctgattgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttg 40860223  T
Q  212 agcattagaagactcttg 229  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  40860222 agcattagaagtctcttg 40860205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #133
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 342 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 54679354 - 54679288
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  54679354 tctccttggaagtgcaagggggacatgactgacttccggtttgtggaaggaacctgtataattgctt 54679288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #134
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 70 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 1674563 - 1674476
Alignment:
Q  70 atttgatacatcttagaaattcactagtctagag--tcttt--attacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttca 153  Q
    |||||||| |||||||||||||   |||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  1674563 atttgatatatcttagaaattcttaagtctagagagtctttcaattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttca 1674476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #135
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 229
Target Start/End: Original strand, 3105879 - 3105995
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaat--agaagcctctcgcctgcgtgcttga 212  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||||  ||||| |||| ||  ||||||||  ||||| |||| || |  ||||||||    
T  3105879 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcatttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaattcagaagtctcttgcatttgtgcttga 3105978  T
Q  213 gcattagaagactcttg 229  Q
    ||| |||||| ||||||    
T  3105979 gcaatagaagtctcttg 3105995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #136
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 342 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 6516914 - 6516841
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggat-aattgcttgtgtct 413  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| |||| | || ||||||||||||||    
T  6516914 tctccttggaagtgcaagggggacaggattgacttccggtttgtggaaggaacctgtataaattgcttgtgtct 6516841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #137
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 342 - 407
Target Start/End: Original strand, 14903098 - 14903163
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| ||||||||| |||| | ||||||||||    
T  14903098 tctccttggaagtgcaagggagacaggactactttcggattgtggaaggaacctgtataattgctt 14903163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #138
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 328 - 389
Target Start/End: Original strand, 16476051 - 16476111
Alignment:
Q  328 atttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaag 389  Q
    |||||||||| || |||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  16476051 atttttagtg-aactctcattggaagtgcaagggggacatgactacttccggtttgtggaag 16476111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #139
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 251
Target Start/End: Original strand, 17057573 - 17057709
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgag 213  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||| |||| ||  ||||||||| ||| |||| || |  |||||||||    
T  17057573 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacat-tttctttgtaattctgtttgaataaaagtctcttgcttttgtgcttgag 17057671  T
Q  214 cattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaa 251  Q
    |||  |||| || |||  || |||||||||||| ||||    
T  17057672 catatgaagtcttttgtgtttgtgcttgagcataggaa 17057709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #140
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 342 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 18473492 - 18473427
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    |||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||    
T  18473492 tctcattggaagtgcaagggggacatgactacttccggattgtggaaggaacctgtataattgctt 18473427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #141
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 351 - 404
Target Start/End: Original strand, 37986307 - 37986360
Alignment:
Q  351 aagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  37986307 aagtgcaagggggacaggactacttccggtttgtggaaggaacctgtataattg 37986360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #142
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 329 - 389
Target Start/End: Original strand, 8686117 - 8686176
Alignment:
Q  329 tttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaag 389  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  8686117 tttttagtg-aactctccttgaaagtgcaaggggggcaggactacttccggtttgtggaag 8686176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #143
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 121 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 23123166 - 23123055
Alignment:
Q  121 tgtgaacactactgattgtatatctagtgttc-aagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaa--tagaagcctctcgcctgcgtgcttgagcatt 217  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||| |||| ||  |||||||  |||||| |||| |||   |||||||||||||    
T  23123166 tgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacatttttctttgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgccattgtgcttgagcatt 23123067  T
Q  218 agaagactcttg 229  Q
    ||||| ||||||    
T  23123066 agaagtctcttg 23123055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #144
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 342 - 415
Target Start/End: Original strand, 14190096 - 14190171
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggat-aattgcttgtgtctct 415  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||| | || ||||| ||||||||||    
T  14190096 tctccttggaagtgcaagggggacaggactgacttccgatttgtggaaggaacctgtataaattgtttgtgtctct 14190171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #145
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 217 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 1671966 - 1671908
Alignment:
Q  217 tagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca 275  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |  |||||||||||    
T  1671966 tagaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgctttagtgcttgagca 1671908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #146
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 342 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 3395075 - 3395013
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    |||||||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||||||||| |||| | |||||||    
T  3395075 tctccttggaagtgcaagagggacatgactactttcggtttgtggaaggaacctgtataattg 3395013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #147
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 342 - 407
Target Start/End: Original strand, 14605590 - 14605656
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| |||  | ||||||||||    
T  14605590 tctccttggaagtgcaagggggacaggattgacttccggtttgtggaaggaacttgtataattgctt 14605656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #148
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 342 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 15135155 - 15135089
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| | |||| |||||    
T  15135155 tctccttggatgcgcaagggggactggactaacttccggtttgtggaaggaacctgtataactgctt 15135089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #149
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 18394193 - 18394032
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgagc 214  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||| |  ||| ||| |||||  | |||| |||| |  |  ||||||||||    
T  18394193 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaaccaaacttattttttcgtaattt-gtttgttttgaagtctcttgtttttgtgcttgagc 18394095  T
Q  215 attagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatt 277  Q
    || ||||  || ||||||  ||||||||| ||| ||||||||| || || || ||||||||||    
T  18394094 ataagaaatctgttgcttgtgtgcttgagtatttgaagtctcttgcttgtgttcttgagcatt 18394032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #150
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 339 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 24619147 - 24619069
Alignment:
Q  339 aaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtctctct 417  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||   || |||||| || |||||||||||||| | |||||||    
T  24619147 aaatctcattggaagtgcatgggggactagactacttccaaattatggaaggaatcaggataattgcttctttctctct 24619069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #151
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 29121016 - 29120900
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaa--tagaagcctctcgcctgcgtgcttg 211  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||| |||| ||  |||||||  |||||| |||| ||   ||||||||    
T  29121016 ttgtactgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttct-tgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagtcgtgcttg 29120918  T
Q  212 agcattagaagactcttg 229  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  29120917 agcattagaagtctcttg 29120900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #152
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 351 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 2651265 - 2651212
Alignment:
Q  351 aagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||    
T  2651265 aagtgcaagggggacaggactacttccggattatggaagaaacctgtataattg 2651212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #153
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 342 - 413
Target Start/End: Original strand, 3106103 - 3106176
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggat-aattgcttgtgtct 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||| |||| | || ||||||||||||||    
T  3106103 tctccttggaagtgcaagggggacataactgacttccggtttgtggaaggaacctgtataaattgcttgtgtct 3106176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #154
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 338 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 7221975 - 7221910
Alignment:
Q  338 gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataatt 403  Q
    |||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| | ||| |||||||    
T  7221975 gaaatctcattgaaagtgcaaggcggactggactacttccagattgtggaagcagccatgataatt 7221910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #155
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 329 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 8103723 - 8103663
Alignment:
Q  329 tttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaag 389  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||    
T  8103723 tttttagtg-aactctccttggaagtgcaagggggacagaactgacttccggtttgtggaag 8103663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #156
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 342 - 407
Target Start/End: Original strand, 10661852 - 10661917
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    |||||| ||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  10661852 tctcctgggaggtgcaagtgggacaagactacttccggtttgtggaaggaacctgtataattgctt 10661917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #157
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 342 - 407
Target Start/End: Original strand, 10875997 - 10876062
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    |||||| ||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  10875997 tctcctgggaggtgcaagtgggacaagactacttccggtttgtggaaggaacctgtataattgctt 10876062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #158
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 13693459 - 13693298
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgagc 214  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||| |||| ||  |||||  |||||| |||| || |  ||||||||||    
T  13693459 ttgtattgcgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaaccaaacatctttctgtgtaatt--gtttgtttagaagtctctagcttttgtgcttgagc 13693362  T
Q  215 attagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttg 279  Q
    ||   ||  |||||||||  ||| ||||| ||| ||||||||| || || ||| |||||||||||    
T  13693361 atacaaaatctcttgcttatgtg-ttgagtatttgaagtctcttgcttgtgtgtttgagcatttg 13693298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #159
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 342 - 413
Target Start/End: Original strand, 17399359 - 17399432
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggac-tggactacttccggtttgtggaagaaaccaggat-aattgcttgtgtct 413  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||| |||| | || ||||||||||||||    
T  17399359 tctccttggaagtgcaagggggacatgaccgacttccggtttgtggaaggaacctgtataaattgcttgtgtct 17399432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #160
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 342 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 18773520 - 18773455
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    |||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||    
T  18773520 tctccttgaaagggcaagggggacatgactacttccggattgtggaaggaacctgtataattgctt 18773455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #161
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 342 - 407
Target Start/End: Original strand, 19912565 - 19912630
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    |||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||    
T  19912565 tctccttgaaaatgcaagggggacatgactacttccggtttgtagaaggaacctgtataattgctt 19912630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #162
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 342 - 394
Target Start/End: Original strand, 37436217 - 37436270
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaacc 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  37436217 tctccttggaagtgcaagggggacaagactgacttccggtttgtggaaggaacc 37436270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #163
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 7222160 - 7221997
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgagc 214  Q
    ||||||| ||||||| | |||||| ||||| ||||||||| | |||| ||||||| |||| ||| |||||  |||||  |||| || |  ||||||||||    
T  7222160 ttgtattatgaacaccagtgattgcatatcaagtgttcaaataaaacttatttctgtgtaattt-gtttgtttagaaatctcttgcttttgtgcttgagc 7222062  T
Q  215 attagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttg 279  Q
    ||  |||  |||||||||  |||||||||  || ||||||||| || |  |||||||||||||||    
T  7222061 ataggaaatctcttgcttgtgtgcttgagtgtttgaagtctcttgcttatgtgcttgagcatttg 7221997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #164
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 229
Target Start/End: Original strand, 12811635 - 12811751
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaa-tagaagcctctcgcctgcgtgcttga 212  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||  |||| ||   |||||| |||||| |||| ||    ||||||||    
T  12811635 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaatctcaaacatttttcgttgtaattctatttgaattagaagtctcttgcaattgtgcttga 12811734  T
Q  213 gcattagaagactcttg 229  Q
    |||||||||| ||||||    
T  12811735 gcattagaagtctcttg 12811751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #165
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 36470480 - 36470420
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgta 174  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||| ||||    
T  36470480 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgta 36470420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #166
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 56034223 - 56034107
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaa-tagaagcctctcgcctgcgtgcttga 212  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||| |||| ||  ||||||| |||||| |||| ||    ||||||||    
T  56034223 ttgtattgtgaataccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcaattgtgcttga 56034124  T
Q  213 gcattagaagactcttg 229  Q
    ||||| |||| ||||||    
T  56034123 gcatttgaagtctcttg 56034107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #167
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 3395241 - 3395202
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa 154  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  3395241 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 3395202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #168
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 6517137 - 6517098
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa 154  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  6517137 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 6517098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #169
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 342 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 6641109 - 6641063
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaag 389  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||    
T  6641109 tctccttggaagtgcaagggggacatgactactt-cggtttgtggaag 6641063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #170
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 8105289 - 8105250
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa 154  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  8105289 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 8105250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #171
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 342 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 10072360 - 10072297
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  10072360 tctccttcgaagtgcaagggggacatgactgacttccggtttgtggaaggaacctgtataattg 10072297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #172
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 11900842 - 11900803
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa 154  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  11900842 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 11900803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #173
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 11915353 - 11915270
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctct 197  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||||||||| |||||||||  ||||||| |||||| |||| ||  ||||||||||||| ||||    
T  11915353 ttgtattgtgaccaccactggttgtatatcaagtgttcaacctcaaacaaatttctttgtaattctgtttgaatagaagtctct 11915270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #174
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 154
Target Start/End: Original strand, 14605364 - 14605403
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa 154  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  14605364 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 14605403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #175
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 229
Target Start/End: Original strand, 15014845 - 15014960
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgag 213  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||  |||||||  ||||| |||| ||  |||| |||||||| |||| ||    |||||||||    
T  15014845 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgtttaacctcaaacaattttctttgtaattctgtttcaatagaagtctcttgcagttgtgcttgag 15014944  T
Q  214 cattagaagactcttg 229  Q
    ||| ||||| ||||||    
T  15014945 cataagaagtctcttg 15014960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #176
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 342 - 389
Target Start/End: Original strand, 16325181 - 16325228
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaag 389  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||    
T  16325181 tctccttggaagtgcaagggggacaagactacttccggattatggaag 16325228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #177
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 154
Target Start/End: Original strand, 17399134 - 17399173
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa 154  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  17399134 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 17399173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #178
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 154
Target Start/End: Original strand, 17701215 - 17701254
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa 154  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  17701215 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 17701254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #179
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 19884353 - 19884314
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa 154  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  19884353 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 19884314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #180
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 154
Target Start/End: Original strand, 21350659 - 21350698
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa 154  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  21350659 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 21350698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #181
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 154
Target Start/End: Original strand, 29681005 - 29681044
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa 154  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  29681005 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 29681044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #182
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 154
Target Start/End: Original strand, 37986070 - 37986109
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa 154  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  37986070 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 37986109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #183
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 38513529 - 38513490
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa 154  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  38513529 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 38513490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #184
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 54679579 - 54679540
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa 154  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  54679579 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 54679540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #185
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 55379961 - 55379922
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa 154  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  55379961 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 55379922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #186
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 114 - 280
Target Start/End: Original strand, 3500111 - 3500280
Alignment:
Q  114 attgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaa--tagaagcctctcgcctgcgtgctt 210  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||  |||| ||  |||||||  |||||| |||| ||    ||||||    
T  3500111 attgtattgtaaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttcattgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttgtgctt 3500210  T
Q  211 gagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttga 280  Q
    ||||| |||||| |||||| | | || |  |||||| |||||||||| ||    ||||||||||||||||    
T  3500211 gagcaatagaagtctcttgatcttgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcatttga 3500280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #187
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 115 - 279
Target Start/End: Original strand, 14902906 - 14903072
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgag 213  Q
    ||||||||||||||| || || |||||||| |||||||||  |||||||| ||||| | || ||  |||||  |||||| |||| || |  |||||| ||    
T  14902906 ttgtattgtgaacaccaccgaatgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctgtataattgtgtttgtctagaagtctcttgcttttgtgcttaag 14903005  T
Q  214 cattagaagactcttgctttagtgcttgagca-ttggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttg 279  Q
    ||| ||||  |||||||||| |||||| || | |||||||||||| || ||  || |||||||||||    
T  14903006 cataagaaatctcttgcttttgtgcttcagtatttggaagtctcttgcatgtatgattgagcatttg 14903072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #188
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 115 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 22190497 - 22190380
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaat--agaagcctctcgcctgcgtgcttg 211  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||| |||| ||  ||||||||  ||||| |||| ||    |||||||    
T  22190497 ttgttttgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttg 22190398  T
Q  212 agcattagaagactcttg 229  Q
    |||| |||||| ||||||    
T  22190397 agcaatagaagtctcttg 22190380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #189
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 342 - 392
Target Start/End: Original strand, 24628585 - 24628635
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaa 392  Q
    |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  24628585 tctctttgaaagtgtaagggggacaggactacttctggtttgtggaagaaa 24628635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #190
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 346 - 414
Target Start/End: Original strand, 27189332 - 27189402
Alignment:
Q  346 cttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggat-aattgcttgtgtctc 414  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||| | || |||||||||||||||    
T  27189332 cttggaagtgcaagagggacaggactgacttccggcttgtggaaggaacctgtataaattgcttgtgtctc 27189402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #191
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 345 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 40860094 - 40860024
Alignment:
Q  345 ccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggat-aattgcttgtgtct 413  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| | || | || ||||||||||||||    
T  40860094 ccttggaagtgcaagggggacaagactgacttccggtttgtggaaggagcctgtataaattgcttgtgtct 40860024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #192
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 342 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 45832813 - 45832747
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||| ||| |||||| |||| | ||||||||||    
T  45832813 tctccttggaagtgcaagggggacaagactgacttccgatttttggaaggaacctgtataattgctt 45832747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #193
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 115 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 45833036 - 45832998
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttca 153  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  45833036 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttca 45832998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #194
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 346 - 394
Target Start/End: Original strand, 9752228 - 9752277
Alignment:
Q  346 cttggaagtgcaagggggactgga-ctacttccggtttgtggaagaaacc 394  Q
    |||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||    
T  9752228 cttggaagtgcaagggggacaggaccgacttccggtttgtggaaggaacc 9752277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #195
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 342 - 394
Target Start/End: Original strand, 13576800 - 13576853
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaacc 394  Q
    |||| |||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  13576800 tctctttggaagtgcaagggggacatgactgacttccggtttgtggaaggaacc 13576853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #196
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 342 - 394
Target Start/End: Original strand, 17701440 - 17701493
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaacc 394  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||    
T  17701440 tctcattggaagtgcaagggggacaggactgacttccggtttgttgaaggaacc 17701493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #197
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 215 - 276
Target Start/End: Original strand, 19889514 - 19889575
Alignment:
Q  215 attagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcat 276  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| |||| | ||  ||||||||||||    
T  19889514 attagaagtctcttgcttttgtgcttgagcataggaagactcttgtctttgtgcttgagcat 19889575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #198
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 346 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 20976880 - 20976831
Alignment:
Q  346 cttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaacc 394  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  20976880 cttggaagtgcaagggggacatgactgacttccggtttgtggaaggaacc 20976831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #199
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 187
Target Start/End: Original strand, 39420195 - 39420268
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaat 187  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||| |||| ||  ||||||||    
T  39420195 ttgtattgttaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaat 39420268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #200
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 216 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 13890410 - 13890374
Alignment:
Q  216 ttagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaag 252  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  13890410 ttagaagactcttgcttttgtgcttgagcataggaag 13890374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #201
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 360 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 15193206 - 15193150
Alignment:
Q  360 ggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggat-aattgcttgtgtctct 415  Q
    |||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||    
T  15193206 ggggactggactacttccgaattatggaaggaaccaggataaattgtttgtgtctct 15193150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #202
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 347 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 18394000 - 18393940
Alignment:
Q  347 ttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    |||||||||||||||||| |  ||||||||||  ||||||||| |||||  ||||||||||    
T  18394000 ttggaagtgcaagggggagtaaactacttccgaattgtggaaggaaccataataattgctt 18393940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #203
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 219 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 24619231 - 24619175
Alignment:
Q  219 gaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca 275  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||| || || |||||||||||    
T  24619231 gaagtctcttgcttttgtgcttgagcatttaaagtctcttgcttgtgtgcttgagca 24619175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #204
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 174
Target Start/End: Original strand, 37436000 - 37436060
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgta 174  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||| ||||    
T  37436000 ttgtatcgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgta 37436060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #205
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 342 - 389
Target Start/End: Original strand, 39420389 - 39420437
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaag 389  Q
    |||||||| |||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  39420389 tctccttgtaagtgcaagggggacatgactgacttccggtttgtggaag 39420437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #206
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 342 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 56033999 - 56033951
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaag 389  Q
    |||| |||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  56033999 tctcattggaagtgcaagggggacatgactgacttccggtttgtggaag 56033951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #207
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 166
Target Start/End: Original strand, 56533520 - 56533572
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatt 166  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  56533520 ttgtattgtgaacaccactaattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatatt 56533572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 300; Significance: 1e-168; HSPs: 176)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 3843497 - 3843081
Alignment:
Q  13 aaaagcgtcaaaactctgtcaa-tttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtctttatt 111  Q
    ||||||| |||||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  3843497 aaaagcgccaaaactctgccaaatttgattctaaaaagcactttgaatttctgcactgatttgatatatcttagaaattcttaagtctagagtctttatt 3843398  T
Q  112 acattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgctt 210  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3843397 gcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacat-tttctgtgtaattttgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgctt 3843299  T
Q  211 gagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagagagtattgagcat 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  3843298 gagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcata-ctagagagtattgagcat 3843200  T
Q  311 ttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtg 410  Q
    |||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3843199 ttgtaatctgtgtgattattt---ctggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaaccaggataattgcttgtg 3843103  T
Q  411 tctctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||| ||||||||||||||    
T  3843102 tctctctttcttttctctgctc 3843081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 22136163 - 22136583
Alignment:
Q  13 aaaagcgtcaaaactctgtcaa-tttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtcttt-at 110  Q
    ||||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||| ||    
T  22136163 aaaagcgccaaaactctgccaaatttgattcta-aaagcactctgaatttctgcactgatttgatatatcttagaaattcttaagtctagagtcttttat 22136261  T
Q  111 tacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgctt 210  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||| |||| ||  |||||| |||||| ||||||||||| |||||    
T  22136262 tgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacaattttctgtgtaattctgtttgattagaagtctctcgcctgcctgctt 22136361  T
Q  211 gagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagagagtattgagcat 310  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||     
T  22136362 gagcattagaagtctcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcata-ctagatagtattgagcag 22136460  T
Q  311 ttgtaatctgtgtgattattt-ttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgt 409  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22136461 ttgtaatctgtgtgattatttcttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaaccaggataattgcttgt 22136560  T
Q  410 gtctctctgtcttttctctgctc 432  Q
    |||||||| ||||||||||||||    
T  22136561 gtctctctttcttttctctgctc 22136583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 22167328 - 22167748
Alignment:
Q  13 aaaagcgtcaaaactctgtcaa-tttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtcttt-at 110  Q
    ||||||| |||||||||  ||| |||||||||| |||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||| ||    
T  22167328 aaaagcgccaaaactcttccaaatttgattcta-aaagcactctgaatttctgcactgatttgatatatcttagaaattcttaagtctagagtcttttat 22167426  T
Q  111 tacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgctt 210  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||| |||| ||  |||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  22167427 tgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacaattttctgtgtaattctgtttgattagaagtctctcgcctgcgtgctt 22167526  T
Q  211 gagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagagagtattgagcat 310  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||     
T  22167527 gagcattagaagtctcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcata-ctagatagtattgagcag 22167625  T
Q  311 ttgtaatctgtgtgattattt-ttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgt 409  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22167626 ttgtaatctgtgtgattatttcttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaaccaggataattgcttgt 22167725  T
Q  410 gtctctctgtcttttctctgctc 432  Q
    |||||||| ||||||||||||||    
T  22167726 gtctctctttcttttctctgctc 22167748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 3 - 413
Target Start/End: Original strand, 40213464 - 40213870
Alignment:
Q  3 atacaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctaga 102  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40213464 atacaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcacaagtctaga 40213563  T
Q  103 gtctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacata-tttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcc 201  Q
    |||||||||||||| | |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||    
T  40213564 gtctttattacattat-ttgtgaacaccactgattgcatatcaagtgttcaagtcaaacatattttctctgtatttttgtttgaatataagcctcttgcc 40213662  T
Q  202 tgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagaga 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||  |||||||||||||||||  |||||    
T  40213663 tgcgtgcttgagcattagaagactcttgc-ttagtgcttgagcattggaagacttttgcctgcgtgcttgagcatttttgagaagtctcatacttagaga 40213761  T
Q  300 gtattgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggat 399  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  40213762 gtattgagcatttgtaatctttctgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaaccaggat 40213856  T
Q  400 aattgcttgtgtct 413  Q
    || |||||||||||    
T  40213857 aactgcttgtgtct 40213870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 3 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 18153722 - 18153316
Alignment:
Q  3 atacaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctaga 102  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18153722 atacaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcacaagtctaga 18153623  T
Q  103 gtctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgt-attttcgtttgaatagaagcctctcgcc 201  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||||  ||||| |||| |||    
T  18153622 gtctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacatattttcctgtaatttttgtttgatcagaagactcttgcc 18153523  T
Q  202 tgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca-tttgagaagtctcataccaagagag 300  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||    
T  18153522 tgcgtgcttgagtattagaagactcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcttgtgtgcttgagcattttgagaagtctcatacttagagag 18153424  T
Q  301 tattgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggata 400  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  18153423 tattgagcatttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaaccaggata 18153329  T
Q  401 attgcttgtgtct 413  Q
    | |||||||||||    
T  18153328 actgcttgtgtct 18153316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 13 - 428
Target Start/End: Original strand, 20259923 - 20260335
Alignment:
Q  13 aaaagcgtcaaaactctgtcaa-tttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtctttatt 111  Q
    ||||||| |||||||||  ||| ||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  20259923 aaaagcgccaaaactctaccaaatttgattttataaagcactttgaatttctgcactgatttgatatatcttagaaattcttaagtctagagtctttatt 20260022  T
Q  112 acattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgctt 210  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| |||| ||| |||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  20260023 gcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacat-tttctgtgtaattttgtttgattagaagcctctcgcctgcatgctt 20260121  T
Q  211 gagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagagagtattgagcat 310  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| |||||||    
T  20260122 gagcattaaaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcata-ctagtgagtactgagcat 20260220  T
Q  311 ttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtg 410  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20260221 ttgtaatctgtgtgatta---ttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaaccaggataattgcttgtg 20260317  T
Q  411 tctctctgtcttttctct 428  Q
    ||  ||| ||||||||||    
T  20260318 tccttctttcttttctct 20260335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 13 - 428
Target Start/End: Original strand, 21046553 - 21046965
Alignment:
Q  13 aaaagcgtcaaaactctgtcaa-tttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtctttatt 111  Q
    ||||||| |||||||||  ||| ||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  21046553 aaaagcgccaaaactctaccaaatttgattttataaagcactttgaatttctgcactgatttgatatatcttagaaattcttaagtctagagtctttatt 21046652  T
Q  112 acattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgctt 210  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| |||| ||| |||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  21046653 gcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacat-tttctgtgtaattttgtttgattagaagcctctcgcctgcatgctt 21046751  T
Q  211 gagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagagagtattgagcat 310  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| |||||||    
T  21046752 gagcattaaaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcata-ctagtgagtactgagcat 21046850  T
Q  311 ttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtg 410  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21046851 ttgtaatctgtgtgatta---ttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaaccaggataattgcttgtg 21046947  T
Q  411 tctctctgtcttttctct 428  Q
    ||  ||| ||||||||||    
T  21046948 tccttctttcttttctct 21046965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 5 - 413
Target Start/End: Original strand, 23469758 - 23470162
Alignment:
Q  5 acaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagt 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  23469758 acaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaaaagtctagagt 23469857  T
Q  105 ctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgc 204  Q
    |||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| || |||  |||||||| ||||||  |||||||||| ||||||    
T  23469858 ctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttaattcattgtatttttgtttgatcagaagcctcttgcctgc 23469957  T
Q  205 gtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||    
T  23469958 gtgcttgagcattagaagactcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcatacttagagagta 23470056  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  23470057 ttgagcatttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaaccaggataac 23470151  T
Q  403 tgcttgtgtct 413  Q
    |||||||||||    
T  23470152 tgcttgtgtct 23470162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 3 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 18158241 - 18157815
Alignment:
Q  3 atacaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctaga 102  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18158241 atacaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcacaagtctaga 18158142  T
Q  103 gtctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgt-attttcgtttgaatagaagcctctcgcc 201  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||||  ||||| |||| |||    
T  18158141 gtctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacatattttcctgtaatttttgtttgatcagaagactcttgcc 18158042  T
Q  202 tgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca-tttgagaagtctcataccaagagag 300  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||    
T  18158041 tgcgtgcttgagtattagaagactcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcttgtgtgcttgagcattttgagaagtctcatacttagagag 18157943  T
Q  301 tattgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggata 400  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  18157942 tattgagcatttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtggaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggata 18157848  T
Q  401 attgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgct 431  Q
    | ||||||||||  | ||| |||||||||||||    
T  18157847 actgcttgtgtctttgtctttcttttctctgct 18157815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 5 - 432
Target Start/End: Original strand, 20161528 - 20161953
Alignment:
Q  5 acaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagt 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  20161528 acaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaaaagtctagagt 20161627  T
Q  105 ctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgc 204  Q
    ||| |||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| || |||  |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||    
T  20161628 cttaattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttaattcattgtatttttgtttgattagaagcctcttgcctgc 20161727  T
Q  205 gtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||    
T  20161728 gtgcttgagcattagaagactcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcatacttagagagta 20161826  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||     
T  20161827 ttgagcatttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttctgatttgtggaaggaaccaggataac 20161921  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  20161922 tgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 20161953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 5 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 19224917 - 19224513
Alignment:
Q  5 acaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagt 104  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  19224917 acaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctaaaaagcacattgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaaaagtctagagt 19224818  T
Q  105 ctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgc 204  Q
    |||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| || |||  |||||||| ||||||  |||||||||| ||||||    
T  19224817 ctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttaattcattgtatttttgtttgatcagaagcctcttgcctgc 19224718  T
Q  205 gtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||| ||||  |||||||||||||||||  | ||||||    
T  19224717 gtgcttgagcattagaagactcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttaagcatttttgagaagtctcatacttaaagagta 19224619  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||     
T  19224618 ttgagcatttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaaccaggataac 19224524  T
Q  403 tgcttgtgtct 413  Q
    || ||||||||    
T  19224523 tgtttgtgtct 19224513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 19418339 - 19417930
Alignment:
Q  1 acatacaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtcta 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  19418339 acatacaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaaaagtcta 19418240  T
Q  101 gagtctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgc 200  Q
     ||||||||    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||  |||||||||| ||    
T  19418239 cagtctttaacgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttatttcattgtatttttgtttgatcagaagcctcttgc 19418140  T
Q  201 ctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagag 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||||||||||||||||  ||||    
T  19418139 ctgcgtgcttgagcattagaagactcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcatacttagag 19418041  T
Q  299 agtattgagca-tttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccagg 397  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||    
T  19418040 agtattgagcattttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaaaggggactggactacttctgatttgtggaaggaaccagg 19417946  T
Q  398 ataattgcttgtgtct 413  Q
    |||| |||||||||||    
T  19417945 ataactgcttgtgtct 19417930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 19428914 - 19428505
Alignment:
Q  1 acatacaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtcta 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  19428914 acatacaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaaaagtcta 19428815  T
Q  101 gagtctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgc 200  Q
    |||||||||    |||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||  |||||||||| ||    
T  19428814 gagtctttaacgtattgtattatgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttatttcattgtatttttgtttgatcagaagcctcttgc 19428715  T
Q  201 ctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagag 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||||||||||||||||  ||||    
T  19428714 ctgcgtgcttgagcattagaagactcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcatacttagag 19428616  T
Q  299 agtattgagca-tttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccagg 397  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||    
T  19428615 agtattgagcattttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaaaggggactggactacttctgatttgtggaaggaaccagg 19428521  T
Q  398 ataattgcttgtgtct 413  Q
    |||| |||||||||||    
T  19428520 ataactgcttgtgtct 19428505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 5 - 413
Target Start/End: Original strand, 30314993 - 30315402
Alignment:
Q  5 acaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagt 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  30314993 acaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcataagtctagagt 30315092  T
Q  105 ctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcc-----tctcg 199  Q
    |||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| || |||  |||||||| ||||||  ||||| |     ||| |    
T  30315093 ctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttaattcattgtatttttgtttgatcagaagtctcttatcttg 30315192  T
Q  200 cctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaaga 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| || || |||||||||||  |||||||||||||||||  |||    
T  30315193 cctgcgtgcttgagcattagaagactcttgc-ttagtgcttgagcatcggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatctttgagaagtctcatacttaga 30315291  T
Q  298 gagtattgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccagg 397  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||    
T  30315292 gagtattgagcatttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggagtacttccgatttgtggaaggaaccagg 30315386  T
Q  398 ataattgcttgtgtct 413  Q
    ||||||||||||||||    
T  30315387 ataattgcttgtgtct 30315402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 5 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 16746983 - 16746579
Alignment:
Q  5 acaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagt 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  16746983 acaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaaaagtctagagt 16746884  T
Q  105 ctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgc 204  Q
    |||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||  |||||  ||| || |||    
T  16746883 ctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttatttctttgtatttttgtttgatcagaagagtcttgcatgc 16746784  T
Q  205 gtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||    
T  16746783 gtgcttgagcattagaagactcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcatacttagagagta 16746685  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||| |||||| ||||     
T  16746684 ttgagcatttgtaatctttgtgatta----tagt-aaaatctccttggaagtgcaagggggactgaactacttccattttgtggaaggaaccagaataac 16746590  T
Q  403 tgcttgtgtct 413  Q
    |||| ||||||    
T  16746589 tgctggtgtct 16746579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 3 - 413
Target Start/End: Original strand, 18769432 - 18769839
Alignment:
Q  3 atacaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctaga 102  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||    
T  18769432 atacaagttaaaaagtgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattaaaaagtctaga 18769531  T
Q  103 gtctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgta-ttttcgtttgaatagaagcctctcgcc 201  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||| |||||| |||| |||    
T  18769532 gtctttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacatatttcattgtattttttgtttgattagaagtctcttgcc 18769631  T
Q  202 tgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagaga 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || |  |||||||||||  |||||||||||||||||  |||||    
T  18769632 tgcgtgcttgagcattagaagactcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtctgtgcttgagcatttttgagaagtctcatacttagaga 18769730  T
Q  300 gtattgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggat 399  Q
    ||||||| ||||| |||||| |||||||||     |  |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  18769731 gtattgaacatttttaatctttgtgattat-----ggtgaaatctccttgaaattgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaaccaggat 18769825  T
Q  400 aattgcttgtgtct 413  Q
    || |||||||||||    
T  18769826 aactgcttgtgtct 18769839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 22 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 31214978 - 31214570
Alignment:
Q  22 aaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtctttattacattgtatt 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31214978 aaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaatagtctagagtctttattatattgtatt 31214879  T
Q  122 gtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgagcattagaa 221  Q
    | |||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| || |||| |||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31214878 gcgaacaccactgattgtatatcaagtgtttaagtcaaacttaattctttgtatttttgtttgatcagaagcctcttgcctgcgtgcttgagcattagaa 31214779  T
Q  222 gactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagtattgagcatttgtaatct 319  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  31214778 gtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatacttagagagtattgagcatttgtaatct 31214680  T
Q  320 gtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtc--tctct 417  Q
     ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||| ||||| ||||  | |||    
T  31214679 ttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaatgaaccaggataactgcttatgtctttgtct 31214585  T
Q  418 gtcttttctctgctc 432  Q
     ||||||||||||||    
T  31214584 ttcttttctctgctc 31214570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 3 - 432
Target Start/End: Original strand, 6318812 - 6319238
Alignment:
Q  3 atacaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctaga 102  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  6318812 atacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaaattgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctaga 6318910  T
Q  103 gtctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcct 202  Q
    |||||||||  ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||  ||||| |||| ||||    
T  6318911 gtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgatcagaagtctcttgcct 6319010  T
Q  203 gcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagag 300  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||  ||| ||    
T  6319011 gcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatacttagaaag 6319109  T
Q  301 tattgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggata 400  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  6319110 tattgagcatttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggata 6319204  T
Q  401 attgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    | ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  6319205 actgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 6319238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 19128728 - 19128306
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  19128728 aagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 19128630  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| ||||||  ||||| |||| ||||||||    
T  19128629 ttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaactcaaactcaattctctgtatttttgtttgatcagaagtctcttgcctgcgt 19128530  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagtatt 304  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||  ||| ||||||    
T  19128529 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatacttagaaagtatt 19128431  T
Q  305 gagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||||||||| ||    
T  19128430 gagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttctgtgttgtggaaggaaccaggataactg 19128336  T
Q  405 cttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  19128335 cttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 19128306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 26111211 - 26110789
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  26111211 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgagtttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 26111113  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  26111112 ttactgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 26111013  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagtatt 304  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||  ||| ||||||    
T  26111012 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatacttagaaagtatt 26110914  T
Q  305 gagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||    
T  26110913 gagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactg 26110819  T
Q  405 cttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  26110818 cttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 26110789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 43248305 - 43247883
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  43248305 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 43248207  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  43248206 ttactgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 43248107  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagtatt 304  Q
    |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||  ||| ||||||    
T  43248106 gcttgagcattaaaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatacttagaaagtatt 43248008  T
Q  305 gagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||    
T  43248007 gagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactg 43247913  T
Q  405 cttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  43247912 cttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 43247883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 3220612 - 3220190
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  3220612 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaaattgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 3220514  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||  ||||| |||| ||||||||    
T  3220513 ttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgatcagaagtctcttgcctgcgt 3220414  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagtatt 304  Q
    | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||  ||| ||||||    
T  3220413 gtttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatacttagaaagtatt 3220315  T
Q  305 gagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||    
T  3220314 gagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactg 3220220  T
Q  405 cttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  3220219 cttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 3220190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 6161003 - 6160582
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  6161003 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 6160905  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  6160904 tttctgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 6160805  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagtatt 304  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||  ||| ||||||    
T  6160804 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatacttagaaagtatt 6160706  T
Q  305 gagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||    
T  6160705 gagcagttgtaatct-tgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactg 6160612  T
Q  405 cttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  6160611 cttgtgtctgtgtctttcttttctctgctc 6160582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Original strand, 15791599 - 15792022
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  15791599 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 15791697  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  15791698 ttactgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 15791797  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca---tttgagaagtctcataccaagagagtat 303  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||   |||| ||||||||||||  ||| ||||     
T  15791798 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcttgtgtgcttgagcattttttgtgaagtctcatacttagaaagtac 15791896  T
Q  304 tgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataatt 403  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| |    
T  15791897 tgagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataact 15791991  T
Q  404 gcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    |||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  15791992 gcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 15792022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Original strand, 13688868 - 13689292
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  13688868 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 13688966  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||    
T  13688967 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctctcgcctgcgt 13689066  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||  ||| ||||    
T  13689067 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcttgtgtgcttgagcatagttttgtgaagtctcatacttagaaagta 13689165  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  13689166 ttgagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttgaaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 13689260  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  13689261 tgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 13689292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 18449350 - 18448928
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  18449350 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 18449252  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  18449251 ttactgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaactcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 18449152  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagtatt 304  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||  ||| ||||||    
T  18449151 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatacttagaaagtatt 18449053  T
Q  305 gagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    | ||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||||| ||    
T  18449052 gcgcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttctggaaggaaccaggataactg 18448958  T
Q  405 cttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  18448957 cttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 18448928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Original strand, 32088569 - 32088991
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  32088569 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 32088667  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||| | |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  32088668 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtattgttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 32088767  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagtatt 304  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||  ||| ||||||    
T  32088768 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatacttagaaagtatt 32088866  T
Q  305 gagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||    
T  32088867 gagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactg 32088961  T
Q  405 cttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  32088962 cttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 32088991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 7 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 26120889 - 26120465
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  26120889 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 26120791  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  26120790 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 26120691  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca-----tttgagaagtctcataccaagagagt 301  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||     |||| ||||||||||||  ||| |||    
T  26120690 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcaatttttttgtgaagtctcatacttagaaagt 26120592  T
Q  302 attgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataa 401  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  26120591 attgagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataa 26120497  T
Q  402 ttgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgct 431  Q
     ||||||||||  | ||| |||||||||||||    
T  26120496 ctgcttgtgtctttgtctttcttttctctgct 26120465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 252389 - 251965
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  252389 aagtttaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 252291  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  252290 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgtttaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 252191  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||  ||| ||||    
T  252190 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaagtctcatacttagaaagta 252092  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  252091 ttgagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 251997  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  251996 tgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 251965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Original strand, 849267 - 849691
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  849267 aagtttaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 849365  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  849366 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgtttaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 849465  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||  ||| ||||    
T  849466 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaagtctcatacttagaaagta 849564  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  849565 ttgagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 849659  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  849660 tgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 849691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 6151048 - 6150627
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  6151048 aagttcaaaagcgccaaaactctgacaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 6150950  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  | ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  6150949 tttctgcattgtattgtgaacatcactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 6150850  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagtatt 304  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||  ||| ||||||    
T  6150849 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatacttagaaagtatt 6150751  T
Q  305 gagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||    
T  6150750 gagcagttgtaatct-tgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactg 6150657  T
Q  405 cttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  6150656 cttgtgtctgtgtctttcttttctctgctc 6150627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 19139260 - 19138838
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  19139260 aagttaaaaatcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 19139162  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| ||||||  ||||| |||| ||||||||    
T  19139161 ttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaactcaaactcaattctctgtatttttgtttgatcagaagtctcttgcctgcgt 19139062  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagtatt 304  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||| |||| || || ||||||||| |  |||| ||||||||||||  ||| ||||||    
T  19139061 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagcgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagaatttttgtgaagtctcatacttagaaagtatt 19138963  T
Q  305 gagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||    
T  19138962 gagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggattggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactg 19138868  T
Q  405 cttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  19138867 cttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 19138838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 29076711 - 29076288
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  29076711 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 29076613  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||    
T  29076612 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctctcgcctgcgt 29076513  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||   || ||||    
T  29076512 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaagtctcatactttgaaagta 29076414  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  29076413 ttgagcagttgtaatct-tgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 29076320  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  29076319 tgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 29076288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 29086962 - 29086539
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  29086962 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 29086864  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||    
T  29086863 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctctcgcctgcgt 29086764  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||   || ||||    
T  29086763 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaagtctcatactttgaaagta 29086665  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  29086664 ttgagcagttgtaatct-tgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 29086571  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  29086570 tgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 29086539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Original strand, 32077996 - 32078418
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  32077996 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 32078094  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||| | |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  32078095 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtattgttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 32078194  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagtatt 304  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||  ||| ||||||    
T  32078195 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatacttagaaagtatt 32078293  T
Q  305 gagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||| ||    
T  32078294 gagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccatgataactg 32078388  T
Q  405 cttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  32078389 cttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 32078418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 36077917 - 36077494
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  36077917 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 36077819  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  36077818 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 36077719  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||  ||| ||||    
T  36077718 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaagtctcatacttagaaagta 36077620  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  36077619 ttgagcagttgtaatct-tgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 36077526  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  36077525 tgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 36077494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 36088503 - 36088080
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  36088503 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 36088405  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  36088404 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 36088305  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||  ||| ||||    
T  36088304 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaagtctcatacttagaaagta 36088206  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  36088205 ttgagcagttgtaatct-tgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 36088112  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  36088111 tgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 36088080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 7 - 413
Target Start/End: Original strand, 9856772 - 9857178
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  9856772 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttctgcaccgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 9856870  T
Q  107 tt-----attacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcc 201  Q
    ||     |||  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| |||    
T  9856871 tttctgtattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcc 9856970  T
Q  202 tgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagaga 299  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||  ||| |    
T  9856971 tgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatacttagaaa 9857069  T
Q  300 gtattgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggat 399  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  9857070 gtattgagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggat 9857164  T
Q  400 aattgcttgtgtct 413  Q
    || |||||||||||    
T  9857165 aactgcttgtgtct 9857178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Original strand, 210453 - 210877
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  210453 aagtttaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattca-aagtctagagtct 210551  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || |||| |  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  210552 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgtttaattcaatctcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 210651  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||  ||| ||||    
T  210652 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaagtctcatacttagaaagta 210750  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  210751 ttgagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 210845  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  210846 tgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 210877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 241804 - 241380
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  241804 aagtttaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaatttaa-agtctagagtct 241706  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  241705 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgtttaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 241606  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||  ||| ||||    
T  241605 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaagtctcatacttagaaagta 241507  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  241506 ttgagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 241412  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  241411 tgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 241380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Original strand, 724076 - 724500
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  724076 aagtttaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattca-aagtctagagtct 724174  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || |||| |  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  724175 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgtttaattcaatctcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 724274  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||  ||| ||||    
T  724275 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaagtctcatacttagaaagta 724373  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  724374 ttgagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 724468  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  724469 tgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 724500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 795159 - 794735
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  795159 aagtttaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaatttaa-agtctagagtct 795061  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  795060 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgtttaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 794961  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||  ||| ||||    
T  794960 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaagtctcatacttagaaagta 794862  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  794861 ttgagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 794767  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  794766 tgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 794735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Original strand, 3348927 - 3349350
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  3348927 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 3349025  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  3349026 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 3349125  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||   || ||||    
T  3349126 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaagtctcatactttgaaagta 3349224  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  3349225 ttgagcagttgtaatct-tgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 3349318  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  3349319 tgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 3349350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Original strand, 3359524 - 3359947
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  3359524 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 3359622  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  3359623 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 3359722  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||   || ||||    
T  3359723 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaagtctcatactttgaaagta 3359821  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  3359822 ttgagcagttgtaatct-tgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 3359915  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  3359916 tgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 3359947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 36292901 - 36292477
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  36292901 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 36292803  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  |  |||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  36292802 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaactctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 36292703  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||   || ||||    
T  36292702 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaagtctcatactttgaaagta 36292604  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  36292603 ttgagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 36292509  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  36292508 tgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 36292477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 36303504 - 36303080
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  36303504 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 36303406  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  |  |||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  36303405 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaactctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 36303306  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||   || ||||    
T  36303305 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaagtctcatactttgaaagta 36303207  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  36303206 ttgagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 36303112  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  36303111 tgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 36303080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 196 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 23363923 - 23363687
Alignment:
Q  196 ctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaa 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  23363923 ctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgcgcttgagcatttgagaagtctcatactaa 23363824  T
Q  296 gagagtattgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaacca 395  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  23363823 gagagtattgaacatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaacta 23363724  T
Q  396 ggataattgcttgtgtctctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  23363723 ggataattgattgtgtctctctttcttttctctgctc 23363687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 7 - 431
Target Start/End: Original strand, 15781010 - 15781432
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  15781010 aagttcaaaagcgccaaagctctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 15781108  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  15781109 ttactgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 15781208  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca---tttgagaagtctcataccaagagagtat 303  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||   |||| ||||||||||||  ||| ||||     
T  15781209 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcttgtgtgcttgagcattttttgtgaagtctcatacttagaaagtac 15781307  T
Q  304 tgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataatt 403  Q
    |||||| ||| ||||| ||||||||    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| |    
T  15781308 tgagcagttgcaatctttgtgatta----tagt-gaaatctcattggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataact 15781402  T
Q  404 gcttgtgtc--tctctgtcttttctctgct 431  Q
    |||||||||  | ||| |||||||||||||    
T  15781403 gcttgtgtctttgtctttcttttctctgct 15781432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 44481071 - 44480648
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  44481071 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 44480973  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  44480972 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 44480873  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||   || ||||    
T  44480872 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaagtctcatactttgaaagta 44480774  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  44480773 ttgagcagttgtaatct-tgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 44480680  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||| ||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  44480679 tgcctgtgtctttgtctttcttttctctgctc 44480648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 44491687 - 44491264
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  44491687 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 44491589  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  44491588 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 44491489  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||   || ||||    
T  44491488 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaagtctcatactttgaaagta 44491390  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  44491389 ttgagcagttgtaatct-tgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 44491296  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||| ||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  44491295 tgcctgtgtctttgtctttcttttctctgctc 44491264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 9341124 - 9340701
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  9341124 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 9341026  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  9341025 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 9340926  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||   || ||||    
T  9340925 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaagtctcatactttgaaagta 9340827  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  9340826 ttgagcagttgtaatct-tgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 9340733  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||  ||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  9340732 tgactgtgtctttgtctttcttttctctgctc 9340701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 9368268 - 9367845
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  9368268 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 9368170  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  9368169 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 9368070  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||   || ||||    
T  9368069 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaagtctcatactttgaaagta 9367971  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  9367970 ttgagcagttgtaatct-tgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 9367877  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||  ||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  9367876 tgactgtgtctttgtctttcttttctctgctc 9367845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 205 - 432
Target Start/End: Original strand, 7018914 - 7019141
Alignment:
Q  205 gtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagagagtatt 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  7018914 gtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcata-ctagagagtatt 7019012  T
Q  305 gagcatttgtaatctgtgtgattattt-ttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataatt 403  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  7019013 gagcatttgtaatctgtgtgattatttcttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggattggactacttccggtttgtggaaggaaccagtataatt 7019112  T
Q  404 gcttgtgtctctctgtcttttctctgctc 432  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7019113 gcttgtgtctctctttcttttctctgctc 7019141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 5 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 20195939 - 20195697
Alignment:
Q  5 acaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagt 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  20195939 acaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaaaagtctagagt 20195840  T
Q  105 ctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgc 204  Q
    ||| |||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| || |||  |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||    
T  20195839 cttaattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttaattcattgtatttttgtttgattagaagcctcttgcctgc 20195740  T
Q  205 gtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcatt 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  20195739 gtgcttgagcattagaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatt 20195697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 215 - 428
Target Start/End: Original strand, 22211869 - 22212082
Alignment:
Q  215 attagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagagagtattgagcatttgt 314  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||| ||||    
T  22211869 attagaagtctcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcctgagcatttgggaagtctcatacta-gagagtattgagcagttgt 22211967  T
Q  315 aatctgtgtgattattt-ttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtct 413  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  22211968 aatctgtgtgattatttcttagtggaaatctccttgaaagtgcaaaggggactggactacttccggtttgtggaaggaaccaggataattgtttgtgtct 22212067  T
Q  414 ctctgtcttttctct 428  Q
    |||| ||||||||||    
T  22212068 ctctttcttttctct 22212082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 70 - 428
Target Start/End: Original strand, 17519509 - 17519872
Alignment:
Q  70 atttgatacatcttagaaattcactagtctagag--tcttt--attacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaag-tcaaacata 164  Q
    |||||||| |||||||||||||   |||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||      
T  17519509 atttgatatatcttagaaattcttaagtctagagagtctttgaattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaat 17519608  T
Q  165 tttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgc 264  Q
    ||| | |||| ||  ||||||||||||| |||| || |  |||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||  |||||||||| ||||||    
T  17519609 tttatgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttgctttagtgcttgagcat-agaagtcttttgctttagtgctttagcaaaggaagtctcttgcctgc 17519707  T
Q  265 gtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagag-agtattgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaaggggg 363  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | | | |||||||| || ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  17519708 gtgcttgagcatttgtgaagtctcatactaggtgtagtattgatcagttgtaatctgtgtgattaaacttagtggaaatctccttggaagtgcaagggga 17519807  T
Q  364 actggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtctctctgtcttttctct 428  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  17519808 actgaactacttccggtttttggaaggaaccagtataattgcttgtgtctctctttcttctctct 17519872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 217 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 19460767 - 19460556
Alignment:
Q  217 tagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagagagtattgagcatttgtaa 316  Q
    |||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |  ||||||||||| ||||||    
T  19460767 tagaagtctcttgctcgagtgcttgagcataggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcatttgtgaagtctcatactaggt-agtattgagcagttgtaa 19460669  T
Q  317 tctgtgtgattattt-ttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtctct 415  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  19460668 tctgtgtgattatttcttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtgaaaggaaccaagataattgcttgtgtctct 19460569  T
Q  416 ctgtcttttctct 428  Q
    || ||||||||||    
T  19460568 ctttcttttctct 19460556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 217 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 19558445 - 19558234
Alignment:
Q  217 tagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagagagtattgagcatttgtaa 316  Q
    |||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |  ||||||||||| ||||||    
T  19558445 tagaagtctcttgctcgagtgcttgagcataggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcatttgtgaagtctcatactaggt-agtattgagcagttgtaa 19558347  T
Q  317 tctgtgtgattattt-ttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtctct 415  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  19558346 tctgtgtgattatttcttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtgaaaggaaccaagataattgcttgtgtctct 19558247  T
Q  416 ctgtcttttctct 428  Q
    || ||||||||||    
T  19558246 ctttcttttctct 19558234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 217 - 428
Target Start/End: Original strand, 23271689 - 23271900
Alignment:
Q  217 tagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagagagtattgagcatttgtaa 316  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |  ||||||||| | ||||||    
T  23271689 tagaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcatttgtgaagtctcatactaggt-agtattgagtagttgtaa 23271787  T
Q  317 tctgtgtgattattt-ttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtctct 415  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||| ||||||||||    
T  23271788 tctgtgtgattatttcttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaactagtttaattgtttgtgtctct 23271887  T
Q  416 ctgtcttttctct 428  Q
    || ||||||||||    
T  23271888 ctttcttttctct 23271900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 70 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 40002928 - 40002563
Alignment:
Q  70 atttgatacatcttagaaattcactagtctagag--tcttt--attacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaag-tcaaacata 164  Q
    |||||||| |||||||||||||   |||||||||  |||||  ||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||| |||||||||  |||||||      
T  40002928 atttgatatatcttagaaattcttaagtctagagagtctttcaattgcattgtactgtgaacatcactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaat 40002829  T
Q  165 tttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgc 264  Q
    ||||| |||| ||  ||||||||||||| |||| || |  ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  40002828 tttctgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgc 40002729  T
Q  265 gtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagag-agtattgagcatttgtaatctgt-gtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggg 362  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||||| | | | ||||||||||| |||||||| || |||||||   ||| ||||| ||||||| |||||||||||||    
T  40002728 gtgcttgagcaattttgaagtctcatactaggtgtagtattgagcagttgtaatcagttgtgattaaacttaatggaactctccttagaagtgcaagggg 40002629  T
Q  363 gactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtctctctgtcttttctct 428  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| ||| |||| |||||    
T  40002628 gactggactacttccggtttgtggaaggaaccagtataattgtttgtgtctttctttcttctctct 40002563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 217 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 29379157 - 29378944
Alignment:
Q  217 tagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagag-agtattgagcatttgta 315  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | | | ||||||||||| |||||    
T  29379157 tagaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcatttgtgaagtctcatactaggtgtagtattgagcagttgta 29379058  T
Q  316 atctg-tgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtctc 414  Q
    ||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||    
T  29379057 atctggtgtgattaaacttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaaccagtataattgcttgtgtttc 29378958  T
Q  415 tctgtcttttctct 428  Q
    ||| |||| |||||    
T  29378957 tctttcttctctct 29378944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 215 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 8031608 - 8031392
Alignment:
Q  215 attagaagactcttgctttag-tgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagag-agtattgagcattt 312  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||| | | | ||||||||||| ||    
T  8031608 attagaagtctcttgctttagctgcttgagcaaaggaagtctcttttctgcgtgcttgagcatttgtgaagtctcatactaggtgtagtattgagcagtt 8031509  T
Q  313 gtaatctgtgtgattattt-ttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgt 411  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||     
T  8031508 gtaatctgtgtgattatttcttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggttcgtggaaggaaccaatataattgcttgtgc 8031409  T
Q  412 ctctctgtcttttctct 428  Q
    |||||| ||||||||||    
T  8031408 ctctctttcttttctct 8031392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 115 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 28903119 - 28902805
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaag-tcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgag 213  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||  ||||| |||| ||  ||||||||||||| |||| || |  |||||||||    
T  28903119 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatagaagtctcttgctttagtgcttgag 28903020  T
Q  214 cattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagag-agtattgagcattt 312  Q
    |||  |||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||| || | ||||||||| | | | | ||||||||||| ||    
T  28903019 cataggaagtctcttgctttagtgcttgagtaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcaattta-aagtctcatgctaggtgtagtattgagcagtt 28902921  T
Q  313 gtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtc 412  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| ||||   |||||||  ||||||    
T  28902920 gtaatctgtgtgattaaacttagtggaactctccttggaagtgcaagggggactgaactacttccgatctgtggaaggaaccgatataattgtctgtgtc 28902821  T
Q  413 tctctgtcttttctct 428  Q
    | ||| |||| |||||    
T  28902820 tttctttcttctctct 28902805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 13 - 277
Target Start/End: Original strand, 7018686 - 7018956
Alignment:
Q  13 aaaagcgtcaaaactctgtcaa-tttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtctttatt 111  Q
    ||||||| |||||||||| ||| |||||||||| ||||||  ||||||||| || ||||||||||  |||||||||||||   |||||||||| ||||||    
T  7018686 aaaagcgccaaaactctgccaaatttgattctaaaaagcaatttgaatttctgctctgatttgatgtatcttagaaattcttaagtctagagtttttatt 7018785  T
Q  112 acattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttc-aagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctc----tcgcctgcgt 206  Q
     ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||| |||| ||  |||||| |||||| |||    ||||||||||    
T  7018786 gcattgtattgtaaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacaattttctgtgtaattatgtttgattagaagtctctcgatcgcctgcgt 7018885  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatt 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || |  |||||||||||||    
T  7018886 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcatt 7018956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 70 - 428
Target Start/End: Original strand, 45568367 - 45568732
Alignment:
Q  70 atttgatacatcttagaaattcactagtctagag--tcttt--attacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaag-tcaaacata 164  Q
    |||||||| |||||||||||||   |||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||      
T  45568367 atttgatatatcttagaaattcttaagtctagagagtctttcaattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaat 45568466  T
Q  165 tttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgc 264  Q
    ||||| |||| ||| ||||||||||||| |||| || |  ||||||||||||  |||| |||||||||  |||||||||||  |||||||| | |||||     
T  45568467 tttctgtgtaattttgtttgaatagaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgcttgtgtgcttgagcaaaggaagtcttttgcctgt 45568566  T
Q  265 gtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagag-agtattgagcatttgtaatctg-tgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggg 362  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||||| | | | ||||||||||| |||||||| | ||||||||   |||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  45568567 gtgcttgagcaatt-tgaagtctcatactaggtgtagtattgagcagttgtaatcagttgtgattaaacttagtgaaactctccttggaagtgtaagggg 45568665  T
Q  363 gactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtctctctgtcttttctct 428  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||| |||| | |||||| | ||||||| ||| |||| |||||    
T  45568666 gacaggactgacttccggtttgtggaaggaacctgtataattacctgtgtctttctttcttctctct 45568732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 215 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 20195759 - 20195543
Alignment:
Q  215 attagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattt--gagaagtctcataccaagagagtattgagcattt 312  Q
    |||||||| ||||||| |  ||||||||||||| |||| |||| || || ||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  20195759 attagaagcctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcatacttagagagtattgagcattt 20195660  T
Q  313 gtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtc 412  Q
    ||||||| |||||||||  |||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  20195659 gtaatctttgtgattatagtta-----aatctccttggaagtgcaagggggactggactacttctgatttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtc 20195565  T
Q  413 --tctctgtcttttctctgctc 432  Q
      | ||| ||||||||||||||    
T  20195564 tttgtctttcttttctctgctc 20195543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 311 - 428
Target Start/End: Original strand, 15969492 - 15969610
Alignment:
Q  311 ttgtaatctgtgtgattattt-ttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgt 409  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  15969492 ttgtaatctgtgtgattatttcttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggaccggactacttccggtttgtggaaggaaccagtataattgcttgt 15969591  T
Q  410 gtctctctgtcttttctct 428  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  15969592 gtctctctttcttttctct 15969610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 214 - 432
Target Start/End: Original strand, 13697185 - 13697403
Alignment:
Q  214 cattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcat----ttgagaagtctcataccaagagagtattgagca 309  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || || ||||||||||||    ||| ||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  13697185 cattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcttgtgtgcttgagcatagttttgtgaagtctcatacttagaaagtattgagca 13697283  T
Q  310 tttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgt 409  Q
     ||||||||| |||||||||    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  13697284 gttgtaatctttgtgattat----agtg-aaatctccttgaaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgt 13697378  T
Q  410 gtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    |||  | ||| ||||||||||||||    
T  13697379 gtctttgtctttcttttctctgctc 13697403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 113 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 21288057 - 21287739
Alignment:
Q  113 cattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaag-tcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttg 211  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||  ||| | |||| ||  ||||||||||||| |||| || |  |||||||    
T  21288057 cattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttatgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttgctttagtgcttg 21287958  T
Q  212 agcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagag-agtattgagcat 310  Q
    |||||  |||| |||||||||  |||||||||||  |||||||||| ||||| || |||||||| ||  |||||||||||| | | | |||||||||||     
T  21287957 agcataggaagtctcttgcttgtgtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgtgtacttgagcaatt-tgaagtctcatactaggtgtagtattgagcag 21287859  T
Q  311 ttgtaatctg-tgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttg 408  Q
    |||||||| | ||||||||   |||||| || |||| |||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||    
T  21287858 ttgtaatcagttgtgattaaacttagtgaaactctcgttggaagtgcaagggggacaagactgacttccggtttgtggaaggaacctgtataattgcatg 21287759  T
Q  409 tgtctctctgtcttttctct 428  Q
    ||| | ||| |||| |||||    
T  21287758 tgtatttctttcttctctct 21287739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 13 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 23370528 - 23370386
Alignment:
Q  13 aaaagcgtcaaaactctgtcaa-tttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtctttatt 111  Q
    |||||||  ||||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  23370528 aaaagcgcaaaaactctgccaaatttgattctataaagcactttgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcttaagtctagagtctttatt 23370429  T
Q  112 acattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa 154  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  23370428 gcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 23370386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 296 - 413
Target Start/End: Original strand, 23270528 - 23270640
Alignment:
Q  296 gagagtattgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaacca 395  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  23270528 gagagtattgagcatttgtaatctttgtgattat----agtg-aaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaacca 23270622  T
Q  396 ggataattgcttgtgtct 413  Q
    |||||| |||||||||||    
T  23270623 ggataactgcttgtgtct 23270640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 5 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 19460952 - 19460707
Alignment:
Q  5 acaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaat-ttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagag 103  Q
    ||||||||||||| | | |||||||| |||  ||| ||||  ||||||| ||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||   |||||||||    
T  19460952 acaagttaaaaagtgcccaaactctgccaaacttgtttctcaaaagcactttgaatttctgcattgatttgatatatcttagaaattcttaagtctagag 19460853  T
Q  104 tcttt-attacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttc-aagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcc 201  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| || |||||||  ||||| |||| ||  ||||||||||||| |||| ||     
T  19460852 tctttcattgcattgtattgtgaacaccactgatagtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttgct 19460753  T
Q  202 tgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcatt 247  Q
     | ||||||||||||  |||| ||||||| |  |||||||||||||    
T  19460752 cgagtgcttgagcataggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcatt 19460707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 5 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 19558630 - 19558385
Alignment:
Q  5 acaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaat-ttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagag 103  Q
    ||||||||||||| | | |||||||| |||  ||| ||||  ||||||| ||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||   |||||||||    
T  19558630 acaagttaaaaagtgcccaaactctgccaaacttgtttctcaaaagcactttgaatttctgcattgatttgatatatcttagaaattcttaagtctagag 19558531  T
Q  104 tcttt-attacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttc-aagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcc 201  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| || |||||||  ||||| |||| ||  ||||||||||||| |||| ||     
T  19558530 tctttcattgcattgtattgtgaacaccactgatagtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttgct 19558431  T
Q  202 tgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcatt 247  Q
     | ||||||||||||  |||| ||||||| |  |||||||||||||    
T  19558430 cgagtgcttgagcataggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcatt 19558385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 227
Target Start/End: Original strand, 22211694 - 22211911
Alignment:
Q  13 aaaagcgtcaaaactctgtcaa-tttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtcttt-at 110  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||||||||  ||||||   |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||   |||||||||||||| ||    
T  22211694 aaaagcatcaaaactctgccaaatttgattctcaaaagcaatctgaatttctgcactaatttgatatatcttagaaattcttaagtctagagtcttttat 22211793  T
Q  111 tacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttc-aagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgct 209  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||| |||| ||  |||||| |||||| |||| || |  |||||    
T  22211794 tgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacaattttctgtgtaattctgtttgattagaagtctcttgctttagtgct 22211893  T
Q  210 tgagcattagaagactct 227  Q
    |||||||| |||| ||||    
T  22211894 tgagcattggaagtctct 22211911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 295 - 413
Target Start/End: Original strand, 15998804 - 15998917
Alignment:
Q  295 agagagtattgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaacc 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  15998804 agagagtattgagcatttgtaatctttgtgattat----agtg-aaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtagaaggaacc 15998898  T
Q  395 aggataattgcttgtgtct 413  Q
    || |||| |||||||||||    
T  15998899 agaataactgcttgtgtct 15998917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 302 - 413
Target Start/End: Original strand, 26735573 - 26735679
Alignment:
Q  302 attgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataa 401  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  26735573 attgagcatttgtaatctttgtgattat----agtg-aaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataa 26735667  T
Q  402 ttgcttgtgtct 413  Q
     |||||||||||    
T  26735668 ctgcttgtgtct 26735679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 70 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 21540654 - 21540305
Alignment:
Q  70 atttgatacatcttagaaattcactagtcta--gagtcttta--ttacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaag-tcaaacata 164  Q
    |||||||| |||||||||||||   ||||||  ||||||||   || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||  |||||||      
T  21540654 atttgatatatcttagaaattcttaagtctaaagagtctttcatttgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtattcaaactcaaacaat 21540555  T
Q  165 tttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgc 264  Q
    ||||| |||| ||  ||||||||||||| ||||  | |  ||||||||||||  |||| ||||||| |  |||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  21540554 tttctgtgtaattctgtttgaatagaagtctctttctttagtgcttgagcataggaagtctcttgcatgtgtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgc 21540455  T
Q  265 gtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagag-agtattgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaaggggg 363  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||||| | | |  |||||||||| |         ||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  21540454 gtgcttgagcaatt-tgaagtctcatactaggtgtcgtattgagcagt---------tgtgattaaacttagtggaactctccttggaagtgcaagggtg 21540365  T
Q  364 actggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtctctctgtctt 422  Q
    ||  |||| |||||||||||||||||| |||  | |||||||| ||||||| ||| ||||    
T  21540364 acatgactgacttccggtttgtggaaggaacttgtataattgcatgtgtctttctttctt 21540305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 299 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 23290587 - 23290458
Alignment:
Q  299 agtattgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccagga 398  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||    
T  23290587 agtattgagcagttgtaatct-tgtgattat----agtg-aaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccagga 23290494  T
Q  399 taattgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||| ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  23290493 taactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 23290458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 115 - 257
Target Start/End: Original strand, 19956838 - 19956981
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagt-caaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgag 213  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||||| |||||| |||| ||  ||||||||||||| |||| || ||||||||||||    
T  19956838 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaaatttctttgtaattatgtttgaatagaagtctcttgcttgcgtgcttgag 19956937  T
Q  214 cattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctct 257  Q
    |||  |||| || ||| ||| || ||||||||| |||| |||||    
T  19956938 cataggaagtctattgattttgttcttgagcataggaaatctct 19956981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 113 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 21298667 - 21298504
Alignment:
Q  113 cattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttc-aagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttg 211  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || |||||||  ||||| |||| ||  ||||||||||||| |||| || |  ||||| |    
T  21298667 cattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttgctttagtgctcg 21298568  T
Q  212 agcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca 275  Q
    |||||  |||| |||||||||  |||||||||||  |||||||||| || || |||||||||||    
T  21298567 agcataggaagtctcttgcttgtgtgcttgagcaaaggaagtctcttgcttgtgtgcttgagca 21298504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 205 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 21298544 - 21298319
Alignment:
Q  205 gtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagag-agtat 303  Q
    |||||||||||   |||| |||||||||  |||||||||||  |||||||||| ||||  |||||  |||| ||  |||||||||||| | | | |||||    
T  21298544 gtgcttgagcaaaggaagtctcttgcttgtgtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctttgtgctgtagcaattt-gaagtctcatactaggtgtagtat 21298446  T
Q  304 tgagcatttgtaatctgt-gtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggataa 401  Q
    |||||| |||||||| || |||||||   |||||| || |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| |||| | ||||    
T  21298445 tgagcagttgtaatcagttgtgattaaacttagtgaaactctccttggaagtgcaagggggaaaggactgacttccggtttgtggaaggaacctgtataa 21298346  T
Q  402 ttgcttgtgtctctctgtcttttctct 428  Q
    |||  ||||||| ||| |||| |||||    
T  21298345 ttgtctgtgtctttctttcttctctct 21298319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 338 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 12541109 - 12541041
Alignment:
Q  338 gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgct 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||    
T  12541109 gaaatctccttggaagtgcaagggggattggactacttccggattgtggaaggaaccaagataattgct 12541041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 115 - 257
Target Start/End: Original strand, 15934132 - 15934275
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaag-tcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgag 213  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||  |||||||  ||||| |||| ||| ||||||||||||| |||| ||    |||||||||    
T  15934132 ttgtattgtgaacaccattgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctttgtaattttgtttgaatagaagtctcttgcagttgtgcttgag 15934231  T
Q  214 cattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctct 257  Q
    ||| ||||| |||||||  | |||||||||||| ||||||||||    
T  15934232 cataagaagtctcttgcagttgtgcttgagcataggaagtctct 15934275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 328 - 407
Target Start/End: Original strand, 15934376 - 15934454
Alignment:
Q  328 atttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  15934376 atttttagtg-aactctccttggaagtgcaagggggacaggactacttccggtttgtggaaggaacctgtataattgctt 15934454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 46 - 247
Target Start/End: Original strand, 23271546 - 23271749
Alignment:
Q  46 aaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtcttt-attacattgtattgtgaacactactgattgtatatc 144  Q
    ||||||| ||||||||| |   |||||||||| ||||||||||||    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  23271546 aaagcactttgaatttctgtgttgatttgatatatcttagaaatttttaagtctagagtctttcattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatgtc 23271645  T
Q  145 tagtgttc-aagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgag 243  Q
     ||||||| || |||||||  ||| | |||| |   ||||||||||||| |||| || |  ||||||||||||  |||| ||||||| |  |||||||||    
T  23271646 aagtgttcaaactcaaacaattttttgtgtaatcctgtttgaatagaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgcctgcgtgcttgag 23271745  T
Q  244 catt 247  Q
    ||||    
T  23271746 catt 23271749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 303 - 415
Target Start/End: Original strand, 24498761 - 24498871
Alignment:
Q  303 ttgagcatttgtaatct-gtgtgattatttttagtggaaa-tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggata 400  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||    |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||    
T  24498761 ttgagcaattgtaatcttgtgtgattat----agtggaaaatctccttcgaaatgcaagggggactggactacttctggattgtggaaggaaccaggata 24498856  T
Q  401 attgcttgtgtctct 415  Q
    ||| | |||||||||    
T  24498857 atttcctgtgtctct 24498871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 44 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 29379305 - 29379097
Alignment:
Q  44 acaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagag--tcttt--attacattgtattgtgaacactactgattgt 139  Q
    ||||||||| ||||||||| |   | |||||||| |||||||||||||   |||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  29379305 acaaagcactttgaatttctgtgttcatttgatatatcttagaaattcttaagtctagagaatctttcaattgcattgtattgtgaacaccactgattgt 29379206  T
Q  140 atatctagtgttc-aagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgc 238  Q
    ||||| ||||||| || ||||| |  ||||| |||| ||  ||||||||||||| |||| || |  |||||||||||   |||| ||||||| |  ||||    
T  29379205 atatcaagtgttcaaactcaaataattttctgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgcgtgc 29379106  T
Q  239 ttgagcatt 247  Q
    |||||||||    
T  29379105 ttgagcatt 29379097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 342 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 19942659 - 19942594
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  19942659 tctccttggaagtgcaagggggacaggactactttcggtttgtggaaggaacctgtataattgctt 19942594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 342 - 407
Target Start/End: Original strand, 20383065 - 20383130
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  20383065 tctccttggaagtgcaagggggacatgactacttccggtttgtggaaggaacctgtataattgctt 20383130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 115 - 251
Target Start/End: Original strand, 22462138 - 22462275
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgag 213  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||| |||| ||  |||| |||||||| |||| |   | |||||||||    
T  22462138 ttgtatggtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatatttctttgtaattctgtttaaatagaagtctcttgtaggtgtgcttgag 22462237  T
Q  214 cattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaa 251  Q
    |||  |||| |||||| |||||| ||||||||| ||||    
T  22462238 catatgaagtctcttgatttagttcttgagcataggaa 22462275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 338 - 394
Target Start/End: Original strand, 16376058 - 16376114
Alignment:
Q  338 gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaacc 394  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  16376058 gaaatctccttggaagtgcaagggggtcatgactacttccggtttgtggaagaaacc 16376114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 328 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 19706952 - 19706874
Alignment:
Q  328 atttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| |||| | ||||||||||    
T  19706952 atttttagtg-aactctccttggaagtgcaagggggacaggactactttcgatttgtggaaggaacctgtataattgctt 19706874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 279
Target Start/End: Original strand, 1210243 - 1210409
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgagc 214  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||  ||||||| ||||| |||| ||| |||||  |||||| || | || |  ||||||||||    
T  1210243 ttgtattgtgaacatcactgattgtatatcaagtgtccaaaccaaacatctttctgtgtaattttgtttgtttagaagtcttttgcttctgtgcttgagc 1210342  T
Q  215 at-ta-gaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttg 279  Q
    || || |||  |||||||||  ||||||||| ||| ||||||||| || || |||||||||||||||    
T  1210343 atataggaaatctcttgcttgtgtgcttgagtatttgaagtctcttgcttgtgtgcttgagcatttg 1210409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 228
Target Start/End: Original strand, 18321659 - 18321773
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgag 213  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||  ||||| |||| ||  ||||||||||||| |||| ||    |||||||||    
T  18321659 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattatgtttgaatagaagtctcttgcagttgtgcttgag 18321758  T
Q  214 cattagaagactctt 228  Q
    ||||||||| |||||    
T  18321759 cattagaagtctctt 18321773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 342 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 18557473 - 18557400
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgc-ttgtgtctct 415  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  18557473 tctccttggaagtgcaagggg-agtggactacttccggattgtggaagaaaccactataattgctttgtgtctct 18557400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 357 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 21547702 - 21547625
Alignment:
Q  357 aagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  21547702 aagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 21547625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 68 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 8031728 - 8031640
Alignment:
Q  68 tgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtcttt--attacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa 154  Q
    |||||||||| |||||||||||||   ||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||    
T  8031728 tgatttgatatatcttagaaattcttaagtttagagtctttcaattgcattgtattgtgaacaccactgatagtatatcaagtgttcaa 8031640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 342 - 407
Target Start/End: Original strand, 19957065 - 19957130
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  19957065 tctccttggaagtgcaagggggatagggctacttccggtttgtggaaggaacctgtataattgctt 19957130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 342 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 22673224 - 22673151
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggat-aattgcttgtgtct 413  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| | || ||||||||||||||    
T  22673224 tctccttggaagtgcaagggggacaggactgacttccggtttgtggaaggaacctgtataaattgcttgtgtct 22673151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 342 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 26832499 - 26832434
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  26832499 tctctttggaagtgcaagggggacaggactacttcctgtttgtggaaggaacctgtataattgctt 26832434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 339 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 17687445 - 17687370
Alignment:
Q  339 aaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtctct 415  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| |||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17687445 aaatctctttggaagtgcaagggagacttgactact-ccgaattgtgtaaggaaccaggataattgcttgtgtctct 17687370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #102
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 329 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 18772127 - 18772041
Alignment:
Q  329 tttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtctctct 417  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||| |||| | |||||||||| |||||||||    
T  18772127 tttttagtg-aactctccttggaagtgcgagggggacaggactacttctggtttgtgaaaggaacctgtataattgctt-tgtctctct 18772041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #103
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 339 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 24634811 - 24634735
Alignment:
Q  339 aaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtctct 415  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||  ||| |||||||||| | |||||||    
T  24634811 aaatctccttggaagggcaagggagactggactacttctgggttgtggaagggacctggataattgcatatgtctct 24634735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #104
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 342 - 393
Target Start/End: Original strand, 40846115 - 40846167
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaac 393  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40846115 tctccttggaagtgcaagggggacaggactgacttccggtttgtggaagaaac 40846167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #105
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 257
Target Start/End: Original strand, 14989952 - 14990097
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaat--agaagcctctcgcctgcgtgcttg 211  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||  ||||| |||| ||  ||||||||  ||||| |||| || |  |||||||    
T  14989952 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaattcagaagtctcttgcatttgtgcttg 14990051  T
Q  212 agcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctct 257  Q
    | || |||||| |||||||  | ||||||||||| | |||||||||    
T  14990052 atcaatagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctct 14990097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #106
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 257
Target Start/End: Original strand, 14990563 - 14990708
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaat--agaagcctctcgcctgcgtgcttg 211  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||  ||||| |||| ||| ||||||||  | ||| |||| || |  |||||||    
T  14990563 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattttgtttgaattcataagtctcttgcatttgtgcttg 14990662  T
Q  212 agcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctct 257  Q
    |||| |||||| |||||||  | ||| ||||||| | |||||||||    
T  14990663 agcaatagaagtctcttgcagttgtgtttgagcaatagaagtctct 14990708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #107
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 257
Target Start/End: Original strand, 18152148 - 18152293
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaat--agaagcctctcgcctgcgtgcttg 211  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||||||   ||||| |||| ||  ||||||||  ||||| |||| || |  |||||||    
T  18152148 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaaccattttctttgtaattctgtttgaattcagaagtctcttgcatttgtgcttg 18152247  T
Q  212 agcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctct 257  Q
    |||| |||||| |||||||  | ||||||||||| | |||||||||    
T  18152248 agcaatagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctct 18152293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #108
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 19942884 - 19942770
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgagc 214  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||| |||| ||  |||||| || ||| |||| ||    |||||||| |    
T  19942884 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgattataagtctcttgcagttgtgcttgacc 19942785  T
Q  215 attagaagactcttg 229  Q
    |||||||| ||||||    
T  19942784 attagaagtctcttg 19942770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #109
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 29692963 - 29692846
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaa--tagaagcctctcgcctgcgtgcttg 211  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||| |||| ||| |||||||  | |||| |||| ||    |||||||    
T  29692963 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattttgtttgaatttggaagtctcttgcagttgtgcttg 29692864  T
Q  212 agcattagaagactcttg 229  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  29692863 agcattagaagtctcttg 29692846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #110
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 229
Target Start/End: Original strand, 30421934 - 30422050
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttc-aagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaa--tagaagcctctcgcctgcgtgcttg 211  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |  |||||||| ||||| |||| ||| |||||||  |||||| |||||||    |||||||    
T  30421934 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcgacctcaaacat-tttctttgtaattttgtttgaatttagaagtctctcgcagttgtgcttg 30422032  T
Q  212 agcattagaagactcttg 229  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  30422033 agcattagaagtctcttg 30422050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #111
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 229
Target Start/End: Original strand, 45538938 - 45539055
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaat--agaagcctctcgcctgcgtgcttg 211  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||| |||| ||  ||||||||  ||||| |||| ||    |||||||    
T  45538938 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttg 45539037  T
Q  212 agcattagaagactcttg 229  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  45539038 agcattagaagtctcttg 45539055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #112
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 342 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 17796846 - 17796793
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaacc 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  17796846 tctccttggaagtgcaagggggacatgactgacttccggtttgtggaagaaacc 17796793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #113
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 342 - 407
Target Start/End: Original strand, 24679115 - 24679180
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||| |||| | ||||||||||    
T  24679115 tctccttggaagtgcaagggggacatgactacttccagattgtggaaggaacctgtataattgctt 24679180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #114
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 342 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 25163494 - 25163429
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||| |||| | ||||||||||    
T  25163494 tctccttggaagtgcaagggggacaagtctacttccggtttatggaaggaacctgtataattgctt 25163429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #115
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 342 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 43773544 - 43773491
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaacc 394  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  43773544 tctccttggaagtgcaagggggacaggactgacttccggtttgtggaaggaacc 43773491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #116
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 118 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 26832722 - 26832582
Alignment:
Q  118 tattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgagcat 216  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||  ||||||| |||||| |||| ||  ||||||||||||| |||| ||     |||||||||||    
T  26832722 tattgtgaacaccactaattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaaatttctttgtaattctgtttgaatagaagtctcttgcagttttgcttgagcat 26832623  T
Q  217 tagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctct 257  Q
      |||| ||||||  ||||| ||||||||| |||| |||||    
T  26832622 aggaagtctcttgacttagttcttgagcataggaaatctct 26832582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #117
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 352 - 407
Target Start/End: Original strand, 12758474 - 12758529
Alignment:
Q  352 agtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  12758474 agtgcaagggggacatgactacttccggtttgtggaaggaacctgtataattgctt 12758529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #118
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 344 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 18679235 - 18679172
Alignment:
Q  344 tccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    |||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| |||| | ||||||||||    
T  18679235 tccttggatgtgcaagggggacatgactacttccggtttatggaaggaacctgtataattgctt 18679172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #119
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 344 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 18718424 - 18718361
Alignment:
Q  344 tccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    |||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| |||| | ||||||||||    
T  18718424 tccttggatgtgcaagggggacatgactacttccggtttatggaaggaacctgtataattgctt 18718361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #120
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 342 - 413
Target Start/End: Original strand, 19506068 - 19506139
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtct 413  Q
    |||||||||||||||||| || ||  |||||||||||| |||| |||| |||| | ||||||||||||||||    
T  19506068 tctccttggaagtgcaagtggaacatgactacttccggattgtcgaagtaacctgtataattgcttgtgtct 19506139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #121
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 342 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 16206694 - 16206629
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  16206694 tctccttggaagtgcaaggggg-caggactgacttccggtttgtggaaggaacctgtataattgctt 16206629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #122
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 342 - 407
Target Start/End: Original strand, 18121835 - 18121901
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| |||  | ||||||||||    
T  18121835 tctccttggaagtgcaagggggacatgactgacttccggtttgtggaaggaacttgtataattgctt 18121901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #123
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 342 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 29692736 - 29692670
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||   ||||||||||    
T  29692736 tctccttggaagtgcaagggggacatgactgacttccggtttgtggaaggaacctatataattgctt 29692670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #124
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 1744802 - 1744730
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttc-aagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaat 187  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || ||||||||| |||| |||| ||| ||||||||    
T  1744802 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacata-ttctttgtaattttgtttgaat 1744730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #125
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 187
Target Start/End: Original strand, 13431121 - 13431194
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaat 187  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||| |||| ||  ||||||||    
T  13431121 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaat 13431194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #126
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 342 - 413
Target Start/End: Original strand, 14990206 - 14990279
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggat-aattgcttgtgtct 413  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| || | | || ||||||||||||||    
T  14990206 tctccttggaagtgcaagggggacaggactgactttcggtttgtggaaggaatctgtataaattgcttgtgtct 14990279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #127
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 329 - 389
Target Start/End: Original strand, 15336803 - 15336863
Alignment:
Q  329 tttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaag 389  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  15336803 tttttagtg-aactctccttggaagtgcaagggggacatgactgacttccggtttgtggaag 15336863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #128
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 329 - 389
Target Start/End: Original strand, 15425868 - 15425928
Alignment:
Q  329 tttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaag 389  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  15425868 tttttagtg-aactctccttggaagtgcaagggggacatgactgacttccggtttgtggaag 15425928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #129
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 329 - 389
Target Start/End: Original strand, 15517172 - 15517232
Alignment:
Q  329 tttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaag 389  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  15517172 tttttagtg-aactctccttggaagtgcaagggggacatgactgacttccggtttgtggaag 15517232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #130
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 342 - 407
Target Start/End: Original strand, 20256240 - 20256305
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||||||||| |||  | ||||||||||    
T  20256240 tctccttggaagtgcaagggagacatgactatttccggtttgtggaaggaacttgtataattgctt 20256305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #131
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 251
Target Start/End: Original strand, 25850494 - 25850631
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgag 213  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||  |||||||||||| | |||| ||  |||||  |||||| |||| || |  |||||||||    
T  25850494 ttgtattgtgaacaccacttattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatatttttgtgtaattgtgtttgtttagaagactcttgcttttgtgcttgag 25850593  T
Q  214 cattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaa 251  Q
     ||  |||||||||||  ||  ||||||||||| ||||    
T  25850594 tataggaagactcttgtgtttatgcttgagcataggaa 25850631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #132
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 342 - 394
Target Start/End: Original strand, 33560941 - 33560994
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaacc 394  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||||    
T  33560941 tctccttggaagtgcaagggggacaggactaacttccggtttgtgcaaggaacc 33560994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #133
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 43639431 - 43639358
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaat 187  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||| |||| ||  ||||||||    
T  43639431 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaat 43639358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #134
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 45292484 - 45292411
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaat 187  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||| |||| ||  ||||||||    
T  45292484 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaat 45292411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #135
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 338 - 394
Target Start/End: Original strand, 45539159 - 45539215
Alignment:
Q  338 gaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaacc 394  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  45539159 gaaatctccttggaagtgcaa-ggggacaggactgacttccggtttgtggaaggaacc 45539215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #136
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 342 - 394
Target Start/End: Original strand, 1210435 - 1210487
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaacc 394  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  1210435 tctccttggaagtgcaagagggacaggactacttccggattgtgaaagtaacc 1210487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #137
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 2810458 - 2810398
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgta 174  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  2810458 ttgtattgtgaacaccactaattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatatttctttgta 2810398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #138
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 16188633 - 16188573
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgta 174  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||| ||||    
T  16188633 ttgtattgtgaacactagtgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacatttttctttgta 16188573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #139
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 360 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 17879107 - 17879063
Alignment:
Q  360 ggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  17879107 ggggactggattacttccggattgtggaaggaaccaggataattg 17879063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #140
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 342 - 406
Target Start/End: Original strand, 23192498 - 23192562
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgct 406  Q
    |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||  | |||||||||    
T  23192498 tctccttggaaaggcaagggggacaggactacttccgaattgtggaagaaacttgtataattgct 23192562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #141
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 347 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 36104759 - 36104691
Alignment:
Q  347 ttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggat-aattgcttgtgtct 413  Q
    |||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| |||| | || ||||||||||||||    
T  36104759 ttggaagtgcaagggggacaagactgacttccggtttgtggaaggaacctgtataaattgcttgtgtct 36104691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #142
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 12193563 - 12193524
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa 154  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  12193563 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 12193524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #143
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 12437991 - 12437952
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa 154  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  12437991 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 12437952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #144
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 17701391 - 17701352
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa 154  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  17701391 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 17701352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #145
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 342 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 17928511 - 17928468
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtg 385  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||    
T  17928511 tctccttggaagtgcaagggggacatgactacttccggattgtg 17928468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #146
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 17928703 - 17928664
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa 154  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  17928703 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 17928664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #147
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 342 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 19153456 - 19153410
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaag 389  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  19153456 tctccttggaagtgcaagggggacaggactactt-cagtttgtggaag 19153410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #148
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 19707158 - 19707119
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa 154  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  19707158 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 19707119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #149
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 154
Target Start/End: Original strand, 20382894 - 20382933
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa 154  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  20382894 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 20382933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #150
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 21932531 - 21932492
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa 154  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  21932531 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 21932492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #151
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 25163721 - 25163682
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa 154  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  25163721 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 25163682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #152
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 154
Target Start/End: Original strand, 40845888 - 40845927
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa 154  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  40845888 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 40845927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #153
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 342 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 43644320 - 43644273
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaag 389  Q
    ||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| |||||||||    
T  43644320 tctccttggaattgcaaggggggcaggactacttccggattgtggaag 43644273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #154
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 43644546 - 43644507
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa 154  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  43644546 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 43644507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #155
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 43773769 - 43773730
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa 154  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  43773769 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 43773730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #156
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 205 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 16206795 - 16206745
Alignment:
Q  205 gtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtct 255  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||    
T  16206795 gtgcttgagcatttgaagtctcttgctgttgtgcttgagcatttgaagtct 16206745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #157
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 114 - 187
Target Start/End: Original strand, 17442319 - 17442393
Alignment:
Q  114 attgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaat 187  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||  |||||||| ||||| |||| ||  ||||||||    
T  17442319 attgtattgtgaacaccactgattgtgtatcaagtgttcaacatcaaacatttttctttgtaattctgtttgaat 17442393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #158
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 120 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 17879278 - 17879236
Alignment:
Q  120 ttgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaaca 162  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  17879278 ttgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaactcaaaca 17879236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #159
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 115 - 197
Target Start/End: Original strand, 19505938 - 19506020
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctct 197  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| ||  ||||||| ||||| |||| ||| |||||  |||||| ||||    
T  19505938 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaaatgtttaaaccaaacatctttctatgtaattttgtttgtttagaagtctct 19506020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #160
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 342 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 21932307 - 21932241
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||||   ||||||||||    
T  21932307 tctccttgaaagtgcaagggggacaggactgacttccggtttgtgaaagtaacctctataattgctt 21932241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #161
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 325 - 407
Target Start/End: Original strand, 25850700 - 25850781
Alignment:
Q  325 attatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    |||| |||||||| || |||| |||||||||||||||||||  ||| |||||||| ||||||||| |||  | ||||||||||    
T  25850700 attaattttagtg-aactctctttggaagtgcaagggggacatgacaacttccggattgtggaaggaacatgtataattgctt 25850781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #162
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 333 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 27739355 - 27739269
Alignment:
Q  333 tagtggaaatctccttggaagtgcaaggggg-actggactacttccggtttgtggaa-gaaaccaggataattgcttgtgtctctct 417  Q
    ||||| ||||||| ||| || |||||||||| |||| ||||||||||  |||||||| | ||||||||||||||||| | |||||||    
T  27739355 tagtgaaaatctctttgaaactgcaaggggggactgaactacttccgaattgtggaaaggaaccaggataattgcttctctctctct 27739269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #163
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 115 - 229
Target Start/End: Original strand, 33560716 - 33560833
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaa--tagaagcctctcgcctgcgtgcttg 211  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||  |||| ||  |||||||  |||||| |||| || |  |||||||    
T  33560716 ttgtattgtgaacatcactgattgtatatcaagtgttcaatctcaaacatttttcattgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcatttgtgcttg 33560815  T
Q  212 agcattagaagactcttg 229  Q
    |||| |||||| ||||||    
T  33560816 agcaatagaagtctcttg 33560833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #164
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 346 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 1744607 - 1744534
Alignment:
Q  346 cttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggataa-ttgcttgtgtctctct 417  Q
    |||||||||||||| |||||  |||| ||||| |||||||||||| |||| | |||| ||||||||||||||||    
T  1744607 cttggaagtgcaagagggacatgactgacttctggtttgtggaaggaacctgtataaattgcttgtgtctctct 1744534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #165
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 342 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 6407182 - 6407109
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggat-aattgcttgtgtct 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||| |||||||| |||| | || ||||||||||||||    
T  6407182 tctccttggaagtgcaagggggacatgactgactttcggtatgtggaaggaacctgtataaattgcttgtgtct 6407109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #166
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 205 - 246
Target Start/End: Original strand, 13697205 - 13697246
Alignment:
Q  205 gtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcat 246  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||    
T  13697205 gtgcttgagcattggaagactcttgcttgtgtgcttgagcat 13697246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #167
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 342 - 413
Target Start/End: Original strand, 18152402 - 18152475
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggat-aattgcttgtgtct 413  Q
    |||||||||||||||||| |||||  |||| ||||| |||||||||||| |||| | || ||||||||||||||    
T  18152402 tctccttggaagtgcaagagggacatgactgacttctggtttgtggaaggaacctgtataaattgcttgtgtct 18152475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #168
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 385
Target Start/End: Original strand, 18321886 - 18321927
Alignment:
Q  344 tccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtg 385  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  18321886 tccttggaagtgcaagggggacataactacttccggtttgtg 18321927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #169
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 342 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 22662511 - 22662458
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaacc 394  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| | |||| ||||||||||||| ||||    
T  22662511 tctccttggaagtgcaagggggacaggattgacttacggtttgtggaaggaacc 22662458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #170
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 22707973 - 22707848
Alignment:
Q  122 gtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgagcattaga 220  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||  ||||| | || ||  ||||||||||||| |||| ||    ||||||||||||  ||    
T  22707973 gtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctttataattatgtttgaatagaagtctcttgcagttgtgcttgagcatatga 22707874  T
Q  221 agactcttgctttagtgcttgagcat 246  Q
    || |||||| ||| || |||||||||    
T  22707873 agtctcttgattttgttcttgagcat 22707848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #171
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 342 - 394
Target Start/End: Original strand, 30422127 - 30422180
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaacc 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||| |||||||||| ||||    
T  30422127 tctccttggaagtgcaagggggacaagactgacttccgatttgtggaaggaacc 30422180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #172
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 346 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 39692956 - 39692907
Alignment:
Q  346 cttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaacc 394  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  39692956 cttggaagtgcaagggggacatgactgacttccggtttgtggaaggaacc 39692907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #173
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 119 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 12541289 - 12541241
Alignment:
Q  119 attgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatattt 167  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||    
T  12541289 attgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaaccaaacttattt 12541241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #174
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 120 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 18557676 - 18557545
Alignment:
Q  120 ttgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaag-tcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgagcatta 218  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| | |||| ||  |||||||| ||||| |||| ||  ||||||||||||| |||| || |  ||||||||||||      
T  18557676 ttgtgaacaccacttattgtatatcaactgttaaacctcaaacat-tttctttgtaattctgtttgaatagaagtctcttgcttttgtgcttgagcatat 18557578  T
Q  219 gaagactcttgctttagtgcttgagcattggaa 251  Q
    |||| ||||||| || |||||||| ||| ||||    
T  18557577 gaagtctcttgcgtttgtgcttgaacataggaa 18557545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #175
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 114 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 18679465 - 18679425
Alignment:
Q  114 attgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa 154  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||    
T  18679465 attgtattgtgaacaccactcattgtatatcaagtgttcaa 18679425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #176
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 114 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 18718654 - 18718614
Alignment:
Q  114 attgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa 154  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||    
T  18718654 attgtattgtgaacaccactcattgtatatcaagtgttcaa 18718614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 297; Significance: 1e-167; HSPs: 214)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 5 - 429
Target Start/End: Original strand, 20417286 - 20417707
Alignment:
Q  5 acaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaa-tttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagag 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||    
T  20417286 acaagttaaaaagcgccaaaactctgccaaatttgattctaaatagcactttgaatttctgcactgatttgatacatattagaaattctcaagtctagag 20417385  T
Q  104 tctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcct 202  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  20417386 tctttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacat-tttctgtgtaattttgtttgaatagaagtctctcgcct 20417484  T
Q  203 gcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  20417485 gcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcatgcgtgcttgagcatttgagaagtctcata-ctagagagta 20417583  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20417584 ttgagcatttgtaatctgtgtgatta---ttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaaccaggataat 20417680  T
Q  403 tgcttgtgtctctctgtcttttctctg 429  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||    
T  20417681 tgcttatgtctctctttcttttctctg 20417707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 14 - 432
Target Start/End: Original strand, 106511 - 106927
Alignment:
Q  14 aaagcgtcaaaactctgtcaa-tttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtctttatta 112  Q
    |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||     
T  106511 aaagcgccaaaactctgccaaatttgattctacaaagcactttgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcttaagtctagagtctttattg 106610  T
Q  113 cattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttg 211  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||  ||||| |||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  106611 cattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacac-tttctgtgtatttctgtttgattagaagcctctcgcctgcgtgcttg 106709  T
Q  212 agcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagagagtattgagcatt 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  106710 agcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagaatttgagaagtctcatactaagagagtattgagcatt 106809  T
Q  312 tgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgt 411  Q
    |||||||| || |||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  106810 tgtaatctttgagatta---ttagtgaaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggattgtggaaggaaccaggataattgcttgtgt 106906  T
Q  412 ctctctgtcttttctctgctc 432  Q
    || ||| ||||||||||||||    
T  106907 ctttctttcttttctctgctc 106927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 20625156 - 20625574
Alignment:
Q  13 aaaagcgtcaaaactctgtcaa-tttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtctttatt 111  Q
    ||||||| |||||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||    
T  20625156 aaaagcgccaaaactctgccaaatttgattctaaaaagcactttgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattctcaagtctatagtctttatt 20625255  T
Q  112 acattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgctt 210  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  20625256 gcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacat-tttctgtgtatttttgtttgaatagaagcctctcgcatgcatgctt 20625354  T
Q  211 gagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca-tttgagaagtctcataccaagagagtattgagca 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  20625355 gagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagcctcttgcctgcgtgcttgagcattttgagaagtctcatacttagagagtattgagca 20625454  T
Q  310 tttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgt 409  Q
    |||||||||| || |||||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20625455 tttgtaatctttgagatta---ttagtgaaaatctccttggaagtgcaagggggactagactacttccggtttgtggaaggaaccaggataattgcttgt 20625551  T
Q  410 gtctctctgtcttttctctgctc 432  Q
    |||||||| ||||||||||||||    
T  20625552 gtctctctttcttttctctgctc 20625574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 3 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 17446576 - 17446169
Alignment:
Q  3 atacaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcac-tagtctag 101  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  17446576 atacaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttctgcactgatttgatatatcttagaaattcacaaagtctag 17446477  T
Q  102 agtctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgta-ttttcgtttgaatagaagcctctcgc 200  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||  ||||| |||| ||    
T  17446476 agtctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttccctgtattttttgtttgatcagaagactcttgc 17446377  T
Q  201 ctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca-tttgagaagtctcataccaagaga 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||    
T  17446376 ctgcgtgcttgagcattagaagactcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcctgtgtgcttgagcattttgagaagtctcatacttagaga 17446278  T
Q  300 gtattgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggat 399  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  17446277 gtattgagcatttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgttttgtggaaggaaccaggat 17446183  T
Q  400 aattgcttgtgtct 413  Q
    || |||||||||||    
T  17446182 aactgcttgtgtct 17446169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 3 - 431
Target Start/End: Original strand, 37407028 - 37407453
Alignment:
Q  3 atacaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctaga 102  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37407028 atacaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcacaagtctaga 37407127  T
Q  103 gtctttattacattgta-ttgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgc 200  Q
    ||||||||| |||| || |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  37407128 gtctttattgcattatatttgtgaacaccactgattatatatcaagtgttcaaggtcaaacat-tttctctgtatttttgtttgaatagaagcctcttgc 37407226  T
Q  201 ctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca-tttgagaagtctcataccaagaga 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||    
T  37407227 ctgcgtgcttgagcattagaagactcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcctgcgtgcttgagcattttgagaagtctcatacttagaga 37407325  T
Q  300 gtattgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggat 399  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| |||||    
T  37407326 gtattgaacatttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccaatttgtggaaggaacgaggat 37407420  T
Q  400 aattgcttgtgtctctc-tgtcttttctctgct 431  Q
    || |||||||||||| | | |||||||||||||    
T  37407421 aactgcttgtgtctcgcttttcttttctctgct 37407453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 21 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 32753807 - 32753402
Alignment:
Q  21 caaaactctgtcaa-tttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtctttattacattgta 119  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||    
T  32753807 caaaactctgccaaatttgattctataaaacactttgaatttctgcactgatttgatatatcttagaaattcttaagtctagagtctttattgcattgta 32753708  T
Q  120 ttgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaag-tcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgagcatta 218  Q
    |||||||||  |||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||    
T  32753707 ttgtgaacatcactgattgtatatcaagtgttcaaaatcaaacat-tttctgtgtaattttgtttgaatagaagtctcttgcctacgtgcttgagcatta 32753609  T
Q  219 gaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagagagtattgagcatttgtaatc 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||    
T  32753608 gaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcata-ctagagagtattgagcatctgtaatc 32753510  T
Q  319 tgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtctctctg 418  Q
    ||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||      
T  32753509 tgtgtg---atttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccagtttgtggaaggaatcaggataattgcttgtgtctctcct 32753413  T
Q  419 tcttttctctg 429  Q
    |||||||||||    
T  32753412 tcttttctctg 32753402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 5 - 413
Target Start/End: Original strand, 8522224 - 8522629
Alignment:
Q  5 acaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagt 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  8522224 acaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaaaagtctagagt 8522323  T
Q  105 ctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgc 204  Q
    |||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| || |||  |||||||| ||||||  |||||||||| ||||||    
T  8522324 ctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttaattcattgtatttttgtttgatcagaagcctcttgcctgc 8522423  T
Q  205 gtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca---tttgagaagtctcataccaagagagt 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||   |||||||||||||||||  |||||||    
T  8522424 gtgcttgagcattagaagactcttgc-ttaatgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattttttgagaagtctcatacttagagagt 8522522  T
Q  302 attgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataa 401  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  8522523 attgagcatttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaaccaggataa 8522617  T
Q  402 ttgcttgtgtct 413  Q
     |||||||||||    
T  8522618 ctgcttgtgtct 8522629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 5 - 413
Target Start/End: Original strand, 36229122 - 36229526
Alignment:
Q  5 acaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagt 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  36229122 acaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttggaaattcaaaagtctagagt 36229221  T
Q  105 ctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgc 204  Q
     ||||    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||  |||||||||| ||||||    
T  36229222 ttttaacgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttatttcattgtatttttgtttgatcagaagcctcttgcctgc 36229321  T
Q  205 gtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||    
T  36229322 gtgcttgagcattagaagactcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcatgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcatacttagagagta 36229420  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||     
T  36229421 ttgagcatttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaaccaggataac 36229515  T
Q  403 tgcttgtgtct 413  Q
    |||||||||||    
T  36229516 tgcttgtgtct 36229526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 5 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 1121779 - 1121354
Alignment:
Q  5 acaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagt 104  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  1121779 acaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaagttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaaaagtctagagt 1121680  T
Q  105 ctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgc 204  Q
    ||| |||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| || |||  |||||||| ||||||  |||||||||| ||||||    
T  1121679 cttaattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttaattcattgtatttttgtttgatcagaagcctcttgcctgc 1121580  T
Q  205 gtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||    
T  1121579 gtgcttgagcattagaagactcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcatacttagagagta 1121481  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||     
T  1121480 ttgagtatttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaaccaggataac 1121386  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  1121385 tgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 1121354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 5 - 413
Target Start/End: Original strand, 23406829 - 23407233
Alignment:
Q  5 acaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagt 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  23406829 acaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgaactgatttgatacatcttagaaattcaaaagtctagagt 23406928  T
Q  105 ctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgc 204  Q
    ||||||   ||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||  | ||| |||| ||||||    
T  23406929 ctttatcgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttatttcattgtatttttgtttgatcaaaagactcttgcctgc 23407028  T
Q  205 gtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||    
T  23407029 gtgcttgagcattagaagactcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcatacttagagagta 23407127  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||     
T  23407128 ttgagcatttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaaccaggataac 23407222  T
Q  403 tgcttgtgtct 413  Q
    |||||||||||    
T  23407223 tgcttgtgtct 23407233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 3 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 17457192 - 17456785
Alignment:
Q  3 atacaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcac-tagtctag 101  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  17457192 atacaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttctgcactgatttgatatatcttagaaattcacaaagtctag 17457093  T
Q  102 agtctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgta-ttttcgtttgaatagaagcctctcgc 200  Q
    ||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||| ||||||  ||||| |||| ||    
T  17457092 agtatttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacatattcccctgtattttttgtttgatcagaagactcttgc 17456993  T
Q  201 ctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca-tttgagaagtctcataccaagaga 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||    
T  17456992 ctgcgtgcttgagcattagaagactcttac-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcctgtgtgcttgagcattttgagaagtctcatacttagaga 17456894  T
Q  300 gtattgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggat 399  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||  |     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  17456893 gtattgagcatttgtaatctttgtgattatcgt-----gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgttttatggaaggaaccaggat 17456799  T
Q  400 aattgcttgtgtct 413  Q
    || |||||||||||    
T  17456798 aactgcttgtgtct 17456785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 5 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 1109021 - 1108596
Alignment:
Q  5 acaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagt 104  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  1109021 acaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaagttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaaaagtctagagt 1108922  T
Q  105 ctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgc 204  Q
    ||| |||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| || |||  |||||||| ||||||  |||||||||| ||||||    
T  1108921 cttaattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttaattcattgtatttttgtttgatcagaagcctcttgcctgc 1108822  T
Q  205 gtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||    
T  1108821 gtgcttgagcattagaagacttttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcatacttagagagta 1108723  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||     
T  1108722 ttgagtatttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaaccaggataac 1108628  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  1108627 tgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 1108596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 5 - 413
Target Start/End: Original strand, 20552198 - 20552603
Alignment:
Q  5 acaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagt 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  20552198 acaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaaaagtctagagt 20552297  T
Q  105 ctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgc 204  Q
    |||||    ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||  |||||||||| ||||||    
T  20552298 ctttaacgtattttattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttatttcattgtatttttgtttgatcagaagcctcttgcctgc 20552397  T
Q  205 gtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||    
T  20552398 gtgcttgagcattagaagactcttgc-ttagtacttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcatacttagagagta 20552496  T
Q  303 ttgagca-tttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataa 401  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  20552497 ttgagcattttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaaccaggataa 20552591  T
Q  402 ttgcttgtgtct 413  Q
     |||||||||||    
T  20552592 ctgcttgtgtct 20552603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 3 - 413
Target Start/End: Original strand, 34063002 - 34063408
Alignment:
Q  3 atacaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctaga 102  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  34063002 atacaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctaaaaagcacactgaatttctgcacttatttgatacatcttagaaattcaaaagtctaga 34063101  T
Q  103 gtctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgta-ttttcgtttgaatagaagcctctcgcc 201  Q
    ||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||| |||| ||||||  ||||| |||| |||    
T  34063102 gtctttatcgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttatttcattgtattttttgtttgatcagaagactcttgcc 34063201  T
Q  202 tgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca-tttgagaagtctcataccaagagag 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||    
T  34063202 tgcgtgcttgagcattagaagactcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcctgtgtgcttgagcattttgagaagtctcatacttagagag 34063300  T
Q  301 tattgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggata 400  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  34063301 tattgagcatttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgttttgtggaaggaaccaggata 34063395  T
Q  401 attgcttgtgtct 413  Q
    | || ||||||||    
T  34063396 actgtttgtgtct 34063408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 5 - 410
Target Start/End: Original strand, 20562708 - 20563110
Alignment:
Q  5 acaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagt 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  20562708 acaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaaaagtctagagt 20562807  T
Q  105 ctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgc 204  Q
    |||||    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||  |||||||||| ||||||    
T  20562808 ctttaacgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttatttcattgtatttttgtttgatcagaagcctcttgcctgc 20562907  T
Q  205 gtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||    
T  20562908 gtgcttgagcattagaagactcttgc-ttagtacttgagcattggaagactcttgcttgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcatacttagagagta 20563006  T
Q  303 ttgagca-tttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataa 401  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  20563007 ttgagcattttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaaccaggataa 20563101  T
Q  402 ttgcttgtg 410  Q
     ||||||||    
T  20563102 ctgcttgtg 20563110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 5 - 413
Target Start/End: Original strand, 42395362 - 42395771
Alignment:
Q  5 acaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagt 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  42395362 acaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaaaagtctagagt 42395461  T
Q  105 ctt-----tattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcg 199  Q
    |||     ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| || |||  |||||||| ||||||  |||||||||| |    
T  42395462 ctttattgtattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttaattcattgtatttttgtttgatcagaagcctcttg 42395561  T
Q  200 cctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaaga 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||||||||||||||||  |||    
T  42395562 cctgcgtgcttgagcattagaagactcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatctttgagaagtctcatacttaga 42395660  T
Q  298 gagtattgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccagg 397  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  42395661 gagtattgagcatttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatcttcttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaaccagg 42395755  T
Q  398 ataattgcttgtgtct 413  Q
    |||| |||||||||||    
T  42395756 ataactgcttgtgtct 42395771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 5 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 43621771 - 43621366
Alignment:
Q  5 acaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagt 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  43621771 acaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatatatcttagaaattcaaaagtctagagt 43621672  T
Q  105 ctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgc 204  Q
    |||||    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||  |||||||||| ||||||    
T  43621671 ctttaacgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttatttcattgtatttttgtttgatcagaagcctcttgcctgc 43621572  T
Q  205 gtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||    
T  43621571 gtgcttgagcattagaagactcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcatacttagagagta 43621473  T
Q  303 ttgagca-tttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataa 401  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  43621472 ttgagcattttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatctgtggaaggaaccaggataa 43621378  T
Q  402 ttgcttgtgtct 413  Q
     |||||||||||    
T  43621377 ctgcttgtgtct 43621366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 5 - 413
Target Start/End: Original strand, 20798079 - 20798483
Alignment:
Q  5 acaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagt 104  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  20798079 acaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaaaagtctagagt 20798178  T
Q  105 ctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgc 204  Q
    |||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| |||||||| ||||||  |||||||||| |||||     
T  20798179 ctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttaattctttgtatttttgtttgatcagaagcctcttgcctgt 20798278  T
Q  205 gtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||  ||||||||    
T  20798279 gtgcttgagcagtagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatacttagagagta 20798377  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||     
T  20798378 ttgagcatttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatatccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaaccaggataac 20798472  T
Q  403 tgcttgtgtct 413  Q
    |||||||||||    
T  20798473 tgcttgtgtct 20798483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 3 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 21703008 - 21702596
Alignment:
Q  3 atacaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctaga 102  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  21703008 atacaagttaaaaagtgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaaaagtctaga 21702909  T
Q  103 gtctt-----tattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctct 197  Q
    |||||     ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||  ||||| ||||    
T  21702908 gtctttattgtattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacatatttcattgtatttttgtttgatcagaagactct 21702809  T
Q  198 cgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaa 295  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||| ||||||  |||||||||||||||||  |    
T  21702808 tgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcatgagcatttttgagaagtctcatactta 21702710  T
Q  296 gagagtattgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaacca 395  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  21702709 aagagtattgagcatttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaacca 21702615  T
Q  396 ggataattgcttgtgtctc 414  Q
    |||||| ||||||||||||    
T  21702614 ggataactgcttgtgtctc 21702596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 5 - 413
Target Start/End: Original strand, 36084844 - 36085248
Alignment:
Q  5 acaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagt 104  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  36084844 acaagttaaaaatcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaaaagtctagagt 36084943  T
Q  105 ctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgc 204  Q
    |||||    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||  ||||| |||| ||||||    
T  36084944 ctttaacgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttatttcattgtatttttgtttgatcagaagtctcttgcctgc 36085043  T
Q  205 gtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||||||||| ||||||  ||||||||    
T  36085044 gtgcttgagcattagaagactcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtttcatacttagagagta 36085142  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||||||||||||| || |||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||     
T  36085143 ttgagcatttgtaatctttgcgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaaccaggataac 36085237  T
Q  403 tgcttgtgtct 413  Q
    |||||||||||    
T  36085238 tgcttgtgtct 36085248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 5 - 431
Target Start/End: Original strand, 19464354 - 19464779
Alignment:
Q  5 acaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagt 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  19464354 acaagttaaaaagcgccaaaactctatcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaaaagtctagagt 19464453  T
Q  105 ctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgc 204  Q
    ||||||   |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||  ||||| |||| ||||||    
T  19464454 ctttatcgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttatttcattgtatttttgtttgatcagaagactcttgcctgc 19464553  T
Q  205 gtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||||| ||||||||||  ||||||||    
T  19464554 gtgcttgagcattagaagactcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagtagtctcatacttagagagta 19464652  T
Q  303 ttgagca-tttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataa 401  Q
    ||||||| ||||||||||  |||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  19464653 ttgagcattttgtaatcttcgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaaccaggataa 19464747  T
Q  402 ttgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgct 431  Q
     ||||||||||  | ||| |||||||||||||    
T  19464748 ctgcttgtgtctttgtctttcttttctctgct 19464779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 3 - 411
Target Start/End: Original strand, 34052341 - 34052745
Alignment:
Q  3 atacaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctaga 102  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  34052341 atacaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctaaaaagcacactgaatttctgcacttatttgatacatcttagaaattcaaaagtctaga 34052440  T
Q  103 gtctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgta-ttttcgtttgaatagaagcctctcgcc 201  Q
    ||||||||   |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||| |||| ||||||  ||||| |||| |||    
T  34052441 gtctttatcgtattgtattgtgaacaccactaattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttatttcattgtattttttgtttgatcagaagactcttgcc 34052540  T
Q  202 tgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca-tttgagaagtctcataccaagagag 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||    
T  34052541 tgcgtgcttgagcattagaagactcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcctgtgtgcttgagcattttgagaagtctcatacttagagag 34052639  T
Q  301 tattgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggata 400  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||    
T  34052640 tattgagcatttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgttttgtggaaggaatcaggata 34052734  T
Q  401 attgcttgtgt 411  Q
    | || ||||||    
T  34052735 actgtttgtgt 34052745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 3 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 5290454 - 5290027
Alignment:
Q  3 atacaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctaga 102  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  5290454 atacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaaattgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctaga 5290356  T
Q  103 gtctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcct 202  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||  ||||| |||| ||||    
T  5290355 gtctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgatcagaagtctcttgcct 5290256  T
Q  203 gcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca---tttgagaagtctcataccaagaga 299  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||   |||| ||||||||||||  ||| |    
T  5290255 gcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattttttgtgaagtctcatacttagaaa 5290157  T
Q  300 gtattgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggat 399  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  5290156 gtattgagcatttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggat 5290062  T
Q  400 aattgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    || ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  5290061 aactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 5290027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 3 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 5301025 - 5300598
Alignment:
Q  3 atacaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctaga 102  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  5301025 atacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaaattgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctaga 5300927  T
Q  103 gtctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcct 202  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||  ||||| |||| ||||    
T  5300926 gtctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgatcagaagtctcttgcct 5300827  T
Q  203 gcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca---tttgagaagtctcataccaagaga 299  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||   |||| ||||||||||||  ||| |    
T  5300826 gcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattttttgtgaagtctcatacttagaaa 5300728  T
Q  300 gtattgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggat 399  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  5300727 gtattgagcatttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggat 5300633  T
Q  400 aattgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    || ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  5300632 aactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 5300598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 5 - 431
Target Start/End: Original strand, 19478384 - 19478809
Alignment:
Q  5 acaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagt 104  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  19478384 acaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctataaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaaaagtctagagt 19478483  T
Q  105 ctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgc 204  Q
    ||||||   |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||  ||||| |||| ||||||    
T  19478484 ctttatcgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttatttcattgtatttttgtttgatcagaagactcttgcctgc 19478583  T
Q  205 gtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||||| ||||||||||  ||||||||    
T  19478584 gtgcttgagcattagaagactcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagtagtctcatacttagagagta 19478682  T
Q  303 ttgagca-tttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataa 401  Q
    |||| || ||||||||||  |||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  19478683 ttgaacattttgtaatcttcgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaaccaggataa 19478777  T
Q  402 ttgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgct 431  Q
     ||||||||||  | ||| |||||||||||||    
T  19478778 ctgcttgtgtctttgtctttcttttctctgct 19478809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 5 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 27603294 - 27602870
Alignment:
Q  5 acaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagt 104  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  27603294 acaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagt 27603196  T
Q  105 ctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgc 204  Q
    |||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||  ||||| |||| ||||||    
T  27603195 ctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgatcagaagtctcttgcctgc 27603096  T
Q  205 gtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||  ||| ||||    
T  27603095 gtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatacttagaaagta 27602997  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  27602996 ttgagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 27602902  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  27602901 tgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 27602870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 5 - 432
Target Start/End: Original strand, 34783239 - 34783663
Alignment:
Q  5 acaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagt 104  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  34783239 acaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaagttgattctacaaagcacattgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagt 34783337  T
Q  105 ctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgc 204  Q
    |||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||  ||||| |||| ||||||    
T  34783338 ctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgatcagaagtctcttgcctgc 34783437  T
Q  205 gtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||  ||| ||||    
T  34783438 gtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatacttagaaagta 34783536  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  34783537 ttgagcatttgtaatttttgtgatta----tagt-gaaatctccttggtagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 34783631  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  34783632 tgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 34783663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 3 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 24926019 - 24925610
Alignment:
Q  3 atacaagttaaaaa-gcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctag 101  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  24926019 atacaagttaaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaaaagtctag 24925920  T
Q  102 agtctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcc 201  Q
    ||||| ||    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||  |||||||||| |||    
T  24925919 agtctctaacgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttatttcattgtatttttgtttgatcagaagcctcttgcc 24925820  T
Q  202 tgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca---tttgagaagtctcataccaagag 298  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||   |||||||| ||||||||  ||||    
T  24925819 tgtgtgcttgagcattagaagactcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatattttgagaaatctcatacttagag 24925721  T
Q  299 agtattgagca-tttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccagg 397  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  24925720 agtattgagcattttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaaccagg 24925626  T
Q  398 ataattgcttgtgtct 413  Q
    |||| |||||||||||    
T  24925625 ataactgcttgtgtct 24925610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 3 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 24983300 - 24982891
Alignment:
Q  3 atacaagttaaaaa-gcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctag 101  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  24983300 atacaagttaaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaaaagtctag 24983201  T
Q  102 agtctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcc 201  Q
    ||||| ||    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||  |||||||||| |||    
T  24983200 agtctctaacgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttatttcattgtatttttgtttgatcagaagcctcttgcc 24983101  T
Q  202 tgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca---tttgagaagtctcataccaagag 298  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||   ||||||||||||||| |  ||||    
T  24983100 tgtgtgcttgagcattagaagactcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatattttgagaagtctcatgcttagag 24983002  T
Q  299 agtattgagca-tttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccagg 397  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  24983001 agtattgagcattttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaaccagg 24982907  T
Q  398 ataattgcttgtgtct 413  Q
    |||| |||||||||||    
T  24982906 ataactgcttgtgtct 24982891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 5 - 432
Target Start/End: Original strand, 34772294 - 34772718
Alignment:
Q  5 acaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagt 104  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  34772294 acaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaagttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagt 34772392  T
Q  105 ctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgc 204  Q
    |||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||  ||||| |||| ||||||    
T  34772393 ctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgatcagaagtctcttgcctgc 34772492  T
Q  205 gtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||  ||| ||||    
T  34772493 gtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatacttagaaagta 34772591  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  34772592 ttgagcatttgtaatttttgtgatta----tagt-gaaatctccttggtagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 34772686  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  34772687 tgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 34772718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 43043552 - 43043123
Alignment:
Q  1 acatacaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtcta 100  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  43043552 acatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaaaagtcta 43043453  T
Q  101 gagtctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgc 200  Q
    |||||||||    ||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| || |||  |||||||| ||||||  ||||| |||| ||    
T  43043452 gagtctttaacgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttaattccttgtatttttgtttgatcagaagactcttgc 43043353  T
Q  201 ctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagag 298  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||  ||||    
T  43043352 ctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttattgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatacttagag 43043254  T
Q  299 agtattgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccagga 398  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||    
T  43043253 agtattgagcatttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccagga 43043159  T
Q  399 taattgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||| ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  43043158 taactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 43043123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Original strand, 40390743 - 40391165
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  40390743 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 40390841  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  40390842 ttactgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaactcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 40390941  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagtatt 304  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||  ||| ||||||    
T  40390942 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatacttagatagtatt 40391040  T
Q  305 gagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    ||||||||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||    
T  40391041 gagcatttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgtaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactg 40391135  T
Q  405 cttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  40391136 cttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 40391165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Original strand, 40401405 - 40401827
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  40401405 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 40401503  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  40401504 ttactgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaactcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 40401603  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagtatt 304  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||  ||| ||||||    
T  40401604 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatacttagatagtatt 40401702  T
Q  305 gagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    ||||||||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||    
T  40401703 gagcatttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttgaaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactg 40401797  T
Q  405 cttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  40401798 cttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 40401827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 5 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 27622643 - 27622219
Alignment:
Q  5 acaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagt 104  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  27622643 acaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagt 27622545  T
Q  105 ctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgc 204  Q
    |||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||  ||||| |||| ||||||    
T  27622544 ctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatataaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgatcagaagtctcttgcctgc 27622445  T
Q  205 gtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||  ||||||||||||  ||| ||||    
T  27622444 gtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttatgaagtctcatacttagaaagta 27622346  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  27622345 ttgagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 27622251  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  27622250 tgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 27622219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 16003765 - 16003343
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  16003765 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 16003667  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  16003666 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 16003567  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagtatt 304  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||  ||| ||||||    
T  16003566 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatacttagaaagtatt 16003468  T
Q  305 gagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||    
T  16003467 gagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactg 16003373  T
Q  405 cttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  16003372 cttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 16003343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Original strand, 22146909 - 22147330
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  22146909 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 22147007  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  22147008 tttctgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 22147107  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagtatt 304  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||  ||| ||||||    
T  22147108 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatacttagaaagtatt 22147206  T
Q  305 gagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||    
T  22147207 gagcagttgtaatct-tgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactg 22147300  T
Q  405 cttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  22147301 cttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 22147330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Original strand, 23296663 - 23297087
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  23296663 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 23296761  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||    
T  23296762 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctctcgcctgcgt 23296861  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||  ||| ||||    
T  23296862 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaagtctcatacttagaaagta 23296960  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  23296961 ttgagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 23297055  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  23297056 tgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 23297087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Original strand, 23307231 - 23307655
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  23307231 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 23307329  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||    
T  23307330 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctctcgcctgcgt 23307429  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||  ||| ||||    
T  23307430 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaagtctcatacttagaaagta 23307528  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  23307529 ttgagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 23307623  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  23307624 tgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 23307655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Original strand, 23707828 - 23708252
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  23707828 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 23707926  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||    
T  23707927 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctctcgcctgcgt 23708026  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||  ||| ||||    
T  23708027 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaagtctcatacttagaaagta 23708125  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  23708126 ttgagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 23708220  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  23708221 tgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 23708252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Original strand, 39352874 - 39353296
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||    
T  39352874 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatatatcttagaaattcaa-agtctagagtct 39352972  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  39352973 ttactgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaactcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 39353072  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagtatt 304  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||  ||| ||||||    
T  39353073 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatacttagaaagtatt 39353171  T
Q  305 gagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||    
T  39353172 gagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactg 39353266  T
Q  405 cttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  39353267 cttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 39353296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Original strand, 39364867 - 39365289
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||    
T  39364867 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatatatcttagaaattcaa-agtctagagtct 39364965  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  39364966 ttactgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaactcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 39365065  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagtatt 304  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||  ||| ||||||    
T  39365066 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatacttagaaagtatt 39365164  T
Q  305 gagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||    
T  39365165 gagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactg 39365259  T
Q  405 cttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  39365260 cttgtgtctttatctttcttttctctgctc 39365289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 40513863 - 40513439
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  40513863 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 40513765  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||    
T  40513764 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctctcgcctgcgt 40513665  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||  ||| ||||    
T  40513664 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaagtctcatacttagaaagta 40513566  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  40513565 ttgagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 40513471  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  40513470 tgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 40513439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Original strand, 42043170 - 42043594
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  42043170 aagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 42043268  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| | ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||    
T  42043269 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcgattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctctcgcctgcgt 42043368  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||  ||| ||||    
T  42043369 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaagtctcatacttagaaagta 42043467  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  42043468 ttgagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 42043562  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  42043563 tgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 42043594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Original strand, 42053745 - 42054169
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  42053745 aagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 42053843  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| | ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||    
T  42053844 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcgattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctctcgcctgcgt 42053943  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||  ||| ||||    
T  42053944 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaagtctcatacttagaaagta 42054042  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  42054043 ttgagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 42054137  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  42054138 tgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 42054169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 3 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 30069783 - 30069355
Alignment:
Q  3 atacaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatctta-gaaattcactagtctag 101  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||    
T  30069783 atacaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaaattgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttaagaaattcaa-agtctag 30069685  T
Q  102 agtctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcc 201  Q
    ||||||||||  ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||  ||||| |||| |||    
T  30069684 agtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgatcagaagtctcttgcc 30069585  T
Q  202 tgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca---tttgagaagtctcataccaagag 298  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||| ||||||   |||| ||||||||||||  |||     
T  30069584 tgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcgtgagcattttttgtgaagtctcatacttagaa 30069486  T
Q  299 agtattgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccagga 398  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||    
T  30069485 agtattgagcatttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccagga 30069391  T
Q  399 taattgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||| ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  30069390 taactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 30069355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 12 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 30227365 - 30226946
Alignment:
Q  12 aaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtctttatt 111  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  |    
T  30227365 aaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtcttttct 30227267  T
Q  112 acattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttg 211  Q
      |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  30227266 gtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctctcgcctgcgtgcttg 30227167  T
Q  212 agcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagtattgag 307  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||  ||| |||||||||    
T  30227166 agcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaagtctcatacttagaaagtattgag 30227068  T
Q  308 catttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    || ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  30227067 cagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgctt 30226973  T
Q  408 gtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    |||||  | ||| ||||||||||||||    
T  30226972 gtgtctttgtctttcttttctctgctc 30226946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 12 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 30237892 - 30237473
Alignment:
Q  12 aaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtctttatt 111  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  |    
T  30237892 aaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtcttttct 30237794  T
Q  112 acattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttg 211  Q
      |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  30237793 gtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctctcgcctgcgtgcttg 30237694  T
Q  212 agcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagtattgag 307  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||  ||| |||||||||    
T  30237693 agcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaagtctcatacttagaaagtattgag 30237595  T
Q  308 catttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    || ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  30237594 cagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgctt 30237500  T
Q  408 gtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    |||||  | ||| ||||||||||||||    
T  30237499 gtgtctttgtctttcttttctctgctc 30237473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 7 - 413
Target Start/End: Original strand, 22157492 - 22157892
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  22157492 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 22157590  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  22157591 tttctgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 22157690  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagtatt 304  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||  ||| ||||||    
T  22157691 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatacttagaaagtatt 22157789  T
Q  305 gagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||    
T  22157790 gagcagttgtaatct-tgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactg 22157883  T
Q  405 cttgtgtct 413  Q
    |||||||||    
T  22157884 cttgtgtct 22157892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Original strand, 6131177 - 6131599
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  6131177 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 6131275  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  6131276 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 6131375  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagtatt 304  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| |||||||| |||  ||| ||||||    
T  6131376 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcttacttagaaagtatt 6131474  T
Q  305 gagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||    
T  6131475 gagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactg 6131569  T
Q  405 cttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  6131570 cttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 6131599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Original strand, 9346928 - 9347350
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  9346928 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 9347026  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||| | |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  9347027 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtattgttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 9347126  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagtatt 304  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||  ||| ||||||    
T  9347127 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatacttagaaagtatt 9347225  T
Q  305 gagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||    
T  9347226 gagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactg 9347320  T
Q  405 cttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  9347321 cttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 9347350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 15993203 - 15992781
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  15993203 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 15993105  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  15993104 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 15993005  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagtatt 304  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||  ||| ||||||    
T  15993004 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatacttagaaagtatt 15992906  T
Q  305 gagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||| ||    
T  15992905 gagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaatgaaccaggataactg 15992811  T
Q  405 cttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  15992810 cttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 15992781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Original strand, 23362497 - 23362919
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  23362497 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 23362595  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | |||||| |||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  23362596 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctatatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 23362695  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagtatt 304  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||  ||| ||||||    
T  23362696 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatacttagaaagtatt 23362794  T
Q  305 gagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||    
T  23362795 gagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactg 23362889  T
Q  405 cttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  23362890 cttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 23362919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Original strand, 31833869 - 31834295
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  31833869 aagttcaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 31833967  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  31833968 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 31834067  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca------tttgagaagtctcataccaagagag 300  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||      |||| ||||||||||||  ||| ||    
T  31834068 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttttttgtgaagtctcatacttagaaag 31834166  T
Q  301 tattgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggata 400  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  31834167 tattgagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggata 31834261  T
Q  401 attgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    | ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  31834262 actgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 31834295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 33951674 - 33951250
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  33951674 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgatactacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 33951576  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||    
T  33951575 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctctcgcctgcgt 33951476  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||  ||| ||||    
T  33951475 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcttgtgtgcttgagcatagttttgtgaagtctcatacttagaaagta 33951377  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  33951376 ttgagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 33951282  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  33951281 tgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 33951250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 7 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 39490824 - 39490423
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  39490824 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 39490726  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||    
T  39490725 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctctcgcctgcgt 39490626  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||  ||| ||||    
T  39490625 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaagtctcatacttagaaagta 39490527  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  39490526 ttgagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 39490432  T
Q  403 tgcttgtgt 411  Q
    |||||||||    
T  39490431 tgcttgtgt 39490423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 7 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 39502014 - 39501613
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  39502014 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 39501916  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||    
T  39501915 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctctcgcctgcgt 39501816  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||  ||| ||||    
T  39501815 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaagtctcatacttagaaagta 39501717  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  39501716 ttgagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 39501622  T
Q  403 tgcttgtgt 411  Q
    |||||||||    
T  39501621 tgcttgtgt 39501613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 3 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 21705855 - 21705436
Alignment:
Q  3 atacaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctaga 102  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  21705855 atacaagttaaaaagtgccaaaactctgtcaatttgattatacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaaaagtctaga 21705756  T
Q  103 gtctt-----tattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctct 197  Q
    |||||     ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||  ||||| ||||    
T  21705755 gtctttattgtattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacatatttcattgtatttttgtttgatcagaagactct 21705656  T
Q  198 cgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaa 295  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||| ||||||  |||||||||||||||||  |    
T  21705655 tgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcatgagcatttttgagaagtctcatactta 21705557  T
Q  296 gagagt-------attgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaa 388  Q
     |||||       |||||||||||||||||| ||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21705556 aagagtattgagcattgagcatttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaa 21705462  T
Q  389 gaaaccaggataattgcttgtgtctc 414  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||    
T  21705461 ggaaccaggataactgcttgtgtctc 21705436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Original strand, 9336341 - 9336763
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  9336341 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattca-aagtctagagtct 9336439  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||| | |||||| ||||||  ||| ||||||||    
T  9336440 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtattgttgtttgattagaagtatcttgcctgcgt 9336539  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagtatt 304  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||  ||| ||||||    
T  9336540 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatacttagaaagtatt 9336638  T
Q  305 gagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||    
T  9336639 gagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactg 9336733  T
Q  405 cttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  9336734 cttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 9336763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Original strand, 23697170 - 23697594
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  23697170 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 23697268  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  23697269 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctctagcctgcgt 23697368  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||| ||||||    |||| ||||||||||||  ||| ||||    
T  23697369 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcgtgagcatagttttgtgaagtctcatacttagaaagta 23697467  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  23697468 ttgagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 23697562  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  23697563 tgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 23697594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Original strand, 27204178 - 27204600
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  27204178 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 27204276  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| || |||||    
T  27204277 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcatgcgt 27204376  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagtatt 304  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| |||| || || ||| |||||||  |||| ||||||||||||  ||| ||||||    
T  27204377 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgtttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgtttgagcatttttgtgaagtctcatacttagaaagtatt 27204475  T
Q  305 gagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||    
T  27204476 gagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactg 27204570  T
Q  405 cttgtgtctc--tctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  27204571 cttgtgtctctgtctttcttttctctgctc 27204600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Original strand, 31844347 - 31844773
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  31844347 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 31844445  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  31844446 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 31844545  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca------tttgagaagtctcataccaagagag 300  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||      |||| ||||||||||||  ||| ||    
T  31844546 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttttttgtgaagtctcatacttagaaag 31844644  T
Q  301 tattgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggata 400  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  31844645 tattgagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggata 31844739  T
Q  401 attgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    | ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  31844740 actgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 31844773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 7 - 431
Target Start/End: Original strand, 22559823 - 22560244
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  22559823 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaaattgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 22559921  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  | |||| |||||||| ||||||  ||||| |||| ||||| ||    
T  22559922 ttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctttgtatttttgtttgatcagaagtctcttgcctgtgt 22560021  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagtatt 304  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||  ||| ||||||    
T  22560022 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatacttagaaagtatt 22560120  T
Q  305 gagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    ||||||||||||||| | ||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||    
T  22560121 gagcatttgtaatctttatgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactgaactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactg 22560215  T
Q  405 cttgtgtc--tctctgtcttttctctgct 431  Q
    ||||||||  | ||| |||||||||||||    
T  22560216 cttgtgtctttgtctttcttttctctgct 22560244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 7 - 411
Target Start/End: Original strand, 22676502 - 22676904
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  22676502 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattca-aagtctagagtct 22676600  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcg 205  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  22676601 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaatttcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctctcgcctgcg 22676700  T
Q  206 tgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagt 301  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||  ||| |||    
T  22676701 tgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaagtctcatacttagaaagt 22676799  T
Q  302 attgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataa 401  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  22676800 attgagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataa 22676894  T
Q  402 ttgcttgtgt 411  Q
     |||||||||    
T  22676895 ctgcttgtgt 22676904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 7 - 411
Target Start/End: Original strand, 22686393 - 22686795
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  22686393 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattca-aagtctagagtct 22686491  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcg 205  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  22686492 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaatttcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctctcgcctgcg 22686591  T
Q  206 tgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagt 301  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||  ||| |||    
T  22686592 tgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaagtctcatacttagaaagt 22686690  T
Q  302 attgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataa 401  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  22686691 attgagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataa 22686785  T
Q  402 ttgcttgtgt 411  Q
     |||||||||    
T  22686786 ctgcttgtgt 22686795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 3 - 432
Target Start/End: Original strand, 10754874 - 10755300
Alignment:
Q  3 atacaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctaga 102  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  10754874 atacaagttaaaaagctccaaaactctgtcaaattgattctacaaagcacactgaatttatgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctaga 10754972  T
Q  103 gtctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcct 202  Q
    |||||||||  ||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||    
T  10754973 gtctttattgtattgtattaagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcct 10755072  T
Q  203 gcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagag 300  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| || || |||| ||||||  |||| ||||||||||||   || ||    
T  10755073 gcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagttcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcgtgagcagttttgtgaagtctcatactttgatag 10755171  T
Q  301 tattgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggata 400  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||    
T  10755172 tattgagcatttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtgaaaggaaccaggata 10755266  T
Q  401 attgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    | ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  10755267 actgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 10755300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 14557891 - 14557467
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  14557891 aagtttaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 14557793  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  14557792 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 14557693  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||   || ||||    
T  14557692 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaagtctcatactttgaaagta 14557594  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||     ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  14557593 ttgagcagttgtaatctttgtgatta----aagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 14557499  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  14557498 tgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 14557467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 14568528 - 14568104
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  14568528 aagtttaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 14568430  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  14568429 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 14568330  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||   || ||||    
T  14568329 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaagtctcatactttgaaagta 14568231  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||     ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  14568230 ttgagcagttgtaatctttgtgatta----aagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 14568136  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  14568135 tgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 14568104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 3 - 432
Target Start/End: Original strand, 31419045 - 31419471
Alignment:
Q  3 atacaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctaga 102  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  31419045 atacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaaattgattctacagagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctaga 31419143  T
Q  103 gtctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcct 202  Q
    |||||||||  ||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| |||||||| ||||||  ||||| |||| || |    
T  31419144 gtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttaattctttgtatttttgtttgatcagaagtctcttgctt 31419243  T
Q  203 gcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagag 300  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||  ||| ||    
T  31419244 gcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatctttgtgaagtctcatacttagaaag 31419342  T
Q  301 tattgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggata 400  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  31419343 tattgagcagttgtaatccttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggata 31419437  T
Q  401 attgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    | | ||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  31419438 acttcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 31419471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 37729126 - 37728703
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  37729126 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgatactacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 37729028  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  37729027 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 37728928  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||  ||| ||||    
T  37728927 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaagtctcatacttagaaagta 37728829  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  37728828 ttgagcagttgtaatct-tgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 37728735  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  37728734 tgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 37728703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 37740442 - 37740019
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  37740442 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgatactacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 37740344  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  37740343 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 37740244  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||  ||| ||||    
T  37740243 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaagtctcatacttagaaagta 37740145  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  37740144 ttgagcagttgtaatct-tgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 37740051  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  37740050 tgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 37740019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 5 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 14446877 - 14446452
Alignment:
Q  5 acaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagt 104  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  14446877 acaagtttaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagt 14446779  T
Q  105 ctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgc 204  Q
    ||||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||    
T  14446778 cttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgc 14446679  T
Q  205 gtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagag 300  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||   || ||    
T  14446678 gtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaagtctcatactttgaaag 14446580  T
Q  301 tattgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggata 400  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  14446579 tattgagcagttgtaatct-tgtgatta----tagt-gaaatctccttgaaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggata 14446486  T
Q  401 attgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    | ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  14446485 actgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 14446452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 5 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 14457489 - 14457064
Alignment:
Q  5 acaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagt 104  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  14457489 acaagtttaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagt 14457391  T
Q  105 ctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgc 204  Q
    ||||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||    
T  14457390 cttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgc 14457291  T
Q  205 gtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagag 300  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||   || ||    
T  14457290 gtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaagtctcatactttgaaag 14457192  T
Q  301 tattgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggata 400  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  14457191 tattgagcagttgtaatct-tgtgatta----tagt-gaaatctccttgaaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggata 14457098  T
Q  401 attgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    | ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  14457097 actgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 14457064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 7 - 411
Target Start/End: Original strand, 6976194 - 6976596
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  6976194 aagtttaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattca-aagtctagagtct 6976292  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcg 205  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||||||  | |||||||||| || |||||| |||||| ||||||||||||    
T  6976293 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaatttcaaactcaattctctgtatctttgtttgattagaagtctctcgcctgcg 6976392  T
Q  206 tgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagt 301  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||  ||| |||    
T  6976393 tgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaagtctcatacttagaaagt 6976491  T
Q  302 attgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataa 401  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  6976492 attgagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataa 6976586  T
Q  402 ttgcttgtgt 411  Q
     |||||||||    
T  6976587 ctgcttgtgt 6976596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 7 - 411
Target Start/End: Original strand, 6986684 - 6987086
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  6986684 aagtttaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattca-aagtctagagtct 6986782  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcg 205  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||||||  | |||||||||| || |||||| |||||| ||||||||||||    
T  6986783 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaatttcaaactcaattctctgtatctttgtttgattagaagtctctcgcctgcg 6986882  T
Q  206 tgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagt 301  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||  ||| |||    
T  6986883 tgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaagtctcatacttagaaagt 6986981  T
Q  302 attgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataa 401  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  6986982 attgagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataa 6987076  T
Q  402 ttgcttgtgt 411  Q
     |||||||||    
T  6987077 ctgcttgtgt 6987086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 36582432 - 36582009
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||    
T  36582432 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacaacctagaaattca-aagtctagagtct 36582334  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgta-ttttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcg 205  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||| |||| |||||| |||||| |||| |||||||    
T  36582333 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtattttttgtttgattagaagtctcttgcctgcg 36582234  T
Q  206 tgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagtat 303  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||  ||| |||||    
T  36582233 tgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatacttagaaagtat 36582135  T
Q  304 tgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataatt 403  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| |    
T  36582134 tgagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataact 36582040  T
Q  404 gcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    |||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  36582039 gcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 36582009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 36592987 - 36592564
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||    
T  36592987 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacaacctagaaattca-aagtctagagtct 36592889  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgta-ttttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcg 205  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||| |||| |||||| |||||| |||| |||||||    
T  36592888 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtattttttgtttgattagaagtctcttgcctgcg 36592789  T
Q  206 tgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagtat 303  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||  ||| |||||    
T  36592788 tgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatacttagaaagtat 36592690  T
Q  304 tgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataatt 403  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| |    
T  36592689 tgagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataact 36592595  T
Q  404 gcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    |||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  36592594 gcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 36592564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Original strand, 14040983 - 14041406
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  14040983 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 14041081  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  14041082 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 14041181  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||   || ||||    
T  14041182 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaagtctcatactttgaaagta 14041280  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  14041281 ttgagcagttgtaatct-tgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 14041374  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||| ||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  14041375 tgcctgtgtctttgtctttcttttctctgctc 14041406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Original strand, 15740354 - 15740777
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  15740354 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 15740452  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  15740453 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 15740552  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||   || ||||    
T  15740553 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaagtctcatactttgaaagta 15740651  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  15740652 ttgagcagttgtaatct-tgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 15740745  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||| ||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  15740746 tgcctgtgtctttgtctttcttttctctgctc 15740777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Original strand, 15769514 - 15769937
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  15769514 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 15769612  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  15769613 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 15769712  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||   || ||||    
T  15769713 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaagtctcatactttgaaagta 15769811  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  15769812 ttgagcagttgtaatct-tgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 15769905  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||| ||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  15769906 tgcctgtgtctttgtctttcttttctctgctc 15769937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Original strand, 27460547 - 27460970
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  27460547 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 27460645  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  27460646 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 27460745  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||   || ||||    
T  27460746 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaagtctcatactttgaaagta 27460844  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  27460845 ttgagcagttgtaatct-tgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 27460938  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||| ||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  27460939 tgcctgtgtctttgtctttcttttctctgctc 27460970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Original strand, 27470946 - 27471369
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  27470946 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 27471044  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  27471045 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 27471144  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||   || ||||    
T  27471145 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaagtctcatactttgaaagta 27471243  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  27471244 ttgagcagttgtaatct-tgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 27471337  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||| ||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  27471338 tgcctgtgtctttgtctttcttttctctgctc 27471369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Original strand, 35215892 - 35216315
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  35215892 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgatactacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 35215990  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  35215991 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 35216090  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||   || ||||    
T  35216091 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaagtctcatactttgaaagta 35216189  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  35216190 ttgagcagttgtaatct-tgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 35216283  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  35216284 tgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 35216315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Original strand, 35226476 - 35226899
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  35226476 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgatactacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 35226574  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  35226575 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 35226674  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||   || ||||    
T  35226675 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaagtctcatactttgaaagta 35226773  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  35226774 ttgagcagttgtaatct-tgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 35226867  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  35226868 tgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 35226899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 5 - 432
Target Start/End: Original strand, 17607443 - 17607868
Alignment:
Q  5 acaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagt 104  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  17607443 acaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagt 17607541  T
Q  105 ctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgc 204  Q
    ||||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||    
T  17607542 cttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgc 17607641  T
Q  205 gtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagag 300  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||   || ||    
T  17607642 gtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaagtctcatactttgaaag 17607740  T
Q  301 tattgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggata 400  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| |||    
T  17607741 tattgagcagttgtaatct-tgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccagtata 17607834  T
Q  401 attgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    | ||| ||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  17607835 actgcctgtgtctttgtctttcttttctctgctc 17607868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 9377336 - 9376913
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  9377336 aagtttaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctaaaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 9377238  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  9377237 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 9377138  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||   || ||||    
T  9377137 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaagtctcatactttgaaagta 9377039  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  9377038 ttgagcagttgtaatct-tgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 9376945  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||| ||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  9376944 tgcctgtgtctttgtctttcttttctctgctc 9376913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Original strand, 14030430 - 14030853
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  14030430 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 14030528  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| || ||| |||| ||||||||    
T  14030529 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattaaaagtctcttgcctgcgt 14030628  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||   || ||||    
T  14030629 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaagtctcatactttgaaagta 14030727  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  14030728 ttgagcagttgtaatct-tgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 14030821  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||| ||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  14030822 tgcctgtgtctttgtctttcttttctctgctc 14030853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 15693906 - 15693483
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  15693906 aagtttaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctaaaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 15693808  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  15693807 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 15693708  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||   || ||||    
T  15693707 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaagtctcatactttgaaagta 15693609  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  15693608 ttgagcagttgtaatct-tgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 15693515  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||| ||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  15693514 tgcctgtgtctttgtctttcttttctctgctc 15693483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Original strand, 17719303 - 17719726
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  17719303 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 17719401  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  17719402 tttctgtattgtactgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 17719501  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||   || ||||    
T  17719502 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaagtctcatactttgaaagta 17719600  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  17719601 ttgagcagttgtaatct-tgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 17719694  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||| ||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  17719695 tgcctgtgtctttgtctttcttttctctgctc 17719726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Original strand, 17729955 - 17730378
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  17729955 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 17730053  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  17730054 tttctgtattgtactgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 17730153  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||   || ||||    
T  17730154 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaagtctcatactttgaaagta 17730252  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  17730253 ttgagcagttgtaatct-tgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 17730346  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||| ||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  17730347 tgcctgtgtctttgtctttcttttctctgctc 17730378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Original strand, 24567475 - 24567898
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  24567475 aagtttaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctaaaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 24567573  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  24567574 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 24567673  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||   || ||||    
T  24567674 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaagtctcatactttgaaagta 24567772  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  24567773 ttgagcagttgtaatct-tgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 24567866  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||| ||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  24567867 tgcctgtgtctttgtctttcttttctctgctc 24567898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 24816760 - 24816337
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  24816760 aagtttaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctaaaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 24816662  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  24816661 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 24816562  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||   || ||||    
T  24816561 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaagtctcatactttgaaagta 24816463  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  24816462 ttgagcagttgtaatct-tgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 24816369  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||| ||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  24816368 tgcctgtgtctttgtctttcttttctctgctc 24816337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 24827348 - 24826925
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  24827348 aagtttaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctaaaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 24827250  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  24827249 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 24827150  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||   || ||||    
T  24827149 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaagtctcatactttgaaagta 24827051  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  24827050 ttgagcagttgtaatct-tgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 24826957  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||| ||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  24826956 tgcctgtgtctttgtctttcttttctctgctc 24826925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 7 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 27052710 - 27052310
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  27052710 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 27052612  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  27052611 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 27052512  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||   || ||||    
T  27052511 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaagtctcatactttgaaagta 27052413  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  27052412 ttgagcagttgtaatct-tgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 27052319  T
Q  403 tgcttgtgt 411  Q
    ||| |||||    
T  27052318 tgcctgtgt 27052310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 3 - 432
Target Start/End: Original strand, 31448936 - 31449362
Alignment:
Q  3 atacaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctaga 102  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  31448936 atacaagttcaaaagcgccaaaactctctcaaattgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctaga 31449034  T
Q  103 gtctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcct 202  Q
    |||||||||  ||||||||| |||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| || |||| |||||||| ||||||  ||||| |||| ||||    
T  31449035 gtctttattgtattgtattgagaacaccactgattatatatcaagtgttcaagtcaaacttaattctttgtatttttgtttgatcagaagtctcttgcct 31449134  T
Q  203 gcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagag 300  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || ||| |||||||  |||| ||||||||||||  ||| ||    
T  31449135 gcgttcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtggttgagcatctttgtgaagtctcatacttagaaag 31449233  T
Q  301 tattgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggata 400  Q
    |||||| || ||||||||  ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  31449234 tattgatcagttgtaatccttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggata 31449328  T
Q  401 attgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    | ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  31449329 actgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 31449362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Original strand, 36688080 - 36688503
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  36688080 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 36688178  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  36688179 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 36688278  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||  | |||||||||||    |||| ||||||||||||   || ||||    
T  36688279 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgagtgtgcttgagcattgttttgtgaagtctcatactttgaaagta 36688377  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  36688378 ttgagcagttgtaatct-tgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 36688471  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||| ||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  36688472 tgcctgtgtctttgtctttcttttctctgctc 36688503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Original strand, 36698646 - 36699069
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  36698646 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 36698744  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  36698745 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 36698844  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||  | |||||||||||    |||| ||||||||||||   || ||||    
T  36698845 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgagtgtgcttgagcattgttttgtgaagtctcatactttgaaagta 36698943  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  36698944 ttgagcagttgtaatct-tgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 36699037  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||| ||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  36699038 tgcctgtgtctttgtctttcttttctctgctc 36699069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Original strand, 24808298 - 24808721
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  24808298 aagtttaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 24808396  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  24808397 tttctgtattgcattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 24808496  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||    | ||||    
T  24808497 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaagtctcatactttaaaagta 24808595  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  24808596 ttgagcagttgtaatct-tgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 24808689  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||| ||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  24808690 tgcatgtgtctttgtctttcttttctctgctc 24808721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 7 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 27042086 - 27041686
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  27042086 aagttcaaaagcgcgaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 27041988  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  27041987 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 27041888  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||   || ||||    
T  27041887 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaagtctcatactttgaaagta 27041789  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  27041788 ttgagcagttgtaatct-tgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 27041695  T
Q  403 tgcttgtgt 411  Q
    ||| |||||    
T  27041694 tgcctgtgt 27041686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Original strand, 31348919 - 31349342
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  31348919 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttaattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 31349017  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  31349018 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 31349117  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||   || ||||    
T  31349118 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaagtctcatactttgaaagta 31349216  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  31349217 ttgagcagttgtaatct-tgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 31349310  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||  ||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  31349311 tgtctgtgtctttgtctttcttttctctgctc 31349342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Original strand, 31359533 - 31359956
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  31359533 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttaattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 31359631  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  31359632 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 31359731  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||   || ||||    
T  31359732 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaagtctcatactttgaaagta 31359830  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  31359831 ttgagcagttgtaatct-tgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 31359924  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||  ||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  31359925 tgtctgtgtctttgtctttcttttctctgctc 31359956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 5 - 432
Target Start/End: Original strand, 17618057 - 17618483
Alignment:
Q  5 acaagttaaaaagcgtc-aaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagag 103  Q
    ||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  17618057 acaagttcaaaagcgaccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagag 17618155  T
Q  104 tctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctg 203  Q
    |||||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| |||||    
T  17618156 tcttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctg 17618255  T
Q  204 cgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagaga 299  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||   || |    
T  17618256 cgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaagtctcatactttgaaa 17618354  T
Q  300 gtattgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggat 399  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| ||    
T  17618355 gtattgagcagttgtaatct-tgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccagtat 17618448  T
Q  400 aattgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    || ||| ||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  17618449 aactgcctgtgtctttgtctttcttttctctgctc 17618483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 218 - 432
Target Start/End: Original strand, 35543694 - 35543908
Alignment:
Q  218 agaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagagagtattgagcatttgtaat 317  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||| |||||||    
T  35543694 agaagtctcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcatgcttgagcatttgggaagtctcatacta-gatagtattgagcagttgtaat 35543792  T
Q  318 ctgtgtgattattt-ttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtctctc 416  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  35543793 ctgtgtgattatttcttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaaccaggataattgcttgtgtctctc 35543892  T
Q  417 tgtcttttctctgctc 432  Q
    | ||||||||||||||    
T  35543893 tttcttttctctgctc 35543908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 215 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 13522779 - 13522566
Alignment:
Q  215 attagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagagagtattgagcatttgt 314  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||| ||||    
T  13522779 attagaagtctcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgggaagtctcatacta-gatagtattgagcagttgt 13522681  T
Q  315 aatctgtgtgattattt-ttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtct 413  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13522680 aatctgtgtgattatttcttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaaccaggataattgcttgtgtct 13522581  T
Q  414 ctctgtcttttctct 428  Q
    |||| | ||||||||    
T  13522580 ctctttattttctct 13522566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 213 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 21420431 - 21420215
Alignment:
Q  213 gcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagagagtattgagcattt 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  21420431 gcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgaccatttgagaagtctcatactaagagagaattgagcattt 21420332  T
Q  313 gtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtc 412  Q
    ||||||| || |||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21420331 gtaatctttgagatta---ttagtgaaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggattgtggaaggaaccaggataattgcttgtgtc 21420235  T
Q  413 tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    | ||| ||||||||||||||    
T  21420234 tttctttcttttctctgctc 21420215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 44 - 428
Target Start/End: Original strand, 20215522 - 20215912
Alignment:
Q  44 acaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagag--tcttt--attacattgtattgtgaacactactgattgt 139  Q
    ||||||||| ||||||||| |   | |||||||| |||||||||||||   ||| |||||  |||||  ||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  20215522 acaaagcactttgaatttctgtgttcatttgatatatcttagaaattcttaagtatagagagtctttcaattgcattgtattgtgaacaccactgattgt 20215621  T
Q  140 atatctagtgttcaag-tcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgc 238  Q
    ||||| |||||||||  |||||||  ||||| | || ||  ||||||||| ||| |||| || |  ||||||||||||  |||| |||||||||||||||    
T  20215622 atatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtataattctgtttgaataaaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgctttagtgc 20215721  T
Q  239 ttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagag-agtattgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtg 337  Q
    |||||||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| | | | ||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||    
T  20215722 ttgagcaaaggaagtctcttgcctgtgtgcttgagcatttgtgaagtctcatactaggtgtagtattgagcagttgtaatctgtgtgattaaacttagtg 20215821  T
Q  338 gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtctctctgtcttttctct 428  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  20215822 gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaaccagtataattgcttgtgtctctctttcttctctct 20215912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 13 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 40228423 - 40227999
Alignment:
Q  13 aaaagcgtcaaaactctgtcaa-tttgattct-acaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagag--tcttt 108  Q
    ||||||| |||||||||| ||| |||| |||  ||||||||| ||||||||| |   | |||||||| |||||||||||||   |||||||||  |||||    
T  40228423 aaaagcgccaaaactctgccaaatttgtttcacacaaagcactttgaatttctgtgttcatttgatatatcttagaaattcttaagtctagagagtcttt 40228324  T
Q  109 a--ttacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaag-tcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcg 205  Q
       || |||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||  ||||| |||| ||  ||||||||||||| |||| || |  |    
T  40228323 catttgcattatattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttgctttag 40228224  T
Q  206 tgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagag-agtatt 304  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||  || ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | | | ||||||    
T  40228223 tgcttgagcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcaaagggagtctcttgcctgcgtgcttgagcatttgtgaagtctcatactaggtgtagtatt 40228124  T
Q  305 gagcatttgtaatctgtgtgattattt-ttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataatt 403  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||    
T  40228123 gagcagttgtaatctgtgtgattattacttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttctagtttgtggaaggaaccagtataatt 40228024  T
Q  404 gcttgtgtctctctgtcttttctct 428  Q
    |||||||||| ||| |||| |||||    
T  40228023 gcttgtgtctttctttcttctctct 40227999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 124 - 413
Target Start/End: Original strand, 23392903 - 23393188
Alignment:
Q  124 gaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgagcattagaaga 223  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||  ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23392903 gaacaccactgattgtatatcaagcgttcaagtcaaacttatttcattgtatttttgtttgatcagaagactcttgcctgcgtgcttgagcattagaaga 23393002  T
Q  224 ctcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagtattgagcatttgtaatctgt 321  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| || | || || |||||||||||  |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| |    
T  23393003 ctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagacttttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcaaacttagagagtattgagcatttgtaatcttt 23393101  T
Q  322 gtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtct 413  Q
    |||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  23393102 gtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaaccaagataactgcttgtgtct 23393188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 215 - 428
Target Start/End: Original strand, 20168630 - 20168843
Alignment:
Q  215 attagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagagagtattgagcatttgt 314  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |  ||||||||||| ||||    
T  20168630 attagaagtctcttgctttagtgcttgagcatagaaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgggaagtctcatactaggt-agtattgagcagttgt 20168728  T
Q  315 aatctgtgtgattattt-ttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtct 413  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  20168729 aatctgtgtgattatttcttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactagactacttccggtttgtggaaggaaccaggataattgcttatgtct 20168828  T
Q  414 ctctgtcttttctct 428  Q
    |||| ||||||||||    
T  20168829 ctctttcttttctct 20168843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #109
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 215 - 428
Target Start/End: Original strand, 36096215 - 36096428
Alignment:
Q  215 attagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagagagtattgagcatttgt 314  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |  ||||||||||| ||||    
T  36096215 attagaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgggaagtctcatactaggt-agtattgagcagttgt 36096313  T
Q  315 aatctgtgtgattattt-ttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtct 413  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36096314 aatctgtgtgattatttcttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactgaactacttccgatttgtggaaggaaccaggataattgcttgtgtct 36096413  T
Q  414 ctctgtcttttctct 428  Q
    || | ||||||||||    
T  36096414 ctgtttcttttctct 36096428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #110
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 215 - 428
Target Start/End: Original strand, 36097672 - 36097885
Alignment:
Q  215 attagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagagagtattgagcatttgt 314  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |  ||||||||||| ||||    
T  36097672 attagaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgggaagtctcatactaggt-agtattgagcagttgt 36097770  T
Q  315 aatctgtgtgattattt-ttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtct 413  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36097771 aatctgtgtgattatttcttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactgaactacttccgatttgtggaaggaaccaggataattgcttgtgtct 36097870  T
Q  414 ctctgtcttttctct 428  Q
    || | ||||||||||    
T  36097871 ctgtttcttttctct 36097885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #111
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 113 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 23478033 - 23477717
Alignment:
Q  113 cattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaag-tcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttg 211  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||  ||||  |||| ||  ||||||||||||| |||| || |  |||||||    
T  23478033 cattgtattctgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttcagtgtaattctgtttgaatagaagtctcttgctttagtgcttg 23477934  T
Q  212 agcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagag-agtattgagcat 310  Q
    |||||  |||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||| | | | |||||||||||     
T  23477933 agcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcaattt-gaagtctcatactaggtgtagtattgagcag 23477835  T
Q  311 ttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtg 410  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  23477834 ttgtaatctgtgtgattaaacttagtggaaatctccttggaagtgcaagagggactggactacttccggtttgtggaaggaaccagtataattgcttgtg 23477735  T
Q  411 tctctctgtcttttctct 428  Q
    ||||||| |||| |||||    
T  23477734 tctctctttcttctctct 23477717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #112
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 217 - 428
Target Start/End: Original strand, 40033321 - 40033534
Alignment:
Q  217 tagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagag-agtattgagcatttgta 315  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | | | ||||||||||| |||||    
T  40033321 tagaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcatttgtgaagtctcatactaggtgtagtattgagcagttgta 40033420  T
Q  316 atctgtgtgattattt-ttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtctc 414  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  40033421 atctgtgtgattattacttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaaccagtataattgcttgtgtctc 40033520  T
Q  415 tctgtcttttctct 428  Q
    ||| ||||||||||    
T  40033521 tctttcttttctct 40033534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #113
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 249 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 13533502 - 13533323
Alignment:
Q  249 gaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagagagtattgagcatttgtaatctgtgtgattattt-ttagtggaaatctcct 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| | || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13533502 gaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgggaagtttcatacta-gatagtattgagcagttgtaatctgtgtgattatttcttagtggaaatctcct 13533404  T
Q  348 tggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtctctctgtcttttctct 428  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13533403 tggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaaccaggataattgcttgtgtctctctttcttttctct 13533323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #114
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 7 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 7032000 - 7031762
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||    
T  7032000 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatatatcttagaaattca-aagtctagagtct 7031902  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| | ||  ||    
T  7031901 ttactgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaactcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttg-cttagt 7031803  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcatt 247  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |  |||||||||||||    
T  7031802 gcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatt 7031762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #115
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 217 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 23488104 - 23487904
Alignment:
Q  217 tagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagag-agtattgagcatttgta 315  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||| | | | ||||||||||| |||||    
T  23488104 tagaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcaattt-gaagtctcatactaggtgtagtattgagcagttgta 23488006  T
Q  316 atctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtctct 415  Q
    ||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  23488005 atctgcgtgattaaacttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaaccagtataattgcttgtgtctct 23487906  T
Q  416 ct 417  Q
    ||    
T  23487905 ct 23487904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #116
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 217 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 1915000 - 1914787
Alignment:
Q  217 tagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagag-agtattgagcatttgta 315  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| || |  ||||| ||||||||| |||||||||||| | | | ||||||||||| |||||    
T  1915000 tagaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgctttagtgctcgagcatttgtgaagtctcatactaggtgtagtattgagcagttgta 1914901  T
Q  316 atctgtgtgattattt-ttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtctc 414  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  1914900 atctgtgtgattattacttagtggaaatctccttgaaagtgcaagggggactggactacttccggtttatggaaggaaccaatataattgcttgtgtctc 1914801  T
Q  415 tctgtcttttctct 428  Q
    ||| ||||||||||    
T  1914800 tctttcttttctct 1914787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #117
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 215 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 7031823 - 7031608
Alignment:
Q  215 attagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattt--gagaagtctcataccaagagagtattgagcattt 312  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || || ||||||||||||||  | ||||||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  7031823 attagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatacttagatagtattgagcattt 7031725  T
Q  313 gtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtc 412  Q
    ||||||| |||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  7031724 gtaatctttgtgattat----agtg-aaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtc 7031630  T
Q  413 --tctctgtcttttctctgctc 432  Q
      | ||| ||||||||||||||    
T  7031629 tttgtctttcttttctctgctc 7031608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #118
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 113 - 422
Target Start/End: Original strand, 25112356 - 25112668
Alignment:
Q  113 cattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaag-tcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttg 211  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||  |||||||  ||||| |||| ||  ||||||||||||| |||| || |  |||||||    
T  25112356 cattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaggtgttcaaactcaaacaattttctatgtaattctgtttgaatagaagtctcttgctttagtgcttg 25112455  T
Q  212 agcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagag-agtattgagcat 310  Q
    |||||  |||| ||||||||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||| | | | |||||||||||     
T  25112456 agcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtatcttgcctgcgtgcttgagcaatt-tgaagtctcatactaggtgtagtattgagcag 25112554  T
Q  311 ttgtaatctg-tgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttg 408  Q
    |||||||| | ||||||||   |||||| || ||||||||||||| ||||||||||  |||| ||||| | |||||||||| |||| | |||||||||||    
T  25112555 ttgtaatcagttgtgattaaacttagtgaaactctccttggaagtacaagggggacatgactgacttctgatttgtggaaggaacctgtataattgcttg 25112654  T
Q  409 tgtctctctgtctt 422  Q
    ||||| ||| ||||    
T  25112655 tgtctttctttctt 25112668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #119
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 113 - 422
Target Start/End: Original strand, 25171447 - 25171759
Alignment:
Q  113 cattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaag-tcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttg 211  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||  |||||||  ||||| |||| ||  ||||||||||||| |||| || |  |||||||    
T  25171447 cattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaggtgttcaaactcaaacaattttctatgtaattctgtttgaatagaagtctcttgctttagtgcttg 25171546  T
Q  212 agcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagag-agtattgagcat 310  Q
    |||||  |||| ||||||||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||| | | | |||||||||||     
T  25171547 agcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtatcttgcctgcgtgcttgagcaatt-tgaagtctcatactaggtgtagtattgagcag 25171645  T
Q  311 ttgtaatctg-tgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttg 408  Q
    |||||||| | ||||||||   |||||| || ||||||||||||| ||||||||||  |||| ||||| | |||||||||| |||| | |||||||||||    
T  25171646 ttgtaatcagttgtgattaaacttagtgaaactctccttggaagtacaagggggacatgactgacttctgatttgtggaaggaacctgtataattgcttg 25171745  T
Q  409 tgtctctctgtctt 422  Q
    ||||| ||| ||||    
T  25171746 tgtctttctttctt 25171759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #120
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 70 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 32160454 - 32160089
Alignment:
Q  70 atttgatacatcttagaaattcactagtctagag--tcttt--attacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaag-tcaaacata 164  Q
    |||||||| |||||||||||||   |||||||||  |||||  ||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||      
T  32160454 atttgatatatcttagaaattcttaagtctagagagtctttcaattgcactgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaat 32160355  T
Q  165 tttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgc 264  Q
    ||||| |||| ||  ||||||||||||| |||| || |  ||||||||||||  |||| |||||||||  |||||||||||  |||| ||||| |||||     
T  32160354 tttctgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgcttgtgtgcttgagcaaaggaaatctcttgcctgt 32160255  T
Q  265 gtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagag-agtattgagcatttgtaatctg-tgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggg 362  Q
    ||||||||| | ||  |||||||||||| | | | ||||||||||| |||||||| | ||||||||   |||||| || |||||||||||||||||||||    
T  32160254 gtgcttgagtaatt-tgaagtctcatactaggtgtagtattgagcagttgtaatcagttgtgattaaacttagtgaaactctccttggaagtgcaagggg 32160156  T
Q  363 gactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtctctctgtcttttctct 428  Q
     || ||||| |||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||||| ||| |||| |||||    
T  32160155 aacaggactgacttccggtttgtggaaggaacctgtataattgcatgtgtctttctttcttctctct 32160089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #121
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 13 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 13533681 - 13533474
Alignment:
Q  13 aaaagcgtcaaaactctgtcaa-tttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtc-tttat 110  Q
    ||||||| | |||||||| ||| |||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||| |||||    
T  13533681 aaaagcgcccaaactctgccaaatttgattctcaaaagcactttgaatttctgcactgatttgatatatcttagaaattcttaagtctagagtcttttat 13533582  T
Q  111 tacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttc-aagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgct 209  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||| |||  ||  |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  13533581 tgcattgtattgtgaacactattgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacaattttctgtgttattctgtttgattagaagtctctcgcctgcgtgct 13533482  T
Q  210 tgagcatt 217  Q
    ||||||||    
T  13533481 tgagcatt 13533474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #122
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 70 - 428
Target Start/End: Original strand, 11208441 - 11208806
Alignment:
Q  70 atttgatacatcttagaaattcactagtctagag--tcttt--attacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaag-tcaaacata 164  Q
    |||||||| |||||||||||||   |||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||      
T  11208441 atttgatatatcttagaaattcttaagtctagagagtctttcaattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaat 11208540  T
Q  165 tttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgc 264  Q
    ||||| |  | ||   |||||||||||| |||| || |  |||||||||||| ||||| |||||||||  ||||||||| |  |||||| ||| || ||     
T  11208541 tttctgtacaattctatttgaatagaagtctcttgctttagtgcttgagcataagaagtctcttgcttgtgtgcttgagtaaaggaagtatcttgc-tgt 11208639  T
Q  265 gtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagag-agtattgagcatttgtaatctgt-gtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggg 362  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| |   | ||||||||||| |||||||| || ||||||||  |||||| || |||||||||||||||||||||    
T  11208640 gtgcttgagcatttt-gaagtctcatactagttgtagtattgagcagttgtaatcagttgtgattatacttagtgaaactctccttggaagtgcaagggg 11208738  T
Q  363 gactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggat-aattgcttgtgtctctctgtcttttctct 428  Q
    | |  |||| |||||||||||||||||| |||| | || |||||| ||||||| ||| ||||||||||    
T  11208739 ggcatgactgacttccggtttgtggaaggaacctgtataaattgcatgtgtctttctttcttttctct 11208806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #123
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 13 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 13522954 - 13522717
Alignment:
Q  13 aaaagcgtcaaaactctgtcaa-tttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtc-tttat 110  Q
    ||||||| | |||||||| ||| |||||||||  |||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||||| |||||    
T  13522954 aaaagcgcctaaactctgccaaatttgattctcaaaagcactctgaatttctgcactgatttgatatatcttagaaattctcaagtctggagtcttttat 13522855  T
Q  111 tacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttc-aagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgct 209  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||| |||| ||  |||||| |||||| |||| || |  |||||    
T  13522854 tgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacaattttctgtgtaattctgtttgattagaagtctcttgctttagtgct 13522755  T
Q  210 tgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcatt 247  Q
    |||||||| |||| |||| || |  |||||||||||||    
T  13522754 tgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatt 13522717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #124
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 13 - 227
Target Start/End: Original strand, 35543517 - 35543733
Alignment:
Q  13 aaaagcgtcaaaactctgtcaa-tttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtcttt-at 110  Q
    ||||||| ||||| |||| ||| |||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||   |||||| ||||||| ||    
T  35543517 aaaagcgccaaaaatctgccaaatttgattctcaaaagcactttgaatttctgcactgatttgatatatcttagaaattcttaagtctatagtcttttat 35543616  T
Q  111 tacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgctt 210  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||| |||| ||  ||||||  ||||| |||| || |  ||||||    
T  35543617 tgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacaattttctgtgtaattctgtttgatcagaagtctcttgctttagtgctt 35543716  T
Q  211 gagcattagaagactct 227  Q
    ||||||| |||| ||||    
T  35543717 gagcattggaagtctct 35543733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #125
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 14 - 247
Target Start/End: Original strand, 36096041 - 36096277
Alignment:
Q  14 aaagcgtcaaaactctgtcaa-tttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtcttt-att 111  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||| ||||  ||| ||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||| |||    
T  36096041 aaagcgtccaaactctgccaaatttgtttctcaaaatcactttgaatttctgcactgatttgatatatcttagaaattcttaagtctagagtcttttatt 36096140  T
Q  112 acattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttc-aagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgctt 210  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||| |||| ||| |||||| |||||| |||| || |  ||||||    
T  36096141 gcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacaattttctgtgtaattttgtttgattagaagtctcttgctttagtgctt 36096240  T
Q  211 gagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcatt 247  Q
    ||||||  |||| |||| || |  |||||||||||||    
T  36096241 gagcataggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatt 36096277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #126
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 14 - 247
Target Start/End: Original strand, 36097498 - 36097734
Alignment:
Q  14 aaagcgtcaaaactctgtcaa-tttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtcttt-att 111  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||| ||||  ||| ||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||| |||    
T  36097498 aaagcgtccaaactctgccaaatttgtttctcaaaatcactttgaatttctgcactgatttgatatatcttagaaattcttaagtctagagtcttttatt 36097597  T
Q  112 acattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttc-aagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgctt 210  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||| |||| ||| |||||| |||||| |||| || |  ||||||    
T  36097598 gcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacaattttctgtgtaattttgtttgattagaagtctcttgctttagtgctt 36097697  T
Q  211 gagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcatt 247  Q
    ||||||  |||| |||| || |  |||||||||||||    
T  36097698 gagcataggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatt 36097734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #127
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 215 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 13403817 - 13403698
Alignment:
Q  215 attagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagag-agtattgagcatttg 313  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | | | ||||||||||| |||    
T  13403817 attagaagtctcttgctttcgtgcttgagcataggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcatttgtgaagtctcatactaggtgtagtattgagcagttg 13403718  T
Q  314 taatctgtgtgattattttt 333  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  13403717 taatctgtgtgattattttt 13403698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #128
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 21 - 216
Target Start/End: Original strand, 20168463 - 20168661
Alignment:
Q  21 caaaactctgtcaa-tttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtc-tttattacattgt 118  Q
    |||||||||| ||| |||| ||||  ||||||| ||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||| |||||| ||||||    
T  20168463 caaaactctgccaaatttgtttctcaaaagcactttgaatttctgtactgatttgatatatcttagaaattcttaagtctagagtcttttattgcattgt 20168562  T
Q  119 attgtgaacactactgattgtatatctagtgttca-agtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgagcat 216  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||  ||||| |||| ||  |||||| |||||| |||| || |  ||||||||||||    
T  20168563 attgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcagagtcaaacaattttctgtgtaattctgtttgattagaagtctcttgctttagtgcttgagcat 20168661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #129
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 1915122 - 1914940
Alignment:
Q  70 atttgatacatcttagaaattcactagtctagag--tcttt--attacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttc-aagtcaaacata 164  Q
    |||||||| |||||||||||||   |||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || |||||||      
T  1915122 atttgatatatcttagaaattcttaagtctagagagtctttcaattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaat 1915023  T
Q  165 tttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcatt 247  Q
    ||||| |||| ||| ||||||||||||| |||| || |  |||||||||||   |||| |||||||||||||||| |||||||    
T  1915022 tttctgtgtaattttgtttgaatagaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgctttagtgctcgagcatt 1914940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #130
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 342 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 21659640 - 21659564
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattg-cttgtgtctctct 417  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||||    
T  21659640 tctccttgaaagtgcaagggggactagactacttccggtttgtggaaggaaccagtataattgatttgtgtctctct 21659564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #131
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 115 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 16607166 - 16607023
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgag 213  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||| |||| ||  |||||||||||||  ||| ||    |||||||||    
T  16607166 ttgtattgtgaacacccctgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatatttctttgtagttctgtttgaatagaagtatcttgcaattgtgcttgag 16607067  T
Q  214 cattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctct 257  Q
    |||  |||| |||||| |||||| ||||||||| |||| |||||    
T  16607066 cataggaagtctcttgatttagttcttgagcataggaaatctct 16607023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #132
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 342 - 407
Target Start/End: Original strand, 7746404 - 7746469
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  7746404 tctccttggaagtgcaagggggacaagactacttccggtttgtggaaggaacctgtataattgctt 7746469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #133
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 342 - 407
Target Start/End: Original strand, 22000737 - 22000802
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  22000737 tctccttggaagtgcaagggggacaagactacttctggtttgtggaagaaacctgtataattgctt 22000802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #134
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 342 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 31117306 - 31117254
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaacc 394  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31117306 tctccttggaagtgcaagggggacaggactacttccggtttgtggaaggaacc 31117254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #135
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 115 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 20550547 - 20550432
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgag 213  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||  |||||||| ||||| |||| ||| |||||| |||||| |||| ||    |||||||||    
T  20550547 ttgtattgtgaacaccactgcttgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattttgtttgattagaagtctcttgcagttgtgcttgag 20550448  T
Q  214 cattagaagactcttg 229  Q
    ||||||||| ||||||    
T  20550447 cattagaagtctcttg 20550432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #136
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 113 - 247
Target Start/End: Original strand, 40033246 - 40033381
Alignment:
Q  113 cattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttc-aagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttg 211  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||| || |||||||  ||||| |||| ||  ||||||||||||| |||| || |  |||||||    
T  40033246 cattgtattgtgaacaccactaattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttgctttagtgcttg 40033345  T
Q  212 agcattagaagactcttgctttagtgcttgagcatt 247  Q
    |||||  |||| ||||||| |  |||||||||||||    
T  40033346 agcataggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcatt 40033381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #137
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 328 - 417
Target Start/End: Original strand, 9399313 - 9399402
Alignment:
Q  328 atttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattg-cttgtgtctctct 417  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||  | |||||||  ||||||||||||    
T  9399313 atttttagtg-aactctccttggaagtgcaagggggacatgactacttccggtttgtggaaggaacttgtataattgttttgtgtctctct 9399402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #138
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 342 - 404
Target Start/End: Original strand, 13546231 - 13546293
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  13546231 tctccttggaagtgcaagggggacatgactacttccggtttgtggaaggaacctgtataattg 13546293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #139
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 342 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 10848201 - 10848128
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggat-aattgcttgtgtct 413  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| | || ||||||||||||||    
T  10848201 tctccttggaagtgcaagggggacaggactgacttccggtttgtggaaggaacctgtataaattgcttgtgtct 10848128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #140
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 113 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 23488179 - 23488046
Alignment:
Q  113 cattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttc-aagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttg 211  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || |||||||  ||||| |||| ||  ||||||||||||| |||| || |  |||||||    
T  23488179 cattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttgctttagtgcttg 23488080  T
Q  212 agcattagaagactcttgctttagtgcttgagca 245  Q
    ||||   |||| ||||||| |  |||||||||||    
T  23488079 agcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttgagca 23488046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #141
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 342 - 407
Target Start/End: Original strand, 25097536 - 25097601
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  25097536 tctccttggaagtgctagggggacatgactacttccggtttgtggaaggaacctgtataattgctt 25097601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #142
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 342 - 407
Target Start/End: Original strand, 25155506 - 25155571
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  25155506 tctccttggaagtgctagggggacatgactacttccggtttgtggaaggaacctgtataattgctt 25155571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #143
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 338 - 407
Target Start/End: Original strand, 26056193 - 26056262
Alignment:
Q  338 gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  26056193 gaaatatcattggaagttcaagggggactggactacttctggattgtggaaggaaccaagataattgctt 26056262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #144
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 328 - 404
Target Start/End: Original strand, 90120 - 90195
Alignment:
Q  328 atttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    |||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  90120 atttttagtg-aactcttcttggaagtgcaagggggacatgactacttccggtttgtggaaggaacctgtataattg 90195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #145
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 342 - 406
Target Start/End: Original strand, 31589651 - 31589715
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgct 406  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  |||| | |||||||||    
T  31589651 tctccttggaagtgcaagggggacaggactacttccggattgtggaatgaacctgtataattgct 31589715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #146
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 229
Target Start/End: Original strand, 643184 - 643299
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaag-tcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgag 213  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||| |||||||  ||||| |||| ||  ||||||||||||| |||| ||    |||||||||    
T  643184 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaaatgttcaagctcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatagaagtctcttgcagttgtgcttgag 643283  T
Q  214 cattagaagactcttg 229  Q
    ||| ||||| ||||||    
T  643284 catgagaagtctcttg 643299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #147
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 342 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 6498741 - 6498675
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  6498741 tctccgtggaagtgcaagggggacaggactgacttccggtttgtggaaggaacctgtataattgctt 6498675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #148
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 342 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 17814392 - 17814326
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  17814392 tctccttggaagagcaagggggacaggactgacttccggtttgtggaaggaacctgtataattgctt 17814326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #149
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 257
Target Start/End: Original strand, 22586466 - 22586608
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgagc 214  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||||||| ||| | |||| ||  |||||  |||||| |||| |  |  ||||||||||    
T  22586466 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacccaaacatttttatgtgtaattgtgtttgtttagaagtctcttggttttgtgcttgagc 22586565  T
Q  215 attagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctct 257  Q
    ||  |||  |||||||||  ||||||||| ||| |||||||||    
T  22586566 ataggaaatctcttgcttgtgtgcttgagtatttgaagtctct 22586608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #150
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 342 - 404
Target Start/End: Original strand, 26120531 - 26120593
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||    
T  26120531 tctccttggaagtacaagggggacaggactacttccggattgtggaaggaacctgtataattg 26120593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #151
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 345 - 413
Target Start/End: Original strand, 35932718 - 35932788
Alignment:
Q  345 ccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggat-aattgcttgtgtct 413  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| | || ||||||||||||||    
T  35932718 ccttggaagtgcaagggggacaggactgacttccggtttgtggaaggaacctgtataaattgcttgtgtct 35932788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #152
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 342 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 11993318 - 11993265
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaacc 394  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  11993318 tctccttggaagtgcaagggggacaggactgacttccggtttgtggaaggaacc 11993265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #153
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 342 - 407
Target Start/End: Original strand, 23413684 - 23413749
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    |||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||| |||| | ||||||||||    
T  23413684 tctccttggaagtgaaagggggacaagactacttccggtttgtgtaaggaacctgtataattgctt 23413749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #154
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 342 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 23880493 - 23880428
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| ||| |||| | ||||||||||    
T  23880493 tctccttggaagtgcaagggggacaagactacatccggtttgtgaaaggaacctgtataattgctt 23880428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #155
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 346 - 407
Target Start/End: Original strand, 26766549 - 26766610
Alignment:
Q  346 cttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  26766549 cttggaaatgcaagggggacaagactacttccggtttgtggaaggaacctgtataattgctt 26766610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #156
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 342 - 413
Target Start/End: Original strand, 28465045 - 28465118
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggat-aattgcttgtgtct 413  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| |||| | || ||||||||||||||    
T  28465045 tctccttggaagtgcaagggggacaggactgacttctggtttgtggaaggaacctgtataaattgcttgtgtct 28465118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #157
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 34638109 - 34637976
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgag 213  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||||| | |||||| |||| ||  ||||||||||||| |||| || |  ||| || ||    
T  34638109 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaaaaaatttctttgtaattctgtttgaatagaagtctcttgcatttgtggttaag 34638010  T
Q  214 cattagaagactcttgctttagtgcttgagcatt 247  Q
    |||  |||| |||||||  | |||||||||||||    
T  34638009 catatgaagtctcttgcagttgtgcttgagcatt 34637976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #158
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 246
Target Start/End: Original strand, 2156757 - 2156889
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgag 213  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||  ||| | |||| ||| ||||||||||||| |||| ||    |||||||||    
T  2156757 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttatttgtaattttgtttgaatagaagtctcttgcagttgtgcttgag 2156856  T
Q  214 cattagaagactcttgctttagtgcttgagcat 246  Q
    |||  |||| |||||| ||| || | |||||||    
T  2156857 catatgaagtctcttgattttgttcatgagcat 2156889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #159
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 342 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 26764933 - 26764885
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaag 389  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  26764933 tctccttggaagtgcaagggggacaggactgacttccggtttgtggaag 26764885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #160
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 34637226 - 34637064
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgagc 214  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||| ||| |||||   ||||| |||| || |  ||| ||||||    
T  34637226 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ccaaacatatttctttgtaattt-gtttgttcagaagtctcttgcttttgtgtttgagc 34637129  T
Q  215 attagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttg 279  Q
    ||  |||  |||||| ||  ||||||||| ||| ||||| | | || || |||||||||||||||    
T  34637128 atatgaaatctcttgtttgtgtgcttgagtatttgaagttttttgcttgtgtgcttgagcatttg 34637064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #161
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 342 - 389
Target Start/End: Original strand, 643410 - 643457
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaag 389  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  643410 tctccttggaagtgcaagggggacatgactacttccggtttgtagaag 643457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #162
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 344 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 4886390 - 4886319
Alignment:
Q  344 tccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggat-aattgcttgtgtct 413  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| |||| | || ||||||||||||||    
T  4886390 tccttggaagtgcaagggggacatgactgacttccggtttgtggaaggaacctgtataaattgcttgtgtct 4886319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #163
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 342 - 404
Target Start/End: Original strand, 6513140 - 6513203
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||| | |||||||    
T  6513140 tctccttggaagtgcaagggggacaggactgacttccgatttgtggaaggaacctgtataattg 6513203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #164
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 115 - 229
Target Start/End: Original strand, 12353279 - 12353393
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgag 213  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||  |||||||| ||||| |||| ||  ||||||||||||| |||| ||    |||||||||    
T  12353279 ttgtattgtgaacaccactaattgtatatcaagtgttcaatctcaaacat-tttctttgtaattctgtttgaatagaagtctcttgcagttgtgcttgag 12353377  T
Q  214 cattagaagactcttg 229  Q
    ||| ||||| ||||||    
T  12353378 cataagaagtctcttg 12353393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #165
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 115 - 229
Target Start/End: Original strand, 21072720 - 21072835
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgag 213  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||  |||||||  ||||| |||| ||| ||||||||| ||| |||| ||    |||||||||    
T  21072720 ttgtattgtgaacaccacttattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattttgtttgaatataagtctcttgcagttgtgcttgag 21072819  T
Q  214 cattagaagactcttg 229  Q
    ||||| ||| ||||||    
T  21072820 cattaaaagtctcttg 21072835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #166
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 115 - 229
Target Start/End: Original strand, 21199484 - 21199599
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgag 213  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||  ||||| |||| ||  ||||||||||||| |||| ||    |||||||||    
T  21199484 ttgtattatgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatagaagtctcttgcaattgtgcttgag 21199583  T
Q  214 cattagaagactcttg 229  Q
    ||| ||||| ||||||    
T  21199584 cataagaagtctcttg 21199599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #167
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 20968866 - 20968700
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgag 213  Q
    |||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||||  |||||||| ||| | |||| |||  ||||  |||||| |||| || |  |||||||||    
T  20968866 ttgtgttgtgaacaccattgattgtatatcaagtgttcaatctcaaacatttttatgtgtaattttttttgtctagaagtctcttgcttttgtgcttgag 20968767  T
Q  214 cattagaagactcttgctttagtgcttgagca-ttggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttg 279  Q
    |||  |||  |||||||||| ||||||||| | |||||||||||| || |   ||||||||||||||    
T  20968766 cataggaaatctcttgcttttgtgcttgagtatttggaagtctcttgcttttatgcttgagcatttg 20968700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #168
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 33932921 - 33932805
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttc-aagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaat--agaagcctctcgcctgcgtgcttg 211  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || ||||||||| |||| |||| ||  ||||||||  ||||| |||| || |  |||||||    
T  33932921 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacata-ttctttgtaattctgtttgaattcagaagtctcttgcatttgtgcttg 33932823  T
Q  212 agcattagaagactcttg 229  Q
    |||| |||||| ||||||    
T  33932822 agcaatagaagtctcttg 33932805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #169
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 10848426 - 10848353
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaat 187  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||  ||||| |||| ||| ||||||||    
T  10848426 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattttgtttgaat 10848353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #170
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 342 - 406
Target Start/End: Original strand, 13736782 - 13736847
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggataattgct 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  13736782 tctccttggaagtgcaagggggacatgactgacttccggtttgtggaaggaacttgtataattgct 13736847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #171
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 358 - 415
Target Start/End: Original strand, 26119272 - 26119329
Alignment:
Q  358 agggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtctct 415  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| | ||||||||    
T  26119272 agggggactagactacttccggattgtggaaggaaccatgataattgatcgtgtctct 26119329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #172
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 342 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 26783781 - 26783716
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    |||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||    
T  26783781 tctctttggaagtgcaagggggacaatactacttccggtttgttgaaggaacctgtataattgctt 26783716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #173
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 342 - 413
Target Start/End: Original strand, 29139112 - 29139185
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggat-aattgcttgtgtct 413  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||| |||| ||||||||||||| |||| | || ||||||||||||||    
T  29139112 tctccttggaagtgcaaggggggcaggactgactttcggtttgtggaaggaacctgtataaattgcttgtgtct 29139185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #174
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 342 - 413
Target Start/End: Original strand, 30116544 - 30116617
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggat-aattgcttgtgtct 413  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| |||| | || ||||||||||||||    
T  30116544 tctccttggaaatgcaagggggacaagactgacttccggtttgtggaaggaacctgtataaattgcttgtgtct 30116617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #175
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 342 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 33932697 - 33932624
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggat-aattgcttgtgtct 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||| |||| | || ||||||||||||||    
T  33932697 tctccttggaagtgcaagggggacaagattgacttccggtttgtggaaggaacctgtataaattgcttgtgtct 33932624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #176
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 278
Target Start/End: Original strand, 6512916 - 6513079
Alignment:
Q  118 tattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaa--tagaagcctctcgcctgcgtgcttgagc 214  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||| |||| ||   ||||||  | |||| |||| ||    ||||||||||    
T  6512916 tattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctatttgaatttggaagtctcttgcagttgtgcttgagc 6513015  T
Q  215 attagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattt 278  Q
    |||||||| |||||| ||| || |  |||||| |||||||||| ||    ||||||||||||||    
T  6513016 attagaagtctcttgattttgttcaagagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcattt 6513079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #177
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 342 - 394
Target Start/End: Original strand, 21199710 - 21199762
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaacc 394  Q
    |||||| | |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  21199710 tctcctcgaaagtgcaagggggacaagactacttccggtttgtggaaggaacc 21199762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #178
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 343 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 30742410 - 30742338
Alignment:
Q  343 ctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggat-aattgcttgtgtct 413  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| | ||||||||| |||| | || ||||||||||||||    
T  30742410 ctccttggaagtgcaagggggacaggactgacttcctggttgtggaaggaacctgtataaattgcttgtgtct 30742338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #179
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 174
Target Start/End: Original strand, 31146118 - 31146178
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgta 174  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||| ||||    
T  31146118 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgta 31146178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #180
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 342 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 33022092 - 33022044
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaag 389  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  33022092 tctccttggaaatgcaagggggacaggactgacttccggtttgtggaag 33022044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #181
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 154
Target Start/End: Original strand, 3245925 - 3245964
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa 154  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  3245925 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 3245964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #182
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 4886676 - 4886637
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa 154  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  4886676 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 4886637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #183
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 6498891 - 6498852
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa 154  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  6498891 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 6498852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #184
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 9088622 - 9088583
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa 154  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  9088622 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 9088583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #185
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 43 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 13404850 - 13404753
Alignment:
Q  43 tacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtct--agagtcttt--attacattgtattgtgaacactactgat 136  Q
    |||||||||| ||||||||| |   |||||||||| |||||||||||||   |||||  |||||||||  ||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  13404850 tacaaagcactttgaatttctgtgttgatttgatatatcttagaaattcttaagtctagagagtctttcaattgcattgtattgtgaacaccactgat 13404753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #186
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 154
Target Start/End: Original strand, 13546008 - 13546047
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa 154  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  13546008 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 13546047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #187
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 342 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 15516400 - 15516329
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggat-aattgcttgtgt 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| || |||| | || ||||||||||||    
T  15516400 tctccttggaagtgcaagggggacatgactgacttccggtttgtggtaggaacctgtataaattgcttgtgt 15516329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #188
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 15516623 - 15516584
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa 154  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  15516623 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 15516584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #189
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 342 - 389
Target Start/End: Original strand, 19537007 - 19537054
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaag 389  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  19537007 tctccttggaagtgcaaggaggacatgactacttccgatttgtggaag 19537054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #190
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 154
Target Start/End: Original strand, 21100186 - 21100225
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa 154  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  21100186 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 21100225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #191
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 21659865 - 21659826
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa 154  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  21659865 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 21659826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #192
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 23880719 - 23880680
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa 154  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  23880719 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 23880680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #193
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 25740764 - 25740725
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa 154  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  25740764 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 25740725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #194
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 154
Target Start/End: Original strand, 26056009 - 26056048
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa 154  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  26056009 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 26056048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #195
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 28139260 - 28139221
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa 154  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  28139260 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 28139221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #196
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 154
Target Start/End: Original strand, 28464821 - 28464860
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa 154  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  28464821 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 28464860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #197
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 154
Target Start/End: Original strand, 29138889 - 29138928
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa 154  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  29138889 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 29138928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #198
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 31117532 - 31117493
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa 154  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  31117532 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 31117493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #199
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 154
Target Start/End: Original strand, 35932490 - 35932529
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa 154  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  35932490 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 35932529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #200
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 154
Target Start/End: Original strand, 35986716 - 35986755
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa 154  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  35986716 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 35986755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #201
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 115 - 192
Target Start/End: Original strand, 9399099 - 9399177
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaag 192  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||  |||||||  ||||| |||| ||  |||||||||||||    
T  9399099 ttgtattgtgaacaccactgattgtatataaagtgttcaacctcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatagaag 9399177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #202
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 342 - 407
Target Start/End: Original strand, 12353504 - 12353570
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| ||||||||| |||  | ||||||||||    
T  12353504 tctccttggaagtgcaagggggacatgactgacttccggcttgtggaaggaacatgtataattgctt 12353570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #203
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 115 - 153
Target Start/End: Original strand, 13736618 - 13736656
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttca 153  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  13736618 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttca 13736656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #204
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 342 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 16606943 - 16606901
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgt 384  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  16606943 tctccatggaagtgcaagggggacaagactacttccggtttgt 16606901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #205
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 346 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 20968671 - 20968613
Alignment:
Q  346 cttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    ||||||||||||||| ||||  |||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||    
T  20968671 cttggaagtgcaaggaggacatgactacttccggattgtggaaggaacctgtataattg 20968613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #206
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 115 - 229
Target Start/End: Original strand, 23392088 - 23392205
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaag-tcaaacatatttctctgtattttcgtttgaat--agaagcctctcgcctgcgtgcttg 211  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||  |||| ||| ||||||||  ||||| |||| ||    |||||||    
T  23392088 ttgtactgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttcattgtaattttgtttgaatttagaagtctcttgcagttgtgcttg 23392187  T
Q  212 agcattagaagactcttg 229  Q
    |||| |||||| ||||||    
T  23392188 agcaatagaagtctcttg 23392205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #207
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 342 - 413
Target Start/End: Original strand, 3246149 - 3246222
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactgga-ctacttccggtttgtggaagaaaccaggat-aattgcttgtgtct 413  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| | ||||||| |||||||||| |||| | || ||||||||||||||    
T  3246149 tctccttggaagtgcaaggaggacaggaccgacttccgttttgtggaaggaacctgtataaattgcttgtgtct 3246222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #208
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 187
Target Start/End: Original strand, 7746177 - 7746250
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaat 187  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||| |||| ||  ||||||||    
T  7746177 ttgtattgtgaacatcactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaat 7746250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #209
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 113 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 20567462 - 20567421
Alignment:
Q  113 cattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa 154  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||    
T  20567462 cattgtattgtgaacaccactgaatgtatatcaagtgttcaa 20567421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #210
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 342 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 28139033 - 28138960
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggat-aattgcttgtgtct 413  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||| |||| | || ||||||||||||||    
T  28139033 tctcattggaagtgcaagggggacaggactgacttcctttttgtggaaggaacctgtataaattgcttgtgtct 28138960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #211
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 219 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 12078413 - 12078357
Alignment:
Q  219 gaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca 275  Q
    |||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||    
T  12078413 gaagtctcttgcttgtgtgcttgagcataggaagtctcttgcttgtgtgcttgagca 12078357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #212
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 216 - 280
Target Start/End: Original strand, 22586537 - 22586601
Alignment:
Q  216 ttagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttga 280  Q
    ||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||| ||||| || || ||||||||| ||||||    
T  22586537 ttagaagtctcttggttttgtgcttgagcataggaaatctcttgcttgtgtgcttgagtatttga 22586601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #213
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 123 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 23589360 - 23589237
Alignment:
Q  123 tgaacactactgattgtatatctagtgttcaag-tcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgagcattagaa 221  Q
    ||||||| ||| |||||||||| |||||||||  |||||||| ||||| |||| ||  |||||| |||||| |||| || |  |||||||||| |  |||    
T  23589360 tgaacaccacttattgtatatcaagtgttcaacctcaaacat-tttctttgtaattctgtttgattagaagtctcttgcttttgtgcttgagcttaggaa 23589262  T
Q  222 gactcttgctttagtgcttgagcat 246  Q
    |||| |||| || ||||||||||||    
T  23589261 gacttttgcgtttgtgcttgagcat 23589237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #214
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 30742635 - 30742583
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttc-aagtcaaacatatt 166  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| || |||||||||||    
T  30742635 ttgtattgtgaacatcactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacatatt 30742583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 297; Significance: 1e-167; HSPs: 286)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 21 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 1053665 - 1053255
Alignment:
Q  21 caaaactctgtcaa-tttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtctttattacattgta 119  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||    
T  1053665 caaaactctgccaaatttgattctacaaagcactttgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcttaagtctagagtctttattgcattgta 1053566  T
Q  120 ttgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgagcatta 218  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1053565 ttgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacat-tttctgtgtcttttcgtttgattagaagcctctcgcctgcgtgcttgagcatta 1053467  T
Q  219 gaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca-tttgagaagtctcataccaagagagtattgagcatttgtaat 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  1053466 gaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagactctcgcctgcgtgcttgagcattttgagaagtctcatacttagagagtattgagcatttgtaat 1053367  T
Q  318 ctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtctctct 417  Q
    |||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1053366 ctgtgtgatta---ttagtgaaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaaccaggataattgcttgtgtctctct 1053270  T
Q  418 gtcttttctctgctc 432  Q
     ||||||||||||||    
T  1053269 ttcttttctctgctc 1053255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 27883347 - 27882930
Alignment:
Q  13 aaaagcgtcaaaactctgtcaa-tttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtctttatt 111  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27883347 aaaagcgccaaaactctgtcaaatttgattctacaaagcaccttgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcacaagtctagagtctttatt 27883248  T
Q  112 acattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgctt 210  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27883247 gcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaggtcaaacat-tttctctgtatttttgtttgaacagaagcctctcgcctgcgtgctt 27883149  T
Q  211 gagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca-tttgagaagtctcataccaagagagtattgagca 309  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  27883148 gagcattagtagactcttgctttagtgcttgagcattggaagactctcgcctgcgtgcttgagcattttgagaagtctcatacttagagagtattgagca 27883049  T
Q  310 tttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgt 409  Q
    |||||||||| ||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27883048 tttgtaatctttgtgatta---ttagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaaccaggataattgcttgt 27882953  T
Q  410 gtctctctgtcttttctctgctc 432  Q
    |||| ||| ||||||||||||||    
T  27882952 gtctttctttcttttctctgctc 27882930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 17281705 - 17282122
Alignment:
Q  13 aaaagcgtcaaaactctgtcaa-tttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtctttatt 111  Q
    ||||||| |||||||||| ||| |||||||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  17281705 aaaagcgccaaaactctgccaaatttgattctataaaacactttgaatttctgcactgatttgatatatcttagaaattctcaagtctagagtctttatt 17281804  T
Q  112 acattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgctt 210  Q
     ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17281805 gcattgtattgtgaacaccactgatagtatatcaagtgttcaaagtcaaacat-tttctgtgtatttttgtttgaatagaagcctcttgcctgcgtgctt 17281903  T
Q  211 gagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagagagtattgagcat 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17281904 gagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcatactaagagagtattgagcat 17282003  T
Q  311 ttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtg 410  Q
    ||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17282004 ttgtaatctgtgtgatta---ttagtgaaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttctgatttgtggaaggaaccaggataattgcttgtg 17282100  T
Q  411 tctctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||| ||||||||||||||    
T  17282101 tctctctttcttttctctgctc 17282122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 13199516 - 13199936
Alignment:
Q  13 aaaagcgtcaaaactctgtcaa-tttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtctttatt 111  Q
    ||||||| |||||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  13199516 aaaagcgccaaaactctgccaaatttgattctaaaaagcactttgaatttctgcaccgatttgatatatcttagaaattcttaagtctagagtctttatt 13199615  T
Q  112 acattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgctt 210  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||  ||||| |||| ||| |||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  13199616 gcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacaattttctgtgtaattttgtttgattagaagtctctcgcctgcgtgctt 13199715  T
Q  211 gagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagagagtattgagcat 310  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  13199716 gacgattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcatacta-gagagtattaagcat 13199814  T
Q  311 ttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtg 410  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13199815 ttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaaccaggataattgcttgtg 13199914  T
Q  411 tctctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||| ||||||||||||||    
T  13199915 tctctctttcttttctctgctc 13199936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 3 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 16076902 - 16076493
Alignment:
Q  3 atacaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaa-tttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctag 101  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||| || ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  16076902 atacaagttaaaa-gcgccaaaactttgccaaatttgattctacaaagcactttgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattctcaagtctag 16076804  T
Q  102 agtctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaag-tcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgc 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  16076803 agtctttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacatcaaacat-tttctctgtatttttgtttgaatagaagcctcttgc 16076705  T
Q  201 ctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca-tttgagaagtctcataccaagaga 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||    
T  16076704 ctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagactctcgcctgcgtgcttgagcattttgagaagtctcatacttagaga 16076605  T
Q  300 gtattgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggat 399  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16076604 gtattgagcatttgtaatctttgtgatta---ttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaaccaggat 16076508  T
Q  400 aattgcttgtgtctc 414  Q
    |||||||||||||||    
T  16076507 aattgcttgtgtctc 16076493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 1064102 - 1063684
Alignment:
Q  13 aaaagcgtcaaaactctgtcaa-tttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtctttatt 111  Q
    ||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  1064102 aaaagcgccaaaactctaccaaatttgattctacaaagcactttgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcttaagtctagagtctttatt 1064003  T
Q  112 acattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgctt 210  Q
     ||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  1064002 gcattgtattgtgaacaccacttattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacat-tttctgtgtcttttcgtttgattagaagcctctcgcctacgtgctt 1063904  T
Q  211 gagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca-tttgagaagtctcataccaagagagtattgagca 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  1063903 gagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagactctcgcctgcgtgcttgagcattttgagaagtctcatacttagagagtattgagca 1063804  T
Q  310 tttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgt 409  Q
    |||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1063803 tttgtaatctgtgtgatta---ttagtgaaaatctccttggaagtgcaagggggactggacaacttctggtttgtggaaggaaccaggataattgcttgt 1063707  T
Q  410 gtctctctgtcttttctctgctc 432  Q
    |||||||| ||||||||||||||    
T  1063706 gtctctctttcttttctctgctc 1063684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 13 - 428
Target Start/End: Original strand, 8740397 - 8740808
Alignment:
Q  13 aaaagcgtcaaaactctgtcaa-tttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtctttatt 111  Q
    ||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  8740397 aaaagcgccaaaactctgccaaatttgattctacaaagcac-ttgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcccaagtctagagtctttatt 8740495  T
Q  112 acattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttg 211  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8740496 gcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacatttttctctgtatttttgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttg 8740595  T
Q  212 agcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca-tttgagaagtctcataccaagagagtattgagcat 310  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  8740596 agcattagaagactcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcctgtgtgcttgagcattttgagaagtctcatacttagagagtattgagcat 8740694  T
Q  311 ttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtg 410  Q
    ||||||||| ||||||||   ||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8740695 ttgtaatctttgtgatta---ttagt-gaaatctccttggaagagcaagggagactggactactttcgatttgtggaaggaaccaggataattgcttgtg 8740790  T
Q  411 tctctctgtcttttctct 428  Q
    ||| ||| || |||||||    
T  8740791 tctttctttcctttctct 8740808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 3 - 428
Target Start/End: Original strand, 9006770 - 9007192
Alignment:
Q  3 atacaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaa-tttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctag 101  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9006770 atacaagttaaaa-gcgccaaaactctgccaaatttgattctacaaagcaccttgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcacaagtctag 9006868  T
Q  102 agtctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttca-agtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgc 200  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||   |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  9006869 agtctttattgcattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcatcatcaaacat-tttctctgtatttttgtttgaatagaagcctcttgc 9006967  T
Q  201 ctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca-tttgagaagtctcataccaagaga 299  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||  |||||    
T  9006968 ctgcgtgcttgagcattagtagactcttgctttagagcttgagcattggaagactcttgcctgcatgcttgagcattttgagaagtctcatactcagaga 9007067  T
Q  300 gtattgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggat 399  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  9007068 gtattgagcatttgtaatctttgtgatta---ttagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaaccaggat 9007163  T
Q  400 aattgcttgtgtctctctgtcttttctct 428  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  9007164 aattgcttgtgtctttctttcttttctct 9007192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 13 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 2246330 - 2245924
Alignment:
Q  13 aaaagcgtcaaaactctgtcaa-tttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtctttatt 111  Q
    ||||||| |||||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  2246330 aaaagcgccaaaactctgccaaatttgattctaaaaagcactttgaatttctgcactgatttgatatatcttagaaattcttaagtctagagtctttatt 2246231  T
Q  112 acattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgctt 210  Q
     ||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||  ||||| |||| ||  |||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  2246230 gcattgtattgtgaacaccactaattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacaattttctgtgtaattctgtttgattagaagtctctcgcctgcgtgctt 2246131  T
Q  211 gagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagagagtattgagcat 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||     
T  2246130 gagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcata-cttgagagtattgagcag 2246032  T
Q  311 ttgtaatctgtgtgattattt-ttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgt 409  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  2246031 ttgtaatctgtgtgattatttcttagtggaaatctccttggaaatacaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaaccatgataattgcttgt 2245932  T
Q  410 gtctctct 417  Q
    ||||||||    
T  2245931 gtctctct 2245924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 3 - 432
Target Start/End: Original strand, 8996218 - 8996644
Alignment:
Q  3 atacaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaa-tttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctag 101  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8996218 atacaagttaaaa-gcgccaaaactctgccaaatttgattctacaaagcaccttgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcacaagtctag 8996316  T
Q  102 agtctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaag-tcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgc 200  Q
    |||||||||| |||||||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||   |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  8996317 agtctttattgcattgtattgagaaaaccactgattgtatatcaagtgttcatcatcaaacat-tttctctgtatttttgtttgaatagaagcctcttgc 8996415  T
Q  201 ctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca-tttgagaagtctcataccaagaga 299  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||    
T  8996416 ctgcgtgcttgagcattagtagactcttgctttagtgcttgagcattggaaaactcttgcctgcgtgcttgagcattttgagaagtctcatacttagaga 8996515  T
Q  300 gtattgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggat 399  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  ||    
T  8996516 gtattgagcatttgtaatctttgtgatta---ttagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaaccaaaat 8996611  T
Q  400 aattgcttgtgtctctctgtcttttctctgctc 432  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  8996612 aattgcttgtgtctttctttcttttctctgctc 8996644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 3 - 431
Target Start/End: Original strand, 13261933 - 13262359
Alignment:
Q  3 atacaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctaga 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13261933 atacaagttaaaaagcgtcaaaactttgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttctgtactgatttgatacatcttagaaattcacaagtctaga 13262032  T
Q  103 gtctttattacattgta-ttgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgc 200  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| |||| ||    
T  13262033 gtctttattgcattgtatttgtgaacaccactgattgtatatcaagtgtttaaggtcaaacat-tttctctgtatttttgtttgaacagaagtctcttgc 13262131  T
Q  201 ctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagag 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||  |||||||||||||||||  ||||    
T  13262132 ctgcgtgcttgagcattagaagactcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcctgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcatacttagag 13262230  T
Q  299 agtattgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccagga 398  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  13262231 agtattgagcatttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaacggggactggactacttccgatttgtggaaggaaccagga 13262325  T
Q  399 taattgcttgtgtctctc-tgtcttttctctgct 431  Q
    ||| |||||||||||| | | |||||||||||||    
T  13262326 taactgcttgtgtctcgcttttcttttctctgct 13262359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 3 - 413
Target Start/End: Original strand, 11216986 - 11217392
Alignment:
Q  3 atacaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctaga 102  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  11216986 atacaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaaaagtctaga 11217085  T
Q  103 gtctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcct 202  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||  ||||| |||| ||||    
T  11217086 gtctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttatttcattgtatttttgtttgatcagaagactcttgcct 11217185  T
Q  203 gcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagag 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||    
T  11217186 gcgtgcttgagcattagaagactcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgagtgcttgagcatttttgagaagtctcatacttagagag 11217284  T
Q  301 tattgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggata 400  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  11217285 tattgagcatttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaaccaggata 11217379  T
Q  401 attgcttgtgtct 413  Q
    | |||||||||||    
T  11217380 actgcttgtgtct 11217392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 3 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 4404247 - 4403841
Alignment:
Q  3 atacaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcacta-gtctag 101  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||    
T  4404247 atacaagttaaaaagcgccaaaactatgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttctgcactgatttgatatatcttagaaattcacaaagtctag 4404148  T
Q  102 agtctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcc 201  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| |||    
T  4404147 agtctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatgaagtgttcaagtcaaacatatttccctgtatttttgtttgatcagaagactcttgcc 4404048  T
Q  202 tgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca-tttgagaagtctcataccaagagag 300  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||    
T  4404047 tgcgtgcttgagcattggaagactcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcctgtgtgcttgagcattttgagaagtctcatacttagagag 4403949  T
Q  301 tattgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggata 400  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  4403948 tattgagcatttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaaccaggata 4403854  T
Q  401 attgcttgtgtct 413  Q
    | |||||||||||    
T  4403853 actgcttgtgtct 4403841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 3 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 11163803 - 11163379
Alignment:
Q  3 atacaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctaga 102  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11163803 atacaagttaaaaagtgccaaaactctgtcaatttaattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcacaagtctaga 11163704  T
Q  103 gtctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcct 202  Q
    ||||||||   ||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| ||||    
T  11163703 gtctttatggtattatattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacatatttccctgtatttttgtttgatcagaagactcttgcct 11163604  T
Q  203 gcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca-tttgagaagtctcataccaagagagt 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  11163603 gcgtgcttgagcattagaagactcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattttgagaagtctcatacttagagagt 11163505  T
Q  302 attgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataa 401  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||    
T  11163504 attgagcatttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaactaggataa 11163410  T
Q  402 ttgcttgtgtctctc-tgtcttttctctgct 431  Q
     |||||||||||| | | |||||||||||||    
T  11163409 ctgcttgtgtctcgcttttcttttctctgct 11163379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 3 - 413
Target Start/End: Original strand, 9391465 - 9391871
Alignment:
Q  3 atacaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctaga 102  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  9391465 atacaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaaaagtctaga 9391564  T
Q  103 gtctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcct 202  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||  ||||| |||| ||||    
T  9391565 gtctttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttatttcattgtatttttgtttgatcagaagactcttgcct 9391664  T
Q  203 gcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagag 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| || || |||||||||||  |||||||||||||||||  ||| ||    
T  9391665 gcgtgcttgagcattagaagactcttgc-ttagtgcttgagcatgggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcatacttagatag 9391763  T
Q  301 tattgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggata 400  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||    
T  9391764 tattgagcatttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggacttcttccgatttgtggaaggaaccaggata 9391858  T
Q  401 attgcttgtgtct 413  Q
    | |||||||||||    
T  9391859 actgcttgtgtct 9391871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 5 - 413
Target Start/End: Original strand, 1794746 - 1795151
Alignment:
Q  5 acaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatct-tagaaattcactagtctagag 103  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||    
T  1794746 acaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatctatagaaatttaaaagtctagag 1794845  T
Q  104 tctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctg 203  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||  ||||| |||| |||||    
T  1794846 tctttattgtattgtattgtgaacactactgattgtatatcaagtgtttaagtcaaacttatttctttgtatttttgtttgatcagaagactcttgcctg 1794945  T
Q  204 cgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagt 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||||||||||||||||  |||||||    
T  1794946 cgtgcttgagcattagaagactcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcatacttagagagt 1795044  T
Q  302 attgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataa 401  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  1795045 attgagcatttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgttttgtggaaggaaccaggataa 1795139  T
Q  402 ttgcttgtgtct 413  Q
     |||||||||||    
T  1795140 ctgcttgtgtct 1795151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 5 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 48337213 - 48336809
Alignment:
Q  5 acaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagt 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  48337213 acaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaaaagtctagagt 48337114  T
Q  105 ctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgc 204  Q
    |||||    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||  |||||||| ||||||  |||||||||| ||||||    
T  48337113 ctttaacgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactaatttcattgtatttttgtttgatcagaagcctcttgcctgc 48337014  T
Q  205 gtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||    
T  48337013 gtgcttgagcattagaagactcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcatacttagagagta 48336915  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||     
T  48336914 ttgagcatttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaaccaggataac 48336820  T
Q  403 tgcttgtgtct 413  Q
    |||||||||||    
T  48336819 tgcttgtgtct 48336809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 5 - 432
Target Start/End: Original strand, 29461476 - 29461901
Alignment:
Q  5 acaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagt 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  29461476 acaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaaaagtctagagt 29461575  T
Q  105 ctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgc 204  Q
    ||| |||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| || |||  |||||||| ||||||  |||||||||| ||||||    
T  29461576 cttaattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttaattcattgtatttttgtttgatcagaagcctcttgcctgc 29461675  T
Q  205 gtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||    
T  29461676 gtgcttgagcattagaagactcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcatacttagagagta 29461774  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||     
T  29461775 ttgagcatttgtaatctttgttatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaactaggataac 29461869  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  29461870 tgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 29461901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 5 - 432
Target Start/End: Original strand, 29472328 - 29472753
Alignment:
Q  5 acaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagt 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  29472328 acaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaaaagtctagagt 29472427  T
Q  105 ctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgc 204  Q
    ||| |||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| || |||  |||||||| ||||||  |||||||||| ||||||    
T  29472428 cttaattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttaattcattgtatttttgtttgatcagaagcctcttgcctgc 29472527  T
Q  205 gtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||    
T  29472528 gtgcttgagcattagaagactcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcatacttagagagta 29472626  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||     
T  29472627 ttgagcatttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctcattggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaactaggataac 29472721  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  29472722 tgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 29472753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 13 - 428
Target Start/End: Original strand, 29947617 - 29948031
Alignment:
Q  13 aaaagcgtcaaaactctg-tcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtctttatt 111  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||  |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  29947617 aaaagcgtcaaaactctgctaaatttgattctcaaaagcactctgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcttaagtctagagtctttatt 29947716  T
Q  112 acattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaag-tcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgctt 210  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||| |||| ||| |||||| | |||| | || ||||||||||||    
T  29947717 gcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaatctcaaacat-tttctgtgtaattttgtttgattggaagtcgcttgcctgcgtgctt 29947815  T
Q  211 gagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagagagtattgagcat 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| |||    
T  29947816 gagcattagaagactcttgctttagggcttgagcattggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcatttgtgaagtctcatacttagagagtattgaacat 29947915  T
Q  311 ttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataa-ttgcttgt 409  Q
    |||||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  29947916 ttgtaatctgtgagatta---ttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaaccaggataatttgcttgt 29948012  T
Q  410 gtctctctgtcttttctct 428  Q
    |||||||| |||| |||||    
T  29948013 gtctctctttcttctctct 29948031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 13 - 428
Target Start/End: Original strand, 29996771 - 29997185
Alignment:
Q  13 aaaagcgtcaaaactctg-tcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtctttatt 111  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||  |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  29996771 aaaagcgtcaaaactctgctaaatttgattctcaaaagcactctgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcttaagtctagagtctttatt 29996870  T
Q  112 acattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaag-tcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgctt 210  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||| |||| ||| |||||| | |||| | || ||||||||||||    
T  29996871 gcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaatctcaaacat-tttctgtgtaattttgtttgattggaagtcgcttgcctgcgtgctt 29996969  T
Q  211 gagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagagagtattgagcat 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| |||    
T  29996970 gagcattagaagactcttgctttagggcttgagcattggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcatttgtgaagtctcatacttagagagtattgaacat 29997069  T
Q  311 ttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataa-ttgcttgt 409  Q
    |||||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  29997070 ttgtaatctgtgagatta---ttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaaccaggataatttgcttgt 29997166  T
Q  410 gtctctctgtcttttctct 428  Q
    |||||||| |||| |||||    
T  29997167 gtctctctttcttctctct 29997185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 3 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 933601 - 933174
Alignment:
Q  3 atacaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctaga 102  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  933601 atacaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcacaagtctaga 933502  T
Q  103 gtctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcct 202  Q
    |||||||    | |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||  |||||||||| ||||    
T  933501 gtctttaacgtaatgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacctatttcattgtatttttgtttgatcagaagcctcttgcct 933402  T
Q  203 gcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagag 300  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||    
T  933401 gcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcatacttagagag 933303  T
Q  301 tattgagca-tttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggat 399  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  933302 tattgagcattttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgttttgtggaaggaaccaggat 933208  T
Q  400 aattgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgct 431  Q
    || ||||||||||  | ||| |||||||||||||    
T  933207 aactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgct 933174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 13 - 414
Target Start/End: Original strand, 14321962 - 14322359
Alignment:
Q  13 aaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtctttatta 112  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  14321962 aaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttctgctctgatttgatacatcttagaaattcacaagtctagagtctttattg 14322061  T
Q  113 cattgta-ttgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgctt 210  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||||    
T  14322062 cattgtatttgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaggtcaaacat-tttctctgtatttttgtttgaacagaagcctctagcctacgtgctt 14322160  T
Q  211 gagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca-tttgagaagtctcataccaagagagtattgagca 309  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  14322161 gagcattagaagactcttgc-ttagtgcttgagcattagaagactcttgcctgtgtggttgagcattttgagaagtctcatagttagagagtattgagca 14322259  T
Q  310 tttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgt 409  Q
    |||||||||| ||||||||    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  14322260 tttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctctttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaaccaggataactgcttgt 14322354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 5 - 413
Target Start/End: Original strand, 1784334 - 1784738
Alignment:
Q  5 acaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagt 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  1784334 acaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctgcaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaaaagtctagagt 1784433  T
Q  105 ctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgc 204  Q
    |||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||| |||| |  ||||| |||| ||||||    
T  1784434 ctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgtttaagtcaaacttatttctttgtatttttgtttaatcagaagactcttgcctgc 1784533  T
Q  205 gtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||    
T  1784534 gtgcttgagcattagaagactcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcatacttagagagta 1784632  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||     
T  1784633 tcgagcatttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccattttgtggaaggaaccaggataac 1784727  T
Q  403 tgcttgtgtct 413  Q
    |||||||||||    
T  1784728 tgcttgtgtct 1784738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 3 - 411
Target Start/End: Original strand, 9380919 - 9381323
Alignment:
Q  3 atacaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctaga 102  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  9380919 atacaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaaaagtctaga 9381018  T
Q  103 gtctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcct 202  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||  ||||| |||| ||||    
T  9381019 gtctttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttatttcattgtatttttgtttgatcagaagactcttgcct 9381118  T
Q  203 gcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagag 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||| ||    
T  9381119 gcgtgcttgagcattagaagactcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcacttttaagaagtctcatacttagatag 9381217  T
Q  301 tattgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggata 400  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||    
T  9381218 tactgagcatttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctcattggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaaccagggta 9381312  T
Q  401 attgcttgtgt 411  Q
    | |||||||||    
T  9381313 actgcttgtgt 9381323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 3 - 413
Target Start/End: Original strand, 19887615 - 19888021
Alignment:
Q  3 atacaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctaga 102  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  19887615 atacaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaattcctgcactgatttgatacatcttagaaattcaagagtctaga 19887714  T
Q  103 gtctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcct 202  Q
    ||||||||   ||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||  ||||| |||| ||||    
T  19887715 gtctttatcgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttatttcattgtatttttgtttgatcagaagactcttgcct 19887814  T
Q  203 gcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagag 300  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||    
T  19887815 gcgtgcttgagcattagaagattcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcatacttagagag 19887913  T
Q  301 tattgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggata 400  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||    
T  19887914 tattgagcatttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaaccaagata 19888008  T
Q  401 attgcttgtgtct 413  Q
    | |||||||||||    
T  19888009 actgcttgtgtct 19888021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 13 - 413
Target Start/End: Original strand, 29906452 - 29906850
Alignment:
Q  13 aaaagcgtcaaaactctg-tcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtctttatt 111  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||  |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  29906452 aaaagcgtcaaaactctgctaaatttgattctcaaaagcactctgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcttaagtctagagtctttatt 29906551  T
Q  112 acattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaag-tcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgctt 210  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||| |||| ||| |||||| | |||| | || ||||||||||||    
T  29906552 gcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaatctcaaacat-tttctgtgtaattttgtttgattggaagtcgcttgcctgcgtgctt 29906650  T
Q  211 gagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagagagtattgagcat 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| |||    
T  29906651 gagcattagaagactcttgctttagggcttgagcattggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcatttgtgaagtctcatacttagagagtattgaacat 29906750  T
Q  311 ttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtg 410  Q
    |||||||||||| |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  29906751 ttgtaatctgtgagatta---ttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaaccaggataactgcttgtg 29906847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 13 - 428
Target Start/End: Original strand, 29933831 - 29934245
Alignment:
Q  13 aaaagcgtcaaaactctg-tcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtctttatt 111  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||  |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  29933831 aaaagcgtcaaaactctgctaaatttgattctcaaaagcactctgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcttaagtctagagtctttatt 29933930  T
Q  112 acattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtc-aaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgctt 210  Q
     ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||  | |||||| ||||| |||| ||| |||||| | |||| |||| |||| |||||||    
T  29933931 gcattgtattgtaaacaccactgattgtatatcaagtgttcaatcccaaacat-tttctgtgtaattttgtttgattggaagtctcttgcctacgtgctt 29934029  T
Q  211 gagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagagagtattgagcat 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  29934030 gagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcatttgtgaagtctcatacttagagagtattgagcat 29934129  T
Q  311 ttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataa-ttgcttgt 409  Q
    |||||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||    
T  29934130 ttgtaatctgtgagatta---ttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaggatccaggataatttgctcgt 29934226  T
Q  410 gtctctctgtcttttctct 428  Q
    |||||||| |||| |||||    
T  29934227 gtctctctttcttctctct 29934245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 13 - 428
Target Start/End: Original strand, 29982985 - 29983399
Alignment:
Q  13 aaaagcgtcaaaactctg-tcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtctttatt 111  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||  |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  29982985 aaaagcgtcaaaactctgctaaatttgattctcaaaagcactctgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcttaagtctagagtctttatt 29983084  T
Q  112 acattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtc-aaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgctt 210  Q
     ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||  | |||||| ||||| |||| ||| |||||| | |||| |||| |||| |||||||    
T  29983085 gcattgtattgtaaacaccactgattgtatatcaagtgttcaatcccaaacat-tttctgtgtaattttgtttgattggaagtctcttgcctacgtgctt 29983183  T
Q  211 gagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagagagtattgagcat 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  29983184 gagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcatttgtgaagtctcatacttagagagtattgagcat 29983283  T
Q  311 ttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataa-ttgcttgt 409  Q
    |||||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||    
T  29983284 ttgtaatctgtgagatta---ttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaggatccaggataatttgctcgt 29983380  T
Q  410 gtctctctgtcttttctct 428  Q
    |||||||| |||| |||||    
T  29983381 gtctctctttcttctctct 29983399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 5 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 38314671 - 38314262
Alignment:
Q  5 acaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcac-tagtctagag 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  38314671 acaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctaaaaagcacattgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcacaaagtctagag 38314572  T
Q  104 tctt-----tattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctc 198  Q
    ||||     ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||| ||||     
T  38314571 tctttattgtattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacatatttccctgtatttttgtttgatcagaagactctt 38314472  T
Q  199 gcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca-tttgagaagtctcataccaaga 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||| | ||| ||||||||||| |||||||||||||||||  |||    
T  38314471 gcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgc-ttagtgcttgagcattggtagactcttgtctgtgtgcttgagcattttgagaagtctcatacttaga 38314373  T
Q  298 gagtattgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccagg 397  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  38314372 gagtattgagcatttgtaatctttgtggtta----tagt-gaaatctccttggaactgcaagggggactggactacttccgttttgtggaaggaaccagg 38314278  T
Q  398 ataattgcttgtgtct 413  Q
    |||| |||||||||||    
T  38314277 ataactgcttgtgtct 38314262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 3 - 413
Target Start/End: Original strand, 7804779 - 7805186
Alignment:
Q  3 atacaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctaga 102  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  7804779 atacaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaaaagtctaga 7804878  T
Q  103 gtctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcct 202  Q
    |||||||    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  | |||||| ||||||  |||||||||| ||||    
T  7804879 gtctttaacgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttatttcattatatttttgtttgatcagaagcctcttgcct 7804978  T
Q  203 gcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagag 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||  ||||||    
T  7804979 gcgtgcttgagcattagaagactcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatacttagagag 7805077  T
Q  301 tattgagca-tttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggat 399  Q
    ||||||||| | |||||||| ||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  7805078 tattgagcactgtgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgttttgtggaaggaaccaggat 7805172  T
Q  400 aattgcttgtgtct 413  Q
    || |||||||||||    
T  7805173 aactgcttgtgtct 7805186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 5 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 23635681 - 23635256
Alignment:
Q  5 acaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagt 104  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  23635681 acaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaaaagtctagagt 23635582  T
Q  105 ctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgc 204  Q
    ||||||   ||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| |||||||| ||||||  ||||| |||| ||||||    
T  23635581 ctttatcgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttaattctttgtatttttgtttgatcagaagactcttgcctgc 23635482  T
Q  205 gtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||  ||||||||    
T  23635481 gtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatacttagagagta 23635383  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  23635382 ttgagcatttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 23635288  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  23635287 tgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 23635256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 5 - 413
Target Start/End: Original strand, 24706818 - 24707223
Alignment:
Q  5 acaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagt 104  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  24706818 acaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaaaagtctagagt 24706917  T
Q  105 ctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgc 204  Q
    |||||    ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| || ||| ||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||    
T  24706918 ctttaacgtattatattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttaattcactgtatttttgtttgatcagaagcctcttgcctgc 24707017  T
Q  205 gtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca---tttgagaagtctcataccaagagagt 301  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||   |||||||||||||||||  ||| |||    
T  24707018 gtgcttgagcattagaaatctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattttttgagaagtctcatacttagatagt 24707116  T
Q  302 attgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataa 401  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  24707117 attgagcatttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaaccaggataa 24707211  T
Q  402 ttgcttgtgtct 413  Q
     |||||||||||    
T  24707212 ctgcttgtgtct 24707223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 5 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 9535581 - 9535176
Alignment:
Q  5 acaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagt 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  9535581 acaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaaaagtctagagt 9535482  T
Q  105 ctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgc 204  Q
    |||||    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||  |||||||||| ||||||    
T  9535481 ctttaacgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttatttcattgtatttttgtttgatcagaagcctcttgcctgc 9535382  T
Q  205 gtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||    
T  9535381 atgcttgagcattagaagactcttgc-ttagcgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattttttagaagtctcatacttagagagta 9535283  T
Q  303 ttgagca-tttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataa 401  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  9535282 ttgagcattttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtacaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaaccaggataa 9535188  T
Q  402 ttgcttgtgtct 413  Q
     |||||||||||    
T  9535187 ctgcttgtgtct 9535176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 23767863 - 23767441
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  23767863 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 23767765  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  23767764 ttactgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 23767665  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagtatt 304  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||  ||| ||||||    
T  23767664 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatacttagaaagtatt 23767566  T
Q  305 gagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||    
T  23767565 gagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactg 23767471  T
Q  405 cttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  23767470 cttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 23767441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 3 - 413
Target Start/End: Original strand, 7794868 - 7795275
Alignment:
Q  3 atacaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctaga 102  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  7794868 atacaagttaaaaagcgccaaaactctatcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaaaagtctaga 7794967  T
Q  103 gtctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcct 202  Q
    |||||||    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||  |||||||||| ||||    
T  7794968 gtctttaacgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttatttcattgtatttttgtttgatcagaagcctcttgcct 7795067  T
Q  203 gcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagag 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||  ||||||    
T  7795068 gcgtgcttgagcattagaagactcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatacttagagag 7795166  T
Q  301 tattgagca-tttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggat 399  Q
    ||||||||| | |||||||| ||||||||    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  7795167 tattgagcactgtgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttcgaagtgcaagggggactggactacttccgttttgtggaaggaaccaggat 7795261  T
Q  400 aattgcttgtgtct 413  Q
    || | |||||||||    
T  7795262 aactacttgtgtct 7795275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 5 - 432
Target Start/End: Original strand, 4175021 - 4175445
Alignment:
Q  5 acaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagt 104  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  4175021 acaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctaaaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagt 4175119  T
Q  105 ctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgc 204  Q
    |||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| ||||||  ||||| |||| ||||||    
T  4175120 ctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaactcaaactcaattctctgtatttttgtttgatcagaagtctcttgcctgc 4175219  T
Q  205 gtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||  ||| ||||    
T  4175220 gtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatacttagaaagta 4175318  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  4175319 ttgagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 4175413  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  4175414 tgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 4175445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Original strand, 39673149 - 39673570
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  39673149 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 39673247  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||  ||||| |||| ||||||||    
T  39673248 ttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgatcagaagtctcttgcctgcgt 39673347  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagtatt 304  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||  ||| ||||||    
T  39673348 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatacttagatagtatt 39673446  T
Q  305 gagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    ||||||||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||    
T  39673447 gagcatttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactg 39673541  T
Q  405 c-ttgtgtctctctgtcttttctctgctc 432  Q
    | |||| | | ||| ||||||||||||||    
T  39673542 ctttgtctttgtctttcttttctctgctc 39673570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 13 - 330
Target Start/End: Original strand, 16671433 - 16671751
Alignment:
Q  13 aaaagcgtcaaaactctgtcaa-tttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtctttatt 111  Q
    ||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  16671433 aaaagcgccaaaactctgccaaatttgattctacaaagcacattgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcataagtctagagtctttatt 16671532  T
Q  112 acattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttg 211  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| || |||||||    
T  16671533 gcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaatcaaacat-tttctctgtatttttgtttgaaaagaagcctctcgcatgtgtgcttg 16671631  T
Q  212 agcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattt-gagaagtctcataccaagagagtattgagcat 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  16671632 agcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgtgtgcttgagcatttagagaagtctcatacttagagagtattgagcat 16671731  T
Q  311 ttgtaatctgtgtgattatt 330  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  16671732 ttgtaatctttgtgattatt 16671751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 3 - 432
Target Start/End: Original strand, 9994155 - 9994581
Alignment:
Q  3 atacaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctaga 102  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  9994155 atacaagttcaaaagtgccaaaactctgtcaaattgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctaga 9994253  T
Q  103 gtctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcct 202  Q
    |||||||||  ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||    
T  9994254 gtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcct 9994353  T
Q  203 gcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagag 300  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||   || ||    
T  9994354 gcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatactttgatag 9994452  T
Q  301 tattgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggata 400  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  9994453 tattgagcatttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggata 9994547  T
Q  401 attgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    | ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  9994548 actgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 9994581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 3 - 432
Target Start/End: Original strand, 12237875 - 12238301
Alignment:
Q  3 atacaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctaga 102  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |    
T  12237875 atacaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaaattgattctacaaagcacaatgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctata 12237973  T
Q  103 gtctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcct 202  Q
    |||||||||  ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||    
T  12237974 gtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcct 12238073  T
Q  203 gcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagag 300  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || || ||||||||  |||| ||||||||||||   || ||    
T  12238074 gcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgttcttgagcagttttgtgaagtctcatactttgatag 12238172  T
Q  301 tattgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggata 400  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  12238173 tattgagcatttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggata 12238267  T
Q  401 attgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    | ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  12238268 actgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 12238301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 3 - 432
Target Start/End: Original strand, 12249701 - 12250127
Alignment:
Q  3 atacaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctaga 102  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  12249701 atacaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaaattgattctacaaagcacactaaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctaga 12249799  T
Q  103 gtctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcct 202  Q
    |||||||||  ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||| || ||| |||| ||||    
T  12249800 gtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattataagtctcttgcct 12249899  T
Q  203 gcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagag 300  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||   || ||    
T  12249900 gcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatactttgatag 12249998  T
Q  301 tattgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggata 400  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  12249999 tattgagcatttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggata 12250093  T
Q  401 attgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    | ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  12250094 actgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 12250127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 13557543 - 13557121
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  13557543 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 13557445  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
     || |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  13557444 gtactgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 13557345  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagtatt 304  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||  ||| ||||||    
T  13557344 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatacttagaaagtatt 13557246  T
Q  305 gagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||    
T  13557245 gagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactg 13557151  T
Q  405 cttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  13557150 cttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 13557121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 23757267 - 23756845
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  23757267 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 23757169  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  23757168 ttactgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 23757069  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagtatt 304  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||  ||| ||||||    
T  23757068 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatacttagaaagtatt 23756970  T
Q  305 gagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| || ||    
T  23756969 gagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggacaactg 23756875  T
Q  405 cttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  23756874 cttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 23756845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 37866414 - 37865992
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  37866414 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 37866316  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| ||||||  ||||| |||| ||||||||    
T  37866315 ttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaactcaaactcaattctctgtatttttgtttgatcagaagtctcttgcctgcgt 37866216  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagtatt 304  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||  ||| ||||||    
T  37866215 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatacttagaaagtatt 37866117  T
Q  305 gagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||    
T  37866116 gagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactg 37866022  T
Q  405 cttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  37866021 cttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 37865992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 37885547 - 37885125
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  37885547 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 37885449  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| ||||||  ||||| |||| ||||||||    
T  37885448 ttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaactcaaactcaattctctgtatttttgtttgatcagaagtctcttgcctgcgt 37885349  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagtatt 304  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||  ||| ||||||    
T  37885348 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatacttagaaagtatt 37885250  T
Q  305 gagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||    
T  37885249 gagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactg 37885155  T
Q  405 cttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  37885154 cttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 37885125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 6180800 - 6181216
Alignment:
Q  13 aaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtctttatta 112  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |     
T  6180800 aaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtctttactg 6180898  T
Q  113 cattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttga 212  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||||||||    
T  6180899 tattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaactcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttga 6180998  T
Q  213 gcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagtattgagcat 310  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||  ||| |||||||||||     
T  6180999 gcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatacttagaaagtattgagcag 6181097  T
Q  311 ttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtg 410  Q
    ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  6181098 ttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtg 6181192  T
Q  411 tc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||  | ||| ||||||||||||||    
T  6181193 tctttgtctttcttttctctgctc 6181216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 6220974 - 6221390
Alignment:
Q  13 aaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtctttatta 112  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |     
T  6220974 aaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtctttactg 6221072  T
Q  113 cattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttga 212  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||||||||    
T  6221073 tattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaactcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttga 6221172  T
Q  213 gcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagtattgagcat 310  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||  ||| |||||||||||     
T  6221173 gcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatacttagaaagtattgagcag 6221271  T
Q  311 ttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtg 410  Q
    ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  6221272 ttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtg 6221366  T
Q  411 tc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||  | ||| ||||||||||||||    
T  6221367 tctttgtctttcttttctctgctc 6221390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 7 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 19788991 - 19788590
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  19788991 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 19788893  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
     || |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  19788892 gtactgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 19788793  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagtatt 304  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||  ||| ||||||    
T  19788792 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatacttagaaagtatt 19788694  T
Q  305 gagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||    
T  19788693 gagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactg 19788599  T
Q  405 cttgtgtct 413  Q
    |||||||||    
T  19788598 cttgtgtct 19788590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 3 - 432
Target Start/End: Original strand, 9982147 - 9982573
Alignment:
Q  3 atacaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctaga 102  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  9982147 atacaagttcaaaagtgccaaaactctgtcaaattgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctaga 9982245  T
Q  103 gtctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcct 202  Q
    |||||||||  ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||    
T  9982246 gtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcct 9982345  T
Q  203 gcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagag 300  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||   || ||    
T  9982346 gcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatactttgatag 9982444  T
Q  301 tattgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggata 400  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  9982445 tattgagcatttgtaatctttatgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggata 9982539  T
Q  401 attgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    | ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  9982540 actgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 9982573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 13121631 - 13121209
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  13121631 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 13121533  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  13121532 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 13121433  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagtatt 304  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||  ||| ||||||    
T  13121432 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatacttagaaagtatt 13121334  T
Q  305 gagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||    
T  13121333 gagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactg 13121239  T
Q  405 cttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  13121238 cttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 13121209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 14476190 - 14475768
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  14476190 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 14476092  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  14476091 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 14475992  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagtatt 304  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||  ||| ||||||    
T  14475991 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatacttagaaagtatt 14475893  T
Q  305 gagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||    
T  14475892 gagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactg 14475798  T
Q  405 cttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  14475797 cttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 14475768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 5 - 411
Target Start/End: Original strand, 5579898 - 5580301
Alignment:
Q  5 acaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagt 104  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  5579898 acaagtttaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagt 5579996  T
Q  105 ctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgc 204  Q
    ||||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||    
T  5579997 cttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctctcgcctgc 5580096  T
Q  205 gtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagag 300  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||  ||| ||    
T  5580097 gtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaagtctcatacttagaaag 5580195  T
Q  301 tattgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggata 400  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  5580196 tattgagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggata 5580290  T
Q  401 attgcttgtgt 411  Q
    | |||||||||    
T  5580291 actgcttgtgt 5580301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 23647718 - 23647295
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  23647718 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 23647620  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  23647619 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 23647520  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca---tttgagaagtctcataccaagagagtat 303  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||   |||| ||||||||||||  ||| |||||    
T  23647519 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattttttgtgaagtctcatacttagaaagtat 23647421  T
Q  304 tgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataatt 403  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| |    
T  23647420 tgagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataact 23647326  T
Q  404 gcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    |||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  23647325 gcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 23647295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Original strand, 5537287 - 5537709
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  5537287 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 5537385  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||| | |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  5537386 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtattgttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 5537485  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagtatt 304  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||  ||| ||||||    
T  5537486 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatacttagaaagtatt 5537584  T
Q  305 gagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||    
T  5537585 gagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactg 5537679  T
Q  405 cttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  5537680 cttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 5537709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 3 - 411
Target Start/End: Original strand, 6501265 - 6501668
Alignment:
Q  3 atacaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctaga 102  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  6501265 atacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaaactgattctacaaagcacactgaatatctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctaga 6501363  T
Q  103 gtctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcct 202  Q
    |||||||||  ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||    
T  6501364 gtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcct 6501463  T
Q  203 gcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagag 300  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||   || ||    
T  6501464 gcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatactttgatag 6501562  T
Q  301 tattgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggata 400  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  6501563 tattgagcatttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggata 6501657  T
Q  401 attgcttgtgt 411  Q
    | |||||||||    
T  6501658 actgcttgtgt 6501668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Original strand, 11272650 - 11273074
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  11272650 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 11272748  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||| ||    
T  11272749 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctctcgcctgagt 11272848  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||  ||| ||||    
T  11272849 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcttgtgtgcttgagcatagttttgtgaagtctcatacttagaaagta 11272947  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  11272948 ttgagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 11273042  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  11273043 tgcttgtgtctttatctttcttttctctgctc 11273074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 3 - 413
Target Start/End: Original strand, 17910263 - 17910673
Alignment:
Q  3 atacaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctaga 102  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  17910263 atacaagttaaaaagcgccaaaactctatcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaaaagtctaga 17910362  T
Q  103 gtctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattt---tcgtttgaatagaagcctctcg 199  Q
    |||||||    |||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||  |||||||   | ||||||  |||||||||| |    
T  17910363 gtctttaacgtattgtagtgtgaacaccactgattgcatatcaagtgttcaaatcaaaaatatttcattgtatttttcttgtttgatcagaagcctcttg 17910462  T
Q  200 cctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaaga 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||  |||    
T  17910463 cctgcgtgcttgagcattagaagactcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatacttaga 17910561  T
Q  298 gagtattgagca-tttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccag 396  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  17910562 gagtattgagcagtttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgttttgtggaaggaaccag 17910656  T
Q  397 gataattgcttgtgtct 413  Q
    ||||| |||||||||||    
T  17910657 gataactgcttgtgtct 17910673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 19778354 - 19777932
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  19778354 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 19778256  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
     || |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  19778255 gtactttattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 19778156  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagtatt 304  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||  ||| ||||||    
T  19778155 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatacttagaaagtatt 19778057  T
Q  305 gagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||       
T  19778056 gagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataacaa 19777962  T
Q  405 cttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  19777961 cttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 19777932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Original strand, 20684045 - 20684466
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  20684045 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgagttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 20684143  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  20684144 tttctgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 20684243  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagtatt 304  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||  ||| ||||||    
T  20684244 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatacttagaaagtatt 20684342  T
Q  305 gagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||    
T  20684343 gagcagttgtaatct-tgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactg 20684436  T
Q  405 cttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  20684437 cttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 20684466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 38194693 - 38194270
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38194693 aagtttaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattca-tagtctagagtct 38194595  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  38194594 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 38194495  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||  ||| ||||    
T  38194494 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaagtctcatacttagaaagta 38194396  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  38194395 ttgagcagttgtaatct-tgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 38194302  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  38194301 tgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 38194270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 5 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 20721084 - 20720658
Alignment:
Q  5 acaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagt 104  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  20721084 acaagtttaaaagcgccaaaactctgtcaaattgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagt 20720986  T
Q  105 ctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgc 204  Q
    ||||  || |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||    
T  20720985 cttttctatattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgc 20720886  T
Q  205 gtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagag 300  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||   || ||    
T  20720885 gtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcttgtgtgcttgagcattgttttgtgaagtctcatactttgaaag 20720787  T
Q  301 tattgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggata 400  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  20720786 tattgagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggata 20720692  T
Q  401 attgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    | ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  20720691 actgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 20720658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 5510665 - 5510242
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  5510665 aagtttaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 5510567  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||    
T  5510566 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctctcgcctgcgt 5510467  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||  ||| ||||    
T  5510466 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaagtctcatacttagaaagta 5510368  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  5510367 ttgagcagttgtaatct-tgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 5510274  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||| ||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  5510273 tgcctgtgtctttgtctttcttttctctgctc 5510242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 5520843 - 5520420
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  5520843 aagtttaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 5520745  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||    
T  5520744 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctctcgcctgcgt 5520645  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||  ||| ||||    
T  5520644 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaagtctcatacttagaaagta 5520546  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  5520545 ttgagcagttgtaatct-tgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 5520452  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||| ||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  5520451 tgcctgtgtctttgtctttcttttctctgctc 5520420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Original strand, 5547871 - 5548293
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  5547871 aagttcaaaagcgccaaaactttgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 5547969  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||| | |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  5547970 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtattgttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 5548069  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagtatt 304  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||  ||| ||||||    
T  5548070 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatacttagaaagtatt 5548168  T
Q  305 gagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||    
T  5548169 gagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactg 5548263  T
Q  405 cttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  5548264 cttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 5548293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Original strand, 5865962 - 5866386
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  5865962 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 5866060  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  5866061 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 5866160  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||   || ||||    
T  5866161 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcttgtgtgcttgagcattgttttgtgaagtctcatactttgaaagta 5866259  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  5866260 ttgagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 5866354  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  5866355 tgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 5866386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Original strand, 5876561 - 5876985
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  5876561 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 5876659  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  5876660 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 5876759  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||   || ||||    
T  5876760 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcttgtgtgcttgagcattgttttgtgaagtctcatactttgaaagta 5876858  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  5876859 ttgagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 5876953  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  5876954 tgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 5876985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 10099037 - 10098614
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  10099037 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 10098939  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  10098938 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 10098839  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||  ||| ||||    
T  10098838 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaagtctcatacttagaaagta 10098740  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  10098739 ttgagcagttgtaatct-tgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 10098646  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  10098645 tgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 10098614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 15 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 13131865 - 13131451
Alignment:
Q  15 aagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtctttattaca 114  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  |  |    
T  13131865 aagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtcttttctgta 13131767  T
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgagc 214  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||||||||||    
T  13131766 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttgagc 13131667  T
Q  215 attagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagtattgagcattt 312  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||  ||| ||||||||||| ||    
T  13131666 attagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatacttagaaagtattgagcagtt 13131568  T
Q  313 gtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtc 412  Q
    ||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||  |||||||||    
T  13131567 gtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataacagcttgtgtc 13131473  T
Q  413 --tctctgtcttttctctgctc 432  Q
      | ||| ||||||||||||||    
T  13131472 tttgtctttcttttctctgctc 13131451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 5 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 8774628 - 8774203
Alignment:
Q  5 acaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagt 104  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  8774628 acaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctaaaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagt 8774530  T
Q  105 ctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgc 204  Q
    ||||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||    
T  8774529 cttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgc 8774430  T
Q  205 gtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagag 300  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||  ||| ||    
T  8774429 gtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaagtctcatacttagaaag 8774331  T
Q  301 tattgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggata 400  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  8774330 tattgagcagttgtaatct-tgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggata 8774237  T
Q  401 attgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    | ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  8774236 actgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 8774203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 39382653 - 39382236
Alignment:
Q  13 aaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtctttatta 112  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |     
T  39382653 aaaagcgccaaaactctgtcaatttgatactacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattca-tagtctagagtcttttctg 39382555  T
Q  113 cattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttga 212  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||||||||    
T  39382554 tattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttga 39382455  T
Q  213 gcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagtattgagc 308  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  39382454 gcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaagtctcatacttagaaagtattgagc 39382356  T
Q  309 atttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttg 408  Q
    | ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  39382355 agttgtaatct-tgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttg 39382262  T
Q  409 tgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||  | ||| ||||||||||||||    
T  39382261 tgtctttgtctttcttttctctgctc 39382236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 7 - 411
Target Start/End: Original strand, 12297067 - 12297469
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  12297067 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattca-aagtctagagtct 12297165  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcg 205  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  12297166 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaatttcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctctcgcctgcg 12297265  T
Q  206 tgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagt 301  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||  ||| |||    
T  12297266 tgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaagtctcatacttagaaagt 12297364  T
Q  302 attgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataa 401  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  12297365 attgagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataa 12297459  T
Q  402 ttgcttgtgt 411  Q
     |||||||||    
T  12297460 ctgcttgtgt 12297469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 38205229 - 38204805
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38205229 aagtttaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattca-tagtctagagtct 38205131  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  38205130 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 38205031  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||  ||| ||||    
T  38205030 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaagtctcatacttagaaagta 38204932  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaa-gggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataa 401  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  38204931 ttgagcagttgtaatct-tgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaaggggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataa 38204838  T
Q  402 ttgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
     ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  38204837 ctgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 38204805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 3 - 411
Target Start/End: Original strand, 6490611 - 6491014
Alignment:
Q  3 atacaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctaga 102  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||    
T  6490611 atacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaaactgattctacaaagcacactgaatatctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtccaga 6490709  T
Q  103 gtctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcct 202  Q
    |||||||||  ||||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||    
T  6490710 gtctttattgtattgtattgagaacaccactaattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcct 6490809  T
Q  203 gcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagag 300  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||   || ||    
T  6490810 gcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagttttgtgaagtctcatactttgatag 6490908  T
Q  301 tattgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggata 400  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  6490909 tattgagcatttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggata 6491003  T
Q  401 attgcttgtgt 411  Q
    | |||||||||    
T  6491004 actgcttgtgt 6491014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 18484013 - 18483590
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  18484013 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 18483915  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  18483914 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 18483815  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||   || ||||    
T  18483814 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaagtctcatactttgaaagta 18483716  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  18483715 ttgagcagttgtaatct-tgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 18483622  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  18483621 tgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 18483590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Original strand, 24383785 - 24384209
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  24383785 aagtttaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 24383883  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  24383884 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 24383983  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||   || ||||    
T  24383984 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaagtctcatactttgaaagta 24384082  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| |||||     
T  24384083 ttgagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaagataac 24384177  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  24384178 tgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 24384209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 5 - 432
Target Start/End: Original strand, 28314496 - 28314922
Alignment:
Q  5 acaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagt 104  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28314496 acaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgatactacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattca-tagtctagagt 28314594  T
Q  105 ctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgta-ttttcgtttgaatagaagcctctcgcctg 203  Q
    ||||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||| |||| |||||| |||||| |||| |||||    
T  28314595 cttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtattttttgtttgattagaagtctcttgcctg 28314694  T
Q  204 cgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagaga 299  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||  ||| |    
T  28314695 cgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaagtctcatacttagaaa 28314793  T
Q  300 gtattgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggat 399  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  28314794 gtattgagcagttgtaatct-tgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggat 28314887  T
Q  400 aattgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    || ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  28314888 aactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 28314922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 5 - 411
Target Start/End: Original strand, 5628282 - 5628684
Alignment:
Q  5 acaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagt 104  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  5628282 acaagtttaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcta-agtctagagt 5628380  T
Q  105 ctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgc 204  Q
    ||||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||    
T  5628381 cttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctctcgcctgc 5628480  T
Q  205 gtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagag 300  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||  ||| ||    
T  5628481 gtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaagtctcatacttagaaag 5628579  T
Q  301 tattgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggata 400  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  5628580 tattgagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaa-ggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggata 5628673  T
Q  401 attgcttgtgt 411  Q
    | |||||||||    
T  5628674 actgcttgtgt 5628684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Original strand, 20673460 - 20673882
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  20673460 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgagttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 20673558  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  20673559 tttctgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 20673658  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca---tttgagaagtctcataccaagagagtat 303  Q
    |||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||   |||| ||||||||||||  ||| |||||    
T  20673659 gcttgagcattagaagtctcttac-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattttttgtgaagtctcatacttagaaagtat 20673757  T
Q  304 tgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataatt 403  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| |    
T  20673758 tgagcagttgtaatct-tgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggattggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataact 20673851  T
Q  404 gcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    |||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  20673852 gcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 20673882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 39372016 - 39371599
Alignment:
Q  13 aaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtctttatta 112  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |     
T  39372016 aaaagcgccaaaactctgtcaatttgatactacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattca-tagtctagagtcttttctg 39371918  T
Q  113 cattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttga 212  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||||||||    
T  39371917 tattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttga 39371818  T
Q  213 gcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagtattgagc 308  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||  ||||||||||    |||| ||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  39371817 gcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtatgcttgagcatagttttgtgaagtctcatacttagaaagtattgagc 39371719  T
Q  309 atttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttg 408  Q
    | ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  39371718 agttgtaatct-tgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttg 39371625  T
Q  409 tgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||  | ||| ||||||||||||||    
T  39371624 tgtctttgtctttcttttctctgctc 39371599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 7 - 411
Target Start/End: Original strand, 12287245 - 12287647
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  12287245 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattca-aagtctagagtct 12287343  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcg 205  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  12287344 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaatttcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctctcgcctgcg 12287443  T
Q  206 tgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagt 301  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||  ||| |||    
T  12287444 tgcttgagcattagaagtctcttg-gttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaagtctcatacttagaaagt 12287542  T
Q  302 attgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataa 401  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  12287543 attgagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataa 12287637  T
Q  402 ttgcttgtgt 411  Q
     |||||||||    
T  12287638 ctgcttgtgt 12287647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 37759639 - 37759216
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  37759639 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 37759541  T
Q  107 ttat-tacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcg 205  Q
    || | |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| |||||||    
T  37759540 ttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcg 37759441  T
Q  206 tgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagtat 303  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||| ||  ||| |||||    
T  37759440 tgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcacacttagaaagtat 37759342  T
Q  304 tgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataatt 403  Q
    |||| | ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||| ||||| |    
T  37759341 tgaggagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactgaactacttccgtgttgtggaaggaaccatgataact 37759247  T
Q  404 gcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    |||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  37759246 gcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 37759216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Original strand, 13372932 - 13373356
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  13372932 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctaaaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 13373030  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  13373031 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 13373130  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||  ||| ||||    
T  13373131 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcttgtgtgcttgagcatttttttgtgaagtctcatacttagaaagta 13373229  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
     |||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |||||||     
T  13373230 ctgagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaactaggataac 13373324  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  13373325 tgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 13373356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 3 - 432
Target Start/End: Original strand, 10655525 - 10655952
Alignment:
Q  3 atacaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctaga 102  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  10655525 atacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaaattgattctacaaagcacacagaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattca-aagtctaga 10655623  T
Q  103 gtctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgta-ttttcgtttgaatagaagcctctcgcc 201  Q
    ||||||| |  ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||| |||| ||||||  ||||| |||| |||    
T  10655624 gtctttactgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtattttttgtttgatcagaagtctcttgcc 10655723  T
Q  202 tgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagaga 299  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || ||| |||||||  |||| ||||||||||||  ||| |    
T  10655724 tgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgtttgagcatctttgtgaagtctcatacttagaaa 10655822  T
Q  300 gtattgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggat 399  Q
    |||||||||| ||||||||  ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  10655823 gtattgagcagttgtaatcgttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggat 10655917  T
Q  400 aattgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    || ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  10655918 aactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 10655952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Original strand, 504434 - 504857
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  504434 aagtttaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctaaaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 504532  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  504533 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 504632  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||   || ||||    
T  504633 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaagtctcatactttgaaagta 504731  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  504732 ttgagcagttgtaatct-tgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 504825  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||| ||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  504826 tgcctgtgtctttgtctttcttttctctgctc 504857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Original strand, 526800 - 527223
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  526800 aagtttaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctaaaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 526898  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  526899 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 526998  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||   || ||||    
T  526999 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaagtctcatactttgaaagta 527097  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  527098 ttgagcagttgtaatct-tgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 527191  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||| ||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  527192 tgcctgtgtctttgtctttcttttctctgctc 527223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 4743707 - 4743284
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  4743707 aagtttaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctaaaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 4743609  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  4743608 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 4743509  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||   || ||||    
T  4743508 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaagtctcatactttgaaagta 4743410  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  4743409 ttgagcagttgtaatct-tgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 4743316  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||| ||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  4743315 tgcctgtgtctttgtctttcttttctctgctc 4743284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 4754294 - 4753871
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  4754294 aagtttaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctaaaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 4754196  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  4754195 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 4754096  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||   || ||||    
T  4754095 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaagtctcatactttgaaagta 4753997  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  4753996 ttgagcagttgtaatct-tgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 4753903  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||| ||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  4753902 tgcctgtgtctttgtctttcttttctctgctc 4753871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Original strand, 13383526 - 13383950
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  13383526 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctaaaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 13383624  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  13383625 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 13383724  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||  | || |||||||||||    |||| ||||||||||||  ||| ||||    
T  13383725 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagttcttgagcattggaagactcttacttgtgtgcttgagcatttttttgtgaagtctcatacttagaaagta 13383823  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
     |||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  13383824 ctgagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 13383918  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  13383919 tgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 13383950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Original strand, 13394120 - 13394544
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  13394120 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctaaaaagtacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 13394218  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  13394219 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 13394318  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||  ||| ||||    
T  13394319 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcttgtgtgcttgagcatttttttgtgaagtctcatacttagaaagta 13394417  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
     |||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |||||||     
T  13394418 ctgagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaactaggataac 13394512  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  13394513 tgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 13394544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 16386044 - 16385621
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  16386044 aagtttaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 16385946  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  16385945 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 16385846  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||   || ||||    
T  16385845 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaagtctcatactttgaaagta 16385747  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  16385746 ttgagcagttgtaatct-tgtgatta----tagt-aaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 16385653  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||| ||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  16385652 tgcctgtgtctttgtctttcttttctctgctc 16385621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 35187346 - 35186923
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  35187346 aagtttaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctaaaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 35187248  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  35187247 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 35187148  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||   || ||||    
T  35187147 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaagtctcatactttgaaagta 35187049  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  35187048 ttgagcagttgtaatct-tgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 35186955  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||| ||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  35186954 tgcctgtgtctttgtctttcttttctctgctc 35186923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 41683647 - 41683224
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  41683647 aagtttaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctaaaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 41683549  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  41683548 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 41683449  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||   || ||||    
T  41683448 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaagtctcatactttgaaagta 41683350  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  41683349 ttgagcagttgtaatct-tgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 41683256  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||| ||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  41683255 tgcctgtgtctttgtctttcttttctctgctc 41683224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 41694216 - 41693793
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  41694216 aagtttaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctaaaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 41694118  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  41694117 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 41694018  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||   || ||||    
T  41694017 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaagtctcatactttgaaagta 41693919  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  41693918 ttgagcagttgtaatct-tgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 41693825  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||| ||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  41693824 tgcctgtgtctttgtctttcttttctctgctc 41693793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 3 - 431
Target Start/End: Original strand, 10627203 - 10627629
Alignment:
Q  3 atacaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctaga 102  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  10627203 atacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaaattgattctacaaagcacacagaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattca-aagtctaga 10627301  T
Q  103 gtctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgta-ttttcgtttgaatagaagcctctcgcc 201  Q
    ||||||| |  ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||| |||| ||||||  ||||| |||| |||    
T  10627302 gtctttactgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtattttttgtttgatcagaagtctcttgcc 10627401  T
Q  202 tgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagaga 299  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||  ||| |    
T  10627402 tgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatctttgtgaagtctcatacttagaaa 10627500  T
Q  300 gtattgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggat 399  Q
    |||||||||| ||||||||  ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||     
T  10627501 gtattgagcagttgtaatcgttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactgtactacttccgtgttgtggaaggaaccaggaa 10627595  T
Q  400 aattgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgct 431  Q
    || ||||||||||  | ||| |||||||||||||    
T  10627596 aactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgct 10627629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 5 - 432
Target Start/End: Original strand, 28325112 - 28325536
Alignment:
Q  5 acaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagt 104  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28325112 acaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgatactacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattca-tagtctagagt 28325210  T
Q  105 ctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgta-ttttcgtttgaatagaagcctctcgcctg 203  Q
    ||||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||| |||| |||||| |||||| |||| ||||     
T  28325211 cttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtattttttgtttgattagaagtctcttgcct- 28325309  T
Q  204 cgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagaga 299  Q
     |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||  ||| |    
T  28325310 -gtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaagtctcatacttagaaa 28325407  T
Q  300 gtattgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggat 399  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  28325408 gtattgagcagttgtaatct-tgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggat 28325501  T
Q  400 aattgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    || ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  28325502 aactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 28325536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 24659869 - 24659446
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  24659869 aagtttaaaagcaccaaaactctgtcaatttgattctaaaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 24659771  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||  |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  24659770 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttctgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 24659671  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||   || ||||    
T  24659670 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaagtctcatactttgaaagta 24659572  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  24659571 ttgagcagttgtaatct-tgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 24659478  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||| ||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  24659477 tgcctgtgtctttgtctttcttttctctgctc 24659446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 76 - 413
Target Start/End: Original strand, 11206408 - 11206741
Alignment:
Q  76 tacatcttagaaattcactagtctagagtctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtat 175  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||    
T  11206408 tacatcttagaaattcaaaagtctagagtctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttatttcattgtat 11206507  T
Q  176 tttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca 275  Q
    ||| ||||||  ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || |  |||||||||||    
T  11206508 ttttgtttgatcagaagactcttgcctgcgtgcttgagtattagaagactcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtatgtgcttgagca 11206606  T
Q  276 --tttgagaagtctcataccaagagagtattgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactac 373  Q
      |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11206607 tttttgagaagtctcatacttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactac 11206701  T
Q  374 ttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtct 413  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  11206702 ttccgatttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtct 11206741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 24670449 - 24670026
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  24670449 aagtttaaaagcaccaaaactctgtcaatttgattctaaaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 24670351  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||  |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  24670350 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattatatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttctgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 24670251  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||   || ||||    
T  24670250 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaagtctcatactttgaaagta 24670152  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  24670151 ttgagcagttgtaatct-tgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 24670058  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||| ||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  24670057 tgcctgtgtctttgtctttcttttctctgctc 24670026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 70 - 428
Target Start/End: Original strand, 31114316 - 31114677
Alignment:
Q  70 atttgatacatcttagaaattcactagtctagagtcttt--attacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaag-tcaaacatatt 166  Q
    |||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||  ||    
T  31114316 atttgatatatcttagaaattcttaagtctagagtctttcaattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattt 31114415  T
Q  167 tctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgt 266  Q
    ||| |||| ||  |||||| |||||| |||| || |  ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  31114416 tctgtgtaattctgtttgattagaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgcgt 31114515  T
Q  267 gcttgagcatttgagaagtctcataccaagagagtattgagcatttgtaatctgtgtgattattt-ttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggac 365  Q
    |||||||||||   |||||||||||| | |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31114516 gcttgagcattattgaagtctcatactaggt-agtattgagcagttgtaatctgtgtgattatttcttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggac 31114614  T
Q  366 tggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtctctctgtcttttctct 428  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31114615 tggactacttccggtttgtggaaggaaccagtataattgcttgtgtctctctttcttttctct 31114677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 114 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 4433622 - 4433328
Alignment:
Q  114 attgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgag 213  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| |||||||||||||||    
T  4433622 attgtattgtgaacaccactgattgtatatgaagtgttcaagtcaaacatatttccctgtatttttgtttgatcagaagactcttgcctgcgtgcttgag 4433523  T
Q  214 cattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca-tttgagaagtctcataccaagagagtattgagcattt 312  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  4433522 cattggaagactcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcctgtgtgcttgagcattttgagaagtctcatacttagagagtattgagcattt 4433424  T
Q  313 gtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtc 412  Q
    ||||||| ||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  4433423 gtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaaccaagataactgcttgtgtc 4433329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 44 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 17006928 - 17006538
Alignment:
Q  44 acaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagag--tcttt--attacattgtattgtgaacactactgattgt 139  Q
    ||||||||| ||||||||| |   | |||||||| |||||||||||||   |||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  17006928 acaaagcactttgaatttctgtgttcatttgatatatcttagaaattcttaagtctagagagtctttcaatttcattgtattgtgaacaccactgattgt 17006829  T
Q  140 atatctagtgttcaag-tcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgc 238  Q
    ||||| |||||||||  |||||||  ||||| |||| ||  ||||||||| ||| |||| || |  |||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  17006828 atatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatataagtctcttgctttagtgcttgagcataagaagtctcttgctttagtgc 17006729  T
Q  239 ttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagag-agtattgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtg 337  Q
    |||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | | | ||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||    
T  17006728 ttgagcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcatttgtgaagtctcatactaggtgtagtattgagcagttgtaatctgtgtgattaaacttagtg 17006629  T
Q  338 gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtctctctgtcttttctct 428  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  17006628 gaaatctccttggaagtgcaagggggactagactacttccagtttgtggaagaaaccagtataatcgcttgtgtctctctttcttctctct 17006538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 90 - 413
Target Start/End: Original strand, 14258412 - 14258732
Alignment:
Q  90 tcactagtctagagtctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacata-tttctctgta-ttttcgtttgaat 187  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||| ||||| |||| ||||||      
T  14258412 tcacaagtctagagtctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaagatattttccctgtattttttgtttgatc 14258511  T
Q  188 agaagcctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca-tttgagaagtc 286  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  14258512 agaagactcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcctgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcctgtgtgcttgagcattttgagaagtc 14258610  T
Q  287 tcataccaagagagtattgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtgg 386  Q
    ||||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14258611 tcatacttagagagtattcagcatttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtgg 14258705  T
Q  387 aagaaaccaggataattgcttgtgtct 413  Q
    ||| ||| ||||||| ||||| |||||    
T  14258706 aaggaacaaggataactgcttatgtct 14258732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 46 - 426
Target Start/End: Original strand, 51989451 - 51989834
Alignment:
Q  46 aaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtcttt--attacattgtattgtgaacactactgattgtatat 143  Q
    ||||||| ||||||||| |   |||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  51989451 aaagcactttgaatttctgtgttgatttgatatatcttagaaattcttaagtctagagtctttcaattgcattgtattgtgaacaccactgatagtatat 51989550  T
Q  144 ctagtgttcaag-tcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttga 242  Q
    | |||||||||  |||||||  || || |||| ||  |||||| |||||| |||| |  |  |||||||||||   |||| |||||||||||||||||||    
T  51989551 caagtgttcaaactcaaacaatttactgtgtaattctgtttgattagaagtctcttgttttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgctttagtgcttga 51989650  T
Q  243 gcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagagagtattgagcatttgtaatctgtgtgattattt-ttagtggaaa 341  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| | |  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  51989651 gcataggaagtctcttgcctgtgtgcttgagcatttgtgaagtctcatactaggt-agtattgagcagttgtaatctgtatgattatttcttagtggaaa 51989749  T
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtctctctgtcttttct 426  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  51989750 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaatcagtataattgcttgtgtctctctttcttttct 51989834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 205 - 432
Target Start/End: Original strand, 15663200 - 15663427
Alignment:
Q  205 gtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagagagtatt 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  15663200 gtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcata-ctagagagtatt 15663298  T
Q  305 gagcatttgtaatctgtgtgattat-ttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataatt 403  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| |||||||||||||    
T  15663299 gagcatttgtaatctttgtgattatctcttagtgaaaatctccttgaaagtgcaagggggactggtctactttcagtttgtggaaggaaccaggataatt 15663398  T
Q  404 gcttgtgtctctctgtcttttctctgctc 432  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  15663399 gcttgtgtctatctttcttttctctgctc 15663427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 208 - 429
Target Start/End: Original strand, 15651568 - 15651789
Alignment:
Q  208 cttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagagagtattgag 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  15651568 cttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagtattggaagtctctcgcctacgtgcttgagcatttgagaagtctcata-ctagagagtattgag 15651666  T
Q  308 catttgtaatctgtgtgattat-ttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgct 406  Q
    |||||||||||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15651667 catttgtaatctttgtgattatctcttagtgaaaatctccttggaagtgcaagggggactagactacttccggtttgtggaaggaaccaggataattgct 15651766  T
Q  407 tgtgtctctctgtcttttctctg 429  Q
    || |||| ||| |||||||||||    
T  15651767 tgcgtctatctttcttttctctg 15651789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 70 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 22150954 - 22150590
Alignment:
Q  70 atttgatacatcttagaaattcactagtctagag--tcttt--attacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaag-tcaaacata 164  Q
    |||||||| |||||||||||||   |||||||||  |||||  ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||      
T  22150954 atttgatatatcttagaaattcttaagtctagagagtctttcaattgcattgttttgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaat 22150855  T
Q  165 tttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgc 264  Q
    ||||| |||| ||  ||||||||||||| |||| || |  ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||    
T  22150854 tttctgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctctttcctgc 22150755  T
Q  265 gtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagag-agtattgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaaggggg 363  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | | | ||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22150754 gtgcttgagcatttgtgaagtctcatactaggtgtagtattgagcagttgtaatctgtgtgattaaacttagtggaaatctccttggaagtgcaaggggg 22150655  T
Q  364 actggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtctctctgtcttttctct 428  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||| |||||    
T  22150654 actggactacttccggtttgtgaaaggaaccagtataattgcatgtgtctctctttcttctctct 22150590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 28169056 - 28168811
Alignment:
Q  3 atacaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctaga 102  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28169056 atacaagttaaaaagcgccaaaaccctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcacaagtctaga 28168957  T
Q  103 gtctttattacattgta-ttgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgc 200  Q
    || |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| |||| ||    
T  28168956 gtttttattgcattgtatttgtgaacactactgattgtatatcaagtgttcaaggtcaaacat-tttctctgtatttttgtttgaacagaagtctcttgc 28168858  T
Q  201 ctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcatt 247  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  28168857 ctgtgtgcttgagcattagaagactcttgcgtgcgtgcttgagcatt 28168811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 46 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 14581068 - 14580685
Alignment:
Q  46 aaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtcttt-attacattgtattgtgaacactactgattgtatatc 144  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||  |||   ||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14581068 aaagcactttgaatttcttcactgatttgatatatcttagaaattc--tag---agagtcttttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatc 14580974  T
Q  145 tagtgttcaag-tcaaacatattt-ctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttga 242  Q
     |||||||||  |||||||||||| || |||| ||  ||||||||||||| |||| || |  ||||||||||||| |||| ||||||| |  ||||||||    
T  14580973 aagtgttcaaactcaaacatattttctgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttgctttagtgcttgagcattggaagtctcttgcctgcgtgcttga 14580874  T
Q  243 gcattgga--agtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagagagtattgagcatttgtaatctgtgtgattatt--tttagtgg 338  Q
    ||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||||     
T  14580873 gcatttgagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcatactt-gaaagtattgagcagttgtaatctgtgagattattgatttagtga 14580775  T
Q  339 aaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtctctctgtcttttctctgctc 432  Q
    |||||||||||||||||||||||    | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14580774 aaatctccttggaagtgcaaggg----tagactacttccggattgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctctctttcttttctctgctc 14580685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 224 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 27172618 - 27172426
Alignment:
Q  224 ctcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagagagtattgagcatttgtaatctgtgt 323  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||    
T  27172618 ctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcatacta-gagagtattgagcagttgtaatctgtgt 27172520  T
Q  324 gattatt--tttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtctct 415  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27172519 gattattgatttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggattgtggaaggaaccaggataattgcttgtgtctct 27172426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 13 - 277
Target Start/End: Original strand, 15662977 - 15663242
Alignment:
Q  13 aaaagcgtcaaaactctgtcaa-tttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtctttatt 111  Q
    ||||||| |||||||||| ||| |||||||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||| ||||    
T  15662977 aaaagcgccaaaactctgccaaatttgattctaaacagcactttgaatttctgcactgatttgatatatcttagaaattcttaagtctagagtctgtatt 15663076  T
Q  112 acattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttg 211  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||| ||  |||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  15663077 gcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacatttttctgtgtaattctgtttgattagaagtctctcgcctgcgtgcttg 15663176  T
Q  212 agcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatt 277  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || |  |||||||||||||    
T  15663177 agcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcatt 15663242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 43 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 41045478 - 41045086
Alignment:
Q  43 tacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagag--tcttt--attacattgtattgtgaacactactgattg 138  Q
    |||||||||| |||||||||     |||||||||| |||||||||||||   |||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||| ||  || |    
T  41045478 tacaaagcactttgaatttctatgttgatttgatatatcttagaaattcttaagtctagagagtctttcaattgcattgtattgtgaacaccaccaatag 41045379  T
Q  139 tatatctagtgttcaag-tcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtg 237  Q
    |||||| |||||||||  |||||||  ||||| |||| ||  |||||| |||||| |||| || |   |||||||||||  |||| ||||||||||||||    
T  41045378 tatatcaagtgttcaaactcaaacaactttctgtgtaattctgtttgattagaagtctcttgctttaatgcttgagcataggaagtctcttgctttagtg 41045279  T
Q  238 cttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagag-agtattgagcatttgtaatctgtgtgattattt-ttag 335  Q
    ||||||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||| | | | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  41045278 cttgagcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttgaacatttgtgaagtctcatactaggtgtagtattgagcagttgtaatctgtgtgattatttcttag 41045179  T
Q  336 tggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtctctctgtcttttctct 428  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||| ||| || ||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  41045178 tggaaatctccttggaagtgcaagggggattggactacttccagtttgtagaaggaactagtataattgtttgtgtctctctttcttttctct 41045086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 217 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 10528931 - 10528724
Alignment:
Q  217 tagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagag-agtattgagcatttgta 315  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| | | | ||||||||||| |||||    
T  10528931 tagaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcatttatgaagtctcatactaggtgtagtattgagcagttgta 10528832  T
Q  316 atctgtgtgattattt-ttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtctc 414  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10528831 atctgtgtgattatttcttagtggaaatctccttggaagttcaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaaccaggataattgcttgtgtctc 10528732  T
Q  415 tctgtctt 422  Q
    ||| ||||    
T  10528731 tctttctt 10528724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 5 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 8785213 - 8784973
Alignment:
Q  5 acaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagt 104  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  8785213 acaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctaaaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagt 8785115  T
Q  105 ctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgc 204  Q
    ||||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||    
T  8785114 cttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgc 8785015  T
Q  205 gtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcat 246  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||    
T  8785014 gtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcat 8784973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 7 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 14465560 - 14465336
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  14465560 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 14465462  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  14465461 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 14465362  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctt 232  Q
    |||||||||||||||| |||||||||    
T  14465361 gcttgagcattagaagtctcttgctt 14465336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 21 - 257
Target Start/End: Original strand, 15651350 - 15651587
Alignment:
Q  21 caaaactctgtcaa-tttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtctttattacattgta 119  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||| |||| |||||||    
T  15651350 caaaactctgccaaatttgattctaaacagcactttgaatttctgcactgatttgatatatcttagaaattcttaagtctagagtctgtattgcattgta 15651449  T
Q  120 ttgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgagcattag 219  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||| ||  |||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  15651450 ttgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacatttttctgtgtaattctgtttgattagaagtctctcgcctacgtgcttgagcattag 15651549  T
Q  220 aagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctct 257  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||    
T  15651550 aagactcttgctttagtccttgagcattagaagactct 15651587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 217 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 17017586 - 17017374
Alignment:
Q  217 tagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagag-agtattgagcatttgta 315  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | | | ||||||||||| |||||    
T  17017586 tagaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcatttgtgaagtctcatactaggtgtagtattgagcagttgta 17017487  T
Q  316 atctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtctct 415  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  17017486 atctgtgtgattaaacttagtggaaatctccttggaagtacaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaaccagtataatcgcttgtgtctct 17017387  T
Q  416 ctgtcttttctct 428  Q
    || |||| |||||    
T  17017386 ctttcttctctct 17017374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 70 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 15833116 - 15832752
Alignment:
Q  70 atttgatacatcttagaaattcactagtctagag--tcttta--ttacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaag-tcaaacata 164  Q
    |||||||| |||||||||||||   |||||||||  |||||   || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||      
T  15833116 atttgatatatcttagaaattcttaagtctagagagtctttcatttgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaat 15833017  T
Q  165 tttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgc 264  Q
    ||||| |||| ||  ||||||||||||| |||| || |  || |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  15833016 tttctgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttgctttagttcttgagcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgc 15832917  T
Q  265 gtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagag-agtattgagcatttgtaatctgt-gtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggg 362  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||||| | | | ||||||||||| |||||||| || |||||||   |||||| || |||||||||||||||||||||    
T  15832916 gtgcttgagcaattt-gaagtctcatactaggtgtagtattgagcagttgtaatcagttgtgattaaacttagtgaaactctccttggaagtgcaagggg 15832818  T
Q  363 gactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtctctctgtcttttctct 428  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| ||| |||| |||||    
T  15832817 gactggactacttccggtttgtggaaggaaccagtataattgcctgtgtctttctttcttctctct 15832752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 249 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 21735896 - 21735713
Alignment:
Q  249 gaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagagagtattgagcatttgtaatctgtgtgattattt-ttagtggaaatctcct 347  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21735896 gaagtctcttgcctgcgtgcttgagcatttgggaagtctcatacta-gatagtattgagcagttgtaatttgtgtgattatttcttagtggaaatctcct 21735798  T
Q  348 tggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtctctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  21735797 tggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaaccaggataattgcttgtgtctctctttcttttctttgctc 21735713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 70 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 49989969 - 49989605
Alignment:
Q  70 atttgatacatcttagaaattcactagtctagag--tcttta--ttacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaag-tcaaacata 164  Q
    |||||||| |||||||||||||   |||||||||  |||||   || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||      
T  49989969 atttgatatatcttagaaattcttaagtctagagagtcttttatttgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaat 49989870  T
Q  165 tttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgc 264  Q
    ||| | |||| ||  ||||||||||||| |||| || |  ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  49989869 tttatgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgc 49989770  T
Q  265 gtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagag-agtattgagcatttgtaatctgt-gtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggg 362  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||||| | | | ||||||||||| |||||||| || |||||||   |||||| || |||||||||||||||||||||    
T  49989769 gtgcttgagcaattt-gaagtctcatactaggtgcagtattgagcaattgtaatcagttgtgattaaacttagtgaaactctccttggaagtgcaagggg 49989671  T
Q  363 gactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtctctctgtcttttctct 428  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||| ||| |||| |||||    
T  49989670 gactggactacttccggtttgtggaaggaaccagtataattgtctgtgtctttctttcttctctct 49989605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 113 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 13953924 - 13953607
Alignment:
Q  113 cattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaag-tcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttg 211  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||  ||||| |||| ||  ||||||||||||| |||| || |  |||||||    
T  13953924 cattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctatgtaattctgtttgaatagaagtctcttgctttagtgcttg 13953825  T
Q  212 agcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagag-agtattgagcat 310  Q
    |||||  |||| |||||||||  |||||||||||  |||||||||| || || ||||||||||| ||  |||||||||||| | | | |||||||||||     
T  13953824 agcataggaagtctcttgcttgtgtgcttgagcaaaggaagtctcttgcttgtgtgcttgagcaattt-gaagtctcatactaggtgtagtattgagcag 13953726  T
Q  311 ttgtaatctgt-gtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgt 409  Q
    |||||||| || |||||||   |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||    
T  13953725 ttgtaatcagttgtgattaaacttagtgaaactctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaaccagtataattgcctgt 13953626  T
Q  410 gtctctctgtcttttctct 428  Q
    |||| ||| ||||||||||    
T  13953625 gtctttctttcttttctct 13953607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 218 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 28168870 - 28168659
Alignment:
Q  218 agaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattt--gagaagtctcataccaagagagtattgagcatttgta 315  Q
    ||||| ||||||| |  ||||||||||||| |||| |||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  28168870 agaagtctcttgcctgtgtgcttgagcattagaagactcttgcgtgcgtgcttgagcatttttgagaagtctcatacttagagagtattgagcatttgta 28168771  T
Q  316 atctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtctc- 414  Q
    |||| |||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | ||||||||||     
T  28168770 atctttgtgattat----agtg-aaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaaccaggataactacttgtgtctcg 28168676  T
Q  415 tctgtcttttctctgct 431  Q
    | | |||||||||||||    
T  28168675 tttttcttttctctgct 28168659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 238 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 13601973 - 13601801
Alignment:
Q  238 cttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattt--gagaagtctcataccaagagagtattgagcatttgtaatctgtgtgattatttttag 335  Q
    ||||||||||||||| |||| || || ||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    ||    
T  13601973 cttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcatacttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgattat----ag 13601878  T
Q  336 tggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtct 413  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  13601877 tg-aaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccaatttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtct 13601801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 219 - 413
Target Start/End: Original strand, 15194516 - 15194707
Alignment:
Q  219 gaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattt--gagaagtctcataccaagagagtattgagcattt-gta 315  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |  || ||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||    
T  15194516 gaagactcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgtgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcatacttagagagtattgagcattttgta 15194614  T
Q  316 atctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtct 413  Q
    |||| |||||||||    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  15194615 atctttgtgattat----agtg-aaatctcctaggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtct 15194707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 113 - 428
Target Start/End: Original strand, 12753120 - 12753438
Alignment:
Q  113 cattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaag-tcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttg 211  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||  |||||||  ||||| |||| ||  ||||||||||||| |||| || |  |||||||    
T  12753120 cattgtattgtgaacaccaatgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttgctttagtgcttg 12753219  T
Q  212 agcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagag-agtattgagcat 310  Q
    |||||  |||| ||||| | |  |||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||||| ||  |||||||||||| | | | |||||||||||     
T  12753220 agcataggaagtctctttcctgtgtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgtgtgcttgagcaatt-tgaagtctcatactaggtgtagtattgagcag 12753318  T
Q  311 ttgtaatctg-tgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttg 408  Q
    |||||||| | ||||||||   |||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| | |||||| | ||    
T  12753319 ttgtaatcagttgtgattaaacttagtgaaactctccttggaagtgcaagggggacaggactgacttccggtttgtggaaggaacctgtataattacctg 12753418  T
Q  409 tgtctctctgtcttttctct 428  Q
    ||||| ||| |||| |||||    
T  12753419 tgtctttctttcttctctct 12753438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 234 - 389
Target Start/End: Original strand, 18857426 - 18857577
Alignment:
Q  234 agtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattt-gagaagtctcataccaagagagtattgagcatttgtaatctgtgtgattatttt 332  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||        
T  18857426 agtgcttgagcattggaagactcttgcctgtgtgcttgagcattttgagaagtctcatacttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgatta---- 18857521  T
Q  333 tagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaag 389  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18857522 tagt-gaaatctccttagaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaag 18857577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 217 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 13147851 - 13147637
Alignment:
Q  217 tagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagag-agtattgagcat-ttgt 314  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||  | |||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||| | | | |||||||||||  ||||    
T  13147851 tagaagtctcttgctttagtgcttgatcaaagtaagtctcttgcctgcgtgcttgagcaattttgaagtctcatactaggtgtagtattgagcaagttgt 13147752  T
Q  315 aatctgt-gtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtct 413  Q
    |||| || |||||||   |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  13147751 aatcagttgtgattaaacttagtgaaactctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaaccagtataattgcatgtgtct 13147652  T
Q  414 ctctgtcttttctct 428  Q
     ||| |||| |||||    
T  13147651 ttctttcttctctct 13147637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 13 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 21736074 - 21735868
Alignment:
Q  13 aaaagcgtcaaaactctgtcaa-tttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtcttt-at 110  Q
    ||||||| | |||||||| ||| |||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||| ||    
T  21736074 aaaagcgcccaaactctgccaaatttgattctcaaaagcactttgaatttctgcactgatttgatatatcttagaaattcttaagtctagagtcttttat 21735975  T
Q  111 tacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgctt 210  Q
    | ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||  ||| | |||| ||  |||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  21735974 tgcattgtattgtgaacaccaccgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacaattttttgtgtaattctgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgctt 21735875  T
Q  211 gagcatt 217  Q
    |||||||    
T  21735874 gagcatt 21735868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 276 - 413
Target Start/End: Original strand, 19121376 - 19121508
Alignment:
Q  276 tttgagaagtctcataccaagagagtattgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactactt 375  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19121376 tttgagaagtctcatacttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgattat----agtg-aaatctccttggaagtgcaagggggactggactactt 19121470  T
Q  376 ccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtct 413  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  19121471 ccgatttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtct 19121508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 215 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 8785034 - 8784817
Alignment:
Q  215 attagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcat----ttgagaagtctcataccaagagagtattgagcat 310  Q
    |||||||| ||||||| |  |||||||||||||||||| |||| || || ||||||||||||    ||| ||||||||||||  ||| |||||||||||     
T  8785034 attagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaagtctcatacttagaaagtattgagcag 8784935  T
Q  311 ttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtg 410  Q
    ||||||||| |||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  8784934 ttgtaatct-tgtgattat----agtg-aaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtg 8784841  T
Q  411 tc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||  | ||| ||||||||||||||    
T  8784840 tctttgtctttcttttctctgctc 8784817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 3 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 4456890 - 4456781
Alignment:
Q  3 atacaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcac-tagtctag 101  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  4456890 atacaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttctgcactgatttgatatatcttagaaattcacaaagtctag 4456791  T
Q  102 agtctttatt 111  Q
    ||||||||||    
T  4456790 agtctttatt 4456781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 205 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 15848710 - 15848486
Alignment:
Q  205 gtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagag-agtat 303  Q
    ||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||| | | | |||||    
T  15848710 gtgcttgagcatagaaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcaattt-gaagtctcatactaggtgtagtat 15848612  T
Q  304 tgagcatttgtaatctgt-gtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    |||||| |||||||| || |||||||   |||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  15848611 tgagcagttgtaatcagttgtgattaaacttagtgaaactctctttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaaccagtataat 15848512  T
Q  403 tgcttgtgtctctctgtcttttctct 428  Q
    ||  ||||||| ||| |||| |||||    
T  15848511 tgtctgtgtctttctttcttctctct 15848486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 70 - 428
Target Start/End: Original strand, 11909492 - 11909857
Alignment:
Q  70 atttgatacatcttagaaattcactagtctagag--tcttt--attacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttca-agtcaaacata 164  Q
    |||||||| |||||||||||||   ||| |||||  |||||  ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||      
T  11909492 atttgatatatcttagaaattcttaagtttagagagtctttcaattgcattgtgttgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcacactcaaacaat 11909591  T
Q  165 tttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgc 264  Q
    ||||| |||| ||  ||||||||||||| |||| || |  ||||||||||||  |||| |||||||||  | |||||||||  |||||| ||| |||||     
T  11909592 tttctgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgcttgtgggcttgagcaaaggaagtttcttgcctgt 11909691  T
Q  265 gtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagag-agtattgagcatttgtaatctg-tgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggg 362  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||||| | | | ||||||||||| |||||||| | ||||||||   |||||| || |||| |||||||||||||||     
T  11909692 gtgcttgagcaatt-tgaagtctcatactaggtgtagtattgagcagttgtaatcagttgtgattaaacttagtgaaactctcattggaagtgcaaggga 11909790  T
Q  363 gactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtctctctgtcttttctct 428  Q
    ||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| | ||| |||| |||||    
T  11909791 gacaggactgactttcggtttgtggaaggaaccagtataattgcctgtgtatttctttcttctctct 11909857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 217 - 423
Target Start/End: Original strand, 45862162 - 45862370
Alignment:
Q  217 tagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagag-agtattgagcatttgta 315  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || || ||||||||||| ||  |||||||||||| | | | ||||||||||| |||||    
T  45862162 tagaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgcttgtgtgcttgagcaatt-tgaagtctcatactaggtgcagtattgagcagttgta 45862260  T
Q  316 atctg-tgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtct 413  Q
    ||| | ||||||||   |||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| | |||||||| |||||||    
T  45862261 atcagttgtgattaaacttagtgaaactctccttggaagtgcaagggggacaggactgacttccggtttgtggaaggaacctgtataattgcctgtgtct 45862360  T
Q  414 ctctgtcttt 423  Q
     ||| |||||    
T  45862361 ttctttcttt 45862370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 100 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 17961223 - 17961073
Alignment:
Q  100 agagtcttt-attacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctc 198  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||  |||||| | |||||| ||||||||||||| ||||     
T  17961223 agagtctttcattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtccaaccaatttctttatatttttgtttgaatagaagtctctt 17961124  T
Q  199 gcctgcgtgcttgagcatt--agaagactcttgctttagtgcttgagcatt 247  Q
    ||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17961123 gcctgtgtgcttgagcatttgagaagtctcttgctttagtgcttgagcatt 17961073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 216 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 37412193 - 37411979
Alignment:
Q  216 ttagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagag-agtattgagcatttgt 314  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| || || ||||||||||| ||  |||||||||||| | | | ||||||||||| ||||    
T  37412193 ttagaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgcttgtgtgcttgagcaatt-tgaagtctcatactaggtgtagtattgagcagttgt 37412095  T
Q  315 aatctg-tgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtc 412  Q
    |||| | ||||||||   |||||| || ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||    
T  37412094 aatcagttgtgattaaacttagtgaaactctccttggaagtgcaagggggacaagactgacttccggtttgtggaaggaacctgtataattgcttgtgtc 37411995  T
Q  413 tctctgtcttttctct 428  Q
    | ||| |||| |||||    
T  37411994 tttctttcttctctct 37411979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 276 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 33650900 - 33650747
Alignment:
Q  276 tttgagaagtctcataccaagagagtattgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactactt 375  Q
    |||| ||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33650900 tttgtgaagtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattat----agtg-aaatctccttggaagtgcaagggggactggactactt 33650806  T
Q  376 ccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    |||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  33650805 ccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 33650747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 249 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 17961133 - 17960949
Alignment:
Q  249 gaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagagagtattgagcatttgtaatctgtgtgattattt--ttagtggaaatctcc 346  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | |    || |  |||||||||||||||||| | |||||||   |||||| |||||| |    
T  17961133 gaagtctcttgcctgtgtgcttgagcatttgagaagtctcttgcttt-agtgc-ttgagcatttgtaatctgagagattattgagttagtgaaaatcttc 17961036  T
Q  347 ttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggat-aattgcttgtgtctc-tctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  17961035 ttggaagtgcaagggggactggactacttccggattgtggaaggaaccagtataaattgcttgtgtctcatct-tcttttctctgctc 17960949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 299 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 11530474 - 11530344
Alignment:
Q  299 agtattgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccagga 398  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||    
T  11530474 agtattgagcagttgtaatctttgtgattat----agtg-aaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccagga 11530380  T
Q  399 taattgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||| ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  11530379 taactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 11530344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 70 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 15848910 - 15848699
Alignment:
Q  70 atttgatacatcttagaaattcactagtctagag--tcttta--ttacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaag-tcaaacata 164  Q
    |||||||| |||||||||||||   |||||||||  |||||   || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||      
T  15848910 atttgatatatcttagaaattcttaagtctagagagtctttcatttgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaat 15848811  T
Q  165 tttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgc 264  Q
    ||||| |||| ||  ||||||||||||| |||| |  |  ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |      
T  15848810 tttctatgtaattctgtttgaatagaagtctcttgttttagtgcttgagcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgcttta 15848711  T
Q  265 gtgcttgagcat 276  Q
    ||||||||||||    
T  15848710 gtgcttgagcat 15848699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 338 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 13076535 - 13076460
Alignment:
Q  338 gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtct 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  13076535 gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgttttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtct 13076460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 113 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 51340672 - 51340509
Alignment:
Q  113 cattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaag-tcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttg 211  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||  ||| | |||| ||  ||||||||||||| |||| || |   ||||||    
T  51340672 cattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttatgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttgctttaatgcttg 51340573  T
Q  212 agcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca 275  Q
    |||||  |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||    
T  51340572 agcataggaagtctcttgctttaatgcttgagcataggaagtctcttgcctgtgtgcttgagca 51340509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 206 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 51340548 - 51340340
Alignment:
Q  206 tgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagag-agtatt 304  Q
    |||||||||||  |||| ||||||| |  |||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||| |||||||| | | | ||||||    
T  51340548 tgcttgagcataggaagtctcttgcctgtgtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcaattt-gaaatctcatactaggtgtagtatt 51340450  T
Q  305 gagcatttgtaatctgt-gtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||| |||||||| || |||||||   |||||| || |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||| ||| |||| | |||||    
T  51340449 gagcagttgtaatcagttgtgattaaacttagtgaaactctccttggaagtgcaagggggagaggactgacttccgttttgtgaaaggaacctgtataat 51340350  T
Q  403 tgcttgtgtc 412  Q
    ||||||||||    
T  51340349 tgcttgtgtc 51340340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 113 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 18006154 - 18005987
Alignment:
Q  113 cattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttga 212  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||  ||||||||||||| |||| || |  ||||||||    
T  18006154 cattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaaccaatttct-tgtatttgtgtttgaatagaagtctcttgctttagtgcttga 18006056  T
Q  213 gcattagaagactcttgctttagtgcttgagcat-tg-gaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttg 279  Q
    ||||  |||| ||||||| |  |||||||||||| || ||||||||| || |  |||||||||||||||    
T  18006055 gcataggaagtctcttgcctgtgtgcttgagcatctgagaagtctcttgctttagtgcttgagcatttg 18005987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 338 - 413
Target Start/End: Original strand, 7608864 - 7608939
Alignment:
Q  338 gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtct 413  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  7608864 gaaatctccttggaagtgcaagggggactggagtacttccgatttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtct 7608939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #146
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 338 - 432
Target Start/End: Original strand, 35579015 - 35579111
Alignment:
Q  338 gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  35579015 gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcctgtgtctttgtctttcttttctctgctc 35579111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #147
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 27172796 - 27172565
Alignment:
Q  13 aaaagcgtcaaaactctgtcaa-tttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtcttt-at 110  Q
    ||||||| | |||||||| ||| |||| ||||  ||||||| ||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||  |||   ||||||||| ||    
T  27172796 aaaagcgcccaaactctgccaaatttgtttctcaaaagcactttgaatttctgcattgatttgatatatcttagaaattc--tag---agagtcttttat 27172702  T
Q  111 tacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgct 209  Q
    | |||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||  ||||| |||| ||  ||||||||| ||| |||| || |  |||||    
T  27172701 tgcattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacgtcaaacaattttct-tgtaattctgtttgaatataagtctcttgctttagtgct 27172603  T
Q  210 tgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcatt 247  Q
    |||||||  |||| ||||||| |  |||||||||||||    
T  27172602 tgagcataggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcatt 27172565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #148
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 338 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 27849659 - 27849590
Alignment:
Q  338 gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||    
T  27849659 gaaatctccttggaagtgcaagggggactgtactacttccggattgtggaaggaacgaggataattgctt 27849590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #149
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 217 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 18006081 - 18006010
Alignment:
Q  217 tagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctc 288  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  18006081 tagaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgcctgtgtgcttgagcatctgagaagtctc 18006010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #150
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 70 - 245
Target Start/End: Original strand, 45862042 - 45862220
Alignment:
Q  70 atttgatacatcttagaaattcactagtctagagtcttt--attacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttc-aagtcaaacatatt 166  Q
    |||||||| |||||||||||||   ||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| || |||||||  ||    
T  45862042 atttgatatatcttagaaattcttaagtatagagtctttcaattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatattaagtgttcaaactcaaacaattt 45862141  T
Q  167 tctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagca 245  Q
    ||| | || ||  ||||||||||||| |||| || |  ||||||||||||  |||| |||||||||  |||||||||||    
T  45862142 tctgtataattctgtttgaatagaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgcttgtgtgcttgagca 45862220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #151
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 276 - 407
Target Start/End: Original strand, 24393357 - 24393483
Alignment:
Q  276 tttgagaagtctcataccaagagagtattgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactactt 375  Q
    |||| ||||||||||||   || ||||||||||| ||||||||| |||||||||    |||| |||||||||| | | ||||||||||||||||||||||    
T  24393357 tttgtgaagtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattat----agtg-aaatctcctttgtattgcaagggggactggactactt 24393451  T
Q  376 ccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    |||  ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  24393452 ccgtgttgtggaaggaaccaggataactgctt 24393483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #152
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 10529053 - 10528871
Alignment:
Q  70 atttgatacatcttagaaattcactagtctagag--tcttt--attacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttc-aagtcaaacata 164  Q
    |||||||| |||||||||||||   |||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || |||||||      
T  10529053 atttgatatatcttagaaattcttaagtctagagagtctttcaattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaat 10528954  T
Q  165 tttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcatt 247  Q
    ||||| |||| ||  ||||||||||||| |||| || |  |||||||||||   |||| ||||||| |  |||||||||||||    
T  10528953 tttctttgtaattctgtttgaatagaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcatt 10528871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #153
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 327 - 407
Target Start/End: Original strand, 23538878 - 23538957
Alignment:
Q  327 tatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  23538878 tatttttagtg-aactctccttggaagtgcaatggggacaggactacttccggtttgtggaaggaacctgtataattgctt 23538957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #154
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 328 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 2560629 - 2560551
Alignment:
Q  328 atttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  2560629 atttttagtg-aactctccttggaagtgcaagggggacatgactacttccggtttgtggaaggaacctgtataattgctt 2560551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #155
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 115 - 257
Target Start/End: Original strand, 26418178 - 26418321
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaag-tcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgag 213  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||  |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| |||| ||    |||||||||    
T  26418178 ttgtattgtgaacaccactgattgtatattaggtgttcaacctcaaacatatttctttgtaattttgtttgaatagaagtctcttgcagttgtgcttgag 26418277  T
Q  214 cattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctct 257  Q
    |||  |||| |||||| |||| | ||||||||| |||| |||||    
T  26418278 cataggaagtctcttgatttatttcttgagcataggaaatctct 26418321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #156
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 44 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 17017734 - 17017526
Alignment:
Q  44 acaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagag--tcttt--attacattgtattgtgaacactactgattgt 139  Q
    ||||||||| ||||||||| |  || |||||||| |||||||||||||   |||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||| ||| |||||    
T  17017734 acaaagcactttgaatttctgtgctcatttgatatatcttagaaattcttaagtctagagagtcttttaatttcattgtattgtgaacaccactcattgt 17017635  T
Q  140 atatctagtgttcaag-tcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgc 238  Q
    ||||| |||||||||  | ||| |  ||||| |||||||  ||||||||||||| |||| || |  |||||||||||   |||| ||||||| |  ||||    
T  17017634 atatcaagtgttcaaacttaaataattttctgtgtatttctgtttgaatagaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgcgtgc 17017535  T
Q  239 ttgagcatt 247  Q
    |||||||||    
T  17017534 ttgagcatt 17017526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #157
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 342 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 3238122 - 3238057
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  3238122 tctccttggaagtgcaagggggacatgactacttccggtttgtggaaggaacctgtataattgctt 3238057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #158
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 342 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 20645584 - 20645519
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  20645584 tctccttggaagtgcaagggggacatgactacttccggtttgtggaagaaacatgtataattgctt 20645519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #159
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 342 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 52919895 - 52919830
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||    
T  52919895 tctccttggaagtgcaagggggacaagactacttccgatttgtggaagaaacctgtataattgctt 52919830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #160
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 342 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 20724518 - 20724466
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaacc 394  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20724518 tctccttggaagtgcaagggggacaggactacttccggtttgtggaaggaacc 20724466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #161
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 338 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 13931430 - 13931367
Alignment:
Q  338 gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataa 401  Q
    ||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  13931430 gaaatctccttagatgtgcaaaggggactggactacttccggattgtggaaggaaccaggataa 13931367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #162
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 344 - 407
Target Start/End: Original strand, 17239653 - 17239716
Alignment:
Q  344 tccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  17239653 tccttggaagtgcaagggggacaagactacttccggtttgtggaaggaacctgtataattgctt 17239716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #163
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 338 - 389
Target Start/End: Original strand, 22804747 - 22804798
Alignment:
Q  338 gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaag 389  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22804747 gaaatctcattggaagtgcaagggggacaggactacttccggtttgtggaag 22804798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #164
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 328 - 407
Target Start/End: Original strand, 26418392 - 26418470
Alignment:
Q  328 atttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    |||||||||| || ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  26418392 atttttagtg-aactctacttggaagtgcaaggggcacaggactacttccggtttgtggaaggaacctgtataattgctt 26418470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #165
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 115 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 52920091 - 52919976
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgag 213  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||| |||| ||  |||||| |||||| |||| ||    |||||||||    
T  52920091 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgattagaagtctcttgcagttgtgcttgag 52919992  T
Q  214 cattagaagactcttg 229  Q
    ||||||||| ||||||    
T  52919991 cattagaagtctcttg 52919976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #166
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 70 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 13147973 - 13147841
Alignment:
Q  70 atttgatacatcttagaaattcactagtctagag--tcttt--attacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttc-aagtcaaacata 164  Q
    |||||||| |||||||||||||   |||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || |||||||      
T  13147973 atttgatatatcttagaaattcttaagtctagagagtctttcaattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaat 13147874  T
Q  165 tttctctgtattttcgtttgaatagaagcctct 197  Q
    ||||| |||| ||  ||||||||||||| ||||    
T  13147873 tttctgtgtaattctgtttgaatagaagtctct 13147841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #167
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 118 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 50299887 - 50299613
Alignment:
Q  118 tattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagt-caaacatatttctctgtattttcgtttgaat--agaagcctctcgcctgcgtgcttgagc 214  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||  ||||| |||| ||  ||||||||  ||||| |||| || |  ||||||||||    
T  50299887 tattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaattcagaagtctcttgcatttgtgcttgagc 50299788  T
Q  215 attagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagag-agtattgagcatttg 313  Q
    | || ||| |||||| ||  || |  |||| | |||||||||||||    ||||||||||| ||  |||||||| ||| |||   |||| ||||||||||    
T  50299787 aatataagtctcttgattgtgttcaggagcctaggaagtctctcgcagttgtgcttgagcaattt-gaagtctcttactaagtttagtagtgagcatttg 50299689  T
Q  314 taatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaacc 394  Q
    ||||| |      ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  50299688 taatcaga-----tatttatagtg-aactctccttggaagtgcaagggggacaggactgacttccggtttgtggaaggaacc 50299613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #168
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 342 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 6090157 - 6090092
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| | ||||| ||||    
T  6090157 tctccttggaagtgcaagggggacatgactacttccggtttgtggaaggaacctgtataatggctt 6090092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #169
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 342 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 6174766 - 6174701
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||    
T  6174766 tctccttggaagtgcaagggggacagaactacttccggtttatggaagaaacatgtataattgctt 6174701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #170
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 251
Target Start/End: Original strand, 8729489 - 8729626
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgag 213  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||  |||||||||||||| |||| ||  |||||  |||||| ||||  | |  ||||||||     
T  8729489 ttgtattgtgaacaccactgattatatatcaagtgttcaacctcaaacatatttctgtgtaattgtgtttgtttagaagtctcttacttttgtgcttgaa 8729588  T
Q  214 cattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaa 251  Q
    ||| ||||| ||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  8729589 cataagaagtctcttgcgtcagtgcttgagcataggaa 8729626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #171
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 251
Target Start/End: Original strand, 9081376 - 9081513
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgag 213  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||  |||||||||||||| |||| ||  |||||  |||||| ||||  | |  ||||||||     
T  9081376 ttgtattgtgaacaccactgattatatatcaagtgttcaacctcaaacatatttctgtgtaattgtgtttgtttagaagtctcttacttttgtgcttgaa 9081475  T
Q  214 cattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaa 251  Q
    ||| ||||| ||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  9081476 cataagaagtctcttgcgtcagtgcttgagcataggaa 9081513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #172
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 339 - 415
Target Start/End: Original strand, 17769679 - 17769756
Alignment:
Q  339 aaatctccttggaagtgc-aagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtctct 415  Q
    |||||||||||||||||| || ||| ||||||||| |||||| ||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  17769679 aaatctccttggaagtgcaaatgggaactggactatttccggattgtggaaggaactaggataattgtttgtgtctct 17769756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #173
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 339 - 415
Target Start/End: Original strand, 19070980 - 19071057
Alignment:
Q  339 aaatctccttggaagtgc-aagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtctct 415  Q
    |||||||||||||||||| || ||| ||||||||| |||||| ||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  19070980 aaatctccttggaagtgcaaatgggaactggactatttccggattgtggaaggaactaggataattgtttgtgtctct 19071057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #174
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 347 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 1463811 - 1463748
Alignment:
Q  347 ttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtg 410  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1463811 ttggaagtgcaagggggactagactaattcttgattgtggaagaaaccatgataattgcttgtg 1463748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #175
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 338 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 6252856 - 6252789
Alignment:
Q  338 gaaatctccttggaagtgcaagggggactg-gactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  6252856 gaaatctccttggaagtgcaagggggacagaaactacttccggtttgtggaaggaacctgtataattg 6252789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #176
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 12967965 - 12967822
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgag 213  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||  ||||||| |||||| |||| ||  ||||||||||||| |||| ||    |||||||||    
T  12967965 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatgaagtgttcaacctcaaacaaatttctttgtaattctgtttgaatagaagtctcttgcagttgtgcttgag 12967866  T
Q  214 cattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctct 257  Q
     ||| |||| || ||| ||||||  |||||||| |||| |||||    
T  12967865 aattggaagtcttttgatttagttattgagcataggaaatctct 12967822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #177
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 230
Target Start/End: Original strand, 21606157 - 21606275
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaat--agaagcctctcgcctgcgtgcttg 211  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||| |||| ||  ||||||||  ||||| |||| || |  |||||||    
T  21606157 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaattcagaagtctcttgcatttgtgcttg 21606256  T
Q  212 agcattagaagactcttgc 230  Q
    |||| |||||| |||||||    
T  21606257 agcaatagaagtctcttgc 21606275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #178
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 333 - 407
Target Start/End: Original strand, 12410418 - 12410492
Alignment:
Q  333 tagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||   |||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  12410418 tagtgaaaatctccttggaagtgtaagggaagctggactacttctggattgtggaaggaaccaagataattgctt 12410492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #179
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 328 - 394
Target Start/End: Original strand, 14063705 - 14063770
Alignment:
Q  328 atttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaacc 394  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  14063705 atttttagtg-aactctccttggaagtgcaagggggacaagactacttccagtttgtggaaggaacc 14063770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #180
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 15902853 - 15902736
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaa--tagaagcctctcgcctgcgtgcttg 211  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||| |||| ||| |||||||  | |||| |||| ||    |||||||    
T  15902853 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattttgtttgaatttggaagtctcttgcaattgtgcttg 15902754  T
Q  212 agcattagaagactcttg 229  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  15902753 agcattagaagtctcttg 15902736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #181
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 257
Target Start/End: Original strand, 21638746 - 21638891
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaat--agaagcctctcgcctgcgtgcttg 211  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||| || | ||  ||||||||  ||||| |||| || |  ||| |||    
T  21638746 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgcaattctgtttgaattcagaagtctcttgcatttgtgtttg 21638845  T
Q  212 agcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctct 257  Q
    |||| |||||| |||||||  | ||||||||||| | |||||||||    
T  21638846 agcaatagaaggctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctct 21638891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #182
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 342 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 28581537 - 28581471
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  28581537 tctccttggaagtgcaagggggacatgactgacttccggtttgtggaaggaacctgtataattgctt 28581471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #183
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 345 - 407
Target Start/End: Original strand, 29952168 - 29952230
Alignment:
Q  345 ccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  29952168 ccttgaaagtgcaaaggggacaggactacttccggtttgtggaaggaacctgtataattgctt 29952230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #184
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 345 - 407
Target Start/End: Original strand, 30001322 - 30001384
Alignment:
Q  345 ccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  30001322 ccttgaaagtgcaaaggggacaggactacttccggtttgtggaaggaacctgtataattgctt 30001384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #185
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 41494654 - 41494488
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgag 213  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||  |||| ||  |||| |||||||| |||| || |  |||||||||    
T  41494654 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttcattgtaattatgtttaaatagaagtctcttgcatttgtgcttgag 41494555  T
Q  214 cattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttga 280  Q
    ||| ||||| || ||| ||  || |  |||||| |||||||||| ||    ||||||||||||||||    
T  41494554 cataagaagtctattgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcatttga 41494488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #186
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 229
Target Start/End: Original strand, 47405925 - 47406042
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaat--agaagcctctcgcctgcgtgcttg 211  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||||| || ||||| |||| ||  ||||||||  ||||| |||||||    |||||||    
T  47405925 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaatctcaaatatttttctttgtaattctgtttgaattaagaagtctctcgcagttgtgcttg 47406024  T
Q  212 agcattagaagactcttg 229  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  47406025 agcattagaagtctcttg 47406042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #187
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 342 - 407
Target Start/End: Original strand, 49554224 - 49554290
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  49554224 tctccttggaagtgcaagggggacatgactgacttccggtttgtggaaggaacctgtataattgctt 49554290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #188
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 342 - 407
Target Start/End: Original strand, 13410766 - 13410831
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| |||  | ||||||||||    
T  13410766 tctccttggaagtgcaagggggacaggactacttccgaattgtggaaggaacatgtataattgctt 13410831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #189
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 342 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 13939326 - 13939261
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| |||  | ||||||||||    
T  13939326 tctccttggaagtgcaagggggacatgacaacttccggtttgtggaaggaacttgtataattgctt 13939261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #190
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 342 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 47207136 - 47207083
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaacc 394  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  47207136 tctccttggaagtgcaagggggacaggactgacttccggtttgtggaaggaacc 47207083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #191
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 280
Target Start/End: Original strand, 49643263 - 49643431
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaa--tagaagcctctcgcctgcgtgcttg 211  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||| |||| ||| |||||||  | |||| |||| ||    |||||||    
T  49643263 ttgtattgtgaacaccaccgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattttgtttgaatttggaagtctcttgcagttgtgcttg 49643362  T
Q  212 agcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttga 280  Q
    ||||||||||| |||||| ||  || |  |||||| |||||||||| ||    ||||||||||||||||    
T  49643363 agcattagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcatttga 49643431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #192
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 342 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 11078186 - 11078134
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaacc 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  11078186 tctccttggaagtgcaagggggacatgactacttccggattgtggaaggaacc 11078134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #193
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 13931615 - 13931452
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgagc 214  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||| |||| ||| |||||  |||||| ||||  | |   |||||||||    
T  13931615 ttgtattgtgaacaacactgattgtatatcaagtgttcaaaccaaacttatttctttgtaattt-gtttgtttagaagtctcttacttttttgcttgagc 13931517  T
Q  215 attagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttg 279  Q
    ||  ||   ||||| |||  ||||||||| ||| ||||||||| || || |||||||||||||||    
T  13931516 ataggatatctctttcttgtgtgcttgagtatttgaagtctcttgcttgtgtgcttgagcatttg 13931452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #194
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 342 - 389
Target Start/End: Original strand, 49669216 - 49669264
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaag 389  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  49669216 tctccttggaagtgcaagggggacaggactgacttccggtttgtggaag 49669264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #195
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 115 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 5213234 - 5213195
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5213234 ttgtattgtgaacactactgattgtatatcaagtgttcaa 5213195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #196
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 342 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 12396499 - 12396452
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaag 389  Q
    |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  12396499 tctccttggaagtgcaagggagataggactacttccggtttgtggaag 12396452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #197
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 224 - 279
Target Start/End: Original strand, 13292159 - 13292214
Alignment:
Q  224 ctcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttg 279  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| || ||||||||||||    
T  13292159 ctcttgcttttgtgcttgagcattggaagtctcttggctgtgtccttgagcatttg 13292214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #198
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 115 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 14072354 - 14072240
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgag 213  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||  |||||||| ||| | |||||||| ||||||||| ||| |||| || |  |||||||||    
T  14072354 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagttttcaacctcaaacat-tttttatgtatttttgtttgaatataagtctcttgcttttgtgcttgag 14072256  T
Q  214 cattagaagactcttg 229  Q
    |||  |||| ||||||    
T  14072255 cataggaagtctcttg 14072240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #199
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 333 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 15647213 - 15647142
Alignment:
Q  333 tagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    ||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||| |||| |||||||||    
T  15647213 tagtgaaaatgttcttggaagtgcaaggggtactggagtacttccgcattgtggaaggaaccgggataattg 15647142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #200
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 115 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 16032252 - 16032169
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctct 197  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||  ||||| |||| ||  ||||||||||||| ||||    
T  16032252 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatagaagtctct 16032169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #201
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 115 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 20724745 - 20724602
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaag-tcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgag 213  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||||||  | ||||||  |||||||||||||| |||| ||  |||||||||||||  ||| || || |||||||||    
T  20724745 ttgtattatgaacaccactgattatatatcaggcgttcaacctcaaacatatttctttgtaattctgtttgaatagaagtatcttgcttgtgtgcttgag 20724646  T
Q  214 cattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctct 257  Q
    |||  |||| |||||| ||||||  || ||||| |||| |||||    
T  20724645 cataggaagtctcttgatttagttatttagcataggaaatctct 20724602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #202
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 116 - 246
Target Start/End: Original strand, 23538666 - 23538797
Alignment:
Q  116 tgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaag-tcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgagc 214  Q
    ||||||||||||||  || ||||||||||  ||||||||  |||||||||||||| |||| ||   |||||||||||| |||| ||    ||||||||||    
T  23538666 tgtattgtgaacaccgcttattgtatatcaggtgttcaacctcaaacatatttctttgtaattctatttgaatagaagtctcttgcagttgtgcttgagc 23538765  T
Q  215 attagaagactcttgctttagtgcttgagcat 246  Q
    ||  |||| |||||| |||||| |||||||||    
T  23538766 ataggaagtctcttgatttagttcttgagcat 23538797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #203
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 115 - 229
Target Start/End: Original strand, 29951939 - 29952054
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgag 213  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||  ||||| | || ||| ||||||||||||| || | ||    |||||||||    
T  29951939 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctttctaattttgtttgaatagaagtcttttgcagttgtgcttgag 29952038  T
Q  214 cattagaagactcttg 229  Q
    ||| ||||| ||||||    
T  29952039 cataagaagtctcttg 29952054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #204
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 115 - 229
Target Start/End: Original strand, 30001093 - 30001208
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgag 213  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||  ||||| | || ||| ||||||||||||| || | ||    |||||||||    
T  30001093 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctttctaattttgtttgaatagaagtcttttgcagttgtgcttgag 30001192  T
Q  214 cattagaagactcttg 229  Q
    ||| ||||| ||||||    
T  30001193 cataagaagtctcttg 30001208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #205
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 115 - 280
Target Start/End: Original strand, 49554003 - 49554170
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaa-tagaagcctctcgcctgcgtgcttga 212  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| ||| |||||||||  |||||||| ||||| |||| ||  ||||||| |||||| |||| ||    ||||||||    
T  49554003 ttgtattgtgaacaccgctgattgtaaatcaagtgttcaacctcaaacatttttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcagttgtgcttga 49554102  T
Q  213 gcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttga 280  Q
    |||||||||| |||||| ||  || |  |||||| |||||||||| ||    ||||||||||||||||    
T  49554103 gcattagaagtctcttgattgtgttcaagagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcatttga 49554170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #206
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 342 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 11189444 - 11189378
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||| | ||||||||||    
T  11189444 tctcgttggaagtgcaagggggacaggactaacttccggtttatggaaggaacctgtataattgctt 11189378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #207
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 217
Target Start/End: Original strand, 12410298 - 12410399
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgagc 214  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||  | |||||||  ||||| ||||||| |||| ||| |||||  |||||| |||| || || ||||||||||    
T  12410298 ttgtattgtgaacaccactgattgtatataaattgttcaaaccaaacttatttctttgtaattt-gtttgtttagaagtctcttgcttgtgtgcttgagc 12410396  T
Q  215 att 217  Q
    |||    
T  12410397 att 12410399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #208
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 229
Target Start/End: Original strand, 12963586 - 12963703
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaat--agaagcctctcgcctgcgtgcttg 211  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||  ||||| |||| ||  ||||||||  ||||| |||| ||    |||||||    
T  12963586 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttg 12963685  T
Q  212 agcattagaagactcttg 229  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  12963686 agcattagaagtctcttg 12963703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #209
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 329 - 407
Target Start/End: Original strand, 12963802 - 12963879
Alignment:
Q  329 tttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||  || |||||||| |||||||||| |||| | ||||||||||    
T  12963802 tttttagtg-aactctccttggaagtgtaagggggacatgattacttccgatttgtggaaggaacctgtataattgctt 12963879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #210
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 342 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 13823498 - 13823432
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| |||  | ||||||||||    
T  13823498 tctccttggaagtgcaagggggacatgactgacttccggtttgtggaaggaacatgtataattgctt 13823432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #211
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 192
Target Start/End: Original strand, 14077822 - 14077899
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaag 192  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||| |||| ||| |||||| ||||||    
T  14077822 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacat-tttctttgtaattttgtttgagtagaag 14077899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #212
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 342 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 14968795 - 14968729
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||    
T  14968795 tctccttggaagttcaagggggacaggactgacttccggtttgtggaacagacctgtataattgctt 14968729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #213
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 205 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 15848740 - 15848670
Alignment:
Q  205 gtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca 275  Q
    ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||| || |  |||||||||||    
T  15848740 gtgcttgagcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcatagaaagtctcttgctttagtgcttgagca 15848670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #214
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 342 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 21316984 - 21316922
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||    
T  21316984 tctccttggaagtgcaagggagacaagactacttccggattgtggaaggaacctgtataattg 21316922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #215
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 22140420 - 22140304
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttc-aagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaat--agaagcctctcgcctgcgtgcttg 211  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || ||||||||| |||| |||| ||  ||||||||  ||||| |||| ||    |||||||    
T  22140420 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacata-ttctttgtaattctgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttg 22140322  T
Q  212 agcattagaagactcttg 229  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  22140321 agcattagaagtctcttg 22140304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #216
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 28581761 - 28581645
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaat--agaagcctctcgcctgcgtgcttg 211  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||| |||| ||  ||||||||  ||||| |||| ||    |||||||    
T  28581761 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttct-tgtaattatgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttg 28581663  T
Q  212 agcattagaagactcttg 229  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  28581662 agcattagaagtctcttg 28581645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #217
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 342 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 31302780 - 31302714
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||| |||  | ||||||||||    
T  31302780 tctccttggaagtgcaagggggacagaactgacttccggtttgtggaaggaacatgtataattgctt 31302714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #218
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 40799553 - 40799437
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaat--agaagcctctcgcctgcgtgcttg 211  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||| |||| ||  ||||||||  ||||| |||| ||    |||||||    
T  40799553 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttct-tgtaattctgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttg 40799455  T
Q  212 agcattagaagactcttg 229  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  40799454 agcattagaagtctcttg 40799437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #219
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 40850405 - 40850335
Alignment:
Q  345 ccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggat-aattgcttgtgtct 413  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| |||| | || ||||||||||||||    
T  40850405 ccttggaagtgcaagggggacatgactgacttccggtttgtggaaggaacctgtataaattgcttgtgtct 40850335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #220
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 2025744 - 2025576
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaat--agaagcctctcgcctgcgtgcttg 211  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||  ||||| |||| ||  ||||||||  ||||| |||| ||    |||||||    
T  2025744 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaattgagaagtctcttgcagttgtgcttg 2025645  T
Q  212 agcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttga 280  Q
    |||| |||||| |||||| ||  || |  |||||| |||||||||| ||    ||||||||||||||||    
T  2025644 agcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcaattgtgcttgagcatttga 2025576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #221
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 346 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 2782906 - 2782837
Alignment:
Q  346 cttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggat-aattgcttgtgtct 413  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| |||| | || ||||||||||||||    
T  2782906 cttggaagtgcaagggggacatgactgacttccggtttgtggaaggaacctgtataaattgcttgtgtct 2782837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #222
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 11223220 - 11223052
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaat--agaagcctctcgcctgcgtgcttg 211  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||  |||||||| ||||| |||| ||  ||||||||  ||||| |||| ||    |||||||    
T  11223220 ttgtattgtgaacaccacttattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttg 11223121  T
Q  212 agcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttga 280  Q
    | ||||||||| |||||| ||  || |  |||||| |||||||||| ||    ||||||||||||||||    
T  11223120 accattagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcatttga 11223052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #223
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 342 - 395
Target Start/End: Original strand, 19198602 - 19198655
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaacca 395  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  19198602 tctccttggaagttcaagggggagtggactactcccggattgtggaaggaacca 19198655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #224
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 347 - 404
Target Start/End: Original strand, 19250085 - 19250142
Alignment:
Q  347 ttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||  | ||||||||||||||| | |||||||    
T  19250085 ttggaagtgcaagggggacaggactacttttgatttgtggaagaaacctgtataattg 19250142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #225
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 342 - 394
Target Start/End: Original strand, 20628160 - 20628213
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaacc 394  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||| ||||    
T  20628160 tctccttggaagtgcaagggggacagggctgacttccggtttgtggaaggaacc 20628213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #226
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 342 - 413
Target Start/End: Original strand, 21639000 - 21639073
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggat-aattgcttgtgtct 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||| |||| | || ||||||||||||||    
T  21639000 tctccttggaagtgcaagggggacatgactaacttccggtttgaggaaggaacctgtataaattgcttgtgtct 21639073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #227
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 187
Target Start/End: Original strand, 22463595 - 22463668
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaat 187  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||  |||| ||| ||||||||    
T  22463595 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttcattgtaattttgtttgaat 22463668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #228
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 345 - 389
Target Start/End: Original strand, 22463763 - 22463808
Alignment:
Q  345 ccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaag 389  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  22463763 ccttggaagtgcaagggggacaggactgacttccggtttgtggaag 22463808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #229
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 187
Target Start/End: Original strand, 22465053 - 22465126
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaat 187  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||  |||| ||| ||||||||    
T  22465053 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttcattgtaattttgtttgaat 22465126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #230
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 345 - 389
Target Start/End: Original strand, 22465221 - 22465266
Alignment:
Q  345 ccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaag 389  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  22465221 ccttggaagtgcaagggggacaggactgacttccggtttgtggaag 22465266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #231
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 187
Target Start/End: Original strand, 30054683 - 30054756
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaat 187  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||  ||||| |||| ||| ||||||||    
T  30054683 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattttgtttgaat 30054756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #232
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 342 - 394
Target Start/End: Original strand, 30054907 - 30054960
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaacc 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  30054907 tctccttggaagtgcaagggggacatgactgacttccggtttgtggaaggaacc 30054960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #233
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 113 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 37412267 - 37412134
Alignment:
Q  113 cattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttc-aagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttg 211  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| || |||||||  ||||| |||| ||  |||||  |||||| |||| || |  |||||||    
T  37412267 cattgtattgtgaacaccgctgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgtttagaagtctcttgctttagtgcttg 37412168  T
Q  212 agcattagaagactcttgctttagtgcttgagca 245  Q
    ||||   |||| |||||||||  |||||||||||    
T  37412167 agcaaaggaagtctcttgcttgtgtgcttgagca 37412134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #234
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 280
Target Start/End: Original strand, 38178147 - 38178314
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaa--tagaagcctctcgcctgcgtgcttg 211  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||| |||| ||  |||||||   ||||| |||| ||    |||||||    
T  38178147 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttct-tgtaattctgtttgaagtaagaagtctcttgcagttgtgcttg 38178245  T
Q  212 agcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttga 280  Q
    ||||||||||| |||||| ||  || |  |||||| |||||||||| ||    ||||||||||||||||    
T  38178246 agcattagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcatttga 38178314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #235
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 40850633 - 40850560
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaat 187  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||| |||| ||  ||||||||    
T  40850633 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaat 40850560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #236
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 338 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 8693580 - 8693512
Alignment:
Q  338 gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgct 406  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||| | || | |||| ||||||||||||||||    
T  8693580 gaaatctccttggacaagcaagggggactgcactacttccagatttttgaaggaaccaggataattgct 8693512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #237
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 338 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 9045467 - 9045399
Alignment:
Q  338 gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgct 406  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||| | || | |||| ||||||||||||||||    
T  9045467 gaaatctccttggacaagcaagggggactgcactacttccagatttttgaaggaaccaggataattgct 9045399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #238
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 351 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 10850012 - 10849956
Alignment:
Q  351 aagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||    
T  10850012 aagtgcaaggaggagtggactacttccggattgtggaaggaaccactataattgctt 10849956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #239
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 14955085 - 14955033
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttc-aagtcaaacatatt 166  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || |||||||||||    
T  14955085 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacatatt 14955033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #240
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 178
Target Start/End: Original strand, 25398759 - 25398823
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtatttt 178  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||| | ||||||    
T  25398759 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttttatttt 25398823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #241
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 154
Target Start/End: Original strand, 1728518 - 1728557
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa 154  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  1728518 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 1728557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #242
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 342 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 11222994 - 11222947
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaa 388  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  11222994 tctccttggaagtgcaagggggacaggactgacttccggtttgaggaa 11222947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #243
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 154
Target Start/End: Original strand, 13410549 - 13410588
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa 154  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  13410549 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 13410588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #244
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 13699026 - 13698987
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa 154  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  13699026 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 13698987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #245
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 342 - 404
Target Start/End: Original strand, 13781314 - 13781377
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    |||||||||| ||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  13781314 tctccttggatgtgcaagggggacagaactgacttccggtttgtggaaggaacctgtataattg 13781377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #246
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 154
Target Start/End: Original strand, 15961132 - 15961171
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa 154  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  15961132 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 15961171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #247
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 346 - 413
Target Start/End: Original strand, 16305781 - 16305848
Alignment:
Q  346 cttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtct 413  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||| |||| | |||||| |||| ||||    
T  16305781 cttggaagtgcaagggggacaggtctacttccgaattgtggaaggaacctgtataatttcttgcgtct 16305848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #248
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 16881945 - 16881906
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa 154  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  16881945 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 16881906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #249
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 154
Target Start/End: Original strand, 19249914 - 19249953
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa 154  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  19249914 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 19249953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #250
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 21640523 - 21640484
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa 154  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  21640523 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 21640484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #251
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 22128701 - 22128662
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa 154  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  22128701 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 22128662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #252
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 154
Target Start/End: Original strand, 24776035 - 24776074
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa 154  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  24776035 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 24776074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #253
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 29855065 - 29855026
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa 154  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  29855065 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 29855026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #254
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 344 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 40799327 - 40799276
Alignment:
Q  344 tccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaacc 394  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||    
T  40799327 tccttggaagtgcaagggggacaggactgacttccggtttgtagaaggaacc 40799276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #255
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 154
Target Start/End: Original strand, 46796870 - 46796909
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa 154  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  46796870 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 46796909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #256
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 47207360 - 47207321
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa 154  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  47207360 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 47207321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #257
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 345 - 394
Target Start/End: Original strand, 1728746 - 1728796
Alignment:
Q  345 ccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaacc 394  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  1728746 ccttggaagtgcaagggggacatgactgacttccggtttgtggaaggaacc 1728796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #258
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 115 - 184
Target Start/End: Original strand, 7833129 - 7833199
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttg 184  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||| |||| ||| |||||    
T  7833129 ttgtattgtaaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctgtgtaattttgtttg 7833199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #259
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 346 - 414
Target Start/End: Original strand, 9700769 - 9700839
Alignment:
Q  346 cttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggat-aattgcttgtgtctc 414  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||| | || |||||||||||||||    
T  9700769 cttggaagtgcaagagggacaggactgacttccggcttgtggaaggaacctgtataaattgcttgtgtctc 9700839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #260
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 342 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 17667837 - 17667771
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  |||| |||| ||||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  17667837 tctccttggaagtgcaaggaggacatgactgacttacggtttgtggaaggaacctgtataattgctt 17667771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #261
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 215 - 257
Target Start/End: Original strand, 22770433 - 22770475
Alignment:
Q  215 attagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctct 257  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  22770433 attagaagtctcttgcttttgtgcttgagcataggaagtctct 22770475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #262
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 346 - 404
Target Start/End: Original strand, 22770589 - 22770647
Alignment:
Q  346 cttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||| |||| | |||||||    
T  22770589 cttggaagtgcaagggggacatgactacttccgaattgtggaaggaacctgtataattg 22770647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #263
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 369 - 432
Target Start/End: Original strand, 27244975 - 27245040
Alignment:
Q  369 actacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  27244975 actacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 27245040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #264
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 115 - 229
Target Start/End: Original strand, 46350348 - 46350465
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaat--agaagcctctcgcctgcgtgcttg 211  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| |||||  |||||||| ||||| |||| ||| ||||||||  ||||| |||  ||    |||||||    
T  46350348 ttgtattgtgaacaccactaattgtatatcaagtattcaacatcaaacatttttctttgtaattttgtttgaattaagaagtctcctgcagttgtgcttg 46350447  T
Q  212 agcattagaagactcttg 229  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  46350448 agcattagaagtctcttg 46350465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #265
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 342 - 407
Target Start/End: Original strand, 49643490 - 49643556
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| || | | ||||||||||    
T  49643490 tctccttgaaagtgcaagggggacaggactgacttccggtttatggaaggaatctgtataattgctt 49643556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #266
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 115 - 229
Target Start/End: Original strand, 53057232 - 53057349
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaat--agaagcctctcgcctgcgtgcttg 211  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||  |||||||| ||||| |||| ||  ||||||||  ||||| |||| ||    |||| ||    
T  53057232 ttgtattgtgaacaccactgactgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattatgtttgaattaagaagtctcttgcaattgtgcctg 53057331  T
Q  212 agcattagaagactcttg 229  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  53057332 agcattagaagtctcttg 53057349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #267
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 333 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 932322 - 932249
Alignment:
Q  333 tagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgct 406  Q
    ||||| ||||||| |||||||| | |||||||||||  |||||| |  ||||||||| ||||| ||||||||||    
T  932322 tagtgaaaatctctttggaagtacgagggggactgggttacttctgtattgtggaaggaaccatgataattgct 932249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #268
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 932493 - 932362
Alignment:
Q  123 tgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgagcattagaag 222  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||  ||| |||| ||||  |||||| |||| || |  |||||||||||| ||||     
T  932493 tgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ccaaacttatttctaagtaatttc-tttgtttagaagtctcttgcttttgtgcttgagcataagaaa 932396  T
Q  223 actcttgctttagtgcttgagcattggaagtctc 256  Q
     |||||||||  ||| ||||| ||| ||||||||    
T  932395 tctcttgcttgtgtgattgagtatttgaagtctc 932362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #269
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 342 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 2025520 - 2025467
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaacc 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| ||| ||||    
T  2025520 tctccttggaagtgcaagggggacatgactgacttccggtttgtgaaaggaacc 2025467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #270
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 6174993 - 6174856
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgag 213  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||  | |||||| ||||| |||| ||   |||||||||||| |||| ||    |||||||||    
T  6174993 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtcttcaaccttaaacatctttctttgtaattctatttgaatagaagtctcttgcagttgtgcttgag 6174894  T
Q  214 cattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaa 251  Q
    |||  ||||  ||||| ||| || ||||||||| ||||    
T  6174893 cataggaagtgtcttgattttgttcttgagcataggaa 6174856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #271
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 238 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 8710455 - 8710418
Alignment:
Q  238 cttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca 275  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  8710455 cttgagcattggaagtctcttgcctgtgtgcttgagca 8710418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #272
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 238 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 9062342 - 9062305
Alignment:
Q  238 cttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca 275  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  9062342 cttgagcattggaagtctcttgcctgtgtgcttgagca 9062305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #273
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 342 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 11222246 - 11222193
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaacc 394  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  11222246 tctccttggaaatgcaagggggacaggactgacttccggtttgaggaaggaacc 11222193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #274
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 342 - 394
Target Start/End: Original strand, 12726963 - 12727016
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaacc 394  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||    
T  12726963 tctccttgaaagtgcaagggggacaggactgacttccggtttgtagaaggaacc 12727016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #275
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 342 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 13698835 - 13698770
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    |||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| ||||||||| |||| | || |||||||    
T  13698835 tctccttggaagtgcaagagggacaagactactaccggattgtggaaggaacctgtattattgctt 13698770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #276
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 14007221 - 14007085
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgag 213  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||| |||| ||  ||||||||||||| |||| ||    |||||||||    
T  14007221 ttgtattgtgaacagccctgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacat-tttctttgtaattctgtttgaatagaagtctcttgcagttgtgcttgag 14007123  T
Q  214 cattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaa 251  Q
    |||  |||| |||||||  | ||||||| |||| ||||    
T  14007122 cataggaagtctcttgcagttgtgcttgtgcataggaa 14007085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #277
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 342 - 395
Target Start/End: Original strand, 14078043 - 14078096
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaacca 395  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| |||||    
T  14078043 tctcctttgaagtgcaagggggagtggactacttccagattatggaaggaacca 14078096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #278
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 342 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 29854837 - 29854784
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaacc 394  Q
    |||| |||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  29854837 tctctttggaagtgcaagggggacatgactgacttccggtttgtggaaggaacc 29854784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #279
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 342 - 394
Target Start/End: Original strand, 46797123 - 46797176
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaacc 394  Q
    |||||||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  46797123 tctccttgaaagtgcaagggggacaagactgacttccggtttgtggaaggaacc 46797176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #280
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 52283387 - 52283315
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaat 187  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||| |||| ||  ||||||||    
T  52283387 ttgtattgtgaacac-actgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaat 52283315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #281
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 342 - 394
Target Start/End: Original strand, 53057456 - 53057509
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaacc 394  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  53057456 tctcattggaagtgcaagggggacaggactgacttccggttcgtggaaggaacc 53057509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #282
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 118 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 1463942 - 1463906
Alignment:
Q  118 tattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa 154  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  1463942 tattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 1463906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #283
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 174
Target Start/End: Original strand, 13781087 - 13781147
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgta 174  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||| ||||    
T  13781087 ttgtattgtgaacatcactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgta 13781147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #284
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 342 - 382
Target Start/End: Original strand, 16659322 - 16659362
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggttt 382  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  16659322 tctccttggaagtgcaagggggacagagctacttccggttt 16659362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #285
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 17697274 - 17697158
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgag 213  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||  |||||||  ||| | |||| ||  ||||||||||||| |||| ||    |||||||||    
T  17697274 ttgtattgtgaacaccactgattgtatattaagtgttcaacctcaaacaattttttttgtaattctgtttgaatagaagtctcttgcagttgtgcttgag 17697175  T
Q  214 cattagaagactcttgc 230  Q
    |||  |||| |||||||    
T  17697174 cataggaagtctcttgc 17697158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #286
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 205 - 257
Target Start/End: Original strand, 46797022 - 46797074
Alignment:
Q  205 gtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctct 257  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||  | ||||||||||||| |||||||||    
T  46797022 gtgcttgagcatttgaagtctcttgcagttgtgcttgagcatttgaagtctct 46797074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 296; Significance: 1e-166; HSPs: 182)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 967793 - 968210
Alignment:
Q  13 aaaagcgtcaaaactctgtcaa-tttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtctttatt 111  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  967793 aaaagcgtcaaaactctgccaaatttgattctataaagcactttgaatttctgcactgatatgatatatcttagaaattcttaagtctagagtctttatt 967892  T
Q  112 acattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgctt 210  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| |||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  967893 gcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacat-tttctgtgtaattttgtttgattagaagcctctcgcctgcgtgctt 967991  T
Q  211 gagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagagagtattgagcat 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  967992 gagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcatactaagagagtattgagcat 968091  T
Q  311 ttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtg 410  Q
    ||||||||||||||||||   |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  968092 ttgtaatctgtgtgatta---ttagagcaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggattgtggaaggaaccaggataattgcttgtg 968188  T
Q  411 tctctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||| ||||||||||||||    
T  968189 tctctctttcttttctctgctc 968210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 33 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 1042067 - 1041671
Alignment:
Q  33 aatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtctttattacattgtattgtgaacactac 132  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  1042067 aatttgattctacaaagcactttgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcttaagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccac 1041968  T
Q  133 tgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgct 231  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||| | ||||| |||||| | |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  1041967 tgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaactt-tttctgtgtattgttgtttgattagaagcctctcgcctgtgtgcttgagcattataagactcttgct 1041869  T
Q  232 ttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagagagtattgagcatttgtaatctgtgtgattattt 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||||       
T  1041868 ttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcatactaagagagtattgagcatttgtaatctataagatta--- 1041772  T
Q  332 ttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtctctctgtcttttctctgct 431  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1041771 ttagtgaaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggattgtggaaggaaccaggataattgcttgtgtctctctttcttttctctgct 1041672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 36785088 - 36785506
Alignment:
Q  13 aaaagcgtcaaaactctgtcaa-tttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtctttatt 111  Q
    ||||||| |||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  36785088 aaaagcgccaaaactctgccaaatttgattctaaaaagcacattgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcttaagtctagagtctttatt 36785187  T
Q  112 acattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgctt 210  Q
     ||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36785188 gcattgtattgtgaacaccactgttagtatatcaagtgttcaaagtcaaacat-tttctctgtatttttgtttgaatagaagcctcttgcctgcgtgctt 36785286  T
Q  211 gagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca-tttgagaagtctcataccaagagagtattgagca 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  36785287 gagcattagaagactcttgctttagtgcttgaccattggaagactcttgcctgcgtgcttgagcattttgagaagtctcatacttagagagtattgagca 36785386  T
Q  310 tttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgt 409  Q
    |||||||| | ||||   ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36785387 tttgtaatttttgtg---attcttagtgaaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaaccaggataattgcttgt 36785483  T
Q  410 gtctctctgtcttttctctgctc 432  Q
    |||||||| ||||||||||||||    
T  36785484 gtctctctttcttttctctgctc 36785506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 13 - 431
Target Start/End: Original strand, 27978672 - 27979087
Alignment:
Q  13 aaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtctttatta 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||     
T  27978672 aaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcataagtctagagtctttattg 27978771  T
Q  113 cattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttg 211  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  27978772 cattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaggtcaaacat-tttctctgtatttttgtttgaacagaagactctcgcctgcgtgcttg 27978870  T
Q  212 agcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca-tttgagaagtctcataccaagagagtattgagcat 310  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  27978871 agcattagtagactcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcctgcgtgcttgagcattttgagaagtctcatacttagagagtattgagcat 27978969  T
Q  311 ttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtg 410  Q
    ||||||||| ||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  27978970 ttgtaatctttgtgatta---ttagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaaccaagataactgcttgtg 27979065  T
Q  411 tctctc-tgtcttttctctgct 431  Q
    |||| | | |||||||||||||    
T  27979066 tctcgcttttcttttctctgct 27979087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 13 - 431
Target Start/End: Original strand, 28065201 - 28065616
Alignment:
Q  13 aaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtctttatta 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||     
T  28065201 aaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcttaagtctagagtctttattg 28065300  T
Q  113 cattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttg 211  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  28065301 cattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaggtcaaacat-tttctctgtatttttgtttgaacagaagactctcgcctgcgtgcttg 28065399  T
Q  212 agcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca-tttgagaagtctcataccaagagagtattgagcat 310  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  28065400 agcattagtagactcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcctgcgtgcttgagcattttgagaagtctcatacttagagagtattgagcat 28065498  T
Q  311 ttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtg 410  Q
    ||||||||| ||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||    
T  28065499 ttgtaatctttgtgatta---ttagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaactatgataattgcttgtg 28065594  T
Q  411 tctctc-tgtcttttctctgct 431  Q
    |||| | | |||||||||||||    
T  28065595 tctcgcttttcttttctctgct 28065616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 13 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 24274964 - 24274552
Alignment:
Q  13 aaaagcgtcaaaactctgtcaa-tttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtctttatt 111  Q
    ||||||| ||||| |||| ||| |||||||||| ||| ||| || |||||| |||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  24274964 aaaagcgccaaaattctgccaaatttgattctataaaacacttttaatttctgcactgatttgatatatcttagaaattcttaagtctagagtctttatt 24274865  T
Q  112 acattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgctt 210  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24274864 gcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacatatt-ctgtgtaattttgtttgaatagaagtctctcgcctgcgtgctt 24274766  T
Q  211 gagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagagagtattgagcat 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||    
T  24274765 gagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcata-ctagtgagtattgagcat 24274667  T
Q  311 ttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtg 410  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24274666 ttgtaatctgtgtgatta---ttagtggaaatctccttggaagtgcgagggggactggactacttccggtttgtggaaggaaccaggataattgcttgtg 24274570  T
Q  411 tctctctgtcttttctct 428  Q
    ||  ||| ||||||||||    
T  24274569 tccttctttcttttctct 24274552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 5 - 413
Target Start/End: Original strand, 18769187 - 18769590
Alignment:
Q  5 acaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagt 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  18769187 acaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaaaagtctagagt 18769286  T
Q  105 ctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgc 204  Q
    |||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||  ||||| |||| ||||||    
T  18769287 ctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttatttcattgtatttttgtttgatcagaagactcttgcctgc 18769386  T
Q  205 gtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca-tttgagaagtctcataccaagagagtat 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||    
T  18769387 gtgcttgagcattagaagactcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcctgtgtgcttgagcattttgagaagtctcatacttagagagcat 18769485  T
Q  304 tgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataatt 403  Q
    |||||||||||||||| ||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |    
T  18769486 tgagcatttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccaatttgtggaagaaaccaggataact 18769580  T
Q  404 gcttgtgtct 413  Q
    ||||||||||    
T  18769581 gcttgtgtct 18769590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 3 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 26867021 - 26866614
Alignment:
Q  3 atacaagttaaaaa-gcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctag 101  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26867021 atacaagttaaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcacaagtctag 26866922  T
Q  102 agtctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgta-ttttcgtttgaatagaagcctctcgc 200  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||  ||||| |||| ||    
T  26866921 agtctttattgcattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacatatttccctgtattttttgtttgatcagaagactcttgc 26866822  T
Q  201 ctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca-tttgagaagtctcataccaagaga 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||    
T  26866821 ctgcgtgcttgagcattagaagactcttgc-ttagtgcttgaggattggaagactcttgcctgtgtgcttgagcattttgagaagtctcatacttagaga 26866723  T
Q  300 gtattgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggat 399  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  26866722 gtattgagcatttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgttttgtggaaggaaccaggat 26866628  T
Q  400 aattgcttgtgtct 413  Q
    || |||||||||||    
T  26866627 aactgcttgtgtct 26866614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 5 - 413
Target Start/End: Original strand, 24427868 - 24428272
Alignment:
Q  5 acaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagt 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  24427868 acaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaaaagtctagagt 24427967  T
Q  105 ctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgc 204  Q
    |||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||  ||||| |||| |||||     
T  24427968 ctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttatctctttgtatttttgtttgatcagaagactcttgcctgt 24428067  T
Q  205 gtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||    
T  24428068 gtgcttgagcattagaagactcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcatacttagagagta 24428166  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||     
T  24428167 ttgagcatttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgttttgtggaaggaaccaggataac 24428261  T
Q  403 tgcttgtgtct 413  Q
    |||||||||||    
T  24428262 tgcttgtgtct 24428272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 3 - 431
Target Start/End: Original strand, 38586366 - 38586794
Alignment:
Q  3 atacaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctaga 102  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38586366 atacaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcacaagtctaga 38586465  T
Q  103 gtctttattacattgta-ttgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgc 200  Q
    ||||||||| |||| || |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||| | ||| |||| ||    
T  38586466 gtctttattgcattatatttgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaggtcaaacat-tttctctgtatttttgtttgaacataagtctcttgc 38586564  T
Q  201 ctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaag 296  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    |||||||||||||||||  ||    
T  38586565 ttgcgtgcttgagcattagaagactcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcctgcgtgcttgagcatttttttgagaagtctcatacttag 38586663  T
Q  297 agagtattgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccag 396  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||    
T  38586664 agagtattgagcacttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgttttgtggaatgaaccag 38586758  T
Q  397 gataattgcttgtgtctctc-tgtcttttctctgct 431  Q
    ||||| |||||||||||| | | |||||||||||||    
T  38586759 gataactgcttgtgtctcgcttttcttttctctgct 38586794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 22763604 - 22763176
Alignment:
Q  1 acatacaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaa-tttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtct 99  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||| |||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||   |||||    
T  22763604 acatacaagttaaaa-gcgcctaaactctgtcaaatttgattctataaagcactgtgaatttctgcactgatttgatatatcttagaaattcttaagtct 22763506  T
Q  100 agagtctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaag-tcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctc 198  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||| |||| ||| |||||| | |||| ||||     
T  22763505 agagtctttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaatctcaaacat-tttctgtgtaattttgtttgattggaagtctctt 22763407  T
Q  199 gcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagag 298  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||    
T  22763406 gcttgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctcttgcctgtgtgcttgagcatttgtgaagtctcatacttagag 22763307  T
Q  299 agtattgagcatttgtaatctgtgtgattattt-ttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccagg 397  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||    
T  22763306 agtattgagcatttgtaatatgtg-gattatttcttagtgtaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccagg 22763208  T
Q  398 ataattgcttgtgtctctctgtcttttctctg 429  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22763207 ataattgcttgtgtctctctttcttttctctg 22763176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 22774308 - 22773881
Alignment:
Q  1 acatacaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaa-tttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtct 99  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||| |||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||   |||||    
T  22774308 acatacaagttaaaa-gcgcctaaactctgtcaaatttgattctataaagcactgtgaatttctgcactgatttgatatatcttagaaattcttaagtct 22774210  T
Q  100 agagtctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaag-tcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctc 198  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||| |||| ||| |||| | | |||| ||||     
T  22774209 agagtctttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaatctcaaacat-tttctgtgtaattttgtttaattggaagtctctt 22774111  T
Q  199 gcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagag 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||    
T  22774110 gcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctttcctgtgtgcttgagcatttgtgaagtctcatacttagag 22774011  T
Q  299 agtattgagcatttgtaatctgtgtgattattt-ttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccagg 397  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22774010 agtattgagcatttgtaatctgtg-gattatttcttagtggaaatctccttggaagtgcaaaggggactggactacttccggtttgtggaaggaaccagg 22773912  T
Q  398 ataattgcttgtgtctctctgtcttttctct 428  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  22773911 ataaatgcttgtgtctctctttcttctctct 22773881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 9 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 2561430 - 2561009
Alignment:
Q  9 gttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtcttt 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||     
T  2561430 gttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaaaagtctagagtctta 2561331  T
Q  109 attacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgc 208  Q
    |||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  || |||  |||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  2561330 attgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaatttaattcattgtatttttgtttgatcagaagcctcttgcctgcgtgc 2561231  T
Q  209 ttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagtattga 306  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  2561230 ttgagcattagaagactcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcatacttagagagtattga 2561132  T
Q  307 gcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgct 406  Q
    ||||||||||||| |||||||||  ||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  2561131 gcatttgtaatctttgtgattatagtt-----aaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaaccaggataactgct 2561037  T
Q  407 tgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  2561036 tgtgtctttgtctttcttttctctgctc 2561009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 5 - 413
Target Start/End: Original strand, 24415303 - 24415707
Alignment:
Q  5 acaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagt 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  24415303 acaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaaaagtctagagt 24415402  T
Q  105 ctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgc 204  Q
    |||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||  ||||| |||| |||||     
T  24415403 ctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttatctctttgtatttttgtttgatcagaagactcttgcctgt 24415502  T
Q  205 gtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||    
T  24415503 gtgcttgagcattagaagactcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcatacttagagagta 24415601  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||     
T  24415602 ttgagcatttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggtgactggacaacttccgttttgtggaaggaaccaggataac 24415696  T
Q  403 tgcttgtgtct 413  Q
    |||||||||||    
T  24415697 tgcttgtgtct 24415707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 5 - 413
Target Start/End: Original strand, 28732184 - 28732588
Alignment:
Q  5 acaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagt 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  28732184 acaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaaaagtctagagt 28732283  T
Q  105 ctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgc 204  Q
    |||||    ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||  |||||||||| ||||||    
T  28732284 ctttaacgtattatattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttatttcattgtatttttgtttgatcagaagcctcttgcctgc 28732383  T
Q  205 gtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||    
T  28732384 gtgcttgagcattagaagactcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcatacttagagagta 28732482  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||     
T  28732483 ttgagcatttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaaccaggataac 28732577  T
Q  403 tgcttgtgtct 413  Q
    || ||||||||    
T  28732578 tgtttgtgtct 28732588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 79 - 432
Target Start/End: Original strand, 17970626 - 17970975
Alignment:
Q  79 atcttagaaattcactagtctagagtctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattt 177  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| |||| ||    
T  17970626 atcttagaaattcttaagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacat-tttctgtgtaatt 17970724  T
Q  178 tcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatt 277  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17970725 ttgtttgattagaagcctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatt 17970824  T
Q  278 tgagaagtctcataccaagagagtattgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttcc 377  Q
    |||||||| ||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17970825 tgagaagtttcata-ctagttagtattgagcatttgtaatctgtgtgatta---ttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactagactacttcc 17970920  T
Q  378 ggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtctctctgtcttttctctgctc 432  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  17970921 ggtttgtggaaggaaccaggataattgcttgtgtctctctttcttctctctgctc 17970975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 3 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 26879610 - 26879203
Alignment:
Q  3 atacaagttaaaaa-gcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctag 101  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26879610 atacaagttaaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattcaacaaagcacactgaatttctgcacttatttgatacatcttagaaattcacaagtctag 26879511  T
Q  102 agtctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgta-ttttcgtttgaatagaagcctctcgc 200  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||| ||||||  ||||| |||| ||    
T  26879510 agtctttattgcattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacatatttccctatattttttgtttgatcagaagactcttgc 26879411  T
Q  201 ctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca-tttgagaagtctcataccaagaga 299  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||    
T  26879410 ctacgtgcttgagcattagaaaactcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcctatgtgcttgagcattttgagaagtctcatacttagaga 26879312  T
Q  300 gtattgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggat 399  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  26879311 gtattgagcatttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgttttgtggaaggaaccaggat 26879217  T
Q  400 aattgcttgtgtct 413  Q
    || |||||||||||    
T  26879216 aactgcttgtgtct 26879203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 3 - 431
Target Start/End: Original strand, 21172746 - 21173174
Alignment:
Q  3 atacaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctaga 102  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  21172746 atacaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaaaagtctaga 21172845  T
Q  103 gtctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcct 202  Q
    |||||||    ||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||  | |||||||| ||||    
T  21172846 gtctttaacgtattgtgttgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttatttcattgtatttttgtttgatcataagcctcttgcct 21172945  T
Q  203 gcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca---tttgagaagtctcataccaagaga 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||   |||||||||||||||||  |||||    
T  21172946 gcgtgcttgagcattagaagactcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattttttgagaagtctcatacttagaga 21173044  T
Q  300 gtattgagca-tttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccagga 398  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||    
T  21173045 gtattgagcattttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccagga 21173139  T
Q  399 taattgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgct 431  Q
    ||| ||||||||||  | ||| |||||||||||||    
T  21173140 taactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgct 21173174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 16768886 - 16768464
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  16768886 aagttcaaaagcgtcaaaactctgtcaaattgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 16768788  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||  ||||| |||| ||||||||    
T  16768787 ttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgatcagaagtctcttgcctgcgt 16768688  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagtatt 304  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||  ||| ||||||    
T  16768687 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatacttagaaagtatt 16768589  T
Q  305 gagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    ||||||||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||    
T  16768588 gagcatttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactg 16768494  T
Q  405 cttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  16768493 cttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 16768464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 43082597 - 43082175
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||    
T  43082597 aagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaagtcaa-agtctagagtct 43082499  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||  ||||| |||| ||||||||    
T  43082498 ttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgatcagaagtctcttgcctgcgt 43082399  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagtatt 304  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||  ||| ||||||    
T  43082398 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatacttagaaagtatt 43082300  T
Q  305 gagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    ||||||||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||    
T  43082299 gagcatttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactg 43082205  T
Q  405 cttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  43082204 cttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 43082175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 43093206 - 43092784
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  43093206 aagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 43093108  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||  ||||| |||| ||||||||    
T  43093107 ttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgatcagaagtctcttgcctgcgt 43093008  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagtatt 304  Q
    |||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||  ||| ||||||    
T  43093007 gcttgagcattagaagtctcttac-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatacttagaaagtatt 43092909  T
Q  305 gagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    ||||||||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||    
T  43092908 gagcatttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactg 43092814  T
Q  405 cttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  43092813 cttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 43092784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 19356260 - 19355838
Alignment:
Q  13 aaaagcgtcaaaactctgtcaa-tttgattctacaaagcacattgaattt-cagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtcttt-a 109  Q
    ||||||| |||||||||  ||| |||||||||  ||||||| |||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||| |    
T  19356260 aaaagcgccaaaactctaccaaatttgattctcaaaagcactttgaattttctgcactgatttgatatatcttagaaattcttaagtctagagtctttta 19356161  T
Q  110 ttacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgct 209  Q
     | ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||| |||| ||  |||||| |||||| |||| || |  |||||    
T  19356160 ctgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacaattttctgtgtaattctgtttgattagaagtctcttgctttagtgct 19356061  T
Q  210 tgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagagagtattgagca 309  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  19356060 tgagcattggaagtctcttgctttagtgcctgagcattggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcatttaggaagtctcata-ctagatagtattgagca 19355962  T
Q  310 tttgtaatctgtgtgattattt-ttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttg 408  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19355961 gttgtaatctgtgtgattatttgttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaagaaaccaggataattgcttg 19355862  T
Q  409 tgtctctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  19355861 tgtctctctttcttttctctgctc 19355838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 5 - 413
Target Start/End: Original strand, 28721598 - 28722002
Alignment:
Q  5 acaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagt 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  28721598 acaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttttgcactgatttgatacatcttagaaattcaaaagtctagagt 28721697  T
Q  105 ctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgc 204  Q
    |||||    ||| |||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||  |||||||| ||||||  |||||||| | ||||||    
T  28721698 ctttaacgtattatattgtgaacaccactaattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttatatcattgtatttttgtttgatcagaagccttttgcctgc 28721797  T
Q  205 gtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||    
T  28721798 gtgcttgagcattagaagactcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcatacttagagagta 28721896  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||     
T  28721897 ttgagcatttgcaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaaccaggataac 28721991  T
Q  403 tgcttgtgtct 413  Q
    |||||||||||    
T  28721992 tgcttgtgtct 28722002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Original strand, 24328019 - 24328441
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  24328019 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 24328117  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  24328118 ttactgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaactcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 24328217  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagtatt 304  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||  ||| ||||||    
T  24328218 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatacttagaaagtatt 24328316  T
Q  305 gagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||    
T  24328317 gagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactg 24328411  T
Q  405 cttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  24328412 cttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 24328441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Original strand, 24338689 - 24339111
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  24338689 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 24338787  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  24338788 ttactgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaactcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 24338887  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagtatt 304  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||  ||| ||||||    
T  24338888 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcaattttgtgaagtctcatacttagaaagtatt 24338986  T
Q  305 gagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||    
T  24338987 gagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactg 24339081  T
Q  405 cttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  24339082 cttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 24339111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 29244165 - 29243743
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  29244165 aagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 29244067  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| ||||||  ||||| |||| ||||||||    
T  29244066 ttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaactcaaactcaattctctgtatttttgtttgatcagaagtctcttgcctgcgt 29243967  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagtatt 304  Q
    |||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||  ||| ||||||    
T  29243966 gcttgagcattagaagtctctttc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatacttagaaagtatt 29243868  T
Q  305 gagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||    
T  29243867 gagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactg 29243773  T
Q  405 cttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  29243772 cttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 29243743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 29254744 - 29254322
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  29254744 aagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 29254646  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| ||||||  ||||| |||| ||||||||    
T  29254645 ttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaactcaaactcaattctctgtatttttgtttgatcagaagtctcttgcctgcgt 29254546  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagtatt 304  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||  ||| ||||||    
T  29254545 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatacttagaaagtatt 29254447  T
Q  305 gagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    ||||| ||||||||| ||| ||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||    
T  29254446 gagcagttgtaatctttgttatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactg 29254352  T
Q  405 cttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  29254351 cttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 29254322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Original strand, 1099480 - 1099902
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  1099480 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 1099578  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  1099579 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 1099678  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagtatt 304  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||  ||| ||||||    
T  1099679 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatacttagaaagtatt 1099777  T
Q  305 gagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||    
T  1099778 gagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactg 1099872  T
Q  405 cttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  1099873 cttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 1099902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 4209832 - 4209410
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  4209832 aagttcaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 4209734  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  4209733 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattatatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 4209634  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagtatt 304  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||  ||| ||||||    
T  4209633 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatacttagaaagtatt 4209535  T
Q  305 gagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||    
T  4209534 gagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactg 4209440  T
Q  405 cttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  4209439 cttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 4209410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Original strand, 11389094 - 11389516
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  11389094 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 11389192  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  11389193 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 11389292  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagtatt 304  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||  ||| ||||||    
T  11389293 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatacttagaaagtatt 11389391  T
Q  305 gagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||    
T  11389392 gagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactg 11389486  T
Q  405 cttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  11389487 cttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 11389516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Original strand, 22915149 - 22915571
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  22915149 aagttcaaaaacgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 22915247  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  22915248 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 22915347  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagtatt 304  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||  ||| ||||||    
T  22915348 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatacttagaaagtatt 22915446  T
Q  305 gagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  22915447 gagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataattg 22915541  T
Q  405 cttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  22915542 cttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 22915571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 7 - 431
Target Start/End: Original strand, 36252129 - 36252550
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  36252129 aagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 36252227  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||| |  ||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||    
T  36252228 ttactgtattgtgttgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagcctcttgcctgcgt 36252327  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagtatt 304  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  | || |||||||||||  |||| ||||||||||||  ||| ||||||    
T  36252328 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttacgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatacttagaaagtatt 36252426  T
Q  305 gagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||    
T  36252427 gagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggattacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactg 36252521  T
Q  405 cttgtgtc--tctctgtcttttctctgct 431  Q
    ||||||||  | ||| |||||||||||||    
T  36252522 cttgtgtcattgtctttcttttctctgct 36252550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 4099757 - 4099335
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  4099757 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 4099659  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  4099658 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgaatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 4099559  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagtatt 304  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||  ||| ||||||    
T  4099558 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatacttagaaagtatt 4099460  T
Q  305 gagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||    
T  4099459 gagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactg 4099365  T
Q  405 cttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  4099364 cttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 4099335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 4220424 - 4220002
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  4220424 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 4220326  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  4220325 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 4220226  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagtatt 304  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||  ||| ||||||    
T  4220225 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatacttagaaagtatt 4220127  T
Q  305 gagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    ||| | ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||    
T  4220126 gagtagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactg 4220032  T
Q  405 cttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  4220031 cttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 4220002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Original strand, 7006092 - 7006514
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  7006092 aagttcaaaagcgccaaaactctatcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 7006190  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
     || |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  7006191 gtactgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaactcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 7006290  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagtatt 304  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||  ||| ||||||    
T  7006291 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatacttagaaagtatt 7006389  T
Q  305 gagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||    
T  7006390 gagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactg 7006484  T
Q  405 cttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  7006485 cttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 7006514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Original strand, 9773589 - 9774011
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  9773589 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattttacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 9773687  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  9773688 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 9773787  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagtatt 304  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||  ||| ||||||    
T  9773788 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatacttagaaagtatt 9773886  T
Q  305 gagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||    
T  9773887 gagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactg 9773981  T
Q  405 cttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  9773982 cttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 9774011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Original strand, 17857722 - 17858144
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  17857722 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 17857820  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||| |  |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  17857821 ttactgtattgtattgtgaacatcactgattgtatatcaagtgttcaactcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 17857920  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagtatt 304  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||  ||| | ||||    
T  17857921 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatacttagaaaatatt 17858019  T
Q  305 gagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||    
T  17858020 gagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactg 17858114  T
Q  405 cttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  17858115 cttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 17858144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Original strand, 18392922 - 18393346
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  18392922 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 18393020  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  18393021 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 18393120  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||  ||| ||||    
T  18393121 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaagtctcatacttagaaagta 18393219  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  18393220 ttgagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 18393314  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  18393315 tgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 18393346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Original strand, 22960617 - 22961039
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  22960617 aagttcaaaaacgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 22960715  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  22960716 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 22960815  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagtatt 304  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||  ||| ||||||    
T  22960816 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatacttagaaagtatt 22960914  T
Q  305 gagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||    
T  22960915 gagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactg 22961009  T
Q  405 cttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  22961010 cttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 22961039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Original strand, 34790502 - 34790924
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  34790502 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 34790600  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  34790601 ttactgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 34790700  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagtatt 304  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||  ||| |||| |    
T  34790701 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcttgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatacttagaaagtact 34790799  T
Q  305 gagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||    
T  34790800 gagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactg 34790894  T
Q  405 cttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    || |||||  | ||| ||||||||||||||    
T  34790895 ctggtgtctttgtctttcttttctctgctc 34790924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Original strand, 34804645 - 34805067
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  34804645 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 34804743  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  34804744 ttactgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 34804843  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagtatt 304  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||  ||| |||| |    
T  34804844 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcttgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatacttagaaagtact 34804942  T
Q  305 gagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||    
T  34804943 gagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactg 34805037  T
Q  405 cttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    || |||||  | ||| ||||||||||||||    
T  34805038 ctggtgtctttgtctttcttttctctgctc 34805067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 7 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 32217817 - 32217414
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  32217817 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 32217719  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  32217718 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 32217619  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||  ||| ||||    
T  32217618 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttttgtgaagtctcatacttagaaagta 32217520  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  32217519 ttgagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 32217425  T
Q  403 tgcttgtgtct 413  Q
    |||||||||||    
T  32217424 tgcttgtgtct 32217414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 34477872 - 34477449
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  34477872 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 34477774  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||| | |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  34477773 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtattgttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 34477674  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca---tttgagaagtctcataccaagagagtat 303  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||   |||| ||||||||||||  ||| |||||    
T  34477673 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattttttgtgaagtctcatacttagaaagtat 34477575  T
Q  304 tgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataatt 403  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| |    
T  34477574 tgagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataact 34477480  T
Q  404 gcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    |||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  34477479 gcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 34477449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Original strand, 9763053 - 9763475
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  9763053 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattttacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 9763151  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  9763152 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 9763251  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagtatt 304  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| |||||||||||   ||| ||||||    
T  9763252 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatatttagaaagtatt 9763350  T
Q  305 gagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||    
T  9763351 gagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactg 9763445  T
Q  405 cttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  9763446 cttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 9763475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 27221324 - 27220901
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27221324 aagtttaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattca-tagtctagagtct 27221226  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | |||||| |||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  27221225 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctatatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 27221126  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||  ||| ||||    
T  27221125 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaagtctcatacttagaaagta 27221027  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  27221026 ttgagcagttgtaatct-tgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 27220933  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  27220932 tgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 27220901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 35263534 - 35263111
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  35263534 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgatactacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattca-tagtctagagtct 35263436  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  35263435 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 35263336  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||  ||| ||||    
T  35263335 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaagtctcatacttagaaagta 35263237  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  35263236 ttgagcagttgtaatct-tgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 35263143  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  35263142 tgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 35263111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 35274159 - 35273736
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  35274159 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgatactacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattca-tagtctagagtct 35274061  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  35274060 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 35273961  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||  ||| ||||    
T  35273960 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaagtctcatacttagaaagta 35273862  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  35273861 ttgagcagttgtaatct-tgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 35273768  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  35273767 tgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 35273736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 40251137 - 40250714
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  40251137 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattca-aagtctagagtct 40251039  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtat-atctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcg 205  Q
    ||  |  |||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| | || |||||||    
T  40251038 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtataatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtcgcttgcctgcg 40250939  T
Q  206 tgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagtat 303  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||  ||| |||||    
T  40250938 tgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatacttagaaagtat 40250840  T
Q  304 tgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataatt 403  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| |    
T  40250839 tgagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataact 40250745  T
Q  404 gcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    |||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  40250744 gcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 40250714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Original strand, 11395457 - 11395881
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  11395457 aagtttaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 11395555  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  11395556 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 11395655  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||   || ||||    
T  11395656 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcttgtgtgcttgagcattgttttgtgaagtctcatactttgaaagta 11395754  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  11395755 ttgagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 11395849  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||| ||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  11395850 tgcctgtgtctttgtctttcttttctctgctc 11395881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Original strand, 11405773 - 11406197
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  11405773 aagtttaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 11405871  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  11405872 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 11405971  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||   || ||||    
T  11405972 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcttgtgtgcttgagcattgttttgtgaagtctcatactttgaaagta 11406070  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  11406071 ttgagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 11406165  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||| ||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  11406166 tgcctgtgtctttgtctttcttttctctgctc 11406197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Original strand, 30489109 - 30489531
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30489109 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgatactacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattca-tagtctagagtct 30489207  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||| ||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  30489208 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctcagtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 30489307  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagtatt 304  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||   ||  ||||||||||||   || ||||||    
T  30489308 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagtcttttgaagtctcatactttgatagtatt 30489406  T
Q  305 gagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    ||||||||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||    
T  30489407 gagcatttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactg 30489501  T
Q  405 cttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  30489502 cttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 30489531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Original strand, 9908447 - 9908872
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  9908447 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 9908545  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| | ||||||    
T  9908546 ttactgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatgaagtgttcaactcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgtctgcgt 9908645  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattt-----gagaagtctcataccaagagagt 301  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || || ||||||||||||||     | ||||||||||||  ||| |||    
T  9908646 gcttgagcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattttttttgtgaagtctcatacttagaaagt 9908744  T
Q  302 attgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataa 401  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  9908745 attgagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgtaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataa 9908839  T
Q  402 ttgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
     ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  9908840 ctgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 9908872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 40222276 - 40221853
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  40222276 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattca-aagtctagagtct 40222178  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtat-atctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcg 205  Q
    ||  |  |||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| |||||||    
T  40222177 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtataatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcg 40222078  T
Q  206 tgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagtat 303  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||| ||||  ||| |||||    
T  40222077 tgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtcttatacttagaaagtat 40221979  T
Q  304 tgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataatt 403  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||| |    
T  40221978 tgagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactgaactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataact 40221884  T
Q  404 gcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    |||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  40221883 gcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 40221853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 35252925 - 35252502
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  35252925 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgatactacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattca-tagtctagagtct 35252827  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |  |||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  35252826 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaattcaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 35252727  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||  ||| ||||    
T  35252726 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaagtctcatacttagaaagta 35252628  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  35252627 ttgagcagttgtaatct-tgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 35252534  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  35252533 tgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 35252502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 43345351 - 43344928
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  43345351 aagtttaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 43345253  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  43345252 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctctagcctgcgt 43345153  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| | ||||||||||  ||| ||||    
T  43345152 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgtagtctcatacttagaaagta 43345054  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  43345053 ttgagcagttgtaatct-tgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 43344960  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||| ||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  43344959 tgcctgtgtctttgtctttcttttctctgctc 43344928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 43354966 - 43354543
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  43354966 aagtttaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 43354868  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  43354867 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctctagcctgcgt 43354768  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| | ||||||||||  ||| ||||    
T  43354767 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgtagtctcatacttagaaagta 43354669  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  43354668 ttgagcagttgtaatct-tgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 43354575  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||| ||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  43354574 tgcctgtgtctttgtctttcttttctctgctc 43354543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Original strand, 9897859 - 9898284
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  9897859 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 9897957  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| | ||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  9897958 ttactgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatgaagtgttcaacttaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 9898057  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattt-----gagaagtctcataccaagagagt 301  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || || ||||||||||||||     | ||||||||||||  ||| |||    
T  9898058 gcttgagcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattttttttgtgaagtctcatacttagaaagt 9898156  T
Q  302 attgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataa 401  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||| |||||||||||    
T  9898157 attgagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactgaactacttccgtgttatggaaggaaccaggataa 9898251  T
Q  402 ttgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
     ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  9898252 ctgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 9898284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 10277514 - 10277091
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  10277514 aagtttaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctaaaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 10277416  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  10277415 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 10277316  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||   || ||||    
T  10277315 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaagtctcatactttgaaagta 10277217  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  10277216 ttgagcagttgtaatct-tgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 10277123  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||| ||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  10277122 tgcctgtgtctttgtctttcttttctctgctc 10277091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 10266937 - 10266514
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  10266937 aagtttaaaagcgccaaaactttgtcaatttgattctaaaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 10266839  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  10266838 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 10266739  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||   || ||||    
T  10266738 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaagtctcatactttgaaagta 10266640  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  10266639 ttgagcagttgtaatct-tgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 10266546  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||| ||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  10266545 tgcctgtgtctttgtctttcttttctctgctc 10266514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 7 - 411
Target Start/End: Original strand, 39170380 - 39170780
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  39170380 aagtttaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 39170478  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||  |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  39170479 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttctgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 39170578  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||   || ||||    
T  39170579 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaagtctcatactttgaaagta 39170677  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  39170678 ttgagcagttgtaatct-tgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 39170771  T
Q  403 tgcttgtgt 411  Q
    ||| |||||    
T  39170772 tgcatgtgt 39170780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 68 - 428
Target Start/End: Original strand, 20646954 - 20647317
Alignment:
Q  68 tgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtcttta--ttacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaag-tcaaacata 164  Q
    |||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||   || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||      
T  20646954 tgatttgatatatcttagaaattcttaagtctagagtctttcatttgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaat 20647053  T
Q  165 tttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgc 264  Q
    ||||| |||| ||  ||||||||||||| ||||  | |  ||||||||||||  |||| |||||| |||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  20647054 tttctgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttactttagtgcttgagcataggaagtctcttgatttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgc 20647153  T
Q  265 gtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagagagtattgagcatttgtaatctgtgtgattattt-ttagtggaaatctccttggaagtgcaaggggg 363  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||||| | |  |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20647154 gtgcttgagcaatttggaagtctcatactaggt-agtattaagcagttgtaatctgtgtgattatttcttagtggaaatctccttggaagtgcaaggggg 20647252  T
Q  364 actggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtctctctgtcttttctct 428  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  20647253 actggactacttccggtttgtggaaagaaccagtataattgcctgtgtctctctttcttttctct 20647317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 217 - 428
Target Start/End: Original strand, 19498457 - 19498668
Alignment:
Q  217 tagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagagagtattgagcatttgtaa 316  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||| ||||||    
T  19498457 tagaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcatttgggaagtctcatacta-gatagtattgagcagttgtaa 19498555  T
Q  317 tctgtgtgattattt-ttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtctct 415  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||    
T  19498556 tctgtgtgattatttcttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaaccagtataactgcttgtgtctct 19498655  T
Q  416 ctgtcttttctct 428  Q
    || ||||||||||    
T  19498656 ctttcttttctct 19498668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 217 - 428
Target Start/End: Original strand, 19302918 - 19303129
Alignment:
Q  217 tagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagagagtattgagcatttgtaa 316  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |  ||||||||||| ||||||    
T  19302918 tagaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcatttgtgaagtctcatactaggt-agtattgagcagttgtaa 19303016  T
Q  317 tctgtgtgattattt-ttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtctct 415  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  19303017 tctgtgtgattatttcttagtgaaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggagggaaccaggataattgcttgtgtctct 19303116  T
Q  416 ctgtcttttctct 428  Q
    || | ||||||||    
T  19303117 cttttttttctct 19303129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 215 - 428
Target Start/End: Original strand, 19313482 - 19313695
Alignment:
Q  215 attagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagagagtattgagcatttgt 314  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |  ||||||||||| || |    
T  19313482 attagaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaaatctcttgcctgcgtgcttgagcatttgggaagtctcatactcggt-agtattgagcagttat 19313580  T
Q  315 aatctgtgtgattattt-ttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtct 413  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19313581 aatctgtgtgattatttcttagtgaaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaaccaggataattgcttgtgtct 19313680  T
Q  414 ctctgtcttttctct 428  Q
    |||| | ||||||||    
T  19313681 ctcttttttttctct 19313695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 70 - 412
Target Start/End: Original strand, 23393065 - 23393412
Alignment:
Q  70 atttgatacatcttagaaattcactagtctagag--tcttta--ttacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaag-tcaaacata 164  Q
    |||||||| |||||||||||||   |||||||||  |||||   || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||      
T  23393065 atttgatatatcttagaaattcttaagtctagagagtctttcatttgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaat 23393164  T
Q  165 tttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgc 264  Q
    ||||| |||| ||  ||||||||||||| ||||  | |  ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  23393165 tttctgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttactttagtgcttgagcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgc 23393264  T
Q  265 gtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagag-agtattgagcatttgtaatctgt-gtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggg 362  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||||| | | | ||||||||||| |||||||| || |||||||  || |||| || |||||||||||||||||||||    
T  23393265 gtgcttgagcaattt-gaagtctcatactaggtgtagtattgagcagttgtaatcagttgtgattaactt-agtgaaactctccttggaagtgcaagggg 23393362  T
Q  363 gactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtc 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  23393363 gactggactacttccggtttgtggaaggaaccagtataattgcttgtgtc 23393412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 70 - 412
Target Start/End: Original strand, 24801945 - 24802293
Alignment:
Q  70 atttgatacatcttagaaattcactagtctagag--tcttt--attacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaag-tcaaacata 164  Q
    |||||||| |||||||||||||   |||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||      
T  24801945 atttgatatatcttagaaattcttaagtctagagagtctttcaattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaat 24802044  T
Q  165 tttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgc 264  Q
    ||||| |||| ||  ||||||||||||| |||| || |  ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  24802045 tttctatgtaattctgtttgaatagaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgc 24802144  T
Q  265 gtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagag-agtattgagcatttgtaatctgt-gtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggg 362  Q
    |||| |||||||||  |||||||||||| | | | ||||||||||| |||||||| || |||||||   || ||| || |||||||||||||||||||||    
T  24802145 gtgcatgagcatttt-gaagtctcatactaggtgtagtattgagcagttgtaatcagttgtgattaaactttgtgaaactctccttggaagtgcaagggg 24802243  T
Q  363 gactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtc 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| ||||||    
T  24802244 gactggactacttccggtttgtggaaagaaccagtataattgcatgtgtc 24802293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 215 - 428
Target Start/End: Original strand, 38033296 - 38033510
Alignment:
Q  215 attagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttga-gaagtctcataccaagagagtattgagcatttg 313  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| | ||||||||||||||||||||   |||||||||||| | |  ||||||||||| |||    
T  38033296 attagaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtcttttgcctgcgtgcttgagcattttttgaagtctcatactaggt-agtattgagcagttg 38033394  T
Q  314 taatctgtgtgattattt-ttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtc 412  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  38033395 taatctgtgtgattatttcttagtggaaatctccttggaagtgcaagggagactggactacttctggtttgtggaaggaaccagtataattgtttgtgtc 38033494  T
Q  413 tctctgtcttttctct 428  Q
    ||||| ||||||||||    
T  38033495 tctctttcttttctct 38033510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 70 - 412
Target Start/End: Original strand, 24814912 - 24815260
Alignment:
Q  70 atttgatacatcttagaaattcactagtctagag--tcttt--attacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaag-tcaaacata 164  Q
    |||||||| |||||||||||||   |||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||      
T  24814912 atttgatatatcttagaaattcttaagtctagagagtctttcaattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaat 24815011  T
Q  165 tttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgc 264  Q
    ||||| |||| ||  ||||||||||||| |||| || |  ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||||    
T  24815012 tttctatgtaattctgtttgaatagaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtcacttgcctgc 24815111  T
Q  265 gtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagag-agtattgagcatttgtaatctg-tgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggg 362  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||||| | | | ||||||||||| |||||||| | ||||||||   |||||| || |||||||| ||||| ||||||    
T  24815112 gtgcttgagcaatt-tgaagtctcatactaggtgtagtattgagcagttgtaatcagttgtgattaaacttagtgaaactctccttgaaagtgtaagggg 24815210  T
Q  363 gactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtc 412  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||| | ||||||| |||||||    
T  24815211 gactggactacttccgatttgtggaaggaaccggtataattgtttgtgtc 24815260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 194 - 432
Target Start/End: Original strand, 21650976 - 21651213
Alignment:
Q  194 ctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctca 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| |||||||||    
T  21650976 ctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaagtctca 21651074  T
Q  290 taccaagagagtattgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaag 389  Q
    |||  ||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  21651075 tacttagaaagtattgagcagttgtaatct-tgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaag 21651168  T
Q  390 aaaccaggataattgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
     ||||||||||| ||| ||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  21651169 gaaccaggataactgcctgtgtctttgtctttcttttctctgctc 21651213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 215 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 22755054 - 22754871
Alignment:
Q  215 attagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagag-agtattgagcatttg 313  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||| || |||||||||||| | | | ||| ||||| | |||    
T  22755054 attagaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttaagcatctgtgaagtctcatactaggtgtagtgttgagaagttg 22754955  T
Q  314 taatctgtgtgattattt-ttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccag 396  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  22754954 taatctgtgtgattatttcttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaaccag 22754871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 5 - 161
Target Start/End: Original strand, 21650814 - 21650969
Alignment:
Q  5 acaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagt 104  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  21650814 acaagtttaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattca-aagtctagagt 21650912  T
Q  105 ctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaac 161  Q
    ||||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  21650913 cttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaac 21650969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 299 - 428
Target Start/End: Original strand, 38040539 - 38040669
Alignment:
Q  299 agtattgagcatttgtaatctgtgtgattattt-ttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccagg 397  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  38040539 agtattgagcagttgtaatctgtgtgattatttcttagtggaaatctccttggaagtgcaagggagactggactacttccggtttgtggaaggaaccagt 38040638  T
Q  398 ataattgcttgtgtctctctgtcttttctct 428  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  38040639 ataattgtttgtgtctctctttcttttctct 38040669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 13 - 163
Target Start/End: Original strand, 17969499 - 17969651
Alignment:
Q  13 aaaagcgtcaaaactctgtcaa-tttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtctttatt 111  Q
    ||||||| |||||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  17969499 aaaagcgccaaaactctgccaaatttgattctataaagcactttgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcttaagtctagagtctttatt 17969598  T
Q  112 acattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttc-aagtcaaacat 163  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  17969599 gcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacat 17969651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 113 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 1083670 - 1083368
Alignment:
Q  113 cattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaag-tcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttg 211  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||| | |||||||  |||||||  ||||| |||| ||  ||||||||||||| |||| || |  |||||||    
T  1083670 cattgtattgtgaacaccattgattgtatatcaaatgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttgctttagtgcttg 1083571  T
Q  212 agcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagag-agtattgagcat 310  Q
    |||||  |||| ||||||| |  |||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||||| ||  |||||||||||| | | | |||||||||||     
T  1083570 agcataggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgtgtgcttgagcaatt-tgaagtctcatactaggtgtagtattgagcag 1083472  T
Q  311 ttgtaatctg-tgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttg 408  Q
    |||||||  | ||||||||   |||||| || |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| |||  | |||||||||||    
T  1083471 ttgtaataagttgtgattaaacttagtgaaactctccttggaagtgcaagggggataggactgacttccggtttgtggaaggaacatgtataattgcttg 1083372  T
Q  409 tgtc 412  Q
    ||||    
T  1083371 tgtc 1083368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 265 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 30794497 - 30794351
Alignment:
Q  265 gtgcttgagcattt--gagaagtctcataccaagagagtattgagcattt-gtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaaggg 361  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||    
T  30794497 gtgcttgagcatttttgagaagtctcatacttagagagtattgagcattttgtaatctttgtgattat----agtg-aaatctccttggaagtgcaaggg 30794403  T
Q  362 ggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtct 413  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  30794402 ggactggactacttccgatttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtct 30794351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 318 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 22615336 - 22615225
Alignment:
Q  318 ctgtgtgattattt-ttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtctctc 416  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||| ||||| ||||||    
T  22615336 ctgtgtgattatttcttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaatgaaccagtataatttcttgtatctctc 22615237  T
Q  417 tgtcttttctct 428  Q
    | ||||||||||    
T  22615236 tttcttttctct 22615225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 247
Target Start/End: Original strand, 19313299 - 19313544
Alignment:
Q  4 tacaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaa-tttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctaga 102  Q
    |||||||||||| ||| | |||||||| ||| |||| ||||  ||||||| ||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||   ||||||||    
T  19313299 tacaagttaaaa-gcgcccaaactctgccaaatttgtttctcaaaagcactttgaatttctgcattgatttgatatatcttagaaattcttaagtctaga 19313397  T
Q  103 gtcttt-attacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttc-aagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgc 200  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||| |||| ||| |||||| |||||| |||| ||    
T  19313398 gtcttttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacaattttctgtgtaattttgtttgattagaagtctcttgc 19313497  T
Q  201 ctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcatt 247  Q
     |  ||||||||||||  |||  ||||||| |  |||||||||||||    
T  19313498 tttagtgcttgagcataggaaatctcttgcctgcgtgcttgagcatt 19313544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 5 - 247
Target Start/End: Original strand, 19498273 - 19498517
Alignment:
Q  5 acaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaa-tttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagag 103  Q
    |||||||||||| || | |||||||| ||| |||||||||  |||||||  |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||   |||||||||    
T  19498273 acaagttaaaaa-cgcccaaactctgccaaatttgattctcaaaagcactgtgaatttctgtactgatttgatatatcttagaaattcttaagtctagag 19498371  T
Q  104 tcttt-attacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttc-aagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcc 201  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || |||||||  ||||| |||| ||  ||||||||||||| |||| ||     
T  19498372 tctttcattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaactttctgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttgct 19498471  T
Q  202 tgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcatt 247  Q
    |  ||||||||||||  |||| ||||||| |  |||||||||||||    
T  19498472 ttagtgcttgagcataggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcatt 19498517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 33 - 247
Target Start/End: Original strand, 19300321 - 19300537
Alignment:
Q  33 aatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtcttt-attacattgtattgtgaacacta 131  Q
    |||||| ||||  ||||||| |||||||||  || |||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  19300321 aatttgtttctcaaaagcactttgaatttctacattgatttgatatatcttagaaattcttaagtctagagtcttttattgcattgtattgtgaacacca 19300420  T
Q  132 ctgattgtatatctagtgttc-aagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgc 230  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||| |||| ||  ||||||||||||| |||| || |  ||||||||||||  |||| |||||||    
T  19300421 ctgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgc 19300520  T
Q  231 tttagtgcttgagcatt 247  Q
     |  |||||||||||||    
T  19300521 ctgcgtgcttgagcatt 19300537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 217 - 292
Target Start/End: Original strand, 19300477 - 19300552
Alignment:
Q  217 tagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcatac 292  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19300477 tagaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcatttgggaagtctcatac 19300552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 333 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 22682866 - 22682796
Alignment:
Q  333 tagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataatt 403  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||    
T  22682866 tagtgaaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggattgtggaaggaaacaggataatt 22682796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 115 - 251
Target Start/End: Original strand, 26619548 - 26619685
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgag 213  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||| |||| ||  ||||||||||||| |||| ||    |||||||||    
T  26619548 ttgtattgtgaacatcactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatatttctttgtaattctgtttgaatagaagtctcttgcagttgtgcttgag 26619647  T
Q  214 cattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaa 251  Q
    |||  |||| |||||| |||||| ||||||||| ||||    
T  26619648 catatgaagtctcttgatttagttcttgagcataggaa 26619685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 338 - 404
Target Start/End: Original strand, 19321030 - 19321096
Alignment:
Q  338 gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||    
T  19321030 gaaatctccttggaagtgcaagggggactgtactacttccgaattgtggaaggaaccatgataattg 19321096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 115 - 279
Target Start/End: Original strand, 21911311 - 21911477
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgag 213  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  |||| |||||||||  |||||||| ||||| |||| ||| |||||| |||||| |||| || |  |||||||||    
T  21911311 ttgtattgtgaacaccactgattgggtatcaagtgttcaacctcaaacatttttctgtgtaattttgtttgattagaagtctcttgcttttgtgcttgag 21911410  T
Q  214 cattagaagactcttgctttagtgcttgagca-ttggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttg 279  Q
    |||  |||  |||||||||  ||||||||| | |||||||||||| ||  | |||||||||||||||    
T  21911411 cataggaaatctcttgcttgtgtgcttgagtatttggaagtctcttgctagtgtgcttgagcatttg 21911477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 342 - 407
Target Start/End: Original strand, 21537860 - 21537925
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  21537860 tctccttggaagtgcaagggggacaagactacttccggtttgtggaaggaacctgtataattgctt 21537925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 328 - 407
Target Start/End: Original strand, 10010413 - 10010491
Alignment:
Q  328 atttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    |||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  10010413 atttttagtg-aactctccttgaaagtgtaagggggacaggactacttccggtttgtggaaggaacctgtataattgctt 10010491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 115 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 18702393 - 18702262
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgag 213  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||| |||| ||  ||||||||||||| |||| ||     ||||||||    
T  18702393 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaaatttctttgtaattctgtttgaatagaagtctcttgcagttatgcttgag 18702294  T
Q  214 cattagaagactcttgctttagtgcttgagca 245  Q
    |||  |||| |||||| |||||| ||||||||    
T  18702293 cataggaagtctcttgatttagttcttgagca 18702262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 115 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 22271784 - 22271641
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgag 213  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| | |||| ||  ||||||||| ||| |||| ||     |||||| |    
T  22271784 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatatttatatgtaattctgtttgaatataagtctcttgcagttatgcttggg 22271685  T
Q  214 cattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctct 257  Q
    ||| ||||| |||||| |||||| ||||||||| |||| |||||    
T  22271684 cataagaagtctcttgatttagttcttgagcataggaaatctct 22271641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 328 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 24376545 - 24376467
Alignment:
Q  328 atttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    |||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  24376545 atttttagtg-aactctccttagaagtgcaagggggacatgactacttccggtttgtggaaggaacctgtataattgctt 24376467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 120 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 24843851 - 24843724
Alignment:
Q  120 ttgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaag-tcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgagcatta 218  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||| |||| ||  ||||||||||||| |||| |||   ||||||||||||      
T  24843851 ttgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaaatttctttgtaattctgtttgaatagaagtctcttgccgttgtgcttgagcatag 24843752  T
Q  219 gaagactcttgctttagtgcttgagcat 246  Q
    |||| |||||| ||| || |||||||||    
T  24843751 gaagtctcttgattttgttcttgagcat 24843724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 338 - 404
Target Start/End: Original strand, 14794461 - 14794526
Alignment:
Q  338 gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||||||    
T  14794461 gaaatctccttggaagtgcaagggg-actggactacttccgaattgttgaaggaaccaggataattg 14794526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 47 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 22755195 - 22755086
Alignment:
Q  47 aagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtcttt--attacattgtattgtgaacactactgattgtatatc 144  Q
    |||||| ||||||||| |   |||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||  |||||| ||||||    
T  22755195 aagcactttgaatttctgtgttgatttgatatatcttagaaattcttaagtctagagtctttcaattgcattgtattgtgaacaccgctgattttatatc 22755096  T
Q  145 tagtgttcaa 154  Q
     |||||||||    
T  22755095 aagtgttcaa 22755086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 342 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 24843631 - 24843578
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaacca 395  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24843631 tctccttggaagtgcaaggtggagtggactacttccggtttgtggaaggaacca 24843578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 328 - 389
Target Start/End: Original strand, 28141263 - 28141323
Alignment:
Q  328 atttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaag 389  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  28141263 atttttagtg-aactctccttggaagtgcaagggggacatgactacttccggtttgtggaag 28141323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 115 - 246
Target Start/End: Original strand, 18431386 - 18431518
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgag 213  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||| |||| ||  ||||||||||||| || | ||    |||||||||    
T  18431386 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaaatttctttgtaattctgtttgaatagaagtctgttgcagttgtgcttgag 18431485  T
Q  214 cattagaagactcttgctttagtgcttgagcat 246  Q
    |||  |||| |||||| |||||| ||| |||||    
T  18431486 cataggaagtctcttgatttagttcttaagcat 18431518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 328 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 18702179 - 18702104
Alignment:
Q  328 atttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| |||| | |||||||    
T  18702179 atttttagtg-aactctccttggaagtgcaagggggacatgactactttcggtttgtggaaggaacctgtataattg 18702104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 342 - 417
Target Start/End: Original strand, 23184976 - 23185052
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgc-ttgtgtctctct 417  Q
    |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| ||||||||||||    
T  23184976 tctccttgaaagtgcaagggggacatgactacttccggtttgtggaagagacctatataattgctttgtgtctctct 23185052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 342 - 417
Target Start/End: Original strand, 23596239 - 23596315
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgc-ttgtgtctctct 417  Q
    |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| ||||||||||||    
T  23596239 tctccttgaaagtgcaagggggacatgactacttccggtttgtggaagagacctatataattgctttgtgtctctct 23596315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 342 - 394
Target Start/End: Original strand, 24851337 - 24851389
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaacc 394  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||    
T  24851337 tctccttggaagtgcaagggggacaggactacttccgatttgtggaaggaacc 24851389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 347 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 40781897 - 40781837
Alignment:
Q  347 ttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  40781897 ttggaagtgcaagggggacaagactacttccggtttgtggaaggaacctgtataattgctt 40781837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 329 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 22271568 - 22271491
Alignment:
Q  329 tttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    ||||||||| || ||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||    
T  22271568 tttttagtg-aactctcctttgaagtccaagggggacaggactacttccggtttgtggaaggaacctatataattgctt 22271491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 25189051 - 25188937
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgag 213  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| |||| ||  ||||||||||||| |||| ||    |||||||||    
T  25189051 ttgttttgtgaacaccactgattgtatatctagtgttcaacctcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatagaagtctcttgcagttgtgcttgag 25188952  T
Q  214 cattagaagactctt 228  Q
    ||| ||||| |||||    
T  25188951 cataagaagtctctt 25188937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #103
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 342 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 25828587 - 25828526
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  25828587 tctccttggaagtgcaaggggg-caggactacttccggtttgtggaaggaacctgtataattg 25828526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #104
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 342 - 406
Target Start/End: Original strand, 13964647 - 13964712
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggataattgct 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| |||| | |||||||||    
T  13964647 tctccttggaagtgcaagggggacatgactgacttccggtttgtggaaggaacctgtataattgct 13964712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #105
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 342 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 19539842 - 19539777
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    ||||||||||||| |||| ||||| |||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  19539842 tctccttggaagttcaagcgggacaggactatttccggtttgtggaaggaacctgtataattgctt 19539777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #106
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 342 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 22257627 - 22257562
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||   ||||||||||    
T  22257627 tctccttggaagtgcaagggggacatgactacttccgatttgtggaaggaacctatataattgctt 22257562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #107
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 24575688 - 24575520
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaa--tagaagcctctcgcctgcgtgcttg 211  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||| |||| ||  |||||||  | |||| |||| ||    |||||||    
T  24575688 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaatttggaagtctcttgcagttgtgcttg 24575589  T
Q  212 agcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttga 280  Q
    ||||||||||| |||||| ||  || |  |||||| |||||||||| ||    ||||||||||||||||    
T  24575588 agcattagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcatttga 24575520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #108
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 342 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 44839860 - 44839787
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggat-aattgcttgtgtct 413  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| | || ||||||||||||||    
T  44839860 tctccttggaagtgtaagggggacaggactgacttccggtttgtggaaggaacctgtataaattgcttgtgtct 44839787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #109
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 342 - 413
Target Start/End: Original strand, 45087655 - 45087728
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggat-aattgcttgtgtct 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||    
T  45087655 tctccttggaagtgcaagggggacatgactgtcttccggtttgtggaagaaacctgtataaattgcttgtgtct 45087728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #110
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 118 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 44880817 - 44880737
Alignment:
Q  118 tattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctct 197  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||  |||||||||||||| |||| ||  ||||||||||||| ||||    
T  44880817 tattgtgaacaccactgattgcatatcaagtgttcaacctcaaacatatttctttgtaattatgtttgaatagaagtctct 44880737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #111
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 115 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 21845810 - 21845673
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa--gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttga 212  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||   |||||||| ||| | |||| ||  |||||  |||||| || | || |  ||||||||    
T  21845810 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaacctcaaacat-tttttgtgtaattgtgtttgtttagaagtcttttgcttttgtgcttga 21845712  T
Q  213 gcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaa 251  Q
    ||||  |||||||||||| || |||||||||||| ||||    
T  21845711 gcataggaagactcttgcgtttgtgcttgagcataggaa 21845673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #112
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 115 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 24376758 - 24376675
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctct 197  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||  ||||| |||| ||  ||||||||||||| ||||    
T  24376758 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatagaagtctct 24376675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #113
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 115 - 154
Target Start/End: Original strand, 45087430 - 45087469
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  45087430 ttgtattgtgaacactactgattgtatatcaagtgttcaa 45087469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #114
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 169
Target Start/End: Original strand, 15671058 - 15671112
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttct 169  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||    
T  15671058 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaatccaaacttatttct 15671112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #115
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 342 - 407
Target Start/End: Original strand, 20569424 - 20569490
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  20569424 tctccttggaagtgctagggggacaagactgacttccggtttgtggaaggaacctgtataattgctt 20569490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #116
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 342 - 388
Target Start/End: Original strand, 21911503 - 21911549
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaa 388  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||    
T  21911503 tctccttggaagtgcaaggaggacaggactacttccggattgtggaa 21911549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #117
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 342 - 407
Target Start/End: Original strand, 22188776 - 22188842
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||| | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  22188776 tctccttggaagtgcaagggggacaaaactgatttccggtttgtggaagaaacctgtataattgctt 22188842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #118
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 342 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 22382911 - 22382849
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||    
T  22382911 tctccttggaagagccagggggacaggactacttccggattgtggaaggaacctgtataattg 22382849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #119
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 342 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 24575461 - 24575395
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggacta-cttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  24575461 tctccttggaagtgcaaaggggagaggactggcttccggtttgtggaaggaaccagtataattgctt 24575395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #120
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 25918363 - 25918234
Alignment:
Q  118 tattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgagcatt 217  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||  |||| |||| ||| ||||   |||||| |||| || |  ||||||||||| |    
T  25918363 tattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaaccaaacatccttctatgtaattttgtttatttagaagtctcttgcttttgtgcttgagca-t 25918265  T
Q  218 agaaga-ctcttgctttagtgcttgagcatt 247  Q
    || ||| |||||||||  |||||||||||||    
T  25918264 agtagatctcttgcttgtgtgcttgagcatt 25918234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #121
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 342 - 388
Target Start/End: Original strand, 26623128 - 26623174
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaa 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  26623128 tctccttggaagtgcaagggggacatgactacttccagtttgtggaa 26623174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #122
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 40331761 - 40331644
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaat--agaagcctctcgcctgcgtgcttg 211  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||||| || ||||| |||| ||  ||||||||  ||||| |||||||    |||||||    
T  40331761 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaatatttttctttgtaattctgtttgaattaagaagtctctcgcagttgtgcttg 40331662  T
Q  212 agcattagaagactcttg 229  Q
    |||| |||||| ||||||    
T  40331661 agcaatagaagtctcttg 40331644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #123
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 328 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 44880714 - 44880653
Alignment:
Q  328 atttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaga 390  Q
    |||||||||| || |||| |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  44880714 atttttagtg-aactctcattggaagtgcaagggggacatgactacttctggtttgtggaaga 44880653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #124
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 342 - 394
Target Start/End: Original strand, 6574770 - 6574823
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaacc 394  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  6574770 tctccttggaagtgcaagggggataggactgacttccggtttgtggaaggaacc 6574823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #125
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 187 - 280
Target Start/End: Original strand, 16587511 - 16587604
Alignment:
Q  187 tagaagcctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttga 280  Q
    |||||| |||| || |||||||||||||||| |||| || || | || ||| ||||||||||||||||||| |  || |||||||| |||||||    
T  16587511 tagaagtctcttgcatgcgtgcttgagcattggaagtctgtttcatttgtgattgagcattggaagtctcttgtttgtgtgcttgaacatttga 16587604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #126
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 228
Target Start/End: Original strand, 20152449 - 20152564
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaat--agaagcctctcgcctgcgtgcttg 211  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||| |||| ||  ||||||||  ||||| |||| ||    |||||||    
T  20152449 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacatcaaacatttttct-tgtaattctgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttg 20152547  T
Q  212 agcattagaagactctt 228  Q
    ||||||||||| |||||    
T  20152548 agcattagaagtctctt 20152564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #127
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 187
Target Start/End: Original strand, 20569197 - 20569270
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttca-agtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaat 187  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||   |||||||| ||||| |||| ||| ||||||||    
T  20569197 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcagcctcaaacatttttctttgtaattttgtttgaat 20569270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #128
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 342 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 21845588 - 21845523
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||| |||  | ||||||||||    
T  21845588 tctccttggaagtgcaagggggacaggactacttctcgattgtggaaggaacttgtataattgctt 21845523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #129
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 215 - 288
Target Start/End: Original strand, 21911382 - 21911454
Alignment:
Q  215 attagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctc 288  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||| |||| ||||| || || ||||||||| ||||| ||||||||    
T  21911382 attagaagtctcttgcttttgtgcttgagcataggaaatctcttgcttgtgtgcttgagtatttg-gaagtctc 21911454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #130
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 342 - 394
Target Start/End: Original strand, 22786328 - 22786381
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaacc 394  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  22786328 tctccttggaagtacaagggggacaggactgacttccggtttgtggaaggaacc 22786381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #131
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 342 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 25188825 - 25188772
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaacc 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  25188825 tctccttggaagtgcaagggggacatgactgacttccggtttgtggaaggaacc 25188772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #132
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 342 - 407
Target Start/End: Original strand, 26367082 - 26367147
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||| || |||||||||| |||  | ||||||||||    
T  26367082 tctccttggaagtgcaagggggacatgactactttcgatttgtggaaggaacttgtataattgctt 26367147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #133
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 342 - 413
Target Start/End: Original strand, 28551592 - 28551665
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggat-aattgcttgtgtct 413  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||| |||| | || ||||||||||||||    
T  28551592 tctccttggaagtgcaagggggataggactgacttgcggtttgtggaaggaacctgtataaattgcttgtgtct 28551665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #134
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 44840085 - 44840012
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaat 187  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||| |||| ||  ||||||||    
T  44840085 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaat 44840012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #135
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 342 - 394
Target Start/End: Original strand, 18431612 - 18431664
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaacc 394  Q
    |||| |||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  18431612 tctcattggaagtgcaacggggacaagactacttccggtttgtggaaggaacc 18431664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #136
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 22802122 - 22802070
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttc-aagtcaaacatatt 166  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || |||||||||||    
T  22802122 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacatatt 22802070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #137
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 360 - 415
Target Start/End: Original strand, 27747147 - 27747203
Alignment:
Q  360 ggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggat-aattgcttgtgtctct 415  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  27747147 ggggactggagtacttccggattgtggaaagaaccaggataaattgcttgtgtctct 27747203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #138
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 154
Target Start/End: Original strand, 31328410 - 31328450
Alignment:
Q  114 attgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa 154  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  31328410 attgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 31328450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #139
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 154
Target Start/End: Original strand, 31335131 - 31335171
Alignment:
Q  114 attgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa 154  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  31335131 attgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 31335171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #140
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 342 - 389
Target Start/End: Original strand, 39038315 - 39038363
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaag 389  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  39038315 tctccttggaagtgcaagcgggacaggactgacttccggtttgtggaag 39038363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #141
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 6392286 - 6392247
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa 154  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  6392286 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatttagtgttcaa 6392247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #142
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 154
Target Start/End: Original strand, 6574576 - 6574615
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa 154  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  6574576 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 6574615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #143
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 154
Target Start/End: Original strand, 10010198 - 10010237
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa 154  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  10010198 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 10010237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #144
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 342 - 389
Target Start/End: Original strand, 10899185 - 10899232
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaag 389  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  10899185 tctccttggaagtgcaaggaggagtggactactttcggattgtggaag 10899232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #145
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 14581210 - 14581171
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa 154  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  14581210 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 14581171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #146
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 197
Target Start/End: Original strand, 21537699 - 21537782
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctct 197  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||  ||||| |||| ||  ||||||||||||| ||||    
T  21537699 ttgtattgtaaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatagaagtctct 21537782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #147
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 154
Target Start/End: Original strand, 22188551 - 22188590
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa 154  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  22188551 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 22188590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #148
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 197
Target Start/End: Original strand, 22455436 - 22455519
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctct 197  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||  |||||||  ||||| |||| ||  ||||||||||||| ||||    
T  22455436 ttgtattgtgaagaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatagaagtctct 22455519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #149
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 154
Target Start/End: Original strand, 22525275 - 22525314
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa 154  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  22525275 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 22525314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #150
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 154
Target Start/End: Original strand, 22786103 - 22786142
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa 154  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  22786103 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 22786142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #151
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 154
Target Start/End: Original strand, 28551367 - 28551406
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa 154  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  28551367 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 28551406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #152
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 154
Target Start/End: Original strand, 31801336 - 31801375
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa 154  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  31801336 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 31801375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #153
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 342 - 411
Target Start/End: Original strand, 34322605 - 34322676
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggat-aattgcttgtgt 411  Q
    |||| |||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| |||| | || ||||||||||||    
T  34322605 tctctttggaagtgcaagggggacaagactgacttccggtttgtggaaggaacctgtataaattgcttgtgt 34322676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #154
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 38781048 - 38781009
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa 154  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  38781048 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 38781009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #155
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 154
Target Start/End: Original strand, 40202838 - 40202877
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa 154  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  40202838 ttgtattatgaacactactgattgtatatcaagtgttcaa 40202877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #156
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 40782129 - 40782090
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa 154  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  40782129 ttgtattgtgaacactagtgattgtatatcaagtgttcaa 40782090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #157
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 197
Target Start/End: Original strand, 41122164 - 41122247
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctct 197  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||| || ||||||  |||||||| ||||| |||| ||  ||||||||||||| ||||    
T  41122164 ttgtattatgaacaccactgattgtatatcaagcgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaatagaagtctct 41122247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #158
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 120 - 197
Target Start/End: Original strand, 10898976 - 10899053
Alignment:
Q  120 ttgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctct 197  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||| | || ||| ||||||||||||| ||||    
T  10898976 ttgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacat-tttctttataattttgtttgaatagaagtctct 10899053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #159
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 345 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 16494771 - 16494701
Alignment:
Q  345 ccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggat-aattgcttgtgtct 413  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| ||| |||| | || ||||||||||||||    
T  16494771 ccttggaagtgcaagggggacatgactgacttccggtttgtgaaaggaacctgtataaattgcttgtgtct 16494701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #160
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 342 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 22317019 - 22316953
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggacta-cttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    |||| |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||  | ||||||||||    
T  22317019 tctcattggaagtgcaagggggacatgactaacttccggtttgtggaaggaacttgtataattgctt 22316953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #161
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 215 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 22383062 - 22383020
Alignment:
Q  215 attagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctct 257  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  22383062 attagaagtctcttgcttttgtgcttgagcataggaagtctct 22383020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #162
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 342 - 407
Target Start/End: Original strand, 22455633 - 22455699
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| |||  | ||||||||||    
T  22455633 tctccttggaattgcaagggggacatgactgacttccggtttgtggaaggaacatgtataattgctt 22455699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #163
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 342 - 387
Target Start/End: Original strand, 22782288 - 22782334
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtgga 387  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  22782288 tctcattggaagtgcaagggggacaggactgacttccggtttgtgga 22782334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #164
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 342 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 23234436 - 23234370
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||| |||| | ||||||||||    
T  23234436 tctcattggaagtgcaagggggacaggactgactttcggtttgtagaaggaacctgtataattgctt 23234370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #165
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 342 - 407
Target Start/End: Original strand, 25037935 - 25038001
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||| | |||||||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  25037935 tctccttggaagtgcaagggtgacatgactgatttccggtttgtggaaggaacctgtataattgctt 25038001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #166
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 329 - 394
Target Start/End: Original strand, 30557984 - 30558049
Alignment:
Q  329 tttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaacc 394  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  30557984 tttttagtg-aactctccttggaagtgcaagggggacatgactgacttctggtttgtggaaggaacc 30558049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #167
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 113 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 1089021 - 1088980
Alignment:
Q  113 cattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa 154  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||    
T  1089021 cattgtattgtgaacaccattgattgtatatcaagtgttcaa 1088980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #168
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 329 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 6392102 - 6392042
Alignment:
Q  329 tttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaag 389  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  6392102 tttttagtg-aactctccttggaagtgcaagagggacatgactgacttccggtttgtggaag 6392042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #169
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 119 - 187
Target Start/End: Original strand, 13964431 - 13964500
Alignment:
Q  119 attgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaat 187  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||| |||| ||  ||||||||    
T  13964431 attgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaat 13964500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #170
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 22257854 - 22257817
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttc 152  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  22257854 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttc 22257817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #171
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 328 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 27296879 - 27296835
Alignment:
Q  328 atttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactac 373  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27296879 atttttagtg-aactctccttggaagtgcaagggggacaggactac 27296835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #172
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 342 - 394
Target Start/End: Original strand, 28701885 - 28701938
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaacc 394  Q
    |||||||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  28701885 tctccttgaaagtgcaagggggacatgactgacttccggtttgtggaaggaacc 28701938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #173
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 152
Target Start/End: Original strand, 35744426 - 35744463
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttc 152  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  35744426 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcgagtgttc 35744463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #174
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 342 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 40331214 - 40331141
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggat-aattgcttgtgtct 413  Q
    |||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||| || | | || ||||||||||||||    
T  40331214 tctccttggaagtgcaaggggggcatgactgacttccggtttgtggaaggaatctgtataaattgcttgtgtct 40331141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #175
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 342 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 40331536 - 40331464
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggat-aattgcttgtgtct 413  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| || |||| | || ||||||||||||||    
T  40331536 tctccttggaagtgcaa-ggggacaggactgacttccggtttgtgggaggaacctgtataaattgcttgtgtct 40331464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #176
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 167
Target Start/End: Original strand, 14794307 - 14794359
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatattt 167  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||  ||||| |||||    
T  14794307 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagttttcaaaccaaacttattt 14794359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #177
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 342 - 389
Target Start/End: Original strand, 20152675 - 20152723
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaag 389  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||||    
T  20152675 tctccttggaagtgcaagggagacatgactaacttccggtttgtggaag 20152723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #178
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 333 - 417
Target Start/End: Original strand, 22525445 - 22525528
Alignment:
Q  333 tagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtctctct 417  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||| ||||||||  || || |||||||| |||| |||||||    
T  22525445 tagtgaaaatttccttggaagtgcaaggtggactaaactactt-cggattgtggaatgaatcatgataattgtttgtctctctct 22525528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #179
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 343 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 22801897 - 22801845
Alignment:
Q  343 ctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaacc 394  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| ||||||| |||||||||| ||||    
T  22801897 ctccttggaagtgcaagggggacaagactgacttccgatttgtggaaggaacc 22801845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #180
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 118 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 23234656 - 23234620
Alignment:
Q  118 tattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa 154  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  23234656 tattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 23234620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #181
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 97 - 154
Target Start/End: Original strand, 38033205 - 38033264
Alignment:
Q  97 tctagagtcttt--attacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa 154  Q
    ||||||||||||  ||| |||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  38033205 tctagagtctttcaattgcattatattgtgaacaccactgattgtatttcaagtgttcaa 38033264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #182
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 342 - 385
Target Start/End: Original strand, 41122360 - 41122404
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtg 385  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  41122360 tctccttgaaagtgcaagggggacaggactgacttccggtttgtg 41122404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 296; Significance: 1e-166; HSPs: 208)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 675338 - 674922
Alignment:
Q  13 aaaagcgtcaaaactctgtcaa-tttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtctttatt 111  Q
    ||||||| |||||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  675338 aaaagcgccaaaactctgccaaatttgattctaaaaagcactttgaatttctgcactaatttgatacatcttagaaattctcaagtctagagtctttatt 675239  T
Q  112 acattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgctt 210  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| | |||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  675238 gcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacat-tttatgtgtaattttgtttgattagaagcctctcgcctgcgtgctt 675140  T
Q  211 gagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagagagtattgagcat 310  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  675139 gagcgttagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcata-ctagagagtattgagcat 675041  T
Q  311 ttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtg 410  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  675040 ttgtaatctgtgtgattattt---gtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaaccaggataattgcttgtg 674944  T
Q  411 tctctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||| ||||||||||||||    
T  674943 tctctctttcttttctctgctc 674922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 20196006 - 20196424
Alignment:
Q  13 aaaagcgtcaaaactctgtcaa-tttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtctttatt 111  Q
    ||||||| |||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  20196006 aaaagcgccaaaactctgccaaatttgattctaaaaagcacattgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcataagtctagagtctttatt 20196105  T
Q  112 acattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgta-ttttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgctt 210  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20196106 gcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaacat-tttctctgtattttttgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgctt 20196204  T
Q  211 gagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca-tttgagaagtctcataccaagagagtattgagca 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  20196205 gagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagactctcgcctgcgtgcttgagcattttgagaagtctcatacttagagagtattgagca 20196304  T
Q  310 tttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgt 409  Q
    |||||||||| ||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20196305 tttgtaatctttgtgatta---ttagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaaccaggataattgcttgt 20196400  T
Q  410 gtctctc-tgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||| | | ||||||||||||||    
T  20196401 gtctcacttttcttttctctgctc 20196424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 22610289 - 22610709
Alignment:
Q  13 aaaagcgtcaaaactctgtcaa-tttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtctttatt 111  Q
    ||||||| |||||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  22610289 aaaagcgccaaaactctgccaaatttgattctaaaaagcactttgaatttctgcactgatttgatatatcttagaaattcttaagtctagagtctttatt 22610388  T
Q  112 acattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttg 211  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||| |||| ||  |||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  22610389 gcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacaattttctgtgtaattctgtttgattagaagtctctcgcctgcgtgcttg 22610488  T
Q  212 agcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagagagtattgagcatt 311  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| |    
T  22610489 agcattagaagtctcctgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcata-ctagaaagtattgagcagt 22610587  T
Q  312 tgtaatctgtgtgattattt-ttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtg 410  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  22610588 tgtaatctgtgtgattatttcttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaacgaggataattgcttgtg 22610687  T
Q  411 tctctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||| ||||||||||||||    
T  22610688 tctctctttcttttctctgctc 22610709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 41132931 - 41133349
Alignment:
Q  13 aaaagcgtcaaaactctgtcaa-tttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtctttatt 111  Q
    ||||||| |||||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  41132931 aaaagcgccaaaactctgccaaatttgattctataaagcactttgaatttctgcactgatttgatatatcttagaaattcttaagtctagagtctttatt 41133030  T
Q  112 acattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttc-gtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgct 209  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||| ||||||||  ||||| |||| |||  |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  41133031 gcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagagttcaaagtcaaacaattttctgtgtaatttatgtttgattagaagtctctcgcctgcgtgct 41133130  T
Q  210 tgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagagagtattgagca 309  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  41133131 tgagcattagaagactcttgttttagtgcttgagcattggaagtccctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcata-ctagagagtattgagca 41133229  T
Q  310 tttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgt 409  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41133230 tttgtaatctgtgtgatta---ttagtggaaatctccttggaagtacaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaaccaggataattgcttgt 41133326  T
Q  410 gtctctctgtcttttctctgctc 432  Q
    |||||||| ||||||||||||||    
T  41133327 gtctctctttcttttctctgctc 41133349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 21 - 432
Target Start/End: Original strand, 18311295 - 18311705
Alignment:
Q  21 caaaactctgtcaa-tttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtctttattacattgta 119  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||   ||| ||||||| ||||| |||||||    
T  18311295 caaaactctgccaaatttgattctacaaagcactttgaatttctgcactgatttgatatatcttaaaaattcttaagtttagagtccttattgcattgta 18311394  T
Q  120 ttgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgagcatta 218  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| |||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18311395 ttgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacat-tttctgtgtaattatgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgagcatta 18311493  T
Q  219 gaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca-tttgagaagtctcataccaagagagtattgagcatttgtaat 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  18311494 gaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattttgagaagtctcatacttagagagtattgagcatttgtaat 18311593  T
Q  318 ctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtctctct 417  Q
     ||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  18311594 atgtgtgatta---ttagtgaaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaattaggataattgcttgtgtctctct 18311690  T
Q  418 gtcttttctctgctc 432  Q
     ||||||||||||||    
T  18311691 ttcttttctctgctc 18311705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 46 - 432
Target Start/End: Original strand, 14388475 - 14388860
Alignment:
Q  46 aaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatct 145  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  14388475 aaagcactttgaatttctgcactgatttgatatatcttagaaattcttaagtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatca 14388574  T
Q  146 agtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaata-gaagcctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgag 243  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| | |||| ||  |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14388575 agtgttcaaagtcaaacattttt-tgtgtaattctgtttgattaagaagcctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgag 14388673  T
Q  244 cattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca-tttgagaagtctcataccaagagagtattgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaat 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| ||||    
T  14388674 cattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattttgagaagtctcatacttagagagtattgagcatttgtaatctgtgtgatta---ttagtgaaaat 14388770  T
Q  343 ctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtctctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14388771 ctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaatgaaccaggataattgcttgtgtctctctttcttttctctgctc 14388860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 11195382 - 11195800
Alignment:
Q  13 aaaagcgtcaaaactctgtcaa-tttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtctttatt 111  Q
    ||||||| |||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||   |||||||||||||||||    
T  11195382 aaaagcgccaaaactctgccaaatttgattctaaaaagcacattgaatttctgcactgatttgatacttctcataaattcttaagtctagagtctttatt 11195481  T
Q  112 acattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgctt 210  Q
     ||||||||||  ||||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  11195482 gcattgtattgataacaccactgatagtatatcaagtgttcaaagtcaaacat-tttctctgtatttttgtttgaatagaagcctcttgcctgcttgctt 11195580  T
Q  211 gagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca-tttgagaagtctcataccaagagagtattgagca 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  11195581 gagcattagaagactcttgctttagtgcttgatcattggaagactcttgcctgtgtgcttgagcattttgagaagtctcatacttagagagtattgagca 11195680  T
Q  310 tttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgt 409  Q
    |||||||||||||||   ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11195681 tttgtaatctgtgtg---atttttaatgaaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaaccaggataattgcttgt 11195777  T
Q  410 gtctctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||| || ||||||||||||||    
T  11195778 gtctcgctttcttttctctgctc 11195800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 5 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 5973658 - 5973233
Alignment:
Q  5 acaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagt 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  5973658 acaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaaaagtctagagt 5973559  T
Q  105 ctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgc 204  Q
    |||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| || |||  || ||||| ||||||  |||||||||| ||||||    
T  5973558 ctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttaattcattgcatttttgtttgatcagaagcctcttgcctgc 5973459  T
Q  205 gtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||| || || |||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||    
T  5973458 gtgcttgagcattagaagactcttgc-ttagtgcttgagcattagaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcatacttagagagta 5973360  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||     
T  5973359 ttgagcatttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgttttgtggaaggaaccaggataac 5973265  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  5973264 tgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 5973233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 3 - 413
Target Start/End: Original strand, 18382207 - 18382614
Alignment:
Q  3 atacaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcac-tagtctag 101  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||     
T  18382207 atacaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttctgcactgatttgatatatcttagaaattcacaaagtctaa 18382306  T
Q  102 agtctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgta-ttttcgtttgaatagaagcctctcgc 200  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| |||| ||||||  ||||| |||| ||    
T  18382307 agtctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacatgtttccctgtattttttgtttgatcagaagactcttgc 18382406  T
Q  201 ctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca-tttgagaagtctcataccaagaga 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||    
T  18382407 ctgcgtgcttgagcattagaagactcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcatgtgtgcttgagcattttgagaagtctcatacttagaga 18382505  T
Q  300 gtattgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggat 399  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  18382506 gtattgagcatttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctctttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaaccaggat 18382600  T
Q  400 aattgcttgtgtct 413  Q
    || |||||||||||    
T  18382601 aactgcttgtgtct 18382614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 5 - 432
Target Start/End: Original strand, 154595 - 155021
Alignment:
Q  5 acaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagt 104  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  154595 acaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaagttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaaaagtctagagt 154694  T
Q  105 ctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgc 204  Q
    ||| |||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| || |||  |||||||| ||||||  |||||||||| ||||||    
T  154695 cttaattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttaattcattgtatttttgtttgatcagaagcctcttgcctgc 154794  T
Q  205 gtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca---tttgagaagtctcataccaagagagt 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || ||| |||||||   |||||||||||||||||  |||||||    
T  154795 gtgcttgagcattagaagactcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgtttgagcattttttgagaagtctcatacttagagagt 154893  T
Q  302 attgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataa 401  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  154894 attgagcatttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaaccaggataa 154988  T
Q  402 ttgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
     ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  154989 ctgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 155021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 95 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 12945019 - 12944685
Alignment:
Q  95 agtctagagtctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcc 194  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12945019 agtctagagtctttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacatttttctctgtatttttgtttgaatagaagcc 12944920  T
Q  195 tctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca-tttgagaagtctcatacc 293  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||     
T  12944919 tcttgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattgtaagtctcttgcctgcgtgcttgagtattttgagaagtctcatact 12944820  T
Q  294 aagagagtattgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaac 393  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  12944819 tagagagtattgagcatttgtaatctttgtgatta---ttagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaac 12944724  T
Q  394 caggataattgcttgtgtctctctgtcttttctctgctc 432  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  12944723 caggataattgcttgtgtctttctttcttttctctgctc 12944685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 17957145 - 17956715
Alignment:
Q  1 acatacaagttaaaaa-gcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtct 99  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17957145 acatacaagttaaaaaagcgccaaaaccctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcacaagtct 17957046  T
Q  100 agagtctttattacattgta-ttgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaag-tcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctct 197  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  17957045 agagtctttattacattgtatttgtgaacaccactgattgtatatcaagtattcaagatcaaacat-tttctctgtatttttgtttgaacagaagtctct 17956947  T
Q  198 cgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgc-ttgagca--tttgagaagtctcatacca 294  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| || || |||| |||||||  |||||||||||||||||      
T  17956946 tgcctacgtgcttgagcattagaagactcttgc-ttagtgtttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgctttgagcatttttgagaagtctcatactt 17956848  T
Q  295 agagagtattgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaacc 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||     
T  17956847 agagagtattgagcatttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaact 17956753  T
Q  395 aggataattgcttgtgtctctc-tgtcttttctctgct 431  Q
    ||||||| || ||||||||| | | |||||||||||||    
T  17956752 aggataactgtttgtgtctcgcttttcttttctctgct 17956715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 7 - 413
Target Start/End: Original strand, 4250873 - 4251279
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  4250873 aagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaaaagtctagagtct 4250972  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    |||||  |||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| || |||  |||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||    
T  4250973 ttattgtattgtattatgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttaattcattgtatttttgtttgatcagaagcctcttgcctgcgt 4251072  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca------tttgagaagtctcataccaagagag 300  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||      ||| |||||||||||||  ||||||    
T  4251073 gcttgagcattagaagactcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattttttttttagaagtctcatacttagagag 4251171  T
Q  301 tattgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggata 400  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||    
T  4251172 tattgagcatttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaaccatgata 4251266  T
Q  401 attgcttgtgtct 413  Q
    | |||||||||||    
T  4251267 actgcttgtgtct 4251279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 5 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 19178858 - 19178434
Alignment:
Q  5 acaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagt 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  19178858 acaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagt 19178760  T
Q  105 ctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgc 204  Q
    |||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| ||||||  ||||| |||| ||||||    
T  19178759 ctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaactcaaactcaattctctgtatttttgtttgatcagaagtctcttgcctgc 19178660  T
Q  205 gtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||  ||| ||||    
T  19178659 gtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatacttagaaagta 19178561  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  19178560 ttgagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 19178466  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  19178465 tgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 19178434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 5 - 413
Target Start/End: Original strand, 20441623 - 20442027
Alignment:
Q  5 acaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagt 104  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  20441623 acaagttaaaaagcaccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaaaagtctagagt 20441722  T
Q  105 ctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgc 204  Q
    ||||||   |||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||  ||||| |||| ||||||    
T  20441723 ctttatcgtattgtattttgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttatttcattgtatttttgtttgatcagaagactcttgcctgc 20441822  T
Q  205 gtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||    
T  20441823 gtgcttgagcattataagactcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcatacttagagagta 20441921  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||     
T  20441922 ttgagcatttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggagtggactacttccgatttgtggaaggaaccaggataac 20442016  T
Q  403 tgcttgtgtct 413  Q
    ||||| |||||    
T  20442017 tgcttttgtct 20442027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 5 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 19187737 - 19187313
Alignment:
Q  5 acaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagt 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  19187737 acaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagt 19187639  T
Q  105 ctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgc 204  Q
    |||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| ||||||  ||||| |||| ||||||    
T  19187638 ctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaactcaaactcaattctctgtatttttgtttgatcagaagtctcttgcctgc 19187539  T
Q  205 gtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||  ||| ||||    
T  19187538 gtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatacttagaaagta 19187440  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  19187439 ttgagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 19187345  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  19187344 tgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 19187313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Original strand, 36236739 - 36237163
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  36236739 aagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 36236837  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||    
T  36236838 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctctcgcctgcgt 36236937  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||  ||| ||||    
T  36236938 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaagtctcatacttagaaagta 36237036  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  36237037 ttgagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 36237131  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  36237132 tgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 36237163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Original strand, 36247286 - 36247710
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  36247286 aagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 36247384  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||    
T  36247385 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctctcgcctgcgt 36247484  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||  ||| ||||    
T  36247485 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaagtctcatacttagaaagta 36247583  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  36247584 ttgagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 36247678  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  36247679 tgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 36247710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 5 - 413
Target Start/End: Original strand, 7689766 - 7690173
Alignment:
Q  5 acaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagt 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  7689766 acaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaaaagtctagagt 7689865  T
Q  105 ctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgc 204  Q
    ||||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||    
T  7689866 cttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgc 7689965  T
Q  205 gtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatt-----tgagaagtctcataccaagaga 299  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||||     || ||||||||||||  ||| |    
T  7689966 gtgcttgagcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattagttttgtgaagtctcatacttagaaa 7690064  T
Q  300 gtattgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggat 399  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  7690065 gtattgagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggat 7690159  T
Q  400 aattgcttgtgtct 413  Q
    || |||||||||||    
T  7690160 aactgcttgtgtct 7690173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 4177812 - 4177390
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||    
T  4177812 aagttcaaaagcaccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatatatcttagaaattcaa-agtctagagtct 4177714  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  4177713 ttactgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 4177614  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagtatt 304  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||  ||| ||||||    
T  4177613 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatacttagaaagtatt 4177515  T
Q  305 gagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||    
T  4177514 gagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactg 4177420  T
Q  405 cttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  4177419 cttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 4177390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Original strand, 10998094 - 10998516
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  10998094 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 10998192  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  10998193 tttctgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 10998292  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagtatt 304  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||  ||| ||||||    
T  10998293 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatacttagaaagtatt 10998391  T
Q  305 gagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||    
T  10998392 gagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggaccggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactg 10998486  T
Q  405 cttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  10998487 cttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 10998516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 21863558 - 21863136
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  21863558 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 21863460  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  21863459 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 21863360  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagtatt 304  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||  ||| ||||||    
T  21863359 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatacttagaaagtatt 21863261  T
Q  305 gagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||    
T  21863260 gagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactg 21863166  T
Q  405 cttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  21863165 cttgtgtctttatctttcttttctctgctc 21863136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 7 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 33084459 - 33084057
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  33084459 aagttcaaaagtgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 33084361  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  33084360 ttactgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 33084261  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca---tttgagaagtctcataccaagagagtat 303  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||   |||| ||||||||||||  ||| |||||    
T  33084260 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattttttgtgaagtctcatacttagaaagtat 33084162  T
Q  304 tgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataatt 403  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| |    
T  33084161 tgagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataact 33084067  T
Q  404 gcttgtgtct 413  Q
    ||||||||||    
T  33084066 gcttgtgtct 33084057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Original strand, 5640020 - 5640442
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||    
T  5640020 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaaacacactgaatttctgcactgatttgatatatcttagaaattcaa-agtctagagtct 5640118  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  5640119 ttactgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 5640218  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagtatt 304  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||  ||| ||||||    
T  5640219 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatacttagaaagtatt 5640317  T
Q  305 gagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||    
T  5640318 gagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactg 5640412  T
Q  405 cttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  5640413 cttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 5640442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Original strand, 5650577 - 5650999
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||    
T  5650577 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatatatcttagaaattcaa-agtctagggtct 5650675  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  5650676 ttactgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaactcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 5650775  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcat--ttgagaagtctcataccaagagagtatt 304  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || ||||||||||||  ||| ||||||||||||  ||| ||||||    
T  5650776 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttgtgaagtctcatacttagaaagtatt 5650874  T
Q  305 gagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||    
T  5650875 gagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactg 5650969  T
Q  405 cttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  5650970 cttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 5650999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 7 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 7507199 - 7506798
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  7507199 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 7507101  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||    
T  7507100 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctctcgcctgcgt 7507001  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||  ||| ||||    
T  7507000 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaagtctcatacttagaaagta 7506902  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  7506901 ttgagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 7506807  T
Q  403 tgcttgtgt 411  Q
    |||||||||    
T  7506806 tgcttgtgt 7506798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 7 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 7517796 - 7517395
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  7517796 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 7517698  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||    
T  7517697 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctctcgcctgcgt 7517598  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||  ||| ||||    
T  7517597 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaagtctcatacttagaaagta 7517499  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  7517498 ttgagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 7517404  T
Q  403 tgcttgtgt 411  Q
    |||||||||    
T  7517403 tgcttgtgt 7517395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 12730444 - 12730022
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  12730444 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 12730346  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  12730345 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 12730246  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagtatt 304  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  12730245 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatacttagagagtatt 12730147  T
Q  305 gagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||| ||||||||||| ||    
T  12730146 gagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactgaactacttccgtgtcgtggaaggaaccaggataactg 12730052  T
Q  405 cttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  12730051 cttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 12730022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 12741037 - 12740615
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  12741037 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 12740939  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  12740938 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 12740839  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagtatt 304  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  12740838 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatacttagagagtatt 12740740  T
Q  305 gagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||| ||||||||||| ||    
T  12740739 gagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactgaactacttccgtgtcgtggaaggaaccaggataactg 12740645  T
Q  405 cttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  12740644 cttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 12740615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Original strand, 12898291 - 12898713
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  12898291 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctaaaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 12898389  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  12898390 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 12898489  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagtatt 304  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||  ||| ||||||    
T  12898490 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatacttagaaagtatt 12898588  T
Q  305 gagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||    
T  12898589 gagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactg 12898683  T
Q  405 cttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  12898684 cttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 12898713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Original strand, 35649001 - 35649425
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  35649001 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 35649099  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  35649100 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 35649199  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||  ||| ||||    
T  35649200 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaagtctcatacttagaaagta 35649298  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  35649299 ttgagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 35649393  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  35649394 tgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 35649425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 38094973 - 38094549
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  38094973 aagtttaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 38094875  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  38094874 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 38094775  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||  ||| ||||    
T  38094774 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaagtctcatacttagaaagta 38094676  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  38094675 ttgagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 38094581  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  38094580 tgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 38094549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 38105598 - 38105174
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  38105598 aagtttaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 38105500  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  38105499 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 38105400  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||  ||| ||||    
T  38105399 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaagtctcatacttagaaagta 38105301  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  38105300 ttgagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 38105206  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  38105205 tgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 38105174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 5 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 39586870 - 39586467
Alignment:
Q  5 acaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagt 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  39586870 acaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactaatttgatatatcttagaaattcaaaagtctagagt 39586771  T
Q  105 ctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgc 204  Q
    || |||   |||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||||   ||||||| ||||||  | ||| |||| ||||||    
T  39586770 ctgtatcgtattgtattgtgaacaccactgatagtatatcaagtgttcaaatcaaacttatttcatggtatttttgtttgatcataagactcttgcctgc 39586671  T
Q  205 gtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca-tttgagaagtctcataccaagagagtat 303  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||    
T  39586670 gtgcttgagcattaaaagactcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcctgtgtgcttgagcattttgagaagtctcatacttagagagtat 39586572  T
Q  304 tgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataatt 403  Q
    |||||||||||||||| ||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||| |    
T  39586571 tgagcatttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgttttatggaatgaaccaggataact 39586477  T
Q  404 gcttgtgtct 413  Q
    | ||||||||    
T  39586476 ggttgtgtct 39586467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Original strand, 12624091 - 12624513
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  12624091 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 12624189  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  12624190 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 12624289  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagtatt 304  Q
    ||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||  ||| ||||||    
T  12624290 gcttgagcagtagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatacttagaaagtatt 12624388  T
Q  305 gagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||    
T  12624389 gagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtggaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactg 12624483  T
Q  405 cttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  12624484 cttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 12624513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 3 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 35012824 - 35012403
Alignment:
Q  3 atacaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctaga 102  Q
    |||||| || ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  35012824 atacaatttcaaaagcgccaaaactctgtcaaattgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattca-aagtctaga 35012726  T
Q  103 gtctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcct 202  Q
    ||| ||     |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||  ||||| |||| ||||    
T  35012725 gtcctt-----attgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgatcagaagtctcttgcct 35012631  T
Q  203 gcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagag 300  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||  ||| ||    
T  35012630 gcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatacttagaaag 35012532  T
Q  301 tattgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggata 400  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  35012531 tattgagcatttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggata 35012437  T
Q  401 attgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    | ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  35012436 actgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 35012403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Original strand, 51629497 - 51629921
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  51629497 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctaaaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 51629595  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  51629596 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 51629695  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||   || ||||    
T  51629696 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaagtctcatactttgatagta 51629794  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  51629795 ttgagcatttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 51629889  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  51629890 tgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 51629921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Original strand, 51656758 - 51657182
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  51656758 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctaaaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 51656856  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  51656857 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 51656956  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||   || ||||    
T  51656957 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaagtctcatactttgatagta 51657055  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  51657056 ttgagcatttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 51657150  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  51657151 tgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 51657182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 3 - 413
Target Start/End: Original strand, 39194398 - 39194807
Alignment:
Q  3 atacaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctaga 102  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  39194398 atacaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaaaagtctaga 39194497  T
Q  103 gtctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcct 202  Q
    |||| ||    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||  |||||||||| ||||    
T  39194498 gtctctaacgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttatttcattgtatttttgtttgatcagaagcctcttgcct 39194597  T
Q  203 gcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca---tttgagaagtctcataccaagaga 299  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||   |||||||||||||||||  |||||    
T  39194598 gtgtgcttgagcattagaagactcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattttttgagaagtctcatacttagaga 39194696  T
Q  300 gtattgagca-tttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaa-gaaaccagg 397  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||    || |||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||    
T  39194697 gtattgagcattttgtaatctttgtga----ttgtagt-gaaatctagctggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaagggaaccagg 39194791  T
Q  398 ataattgcttgtgtct 413  Q
    |||| || ||||||||    
T  39194792 ataactgtttgtgtct 39194807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 6 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 3171520 - 3171096
Alignment:
Q  6 caagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtc 105  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  3171520 caagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctaaaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtc 3171422  T
Q  106 tttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcg 205  Q
    |||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| |||||||    
T  3171421 ttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcg 3171322  T
Q  206 tgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagt 301  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||  ||| |||    
T  3171321 tgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaagtctcatacttagaaagt 3171223  T
Q  302 attgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataa 401  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  3171222 attgagcagttgtaatct-tgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataa 3171129  T
Q  402 ttgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
     ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  3171128 ctgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 3171096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 6 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 3182122 - 3181698
Alignment:
Q  6 caagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtc 105  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  3182122 caagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctaaaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtc 3182024  T
Q  106 tttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcg 205  Q
    |||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| |||||||    
T  3182023 ttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcg 3181924  T
Q  206 tgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagt 301  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||  ||| |||    
T  3181923 tgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaagtctcatacttagaaagt 3181825  T
Q  302 attgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataa 401  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  3181824 attgagcagttgtaatct-tgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataa 3181731  T
Q  402 ttgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
     ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  3181730 ctgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 3181698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 21877664 - 21877241
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  21877664 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattca-aagtctagagtct 21877566  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcg-tttgaatagaagcctctcgcctgcg 205  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| | ||||| |||||| |||| |||||||    
T  21877565 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgttttgattagaagtctcttgcctgcg 21877466  T
Q  206 tgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagtat 303  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||  ||| |||||    
T  21877465 tgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatacttagaaagtat 21877367  T
Q  304 tgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataatt 403  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| |    
T  21877366 tgagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggattggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataact 21877272  T
Q  404 gcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    |||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  21877271 gcttgtgtctttatctttcttttctctgctc 21877241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 5 - 367
Target Start/End: Original strand, 148520 - 148879
Alignment:
Q  5 acaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagt 104  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  148520 acaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaagttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaaaagtctagagt 148619  T
Q  105 ctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgc 204  Q
    ||| |||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| || |||  |||||||| ||||||  |||||||||| ||||||    
T  148620 cttaattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttaattcattgtatttttgtttgatcagaagcctcttgcctgc 148719  T
Q  205 gtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca---tttgagaagtctcataccaagagagt 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||   |||||||||||||||||  |||||||    
T  148720 gtgcttgagcattagaagactcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattttttgagaagtctcatacttagagagt 148818  T
Q  302 attgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactg 367  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  148819 attgagcatttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaaggaggactg 148879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 2538433 - 2538010
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  2538433 aagtttaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacatagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 2538335  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||    
T  2538334 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctctcgcctgcgt 2538235  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||  ||| ||||    
T  2538234 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaagtctcatacttagaaagta 2538136  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  2538135 ttgagcagttgtaatct-tgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 2538042  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||| ||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  2538041 tgcctgtgtctttgtctttcttttctctgctc 2538010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Original strand, 12614626 - 12615048
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |    
T  12614626 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagttt 12614724  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  12614725 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 12614824  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagtatt 304  Q
    ||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||  ||| ||||||    
T  12614825 gcttgagcagtagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatacttagaaagtatt 12614923  T
Q  305 gagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||    
T  12614924 gagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtggaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactg 12615018  T
Q  405 cttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  12615019 cttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 12615048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Original strand, 35404702 - 35405126
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  35404702 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgatactaaaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattca-tagtctagagtct 35404800  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  | |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  35404801 tttctgtactgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 35404900  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||  ||| ||||    
T  35404901 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaagtctcatacttagaaagta 35404999  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  35405000 ttgagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 35405094  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  35405095 tgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 35405126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 5833115 - 5832692
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  5833115 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgatactacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 5833017  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  5833016 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 5832917  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||   || ||||    
T  5832916 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaagtctcatactttgaaagta 5832818  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  5832817 ttgagcagttgtaatct-tgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 5832724  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  5832723 tgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 5832692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 5843717 - 5843294
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  5843717 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgatactacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 5843619  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  5843618 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 5843519  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||   || ||||    
T  5843518 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaagtctcatactttgaaagta 5843420  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  5843419 ttgagcagttgtaatct-tgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 5843326  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  5843325 tgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 5843294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 13 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 23926826 - 23926406
Alignment:
Q  13 aaaagcgtcaaaactctg-tcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtcttt-at 110  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||  |||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||| ||    
T  23926826 aaaagcgtcaaaactctgctaaatttgattctcaaaagcactctgaatttctgcactgatttgatatatcttagaaattcttaagtctagagtcttttat 23926727  T
Q  111 tacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaag-tcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgct 209  Q
    | ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||  ||||| |||| ||  |||||| |||||| |||| || |  |||||    
T  23926726 tgcattgtactgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgattagaagtctcttgctttagtgct 23926627  T
Q  210 tgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagag-agtattgagc 308  Q
    |||||||| |||| ||||||| |  |||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||| | | | ||||||||||    
T  23926626 tgagcattggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgcgtccttgagcaattgagaagtctcatactaggtgtagtattgagc 23926527  T
Q  309 atttgtaatctgtgtgattattt-ttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  23926526 agttgtaatctgtgtgattatttcttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaaccagtataattgctt 23926427  T
Q  408 gtgtctctctgtcttttctct 428  Q
    |||||||||| ||||||||||    
T  23926426 gtgtctctctttcttttctct 23926406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Original strand, 47608241 - 47608664
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  47608241 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgatactacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 47608339  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  47608340 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 47608439  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||   || ||||    
T  47608440 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttattgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaagtctcatactttgaaagta 47608538  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  47608539 ttgagcagttgtaatct-tgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 47608632  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  47608633 tgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 47608664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Original strand, 47618849 - 47619272
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  47618849 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgatactacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 47618947  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  47618948 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 47619047  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||   || ||||    
T  47619048 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttattgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaagtctcatactttgaaagta 47619146  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  47619147 ttgagcagttgtaatct-tgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 47619240  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  47619241 tgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 47619272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Original strand, 35638349 - 35638770
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  35638349 aagttcaaaagcgccaaaactcggtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaatt-aaaagtctagagtct 35638447  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||| ||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  35638448 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctg-atttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 35638546  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagtatt 304  Q
    ||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||  ||| ||||||    
T  35638547 gcttgagcagtagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatacttagaaagtatt 35638645  T
Q  305 gagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||    
T  35638646 gagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtggaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactg 35638740  T
Q  405 cttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  35638741 cttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 35638770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 68 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 5929416 - 5929054
Alignment:
Q  68 tgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtcttt--attacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaag-tcaaacata 164  Q
    |||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||      
T  5929416 tgatttgatatatcttagaaattcttaagtctagagtctttcaattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaat 5929317  T
Q  165 tttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgc 264  Q
    ||| | |||| ||  |||||| |||||| |||| || |  ||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5929316 tttttgtgtaattctgtttgattagaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcattggaagtctcttgcctgc 5929217  T
Q  265 gtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagagagtattgagcatttgtaatctgtgtgattattt-ttagtggaaatctccttggaagtgcaaggggg 363  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | |  ||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5929216 gtgcttgagcatttgggaagtctcatactaggt-agtattgagcagtt-taatctgtgtgattatttcttagtgaaaatctccttggaagtgcaaggggg 5929119  T
Q  364 actggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtctctctgtcttttctct 428  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  5929118 actagactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgtttgtgtctctctttcttttctct 5929054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 3 - 247
Target Start/End: Original strand, 9050791 - 9051036
Alignment:
Q  3 atacaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctaga 102  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9050791 atacaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcacaagtctaga 9050890  T
Q  103 gtctttattacattgta-ttgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcc 201  Q
    ||| | ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||    
T  9050891 gtcataattacattgtatttgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaaaatatttctctgtatttttgtttgattagaagcctcttgcc 9050990  T
Q  202 tgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcatt 247  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |  |||||||||||||    
T  9050991 tgcgtgcttgagcattggaagactcttgcctgtgtgcttgagcatt 9051036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 3 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 47195164 - 47194891
Alignment:
Q  3 atacaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctaga 102  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  47195164 atacaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatatatcttagaaattcaaaagtctaga 47195065  T
Q  103 gtctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcct 202  Q
    ||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||  ||||| |||| ||||    
T  47195064 gtctttatcgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttatttcattgtatttttgtttgatcagaagactcttgcct 47194965  T
Q  203 gcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatt 277  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||| ||||    
T  47194964 gcgtgcttgagcattagaagactcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcctatgtgcttgatcatt 47194891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 7 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 4167156 - 4166871
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||    
T  4167156 aagttcaaaagcaccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatatatcttagaaattcaa-agtctagagtct 4167058  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  4167057 ttactgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 4166958  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcatac 292  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  4166957 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatac 4166871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 46 - 428
Target Start/End: Original strand, 26548606 - 26548994
Alignment:
Q  46 aaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagag--tcttt--attacattgtattgtgaacactactgattgtat 141  Q
    ||||||| |||||||||||   | |||||||| |||||||||||||   |||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26548606 aaagcactttgaatttcagtgttcatttgatatatcttagaaattcttaagtctagagagtctttcaattgcattgtattgtgaacaccactgattgtat 26548705  T
Q  142 atctagtgttcaag-tcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgctt 240  Q
    ||| |||||||||  |||||||  ||||| |||| ||  ||||||||||||| |||| |  |  ||||||||||||  |||| |||||||||||||||||    
T  26548706 atcaagtgttcaaaatcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttggtttagtgcttgagcataggaagtctcttgctttagtgctt 26548805  T
Q  241 gagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagag-agtattgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtgga 339  Q
    |||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||| | | | ||||||||||| |||||||  | |||||||   ||||||||    
T  26548806 gagcaaaggaagtctcttgactgcgtgcttgagcatttgtgaagtctcatactaggtgtagtattgagcagttgtaataagagtgattaaacttagtgga 26548905  T
Q  340 aatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtctctctgtcttttctct 428  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||| |||||    
T  26548906 aatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaaccagtataattgcatgtgtctctctttcttctctct 26548994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 215 - 432
Target Start/End: Original strand, 46181367 - 46181585
Alignment:
Q  215 attagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagagagtattgagcatttgt 314  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||    
T  46181367 attagaagtctcttgctttagtgcttgagcattggaagtctcttgcatgcgtgcttgagcatttgggaagtctcata-ctagatagtattgagcagttgt 46181465  T
Q  315 aatctgtgtgattattt-ttagtggaaatctccttggaagtgcaa-gggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtc 412  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  46181466 aatctgtgtgattatttcttagtggaaatctccttggaagtgcaaggggggactggactacttccgatttgtggaaggaaccaggataattgcttgtgtc 46181565  T
Q  413 tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  46181566 tctctttcttttctctgctc 46181585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 114 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 7677635 - 7677339
Alignment:
Q  114 attgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgag 213  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||  ||||| |||| ||||| |||||||||    
T  7677635 attgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttatttctttgtatttttgtttgatcagaagactcttgcctgtgtgcttgag 7677536  T
Q  214 cattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagtattgagcatt 311  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| || || ||| |||||||  |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  7677535 cattggaagactcttgc-ttagtgcttgagcattggaaaactcttgcgtgtgtgtttgagcatttttgagaagtctcatacttagagagtattgagcatt 7677437  T
Q  312 tgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaacc-aggataattgcttgtg 410  Q
     ||||||| ||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | ||||| ||||||||    
T  7677436 cgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgttttgtggaaggaaccaatgataactgcttgtg 7677342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 113 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 28379655 - 28379337
Alignment:
Q  113 cattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaag-tcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttg 211  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||  ||| | |||| ||  ||||||||||||| |||| || |  |||||||    
T  28379655 cattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttttgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttgctttagtgcttg 28379556  T
Q  212 agcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagag-agtattgagcat 310  Q
    |||||  |||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| |  || ||||||||||||||| |||||||||||| | | | |||||||| ||     
T  28379555 agcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgtttgtgtgcttgagcatttgtgaagtctcatactaggtgtagtattgaacag 28379456  T
Q  311 ttgtaatctgtgtgattattt-ttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgt 409  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  28379455 ttgtaatctgtgtgattattacttagtgaaaatctccttggaagtgcaagggggaatggactacttccggtttgtggaaggaaccagtataattgcttgt 28379356  T
Q  410 gtctctctgtcttttctct 428  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  28379355 gtctctctttcttttctct 28379337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 215 - 428
Target Start/End: Original strand, 45071117 - 45071330
Alignment:
Q  215 attagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagagagtattgagcatttgt 314  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |  ||||||||||| ||||    
T  45071117 attagaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctctagcctgcgtgcttgagcatttgggaagtctcatactacgt-agtattgagcagttgt 45071215  T
Q  315 aatctgtgtgattattt-ttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtct 413  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  45071216 aatttgtgtgattatttcttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaaccaggataattgtttgtgtct 45071315  T
Q  414 ctctgtcttttctct 428  Q
    |||| ||||||||||    
T  45071316 ctctttcttttctct 45071330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 118 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 22018987 - 22018675
Alignment:
Q  118 tattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaag-tcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgagcat 216  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||  ||||| |||| ||  ||||||||||||| |||| || |  ||||||||||||    
T  22018987 tattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttgctttagtgcttgagcat 22018888  T
Q  217 tagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagag-agtattgagcatttgta 315  Q
      |||| ||||| ||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | | | ||||||||||| |||||    
T  22018887 aggaagtctctttctttagtgcttgagcaaaggaagtgtcttgcctgcgtgcttgagcatttgtgaagtctcatactaggtgtagtattgagcagttgta 22018788  T
Q  316 atctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtctct 415  Q
    |||||||||||||   |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||    
T  22018787 atctgtgtgattaaacttagtgaaaatatccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaaccagtataattgcctgtgtctct 22018688  T
Q  416 ctgtcttttctct 428  Q
    || |||| |||||    
T  22018687 ctttcttctctct 22018675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 217 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 20251361 - 20251148
Alignment:
Q  217 tagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagag-agtattgagcatttgta 315  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| | | | ||||||||||| |||||    
T  20251361 tagaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcatttttgaagtctcatactaggtgtagtattgagcagttgta 20251262  T
Q  316 atctgtgtgattattt-ttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtctc 414  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  20251261 atctgtgtgattatttgttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggaatggactacttccggtttgtggaaggaaccagtataattgcttgtgtctc 20251162  T
Q  415 tctgtcttttctct 428  Q
    ||| ||||||||||    
T  20251161 tctttcttttctct 20251148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 113 - 428
Target Start/End: Original strand, 19170746 - 19171063
Alignment:
Q  113 cattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaag-tcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttg 211  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||  |||||||  ||| | |||| ||  ||||||||||||| |||| || |  |||||||    
T  19170746 cattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttaaaactcaaacaattttttgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttgctttagtgcttg 19170845  T
Q  212 agcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagag-agtattgagcat 310  Q
    ||||   |||| ||||||| |  |||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||| | | | |||||||||||     
T  19170846 agcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcaattt-gaagtctcatactaggtgtagtattgagcag 19170944  T
Q  311 ttgtaatctgtgtgattattt-ttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgt 409  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  19170945 ttgtaatctgtgtgattattacttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaaccaatataattgcttgt 19171044  T
Q  410 gtctctctgtcttttctct 428  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  19171045 gtctctctttcttttctct 19171063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 3 - 247
Target Start/End: Original strand, 23580632 - 23580874
Alignment:
Q  3 atacaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctaga 102  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  23580632 atacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaaattgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattca-aagtctaga 23580730  T
Q  103 gtctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcct 202  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||  ||||| |||| | ||    
T  23580731 gtctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgatcagaagtctcttg-ct 23580829  T
Q  203 gcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcatt 247  Q
      ||||||||||||| |||||||||||| |  |||||| ||||||    
T  23580830 tagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttaagcatt 23580874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 70 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 17370749 - 17370385
Alignment:
Q  70 atttgatacatcttagaaattcactagtcta--gagtcttta--ttacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaag-tcaaacata 164  Q
    |||||||| |||||||||||||   ||||||  ||||||||   || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||      
T  17370749 atttgatatatcttagaaattcttaagtctatagagtctttcatttgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaat 17370650  T
Q  165 tttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgc 264  Q
    ||||| |||| ||   |||||||||||| |||| || |  ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  17370649 tttctgtgtaattctatttgaatagaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgc 17370550  T
Q  265 gtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagag-agtattgagcatttgtaatctgt-gtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggg 362  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||||| | | | ||||||||||| |||||||| || |||||||   |||||| || ||||||||||||||||| |||    
T  17370549 gtgcttgagcaattt-gaagtctcatactaggtgtagtattgagcagttgtaatcagttgtgattaaacttagtgaaactctccttggaagtgcaatggg 17370451  T
Q  363 gactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtctctctgtcttttctct 428  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||| |||||    
T  17370450 gactcgactacttccggtttgtggaaggaaccagtataattgcatgtgtctctctttcttctctct 17370385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 205 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 47194903 - 47194699
Alignment:
Q  205 gtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattt-gagaagtctcataccaagagagtat 303  Q
    |||||||| |||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  47194903 gtgcttgatcattggaagactcttgcctatgtgcttgagcattggaagactcttgcctatgtgcttgagcattttgagaagtctcatacttagagagtat 47194804  T
Q  304 tgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataatt 403  Q
    |||||||||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| |    
T  47194803 tgagcatttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataact 47194709  T
Q  404 gcttgtgtct 413  Q
    ||||||||||    
T  47194708 gcttgtgtct 47194699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 205 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 22642432 - 22642207
Alignment:
Q  205 gtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagag-agtat 303  Q
    ||||||||||||  |||| ||||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | | | |||||    
T  22642432 gtgcttgagcataggaagtctcttgcttgagtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcatttgtgaagtctcatactaggtgtagtat 22642333  T
Q  304 tgagcatttgtaatctgt-gtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    |||||| |||||||| || |||||||   |||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  22642332 tgagcagttgtaatcagttgtgattaaacttagtgaaactcttcttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaaccagtataat 22642233  T
Q  403 tgcttgtgtctctctgtcttttctct 428  Q
    ||| ||||||| ||| |||| |||||    
T  22642232 tgcctgtgtctttctttcttctctct 22642207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 215 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 28473818 - 28473660
Alignment:
Q  215 attagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagagagtattgagcatttgt 314  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||  ||||||||| | ||||    
T  28473818 attagaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcatttgtgaagtctcata-ctaggtagtattgagtagttgt 28473720  T
Q  315 aatctgtgtgattattt-ttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactac 373  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28473719 aatctgtgtgattatttcttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactac 28473660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 215 - 353
Target Start/End: Original strand, 20884370 - 20884508
Alignment:
Q  215 attagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagagagtattgagcatttgt 314  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||    
T  20884370 attagaagtctcttgctttagtgcttgagcattggaattctctcgcctgcgtgcttgagcatttgggaagtctcata-ctagatagtattgagcagttgt 20884468  T
Q  315 aatctgtgtgattattt-ttagtggaaatctccttggaag 353  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20884469 aatctgtgtgattatttcttagtggaaatctccttggaag 20884508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 13 - 247
Target Start/End: Original strand, 46181193 - 46181429
Alignment:
Q  13 aaaagcgtcaaaactctgtcaa-tttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtcttt-at 110  Q
    ||||||| | |||||||| ||| |||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||| ||    
T  46181193 aaaagcgcccaaactctgccaaatttgattctcaaaagcactttgaatttctgcactgatttgatatatcttagaaattcttaagtctagagtcttttat 46181292  T
Q  111 tacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgctt 210  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||| |||| ||  |||||| |||||| |||| || |  ||||||    
T  46181293 tgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacaattttctgtgtaattctgtttgattagaagtctcttgctttagtgctt 46181392  T
Q  211 gagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcatt 247  Q
    ||||||| |||| ||||||| |  |||||||||||||    
T  46181393 gagcattggaagtctcttgcatgcgtgcttgagcatt 46181429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 218 - 432
Target Start/End: Original strand, 23580816 - 23581028
Alignment:
Q  218 agaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattt--gagaagtctcataccaagagagtattgagcatttgta 315  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || || |||||| |||||||  | ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||    
T  23580816 agaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttaagcatttttgtgaagtctcatacttagaaagtattgagcatttgta 23580914  T
Q  316 atctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtc--t 413  Q
    |||| |||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |    
T  23580915 atctttgtgattat----agtg-aaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtcttt 23581009  T
Q  414 ctctgtcttttctctgctc 432  Q
     ||| ||||||||||||||    
T  23581010 gtctttcttttctctgctc 23581028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 215 - 387
Target Start/End: Original strand, 9050974 - 9051143
Alignment:
Q  215 attagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattt--gagaagtctcataccaagagagtattgagcattt 312  Q
    |||||||| ||||||| |  |||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  9050974 attagaagcctcttgcctgcgtgcttgagcattggaagactcttgcctgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcatacttagagagtattgagcattt 9051073  T
Q  313 gtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtgga 387  Q
    ||||||| ||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9051074 gtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtgga 9051143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 13 - 247
Target Start/End: Original strand, 20884196 - 20884432
Alignment:
Q  13 aaaagcgtcaaaactctgtcaa-tttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtcttt-at 110  Q
    ||||||| |||||||||| ||| |||||||||  |||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||| ||    
T  20884196 aaaagcgccaaaactctgccaaatttgattctcaaaagcactctgaatttctgcactgatttgatatatcttagaaattcttaagtctagagtcttttat 20884295  T
Q  111 tacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgctt 210  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||| ||  |||||| |||||| |||| || |  ||||||    
T  20884296 tgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacatttttctgtgtaattctgtttgattagaagtctcttgctttagtgctt 20884395  T
Q  211 gagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcatt 247  Q
    ||||||| |||  |||| || |  |||||||||||||    
T  20884396 gagcattggaattctctcgcctgcgtgcttgagcatt 20884432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 114 - 412
Target Start/End: Original strand, 34255938 - 34256238
Alignment:
Q  114 attgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttga 212  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||  ||||| |||| ||  ||||||  ||||| |||| || |  ||||||||    
T  34255938 attgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaatctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgataagaagtctcttgctttagtgcttga 34256037  T
Q  213 gcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagag-agtattgagcatt 311  Q
    |||| ||||| |||||||| | |||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||| | | | ||||||||||| |    
T  34256038 gcataagaagtctcttgctgt-gtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcaatt-tgaagtctcatactaggtgtagtattgagcagt 34256135  T
Q  312 tgtaatctg-tgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgt 409  Q
    ||||||| | ||||||||   |||||| || ||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| |||| | |||||||| |||    
T  34256136 tgtaatcagttgtgattaaacttagtgaaactctacttggaagtgcaagggggacaagactgacttccggtttgtggaaggaacctgtataattgcctgt 34256235  T
Q  410 gtc 412  Q
    |||    
T  34256236 gtc 34256238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 227
Target Start/End: Original strand, 20867175 - 20867383
Alignment:
Q  21 caaaactctgtcaa-tttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtcttt-attacattgt 118  Q
    |||||||||| ||| |||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||| | | ||||||    
T  20867175 caaaactctgccaaatttgattctcaaaagcactttgaatttctgcactgatttgatatatcttagaaattcttaagtctagagtcttttactgcattgt 20867274  T
Q  119 attgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgagcatta 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||| |||| ||  |||||| |||||| |||| || |  |||||||||||||     
T  20867275 attgtgaacactactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacaattttctgtgtaattctgtttgattagaagtctcttgctttagtgcttgagcattg 20867374  T
Q  219 gaagactct 227  Q
    |||| ||||    
T  20867375 gaagtctct 20867383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 13 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 20798831 - 20798689
Alignment:
Q  13 aaaagcgtcaaaactctgtcaa-tttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtctttatt 111  Q
    ||||||| |||||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  20798831 aaaagcgccaaaactctgccaaatttgattctaaaaagcactttgaatttctgcactgatttgatatatcttagaaattcttaagtctagagtctttatt 20798732  T
Q  112 acattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa 154  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  20798731 gcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 20798689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 7 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 21895101 - 21894964
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtc- 105  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||     
T  21895101 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattca-aagtctagagtct 21895003  T
Q  106 tttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatc 144  Q
    ||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21895002 tttcttgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatc 21894964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 319 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 23059048 - 23058938
Alignment:
Q  319 tgtgtgattattt-ttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtctctct 417  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  23059048 tgtgtgattatttcttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactgaactacttccggtttgtggaaggaaccagtatagttgcttgtgtctctct 23058949  T
Q  418 gtcttttctct 428  Q
     ||||||||||    
T  23058948 ttcttttctct 23058938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 13 - 247
Target Start/End: Original strand, 45070942 - 45071179
Alignment:
Q  13 aaaagcgtcaaaactctgtcaa-tttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtc-tttat 110  Q
    ||||||| |||||||||| ||| |||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||| |||||    
T  45070942 aaaagcgccaaaactctgccaaatttgattctcaaaagcactttgaatttctgcactgatttgatatatcttagaaattcctaagtctagagtcttttat 45071041  T
Q  111 tacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgtt-caagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgct 209  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||||  ||||| |||| ||  |||||| |||||| |||| || |  |||||    
T  45071042 tgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttaaaagtcaaacaattttctgtgtaattctgtttgattagaagtctcttgctttagtgct 45071141  T
Q  210 tgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcatt 247  Q
    |||||||  |||| |||| || |  |||||||||||||    
T  45071142 tgagcataggaagtctctagcctgcgtgcttgagcatt 45071179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 321 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 19037459 - 19037351
Alignment:
Q  321 tgtgattattt-ttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtctctctgt 419  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |    
T  19037459 tgtgattatttcttagtggaaatctccttggaagtgcaaggtggactggactacttccgatttgtggaaggaaccagtataattgcttgtgtctctcttt 19037360  T
Q  420 cttttctct 428  Q
    |||||||||    
T  19037359 cttttctct 19037351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 215 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 44200604 - 44200443
Alignment:
Q  215 attagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcg----tgcttgagcatttgagaagtctcataccaagagagtattgagcat 310  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||| || ||||    |||||||||||||| |||||||||||| | |  |||||||||||     
T  44200604 attagaaatctcttgctttagtgcttgagcatatgaagtctcttgcgtgcgcgcatgcttgagcatttgtgaagtctcatactaggt-agtattgagcag 44200506  T
Q  311 ttgtaatctgtgtgattattt-ttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggacta 372  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44200505 ttgtaatctgtgtgattatttcttagtgaaaatctccttggaagtgcaagggggactgaacta 44200443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 70 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 22642602 - 22642392
Alignment:
Q  70 atttgatacatcttagaaattcactagtctagag--tcttt--attacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaag-tcaaacata 164  Q
    |||||||| |||||||||||||   |||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||      
T  22642602 atttgatatatcttagaaattcttaagtctagagagtctttcaattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaat 22642503  T
Q  165 tttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgc 264  Q
    ||||| |||| ||  ||||||||||||| |||| || |  ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||     
T  22642502 tttctgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgcttga 22642403  T
Q  265 gtgcttgagca 275  Q
    |||||||||||    
T  22642402 gtgcttgagca 22642392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 281 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 16710456 - 16710308
Alignment:
Q  281 gaagtctcataccaagagagtattgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggt 380  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  16710456 gaagtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattat----agtg-aaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtg 16710362  T
Q  381 ttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  16710361 ttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 16710308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 219 - 394
Target Start/End: Original strand, 7745579 - 7745752
Alignment:
Q  219 gaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagag-agtattgagcatttgtaat 317  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||   ||  ||||||||||     | ||||||||||| |||||||    
T  7745579 gaagactcttgcttgtgtgcttgagcataggaagtctcttgc-tgtgtgcttgagcaaagga--agtctcatacttgttgtagtattgagcaattgtaat 7745675  T
Q  318 ctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaacc 394  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||    
T  7745676 ctgtgtgattatttttagtgaaactctccttggaagtgcaagggggacatggctacttccggtttgtggaaggaacc 7745752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 299 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 4717736 - 4717606
Alignment:
Q  299 agtattgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccagga 398  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||    
T  4717736 agtattgagcagttgtaatctttgtgattat----agtg-aaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccagga 4717642  T
Q  399 taattgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||| ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  4717641 taactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 4717606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 97 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 19037685 - 19037501
Alignment:
Q  97 tctagagtcttt--attacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaag-tcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagc 193  Q
    ||||||||||||  ||| |||| |||||||||||| ||| || ||||||| |||||||||  |||||||  ||||| |||| ||  |||||| ||||||     
T  19037685 tctagagtctttcaattgcattttattgtgaacaccacttatagtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgattagaagt 19037586  T
Q  194 ctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattt 278  Q
    |||| || |  |||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19037585 ctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattt 19037501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 332 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 21541244 - 21541148
Alignment:
Q  332 ttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtctctctgtcttttctct 428  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||  ||| ||||||||||    
T  21541244 ttagtgaaactctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaaccagtataattgcatgtgtccttctttcttttctct 21541148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 338 - 432
Target Start/End: Original strand, 9749854 - 9749950
Alignment:
Q  338 gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  9749854 gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 9749950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 338 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 13223624 - 13223528
Alignment:
Q  338 gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  13223624 gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 13223528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 338 - 432
Target Start/End: Original strand, 24049133 - 24049229
Alignment:
Q  338 gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  24049133 gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 24049229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 338 - 432
Target Start/End: Original strand, 25218056 - 25218152
Alignment:
Q  338 gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  25218056 gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 25218152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 46 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 28473960 - 28473756
Alignment:
Q  46 aaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtcttt--attacattgtattgtgaacactactgattgtatat 143  Q
    ||||||| ||||||||| |   |||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28473960 aaagcacgttgaatttctgtgttgatttgatatatcttagaaattcttaagtctagagtctttcaattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatat 28473861  T
Q  144 ctagtgttc-aagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttga 242  Q
    | ||||||| || |||||||  ||||| |||| ||  |||||| |||||| |||| || |  ||||||||||||  |||| ||||||| |  ||||||||    
T  28473860 caagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgattagaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgcctgcgtgcttga 28473761  T
Q  243 gcatt 247  Q
    |||||    
T  28473760 gcatt 28473756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 7 - 92
Target Start/End: Original strand, 35401475 - 35401560
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattca 92  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35401475 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgatactaaaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattca 35401560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 338 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 36100111 - 36100015
Alignment:
Q  338 gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  36100111 gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 36100015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 338 - 432
Target Start/End: Original strand, 36551173 - 36551269
Alignment:
Q  338 gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  36551173 gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 36551269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 347 - 428
Target Start/End: Original strand, 52351269 - 52351350
Alignment:
Q  347 ttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtctctctgtcttttctct 428  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  52351269 ttggaagtgcaggggggactggactacttccggtttgtagaaggaaccagtataattgcttgtgtctctctttcttttctct 52351350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 47 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 44200744 - 44200636
Alignment:
Q  47 aagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtcttt-attacattgtattgtgaacactactgattgtatatct 145  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  44200744 aagcactttgaatttctgcactgatttgatatatcttagaaattcttaagtctagagtctttccttgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatca 44200645  T
Q  146 agtgttcaa 154  Q
    |||||||||    
T  44200644 agtgttcaa 44200636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 70 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 22655184 - 22654992
Alignment:
Q  70 atttgatacatcttagaaattcactagtctagag--tcttt--attacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttc-aagtcaaacata 164  Q
    |||||| | |||||||||||||   |||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || |||||||      
T  22655184 atttgagatatcttagaaattcttaagtctagagagtctttcaattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaat 22655085  T
Q  165 tttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctct 257  Q
    ||||| |||| ||  ||||||||||||| |||| |  |  ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  22655084 tttctgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttggtttagtgcttgagcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctct 22654992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 46 - 247
Target Start/End: Original strand, 52351032 - 52351236
Alignment:
Q  46 aaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtcttt--attacattgtattgtgaacactactgattgtatat 143  Q
    ||||||| ||||||||| |   |||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  52351032 aaagcactttgaatttctgtgttgatttgatatatcttagaaattcttaagtctagagtctttcaattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatat 52351131  T
Q  144 ctagtgttc-aagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttga 242  Q
    | ||||||| || |||||||  ||||| |||| ||  |||||| |||||| |||| || |  ||||||||||||  |||| ||||| | |  ||||||||    
T  52351132 caagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgattagaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttacctgcgtgcttga 52351231  T
Q  243 gcatt 247  Q
    |||||    
T  52351232 gcatt 52351236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 215 - 292
Target Start/End: Original strand, 52351174 - 52351251
Alignment:
Q  215 attagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcatac 292  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  52351174 attagaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttacctgcgtgcttgagcatttgtgaagtctcatac 52351251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 115 - 257
Target Start/End: Original strand, 17025386 - 17025529
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaag-tcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgag 213  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||  |||| ||  ||||||||||||| |||| || || |||||||||    
T  17025386 ttgtattgtgaacaccattgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttccttgtaattctgtttgaatagaagtctcttgcttgtgtgcttgag 17025485  T
Q  214 cattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctct 257  Q
    |||  |||| |||||| |||||| ||||||||| |||| |||||    
T  17025486 cataggaagtctcttgatttagttcttgagcataggaaatctct 17025529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 338 - 407
Target Start/End: Original strand, 22202380 - 22202449
Alignment:
Q  338 gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || | | ||||||||||    
T  22202380 gaaatctccttggaagtgcaagggggacaggactacttccggtttgtggaaggaagctgtataattgctt 22202449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 339 - 404
Target Start/End: Original strand, 23975496 - 23975561
Alignment:
Q  339 aaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||    
T  23975496 aaatcttcttggaagtgcaagggggactggactacttccggattgtggaaggaaccatgataattg 23975561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 20251483 - 20251301
Alignment:
Q  70 atttgatacatcttagaaattcactagtcta--gagtcttt--attacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttc-aagtcaaacata 164  Q
    |||||||| |||||||||||||   ||||||  ||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || |||||||      
T  20251483 atttgatatatcttagaaattcttaagtctatagagtctttcaattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaat 20251384  T
Q  165 tttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcatt 247  Q
    ||||| |||| ||  ||||||||||||| |||| || |  |||||||||||   |||| ||||||| |  |||||||||||||    
T  20251383 tttctgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcatt 20251301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 115 - 413
Target Start/End: Original strand, 21215100 - 21215398
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaat--agaagcctctcgcctgcgtgcttg 211  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||| |||||||| ||||||||  ||||| |||| ||    |||||||    
T  21215100 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtatttttgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttg 21215199  T
Q  212 agcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaa-gagagtattgagcat 310  Q
    |||| |||||| |||||| ||  || |  |||||| |||||||||| ||    ||||||||||| ||  |||||||| ||| || |  |||| |||||||    
T  21215200 agcaatagaagtctcttgattgtgttccggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatt-tgaagtctcttactaaggttagtagtgagcat 21215298  T
Q  311 ttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggat-aattgcttg 408  Q
    ||||||||     |||  |   |||| ||| || ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| | || |||||||||    
T  21215299 ttgtaatc----agatattacatagt-gaattccccttggaagtgcaagggggacaggactgacttccggtttgtggaaggaacctgtataaattgcttg 21215393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 327 - 407
Target Start/End: Original strand, 22465446 - 22465525
Alignment:
Q  327 tatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  22465446 tatttttagtg-aactctccttggaagtgcaagggggacaagactacttccggtttgtggaagaaacatgtataattgctt 22465525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 115 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 7309475 - 7309177
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaag-tcaaacatatttctctgtattttcgtttgaat--agaagcctctcgcctgcgtgcttg 211  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||| |||  ||||| |||| ||  ||||||||  ||||| |||| || |  |||||||    
T  7309475 ttgtaatgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcagacaattttctgtgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcatttgtgcttg 7309376  T
Q  212 agcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagag-agtattgagcat 310  Q
    | ||||||||| |||||| ||  || ||||||||| |||||||||| ||    ||||||||||||||||  |||||| | | |||   || | |||||||    
T  7309375 aacattagaagtctcttgattgtgttcttgagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcatttga--agtctcttgctaagtttagcagtgagcat 7309278  T
Q  311 ttgtaatctgtgtgattat-ttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgt 409  Q
    |||||||| |    ||||  |||||||| || ||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| ||||   ||||||||||||    
T  7309277 ttgtaatcagat--attacattttagtg-aactctccttagaagtgcaagggggacagtactacttccgatttgtggaaggaacctatataattgcttgt 7309181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 333 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 31358804 - 31358730
Alignment:
Q  333 tagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  | ||||||||| |||||||||||||||||    
T  31358804 tagtgaaaatctccttggaagtgcaggggggattggactacttctagattgtggaaggaaccaggataattgctt 31358730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 113 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 21543699 - 21543566
Alignment:
Q  113 cattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttc-aagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttg 211  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || |||||||  ||||| |||| ||  ||||||||||||| |||| || |  |||||||    
T  21543699 cattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttgctttagtgcttg 21543600  T
Q  212 agcattagaagactcttgctttagtgcttgagca 245  Q
    |||||   ||| |||||||||  |||||||||||    
T  21543599 agcatagaaagtctcttgcttgtgtgcttgagca 21543566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 328 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 12283865 - 12283790
Alignment:
Q  328 atttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  12283865 atttttagtg-aactctccttggaagtgcaagggggacatgactacttccggtttgtggaaggaacctgtataattg 12283790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 342 - 406
Target Start/End: Original strand, 12625203 - 12625267
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgct 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||    
T  12625203 tctccttggaagtgcaagggggacatgactacttccggtttgtggaaggaacctgtataattgct 12625267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 328 - 404
Target Start/End: Original strand, 22427975 - 22428050
Alignment:
Q  328 atttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  22427975 atttttagtg-aactctccttggaagtgcaagggggacatgactacttccggtttgtggaaggaacctgtataattg 22428050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #114
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 115 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 10757081 - 10756966
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgag 213  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||  ||||| |||| ||  ||||||||||||| |||| ||    |||||||||    
T  10757081 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttgcagttgtgcttgag 10756982  T
Q  214 cattagaagactcttg 229  Q
    ||||||||| ||||||    
T  10756981 cattagaagtctcttg 10756966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #115
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 70 - 154
Target Start/End: Original strand, 24029059 - 24029145
Alignment:
Q  70 atttgatacatcttagaaattcactagtctagagtctttat--tacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa 154  Q
    |||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||   | ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  24029059 atttgatatatcttagaaattcttaagtctagagtctttaaactgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 24029145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #116
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 209 - 279
Target Start/End: Original strand, 19965760 - 19965829
Alignment:
Q  209 ttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttg 279  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  19965760 ttgagcattagaagtctcctgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcttgcgtgcttgagcatttg 19965829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #117
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 339 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 22639750 - 22639672
Alignment:
Q  339 aaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtctctct 417  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||  ||||||||||||| | |||||||    
T  22639750 aaatctcctttgaagtgcaaggggaactggactacttccaggttgtggaaggaaataggataattgcttctctctctct 22639672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #118
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 288
Target Start/End: Original strand, 26280474 - 26280647
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaag-tcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgag 213  Q
    |||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||| |||| ||| |||||  |||||| |||| || |  |||||||||    
T  26280474 ttgtatcgtgaacacctctgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctgtgtaattttgtttgtctagaagtctcttgcttttgtgcttgag 26280573  T
Q  214 cattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctc 288  Q
    |||  |||| ||||||| || ||||||||||||  ||| ||||| || |  ||||||||| ||||| ||||||||    
T  26280574 catatgaagtctcttgcgtttgtgcttgagcataagaaatctcttgcttttgtgcttgagtatttg-gaagtctc 26280647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #119
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 342 - 407
Target Start/End: Original strand, 26702779 - 26702845
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  26702779 tctccttggaagtgcaagggggacaggactgacttccggtttgtggaaggaacctgtataattgctt 26702845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #120
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 339 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 8698327 - 8698239
Alignment:
Q  339 aaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtctctctgtcttttctct 428  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||| ||| ||||||| | |||| |||||    
T  8698327 aaatctccttggaagtgcaatggggactagactacttctggattgtggaaggaacgaggataattactt-tgtctctttctcttctctct 8698239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #121
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 251
Target Start/End: Original strand, 16233552 - 16233689
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaag-tcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgag 213  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||| || |||||||||  |||||||||||||| |||| ||  |||||  ||||||  ||| || |  |||||||||    
T  16233552 ttgtattgtgaacaccactgatagtatgtcaagtgttcaacctcaaacatatttctatgtaattgtgtttgtttagaagtttcttgcttttgtgcttgag 16233651  T
Q  214 cattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaa 251  Q
    |||  |||||||||||| || |||||||||||| ||||    
T  16233652 cataggaagactcttgcgtttgtgcttgagcataggaa 16233689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #122
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 342 - 417
Target Start/End: Original strand, 22600835 - 22600912
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggataattgc-ttgtgtctctct 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||||||||||    
T  22600835 tctccttggaagtgcaagggggacatgactgacttccggtttgtggaaggaacctgtataattgctttgtgtctctct 22600912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #123
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 115 - 279
Target Start/End: Original strand, 2819733 - 2819896
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgagc 214  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||| ||| |||||  |||||| |||| || |  ||||||||||    
T  2819733 ttgtactgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaaccaaacatatttctttgtaattt-gtttgtttagaagtctcttgcttttgtgcttgagc 2819831  T
Q  215 attagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttg 279  Q
    ||| |||  || ||||||  ||||||| | ||  ||||||||  || || |||||||| ||||||    
T  2819832 attggaaatcttttgcttgtgtgcttgggtatctgaagtctcatgcttgtgtgcttgaacatttg 2819896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #124
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 46 - 256
Target Start/End: Original strand, 7745441 - 7745645
Alignment:
Q  46 aaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatct 145  Q
    ||||||| | ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||   |||      |||| ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||     
T  7745441 aaagcacttagaatttctgtactgatttgatatatcttagaaattcttaagt------tcttcattgcattgtattgtgaacacccctgattgtatatca 7745534  T
Q  146 agtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagc 244  Q
    |||||||||  |||||||  ||||| |||| ||  ||||||   |||| |||| || || ||||||||||||  |||| |||||||| | ||||||||||    
T  7745535 agtgttcaacctcaaacaattttctttgtaattctgtttgataggaagactcttgcttgtgtgcttgagcataggaagtctcttgctgt-gtgcttgagc 7745633  T
Q  245 attggaagtctc 256  Q
    |  |||||||||    
T  7745634 aaaggaagtctc 7745645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #125
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 115 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 31358983 - 31358821
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgagc 214  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||| |||| ||| |||||  |||||| |||| || |  | ||||||||    
T  31358983 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-ccaaacttatttctttgtaattt-gtttgtttagaagtctcttgcttttgcgcttgagc 31358886  T
Q  215 attagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttg 279  Q
    ||  |||  |||||||||  ||||||||| ||| ||||| | | || || |||||||||||||||    
T  31358885 ataggaaatctcttgcttgtgtgcttgagaatttgaagttttttgcttgtgtgcttgagcatttg 31358821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #126
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 243
Target Start/End: Original strand, 18130434 - 18130564
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa--gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttga 212  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||   |||||||| ||||| |||| ||  |||||| |||||| |||| || |  ||||||||    
T  18130434 ttgtattgtgaacaccactaattgtatatcaagtgttcaaacctcaaacatttttctgtgtaattctgtttgattagaagtctcttgcttttgtgcttga 18130533  T
Q  213 gcattagaagactcttgctttagtgcttgag 243  Q
    ||||  |||  |||||||||| |||||||||    
T  18130534 gcataggaaacctcttgcttttgtgcttgag 18130564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #127
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 197
Target Start/End: Original strand, 18897017 - 18897099
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctct 197  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||| |||| ||| | ||||||||||| ||||    
T  18897017 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatatttctttgtaattttg-ttgaatagaagtctct 18897099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #128
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 215 - 257
Target Start/End: Original strand, 20867341 - 20867383
Alignment:
Q  215 attagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctct 257  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20867341 attagaagtctcttgctttagtgcttgagcattggaagtctct 20867383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #129
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 342 - 407
Target Start/End: Original strand, 21192514 - 21192580
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||    
T  21192514 tctccttggaagtgcaagggggacaagactgacttccggtttgttgaaggaaccagtataattgctt 21192580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #130
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 342 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 1577298 - 1577233
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggataattgct 406  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| | |||||||||    
T  1577298 tctccttggaaatgcaagggggacaggactgacttccggtttgtggaaggaacctgtataattgct 1577233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #131
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 118 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 8698510 - 8698374
Alignment:
Q  118 tattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgagcatt 217  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||   |||| || |||| |||| ||| |||||  |||||| |||| || |  ||||||||||||     
T  8698510 tattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaacgaaacttaattctttgtaattt-gtttgtctagaagtctcttgcttttgtgcttgagcata 8698412  T
Q  218 agaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtct 255  Q
     |||  |||||||||| ||||||||| ||| |||||||    
T  8698411 ggaaatctcttgcttttgtgcttgagtatttgaagtct 8698374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #132
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 328 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 10756867 - 10756807
Alignment:
Q  328 atttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaag 389  Q
    |||||||||| || |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  10756867 atttttagtg-aactctccttgaaagtgcaagggggacatgactacttccggtttgtggaag 10756807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #133
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 26703233 - 26703069
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgagc 214  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||||||| ||| | |||| ||| |||||  || ||| |||| || |  ||||||||||    
T  26703233 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaaccaaacatctttatatgtaattttgtttgtttataagtctcttgcttttgtgcttgagc 26703134  T
Q  215 attagaaga-ctcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttg 279  Q
    | ||||| | ||||||| |  | ||||||| ||| ||||||||| || || ||| |||||||||||    
T  26703133 a-tagaaaatctcttgcatgtgcgcttgagtatttgaagtctcttgcttgtgtgtttgagcatttg 26703069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #134
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 342 - 407
Target Start/End: Original strand, 28492932 - 28492996
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  28492932 tctccttggaagtgcaagggg-ataggactacttccggtttgtggaaggaacctgtataattgctt 28492996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #135
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 342 - 394
Target Start/End: Original strand, 44824408 - 44824461
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaacc 394  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  44824408 tctccttggaagtgcaagggggacaggactgacttccggtttgtggaaggaacc 44824461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #136
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 342 - 389
Target Start/End: Original strand, 23037154 - 23037202
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaag 389  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  23037154 tctccttggaagtgcaagggggacaggactgacttccggtttgtggaag 23037202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #137
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 343 - 394
Target Start/End: Original strand, 25449208 - 25449260
Alignment:
Q  343 ctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaacc 394  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  25449208 ctccttggaagtgcaagggggacaggactgacttccggtttgtggaaggaacc 25449260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #138
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 205 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 47194933 - 47194861
Alignment:
Q  205 gtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatt 277  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |  |||||||| ||||||||| |||| ||||  |||||||||||||    
T  47194933 gtgcttgagcattggaagactcttgcctatgtgcttgatcattggaagactcttgcctatgtgcttgagcatt 47194861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #139
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 115 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 2834343 - 2834233
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaat--agaagcctctcgcctgcgtgcttg 211  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||| |||| ||  ||||||||  ||||| |||| ||    |||||||    
T  2834343 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattgtgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttg 2834244  T
Q  212 agcattagaag 222  Q
    |||||||||||    
T  2834243 agcattagaag 2834233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #140
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 217 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 21543624 - 21543550
Alignment:
Q  217 tagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcatac 292  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||| || || ||||||||||| ||  ||||||||||||    
T  21543624 tagaagtctcttgctttagtgcttgagcatagaaagtctcttgcttgtgtgcttgagcaatt-tgaagtctcatac 21543550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #141
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 217 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 22642480 - 22642421
Alignment:
Q  217 tagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcat 276  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |  ||||||||||||    
T  22642480 tagaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcat 22642421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #142
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 257
Target Start/End: Original strand, 14263854 - 14263999
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttca-agtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaat--agaagcctctcgcctgcgtgcttg 211  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||   |||||||  ||||| |||| ||  ||||||||  ||||| |||| || |  |||||||    
T  14263854 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcagtctcaaacaattttctttgtaattctgtttgaattgagaagtctcttgcttttgtgcttg 14263953  T
Q  212 agcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctct 257  Q
    |||| |||||| ||||||  ||||| |  |||||| ||||||||||    
T  14263954 agcaatagaagtctcttgacttagttcaggagcataggaagtctct 14263999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #143
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 342 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 18614347 - 18614301
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaa 388  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  18614347 tctccttggaagttcaagggggagtggactacttccggattgtggaa 18614301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #144
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 229
Target Start/End: Original strand, 21121488 - 21121605
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaat--agaagcctctcgcctgcgtgcttg 211  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||  ||||| |||| || |||||||||  ||||| |||| ||    |||||||    
T  21121488 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctttgtaattccgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttg 21121587  T
Q  212 agcattagaagactcttg 229  Q
    |||| |||||| ||||||    
T  21121588 agcaatagaagtctcttg 21121605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #145
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 394
Target Start/End: Original strand, 21121716 - 21121766
Alignment:
Q  345 ccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaacc 394  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  21121716 ccttggaagtgcaagggggacaggactgacttccggtttgtggaaggaacc 21121766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #146
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 229
Target Start/End: Original strand, 21205296 - 21205413
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaat--agaagcctctcgcctgcgtgcttg 211  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||  |||||||| ||||| |||| ||| ||||||||  ||||| |||| ||    |||||||    
T  21205296 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagggttcaacctcaaacatttttctttgtaattttgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttg 21205395  T
Q  212 agcattagaagactcttg 229  Q
    |||| |||||| ||||||    
T  21205396 agcaatagaagtctcttg 21205413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #147
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 21984024 - 21983974
Alignment:
Q  345 ccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaacc 394  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  21984024 ccttggaagtgcaagggggacaggactgacttccggtttgtggaaggaacc 21983974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #148
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 342 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 36133635 - 36133569
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggacta-cttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    |||||||||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  36133635 tctccttggaagtgcaagggggccagggctaacttccggtttgtggaaggaacctgtataattgctt 36133569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #149
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 48703859 - 48703741
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaa-tagaagcctctcgcctgcgtgcttga 212  Q
    |||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||| |||| ||| ||||||| |||||| |||| ||    ||||||||    
T  48703859 ttgtatcgtgaacaccattgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattttgtttgaattagaagtctcttgcagttgtgcttga 48703760  T
Q  213 gcattagaagactcttgct 231  Q
    ||||| |||| ||||||||    
T  48703759 gcatttgaagtctcttgct 48703741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #150
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 342 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 10250420 - 10250367
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaacc 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  10250420 tctccttggaagtgcaagggggacatgactgacttccggtttgtggaaggaacc 10250367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #151
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 342 - 407
Target Start/End: Original strand, 22601233 - 22601297
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||| |||| | ||||||||||    
T  22601233 tctccttggaagtgcaagggggacatgactacttcc-gattgtggaaggaacctgtataattgctt 22601297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #152
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 187
Target Start/End: Original strand, 33256773 - 33256846
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaat 187  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||| |||| ||  ||||||||    
T  33256773 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaat 33256846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #153
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 187
Target Start/End: Original strand, 33276945 - 33277018
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaat 187  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||| |||| ||  ||||||||    
T  33276945 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaat 33277018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #154
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 35039822 - 35039749
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaat 187  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||| |||| ||  ||||||||    
T  35039822 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaat 35039749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #155
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 280
Target Start/End: Original strand, 44824185 - 44824352
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaat--agaagcctctcgcctgcgtgcttg 211  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||| |||| ||  ||||||||  ||||| |||| ||    |||||||    
T  44824185 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttct-tgtaattctgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttg 44824283  T
Q  212 agcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttga 280  Q
    |||| |||||| |||||| ||  || |  |||||| |||||||||| ||    ||||||||||||||||    
T  44824284 agcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcatttga 44824352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #156
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 342 - 413
Target Start/End: Original strand, 48570877 - 48570950
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggat-aattgcttgtgtct 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||| |||| | || ||||||||||||||    
T  48570877 tctccttggaagtgcaagggggacatgattgacttccggtttgtggaaggaacctgtataaattgcttgtgtct 48570950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #157
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 166
Target Start/End: Original strand, 2327859 - 2327911
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatt 166  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  2327859 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatatt 2327911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #158
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 342 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 17018021 - 17017957
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgct 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | ||| |||||| |||| | |||||||||    
T  17018021 tctccttggaagtgcaagggggacaagactacttctgatttatggaaggaacctgtataattgct 17017957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #159
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 279
Target Start/End: Original strand, 17497094 - 17497166
Alignment:
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttg 279  Q
    |||||||||||||||| ||||| |  ||||| |||||||||| |||||| | || |||||||||||| |||||    
T  17497094 gcttgagcattagaagtctctttcagtagtgattgagcattgaaagtctattgcatgcgtgcttgagaatttg 17497166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #160
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 36133858 - 36133742
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaa-tagaagcctctcgcctgcgtgcttga 212  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||  |||||||| ||||| |||| ||  ||||||| |||||| |||| |     ||||||||    
T  36133858 ttgtattgtgaacaccactgaatgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctatgtaattctgtttgaattagaagtctcttgtagttgtgcttga 36133759  T
Q  213 gcattagaagactcttg 229  Q
    |||||||||| ||||||    
T  36133758 gcattagaagtctcttg 36133742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #161
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 2266753 - 2266699
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaag-tcaaacatatttct 169  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||    
T  2266753 ttgtattgtgaacac-actgattgtatatcaagtgttcaagctcaaacatttttct 2266699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #162
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 10250642 - 10250603
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa 154  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  10250642 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 10250603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #163
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 154
Target Start/End: Original strand, 14293107 - 14293146
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa 154  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  14293107 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 14293146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #164
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 342 - 389
Target Start/End: Original strand, 16233773 - 16233820
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaag 389  Q
    |||||||||||| |||||||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  16233773 tctccttggaagcgcaagggggacaagactacttccggattgtggaag 16233820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #165
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 154
Target Start/End: Original strand, 18517583 - 18517622
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa 154  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  18517583 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 18517622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #166
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 22153513 - 22153398
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgag 213  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||  |||| ||  ||||||||| ||| |||| ||    |||||| ||    
T  22153513 ttgtattgtgaatacaactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttcgttgtaattctgtttgaataaaagtctcttgcagttgtgcttaag 22153414  T
Q  214 cattagaagactcttg 229  Q
    ||||||||| ||||||    
T  22153413 cattagaagtctcttg 22153398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #167
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 154
Target Start/End: Original strand, 22202157 - 22202196
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa 154  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  22202157 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 22202196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #168
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 154
Target Start/End: Original strand, 22427761 - 22427800
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa 154  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  22427761 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 22427800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #169
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 23024449 - 23024410
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa 154  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  23024449 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 23024410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #170
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 154
Target Start/End: Original strand, 23036930 - 23036969
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa 154  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  23036930 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 23036969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #171
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 154
Target Start/End: Original strand, 25448980 - 25449019
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa 154  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  25448980 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 25449019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #172
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 229
Target Start/End: Original strand, 26702552 - 26702667
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgag 213  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||||||| |||||||||  |||||||  ||||| |||| ||  ||||||||||||| |||| ||    |||||||||    
T  26702552 ttgtactgtgaacaccattgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatagaagtctcttgcagttgtgcttgag 26702651  T
Q  214 cattagaagactcttg 229  Q
    ||| ||||| ||||||    
T  26702652 cataagaagtctcttg 26702667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #173
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 342 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 26703043 - 26702972
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtct 413  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| | ||||||||| | ||||||||| |||  | ||||||||||||||||    
T  26703043 tctctttggaagtgcaagagggacagaactacttccagattgtggaaggaacttgtataattgcttgtgtct 26702972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #174
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 27858397 - 27858231
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgag 213  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||  |||||||| ||| | |||| ||| |||||  |||||| |||| || |  |||||||||    
T  27858397 ttgtattgtgaacaccactaattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttttgtgtaattttgtttgtttagaagtctcttgcttttgtgcttgag 27858298  T
Q  214 cattagaaga-ctcttgctttagtgcttgagca-ttggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttg 279  Q
    || ||||| | |||||| ||  ||||||||| | ||| |||||||| || ||  ||||||||||||||    
T  27858297 ca-tagaaaatctcttgtttgtgtgcttgagtatttgaaagtctcttgcttgtatgcttgagcatttg 27858231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #175
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 30892750 - 30892711
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa 154  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  30892750 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 30892711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #176
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 37640666 - 37640627
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa 154  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  37640666 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 37640627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #177
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 38282220 - 38282181
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa 154  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  38282220 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 38282181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #178
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 154
Target Start/End: Original strand, 48570654 - 48570693
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa 154  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  48570654 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 48570693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #179
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 342 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 48703693 - 48703646
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaag 389  Q
    ||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  48703693 tctccttggaagtgcaatgggggcatgactacttccggtttgtggaag 48703646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #180
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 333 - 407
Target Start/End: Original strand, 2819913 - 2819987
Alignment:
Q  333 tagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    ||||| ||||||| ||| |||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||  ||| ||| |||||||||    
T  2819913 tagtgaaaatctcattgaaagtgcaaggggaagtggactacttccggattgtagaatgaacaagggtaattgctt 2819987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #181
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 205 - 247
Target Start/End: Original strand, 19965785 - 19965827
Alignment:
Q  205 gtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcatt 247  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  19965785 gtgcttgagcattggaagactcttgcttgcgtgcttgagcatt 19965827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #182
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 337 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 20908847 - 20908777
Alignment:
Q  337 ggaaatctccttggaagtgc-aagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgct 406  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| | |||||||||| |||| | |||||||||    
T  20908847 ggaactctccttggaagtgcaaagggggacaagactacttcagatttgtggaaggaacctgtataattgct 20908777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #183
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 345 - 394
Target Start/End: Original strand, 21205524 - 21205574
Alignment:
Q  345 ccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaacc 394  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  21205524 ccttggaagtgcaagggggacaggactgacttctggtttgtggaaggaacc 21205574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #184
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 342 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 22153286 - 22153220
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactgga-ctacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||| | |||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  22153286 tctccttggaagtgcaagagggacaggaccgacttccagtttgtggaaggaacctgtataattgctt 22153220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #185
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 217 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 22655062 - 22655004
Alignment:
Q  217 tagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca 275  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||| || |  |||||||||||    
T  22655062 tagaagtctcttggtttagtgcttgagcataggaagtctcttgctttagtgcttgagca 22655004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #186
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 348 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 24218786 - 24218720
Alignment:
Q  348 tggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattg-cttgtgtct 413  Q
    |||||| | |||| |||||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||| |||||||||    
T  24218786 tggaagagaaaggaggactggactacttccggatcgtggaaggaaccagaataattgccttgtgtct 24218720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #187
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 342 - 407
Target Start/End: Original strand, 32786587 - 32786653
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  32786587 tctccttggaagtgcaagggagacaggattgacttccagtttgtggaaggaacctgtataattgctt 32786653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #188
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 342 - 407
Target Start/End: Original strand, 33257000 - 33257066
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    ||||||||||||| |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||  | ||||||||||    
T  33257000 tctccttggaagtacaagagggacaggactgacttccggtttgtggaaggaacttgtataattgctt 33257066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #189
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 342 - 407
Target Start/End: Original strand, 33277172 - 33277238
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    ||||||||||||| |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||  | ||||||||||    
T  33277172 tctccttggaagtacaagagggacaggactgacttccggtttgtggaaggaacttgtataattgctt 33277238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #190
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 115 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 46088645 - 46088528
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaat--agaagcctctcgcctgcgtgcttg 211  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||| |||| ||  ||||||||  ||||| |||| ||    |||||||    
T  46088645 ttgtattatgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttg 46088546  T
Q  212 agcattagaagactcttg 229  Q
    |||| |||||| ||||||    
T  46088545 agcaatagaagtctcttg 46088528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #191
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 342 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 2266530 - 2266478
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaacc 394  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  2266530 tctccttggaagtgcaagggg-acatgactgacttccggtttgtggaagaaacc 2266478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #192
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 342 - 394
Target Start/End: Original strand, 2328084 - 2328137
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaacc 394  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||| ||||    
T  2328084 tctccttggaagtgcaagggggacaggactgacttccaatttgtggaaggaacc 2328137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #193
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 342 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 9346208 - 9346143
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||| ||||||||| |||  | ||||||||||    
T  9346208 tctccttggaagtgcaaaggggacatgactacttacggattgtggaaggaacatgtataattgctt 9346143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #194
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 342 - 394
Target Start/End: Original strand, 14293273 - 14293326
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggac-tacttccggtttgtggaagaaacc 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||| || |||||||||||||||| ||||    
T  14293273 tctccttggaagtgcaagggggacaagacttatttccggtttgtggaaggaacc 14293326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #195
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 19717179 - 19717106
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaat 187  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||  |||||||| ||||| |||| ||  ||||||||    
T  19717179 ttgtattgtgaacaccactgattgcatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaat 19717106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #196
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 342 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 21702246 - 21702193
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaacc 394  Q
    |||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  21702246 tctccttggaagtgcaagagggataggactgacttccggtttgtggaaggaacc 21702193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #197
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 224 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 22639828 - 22639779
Alignment:
Q  224 ctcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgag 273  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || || |||||||||    
T  22639828 ctcttgcttttgtgcttgagcatttgaagtctcttgcttgtgtgcttgag 22639779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #198
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 342 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 23024224 - 23024171
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaacc 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  23024224 tctccttggaagtgcaagggggacatgactgacttctggtttgtggaaggaacc 23024171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #199
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 342 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 30892523 - 30892459
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||| || | | ||||||||||    
T  30892523 tctccttggaagtgcaa-ggggacatgactacttctggtttgtggaaggaatctgtataattgctt 30892459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #200
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 346 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 37640436 - 37640387
Alignment:
Q  346 cttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaacc 394  Q
    |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||| ||||    
T  37640436 cttggaagtgcaagggggacagggctgacttccggtttgtggaaggaacc 37640387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #201
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 342 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 46088420 - 46088347
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggat-aattgcttgtgtct 413  Q
    |||||||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| |||  | || ||||||||||||||    
T  46088420 tctccttgaaagtgcaagggggacaagactgacttccggtttgtggaaggaacttgtataaattgcttgtgtct 46088347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #202
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 342 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 1899778 - 1899730
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaag 389  Q
    ||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  1899778 tctccttagaagtgcaagggggataggactgacttccggtttgtggaag 1899730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #203
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 371 - 432
Target Start/End: Original strand, 19087862 - 19087925
Alignment:
Q  371 tacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  19087862 tacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 19087925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #204
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 183
Target Start/End: Original strand, 21684477 - 21684545
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgttt 183  Q
    ||||||||||||||  | |||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||| |||| ||| ||||    
T  21684477 ttgtattgtgaacatcagtgattgtatatcaagtgttcaaagcaaacatctttctgtgtaattttgttt 21684545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #205
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 22639934 - 22639898
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgtt 151  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  22639934 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgtt 22639898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #206
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 342 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 29215227 - 29215179
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaag 389  Q
    |||| |||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  29215227 tctcattggaagtgcaagggggacatgactgacttccggtttgtggaag 29215179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #207
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 342 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 30571631 - 30571583
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaag 389  Q
    |||||||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  30571631 tctccttgaaagtacaagggggacaggactgacttccggtttgtggaag 30571583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #208
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 217 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 35895745 - 35895705
Alignment:
Q  217 tagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctct 257  Q
    |||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  35895745 tagaagtctcttgcttgtgtgcttgagcattggaagtctct 35895705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 292; Significance: 1e-164; HSPs: 211)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 13 - 428
Target Start/End: Original strand, 27166724 - 27167136
Alignment:
Q  13 aaaagcgtcaaaactctgtcaa-tttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtctttatt 111  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  27166724 aaaagcgccaaaactctgtcaaattttattctacaaagcacattgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcataagtctagagtctttatt 27166823  T
Q  112 acattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttg 211  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27166824 gcattgtattgtgaacaccactgattgtgtatcaagtgttcaattcaaacat-tttctctgtatttttgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttg 27166922  T
Q  212 agcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca-tttgagaagtctcataccaagagagtattgagcat 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  27166923 agcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagactctcgcctgcgtgcttgagcattttgagaagtctcatacttagagagtattgagcat 27167022  T
Q  311 ttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtg 410  Q
    ||||||||| ||||||||   ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27167023 ttgtaatctttgtgatta---ttagt-gaaatctccttgaaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaaccaggataattgcttgtg 27167118  T
Q  411 tctctctgtcttttctct 428  Q
    ||| ||| ||||||||||    
T  27167119 tctttctctcttttctct 27167136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 3 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 31572337 - 31571912
Alignment:
Q  3 atacaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaa-tttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctag 101  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31572337 atacaagttaaaa-gcgccaaaactctgccaaatttgattctacaaagcac-ttgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcacaagtctag 31572240  T
Q  102 agtctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcc 201  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31572239 agtctttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacat-tttctctgtatttttgtttgaatagaagcctctcgcc 31572141  T
Q  202 tgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca-tttgagaagtctcataccaagagag 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| ||    
T  31572140 tgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagactctcgcctgcgtgcttgagcattttgagaagtctcatacttagatag 31572041  T
Q  301 tattgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggata 400  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  31572040 tattgagcatttgtaatctttgtgatta---ttagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactgaactacttccgatttgtggaaggaaccaggata 31571945  T
Q  401 attgcttgtgtctctc-tgtcttttctctgctc 432  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||    
T  31571944 attgcttgtgtctcgcttttcttttctctgctc 31571912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 13 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 29765450 - 29765049
Alignment:
Q  13 aaaagcgtcaaaactctgtcaa-tttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtctttatt 111  Q
    ||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  29765450 aaaagcgccaaaactctgccaaatttgattctacaaagtacattgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcataagtctagagtctttatt 29765351  T
Q  112 acattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttg 211  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29765350 gcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaacat-tttctttgtatttttgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttg 29765252  T
Q  212 agcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca-tttgagaagtctcataccaagagagtattgagcat 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  29765251 agcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagactctcgcctgcgtgcttgagcattttgagaagtctcatacttagagagtattgagcat 29765152  T
Q  311 ttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtg 410  Q
    ||||||||| ||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29765151 ttgtaatctttgtgatta---ttagt-gaaatctccttggaagtgcaaggaggactggactacttccgatttgtggaaggaaccaggataattgcttgtg 29765056  T
Q  411 tctctct 417  Q
    |||||||    
T  29765055 tctctct 29765049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 21 - 432
Target Start/End: Original strand, 17746072 - 17746483
Alignment:
Q  21 caaaactctgtcaa-tttgattctacaaagca-cattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtctttattacattgt 118  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  17746072 caaaactctgtcaaatttgattctacaaagcatccttgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcacaagtctagagtctttattgcattgt 17746171  T
Q  119 attgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgagcatt 217  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17746172 attgtgaacaccactgattatatatcaagtgttcaaagtcaaacat-tttctctgtatttttgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgagcatt 17746270  T
Q  218 agaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca-tttgagaagtctcataccaagagagtattgagcatttgtaa 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  17746271 agaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagactctcgcctgcgtgcttgagcattttgagaagtctcatacttagagagtattgagcatttgtaa 17746370  T
Q  317 tctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtctctc 416  Q
    ||| ||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  17746371 tctttgtgatta---ttagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaaccaggataattgcttgtgtctcgc 17746466  T
Q  417 -tgtcttttctctgctc 432  Q
     | ||||||||||||||    
T  17746467 ttttcttttctctgctc 17746483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 18834916 - 18835331
Alignment:
Q  13 aaaagcgtcaaaactctgtcaa-tttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtctttatt 111  Q
    ||||||| || ||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  18834916 aaaagcgccacaactctgccaaatttgattctacaaagcaccttgaatttct-cactgatttgatacatcttagaaattcataagtctagagtctttatt 18835014  T
Q  112 acattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttg 211  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |  |||||||    
T  18835015 gcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaatcaaacat-tttctctgtatttttgtttgaaaagaagcctctcgcttctgtgcttg 18835113  T
Q  212 agcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca-tttgagaagtctcataccaagagagtattgagcat 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  18835114 agcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgtgtgcttgagcattttgagaagtctcatacttagagagtattgagcat 18835213  T
Q  311 ttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtg 410  Q
    ||||||||| ||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18835214 ttgtaatctttgtgatta---ttagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaaccaggataattgcttgtg 18835309  T
Q  411 tctctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||| ||||||||||||||    
T  18835310 tctctctttcttttctctgctc 18835331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 21 - 432
Target Start/End: Original strand, 18826528 - 18826936
Alignment:
Q  21 caaaactctgtcaa-tttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtctttattacattgta 119  Q
    |||||||||| ||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  18826528 caaaactctgccaaatttaattctacaaagcaccttgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcataagtctagagtctttattgcattgta 18826627  T
Q  120 ttgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgagcattag 219  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||| ||||||||| |||||    
T  18826628 ttgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaatcaaacat-tttctctgtatttttgtttgaaaagaagtctgtcgcctgtgtgcttgagtattag 18826726  T
Q  220 aagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca-tttgagaagtctcataccaagagagtattgagcatttgtaatc 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  18826727 aagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgtgtgcttgagcattttgagaaatctcatacttagagagtattgagcatttgtaatc 18826826  T
Q  319 tgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtctctctg 418  Q
    | ||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  18826827 tttgtgatta---ttagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttatggaaggaaccaggataattgcttgtgtctctctt 18826922  T
Q  419 tcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||||||||    
T  18826923 tcttttctctgctc 18826936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 6 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 22308710 - 22308285
Alignment:
Q  6 caagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaa-tttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagt 104  Q
    ||||| |||||||  |||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  22308710 caagtcaaaaagcaccaaaactctgccaaatttgattctacaaagcactttgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcttaagtctagagt 22308611  T
Q  105 ctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctg 203  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| |||||||  |||||| ||||||||||| |||||    
T  22308610 ctttattgcattgcattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacat-tttctgtgtatttctgtttgattagaagcctcttgcctg 22308512  T
Q  204 cgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca-tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  22308511 cttgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattttgagaagtctcatactaagagagta 22308412  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||||||||||||| || |||||   ||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  22308411 ttgagcatttgtaatctttgagatta---ttattgaaaatctccttcgaagtgcaagggggactggactacttacggattgtggaaggaaccaggataat 22308315  T
Q  403 tgcttgtgtctctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22308314 tgcttgtgtctctctttcttttctctgctc 22308285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 11 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 5845001 - 5844605
Alignment:
Q  11 taaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtctttat 110  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5845001 taaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaaa-acactgaatttctgcactgatttgatacatcatagaaattcacaagtctagagtctttat 5844903  T
Q  111 tacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaag-tcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgct 209  Q
    | ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5844902 tgcattgtattgtgaacaccaccgattgtatatcaagtgttcaaggtcaaacat-tttctctgtatttttgtttgaacagaagcctctcgcctgcgtgct 5844804  T
Q  210 tgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca-tttgagaagtctcataccaagagagtattgagc 308  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  5844803 tgagcattagtagagtcttgctttagtgcttgagcattggaagactcttgcctgcgtgcttgagcattttgagaagtctcatacttagaaagtattgagc 5844704  T
Q  309 atttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttg 408  Q
    ||||||||||| ||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||    
T  5844703 atttgtaatctttgtgatta---ttagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaagcaggataattgcttg 5844608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 13 - 429
Target Start/End: Original strand, 17741985 - 17742400
Alignment:
Q  13 aaaagcgtcaaaactctgtcaa-tttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtctttatt 111  Q
    ||||||| |||||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  17741985 aaaagcgccaaaactctgccaaatttgattctaaaaagcactttgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcttaagtctagagtctttatt 17742084  T
Q  112 acattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaata-gaagcctctcgcctgcgtgct 209  Q
     ||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| |||| ||  |||||| || |||| ||||||||||||||||    
T  17742085 gcattgtattgtgagcaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacat-tttctatgtaattctgtttgattaagaagtctctcgcctgcgtgct 17742183  T
Q  210 tgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagagagtattgagca 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  17742184 tgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctcccgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcata-ctagagagtattgagca 17742282  T
Q  310 tttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctcctt-ggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttg 408  Q
    ||||||||||||| |||||   |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  17742283 tttgtaatctgtgcgatta---ttagtggaaatctccttaaaaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaactaggataattgcttg 17742379  T
Q  409 tgtctctctgtcttttctctg 429  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  17742380 tgtctctctttcttttctctg 17742400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 7 - 431
Target Start/End: Original strand, 16123810 - 16124233
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16123810 aagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttttgcactgatttgatacatcttagaaattcacaagtctagagtct 16123909  T
Q  107 ttattacattgta-ttgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgc 204  Q
    ||||||||||||| |||||||||  |||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||    
T  16123910 ttattacattgtatttgtgaacatcactgattgtacatcaagtgttcaaggtcaaacatttttctctgtatttttgtttgaatagaagtctcttgcctgc 16124009  T
Q  205 gtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||    
T  16124010 gtgcttgagcattagaagactcttgc-ttagtgctttagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcatacttagagagta 16124108  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||     
T  16124109 ttgagcatttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggacttgactacttccgatttgtggaaggaaccatgataac 16124203  T
Q  403 tgcttgtgtctctc-tgtcttttctctgct 431  Q
    |||||||||||| | | |||||||||||||    
T  16124204 tgcttgtgtctcgcttttcttttctctgct 16124233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 5 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 25787623 - 25787220
Alignment:
Q  5 acaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagt 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  25787623 acaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaaaagtctagagt 25787524  T
Q  105 ctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgc 204  Q
    |||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||  ||||| |||| ||||||    
T  25787523 ctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttatttcattgtatttttgtttgatcagaagactcttgcctgc 25787424  T
Q  205 gtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca-tttgagaagtctcataccaagagagtat 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || ||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||    
T  25787423 gtgcttgagcattagaagactcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattttgagaagtgtcatacttagagagtat 25787325  T
Q  304 tgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataatt 403  Q
    |||||||||||||||| ||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |    
T  25787324 tgagcatttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaaccaggataact 25787230  T
Q  404 gcttgtgtct 413  Q
    | ||||||||    
T  25787229 gtttgtgtct 25787220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 4 - 413
Target Start/End: Original strand, 20030177 - 20030582
Alignment:
Q  4 tacaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagag 103  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  20030177 tacaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaaaagtctagag 20030276  T
Q  104 tctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctg 203  Q
    ||||||    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||   ||||||| ||||||  |||||||||| |||||    
T  20030277 tctttaacgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttatttcatagtatttttgtttgatcagaagcctcttgcctg 20030376  T
Q  204 cgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagt 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||||||||||||||||  |||||||    
T  20030377 cgtgcttgagcattagaagactcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcatacttagagagt 20030475  T
Q  302 attgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataa 401  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  20030476 attgagcatttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaaccaggataa 20030570  T
Q  402 ttgcttgtgtct 413  Q
     |||||||||||    
T  20030571 ctgcttgtgtct 20030582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 3 - 413
Target Start/End: Original strand, 20062927 - 20063333
Alignment:
Q  3 atacaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctaga 102  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  20062927 atacaagttaaaaagcgccaaaactctatcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaaaagtctaga 20063026  T
Q  103 gtctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcct 202  Q
    |||||||    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||   ||||||| |||||| ||||||||||| ||||    
T  20063027 gtctttaacgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttatttcatagtatttttgtttgattagaagcctcttgcct 20063126  T
Q  203 gcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagag 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||    
T  20063127 gcgtgcttgagcattagaagactcttgc-ttagtacttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcatacttagagag 20063225  T
Q  301 tattgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggata 400  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  20063226 tattgagcatttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaaccaggata 20063320  T
Q  401 attgcttgtgtct 413  Q
    | |||||||||||    
T  20063321 actgcttgtgtct 20063333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 5 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 12827614 - 12827210
Alignment:
Q  5 acaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagt 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  12827614 acaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaaaagtctagagt 12827515  T
Q  105 ctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgc 204  Q
    |||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||  ||||| |||| |||||     
T  12827514 ctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttatttcattgtatttttgtttgatcagaagactcttgcctgt 12827415  T
Q  205 gtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||    
T  12827414 gtgcttgagcattagaagactattgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcatacttagagagta 12827316  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||  ||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||     
T  12827315 ttgagcatttgtaatctttgtgattatagtt-----aaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgttttgtggaaggaaccaggataac 12827221  T
Q  403 tgcttgtgtct 413  Q
    |||||||||||    
T  12827220 tgcttgtgtct 12827210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 3 - 413
Target Start/End: Original strand, 18926036 - 18926441
Alignment:
Q  3 atacaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctaga 102  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  18926036 atacaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattccacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatatatcttagaaattcaaaagtctaga 18926135  T
Q  103 gtctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcct 202  Q
    |||| |||   |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||  ||||| |||| ||||    
T  18926136 gtctgtatcgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttatttcattgtatttttgtttgatcagaagactcttgcct 18926235  T
Q  203 gcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca-tttgagaagtctcataccaagagagt 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||  |||||||    
T  18926236 gcgtgcttgagcattagaagactcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcctgtgtgcttgagaattttgagaagtctcatacttagagagt 18926334  T
Q  302 attgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataa 401  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  18926335 attgagcatttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaagaaaccaggataa 18926429  T
Q  402 ttgcttgtgtct 413  Q
     |||||||||||    
T  18926430 ctgcttgtgtct 18926441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 428
Target Start/End: Original strand, 25687020 - 25687447
Alignment:
Q  1 acatacaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaa-tttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtct 99  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||| |||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||   |||||    
T  25687020 acatacaagttaaaa-gcgcctaaactctgtcaaatttgattctataaagcactgtgaatttctgcactgatttgatatatcttagaaattcttaagtct 25687118  T
Q  100 agagtctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaag-tcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctc 198  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||| | |||| ||| |||||| |||||| ||||     
T  25687119 agagtctttattgcattatattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaatctcaaacat-tttatgtgtaattttgtttgattagaagactctt 25687217  T
Q  199 gcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagag 298  Q
    || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||    
T  25687218 gctttagtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctcttgcctgagtgcttgagcatttgtgaagtctcatacttagag 25687317  T
Q  299 agtattgagcatttgtaatctgtgtgattattt-ttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccagg 397  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  25687318 agtattgagcatttgtaatctgtg-gattatttcttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaagaaccagg 25687416  T
Q  398 ataattgcttgtgtctctctgtcttttctct 428  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  25687417 ataattgcttgtgtctctctttcttctctct 25687447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 5 - 413
Target Start/End: Original strand, 7376032 - 7376437
Alignment:
Q  5 acaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagt 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  7376032 acaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaaaagtctagagt 7376131  T
Q  105 ctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgc 204  Q
    |||||    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||  |||||||||| ||||||    
T  7376132 ctttaacgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttatttcattgtatttttgtttgatcagaagcctcttgcctgc 7376231  T
Q  205 gtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||| ||||  |||||||||||||||||  ||||||||    
T  7376232 gtgcttgagcattagaagactcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttaagcatttttgagaagtctcatacttagagagta 7376330  T
Q  303 ttgagca-tttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataa 401  Q
    ||||||| ||||||||||  |||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  7376331 ttgagcattttgtaatcttcgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaaccaggataa 7376425  T
Q  402 ttgcttgtgtct 413  Q
     |||||||||||    
T  7376426 ctgcttgtgtct 7376437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 3 - 432
Target Start/End: Original strand, 9123405 - 9123831
Alignment:
Q  3 atacaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctaga 102  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  9123405 atacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaaattgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctaga 9123503  T
Q  103 gtctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcct 202  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||  ||||| |||| ||||    
T  9123504 gtctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgatcagaagtctcttgcct 9123603  T
Q  203 gcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagag 300  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||  ||| ||    
T  9123604 gcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatacttagaaag 9123702  T
Q  301 tattgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggata 400  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  9123703 tattgagcatttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggata 9123797  T
Q  401 attgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    | ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  9123798 actgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 9123831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 3 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 26044135 - 26043730
Alignment:
Q  3 atacaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctaga 102  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  26044135 atacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaaattgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctaga 26044037  T
Q  103 gtctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcct 202  Q
    |||||||||  ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||    
T  26044036 gtctttattgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcct 26043937  T
Q  203 gcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagag 300  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||   || ||    
T  26043936 gcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcagctttgtgaagtctcatactttgatag 26043838  T
Q  301 tattgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggata 400  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  26043837 tattgagcatttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggata 26043743  T
Q  401 attgcttgtgtct 413  Q
    |||||||||||||    
T  26043742 attgcttgtgtct 26043730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 3 - 432
Target Start/End: Original strand, 9112768 - 9113194
Alignment:
Q  3 atacaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctaga 102  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  9112768 atacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaaattgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctaga 9112866  T
Q  103 gtctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcct 202  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||  ||||| |||| ||||    
T  9112867 gtctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgatcagaagtctcttgcct 9112966  T
Q  203 gcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagag 300  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||  ||| ||    
T  9112967 gcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatacttagaaag 9113065  T
Q  301 tattgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggata 400  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  9113066 tattgagcatttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctctttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggata 9113160  T
Q  401 attgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    | ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  9113161 actgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 9113194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 3 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 25518611 - 25518189
Alignment:
Q  3 atacaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaa-tttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctag 101  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||| ||| |||| ||||  |||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||   |||||||    
T  25518611 atacaagttaaaa-gcgccaaaactctgccaaatttgtttctcaaaagcactctgaatttctgcactgatttgatatatcttataaattcttaagtctag 25518513  T
Q  102 agtctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgc 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||  ||||| |||| ||  |||||| |||||| |||||||    
T  25518512 agtctttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacaattttctgtgtaattctgtttgattagaagtctctcgc 25518413  T
Q  201 ctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagagag 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |  ||    
T  25518412 ctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctgtagtgcttgagcattgaaagtcttttgcctgcgtacttgagcatttgagaagtctcatactaggt-ag 25518314  T
Q  301 tattgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggata 400  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||    
T  25518313 tattgagcagttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctctttggaagtgcaagggggactggactacttccgggttgtggaaggaaccagtata 25518214  T
Q  401 attgcttgtgtctctctgtcttttc 425  Q
    | |  |||||||||||| |||||||    
T  25518213 actatttgtgtctctctttcttttc 25518189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Original strand, 32962211 - 32962633
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  32962211 aagttcaaaagcgtcaaaactctgtcaatttaattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 32962309  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  32962310 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 32962409  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagtatt 304  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||  ||| ||||||    
T  32962410 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatacttagaaagtatt 32962508  T
Q  305 gagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||    
T  32962509 gagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactg 32962603  T
Q  405 cttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  32962604 cttgtgtctttatctttcttttctctgctc 32962633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 5 - 432
Target Start/End: Original strand, 12717111 - 12717537
Alignment:
Q  5 acaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagt 104  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  12717111 acaagtttaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagt 12717209  T
Q  105 ctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgc 204  Q
    ||||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||    
T  12717210 cttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgc 12717309  T
Q  205 gtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagag 300  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||  ||| ||    
T  12717310 gtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaagtctcatacttagaaag 12717408  T
Q  301 tattgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggata 400  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  12717409 tattgagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggata 12717503  T
Q  401 attgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    | ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  12717504 actgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 12717537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 5 - 432
Target Start/End: Original strand, 12727760 - 12728186
Alignment:
Q  5 acaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagt 104  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  12727760 acaagtttaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagt 12727858  T
Q  105 ctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgc 204  Q
    ||||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||    
T  12727859 cttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgc 12727958  T
Q  205 gtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagag 300  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||  ||| ||    
T  12727959 gtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaagtctcatacttagaaag 12728057  T
Q  301 tattgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggata 400  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  12728058 tattgagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggata 12728152  T
Q  401 attgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    | ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  12728153 actgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 12728186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 5 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 25986003 - 25985577
Alignment:
Q  5 acaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagt 104  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  25986003 acaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagt 25985905  T
Q  105 ctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgc 204  Q
    ||||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||    
T  25985904 cttttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgc 25985805  T
Q  205 gtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagag 300  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||  ||| ||    
T  25985804 gtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttttgtgaagtctcatacttagaaag 25985706  T
Q  301 tattgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggata 400  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  25985705 tattgagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggata 25985611  T
Q  401 attgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    | ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  25985610 actgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 25985577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 3671966 - 3671544
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  3671966 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 3671868  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  3671867 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 3671768  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagtatt 304  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||  ||  ||||||    
T  3671767 gcttgagcattagaagtctcttgcttt-gtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatacttaggaagtatt 3671669  T
Q  305 gagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||    
T  3671668 gagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactg 3671574  T
Q  405 cttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  3671573 cttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 3671544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 12865466 - 12865044
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  12865466 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 12865368  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  12865367 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 12865268  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagtatt 304  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||  ||||||||||||  ||| ||||||    
T  12865267 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttctgaagtctcatacttagaaagtatt 12865169  T
Q  305 gagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||    
T  12865168 gagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactg 12865074  T
Q  405 cttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  12865073 cttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 12865044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Original strand, 17982778 - 17983202
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||    
T  17982778 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtccagagtct 17982876  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||    
T  17982877 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctctcgcctgcgt 17982976  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||  ||| ||||    
T  17982977 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaagtctcatacttagaaagta 17983075  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  17983076 ttgagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 17983170  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  17983171 tgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 17983202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Original strand, 17984987 - 17985411
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||    
T  17984987 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtccagagtct 17985085  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||    
T  17985086 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctctcgcctgcgt 17985185  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||  ||| ||||    
T  17985186 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaagtctcatacttagaaagta 17985284  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  17985285 ttgagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 17985379  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  17985380 tgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 17985411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Original strand, 32972830 - 32973253
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  32972830 aagttcaaaagcgtcaaaactctgtcaatttaattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 32972928  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  32972929 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 32973028  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagtatt 304  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||  ||| ||||||    
T  32973029 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatacttagaaagtatt 32973127  T
Q  305 gagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaa-gggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataatt 403  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| |    
T  32973128 gagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaaggggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataact 32973222  T
Q  404 gcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    |||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  32973223 gcttgtgtctttatctttcttttctctgctc 32973253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 3661302 - 3660880
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  3661302 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 3661204  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  3661203 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 3661104  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagtatt 304  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||  ||  ||||||    
T  3661103 gcttgagcattagaagtctcttgcttt-gtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatacttaggaagtatt 3661005  T
Q  305 gagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||| ||    
T  3661004 gagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactactttcgtgttgtggaaggaaccaggataactg 3660910  T
Q  405 cttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  3660909 cttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 3660880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 3 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 27505865 - 27505439
Alignment:
Q  3 atacaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctaga 102  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  27505865 atacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaaattgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctaga 27505767  T
Q  103 gtctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcct 202  Q
    ||||||| |  ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||  ||||| |||| ||||    
T  27505766 gtctttactgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgatcagaagtctcttgcct 27505667  T
Q  203 gcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagag 300  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||| ||  ||| ||    
T  27505666 gcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatctttgtgaagtctcacacttagatag 27505568  T
Q  301 tattgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggata 400  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  27505567 tattgagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtacaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggata 27505473  T
Q  401 attgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    | ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  27505472 actgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 27505439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 29384671 - 29384248
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  29384671 aagtttaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 29384573  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||    
T  29384572 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctctcgcctgcgt 29384473  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||  ||| ||||    
T  29384472 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaagtctcatacttagaaagta 29384374  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  29384373 ttgagcagttgtaatct-tgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 29384280  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||| ||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  29384279 tgcctgtgtctttgtctttcttttctctgctc 29384248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Original strand, 31982903 - 31983326
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  31982903 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 31983001  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    || ||  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  31983002 tttttgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 31983101  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||   || ||||    
T  31983102 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaagtctcatactttgaaagta 31983200  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  31983201 ttgagcagttgtaatct-tgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 31983294  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  31983295 tgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 31983326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Original strand, 34818069 - 34818493
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  34818069 aagttcaaaaacgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 34818167  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  34818168 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 34818267  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||  ||| ||||    
T  34818268 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttttgtgaagtctcatacttagaaagta 34818366  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  34818367 ttgagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 34818461  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  34818462 tgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 34818493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Original strand, 34807437 - 34807862
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  34807437 aagttcaaaaacgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 34807535  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  34807536 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 34807635  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattt-----gagaagtctcataccaagagagt 301  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || || ||||||||||||||     | ||||||||||||  ||| |||    
T  34807636 gcttgagcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattttttttgtgaagtctcatacttagaaagt 34807734  T
Q  302 attgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataa 401  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  34807735 attgagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataa 34807829  T
Q  402 ttgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
     ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  34807830 ctgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 34807862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 12854940 - 12854518
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  12854940 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 12854842  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  12854841 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 12854742  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagtatt 304  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||  ||||||||||||  ||| ||||||    
T  12854741 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttctgaagtctcatacttagaaagtatt 12854643  T
Q  305 gagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||| ||    
T  12854642 gagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccatgttgtggaaggaaccaggataactg 12854548  T
Q  405 cttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||| ||||  | ||| ||||||||||||||    
T  12854547 cttatgtctttgtctttcttttctctgctc 12854518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 26864705 - 26864282
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  26864705 aagtttaaaagcgccaaaactctgtcaatttgagtctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 26864607  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  26864606 tttctgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 26864507  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| |||||||| |||  ||| ||||    
T  26864506 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaagtctcttacttagaaagta 26864408  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  26864407 ttgagcagttgtaatct-tgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 26864314  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  26864313 tgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 26864282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 26875329 - 26874906
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  26875329 aagtttaaaagcgccaaaactctgtcaatttgagtctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 26875231  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  26875230 tttctgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 26875131  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| |||||||| |||  ||| ||||    
T  26875130 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaagtctcttacttagaaagta 26875032  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  26875031 ttgagcagttgtaatct-tgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 26874938  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  26874937 tgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 26874906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 3 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 27372755 - 27372329
Alignment:
Q  3 atacaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctaga 102  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  27372755 atacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaaattgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctaga 27372657  T
Q  103 gtctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcct 202  Q
    ||||||| |  ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||  ||||| |||| ||||    
T  27372656 gtctttactgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgatcagaagtctcttgcct 27372557  T
Q  203 gcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagag 300  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||| ||  ||| ||    
T  27372556 gcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatctttgtgaagtctcacacttagatag 27372458  T
Q  301 tattgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggata 400  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  27372457 tattgagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtacaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggata 27372363  T
Q  401 attgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    | | ||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  27372362 actacttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 27372329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 3 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 27463105 - 27462679
Alignment:
Q  3 atacaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctaga 102  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  27463105 atacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaaattgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctaga 27463007  T
Q  103 gtctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcct 202  Q
    ||||||| |  ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||  ||||| |||| ||||    
T  27463006 gtctttactgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgatcagaagtctcttgcct 27462907  T
Q  203 gcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagag 300  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||| ||  ||| ||    
T  27462906 gcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatctttgtgaagtctcacacttagatag 27462808  T
Q  301 tattgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggata 400  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  27462807 tattgagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtacaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggata 27462713  T
Q  401 attgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    | | ||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  27462712 actacttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 27462679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 13 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 11235413 - 11234995
Alignment:
Q  13 aaaagcgtcaaaactctgtcaa-tttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtcttt-at 110  Q
    ||||||| | |||||||| ||| |||| ||||  ||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||    
T  11235413 aaaagcgcccaaactctgccaaatttgtttctcaaaagcactttgaatttctgtactgatttgatacatcttagaaattcttaagtctagagtctttcat 11235314  T
Q  111 tacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaag-tcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgct 209  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||  ||||| |||| ||  |||||| |||||| |||| || |  |||||    
T  11235313 tgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgattagaagtctcttgctttagtgct 11235214  T
Q  210 tgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagagagtattgagca 309  Q
    |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||||||||    
T  11235213 tgagcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcatttgtgaagtctcatacta-gatagtattgagca 11235115  T
Q  310 tttgtaatctgtgtgattattt-ttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttg 408  Q
     ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  11235114 gttgtaatttgtgtgattatttcttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggaatggactacttccggtttgtggaaggaatcagtataattgcttg 11235015  T
Q  409 tgtctctctgtcttttctct 428  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  11235014 tgtctctctttcttttctct 11234995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 26025378 - 26024955
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  26025378 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 26025280  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  26025279 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 26025180  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||   || ||||    
T  26025179 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaagtctcatactttgaaagta 26025081  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  26025080 ttgagcagttgtaatct-tgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 26024987  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||| ||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  26024986 tgcctgtgtctttgtctttcttttctctgctc 26024955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 26035952 - 26035529
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  26035952 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 26035854  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  26035853 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 26035754  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||   || ||||    
T  26035753 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaagtctcatactttgaaagta 26035655  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  26035654 ttgagcagttgtaatct-tgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 26035561  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||| ||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  26035560 tgcctgtgtctttgtctttcttttctctgctc 26035529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 27341613 - 27341190
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  27341613 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 27341515  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  27341514 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 27341415  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||   || ||||    
T  27341414 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaagtctcatactttgaaagta 27341316  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  27341315 ttgagcagttgtaatct-tgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 27341222  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||| ||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  27341221 tgcctgtgtctttgtctttcttttctctgctc 27341190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 27402353 - 27401930
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  27402353 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 27402255  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  27402254 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 27402155  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||   || ||||    
T  27402154 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaagtctcatactttgaaagta 27402056  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  27402055 ttgagcagttgtaatct-tgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 27401962  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||| ||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  27401961 tgcctgtgtctttgtctttcttttctctgctc 27401930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 27413012 - 27412589
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  27413012 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 27412914  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  27412913 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 27412814  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||   || ||||    
T  27412813 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaagtctcatactttgaaagta 27412715  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  27412714 ttgagcagttgtaatct-tgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 27412621  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||| ||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  27412620 tgcctgtgtctttgtctttcttttctctgctc 27412589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Original strand, 32301320 - 32301743
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  32301320 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 32301418  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  32301419 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 32301518  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||   || ||||    
T  32301519 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaagtctcatactttgaaagta 32301617  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  32301618 ttgagcagttgtaatct-tgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 32301711  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||| ||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  32301712 tgcctgtgtctttgtctttcttttctctgctc 32301743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Original strand, 32312009 - 32312432
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  32312009 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 32312107  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  32312108 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 32312207  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||   || ||||    
T  32312208 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaagtctcatactttgaaagta 32312306  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  32312307 ttgagcagttgtaatct-tgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 32312400  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||| ||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  32312401 tgcctgtgtctttgtctttcttttctctgctc 32312432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 16930370 - 16929947
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  16930370 aagtttaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 16930272  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  16930271 tttctgtattgcattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 16930172  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||   || ||||    
T  16930171 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaagtctcatactttgaaagta 16930073  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  16930072 ttgagcagttgtaatct-tgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 16929979  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||| ||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  16929978 tgcctgtgtctttgtctttcttttctctgctc 16929947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 33199247 - 33198824
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  33199247 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 33199149  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||| |  ||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| |||||| |    
T  33199148 ttactgtattgttttgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaactcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcat 33199049  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca---tttgagaagtctcataccaagagagtat 303  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||   |||| ||||||||||||  ||| |||||    
T  33199048 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattttttgtgaagtctcatacttagaaagtat 33198950  T
Q  304 tgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataatt 403  Q
    |||||| |||||||||  |||||||    ||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| |||| |    
T  33198949 tgagcagttgtaatcttggtgatta----tagt-caaatctccttagaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccagaataact 33198855  T
Q  404 gcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    |||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  33198854 gcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 33198824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 4630790 - 4630367
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  4630790 aagttcaaaagcgccaaaactttgtcaatttgatactacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 4630692  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  4630691 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 4630592  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||   || ||||    
T  4630591 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaagtctcatactttgaaagta 4630493  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  4630492 ttgagcagttgtaatct-tgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 4630399  T
Q  403 tgcttgtgtctct--ctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||| ||||||| |  || ||||||||||||||    
T  4630398 tgcctgtgtctttgactttcttttctctgctc 4630367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 16959541 - 16959118
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  16959541 aagtttaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 16959443  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  16959442 tttctgtattgcattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 16959343  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||   || ||||    
T  16959342 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaagtctcatactttgaaagta 16959244  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  16959243 ttgagcagttgtaatct-tgtgatta----tagt-gaaatctctttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 16959150  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||| ||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  16959149 tgcctgtgtctttgtctttcttttctctgctc 16959118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 55 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 32757271 - 32756899
Alignment:
Q  55 tgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtctttattacattgta-ttgtgaacactactgattgtatatctagtgttca 153  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| || ||||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  32757271 tgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcacaagtctagagtctttattgcattatatttgtgaaaaccactgattgtatatcaagtgttca 32757172  T
Q  154 a-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaag 252  Q
    | ||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| |||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32757171 aggtcaaacat-tttctctgtatttttgtttgaacagaagtctcttgtctgcgtacttgagcattagaagactcttgc-ttagtgcttgagcattggaag 32757074  T
Q  253 tctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagtattgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttgg 350  Q
     |||| ||||| |||||||||||  |||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||    
T  32757073 actcttgcctgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcatac--ttagagtattgagcatttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttgg 32756981  T
Q  351 aagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtctctc-tgtcttttctctgct 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | | |||||||||||||    
T  32756980 aagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctcgcttttcttttctctgct 32756899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 5 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 21128002 - 21127576
Alignment:
Q  5 acaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaa-tttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagag 103  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| ||| |||| ||| || |||||| |||||||||     |||||||||| |||||||||||||   |||||||||    
T  21128002 acaagttaaaaagcgcctaaactctgccaaatttgtttc-accaagcactttgaatttctatgttgatttgatatatcttagaaattcttaagtctagag 21127904  T
Q  104 tcttt--attacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaag-tcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgc 200  Q
    |||||  ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||  ||||| |||| ||  |||||| |||||| |||| ||    
T  21127903 tctttcaattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgattagaagtctcttgc 21127804  T
Q  201 ctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagagag 300  Q
     |  ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |  ||    
T  21127803 tttagtgcttgagcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcgtaggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcatttgtgaagtctcatactaggt-ag 21127705  T
Q  301 tattgagcatttgtaatctgtgtgattattt-ttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggat 399  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  21127704 tattgagcagttgtaatctgtgtgattatttcttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaaccagtat 21127605  T
Q  400 aattgcttgtgtctctctgtcttttctct 428  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  21127604 aattgcttatgtctctctttcttttctct 21127576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 3 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 27384356 - 27383930
Alignment:
Q  3 atacaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctaga 102  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  27384356 atacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaaattgattctacaaagcacacagaatttctgcactgatttgataaatcttagaaattca-aagtctaga 27384258  T
Q  103 gtctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcct 202  Q
    ||||||| |  ||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | || |||||| ||| |||||| |||||| |||| | ||    
T  27384257 gtctttactgtattgtattgagaacatcactgattgtatatcaagtgttcaaatcaaactcaattgtctgtacttttgtttgattagaagtctcttg-ct 27384159  T
Q  203 gcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagag 300  Q
      |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||  ||| ||    
T  27384158 tagtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagtctcttgcgtgtgtgcttgagcatctttgtgaagtctcatacttagaaag 27384060  T
Q  301 tattgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggata 400  Q
    ||||||||| |||||||||   ||||||    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  27384059 tattgagcagttgtaatcttgttgatta----tagtgaaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggata 27383964  T
Q  401 attgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    | ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  27383963 actgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 27383930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 3 - 413
Target Start/End: Original strand, 28251836 - 28252240
Alignment:
Q  3 atacaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctaga 102  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  28251836 atacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaaattgattctacaaagcacacagaatttctgcactgatttgataaatcttagaaattca-aagtctaga 28251934  T
Q  103 gtctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcct 202  Q
    ||||||| |  ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  | || |||||||||| |||||| |||||| |||| | ||    
T  28251935 gtctttactgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattgtctgtatttttgtttgattagaagtctcttg-ct 28252033  T
Q  203 gcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagag 300  Q
      |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||   || ||    
T  28252034 tagtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcagtggaagtctcttgcgtgtgtgcttgagcatctttgtgaagtctcatactttgaaag 28252132  T
Q  301 tattgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggata 400  Q
    ||||||||| |||||||||   ||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  28252133 tattgagcagttgtaatcttgttgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggata 28252227  T
Q  401 attgcttgtgtct 413  Q
    | |||||||||||    
T  28252228 actgcttgtgtct 28252240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 3 - 413
Target Start/End: Original strand, 28356983 - 28357387
Alignment:
Q  3 atacaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctaga 102  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  28356983 atacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaaattgattctacaaagcacacagaatttctgcactgatttgataaatcttagaaattca-aagtctaga 28357081  T
Q  103 gtctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcct 202  Q
    ||||||| |  ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  | || |||||||||| |||||| |||||| |||| | ||    
T  28357082 gtctttactgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattgtctgtatttttgtttgattagaagtctcttg-ct 28357180  T
Q  203 gcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagag 300  Q
      |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||   || ||    
T  28357181 tagtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcagtggaagtctcttgcgtgtgtgcttgagcatctttgtgaagtctcatactttgaaag 28357279  T
Q  301 tattgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggata 400  Q
    ||||||||| |||||||||   ||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  28357280 tattgagcagttgtaatcttgttgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggata 28357374  T
Q  401 attgcttgtgtct 413  Q
    | |||||||||||    
T  28357375 actgcttgtgtct 28357387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 46 - 428
Target Start/End: Original strand, 7586575 - 7586960
Alignment:
Q  46 aaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtcttt--attacattgtattgtgaacactactgattgtatat 143  Q
    ||||||| ||||||||| |   |||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  7586575 aaagcactttgaatttctgtgttgatttgatatatcttagaaattcttaagtctagagtctttcaattgcattgtattgtgaacaccactgatagtatat 7586674  T
Q  144 ctagtgttcaag-tcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttga 242  Q
    | || ||||||  |||||||  ||||| ||||  |  |||||| |||||| |||| || |  ||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||    
T  7586675 caagcgttcaaactcaaacaattttctgtgtaaatctgtttgattagaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgctttagtgcttga 7586774  T
Q  243 gcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagagagtattgagcatttgtaatctgtgtgattattt-ttagtggaaa 341  Q
    || | |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |  ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  7586775 gcgtaggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcatttgtgaagtctcatactaggt-agtattgagcagttgtaatcagtgtgattatttcttagtggaaa 7586873  T
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtctctctgtcttttctct 428  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7586874 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaaccagtataattgcttgtgtctctctttcttttctct 7586960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 3 - 409
Target Start/End: Original strand, 7751508 - 7751911
Alignment:
Q  3 atacaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctaga 102  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  7751508 atacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaaattgattctacaaagcacacagaatttctgcactgatttgataaatcttagaaattca-aagtctaga 7751606  T
Q  103 gtctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcct 202  Q
    ||||||| |  ||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | || |||||| ||| |||||| |||||| |||| || |    
T  7751607 gtctttactgtattgtattgagaacatcactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattgtctgtacttttgtttgattagaagtctcttgctt 7751706  T
Q  203 gcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagag 300  Q
      |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||  ||| ||    
T  7751707 ttgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagtctcttgcgtgtgtgcttgagcatctttgtgaagtctcatacttagaaag 7751805  T
Q  301 tattgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaa-gggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggat 399  Q
    ||||||||| |||||||||   ||||||    ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  7751806 tattgagcagttgtaatcttgttgatta----tagtgaaaatctctttggaagtgcaaggggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggat 7751901  T
Q  400 aattgcttgt 409  Q
    || |||||||    
T  7751902 aactgcttgt 7751911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 215 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 18555010 - 18554797
Alignment:
Q  215 attagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagagagtattgagcatttgt 314  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||| ||||    
T  18555010 attagaagtctcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgggaagtctcatacta-gatagtattgagcagttgt 18554912  T
Q  315 aatctgtgtgattattt-ttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtct 413  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18554911 aatctgtgtgattatttcttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaaccaggataattgcttgtgtct 18554812  T
Q  414 ctctgtcttttctct 428  Q
    |||| ||||||||||    
T  18554811 ctctttcttttctct 18554797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 215 - 428
Target Start/End: Original strand, 12953586 - 12953799
Alignment:
Q  215 attagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagagagtattgagcatttgt 314  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||| ||||    
T  12953586 attagaagcctcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctagcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcatacta-gatagtattgagcaattgt 12953684  T
Q  315 aatctgtgtgattattt-ttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtct 413  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  12953685 aatctgtgtgattatttcttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaaccaggataattgtttgtgtct 12953784  T
Q  414 ctctgtcttttctct 428  Q
    |||| ||||||||||    
T  12953785 ctctttcttttctct 12953799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 13 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 4292640 - 4292419
Alignment:
Q  13 aaaagcgtcaaaactctgtcaa-tttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtctttatt 111  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4292640 aaaagcgccaaaactctgtcaaatttgattctacaaagcaccttgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcacaagtctagagtctttatt 4292541  T
Q  112 acattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttg 211  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4292540 gcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaaaaaatttcgctgtatttttgtttgaatagaagcctcttgcctgcgtgcttg 4292441  T
Q  212 agcattagaagactcttgcttt 233  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  4292440 agcattagaagactcttgcttt 4292419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 215 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 31931163 - 31930950
Alignment:
Q  215 attagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagagagtattgagcatttgt 314  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||| ||||    
T  31931163 attagaagtctcttgctttagtgcttgagcattggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcatttgggaagtctcatacta-gatagtattgagcagttgt 31931065  T
Q  315 aatctgtgtgattattt-ttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtct 413  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31931064 aatctgtgtgattatttcttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaaccaggataattgcttgtgtct 31930965  T
Q  414 ctctgtcttttctct 428  Q
    |||| ||||||||||    
T  31930964 ctctttcttttctct 31930950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 217 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 17047297 - 17047082
Alignment:
Q  217 tagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagagagtattgagcatttgtaa 316  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||| ||||||    
T  17047297 tagaagtctcttgctttagtgcttgagcattggaagtctcttgcctgcatgcttgagcatttgagaagtctcatactt-gatagtattgagcagttgtaa 17047199  T
Q  317 tctgtgtgattattttt-agtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtctct 415  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  17047198 tctgtgtgattattttttagtgaaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggattgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctct 17047099  T
Q  416 ctgtcttttctctgctc 432  Q
    || ||||||||||||||    
T  17047098 ctttcttttctctgctc 17047082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 70 - 428
Target Start/End: Original strand, 19452962 - 19453327
Alignment:
Q  70 atttgatacatcttagaaattcactagtctagag--tcttt--attacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagt-caaacata 164  Q
    |||||||| |||||||||||||   |||||||||  |||||  ||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||   ||||||      
T  19452962 atttgatatatcttagaaattcttaagtctagagagtctttcaattgcattgtattatgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaacacaaacaat 19453061  T
Q  165 tttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgc 264  Q
    ||||| |||| ||  ||||||||||||| |||| |  |  ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||   ||||| ||| ||||||    
T  19453062 tttctgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttgatttagtgcttgagcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaagaagtatcttgcctgc 19453161  T
Q  265 gtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagag-agtattgagcatttgtaatctgtgtgattattt-ttagtggaaatctccttggaagtgcaagggg 362  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | | | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  19453162 gtgcttgagcatttgtgaagtctcatactaggtgtagtattgagcagttgtaatctgtgtgattttttcttagtggaaatctccttggaaatacaagggg 19453261  T
Q  363 gactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtctctctgtcttttctct 428  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19453262 gactggactacttccggtttgtggaaggaaccggtataattgcttgtgtctctctttcttttctct 19453327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 12353481 - 12353237
Alignment:
Q  1 acatacaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtcta 100  Q
    ||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  12353481 acatataagttcaaaagcgccaaaactctatcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaaaagtcta 12353382  T
Q  101 gagtctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgc 200  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| || |||| |||||||| ||||||  |||||||||| ||    
T  12353381 gagtctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaacttaattctttgtatttttgtttgatcagaagcctcttgc 12353282  T
Q  201 ctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagca 245  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |  |||||||||||    
T  12353281 ctgcgtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagca 12353237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 217 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 11205683 - 11205472
Alignment:
Q  217 tagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagagagtattgagcatttgtaa 316  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||| ||||||    
T  11205683 tagaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcatttgtgaagtctcatacta-gatagtattgagcagttgtaa 11205585  T
Q  317 tctgtgtgattattt-ttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtctct 415  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  11205584 tatgtgtgattatttcttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggaatggactacttctggtttgtggaaggaaccagtataattgcttgtgtctct 11205485  T
Q  416 ctgtcttttctct 428  Q
    || ||||||||||    
T  11205484 ctttcttttctct 11205472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 249 - 429
Target Start/End: Original strand, 9934131 - 9934308
Alignment:
Q  249 gaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagagagtattgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctcctt 348  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  9934131 gaagactctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcgtactaagagagtattgagcatttgtaatctgtgtgattatt---agtggaaatctcctt 9934227  T
Q  349 ggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtctctctgtcttttctctg 429  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9934228 ggaagtgcgagggggactggactacttccggtttgtggaaggaaccaggataattgcttgtgtctctctttcttttctctg 9934308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 70 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 22386513 - 22386149
Alignment:
Q  70 atttgatacatcttagaaattcactagtctagag--tcttt--attacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaag-tcaaacata 164  Q
    |||||||| |||||||||||||   |||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||      
T  22386513 atttgatatatcttagaaattcttaagtctagagagtctttcaattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaat 22386414  T
Q  165 tttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgc 264  Q
    ||||| |||| ||  ||||||||||||| |||| || |  ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||    
T  22386413 tttctttgtaattctgtttgaatagaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcatgcctgc 22386314  T
Q  265 gtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagag-agtattgagcatttgtaatctgt-gtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggg 362  Q
    || |||||||| ||  |||||||||||| | | | | ||||||||| |||||||| || |||||||   |||||| || |||||||||||||||||||||    
T  22386313 gtacttgagcaattt-gaagtctcatactaggtgtaatattgagcagttgtaatcagttgtgattaaacttagtgaaactctccttggaagtgcaagggg 22386215  T
Q  363 gactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtctctctgtcttttctct 428  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||||||    
T  22386214 gactggactacttccggtttgtggaagaaaccagtataattgcctgtgtctttctttcttttctct 22386149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 3 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 27504268 - 27504016
Alignment:
Q  3 atacaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctaga 102  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  27504268 atacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaaattgattctacaaagcacacagaatttctgcactgatttgataaatcttagaaattcaa-agtctaga 27504170  T
Q  103 gtctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcct 202  Q
    ||||||| |  ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | || |||||||||| ||||||  ||||| |||| ||||    
T  27504169 gtctttactgtattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaatcaaactcaattgtctgtatttttgtttgatcagaagtctcttgcct 27504070  T
Q  203 gcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctct 257  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  27504069 gcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattagaagtctct 27504016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 113 - 428
Target Start/End: Original strand, 17608794 - 17609110
Alignment:
Q  113 cattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaag-tcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttg 211  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||  |||||||  ||| | |||| ||  ||||||||||||| |||| || |  |||||||    
T  17608794 cattgtattgtgaacaccattgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttatgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttgctttagtgcttg 17608893  T
Q  212 agcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagagag-tattgagcat 310  Q
    |||||  |||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||||||| |||| | | | | ||||||| |     
T  17608894 agcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcaattt-gaagtcttatactaggtgtggtattgagtag 17608992  T
Q  311 ttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtg 410  Q
    ||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  17608993 ttgtaatctgtgtgattaaacttagtgaaaatctccttggaagtgcaagggagactggactacttccggtttgtggaaggaaccagtataattgcttgtg 17609092  T
Q  411 tctctctgtcttttctct 428  Q
    ||||||| |||| |||||    
T  17609093 tctctctttcttctctct 17609110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 7 - 217
Target Start/End: Original strand, 11147526 - 11147736
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  11147526 aagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaaaagtctagagtct 11147625  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    |||    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| |||||||| ||||||  ||||| |||| || || ||    
T  11147626 ttaacgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttaattctttgtatttttgtttgataagaagactcttgcgtgtgt 11147725  T
Q  207 gcttgagcatt 217  Q
    |||||||||||    
T  11147726 gcttgagcatt 11147736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 70 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 20635430 - 20635066
Alignment:
Q  70 atttgatacatcttagaaattcactagtctagag--tcttta--ttacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaag-tcaaacata 164  Q
    |||||||| |||||||||||||   |||||||||  |||||   || ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||  |||||||      
T  20635430 atttgatatatcttagaaattcttaagtctagagagtctttcatttgcattgtattgtgaacaccactgattgtatttcaagtgttcaaactcaaacaat 20635331  T
Q  165 tttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgc 264  Q
    ||||| |||| ||  ||||||||||||| |||| || |  ||||||||||||  |||| ||||||||||||| ||||||||   ||||||||| ||||||    
T  20635330 tttctgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgctttagtacttgagcaaatgaagtctcttgcctgc 20635231  T
Q  265 gtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagag-agtattgagcatttgtaatctgt-gtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggg 362  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||||| | | | ||||||||||| |||||||| || |||||||   |||||| || |||||||||||||||||||||    
T  20635230 gtgcttgagcagttt-gaagtctcatactaggtgtagtattgagcagttgtaatcagttgtgattaaacttagtgaaactctccttggaagtgcaagggg 20635132  T
Q  363 gactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtctctctgtcttttctct 428  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| ||| |||| |||||    
T  20635131 gactggactacttccggtttgtggaaggaaccagtataattgcctgtgtctttctttcttctctct 20635066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 224 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 17063931 - 17063726
Alignment:
Q  224 ctcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagagagtattgagcatttgtaatctgtgt 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||||||||||||     
T  17063931 ctcttgctttagtgcttgagcattggaagtctcttgcctgcgtgtttgagcatttgagaagtctcata-catgatagtattgaacaattgtaatctgtga 17063833  T
Q  324 gattatt--tttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtctctctgtct 421  Q
    |||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||    | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  17063832 gattattgatttagtgaaaatctccttggaagtgcaaggg----tagactacttccggattgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctctctttct 17063737  T
Q  422 tttctctgctc 432  Q
    |||||||||||    
T  17063736 tttctctgctc 17063726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 13 - 217
Target Start/End: Original strand, 9933954 - 9934159
Alignment:
Q  13 aaaagcgtcaaaactctgtcaa-tttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtctttatt 111  Q
    ||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  9933954 aaaagcgccaaaactctgccaaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcgtaagtctagagtctttatt 9934053  T
Q  112 acattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttc-aagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgctt 210  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||  |||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  9934054 gcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacat-tttctgtgtaattctgtttgattagaagactctcgcctgcgtgctt 9934152  T
Q  211 gagcatt 217  Q
    |||||||    
T  9934153 gagcatt 9934159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 3 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 27474769 - 27474518
Alignment:
Q  3 atacaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctaga 102  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  27474769 atacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaaattgattctacaaagcacacagaatttctgcactgatttgataaatcttagaaattca-aagtctaga 27474671  T
Q  103 gtctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcct 202  Q
    ||||||| |  ||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | || |||||| ||| |||||| |||||| |||| | ||    
T  27474670 gtctttactgtattgtattgagaacatcactgattgtatatcaagtgttcaaatcaaactcaattgtctgtacttttgtttgattagaagtctcttg-ct 27474572  T
Q  203 gcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctct 257  Q
      |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  27474571 tagtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattagaagtctct 27474518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 278 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 22292541 - 22292390
Alignment:
Q  278 tgagaagtctcataccaagagagtattgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttcc 377  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||   |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22292541 tgagaagtctcatactaagagagtattgagcatttgtaatctttgagattatt---agtgaaaatctccttggaaatgcaagggggactggactacttcc 22292445  T
Q  378 ggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtctctctgtcttttctctgctc 432  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22292444 ggattgtggaaggaaccaggataattgcttgtgtctctctttcttttctctgctc 22292390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 205 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 27474540 - 27474314
Alignment:
Q  205 gtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||  ||| ||||    
T  27474540 gtgcttgagcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagtctcttgcgtgtgtgcttgagcatctttgtgaagtctcatacttagaaagta 27474442  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| |||||||||   ||||||    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  27474441 ttgagcagttgtaatcttgttgatta----tagtgaaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 27474346  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  27474345 tgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 27474314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 205 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 27504038 - 27503812
Alignment:
Q  205 gtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||  ||| ||||    
T  27504038 gtgcttgagcattagaagtctcttgctt-agtgcttgagcattggaagtctcttgcgtgtgtgcttgagcatctttgtgaagtctcatacttagaaagta 27503940  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| |||||||||   ||||||    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  27503939 ttgagcagttgtaatcttgttgatta----tagtgaaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 27503844  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  27503843 tgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 27503812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 13 - 247
Target Start/End: Original strand, 12953413 - 12953648
Alignment:
Q  13 aaaagcgtcaaaactctgtcaa-tttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtctttatt 111  Q
    ||||||| |||||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  12953413 aaaagcgccaaaactctgccaaatttgattctaaaaagcactttgaatttctgcactgatttgatatatcttagaaattcttaagtctagagtctttatt 12953512  T
Q  112 acattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttg 211  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| | |||| ||  |||||| ||||||||||| || |  |||||||    
T  12953513 gcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaacaaatttttgtgtaattctgtttgattagaagcctcttgctttagtgcttg 12953612  T
Q  212 agcattagaagactcttgctttagtgcttgagcatt 247  Q
    |||||| |||| |||| || |  |||||||||||||    
T  12953613 agcattggaagtctctagcctgcgtgcttgagcatt 12953648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 236 - 413
Target Start/End: Original strand, 10404043 - 10404217
Alignment:
Q  236 tgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattt--gagaagtctcataccaagagagtattgagcatttgtaatctgtgtgattattttt 333  Q
    ||||||||||||||||| |||| || || ||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||        
T  10404043 tgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcatacttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgattat---- 10404138  T
Q  334 agtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtct 413  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  10404139 agtg-aaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgttttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtct 10404217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 56 - 394
Target Start/End: Original strand, 14070501 - 14070843
Alignment:
Q  56 gaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtcttt--attacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttca 153  Q
    ||||||| | ||| |||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||    
T  14070501 gaatttctgtactcatttgatatatcttagaaattcttaagtctagagtctttcaattgcattgtattgtgaacaccactaattgtatatcaagtgttca 14070600  T
Q  154 ag-tcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaag 252  Q
    |  |||||||  ||||| |||| ||  ||||||||||||| |||| || |  |||||||||||| ||||| |||||||||  |||||||||||| |||||    
T  14070601 aactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttgctttagtgcttgagcataagaagtctcttgcttgtgtgcttgagcataggaag 14070700  T
Q  253 tctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagag-agtattgagcatttgtaatctg-tgtgattatttttagtggaaatctccttgg 350  Q
    ||||| |  || ||||||||||||||  |||||||| |||     | ||||||||||| |||||||| | |||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  14070701 tctcttg-ttgtgtgcttgagcattt-tgaagtctcgtacttgttgaagtattgagcagttgtaatcagttgtgattatacttagtggaactctccttgg 14070798  T
Q  351 aagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaacc 394  Q
    |||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  14070799 aagtgcaagggggacaagactgacttccggtttgtggaaggaacc 14070843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 25735829 - 25736044
Alignment:
Q  1 acatacaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtcta 100  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||   ||||||    
T  25735829 acatacaagttaaaa-gcgcctaaactctgtcaatttgattctataaagcactgtgaatttctgcactgatttgatatatcttagaaattcttaagtcta 25735927  T
Q  101 gagtctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcg 199  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||| |||| ||| |||||| |||||| |||| |    
T  25735928 gagtctttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaatctcaaacat-tttctgtgtaattttgtttgattagaagactcttg 25736026  T
Q  200 cctgcgtgcttgagcatt 217  Q
    | |  |||||||||||||    
T  25736027 ctttagtgcttgagcatt 25736044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 218 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 12353294 - 12353080
Alignment:
Q  218 agaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca---tttgagaagtctcataccaagagagtattgagcatttgt 314  Q
    ||||| ||||||| |  |||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||   |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  12353294 agaagcctcttgcctgcgtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcaatttttgagaagtctcatacttagagagtattgagcatttgt 12353195  T
Q  315 aatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtc-- 412  Q
    ||||| |||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| | ||||||||      
T  12353194 aatctttgtgattat----agtg-aaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactacttgtgtctt 12353100  T
Q  413 tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    | ||| ||||||||||||||    
T  12353099 tgtctttcttttctctgctc 12353080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 13 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 31931337 - 31931101
Alignment:
Q  13 aaaagcgtcaaaactctgtcaa-tttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtcttt-at 110  Q
    ||||||| |||||||||| ||| |||| ||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||| ||    
T  31931337 aaaagcgccaaaactctgccaaatttgtttctcaaaagcactttgaatttctgcactgatttgatatatcttagaaattcttaagtctagagtcttttat 31931238  T
Q  111 tacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgctt 210  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||| |||| ||  |||||| |||||| |||| || |  ||||||    
T  31931237 tgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacaattttctgtgtaattctgtttgattagaagtctcttgctttagtgctt 31931138  T
Q  211 gagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcatt 247  Q
    ||||||| |||| ||||||| |  |||||||||||||    
T  31931137 gagcattggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcatt 31931101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 7 - 154
Target Start/End: Original strand, 31543173 - 31543319
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||    
T  31543173 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatatatcttagaaattca-aagtctagagtct 31543271  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa 154  Q
    ||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  31543272 ttactgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 31543319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 33 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 18555163 - 18554948
Alignment:
Q  33 aatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtcttt-attacattgtattgtgaacacta 131  Q
    |||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  18555163 aatttgattctcaaaagcactttgaatttctgcactgatttgatatatcttagaaattcttaagtctagagtcttttattgcattgtattgtgaacacca 18555064  T
Q  132 ctgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgct 231  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||| |||| ||  |||||| |||||| |||| || |  ||||||||||||| |||| |||| ||     
T  18555063 ctgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacaattttctgtgtaattctgtttgattagaagtctcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcc 18554964  T
Q  232 ttagtgcttgagcatt 247  Q
    |  |||||||||||||    
T  18554963 tgcgtgcttgagcatt 18554948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 299 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 21119284 - 21119154
Alignment:
Q  299 agtattgagcatttgtaatctgtgtgattattt-ttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccagg 397  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||||     
T  21119284 agtattgagcagttgtaatctgtgtgattatttcttagtggaaatctccttagaagtgtaagggggactgaactacttccagtatgtggaaggaaccagt 21119185  T
Q  398 ataattgcttgtgtctctctgtcttttctct 428  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21119184 ataattgcttgtgtctctctttcttttctct 21119154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 265 - 432
Target Start/End: Original strand, 11147724 - 11147888
Alignment:
Q  265 gtgcttgagcattt--gagaagtctcataccaagagagtattgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggg 362  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11147724 gtgcttgagcatttttgtgaagtctcatacttagagagtattaagcatttgtaatctttgtgattat----agtg-aaatctccttggaagtgcaagggg 11147818  T
Q  363 gactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtctctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||| | | ||| ||||||||||||||    
T  11147819 gactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtctttgtctttcttttctctgctc 11147888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 240 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 25583600 - 25583430
Alignment:
Q  240 tgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattt--gagaagtctcataccaagagagtattgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtg 337  Q
    ||||||||||||| |||  || || ||||||||||||||  | ||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||    ||||    
T  25583600 tgagcattggaagactcatgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattat----agtg 25583505  T
Q  338 gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtct 413  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  25583504 -aaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtct 25583430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 25679162 - 25679024
Alignment:
Q  1 acatacaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtcta 100  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||   ||||||    
T  25679162 acatacaagttaaaa-gcgcctaaactctgtcaatttgattctataaagcactgtgaatttctgcactgatttgatatatcttagaaattcttaagtcta 25679064  T
Q  101 gagtctttattacattgtattgtgaacactactgattgta 140  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25679063 gagtcttaattgcattgtattgtgaacaccactgattgta 25679024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 215 - 340
Target Start/End: Original strand, 19289837 - 19289962
Alignment:
Q  215 attagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagagagtattgagcatttgt 314  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||    
T  19289837 attagaagtctcttcctttagtgcttgagcataggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgggaagtctcata-ctagatagtattgagcagttgt 19289935  T
Q  315 aatctgtgtgattattt-ttagtggaa 340  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  19289936 aatatgtgtgattatttcttagtggaa 19289962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 311 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 25679028 - 25678911
Alignment:
Q  311 ttgtaatctgtgtgattattt-ttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgt 409  Q
    ||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  25679028 ttgtaatatgtg-gattatttcttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttctggtttgtggaaggaaccaggataattgcgtgt 25678930  T
Q  410 gtctctctgtcttttctct 428  Q
    |||||||| |||| |||||    
T  25678929 gtctctctttcttctctct 25678911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 70 - 394
Target Start/End: Original strand, 14051834 - 14052152
Alignment:
Q  70 atttgatacatcttagaaattcactagtctagagtcttt--attacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaag-tcaaacatatt 166  Q
    |||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||  |||||||  ||    
T  14051834 atttgatatatcttagaaattcttaagtctagagtctttcaattgcattgtattgtgaacaccactaattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattt 14051933  T
Q  167 tctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgt 266  Q
    ||| |||| ||  ||||||||||||| |||| || |  |||||||||||| ||||| |||||||||  |||||||||||| ||| |||||| |  || ||    
T  14051934 tctgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttgctttagtgcttgagcataagaagtctcttgcttgtgtgcttgagcataggatgtctcttg-ttgtgt 14052032  T
Q  267 gcttgagcatttgagaagtctcataccaagag-agtattgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggac 365  Q
    ||||||| ||||  |||||||| |||     | ||||||||||| |         |||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14052033 gcttgagaattt-tgaagtctcgtacttgttgaagtattgagcagt---------tgtgattatacttagtggaactctccttggaagtgcaagggggac 14052122  T
Q  366 tggact-acttccggtttgtggaagaaacc 394  Q
     ||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  14052123 aggactgacttccggtttgtggaaggaacc 14052152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 11205860 - 11205623
Alignment:
Q  13 aaaagcgtcaaaactctgtcaa-tttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtcttt-at 110  Q
    ||||||| | |||||||| ||| |||| ||||  ||||||| ||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||    
T  11205860 aaaagcgcccaaactctgccaaatttgtttctcaaaagcactttgaatttctgtattgatttgatacatcttagaaattcttaagtctagagtctttgat 11205761  T
Q  111 tacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttc-aagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgct 209  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||  ||||||  ||||| |||| ||  ||||||||||||| |||| || |  |||||    
T  11205760 tgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaacacaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttgctttagtgct 11205661  T
Q  210 tgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcatt 247  Q
    |||||||  |||| ||||||| |  |||||||||||||    
T  11205660 tgagcataggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcatt 11205623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 247
Target Start/End: Original strand, 19289662 - 19289899
Alignment:
Q  13 aaaagcgtcaaaactctgtcaa-tttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtc-tttat 110  Q
    ||||||||| |||||||| ||| |||| ||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||   |||| |||||| |||||    
T  19289662 aaaagcgtccaaactctgccaaatttgtttctcaaaagcactttgaatttctgcactgatttgatatatcttagaaattcttaagtccagagtcttttat 19289761  T
Q  111 tacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgtt-caagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgct 209  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||||  ||||| |||| ||  |||||| |||||| ||||  | |  |||||    
T  19289762 tgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttaaaagtcaaacaattttctgtgtaattctgtttgattagaagtctcttcctttagtgct 19289861  T
Q  210 tgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcatt 247  Q
    |||||||  |||| |||| || |  |||||||||||||    
T  19289862 tgagcataggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatt 19289899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 7 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 8653581 - 8653495
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcac 93  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8653581 aagttaaaaagcgccaaaactatgtcaatttgattctgcaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcac 8653495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 276 - 432
Target Start/End: Original strand, 12416903 - 12417055
Alignment:
Q  276 tttgagaagtctcataccaagagagtattgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactactt 375  Q
    |||| ||||||||||||   || ||||||||||| ||||||||| |||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12416903 tttgtgaagtctcatactttgaaagtattgagcagttgtaatct-tgtgattat----agtg-aaatctccttggaagtgcaagggggactggactactt 12416996  T
Q  376 ccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    |||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  12416997 ccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcctgtgtctttgtctttcttttctctgctc 12417055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #100
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 338 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 1902327 - 1902231
Alignment:
Q  338 gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  1902327 gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 1902231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #101
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 8 - 110
Target Start/End: Original strand, 26023073 - 26023174
Alignment:
Q  8 agttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtctt 107  Q
    |||| ||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||||||||    
T  26023073 agttcaaaagcgccaaaactctttcaaattgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaatcca-aaggctagagtctt 26023171  T
Q  108 tat 110  Q
    |||    
T  26023172 tat 26023174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #102
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 338 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 15551461 - 15551392
Alignment:
Q  338 gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  15551461 gaaatctccttgaaagtgcaagggggactggactacttccggattgtggaaggaaccaggataattgctt 15551392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #103
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 338 - 432
Target Start/End: Original strand, 27819068 - 27819164
Alignment:
Q  338 gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  27819068 gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcctgtgtctttgtctttcttttctctgctc 27819164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #104
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 5 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 17064117 - 17063878
Alignment:
Q  5 acaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaat-ttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagag 103  Q
    |||||||||||||||   |||||||| |||  ||| ||||  ||||||| ||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||  |||   ||||    
T  17064117 acaagttaaaaagcgcacaaactctgccaaaattgtttctcaaaagcactttgaatttctgcattgatttgatatatcttagaaattc--tag---agag 17064023  T
Q  104 tcttt-attacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcc 201  Q
    ||||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||  ||||| |||| ||  ||||||||| ||| |||| ||     
T  17064022 tcttttattgcattgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacgtcaaacaattttct-tgtaattctgtttgaatataagtctcttgct 17063924  T
Q  202 tgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcatt 247  Q
    |  ||||||||||||| |||| ||||||| |  ||| |||||||||    
T  17063923 ttagtgcttgagcattggaagtctcttgcctgcgtgtttgagcatt 17063878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #105
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 303 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 14757848 - 14757736
Alignment:
Q  303 ttgagcatttgtaatct-gtgtgattatttttagtggaaa-tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggata 400  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||    
T  14757848 ttgagcatttgtaatcttgtgtgattat----agtgaaaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgaattgtggaaggaaccatgata 14757753  T
Q  401 attgcttgtgtctctct 417  Q
    |||| |||| |||||||    
T  14757752 attgtttgtctctctct 14757736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #106
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 338 - 413
Target Start/End: Original strand, 30120496 - 30120571
Alignment:
Q  338 gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtct 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| | |||||||||    
T  30120496 gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaaccaagataactacttgtgtct 30120571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #107
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 347 - 432
Target Start/End: Original strand, 12575773 - 12575860
Alignment:
Q  347 ttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  12575773 ttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 12575860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #108
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 347 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 18720297 - 18720210
Alignment:
Q  347 ttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  18720297 ttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 18720210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #109
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 329 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 3680556 - 3680479
Alignment:
Q  329 tttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  3680556 tttttagtg-aactctccttggaagtgcaagggggacaggactacttccggtttgtggaaggaacctgtataattgctt 3680479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #110
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 46 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 17047435 - 17047237
Alignment:
Q  46 aaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtcttt-attacattgtattgtgaacactactgattgtatatc 144  Q
    ||||||| ||||||||| |   |||||||||| |||||||||||||  |||   ||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  17047435 aaagcactttgaatttctgttttgatttgatatatcttagaaattc--tag---agagtcttttattacattgtattgagaacaccattgattgtatatc 17047341  T
Q  145 tagtgttc-aagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgag 243  Q
     ||||||| |||||||| |  ||||| |||| ||  ||||||||||||| |||| || |  ||||||||||||| |||| ||||||| |   ||||||||    
T  17047340 aagtgttcaaagtcaaataattttctgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttgctttagtgcttgagcattggaagtctcttgcctgcatgcttgag 17047241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #111
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 342 - 407
Target Start/End: Original strand, 20113355 - 20113420
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  20113355 tctccttggaagtgcaagggggacaggactacttccggtttgtggaagtaacctgtataattgctt 20113420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #112
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 338 - 406
Target Start/End: Original strand, 18027396 - 18027464
Alignment:
Q  338 gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgct 406  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||    
T  18027396 gaaatctccttagaagtgcaagggagactggactacttccagattgtggaagaaatcaggataattgct 18027464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #113
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 333 - 404
Target Start/End: Original strand, 15478455 - 15478525
Alignment:
Q  333 tagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||    
T  15478455 tagtgaaaatctccttggaagtgcaagggg-actggactacttccggattgtggaaggaaccaagataattg 15478525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #114
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 342 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 13435316 - 13435251
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  13435316 tctccttggaagtgcaagggggaaaggactacttccggtttgtggaaggaacctgcataattgctt 13435251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #115
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 114 - 279
Target Start/End: Original strand, 18027210 - 18027374
Alignment:
Q  114 attgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgag 213  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| |||||| |||||||||  ||||| ||||||| |||| ||| |||||  |||||| |||| || |  |||||||||    
T  18027210 attgtattatgaacaccactgattttatatcaagtgttcaaaccaaacttatttctgtgtaattt-gtttgtttagaagtctcttgcttttgtgcttgag 18027308  T
Q  214 cattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttg 279  Q
    |||  |||  |||||||||  ||||||||| ||| |||||| || || || |||||||||||||||    
T  18027309 catatgaaatctcttgcttgtgtgcttgagtatttgaagtcccttgcttgtgtgcttgagcatttg 18027374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #116
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 342 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 25929909 - 25929844
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||    
T  25929909 tctccttggaagtgcaagggggacaggactacttccggtttgttgaaggaacctgtataattgctt 25929844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #117
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 120 - 251
Target Start/End: Original strand, 17446151 - 17446282
Alignment:
Q  120 ttgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgagcatta 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||| |||| ||  ||||||||| ||| |||| || |  ||||||||||||      
T  17446151 ttgtgaacactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacat-tttctttgtaattctgtttgaatataagtctcttgcttttgtgcttgagcatat 17446249  T
Q  219 gaagactcttgctttagtgcttgagcattggaa 251  Q
    |||| ||||||| || |||||||||||| ||||    
T  17446250 gaagtctcttgcatttgtgcttgagcataggaa 17446282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #118
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 343 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 19623409 - 19623345
Alignment:
Q  343 ctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  19623409 ctccttggaagtgcaagggggacaagactacttccggtttgtggaaggaacctgtataattgctt 19623345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #119
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 229
Target Start/End: Original strand, 12715913 - 12716030
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaa--tagaagcctctcgcctgcgtgcttg 211  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||| |||| ||  |||||||  |||||| |||| ||  | |||||||    
T  12715913 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctatgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcaggtgtgcttg 12716012  T
Q  212 agcattagaagactcttg 229  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  12716013 agcattagaagtctcttg 12716030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #120
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 342 - 404
Target Start/End: Original strand, 14101156 - 14101218
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  14101156 tctccttggaagtgcaagggggacatgactacttccggtttgtggaaggaacctgtataattg 14101218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #121
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 342 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 17927223 - 17927161
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||    
T  17927223 tctccttggaagtgcaagggggacaggactacttccagtttgtggaaggaacctgtataattg 17927161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #122
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 12422919 - 12422623
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaag-tcaaacatatttctctgtattttcgtttgaat--agaagcctctcgcctgcgtgcttg 211  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||| |||| ||  ||||||||  ||||| |||  ||    |||||||    
T  12422919 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttct-tgtaattctgtttgaattaagaagtctcctgcagttgtgcttg 12422821  T
Q  212 agcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagag-agtattgagcat 310  Q
    |||| ||||||||||||| ||  || |  |||||| |||||||||| ||    ||||||||||||||||  |||||| ||| |||   |||| |||||||    
T  12422820 agcaatagaagactcttgattgtgttcaggagcatgggaagtctcttgcagttgtgcttgagcatttga--agtctcttactaagtttagtagtgagcat 12422723  T
Q  311 ttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggat-aattgcttg 408  Q
    |||||||| |    ||  |   ||||| || |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| |||| | || |||||||||    
T  12422722 ttgtaatcag----atattacatagtg-aactctccttggaagtgcaagggggacaggagtgacttccggtttgtggaaggaacctgtataaattgcttg 12422628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #123
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 215 - 276
Target Start/End: Original strand, 23006567 - 23006628
Alignment:
Q  215 attagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcat 276  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||    
T  23006567 attagaagtctcttgttttagtgcttgagcataggaagtctctcgcctttgtgcttgagcat 23006628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #124
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 215 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 23781799 - 23781738
Alignment:
Q  215 attagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcat 276  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||    
T  23781799 attagaagtctcttgttttagtgcttgagcataggaagtctctcgcctttgtgcttgagcat 23781738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #125
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 342 - 407
Target Start/End: Original strand, 24719451 - 24719516
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||| |||| | ||||||||||    
T  24719451 tctccttggaagtgcaagggggacaggactacttctggattgtggaaggaacctgtataattgctt 24719516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #126
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 342 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 29917458 - 29917393
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||  | ||||||||||    
T  29917458 tctccttggaagtgcaacggggactagactacttccggtttgtggaaggaacttgtataattgctt 29917393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #127
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 333 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 30372796 - 30372715
Alignment:
Q  333 tagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtctc 414  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||||  ||| ||||| ||| ||||||||||||||    
T  30372796 tagtgaaaatctccttggaaatgcaagtgggattggactacttccggattgtataaggaaccaagattattgcttgtgtctc 30372715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #128
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 344 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 12347521 - 12347461
Alignment:
Q  344 tccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  12347521 tccttggaagtgcaatggggacaggactacttccggtttgtggaaggaacctgtataattg 12347461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #129
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 342 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 24116258 - 24116206
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaacc 394  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  24116258 tctccttggaagtgcaagggggacaggactacttctggtttgtggaaggaacc 24116206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #130
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 115 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 26942094 - 26941962
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgag 213  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||| | || ||  ||||||||||||| |||| ||    |||||||||    
T  26942094 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttataattctgtttgaatagaagtctcttgcagttgtgcttgag 26941995  T
Q  214 cattagaagactcttgctttagtgcttgagcat 246  Q
    |||  |||| |||| | |||||| |||||||||    
T  26941994 catatgaagtctctcgatttagttcttgagcat 26941962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #131
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 342 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 16528742 - 16528679
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  16528742 tctccttggaagtgcaagggggacaggactgacttccggtttgtggaaggaacctgtataattg 16528679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #132
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 342 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 18377874 - 18377811
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  18377874 tctccttggaagtgcaagggggaccggactgacttccggtttgtggaaggaacctgtataattg 18377811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #133
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 19625468 - 19625385
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctct 197  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||| |||| ||  ||||||||||||| ||||    
T  19625468 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaaatttctttgtaattctgtttgaatagaagtctct 19625385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #134
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 342 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 15301646 - 15301584
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| |||| | |||||||    
T  15301646 tctccttggaagtgcaagggggacaggtctacttctggtttgtggaaggaacctgtataattg 15301584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #135
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 346 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 16739883 - 16739817
Alignment:
Q  346 cttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggat-aattgcttgtgt 411  Q
    |||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  16739883 cttgtaagtgaaaaggggactggactacttccggattgtggaagaaactaggataaattgcttgtgt 16739817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #136
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 342 - 392
Target Start/End: Original strand, 17303990 - 17304040
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaa 392  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||    
T  17303990 tctccttggaagtgcaagggagacatgactacttccggtttgtggaagaaa 17304040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #137
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 229
Target Start/End: Original strand, 20731197 - 20731313
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaat--agaagcctctcgcctgcgtgcttg 211  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||| |||| ||  ||||||||  ||||| |||||||    |||||||    
T  20731197 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttct-tgtaattctgtttgaattaagaagtctctcgcagttgtgcttg 20731295  T
Q  212 agcattagaagactcttg 229  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  20731296 agcattagaagtctcttg 20731313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #138
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 342 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 21624523 - 21624457
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||  | ||||||||||    
T  21624523 tctccttggaagtgcaagggggacaggactgacttccggtttgtggaaggaacttgtataattgctt 21624457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #139
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 257
Target Start/End: Original strand, 22076898 - 22077042
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaat--agaagcctctcgcctgcgtgcttg 211  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||| |||| ||  ||||||||  | ||| |||| ||    |||||||    
T  22076898 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttct-tgtaattctgtttgaattaaaaagtctcttgcagttgtgcttg 22076996  T
Q  212 agcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctct 257  Q
    |||| |||||| |||||||  | ||||||||||||| |||||||||    
T  22076997 agcaatagaagtctcttgcagttgtgcttgagcatttgaagtctct 22077042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #140
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 342 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 12041283 - 12041218
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggataattgct 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| |||| | |||||||||    
T  12041283 tctccttggaagtgcaagggggacatgactgacttccggtttgtggaaggaacctgtataattgct 12041218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #141
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 342 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 15954130 - 15954077
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaacc 394  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  15954130 tctccttggaagtgcaagggggacaggactgacttccggtttgtggaaggaacc 15954077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #142
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 342 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 19482184 - 19482131
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaacc 394  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  19482184 tctccttggaagtgcaagggggacaggactgacttccggtttgtggaaggaacc 19482131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #143
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 328 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 19625254 - 19625198
Alignment:
Q  328 atttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtg 385  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  19625254 atttttagtg-aactctccttggaagtgcaagggggacaggactacttccagtttgtg 19625198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #144
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 342 - 394
Target Start/End: Original strand, 19952287 - 19952340
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaacc 394  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  19952287 tctccttggaagtgcaagggggacaggactgacttccggtttgtggaaggaacc 19952340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #145
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 342 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 21234591 - 21234538
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaacc 394  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  21234591 tctccttggaagtgcaagggggacaggactgacttccggtttgtggaaggaacc 21234538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #146
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 245
Target Start/End: Original strand, 15395178 - 15395310
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgag 213  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||| |||| ||| || ||  |||||| |||| || ||  ||||||||    
T  15395178 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctgtgtaattttgtatgtctagaagtctcttgcttgtctgcttgag 15395277  T
Q  214 ca-ttagaagactcttgctttagtgcttgagca 245  Q
     | || |||| |||||||||| || ||||||||    
T  15395278 tatttggaagtctcttgcttttgtacttgagca 15395310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #147
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 329 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 18434981 - 18434922
Alignment:
Q  329 tttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaag 389  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||    
T  18434981 tttttagtg-aactctccttggaagtgcaagggggacaggagtacttccgatttgtggaag 18434922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #148
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 342 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 25592053 - 25591989
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgct 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||| |||| | |||||||||    
T  25592053 tctccttggaagtgcaagggggacaagactactttcggattgtggaaggaacctgtataattgct 25591989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #149
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 115 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 7763311 - 7763228
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctct 197  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||  ||||| |||| ||  ||||||||||||| ||||    
T  7763311 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatagaagtctct 7763228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #150
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 342 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 10631566 - 10631503
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  10631566 tctccttggaagtgcaagggggacatgactgacttccggtttgtggaaggaacctgtataattg 10631503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #151
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 342 - 389
Target Start/End: Original strand, 15395340 - 15395387
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaag 389  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  15395340 tctccttggaagtgcaagagggacaggactacttccggattgtggaag 15395387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #152
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 115 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 19470324 - 19470241
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctct 197  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||  |||||||| ||||| |||| ||  ||||||||||||| ||||    
T  19470324 ttgtattgtgaacaccactaattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaatagaagtctct 19470241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #153
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 115 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 21034647 - 21034564
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctct 197  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||| |||| ||  ||||||||||||| ||||    
T  21034647 ttgtattgcgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaatagaagtctct 21034564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #154
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 115 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 21234815 - 21234650
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaat--agaagcctctcgcctgcgtgcttg 211  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||| |||| ||   |||||||  ||||| |||||||    |||||||    
T  21234815 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttct-tgtaattctatttgaattaagaagtctctcgcagttgtgcttg 21234717  T
Q  212 agcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattt 278  Q
    |||||||||||  ||||| ||  || |  |||||| |||||||||| |||   ||||||||||||||    
T  21234716 agcattagaagtttcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgccgttgtgcttgagcattt 21234650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #155
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 339 - 417
Target Start/End: Original strand, 24471074 - 24471153
Alignment:
Q  339 aaatctccttggaagtgcaag-ggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtctctct 417  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| |||| |||| ||||| |||||||| || | |||||||    
T  24471074 aaatctccttagaagtgcaagaggggactggactactttcggattgtagaaggaaccatgataattgtttctctctctct 24471153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #156
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 361 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 27720937 - 27720866
Alignment:
Q  361 gggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtctctctgtcttttctctgctc 432  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| |||| || || ||||| ||| ||||||||||||||    
T  27720937 gggactgggctacttccggattgtggaaggaaccagtataactgtttctgtctatctttcttttctctgctc 27720866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #157
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 328 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 7763097 - 7763020
Alignment:
Q  328 atttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggataattgc 405  Q
    |||||||||| || ||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| | ||||||||    
T  7763097 atttttagtg-aactcttcttgaaagtgcaagggggacgggactgacttccggtttgtggaaggaacctgtataattgc 7763020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #158
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 10631760 - 10631615
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaat--agaagcctctcgcctgcgtgcttg 211  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||| |||| ||  ||||||||  ||||| |||| |  || || |  |    
T  10631760 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacatttttctttgtaattctgtttgaattaagaagtctcttgattgtgttcagg 10631661  T
Q  212 agcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctct 257  Q
    |||||  |||| |||||||  | ||||||||||||| |||||||||    
T  10631660 agcatatgaagtctcttgcagttgtgcttgagcatttgaagtctct 10631615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #159
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 342 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 13601598 - 13601532
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  13601598 tctccttggaagtgcaagggggacatgaccgacttccggtttgtggaaggaacctgtataattgctt 13601532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #160
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 19085817 - 19085700
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaat--agaagcctctcgcctgcgtgcttg 211  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||  ||||| |||| ||  ||||||||  ||||| |||| ||    |||||||    
T  19085817 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctttgtaattctgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttg 19085718  T
Q  212 agcattagaagactcttg 229  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  19085717 agcattagaagtctcttg 19085700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #161
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 342 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 26589030 - 26588956
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggat-aattgcttgtgtctc 414  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| |||| | || |||||| ||||||||    
T  26589030 tctccttggaagtgcaagggggacatgactgacttccggtttgtggaaggaacctgtataaattgcctgtgtctc 26588956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #162
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 26589256 - 26589111
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaa--tagaagcctctcgcctgcgtgcttg 211  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||  |||| ||| |||||||  |||||  |||| ||    |||||||    
T  26589256 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttcattgtaattttgtttgaatttagaattctcttgcagttgtgcttg 26589157  T
Q  212 agcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctct 257  Q
    |||| |||||| |||||| ||| || |  |||||| ||||||||||    
T  26589156 agcaatagaagtctcttgattttgttcaggagcataggaagtctct 26589111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #163
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 394
Target Start/End: Original strand, 33352723 - 33352997
Alignment:
Q  118 tattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagt-caaacatatttctctgtattttcgtttgaat--agaagcctctcgcctgcgtgcttgagc 214  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||  ||||| |||| ||  ||||||||  ||||| |||| ||    ||||||||||    
T  33352723 tattgtgaacaccactgattgtatatcgagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaattcagaagtctcttgcagttgtgcttgagc 33352822  T
Q  215 attagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagag-agtattgagcatttg 313  Q
    | |||||| |||||| ||  || |  |||||| |||||||||| ||    ||||||||||||||||  |||||| ||| |||   |||| ||||||||||    
T  33352823 aatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcatttga--agtctcttactaagtttagtagtgagcatttg 33352920  T
Q  314 taatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaacc 394  Q
    ||||| |    ||| |   ||||| || |||||||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  33352921 taatcag----attttacatagtg-aactctccttggaagtgcaagggggatatgactgacttccggtttgtggaaggaacc 33352997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #164
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 338 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 7811444 - 7811387
Alignment:
Q  338 gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaacca 395  Q
    |||||||||||  |||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7811444 gaaatctccttataagtgcaatgaggagtggactacttccggtttgtggaaggaacca 7811387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #165
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 342 - 394
Target Start/End: Original strand, 12716140 - 12716193
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaacc 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  12716140 tctccttggaagtgcaagggggacatgactgacttccggtttgtggaaggaacc 12716193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #166
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 13601825 - 13601752
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaat 187  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||| |||| ||  ||||||||    
T  13601825 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattatgtttgaat 13601752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #167
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 342 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 17381009 - 17380956
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaacc 394  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  17381009 tctcattggaagtgcaagggggacaggactgacttccggtttgtggaaggaacc 17380956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #168
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 342 - 407
Target Start/End: Original strand, 17446367 - 17446431
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||    
T  17446367 tctccttggaagtgcaaggggtg-tggactactttcggattgtggaagaaaccactataattgctt 17446431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #169
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 187
Target Start/End: Original strand, 19066510 - 19066583
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaat 187  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||| |||| ||  ||||||||    
T  19066510 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaat 19066583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #170
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 19482409 - 19482336
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaat 187  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||| |||| ||  ||||||||    
T  19482409 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaat 19482336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #171
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 342 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 21034462 - 21034409
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaacca 395  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||| |||||    
T  21034462 tctccttggaagtgcaagggggagtggactacttctgtattgtggaaggaacca 21034409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #172
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 342 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 21617678 - 21617605
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggat-aattgcttgtgtct 413  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||| || ||||| ||||||||    
T  21617678 tctcctttgaagtgcaagggggacaggactgacttccggtttgtggaatgaaccagtataaattgtttgtgtct 21617605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #173
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 339 - 415
Target Start/End: Original strand, 24481119 - 24481196
Alignment:
Q  339 aaatctccttggaagtgcaagggg-gactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtctct 415  Q
    |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| | ||| |||| |||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  24481119 aaatctccttgggagtggaaggggggactggactacattcggattgtagaaggaaccaggataattgtttgtatctct 24481196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #174
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 346 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 29538039 - 29537978
Alignment:
Q  346 cttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| ||||   ||||||||||    
T  29538039 cttggaagtgcaagggggacatgactacttccggtttatggaaggaacctatataattgctt 29537978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #175
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 29597731 - 29597658
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaat 187  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||| |||| ||  ||||||||    
T  29597731 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaat 29597658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #176
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 16915079 - 16914967
Alignment:
Q  118 tattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgagcat 216  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||  |||||||| ||||| || | ||  ||||||||||||| |||| ||    ||||||||||||    
T  16915079 tattgtgaacacgactaattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgaaattatgtttgaatagaagtctcttgcagttgtgcttgagcat 16914980  T
Q  217 tagaagactcttg 229  Q
     ||||| ||||||    
T  16914979 aagaagtctcttg 16914967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #177
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 17927445 - 17927305
Alignment:
Q  118 tattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgagcat 216  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||| ||| |||||  |||||||||||||| |||| ||  |||| |||||||| |||| ||    ||||||||||||    
T  17927445 tattgtgaacaccactgattgtttatcaagtattcaacctcaaacatatttctttgtaattctgtttaaatagaagtctcttgcagttgtgcttgagcat 17927346  T
Q  217 tagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctct 257  Q
      |||| |||||| ||| |  ||||||||| |||| |||||    
T  17927345 gggaagtctcttgattttgctcttgagcataggaaatctct 17927305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #178
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 215 - 247
Target Start/End: Original strand, 25736012 - 25736044
Alignment:
Q  215 attagaagactcttgctttagtgcttgagcatt 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25736012 attagaagactcttgctttagtgcttgagcatt 25736044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #179
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 363 - 415
Target Start/End: Original strand, 31720295 - 31720347
Alignment:
Q  363 gactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtctct 415  Q
    ||||| ||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  31720295 gactgaactacttccaggttgtggaatgaaccaggataattgcttgtgtctct 31720347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #180
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 32335494 - 32335363
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgag 213  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||  |||||||| ||||| |||| ||  |||||| || ||| |||| || |  |||||||||    
T  32335494 ttgtattgtgaacaccactaattgtatatcaagtgttcaacctcaaacat-tttctttgtaattctgtttgattataagtctcttgcttttgtgcttgag 32335396  T
Q  214 cattagaagactcttgctttagtgcttgagcat 246  Q
    |||  |||| || |||| || ||||||||||||    
T  32335395 cataggaagtctattgcgtttgtgcttgagcat 32335363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #181
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 9717499 - 9717460
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa 154  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  9717499 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 9717460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #182
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 154
Target Start/End: Original strand, 10705025 - 10705064
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa 154  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  10705025 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 10705064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #183
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 342 - 404
Target Start/End: Original strand, 15532342 - 15532405
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||||| |||| | |||||||    
T  15532342 tctccttggaagtgcaagggggacatgactgactttcggtttgtggaaggaacctgtataattg 15532405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #184
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 154
Target Start/End: Original strand, 16265643 - 16265682
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa 154  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  16265643 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 16265682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #185
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 154
Target Start/End: Original strand, 17317016 - 17317055
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa 154  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  17317016 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 17317055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #186
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 197
Target Start/End: Original strand, 18172720 - 18172803
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctct 197  Q
    |||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||||  |||||||||||||| |||| ||  |||||| |||||| ||||    
T  18172720 ttgttttgtgaacaccattgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatatttctgtgtaattctgtttgattagaagtctct 18172803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #187
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 342 - 389
Target Start/End: Original strand, 18172939 - 18172986
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaag 389  Q
    |||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||    
T  18172939 tctccttggaagtgcaagcgggacatgactacttccggattgtggaag 18172986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #188
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 342 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 18226862 - 18226815
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaag 389  Q
    |||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||    
T  18226862 tctccttggaagtgcaagcgggacatgactacttccggattgtggaag 18226815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #189
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 18227081 - 18226998
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctct 197  Q
    |||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||||  |||||||||||||| |||| ||  |||||| |||||| ||||    
T  18227081 ttgttttgtgaacaccattgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatatttctgtgtaattctgtttgattagaagtctct 18226998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #190
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 18435197 - 18435158
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa 154  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  18435197 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 18435158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #191
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 342 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 19470098 - 19470051
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaag 389  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  19470098 tctccttagaagtgctagggggacatgactacttccggtttgtggaag 19470051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #192
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 21617901 - 21617862
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa 154  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  21617901 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 21617862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #193
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 25595833 - 25595774
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgta 174  Q
    ||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  25595833 ttgtattgtgaacatcactgcttgtatatcaagtgttcaaatcaaacatttttctgtgta 25595774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #194
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 342 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 32543697 - 32543634
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    |||||||| || |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  32543697 tctccttgaaaatgcaagggggacaggactgacttccggtttgtggaaggaacctgtataattg 32543634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #195
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 32543921 - 32543882
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa 154  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  32543921 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 32543882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #196
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 342 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 15986785 - 15986719
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| || | | ||||||||||    
T  15986785 tctcctttgaagtgcaagggggacatgactgacttccggtttgtggaaggaaactgtataattgctt 15986719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #197
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 342 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 25593500 - 25593434
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    ||||||||||| |||||||||| | ||||| | |||||||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  25593500 tctccttggaaatgcaaggggggcaggactgatttccggtttgtggaaggaacctgtataattgctt 25593434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #198
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 342 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 26185216 - 26185154
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    |||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||| |||| | |||||||    
T  26185216 tctccttgaaagtgcaagggggacaagactacatccggattgtggaagtaacctgtataattg 26185154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #199
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 342 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 26941867 - 26941801
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || | ||||| ||||||||||||||| | | ||||||||||    
T  26941867 tctccttggaagtgcaagggggacatgattgacttctggtttgtggaagaaatctgtataattgctt 26941801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #200
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 351 - 407
Target Start/End: Original strand, 14732844 - 14732901
Alignment:
Q  351 aagtgcaagggggactggacta-cttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  14732844 aagtgcaagggggacaggactaacttccagtttgtggaaggaacctgtataattgctt 14732901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #201
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 216
Target Start/End: Original strand, 15478274 - 15478374
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgagc 214  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||| | |||||||||  ||||| ||||||| |||| ||| |||||  |||||| |||| || |  ||||||||||    
T  15478274 ttgtattgtgaacaccattgattgtatagcaagtgttcaaaccaaacttatttctttgtaattt-gtttgtttagaagtctcttgcttttgtgcttgagc 15478372  T
Q  215 at 216  Q
    ||    
T  15478373 at 15478374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #202
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 389
Target Start/End: Original strand, 19066738 - 19066783
Alignment:
Q  345 ccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaag 389  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  19066738 ccttggaagtgcaagggggacatgactgacttccggtttgtggaag 19066783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #203
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 383 - 428
Target Start/End: Original strand, 19289957 - 19290002
Alignment:
Q  383 gtggaagaaaccaggataattgcttgtgtctctctgtcttttctct 428  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  19289957 gtggaaggaaccatgataattgcttgtgtctctgtttcttttctct 19290002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #204
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 342 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 23296217 - 23296152
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||  || ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  23296217 tctccttggaagtgctaagggaacaagaatacttccggtttgtggaaggaacctgtataattgctt 23296152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #205
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 251
Target Start/End: Original strand, 24729014 - 24729151
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaag-tcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgag 213  Q
    ||||||| ||||||  | |||||||| ||| |||||||||  |||||||||||||| |||| ||  |||||  |||||| |||| || |  |||||||||    
T  24729014 ttgtattatgaacatcattgattgtacatcaagtgttcaacctcaaacatatttctgtgtaattgtgtttgtttagaagtctcttgcttttgtgcttgag 24729113  T
Q  214 cattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaa 251  Q
    |||  |||||||||||| |  | |||||||||| ||||    
T  24729114 catacgaagactcttgcgtgtgggcttgagcataggaa 24729151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #206
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 342 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 32335273 - 32335208
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||  ||||| |||||| ||||||||| |||| | ||||||||||    
T  32335273 tctccttggaaatgcaaaggggacatgactatttccggattgtggaaggaacctgtataattgctt 32335208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #207
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 118 - 229
Target Start/End: Original strand, 14100933 - 14101045
Alignment:
Q  118 tattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaag-tcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgagcat 216  Q
    ||||||||| || ||||||||||| || ||||| |||  |||||||| ||||| | || ||  ||||||||||||| |||| ||    ||||||||||||    
T  14100933 tattgtgaataccactgattgtatttcaagtgtccaacctcaaacatttttctttataattctgtttgaatagaagtctcttgcagttgtgcttgagcat 14101032  T
Q  217 tagaagactcttg 229  Q
    |||||| ||||||    
T  14101033 tagaagtctcttg 14101045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #208
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 279
Target Start/End: Original strand, 14923703 - 14923867
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgagc 214  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| |  ||||||| ||| | |||| ||| |||||  |||||| |||| || |  |||||| |||    
T  14923703 ttgtattgtgaacaccactgatagtatatcaagtgttcgaaccaaacatctttatgtgtaattttgtttgtttagaagtctcttgcttttgtgcttaagc 14923802  T
Q  215 attagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttg 279  Q
    ||  |||  || ||||||  ||||||||  ||| |||||||||  | || ||| |||||||||||    
T  14923803 ataggaaatctattgcttgtgtgcttgaatatttgaagtctctttcttgtgtgattgagcatttg 14923867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #209
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 342 - 413
Target Start/End: Original strand, 14923893 - 14923964
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaaggg-ggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtct 413  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| ||||||||| |||  | ||||||| ||||||||    
T  14923893 tctccttggaagtgcaagggaggaatg-actacttccggattgtggaaggaacatgtataattgtttgtgtct 14923964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #210
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 338 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 22801576 - 22801524
Alignment:
Q  338 gaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaag 389  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||  |||| |||||| |||||||||||    
T  22801576 gaaatctccttggaaatgcaagggggacatgactgacttccagtttgtggaag 22801524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #211
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 342 - 389
Target Start/End: Original strand, 24729236 - 24729284
Alignment:
Q  342 tctccttggaa-gtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaag 389  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  24729236 tctccttggaaagtgcaagggggacaagactacttccggattgtggaag 24729284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 291; Significance: 1e-163; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 33 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 40426 - 40030
Alignment:
Q  33 aatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtctttattacattgtattgtgaacactac 132  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  40426 aatttgattctaaaaagcactttgaatttctgcactgatttgatacatattagaaattcttaagtctagagtctttattgcattgtattgtaaacaccac 40327  T
Q  133 tgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgct 231  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  40326 tgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacat-tttctctgtatttttgtttgaatagaagcctcttgcctgtgtgcttgagcattagaagactcttgct 40228  T
Q  232 ttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagagagtattgagcatttgtaatctgtgtgattattt 331  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  40227 ttagtgcttgagtattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcatacttagagagtattgagcatttgtaatctgtgtgatta--- 40131  T
Q  332 ttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtctctctgtcttttctctgct 431  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40130 ttagtgaaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaaccaggataattgcttgtgtctctctttcttttctctgct 40031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154 (Bit Score: 289; Significance: 1e-162; HSPs: 1)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 35483 - 35064
Alignment:
Q  13 aaaagcgtcaaaactctgtcaa-tttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtctttatt 111  Q
    |||||||  ||||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  35483 aaaagcgctaaaactctgccaaatttgattctaaaaagcactttgaatttctgcactgatttgatatatcttagaaattcttaagtctagagtctttatt 35384  T
Q  112 acattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttg 211  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||   ||||| |||| ||  |||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  35383 gcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtctaactattttctgtgtaattctgtttgattagaagtctctcgcctgcgtgcttg 35284  T
Q  212 agcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagagagtattgagcatt 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||    
T  35283 agcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcata-ctagagagtattgaacatt 35185  T
Q  312 tgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgt 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  35184 tgtaatctgtgtgattatttttagtagaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttctggtttgtggaaggaaccaggataattgcttgtgt 35085  T
Q  412 ctctctgtcttttctctgctc 432  Q
    |||||| ||||||||||||||    
T  35084 ctctctttcttttctctgctc 35064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 285; Significance: 1e-159; HSPs: 4)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 57093 - 57511
Alignment:
Q  13 aaaagcgtcaaaactctgtcaa-tttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtctttatt 111  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | | |||||||||||||||||    
T  57093 aaaagcgccaaaactctgtcaaatttgattctaaaaagcactttgaatttctgcactgatttgatacatcttagaattactcaagtctagagtctttatt 57192  T
Q  112 acattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgctt 210  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  57193 gcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacat-tttctgtgtatttttgttttaatagaagcctctcgcctgcgtgctt 57291  T
Q  211 gagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca-tttgagaagtctcataccaagagagtattgagca 309  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||||    
T  57292 gtgcattagaagactcttgcattagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattttgagaagtatcatacttagagagtattgagca 57391  T
Q  310 tttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgt 409  Q
    |||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  57392 tttgtaatctgtgtgatta---ttagtgaaaatctccttggaagtgcaagggggactagactacttccggtttgtggaaggaaccaggataattgcttgt 57488  T
Q  410 gtctctctgtcttttctctgctc 432  Q
    |||||||| ||||||||||||||    
T  57489 gtctctctttcttttctctgctc 57511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 70 - 428
Target Start/End: Original strand, 790 - 1155
Alignment:
Q  70 atttgatacatcttagaaattcactagtctagag--tcttt--attacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaag-tcaaacata 164  Q
    |||| ||| |||||||||||||   |||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||      
T  790 atttcatatatcttagaaattcttaagtctagagattctttcaattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaat 889  T
Q  165 tttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgc 264  Q
    ||||| |||| ||  ||||||||||||| ||||    |  ||||||||||||  |||| |||||||||  |||||||||||  |||||||||| | |||     
T  890 tttctgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttaatttagtgcttgagcataggaagtctcttgcttgtgtgcttgagcaaaggaagtctcttgtctgt 989  T
Q  265 gtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagag-agtattgagcatttgtaatctg-tgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggg 362  Q
    ||||||||| | ||  |||||||||||| | | | ||||||||||| |||||||| | ||||||||   |||||| || |||||||||||||||||||||    
T  990 gtgcttgagtaatt-tgaagtctcatactaggtgtagtattgagcagttgtaatcagttgtgattaaacttagtgaaactctccttggaagtgcaagggg 1088  T
Q  363 gactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtctctctgtcttttctct 428  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||||| ||| |||| |||||    
T  1089 gacaggactgacttccggtttgtggaaggaacctgtataattgcctgtgtctttctttcttctctct 1155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 342 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 32018 - 31952
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  32018 tctccttggaagtgcaagggggacaggactgacttccggtttgtggaaggaacctgtataattgctt 31952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 342 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 48764 - 48698
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  48764 tctccttggaagtgcaagggggacatgactgacttccggtttgtggaaggaacctgtataattgctt 48698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0407 (Bit Score: 277; Significance: 1e-155; HSPs: 1)
Name: scaffold0407
Description:

Target: scaffold0407; HSP #1
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 13 - 432
Target Start/End: Original strand, 12427 - 12845
Alignment:
Q  13 aaaagcgtcaaaactctgtcaa-tttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtctttatt 111  Q
    ||||||| |||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||    
T  12427 aaaagcgccaaaactctgccaaatttgattctaaaaagcacattgaatttctgcactgatttgatacatctcagaaattcttaagtctagagtctttatt 12526  T
Q  112 acattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgctt 210  Q
     ||||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12527 gcattgtattgtgaacaccactgatagaatatcaagtgttcaaagtcaaacat-tttctctgtatttttgtttgaatagaagcctcttgcctgcgtgctt 12625  T
Q  211 gagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca-tttgagaagtctcataccaagagagtattgagca 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  12626 gagcattagaagactcttgctttagtccttgagcattggaagactcttgcctgcgtgcttgagcattttgagaagtctcatacttagagagtattgagca 12725  T
Q  310 tttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgt 409  Q
    |||||||||| ||||   ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12726 tttgtaatctttgtg---attcttagtgaaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaaccaggataattgcttgt 12822  T
Q  410 gtctctctgtcttttctctgctc 432  Q
    |||||||| ||||||||||||||    
T  12823 gtctctctttcttttctctgctc 12845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0497 (Bit Score: 273; Significance: 1e-152; HSPs: 1)
Name: scaffold0497
Description:

Target: scaffold0497; HSP #1
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 13 - 409
Target Start/End: Original strand, 10598 - 10992
Alignment:
Q  13 aaaagcgtcaaaactctgtcaa-tttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtctttatt 111  Q
    ||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||  ||||||    
T  10598 aaaagcgccaaaactctgccaaatttgattctacaaagcactttgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattctcaagtctagagaatttatt 10697  T
Q  112 acattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgctt 210  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10698 gcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaatgtcaaacat-tttctgtgtatttttatttgaatagaagcctctcgcctgcgtgctt 10796  T
Q  211 gagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagagagtattgagcat 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10797 gagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcacctgcgtgcttgagcatctgagaagtctcatactaagagagtattgagcat 10896  T
Q  311 ttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgt 409  Q
    ||||||||| || |||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  10897 ttgtaatctttgagatta---ttagtgaaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaaccaggataattgattgt 10992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 268; Significance: 1e-149; HSPs: 4)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 55 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 16508 - 16130
Alignment:
Q  55 tgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa 154  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||   |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  16508 tgaatttctgcactgatttgatatatcttagaaattcttaagtcgagagtctttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 16409  T
Q  155 -gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaata-gaagcctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaag 252  Q
     ||||||||| ||||| |||| ||  |||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16408 agtcaaacat-tttctgtgtaattctgtttgattaagaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaag 16310  T
Q  253 tctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagagagtattgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaa 352  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16309 tctctcgcctgcgcgcttgagcatttgagaagtctcatactaagagagtattgagcatttgtaatctgtgtgattatctttagtggaaatctccttggaa 16210  T
Q  353 gtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtctctctgtcttttctctgctc 432  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16209 gtgcaagggggactagactagttccggtttgtggaaggaaccaggataattgcttgtgtctctctttcttttctctgctc 16130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 13 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 127592 - 127175
Alignment:
Q  13 aaaagcgtcaaaactctg-tcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtctttatt 111  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||  |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  127592 aaaagcgtcaaaactctgctaaatttgattctcaaaagcactctgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcttaagtctagagtctttatt 127493  T
Q  112 acattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaag-tcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgctt 210  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||| | |||| ||| |||||| | |||| |||| ||||||||||||    
T  127492 gcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacat-tttatgtgtaattttgtttgattggaagtctcttgcctgcgtgctt 127394  T
Q  211 gagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagag-agtattgagca 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | | | |||||||||||    
T  127393 gagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgtgtgcttgagcatttgagaagtctcatactaggtgtagtattgagca 127294  T
Q  310 tttgtaatctgtgtgattattt-ttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttg 408  Q
     |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  127293 gttgtaatctgtg-gattatttcttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaaccaggataattgctcg 127195  T
Q  409 tgtctctctgtcttttctct 428  Q
    ||||||||| |||| |||||    
T  127194 tgtctctctttcttctctct 127175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #3
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 13 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 140750 - 140608
Alignment:
Q  13 aaaagcgtcaaaactctg-tcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtctttatt 111  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||  |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  140750 aaaagcgtcaaaactctgctaaatttgattctcaaaagcactctgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcttaagtctagagtctttatt 140651  T
Q  112 acattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa 154  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  140650 gcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 140608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #4
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 68 - 154
Target Start/End: Original strand, 8019 - 8107
Alignment:
Q  68 tgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtcttta--ttacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa 154  Q
    |||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||   || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  8019 tgatttgatatatcttagaaattcttaagtctagagtctttcacttgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 8107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0410 (Bit Score: 266; Significance: 1e-148; HSPs: 1)
Name: scaffold0410
Description:

Target: scaffold0410; HSP #1
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 13 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 15674 - 15259
Alignment:
Q  13 aaaagcgtcaaaactctg-tcaatttgattct-acaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtctttat 110  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| |||| | ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||| |    
T  15674 aaaagcgtcaaaactctgctaaatttgtttctcaaaaagcactttgaatttctgcactgatttgatatatcttagaaattcttaagtctagagtctttgt 15575  T
Q  111 tacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgct 209  Q
    | |||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| |||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  15574 tgcattatattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacat-tttctgtgtaattttgtttgatcagaagcctctcgcctgcgtgct 15476  T
Q  210 tgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagagagtattgagca 309  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15475 tgaccattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttcagcatttgagaagtctcatactaagagagtattgagca 15376  T
Q  310 tttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgt 409  Q
    | |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  15375 tctgtaatctgtgtgatta---ttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaaccagaataattgcttgt 15279  T
Q  410 gtctctctgtcttttctctg 429  Q
    |||| ||| |||||||||||    
T  15278 gtctttctttcttttctctg 15259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 259; Significance: 1e-144; HSPs: 1)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 5 - 413
Target Start/End: Original strand, 37037 - 37441
Alignment:
Q  5 acaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagt 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  37037 acaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatatatcttagaaattcaaaagtctagagt 37136  T
Q  105 ctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgc 204  Q
    |||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||  ||||| |||| ||||||    
T  37137 ctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttatttctttgtatttttgtttgatcagaagactcttgcctgc 37236  T
Q  205 gtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||    
T  37237 gtgcttgagcattagaagactcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcatacttagagagta 37335  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||     
T  37336 ttgagcatttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgttttgtggaaggaaccaggataac 37430  T
Q  403 tgcttgtgtct 413  Q
    |||||||||||    
T  37431 tgcttgtgtct 37441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0739 (Bit Score: 255; Significance: 1e-142; HSPs: 1)
Name: scaffold0739
Description:

Target: scaffold0739; HSP #1
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 13 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 1939 - 1551
Alignment:
Q  13 aaaagcgtcaaaactctgtcaa-tttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtctttatt 111  Q
    |||||||  ||||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  1939 aaaagcgctaaaactctgccaaatttgattctaaaaagcactttgaatttctgcacggatttgatatatcttagaaattcttaagtctagagtctttatt 1840  T
Q  112 acattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttg 211  Q
     ||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||  ||||| |||| ||  |||||| |||||| |||| |||||||||||||    
T  1839 gcattgtattgtgaacaccattgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacaattttctgtgtaattctgtttgattagaagtctcttgcctgcgtgcttg 1740  T
Q  212 agcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagagagtattgagcatt 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||    
T  1739 agcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcata-ctagtgagtattgagcatt 1641  T
Q  312 tgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1640 tgtaatctgtgtgatta---ttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaaccaggataattg 1551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 251; Significance: 1e-139; HSPs: 5)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 3 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 14538 - 14111
Alignment:
Q  3 atacaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctaga 102  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  14538 atacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaagttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaaaagtctaga 14439  T
Q  103 gtctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcct 202  Q
    ||||| |||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| || |||  |||||||| ||||||  |||||||||| ||||    
T  14438 gtcttaattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttaattcattgtatttttgtttgatcagaagcctcttgcct 14339  T
Q  203 gcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagag 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||    
T  14338 gcgtgcttgagcattagaagactcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcatacttagagag 14240  T
Q  301 tattgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggata 400  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  14239 tattgagcatttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaaccaggata 14145  T
Q  401 attgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    | ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  14144 actgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 14111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 3 - 432
Target Start/End: Original strand, 54424 - 54851
Alignment:
Q  3 atacaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctaga 102  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  54424 atacaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgatactacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaaaagtctaga 54523  T
Q  103 gtctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcct 202  Q
    ||||| |||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  || |||  |||||||| ||||||  |||||||||| ||||    
T  54524 gtcttaattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaagttaattcattgtatttttgtttgatcagaagcctcttgcct 54623  T
Q  203 gcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagag 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||    
T  54624 gcgtgcttgagcattagaagactcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcatacttagagag 54722  T
Q  301 tattgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggata 400  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  54723 tattgagcatttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaaccaggata 54817  T
Q  401 attgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    | ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  54818 actgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 54851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 328 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 80840 - 80765
Alignment:
Q  328 atttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    |||||||||| || ||||||||||||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  80840 atttttagtg-aactctccttggaagtacaatgaggacaggactacttccggtttgtggaaggaacctgtataattg 80765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 81054 - 81015
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa 154  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  81054 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 81015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 342 - 389
Target Start/End: Original strand, 24455 - 24503
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaag 389  Q
    |||| |||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  24455 tctcattggaagtgcaagggggacatgactgacttccggtttgtggaag 24503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391 (Bit Score: 245; Significance: 1e-136; HSPs: 1)
Name: scaffold0391
Description:

Target: scaffold0391; HSP #1
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 5 - 431
Target Start/End: Original strand, 2521 - 2946
Alignment:
Q  5 acaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagt 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  2521 acaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaaaagtctagagt 2620  T
Q  105 ctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgc 204  Q
    |||||    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||  |||||||||| || |||    
T  2621 ctttaacgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacatatttcattgtatttttgtttgatcagaagcctcttgcttgc 2720  T
Q  205 gtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||    
T  2721 gtgcttgagcattagaagactcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgagaagtctcatacttagagagta 2819  T
Q  303 ttgagca-tttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataa 401  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  2820 ttgagcattttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataa 2914  T
Q  402 ttgcttgtgtctct--ctgtcttttctctgct 431  Q
     ||||||||||| |  || |||||||||||||    
T  2915 ctgcttgtgtctttgcctttcttttctctgct 2946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0163 (Bit Score: 241; Significance: 1e-133; HSPs: 2)
Name: scaffold0163
Description:

Target: scaffold0163; HSP #1
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 3 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 29428 - 29003
Alignment:
Q  3 atacaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaa-tttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctag 101  Q
    ||||||||||||| | | |||||||||| ||| |||||||||  |||||||  |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||   |||||||    
T  29428 atacaagttaaaa-gtgccaaaactctgccaaatttgattctcaaaagcactctgaatttctgcgctgatttgatatatcttagaaattcttaagtctag 29330  T
Q  102 agtcttt-attacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgc 200  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||||||||  ||||| |||| ||  |||||| |||||| |||||||    
T  29329 agtctttcattgcattgtattgtgaacacacttgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacaattttctgtgtaattctgtttgattagaagtctctcgc 29230  T
Q  201 ctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagagag 300  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||  |    
T  29229 ctgcgtgcctaagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctctcctgcgtgcttgagcatttgggaagtctcata-ctaga-tg 29132  T
Q  301 tattgagcatttgtaatctgtgtgattattt-ttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggat 399  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29131 tattgagcagttgtaatctgtgtgattatttcttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaaccaggat 29032  T
Q  400 aattgcttgtgtctctctgtcttttctct 428  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29031 aattgcttgtgtctctctttcttttctct 29003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0163; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 328 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 25904 - 25826
Alignment:
Q  328 atttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  25904 atttttagtg-aactctccttggaagtgcaagggg-acaggactgacttccggtttgtggaaggaacctgtataattgctt 25826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 239; Significance: 1e-132; HSPs: 2)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 3 - 414
Target Start/End: Original strand, 10902 - 11314
Alignment:
Q  3 atacaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctaga 102  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  10902 atacaagttaaaaagtgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaaaagtctaga 11001  T
Q  103 gtctt-----tattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctct 197  Q
    |||||     ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||  ||||| ||||    
T  11002 gtctttattgtattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacatatttcattgtatttttgtttgatcagaagactct 11101  T
Q  198 cgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaa 295  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||| ||||||  |||||||||||||||||  |    
T  11102 tgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcatgagcatttttgagaagtctcatactta 11200  T
Q  296 gagagtattgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaacca 395  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  11201 aagagtattgagcatttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaacca 11295  T
Q  396 ggataattgcttgtgtctc 414  Q
    |||||| ||||||||||||    
T  11296 ggataactgcttgtgtctc 11314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068; HSP #2
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 3 - 414
Target Start/End: Original strand, 8055 - 8474
Alignment:
Q  3 atacaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctaga 102  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  8055 atacaagttaaaaagtgccaaaactctgtcaatttgattatacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaaaagtctaga 8154  T
Q  103 gtctt-----tattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctct 197  Q
    |||||     ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||  ||||| ||||    
T  8155 gtctttattgtattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacatatttcattgtatttttgtttgatcagaagactct 8254  T
Q  198 cgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaa 295  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||| ||||||  |||||||||||||||||  |    
T  8255 tgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcatgagcatttttgagaagtctcatactta 8353  T
Q  296 gagagt-------attgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaa 388  Q
     |||||       |||||||||||||||||| ||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8354 aagagtattgagcattgagcatttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaa 8448  T
Q  389 gaaaccaggataattgcttgtgtctc 414  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||    
T  8449 ggaaccaggataactgcttgtgtctc 8474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 239; Significance: 1e-132; HSPs: 2)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 5 - 413
Target Start/End: Original strand, 33205 - 33609
Alignment:
Q  5 acaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagt 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| || |||    
T  33205 acaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaaaagtttatagt 33304  T
Q  105 ctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgc 204  Q
    |||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||  ||||| |||| |||||     
T  33305 ctttattgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttatttctttgtatttttgtttgatcagaagactctagcctgt 33404  T
Q  205 gtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||| || |  |||||||||||||||||  ||||||||    
T  33405 gtgcttgagcattagaagactcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttaagtatttttgagaagtctcatacttagagagta 33503  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||     
T  33504 ttgagcatttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagagggactggactacttccgttttgtggaaggaaccaggataaa 33598  T
Q  403 tgcttgtgtct 413  Q
    |||||||||||    
T  33599 tgcttgtgtct 33609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047; HSP #2
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Original strand, 40759 - 41181
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  40759 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 40857  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  40858 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 40957  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagtatt 304  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||  ||| ||||||    
T  40958 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatacttagaaagtatt 41056  T
Q  305 gagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
     |||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||    
T  41057 aagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactg 41151  T
Q  405 cttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  41152 cttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 41181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 235; Significance: 1e-130; HSPs: 1)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 5 - 413
Target Start/End: Original strand, 7188 - 7591
Alignment:
Q  5 acaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagt 104  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  7188 acaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattca-aagtctagagt 7286  T
Q  105 ctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgc 204  Q
    |||||||   |||||||| |||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||  ||||| |||| ||||||    
T  7287 ctttattgttttgtattgagaacaccactaattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttaattctctgtatttttgtttgatcagaagtctcttgcctgc 7386  T
Q  205 gtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| |||||||| |||  ||| ||||    
T  7387 gtgcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcttacttagaaagta 7485  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  7486 ttgagcatttgtaatctttgtgatta----tagt-caaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaaccaggataat 7580  T
Q  403 tgcttgtgtct 413  Q
    |||||||||||    
T  7581 tgcttgtgtct 7591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0386 (Bit Score: 223; Significance: 1e-122; HSPs: 1)
Name: scaffold0386
Description:

Target: scaffold0386; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 12307 - 11885
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  12307 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 12209  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  12208 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 12109  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagtatt 304  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||  ||| ||||||    
T  12108 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatacttagaaagtatt 12010  T
Q  305 gagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||    
T  12009 gagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactg 11915  T
Q  405 cttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  11914 cttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 11885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0105 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 2)
Name: scaffold0105
Description:

Target: scaffold0105; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 7911 - 7487
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  7911 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 7813  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||    
T  7812 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctctcgcctgcgt 7713  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    ||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||  ||| ||||    
T  7712 gcttgagcaatagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaagtctcatacttagaaagta 7614  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  7613 ttgagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 7519  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  7518 tgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 7487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0105; HSP #2
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Original strand, 37264 - 37688
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  37264 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 37362  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||    
T  37363 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctctcgcctgcgt 37462  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    ||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||  ||| ||||    
T  37463 gcttgagcaatagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatagttttgtgaagtctcatacttagaaagta 37561  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  37562 ttgagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 37656  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  37657 tgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 37688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 2)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 31082 - 30658
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  31082 aagtttaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 30984  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||  |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||    
T  30983 tttctgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaattcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtctcttgcctgcgt 30884  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca----tttgagaagtctcataccaagagagta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    |||| ||||||||||||   || ||||    
T  30883 gcttgagcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcattgttttgtgaagtctcatactttgaaagta 30785  T
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||     
T  30784 ttgagcagttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataac 30690  T
Q  403 tgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  30689 tgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 30658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133; HSP #2
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 5 - 413
Target Start/End: Original strand, 42823 - 43232
Alignment:
Q  5 acaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagt 104  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  42823 acaagttaaaaagcgccgaaactctgtcaatttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaaaagtctagagt 42922  T
Q  105 ctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgc 204  Q
    |||||    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||  |||||||||| ||||||    
T  42923 ctttaacgtattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacttatttcttggtatttttgtttgatcagaagcctctggcctgc 43022  T
Q  205 gtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca------tttgagaagtctcataccaagag 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||      |||  ||||||||||||  ||||    
T  43023 gtgcttgagcattagaagactcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttttttttgaagtctcatacttagag 43121  T
Q  299 agtattgagc-atttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccagg 397  Q
    |||||| |||  |||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |    
T  43122 agtattaagcgttttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttgaaagtgcaagggggactggactacttccgttttgtggaaggaaccaag 43216  T
Q  398 ataattgcttgtgtct 413  Q
    |||| |||||||||||    
T  43217 ataactgcttgtgtct 43232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0027 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 1)
Name: scaffold0027
Description:

Target: scaffold0027; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 7 - 432
Target Start/End: Original strand, 7148 - 7570
Alignment:
Q  7 aagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct 106  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  7148 aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgatactacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtct 7246  T
Q  107 ttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgt 206  Q
    ||| |  |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||| ||||||  ||| ||||||||    
T  7247 ttactgtattgtattgtgaacatcactgattgtatatcaagtgttcaactcaaactcaattctctgtatttttgtttgattagaagtttcttgcctgcgt 7346  T
Q  207 gcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagtatt 304  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||  ||| ||||||    
T  7347 gcttgatcattagaagtctcttgc-ttagtgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatacttagacagtatt 7445  T
Q  305 gagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    ||||||||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||    
T  7446 gagcatttgtaatctttgtgatta----tagt-gaaatctccttgaaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactg 7540  T
Q  405 cttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    ||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  7541 cttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 7570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0747
Description:

Target: scaffold0747; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 36 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 2611 - 2218
Alignment:
Q  36 ttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtctttattacattgtattgtgaacactactga 135  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  2611 ttgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattcaa-agtctagagtctttattgtattgtattgtgaacaccactga 2513  T
Q  136 ttgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttag 235  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||  ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||    
T  2512 ttgtatatcaagtgttcaagtcaaactcaattctctgtatttttgtttgatcagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattagaagtctcttgc-atag 2414  T
Q  236 tgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca--tttgagaagtctcataccaagagagtattgagcatttgtaatctgtgtgattattttt 333  Q
    ||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||| ||||||||||||   || |||||||||||||||||||||  |||||||    |    
T  2413 tgcttgagcattggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcatttttgtgaagtctcatactttgaaagtattgagcatttgtaatcttggtgatta----t 2318  T
Q  334 agtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgct 431  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||| |||| ||||||||||  | ||| |||||||||||||    
T  2317 agt-gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtgcaaggaaccagaataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgct 2219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0185 (Bit Score: 175; Significance: 5e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0185
Description:

Target: scaffold0185; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 68 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 32700 - 32335
Alignment:
Q  68 tgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtcttta--ttacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaag-tcaaacata 164  Q
    |||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||   || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||      
T  32700 tgatttgatatatcttagaaattcttaagtctagagtctttcatttgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaat 32601  T
Q  165 tttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgc 264  Q
    ||||| |||| ||  |||||| |||||| |||| || |  ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  32600 tttctgtgtaattctgtttgattagaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgcctgc 32501  T
Q  265 gtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagag-agtattgagcatttgtaatctgtgtgattattt-ttagtggaaatctccttggaagtgcaagggg 362  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | | | ||||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32500 gtgcttgagcatttgtgaagtctcatactaggtgtagtattgagcagttgtaaattgtgtgattatttcttagtggaaatctccttggaagtgccagggg 32401  T
Q  363 gactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtctctctgtcttttctct 428  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32400 gactgaactacttccggtttgtggaaggaaccaatataattgcttgtgtctctctttcttttctct 32335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 174; Significance: 2e-93; HSPs: 4)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 68 - 428
Target Start/End: Original strand, 59260 - 59623
Alignment:
Q  68 tgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtcttt--attacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaag-tcaaacata 164  Q
    |||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||||  |||||||      
T  59260 tgatttgatatatcttagaaattcttaagtctagagtctttcaattgcattgtattgtaaacatcactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaat 59359  T
Q  165 tttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgc 264  Q
    ||| | |||| ||  ||||||||||||| |||| || |  ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  59360 tttatgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgc 59459  T
Q  265 gtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagagagtattgagcatttgtaatctgtgtgattattt-ttagtggaaatctccttggaagtgcaaggggg 363  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  59460 gtgcttgagcatttgtgaagtctcatactaggt-agtattgagcatttgtaatctgtgtgattatttcttagtggaaatctccttggaagtgcaagggag 59558  T
Q  364 actggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtctctctgtcttttctct 428  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  59559 actggactacttctggtttgtggaaggaaccagtataattgtttgtgtctctctttcttctctct 59623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 46 - 425
Target Start/End: Original strand, 40692 - 41076
Alignment:
Q  46 aaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtcttt--attacattgtattgtgaacactactgattgtatat 143  Q
    ||||||| ||||||||| |   |||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||  ||| |||||||||||||| || |||||| ||||||    
T  40692 aaagcactttgaatttctgtgttgatttgatatatcttagaaattcttaagtctagagtctttcaattgcattgtattgtgaaaaccactgatagtatat 40791  T
Q  144 ctagtgttcaag-tcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttga 242  Q
    | |||||||||  |||||||  ||||| |||| ||  |||||| |||||| |||| || |  ||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||    
T  40792 caagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgattagaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgctttattgcttga 40891  T
Q  243 gcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagag-agtattgagcatttgtaatctgtgtgattattt-ttagtggaa 340  Q
    |||  |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||| | | | | ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  40892 gcaaaggaagtctcttgcctacgtgcttgagcatttgtgaagtctcatactaggtgtaatattgagcagttgtaatctgtgtgattatttcttagtggaa 40991  T
Q  341 atctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtctctctgtcttttc 425  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  40992 atctccttggaagtgcaagggggactagactacttccggtttgtggaaggaaccagtataattgcttgtgtctctctttcttttc 41076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #3
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 13 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 175270 - 175062
Alignment:
Q  13 aaaagcgtcaaaactctgtcaa-tttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtctttatt 111  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  175270 aaaagcgccaaaactctgtcaaatttgattctacaaagcaccttgaatgtctgcactgatttgatacatcttagaaattcacaagtctagagtctttatt 175171  T
Q  112 acattgtattgtgaacactactg---attgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgc 208  Q
     ||||||||||||||||  ||||   |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  175170 gcattgtattgtgaacatcactgattattgtatatcaagtgttcaagtcaaacatttttctctgtatttttgtttgaatagaagcctcttgcctacgtgc 175071  T
Q  209 ttgagcatt 217  Q
    |||||||||    
T  175070 ttgagcatt 175062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #4
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 249 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 175090 - 174909
Alignment:
Q  249 gaagtctctcgcctgcgtgcttgagcattt-gagaagtctcataccaagagagtattgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctcct 347  Q
    |||| |||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||    
T  175090 gaagcctcttgcctacgtgcttgagcattttgagaagtctcatacttagagagtattgagcatttgtaatctgtgtgatt---tttagtgaaaatctcct 174994  T
Q  348 tggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtctctctgtcttttctctgctc 432  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  174993 tggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaaccaggataattgcttgtgtctctctttctttcctctgctc 174909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0738 (Bit Score: 170; Significance: 4e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0738
Description:

Target: scaffold0738; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 224 - 432
Target Start/End: Original strand, 5323 - 5531
Alignment:
Q  224 ctcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagagagtattgagcatttgtaatctgtgt 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||    
T  5323 ctcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagaatttgggaagtctcatacta-gagagtattgagcagttgtaatctgtgt 5421  T
Q  324 gattattt-ttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtctctctgtctt 422  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5422 gattatttcttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaaccaggataattgcttgtgtctctctttctt 5521  T
Q  423 ttctctgctc 432  Q
    ||||||||||    
T  5522 ttctctgctc 5531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0544 (Bit Score: 163; Significance: 7e-87; HSPs: 2)
Name: scaffold0544
Description:

Target: scaffold0544; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 215 - 428
Target Start/End: Original strand, 10275 - 10488
Alignment:
Q  215 attagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagagagtattgagcatttgt 314  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||| ||||    
T  10275 attagaagtctcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgggaagtctcatacta-gatagtattgagcagttgt 10373  T
Q  315 aatctgtgtgattatttt-tagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtct 413  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  10374 aatctgtgtgattatttcatagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaaccaggataattgtttgtgtct 10473  T
Q  414 ctctgtcttttctct 428  Q
    |||| ||||||||||    
T  10474 ctctttcttttctct 10488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0544; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 46 - 247
Target Start/End: Original strand, 10135 - 10337
Alignment:
Q  46 aaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtcttt-attacattgtattgtgaacactactgattgtatatc 144  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10135 aaagcactttgaatttctgcactgatttgatatatcttagaaattcctaagtctagagtcttttattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatc 10234  T
Q  145 tagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagc 244  Q
     |||||||||||||||||  ||||| |||| ||  |||||| |||||| |||| || |  ||||||||||||| |||| |||| || |  ||||||||||    
T  10235 aagtgttcaagtcaaacaattttctgtgtaattctgtttgattagaagtctcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagc 10334  T
Q  245 att 247  Q
    |||    
T  10335 att 10337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 161; Significance: 1e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 70 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 61441 - 61075
Alignment:
Q  70 atttgatacatcttagaaattcactagtctagag--tcttt--attacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaag-tcaaacata 164  Q
    |||||||| |||||||||||||   |||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||  |||||||      
T  61441 atttgatatatcttagaaattcttaagtctagagagtctttcaattgcattgtattgtgaacaccactaattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaat 61342  T
Q  165 tttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgcttta-gtgcttgagcattggaagtctctcgcctg 263  Q
    ||||| |||| ||  ||||||||||||| |||| || |  ||||||||||||  |||| ||||||||||  |||||||||||  |||||||||| |||||    
T  61341 tttctgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgctttttgtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctg 61242  T
Q  264 cgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagag-agtattgagcatttgtaatctgtgtgattattt-ttagtggaaatctccttggaagtgcaaggg 361  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| | | | ||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  61241 cgtgcttgagcatttgcgaagtctcatactaggtgtagtattgagcagttataatctgtgtgattattacttagtggaaatctccttggaagtgcaaggg 61142  T
Q  362 ggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtctctctgtcttttctct 428  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  61141 ggactggactacttccggtttgtggaaggaaccagtataattgcttgtgtctctctttcttctctct 61075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0570 (Bit Score: 159; Significance: 2e-84; HSPs: 2)
Name: scaffold0570
Description:

Target: scaffold0570; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 212 - 428
Target Start/End: Original strand, 1 - 214
Alignment:
Q  212 agcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagagagtattgagcatt 311  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| ||||    
T  1 agcattagaagactcttgttttagtgcttgagcattggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcatttgtgaagtctcatacttagagagtattgaacatt 100  T
Q  312 tgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgt 411  Q
    ||||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  101 tgtaatctgtgagatta---ttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaagaaccaggataattgcttgtgt 197  T
Q  412 ctctctgtcttttctct 428  Q
    |||||| |||| |||||    
T  198 ctctctttcttctctct 214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0570; HSP #2
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 70 - 428
Target Start/End: Original strand, 2076 - 2439
Alignment:
Q  70 atttgatacatcttagaaattcactagtctagag--tcttt--attacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaag-tcaaacata 164  Q
    |||||||| |||||||||||||   |||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||      
T  2076 atttgatatatcttagaaattcttaagtctagagagtctttcaattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaat 2175  T
Q  165 tttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgc 264  Q
    ||| | |||| ||   |||||||||||| |||| || |  |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| || |||    
T  2176 tttatgtgtaattctatttgaatagaagtctcttgctttagtgcttgagcat-agaagcctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgcatgc 2274  T
Q  265 gtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagag-agtattgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaaggggg 363  Q
     |||||||||||||| |||||||||||| | | | ||||||||||| |||||||| |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  2275 atgcttgagcatttgtgaagtctcatactaggtgtagtattgagcagttgtaatcagtgtgattaaacttagtggaaatctccttggaagtgcaagggag 2374  T
Q  364 actggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtctctctgtcttttctct 428  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  2375 actggactacttccgatttgtggaaggaaccagtataattgtttgtgtctctctttcttctctct 2439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 159; Significance: 2e-84; HSPs: 5)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 70 - 428
Target Start/End: Original strand, 475654 - 476018
Alignment:
Q  70 atttgatacatcttagaaattcactagtctagag--tcttt--attacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaag-tcaaacata 164  Q
    |||||||| |||||||||||||   |||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||      
T  475654 atttgatatatcttagaaattcttaagtctagagagtctttcaattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaat 475753  T
Q  165 tttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgc 264  Q
    ||||| |||| ||   |||||||||||| |||| || |  ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||    
T  475754 tttctgtgtaattctttttgaatagaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgtctgc 475853  T
Q  265 gtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagag-agtattgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaaggggg 363  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | | | ||||||||||| ||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  475854 gtgcttgagcatttgtgaagtctcatactaggtgtagtattgagcagttgtaatatgtgtgattaaacttagtggaaatctccttggaagtgcaaggggg 475953  T
Q  364 actggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtctctctgtcttttctct 428  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||    
T  475954 actggactacttccagtttgtggaaggaaccagtataattgcttgtgtttctctttcttctctct 476018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 70 - 428
Target Start/End: Original strand, 482174 - 482538
Alignment:
Q  70 atttgatacatcttagaaattcactagtctagag--tcttt--attacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaag-tcaaacata 164  Q
    |||||||| |||||||||||||   |||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||      
T  482174 atttgatatatcttagaaattcttaagtctagagagtctttcaattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaat 482273  T
Q  165 tttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgc 264  Q
    ||||| |||| ||   |||||||||||| |||| || |  ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||    
T  482274 tttctgtgtaattctttttgaatagaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgtctgc 482373  T
Q  265 gtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagag-agtattgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaaggggg 363  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | | | ||||||||||| ||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  482374 gtgcttgagcatttgtgaagtctcatactaggtgtagtattgagcagttgtaatatgtgtgattaaacttagtggaaatctccttggaagtgcaaggggg 482473  T
Q  364 actggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtctctctgtcttttctct 428  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||    
T  482474 actggactacttccagtttgtggaaggaaccagtataattgcttgtgtttctctttcttctctct 482538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #3
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 303 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 100272 - 100167
Alignment:
Q  303 ttgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||     
T  100272 ttgagcatttgtaatctttgtgattat----agtg-aaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgttttgtggaaggaaccaggataac 100178  T
Q  403 tgcttgtgtct 413  Q
    |||||||||||    
T  100177 tgcttgtgtct 100167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 70 - 154
Target Start/End: Original strand, 157029 - 157117
Alignment:
Q  70 atttgatacatcttagaaattcactagtctagag--tcttt--attacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa 154  Q
    |||||||| |||||||||||||   |||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  157029 atttgatatatcttagaaattcttaagtctagagagtctttcaattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 157117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #5
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 342 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 111838 - 111786
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaacc 394  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||| ||||||||| ||||    
T  111838 tctccttggaagtacaagggagacaggactactttcggattgtggaaggaacc 111786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0547 (Bit Score: 155; Significance: 4e-82; HSPs: 2)
Name: scaffold0547
Description:

Target: scaffold0547; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 215 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 489 - 276
Alignment:
Q  215 attagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagagagtattgagcatttgt 314  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |  ||||||||||| ||||    
T  489 attagaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgggaagtctcatactaggt-agtattgagcagttgt 391  T
Q  315 aatctgtgtgattattt-ttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtct 413  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  390 aatctgtgtgattatttcttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaaccaggataattgcttgtgtct 291  T
Q  414 ctctgtcttttctct 428  Q
    || | ||||||||||    
T  290 ctgtttcttttctct 276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0547; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 664 - 427
Alignment:
Q  13 aaaagcgtcaaaactctgtcaa-tttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtcttt-at 110  Q
    ||||||| ||||||| || ||| |||| ||||  ||||||| ||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||| ||    
T  664 aaaagcgccaaaactttgccaaatttgtttctcaaaagcactttgaatttctgtactgatttgatatatcttagaaattcctaagtctagagtcttttat 565  T
Q  111 tacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttc-aagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgct 209  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||| |||| ||  |||||| |||||| |||| || |  |||||    
T  564 tgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacaattttctgtgtaattctgtttgattagaagtctcttgctttagtgct 465  T
Q  210 tgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcatt 247  Q
    |||||||  |||| |||| || |  |||||||||||||    
T  464 tgagcataggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatt 427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0443 (Bit Score: 155; Significance: 4e-82; HSPs: 2)
Name: scaffold0443
Description:

Target: scaffold0443; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 215 - 428
Target Start/End: Original strand, 1525 - 1738
Alignment:
Q  215 attagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagagagtattgagcatttgt 314  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |  ||||||||||| ||||    
T  1525 attagaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcatttgtgaagtctcatactaggt-agtattgagcagttgt 1623  T
Q  315 aatctgtgtgattattt-ttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtct 413  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  1624 aatctgtgtgattatttcttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaaccagtataattgcttgtgtct 1723  T
Q  414 ctctgtcttttctct 428  Q
    |||| ||||||||||    
T  1724 ctctttcttttctct 1738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0443; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 44 - 247
Target Start/End: Original strand, 1381 - 1587
Alignment:
Q  44 acaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtcttt--attacattgtattgtgaacactactgattgtat 141  Q
    ||||||||| ||||||||| |   |||||||||| |||||||||||||   |||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1381 acaaagcactttgaatttctgtgttgatttgatatatcttagaaattcttaagtctagagtctctcaattgcattgtattgtgaacaccactgattgtat 1480  T
Q  142 atctagtgttc-aagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgctt 240  Q
    ||| ||||||| || |||||||  ||||| |||| ||  |||||| |||||| |||| || |  ||||||||||||  |||| ||||||| |  ||||||    
T  1481 atcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgattagaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgcctgcgtgctt 1580  T
Q  241 gagcatt 247  Q
    |||||||    
T  1581 gagcatt 1587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0073 (Bit Score: 155; Significance: 4e-82; HSPs: 3)
Name: scaffold0073
Description:

Target: scaffold0073; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 215 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 58107 - 57894
Alignment:
Q  215 attagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagagagtattgagcatttgt 314  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||| || |    
T  58107 attagaagtctcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctacatgcttgagcatttgggaagtctcatacta-gatagtattgagcagttat 58009  T
Q  315 aatctgtgtgattattt-ttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtct 413  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  58008 aatctgtgtgattatttcttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttatggaaggaaccaggataattgcttgtgtct 57909  T
Q  414 ctctgtcttttctct 428  Q
    |||| ||||||||||    
T  57908 ctctttcttttctct 57894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0073; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 58247 - 58170
Alignment:
Q  13 aaaagcgtcaaaactctgtcaa-tttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaat 89  Q
    ||||||| |||||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||||||| | |||||||||||| |||||||||||    
T  58247 aaaagcgccaaaactctgccaaatttgattctaaaaagcactttgaatttctgtactgatttgatatatcttagaaat 58170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0073; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 131 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 58161 - 58065
Alignment:
Q  131 actgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactct 227  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||| |||| ||  |||||| |||||| |||| || |  ||||||||||||| |||| ||||    
T  58161 actgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacaattttctgtgtaattctgtttgattagaagtctcttgctttagtgcttgagcattggaagtctct 58065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 148; Significance: 6e-78; HSPs: 3)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 215 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 60813 - 60598
Alignment:
Q  215 attagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagag-agtattgagcatttg 313  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | | | ||||||||||| |||    
T  60813 attagaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcatttgtgaagtctcatactaggtgtagtattgagcagttg 60714  T
Q  314 taatctgtgtgattattt-ttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtc 412  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  60713 taatctgtgtgattatttcttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggacaggactacttccggtttgtggaaggaaccagtataattgcttgtgtc 60614  T
Q  413 tctctgtcttttctct 428  Q
    ||||| ||||||||||    
T  60613 tctctttcttttctct 60598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 5 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 60998 - 60751
Alignment:
Q  5 acaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaa-tttgattc-tacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctaga 102  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| ||| |||| ||| |||||||||| ||||||||| |   | |||||||| |||||||||||||   ||||||||    
T  60998 acaagttaaaaagcgcctaaactctgccaaatttgtttcatacaaagcactttgaatttctgtgttcatttgataaatcttagaaattcttaagtctaga 60899  T
Q  103 gtcttt--attacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttc-aagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcg 199  Q
    ||||||  ||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||| || |||||||  ||||| |||| ||  |||||| |||||| |||| |    
T  60898 gtctttcaattgcattgttttgtgaacaccactgatagtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgattagaagtctcttg 60799  T
Q  200 cctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcatt 247  Q
    | |  |||||||||||   |||| ||||||| |  |||||||||||||    
T  60798 ctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcatt 60751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 342 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 211788 - 211722
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| |||  | ||||||||||    
T  211788 tctccttggaagtgcaagggggacaggaatgacttccggtttgtggaaggaacttgtataattgctt 211722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0752 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 4)
Name: scaffold0752
Description:

Target: scaffold0752; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 215 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 976 - 763
Alignment:
Q  215 attagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagagagtattgagcatttgt 314  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| | |  ||||||||||| ||||    
T  976 attagaagtctcttgctttagtccttgaacataggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgggcattctcatactaggt-agtattgagcagttgt 878  T
Q  315 aatctgtgtgattattt-ttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtct 413  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  877 aatctgtgtgattatttcttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaaccaggataattgcttgtgtct 778  T
Q  414 ctctgtcttttctct 428  Q
    |||| ||||||||||    
T  777 ctctttcttttctct 763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0752; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 1159 - 964
Alignment:
Q  4 tacaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaa-tttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctaga 102  Q
    |||||||||||| ||| | |||||||||||| |||| ||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||    
T  1159 tacaagttaaaa-gcgcccaaactctgtcaaatttgtttctcaaaagcactttgaatttctgcactgatttgatatatcttagaaattcttaagtctaga 1061  T
Q  103 gtc-tttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttc-aagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctct 197  Q
    ||| ||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||| |||| ||| |||||| |||||| ||||    
T  1060 gtcttttgttgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacaattttctgtgtaattttgtttgattagaagtctct 964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0752; HSP #3
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 1774 - 1579
Alignment:
Q  4 tacaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaa-tttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctaga 102  Q
    |||||||||||| ||| | |||||||||||| |||| ||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||    
T  1774 tacaagttaaaa-gcgcccaaactctgtcaaatttgtttctcaaaagcactttgaatttctgcactgatttgatatatcttagaaattcttaagtctaga 1676  T
Q  103 gtc-tttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttc-aagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctct 197  Q
    ||| ||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||| |||| ||| |||||| |||||| ||||    
T  1675 gtcttttgttgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacaattttctgtgtaattttgtttgattagaagtctct 1579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0752; HSP #4
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 215 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 1591 - 1456
Alignment:
Q  215 attagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagagagtattgagcatttgt 314  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| | ||  ||||||||||| ||||    
T  1591 attagaagtctcttgctttagttcttgatcataggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgggcattctcata-ctaggtagtattgagcagttgt 1493  T
Q  315 aatctgtgtgattattt-ttagtggaaatctccttgg 350  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  1492 aatctgtgtgattatttcttagtggaaatctccntgg 1456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 2)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 224 - 429
Target Start/End: Original strand, 38491 - 38695
Alignment:
Q  224 ctcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagagagtattgagcatttgtaatctgtgt 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | || ||||||||||| |||||||||||||    
T  38491 ctcttgctttagtgcttgagcattg-aagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgggaagtcttatacta-gatagtattgagcagttgtaatctgtgt 38588  T
Q  324 gattattt-ttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtctctctgtctt 422  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38589 gattatttcttagtggaaatctccttggaagtgcaaggggaactggactacttacggtttgtggaaggaaccaggataattgcttgtgtctctctttctt 38688  T
Q  423 ttctctg 429  Q
    |||||||    
T  38689 ttctctg 38695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 162
Target Start/End: Original strand, 38308 - 38459
Alignment:
Q  13 aaaagcgtcaaaactctgtcaa-tttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtcttt-at 110  Q
    ||||||| |||||||||| ||| |||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||    |||||||||||||| ||    
T  38308 aaaagcgccaaaactctgccaaatttgattctcaaaagcactttgaatttctgcactgatttgatatatcttagacatttttaagtctagagtcttttat 38407  T
Q  111 tacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaaca 162  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  38408 tgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaaca 38459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 215 - 428
Target Start/End: Original strand, 29282 - 29495
Alignment:
Q  215 attagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagagagtattgagcatttgt 314  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||| ||||    
T  29282 attagaagtctcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctagcatgcatgcttgagcatttgggaagtctcatacta-gatagtattgagcagttgt 29380  T
Q  315 aatctgtgtgattatttt-tagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtct 413  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29381 aatctgtgtgattatttcatagtggaaatctcattggaagtgcaagggggactagactacttccggtttgtggaaggaaccaggataattgcttgtgtct 29480  T
Q  414 ctctgtcttttctct 428  Q
    |||| ||||||||||    
T  29481 ctctttcttttctct 29495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 13 - 227
Target Start/End: Original strand, 29108 - 29324
Alignment:
Q  13 aaaagcgtcaaaactctgtcaa-tttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtcttt-at 110  Q
    ||||||| | |||||||| ||| |||||||||  |||||||  |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||   |||||||||||||| ||    
T  29108 aaaagcgcccaaactctgccaaatttgattctcaaaagcactctgaatttctgcactaatttgatatatcttagaaattcttaagtctagagtcttttat 29207  T
Q  111 tacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgctt 210  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||| |||| ||  |||||| |||||| |||| || |  ||||||    
T  29208 tgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacaattttctgtgtaattctgtttgattagaagtctcttgctttagtgctt 29307  T
Q  211 gagcattagaagactct 227  Q
    ||||||| |||| ||||    
T  29308 gagcattggaagtctct 29324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 370 - 432
Target Start/End: Original strand, 411983 - 412047
Alignment:
Q  370 ctacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    |||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  411983 ctacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 412047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0655 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0655
Description:

Target: scaffold0655; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 70 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 4826 - 4461
Alignment:
Q  70 atttgatacatcttagaaattcactagtctagag--tcttt--attacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaag-tcaaacata 164  Q
    |||||||| | |||||||||||   |||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||||| |      
T  4826 atttgatatagcttagaaattcttaagtctagagagtctttcaattgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaataat 4727  T
Q  165 tttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgc 264  Q
    ||||| |||| ||  ||||||||||||| |||| || |  ||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  4726 tttctgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgctttaatgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgc 4627  T
Q  265 gtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagag-agtattgagcatttgtaatctgt-gtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggg 362  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||||| | | | ||||||||||| |||||||| || |||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4626 gtgcttgagcaattttgaagtctcatactaggtgtagtattgagcagttgtaatcagttgtgattaaacttagtggaactctccttggaagtgcaagggg 4527  T
Q  363 gactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtctctctgtcttttctct 428  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| | ||||| ||| |||| |||||    
T  4526 gactggactacttccggtttgtggaaggaaccagtataattgcctctgtctttctttcttctctct 4461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2071 (Bit Score: 128; Significance: 5e-66; HSPs: 2)
Name: scaffold2071
Description:

Target: scaffold2071; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 215 - 377
Target Start/End: Original strand, 955 - 1117
Alignment:
Q  215 attagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagagagtattgagcatttgt 314  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||    
T  955 attagaagtctcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgggaagtctcata-ctagatagtattgagcagttgt 1053  T
Q  315 aatctgtgtgattattt-ttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttcc 377  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1054 aatctgtgtgattatttcttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttcc 1117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2071; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 33 - 247
Target Start/End: Original strand, 802 - 1017
Alignment:
Q  33 aatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtct-ttattacattgtattgtgaacacta 131  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||   |||||| ||| | ||||| |||||||||||||| || |    
T  802 aatttgattctaaaaagcactttgaatttctgcactgatttgatatatcttagaaattcttaagtctaaagtatattattgcattgtattgtgaaaacca 901  T
Q  132 ctgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgct 231  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||| |||| ||  |||||| |||||| |||| || |  ||||||||||||| |||| |||| ||     
T  902 ctgattgtatatcaagtgttcaagtcaaacaattttctgtgtaattctgtttgattagaagtctcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcc 1001  T
Q  232 ttagtgcttgagcatt 247  Q
    |  |||||||||||||    
T  1002 tgcgtgcttgagcatt 1017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 121; Significance: 8e-62; HSPs: 4)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 217 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 415 - 204
Alignment:
Q  217 tagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagagagtattgagcatttgtaa 316  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| | |  ||||||||||| ||||||    
T  415 tagaagtctcttgctttagttcttgagcataggaagtctcttgcctgtgtgcttgagcatttgggaagtctcatactaggt-agtattgagcagttgtaa 317  T
Q  317 tctgtgtgattattt-ttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtctct 415  Q
    | ||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  316 tatgtgtgattatttcttagtcaaaatctccttggaagtgcaaggggtactgaactacttctggtttgtggaaggaaccaagataattgcttgtgtctct 217  T
Q  416 ctgtcttttctct 428  Q
    || ||||||||||    
T  216 ctttcttttctct 204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 217 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 4795 - 4584
Alignment:
Q  217 tagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagagagtattgagcatttgtaa 316  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| | |  ||||||||||| ||||||    
T  4795 tagaagtctcttgctttagttcttgagcataggaagtctcttgcctgtgtgcttgagcatttgggaagtctcatactaggt-agtattgagcagttgtaa 4697  T
Q  317 tctgtgtgattattt-ttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtctct 415  Q
    | ||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  4696 tatgtgtgattatttcttagtcaaaatctccttggaagtgcaaggggtactgaactacttctggtttgtggaaggaaccaagataattgcttgtgtctct 4597  T
Q  416 ctgtcttttctct 428  Q
    || ||||||||||    
T  4596 ctttcttttctct 4584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #3
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 33 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 571 - 355
Alignment:
Q  33 aatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtcttt-attacattgtattgtgaacacta 131  Q
    |||||| ||||  ||||||| ||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||   ||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  571 aatttgtttctcaaaagcactttgaatttctgcattgatttgatatatcttagaaattcttaagtttagagtcttttattgcattgtattgtgaacacca 472  T
Q  132 ctgattgtatatctagtgttc-aagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgc 230  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||| |||| ||  ||||||||||||| |||| || |  || |||||||||  |||| |||||||    
T  471 ctgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacaattttctgtgtaattatgtttgaatagaagtctcttgctttagttcttgagcataggaagtctcttgc 372  T
Q  231 tttagtgcttgagcatt 247  Q
     |  |||||||||||||    
T  371 ctgtgtgcttgagcatt 355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #4
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 33 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 4951 - 4735
Alignment:
Q  33 aatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtcttt-attacattgtattgtgaacacta 131  Q
    |||||| ||||  ||||||| ||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||   ||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  4951 aatttgtttctcaaaagcactttgaatttctgcattgatttgatatatcttagaaattcttaagtttagagtcttttattgcattgtattgtgaacacca 4852  T
Q  132 ctgattgtatatctagtgttc-aagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgc 230  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||| |||| ||  ||||||||||||| |||| || |  || |||||||||  |||| |||||||    
T  4851 ctgattgtatatcaagtgttcaaagtcaaacaattttctgtgtaattatgtttgaatagaagtctcttgctttagttcttgagcataggaagtctcttgc 4752  T
Q  231 tttagtgcttgagcatt 247  Q
     |  |||||||||||||    
T  4751 ctgtgtgcttgagcatt 4735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1263 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold1263
Description:

Target: scaffold1263; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 70 - 412
Target Start/End: Original strand, 1531 - 1879
Alignment:
Q  70 atttgatacatcttagaaattcactagtctagag--tcttt--attacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaag-tcaaacata 164  Q
    |||||||  |||||||||||||   |||||||||  |||||  ||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||  |||||||      
T  1531 atttgatgtatcttagaaattcttaagtctagagagtctttcaattgcattgtattctgaacaccactgactgtatatcaagtgttcaaactcaaacaat 1630  T
Q  165 tttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgc 264  Q
    ||||| |||| ||  ||||||||||||| |||| || |  ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||||    
T  1631 tttctgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcaaagaaagtctcttgcctgc 1730  T
Q  265 gtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagag-agtattgagcatttgtaatctg-tgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggg 362  Q
    ||||||||||| ||  |||||||| ||| | | | ||||||||||| |||||||| | ||||||||   |||||| || |||||||||||||||||||||    
T  1731 gtgcttgagcaatt-tgaagtctcgtactaggtgtagtattgagcagttgtaatcagttgtgattaaacttagtgaaactctccttggaagtgcaagggg 1829  T
Q  363 gactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtc 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||    
T  1830 gactggactacttccggtttgtggaaggaaccaatataattgcatgtgtc 1879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1321 (Bit Score: 108; Significance: 4e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold1321
Description:

Target: scaffold1321; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 70 - 412
Target Start/End: Original strand, 1338 - 1686
Alignment:
Q  70 atttgatacatcttagaaattcactagtctagag--tcttt--attacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaag-tcaaacata 164  Q
    |||||||  |||||||||||||   |||||||||  |||||  ||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||  |||||||      
T  1338 atttgatgtatcttagaaattcttaagtctagagagtctttcaattgcattgtattctgaacaccactgactgtatatcaagtgttcaaactcaaacaat 1437  T
Q  165 tttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgc 264  Q
    ||||| |||| ||  ||||||||||||| ||||  | |  ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||||    
T  1438 tttctgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttactttagtgcttgagcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcaaagaaagtctcttgcctgc 1537  T
Q  265 gtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagag-agtattgagcatttgtaatctgt-gtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggg 362  Q
    ||||||||||| ||  |||||||| ||| | | | ||||||||||| |||||||| || |||||||   |||||| || |||||||||||||||||||||    
T  1538 gtgcttgagcaattt-gaagtctcgtactaggtgtagtattgagcagttgtaatcagttgtgattaaacttagtgaaactctccttggaagtgcaagggg 1636  T
Q  363 gactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtc 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||    
T  1637 gactggactacttccggtttgtggaaggaaccaatataattgcatgtgtc 1686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0177 (Bit Score: 108; Significance: 4e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0177
Description:

Target: scaffold0177; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 70 - 428
Target Start/End: Original strand, 20776 - 21140
Alignment:
Q  70 atttgatacatcttagaaattcactagtctagag--tcttta--ttacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaag-tcaaacata 164  Q
    |||||||| |||||||||||||   |||||||||  |||||   || ||||||||||||||||| |||||||||||||    |||||||  |||||||      
T  20776 atttgatatatcttagaaattcttaagtctagagagtctttcatttgcattgtattgtgaacaccactgattgtatattatttgttcaaactcaaacaat 20875  T
Q  165 tttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgc 264  Q
    ||| | |||| ||  ||||||||||||| |||| || |  ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  20876 tttttgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgc 20975  T
Q  265 gtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagag-agtattgagcatttgtaatctgt-gtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggg 362  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||||| | | | ||||||||| | |||||||| || |||||||   |||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  20976 gtgcttgagcaattt-gaagtctcatactaggtgtagtattgagtagttgtaatcagttgtgattaaacttagtgaaacactccttggaagtgcaagggg 21074  T
Q  363 gactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtctctctgtcttttctct 428  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||| ||| |||| |||||    
T  21075 gactggactacttccggtttgtggaaggaaccagtataattgtatgtgtctttctttcttctctct 21140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0050 (Bit Score: 105; Significance: 3e-52; HSPs: 3)
Name: scaffold0050
Description:

Target: scaffold0050; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 205 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 35185 - 34962
Alignment:
Q  205 gtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagag-agtat 303  Q
    ||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||| | | | |||||    
T  35185 gtgcttgagcatagaaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaagaagtctcttgcctgcgtgcttgagcaattt-gaagtctcatactaggtgtagtat 35087  T
Q  304 tgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataatt 403  Q
    |||||| ||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||    
T  35086 tgagcagttgtaatctgtgtgattaaacttagtgaaaatctccttggaagtgcaagggaaactggactactttcggtttgtggaaggaaccagtataatt 34987  T
Q  404 gcttgtgtctctctgtcttttctct 428  Q
    || ||||||||||| |||| |||||    
T  34986 gcctgtgtctctctttcttctctct 34962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0050; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 113 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 35308 - 35145
Alignment:
Q  113 cattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaag-tcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttg 211  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||  ||| | |||| ||  ||||||||||||| |||| || |  |||||||    
T  35308 cattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttatgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttgctttagtgcttg 35209  T
Q  212 agcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca 275  Q
    |||||  |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||| || |  |||||||||||    
T  35208 agcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcatagaaagtctcttgctttagtgcttgagca 35145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0050; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 217 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 35233 - 35174
Alignment:
Q  217 tagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcat 276  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |  ||||||||||||    
T  35233 tagaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcat 35174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0422 (Bit Score: 102; Significance: 2e-50; HSPs: 2)
Name: scaffold0422
Description:

Target: scaffold0422; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 205 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 11299 - 11087
Alignment:
Q  205 gtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagag-agtat 303  Q
    |||||||||||   |||| || |||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||| | | |  ||||    
T  11299 gtgcttgagcaaaggaagtctattgctttagtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttgagcaatt-tgaagtctcatactaggtgtggtat 11201  T
Q  304 tgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataatt 403  Q
    |||||| ||||||||||||||||||   | |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||    
T  11200 tgagcagttgtaatctgtgtgattaaactgagtgaaaatctccttggaagtgcaaaggggactggactacttccgatttgtggaaggaaccagtataatt 11101  T
Q  404 gcttgtgtctctct 417  Q
    ||||||||||||||    
T  11100 gcttgtgtctctct 11087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0422; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 113 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 11422 - 11259
Alignment:
Q  113 cattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaag-tcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttg 211  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||  |||||||  ||||| |||| ||  ||||||||||||| || | || |  |||||||    
T  11422 cattgtattgtgaacaccactgattgcatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatagaagtctattgctttagtgcttg 11323  T
Q  212 agcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca 275  Q
    |||||  |||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| | || |  |||||||||||    
T  11322 agcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtctattgctttagtgcttgagca 11259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 102; Significance: 2e-50; HSPs: 3)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 22 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 19165 - 18755
Alignment:
Q  22 aaaactctgtcaa--tttgattctacaaa-gcacattgaatttcag-cactgatttgatacatcttagaaattcactagt-ctagagtctttattacatt 116  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||    |||    
T  19165 aaaactctgtcaaattttgattctacaaaagcacactgaatttctgtcactgatttgatacatcttagaaattcaaaagtactagagtctctaacgtatt 19066  T
Q  117 gtattgtgaacactactgattgta-tatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgta-ttttcgtttgaatagaagcctc-tcgcctgcgtgcttgag 213  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||  |||| |||| ||||||  ||||||||| | ||||| |||||||||    
T  19065 gtattgtgaacaccactgattgtattatcaagtgttcaagtcaaacttatttcattgtattttttgtttgatcagaagcctctttgcctgtgtgcttgag 18966  T
Q  214 c-attagaagactcttgctttag-tgcttgagcatt--ggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca-----tttgagaagtctcataccaagagagtatt 304  Q
    | |||||||||||||||  |||| ||||||||||||  ||||| |||| || || |||||||||||     |||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  18965 ctattagaagactcttgtcttagttgcttgagcatttgggaagactcttgcgtgtgtgcttgagcataatttttgagaaatctcatacttagagagtatt 18866  T
Q  305 -gagcattt--gtaatctgtg-tgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaa-gggggact-ggactacttccggtttgtggaagaaaccagga 398  Q
     ||||||||   |||||| || ||||||    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  18865 agagcattttgttaatctttgttgatta----tagt-gaaatctccttggaagtgcaaggggggactgggactacttccgatttgtggaaggaaccagga 18771  T
Q  399 taa-ttgcttgtgtct 413  Q
    ||| | ||||||||||    
T  18770 taactcgcttgtgtct 18755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 257
Target Start/End: Original strand, 17270 - 17514
Alignment:
Q  21 caaaactctgtcaattt-gattctacaaagcacattgaatttcag-cact-gatttgatacatctt-agaaattcactagtctagagtctttattacatt 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||    |||    
T  17270 caaaactctgtcaattttgattctacaaagcacactgaatttctgacacttgatttgatacatctttagaaattcaaaagtctagagtctctaacgtatt 17369  T
Q  117 gtatt-gtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaa-catatttctctgtattttcgttt-gaat-agaagcctctcgcctgcgtgcttga 212  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||  |||||||| |||| | || |||||||||| ||||| ||||||||    
T  17370 gtatttgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaaacttatttcattgtatttttgttttgtatcagaagcctcttgcctgtgtgcttga 17469  T
Q  213 gcattagaagactcttgctttagtgcttg-agcattggaagtctct 257  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  17470 gcattagaagactcttgc-ttagtgcttgtagcattggaagactct 17514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 343 - 401
Target Start/End: Original strand, 17609 - 17670
Alignment:
Q  343 ctccttggaa-gtgcaagggg-gactggactacttccg-gtttgtggaagaaaccaggataa 401  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  17609 ctccttggaaagtgcaaggggggactggactacttccgtatttgtggaaggaaccaggataa 17670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0382 (Bit Score: 99; Significance: 1e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0382
Description:

Target: scaffold0382; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 299 - 428
Target Start/End: Original strand, 1883 - 2013
Alignment:
Q  299 agtattgagcatttgtaatctgtgtgattattt-ttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccagg 397  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  1883 agtattgagcagttgtaatctgtgtgattattacttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaacagt 1982  T
Q  398 ataattgcttgtgtctctctgtcttttctct 428  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  1983 ataattgcttgtgtctctctttcttctctct 2013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 99; Significance: 1e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 3 - 161
Target Start/End: Original strand, 2642 - 2799
Alignment:
Q  3 atacaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctaga 102  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||    
T  2642 atacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaaattgattctacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttagaaattca-aagtcgaga 2740  T
Q  103 gtctttattacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaac 161  Q
    |||||||||   |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2741 gtctttattgttttgtattgagaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaac 2799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349 (Bit Score: 94; Significance: 1e-45; HSPs: 3)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 235 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 14068 - 13934
Alignment:
Q  235 gtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagagagtattgagcatttgtaatctgtgtgattat---tt 331  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||    
T  14068 gtgcttgagcattggaagtctcttgcctgtgtgcttgagcatttgataagtctcata-ctagagagtattgagcatctgtaatctgtgtgattattgatt 13970  T
Q  332 ttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactg 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13969 ttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactg 13934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 361 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 10355 - 10284
Alignment:
Q  361 gggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtctctctgtcttttctctgctc 432  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| |||| || || ||||| ||| ||||||||||||||    
T  10355 gggactgggctacttccggattgtggaaggaaccagtataactgtttctgtctatctttcttttctctgctc 10284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 189 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 14084 - 14026
Alignment:
Q  189 gaagcctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcatt 247  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||| |  |||||||||||||    
T  14084 gaagtctcttgcctgcgtgcttgagcattggaagtctcttgcctgtgtgcttgagcatt 14026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 265 - 413
Target Start/End: Original strand, 11 - 155
Alignment:
Q  265 gtgcttgagcattt-gagaagtctcataccaagagagtattgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaaggggg 363  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    |||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  11 gtgcttgagcattttgagaagtctcatacttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgattat----agtg-aaatctccttggaattgcaaggggg 105  T
Q  364 actggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtct 413  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  106 actggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtct 155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 342 - 407
Target Start/End: Original strand, 28106 - 28172
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  28106 tctccttggaagtgcaagggggacaggactgacttccggtttgtggaaggaacctgtataattgctt 28172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0627 (Bit Score: 84; Significance: 9e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0627
Description:

Target: scaffold0627; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 282 - 431
Target Start/End: Original strand, 8650 - 8796
Alignment:
Q  282 aagtctcataccaagagagtattgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtt 381  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  8650 aagtctcatacttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgattat----agtg-aaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgttt 8744  T
Q  382 tgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgct 431  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||  | ||| |||||||||||||    
T  8745 tgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgct 8796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 5)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 189 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 20147 - 19923
Alignment:
Q  189 gaagcctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctc 288  Q
    |||| |||| ||||||||||||||| |   | || |||||||||||||||||||| |  |||||||||| || |||||||||||||| ||  ||||||||    
T  20147 gaagtctcttgcctgcgtgcttgagaaaagggagtctcttgctttagtgcttgagaaaaggaagtctcttgcttgcgtgcttgagcaattt-gaagtctc 20049  T
Q  289 ataccaagag-agtattgagcatttgtaatctgt-gtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtgg 386  Q
    |||| | | | ||||||||||| |||||||| || |||||||   |||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  20048 atactaggtgtagtattgagcagttgtaatcagttgtgattaaacttagtgaaactctccttggaagtgcaaggggaactggactacttccagtttgtgg 19949  T
Q  387 aagaaaccaggataattgcttgtgtc 412  Q
    ||| |||||| |||||||| ||||||    
T  19948 aaggaaccagtataattgcatgtgtc 19923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 113 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 20284 - 20123
Alignment:
Q  113 cattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaag-tcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttg 211  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||  |||||||  ||||| |||| ||  ||||||||||||| |||| || |  |||||||    
T  20284 cattgtattgtgaacaccacaaattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaattcagtttgaatagaagtctcttgctttagtgcttg 20185  T
Q  212 agcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgag 273  Q
    |||||  |||| ||||||||| | ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  20184 agcataggaagtctcttgcttgattgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgcgtgcttgag 20123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207; HSP #3
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 114 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 10382 - 10240
Alignment:
Q  114 attgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaag-tcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttga 212  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||||| |  ||||| |||| ||  ||||||||||||| |||| || |  ||||||||    
T  10382 attgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaataattttctgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttgctttagtgcttga 10283  T
Q  213 gcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtct 255  Q
    ||||  |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  10282 gcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtct 10240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 217 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 10308 - 10250
Alignment:
Q  217 tagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca 275  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |  |||||||||||    
T  10308 tagaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgctttagtgcttgagca 10250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207; HSP #5
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 217 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 20209 - 20151
Alignment:
Q  217 tagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca 275  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||  ||||||||||    
T  20209 tagaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgcttgattgcttgagca 20151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 3)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 205 - 412
Target Start/End: Original strand, 7026 - 7234
Alignment:
Q  205 gtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagag-agtat 303  Q
    ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||| ||  |||||||||||| | | | |||||    
T  7026 gtgcttgagcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcaaaggaagtcacttgcctgcgtgcttgagcaattt-gaagtctcatactaggtgtagtat 7124  T
Q  304 tgagcatttgtaatctgt-gtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataat 402  Q
    |||||| |||||||| || |||||||   |||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | |||||    
T  7125 tgagcagttgtaatcagttgtgattaaacttagtgaaactctccttgaaagtgtaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaaccggtataat 7224  T
Q  403 tgcttgtgtc 412  Q
    || |||||||    
T  7225 tgtttgtgtc 7234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 70 - 275
Target Start/End: Original strand, 6856 - 7066
Alignment:
Q  70 atttgatacatcttagaaattcactagtctagag--tcttt--attacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaag-tcaaacata 164  Q
    |||||||| |||||||||||||   |||||||||  |||||  ||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||| |||||||||  |||||||      
T  6856 atttgatatatcttagaaattcttaagtctagagagtctttcaattgcattgtaatgtgaacaacactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaat 6955  T
Q  165 tttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgc 264  Q
    ||||| |||| ||  ||||||||||||| |||| || |  ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |      
T  6956 tttctatgtaattctgtttgaatagaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgcttta 7055  T
Q  265 gtgcttgagca 275  Q
    |||||||||||    
T  7056 gtgcttgagca 7066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 217 - 276
Target Start/End: Original strand, 6978 - 7037
Alignment:
Q  217 tagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcat 276  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |  ||||||||||||    
T  6978 tagaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgctttagtgcttgagcat 7037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1200 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold1200
Description:

Target: scaffold1200; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 285 - 413
Target Start/End: Original strand, 1 - 124
Alignment:
Q  285 tctcataccaagagagtattgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgt 384  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1 tctcatacttagagagtattgagcatttgtaatctttgtgattat----agtg-aaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgt 95  T
Q  385 ggaagaaaccaggataattgcttgtgtct 413  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  96 ggaaggaaccaggataactgcttgtgtct 124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 4)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 162
Target Start/End: Original strand, 59601 - 59752
Alignment:
Q  13 aaaagcgtcaaaactctgtcaa-tttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtcttt-at 110  Q
    ||||||| | |||||||| ||| |||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||| ||    
T  59601 aaaagcgcccaaactctgccaaatttgattctcaaaagcactttgaatttctgcactgatttgatatatcttagaaattcttaagtctagagtcttttat 59700  T
Q  111 tacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaaca 162  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  59701 tgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaagtcaaaca 59752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 215 - 291
Target Start/End: Original strand, 59775 - 59851
Alignment:
Q  215 attagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcata 291  Q
    |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  59775 attagaagtctctttttttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgggaagtctcata 59851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 64027 - 63883
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttc-aagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaat--agaagcctctcgcctgcgtgcttg 211  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || |||||||||  ||| |||| ||  ||||||||  ||||| |||| ||    |||||||    
T  64027 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacata-atctttgtaattctgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttg 63929  T
Q  212 agcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctct 257  Q
    |||| |||||| |||||||  | ||||||||||| | |||||||||    
T  63928 agcaatagaagtctcttgcagttgtgcttgagcaatagaagtctct 63883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 329 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 46109 - 46044
Alignment:
Q  329 tttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaacc 394  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||| ||||    
T  46109 tttttagtg-aactctccttggaagtgcaagggggacagggctgacttccggtttgtagaaggaacc 46044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0771 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0771
Description:

Target: scaffold0771; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 249 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 5927 - 5747
Alignment:
Q  249 gaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagag-agtattgagcatttgtaatctgt-gtgattatttttagtggaaatctcc 346  Q
    ||||||||| || || ||||||||||| ||  |||||||||||| | | | ||||||||||| |||||||| || |||||||   |||||| || |||||    
T  5927 gaagtctcttgcttgtgtgcttgagcaattt-gaagtctcatactaggtgtagtattgagcagttgtaatcagttgtgattaaacttagtgaaactctcc 5829  T
Q  347 ttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtctctctgtcttttctct 428  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||||||    
T  5828 ttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaaccagtataattgcctgtgtctttctttcttttctct 5747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0771; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 70 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 6051 - 5901
Alignment:
Q  70 atttgatacatcttagaaattcactagtcta--gagtcttta--ttacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttc-aagtcaaacata 164  Q
    |||||||| |||||||||||||   ||||||  ||||||||   || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || |||||||      
T  6051 atttgatatatcttagaaattcttaagtctatagagtctttcatttgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaat 5952  T
Q  165 tttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgagca 215  Q
    ||||| |||| ||  ||||||||||||| |||| || || |||||||||||    
T  5951 tttctatgtaattctgtttgaatagaagtctcttgcttgtgtgcttgagca 5901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 113 - 428
Target Start/End: Original strand, 38534 - 38852
Alignment:
Q  113 cattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaag-tcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttg 211  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||||||  |||||||  ||||| |||| ||  ||||||||||||| |||| || |  |||||||    
T  38534 cattgtatagtgaacaccactaattgtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctatgtaattctgtttgaatagaagtctcttgctttagtgcttg 38633  T
Q  212 agcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagag-agtattgagcat 310  Q
    |||||   ||| |||||||||  |||||||||||  |||||||||| ||||| |||| |||| | ||  ||||| |||||| | | | |||||||||||     
T  38634 agcatagaaagtctcttgcttgtgtgcttgagcaaaggaagtctcttgcctgtgtgcctgagaaatt-tgaagtgtcatactaggtgtagtattgagcag 38732  T
Q  311 ttgtaatctg-tgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggac-tggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttg 408  Q
    |||||||| | ||||||||   |||||| || |||||||||| ||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||    
T  38733 ttgtaatcagttgtgattaaacttagtgaaactctccttggatgtgcaagggggacatgaccgacttccggtttgtggaaggaacctgtataattgcctg 38832  T
Q  409 tgtctctctgtcttttctct 428  Q
    ||||| ||| |||| |||||    
T  38833 tgtctttctttcttctctct 38852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 71; Significance: 5e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 276 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 23452 - 23322
Alignment:
Q  276 tttgagaagtctcataccaagagagtattgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactactt 375  Q
    |||| ||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23452 tttgtgaagtctcatacttagaaagtattgagcagttgtaatctttgtgattat----agtg-aaatctccttggaagtgcaagggggactggactactt 23358  T
Q  376 ccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgt 411  Q
    |||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  23357 ccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgt 23322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 217 - 428
Target Start/End: Original strand, 2338 - 2551
Alignment:
Q  217 tagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagag-agtattgagcatttgta 315  Q
    |||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| ||  |||||||||||| | | | ||||||||||| |||||    
T  2338 tagaagtctcttgcttgtgtgcttgagcataggaagtctcttgcctgtgtgcttgagcaatt-tgaagtctcatactaggtgtagtattgagcagttgta 2436  T
Q  316 atctg-tgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtct 413  Q
    ||| | ||||||||   |||||| || |||| ||||||||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| |    
T  2437 atcagttgtgattaaacttagtgaaactctcattggaagtgcaagggagacaggactgactttcggtttgtggaaggaaccagtataattgcctgtgtat 2536  T
Q  414 ctctgtcttttctct 428  Q
     ||| |||| |||||    
T  2537 ttctttcttctctct 2551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 70 - 245
Target Start/End: Original strand, 2216 - 2396
Alignment:
Q  70 atttgatacatcttagaaattcactagtctagag--tcttt--attacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttca-agtcaaacata 164  Q
    |||||||| |||||||||||||   |||||||||  |||||  ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||      
T  2216 atttgatatatcttagaaattcttaagtctagagagtctttcaattgcattgtgttgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcacactcaaacaat 2315  T
Q  165 tttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagca 245  Q
    ||||| |||| ||  ||||||||||||| |||| || || ||||||||||||  |||| ||||||| |  |||||||||||    
T  2316 tttctgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttgcttgtgtgcttgagcataggaagtctcttgcctgtgtgcttgagca 2396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 66; Significance: 5e-29; HSPs: 7)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 156 - 422
Target Start/End: Original strand, 165125 - 165393
Alignment:
Q  156 tcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtct 255  Q
    |||||||  ||||| |||| ||| ||||||||||||| |||| || |  ||||||||||||  |||| ||||| | |  |||||||||||  ||||||||    
T  165125 tcaaacaattttctgtgtaattttgtttgaatagaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctctttcctgtgtgcttgagcaaaggaagtct 165224  T
Q  256 ctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagag-agtattgagcatttgtaatc-tgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaag 353  Q
    || ||||| ||||||||||| ||  |||||||||||| | | | ||||||||||| |||||||| | ||||||||   |||||| || ||||||||||||    
T  165225 cttgcctgtgtgcttgagcaatt-tgaagtctcatactaggtgtagtattgagcagttgtaatcatttgtgattaaacttagtgaaactctccttggaag 165323  T
Q  354 tgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtctctctgtctt 422  Q
    |||||||| ||| ||| | |||||||||||||||||| |||  | |||||||| ||||||| ||| ||||    
T  165324 tgcaagggagacaggagtgacttccggtttgtggaaggaacttgtataattgcctgtgtctttctttctt 165393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 333 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 251110 - 251037
Alignment:
Q  333 tagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgct 406  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| || | |||||||||| | ||||||||| |||||| |||||||||    
T  251110 tagtgaaaatctccttgaaagtgcaagggagatttgactacttccagattgtggaaggaaccagaataattgct 251037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 280
Target Start/End: Original strand, 65859 - 66027
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaat--agaagcctctcgcctgcgtgcttg 211  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||  ||||| |||| ||  ||||||||  ||||| |||| ||    |||||||    
T  65859 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaattcagaagtctcttgcagttgtgcttg 65958  T
Q  212 agcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttga 280  Q
    |||| |||||| |||||| ||  || |  |||||| |||||||||| ||    ||||||||||||||||    
T  65959 agcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcatttga 66027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 346 - 413
Target Start/End: Original strand, 145132 - 145201
Alignment:
Q  346 cttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggat-aattgcttgtgtct 413  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| |||| | || ||||||||||||||    
T  145132 cttggaagtgcaagggggacatgactgacttccggtttgtggaaggaacctgtataaattgcttgtgtct 145201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #5
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 154
Target Start/End: Original strand, 144904 - 144943
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa 154  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  144904 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 144943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #6
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 342 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 58996 - 58934
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    ||||||||||| |||||| |||||  |||||||||||  |||||||||||||| | |||||||    
T  58996 tctccttggaaatgcaagagggacatgactacttccgaattgtggaagaaacctgtataattg 58934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #7
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 342 - 394
Target Start/End: Original strand, 66083 - 66136
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaacc 394  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  66083 tctccttggaagtggaagggggacaggactgacttctggtttgtggaaggaacc 66136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1507 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold1507
Description:

Target: scaffold1507; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 332 - 428
Target Start/End: Original strand, 19 - 115
Alignment:
Q  332 ttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtctctctgtcttttctct 428  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| ||| |||| |||||    
T  19 ttagtgaaactctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaaggaaccagtataattgcctgtgtctttctttcttctctct 115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1409 (Bit Score: 64; Significance: 8e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold1409
Description:

Target: scaffold1409; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 338 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 1835 - 1760
Alignment:
Q  338 gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtct 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  1835 gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtct 1760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0414 (Bit Score: 64; Significance: 8e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0414
Description:

Target: scaffold0414; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 338 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 1512 - 1437
Alignment:
Q  338 gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtct 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  1512 gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgttttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtct 1437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0414; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 154
Target Start/End: Original strand, 7611 - 7650
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa 154  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  7611 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 7650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 113 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 9632 - 9312
Alignment:
Q  113 cattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaag-tcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgc--gtgct 209  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| ||||||| |||||||||  |||||||  ||||| |||| |   ||||||||||||| |||| || |    |||||    
T  9632 cattgtactgtgaacaccactgatggtatatcaagtgttcaaactcaaacaattttctgtgtaatactgtttgaatagaagtctcttgctttttagtgct 9533  T
Q  210 tgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagag-agtattgagc 308  Q
    |||||||  |||| ||||||  |  |||||||||||  || ||||||| ||||| ||||||||||| ||  |||||||||||| | | | ||||||||||    
T  9532 tgagcataggaagtctcttgtctgtgtgcttgagcaaagggagtctcttgcctgtgtgcttgagcaattt-gaagtctcatactaggtgtagtattgagc 9434  T
Q  309 atttgtaatctgt-gtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggataattgct 406  Q
    | |||||||| || |||||||   |||||   | ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| |||| | ||||||||     
T  9433 agttgtaatcagttgtgattaagcttagttatactctccttggaagtgcaagggggacaagactgacttccggtttgtggaaggaacctgtataattgcc 9334  T
Q  407 tgtgtctctctgtcttttctct 428  Q
    ||||||| ||| |||| |||||    
T  9333 tgtgtctttctttcttctctct 9312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0272 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0272
Description:

Target: scaffold0272; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 3 - 85
Target Start/End: Original strand, 13907 - 13989
Alignment:
Q  3 atacaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttag 85  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13907 atacaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgatttcacaaagcacactgaatttctgcactgatttgatacatcttag 13989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 205 - 428
Target Start/End: Original strand, 19 - 244
Alignment:
Q  205 gtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagag-agtat 303  Q
    ||||||||||||  |||| |||||||||  |||||||||||  |||||||||| | ||| ||||||||||| ||  ||||| ||| || | | | |||||    
T  19 gtgcttgagcataggaagtctcttgcttgtgtgcttgagcaaaggaagtctcttgtctgtgtgcttgagcaattt-gaagtgtcaaactaggtgtagtat 117  T
Q  304 tgagcatttgtaatctgt-gtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggataa 401  Q
    |||||| |||||||| || |||||||   |||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| | ||||    
T  118 tgagcagttgtaatcagttgtgattaaacttagtgaaactctccttggaagtgcaagggggacaggactgacttccggtttgtggaaggaacctgtataa 217  T
Q  402 ttgcttgtgtctctctgtcttttctct 428  Q
    |||| ||| ||| ||| |||| |||||    
T  218 ttgcatgtctctttctttcttctctct 244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 217 - 275
Target Start/End: Original strand, 1 - 59
Alignment:
Q  217 tagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagca 275  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||    
T  1 tagaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgcttgtgtgcttgagca 59  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 304 - 432
Target Start/End: Original strand, 155682 - 155807
Alignment:
Q  304 tgagcatttgtaatctgtgtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataatt 403  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| |    
T  155682 tgagcagttgtaatctttgtgattat----agtg-aaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataact 155776  T
Q  404 gcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    |||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  155777 gcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 155807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0289 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0289
Description:

Target: scaffold0289; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 338 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 4351 - 4255
Alignment:
Q  338 gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  4351 gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 4255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 115 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 13701 - 13558
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaag-tcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgag 213  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||| | |||||| |||| |||||||| |||| || || || ||||||    
T  13701 ttgtattgtgagcaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatatttctttatatttttgttttaatagaagtctcttgcttgtgtacttgag 13602  T
Q  214 cattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctct 257  Q
    ||| ||||| |||||| |||||| ||||||||| |||| |||||    
T  13601 cataagaagtctcttgatttagttcttgagcataggaaatctct 13558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 342 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 13475 - 13410
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||| | ||||||||||    
T  13475 tctccttggtagtgtaagggggacaggacaacttccggtttgtgaaaggaacctgtataattgctt 13410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 338 - 432
Target Start/End: Original strand, 61149 - 61245
Alignment:
Q  338 gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  61149 gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcctgtgtctttgtctttcttttctctgctc 61245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 70 - 318
Target Start/End: Original strand, 4301 - 4554
Alignment:
Q  70 atttgatacatcttagaaattcactagtctagag--tcttta--ttacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaag-tcaaacata 164  Q
    |||||||| |||||||||||||   |||||||||  |||||   || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||  |||||||      
T  4301 atttgatatatcttagaaattcttaagtctagagagtctttcatttgcattgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgtttaaactcaaacaat 4400  T
Q  165 tttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgc 264  Q
    ||||| |||| ||  ||||||||||||| |||| || |  ||||||||||||  |||  |||||||||  |||||||||||  |||||||||| || ||     
T  4401 tttctatgtaattctgtttgaatagaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaaatctcttgcttgtgtgcttgagcaaaggaagtctcttgcttgt 4500  T
Q  265 gtgcttgagcatttgagaagtctcataccaagag-agtattgagcatttgtaatc 318  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||||| | | | ||||||||||| ||||||||    
T  4501 gtgcttgagcaatt-tgaagtctcatactaggtgtagtattgagcagttgtaatc 4554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269 (Bit Score: 56; Significance: 5e-23; HSPs: 3)
Name: scaffold0269
Description:

Target: scaffold0269; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 299 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 16441 - 16338
Alignment:
Q  299 agtattgagcatttgtaatctgt-gtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccagg 397  Q
    ||||||||||| |||||||| || |||||||   |||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  16441 agtattgagcagttgtaatcagttgtgattaaacttagtgaaactctccttggaagtgcaagggggattggactacttccggtttgtggaaggaaccagt 16342  T
Q  398 ataa 401  Q
    ||||    
T  16341 ataa 16338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 70 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 6990 - 6825
Alignment:
Q  70 atttgatacatcttagaaattcactagtctagag--tcttta--ttacattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttc-aagtcaaacata 164  Q
    |||||||| |||||||||||||   |||||||||  |||||   || ||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||| || |||||||      
T  6990 atttgatatatcttagaaattcttaagtctagagagtctttcatttgcattgtattgtgaacaccactgattgtatattatgtgttcaaactcaaacaat 6891  T
Q  165 tttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttgc 230  Q
    ||||| |||| ||  ||||||||||||| |||| || |  ||||||||||||  |||| |||||||    
T  6890 tttctgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctcttgc 6825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 217 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 6868 - 6828
Alignment:
Q  217 tagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctct 257  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6868 tagaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctct 6828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 343 - 413
Target Start/End: Original strand, 52370 - 52440
Alignment:
Q  343 ctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtct 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  52370 ctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtct 52440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0251
Description:

Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 350 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 21430 - 21367
Alignment:
Q  350 gaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtct 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  21430 gaagtgcaagggggactggactacttccgatttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtct 21367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 7480 - 7443
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttc 152  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  7480 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttc 7443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0194 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0194
Description:

Target: scaffold0194; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 338 - 413
Target Start/End: Original strand, 4459 - 4534
Alignment:
Q  338 gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtct 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||| || ||||||||    
T  4459 gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactatttccgatttgtggaaggaaccatgataactgtttgtgtct 4534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 21 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 16448 - 16349
Alignment:
Q  21 caaaactctgtcaa-tttgattctacaaagcacattgaatttcagcactgatttgatacatcttagaaattcactagtctagagtctttattacattgta 119  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| |||| || ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||    
T  16448 caaaactctgccaaatttgattctaaaaagtactttgaatttctgcactgatttgatatatcttagaaattcttaagtctagagtctttattgcattgta 16349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1281 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold1281
Description:

Target: scaffold1281; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 342 - 407
Target Start/End: Original strand, 2064 - 2129
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  2064 tctccttggaagtgcaagggggacaggactacttccggtttgtggaagaaacatgtataattgctt 2129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 9)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 115 - 251
Target Start/End: Original strand, 244734 - 244870
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaag-tcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgag 213  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||| |||| ||  ||||||||||||  |||| || || |||||||||    
T  244734 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagt-ttcaacctcaaacatatttctttgtaattctgtttgaatagaactctcttgcttgtgtgcttgag 244832  T
Q  214 cattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaa 251  Q
    |||  |||| |||||| |||||| ||||||||| ||||    
T  244833 cataggaagtctcttgatttagttcttgagcataggaa 244870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 342 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 219671 - 219606
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||    
T  219671 tctccttgaaagtgcaagggggacatgactacttccgatttgtggaagaaacctgtataattgctt 219606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 343 - 407
Target Start/End: Original strand, 244961 - 245025
Alignment:
Q  343 ctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  244961 ctccttgaaagtgcaagggggacacgactacttccggtttgtggaaggaacctgtataattgctt 245025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 342 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 87841 - 87788
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaacca 395  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  87841 tctccttggaagtgcaagggggagtgaactacttccggattgtggaaggaacca 87788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #5
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 211057 - 210889
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaat--agaagcctctcgcctgcgtgcttg 211  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||  ||||| |||| ||  ||||||||  ||||| |||| ||    |||||||    
T  211057 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacaattttctttgtaattctgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttg 210958  T
Q  212 agcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttga 280  Q
    |||| |||||| |||||| ||  || |  |||||| |||||||||| ||    ||||||||||||||||    
T  210957 agcaatagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcatttga 210889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #6
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 219897 - 219814
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctct 197  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||  ||| ||| |||||| |||| ||  ||||||||||||| ||||    
T  219897 ttgtattgtgaacaccgctgattgtatatcaagtgttcaacctcacacaaatttctttgtaattctgtttgaatagaagtctct 219814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #7
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 342 - 389
Target Start/End: Original strand, 378226 - 378273
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaag 389  Q
    |||||||||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||    
T  378226 tctccttggaagtgcaaggggggcatgactacttccagtttgtggaag 378273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #8
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 88063 - 87926
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgag 213  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||  ||||||||  || |||||| ||   |||||||||||| |||| ||    | |||||||    
T  88063 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgtttaacctcaaacattgttatctgtaattctatttgaatagaagtctcttgcagttgcgcttgag 87964  T
Q  214 cattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaa 251  Q
    |||  |||| |||||| ||| || ||||||||| ||||    
T  87963 cataggaagtctcttgattttgttcttgagcataggaa 87926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #9
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 174
Target Start/End: Original strand, 377999 - 378059
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgta 174  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||  |||||||| ||||| ||||    
T  377999 ttgtattgtgaacaccactgattgtatgtcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgta 378059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1820 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold1820
Description:

Target: scaffold1820; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 299 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 1309 - 1178
Alignment:
Q  299 agtattgagcatttgtaatctgt-gtgattatttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccag 396  Q
    ||||||||||| |||||||| || |||||||   |||||| || |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| |||| |    
T  1309 agtattgagcagttgtaatcagttgtgattaaacttagtgaaactctccttggaagtgcaagggggaaaggactgacttccggtttgtggaaggaacctg 1210  T
Q  397 gataattgcttgtgtctctctgtcttttctct 428  Q
     |||||||  ||||||| ||| |||| |||||    
T  1209 tataattgtctgtgtctttctttcttctctct 1178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 3 - 53
Target Start/End: Original strand, 52407 - 52457
Alignment:
Q  3 atacaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcaca 53  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52407 atacaagttaaaaagtgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaagcaca 52457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 4)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 115 - 279
Target Start/End: Original strand, 4464 - 4629
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgag 213  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||| |||| ||  |||||  |||||| |||| || |  |||||||||    
T  4464 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttct-tgtaattgtgtttgtttagaagtctcttgctttggtgcttgag 4562  T
Q  214 cattagaagactcttgctttagtgcttgagca-ttggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttg 279  Q
    |||  |||  |||||||||  ||||||||| | |||||||||||| || || |||||||||||||||    
T  4563 cataggaaatctcttgcttgtgtgcttgagtatttggaagtctcttgcttgtgtgcttgagcatttg 4629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 342 - 407
Target Start/End: Original strand, 6815 - 6880
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| |||| | ||||||||||    
T  6815 tctccttggaagtgcaagggggacaggactacttccggattgtgaaaggaacctgtataattgctt 6880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 328 - 407
Target Start/End: Original strand, 2726 - 2804
Alignment:
Q  328 atttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||  | ||||||||||    
T  2726 atttttagtg-aactctccttggaagtgaaagggggacatgactacttccggattgtggaaggaacttgtataattgctt 2804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 206 - 257
Target Start/End: Original strand, 8279 - 8330
Alignment:
Q  206 tgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctct 257  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  8279 tgcttgagcattggaagcctcttgcttgtgtgcttgagcattggaagtctct 8330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0567 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0567
Description:

Target: scaffold0567; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 342 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 9337 - 9272
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  9337 tctccttggaagtgcaagggggacatgactacttccggtttgtggaaggaacctgtataattgctt 9272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0525
Description:

Target: scaffold0525; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 356 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 7274 - 7217
Alignment:
Q  356 caagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtct 413  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  7274 caagggggactggactacttccgatttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtct 7217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 3)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 328 - 404
Target Start/End: Original strand, 20136 - 20211
Alignment:
Q  328 atttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    |||||||||| || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  20136 atttttagtg-aactctctttggaagtgcaagggggacaggactacttccggtttgtggaaggaacctgtataattg 20211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 29452 - 29315
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgag 213  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||  ||||| |||| ||  ||||||||| |||||||| ||    |||||||||    
T  29452 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatataagcctcttgcagttgtgcttgag 29353  T
Q  214 cattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaa 251  Q
    |||  |||| |||||| |||  | ||||||||| ||||    
T  29352 cataggaagtctcttgatttttttcttgagcataggaa 29315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 154
Target Start/End: Original strand, 19921 - 19960
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa 154  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  19921 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 19960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146 (Bit Score: 44; Significance: 7e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0146
Description:

Target: scaffold0146; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 344 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 14547 - 14484
Alignment:
Q  344 tccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  14547 tccttggaagtgcaagggggacaagactacttccggtttgtggaaggaacctgtataattgctt 14484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 44; Significance: 7e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 115 - 229
Target Start/End: Original strand, 21429 - 21544
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgag 213  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||| |||| ||  ||||||||||||| |||| ||    | |||||||    
T  21429 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaatctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaatagaagtctcttgcagttgggcttgag 21528  T
Q  214 cattagaagactcttg 229  Q
    ||||||||| ||||||    
T  21529 cattagaagtctcttg 21544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 151
Target Start/End: Original strand, 2427 - 2463
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgtt 151  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  2427 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgtt 2463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 44; Significance: 7e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 115 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 144564 - 144421
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaag-tcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgag 213  Q
    |||||||||| |||| | |||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||| |||| ||  ||||||||||||| |||| ||    |||||||||    
T  144564 ttgtattgtggacaccaatgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaaatttctttgtaattctgtttgaatagaagtctcttgcagttgtgcttgag 144465  T
Q  214 cattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctct 257  Q
    ||| ||||| |||||| |||||| ||| ||||| |||| |||||    
T  144464 cataagaagtctcttgatttagttcttcagcataggaaatctct 144421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 328 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 144350 - 144285
Alignment:
Q  328 atttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaacc 394  Q
    |||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  144350 atttttagtg-aactctccttagaagtgcaagggggacatgactacttccggattgtggaaggaacc 144285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 342 - 404
Target Start/End: Original strand, 16808 - 16870
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  16808 tctccttggaagtgcaagggggacgtgactacttccggtttgtggaaggaacctgtataattg 16870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 342 - 413
Target Start/End: Original strand, 16394 - 16467
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggat-aattgcttgtgtct 413  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| | || ||||||||||||||    
T  16394 tctccttggaagtgcaagggggacaggactgacttccggtttgtggaaggaacctgtataaattgcttgtgtct 16467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 342 - 407
Target Start/End: Original strand, 37425 - 37490
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||| | ||||||||||    
T  37425 tctccttggaagagcaagggggacaggactacttccgatttgtggaaggaacctgtataattgctt 37490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 342 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 76677 - 76612
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | | ||||||||    
T  76677 tctctttggaagtgcaagggggacaggactacttccggtttgtggaaggaacctgtagaattgctt 76612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 131 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 76856 - 76743
Alignment:
Q  131 actgattgtatatctagtgttcaagtc-aaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgagcattagaagactcttg 229  Q
    |||||||||||||| |||||||||  | |||||||||||| |||| ||  ||||||||||||| |||| ||    ||||||||||||  |||| ||||||    
T  76856 actgattgtatatcaagtgttcaacccgaaacatatttctttgtaattctgtttgaatagaagtctcttgcagttgtgcttgagcataggaagtctcttg 76757  T
Q  230 ctttagtgcttgag 243  Q
     ||| || ||||||    
T  76756 attttgttcttgag 76743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 118 - 257
Target Start/End: Original strand, 729 - 869
Alignment:
Q  118 tattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgagcat 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||| |||| ||   ||||||||||||  ||| ||    ||||||||||||    
T  729 tattgtgaacactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaaatttctttgtaattctatttgaatagaagtatcttgcagttgtgcttgagcat 828  T
Q  217 tagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctct 257  Q
      |||| |||||| |||||| ||| ||||| |||| |||||    
T  829 aggaagtctcttgatttagttcttaagcataggaaatctct 869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 338 - 406
Target Start/End: Original strand, 3934 - 4001
Alignment:
Q  338 gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgct 406  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||||||    
T  3934 gaaatctcattggaagtgcaaaggg-actgaactacttccggattgtgcaaggaaccaagataattgct 4001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0210
Description:

Target: scaffold0210; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 115 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 1317 - 1201
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaa-tagaagcctctcgcctgcgtgcttga 212  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||| |||| ||  ||||||| |||||| |||| ||   |||||||||    
T  1317 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctatgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcagtcgtgcttga 1218  T
Q  213 gcattagaagactcttg 229  Q
    ||||| |||| ||||||    
T  1217 gcatttgaagtctcttg 1201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1747 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold1747
Description:

Target: scaffold1747; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 976 - 862
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgag 213  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||| |||| ||  |||| |||||||| |||| || || |||||||||    
T  976 ttgtattgtgagcactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgttt-aatagaagtctcttgcttgtgtgcttgag 878  T
Q  214 cattagaagactcttg 229  Q
    |||  |||| ||||||    
T  877 catatgaagtctcttg 862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1747; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 329 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 765 - 707
Alignment:
Q  329 tttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaa 388  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  765 tttttagtg-aactctccttggaagtgcaagggggataggactactttcggtttgtggaa 707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0330 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0330
Description:

Target: scaffold0330; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 280
Target Start/End: Original strand, 107 - 274
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaa-tagaagcctctcgcctgcgtgcttga 212  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||  |||||||| ||||| |||| ||  ||||||| |||||| |||| ||    ||||||||    
T  107 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaattgttcaacttcaaacatttttctgtgtaattctgtttgaattagaagtctcttgcagttgtgcttga 206  T
Q  213 gcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctctcgcctgcgtgcttgagcatttga 280  Q
    |||||||||| |||||| ||  || |  |||||| |||||||||| ||    ||||||||||||||||    
T  207 gcattagaagtctcttgattgtgttcaggagcataggaagtctcttgcagttgtgcttgagcatttga 274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0330; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 344 - 407
Target Start/End: Original strand, 332 - 396
Alignment:
Q  344 tccttggaagtgcaagggggactggacta-cttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  332 tccttggaagtgcaagggggacatgactaacttccggtttgtggaaggaacctgtataattgctt 396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 3)
Name: scaffold0273
Description:

Target: scaffold0273; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 5288 - 5205
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctct 197  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||| |||| ||  ||||||||||||| ||||    
T  5288 ttgtattgtgcacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatatttctttgtaattatgtttgaatagaagtctct 5205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 342 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 22449 - 22396
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaacca 395  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||| |||||    
T  22449 tctccttgaaagtgcaagggggagtggactactctcggattgtggaaggaacca 22396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 217 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 22598 - 22558
Alignment:
Q  217 tagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctct 257  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  22598 tagaagtctcttgcttttgtgcttgagcataggaagtctct 22558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 342 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 59511 - 59449
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  59511 tctccttggaagtgcaaggggtacatgactacttccggtttgtggaaggaacctgtataattg 59449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 342 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 7356 - 7293
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgct 406  Q
    ||||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||||||||||| |||| | |||||||||    
T  7356 tctccttggaagtgcaagggg-ataggactactttcggtttgtggaaggaacctgtataattgct 7293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 342 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 74014 - 73948
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||   ||||||||||    
T  74014 tctccttggaagtgcaagggggacaggactgacttccggtttgtggaaggaacctatataattgctt 73948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000006; HSPs: 4)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 342 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 268214 - 268152
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  268214 tctccttggaagtgcaaggggaataggactacttccggtttgtggaaggaacctgtataattg 268152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 115 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 268439 - 268356
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctct 197  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||  ||||| |||| ||  ||||||||||||| ||||    
T  268439 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatagaagtctct 268356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 342 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 83825 - 83759
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||  ||| | ||||||||||    
T  83825 tctccttggaagtgcaagggggacaggactgacttccggtttatggaaggtacctgtataattgctt 83759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 84050 - 84011
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa 154  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  84050 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 84011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1657 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold1657
Description:

Target: scaffold1657; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 1498 - 1421
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaa 191  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||  |||||||||||||| |||| ||| |||||| |||||    
T  1498 ttgtattgtgaacaccactgattgtagatcaagtgttcaacctcaaacatatttctttgtaattttgtttgattagaa 1421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1657; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 329 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 1285 - 1209
Alignment:
Q  329 tttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||| |||  | ||||||||||    
T  1285 tttttagtg-aactctccttggaagtgcaaggggatatg-actacttccggtttgtggaaggaacttgtataattgctt 1209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 342 - 407
Target Start/End: Original strand, 2460 - 2525
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||| |||| | ||||||||||    
T  2460 tctccttggaagtgcaaggaggacaggactacttccgaattgtggaaggaacctgtataattgctt 2525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0351
Description:

Target: scaffold0351; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 342 - 407
Target Start/End: Original strand, 9666 - 9731
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||| | ||||||||||    
T  9666 tctccttggaagtacaagggggacaggactactttcggattgtggaaggaacctgtataattgctt 9731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0280 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0280
Description:

Target: scaffold0280; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 342 - 413
Target Start/End: Original strand, 3346 - 3419
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggat-aattgcttgtgtct 413  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| |||| | || ||||||||||||||    
T  3346 tctccttggaagtgcaagggggacaggactgacttccagtttgtggaaggaacctgtataaattgcttgtgtct 3419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0280; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 187
Target Start/End: Original strand, 3183 - 3255
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaat 187  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||| |||| ||| ||||||||    
T  3183 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttct-tgtaattttgtttgaat 3255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 3)
Name: scaffold0205
Description:

Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 187
Target Start/End: Original strand, 393 - 466
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaat 187  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||| |||| ||| ||||||||    
T  393 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattttgtttgaat 466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 342 - 394
Target Start/End: Original strand, 618 - 671
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaacc 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  618 tctccttggaagtgcaagggggacatgactgacttccggtttgtggaaggaacc 671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 318 - 258
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgta 174  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  318 ttgtattttgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatatttctttgta 258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 342 - 407
Target Start/End: Original strand, 32465 - 32530
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||    
T  32465 tctccttggaaatgcaagggggacaagactacttccggtttgtggaaggaacctatataattgctt 32530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 257
Target Start/End: Original strand, 32239 - 32382
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgag 213  Q
    ||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||  |||| ||  |||||| |||||| |||| ||    |||||||||    
T  32239 ttgtattatgaaaaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaaatttcattgtaattctgtttgattagaagtctcttgcagttgtgcttgag 32338  T
Q  214 cattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctct 257  Q
    |||  |||| |||||| |||||| |||||| || |||| |||||    
T  32339 catatgaagtctcttgatttagttcttgagtataggaaatctct 32382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 338 - 407
Target Start/End: Original strand, 17009 - 17078
Alignment:
Q  338 gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    ||||||||||||||||||||| || || |||||||||| | | |||||||||||| ||| ||||||||||    
T  17009 gaaatctccttggaagtgcaaaggagattggactactttcagattgtggaagaaatcagtataattgctt 17078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 144
Target Start/End: Original strand, 16827 - 16856
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatc 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16827 ttgtattgtgaacactactgattgtatatc 16856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 342 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 147 - 86
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataatt 403  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||    
T  147 tctccttggaagtgcaagtgggacaggactacttccggattgtggaaggaacctgtataatt 86  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 187
Target Start/End: Original strand, 90513 - 90582
Alignment:
Q  118 tattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaat 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||| |||| ||| ||||||||    
T  90513 tattgtgaacactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttct-tgtaattttgtttgaat 90582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1359 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold1359
Description:

Target: scaffold1359; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 329 - 389
Target Start/End: Original strand, 1323 - 1382
Alignment:
Q  329 tttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaag 389  Q
    ||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  1323 tttttagtg-aactctacttggaagtgcaagggggacaagactacttccggtttgtggaag 1382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1359; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 154
Target Start/End: Original strand, 1109 - 1148
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa 154  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  1109 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 1148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 346 - 413
Target Start/End: Original strand, 10791 - 10859
Alignment:
Q  346 cttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgc-ttgtgtct 413  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||| | |||||||| ||||||||    
T  10791 cttggaagtgcaagggggacaggactacttttggtttgtggaaggaacctgtataattgcattgtgtct 10859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 346 - 413
Target Start/End: Original strand, 15455 - 15523
Alignment:
Q  346 cttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgc-ttgtgtct 413  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||| | |||||||| ||||||||    
T  15455 cttggaagtgcaagggggacaggactacttttggtttgtggaaggaacctgtataattgcattgtgtct 15523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0069
Description:

Target: scaffold0069; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 411
Target Start/End: Original strand, 5950 - 6018
Alignment:
Q  345 ccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggat-aattgcttgtgt 411  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| | || ||||||||||||    
T  5950 ccttggaagtgcaagggggacaggactgacttccggtttgtggaaggaacctgtataaattgcttgtgt 6018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 154
Target Start/End: Original strand, 5778 - 5817
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa 154  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  5778 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 5817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1745 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold1745
Description:

Target: scaffold1745; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 329 - 388
Target Start/End: Original strand, 646 - 704
Alignment:
Q  329 tttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaa 388  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  646 tttttagtg-aactctccttggaagtgcaagggggataggactactttcggtttgtggaa 704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1745; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 229
Target Start/End: Original strand, 435 - 549
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgag 213  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||  |||||||| ||||| |||| ||  |||| |||||||| |||| || || |||||||||    
T  435 ttgtattgtgaacacaacaaattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgttt-aatagaagtctcttgcttgtgtgcttgag 533  T
Q  214 cattagaagactcttg 229  Q
    |||  |||| ||||||    
T  534 catatgaagtctcttg 549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 119 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 158764 - 158653
Alignment:
Q  119 attgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgagcatt 217  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||  ||||||| |||||| |||| ||  ||||||||||||| ||||  | || ||||||||||||     
T  158764 attgtgaacaccactgattgtatatcaagttttcaacctcaaacaaatttctttgtaattctgtttgaatagaagtctctttcttgtgtgcttgagcata 158665  T
Q  218 agaagactcttg 229  Q
     |||| ||||||    
T  158664 ggaagtctcttg 158653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 342 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 36861 - 36799
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    |||||||| |||||||| |||||  |||||||||| |||||||||||| |||| | |||||||    
T  36861 tctccttgtaagtgcaaaggggataggactacttctggtttgtggaaggaacctgtataattg 36799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 342 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 134921 - 134859
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattg 404  Q
    |||||||| |||||||| |||||  |||||||||| |||||||||||| |||| | |||||||    
T  134921 tctccttgtaagtgcaaaggggataggactacttctggtttgtggaaggaacctgtataattg 134859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0488 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0488
Description:

Target: scaffold0488; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 11626 - 11556
Alignment:
Q  345 ccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggat-aattgcttgtgtct 413  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| |||| | || ||||||||||||||    
T  11626 ccttggaagtgcaagggggacatgactgacttccggtttgtggaaggaacctgtataaattgcttgtgtct 11556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0488; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 115 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 11855 - 11738
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaat--agaagcctctcgcctgcgtgcttg 211  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||  |||||||| ||||| |||| ||  ||||||||  ||||| |||| ||    |||||||    
T  11855 ttgtattgtgaacaccactgattgtttatcaagtgttcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttg 11756  T
Q  212 agcattagaagactcttg 229  Q
    |||| |||||| ||||||    
T  11755 agcaatagaagtctcttg 11738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0479 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0479
Description:

Target: scaffold0479; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 342 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 9396 - 9330
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||   ||||||||||    
T  9396 tctccttgtaagtgcaagggggacaggactgacttccggtttgtggaaggaacctatataattgctt 9330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0439
Description:

Target: scaffold0439; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 329 - 394
Target Start/End: Original strand, 7408 - 7473
Alignment:
Q  329 tttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaacc 394  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  7408 tttttagtg-aactctccttggaagtgcaagggggacaagactgacttccggtttgtggaaggaacc 7473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 229
Target Start/End: Original strand, 6144 - 6261
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaat--agaagcctctcgcctgcgtgcttg 211  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||| |||| ||  ||||||||  ||||| |||| ||    |||||||    
T  6144 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacttcaaacatttttctttgtaattctgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttg 6243  T
Q  212 agcattagaagactcttg 229  Q
    ||||||| ||| ||||||    
T  6244 agcattaaaagtctcttg 6261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 342 - 407
Target Start/End: Original strand, 6368 - 6434
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||  |||||||||| |||| | ||||||||||    
T  6368 tctccttggaagtgcaagggggacatgactgacttccattttgtggaaggaacctgtataattgctt 6434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0334 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0334
Description:

Target: scaffold0334; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 7484 - 7367
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaa--tagaagcctctcgcctgcgtgcttg 211  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||  ||||| |||| ||  |||||||  |||||| |||| ||    |||||||    
T  7484 ttgtactgtgaacactactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatttagaagtctcttgcagttgtgcttg 7385  T
Q  212 agcattagaagactcttg 229  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  7384 agcattagaagtctcttg 7367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 9615 - 9501
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttgag 213  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||  |||||||  ||||| |||| ||  ||||||||||||| |||| ||    |||||||||    
T  9615 ttgtattgtgaacaccactaattgtatatcaagtgttcaacctcaaacaattttctttgtaattctgtttgaatagaagtctcttgcagttgtgcttgag 9516  T
Q  214 cattagaagactctt 228  Q
    ||| ||||| |||||    
T  9515 cataagaagtctctt 9501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 342 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 9389 - 9323
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||| |||| | ||||||||||    
T  9389 tctccttggaagtgcaaggggaacaggactgacttctggtttgtgaaaggaacctgtataattgctt 9323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 7749 - 7696
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttct 169  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||    
T  7749 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa-tcaaacttatttct 7696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 413
Target Start/End: Original strand, 35427 - 35497
Alignment:
Q  345 ccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggat-aattgcttgtgtct 413  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| |||| | || ||||||||||||||    
T  35427 ccttggaagtgcaagggggacaggactgacttccagtttgtggaaggaacctgtataaattgcttgtgtct 35497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 229
Target Start/End: Original strand, 88054 - 88171
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa-gtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaat--agaagcctctcgcctgcgtgcttg 211  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| |||| ||  ||||||||  ||||| |||| ||    |||||||    
T  88054 ttgtatcgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacgtcaaacatttttctttgtaattctgtttgaattaagaagtctcttgcagttgtgcttg 88153  T
Q  212 agcattagaagactcttg 229  Q
    |||| |||||| ||||||    
T  88154 agcaatagaagtctcttg 88171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0859 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0859
Description:

Target: scaffold0859; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 342 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 2414 - 2361
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaacc 394  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||| ||||    
T  2414 tctccttggaagtgcaagggggacagtactaacttccggtttgtggaaggaacc 2361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0859; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 2638 - 2599
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa 154  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  2638 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 2599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0622
Description:

Target: scaffold0622; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 342 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 2092 - 2027
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||||    
T  2092 tctccttggaagtgcaaatgggacaggactacttccagtttgtggaaggaacctatataattgctt 2027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 342 - 407
Target Start/End: Original strand, 4041 - 4106
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || ||||| ||| |||| | ||||||||||    
T  4041 tctccttggaagtgcaagggggacatgactacttctggattgtgtaaggaacctgtataattgctt 4106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 342 - 407
Target Start/End: Original strand, 2696 - 2760
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    ||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||    
T  2696 tctccttggaagtgcaagggc-acaggactacttccggtttgtggaaggaacctatataattgctt 2760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 154
Target Start/End: Original strand, 2440 - 2479
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa 154  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  2440 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 2479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0275 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0275
Description:

Target: scaffold0275; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 342 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 24063 - 24010
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaacc 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  24063 tctccttggaagtgcaagggggacatgactgacttccggtttgtggaaggaacc 24010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0664 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0664
Description:

Target: scaffold0664; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 217 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 949 - 909
Alignment:
Q  217 tagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctct 257  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  949 tagaagtctcttgctttagtgcttgagcataggaagtctct 909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0664; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 113 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 1024 - 920
Alignment:
Q  113 cattgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttc-aagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaagcctctcgcctgcgtgcttg 211  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||| ||| || |||||||  ||||| |||| ||  ||||||||||||| |||| || |  |||||||    
T  1024 cattgtattgtgaacaccacatattgtatatcaagttttcaaactcaaacaattttctgtgtaattctgtttgaatagaagtctcttgctttagtgcttg 925  T
Q  212 agcat 216  Q
    |||||    
T  924 agcat 920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0471 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0471
Description:

Target: scaffold0471; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 347 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 2875 - 2807
Alignment:
Q  347 ttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggat-aattgcttgtgtct 413  Q
    |||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| |||| | || ||||||||||||||    
T  2875 ttggaagtgcaagggggacaagactgacttccggtttgtggaaggaacctgtataaattgcttgtgtct 2807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0471; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 2963 - 2886
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaagtcaaacatatttctctgtattttcgtttgaatagaag 192  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  |  |||||||| ||||| |||| ||  |||||||| ||||    
T  2963 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgtcaacctcaaacatttttctttgtaattctgtttgaattgaag 2886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 205 - 257
Target Start/End: Original strand, 111196 - 111248
Alignment:
Q  205 gtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctct 257  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||| || ||||||||| ||||||||||    
T  111196 gtgcttgagcattagaagtctcttgattttgttcttgagcataggaagtctct 111248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 338 - 394
Target Start/End: Original strand, 111326 - 111382
Alignment:
Q  338 gaaatctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaacc 394  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  ||  ||| |||||||||||||| ||||    
T  111326 gaaatctccttggaagtgcaagagggacaagatgactaccggtttgtggaaggaacc 111382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0772
Description:

Target: scaffold0772; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 154
Target Start/End: Original strand, 1331 - 1370
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa 154  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  1331 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 1370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0607 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0607
Description:

Target: scaffold0607; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 5664 - 5625
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa 154  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  5664 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 5625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0515 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0515
Description:

Target: scaffold0515; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 5840 - 5801
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa 154  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  5840 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 5801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0426 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0426
Description:

Target: scaffold0426; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 13230 - 13191
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa 154  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  13230 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 13191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0306
Description:

Target: scaffold0306; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 5850 - 5811
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa 154  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  5850 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 5811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 368 - 432
Target Start/End: Original strand, 10201 - 10267
Alignment:
Q  368 gactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtc--tctctgtcttttctctgctc 432  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  10201 gactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtctttgtctttcttttctctgctc 10267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 3)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 18687 - 18648
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa 154  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  18687 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 18648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 154
Target Start/End: Original strand, 22584 - 22623
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa 154  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  22584 ttgtattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 22623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 346 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 18460 - 18411
Alignment:
Q  346 cttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaacc 394  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  18460 cttggaagtgcaagggggacatgactgacttccggtttgtggaaggaacc 18411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0199 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0199
Description:

Target: scaffold0199; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 366 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 17929 - 17882
Alignment:
Q  366 tggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgtct 413  Q
    |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  17929 tggactacttccgtgttgtggaaggaaccaggataactgcttgtgtct 17882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 8813 - 8758
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaag-tcaaacatatttct 169  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||| |||||    
T  8813 ttgtattgtgaacaccactgattatatatcaagtgttcaagctcaaacatttttct 8758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0364 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0364
Description:

Target: scaffold0364; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 342 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 5647 - 5581
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    |||| ||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| |||  | ||||||||||    
T  5647 tctcgttggaagtgcaagggggataggactgacttccggtttgtggaaggaacttgtataattgctt 5581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0315 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0315
Description:

Target: scaffold0315; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 342 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 8091 - 8025
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||| |||  | ||||||||||    
T  8091 tctccttggaagtgcaagggggacaggactgacttccggttattggaaggaacatgtataattgctt 8025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 342 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 2663 - 2597
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccgg-tttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    |||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||| ||||   ||||||||||    
T  2663 tctccttgtaagtgcaagggggacaagactacttccggttttgtggaaggaacctatataattgctt 2597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 344 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 103000 - 102954
Alignment:
Q  344 tccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaag 389  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  103000 tccttggaagtgcaagggggacaagactgacttccggtttgtggaag 102954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 115 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 380 - 263
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaag-tcaaacatatttctctgtattttcgtttgaat--agaagcctctcgcctgcgtgcttg 211  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||  |||| ||| ||||||||  ||||| |||| ||    |||||||    
T  380 ttgtactgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaacctcaaacatttttcattgtaattttgtttgaatttagaagtctcttgcagttgtgcttg 281  T
Q  212 agcattagaagactcttg 229  Q
    |||| |||||| ||||||    
T  280 agcaatagaagtctcttg 263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1339 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1339
Description:

Target: scaffold1339; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 205 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 1825 - 1776
Alignment:
Q  205 gtgcttgagcattagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtc 254  Q
    |||||||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  1825 gtgcttgagcataaaaagtctcttgcttttgtgcttgagcataggaagtc 1776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1107 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1107
Description:

Target: scaffold1107; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 144
Target Start/End: Original strand, 2767 - 2796
Alignment:
Q  115 ttgtattgtgaacactactgattgtatatc 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2767 ttgtattgtgaacactactgattgtatatc 2796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0758 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0758
Description:

Target: scaffold0758; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 342 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 3740 - 3675
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgctt 407  Q
    ||||||||||||| |||||||||   |||||||||||| ||||||||| |||  | ||||||||||    
T  3740 tctccttggaagtacaagggggagaagactacttccggattgtggaaggaacatgtataattgctt 3675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0290 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0290
Description:

Target: scaffold0290; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 342 - 394
Target Start/End: Original strand, 19301 - 19354
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaagaaacc 394  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  19301 tctccttggaagtgcaaggatgacaggactgacttccggtttgtggaaggaacc 19354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 342 - 411
Target Start/End: Original strand, 2441 - 2510
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggataattgcttgtgt 411  Q
    |||| |||||||||||||| |||  || |||||||||| ||||||||| |||| | |||||| |||||||    
T  2441 tctcattggaagtgcaaggaggataggtctacttccggattgtggaaggaacctgtataatttcttgtgt 2510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 329 - 388
Target Start/End: Original strand, 79024 - 79083
Alignment:
Q  329 tttttagtggaaatctccttggaagtgcaagggggactggact-acttccggtttgtggaa 388  Q
    ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||    
T  79024 tttttagtg-aactctccttggaagtacaagggggacatgactgacttccggtttgtggaa 79083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0352 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0352
Description:

Target: scaffold0352; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 118 - 154
Target Start/End: Original strand, 1277 - 1313
Alignment:
Q  118 tattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa 154  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  1277 tattgtgaacaccactgattgtatatcaagtgttcaa 1313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0340 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0340
Description:

Target: scaffold0340; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 360 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 17441 - 17385
Alignment:
Q  360 ggggactggactacttccggtttgtggaagaaaccaggat-aattgcttgtgtctct 415  Q
    ||||||| |||| ||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  17441 ggggactagactgcttccggattgtggaaagaaccaggataaattgcttgtgtctct 17385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0311 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0311
Description:

Target: scaffold0311; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 342 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 19509 - 19473
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccg 378  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  19509 tctccttggaagtgcaaggggggcaggactacttccg 19473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0311; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 216 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 19661 - 19621
Alignment:
Q  216 ttagaagactcttgctttagtgcttgagcattggaagtctc 256  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  19661 ttagaagtctcttgcttttgtgcttgagcataggaagtctc 19621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 114 - 154
Target Start/End: Original strand, 44342 - 44382
Alignment:
Q  114 attgtattgtgaacactactgattgtatatctagtgttcaa 154  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  44342 attgtattgtgaacaccactgattgtttatcaagtgttcaa 44382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 342 - 394
Target Start/End: Original strand, 44541 - 44593
Alignment:
Q  342 tctccttggaagtgcaagggggactggactacttccggtttgtggaagaaacc 394  Q
    |||||||| |||||||| || |||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  44541 tctccttgaaagtgcaaaggcgacatgactacttccggtttgtggaaggaacc 44593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 4014 times since January 2019
Visitors: 4825