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 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0726_low_8 (Length: 394)

Name: NF0726_low_8
Description: NF0726
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0726_low_8
NF0726_low_8
[»] chr3 (4 HSPs)
chr3 (1-279)||(18663010-18663288)
chr3 (1-274)||(18663216-18663489)
chr3 (1-274)||(18663417-18663690)
chr3 (10-150)||(18662938-18663078)
[»] chr2 (3 HSPs)
chr2 (1-279)||(37461223-37461501)
chr2 (36-274)||(37461057-37461295)
chr2 (25-150)||(37461448-37461573)
[»] chr4 (9 HSPs)
chr4 (1-279)||(13656530-13656808)
chr4 (1-279)||(13671176-13671454)
chr4 (1-279)||(5739228-5739506)
chr4 (1-274)||(13671382-13671655)
chr4 (1-274)||(13671583-13671856)
chr4 (1-274)||(13656736-13657009)
chr4 (10-150)||(5739156-5739296)
chr4 (10-150)||(13671104-13671244)
chr4 (25-150)||(13656458-13656583)
[»] chr5 (3 HSPs)
chr5 (1-279)||(18581552-18581830)
chr5 (1-274)||(18581351-18581624)
chr5 (25-150)||(18581777-18581902)
[»] scaffold0014 (2 HSPs)
scaffold0014 (6-279)||(22565-22838)
scaffold0014 (10-150)||(22770-22910)
[»] chr6 (6 HSPs)
chr6 (1-279)||(12923829-12924104)
chr6 (1-274)||(12923427-12923700)
chr6 (1-200)||(12923628-12923827)
chr6 (25-150)||(12924051-12924176)
chr6 (121-180)||(19540742-19540801)
chr6 (121-193)||(19540631-19540702)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 267; Significance: 1e-149; HSPs: 4)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 18663288 - 18663010
Alignment:
Q  1 atccttatttacaaagcaacctacacatcatcccatatctcaaacacatacaaacttcccacctttcctctctacttcaagtccacaaatgtctactgtc 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18663288 atccctatttacaaagcaacctacacatcatcccatatctcaaacacatacaaacttcccacctttcctctctacttcaagtccacaaatgtctactgtc 18663189  T
Q  101 catgctcccacttctcaaatacctacaaatacccaacaaccccactctacaaggaaacctacacatcatcttacatctaacacaccttcaaatatccaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18663188 catgctcccacttctcaaatacctacaaatacccaacaaccccactctacaaggaaacctacacatcatcttacatctaacacaccttcaaatatccaac 18663089  T
Q  201 ttccacaacctacaaggcaactgaaacatcatcccatatctcaaacatttacaaatttcccacctttcctctctgctcc 279  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18663088 ttccacaacctacaaggcaaccgaaacatcatcccatatctcaaacatttacaaatttcccacctttcctctctactcc 18663010  T

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Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 18663489 - 18663216
Alignment:
Q  1 atccttatttacaaagcaacctacacatcatcccatatctcaaacacatacaaacttcccacctttcctctctacttcaagtccacaaatgtctactgtc 100  Q
    |||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18663489 atccctatctacaaagcagcctacacatcatcccatatctcaaacacatacaaacttcccacctttcctctctacttcaagtccacaaatgtctactgtc 18663390  T
Q  101 catgctcccacttctcaaatacctacaaatacccaacaaccccactctacaaggaaacctacacatcatcttacatctaacacaccttcaaatatccaac 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18663389 catgctcccacttctcaaatacctacaaatacccaacaaccccactctacaaggaaacctacacatcatcttacatctaaaacaccttcaaatatccaac 18663290  T
Q  201 ttccacaacctacaaggcaactgaaacatcatcccatatctcaaacatttacaaatttcccacctttcctctct 274  Q
       | | |  ||||| |||||  | ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  18663289 aatccctatttacaaagcaacctacacatcatcccatatctcaaacacatacaaacttcccacctttcctctct 18663216  T

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Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 18663690 - 18663417
Alignment:
Q  1 atccttatttacaaagcaacctacacatcatcccatatctcaaacacatacaaacttcccacctttcctctctacttcaagtccacaaatgtctactgtc 100  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18663690 atccctatctacaaagcaacctacacatcatcccatatctcaaacacatactaacttcccacctttcctctctacttcaagtccacaaatgtctactgtc 18663591  T
Q  101 catgctcccacttctcaaatacctacaaatacccaacaaccccactctacaaggaaacctacacatcatcttacatctaacacaccttcaaatatccaac 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18663590 catgctcccacttctcaaatacctacaaatacccaacaaccccactctacaatgaaacctacacatcatcttacatctaaaacaccttcaaatatccaac 18663491  T
Q  201 ttccacaacctacaaggcaactgaaacatcatcccatatctcaaacatttacaaatttcccacctttcctctct 274  Q
       | | | |||||| ||| |  | ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  18663490 aatccctatctacaaagcagcctacacatcatcccatatctcaaacacatacaaacttcccacctttcctctct 18663417  T

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Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 10 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 18663078 - 18662938
Alignment:
Q  10 tacaaagcaacctacacatcatcccatatctcaaacacatacaaacttcccacctttcctctctacttcaagtccacaaatgtctactgtccatgctccc 109  Q
    ||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | |||||||||    
T  18663078 tacaaggcaaccgaaacatcatcccatatctcaaacatttacaaatttcccacctttcctctctactccaagtccacaaatgtctacaattcatgctccc 18662979  T
Q  110 acttctcaaatacctacaaatacccaacaaccccactctac 150  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||    
T  18662978 acctctcaaatacctacaaatatccaatctccccactctac 18662938  T

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Target: chr2 (Bit Score: 263; Significance: 1e-146; HSPs: 3)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Original strand, 37461223 - 37461501
Alignment:
Q  1 atccttatttacaaagcaacctacacatcatcccatatctcaaacacatacaaacttcccacctttcctctctacttcaagtccacaaatgtctactgtc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  37461223 atccttatttacaaagcatcctacacatcatcccatatctcaaacacatacaaacttcccacctttcctctctacttcaagtccacaaatgtctactttc 37461322  T
Q  101 catgctcccacttctcaaatacctacaaatacccaacaaccccactctacaaggaaacctacacatcatcttacatctaacacaccttcaaatatccaac 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  37461323 catgctcccacttctcaaatacctacaaatacccaacaaccccactctacaaggaaacctacacatcatcttacatctaacacaccttcaaatatccaat 37461422  T
Q  201 ttccacaacctacaaggcaactgaaacatcatcccatatctcaaacatttacaaatttcccacctttcctctctgctcc 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37461423 ttccacaacctacaaggcaactgaaacatcatcccatatctcaaacatttacaaatttcccacctttcctctctactcc 37461501  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 36 - 274
Target Start/End: Original strand, 37461057 - 37461295
Alignment:
Q  36 tatctcaaacacatacaaacttcccacctttcctctctacttcaagtccacaaatgtctactgtccatgctcccacttctcaaatacctacaaataccca 135  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37461057 tatctcaaacacatactaacttcccacctttcctctctacttcaagtccacaaatgtctaatgtccatgctcccacttctcaaatacctacaaataccca 37461156  T
Q  136 acaaccccactctacaaggaaacctacacatcatcttacatctaacacaccttcaaatatccaacttccacaacctacaaggcaactgaaacatcatccc 235  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |   |  ||||| ||| |  | ||||||||||    
T  37461157 acaaccccactctacaatgaaacctacacatcatcttacatctaaaacaccttcaaatatccaacaatccttatttacaaagcatcctacacatcatccc 37461256  T
Q  236 atatctcaaacatttacaaatttcccacctttcctctct 274  Q
    ||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  37461257 atatctcaaacacatacaaacttcccacctttcctctct 37461295  T

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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 25 - 150
Target Start/End: Original strand, 37461448 - 37461573
Alignment:
Q  25 acatcatcccatatctcaaacacatacaaacttcccacctttcctctctacttcaagtccacaaatgtctactgtccatgctcccacttctcaaatacct 124  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||||||||||    
T  37461448 acatcatcccatatctcaaacatttacaaatttcccacctttcctctctactccaagtccacaaatgtctacaattcatgctcccacctctcaaatacct 37461547  T
Q  125 acaaatacccaacaaccccactctac 150  Q
    ||||||| ||||   |||||||||||    
T  37461548 acaaatatccaatctccccactctac 37461573  T

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Target: chr4 (Bit Score: 259; Significance: 1e-144; HSPs: 9)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 13656808 - 13656530
Alignment:
Q  1 atccttatttacaaagcaacctacacatcatcccatatctcaaacacatacaaacttcccacctttcctctctacttcaagtccacaaatgtctactgtc 100  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13656808 atccatatatacaaagcaacctacacatcatcccatatctcaaacacatacaaacttcccacctttcctctctacttcaagtccacaaatgtctactgtc 13656709  T
Q  101 catgctcccacttctcaaatacctacaaatacccaacaaccccactctacaaggaaacctacacatcatcttacatctaacacaccttcaaatatccaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13656708 catgctcccacttctcaaatacctacaaatacccaacaaccccactctacaaggaaacctacacatcatcttacatctaacacaccttcaaatatccaac 13656609  T
Q  201 ttccacaacctacaaggcaactgaaacatcatcccatatctcaaacatttacaaatttcccacctttcctctctgctcc 279  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13656608 ttccacaacctacaaggcaaaagaaacatcatcccatatctcaaacatttacaaatttcccacctttcctctctactcc 13656530  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 13671454 - 13671176
Alignment:
Q  1 atccttatttacaaagcaacctacacatcatcccatatctcaaacacatacaaacttcccacctttcctctctacttcaagtccacaaatgtctactgtc 100  Q
    |||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13671454 atccctatctacaaagcagcctacacatcatcccatatctcaaacacatacaaacttcccacctttcctctctacttcaagtccacaaatgtctactgtc 13671355  T
Q  101 catgctcccacttctcaaatacctacaaatacccaacaaccccactctacaaggaaacctacacatcatcttacatctaacacaccttcaaatatccaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13671354 catgctcccacttctcaaatacctacaaatacccaacaaccccactctacaaggaaacctacacatcatcttacatctaacacaccttcaaatatccaac 13671255  T
Q  201 ttccacaacctacaaggcaactgaaacatcatcccatatctcaaacatttacaaatttcccacctttcctctctgctcc 279  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13671254 ttccacaacctacaaggcaaccgaaacatcatcccatatctcaaacatttacaaatttcccacctttcctctctactcc 13671176  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 5739506 - 5739228
Alignment:
Q  1 atccttatttacaaagcaacctacacatcatcccatatctcaaacacatacaaacttcccacctttcctctctacttcaagtccacaaatgtctactgtc 100  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5739506 atccctatctacaaagcaacctacacatcatcccatatctcaaacacatacaaatttcccacctttcctctctacttcaagtccacaaatgtctactgtc 5739407  T
Q  101 catgctcccacttctcaaatacctacaaatacccaacaaccccactctacaaggaaacctacacatcatcttacatctaacacaccttcaaatatccaac 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5739406 catgctcccacttctcaaatacctacaaatacccaacaaccccactctacaatgaaacctacacatcatcttacatctaacacaccttcaaatatccaac 5739307  T
Q  201 ttccacaacctacaaggcaactgaaacatcatcccatatctcaaacatttacaaatttcccacctttcctctctgctcc 279  Q
       | | | |||||| ||| |  | |||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5739306 aatcgctatctacaaagcagcctacacatcatctcatatctcaaacacatacaaatttcccacctttcctctctactcc 5739228  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 13671655 - 13671382
Alignment:
Q  1 atccttatttacaaagcaacctacacatcatcccatatctcaaacacatacaaacttcccacctttcctctctacttcaagtccacaaatgtctactgtc 100  Q
    |||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13671655 atccctatctacaaagcagcctacacatcatcccatatctcaaacacatacaaacttcccacctttcctctctacttcaagtccacaaatgtctactgtc 13671556  T
Q  101 catgctcccacttctcaaatacctacaaatacccaacaaccccactctacaaggaaacctacacatcatcttacatctaacacaccttcaaatatccaac 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13671555 catgctcccacttctcaaatacctacaaatacccaacaaccccactctacaaggaaacctacacatcatcttacatctaaaacaccttcaaatatccaac 13671456  T
Q  201 ttccacaacctacaaggcaactgaaacatcatcccatatctcaaacatttacaaatttcccacctttcctctct 274  Q
       | | | |||||| ||| |  | ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  13671455 aatccctatctacaaagcagcctacacatcatcccatatctcaaacacatacaaacttcccacctttcctctct 13671382  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 13671856 - 13671583
Alignment:
Q  1 atccttatttacaaagcaacctacacatcatcccatatctcaaacacatacaaacttcccacctttcctctctacttcaagtccacaaatgtctactgtc 100  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13671856 atccctatctacaaagcaacctacacatcatcccatatctcaaacacatactaacttcccacctttcctctctacttcaagtccacaaatgtctactgtc 13671757  T
Q  101 catgctcccacttctcaaatacctacaaatacccaacaaccccactctacaaggaaacctacacatcatcttacatctaacacaccttcaaatatccaac 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13671756 catgctcccacttctcaaatacctacaaatacccaacaaccccactctacaatgaaacctacacatcatcttacatctaaaacaccttcaaatatccaac 13671657  T
Q  201 ttccacaacctacaaggcaactgaaacatcatcccatatctcaaacatttacaaatttcccacctttcctctct 274  Q
       | | | |||||| ||| |  | ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  13671656 aatccctatctacaaagcagcctacacatcatcccatatctcaaacacatacaaacttcccacctttcctctct 13671583  T

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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 13657009 - 13656736
Alignment:
Q  1 atccttatttacaaagcaacctacacatcatcccatatctcaaacacatacaaacttcccacctttcctctctacttcaagtccacaaatgtctactgtc 100  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13657009 atccctatctacaaagcaacctacacatcatcccatatctcaaacacatactaacttcccacctttcctctctacttcaagtccacaaatgtctactgtc 13656910  T
Q  101 catgctcccacttctcaaatacctacaaatacccaacaaccccactctacaaggaaacctacacatcatcttacatctaacacaccttcaaatatccaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13656909 catgctcccacttctcaaatacctacaaatatccaacaaccccactctacaatgaaacctacacatcatcttacatctaaaacaccttcaaatatccaac 13656810  T
Q  201 -ttccacaacctacaaggcaactgaaacatcatcccatatctcaaacatttacaaatttcccacctttcctctct 274  Q
      ||||  |  ||||| |||||  | ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  13656809 aatcca-tatatacaaagcaacctacacatcatcccatatctcaaacacatacaaacttcccacctttcctctct 13656736  T

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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 5739296 - 5739156
Alignment:
Q  10 tacaaagcaacctacacatcatcccatatctcaaacacatacaaacttcccacctttcctctctacttcaagtccacaaatgtctactgtccatgctccc 109  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | ||| |||||    
T  5739296 tacaaagcagcctacacatcatctcatatctcaaacacatacaaatttcccacctttcctctctactccaagtccacaaatgtctacaattcatactccc 5739197  T
Q  110 acttctcaaatacctacaaatacccaacaaccccactctac 150  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||    
T  5739196 acctctcaaatacctacaaatatccaatctccccactctac 5739156  T

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Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 10 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 13671244 - 13671104
Alignment:
Q  10 tacaaagcaacctacacatcatcccatatctcaaacacatacaaacttcccacctttcctctctacttcaagtccacaaatgtctactgtccatgctccc 109  Q
    ||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | |||||||||    
T  13671244 tacaaggcaaccgaaacatcatcccatatctcaaacatttacaaatttcccacctttcctctctactccaagtccacaaatgtctacaattcatgctccc 13671145  T
Q  110 acttctcaaatacctacaaatacccaacaaccccactctac 150  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||    
T  13671144 acctctcaaatacctacaaatatccaatctccccactctac 13671104  T

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Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 25 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 13656583 - 13656458
Alignment:
Q  25 acatcatcccatatctcaaacacatacaaacttcccacctttcctctctacttcaagtccacaaatgtctactgtccatgctcccacttctcaaatacct 124  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||||||||||    
T  13656583 acatcatcccatatctcaaacatttacaaatttcccacctttcctctctactccaagtccacaaatgtctacaattcatgctcccacctctcaaatacct 13656484  T
Q  125 acaaatacccaacaaccccactctac 150  Q
    ||||||| ||||   |||||||||||    
T  13656483 acaaatatccaatctccccactctac 13656458  T

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Target: chr5 (Bit Score: 255; Significance: 1e-142; HSPs: 3)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Original strand, 18581552 - 18581830
Alignment:
Q  1 atccttatttacaaagcaacctacacatcatcccatatctcaaacacatacaaacttcccacctttcctctctacttcaagtccacaaatgtctactgtc 100  Q
    |||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18581552 atccctatctacaaagcagcctacacatcatcccatatctcaaacacatacaaacttcccacctttcctctctacttcaagtccacaaatgtctactgtc 18581651  T
Q  101 catgctcccacttctcaaatacctacaaatacccaacaaccccactctacaaggaaacctacacatcatcttacatctaacacaccttcaaatatccaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18581652 catgctcccacttctcaaatacctacaaatacccaacaaccccactctacaaggaaacctacacatcatcttacatctaacacaccttcaaatatccaac 18581751  T
Q  201 ttccacaacctacaaggcaactgaaacatcatcccatatctcaaacatttacaaatttcccacctttcctctctgctcc 279  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18581752 ttccacaacctacaaggcaatcgaaacatcatcccatatctcaaacatttacaaatttcccacctttcctctctactcc 18581830  T

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Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Original strand, 18581351 - 18581624
Alignment:
Q  1 atccttatttacaaagcaacctacacatcatcccatatctcaaacacatacaaacttcccacctttcctctctacttcaagtccacaaatgtctactgtc 100  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18581351 atccctatctacaaagcaacctacacatcatcccatatctcaaacacatactaacttcccacctttcctctctacttcaagtccacaaatgtctactgtc 18581450  T
Q  101 catgctcccacttctcaaatacctacaaatacccaacaaccccactctacaaggaaacctacacatcatcttacatctaacacaccttcaaatatccaac 200  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18581451 catgctcccatttctcaaatacctacaaatacccaacaaccccgctctacaatgaaacctacacatcatcttacatctaaaacaccttcaaatatccaac 18581550  T
Q  201 ttccacaacctacaaggcaactgaaacatcatcccatatctcaaacatttacaaatttcccacctttcctctct 274  Q
       | | | |||||| ||| |  | ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  18581551 aatccctatctacaaagcagcctacacatcatcccatatctcaaacacatacaaacttcccacctttcctctct 18581624  T

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Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 25 - 150
Target Start/End: Original strand, 18581777 - 18581902
Alignment:
Q  25 acatcatcccatatctcaaacacatacaaacttcccacctttcctctctacttcaagtccacaaatgtctactgtccatgctcccacttctcaaatacct 124  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||| ||| ||||||||||||    
T  18581777 acatcatcccatatctcaaacatttacaaatttcccacctttcctctctactccaagtccacaaatgtctacaattcatgctctcacctctcaaatacct 18581876  T
Q  125 acaaatacccaacaaccccactctac 150  Q
    ||||||| ||||   |||||||||||    
T  18581877 acaaatatccaatctccccactctac 18581902  T

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Target: scaffold0014 (Bit Score: 250; Significance: 1e-139; HSPs: 2)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 6 - 279
Target Start/End: Original strand, 22565 - 22838
Alignment:
Q  6 tatttacaaagcaacctacacatcatcccatatctcaaacacatacaaacttcccacctttcctctctacttcaagtccacaaatgtctactgtccatgc 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22565 tatttacaaagcaacctacacatcatcccatatctcaaacacatactaacttcccacctttcctctctacttcaagtccacaaatgtctactttccatgc 22664  T
Q  106 tcccacttctcaaatacctacaaatacccaacaaccccactctacaaggaaacctacacatcatcttacatctaacacaccttcaaatatccaacttcca 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22665 tcccacttctcaaatacctacaaatacccaacaaccccactctacaaggaaacctacacatcatcttacatctaacacaccttcaaatatccaatttcca 22764  T
Q  206 caacctacaaggcaactgaaacatcatcccatatctcaaacatttacaaatttcccacctttcctctctgctcc 279  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  22765 caacctacaaggcaaccgaaacatcatcccatatctcaaacatttacaaatttcccacctttgctctctactcc 22838  T

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Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 10 - 150
Target Start/End: Original strand, 22770 - 22910
Alignment:
Q  10 tacaaagcaacctacacatcatcccatatctcaaacacatacaaacttcccacctttcctctctacttcaagtccacaaatgtctactgtccatgctccc 109  Q
    ||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  | |||||||||    
T  22770 tacaaggcaaccgaaacatcatcccatatctcaaacatttacaaatttcccacctttgctctctactccaagtccacaaatgtctacaattcatgctccc 22869  T
Q  110 acttctcaaatacctacaaatacccaacaaccccactctac 150  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||    
T  22870 acctctcaaatacctacaaatatccaatctccccactctac 22910  T

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Target: chr6 (Bit Score: 249; Significance: 1e-138; HSPs: 6)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Original strand, 12923829 - 12924104
Alignment:
Q  1 atccttatttacaaagcaacctacacatcatcccatatctcaaacacatacaaacttcccacctttcctctctacttcaagtccacaaatgtctactgtc 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12923829 atccctatttacaaagcaacctacacatcatccc---tctcaaaaaaatacaaacttcccacctttcctctctacttcaagtccacaaatgtctactgtc 12923925  T
Q  101 catgctcccacttctcaaatacctacaaatacccaacaaccccactctacaaggaaacctacacatcatcttacatctaacacaccttcaaatatccaac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12923926 catgctcccacttctcaaatacctacaaatacccaacaaccccactctacaaggaaacctacacatcatcttacatctaacacaccttcaaatatccaac 12924025  T
Q  201 ttccacaacctacaaggcaactgaaacatcatcccatatctcaaacatttacaaatttcccacctttcctctctgctcc 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12924026 ttccacaacctacaaggcaactgaaacatcatcccatatctcaaacatttacaaatttcccacctttcctctctactcc 12924104  T

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Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Original strand, 12923427 - 12923700
Alignment:
Q  1 atccttatttacaaagcaacctacacatcatcccatatctcaaacacatacaaacttcccacctttcctctctacttcaagtccacaaatgtctactgtc 100  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12923427 atccctatctacaaagcaacctacacatcatcccatatctcaaacacatactaacttcccacctttcctctctacttcaagtccacaaatgtctactatc 12923526  T
Q  101 catgctcccacttctcaaatacctacaaatacccaacaaccccactctacaaggaaacctacacatcatcttacatctaacacaccttcaaatatccaac 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12923527 catgctcccacttctcaaatacctacaaatacccaacaaccccactctacaatgaaacctacacatcatcttacatctaaaacaccttcaaatatccaac 12923626  T
Q  201 ttccacaacctacaaggcaactgaaacatcatcccatatctcaaacatttacaaatttcccacctttcctctct 274  Q
       | | | |||||| ||| |  | ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  12923627 aatccctatctacaaagcagcctacacatcatcccatatctcaaacacatacaaacttcccacctttcctctct 12923700  T

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Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Original strand, 12923628 - 12923827
Alignment:
Q  1 atccttatttacaaagcaacctacacatcatcccatatctcaaacacatacaaacttcccacctttcctctctacttcaagtccacaaatgtctactgtc 100  Q
    |||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12923628 atccctatctacaaagcagcctacacatcatcccatatctcaaacacatacaaacttcccacctttcctctctacttcaagtccacaaatgtctactgtc 12923727  T
Q  101 catgctcccacttctcaaatacctacaaatacccaacaaccccactctacaaggaaacctacacatcatcttacatctaacacaccttcaaatatccaac 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12923728 catgctcccacttctcaaatacctacaaatacccaacaaccccactctacaaggaaacctacacatcatcttacatctaaaacaccttcaaatatccaac 12923827  T

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Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 25 - 150
Target Start/End: Original strand, 12924051 - 12924176
Alignment:
Q  25 acatcatcccatatctcaaacacatacaaacttcccacctttcctctctacttcaagtccacaaatgtctactgtccatgctcccacttctcaaatacct 124  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||||||||||    
T  12924051 acatcatcccatatctcaaacatttacaaatttcccacctttcctctctactccaagtccacaaatgtctacaattcatgctcccacctctcaaatacct 12924150  T
Q  125 acaaatacccaacaaccccactctac 150  Q
    ||| ||| ||||   |||||||||||    
T  12924151 acatatatccaatctccccactctac 12924176  T

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Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 121 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 19540801 - 19540742
Alignment:
Q  121 acctacaaatacccaacaaccccactctacaaggaaacctacacatcatcttacatctaa 180  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||    
T  19540801 acctacaaatacccaacaaccccactctacaaggcaacctacatatcatctcacatctaa 19540742  T

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Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 121 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 19540702 - 19540631
Alignment:
Q  121 acctacaaatacccaacaaccccactctacaaggaaacctacacatcatcttacatctaacacaccttcaaat 193  Q
    ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  19540702 acctacaaatatc-aacaacaccactctacaaggaaatctacacatcatcttacatctaaaataccttcaaat 19540631  T

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